chr1 855764 856157 855856 Y NA SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1 NA NA NA NA SAMD11 2103 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 858256 858648 858448 Y SAMD11 NOC2L,KLHL17,PLEKHN1 NA NA NA NA SAMD11 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr1 1014834 1015095 1014859 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 RNF223 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RP11-465B22.3 21720 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 1136075 1136463 1136398 Y HES4,ISG15 SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA SDF4 28948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 1136667 1137146 1136877 Y HES4,MIB2 SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA SDF4 28265 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 1456676 1456699 1456688 Y NA ATAD3A NA NA NA NA ATAD3A 11145 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 2162325 2162996 2162733 Y TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 20166 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 2190530 2190674 2190620 Y TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 48371 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 6261 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 6336471 6336830 6336716 Y ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7 ICMT,GPR153 GPR153 K562 ChIA-PET 22265404 GPR153 17436 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 7177733 7177848 7177794 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 334349 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 7207208 7207593 7207350 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 363824 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 7359415 7359679 7359556 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 469650 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 7531062 7531540 7531160 Y PARK7 NA NA NA NA NA VAMP3 297789 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 7538871 7539273 7539100 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 290056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 7540504 7540548 7540528 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 288781 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 7551468 7551846 7551701 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 277483 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 7609389 7609632 7609504 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 219697 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 7843556 7843653 7843585 Y PER3 VAMP3,PER3 NA NA NA NA PER3 1176 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 8157417 8157780 8157543 Y NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 73049 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 8198088 8198334 8198235 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 113720 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 8229904 8230047 8229996 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 145536 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 8257762 8258040 8257906 Y NA NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 173394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 8262223 8262541 8262360 Y ERRFI1 NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 177855 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr1 8272041 8272390 8272277 Y NA NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 187673 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr1 8686491 8686867 8686745 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 188835 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 8762126 8762475 8762428 Y NA NA NA NA NA NA RERE 113227 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 9293549 9293739 9293591 Y H6PD H6PD NA NA NA NA H6PD 715 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 9298798 9298942 9298853 Y NA H6PD NA NA NA NA H6PD 5964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr1 9760502 9760837 9760631 Y NA RP11-558F24.4 NA NA NA NA RP11-558F24.4 14889 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 9885367 9885695 9885655 Y NA CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 2783 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 10447707 10448369 10448247 Y NA PGD,APITD1,APITD1-CORT NA NA NA NA PGD 8280 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 10960432 10960567 10960498 Y NA NA PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CASZ1 105725 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 11410602 11410834 11410718 Y NA NA FBXO2,FBXO44,UBIAD1 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 79339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 11559549 11559947 11559917 Y NA PTCHD2 NA NA NA NA PTCHD2 22326 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 11798209 11798600 11798405 Y FBXO6,AGTRAP,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2,MTHFR,CLCN6 MAD2L2,AGTRAP,C1orf167 NA NA NA NA AGTRAP 4068 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 11990003 11990329 11990105 Y PLOD1 KIAA2013,PLOD1,MFN2 NA NA NA NA PLOD1 1933 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 12485613 12485784 12485698 Y PRAMEF1,AADACL4 NA NA NA NA NA DHRS3 189953 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 12599928 12600179 12600028 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 75558 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 13931629 13932064 13931884 Y PRDM2,PDPN NA NA NA NA NA PRDM2 92629 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 14656585 14656699 14656641 Y NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 KAZN 266501 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 15499033 15499473 15499185 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 22005 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 15519488 15519688 15519655 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 42460 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 15649550 15649749 15649647 Y PLEKHM2,EFHD2,CASP9 NA EFHD2 IMR90 Hi-C 24141950 FHAD1 77782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.98124888041785 chr1 15738661 15738986 15738829 Y SPEN,PLEKHM2,DDI2,EFHD2,CASP9,CASP9 EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 4270 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 15781625 15781660 15781643 Y NA EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 47234 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 15786440 15786713 15786642 Y PLEKHM2,CTRC,CELA2A,CELA2B NA NA NA NA NA EFHD2 52049 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 RP11-169K16.4,FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 16158409 16158760 16158690 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 5685 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 16292565 16293101 16292653 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 7526 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17,HSPB7 NA NA NA NA HSPB7 4493 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 16342592 16343008 16342942 Y SLC25A34,HSPB7 ZBTB17,HSPB7 NA NA NA NA HSPB7 1081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 16508402 16508642 16508565 Y FBLIM1 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 27820 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA RNU1-1 SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-1 12489 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.98124888041785 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr1 17425016 17425355 17425116 Y PADI4,PADI2 SDHB NA NA NA NA SDHB 46351 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 17518941 17519138 17519054 Y ATP13A2,PADI3 NA NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 SDHB 140276 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 10.9490069707302 chr1 17896198 17896624 17896362 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 31868 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 21401731 21402159 21402110 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 3485 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr1 21588829 21589430 21588896 Y ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 80567 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 21655798 21656254 21656078 Y NA ECE1 NA NA NA NA ECE1 13743 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 21724067 21724372 21724186 Y NA NBPF3 ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48 IMR90 Hi-C 24141950 NBPF3 40249 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 22066009 22066225 22066117 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 41874 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 22863291 22863389 22863341 Y LOC729059 NA NA NA NA NA ZBTB40 86947 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 23003504 23003620 23003562 Y LOC729059 NA NA NA NA NA ZBTB40 227160 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 23076914 23077145 23077061 Y NA NA NA NA NA NA KDM1A 266796 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA NA NA NA NA NA ZNF436 55038 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 23849183 23849405 23849280 Y PNRC2,RPL11 ASAP3,E2F2,ID3 NA NA NA NA E2F2 6307 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.66842010982555 chr1 23903714 23904323 23904234 Y ID3 E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 19429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 23912037 23912393 23912293 Y PNRC2,RPL11 ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 27752 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 23961555 23961694 23961621 Y NA NA NA NA NA NA RPL11 54575 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 24063897 24064210 24064053 Y PNRC2,RPL11 RPL11,TCEB3,PITHD1 RPL11 IMR90 Hi-C 24141950 TCEB3 3435 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 24349340 24349488 24349411 Y NA RP11-4M23.7 LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-4M23.7 16331 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 25095502 25095845 25095665 Y NA CLIC4 NA NA NA NA CLIC4 25654 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 25559638 25560067 25559796 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 SYF2 NA NA NA NA SYF2 2645 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 26452850 26453250 26452988 Y FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L PDIK1L,ZNF593,CNKSR1 NA NA NA NA PDIK1L 17186 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 26490998 26491259 26491133 Y NA ZNF593,CNKSR1 NA NA NA NA ZNF593 3103 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr1 27336678 27336931 27336804 Y NA RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA FAM46B 396 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 27625914 27626081 27626007 Y TRNP1,MAP3K6,TMEM222 TMEM222,RP11-4K3__A.5 NA NA NA NA TMEM222 20570 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr1 27762936 27763307 27763206 Y WASF2,STX12,FGR,FGR,FGR,C1orf38 GPR3 NA NA NA NA GPR3 45788 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 27831022 27831314 27831199 Y NA WASF2 SYTL1,GPR3,WASF2,AHDC1,FGR IMR90 Hi-C 24141950 WASF2 16353 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 27986111 27986384 27986268 Y EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 10345 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 28776524 28777127 28776532 Y NA NA NA NA NA NA RCC1 53328 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 29214759 29214998 29214903 Y GMEB1,EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 3156 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 29563709 29564430 29563877 Y PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 2681 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 31223594 31223943 31223836 Y LAPTM5 NA NA NA NA NA SDC3 155665 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 31360609 31360977 31360897 Y NA SDC3 NA NA NA NA SDC3 18631 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 31517703 31518005 31517854 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 18833 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 31602770 31603168 31602969 Y NKAIN1 NA PRO0611,PUM1,NKAIN1,SNRNP40 IMR90 Hi-C 24141950 PUM1 65932 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 32108020 32108204 32108102 Y NA PEF1 NA NA NA NA PEF1 293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 32253647 32254040 32253861 Y LCK BAI2 NA NA NA NA BAI2 25153 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 32405536 32405898 32405618 Y NA PTP4A2 NA NA NA NA PTP4A2 2559 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 33082385 33082406 33082394 Y ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 32098 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 33182280 33182513 33182368 Y KIAA1522 SYNC SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYNC 15083 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 33202470 33202806 33202641 Y ZBTB8OS,RBBP4,RBBP4,KIAA1522 SYNC KIAA1522 K562 ChIA-PET 22265404 SYNC 35273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 NA NA NA NA NA S100PBP 54284 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 33428474 33429020 33428770 Y NA RNF19B NA NA NA NA RNF19B 188 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 33454783 33455472 33455325 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 26497 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 36489072 36489418 36489191 Y NA NA COL8A2,TEKT2,ADPRHL2 IMR90 Hi-C 24141950 ADPRHL2 63058 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 ADPRHL2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.79670781574847 chr1 37885584 37885820 37885702 Y NA NA NA NA NA NA LINC01137 52192 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 39596184 39596482 39596236 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 51196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 39624919 39625154 39625144 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 79931 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 39791626 39791706 39791638 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 82445 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 6.67368043930222 chr1 41495531 41495820 41495676 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 169513 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 41501440 41501773 41501639 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 175422 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA EDN2 NA NA NA NA EDN2 13581 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 41981831 41982007 41981926 Y SLFNL1,SLFNL1 EDN2 NA NA NA NA EDN2 33487 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 179507 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2 NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 44240162 44240471 44240217 Y ATP6V0B NA NA NA NA NA ST3GAL3 70667 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 44430681 44431060 44430788 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24 NA NA NA NA DPH2 2612 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 44950888 44951090 44950987 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 82022 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 45167170 45167180 45167175 Y NA TMEM53,RNU5F-1,KIF2C NA NA NA NA RNU5F-1 18394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 45746932 45746947 45746939 Y NA ZSWIM5,HPDL ZSWIM5,UROD,HECTD3 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM5 22934 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 12688 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 46268583 46268737 46268651 Y NA MAST2 NA NA NA NA MAST2 17924 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 46573980 46574380 46574180 Y TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA PIK3R3 65780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA2 196779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 51097851 51098184 51098018 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA2 210679 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 51454917 51455119 51455049 Y NA FAF1,CDKN2C NA NA NA NA CDKN2C 30500 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 51475745 51476056 51475832 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2C 51328 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 54739679 54739787 54739710 Y NA NA NA NA NA NA CYB5RL 75970 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 54744858 54745090 54744974 Y NA NA CYB5RL,MRPL37 IMR90 Hi-C 24141950 CYB5RL 81149 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 57906316 57906442 57906379 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P15 613710 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 32988 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA JUN 121264 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 61522505 61523042 61522705 Y NFIA,NFIA,NFIA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 193574 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 61583915 61584228 61583999 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 254984 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 61768031 61768305 61768169 Y NA NA NA NA NA NA TM2D1 420790 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 62773248 62773553 62773401 Y NA KANK4 NA NA NA NA KANK4 9532 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 64051806 64051915 64051861 Y NA PGM1,ITGB3BP NA NA NA NA PGM1 5032 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 65363729 65364057 65363938 Y JAK1 NA NA NA NA NA JAK1 66130 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 65421731 65422136 65422135 Y NA JAK1,RP11-182I10.3 NA NA NA NA JAK1 8051 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 65527577 65527856 65527728 Y NA RP4-535B20.1 AK4 K562 ChIA-PET 22265404 RP4-535B20.1 3564 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 65701792 65701883 65701838 Y NA DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 10019 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 65946781 65947169 65947001 Y NA NA NA NA NA NA LEPROT 62511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 65992905 65993110 65992971 Y NA NA NA NA NA NA LEPROT 108635 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 66603112 66603115 66603114 Y PDE4B NA NA NA NA NA LEPROT 718842 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 68077196 68077460 68077328 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90 Hi-C 24141950 GADD45A 71284 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 68314949 68315302 68315127 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 17799 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 68316516 68316582 68316549 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 19366 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 68364057 68364377 68364218 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 66907 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 68572958 68573227 68573176 Y NA NA NA NA NA NA WLS 123576 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 68688308 68688621 68688465 Y NA WLS,RPS7P4 NA NA NA NA WLS 8182 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 14453 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 16.5799248413914 chr1 70635460 70635702 70635581 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA LRRC40 33601 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 70877943 70877992 70877968 Y CTH CTH NA NA NA NA CTH 3042 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 75182913 75182976 75182918 Y NA TYW3,CRYZ NA NA NA NA TYW3 13860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 78021710 78022056 78021808 Y AK5,AK5,FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 125048 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 78026939 78027232 78027062 Y FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 119872 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr1 85007374 85007584 85007581 Y NA GNG5,CTBS NA NA NA NA CTBS 30579 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr1 85248638 85248992 85248815 Y NA NA GNG5,MCOLN2,TTLL7,LPAR3,PRKACB IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 94152 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 85667688 85667915 85667906 Y NA SYDE2 NA NA NA NA SYDE2 2959 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 85794698 85795078 85794848 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 53925 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 87799623 87799998 87799801 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 7472 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 88716578 88716942 88716762 Y NA NA NA NA NA NA PKN2 430963 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 88907516 88907759 88907638 Y NA NA NA NA NA NA PKN2 240146 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr1 89887466 89887838 89887537 Y GBP3,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B NA NA NA NA NA LRRC8B 100557 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 90101821 90102213 90101853 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 5190 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 91322848 91323191 91323185 Y NA RP4-665J23.1 NA NA NA NA RP4-665J23.1 7641 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 186435 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 92184014 92184251 92184134 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 185641 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 92189033 92189061 92189048 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 180831 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 92295673 92296022 92295848 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 73870 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 92725087 92725311 92725273 Y RPAP2,GLMN RPAP2,GLMN NA NA NA NA RPAP2 37211 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 151050 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.33684021965111 chr1 94224546 94224929 94224684 Y DNTTIP2 NA MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L IMR90 Hi-C 24141950 MIR760 85459 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 94244939 94245309 94245199 Y ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3 NA BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 65079 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 95179307 95179605 95179478 Y F3 NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 104232 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 95811904 95812058 95811981 Y NA NA NA NA NA NA RWDD3 114193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 97291085 97291340 97291213 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 105864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 97308752 97309076 97308966 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 123531 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 372241 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 98334223 98334553 98334370 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 50052 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 221450 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 100000188 100000393 100000274 Y NA NA LPPR5 IMR90 Hi-C 24141950 PALMD 109106 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 100138206 100138591 100138311 Y AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD PALMD NA NA NA NA PALMD 28707 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 100678369 100678762 100678562 Y NA DBT NA NA NA NA DBT 34628 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 100828525 100828922 100828611 Y SASS6 CDC14A NA NA NA NA CDC14A 19941 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.29407765101014 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA NA NA NA NA NA EXTL2 156983 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 101392986 101393260 101393033 Y S1PR1,SLC30A7,SLC30A7 EXTL2,SLC30A7 NA NA NA NA SLC30A7 33354 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 108231996 108232161 108232053 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A24 509310 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 108741685 108742156 108741931 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 214 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 110151943 110152270 110152107 Y NA AMPD2,GSTM4 NA NA NA NA AMPD2 4456 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 110271520 110271826 110271755 Y GSTM3 GSTM3 NA NA NA NA GSTM3 10558 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 110435112 110435421 110435324 Y SORT1,SORT1 CSF1 CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,AHCYL1,GNAI3,GSTM4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 15443 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 110927812 110928210 110927883 Y CD53,FAM40A,RBM15 RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4 NA NA NA NA SLC16A4 3494 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 111163364 111163623 111163482 Y PROK1 NA NA NA NA NA SLC16A4 231660 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 111489179 111489247 111489213 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 15454 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 111996023 111996307 111996190 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 6025 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 112438367 112438956 112438733 Y NA NA NA NA NA NA FAM212B 141921 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 113086746 113087141 113086830 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 72654 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 113525578 113525919 113525789 Y NA SLC16A1-AS1,SLC16A1 SLC16A1,AKR7A2P1,LRIG2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC16A1 27943 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 114950620 114950667 114950644 Y NA NA NA NA NA NA TRIM33 101114 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 NA NA NA NA NA SIKE1 283884 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 115873164 115873576 115873409 Y NGF NA NA NA NA NA VANGL1 308998 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 116588429 116588746 116588471 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 71310 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 117082797 117083071 117083005 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 28590 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 119506251 119506502 119506377 Y NA NA NA NA NA NA RP11-418J17.1 174517 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 144941125 144941602 144941408 Y NA NA NA NA NA NA NBPF9 131381 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 145454760 145454851 145454762 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L NA NA NA NA POLR3GL 13537 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 145519496 145519624 145519499 Y NBPF10,TXNIP LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B NA NA NA NA PEX11B 5244 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 146956714 146956895 146956804 Y GPR89B NA NA NA NA NA BCL9 54287 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 147775754 147775884 147775851 Y NBPF14 RNU1-120P,RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 29002 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.5453927333793 chr1 147825273 147825748 147825617 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 20387 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SF3B4,MTMR11 NA NA NA NA MTMR11 4109 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 150600412 150600701 150600561 Y CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 ENSA NA NA NA NA ENSA 324 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA CERS2 4090 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 151255796 151256115 151256047 Y NA PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB NA NA NA NA RP11-126K1.2 3391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 151284018 151284391 151284246 Y FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5 NA NA NA NA PI4KB 13800 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 151344220 151344519 151344431 Y NA PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4 NA NA NA NA SELENBP1 1011 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 151580936 151581099 151580976 Y NA SNX27,RP11-404E16.1 RIIAD1,CELF3 IMR90 Hi-C 24141950 SNX27 1442 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 151809390 151809745 151809546 Y RORC,C2CD4D RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,AL450992.2 NA NA NA NA AL450992.2 2608 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr1 152022022 152022514 152022379 Y SNX27,S100A10,S100A11 S100A11 THEM4 MCF7 ChIA-PET 22265404 S100A11 3639 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 BX470102.3,S100A6,S100A4,S100A16,S100A14 NA NA NA NA S100A4 20406 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 153670755 153671012 153670885 Y S100A9,S100A12 SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3 NA NA NA NA NPR1 21642 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 153671679 153672046 153671861 Y NA SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3 NA NA NA NA NPR1 22566 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 154529043 154529152 154529118 Y NA UBE2Q1 NA NA NA NA UBE2Q1 352 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 154977099 154977253 154977190 Y ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 3972 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 154997722 154998120 154997917 Y NA FLAD1,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3 NA NA NA NA ADAM15 22922 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 155097183 155097419 155097260 Y NA EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2 NA NA NA NA EFNA1 517 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA KRTCAP2,MIR92B,MTX1,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 155535083 155535193 155535176 Y HCN3 ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L 4485 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 155703696 155704096 155703788 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA YY1AP1 46905 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 156073142 156073699 156073532 Y YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 22778 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 156074715 156075305 156075042 Y YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 24351 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.08552513728194 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 156103413 156103690 156103594 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA NA NA NA NA NA LMNA 53049 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 156134935 156135401 156135063 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2 SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1 NA NA NA NA SLC25A44 26479 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr1 156473111 156473378 156473326 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1 MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4491 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 156629760 156630406 156629967 Y PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2 RP11-284F21.7,NES NA NA NA NA RP11-284F21.7 544 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 157964633 157965029 157964831 Y OR10T2 KIRREL NA NA NA NA KIRREL 3570 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 158982200 158982857 158982480 Y AIM2,PYHIN1,IFI16 IFI16 NA NA NA NA IFI16 14442 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 158994687 158995148 158994758 Y OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A IFI16 NA NA NA NA IFI16 26929 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 159270044 159270159 159270076 Y OR10J1 NA NA NA NA NA IFI16 302286 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 159851477 159851987 159851825 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15966 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 159878004 159878104 159878054 Y NCSTN,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 10051 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 160203977 160204039 160204035 Y NA PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 25495 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 160379189 160379307 160379249 Y NA NA NA NA NA NA COPA 67999 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 160696081 160696317 160696161 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 166453 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A HSPA6 NA NA NA NA HSPA6 8572 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA HSPA6 90176 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 162508612 162508929 162508802 Y UAP1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 20394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 162539981 162540420 162539994 Y C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 10658 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 162659800 162660152 162659976 Y NA NA NA NA NA NA DDR2 60637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 164389251 164389388 164389267 Y NA NA NA NA NA NA HMGB3P6 65247 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 164717528 164717907 164717706 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 194707 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 173165720 173166046 173165883 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 278359 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 173384654 173384941 173384742 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 59464 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 176174471 176174980 176174673 Y RFWD2 NA NA NA NA NA RFWD2,RP11-195C7.1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 177151173 177151362 177151277 Y ASTN1,FAM5B NA NA NA NA NA RP11-568K15.1 853723 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 178758932 178759269 178759101 Y NA NA NA NA NA NA RALGPS2 66632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 179153644 179153909 179153868 Y NA ABL2 NA NA NA NA ABL2 42910 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 179290775 179290979 179290800 Y NA SOAT1 NA NA NA NA SOAT1 29850 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 LHX4 NA NA NA NA LHX4 2894 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 180613229 180613603 180613357 Y NA XPR1 NA NA NA NA XPR1 14089 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 181065454 181065797 181065538 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 9816 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr1 182056560 182056703 182056632 Y NA NA TEDDM1,GLUL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 302638 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 182070634 182071001 182070793 Y NA NA CACNA1E IMR90 Hi-C 24141950 GLUL 288340 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 182585205 182585710 182585424 Y NA RNASEL,RGS16 NA NA NA NA RGS16 13662 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 183594812 183595033 183594923 Y NA NCF2,ARPC5 NA NA NA NA ARPC5 7859 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 184794829 184794875 184794854 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 72782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 184809721 184810151 184809898 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 87674 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 185032022 185032401 185032047 Y SWT1,SWT1,IVNS1ABP,RNF2 RNF2 NA NA NA NA RNF2 19526 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 185253692 185254037 185253865 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 30424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 185264835 185265233 185265202 Y NA IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 19228 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 192583467 192583478 192583473 Y RGS1 NA UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 99835 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 193080839 193080969 193080896 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 7595 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 193726401 193726456 193726429 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 637254 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 197908297 197908430 197908355 Y NA C1orf53,LHX9 NA NA NA NA LHX9 29260 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 198124316 198124670 198124458 Y C1orf53,NEK7 NEK7 NA NA NA NA NEK7 223 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 198127475 198127965 198127580 Y NA NEK7 NA NA NA NA NEK7 3382 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 198625518 198626374 198625745 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 501425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 200622357 200622464 200622411 Y NA KIF14,DDX59 NA NA NA NA DDX59 14633 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 201139670 201140154 201139905 Y NA TMEM9 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 968 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 201449602 201449822 201449716 Y LAD1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 PHLDA3 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA3 13237 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 201469668 201470038 201469853 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 4331 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.29407765101014 chr1 201494461 201494578 201494476 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 17877 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 201618983 201619286 201619160 Y NA NA NA NA NA NA CSRP1 142399 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NA NA NA NA NA CSRP1 142799 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA IPO9 112029 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 202131734 202131905 202131820 Y PTPN7,PTPN7 ARL8A NA NA NA NA ARL8A 19865 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA ADORA1 NA NA NA NA ADORA1 43291 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 203794311 203794511 203794411 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 31529 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 204049581 204049822 204049645 Y LAX1,PIK3C2B,SOX13 SOX13 NA NA NA NA SOX13 9338 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 204363456 204363666 204363499 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 15253 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.66842010982555 chr1 204388302 204388627 204388415 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 9383 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr1 204389721 204389989 204389958 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 10802 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 204430759 204431008 204430941 Y SOX13,PIK3C2B PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 30844 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 204432329 204432499 204432494 Y SOX13,PIK3C2B PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 29353 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 205267691 205267999 205267801 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 20884 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 205288770 205288915 205288818 Y TMEM81,RBBP5,NUAK2 NA NA NA NA NA NUAK2 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 12504 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 205413830 205414535 205414383 Y NA LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 8547 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 205709805 205710150 205710085 Y NA NUCKS1,RAB7L1 NA NA NA NA NUCKS1 7254 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 206752030 206752370 206752201 Y RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 31534 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 206897147 206897463 206897235 Y RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 40858 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 206918122 206918360 206918230 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 61833 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 207030573 207030797 207030685 Y RASSF5,IL19,IL19 IL24,RP11-564A8.4 IL20 IMR90 Hi-C 24141950 IL24 37991 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 4359 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 207265739 207265906 207265769 Y NA PFKFB2,YOD1,C4BPB,C4BPA NA NA NA NA C4BPB 5552 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 207413364 207413503 207413411 Y IL19,CD55 NA CD55 MCF7 ChIA-PET 22265404 CD55 79350 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 207509006 207509478 207509176 Y CR1,CD46,CD55 CD55 NA NA NA NA CD55 16153 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 208381145 208381344 208381321 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 34321 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 208388887 208389573 208389450 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 26092 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 208418631 208418859 208418806 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2966 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 208946880 208946889 208946885 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P1 492679 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 209633173 209633397 209633285 Y NA NA NA NA NA NA LAMB3 190414 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 211688648 211688771 211688711 Y NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61313 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA RP11-354K1.1,NEK2 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 212102475 212102639 212102508 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 100361 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 NA NA NA NA NA PPP2R5A 56451 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr1 212661846 212662402 212662104 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 57617 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.29407765101014 chr1 212769584 212769966 212769788 Y ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3 ATF3 NA NA NA NA ATF3 32908 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 212808992 212809268 212809126 Y VASH2,PPP2R5A RP11-338C15.3 NA NA NA NA RP11-338C15.3 27508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 212864843 212865470 212865177 Y BATF3 RP11-338C15.3 NA NA NA NA RP11-338C15.3 28067 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 219514172 219514180 219514178 Y NA NA RRP15,TGFB2,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 168986 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 221048646 221048850 221048821 Y NA NA NA NA NA NA MARC1 90545 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 221201814 221202202 221201887 Y HLX NA NA NA NA NA MARC1 243713 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 221567491 221567844 221567649 Y NA NA C1orf140,HLX IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 345674 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHIPL2 80241 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr1 224026476 224026743 224026681 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 4931 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 8.86348183344825 chr1 224545542 224546006 224545661 Y FBXO28,CNIH4 NVL,CNIH4 NA NA NA NA CNIH4 2990 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 226014145 226014403 226014226 Y EPHX1,EPHX1 EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 18351 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 226263544 226263865 226263697 Y C1orf55 H3F3A NA NA NA NA H3F3A 15992 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 226315308 226315548 226315420 Y PARP1 NA NA NA NA NA ACBD3 56883 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 226366367 226366621 226366494 Y NA ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 5810 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 226430284 226430401 226430343 Y NA NA NA NA NA NA ACBD3 57853 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr1 227751865 227752213 227752044 Y ZNF678 ZNF678 NA NA NA NA ZNF678 2621 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 228273480 228273740 228273633 Y ARF1,ARF1 ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5119 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 228350789 228351109 228350864 Y JMJD4 GUK1,IBA57,C1orf145 NA NA NA NA IBA57 407 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 228688608 228688902 228688729 Y HIST3H2A HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA RNF187 15846 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 230249347 230250007 230249645 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 57811 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA NA NA NA NA NA COG2 113086 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 232428903 232429197 232429192 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 536736 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 232714427 232714703 232714513 Y NA NA SIPA1L2,TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 251230 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.5453927333793 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 233763307 233763375 233763341 Y KCNK1 KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 15557 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 234669721 234669929 234669823 Y NA NA LOC100506795 K562 ChIA-PET 22265404 TARBP1 56872 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.66842010982555 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 234749342 234749645 234749570 Y IRF2BP2 IRF2BP2 LINC00184,LOC100506810,ARID4B IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 6071 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 234857710 234858181 234857899 Y NA NA NA NA NA NA LINC01132 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC01132 50362 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORA14B 191182 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 235120162 235120433 235120341 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORA14B 168819 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 235122652 235122939 235122843 Y NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORA14B 166313 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 235133014 235133422 235133155 Y NA NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORA14B 155830 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B SNORA14B,TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SNORA14B 42395 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 235267591 235267744 235267678 Y NA SNORA14B,TOMM20 NA NA NA NA SNORA14B 21508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 237007861 237008154 237008008 Y NA NA NA NA NA NA MTR 51251 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 237029172 237029469 237029246 Y NA NA NA NA NA NA MTR 72562 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P1 491614 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 15.1200572452941 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 241771916 241772216 241772151 Y KMO CHML NA NA NA NA CHML 25016 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 241781298 241781471 241781421 Y NA CHML NA NA NA NA CHML 15761 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 244212276 244213430 244213047 Y NA NA NA NA NA NA ADSS 400006 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 244525463 244525578 244525509 Y NA NA NA NA NA NA ADSS 87858 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr1 246323685 246324051 246324002 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 344563 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 246469940 246470214 246470139 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 198400 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr1 246588477 246588670 246588563 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 79944 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA MIR3124 224044 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 10.8447307138661 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 307117 307186 307176 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 128712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 564401 564761 564664 Y ZMYND11,ZMYND11 NA NA NA NA NA DIP2C 168922 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 903940 904213 904109 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 71351 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 3216614 3216797 3216708 Y NA PITRM1 NA NA NA NA PITRM1 3611 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 3511181 3511689 3511507 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 298178 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 3524547 3524820 3524727 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 300653 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr10 3542742 3543014 3542849 Y NA NA LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 282459 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr10 3598970 3599136 3599051 Y KLF6 NA NA NA NA NA KLF6 226337 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr10 3808656 3808872 3808754 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 16601 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 3867491 3867713 3867639 Y NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42018 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 3928866 3929216 3928980 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 103393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 3929991 3930887 3930290 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 104518 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 3937227 3937631 3937383 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 111754 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 4034997 4035363 4035214 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 209524 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 4386754 4387085 4386858 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 561281 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 4396174 4396330 4396296 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 570701 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA NA NA NA NA NA AKR1C2 352440 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA NET1 51913 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 5770570 5770836 5770703 Y NA FAM208B NA NA NA NA FAM208B 45769 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 5783071 5783414 5783247 Y NA NA GDI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 58270 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 6237775 6238114 6237949 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 52894 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 6321537 6321781 6321618 Y NA NA NA NA NA NA PFKFB3 136656 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 6449763 6450038 6449901 Y PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 264882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 6764164 6764384 6764289 Y NA RP11-554I8.2 LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-554I8.2 12960 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 7275320 7275743 7275581 Y NA NA NA NA NA NA RP11-554I8.2 497976 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 8457951 8458678 8458502 Y GATA3 NA NA NA NA NA TAF3 599484 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 9115735 9116358 9115988 Y NA NA GATA3,FLJ45983 MCF7 ChIA-PET 22265404 TAF3 1257268 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 9488870 9489204 9489037 Y NA NA CELF2 IMR90 Hi-C 24141950 TAF3 1630403 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 11652835 11653073 11652954 Y CELF2,USP6NL USP6NL NA NA NA NA USP6NL 1082 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 12762455 12762628 12762543 Y NA NA NA NA NA NA CAMK1D 372974 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 12823373 12823670 12823432 Y NA NA NA NA NA NA OPTN 315779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 13388296 13388525 13388411 Y NA PHYH NA NA NA NA SEPHS1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 14602319 14602604 14602483 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 212292 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 172933 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 14931162 14931541 14931180 Y NA SUV39H2 NA NA NA NA SUV39H2 12343 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 14955590 14955884 14955736 Y HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2 SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1 NA NA NA NA SUV39H2 36771 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 15158719 15159034 15158939 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA C10orf111 21401 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 17067559 17067950 17067759 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 174103 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 17652629 17652974 17652802 Y NA PTPLA,STAM NA NA NA NA PTPLA 4402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 17707752 17708081 17707913 Y VIM,ST8SIA6,STAM STAM NA NA NA NA STAM 23628 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 21317807 21317920 21317859 Y C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 143196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr10 21703520 21703700 21703684 Y NA NA MLLT10 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT10 117394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr10 21816987 21817223 21817104 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 3871 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 21991974 21992366 21992143 Y NA NA NA NA NA NA MLLT10 170880 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 22201596 22201935 22201928 Y EBLN1 RN7SKP37 NA NA NA NA RN7SKP37 18137 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 22242936 22243341 22243231 Y NA RN7SKP37,DNAJC1 NA NA NA NA RN7SKP37 22864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 22265792 22265961 22265887 Y NA RN7SKP37,DNAJC1 NA NA NA NA DNAJC1 24737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 22887940 22888243 22888209 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 113241 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 22890368 22890535 22890414 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 110949 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 23801336 23801634 23801483 Y OTUD1 NA NA NA NA NA OTUD1 75138 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 24754185 24754590 24754306 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 256007 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 25602421 25602556 25602489 Y NA NA NA NA NA NA THNSL1 298834 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 26775274 26775560 26775412 Y APBB1IP,PDSS1,ABI1 NA NA NA NA NA APBB1IP 50142 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 26775885 26776759 26776046 Y APBB1IP,ABI1 NA NA NA NA NA APBB1IP 50753 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 27026601 27027004 27026841 Y MASTL,APBB1IP,PDSS1,ABI1 PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 42013 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 27028326 27028583 27028339 Y MASTL,PDSS1,ABI1 PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 43738 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 27354652 27354729 27354695 Y NA ANKRD26 NA NA NA NA ANKRD26 32692 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr10 28002936 28003088 28002983 Y ARMC4,MKX RP11-360I20.2,MKX NA NA NA NA RP11-360I20.2 28627 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr10 28957755 28957993 28957831 Y BAMBI BAMBI BAMBI K562 ChIA-PET 22265404 BAMBI 6278 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 30711320 30711474 30711381 Y MAP3K8 MTPAP,MAP3K8 MAP3K8 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K8 9392 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 30720407 30720642 30720475 Y MAP3K8 MAP3K8 NA NA NA NA MAP3K8 224 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr10 30756708 30756891 30756779 Y MAP3K8 MAP3K8 NA NA NA NA MAP3K8 35842 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr10 32215994 32216410 32215998 Y NA ARHGAP12 NA NA NA NA ARHGAP12 252 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 32301568 32301771 32301670 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 41588 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 32335843 32336217 32336161 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 7142 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 32438322 32438553 32438446 Y NA RPS4XP11 KIF5B,ARHGAP12,EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP11 48101 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 32611846 32612286 32612204 Y EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 53440 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA ITGB1 NA NA NA NA ITGB1 41416 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr10 34391167 34391516 34391265 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 559513 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 35195075 35195256 35195166 Y NA SS18L2P1 PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 SS18L2P1 32937 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11093 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 44046358 44046416 44046387 Y NA ZNF239 NA NA NA NA ZNF239 21650 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 47057375 47057652 47057526 Y NA NA GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-38L15.3 107903 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 47092943 47093271 47093193 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 143471 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 50462696 50462912 50462787 Y C10orf128 NA WDFY4,VSTM4 IMR90 Hi-C 24141950 PGBD3 282174 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 51039519 51039692 51039605 Y NA NA NA NA NA NA OGDHL 71094 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 51488946 51489392 51489137 Y NCOA4,NCOA4,NCOA4 RP11-109G10.2 NA NA NA NA RP11-109G10.2 41180 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 NA SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM21A 212192 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr10 52085013 52085461 52085351 Y FAM21A NA NA NA NA NA FAM21A 259365 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 52154516 52154956 52154688 Y FAM21A NA NA NA NA NA SGMS1 227967 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 62674070 62674082 62674076 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB1 85116 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 63596779 63597177 63597154 Y NA NA RHOBTB1,C10orf107,ARID5B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID5B 61882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 63658924 63659147 63659031 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr10 63698832 63699053 63698915 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 39773 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 63702592 63703184 63702855 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 43533 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 63747685 63748213 63747937 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 88626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 63752119 63752912 63752632 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 93060 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr10 63778860 63779091 63779011 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 119801 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 63803306 63803648 63803427 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 144247 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 63805040 63805237 63805084 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 145981 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 63814731 63815034 63814907 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 155672 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 63979384 63979550 63979547 Y NA RTKN2 NA NA NA NA RTKN2 46916 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 64320064 64320236 64320175 Y NA NA NA NA NA NA ZNF365 188113 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 65016713 65017097 65017085 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 125663 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 65274637 65275000 65274913 Y NA REEP3 JMJD1C,REEP3 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 4123 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 68137896 68138170 68138033 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 1457754 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 69550767 69550960 69550901 Y NA DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 44964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr10 69778500 69778679 69778642 Y NA NA NA NA NA NA HERC4 54426 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 69796463 69796828 69796573 Y HERC4 HERC4 NA NA NA NA HERC4 36277 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 69854882 69855277 69855187 Y HERC4 HERC4,MYPN ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYPN 8635 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr10 69913307 69913725 69913572 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 MYPN NA NA NA NA MYPN 49395 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 70088080 70088572 70088236 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 HNRNPH3,PBLD NA NA NA NA HNRNPH3 359 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 70782889 70783013 70782952 Y NA KIAA1279 NA NA NA NA KIAA1279 36402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 70821151 70821852 70821361 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 24010 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 70976966 70977432 70977124 Y DDX21,SRGN,VPS26A SUPV3L1,RP11-227H15.4 NA NA NA NA RP11-227H15.4 12814 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 71109104 71109433 71109270 Y NA NA NA NA NA NA HK1 81364 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 72311743 72312111 72311889 Y NA NA NA NA NA NA EIF4EBP2 149608 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA SLC29A3 50618 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr10 73039102 73039294 73039207 Y NA SLC29A3 NA NA NA NA SLC29A3 37721 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 73627974 73628371 73628194 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 18848 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 73735695 73736076 73735808 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 13572 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 73986513 73986881 73986533 Y C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA ASCC1 11621 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 74014911 74015029 74015003 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 16649 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 74019515 74019657 74019544 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 12021 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 74020239 74021717 74020385 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9961 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 74091361 74091474 74091418 Y SPOCK2,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 21514 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 75022023 75022098 75022060 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA RP11-152N13.5 11474 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr10 78790288 78790415 78790352 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 893963 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 78828890 78829127 78829009 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 855251 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 79069997 79070387 79070206 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 613991 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 79313411 79313746 79313629 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 370632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 79538272 79538371 79538344 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 146007 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr10 79632209 79632601 79632446 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 51777 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 79670022 79670276 79670149 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 14102 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr10 80062995 80063366 80063293 Y NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 271477 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 80737664 80737999 80737882 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 88793 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 81071549 81071690 81071644 Y ZMIZ1,ZCCHC24,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 33535 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 81085771 81086240 81085963 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 18985 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 85937530 85937952 85937586 Y NA GHITM NA NA NA NA GHITM 40334 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 86152070 86152317 86152175 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP5 165882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA GRID1 WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 GRID1 35761 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 89602886 89603081 89603056 Y NA CFL1P1,ATAD1,PTEN NA NA NA NA ATAD1 3786 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 90053186 90053542 90053532 Y NA NA NA NA NA NA RNLS 288745 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 90258909 90259131 90259020 Y NA NA NA NA NA NA RNLS 83156 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 90753757 90754132 90754032 Y NA FAS NA NA NA NA FAS 5343 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 90759367 90759687 90759559 Y NA FAS NA NA NA NA FAS 10953 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr10 92690903 92691268 92691118 Y NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 11870 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 92695341 92695597 92695444 Y NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 16308 