chr1 993498 993878 993664 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223 NA NA NA NA RP11-465B22.3 384 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 NA NA NA NA RNF223 2701 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 1014834 1015095 1014859 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 RNF223 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNF223 7147 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 1070745 1071151 1070944 Y NA C1orf159 NA NA NA NA C1orf159 21004 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 1093610 1093958 1093954 Y ATAD3C,TMEM88B C1orf159,TNFRSF18 NA NA NA NA C1orf159 43869 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 1124600 1124942 1124659 Y HES4 TNFRSF18,SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA TNFRSF18 15129 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 1343359 1343768 1343546 Y NA AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,ANKRD65,VWA1,ATAD3C NA NA NA NA MRPL20 2666 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 2082729 2083012 2082899 Y TNFRSF14,SKI,PANK4,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1 NA NA NA NA NA C1orf86 59147 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 2171824 2171946 2171897 Y NADK,TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 29665 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 2232428 2232896 2232683 Y SKI,TNFRSF14 NA NA NA NA NA MORN1 88250 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,HES5,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr1 2509702 2510198 2509855 Y SKI,TNFRSF14 TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA FAM213B 5732 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 3309990 3310261 3310127 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 58729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 3373716 3374006 3373818 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 4726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 3398864 3399114 3399029 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 29874 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 5172646 5173061 5172846 Y NA NA NA NA NA NA KCNAB2 876465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 5184476 5184496 5184487 Y NA NA NA NA NA NA KCNAB2 865030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 6053603 6054107 6053839 Y CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 3070 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 6336471 6336830 6336716 Y ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7 ICMT,GPR153 GPR153 K562 ChIA-PET 22265404 GPR153 17436 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 6451759 6451831 6451795 Y NA ACOT7,HES2 NA NA NA NA ACOT7 620 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 6566323 6566594 6566485 Y NA PLEKHG5,NOL9 NA NA NA NA PLEKHG5 11527 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 6894689 6894717 6894703 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 51305 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 7538871 7539273 7539100 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-8P 261451 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 7540504 7540548 7540528 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-8P 263084 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 7558449 7558725 7558667 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 270604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 52933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 8143203 8143348 8143235 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 58835 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 8156648 8157003 8156918 Y VAMP3 NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 72280 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 8215795 8215905 8215839 Y NA RNU1-7P ERRFI1,SLC45A1,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-7P 48752 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 8229904 8230047 8229996 Y NA RNU1-7P ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-7P 34610 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 8230370 8230423 8230397 Y ERRFI1 RNU1-7P ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-7P 34234 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 8254637 8254907 8254798 Y NA RNU1-7P ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-7P 9750 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 8571636 8571856 8571737 Y SLC45A1,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 195750 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 8981771 8982005 8981888 Y NA ENO1-IT1,ENO1,CA6 ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5 IMR90 Hi-C 24141950 CA6 21921 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 8999811 9000211 8999889 Y NA CA6 SLC2A5,SLC2A7 IMR90 Hi-C 24141950 CA6 3715 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 9271499 9271772 9271635 Y NA RP3-510D11.2,H6PD SLC25A33,SLC2A7,PIK3CD,SLC2A5,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1 IMR90 Hi-C 24141950 H6PD 21062 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 9960528 9960713 9960585 Y NA CTNNBIP1,LZIC,NMNAT1 NA NA NA NA CTNNBIP1 7681 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 10359215 10359483 10359349 Y NA NA NA NA NA NA KIF1B 90352 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 10496880 10497075 10496978 Y KIF1B PGD,APITD1,APITD1-CORT,PEX14,DFFA NA NA NA NA APITD1,APITD1-CORT 8721 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 10745709 10746041 10745880 Y NA NA NA NA NA NA CASZ1 108666 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr1 11376903 11377179 11377126 Y NA UBIAD1 NA NA NA NA UBIAD1 45640 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 11791882 11792060 11791938 Y NA MAD2L2,AGTRAP AGTRAP IMR90 Hi-C 24141950 AGTRAP 2081 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 11841016 11841080 11841048 Y NA AGTRAP,CLCN6 NA NA NA NA CLCN6 23127 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 11942925 11943217 11943160 Y NPPB,MFN2 NPPA,NPPB,RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1 CLCN6,MTHFR,NPPB,NPPA,MFN2,PLOD1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU5E-1 22992 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 12050736 12051137 12050880 Y NPPA,NPPB,MFN2 MFN2,MIIP NA NA NA NA MFN2 12498 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 12518050 12518251 12518128 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 157486 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 12675687 12675874 12675779 Y VPS13D NA NA NA NA NA DHRS3 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 14638404 14638703 14638561 Y NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 KAZN 284497 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 14765058 14765382 14765172 Y NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 KAZN 157818 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 15415174 15415506 15415314 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 61522 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 15416988 15417263 15417153 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 59765 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 10.9281028149405 chr1 15786440 15786713 15786642 Y PLEKHM2,CTRC,CELA2A,CELA2B NA NA NA NA NA EFHD2 52049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 SLC25A34 NA NA NA NA SLC25A34 26289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 16291784 16292062 16291897 Y CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 8565 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 16553276 16553594 16553536 Y NA RSG1 NA NA NA NA RSG1 8063 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 16670445 16670837 16670642 Y SPEN,C1orf64,FBXO42 FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 6112 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr1 17027024 17027386 17027173 Y NA EIF1AXP1 NA NA NA NA EIF1AXP1 16474 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 17746173 17746585 17746297 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 17635 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 17796675 17796982 17796736 Y NA RCC2 RCC2,ARHGEF10L IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 32455 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 19324821 19325090 19324988 Y TAS1R2,IFFO2 IFFO2 ALDH4A1,IFFO2,UBR4 IMR90 Hi-C 24141950 IFFO2 43641 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 19703880 19704261 19704067 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 67060 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 19778785 19779174 19779108 Y NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1 CAPZB NA NA NA NA CAPZB 30892 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 20091332 20091506 20091448 Y PLA2G2A,TMCO4 TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 32932 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 20111066 20111358 20111348 Y NA TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 13080 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 20780827 20780970 20780908 Y PLA2G2A CAMK2N1 OTUD3,LOC339505 IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2N1 29743 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 21284001 21284025 21284019 Y NA NA NA NA NA NA RP11-487E1.2 114221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 21649091 21649481 21649332 Y EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 20516 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 21655798 21656254 21656078 Y NA ECE1 NA NA NA NA ECE1 13743 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 21965161 21965473 21965377 Y RAP1GAP RAP1GAP NA NA NA NA RAP1GAP 28328 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 22002610 22002786 22002701 Y NA RAP1GAP RAP1GAP K562 ChIA-PET 22265404 RAP1GAP 8809 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 22260274 22260656 22260512 Y HSPG2 HSPG2 NA NA NA NA HSPG2 1134 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 22503965 22504133 22504049 Y NA WNT4 ZBTB40,C1QC,C1QA,WNT4,EPHA8,C1QB,EPHB2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT4 35503 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 22829217 22829453 22829426 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB40 52873 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 22836447 22836690 22836500 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB40 60103 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 23387479 23387794 23387637 Y ZNF436 KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 43538 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 23849183 23849405 23849280 Y PNRC2,RPL11 ASAP3,E2F2,ID3 NA NA NA NA E2F2 6307 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 23916433 23916712 23916573 Y ZNF436 ID3 E2F2,ID3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 32148 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 23916918 23917225 23917105 Y HNRNPR ID3 E2F2,ID3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 32633 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 23918101 23918449 23918188 Y SRSF10,CNR2,E2F2 ID3 E2F2,ID3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 33816 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 24521560 24521927 24521780 Y PNRC2,GRHL3 NA IL22RA1,IL28RA IMR90 Hi-C 24141950 RP11-4M23.7 188551 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 24722613 24722643 24722628 Y NA NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 17641 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 24736156 24736250 24736199 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 4034 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 24856559 24856784 24856672 Y NA RCAN3 C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 RCAN3 29172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 25051079 25051208 25051162 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 18640 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 25425738 25426059 25426056 Y NA NA RUNX3,IL22RA1,CLIC4,SRRM1,SYF2 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 130934 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 26249033 26249281 26249192 Y EXTL1,STMN1,STMN1,STMN1 MIR3917,STMN1 STMN1,PAFAH2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STMN1 17551 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 26617206 26617304 26617268 Y SH3BGRL3,RPS6KA1,PIGV,ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 13539 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 26735858 26736255 26735942 Y NA DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA DHDDS 20518 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr1 27154485 27154771 27154729 Y WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18 PIGV,ZDHHC18,SFN NA NA NA NA ZDHHC18 3284 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 27185755 27186143 27185948 Y C1orf172,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 1490 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3,NR0B2 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr1 27289282 27289295 27289289 Y NA C1orf172,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA C1orf172 4385 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 27775351 27775365 27775358 Y GPR3 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39304 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 27848725 27849287 27848935 Y WDTC1,SYTL1,FAM76A WASF2 NA NA NA NA WASF2 34056 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 27854575 27854919 27854692 Y SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39906 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 27926165 27926491 27926331 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 2451 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 27926949 27927449 27927117 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 1493 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 28098635 28098880 28098690 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12 FAM76A,STX12 NA NA NA NA STX12 941 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 29101544 29101853 29101799 Y EPB41 YTHDF2 NA NA NA NA YTHDF2 40411 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 29253461 29253677 29253525 Y EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 41858 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 29370205 29370321 29370263 Y NA NA NA NA NA NA RP4-604A21.1 63085 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 31320336 31320627 31320524 Y NA NA SDC3 K562 ChIA-PET 22265404 SDC3 58981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 31504221 31504603 31504488 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 32235 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 31904621 31905133 31905124 Y NA SERINC2 NA NA NA NA SERINC2 24209 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 31921261 31921410 31921280 Y NA SERINC2 NA NA NA NA SERINC2 40849 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 31943761 31943827 31943813 Y NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 63349 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr1 31944306 31944695 31944578 Y NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 63894 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 31976608 31977048 31976952 Y PUM1 NA LOC284551 IMR90 Hi-C 24141950 TINAGL1 63068 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 33131314 33131452 33131383 Y NA ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA RBBP4 16571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 33405191 33405597 33405376 Y RNF19B TMEM54,RNF19B NA NA NA NA RNF19B 22689 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2 AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 35953903 35954237 35954109 Y SFPQ,EIF2C3 NA NA NA NA NA NCDN 66837 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 36351655 36352020 36351717 Y NA NA NA NA NA NA CLSPN 118087 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 TEKT2,ADPRHL2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 36641160 36641451 36641218 Y NA TRAPPC3,MAP7D1,THRAP3 NA NA NA NA MAP7D1 21980 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 36853020 36853462 36853143 Y NA STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 3523 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 38312444 38312820 38312535 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 10472 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 39593257 39593498 39593378 Y NA MACF1 NA NA NA NA MACF1 48269 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 39791626 39791706 39791638 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 82445 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr1 40628781 40629153 40628997 Y NA RLF NA NA NA NA RLF 3736 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 40848967 40849502 40849291 Y MFSD2A,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 40445 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 40866111 40866454 40866257 Y RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 NA NA NA NA NA SMAP2 57589 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 41622480 41622650 41622563 Y NA NA CTPS,LOC100507178 IMR90 Hi-C 24141950 SCMH1 83176 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 41825927 41826139 41826062 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 333 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 5850 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 42354251 42354647 42354385 Y RIMKLA,HIVEP3 NA NA NA NA NA HIVEP3 144949 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 44419838 44419961 44419903 Y SLC6A9,RNF220,IPO13 ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24 NA NA NA NA IPO13 9227 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 44430681 44431060 44430788 Y NA ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24 NA NA NA NA DPH2 2612 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 44962677 44962982 44962698 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 93811 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 45909846 45909857 45909852 Y NA TESK2 NA NA NA NA TESK2 45015 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 47055088 47055141 47055115 Y NA MKNK1 NA NA NA NA MKNK1 25374 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 47910443 47910471 47910460 Y NA NA NA NA NA NA CMPK1 112974 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 48079368 48079696 48079596 Y NA NA NA NA NA NA CMPK1 281899 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 49995089 49995393 49995241 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 492192 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 50902653 50903020 50902837 Y NA DMRTA2 NA NA NA NA DMRTA2 15481 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 51245588 51245972 51245952 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 177963 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 51703075 51703494 51703244 Y OSBPL9 RNF11 NA NA NA NA RNF11 3132 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 53092647 53093031 53092839 Y NA GPX7 NA NA NA NA GPX7 26603 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 53566298 53566719 53566319 Y NA NA NA NA NA NA CPT2 93382 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 53576083 53576397 53576240 Y NA NA PODN,SCP2 IMR90 Hi-C 24141950 CPT2 83704 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 53702100 53702340 53702220 Y NA CPT2,C1orf123 NA NA NA NA MAGOH 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 54261078 54261111 54261098 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 54276863 54277244 54277063 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 77163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 54358495 54358647 54358571 Y YIPF1 YIPF1 NA NA NA NA YIPF1 4088 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42,LDLRAD1 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 54765179 54765190 54765186 Y NA NA MRPL37,CYB5RL IMR90 Hi-C 24141950 CYB5RL 101470 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 54808081 54808294 54808188 Y NA NA NA NA NA NA SSBP3 68858 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 55431735 55431939 55431831 Y NA TMEM61 TMEM61,HEATR8-TTC4,BSND,PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM61 12526 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 55436992 55437436 55437098 Y NA TMEM61 TMEM61,HEATR8-TTC4,BSND,PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM61 7029 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 55445592 55445683 55445638 Y HEATR8,C1orf177,TMEM61 TMEM61 NA NA NA NA TMEM61 1127 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr1 56991269 56991531 56991390 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 117443 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 56992489 56992799 56992673 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 116175 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 57995135 57995251 57995193 Y NA NA NA NA NA NA C1orf168 711766 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 59280364 59280505 59280397 Y NA JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 31541 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 33050 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA LINC01135 120226 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 59629518 59629774 59629646 Y NA NA LOC100131060,FGGY IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 130536 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 60087129 60087147 60087138 Y CYP2J2 NA NA NA NA NA HOOK1 191311 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 60157078 60157331 60157204 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 121127 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 60216360 60216669 60216553 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 61789 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 61039424 61039611 61039555 Y NA NA NA NA NA NA CYP2J2 648962 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 62307827 62308113 62307970 Y NA NA NA NA NA NA INADL 101678 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 62416847 62417238 62417043 Y INADL,USP1,KANK4 NA NA NA NA NA INADL 210698 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 62726098 62726337 62726314 Y NA NA NA NA NA NA USP1 173631 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 65387772 65388547 65388120 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 41640 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 65510370 65510451 65510413 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 20969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 65701792 65701883 65701838 Y NA DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 10019 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 66724458 66724790 66724562 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 272276 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 66757072 66757442 66757250 Y NA NA NA NA NA NA SGIP1 239624 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 66800202 66800555 66800228 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 196511 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr1 66815726 66816360 66815919 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 180706 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 66817705 66818086 66817818 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 178980 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 67494221 67494361 67494358 Y SLC35D1,MIER1 SLC35D1 NA NA NA NA SLC35D1 23421 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 67883059 67883215 67883204 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 10883 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 68027599 68027762 68027652 Y NA NA GADD45A,GNG12,LOC100289178 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 120982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 8.74248225195244 chr1 68166463 68166766 68166597 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 17719 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 68364057 68364377 68364218 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 66907 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 68488279 68488394 68488337 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 191129 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 14453 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 8.30535813935482 chr1 70034819 70036254 70034877 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 2738 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 70418678 70418852 70418759 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC40 250451 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 71413812 71414188 71413950 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB2 130792 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 72554223 72554508 72554339 Y NA NA NA NA NA NA NEGR1 191909 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 75182913 75182976 75182918 Y NA TYW3,CRYZ NA NA NA NA TYW3 13860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 75683161 75683232 75683197 Y NA NA NA NA NA NA CRYZ 486069 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 75694572 75694736 75694622 Y NA NA NA NA NA NA ACADM 493300 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 75972237 75972619 75972428 Y NA NA NA NA NA NA ACADM 215417 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 77013544 77013818 77013552 Y NA NA NA NA NA NA TPI1P1 149656 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 77236764 77237140 77237135 Y NA NA ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 73290 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 78008083 78008322 78008203 Y NA NA ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 ZZZ3 138782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 78019403 78019530 78019478 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 127574 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NA NA NA NA NA FUBP1 94366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 78386302 78386347 78386324 Y NEXN NA NA NA NA NA FUBP1 56447 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA GIPC2 114120 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.80836523857384 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA GIPC2 772546 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 82026431 82026771 82026601 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 2297935 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 83479623 83479625 83479624 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 845081 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 83530346 83530531 83530439 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 794175 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 84083536 84083914 84083802 Y PRKACB NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 240792 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 84127102 84127325 84127214 Y PRKACB NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 197381 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 84289999 84290187 84290093 Y TTLL7,SAMD13,SAMD13,PRKACB RP11-475O6.1 NA NA NA NA RP11-475O6.1 34519 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 84966686 84966774 84966730 Y NA RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 3474 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 84970111 84970722 84970500 Y NA RPF1 NA NA NA NA GNG5 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 85143846 85143980 85143979 Y SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,LPAR3,SSX2IP,SSX2IP RP11-484D4.3,SSX2IP NA NA NA NA SSX2IP 10506 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 85695505 85695602 85695542 Y NA SYDE2,C1orf52,BCL10 NA NA NA NA C1orf52 27753 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 85836666 85837017 85836916 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 95893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 88081374 88081620 88081497 Y NA NA LOC339524 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 289223 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 88655570 88655742 88655656 Y NA NA NA NA NA NA PKN2 492163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 88907516 88907759 88907638 Y NA NA NA NA NA NA PKN2 240146 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 90137741 90138074 90137909 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 41110 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 90167657 90167773 90167712 Y NA NA NA NA NA NA LRRC8C 71026 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 90321378 90321621 90321467 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 36805 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 91154949 91155305 91155127 Y NA NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 159902 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 91185058 91185169 91185091 Y BARHL2 NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 130038 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 91793812 91793887 91793849 Y NA NA NA NA NA NA CDC7 170521 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 92907492 92907607 92907552 Y NA GFI1 NA NA NA NA GFI1 42826 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 93002551 93002867 93002761 Y RPAP2,GLMN,GFI1 NA NA NA NA NA GFI1 52118 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 93773027 93773315 93773230 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 36130 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 94161111 94161471 94161388 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90 Hi-C 24141950 MIR760 148917 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 94371317 94371601 94371445 Y NA DNTTIP2,GCLM NA NA NA NA GCLM 1365 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 94535371 94535770 94535449 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 162405 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 94626535 94626661 94626598 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 111963 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 94684511 94684818 94684682 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 53806 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 95248599 95248610 95248605 Y NA LINC01057,SLC44A3 ABCD3,F3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 35227 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 95388205 95388608 95388523 Y NA CNN3,RP4-639F20.1 NA NA NA NA CNN3 2226 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 96476779 96477021 96476900 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P11 433465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 97308752 97309076 97308966 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 123531 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 97596064 97596178 97596116 Y PTBP2 NA NA NA NA NA PTBP2 410843 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 97994700 97995088 97995052 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 14169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 98177967 98178251 98178164 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 168710 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 221450 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 100113534 100114036 100113879 Y AGL,PALMD NA NA NA NA NA FRRS1 116151 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 100502622 100502881 100502754 Y NA HIAT1 NA NA NA NA HIAT1 969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 101725356 101725679 101725470 Y SLC30A7,SLC30A7 NA NA NA NA NA DPH5 235712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 106883678 106884013 106883845 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 713254 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 107793275 107793534 107793405 Y NTNG1,NTNG1 NA NA NA NA NA PRMT6 196008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 107891659 107891745 107891700 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 294392 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 108199393 108199592 108199493 Y VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 306174 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 109099158 109099479 109099238 Y NA FAM102B NA NA NA NA FAM102B 1232 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 109189516 109189718 109189617 Y TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,HENMT1 HENMT1,PRPF38B NA NA NA NA HENMT1 12430 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 109933790 109934137 109934039 Y TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1 SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 4436 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 110175406 110175537 110175472 Y NA AMPD2,GSTM4 NA NA NA NA AMPD2 18680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 110438276 110438910 110438607 Y NA NA CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,GNAI3,GSTM4,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 AHCYL1 86398 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 110694968 110695154 110695000 Y KCNA2,SLC6A17 SLC6A17 NA NA NA NA SLC6A17 3860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.68261346376908 chr1 111745467 111745610 111745539 Y CD53,CEPT1,DRAM2,CHI3L2 NA NA NA NA NA DRAM2 64629 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 111996023 111996307 111996190 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 6025 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 112015702 112015900 112015801 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 25704 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 112050044 112050594 112050328 Y C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3 RAP1A NA NA NA NA RAP1A 32246 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 112135698 112135869 112135721 Y C1orf183,DENND2D,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 52858 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 112163412 112163797 112163622 Y C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 80572 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 112437663 112437858 112437845 Y NA NA NA NA NA NA KCND3 91919 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 112438367 112438956 112438733 Y NA NA NA NA NA NA KCND3 90821 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 113394964 113395159 113395070 Y NA RP3-522D1.1,RP11-426L16.8 FAM19A3,PPM1J IMR90 Hi-C 24141950 RP11-426L16.8 3699 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 113468568 113468671 113468620 Y NA SLC16A1-AS1,SLC16A1 NA NA NA NA SLC16A1-AS1 28366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 113734243 113734639 113734494 Y NA RP11-389O22.4 NA NA NA NA RP11-389O22.4 24627 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 115732772 115733197 115732900 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 RP4-666F24.3 92479 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 116191587 116191760 116191750 Y NA VANGL1 NA NA NA NA VANGL1 9013 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 117111804 117112156 117112090 Y TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NA NA NA NA NA ATP1A1OS 152560 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 118185712 118185829 118185771 Y NA FAM46C NA NA NA NA FAM46C 39156 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA RP11-439A17.7 648739 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.80836523857384 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 45407 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 145030583 145030978 145030933 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 43208 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 145092450 145092883 145092733 Y SEC22B,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 1337 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 145435103 145435641 145435221 Y CD160,TXNIP,ANKRD34A TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L NA NA NA NA TXNIP 828 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 146774989 146775112 146775013 Y NA NA NA NA NA NA CHD1L 62698 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 147189197 147189465 147189317 Y NA ACP6 ACP6,LOC100289211 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ACP6 48579 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-122P 195813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 149931955 149932255 149932237 Y NA SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B MTMR11,SF3B4 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR11 25164 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 150600412 150600701 150600561 Y CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 ENSA NA NA NA NA ENSA 324 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 151418157 151418544 151418397 Y NA PSMB4,POGZ NA NA NA NA POGZ 11397 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 151795693 151795913 151795794 Y TCHHL1,RORC,RORC RP11-98D18.9,TDRKH,AL450992.2 NA NA NA NA AL450992.2 16440 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 151913815 151914271 151914054 Y S100A10 THEM4 S100A10,CELF3,THEM4,RORC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33531 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 152140379 152140745 152140485 Y NA NA NA NA NA NA S100A11 121996 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 153488459 153488748 153488622 Y PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14 BX470102.3,S100A6,S100A4 NA NA NA NA BX470102.3 15331 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 BX470102.3,S100A6,S100A4 NA NA NA NA S100A4 20406 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 153549643 153549828 153549736 Y PGLYRP3,S100A7L2 BX470102.3,S100A6,S100A4,S100A1 S100A14,S100A13,S100A16,CHTOP,S100A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S100A4 29031 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 153762591 153763309 153762932 Y NPR1 SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 17761 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 154166147 154166533 154166338 Y NUP210L,TDRD10,CHRNB2,C1orf189 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 1023 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 154392646 154393050 154392862 Y CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 16977 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 154405619 154406249 154405788 Y UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR IL6R NA NA NA NA IL6R 29950 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 154468503 154468634 154468566 Y SHE NA NA NA NA NA UBE2Q1 60870 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 154577703 154577929 154577737 Y NA UBE2Q1,CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 20546 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 154720589 154720696 154720649 Y NA NA NA NA NA NA KCNN3 120060 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,FLAD1,LENEP,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 154986150 154986272 154986211 Y NA FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 13023 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 155433776 155433971 155433878 Y MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1 NA NA NA NA NA ASH1L-AS1 95850 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 155496665 155497012 155496914 Y DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L-AS1 32809 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 155568911 155569221 155569066 Y ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676 IMR90 Hi-C 24141950 ASH1L 38313 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 156629760 156630406 156629967 Y PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2 RP11-284F21.7,NES NA NA NA NA RP11-284F21.7 544 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 157111103 157111381 157111197 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 NA NA NA NA ETV3 4837 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 158779760 158780042 158779908 Y PYHIN1,IFI16,MNDA NA PYHIN1,CD1A IMR90 Hi-C 24141950 DUSP23 968680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 159515755 159515769 159515762 Y NA NA NA NA NA NA DUSP23 232953 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 159892447 159892988 159892803 Y NCSTN,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 534 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 160182240 160182579 160182410 Y NA CASQ1,PEA15,RP11-574F21.2 NA NA NA NA PEA15 9113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 160510042 160510238 160510216 Y DCAF8,SLAMF1,CD48,SLAMF6 NA NA NA NA NA VANGL2 141666 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 160714037 160714549 160714116 Y CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7 NA NA NA NA NA ITLN1 138411 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 160767340 160767450 160767395 Y SLAMF6,CD48,USF1,LY9 NA NA NA NA NA ITLN1 85510 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 161002043 161002401 161002222 Y NA F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA TSTD1 4379 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 161348767 161349231 161349047 Y NDUFS2 C1orf192 NA NA NA NA C1orf192 13103 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA C1orf192 ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf192 33409 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A HSPA6 NA NA NA NA HSPA6 8572 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA HSPA6 90176 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 162539981 162540420 162539994 Y C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 10658 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 162659800 162660152 162659976 Y NA NA NA NA NA NA UAP1 130477 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 162666168 162666338 162666209 Y NA NA NA NA NA NA UAP1 136845 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 163588435 163588629 163588532 Y NA NA NA NA NA NA NUF2 354069 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 164388013 164388288 164388151 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 134533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 164686304 164686686 164686418 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 163483 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 165204752 165205122 165204813 Y RXRG NA NA NA NA NA MGST3 392976 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 165823413 165823808 165823568 Y NA UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 28421 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 167192959 167193266 167193111 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 4893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 167532775 167533094 167532930 Y CREG1 CREG1 CREG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREG1 11771 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 168446219 168446589 168446402 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 197941 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 168961520 168961569 168961544 Y NA NA ATP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1B1 111366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 169229816 169229911 169229864 Y NA NA NA NA NA NA NME7 105294 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 169443033 169443373 169443298 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 9868 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 170794960 170795269 170795115 Y FMO3 NA KIFAP3,METTL11B IMR90 Hi-C 24141950 GORAB 295690 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 174122877 174123205 174123041 Y NA RABGAP1L NA NA NA NA RABGAP1L 3343 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 174220636 174220943 174220783 Y RABGAP1L NA NA NA NA NA RABGAP1L 94088 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 175290630 175291019 175291015 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 130495 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr1 175310296 175310302 175310299 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 150161 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 175547578 175547933 175547832 Y NA NA NA NA NA NA TNR 162973 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 175571336 175571362 175571351 Y NA NA NA NA NA NA TNR 139544 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr1 176501841 176501939 176501877 Y PAPPA2 NA NA NA NA NA RP11-195C7.1 327057 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 177903071 177903284 177903119 Y NA NA NA NA NA NA RP11-568K15.1 101801 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 179290775 179290979 179290800 Y NA SOAT1 NA NA NA NA SOAT1 29850 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 181110732 181111003 181110864 Y STX6,MR1,IER5 NA STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 55094 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 181841665 181841910 181841788 Y NA NA NA NA NA NA GLUL 517431 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 182363463 182363693 182363584 Y RNASEL,NPL,GLUL,GLUL GLUL NA NA NA NA GLUL 4122 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 183133608 183133779 183133664 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 19594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 183846576 183846867 183846649 Y NMNAT2,RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 171944 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 184129300 184129941 184129508 Y NA NA C1orf21 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 110489 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 184161714 184161954 184161834 Y NA NA C1orf21 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 142903 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 184773428 184773803 184773695 Y SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3 NA NA NA NA NA EDEM3 51381 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 185344563 185345243 185344914 Y FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 60102 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 185389788 185390210 185390053 Y FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP NA NA NA NA NA IVNS1ABP 105327 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 185453251 185453699 185453469 Y RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP NA NA NA NA NA IVNS1ABP 168790 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 185536131 185536449 185536350 Y NA NA IVNS1ABP,SWT1,MIR548F1,HMCN1 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 251670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 185796352 185796554 185796468 Y HMCN1 NA NA NA NA NA IVNS1ABP 511891 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 186818021 186818219 186818132 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA PTGS2 170462 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 190286298 190286417 190286358 Y FAM5C NA NA NA NA NA MIR4426 2396896 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 192458942 192459176 192459156 Y RGS2,RGS13,RGS1 NA RGS1,RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 224137 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 193073509 193073815 193073644 Y NA TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 265 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 193180704 193180924 193180776 Y NA B3GALT2 NA NA NA NA B3GALT2 26920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 193536100 193536513 193536317 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT2 382316 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 196317530 196317735 196317633 Y NA NA NA NA NA NA KCNT2 258620 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 197530309 197530378 197530355 Y NA NA NA NA NA NA DENND1B 212448 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 198124316 198124670 198124458 Y C1orf53,NEK7 NEK7 NA NA NA NA NEK7 223 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 200341273 200341515 200341438 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 35669 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 200783735 200784105 200783920 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 77049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NAV1 NA NA NA NA NAV1 28972 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 201717986 201718364 201718179 Y NA NA IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 77905 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 201992149 201992501 201992334 Y NA RNPEP,ELF3 NA NA NA NA ELF3 17076 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 202075010 202075191 202075097 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ARL8A RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL8A 36678 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 203244129 203244381 203244323 Y BTG2 RP11-134P9.3,BTG2 NA NA NA NA RP11-134P9.3 9899 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 203259429 203259985 203259729 Y RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2 RP11-134P9.3,BTG2 NA NA NA NA RP11-134P9.3 5149 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 203289937 203290406 203290261 Y BTG2 RP11-134P9.3,BTG2 NA NA NA NA BTG2 17318 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 RP11-134P9.3,BTG2 NA NA NA NA BTG2 23709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 204049581 204049822 204049645 Y LAX1,PIK3C2B,SOX13 SOX13 NA NA NA NA SOX13 9338 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 204053773 204053963 204053834 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 13530 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 204058173 204058362 204058281 Y SOX13 SOX13 NA NA NA NA SOX13 17930 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 204976101 204976640 204976291 Y LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,KLHDC8A,DSTYK,CNTN2,CDK18,NFASC NA NA NA NA NA RBBP5 112503 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 205253892 205254222 205253971 Y NUAK2 NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 34661 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 205288770 205288915 205288818 Y TMEM81,RBBP5,NUAK2 NA NA NA NA NA NUAK2 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA NA CDK18 61145 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 206736469 206736632 206736474 Y NA RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA RP11-534L20.4 36221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr1 206751685 206751882 206751743 Y IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 32022 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 206879935 206880172 206880039 Y NA MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 23646 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 206966600 206966901 206966735 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,IL10,IL19 NA MAPKAPK2,IL10,IL19 IMR90 Hi-C 24141950 MAPKAPK2 110311 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 207265739 207265906 207265769 Y NA PFKFB2,YOD1 NA NA NA NA YOD1 41414 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 207821800 207821952 207821876 Y CR1L CR1L NA NA NA NA CR1L 5342 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 207921430 207921703 207921565 Y CR1L CD46 CR1L IMR90 Hi-C 24141950 CD46 1699 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 208021631 208021781 208021738 Y CR1,CD46,PLXNA2,CD34 C1orf132 CD34 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf132 18714 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 208357514 208358085 208357775 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 57580 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 208418631 208418859 208418806 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2966 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 208442735 208442900 208442818 Y NA PLXNA2 PLXNA2,CD34 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA2 27070 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 208711842 208712367 208712161 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 296177 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 208946880 208946889 208946885 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P1 492679 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr1 209215272 209215534 209215454 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P1 224034 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 209915892 209916078 209915980 Y NA C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 39826 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 209934463 209934573 209934515 Y LAMB3,G0S2 C1orf74,IRF6 NA NA NA NA C1orf74 21331 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 211423824 211424043 211423934 Y NA RCOR3 NA NA NA NA RCOR3 5676 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 212256975 212257253 212257095 Y DTL,INTS7 RPL21P28 NA NA NA NA RPL21P28 33604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 212447459 212447732 212447595 Y NA PPP2R5A DTL,PPP2R5A,NENF IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5A 9147 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 212458080 212458253 212458113 Y INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A PPP2R5A NA NA NA NA PPP2R5A 1201 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 212650622 212650921 212650683 Y ATF3,ATF3,ATF3 NENF NSL1,ATF3,FAM71A,BATF3,FLVCR1,VASH2,ANGEL2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 46393 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 212661846 212662402 212662104 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 57617 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr1 212769584 212769966 212769788 Y ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3 ATF3 NA NA NA NA ATF3 32908 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 212808477 212808830 212808706 Y RPS6KC1,ATF3,ATF3,ATF3 NA NA NA NA NA BATF3 62497 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 212923712 212923837 212923822 Y NA NSL1,TATDN3 NA NA NA NA NSL1 39287 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 213525317 213525339 213525328 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KC1 302728 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 213545455 213545863 213545754 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KC1 322866 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 214157858 214157941 214157900 Y PROX1 PROX1,PROX1-AS1 PROX1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PROX1-AS1 1032 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 214162828 214163073 214162948 Y PROX1 PROX1,PROX1-AS1 NA NA NA NA PROX1-AS1 3855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr1 214163432 214163790 214163677 Y NA PROX1,PROX1-AS1 NA NA NA NA PROX1-AS1 4459 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 216774004 216774285 216774188 Y ESRRG,ESRRG NA NA NA NA NA GPATCH2 1028139 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 216938634 216938811 216938777 Y NA NA NA NA NA NA GPATCH2 863613 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 218546684 218546887 218546789 Y NA NA NA NA NA NA RRP15 90055 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 218669910 218670282 218669996 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 RRP15 213281 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 218866278 218866341 218866301 Y NA NA TGFB2,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 RRP15 409649 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 219455848 219455941 219455895 Y NA NA NA NA NA NA EPRS 762059 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 219497403 219497406 219497405 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 EPRS 720594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 219497639 219497836 219497817 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 EPRS 720164 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 219632644 219633145 219633054 Y NA NA NA NA NA NA EPRS 584855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 219633560 219633803 219633682 Y NA NA NA NA NA NA EPRS 584197 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1A 122071 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 222828361 222828786 222828451 Y TLR5 MIA3 NA NA NA NA MIA3 38933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 222829045 222829186 222829145 Y NA MIA3 NA NA NA NA MIA3 39617 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 222830626 222830783 222830705 Y TAF1A,MIA3 MIA3 NA NA NA NA MIA3 41198 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 223276523 223276867 223276768 Y NA TLR5 NA NA NA NA TLR5 37757 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.11973757636671 chr1 223925260 223925580 223925340 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 37965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.68261346376908 chr1 224240602 224240763 224240683 Y TP53BP2 NA NVL IMR90 Hi-C 24141950 FBXO28 59026 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 224598124 224598418 224598271 Y WDR26 WDR26 NA NA NA NA WDR26 24317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 224690718 224691054 224690869 Y WDR26 NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 67983 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 224811590 224812043 224811760 Y NA NA NA NA NA NA WDR26 188855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 225654906 225655584 225655524 Y TMEM63A,LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 40279 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 225845408 225845613 225845516 Y ENAH ENAH NA NA NA NA ENAH 6564 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 226084943 226085104 226084975 Y LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 11978 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 226086980 226087330 226087189 Y NA TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 9752 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 226189681 226190319 226189910 Y H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 57233 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 226361229 226361382 226361305 Y NA ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 11049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 226815517 226815910 226815821 Y NA ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 44858 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 226839418 226839818 226839697 Y C1orf95,ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 20950 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 226878935 226879345 226879207 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 18167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 227953974 227954299 227954123 Y IBA57 SNAP47,JMJD4 NA NA NA NA JMJD4 32862 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr1 228917012 228917506 228917078 Y RHOU RHOU RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 48188 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 229074291 229074557 229074548 Y NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 205467 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 229388898 229389111 229388968 Y URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96 RP5-1061H20.4,RAB4A RHOU,NUP133,ABCB10 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 15664 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 229690998 229691240 229691190 Y ABCB10 NUP133,RP4-613A2.1,ABCB10 NUP133 K562 ChIA-PET 22265404 ABCB10 1202 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 229692979 229693368 229693287 Y NUP133,TAF5L,ABCB10 ABCB10 NA NA NA NA ABCB10 537 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA CAPN9 NA NA NA NA CAPN9 8191 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 231036878 231036937 231036909 Y NA C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 33543 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 231113054 231113423 231113208 Y EXOC8,C1orf124,TTC13 TTC13,ARV1 NA NA NA NA ARV1 327 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 231347338 231347496 231347363 Y C1orf124 C1orf131,GNPAT NA NA NA NA C1orf131 27437 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 231513422 231513769 231513758 Y NA EXOC8,EGLN1 NA NA NA NA EXOC8 41824 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 231750755 231751033 231750894 Y NA NA NA NA NA NA TSNAX 88356 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 232428903 232429197 232429192 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 536736 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 233750790 233751092 233750957 Y KCNK1 NA NA NA NA NA RNU4-77P 168263 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 327540 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 234559176 234559516 234559346 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.4 51837 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 234862200 234862535 234862470 Y NA LINC01132 NA NA NA NA LINC01132 4411 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 234881537 234881788 234881657 Y NA LINC01132 NA NA NA NA LINC01132 23748 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC01132 50362 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235096560 235096855 235096619 Y ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 193396 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235106929 235107153 235107059 Y TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 183098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235110834 235111403 235111103 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 178848 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235126160 235126371 235126266 Y NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 163880 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235146978 235147112 235146990 Y IRF2BP2,RBM34,ARID4B,ARID4B NA LINC00184,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 143139 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235151501 235151917 235151577 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 138334 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235188116 235188420 235188313 Y NA NA LINC00184,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 101831 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235267591 235267744 235267678 Y NA TOMM20 NA NA NA NA TOMM20 22507 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235484403 235484795 235484782 Y NA GGPS1,ARID4B,TBCE NA NA NA NA GGPS1 3870 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 235805098 235806119 235805875 Y LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B GNG4 NA NA NA NA GNG4 5935 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 236021417 236021780 236021768 Y NA LYST NA NA NA NA LYST 23160 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 236022018 236022676 236022299 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22264 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 236022682 236022818 236022763 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22122 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 236430059 236430250 236430155 Y NA ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 13069 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 237207715 237208218 237207860 Y NA NA NA NA NA NA MTR 251105 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 237435467 237435795 237435579 Y RYR2 NA NA NA NA NA MTR 478857 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA MTR 677641 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr1 238730357 238730538 238730448 Y NA NA NA NA NA NA LINC01139 83034 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA NA NA NA NA NA FMN2 131242 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA NA NA NA NA NA FMN2 131973 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 241093225 241093542 241093384 Y NA NA NA NA NA NA RP11-467I20.3 294873 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 241209593 241209845 241209719 Y RGS7 NA NA NA NA NA RGS7 308685 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 241320009 241320104 241320058 Y NA NA NA NA NA NA RGS7 198426 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr1 241390681 241391063 241391027 Y RGS7 NA NA NA NA NA RGS7 127467 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 241469731 241469956 241469941 Y RGS7 RGS7 NA NA NA NA RGS7 48574 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr1 241771916 241772216 241772151 Y KMO CHML NA NA NA NA CHML 25016 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 241804319 241804678 241804577 Y NA CHML,OPN3 NA NA NA NA CHML 7087 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 242627058 242627162 242627110 Y NA NA NA NA NA NA PLD5 58836 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 243637125 243637295 243637255 Y CEP170,AKT3,AKT3 NA NA NA NA NA SDCCAG8 219805 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 243876652 243876733 243876693 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 135648 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr1 245971113 245971386 245971357 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 654826 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 246297322 246297388 246297355 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 371226 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 246323685 246324051 246324002 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 344563 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 246730569 246731007 246730621 Y AHCTF1,CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 2823 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 246743297 246743408 246743371 Y CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 15551 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 1240958 1241356 1241181 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 147480 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 1335739 1336079 1335908 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 242261 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 1390281 1390451 1390366 Y ADARB2 NA NA NA NA NA WDR37 296803 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 1541138 1541906 1541672 Y WDR37,ADARB2 NA NA NA NA NA ADARB2 235764 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.24548935117146 chr10 1698787 1699160 1698974 Y NA NA NA NA NA NA ADARB2 78510 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 3028046 3028193 3028123 Y NA NA LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 78332 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 3123873 3124204 3123982 Y NA PFKP NA NA NA NA PFKP 17348 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 3441336 3441600 3441518 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 228333 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr10 3507725 3507898 3507811 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 294722 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 3848037 3849536 3848891 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 22564 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr10 3850308 3850795 3850409 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 24835 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 3893365 3894190 3893886 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 67892 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 4162773 4163003 4162848 Y KLF6 NA NA NA NA NA KLF6 337300 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 4170248 4170427 4170324 Y NA NA KLF6 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF6 344775 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 4283808 4284356 4284092 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 458335 