chr1 1343359 1343768 1343546 Y NA MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,RP4-758J18.7,VWA1,ATAD3C NA NA NA NA MRPL20 2666 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1 NA NA NA NA GNB1 19954 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 6336471 6336830 6336716 Y ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7 ICMT,GPR153 GPR153 K562 ChIA-PET 22265404 GPR153 17436 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 8156648 8157003 8156918 Y VAMP3 NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 72280 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 8262223 8262541 8262360 Y ERRFI1 RNU1-7P ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-7P 2116 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 8499087 8499228 8499177 Y NA NA NA NA NA NA SLC45A1 123201 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN NA NA NA NA SPEN 40400 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 16292565 16293101 16292653 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 7526 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 17027024 17027386 17027173 Y NA EIF1AXP1 NA NA NA NA EIF1AXP1 16474 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 21348947 21349299 21348998 Y CDA,ECE1,ECE1 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48947 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 21349725 21349786 21349755 Y EIF4G3 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48460 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 21965161 21965473 21965377 Y RAP1GAP NA NA NA NA NA USP48 142626 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 22221933 22221950 22221942 Y NA RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA RP11-26H16.1 10641 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 22236410 22236692 22236686 Y NA RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA RP11-26H16.1 3819 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 24229023 24229388 24229190 Y NA FUCA1 NA NA NA NA FUCA1 36239 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 26022319 26022793 26022555 Y SEPN1 NA NA NA NA NA SEPN1 101874 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 MIR3917,STMN1 NA NA NA NA MIR3917 29188 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 27321452 27321840 27321632 Y TMEM222,TRNP1,FAM46B RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA TRNP1 3254 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 27926949 27927449 27927117 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 1493 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 29214759 29214998 29214903 Y GMEB1,EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 3156 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 39596184 39596482 39596236 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 51196 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 39644229 39644606 39644401 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 99241 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 39657786 39658129 39657912 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 112798 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 370805 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 44962677 44962982 44962698 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 93811 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 45085192 45085548 45085380 Y NA NA C1orf228,TMEM53 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM53 52679 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 50763281 50763486 50763384 Y NA NA AGBL4 IMR90 Hi-C 24141950 FAF1 660449 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA RP11-191G24.1,EPS15 NA NA NA NA RP11-191G24.1 46389 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 52110368 52110491 52110430 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 69517 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 53588397 53588520 53588474 Y PODN,PODN NA PODN IMR90 Hi-C 24141950 PODN 62543 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACOT11 51605 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 59228706 59229186 59229035 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 18599 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr1 59479443 59479773 59479608 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 4286 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 59910700 59911009 59910820 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 150390 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 60015651 60015887 60015758 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 255341 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 60062084 60062408 60062209 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 301774 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 64505281 64505575 64505361 Y ROR1,UBE2U NA NA NA NA NA CFL1P3 197925 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 66277656 66278058 66277920 Y LEPROT,LEPR,LEPROT NA NA NA NA NA LEPROT 393386 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 67029191 67029437 67029359 Y NA SGIP1 NA NA NA NA SGIP1 32125 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr1 67029939 67030347 67030122 Y PDE4B SGIP1 NA NA NA NA SGIP1 32873 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr1 68849988 68850367 68850179 Y NA NA LOC100289178,WLS,RPE65 IMR90 Hi-C 24141950 WLS 153185 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 72750417 72750888 72750606 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 4000 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44L 125845 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 79154444 79154658 79154581 Y NA IFI44 NA NA NA NA IFI44 40963 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 85667688 85667915 85667906 Y NA SYDE2 NA NA NA NA SYDE2 2959 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 85991291 85991622 85991523 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA DDAH1 50311 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 90190139 90190909 90190374 Y GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326 NA NA NA NA NA LRRC8C 93508 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 92048914 92049154 92049034 Y NA NA TGFBR3,CDC7,HSP90B3P IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR3 320738 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA MIR760 164270 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 151050 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.13824442694565 chr1 94167175 94167520 94167394 Y BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 142868 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 94792807 94793133 94793077 Y ARHGAP29 RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 3690 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 98334223 98334553 98334370 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 50052 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 100422351 100422596 100422492 Y NA SLC35A3 AGL,HIAT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC35A3 10749 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 108169181 108169438 108169310 Y NA NA NA NA NA NA NTNG1 488552 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 108741685 108742156 108741931 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 214 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 109981518 109981703 109981616 Y NA SORT1,PSMA5,SYPL2 CELSR2,SORT1,PSMA5,SYPL2,CYB561D1,MYBPHL,ATXN7L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMA5 14456 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 110778589 110778756 110778673 Y NA KCNC4 NA NA NA NA KCNC4 26624 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 112135698 112135869 112135721 Y C1orf183,DENND2D,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 52858 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 112163826 112164071 112163877 Y C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 80986 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 117424835 117425013 117424940 Y PTGFRN PTGFRN PTGFRN MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 25666 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 145092450 145092883 145092733 Y SEC22B,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 1337 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 145093258 145093700 145093462 Y NA PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 520 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 150800498 150800843 150800671 Y NA CTSK,ARNT NA NA NA NA CTSK 21699 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 152140379 152140745 152140485 Y NA FLG-AS1 NA NA NA NA FLG-AS1 1778 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A2,S100A16,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 153824989 153825297 153825210 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 68154 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr1 154392646 154393050 154392862 Y CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 16977 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 154699087 154699216 154699140 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 100612 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 154977099 154977253 154977190 Y ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 3972 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 155052148 155052357 155052334 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1 NA NA NA NA EFNA3 17924 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MTX1 11531 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 155757099 155757186 155757142 Y NA NA NA NA NA NA GON4L 70005 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA ELL2P1 LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2P1 25856 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA ELL2P1 1154 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 162603017 162603226 162603122 Y DDR2 DDR2 NA NA NA NA DDR2 3854 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 162830850 162831244 162831104 Y NA NA NA NA NA NA RGS4 205321 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr1 162846595 162846764 162846655 Y DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 NA C1orf110,RGS4,RGS5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 189801 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 163005587 163006022 163005933 Y UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 RGS4 C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 30543 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 164655011 164655383 164655197 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 132190 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 164734934 164735098 164735029 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 212113 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 164750243 164750515 164750387 Y PBX1 NA NA NA NA NA PBX1 227422 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 165345662 165345996 165345868 Y NA NA LRRC52,LOC400794 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 252102 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA NA NA NA NA NA RP11-277B15.1 60947 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 171257317 171257381 171257324 Y PRRC2C,FMO4 FMO4 NA NA NA NA FMO4 23966 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 171712214 171712716 171712399 Y FMO4,PRRC2C VAMP4,METTL13 NA NA NA NA VAMP4 2827 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 172715484 172715760 172715631 Y NA NA C1orf105,TNFSF4,LOC100506023,PRDX6,RC3H1,SLC9A11,CENPL,DARS2,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 304254 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 173091914 173092434 173092232 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023 IMR90 Hi-C 24141950 PRDX6 351971 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 180120187 180120425 180120330 Y TOR1AIP1,CEP350 QSOX1 NA NA NA NA QSOX1 1544 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 NA NA NA NA NA QSOX1 78346 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 180250812 180250948 180250921 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 128843 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 183178797 183178927 183178861 Y NA NA NA NA NA NA LAMC1 188202 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 184005350 184005919 184005662 Y RGL1,GLT25D2 TSEN15 RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 12892 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 184836042 184836526 184836376 Y EDEM3,TRMT1L,TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A NA NA NA NA NA FAM129A 105156 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 187996792 187997117 187996893 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 1200707 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 193073509 193073815 193073644 Y NA TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 265 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 200321353 200321596 200321470 Y DDX59,ZNF281 NA NA NA NA NA ZNF281 55588 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 200481491 200481643 200481567 Y NA NA NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 104307 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 201431088 201431253 201431176 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 5112 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NAV1 NA NA NA NA NAV1 28972 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 201682596 201682901 201682784 Y ARL8A NA NA NA NA NA NAV1 92185 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 201883288 201883655 201883472 Y NA SHISA4,LMOD1,TIMM17A IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 SHISA4 27480 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 PRELP NA NA NA NA PRELP 39026 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr1 203524939 203525564 203525325 Y NA NA ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 68125 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr1 203525711 203525894 203525744 Y NA NA ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 67795 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 203561987 203562359 203562082 Y BTG2,ZC3H11A ATP2B4 ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 31330 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 203576404 203576703 203576575 Y BTG2,LAX1 ATP2B4 ATP2B4,FMOD,PRELP,OPTC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B4 16986 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 203598711 203598999 203598777 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 5022 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 203599092 203599518 203599142 Y BTG2,LAX1 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 5403 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 204058173 204058362 204058281 Y SOX13 SOX13 NA NA NA NA SOX13 17930 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 204432329 204432499 204432494 Y SOX13,PIK3C2B PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 29353 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 12504 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 206807155 206807335 206807245 Y NA EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2 NA NA NA NA DYRK3 274 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 208021631 208021781 208021738 Y CR1,CD46,PLXNA2,CD34 C1orf132 CD34 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf132 18714 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 209915892 209916078 209915980 Y NA C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 39826 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 213090277 213090696 213090331 Y VASH2,FLVCR1 NA NA NA NA NA FLVCR1 60680 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 215130656 215131050 215130800 Y KCNK2,KCNK2 KCNK2 KCNK2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNK2 46068 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 218671989 218672275 218672071 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 154412 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 219262446 219262621 219262479 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 82565 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr1 219497639 219497836 219497817 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-95P13.1 116148 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 221143804 221143903 221143854 Y NA NA NA NA NA NA HLX 94105 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 221614030 221614267 221614237 Y DUSP10 NA C1orf140,HLX,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 299251 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 221899063 221899285 221899220 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 14233 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 223901276 223901546 223901311 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 13981 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr1 224811590 224812043 224811760 Y NA NA NA NA NA NA WDR26 188855 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 226005413 226005573 226005512 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 9619 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 228688608 228688902 228688729 Y HIST3H2A RNF187 NA NA NA NA RNF187 15846 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 234669721 234669929 234669823 Y NA RP5-855F14.1 LOC100506795 K562 ChIA-PET 22265404 RP5-855F14.1 4196 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 234754264 234754665 234754337 Y NA IRF2BP2 ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 10993 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 234812067 234812214 234812141 Y NA NA LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 68796 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 234857710 234858181 234857899 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 114439 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 115572 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 235133014 235133422 235133155 Y NA RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 18463 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 235183936 235184197 235184018 Y NA NA LINC00184,LOC100506795,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.3 69385 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B SNORA14B,TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SNORA14B 42395 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 235835688 235836968 235835896 Y NA NA NA NA NA NA B3GALNT2 169907 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 236080566 236081247 236080933 Y LYST,GPR137B LYST B3GALNT2,LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 35626 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 240397761 240398076 240397984 Y GREM2 NA NA NA NA NA ADH5P3 66306 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr1 240476321 240476487 240476382 Y GREM2 NA NA NA NA NA ADH5P3 144866 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 243431437 243431793 243431509 Y NA CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 14117 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr1 244512430 244512879 244512496 Y ADSS NA C1orf100,ADSS,AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 100557 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 179287 179666 179475 Y NA ZMYND11 NA NA NA NA ZMYND11 882 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 830510 830663 830589 Y NA NA DIP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 DIP2C 96827 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 830904 831008 830920 Y DIP2C NA DIP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 DIP2C 97221 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 3984866 3985563 3985082 Y KLF6 NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 159393 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr10 4396174 4396330 4396296 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 112070 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 12563 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 4891874 4892173 4892030 Y NA AKR1C1 NA NA NA NA AKR1C1 40623 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 6243287 6243821 6243659 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 58406 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 17028207 17028677 17028581 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 170680 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 17067559 17067950 17067759 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 174103 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 17116431 17116714 17116628 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 125339 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 21799318 21799715 21799601 Y C10orf113 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 21379 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 24740338 24740618 24740546 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 269979 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 26775274 26775560 26775412 Y APBB1IP,PDSS1,ABI1 NA NA NA NA NA PDSS1 209028 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 26775885 26776759 26776046 Y APBB1IP,ABI1 NA NA NA NA NA PDSS1 207829 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 29922205 29922549 29922392 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 101161 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 30073207 30073608 30073571 Y SVIL SVIL SVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SVIL 49497 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr10 30092989 30093361 30093263 Y SVIL NA SVIL,KIAA1462,MIR604 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SVIL 69279 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 31073492 31073855 31073655 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 245011 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 31109229 31109540 31109356 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,KIF5B,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 209326 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 31293680 31294164 31294019 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 24702 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 31871598 31871776 31871672 Y NA NA ZNF438,ARHGAP12,ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 264222 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA RP11-462L8.1,ITGB1 NA NA NA NA RP11-462L8.1 5078 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 RP11-462L8.1,ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr10 33621123 33621423 33621243 Y NRP1 NRP1 NA NA NA NA NRP1 1767 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 35028968 35029134 35029048 Y NA NA NA NA NA NA PARD3 73119 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 35070002 35070125 35070067 Y CREM PARD3 NA NA NA NA PARD3 32128 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 35932153 35932694 35932189 Y FZD8 MIR4683,FZD8 NA NA NA NA FZD8 3791 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 45374285 45374680 45374305 Y NA NA NA NA NA NA RASSF4 78175 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 50595145 50595278 50595227 Y C10orf128 NA NA NA NA NA PGBD3 149808 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 52751732 52752116 52752062 Y PRKG1 PRKG1 NA NA NA NA PRKG1 2787 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 54069854 54070012 54069944 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 2044 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 54078280 54078480 54078433 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6224 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 54078781 54079176 54078966 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6725 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 54211545 54211936 54211751 Y NA NA LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DKK1 139489 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 NA DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK1 174501 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr10 54293866 54294084 54293893 Y DKK1 NA LOC100506939,DKK1 IMR90 Hi-C 24141950 DKK1 221810 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 60949726 60949909 60949819 Y NA NA NA NA NA NA BICC1 678826 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 61665210 61665415 61665365 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 796 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 63596779 63597177 63597154 Y NA NA RHOBTB1,C10orf107,ARID5B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID5B 61882 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 63697389 63697783 63697593 Y NA ARID5B NA NA NA NA ARID5B 38330 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 63698832 63699053 63698915 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 39773 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 63805800 63806070 63805931 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 146741 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 64875678 64875783 64875732 Y NA NRBF2 ZNF365,ADO,NRBF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRBF2 15267 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 65467084 65467405 65467282 Y JMJD1C NA JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 187961 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 SIRT1 33037 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 69854882 69855277 69855187 Y HERC4 HERC4 ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HERC4 21777 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 70088080 70088572 70088236 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 HNRNPH3,PBLD NA NA NA NA