chr1 839741 840250 839788 Y NA NA NA NA NA NA NOC2L 52439 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 1283060 1283625 1283139 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2 NA NA NA NA DVL1 330 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 378 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 1456676 1456699 1456688 Y NA ATAD3A NA NA NA NA ATAD3A 11145 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 2221868 2222548 2222316 Y TNFRSF14,SKI NA NA NA NA NA C1orf86 79709 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA MEGF6 295902 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr1 7843556 7843653 7843585 Y PER3 VAMP3,PER3 NA NA NA NA PER3 1176 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 52503 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 8254637 8254907 8254798 Y NA NA ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 169839 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 8762126 8762475 8762428 Y NA NA NA NA NA NA RERE 113227 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 9889535 9889880 9889709 Y KIF1B CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 6951 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 10447707 10448369 10448247 Y NA PGD,APITD1,APITD1-CORT NA NA NA NA PGD 8280 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 10927237 10927380 10927309 Y CASZ1 NA PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127 IMR90 Hi-C 24141950 TARDBP 143034 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 12599928 12600179 12600028 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 75558 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 15519488 15519688 15519655 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 42460 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN NA NA NA NA SPEN 3332 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN NA NA NA NA SPEN 40400 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 16508402 16508642 16508565 Y FBLIM1 EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 27820 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA RNU1-1 SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-1 12489 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr1 17578205 17578469 17578334 Y NA PADI3 NA NA NA NA PADI3 4612 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 21349725 21349786 21349755 Y EIF4G3 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48460 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr1 21588829 21589430 21588896 Y ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 80567 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.81899290069135 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 25051605 25051987 25051744 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 17861 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 25281668 25281921 25281754 Y NA RUNX3 NA NA NA NA RUNX3 7691 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 MIR3917,STMN1 NA NA NA NA MIR3917 29188 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 27175784 27176273 27175984 Y C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 11360 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 27985480 27985709 27985578 Y EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 11020 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 33450600 33450837 33450735 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19B 22314 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 33454783 33455472 33455325 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 26497 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 33458800 33459074 33458865 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 30514 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 36397577 36397741 36397665 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 154735 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 ADPRHL2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr1 36853020 36853462 36853143 Y NA STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 3523 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 370805 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 42328578 42328878 42328730 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 170718 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 42334608 42334670 42334638 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 164926 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 42351041 42351345 42351193 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 148251 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 42367142 42367456 42367439 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132140 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr1 43988888 43989038 43988936 Y PTPRF PTPRF PTPRF IMR90 Hi-C 24141950 PTPRF 30 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 44232152 44232509 44232262 Y SLC6A9,IPO13,ST3GAL3 NA NA NA NA NA ST3GAL3 62657 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 48515939 48516296 48516118 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-61P 395312 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA EPS15 NA NA NA NA EPS15 47408 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 53385696 53386052 53386029 Y NA ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 4832 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 54150852 54151742 54151620 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 202665 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 54810685 54810861 54810859 Y NA NA NA NA NA NA SSBP3 66291 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 56771744 56771759 56771752 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 337215 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 59229881 59230252 59230003 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 17533 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA JUN 121264 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 59392782 59392938 59392865 Y FGGY NA LOC100131060,JUN,HSD52,FGGY,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 JUN 144997 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 59761390 59761720 59761439 Y NA FGGY NA NA NA NA FGGY 1080 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 64254998 64255371 64255034 Y ROR1 ROR1 NA NA NA NA ROR1 17305 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 67029191 67029437 67029359 Y NA NA NA NA NA NA WDR78 359133 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr1 67029939 67030347 67030122 Y PDE4B NA NA NA NA NA WDR78 358223 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 8.91098343494649 chr1 68041528 68041694 68041684 Y GADD45A NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 107050 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 68663588 68663867 68663728 Y NA WLS,RPS7P4 NA NA NA NA WLS 32936 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 68849988 68850367 68850179 Y NA NA LOC100289178,WLS,RPE65 IMR90 Hi-C 24141950 DEPDC1 110537 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 70807938 70808237 70808103 Y NA ANKRD13C,HHLA3 NA NA NA NA ANKRD13C 10180 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 78011624 78012030 78011967 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 135074 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 85737728 85738105 85737917 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 2668 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 85763626 85763846 85763779 Y NA C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 22853 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 86077140 86077408 86077190 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 32696 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 92907492 92907607 92907552 Y NA GFI1 NA NA NA NA GFI1 42826 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 93773027 93773315 93773230 Y NA DR1 NA NA NA NA DR1 36130 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr1 94021310 94021626 94021469 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 109622 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 94089710 94089715 94089713 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 149285 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 92882 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 79662 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 94244939 94245309 94245199 Y ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3 RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 5939 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 94992236 94992413 94992325 Y NA NA NA NA NA NA ABCD3 110303 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA NA NA NA NA NA ABCD3 126062 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 96502437 96502585 96502484 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P11 407901 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 97890575 97890709 97890642 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 118548 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA RP5-1070A16.1 NA NA NA NA RP5-1070A16.1 31459 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 100820585 100820838 100820683 Y HIAT1,CDC14A CDC14A NA NA NA NA CDC14A 12001 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 111178912 111179243 111179089 Y RBM15,CD53 NA KCNA2 K562 ChIA-PET 22265404 SLC16A4 247208 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 113014906 113015158 113015047 Y CAPZA1 NA NA NA NA NA CTTNBP2NL 78103 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 113584893 113585079 113584961 Y NA RP11-31F15.2,LRIG2 SLC16A1,AKR7A2P1,RHOC,PPM1J IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-31F15.2 28648 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 117030831 117031034 117030889 Y ATP1A1,ATP1A1 NAP1L4P1 ATP1A1,ATP1A1OS,SLC22A15,MAB21L3,CD58 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAP1L4P1 43680 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 120147764 120147961 120147863 Y HSD3B1 GAPDHP33,ZNF697 NA NA NA NA GAPDHP33 9962 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 120530787 120531205 120531127 Y NOTCH2,ZNF697 NA NA NA NA NA NOTCH2 79035 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 120692453 120692808 120692620 Y NBPF7,NOTCH2 NA NA NA NA NA NOTCH2 82213 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 144993199 144993244 144993232 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 80942 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 145042783 145043227 145042898 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 30959 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 145113904 145114998 145114671 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 19684 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6 LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 150668096 150668276 150668180 Y NA GOLPH3L NA NA NA NA GOLPH3L 466 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA CERS2 4090 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 151913815 151914271 151914054 Y S100A10 THEM4 S100A10,CELF3,THEM4,RORC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33531 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 151962641 151962839 151962740 Y NA S100A10 NA NA NA NA S100A10 2027 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 154782504 154782818 154782668 Y NA NA NA NA NA NA KCNN3 57938 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 155066604 155066635 155066620 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 DPM3,KRTCAP2,EFNA1,TRIM46,SLC50A1 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA1 31301 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA KRTCAP2,MIR92B,MTX1,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 155469100 155469412 155469293 Y MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2 NA NA NA NA NA ASH1L-AS1 60409 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 155904830 155905033 155904931 Y NA RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 2639 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 157124774 157125221 157124855 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 ETV3,ETV3L K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ETV3 18508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr1 161320542 161320880 161320598 Y FCRLB,ATF6,CD244,FCER1G SDHC NA NA NA NA SDHC 38495 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr1 162539981 162540420 162539994 Y C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 10658 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 162657724 162657971 162657804 Y NA NA NA NA NA NA DDR2 58561 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 167424728 167425462 167425239 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 95542 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 171267886 171268138 171268012 Y NA FMO4 NA NA NA NA FMO4 13209 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 178252303 178252477 178252337 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 191439 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 179115539 179115872 179115703 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 67027 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 180237101 180237317 180237140 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 115132 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 180249791 180250006 180249913 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 127822 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 183133608 183133779 183133664 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 19594 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 184130086 184130836 184130514 Y NA NA C1orf21 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 111275 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 185264835 185265233 185265202 Y NA IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 19228 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 185615541 185615870 185615591 Y NA NA SWT1,LOC100288079,IVNS1ABP IMR90 Hi-C 24141950 HMCN1 85813 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 187996792 187997117 187996893 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 1200707 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 6.68323757620986 chr1 191536543 191536778 191536610 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 1146535 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 192508796 192509150 192509060 Y NA NA UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 174163 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 192914637 192914772 192914747 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 NA NA NA NA NA TROVE2 111780 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 192924608 192924823 192924716 Y NA NA RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 TROVE2 101729 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 193226500 193227132 193226836 Y RGS2 NA NA NA NA NA CDC73 137353 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 198898987 198899513 198899179 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 774894 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 200857233 200857815 200857711 Y KIF21B NA NA NA NA NA KIF21B 133013 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr1 201236006 201236165 201236054 Y LAD1,C1orf106,PKP1 NA NA NA NA NA TMEM9 97304 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 201613549 201613726 201613638 Y NA NAV1 NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAV1 23138 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA NAV1 93346 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 201717535 201717792 201717621 Y NA NA IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 78477 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 202872285 202872308 202872297 Y NA RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12 RABIF MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA1P59 6632 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 PRELP NA NA NA NA PRELP 39026 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr1 203789427 203789442 203789436 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 26645 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 204976101 204976640 204976291 Y LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,KLHDC8A,DSTYK,CNTN2,CDK18,NFASC NA NA NA NA NA RBBP5 112503 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 205257253 205257766 205257562 Y RAB7L1,RBBP5,NUAK2,DSTYK NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 31117 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 206828330 206828510 206828373 Y NA EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2 NA NA NA NA DYRK3 21449 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 207080273 207080661 207080467 Y FAIM3,FAIM3,IL19 RP11-564A8.4 NA NA NA NA RP11-564A8.4 1309 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 208377298 208378003 208377521 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 37662 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 211976591 211977124 211977068 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 24990 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 214614555 214614760 214614639 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109032 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 216774004 216774285 216774188 Y ESRRG,ESRRG NA NA NA NA NA GPATCH2 1028139 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 221201814 221202202 221201887 Y HLX NA NA NA NA NA HLX 152115 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 222000173 222000483 222000346 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 86655 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 222814663 222814910 222814786 Y NA MIA3 NA NA NA NA MIA3 25235 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 7.6379858013827 chr1 224598124 224598418 224598271 Y WDR26 WDR26 NA NA NA NA WDR26 24317 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 227936688 227936978 227936805 Y ZNF678 SNAP47,JMJD4 NA NA NA NA JMJD4 15576 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 228640073 228640088 228640081 Y NA TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 3472 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr1 229601636 229601883 229601761 Y NA NUP133,RP4-613A2.1 NA NA NA NA NUP133 40220 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.86424467551851 chr1 234275805 234276023 234275906 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 214864 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr1 234792654 234793437 234793098 Y NA IRF2BP2,RP4-781K5.4 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-781K5.4 12619 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr1 234793934 234794239 234794125 Y NA RP4-781K5.4 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-781K5.4 13899 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 235842870 235843206 235843038 Y NA GNG4 NA NA NA NA GNG4 30816 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 236022682 236022818 236022763 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22122 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 236026992 236027471 236027217 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 17469 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 243431437 243431793 243431509 Y NA CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 14117 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 243788022 243788404 243788357 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 223977 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 246035151 246035554 246035345 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 633060 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 3133662 3133717 3133688 Y PITRM1,PFKP PFKP NA NA NA NA PFKP 27137 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 3797195 3797502 3797389 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 27971 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 3800307 3800531 3800378 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 24942 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 3848037 3849536 3848891 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 22564 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 3881297 3881662 3881434 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF6 55824 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 4685784 4686138 4685885 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 32208 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 4713647 4713873 4713697 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 4473 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr10 4983862 4984222 4983900 Y NA NA tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 51066 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 5105953 5106270 5106114 Y NA AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 30407 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 5113786 5114179 5114065 Y AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3 AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 38240 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 118302 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr10 5334474 5334640 5334544 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 117874 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA NET1 51913 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 5638863 5639270 5639216 Y NET1,CALML3 RP13-463N16.6 NET1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP13-463N16.6 2782 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 6584920 6585624 6585165 Y PRKCQ PRKCQ NA NA NA NA PRKCQ 34639 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 8374227 8374893 8374382 Y GATA3 NA NA NA NA NA GATA3 280660 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 8408171 8408387 8408297 Y NA NA FLJ45983,GATA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GATA3 314604 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 10558695 10559022 10558704 Y CELF2 NA NA NA NA NA SFTA1P 275921 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 11017838 11018101 11017971 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 182895 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 11652835 11653073 11652954 Y CELF2,USP6NL USP6NL NA NA NA NA USP6NL 1082 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 281363 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr10 14026617 14027027 14026853 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 399690 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 172933 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 14647138 14647588 14647478 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 167308 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 NEBL 120572 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 22555688 22555894 22555791 Y NA COMMD3 NA NA NA NA COMMD3 47009 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 22887940 22888243 22888209 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 113241 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 24498955 24499204 24499146 Y KIAA1217 NA NA NA NA NA ARHGAP21 511393 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 24772710 24773084 24772822 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 237513 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 26827838 26827901 26827870 Y NA NA NA NA NA NA PDSS1 156687 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 27354652 27354729 27354695 Y NA ANKRD26 NA NA NA NA ANKRD26 32692 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 29717478 29717845 29717536 Y NA PTCHD3P1 NA NA NA NA PTCHD3P1 21147 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 29761620 29761743 29761682 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 65289 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 29978009 29978233 29978173 Y SVIL SVIL NA NA NA NA SVIL 45477 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 30073207 30073608 30073571 Y SVIL SVIL SVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SVIL 49497 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 31986692 31987073 31986913 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 228669 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 32215994 32216410 32215998 Y NA ARHGAP12 NA NA NA NA ARHGAP12 252 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 33265376 33265557 33265464 Y NA ITGB1 ITGB1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITGB1 27163 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 33654776 33655204 33655009 Y NA NRP1 PARD3,NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 31586 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 35640077 35640405 35640144 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 106124 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 43422233 43422523 43422379 Y NA NA RET IMR90 Hi-C 24141950 BMS1 145984 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 52081951 52082279 52082036 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 59213 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 52261858 52262194 52262143 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 120729 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 54078280 54078480 54078433 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6224 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 NA DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK1 174501 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 55377812 55377822 55377817 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 1305756 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 63658924 63659147 63659031 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 65016713 65017097 65017085 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 125663 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 65196810 65197156 65196994 Y NA PRELID1P3,JMJD1C NA NA NA NA PRELID1P3 11753 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 65282188 65282459 65282345 Y JMJD1C,JMJD1C REEP3 NA NA NA NA REEP3 3065 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 71386629 71386882 71386756 Y NA C10orf35 NA NA NA NA C10orf35 1125 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 71626507 71626840 71626632 Y COL13A1 NA NA NA NA NA COL13A1 66863 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1,CALM2P2 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 73735695 73736076 73735808 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 13572 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 73840531 73840743 73840590 Y ASCC1,ASCC1,SPOCK2 NA NA NA NA NA CHST3 118408 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 74091361 74091474 74091418 Y SPOCK2,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 21514 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 74323187 74323566 74323386 Y DDIT4,DNAJB12 NA NA NA NA NA MICU1 60333 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 74453097 74453245 74453141 Y CCDC109A MCU NA NA NA NA MCU 3208 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 75253773 75253975 75253905 Y NA RP11-137L10.6 NA NA NA NA PPP3CB 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 76985148 76985510 76985329 Y NA VDAC2,COMTD1,HMGA1P5 NA NA NA NA COMTD1 8278 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 78790288 78790415 78790352 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 605938 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 78826666 78827029 78826848 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 569324 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 78828890 78829127 78829009 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 567226 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 78923836 78924098 78923933 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 472255 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 79006844 79007202 79006984 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 389151 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 79346819 79347304 79347005 Y KCNMA1 KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 49049 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 79382631 79383090 79382827 Y NA KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 13263 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 79526031 79526385 79526077 Y NA NA KCNMA1,POLR3A,DLG5 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMA1 129678 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 79731077 79731252 79731165 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 46699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 80737664 80737999 80737882 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 88793 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr10 81009590 81010024 81009644 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 95201 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 81028676 81029041 81028720 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76184 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 81030195 81030403 81030359 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 74822 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 81077317 81078576 81077648 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 26649 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 81159335 81159579 81159503 Y ZCCHC24 ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 43804 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 82207287 82207512 82207367 Y NA FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 4410 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 82215085 82215437 82215324 Y TSPAN14,SH2D4B FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 3163 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 82258642 82258780 82258737 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 46720 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 82415742 82416112 82416077 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN14 203820 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 87752944 87753321 87753210 Y NA NA NA NA NA NA GRID1 370929 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr10 90923331 90923726 90923650 Y ANKRD22,FAS,IFIT5,IFIT3,IFIT3,IFIT2,IFIT1 NA CH25H IMR90 Hi-C 24141950 IFIT2 135986 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 93254153 93254526 93254340 Y NA NA NA NA NA NA HECTD2 86057 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 94195534 94195885 94195710 Y NA NA NA NA NA NA IDE 135948 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr10 95035130 95035576 95035308 Y NA NA NA NA NA NA XRCC6P1 67746 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr10 97020432 97020603 97020519 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 28178 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 97024100 97024800 97024493 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 23981 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 97809134 97809259 97809196 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 7983 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 98308552 98308827 98308687 Y LCOR,C10orf12,ZNF518A,PIK3AP1,TM9SF3 TM9SF3 NA NA NA NA TM9SF3 36382 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 101677861 101678026 101677917 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 89650 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 101780024 101780319 101780173 Y CUTC,WNT8B DNMBP DNMBP MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMBP 12348 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 102284617 102284981 102284927 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1848 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 219421 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 109306918 109307188 109307036 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 2374123 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 112168008 112168205 112168118 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 87391 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 112674359 112675211 112674854 Y NA PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 1821 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 114148894 114149633 114149365 Y VTI1A,ACSL5,ACSL5 ACSL5 NA NA NA NA ACSL5 17118 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 114718173 114718547 114718195 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 10164 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 114823862 114824125 114823994 Y HABP2 NA NA NA NA NA TCF7L2 115853 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr10 119028396 119028853 119028412 Y SLC18A2 NA NA NA NA NA PDZD8 104125 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 125754916 125755682 125755196 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 95524 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 126445536 126445891 126445571 Y ZRANB1 FAM53B,METTL10,FAM175B NA NA NA NA FAM53B 14698 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 126749212 126749581 126749525 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98158 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 