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 4396174 4396330 4396296 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1E2 430491 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 5045021 5045414 5045392 Y AKR1C2 AKR1C2,AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C2 12809 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 5113786 5114179 5114065 Y AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3 AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 38240 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 UCN3 70760 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 5334474 5334640 5334544 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 UCN3 70332 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 5336164 5336286 5336241 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 UCN3 68686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 6017924 6018316 6018090 Y RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,IL15RA NA NA NA NA NA ANKRD16 88055 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 6281305 6281494 6281382 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 96424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 6333794 6333936 6333889 Y PFKFB3,PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 148913 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 7277177 7277507 7277289 Y ITIH2 NA NA NA NA NA KIN 550483 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 7300945 7301168 7301056 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA KIN 526822 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 7356268 7356516 7356367 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA KIN 471474 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 7449149 7449274 7449212 Y NA NA NA NA NA NA KIN 378716 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 8457951 8458678 8458502 Y GATA3 NA NA NA NA NA TAF3 599484 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA TAF3 803694 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 8794296 8794681 8794490 Y NA NA NA NA NA NA TAF3 935829 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 8897116 8897206 8897161 Y NA NA TAF3,GATA3,FLJ45983 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF3 1038649 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 9042425 9042760 9042593 Y NA NA NA NA NA NA TAF3 1183958 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 10754108 10754441 10754195 Y CELF2,CELF2 NA LOC254312,CELF2 IMR90 Hi-C 24141950 USP6NL 897312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 11061356 11061896 11061544 Y NA NA NA NA NA NA USP6NL 589857 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 11252483 11252766 11252686 Y NA NA NA NA NA NA USP6NL 398987 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 11917828 11918087 11917940 Y C10orf47 NA NA NA NA NA UPF2 165082 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 12313010 12313140 12313022 Y UPF2,UPF2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 76341 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 12455599 12455959 12455812 Y SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 66118 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 12823373 12823670 12823432 Y NA NA NA NA NA NA OPTN 315779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 14155606 14155791 14155699 Y FRMD4A NA NA NA NA NA PRPF18 528679 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 14549247 14549550 14549402 Y HSPA14,CDNF NA NA NA NA NA FAM107B 265346 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 14624029 14624329 14624184 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FAM107B 190567 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 172933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 15157630 15158203 15157954 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111 NA NA NA NA C10orf111 20312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 15777859 15778119 15777989 Y NA NA NA NA NA NA FAM188A 122400 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 16481463 16481634 16481561 Y NA PTER NA NA NA NA PTER 4521 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 17456684 17457055 17456726 Y NA ST8SIA6-AS1,ST8SIA6 NA NA NA NA ST8SIA6-AS1 29749 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 21436057 21436346 21436225 Y C10orf113,NEBL NEBL NA NA NA NA NEBL 24770 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 22625615 22626028 22625937 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 17475 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr10 22922432 22922728 22922682 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 78756 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 22961361 22961802 22961720 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 39682 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 24772710 24773084 24772822 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 237513 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 25190845 25191315 25190947 Y NA PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 48218 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 25724945 25725304 25725156 Y NA NA NA NA NA NA GPR158 262954 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 26971794 26972079 26972065 Y MASTL,ABI1 PDSS1 ABI1 IMR90 Hi-C 24141950 PDSS1 12509 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 27354652 27354729 27354695 Y NA ANKRD26 NA NA NA NA ANKRD26 32692 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 27991244 27991520 27991382 Y NA NA NA NA NA NA RAB18 200047 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 28230250 28230547 28230399 Y NA NA NA NA NA NA ARMC4 55430 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 30040172 30040477 30040319 Y NA NA SVIL,KIAA1462 IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD3P1 343841 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 30825528 30825848 30825569 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA MAP3K8,KIAA1462,LOC729668,LYZL2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 104662 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 31192523 31192722 31192556 Y NA NA NA NA NA NA ZEB1 412702 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 32335843 32336217 32336161 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 7142 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 33798158 33798349 33798267 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 174968 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 34922261 34922558 34922409 Y PARD3 RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 28471 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 35059349 35059608 35059479 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 42645 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 35932153 35932694 35932189 Y FZD8 NA NA NA NA NA CCNY 398200 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 38418230 38418599 38418292 Y NA ZNF37A NA NA NA NA ZNF37A 36966 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 45491838 45491921 45491882 Y C10orf10 C10orf10,ZNF22 NA NA NA NA ZNF22 2002 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 45731417 45731707 45731606 Y C10orf10 NA NA NA NA NA ZNF22 237494 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 47057375 47057652 47057526 Y NA NA GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL IMR90 Hi-C 24141950 FAM21C 836727 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 51488946 51489392 51489137 Y NCOA4,NCOA4,NCOA4 RP11-109G10.2 NA NA NA NA RP11-109G10.2 41180 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 51502625 51503626 51503507 Y NCOA4,NCOA4,NCOA4 RP11-109G10.2,MSMB NA NA NA NA RP11-109G10.2 26946 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 52217733 52218081 52217894 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 164842 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 54212412 54212659 54212464 Y NA NA LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CSTF2T 755057 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 54774491 54774616 54774570 Y MBL2 NA NA NA NA NA CSTF2T 1317136 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 55357540 55358018 55357746 Y NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1900185 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 56854357 56854710 56854534 Y NA NA NA NA NA NA MTRNR2L5 502040 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 60026015 60026385 60026202 Y UBE2D1,IPMK IPMK,CISD1 NA NA NA NA IPMK 321 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 60674120 60674133 60674127 Y BICC1 NA NA NA NA NA PHYHIPL 260217 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 63823957 63824187 63824054 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 164898 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 64024468 64024613 64024559 Y ARID5B RTKN2 NA NA NA NA RTKN2 1853 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 69523880 69524330 69524240 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 71594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 70782889 70783013 70782952 Y NA KIAA1279 NA NA NA NA KIAA1279 36402 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 70846057 70846170 70846083 Y NA VPS26A NA NA NA NA VPS26A 35098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 71984000 71984297 71984282 Y NA PPA1 NA NA NA NA PPA1 7370 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 72082681 72083053 72082867 Y NA NA NA NA NA NA LRRC20 57329 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA SLC29A3 50618 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 73531831 73532355 73532130 Y C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 576 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 73605642 73606023 73605974 Y DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP NA NA NA NA PSAP 3103 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 74076833 74077036 74076912 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 35952 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 74082335 74082540 74082412 Y DDIT4 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 30448 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 74271285 74271561 74271407 Y DDIT4,DNAJB12,CBARA1 NA NA NA NA NA MICU1 112338 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 74289425 74289733 74289722 Y NA NA NA NA NA NA MICU1 94166 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 74836640 74837022 74836864 Y NA P4HA1,NUDT13 NA NA NA NA P4HA1 17710 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA NUDT13 9541 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 74991679 74992005 74991988 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 14615 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 75022023 75022098 75022060 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA RP11-152N13.5 11474 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 75768391 75768772 75768419 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 12519 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 77164585 77164731 77164659 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4921 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 77189888 77190112 77189953 Y NA ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 30224 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 77300831 77301201 77300915 Y NA NA KCNMA1,C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 57797 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 77418041 77418318 77418185 Y C10orf11 NA C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 59043 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 77548245 77548262 77548254 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 189247 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 77664306 77664573 77664408 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 305308 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 78163731 78164099 78163833 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 804733 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 78784039 78784371 78784322 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 611982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 79006844 79007202 79006984 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 389151 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 79147874 79148082 79147903 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 248271 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 79152642 79152983 79152827 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 243370 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 79274655 79274751 79274706 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 121602 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 79313411 79313746 79313629 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 82607 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 79822421 79822811 79822453 Y NA POLR3A,RPS24 NA NA NA NA RPS24 30903 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 79979357 79979662 79979507 Y NA NA RPS24,ZMIZ1,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 187839 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 80015034 80015301 80015187 Y RPS24 NA NA NA NA NA RPS24 223516 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 80912242 80912363 80912303 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 85450 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 81946319 81946704 81946639 Y ANXA11 ANXA11 NA NA NA NA ANXA11 16624 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr10 81956011 81956585 81956252 Y ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 6743 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 81960969 81961796 81961521 Y SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 1532 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 82224459 82224735 82224582 Y NA TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 12537 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 82253401 82253904 82253623 Y NA TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 41479 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 85938991 85939155 85939061 Y FAM190B GHITM NA NA NA NA GHITM 41795 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 89827526 89827767 89827673 Y KLLN,PTEN NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 124267 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 89867228 89867664 89867376 Y PTEN NA PTEN,KLLN,RNLS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 163969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 90657069 90657527 90657362 Y NA ANKRD22,STAMBPL1 NA NA NA NA STAMBPL1 19578 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 90791932 90792275 90792106 Y NA NA NA NA NA NA STAMBPL1 154441 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 91002651 91002940 91002773 Y ANKRD22,IFIT5,IFIT3,IFIT3,IFIT2 RP11-149I23.3 NA NA NA NA RP11-149I23.3 38582 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 91020368 91020477 91020401 Y IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 RP11-149I23.3,IFIT2 NA NA NA NA RP11-149I23.3 21045 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 92974122 92974225 92974155 Y NA PCGF5 NA NA NA NA PCGF5 3683 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 92975258 92975295 92975277 Y NA PCGF5 NA NA NA NA PCGF5 2613 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 95200243 95200778 95200520 Y CYP26C1,MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 39296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 95226262 95226423 95226291 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 13651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 95766976 95767368 95767096 Y NA NA NA NA NA NA SLC35G1 115246 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 97313430 97313789 97313690 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 5382 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 97640254 97640658 97640438 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA RP11-248J23.5 117342 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 99334341 99334704 99334523 Y NA PI4K2A NA NA NA NA PI4K2A 7427 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 99640353 99640735 99640548 Y NA GOLGA7B NA NA NA NA GOLGA7B 14464 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 100019738 100019959 100019849 Y C10orf28 LOXL4 NA NA NA NA LOXL4 6048 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 100020230 100020246 100020237 Y NA LOXL4 NA NA NA NA LOXL4 5761 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 100120877 100121283 100120897 Y PYROXD2,LOXL4 NA PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1 IMR90 Hi-C 24141950 PYROXD2 51658 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr10 100153906 100154210 100154161 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 18731 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 101539519 101539906 101539726 Y NA COX15 NA NA NA NA COX15 49662 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 101780024 101780319 101780173 Y CUTC,WNT8B DNMBP DNMBP MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMBP 12348 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 102950131 102950148 102950140 Y NA NA BTRC,C10orf76,TLX1NB,FBXW4,POLL,DPCD IMR90 Hi-C 24141950 SFXN3 161140 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 103733720 103734121 103734043 Y NA NA LOC100289509,MGEA5,KCNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf76 79829 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 104769429 104769711 104769602 Y INA NA NT5C2 IMR90 Hi-C 24141950 CNNM2 93379 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 105409078 105409369 105409249 Y NA NA NA NA NA NA CALHM2 198418 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 105521334 105521711 105521524 Y SH3PXD2A NA NA NA NA NA OBFC1 154252 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 105611177 105611504 105611341 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 64459 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr10 105650011 105650288 105650237 Y GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK OBFC1 SH3PXD2A IMR90 Hi-C 24141950 OBFC1 25675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 105667994 105668449 105668210 Y GSTO1,GSTO1,SLK OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 7514 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 109593803 109593820 109593812 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 2087491 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 111650301 111650520 111650491 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 30791 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 112084573 112085018 112084784 Y DUSP5 SMNDC1 DUSP5,SMC3,RBM20,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 21864 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 112116359 112116685 112116467 Y DUSP5,MXI1 NA SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 53650 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 112155518 112156031 112155808 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 92809 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 112168008 112168205 112168118 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 87391 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 112174147 112174523 112174256 Y SMC3,DUSP5 NA DUSP5,SMC3,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 81073 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 112207134 112207519 112207380 Y NA DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 48077 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 112220227 112220521 112220467 Y SMC3,DUSP5 DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 35075 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 112272592 112272848 112272747 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 16996 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 112401121 112401469 112401220 Y SMC3,RBM20 RBM20 NA NA NA NA RBM20 686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 112402938 112403137 112402952 Y NA RBM20 NA NA NA NA RBM20 783 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 114940347 114940490 114940443 Y CASP7,TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 232338 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 115719262 115719399 115719345 Y NA NA ADRB1,NHLRC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADRB1 82407 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA ABLIM1 187173 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 116561110 116561522 116561275 Y NA FAM160B1 AFAP1L2,ABLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM160B1 17981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 117502747 117502760 117502754 Y NA NA NA NA NA NA TRUB1 806795 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 118714609 118714623 118714617 Y NA NA NA NA NA NA RP11-539I5.1 106893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 121154797 121155146 121155008 Y NA NA NA NA NA NA RGS10 145074 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 121258857 121259125 121258993 Y NA RGS10 NA NA NA NA RGS10 41095 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 121923103 121923120 121923110 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 167882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 124070319 124070720 124070447 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA1 61492 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 125756933 125757735 125757580 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 93471 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 125954943 125955282 125955134 Y CHST15 NA CHST15 IMR90 Hi-C 24141950 CHST15 103737 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 126346022 126346943 126346570 Y FAM53B FAM53B-AS1 NA NA NA NA FAM53B-AS1 43251 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 126349618 126349650 126349637 Y NA FAM53B-AS1 NA NA NA NA FAM53B-AS1 40544 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 126397729 126397974 126397834 Y FAM53B FAM53B-AS1,FAM53B NA NA NA NA FAM53B-AS1 7535 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr10 126406559 126407126 126406852 Y ZRANB1,FAM53B FAM53B-AS1,FAM53B NA NA NA NA FAM53B-AS1 16365 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 126712433 126712623 126712473 Y NA NA ZRANB1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-298J20.4 108721 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 126837951 126838191 126838020 Y NA CTBP2,MRPS21P6 NA NA NA NA CTBP2 9548 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 126840629 126841204 126840953 Y NA CTBP2,MRPS21P6 NA NA NA NA CTBP2 6535 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 127576052 127576450 127576389 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 797 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 127587236 127587432 127587340 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 4128 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 127819995 127820181 127820087 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 236887 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 128119843 128120222 128120190 Y ADAM12 NA NA NA NA NA DOCK1 471756 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr10 133454610 133454819 133454663 Y NA NA NA NA NA NA BNIP3 338616 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 133776164 133776302 133776237 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 17133 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 133793049 133793425 133793362 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 10 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 134221970 134222202 134222031 Y PWWP2B PWWP2B NA NA NA NA PWWP2B 13298 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.24548935117146 chr10 134235789 134236113 134236058 Y NA PWWP2B C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 PWWP2B 27117 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 NA NA NA NA NA PWWP2B 51669 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 134385594 134385710 134385631 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 36270 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 135074691 135075148 135074934 Y TUBGCP2,ADAM8 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 44831 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr10 135092117 135092276 135092147 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 27703 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 364521 364678 364634 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3 ANO9,SIGIRR,B4GALNT4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 3118 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 368352 368730 368427 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR NA NA NA NA B4GALNT4 556 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7 NA NA NA NA IRF7 15193 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 749835 750077 749967 Y IFITM2,IRF7,IRF7,TMEM80,DEAF1,TALDO1 DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5,CEND1,SLC25A22 NA NA NA NA TALDO1 4506 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 1073369 1073545 1073512 Y DRD4,EFCAB4A MUC2 NA NA NA NA MUC2 494 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 1543133 1543339 1543203 Y NA DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 47811 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 1568333 1568421 1568379 Y BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 22729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 1794819 1794975 1794880 Y NA RP11-295K3.1,CTSD MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B IMR90,MCF7,K562,H1ESC Hi-C,3C,ChIA-PET,5C 24141950,19890323,22265404,22955621 CTSD 11597 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 2009660 2010154 2009976 Y IGF2,IGF2,SYT8 MRPL23,MRPL23-AS1,H19 NA NA NA NA MRPL23-AS1 510 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 2082720 2083054 2082737 Y NA NA MOB2,IGF2-AS1,IGF2,INS-IGF2,LSP1,TH,MIR4686 IMR90,K562,GM12878,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 H19 62020 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 2238005 2238048 2238027 Y NA NA KCNQ1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2 69172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 2643075 2643474 2643317 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 75750 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 2714612 2714953 2714746 Y NA KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 4271 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 3077664 3078057 3077925 Y NA RNU1-91P,CARS NAP1L4 K562 ChIA-PET 22265404 CARS 821 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 3792611 3792742 3792677 Y STIM1,RHOG,NUP98 PGAP2,NUP98 NA NA NA NA PGAP2 24212 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 3831146 3831197 3831172 Y NA PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1 NA NA NA NA NUP98 14124 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 3902068 3902471 3902356 Y OR52B4,CHRNA10,NUP98,RHOG,STIM1 RHOG,STIM1 NA NA NA NA STIM1 28311 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 4111553 4111947 4111636 Y STIM1 RRM1 NA NA NA NA RRM1 1990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 5350226 5350590 5350390 Y OR51S1,OR51T1,OR51G2,OR51G1,MMP26,OR51L1,OR52J3,OR52A1,OR51V1,OR52N2,OR51M1,OR56B1,OR52N4,OR52D1,OR51Q1,OR52N5,OR52N1,OR51B2,OR51B6 AC104389.32 NA NA NA NA AC104389.32 31255 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 6224718 6224948 6224898 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 28993 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 6344620 6344857 6344735 Y NA PRKCDBP NA NA NA NA PRKCDBP 4743 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 6699628 6699937 6699850 Y OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 2695 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 8756335 8756571 8756455 Y ST5,ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 54377 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7,SNORA23 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 9732058 9732249 9732166 Y NA SWAP70,SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 45590 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 9786985 9787566 9787311 Y NA SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 9146 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr11 10373965 10374241 10374089 Y LYVE1,EIF4G2 ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49738 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr11 10955665 10956051 10955935 Y NA NA EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBED5 77322 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 12136145 12136580 12136313 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 22602 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 12146355 12146795 12146568 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 32812 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 12214399 12214709 12214476 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 100856 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr11 12218036 12218499 12218053 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 104493 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 12824175 12824668 12824395 Y TEAD1 NA NA NA NA NA TEAD1 130206 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 13139342 13139463 13139403 Y NA NA LOC100506305,RASSF10 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF10 110646 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 14564922 14565133 14565013 Y PSMA1 COPB1,PSMA1 NA NA NA NA PSMA1 25032 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1,CALCB NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 15836914 15837253 15837132 Y NA NA C11orf58 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf58 795426 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 22814174 22814335 22814255 Y SVIP SVIP NA NA NA NA SVIP 35510 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 23658000 23658323 23658162 Y NA NA NA NA NA NA SVIP 808155 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 26265748 26266047 26265944 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1L12.3 973613 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 27481800 27481840 27481820 Y NA LIN7C NA NA NA NA LIN7C 44480 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 27683148 27683223 27683174 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58382 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 30072504 30072650 30072577 Y NA NA NA NA NA NA DCDC1 1316707 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 34676467 34676782 34676555 Y ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF EHF NA NA NA NA EHF 35827 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 35132711 35132959 35132793 Y CD44 NA PDHX,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 APIP 196665 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 NA NA NA NA NA APIP 268938 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 35293930 35294558 35294394 Y CD44 NA NA NA NA NA APIP 357884 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 35297997 35298240 35298173 Y CD44,SLC1A2,SLC1A2 NA NA NA NA NA APIP 361951 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 42075853 42076183 42076170 Y NA NA NA NA NA NA API5 1255330 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 43773446 43773547 43773497 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 126814 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 44123492 44123510 44123502 Y NA ACCS,EXT2 NA NA NA NA EXT2 8393 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 45000515 45000921 45000720 Y SYT13,TSPAN18 TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 29675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 103265 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr11 45685212 45685518 45685319 Y SYT13,MAPK8IP1,CRY2,CRY2,CHST1 CHST1 NA NA NA NA CHST1 40 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 46094625 46094954 46094790 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 46031 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 46143609 46143973 46143928 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 2624 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CTD-2589M5.4,CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 28900 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr11 46706691 46706778 46706735 Y NA ARHGAP1,ZNF408,F2 NA NA NA NA ARHGAP1 13387 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 47108178 47108230 47108204 Y HARBI1 NA NA NA NA NA ARFGAP2 88446 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 48034964 48035405 48035033 Y OR4X1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 34851 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 48040170 48040457 48040234 Y NA PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 40057 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 56980843 56981208 56981026 Y NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 109218 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 57771205 57771314 57771249 Y NA NA NA NA NA NA CTNND1 252490 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 58965379 58965764 58965549 Y PATL1,FAM111A,MPEG1 NA NA NA NA NA FAM111A 57158 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 38517 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 59941256 59941428 59941364 Y NA NA NA NA NA NA MRPL16 364911 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,TMEM258,FADS2 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 62164133 62164439 62164244 Y NA CTD-2531D15.5 NA NA NA NA CTD-2531D15.5 5289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA CTD-2531D15.5 52782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 62305940 62306223 62306072 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3 AHNAK,EEF1G NA NA NA NA AHNAK 15484 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr11 62306762 62307027 62306934 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654 NA NA NA NA AHNAK 14680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr11 62586827 62586893 62586843 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 10667 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 62587560 62587930 62587905 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 9630 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 63686695 63687182 63686923 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 4379 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 63705603 63705837 63705685 Y NA RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA NAA40 1172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 63775286 63775368 63775342 Y KCNK4 COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA OTUB1 23961 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 63954598 63954956 63954814 Y FERMT3,CCDC88B,OTUB1 MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4,RP11-783K16.14,VEGFB NA NA NA NA STIP1 3854 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 MALAT1 23363 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.24548935117146 chr11 65246279 65246484 65246387 Y SCYL1,LTBP3,EFEMP2 MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 16749 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 65259930 65260851 65260542 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 2382 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 10.0538545897453 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 66221780 66221966 66221875 Y RBM4 NPAS4,MRPL11,PELI3,DPP3,CTD-3074O7.5 PELI3,DPP3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL11 10243 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 66632141 66632247 66632177 Y PELI3,SPTBN2 RCE1,LRFN4 NA NA NA NA LRFN4 10023 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 67121988 67122388 67122127 Y POLD4,CLCF1 POLD4,RAD9A NA NA NA NA POLD4 55 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA POLD4 16409 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 68596704 68596832 68596771 Y CPT1A CPT1A NA NA NA NA CPT1A 13046 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 68611298 68611611 68611498 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1420 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 69965939 69966135 69966116 Y NA NA NA NA NA NA FADD 81134 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 70150439 70150493 70150466 Y NA PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 35633 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 72498496 72498726 72498679 Y STARD10 ARAP1,STARD10,ATG16L2 NA NA NA NA ARAP1 3918 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr11 73014768 73014913 73014905 Y NA NA NA NA NA NA RELT 70396 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 74314500 74314859 74314680 Y NA NA NA NA NA NA POLD3 111604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 74812864 74813191 74812953 Y NA NA XRRA1,LOC100507050,OR2AT4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEU3 115685 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 75581181 75581426 75581320 Y MAP6 NA NA NA NA NA RP11-535A19.2 56730 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 75755875 75756235 75755993 Y UVRAG NA NA NA NA NA RP11-535A19.2 231424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 76574228 76574537 76574458 Y OMP,ACER3 ACER3 NA NA NA NA ACER3 4317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 83668458 83668564 83668511 Y DLG2,DLG2,DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 673008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 85467449 85467754 85467623 Y SYTL2,SYTL2 NA CCDC89 IMR90 Hi-C 24141950 SYTL2 52430 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 85702937 85703343 85703240 Y NA NA NA NA NA NA PICALM 75581 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 86381936 86382132 86382071 Y NA ME3 NA NA NA NA ME3 258 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 86447030 86447398 86447213 Y NA NA PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 52703 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 86452946 86453377 86453076 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 46724 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 86454778 86455149 86454967 Y PRSS23 PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 44952 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 87067687 87067836 87067698 Y NA NA GRM5 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 320801 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr11 87149211 87149297 87149219 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 402325 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 87525483 87525645 87525564 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 543310 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 88329241 88329453 88329273 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 260286 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 93258917 93259186 93259082 Y MED17,SLC36A4,C11orf75 RP11-288E14.2 NA NA NA NA RP11-288E14.2 7448 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 95525355 95525734 95525518 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 3782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 99734583 99734830 99734707 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 821554 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 102631066 102631384 102631342 Y BIRC2 MMP10,MMP1 NA NA NA NA MMP10 17975 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 104576314 104576795 104576668 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4 NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 CASP4 261368 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 105933861 105934087 105933948 Y NA AASDHPPT,KBTBD3 NA NA NA NA AASDHPPT 10141 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 107846158 107846176 107846168 Y NA SLC35F2,RAB39A,CUL5 NA NA NA NA CUL5 31283 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 107859673 107859731 107859704 Y RAB39 CUL5 NA NA NA NA CUL5 17728 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 111534401 111534774 111534406 Y CRYAB NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK2 63286 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 111990651 111990899 111990830 Y NA C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD NA NA NA NA SDHD 35024 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 112375624 112375994 112375809 Y NA NA NA NA NA NA RP11-356J5.12 236152 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 112941331 112941794 112941502 Y NA NA NA NA NA NA NCAM1 111334 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 113053106 113053348 113053234 Y NA NA NA NA NA NA TTC12 129903 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 113071638 113071808 113071709 Y NA NA NA NA NA NA TTC12 111443 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 113637897 113638051 113637974 Y CLDN25 ZW10 NA NA NA NA ZW10 4482 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 113962751 113963246 113962839 Y NA ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 34436 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 113999597 113999969 113999698 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB16 71282 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 114031661 114032121 114031976 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA ZBTB16 103346 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 114033536 114034161 114033636 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA ZBTB16 105221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 114037766 114038216 114037805 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB16 109451 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 115825408 115825633 115825521 Y CADM1 NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 451733 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 116802235 116802679 116802498 Y SIK3,PCSK7 NA NA NA NA NA AP000936.1 102088 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 117732354 117732627 117732491 Y NA DSCAML1,RP11-728F11.4,FXYD6-FXYD2,FXYD6 NA NA NA NA FXYD6-FXYD2 12755 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 118493108 118493651 118493460 Y NA NA NA NA NA NA IFT46 51423 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.68261346376908 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 120302835 120303154 120303088 Y OAF,ARHGEF12 NA NA NA NA NA GRIK4 77314 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 121337416 121337512 121337466 Y NA SORL1 NA NA NA NA SORL1 16504 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 122072667 122072944 122072770 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 751755 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 122586167 122586342 122586202 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P23 318233 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 123951200 123951810 123951503 Y OR8B12,OR8A1,OR8G2,OR8D1,VWA5A VWA5A NA NA NA NA VWA5A 32259 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 124812430 124812599 124812544 Y PKNOX2,HEPN1,HEPACAM CCDC15 ROBO4,ROBO3,HEPACAM,CCDC15,PKNOX2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC15 9418 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM118B 95571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr11 125985923 125986168 125986013 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM118B 93141 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 126189109 126189259 126189183 Y HYLS1 TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 16896 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 126210041 126210184 126210131 Y NA DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA ST3GAL4 13351 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 128212720 128212961 128212844 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 242492 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 128294765 128294892 128294836 Y NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 160561 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr11 128323342 128323695 128323510 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 131758 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 129102482 129102753 129102618 Y NA ARHGAP32 NA NA NA NA ARHGAP32 44466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 129942098 129942391 129942179 Y PRDM10 TCEB2P2,APLP2 NA NA NA NA APLP2 4366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 130016455 130016576 130016492 Y NA ST14 NA NA NA NA ST14 10881 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr11 130113792 130113937 130113867 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB44 68644 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 130506997 130507161 130507118 Y NA NA ADAMTS15,ADAMTS8 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 190128 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 131863969 131864325 131864147 Y NTM NA NA NA NA NA SNX19 1079565 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 132162679 132162975 132162706 Y NTM NA NA NA NA NA OPCML 1237439 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr11 132502586 132503019 132502881 Y NA NA NA NA NA NA OPCML 897395 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 574296 574697 574406 Y B4GALNT3 NA NA NA NA NA KDM5A 77676 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 57680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 685193 685500 685436 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 52557 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 1314182 1314497 1314340 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 ERC1 216507 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 1512706 1512846 1512771 Y ERC1 NA NA NA NA NA FBXL14 188485 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 1698978 1699322 1699295 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2009 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 2144277 2144357 2144308 Y LRTM2 DCP1B CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B IMR90 Hi-C 24141950 DCP1B 32576 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 2547305 2547477 2547330 Y NA NA NA NA NA NA FKBP4 354642 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 2952217 2952396 2952310 Y NA ITFG2,RP4-816N1.6,FOXM1,TULP3 NA NA NA NA FOXM1 31810 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 3180278 3180396 3180348 Y NA TSPAN9 TSPAN9 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN9 4125 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 3334572 3334968 3334768 Y NA RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 15476 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 3420231 3420354 3420293 Y PRMT8 NA NA NA NA NA PRMT8 68161 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 3700577 3700596 3700587 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB4B 171389 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 3857515 3857570 3857543 Y NA EFCAB4B NA NA NA NA EFCAB4B 14415 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 4425726 4425978 4425852 Y NA C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 2393 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 4770172 4770413 4770176 Y NA AKAP3,NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 13911 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 6175047 6175276 6175191 Y VAMP1,TNFRSF1A NA NA NA NA NA CD9 131605 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 6291358 6291755 6291562 Y VWF,CD9 CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 15126 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 6325035 6325634 6325452 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 18154 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 6339954 6340271 6340062 Y VAMP1,TAPBPL,IFFO1 CD9 NA NA NA NA CD9 33073 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.24548935117146 chr12 6403662 6404056 6403860 Y PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6 PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 13546 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 12935 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.68261346376908 chr12 6454526 6454970 6454793 Y CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 5246 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 6482550 6482923 6482687 Y SCNN1A,SCNN1A TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A TNFRSF1A K562 ChIA-PET 22265404 LTBR 339 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4 NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,LPCAT3 NA NA NA NA LPCAT3 19454 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.68261346376908 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 8307747 8307921 8307806 Y CLEC6A,CLEC4E,CLEC4D,C3AR1,NECAP1,CLEC4A NA NA NA NA NA NECAP1 74940 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 8725184 8725464 8725363 Y NECAP1,CLEC4A,CLEC6A,M6PR,CLEC4D,CLEC4E SCARNA11 KLRG1 IMR90 Hi-C 24141950 SCARNA11 22641 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 9060195 9060360 9060254 Y PHC1 PHC1,M6PR,KLRG1 NA NA NA NA PHC1 4132 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 9263143 9263504 9263324 Y KLRB1,KLRG1 NA NA NA NA NA PTMAP4 127423 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 9910959 9911930 9911334 Y KLRB1,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69 NA NA NA NA NA DDX12P 312134 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 9929416 9929512 9929464 Y NA NA NA NA NA NA DDX12P 330591 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 10130625 10130889 10130637 Y CD69,CLEC2B,OLR1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC12A,CLEC12A NA NA NA NA NA GABARAPL1 232168 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 10306018 10306454 10306037 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 56603 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 10538589 10538605 10538596 Y KLRC4-KLRK1,KLRK1,KLRC4 RP11-277P12.20 NA NA NA NA RP11-277P12.20 24221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 10824879 10825003 10824941 Y NA NA MAGOHB,KLRAP1 IMR90 Hi-C 24141950 STYK1 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 11486966 11487331 11487130 Y NA NA NA NA NA NA TAS2R14 164794 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11736764 11737137 11736922 Y TAS2R42 NA NA NA NA NA ETV6 63651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11828862 11829235 11828994 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 28074 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11867581 11867722 11867638 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 66793 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11884596 11884909 11884601 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 83808 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11909552 11909810 11909712 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 108764 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11911642 11913422 11912121 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 110854 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11933482 11933754 11933622 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 132694 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11949422 11949819 11949574 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 148634 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11963262 11963646 11963299 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 162474 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 11966137 11966507 11966203 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 165349 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 12009987 12010279 12010170 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 209199 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 12016846 12017194 12017120 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 216058 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 12038206 12038369 12038301 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA RP11-267J23.4 223728 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 12111679 12111898 12111693 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 150199 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 12164191 12164556 12164498 Y NA NA ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 97541 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 36148 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 12504083 12504386 12504252 Y BCL2L14,MANSC1 MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 NA NA NA NA MANSC1 2608 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 12599819 12600045 12599926 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 91806 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 12960939 12961466 12961074 Y NA DDX47 NA NA NA NA DDX47 2784 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr12 13213632 13213789 13213702 Y DUSP16 KIAA1467 NA NA NA NA KIAA1467 18414 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 13255105 13255488 13255167 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 59887 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 13814153 13814481 13814422 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1467 618935 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 14417881 14418036 14417969 Y PLBD1 NA ATF7IP IMR90 Hi-C 24141950 ATF7IP 98574 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 17520560 17520632 17520596 Y NA RP11-871F6.2 NA NA NA NA RP11-871F6.2 30701 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 19557871 19558201 19558036 Y NA AEBP2 AEBP2 IMR90 Hi-C 24141950 AEBP2 2892 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 20124309 20124606 20124452 Y PDE3A RP11-405A12.1 PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 31854 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 20780077 20780376 20780084 Y LST-3TM12,PDE3A NA NA NA NA NA RP11-405A12.1 687622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 23324864 23325062 23324963 Y NA NA NA NA NA NA RP11-114G22.1 474071 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 23770675 23770997 23770816 Y SOX5 NA NA NA NA NA SOX5 330969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 24758140 24758162 24758151 Y NA NA SOX5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-662I13.1 360276 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 25380896 25381137 25381017 Y NA CASC1,LYRM5,KRAS NA NA NA NA KRAS 20733 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 15955 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr12 26495152 26495452 26495369 Y ITPR2 NA NA NA NA NA ITPR2 488679 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 26522536 26522924 26522687 Y ITPR2 NA NA NA NA NA ITPR2 461207 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 26538001 26538320 26538173 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 445811 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 26624362 26624835 26624675 Y FGFR1OP2 NA NA NA NA NA ITPR2 359296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 26626326 26626794 26626426 Y FGFR1OP2 NA NA NA NA NA ITPR2 357337 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 26805266 26805775 26805502 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 178356 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 27557115 27557162 27557139 Y C12orf71,KLHDC5 NA NA NA NA NA ARNTL2 73328 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 27726864 27727242 27727000 Y STK38L,PPFIBP1 NA NA NA NA NA PPFIBP1 52500 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 28185706 28185999 28185851 Y PTHLH,PTHLH NA NA NA NA NA CCDC91 98183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 29256492 29256711 29256590 Y NA FAR2 NA NA NA NA FAR2 43325 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 29555065 29555315 29555211 Y NA ERGIC2 IPO8 IMR90 Hi-C 24141950 ERGIC2 22943 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 62855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.55686168896433 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 22028 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 31909925 31910440 31910295 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 29817 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 32607967 32608138 32608054 Y NA NA FGD4,BICD1 IMR90 Hi-C 24141950 DNM1L 221996 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 32738766 32738845 32738790 Y NA NA NA NA NA NA DNM1L 91289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 32742557 32742716 32742609 Y NA NA NA NA NA NA DNM1L 87418 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 34846341 34846449 34846401 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 445925 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 46825426 46825886 46825665 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 49964 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 46867492 46867759 46867536 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 92030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 47044408 47044812 47044711 Y NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 268946 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 47053760 47053887 47053821 Y NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 278298 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 47074564 47074850 47074707 Y NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 299102 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 48076459 48076736 48076534 Y NA RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 21108 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 48201899 48202220 48202071 Y SENP1,PFKM,ASB8 RAPGEF3,HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 22695 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 48204446 48204457 48204451 Y NA RAPGEF3,HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 20458 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 49203713 49203966 49203840 Y NA ADCY6,CACNB3,DDX23 NA NA NA NA CACNB3 1611 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 49276307 49276420 49276362 Y OR8S1,RND1 DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 18626 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 49595765 49596022 49595888 Y LMBR1L TUBA1C,TUBA1A TUBA1A,TUBA1B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TUBA1A 14658 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 50092156 50092464 50092310 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 7044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 50096461 50096860 50096656 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 2648 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 50507967 50508334 50508141 Y NA SMARCD1 NA NA NA NA SMARCD1 31212 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 50936330 50936621 50936410 Y DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 39562 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7 NA NA NA NA KRT7 49739 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 52890343 52890794 52890475 Y C12orf44,KRT7,KRT18,KRT18,KRT6A,KRT5 NA NA NA NA NA KRT7 266039 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 53336677 53336830 53336786 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 3825 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 53515585 53515944 53515597 Y NA SPRYD3,IGFBP6,SOAT2,HIGD1AP1,RP11-1136G11.6 NA NA NA NA HIGD1AP1 17893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 53627985 53628353 53628269 Y NA ITGB7,MFSD5 MFSD5 K562 ChIA-PET 22265404 MFSD5 14682 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 53892109 53892322 53892185 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 262 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 53955466 53955638 53955506 Y NA NA NA NA NA NA ATF7 62561 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 54090300 54090537 54090319 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 21108 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 54149784 54149995 54149877 Y PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 30255 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 54150655 54151094 54151055 Y NA CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11,HOXC13,HOTAIR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 31126 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 54563652 54563918 54563802 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 16860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 54752421 54752649 54752549 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA COPZ1 59435 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 55806634 55807051 55806823 Y NA NA NA NA NA NA BLOC1S1 300769 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA BLOC1S1 298940 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 56036628 56036862 56036687 Y NA NA NA NA NA NA BLOC1S1 70958 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 56275045 56275257 56275151 Y OR6C65,OR6C76,OR6C2,OR6C4,OR10P1 DGKA,WIBG NA NA NA NA DGKA 43846 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 56356198 56356265 56356248 Y CDK2,PMEL DGKA,WIBG,CDK2,RAB5B,SUOX,IKZF4 NA NA NA NA CDK2 2288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 56357532 56357679 56357667 Y NA DGKA,WIBG,CDK2,RAB5B,SUOX,IKZF4 NA NA NA NA CDK2 874 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 56434218 56434302 56434260 Y OR6C4,OR10P1 SUOX,IKZF4,RPS26,ERBB3 NA NA NA NA RPS26 581 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 56831514 56831759 56831654 Y IKZF4 TIMELESS,SPRYD4,GLS2 NA NA NA NA TIMELESS 9428 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr12 57512672 57512926 57512798 Y NAB2 TMEM194A,NAB2,STAT6 TMEM194A,STAT6,LRP1,STAC3,SHMT2,NDUFA4L2 IMR90 Hi-C 24141950 STAT6 10996 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 58283417 58283685 58283602 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,CTDSP2 CTDSP2,XRCC6BP1 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 44895 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 58903110 58903474 58903296 Y NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 408829 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 59300729 59300915 59300862 Y LRIG3,LRIG3 LRIG3 NA NA NA NA LRIG3 11388 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 59434557 59434696 59434648 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 122254 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 59449084 59449472 59449406 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA LRIG3 136781 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 60943768 60943906 60943837 Y NA NA NA NA NA NA SLC16A7 955920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 62559325 62559470 62559411 Y NA NA NA NA NA NA USP15 92649 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 153991 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 64482177 64482504 64482346 Y SRGAP1,TBK1,C12orf66 NA NA NA NA NA C12orf66 131572 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 65012959 65013250 65013088 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 10666 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 65262498 65262651 65262575 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D30 89909 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 65528086 65528453 65528315 Y NA LEMD3 WIF1,TBC1D30,LEMD3,FLJ41278 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD3 32898 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 66012877 66013074 66012996 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-118B13.1 415941 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 66159144 66159329 66159237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-118B13.1 269686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 68660485 68660819 68660713 Y IL26,IL22 NA NA NA NA NA MDM1 63342 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 68766640 68767030 68766969 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 42479 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 69006143 69006530 69006154 Y CPM,IFNG,RAP1B RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RAP1B 3524 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr12 69403025 69403359 69403177 Y NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6 NA CPM IMR90 Hi-C 24141950 MDM2 203069 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 70558769 70558849 70558809 Y NA NA NA NA NA NA CNOT2 75925 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 71816365 71816416 71816391 Y TBC1D15 LGR5,TSPAN8 NA NA NA NA LGR5 15134 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 72700873 72701321 72700945 Y TPH2 NA NA NA NA NA TBC1D15 469386 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 73636899 73637241 73637070 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 1292310 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 76685255 76685355 76685300 Y NA NA NAP1L1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 BBS10 54867 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 76751627 76751939 76751780 Y NA BBS10 NA NA NA NA BBS10 11405 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 77060081 77060100 77060091 Y NA NA E2F7,ZDHHC17 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC17 95268 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 77426192 77426447 77426357 Y OSBPL8 E2F7 NA NA NA NA E2F7 30913 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 79323956 79323978 79323967 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 68183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 79356068 79356388 79356099 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 100295 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 79363511 79363565 79363558 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 107738 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 79994209 79994302 79994256 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 88575 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 83269676 83269939 83269806 Y TMTC2 NA NA NA NA NA TMTC2 191017 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 86658149 86658358 86658243 Y NA NA NA NA NA NA NTS 392076 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 87124382 87124690 87124385 Y NA NA NA NA NA NA MGAT4C 105991 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 89573766 89574183 89574007 Y POC1B,DUSP6,ATP2B1 NA POC1B,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP6 170865 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 89910622 89910739 89910701 Y NA POC1B,GALNT4 NA NA NA NA POC1B 7062 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 90127113 90127954 90127635 Y DUSP6,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 26036 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 91775053 91775433 91775292 Y NA NA LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C12orf79 759257 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 92402520 92402848 92402650 Y NA NA NA NA NA NA C12orf79 131842 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 9.61673047714768 chr12 92419313 92419515 92419511 Y NA NA NA NA NA NA C12orf79 115175 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 92423160 92423214 92423187 Y NA NA NA NA NA NA C12orf79 111476 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 92458847 92459245 92459094 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 75445 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 92517420 92517830 92517671 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16292 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 96031341 