HNRNPH3 359 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 71626507 71626840 71626632 Y COL13A1 NA NA NA NA NA COL13A1 66863 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 72082681 72083053 72082867 Y NA NA NA NA NA NA LRRC20 57329 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 72416244 72416577 72416419 Y ADAMTS14 NA ADAMTS14,PRF1,KIAA1274,C10orf27,SGPL1,PCBD1 IMR90 Hi-C 24141950 SGPL1 157140 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 74453097 74453245 74453141 Y CCDC109A MCU NA NA NA NA MCU 3208 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 78920467 78920779 78920602 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 475574 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr10 79069997 79070387 79070206 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 325966 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 79166166 79166289 79166224 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 230064 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 79265772 79266169 79265902 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 130184 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 79291052 79291779 79291330 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 104574 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 79382631 79383090 79382827 Y NA KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 13263 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 79383458 79383833 79383807 Y NA KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 12520 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 79651191 79651354 79651229 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 33024 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 80015725 80016226 80016048 Y RPS24 LINC00856 NA NA NA NA LINC00856 9220 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 80091311 80091643 80091437 Y NA NA LOC100132987,LOC283050,ZMIZ1,RPS24 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00856 84806 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 80303504 80303921 80303741 Y NA NA RPS24,LOC283050,POLR3A,ZMIZ1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00856 296999 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 80998898 81000011 80999247 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 105214 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 82214819 82214901 82214871 Y TSPAN14 FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 2897 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 87704584 87704927 87704756 Y NA NA NA NA NA NA GRID1 419323 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 89802399 89802689 89802412 Y NA NA RNLS,CFL1P1,ATAD1,KLLN,PTEN,LIPF,LIPM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 99140 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 90711253 90711764 90711560 Y LIPF,CH25H,ACTA2 FAS,ACTA2 NA NA NA NA FAS 36650 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 90995212 90995521 90995376 Y ANKRD22,FAS,IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 RP11-149I23.3 NA NA NA NA RP11-149I23.3 46001 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 92690903 92691268 92691118 Y NA NA ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 RPP30 61430 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 16896 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr10 94520397 94520594 94520523 Y NA NA EXOC6,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOC6 68341 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 95145053 95145431 95145242 Y NA NA NA NA NA NA MYOF 94643 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr10 95226262 95226423 95226291 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 13651 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr10 96282867 96283106 96282931 Y TBC1D12 HELLS NA NA NA NA HELLS 20441 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 98433072 98433822 98433312 Y LCOR,PIK3AP1,TM9SF3 NA NA NA NA NA RPL13AP5 74223 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 99449337 99449738 99449607 Y C10orf28,RRP12,PI4K2A AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA AVPI1 4257 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 99583674 99583743 99583710 Y NA GOLGA7B NA NA NA NA GOLGA7B 42146 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr10 104370147 104370568 104370420 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 31685 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.13824442694565 chr10 104406463 104406725 104406695 Y NFKB2,NFKB2,TRIM8 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 4210 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 104953975 104954222 104954115 Y C10orf26,C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 2919 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 156759 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr10 105532054 105532211 105532109 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 81090 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 105650011 105650288 105650237 Y GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK SH3PXD2A,OBFC1 SH3PXD2A IMR90 Hi-C 24141950 OBFC1 25675 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 105667994 105668449 105668210 Y GSTO1,GSTO1,SLK OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 7514 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 108342157 108342240 108342208 Y NA NA NA NA NA NA SORCS3 1943298 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 110671685 110671807 110671696 Y NA NA NA NA NA NA RP11-163F15.1 352112 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 112051912 112052490 112052119 Y ADD3,MXI1 SMNDC1 NA NA NA NA SMNDC1 10219 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 112159079 112159451 112159258 Y NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 96145 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 112170161 112170538 112170357 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 85058 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 112207134 112207519 112207380 Y NA DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 48077 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 112261043 112261328 112261185 Y SHOC2,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 5447 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 112263780 112264181 112263965 Y SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 8184 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 119293077 119293204 119293150 Y NA EMX2,EMX2OS NA NA NA NA EMX2 6751 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 119300827 119301053 119300919 Y VAX1,EMX2 EMX2,EMX2OS NA NA NA NA EMX2 872 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 119305717 119306203 119305928 Y EMX2 EMX2,EMX2OS NA NA NA NA EMX2OS 3138 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 119311834 119312129 119311974 Y RAB11FIP2,EMX2 EMX2,EMX2OS NA NA NA NA EMX2OS 9255 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 120692616 120692979 120692798 Y NA NA NA NA NA NA NANOS1 94249 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr10 123900074 123900243 123900143 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 153385 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 123914446 123914761 123914722 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 167757 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 124613518 124613778 124613722 Y NA FAM24B NA NA NA NA FAM24B 23379 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 127752206 127752491 127752329 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 169098 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr10 127916240 127916659 127916465 Y ADAM12 NA NA NA NA NA ADAM12 158365 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 127932254 127933051 127932680 Y ADAM12 NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM12 141973 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7 NA NA NA NA IRF7 15193 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 2913617 2913951 2913751 Y NA CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA SLC22A18 5000 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 5311058 5311280 5311161 Y NA NA NA NA NA NA AC104389.32 70565 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 8041450 8041887 8041518 Y OR10A3,RIC3,TUB,TUB TUB TUB IMR90 Hi-C 24141950 TUB 2659 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 9770028 9770265 9770206 Y WEE1,SWAP70 NA NA NA NA NA SWAP70 86404 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 10681207 10681687 10681411 Y ADM,MRVI1,MRVI1 MRVI1 LYVE1,MRVI1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MRVI1 31848 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 13359856 13360227 13360061 Y ARNTL NA NA NA NA NA ARNTL 63657 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 19736892 19737150 19737126 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 366621 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 26863519 26863562 26863540 Y NA NA NA NA NA NA FIBIN 150066 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 29207165 29207501 29207312 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 485003 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 30943465 30943630 30943550 Y NA NA NA NA NA NA MPPED2 337046 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 32728667 32728946 32728768 Y NA NA NA NA NA NA EIF3M 125323 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 33468371 33468737 33468467 Y NA NA C11orf41,LOC338739 IMR90 Hi-C 24141950 HIPK3 192153 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 34187284 34187655 34187468 Y NA NA NA NA NA NA NAT10 62135 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 34393112 34393337 34393189 Y ABTB2 RP1-145M24.1,ABTB2 ABTB2,ELF5,NAT10,CAT IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 15557 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 35088540 35088910 35088827 Y NA NA CD44,PDHX,APIP IMR90 Hi-C 24141950 CD44 69507 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52906 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 35148142 35148254 35148206 Y CD44 CD44 PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 10163 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 43955473 43955506 43955502 Y NA C11orf96 NA NA NA NA C11orf96 10581 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 44590064 44591217 44590888 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 6087 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CTD-2589M5.4,CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 34865 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 47421735 47422128 47421819 Y MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SLC39A13,RP11-750H9.5,PSMC3 SLC39A13 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A13 4555 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 57333685 57333973 57333758 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6 TIMM10,SERPING1 NA NA NA NA UBE2L6 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 59524471 59524655 59524596 Y MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3 STX3,AP000640.10 NA NA NA NA AP000640.10 4023 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 60722044 60722202 60722056 Y VPS37C,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SLC15A3 PRPF19,TMEM109,TMEM132A,SLC15A3 NA NA NA NA SLC15A3 4042 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 60843253 60843606 60843384 Y SLC15A3,TMEM138 NA CD5 IMR90 Hi-C 24141950 VPS37C 83483 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 60926054 60926399 60926274 Y NA VPS37C NA NA NA NA VPS37C 690 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr11 61872496 61872975 61872791 Y DAGLA,FTH1 INCENP FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,C11orf9,DAGLA,DKFZP434K028,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 16470 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 99210 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65058176 65058598 65058417 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 21691 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65059737 65059988 65059827 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20301 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65083603 65083722 65083697 Y NA CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 3314 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 65246279 65246484 65246387 Y SCYL1,LTBP3,EFEMP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 16749 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 65248969 65249218 65249208 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 14015 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65256318 65257363 65256982 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 5870 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 65259637 65259913 65259840 Y SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3320 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.65552498031386 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 SPTBN2,C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SPTBN2 83 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PC 14439 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 67121988 67122388 67122127 Y POLD4,CLCF1 POLD4,AP003419.11,RAD9A NA NA NA NA POLD4 55 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr11 68778534 68778789 68778694 Y MRGPRF MRGPRF,TPCN2 NA NA NA NA MRGPRF 88 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 195423 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 75270235 75270345 75270334 Y NA GDPD5,SERPINH1 NA NA NA NA SERPINH1 756 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 76353435 76353617 76353564 Y ACER3 LRRC32 NA NA NA NA LRRC32 26174 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 86514780 86515120 86515008 Y NA PRSS23 NA NA NA NA PRSS23 14679 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 89222982 89223368 89223335 Y NA NA NA NA NA NA NOX4 97411 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 92083144 92083535 92083339 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 845595 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 102140637 102141105 102140856 Y NA BIRC3 YAP1,BIRC2,MMP20,BIRC3,C11orf70 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BIRC3 45110 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 102191573 102191697 102191574 Y NA BIRC3,BIRC2 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC3 5358 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 110581726 110581943 110581819 Y ARHGAP20 NA NA NA NA NA ARHGAP20 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 111402540 111402739 111402658 Y NA LAYN NA NA NA NA LAYN 6266 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 112706090 112706200 112706145 Y NCAM1 NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 NCAM1 123797 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 117016262 117016599 117016456 Y NA SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 3279 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 118788249 118788453 118788294 Y MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5864 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 119598046 119598312 119598172 Y USP2 PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 252 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 121526040 121526695 121526415 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205128 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 121526794 121527145 121526879 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205882 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 121906863 121907080 121906924 Y NA NA SORL1,MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR125B1 61472 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 122049218 122049681 122049522 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 28202 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 122063445 122063834 122063519 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 42429 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 122080743 122080920 122080836 Y NA NA SORL1,BLID,MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR100 59727 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr11 124514246 124514548 124514258 Y OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B4,OR8B8,OR8B12,OR8A1 TBRG1,SPA17,SIAE NA NA NA NA TBRG1 23514 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 52393 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr11 130392180 130392594 130392285 Y NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 75311 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr11 130767172 130767510 130767285 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 16894 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 775890 776284 776001 Y NA NA NINJ2,CCDC77,B4GALNT3,WNK1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNK1 83475 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 1584094 1584332 1584168 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 52725 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 1632900 1633084 1632977 Y NA WNT5B NA NA NA NA WNT5B 3973 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 2144277 2144357 2144308 Y LRTM2 DCP1B CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B IMR90 Hi-C 24141950 DCP1B 32576 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 2378088 2378425 2378378 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 266387 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 6721904 6722326 6722186 Y GPR162,ENO2,C12orf53 NOP2,CHD4,ING4 NA NA NA NA CHD4 7262 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 10794413 10794704 10794528 Y NA MAGOHB NA NA NA NA MAGOHB 30191 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA NA NA NA NA NA MAGOHB 105076 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr12 11755379 11755464 11755421 Y NA ETV6 ETV6 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 45324 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 12960939 12961466 12961074 Y NA DDX47 NA NA NA NA DDX47 2784 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 7220 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 25099512 25100288 25099550 Y BCAT1 BCAT1,RP11-662I13.1 NA NA NA NA BCAT1 105 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr12 26130090 26130317 26130202 Y NA RASSF8 NA NA NA NA RASSF8 20128 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 27745630 27745707 27745691 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 71266 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 29489399 29489493 29489486 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 42629 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 30945631 30945953 30945771 Y NA CAPRIN2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 24 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA METTL20 NA NA NA NA METTL20 6792 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 6.72464719378669 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA ALG10B 395685 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr12 46918651 46918824 46918737 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 143189 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 47066053 47066292 47066182 Y SLC38A2 NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 290591 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 49624607 49624922 49624716 Y NA TUBA1C,TUBA1A RHEBL1,DHH,LMBR1L,TUBA1A,TUBA1C,TUBA1B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 43500 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 49641026 49641246 49641136 Y NA NA RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 59919 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 49739970 49740063 49739997 Y NA TROAP,SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 18304 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 50931365 50931732 50931390 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 34597 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 51787794 51788248 51788116 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6 SLC4A8,GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 3143 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 51986166 51986575 51986504 Y NA SCN8A NA NA NA NA SCN8A 4116 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 53398446 53398634 53398511 Y NA EIF4B,TENC1 NA NA NA NA EIF4B 504 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 53890170 53890360 53890251 Y MFSD5 MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 1487 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 53892109 53892322 53892185 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 262 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 54072437 54072838 54072741 Y CSAD,MAP3K12,ATF7,ATF7,ATP5G2,CALCOCO1 ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 3245 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 12047 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 56294124 56294208 56294164 Y NA DGKA,WIBG NA NA NA NA DGKA 24895 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr12 57546545 57546685 57546623 Y MBD6,DDIT3,NAB2,STAT6,STAT6 LRP1,STAT6 NA NA NA NA STAT6 22623 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 58238225 58238735 58238639 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2 NA NA NA NA NA CTDSP2 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 58758718 58759055 58758893 Y XRCC6BP1 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 XRCC6BP1 425394 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 58819259 58819609 58819396 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA XRCC6BP1 485935 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 58923778 58923975 58923913 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 388328 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr12 59310774 59310957 59310933 Y LRIG3,LRIG3 LRIG3 NA NA NA NA LRIG3 1346 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 63086673 63087045 63086801 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 91207 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 66008791 66009141 66009009 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 14142 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 66025227 66025796 66025503 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 30578 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 66042799 66043321 66043056 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 48150 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 66048868 66049228 66049091 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 54219 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 66050559 66051086 66050841 Y LEMD3 NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 55910 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 66060821 66060972 66060881 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 66172 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 66136008 66136292 66136116 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 79619 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 66285844 66286273 66285967 Y IRAK3 RP11-366L20.2 NA NA NA NA RP11-366L20.2 11897 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr12 71055637 71055848 71055742 Y NA NA NA NA NA NA KCNMB4 297581 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 72690281 72690495 72690341 Y TPH2,TRHDE TRHDE-AS1 NA NA NA NA TRHDE-AS1 23594 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 74668744 74669132 74668938 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 260419 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 76045179 76045405 76045348 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 141763 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 76060831 76060974 76060901 Y NA NA PHLDA1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 157415 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 76116548 76116691 76116626 Y NA NA PHLDA1,OSBPL8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRR1 213132 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr12 76153718 76154163 76153855 Y NA NA PHLDA1,KRR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRR1 250302 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 76206207 76206725 76206399 Y GLIPR1 NA NA NA NA NA PHLDA1 218987 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr12 76209246 76209451 76209339 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 216261 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 76219425 76219952 76219684 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 205760 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 76337836 76338217 76338130 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PHLDA1 87495 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 77425555 77425931 77425698 Y OSBPL8 E2F7 NA NA NA NA E2F7 31429 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 79848111 79848561 79848284 Y NA RP1-78O14.1 NA NA NA NA RP1-78O14.1 46615 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr12 80974115 80974384 80974233 Y MYF5 NA NA NA NA NA ACSS3 355210 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 81171843 81172335 81171905 Y NA NA NA NA NA NA ACSS3 157259 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 88828245 88828424 88828303 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 KITLG 144204 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 89532084 89532176 89532144 Y DUSP6 NA POC1B IMR90 Hi-C 24141950 DUSP6 212872 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 89619217 89620117 89619718 Y DUSP6,ATP2B1 NA DUSP6,LOC728084,POC1B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DUSP6 