127574091 127574564 127574346 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 2683 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 127576777 127576887 127576832 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 360 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 127583558 127583978 127583747 Y MMP21 RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 450 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 127858962 127859176 127859085 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 275854 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 129742865 129742981 129742943 Y NPS NA NA NA NA NA MKI67 179668 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 C10orf91 NA NA NA NA C10orf91 4510 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr11 368352 368730 368427 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR NA NA NA NA B4GALNT4 556 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 749835 750077 749967 Y IFITM2,IRF7,IRF7,TMEM80,DEAF1,TALDO1 DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5,SLC25A22 NA NA NA NA TALDO1 4506 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr11 1409546 1409852 1409608 Y KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3 BRSK2 NA NA NA NA BRSK2 417 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 1768025 1768222 1768084 Y IFITM10 RP11-295K3.1,CTSD NA NA NA NA RP11-295K3.1 10059 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 2951529 2951649 2951619 Y KCNQ1,PHLDA2 CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 2844 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 10003812 10004242 10004040 Y ADM NA NA NA NA NA SBF2 309512 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 10388178 10388602 10388329 Y ADM NA SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 AMPD3 60318 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 12199343 12199732 12199431 Y NA NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 85800 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 13238046 13238305 13238120 Y NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 57894 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 13283262 13283494 13283392 Y NA ARNTL ARNTL IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 12705 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 17230717 17231092 17230803 Y NA PIK3C2A,NUCB2 NA NA NA NA NUCB2 3017 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 18404883 18405218 18405078 Y LDHA LDHA,AC084117.3,LDHC NA NA NA NA LDHA 8717 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 24953714 24954095 24953889 Y NA NA NA NA NA NA SVIP 2103869 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 27140468 27140646 27140558 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 242769 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 27682701 27682852 27682777 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58753 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 27683148 27683223 27683174 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58382 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 27955713 27956134 27955920 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45133 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 53999 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr11 28857853 28858464 28857991 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 135691 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 29330322 29330692 29330507 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 608160 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 33394151 33394320 33394196 Y C11orf41 NA NA NA NA NA HIPK3 117933 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 105728 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52906 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr11 35165614 35166208 35165794 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 7197 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 35188303 35189153 35188420 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 29886 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 35840381 35840713 35840619 Y NA NA NA NA NA NA LDLRAD3 122818 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 35986660 35987036 35986965 Y NA LDLRAD3 NA NA NA NA LDLRAD3 23129 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 36132577 36133046 36132774 Y NA NA NA NA NA NA LDLRAD3 169046 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 36705519 36705671 36705593 Y RAG1,RAG2 NA NA NA NA NA C11orf74 91468 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 43955473 43955506 43955502 Y NA C11orf96 NA NA NA NA C11orf96 10581 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 45166793 45166902 45166852 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 195953 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 231118 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ NA PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZ 93222 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 46706691 46706778 46706735 Y NA ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ARHGAP1 13387 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 48028604 48028990 48028813 Y CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 28491 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr11 57713900 57713912 57713908 Y UBE2L6,OR9I1,OR5B17,OR1S1,OR10Q1,OR5B3,OR5B2,OR5B12,OR1S2,OR10W1,OR9Q2,OR9Q1,OR6Q1 NA NA NA NA NA CTNND1 195185 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA ZFP91 3013 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 61270255 61270376 61270301 Y NA LRRC10B NA NA NA NA LRRC10B 3896 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 61764548 61764590 61764569 Y NA FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,C11orf9,FEN1,C11orf10,FADS3,RAB3IL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 31416 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA AHNAK 9310 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 63337722 63338129 63338119 Y NA RARRES3,PLA2G16 NA NA NA NA RARRES3 35441 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 64102702 64102834 64102750 Y NA ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA PRDX5 19142 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 65151984 65152145 65152131 Y NA NEAT1 NA NA NA NA FRMD8 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr11 65259637 65259913 65259840 Y SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3320 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 20.3679621370205 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.18249408390946 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 8.91098343494649 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 67146992 67147327 67147282 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 7937 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 69794643 69794820 69794756 Y FADD,ANO1 NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 FADD 252449 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 70005779 70006157 70005922 Y ANO1,CTTN,PPFIA1,FADD FADD NA NA NA NA FADD 41112 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 70150439 70150493 70150466 Y NA PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 35633 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 73731710 73731974 73731870 Y NA UCP2 NA NA NA NA UCP2 39358 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 73860209 73860535 73860372 Y C2CD3 PPME1,C2CD3 NA NA NA NA PPME1 19609 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr11 75538796 75538953 75538875 Y NA UVRAG NA NA NA NA UVRAG 14584 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 76480789 76480971 76480905 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 3522 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 77696711 77696891 77696801 Y NA INTS4 C11orf67,RSF1 IMR90 Hi-C 24141950 INTS4 6833 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 85463912 85464270 85464111 Y CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2 NA CCDC89 IMR90 Hi-C 24141950 SYTL2 55914 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 86355497 86355659 86355578 Y NA ME3 NA NA NA NA ME3 26019 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 86454778 86455149 86454967 Y PRSS23 PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 44952 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 87133739 87133898 87133788 Y NA NA GRM5,FZD4,LOC100506368 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 386853 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 88087400 88087583 88087522 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 18445 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 102283995 102284326 102284226 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 NA BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 54789 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 103742967 103742991 103742981 Y NA NA NA NA NA NA PDGFD 290116 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 115825408 115825633 115825521 Y CADM1 NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 451733 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 1969 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 119465443 119465711 119465599 Y CBL NA LOC100499227,USP2,PVRL1,TRIM29,GRIK4 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 132083 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 122052220 122052515 122052369 Y NA MIRLET7A2 NA NA NA NA MIRLET7A2 36919 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 122608190 122608588 122608260 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 83807 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 123353850 123354009 123353930 Y NA LINC01059 CLMP IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 30744 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr11 123394284 123394590 123394437 Y NA NA NA NA NA NA LINC01059 71178 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 123397233 123397392 123397331 Y SCN3B,GRAMD1B NA NA NA NA NA LINC01059 74127 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 123468998 123469339 123469251 Y NA NA NA NA NA NA SCN3B 54613 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 125937888 125938141 125938004 Y NA CDON NA NA NA NA CDON 6658 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr11 126191145 126191518 126191332 Y NA TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 18932 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 128149754 128150077 128149906 Y NA NA KCNJ1,FLI1,ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 305376 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 128318387 128318699 128318622 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 136754 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 128339730 128340284 128340256 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 115169 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 128388897 128389626 128389454 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 65827 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 128588753 128589006 128588882 Y FLI1,FLI1,KCNJ5 FLI1 NA NA NA NA FLI1 34323 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 128590332 128590660 128590581 Y ETS1,FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 35902 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 129508234 129508346 129508288 Y NA NA BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 NFRKB 255139 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr11 129781322 129781453 129781412 Y APLP2 NFRKB NA NA NA NA NFRKB 17837 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr12 4120809 4121079 4120983 Y NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf5 307292 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 7100414 7100432 7100423 Y NA EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 6063 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 9855016 9855380 9855049 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2B,CLECL1,CD69 NA NA NA NA NA CLEC2B 165355 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 10515405 10515669 10515567 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 152348 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 11736764 11737137 11736922 Y TAS2R42 NA NA NA NA NA ETV6 63651 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 11828862 11829235 11828994 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 28074 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 11908291 11908514 11908403 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 107503 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 12111679 12111898 12111693 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 150199 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 12504083 12504386 12504252 Y BCL2L14,MANSC1 MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 NA NA NA NA MANSC1 2608 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 13357534 13357828 13357577 Y NA EMP1 NA NA NA NA EMP1 9884 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 13359236 13359687 13359415 Y EMP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 11586 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 16698348 16698413 16698381 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 200272 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 24753550 24753706 24753667 Y BCAT1 RP11-444D3.1 SOX5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-444D3.1 40026 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 24990714 24991079 24990897 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 109314 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 25537800 25538060 25537930 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 135930 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr12 26142824 26143171 26142998 Y NA RASSF8,RASSF8-AS1 NA NA NA NA RASSF8-AS1 32126 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 26522536 26522924 26522687 Y ITPR2 NA NA NA NA NA RP11-283G6.5 51883 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 26538001 26538320 26538173 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.5 67348 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 26805266 26805775 26805502 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 178356 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 27484254 27484540 27484416 Y FGFR1OP2,STK38L ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 467 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 27513734 27513812 27513790 Y NA ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 29947 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 27565982 27566076 27566029 Y ARNTL2 NA NA NA NA NA ARNTL2 82195 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 27613510 27613909 27613776 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 60455 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr12 27678028 27678417 27678221 Y C12orf71 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 3664 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr12 29317763 29317994 29317897 Y NA FAR2 NA NA NA NA FAR2 17727 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 29408184 29408368 29408281 Y NA NA NA NA NA NA FAR2 108148 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 29487594 29487680 29487637 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 44442 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 29489399 29489493 29489486 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 42629 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 30949517 30949896 30949519 Y CAPRIN2 CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 3540 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 31469690 31470116 31469962 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 7876 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 32380941 32381343 32381040 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 123172 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 33072560 33072656 33072597 Y PKP2 PKP2 NA NA NA NA PKP2 24786 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 39816699 39816988 39816844 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 18204 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 40610826 40611008 40610899 Y LRRK2 NA NA NA NA NA SLC2A13 112935 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 42470575 42470704 42470641 Y NA NA NA NA NA NA GXYLT1 65977 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 44936022 44936417 44936038 Y NELL2,NELL2,NELL2 NA NA NA NA NA ANO6 671353 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 45654086 45654401 45654190 Y NA ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 46262 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 46609835 46610258 46610179 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 51542 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr12 46797992 46798094 46798088 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 22530 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 46825426 46825886 46825665 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 49964 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 46848355 46848425 46848370 Y NA NA SLC38A2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-96H19.1 72893 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.18249408390946 chr12 46947043 46947401 46947166 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 171581 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 46951455 46951753 46951519 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 175993 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 46956686 46956942 46956800 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 181224 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 47033293 47033660 47033445 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 257831 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 7.00148698460081 chr12 47608427 47608826 47608720 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 136693 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 47701468 47701752 47701723 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 229734 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 48431282 48431505 48431439 Y NA NA NA NA NA NA PFKM 65417 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 50019907 50020190 50020017 Y NA NA NA NA NA NA PRPF40B 59906 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 50092156 50092464 50092310 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 7044 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 50899744 50900179 50899947 Y DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 2976 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 51787794 51788248 51788116 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6 SLC4A8,GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 3143 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 52438176 52438423 52438378 Y NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 22607 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 52525424 52525587 52525584 Y NA NA NA NA NA NA KRT80 58197 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7 NA NA NA NA KRT7 49739 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 54563652 54563918 54563802 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 16860 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 54746696 54746816 54746742 Y NA NA NA NA NA NA COPZ1 53710 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 56294124 56294208 56294164 Y NA DGKA,WIBG NA NA NA NA DGKA 24895 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 5.41023994264608 chr12 62609319 62609899 62609601 Y C12orf61,USP15 USP15 NA NA NA NA USP15 42220 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 63067118 63067447 63067283 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 71652 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 63179567 63180349 63179723 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 146468 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 64349679 64350074 64349795 Y TBK1 NA NA NA NA NA SRGAP1 113606 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 64482177 64482504 64482346 Y SRGAP1,TBK1,C12orf66 NA NA NA NA NA C12orf66 131572 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 65077868 65077886 65077879 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA GNS 73341 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 65262498 65262651 65262575 Y NA NA NA NA NA NA GNS 111271 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 66008791 66009141 66009009 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 14142 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 66048868 66049228 66049091 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 54219 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 66136008 66136292 66136116 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 79619 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 66159144 66159329 66159237 Y NA NA NA NA NA NA HMGA2 56582 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 66237933 66238219 66238043 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA RPSAP52 19179 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 66242690 66243107 66242729 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA RPSAP52 23936 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 66285844 66286273 66285967 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RP11-366L20.3 53986 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 66311039 66311339 66311117 Y HMGA2 RP11-366L20.3 NA NA NA NA RP11-366L20.3 28920 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB NA NA NA NA NA HELB 65035 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 70626158 70626373 70626266 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 8401 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 70633612 70633702 70633681 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 1072 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 72691947 72692219 72692098 Y TPH2,TRHDE NA NA NA NA NA TRHDE 212901 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 76338350 76338647 76338468 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PHLDA1 87065 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 53585 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr12 77060081 77060100 77060091 Y NA NA E2F7,ZDHHC17 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC17 95268 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 79279208 79279511 79279476 Y NA SYT1 NA NA NA NA SYT1 23435 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 79323956 79323978 79323967 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 68183 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 79566745 79567141 79566931 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 310972 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 79608943 79609085 79609014 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 353170 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 83183951 83184023 83183988 Y NA NA NA NA NA NA TMTC2 105292 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 88527986 88528043 88528042 Y NA CEP290,TMTC3 NA NA NA NA CEP290 5950 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 89727563 89727887 89727725 Y ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 17161 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 89740427 89740813 89740638 Y POC1B,ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 4235 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 90484866 90485476 90485213 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 383789 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 94681590 94681805 94681698 Y NA NA NA NA NA NA RBMS2P1 134940 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 95037595 95038737 95038539 Y PLXNC1,TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 3601 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 95508307 95508578 95508443 Y NA NR2C1 NA NA NA NA NR2C1 42828 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 95594660 95595399 95595279 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 13859 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 96027120 96027372 96027186 Y LTA4H NA NTN4 IMR90 Hi-C 24141950 USP44 83854 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 96634891 96635110 96635001 Y CDK17 ELK3 NA NA NA NA ELK3 48731 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 96635574 96636027 96635766 Y CDK17 ELK3 NA NA NA NA ELK3 49414 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 96648142 96648594 96648361 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 61982 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 101692271 101692665 101692300 Y NA UTP20 NA NA NA NA UTP20 20384 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 107424746 107425166 107425085 Y NA MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 45802 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr12 109035890 109036155 109035901 Y NA NA NA NA NA NA ISCU 81532 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 109120887 109121218 109121134 Y NA CORO1C NA NA NA NA CORO1C 2154 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 110682622 110683080 110682796 Y ATP2A2 ATP2A2 ATP2A2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP2A2 33481 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 110694570 110694771 110694670 Y PPTC7,ARPC3 ATP2A2 ATP2A2,IFT81,ANKRD13A,GIT2,C12orf76,ANAPC7,ARPC3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2A2 21790 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr12 111847615 111848064 111847953 Y ALDH2,FAM109A,SH2B3 FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 5863 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 111867956 111868269 111868101 Y BRAP,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26204 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 111868510 111869152 111868792 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26758 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 113630509 113630869 113630677 Y NA DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA DDX54 9225 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 113741046 113741165 113741159 Y NA NA NA NA NA NA PLBD2 53206 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 117375665 117375672 117375669 Y NA FBXW8 NA NA NA NA FBXW8 28904 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 118263351 118263381 118263366 Y NA NA NA NA NA NA RFC5 186012 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 120669025 120669761 120669334 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 31813 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 121268399 121268878 121268839 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 71296 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 121471797 121472025 121471886 Y P2RX4,CAMKK2,OASL C12orf43,OASL NA NA NA NA OASL 3020 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr12 121866033 121866226 121866130 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 30189 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 122067749 122067897 122067832 Y ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA ORAI1 5294 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr12 122086492 122086728 122086610 Y KDM2B,SETD1B,ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA MORN3 21809 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 122228443 122228705 122228504 Y CAMKK2,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 10604 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.81899290069135 chr12 123131126 123131793 123131490 Y CLIP1,RSRC2,VPS37B,HCAR3,HCAR2 NA NA NA NA NA HCAR1 81597 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 123582236 123582631 123582307 Y SNRNP35 PITPNM2 NA NA NA NA PITPNM2 49931 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 22142 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr12 132970087 132970237 132970177 Y CHFR,ANKLE2,FBRSL1 NA GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL IMR90 Hi-C 24141950 FBRSL1 93900 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 22000564 22000681 22000573 Y NA ZDHHC20 NA NA NA NA ZDHHC20 30828 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 22107257 22107449 22107379 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 75748 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 24722927 24723324 24723037 Y NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIPEP 261369 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 26948386 26948578 26948482 Y NA NA NA NA NA NA CDK8 122110 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 27706563 27707017 27706898 Y NA USP12 NA NA NA NA USP12 37016 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 28006253 28006341 28006297 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 9572 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 29148829 29149214 29148994 Y POMP EIF4A1P7 FLT1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A1P7 21756 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr13 29271220 29271413 29271304 Y NA POMP,SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 19694 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 29290769 29291025 29290846 Y POMP SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 82 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr13 29291126 29291443 29291386 Y SLC46A3 SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 19 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr13 31371316 31371638 31371482 Y NA NA ALOX5AP,USPL1,KATNAL1,HMGB1,UBL3,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALOX5AP 63671 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5AP 175921 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr13 33870395 33870537 33870466 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 52230 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 34304425 34304581 34304508 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 85605 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 34527456 34527530 34527492 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 137270 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 36872739 36873168 36872839 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2 NA NA NA NA CCDC169-SOHLH2,SOHLH2 2760 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 38874589 38874762 38874676 Y NA UFM1 NA NA NA NA UFM1 47224 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 41560539 41560879 41560717 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1P3 66629 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 42219317 42219744 42219583 Y NAA16,C13orf15 NA NA NA NA NA NAA16 335976 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr13 43662550 43662935 43662749 Y EPSTI1 NA NA NA NA NA DNAJC15 67211 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr13 44237239 44237376 44237308 Y ENOX1,ENOX1 NA NA NA NA NA ENOX1 121668 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 48464437 48464519 48464469 Y NA NA HTR2A IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L4P3 128842 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 50602874 50603059 50603020 Y NA TRIM13 NA NA NA NA TRIM13 34850 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 50857956 50857973 50857965 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 75926 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 51176389 51176436 51176413 Y NA NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 242490 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 58992699 58992709 58992704 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 1743412 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 60570337 60570455 60570340 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 165666 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 67461334 67461726 67461614 Y PCDH9 NA NA NA NA NA PCDH9 340742 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 NA NA NA NA NA H3F3BP1 172579 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 72996613 72996915 72996766 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 278916 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 88259012 88259340 88259160 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1887389 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 95889051 95889313 95889178 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 62374 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 97877294 97877762 97877400 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 5606 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 99033515 99033578 99033537 Y NA NA NA NA NA NA STK24 194616 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 99123285 99123381 99123333 Y NA NA NA NA NA NA STK24 104813 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 99128143 99128552 99128498 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99642 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr13 99128638 99129073 99128919 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99121 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr13 99955691 99955924 99955808 Y GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 104663 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 100008214 100008389 100008314 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 143282 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 103557671 103557972 103557679 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 62477 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 205742 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr13 108520131 108520835 108520801 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3048 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr13 110780432 110780795 110780703 Y NA NA NA NA NA NA COL4A2 175364 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 110850022 110850027 110850025 Y NA NA NA NA NA NA COL4A2 106132 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 111526935 111527249 111527195 Y RAB20 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA LINC00346 6773 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 111719893 111720066 111720029 Y NA ARHGEF7 ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF7 44840 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 113514166 113514374 113514224 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 171523 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 113926958 113927400 113927109 Y NA LAMP1 NA NA NA NA LAMP1 22156 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 114065698 114065892 114065794 Y MCF2L,ADPRHL1 GRTP1 NA NA NA NA GRTP1 49252 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 114127046 114127213 114127130 Y GRTP1,DCUN1D2 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 16054 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 114770181 114770639 114770503 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 125447 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 114809032 114809271 114809129 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 86815 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 114810103 114810577 114810313 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 85509 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 114834440 114834743 114834634 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 61343 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr13 114864762 114865011 114864824 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 31075 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr13 114890433 114890784 114890662 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 5302 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5 NA NA NA NA LRP10 19383 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 24016944 24017157 24017064 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2 NA NA NA NA THTPA 6059 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 29706068 29706381 29706228 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 748952 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr14 33433361 33433472 33433420 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 481355 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 35090811 35090907 35090859 Y NA SNX6 NA NA NA NA SNX6 6482 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 35767605 35767844 35767749 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6 PSMA6 NA NA NA NA PSMA6 21766 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 39954969 39955272 39955039 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 55265 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 42075138 42075996 42075609 Y LRFN5 NA NA NA NA NA FBXO33 2175434 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr14 45714299 45714525 45714379 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 6218 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 46620797 46620809 46620803 Y NA NA NA NA NA NA MIS18BP1 900054 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 50090977 50091033 50091007 Y METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2 RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2 NA NA NA NA MGAT2 5488 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D C14orf182 NA NA NA NA C14orf182 3392 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr14 50526790 50527127 50527082 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA ARF6,C14orf182 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf182 54552 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 51144322 51144826 51144405 Y NA SAV1 ATL1,SAV1,NIN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAV1 11273 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 51367871 51368235 51368053 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 41219 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 51865642 51865984 51865869 Y FRMD6 NA LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 87834 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 50409 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 52622606 52622722 52622664 Y NA NA C14orf166,NID2,PTGDR IMR90 Hi-C 24141950 NID2 88894 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 53399403 53399746 53399574 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 17407 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 55035984 55036343 55036300 Y SAMD4A SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 4169 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr14 55584452 55585250 55584591 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 3578 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 55765939 55766288 55766115 Y GCH1 FBXO34 NA NA NA NA FBXO34 29918 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 57343255 57343511 57343375 Y OTX2,OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 390215 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 57456926 57457040 57456983 Y NA NA NA NA NA NA EXOC5 276686 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 57459148 57459304 57459264 Y NA NA NA NA NA NA EXOC5 274422 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr14 60618583 60618767 60618659 Y PPM1A,C14orf135,DHRS7 DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 15807 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 61188145 61188381 61188263 Y NA SIX4,MNAT1 NA NA NA NA SIX4 685 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 61654939 61655124 61655060 Y NA PRKCH SLC38A6,SIX4,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 2662 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 61993253 61993443 61993274 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 166788 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 63829601 63829975 63829789 Y WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA RHOJ 160769 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 63894419 63894585 63894502 Y PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 113507 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 68555905 68556402 68556038 Y PIGH NA NA NA NA NA RAD51B 271409 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 68607037 68607479 68607161 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 279434 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 68658646 68658820 68658748 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 228093 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 68973571 68973743 68973640 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 86658 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 69014304 69014714 69014453 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 127391 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 69047219 69047274 69047247 Y ZFP36L1 NA NA NA NA NA PPIAP6 160306 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 69053850 69054170 69053954 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 166937 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 69076965 69077322 69077310 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 183868 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 69301401 69301774 69301727 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 40211 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 69400981 69401191 69401073 Y ZFP36L1,DCAF5 ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 42966 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 69417780 69418181 69417964 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 25976 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr14 69851262 69851639 69851451 Y NA SLC39A9,ERH NA NA NA NA SLC39A9 11093 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 70251545 70251918 70251732 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 59928 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 71870372 71870659 71870456 Y PCNX,SIPA1L1 NA NA NA NA NA SIPA1L1 85206 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 73585185 73585324 73585255 Y NA PSEN1 NA NA NA NA PSEN1 15802 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 74208106 74208498 74208298 Y C14orf43 PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA PNMA1 28978 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 74252099 74252503 74252342 Y NA RP5-1021I20.1,RP5-1021I20.2 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 36 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 75033495 75033781 75033700 Y NA CTD-2207P18.2 NA NA NA NA CTD-2207P18.2 47569 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 75038441 75039020 75038725 Y NPC2,DLST CTD-2207P18.2 NA NA NA NA CTD-2207P18.2 42330 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 75084188 75084360 75084254 Y PGF,EIF2B2 CTD-2207P18.2 LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTD-2207P18.2 2838 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 75087327 75087770 75087539 Y PGF,EIF2B2,LTBP2 CTD-2207P18.2 YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2207P18.2 5977 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 75592667 75593037 75593004 Y NA RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NA NA NA NA NEK9 620 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 76234838 76235006 76234846 Y NA NA TGFB3,IFT43 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf1 109306 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 76343734 76343966 76343850 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 22513 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA IFT43 147497 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr14 79485942 79486245 79486016 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1221516 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr14 85398952 85399308 85399126 Y NA NA NA NA NA NA GALC 3058701 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 201352 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 90049518 90049848 90049714 Y TDP1,FOXN3 FOXN3 NA NA NA NA FOXN3 33645 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 90765988 90766106 90766043 Y KCNK13 PSMC1 NA NA NA NA PSMC1 45149 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 91393752 91394149 91393951 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 112929 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 91454457 91454803 91454684 Y NA NA NA NA NA NA C14orf159 69874 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 94811760 94811889 94811825 Y NA SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA1 43141 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 95064751 95064770 95064761 Y SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA12,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3 SERPINA3 NA NA NA NA SERPINA3 11944 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 95610253 95610413 95610333 Y CLMN,DICER1,DICER1 DICER1 NA NA NA NA DICER1 11934 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 95691488 95691499 95691495 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 69141 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 95734707 95735043 95734878 Y NA CLMN NA NA NA NA CLMN 49200 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 101155057 101155401 101155388 Y NA NA NA NA NA NA WARS 313915 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 101159258 101159870 101159708 Y NA NA NA NA NA NA WARS 318116 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr14 102089844 102089938 102089891 Y NA NA MEG8,LINC00523,MIR381,MIR376C,MIR654,MIR1185-1,MIR539,MIR376B,MIR495,MIR889,MIR1185-2,MIR300,MIR376A2,MIR376A1,MIR655,MIR487B IMR90 Hi-C 24141950 DIO3OS 65076 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 102188292 102188876 102188640 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C RP11-1029J19.5,PPP2R5C LINC00239 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-1029J19.5 6569 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.86424467551851 chr14 102415545 102415736 102415629 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13129 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 103266656 103267057 103266785 Y NA TRAF3 CDC42BPB,AMN IMR90 Hi-C 24141950 TRAF3 24843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 528 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 105438668 105438757 105438725 Y KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA AHNAK2 3937 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr14 105491233 105491512 105491453 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 5748 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr14 105546439 105546836 105546640 Y NA NA BTBD6,BRF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA4 60954 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 27143884 27143956 27143920 Y NA GABRB3 NA NA NA NA GABRB3 38730 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 31591006 31591060 31591034 Y KLF13 KLF13 OTUD7A,KLF13,LOC283710,MTMR10,TRPM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 25998 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 31598782 31598890 31598869 Y NA KLF13 OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 18168 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 33418806 33419006 33418854 Y NA NA FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 FMN1 65891 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 35502627 35502996 35502807 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 224139 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 36720333 36720777 36720654 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf41 149035 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 37169508 37169702 37169583 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA MEIS2 221802 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 37203314 37203431 37203373 Y NA NA NA NA NA NA MEIS2 188073 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 40393486 40393659 40393558 Y FSIP1,PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 5434 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 41233721 41234461 41233781 Y C15orf57,VPS18 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 8699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 42535686 42535733 42535710 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 27698 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 42547123 42547182 42547153 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 16249 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 43135579 43135976 43135778 Y TGM7 NA NA NA NA NA TTBK2 75031 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48,RP11-519G16.3 NA NA NA NA RP11-519G16.3 9844 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr15 45932818 45933115 45932936 Y C15orf48,PLDN,SQRDL SQRDL NA NA NA NA SQRDL 11472 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 50140337 50140734 50140509 Y FGF7,DTWD1 NA NA NA NA NA DTWD1 229160 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 52122599 52122915 52122757 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 2774 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 52369278 52369628 52369325 Y MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 GNB5,BCL2L10,MYO5C IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2184D3.1 15864 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA MYO5A,ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 55928441 55928509 55928475 Y NA PYGO1 NA NA NA NA PYGO1 49296 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 56341448 56341541 56341527 Y NA NA NEDD4 IMR90 Hi-C 24141950 NEDD4 57504 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 56940397 56940741 56940580 Y ZNF280D,TCF12 NA NA NA NA NA MNS1 185062 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 57323913 57324233 57324065 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 115092 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 57946197 57946519 57946360 Y NA NA NA NA NA NA POLR2M 63966 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 154856 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 59467276 59467383 59467330 Y ADAM10,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 71999 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 62215780 62216024 62215899 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 134648 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 62405210 62405473 62405223 Y NA C2CD4A NA NA NA NA C2CD4A 48034 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 63368396 63368491 63368444 Y NA TPM1,LACTB NA NA NA NA TPM1 35565 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 63871063 63871418 63871089 Y NA USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 20370 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA DAPK2,FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 64748954 64749303 64749001 Y PLEKHO2,SNX1 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 1638 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 64940943 64941327 64941079 Y NA NA NA NA NA NA OAZ2 52153 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 65176143 65176677 65176391 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 PLEKHO2,ANKDD1A NA NA NA NA ANKDD1A 25424 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 65841762 65842141 65841952 Y PARP16 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 21006 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 66177095 66177419 66177152 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 94464 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 66446289 66446658 66446570 Y DIS3L,DIS3L NA NA NA NA NA MEGF11 97427 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.81899290069135 chr15 67409139 67409556 67409296 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 55038 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 67426476 67426864 67426547 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 72375 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 67436996 67437215 67437119 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 82895 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 67440675 67441024 67440815 Y SMAD3 NA NA NA NA NA RPS24P16 81760 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 RPS24P16 NA NA NA NA RPS24P16 33898 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 RPS24P16 NA NA NA NA RPS24P16 32338 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 67516633 67516865 67516859 Y NA RPS24P16,IQCH,AAGAB NA NA NA NA RPS24P16 5919 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 68078361 68078371 68078366 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 245314 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 68894151 68894553 68894360 Y CORO2B,CORO2B,CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 24843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr15 71155799 71156069 71155993 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 11301 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 71408872 71409066 71408998 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 225748 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 71409431 71409745 71409525 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 226307 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 71615809 71616164 71615988 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 432685 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 71657535 71657734 71657662 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 474411 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 72617371 72617435 72617389 Y MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6 HEXA NA NA NA NA HEXA 49382 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 77710600 77710857 77710802 Y NA PEAK1 NA NA NA NA HMG20A 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 78476376 78476653 78476619 Y ACSBG1 NA NA NA NA NA CIB2 54490 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 80453068 80453275 80453180 Y BCL2A1,ZFAND6 FAH NA NA NA NA FAH 10236 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 81099060 81099288 81099113 Y NA KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 29376 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 82302959 82303245 82303102 Y NA MEX3B NA NA NA NA MEX3B 33237 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 83862328 83862648 83862488 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 12122 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 88633664 88633865 88633769 Y NA NA NA NA NA NA MRPL46 374785 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 89683953 89684135 89684061 Y ABHD2 HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 6227 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA POLG 18820 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 90005846 90006063 90005954 Y NA NA NA NA NA NA MIR9-3 96598 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 90197559 90197639 90197586 Y KIF7 KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA KIF7 877 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 90350645 90350936 90350791 Y NA ANPEP NA NA NA NA ANPEP 5697 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 90371902 90372049 90371963 Y ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2 ANPEP NA NA NA NA ANPEP 15269 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr15 92674353 92674494 92674375 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 152577 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr15 96898438 96898666 96898552 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 29848 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 99387614 99387887 99387660 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 197414 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr15 101499118 101499600 101499493 Y LRRK1 LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 41698 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr15 101783359 101783726 101783540 Y CHSY1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 6411 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ,NHLRC4 NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 1239202 1239436 1239320 Y BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H CACNA1H NA NA NA NA CACNA1H 37961 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA PRSS21,FLYWCH2 NA NA NA NA PRSS21 20597 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 3237977 3238591 3238121 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 45630 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 3285972 3286117 3286070 Y PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263 ZNF200,MEFV,ZNF263 NA NA NA NA ZNF200 1751 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 4900331 4900638 4900507 Y MGRN1,UBN1,UBN1 ROGDI,UBN1,GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 4988 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 6.68323757620986 chr16 10549193 10549271 10549232 Y EMP2 NA NA NA NA NA ATF7IP2 130902 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 11086769 11086952 11086818 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 50424 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 11644813 11645143 11645061 Y NA NA NA NA NA NA LITAF 83094 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 11764274 11764504 11764414 Y ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN NA NA NA NA SNN 4004 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 12071486 12071797 12071761 Y NA RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 2892 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 12623440 12623621 12623531 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 272253 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr16 19532119 19532450 19532314 Y CCP110 RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62 NA NA NA NA GDE1 652 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 20877631 20877934 20877768 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 31256 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 20910424 20910792 20910538 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 718 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 20913163 20913441 20913303 Y CRYM,DCUN1D3,LYRM1 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 3457 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 25103942 25104115 25104053 Y NA LCMT1 SLC5A11,ARHGAP17,LCMT1,LOC100506655 IMR90 Hi-C 24141950 LCMT1 16935 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 28103790 28104177 28103984 Y APOBR,XPO6,SBK1 NA NA NA NA NA XPO6 117064 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 28860977 28861369 28861174 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1,ATP2A1 NA NA NA NA SH2B1 5056 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr16 31223480 31223547 31223514 Y ZNF629 FUS,PYCARD NA NA NA NA PYCARD 10709 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 31888166 31888535 31888469 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5087 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 33509690 33509798 33509723 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 1626611 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr16 51670868 51671078 51670973 Y NA HNRNPA1P48 NA NA NA NA HNRNPA1P48 6589 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 53077641 53077824 53077723 Y NA CHD9 CHD9 IMR90 Hi-C 24141950 CHD9 9121 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 53134908 53135206 53135001 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 47963 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 53865846 53866045 53865946 Y NA NA NA NA NA NA FTO 129971 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 53908172 53908236 53908205 Y NA NA NA NA NA NA FTO 172297 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 53915459 53915524 53915492 Y NA NA NA NA NA NA FTO 179584 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 56352339 56352494 56352417 Y MT3,CES5A,GNAO1,BBS2 NA NA NA NA NA AMFR 104956 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 56640479 56640669 56640573 Y NA MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A NA NA NA NA MT2A 368 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 56641054 56641530 56641359 Y MT2A,MT1E MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A NA NA NA NA MT2A 943 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 57680678 57681373 57680764 Y NA GPR56,CCDC135 NA NA NA NA GPR56 38114 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 62925701 62925982 62925842 Y NA NA NA NA NA NA LINC00920 3514445 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 4.45549171747324 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 67186810 67187094 67186952 Y NA C16orf70,FBXL8,TRADD,NOL3,KIAA0895L,E2F4 NA NA NA NA FBXL8 4740 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr16 67993555 67993691 67993621 Y NA PSMB10,SLC12A4 NA NA NA NA SLC12A4 7813 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 68418958 68419037 68419019 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-30P 57526 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 69351854 69351929 69351891 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 8595 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 69751128 69751528 69751345 Y PDF,TERF2,NQO1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 7326 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 70444676 70444732 70444694 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 26408 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 72237360 72237779 72237529 Y AP1G1,ATXN1L,KIAA0174,DHX38 NA HPR,PMFBP1,LOC100506172 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 111030 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 75410566 75410863 75410755 Y BCAR1 NA NA NA NA NA CFDP1 54520 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 81514966 81515415 81515191 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 38191 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 81732062 81732263 81732080 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 38439 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 104576 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr16 81935127 81935346 81935237 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 164425 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 84177434 84177775 84177582 Y NA MBTPS1,HSDL1,TAF1C NA NA NA NA HSDL1 637 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 84784930 84785133 84785062 Y KIAA0513,COTL1 NA CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 USP10 53346 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 204800 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 85606114 85606473 85606294 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 115206 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 86229284 86229646 86229464 Y FOXF1 NA FOXF1,LOC400550,LOC146513,LOC732275,MTHFSD,COX4I1,COX4NB,IRF8 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 357195 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD,FOXC2,FOXL1 NA NA NA NA FOXL1 1525 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr16 86653031 86653193 86653112 Y NA FOXL1 FOXL1,FOXC2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 45057 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 363255 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 87889826 87890140 87890011 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 10954 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 88365536 88366092 88365805 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 151633 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 4.77374112586419 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 89382399 89382987 89382651 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11 NA NA NA NA NA ZNF778 100281 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 89388621 89389157 89388908 Y ZNF276,C16orf7 NA NA NA NA NA ZNF778 106503 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr16 89396771 89397135 89396953 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 114653 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 89474257 89474602 89474526 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 80367 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 89683162 89683271 89683207 Y DPEP1,C16orf55 CPNE7,CHMP1A NA NA NA NA CHMP1A 38982 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 1014015 1014933 1014151 Y PITPNA,CRK,ABR NA NA NA NA NA ABR 115382 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 9740 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr17 2074761 2075171 2074968 Y NA NA NA NA NA NA SRR 129506 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 2077546 2077639 2077593 Y NA NA NA NA NA NA SRR 127038 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 3699697 3700093 3699885 Y ZZEF1,ATP2A3 ITGAE,C17orf85 NA NA NA NA ITGAE 2444 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 4125491 4125809 4125534 Y NA ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39465 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 4915328 4915680 4915430 Y NA SPAG7,CAMTA2,INCA1,KIF1C NA NA NA NA KIF1C 16085 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 20328 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 18450 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 13194 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 12120 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 8436852 8437236 8437053 Y MYH10 NA NA NA NA NA MYH10 94843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 8517371 8517653 8517512 Y NA MYH10 NA NA NA NA MYH10 14426 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 8878761 8878989 8878877 Y PIK3R5,PIK3R5 NTN1 NA NA NA NA NTN1 43870 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 9258278 9258564 9258422 Y NA NA NA NA NA NA STX8 219344 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 16374519 16374788 16374546 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 18679 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr17 17484274 17484547 17484424 Y NA PEMT NA NA NA NA PEMT 8475 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 17615930 17616232 17616056 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 33143 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 17817256 17817562 17817444 Y SREBF1 NA NA NA NA NA TOM1L2 56174 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 17851403 17851564 17851499 Y NA TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 22172 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 21314266 21314623 21314560 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K3 128282 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 6.04673875942797 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 27429797 27430178 27430111 Y NA NA NA NA NA NA MYO18A 75252 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 28031718 28032050 28032008 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 83793 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 29599453 29600092 29599789 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 39038 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 29923737 29923924 29923895 Y EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 207095 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 33349623 33350064 33349994 Y SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL LIG3,CCT6B NA NA NA NA CCT6B 43526 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 34045470 34045815 34045642 Y NA NA RASL10B IMR90 Hi-C 24141950 MMP28 74896 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 34219582 34220299 34219858 Y CCL5,CCL3L3,CCL3L1,CCL4,CCL3,CCL23 CCL5,RDM1 NA NA NA NA CCL5 13785 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 35292129 35292558 35292512 Y ACACA,LHX1,AATF RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 169 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr17 35682301 35682446 35682421 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 82463 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 36480536 36480738 36480637 Y NA MRPL45,SOCS7 NA NA NA NA SOCS7 25373 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 36853458 36853679 36853598 Y NA C17orf96,MLLT6,CISD3 NA NA NA NA MLLT6 6116 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 37661852 37662117 37661985 Y STAC2,FBXL20,MED1,CDK12 CDK12 NA NA NA NA CDK12 46088 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 38085522 38085789 38085697 Y ERBB2,IKZF3,ORMDL3 ORMDL3,PSMD3 NA NA NA NA ORMDL3 3668 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 38170793 38171091 38171022 Y CSF3 PSMD3,CSF3,THRA,MED24 NA NA NA NA CSF3 1179 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 38496652 38496786 38496719 Y MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA RARA NA NA NA NA RARA 33208 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 38630978 38631299 38631288 Y NA IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA TNS4 24550 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 TNS4 IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS4 19029 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 38708057 38709216 38708396 Y KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4 NA NA NA NA NA TNS4 52208 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 41162878 41163074 41162972 Y TUBG1,CNTD1,NBR1,NBR1,ETV4 AARSD1,RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA IFI35 6136 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 41827198 41827473 41827372 Y NA DUSP3 NA NA NA NA DUSP3 26883 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 42198947 42199210 42199140 Y NA C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 4.45549171747324 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 NA NA NA NA NA GPATCH8 55222 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 43302645 43302970 43302880 Y NA FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 5834 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr17 43817871 43818233 43818138 Y NA NA NA NA NA NA CRHR1 120604 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1,TBX21 NA NA NA NA TBX21 37143 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB6 17123 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr17 47857403 47857727 47857543 Y NA KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4 FAM117A,ZNF652,KAT7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KAT7 6190 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.18249408390946 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B NA NA NA NA NA XYLT2 53639 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr17 54947312 54947763 54947640 Y SCPEP1,TRIM25 DGKE,C17orf67,TRIM25 NA NA NA NA C17orf67 33178 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 54993018 54993544 54993286 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL DGKE MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM25 3619 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 55912487 55912699 55912681 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12718 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 57048474 57048847 57048688 Y YPEL2 NA NA NA NA NA AC099850.1 133112 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 57298532 57298798 57298672 Y NA SMG8,GDPD1 NA NA NA NA GDPD1 2704 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 57698412 57698732 57698592 Y YPEL2,RNFT1,VMP1 CLTC NA NA NA NA CLTC 3193 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 8558 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 13999 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 57932982 57933345 57933242 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 16355 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 58804933 58805128 58805031 Y NA NA NA NA NA NA BCAS3 52119 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 59473194 59473360 59473229 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 1897 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 60256998 60257133 60257064 Y NA NA NA NA NA NA MED13 116355 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 60780424 60780717 60780568 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 77662 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 61323201 61323584 61323320 Y NA NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 198155 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 61451328 61451417 61451341 Y NA NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 70322 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 62409252 62409599 62409468 Y ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70591 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 62526246 62526643 62526459 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 23929 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 62703261 62703596 62703473 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 47075 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 63624560 63624814 63624604 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 561388 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 545803 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr17 64128284 64128318 64128301 Y CEP112,CEP112 NA NA NA NA NA CEP112 57884 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 65386872 65387224 65386898 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 15297 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 66419326 66419636 66419592 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 32018 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 66818173 66818316 66818245 Y NA NA ABCA8 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA8 131217 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 69617489 69617539 69617508 Y NA LOC124685 LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 LOC124685 2370 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 70403681 70403886 70403813 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 217484 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 71338137 71338558 71338458 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 31823 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 71951541 71951772 71951658 Y NA NA NA NA NA NA RPL38 245949 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 73718198 73718514 73718306 Y NA ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 2790 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.86424467551851 chr17 73860608 73860975 73860910 Y NA UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 UNC13D,UNK,WBP2 IMR90 Hi-C 24141950 WBP2 10020 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 75103651 75103906 75103737 Y JMJD6,SRSF2 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 22853 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr17 75134867 75135304 75135067 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 54069 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201013 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr17 75312591 75312808 75312697 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 231793 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238230 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238872 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 340504 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 75422359 75422648 75422577 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 341561 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 75451587 75451956 75451821 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 370789 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 75504499 75504824 75504660 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-80P 409356 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr17 76291015 76291144 76291081 Y NA NA DNAH17,CYTH1,PGS1,SOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS3 63014 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr17 76588219 76588768 76588537 Y NA NA DNAH17,CYTH1,USP36 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 187611 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 76879876 76880180 76879977 Y NA USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39289 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 77034665 77035262 77034914 Y CYTH1,USP36,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 17769 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 78087852 78088239 78088062 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA GAA 14497 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 78198081 78198434 78198366 Y NA SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA SGSH 5359 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 78524165 78524352 78524226 Y NA RPL32P31,RPTOR NA NA NA NA RPTOR 7546 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 78626044 78626134 78626054 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 109425 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 78992000 78992331 78992033 Y C17orf56 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 14617 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 79068878 79069252 79068906 Y C17orf56 NA NA NA NA NA BAIAP2 61930 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 16851 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 67100 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 80029941 80030069 80030002 Y HEXDC STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA DUS1L 8178 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 159482 159743 159659 Y CETN1 USP14 NA NA NA NA USP14 3099 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 221277 221425 221379 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 44625 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr18 830446 830703 830580 Y NA YES1 CLUL1,ENOSF1,YES1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YES1 19899 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 908602 908952 908777 Y NA NA NA NA NA NA YES1 98055 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 2302701 2302761 2302738 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 266747 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 2516331 2516615 2516492 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 52893 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 2968622 2968906 2968769 Y NA LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 42407 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 3015219 3015501 3015351 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 3906 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr18 3610673 3610894 3610785 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 201067 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr18 3625326 3625427 3625380 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 215720 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 3639477 3639730 3639610 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 229871 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 3787478 3787640 3787637 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 377872 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 5584856 5584964 5584919 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA RPL6P27 876050 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 8412266 8412506 8412385 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 194937 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr18 9101793 9102110 9101852 Y RAB12,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 NA NA NA NA NDUFV2 1165 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 9138526 9138911 9138547 Y ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 NA NA NA NA ANKRD12 4300 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 9219810 9220134 9219877 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD12 85584 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr18 11846235 11846388 11846281 Y GNAL,GNAL CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 3007 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 11859926 11860218 11860181 Y CHMP1B CHMP1B,MPPE1 NA NA NA NA CHMP1B 10531 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr18 12306995 12307375 12307158 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 1327 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr18 12317654 12318000 12317871 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 11986 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 19373794 19374099 19373861 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 90876 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 19759263 19759580 19759296 Y GATA6 GATA6 NA NA NA NA GATA6 11859 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 19774212 19774351 19774284 Y GATA6 GATA6 NA NA NA NA GATA6 26808 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 20811230 20811702 20811444 Y NPC1,C18orf8,RBBP8,RBBP8 NA NA NA NA NA CABLES1 98702 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 21165246 21165762 21165429 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 384 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 23657156 23657540 23657507 Y NA SS18 NA NA NA NA SS18 11641 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 988691 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr18 32424641 32425032 32424811 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 129860 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 33042221 33042422 33042327 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 33533 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 34258485 34258689 34258587 Y FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 148380 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 43297098 43297112 43297106 Y SLC14A2 NA NA NA NA NA EPG5 248128 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 43608916 43609273 43609243 Y PSTPIP2,EPG5 NA NA NA NA NA EPG5 63676 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr18 44372138 44372406 44372272 Y RNF165,PIAS2 NA NA NA NA NA KATNAL2 123049 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 45454827 45455289 45455128 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 226 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 45828290 45828381 45828336 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 235036 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 286345 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 NA SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTIF 438763 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 46739298 46739521 46739417 Y NA NA NA NA NA NA DYM 246196 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 47785953 47786324 47786143 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 NA NA NA NA CCDC11 4568 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 48737977 48738244 48738154 Y ME2 MEX3C MEX3C K562 ChIA-PET 22265404 MEX3C 4430 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 55880754 55881007 55880894 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171155 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 NA NA NA NA NA KIAA1468 340891 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 60941193 60941490 60941349 Y BCL2 BCL2 NA NA NA NA BCL2 43871 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 61426678 61427045 61426861 Y SERPINB8,SERPINB2 NA NA NA NA NA SERPINB2 109881 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr18 68087534 68087889 68087601 Y CD226,SOCS6 NA RTTN,SOCS6 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 133397 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 72704413 72704615 72704528 Y TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 214688 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 74745176 74745688 74745337 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 212613 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 74755425 74755811 74755618 Y MBP,MBP NA NA NA NA NA ZNF236 222862 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 74766602 74767022 74766743 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234039 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 74767033 74767545 74767189 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234470 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 74805603 74805845 74805816 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 273040 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 74815308 74815668 74815588 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 282745 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 74837664 74837983 74837939 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 305101 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 74841905 74842663 74842144 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 309342 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 76734377 76734736 76734420 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 92549 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr18 77218531 77218849 77218576 Y NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 64675 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 4137 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 751766 752111 751822 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 42964 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr19 823657 823956 823874 Y BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1 PTBP1,MIR4745,MIR3187,CFD NA NA NA NA MIR3187 12073 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 909116 909504 909461 Y STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22 MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 1736 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 1171933 1172315 1172045 Y NA STK11 NA NA NA NA SBNO2 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 1213863 1214369 1213961 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA C19orf26 21657 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr19 1942393 1942508 1942451 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3205 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 2620825 2621136 2620936 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B NA NA NA NA NA GNG7 79571 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 3154006 3154458 3154241 Y GNA15,FZR1,S1PR4 GNA15,NCLN NA NA NA NA GNA15 19815 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 3555158 3555442 3555300 Y C19orf28 HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 15333 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 4051584 4052099 4051914 Y CCDC94 PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 12844 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 4052414 4052757 4052628 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 12186 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 4059877 4060289 4060128 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 4654 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 4636294 4636441 4636384 Y ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 1089 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 4835065 4835273 4835169 Y NA FEM1A,TICAM1,PLIN3 NA NA NA NA TICAM1 5349 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 5989815 5989915 5989890 Y SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 13662 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 6076501 6076965 6076757 Y NA NA NA NA NA NA RANBP3 100348 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TUBB4A,TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 8518703 8518940 8518821 Y NA MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA HNRNPM 11052 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 NA NA NA NA NA ZNF414 97102 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 9902440 9902843 9902543 Y ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 33649 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 10766466 10766790 10766534 Y NA ILF3,QTRT1 NA NA NA NA ILF3 3529 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 11253262 11253482 11253341 Y TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 11002 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 11484314 11484469 11484411 Y ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4 CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3 NA NA NA NA SWSAP1 953 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 11804467 11804940 11804795 Y ZNF878,ZNF823,ZNF491 HNRNPA1P10,ZNF823 NA NA NA NA HNRNPA1P10 28622 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 11925678 11926080 11925867 Y NA ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439 NA NA NA NA ZNF440 2579 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 13148637 13149083 13148724 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 44215 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.86424467551851 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 13275397 13275802 13275486 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 16168 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 13324184 13324516 13324349 Y MAST1,CACNA1A NA NA NA NA NA IER2 64955 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 14414232 14414293 14414263 Y NA NA NA NA NA NA CD97 75020 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 14636614 14636887 14636775 Y OR7C2 GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA DNAJB1 1695 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 15492858 15492952 15492905 Y NA AKAP8,AKAP8L NA NA NA NA AKAP8 4249 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F12 166050 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 17246297 17246722 17246423 Y SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 61706 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,AC006539.2 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 14571 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 28217479 28217822 28217621 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1484626 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 28232492 28232748 28232631 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1469700 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 34311417 34311691 34311576 Y KCTD15 KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26579 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 34992713 34992833 34992773 Y NA WTIP NA NA NA NA WTIP 22839 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 51798 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 36449882 36450230 36450084 Y NA LRFN3,SDHAF1 NA NA NA NA LRFN3 25622 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 36519340 36519516 36519376 Y ZNF565 SDHAF1,ALKBH6,CLIP3,THAP8,WDR62 NA NA NA NA CLIP3 2729 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 38186506 38186731 38186619 Y ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573 ZFP30,ZNF607 NA NA NA NA ZFP30 5268 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 38495647 38495987 38495738 Y SPRED3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 99779 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 38807798 38808031 38807971 Y MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA KCNK6 453 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 39166302 39166492 39166383 Y LGALS7B ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 30013 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.81899290069135 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 39550329 39550402 39550365 Y EID2B,LGALS7,PAPL FBXO27 SAMD4B,FBXO27,GMFG IMR90 Hi-C 24141950 FBXO27 28904 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 41834727 41835191 41834967 Y CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 19625 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA DEDD2,ZNF526 NA NA NA NA DEDD2 29017 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr19 44066872 44067293 44067141 Y ZNF230,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ ZNF575,ETHE1,XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5 NA NA NA NA XRCC1 15332 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 44288540 44288860 44288798 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 5131 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 44749585 44749846 44749685 Y LYPD5,ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZNF229,ZFP112,ZNF227,ZNF235,ZNF233,ZNF233 ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 39885 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1 ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 163936 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 16792 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr19 47874632 47874802 47874721 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,GLTSCR1,DHX34 DHX34,MEIS3 NA NA NA NA DHX34 24094 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 47893291 47893410 47893319 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,GLTSCR1,DHX34 DHX34,MEIS3 NA NA NA NA MEIS3 27370 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 47950200 47950556 47950503 Y SLC8A2 MEIS3,KPTN NA NA NA NA MEIS3 29420 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 48151789 48152128 48151872 Y NA NA NA NA NA NA EHD2 62472 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 48596127 48596433 48596418 Y NA PLA2G4C NA NA NA NA PLA2G4C 15641 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 48625125 48625566 48625247 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA PLA2G4C 13051 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 49577003 49577438 49577313 Y SULT2B1,MAMSTR,KCNA7 SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3 NA NA NA NA SNRNP70 9238 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 49698080 49698342 49698211 Y NA TRPM4 NA NA NA NA TRPM4 39082 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 50116585 50116794 50116665 Y NA NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1 NA NA NA NA PRR12 23685 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 50141205 50141513 50141452 Y AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1 NA NA NA NA RRAS 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 50362574 50362883 50362717 Y PRRG2,MYH14,PNKP FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1 NA NA NA NA PNKP 6283 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 50414628 50414884 50414779 Y RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62 NA NA NA NA ATF5 15075 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 47334 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 121505 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 52320046 52320281 52320149 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3 NA NA NA NA NA ZNF649 86012 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 52323338 52323678 52323420 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3 NA NA NA NA NA ZNF649 82615 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr19 54411435 54411746 54411498 Y MYADM,PRKCG,CACNG8,CACNG7 MYADM,PRKCG,CACNG7 NA NA NA NA CACNG7 846 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 54538982 54539278 54539125 Y NA NA NA NA NA NA OSCAR 64722 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr2 1725053 1725311 1725239 Y NA NA NA NA NA NA SNTG2 780499 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 9374844 9375591 9375054 Y YWHAQ,ASAP2 ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 29950 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr2 9411571 9411694 9411610 Y ADAM17 NA NA NA NA NA ASAP2 66677 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 9893339 9893657 9893442 Y ADAM17,KLF11,KLF11 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 87826 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 9941222 9941554 9941329 Y ADAM17,KLF11,KLF11 TAF1B YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 39929 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 10423423 10423670 10423576 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 17345 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 10441145 10441558 10441458 Y KLF11 HPCAL1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 HPCAL1 130 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 11343595 11343995 11343855 Y E2F6 NA NA NA NA NA PQLC3 50271 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 11483029 11483376 11483266 Y NA ROCK2 NA NA NA NA ROCK2 3080 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 11560928 11560984 11560935 Y NA E2F6 NA NA NA NA E2F6 43313 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 19547126 19547267 19547173 Y NA OSR1 NA NA NA NA OSR1 9147 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 20431248 20431615 20431535 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 8054 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 20435780 20436055 20435965 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 12586 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 20624612 20624982 20624777 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 19853 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 20793103 20793496 20793437 Y APOB NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 55353 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 20795868 20796230 20795893 Y RHOB,HS1BP3 NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 52619 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 20849276 20849608 20849479 Y NA HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 427 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 24213695 24213947 24213707 Y NA NA NA NA NA NA C2orf44 56498 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 24491972 24492409 24492370 Y NA NA NA NA NA NA ITSN2 89174 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 25781272 25781487 25781393 Y RAB10 NA NA NA NA NA DTNB 113016 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 26220678 26220902 26220866 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF3C 17060 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 26946934 26947339 26946998 Y C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18 AC015977.5,KCNK3,CENPA NA NA NA NA KCNK3 33315 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 27432989 27433207 27433072 Y NA SLC5A6,CAD NA NA NA NA SLC5A6 619 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 27629706 27629770 27629738 Y NA EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA PPM1G 784 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 28085867 28086253 28086060 Y NA BRE,RBKS NA NA NA NA BRE 24555 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 28519223 28519459 28519305 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 93856 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 28668874 28669088 28668964 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA BRE,RBKS,PLB1 IMR90 Hi-C 24141950 AC104695.3 53335 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 29009696 29009902 29009742 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB NA NA NA NA PPP1CB 37190 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 30791728 30792075 30791902 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 123636 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 33463216 33463618 33463322 Y RASGRP3 NA NA NA NA NA LTBP1 293177 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 36795570 36795942 36795825 Y FEZ2 NA NA NA NA NA FEZ2 75288 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 37139828 37140219 37140054 Y NA NA NA NA NA NA STRN 51396 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 37788822 37789049 37788928 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 174562 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 37789550 37789826 37789587 