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 93300438 93300742 93300617 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R3C 90069 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 93364636 93364917 93364795 Y NA PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 25894 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr10 94353992 94354203 94354151 Y MARCH5 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 2949 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 94367821 94367909 94367865 Y CYP26C1,KIF11 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 16778 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 95195782 95196689 95196040 Y MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 43385 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 95201631 95201931 95201645 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 38143 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 34444 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 95576027 95576245 95576136 Y NA NA NA NA NA NA SLC35G1 75485 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 97239155 97239567 97239500 Y SORBS1,SORBS1 NA NA NA NA NA SORBS1 79604 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 97809134 97809259 97809196 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 7983 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 97809290 97809583 97809571 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 8139 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 99449337 99449738 99449607 Y C10orf28,RRP12,PI4K2A AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA AVPI1 4257 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 99497485 99497673 99497579 Y NA MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA ZFYVE27 2607 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 100020230 100020246 100020237 Y NA NA NA NA NA NA PYROXD2 152695 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 101170653 101170798 101170732 Y SLC25A28 GOT1,RP11-441O15.3 NA NA NA NA GOT1 17583 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 101767938 101768201 101768028 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 262 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 103514539 103514868 103514704 Y NA NPM3 NA NA NA NA NPM3 26302 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 103699141 103699397 103699242 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 114553 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr10 104683249 104683568 104683410 Y NA CNNM2 NA NA NA NA CNNM2 7199 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 104909684 104910071 104909878 Y NA NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 40985 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 104953975 104954222 104954115 Y C10orf26,C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 2919 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 104990991 104991184 104991120 Y NA NT5C2 SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 39935 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 105001224 105001453 105001331 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50168 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 105001544 105001968 105001663 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50488 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 105436153 105436400 105436275 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 239563 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 105451160 105451473 105451219 Y INA NA NA NA NA NA OBFC1 224490 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 219421 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 105681714 105681858 105681786 Y NA OBFC1,SLK NA NA NA NA OBFC1 5751 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 106065321 106065564 106065443 Y NA MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP,CCDC147-AS1 NA NA NA NA ITPRIP 30598 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 106096287 106096870 106096611 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP,CCDC147-AS1 ITPRIP,GSTO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITPRIP 125 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 111981639 111982026 111981734 Y ADD3,MXI1,MXI1 MXI1 SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 MXI1 16276 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 112123790 112124003 112123953 Y MXI1 NA SMC3,DUSP5,RBM20 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 61081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 112159079 112159451 112159258 Y NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 96145 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 112174673 112174737 112174702 Y NA NA SMC3,DUSP5,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 80859 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 112259301 112259712 112259445 Y MXI1,PDCD4,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 3705 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 112272592 112272848 112272747 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 16996 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 112290201 112290297 112290249 Y NA DUSP5,SMC3 NA NA NA NA DUSP5 34605 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 112432258 112432673 112432308 Y PDCD4 NA PDCD4,LOC282997 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 106809 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 112533972 112534336 112534061 Y PDCD4 NA NA NA NA NA PDCD4 95229 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 113852369 113852641 113852488 Y NA NA NA NA NA NA GPAM 120494 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr10 113855611 113855893 113855723 Y NA NA NA NA NA NA GPAM 117242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr10 114025637 114025952 114025790 Y NA NA NA NA NA NA GPAM 52502 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 114693939 114693964 114693952 Y NA TCF7L2 TCF7L2,VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 14045 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 114816164 114816362 114816263 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 108155 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 114891441 114891844 114891554 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 183432 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 115070178 115070533 115070251 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 362169 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 115122408 115122600 115122509 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 314342 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 115923622 115923898 115923760 Y C10orf81 MIR2110,C10orf118 NA NA NA NA MIR2110 8040 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA ABLIM1 187173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 116392908 116393338 116393223 Y ABLIM1 ABLIM1 NA NA NA NA ABLIM1 49424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 118643126 118643297 118643273 Y KIAA1598 ENO4,RP11-539I5.1 NA NA NA NA RP11-539I5.1 35410 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 118714609 118714623 118714617 Y NA NA NA NA NA NA RP11-539I5.1 106893 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 86195 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 121030438 121030814 121030688 Y GRK5 NA NA NA NA NA PRDX3 94093 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr10 121065390 121065964 121065436 Y NA NA NA NA NA NA PRDX3 129045 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 121417930 121418047 121417978 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 9048 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 123494191 123494316 123494254 Y NA NA NA NA NA NA ATE1-AS1 191511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 123526019 123526096 123526058 Y NA NA NA NA NA NA ATE1-AS1 159731 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr10 124067478 124067825 124067684 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA1 64387 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 124133234 124133500 124133290 Y NA PLEKHA1 NA NA NA NA PLEKHA1 1022 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 124613518 124613778 124613722 Y NA FAM24B,RP11-564D11.3 NA NA NA NA FAM24B 23379 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 126382372 126382711 126382460 Y ZRANB1,FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 48127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 126421726 126422139 126421939 Y FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 8699 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 133763722 133764008 133763747 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 29427 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 NA NA NA NA NA PWWP2B 51669 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr10 134330832 134331178 134331005 Y NA INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 INPP5A 18146 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr11 364521 364678 364634 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3 ANO9,SIGIRR,B4GALNT4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 3118 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 1073369 1073545 1073512 Y DRD4,EFCAB4A NA NA NA NA NA AP2A2 150475 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 1569740 1569888 1569766 Y TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 21262 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 1794819 1794975 1794880 Y NA CTSD,RPL36AP39,AC139143.2 MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B IMR90,MCF7,K562,H1ESC Hi-C,3C,ChIA-PET,5C 24141950,19890323,22265404,22955621 CTSD 11597 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 1938897 1938966 1938954 Y NA MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 27542 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 2913617 2913951 2913751 Y NA CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA SLC22A18 5000 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 2919958 2920393 2920124 Y KCNQ1 CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA SLC22A18 1007 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 3077664 3078057 3077925 Y NA RNU1-91P,CARS NAP1L4 K562 ChIA-PET 22265404 CARS 821 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 3833340 3833454 3833393 Y RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687 NA NA NA NA NUP98 16318 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 3918054 3918451 3918253 Y NA STIM1,MIR4687 NA NA NA NA MIR4687 42762 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 5401217 5401226 5401222 Y OR51T1,OR51G2,OR51G1,MMP26,OR51L1,OR52J3,OR52E2,OR52A1,OR51V1,OR51B2,OR52N2,OR52E6,OR56B1,OR52N4,OR52D1,OR52N5,OR52N1,OR51M1,OR51I1,OR51Q1 OR51B5 NA NA NA NA OR51B5 38408 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 6699628 6699937 6699850 Y OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 2695 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 8756335 8756571 8756455 Y ST5,ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 54377 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 8973817 8973979 8973898 Y NA AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B C11orf16 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9B-AS1 10243 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 9185386 9185638 9185566 Y NA NA NA NA NA NA DENND5A 99299 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 9310546 9310889 9310715 Y ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA TMEM41B 23438 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr11 9636768 9636900 9636824 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 43540 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 9824167 9824574 9824403 Y NA SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 46328 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 10003812 10004242 10004040 Y ADM NA NA NA NA NA SBF2-AS1 225973 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 10246954 10247167 10247061 Y NA NA NA NA NA NA SBF2 66587 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 12458488 12458795 12458642 Y NA NA NA NA NA NA PARVA 61756 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 12821812 12822118 12821851 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 127843 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 12884715 12885004 12884787 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 190746 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 12973520 12973623 12973568 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 279551 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 14564922 14565133 14565013 Y PSMA1 COPB1,PSMA1 NA NA NA NA PSMA1 25032 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 NA NA NA NA NA PDE3B 210980 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr11 15541496 15541514 15541505 Y NA NA NA NA NA NA PDE3B 878227 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 17008586 17008989 17008853 Y PLEKHA7 RP11-466H18.1,PLEKHA7 NA NA NA NA RP11-466H18.1 14026 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 18649925 18650050 18650045 Y NA UEVLD,SPTY2D1 NA NA NA NA SPTY2D1 4288 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 19736892 19737150 19737126 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 366621 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 27380505 27380624 27380565 Y NA CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 2791 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 27682701 27682852 27682777 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58753 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 27715832 27716154 27716086 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 25451 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 27725050 27725226 27725138 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 16379 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr11 27740535 27740662 27740569 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 943 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 27955713 27956134 27955920 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45133 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 27956455 27956618 27956527 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 28132530 28132826 28132694 Y NA METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 4675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 28857853 28858464 28857991 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 135691 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 28864582 28864807 28864697 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 142420 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 29330322 29330692 29330507 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 608160 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr11 33012698 33013071 33012885 Y NA DEPDC7,TCP11L1 NA NA NA NA DEPDC7 22339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 34356172 34356320 34356246 Y NA RP1-145M24.1,ABTB2 NA NA NA NA RP1-145M24.1 622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 34368265 34368539 34368419 Y NA RP1-145M24.1,ABTB2 NAT10,CAPRIN1 IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 9016 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 34386157 34386357 34386257 Y ABTB2 RP1-145M24.1,ABTB2 NAT10,ABTB2,ELF5 IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 8602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 105728 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 35358493 35359078 35358891 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 200076 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 35966511 35966551 35966528 Y NA LDLRAD3 NA NA NA NA LDLRAD3 2980 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 39183372 39183493 39183434 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 2374491 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 43955473 43955506 43955502 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 55112 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 231118 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr11 45864713 45865116 45864826 Y NA SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1 NA NA NA NA CRY2 1553 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 45922261 45922718 45922513 Y DGKZ,MAPK8IP1 MAPK8IP1,PEX16 NA NA NA NA PEX16 15645 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CTD-2589M5.4 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 34865 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CTD-2589M5.4 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 28900 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr11 46753121 46753488 46753304 Y F2 ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ZNF408 32753 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 47168963 47169205 47169084 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 27471 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr11 57173048 57173332 57173170 Y ZDHHC5,UBE2L6,SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 NA NA NA NA NA RTN4RL2 52690 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 60753567 60754105 60753691 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA NA NA NA NA TMEM132A 63632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 49157 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 61319246 61319400 61319342 Y NA SYT7 NA NA NA NA SYT7 27220 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr11 61456345 61456647 61456520 Y CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 10440 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 61565191 61565522 61565357 Y NA FEN1,TMEM258,FADS1 NA NA NA NA TMEM258 6917 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 61742606 61743000 61742909 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 9474 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 61781118 61781313 61781282 Y DAGLA,FTH1 FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47986 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 61792928 61793609 61793204 Y DAGLA,FTH1 NA FADS3,FADS2,FTH1,BEST1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 59796 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 61880097 61880151 61880125 Y FADS2,FADS3,RAB3IL1 INCENP FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 9294 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 62441871 62442205 62442039 Y NXF1 GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2 NA NA NA NA UBXN1 2362 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 62625165 62625549 62625272 Y TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2 STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 3647 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 63319473 63319796 63319589 Y RARRES3,OTUB1 RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 17192 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 63686695 63687182 63686923 Y NA NAA40 NA NA NA NA NAA40 17249 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr11 64320859 64321220 64321040 Y C11orf85 NA SLC22A12,NRXN2 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KA4 196239 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 65042835 65043130 65042858 Y EHD1,C11orf85,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2 NA NA NA NA POLA2 15602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 65152750 65152863 65152819 Y LOC100130348,CDC42EP2,DKFZp761E198,FRMD8 TIGD3,SLC25A45,FRMD8,NEAT1 NA NA NA NA FRMD8 680 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.02401144905882 chr11 65238917 65239096 65239037 Y CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198 AP000769.1,MALAT1 TIGD3 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.5453927333793 chr11 65252951 65253044 65253026 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 65256318 65257363 65256982 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 5870 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 65259217 65259522 65259389 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3711 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 6.77795669616631 chr11 65273934 65274467 65274182 Y NA MALAT1,SCYL1,LTBP3 LTBP3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10701 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 65782974 65783337 65783107 Y FOSL1 BANF1,EIF1AD,SF3B2 NA NA NA NA EIF1AD 15327 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr11 66511038 66511198 66511076 Y KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2 C11orf80 NA NA NA NA C11orf80 1116 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 66717584 66717809 66717709 Y CLCF1,ADRBK1 PC,C11orf86 NA NA NA NA PC 6038 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC,C11orf86,SYT12 PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf86 1856 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 67143202 67143472 67143423 Y CLCF1 POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 4147 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 67146992 67147327 67147282 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 7937 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 69197125 69197542 69197234 Y ORAOV1,MYEOV NA MYEOV,CCND1 IMR90 Hi-C 24141950 IFITM9P 127851 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 69235389 69235576 69235517 Y NA NA MYEOV,ORAOV1,CCND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFITM9P 166115 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 70079442 70079825 70079633 Y ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FADD 32173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 70107513 70107580 70107548 Y NA PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 7226 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 71650610 71650763 71650692 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NUMA1,IL18BP IMR90 Hi-C 24141950 RNF121 12863 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 71658678 71659025 71658708 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NA NA NA NA RNF121 20931 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 71769812 71769929 71769891 Y NA LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1 NA NA NA NA LRTOMT 19453 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 72348117 72348448 72348274 Y NA NA NA NA NA NA ARAP1 154196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 72431268 72431435 72431330 Y FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 71209 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 72968455 72968625 72968568 Y NA P2RY2,P2RY6,ARHGEF17 P2RY6 MCF7 ChIA-PET 22265404 P2RY6 4925 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr11 73014768 73014913 73014905 Y NA P2RY6,ARHGEF17 NA NA NA NA ARHGEF17 2421 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 73490242 73490316 73490279 Y NA RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6045 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 73874303 73874639 73874471 Y NA PPME1,C2CD3 NA NA NA NA PPME1 5505 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr11 74534779 74535147 74534795 Y XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA RNF169 76866 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 74608675 74608873 74608772 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 49372 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 GDPD5,SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr11 75270235 75270345 75270334 Y NA GDPD5,SERPINH1 NA NA NA NA SERPINH1 756 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 75748582 75748924 75748753 Y UVRAG NA NA NA NA NA WNT11 170856 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 75781411 75781582 75781473 Y NA NA NA NA NA NA WNT11 138198 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.06677401769979 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 75946013 75946323 75946187 Y NA WNT11 C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT11 26233 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 76463883 76464042 76463970 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 ACER3,TSKU,B3GNT6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 13225 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.79670781574847 chr11 76480789 76480971 76480905 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 3522 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA NA NA NA NA NA ACER3 232238 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 77260240 77260365 77260335 Y NA NA PAK1,MYO7A,GDPD4,CAPN5 IMR90 Hi-C 24141950 PAK1 76560 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 77696711 77696891 77696801 Y NA INTS4 C11orf67,RSF1 IMR90 Hi-C 24141950 INTS4 6833 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2-KCTD14 37557 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 82781050 82781223 82781203 Y NA RAB30 NA NA NA NA RAB30 85 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 282552 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 85768953 85769276 85769115 Y NA PICALM NA NA NA NA PICALM 9648 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 85887618 85887919 85887680 Y PICALM,PICALM NA PICALM,CCDC83,EED,C11orf73 IMR90 Hi-C 24141950 EED 65667 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 86025840 86026030 86025935 Y NA C11orf73 NA NA NA NA C11orf73 14587 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 86185128 86185335 86185247 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 173875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 86447030 86447398 86447213 Y NA NA PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 52703 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 86451588 86451883 86451813 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 48218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 86514557 86514754 86514624 Y NA PRSS23 NA NA NA NA PRSS23 14456 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 86792626 86792948 86792684 Y NA TMEM135 NA NA NA NA TMEM135 45740 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 90016507 90016673 90016590 Y NA RP11-121L10.3 NA NA NA NA RP11-121L10.3 2779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 93446176 93446355 93446266 Y NA SCARNA9,SNORD5,C11orf54 NA NA NA NA SCARNA9 6324 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr11 95838694 95838939 95838802 Y FAM76B,CEP57,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 182215 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 96006843 96007267 96007082 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 67077 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 98114746 98115057 98114904 Y NA NA NA NA NA NA JRKL 1993593 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr11 102231981 102232209 102232014 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 16039 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 103801275 103801290 103801283 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37O16.8 522890 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 104838372 104838510 104838471 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4 CASP4 NA NA NA NA CASP4 209 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 109952219 109952637 109952296 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3H12C 9450 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 112028082 112028533 112028265 Y IL18 IL18,BCO2 NA NA NA NA IL18 4307 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 113828537 113828676 113828607 Y NA NA NA NA NA NA USP28 84245 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 180660 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 114039430 114039671 114039576 Y CLDN25,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 86838 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 118493849 118494041 118493911 Y NA PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 18694 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 118691289 118691413 118691363 Y NA DDX6 DDX6,PHLDB1,UPK2,TREH,CXCR5,BCL9L,MIR4492,FOXR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX6 31431 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 3422 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 118799839 118800231 118800031 Y C2CD2L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5522 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 119241226 119241377 119241346 Y NA RNF26,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2-AS1 9111 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 120218040 120218378 120218085 Y NA TMEM136,ARHGEF12 NA NA NA NA ARHGEF12 12253 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 120895811 120895984 120895886 Y GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA TBCEL NA NA NA NA TBCEL 3030 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 121107211 121107513 121107369 Y SC5DL,SC5DL NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 213399 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 121526040 121526695 121526415 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205128 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 121526794 121527145 121526879 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 122292534 122292605 122292585 Y NA RP11-820L6.1 SORL1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 RP11-820L6.1 955 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 122956299 122956503 122956402 Y NA SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 24361 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 123407861 123408201 123408031 Y NA NA NA NA NA NA LINC01059 84755 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 124552795 124553089 124552942 Y OR8B4,C11orf61 SPA17,SIAE NA NA NA NA SIAE 10514 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 52393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 125985079 125985242 125985162 Y CDON,ST3GAL4 NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 53849 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 125985923 125986168 125986013 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 54693 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 126210041 126210184 126210131 Y NA DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA ST3GAL4 13351 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 126337982 126338153 126338089 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 114447 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 128078462 128078679 128078487 Y NA NA FLI1,ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 376774 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 129993921 129994394 129994167 Y PRDM10,APLP2 NA NA NA NA NA APLP2 56189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr11 130392180 130392594 130392285 Y NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 75311 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 130767627 130768066 130767878 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 16338 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr11 133991300 133991384 133991342 Y NA NA NA NA NA NA VPS26B 101155 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr11 134509789 134510106 134509920 Y NA NA NA NA NA NA GLB1L2 310021 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 57680 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 690377 690646 690594 Y NA RP11-218M22.1 NA NA NA NA RP11-218M22.1 47411 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 864034 864343 864158 Y CCDC77,KDM5A WNK1 NA NA NA NA WNK1 4275 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 1314182 1314497 1314340 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 ERC1 216507 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 1387073 1387485 1387229 Y ERC1 NA NA NA NA NA ERC1 289398 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA FBXL14 293074 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 1511133 1511360 1511261 Y ERC1 NA NA NA NA NA FBXL14 189971 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 1532185 1532472 1532256 Y ERC1 NA NA NA NA NA FBXL14 168859 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 1714275 1714637 1714592 Y NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 12944 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 1778192 1778764 1778488 Y NA ADIPOR2 ADIPOR2,DCP1B IMR90 Hi-C 24141950 ADIPOR2 16976 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 2144277 2144357 2144308 Y LRTM2 DCP1B,RP5-1096D14.6 CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1096D14.6 32445 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 2374154 2374447 2374269 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 262322 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 3333828 3333981 3333926 Y NA RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 14732 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 4758958 4759134 4759102 Y NA AKAP3,NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 2697 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 5915509 5915755 5915702 Y NA NA NA NA NA NA CD9 391126 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 7.1950617236227 chr12 5918139 5918518 5918331 Y NA NA NA NA NA NA CD9 388363 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 6278115 6278307 6278240 Y TAPBPL CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 28574 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 6325035 6325634 6325452 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 18154 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9,RP1-96H9.5 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr12 6387822 6388153 6388049 Y NA RP1-96H9.5 VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-96H9.5 10231 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA RP1-96H9.5,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-96H9.5 26648 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 6444583 6445131 6444861 Y CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 4149 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 6539566 6540029 6539921 Y NA RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1 NA NA NA NA RP1-102E24.9 5635 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4 NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB MFAP5,RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 9367295 9367562 9367429 Y NA PTMAP4 NA NA NA NA PTMAP4 23365 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 9797730 9798098 9797800 Y NA RP11-705C15.4 NA NA NA NA RP11-705C15.4 507 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 10517487 10517775 10517755 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 154430 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA NA NA NA NA NA MAGOHB 68935 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 11909552 11909810 11909712 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 108764 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 11966137 11966507 11966203 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 165349 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 11976145 11976420 11976223 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 175357 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 36148 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 12602381 12602995 12602706 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 94368 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 12735834 12736179 12735985 Y NA DUSP16,CREBL2 LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP16 22517 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 12956264 12956405 12956396 Y GPRC5A,DDX47 DDX47 NA NA NA NA DDX47 7845 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr12 13056884 13057235 13057060 Y GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA MIR614 9528 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 13332644 13332915 13332868 Y NA EMP1 EMP1,KIAA1467 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 14735 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 13376628 13377027 13376828 Y NA EMP1 NA NA NA NA EMP1 28978 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 13677891 13678188 13677997 Y NA NA NA NA NA NA EMP1 330241 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 19932429 19932596 19932501 Y NA NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-841C19.1 272591 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A NA LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 PDE3A 420339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 20365637 20365979 20365748 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 154200 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 20543386 20543422 20543406 Y NA PDE3A,RP11-284H19.1 NA NA NA NA RP11-284H19.1 22190 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 20780077 20780376 20780084 Y LST-3TM12,PDE3A NA NA NA NA NA RP11-284H19.1 258881 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 24959393 24959656 24959538 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 140737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 24992180 24992695 24992446 Y BCAT1 NA NA NA NA NA BCAT1 107698 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 25402760 25403150 25403054 Y LRMP,CASC1,KRAS KRAS NA NA NA NA KRAS 890 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.66842010982555 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA BHLHE41 8249 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 26400740 26401146 26400920 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 123190 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 27332593 27333057 27332936 Y STK38L NA STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 61844 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 27346815 27347118 27346987 Y NA STK38L STK38L,REP15,PPFIBP1,C12orf71 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 47783 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 29487594 29487680 29487637 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 44442 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-467L13.5 3085 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 32380941 32381343 32381040 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 123172 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 32842101 32842415 32842258 Y NA DNM1L,RP11-278C7.1 NA NA NA NA DNM1L 11967 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 34500403 34500725 34500579 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 99987 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr12 40250890 40251201 40251046 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A13 246690 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 42734111 42734478 42734288 Y NA ZCRB1 NA NA NA NA ZCRB1 16191 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 46571692 46571878 46571769 Y SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 89922 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 46608402 46609191 46609043 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 52609 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 46614251 46614418 46614333 Y NA SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 47382 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 46636369 46636708 46636589 Y SCAF11,SLC38A1 SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 25092 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr12 46825426 46825886 46825665 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 49964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA RPAP3 485371 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 48076459 48076736 48076534 Y NA RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 21108 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 48100473 48100834 48100653 Y VDR,ASB8 RPAP3,RP1-197B17.3,SLC48A1 NA NA NA NA RP1-197B17.3 2605 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 48204446 48204457 48204451 Y NA RAPGEF3,HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 20458 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 48282882 48283045 48282955 Y ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR NA NA NA NA NA VDR 51786 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 48294417 48294695 48294497 Y OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR VDR NA NA NA NA VDR 40136 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 48431282 48431505 48431439 Y NA NA NA NA NA NA PFKM 65417 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 49449678 49450138 49449974 Y CCDC65,DHH PRKAG1,RHEBL1 NA NA NA NA RHEBL1 11670 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr12 49866902 49867154 49867028 Y PRPF40B,PRPF40B NA NA NA NA NA MCRS1 92782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 50019907 50020190 50020017 Y NA NA NA NA NA NA PRPF40B 59906 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 50221084 50221421 50221231 Y NCKAP5L NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 551 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 50460197 50460562 50460363 Y NA RACGAP1,SMARCD1,GPD1 NA NA NA NA SMARCD1 16193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 51765347 51765619 51765517 Y FIGNL2,GALNT6 NA BIN2,CELA1 IMR90 Hi-C 24141950 SMAGP 102673 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr12 52457778 52458372 52458110 Y NA NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 2658 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.87697262355375 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr12 52583620 52584080 52583828 Y NA KRT7 NA NA NA NA KRT80 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr12 52588132 52588259 52588205 Y FIGNL2,GRASP,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 4348 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 52591671 52592071 52591819 Y GRASP,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 7887 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr12 52609215 52609817 52609526 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 14487 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 52624014 52624394 52624158 Y KRT7 KRT80 NA NA NA NA KRT7 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 52624687 52625139 52624914 Y KRT7 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 383 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.08552513728194 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.50263016473833 chr12 53265042 53265518 53265316 Y PFDN5,KRT2 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRT18 75137 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 53273269 53273433 53273418 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 67222 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr12 53890170 53890360 53890251 Y MFSD5 MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 1487 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 54372759 54373189 54372957 Y HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10 HOXC13,HOXC13-AS,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1 NA NA NA NA HOXC10 3660 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 12047 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 54446030 54446105 54446068 Y NA HOXC5,HOXC4 FLJ12825 IMR90 Hi-C 24141950 HOXC4 369 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 54563652 54563918 54563802 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 16860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 54611719 54612027 54611873 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30941 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA BLOC1S1 299381 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 56614575 56614693 56614609 Y NA SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,ANKRD52,COQ10A NA NA NA NA RNF41 858 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 56729298 56729459 56729406 Y NA RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2 NA NA NA NA PAN2 3461 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 56877461 56877501 56877482 Y NA TIMELESS,SPRYD4,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA SPRYD4 17160 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 56914338 56914532 56914358 Y NA RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA RBMS2 625 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 8.55065306285596 chr12 57672745 57672985 57672868 Y NA NDUFA4L2 NA NA NA NA NDUFA4L2 40247 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 58259163 58259391 58259220 Y TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2 CTDSP2 CTDSP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 20641 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 58281637 58282038 58281777 Y CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM CTDSP2,RP11-620J15.3 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 43115 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr12 58337769 58337952 58337777 Y NA RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 4445 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 62725942 62726315 62725965 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A2 55011 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 62983522 62983540 62983531 Y NA RP11-631N16.2 NA NA NA NA RP11-631N16.2 10992 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 63051832 63051994 63051914 Y MON2,PPM1H NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 57300 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 63179567 63180349 63179723 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 146468 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 64311746 64312216 64311964 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 75673 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 64482177 64482504 64482346 Y SRGAP1,TBK1,C12orf66 NA NA NA NA NA C12orf66 131572 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA C12orf66 69010 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 65065216 65065277 65065242 Y LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 62923 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 65074143 65074354 65074186 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 71850 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 65262498 65262651 65262575 Y NA NA NA NA NA NA GNS 111271 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 66061664 66061966 66061876 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 MSRB3 391241 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr12 69305634 69305702 69305668 Y RAP1B,LYZ,CPM,CPM NA NA NA NA NA CPM 57648 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 69868200 69868446 69868430 Y CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2 FRS2 NA NA NA NA FRS2 6071 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 70626158 70626373 70626266 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 8401 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 70644560 70644959 70644584 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 9420 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 75877380 75877665 75877492 Y GLIPR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 4920 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 53585 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 79608943 79609085 79609014 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 473792 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 79817950 79818263 79818028 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 264614 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 79918085 79918441 79918422 Y NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 164436 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 79941021 79941361 79941199 Y PAWR NA SYT1,PAWR,PPP1R12A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 141516 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA NA SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 139240 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 80032366 80032529 80032417 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 50348 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 80085577 80085980 80085873 Y NA PAWR NA NA NA NA PAWR 2700 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 80450155 80450249 80450200 Y NA RP11-244J10.1 SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-244J10.1 44864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 81171843 81172335 81171905 Y NA NA NA NA NA NA PTPRQ 374069 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 85344886 85345065 85345044 Y NA SLC6A15 NA NA NA NA SLC6A15 39492 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 89727563 89727887 89727725 Y ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 17161 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 89978345 89978700 89978451 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA GALNT4,POC1B-GALNT4 60306 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 91527742 91527993 91527846 Y NA NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 1009356 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 92995849 92996628 92996444 Y EEA1,BTG1 NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EEA1 324479 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 93709037 93709216 93709174 Y NA NA NA NA NA NA NUDT4 60443 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 93890331 93890756 93890540 Y NA MRPL42 NA NA NA NA MRPL42 31067 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 94135673 94136306 94136137 Y NUDT4,SOCS2 NA NA NA NA NA CRADD 66522 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 94696122 94696451 94696433 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA RBMS2P1 120294 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 95404686 95404921 95404803 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 9140 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 96047992 96048216 96048102 Y METAP2,LTA4H NA NA NA NA NA NTN4 134714 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 98818500 98818672 98818666 Y NA RNU4-41P LOC100128191,TMPO MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-41P 8684 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 99235060 99235389 99235225 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 198141 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 100518805 100519127 100519119 Y NA UHRF1BP1L NA NA NA NA UHRF1BP1L 15499 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 102186333 102186570 102186556 Y NA GNPTAB NA NA NA NA GNPTAB 36146 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 102909608 102909974 102909790 Y PAH NA NA NA NA NA NUP37 397706 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 104252933 104253121 104253026 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 19958 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 104613052 104613575 104613267 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 5495 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 104675995 104676292 104676137 Y GLT8D2,TXNRD1 RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 18939 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 EID3 96042 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 104846909 104846975 104846916 Y NA NA NA NA NA NA EID3 151392 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 104998326 104998912 104998568 Y TXNRD1,EID3,CHST11 NA NA NA NA NA EID3 302809 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 105064571 105065844 105065441 Y EID3,CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA SLC41A2 284678 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 105477471 105477556 105477526 Y ALDH1L2 ALDH1L2,KIAA1033 NA NA NA NA ALDH1L2 1116 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 105837759 105838125 105838029 Y NA NA NUAK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APPL2 209743 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 106529993 106530447 106530148 Y NA NA NA NA NA NA TCP11L2 163260 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 107682481 107682807 107682644 Y NA NA BTBD11 IMR90 Hi-C 24141950 CRY1 196874 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 109030971 109031245 109031128 Y NA NA NA NA NA NA ISCU 76613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 109084686 109085066 109084867 Y SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 38306 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5 NA NA NA NA RP11-968O1.5 23553 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 109900993 109901418 109901152 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 11789 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 111053049 111053390 111053220 Y NA PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA TCTN1 3217 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 112464061 112464211 112464136 Y NA TMEM116,ERP29 NA NA NA NA ERP29 14941 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 112633664 112633952 112633817 Y NA NA TRAFD1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAFD1 72359 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 114200256 114200532 114200390 Y NA RP11-438N16.1 NA NA NA NA RP11-438N16.1 8956 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 116893494 116893818 116893640 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 75409 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 120486152 120486402 120486307 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 66904 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 120639993 120640274 120640078 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1 NA NA NA NA PXN-AS1 2899 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 120926786 120926862 120926830 Y SIRT4 TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5 NA NA NA NA DYNLL1 21133 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 120967554 120967708 120967668 Y NA RNF10,COQ5,POP5 NA NA NA NA RNF10 1575 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 121497390 121497638 121497514 Y OASL C12orf43,OASL SPPL3,UNC119B,ACADS,C12orf43,HNF1A,OASL,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 IMR90 Hi-C 24141950 OASL 22345 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 122444524 122444823 122444769 Y BCL7A BCL7A NA NA NA NA BCL7A 10505 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 122519763 122520228 122519936 Y ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 5135 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.06677401769979 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 125003619 125003834 125003727 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 46301 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 125185875 125186011 125185947 Y NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 135740 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 125331273 125331577 125331425 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 33637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 25323 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr12 131249995 131250369 131250318 Y NA NA NA NA NA NA STX2 71442 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 131405313 131405624 131405469 Y RIMBP2,GPR133 GPR133 NA NA NA NA GPR133 30828 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 131510828 131511048 131510920 Y NA NA NA NA NA NA GPR133 74376 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr12 131513179 131513358 131513281 Y GPR133 NA NA NA NA NA GPR133 76727 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr12 131706292 131706484 131706406 Y NA NA NA NA NA NA GPR133 269840 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr12 133688468 133688629 133688567 Y NA ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 16430 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 20419964 20420131 20420036 Y PSPC1,ZMYM5 ZMYM5 NA NA NA NA ZMYM5 15645 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 20735697 20735843 20735813 Y PSPC1,ZMYM5 NA NA NA NA NA ZMYM2 204887 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 20993930 20994321 20994126 Y NA NA NA NA NA NA CRYL1 103675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 21241518 21241702 21241584 Y NA NA NA NA NA NA IFT88 102933 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 23471356 23471597 23471410 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P7 202643 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 24131522 24131823 24131734 Y SACS TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 10686 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 24133122 24133556 24133337 Y NA TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 8953 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 24697003 24697328 24697264 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 145059 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr13 28787263 28787277 28787270 Y NA EEF1A1P3 NA NA NA NA EEF1A1P3 613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 29106909 29107160 29107135 Y NA NA FLT1,PAN3,POMP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF4A1P7 63810 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 29327742 29327905 29327792 Y NA NA NA NA NA NA POMP 96501 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 30060513 30060580 30060547 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A1 107245 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 30415465 30415864 30415857 Y NA UBL3 NA NA NA NA UBL3 6957 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058 LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 31444557 31445090 31444788 Y C13orf26 NA NA NA NA NA USPL1 254727 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA HSPH1 250589 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 33841256 33841381 33841376 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 81386 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 35322323 35322497 35322408 Y NBEA NA NA NA NA NA RFC3 932137 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 37611695 37611945 37611820 Y NA EXOSC8,ALG5 NA NA NA NA ALG5 39297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 38491234 38491367 38491301 Y NA NA NA NA NA NA UFM1 430619 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA ELF1 18049 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 43727960 43728297 43728107 Y NA NA ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 ENOX1 630747 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00284 61882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 44817306 44817618 44817554 Y NA NA TSC22D1,SERP2,LINC00284 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TSC22D1 331665 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 44875300 44875802 44875641 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 273481 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr13 44884974 44885381 44885134 Y CCDC122,TSC22D1 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 263902 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr13 45928010 45928281 45928087 Y NA TPT1-AS1,TPT1 NA NA NA NA TPT1 14505 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 47369610 47369907 47369759 Y NA ESD NA NA NA NA ESD 243 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 48464437 48464519 48464469 Y NA NA HTR2A IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L4P3 128842 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr13 48907859 48907955 48907897 Y NA LINC00441,RB1 NA NA NA NA RB1 31972 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 49365956 49366344 49366103 Y RB1,RCBTB2,FNDC3A PSME2P2 FNDC3A,MLNR IMR90 Hi-C 24141950 PSME2P2 22692 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 49458465 49458772 49458590 Y RCBTB2,FNDC3A NA FNDC3A IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3A 89276 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 49569007 49569270 49569139 Y NA FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 20959 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 49761885 49761908 49761899 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 58139 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13,MIR3613 NA NA NA NA MIR3613 28839 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 52218923 52219366 52219003 Y WDFY2,DHRS12,DHRS12 NA NA NA NA NA WDFY2 62279 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 60580804 60581154 60581101 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 154967 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 60679231 60679569 60679243 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 56552 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 60736273 60736548 60736444 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 152 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 63021628 63021960 63021792 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 2053037 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 67151392 67151489 67151441 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 5095710 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 67461334 67461726 67461614 Y PCDH9 NA NA NA NA NA H3F3BP1 4785473 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 67674730 67675228 67675034 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 4571971 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 NA NA NA NA NA H3F3BP1 172579 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 74228674 74228703 74228690 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 477691 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 75882191 75882614 75882549 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 171636 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 76279599 76280073 76279764 Y LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 87029 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 76336754 76337033 76336914 Y COMMD6,LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 144184 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 80510902 80511186 80511006 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 401900 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 95753354 95753450 95753358 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 198237 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 95925874 95926219 95926059 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 25468 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 97877294 97877762 97877400 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 5606 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 97890366 97890711 97890515 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 18678 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 97913986 97914316 97914087 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 42298 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 98924976 98925080 98925019 Y NA NA NA NA NA NA FARP1 132160 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 100738422 100738621 100738542 Y NA PCCA NA NA NA NA PCCA 648 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 100928465 100928851 100928516 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P18 127119 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 102731343 102731405 102731389 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 515948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 103557671 103557972 103557679 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 62477 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 107186008 107186474 107186341 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 32038 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 108153519 108153767 108153691 Y NA NA NA NA NA NA LIG4 714949 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 108407171 108407488 108407466 Y NA NA NA NA NA NA LIG4 461228 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 109818071 109818351 109818211 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 587264 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 109909294 109909814 109909611 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 495801 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr13 110426988 110427362 110427201 Y NA AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 9553 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 110443694 110443751 110443735 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 MYO16,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 6779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 111039905 111040155 111040082 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 82409 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 111061947 111062361 111062286 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 104451 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 111172874 111173635 111173314 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 38445 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr13 111174336 111174835 111174468 Y ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 37245 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr13 111180820 111181023 111180903 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 31057 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 111212967 111213224 111213111 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 COL4A2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAB20 887 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr13 113585588 113585716 113585676 Y CUL4A,CUL4A NA C13orf35,ATP11A,MCF2L GM12878,HELA,K562,H1ESC 5C 22955621 ATP11A 242945 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 8.44637680599187 chr13 113597069 113597276 113597160 Y MCF2L NA MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,ChIA-PET 22955621,24141950,22265404 ATP11A 254426 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 113870568 113870732 113870682 Y MCF2L,DCUN1D2,ADPRHL1,F10 CUL4A,PCID2 NA NA NA NA PCID2 9539 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 113928164 113928348 113928293 Y CUL4A LAMP1 NA NA NA NA LAMP1 21208 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr13 113982391 113982456 113982424 Y NA LAMP1,GRTP1 NA NA NA NA LAMP1 32835 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 114119812 114119949 114119881 Y NA DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 23318 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.50263016473833 chr13 114740287 114740680 114740494 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 155406 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr13 114864762 114865011 114864824 