124931 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 92474192 92474586 92474423 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 60104 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 94172136 94172517 94172167 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 102985 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 94190374 94190467 94190421 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 121223 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA CCDC41 NA NA NA NA CCDC41 33416 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 96819918 96820022 96819970 Y NA CDK17,RN7SKP11 CDK17,ELK3,LTA4H IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 654 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 96839212 96840356 96839676 Y NEDD1,NEDD1,CDK17 CDK17,RN7SKP11 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 19948 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 102930045 102930144 102930098 Y NA NA PARPBP,IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 NUP37 418143 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 104675995 104676292 104676137 Y GLT8D2,TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RP11-818F20.5 3495 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr12 105711063 105711549 105711425 Y C12orf75 RP11-474B16.1 C12orf75,APPL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-474B16.1 7246 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 106328094 106328476 106328238 Y CKAP4 NA NUAK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCP11L2 365231 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 109900993 109901418 109901152 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 11789 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 115803300 115803402 115803336 Y NA NA NA NA NA NA TBX3 683331 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 116821073 116821333 116821156 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 107930 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 116893494 116893818 116893640 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 180351 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 118745418 118745709 118745623 Y NA NA NA NA NA NA TAOK3 63041 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 120668258 120668871 120668569 Y RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN-AS1 31164 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 120669025 120669761 120669334 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 31813 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 120700935 120701192 120701121 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1 NA NA NA NA PXN 382 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 122519763 122520228 122519936 Y ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 5135 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 124875337 124875736 124875419 Y NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 174399 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr12 125423202 125423335 125423285 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 23288 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 125702978 125703342 125703032 Y TMEM132B TMEM132B TMEM132B IMR90 Hi-C 24141950 TMEM132B 33596 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 126780658 126780679 126780668 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 867993 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 127730069 127730271 127730149 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 81397 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 GJA3 NA NA NA NA GJA3 39644 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr13 30568304 30568485 30568443 Y KATNAL1,KATNAL1 NA UBL3 IMR90 Hi-C 24141950 UBL3 145483 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 30717135 30717194 30717166 Y NA NA UBL3,KATNAL1,HMGB1,USPL1,ALOX5AP,LINC00426,TEX26-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDX2P1 151090 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058,UBE2L5P LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 31619955 31620221 31620066 Y ALOX5AP NA TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 114304 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 33825211 33825616 33825598 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 97151 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr13 34527456 34527530 34527492 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 137270 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 34914782 34915013 34914898 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 524596 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 36501740 36502135 36501882 Y NA NA NA NA NA NA CCDC169 367842 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.13824442694565 chr13 36630888 36631287 36631099 Y DCLK1 NA NA NA NA NA CCDC169 238690 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 41560539 41560879 41560717 Y NA NA NA NA NA NA WBP4 72531 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 42370920 42370928 42370925 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 473361 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 45333095 45333256 45333140 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 183812 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 45752820 45753055 45752934 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 60170 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr13 48478393 48478707 48478627 Y RB1 NA NA NA NA NA NUDT15 130996 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr13 50216185 50216584 50216280 Y CAB39L,SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11 EBPL NA NA NA NA EBPL 47027 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 51103280 51103738 51103647 Y NA NA DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL34P26 169381 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 52922324 52922434 52922379 Y THSD1 NA THSD1 IMR90 Hi-C 24141950 THSD1 56195 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 52923212 52923413 52923314 Y NA NA THSD1 IMR90 Hi-C 24141950 THSD1 55216 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 72402256 72402488 72402430 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 873343 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 75346258 75346396 75346327 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 639864 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 80658121 80658499 80658313 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 254587 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 93880621 93881133 93881009 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 3526 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr13 95753354 95753450 95753358 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 198237 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 95919951 95920261 95920073 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 31426 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 109909294 109909814 109909611 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 527101 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 110982194 110982608 110982413 Y NA COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A1 24698 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr13 111560939 111561133 111561094 Y NA LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 4283 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 113946276 113946648 113946334 Y NA LAMP1 LAMP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 LAMP1 2908 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr13 114565478 114566323 114565869 Y GAS6,GAS6,GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 432 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr13 114810103 114810577 114810313 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 85509 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr13 114834440 114834743 114834634 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 61343 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 23307440 23308274 23307581 Y SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14 MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 3674 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 23308431 23309148 23308805 Y NA MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 4665 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 29706068 29706381 29706228 Y NA NA NA NA NA NA FOXG1 473018 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 32979007 32979394 32979291 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 27001 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 35084533 35084797 35084665 Y EAPP SNX6 NA NA NA NA SNX6 12592 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 38542945 38543074 38543011 Y NA NA NA NA NA NA SSTR1 132130 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 39954969 39955272 39955039 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 55265 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 50527611 50528257 50527921 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA SOS2 168019 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 51992800 51993196 51992853 Y NA FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 38982 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 FRMD6-AS2 NA NA NA NA FRMD6-AS2 46098 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 50409 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 52622606 52622722 52622664 Y NA NA C14orf166,NID2,PTGDR IMR90 Hi-C 24141950 NID2 88894 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 54465835 54466164 54465918 Y NA NA NA NA NA NA CDKN3 395403 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 55569033 55569319 55569207 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 19509 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr14 55596570 55597156 55596587 Y NA LGALS3 NA NA NA NA LGALS3 7742 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 58215910 58216306 58216098 Y NA NA NA NA NA NA C14orf105 257325 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 59742406 59742712 59742574 Y DAAM1 NA NA NA NA NA DAAM1 89042 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 59949393 59949731 59949550 Y C14orf149 GPR135,JKAMP NA NA NA NA JKAMP 232 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 61938268 61939375 61939158 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 220856 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 68407691 68408026 68407854 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123195 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 68408350 68408505 68408421 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123854 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 68409175 68409464 68409327 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 124679 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr14 68928051 68928068 68928059 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 41138 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 68933312 68933746 68933512 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 46399 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 69013502 69013901 69013730 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 126589 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 69014304 69014714 69014453 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 127391 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 69014972 69015327 69015083 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 128059 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 69155852 69156106 69155979 Y NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 105084 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 69169939 69170184 69170014 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 91006 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 69241519 69241814 69241672 Y NA ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 19376 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 69246726 69246992 69246942 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 14198 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 69247587 69247770 69247677 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 13420 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 69417780 69418181 69417964 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 25976 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 69424468 69424783 69424642 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 19374 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 75038441 75039020 75038725 Y NPC2,DLST LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 38286 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 75063394 75063798 75063525 Y NPC2,LTBP2 LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 13508 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 76334268 76334588 76334390 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 31891 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 77509664 77510215 77509840 Y IRF2BPL IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 16630 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 77780620 77780713 77780667 Y NA GSTZ1,POMT2 NA NA NA NA GSTZ1,POMT2 4514 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 80062928 80063212 80063068 Y NA NA NA NA NA NA RP11-114N19.3 1571546 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 93192576 93192808 93192662 Y MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 20239 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 100040610 100041006 100040947 Y SETD3,CCDC85C CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 27357 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.65552498031386 chr14 102780583 102780765 102780709 Y NA MOK,ZNF839,CINP,TECPR2 MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF839 949 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 103584331 103584767 103584436 Y MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2 NA NA NA NA NA CDC42BPB 62532 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 123915 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 104855748 104855902 104855858 Y NA NA NA NA NA NA RP11-260M19.2 167827 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 105148231 105148612 105148591 Y INF2 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 2748 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr14 105434660 105434907 105434734 Y INF2,KIAA0284,C14orf79 AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 7787 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 105435117 105435479 105435281 Y KIAA0284 AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 7215 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA TMEM121 1261991 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr15 31733081 31733438 31733352 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 116023 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 34807090 34807442 34807248 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA8A,GOLGA8B 71262 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 35983013 35983197 35983137 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150L8.4 393372 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 37249666 37249815 37249741 Y NA NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 139725 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 37398990 37399302 37399145 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 7486 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 37403099 37403474 37403147 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 LOC100507466,C15orf41,MEIS2 IMR90 Hi-C 24141950 MEIS2 11595 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14 NA NA NA NA SRP14 44388 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr15 40730551 40730903 40730713 Y NA IVD,BAHD1,CHST14,RP11-64K12.1 NA NA NA NA BAHD1 631 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 41456018 41456111 41456065 Y NA INO80 NA NA NA NA INO80 49466 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 45933530 45934014 45933606 Y C15orf48,PLDN,SQRDL SQRDL NA NA NA NA SQRDL 12184 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 49967299 49967495 49967408 Y FGF7,DTWD1 NA GALK2,C15orf33,ATP8B4,DTWD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DTWD1 56122 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 50169774 50170115 50169945 Y FGF7,DTWD1 NA NA NA NA NA DTWD1 258597 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 51169242 51169420 51169339 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,USP50,SPPL2A,AP4E1,ASB18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 AP4E1 29449 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 52385766 52385957 52385877 Y DMXL2,MAPK6 CTD-2184D3.1 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 274 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr15 52395777 52396019 52395882 Y DMXL2,TMOD3,MAPK6 CTD-2184D3.1 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 10285 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr15 52545063 52545254 52545150 Y MAPK6 NA NA NA NA NA GNB5 63497 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 57853638 57853874 57853726 Y NA GCOM1,MYZAP,POLR2M NA NA NA NA GCOM1 28232 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 62683990 62684402 62684060 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3265 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 62684510 62685208 62684868 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3785 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 65054489 65054592 65054541 Y NA NA NA NA NA NA OAZ2 61009 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr15 67095524 67095803 67095671 Y NA NA NA NA NA NA SMAD3 258298 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 70785060 70785587 70785260 Y TLE3 NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 268345 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 70867778 70867861 70867857 Y NA NA NA NA NA NA UACA 186071 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 71084406 71084742 71084644 Y UACA,LARP6 UACA UACA,LARP6,LRRC49 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 30474 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 71373131 71373408 71373250 Y NA NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 190007 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 71409431 71409745 71409525 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 226307 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr15 73978221 73978605 73978367 Y NA CD276 NA NA NA NA CD276 3914 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 74216715 74216840 74216797 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 385 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 74289381 74289564 74289454 Y PML STOML1,PML NA NA NA NA PML 4367 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr15 77710600 77710857 77710802 Y NA PEAK1 NA NA NA NA HMG20A 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 85227339 85227652 85227485 Y PDE8A,ZNF592,SEC11A WDR73,NMB,SEC11A NA NA NA NA NMB 27545 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2 NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 96867848 96868085 96868000 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2-AS1 505 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 205286 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 99396507 99396665 99396608 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206307 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 99995215 99995527 99995307 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 19843 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ,NHLRC4 NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr16 2057211 2057401 2057386 Y NA NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 423 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 2175102 2175363 2175212 Y NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2 SNORD60,TRAF7 NA NA NA NA SNORD60 27743 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA ZG16B,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 3763227 3763392 3763351 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 2206 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 3889135 3889287 3889211 Y NA CREBBP NA NA NA NA CREBBP 39440 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 4264073 4264474 4264297 Y SRL NA NA NA NA NA TFAP4 56602 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 4424244 4424335 4424249 Y CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2 PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 4395 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 4587360 4587817 4587427 Y HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5 NMRAL1 NA NA NA NA NMRAL1 43596 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL PPL UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPL 15012 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 9162231 9162510 9162397 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 20995 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 11086769 11086952 11086818 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 50424 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 11198828 11199160 11198954 Y LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 NA NA NA NA NA RMI2 142316 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 14402100 14402342 14402181 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 238922 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 15238136 15238371 15238252 Y NA NA NA NA NA NA NTAN1 90215 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 15979661 15979785 15979715 Y NA FOPNL,RPL15P20 NA NA NA NA FOPNL 697 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr16 16070854 16071189 16071093 Y NDE1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 29420 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 20910424 20910792 20910538 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 718 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 20922860 20922979 20922921 Y CRYM,DCUN1D3,LYRM1 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 13154 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 21611842 21611954 21611919 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 5303 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 22020044 22020453 22020259 Y OTOA,VWA3A C16orf52 VWA3A IMR90 Hi-C 24141950 C16orf52 3085 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 22221382 22221539 22221458 Y EEF2K EEF2K NA NA NA NA EEF2K 5779 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 23508487 23508934 23508786 Y GGA2 COG7,GGA2 NA NA NA NA GGA2 22382 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 33959236 33959284 33959270 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2076157 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 34956727 34956933 34956830 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 3073648 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA NA NA NA NA NA PAPD5 52052 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 2763 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 51189377 51189768 51189573 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 6099 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 51250029 51250326 51250178 Y NA NA NA NA NA NA SALL1 66751 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 53125869 53126178 53125948 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 38924 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 56640479 56640669 56640573 Y NA MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A NA NA NA NA MT2A 368 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 57564039 57564411 57564096 Y ZNF319,GPR114 DOK4,CCDC102A NA NA NA NA CCDC102A 4100 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 65153548 65154160 65153979 Y CDH11 CDH11 NA NA NA NA CDH11 3855 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 67250789 67251131 67250954 Y NA NOL3,KIAA0895L,E2F4,LRRC29,TMEM208,SLC9A5,FHOD1 NA NA NA NA LRRC29 7820 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 67565199 67565482 67565398 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,FHOD1,PSMB10,DPEP2,DDX28,ATP6V0D1,FAM65A FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 14878 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 69019845 69020210 69019891 Y NA NA CHTF8,HAS3 IMR90 Hi-C 24141950 CHTF8 132121 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 73090044 73090191 73090091 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 1406 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 73102477 73102709 73102578 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 10880 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 75034413 75034614 75034514 Y FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1 ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 2342 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 75411958 75412267 75412159 Y NA NA NA NA NA NA CFDP1 53116 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 77217218 77217275 77217245 Y NA MON1B,SYCE1L NA NA NA NA MON1B 5457 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 82661526 82661961 82661896 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 3118 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 85038009 85038299 85038256 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 4842 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 85185210 85185759 85185517 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 125835 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 