96031520 96031430 Y NTN4 NA NA NA NA NA METAP2 166045 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 96627830 96628313 96628063 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 41670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 96664847 96665248 96665048 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 78687 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 97962496 97962841 97962674 Y NA MIR135A2 NA NA NA NA MIR135A2 6906 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 98503598 98503623 98503612 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-41P 306193 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 99250809 99251297 99251146 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 213890 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 102187051 102187461 102187342 Y DRAM1,GNPTAB GNPTAB NA NA NA NA GNPTAB 35255 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 102734344 102734692 102734517 Y NA NA IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 NUP37 222442 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 103348133 103348242 103348178 Y NA ASCL1,PAH NA NA NA NA ASCL1 1222 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr12 103358686 103358916 103358881 Y NA ASCL1,PAH NA NA NA NA PAH 8498 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 103359249 103359470 103359411 Y NA ASCL1,PAH NA NA NA NA PAH 9061 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 104274396 104274663 104274530 Y NA NT5DC3,HSP90B1 NA NA NA NA NT5DC3 41421 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 104330398 104330552 104330475 Y NA HSP90B1,C12orf73,TDG NA NA NA NA HSP90B1 8513 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 104846909 104846975 104846916 Y NA NA NA NA NA NA EID3 151392 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 105064571 105065844 105065441 Y EID3,CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA SLC41A2 284678 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 105900072 105900358 105900257 Y NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 APPL2 272056 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 106682328 106682503 106682422 Y NA TCP11L2,CKAP4 CKAP4,NUAK1,TCP11L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCP11L2 11204 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 109167575 109167781 109167683 Y NA CORO1C NA NA NA NA CORO1C 44203 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 109227089 109227462 109227320 Y NA NA NA NA NA NA CORO1C 103717 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 NA NA NA NA NA CORO1C 108771 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 109300500 109300763 109300632 Y SVOP,DAO NA NA NA NA NA USP30 158131 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 110931784 110931990 110931887 Y NA ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29 NA NA NA NA VPS29 5932 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 112545862 112545946 112545885 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 1036 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 112554455 112554606 112554536 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 TRAFD1,NAA25 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TRAFD1 6699 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 112633664 112633952 112633817 Y NA NA TRAFD1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAFD1 72359 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 113684297 113684702 113684391 Y NA TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 27398 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 113798034 113798144 113798106 Y SLC24A6,PLBD2,SDSL,SDS PLBD2 SDS,SDSL IMR90 Hi-C 24141950 PLBD2 3663 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 114029271 114029455 114029396 Y LHX5 NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 LHX5 121186 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.55686168896433 chr12 116111611 116111662 116111637 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 601481 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 116188760 116188962 116188861 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 524181 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 116530359 116530538 116530483 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 182605 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 117871849 117872390 117872076 Y NOS1 NA NA NA NA NA FBXO21 245513 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 118012695 118013095 118012896 Y NA NA NA NA NA NA FBXO21 386359 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 118123457 118123641 118123524 Y NA NA NA NA NA NA KSR2 281147 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 118632324 118632442 118632383 Y NA RPS2P5 PEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P5 49435 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 119646482 119646796 119646670 Y SRRM4,CCDC60,HSPB8 HSPB8 NA NA NA NA HSPB8 32035 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 119648635 119648890 119648691 Y CCDC60 HSPB8 NA NA NA NA HSPB8 34188 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 120433844 120433899 120433873 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 119407 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 120669025 120669761 120669334 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 31813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 121245538 121245859 121245790 Y NA NA NA NA NA NA ACADS 84000 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 121268399 121268878 121268839 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 71296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 121462488 121462659 121462590 Y NA C12orf43 C12orf43 MCF7 ChIA-PET 22265404 C12orf43 10183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 121497390 121497638 121497514 Y OASL C12orf43 SPPL3,UNC119B,ACADS,C12orf43,HNF1A,OASL,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf43 45085 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 MORN3,TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MORN3 16245 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 122462417 122462775 122462615 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 7089 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 123207042 123207235 123207132 Y CLIP1,ZCCHC8,CCDC62 HCAR3,DENR NA NA NA NA HCAR3 7603 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr12 123367402 123367963 123367875 Y VPS37B VPS37B NA NA NA NA VPS37B 11028 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 123528001 123528432 123528293 Y C12orf65,C12orf65,C12orf65 NA NA NA NA NA ABCB9 63805 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 123563294 123563583 123563475 Y C12orf65,C12orf65,C12orf65 NA NA NA NA NA PITPNM2 68979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 123606030 123606279 123606155 Y SNRNP35,HIP1R PITPNM2 MPHOSPH9,PITPNM2,OGFOD2,ABCB9,ARL6IP4,LOC100507091,VPS37B,C12orf65 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNM2 26283 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 123615846 123616275 123616026 Y NA PITPNM2 PITPNM2,ARL6IP4,ABCB9,OGFOD2,LOC100507091,MPHOSPH9 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNM2 16287 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 123616405 123617083 123616761 Y ABCB9,MPHOSPH9,C12orf65,C12orf65,C12orf65 PITPNM2 PITPNM2,ARL6IP4,ABCB9,OGFOD2,LOC100507091,MPHOSPH9 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNM2 15479 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 123872201 123872612 123872414 Y NA SBNO1,SETD8 NA NA NA NA SETD8 5881 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 124198913 124199092 124199012 Y ATP6V0A2 TCTN2,ATP6V0A2 NA NA NA NA ATP6V0A2 4048 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 124717911 124718282 124718055 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 262123 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 125066562 125066782 125066660 Y FAM101A NCOR2 NCOR2,SCARB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NCOR2 16427 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 1042 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 125577703 125578001 125577737 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 29778 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 127567979 127568114 127568034 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 80558 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 128055090 128055285 128055188 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 406418 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 129054843 129055190 129054997 Y NA NA NA NA NA NA SLC15A4 251338 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 130168445 130168570 130168508 Y NA NA NA NA NA NA RP11-474D1.2 384300 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 130923831 130924224 130924207 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 274602 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr12 131111744 131112133 131112105 Y RIMBP2 NA RIMBP2 IMR90 Hi-C 24141950 RIMBP2,RP11-662M24.2 86693 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr12 131117194 131117823 131117569 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 81003 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr12 131513179 131513358 131513281 Y GPR133 NA NA NA NA NA RAN 158755 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 NA NA NA NA NA ULK1 61957 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 132368164 132368433 132368235 Y NA ULK1,PUS1 SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1 IMR90 Hi-C 24141950 ULK1 8763 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 132558778 132559145 132558825 Y NA SNORA49,EP400NL NA NA NA NA EP400NL 7683 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 132970087 132970237 132970177 Y CHFR,ANKLE2,FBRSL1 NA GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL IMR90 Hi-C 24141950 FBRSL1 93900 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 132970628 132971029 132970787 Y CHFR,ANKLE2,FBRSL1 NA GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL IMR90 Hi-C 24141950 FBRSL1 93108 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr12 133065143 133065512 133065289 Y NA FBRSL1 NA NA NA NA FBRSL1 1006 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 133528012 133528357 133528019 Y NA CHFR,ZNF605 NA NA NA NA CHFR 2533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr12 133688468 133688629 133688567 Y NA ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 16430 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 NA NA NA NA NA ZMYM2 162595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 20735697 20735843 20735813 Y PSPC1,ZMYM5 NA NA NA NA NA ZMYM2 204887 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 22009901 22010336 22010211 Y NA ZDHHC20 NA NA NA NA ZDHHC20 21173 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 22111458 22111566 22111512 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 79949 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr13 22545143 22545315 22545232 Y NA NA FGF9 IMR90 Hi-C 24141950 RPS7P10 343989 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr13 24131522 24131823 24131734 Y SACS TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 10686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 24365850 24365860 24365855 Y NA NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 95168 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 24543608 24543809 24543709 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 82050 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 24821440 24821584 24821512 Y NA NA NA NA NA NA PARP4 263364 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 25886402 25886789 25886419 Y NA MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 12740 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr13 26475840 26476144 26475975 Y CDK8 NA NA NA NA NA RNF6 318647 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 26551633 26551678 26551661 Y NA NA NA NA NA NA RNF6 243113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 27166168 27166184 27166175 Y GPR12,WASF3 WASF3 NA NA NA NA WASF3 36328 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 27728821 27729155 27728988 Y USP12 USP12 NA NA NA NA USP12 14878 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 28010544 28010826 28010685 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 11913 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 28167075 28167372 28167253 Y NA LNX2,POLR1D NA NA NA NA LNX2 25169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 28615672 28615941 28615791 Y PAN3 NA NA NA NA NA PAN3-AS1 94389 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 28997275 28997445 28997347 Y PAN3,POMP NA NA NA NA NA EEF1A1P3 210625 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 29045646 29045856 29045744 Y PAN3 NA NA NA NA NA POMP 185385 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 30812389 30812594 30812492 Y NA NA NA NA NA NA PRDX2P1 55690 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA HSPH1 250589 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 31580661 31581221 31580916 Y NA NA USPL1,C13orf33,TEX26-AS1,KATNAL1 IMR90 Hi-C 24141950 HSPH1 153304 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 32324057 32324474 32324315 Y NA NA NA NA NA NA EEF1DP3 94504 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 32433681 32434084 32433895 Y NA EEF1DP3 NA NA NA NA EEF1DP3 14703 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 32539898 32540079 32539992 Y N4BP2L1 NA NA NA NA NA FRY 63358 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 32620673 32620873 32620777 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY FRY NA NA NA NA FRY 17236 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr13 32623844 32624078 32623961 Y NA FRY NA NA NA NA FRY 20407 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 32625512 32625609 32625561 Y NA FRY NA NA NA NA FRY 22075 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 32688606 32688996 32688801 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2 NA NA NA NA NA FRY 85169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 33788488 33788595 33788542 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 134172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 33841256 33841381 33841376 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 81386 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 33927374 33927704 33927592 Y NA STARD13 NA NA NA NA STARD13 4607 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 34216569 34217156 34216982 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 173030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 23.167577967674 chr13 34664689 34665025 34664857 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 274503 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr13 34729958 34730262 34730146 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 339772 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.55686168896433 chr13 34914782 34915013 34914898 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 524596 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr13 35322323 35322497 35322408 Y NBEA NA NA NA NA NA NBEA 191927 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr13 35778543 35778756 35778650 Y NBEA,MAB21L1 NA NA NA NA NA NBEA 264119 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 35923856 35924125 35924012 Y NBEA NA NA NA NA NA NBEA 409432 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 36054193 36054594 36054324 Y NA NA NA NA NA NA NBEA 539769 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 40690248 40690533 40690364 Y NA NA FOXO1 IMR90 Hi-C 24141950 COG6 462484 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 41078224 41078580 41078410 Y NA NA FOXO1,TTL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FOXO1 160154 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 41558714 41559024 41558959 Y C13orf15,FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1 NA NA NA NA NA SUGT1P3 64804 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 41589057 41589218 41589148 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 44192 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 41591294 41591779 41591504 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 41631 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 42942077 42942145 42942079 Y TNFSF11,AKAP11 NA NA NA NA NA AKAP11 97788 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 44817306 44817618 44817554 Y NA NA TSC22D1,SERP2,LINC00284 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERP2 128183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 45941510 45941762 45941695 Y COG3,TPT1 TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30 NA NA NA NA TPT1 28005 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 46095529 46095772 46095647 Y TPT1 NA NA NA NA NA COG3 58469 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 46244354 46244716 46244645 Y NA NA NA NA NA NA COG3 207294 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 46752144 46752602 46752461 Y C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 31404 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 47688288 47688343 47688330 Y NA NA NA NA NA NA HTR2A 219119 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 SUCLA2-AS1 NA NA NA NA SUCLA2-AS1 47390 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 49688107 49688286 49688182 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 131761 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 49757640 49757959 49757800 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 62088 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 23387 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 50661413 50661685 50661628 Y NA MIR16-1,DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 7106 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 51200392 51200766 51200454 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P26 266493 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 51886195 51886377 51886335 Y NA NA FAM124A IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP16 139923 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 52115699 52115709 52115704 Y UTP14C WDFY2 MIR4703,WDFY2,INTS6,DHRS12,LINC00282 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDFY2 40935 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 55208577 55208909 55208656 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 1983733 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 60053889 60054114 60054002 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 682007 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 60835773 60835952 60835863 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 99652 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr13 61157781 61157905 61157871 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 189190 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 64623751 64624068 64623941 Y NA NA NA NA NA NA PCDH20 2623531 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 67298502 67298528 67298515 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 503940 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 67730122 67730387 67730193 Y PCDH9 NA NA NA NA NA PCDH9 72081 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 71362393 71362632 71362470 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 1076698 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 74228674 74228703 74228690 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-10P 465009 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 74276580 74276751 74276632 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 429643 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 74341263 74341518 74341389 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 364876 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 76788256 76788273 76788264 Y NA NA KCTD12 IMR90 Hi-C 24141950 LMO7 595686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 77881758 77881859 77881809 Y SLAIN1 MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 17326 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 77897670 77898015 77897832 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 1170 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 78434917 78435014 78434954 Y NA NA EDNRB IMR90 Hi-C 24141950 SLAIN1 164894 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 80319311 80319640 80319476 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP2 266024 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 80357144 80357292 80357207 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP2 303857 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 80936113 80936309 80936180 Y NA SPRY2 SPRY2 K562 ChIA-PET 22265404 SPRY2 23027 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 85779521 85779874 85779724 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 591749 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 91709082 91709307 91709247 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 288767 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 93361116 93361155 93361136 Y NA GPC5-AS1 NA NA NA NA GPC5-AS1 10712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 93495866 93496249 93496058 Y NA NA NA NA NA NA GPC5-AS1 123999 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr13 95128334 95128746 95128451 Y DCT NA NA NA NA NA TGDS 117765 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 96332135 96332467 96332276 Y NA DNAJC3-AS1,DNAJC3 NA NA NA NA DNAJC3 4742 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 97143722 97143959 97143730 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 439986 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 97877294 97877762 97877400 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 5606 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr13 99562711 99562955 99562841 Y GPR183,STK24 NA NA NA NA NA DOCK9 173924 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 99655287 99655290 99655289 Y NA NA NA NA NA NA DOCK9 81589 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 102565701 102565995 102565836 Y FGF14,FGF14 NA NA NA NA NA TPP2 681358 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 102569627 102570054 102569972 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 677299 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 51.1435211739218 chr13 103557671 103557972 103557679 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 62477 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 107186008 107186474 107186341 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 32038 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 108099145 108099375 108099322 Y FAM155A NA NA NA NA NA LIG4 769341 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 699317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 109909294 109909814 109909611 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 527101 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 110303307 110303445 110303376 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 133470 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 110401088 110401398 110401243 Y NA IRS2 NA NA NA NA IRS2 35517 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr13 110443694 110443751 110443735 Y IRS2 IRS2 MYO16,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 6779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 110521819 110522258 110522077 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 84904 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr13 110781860 110782469 110782431 Y NA NA NA NA NA NA IRS2 344945 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 110950675 110951614 110951198 Y NA NA NA NA NA NA RAB20 260466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 111560939 111561133 111561094 Y NA LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 4283 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 111564894 111565358 111565241 Y RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 58 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr13 111976415 111976735 111976477 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 211509 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 113179985 113180373 113180107 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP3 60108 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 113393010 113393289 113393150 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 50367 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 113585588 113585716 113585676 Y CUL4A,CUL4A MCF2L-AS1 C13orf35,ATP11A,MCF2L GM12878,HELA,K562,H1ESC 5C 22955621 MCF2L-AS1 35422 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr13 113597069 113597276 113597160 Y MCF2L MCF2L-AS1 MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,ChIA-PET 22955621,24141950,22265404 MCF2L-AS1 23862 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 113650051 113650400 113650313 Y MCF2L MCF2L-AS1 NA NA NA NA MCF2L-AS1 28913 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr13 113691953 113691973 113691963 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 70815 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 114770181 114770639 114770503 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 125447 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr13 114890433 114890784 114890662 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 5302 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 NA NA NA NA NA PNP 215492 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA NA NA NA NA NA PNP 216220 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA HAUS4 25387 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 25625433 25625557 25625532 Y NA NA NA NA NA NA STXBP6 107930 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 26369871 26369995 26369970 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 694965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 32670916 32671247 32671221 Y NA NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 126917 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 409598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 34162040 34162301 34162172 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 767261 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 34409916 34410012 34409947 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 519550 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 34472073 34472091 34472083 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 457471 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 34532843 34533079 34532927 Y EGLN3 NA NA NA NA NA SPTSSA 396483 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 34802064 34802306 34802186 Y C14orf147 NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127256 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 35325148 35325514 35325424 Y PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A RP11-73E17.2,BAZ1A NA NA NA NA RP11-73E17.2 16035 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 35346506 35346753 35346630 Y PSMA6,EAPP,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A RP11-73E17.2,BAZ1A NA NA NA NA BAZ1A 3653 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr14 35855857 35856187 35856101 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA RP11-561B11.1 88 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 37119826 37119959 37119893 Y NA PAX9 NA NA NA NA PAX9 4814 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 37317346 37317701 37317507 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA PAX9 192573 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr14 38054173 38054544 38054319 Y NA TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 8508 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 38067310 38067714 38067659 Y NA TTC6,FOXA1 NA NA NA NA FOXA1 65 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr14 38965761 38966052 38965907 Y NA NA NA NA NA NA SEC23A 610798 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 44437752 44437871 44437812 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 926627 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 44804196 44804463 44804330 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 560035 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 49956543 49956745 49956644 Y NA NA NA NA NA NA RPS29 106663 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 50328882 50329315 50329091 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10961 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 50528497 50528810 50528555 Y NA NA NA NA NA NA SOS2 167466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 52145900 52146294 52146052 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 192082 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 52774627 52775077 52774946 Y GNG2,PTGER2 NA NA NA NA NA TXNDC16 242163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 53533673 53533892 53533783 Y NA NA NA NA NA NA DDHD1 84108 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 54035273 54035507 54035390 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD1 417273 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 54443717 54444101 54443910 Y NA NA NA NA NA NA CDKN3 417466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 55569033 55569319 55569207 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 19509 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr14 55574465 55575376 55574639 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 13452 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 55592226 55592437 55592322 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 NA NA NA NA LGALS3 3398 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 56393861 56394247 56394115 Y NA NA NA NA NA NA PELI2 188285 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr14 57282014 57282348 57282082 Y OTX2,OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 451378 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 58637905 58638297 58638125 Y NA UBA52P3,ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26501 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 58911911 58912089 58912000 Y KIAA0586 KIAA0586,TIMM9 NA NA NA NA TIMM9 19579 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 59106687 59106948 59106735 Y NA DACT1 NA NA NA NA DACT1 8002 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 59159760 59159979 59159850 Y NA NA DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 DACT1 61075 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr14 59742406 59742712 59742574 Y DAAM1 NA NA NA NA NA DAAM1 89042 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 59768078 59768328 59768116 Y RTN1,DAAM1 NA NA NA NA NA DAAM1 114714 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 59861080 59861273 59861260 Y DAAM1,RTN1 NA DAAM1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR135 68787 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 61652622 61652735 61652681 Y NA NA SLC38A6,SIX4,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM30B 93823 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 61939634 61940081 61939867 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 152098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 62170336 62170562 62170449 Y NA HIF1A,RP11-618G20.1,HIF1A-AS2 NA NA NA NA HIF1A 10105 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 65172114 65172865 65172414 Y SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 3294 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 65273271 65273625 65273457 Y NA NA NA NA NA NA SPTB 70976 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 65293635 65294075 65293719 Y NA NA NA NA NA NA SPTB 50526 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 65347160 65347466 65347258 Y RAB15 SPTB,CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB SPTB IMR90 Hi-C 24141950 SPTB 2559 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 66510769 66510922 66510841 Y NA NA NA NA NA NA GPHN 461203 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 67763359 67763655 67763501 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 57533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 68005927 68006205 68006064 Y MPP5,TMEM229B,PLEKHH1 PLEKHH1,TMEM229B NA NA NA NA TMEM229B 7471 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 68420679 68421053 68420830 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 136183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 68720004 68720020 68720012 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 166893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 69524252 69524453 69524353 Y ZFP36L1,DCAF5 NA NA NA NA NA ACTN1 80095 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 70447892 70448065 70447949 Y SMOC1 NA NA NA NA NA SMOC1 129044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 70465984 70466470 70466191 Y NA NA NA NA NA NA SMOC1 147136 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr14 70844763 70845165 70845114 Y NA COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP NA NA NA NA COX16 20315 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 71132254 71132379 71132336 Y TTC9 TTC9 NA NA NA NA TTC9 25750 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 71164534 71164679 71164625 Y MED6 NA NA NA NA NA TTC9 58030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 72438276 72438928 72438440 Y NA RGS6 NA NA NA NA RGS6 41120 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 72886764 72887025 72886895 Y DPF3 NA NA NA NA NA RGS6 489608 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 73699013 73699355 73699167 Y NA NA NA NA NA NA PSEN1 97887 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 74229197 74229543 74229334 Y NUMB,ZNF410,C14orf43 NA NA NA NA NA PNMA1 50069 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 75492523 75492557 75492545 Y NA EIF2B2,MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 23678 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 75704218 75704581 75704341 Y NA RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS TMED10,FOS,LOC731223 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.2 19533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 76243945 76244101 76244023 Y TGFB3 NA NA NA NA NA C14orf1 118413 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 76334268 76334588 76334390 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 31891 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 76342346 76342569 76342455 Y BATF,TGFB3 IFT43 TGFB3 IMR90 Hi-C 24141950 IFT43 23910 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr14 76444839 76444980 76444910 Y ESRRB,TGFB3 TGFB3 NA NA NA NA TGFB3 2354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 76446236 76446389 76446309 Y NA TGFB3 NA NA NA NA TGFB3 945 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 66642 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 77195442 77195914 77195699 Y VASH1,IRF2BPL,C14orf166B NA VASH1,ZDHHC22,ANGEL1 IMR90 Hi-C 24141950 ANGEL1 94675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 77495718 77495873 77495815 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 2684 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 77505083 77505447 77505354 Y TMEM63C,TMED8,KIAA1737 IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 12049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 79485942 79486245 79486016 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1221516 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 81509303 81509465 81509322 Y TSHR NA NA NA NA NA CEP128 85442 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr14 81867886 81868104 81867969 Y GTF2A1,GTF2A1 STON2 NA NA NA NA STON2 32705 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 82233009 82233227 82233113 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L 234804 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 83623464 83623477 83623471 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L 1625259 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 84389772 84389929 84389851 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L 2391567 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 87025819 87025837 87025829 Y NA NA NA NA NA NA GALC 1432172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 87546758 87546785 87546784 Y NA NA NA NA NA NA GALC 911224 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 88507103 88507530 88507199 Y GALC GALC NA NA NA NA GALC 49094 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 88786403 88786557 88786480 Y NA NA NA NA NA NA SPATA7 62711 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 89770346 89770725 89770409 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA TTC8 481849 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 90875651 90876041 90875751 Y NA RPL21P11,CALM1 NA NA NA NA CALM1 14805 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 91069038 91069054 91069046 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 208192 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 91102939 91103218 91103079 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 177605 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 91393752 91394149 91393951 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 112929 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 91528012 91528136 91528074 Y SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5 C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA RPS6KA5 3032 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 91863961 91864070 91864025 Y C14orf159,CCDC88C CCDC88C NA NA NA NA CCDC88C 18118 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 92211789 92212017 92211903 Y ATXN3,SMEK1 NA NA NA NA NA FBLN5 200314 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 94748201 94748526 94748499 Y SERPINA6,SERPINA5,SERPINA4,SERPINA3,SERPINA11,SERPINA1,SERPINA10,SERPINA10 SERPINA6 NA NA NA NA SERPINA6 39205 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 95691488 95691499 95691495 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 69141 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 97875296 97875460 97875409 Y NA NA NA NA NA NA VRK1 613655 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 99132884 99133181 99132894 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 812035 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 99709481 99710408 99709988 Y BCL11B NA NA NA NA NA SETD3 234808 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 3288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr14 100905618 100905757 100905695 Y BEGAIN NA BEGAIN IMR90 Hi-C 24141950 WARS 64476 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 100952760 100952992 100952839 Y NA NA NA NA NA NA WARS 111618 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 102176439 102176788 102176690 Y PPP2R5C RP11-1029J19.5,PPP2R5C PPP2R5C,LINC00239 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-1029J19.5 18657 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr14 102530459 102530762 102530662 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 73078 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 102554875 102555215 102555129 Y HSP90AA1 WDR20,HSP90AA1 NA NA NA NA WDR20 48625 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 103781496 103782004 103781810 Y EXOC3L4,TNFAIP2 EIF5 RCOR1,EIF5,MARK3,CDC42BPB,LOC100131366,TNFAIP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF5 15877 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 103954462 103954719 103954539 Y MARK3,KLC1 CKB,TRMT61A NA NA NA NA CKB 32729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 104993565 104993828 104993574 Y NA NA KIF26A IMR90 Hi-C 24141950 TMEM179 76156 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 105546439 105546836 105546640 Y NA NA BTBD6,BRF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA4 60954 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.99398580156195 chr14 106029905 106030244 106030075 Y NA TMEM121 NA NA NA NA TMEM121 38965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 106164516 106164556 106164555 Y NA NA NA NA NA NA TMEM121 173576 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr14 106324206 106324758 106324477 Y TEX22 NA NA NA NA NA TMEM121 333266 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 20596893 20597220 20597190 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 2234175 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 20616457 20616559 20616506 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 2214836 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr15 25018281 25018456 25018384 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 48338 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 25577365 25577592 25577422 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 104536 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 25587380 25587405 25587393 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 94723 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 25913612 25913652 25913632 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 231484 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 26958560 26958904 26958869 Y NA NA NA NA NA NA GABRB3 223782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 28233683 28233845 28233764 Y NA NA NA NA NA NA APBA2 893784 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 28342283 28342646 28342468 Y OCA2 NA NA NA NA NA APBA2 784983 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 29407243 29407640 29407337 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA NDNL2 152393 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA FAM189A1 161595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 30315678 30315833 30315756 Y NA NA NA NA NA NA TJP1 56610 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 32020218 32020316 32020267 Y NA NA OTUD7A IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 403160 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 32974763 32975144 32974961 Y NA SCG5 NA NA NA NA SCG5 42886 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 33124594 33124991 33124793 Y NA NA NA NA NA NA SCG5 192717 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 33125525 33125772 33125733 Y NA NA NA NA NA NA SCG5 193648 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 33148173 33148432 33148370 Y GREM1 NA NA NA NA NA SCG5 216296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 33188603 33188636 33188634 Y NA NA NA NA NA NA SCG5 256726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 35989992 35990298 35990145 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 711504 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 37207397 37207450 37207424 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 182090 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 37883182 37883347 37883221 Y NA NA NA NA NA NA MEIS2 491678 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 38157700 38157714 38157707 Y NA NA NA NA NA NA SPRED1 384813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr15 38944064 38944182 38944113 Y RASGRP1,C15orf53 NA FAM98B,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 199736 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 39416453 39416514 39416484 Y NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 454766 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 39563210 39563560 39563357 Y THBS1 NA NA NA NA NA THBS1 307720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 39619186 39619513 39619323 Y NA NA C15orf53,THBS1,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 251767 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 39702122 39702492 39702291 Y NA NA THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 168788 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 39985163 39985564 39985388 Y NA NA NA NA NA NA FSIP1 87467 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 40385571 40385715 40385643 Y BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 13378 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 41138213 41138409 41138269 Y RHOV,SPINT1,SPINT1 ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 3997 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 41199675 41199878 41199759 Y DLL4 RHOV,VPS18,DLL4,CHAC1 DLL4 IMR90 Hi-C 24141950 VPS18 15047 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 42261117 42261163 42261140 Y EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 1613 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 NA PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 86648 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 44161980 44162105 44162047 Y NA MFAP1,WDR76 NA NA NA NA WDR76 44819 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 44181815 44182145 44181980 Y NA NA NA NA NA NA WDR76 64654 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 44869897 44870156 44869963 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 42642 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 45005185 45005759 45005376 Y CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3510 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 45784407 45784611 45784453 Y C15orf48,SQRDL,PLDN SLC30A4 NA NA NA NA SLC30A4 28394 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 46441434 46441833 46441634 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 520088 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 48104672 48105061 48104769 Y NA NA SEMA6D IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2270N23.1 83540 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr15 49217829 49218211 49218108 Y SHC4 EID1,SHC4 NA NA NA NA SHC4 35430 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 49801788 49802033 49801795 Y NA NA NA NA NA NA DTWD1 109144 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 50475759 50476090 50475833 Y SLC27A2 SLC27A2 NA NA NA NA SLC27A2 3366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 50551577 50551761 50551665 Y ATP8B4,GABPB1,SLC27A2,HDC NA NA NA NA NA SLC27A2 79184 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 50633863 50634132 50634006 Y ATP8B4,HDC,USP8,GABPB1 GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 11393 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 50634288 50634665 50634477 Y NA GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 10860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 51212270 51212627 51212449 Y NA AP4E1 NA NA NA NA AP4E1 13401 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 51477619 51477870 51477745 Y SPPL2A,DMXL2 NA NA NA NA NA AP4E1 278750 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 53063704 53063805 53063755 Y NA ONECUT1 NA NA NA NA ONECUT1 17468 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 55273105 55273417 55273157 Y NA NA NA NA NA NA RSL24D1 213848 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 55559597 55559729 55559672 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 49429 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 55928441 55928509 55928475 Y NA NA NA NA NA NA PRTG 104779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 56127522 56127639 56127539 Y NA NA NA NA NA NA PRTG 94234 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 56162319 56162688 56162565 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4 121256 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 57814441 57814703 57814560 Y CGNL1 NA NA NA NA NA GCOM1 67403 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 57853638 57853874 57853726 Y NA GCOM1,MYZAP,POLR2M NA NA NA NA GCOM1 28232 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr15 57857567 57857833 57857701 Y NA GCOM1,MYZAP,POLR2M NA NA NA NA GCOM1 24273 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 57946197 57946519 57946360 Y NA NA NA NA NA NA POLR2M 63966 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 58551930 58552325 58552121 Y NA NA SLTM,ADAM10,FAM63B,LIPC IMR90 Hi-C 24141950 LIPC 148443 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr15 58939079 58939427 58939418 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 100750 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 59646649 59647004 59646975 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 15888 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 59862569 59862935 59862765 Y NA GCNT3 NA NA NA NA GCNT3 22139 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 60700608 60701055 60700809 Y NA ANXA2 NA NA NA NA ANXA2 7526 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 60867318 60867604 60867466 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 97941 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 60927699 60928017 60927821 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 158322 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 60937521 60937640 60937631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 168144 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 61145347 61145714 61145592 Y NA NA NA NA NA NA RORA 373804 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 61191372 61191904 61191714 Y NA NA NA NA NA NA RORA 327614 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 61264927 61265345 61265257 Y NA NA NARG2 IMR90 Hi-C 24141950 RORA 254173 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 61505182 61505193 61505186 Y RORA RORA NA NA NA NA RORA 14325 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 61520020 61520614 61520340 Y RORA RORA NA NA NA NA RORA 502 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 62207321 62207567 62207441 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 143105 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 62574155 62574333 62574245 Y NA NA NA NA NA NA TLN2 106392 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr15 63208487 63208634 63208561 Y NA RP11-244F12.1 TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-244F12.1 34738 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 63602976 63602991 63602984 Y NA APH1B NA NA NA NA APH1B 36759 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 63766170 63766327 63766326 Y HERC1,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 28466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 63871063 63871418 63871089 Y NA USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 20370 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 PLEKHO2 3880 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 65174333 65174776 65174649 Y OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 PLEKHO2,ANKDD1A NA NA NA NA ANKDD1A 27325 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 65185651 65186463 65186157 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 ANKDD1A NA NA NA NA ANKDD1A 15638 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr15 65589242 65589632 65589437 Y NA RNU5A-1,PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 1324 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 66125063 66125305 66125185 Y NA DENND4A SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND4A 42432 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr15 66446289 66446658 66446570 Y DIS3L,DIS3L NA NA NA NA NA MEGF11 97427 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 66701075 66701322 66701144 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 SNAPC5,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,ZWILCH,SNORD16 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 23920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr15 67385827 67386130 67385989 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 31726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 67606820 67606971 67606914 Y NA NA NA NA NA NA AAGAB 61287 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 67926783 67927143 67926830 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 93736 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA CALML4 54729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr15 68644845 68645256 68644912 Y PIAS1 NA NA NA NA NA FEM1B 76704 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 69114506 69114876 69114758 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA ANP32A 3270 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 69385602 69385765 69385704 Y NA NA NA NA NA NA GLCE 65158 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 69826034 69826378 69826206 Y NA NA C15orf50,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 82911 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 70146031 70146330 70146181 Y NA NA NA NA NA NA TLE3 242185 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 70160829 70160983 70160930 Y TLE3 NA NA NA NA NA TLE3 227532 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 70827382 70827642 70827515 Y NA NA TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 226290 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 71144876 71145062 71144944 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 378 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 72226785 72227154 72226872 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 177445 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 72270951 72271133 72271042 Y GRAMD2 NA NA NA NA NA SENP8 133466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 72468614 72468846 72468820 Y NA GRAMD2 SENP8 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD2 19280 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 73478919 73479295 73478923 Y NA NA NA NA NA NA NEO1 136868 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 74226590 74227025 74226821 Y NA NA NA NA NA NA STOML1 57938 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA STOML1,PML NA NA NA NA STOML1 35515 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr15 74343707 74344076 74343754 Y NA NA NA NA NA NA PML 58693 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 74536866 74536980 74536923 Y NA RP11-60L3.1,CCDC33 NA NA NA NA CCDC33 29253 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 74666695 74666987 74666837 Y CLK3,ARID3B NA NA NA NA NA SEMA7A 57821 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 75250602 75250974 75250783 Y RPP25 COX5A,SCAMP5,RPP25 NA NA NA NA RPP25 2797 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 75288966 75289325 75289146 Y CPLX3,ULK3,SCAMP5 SCAMP5,RPP25,PPCDC NA NA NA NA PPCDC 24571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 76574080 76574224 76574152 Y NA ETFA NA NA NA NA ETFA 27589 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 76901664 76901845 76901842 Y SCAPER NA NA NA NA NA SCAPER 293940 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 77049228 77049527 77049378 Y NA NA NA NA NA NA SCAPER 146258 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 77579824 77580262 77579914 Y NA NA NA NA NA NA PEAK1 130224 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 78343418 78343565 78343498 Y IREB2,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 24501 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 78368268 78368362 78368315 Y TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 202 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 79315517 79315838 79315652 Y NA NA NA NA NA NA CTSH 75601 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 80712071 80712357 80712214 Y NA ARNT2 NA NA NA NA ARNT2 17379 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 80771335 80771476 80771406 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 76643 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 80772387 80772765 80772517 Y ARNT2,KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 77695 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 80880322 80880600 80880404 Y ARNT2 NA NA NA NA NA ARNT2 185630 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 81277983 81278007 81277997 Y NA MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2212 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 81387226 81387398 81387312 Y NA NA IL16,C15orf26 IMR90 Hi-C 24141950 IL16 62518 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 82050341 82050360 82050353 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 286122 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 82562088 82562478 82562339 Y NA EFTUD1,FAM154B NA NA NA NA FAM154B 8937 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 83376680 83377056 83376874 Y NA RP11-752G15.4,AP3B2,RP11-752G15.6 NA NA NA NA AP3B2 14 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 83680959 83681167 83681099 Y NA FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 2566 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 83733499 83733939 83733822 Y WHAMM BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA BTBD1 167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr15 83817881 83818018 83817954 Y NA TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 43722 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 83857860 83858021 83857985 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16749 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 86165783 86166027 86165915 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 170234 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 86246557 86246765 86246709 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 89496 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 86337060 86337529 86337372 Y NA KLHL25 NA NA NA NA KLHL25 799 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 87227426 87227675 87227551 Y NA NA NA NA NA NA LINC00052 890485 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 88021101 88021401 88021180 Y NA NA NTRK3,AGBL1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00052 96759 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 89328925 89329315 89329120 Y NA NA ACAN,HAPLN3 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 125327 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 89638395 89638800 89638498 Y ISG20,HAPLN3,ABHD2 ABHD2 NA NA NA NA ABHD2 9705 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 89664635 89664981 89664666 Y NA ABHD2 NA NA NA NA ABHD2 35945 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr15 89727640 89727726 89727722 Y ABHD2 NA NA NA NA NA FANCI 57454 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 90577561 90577868 90577654 Y AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 34937 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 90578178 90578635 90578479 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 35554 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 90578762 90579351 90578884 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 36138 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 90604221 90604520 90604374 Y ANPEP,ZNF710,IQGAP1,CIB1 IDH2 NA NA NA NA IDH2 39216 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 90605708 90605863 90605756 Y NA IDH2 NA NA NA NA IDH2 37873 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 90649995 90650276 90650136 Y NA IDH2 NA NA NA NA IDH2 6259 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr15 90701535 90701765 90701609 Y ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1 SEMA4B IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 71 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 90722818 90722829 90722824 Y ZNF774 SEMA4B SEMA4B MCF7 ChIA-PET 22265404 SEMA4B 20982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr15 91107423 91107655 91107549 Y UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,C15orf58,IQGAP1,CRTC3 CRTC3 NA NA NA NA CRTC3 36266 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 92293461 92293635 92293548 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 101290 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 92400967 92401402 92401150 Y SLCO3A1 SLCO3A1 NA NA NA NA SLCO3A1 6042 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 92486330 92486707 92486433 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 91405 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 92497568 92497970 92497770 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 102643 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 92674353 92674494 92674375 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 152577 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 93012777 93012983 93012904 Y C15orf32 NA NA NA NA NA NPM1P5 185706 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 93131436 93131762 93131609 Y RGMA,C15orf32,FAM174B NA NA NA NA NA RP11-386M24.4 143663 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 93180228 93180540 93180295 Y NA NA NA NA NA NA RP11-386M24.4 94885 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 93230839 93230845 93230842 Y ST8SIA2,C15orf32 RP11-386M24.4 SLCO3A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-386M24.4 44580 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 93354824 93354998 93354897 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3710 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.24548935117146 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 93633328 93633692 93633549 Y RGMA,RGMA,RGMA,RGMA NA NA NA NA NA CHD2 208802 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 93864881 93865242 93865107 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 440355 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 95802916 95802946 95802933 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 1030149 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 95847774 95848063 95847919 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2 1019104 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 96155084 96155099 96155092 Y NA NA NR2F2,LOC400456,LOC145820 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 712068 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 98044402 98044848 98044694 Y ARRDC4 NA NA NA NA NA ARRDC4 415936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr15 99259262 99259477 99259337 Y SYNM NA NA NA NA NA IGF1R 69062 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 99387614 99387887 99387660 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 197414 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 99661093 99661479 99661184 Y NA SYNM NA NA NA NA SYNM 24673 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 99864304 99864757 99864539 Y NA NA NA NA NA NA HSP90B2P 68467 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 99914657 99915195 99914962 Y NA NA NA NA NA NA MEF2A 100175 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 100243855 100244145 100244036 Y NA LYSMD4 NA NA NA NA LYSMD4 27621 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 101102236 101102405 101102321 Y NA ASB7,LINS NA NA NA NA ASB7 38334 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 101690439 101690702 101690610 Y CHSY1 NA NA NA NA NA CHSY1 99435 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 101741612 101741900 101741753 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 48237 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 101790495 101790968 101790609 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 358 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 101834172 101834455 101834316 Y TM2D3,TARSL2,SNRPA1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 685 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr16 151121 151408 151265 Y NA POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 26115 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 369599 369830 369715 Y NA RGS11,PDIA2,AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 30843 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 374352 374895 374583 Y RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L PDIA2,AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 25778 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr16 643606 643989 643708 Y SSTR5,RAB40C,RAB40C PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A NA NA NA NA RAB40C 6249 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr16 651803 652154 651979 Y NA PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90 NA NA NA NA RAB40C 14446 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78 NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr16 858833 859023 858927 Y RHBDL1,FBXL16,SOX8 CHTF18,RPUSD1 NA NA NA NA RPUSD1 22436 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 1052842 1052973 1052908 Y NA NA NA NA NA NA SSTR5 67783 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 1132307 1132794 1132674 Y RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5 SSTR5 NA NA NA NA SSTR5 11551 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 18.3592127291001 chr16 1133120 1133226 1133175 Y RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5 SSTR5 NA NA NA NA SSTR5 12364 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 1175604 1175749 1175663 Y RHBDL1,FBXL16,CACNA1H,BAIAP3,BAIAP3,BAIAP3,SSTR5 CACNA1H CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNA1H 25492 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 1341001 1341384 1341186 Y CACNA1H,BAIAP3 UBE2I,BAIAP3 UBE2I,UNKL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2I 12164 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr16 1349375 1349723 1349678 Y NA UBE2I,BAIAP3 NA NA NA NA UBE2I 3825 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 1381826 1382192 1381930 Y UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3 UBE2I,BAIAP3,GNPTG NA NA NA NA BAIAP3 224 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.24548935117146 chr16 1963457 1963729 1963593 Y HS3ST6 HS3ST6,NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9 C16orf73,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST6 2712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 2407421 2407607 2407514 Y NA ABCA3 NA NA NA NA ABCA3 18674 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRSS22 11760 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 3055976 3056164 3056082 Y NA PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 10282 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 7.86823402675719 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 3202363 3202472 3202417 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 24585 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 3285972 3286117 3286070 Y PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263 ZNF200,ZNF263 NA NA NA NA ZNF200 1751 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr16 3889135 3889287 3889211 Y NA CREBBP NA NA NA NA CREBBP 39440 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 4464344 4465352 4464553 Y NUDT16L1,CORO7 VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA CORO7 8354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr16 4944877 4945061 4944987 Y HMOX2,C16orf5,C16orf5,LOC342346,C16orf71,SEPT12,SEC14L5,ROGDI GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 49534 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 4985283 4985359 4985321 Y NA SEC14L5,PPL NA NA NA NA SEC14L5 20959 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL SEC14L5,PPL UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC14L5 12588 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr16 6070691 6070772 6070742 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 924882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 6564961 6565349 6565155 Y RBFOX1,RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 1419152 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 6882597 6882937 6882663 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 1736788 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 7108004 7108306 7108155 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA METTL22 1605234 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 7354527 7355049 7354969 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1358491 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 10.9281028149405 chr16 7355051 7355694 7355418 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1357846 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 7725716 7726034 7725879 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 987506 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 9237080 9237205 9237143 Y NA NA NA NA NA NA C16orf72 53575 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 9583805 9584097 9583876 Y NA NA GRIN2A IMR90 Hi-C 24141950 C16orf72 400300 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 10710369 10710537 10710438 Y NA EMP2 NA NA NA NA EMP2 37814 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 11058771 11058999 11058871 Y CIITA,SOCS1,CLEC16A DEXI,CLEC16A NA NA NA NA CLEC16A 22426 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 11894292 11894377 11894335 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A,RSL1D1 NA NA NA NA ZC3H7A 5169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 12049208 12049600 12049404 Y NA GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29 SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166B2.1 18900 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 12677677 12677965 12677821 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 217909 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 12861809 12861981 12861895 Y NA CPPED1 NA NA NA NA CPPED1 33893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 15498743 15498890 15498817 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0430 236133 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 15670640 15671032 15670885 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0430 63991 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 7.43110991415957 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr16 16131643 16131874 16131759 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P20 107492 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 17328915 17329184 17329121 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P20 1304764 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 20030794 20030847 20030821 Y NA NA NA NA NA NA GPRC5B 135305 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 20079556 20079735 20079646 Y IQCK,GPRC5B NA NA NA NA NA GPRC5B 184067 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 22201170 22202123 22201439 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13480 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 22633888 22634263 22634075 Y NA NA SLC7A5P2,OTOA,CRYM,CRYM-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RRN3P3 186852 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 23364862 23365207 23364921 Y NA NA NA NA NA NA SCNN1B 77310 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 23377055 23377415 23377279 Y SCNN1B NA NA NA NA NA COG7 85086 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 23431856 23432257 23432204 Y USP31,COG7 COG7 SCNN1B IMR90 Hi-C 24141950 COG7 30244 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 23473263 23473545 23473445 Y SCNN1G,GGA2 COG7 NA NA NA NA COG7 10762 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 23968296 23968621 23968461 Y NA NA NA NA NA NA PLK1 281319 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 24431166 24431395 24431229 Y RBBP6 NA PRKCB IMR90 Hi-C 24141950 RBBP6 115619 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 26014222 26014281 26014252 Y HS3ST4 NA NA NA NA NA ZKSCAN2 746970 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 27149778 27150235 27150058 Y NA NA HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 127880 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 27184245 27184257 27184251 Y NA NA HS3ST4,LOC283888,IL21R IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 93858 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 27240450 27240772 27240769 Y NA NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 37343 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 27248798 27249418 27249027 Y KIAA0556,IL4R,IL21R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 28697 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 27265638 27265791 27265719 Y KIAA0556,IL4R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 12324 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 28839972 28840187 28840086 Y CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA ATXN2L 7616 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 30458943 30459145 30459094 Y SEPHS2 ZNF771,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SEPHS2 3441 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 30579441 30579843 30579693 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689 ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF785 NA NA NA NA ZNF688 2212 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 30994228 30994553 30994360 Y VKORC1,HSD3B7 ORAI3,SETD1A,STX4 NA NA NA NA HSD3B7 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 31880759 31881790 31880862 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 KIAA0664L3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF267 1289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 31888166 31888535 31888469 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5087 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 33509690 33509798 33509723 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 1626611 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 33948799 33949141 33948910 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2065720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 33971109 33971442 33971126 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2088030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 34978345 34978669 34978507 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 3095266 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 46392244 46392645 46392447 Y NA NA NA NA NA NA SHCBP1 260893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 46406585 46406940 46406771 Y NA NA NA NA NA NA SHCBP1 246598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 47208056 47208220 47208138 Y NA NETO2 NA NA NA NA NETO2 32148 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 48645394 48646040 48645807 Y SIAH1,N4BP1 N4BP1 NA NA NA NA N4BP1 6019 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 50101332 50101352 50101341 Y NA HEATR3 NA NA NA NA HEATR3 3480 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 51797343 51797505 51797414 Y NA NA SALL1,CYLD,LOC388276 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 119676 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 52526808 52526987 52526898 Y TOX3,TOX3 NA NA NA NA NA TOX3 52727 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 53517834 53518098 53518006 Y NA AKTIP NA NA NA NA AKTIP 18225 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 53802432 53802770 53802659 Y NA NA NA NA NA NA FTO 66557 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 55869661 55869957 55869814 Y NA NA NA NA NA NA AMFR 587493 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 55870128 55870546 55870373 Y NA NA NA NA NA NA AMFR 586904 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 56641054 56641530 56641359 Y MT2A,MT1E MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 943 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 57655846 57656393 57655974 Y FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56 GPR97 NA NA NA NA GPR97 43706 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 58061325 58061443 58061395 Y NA MMP15 NA NA NA NA MMP15 3855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 58445622 58445902 58445848 Y NA NDRG4 NA NA NA NA NDRG4 48848 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 58493284 58493520 58493447 Y NDRG4,NDRG4,NDRG4 NDRG4 NA NA NA NA NDRG4 1230 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 63294066 63294457 63294335 Y NA NA NA NA NA NA TK2 3289990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 67149596 67149757 67149715 Y LRRC29,LRRC29,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70 C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD,HSF4 NA NA NA NA C16orf70 7735 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 67891676 67892114 67891889 Y RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1 NA NA NA NA CENPT 11962 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 67993555 67993691 67993621 Y NA PSMB10,SLC12A4 NA NA NA NA SLC12A4 7813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 68468062 68468227 68468144 Y NA SMPD3 NA NA NA NA SMPD3 12364 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 68794775 68795028 68794920 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 25647 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 69225511 69225823 69225667 Y HAS3 SNTB2 NA NA NA NA SNTB2 6479 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr16 69819174 69819469 69819322 Y NA NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 24965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 70712649 70712861 70712739 Y NA MTSS1L NA NA NA NA MTSS1L 5108 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 70740989 70741599 70741286 Y NA MTSS1L NA NA NA NA MTSS1L 23020 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 70771415 70771759 70771684 Y EXOSC6 NA NA NA NA NA MTSS1L 53446 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 70779915 70780216 70780046 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 52848 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr16 70780634 70780961 70780786 Y MTSS1L NA NA NA NA NA VAC14 52103 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 72897745 72898023 72897884 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 193574 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 73023566 73023933 73023728 Y ZFHX3 NA NA NA NA NA ZFHX3 67664 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 73084736 73084892 73084798 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 6705 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 74494901 74495019 74494960 Y NA NA NA NA NA NA RP11-252A24.2 94763 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 74610751 74610842 74610827 Y NA GLG1 NA NA NA NA GLG1 28170 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 74672577 74672957 74672890 Y NA GLG1,RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 25822 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 75101005 75101352 75101179 Y NA NA NA NA NA NA WDR59 68934 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 75483148 75483204 75483176 Y NA CFDP1,TMEM170A NA NA NA NA TMEM170A 14191 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 75683626 75683906 75683817 Y NA ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA KARS 3085 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 75977962 75977979 75977971 Y CHST5 NA NA NA NA NA RPL18P13 289542 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 76566154 76566369 76566287 Y NA NA NA NA NA NA RPL18P13 298633 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 78498317 78498699 78498508 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 367007 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 78802745 78802853 78802799 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 671435 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 78832287 78832508 78832373 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 700977 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA MAF 724004 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 79040745 79040971 79040807 Y NA NA NA NA NA NA MAF 591640 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 79204565 79204790 79204678 Y NA NA NA NA NA NA MAF 427821 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 79320743 79321105 79320987 Y NA NA NA NA NA NA MAF 311506 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 79613452 79613848 79613650 Y NA MAF NA NA NA NA MAF 18763 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 79622803 79622925 79622863 Y MAF MAF NA NA NA NA MAF 9686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 80401381 80401567 80401473 Y NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 CENPN 636536 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 80694679 80694985 80694832 Y CDYL2 NA NA NA NA NA CENPN 343118 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 81026963 81027197 81027054 Y NA CENPN,ATMIN NA NA NA NA CENPN 10906 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 81434776 81434850 81434813 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 41925 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 81557764 81558419 81558110 Y CMIP NA NA NA NA NA CMIP 80989 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 81684511 81685002 81684729 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 85700 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 81693209 81693442 81693326 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 77260 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 81701284 81701528 81701406 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 69174 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 81763852 81764387 81764185 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 6315 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 81855087 81855491 81855343 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 84385 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 81871176 81871311 81871248 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 100474 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 104576 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 82687467 82688028 82687715 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 29059 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 83029672 83029964 83029912 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 371264 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 83159856 83159879 83159868 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 501448 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 83777004 83777385 83777194 Y HSDL1 NA NA NA NA NA HSBP1 62063 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 83795986 83796265 83796126 Y NA HSBP1 NA NA NA NA HSBP1 43183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 83953538 83953937 83953606 Y NA MLYCD,OSGIN1 NA NA NA NA MLYCD 22807 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 84305711 84305761 84305735 Y NA NA ATP2C2,KCNG4,WFDC1,KIAA1609 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1C 87042 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 84393830 84394115 84393945 Y OSGIN1,CRISPLD2,COTL1 ATP2C2 ATP2C2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP2C2 6018 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 84523883 84523965 84523925 Y NA NA NA NA NA NA ATP2C2 123750 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 84544701 84544717 84544711 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104966 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 84633108 84633501 84633306 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 16182 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 85339922 85340091 85340012 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 280547 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 85346294 85346686 85346622 Y FAM92B NA KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0513 286919 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr16 85418434 85418651 85418593 Y NA NA LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 303028 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 85456219 85456617 85456516 Y FAM92B NA KIAA0182,LOC400548,LOC727710,C16orf74 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 265062 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 85458916 85459273 85459095 Y NA NA KIAA0182,LOC400548,LOC727710 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 262406 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr16 85498599 85498960 85498791 Y KIAA0182 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 222719 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 85558121 85558453 85558347 Y KIAA0182,KIAA0182 NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 163226 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr16 85558951 85559083 85559056 Y KIAA0513,IRF8 NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 162596 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 85902945 85903076 85903011 Y NA NA IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-568J23.1 54803 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 87158204 87158531 87158278 Y NA NA FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 190491 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 87807027 87807287 87807138 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 9429 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 11.3652269275382 chr16 87814047 87814397 87814161 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 16449 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr16 87839693 87840050 87839856 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42095 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 87889826 87890140 87890011 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 10954 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 87978906 87979489 87979213 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 1361 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 87981759 87982021 87981940 Y ZCCHC14,BANP,BANP,BANP BANP CA5A K562 ChIA-PET 22265404 BANP 909 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 88082514 88082829 88082672 Y NA NA NA NA NA NA BANP 101664 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 88683643 88683946 88683795 Y NA ZC3H18,IL17C,CYBA,MVD NA NA NA NA IL17C 19053 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 88836450 88836610 88836518 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 13009 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 89181535 89182183 89181777 Y CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3 ACSF3 NA NA NA NA ACSF3 28752 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 89323118 89323579 89323381 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 41000 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr16 89410388 89410772 89410415 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 128270 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 89893816 89894170 89893993 Y SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 11229 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr16 90087429 90087721 90087595 Y TUBB3,DBNDD1,PRDM7 GAS8,DBNDD1 NA NA NA NA DBNDD1 2893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 90088262 90088277 90088270 Y PRDM7 GAS8,DBNDD1 NA NA NA NA DBNDD1 3726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 189449 189776 189505 Y NA RPH3AL NA NA NA NA RPH3AL 44269 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 198472 198837 198612 Y RPH3AL RPH3AL NA NA NA NA RPH3AL 35208 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 574639 574965 574941 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 15852 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 873777 873849 873813 Y NA TIMM22 NA NA NA NA TIMM22 24508 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 990722 991295 990801 Y NA NA NA NA NA NA TIMM22 92365 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 1510355 1511124 1510942 Y CRK,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 PITPNA,SLC43A2,RILP NA NA NA NA SLC43A2 19056 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 1773985 1774184 1774050 Y SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,WDR81,WDR81,SMYD4 RPA1,SMYD4,AC016292.3 NA NA NA NA AC016292.3 14245 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr17 2652547 2653322 2653300 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 158043 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 2719284 2719546 2719376 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 224780 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 2795960 2796135 2796054 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 301456 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 3600340 3600752 3600646 Y NA TAX1BP3,P2RX5-TAX1BP3,P2RX5,GSG2 NA NA NA NA P2RX5 2642 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 4064613 4064785 4064717 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20151 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 4118580 4118797 4118689 Y NA ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 46477 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 4244674 4245003 4244975 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 22920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 4297689 4298014 4297723 Y NA UBE2G1 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 29766 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 4812526 4812616 4812571 Y SMTNL2,ZNF232,KIF1C RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 28687 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 5245508 5245890 5245691 Y NA NA NA NA NA NA RABEP1 61950 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 5505945 5506132 5506040 Y NA NA WSCD1,AIPL1,FAM64A IMR90 Hi-C 24141950 DERL2 117814 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 6396224 6396493 6396421 Y NA NA NA NA NA NA FAM64A 50489 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 7233457 7233867 7233744 Y WRAP53,POLR2A,DNAH2,DLG4,EIF5A EIF5A,GPS2,NEURL4,KCTD11,TNK1 NA NA NA NA NEURL4 2745 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 7381310 7382154 7381844 Y KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4 TMEM102,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 3428 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 8761203 8761507 8761409 Y PIK3R6 NA NA NA NA NA MYH10 229124 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 9131847 9132010 9131919 Y WDR16,NTN1 NA NA NA NA NA STX8 345898 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 9258278 9258564 9258422 Y NA NA NA NA NA NA STX8 219344 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 9720284 9720569 9720567 Y GAS7 NA USP43,GLP2R IMR90 Hi-C 24141950 USP43 174269 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 10581804 10582199 10582113 Y MYH4 SCO1 NA NA NA NA SCO1 17493 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 11266931 11267244 11267127 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P21 504152 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 14206072 14206436 14206180 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 3672 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 14212324 14213048 14212775 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 9924 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 14256459 14256625 14256586 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 54059 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 14331583 14331800 14331731 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 129183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 16893867 16894139 16894047 Y NA MPRIP MPRIP,FLCN IMR90 Hi-C 24141950 MPRIP 49720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 16944636 16944769 16944688 Y NA MPRIP NA NA NA NA MPRIP 777 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 17204544 17204774 17204670 Y NA COPS3 NA NA NA NA NT5M 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 17302391 17302480 17302436 Y NA RPL13P12 MED9,SMCR9,SREBF1,TOM1L2,PEMT,RAI1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL13P12 17065 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 17439265 17439511 17439439 Y NA RASD1 NA NA NA NA RASD1 41556 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 17686462 17687119 17686716 Y NA NA NA NA NA NA SREBF1 51206 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 17817256 17817562 17817444 Y SREBF1 NA NA NA NA NA TOM1L2 56174 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 19141562 19141875 19141665 Y RNF112,EPN2 NA NA NA NA NA SNORD3D 127613 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 19273192 19273452 19273316 Y FAM83G,MAPK7,MAPK7 MAPK7,B9D1 NA NA NA NA MAPK7 5582 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 19411188 19411542 19411351 Y NA NA EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 B9D1 131693 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 20755696 20755942 20755820 Y NA RP11-344E13.3 NA NA NA NA RP11-344E13.3 13804 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr17 20943914 20944165 20944106 Y NA USP22 NA NA NA NA USP22 908 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 21188812 21189500 21189174 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 2828 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr17 25572576 25572861 25572643 Y WSB1 WSB1 WSB1,KSR1,MIR4522 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 46241 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 25659360 25659787 25659571 Y LGALS9,WSB1 WSB1 NA NA NA NA WSB1 40258 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 25672386 25672687 25672621 Y NA NA KSR1,MIR4522,WSB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 53284 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 25821459 25821654 25821516 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 39789 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 26311866 26312151 26312056 Y NLK NA NOS2,NLK IMR90 Hi-C 24141950 NLK 54612 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 26458610 26458889 26458687 Y NA NA NA NA NA NA NLK 91847 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 26712546 26712820 26712749 Y NA POLDIP2,TMEM199,SARM1,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA VTN 14436 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 26718724 26718918 26718801 Y FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1 POLDIP2,TMEM199,SARM1,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 13297 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 26827709 26827953 26827831 Y NA RPS7P1,UNC119 NA NA NA NA RPS7P1 34895 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 27482450 27482602 27482543 Y NA MYO18A NA NA NA NA MYO18A 22828 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 27791459 27791862 27791696 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 75779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA ABHD15 67210 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 27919265 27919579 27919303 Y NA ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 193 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 27972817 27973010 27972914 Y NA CORO6 NA NA NA NA CORO6 24892 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 28009923 28010244 28010118 Y SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 61998 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 29154156 29154190 29154173 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CTD-2349P21.1 1729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 30923806 30924081 30923942 Y NA NA NA NA NA NA CDK5R1 112169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 31159026 31159151 31159124 Y NA MYO1D NA NA NA NA MYO1D 43044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 31598855 31599016 31598936 Y NA NA NA NA NA NA TMEM98 345927 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 32569579 32570323 32569761 Y CCL8,CCL7 NA CCL11 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF830 716226 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 34045470 34045815 34045642 Y NA RASL10B RASL10B IMR90 Hi-C 24141950 RASL10B 10853 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA TAF15 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 35281857 35282039 35281949 Y LHX1 AATF NA NA NA NA AATF 22136 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 35682301 35682446 35682421 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 82463 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 36899884 36899982 36899923 Y SOCS7,FBXO47,C17orf98 MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA PCGF2 4088 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 37056956 37057300 37057070 Y NA SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 32844 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 37836975 37837156 37837086 Y NA STARD3,PGAP3,MIEN1 NA NA NA NA PGAP3 13894 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 18231 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 38254249 38254664 38254597 Y GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 314 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 38509274 38509600 38509311 Y NA RARA NA NA NA NA RARA 45830 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 38514847 38514935 38514891 Y NA NA NA NA NA NA RARA 51403 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 38601076 38601487 38601191 Y GJD3,IGFBP4 TOP2A NA NA NA NA TOP2A 28874 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 38666550 38666883 38666717 Y TNS4 TNS4 CDC6,TOP2A,IGFBP4,TNS4,CCR7,KRT42P IMR90 Hi-C 24141950 TNS4 10701 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 38703564 38704159 38703879 Y SMARCE1,MED24,CASC3,TOP2A,CCR7 TNS4 NA NA NA NA TNS4 47715 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 40689876 40689925 40689901 Y NA AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX,PSMC3IP NA NA NA NA NAGLU 3686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 41410079 41410140 41410127 Y NA NA IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NBR1 89581 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 42100535 42100831 42100709 Y NA TMEM101,LSM12,G6PC3 NA NA NA NA TMEM101 1221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 ASB16,TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 42706147 42706421 42706320 Y NA NA GPATCH8,C17orf104,RUNDC3A,CCDC43,DBF4B,ITGA2B,FZD2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC43 58726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 43053342 43053729 43053536 Y NA KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA C1QL1 9903 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 43201428 43201633 43201517 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 6334 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 43398309 43398621 43398414 Y NA MAP3K14 LOC100133991,FMNL1,MAP3K14,TEX34,ARHGAP27 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 5895 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 45796870 45797334 45797030 Y TBKBP1,TBX21 NA NA NA NA NA KPNB1 72028 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 45867879 45868153 45868016 Y NA OSBPL7,MRPL10,LRRC46,SCRN2 NA NA NA NA OSBPL7 29047 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 46314423 46314444 46314434 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 135704 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 46315130 46315301 46315294 Y OSBPL7,CDK5RAP3,SKAP1 NA NA NA NA NA SNX11 136411 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 46318516 46318700 46318601 Y SKAP1,HOXB4 NA NA NA NA NA SNX11 139797 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 46377133 46377263 46377218 Y NA NA NA NA NA NA SKAP1 128374 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 46583139 46583523 46583310 Y SKAP1 HOXB-AS3 HOXB2,HOXB3,HOXB4,SKAP1,HOXB8,HOXB1,HOXB9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HOXB-AS3 41469 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr17 46642274 46642589 46642562 Y NA HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 12884 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 46643791 46644035 46643913 Y NA HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 11438 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 46662223 46662405 46662377 Y NA HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 6750 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 46664992 46665342 46665097 Y NA HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB5 3981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr17 46680378 46680812 46680678 Y NA HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB6 24 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 47113510 47113580 47113552 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-42P 88628 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 NA NA NA NA NA ZNF652 167326 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 47765495 47765594 47765536 Y ABI3,GNGT2,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A,SPOP SPOP,SLC35B1 NA NA NA NA SPOP 11899 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 48386710 48386950 48386837 Y NA XYLT2 LRRC59,PPP1R9B,PDK2,SAMD14,SGCA,HILS1,COL1A1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 XYLT2 34503 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 48504874 48504976 48504927 Y NA LRRC59,ACSF2,RSAD1 NA NA NA NA ACSF2 3355 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 48981540 48981884 48981711 Y RSAD1 TOB1,RP11-700H6.1 TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-700H6.1 38190 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 48996944 48997365 48997235 Y UTP18,RSAD1,TOB1 RP11-700H6.1 LOC400604,TOB1,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-700H6.1 22709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 49324611 49324828 49324669 Y MBTD1 MBTD1,UTP18 NA NA NA NA MBTD1 10696 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 50227051 50227445 50227139 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 891162 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 50561518 50561825 50561670 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1225629 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 51059537 51059872 51059705 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1723648 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 54833294 54833574 54833432 Y NA NA NA NA NA NA DGKE 75886 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 55947370 55947506 55947438 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 21953 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 55977135 55977456 55977362 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 51718 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 55978714 55978990 55978831 Y NA NA NA NA NA NA CUEDC1 51694 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 56012688 56013140 56012704 Y NA CUEDC1 VEZF1,SRSF1,CUEDC1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 17544 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 56015325 56015755 56015655 Y CUEDC1 CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 14929 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr17 56426877 56426962 56426920 Y MTMR4,SUPT4H1 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 1492 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 57869540 57869779 57869705 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 46848 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 57902814 57903248 57902913 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 13379 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 60555037 60555507 60555099 Y NA NA MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 MED13 414394 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 60649611 60649792 60649701 Y NA NA MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 MED13 508968 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 60856273 60856623 60856561 Y EFCAB3 NA NA NA NA NA CYB561 665116 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 60877951 60878269 60878188 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 643470 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 478091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 61323201 61323584 61323320 Y NA NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 198155 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA KCNH6,DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 61796482 61796787 61796636 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 19950 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 62138721 62138967 62138947 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,DDX5,ERN1 ICAM2 NA NA NA NA ICAM2 42727 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 62140311 62140756 62140628 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ICAM2 NA NA NA NA ICAM2 44317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 62154723 62155082 62154942 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 NA NA NA NA NA ERN1 51097 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr17 62534383 62534677 62534525 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 32066 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 62537971 62538164 62538007 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 35654 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 11928 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 63140838 63141188 63141013 Y NA RGS9 NA NA NA NA RGS9 9289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 508381 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr17 64518890 64518971 64518949 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 222136 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 64551659 64552047 64551761 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 254905 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 64695504 64695853 64695677 Y NA NA NA NA NA NA CACNG4 263173 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 65525014 65525424 65525241 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 153439 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 66419326 66419636 66419592 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 32018 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 67315191 67315526 67315500 Y NA ABCA5 NA NA NA NA ABCA5 5859 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 67653634 67653769 67653702 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 AC004562.1 302079 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 70113355 70113523 70113439 Y NA SOX9 NA NA NA NA SOX9 1638 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 70395717 70396043 70395724 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 238568 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 70442621 70442708 70442666 Y SOX9 NA NA NA NA NA LINC00511 191903 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 70464411 70464702 70464656 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 169909 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 70484276 70484648 70484400 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 149963 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 70499253 70499546 70499535 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 135065 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 70585200 70585480 70585419 Y NA LINC00511 NA NA NA NA LINC00511 49131 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 70628447 70628581 70628499 Y NA LINC00511 NA NA NA NA LINC00511 6030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 70878609 70878955 70878782 Y CPSF4L NA NA NA NA NA SLC39A11 207896 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 72189661 72189728 72189666 Y KIF19 RPL38,TTYH2 NA NA NA NA RPL38 7993 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 72190680 72190789 72190746 Y NA RPL38,TTYH2 NA NA NA NA RPL38 6932 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 72426026 72426159 72426078 Y DNAI2,GPRC5C GPRC5C NA NA NA NA GPRC5C 7036 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 72512852 72513150 72513057 Y NA CD300C NA NA NA NA CD300C 27132 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 72532761 72533135 72532770 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300LD,CD300C CD300C NA NA NA NA CD300C 7147 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 72734256 72734824 72734605 Y DNAI2,CD300A,CD300LB,SLC9A3R1,CD300LF,RAB37,RAB37 SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 7967 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 72809186 72809552 72809426 Y KIF19,RAB37,KCTD2,FADS6,GRIN2C NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 38564 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 72830385 72830471 72830428 Y NA FDXR NA NA NA NA FDXR 36685 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L OTOP3,CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr17 73007152 73007476 73007237 Y RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 387 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr17 73120387 73120767 73120528 Y GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C ARMC7,NT5C,HN1 NA NA NA NA NT5C 5123 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 73805010 73805399 73805102 Y NA GALK1,UNK,H3F3B,WBP2 NA NA NA NA H3F3B 25036 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA TRIM47 3454 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 74128444 74128992 74128680 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1 EXOC7,FOXJ1 NA NA NA NA FOXJ1 6388 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 74255513 74255743 74255629 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 21059 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 74415585 74415933 74415760 Y MFSD11,RNF157 SPHK1,PRPSAP1,UBE2O NA NA NA NA UBE2O 31355 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 74991518 74991908 74991857 Y NA NA MFSD11,MGAT5B,SEC14L1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00338,SEC14L1 88890 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201905 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 75284936 75285118 75285041 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 204138 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 303838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 75953939 75954304 75954190 Y TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C RNU1-80P TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 39759 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 9.17960636455006 chr17 76023092 76023250 76023241 Y NA NA NA NA NA NA TMC8 101601 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 76265037 76265239 76265129 Y NA NA TNRC6C,LOC100131096,TK1,AFMID,CYTH1 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 56770 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 76312866 76313241 76313131 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 SOCS3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 40917 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 76649052 76649341 76649203 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 127038 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 76764263 76764724 76764556 Y SOCS3,PGS1,USP36,CANT1,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 11655 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 76871917 76872130 76872058 Y PGS1,CYTH1,CANT1 USP36,TIMP2 NA NA NA NA USP36 36394 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 76879876 76880180 76879977 Y NA USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 77032690 77033106 77032818 Y CYTH1,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 15794 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 77663951 77663958 77663954 Y NA NA NA NA NA NA CBX2 85973 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr17 77970749 77971301 77971166 Y CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 36346 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 77990350 77990422 77990386 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 17225 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 78992000 78992331 78992033 Y C17orf56 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 14617 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 79024187 79024380 79024262 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 17239 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 79056542 79056873 79056681 Y NA BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 49594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA SLC38A10 93061 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 102227 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 79439092 79439387 79439261 Y PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1 ACTG1 NA NA NA NA ACTG1 49486 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 79448388 79448678 79448571 Y NPB,AATK,AZI1,BAHCC1 ACTG1 NA NA NA NA ACTG1 40195 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr17 79979263 79979824 79979465 Y NA ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L NA NA NA NA LRRC45 85 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 80245965 80246238 80246057 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 16358 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 80834043 80834346 80834307 Y ZNF750 NA NA NA NA NA TBCD 126103 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr17 80840475 80841074 80840735 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 132535 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr17 81058904 81059222 81058949 Y METRNL NA NA NA NA NA B3GNTL1 51218 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 410446 410458 410452 Y ADCYAP1,ADCYAP1 NA NA NA NA NA THOC1 144396 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr18 1888648 1888915 1888782 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP72 566562 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 2516331 2516615 2516492 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 52893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 2972158 2972493 2972361 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 38820 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 2979905 2979994 2979950 Y SMCHD1 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 31319 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 2981236 2981736 2981487 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2,LPIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 29577 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 3015219 3015501 3015351 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 3906 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 3625326 3625427 3625380 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 215720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 4355972 4356212 4356102 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 946366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 7950764 7950916 7950843 Y NA NA NA NA NA NA SNORA48 651613 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 8661812 8662039 8661951 Y NA NA ANKRD12,CCDC165,TWSG1,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 54369 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr18 9554563 9554587 9554575 Y NA NA NA NA NA NA PPP4R1 58651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 10297142 10297534 10297283 Y NA NA APCDD1,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 APCDD1 155091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 10543130 10543398 10543236 Y NAPG NAPG NA NA NA NA NAPG 19228 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 10544333 10544521 10544427 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 20431 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 10545349 10545498 10545424 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 21447 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 12808880 12809062 12808971 Y NA NA NA NA NA NA CEP76 108104 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 13313521 13313917 13313675 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 324160 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 13382338 13382799 13382497 Y RNMT,PTPN2,CEP192 NA NA NA NA NA RNMT 341860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr18 13500609 13500835 13500766 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 223824 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr18 13539098 13539457 13539245 Y RNMT,C18orf1,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 185202 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 13542199 13542509 13542255 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 182150 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr18 13594708 13595078 13594794 Y C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 129581 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 18517849 18518397 18517887 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 171415 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 20913960 20914007 20913982 Y NA NA NA NA NA NA TMEM241 101918 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 21002815 21003000 21002900 Y RBBP8,RBBP8,NPC1,C18orf8 TMEM241,RIOK3 NA NA NA NA TMEM241 12925 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 23657156 23657540 23657507 Y NA SS18 NA NA NA NA SS18 11641 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 25292089 25292407 25292237 Y NA NA NA NA NA NA KCTD1 1056724 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 27949188 27949221 27949205 Y NA NA NA NA NA NA DSG2 1126785 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 29952485 29952862 29952679 Y NA NA NA NA NA NA RNF138 282667 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 31336306 31336396 31336375 Y NA NA NA NA NA NA ASXL3 179727 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 32674767 32675124 32674837 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 119875 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 33042221 33042422 33042327 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 33533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 33407474 33407836 33407618 Y ZNF24,ZNF396,INO80C NA NA NA NA NA C18orf21 142210 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 35009721 35010039 35009931 Y CELF4 NA NA NA NA NA CELF4 133961 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 35188178 35188197 35188187 Y NA CELF4 NA NA NA NA CELF4 44178 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 42261426 42261651 42261539 Y NA SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 3288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 42295257 42295574 42295401 Y SETBP1,SETBP1 SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 37119 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 43351602 43351892 43351629 Y SLC14A1 SLC14A1 NA NA NA NA SLC14A1 49510 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 43381768 43381900 43381886 Y NA SIGLEC15 EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIGLEC15 21577 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr18 43382830 43382969 43382904 Y NA SIGLEC15 EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIGLEC15 20508 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 43407687 43408063 43407797 Y PSTPIP2,EPG5 SIGLEC15 NA NA NA NA SIGLEC15 4210 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 43830546 43830877 43830624 Y EPG5,PSTPIP2 NA NA NA NA NA C18orf25 79027 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 44605074 44605239 44605157 Y NA NA NA NA NA NA HDHD2 69652 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 45420480 45420806 45420653 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 34709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 45790060 45790073 45790067 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB7C 145050 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 45852472 45852486 45852479 Y NA NA ZBTB7C IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB7C 82637 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 46297484 46297823 46297654 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 234067 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 414813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 46740928 46741364 46741195 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 244353 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 51703852 51704220 51704036 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 44938 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 53060777 53060994 53060923 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 269024 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 53180110 53180413 53180343 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 149605 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 53204965 53205096 53205075 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 124922 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 55095005 55095410 55095044 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 5507 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr18 55105190 55105288 55105239 Y ST8SIA3,ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 4273 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 55108186 55108329 55108231 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 7269 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 55109141 55109496 55109318 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 8224 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr18 55890970 55891630 55891068 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 181371 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 55957381 55957780 55957581 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 247782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 56339458 56339877 56339543 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 73595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 59766177 59766307 59766242 Y NA NA NA NA NA NA PIGN 86044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr18 60828947 60829338 60829223 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 156023 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr18 60874386 60874946 60874584 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 110415 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 60903050 60903417 60903276 Y VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 81944 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 60941193 60941490 60941349 Y BCL2 BCL2 NA NA NA NA BCL2 43871 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 60979120 60979234 60979125 Y BCL2 BCL2 NA NA NA NA BCL2 6127 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 60984165 60984609 60984519 Y BCL2 BCL2,KDSR NA NA NA NA BCL2 752 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 61085026 61085396 61085214 Y VPS4B VPS4B NA NA NA NA VPS4B 2320 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 61642248 61642613 61642430 Y NA SERPINB8 NA NA NA NA SERPINB8 7089 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 67083698 67084057 67083878 Y DOK6 NA NA NA NA NA TMX3 703163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 67862254 67862313 67862284 Y NA RTTN NA NA NA NA RTTN 8868 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 71563069 71563215 71563130 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 249885 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 71731822 71731991 71731885 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 81109 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 71745965 71746280 71746179 Y FAM69C,CNDP1,FBXO15,FBXO15 NA NA NA NA NA FBXO15 66820 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 71749532 71749567 71749550 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 63533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr18 71901673 71901892 71901764 Y NA NA NA NA NA NA CYB5A 55359 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr18 74088486 74089010 74088832 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 116136 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 74205649 74206020 74205889 Y NA ZNF516 NA NA NA NA ZNF516 503 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 74237245 74237630 74237448 Y NA ZNF516 NA NA NA NA ZNF516 32099 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 74766602 74767022 74766743 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF516 561456 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 74767033 74767545 74767189 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF516 561887 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 74767591 74768136 74768025 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF516 562445 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 74773141 74773504 74773389 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF516 567995 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 74774000 74774964 74774473 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF516 568854 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 74810011 74810388 74810104 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF516 604865 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 76058031 76058292 76058162 Y NA NA SALL3 IMR90 Hi-C 24141950 ATP9B 768993 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 76574789 76574960 76574953 Y SALL3 NA NA NA NA NA ATP9B 252325 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr18 76831132 76831674 76831321 Y NFATC1,NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 3847 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr18 77558494 77558673 77558529 Y NA NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 120693 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 289700 289869 289784 Y C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 307 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr19 383028 383243 383101 Y NA MIER2,C2CD4C NA NA NA NA C2CD4C 23896 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr19 481673 481793 481759 Y PALM,HCN2,FGF22 SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA MADCAM1 5383 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 511222 511648 511350 Y RNF126,GZMM MADCAM1,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA TPGS1 5923 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 789308 789721 789469 Y NA PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 5354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 909116 909504 909461 Y STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22 MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 1736 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr19 934999 935434 935086 Y MIDN,CIRBP MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 11218 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,CNN2,ABCA7 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 1133172 1133384 1133209 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E,GPX4,SBNO2 NA NA NA NA GPX4 31236 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 1133542 1133865 1133752 Y C19orf22,ARID3A,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E,GPX4,SBNO2 NA NA NA NA GPX4 31606 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 1284432 1284856 1284552 Y REEP6,ONECUT3,GAMT,EFNA2 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA MUM1 542 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 1410481 1410741 1410600 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 4913 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 1654223 1654456 1654354 Y NA TCF3 NA NA NA NA TCF3 3619 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 1857160 1857480 1857446 Y NA REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 4087 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 1942393 1942508 1942451 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3205 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 2507206 2507458 2507335 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B GADD45B NA NA NA NA GADD45B 33086 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 2578988 2579272 2579256 Y TMPRSS9 NA NA NA NA NA GADD45B 104868 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 2616819 2617162 2616940 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B NA NA NA NA NA SLC39A3 120988 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 2621859 2622002 2621918 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B,TLE2 NA NA NA NA NA SLC39A3 116148 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 3520804 3521051 3520913 Y NA DOHH,FZR1,HMG20B NA NA NA NA FZR1 16533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 3655813 3656105 3655965 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 42372 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 3683675 3684043 3683874 Y NA PIP5K1C,TJP3 NA NA NA NA PIP5K1C 14434 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 4061604 4061945 4061775 Y SEMA6B,PLIN5 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 2998 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 5046594 5046918 5046679 Y NA NA NA NA NA NA KDM4B 79469 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 5578316 5578496 5578453 Y NA SAFB,SAFB2 NA NA NA NA SAFB 42550 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 5940860 5941142 5941001 Y NA FUT5,NDUFA11,VMAC,RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 35011 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 5968077 5968307 5968208 Y NA RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7846 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 5968660 5968756 5968716 Y PSPN,SLC25A41,TMEM146,PRR22,NRTN,RFX2,ACSBG2 RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7397 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr19 6067299 6067617 6067410 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 91146 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 6087956 6088249 6088075 Y PSPN,SAFB2,FUT5,RFX2 NA RANBP3,LOC100128568 IMR90 Hi-C 24141950 RFX2 109334 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 6587274 6587651 6587637 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 NA NA NA NA NA TNFSF9 58264 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 6766042 6766297 6766158 Y NA GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1 NA NA NA NA SH2D3A 443 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr19 6802447 6802718 6802569 Y DENND1C,TNFSF9,TNFSF14,EMR1,GPR108,VAV1 SH2D3A,VAV1 NA NA NA NA VAV1 31722 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 6892126 6892525 6892314 Y DENND1C,TNFSF14,GPR108,VAV1,EMR1 NA NA NA NA NA VAV1 121401 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 7414639 7414850 7414793 Y NA ARHGEF18 ZNF557,INSR IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 43149 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 7445572 7445841 7445694 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 12158 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 7547395 7547510 7547453 Y STXBP2,EVI5L,ARHGEF18,PNPLA6,PEX11G C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA C19orf45 8352 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 7547905 7548376 7548024 Y STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1 C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA C19orf45 7486 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 7608551 7608716 7608681 Y PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,C19orf59,STXBP2 PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA PNPLA6 11661 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 7816227 7816567 7816322 Y XAB2,FCER2 NA NA NA NA NA TRAPPC5 72498 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 7907381 7907869 7907475 Y PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1 EVI5L,LRRC8E NA NA NA NA EVI5L 14262 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 8075966 8076193 8076120 Y NA ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 7423 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 8115456 8115774 8115631 Y PRAM1,STXBP2,C19orf59 ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 46913 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 8226134 8226320 8226231 Y NA CERS4 FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 43300 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 8272965 8273383 8273152 Y NA CERS4 NA NA NA NA CERS4 3345 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 8593717 8594039 8593972 Y NA ZNF414 NA NA NA NA ZNF414 16669 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 9517572 9518021 9517955 Y NA ZNF266 NA NA NA NA ZNF266 26233 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 9895815 9895899 9895870 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 40593 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 9896233 9896620 9896495 Y ZNF266,COL5A3,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 39872 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 10352370 10352740 10352555 Y KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1 S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1 MRPL4,ICAM1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL4 7837 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 10513154 10513331 10513243 Y ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 940 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr19 10766466 10766790 10766534 Y NA ILF3,QTRT1 NA NA NA NA ILF3 3529 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 11044199 11044446 11044323 Y NA YIPF2,C19orf52,SMARCA4 NA NA NA NA C19orf52 6790 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 11206953 11207150 11207057 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 8915 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 11592904 11593323 11593025 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 PRKCSH,CCDC151,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT NA NA NA NA ZNF653 21415 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 11675625 11675958 11675811 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 7436 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 11804467 11804940 11804795 Y ZNF878,ZNF823,ZNF491 HNRNPA1P10,ZNF823 NA NA NA NA HNRNPA1P10 28622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN NA NA NA NA JUNB 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 12901644 12901726 12901699 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN NA NA NA NA JUNB 1334 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 12947043 12947383 12947213 Y MAST1 JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN,HOOK2,DNASE2 NA NA NA NA RTBDN 2801 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13137197 13137461 13137217 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 32775 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13324184 13324516 13324349 Y MAST1,CACNA1A NA NA NA NA NA IER2 64955 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 13444695 13444933 13444906 Y MAST1,CACNA1A NA NA NA NA NA IER2 185466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13597293 13597592 13597549 Y C19orf57,CACNA1A NA NA NA NA NA CCDC130 242982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13721187 13721366 13721219 Y NA NA CACNA1A,MRI1,C19orf53,ZSWIM4,CCDC130 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 119208 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13732373 13732509 13732441 Y NA NA CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 108065 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13743837 13744244 13743993 Y NA NA CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 96330 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 19.2334609542954 chr19 13907523 13907866 13907763 Y NA MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 3249 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 13954357 13954714 13954441 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 50083 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr19 