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 31075 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr13 115046177 115046319 115046229 Y RASA3 CDC16,UPF3A,CHAMP1 NA NA NA NA UPF3A 1118 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 23222866 23223018 23222950 Y NA OXA1L,CTD-2555K7.2 NA NA NA NA OXA1L 10713 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 23466494 23466910 23466688 Y CDH24,C14orf93 MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 10465 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 23611395 23611621 23611510 Y SLC7A8 C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA ACIN1 48572 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 24454112 24454320 24454216 Y DHRS4L2,DHRS4L2 DHRS4,DHRS4L2 NA NA NA NA DHRS4L2 16964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA KHNYN 34774 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr14 24934340 24934390 24934365 Y NA KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA SDR39U1 24229 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 30663968 30664325 30664158 Y PRKD1 PRKD1 PRKD1,FOXG1,C14orf23 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD1 4864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 31698850 31699225 31699035 Y STRN3 HECTD1 AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECTD1 23840 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 31905446 31905450 31905448 Y NA HEATR5A,RP11-176H8.1 NA NA NA NA HEATR5A 17658 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 409598 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 32979007 32979394 32979291 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 435008 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 34409916 34410012 34409947 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 519550 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 34987475 34987508 34987491 Y EAPP EAPP,RPS19P3 NA NA NA NA EAPP 19408 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 35802308 35802726 35802409 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA RP11-561B11.1 53549 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 35810635 35811251 35810911 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 45024 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 35855857 35856187 35856101 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA RP11-561B11.1 88 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 35875800 35875964 35875882 Y SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 3845 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 37310739 37311071 37310955 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA PAX9 185966 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 37317346 37317701 37317507 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA PAX9 192573 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 37465189 37465490 37465428 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 174581 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 39737909 39738305 39738022 Y NA CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 5421 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 39768270 39768447 39768359 Y PNN,MIA2 CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 35782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 45483090 45483569 45483224 Y NA KLHL28 NA NA NA NA KLHL28 25956 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 45723245 45723364 45723320 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 2502 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 48184413 48184780 48184597 Y NA NA NA NA NA NA RPL13AP2 516106 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 49375724 49376075 49375898 Y NA NA NA NA NA NA RN7SL1 675222 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA ARF6 109565 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr14 50475850 50475934 50475889 Y ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA ARF6 118040 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 51136928 51137372 51137340 Y NA SAV1 NA NA NA NA SAV1 3879 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 52119936 52120349 52120008 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 166118 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 53269343 53269708 53269600 Y PTGER2 GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 12957 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 53533673 53533892 53533783 Y NA NA NA NA NA NA DDHD1 84108 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 55166048 55166175 55166112 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 134233 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 55197259 55197652 55197332 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 165444 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 55538737 55539349 55538846 Y FBXO34,FBXO34,ATG14,MAPK1IP1L WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 22388 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 55544307 55544654 55544518 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27958 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.29407765101014 chr14 55841053 55841315 55841186 Y MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,ATG14 ATG14 NA NA NA NA ATG14 35261 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 58637905 58638297 58638125 Y NA UBA52P3,ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26501 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 59949393 59949731 59949550 Y C14orf149 JKAMP NA NA NA NA JKAMP 232 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 61960014 61960497 61960231 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 172478 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 61969529 61970113 61969734 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 181993 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 61978357 61978646 61978426 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 181585 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 61978878 61979019 61978952 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 181212 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 61979288 61979588 61979394 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 180643 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 62129212 62129618 62129522 Y HIF1A HIF1A NA NA NA NA HIF1A 30613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 64170371 64170528 64170450 Y NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 22229 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 ZBTB25 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 65148642 65149174 65148980 Y HSPA2,FNTB PLEKHG3 SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG3 19646 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 65546452 65546770 65546602 Y NA MAX NA NA NA NA MAX 20643 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 67998625 67999040 67998762 Y NA PLEKHH1,TMEM229B NA NA NA NA TMEM229B 169 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 68644384 68644906 68644390 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 242007 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 68835621 68835756 68835701 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 51157 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 69010932 69011443 69011159 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 124019 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 69014304 69014714 69014453 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 127391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 69014972 69015327 69015083 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 128059 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 69104286 69104416 69104358 Y NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 156774 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 69301401 69301774 69301727 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 40211 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 69417780 69418181 69417964 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 25976 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 69576488 69576915 69576681 Y NA DCAF5 NA NA NA NA DCAF5 40952 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 70020113 70020453 70020282 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0247 55860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr14 70464665 70464959 70464731 Y NA NA NA NA NA NA SMOC1 145817 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr14 70465984 70466470 70466191 Y NA NA NA NA NA NA SMOC1 147136 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 71870372 71870659 71870456 Y PCNX,SIPA1L1 NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 83841 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 74252099 74252503 74252342 Y NA RP5-1021I20.1,RP5-1021I20.2 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 36 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr14 74607211 74607609 74607410 Y NA NA VSX2 IMR90 Hi-C 24141950 LIN52 57712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 75491919 75492089 75492033 Y NA EIF2B2,MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 24146 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 75649674 75650038 75649826 Y FOS TMED10 TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMED10 8340 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 75740024 75740353 75740051 Y JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FOS RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 LOC731223 IMR90 Hi-C 24141950 FOS 3124 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 75765697 75765964 75765861 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2 RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 6590 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 76334268 76334588 76334390 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 31891 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 66642 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 77431067 77431579 77431238 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 1447 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 77495718 77495873 77495815 Y NA IRF2BPL,RP11-7F17.3 NA NA NA NA IRF2BPL 2684 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 78144886 78145071 78144891 Y NA ALKBH1,SLIRP NA NA NA NA ALKBH1 27292 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 78196199 78196534 78196363 Y NA ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 23785 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 79432037 79432160 79432099 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1167611 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 81440226 81440497 81440374 Y CEP128,TSHR CEP128 NA NA NA NA CEP128 16365 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr14 89771520 89771819 89771727 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 311674 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 201352 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 90378938 90379536 90379158 Y FOXN3,FOXN3,KCNK13 EFCAB11,TDP1 NA NA NA NA EFCAB11 39585 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 93044640 93044810 93044725 Y NA NA NA NA NA NA LGMN 168237 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 93509801 93510236 93510094 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 70429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 93552204 93552427 93552400 Y NA ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 28238 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 93776910 93777138 93777024 Y PRIMA1 BTBD7 NA NA NA NA BTBD7 20300 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 95947097 95947214 95947185 Y NA RP11-1070N10.3 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 33259 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 97043507 97043643 97043575 Y NA NA NA NA NA NA PAPOLA 77737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 97282222 97282363 97282293 Y NA VRK1 NA NA NA NA VRK1 20581 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr14 99827366 99827674 99827539 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 117542 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 100633368 100633655 100633513 Y YY1 NA NA NA NA NA YY1 68980 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr14 100804523 100804880 100804765 Y NA SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS NA NA NA NA RP11-638I2.10 26085 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 100874667 100875097 100874987 Y WARS,WARS,WDR25,WDR25 RP11-638I2.10,WDR25,WARS NA NA NA NA WARS 33525 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr14 100889838 100890227 100890041 Y BEGAIN WDR25,WARS BEGAIN IMR90 Hi-C 24141950 WARS 48696 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 100905618 100905757 100905695 Y BEGAIN NA BEGAIN IMR90 Hi-C 24141950 WARS 64476 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 100906618 100906904 100906684 Y NA NA BEGAIN IMR90 Hi-C 24141950 WARS 65476 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 101020509 101020866 101020628 Y WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN BEGAIN NA NA NA NA BEGAIN 30884 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 101023349 101023562 101023455 Y BEGAIN BEGAIN NA NA NA NA BEGAIN 28188 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 101024059 101024421 101024266 Y WARS,WARS,WDR25,WDR25 BEGAIN NA NA NA NA BEGAIN 27329 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 101539526 101539734 101539702 Y NA NA NA NA NA NA BEGAIN 487776 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 102277268 102277494 102277347 Y PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C NA NA NA NA NA PPP2R5C 51133 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.90098407261256 chr14 102868139 102868468 102868196 Y HSP90AA1,RCOR1,TECPR2 CINP,TECPR2 NA NA NA NA TECPR2 40839 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 102977207 102977381 102977329 Y AMN ANKRD9 NA NA NA NA ANKRD9 3071 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 102997284 102997579 102997375 Y TRAF3,RCOR1 ANKRD9 MIR4309,RCOR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 23148 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 103051810 103052039 103051996 Y NA RCOR1 TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 4959 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 103541337 103541574 103541446 Y NA CDC42BPB,TNFAIP2 CDC42BPB,EIF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42BPB 19538 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 103577206 103577606 103577492 Y C14orf153 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 10173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 85648 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.39835390787423 chr14 104763034 104763369 104763107 Y TMEM179 NA NA NA NA NA KIF26A 159974 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 104766695 104767088 104766699 Y TMEM179 NA NA NA NA NA KIF26A 163635 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr14 105198821 105199110 105199005 Y C14orf180,ADSSL1 INF2,SIVA1 NA NA NA NA SIVA1 18327 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr15 20547295 20547641 20547374 Y NA NA LOC348120,REREP3,POTEB IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 2283754 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 25018281 25018456 25018384 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 48338 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 25586903 25587047 25586976 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 95081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 25597069 25597306 25597188 Y SNRPN,SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 84822 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 26315231 26315527 26315379 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 633103 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 33111010 33111355 33111242 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 205665 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 33266942 33267258 33267072 Y GREM1 NA NA NA NA NA ARHGAP11A 361597 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 34807090 34807442 34807248 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA8A,GOLGA8B 71262 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 35014105 35014549 35014217 Y NA NA AQR,GJD2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTC1 71791 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr15 35989992 35990298 35990145 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 711504 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 38750000 38750177 38750089 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 5672 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 38784019 38784367 38784201 Y RASGRP1 FAM98B NA NA NA NA FAM98B 39691 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 38814347 38814382 38814365 Y C15orf53,RASGRP1 RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 41394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 38820654 38820765 38820702 Y NA RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 35011 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 38828822 38829084 38828901 Y RASGRP1 RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 26692 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 38853240 38853506 38853363 Y C15orf53,RASGRP1 RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 2270 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 39668694 39669075 39668948 Y NA RP11-624L4.1 THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 48321 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 40337433 40337595 40337464 Y PLCB2,BMF,BMF,BMF SRP14 NA NA NA NA SRP14 8044 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 40460566 40460976 40460804 Y NA BUB1B NA NA NA NA BUB1B 9342 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 40463815 40464014 40463832 Y NA BUB1B NA NA NA NA BUB1B 12591 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 40803808 40804249 40803896 Y NA CHST14 NA NA NA NA CHST14 42648 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 41139695 41139794 41139738 Y NA ZFYVE19,DNAJC17,RHOV,VPS18 NA NA NA NA RHOV 24693 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 41233721 41234461 41233781 Y C15orf57,VPS18 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 8699 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 41581854 41582095 41581909 Y NA OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1 NA NA NA NA OIP5-AS1 7666 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr15 42083275 42083582 42083459 Y NA MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B NA NA NA NA MAPKBP1 18643 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 NA PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 86648 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr15 42547123 42547182 42547153 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 16249 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 42833928 42834273 42834101 Y NA LRRC57,HAUS2,STARD9 NA NA NA NA LRRC57 4727 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 44161980 44162105 44162047 Y NA MFAP1,WDR76 NA NA NA NA WDR76 44819 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN RP11-519G16.3 NA NA NA NA RP11-519G16.3 9844 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.17105027456388 chr15 48104672 48105061 48104769 Y NA NA SEMA6D IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2270N23.1 83540 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr15 48975243 48975418 48975260 Y NA FBN1 FBN1,SHC4,CEP152 IMR90 Hi-C 24141950 FBN1 39197 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 49268018 49268116 49268067 Y NA SHC4 NA NA NA NA SHC4 14377 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 50347446 50348347 50347721 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 124046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 50358473 50358749 50358576 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 113644 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 51868984 51870333 51869210 Y NA DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 42697 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 52120789 52121195 52120954 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 52122599 52122915 52122757 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 2774 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 52153526 52153874 52153708 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 33701 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 52580530 52580869 52580787 Y ARPP19,MYO5C MYO5C NA NA NA NA MYO5C 5126 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 52774147 52774333 52774216 Y MAPK6,MYO5A MYO5A NA NA NA NA MYO5A 44914 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 55503902 55504218 55504040 Y RAB27A,PIGB RSL24D1 RSL24D1 K562 ChIA-PET 22265404 RSL24D1 16637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 55614631 55614957 55614885 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA RP11-139H15.1 5272 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr15 56475345 56475479 56475412 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 58004 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 154856 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 59019191 59019406 59019394 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 20771 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 59023904 59024166 59024035 Y RNF111 ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 16011 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 59467276 59467383 59467330 Y ADAM10,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 71999 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 59646072 59646468 59646249 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 16424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 60883059 60884017 60883872 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 113682 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 63432131 63432432 63432186 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 15788 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 63539312 63539664 63539446 Y LACTB,USP3,RAB8B APH1B APH1B IMR90 Hi-C 24141950 APH1B 26553 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 63803463 63803731 63803481 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 8670 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA DAPK2,FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 64754012 64754177 64754162 Y NA ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 3071 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 RP11-330L19.1 NA NA NA NA RP11-330L19.1 37654 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 64940943 64941327 64941079 Y NA NA NA NA NA NA OAZ2 52153 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 65101103 65101281 65101196 Y NA RBPMS2,PIF1,PLEKHO2 NA NA NA NA PIF1 14586 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 PLEKHO2 3880 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 65831867 65832220 65831871 Y NA DPP8,PTPLAD1 C15orf44 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD1 11111 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 66112118 66112295 66112211 Y DENND4A DENND4A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44,RAB11A,MEGF11 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4A 29487 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr15 67095524 67095803 67095671 Y NA NA NA NA NA NA SMAD6 102958 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr15 67426476 67426864 67426547 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 72375 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 67516633 67516865 67516859 Y NA IQCH,AAGAB NA NA NA NA IQCH 28273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 69948905 69949301 69949066 Y NA NA TLE3,C15orf50,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 205782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 70391261 70391735 70391557 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 2746 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr15 71126164 71126470 71126369 Y NA LRRC49,LARP6 NA NA NA NA LRRC49 17108 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 71371688 71372044 71371801 Y THSD4 NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 188564 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 71571390 71571701 71571551 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388266 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 205591 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 74216715 74216840 74216797 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 385 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 74801015 74801389 74801202 Y NA UBL7,ARID3B NA NA NA NA ARID3B 30129 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3 NA NA NA NA EDC3 32032 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr15 75939210 75939595 75939262 Y NA SNUPN,SNX33,IMP3 NA NA NA NA IMP3 163 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 76218014 76218024 76218019 Y NA FBXO22 NA NA NA NA FBXO22 23814 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 76455838 76456047 76455943 Y NA NA NA NA NA NA C15orf27 105660 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 77055500 77055901 77055892 Y NA NA NA NA NA NA SCAPER 139884 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 79153464 79153800 79153632 Y RASGRF1 RPL21P116 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL21P116 271 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 81125183 81125474 81125331 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1199 55499 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 81131497 81131895 81131781 Y IL16 NA NA NA NA NA KIAA1199 61813 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 82302959 82303245 82303102 Y NA MEX3B NA NA NA NA MEX3B 33237 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 86285642 86285870 86285715 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 50391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 86337060 86337529 86337372 Y NA KLHL25 NA NA NA NA KLHL25 799 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 87244660 87245052 87244738 Y NA NA NA NA NA NA LINC00052 873108 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 87328596 87328625 87328612 Y NA NA NA NA NA NA LINC00052 789535 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 89014009 89014390 89014200 Y NA MRPL46,MRPS11 NA NA NA NA MRPS11 5325 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 89156201 89156887 89156382 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA AEN 5640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 89183173 89183667 89183329 Y ABHD2,ISG20 AEN,ISG20 NA NA NA NA ISG20 5789 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 90241907 90242276 90242092 Y NA KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA WDR93 9879 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 90669829 90670140 90669985 Y NA IDH2,SEMA4B IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IDH2 26093 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 90956663 90957019 90956743 Y NA IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27213 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 91107423 91107655 91107549 Y UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,C15orf58,IQGAP1,CRTC3 CRTC3 NA NA NA NA CRTC3 36266 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 68192 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 91191799 91192162 91191976 Y UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1 NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 66210 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 91331328 91331736 91331526 Y NA NA NA NA NA NA BLM 72770 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 92481402 92481730 92481524 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 86477 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 92491615 92492039 92491744 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 96690 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 93347056 93347810 93347183 Y CHD2 NA NA NA NA NA RP11-386M24.4 71631 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 93354824 93354998 93354897 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 69528 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 CHD2 60372 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD2 48928 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 94746622 94746847 94746732 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 1322096 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 94850045 94850297 94850155 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 1425519 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 95029258 95029308 95029272 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 1604732 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 95050162 95050468 95050315 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 1625636 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2 NA NA NA NA NR2F2 16875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2 NA NA NA NA NR2F2 33020 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 98400609 98400736 98400673 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 60048 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 99298945 99299364 99299005 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 108745 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 99366453 99366700 99366460 Y NA NA NA NA NA NA RP11-654A16.1 68064 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 99387029 99387216 99387183 Y NA RP11-654A16.1 NA NA NA NA RP11-654A16.1 47548 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr15 99387614 99387887 99387660 Y NA RP11-654A16.1 NA NA NA NA RP11-654A16.1 46877 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 99397047 99397167 99397105 Y NA RP11-654A16.1 NA NA NA NA RP11-654A16.1 37597 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA RP11-654A16.1 NA NA NA NA RP11-654A16.1 25779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 99416036 99416369 99416103 Y IGF1R RP11-654A16.1 NA NA NA NA RP11-654A16.1 18395 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 99559007 99559192 99559062 Y NA NA PGPEP1L MCF7 ChIA-PET 22265404 SYNM 77228 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr15 99665380 99665686 99665571 Y NA SYNM NA NA NA NA SYNM 28960 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 100914283 100914527 100914405 Y ADAMTS17 NA NA NA NA NA ASB7 226212 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 101234924 101235169 101235060 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1,ASB7 IMR90 Hi-C 24141950 LINS 93489 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr15 101667775 101667985 101667844 Y CHSY1 NA CHSY1,SELS,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 CHSY1 122152 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 145023 145249 145139 Y NHLRC4 SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 20017 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ,NHLRC4 NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 809662 809847 809755 Y MSLN,MSLN,MSLN METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78,NARFL,MSLN,CHTF18,RPUSD1 NA NA NA NA MSLN 900 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 858833 859023 858927 Y RHBDL1,FBXL16,SOX8 CHTF18,RPUSD1 NA NA NA NA RPUSD1 22436 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 1132307 1132794 1132674 Y RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5 NA NA NA NA NA UBE2I 220754 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 1133120 1133226 1133175 Y RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5 NA NA NA NA NA UBE2I 220322 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 1210403 1210717 1210625 Y NA NA NA NA NA NA UBE2I 142831 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 1232339 1232689 1232437 Y NA NA NA NA NA NA UBE2I 120859 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB10 27349 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr16 2065446 2065768 2065545 Y NA TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 RAB26 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC9A3R2 7589 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 2518760 2519270 2519088 Y RAB26,E4F1,SRRM2,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA NTN3 230 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 2743231 2743530 2743363 Y NA ERVK13-1,KCTD5 NA NA NA NA KCTD5 12755 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA PRSS21,FLYWCH2 NA NA NA NA PRSS21 20597 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.4411164765152 chr16 2924940 2925188 2925019 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,FLYWCH1,PRSS41,PRSS33,TCEB2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21,FLYWCH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLYWCH2 5999 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr16 3207486 3207903 3207712 Y SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 29708 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 3237977 3238591 3238121 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 45630 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 3730332 3730635 3730484 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 34963 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 3996199 3996445 3996330 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 67472 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr16 4063476 4063638 4063556 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 100548 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr16 4349200 4349352 4349284 Y NA TFAP4 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 28124 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 4420946 4421237 4421026 Y NA PAM16,VASN NA NA NA NA VASN 1097 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 4422682 4422871 4422704 Y NA PAM16,VASN NA NA NA NA VASN 2833 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 4587360 4587817 4587427 Y HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5 NMRAL1 NA NA NA NA NMRAL1 43596 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.66842010982555 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 10672211 10672611 10672411 Y ATF7IP2,EMP2 NA NA NA NA NA EMP2 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 10710369 10710537 10710438 Y NA EMP2 NA NA NA NA EMP2 37814 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 10713350 10713596 10713516 Y NUBP1 EMP2 NA NA NA NA EMP2 40795 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr16 10746944 10747196 10747087 Y NA NA NA NA NA NA EMP2 74389 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 10922717 10923252 10923012 Y NUBP1,SOCS1,CIITA NA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 NUBP1 87074 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 10956294 10956664 10956435 Y NUBP1,CIITA NA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 DEXI 77653 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 11086769 11086952 11086818 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 50424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 11407202 11407368 11407306 Y NA NA CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 59166 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 11590987 11591512 11591296 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136725 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 11591931 11591962 11591945 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136275 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 11666045 11666804 11666319 Y ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF NA NA NA NA NA LITAF 61433 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr16 12071486 12071797 12071761 Y NA RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 2892 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 13873618 13873819 13873731 Y NA NA NA NA NA NA ERCC4 138195 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 15583408 15583655 15583541 Y NDE1,C16orf45 NA KIAA0430 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf45 57256 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr16 15617016 15617455 15617336 Y NDE1,KIAA0430 NA NA NA NA NA C16orf45 90864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 15670640 15671032 15670885 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0430 63991 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.98124888041785 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr16 16198084 16198445 16198250 Y NA NA NA NA NA NA NOMO3 125907 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 19222406 19222654 19222461 Y NA SYT17 NA NA NA NA SYT17 45113 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 20877631 20877934 20877768 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 31256 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 21566198 21566360 21566279 Y DNAH3 SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9 METTL9,IGSF6 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2547E10.2 36433 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 21622558 21622759 21622643 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 16019 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 22211037 22211162 22211126 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 EEF2K 4441 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 23455511 23455803 23455657 Y SCNN1G COG7 NA NA NA NA COG7 6698 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 24538501 24538703 24538598 Y RBBP6 RBBP6 NA NA NA NA RBBP6 8311 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 25072371 25072507 25072437 Y SLC5A11 ARHGAP17,LCMT1 LCMT1,LOC100506655 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP17 47384 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 27338285 27338559 27338369 Y KIAA0556,IL4R IL4R NA NA NA NA IL4R 15296 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 28160349 28160575 28160437 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 60666 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 28543579 28543953 28543732 Y EIF3CL,EIF3C,SPNS1,IL27 CLN3,NUPR1,CCDC101 IL27 IMR90 Hi-C 24141950 NUPR1 4542 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 28860977 28861369 28861174 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 5056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 29836551 29836761 29836656 Y NA KIF22,MAZ,PRRT2,MVP,CDIPT NA NA NA NA MVP 6836 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 29954900 29955228 29955066 Y NA SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM219 4694 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 6.98650920989451 chr16 30713870 30713962 30713916 Y NA FBRS,SRCAP,PHKG2 NA NA NA NA SRCAP 6340 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 30876491 30876606 30876548 Y NA MIR4519,BCL7C NA NA NA NA MIR4519 8038 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 30927821 30927845 30927833 Y NA MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1,ORAI3,SETD1A NA NA NA NA FBXL19 4531 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 33952235 33952334 33952272 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2069156 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 46671518 46671564 46671541 Y NA SHCBP1,VPS35,ORC6 NA NA NA NA SHCBP1 17980 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 46683529 46683842 46683691 Y NA SHCBP1,VPS35,ORC6 NA NA NA NA SHCBP1 29991 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA MYLK3,C16orf87 NA NA NA NA MYLK3 1464 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 47281592 47281819 47281707 Y NA NA NA NA NA NA NETO2 105684 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 47324349 47324747 47324746 Y NA NA NA NA NA NA NETO2 148441 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 48656490 48656672 48656584 Y SIAH1,N4BP1 N4BP1 ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 4431 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 50758375 50758737 50758558 Y SNX20,NOD2,CYLD,CYLD CYLD NA NA NA NA CYLD 15224 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 50774747 50775040 50774945 Y ADCY7,SNX20,NOD2,CYLD,CYLD CYLD NA NA NA NA CYLD 786 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 51704772 51704784 51704778 Y LOC388276 HNRNPA1P48 SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 27105 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 53128013 53128430 53128279 Y RBL2 CHD9 NA NA NA NA CHD9 41068 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 53810167 53810347 53810243 Y NA NA NA NA NA NA FTO 74292 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 56314617 56314966 56314752 Y MT3,MT1M,GNAO1,BBS2 NA NA NA NA NA GNAO1 91315 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT2A,MT1E,MT1A NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 57655846 57656393 57655974 Y FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56 GPR56 NA NA NA NA GPR56 13282 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 66719308 66719396 66719350 Y NA CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 9214 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.69243155888437 chr16 67561753 67561884 67561820 Y HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A ATP6V0D1,FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 11432 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 67891676 67892114 67891889 Y RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1 NA NA NA NA CENPT 11962 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 67892470 67892795 67892734 Y RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1 NA NA NA NA EDC4 12131 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 67993555 67993691 67993621 Y NA PSMB10,SLC12A4 NA NA NA NA SLC12A4 7813 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.66842010982555 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 68418958 68419037 68419019 Y NA NA NA NA NA NA PRMT7 76081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA HAS3 76986 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 69444205 69444538 69444372 Y NA TERF2,CYB5B NFAT5,CYB5B,TERF2,COG8,NIP7,TMED6,MIR1538,NQO1,WWP2,NOB1 IMR90 Hi-C 24141950 TERF2 3731 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 69556739 69556897 69556827 Y HAS3,TERF2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2 IMR90 Hi-C 24141950 NFAT5 40100 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 69751128 69751528 69751345 Y PDF,TERF2,NQO1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 7326 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 69761641 69762033 69761837 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 2787 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.18980139414604 chr16 70564094 70564236 70564165 Y NA COG4,SF3B3,SNORD111B NA NA NA NA SNORD111B 2682 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 71072056 71072175 71072116 Y NA NA NA NA NA NA HYDIN 190450 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr16 73023566 73023933 73023728 Y ZFHX3 NA NA NA NA NA ZFHX3 67664 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 73053285 73053647 73053466 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 37950 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 73076128 73076469 73076445 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 15128 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 73090044 73090191 73090091 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 1406 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 73096616 73096908 73096789 Y NA ZFHX3 ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 5019 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 73100430 73100582 73100506 Y NA ZFHX3 ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 8833 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 73102477 73102709 73102578 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 10880 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 73102955 73103191 73103082 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 11358 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr16 74356396 74356719 74356558 Y NA PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 27723 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 74672577 74672957 74672890 Y NA GLG1,RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 25822 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 74774732 74775110 74775064 Y FA2H MLKL NA NA NA NA MLKL 41874 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 74991657 74991945 74991906 Y NA ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA ZNRF1 38983 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 75410566 75410863 75410755 Y BCAR1 NA NA NA NA NA CFDP1 54520 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 75618166 75618518 75618190 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA GABARAPL2 19917 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 11.4703882550507 chr16 77979179 77979195 77979185 Y VAT1L,WWOX NA NA NA NA NA CLEC3A 75217 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 78199099 78199491 78199298 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 67789 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 78325751 78325980 78325865 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 194441 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 80614104 80614217 80614175 Y C16orf61 DYNLRB2 DYNLRB2 IMR90 Hi-C 24141950 DYNLRB2 41473 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 80694679 80694985 80694832 Y CDYL2 NA NA NA NA NA DYNLRB2 122048 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 80838768 80839127 80839024 Y CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2 CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 2542 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 80965900 80966145 80965922 Y NA NA CMC2 IMR90 Hi-C 24141950 CENPN 71958 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 80971971 80972227 80972105 Y CENPN NA NA NA NA NA CENPN 65876 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.18980139414604 chr16 81026963 81027197 81027054 Y NA CENPN,ATMIN NA NA NA NA CENPN 10906 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 81434776 81434850 81434813 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 41925 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 81465654 81465943 81465745 Y PLCG2,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 10832 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 81512608 81512902 81512703 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 35833 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 81585647 81585896 81585798 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 108872 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 110149 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 81660645 81660993 81660973 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 109709 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 81763852 81764387 81764185 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 6315 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 81876199 81876416 81876256 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 105497 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 82071348 82071461 82071424 Y HSD17B2 NA NA NA NA NA MPHOSPH6 130370 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 84177434 84177775 84177582 Y NA MBTPS1,HSDL1,DNAAF1,TAF1C NA NA NA NA DNAAF1 569 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 84208911 84209121 84208992 Y OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C HSDL1,DNAAF1,TAF1C NA NA NA NA TAF1C 9548 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr16 84329773 84330037 84329933 Y NA WFDC1 NA NA NA NA WFDC1 3521 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr16 84624738 84624752 84624744 Y HSDL1,COTL1 COTL1 NA NA NA NA COTL1 24931 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 84641438 84641605 84641502 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 8078 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 84869763 84870234 84870125 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 18173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr16 85339922 85340091 85340012 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 280547 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 85355565 85356105 85355766 Y NA NA FAM92B,LOC727710,GINS2,KIAA0182,KIAA0513,LINC00311 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 296190 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 85405119 85405354 85405237 Y NA NA KIAA0513,FAM92B,LINC00311,LOC727710,KIAA0182 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 316325 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 85424430 85424739 85424585 Y NA NA LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 296940 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 85878522 85878578 85878550 Y NA COX4I1,RP11-568J23.1 LOC400550,COX4NB,IRF8,FLJ30679,MTHFSD,LOC146513,LOC732275,FOXF1,COX4I1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-568J23.1 30380 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 85995905 85996102 85996008 Y NA NA IRF8,COX4NB,MTHFSD,COX4I1,FLJ30679,FOXC2,LOC400550 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-568J23.1 147763 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 86012146 86012389 86012268 Y COX4I1,IRF8 NA COX4NB,MTHFSD,COX4I1,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-568J23.1 164004 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 86417419 86417805 86417701 Y NA NA LOC400550,LOC732275,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 169036 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 86587305 86587716 86587504 Y NA MTHFSD,FOXC2 NA NA NA NA MTHFSD 464 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD,FOXC2 NA NA NA NA FOXC2 10642 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 86795224 86795595 86795410 Y NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,C16orf95,FOXC2,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 196367 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr16 86964858 86965748 86965178 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 366001 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 87498995 87499259 87499135 Y BANP,BANP,MAP1LC3B,ZCCHC14 NA NA NA NA NA FBXO31 75247 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 87780321 87780693 87780507 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16905 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr16 87823592 87823837 87823720 Y NA KLHDC4 JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 25994 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 87839693 87840050 87839856 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 87840547 87840941 87840913 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42949 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 87870717 87871153 87871035 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 29941 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 87888208 87888468 87888297 Y KLHDC4,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 12626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 87889826 87890140 87890011 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 10954 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 87904170 87904524 87904347 Y FBXO31 SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 3076 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 88338212 88338634 88338285 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179091 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 88448195 88448445 88448286 Y NA NA CA5A,SLC7A5,BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 69280 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 88612474 88612771 88612623 Y NA ZC3H18 ZC3H18 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H18 22018 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 88829964 88830251 88830166 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 19368 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 88835950 88836275 88836191 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT RNF166,CTU2 K562 ChIA-PET 22265404 PIEZO1 13344 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chr16 88848890 88849172 88848995 Y CYBA,RNF166,RNF166 PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 447 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 88866491 88866710 88866640 Y ACSF3,CBFA2T3 PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA CDT1 911 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 89066514 89066746 89066599 Y CBFA2T3 CBFA2T3 ACSF3 IMR90 Hi-C 24141950 CBFA2T3 24902 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 89086731 89086969 89086798 Y NA CBFA2T3,CTD-2555A7.2 ACSF3,CBFA2T3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2555A7.2 30404 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 89475542 89475927 89475838 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 79042 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 89568763 89569125 89568979 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPG7 13438 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 89893816 89894170 89893993 Y SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 11229 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 32253 32376 32346 Y DOC2B NA NA NA NA NA C17orf97 225742 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 505873 506062 505986 Y VPS53 NA NA NA NA NA RPS4XP17 52725 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 998449 998620 998483 Y PITPNA,INPP5K,CRK,ABR NA NA NA NA NA TIMM22 100092 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr17 1863470 1863779 1863610 Y SGSM2,SGSM2,RTN4RL1 NA NA NA NA NA RTN4RL1 62860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 9740 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 2757819 2758227 2758154 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 79469 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 2795960 2796135 2796054 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 117610 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 2952123 2952503 2952284 Y ASPA,ASPA,PAFAH1B1 NA NA NA NA NA RAP1GAP2 273773 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 3791085 3791371 3791288 Y OR1E2,ZZEF1,P2RX1 C17orf85,CAMKK1 NA NA NA NA CAMKK1 4814 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 3791812 3792145 3792008 Y GSG2 C17orf85,CAMKK1 NA NA NA NA CAMKK1 4040 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 5813088 5813344 5813243 Y NA NA NA NA NA NA NLRP1 292344 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 6470839 6471155 6470959 Y PITPNM3,TXNDC17 PITPNM3 PITPNM3 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNM3 13025 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 6541812 6541912 6541862 Y NA TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100 NA NA NA NA TXNDC17 166 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 6790647 6790875 6790776 Y SLC16A11,DLG4,DLG4 NA NA NA NA NA AC027763.2 122793 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 7381310 7382154 7381844 Y KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4 TMEM102,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 3428 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 20328 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 18450 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 8029074 8029494 8029268 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 3664 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.18980139414604 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 9155924 9156306 9156115 Y PIK3R5 NA NA NA NA NA STX8 321602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 9731829 9732213 9732092 Y NA GLP2R NA NA NA NA GLP2R 8306 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 10581804 10582199 10582113 Y MYH4 SCO1 NA NA NA NA SCO1 17493 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10 134195 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 15895023 15895192 15895111 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA TTC19 5502 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr17 16355497 16355695 16355534 Y TTC19,PIGL FAM211A NA NA NA NA FAM211A 37772 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 45443 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 17439265 17439511 17439439 Y NA RASD1 NA NA NA NA RASD1 41556 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr17 17644687 17645051 17644950 Y TOM1L2,LRRC48,LLGL1 NA NA NA NA NA RAI1 61900 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr17 21314266 21314623 21314560 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K3 128282 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.6496689902434 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.96249776083569 chr17 25981784 25982180 25981982 Y NA NA NA NA NA NA KSR1 200114 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 26216019 26216352 26216295 Y NA NA NA NA NA NA NLK 150411 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 26718724 26718918 26718801 Y FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1 POLDIP2,TMEM199,SARM1,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 13297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 26734916 26735044 26734980 Y NA SARM1,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 2701 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 27104790 27105049 27104918 Y SEBOX TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 35788 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 27129097 27129445 27129306 Y NA NA NA NA NA NA ERAL1 50511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 27429797 27430178 27430111 Y NA NA NA NA NA NA MYO18A 75252 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 27791459 27791862 27791696 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 75779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 27919265 27919579 27919303 Y NA TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1 NA NA NA NA GIT1 193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 28019224 28019454 28019389 Y NSRP1,NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA GIT1 100152 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 28070496 28070746 28070685 Y SSH2,EFCAB5 NA NA NA NA NA GIT1 151424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 28928053 28928382 28928251 Y NA KRT17P3,SMURF2P1 NA NA NA NA SMURF2P1 2239 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 29210096 29210162 29210129 Y NA TEFM NA NA NA NA TEFM 21676 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA UTP6 349393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr17 29920789 29921150 29921018 Y NA NA NA NA NA NA UTP6 305634 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 29923737 29923924 29923895 Y EVI2A NA NA NA NA NA UTP6 302860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 30723443 30723679 30723561 Y NA C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 45600 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 32365538 32365912 32365713 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 214392 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 33349623 33350064 33349994 Y SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL LIG3,CCT6B NA NA NA NA CCT6B 43526 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 33577736 33577912 33577824 Y ZNF830,RFFL,SLFN5 SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 9681 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 33786708 33787098 33786905 Y NA NA NA NA NA NA AP2B1 115967 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 34045470 34045815 34045642 Y NA RASL10B RASL10B IMR90 Hi-C 24141950 RASL10B 10853 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 34227790 34227961 34227895 Y SLFN12L,CCL5 CCL5 NA NA NA NA CCL5 21993 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 35425108 35425365 35425237 Y NA NA NA NA NA NA AATF 120933 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr17 36758537 36758835 36758687 Y NA SRCIN1 NA NA NA NA SRCIN1 1348 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr17 37024501 37024874 37024707 Y NA CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 389 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 37542274 37542291 37542284 Y NA FBXL20 NA NA NA NA FBXL20 14485 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 38477236 38480096 38479169 Y IKZF3,ZPBP2,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 13792 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 38655848 38656036 38655907 Y GJD3,IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA NA TNS4 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 38705273 38706158 38705806 Y GJD3,IGFBP4 TNS4 NA NA NA NA TNS4 49424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 39735892 39736012 39735959 Y JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14 KRT16,KRT17 NA NA NA NA KRT16 34139 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 39956975 39957353 39957171 Y KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA LEPREL4 9503 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 40418689 40419364 40419075 Y EZH1,KLHL11,DNAJC7,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,RAB5C,STAT3,STAT3,STAT5B,STAT5A STAT5B,STAT5A GHDC,HCRT,KCNH4,RAB5C IMR90 Hi-C 24141950 STAT5B 7361 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 40689876 40689925 40689901 Y NA AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX,PSMC3IP NA NA NA NA NAGLU 3686 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 40816292 40816343 40816318 Y NA TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 6969 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 41410079 41410140 41410127 Y NA NA IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL4D 64187 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 41656262 41656390 41656311 Y G6PC3 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 1274 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 41796772 41797488 41797204 Y TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3 NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 56868 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 41827198 41827473 41827372 Y NA DUSP3 NA NA NA NA DUSP3 26883 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 42198947 42199210 42199140 Y NA C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 42619291 42619496 42619449 Y NA GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 13429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,ADAM11 NA NA NA NA DBF4B 14005 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 43084352 43084694 43084637 Y NA C1QL1,NMT1 NA NA NA NA C1QL1 40913 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 43249989 43250354 43250021 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1 NA NA NA NA HEXIM2 13922 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 43304336 43305039 43304628 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 7525 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.08552513728194 chr17 43309202 43309383 43309263 Y MAP3K14,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 12391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 NA NA NA NA NA PLEKHM1 94696 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 43951029 43951274 43951198 Y NA MAPT NA NA NA NA MAPT 18474 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 44155479 44155559 44155517 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 185731 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.7539452471075 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 45021726 45021957 45021796 Y NA GOSR2,RPRML NA NA NA NA GOSR2 23243 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 45302836 45303175 45303013 Y NA CDC27 NA NA NA NA CDC27 38048 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 45356357 45357027 45356891 Y NA NA NA NA NA NA CDC27 91569 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 45515544 45515843 45515768 Y NA NA NA NA NA NA NPEPPS 82465 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 46648538 46649382 46648794 Y NA HOXB4,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 6091 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 46680378 46680812 46680678 Y NA HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB6 24 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 47081081 47081234 47081133 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 8307 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 NA NA NA NA NA ZNF652 167326 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr17 47337469 47337918 47337568 Y CALCOCO2,UBE2Z NA NA NA NA NA ZNF652 99917 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 47586040 47586243 47586212 Y NA NA NA NA NA NA AC004797.1 85742 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 47960332 47960723 47960647 Y NA NA DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,TAC4,FLJ45513,DLX4,PDK2,ITGA3,LOC284080 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DLX4 83611 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 48255388 48256117 48255676 Y NA PPP1R9B,SGCA,COL1A1 NA NA NA NA SGCA 15813 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 20579 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 48996944 48997365 48997235 Y UTP18,RSAD1,TOB1 RP11-700H6.1 LOC400604,TOB1,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-700H6.1 22709 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 49008376 49008926 49008868 Y NA RP11-700H6.1 WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-700H6.1 11148 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 50227051 50227445 50227139 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 891162 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 50561518 50561825 50561670 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1225629 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 50838489 50838508 50838499 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 994723 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 53661870 53662078 53661978 Y NA NA TMEM100 IMR90 Hi-C 24141950 PCTP 164262 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 