85783855 85783992 85783913 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 1120 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 86664163 86664323 86664252 Y NA NA FOXL1,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 65306 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 86855510 86855797 86855532 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 256653 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 88337697 88337985 88337883 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179740 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 88450186 88450490 88450462 Y NA NA CA5A,SLC7A5,BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 67235 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 88835950 88836275 88836191 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT RNF166,CTU2 K562 ChIA-PET 22265404 PIEZO1 13344 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr16 89392350 89392997 89392648 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 110232 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 773525 773702 773655 Y RNMTL1 NA NA NA NA NA GLOD4 89944 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 998449 998620 998483 Y PITPNA,INPP5K,CRK,ABR NA NA NA NA NA TIMM22 100092 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 2075592 2075724 2075696 Y HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 120144 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 2084621 2084734 2084671 Y NA NA NA NA NA NA SRR 119943 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 2084810 2085252 2085043 Y HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA SRR 119425 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 2095819 2096093 2095903 Y WDR81 NA NA NA NA NA SRR 108584 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 2143435 2143643 2143533 Y HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA SRR 61034 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 2241529 2241816 2241651 Y NA SRR,SMG6,SGSM2,TSR1 NA NA NA NA TSR1 2728 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 7381310 7382154 7381844 Y KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4 ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 3428 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 12120 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,PFAS,CTC1 NA NA NA NA C17orf59 11764 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 13447669 13448094 13447771 Y HS3ST3A1 NA NA NA NA NA HS3ST3A1 55150 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 13460367 13460669 13460622 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 42575 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 16310492 16310776 16310647 Y NA UBB,TRPV2 TRPV2,C17orf76-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRPV2 6080 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 17098696 17098916 17098799 Y MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN PLD6,FLCN NA NA NA NA PLD6 8713 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 17617254 17617499 17617388 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 34467 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 18084670 18084979 18084825 Y NA ALKBH5,LLGL1 NA NA NA NA ALKBH5 278 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 25676124 25676302 25676192 Y LGALS9,WSB1 NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 57022 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 25707009 25707412 25707348 Y NA NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 KSR1 74258 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 27703475 27703981 27703860 Y TIAF1,MYO18A,GIT1,TAOK1 MIR4523 MYO18A,TAOK1,CORO6,SSH2,CRYBA1,GIT1,TP53I13,ABHD15,MIR4523 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR4523 11699 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 29599453 29600092 29599789 Y NA EVI2A NA NA NA NA EVI2A 46810 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 229790 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 33349623 33350064 33349994 Y SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL LIG3 NA NA NA NA LIG3 44110 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L SLFN12 NA NA NA NA SLFN12 29106 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 33923571 33923796 33923685 Y NA AP2B1,PEX12 NA NA NA NA PEX12 19689 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 36122885 36123141 36123013 Y NA NA DDX52,HNF1B,SYNRG IMR90 Hi-C 24141950 DDX52 121392 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 36585417 36585600 36585486 Y ARHGAP23 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 2755 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 37366071 37366159 37366135 Y STAC2 CACNB1,RPL19 NA NA NA NA RPL19 11535 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 37896808 37897181 37897022 Y GRB7,GRB7,GRB7,GRB7 PGAP3,MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 11768 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 38601076 38601487 38601191 Y GJD3,IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 3374 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 38607821 38607996 38607876 Y NA TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 10119 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 38646848 38646954 38646881 Y KRT222,THRA,RAPGEFL1 IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 49146 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 39010500 39010808 39010654 Y NA TMEM99 NA NA NA NA TMEM99 37142 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 39066622 39066986 39066860 Y IGFBP4,KRTAP1-1,KRTAP1-5 NA NA NA NA NA KRTAP3-2 87152 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 39113005 39113367 39113263 Y NA KRTAP3-2 NA NA NA NA KRTAP3-2 40771 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 39218168 39218609 39218458 Y NA KRTAP1-5,KRTAP4-8 NA NA NA NA KRTAP4-8 33784 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 39536188 39536609 39536415 Y NA KRT34 NA NA NA NA KRT34 46 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 39572748 39572757 39572754 Y NA KRT34 NA NA NA NA KRT34 36093 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT13 NA NA NA NA KRT13 26501 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 39705098 39705383 39705310 Y NA KRT13 NA NA NA NA KRT13 45141 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 40573451 40573881 40573544 Y AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF STAT3,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 40805539 40806065 40805782 Y NA TUBG1,FAM134C,TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 3258 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 40942176 40942529 40942199 Y NA EZH1,VPS25,WNK4,PSME3,BECN1 NA NA NA NA WNK4 11480 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 41324260 41324525 41324381 Y TMEM106A BRCA1,NBR2,NBR1,TMEM106A NA NA NA NA NBR1 3762 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 41478754 41478975 41478864 Y ARL4D ARL4D NA NA NA NA ARL4D 4427 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 43221862 43221955 43221890 Y ACBD4,HEXIM1 ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM1 729 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 NA NA NA NA NA MAP3K14 268397 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 46101351 46101579 46101379 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 11813 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 PPP1R9B,SGCA,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B NA NA NA NA NA XYLT2 53639 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 54263832 54264049 54263912 Y NA NA NA NA NA NA NOG 405011 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 54857525 54857918 54857805 Y NA NA NA NA NA NA C17orf67 56216 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 55951789 55952442 55952113 Y SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 26372 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,RPS6KB1 NA NA NA NA RPS6KB1 5631 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr17 59473194 59473360 59473229 Y NA TBX2,C17orf82 NA NA NA NA TBX2 1897 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 59473431 59474098 59473741 Y TBX2,C17orf82 TBX2,C17orf82 NA NA NA NA TBX2 1159 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 61370802 61371122 61370929 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 150617 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA GNA13 588973 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr17 64301184 64301397 64301241 Y NA PRKCA NA NA NA NA PRKCA 4430 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 64455929 64456369 64456061 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 159175 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 65477756 65478333 65478203 Y HELZ,PSMD12 NA NA NA NA NA PITPNC1 106181 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 66421215 66421317 66421250 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 30337 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 67603336 67603572 67603425 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA5 281951 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 71304431 71304616 71304518 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 1698 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 71305759 71306422 71306099 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 45019 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 75387909 75388384 75388205 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 113258 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 75388510 75388802 75388677 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 113859 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 75405377 75405733 75405639 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 130726 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 75422359 75422648 75422577 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 147708 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.13824442694565 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr17 76165603 76166001 76165654 Y SYNGR2 SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 2964 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 76879876 76880180 76879977 Y NA USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39289 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 76919844 76920193 76919970 Y CYTH1,CANT1 TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 375 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr17 78500391 78500494 78500444 Y NA RPL32P31,RPTOR RPTOR,NPTX1,LOC100294362,ENDOV IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL32P31 13509 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 79316253 79317268 79317090 Y NA SLC38A10 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 48906 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 103407 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 79439092 79439387 79439261 Y PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1 ACTG1 NA NA NA NA ACTG1 49486 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 79789691 79790066 79789800 Y NA FAM195B,P4HB,ARHGDIA NA NA NA NA FAM195B 513 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,CD7,SECTM1 NA NA NA NA CD7 17723 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,CD7,SECTM1 NA NA NA NA CD7 17003 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 80834043 80834346 80834307 Y ZNF750 NA NA NA NA NA TBCD 126103 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr17 80889616 80889925 80889758 Y NA NA NA NA NA NA B3GNTL1 117761 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 159482 159743 159659 Y CETN1 USP14 NA NA NA NA USP14 3099 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 830446 830703 830580 Y NA RNU1-109P,YES1 CLUL1,ENOSF1,YES1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YES1 19899 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 2978254 2978441 2978377 Y NA LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 32872 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 3446696 3446930 3446873 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 TGIF1 NA NA NA NA TGIF1 37090 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 8704447 8704767 8704559 Y NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 97004 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 9017103 9017601 9017310 Y ANKRD12 NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 83027 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 9554563 9554587 9554575 Y NA NA NA NA NA NA PPP4R1 58651 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr18 10766591 10766813 10766750 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 242689 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPPE1 40050 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr18 12076743 12076871 12076848 Y NA NA GNAL IMR90 Hi-C 24141950 MPPE1 169521 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 19746222 19746392 19746310 Y GATA6 GATA6 NA NA NA NA GATA6 1012 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 20272481 20272650 20272518 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 103574 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 101125 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr18 21463540 21463749 21463607 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 106988 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 32289089 32289403 32289194 Y NA NA NA NA NA NA DTNA 217835 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 34160410 34160525 34160482 Y FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 246544 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 34813677 34814006 34813844 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 406519 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 42295257 42295574 42295401 Y SETBP1,SETBP1 SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 37119 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr18 43351602 43351892 43351629 Y SLC14A1 SLC14A1 NA NA NA NA SLC14A1 49510 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 43381768 43381900 43381886 Y NA NA EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC14A1 79676 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 43382830 43382969 43382904 Y NA NA EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC14A1 80738 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 43407687 43408063 43407797 Y PSTPIP2,EPG5 NA NA NA NA NA SLC14A1 105595 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 45444466 45444807 45444662 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 10708 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 46340145 46340852 46340433 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA SMAD7 134229 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 52409898 52410241 52410083 Y NA RAB27B WDR7,CCDC68,RAB27B IMR90 Hi-C 24141950 RAB27B 26807 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 55880754 55881007 55880894 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171155 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr18 55922134 55922493 55922309 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 212535 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 57585799 57586003 57585903 Y PMAIP1 PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 20619 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 68772419 68772586 68772499 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 818282 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 73201827 73202008 73201925 Y NA NA ZNF407,TSHZ1 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ1 281117 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 72093 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr18 74409297 74409534 74409399 Y NA NA ZNF516 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF236 123029 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr18 74819276 74819721 74819374 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 286713 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 710143 710459 710314 Y GPX4,C2CD4C,PALM RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA PALM 3190 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 1171933 1172315 1172045 Y NA STK11 NA NA NA NA SBNO2 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr19 1213863 1214369 1213961 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA C19orf26 21657 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr19 2064980 2065181 2065097 Y MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 15737 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 2095281 2095723 2095416 Y NA MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MOB3A 609 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 2700809 2701070 2700932 Y LINGO3,TMPRSS9,ZNF555,GNG7 DIRAS1,SLC39A3 NA NA NA NA DIRAS1 18346 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 3655813 3656105 3655965 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 42372 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 3687832 3687894 3687862 Y FZR1,APBA3 PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 10583 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 4089074 4089290 4089084 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24131 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 6.20736664041848 chr19 4870294 4870493 4870397 Y SEMA6B,TICAM1 TICAM1,PLIN3,UHRF1 NA NA NA NA PLIN3 4514 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 4912030 4912419 4912247 Y NA PLIN3,UHRF1 NA NA NA NA UHRF1 10938 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 5336072 5336705 5336347 Y PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 2109 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 5966194 5966581 5966386 Y CAPS RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 9572 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 10988040 10988081 10988060 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 7851 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 11641329 11641510 11641441 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ECSIT 3340 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 13133010 13133371 13133241 Y FBXW9,NFIX NFIX NA NA NA NA NFIX 28588 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 13138013 13138252 13138133 Y TNPO2,TNPO2,MAST1,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 33591 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 13166882 13167358 13167036 Y NA NA NA NA NA NA TRMT1 59023 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 5.17280553368207 chr19 15333627 15333747 15333631 Y SYDE1,NOTCH3 NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 23835 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 17206039 17206296 17206201 Y NA HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 21448 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 17667126 17667426 17667289 Y MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1 PGLS NA NA NA NA PGLS 46688 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 18264934 18265291 18265179 Y NA PIK3R2,IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA PIK3R2 2966 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA JUND 11955 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA JUND 13667 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,LRRC25,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 18588665 18588964 18588926 Y NA ISYNA1,ELL NA NA NA NA ISYNA1 41554 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 18600936 18601077 18601043 Y NA ELL NA NA NA NA ELL 29860 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 19574690 19574814 19574752 Y GATAD2A,GMIP NDUFA13 NA NA NA NA NDUFA13 49731 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 20606211 20606644 20606560 Y ZNF90 ZNF826P NA NA NA NA ZNF826P 436 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 30157267 30157499 30157417 Y PLEKHF1,C19orf12,C19orf12 PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA PLEKHF1 3304 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr19 30207596 30207744 30207670 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 3232 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 31371885 31372199 31372043 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ3 466254 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 33750621 33750673 33750623 Y CEBPA CEBPA CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA IMR90 Hi-C 24141950 CEBPA 40797 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 36449882 36450230 36450084 Y NA LRFN3,SDHAF1 NA NA NA NA LRFN3 25622 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 37424676 37424848 37424761 Y ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 19445 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 40441958 40442162 40442060 Y FCGBP CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546 NA NA NA NA CTC-471F3.4 5472 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 40696507 40696680 40696594 Y SERTAD1 MAP3K10 NA NA NA NA MAP3K10 856 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 6330 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 5368 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 14986 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 15495 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 17070 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA PRR19 19259 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 43241725 43242137 43241944 Y NA NA NA NA NA NA MEGF8 413964 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 43525971 43526126 43526036 Y NA NA NA NA NA NA ZNF575 501523 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 44261449 44261664 44261525 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 4307 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 44283400 44283793 44283490 Y TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 45195366 45195649 45195556 Y RELB,CLASRP,BCL3 NA NA NA NA NA PVR 50268 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA NA NA NA NA NA HIF3A 113988 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.13824442694565 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA CCDC8 NA NA NA NA CCDC8 7192 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 48832028 48832343 48832234 Y CARD8,IZUMO1,EMP3 EMP3,TMEM143 NA NA NA NA EMP3 9262 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr19 50400896 50401285 50401161 Y ALDH16A1,RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5 PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA AKT1S1 21180 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 47334 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA TMEM238 12795 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr19 58742086 58742094 58742090 Y NA ZNF274,ZNF544,ZNF8 NA NA NA NA ZNF544 4126 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 3583560 3583858 3583796 Y NA AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7 NA NA NA NA AC108488.4 1097 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 7814871 7814997 7814934 Y NA NA LOC100506274,LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 RNF144A 759348 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr2 9795695 9795818 9795794 Y NA YWHAQ,RP11-521D12.1 YWHAQ,GRHL1,ADAM17,KLF11 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-521D12.1 18794 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 9893339 9893657 9893442 Y ADAM17,KLF11,KLF11 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 87826 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 11970305 11970612 11970555 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 154584 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 12308947 12309431 12309189 Y LPIN1 NA TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 493226 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 12860025 12860219 12860122 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 5010 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 12928047 12928351 12928221 Y NA NA LPIN1,MIR4262,TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 73032 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA VSNL1 106096 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr2 18811449 18811776 18811476 Y NA NA OSR1,NT5C1B-RDH14 IMR90 Hi-C 24141950 RDH14 71503 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 20249984 20250622 20250147 Y TTC32,PUM2 MATN3,LAPTM4A NA NA NA NA LAPTM4A 195 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA UBXN2A 245798 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 131763 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 25136821 25136958 25136890 Y NA ADCY3 NA NA NA NA ADCY3 3750 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 26241064 26241266 26241191 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 13710 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,EMILIN1,CGREF1 NA NA NA NA EMILIN1 4617 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 33886 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 28021914 28022357 28022176 Y RBKS MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 29330 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 28629645 28630316 28629830 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA AC104695.3 14106 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 28939068 28939564 28939261 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 32942 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 30516276 30516651 30516416 Y NA NA LCLAT1,LBH IMR90 Hi-C 24141950 LBH 63879 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 30889265 30889652 30889547 Y NA NA YPEL5,LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 