13995889 13996057 13995977 Y NA CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 18957 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 14089228 14089566 14089336 Y CCDC130,PKN1,CD97,RFX1 DCAF15,RFX1 NA NA NA NA RFX1 26285 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr19 14097142 14097697 14097482 Y CCDC130,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA DCAF15,RFX1,IL27RA NA NA NA NA RFX1 18154 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 14115648 14116111 14115801 Y CCDC130,ZSWIM4,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA IL27RA NA NA NA NA RFX1 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 14189294 14189532 14189398 Y CCDC130,ZSWIM4,NANOS3,DCAF15,RFX1,PKN1,DNAJB1,CD97 IL27RA,SAMD1,PRKACA NA NA NA NA SAMD1 10316 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 14229419 14229865 14229637 Y CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA PRKACA 2523 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 14480472 14481175 14480644 Y ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 CD97,DDX39A NA NA NA NA CD97 8138 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 14499980 14500202 14500091 Y OR7A17,ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,CD97 CD97,DDX39A,PKN1 NA NA NA NA CD97 10667 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 14880267 14880429 14880348 Y NA AC005255.3 NA NA NA NA AC005255.3 20692 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 15321082 15321623 15321224 Y RASAL3 EPHX3 NA NA NA NA EPHX3 20623 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ EPHX3 NA NA NA NA EPHX3 7770 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 17220741 17221250 17221017 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 36150 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 17225282 17225997 17225467 Y SIN3B,CPAMD8 HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 40691 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 18625662 18626077 18625893 Y UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL ELL,FKBP8,KXD1 NA NA NA NA ELL 4860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 18630929 18631259 18631008 Y UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 18811913 18812040 18811994 Y UPF1,SLC25A42,JUND,FKBP8,UBA52,CRTC1 CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 19426 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr19 18852715 18852875 18852814 Y GDF1,GDF15 NA NA NA NA NA CRTC1 60228 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr19 18874702 18875152 18875024 Y NA NA NA NA NA NA UPF1 65595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 19488658 19488936 19488750 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 5699 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 19705357 19705479 19705434 Y NA LPAR2,GMIP NA NA NA NA LPAR2 32260 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,ZNF90,AC006539.2 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 14571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 21767985 21768321 21768201 Y ZNF708,ZNF493,ZNF429,ZNF100 NA NA NA NA NA ZNF429 90501 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 24216985 24217321 24217111 Y ZNF254 ZNF254 NA NA NA NA ZNF254 2709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 27734782 27735200 27734996 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1967248 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 27735229 27735890 27735275 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1966558 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 28232492 28232748 28232631 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1469700 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 28798664 28798976 28798820 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 903472 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 29219593 29219990 29219791 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 482458 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 30198391 30198719 30198555 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 5645 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 31586649 31586851 31586836 Y NA NA ZNF507,TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 URI1 1174098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 32754044 32754196 32754068 Y NA NA NA NA NA NA ZNF507 80304 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 32866000 32866258 32866129 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA DPY19L3 28191 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 33664629 33664677 33664651 Y NA LRP3 NA NA NA NA LRP3 1832 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 33778869 33779131 33779048 Y NA CEBPA NA NA NA NA CEBPA 12339 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 33977879 33978014 33977973 Y SLC7A10 PEPD NA NA NA NA PEPD 32686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 34259901 34260068 34259985 Y NA NA NA NA NA NA CHST8 149040 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 35139249 35139608 35139368 Y NA AC020910.2,ZNF302 NA NA NA NA AC020910.2 26878 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 35605566 35605978 35605759 Y MAG,FFAR1,LGI4 FXYD3,FXYD5 NA NA NA NA FXYD3 834 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 35763871 35764402 35764192 Y FXYD1,FXYD1,HAMP LSR,USF2 NA NA NA NA USF2 5990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 36720266 36720641 36720459 Y ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565 ZNF146,ZNF565 NA NA NA NA ZNF565 14518 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 36891925 36892272 36892205 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP82 15286 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 37156610 37156902 37156838 Y ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461 ZNF461,AC074138.3,ZNF567 NA NA NA NA ZNF461 855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 37424676 37424848 37424761 Y ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 19445 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 39167742 39168127 39167771 Y NA ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 31453 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 40413949 40414284 40414119 Y SUPT5H,SUPT5H CTC-471F3.4 NA NA NA NA CTC-471F3.4 33350 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 41226531 41226793 41226653 Y PLD3,SPTBN4,LTBP4,EGLN2,EGLN2,CYP2B6,ITPKC,RAB4B NUMBL,ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA NA NA NA NA ADCK4 4419 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 41701582 41701929 41701850 Y CYP2A13,CYP2F1 RPL36P16 NA NA NA NA RPL36P16 27816 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL HNRNPUL1 NA NA NA NA HNRNPUL1 36822 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 41804006 41804567 41804366 Y TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 9527 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 42033050 42033361 42033223 Y NA NA LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 88428 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 42069848 42070019 42069937 Y NA NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 125226 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 42239278 42239383 42239331 Y CEACAM7 CEACAM5,CEACAM6 NA NA NA NA CEACAM6 13502 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 42430880 42431141 42430883 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 30401 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 42444277 42444712 42444407 Y POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16830 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 42514619 42514744 42514681 Y ATP1A3 ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 14970 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 42606774 42607144 42606983 Y NA ZNF574,CTC-378H22.1 NA NA NA NA CTC-378H22.1 27563 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr19 42902919 42903213 42903066 Y TMEM145 NA CNFN MCF7 ChIA-PET 22265404 MEGF8 75158 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 44178452 44178782 44178557 Y NA CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 5753 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 44308607 44308871 44308732 Y CADM4 ZNF283 NA NA NA NA ZNF283 20573 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 44555398 44555498 44555444 Y ZNF155,ZNF223 ZNF222,ZNF223,ZNF284,ZNF224 NA NA NA NA ZNF223 1878 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 45100230 45100376 45100298 Y NA PVR CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23 IMR90 Hi-C 24141950 PVR 44722 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 45189303 45189576 45189367 Y RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 PVR NA NA NA NA PVR 44205 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 45352107 45352544 45352311 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 4675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr19 45601584 45601804 45601678 Y FOSB ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 8930 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 45616872 45617353 45617125 Y NA ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 24218 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 45803954 45804164 45804074 Y NA NA NA NA NA NA ERCC2 68012 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 46386037 46386278 46386146 Y OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3 SYMPK,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 59077 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 47059268 47059423 47059384 Y NA GAPDHP38,CALM3 NA NA NA NA GAPDHP38 475 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 47324064 47324441 47324224 Y NA SLC1A5,AP2S1 NA NA NA NA AP2S1 27808 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 47487878 47488175 47487946 Y ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM160 61713 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.80836523857384 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 16792 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 47949356 47949644 47949521 Y NA MEIS3,KPTN NA NA NA NA MEIS3 28576 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr19 48151789 48152128 48151872 Y NA NA NA NA NA NA GLTSCR2 94651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 48657871 48658185 48658028 Y NA PLA2G4C,LIG1 NA NA NA NA LIG1 13675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 49832847 49832906 49832877 Y PTH2 CD37 NA NA NA NA CD37 3522 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 50362574 50362883 50362717 Y PRRG2,MYH14,PNKP FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1,MIR4750 NA NA NA NA PNKP 6283 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 50417620 50417965 50417778 Y NA PNKP,TBC1D17,AKT1S1,MIR4750,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 11994 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 50833837 50834367 50834143 Y MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3 NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA KCNC3 405 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr19 50835103 50835475 50835356 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA KCNC3 331 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 50860908 50861268 50861186 Y PNKP,VRK3,NR1H2 NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 24193 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 15670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 51012062 51012382 51012222 Y KLK6,SYT3,SHANK1 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 228 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 51111018 51111676 51111369 Y NA NA NA NA NA NA JOSD2 98408 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 51166998 51167396 51167198 Y KLK4,KLK6,KLK14,SYT3,LOC342918 NA NA NA NA NA C19orf48 138790 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48,KLK1 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 51339255 51339614 51339393 Y KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3 C19orf48,KLK1,KLK3 NA NA NA NA KLK1 14212 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 52243151 52243317 52243254 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF577 148886 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 53173643 53173679 53173660 Y ZNF83 ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 18070 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 53449736 53449992 53449814 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347,ZNF83 ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 5882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 53635063 53635358 53635174 Y ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347 ZNF160,ZNF415,ZNF347 NA NA NA NA ZNF415 733 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr19 54288550 54288757 54288603 Y ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX AC008753.3 NA NA NA NA AC008753.3 11697 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 54713468 54714085 54713942 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 10858 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 55383279 55383463 55383370 Y TMEM150B,PPP6R1,PPP1R12C,LENG8,LILRA2,LILRA1,LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR NA NA NA NA NA RDH13 197196 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,EPS8L1,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 55721470 55721547 55721521 Y NA SYT5,PTPRH,PPP6R1 NA NA NA NA PTPRH 2596 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr19 55787779 55788010 55787914 Y KIR3DL1,KIR2DS4,KIR3DL2,NCR1,ZNF628,SUV420H2,EPN1,PPP6R1 PPP6R1,HSPBP1,BRSK1 NA NA NA NA HSPBP1 1739 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 55794552 55795020 55794712 Y NA PPP6R1,HSPBP1,BRSK1 NA NA NA NA BRSK1 3112 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 55832834 55833432 55833321 Y FCAR,PPP1R12C,TMEM150B HSPBP1,BRSK1,SUV420H2 NA NA NA NA SUV420H2 15789 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr19 56060798 56061018 56060898 Y NA ZNF579,ZNF524 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 29193 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 28507 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 56098668 56099098 56098905 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 8457 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr19 56118803 56119132 56118967 Y COX6B2 ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 7467 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 56224436 56224703 56224570 Y TMEM150B EPN1 NA NA NA NA EPN1 39844 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 56823857 56823998 56823922 Y ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZNF542 53470 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 56831287 56831644 56831534 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NA NA NA NA ZNF542 45824 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 57020241 57020583 57020445 Y ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28 ZNF471 NA NA NA NA ZNF471 3029 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 57218016 57218204 57218110 Y NA NA NA NA NA NA ZNF71 113384 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 57976528 57976751 57976646 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 10187 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 58175767 58176046 58175802 Y ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551 ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF551 15291 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 58218479 58218613 58218485 Y ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154 ZNF551,ZNF776 NA NA NA NA ZNF551 27142 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 58824678 58824957 58824818 Y ZNF256 ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG-AS1,A1BG,ZNF497 NA NA NA NA ERVK3-1 9963 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr19 59029635 59029989 59029796 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M SLC27A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC27A5 7855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 394418 394640 394594 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA SH3YL1 130020 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 1608037 1608218 1608215 Y NA NA NA NA NA NA TMEM18 932598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA NA NA NA NA NA TMEM18 1046711 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 2468009 2468259 2468065 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 911394 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 62.5087481014599 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 6997134 6997480 6997307 Y RSAD2,CMPK2 RSAD2,CMPK2 NA NA NA NA RSAD2 6457 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 7012587 7012814 7012739 Y CMPK2,RSAD2 RSAD2,CMPK2,RNF144A NA NA NA NA CMPK2 7821 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 8548793 8549175 8549042 Y ID2 NA LOC100506274,LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 172747 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 8551192 8551196 8551194 Y KIDINS220 NA LOC100506274,LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 170726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 8712183 8712281 8712245 Y NA AC011747.4 LINC00299,LOC100506274,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC011747.4 9641 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 8.30535813935482 chr2 8713737 8713978 8713829 Y NA AC011747.4 LOC100506274,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC011747.4 7944 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 9374844 9375591 9375054 Y YWHAQ,ASAP2 ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 29950 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 9411571 9411694 9411610 Y ADAM17 NA NA NA NA NA ASAP2 66677 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 9428594 9428712 9428653 Y NA NA NA NA NA NA ASAP2 83700 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 9879413 9880120 9879773 Y ADAM17 NA ADAM17,YWHAQ,IAH1,KLF11,ITGB1BP1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 101363 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 10489892 10489997 10489924 Y HPCAL1 HPCAL1 NA NA NA NA HPCAL1 48877 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 11075202 11075449 11075335 Y NA KCNF1 KCNF1,FLJ33534,PDIA6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNF1 25139 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 11076268 11076628 11076485 Y NA KCNF1 KCNF1,FLJ33534,PDIA6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNF1 26205 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 11562098 11562245 11562172 Y NA E2F6 NA NA NA NA E2F6 42052 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 11675998 11676466 11676097 Y NA GREB1 NA NA NA NA GREB1 3756 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 11894336 11894526 11894507 Y LPIN1 NA NA NA NA NA LPIN1 78615 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 12466136 12466597 12466183 Y TRIB2 NA LOC100506474,MIR4262,TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 650415 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 12538008 12538228 12538087 Y TRIB2 NA LPIN1,LOC100506474,TRIB2,MIR4262 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 722287 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 15282327 15282677 15282506 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 416777 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 15446828 15446905 15446867 Y NBAS NA NA NA NA NA NBAS 252549 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 15464031 15464396 15464252 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 235058 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 16770965 16771342 16771154 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120J4.1 762902 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 17129381 17129602 17129494 Y NA NA NA NA NA NA VSNL1 588791 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 19811541 19811934 19811810 Y NA NA NA NA NA NA LINC00954 254687 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 20176136 20176469 20176303 Y WDR35 WDR35 NA NA NA NA WDR35 11423 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 20262884 20263152 20263015 Y TTC32 LAPTM4A,RP11-644K8.1 WDR35,MATN3,LAPTM4A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-644K8.1 12989 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 20431248 20431615 20431535 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 8054 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 21518335 21518607 21518471 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 497453 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 23743180 23743526 23743353 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 137092 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 24213695 24213947 24213707 Y NA SDHCP3 NA NA NA NA SDHCP3 48979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA RPL36AP13 63439 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 24491972 24492409 24492370 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP13 62972 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 24535588 24535972 24535848 Y NA RPL36AP13,ITSN2 NA NA NA NA RPL36AP13 19409 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 24552849 24553177 24552876 Y NA RPL36AP13,ITSN2 NA NA NA NA RPL36AP13 2204 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 131763 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 25352140 25352468 25352150 Y DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A NA NA NA NA NA EFR3B 89141 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 25517596 25517908 25517752 Y DNAJC27,DNMT3A DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 45551 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 25545894 25546051 25546003 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 17408 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 26634949 26635470 26635230 Y RAB10 NA NA NA NA NA GPR113 67264 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 26946934 26947339 26946998 Y C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18 AC015977.5,KCNK3,CENPA NA NA NA NA KCNK3 33315 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 27543962 27544264 27544065 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17 NA NA NA NA MPV17 2283 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 27574731 27574755 27574743 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3 NA NA NA NA AC074117.10 2358 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 27877424 27877712 27877568 Y NA GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 6626 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 33886 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 28856660 28856889 28856764 Y NA NA NA NA NA NA PPP1CB 115617 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 28858256 28858580 28858344 Y NA NA NA NA NA NA PPP1CB 113926 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 28939068 28939564 28939261 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 32942 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 29050679 29050871 29050775 Y NA SPDYA,TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 40296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 29229387 29229624 29229598 Y NA NA NA NA NA NA WDR43 113878 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 30704285 30704557 30704478 Y NA LCLAT1 NA NA NA NA LCLAT1 36193 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 30807812 30808169 30807846 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 139720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 32166229 32166498 32166237 Y NA NA NA NA NA NA MEMO1 67801 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 33333903 33334283 33334018 Y NA NA NA NA NA NA TTC27 482804 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 33441691 33441836 33441744 Y LTBP1 NA NA NA NA NA FAM98A 380613 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 33463216 33463618 33463322 Y RASGRP3 NA NA NA NA NA FAM98A 358831 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 33567334 33567407 33567353 Y NA NA NA NA NA NA FAM98A 255042 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 182362 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 37043619 37043714 37043667 Y NA NA NA NA NA NA STRN 147901 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 37576725 37576898 37576775 Y STRN,HEATR5B,PRKD3,QPCT PRKD3,QPCT NA NA NA NA QPCT 7008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr2 37785993 37786119 37786055 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 177492 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 37788822 37789049 37788928 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 174562 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 37842733 37843439 37843059 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 120172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 37853380 37853621 37853410 Y EIF2AK2,EIF2AK2 NA NA NA NA NA CDC42EP3 109990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 37860871 37861279 37860884 Y EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 102332 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 37893644 37893973 37893812 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 69638 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 38007638 38007650 38007644 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 44027 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 38008241 38008581 38008345 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 44630 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr2 38894252 38894471 38894390 Y ATL2,SRSF7,HNRPLL GALM NA NA NA NA GALM 3200 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 39078847 39079086 39078967 Y NA DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21989 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 40264573 40264733 40264653 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD2 260166 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 42236347 42236733 42236554 Y PKDCC PKDCC LOC388942,C2orf91 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 36427 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 42329971 42330163 42329978 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 56811 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 8.74248225195244 chr2 42332532 42332812 42332662 Y EML4 NA EML4,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 59372 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr2 42360195 42360705 42360352 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 33785 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 42481657 42481775 42481735 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 87167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 42783314 42783348 42783329 Y NA NA MTA3 IMR90 Hi-C 24141950 MTA3 63605 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 317515 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 43063239 43063414 43063325 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,ABCG8 IMR90 Hi-C 24141950 MTA3 343530 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 43197884 43198002 43197975 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 253746 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 43560766 43560944 43560854 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L2 109018 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 43705862 43706134 43705998 Y NA NA NA NA NA NA THADA 115051 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 43746950 43747270 43747109 Y ZFP36L2 NA LOC100129726,ZFP36L2 K562 ChIA-PET 22265404 THADA 73915 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 45464369 45464490 45464416 Y NA NA NA NA NA NA SIX2 229800 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 45974142 45974515 45974197 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 97658 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 48718676 48719233 48718981 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R21 52939 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 48737563 48737807 48737675 Y STON1-GTF2A1L,STON1 NA NA NA NA NA PPP1R21 71826 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 50267276 50267578 50267576 Y NA NA NA NA NA NA AC007560.1 787238 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 50743315 50743645 50743480 Y NA NA NA NA NA NA AC007560.1 311171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 50777651 50777841 50777746 Y NRXN1 NA NA NA NA NA AC007560.1 276975 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 51092337 51092826 51092639 Y NRXN1 AC007560.1 NA NA NA NA AC007560.1 37521 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 53966054 53966447 53966241 Y PSME4 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA CHAC2 26482 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 55248216 55248544 55248355 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 89213 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 55552986 55553278 55553132 Y NA NA NA NA NA NA MTIF2 58503 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 56066410 56066608 56066510 Y NA NA EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PNPT1 147365 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 56070301 56070618 56070423 Y NA NA EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PNPT1 151256 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 56112478 56112793 56112711 Y NA NA NA NA NA NA PNPT1 193433 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 56554964 56555264 56554974 Y NA NA NA NA NA NA PNPT1 635919 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 57623387 57623716 57623641 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 509070 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 57861899 57862248 57862095 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 270538 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 58121629 58121888 58121689 Y VRK2,VRK2,VRK2 VRK2 NA NA NA NA VRK2 10898 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 59385638 59385932 59385785 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 919131 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 59983827 59983888 59983858 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 625852 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 61165363 61165465 61165452 Y NA RNU4-51P NA NA NA NA RNU4-51P 28925 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 61586795 61586939 61586907 Y AHSA2,USP34 NA NA NA NA NA USP34 108965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 61917397 61917646 61917558 Y NA NA FAM161A,XPO1 IMR90 Hi-C 24141950 XPO1 153636 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.11973757636671 chr2 62536871 62537441 62537187 Y NA NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 115623 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 62881470 62881867 62881666 Y NA EHBP1 EHBP1,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 EHBP1 17119 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 63961711 63961835 63961773 Y NA NA UGP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC096664.1 52272 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 64364775 64365257 64365170 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 3116 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 64446399 64446520 64446425 Y NA NA PELI1,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 76811 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 64587056 64587400 64587325 Y NA NA AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 LGALSL 91703 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 65058327 65058875 65058618 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 82188 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 65326595 65326952 65326834 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 28288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 65328578 65328848 65328754 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 26392 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 65583296 65583698 65583484 Y NA NA NA NA NA NA SPRED2 74073 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr2 68278313 68278683 68278526 Y NA NA NA NA NA NA C1D 57397 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 68668395 68668537 68668466 Y C1D,PROKR1,APLF FBXO48,APLF PPP3R1 K562 ChIA-PET 22265404 FBXO48 23853 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 68964895 68965352 68965007 Y PLEK,FBXO48,APLF NA NA NA NA NA APLF 272202 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 68994705 68995199 68995002 Y FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25 NA BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR1 243111 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR1 102453 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr2 69536922 69537085 69537004 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 75297 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 69989990 69990667 69990520 Y NA NA GMCL1 IMR90 Hi-C 24141950 GMCL1 64107 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 70823463 70823663 70823562 Y TGFA TGFA NA NA NA NA TGFA 44138 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 71822891 71823089 71822990 Y NA NA NA NA NA NA ZNF638 321200 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 72426245 72426403 72426323 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 624767 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 72732418 72732763 72732614 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 318407 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 74153090 74153262 74153147 Y NA DGUOK NA NA NA NA DGUOK 1137 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 74647656 74647929 74647851 Y SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81 DCTN1,C2orf81,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS NA NA NA NA WDR54 851 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 74778065 74778079 74778072 Y NA LBX2,PCGF1,HTRA2,AUP1,DOK1 NA NA NA NA DOK1 3912 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 75114636 75114786 75114714 Y NA NA NA NA NA NA HK2 55528 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 75894065 75894458 75894192 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 22156 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 76357037 76357141 76357089 Y NA NA NA NA NA NA GCFC2 420922 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 77432935 77433201 77433068 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA AC105399.2 580307 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 78386991 78387304 78387148 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 373483 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 78478830 78479153 78479031 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 465322 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 78525487 78525634 78525561 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 511979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 78632836 78632912 78632895 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 619328 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 78683398 78683574 78683486 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 669890 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 79522415 79522663 79522537 Y CTNNA2 NA NA NA NA NA AC016716.1 865598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 80511562 80511761 80511662 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 123301 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 80648280 80648615 80648448 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 260019 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 83460597 83460801 83460699 Y NA NA NA NA NA NA AC098817.3 417342 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr2 85492413 85492544 85492479 Y SH2D6 NA NA NA NA NA TGOLN2 61004 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA CAPG NA NA NA NA CAPG 29587 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 86554504 86554663 86554584 Y NA REEP1 NA NA NA NA REEP1 8543 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 86922220 86922584 86922381 Y NA RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3 NA NA NA NA RMND5A 22712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 88959127 88959352 88959240 Y NA EIF2AK3,RPIA EIF2AK3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPIA 29810 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 89053744 89054153 89053865 Y EIF2AK3 ANKRD36BP2 NA NA NA NA ANKRD36BP2 9171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 89848673 89848677 89848675 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 785349 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 91960340 91960566 91960493 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2897016 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 92274908 92275112 92275010 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 3211584 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 92309033 92309202 92309197 Y NA NA NA NA NA NA TEKT4 3225976 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 92317324 92317742 92317530 Y NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4 3217436 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 92320856 92321102 92320979 Y NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4 3214076 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 96077364 96077399 96077382 Y NA FAHD2A NA NA NA NA FAHD2A 10895 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 96911483 96911666 96911570 Y DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127 STARD7,TMEM127,CIAO1 NA NA NA NA TMEM127 18066 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 97204407 97205263 97204568 Y NA ARID5A NA NA NA NA ARID5A 3927 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 97522669 97523105 97522935 Y NA CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA ANKRD39 837 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 97561594 97561991 97561828 Y FAM178B ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 27100 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA RNU4-8P 88784 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 99387536 99387795 99387553 Y TSGA10,TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A MGAT4A MGAT4A MCF7 ChIA-PET 22265404 MGAT4A 41947 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 99391741 99391953 99391854 Y TSGA10,C2orf15 MGAT4A NA NA NA NA MGAT4A 46152 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.80836523857384 chr2 100026434 100026453 100026444 Y NA NA NA NA NA NA TXNDC9 71269 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 100036640 100036800 100036773 Y NA NA NA NA NA NA REV1 67697 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 100937334 100937484 100937407 Y LONRF2 NA NA NA NA NA PDCL3 239668 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 101669826 101670190 101670079 Y TBC1D8 NA NA NA NA NA RPL31 53649 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 101944459 101944757 101944675 Y NA RNF149 NA NA NA NA RNF149 21296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 102380179 102380656 102380455 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 68867 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 102649919 102650192 102650054 Y IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2 NA NA NA NA NA MAP4K4 338607 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 102938777 102939102 102938821 Y IL1R2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1 NA NA NA NA NA SLC9A2 295064 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 103390349 103390733 103390541 Y NA MFSD9,TMEM182 NA NA NA NA TMEM182 38982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 106444120 106444569 106444380 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 84766 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 106474357 106474542 106474414 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 115003 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 106484597 106484940 106484748 Y UXS1 NA NA NA NA NA NCK2 125243 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 106809174 106809856 106809272 Y UXS1 UXS1 NA NA NA NA UXS1 379 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 108100579 108100790 108100686 Y NA NA NA NA NA NA ST6GAL2 599015 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 108805860 108806149 108806048 Y NA NA NA NA NA NA SULT1C2 96946 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 108841436 108841459 108841449 Y NA NA SULT1C2P1 IMR90 Hi-C 24141950 SULT1C2 61636 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 111976914 111977297 111977138 Y BCL2L11 NA NA NA NA NA BCL2L11 101959 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 112208180 112208564 112208233 Y BCL2L11 NA NA NA NA NA BCL2L11 333225 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 112420062 112420336 112420200 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 219931 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 113388786 113388926 113388836 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 11042 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 113476608 113476855 113476657 Y POLR1B,IL1A CKAP2L NA NA NA NA CKAP2L 43399 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 113562551 113562581 113562567 Y IL1A CKAP2L CKAP2L IMR90 Hi-C 24141950 CKAP2L 42297 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 113924878 113925123 113925003 Y IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN,CBWD2 NA PSD4 K562 ChIA-PET 22265404 CKAP2L 404624 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 114014908 114015299 114015271 Y NA NA NA NA NA NA RABL2A 367507 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 AC017074.2,SLC35F5 NA NA NA NA AC017074.2 9711 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 115201274 115201661 115201437 Y DPP10 DPP10 NA NA NA NA DPP10 3398 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 115897297 115897567 115897434 Y DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA DPP10 699421 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 115944602 115944633 115944617 Y DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA DPP10 746726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 119067655 119067950 119067737 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 125693 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 120025136 120025424 120025403 Y DBI STEAP3 NA NA NA NA STEAP3 45752 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 121200367 121200763 121200697 Y NA NA NA NA NA NA INHBB 98648 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr2 121943239 121943562 121943401 Y NA NA NA NA NA NA TFCP2L1 97221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 121955043 121955176 121955099 Y CLASP1 NA NA NA NA NA TFCP2L1 85607 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 122226715 122226882 122226860 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC 59575 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 122656153 122656341 122656293 Y NA NA NA NA NA NA TSN 163474 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 123497457 123498157 123497475 Y NA NA NA NA NA NA TSN 1004778 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 125531573 125531803 125531688 Y NA NA NA NA NA NA YWHAZP2 1781936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 127840546 127840814 127840619 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 22117 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 128143711 128144108 128144023 Y SFT2D3,MAP3K2 NA CYP27C1,IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 128147350 128147625 128147497 Y WDR33,SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2 MAP3K2 CYP27C1,IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 3309 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 128266210 128266439 128266348 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L,IWS1 RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 16023 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 128773511 128773726 128773583 Y NA SAP130 NA NA NA NA SAP130 9968 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 131148815 131149203 131148908 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18 PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37235 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 363500 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 131683053 131683224 131683139 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 165809 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA LYPD1 NA NA NA NA LYPD1 6563 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 133561799 133561885 133561850 Y NA NA LYPD1,GPR39 IMR90 Hi-C 24141950 LYPD1 134647 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 135062328 135062641 135062375 Y NA NA NA NA NA NA MGAT5 186774 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 136504457 136504522 136504461 Y NA UBXN4 NA NA NA NA UBXN4 7268 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 136971782 136972392 136972031 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA DARS 230112 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 139226248 139226635 139226522 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA AC097721.2 30633 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 144048951 144048966 144048960 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 1039169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 144380348 144380398 144380373 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 707737 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 145429754 145429863 145429854 Y GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA GTDC1 341619 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 145461218 145461913 145461584 Y GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA GTDC1 373083 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 146317080 146317300 146317190 Y NA NA NA NA NA NA PABPC1P2 1025712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 149017229 149017560 149017414 Y NA NA NA NA NA NA ORC4 240082 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 149416749 149416956 149416876 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 16740 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 149633974 149634183 149633979 Y NA KIF5C NA NA NA NA KIF5C 3155 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 149634441 149634782 149634502 Y KIF5C KIF5C NA NA NA NA KIF5C 3622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 149645940 149646152 149646140 Y KIF5C KIF5C NA NA NA NA KIF5C 15121 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr2 150278954 150279172 150279087 Y NA NA NA NA NA NA LYPD6 94455 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 150999106 150999378 150999253 Y RND3 NA RND3,MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 394147 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 151385444 151385651 151385488 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7874 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 151536085 151536156 151536124 Y RND3 NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 142560 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 151567491 151567674 151567620 Y NA NA NA NA NA NA RND3 173966 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 152144821 152144962 152144854 Y RIF1,RIF1,RIF1,NMI RBM43,NMI NA NA NA NA NMI 250 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 153263916 153264284 153263950 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 74165 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 153362104 153362315 153362141 Y FMNL2 NA NA NA NA NA FMNL2 172353 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 154333342 154333495 154333419 Y RPRM RPRM NA NA NA NA RPRM 20 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 154335936 154336181 154336134 Y RPRM RPRM NA NA NA NA RPRM 2614 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 154495676 154495864 154495770 Y NA NA NA NA NA NA RPRM 162354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr2 157659765 157659881 157659802 Y NA NA NA NA NA NA GPD2 369963 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr2 158039321 158039798 158039630 Y NA NA NR4A2,GALNT5,GPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GALNT5 72312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 44105 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 158117931 158118105 158118018 Y GALNT5 GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 5821 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 158118717 158119062 158118890 Y GALNT5 GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 6607 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 158325907 158326296 158326106 Y CYTIP NA NA NA NA NA ACVR1C 157221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 158673009 158673352 158673181 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 57022 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 160095412 160095531 160095474 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 45779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 161155946 161156394 161156280 Y NA ITGB6 NA NA NA NA ITGB6 29547 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 161173742 161174088 161173899 Y NA ITGB6 NA NA NA NA ITGB6 47343 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 161522878 161523352 161523066 Y TANK,TANK NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 174573 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 AC009299.3 NA NA NA NA AC009299.3 3839 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr2 162843897 162844111 162844002 Y IFIH1 NA NA NA NA NA IFIH1 329102 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 165727413 165727426 165727420 Y NA COBLL1 COBLL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COBLL1 29224 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 166523404 166523752 166523720 Y NA NA NA NA NA NA GALNT3 125440 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 166534089 166534369 166534230 Y NA NA NA NA NA NA GALNT3 114823 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 166555238 166555468 166555315 Y CSRNP3 NA NA NA NA NA GALNT3 93724 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 166671246 166671486 166671366 Y CSRNP3 GALNT3 NA NA NA NA GALNT3 22054 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 166946411 166946569 166946490 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 138058 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 166982475 166982914 166982672 Y SCN1A,SCN1A NA NA NA NA NA TTC21B 174122 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 168263159 168263570 168263327 Y NA NA NA NA NA NA AC074363.1 115478 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 168291941 168292335 168292012 Y B3GALT1 NA NA NA NA NA AC074363.1 144260 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 168366215 168366278 168366264 Y NA NA NA NA NA NA AC074363.1 218534 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 169893346 169893881 169893427 Y DHRS9,DHRS9 NA ABCB11 K562 ChIA-PET 22265404 SPC25 125465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 170573146 170573520 170573335 Y NA PHOSPHO2,KLHL23 NA NA NA NA KLHL23 24148 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 171997679 171997950 171997833 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 87874 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 173111540 173111762 173111691 Y ITGA6 NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 145912 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 173116941 173117298 173117012 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 151313 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 173302497 173302807 173302540 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 12415 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 174016358 174016802 174016556 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 200746 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 174518967 174519016 174518991 Y NA NA OLA1,CIR1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7 301419 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 175085975 175086128 175086062 Y NA OLA1 NA NA NA NA OLA1 25298 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 175708423 175708587 175708507 Y NA NA NA NA NA NA CHRNA1 81223 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 176495464 176495481 176495473 Y NA NA EVX2,HOXD13 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1715 370086 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD13,HOXD11,HOXD10,HOXD9,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4 NA NA NA NA HOXD10 1222 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 177047108 177047317 177047213 Y NA HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4,AC009336.24,HOXD1,HOXD-AS1,AC016739.2 NA NA NA NA HOXD1 3990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 177864233 177864340 177864290 Y NFE2L2,NFE2L2 NA PDE11A IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA3 210951 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 178030162 178030520 178030353 Y NFE2L2 HNRNPA3,AC079305.8 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 44771 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 179864853 179864962 179864908 Y NA NA NA NA NA NA SESTD1 262555 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 179866335 179866441 179866388 Y NA NA NA NA NA NA SESTD1 261076 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 180098781 180098979 180098880 Y NA SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 28538 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 180116495 180116858 180116779 Y SESTD1 SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 10659 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 182311485 182311704 182311492 Y NA NA NA NA NA NA NEUROD1 231899 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 186616540 186616923 186616825 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 731960 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 190032574 190032988 190032786 Y NA NA NA NA NA NA WDR75 271171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 190213422 190213737 190213580 Y NA NA COL5A2,COL3A1,GULP1,MIR1245B IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 90422 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 190523676 190523817 190523747 Y C2orf88 ASNSD1,ANKAR NA NA NA NA ASNSD1 294 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 191217459 191217900 191217739 Y NA INPP1,HIBCH NA NA NA NA HIBCH 10540 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 191377806 191377826 191377816 Y NA TMEM194B NA NA NA NA TMEM194B 19622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 191984586 191984681 191984634 Y NA NA NA NA NA NA STAT1 100900 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 191991210 191991392 191991306 Y STAT4 NA NA NA NA NA STAT1 107524 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 192484958 192485198 192485089 Y OBFC2A NA OBFC2A IMR90 Hi-C 24141950 SDPR 224783 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 192489815 192490209 192490062 Y STAT4,OBFC2A NA OBFC2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDPR 219772 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 147063 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 196424286 196424738 196424564 Y SLC39A10 SLC39A10 SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 13963 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 196425923 196426330 196426251 Y NA SLC39A10 SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 12371 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 197098625 197098768 197098634 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 59398 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 197686451 197686687 197686569 Y PGAP1,C2orf66 GTF3C3 NA NA NA NA GTF3C3 24002 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 197818777 197818924 197818851 Y NA PGAP1 PGAP1,ANKRD44 IMR90 Hi-C 24141950 PGAP1 28257 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 198143933 198144271 198144067 Y SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,PGAP1,ANKRD44 ATP5G2P3,ANKRD44 NA NA NA NA ATP5G2P3 18098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 200579268 200579381 200579325 Y NA NA NA NA NA NA FTCDNL1 134515 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 200912605 200912617 200912611 Y NA NA SPATS2L,KCTD18 IMR90 Hi-C 24141950 TYW5 94146 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 201238754 201239056 201238905 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2L 70150 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 201268506 201268867 201268734 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SPATS2L 99902 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 201273148 201273356 201273255 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SGOL2 99375 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 202079360 202079680 202079556 Y CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10 NA NA NA NA NA CFLAR 100533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 202522160 202522705 202522330 Y NA TMEM237 NA NA NA NA TMEM237 15867 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 204672477 204672504 204672490 Y NA NA RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 274344 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 204676480 204676691 204676598 Y NA NA RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 278347 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 204813975 204814305 204814050 Y CD28,CTLA4,ICOS NA NA NA NA NA AC009498.1 283403 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 205595294 205595620 205595457 Y NA NA NA NA NA NA AC009498.1 497586 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 207076453 207076789 207076513 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS1 54126 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 207348794 207348941 207348896 Y NA NA NA NA NA NA ZDBF2 211407 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 208175027 208175372 208175141 Y NA NA KLF7,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF7 145036 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 208176046 208176541 208176319 Y CREB1,CCNYL1 NA KLF7,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF7 146055 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 208643639 208643724 208643686 Y NA FZD5 NA NA NA NA FZD5 11352 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 208656928 208657357 208657034 Y FZD5 FZD5 PLEKHM3,CCNYL1,FZD5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD5 24641 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 210429278 210429418 210429290 Y MAP2,MAP2 NA NA NA NA NA MAP2 142496 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 211032670 211033036 211032982 Y NA NA NA NA NA NA RPE 167381 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 213400949 213401339 213401014 Y ERBB4 NA NA NA NA NA IKZF2 613812 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 213546106 213546425 213546344 Y IKZF2 NA NA NA NA NA IKZF2 468726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 214108207 214108648 214108600 Y IKZF2 SPAG16 BARD1,SPAG16 IMR90 Hi-C 24141950 SPAG16 38465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 215964526 215964926 215964726 Y NA NA NA NA NA NA ATIC 209614 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 216558345 216558652 216558547 Y NA NA NA NA NA NA MREG 338167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 216695142 216695306 216695226 Y NA NA NA NA NA NA MREG 201513 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 216948718 216948931 216948849 Y NA TMEM169,PECR,XRCC5 NA NA NA NA PECR 3040 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA IGFBP5 NA NA NA NA IGFBP5 937 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 218027339 218027548 218027469 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 469091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 219819543 219819875 219819831 Y RESP18,PTPRN,PTPRN,DNAJB2,CDK5R2,CCDC108 CDK5R2,CRYBA2,AC097468.4 CDK5R2,NHEJ1,TTLL4,WNT6,WNT10A IMR90 Hi-C 24141950 CDK5R2 2502 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV CDK5R2,CRYBA2,AC097468.4 NA NA NA NA CDK5R2 5566 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.24548935117146 chr2 219862366 219862575 219862480 Y FEV CDK5R2,CRYBA2,AC097468.4 NA NA NA NA AC097468.4 2362 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 219972742 219972853 219972823 Y NA IHH LOC100129175,CRYBA2,CCDC108,LOC151300,FEV,MIR375,IHH IMR90 Hi-C 24141950 IHH 49553 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 220460061 220460205 220460133 Y NA OBSL1,STK11IP,SLC4A3 NA NA NA NA STK11IP 377 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 222382501 222382744 222382664 Y EPHA4 NA NA NA NA NA EPHA4 54178 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 222383007 222383509 222383204 Y EPHA4 NA NA NA NA NA EPHA4 53413 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 222435699 222436339 222436058 Y EPHA4 EPHA4 NA NA NA NA EPHA4 583 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 223670470 223670622 223670545 Y NA NA ACSL3,MOGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL3 53030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 223784632 223784923 223784806 Y NA NA NA NA NA NA ACSL3 60980 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 224079705 224079957 224079831 Y NA NA NA NA NA NA KCNE4 165173 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 224428219 224428432 224428353 Y NA SCG2 SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 36789 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 224467803 224467963 224467901 Y SCG2 SCG2 NA NA NA NA SCG2 2582 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 225249837 225250244 225250048 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 197866 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 225621293 225621621 225621457 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 173183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 227048517 227048542 227048530 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 613933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 227110529 227110615 227110572 Y NA NA IRS1,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 551860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 227625202 227625402 227625304 Y NA IRS1 NA NA NA NA IRS1 37073 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 227842377 227842834 227842635 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 144080 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 230470740 230471103 230470968 Y NA NA NA NA NA NA DNER 106171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 231277179 231277351 231277276 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1306 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 231299753 231300176 231299905 Y SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,SP100,SP100 SP100 NA NA NA NA SP100 21096 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 231467403 231467585 231467498 Y GPR55,SP110,SP110,SP140,SP140L,SP100,SP100 NA SP140,SP110,CAB39,SP100,SP140L IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 107975 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 232532385 232532510 232532473 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37095 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 232536483 232536778 232536606 Y DIS3L2,PTMA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 32827 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr2 232537656 232538064 232537748 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 31541 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 232542757 232542767 232542764 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 26838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 232580827 232581056 232580891 Y NA PTMA NA NA NA NA PTMA 11222 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 233096331 233096791 233096507 Y NA NA NA NA NA NA DIS3L2 272376 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 235166155 235166362 235166255 Y NA NA SH3BP4,TRPM8,ARL4C,AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 237335 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 236489079 236489125 236489102 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1-IT1 76684 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA GBX2 407971 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 237685373 237686074 237685499 Y CXCR7 NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 305881 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 237775369 237775464 237775413 Y NA NA IQCA1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 216491 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 237784498 237784842 237784604 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 207113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 238392046 238392381 238392184 Y LRRFIP1,MLPH NA NA NA NA NA MLPH 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 238396973 238397455 238397139 Y NA MLPH NA NA NA NA MLPH 4902 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 238421741 238422134 238421894 Y MLPH MLPH NA NA NA NA MLPH 29670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 238507381 238507559 238507550 Y NA RAB17,LRRFIP1 NA NA NA NA RAB17 698 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 238508822 238509122 238509050 Y RAB17,LRRFIP1 RAB17,LRRFIP1 NA NA NA NA RAB17 565 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 238582267 238582825 238582560 Y LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 48048 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr2 238583352 238583931 238583637 Y UBE2F,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 49133 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr2 238616188 238616491 238616226 Y ILKAP,LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 81969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 238832423 238832667 238832502 Y NA UBE2F NA NA NA NA UBE2F 40802 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 239050654 239050828 239050729 Y KLHL30 KLHL30 NA NA NA NA KLHL30 5291 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr2 239194414 239194788 239194667 Y NA HES6,PER2,TRAF3IP1 LOC643387,LOC151174,HES6 IMR90 Hi-C 24141950 PER2 1955 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr2 240080723 240081253 240081085 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 239877 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 240168373 240168774 240168689 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 152356 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 240867818 240868062 240867906 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA10 94757 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 241309624 241309945 241309791 Y GPC1 NA PP14571,GPC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPC1 63143 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 241771658 241772038 241771862 Y KIF1A KIF1A,AGXT ANKMY1,RNPEPL1,CAPN10,KIF1A,C2orf54,SNED1,PASK,HDLBP,ANO7,PPP1R7 IMR90 Hi-C 24141950 KIF1A 13933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 241845496 241845803 241845554 Y NA AGXT,C2orf54 LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf54 11190 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 242030281 242030580 242030300 Y SNED1,PASK AC005237.4,MTERFD2 NA