54864431 54864801 54864568 Y TRIM25,SCPEP1 DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 44659 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 54993018 54993544 54993286 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL DGKE MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM25 3619 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 55540558 55540950 55540705 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 209346 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 55952714 55953105 55953007 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 27297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 55970352 55970806 55970481 Y SUPT4H1,VEZF1 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 44935 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 56161643 56161969 56161895 Y VEZF1,MTMR4 DYNLL2 NA NA NA NA DYNLL2 2867 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 56413212 56413667 56413409 Y VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 14787 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 57194064 57194075 57194070 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 11782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 57200500 57200626 57200599 Y GDPD1 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 18218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 57698412 57698732 57698592 Y YPEL2,RNFT1,VMP1 CLTC NA NA NA NA CLTC 3193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA PTRH2 77269 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 80172 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 57881973 57882438 57882250 Y NA NA NA NA NA NA TUBD1 85866 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 57882537 57882682 57882623 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 NA NA NA NA NA TUBD1 85622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 57929068 57929265 57929192 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 39039 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 57932982 57933345 57933242 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 34959 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr17 58678620 58678973 58678714 Y PPM1D PPM1D NA NA NA NA PPM1D 3076 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 59213347 59213460 59213422 Y TBX4,TBX2 NA NA NA NA NA AC005884.1 68115 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 59329573 59329874 59329791 Y NACA2 NA NA NA NA NA TBX2 145383 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 59784149 59784411 59784258 Y BRIP1 NA NA NA NA NA NACA2 117586 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 59939507 59939855 59939761 Y BRIP1 BRIP1 NA NA NA NA BRIP1 625 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 60141349 60141594 60141514 Y NACA2,MED13 MED13 INTS2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED13 706 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 60780424 60780717 60780568 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 77662 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 60868052 60868313 60868162 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 165290 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 60869162 60869387 60869275 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 166400 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 61370802 61371122 61370929 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 150617 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 61451328 61451417 61451341 Y NA NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 70322 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 62161129 62161576 62161448 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 44603 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 62484790 62485162 62485096 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 5992 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 62958497 62958860 62958615 Y NA LRRC37A3,AMZ2P1 NA NA NA NA AMZ2P1 10834 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 63179961 63180187 63180056 Y NA NA NA NA NA NA GNA13 129004 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 545803 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 64708425 64708706 64708566 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 411671 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 65386872 65387224 65386898 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 15297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 65389377 65389540 65389482 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 17802 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 65394789 65395150 65395019 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NOL11 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNC1 23214 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 65418011 65418377 65418257 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 46436 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 65470400 65470556 65470469 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 98825 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 65471645 65472025 65471701 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 100070 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 65477756 65478333 65478203 Y HELZ,PSMD12 NA NA NA NA NA PITPNC1 106181 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 65485462 65485785 65485684 Y HELZ,BPTF NA NA NA NA NA PITPNC1 113887 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 65847253 65847408 65847335 Y NA BPTF NA NA NA NA BPTF 27613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 66348483 66348670 66348577 Y PRKAR1A NA NA NA NA NA SLC16A6 63075 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 66374219 66374806 66374507 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76848 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.98124888041785 chr17 66374808 66375131 66375016 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76523 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.71118267846652 chr17 66376984 66377775 66377396 Y NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 73879 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr17 66379549 66379922 66379702 Y SLC16A6,WIPI1 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 71732 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 66382740 66382853 66382787 Y NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 68801 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr17 66384429 66384662 66384544 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 66992 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr17 66456929 66457226 66456998 Y NA WIPI1,PRKAR1A NA NA NA NA WIPI1 5275 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 67315191 67315526 67315500 Y NA ABCA5 NA NA NA NA ABCA5 5859 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 67603336 67603572 67603425 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 194497 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 67729924 67730199 67729927 Y NA NA KCNJ2-AS1,KCNJ2,KCNJ16 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 321085 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 67760385 67760690 67760468 Y KCNJ2 NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 351546 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 67900401 67900565 67900472 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ2 262249 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 70335121 70335458 70335290 Y NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 219960 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 71160364 71160483 71160395 Y SSTR2 COG1 NA NA NA NA COG1 26646 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 71304431 71304616 71304518 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 1698 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 71338137 71338558 71338458 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 31823 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 72512852 72513150 72513057 Y NA NA NA NA NA NA GPRC5C 93862 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 72728741 72729539 72729096 Y KIF19,KCTD2,GRIN2C,FADS6,RAB37,RAB37,RAB37 SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 13252 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 72745955 72746124 72746086 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3164 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr17 72984795 72985307 72985001 Y RAB37,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 NA NA NA NA CDR2L 3068 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 73007152 73007476 73007237 Y RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 387 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 73545364 73545732 73545559 Y NA CASKIN2,TSEN54,LLGL2 NA NA NA NA LLGL2 26203 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 73850621 73850811 73850693 Y GRB2,GRB2,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,EVPL,ACOX1,UNC13D,WBP2,TRIM47 UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65 NA NA NA NA WBP2 33 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA TRIM47 3454 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 74117633 74117738 74117682 Y NA EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 1976 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.39835390787423 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr17 75086431 75086552 75086490 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 5633 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 75118026 75118235 75118074 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 37228 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201013 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201905 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 75284936 75285118 75285041 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 204138 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 303838 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 75385660 75386043 75385777 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 304862 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 75386259 75386377 75386341 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 305461 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 76291015 76291144 76291081 Y NA NA DNAH17,CYTH1,PGS1,SOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS3 63014 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 76312866 76313241 76313131 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 SOCS3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 40917 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 76361692 76362147 76361865 Y NA SOCS3,PGS1 PGS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 7534 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 76480175 76480442 76480309 Y TMEM235 NA NA NA NA NA PGS1 107454 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr17 76813236 76813533 76813481 Y CYTH1,ENGASE,USP36 CYTH1,USP36 NA NA NA NA USP36 21990 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 77330475 77330799 77330637 Y NA NA NA NA NA NA ENGASE 261454 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 77730841 77731207 77731024 Y CBX8,CBX2 CBX2,CBX8 NA NA NA NA CBX2 18724 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 77965696 77966573 77966281 Y CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 41074 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 5.10953658634076 chr17 77990350 77990422 77990386 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 17225 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 78087852 78088239 78088062 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA GAA 14497 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 78121490 78121818 78121740 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 2508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 78149249 78149503 78149364 Y NA EIF4A3,SLC26A11,SGSH EIF4A3 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF4A3 30267 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.50263016473833 chr17 78471918 78472124 78472096 Y NA NPTX1,RPL32P31,RPTOR RPTOR,ENDOV,LOC100294362,CHMP6 IMR90 Hi-C 24141950 NPTX1 22275 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 78524165 78524352 78524226 Y NA RPL32P31,RPTOR NA NA NA NA RPTOR 7546 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 78725388 78725609 78725479 Y AATK NA NA NA NA NA RPTOR 208769 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 78735331 78735538 78735429 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 218712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 78756741 78756888 78756815 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 206510 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 78800697 78801105 78800867 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 162293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 79024187 79024380 79024262 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 17239 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 79046413 79046604 79046526 Y NA BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 39465 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 50438 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 79339701 79340108 79339894 Y NA NA SLC38A10,NPLOC4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC38A10 72354 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 79365060 79367456 79365203 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 97713 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 102227 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 79375864 79375954 79375909 Y DYSFIP1,BAHCC1 NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 102135 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 79399752 79400128 79399940 Y NPB NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 77961 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 79439092 79439387 79439261 Y PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 38702 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 79698331 79698466 79698406 Y TMEM105 HGS,ARL16,MRPL12,SLC25A10 NA NA NA NA SLC25A10 29927 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 79949658 79950000 79949804 Y SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1 ASPSCR1,LRRC45,STRA13,DCXR NA NA NA NA ASPSCR1 16975 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 79979263 79979824 79979465 Y NA ASPSCR1,LRRC45,STRA13,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L NA NA NA NA LRRC45 85 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr17 80068190 80068440 80068326 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 13982 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr17 80132206 80132561 80132393 Y NA CCDC57 NA NA NA NA CCDC57 36145 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 80164087 80164383 80164236 Y SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 NA NA NA NA CCDC57 4323 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 80245965 80246238 80246057 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 16358 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 80296831 80297318 80297085 Y NA SECTM1,TEX19 SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SECTM1 6881 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr17 81067352 81067511 81067418 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31785 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr17 81143253 81144043 81143500 Y NA NA METRNL MCF7 ChIA-PET 22265404 METRNL 107686 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 106616 106942 106784 Y NA ROCK1P1,USP14 NA NA NA NA ROCK1P1 123 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 2848392 2848824 2848619 Y EMILIN2 NA LPIN2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN2 162489 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 2897860 2897994 2897926 Y NA NA NA NA NA NA LPIN2 113319 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 2981236 2981736 2981487 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2,LPIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 29577 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 3250721 3251122 3250738 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr18 3251422 3251674 3251471 Y MYOM1 MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5943 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 3383416 3383792 3383691 Y TGIF1,TGIF1 TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 25814 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr18 3385002 3385317 3385084 Y NA TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 24289 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr18 3650005 3650381 3650193 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 240399 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 3665613 3666165 3665884 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 256007 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 5294371 5294839 5294435 Y ZFP161 NA NA NA NA NA RPL6P27 1166175 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 5463205 5463732 5463541 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA RPL6P27 997282 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr18 8412266 8412506 8412385 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 194937 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr18 9017103 9017601 9017310 Y ANKRD12 NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 83027 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 9743544 9744009 9743684 Y VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 37382 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 9753891 9754160 9754063 Y VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 47729 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 9824351 9824715 9824532 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 87284 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr18 10086468 10086802 10086635 Y NAPG,APCDD1 NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 174469 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 10544333 10544521 10544427 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 20431 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 10726542 10726663 10726595 Y NAPG NA NA NA NA NA NAPG 202640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr18 11859926 11860218 11860181 Y CHMP1B CHMP1B,MPPE1 NA NA NA NA CHMP1B 10531 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 12471098 12471401 12471374 Y PSMG2 NA NA NA NA NA SLMO1 65203 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 12880036 12880906 12880743 Y NA PTPN2 NA NA NA NA PTPN2 46736 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 12993260 12993605 12993433 Y NA SEH1L,CEP192 NA NA NA NA CEP192 3899 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 13542199 13542509 13542255 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 182150 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.91973519219472 chr18 20046739 20046926 20046743 Y GATA6 NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 299335 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 20128581 20128874 20128764 Y NA NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 247350 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 21176326 21176498 21176427 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 11464 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 21552370 21552656 21552582 Y C18orf8,TTC39C,TTC39C TTC39C NA NA NA NA TTC39C 18081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 21562247 21562750 21562607 Y NA TTC39C TTC39C IMR90 Hi-C 24141950 TTC39C 7987 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.87697262355375 chr18 23305188 23305322 23305259 Y NA NA NA NA NA NA SS18 363859 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 24237719 24238162 24238112 Y NA KCTD1 TAF4B,KCTD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD1 2354 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr18 25623626 25623889 25623758 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 131521 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 32622568 32623026 32622758 Y ZNF24,MAPRE2 NA NA NA NA NA MAPRE2 67676 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 32990022 32990156 32990089 Y NA ZNF396 GALNT1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF396 34721 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 33073738 33073904 33073824 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 2051 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.50263016473833 chr18 33093148 33093751 33093628 Y GALNT1 INO80C NA NA NA NA INO80C 17193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 33311016 33311295 33311162 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 151935 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 33389735 33389972 33389879 Y ZNF24,ZNF396,INO80C NA NA NA NA NA C18orf21 160074 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 33844964 33845139 33845043 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 30538 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 34392785 34392973 34392879 Y NA KIAA1328,TPGS2 NA NA NA NA KIAA1328 14096 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 34765473 34765582 34765528 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 358315 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 35138994 35139043 35139019 Y CELF4 NA NA NA NA NA TPGS2 731836 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 42857952 42858246 42858076 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 686994 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 44675442 44676177 44675810 Y NA HDHD2,IER3IP1 NA NA NA NA HDHD2 551 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 45379355 45379691 45379492 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 75824 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 45454827 45455289 45455128 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 226 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr18 45494348 45494736 45494572 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 38833 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 45530162 45530545 45530368 Y SMAD2,SMAD2 NA SMAD2,ZBTB7C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD2 74647 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 45541725 45542128 45542097 Y SMAD2,SMAD2 NA NA NA NA NA SMAD2 86210 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr18 46074456 46074621 46074556 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 11039 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 46269539 46269878 46269723 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 205203 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 46456597 46456819 46456703 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 18262 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 46461141 46461770 46461393 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 13311 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr18 46482158 46482454 46482304 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 SMAD7 K562 ChIA-PET 22265404 SMAD7 7077 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 46520518 46520924 46520659 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 45437 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 46523478 46523814 46523611 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 48397 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 46524155 46524830 46524741 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 49074 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 46547875 46548139 46548027 Y NA NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 72794 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr18 46700838 46701084 46700955 Y DYM NA NA NA NA NA SMAD7 225757 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 47548085 47548102 47548094 Y NA NA NA NA NA NA ACAA2 209755 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 47834587 47834811 47834691 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21913 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr18 51675484 51675804 51675634 Y NA NA NA NA NA NA MBD2 73354 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 52736760 52737109 52736909 Y NA NA NA NA NA NA CCDC68 112021 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 56159165 56159246 56159180 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 106617 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr18 56248728 56248836 56248808 Y NA SNORD28,ALPK2 NA NA NA NA SNORD28 17027 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 60456322 60456424 60456373 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 75650 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 60827467 60827631 60827548 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 157730 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 60875086 60875640 60875342 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 109721 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr18 72835144 72835775 72835214 Y NA NA ZNF407 IMR90 Hi-C 24141950 ZADH2 83528 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 72919988 72920296 72920123 Y ZADH2,TSHZ1 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA TSHZ1 414 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 74823541 74824614 74824455 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 290978 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 76734377 76734736 76734420 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 92549 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 77153646 77154504 77153944 Y ATP9B,NFATC1,NFATC1 NA NA NA NA NA NFATC1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr18 78004258 78004625 78004566 Y PARD6G PARD6G NA NA NA NA PARD6G 829 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 488227 488667 488380 Y NA MADCAM1,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MADCAM1 1051 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 555976 556322 556024 Y NA CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 12975 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 567332 567750 567473 Y NA CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 1547 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 4137 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 751766 752111 751822 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 42964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 26.798998014073 chr19 934999 935434 935086 Y MIDN,CIRBP MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 11218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 996390 996745 996544 Y HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7 NA NA NA NA WDR18 15216 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 1453873 1454140 1454045 Y C19orf26,MUM1,APC2 DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 17515 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr19 2162744 2162943 2162860 Y CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 280 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 2507206 2507458 2507335 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B GADD45B NA NA NA NA GADD45B 33086 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 2529574 2529858 2529677 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 55454 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 2544084 2544261 2544159 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 69964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 2599036 2599584 2599134 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA DIRAS1 119832 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 2775891 2776162 2776129 Y NA SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554 NA NA NA NA SGTA 5207 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 3344211 3344472 3344340 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC NFIC NFIC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 NFIC 13089 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 3369394 3369884 3369615 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 11833 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 3397236 3397600 3397594 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 39675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 3398670 3398894 3398830 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 41109 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 3404656 3404792 3404728 Y TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 47095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 3405079 3405252 3405203 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 47518 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 3428769 3429112 3428821 Y TLE2,NFIC NA NA NA NA NA DOHH 69826 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 3450938 3451227 3451079 Y GNA15 DOHH NA NA NA NA DOHH 47711 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 3555158 3555442 3555300 Y C19orf28 HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 15333 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 3562421 3562565 3562489 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 8210 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 3570616 3571018 3570829 Y C19orf28,HMG20B,GIPC3 MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 3603116 3603307 3603197 Y GIPC3,TBXA2R HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA TBXA2R 1531 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 16.1628198139351 chr19 3603456 3603548 3603535 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA TBXA2R 1290 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 3670243 3670423 3670333 Y NFIC PIP5K1C,TJP3 NA NA NA NA PIP5K1C 28054 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr19 3671007 3671294 3671202 Y NFIC,MAP2K2,EEF2,PIP5K1C,APBA3 PIP5K1C,TJP3 NA NA NA NA PIP5K1C 27183 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 4064154 4064453 4064218 Y SEMA6B,MATK ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 490 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 4567148 4567365 4567215 Y TICAM1,SEMA6B PLIN5 NA NA NA NA PLIN5 33912 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 4575288 4575908 4575613 Y CCDC94,TICAM1,SEMA6B PLIN5 EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10 IMR90 Hi-C 24141950 PLIN5 42052 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 4677231 4677531 4677381 Y NA TNFAIP8L1,C19orf10,DPP9 NA NA NA NA C19orf10 8849 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 5046594 5046918 5046679 Y NA NA NA NA NA NA KDM4B 79469 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 5357360 5357663 5357512 Y NA PTPRS PTPRS,ZNRF4,KDM4B,SAFB2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRS 18546 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 5585977 5586132 5586057 Y NA SAFB,SAFB2 NA NA NA NA SAFB 34914 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 6071128 6071397 6071200 Y NA NA NA NA NA NA RANBP3 94975 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 6076501 6076965 6076757 Y NA NA NA NA NA NA RANBP3 100348 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 6271729 6272422 6272353 Y NDUFA11,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 5537 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr19 6600003 6600291 6600148 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF9 70993 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 7196747 7197124 7196928 Y KIAA1543,INSR NA NA NA NA NA INSR 94921 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 7525376 7525563 7525475 Y NA PEX11G NA NA NA NA PEX11G 34772 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 8051436 8051456 8051449 Y NA TIMM44,ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 17087 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 9120594 9120838 9120762 Y MUC16 NA NA NA NA NA ZNF317 128218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 9128934 9129115 9129008 Y NA NA NA NA NA NA ZNF317 119941 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 9748883 9749171 9749027 Y OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF561 18808 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 9758216 9758505 9758322 Y ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 25271 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 NA NA NA NA NA PIN1 112303 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 10829647 10829946 10829894 Y ICAM3,TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2 QTRT1,DNM2 NA NA NA NA DNM2 2892 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 11248443 11248964 11248826 Y NA SPC24 NA NA NA NA SPC24 15520 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 11804467 11804940 11804795 Y ZNF878,ZNF823,ZNF491 HNRNPA1P10,ZNF823 NA NA NA NA HNRNPA1P10 28622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr19 12889371 12889726 12889619 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10584 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN NA NA NA NA JUNB 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 13006078 13006409 13006086 Y NA HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A NA NA NA NA GCDH 6238 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.29407765101014 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr19 13445795 13446271 13446068 Y SYCE2 NA NA NA NA NA IER2 186566 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 13783472 13783589 13783575 Y NA NA CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 56985 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 13955108 13955589 13955298 Y CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4 NA NA NA NA NA ZSWIM4 50834 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 13995440 13995781 13995611 Y NA CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 19233 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 14189294 14189532 14189398 Y CCDC130,ZSWIM4,NANOS3,DCAF15,RFX1,PKN1,DNAJB1,CD97 IL27RA,EEF1DP1,SAMD1,PRKACA NA NA NA NA EEF1DP1 10140 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 14276845 14277176 14277145 Y NA PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 31077 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 14528800 14529217 14529142 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A CD97,DDX39A,PKN1 NA NA NA NA DDX39A 608 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 14616908 14617174 14617017 Y GIPC1 GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 8723 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 15336591 15336774 15336684 Y NA NA NA NA NA NA ILVBL 101995 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA TPM4 227712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 16442138 16442160 16442149 Y NA KLF2 NA NA NA NA KLF2 8510 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 16452764 16452992 16452877 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 19136 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 16510195 16510544 16510471 Y RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2 NA NA NA NA NA EPS15L1 70352 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 17188668 17188879 17188834 Y HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 4077 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 17236053 17237400 17237360 Y MED26,HAUS8,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 51462 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 17371801 17372164 17371849 Y NXNL1,GTPBP3 USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,MRPL34,DDA1,ABHD8 NR2F6 K562 ChIA-PET 22265404 BABAM1 3995 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 17890338 17890582 17890537 Y FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1 FCHO1 NA NA NA NA FCHO1 33811 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 18131991 18132570 18132392 Y MAP1S,FCHO1,KCNN1,PGPEP1,LRRC25,JUND,IFI30,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA MAST3 74033 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA MAST3 73294 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.7539452471075 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 18401020 18401539 18401437 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,LRRC25,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 10133 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.87697262355375 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.60690642160243 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 GDF15,SSBP4 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 18768622 18768973 18768794 Y KIAA1683 KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA KLHL26 22847 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 19192588 19193136 19192878 Y NA SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SLC25A42 19780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 19488658 19488936 19488750 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 5699 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 21882044 21882358 21882227 Y ZNF676,ZNF208 NA NA NA NA NA ZNF208 309393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr19 28225585 28226223 28225838 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1476225 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 28239770 28239799 28239785 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1462649 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 29702850 29703471 29703365 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 32863977 32864267 32864121 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA ZNF507 29477 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 33740333 33740640 33740371 Y NA NA CHST8,CEBPA,LOC80054,PEPD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPA 50830 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr19 34874880 34875495 34875019 Y NA GPI,PDCD2L,UBA2 NA NA NA NA PDCD2L 17794 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 35643836 35643967 35643905 Y FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4 FXYD5 NA NA NA NA FXYD5 203 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 51798 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 36030863 36031038 36030900 Y NA DMKN,TMEM147,AD000090.2 NA NA NA NA TMEM147 3459 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 36135988 36136183 36136108 Y ARHGAP33 HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1 NA NA NA NA COX6B1 942 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 36519340 36519516 36519376 Y ZNF565 SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62 NA NA NA NA ALKBH6 16199 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 38791297 38791661 38791416 Y C19orf33 C19orf33,YIF1B,CATSPERG NA NA NA NA C19orf33 1140 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 39150238 39150530 39150365 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 13949 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 39175000 39175365 39175141 Y NFKBIB,HNRNPL,EIF3K ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 38711 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.87697262355375 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 40543471 40543758 40543711 Y SPTBN4,ZNF546,ZNF780B ZNF780B NA NA NA NA ZNF780B 16358 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 41152132 41152466 41152220 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 42411 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr19 41802534 41802970 41802553 Y B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 11124 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 41834727 41835191 41834967 Y CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 19625 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 41849661 41849907 41849784 Y HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 4909 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.08552513728194 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 42514619 42514744 42514681 Y ATP1A3 NA NA NA NA NA RABAC1 53077 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 42532310 42532673 42532485 Y NA ZNF574 NA NA NA NA ZNF574 37956 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA NA TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 PSG4 126097 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 44113081 44113405 44113330 Y NA XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4 NA NA NA NA ZNF428 8621 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 44287065 44287299 44287223 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 3656 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 44825986 44826083 44826035 Y ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 18787 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 45228436 45228775 45228695 Y IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 20187 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 45231729 45232033 45231881 Y IGSF23,CLASRP,APOC2 BCL3 NA NA NA NA BCL3 16929 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 7584 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 45905744 45905944 45905844 Y EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1 ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA CD3EAP 1523 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 45959420 45959846 45959631 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP FOSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 9407 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 45987073 45987327 45987197 Y NOVA2,RELB,CLASRP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA PPM1N 2708 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 46133845 46134220 46134022 Y NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2 OPA3,EML2 NA NA NA NA EML2 12667 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 163936 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3 NA NA NA NA CALM3 39864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr19 47552678 47552827 47552750 Y NA TMEM160 NA NA NA NA TMEM160 2790 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 47744387 47744529 47744512 Y SLC8A2 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA BBC3 10364 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 16792 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 47805638 47805769 47805718 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1 CCDC9,PRR24,DHX34 PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2 IMR90 Hi-C 24141950 PRR24 29496 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 47817254 47817597 47817448 Y ZC3H4,NAPA,DHX34,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77 PRR24,DHX34 NA NA NA NA DHX34 32941 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 47867147 47867265 47867191 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 16609 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 47892475 47892975 47892646 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34,MEIS3 NA NA NA NA MEIS3 27805 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 48102180 48102576 48102418 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85683 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr19 48167427 48167718 48167620 Y NA EHD2 NA NA NA NA EHD2 46882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 48648975 48649130 48649035 Y SYNGR4,SPACA4 PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA LIG1 22730 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 49832847 49832906 49832877 Y PTH2 DKKL1,TEAD2 NA NA NA NA DKKL1 30134 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 ALDH16A1,PIH1D1 NA NA NA NA ALDH16A1 29950 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 50004159 50004640 50004502 Y PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11 ALDH16A1,PIH1D1,RPL13A,SNORD33,SNORD34,SNORD35A,RPS11,SNORD35B,FCGRT,RCN3 NA NA NA NA FCGRT 3433 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 50141205 50141513 50141452 Y AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1 NA NA NA NA RRAS 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 51898753 51899047 51898851 Y SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1 ETFB NA NA NA NA ETFB 31081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 52192842 52193550 52192951 Y ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 120291 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 52586676 52587051 52586863 Y NA ZNF432,ZNF841 NA NA NA NA ZNF432 9940 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA NA NA NA NA NA ZNF845 107141 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 54048513 54048640 54048574 Y NA NA NA NA NA NA ZNF813 79524 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 NA NA NA NA NA MYADM 97766 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.12828770592291 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 55546101 55546409 55546255 Y NA RDH13 NA NA NA NA RDH13 34250 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 55620515 55620603 55620559 Y NA RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 6324 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 55988531 55988605 55988568 Y NAT14 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA ZNF628 2832 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 56060798 56061018 56060898 Y NA ZNF579,ZNF524 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 29193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 28507 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr19 56118803 56119132 56118967 Y COX6B2 ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 7467 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 56603212 56603388 56603235 Y ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5 ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 27261 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 56831287 56831644 56831534 Y ZSCAN5A ZSCAN5A NA NA NA NA ZSCAN5A 46108 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 57944833 57945004 57944919 Y NA ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772 NA NA NA NA ZNF749 136 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 58321012 58321020 58321017 Y VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 3261 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF417 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 44565 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr19 58824678 58824957 58824818 Y ZNF256 ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG-AS1,A1BG,ZNF497 NA NA NA NA ERVK3-1 9963 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 59078228 59078288 59078258 Y CHMP2A,CHMP2A ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA CENPBD1P1 4582 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr19 59087419 59087864 59087514 Y NA ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA MGC2752 3527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 393939 394227 394175 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA ACP1 131799 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 628526 628919 628630 Y NA TMEM18 FAM150B IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 46520 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr2 857378 857399 857389 Y NA NA NA NA NA NA TMEM18 181939 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 915949 916124 916037 Y NA NA TPO,SNTG2,MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 240510 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 1735614 1736022 1735851 Y PXDN PXDN NA NA NA NA PXDN 10602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 1742676 1742796 1742704 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 3828 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 3583560 3583858 3583796 Y NA AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7 NA NA NA NA AC108488.4 1097 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 3699787 3700199 3700016 Y NA NA NA NA NA NA RPS7 78992 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 9922366 9922715 9922451 Y NA NA YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,GRHL1,RRM2,TAF1B IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 58768 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 10176248 10176551 10176348 Y NA KLF11 NA NA NA NA KLF11 4425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 10258344 10258406 10258377 Y NA RRM2 NA NA NA NA RRM2 2049 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr2 10341486 10341905 10341708 Y KLF11 NA NA NA NA NA RRM2 81031 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 10423423 10423670 10423576 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 17345 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 10572027 10572239 10572154 Y NA ODC1,RP11-320M2.1 NA NA NA NA ODC1 14391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 11514785 11514933 11514926 Y NA ROCK2 ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 28329 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 11720189 11720409 11720300 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 95312 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 11890513 11890846 11890740 Y LPIN1 NA NA NA NA NA LPIN1 74792 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 15309828 15310293 15310034 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 389161 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 15561739 15562014 15561765 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 137440 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 20417309 20417694 20417511 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 5500 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 20421306 20421667 20421468 Y NA SDC1 NA NA NA NA SDC1 1527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 20548410 20548604 20548507 Y NA PUM2 HS1BP3,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 1391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 20732744 20733106 20733037 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC023137.2 83941 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 20779015 20779511 20779185 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 69338 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 20817015 20817334 20817182 Y RHOB,GDF7 HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 31515 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 21691615 21691861 21691725 Y NA NA NA NA NA NA AC067959.1 249568 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 23275216 23275518 23275368 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 330570 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 24580732 24581123 24580905 Y NA RPL36AP13,ITSN2 NA NA NA NA ITSN2 460 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 25096617 25097268 25096771 Y NA ADCY3 NA NA NA NA ADCY3 43440 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 26943701 26943984 26943834 Y GPR113 AC015977.5,CENPA NA NA NA NA CENPA 41173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 26946934 26947339 26946998 Y C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18 AC015977.5,CENPA NA NA NA NA CENPA 37818 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 27005355 27005756 27005547 Y NA CENPA NA NA NA NA CENPA 20198 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr2 27543962 27544264 27544065 Y NA SLC30A3,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17 NA NA NA NA MPV17 2283 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 33886 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr2 28003613 28003725 28003670 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 11029 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 28024813 28024890 28024852 Y IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33 MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 32229 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 28182324 28182658 28182394 Y FOSL2,GCKR,RBKS NA NA NA NA NA RBKS 70359 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 28303771 28304058 28303879 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 191806 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 28383730 28384110 28383893 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 229205 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 28496743 28497020 28496828 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 116295 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 28653761 28654131 28653949 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA AC104695.3 38222 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 28939068 28939564 28939261 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 32942 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 29060448 29060640 29060540 Y PPP1CB,PPP1CB TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 30527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 32166229 32166498 32166237 Y NA NA NA NA NA NA MEMO1 67801 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 33435749 33436022 33435923 Y FAM98A,LTBP1 NA NA NA NA NA FAM98A 386427 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 33437244 33437520 33437371 Y FAM98A,LTBP1 NA NA NA NA NA FAM98A 384929 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 35360558 35360702 35360630 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 1220367 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr2 36665586 36666219 36665918 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 84517 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 36687110 36687380 36687132 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 106041 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 36700444 36700711 36700553 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 119375 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 36790074 36790520 36790216 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 80710 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 38315585 38315885 38315608 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 CYP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYP1B1 19159 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 38323202 38323810 38323564 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYP1B1 11234 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 38334903 38335105 38334999 Y NA NA FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1B1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 38340220 38340542 38340303 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP1B1 5176 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 38341642 38341844 38341699 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1,QPCT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP1B1 6598 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 38356620 38356932 38356711 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 21576 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 38368766 38369153 38368894 Y CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 33722 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 38369402 38369882 38369670 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 34358 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 38372999 38373624 38373225 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 37955 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 38380770 38381135 38380953 Y CDC42EP3,FAM82A1,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 45726 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 38395987 38396176 38396066 Y CDC42EP3 NA NA NA NA NA RPL7P12 60534 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 38398414 38398595 38398505 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 58115 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 38418747 38419129 38419037 Y NA RPL7P12,AC009229.5 NA NA NA NA RPL7P12 37581 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 39722003 39722381 39722147 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K3 59550 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 42155945 42156079 42156067 Y NA NA NA NA NA NA PKDCC 117081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 42157961 42158315 42158139 Y PKDCC NA NA NA NA NA PKDCC 114845 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 42182061 42182670 42182320 Y PKDCC NA NA NA NA NA PKDCC 90490 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 42567305 42567366 42567336 Y EML4 NA NA NA NA NA COX7A2L 82862 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 42696554 42696964 42696742 Y NA COX7A2L,KCNG3,MTA3 NA NA NA NA KCNG3 22273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 43265724 43265951 43265843 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 185797 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 43269026 43269323 43269208 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 182425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 43302253 43302513 43302383 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 149235 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 43405877 43406433 43406206 Y OXER1 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 45315 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 43440136 43440508 43440361 Y OXER1,ZFP36L2 ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 11240 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 44664975 44664991 44664983 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 77886 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 45834799 45835123 45834961 Y NA SRBD1,PRKCE NA NA NA NA SRBD1 2181 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 46212455 46212485 46212471 Y PRKCE NA NA NA NA NA EPAS1 306321 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 46294979 46295300 46295093 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 223506 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 46406206 46406535 46406438 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 112271 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 46409270 46409537 46409436 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 109269 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 46452124 46452363 46452229 Y RHOQ NA PRKCE,EPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 EPAS1 66443 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 46525633 46526278 46526263 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 6827 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 46586439 46586863 46586504 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 67633 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 46614603 46614745 46614671 Y RHOQ NA NA NA NA NA EPAS1 95797 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr2 54816609 54817000 54816923 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA EML6 131636 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 55327778 55327923 55327859 Y NA RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 9834 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 55360803 55361407 55361172 Y SMEK2,CCDC88A,RTN4 RTN4 RTN4,C2orf63,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 23046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr2 62422210 62422461 62422453 Y NA B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 962 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 62424513 62424632 62424578 Y B3GNT2 B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 3265 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 62519354 62519381 62519368 Y NA NA COMMD1,B3GNT2 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 98106 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 64239166 64239247 64239208 Y PELI1 VPS54 NA NA NA NA VPS54 4959 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 65058327 65058875 65058618 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 82188 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 65093958 65094266 65094153 Y NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 117819 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 65326595 65326952 65326834 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 28288 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 65804222 65804385 65804306 Y RAB1A NA ACTR2,SPRED2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 146451 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.79670781574847 chr2 69085194 69085477 69085348 Y PLEK,FBXO48,APLF NA NA NA NA NA ANTXR1 152833 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR1 102453 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 69241314 69241782 69241454 Y ANTXR1 ANTXR1 NA NA NA NA ANTXR1 3004 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 69250610 69250802 69250769 Y NA ANTXR1 NA NA NA NA ANTXR1 12300 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 69309666 69309994 69309927 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 71356 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 69390293 69390547 69390355 Y ARHGAP25,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ANTXR1 151983 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 69469857 69470021 69469934 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 142361 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 69481133 69481450 69481229 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 130932 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 69663778 69663884 69663817 Y AAK1 NFU1 NA NA NA NA NFU1 1018 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 70048617 70048893 70048741 Y ANXA4 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 5881 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 70255582 70255905 70255725 Y MXD1,PCBP1 NA NA NA NA NA PCBP1 56680 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 70270545 70270983 70270722 Y MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1 NA NA NA NA PCBP1 41602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 70350372 70350687 70350608 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 22689 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 70388970 70389092 70389031 Y NA NA NA NA NA NA AC016700.4 61287 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 72372444 72372716 72372574 Y CYP26B1 NA NA NA NA NA EXOC6B 678454 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 74258403 74258434 74258418 Y NA AC073046.25 DGUOK,STAMBP,ACTG2,TET3,BOLA3,BOLA3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC073046.25 48144 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 74793766 74794164 74794010 Y WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1 HTRA2,AUP1 NA NA NA NA AUP1 38700 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 74968770 74968998 74968973 Y TLX2,HK2 AC007387.2 HK2,SEMA4F IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007387.2 10948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr2 75072652 75072899 75072736 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 13544 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 75089962 75090221 75090092 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 30854 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 75114636 75114786 75114714 Y NA NA NA NA NA NA HK2 55528 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 75427361 75427621 75427415 Y TACR1 NA NA NA NA NA POLE4 243742 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 75498571 75498680 75498627 Y NA NA TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 POLE4 314952 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 78478830 78479153 78479031 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 465322 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 78683398 78683574 78683486 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 669890 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 80763685 80763993 80763839 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 375424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 81430794 81430886 81430840 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1042533 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 85034355 85034669 85034421 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 96080 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 85066726 85066734 85066730 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 64015 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr2 85151844 85152193 85152004 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 21095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 85154234 85154422 85154323 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 23485 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 85242321 85242336 85242334 Y NA KCMF1 NA NA NA NA KCMF1 46105 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 85632531 85633066 85632892 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG CAPG NA NA NA NA CAPG 10489 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA CAPG NA NA NA NA CAPG 29587 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 85982713 85983043 85983025 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 6246 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 86048153 86048345 86048249 Y ATOH8 NA NA NA NA NA ST3GAL5 65792 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 86299445 86299644 86299569 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 31634 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 86761300 86761347 86761323 Y REEP1,REEP1 NA NA NA NA NA RNF103 87642 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 88353539 88354148 88353800 Y KRCC1 RNU2-63P,KRCC1 NA NA NA NA KRCC1 291 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 91759872 91760090 91759934 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2770710 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 96995983 96996007 96995995 Y ITPRIPL1,ITPRIPL1 SNRNP200,NCAPH NA NA NA NA NCAPH 3518 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 97199230 97199661 97199468 Y DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A ARID5A NA NA NA NA ARID5A 819 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 97291626 97292008 97291852 Y NA KANSL3 NA NA NA NA KANSL3 14516 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 98290312 98290690 98290542 Y TMEM131 COX5B,ACTR1B NA NA NA NA ACTR1B 11742 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA ACTR1B 89408 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 164641 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 99118904 