221173 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 33111186 33111571 33111379 Y NA NA NA NA NA NA LTBP1 58468 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 33383509 33383834 33383717 Y FAM98A NA NA NA NA NA LTBP1 213470 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 33435749 33436022 33435923 Y FAM98A,LTBP1 NA NA NA NA NA RASGRP3 223369 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 33437244 33437520 33437371 Y FAM98A,LTBP1 NA NA NA NA NA RASGRP3 221871 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 37605671 37605839 37605750 Y CCDC75,QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 35954 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 37617673 37618124 37617783 Y CDC42EP3,EIF2AK2 QPCT NA NA NA NA QPCT 47956 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 37993289 37993401 37993340 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 29678 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 38023099 38023324 38023154 Y NA NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 59488 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 38373682 38374230 38374188 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 82480 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 40260196 40260378 40260267 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD2 255789 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 40261444 40261729 40261611 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD2 257037 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr2 40509736 40509978 40509875 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 326215 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 40630548 40630840 40630736 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 205353 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 40677210 40677858 40677371 Y NA NA LOC100128590 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 158335 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 43666042 43666391 43666188 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 154794 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 45237112 45237533 45237325 Y SIX2 AC012354.8,SIX2 NA NA NA NA SIX2 2543 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 45870946 45871356 45871039 Y NA SRBD1,PRKCE PRKCE,EPAS1,RHOQ,SRBD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCE 5128 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 46542843 46542999 46542890 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 24037 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 47039745 47040099 47039914 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 LINC01119 NA NA NA NA LINC01119 1737 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 47076896 47077421 47077187 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 LINC01119 NA NA NA NA LINC01119 35060 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr2 47077976 47078245 47078111 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 LINC01119 NA NA NA NA LINC01119 36140 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 47299215 47299677 47299496 Y TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA NA CALM2 102063 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 47418967 47419222 47419129 Y NA CALM2 TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 17227 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 47526778 47526800 47526792 Y KCNK12 NA TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61,EPCAM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSH2 101308 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 47796567 47796699 47796698 Y NA KCNK12 NA NA NA NA KCNK12 489 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 48737563 48737807 48737675 Y STON1-GTF2A1L,STON1 STON1 NA NA NA NA STON1 16715 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr2 50631357 50631742 50631589 Y NRXN1 NA NA NA NA NA STON1 1876835 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 54900806 54901065 54900960 Y NA EML6 NA NA NA NA EML6 47571 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 58266393 58266527 58266430 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 133607 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 60696747 60696946 60696847 Y REL NA NA NA NA NA BCL11A 81756 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD1 122199 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 64998040 64998317 64998210 Y NA SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 21901 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr2 65065938 65066285 65066136 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 89799 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 65093958 65094266 65094153 Y NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 117819 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 66673073 66673647 66673570 Y NA MEIS1,MEIS1-AS3 NA NA NA NA MEIS1-AS3 14471 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 66801899 66802241 66801940 Y MEIS1 AC007392.3 NA NA NA NA AC007392.3 2737 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 66804515 66804719 66804617 Y MEIS1 AC007392.3 NA NA NA NA AC007392.3 5353 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr2 66805277 66805644 66805568 Y MEIS1 AC007392.3 NA NA NA NA AC007392.3 6115 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 67730161 67730513 67730267 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 107710 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 67791335 67791436 67791382 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 168884 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 67876596 67876952 67876755 Y NA NA MEIS1,ETAA1,LOC644838 IMR90 Hi-C 24141950 AC010987.6 173742 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 69163712 69163881 69163761 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 74429 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 69533320 69533461 69533391 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 78921 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 73233755 73233809 73233782 Y NA NA EMX1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN5 66938 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 73338552 73338952 73338867 Y RAB11FIP5 SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37805 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 73402910 73403369 73403123 Y SFXN5 RAB11FIP5,SMYD5 EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB11FIP5 21061 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 73404053 73404270 73404162 Y EGR4 RAB11FIP5,SMYD5 EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB11FIP5 22204 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 77488333 77488701 77488549 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA AC105399.2 524807 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP5 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 85982713 85983043 85983025 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 6246 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr2 86102907 86103036 86102912 Y NA ST3GAL5 NA NA NA NA ST3GAL5 11101 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 96190968 96191044 96191006 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 124499 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 96348390 96348623 96348461 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 281921 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 100036640 100036800 100036773 Y NA NA NA NA NA NA REV1 67697 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 101435496 101435968 101435616 Y NPAS2 NPAS2 NA NA NA NA NPAS2 882 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 102133779 102134093 102133972 Y MAP4K4,MAP4K4 NA MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREG2 131722 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 102643904 102644218 102643997 Y NA IL1R1 NA NA NA NA IL1R1 34786 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 102654225 102654461 102654316 Y NA IL1R1 NA NA NA NA IL1R1 24543 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 106020631 106021071 106020783 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 31899 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA MALL NA NA NA NA MALL 12646 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 113384986 113385271 113385131 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 7242 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 114014908 114015299 114015271 Y NA PAX8-AS1 NA NA NA NA PAX8-AS1 47809 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 115350 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 119498698 119498987 119498818 Y NA NA NA NA NA NA C1QL2 415478 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA RALB 629280 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr2 127863441 127863795 127863513 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 510 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 131148815 131149203 131148908 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18 PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37235 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF4 106956 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 134544977 134545065 134545021 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 NCKAP5 220943 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 134546051 134546253 134546153 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 NCKAP5 222017 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 134570885 134571181 134570989 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 NCKAP5 246851 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 138829868 138830168 138829962 Y NA NA HNMT MCF7 ChIA-PET 22265404 HNMT 110278 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 148296630 148296767 148296652 Y NA NA NA NA NA NA ACVR2A 303319 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 150440132 150440521 150440417 Y NA MMADHC NA NA NA NA MMADHC 1809 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 150505364 150505670 150505432 Y NA NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 63034 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr2 151385444 151385651 151385488 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7874 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr2 151385999 151386295 151386059 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7230 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 151477368 151477581 151477492 Y RND3 NA RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 83843 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 161522878 161523352 161523066 Y TANK,TANK NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 174573 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 161607616 161608069 161607675 Y TANK,TANK NA RBMS1,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 259311 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 5.17280553368207 chr2 165777057 165777208 165777083 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 78868 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 172101823 172102272 172102041 Y NA TLK1 METTL8,TLK1 IMR90 Hi-C 24141950 TLK1 15999 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 172961678 172962145 172962061 Y NA DLX2 NA NA NA NA DLX2 3483 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 173113663 173113922 173113833 Y ITGA6 NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 148035 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 173557830 173558066 173557982 Y ZAK NA RAPGEF4,PDK1 IMR90 Hi-C 24141950 AC093818.1 138506 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD11,HOXD10,HOXD9,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2 NA NA NA NA HOXD10 1222 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 24.8294665616739 chr2 188326523 188326725 188326579 Y NA NA NA NA NA NA TFPI 101762 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA SDPR 164749 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 196478695 196478993 196478847 Y NA SLC39A10 SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 39994 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.13824442694565 chr2 198834136 198834535 198834225 Y NA NA NA NA NA NA PLCL1 166710 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 201273148 201273356 201273255 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SGOL2 99375 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 202517448 202517800 202517452 Y NA ALS2CR11,TMEM237,MPP4 NA NA NA NA TMEM237 11155 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 202897639 202898135 202897874 Y FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 329 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 203239784 203239912 203239798 Y NA BMPR2 NA NA NA NA BMPR2 125 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 206613471 206613845 206613585 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 68757 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 207663978 207664088 207664013 Y NA FASTKD2,MDH1B NA NA NA NA MDH1B 35707 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 208175027 208175372 208175141 Y NA NA KLF7,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 AC007879.7 72653 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 208176046 208176541 208176319 Y CREB1,CCNYL1 NA KLF7,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 AC007879.7 73672 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1 NA NA NA NA CREB1 2961 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 216290729 216290756 216290730 Y FN1 FN1,AC012462.1 NA NA NA NA FN1 8139 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 216489283 216489494 216489351 Y FN1 NA NA NA NA NA AC012462.1 190307 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 216529638 216529897 216529693 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 230662 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 216557446 216557685 216557585 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 258470 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 216638374 216638853 216638649 Y FN1 NA NA NA NA NA MREG 257966 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr2 218278062 218278387 218278165 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 587331 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 218282906 218283101 218283004 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 582617 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1,PLCD4 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 220553753 220554082 220553876 Y NA NA DES,SLC4A3 K562 5C 22955621 SLC4A3 63704 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 226979861 226980232 226980018 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRS1 682243 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 226983767 226984186 226983892 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRS1 678289 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 227514922 227515156 227515015 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 147319 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 227517160 227517436 227517301 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 145039 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr2 227526564 227526855 227526789 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 135620 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 227665142 227665696 227665306 Y IRS1 IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 2667 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 230309727 230309993 230309861 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 175726 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 SNORD82 NA NA NA NA SNORD82 45708 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 235198516 235198843 235198584 Y ARL4C NA TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 204854 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 235353626 235353934 235353758 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 49763 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 237073092 237073409 237073337 Y NA AC079135.1 NA NA NA NA AC079135.1 681 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 408893 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 238065108 238065400 238065254 Y COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 72648 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 238187174 238187402 238187364 Y NA NA COL6A3,MLPH,COPS8 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 133616 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 238188791 238189175 238189021 Y COL6A3 NA MLPH,COL6A3,COPS8 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 131843 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 238299841 238300132 238300017 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 COL6A3,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 20886 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 238508822 238509122 238509050 Y RAB17,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 25097 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 239631175 239631419 239631288 Y NA NA LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 123254 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 240145548 240145836 240145702 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 175294 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 241373489 241373922 241373594 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 401 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 241374162 241374480 241374229 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 1074 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 241860652 241861096 241860920 Y GPC1,SNED1 NA LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 SNED1 75159 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 242480531 242480899 242480752 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 15237 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 242549642 242550327 242549774 Y ATG4B ATG4B,THAP4 NA NA NA NA ATG4B 24301 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr2 242714145 242714474 242714395 Y NEU4,D2HGDH,GAL3ST2 D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 42151 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr20 290991 291448 291293 Y C20orf54 C20orf96,ZCCHC3,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 12759 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 823028 823308 823133 Y FAM110A FAM110A NA NA NA NA FAM110A 10670 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 1398801 1399138 1399021 Y FKBP1A FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 26995 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr20 1744868 1745008 1744937 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 128146 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr20 2648841 2649036 2648938 Y NA NOP56,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7 EBF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-686C3.7 5843 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 5127563 5128387 5127720 Y GPCPD1,PRNP,PRNP,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA CDS2 22131 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 5899454 5899753 5899716 Y NA RNU1-55P,TRMT6 NA NA NA NA TRMT6 29429 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 9065873 9065924 9065899 Y NA PLCB4 NA NA NA NA PLCB4 18463 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 12035318 12035495 12035382 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 165947 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 18034343 18034358 18034351 Y NA NA NA NA NA NA CSRP2BP 82404 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 19766218 19766359 19766289 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 29866 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 21417020 21417216 21417107 Y NA NA XRN2 IMR90 Hi-C 24141950 XRN2 135078 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr20 33907005 33907177 33907091 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36217 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 34685769 34686042 34685906 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1,DLGAP4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 8343 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 35290523 35290606 35290565 Y DLGAP4 NA SLA2,TGIF2-C20ORF24 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf24 58386 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 35874402 35874620 35874497 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 41421 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 39958158 39958419 39958360 Y NA ZHX3 PLCG1,ZHX3,LPIN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX3 13846 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr20 42571412 42571561 42571487 Y C20orf111 TOX2 NA NA NA NA TOX2 29908 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 42718699 42718853 42718776 Y NA NA NA NA NA NA GDAP1L1 155034 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 37086 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 20353 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 48212349 48213057 48212923 Y PTGIS PTGIS ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 29666 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 48901354 48901524 48901384 Y NA RP11-290F20.3 PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 19331 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 48903106 48903611 48903352 Y NA RP11-290F20.3 LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-290F20.3 21083 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr20 48921857 48922230 48922089 Y NA RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 39834 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 49341306 49341865 49341532 Y NA FAM65C NCOA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM65C 35241 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 50017073 50017292 50017116 Y NFATC2 NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 331780 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 51110889 51111034 51110969 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 292042 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr20 52444580 52444892 52444748 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220134 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 55363467 55363682 55363577 Y NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 TFAP2C 161109 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 59761167 59761446 59761307 Y NA NA CDH26,LOC284757,C20orf197,CDH4 IMR90 Hi-C 24141950 CDH4 64036 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 59828827 59829192 59829064 Y CDH4 CDH4 NA NA NA NA CDH4 3345 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 5.17280553368207 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 16596629 16597038 16596898 Y NRIP1 NA NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 161308 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 519825 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr21 18984370 18984546 18984496 Y NA BTG3 NA NA NA NA BTG3 1105 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 28336800 28337144 28336952 Y ADAMTS1,ADAMTS5 NA NA NA NA NA ADAMTS5 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr21 28795435 28795716 28795624 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 458603 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 28942556 28942990 28942803 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 605724 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr21 30006167 30006692 30006407 Y NA AF131217.1 ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 AF131217.1 38478 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 30126542 30126837 30126741 Y NA NA LINC00113,ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 AF131217.1 81372 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 32545915 32546496 32546250 Y NA NA NA NA NA NA TIAM1 383794 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 33836273 33836551 33836412 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 72834 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 34020244 34020455 34020360 Y SYNJ1,SYNJ1 C21orf59 NA NA NA NA C21orf59 37068 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 35308653 35309105 35308775 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 22369 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 38801876 38802213 38802018 Y DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 65784 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr21 40018484 40018900 40018698 Y NA NA NA NA NA NA ETS2 156331 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 40753076 40753485 40753292 Y WRB HMGN1,WRB NA NA NA NA WRB 2906 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 42879173 42879227 42879200 Y FAM3B,TMPRSS2,TMPRSS2 SNORA32 NA NA NA NA SNORA32 29906 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 44697672 44698016 44697845 Y NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 146992 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 45358133 45358224 45358178 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC10 71976 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 45557942 45558217 45558021 Y AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 6455 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 47394030 47394545 47394409 Y LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 5106 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr21 47512247 47512670 47512489 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 3341 