NA NA NA MTERFD2 9167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr2 242549642 242550327 242549774 Y ATG4B ATG4B,THAP4 NA NA NA NA ATG4B 24301 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 268547 268840 268655 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12 NA NA NA NA C20orf96 550 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr20 290991 291448 291293 Y C20orf54 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 12759 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 453687 453779 453733 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 12490 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 625872 626198 626085 Y NA SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 5816 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 1083260 1083345 1083304 Y SCRT2 PSMF1 RSPO4 IMR90 Hi-C 24141950 PSMF1 8561 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 1310858 1311228 1310987 Y SDCBP2,SDCBP2,SIRPG SDCBP2 NA NA NA NA SDCBP2 2975 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 2090589 2090758 2090698 Y NA STK35 NA NA NA NA STK35 10332 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 2450025 2450398 2450237 Y NA SNORD119,SNRPB NA NA NA NA SNRPB 526 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 2964753 2965068 2964761 Y NA NA NA NA NA NA GNRH2 57200 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 3170247 3170648 3170474 Y NA FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA DDRGK1 12683 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 3188788 3188839 3188809 Y NA UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 1274 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 3286864 3286977 3286928 Y NA NA NA NA NA NA SLC4A11 69028 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 3960925 3961306 3961172 Y PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 NA NA NA NA RNF24 32923 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 4018656 4019040 4018859 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 16104 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 4906233 4906312 4906273 Y RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 NA NA NA NA NA SNORA31 58603 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 4941641 4941708 4941700 Y NA SLC23A2 RASSF2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 47231 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 5070783 5071219 5071039 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 34053 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 5588948 5589498 5589341 Y CDS2,TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 174 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.68261346376908 chr20 5628590 5628895 5628813 Y TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 38918 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 5717960 5718260 5718168 Y C20orf196 C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 10779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 5741425 5741673 5741600 Y NA C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 12386 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 5748625 5748995 5748810 Y NA C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 19586 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 5825010 5825403 5825098 Y NA NA NA NA NA NA CHGB 64673 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 5900000 5900262 5900165 Y GPCPD1,TRMT6 CHGB,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA CHGB 9924 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 5900941 5901075 5900974 Y GPCPD1,TRMT6 CHGB,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA CHGB 10865 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 6094285 6094396 6094341 Y NA FERMT1 NA NA NA NA FERMT1 7795 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 7502070 7502079 7502075 Y NA NA NA NA NA NA RP5-971N18.3 495791 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 7978054 7978163 7978110 Y NA RP5-971N18.3,TMX4 NA NA NA NA RP5-971N18.3 19707 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 8173456 8173854 8173482 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 62632 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 8350099 8350497 8350131 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 239275 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 8619924 8620034 8619979 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 427376 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 9100209 9100421 9100248 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 52799 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 9291356 9291748 9291412 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 243946 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 9384292 9384675 9384295 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 336882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 10492212 10492484 10492413 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 79342 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr20 10501861 10501978 10501938 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 88991 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 12250218 12250236 12250226 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 380847 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 12374037 12374068 12374053 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 504666 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 12578364 12578389 12578377 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 708993 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 13088080 13088439 13088260 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 529148 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 13183309 13183449 13183391 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 434138 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 13211702 13211926 13211792 Y TASP1,ISM1 NA NA NA NA NA TASP1 405661 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 13379016 13379145 13379075 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 238442 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 13380021 13380161 13380091 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 237426 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 13434936 13435260 13435184 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 182327 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 14500869 14501154 14501002 Y NA NA NA NA NA NA MACROD2 526854 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 16562251 16562551 16562401 Y NA KIF16B KIF16B K562 ChIA-PET 22265404 KIF16B 10173 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 17402450 17402801 17402626 Y PCSK2,BANF2 NA NA NA NA NA DSTN 145707 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 17554539 17554936 17554702 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 6031 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 17593106 17593506 17593263 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 44598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 17830949 17831353 17831268 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 110236 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 17839663 17840033 17839936 Y RRBP1,SNX5,SNX5,C20orf72 NA BANF2,RRBP1,BFSP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 101556 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr20 18565876 18566072 18565973 Y CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1 LINC00493,DTD1 NA NA NA NA DTD1 465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 19249139 19249387 19249181 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 486965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 19888107 19888337 19888123 Y NA RIN2 NA NA NA NA RIN2 22942 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 20196841 20197160 20196898 Y NA NA NA NA NA NA INSM1 149605 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr20 20343522 20343915 20343617 Y NA INSM1 INSM1 IMR90 Hi-C 24141950 INSM1 2850 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 20344554 20345237 20344967 Y NA INSM1 INSM1 IMR90 Hi-C 24141950 INSM1 1528 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr20 20347223 20347613 20347293 Y NA INSM1 NA NA NA NA INSM1 458 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 20432950 20433312 20432989 Y C20orf26,INSM1 NA NA NA NA NA INSM1 86185 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.55686168896433 chr20 20499728 20499916 20499822 Y NA NA NA NA NA NA INSM1 152963 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 21058164 21058497 21058329 Y NA PLK1S1 NA NA NA NA PLK1S1 46127 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 21155323 21155529 21155428 Y NA NA NA NA NA NA PLK1S1 50699 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 21501663 21502213 21501986 Y PLK1S1,NKX2-4,NKX2-2,PAX1 NKX2-2,RP5-984P4.4 PLK1S1 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-984P4.4 6627 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 21576434 21576748 21576508 Y NA NA NA NA NA NA RP5-984P4.4 67594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 21967491 21967519 21967505 Y NA NA NA NA NA NA RP5-984P4.4 458651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 22471596 22471813 22471642 Y FOXA2,FOXA2 NA NA NA NA NA LINC00261 85467 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr20 22558447 22558719 22558568 Y FOXA2,FOXA2 LINC00261,FOXA2 NA NA NA NA LINC00261 1167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr20 23206035 23206305 23206209 Y THBD,CD93,GZF1,CST3 NA THBD,CD93 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 123068 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 24510047 24510433 24510242 Y NA NA NA NA NA NA ACSS1 527183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 24603886 24604015 24603951 Y TMEM90B NA NA NA NA NA ACSS1 433601 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 25047846 25048544 25048538 Y NA ACSS1 ACSS1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 10230 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 25071819 25071933 25071899 Y GINS1 ACSS1 ACSS1,VSX1,ENTPD6,PYGB IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 34203 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 25214082 25214352 25214216 Y ENTPD6,PYGB ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 12353 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 25522357 25522633 25522495 Y NA NINL NA NA NA NA NINL 41520 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 25720350 25720533 25720473 Y NA ZNF337,RP13-401N8.1 NA NA NA NA RP13-401N8.1 9321 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 112354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 30194967 30195344 30195216 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 3881 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 30255856 30255976 30255884 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L1 53816 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 30263480 30263875 30263840 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 45917 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 30538610 30538727 30538660 Y DUSP15,DUSP15,DUSP15,TTLL9 PDRG1,XKR7 NA NA NA NA PDRG1 715 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 30793004 30793191 30793072 Y HCK,PLAGL2 PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA PLAGL2 403 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 31373290 31373636 31373312 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B,MAPRE1 MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 25099 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 32093960 32094027 32093984 Y NA CBFA2T2 NA NA NA NA CBFA2T2 18079 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 32400902 32401106 32400958 Y CHMP4B CHMP4B NA NA NA NA CHMP4B 3792 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 32690137 32690399 32690268 Y NA EIF2S2 NA NA NA NA EIF2S2 7739 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 32826582 32826856 32826719 Y TP53INP2 NA EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 70752 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 33100877 33101215 33100990 Y NA DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA DYNLRB1 999 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 33699049 33699250 33699220 Y TRPC4AP,EDEM2 TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 20375 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 33803083 33803443 33803260 Y NA MT1P3,MMP24 TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6 IMR90 Hi-C 24141950 MT1P3 369 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 34127589 34128004 34127717 Y NA NA NA NA NA NA ERGIC3 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA NA LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCAND1 107196 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr20 35019888 35020140 35020089 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP4 127630 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 35083291 35083376 35083331 Y EPB41L1,DLGAP4,NDRG3,KIAA0889,KIAA0889 NA NA NA NA NA RP5-977B1.7 116418 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 35362274 35362463 35362369 Y NA NDRG3,DSN1 NA NA NA NA NDRG3 10018 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 35489284 35489554 35489419 Y NA NA NA NA NA NA SAMHD1 88692 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 35572677 35573004 35572914 Y RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5242 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 35583660 35583902 35583783 Y TGIF2,TGIF2,TGIF2 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5414 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 35923453 35923684 35923588 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 7412 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 35943689 35943832 35943744 Y NA MANBAL,SRC NA NA NA NA SRC 27256 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36007590 36007925 36007762 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC SRC NA NA NA NA SRC 36502 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36045421 36045655 36045607 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 26281 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36048250 36048624 36048494 Y VSTM2L RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 23312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36077757 36077955 36077851 Y NNAT RPL7AP14 SRC,RPRD1B,VSTM2L,GHRH,BLCAP,BPI IMR90 Hi-C 24141950 RPL7AP14 5821 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 21440 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36389387 36389716 36389551 Y NA NA VSTM2L IMR90 Hi-C 24141950 CTNNBL1 68979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36542426 36542653 36542463 Y NA VSTM2L NA NA NA NA VSTM2L 12927 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36550208 36550483 36550346 Y NNAT,VSTM2L VSTM2L NA NA NA NA VSTM2L 20709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36618785 36619379 36619133 Y RALGAPB,RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 40491 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 36621379 36621533 36621455 Y NNAT,VSTM2L TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 38337 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 37229958 37230063 37230010 Y ARHGAP40 NA NA NA NA NA RALGAPB 130499 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 38079028 38079044 38079036 Y NA NA NA NA NA NA DHX35 490086 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 39093469 39093767 39093632 Y MAFB NA MAFB MCF7 ChIA-PET 22265404 MAFB 222113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 39878072 39878223 39878164 Y NA NA NA NA NA NA ZHX3 66089 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 40188226 40188487 40188477 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 56646 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 40193452 40193754 40193691 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 51379 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 42189975 42190335 42190153 Y SGK2,SGK2 IFT52 NA NA NA NA IFT52 27236 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 43540233 43540373 43540312 Y DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L YWHAB,PABPC1L,TOMM34 NA NA NA NA PABPC1L 3530 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 43869504 43869693 43869682 Y DBNDD2,SLPI SLPI NA NA NA NA SLPI 11512 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 43876988 43877346 43877094 Y NA SLPI NA NA NA NA SLPI 3859 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 44001576 44001658 44001579 Y WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT NA NA NA NA SYS1-DBNDD2 11736 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 44136889 44137182 44137082 Y NA WFDC2 NA NA NA NA WFDC2 40543 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 44633606 44634146 44634047 Y PCIF1,CD40,ZNF335 ZNF335,SLC12A5 SLC12A5,NCOA5 IMR90 Hi-C 24141950 SLC12A5 14210 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 44935542 44935954 44935889 Y ZNF334,SLC12A5,CDH22 CDH22 CDH22 IMR90 Hi-C 24141950 CDH22 405 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 45028892 45029133 45029011 Y CD40 SLC35C2,ELMO2 NA NA NA NA ELMO2 30571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 45526625 45526933 45526720 Y NA NA NA NA NA NA TP53RK 210207 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 45599929 45600258 45600137 Y NA NA NA NA NA NA TP53RK 283511 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 45944502 45944683 45944617 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 38884 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 37086 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 23191 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 46116511 46116614 46116567 Y NCOA3 NCOA3 NCOA3,ZMYND8,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 11987 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 46377654 46377949 46377671 Y SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA NCOA3 249053 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 46556797 46557054 46556926 Y NA NA NA NA NA NA NCOA3 428196 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 47040513 47040840 47040677 Y NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 ARFGEF2 495587 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 47386003 47386431 47386144 Y STAU1,PREX1 NA NA NA NA NA ARFGEF2 149996 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 47784409 47784640 47784548 Y PREX1,ZNFX1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 18264 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 47803381 47804147 47803544 Y PREX1,STAU1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 477 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48313235 48313496 48313350 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 14919 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48317822 48318037 48318021 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 10378 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr20 48416880 48416976 48416956 Y B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SLC9A8 SLC9A8,B4GALT5,KCNB1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 10274 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48598723 48598794 48598730 Y B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1 RNF114,SNAI1 NA NA NA NA SNAI1 1187 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48659627 48659945 48659786 Y NA NA UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,SNAI1,SLC9A8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 62091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48707582 48707967 48707775 Y NA UBE2V1 NA NA NA NA UBE2V1 22529 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48760872 48761304 48761158 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 6870 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48763277 48763795 48763638 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 4379 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 48875786 48876183 48875986 Y NA NA PTPN1,LOC284751,FAM65C,PARD6B,CEBPB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 70410 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48921857 48922230 48922089 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 116481 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 48951795 48951969 48951898 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 146419 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 49063008 49063172 49063083 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 61719 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 49120900 49121269 49120978 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 3622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 49130261 49130753 49130448 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 5370 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 49306526 49306915 49306601 Y NA PARD6B PARD6B,PTPN1,EYA2,MIR645 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARD6B 39166 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 49378032 49378227 49378094 Y PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 31204 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 49454379 49454475 49454388 Y NA BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 44948 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 21252 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 49582344 49582455 49582393 Y NA ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 8981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 49720229 49720557 49720393 Y NA NA KCNG1,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS3 146866 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 50021136 50021625 50021333 Y NFATC2 NA NA NA NA NA NFATC2 155745 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 50145288 50145440 50145335 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 31930 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 70300 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 50252715 50253081 50252915 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 75345 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA ATP9A 33530 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 51648602 51648709 51648656 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ2 61656 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 51775056 51775397 51775227 Y TSHZ2,TSHZ2 NA NA NA NA NA TSHZ2 188110 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 51842749 51842980 51842865 Y TSHZ2 NA NA NA NA NA TSHZ2 255803 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 52351984 52352361 52352104 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 127538 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 52374184 52374569 52374228 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 149738 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 52516053 52516507 52516332 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 291607 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 52546811 52547086 52546962 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 275300 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 256247 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 53116440 53116542 53116504 Y DOK5 NA NA NA NA NA PFDN4 294054 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 54984681 54984944 54984781 Y CASS4,CASS4,C20orf43 AURKA,CSTF1 NA NA NA NA CSTF1 19254 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 55838908 55839396 55838948 Y NA NA NA NA NA NA RAE1 84670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 55976268 55976716 55976350 Y RBM38,ZBP1,PMEPA1 MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 11805 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 56421025 56421156 56421091 Y NA NA PMEPA1 IMR90 Hi-C 24141950 HMGB1P1 358942 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 57270107 57270808 57270490 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA NPEPL1 7920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 58402426 58402798 58402570 Y NA NA NA NA NA NA SYCP2 103912 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 54923 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 58631661 58631838 58631749 Y PPP1R3D,C20orf177,C20orf197 NA NA NA NA NA PPP1R3D 118309 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 58784200 58784511 58784424 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R3D 270848 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr20 60033866 60034028 60033960 Y CDH4 NA NA NA NA NA TAF4 604838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 60529765 60530009 60529928 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 108857 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 60735261 60735480 60735370 Y NA LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 18439 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 60933408 60933760 60933692 Y NA MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 6608 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 8.30535813935482 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr20 61585554 61585775 61585703 Y SLC17A9 DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA SLC17A9 3502 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 8.30535813935482 chr20 62527317 62528264 62527831 Y PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5 TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA DNAJC5 2799 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr21 11082328 11082591 11082458 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 1258496 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 11128400 11128724 11128645 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 MIR3648 1304568 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 16222795 16222981 16222977 Y NA NA NRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA13 468990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 16288603 16288806 16288642 Y NA NA NRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA13 534798 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 17568022 17568137 17568068 Y NA NA NA NA NA NA CXADR 1314563 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 18147470 18147769 18147614 Y NA NA NA NA NA NA CXADR 734931 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 18809176 18809383 18809253 Y NA NA NA NA NA NA CXADR 73317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 23855769 23855794 23855782 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 923654 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 25487464 25487861 25487662 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 708016 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 27544040 27544194 27544117 Y APP APP NA NA NA NA APP 2594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr21 27855729 27855767 27855735 Y CYYR1 NA NA NA NA NA APP 314283 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 29765694 29766009 29765812 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT1 489684 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 29791196 29791277 29791236 Y NA NA ADAMTS1,LINC00113 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 464416 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr21 30590117 30590529 30590261 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 25725 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 31220806 31221111 31220959 Y KRTAP27-1,KRTAP25-1,KRTAP23-1 NA NA NA NA NA BACH1 656414 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 32560711 32560765 32560739 Y NA NA NA NA NA NA SOD1 469170 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 34020244 34020455 34020360 Y SYNJ1,SYNJ1 C21orf59 NA NA NA NA C21orf59 37068 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 34718616 34718973 34718794 Y OLIG2,OLIG1 IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 23882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 35402450 35402634 35402553 Y GART,GART MRPS6,SLC5A3 MRPS6,LOC100506334 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS6 40890 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 35750965 35751183 35751074 Y KCNE1 NA NA NA NA NA CLIC6 288505 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 35959381 35959645 35959576 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 80043 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 37009808 37010026 37009922 Y NA NA RUNX1,CLIC6,LINC00160,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 364939 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 37259191 37259579 37259516 Y NA NA LOC100506385,CLIC6,LINC00160 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 115386 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 37456479 37456769 37456624 Y NA CBR1,SETD4 NA NA NA NA SETD4 6792 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 37909542 37909917 37909766 Y NA NA NA NA NA NA AP000695.6 108884 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 38986410 38986680 38986546 Y KCNJ6 NA NA NA NA NA DYRK1A 250318 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr21 39593313 39593902 39593631 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ6 306564 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 40302730 40303085 40302947 Y ETS2 NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 127499 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 40338093 40338255 40338153 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 162862 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr21 40527943 40528201 40528072 Y NA PSMG1 NA NA NA NA PSMG1 25576 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 41524041 41524191 41524116 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT5 597672 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 41872740 41872794 41872767 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 664934 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 42543184 42543509 42543444 Y BACE2 BACE2 NA NA NA NA BACE2 5456 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 42880678 42881074 42881005 Y TMPRSS2,TMPRSS2 TMPRSS2,SNORA32 NA NA NA NA TMPRSS2 19969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 43784554 43784935 43784758 Y NA TMPRSS3 NA NA NA NA TFF1 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr21 43881255 43881524 43881384 Y NA SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA SLC37A1 32594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr21 43952961 43953452 43953160 Y PKNOX1,ABCG1,ABCG1,ABCG1 SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA RSPH1 38497 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 44469974 44470172 44470008 Y CBS CBS NA NA NA NA CBS 24881 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 44529146 44529448 44529286 Y U2AF1 CBS,U2AF1 NA NA NA NA U2AF1 3449 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr21 44727448 44727599 44727495 Y PKNOX1,SIK1 NA LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 117409 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr21 44803157 44803673 44803421 Y PKNOX1,SIK1 SIK1 HSF2BP,RRP1B,SIK1 IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 41335 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 44850435 44851222 44850996 Y CBS SIK1 CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 5427 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr21 44936784 44937143 44936907 Y PDXK NA NA NA NA NA SIK1 91776 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 45237788 45238060 45237872 Y TRAPPC10,ICOSLG,AGPAT3 CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3 NA NA NA NA RRP1 30394 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr21 45661962 45662435 45662161 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 3113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr21 45663780 45664167 45664129 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 4931 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr21 46127419 46127576 46127516 Y NA NA NA NA NA NA UBE2G2 92358 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 18916909 18917370 18917163 Y MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH DGCR6,PRODH,DGCR5 NA NA NA NA PRODH 4696 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 19433007 19433028 19433018 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA HIRA 196 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 20142939 20143182 20143142 Y NA RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA ZDHHC8 27960 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 21221716 21221966 21221814 Y NA SNAP29,PI4KA,CRKL NA NA NA NA PI4KA 10011 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr22 23226163 23226651 23226399 Y IGLL5 NA NA NA NA NA GNAZ 183889 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 23751089 23751099 23751094 Y NA ZDHHC8P1 GNAZ,RTDR1,BCR,ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 8176 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr22 23869031 23869208 23869053 Y NA NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 126118 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 24184973 24185254 24185128 Y C22orf43 DERL3,SLC2A11,MIF NA NA NA NA DERL3 5658 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 24186544 24186827 24186686 Y DERL3 DERL3,SLC2A11,MIF DERL3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 DERL3 7229 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 24234499 24234593 24234547 Y NA SLC2A11,MIF NA NA NA NA MIF 308 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 53550 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 27054967 27055259 27055032 Y SEZ6L,ASPHD2 MIAT,CTA-211A9.5 NA NA NA NA CTA-211A9.5 11471 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 27520704 27520983 27520791 Y NA NA NA NA NA NA RP1-40G4P.1 239193 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 27872779 27873029 27872871 Y NA NA PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 MN1 322457 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 28115717 28115905 28115775 Y NA NA NA NA NA NA MN1 79581 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 28187017 28187166 28187092 Y MN1 MN1 NA NA NA NA MN1 8320 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 29209751 29210048 29209892 Y CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 15080 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 30279863 30280214 30279898 Y NA ASCC2,MTMR3 NA NA NA NA MTMR3 2719 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 30390990 30391309 30391217 Y NA NA NA NA NA NA MTMR3 113846 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 31617973 31618078 31618026 Y RNF185,SFI1,EIF4ENIF1,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 11748 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 31665995 31666466 31666007 Y NA PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 20054 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 31689398 31689773 31689585 Y SMTN,DEPDC5 PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 2878 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 32042427 32042918 32042716 Y RNF185,LIMK2 PISD NA NA NA NA PISD 13500 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 33248825 33249077 33248981 Y SYN3 NA NA NA NA NA FBXO7 380162 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 33446975 33447060 33447003 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 578312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 34167018 34167152 34167086 Y NA NA NA NA NA NA ISX 1292977 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 35710736 35710808 35710790 Y APOL6,TOM1,TOM1 TOM1 NA NA NA NA TOM1 17468 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 35767811 35768194 35767985 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 HMOX1,MCM5 NA NA NA NA HMOX1 6160 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 36245846 36246212 36246206 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 176261 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 24084 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 36855477 36855678 36855599 Y NA TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 20399 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 37618501 37618905 37618615 Y NA NA NA NA NA NA TMPRSS6 114898 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 NA NA NA NA NA TMPRSS6 134725 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 38351215 38351232 38351224 Y NA POLR2F,C22orf23 NA NA NA NA C22orf23 3539 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 38711439 38711868 38711815 Y SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6 TMEM184B NA NA NA NA TMEM184B 44399 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 39343276 39343645 39343496 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,APOBEC3A APOBEC3B NPTXR,MGAT3,APOBEC3A,CBX6,CBX7,APOBEC3H IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APOBEC3B 32707 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr22 39635664 39635940 39635710 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 2816 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr22 39660087 39660261 39660151 Y ATF4,APOBEC3A PDGFB PDGFB IMR90 Hi-C 24141950 PDGFB 21331 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 39784258 39784471 39784339 Y MGAT3,MGAT3,CBX7,SYNGR1 SYNGR1,TAB1 NA NA NA NA TAB1 9275 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 39890901 39891082 39890968 Y ATF4 ATF4,RPS19BP1 SMCR7L IMR90 Hi-C 24141950 ATF4 22618 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 39923809 39924011 39923907 Y NA ATF4,RPS19BP1 NA NA NA NA RPS19BP1 2849 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 40200455 40200474 40200463 Y MGAT3 NA NA NA NA NA UQCRFS1P1 68819 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 40357456 40357744 40357564 Y TNRC6B,GRAP2 FAM83F NA NA NA NA FAM83F 31209 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 40573139 40573276 40573210 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 72069 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 40589903 40590338 40589971 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 88833 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 41416837 41417114 41416960 Y NA RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 40942 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr22 42008568 42008780 42008674 Y NA PMM1,XRCC6 NA NA NA NA XRCC6 6343 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 42327988 42328313 42328152 Y NA CENPM,SEPT3 TNFRSF13C MCF7 ChIA-PET 22265404 CENPM 12855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 42718410 42718572 42718489 Y NA Z83851.1 TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 Z83851.1 44670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 42736832 42736915 42736874 Y SEPT3 Z83851.1 LOC100132273,NDUFA6,TCF20,CYP2D6,LOC388906 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 Z83851.1 26327 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 43165805 43166293 43166166 Y NFAM1,ARFGAP3 NA ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3 IMR90 Hi-C 24141950 ARFGAP3 85819 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 43369643 43369761 43369702 Y NA PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 39390 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 43387243 43387305 43387274 Y PACSIN2,PACSIN2 PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 21846 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 43421059 43421209 43421134 Y NA PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 11908 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 43602706 43602942 43602824 Y NA TTLL12 NA NA NA NA TTLL12 21567 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 44730251 44730590 44730516 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1L 161588 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 44993593 44993881 44993680 Y NA NA NA NA NA NA PRR5 68712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr22 45012617 45012993 45012776 Y NA PRR5 NA NA NA NA PRR5 49600 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 45106642 45106985 45106689 Y NA PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 NA NA NA NA ARHGAP8 10287 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 45525658 45525880 45525792 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 31782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 45623668 45623768 45623700 Y KIAA0930 KIAA0930 NA NA NA NA KIAA0930 10882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 46970983 46971382 46971054 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 1074 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr22 47145245 47145535 47145456 Y TRMU,CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 10983 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 49031660 49032049 49031799 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 1006237 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr22 49548057 49548240 49548148 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 670920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 50248429 50248807 50248623 Y TUBGCP6,TRABD,SELO,PIM3,MOV10L1,HDAC10,BRD1,ZBED4 BRD1,ZBED4 NA NA NA NA ZBED4 2939 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 50449135 50449422 50449263 Y TUBGCP6,HDAC10,PIM3 NA NA NA NA NA PIM3 96974 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 50625511 50626004 50625814 Y BRD1,ZBED4,PIM3,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TUBGCP6,SELO,HDAC10 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA TRABD 3167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 50680113 50680250 50680180 Y SELO SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11 NA NA NA NA TUBGCP6 1171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 50815545 50815813 50815668 Y MOV10L1,MOV10L1,SELO,MAPK8IP2,FAM116B PPP6R2 NA NA NA NA PPP6R2 35812 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr22 50976397 50976540 50976449 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 7388 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 253885 254142 254014 Y NA NA NA NA NA NA AC090043.1 1381787 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 2257565 2257584 2257575 Y NA NA NA NA NA NA AC090043.1 621636 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 3532969 3532987 3532979 Y NA NA NA NA NA NA CRBN 313575 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 4392615 4392774 4392664 Y ITPR1 SETMAR NA NA NA NA SETMAR 49627 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 4861560 4861757 4861659 Y NA NA NA NA NA NA BHLHE40 157044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 4870806 4870892 4870849 Y NA NA NA NA NA NA BHLHE40 147909 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 5050429 5050605 5050534 Y EDEM1,BHLHE40 BHLHE40 NA NA NA NA BHLHE40 31628 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 6573697 6574039 6573711 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 1346366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 8335682 8335807 8335745 Y NA NA NA NA NA NA LMCD1 205586 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 8500443 8500771 8500604 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 40622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 8801864 8802112 8802043 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 201345 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 9050336 9050687 9050476 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 46879 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 10228924 10229327 10229283 Y VHL,IRAK2,TATDN2 VHL,IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 24375 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 10238203 10238635 10238546 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA IRAK2 33654 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 11261398 11261658 11261529 Y HRH1 NA NA NA NA NA ATG7 50337 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 13040844 13041238 13041111 Y RAF1 NA NA NA NA NA IQSEC1 71379 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 13049028 13049396 13049212 Y NA NA NA NA NA NA IQSEC1 63221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 13151388 13151404 13151396 Y NA IQSEC1 LOC285375,NUP210,HDAC11 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 38771 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 13152253 13152557 13152379 Y NUP210,IQSEC1 IQSEC1 LOC285375,NUP210,HDAC11 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 39636 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 13153064 13153212 13153138 Y RPL32,IQSEC1 IQSEC1 LOC285375,NUP210,HDAC11 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 40447 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 13153880 13154026 13153953 Y NA IQSEC1 LOC285375,NUP210,HDAC11 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 41263 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr3 13231333 13231490 13231397 Y NA NA LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 118716 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 15352253 15352542 15352441 Y NA SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 28333 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 15599049 15599493 15599306 Y ANKRD28,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ BTD,HACL1 NA NA NA NA BTD 41355 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 16145048 16145389 16145286 Y NA NA GALNTL2,ANKRD28,DPH3,OXNAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 159090 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 16351640 16351656 16351648 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 46934 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 16381472 16381685 16381579 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 76766 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 16544909 16545021 16544965 Y RFTN1 RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 8512 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 16545937 16546186 16546046 Y PLCL2,RFTN1 RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 7347 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 17378312 17378639 17378476 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 536153 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 18430720 18430774 18430747 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 53535 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 18485117 18485365 18485120 Y NA TBC1D5,AC144521.1,SATB1 NA NA NA NA SATB1 37 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr3 18598150 18598373 18598222 Y SATB1 RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 19985 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA KCNH8 NA NA NA NA KCNH8 423 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 19470380 19470682 19470561 Y NA NA NA NA NA NA KCNH8 282434 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 22039046 22039346 22039196 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 1203165 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 22060274 22060563 22060426 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 1181948 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 23935594 23935945 23935770 Y NA RPL15,NR1D2 NA NA NA NA RPL15 20091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 27957485 27957491 27957488 Y NA NA NA NA NA NA CMC1 323584 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 28050894 28051260 28051082 Y EOMES,CMC1 NA NA NA NA NA CMC1 229815 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 28178906 28179294 28179100 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA CMC1 101781 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 28534381 28534544 28534465 Y ZCWPW2 NA NA NA NA NA ZCWPW2 145744 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 28713649 28713858 28713754 Y ZCWPW2 NA NA NA NA NA ZCWPW2 325012 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 29214475 29214634 29214556 Y NA NA RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 ZCWPW2 825838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 30377149 30377465 30377308 Y NA NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 1194665 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 31737462 31737733 31737598 Y NA NA NA NA NA NA STT3B 165332 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 32412858 32413131 32413058 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 18032 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 33478074 33478410 33478365 Y NA UBP1 NA NA NA NA UBP1 2453 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 33758685 33758853 33758767 Y UBP1,UBP1,CLASP2 CLASP2 NA NA NA NA CLASP2 837 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 34250297 34250461 34250356 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 412453 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 34546800 34546816 34546806 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 708956 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr3 36953847 36954333 36954176 Y TRANK1,MLH1,LRRFIP2,GOLGA4,EPM2AIP1 NA NA NA NA NA EPM2AIP1 78462 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 37218637 37218971 37218954 Y DCLK3,TRANK1,C3orf35 LRRFIP2 MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 4209 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 37495440 37496065 37495716 Y ITGA9 ITGA9 NA NA NA NA ITGA9 3834 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 38207945 38208258 38208101 Y VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 3365 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 39192828 39193549 39193225 Y NA TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 504 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 43427917 43428246 43428244 Y NA NA NA NA NA NA SNRK 101913 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 44652575 44652865 44652702 Y ZNF445,ZNF502,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 28195 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 45185924 45186005 45185965 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 10 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 45208648 45208845 45208728 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 8981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 46131249 46131612 46131415 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 95933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 46136758 46137178 46136998 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 101442 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 47201175 47201471 47201342 Y CSPG5,SETD2 SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 1986 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 49938038 49938186 49938111 Y TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54 TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6 NA NA NA NA MST1R 1113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 50243484 50243685 50243589 Y HYAL1,SLC38A3 SLC38A3,GNAI2 NA NA NA NA SLC38A3 2805 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 50292420 50292632 50292507 Y RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3 C3orf45,SEMA3B IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3B 10358 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 50354393 50354598 50354449 Y MST1R IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA HYAL2 3739 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 50487622 50487847 50487731 Y RBM5,GNAI2,GNAI2,RASSF1,RASSF1,CYB561D2,MAPKAPK3 NA CYB561D2,TMEM115,NPRL2 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA2D2 51828 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 52079728 52079827 52079778 Y DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 8739 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 52299133 52299501 52299437 Y NA TLR9,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA GLYCTK 19604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 52502448 52502781 52502494 Y ABHD14B,NISCH TNNC1,NISCH NA NA NA NA NISCH 15314 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 53568043 53568300 53568167 Y SFMBT1 CACNA1D NA NA NA NA CACNA1D 41360 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 53859957 53860202 53860080 Y CACNA1D,CHDH CHDH,IL17RB NA NA NA NA CHDH 18215 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 53897423 53897785 53897604 Y NA CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK NA NA NA NA ACTR8 16444 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 55201679 55201928 55201859 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 320045 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 55398457 55398867 55398717 Y NA NA CACNA2D3 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 123106 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 55511418 55511654 55511489 Y WNT5A WNT5A NA NA NA NA WNT5A 10319 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 56106137 56106188 56106158 Y NA NA NA NA NA NA ERC2 394203 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 56814931 56815295 56815113 Y NA NA NA NA NA NA FAM208A 99666 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr3 57995654 57995894 57995762 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3527 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 58162589 58162663 58162637 Y KCTD6 NA NA NA NA NA ABHD6 58570 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 58339773 58340193 58340113 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 23166 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 59316034 59316229 59316222 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 282224 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 59488457 59488969 59488744 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 454647 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 62052710 62052952 62052831 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 249696 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 62780450 62780695 62780574 Y CADPS NA NA NA NA NA CADPS 78359 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 65690412 65690419 65690417 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 332090 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 65939140 65939412 65939262 Y MAGI1 NA NA NA NA NA MAGI1 83097 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 66021951 66022397 66022084 Y NA MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 112 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 66022863 66023161 66022996 Y MAGI1 MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 67455058 67455415 67455236 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG2 247623 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 69380103 69380434 69380250 Y MITF,FRMD4B NA NA NA NA NA ARL6IP5 248008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 69698353 69698679 69698548 Y NA NA MITF IMR90 Hi-C 24141950 ARL6IP5 566258 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 70175230 70175612 70175604 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 1043135 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 71116020 71116294 71116249 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 514846 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 71150221 71150629 71150383 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 480511 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 71153323 71153512 71153422 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 477628 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 71267437 71267786 71267612 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 363354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 71439009 71439199 71439166 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 191941 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 71588104 71588187 71588146 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 42953 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 72048209 72048563 72048384 Y RYBP NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4E3 246285 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 72532064 72532489 72532159 Y RYBP RYBP PPP4R2,SHQ1,LOC201617 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 37995 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 72936024 72936237 72936180 Y RYBP,EBLN2 SHQ1,FTH1P23 NA NA NA NA SHQ1 26959 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 73040663 73040928 73040772 Y NA PPP4R2 NA NA NA NA PPP4R2 3008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 73611832 73612189 73612011 Y NA NA NA NA NA NA PDZRN3 59902 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 76544086 76544385 76544235 Y NA NA NA NA NA NA ROBO2 590240 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 78848211 78848429 78848320 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 966536 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 80630991 80631014 80631005 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 816026 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 85011127 85011790 85011174 Y NA CADM2 NA NA NA NA CADM2 4995 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 85071263 85071596 85071400 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 65131 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 88247401 88247562 88247491 Y NA NA NA NA NA NA CGGBP1 50366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 95797016 95797346 95797181 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 1684019 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 1144696 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr3 97211520 97211837 97211678 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 269528 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 97509307 97509490 97509360 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27942 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 98665369 98665647 98665551 Y NA LINC00973 DCBLD2,MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 32255 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 98916657 98917000 98916829 Y NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 218755 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 99356024 99356457 99356227 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 474900 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 255752 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 251621 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 99600050 99600430 99600273 Y FILIP1L,C3orf26 NA NA NA NA NA FILIP1L 230927 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 99614794 99615242 99614937 Y TBC1D23 NA NA NA NA NA FILIP1L 216115 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 99764609 99765000 99764644 Y FILIP1L,C3orf26 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 66357 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 100088429 100088702 100088566 Y NA NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA LNP1 29335 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 103861090 103861239 103861165 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 984286 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 105088270 105088514 105088471 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4517 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 105395533 105395739 105395657 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 190657 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 107723601 107723807 107723679 Y CD47 NA MYH15,CD47,IFT57,HHLA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 84065 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 107850030 107850463 107850156 Y MYH15,CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 42158 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 110545896 110546080 110545988 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V0CP2 649504 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 111265245 111265633 111265405 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V0CP2 69661 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 111723588 111723714 111723651 Y SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3 ABHD10,TAGLN3 NA NA NA NA TAGLN3 8077 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 112093198 112093568 112093374 Y CD200 NA NA NA NA NA SLC35A5 184988 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 112145303 112145705 112145529 Y TMPRSS7 NA CD200 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35A5 132851 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 112494891 112495176 112495106 Y ATG3 NA GTPBP8 IMR90 Hi-C 24141950 GTPBP8 212589 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 113142674 113142797 113142737 Y NA WDR52 NA NA NA NA WDR52 15660 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 114246828 114247170 114246841 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 473368 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 114257066 114257260 114257069 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 483606 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 114742139 114742159 114742149 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 121959 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639145 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 115556507 115556695 115556650 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 692389 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 116966889 116967037 116966963 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 223344 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 119613107 119613331 119613219 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 197933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 119644387 119644860 119644721 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 166404 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 119809073 119809433 119809278 Y NA GSK3B,RP11-18H7.1 NA NA NA NA GSK3B 1831 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 120279186 120279582 120279384 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 33574 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 120463141 120463503 120463258 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 3301 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 121083011 121083367 121083189 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP11 127590 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 121364461 121364464 121364463 Y NA HCLS1 NA NA NA NA HCLS1 13310 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 121374377 121374548 121374517 Y EAF2,HCLS1,GOLGB1 HCLS1 NA NA NA NA HCLS1 3226 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 121777305 121777514 121777343 Y HCLS1,EAF2,CD86 ILDR1 NA NA NA NA ILDR1 38254 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 121800469 121800680 121800559 Y EAF2,CD86 NA NA NA NA NA ILDR1 61418 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 121982687 121983119 121983048 Y NA NA NA NA NA NA CCDC58 116959 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 122463361 122463618 122463490 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 47053 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 123372011 123372488 123372368 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 69622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 123388051 123388291 123388171 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 85662 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 123476863 123477567 123477241 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK 123611 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 123782092 123782280 123782136 Y NA NA KALRN,ROPN1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 103528 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 124152441 124152638 124152541 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 294575 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 124531464 124532111 124531823 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 84251 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr3 125200225 125200611 125200423 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 36430 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA SLC41A3 108923 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr3 126126680 126126867 126126779 Y NA NA NA NA NA NA KLF15 52395 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 126945882 126946306 126946211 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 368760 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 127244302 127244595 127244437 Y NA NA UROC1,CHST13,NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 70471 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 127470580 127470980 127470857 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA MGLL 69071 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 127795566 127796407 127795838 Y GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8 SEC61A1 NA NA NA NA SEC61A1 27082 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 127799227 127799458 127799344 Y GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8 SEC61A1 NA NA NA NA SEC61A1 30743 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-475N22.4 10465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 128564550 128565114 128564776 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 31325 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 128735204 128735460 128735306 Y NA KIAA1257,GP9 GP9 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1257 15671 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA KIAA1257,GP9 NA NA NA NA KIAA1257 26306 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr3 128777311 128777632 128777514 Y C3orf25 NA NA NA NA NA GP9 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 128964355 128964687 128964560 Y NA NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 63590 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 129167159 129167354 129167260 Y NA MBD4,IFT122 NA NA NA NA IFT122 10191 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 129180710 129180864 129180787 Y IFT122 MBD4,IFT122 NA NA NA NA IFT122 23742 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 129295610 129296083 129295875 Y RAB43,C3orf37,C3orf37,H1FX,MBD4 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 27578 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 129315034 129315445 129315335 Y COPG,PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 8216 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 129315678 129315871 129315798 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 7790 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 129344975 129345039 129344984 Y NA PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 21314 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 129346331 129346490 129346427 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 22670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 132138974 132139193 132139084 Y NA DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 4604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 133295128 133295300 133295215 Y NA CDV3 NA NA NA NA CDV3 4554 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 134145641 134145965 134145857 Y NA NA ANAPC13,AMOTL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMOTL2 53320 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 134181248 134181600 134181434 Y NA CEP63,ANAPC13 NA NA NA NA CEP63 20985 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 135827453 135827844 135827484 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 86239 