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 173785 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 37858321 37858709 37858681 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 104902 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 37875700 37876061 37875917 Y EIF2AK2,QPCT,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 87550 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 37879485 37879782 37879514 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 83829 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 38422036 38422352 38422194 Y FAM82A1,CYP1B1 RPL7P12 NA NA NA NA RPL7P12 34358 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 38552581 38552739 38552658 Y NA ATL2 NA NA NA NA ATL2 49688 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 43038629 43038924 43038876 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 280047 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 44398343 44398537 44398440 Y NA PPM1B NA NA NA NA PPM1B 5235 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 44518633 44519032 44518761 Y NA NA NA NA NA NA PREPL 67969 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 45164818 45165169 45165126 Y NA RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 480 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 46294979 46295300 46295093 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 223506 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr2 47109327 47109734 47109459 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 TTC7A NA NA NA NA TTC7A 31562 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 50378862 50379239 50379186 Y NA NA NA NA NA NA STON1 1624340 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 52785437 52785822 52785630 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1207107 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 54022416 54022710 54022562 Y NA CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 10235 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr2 54800045 54800558 54800206 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 118623 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 54816609 54817000 54816923 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA EML6 131636 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 55248216 55248544 55248355 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 89213 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 55320625 55320761 55320684 Y RTN4 RTN4 C2orf63,EML6,RTN4 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 16996 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 55327095 55327368 55327210 Y RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 10389 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 55379709 55379882 55379800 Y SMEK2,RTN4 RTN4 NA NA NA NA RTN4 41952 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 56267618 56267636 56267627 Y NA NA NA NA NA NA AC007743.1 143269 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 61165363 61165465 61165452 Y NA RNU4-51P NA NA NA NA RNU4-51P 28925 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 63514058 63514136 63514097 Y WDPCP NA NA NA NA NA OTX1 238866 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 64175541 64175571 64175556 Y NA NA NA NA NA NA VPS54 68635 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 64756167 64756526 64756224 Y NA AFTPH NA NA NA NA AFTPH 6702 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 65782552 65782570 65782560 Y NA NA SPRED2,ACTR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRED2 124781 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 66673073 66673647 66673570 Y NA MEIS1-AS3 NA NA NA NA MEIS1-AS3 14471 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 68544914 68545935 68545552 Y CNRIP1 NA NA NA NA NA CNRIP1 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 69062805 69062948 69062879 Y PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ANTXR1 175362 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 69717115 69717269 69717170 Y NA NA NA NA NA NA NFU1 54355 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 70144957 70145388 70145176 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22137 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 70285414 70285703 70285559 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA PCBP1 26882 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 70294861 70295138 70295000 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA PCBP1 17447 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 71129017 71129173 71129049 Y NA VAX2 NA NA NA NA VAX2 3297 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 71679813 71679928 71679869 Y NAGK,ZNF638,DYSF DYSF NA NA NA NA DYSF 961 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 71831880 71832245 71832063 Y NA NA NA NA NA NA DYSF 153028 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 72255008 72255182 72255094 Y NA NA DYSF IMR90 Hi-C 24141950 DYSF 576156 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 72426245 72426403 72426323 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 624767 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 85982713 85983043 85983025 Y NA RNU1-38P NA NA NA NA RNU1-38P 29253 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 86113603 86114063 86113862 Y CAPG,GNLY,ST3GAL5 ST3GAL5 LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 74 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 86120990 86121249 86121122 Y NA ST3GAL5 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 6853 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 86121717 86122002 86121863 Y NA ST3GAL5 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 7580 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826510 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 92317324 92317742 92317530 Y NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 AC097374.3 3246664 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 95925847 95925871 95925861 Y NA NA PROM2 IMR90 Hi-C 24141950 AC092835.2 54564 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 97155482 97155685 97155564 Y DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A NEURL3,ARID5A NA NA NA NA NEURL3 16161 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA RNU4-8P 88784 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 100287433 100287833 100287631 Y NA NA NA NA NA NA REV1 182936 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 100484034 100484497 100484368 Y NA NA NA NA NA NA REV1 379537 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr2 101435496 101435968 101435616 Y NPAS2 NPAS2 NA NA NA NA NPAS2 882 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 102492851 102493221 102493042 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 181539 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 105676474 105676490 105676482 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 24033 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 110871797 110872011 110872000 Y MALL MALL NA NA NA NA MALL 132 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr2 111829364 111829577 111829485 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 45378 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 113657771 113658101 113657937 Y NA NA CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 65291 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 RABL2A 299991 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 122226715 122226882 122226860 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC 59575 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 124260647 124260891 124260797 Y NA NA NA NA NA NA TSN 1767968 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 127915404 127915435 127915422 Y NA NA CYP27C1,BIN1,MAP3K2 IMR90 Hi-C 24141950 BIN1 52473 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 128266210 128266439 128266348 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L,IWS1 RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 16023 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 128617356 128617514 128617464 Y NA POLR2D NA NA NA NA POLR2D 3625 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 363500 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA LYPD1 NA NA NA NA LYPD1 6563 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 137084668 137085432 137085239 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 210933 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 138909425 138909801 138909599 Y NA NA NA NA NA NA HNMT 189835 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 139112246 139112514 139112380 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 144754 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 142222584 142223129 142223081 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 664141 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 143630782 143631707 143631171 Y KYNU KYNU NA NA NA NA KYNU 1360 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 144769205 144769351 144769311 Y GTDC1,GTDC1 NA NA NA NA NA GTDC1 318784 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 148671388 148671433 148671412 Y ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4 NA NA NA NA NA ACVR2A 71302 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 149925246 149925613 149925433 Y NA NA NA NA NA NA LYPD6 258886 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr2 152789657 152790028 152790018 Y FMNL2 NA NA NA NA NA ARL5A 106651 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 154729073 154729474 154729153 Y NA GALNT13 NA NA NA NA GALNT13 2647 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 157147606 157147983 157147795 Y NA NR4A2 NA NA NA NA NR4A2 48877 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 160350650 160351006 160350912 Y MARCH7,CD302,BAZ2B AC009506.2 NA NA NA NA AC009506.2 32883 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 160817748 160817942 160817845 Y NA NA NA NA NA NA PLA2R1 99179 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 GCA 1031348 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 172083820 172084110 172083935 Y NA TLK1 NA NA NA NA TLK1 1714 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 174800246 174800560 174800554 Y NA SP3 NA NA NA NA SP3 27870 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 175464337 175464570 175464451 Y CIR1,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 81074 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD11 NA NA NA NA HOXD11 2917 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 180123713 180123938 180123827 Y NA SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 3579 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 187263813 187264095 187263899 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 84788 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 187409105 187409391 187409239 Y ITGAV,ITGAV ITGAV ITGAV MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGAV 43401 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 187420042 187420288 187420183 Y ITGAV,ITGAV,ZC3H15 ITGAV ZC3H15,ITGAV IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 32504 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 188340607 188340894 188340852 Y NA CALCRL NA NA NA NA CALCRL 29420 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 188389811 188390126 188390006 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 38361 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 190118899 190119326 190119165 Y NA NA COL5A2,COL3A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 76294 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 NA NA NA NA NA PMS1 82702 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 190741113 190741271 190741187 Y NA NA NA NA NA NA PMS1 94006 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 191709136 191709198 191709167 Y STAT4,NAB1,STAT1,GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 34355 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 NA NA NA NA NA STAT1 69179 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 191861492 191861699 191861596 Y STAT1 STAT1 NA NA NA NA STAT1 21987 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 191984586 191984681 191984634 Y NA NA NA NA NA NA STAT1 100900 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA SDPR 164749 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 147063 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 197787148 197787421 197787192 Y NA PGAP1 NA NA NA NA PGAP1 3099 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 200270966 200271332 200271300 Y NA NA NA NA NA NA SATB2 62657 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 201172384 201172536 201172446 Y NA SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 3780 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 202078581 202078959 202078777 Y CASP10 CASP10,CASP8 NA NA NA NA CASP8 17207 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 204858118 204858490 204858414 Y CD28,CTLA4,ICOS NA NA NA NA NA RAPH1 459985 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 206205217 206205608 206205348 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 339106 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 207981292 207981447 207981370 Y NA KLF7 NA NA NA NA KLF7 48544 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 211426065 211426416 211426368 Y ACADL,CPS1,CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 85689 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 213352343 213352729 213352575 Y NA NA NA NA NA NA SPAG16 794384 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP2 592647 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 218549825 218550302 218550107 Y NA NA NA NA NA NA ARPC2 529515 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 218576069 218576235 218576145 Y NA NA NA NA NA NA ARPC2 503582 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48366 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr2 222305020 222305156 222305087 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 131766 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 223462160 223462364 223462326 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 56692 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 224413942 224414282 224414142 Y NA NA NA NA NA NA SCG2 50939 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 226891308 226891496 226891402 Y NA NA IRS1,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 156591 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 226896202 226896600 226896518 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 151487 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 226985613 226985988 226985800 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC068138.1 62099 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 227002262 227002653 227002458 Y NA AC068138.1 LOC646736,IRS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC068138.1 45434 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 227169046 227169447 227169241 Y NA NA IRS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC068138.1 120959 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 227514922 227515156 227515015 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 147319 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 227517160 227517436 227517301 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 145039 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.86424467551851 chr2 227526564 227526855 227526789 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 135620 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 227580904 227581301 227581103 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 81174 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 228728073 228728272 228728126 Y NA NA NA NA NA NA CCL20 51515 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 230299119 230299349 230299203 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 165118 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA NMUR1 75682 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 232542757 232542767 232542764 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 26838 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 233703407 233703613 233703510 Y NEU2 NA NA NA NA NA GIGYF2 143398 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 233763823 233764207 233764133 Y EFHD1,NGEF NA NA NA NA NA NGEF 111775 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 233766797 233767190 233766879 Y NA NA NA NA NA NA NGEF 108792 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr2 236663549 236663825 236663687 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 262816 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA GBX2 407971 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 8715 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr2 238396973 238397455 238397139 Y NA MLPH NA NA NA NA MLPH 4902 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 238421741 238422134 238421894 Y MLPH MLPH NA NA NA NA MLPH 29670 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 238583352 238583931 238583637 Y UBE2F,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 49133 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA HDAC4 124012 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 240920223 240920529 240920311 Y NA NDUFA10 NA NA NA NA NDUFA10 42290 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 321375 321752 321587 Y NA ZCCHC3,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3 NA NA NA NA NRSN2 3674 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 353974 354548 354311 Y SRXN1,FAM110A SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 4713 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 447394 447636 447634 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 6197 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 1119535 1119804 1119673 Y NA PSMF1,TMEM74B NA NA NA NA PSMF1 27629 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 1372569 1372994 1372930 Y PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 763 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 1548183 1548579 1548480 Y SDCBP2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA,SIRPB2 NA NA NA NA NA SIRPB1 50128 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 1747670 1747986 1747984 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 125168 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 1883804 1884142 1883973 Y NA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 10650 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 2648841 2649036 2648938 Y NA NOP56,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7,EBF4 EBF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-686C3.7 5843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 2851057 2851398 2851292 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 8227 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 3156363 3156554 3156472 Y EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 17521 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 4198420 4198722 4198592 Y SMOX,ADRA1D ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 28999 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 4941641 4941708 4941700 Y NA SLC23A2 RASSF2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 47231 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr20 5637936 5638327 5638312 Y NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 48264 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 9480303 9480657 9480480 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 432893 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 10573634 10573815 10573748 Y NA NA JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 JAG1 51199 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 10655214 10655688 10655561 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 30200 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 12274197 12274212 12274205 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 404826 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 13473886 13474103 13473974 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 143484 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 13678137 13678519 13678328 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 60550 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 19881587 19881718 19881652 Y RIN2,RIN2 RIN2 NA NA NA NA RIN2 16422 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 19895665 19896589 19896325 Y NA RIN2 NA NA NA NA RIN2 30500 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 23140057 23140426 23140138 Y THBD,CD93,NXT1,GZF1 NA NA NA NA NA THBD 111679 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr20 25229395 25229593 25229494 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 2690 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 29518777 29518943 29518821 Y NA NA NA NA NA NA FRG1B 90914 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 30175524 30175854 30175562 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 15232 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 30183712 30184220 30184085 Y ID1 ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 6866 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.81899290069135 chr20 32803033 32803441 32803244 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 94167 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 33100877 33101215 33100990 Y NA DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA DYNLRB1 999 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 33263826 33263865 33263846 Y MYH7B PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA PIGU 916 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 33294754 33295084 33294783 Y NA PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA TP53INP2 4660 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 33769921 33770187 33770054 Y NA PROCR,MT1P3 NA NA NA NA PROCR 12045 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 33861234 33861630 33861491 Y NA EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EDEM2 2298 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 34093619 34093844 34093641 Y NA ERGIC3 NA NA NA NA ERGIC3 33926 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 34658286 34658599 34658390 Y EPB41L1 EPB41L1 LOC647979,C20orf152,EPB41L1,PHF20 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 18827 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 35362274 35362463 35362369 Y NA NDRG3,DSN1 NA NA NA NA NDRG3 10018 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 35922737 35923093 35922847 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 6696 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 36763112 36763416 36763201 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 29564 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 37302978 37303466 37303191 Y ACTR5,SLC32A1 NA ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B IMR90 Hi-C 24141950 ACTR5 71619 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 37626282 37626666 37626585 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 37340 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 39339297 39339534 39339402 Y NA MAFB MAFB IMR90 Hi-C 24141950 MAFB 23417 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 39620099 39620424 39620302 Y MAFB,TOP1 TOP1 TOP1,PLCG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 35034 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6,L3MBTL1 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 43965327 43965544 43965453 Y SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 9520 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 44056635 44056652 44056644 Y NA PIGT NA NA NA NA PIGT 13918 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 108787 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 18929 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 46320177 46320280 46320230 Y SULF2 NA NA NA NA NA NCOA3 191576 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 48311078 48311758 48311363 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 16657 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 48763277 48763795 48763638 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 4379 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 5.09199053425514 chr20 49055532 49055924 49055757 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 68967 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA KCNG1 344943 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr20 50180369 50180507 50180463 Y NFATC2 NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 168565 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 100689 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 50601567 50601698 50601647 Y NA NA ATP9A,SALL4,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP64 217149 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 52195343 52195714 52195527 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 28732 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 52391089 52391563 52391364 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 166643 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 52445043 52445455 52445100 Y NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220597 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 53116440 53116542 53116504 Y DOK5 NA NA NA NA NA PFDN4 294054 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 55362710 55362938 55362792 Y AURKA,TFAP2C NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 TFAP2C 160352 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr20 55985197 55985345 55985270 Y RBM38,ZBP1 RBM38 NA NA NA NA RBM38 20734 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 56251701 56252046 56251896 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 32546 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 56270075 56270492 56270216 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 14100 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 56566291 56566641 56566399 Y NA NA ZBP1,PMEPA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PMEPA1 281699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 56592800 56593208 56592856 Y NA NA ZBP1,PMEPA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1L 289287 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr20 58436515 58436843 58436553 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 69867 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 6.36498816781892 chr20 60939635 60939778 60939673 Y SLCO4A1,NTSR1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 590 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 61342361 61342694 61342588 Y NA RP11-93B14.5,NTSR1 NA NA NA NA NTSR1 4172 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 61399799 61400015 61399965 Y NA OGFR NA NA NA NA OGFR 34172 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr20 61560348 61560848 61560731 Y NA DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 6456 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr20 62081744 62082029 62081931 Y NA RP11-358D14.2,KCNQ2,EEF1A2 NA NA NA NA RP11-358D14.2 4340 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr20 62908248 62908643 62908435 Y NA PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 23154 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 11130122 11130404 11130162 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1163537 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 16596629 16597038 16596898 Y NRIP1 NA NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 161308 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 26800874 26801226 26801090 Y NA NA NA NA NA NA MRPL39 176603 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 27242944 27243154 27243052 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 136960 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 27275894 27276232 27276045 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 169910 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 29660800 29661042 29660922 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 594651 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr21 30555048 30555502 30555259 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA U3 4088 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr21 34752926 34753284 34753094 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 19918 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 35508184 35508396 35508291 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 64314 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 36185927 36186112 36186038 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 200486 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 247775 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 39649239 39650359 39649644 Y KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15 NA NA NA NA NA ETS2 524872 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 39675119 39675662 39675396 Y NA NA NA NA NA NA ETS2 499569 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 39723755 39724311 39724014 Y ETS2 NA NA NA NA NA ETS2 450920 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 40753076 40753485 40753292 Y WRB HMGN1,WRB NA NA NA NA WRB 2906 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 42619630 42619951 42619670 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 81902 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 43181534 43181711 43181623 Y MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3555 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 43183711 43183960 43183836 Y RIPK4 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 1306 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 43188787 43189188 43188843 Y RIPK4 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3521 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.81899290069135 chr21 43481602 43481805 43481672 Y C2CD2,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ZNF295,UMODL1 NA NA NA NA NA C2CD2 109603 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 44614192 44614410 44614235 Y NA NA HSF2BP,LINC00313,SIK1 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 88495 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr21 44760713 44760913 44760830 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 84095 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 44831891 44832268 44832005 Y SIK1 SIK1 NA NA NA NA SIK1 12740 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 44913472 44913707 44913565 Y PDXK NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 68464 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr21 45573018 45573302 45573138 Y PDXK,CSTB,TRPM2,ICOSLG PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 21531 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 45627966 45628150 45628090 Y NA ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 30699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 45663780 45664167 45664129 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 4931 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 46738832 46739011 46738964 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33019 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 46739517 46739788 46739671 Y NA POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33704 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr21 47027110 47027382 47027175 Y NA PCBP3 PCBP3,SLC19A1,POFUT2 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 34226 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 47167832 47168236 47167895 Y NA NA PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 106224 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 47394721 47394936 47394787 Y NA COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4715 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr21 47395087 47395227 47395108 Y COL6A2,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4424 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 20885626 20885829 20885752 Y NA KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 37426 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 21285744 21286048 21285865 Y NA CRKL,XXbac-B135H6.15,LZTR1 NA NA NA NA CRKL 16030 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 CHCHD10,SMARCB1,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCB1 26138 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 24878539 24879065 24878732 Y GGT1 NA NA NA NA NA ADORA2A 66692 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 53550 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 25365957 25366157 25366057 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD56 70776 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 24982 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 27872779 27873029 27872871 Y NA NA PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 MN1 322457 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 28065247 28065726 28065530 Y PITPNB,MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 129760 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 29705410 29705600 29705517 Y GAS2L1 EWSR1,RHBDD3,GAS2L1,RASL10A NA NA