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 18539229 18539381 18539279 Y NA MICAL3,PEX26 NA NA NA NA PEX26 19308 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr22 20226620 20226831 20226686 Y NA NA NA NA NA NA DGCR6L 78772 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr22 28536034 28536328 28536157 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 221912 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 30440424 30440670 30440589 Y MTMR3,OSM,CCDC157 NA NA NA NA NA MTMR3 163280 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 36310688 36310985 36310744 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 111488 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 36762359 36762844 36762518 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2 MYH9 NA NA NA NA MYH9 19219 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.13824442694565 chr22 36765300 36765605 36765487 Y APOL3,NCF4,MYH9 MYH9 NA NA NA NA MYH9 16458 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 38142899 38142964 38142949 Y CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54 NA NA NA NA NA TRIOBP 51888 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37,MCHR1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,RP11-12M9.4,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 44947082 44947372 44947286 Y PARVG,PARVG NA PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 54904 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 45900177 45900595 45900449 Y FBLN1 FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 4059 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr22 46455003 46455485 46455192 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26 NA NA NA NA C22orf26 6979 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763 NA NA NA NA C22orf26 24592 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763 NA NA NA NA C22orf26 26619 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763 NA NA NA NA MIR4763 26182 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr22 50743436 50743850 50743726 Y PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 206 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 5027453 5027635 5027574 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 7807 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 11279893 11280094 11280011 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 31901 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.13824442694565 chr3 14457192 14457307 14457247 Y NA SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 15116 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 15351984 15352244 15352145 Y NA SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 28631 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 16181971 16182303 16182167 Y GALNTL2 NA GALNTL2,ANKRD28,BTD,DPH3,OXNAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 122176 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 5.69008608705027 chr3 27969490 27969763 27969630 Y AZI2 NA NA NA NA NA AC098614.2 297023 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 28534381 28534544 28534465 Y ZCWPW2 NA NA NA NA NA AZI2 145763 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 29365730 29366225 29365913 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 45257 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 29735360 29735534 29735491 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 414887 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 29799751 29800074 29799882 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 479278 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 30586274 30586622 30586478 Y TGFBR2 NA TGFBR2,RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 59372 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 40491258 40491489 40491375 Y NA RPL14,ZNF619 NA NA NA NA RPL14 5294 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 MIR138-1 112870 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 7.24192774715489 chr3 45035735 45035877 45035806 Y ZNF660,ZNF35 EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA ZDHHC3 20058 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 45165344 45165812 45165623 Y NA RPS24P8 NA NA NA NA RPS24P8 33855 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 47466111 47466297 47466204 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 45610 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA SMARCC1 116343 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 49171125 49171202 49171164 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2,CCDC71,KLHDC8B NA NA NA NA LAMB2 2574 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 49968490 49968553 49968522 Y NA MON1A,RBM6 NA NA NA NA MON1A 2884 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 58163548 58163776 58163593 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57457 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 59579572 59579902 59579705 Y NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 C3orf67 545762 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 62572991 62573174 62573036 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 270343 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 69134869 69134938 69134904 Y TMF1 TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 2774 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr3 69795384 69795667 69795492 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 8798 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 71153323 71153512 71153422 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 477628 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 72025490 72025621 72025556 Y RYBP,EIF4E3 NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4E3 223566 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 1144696 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 98685741 98686133 98685825 Y NA LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 11769 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 98691142 98691300 98691170 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 6602 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 100784871 100785104 100785043 Y ABI3BP NA ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 ABI3BP 74512 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 101645465 101645839 101645546 Y NA NA FAM55C,NFKBIZ,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 100630 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 101899188 101899342 101899284 Y NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 354353 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 105078282 105078611 105078543 Y NA ALCAM ALCAM IMR90 Hi-C 24141950 ALCAM 5142 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 105316935 105317233 105317084 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 233182 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 111289781 111290083 111289847 Y CD96 NA NA NA NA NA PHLDB2 159261 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 111480028 111480653 111480348 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 30684 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 112315835 112316301 112316186 Y NA SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA ATG3 36942 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 112372486 112372667 112372577 Y NA CCDC80 CCDC80,CD200R1L IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 6109 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 112537180 112537558 112537325 Y ATG3,SLC35A5 NA NA NA NA NA GTPBP8 170207 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 116118770 116119229 116119052 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 624316 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 119349456 119349617 119349555 Y GSK3B,ARHGAP31,CD80,ADPRH,COX17 RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 3380 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 119356620 119357543 119356968 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH,COX17 RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 3623 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 123396914 123397344 123397115 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 94882 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 123469666 123469916 123469803 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK 131262 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 126259496 126259659 126259567 Y ZXDC NA NA NA NA NA TXNRD3NB 65739 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 281870 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 127795566 127796407 127795838 Y GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8 SEC61A1 NA NA NA NA SEC61A1 27082 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 138634319 138634690 138634472 Y NA FOXL2,C3orf72 ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXL2 29292 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 146686002 146686397 146686202 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 425351 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 149151278 149151442 149151363 Y NA NA GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 57626 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 149180653 149180836 149180808 Y RNF13 RP11-278L15.6 HPS3,TM4SF18,TM4SF1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-278L15.6 29611 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 151839053 151839312 151839161 Y NA NA MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL1 120305 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 151917246 151917489 151917451 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL1 42128 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 151923088 151923367 151923343 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 36250 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 151976173 151976628 151976408 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 8716 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 153011087 153011326 153011218 Y P2RY1,RAP2B NA RAP2B IMR90 Hi-C 24141950 RAP2B 133058 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 158846510 158846720 158846529 Y NA NA NA NA NA NA RARRES1 398025 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 158887731 158887850 158887799 Y NA NA NA NA NA NA RARRES1 439246 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 169172792 169172932 169172865 Y NA NA NA NA NA NA TERC 307916 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN NA NA NA NA TERC 1241 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 170420897 170421107 170421029 Y CLDN11 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 36047 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 170442364 170442688 170442585 Y CLDN11 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 14466 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 170469010 170469069 170469037 Y CLDN11,CLDN11,EIF5A2 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11856 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 170471340 170471726 170471533 Y NA RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 14186 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 170527835 170528013 170527928 Y NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58259 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 171948409 171948713 171948561 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 192991 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 175695899 175696046 175695968 Y NA NA NLGN1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V1P2 261441 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 177181725 177182062 177181754 Y NA LINC00578 TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 24016 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 177542015 177542147 177542058 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 384306 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 177623981 177624160 177624047 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 466272 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 182973593 182973879 182973736 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 4561 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 187004502 187004623 187004526 Y MASP1 MASP1 NA NA NA NA MASP1 3187 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 187011848 187012020 187011926 Y MASP1 MASP1 RTP1 IMR90 Hi-C 24141950 MASP1 4038 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 188296495 188296603 188296541 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 426650 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 189794828 189795104 189794939 Y NA LEPREL1 NA NA NA NA LEPREL1 43122 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 194296552 194296878 194296640 Y HES1,ATP13A3 TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 5862 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 194871039 194871493 194871089 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 118403 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 194981425 194981579 194981527 Y ACAP2 XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 8317 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 195633702 195634304 195633876 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 NA NA NA NA NA TFRC 172756 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 196377844 196378239 196377963 Y NA LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 13198 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr4 3438789 3438989 3438900 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 93297 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 5640113 5640289 5640201 Y NA NA NA NA NA NA EVC2 68986 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 6887984 6888235 6888115 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 20734 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 7209017 7209262 7209117 Y NA SORCS2 NA NA NA NA SORCS2 16752 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA NA NA NA NA NA CPZ 562368 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 10116801 10117310 10116981 Y WDR1 WDR1 NA NA NA NA WDR1 228 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 841794 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 13919881 13920079 13919925 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 191513 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 13920582 13920969 13920807 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 190623 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 13922430 13922925 13922628 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 188667 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 15151544 15151754 15151565 Y NA NA CPEB2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 149246 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 15235793 15235968 15235850 Y CPEB2,FBXL5,BST1 NA PROM1,C1QTNF7,FBXL5,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 233495 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 24263388 24263431 24263410 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 320742 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA NA CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 75834 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 34183539 34183770 34183747 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 2060361 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 34734758 34735069 34734951 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1509062 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 37668347 37668621 37668474 Y NA RELL1 NA NA NA NA RELL1 17377 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 38080568 38081008 38080843 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 120512 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 38084338 38084956 38084492 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 124282 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 38102941 38103486 38103298 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 142885 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 38147438 38147709 38147590 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 187382 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 6.20736664041848 chr4 40910052 40910602 40910542 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 306129 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 44727575 44727855 44727678 Y KCTD8,GNPDA2 GUF1,GNPDA2 NA NA NA NA GNPDA2 963 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 54600901 54601043 54600966 Y CHIC2 NA NA NA NA NA CHIC2 327814 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 55100480 55100923 55100634 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 7216 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr4 55650358 55650789 55650482 Y NA NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 KIT 128273 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 56419632 56419978 56419838 Y NA CLOCK NA NA NA NA CLOCK 8327 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 57940962 57941225 57941094 Y NA IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7 33326 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 61590476 61590574 61590525 Y NA NA NA NA NA NA RP11-84A1.1 1379193 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 65475793 65476032 65475913 Y NA NA NA NA NA NA RP11-204H9.2 181166 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 74922344 74922785 74922568 Y IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2 CXCL3,CXCL2 CXCL3 K562 ChIA-PET 22265404 CXCL3 19820 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 80958042 80958450 80958250 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 86158 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr4 85812250 85812275 85812263 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 73263 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 88128695 88128755 88128733 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30711 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 89455158 89455345 89455247 Y NA HERC3,PIGY NA NA NA NA PIGY 14218 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 90391330 90391567 90391434 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 365899 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 95437375 95437547 95437461 Y PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 66338 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 99575135 99575326 99575229 Y NA TSPAN5 NA NA NA NA TSPAN5 2454 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 102200557 102200885 102200839 Y PPP3CA NA NA NA NA NA AP001816.1 66052 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 103359657 103359837 103359736 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 BDH2,NFKB1,SLC9B1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 9242 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 103360468 103360812 103360586 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 10053 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 103360821 103361254 103361183 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 10406 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 31502 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 111116750 111117174 111116883 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 1181 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 113572868 113573168 113573031 Y NA LARP7,C4orf21 NA NA NA NA C4orf21 16717 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 15766 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr4 114366444 114366711 114366574 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 26965 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 114367129 114367387 114367298 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 27650 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 114389425 114389805 114389547 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 49946 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 119338638 119338745 119338688 Y NA NA PRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 PRSS12 66480 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 120024463 120024846 120024696 Y NA NA SYNPO2,USP53,MYOZ2 IMR90 Hi-C 24141950 USP53 106896 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 120130181 120130604 120130427 Y NA USP53,RP11-455G16.1 NA NA NA NA USP53 1138 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 120205306 120205694 120205553 Y NA C4orf3 NA NA NA NA C4orf3 17906 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr4 122632771 122633033 122632919 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 16503 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr4 123719302 123719557 123719375 Y FGF2 NA FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 BBS12 67445 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 127699482 127699754 127699681 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 842672 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 129305373 129305758 129305535 Y NA NA PGRMC2,PHF17,LARP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 97389 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 134191473 134191538 134191506 Y NA NA NA NA NA NA PCDH10 123003 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 135287127 135287346 135287189 Y NA NA NA NA NA NA PABPC4L 166224 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr4 140334690 140334958 140334824 Y ELF2 RAB33B NA NA NA NA RAB33B 37428 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 146655718 146656086 146655845 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118303 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 146725275 146725660 146725360 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 132127 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 153180278 153180573 153180364 Y NA NA PET112,FAM160A1,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-18H21.1 160372 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 153424227 153424394 153424311 Y NA FBXW7 NA NA NA NA FBXW7 30859 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 157397521 157397868 157397695 Y NA NA GRIA2,PDGFC,GLRB IMR90 Hi-C 24141950 PDGFC 492678 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 157692679 157692824 157692748 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 197722 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 157889828 157890031 157889884 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 515 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 159731152 159732543 159732097 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 42862 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 169371058 169372404 169371437 Y DDX60,DDX60L PALLD NA NA NA NA PALLD 43813 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 169406739 169406912 169406786 Y DDX60,DDX60L PALLD DDX60,DDX60L,PALLD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PALLD 9305 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 177459522 177459662 177459586 Y VEGFC NA NA NA NA NA RP11-87F15.2 219913 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 277975 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr4 185771166 185771424 185771307 Y NA ACSL1 LOC731424 K562 ChIA-PET 22265404 ACSL1 25194 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 378611 379250 378849 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 62008 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 1522529 1522699 1522639 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 437 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr5 10229611 10229778 10229690 Y NA FAM173B,CCT5 NA NA NA NA FAM173B 18231 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 15451801 15451916 15451863 Y NA FBXL7 FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXL7 46389 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr5 33312073 33312323 33312255 Y NA CTD-2066L21.3 NPR3,LOC340113 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2066L21.3 16057 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 34571249 34571361 34571303 Y NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 82981 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 34585438 34585952 34585758 Y RAI14,RAI14 NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 68390 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 34586139 34586737 34586416 Y NA NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 67605 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 34655418 34655812 34655539 Y NA RAI14 TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 1076 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 34710052 34710312 34710173 Y RAI14,RAI14 NA NA NA NA NA RAI14 55710 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 35136467 35136726 35136597 Y PRLR NA NA NA NA NA DNAJC21 208769 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 38446340 38446486 38446390 Y EGFLAM CTD-2263F21.1 NA NA NA NA CTD-2263F21.1 19955 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr5 39716547 39716931 39716737 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 256145 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA NA NA NA NA NA ZNF131 55101 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA NA NA NA NA NA ZNF131 54840 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 43061828 43062062 43061945 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 1216 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 43945591 43945673 43945632 Y NA NA NA NA NA NA NNT-AS1 344259 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2,CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 43484 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 