99119212 99119061 Y NA NA NA NA NA NA INPP4A 59587 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 99213145 99213306 99213215 Y INPP4A COA5,UNC50 NA NA NA NA COA5 9672 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 100104968 100105518 100105262 Y REV1 REV1 NA NA NA NA REV1 471 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 101884483 101884674 101884578 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 TBC1D8,RNF149 NA NA NA NA TBC1D8 17155 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 101923239 101923757 101923472 Y RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149 RNF149 NA NA NA NA RNF149 76 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 102867550 102867715 102867627 Y NA NA NA NA NA NA MFSD9 483632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 102878603 102878966 102878726 Y NA NA NA NA NA NA MFSD9 472381 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 105430210 105430587 105430504 Y NA NA NA NA NA NA MRPS9 221854 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 105676474 105676490 105676482 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 24033 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 106009982 106010344 106010250 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 42626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 106020017 106020290 106020154 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 32680 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 106020631 106021071 106020783 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 31899 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 109506497 109506716 109506551 Y LIMS1,CCDC138,EDAR NA NA NA NA NA CCDC138 105284 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 109514642 109514975 109514799 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 113429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 109859358 109859584 109859496 Y SH3RF3 NA NA NA NA NA CCDC138 458145 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 110318153 110318301 110318244 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 51482 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 112375521 112375561 112375551 Y NA NA NA NA NA NA ANAPC1 264706 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 112456456 112456792 112456629 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 183475 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 113450039 113450435 113450231 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 48605 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 113551784 113552157 113551927 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 11617 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 114615220 114615283 114615253 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 ACTR3,SLC35F5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTR3 30254 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 114649026 114649412 114649076 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 3489 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 120891923 120892273 120892121 Y NA NA NA NA NA NA TMEM185B 86711 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 127863441 127863795 127863513 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 510 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 127915404 127915435 127915422 Y NA NA CYP27C1,BIN1,MAP3K2 IMR90 Hi-C 24141950 BIN1 52473 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 128143711 128144108 128144023 Y SFT2D3,MAP3K2 NA CYP27C1,IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 128266210 128266439 128266348 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L,IWS1 IWS1 NA NA NA NA IWS1 16023 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 128469057 128469300 128469179 Y NA LIMS2,SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 12460 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 129131715 129132088 129131976 Y NA NA HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 57564 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 129381655 129381863 129381711 Y NA NA UGGT1,HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 307504 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 130201021 130201117 130201085 Y NA NA NA NA NA NA AC079776.4 494673 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.6496689902434 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 134084028 134084575 134084301 Y NA NA NA NA NA NA MGAT5 790979 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 135427946 135428165 135428068 Y CCNT2 NA NA NA NA NA CCNT2 245640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 136242341 136242686 136242514 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 44120 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 136404449 136404849 136404497 Y R3HDM1 NA NA NA NA NA UBXN4 92340 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 136887149 136887816 136887360 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 CXCR4 K562 ChIA-PET 22265404 CXCR4 13414 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 138845772 138845790 138845781 Y NA NA HNMT IMR90 Hi-C 24141950 AC097721.2 411478 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 142874625 142874987 142874896 Y LRP1B NA NA NA NA NA KYNU 758080 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 143630782 143631707 143631171 Y KYNU KYNU NA NA NA NA KYNU 1360 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr2 143697269 143697638 143697450 Y KYNU NA NA NA NA NA KYNU 64202 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 143809081 143809289 143809162 Y KYNU NA NA NA NA NA KYNU 176014 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 144488458 144488893 144488487 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 599242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 145078226 145078371 145078292 Y ZEB2,GTDC1,GTDC1,GTDC1 GTDC1 NA NA NA NA GTDC1 9764 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 145420866 145421073 145420998 Y ZEB2 TEX41 ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 TEX41 2461 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 148296630 148296767 148296652 Y NA NA NA NA NA NA AC009480.4 269148 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 151377866 151378135 151377929 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 15390 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 153568262 153568351 153568307 Y NA ARL6IP6,PRPF40A NA NA NA NA ARL6IP6 4056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 154333342 154333495 154333419 Y RPRM NA NA NA NA NA PRPF40A 760831 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 154335936 154336181 154336134 Y RPRM NA NA NA NA NA PRPF40A 763425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr2 154729073 154729474 154729153 Y NA NA NA NA NA NA PRPF40A 1156562 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 157147606 157147983 157147795 Y NA NR4A2 NA NA NA NA NR4A2 48877 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr2 157257270 157257340 157257305 Y NA GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 32462 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 158030373 158030519 158030484 Y NA NA NR4A2,GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1 699855 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 662369 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 160057929 160058272 160058017 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 83038 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 160095412 160095531 160095474 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 45779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 160470388 160470776 160470715 Y NA AC009506.1,BAZ2B NA NA NA NA BAZ2B 427 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 161083916 161084239 161083958 Y CD302,ITGB6 NA ITGB6,TANK,RBMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR4785 178154 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 NA TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4785 163770 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 161348201 161348679 161348535 Y RBMS1 NA NA NA NA NA RBMS1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14 NA NA NA NA PSMD14 34796 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 164205577 164205788 164205730 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 384734 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA NA NA NA NA NA AC019181.2 264828 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 165640958 165641192 165641060 Y NA NA NA NA NA NA AC019181.2 54067 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 168994093 168994243 168994234 Y NA NA NA NA NA NA STK39 108408 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 170441657 170442069 170441908 Y NA FASTKD1,PPIG NA NA NA NA PPIG 2807 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 172621126 172621511 172621230 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 79207 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 172628972 172629294 172629196 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 87053 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 173117910 173118399 173118084 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 152282 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 173165602 173165883 173165780 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA6 124199 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 173302497 173302807 173302540 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 12415 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 173647954 173648254 173648105 Y NA NA NA NA NA NA AC093818.1 228630 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 173796243 173796588 173796342 Y NA NA NA NA NA NA AC093818.1 376919 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 175069870 175070170 175070019 Y WIPF1,SP3,SP3 OLA1 NA NA NA NA OLA1 41256 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 177426339 177426739 177426504 Y NA NA HOXD-AS2,HOXD8,MIR10B,HOXD9,HOXD4,HOXD3,HOXD-AS1,HOXD1,LOC375295 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 294216 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 17167 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr2 178176683 178176989 178176836 Y NA AC079305.10 NA NA NA NA AC079305.10 49596 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 183876955 183877317 183877185 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 24269 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 183950583 183950613 183950599 Y NA NCKAP1,DUSP19,NUP35 NA NA NA NA DUSP19 9296 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 187015061 187015446 187015349 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 333437 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 187318926 187319192 187319071 Y NA ZC3H15 NA NA NA NA ZC3H15 29691 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 188347584 188347786 188347681 Y NA CALCRL NA NA NA NA CALCRL 36397 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 188404228 188404596 188404560 Y TFPI TFPI NA NA NA NA TFPI 23891 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 190741113 190741271 190741187 Y NA NA NA NA NA NA PMS1 94006 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA HIBCH 130946 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 191377806 191377826 191377816 Y NA TMEM194B NA NA NA NA TMEM194B 19622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 191876857 191877189 191877023 Y NA AC067945.3,STAT1 NA NA NA NA STAT1 6497 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 191984586 191984681 191984634 Y NA NA NA NA NA NA STAT1 100900 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 194142383 194142416 194142400 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 1432402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 196428777 196429172 196429092 Y SLC39A10 SLC39A10 SLC39A10 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC39A10 9529 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 197420372 197420700 197420626 Y NA NA NA NA NA NA CCDC150 81578 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 199736102 199736481 199736292 Y NA NA NA NA NA NA FTCDNL1 977415 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 201172384 201172536 201172446 Y NA SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 3780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 201403171 201403461 201403317 Y NA SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 20664 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 201652202 201652395 201652320 Y NA BZW1 BZW1 IMR90 Hi-C 24141950 BZW1 20922 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 201830040 201830326 201830203 Y KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1 ORC2 NA NA NA NA ORC2 3637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 202100663 202100910 202100770 Y NA NA NA NA NA NA CASP10 55059 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 202209480 202209837 202209779 Y NA STRADB NA NA NA NA STRADB 40744 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 207076453 207076789 207076513 Y NA GPR1 NA NA NA NA GPR1 3982 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 207663978 207664088 207664013 Y NA FASTKD2,MDH1B NA NA NA NA MDH1B 35707 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 208016492 208017045 208016857 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 12946 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 208348288 208348659 208348648 Y NA CREB1,AC007879.5 KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 43802 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 210046809 210047163 210046986 Y MAP2 NA NA NA NA NA MAP2 239619 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA CPS1 64529 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 211413660 211414008 211413843 Y ACADL,CPS1,CPS1 NA NA NA NA NA CPS1 73254 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr2 211423571 211423754 211423675 Y ACADL,CPS1,CPS1 NA NA NA NA NA CPS1 83165 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 211423993 211424366 211424119 Y CPS1,CPS1,CPS1 NA NA NA NA NA CPS1 83587 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr2 211426065 211426416 211426368 Y ACADL,CPS1,CPS1 NA NA NA NA NA CPS1 85659 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 211470804 211470937 211470808 Y NA NA NA NA NA NA CPS1 130398 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 211571404 211571410 211571407 Y NA NA NA NA NA NA CPS1 230998 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 213707567 213707874 213707766 Y NA NA IKZF2 IMR90 Hi-C 24141950 ERBB4 306002 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 216865894 216866240 216866102 Y TMEM169,PECR,MREG MREG NA NA NA NA MREG 30579 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 216867934 216868318 216868147 Y TMEM169 MREG NA NA NA NA MREG 28501 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 216870818 216871425 216871006 Y NA MREG NA NA NA NA MREG 25394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 217970488 217971016 217970653 Y NA NA IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 412240 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 218085163 218085182 218085174 Y NA NA DIRC3,TNP1,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 526915 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 218857857 218858115 218857951 Y NA NA TNS1,RUFY4 IMR90 Hi-C 24141950 HMGB1P9 205042 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 219177286 219177625 219177456 Y NA AAMP,PNKD,TMBIM1,AC021016.7,C2orf62 NA NA NA NA TMBIM1 21977 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 219235108 219235675 219235453 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ARPC2,ARPC2,GPBAR1,USP37,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1 AC021016.7,C2orf62,AC021016.6,CTDSP1 NA NA NA NA AC021016.6 4550 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 AC021016.6,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 AC021016.6,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr2 219742138 219742379 219742244 Y NA WNT6 NA NA NA NA WNT6 19594 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 FARSB 691645 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 223654105 223654355 223654256 Y SGPP2 NA ACSL3,MOGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL3 69297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 224330555 224330880 224330675 Y WDFY1 NA SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 134341 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 224477772 224478078 224477872 Y NA SCG2 AP1S3,KCNE4,SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 12551 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 224564336 224564481 224564409 Y NA NA SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 99115 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 225010758 225010857 225010808 Y NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINE2 108722 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 227015814 227016273 227016071 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 646202 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 227525366 227525547 227525486 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 136928 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 228331050 228331499 228331159 Y NA AGFG1 AGFG1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGFG1 3369 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 228717939 228718338 228718141 Y NA NA WDR69 IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 383071 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 230175161 230175497 230175399 Y PID1 PID1 NA NA NA NA PID1 41160 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 230204501 230204669 230204582 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 70500 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 230299119 230299349 230299203 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 165118 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 230435730 230436079 230435905 Y SLC16A14 NA NA NA NA NA DNER 141195 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 231299753 231300176 231299905 Y SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,SP100,SP100 SP100 NA NA NA NA SP100 21096 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 232505425 232505799 232505482 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 63806 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 232546670 232546982 232546826 Y NA PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 22623 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 232551717 232552221 232552147 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17384 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr2 232566219 232566469 232566340 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 3136 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 232840477 232840577 232840527 Y DIS3L2 DIS3L2 NA NA NA NA DIS3L2 16522 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 233250431 233250842 233250658 Y NA NA NA NA NA NA ALPI 67991 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 233312348 233312929 233312663 Y NA ALPI MIR1471,NPPC,ALPPL2,ECEL1P2 IMR90 Hi-C 24141950 ALPI 5904 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 233367792 233368150 233367876 Y ALPP,GIGYF2,ALPI,ECEL1,PRSS56,TIGD1 ALPI,PRSS56,EIF4E2,TIGD1 MIR1471,ECEL1P2 IMR90 Hi-C 24141950 PRSS56 15023 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr2 233763823 233764207 233764133 Y EFHD1,NGEF NA NA NA NA NA NGEF 111775 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 235862299 235862667 235862586 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 3682 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 235863329 235863490 235863430 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 4712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 235905010 235905389 235905297 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 46393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 235935583 235936015 235935761 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 76966 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA GBX2 407971 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 237933842 237934085 237933935 Y NA NA CXCR7,IQCA1,ASB18 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 COPS8 57870 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 238038460 238038824 238038818 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 46000 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 238188101 238188190 238188146 Y COPS8,COL6A3 NA COL6A3,MLPH,COPS8 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 195641 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 239085902 239086198 239086162 Y NA KLHL30,FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 20279 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 239593183 239593431 239593307 Y NA NA LOC151171 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 161242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 240196255 240196671 240196554 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 124459 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 123794 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr2 240199614 240199929 240199643 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 121201 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 240201720 240202445 240202126 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 118685 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 240249100 240249193 240249159 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 71937 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 240250439 240250711 240250592 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 70419 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 53464 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr2 240386953 240387173 240387118 Y NA NA NDUFA10,HDAC4,LOC150935 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC4 65605 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 241374162 241374480 241374229 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 1074 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr2 241585712 241586190 241585819 Y DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2 NA NA NA NA NA CAPN10 61579 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 241995888 241996280 241996083 Y AQP12A,SNED1 AC005237.4,MTERFD2 NA NA NA NA AC005237.4 5253 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 242030281 242030580 242030300 Y SNED1,PASK AC005237.4,MTERFD2 NA NA NA NA MTERFD2 9167 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 242262018 242262304 242262161 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 7542 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr2 242480531 242480899 242480752 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 15237 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr2 242703731 242703954 242703858 Y ATG4B D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 31737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 353974 354548 354311 Y SRXN1,FAM110A SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 4713 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 483361 483443 483402 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 39022 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 1168274 1168908 1168417 Y NA NA NA NA NA NA SNPH 76052 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 1474291 1474448 1474363 Y SDCBP2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA,SIRPB2 NSFL1C NA NA NA NA NSFL1C 21804 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 1757792 1758093 1758078 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 115061 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 1785698 1786068 1785859 Y SIRPA,SIRPA NA LOC100289473,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 87086 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 2802059 2802221 2802148 Y CPXM1 VPS16,PTPRA NA NA NA NA VPS16 17128 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 3155446 3155862 3155811 Y EBF4,PTPRA,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 16604 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr20 3159596 3159937 3159912 Y PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 20754 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 3377596 3377907 3377772 Y C20orf194 C20orf194 NA NA NA NA C20orf194 8365 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 3472887 3473113 3473000 Y NA ATRN NA NA NA NA ATRN 23200 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 4018656 4019040 4018859 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 16104 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 4090299 4090467 4090408 Y SMOX SMOX LOC728228,PANK2,MIR103B2,ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 9160 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr20 4487937 4488131 4488040 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP2 120734 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 5046140 5046913 5046758 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 NA SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 57201 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 5060940 5061369 5061194 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 43903 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 5070783 5071219 5071039 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 34053 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 7998924 7999176 7999047 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 448 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 8412863 8413194 8412910 Y TMX4,PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 302039 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr20 9065873 9065924 9065899 Y NA PLCB4 NA NA NA NA PLCB4 18463 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 10471502 10471750 10471599 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 58632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 11831025 11831188 11831107 Y BTBD3 BTBD3 NA NA NA NA BTBD3 38183 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 13036502 13036844 13036725 Y NA SPTLC3 NA NA NA NA SPTLC3 48875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 13473886 13474103 13473974 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 143484 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 17554539 17554936 17554702 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 6031 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 18565876 18566072 18565973 Y CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1 LINC00493,DTD1 NA NA NA NA DTD1 465 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 19574578 19574842 19574710 Y NA NA NA NA NA NA NAA20 420918 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 584873 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 23031353 23032100 23031620 Y GZF1,THBD,CD93 NA NA NA NA NA NXT1 297273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 23226243 23226447 23226434 Y NAPB NA THBD IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 102926 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 24969855 24970103 24969979 Y NA NA NA NA NA NA ENTPD6 204226 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 25273617 25273934 25273643 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 46912 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 170704 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr20 30110463 30111086 30110768 Y HM13 HM13 NA NA NA NA HM13 10232 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 30161920 30162316 30162154 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 28770 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 30182515 30183026 30182914 Y NA ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 8060 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr20 30183712 30184220 30184085 Y ID1 ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 6866 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr20 30194967 30195344 30195216 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 3881 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 30200712 30201016 30200864 Y TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121 ID1 NA NA NA NA ID1 9626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 30255856 30255976 30255884 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L1 53816 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 30266315 30266710 30266574 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 43082 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr20 30624710 30624829 30624798 Y PLAGL2,C20orf112,HCK NA NA NA NA NA TM9SF4 70480 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 30700574 30701059 30700820 Y HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 5265 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 30807220 30807332 30807276 Y NA PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA POFUT1 13537 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr20 31350973 31351317 31351235 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 2782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 31410946 31411262 31411169 Y NA MAPRE1 NA NA NA NA MAPRE1 5247 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 31687729 31687935 31687834 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE1 282030 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 32321714 32321896 32321832 Y NA E2F1,ZNF341 NA NA NA NA ZNF341 4251 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH,CDC42P1 NA NA NA NA CDC42P1 1169 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 37627 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 33150860 33150919 33150894 Y NA DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 48646 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 33653192 33653349 33653271 Y NA TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 25325 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 34197138 34197351 34197252 Y NA NA NA NA NA NA CPNE1,RBM12 53527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA CPNE1,RBM12 NA NA NA NA CPNE1,RBM12 33318 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 34463368 34463773 34463624 Y NFS1 RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 9808 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 1157 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr20 34479476 34479734 34479606 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 5895 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr20 34681523 34681969 34681863 Y EPB41L1,DLGAP4,EPB41L1 EPB41L1 LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPB41L1 4097 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 34686333 34686697 34686525 Y SPAG4,RBM39,PHF20 EPB41L1 SCAND1,C20orf152,EPB41L1 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 8907 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 34689096 34689267 34689261 Y C20orf152 EPB41L1 SCAND1,C20orf152,EPB41L1 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 11670 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 34803190 34803436 34803313 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP4 88822 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 35239893 35239986 35239939 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 7756 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr20 35612420 35612442 35612434 Y RBL1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 34174 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 35905068 35905696 35905172 Y SAMHD1,SRC,MANBAL MANBAL RPN2,NNAT,BLCAP,MANBAL,GHRH,SRC,LOC100287792,VSTM2L,TTI1,RPRD1B IMR90 Hi-C 24141950 MANBAL 10345 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 36040566 36040861 36040811 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31075 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 36045421 36045655 36045607 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 26281 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 36046410 36046637 36046524 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 25299 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 36154671 36154957 36154793 Y BLCAP,BLCAP,BLCAP BLCAP NA NA NA NA BLCAP 338 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 37229958 37230063 37230010 Y ARHGAP40 NA NA NA NA NA RALGAPB 130499 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 37398577 37398739 37398665 Y NA ACTR5 NA NA NA NA ACTR5 23492 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 41687154 41687522 41687506 Y NA NA NA NA NA NA SRSF6 397046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr20 42780306 42780638 42780459 Y NA JPH2 NA NA NA NA JPH2 33580 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr20 42833040 42833424 42833233 Y C20orf111 JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA OSER1-AS1 4176 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 42847207 42847559 42847248 Y NA JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA OSER1-AS1 9607 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 43321614 43322020 43321838 Y WISP2,KCNK15 ADA,RP11-445H22.3,WISP2 LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-445H22.3 717 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 43582253 43582415 43582335 Y NA TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 4712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 43598276 43598454 43598400 Y SERINC3,ADA,SYS1,STK4 TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 5161 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 43767332 43767709 43767669 Y NA PI3 STK4,MATN4,RBPJL IMR90 Hi-C 24141950 PI3 33808 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 43869504 43869693 43869682 Y DBNDD2,SLPI SLPI NA NA NA NA SLPI 11512 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 45028892 45029133 45029011 Y CD40 SLC35C2,ELMO2 NA NA NA NA ELMO2 30571 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 23191 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 48316345 48316673 48316621 Y NA B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 11742 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 48726581 48727101 48726820 Y SPATA2,SPATA2 UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189 NA NA NA NA UBE2V1 3395 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 48763277 48763795 48763638 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 4379 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr20 48809447 48810205 48810164 Y B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB NA NA NA NA CEBPB 4071 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 48841053 48841720 48841386 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB CEBPB PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 35677 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 48903106 48903611 48903352 Y NA NA LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90 Hi-C 24141950 CEBPB 97730 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.96249776083569 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 49650336 49650514 49650422 Y NA KCNG1 KCNG1,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCNG1 12670 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 200870 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr20 49947847 49948420 49948354 Y NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 310181 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA KCNG1 344943 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4 NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4 NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr20 50601567 50601698 50601647 Y NA NA ATP9A,SALL4,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SALL4 184508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 51779015 51779124 51779066 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ2 192069 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 52213211 52213282 52213247 Y NA ZNF217 BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 11164 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 52238527 52238650 52238555 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 14081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 52445043 52445455 52445100 Y NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220597 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 52533564 52534521 52533763 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 253991 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 55723431 55723679 55723544 Y RAE1,RAE1,BMP7 NA NA NA NA NA RAE1 200387 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 57557787 57558211 57558054 Y ZNF831,STX16 CTSZ,ATP5E NA NA NA NA CTSZ 22091 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 57670365 57670649 57670522 Y NA NA ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 54401 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 60875997 60876347 60876165 Y GATA5,CABLES2 ADRM1,RP11-157P1.5 NA NA NA NA ADRM1 848 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.08552513728194 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 78738 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr20 61337130 61337323 61337237 Y NA NA C20orf20,LOC100652730,SLCO4A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLCO4A1 65333 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 61400175 61400479 61400325 Y NA OGFR NA NA NA NA OGFR 33708 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr20 61585554 61585775 61585703 Y SLC17A9 DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA SLC17A9 3502 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 61822824 61823015 61822948 Y NA YTHDF1 NA NA NA NA YTHDF1 22571 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr20 62313782 62314225 62314041 Y NA STMN3,RTEL1,ZGPAT,ARFRP1 NA NA NA NA ZGPAT 22592 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 17276028 17276063 17276046 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 164779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 17681993 17682347 17682285 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 26904 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 251820 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 17958916 17959192 17958984 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 303827 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 304311 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 305578 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr21 18809176 18809383 18809253 Y NA NA NA NA NA NA CXADR 73317 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 18984370 18984546 18984496 Y NA BTG3 NA NA NA NA BTG3 1105 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 23538013 23538045 23538029 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 1241403 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 28173911 28174139 28174005 Y ADAMTS1 ADAMTS1 ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS1 41589 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.58815530202027 chr21 30604921 30605035 30604987 Y USP16,BACH1,BACH1 BACH1 NA NA NA NA BACH1 40529 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 33042550 33042842 33042696 Y NA SOD1 NA NA NA NA SOD1 12615 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 33836273 33836551 33836412 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 72834 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 33853478 33853730 33853567 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 90039 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 33893754 33894020 33893930 Y C21orf63 NA NA NA NA NA C21orf59 89156 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 67464 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 36185927 36186112 36186038 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 200486 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 36223731 36223900 36223856 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 238290 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 247775 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 268763 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 104093 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 39291581 39291864 39291721 Y NA NA NA NA NA NA DYRK1A 555489 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 39845079 39845092 39845088 Y NA NA NA NA NA NA ETS2 330139 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 40270254 40270530 40270471 Y NA NA ETS2 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 95023 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 40389005 40389356 40389205 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 164421 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 40393264 40393350 40393326 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 160427 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr21 40395176 40395277 40395227 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 158500 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 40476284 40476629 40476514 Y ETS2 NA ETS2,LINC00114,ERG IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 77148 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 40527943 40528201 40528072 Y NA PSMG1 NA NA NA NA PSMG1 25576 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 42543184 42543509 42543444 Y BACE2 BACE2,PLAC4 NA NA NA NA BACE2 5456 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 42619630 42619951 42619670 Y NA NA NA NA NA NA PLAC4 62915 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 44598375 44598751 44598475 Y NA NA NA NA NA NA U2AF1 72678 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr21 44599156 44599262 44599209 Y NA NA NA NA NA NA U2AF1 73459 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 44631329 44631684 44631488 Y NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 105632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr21 44727003 44727328 44727122 Y RRP1,HSF2BP LINC00322 LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90 Hi-C 24141950 LINC00322 22591 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 44752617 44753007 44752874 Y NA LINC00322 LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00322 2698 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA LINC00322 LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00322 3373 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr21 44753663 44753942 44753875 Y NA LINC00322 LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00322 3744 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr21 44759656 44759904 44759692 Y NA LINC00322 LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00322 9737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr21 44760713 44760913 44760830 Y NA LINC00322 LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00322 10794 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.08552513728194 chr21 44761192 44761567 44761446 Y CRYAA LINC00322 LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00322 11273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr21 44764269 44764611 44764455 Y NA LINC00322 LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00322 14350 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 44768943 44769386 44769014 Y PDXK LINC00322 LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00322 19024 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr21 44792965 44793192 44793096 Y NA LINC00322 LINC00313,CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 LINC00322 43046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 44796506 44796705 44796660 Y NA LINC00322,SIK1 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 LINC00322 46587 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 23.2536052806937 chr21 44817742 44818046 44817914 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 26962 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr21 44819332 44820064 44819633 Y PKNOX1,SIK1 SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 24944 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 44831131 44831382 44831257 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 13626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 44850435 44851222 44850996 Y CBS SIK1,LINC00319,LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 5427 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 44859375 44859527 44859442 Y NA SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 4954 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 44860778 44861412 44860950 Y SIK1 SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 3069 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr21 44862613 44862764 44862681 Y NA SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 1717 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 44876530 44876883 44876692 Y NA SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 12049 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 44876908 44877060 44877025 Y NA SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 12427 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr21 44913472 44913707 44913565 Y PDXK LINC00319,LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 16058 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 44936784 44937143 44936907 Y PDXK LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 39370 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 45132062 45132504 45132250 Y HSF2BP,PDXK PDXK NA NA NA NA PDXK 4471 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr21 45237788 45238060 45237872 Y TRAPPC10,ICOSLG,AGPAT3 CSTB,RRP1,AGPAT3 NA NA NA NA RRP1 30394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr21 45566076 45566451 45566257 Y TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 14589 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA C21orf90 NA NA NA NA C21orf90 8679 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46294509 46294819 46294590 Y ITGB2 PTTG1IP NA NA NA NA PTTG1IP 2757 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46298625 46298957 46298811 Y ITGB2 PTTG1IP PTTG1IP K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTTG1IP 6873 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 46387960 46388437 46388173 Y POFUT2,ITGB2 FAM207A,LINC00162 NA NA NA NA FAM207A 30035 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46461202 46461645 46461341 Y ITGB2,ADARB1 LINC00162,ADARB1 ADARB1,SSR4P1 K562 ChIA-PET 22265404 ADARB1 30123 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 46470710 46471152 46470922 Y NA LINC00162,ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 20616 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr21 46488937 46489238 46489088 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 2530 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46495480 46495526 46495490 Y KRTAP10-12,ADARB1 ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 3712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr21 46496242 46496452 46496442 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 4474 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46549530 46549961 46549631 Y NA NA NA NA NA NA ADARB1 57762 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46726845 46727332 46727050 Y NA POFUT2 NA NA NA NA POFUT2 21032 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46738832 46739011 46738964 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33019 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr21 46739517 46739788 46739671 Y NA POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33704 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46740711 46740979 46740801 Y NA POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 34898 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46823895 46824295 46824014 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 843 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 46894520 46894647 46894596 Y COL18A1 NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 67678 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr21 47394030 47394545 47394409 Y LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 5106 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 18404666 18404945 18404902 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 100380 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 18452405 18452779 18452681 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 52546 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.33684021965111 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L,AC000078.5 GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 AC000078.5 1702 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 19946096 19946477 19946360 Y NA COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 18755 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 20885626 20885829 20885752 Y NA KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 37426 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 20923375 20923909 20923414 Y THAP7,MED15 NA NA NA NA NA MED15 75175 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 21925144 21925370 21925257 Y NA SCARNA17,UBE2L3 NA NA NA NA UBE2L3 23408 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr22 24752898 24753006 24752951 Y UPB1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 88032 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM211B 361556 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 25373601 25373706 25373654 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 FAM211B 386426 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 27816576 27816924 27816809 Y NA NA MIAT,MN1,PITPNB,TTC28,TTC28-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 378562 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 28065247 28065726 28065530 Y PITPNB,MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 129760 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 28114157 28114741 28114406 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 80745 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 28115717 28115905 28115775 Y NA NA NA NA NA NA MN1 79581 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 28122669 28123242 28122949 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 72244 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 28261904 28262359 28262203 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA TTC28-AS1 51005 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 28262860 28262973 28262918 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA TTC28-AS1 50391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 28549378 28549438 28549411 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 235256 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 29877762 29878123 29877961 Y NA NA NA NA NA NA AP1B1 60594 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF NA HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D10A 118936 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr22 30615216 30615605 30615417 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D10A 105430 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 NA LIF IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D10A 66724 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr22 30721148 30721367 30721290 Y MTMR3,OSM,SLC35E4,TBC1D10A TBC1D10A,CCDC157,SF3A1 NA NA NA NA TBC1D10A 113 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 31219107 31219239 31219180 Y NA NA NA NA NA NA OSBP2 131338 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.60690642160243 chr22 31226011 31226350 31226247 Y NA NA NA NA NA NA OSBP2 138242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 31278490 31278624 31278556 Y SEC14L4 NA NA NA NA NA TUG1 86039 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TUG1 66473 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 31639418 31639541 31639442 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 32446579 32447120 32446852 Y NA SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 13102 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr22 35767811 35768194 35767985 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 HMOX1,MCM5 NA NA NA NA HMOX1 6160 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 35983528 35983815 35983759 Y NA NA NA NA NA NA APOL6 58627 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr22 36310688 36310985 36310744 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 111488 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 36748222 36748386 36748297 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 33677 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr22 36750973 36751374 36751265 Y APOL3 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 30689 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 36847830 36847945 36847861 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4,CSF2RB RP5-1119A7.14,TXN2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 1046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 9245 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 37484097 37484413 37484195 Y IL2RB KCTD17 NA NA NA NA KCTD17 38318 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 37897761 37897917 37897872 Y NA CARD10 NA NA NA NA CARD10 15632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 37937864 37938255 37937972 Y SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1 CARD10,CDC42EP1 CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 16199 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 37986436 37986718 37986607 Y CYTH4,SH3BP1,EIF3L,LGALS2,GGA1,GGA1 CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA GGA1 15763 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 37997690 37997947 37997695 Y GGA1,GGA1 CDC42EP1,GGA1 CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GGA1 4534 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 38003646 38003923 38003656 Y GGA1,GGA1 CDC42EP1,GGA1,PDXP NA NA NA NA GGA1 1165 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 38458818 38459072 38458999 Y SOX10,PLA2G6,PLA2G6,PICK1,SLC16A8 PICK1 NA NA NA NA PICK1 8500 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 38599886 38600218 38600032 Y NA MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 38705287 38705445 38705426 Y NA TMEM184B NA NA NA NA TMEM184B 38247 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 39091291 39091422 39091336 Y NA CBY1,RP3-508I15.9,TOMM22,JOSD1,GTPBP1 NA NA NA NA JOSD1 4139 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 39570081 39570473 39570178 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 23402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 39631244 39631333 39631289 Y PDGFB PDGFB NA NA NA NA PDGFB 7423 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 39635664 39635940 39635710 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 2816 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 39704707 39705214 39704970 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 9180 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 40885973 40886127 40886071 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 121378 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.87697262355375 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 42073632 42073949 42073667 Y TOB2 C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 8994 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 42339043 42339310 42339264 Y NA CENPM,SEPT3 NA NA NA NA CENPM 1858 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 42345357 42345934 42345409 Y NA CENPM,SEPT3,WBP2NL TNFRSF13C K562 ChIA-PET 22265404 CENPM 4189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 43004784 43005250 43005076 Y SERHL2 RRP7B,POLDIP3,RNU12,CYB5R3 NA NA NA NA POLDIP3 3718 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 43269385 43269620 43269503 Y NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2 ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 17273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 43551882 43552085 43551987 Y ARFGAP3,PACSIN2 MCAT,TSPO,TTLL12 NA NA NA NA TSPO 6362 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 44140171 44140361 44140266 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB6 65856 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 44731310 44731638 44731630 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1L 160540 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 44756999 44757252 44757125 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 134926 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr22 44856761 44856923 44856842 Y NA LDOC1L PARVB,PARVG,SAMM50,KIAA1644,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 35255 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 45067693 45068028 45067921 Y NUP50,PARVG,PRR5 PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 SAMM50,PARVB,LINC00229,KIAA1644 IMR90 Hi-C 24141950 PRR5 5100 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 45635319 45635444 45635382 Y NA KIAA0930 NA NA NA NA KIAA0930 669 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 45642150 45642482 45642292 Y NA KIAA0930 LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 7500 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 45879926 45880282 45880095 Y NA FBLN1 FBLN1,NUP50,UPK3A,FAM118A,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 FBLN1 15836 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 46325366 46325760 46325504 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 45249 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 46330758 46331082 46331012 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 39927 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 46483894 46484294 46483949 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 20123 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 48185959 48186142 48186052 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 160536 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 49768624 49768992 49768711 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 280198 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 50327730 50328489 50328002 Y TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17624 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr22 50329443 50330313 50330025 Y TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 19337 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 50336699 50336868 50336781 Y SELO CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA PIM3 15293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 50342658 50342932 50342773 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 9229 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr22 50738042 50738272 50738161 Y NA MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 5784 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 50743436 50743850 50743726 Y PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 206 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,CTA-384D8.31,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA CTA-384D8.31 4415 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr22 51051274 51051666 51051314 Y NA CHKB-CPT1B,CHKB,ARSA NA NA NA NA ARSA 12941 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 3202241 3202572 3202332 Y NA TRNT1,CRBN NA NA NA NA CRBN 16822 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA NA NA NA NA NA SETMAR 488335 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 4764846 4765049 4764983 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA ITPR1 231814 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 4782990 4783362 4783182 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 235439 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 235106 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 4863691 4864149 4863808 Y BHLHE40 NA NA NA NA NA BHLHE40 154652 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 4871506 4871670 4871602 Y ITPR1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 147131 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 4885679 4886087 4885777 Y NA NA NA NA NA NA BHLHE40 132714 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 5052861 5053708 5053449 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 BHLHE40 34060 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 5067974 5068590 5068209 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40 49173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 5191163 5191386 5191276 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,AC026202.3,EDEM1 NA NA NA NA ARL8B 29258 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 6573697 6574039 6573711 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 1346366 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 9452001 9452408 9452073 Y MTMR14,SETD5 THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5-AS1 13738 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 11261398 11261658 11261529 Y HRH1 NA NA NA NA NA ATG7 50337 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 11336940 11337150 11337065 Y HRH1,ATG7 ATG7 NA NA NA NA ATG7 24945 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 12131259 12131529 12131269 Y NA NA NA NA NA NA TIMP4 67322 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr3 13580930 13581161 13581030 Y FBLN2 NA HDAC11,FBLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HDAC11 61706 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 14246419 14246703 14246618 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 28136 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr3 14579717 14580123 14579927 Y NA GRIP2 NA NA NA NA GRIP2 1465 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 15443040 15443420 15443273 Y ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 23442 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 15599049 15599493 15599306 Y ANKRD28,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ BTD,HACL1 NA NA NA NA BTD 41355 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 15704167 15704382 15704274 Y ANKRD28,CAPN7 NA NA NA NA NA HACL1 62829 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 16416099 16416434 16416325 Y RFTN1 NA NA NA NA NA OXNAD1 111393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 17378312 17378639 17378476 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 536153 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 17506581 17506846 17506713 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA PLCL2 664422 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 17913596 17913897 17913750 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 570412 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr3 18782261 18782430 18782338 Y SATB1 NA NA NA NA NA RAD23BP1 204096 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 19379484 19379512 19379499 Y KCNH8 NA NA NA NA NA EFHB 607005 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 24340917 24341295 24341106 Y NA NA NA NA NA NA THRB 193478 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 87236 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr3 27719100 27719312 27719216 Y NA EOMES NEK10,SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 42894 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 339559 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 29800986 29801236 29801157 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 480513 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 31207703 31207815 31207739 Y STT3B NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 364315 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 33089398 33089551 33089467 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE,GLB1 NA NA NA NA SEC13P1 16043 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 33190938 33191178 33190994 Y NA CRTAP NA NA NA NA CRTAP 37467 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 33478074 33478410 33478365 Y NA UBP1 NA NA NA NA UBP1 2453 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 37164159 37164535 37164493 Y NA NA MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 58645 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 37939195 37939560 37939378 Y NA AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 37744 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 38193404 38193826 38193575 Y VILL,ACAA1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 OXSR1 IMR90 Hi-C 24141950 OXSR1 10754 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 38209266 38209592 38209336 Y VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 4686 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 42062353 42062651 42062504 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 9059 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 42237448 42237989 42237678 Y NA NA NA NA NA NA CCK 67710 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 43042805 43043020 43042913 Y FAM198A FAM198A NA NA NA NA FAM198A 24046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 45138887 45139080 45139004 Y NA NA NA NA NA NA RPS24P8 60587 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 45240276 45240388 45240335 Y NA RPS24P8,TMEM158 NA NA NA NA TMEM158 25382 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 45506091 45506240 45506161 Y NA NA NA NA NA NA LARS2 78093 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 46971519 46971826 46971651 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 47347 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 49389809 49389972 49389904 Y ARIH2,DALRD3,RHOA,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA GPX1 4061 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr3 50370591 50370860 50370724 Y RBM6,SEMA3B,RASSF1 IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA RASSF1 5551 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 50377372 50377700 50377536 Y NA IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA RASSF1 961 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 50638353 50638905 50638586 Y MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 8046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 53288705 53289353 53289077 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 53859957 53860202 53860080 Y CACNA1D,CHDH CHDH,IL17RB NA NA NA NA CHDH 18215 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 54390282 54390612 54390584 