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 136153802 136154197 136154172 Y NA NA NA NA NA NA PCCB 186654 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 136420425 136420819 136420623 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 48401 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 136509398 136509586 136509492 Y NA STAG1 PPP2R3A,STAG1,IL20RB,NCK1,MSL2,TMEM22 IMR90 Hi-C 24141950 STAG1 40178 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 136571906 136572239 136572061 Y TMEM22 RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 6657 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 137768870 137769254 137769106 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 63406 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 138465994 138466395 138466194 Y NA NA NA NA NA NA PIK3CB 85385 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 138510806 138511198 138511002 Y NA PIK3CB NA NA NA NA PIK3CB 40582 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 138581757 138582253 138582041 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29977 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 139824639 139824888 139824698 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 172612 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 139898460 139898757 139898544 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 246433 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 270282 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr3 140077980 140078337 140078159 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 425953 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 141126018 141126305 141126087 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 77584 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 141129371 141129776 141129494 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 74113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 141130337 141130617 141130393 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 73272 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 141133650 141133961 141133787 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 69928 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 141240287 141240651 141240396 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 36398 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 141887290 141887616 141887590 Y NA TFDP2 NA NA NA NA TFDP2 20904 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 143319763 143319882 143319824 Y NA NA NA NA NA NA C3orf58 368758 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 143550197 143550392 143550264 Y C3orf58 NA NA NA NA NA C3orf58 138248 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 143828914 143829061 143828972 Y C3orf58,C3orf58 NA NA NA NA NA C3orf58 140274 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 146259909 146260381 146260206 Y PLSCR1 PLSCR2,PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 270 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 149057749 149057981 149057865 Y NA NA NA NA NA NA CPHL1P 50162 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 149271786 149271997 149271800 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 180504 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 149330317 149330600 149330464 Y WWTR1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 121901 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 149333585 149333911 149333859 Y TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 118590 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 149361418 149361700 149361559 Y WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 90801 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 150329194 150329427 150329421 Y NA SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 10179 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 150453151 150453509 150453478 Y CLRN1 RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2 25755 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 151974707 151975007 151974858 Y NA MBNL1 NA NA NA NA MBNL1 15090 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 153720980 153721188 153721084 Y NA NA NA NA NA NA DHX36 319098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 155905021 155905068 155905045 Y NA NA NA NA NA NA GMPS 318696 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 156229646 156229758 156229715 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 41215 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 156402848 156403019 156402937 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 12681 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 156443600 156443618 156443611 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 53433 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 157935893 157935900 157935896 Y NA NA NA NA NA NA SHOX2 113601 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 158440805 158440990 158440882 Y MFSD1 MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 6997 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 158466226 158466540 158466401 Y MFSD1 MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 18239 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 159123796 159123957 159123826 Y NA NA NA NA NA NA MFSD1 675809 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 159542121 159542517 159542198 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 398906 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 159983948 159984179 159984064 Y NA C3orf80 NA NA NA NA C3orf80 42525 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 72930 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 160663076 160663172 160663124 Y NA NA NA NA NA NA NMD3 157312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 160714920 160715128 160715024 Y NA NA NA NA NA NA NMD3 105356 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 161087231 161087661 161087620 Y NA SPTSSB NA NA NA NA SPTSSB 1007 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 161139893 161140384 161140069 Y NA NA NMD3,PPM1L,B3GALNT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSB 51225 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 163200280 163200389 163200295 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSB 2111612 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 165215973 165216343 165216172 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 336917 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 165557542 165557875 165557614 Y BCHE BCHE NA NA NA NA BCHE 4282 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 166686803 166687129 166686941 Y NA NA NA NA NA NA PDCD10 763598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA TERC 1241 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 169508571 169508792 169508647 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 19952 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 169669954 169670204 169670056 Y SKIL,SKIL,SEC62 SEC62 NA NA NA NA SEC62 12219 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 169872442 169872609 169872497 Y NA PHC3 NA NA NA NA PHC3 24928 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 170073991 170074311 170074218 Y SKIL,SKIL SKIL NA NA NA NA SKIL 525 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 170442364 170442688 170442585 Y CLDN11 NA CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 SLC7A14 140501 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 170446657 170446914 170446737 Y NA NA CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 139358 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 170529231 170529401 170529316 Y NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI,RPL22L1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 56871 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 170795068 170795319 170795194 Y NA NA NA NA NA NA EIF5A2 170586 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 171495458 171495728 171495684 Y FNDC3B,PLD1 PLD1 NA NA NA NA PLD1 31012 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 171684878 171685278 171685188 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 70140 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 171853185 171854055 171853751 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 97767 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 172418207 172418359 172418236 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 8649 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 172423916 172424228 172424139 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 2780 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2,RNU4-4P NA NA NA NA RNU4-4P 2089 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 173071500 173071510 173071505 Y NA NLGN1 NA NA NA NA NLGN1 40564 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 175054266 175054532 175054399 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-91P 270735 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 175695899 175696046 175695968 Y NA NA NLGN1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-91P 370632 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 176439687 176439857 176439773 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 473404 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 177293593 177293900 177293627 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 380332 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 177309103 177309580 177309365 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 395842 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 177472457 177472684 177472465 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMB2 516036 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 177548160 177548535 177548360 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMB2 440185 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 178239862 178239999 178239925 Y NA NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMB2 251142 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 179165833 179166212 179166067 Y NA NA NA NA NA NA MFN1 102353 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 179685404 179685725 179685692 Y NA NA NA NA NA NA PEX5L 67116 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 179687230 179687579 179687379 Y PEX5L NA NA NA NA NA PEX5L 65262 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 181456298 181456477 181456331 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 28584 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 182642205 182642465 182642335 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D1 59276 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 12.2394751527334 chr3 183098974 183099227 183099069 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 MCF2L2 NA NA NA NA MCF2L2 45339 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 183226681 183226921 183226804 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA MCF2L2 82115 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 184624847 184625231 184625035 Y NA NA NA NA NA NA VPS8 96916 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 186490704 186490868 186490793 Y ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2 EIF4A2,RFC4 NA NA NA NA EIF4A2 8126 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr3 186695100 186695431 186695266 Y RTP1 ST6GAL1 NA NA NA NA ST6GAL1 48826 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 186715660 186715959 186715816 Y RTP1,ST6GAL1,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 69386 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 186784569 186784773 186784671 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 111923 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 187495200 187495392 187495316 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 BCL6,LPP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCL6 33685 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 187983465 187984215 187983993 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 113620 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 188012691 188013249 188012784 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 142846 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 189524070 189524362 189524216 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAP 705478 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 191782024 191782374 191782199 Y NA NA NA NA NA NA FGF12 701179 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 192610862 192611520 192611033 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 22430 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 193857372 193857551 193857481 Y HES1 HES1 NA NA NA NA HES1 5438 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr3 194041526 194041906 194041553 Y HES1 NA NA NA NA NA ATP13A3 175187 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 194277383 194277706 194277514 Y NA TMEM44-AS1 ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,GP5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM44-AS1 25034 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 194843909 194844196 194844053 Y APOD NA NA NA NA NA XXYLT1 145700 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 194909017 194909237 194909137 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 80659 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 194981425 194981579 194981527 Y ACAP2 XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 8317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr3 195891844 195892227 195892035 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 84784 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 196064212 196064579 196064504 Y WDR53,ZDHHC19 TCTEX1D2,TM4SF19 NA NA NA NA TM4SF19 838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr3 196694427 196694825 196694642 Y NA NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 496 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 197044593 197044660 197044627 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 20422 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 197254564 197254715 197254640 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 43479 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 46429 46531 46521 Y NA ZNF595 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF595 4648 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 48171 48447 48418 Y ZNF141 ZNF595 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF595 2732 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 50610 50903 50681 Y NA ZNF595 NA NA NA NA ZNF595 276 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 1339592 1340250 1339850 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57953 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 2762487 2762593 2762537 Y SH3BP2 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 6384 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 3484611 3485071 3484896 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 47215 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 5640113 5640289 5640201 Y NA NA NA NA NA NA CRMP1 252496 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 5884684 5884906 5884686 Y NA CRMP1 EVC IMR90 Hi-C 24141950 CRMP1 7879 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 6171393 6171654 6171618 Y CRMP1 JAKMIP1 NA NA NA NA JAKMIP1 28664 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 6513482 6513861 6513684 Y JAKMIP1,PPP2R2C,PPP2R2C NA NA NA NA NA MAN2B2 61041 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 6809071 6809294 6809183 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 27969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 7191564 7191944 7191754 Y NA NA NA NA NA NA GRPEL1 123640 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 7975985 7976228 7976096 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 36332 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 8047837 8047991 8047936 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 108184 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 8098106 8098298 8098202 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 158453 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 9605717 9605843 9605777 Y NA NA NA NA NA NA RP11-448G15.1 400263 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 10053251 10053319 10053285 Y NA RP11-448G15.1 NA NA NA NA RP11-448G15.1 47145 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 10601291 10601673 10601351 Y NA NA NA NA NA NA ZNF518B 144257 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 10627577 10627791 10627684 Y NA NA NA NA NA NA ZNF518B 170543 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 11484629 11485098 11484903 Y NA RP11-281P23.1 CLNK,HS3ST1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-281P23.1 15755 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 12189077 12189099 12189089 Y NA NA NA NA NA NA RP11-352E6.2 451162 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 14809578 14809765 14809678 Y NA NA BOD1L IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 192533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 16125304 16125914 16125552 Y NA PROM1 PROM1 IMR90 Hi-C 24141950 PROM1 41303 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 16871833 16872157 16872139 Y LDB2 NA NA NA NA NA RPS21P4 615655 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 17495942 17496188 17496050 Y MED28,LAP3 QDPR NA NA NA NA QDPR 15669 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 17829390 17829398 17829394 Y CLRN2,NCAPG DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 18865 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 17979858 17980211 17980206 Y CLRN2,LCORL LCORL NA NA NA NA LCORL 41288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 18320696 18320883 18320800 Y NA NA NA NA NA NA LCORL 299197 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 20757566 20757961 20757877 Y KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 61661 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 21368541 21368959 21368808 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 672636 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 23947088 23947695 23947571 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 43376 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 24980412 24980568 24980490 Y DHX15,CCDC149,CCDC149 CCDC149,LGI2 NA NA NA NA CCDC149 586 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 25828026 25828318 25828201 Y NA SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 35064 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 25867382 25867475 25867429 Y SLC34A2 SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 4000 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 26123354 26123506 26123386 Y NA RBPJ RBPJ,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 39571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 26240784 26241159 26240972 Y NA NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 77707 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 26479198 26479263 26479231 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D19 96796 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 35107542 35107966 35107823 Y NA NA NA NA NA NA C4orf19 2345597 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 38001084 38001300 38001133 Y NA PTTG2 NA NA NA NA PTTG2 41028 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 38607589 38607693 38607690 Y NA NA NA NA NA NA KLF3 56124 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 38663074 38663393 38663234 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA KLF3 424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 38668617 38669179 38668850 Y KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 4113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 38857753 38857899 38857797 Y KLF3,TLR1,TLR6 FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 9399 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 38870386 38870769 38870503 Y FAM114A1 FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 3088 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 38871281 38871430 38871296 Y NA FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 3983 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 39316114 39316675 39316347 Y NA RFC1 NA NA NA NA RFC1 49320 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 40187874 40187932 40187902 Y RBM47 NA RHOH IMR90 Hi-C 24141950 N4BP2 131428 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 40533771 40533999 40533881 Y NA NA NA NA NA NA RBM47 96893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 40765283 40765623 40765452 Y RBM47 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 15369 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 40910052 40910602 40910542 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 160138 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr4 41162074 41162440 41162321 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 54291 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 41363966 41364137 41364015 Y LIMCH1,LIMCH1 LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 4342 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 41469951 41470276 41469966 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 110327 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 44712631 44712762 44712670 Y NA GUF1,GNPDA2 NA NA NA NA GNPDA2 13850 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 47473680 47473878 47473784 Y NA COMMD8,ATP10D NA NA NA NA COMMD8 9944 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 48126278 48126641 48126461 Y ZAR1,TEC,SLAIN2 NA NA NA NA NA TEC 143240 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 48757987 48758274 48758261 Y NA FRYL,OCIAD1 NA NA NA NA FRYL 22065 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 54568898 54569145 54569018 Y CHIC2 NA SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 327088 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 54866446 54866641 54866544 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 62216 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 55100480 55100923 55100634 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 7216 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 57132335 57132393 57132366 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP31 87908 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 57623645 57623837 57623739 Y NA RPL17P20 PAICS,HOPX,THEGL IMR90 Hi-C 24141950 RPL17P20 49419 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 66899965 66900079 66900021 Y NA NA NA NA NA NA RP11-584P21.4 1409906 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 67972662 67972987 67972824 Y NA NA NA NA NA NA RP11-584P21.4 336998 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 68266370 68266649 68266476 Y NA RP11-584P21.4 NA NA NA NA RP11-584P21.4 43336 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 69598714 69599110 69598795 Y UGT2B10,UGT2B7,UGT2A3 NA NA NA NA NA YTHDC1 384907 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 72125321 72125676 72125518 Y NA NA NA NA NA NA DCK 269066 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 74472194 74472476 74472318 Y RASSF6,RASSF6 RASSF6 NA NA NA NA RASSF6 11872 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 74688679 74689024 74688851 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 NA CXCL2,RASSF6,PF4V1,CXCL1,PPBPL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 84456 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 75806298 75806441 75806350 Y NA PARM1 NA NA NA NA PARM1 49864 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 75859868 75860329 75860092 Y BTC,PARM1 PARM1 NA NA NA NA PARM1 3563 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr4 76621405 76621540 76621497 Y RCHY1,THAP6,NUP54,G3BP2,G3BP2 G3BP2,USO1 NA NA NA NA G3BP2 26169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 77121153 77121281 77121217 Y NA SCARB2,FAM47E NA NA NA NA SCARB2 11765 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 78842671 78842943 78842808 Y NA NA NA NA NA NA MRPL1 60997 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr4 79083838 79083918 79083865 Y NA NA NA NA NA NA RP11-777B9.5 155996 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 79253143 79253310 79253148 Y NA NA NA NA NA NA RP11-777B9.5 325301 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 79550555 79550802 79550658 Y NA NA NA NA NA NA BMP2K 144694 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 79859042 79859275 79859190 Y PAQR3 PAQR3,LINC01088 NA NA NA NA PAQR3 450 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 81990935 81991080 81991055 Y NA NA NA NA NA NA PRDM8 887902 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 83680712 83680815 83680808 Y NA NA NA NA NA NA THAP9 139022 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 83755588 83755973 83755970 Y NA NA NA NA NA NA THAP9 63864 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 84029980 84030193 84029996 Y NA PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 26035 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 84034119 84034423 84034342 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 21805 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 84872849 84873141 84872995 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 417782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 87048261 87048368 87048363 Y NA NA NA NA NA NA MAPK10 464916 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 87204498 87204708 87204603 Y NA NA NA NA NA NA MAPK10 308576 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 87626625 87626818 87626720 Y PTPN13 NA NA NA NA NA PTPN13 113157 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr4 87932880 87932928 87932888 Y AFF1,AFF1 NA NA NA NA NA TECRP1 63604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 88480669 88480961 88480822 Y NA NA NA NA NA NA NUDT9 138935 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 89433703 89434055 89433857 Y HERC5 HERC3,PIGY NA NA NA NA HERC3 6144 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 89534713 89535020 89534799 Y PPM1K,HERC3 NA NA NA NA NA PIGY 93773 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 89713529 89713901 89713721 Y HERC6,HERC5 NA FAM13A-AS1,NAP1L5,HERC3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGY 272589 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 89726737 89726837 89726787 Y NA NA NA NA NA NA PIGY 285797 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 90174156 90174307 90174302 Y NA NA NA NA NA NA GPRIN3 52854 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 90224802 90225147 90225000 Y FAM13A,GPRIN3 GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 2014 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 90226723 90227111 90227016 Y GPRIN3 GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 50 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA SNCA 292131 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 91238961 91239218 91239076 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 481495 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 93104192 93104578 93104286 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2022184 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr4 99319477 99319794 99319573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 138942 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 102173679 102174077 102173884 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 92860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 102200557 102200885 102200839 Y PPP3CA NA NA NA NA NA AP001816.1 66052 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 102237823 102238346 102238192 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 28591 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 102243269 102243535 102243491 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 23402 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 106635528 106635690 106635582 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 7593 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 108783895 108784172 108784033 Y SGMS2 SGMS2 NA NA NA NA SGMS2 40176 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 109513186 109513523 109513472 Y NA RPL34-AS1,RPL34 NA NA NA NA RPL34-AS1 26093 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 110623287 110623426 110623357 Y LRIT3 CASP6,PLA2G12A NA NA NA NA CASP6 548 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 113985460 113985726 113985592 Y NA NA NA NA NA NA ANK2 248195 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr4 114382932 114383313 114383209 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 43453 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 114390310 114390498 114390393 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-138P 50831 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 119115424 119115493 119115457 Y NA NA NA NA NA NA SNHG8 82371 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 121670758 121670998 121670880 Y NA NA NA NA NA NA PRDM5 171027 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 124398959 124399392 124399124 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 83009 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 124538169 124538584 124538401 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 222219 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 124907430 124907717 124907574 Y NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 TECRP2 475228 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 127487763 127488061 127487932 Y NA NA NA NA NA NA INTU 1054365 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 139447289 139447391 139447341 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 285786 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 139831999 139832463 139832295 Y NA NA LOC641365,SLC7A11,LOC641364 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 102480 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 140727942 140728268 140728103 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 143020 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr4 140967961 140968185 140967999 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 105153 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 140970177 140970718 140970535 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 102620 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 141011416 141011614 141011507 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 61724 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 141021103 141021485 141021348 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 51853 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 141164479 141164682 141164571 Y MAML3 SCOC MAML3,MGST2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCOC 11758 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 141217539 141217769 141217667 Y NA SCOC NA NA NA NA SCOC 41099 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 142477035 142477207 142477121 Y NA NA NA NA NA NA ZNF330 336994 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 144332697 144332829 144332792 Y GAB1 NA NA NA NA NA GAB1 76782 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 146101946 146102251 146102199 Y NA OTUD4 ABCE1 K562 ChIA-PET 22265404 OTUD4 2633 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 147192653 147192904 147192792 Y ZNF827,SLC10A7 NA NA NA NA NA LSM6 97816 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 148768906 148769305 148769088 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 117692 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 151956610 151956785 151956696 Y NA LRBA LRBA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRBA 21731 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 152090134 152090652 152090546 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 71409 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 152127737 152127987 152127916 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 109012 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 153180891 153181284 153181088 Y NA NA PET112,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-18H21.1 160985 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 153265183 153265560 153265526 Y FBXW7 NA NA NA NA NA FBXW7 189693 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 153445736 153446128 153446118 Y NA FBXW7,MIR4453 NA NA NA NA FBXW7 9125 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 153884926 153884958 153884941 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 29422 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA TRIM2 98802 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 154360422 154360809 154360778 Y MND1,KIAA0922 KIAA0922 MND1,TRIM2,KIAA0922 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0922 24689 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 156388113 156388229 156388171 Y NA NA GUCY1A3 IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 91991 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 157397521 157397868 157397695 Y NA NA GRIA2,PDGFC,GLRB IMR90 Hi-C 24141950 PDGFC 492678 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 157893618 157893834 157893797 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 3072 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 159463671 159463825 159463736 Y PPID,FNIP2 NA NA NA NA NA ETFDH 127452 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 162625637 162625896 162625763 Y FSTL5 NA NA NA NA NA NAF1 1460177 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 162684841 162685083 162684938 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 1400990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 378130 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 166298963 166299290 166298992 Y NA CPE NA NA NA NA CPE 18617 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 166422422 166422684 166422539 Y KLHL2,CPE NA NA NA NA NA CPE 142076 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 168154040 168154351 168154284 Y SPOCK3,SPOCK3 SPOCK3 NA NA NA NA SPOCK3 93 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 169705913 169706245 169706080 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 223181 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 178302515 178302653 178302573 Y NA NA NA NA NA NA AGA 59004 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 179487975 179488371 179488173 Y NA NA NA NA NA NA AGA 1126318 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 184751768 184752101 184751917 Y NA NA ENPP6,STOX2,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 TRAPPC11 173348 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 277975 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 185205400 185205552 185205478 Y NA NA IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2 188182 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 185276361 185276710 185276589 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 117024 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 185613623 185613900 185613762 Y CCDC111 CASP3 NA NA NA NA CASP3 44960 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 186738363 186738465 186738414 Y NA NA NA NA NA NA SORBS2 137341 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 188076030 188076363 188076230 Y NA NA FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP4V2 965356 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 190487491 190487755 190487631 Y FRG1 NA NA NA NA NA HSP90AA4P 95372 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr4 190523750 190523781 190523766 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 105087 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 NA LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG4B 84199 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 98.7900494470626 chr5 148457 148511 148484 Y NA PLEKHG4B NA NA NA NA PLEKHG4B 10084 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 175502 175522 175512 Y NA PLEKHG4B,CCDC127,SDHA NA NA NA NA PLEKHG4B 37129 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 378611 379250 378849 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 62008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 394851 394874 394864 Y NA C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 46384 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 7.86823402675719 chr5 523686 523917 523764 Y SLC9A3 SLC9A3 NA NA NA NA SLC9A3 1239 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 672237 672545 672500 Y EXOC3,CEP72 TPPP NA NA NA NA TPPP 18965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 10.9281028149405 chr5 692381 692722 692686 Y TPPP TPPP NA NA NA NA TPPP 871 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 758121 758535 758359 Y TPPP NA SLC9A3,ZDHHC11,BRD9,CEP72,TRIP13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPPP 66611 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 759096 759567 759320 Y TPPP NA SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13 IMR90 Hi-C 24141950 TPPP 67586 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 777448 777883 777776 Y NA NA NA NA NA NA TPPP 85938 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 9.61673047714768 chr5 1067872 1068133 1067963 Y NA SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 42017 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 1092786 1092861 1092788 Y NA SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 17289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 1129967 1130071 1130019 Y SLC12A7 SLC12A7 BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 19817 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr5 1130725 1130985 1130924 Y NA SLC12A7 BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 20575 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 33.2214325574193 chr5 1152929 1153246 1153088 Y NA SLC12A7 SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9 IMR90 Hi-C 24141950 SLC12A7 42779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 1313264 1313453 1313378 Y NA TERT,CLPTM1L NA NA NA NA TERT 20080 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 1316464 1316882 1316563 Y TERT,SLC6A3 TERT,CLPTM1L TERT IMR90 Hi-C 24141950 TERT 23280 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr5 1475636 1475716 1475666 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 46376 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 2580576 2580893 2580736 Y NA NA NA NA NA NA C5orf38 169352 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 2594554 2594649 2594602 Y NA NA NA NA NA NA C5orf38 155596 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 2694499 2694872 2694689 Y NA NA NA NA NA NA C5orf38 55373 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 392414 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 5209907 5210282 5210095 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 208495 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 6449899 6450414 6450093 Y UBE2QL1 UBE2QL1 NA NA NA NA UBE2QL1 3163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 9.61673047714768 chr5 6766717 6766947 6766763 Y SRD5A1,PAPD7 NA NA NA NA NA SRD5A1 135261 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 6927514 6927543 6927527 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 296058 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 6961316 6961478 6961397 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 329860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 9681641 9681655 9681648 Y NA NA TAS2R1 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA5A 137454 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 9833016 9833279 9833220 Y NA NA NA NA NA NA SEMA5A 288829 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 10229611 10229778 10229690 Y NA FAM173B,CCT5 NA NA NA NA FAM173B 18231 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 10303912 10303996 10303954 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA CMBL 2142 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 10585111 10585259 10585181 Y NA NA NA NA NA NA RPL30P7 98179 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 10743646 10743952 10743932 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 15432 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 11648258 11648305 11648298 Y NA NA NA NA NA NA DAP 888874 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 12314219 12314247 12314235 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1554835 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 14107708 14107995 14107845 Y NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 33816 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 14204877 14205144 14204973 Y FAM105B NA NA NA NA NA TRIO 63066 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 14251046 14251256 14251151 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 109235 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 14582921 14583040 14582953 Y FAM105A FAM105A NA NA NA NA FAM105A 3037 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 14593853 14594225 14594048 Y NA FAM105A NA NA NA NA FAM105A 13969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 14937373 14937729 14937572 Y FAM105A NA ANKH,FAM105B IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 67486 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 15451801 15451916 15451863 Y NA NA FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 581914 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 16492574 16492683 16492630 Y FAM134B ZNF622 NA NA NA NA ZNF622 28673 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr5 16539355 16539674 16539525 Y FAM134B NA NA NA NA NA ZNF622 75454 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 16727981 16728387 16728161 Y FAM134B NA NA NA NA NA FAM134B 112814 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 16736297 16736738 16736539 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 121130 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 16821332 16821498 16821415 Y NA NA NA NA NA NA MYO10 112874 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 16898106 16898497 16898302 Y MYO10 MYO10 NA NA NA NA MYO10 35875 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 17192994 17193219 17193125 Y NA NA NA NA NA NA BASP1 129287 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 17196578 17196835 17196707 Y NA NA NA NA NA NA BASP1 132871 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 21539943 21540207 21540075 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 200001 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 24272966 24273308 24273185 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 536282 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 24283282 24283641 24283411 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 525949 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 26336181 26336366 26336274 Y NA NA NA NA NA NA LINC01021 1134033 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 27309667 27310060 27309866 Y NA NA NA NA NA NA LINC01021 160339 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr5 32175167 32175567 32175368 Y NA GOLPH3,CTD-2186M15.1 NA NA NA NA GOLPH3 2711 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 32592950 32593432 32593186 Y NA NA NA NA NA NA SUB1 63211 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 33688737 33688976 33688873 Y NA NA NA NA NA NA TARS 249935 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 34587608 34588326 34587915 Y NA NA RAI14 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 66016 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 34877157 34877486 34877355 Y NA TTC23L,BRIX1,RAD1 NA NA NA NA BRIX1 35995 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 35797370 35797672 35797610 Y SPEF2,IL7R NA NA NA NA NA LMBRD2 352391 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 36119586 36119746 36119728 Y SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA LMBRD2 30317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr5 36277104 36277309 36277165 Y NA NA NA NA NA NA SKP2 127013 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 36425659 36425959 36425758 Y NA NA NA NA NA NA SKP2 275568 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 36898243 36898633 36898363 Y NIPBL NIPBL NA NA NA NA NIPBL 23382 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 37272795 37272956 37272876 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 25265 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 37311676 37311784 37311730 Y NA NA NA NA NA NA NUP155 57499 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 37776965 37777327 37776998 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 399651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 38324139 38324158 38324148 Y NA NA NA NA NA NA LIFR 282298 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 38514652 38514707 38514680 Y NA NA NA NA NA NA LIFR 91749 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr5 38872248 38872554 38872396 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 199956 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 39025065 39025383 39025224 Y NA RICTOR NA NA NA NA RICTOR 47127 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr5 39186669 39186768 39186720 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 114159 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 39292432 39292553 39292530 Y NA NA NA NA NA NA C9 130417 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 39403483 39403837 39403660 Y NA C9 NA NA NA NA C9 19133 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 39411101 39411451 39411362 Y NA C9,DAB2 NA NA NA NA C9 11519 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 39716547 39716931 39716737 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 256145 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 39721328 39721512 39721418 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 260926 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 40411118 40411409 40411246 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 266191 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 40430020 40430156 40430070 Y PTGER4 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 247444 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr5 40570659 40570764 40570714 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 106836 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 40682862 40683125 40682898 Y CARD6,PTGER4 PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 5262 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 40689630 40689893 40689724 Y NA PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 12030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 40754670 40754884 40754791 Y PTGER4 TTC33,PRKAA1 NA NA NA NA TTC33 593 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 41826733 41826755 41826744 Y NA OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 41866 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA CTD-2035E11.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8093 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 43010298 43010802 43010620 Y GHR,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 5729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 43061828 43062062 43061945 Y NA CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 1216 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 43480579 43480813 43480696 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 NA NA NA NA C5orf28 1182 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 44663713 44663769 44663741 Y NA NA NA NA NA NA RP11-53O19.1 143110 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 44875784 44875973 44875831 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 68757 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 45793437 45793825 45793631 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 986410 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 53293727 53293898 53293842 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 310514 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 56704615 56704811 56704720 Y NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 236840 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 57479551 57479905 57479697 Y NA NA PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLK2 274182 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 58165920 58166304 58166218 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 289872 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 58317891 58318186 58317997 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 441843 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 58418380 58418697 58418552 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 542332 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 58951498 58952014 58951831 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 863933 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 59004737 59004748 59004743 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 811199 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 47046 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 65898344 65898352 65898348 Y MAST4 MAST4 NA NA NA NA MAST4 8168 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4-AS1 151855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 67853503 67853694 67853599 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 343955 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 182388 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 71424352 71424432 71424374 Y NA MAP1B NA NA NA NA MAP1B 23291 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 71462643 71462861 71462688 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 61582 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 71505945 71506221 71506083 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 104884 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 71763835 71764098 71763993 Y NA NA NA NA NA NA MRPS27 149362 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 71855629 71855963 71855845 Y NA NA TNPO1,ZNF366 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 241156 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 72950370 72950710 72950420 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 90859 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 75034241 75034569 75034405 Y NA POC5 NA NA NA NA POC5 22928 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 75206184 75206581 75206350 Y IQGAP2,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP NA SV2C IMR90 Hi-C 24141950 POC5 194871 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 NA NA NA NA NA AGGF1 287976 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 76590045 76590451 76590191 Y NA NA NA NA NA NA PDE8B 85771 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 77837654 77837953 77837804 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 183315 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 77843471 77844086 77843723 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 189132 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 78204289 78204572 78204406 Y NA NA NA NA NA NA ARSB 75338 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 78439900 78440059 78439990 Y NA NA NA NA NA NA DMGDH 89802 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 78520885 78521246 78521066 Y NA DMGDH,JMY NA NA NA NA DMGDH 8615 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 80253952 80254094 80254023 Y NA NA NA NA NA NA DHFR 305150 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 80372631 80372748 80372736 Y NA NA NA NA NA NA CKMT2-AS1 222631 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 80394008 80394030 80394018 Y NA NA NA NA NA NA CKMT2-AS1 201349 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 80551638 80551938 80551834 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 43441 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 80895638 80895717 80895678 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 149899 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr5 81934356 81934439 81934367 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 361960 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 82356692 82356869 82356781 Y NA XRCC4,TMEM167A NA NA NA NA XRCC4 14448 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 83776854 83777163 83777009 Y NA NA NA NA NA NA TMEM167A 1405172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 86649300 86650123 86649885 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 56713 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 87530742 87531117 87530930 Y NA TMEM161B-AS1,TMEM161B NA NA NA NA TMEM161B-AS1 31595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 88042920 88043139 88043027 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA CTC-467M3.1 72884 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 88049137 88049533 88049445 Y MEF2C NA NA NA NA NA CTC-467M3.1 79101 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 88252267 88252500 88252370 Y NA NA NA NA NA NA CTC-467M3.1 282231 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 89052822 89053009 89052916 Y NA NA NA NA NA NA CETN3 650594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 90354334 90354731 90354568 Y ARRDC3 NA NA NA NA NA RNU4-90P 209813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 90546326 90546345 90546336 Y NA RNU4-90P ARRDC3,LOC100129716,GPR98 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU4-90P 18199 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 90579794 90579971 90579883 Y ARRDC3 RNU4-90P,LUCAT1 ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-90P 15250 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 90679835 90680013 90679955 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 2659 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 92958001 92958327 92958133 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 40958 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 94412847 94413065 94412956 Y MCTP1 NA NA NA NA NA MCTP1 205214 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 95207014 95207210 95207113 Y ELL2 NA NA NA NA NA GLRX 50305 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 98253335 98253735 98253703 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 9140 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 102304978 102305194 102305031 Y NA NA NA NA NA NA PPIP5K2 148659 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr5 106822252 106822471 106822392 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 182125 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 106837531 106838094 106837969 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 166502 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr5 110797509 110797845 110797534 Y NA NA NA NA NA NA WDR36 372095 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 112218687 112219263 112218745 Y APC SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 23768 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 112509140 112509432 112509369 Y NA NA NA NA NA NA DCP2 198741 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 114750887 114751289 114751050 Y NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 120359 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 114959651 114959879 114959766 Y COMMD10 TMED7 NA NA NA NA TMED7-TICAM2,TICAM2 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 119434159 119434302 119434231 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 363671 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 122034407 122034744 122034604 Y NA NA NA NA NA NA SNX2 73947 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 123211449 123211701 123211673 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G3 365656 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 123739028 123739231 123739141 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 343269 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 13.5508474905263 chr5 124085012 124085124 124085092 Y NA ZNF608 ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 2512 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 124473209 124473536 124473320 Y NA NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 330283 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 125572604 125572646 125572625 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD3 121178 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 125730040 125730374 125730276 Y C5orf48,ALDH7A1,GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 36216 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 131450160 131450175 131450167 Y NA NA IL3,ACSL6,CSF2,LOC553103,SLC22A4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL6 104224 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA SLC22A4 26354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 131763102 131763516 131763179 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.6 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf56 18774 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 131795302 131795488 131795309 Y NA AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 11247 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 132137425 132137486 132137431 Y SEPT8,SEPT8 SEPT8,SOWAHA,SHROOM1 NA NA NA NA SEPT8 3447 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA AFF4 26161 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 133290184 133290209 133290197 Y NA C5orf15,VDAC1 NA NA NA NA C5orf15 12269 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 133540709 133541017 133540863 Y NA SKP1,PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 18816 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA AC005355.1 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.1 31064 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA AC005355.1 92728 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 133880902 133881116 133881009 Y PCBD2,CDKL3,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 101363 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.99398580156195 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr5 134451996 134452165 134452096 Y NA NA H2AFY,PCBD2,CATSPER3,LOC340073 IMR90 Hi-C 24141950 PITX1 83493 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 135097584 135097864 135097724 Y NA NA TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 264720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 135372729 135373019 135372874 Y NA TGFBI NA NA NA NA TGFBI 10145 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 135405259 135405482 135405390 Y NA TGFBI NA NA NA NA TGFBI 42675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 136420806 136421212 136420952 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 229489 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 136715478 136715738 136715608 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 216330 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 137797072 137797362 137797204 Y FAM53C,ETF1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1817 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 138058227 138058591 138058405 Y NA AC034243.1 CTNNA1,SIL1,MATR3,LRRTM2 IMR90 Hi-C 24141950 AC034243.1 28407 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 138263528 138263871 138263700 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 176530 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 190951 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 138786651 138786712 138786682 Y NA SPATA24,DNAJC18 NA NA NA NA DNAJC18 8471 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 139017086 139017541 139017145 Y CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 7343 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 139017934 139018665 139018227 Y MZB1,CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 6219 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 139031397 139032095 139031636 Y C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 6513 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 139049454 139050310 139049802 Y MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 24570 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr5 139691635 139691999 139691907 Y HBEGF PFDN1,HBEGF NA NA NA NA PFDN1 10929 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 140381128 140381335 140381222 Y NA PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 37308 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 141256552 141256862 141256814 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 KIAA0141 NA NA NA NA PCDH1 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 142341115 142341252 142341163 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 193166 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 142383259 142383413 142383268 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 235310 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 142690864 142691375 142691192 Y NR3C1,NR3C1 RPL7P21 NA NA NA NA RPL7P21 18795 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 143078144 143078385 143078261 Y NA NA ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 265067 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 145150590 145150800 145150695 Y NA NA NA NA NA NA LARS 409423 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 146268013 146268084 146268061 Y STK32A,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA PPP2R2B 194263 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 146832241 146832308 146832261 Y JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55311 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 147218600 147219023 147218871 Y SPINK1 NA JAKMIP2 IMR90 Hi-C 24141950 JAKMIP2 58262 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 147646107 147646243 147646175 Y NA NA NA NA NA NA RP11-373N22.3 115103 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 148172345 148172765 148172447 Y FBXO38,ADRB2 NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 346281 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 148510344 148510723 148510652 Y NA ABLIM3 AFAP1L1,SH3TC2,ABLIM3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABLIM3 8323 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 148533618 148533717 148533668 Y NA ABLIM3 NA NA NA NA ABLIM3 14572 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 149853688 149853975 149853788 Y NA RPS14,NDST1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 9406 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 149902198 149902484 149902343 Y NA NDST1 NA NA NA NA NDST1 38817 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 155902989 155903114 155903052 Y NA NA NA NA NA NA HAVCR2 664766 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 156694779 156695141 156694960 Y NA CYFIP2 NA NA NA NA CYFIP2 3690 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr5 156814689 156815040 156814693 Y NA NA NA NA NA NA CYFIP2 123600 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 156913799 156914134 156913967 Y NA NA NA NA NA NA CYFIP2 222710 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 156994129 156994375 156994248 Y HAVCR2,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2,NIPAL4,ADAM19 NA NA NA NA NA THG1L 161830 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 159434366 159434726 159434546 Y FABP6 TTC1 NA NA NA NA TTC1 246 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 159688113 159688294 159688164 Y CCNJL RP11-34P1.2 NA NA NA NA RP11-34P1.2 4853 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 160353597 160353673 160353635 Y NA NA NA NA NA NA PTTG1 506768 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 168051900 168052268 168052099 Y NA PANK3,CTC-575D19.1 SLIT3 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-575D19.1 10583 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 168703630 168703948 168703744 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 662313 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 169130299 169130340 169130320 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 1088982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 169173087 169173552 169173102 Y NA NA NA NA NA NA RANBP17 1113322 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 169180786 169180969 169180879 Y DOCK2 NA NA NA NA NA RANBP17 1105905 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 170174489 170174734 170174652 Y GABRP NA NA NA NA NA RANBP17 112140 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 149774 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 171326428 171326478 171326475 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 105399 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 171602273 171602685 171602548 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 10705 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 171847636 171847998 171847816 Y NA SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 31529 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 172127299 172127478 172127433 Y NEURL1B CTB-79E8.3 NA NA NA NA CTB-79E8.3 45583 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 172202171 172203025 172202666 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 5973 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 172228151 172228566 172228394 Y DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 30712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 172257827 172258390 172258174 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 888 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 172262088 172262814 172262509 Y DUSP1,C5orf41 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 2810 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 172264744 172264958 172264926 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 5466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 172283530 172283741 172283563 Y NA ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 24252 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 173125292 173125488 173125398 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 45726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr5 173369010 173369228 173369031 Y NA NA NA NA NA NA CPEB4 55727 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 173391031 173391183 173391109 Y HMP19 NA NA NA NA NA CPEB4 77748 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 173586705 173586920 173586830 Y NA NA NA NA NA NA CPEB4 273422 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 174153587 174153702 174153684 Y NA NA NA NA NA NA SFXN1 748363 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 176543923 176544044 176544003 Y TSPAN17,PRR7,DBN1 NSD1 NA NA NA NA NSD1 13982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr5 177373047 177373130 177373089 Y PROP1 RP11-1252I4.2 NA NA NA NA RP11-1252I4.2 8424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 179038504 179038699 179038602 Y NA HNRNPH1 NA NA NA NA HNRNPH1 21086 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 179513863 179514025 179513944 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 16745 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM41 13382 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 542839 543066 543064 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 148051 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 710742 711015 710979 Y HUS1B EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 19625 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 1869270 1869328 1869296 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 374598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 2330490 2330806 