55471391 55471677 55471521 Y IL6ST NA NA NA NA NA CTD-2031P19.3 182396 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 56731620 56731973 56731778 Y NA NA PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPBP1 263845 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 60571773 60571988 60571884 Y ZSWIM6 NA NDUFAF2 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM6 54112 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 60625710 60626179 60625844 Y ELOVL7,ZSWIM6 NA ZSWIM6 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZSWIM6 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 63506762 63506909 63506842 Y NA RNF180 NA NA NA NA RNF180 47091 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 64505244 64505511 64505327 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA CENPK 351487 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4 255574 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 67628501 67628685 67628592 Y PIK3R1,PIK3R1,PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 118953 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 76102045 76102389 76102284 Y F2RL1 NA F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2R 92177 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 76103019 76103387 76103332 Y F2RL1 NA F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2R 93151 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 77821454 77822246 77822105 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 167115 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 77888034 77888302 77888035 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA CTD-2073O6.1 121603 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 80263371 80263585 80263478 Y NA NA NA NA NA NA CKMT2 263519 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 81653126 81653457 81653257 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 80730 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 82771448 82771603 82771549 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 6164 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 86604017 86604207 86604034 Y RASA1,RASA1 RASA1 NA NA NA NA RASA1 42312 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 90236488 90236655 90236581 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-90P 327889 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 90772639 90772960 90772848 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 95463 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 94072643 94072953 94072798 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0825 120334 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 94363177 94363338 94363238 Y MCTP1 NA NA NA NA NA MCTP1 254941 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 95227563 95227763 95227704 Y NA NA NA NA NA NA ELL2 68012 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 95482384 95482735 95482679 Y NA NA ELL2 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 186609 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 95555701 95555931 95555845 Y NA NA ELL2,RHOBTB3 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 259926 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 97445347 97445652 97445445 Y NA NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 226796 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 97446063 97446328 97446197 Y NA NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 226120 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 97650049 97650331 97650134 Y RGMB CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 22117 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 97790785 97791036 97790856 Y RGMB NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 118337 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 98253335 98253735 98253703 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 9140 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA FAM174A 480164 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 111809915 111810119 111810017 Y NA NA NA NA NA NA APC 231076 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 118664608 118664762 118664738 Y DMXL1,TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 62221 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 121516793 121517196 121516968 Y LOX,LOX CTC-441N14.2 NA NA NA NA CTC-441N14.2 28242 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.65552498031386 chr5 121519182 121519443 121519230 Y NA CTC-441N14.2 NA NA NA NA CTC-441N14.2 30631 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 122885327 122885717 122885442 Y CEP120,CSNK1G3 CSNK1G3 NA NA NA NA CSNK1G3 39534 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 131422074 131422446 131422224 Y NA NA NA NA NA NA PDLIM4 168918 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 131560740 131561286 131561173 Y IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2 PDLIM4 NA NA NA NA PDLIM4 30078 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 131594769 131595694 131595371 Y PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 3405 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 131595834 131595951 131595900 Y KIF3A,PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 4470 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 131641002 131641297 131641050 Y NA PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 11994 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 131763542 131763915 131763870 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf56 19214 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 131833441 131833717 131833513 Y IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8951 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 133458261 133458756 133458481 Y UBE2B,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 NA NA NA NA TCF7 9859 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr5 133864116 133864195 133864168 Y NA NA NA NA NA NA SEC24A 118284 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 137868208 137868538 137868536 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 8451 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA MATR3 329197 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 138838499 138838633 138838566 Y TMEM173 TMEM173 NA NA NA NA TMEM173 21887 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 139464204 139464218 139464211 Y NA PURA CYSTM1,NRG2 IMR90 Hi-C 24141950 PURA 21144 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 140457576 140457668 140457630 Y NA PCDHB2,PCDHB3 NA NA NA NA PCDHB2 14559 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3,PCDHGC5 NA NA NA NA PCDHGC5 26705 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 141395225 141395941 141395831 Y DIAPH1,KIAA0141,PCDH12,GNPDA1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GNPDA1 4619 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 141825669 141826086 141825870 Y SPRY4 NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 121649 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 142209487 142209761 142209583 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 61538 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 146047313 146047450 146047388 Y NA NA NA NA NA NA TCERG1 222439 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 148591795 148592037 148591918 Y ABLIM3 NA NA NA NA NA AFAP1L1 57397 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 148700478 148700631 148700542 Y NA GRPEL2,PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L IMR90 Hi-C 24141950 GRPEL2 22362 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 150142965 150143377 150143063 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 DCTN4,C5orf62 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 DCTN4 6294 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 150161319 150161633 150161505 Y ANXA6,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 24648 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 150163031 150163501 150163387 Y TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 26360 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 150169826 150170319 150169982 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 33155 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 151078700 151079028 151078874 Y ATOX1,SPARC SPARC SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 13974 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 153008472 153008835 153008712 Y NA NA NA NA NA NA GRIA1 141297 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 155202123 155202494 155202309 Y NA NA PPP1R2P3 IMR90 Hi-C 24141950 SGCD 92860 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 156943029 156943356 156943193 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 NA NA NA NA NA ADAM19 57427 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 157001390 157002014 157001697 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 NA NA NA NA ADAM19 607 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 157029541 157029807 157029692 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 28758 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 169404223 169404546 169404350 Y FAM196B FAM196B NA NA NA NA FAM196B 1198 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr5 171879589 171880295 171879961 Y SH3PXD2B SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 62 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 171882832 171882998 171882915 Y SH3PXD2B SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 3305 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 172222248 172222806 172222661 Y NA DUSP1,ERGIC1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 26050 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 172228151 172228566 172228394 Y DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 30712 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 172380663 172381064 172380838 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 2668 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 175962179 175962700 175962413 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2 RNF44 FAF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF44 326 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 178323440 178323622 178323554 Y NA ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2,ZNF454 NA NA NA NA ZFP2 2545 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr5 178741194 178741503 178741376 Y NA ADAMTS2 NA NA NA NA ADAMTS2 28928 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 422827 423098 422962 Y DUSP22,IRF4 NA NA NA NA NA DUSP22 133197 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 3308463 3308483 3308477 Y NA NA NA NA NA NA PSMG4 78826 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 3389811 3390490 3390264 Y SERPINB6,SLC22A23,C6orf145 NA NA NA NA NA SLC22A23 64766 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr6 3916569 3916712 3916641 Y NA NA SLC22A23,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 68949 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 6314813 6315110 6314962 Y LY86,F13A1 NA NA NA NA NA RREB1 790720 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 6890950 6891223 6891087 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 214607 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A NA NA NA NA NA PAK1IP1 288678 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 10552532 10552740 10552636 Y NA NA NA NA NA NA PAK1IP1 140188 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 11921182 11921467 11921322 Y NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP1 85528 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 16322882 16323237 16323091 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 86071 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 16741302 16741617 16741570 Y NA ATXN1 NA NA NA NA ATXN1 18105 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 17715315 17715544 17715493 Y NUP153 NUP153 NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 10659 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 18148522 18148811 18148697 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,TPMT,KDM1B NHLRC1 IMR90 Hi-C 24141950 TPMT 4494 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 20211469 20211688 20211565 Y NA NA NA NA NA NA E2F3 188710 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 21589338 21589711 21589681 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2261 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 21808482 21808727 21808539 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 216510 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 26232920 26233434 26233137 Y NA HIST1H4D,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI NA NA NA NA HIST1H1D 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 27585757 27586130 27585944 Y NA NA NA NA NA NA ZNF184 146860 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.13824442694565 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 31789098 31789184 31789146 Y TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 4328 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 33181288 33181504 33181396 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25 NA NA NA NA RING1 7016 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 33216178 33216307 33216243 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2 NA NA NA NA HCG25 867 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 34514432 34514838 34514655 Y NA RP3-391O22.3 NA NA NA NA RP3-391O22.3 27595 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 36821118 36821514 36821315 Y NA CPNE5,C6orf89,PPIL1 CPNE5 IMR90 Hi-C 24141950 CPNE5 15340 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr6 42280829 42281179 42280973 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 97226 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 45051436 45051642 45051539 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 292048 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 45618234 45618676 45618425 Y RUNX2 NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 274544 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 49521190 49521511 49521254 Y NA C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 5077 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 50818020 50818494 50818241 Y NA RPS17P5 NA NA NA NA RPS17P5 4881 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 53225010 53225140 53225110 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 13063 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 68340064 68340094 68340079 Y NA NA NA NA NA NA LMBRD1 2164909 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 74432369 74432753 74432573 Y MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109 CD109 NA NA NA NA CD109 28861 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 82953012 82953093 82953052 Y NA IBTK NA NA NA NA IBTK 2378 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E RP11-30P6.6,NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-30P6.6 15528 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E RP11-30P6.6,NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-30P6.6 16592 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 88398633 88398672 88398653 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 11255 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 91004830 91005121 91005041 Y MDN1,BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA MAP3K7 289643 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 325188 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 106611101 106611647 106611464 Y PRDM1 NA NA NA NA NA ATG5 160019 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 109102631 109102946 109102736 Y NA NA NA NA NA NA ARMC2 64673 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 109218749 109218814 109218782 Y NA RP11-249L21.4 NA NA NA NA RP11-249L21.4 8262 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 111924339 111924647 111924531 Y TRAF3IP2 TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 834 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 111925507 111925888 111925538 Y REV3L,TRAF3IP2 TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 26 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr6 111946812 111947024 111946918 Y NA TRAF3IP2 TRAF3IP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAF3IP2 21331 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 112573913 112574044 112574030 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 97 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 117720321 117720599 117720460 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD1 52381 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 120445667 120446036 120445852 Y NA NA NA NA NA NA MAN1A1 776741 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1 NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 127892310 127892704 127892511 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 137529 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 129504822 129504957 129504926 Y NA NA NA NA NA NA LAMA2 302480 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 132057565 132057807 132057687 Y NA RP5-988G15.1 NA NA NA NA RP5-988G15.1 42645 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 136788990 136789214 136789102 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 80743 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 138194322 138194912 138194642 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 7971 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr6 138213585 138213859 138213696 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 27234 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 138290142 138290398 138290268 Y TNFAIP3 NA NA NA NA NA TNFAIP3 103791 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 139697079 139697371 139697327 Y NA CITED2 NA NA NA NA CITED2 3322 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 140029935 140030328 140030123 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-899B16.1 143659 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 140085604 140086085 140085978 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-899B16.1 87902 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 140807335 140807614 140807478 Y NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-899B16.1 633348 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 140858869 140859245 140859045 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-899B16.1 684882 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr6 140893217 140893627 140893519 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 719230 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 141171716 141171869 141171793 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 997729 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 141300848 141301178 141301014 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 1126861 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 143221710 143222285 143222093 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 42053 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 144284201 144284585 144284512 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 99150 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 144585551 144585700 144585606 Y NA NA UTRN IMR90 Hi-C 24141950 TPT1P4 65449 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 146941927 146942088 146942011 Y NA NA NA NA NA NA RAB32 79098 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 148588961 148589218 148589102 Y UST NA SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 UST 477246 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 152213732 152213746 152213738 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA ESR1 237906 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 154829940 154830043 154829992 Y NA CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 147 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 157639062 157639495 157639253 Y C6orf35 NA NA NA NA NA TMEM242 103138 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 158481547 158481708 158481650 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 80659 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 158982051 158982465 158982168 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81306 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 159141436 159141829 159141621 Y TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR NA NA NA NA NA DYNLT1 77665 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 160402732 160403272 160403091 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 14601 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 167411692 167411848 167411735 Y RNASET2,GPR31 RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 1022 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 168388482 168388509 168388496 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 162880 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 169470702 169471012 169470790 Y THBS2 NA WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 THBS2 181127 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr6 169475360 169475647 169475438 Y THBS2 NA WDR27,PHF10,FAM120B IMR90 Hi-C 24141950 THBS2 176492 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 556288 556672 556400 Y LOC100288524,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 1261 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 1553000 1553189 1553120 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 9511 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 2058424 2058871 2058630 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 212007 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 2143904 2144149 2144041 Y LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 126729 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 3528330 3528371 3528351 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 646372 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 7608686 7608956 7608841 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 4183 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 16095120 16095542 16095311 Y NA NA NA NA NA NA ISPD 363405 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 17315787 17316189 17315986 Y NA AHR,AC003075.4 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 20057 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 227019 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 18678257 18678434 18678328 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 476861 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 19146147 19146774 19146493 Y FERD3L,TWIST1 TWIST1 NA NA NA NA TWIST1 8521 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 20239036 20239390 20239182 Y TWISTNB NA NA NA NA NA AC005062.2 60960 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 27231816 27231998 27231907 Y HOXA10,HOXA11,HOXA13 HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOXA13 NA NA NA NA HOXA13 5727 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr7 33943577 33943776 33943645 Y NA BMPER NA NA NA NA BMPER 1054 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 34026970 34027411 34027080 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 84447 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 39632170 39632581 39632314 Y RALA YAE1D1,RALA NA NA NA NA YAE1D1 28195 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 39641991 39642218 39642176 Y RALA YAE1D1,RALA LINC00265 IMR90 Hi-C 24141950 RALA 18864 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 39660879 39661112 39661042 Y NA NA NA NA NA NA RALA 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 42174635 42174902 42174765 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 100567 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 43612098 43612408 43612297 Y DBNL STK17A NA NA NA NA STK17A 7949 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 44127636 44127736 44127679 Y YKT6,AEBP1 DBNL,POLM,AEBP1,POLD2 PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B IMR90 Hi-C 24141950 POLM 7497 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 44677628 44678244 44677873 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 33457 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 46597190 46597387 46597291 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 637717 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr7 47293209 47293414 47293276 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 326742 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 47533820 47533921 47533853 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 86235 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 47823605 47823820 47823740 Y TNS3 C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 9069 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 6293 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 48127053 48127182 48127123 Y HUS1,UPP1,UPP1 UPP1 NA NA NA NA UPP1 828 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL NA NA NA NA NA GRB10 511403 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 65613460 65613645 65613556 Y ASL,ASL CRCP NA NA NA NA CRCP 35869 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 73512377 73512557 73512465 Y NA CTB-51J22.1,LIMK1 NA NA NA NA LIMK1 17114 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 73866647 73867033 73866768 Y LAT2 GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 527 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 75993529 75993613 75993570 Y POR YWHAG YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7181 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG NA NA NA NA YWHAG 22825 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 