NA NA GAS2L1 4838 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 35565 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 30644816 30645407 30645321 Y NA LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 3976 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr22 30648392 30648767 30648580 Y SF3A1 LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 7552 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 30649196 30649657 30649496 Y MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 8356 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr22 30651841 30652045 30651989 Y RNF215 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 11001 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.81899290069135 chr22 30652191 30652351 30652329 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 11351 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 12734 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 7.6379858013827 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MORC2 64094 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 31689398 31689773 31689585 Y SMTN,DEPDC5 PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 2878 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 32448968 32449243 32449043 Y SLC5A4,RFPL3,SLC5A1 SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 15491 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 34263249 34263475 34263362 Y NA NA NA NA NA NA TIMP3 1067562 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 35983528 35983815 35983759 Y NA RASD2 NA NA NA NA RASD2 48613 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 6.04673875942797 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 36172767 36172943 36172931 Y MB,MB,RBFOX2,RBFOX2 NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 130325 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr22 37261378 37262019 37261471 Y RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB NA NA NA NA NA IFT27 91078 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 37624836 37624960 37624904 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1,RAC2 NA NA NA NA Z82188.1 4801 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1,CYTH4 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 38143248 38143734 38143618 Y LGALS1,TRIOBP,POLR2F NA NA NA NA NA TRIOBP 52237 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 38705287 38705445 38705426 Y NA TMEM184B NA NA NA NA TMEM184B 38247 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr22 42008568 42008780 42008674 Y NA PMM1,XRCC6 NA NA NA NA XRCC6 6343 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 45642150 45642482 45642292 Y NA KIAA0930 LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 7500 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 45899980 45900171 45900075 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 3862 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr22 47330872 47331057 47330965 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 174354 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 3177157 3177268 3177188 Y CRBN TRNT1,CRBN NA NA NA NA TRNT1 10557 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA NA NA NA NA NA SETMAR 488335 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 5181258 5181597 5181446 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 19353 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 5182623 5182897 5182737 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 20718 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 9143032 9143317 9143164 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 139575 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 10237175 10237307 10237243 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 32626 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 10276652 10276834 10276729 Y NA TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 10873 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 10593561 10593984 10593868 Y NA NA ATP2B2 IMR90 Hi-C 24141950 SEC13 232699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 11187629 11187920 11187792 Y HRH1 HRH1 NA NA NA NA HRH1 10850 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 11609664 11609798 11609746 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 150422 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 11612359 11612503 11612424 Y HRH1,ATG7 NA NA NA NA NA VGLL4 147717 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 12350153 12350305 12350183 Y NA PPARG NA NA NA NA PPARG 23286 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr3 12567743 12567843 12567793 Y NA TSEN2,MKRN2 NA NA NA NA MKRN2 28670 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA WNT7A C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT7A 17231 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 15286616 15286745 15286681 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 40957 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 15677848 15678314 15678139 Y ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1 BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 36510 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 16489627 16489868 16489748 Y NA NA NA NA NA NA RFTN1 63665 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 18423285 18423595 18423440 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 60714 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA NA NA NA NA NA SATB1 95162 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 18933064 18933626 18933337 Y NA NA NA NA NA NA SATB1 447984 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 20012721 20012798 20012760 Y NA EFHB,RAB5A,RNU4-85P NA NA NA NA RNU4-85P 23497 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 20205868 20206079 20206039 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 19705 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 27396607 27396872 27396740 Y NA NA NA NA NA NA SLC4A7 127039 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 27448684 27449023 27448831 Y NA NA NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 74888 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 32434248 32434406 32434345 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 3085 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 32461951 32462075 32462013 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 30788 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 32499535 32499861 32499683 Y CCR4,CMTM7 CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 43039 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 32557705 32558097 32557882 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 14805 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 36805780 36806178 36806113 Y NA NA NA NA NA NA TRANK1 178370 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 36948410 36948523 36948442 Y MLH1,MLH1,LRRFIP2,EPM2AIP1 TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 36025 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 38227489 38227608 38227524 Y NA MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 22909 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 40341288 40341806 40341708 Y EIF1B EIF1B NA NA NA NA EIF1B 7369 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 42531634 42531985 42531932 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 NA NA NA NA VIPR1 2843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 42601905 42602046 42601976 Y NA SS18L2,NKTR,SEC22C NA NA NA NA SS18L2 19286 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 43427917 43428246 43428244 Y NA NA NA NA NA NA SNRK 101913 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA SNRK 111255 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 45155178 45155398 45155286 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 30516 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 45607728 45607863 45607784 Y LIMD1 LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 12842 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 48469321 48469953 48469633 Y NA CCDC51,ATRIP NA NA NA NA CCDC51 9913 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 49938038 49938186 49938111 Y TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54 TRAIP,CAMKV,MST1R,MON1A,RBM6 NA NA NA NA MST1R 1113 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 50628296 50628501 50628442 Y RASSF1,RASSF1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 18450 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 50664800 50665228 50664999 Y GNAI2,MAPKAPK3 MAPKAPK3,CISH,MIR4787 NA NA NA NA CISH 17538 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 52704686 52705129 52704984 Y WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1 GNL3,PBRM1,SNORD69,SPCS1,GLT8D1 NA NA NA NA GNL3 8043 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 55178043 55178603 55178498 Y NA NA WNT5A,CACNA2D3 IMR90 Hi-C 24141950 SELK 1254028 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 56665346 56665542 56665444 Y C3orf63 FAM208A NA NA NA NA FAM208A 49723 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 57969350 57969849 57969627 Y PDE12,PXK FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 22278 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 58163548 58163776 58163593 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57457 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 58859909 58860302 58860288 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 173508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 59803830 59804011 59803964 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 770020 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 60067500 60067675 60067588 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 1033690 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 60777295 60777669 60777482 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 457464 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 61667893 61667951 61667922 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP6 58829 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 62572991 62573174 62573036 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 219986 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr3 65694421 65694810 65694689 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 327699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 65831008 65831290 65831149 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 191219 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 66491047 66491055 66491050 Y NA NA NA NA NA NA LRIG1 58632 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 68072115 68072134 68072122 Y NA NA NA NA NA NA RP11-81N13.1 368994 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 71158778 71158960 71158907 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 472180 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 72129315 72129641 72129512 Y RYBP,EIF4E3 NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4E3 327391 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA NA NA NA NA NA CCDC75P1 467172 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 78848211 78848429 78848320 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 966536 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 87344950 87345241 87345096 Y NA NA CGGBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CHMP2B 70529 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 1144696 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 98509261 98509585 98509483 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 108948 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 98549481 98549862 98549828 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 68671 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 402239 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 99587238 99587483 99587373 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 390361 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 99646991 99647087 99647049 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 330757 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 101146332 101146443 101146386 Y NA NA NA NA NA NA SENP7 83642 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 107657296 107657394 107657308 Y CD47 NA NA NA NA NA CD47 150478 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 114358213 114358332 114358238 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 584753 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 115545713 115545826 115545800 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 1197719 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 115595102 115595314 115595123 Y GAP43 NA NA NA NA NA PTMAP8 1148231 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 115790074 115790198 115790193 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 953347 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 118561016 118561389 118561159 Y NA NA NA NA NA NA B4GALT4 396561 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 119613107 119613331 119613219 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 197933 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 122493180 122493752 122493620 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 16919 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA CHCHD6 209278 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 280334 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 281870 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 127404993 127405883 127405741 Y MGLL ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 15215 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 128589304 128589705 128589400 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 6734 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 132862256 132862620 132862263 Y NA NA NA NA NA NA NPHP3 422953 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 137768870 137769254 137769106 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 63406 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 137990064 137990319 137990141 Y NA NA NA NA NA NA ARMC8 85955 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 138109159 138109469 138109274 Y NA NA NA NA NA NA CEP70 201911 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 141659994 141660128 141660061 Y NA NA NA NA NA NA ATP1B3 67028 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 142597387 142597805 142597731 Y NA PCOLCE2 NA NA NA NA PCOLCE2 8240 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 146224364 146224853 146224698 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 35798 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 149265788 149265935 149265852 Y WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 55341 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 149665230 149665637 149665395 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18535 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 151486383 151486557 151486470 Y NA NA NA NA NA NA SUCNR1 102874 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 151507223 151507685 151507381 Y NA NA NA NA NA NA SUCNR1 81746 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr3 151514227 151514622 151514246 Y NA NA NA NA NA NA SUCNR1 74809 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 151582597 151582803 151582700 Y NA SUCNR1 MED12L IMR90 Hi-C 24141950 SUCNR1 6628 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 155316441 155316741 155316588 Y NA NA NA NA NA NA PLCH1 144115 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 156432757 156433079 156432845 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 42590 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 156453441 156453522 156453482 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 63274 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 156506058 156506346 156506123 Y SSR3 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 20175 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 156538683 156538849 156538764 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LEKR1 2421 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 158226530 158226854 158226539 Y NA NA NA NA NA NA MLF1 60098 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 159514645 159514911 159514780 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 600151 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 159542121 159542517 159542198 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 572545 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 159597816 159598076 159597925 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 516986 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 159629045 159629355 159629192 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 485707 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 167737805 167738014 167737910 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 73749 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 170073991 170074311 170074218 Y SKIL,SKIL SKIL NA NA NA NA SKIL 525 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 171594447 171594730 171594655 Y NA NA NA NA NA NA PLD1 67707 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 171678764 171678932 171678818 Y NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 76486 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 171708179 171708567 171708376 Y PLD1,FNDC3B FNDC3B PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 46851 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 171820468 171820770 171820540 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 65050 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 171856568 171857271 171856877 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 101150 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 171948409 171948713 171948561 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 192991 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2,RNU4-4P NA NA NA NA RNU4-4P 2089 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 177075253 177075542 177075439 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 161992 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 180076528 180076864 180076696 Y NA NA NA NA NA NA TTC14 241054 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 180122489 180122783 180122636 Y NA NA NA NA NA NA TTC14 195135 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 181035769 181036114 181035791 Y SOX2,DNAJC19,DNAJC19 NA NA NA NA NA DNAJC19 330207 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 182973152 182973434 182973425 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 4120 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.18249408390946 chr3 183098974 183099227 183099069 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 MCF2L2 NA NA NA NA MCF2L2 45339 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 185484664 185484670 185484667 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 56174 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 187980692 187981197 187980748 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 110847 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 188012691 188013249 188012784 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 142846 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 188155903 188156126 188156022 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 286058 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 188572527 188572842 188572731 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 702682 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 188663292 188663701 188663364 Y NA NA LPP-AS2,LPP,BCL6 IMR90 Hi-C 24141950 LPP-AS2 793447 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 188826947 188827206 188827077 Y NA NA BCL6,LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP-AS2 957102 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 188953015 188953026 188953020 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 883727 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 190041292 190041577 190041442 Y NA CLDN1 NA NA NA NA CLDN1 3028 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 194040514 194040910 194040840 Y HES1 NA NA NA NA NA ATP13A3 176183 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 194212902 194213208 194212990 Y ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 3885 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 194360985 194361172 194361065 Y NA AC046143.3,TMEM44,LSG1,FAM43A NA NA NA NA TMEM44 8567 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 196047617 196047878 196047747 Y NA PCYT1A,TCTEX1D2,TM4SF19 NA NA NA NA TCTEX1D2 4447 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 873387 873975 873731 Y NA NA NA NA NA NA GAK 50186 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 924714 925388 925028 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK GAK,TMEM175 NA NA NA NA TMEM175 539 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 1184509 1184886 1184846 Y RNF212,CRIPAK NA NA NA NA NA CTBP1 56855 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr4 3438789 3438989 3438900 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 93297 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA PPP2R2C,MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 S100P,MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 105342 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 7846072 7846237 7846145 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 93416 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 7978189 7978377 7978271 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 38536 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 841794 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr4 13219623 13219635 13219629 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 264354 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 13329661 13329866 13329822 Y NA NA HSP90AB2P IMR90 Hi-C 24141950 RAB28 154123 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 15660440 15660677 15660613 Y CD38,FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 20608 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 15895700 15895839 15895750 Y FGFBP1 NA CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115L11.1 164450 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 22317541 22317786 22317581 Y NA NA NA NA NA NA GPR125 197891 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 24472474 24473298 24472910 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 110875 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 26123354 26123506 26123386 Y NA RBPJ RBPJ,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 39571 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr4 32142342 32142554 32142470 Y NA NA NA NA NA NA PCDH7 1422305 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 37956443 37956472 37956456 Y NA PTTG2 NA NA NA NA PTTG2 3584 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 38080175 38080435 38080304 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 120119 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 38162192 38162313 38162253 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 202136 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 38735219 38735515 38735398 Y NA NA KLF3,TBC1D1,FLJ13197 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-617D20.1 70715 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 38836297 38836387 38836342 Y NA TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 20051 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 7.95623520977365 chr4 39813102 39813401 39813252 Y NA NA NA NA NA NA UBE2K 115438 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 40165955 40166245 40166174 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 109509 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 41936193 41936441 41936268 Y TMEM33 TMEM33 NA NA NA NA TMEM33 1056 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr4 48700290 48700744 48700528 Y NA NA NA NA NA NA FRYL 79595 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 54507359 54507623 54507423 Y NA NA LNX1,FIP1L1,SCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 265549 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 54825725 54826062 54825894 Y GSX2 NA RPL21P44,SCFD2,LNX1,FIP1L1,CHIC2,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 102795 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 57254661 57255026 57254688 Y CEP135 RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA AASDH 2995 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 74055104 74055142 74055123 Y ANKRD17,ALB,AFM NA NA NA NA NA ANKRD17 67373 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 74569694 74570920 74570464 Y ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 33303 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 74583240 74583435 74583319 Y ANKRD17,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 MTHFD2L,CXCL3 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 20788 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 75094731 75095678 75095332 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA MTHFD2L 116840 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 75411825 75412170 75412032 Y NA NA EREG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EREG 182965 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 464630 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 87838829 87839174 87839055 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 14980 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr4 89377235 89377564 89377513 Y HERC6,HERC5 HERC5 NA NA NA NA HERC5 967 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 106362976 106363368 106363172 Y NA PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 29870 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 106390941 106391445 106391094 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 1793 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 107780277 107780572 107780473 Y NA NA NA NA NA NA TBCK 539625 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 15766 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr4 114390310 114390498 114390393 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-138P 50831 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 119629667 119629850 119629760 Y NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 25144 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 120693729 120693786 120693759 Y NA NA PDE5A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-679C8.2 292327 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 122610538 122611647 122611314 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 4621 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr4 139960939 139961173 139961057 Y NAA15,CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25996 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 140982751 140983079 140982915 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 90259 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 143488504 143488630 143488569 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 277955 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr4 146856855 146857112 146856936 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 675 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 152033251 152033470 152033361 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 14526 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 152127737 152127987 152127916 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 109012 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 154711839 154712367 154712106 Y SFRP2 RNF175 NA NA NA NA RNF175 32452 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 162565757 162566134 162565946 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 1519939 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 164471489 164471679 164471583 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 385416 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 169791118 169791499 169791286 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 137927 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 170023521 170023783 170023621 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 94095 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 170266359 170266712 170266646 Y NA NA CBR4,SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3RF1 76103 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 177705907 177706270 177706189 Y NA VEGFC NA NA NA NA VEGFC 5611 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 187614690 187615080 187614853 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 30796 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 190936592 190936699 190936668 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 76649 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr5 671573 671920 671762 Y TPPP TPPP NA NA NA NA TPPP 19590 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr5 3188206 3188572 3188389 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS6 1388692 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 50027 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr5 10733059 10733302 10733226 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 26082 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr5 14809867 14810211 14810035 Y FAM105A,FAM105B RBBP4P1 NA NA NA NA RBBP4P1 13358 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA MYO10 NA NA NA NA MYO10 39198 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr5 26847119 26847280 26847167 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 1658354 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr5 29834826 29835182 29835004 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 1216490 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 32772062 32772072 32772067 Y NA NA NA NA NA NA SUB1 242323 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 34037436 34037722 34037670 Y NA AMACR NA NA NA NA AMACR 31216 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 34587608 34588326 34587915 Y NA NA RAI14 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 66016 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 35220570 35220626 35220598 Y AGXT2,PRLR NA NA NA NA NA DNAJC21 292872 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP6 53296 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 37102128 37102249 37102189 Y NA RPS4XP6 NA NA NA NA RPS4XP6 18970 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 38846956 38846992 38846979 Y OSMR,OSMR CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 2996 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 40411118 40411409 40411246 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 266191 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 40840324 40840492 40840354 Y NA PRKAA1,RPL37 NA NA NA NA RPL37 6887 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA AC025171.1 NA NA NA NA AC025171.1 44331 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA AC025171.1 NA NA NA NA AC025171.1 31500 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 43034859 43034967 43034962 Y NA AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC648987 MCF7 ChIA-PET 22265404 AC025171.1 4710 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.81899290069135 chr5 43061828 43062062 43061945 Y NA AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 1216 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 43105884 43106284 43106088 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC153684,LOC100132356,ZNF131 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2201E18.3 40363 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 45793437 45793825 45793631 Y NA NA NA NA NA NA HCN1 99184 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 49719324 49719499 49719409 Y PARP8 NA NA NA NA NA PARP8 240234 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 52023689 52023809 52023721 Y NA NA NA NA NA NA ITGA1 57921 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 52145845 52146161 52146003 Y NA NA NA NA NA NA PELO 64071 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 52155124 52155267 52155195 Y NA NA NA NA NA NA PELO 73350 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2 NA NA NA NA ITGA2 44436 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 55287334 55287994 55287973 Y NA IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA IL6ST 827 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 55288370 55289209 55288952 Y IL6ST NA NA NA NA NA IL6ST,CTD-2031P19.3 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 55461813 55461854 55461833 Y IL6ST NA NA NA NA NA CTD-2031P19.3 172818 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 57111915 57112364 57112128 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 641723 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 58165920 58166304 58166218 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 411833 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 58314415 58314788 58314579 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 560328 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 58422372 58422713 