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D3 235708 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 54734224 54734587 54734407 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 75982 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 54916561 54916754 54916658 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 258319 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 55364571 55364745 55364625 Y NA NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 RPS15P5 706329 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 57051619 57051945 57051783 Y NA SPATA12 NA NA NA NA SPATA12 40524 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 57818713 57819025 57818868 Y NA NA NA NA NA NA SLMAP 79536 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 57874517 57874643 57874579 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 117484 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 57995654 57995894 57995762 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 58035006 58035314 58035102 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 42879 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 58457172 58457525 58457255 Y RPP14,RPP14,KCTD6 PDHB,KCTD6 PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 18316 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 63946118 63946531 63946303 Y NA NA LOC100507062 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 61127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 65694421 65694810 65694689 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 327699 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 66021951 66022397 66022084 Y NA MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 112 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr3 66394529 66394891 66394710 Y NA NA NA NA NA NA LRIG1 154796 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 67741334 67741732 67741533 Y NA SUCLG2,RP11-81N13.1 NA NA NA NA RP11-81N13.1 38213 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 68072115 68072134 68072122 Y NA NA NA NA NA NA RP11-81N13.1 368994 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 70175230 70175612 70175604 Y NA NA NA NA NA NA MITF 388644 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 71267437 71267786 71267612 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 363354 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 73049169 73049333 73049244 Y PPP4R2,EBLN2 PPP4R2 NA NA NA NA PPP4R2 5233 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 78867121 78867519 78867219 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 947446 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B NA NA NA NA NA CHMP2B 275121 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 87101402 87101690 87101545 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 172731 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 88151728 88152092 88151734 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA C3orf38 44801 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 1144696 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr3 98255377 98255965 98255704 Y NA CLDND1 NA NA NA NA CLDND1 15467 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 223910 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 99909937 99910189 99910085 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 67655 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr3 100482455 100482783 100482461 Y NA NA NA NA NA NA TFG 56250 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 100516379 100516430 100516403 Y ABI3BP NA NA NA NA NA TFG 90174 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 101707550 101707746 101707649 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 162715 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 101899188 101899342 101899284 Y NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 354353 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 103710556 103710861 103710689 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 833752 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 107503481 107503523 107503501 Y NA NA NA NA NA NA BBX 263698 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 107705661 107706042 107705959 Y CD47 NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101830 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 107802397 107802714 107802497 Y MYH15,HHLA2 CD47 NA NA NA NA CD47 5158 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 107841863 107841996 107841935 Y NA CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 33991 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 110688601 110689002 110688903 Y NA NA NA NA NA NA PVRL3 97916 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr3 112109657 112110558 112110278 Y CD200 NA CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35A5 167998 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 114100743 114101091 114100917 Y ZBTB20,ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 327283 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 114103176 114103363 114103329 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 329716 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 114212122 114212387 114212225 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 438662 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 114246828 114247170 114246841 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 473368 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 114373701 114374062 114373901 Y ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20 490056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 114374818 114375057 114374945 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 489061 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 114500516 114500693 114500605 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 363425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 114563365 114563725 114563545 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20 300393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 114577698 114578255 114577941 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 285863 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 114998646 114998840 114998743 Y NA NA GAP43 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB20 134528 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 118561016 118561389 118561159 Y NA NA NA NA NA NA B4GALT4 396561 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 119147570 119147724 119147648 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 37953 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 119157549 119157626 119157588 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 28051 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 119356620 119357543 119356968 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH,COX17 RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 3623 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.7539452471075 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 122151096 122151154 122151125 Y KPNA1 WDR5B NA NA NA NA WDR5B 18214 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 122467278 122467457 122467368 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 43214 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 122476470 122476801 122476636 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 33870 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 123229622 123229815 123229688 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 72217 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 123351425 123351671 123351446 Y ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 49036 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 123391718 123392030 123392015 Y ADCY5,MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 89329 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 123553686 123553794 123553787 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 124770 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 124531464 124532111 124531823 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 84251 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 124564415 124564677 124564502 Y HEG1,ITGB5 NA NA NA NA NA ITGB5 53588 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 124708345 124708776 124708566 Y NA MUC13 NA NA NA NA MUC13 37682 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 124773884 124774020 124773942 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 1082 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr3 125231315 125231583 125231558 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 5458 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 125986265 125986571 125986320 Y NA RP11-71E19.1 KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-71E19.1 2626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 126074775 126075511 126074965 Y ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15 KLF15 NA NA NA NA KLF15 490 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 126108107 126108472 126108304 Y NA KLF15 KLF15,CCDC37,ALDH1L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF15 33822 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 126126680 126126867 126126779 Y NA NA NA NA NA NA KLF15 52395 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 126569545 126569928 126569643 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD6 148482 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 126945431 126945830 126945484 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 369236 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.87697262355375 chr3 126945882 126946306 126946211 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 368760 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 127465577 127465875 127465733 Y NA NA NA NA NA NA MGLL 74176 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 127487223 127487760 127487461 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA MGLL 52291 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 127729316 127729371 127729322 Y DNAJB8 SEC61A1 SEC61A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SEC61A1 39113 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr3 127831332 127831517 127831439 Y GATA2,GATA2 EEFSEC,RUVBL1 NA NA NA NA EEFSEC 38780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 128325000 128325227 128325090 Y DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2,KIAA1257 NA NA NA NA NA RPN1 72691 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 128538992 128539042 128539017 Y DNAJB8,C3orf27 NA NA NA NA NA FTH1P4 57131 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 128837764 128838022 128837873 Y MBD4,H1FX,C3orf37,C3orf37,KIAA1257,ISY1,CNBP,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43 RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 1622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 130539887 130540309 130539974 Y ATP2C1 ATP2C1 ATP2C1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2C1 27130 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 132261870 132262263 132261985 Y DNAJC13 NA NA NA NA NA UBA5 109027 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 133147395 133147694 133147637 Y NA NA NA NA NA NA CDV3 142880 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 134051149 134051359 134051254 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 22044 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 4817 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 135890782 135891068 135890882 Y NA MSL2 NA NA NA NA MSL2 23015 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 136492102 136492187 136492145 Y NA STAG1 NCK1,IL20RB IMR90 Hi-C 24141950 STAG1 22882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 136571906 136572239 136572061 Y TMEM22 RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 6657 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 139082145 139082521 139082356 Y PRR23A,PRR23B,PRR23C COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 24053 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA SLC25A36 736336 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 141131755 141132151 141131882 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 71738 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 141707258 141707451 141707397 Y NA NA NA NA NA NA RP11-343B5.1 53589 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 141746457 141746834 141746789 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 14206 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 142164400 142165110 142164972 Y XRN1 RNU1-100P NA NA NA NA XRN1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 145416082 145416315 145416265 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 124211 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 148781596 148781850 148781723 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20491 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 149099928 149100323 149100052 Y TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 6276 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 149151278 149151442 149151363 Y NA NA GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 57626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 149330317 149330600 149330464 Y WWTR1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 119870 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 149665230 149665637 149665395 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18535 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 149666531 149666918 149666689 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 17254 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 150417166 150417289 150417212 Y NA RP11-103G8.2,FAM194A NA NA NA NA RP11-103G8.2 2062 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 150482569 150482635 150482602 Y NA SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2 3305 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 151917246 151917489 151917451 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL1 42128 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 151923088 151923367 151923343 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 36250 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 152030036 152030551 152030147 Y MBNL1,MBNL1 MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 44692 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 155463707 155463869 155463800 Y NA NA NA NA NA NA C3orf33 58271 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 155705974 155706059 155706016 Y NA SETP14 NA NA NA NA SETP14 2881 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 156229646 156229758 156229715 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 41215 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 156757953 156758209 156758081 Y NA RP11-6F2.5 NA NA NA NA RP11-6F2.5 39421 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 156837520 156837824 156837670 Y NA RP11-6F2.5,CCNL1 NA NA NA NA CCNL1 38725 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 157336015 157336135 157336022 Y NA NA NA NA NA NA PTX3 183437 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 158070419 158070585 158070503 Y MFSD1 NA NA NA NA NA SHOX2 248127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 158440805 158440990 158440882 Y MFSD1 MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 6997 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 158463445 158463640 158463543 Y NA MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 15458 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 159465414 159465509 159465463 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 475914 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 159480182 159480541 159480238 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 460882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 159745418 159745477 159745450 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 195946 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 159765726 159765787 159765757 Y NA NA IQCJ-SCHIP1 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf80 175636 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA NMD3 128701 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 165287004 165287078 165287041 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 266182 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 165535017 165535196 165535158 Y NA BCHE NA NA NA NA BCHE 18064 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 169378305 169378656 169378554 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 750 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN NA NA NA NA TERC 1241 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 170579509 170579531 170579522 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 6741 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 171592038 171592451 171592208 Y FNDC3B NA NA NA NA NA PLD1 65298 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 171594447 171594730 171594655 Y NA NA NA NA NA NA PLD1 67707 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA BZW1P1 188097 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2 NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2 NA NA NA NA ECT2 43612 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 177018025 177018414 177018104 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 104764 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 177623981 177624160 177624047 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 710720 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 181473928 181474194 181474085 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC19 768366 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 182613640 182613943 182613809 Y MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 87798 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr3 182973152 182973434 182973425 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 4120 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.12828770592291 chr3 183980250 183980567 183980542 Y CAMK2N2,ECE2 ALG3,ECE2,CAMK2N2,PSMD2,EIF4G1 NA NA NA NA CAMK2N2 2999 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA VPS8 199839 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 185339016 185339200 185339107 Y NA SENP2 NA NA NA NA SENP2 40732 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 185948324 185948597 185948503 Y DGKG NA NA NA NA NA ETV5 122217 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 186784569 186784773 186784671 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 111923 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 186819692 186820086 186819740 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 76610 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr3 187004502 187004623 187004526 Y MASP1 NA NA NA NA NA RTP4 79497 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr3 187754201 187754558 187754362 Y NA NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 LPP 114514 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 187983465 187984215 187983993 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 113620 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 187984257 187984703 187984570 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 114412 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr3 188012018 188012343 188012183 Y LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP-AS2 142173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 188139673 188140134 188139816 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 269828 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 188149383 188149832 188149544 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 279538 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 188151524 188151812 188151760 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 281679 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 188155903 188156126 188156022 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 286058 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 188324508 188324886 188324659 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 338542 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 190104242 190104447 190104367 Y NA NA NA NA NA NA CLDN1 65978 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 IL1RAP NA NA NA NA IL1RAP 21547 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.66842010982555 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 193807302 193807696 193807488 Y ATP13A3,HES1 HES1 HES1,LOC100131551,LOC647323 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 44238 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 194341751 194341921 194341813 Y NA TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44,LSG1 NA NA NA NA AC046143.3 9731 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 194360985 194361172 194361065 Y NA AC046143.3,TMEM44,LSG1,FAM43A NA NA NA NA TMEM44 8567 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 194909017 194909237 194909137 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 80659 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 195073897 195074088 195073990 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 84001 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr3 196208308 196208582 196208445 Y NA RNF168 NA NA NA NA RNF168 20057 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 196377844 196378239 196377963 Y NA LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 13198 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr3 197044593 197044660 197044627 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 20422 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr4 789468 789689 789607 Y NA RP11-440L14.1,CPLX1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 15831 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 1027686 1027967 1027729 Y FGFRL1,FGFRL1,FGFRL1 DGKQ,IDUA,FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 25962 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr4 1339592 1340250 1339850 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57953 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 3438789 3438989 3438900 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 93297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 4855584 4855774 4855697 Y NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 3619 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 7858938 7859554 7859231 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 80099 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 7868592 7868926 7868734 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 70727 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 8119010 8119317 8119178 Y ABLIM2 ABLIM2 NA NA NA NA ABLIM2 39242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 15074859 15075210 15075035 Y NA NA NA NA NA NA CPEB2 72561 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 15297006 15297030 15297019 Y NA NA C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 CC2D2A 172459 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 15422456 15422482 15422468 Y C1QTNF7 CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 47007 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 15488697 15488958 15488934 Y NA CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 19208 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 17483580 17483992 17483821 Y QDPR,CLRN2 QDPR NA NA NA NA QDPR 27865 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 23890635 23890864 23890849 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 12848 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 24057283 24057564 24057438 Y NA NA NA NA NA NA PPARGC1A 153571 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 24079320 24079729 24079712 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1A 175608 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 24159507 24159811 24159735 Y NA NA NA NA NA NA PPARGC1A 255795 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 24220772 24221175 24221047 Y PPARGC1A NA NA NA NA NA PPARGC1A 317060 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr4 24227575 24227894 24227795 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1A 323863 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr4 24262994 24263251 24263044 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 320922 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 24322640 24323331 24322979 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 260842 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.48387904515618 chr4 24324929 24325054 24324992 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 259119 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr4 24332761 24333117 24332939 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 251056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr4 24346800 24347040 24346920 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 237133 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 24407095 24407488 24407238 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 176685 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 24472474 24473298 24472910 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 110875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 24474307 24474984 24474891 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 109189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA NA CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 75834 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 26338276 26338542 26338322 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 175199 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 60645 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 38159115 38159505 38159287 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 199059 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 38205649 38205886 38205830 Y NA NA FAM114A1,TLR6,KLF3,FLJ13197 IMR90 Hi-C 24141950 PTTG2 245593 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr4 39641402 39641506 39641505 Y NA RP11-539G18.2 NA NA NA NA RP11-539G18.2 2642 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 40056293 40056591 40056356 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 40240312 40240963 40240621 Y RHOH,RBM47 NA NA NA NA NA CHRNA9 94383 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.60690642160243 chr4 40324884 40325018 40324960 Y NA CHRNA9 LOC344967,N4BP2,CHRNA9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHRNA9 10328 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 40791893 40792102 40791997 Y NSUN7 NA NA NA NA NA RBM47 161001 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 40910052 40910602 40910542 Y NA NA NA NA NA NA RBM47 279160 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 40911488 40911803 40911603 Y NA NA NA NA NA NA RBM47 280596 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 41469951 41470276 41469966 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 110327 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr4 41509451 41509766 41509557 Y LIMCH1 NA NA NA NA NA LIMCH1 149827 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr4 41574178 41574364 41574271 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 214554 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 53725752 53726074 53725904 Y NA NA NA NA NA NA USP46-AS1 202179 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 53890542 53890886 53890882 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 339356 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 57905676 57905866 57905771 Y NA NA NA NA NA NA NOA1 62687 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 57985357 57985541 57985449 Y IGFBP7 IGFBP7-AS1,IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7 10806 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 68281708 68281730 68281719 Y NA RP11-584P21.4 NA NA NA NA RP11-584P21.4 28255 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 74975298 74975961 74975834 Y CXCL1,AREG CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 1930 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 74977575 74978125 74977847 Y NA CXCL2 RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 75096380 75097063 75096677 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA EPGN 75127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 75137698 75138053 75137885 Y NA EPGN NA NA NA NA EPGN 34137 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 77752154 77752315 77752229 Y NA NA SHROOM3,SEPT11,SOWAHB IMR90 Hi-C 24141950 SEPT11 116541 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 77869398 77869850 77869619 Y SEPT11 SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 542 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 78823537 78823752 78823560 Y NA MRPL1 NA NA NA NA MRPL1 41863 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 83383009 83383387 83383198 Y NA ENOPH1 NA NA NA NA ENOPH1 33294 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 84033440 84033690 84033502 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 22538 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 84034119 84034423 84034342 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 21805 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 84073969 84074156 84074073 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 17741 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 84130014 84130163 84130089 Y NA NA COPS4,COQ2,PLAC8 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC8 73786 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 88038562 88038726 88038648 Y NA NA NA NA NA NA KLHL8 120740 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 89747458 89747948 89747469 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 282601 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr4 95374521 95374795 95374668 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 3484 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 95406092 95406259 95406175 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 35055 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 95469761 95469962 95469859 Y HPGDS,PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 98724 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 102173679 102174077 102173884 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 92860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 103520132 103520300 103520232 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 99646 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 103673229 103673433 103673315 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA MANBA NA NA NA NA MANBA 6718 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 103750426 103750532 103750434 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3 RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA RP11-10L12.4 3214 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 103788773 103788886 103788830 Y NA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA CISD2 638 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 106064596 106064807 106064750 Y NA TET2 TET2 K562 ChIA-PET 22265404 TET2 225 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 106226051 106226420 106226239 Y TET2,TET2 NA NA NA NA NA TET2 161019 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 106324406 106324791 106324687 Y NA NA NA NA NA NA PPA2 68447 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 106391866 106392288 106392204 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 950 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 108980077 108980406 108980323 Y NA NA NA NA NA NA HADH 71207 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 113095488 113095850 113095539 Y NA C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 30935 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 325456 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr4 114563561 114563906 114563734 Y CAMK2D NA NA NA NA NA CAMK2D 117177 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 122606332 122606884 122606598 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 9384 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 122610538 122611647 122611314 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 4621 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 125399641 125399657 125399649 Y NA TECRP2 NA NA NA NA TECRP2 16696 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 128752654 128753022 128752839 Y HSPA4L PLK4 NA NA NA NA PLK4 46994 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 129275726 129275798 129275762 Y NA NA PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 67742 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 139173167 139173319 139173175 Y NA SLC7A11 SLC7A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC7A11 11664 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr4 139177153 139177364 139177274 Y SLC7A11 SLC7A11 SLC7A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC7A11 15650 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 139960939 139961173 139961057 Y NAA15,CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25996 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 140650307 140650710 140650510 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 65385 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 140696118 140696274 140696196 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 111196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 141287573 141287758 141287638 Y NA RP11-425I13.1 NA NA NA NA RP11-425I13.1 1558 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 142271356 142271489 142271421 Y ZNF330,IL15 NA IL15,INPP4B IMR90 Hi-C 24141950 ZNF330 131315 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 142559455 142559780 142559588 Y ZNF330,IL15 IL15 NA NA NA NA IL15 3703 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 143012897 143013276 143013057 Y NA NA NA NA NA NA IL15 457145 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 145026045 145026218 145026120 Y GYPE,GYPB,GYPA NA NA NA NA NA SMARCA5 593429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 145498597 145498714 145498656 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 518370 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr4 148374725 148374999 148374823 Y TMEM184C NA TMEM184C IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 161535 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 148654111 148654384 148654270 Y PRMT10 ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 2897 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 151155902 151156274 151156088 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 158476 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 151564216 151564527 151564372 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 370352 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 152048107 152048440 152048274 Y LRBA,LRBA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 29382 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 152105959 152106222 152106091 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 87234 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 153313306 153313343 153313324 Y NA NA NA NA NA NA FBXW7 141910 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 153884926 153884958 153884941 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 29422 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 154580466 154580842 154580627 Y TLR2 NA NA NA NA NA KIAA0922 194968 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA NA NA NA NA NA CTSO 997646 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr4 159456414 159456798 159456682 Y PPID,FNIP2 NA NA NA NA NA ETFDH 134479 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 159592059 159592445 159592194 Y NA ETFDH,C4orf46 NA NA NA NA C4orf46 652 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 378130 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 164471489 164471679 164471583 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 385416 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 169644236 169644423 169644322 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 187299 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 169661125 169661437 169661279 Y DDX60,DDX60L NA NA NA NA NA DDX60L 204188 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 169705913 169706245 169706080 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 223181 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 169752314 169752599 169752402 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 176827 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 169849945 169850177 169850075 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 79249 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 169853850 169854103 169853858 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 75323 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 170030173 170030283 170030178 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 100747 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr4 174443232 174443552 174443433 Y HAND2 NA NA NA NA NA RANP6 109970 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 178362238 178362457 178362307 Y NA AGA NA NA NA NA AGA 581 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 183110695 183110955 183110887 Y NA AC108142.1 NA NA NA NA AC108142.1 46293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 184319940 184320161 184319981 Y NA CDKN2AIP WWC2,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 43583 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.17105027456388 chr4 184330014 184330225 184330125 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 33519 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 5.94374664125354 chr4 184390171 184390713 184390483 Y NA CDKN2AIP,ING2 NA NA NA NA CDKN2AIP 26427 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 184423820 184424211 184423984 Y STOX2 NA NA NA NA NA ING2 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 184718887 184719489 184719407 Y NA NA ENPP6,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 STOX2 53095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.39835390787423 chr4 184751768 184752101 184751917 Y NA STOX2 ENPP6,STOX2,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 STOX2 20483 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 184910732 184910983 184910894 Y C4orf41,IRF2 RP11-739P1.2 NA NA NA NA RP11-739P1.2 3901 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA RP11-739P1.2 208523 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 185230857 185231140 185231034 Y NA NA IRF2,LOC728175 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2 162594 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 185296800 185297408 185297103 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 96326 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 185331149 185331516 185331503 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 62218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 186730607 186731122 186730955 Y NA NA NA NA NA NA TLR3 257184 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 186760271 186760668 186760511 Y NA NA NA NA NA NA TLR3 227638 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 187810272 187810501 187810328 Y NA NA FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP4V2 699598 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 189101565 189101968 189101694 Y TRIML2 RP11-366H4.1 TRIML1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-366H4.1 22346 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 79769 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr4 190820880 190821275 190820936 Y NA FRG1 NA NA NA NA FRG1 38668 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 372694 372970 372922 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 68288 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 373392 373627 373429 Y EXOC3,C5orf55,PDCD6 NA NA NA NA NA C5orf55 67631 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr5 378611 379250 378849 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 62008 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 389983 390379 390026 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 50879 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 426647 427011 426980 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA C5orf55 14247 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 448928 449328 449227 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA EXOC3 7655 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.08552513728194 chr5 759096 759567 759320 Y TPPP NA SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13 IMR90 Hi-C 24141950 TPPP 67586 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 6.56940418243812 chr5 957591 958302 957640 Y NKD2 RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA RP11-43F13.3 37121 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 1103805 1104368 1103973 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 5782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 1478329 1478968 1478499 Y LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 43124 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 1517056 1517558 1517419 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 4534 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 1552632 1553029 1552648 Y NA LPCAT1,SDHAP3 NA NA NA NA LPCAT1 30540 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 3304230 3304631 3304430 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS6 1504716 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 3311711 3311862 3311757 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS6 1512197 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 5311411 5311643 5311527 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 107134 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 5340490 5340721 5340596 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 78056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 6373242 6373393 6373318 Y NA MED10 NA NA NA NA MED10 3314 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 50027 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 7.2993379804868 chr5 9681641 9681655 9681648 Y NA NA TAS2R1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM173B 566354 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 10302153 10302258 10302208 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA CMBL 3880 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 10601684 10601853 10601839 Y ANKRD33B ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 39242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 10759548 10759882 10759715 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 164 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 14186205 14186627 14186374 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 44394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 14489488 14489835 14489662 Y NA NA NA NA NA NA FAM105A 90049 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 16492574 16492683 16492630 Y FAM134B ZNF622 NA NA NA NA ZNF622 28673 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 16698370 16698703 16698671 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 83203 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr5 17154796 17154999 17154850 Y BASP1 NA NA NA NA NA AC091878.1 60157 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 17177639 17177702 17177672 Y NA AC091878.1 NA NA NA NA AC091878.1 37454 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 17224986 17225514 17225115 Y BASP1 AC091878.1 NA NA NA NA AC091878.1 9830 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 17249327 17249860 17249454 Y NA AC091878.1 NA NA NA NA AC091878.1 34171 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 17255490 17256325 17255691 Y BASP1 AC091878.1 NA NA NA NA AC091878.1 40334 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 19735118 19735431 19735276 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2023M8.1 990836 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 21539943 21540207 21540075 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 200001 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr5 27309667 27310060 27309866 Y NA NA NA NA NA NA LINC01021 160339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 31894536 31894834 31894609 Y NA NA NA NA NA NA GOLPH3 277622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 32083300 32083310 32083305 Y PDZD2 NA NA NA NA NA GOLPH3 89146 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 32175167 32175567 32175368 Y NA GOLPH3,CTD-2186M15.1 NA NA NA NA GOLPH3 2711 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 32349231 32349269 32349250 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 38116 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 32714238 32714628 32714433 Y NPR3,NPR3 NPR3 NA NA NA NA NPR3 27062 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 32760271 32760413 32760371 Y SUB1 NA NA NA NA NA NPR3 73095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 32768263 32768639 32768422 Y SUB1 NA NA NA NA NA NPR3 81087 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 33313222 33313474 33313360 Y NA NA NPR3,TARS IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2203K17.1 125251 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr5 34048471 34048803 34048799 Y NA AMACR NA NA NA NA AMACR 42251 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 34655418 34655812 34655539 Y NA RAI14 TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 1076 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 34658306 34658537 34658364 Y RAI14,RAI14 RAI14 TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 3964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 34710052 34710312 34710173 Y RAI14,RAI14 NA NA NA NA NA RAI14 55710 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr5 36174356 36174616 36174412 Y SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 24265 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 36229884 36229947 36229916 Y UGT3A1,C5orf33,C5orf33 NA NA NA NA NA SKP2 79793 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 36243430 36243676 36243553 Y SLC1A3 NA NA NA NA NA SKP2 93339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 36740224 36740324 36740257 Y NA NA LOC646719,NIPBL MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 NIPBL 134537 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP6 53296 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 37102128 37102249 37102189 Y NA RPS4XP6 NA NA NA NA RPS4XP6 18970 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 37272795 37272956 37272876 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 25265 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 37717466 37717611 37717526 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 340152 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 38467529 38467846 38467689 Y NA CTD-2263F21.1 NA NA NA NA CTD-2263F21.1 1088 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 38514652 38514707 38514680 Y NA CTD-2263F21.1,MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 40956 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 38546436 38546759 38546707 Y NA MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 8904 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 38551608 38551876 38551742 Y NA MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 3787 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.27532653142798 chr5 38854077 38854436 38854323 Y OSMR,OSMR CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 10117 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 38968924 38969094 38969009 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 103416 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 39025065 39025383 39025224 Y NA RICTOR NA NA NA NA RICTOR 47127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 39469449 39469725 39469587 Y NA C9,DAB2 DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 9047 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 39519768 39520016 39519839 Y DAB2 NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 59366 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 39721328 39721512 39721418 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 260926 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 39760848 39761179 39761033 Y NA NA PTGER4,PRKAA1,TTC33 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 300446 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 40263385 40263650 40263545 Y NA NA PTGER4,TTC33 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 413950 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 40754670 40754884 40754791 Y PTGER4 TTC33,PRKAA1 NA NA NA NA TTC33 593 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 40796420 40796758 40796693 Y NA TTC33,RPL37,CARD6 NA NA NA NA PRKAA1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 40967939 40968194 40968008 Y C6,C7 NA NA NA NA NA CARD6 128653 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 42837776 42837985 42837885 Y GHR,SEPP1 SEPP1 NA NA NA NA SEPP1 47509 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 10.5319019432738 chr5 42999523 42999876 42999700 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 16655 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8093 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr5 43020658 43020829 43020797 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 4127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 43061828 43062062 43061945 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 1216 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 43480579 43480813 43480696 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 NA NA NA NA C5orf28 1182 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 43498058 43498404 43498231 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 C5orf28 MCF7 ChIA-PET 22265404 C5orf34 14843 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 43773427 43773527 43773474 Y NA NA NA NA NA NA NNT-AS1 172095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 44821100 44821499 44821234 Y NA RP11-53O19.1,MRPS30 NA NA NA NA MRPS30 14073 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 49989954 49990143 49990051 Y EMB,PARP8 PARP8 NA NA NA NA PARP8 30221 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 52168603 52169046 52168938 Y PELO,ITGA1 NA NA NA NA NA PELO 86829 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 52319874 52320078 52320019 Y NA ITGA2 LOC257396 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA2 36718 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 52714720 52715039 52714904 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS4 139424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 54759780 54760082 54759933 Y NA NA SKIV2L2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF138P1 64447 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 54897039 54897427 54897238 Y IL6ST,PPAP2A NA NA NA NA NA PPAP2A 68161 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 55463907 55464287 55464105 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2031P19.3 174912 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 55575946 55576115 55576004 Y NA NA MAP3K1,MIER3 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 222784 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 56468272 56468727 56468348 Y MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1 GPBP1 NA NA NA NA GPBP1 497 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 58186995 58187365 58187085 Y PDE4D NA PDE4D IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 432908 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 58255899 58256231 58256006 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 501812 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 58314415 58314788 58314579 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 560328 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 58358500 58358548 58358538 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 604413 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 605797 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr5 58365928 58366326 58366127 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 611841 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 58374119 58374354 58374236 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 620032 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 58375824 58376057 58376052 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 621737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 58391200 58391585 58391393 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 637113 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 58395760 58396044 58395902 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 641673 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 58400134 58400374 58400226 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 646047 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 58408149 58408473 58408383 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 654062 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 58408556 58408894 58408726 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 654469 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 58418380 58418697 58418552 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 664293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 58420146 58420252 58420199 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 666059 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 58421119 58421626 58421279 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 667032 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 58422372 58422713 58422580 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 668285 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 58423022 58423147 58423096 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 668935 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 669224 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr5 58426345 58426806 58426483 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 672258 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 58428038 58428165 58428144 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 673951 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 58445128 58445519 58445324 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 691041 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 58497739 58497828 58497784 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 743652 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 58508843 58508938 58508881 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 754756 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr5 58575824 58576193 58576112 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 821737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 58616191 58616562 58616377 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 862104 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 58798066 58798450 58798258 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 1017497 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 58816932 58817290 58817225 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 998657 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 58874550 58874813 58874554 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 941134 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 58952543 58952885 58952791 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 863062 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 59041159 59041490 59041319 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 774457 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 59042319 59042506 59042428 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 773441 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 59045613 59045932 59045792 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 770015 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 59057056 59057135 59057102 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 758812 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 59086263 59086677 59086406 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 729270 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 59171284 59171310 59171298 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 644637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 59173236 59173442 59173374 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 642505 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 59183388 59183889 59183871 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 632058 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 59618984 59619244 59619114 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 196703 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 59702985 59703129 59703057 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 112818 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 59735221 59735571 59735396 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 80376 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 59743173 59743572 59743444 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 72375 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 60315642 60315784 60315678 Y NA NA NA NA NA NA NDUFAF2 76686 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 60626321 60626538 60626370 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 221 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 60626678 60627139 60626902 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 578 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 64710773 64711167 64710966 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 64580 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 65030733 65031192 65030953 Y SREK1,ERBB2IP,SGTB NLN,SGTB NA NA NA NA SGTB 13871 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 65228217 65228394 65228309 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 7914 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 65447669 65447962 65447814 Y SREK1,SREK1 SREK1 NA NA NA NA SREK1 13870 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4-AS1 151855 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 66760363 66760425 66760395 Y NA NA NA NA NA NA MAST4-AS1 462582 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 66786490 66786676 66786582 Y NA NA NA NA NA NA MAST4-AS1 488709 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.71118267846652 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MCCC2 337395 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 71659094 71659472 71659166 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 44621 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 71790679 71790815 71790747 Y NA NA NA NA NA NA MRPS27 176206 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 72511984 72512100 72512037 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 230252 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 72792808 72793048 72792966 Y NA BTF3 NA NA NA NA BTF3 575 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 76422152 76422524 76422338 Y NA ZBED3-AS1,ZBED3 NA NA NA NA ZBED3 41004 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 77792703 77793028 77792954 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 138364 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 77814404 77814787 77814528 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 160065 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 78429598 78429944 78429771 Y NA NA NA NA NA NA DMGDH 99917 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 79553045 79553765 79553579 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 3147 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 80394008 80394030 80394018 Y NA NA NA NA NA NA CKMT2-AS1 201349 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 80989989 80990372 80990282 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 55244 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 81319192 81319550 81319375 Y NA NA NA NA NA NA ATG10 53348 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 81465137 81465359 81465307 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA RPS23 107037 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 81655341 81655441 81655346 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 82945 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 81702078 81702394 81702360 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129682 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 82807080 82807411 82807109 Y XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA TMEM167A 435398 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 86629389 86629577 86629451 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 67684 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 86673186 86673474 86673330 Y CCNH,CCNH CCNH NA NA NA NA CCNH 33362 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 88219671 88220042 88220001 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP22 543897 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 90772639 90772960 90772848 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 95463 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 92940140 92940350 92940245 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 23097 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 93316390 93316647 93316523 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 128757 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 93768342 93768439 93768383 Y NA NA NA NA NA NA RP11-461G12.2 134806 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 93769266 93769440 93769342 Y NA NA NA NA NA NA RP11-461G12.2 133805 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 93900444 93900820 93900632 Y NA RP11-461G12.2 NA NA NA NA RP11-461G12.2 2425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 94033836 94034405 94034124 Y KIAA0825,ANKRD32 NA NA NA NA NA KIAA0825 81527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr5 94038768 94039036 94038830 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0825 86459 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 94049532 94049756 94049644 Y KIAA0825 NA NA NA NA NA KIAA0825 97223 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 94052096 94052474 94052285 Y KIAA0825 NA NA NA NA NA KIAA0825 99787 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 95048086 95048445 95048385 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 95170246 95170624 95170377 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 13537 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 95294794 95295285 95294896 Y ELL2 CTD-2337A12.1,ELL2 NA NA NA NA CTD-2337A12.1 420 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 99386410 99387139 99386777 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 481827 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 100163819 100164102 100163976 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA FAM174A 294810 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 106699543 106699944 106699621 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 304652 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 106803068 106803432 106803267 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 201164 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 106806041 106806198 106806107 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 198398 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 106878561 106878904 106878854 Y EFNA5 NA NA NA NA NA EFNA5 125692 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 106900103 106900354 106900202 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 104242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 106907307 106907511 106907485 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97085 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 106931094 106931453 106931417 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 73143 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 108791627 108791782 108791705 Y NA PJA2 PJA2 IMR90 Hi-C 24141950 PJA2 47932 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 110797509 110797845 110797534 Y NA STARD4 NA NA NA NA STARD4 48443 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 110865894 110866475 110866210 Y STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 19606 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 114913600 114913827 114913746 Y NA FEM1C,AC010226.4,TMED7-TICAM2 NA NA NA NA AC010226.4 21927 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 115236990 115237113 115237051 Y NA NA NA NA NA NA ATG12 61435 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 115412236 115412448 115412328 Y NA CTD-2287O16.1,COMMD10 NA NA NA NA COMMD10 6240 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 118453384 118453586 118453485 Y NA CTB-161M19.4,RP11-950K24.2 NA NA NA NA RP11-950K24.2 8553 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 118659966 118660476 118660173 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8 57579 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 119016321 119016356 119016339 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 230183 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 122181959 122182300 122182177 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 4825 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 125686848 125687181 125687011 Y GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3,ALDH7A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 6643 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 125690030 125690185 125690123 Y GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 3639 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 125721947 125722154 125722072 Y NA GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 28123 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA MARCH3 114379 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 130971517 130972046 130971999 Y NA RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 2588 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 131560740 131561286 131561173 Y IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2 NA NA NA