81247788 81247966 81247912 Y NA NA HGF IMR90 Hi-C 24141950 HGF 149788 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 81739157 81739440 81739299 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 331674 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 84267436 84267624 84267532 Y NA NA SEMA3A IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 147396 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 86946167 86946460 86946286 Y NA TP53TG1,CROT NA NA NA NA TP53TG1 26371 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 92437286 92437617 92437517 Y SAMD9 CDK6 NA NA NA NA CDK6 26291 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 93672671 93673149 93672763 Y NA BET1,AC003092.1 GNG11,TFPI2,BET1 IMR90 Hi-C 24141950 AC003092.1 22526 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 93926616 93927074 93926886 Y SGCE,COL1A2 NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A2 94799 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 93928348 93928567 93928538 Y SGCE,COL1A2 NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A2 93306 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 94003622 94003870 94003684 Y NA COL1A2 NA NA NA NA COL1A2 18003 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 97913424 97913987 97913861 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 33733 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 99969754 99970252 99970079 Y OR2AE1,C7orf59,ZCWPW1,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 32223 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 100042030 100042585 100042239 Y COPS6,EPHB4 MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35,TSC22D4,NYAP1 NA NA NA NA PPP1R35 9842 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 100143295 100143664 100143516 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 8461 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 100144113 100144628 100144364 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9279 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr7 100144720 100144853 100144769 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9886 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 102516226 102516619 102516429 Y LRRC17 LRRC17 FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 LRRC17 34819 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 102555127 102555592 102555343 Y LRRC17 LRRC17 NA NA NA NA LRRC17 3689 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 103277543 103277794 103277680 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC2 294223 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 105223133 105223294 105223281 Y NA NA NA NA NA NA RINT1 52601 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 111722371 111722702 111722539 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 121764 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 115912136 115912451 115912327 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV2 NA NA NA NA CAV2 12983 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 115955390 115955624 115955546 Y NA CAV2 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 29956 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 116168216 116168790 116168273 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 5377 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 116217100 116217359 116217210 Y CAV1,CAV1 NA NA NA NA NA CAV1 54261 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 116314942 116315351 116315128 Y ST7,TES,CAV2,CAV2,MET MET NA NA NA NA MET 4498 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr7 118520575 118520914 118520745 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 698489 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 120724784 120725242 120725000 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 135981 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 127876972 127877440 127877187 Y IMPDH1,LRRC4 NA PAX4,FSCN3,SND1,LEP,RBM28 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM28 104522 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.65552498031386 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.58640276684103 chr7 128472556 128472915 128472760 Y NA CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 4125 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 129078824 129079119 129078920 Y NA RP11-305M3.2,RNU1-72P NA NA NA NA RP11-305M3.2 30613 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 131580267 131580830 131580536 Y NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 PODXL 339291 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 133706471 133706698 133706584 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B4 293105 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 134427779 134428168 134427974 Y CALD1 CALD1 CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 CALD1 776 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 134939025 134939170 134939094 Y TMEM140,CNOT4,WDR91 WDR91 NA NA NA NA WDR91 44709 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 137663180 137663556 137663478 Y CREB3L2 CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 21257 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 149193399 149193541 149193458 Y ZNF467,ZNF746 ZNF746 NA NA NA NA ZNF746 491 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr7 158500449 158500649 158500582 Y NA NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 4929 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA GS1-57L11.1 NA NA NA NA GS1-57L11.1 8311 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr8 18244410 18244774 18244528 Y NA NA NA NA NA NA NAT1 218424 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NA NA NA NA NA FAM160B2 76752 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 23034603 23034952 23034670 Y TNFRSF10B,TNFRSF10D TNFRSF10D,TNFRSF10A NA NA NA NA TNFRSF10D 15060 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 24861094 24861317 24861155 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 48470 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr8 25133664 25134104 25133793 Y NA NA NA NA NA NA DOCK5 93426 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 26305968 26306033 26305997 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 63575 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 26498541 26498935 26498595 Y NA NA NA NA NA NA RP11-384C12.1 128372 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr8 30580467 30580796 30580574 Y GSR GSR,UBXN8 NA NA NA NA GSR 2647 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 33579772 33580017 33579844 Y NA NA NA NA NA NA RP1-273G13.1 135724 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr8 37643587 37643772 37643645 Y NA PROSC,GPR124 NA NA NA NA GPR124 3878 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA HTRA4,TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr8 41146046 41146081 41146065 Y SFRP1 SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 18935 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 41160567 41160649 41160637 Y NA SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 4367 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 42270426 42270603 42270558 Y NA VDAC3 NA NA NA NA VDAC3 23284 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 224269 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 49229155 49229573 49229245 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 65577 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 49321087 49321473 49321210 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25937 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 132396 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 49467466 49467648 49467542 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 172316 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 54884595 54884649 54884642 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 48440 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 57389900 57390701 57390447 Y NA PENK NA NA NA NA PENK 32607 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 62631895 62632623 62632238 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 6740 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 65283356 65283636 65283503 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 1204244 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 67419818 67420060 67419977 Y NA NA NA NA NA NA ADHFE1 79398 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 69672075 69672426 69672227 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 704433 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 70042378 70042779 70042585 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 334080 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 73497405 73497640 73497408 Y NA NA NA NA NA NA TERF1 421459 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 77515612 77515766 77515691 Y NA NA NA NA NA NA LINC01111 198723 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 248204 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr8 83490846 83490929 83490888 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND1 847708 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 95271404 95271652 95271620 Y GEM GEM NA NA NA NA GEM 926 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 101920209 101920392 101920320 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 14235 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 14749 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 21757 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 102015928 102016078 102016021 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 52312 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 102167683 102167913 102167765 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48508 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 103249003 103249378 103249091 Y UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B KB-431C1.4 NA NA NA NA RRM2B 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 103613012 103613469 103613324 Y KLF10,KLF10 NA UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1,RRM2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 52661 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 103741796 103742226 103742065 Y NA NA KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 75666 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 103766474 103766656 103766574 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 100344 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 107059911 107060047 107059923 Y NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-395G23.3 220325 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr8 107633742 107634133 107633852 Y OXR1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 74108 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 124547812 124548082 124548041 Y NA FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 3364 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 124549741 124550229 124550044 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1217 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 124665857 124666229 124666132 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 112467 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 127438735 127439116 127438766 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 129522 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 128344177 128344591 128344565 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 401089 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 130697904 130698138 130698105 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 GSDMC 98996 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 130720341 130720558 130720412 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 GSDMC 76576 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr8 131264949 131265429 131265208 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 188477 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr8 131515414 131515718 131515576 Y NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 61508 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 134415744 134416227 134416033 Y SLA,ST3GAL1 NA TG,NDRG1,WISP1,PHF20L1,ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-458A3.1 79504 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 142289630 142289814 142289772 Y NA SLC45A4 SLC45A4,PTK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 26590 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr8 144301806 144302247 144302025 Y MAFA ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 25033 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 442373 442547 442460 Y NA KANK1 NA NA NA NA KANK1 25744 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 5509549 5510003 5509837 Y C9orf46,CD274,PDCD1LG2 PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 1004 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 6788210 6788382 6788241 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 69347 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 6958089 6958102 6958095 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 239226 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 16505238 16505575 16505407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 219237 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 18474958 18475225 18475032 Y ADAMTSL1 ADAMTSL1 NA NA NA NA ADAMTSL1 3066 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr9 18490587 18490949 18490797 Y ADAMTSL1 ADAMTSL1 NA NA NA NA ADAMTSL1 18695 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 246525 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 19184256 19184894 19184463 Y PLIN2 PLIN2 HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 36968 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 21576231 21576644 21576439 Y NA MIR31HG MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 18563 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 21674915 21675193 21674990 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 117247 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 21685022 21685416 21685227 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 115126 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103429 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P2 1615829 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P2 1003845 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 33770440 33770694 33770558 Y NA PRSS3,UBE2R2 NA NA NA NA PRSS3 21925 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 34577617 34577859 34577738 Y ARID3C,DNAJB5,DNAJB5,CNTFR,CNTFR DCTN3 NA NA NA NA DCTN3 40656 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 35490989 35491345 35491127 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 2865 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 35491656 35492052 35492019 Y OR13J1,TPM2,CREB3,CCDC107,RUSC2 RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 3532 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 37009861 37010203 37010032 Y PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 108333 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1B1 46909 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.10368332020924 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 75549526 75549619 75549601 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 143739 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 81637955 81638246 81638090 Y NA NA NA NA NA NA TLE4 546442 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 86239584 86239974 86239757 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 80535 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 89366066 89366516 89366184 Y NA NA NA NA NA NA GAS1 193588 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 5.17280553368207 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 94860272 94860642 94860609 Y NA SPTLC1,LINC00475 NA NA NA NA SPTLC1 15024 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 NA NA NA NA NA FANCC 195021 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 98744078 98744248 98744144 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 107819 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 99213129 99213681 99213680 Y ZNF510,CDC14B,HABP4 RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA HABP4 2646 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 107833426 107833839 107833430 Y NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 144908 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 109655091 109655246 109655169 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 31713 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 110377627 110377777 110377710 Y KLF4 NA NA NA NA NA KLF4 126864 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF4 261390 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 110517575 110517896 110517754 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 266812 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 111206149 111206336 111206243 Y NA NA NA NA NA NA RP11-220D10.1 180777 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 111241256 111241607 111241441 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-220D10.1 145506 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 111315008 111315237 111315108 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-220D10.1 71876 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 112831833 112832445 112832154 Y NA NA NA NA NA NA TXN 184475 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 113412585 113412772 113412669 Y NA NA LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10 IMR90 Hi-C 24141950 LPAR1 386209 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 113413222 113413721 113413633 Y LPAR1 NA LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10 IMR90 Hi-C 24141950 LPAR1 385260 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 113515103 113515367 113515167 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 283614 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 114723325 114723781 114723480 Y NA NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 66279 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 116937744 116937911 116937764 Y ORM1,COL27A1 COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 21904 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 117657108 117657611 117657338 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 90702 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 118706424 118707025 118706637 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 207058 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 118917854 118918405 118917899 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 3771 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 119311432 119311888 119311785 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 135693 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 120523356 120523735 120523438 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 1075775 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 124031340 124031517 124031432 Y GSN RAB14 NA NA NA NA RAB14 48048 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 124040831 124041134 124040970 Y GSN NA NA NA NA NA RAB14 57539 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 124704763 124705076 124704868 Y TTLL11,MRRF,DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 148809 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 126102323 126102736 126102675 Y NA NA RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STRBP 73468 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 128275898 128276280 128276126 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 191233 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 130281582 130281994 130281773 Y TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9 NA NA NA NA NA FAM129B 57274 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 130564311 130564645 130564479 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9 CDK9,FPGS NA NA NA NA FPGS 9435 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 130731999 130732057 130732026 Y SLC25A25,DPM2,FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 8735 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 130743802 130743907 130743855 Y FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 3010 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 131908135 131908616 131908494 Y METTL11A PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA IER5L 29924 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 131929021 131929365 131929193 Y NA IER5L NA NA NA NA IER5L 9175 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 131930457 131930532 131930510 Y PRRX2 IER5L NA NA NA NA IER5L 8008 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-65J3.1 53278 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 132359283 132359664 132359324 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6 ASB6 NA NA NA NA ASB6 42780 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 132373475 132373922 132373518 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 28522 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 132539303 132540203 132539702 Y C9orf106,FNBP1,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 23229 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 137221069 137221192 137221119 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 14125 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 137494646 137494892 137494734 Y NA COL5A1 RXRA,COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 36728 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 7.7592083005231 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 2.06912221347283 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 12228582 12228906 12228588 Y NA NA NA NA NA NA MSL3 454304 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 13138325 13138351 13138340 Y NA NA FAM9C,LOC100133123,TMSB4X IMR90 Hi-C 24141950 TMSB4X 147098 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 23922308 23922544 23922448 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 1513 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 40005202 40005365 40005305 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 29217 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 40026864 40027458 40027209 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 7124 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA NDP 57840 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 45210801 45210962 45210882 Y NA NA NA NA NA NA RP11-245M24.1 151671 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 45305345 45305614 45305509 Y NA NA NA NA NA NA RP11-245M24.1 57019 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 45374628 45375077 45374937 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 11995 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 3.62096387357745 chrX 45376807 45376988 45376867 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 14174 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 8.27648885389131 chrX 45568719 45568861 45568812 Y NA MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 35669 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 45631125 45631239 45631172 Y NA MIR222 NA NA NA NA MIR222 26595 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 46496839 46496883 46496861 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 65620 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chrX 53110126 53110560 53110260 Y NA GPR173,TSPYL2,LINC01155 NA NA NA NA TSPYL2 577 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.55184166010462 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 64255385 64255512 64255449 Y ZC4H2 ZC4H2 NA NA NA NA ZC4H2 2792 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 145914 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NLGN3 NA NA NA NA NLGN3 39172 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 73228588 73229157 73228689 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 66429 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 87351546 87351899 87351791 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 1320 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2 NA NA NA NA CSTF2 38037 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 NA NA NA NA NA GPRASP2 50168 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235610 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 114849502 114849636 114849587 Y NA NA NA NA NA NA PLS3 56001 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 119619980 119620335 119620161 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18760 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 4.65552498031386 chrX 127434305 127434453 127434370 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 1221024 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 128915135 128915622 128915382 Y ELF4,ELF4,BCORL1,SASH3 NA NA NA NA NA ZDHHC9 60263 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 134048475 134048529 134048502 Y MOSPD1 MOSPD1 NA NA NA NA MOSPD1 1178 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 134718222 134718415 134718313 Y NA NA NA NA NA NA LINC00086 164354 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 149084401 149084780 149084588 Y NA LINC00894,CXorf40B NA NA NA NA LINC00894 20066 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 5996 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA NSDHL 129860 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 1.03456110673641 chrX 153600469 153600779 153600667 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ NA NA NA NA FLNA 227 CAGE 10964C hg19 FANTOM5 0.517280553368207