58422580 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 668285 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 669224 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 60751661 60751965 60751750 Y ZSWIM6 NA NA NA NA NA RPL3P6 65963 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 64423186 64423354 64423272 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA ADAMTS6 352393 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 67875476 67875860 67875665 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 365928 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 71481497 71481884 71481610 Y MAP1B NA NA NA NA NA MAP1B 80436 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 72235988 72236210 72236099 Y FCHO2 FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 13598 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 73002983 73003378 73003181 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 143472 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 73209063 73209467 73209267 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 349552 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 76451280 76451584 76451411 Y NA NA NA NA NA NA ZBED3 70132 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 77791213 77791569 77791505 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 136874 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 77797282 77797316 77797309 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 142943 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 77945760 77945963 77945862 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2073O6.1 63942 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 80216788 80217158 80217017 Y NA NA RASGRF2,MSH3 IMR90 Hi-C 24141950 DHFR 267986 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 86619148 86619498 86619336 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 57443 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 86662563 86662890 86662661 Y RASA1,RASA1 CCNH NA NA NA NA CCNH 43946 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 86673186 86673474 86673330 Y CCNH,CCNH CCNH NA NA NA NA CCNH 33362 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 88182731 88182852 88182759 Y MEF2C,MEF2C MEF2C NA NA NA NA MEF2C 15070 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 90458384 90458975 90458686 Y ARRDC3 NA NA NA NA NA RNU4-90P 105569 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 92678371 92678771 92678494 Y NA NA FLJ42709,NR2F1 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 238272 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 94033836 94034405 94034124 Y KIAA0825,ANKRD32 NA NA NA NA NA KIAA0825 81527 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 95170246 95170624 95170377 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 13537 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 96217415 96217751 96217602 Y CAST,CAST ERAP2 NA NA NA NA ERAP2 7772 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 99386410 99387139 99386777 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 481827 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 106837531 106838094 106837969 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 166502 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 106878561 106878904 106878854 Y EFNA5 NA NA NA NA NA EFNA5 125692 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 106901710 106902084 106901897 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 102512 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 108329034 108329385 108329210 Y NA NA NA NA NA NA FER 247511 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 114750887 114751289 114751050 Y NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 120359 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 114797286 114797501 114797397 Y PGGT1B,TICAM2,FEM1C NA NA NA NA NA FEM1C 81090 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 114959651 114959879 114959766 Y COMMD10 TMED7 NA NA NA NA TMED7-TICAM2 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 118453384 118453586 118453485 Y NA RP11-950K24.2 NA NA NA NA RP11-950K24.2 8553 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 118677194 118677610 118677495 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 74807 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA MARCH3 114379 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 126847905 126848122 126848004 Y NA PRRC1 PRRC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRRC1 3179 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 131074214 131074509 131074363 Y NA NA NA NA NA NA FNIP1 56201 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 131560740 131561286 131561173 Y IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2 PDLIM4 NA NA NA NA PDLIM4 30078 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 133880902 133881116 133881009 Y PCBD2,CDKL3,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 101363 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 136478407 136478752 136478599 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 453316 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 138838499 138838633 138838566 Y TMEM173 ECSCR,TMEM173 NA NA NA NA ECSCR 1695 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 139104562 139104943 139104720 Y NA NA DNAJC18,UBE2D2,CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 79678 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 139631101 139631601 139631302 Y SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 49105 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 5115 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 141825669 141826086 141825870 Y SPRY4 NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 121649 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr5 142384131 142384662 142384553 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 325508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 142504289 142504528 142504400 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 205642 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 146751772 146751865 146751838 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 135754 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 147782971 147782994 147782983 Y ADRB2,SPINK14,FBXO38 RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 21473 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 148230110 148230196 148230153 Y NA ADRB2 NA NA NA NA ADRB2 25954 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 149789263 149789759 149789627 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,CD74,CD74 CD74,RPS14 NA NA NA NA CD74 733 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 150438663 150438839 150438728 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 GPX3,TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 32299 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 150477506 150477962 150477585 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 6368 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 151129219 151129502 151129338 Y SLC36A1 RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 14437 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 153008472 153008835 153008712 Y NA NA NA NA NA NA MFAP3 407631 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 158491555 158491917 158491726 Y EBF1 EBF1 NA NA NA NA EBF1 32852 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 159355194 159355367 159355277 Y NA ADRA1B NA NA NA NA ADRA1B 13404 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 167961977 167962275 167962126 Y NA FBLL1,MIR103A1,PANK3 PANK3,MIR103B1 IMR90 Hi-C 24141950 FBLL1 7856 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 168051900 168052268 168052099 Y NA PANK3,CTC-575D19.1 SLIT3 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-575D19.1 10583 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 170378492 170378604 170378547 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 91618 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 171326428 171326478 171326475 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 105399 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 171601698 171602038 171601921 Y NA STK10 NA NA NA NA STK10 11352 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 171602273 171602685 171602548 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 10705 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 171606484 171606964 171606720 Y UBTD2,STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 6426 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 171702162 171702431 171702281 Y DUSP1,UBTD2,STK10 UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 6644 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 172463160 172463425 172463226 Y NA NA C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V0E1 54400 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 172882283 172882785 172882503 Y NA NA LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 127777 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 176359562 176359884 176359876 Y RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6 NA NA NA NA NA UIMC1 87750 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 179188972 179189165 179189138 Y NA MAML1,SQSTM1,MGAT4B NA NA NA NA MAML1 31121 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr5 179461499 179461900 179461782 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 35218 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 179718006 179718384 179718320 Y NA MAPK9 NA NA NA NA CTB-129O4.1 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA DUSP22 183058 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 2299603 2299973 2299788 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 55621 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 3069574 3070273 3069674 Y NA HTATSF1P2,RIPK1,BPHL LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 7349 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 30302 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA PSMG4 126462 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 5671479 5671687 5671530 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 333513 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 6750084 6750462 6750414 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 355368 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 7996922 7997003 7996963 Y BMP6,TXNDC5,TXNDC5 TXNDC5 NA NA NA NA TXNDC5 27643 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 10970926 10971179 10971053 Y NA NA NA NA NA NA MAK 134162 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 14826835 14827098 14826967 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 417429 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 15107334 15107747 15107449 Y NA NA JARID2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 136780 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 16673403 16673483 16673443 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 85886 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 16766520 16766751 16766672 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562 ChIA-PET 22265404 ATXN1 6798 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 16771345 16771373 16771363 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATXN1 11623 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 18391380 18391715 18391394 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B NA NA NA NA NA DEK 128326 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 19491602 19491780 19491714 Y NA NA NA NA NA NA RP4-625H18.2 311203 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 20239005 20239080 20239045 Y NA MBOAT1 MBOAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT1 28335 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA CMAHP 70052 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 25174209 25174610 25174347 Y C6orf62 CMAHP CMAHP,FAM65B,LRRC16A IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 9416 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H3B 3493 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 27065086 27065154 27065121 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H2BK,HIST1H2AH NA NA NA NA HIST1H2BJ 33387 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 27513313 27513537 27513433 Y NA NA HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 74416 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 28080593 28080792 28080693 Y NA ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9546 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.86424467551851 chr6 28601930 28602271 28602104 Y NA SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 19941 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 93748 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 30477053 30477329 30477202 Y PPP1R11,TRIM40,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,HLA-E,PRR3 RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1 NA NA NA NA HLA-E 21809 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 30722480 30722729 30722541 Y TRIM39,TRIM39,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 12149 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.81899290069135 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA BRD2 NA NA NA NA BRD2 21600 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 37102324 37102775 37102642 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 33204 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 40354913 40355113 40355096 Y NA NA NA NA NA NA RP1-278E11.3 430341 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 42306418 42306926 42306742 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 110863 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 42361651 42361664 42361659 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 56125 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA C6orf223 87630 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 43978439 43978901 43978686 Y NFKBIE C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 12122 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 44002049 44002379 44002368 Y NFKBIE,GTPBP2 C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 35732 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 44011469 44011879 44011690 Y NA C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 45152 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 45629 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 45319946 45320392 45320176 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 23298 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 47275760 47275938 47275849 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 119 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 49533704 49534052 49533813 Y C6orf141 NA NA NA NA NA CENPQ 104613 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 52389241 52389494 52389368 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 50219 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 57004936 57005232 57005084 Y NA BAG2 NA NA NA NA BAG2 29892 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 72034617 72034728 72034673 Y NA OGFRL1 NA NA NA NA OGFRL1 38111 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 72051718 72051897 72051837 Y NA NA NA NA NA NA OGFRL1 55212 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 103040 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 74432369 74432753 74432573 Y MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109 CD109 NA NA NA NA CD109 28861 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 81348599 81348680 81348638 Y NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 534235 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 82854780 82854947 82854862 Y NA NA NA NA NA NA IBTK 100524 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 83106802 83107017 83106898 Y NA TPBG TPBG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPBG 35879 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 83546132 83546541 83546207 Y NA NA UBE3D,IBTK IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 228844 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 83745270 83745402 83745336 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 29983 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr6 86174491 86174911 86174693 Y NA NT5E NA NA NA NA NT5E 16682 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 86370103 86370257 86370180 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 16194 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 325188 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 99382979 99383150 99383065 Y NA FBXL4 NA NA NA NA FBXL4 10699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 99886915 99887218 99887074 Y NA COQ3,RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 15708 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 91524 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 111841823 111842197 111842010 Y NA REV3L NA NA NA NA REV3L 38905 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 112110273 112110463 112110418 Y NA NA NA NA NA NA FYN 82192 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 112449250 112449618 112449554 Y NA TUBE1 NA NA NA NA TUBE1 42518 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 112619942 112620186 112620045 Y NA LAMA4 LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 45801 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 116247686 116248075 116247881 Y NA NA NA NA NA NA NT5DC1 171937 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 116707738 116708095 116707832 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 108672 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 116708579 116708861 116708730 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 109513 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 127745246 127745525 127745387 Y RNF146 NA NA NA NA NA ECHDC1 82492 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 127778453 127778833 127778741 Y NA NA NA NA NA NA ECHDC1 115699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 127892310 127892704 127892511 Y NA NA NA NA NA NA ECHDC1 229556 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 128293064 128293422 128293333 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 546448 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 129667099 129667337 129667218 Y LAMA2 NA NA NA NA NA ARHGAP18 362033 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 131929733 131930009 131929873 Y NA MED23,RNU4-18P NA NA NA NA MED23 17360 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 133134288 133134908 133134317 Y NA RPS12 NA NA NA NA SNORD101 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 134616841 134617592 134617239 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 19658 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 134696098 134696325 134696202 Y NA NA ALDH8A1,LOC154092,SGK1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 58848 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 135804002 135804049 135804028 Y NA LINC00271,AHI1 NA NA NA NA LINC00271 12440 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 136336050 136336507 136336258 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 165216 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 137517813 137517908 137517861 Y NA IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 20678 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 138057580 138057838 138057749 Y PBOV1,TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 128513 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 138353138 138353418 138353320 Y PERP NA PERP MCF7 ChIA-PET 22265404 PERP 73230 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 138552516 138552583 138552548 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1244 71458 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 139351818 139352158 139351992 Y CCDC28A,C6orf115,HECA REPS1 NA NA NA NA REPS1 44420 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 139859712 139859864 139859773 Y HECA NA CITED2,LOC100132735 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 165955 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 140299062 140299512 140299364 Y NA NA CITED2,HECA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 605305 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 141765105 141765268 141765171 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 701099 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 142335769 142335959 142335859 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 130408 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 143123144 143123510 143123441 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 140828 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 143130260 143130659 143130530 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 133679 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 144975415 144975576 144975532 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 370578 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 145131744 145132215 145131879 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 526907 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 686 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 151246480 151246919 151246675 Y ZBTB2 NA NA NA NA NA MTHFD1L 61795 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 151381285 151381592 151381452 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 37073 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 151462497 151462602 151462550 Y NA RP1-292B18.1 MTHFD1L IMR90 Hi-C 24141950 RP1-292B18.1 43832 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 151634197 151634634 151634284 Y NA NA NA NA NA NA AKAP12 75063 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 154505237 154505477 154505359 Y NA NA NA NA NA NA CNKSR3 324316 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 154665591 154665920 154665816 Y IPCEF1 NA NA NA NA NA CNKSR3 163873 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 154753926 154754309 154754118 Y CNKSR3 NA NA NA NA NA CNKSR3 75484 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 155593046 155593119 155593050 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 40508 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 157726321 157726550 157726459 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 16083 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 158463343 158463878 158463391 Y SNX9,SYNJ2 NA NA NA NA NA SYNJ2 62455 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 158478416 158478907 158478642 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 77528 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr6 159141436 159141829 159141621 Y TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR NA NA NA NA NA DYNLT1 77665 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 166754936 166755437 166755076 Y SFT2D1 SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 857 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 166970262 166970784 166970543 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 216183 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 167411045 167411413 167411177 Y NA RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 375 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 168493730 168493970 168493824 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 268128 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 169325623 169325636 169325631 Y NA NA LINC00574,WDR27,LOC154449,PHF10 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 235383 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 169495883 169496177 169495989 Y NA NA PHF10,THBS2,WDR27,C6orf70 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 64842 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.90949645034568 chr7 1198505 1198792 1198744 Y NA C7orf50,AC091729.9,ZFAND2A NA NA NA NA ZFAND2A 110 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 1274384 1274791 1274446 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND2A 75989 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 1546091 1546367 1546260 Y NA MICALL2,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2602 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 1553000 1553189 1553120 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 9511 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 5.09199053425514 chr7 1573524 1573718 1573598 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5174 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 2749963 2750288 2750147 Y LFNG,LFNG,CARD11 AMZ1 NA NA NA NA AMZ1 32807 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 2797465 2798227 2798113 Y SNX8,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 75028 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 2838950 2839257 2839071 Y SNX8,LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 33998 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 3022606 3022704 3022655 Y LFNG,LFNG,CARD11 NA NA NA NA NA CARD11 58875 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 4913549 4913687 4913618 Y NA AC092610.12,RADIL NA NA NA NA RADIL 7663 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 5452779 5453024 5452968 Y NA TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 10021 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 8016516 8016759 8016566 Y GLCCI1 GLCCI1 NA NA NA NA GLCCI1 10091 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 13368007 13368354 13368181 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 643526 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 227019 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 20463565 20463840 20463661 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 95240 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8,RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 22631710 22632105 22631870 Y IL6 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 82092 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr7 23488792 23489118 23488955 Y KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 18968 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 24229401 24229422 24229412 Y NA NA NA NA NA NA NPY 92360 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 24795767 24795828 24795792 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 11416 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 25071903 25072051 25071977 Y NA NA OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL3 52650 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 26346471 26347292 26346975 Y CBX3,SNX10,SNX10,SNX10 AC010677.5,SNX10 NA NA NA NA SNX10 16930 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 27143635 27143783 27143725 Y NA HOXA-AS2,HOXA5,HOXA6 NA NA NA NA HOXA-AS2 1613 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 27152655 27152825 27152741 Y NA HOXA-AS2,HOXA5,HOXA6 NA NA NA NA HOXA-AS2 7259 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 28180762 28180941 28180859 Y NA JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 37421 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 29534563 29534631 29534599 Y WIPF3 NA NA NA NA NA AC007255.8 66655 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 31757734 31758047 31757891 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 774848 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 36843340 36843728 36843600 Y ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 415606 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 44426024 44426371 44426281 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2B 53848 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 47302239 47302434 47302368 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 317722 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 47366502 47366627 47366552 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 253529 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 47533820 47533921 47533853 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 86235 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 47691174 47691510 47691360 Y C7orf69,TNS3,C7orf65 NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 71018 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr7 55198488 55198937 55198616 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 113774 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 56606357 56606502 56606382 Y LOC389493 NA NA NA NA NA CHCHD2 434088 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA CHCHD2 1534165 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 66096553 66096745 66096681 Y NA KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA KCTD7 4685 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 66120269 66120628 66120390 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA RP4-756H11.3 2744 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 73133049 73133354 73133303 Y NA WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11 NA NA NA NA STX1A 1047 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 74074203 74074528 74074318 Y LAT2,GTF2I GTF2I NA NA NA NA GTF2I 4209 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 77177634 77177834 77177685 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 13042 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 77201219 77201434 77201295 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 36627 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 77316787 77316835 77316811 Y NA RSBN1L-AS1,RSBN1L NA NA NA NA RSBN1L-AS1 6747 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA GNAI1 838141 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 79844591 79844960 79844776 Y NA NA NA NA NA NA GNAI1 83320 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 80270954 80271129 80271024 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 278546 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 80399893 80400101 80400015 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 149574 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 81233474 81233832 81233648 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 683799 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 81234008 81234151 81234026 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 684333 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 83866816 83867276 83866988 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 252764 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 86563227 86563622 86563425 Y NA NA NA NA NA NA DMTF1 216055 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 91456025 91456190 91456079 Y NA NA NA NA NA NA MTERF 51844 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 92261903 92262272 92262087 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 44195 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 92263416 92263696 92263624 Y SAMD9,CDK6 FAM133B FAM133B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 45708 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 92274593 92274946 92274914 Y CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 56885 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 92290698 92291011 92290856 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 72990 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 92745192 92745375 92745297 Y SAMD9 SAMD9L NA NA NA NA SAMD9 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 94021237 94021945 94021560 Y NA NA NA NA NA NA CASD1 114586 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 95179507 95179842 95179679 Y DYNC1I1 PDK4,AC002451.3 NA NA NA NA PDK4 43961 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 98739351 98739615 98739543 Y NA SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 108 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 98871923 98872129 98871984 Y NA ARPC1A NA NA NA NA ARPC1A 49392 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr7 102790674 102790901 102790766 Y NAPEPLD RPL19P12,NAPEPLD NA NA NA NA NAPEPLD 2667 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 104614051 104614727 104614598 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 36764 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 105407460 105407845 105407653 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 107205 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 107136125 107136576 107136361 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 65353 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 107205466 107205592 107205534 Y COG5 DUS4L,COG5,BCAP29 NA NA NA NA COG5 2507 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 107555392 107555607 107555420 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 25977 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 343487 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 111200844 111201149 111201059 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 271 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 111971895 111972278 111972086 Y NA NA NA NA NA NA IFRD1 88745 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 114677768 114677789 114677777 Y MDFIC NA NA NA NA NA MDFIC 117559 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 