NA NA SLC22A4 66850 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 131641002 131641297 131641050 Y NA SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 11994 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 131774835 131775712 131775188 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,IRF1 NA NA NA NA C5orf56 30507 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 131800033 131800450 131800090 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 NA NA NA NA IRF1 24040 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 131802496 131802987 131802660 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 NA NA NA NA IRF1 21503 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 132404436 132404641 132404539 Y LEAP2 ZCCHC10,HSPA4 NA NA NA NA HSPA4 18782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 133456495 133456816 133456660 Y UBE2B,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 NA NA NA NA NA SKP1 53913 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 133460352 133460406 133460379 Y UBE2B,PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 NA NA NA NA NA SKP1 50323 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 38489 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 22887 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 134471631 134472059 134471710 Y C5orf20,PITX1 NA PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTC-276P9.1 97894 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 134475601 134475808 134475692 Y PITX1 NA LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY IMR90 Hi-C 24141950 CTC-276P9.1 101864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 134727973 134728292 134728105 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 5312 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 134729023 134729250 134729122 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 4354 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 136083171 136083461 136083316 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 107856 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 136359479 136359669 136359574 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 168162 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 136727566 136727823 136727577 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 204245 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 136784881 136785093 136784987 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 146975 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 136795919 136796307 136796181 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 135761 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 136833088 136833480 136833319 Y KLHL3,SPOCK1 NA NA NA NA NA SPOCK1 98588 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 136900041 136900222 136900186 Y NA SPOCK1 TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 31846 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr5 136930873 136930924 136930899 Y NA SPOCK1 NA NA NA NA SPOCK1 1144 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 136940488 136940640 136940554 Y NA SPOCK1 NA NA NA NA SPOCK1 8420 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 137370531 137370718 137370637 Y PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5 FAM13B PKD2L2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM13B 14932 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 190951 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 138325344 138325620 138325482 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 238346 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 138851930 138852095 138852011 Y NA TMEM173 NA NA NA NA TMEM173 8425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 139043719 139044204 139043873 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 18835 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 139088295 139089196 139088669 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 63411 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 139167686 139167904 139167758 Y NA NA CXXC5,UBE2D2,DNAJC18,NRG2,PSD2,CYSTM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC5 142802 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 139464204 139464218 139464211 Y NA NRG2,PURA CYSTM1,NRG2 IMR90 Hi-C 24141950 PURA 21144 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 139598972 139599011 139598993 Y ANKHD1 NA NA NA NA NA PFDN1 81695 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 139631101 139631601 139631302 Y SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 49105 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 139641396 139641769 139641570 Y SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 38937 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 12737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 5115 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 140714021 140714065 140714043 Y PCDHB12,PCDHB15,PCDHGC4 TAF7,PCDHGA1,PCDHGA3,PCDHGB1,PCDHGA4,PCDHGB2,PCDHGA6 NA NA NA NA PCDHGA1 5769 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 141201064 141201327 141201197 Y PCDH1 NA PCDH1,LOC729080,FCHSD1,ARAP3,KIAA0141,PCDH12,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH1 55484 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 141256552 141256862 141256814 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 KIAA0141 NA NA NA NA PCDH1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 141407173 141407212 141407192 Y NA GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GNPDA1 16567 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 142105384 142105400 142105392 Y FGF1 ARHGAP26 ARHGAP26,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP26 42549 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 142182965 142183820 142183151 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 35016 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr5 142534225 142534485 142534355 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 175685 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 142697698 142698151 142698028 Y NR3C1,NR3C1 RPL7P21 NA NA NA NA RPL7P21 12019 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 142785420 142785784 142785543 Y NR3C1 NR3C1 ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 27293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 142937060 142937324 142937206 Y NR3C1,NR3C1 NA ARHGAP26,HMHB1,NR3C1,YIPF5 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 123983 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 142974978 142975222 142975128 Y NR3C1,NR3C1 NA ARHGAP26,NR3C1,KCTD16,YIPF5,HMHB1 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 161901 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 145455339 145455700 145455520 Y NA NA NA NA NA NA LARS 104523 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 146242419 146242610 146242553 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R2B 219737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 147603808 147604119 147603866 Y SPINK6,SPINK13 SPINK6,CTC-295J13.3,SPINK13 NA NA NA NA CTC-295J13.3 12014 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr5 147605275 147606051 147605859 Y NA SPINK6,CTC-295J13.3,SPINK13 NA NA NA NA CTC-295J13.3 10082 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 147646107 147646243 147646175 Y NA CTC-295J13.3,SPINK13 NA NA NA NA SPINK13 364 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 147777538 147777934 147777556 Y NA RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 16040 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 148172345 148172765 148172447 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 31391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 149111581 149111664 149111645 Y NA PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 3720 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 149318595 149318961 149318771 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 19339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 149379132 149379170 149379142 Y NA SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 149522462 149523132 149522666 Y NA NA NA NA NA NA TIGD6 143732 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 149789263 149789759 149789627 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,CD74,CD74 CD74,RPS14 NA NA NA NA CD74 733 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 149945724 149945760 149945742 Y SYNPO,ZNF300 SYNPO NA NA NA NA SYNPO 32882 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 150261861 150262245 150261884 Y IRGM ZNF300 NA NA NA NA ZNF300 20300 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 150267218 150267533 150267276 Y IRGM ZNF300 NA NA NA NA ZNF300 15012 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 150464543 150466084 150465220 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5054 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 150477506 150477962 150477585 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 6368 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 153939934 153940118 153940082 Y NA NA FAM114A2,MFAP3,SAP30L IMR90 Hi-C 24141950 SAP30L 116417 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 153963327 153963532 153963423 Y MRPL22,SAP30L,HAND1 NA NA NA NA NA LARP1 126930 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 154062607 154063000 154062805 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 27462 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 156897739 156898102 156897921 Y NA NA NA NA NA NA CYFIP2 206650 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 157257409 157257732 157257678 Y NA CLINT1 NA NA NA NA CLINT1 26451 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 157297918 157298287 157298172 Y NA CLINT1 CLINT1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 13735 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 157305063 157305235 157305149 Y NA CLINT1 CLINT1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 20880 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 157521038 157521096 157521067 Y NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 236855 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 157751571 157751794 157751624 Y NA NA NA NA NA NA CLINT1 467388 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 158605991 158606398 158606265 Y NA RNF145 NA NA NA NA RNF145 28663 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19947 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19319 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 167066911 167067143 167066981 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 649513 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 167372516 167372785 167372694 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 343871 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 168232470 168232861 168232812 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 191153 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 171298269 171298393 171298371 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 133484 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 171326428 171326478 171326475 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 105399 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 171847636 171847998 171847816 Y NA SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 31529 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 172064248 172064489 172064361 Y NA NEURL1B,CTB-79E8.3 NA NA NA NA NEURL1B 1780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 172160417 172160946 172160788 Y ATP6V0E1 DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35252 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 172288216 172288483 172288386 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 28938 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 172310587 172310757 172310673 Y DUSP1 NA NA NA NA NA ERGIC1 51309 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 172313877 172314602 172314167 Y DUSP1,C5orf41 NA NA NA NA NA ERGIC1 54599 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr5 172314817 172315056 172314937 Y DUSP1,C5orf41 NA NA NA NA NA ERGIC1 55539 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr5 172327024 172327318 172327167 Y NA NA NA NA NA NA RPL26L1 56414 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 172329840 172330200 172330006 Y DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1 NA NA NA NA NA RPL26L1 53532 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr5 172380663 172381064 172380838 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 2668 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 172442253 172442613 172442433 Y NA ATP6V0E1 NA NA NA NA ATP6V0E1 33493 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 172761341 172761739 172761505 Y STC2 STC2 NA NA NA NA STC2 6835 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 173031200 173031306 173031275 Y NA BOD1 NA NA NA NA BOD1 10357 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 173169995 173170330 173170163 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 884 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 173180419 173180632 173180581 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 9205 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 173191567 173191754 173191643 Y CPEB4 CTB-43E15.3 CPEB4,C5orf47 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 20353 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 22163 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr5 173300199 173300299 173300265 Y NA CPEB4 BOD1,CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 12984 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 173390340 173390538 173390358 Y NA NA NA NA NA NA CPEB4 77057 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 173391031 173391183 173391109 Y HMP19 NA NA NA NA NA CPEB4 77748 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 176359562 176359884 176359876 Y RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6 NA NA NA NA NA UIMC1 87750 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 176790168 176790403 176790363 Y DOK3,RGS14 LMAN2,GRK6 NA NA NA NA LMAN2 13315 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 177607687 177607881 177607743 Y NA NHP2,HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 21627 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 178034122 178034420 178034258 Y ZNF354B,AGXT2L2,CLK4 CLK4 NA NA NA NA CLK4 21196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr5 179513863 179514025 179513944 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 16745 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 180600516 180600767 180600667 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 16157 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 387336 387726 387531 Y DUSP22 NA IRF4,DUSP22 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 97706 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 567084 567274 567179 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 123843 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 1131986 1132306 1132130 Y NA NA LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 178369 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 1311143 1311466 1311342 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 468 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 1311552 1311897 1311757 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 877 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 1335859 1336005 1335918 Y NA FOXQ1 LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 25184 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 1609094 1609758 1609395 Y FOXC1 FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 413 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chr6 1702305 1702315 1702310 Y NA NA NA NA NA NA FOXC1 93624 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 2330490 2330806 2330587 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 86508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 2767771 2767941 2767856 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 4123 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 2790944 2791090 2791014 Y NA WRNIP1,SERPINB1 SERPINB1 IMR90 Hi-C 24141950 WRNIP1 27296 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 2853307 2853467 2853442 Y SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 13067 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 2868839 2869182 2869098 Y SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 28599 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 2952080 2952258 2952142 Y SERPINB1,RIPK1,SERPINB9,NQO2 SERPINB6,NQO2,RP1-90J20.8 NA NA NA NA SERPINB6 17832 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 3160462 3160701 3160583 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 4702 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 9108 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 3254273 3254642 3254472 Y SLC22A23 PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 24636 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA PSMG4 126462 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 3789456 3789809 3789635 Y NA PXDC1 SLC22A23,PXDC1,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 39196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 3797931 3798162 3798051 Y NA PXDC1,FAM50B SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 47671 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21107 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183257 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 4358823 4359231 4358978 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 224992 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 4603647 4603982 4603794 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 100411 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 5157743 5158129 5157936 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 101043 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 5994378 5994644 5994564 Y NRN1 NA NA NA NA NA FARS2 735101 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr6 6811454 6812228 6812086 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 293602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 6885637 6886125 6885854 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 219705 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 12.5131508236917 chr6 6886373 6886682 6886449 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 219148 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 7130548 7130794 7130662 Y RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 24718 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 8083649 8083837 8083720 Y NA EEF1E1 NA NA NA NA EEF1E1 16974 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 10315279 10315501 10315368 Y PAK1IP1,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A NA LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2A 102391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 10316491 10316897 10316818 Y TFAP2A,TFAP2A NA LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2A 100995 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 10383571 10383981 10383824 Y TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 33911 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 4.48387904515618 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518,GCNT2 NA NA NA NA LINC00518 8419 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr6 10771427 10771996 10771700 Y ELOVL2,MAK TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA SYCP2L 25400 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 10897145 10897485 10897326 Y NA NA NA NA NA NA MAK 60381 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 11197003 11197299 11197017 Y ERVFRD-1,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 183282 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 11210069 11210603 11210460 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 169978 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 11217429 11217753 11217578 Y MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 162828 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 11229489 11229708 11229675 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 150873 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 11263609 11264019 11263885 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 116562 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 11318376 11319012 11318732 Y TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 61569 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr6 11344526 11344935 11344784 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 35646 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 11414898 11415336 11414989 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NEDD9,C6orf228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 34317 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 11730766 11731308 11730965 Y TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 194828 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 12285143 12285495 12285317 Y NA EDN1 TMEM170B,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 3101 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 12288471 12288892 12288524 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 12324386 12324755 12324542 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 35790 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 13462093 13462464 13462300 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1 GFOD1 NA NA NA NA GFOD1 23430 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 13636617 13636971 13636795 Y TBC1D7,GFOD1,CD83 NOL7 NA NA NA NA NOL7 23058 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 13671877 13672171 13672102 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1,CD83 RANBP9 NOL7,SIRT5 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 37625 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 13811144 13811203 13811174 Y RNF182,RNF182 NA NA NA NA NA RANBP9 101348 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 14121845 14123283 14121874 Y NA CD83 NA NA NA NA CD83 5973 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 14138760 14138894 14138788 Y CD83 CD83 NA NA NA NA CD83 22888 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 14283985 14284180 14284073 Y CD83 NA DTNBP1,JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 168113 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 14744083 14744613 14744392 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 499914 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 15474239 15474654 15474451 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 186635 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 15516223 15516554 15516389 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 144735 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 15526544 15526623 15526553 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 134666 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 15535179 15535578 15535319 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 125711 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 16205650 16206035 16205852 Y NA NA DTNBP1,MYLIP,GMPR IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYLIP 78294 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 16712557 16713382 16713252 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45987 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 16724246 16724395 16724344 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 34974 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 16741302 16741617 16741570 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 17752 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 16771345 16771373 16771363 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATXN1 11623 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 17496190 17496270 17496230 Y NA RPL7P26 NA NA NA NA RPL7P26 33613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 18405939 18406237 18405987 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 39160 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 20444927 20445761 20445060 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 44529 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 20604004 20604027 20604016 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 71316 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 20642705 20642902 20642804 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 110017 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 24514097 24514400 24514249 Y NA ALDH5A1,GPLD1 NA NA NA NA GPLD1 20664 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 24686171 24686408 24686290 Y DCDC2 TDP2,ACOT13,C6orf62 NA NA NA NA ACOT13 20908 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 24698648 24698887 24698768 Y NA TDP2,ACOT13,C6orf62 NA NA NA NA C6orf62 20177 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 24929581 24929797 24929724 Y NA PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 44850 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 25089428 25090170 25089848 Y TDP2,C6orf62 NA NA NA NA NA PPIAP29 114781 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 25458860 25459089 25458879 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 181554 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 7.61216675107909 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 26322637 26323123 26322876 Y NA HIST1H4H,BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H4H 38875 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN3A3,BTN2A1,HCG11 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 26521444 26521777 26521577 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 1368 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 26550694 26551000 26550826 Y NA HCG11,HMGN4,ABT1 NA NA NA NA HMGN4 14061 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 27205361 27205470 27205416 Y NA RP11-209A2.1 OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-209A2.1 28338 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 27261332 27261668 27261500 Y FKSG83 NA NA NA NA NA ZNF204P 75636 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 27720726 27720895 27720796 Y NA NA HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC100131289 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BL 52814 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr6 28080593 28080792 28080693 Y NA ZNF165,ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9546 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 28188130 28188520 28188276 Y ZNF193 ZKSCAN4 NA NA NA NA ZKSCAN4 36491 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 28280351 28280639 28280495 Y NA PGBD1,ZKSCAN3 NA NA NA NA PGBD1 33037 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 28302002 28302386 28302196 Y NA ZKSCAN3 NA NA NA NA ZKSCAN3 13305 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN12 91714 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 50.5739845790871 chr6 28601930 28602271 28602104 Y NA SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 19941 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 28603148 28603326 28603259 Y NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3 SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 21159 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 28956602 28956848 28956725 Y NA HCG15,ZNF311 NA NA NA NA HCG15 4622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 30811913 30812084 30812025 Y NA DDR1 FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1 IMR90 Hi-C 24141950 DDR1 30114 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 31761868 31762215 31762042 Y LY6G5C VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52 NA NA NA NA VARS 138 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 31942054 31942322 31942254 Y NA CFB,SKIV2L,STK19 NA NA NA NA STK19 5186 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 32072186 32072277 32072232 Y C2,TNXB ATF6B,FKBPL,PPT2 NA NA NA NA ATF6B 21753 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 32819276 32819643 32819486 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,TAPBP,RGL2,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP1 112 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2-IT1 20028 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 32986611 32987175 32986859 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA NA HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPB2,COL11A2,VPS52 IMR90 Hi-C 24141950 BRD2-IT1 50602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 32996316 32996705 32996419 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,HLA-DOA NA HLA-DPB2,VPS52,HLA-DPB1 IMR90 Hi-C 24141950 BRD2-IT1 60307 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 33129390 33129479 33129402 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 36743 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 33216178 33216307 33216243 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,PFDN6,WDR46,RGL2 NA NA NA NA HCG25 867 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9 NA NA NA NA CUTA 8702 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 33950913 33951144 33951041 Y NA NA NA NA NA NA LEMD2 196000 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 34625381 34625487 34625387 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37149 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 35035271 35035638 35035433 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 180229 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 35311267 35311540 35311417 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 2932 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 36391779 36391863 36391821 Y NA KCTD20,PXT1 NA NA NA NA KCTD20 16681 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA PXT1 591 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 36547678 36548077 36547769 Y PI16,MTCH1 STK38,SRSF3 STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF3 12068 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 36628616 36629003 36628769 Y ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90 Hi-C 24141950 LAP3P2 10591 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 36634782 36635224 36635042 Y MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAP3P2 4370 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 36786044 36786391 36786334 Y NA NA NA NA NA NA C6orf89 51255 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 36821118 36821514 36821315 Y NA C6orf89,PPIL1 CPNE5 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf89 16132 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 37094186 37094408 37094276 Y PPIL1 PIM1 PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 41571 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr6 37098455 37099411 37099295 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 36568 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 37102324 37102775 37102642 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 33204 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 38033139 38033395 38033278 Y ZFAND3 NA NA NA NA NA ZFAND3 247864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 38450593 38450822 38450666 Y BTBD9 NA NA NA NA NA BTBD9 155102 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 40132230 40132456 40132336 Y NA NA NA NA NA NA RP1-278E11.3 207658 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 41008417 41008606 41008512 Y UNC5CL,TSPO2,TSPO2 NFYA NA NA NA NA NFYA 30078 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 41512989 41513289 41513139 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 825 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 42219475 42219699 42219588 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 35872 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 42228452 42228568 42228527 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 44849 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 42735698 42735757 42735728 Y NA ATP6V0CP3,TBCC TBCC,KIAA0240,GUCA1A,PRPH2,UBR2,ATP6V0CP3,RPL7L1,C6orf226,CNPY3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 23140 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 43058034 43058580 43058415 Y NA CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA PTK7 16028 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 43295599 43295850 43295834 Y TJAP1 ZNF318 NA NA NA NA ZNF318 39366 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA C6orf223 87630 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.96249776083569 chr6 43894411 43894725 43894584 Y NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP NA NA NA NA NA C6orf223 71592 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 44011469 44011879 44011690 Y NA C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 45152 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 45629 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 44020614 44020967 44020695 Y NFKBIE NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 54297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 44026121 44027353 44026480 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf223 59804 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 44052522 44052743 44052633 Y NA TMEM63B,MRPL14 MAD2L1BP,GTPBP2,RSPH9,POLH,VEGFA,MRPS18A,XPO5,LOC100132354,TMEM63B,CAPN11,MRPL14,HSP90AB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 39908 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 44186277 44186510 44186378 Y SLC29A1 SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 1035 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 44835345 44835718 44835412 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 482083 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 45294493 45294953 45294580 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 41388 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 45330194 45330521 45330358 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 13169 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 52339756 52339820 52339788 Y NA NA NA NA NA NA EFHC1 56650 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 52911792 52912057 52911925 Y NA FBXO9,ICK NA NA NA NA FBXO9 2732 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 53165916 53166137 53165996 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 45810 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA NA NA NA NA NA DST 520858 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 56315031 56315399 56315215 Y NA NA NA NA NA NA DST 502027 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 57178706 57179008 57178897 Y RAB23 PRIM2 BAG2,ZNF451,PRIM2 IMR90 Hi-C 24141950 PRIM2 1103 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 57389697 57390070 57389732 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 212094 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 57478986 57479248 57479117 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 301383 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 64055548 64055769 64055667 Y NA NA PTP4A1,EYS IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1C 136197 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 64057545 64057895 64057656 Y NA NA PTP4A1,EYS IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1C 138194 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 64062508 64062954 64062798 Y NA NA PTP4A1,EYS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FKBP1C 143157 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 64088639 64088972 64088831 Y NA NA EYS IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A1 140694 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 64150073 64150241 64150156 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 79425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 64168515 64168918 64168771 Y PTP4A1 NA NA NA NA NA PTP4A1 60748 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 69431654 69431887 69431658 Y NA NA NA NA NA NA LMBRD1 1073116 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 70505414 70505608 70505498 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 411 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 71184425 71184878 71184622 Y NA NA NA NA NA NA FAM135A 63781 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 71856502 71856731 71856607 Y B3GAT2 NA NA NA NA NA OGFRL1 139775 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 71906987 71907342 71907159 Y NA NA OGFRL1,MIR30A IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 89164 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 74861347 74861685 74861516 Y NA NA COL12A1 IMR90 Hi-C 24141950 CD109 457839 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 75917428 75917795 75917727 Y NA COL12A1,COX7A2 NA NA NA NA COL12A1 3661 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 79758680 79758772 79758726 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 27181 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 83449136 83449335 83449235 Y NA NA UBE3D IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 326050 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 83935269 83935637 83935453 Y NA RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA PGM3 33614 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 87800989 87801207 87801098 Y CGA CGA,RCN1P1 NA NA NA NA CGA 1617 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 87832223 87832245 87832242 Y NA CGA,RCN1P1,ZNF292 ZNF292 IMR90 Hi-C 24141950 RCN1P1 1817 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 88401154 88401337 88401278 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 8590 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 89315918 89316052 89315985 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP8 331210 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 89744998 89746016 89745827 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNRC1 42454 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 90878882 90879095 90878991 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 125532 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 90983807 90984597 90984358 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 20030 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 91078844 91079184 91078980 Y NA NA BACH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BACH2 74217 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 91134952 91135221 91135020 Y NA NA BACH2 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 130325 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 101211686 101211775 101211752 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 115473 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 101593141 101593339 101593267 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 265893 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 91524 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 107014040 107014053 107014047 Y BEND3,RTN4IP1 NA NA NA NA NA RTN4IP1 61320 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 107150270 107150783 107150511 Y NA NA NA NA NA NA QRSL1 74817 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 107774853 107775271 107775085 Y BEND3 PDSS2 NA NA NA NA PDSS2 3497 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 108895400 108895781 108895496 Y NA FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 16362 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 108954654 108955002 108954825 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 75616 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 109193508 109193566 109193543 Y SESN1 ARMC2,RP11-249L21.4 NA NA NA NA ARMC2 25889 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 112068361 112068832 112068769 Y REV3L,FYN,FYN,FYN NA NA NA NA NA FYN 123823 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 112081684 112082055 112081891 Y NA NA NA NA NA NA FYN 110600 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 112192236 112192610 112192499 Y REV3L,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 45 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 112364338 112364486 112364397 Y TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 42246 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 113803139 113803358 113803242 Y MARCKS NA LOC285758,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 373183 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 113975639 113976185 113975774 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 200356 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 116550472 116550927 116550585 Y KPNA5,TSPYL4,TSPYL1 TSPYL4,RP3-486I3.4,TSPYL1,RP1-93H18.1 NA NA NA NA TSPYL4 22334 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 117761832 117762028 117761987 Y NA DCBLD1 DCBLD1,GOPC IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD1 10952 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 119214275 119214495 119214295 Y C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 891 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 NA NA NA NA NA HSF2 959886 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 125282351 125282561 125282440 Y NA RNF217,RP11-510H23.1 NA NA NA NA RP11-510H23.1 166 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 125315315 125315695 125315334 Y NA RNF217,RP11-510H23.1 NA NA NA NA RP11-510H23.1 33130 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 125599408 125599745 125599577 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 21537 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 125622252 125622475 125622321 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 970 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 126167488 126167529 126167508 Y NCOA7 NA NA NA NA NA NCOA7 67181 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 126271537 126271736 126271680 Y NA HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 4191 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 126579500 126579620 126579560 Y NA NA NA NA NA NA CENPW 79700 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 127638757 127639069 127638966 Y NA ECHDC1 NA NA NA NA ECHDC1 23685 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 127892310 127892704 127892511 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 137529 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 NA NA NA NA NA ARHGAP18 312842 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr6 131375294 131375442 131375382 Y NA EPB41L2 NA NA NA NA EPB41L2 7020 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 133837061 133837238 133837150 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 277325 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 133843297 133843543 133843427 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 283561 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 133890779 133890909 133890844 Y NA NA MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 EYA4 331043 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 134264415 134264799 134264607 Y NA TBPL1 TBPL1,SLC2A12 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TBPL1 6509 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 134614780 134615032 134614956 Y SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 22218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 134616841 134617592 134617239 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 19658 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr6 134620325 134620468 134620398 Y NA SGK1 NA NA NA NA SGK1 16782 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 134622486 134622615 134622584 Y SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 14635 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 134668918 134669336 134669288 Y NA SGK1 SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 31668 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 134669516 134669878 134669820 Y NA SGK1 SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 32266 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 134679459 134679725 134679553 Y SGK1,SGK1 SGK1 SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 42209 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 134684660 134684778 134684697 Y SGK1,SGK1 SGK1 SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 47410 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 134692898 134693006 134692952 Y NA NA ALDH8A1,SGK1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 55648 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 134700193 134700599 134700296 Y SGK1,SGK1 NA ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 62943 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 134701422 134701794 134701609 Y NA NA ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK1 64172 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 134742048 134742399 134742278 Y SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104798 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA MYB 136311 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 136455870 136456219 136456181 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 152770 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 136688131 136688248 136688227 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 79142 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 136724164 136724966 136724405 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 115175 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 136729350 136729610 136729525 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 120361 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 136789939 136790352 136790100 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA MAP7 79605 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 136839838 136840084 136840036 Y NA MAP7 NA NA NA NA MAP7 29873 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 136965409 136965459 136965418 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 95452 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 138027517 138027801 138027604 Y NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 158550 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 138132277 138133056 138132650 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53295 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 138216222 138216422 138216312 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 29871 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 138352596 138352732 138352664 Y PERP NA KIAA1244,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PERP 73916 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 138786189 138786282 138786236 Y NA NA NA NA NA NA HEBP2 63521 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 138914342 138914559 138914540 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 NHSL1 97149 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 141171716 141171869 141171793 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 1294498 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 143770817 143770943 143770879 Y ADAT2 ADAT2,PEX3 NA NA NA NA PEX3 873 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 144479850 144480240 144479875 Y NA STX11 NA NA NA NA STX11 10187 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 146867560 146867942 146867733 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 4731 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 149416134 149416493 149416352 Y TAB2 NA NA NA NA NA TAB2 121284 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 149810083 149810269 149810175 Y ZC3H12D NA NA NA NA NA PPIL4 54905 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 150944036 150944676 150944139 Y PLEKHG1 PLEKHG1 NA NA NA NA PLEKHG1 25037 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 151178145 151178545 151178467 Y MTHFD1L MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 6140 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chr6 151365804 151366060 151365928 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 52605 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 151391768 151392248 151391859 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 26417 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 151701197 151701769 151701451 Y C6orf97,ZBTB2 ZBTB2 NA NA NA NA ZBTB2 8914 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 151803491 151803848 151803698 Y ZBTB2 RMND1,C6orf211 NA NA NA NA C6orf211 32069 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 151973589 151973736 151973663 Y NA NA NA NA NA NA C6orf211 202167 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 151990047 151990437 151990162 Y NA NA ESR1,RMND1,C6orf211,SYNE1,C6orf97 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf211 218625 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 152085145 152085342 152085266 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA C6orf211 313723 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.81545893533062 chr6 154664890 154665258 154665161 Y IPCEF1 NA NA NA NA NA CNKSR3 164535 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 154753926 154754309 154754118 Y CNKSR3 NA NA NA NA NA CNKSR3 75484 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 155179611 155179904 155179758 Y NA TIAM2 TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 27780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 155526313 155526389 155526351 Y NA RP11-477D19.2 TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-477D19.2 49469 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 155590165 155590417 155590245 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 14307 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 157097774 157098131 157097933 Y NA ARID1B NA NA NA NA ARID1B 711 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 157694703 157694954 157694858 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 47679 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 157695432 157695688 157695582 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 46945 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 157978590 157978748 157978669 Y SYNJ2,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ZDHHC14 178425 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 158136804 158137189 158136890 Y NA NA TMEM242,SNX9,ZDHHC14 IMR90 Hi-C 24141950 SNX9 105107 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 16971 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 14078 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 159284894 159285253 159285074 Y NA EZR,C6orf99 OSTCP1 K562 ChIA-PET 22265404 C6orf99 3718 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 160699946 160700334 160700305 Y LPA RP1-276N6.2 NA NA NA NA RP1-276N6.2 8297 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 161545851 161546111 161545978 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 135092 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 165837337 165837347 165837342 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 560744 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 165988383 165988522 165988473 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 409569 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 166067950 166069085 166068916 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 329006 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 166121234 166121494 166121453 Y NA NA PDE10A IMR90 Hi-C 24141950 PDE10A 276597 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 166364914 166365167 166365041 Y T PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 32924 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 166378442 166378825 166378818 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 19266 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 166385606 166385834 166385795 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 12257 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr6 166386011 166386354 166386183 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 11737 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr6 166398427 166398527 166398479 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 336 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr6 166418787 166419137 166419099 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA LINC00473 19251 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 166419567 166419719 166419697 Y PRR18 PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA LINC00473 20031 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr6 166420168 166420416 166420184 Y T PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA LINC00473 20632 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA LINC00473 22766 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr6 166470192 166470586 166470296 Y NA NA LINC00473,LOC441177 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00473 70656 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 167411045 167411413 167411177 Y NA RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 375 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr6 170461603 170461884 170461744 Y NA NA LINC00574,LOC154449 IMR90 Hi-C 24141950 FAM120B 135907 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 577876 578141 578015 Y PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 19943 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 633040 633441 633240 Y ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 75107 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 94709 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 946891 947297 947190 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 32702 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 1099866 1100419 1100164 Y ADAP1,COX19,ZFAND2A,MAFK GPR146 NA NA NA NA GPR146 17654 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 1546091 1546367 1546260 Y NA MICALL2,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 1553000 1553189 1553120 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 9511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr7 1560213 1560697 1560426 Y C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 7653 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr7 2353156 2353455 2353307 Y NA EIF3B,SNX8 NA NA NA NA EIF3B 38266 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 5.00526032947666 chr7 4747693 4747769 4747737 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 66305 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 5039702 5040026 5039789 Y NA RNF216P1,RBAK NA NA NA NA RNF216P1 28083 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr7 8016516 8016759 8016566 Y GLCCI1 GLCCI1 NA NA NA NA GLCCI1 10091 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 8300349 8300667 8300508 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 32 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 16707771 16707941 16707875 Y NA ANKMY2,BZW2 NA NA NA NA BZW2 24015 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 17139132 17139382 17139242 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 196864 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 17162731 17163011 17162882 Y AHR NA NA NA NA NA AHR 173235 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 17402534 17402650 17402592 Y NA NA NA NA NA NA AC003075.4 65553 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 20447290 20447655 20447472 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 78965 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8,RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 22011633 22011901 22011770 Y NA CDCA7L NA NA NA NA CDCA7L 27931 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 22616988 22617783 22617407 Y IL6 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 67370 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 22622740 22623204 22623070 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 73122 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 23084280 23084501 23084407 Y NA FAM126A SNORD93,LOC100506178,TOMM7 IMR90 Hi-C 24141950 FAM126A 32531 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 23410116 23410259 23410188 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 97827 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 23411315 23411579 23411447 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 96507 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 24772828 24773057 24772934 Y DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 34187 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 26369550 26369804 26369732 Y CBX3,SNX10,SNX10 SNX10 NA NA NA NA SNX10 40009 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 28094781 28094986 28094893 Y HIBADH NA NA NA NA NA JAZF1 123376 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 32202741 32202908 32202813 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 329987 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 32944853 32945232 32945065 Y KBTBD2 KBTBD2,RP9P,FKBP9 NA NA NA NA KBTBD2 13110 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr7 36776109 36776821 36776493 Y ELMO1,AOAH NA ELMO1 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1P18 79743 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 37731277 37731583 37731449 Y GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA STARD3NL 484241 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 38712091 38712232 38712098 Y STARD3NL,TARP NA NA NA NA NA VPS41 257762 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 38750267 38750277 38750273 Y NA NA NA NA NA NA VPS41 219717 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 39695521 39695649 39695585 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 34439 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 40756959 40757193 40757114 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 769323 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 40938770 40939089 40938937 Y NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 801617 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.87697262355375 chr7 40961938 40962183 40962107 Y NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 778523 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr7 43593728 43593915 43593801 Y NA STK17A NA NA NA NA STK17A 26442 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr7 43612098 43612408 43612297 Y DBNL STK17A NA NA NA NA STK17A 7949 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 43625293 43625372 43625313 Y URGCP,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 4936 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 43714128 43714419 43714274 Y NA NA NA NA NA NA BLVRA 81860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 43732901 43733056 43732913 Y DBNL,STK17A NA NA NA NA NA BLVRA 63223 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 44616133 44616490 44616314 Y NA DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA TMED4 3396 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 47185619 47185934 47185820 Y NA NA IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 178319 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 47518819 47519136 47519085 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 101020 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 50346623 50346926 50346749 Y IKZF1 NA NA NA NA NA FIGNL1 169162 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 50666851 50666964 50666921 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 150763 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 51382954 51383359 51383079 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 439 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 51544453 51544703 51544577 Y NA NA NA NA NA NA COBL 161938 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 55142882 55143327 55143024 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 58168 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 55155188 55155533 55155358 Y EGFR NA NA NA NA NA EGFR 70474 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 56168682 56168929 56168809 Y ZNF713 SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 3340 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA CHCHD2 1534165 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA ZNF736 1796107 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 61970082 61970606 61970553 Y NA NA NA NA NA NA ZNF736 1795231 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 66206459 66206659 66206557 Y KCTD7,C7orf42,RABGEF1 NA NA NA NA NA RABGEF1 61308 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 68877694 68877897 68877796 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 184008 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 70358448 70358664 70358566 Y NA NA NA NA NA NA GS1-111G14.1 1046580 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 73002313 73002519 73002399 Y BCL7B BCL7B,TBL2,MLXIPL TBL2 K562 ChIA-PET 22265404 TBL2 11192 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 73037168 73037552 73037436 Y MLXIPL TBL2,MLXIPL NA NA NA NA MLXIPL 295 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr7 73133049 73133354 73133303 Y NA WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11 NA NA NA NA STX1A 1047 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 73869161 73869472 73869346 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 3041 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 73869724 73869891 73869863 Y GTF2IRD1 GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 3604 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr7 73915723 73915843 73915806 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 49603 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 73994648 73994954 73994780 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 75040 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 75291375 75291448 75291402 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 74832 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 AC005077.12 59736 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3,SRCRB4D NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 76052692 76053023 76052931 Y NA ZP3,SRCRB4D NA NA NA NA SRCRB4D 15680 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 77201219 77201434 77201295 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 36627 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 85450448 85450904 85450654 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 636277 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 86637666 86638039 86637853 Y NA KIAA1324L NA NA NA NA KIAA1324L 48976 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 87918906 87919150 87919043 Y SRI STEAP4 NA NA NA NA STEAP4 15056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 87937179 87937443 87937284 Y STEAP4 STEAP4 NA NA NA NA STEAP4 2973 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 88029071 88029091 88029081 Y NA NA NA NA NA NA STEAP4 94865 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 91466585 91467314 91466893 Y NA MTERF NA NA NA NA MTERF 40720 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 92227351 92227620 92227450 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 9643 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 92260832 92261202 92261012 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43124 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 92261439 92261837 92261823 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43731 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 92437286 92437617 92437517 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 26180 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 92439060 92439368 92439205 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 24429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 94280099 94280356 94280228 Y NA SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA SGCE 3165 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 94284072 94284624 94284343 Y NA SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA PEG10 435 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 97995155 97995543 97995349 Y NA RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 18353 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 99020392 99020577 99020441 Y OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789 BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789 NA NA NA NA CPSF4 13968 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 99178135 99178365 99178354 Y ZNF789 ZNF655,FAM200A NA NA NA NA FAM200A 23976 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 101372678 101373024 101372861 Y NA NA CUX1,EMID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 83935 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 101377148 101377442 101377338 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 79517 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 101525517 101525682 101525579 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 68558 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 101586234 101586281 101586260 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 129275 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 101775527 101775981 101775908 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 226338 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr7 104884738 104885065 104884890 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 152690 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 105123568 105123582 105123575 Y NA PUS7,RINT1 NA NA NA NA PUS7 37132 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 105329677 105330033 105329813 Y NA NA NA NA NA NA CTA-351J1.1 127905 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 105602769 105602970 105602871 Y NA NA NA NA NA NA CDHR3 87527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 89729 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 107116622 107117169 107116900 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 84760 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 107999064 107999449 107999339 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P32 149228 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 108015500 108015588 108015544 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P32 133089 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 110326819 110326998 110326909 Y NA NA NA NA NA NA AC003088.1 154008 