69798 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 116217100 116217359 116217210 Y CAV1,CAV1 NA NA NA NA NA CAV1 54261 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 116651956 116652355 116652105 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 59568 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 121874177 121874561 121874390 Y NA NA NA NA NA NA FEZF1-AS1 67151 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 127876972 127877440 127877187 Y IMPDH1,LRRC4 NA PAX4,FSCN3,SND1,LEP,RBM28 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM28 104522 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr7 129419118 129419176 129419138 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169563 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr7 129460659 129460706 129460683 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 130083 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 130606000 130606565 130606293 Y NA MIR29A LOC646329 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR29A 9931 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 130644314 130644883 130644570 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48245 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 130795999 130796263 130796171 Y MKLN1,MKLN1 MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 3064 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 130875085 130875581 130875276 Y NA AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 49768 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 130920397 130920794 130920689 Y MKLN1,MKLN1 AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 4555 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 131166569 131166943 131166757 Y PODXL NA NA NA NA NA PODXL 74033 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 131806652 131806768 131806697 Y NA NA NA NA NA NA AC009518.4 226252 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 133706471 133706698 133706584 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 103354 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr7 134836004 134836265 134836096 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49 NA NA NA NA TMEM140 5180 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 134862087 134862457 134862329 Y NA TMEM140,C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 8540 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 139320398 139320629 139320471 Y LUC7L2 NA NA NA NA NA ERHP1 103412 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 139320693 139321014 139320839 Y PARP12,LUC7L2 NA NA NA NA NA ERHP1 103707 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 139420496 139420947 139420749 Y TBXAS1,JHDM1D,HIPK2 NA NA NA NA NA HIPK2 54630 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 139498127 139498170 139498155 Y TBXAS1 HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 22550 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 139555360 139555974 139555461 Y JHDM1D,TBXAS1 NA NA NA NA NA HIPK2 79783 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 140267387 140267618 140267517 Y DENND2A NA NA NA NA NA MKRN1 90018 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 140577074 140577378 140577094 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 45186 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 140947588 140947591 140947590 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-74P 197539 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147,RNU1-82P NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 144462107 144462147 144462127 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 69341 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 148306193 148306206 148306200 Y NA AC005229.5 NA NA NA NA AC005229.5 30700 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr7 151193551 151193826 151193799 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21380 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 155744220 155744341 155744281 Y NA AC021218.2 LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC021218.2 8985 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr7 155744375 155744769 155744531 Y NA AC021218.2 LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC021218.2 8557 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.50074349230041 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA AC021218.2 LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 AC021218.2 1232 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 156932490 156932855 156932681 Y NA UBE3C NA NA NA NA UBE3C 2883 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 270529 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.54599526712757 chr7 158225517 158225999 158225657 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 269521 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr7 158493510 158493807 158493659 Y NCAPG2 NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 1713 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 11337266 11337614 11337440 Y FAM167A FAM167A C8orf12,BLK IMR90 Hi-C 24141950 FAM167A 7042 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 15546823 15547116 15546970 Y NA NA NA NA NA NA TUSC3 274099 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 18836263 18836433 18836318 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 103807 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 18991999 18992391 18992140 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 51759 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 19066932 19067320 19067099 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 101808 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 19782770 19783069 19782974 Y NA NA NA NA NA NA INTS10 110119 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 22561043 22561327 22561142 Y PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 12228 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 23390028 23390384 23390041 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 5710 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr8 25059177 25059384 25059268 Y DOCK5 DOCK5 NA NA NA NA DOCK5 18939 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 26437404 26437761 26437433 Y PNMA2,DPYSL2,DPYSL2 NA NA NA NA NA DPYSL2 67613 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 27090782 27091032 27090831 Y NA NA NA NA NA NA TRIM35 75804 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 29097584 29097960 29097935 Y HMBOX1,HMBOX1,KIF13B KIF13B NA NA NA NA KIF13B 20681 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 29202154 29202365 29202273 Y DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 3820 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 29230223 29230556 29230411 Y KIF13B,DUSP4 DUSP4 C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 24038 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 29230784 29230978 29230896 Y KIF13B,DUSP4 DUSP4 C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 24599 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 29495067 29495424 29495202 Y KIF13B NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 288882 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr8 29516615 29516871 29516762 Y KIF13B NA DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 310430 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 29522725 29523096 29522814 Y KIF13B NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 316540 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 29526859 29527039 29527017 Y NA NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 320674 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr8 30580467 30580796 30580574 Y GSR GSR,UBXN8 NA NA NA NA GSR 2647 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 4.77374112586419 chr8 36758959 36759166 36759082 Y NA NA NA NA NA NA ZNF703 792103 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 37376212 37376482 37376355 Y NA NA KCNU1,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF703 174787 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 37992032 37992208 37992120 Y NA ASH2L,BAG4,LSM1 NA NA NA NA ASH2L 31272 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 38816649 38817007 38816807 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA TM2D2 35336 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 39861721 39861852 39861792 Y NA NA NA NA NA NA IDO1 103927 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 40207660 40208018 40207838 Y NA CTA-392C11.1 ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-392C11.1 8739 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 41146046 41146081 41146065 Y SFRP1 SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 18935 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 41886687 41887061 41886965 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 20447 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 50466157 50466168 50466163 Y NA NA NA NA NA NA SNAI2 633858 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 52747281 52747589 52747434 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 62146 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 52797055 52797111 52797083 Y NA PCMTD1,RP11-110G21.1 NA NA NA NA PCMTD1 12624 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 54884595 54884649 54884642 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 48440 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 61825257 61825601 61825298 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 235920 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 66652181 66652518 66652302 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 97212 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 67626224 67626609 67626278 Y SGK3,VCPIP1,SGK3 VCPIP1,C8orf44,SGK3 NA NA NA NA SGK3 3571 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 67694398 67694637 67694506 Y VCPIP1,SGK3,SGK3 NA NA NA NA NA SGK3 71745 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 68075038 68075412 68075329 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 81020 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 68098646 68098899 68098873 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 104628 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 236574 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 80642210 80642465 80642338 Y STMN2 HEY1 TPD52,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 35633 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 4.45549171747324 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59,CA13 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 87484005 87484360 87484214 Y NA CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 10699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 90899646 90899998 90899819 Y RIPK2,OSGIN2 OSGIN2 OSGIN2,RIPK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OSGIN2 12089 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 92112003 92112264 92112167 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 31579 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 95271404 95271652 95271620 Y GEM GEM NA NA NA NA GEM 926 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 101222720 101222891 101222806 Y NA NA NA NA NA NA SPAG1 54586 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 101920209 101920392 101920320 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 43224 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 103639654 103639717 103639685 Y NA KLF10 UBR5,ODF1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF10 26413 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 103669922 103670289 103670129 Y ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3792 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 72755 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 103803215 103803631 103803453 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 70897 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 103825525 103825897 103825586 Y NA KB-1507C5.2 NA NA NA NA KB-1507C5.2 48631 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 104038342 104038540 104038441 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 7051 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 104406173 104406574 104406390 Y NA CTHRC1,DCAF13,SLC25A32 NA NA NA NA DCAF13 18368 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 306720 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 107059911 107060047 107059923 Y NA RP11-152P17.2 OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 10705 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 109222483 109222836 109222544 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 222726 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 111381887 111381916 111381903 Y NA NA NA NA NA NA SYBU 679867 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 117049380 117049760 117049565 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 229481 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 119049251 119049636 119049444 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 72456 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 119781554 119781682 119781618 Y NA NA TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 SAMD12 149320 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 123050237 123050548 123050394 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 398607 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 124552481 124552488 124552485 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1035 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 NA NA NA NA NA TMEM65 80121 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 125642565 125642695 125642641 Y NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1 NA NA NA NA NA TATDN1 92866 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 126083515 126083743 126083629 Y NA NSMCE2,KIAA0196 NA NA NA NA NSMCE2 18178 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 530819 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 128231853 128232218 128232163 Y NA NA LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 MYC 513462 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 128264964 128265070 128265034 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 480610 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 128879185 128879808 128879466 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 74406 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 128944008 128944415 128944139 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 76442 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 128948050 128948240 128948055 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 72617 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 129047466 129047656 129047576 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26609 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 129348203 129348321 129348262 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 327346 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 130975001 130975392 130975263 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 51983 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 131289962 131290145 131290029 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 163761 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 131296989 131297286 131297259 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 156620 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 136476552 136476867 136476709 Y NA KHDRBS3 NA NA NA NA KHDRBS3 8852 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 141212639 141212826 141212733 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 253852 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 141607900 141608150 141608005 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 88503 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 142047873 142048201 142048171 Y PTK2 PTK2 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 37558 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 3.18249408390946 chr8 143532398 143532722 143532656 Y LYNX1,LYNX1,LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA BAI1 3607 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 143757526 143757895 143757616 Y NA PSCA,JRK,LY6K NA NA NA NA JRK 3491 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 143809767 143809928 143809818 Y C8orf55 JRK,LY6K NA NA NA NA LY6K 30238 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 144300737 144301128 144300944 Y GPIHBP1 GPIHBP1,ZFP41,GLI4 NA NA NA NA GPIHBP1 7669 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA NAPRT1,TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr8 145909522 145909717 145909620 Y NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 328 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr9 2241944 2242239 2242031 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 228602 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 2490043 2490145 2490094 Y NA NA KIAA0020 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 129689 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 4864348 4864647 4864448 Y NA NA NA NA NA NA RCL1 73479 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 12784417 12784967 12784682 Y C9orf150 RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 27377 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 14263032 14263410 14263221 Y NA NA NA NA NA NA NFIB 133572 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 14575436 14575689 14575562 Y ZDHHC21 NA NA NA NA NA ZDHHC21 115780 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 15477137 15477463 15477300 Y NA PSIP1,FTH1P12 NA NA NA NA PSIP1 31554 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 16062752 16063225 16063009 Y NA NA CNTLN,C9orf93,BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 537071 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 16337405 16337786 16337534 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 BNC2 531055 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 20821674 20822013 20822003 Y IFNA5,IFNA21 NA NA NA NA NA MLLT3 201132 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 313922 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 1642036 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr9 33814905 33815171 33814978 Y UBE2R2,UBAP1 UBE2R2 NA NA NA NA UBE2R2 394 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 36765862 36766252 36766147 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 195003 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 37954084 37954355 37954258 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 112329 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1,IGFBPL1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBPL1 15126 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 38682685 38683007 38682923 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD18A 107481 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 68377347 68377469 68377407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 75906 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 12.0934775188559 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.86424467551851 chr9 73701762 73702162 73701962 Y TRPM3 NA NA NA NA NA TRPM3 357658 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 74823247 74823495 74823337 Y NA NA NA NA NA NA GDA 95736 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 77588894 77589149 77589022 Y NA C9orf40 NA NA NA NA C9orf40 23092 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 79303501 79303668 79303622 Y GCNT1 NA NA NA NA NA AL161626.1 118770 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 81003152 81003350 81003249 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 93093 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 81329740 81329936 81329769 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 419681 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 81641483 81641834 81641545 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 362385 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 81704987 81705355 81705134 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 298864 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 82185317 82185693 82185378 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 629 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 86271805 86271878 86271876 Y NA RP11-522I20.3,UBQLN1 NA NA NA NA RP11-522I20.3 48631 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 88184194 88184649 88184621 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 170295 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 88544402 88544561 88544480 Y NA NAA35 NA NA NA NA NAA35 9500 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 90407699 90408115 90407854 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA CDK20 179553 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 91125141 91125399 91125267 Y NA NA SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2 IMR90 Hi-C 24141950 SPIN1 123807 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 93710406 93710774 93710540 Y NA NA ROR2,AUH,LOC100129316,NFIL3 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 411421 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 94945824 94946159 94945966 Y NA BEND3P2 NA NA NA NA BEND3P2 14301 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 94993084 94993195 94993158 Y NA NA NA NA NA NA IARS 60843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 95845794 95846166 95845981 Y NINJ1,C9orf89 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA C9orf89 10334 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr9 97622499 97622697 97622598 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 135516 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 143091 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 97968410 97968794 97968763 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 109197 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 98772080 98772357 98772164 Y C9orf102 NA NA NA NA NA EIF4BP3 133932 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 99171138 99171308 99171256 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA RP11-172F4.2 3572 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 100432763 100433089 100432926 Y TSTD2,XPA NCBP1,TSTD2,XPA NA NA NA NA XPA 24550 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 100747732 100748046 100747912 Y NA ANP32B NA NA NA NA ANP32B 4089 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 100788386 100788828 100788550 Y NA ANP32B,NANS NA NA NA NA NANS 28193 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 100985595 100985973 100985751 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 29942 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 101868249 101868435 101868378 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 3929 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 101883874 101884261 101884068 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 19554 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 107510718 107511248 107511059 Y ABCA1,NIPSNAP3A NIPSNAP3A,NIPSNAP3B NA NA NA NA NIPSNAP3A 2749 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 107723549 107723790 107723714 Y NIPSNAP3A,ABCA1 ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 35031 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 107983498 107983520 107983511 Y NA SLC44A1 SLC44A1,ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 21383 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 111386829 111386933 111386883 Y NA RP11-220D10.1 KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 180 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 112569081 112569243 112569086 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 28312 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 112811971 112812606 112812251 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 26333 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 112905689 112906067 112905829 Y NA NA NA NA NA NA TXN 110853 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 113507067 113507395 113507232 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 291586 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 113783956 113784262 113784109 Y NA LPAR1 NA NA NA NA LPAR1 14719 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 113886558 113886563 113886560 Y NA NA LPAR1,MUSK,KIAA0368 IMR90 Hi-C 24141950 LPAR1 87577 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 114505631 114505796 114505739 Y NA NA NA NA NA NA GNG10 84016 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 114705587 114705765 114705623 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 48541 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 115258728 115258879 115258816 Y SNX30,SUSD1,ROD1 KIAA1958,C9orf147 NA NA NA NA C9orf147 11244 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 115703593 115703826 115703710 Y NA NA SNX30,ZNF883,ZFP37,LINC00256B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP37 113213 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 116341254 116341479 116341362 Y RGS3 NA NA NA NA NA RP11-18B16.2 69757 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 117657108 117657611 117657338 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 90702 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 117691412 117691904 117691627 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 125006 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 118358577 118359027 118358666 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 480041 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr9 118436011 118436199 118436119 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 477884 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr9 125109314 125109437 125109338 Y NA NA TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL IMR90 Hi-C 24141950 RBM18 84196 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 125934200 125934213 125934207 Y OR1L4,OR1L6,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 94642 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 126200869 126200875 126200873 Y RABGAP1,GPR21,DENND1A NA NA NA NA NA STRBP 172014 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 126237774 126237937 126237796 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 208919 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr9 126446407 126446440 126446424 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 243991 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 126695812 126695993 126695905 Y PSMB7 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 5381 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 130281582 130281994 130281773 Y TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9 NA NA NA NA NA FAM129B 57274 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 130283548 130283912 130283802 Y SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C,PTRH1,FPGS,FPGS,FAM129B,ENG NA NA NA NA NA FAM129B 55356 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 130373507 130373780 130373645 Y GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1 FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA STXBP1 963 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 130600573 130601245 130600861 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 13790 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 131660472 131660616 131660545 Y NA LRRC8A,CCBL1,DOLK,NUP188 NA NA NA NA CCBL1 17699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.954748225172838 chr9 132195051 132195301 132195202 Y NA LINC00963 C9orf106,C9orf50,PPP2R4,LOC100506190 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00963 48429 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 132244062 132244824 132244277 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 332 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 132247452 132247693 132247545 Y C9orf106 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 3722 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 132249735 132250094 132249903 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 6005 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 132330921 132331424 132331168 Y IER5L,C9orf50 NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71020 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 132514052 132514155 132514104 Y NA PTGES,TOR1B NA NA NA NA PTGES 726 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 132539303 132540203 132539702 Y C9orf106,FNBP1,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 23229 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chr9 132785309 132785843 132785545 Y USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 17630 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chr9 134316967 134317380 134317020 Y NA PRRC2B NA NA NA NA PRRC2B 49487 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 137288067 137288421 137288149 Y BRD3,RXRA NA NA NA NA NA RXRA 81123 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 139541579 139541677 139541660 Y NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7 AGPAT2 SEC16A,C9orf163 K562 ChIA-PET 22265404 AGPAT2 38198 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 139608810 139609132 139608936 Y SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3788 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 5.41023994264608 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.59124704195473 chr9 140163781 140164247 140164025 Y NA TUBB4B,NRARP NA NA NA NA TUBB4B 30116 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 140388730 140388770 140388753 Y FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1 NA NA NA NA NA MRPL41 54881 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 140523205 140523460 140523276 Y ANAPC2,NDOR1,EHMT1 ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA EHMT1 11761 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chrX 9509355 9509595 9509475 Y NA NA NA NA NA NA TBL1X 80020 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 11131962 11132102 11132014 Y HCCS RP11-120D5.1,HCCS NA NA NA NA HCCS 4541 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 11843387 11843764 11843576 Y NA NA NA NA NA NA MSL3 69109 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 13711501 13711681 13711616 Y ATXN3L,RAB9A RAB9A,TRAPPC2,OFD1 NA NA NA NA RAB9A 6257 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 18488966 18489254 18489110 Y NA CDKL5 NA NA NA NA CDKL5 47263 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 19815616 19815777 19815695 Y RPS6KA3,SH3KBP1,SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 87942 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 20283183 20283718 20283506 Y SH3KBP1,RPS6KA3 NA NA NA NA NA RPS6KA3 0 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 29678122 29678339 29678241 Y NA NA NA NA NA NA FTLP2 968076 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 30679380 30679764 30679404 Y NA FTLP2,GK NA NA NA NA GK 9904 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 40691770 40692090 40691930 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 73147 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 41097774 41098084 41098012 Y USP9X,GPR82,DDX3X NA NA NA NA NA DDX3X 92567 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chrX 44877456 44877597 44877527 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 146699 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 46148096 46148185 46148140 Y NA RP1-30G7.2 NA NA NA NA RP1-30G7.2 36895 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 46316161 46316444 46316394 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18012 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 53292881 53293274 53292937 Y NA KDM5C NA NA NA NA KDM5C 40277 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 57420009 57420263 57420031 Y NA NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 273914 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 58292059 58292236 58292148 Y NA NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 1145964 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 64255385 64255512 64255449 Y ZC4H2 ZC4H2 NA NA NA NA ZC4H2 2792 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 145914 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA RNU1-56P,SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 1.27299763356378 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA PRPS1 84528 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chrX 109429267 109429621 109429491 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA TMEM164 185408 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 120331489 120331718 120331553 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 569484 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.86424467551851 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 2.22774585873662 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.636498816781892 chrX 134138094 134138444 134138243 Y NA FAM127C,FAM127A,FAM127B NA NA NA NA FAM127C 16115 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946 chrY 23402211 23402477 23402342 Y NA NA NA NA NA NA NA NA CAGE 1C3D3 hg19 FANTOM5 0.318249408390946