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 110470494 110470759 110470627 Y NA NA NA NA NA NA AC003088.1 297683 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 110723657 110723799 110723727 Y LRRN3 NA NA NA NA NA IMMP2L 476774 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 110849154 110849473 110849333 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 351100 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 343487 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 110874557 110874601 110874588 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 325972 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 111024464 111024780 111024739 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 175793 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 111156714 111156954 111156834 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 43619 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr7 111200844 111201149 111201059 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 271 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 111719425 111719516 111719471 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 124950 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 69798 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 116058055 116058274 116058222 Y NA NA CAV2,TES,MET,CAV1 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 CAV1 104565 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 116523983 116524309 116524052 Y NA NA NA NA NA NA ST7 66983 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 117863844 117864014 117863854 Y ANKRD7 NAA38 NA NA NA NA NAA38 41758 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 120666718 120667076 120666787 Y NA NA NA NA NA NA ING3 77915 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 123214320 123214699 123214510 Y NA IQUB,NDUFA5 NA NA NA NA NDUFA5 18011 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 123903491 123903761 123903674 Y NA NA GPR37,LOC154872 IMR90 Hi-C 24141950 GPR37 499920 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.02401144905882 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 129014301 129014725 129014533 Y AHCYL2,FAM40B,AHCYL2 RP11-305M3.2 FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 33486 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 129246747 129246901 129246817 Y NA NRF1 NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 2654 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 129540244 129540548 129540396 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 50241 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 130571851 130572495 130572306 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA COPG2 220253 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 NA FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 190035 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 158985 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 147396 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 130697034 130697567 130697379 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95288 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 130720133 130720826 130720768 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 72029 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 131919616 131920007 131919874 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PODXL 678640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 132106504 132106703 132106622 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA CHCHD3 658145 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr7 134469498 134469802 134469635 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 42495 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 134475089 134475514 134475151 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 48086 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 134798847 134799175 134799011 Y NA TMEM140 NA NA NA NA TMEM140 31649 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr7 135120473 135120740 135120725 Y NA NA NA NA NA NA CNOT4 72135 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A NA C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 98196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chr7 137311444 137311452 137311448 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 373361 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 137387266 137387617 137387499 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 297196 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 137685065 137685809 137685664 Y TRIM24,CREB3L2 CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 252 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 138858843 138859133 138858995 Y SVOPL TTC26 NA NA NA NA TTC26 42353 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 64906 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 139584364 139584758 139584561 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 108787 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 140271542 140271796 140271668 Y NA NA NA NA NA NA MKRN1 94173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 141264058 141264442 141264180 Y TAS2R38,CLEC5A AGK NA NA NA NA AGK 15069 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 141334636 141334647 141334642 Y TAS2R3 NA NA NA NA NA KIAA1147 65306 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147,RNU1-82P NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 141492164 141492415 141492290 Y TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 56043 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 141501394 141501805 141501703 Y NA NA NA NA NA NA SSBP1 65273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 141512676 141512822 141512821 Y TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 76555 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 141584515 141584993 141584749 Y TAS2R38,CLEC5A NA LOC100124692 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP1 148394 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 141804639 141804894 141804740 Y CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA SSBP1 368518 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 143589612 143589642 143589628 Y OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A FAM115A NA NA NA NA FAM115A 7649 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1693 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.18980139414604 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 148685182 148685277 148685231 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 38456 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 150054539 150054733 150054638 Y NA LRRC61,ACTR3C,REPIN1,ZNF775 RARRES2 IMR90 Hi-C 24141950 REPIN1 8545 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 150075425 150075527 150075503 Y NA REPIN1,ZNF775 NA NA NA NA ZNF775 11546 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 57774 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 151199311 151199621 151199557 Y NA RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 15585 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 151386683 151387049 151386915 Y NA NA NA NA NA NA RHEB 171477 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 151442202 151442898 151442523 Y NA NA CRYGN,RHEB IMR90 Hi-C 24141950 PRKAG2-AS1 129229 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 153876218 153876403 153876311 Y NA NA NA NA NA NA PAXIP1 916391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 154958521 154958650 154958585 Y NA AC099552.3 PAXIP1,HTR5A,LOC100128264,CNPY1 IMR90 Hi-C 24141950 AC099552.3 35207 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 155006028 155006426 155006187 Y NA AC099552.3 NA NA NA NA AC099552.3 12171 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 155049368 155049519 155049432 Y NA INSIG1 NA NA NA NA INSIG1 37967 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 156544134 156544345 156544262 Y NA NA NA NA NA NA C7orf13 112786 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 156932490 156932855 156932681 Y NA UBE3C NA NA NA NA UBE3C 2883 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 157067817 157068138 157067978 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 57937 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 157092515 157093215 157092989 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB6 32860 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr7 157334866 157335140 157335002 Y DNAJB6,DNAJB6 NA NA NA NA NA DNAJB6 208791 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 270529 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 158357376 158357683 158357548 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 137837 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 158387429 158387829 158387629 Y WDR60 NA PTPRN2 K562 ChIA-PET 22265404 NCAPG2 107691 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 158500449 158500649 158500582 Y NA NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 4929 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 158656529 158657066 158657015 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA WDR60 9260 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr7 158808159 158808606 158808258 Y VIPR2 NA NA NA NA NA VIPR2 127043 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 582547 582966 582856 Y ERICH1 NA NA NA NA NA ERICH1 103140 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 1971088 1971527 1971116 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 200946 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 2418829 2418999 2418939 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 648687 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 2530387 2530737 2530464 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 760245 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 4332649 4333047 4332848 Y NA NA NA NA NA NA PAICSP4 309807 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 6394489 6394505 6394499 Y AGPAT5,ANGPT2 NA NA NA NA NA MCPH1 132376 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 6490542 6490767 6490601 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 72963 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 6721983 6722491 6722202 Y NA XKR5 NA NA NA NA XKR5 30817 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 8142177 8142516 8142347 Y NA ALG1L13P SGK223,CLDN23,MFHAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ALG1L13P 41988 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 8746516 8746997 8746809 Y CLDN23 MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 2158 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 8932382 8932915 8932599 Y CLDN23,PPP1R3B NA PPP1R3B,ERI1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PPP1R3B 74169 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 10676875 10677241 10677058 Y NA PINX1 NA NA NA NA PINX1 18153 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 11032163 11032532 11032339 Y NA NA NA NA NA NA MTMR9 107393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 15546823 15547116 15546970 Y NA NA NA NA NA NA VPS37A 1554964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 16479323 16479556 16479440 Y NA NA NA NA NA NA VPS37A 622524 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 17467552 17467711 17467600 Y MTMR7,MTUS1 PDGFRL NA NA NA NA PDGFRL 35610 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 19332797 19333402 19333164 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 163669 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 19341372 19341590 19341526 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 172244 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 19591741 19592019 19591880 Y NA CSGALNACT1 CSGALNACT1,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 CSGALNACT1 21521 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 19798785 19799134 19798803 Y NA LPL NA NA NA NA LPL 41557 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr8 19799323 19799727 19799695 Y NA LPL NA NA NA NA LPL 42095 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 19808496 19808756 19808622 Y NA NA NA NA NA NA LPL 51268 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 20218774 20218986 20218880 Y NA NA ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 165896 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,LGI3,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 22068132 22068339 22068246 Y NA BMP1,MIR320A,POLR3D NA NA NA NA MIR320A 32217 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 22103553 22103662 22103605 Y NA MIR320A,POLR3D NA NA NA NA POLR3D 2936 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 22306621 22306908 22306765 Y NPM2,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 10289 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 22808149 22808394 22808223 Y NA RHOBTB2 PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 34536 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.29407765101014 chr8 23202733 23203217 23203148 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 77100 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 23353842 23353942 23353892 Y TNFRSF10C,SLC25A37 ENTPD4,SLC25A37 NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A37 30376 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 24013716 24014104 24013764 Y STC1 NA STC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-148P 81045 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 25867714 25867910 25867807 Y EBF2 NA NA NA NA NA PPP2R2A 279097 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 26008929 26009154 26009015 Y NA NA PPP2R2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 137853 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 26429509 26429959 26429867 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 59718 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 26466209 26466513 26466418 Y PPP2R2A,BNIP3L NA NA NA NA NA DPYSL2 96418 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 27730121 27730534 27730322 Y ELP3,PBK PBK NA NA NA NA PBK 36509 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr8 28004860 28005043 28004968 Y NA NA NA NA NA NA ELP3 59670 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 28258528 28258941 28258737 Y HMBOX1,HMBOX1 ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 310 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 28569820 28569970 28569874 Y ZNF395,FZD3,EXTL3 EXTL3-AS1 NA NA NA NA EXTL3-AS1 12839 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 28923074 28923318 28923180 Y NA CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 11622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 29522725 29523096 29522814 Y KIF13B NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 316540 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 29948448 29949236 29948548 Y TMEM66,LEPROTL1 TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA LEPROTL1 1678 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 30506010 30506203 30506101 Y NA GTF2E2 NA NA NA NA GTF2E2 7565 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 33579772 33580017 33579844 Y NA NA NA NA NA NA RP1-273G13.1 135724 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 13.7644659060608 chr8 33718252 33718557 33718395 Y NA RP1-273G13.1 NA NA NA NA RP1-273G13.1 2511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 33747203 33747216 33747209 Y NA RP1-273G13.1 NA NA NA NA RP1-273G13.1 31462 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 35119361 35119644 35119503 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 261637 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.98124888041785 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 38160807 38161004 38160956 Y NA PPAPDC1B NA NA NA NA PPAPDC1B 36046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 40016557 40016909 40016733 Y NA C8orf4 NA NA NA NA C8orf4 7568 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 40032102 40032537 40032342 Y IDO1 C8orf4 NA NA NA NA C8orf4 23113 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 40049035 40049230 40049136 Y NA C8orf4 GOLGA7,C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 40046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 40056491 40056661 40056575 Y C8orf4 C8orf4 GOLGA7,ZMAT4,IDO2 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 47502 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 40273499 40273632 40273622 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 264510 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 41015718 41016076 41015872 Y SFRP1 NA SFRP1 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD65 266098 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 41867551 41867895 41867722 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 39613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 42398083 42398473 42398470 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 3014 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 47885401 47885427 47885415 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP2 181314 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 48343978 48344357 48344119 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 269485 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 224269 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 49701443 49701572 49701502 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 SNAI2 130727 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 49835974 49836286 49836197 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 3675 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 50968903 50969278 50969091 Y NA NA NA NA NA NA C8orf22 1004033 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 50969485 50969741 50969613 Y NA NA NA NA NA NA C8orf22 1004615 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 53188453 53188874 53188470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 378568 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr8 56885324 56886256 56885536 Y LYN NA NA NA NA NA LYN 94952 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 58122348 58122589 58122430 Y NA NA LOC100507632,LOC100507651,LOC286177 IMR90 Hi-C 24141950 IMPAD1 217945 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 58122731 58123025 58122849 Y NA NA LOC100507632,LOC100507651,LOC286177 IMR90 Hi-C 24141950 IMPAD1 218328 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 59491466 59491801 59491581 Y UBXN2B,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 27983 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 60927099 60927362 60927228 Y NA NA NA NA NA NA RP11-163N6.2 499992 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 61657043 61657068 61657053 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 67706 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 62385898 62385985 62385942 Y CLVS1 NA NA NA NA NA ASPH 239170 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 62427686 62427987 62427837 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 197168 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 62534300 62534453 62534449 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 90702 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 62647103 62647241 62647155 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 21948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 66652181 66652518 66652302 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 97212 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 67424340 67424761 67424541 Y C8orf45 NA NA NA NA NA RRS1 85077 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 67454365 67454567 67454497 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 69915 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 70310732 70311124 70310931 Y NA NA C8orf34 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-101P 677143 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1 NA NA NA NA TRAM1 3988 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 74432524 74433240 74432853 Y C8orf84,RDH10 NA NA NA NA NA STAU2 224703 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 77590079 77590470 77590424 Y ZFHX4 NA NA NA NA NA LINC01111 273190 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 80680806 80681178 80681064 Y HEY1 HEY1 NA NA NA NA HEY1 2708 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 80692421 80692589 80692511 Y HEY1 HEY1 NA NA NA NA HEY1 14323 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr8 81034251 81034528 81034390 Y ZBTB10,TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 93727 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 87047480 87047818 87047606 Y NA NA NA NA NA NA WWP1 305149 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 90443511 90443699 90443605 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 324256 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 90942619 90942853 90942786 Y RIPK2,NBN,OSGIN2 OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 30532 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 95943173 95943450 95943312 Y NA CCNE2,TP53INP1 NA NA NA NA TP53INP1 16189 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 96146998 96147210 96147103 Y TP53INP1,PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 2966 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 97870778 97871083 97870857 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 367199 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 97934277 97934647 97934426 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 430698 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 99485745 99486120 99486088 Y NA NA NA NA NA NA POP1 358220 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 101338082 101338542 101338349 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A RNF19A,KB-1991G8.1 SPAG1,ANKRD46,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19A 7904 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 101427912 101428321 101428112 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 57582 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr8 101476271 101476730 101476459 Y YWHAZ,SPAG1,RNF19A,RNF19A KB-1615E4.2 SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 KB-1615E4.2 9173 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 14749 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 21757 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 102038562 102039020 102038731 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 74946 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 102167683 102167913 102167765 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48508 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 103549220 103549421 103549330 Y NA NA UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 116709 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 104331705 104332089 104331783 Y RIMS2 FZD6,RP11-318M2.2 NA NA NA NA RP11-318M2.2 22705 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 104406173 104406574 104406390 Y NA DCAF13,SLC25A32 NA NA NA NA DCAF13 18368 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 306720 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 106878097 106878155 106878126 Y NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 192597 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 110324960 110325029 110324995 Y NA ENY2,NUDCD1 NA NA NA NA ENY2 19524 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 110602225 110602239 110602235 Y SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1 NA NA NA NA NA EBAG9 52285 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 114266349 114266595 114266472 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 120303 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 116439816 116440252 116439936 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 379647 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 116454411 116454736 116454628 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 365163 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 119345117 119345386 119345219 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 223025 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 119761036 119761418 119761238 Y TNFRSF11B RPS26P35 COLEC10 IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P35 11022 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 120232000 120232286 120232044 Y NA NA NA NA NA NA MAL2 56727 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 121822442 121823157 121823030 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 356 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 124169504 124169661 124169520 Y NA FAM83A NA NA NA NA FAM83A 19539 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 124363606 124363931 124363783 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2 62659 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 124649068 124649399 124649254 Y NA NA NA NA NA NA FBXO32 97622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 124665857 124666229 124666132 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 112467 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 125466570 125466668 125466619 Y NA TRMT12,RNF139-AS1,RNF139 NA NA NA NA TRMT12 5522 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 125984707 125984742 125984718 Y ZNF572 ZNF572,SQLE NA NA NA NA ZNF572 1167 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 126232781 126233016 126232896 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 130699 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr8 126322031 126322772 126322054 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 117791 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 127927068 127927434 127927240 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 301899 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128048074 128048382 128048201 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 180951 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA CCAT1 158704 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 129791 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr8 128167127 128167527 128167484 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 61806 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 128171088 128171312 128171255 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 58021 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr8 128176067 128176333 128176204 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 53000 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 128180134 128180587 128180334 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 48746 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 128185119 128185731 128185383 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 43602 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128227053 128227754 128227491 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 1579 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128231853 128232218 128232163 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 2520 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chr8 128237300 128237732 128237515 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 7967 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 128239593 128240207 128240123 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 10260 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.04276256864097 chr8 128258299 128258698 128258657 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 28966 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr8 128260594 128261000 128260832 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 31261 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 128277603 128277799 128277701 Y MYC CCAT1 LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 48270 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128306934 128307283 128307196 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 77601 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 128308850 128309232 128309041 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 79517 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 128311782 128311908 128311845 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 82449 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128313576 128313848 128313696 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 84243 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128352367 128352670 128352528 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 123034 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128680816 128681380 128681307 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 64300 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128772812 128773062 128772941 Y NA MYC,PVT1 NA NA NA NA MYC 27132 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128811691 128811973 128811933 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 6912 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 128911546 128911899 128911640 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 106767 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128948050 128948240 128948055 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 72617 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 128961875 128962320 128962073 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 58537 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 129047466 129047656 129047576 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26609 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 129121216 129121486 129121350 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100359 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 129129719 129130040 129129840 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 108862 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 129162104 129162535 129162406 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 141247 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 129336748 129337038 129336807 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 315891 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 130897837 130898360 130898140 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 129015 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 130996080 130996422 130996182 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30953 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr8 131291188 131291588 131291505 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 162318 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 134453521 134453599 134453592 Y SLA NA NA NA NA NA CTC-458A3.1 117281 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr8 139799567 139799714 139799659 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 1666964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 140716297 140716707 140716660 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 749971 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 140843827 140843872 140843850 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 622806 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 141475903 141476104 141476028 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 9225 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr8 141707505 141707982 141707957 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 188108 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 141804565 141804680 141804623 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 205635 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 142182442 142182863 142182588 Y NA NA NA NA NA NA DENND3 57065 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 144072877 144073072 144072963 Y LYPD2,C8orf31 LY6E,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 24327 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 144094701 144094997 144094860 Y LY6K,C8orf55 LY6E,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 2402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr8 144799188 144799437 144799334 Y MAPK15 ZNF707,FAM83H NA NA NA NA FAM83H 14534 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 144820199 144820570 144820386 Y RHPN1,C8orf73,FAM83H FAM83H NA NA NA NA FAM83H 6228 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 144948428 144948782 144948624 Y EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 NRBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EPPK1 1850 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr8 144950990 144951185 144951055 Y C8orf73,NAPRT1,FAM83H,EXOSC4,CYC1,SCRIB,PUF60,PUF60,EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 NRBP2,PLEC,LOC100128338,FAM83H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPPK1 358 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr8 145087499 145087624 145087611 Y PLEC,GRINA,SPATC1 PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1 NA NA NA NA PARP10 2559 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 145911932 145912089 145912059 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 2738 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 211500 211823 211657 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 256468 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr9 277612 278164 277810 Y DOCK8 NA NA NA NA NA KANK1 190127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 708443 708758 708711 Y KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 240152 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 758228 758480 758338 Y KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 289937 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 2018040 2018611 2018274 Y SMARCA2 SMARCA2 NA NA NA NA SMARCA2 4698 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 2494677 2494706 2494692 Y VLDLR NA KIAA0020 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 125128 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 2663518 2663568 2663543 Y NA VLDLR,RP11-125B21.2 NA NA NA NA RP11-125B21.2 24123 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 4042913 4043209 4043135 Y NA NA NA NA NA NA SLC1A1 445235 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 4855592 4855625 4855609 Y NA MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 7301 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 5587158 5587341 5587267 Y C9orf46,CD274,KIAA1432 KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 39684 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 5895206 5895407 5895334 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 64089 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 6488249 6488567 6488283 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 77098 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.14703882550507 chr9 6926338 6926600 6926461 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 207475 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 11018357 11018684 11018521 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 1793660 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 1746982 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 37.4351762142109 chr9 14271164 14271559 14271500 Y NA NA NA NA NA NA NFIB 125423 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 14316018 14316353 14316263 Y NFIB NA NA NA NA NA NFIB 80629 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.02401144905882 chr9 15936680 15936904 15936792 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P12 410999 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 208360 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 18437501 18437903 18437771 Y NA ADAMTSL1 FAM154A,ADAMTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTSL1 33989 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 18474958 18475225 18475032 Y ADAMTSL1 ADAMTSL1 NA NA NA NA ADAMTSL1 3066 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 18768460 18768476 18768467 Y ADAMTSL1 NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 256414 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 IFNB1 MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 IFNB1 20451 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr9 21576231 21576644 21576439 Y NA MIR31HG MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 18563 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 22026827 22027085 22026888 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 16673 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 27333351 27333416 27333383 Y IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA MOB3B 194363 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 27365157 27365383 27365271 Y MOBKL2B NA NA NA NA NA MOB3B 162396 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 27416206 27416570 27416389 Y NA NA NA NA NA NA MOB3B 111209 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 27564116 27564302 27564198 Y C9orf72,C9orf72 MOB3B,C9orf72 NA NA NA NA C9orf72 7562 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 28813062 28813251 28813159 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 1241198 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr9 32437038 32437275 32437091 Y NA NA NA NA NA NA ACO1 54420 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 32524178 32524624 32524592 Y DDX58 TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 33160944 33161390 33161236 Y DNAJA1,SMU1,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 3964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr9 33162668 33163130 33162954 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 2224 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr9 33164497 33164994 33164772 Y APTX,APTX,APTX,SMU1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 360 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chr9 33233885 33234477 33234128 Y NA BAG1,CHMP5 NA NA NA NA BAG1 28284 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 34016159 34016420 34016379 Y NA UBAP2 NA NA NA NA UBAP2 30527 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 34352304 34352500 34352353 Y NA SERPINH1P1,KIF24,NUDT2,KIAA1161 NA NA NA NA KIAA1161 22351 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA NA NA NA NA NA TESK1 82515 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 35769980 35770349 35770169 Y NA CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,TMEM8B,HINT2 NA NA NA NA GBA2 21997 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 35914292 35914707 35914657 Y NA NDUFA5P4,HRCT1 NA NA NA NA HRCT1 10103 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chr9 35924004 35924206 35924105 Y NA HRCT1,YBX1P10 NA NA NA NA HRCT1 19815 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 36621370 36621719 36621545 Y NA NA NA NA NA NA MELK 50511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 36764220 36764685 36764538 Y NA NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 193361 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 36765862 36766252 36766147 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 195003 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 37035783 37036025 37035954 Y ZCCHC7,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 82511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 37198449 37198887 37198604 Y ZBTB5,ZCCHC7 NA NA NA NA NA ZCCHC7 79913 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 37938183 37938323 37938277 Y SHB NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 128361 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 68377347 68377469 68377407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 75906 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 71476577 71476832 71476704 Y NA NA NA NA NA NA FAM122A 83613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 72591131 72591428 72591305 Y NA NA MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,SMC5,TRPM3,TJP2 IMR90 Hi-C 24141950 PTAR1 218256 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 72781786 72782158 72781853 Y NA NA NA NA NA NA SMC5 89779 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 72805213 72805492 72805447 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 66445 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 73021440 73021667 73021582 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5873 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 3.4411164765152 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 73215942 73217043 73216172 Y KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 188402 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr9 73219456 73219798 73219627 Y TRPM3,KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 191916 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr9 76299237 76299618 76299309 Y NA NA NA NA NA NA ANXA1 534564 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 77588894 77589149 77589022 Y NA RP11-197P3.1,C9orf40 NA NA NA NA C9orf40 23092 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 77927689 77927701 77927695 Y NA NA NA NA NA NA OSTF1 226230 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 81131124 81131152 81131138 Y CEP78 NA NA NA NA NA PSAT1 221065 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 87320052 87320082 87320067 Y NA NA NA NA NA NA RMI1 726426 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 88329158 88329382 88329166 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 25562 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 88358353 88358730 88358394 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 3409 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 88588670 88588806 88588674 Y NA NAA35 NA NA NA NA NAA35 34609 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 91147328 91147523 91147436 Y NXNL2 NA NA NA NA NA SPIN1 145994 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 93880356 93880696 93880620 Y NA NA LOC100129316,AUH,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 241499 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 94442528 94442868 94442728 Y NA NA SYK,AUH,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-2,MIR3910-1,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 NFIL3 258384 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 94587450 94587551 94587492 Y NA NA NA NA NA NA ROR2 122893 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 95055002 95055331 95055316 Y IPPK IARS,CENPP,NOL8 NA NA NA NA IARS 964 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 95383874 95384172 95384023 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 46375 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 95882095 95882646 95882428 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 11924 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 96335202 96335517 96335360 Y NA PHF2 NA NA NA NA PHF2 1172 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr9 97411409 97411895 97411585 Y ZNF169,HIATL1,FBP1,C9orf3 NA FBP1,FANCC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf3 75088 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 97881296 97881429 97881363 Y FBP1 NA NA NA NA NA FANCC 196562 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 97906311 97906710 97906505 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 171281 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 98054647 98055067 98054952 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 22924 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 98173547 98173783 98173614 Y NA RP11-435O5.2 NA NA NA NA RP11-435O5.2 13295 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr9 98768233 98768612 98768423 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 131974 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 99132173 99132333 99132255 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367 NA NA NA NA SLC35D2 11659 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 100454693 100454853 100454773 Y TSTD2,XPA XPA NA NA NA NA XPA 2786 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 100455337 100455352 100455343 Y NA XPA NA NA NA NA XPA 2287 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 100696898 100697242 100697085 Y NA C9orf156,ANP32B NA NA NA NA C9orf156 14046 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 100747732 100748046 100747912 Y NA ANP32B NA NA NA NA ANP32B 4089 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 101011075 101011589 101011252 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 4326 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 101554135 101554384 101554323 Y NA ANKS6 NA NA NA NA ANKS6 2863 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 101871896 101872113 101872024 Y TGFBR1 TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 7576 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 101973951 101974336 101974174 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA ALG2 7902 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 102007294 102007527 102007424 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 102277502 102277650 102277581 Y TGFBR1,NR4A3 NA SEC61B,ALG2 IMR90 Hi-C 24141950 SEC61B 295156 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 102585833 102586368 102586147 Y ERP44,NR4A3 RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA NR4A3 3696 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 104248590 104248780 104248669 Y C9orf125 RNF20 NA NA NA NA RNF20 45353 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 104805727 104805738 104805734 Y NA NA NA NA NA NA RNF20 511594 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 NIPSNAP3A 222541 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 107814689 107815137 107814792 Y NA NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 189766 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 110266981 110267369 110267173 Y NA KLF4,RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 16218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 110310627 110311050 110310826 Y KLF4 RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 15956 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 110500244 110500586 110500377 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-438P9.1 205573 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr9 111386829 111386933 111386883 Y NA RP11-220D10.1 KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 180 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 112091755 112092133 112091802 Y PTPN3 EPB41L4B EPB41L4B MCF7 ChIA-PET 22265404 EPB41L4B 10511 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 112791583 112792117 112791820 Y NA RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 5945 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 113014576 113014999 113014920 Y AKAP2,TXN TXN NA NA NA NA TXN 1921 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 113507067 113507395 113507232 Y NA NA NA NA NA NA MUSK 78016 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 115258728 115258879 115258816 Y SNX30,SUSD1,ROD1 KIAA1958,C9orf147 NA NA NA NA C9orf147 11244 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 115657106 115657497 115657253 Y SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2 NA NA NA NA NA SNX30 145988 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 116036635 116036980 116036798 Y SLC31A2,FKBP15,RGS3 PRPF4,CDC26 NA NA NA NA CDC26 766 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 116281787 116282895 116282664 Y NA NA NA NA NA NA POLE3 110835 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 117249092 117249487 117249472 Y NA DFNB31 NA NA NA NA DFNB31 16243 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 1012368 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 118706424 118707025 118706637 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 740556 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 118917854 118918405 118917899 Y PAPPA NA NA NA NA NA TRIM32 529176 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 119055041 119055304 119055148 Y PAPPA NA NA NA NA NA TRIM32 392277 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 119311432 119311888 119311785 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 135693 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 122984020 122984078 122984028 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 356370 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 123283577 123283819 123283724 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 56629 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 123446824 123446976 123446902 Y TRAF1,TRAF1 MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 27772 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 124134922 124135274 124134953 Y NA STOM GSN MCF7 ChIA-PET 22265404 STOM 4391 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 124161523 124161647 124161545 Y NA STOM GSN,RAB14,GGTA1P,CNTRL,STOM IMR90 Hi-C 24141950 STOM 30992 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA NA NA NA NA NA STOM 231066 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 124498744 124498978 124498839 Y GSN NA NA NA NA NA TTLL11 354907 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 124499221 124499709 124499392 Y NA NA NA NA NA NA TTLL11 354176 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 8.65492931972006 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 126119304 126119701 126119598 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 90449 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 126237774 126237937 126237796 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 208919 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 126597388 126597650 126597587 Y DENND1A NA NA NA NA NA DENND1A 92781 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 126632279 126632299 126632291 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 58132 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 127457265 127457441 127457351 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 38519 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 127468042 127468336 127468195 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 49296 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 127621077 127621225 127621167 Y NA RPL35,ARPC5L,RNU4-82P NA NA NA NA RPL35 1035 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 128415171 128415347 128415267 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 52166 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 128927254 128927412 128927327 Y NA NA MAPKAP1,FAM125B IMR90 Hi-C 24141950 PBX3 419630 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 129525777 129525955 129525866 Y FAM125B ZBTB43 LMX1B,FAM125B IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB43 39330 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 130308766 130308904 130308855 Y NA FAM129B NA NA NA NA FAM129B 30364 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 130336494 130336746 130336628 Y TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2522 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 130834970 130835273 130835056 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25 SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 6485 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 131637939 131638335 131638137 Y NA C9orf114,LRRC8A,CCBL1,PHYHD1 C9orf114,ENDOG IMR90 Hi-C 24141950 LRRC8A 4056 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 131929021 131929365 131929193 Y NA IER5L NA NA NA NA IER5L 9175 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 132107111 132107275 132107178 Y C9orf78,C9orf106 C9orf106,RP11-65J3.1 IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,ASB6,METTL11A,PPP2R4 H1ESC,HELA,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,ChIA-PET 22955621,24141950,22265404 RP11-65J3.1 14532 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 132168772 132168919 132168823 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 74811 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.45986759609736 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.72993379804868 chr9 132176730 132177172 132176936 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 66558 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 132244062 132244824 132244277 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 332 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 30379 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 28069 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 132459422 132459648 132459595 Y NA PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 33502 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 132539303 132540203 132539702 Y C9orf106,FNBP1,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 23229 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 30920 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr9 134157961 134158264 134158112 Y NA PPAPDC3 NUP214,FAM78A,PPAPDC3,PRRC2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAPDC3 4817 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 2.18980139414604 chr9 134278219 134278688 134278276 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 10739 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 134553923 134554245 134554041 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 59216 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 134600757 134600889 134600837 Y RAPGEF1,NTNG2 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 12572 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 134608936 134609538 134609242 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3923 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 134882586 134882673 134882600 Y SETX,NTNG2,MED27 NA NA NA NA NA MED27 70622 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 135016724 135016887 135016786 Y NA NA MED27,RAPGEF1,NTNG2,SETX IMR90 Hi-C 24141950 MED27 63429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr9 136019465 136020353 136020023 Y NA RALGDS NA NA NA NA RALGDS 16948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 136720858 136721171 136721081 Y SLC2A6,RXRA NA NA NA NA NA VAV2 134555 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 136738611 136738757 136738701 Y NA NA NA NA NA NA VAV2 116969 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 136739075 136739598 136739373 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 116128 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 137215635 137215833 137215709 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 8691 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 137257724 137257990 137257923 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 50780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 137348030 137348540 137348200 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 141086 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 137367331 137367474 137367390 Y COL5A1 NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 RXRA 160387 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr9 139120043 139120348 139120196 Y NOTCH1 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 15339 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 139462526 139462651 139462613 Y C9orf69 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-611D20.2 23862 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 139613892 139613944 139613895 Y NA AGPAT2,SNHG7 NA NA NA NA SNHG7 6692 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5,C8G NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 24.9220253905192 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.35559133923326 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.834210054912777 chr9 140306093 140306345 140306289 Y NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 9369 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chr9 140463644 140464019 140463889 Y FAM166A,C9orf173 MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA ZMYND19 18923 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 1367285 1367756 1367429 Y P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA CSF2RA NA NA NA NA CSF2RA 17937 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 1480354 1481325 1480771 Y NA SLC25A6 NA NA NA NA SLC25A6 28292 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 1524384 1524716 1524554 Y CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL SLC25A6,ASMTL NA NA NA NA SLC25A6 14767 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 1600679 1600951 1600851 Y CSF2RA,CSF2RA,IL3RA,SLC25A6,ASMTL,ASMTL,ASMT,AKAP17A,P2RY8 ASMTL NA NA NA NA ASMTL 30024 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chrX 3629342 3629771 3629444 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 7896783 7897141 7896963 Y VCX PNPLA4 NA NA NA NA PNPLA4 3003 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 10547215 10547494 10547354 Y NA NA NA NA NA NA MID1 302279 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 11061735 11061767 11061751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120D5.1 65494 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 11455735 11455931 11455831 Y NA NA NA NA NA NA MSL3 318347 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 11460430 11460509 11460495 Y AMELX NA NA NA NA NA MSL3 313769 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 12390298 12390694 12390463 Y NA NA NA NA NA NA PRPS2 416780 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 13208985 13209208 13209149 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 GS1-600G8.5 110363 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 15787454 15787695 15787561 Y NA ZRSR2 NA NA NA NA ZRSR2 18900 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 18445170 18445478 18445437 Y NA CDKL5 NA NA NA NA CDKL5 3467 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chrX 20154251 20154286 20154269 Y NA EIF1AX NA NA NA NA EIF1AX 3676 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 20283183 20283718 20283506 Y SH3KBP1,RPS6KA3 NA NA NA NA NA RPS6KA3 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 20628422 20628647 20628433 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 344899 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 23368174 23368523 23368350 Y NA NA NA NA NA NA PRDX4 311856 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 23806806 23807042 23806932 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1 ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 7516 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 30679380 30679764 30679404 Y NA FTLP2,GK NA NA NA NA GK 9904 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 32470299 32470689 32470522 Y NA NA NA NA NA NA TBCAP1 586823 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 38130522 38130869 38130628 Y CYBB,RPGR NA NA NA NA NA RPGR 53948 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 38922224 38922690 38922464 Y MID1IP1 NA NA NA NA NA MID1IP1 263539 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 39619041 39619197 39619186 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 26193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chrX 39767458 39767957 39767519 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 122068 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 39871700 39871985 39871950 Y BCOR,BCOR NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 162597 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chrX 39964938 39965503 39965246 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 69079 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 40012729 40012965 40012840 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 21617 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 40692126 40692324 40692241 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 72913 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 40749971 40750359 40750172 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 RP11-77G22.2 USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 14878 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 40869399 40869667 40869505 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73221 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 41301456 41301878 41301579 Y NA NA DDX3X K562 ChIA-PET 22265404 DDX3X 110805 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 44774748 44775132 44774822 Y NA KDM6A NA NA NA NA KDM6A 43991 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 44877456 44877597 44877527 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 146699 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 45989834 45990282 45989950 Y NA NA NA NA NA NA PCNAP3 72871 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 46697676 46697837 46697692 Y ZNF674,CHST7,CDK16,RP2 RP2 CXorf31 IMR90 Hi-C 24141950 RP2 3301 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 46724768 46724961 46724901 Y NA RP2 NA NA NA NA RP2 30393 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA NUS1P1,ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chrX 47701110 47701161 47701136 Y NA ZNF81 NA NA NA NA ZNF81 6809 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 48748801 48749222 48749175 Y NA PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2 NA NA NA NA PQBP1 3973 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 48777238 48777933 48777700 Y TBC1D25,WAS,PQBP1,PPP1R3F,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1 PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5 NA NA NA NA PIM2 2937 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 48794892 48795256 48795094 Y TBC1D25,WAS,PQBP1,WDR45,TFE3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1 PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5 NA NA NA NA OTUD5 18392 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 49011448 49011844 49011738 Y GATA1,HDAC6,MAGIX GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 14429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.417105027456388 chrX 49139256 49139619 49139438 Y FOXP3,PPP1R3F CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 14950 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.625657541184583 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.25131508236917 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 57421884 57422193 57422039 Y FAAH2 NA NA NA NA NA FAAH2 110745 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 57490949 57491197 57490977 Y NA NA NA NA NA NA ZXDB 125072 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 62728532 62728688 62728610 Y NA NA NA NA NA NA RP11-357C3.3 50263 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 64816232 64816499 64816342 Y NA MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 9975 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA DLG3 NA NA NA NA DLG3 8763 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.938486311776874 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NA NA NA NA NA MED12 65447 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA RPS4X 140764 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 71768805 71768968 71768887 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 21985 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 73228588 73229157 73228689 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 66429 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chrX 73272054 73272428 73272273 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 109895 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 73791399 73791714 73791557 Y RLIM RLIM NA NA NA NA RLIM 40738 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 79827525 79827860 79827693 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 235327 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 79965324 79965547 79965436 Y BRWD3 NA NA NA NA NA BRWD3 97640 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 96737764 96737861 96737813 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN6 3155127 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 103382264 103382489 103382378 Y NA FAM199X NA NA NA NA FAM199X 26812 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 106693156 106693529 106693316 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 176208 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.77269636668965 chrX 107313303 107313469 107313386 Y NA PSMD10,ATG4A NA NA NA NA PSMD10 19379 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 109429267 109429621 109429491 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA TMEM164 185408 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 110863259 110863845 110863518 Y NA EIF4BP7,ALG13 NA NA NA NA EIF4BP7 542 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 114849502 114849636 114849587 Y NA NA NA NA NA NA PLS3 56001 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 115239457 115239782 115239623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 156035 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 119385485 119385791 119385733 Y NA NKAPP1,ZBTB33 NA NA NA NA ZBTB33 2878 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 119619289 119619732 119619620 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18069 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.208552513728194 chrX 119619980 119620335 119620161 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18760 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 1.56414385296146 chrX 129307329 129307713 129307433 Y NA AIFM1 NA NA NA NA AIFM1 9468 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 134718222 134718415 134718313 Y NA NA NA NA NA NA ZNF449 241501 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 135917972 135918329 135918167 Y NA RBMX NA NA NA NA RBMX 42594 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 148595188 148595518 148595383 Y IDS,CXorf40A IDS,CXorf40A,LINC00893 NA NA NA NA IDS 17952 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 149084401 149084780 149084588 Y NA LINC00894,CXorf40B NA NA NA NA LINC00894 20066 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 5996 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chrX 149535049 149535581 149535391 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 7360 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.312828770592291 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.521381284320486 chrX 153771070 153771275 153771201 Y IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG FAM3A,IKBKG,G6PD NA NA NA NA G6PD 2512 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097 chrX 153956289 153956510 153956418 Y TKTL1,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,GAB3 DKC1 NA NA NA NA DKC1 32521 CAGE D98-AH2 hg19 FANTOM5 0.104276256864097