2330587 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 86508 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 2522882 2523160 2522884 Y NA NA GMDS,C6orf195,FOXC1 IMR90 Hi-C 24141950 WRNIP1 240488 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 2818084 2818421 2818253 Y SERPINB9 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 21819 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 3069574 3070273 3069674 Y NA HTATSF1P2,RIPK1,BPHL LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 7349 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 3160462 3160701 3160583 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 4702 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 3254273 3254642 3254472 Y SLC22A23 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 24309 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 3403581 3403822 3403689 Y BPHL,SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 51434 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 3427913 3428207 3428060 Y SLC22A23 SLC22A23 NA NA NA NA SLC22A23 27049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 3616228 3616497 3616363 Y NA NA SLC22A23,BPHL,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 133763 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 3916569 3916712 3916641 Y NA NA SLC22A23,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 68949 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 297587 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 4778036 4778769 4778420 Y CDYL NA NA NA NA NA CDYL 73643 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 5031190 5031205 5031197 Y NA RPP40 RPP40 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPP40 28893 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 401666 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 5724558 5724824 5724692 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 465281 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 6000594 6000986 6000896 Y NRN1 NA NA NA NA NA FARS2 741317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 6005714 6006036 6005928 Y NRN1 NA NA NA NA NA FARS2 746437 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 6008887 6009261 6009138 Y NRN1 NA NA NA NA NA FARS2 749610 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 6678540 6678781 6678655 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 427049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr6 6750084 6750462 6750414 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 355368 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 6825409 6825642 6825558 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 280188 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 6826619 6826698 6826659 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 279132 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 7137966 7138068 7138020 Y RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 32136 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 7532623 7532708 7532667 Y NA DSP CAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 DSP 7100 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 9710906 9711148 9711028 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 706744 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 10355646 10355875 10355765 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 62017 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 10771427 10771996 10771700 Y ELOVL2,MAK TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA SYCP2L 25400 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 11197003 11197299 11197017 Y ERVFRD-1,NEDD9 NA NA NA NA NA ELOVL2 154456 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 11229489 11229708 11229675 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 150873 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 11374452 11374883 11374763 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 5698 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 11393241 11393536 11393390 Y NEDD9 NEDD9 NEDD9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 12660 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 11495068 11495420 11495113 Y TMEM170B,NEDD9 TMEM170B NEDD9,LOC100506409,ELOVL2,ERVFRD-1,C6orf228,SYCP2L,GCM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM170B 40518 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 11523168 11523305 11523200 Y TMEM170B,HIVEP1 TMEM170B NEDD9,SYCP2L,C6orf228,ELOVL2,LOC100506409,GCM2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 12633 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 11729368 11729745 11729666 Y HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 193430 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 12209013 12209223 12209145 Y HIVEP1,EDN1 NA HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 202018 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 12277553 12277959 12277761 Y HIVEP1,EDN1 NA NA NA NA NA HIVEP1 270558 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 12472967 12473281 12473124 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP1 465972 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 13449737 13449960 13449842 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1 GFOD1 NA NA NA NA GFOD1 35934 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 14121845 14123283 14121874 Y NA CD83 NA NA NA NA CD83 5973 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 14884214 14884345 14884265 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 360182 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 14921244 14921932 14921499 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 322595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 15021707 15021883 15021795 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 222644 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 15542142 15542162 15542152 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 119127 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 15962763 15962891 15962828 Y NA NA NA NA NA NA MYLIP 164465 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 16151584 16151748 16151704 Y NA MYLIP NA NA NA NA MYLIP 24228 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 16205650 16206035 16205852 Y NA GMPR DTNBP1,MYLIP,GMPR IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GMPR 30776 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 16215873 16216103 16215954 Y MYLIP GMPR GMPR,JARID2,DTNBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GMPR 20708 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 16320322 16320626 16320375 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 83511 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 16422379 16422759 16422608 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 185568 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 16439523 16439703 16439580 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 202712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 16687739 16687973 16687884 Y ATXN1 NA NA NA NA NA ATXN1 71749 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 17312081 17312238 17312192 Y RBM24 NA NA NA NA NA CAP2 79209 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 17614611 17614952 17614695 Y KIF13A,NUP153,FAM8A1 FAM8A1 NA NA NA NA FAM8A1 16025 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 18700371 18700729 18700516 Y NA NA NA NA NA NA DEK 437317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 19448405 19448469 19448461 Y NA NA NA NA NA NA RP4-625H18.2 354514 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 20069175 20069519 20069346 Y NA NA NA NA NA NA MBOAT1 141151 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 20174199 20174610 20174442 Y MBOAT1 MBOAT1 NA NA NA NA MBOAT1 36060 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 20239005 20239080 20239045 Y NA MBOAT1 MBOAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT1 28335 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 20239709 20240042 20239874 Y E2F3 MBOAT1 MBOAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT1 29039 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 20575670 20575691 20575681 Y NA CDKAL1 NA NA NA NA CDKAL1 42982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 20978432 20978689 20978561 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 445744 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 21264288 21264471 21264361 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 327501 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 21383430 21383704 21383606 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 208268 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 22072015 22072158 22072069 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 480043 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 24584505 24584676 24584669 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0319 59707 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr6 24927472 24927654 24927651 Y ALDH5A1,TDP2,C6orf62 PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 46993 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 25007534 25007864 25007632 Y TDP2,C6orf62 PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 32887 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA CMAHP 70052 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 25098063 25098345 25098205 Y NA NA NA NA NA NA CMAHP 66448 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 25170221 25170501 25170366 Y C6orf62 CMAHP CMAHP,FAM65B,LRRC16A IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 5428 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 25352378 25352572 25352400 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 75072 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 25815535 25815661 25815655 Y SLC17A3,SLC17A1 NA NA NA NA NA TRIM38 145369 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 7.43110991415957 chr6 26025834 26026125 26026038 Y BTN2A1,BTN2A1,TRIM38 HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 354 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr6 26521444 26521777 26521577 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 1368 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 26550694 26551000 26550826 Y NA HCG11,HMGN4,ABT1 NA NA NA NA HMGN4 14061 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 27416333 27416557 27416445 Y NA ZNF184 NA NA NA NA ZNF184 22340 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 27637197 27637397 27637297 Y OR2B6,OR2B2 NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN12 NA NA NA NA ZSCAN12 49442 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA TRIM39,HCG18 NA NA NA NA TRIM39 37784 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 30717441 30717627 30717503 Y RPP21,SFTA2,PSORS1C1 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 7110 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 30748515 30748873 30748611 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,NRM,MRPS18B,PPP1R10,DDR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 38184 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 31240851 31241006 31240942 Y NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B HLA-C,RPL3P2 NA NA NA NA HLA-C 2944 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 32075999 32076179 32076125 Y LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB ATF6B,FKBPL,PPT2 NA NA NA NA ATF6B 17851 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8 NA NA NA NA ATF6B 11988 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 32762261 32762648 32762525 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQB1,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8 NA NA NA NA TAP2 41909 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 32952668 32952702 32952685 Y NA BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2-IT1 16659 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 33538378 33538887 33538702 Y LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 7132 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 33558672 33558897 33558785 Y NA BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 12653 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 33684801 33685193 33684861 Y NA IP6K3 MNF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IP6K3 27569 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 33712309 33712484 33712432 Y IP6K3 IP6K3,LEMD2 NA NA NA NA IP6K3 278 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 34111450 34111793 34111613 Y PACSIN1,GRM4 NA MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 CYCSP55 73423 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 34624445 34624747 34624649 Y TAF11 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37889 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 35016451 35016706 35016532 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 161409 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 35337950 35338511 35338285 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 29615 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 35532430 35532714 35532506 Y NA NA NA NA NA NA RPL10A 98245 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 35632268 35633036 35633003 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 61324 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr6 37190361 37190574 37190538 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 32974 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 37470188 37470996 37470682 Y NA CCDC167 CCDC167,FTSJD2,MDGA1,RNF8,MIR4462,BTBD9 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC167 4490 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 37892657 37892863 37892737 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 107382 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 39279620 39279758 39279742 Y NA NA NA NA NA NA KCNK5 84394 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 40404515 40404662 40404592 Y NA NA NA NA NA NA LRFN2 148542 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 40445607 40445840 40445690 Y NA NA NA NA NA NA LRFN2 107364 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 40552429 40552712 40552638 Y LRFN2 LRFN2 NA NA NA NA LRFN2 492 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 41512989 41513289 41513139 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 825 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 41623844 41623904 41623860 Y NA NA NA NA NA NA TFEB 78093 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 41649853 41650127 41649990 Y NA NA NA NA NA NA TFEB 51870 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 41938271 41938604 41938519 Y TFEB NA NA NA NA NA BYSL 51345 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 42375139 42375533 42375327 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 42256 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 42515662 42516014 42516002 Y GUCA1A,MEA1,KIAA0240 UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 13786 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 42522150 42522385 42522267 Y GUCA1A,MEA1,KIAA0240 UBR2 GUCA1B,TRERF1,TAF8,C6orf132,UBR2,MRPS10 IMR90 Hi-C 24141950 UBR2 7415 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 42694331 42694739 42694439 Y KLC4,KLC4,CUL9,TRERF1,C6orf226,PRPH2,TBCC ATP6V0CP3,TBCC NA NA NA NA ATP6V0CP3 1359 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 42944082 42944413 42944248 Y NA CNPY3,RPL24P4,PEX6,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36 NA NA NA NA PEX6 545 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 43085846 43085863 43085854 Y NA PTK7 NA NA NA NA PTK7 43840 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 43635973 43636240 43636108 Y NA GTPBP2,MAD2L1BP,RSPH9,MRPS18A NA NA NA NA MRPS18A 17288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 43766474 43766976 43766784 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 30553 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 43767552 43768173 43767868 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 31631 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 43771690 43772179 43771963 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 35769 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 43894411 43894725 43894584 Y NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP NA NA NA NA NA C6orf223 71592 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 44020614 44020967 44020695 Y NFKBIE NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 54297 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 44618318 44618334 44618326 Y NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 265056 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 44887030 44887214 44887174 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 456476 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 45294493 45294953 45294580 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48737 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 41388 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 45306825 45307168 45307007 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 36522 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 45322073 45322342 45322124 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 21348 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 45575518 45575910 45575680 Y NA NA RUNX2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SUPT3H 231828 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 47550559 47550935 47550672 Y NA NA NA NA NA NA GPR111 71237 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 49510900 49511136 49511061 Y NA C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 4977 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr6 49524322 49524464 49524384 Y NA C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 8209 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 49533704 49534052 49533813 Y C6orf141 C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 17591 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr6 52376478 52376751 52376615 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 62962 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 52383934 52384018 52383972 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 55695 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 52505026 52505217 52505106 Y NA TMEM14A EFHC1,TRAM2,PAQR8,LOC730101 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM14A 28690 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.68261346376908 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 53225010 53225140 53225110 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 13063 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 53454332 53454653 53454605 Y NA GCLC,RP1-27K12.2 KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 GCLC 25115 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 53919215 53919239 53919233 Y NA NA NA NA NA NA MLIP 126435 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 54065403 54065434 54065422 Y MLIP NA NA NA NA NA MLIP 272623 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 56459514 56459884 56459699 Y NA NA NA NA NA NA DST 357542 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 56779787 56780031 56779873 Y NA DST,BEND6 BAG2,ZNF451,BEND6,PRIM2 IMR90 Hi-C 24141950 DST 37395 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 57396616 57396964 57396757 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 219013 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 57408924 57409255 57409252 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 231321 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 62702778 62703151 62702965 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS2 290981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 66637182 66637579 66637401 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2293457 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 67225027 67225145 67225086 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2881302 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 70489653 70490034 70489967 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 14969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 71590052 71590374 71590213 Y FAM135A NA NA NA NA NA SMAP1 214573 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 103040 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 76367901 76367953 76367944 Y NA NA NA NA NA NA SENP6 58676 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 80663174 80663336 80663221 Y NA TTK NA NA NA NA TTK 48268 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 81048044 81048318 81048128 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 233680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 82547816 82548067 82547911 Y FAM46A NA FAM46A MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM46A 87325 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 82854780 82854947 82854862 Y NA NA NA NA NA NA IBTK 100524 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 83521076 83521456 83521266 Y NA NA NA NA NA NA DOPEY1 253929 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 83745270 83745402 83745336 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 29983 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 83793136 83793338 83793237 Y PRSS35,DOPEY1 DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 17751 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 84139998 84140114 84140099 Y ME1 ME1 NA NA NA NA ME1 1201 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 85705228 85705597 85705413 Y NA NA NA NA NA NA SNX14 596277 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 88401154 88401337 88401278 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 8590 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 90061423 90061611 90061503 Y RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 856 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 90782420 90782788 90782672 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 244807 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 90797796 90798074 90797935 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 260183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 90856849 90857084 90856969 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 319236 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 325188 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 96616633 96616738 96616686 Y FUT9 NA NA NA NA NA UFL1 350733 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 100584000 100584312 100584155 Y NA NA SIM1,ASCC3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-121G13.3 391840 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 101204667 101204976 101204826 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 122272 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 105214871 105215235 105215053 Y NA NA NA NA NA NA HACE1 90559 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 105540278 105540291 105540285 Y HACE1,LIN28B BVES NA NA NA NA BVES 42758 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 106540002 106540199 106540101 Y PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 7807 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 107621791 107622175 107621983 Y NA NA NA NA NA NA PDSS2 156593 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 109672770 109673128 109672949 Y NA CD164 NA NA NA NA CD164 28634 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 110415658 110415810 110415734 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 83397 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 111265873 111266130 111266017 Y SLC16A10,AMD1,AMD1 GTF3C6,RPF2 CDK19,AMD1,SLC22A16 IMR90 Hi-C 24141950 GTF3C6 11633 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 111614404 111614762 111614615 Y NA KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 35853 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 112192236 112192610 112192499 Y REV3L,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 45 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 112364338 112364486 112364397 Y TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 42246 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 112428707 112428734 112428721 Y LAMA4 TUBE1 NA NA NA NA TUBE1 21975 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 113680929 113681231 113681080 Y NA NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 495310 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 116469368 116469398 116469382 Y NA NT5DC1 NA NA NA NA NT5DC1 49356 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 116771989 116772055 116772034 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA RWDD1 118475 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 118008335 118008695 118008355 Y NA NUS1 NA NA NA NA NUS1 13670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 118897256 118897573 118897333 Y NA NA NA NA NA NA CEP85L 131665 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 119214275 119214495 119214295 Y C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 891 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 119468463 119468799 119468540 Y FAM184A NA NA NA NA NA FAM184A 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 119764172 119764289 119764182 Y MAN1A1 NA NA NA NA NA MAN1A1 95246 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr6 121396728 121397112 121396920 Y C6orf170 NA NA NA NA NA RNU4-35P 376155 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 124126884 124127258 124127027 Y NA NKAIN2 NA NA NA NA NKAIN2 3598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr6 124207089 124207423 124207256 Y NKAIN2 NA NA NA NA NA NKAIN2 83803 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 126071522 126071828 126071676 Y NA HEY2,NCOA7 NA NA NA NA HEY2 4712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 126167488 126167529 126167508 Y NCOA7 NA NA NA NA NA NCOA7 67181 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA ECHDC1 318584 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 128816273 128816626 128816620 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 23244 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 130212906 130213257 130213070 Y NA NA TMEM244,LAMA2,ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 L3MBTL3 119587 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 131350914 131351060 131350987 Y AKAP7 NA NA NA NA NA MED23 596309 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 134088671 134088966 134088914 Y NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 182342 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 134395597 134395721 134395640 Y NA NA TBPL1,SLC2A12,HBS1L,EYA4 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 124289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr6 134761528 134761869 134761739 Y SGK1,SGK1 NA NA NA NA NA SGK1 124278 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 135344059 135344242 135344151 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 77952 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA MYB 136311 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 136434966 136435173 136435049 Y BCLAF1 NA NA NA NA NA BCLAF1 173816 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 136716338 136716450 136716395 Y MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 107349 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 136724164 136724966 136724405 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 115175 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 136729350 136729610 136729525 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 120361 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 136788990 136789214 136789102 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 80743 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 136907576 136907759 136907659 Y NA MAP7 NA NA NA NA MAP7 37619 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 136965409 136965459 136965418 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 95452 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 137242009 137242335 137242164 Y IL20RA,SLC35D3 SLC35D3 NA NA NA NA SLC35D3 607 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 137310723 137310892 137310775 Y IL20RA,SLC35D3 NA NA NA NA NA IL20RA 53406 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 138038588 138039125 138038794 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3,PERP IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 147226 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 138045007 138045495 138045466 Y NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 140856 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 138291437 138291772 138291605 Y PBOV1 NA NA NA NA NA TNFAIP3 105086 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 138495604 138495926 138495622 Y NA KIAA1244 NA NA NA NA KIAA1244 14546 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 138552516 138552583 138552548 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1244 71458 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 138776959 138777186 138777132 Y PBOV1 NA NA NA NA NA HEBP2 54291 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 139213986 139214343 139214165 Y NA NA NA NA NA NA REPS1 93055 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 139304978 139305148 139305081 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 2250 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 139812084 139812114 139812099 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 118327 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 143141084 143141442 143141235 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 122896 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 143471502 143471640 143471571 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 91869 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 143503002 143503176 143503018 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 123369 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 144066654 144067070 144066822 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 95411 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 145147432 145147802 145147573 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 627330 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 146867560 146867942 146867733 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 4731 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 146870033 146870230 146870118 Y NA RAB32 NA NA NA NA RAB32 7204 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 147217441 147217852 147217780 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5 305709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 147477372 147477535 147477473 Y NA STXBP5,STXBP5-AS1 NA NA NA NA STXBP5 46026 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 19.670585066893 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5-AS1 119623 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 149375159 149375460 149375259 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 162317 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 150075680 150075936 150075837 Y SUMO4 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 6879 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 150576036 150576243 150576102 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-7P 69656 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 150590987 150591352 150591048 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-7P 54547 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 150647426 150647808 150647617 Y NA RNU4-7P PPP1R14C IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-7P 1527 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 151246480 151246919 151246675 Y ZBTB2 NA NA NA NA NA MTHFD1L 61795 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 151325792 151326084 151325926 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 92581 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 152281783 152282174 152281880 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA ESR1 305957 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 153002467 153002857 153002662 Y NA NA SYNE1,MYCT1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO5 299857 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 153358098 153358156 153358117 Y SYNE1,RGS17 MTRF1L NA NA NA NA MTRF1L 36278 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 154664890 154665258 154665161 Y IPCEF1 NA NA NA NA NA CNKSR3 164535 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 154753926 154754309 154754118 Y CNKSR3 NA NA NA NA NA CNKSR3 75484 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr6 154798068 154798417 154798243 Y NA CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 31376 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 154914262 154914493 154914392 Y CNKSR3 RPS4XP8 NA NA NA NA RPS4XP8 18819 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr6 156428584 156428923 156428735 Y NA NA NA NA NA NA TFB1M 794957 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 645468 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B NA NA NA NA NA TMEM242 640550 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr6 157726321 157726550 157726459 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 16083 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 157881944 157882245 157882133 Y ZDHHC14,SNX9 NA NA NA NA NA ZDHHC14 81779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 158184460 158184689 158184561 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 57607 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 161794970 161795177 161795007 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 101877 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 162625487 162625760 162625624 Y NA NA NA NA NA NA PACRG 520404 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 163098494 163098513 163098505 Y PARK2,PACRG,PACRG PACRG,PARK2 NA NA NA NA PACRG 47651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 163606625 163606682 163606645 Y QKI NA NA NA NA NA QKI 226350 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 163775993 163776169 163776078 Y QKI NA DKFZp451B082,PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 56863 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 163817744 163818245 163818151 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 14787 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA NA NA NA NA NA PRR18 297074 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr6 166964478 166964522 166964502 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 210399 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 167411045 167411413 167411177 Y NA RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 375 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 167527463 167527857 167527693 Y CCR6,CCR6 CCR6 NA NA NA NA CCR6 4168 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 168493730 168493970 168493824 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 268128 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 168558082 168558596 168558447 Y NA NA NA NA NA NA SMOC2 281235 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 168789584 168789819 168789635 Y NA NA CCR6 IMR90 Hi-C 24141950 SMOC2 50012 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr6 170089976 170090376 170090176 Y NA WDR27,C6orf120,PHF10 NA NA NA NA WDR27 9783 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 170208297 170208700 170208496 Y NA NA NA NA NA NA TCTE3 58642 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 170491997 170492052 170492021 Y NA NA NA NA NA NA DLL1 105509 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr6 170577975 170578174 170578069 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA DLL1 19387 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr7 475920 475996 475984 Y NA NA HEATR2,PRKAR1B MCF7 ChIA-PET 22265404 PDGFA 81937 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 94709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 655576 655910 655797 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 97643 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 850307 850449 850380 Y SUN1,SUN1 SUN1 NA NA NA NA SUN1 3079 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 949613 949923 949864 Y NA GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 35424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 1066965 1067028 1066969 Y NA GPR146 NA NA NA NA GPR146 15184 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 1270215 1270604 1270440 Y UNCX NA NA NA NA NA ZFAND2A 71820 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 1416814 1417157 1416984 Y NA NA NA NA NA NA MICALL2 79981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 1495047 1495214 1495102 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1 NA NA NA NA MICALL2 1924 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.11973757636671 chr7 1546424 1546775 1546565 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2935 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr7 1574153 1574602 1574313 Y NA INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5803 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 1968189 1968469 1968397 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 188262 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 55.0776381873004 chr7 1990940 1991132 1991045 Y SNX8,MAFK NA NA NA NA NA AC074389.9 211013 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr7 2006506 2006818 2006734 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 226579 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 2548551 2548955 2548724 Y LFNG,LFNG LFNG,BRAT1,IQCE LFNG K562 ChIA-PET 22265404 LFNG 1208 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr7 2550421 2551074 2550672 Y LFNG,LFNG,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 258 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr7 2551232 2551336 2551252 Y LFNG,LFNG,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 1069 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 2860040 2860490 2860319 Y LFNG,LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 12765 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 2934107 2934513 2934382 Y CARD11 NA NA NA NA NA GNA12 52149 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 3453682 3454067 3453904 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 114602 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 3490744 3491107 3491069 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 151664 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 3528330 3528371 3528351 Y NA NA NA NA NA NA SDK1 189250 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 3568098 3568478 3568121 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 229018 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 3603136 3603457 3603297 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 264056 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 3699539 3699733 3699636 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 360459 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 4133088 4133284 4133186 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 548104 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 4184588 4184872 4184657 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 496516 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 4765280 4765661 4765569 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 83892 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 4913549 4913687 4913618 Y NA AC092610.12,RADIL NA NA NA NA RADIL 7663 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 5276988 5277279 5277091 Y KIAA0415 WIPI2 NA NA NA NA WIPI2 49169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 5638553 5639025 5638653 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 8114 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 5733172 5733453 5733321 Y CCZ1,USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 85917 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 6296618 6296924 6296769 Y CCZ1 CYTH3 NA NA NA NA CYTH3 13351 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 6422514 6422839 6422633 Y CCZ1 RAC1 NA NA NA NA RAC1 10360 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 6425136 6425343 6425226 Y CCZ1,USP42 RAC1 NA NA NA NA RAC1 12982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 7608686 7608956 7608841 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 4183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 8171530 8172177 8171751 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA AC007009.1 127686 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 8200439 8200588 8200466 Y NXPH1 NA NA NA NA NA AC007009.1 99275 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 8300349 8300667 8300508 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 32 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 8663784 8663976 8663856 Y NXPH1 NA NA NA NA NA ICA1 363467 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 9200213 9200579 9200435 Y NA NA NA NA NA NA ICA1 899896 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 11859641 11859960 11859801 Y THSD7A THSD7A NA NA NA NA THSD7A 9864 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 11867283 11867421 11867420 Y NA THSD7A NA NA NA NA THSD7A 2403 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 12105634 12105996 12105845 Y NA NA NA NA NA NA TMEM106B 142871 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 12582030 12582229 12582042 Y NA SCIN SCIN IMR90 Hi-C 24141950 SCIN 25974 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 12624573 12625024 12624751 Y NA SCIN NA NA NA NA SCIN 16370 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 13085757 13085829 13085793 Y NA NA ARL4A IMR90 Hi-C 24141950 ARL4A 361276 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 13372875 13373192 13373034 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 648394 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 13512547 13512927 13512737 Y NA NA DGKB IMR90 Hi-C 24141950 ETV1 516123 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 13758700 13759051 13758876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 269999 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 15595276 15595396 15595337 Y NA AGMO NA NA NA NA AGMO 4244 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 16060900 16061318 16061010 Y NA NA NA NA NA NA MEOX2 336463 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 18161165 18161355 18161260 Y NA HDAC9 NA NA NA NA HDAC9 36593 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 18678257 18678434 18678328 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 553685 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 18688713 18688867 18688789 Y HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 564141 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 20228342 20228547 20228441 Y TWISTNB,ITGB8 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 26480 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 20239036 20239390 20239182 Y TWISTNB MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 15637 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 20254261 20255002 20254926 Y MACC1 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 25 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 21254361 21254488 21254451 Y NA NA NA NA NA NA SP4 211164 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 21417349 21417477 21417448 Y NA SP4 NA NA NA NA SP4 48175 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 21502446 21502711 21502550 Y SP4 SP4 NA NA NA NA SP4 36794 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 22027858 22027865 22027862 Y NA CDCA7L NA NA NA NA CDCA7L 44156 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 22130088 22130317 22130208 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 146386 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 22398962 22399217 22399216 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 150401 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 22485088 22485297 22485116 Y RAPGEF5 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 64321 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 22631710 22632105 22631870 Y IL6 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 82092 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 22851635 22851773 22851763 Y NA TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 8697 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2 NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA NUPL2 126928 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 23411315 23411579 23411447 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 96507 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 23488792 23489118 23488955 Y KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 18968 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 7.43110991415957 chr7 25269294 25269305 25269300 Y NPVF NA NA NA NA NA CYCS 106314 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 25299375 25299555 25299465 Y NA NA NA NA NA NA CYCS 136395 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr7 25897167 25897316 25897282 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292544 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr7 25899920 25900213 25900190 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90 Hi-C 24141950 NFE2L3 289647 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr7 25992296 25992472 25992423 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 197388 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr7 26007044 26007425 26007148 Y HNRNPA2B1 NA NA NA NA NA NFE2L3 182435 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr7 26008426 26008494 26008464 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 181366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 26193570 26193972 26193862 Y SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA NFE2L3 3710 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 26355868 26356236 26355954 Y NA AC010677.5,SNX10 NA NA NA NA SNX10 26327 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 26523285 26523306 26523295 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0087 53101 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 26568856 26569109 26568983 Y NA KIAA0087,AC004947.2 NA NA NA NA KIAA0087 7298 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 26815721 26816027 26815980 Y SNX10,SNX10,SKAP2 NA NA NA NA NA SKAP2 216831 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 26888997 26889313 26889155 Y NA NA NA NA NA NA SKAP2 143545 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 27143635 27143783 27143725 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA5,HOXA3 NA NA NA NA HOXA1 10020 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 27149064 27149414 27149148 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA5,HOXA3 NA NA NA NA HOXA1 15449 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 27188378 27188640 27188509 Y NA HOXA5,HOXA3,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOXA13 NA NA NA NA HOXA3 1560 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 27206716 27206932 27206874 Y HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10 HOXA5,HOXA3,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOXA13 NA NA NA NA HOXA10-AS 478 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 27231816 27231998 27231907 Y HOXA10,HOXA11,HOXA13 HOXA3,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOXA13 NA NA NA NA HOXA13 5727 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 8.30535813935482 chr7 28612745 28613056 28612829 Y NA NA NA NA NA NA JAZF1 394383 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 29115131 29115317 29115226 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 44573 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 29310713 29310833 29310750 Y NA NA NA NA NA NA CHN2 150823 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 29325062 29325307 29325213 Y CHN2 NA NA NA NA NA CHN2 165172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 29464630 29464858 29464676 Y WIPF3 NA NA NA NA NA AC007255.8 136428 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 30005426 30005693 30005606 Y NA AC007285.6,SCRN1 NA NA NA NA AC007285.6 20523 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 30188805 30188913 30188846 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8 123785 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 30278478 30278832 30278618 Y NA ZNRF2 NA NA NA NA ZNRF2 43091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 30956234 30956541 30956398 Y NA NA NA NA NA NA FAM188B 147201 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 31704634 31704826 31704694 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 828069 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 32551548 32551619 32551584 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 18510 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 33708733 33708947 33708840 Y NA NA NA NA NA NA BMPER 233576 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 33762230 33762341 33762268 Y NA NA BMPER,BBS9 IMR90 Hi-C 24141950 BMPER 180182 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 36238635 36238884 36238775 Y EEPD1 EEPD1 NA NA NA NA EEPD1 47877 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 36331807 36331936 36331811 Y NA NA NA NA NA NA ANLN 95479 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 36532434 36532616 36532525 Y ELMO1,AOAH,EEPD1 NA NA NA NA NA KIAA0895 104700 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 36789237 36789558 36789469 Y AOAH NA NA NA NA NA KIAA0895 361503 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 37023926 37024076 37024004 Y AOAH,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 596192 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 37071492 37071821 37071657 Y AOAH,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 643758 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 37321463 37321896 37321681 Y GPR141,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 893729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 37403436 37403747 37403647 Y NA NA NA NA NA NA STARD3NL 812077 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 40138099 40138142 40138120 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 150463 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 40755655 40755948 40755803 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 768019 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 40756959 40757193 40757114 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 769323 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 41670449 41670706 41670569 Y NA NA C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 70000 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 43138797 43138930 43138838 Y NA NA HECW1 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA2 168975 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 43676905 43677264 43677045 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP NA NA NA NA NA STK17A 56548 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 44127636 44127736 44127679 Y YKT6,AEBP1 DBNL,POLM,AEBP1,POLD2 PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B IMR90 Hi-C 24141950 POLM 7497 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 44549904 44550285 44550054 Y NA AC004453.8,NUDCD3 NA NA NA NA NUDCD3 21425 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 44654798 44655022 44654925 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA OGDH 10627 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 44764845 44765151 44764999 Y RAMP3 ZMIZ2 NA NA NA NA ZMIZ2 21029 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 44907031 44907191 44907086 Y NA H2AFV,PURB NA NA NA NA PURB 15769 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 46597190 46597387 46597291 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 637717 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 46708141 46708157 46708149 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 748668 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 47482953 47483112 47483033 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 137044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 47510195 47510559 47510444 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 109597 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr7 47588229 47588393 47588311 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 31763 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 47610205 47610436 47610283 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 9720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 48294708 48294972 48294840 Y HUS1,UPP1,UPP1 NA NA NA NA NA UPP1 168483 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 50043357 50043617 50043487 Y NA NA NA NA NA NA ZPBP 115308 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 50248047 50248231 50248138 Y NA NA COBL IMR90 Hi-C 24141950 ZPBP 89122 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 50602565 50602886 50602809 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 86477 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 50695953 50696288 50696121 Y NA NA NA NA NA NA GRB10 162871 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 11814 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 55063666 55063958 55063856 Y EGFR NA EGFR IMR90 Hi-C 24141950 SEC61G 237999 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 55541787 55541962 55541880 Y NA NA NA NA NA NA VOPP1 96719 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 55542922 55542955 55542935 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 55543241 55543436 55543358 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95245 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 55576915 55577332 55577184 Y NA NA NA NA NA NA VOPP1 61349 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 55615946 55616205 55616135 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 22476 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 56013517 56013601 56013542 Y ZNF713 GBAS,MRPS17 NA NA NA NA GBAS 3885 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 56243524 56243790 56243559 Y LOC389493 NA NA NA NA NA NUPR1L 61431 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 56606357 56606502 56606382 Y LOC389493 NA NA NA NA NA NUPR1L 424264 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-73B2.6 1414954 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr7 61976180 61976543 61976362 Y NA NA NA NA NA NA RP11-73B2.6 1408141 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 63775449 63776053 63775748 Y NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 9612 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 65360437 65360759 65360712 Y NA VKORC1L1 NA NA NA NA VKORC1L1 24183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 65613460 65613645 65613556 Y ASL,ASL CRCP NA NA NA NA CRCP 35869 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 65790150 65790379 65790243 Y RABGEF1,KCTD7,TPST1 NA LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 TPST1 121964 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 69091011 69091330 69091153 Y NA AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 29106 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 69308115 69308415 69308239 Y AUTS2,AUTS2 NA NA NA NA NA AUTS2 246210 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 70204788 70204872 70204831 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1142883 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 70206735 70207047 70206891 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1144830 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 70253382 70253537 70253463 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1191477 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 73002313 73002519 73002399 Y BCL7B BCL7B,TBL2 TBL2 K562 ChIA-PET 22265404 TBL2 11192 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 73133049 73133354 73133303 Y NA WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA STX1A 1047 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 73153813 73154099 73154081 Y FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 2616 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 75291375 75291448 75291402 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 74832 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 75567331 75567651 75567437 Y POR POR NA NA NA NA POR 40813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR SRRM3 SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 SRRM3 33163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.55686168896433 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 75993825 75994303 75994024 Y NA YWHAG YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7477 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG NA NA NA NA YWHAG 22825 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 76907614 76907779 76907731 Y NA NA NA NA NA NA CCDC146 157863 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 77028776 77029116 77028943 Y NA NA NA NA NA NA PTPN12 135476 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 79758220 79758512 79758459 Y GNAI1 GNAI1 GNAT3 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 2759 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 80399893 80400101 80400015 Y NA NA NA NA NA NA GNAI1 638622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 5.24548935117146 chr7 81475817 81476043 81475927 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 595071 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 81582871 81583219 81583134 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 487895 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 81655164 81655347 81655329 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 415767 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 81858656 81858971 81858814 Y CACNA2D1 NA NA NA NA NA CACNA2D1 212143 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 82071570 82071737 82071656 Y NA CACNA2D1 NA NA NA NA CACNA2D1 456 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 82596075 82596467 82596271 Y NA NA NA NA NA NA PCLO 193779 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 83081582 83081807 83081725 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 194519 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 83865799 83865921 83865847 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 254119 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 85403399 85403494 85403443 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 589228 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 86534596 86534997 86534797 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 152018 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 86637666 86638039 86637853 Y NA KIAA1324L NA NA NA NA KIAA1324L 48976 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 86948267 86948659 86948457 Y CROT TP53TG1,CROT NA NA NA NA TP53TG1 24172 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 87389107 87389401 87389254 Y NA ABCB1 NA NA NA NA ABCB1 48496 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 87448204 87448549 87448377 Y RUNDC3B,ADAM22 NA NA NA NA NA DBF4 54982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 87571513 87571795 87571654 Y NA ADAM22 NA NA NA NA ADAM22 10055 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 87918906 87919150 87919043 Y SRI NA NA NA NA NA SRI 64598 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 89824940 89825230 89825139 Y NA STEAP1,C7orf63 NA NA NA NA STEAP1 43251 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 90305838 90306207 90306023 Y NA NA NA NA NA NA AC002456.2 81171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 91324942 91325270 91325105 Y LRRD1,MTERF NA NA NA NA NA MTERF 182764 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 91456025 91456190 91456079 Y NA NA NA NA NA NA MTERF 51844 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 92125304 92125376 92125308 Y NA PEX1,RBM48 NA NA NA NA PEX1 30469 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 92261903 92262272 92262087 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 44195 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 93567669 93567854 93567798 Y NA NA NA NA NA NA BET1 63840 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 93577576 93577749 93577619 Y NA NA GNG11,BET1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 53945 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 94781809 94782176 94781990 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-16P 56270 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 95138629 95138984 95138807 Y ASB4 NA NA NA NA NA PON2 76119 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 95627551 95627797 95627674 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I1 227685 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 95645399 95645785 95645516 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I1 245533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 95674465 95674690 95674578 Y DYNC1I1,FLJ42280 NA NA NA NA NA DYNC1I1 274599 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 95835254 95835261 95835258 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 114198 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 96646199 96646417 96646378 Y DLX6,DLX5 DLX6,DLX5 NA NA NA NA DLX5 5992 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 96858072 96858113 96858093 Y NA NA NA NA NA NA ACN9 114170 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 97773212 97773327 97773270 Y NA LMTK2 NA NA NA NA LMTK2 39015 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 98970307 98970479 98970399 Y PTCD1,CPSF4 ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 435 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 98990795 98991133 98991082 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 13131 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 99020392 99020577 99020441 Y OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789 BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789 NA NA NA NA CPSF4 13968 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.11973757636671 chr7 99389389 99389610 99389500 Y CYP3A5,CYP3A43 NA CYP3A7-CYP3AP1,CYP3A43 IMR90 Hi-C 24141950 CYP3A5 113768 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 99678619 99678725 99678657 Y NA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA ZNF3 448 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 100042030 100042585 100042239 Y COPS6,EPHB4 MEPCE,RP11-758P17.3,PPP1R35,TSC22D4,NYAP1 NA NA NA NA PPP1R35 9842 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 100140069 100140501 100140294 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 5235 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 100142246 100142436 100142312 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 7412 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 100144113 100144628 100144364 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9279 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 100144720 100144853 100144769 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9886 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 101377148 101377442 101377338 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 79517 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 101428138 101428355 101428247 Y NA CUX1 CUX1 IMR90 Hi-C 24141950 CUX1 28604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 101569375 101569771 101569405 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 112416 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 101585210 101585567 101585389 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 128251 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 101613260 101613283 101613272 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 156301 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 101775527 101775981 101775908 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 226338 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 11.3652269275382 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 70882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 102452256 102452586 102452421 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 64838 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 102773056 102773346 102773244 Y NA NAPEPLD ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 NAPEPLD 14661 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 104585458 104586124 104585640 Y MLL5 NA LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01004 65367 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 NA NA NA NA NA LINC01004 53622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 104684659 104684988 104684665 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 33168 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 104771634 104771765 104771700 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 120143 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 104857177 104857523 104857432 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 180232 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 105602769 105602970 105602871 Y NA NA NA NA NA NA CDHR3 87527 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 105766301 105766504 105766403 Y NA SYPL1 CDHR3,ATXN7L1,SYPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 15279 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 89729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 106767105 106767389 106767258 Y PIK3CG,HBP1 HBP1 NA NA NA NA HBP1 40017 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 106838325 106838672 106838499 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 30919 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 107079032 107079264 107079148 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 122665 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 92284 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 107116622 107117169 107116900 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 84760 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 107190959 107191312 107191306 Y NA DUS4L,COG5,BCAP29 NA NA NA NA DUS4L 10617 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 107594636 107594797 107594717 Y NA NA NA NA NA NA DLD 65221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 107784751 107785008 107784880 Y NA NA NA NA NA NA DLD 255336 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 107875663 107876003 107875815 Y NRCAM NA NA NA NA NA NRCAM 219158 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 108056534 108056914 108056866 Y PNPLA8,DNAJB9 NRCAM NA NA NA NA NRCAM 38247 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 108095684 108095814 108095727 Y NRCAM,NRCAM NRCAM NA NA NA NA NRCAM 523 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 108139925 108140311 108140116 Y PNPLA8,DNAJB9 NRCAM NA NA NA NA NRCAM 44764 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 110326552 110326706 110326634 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 873867 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 111156714 111156954 111156834 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 43619 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 111455220 111455605 111455549 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 254647 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 111641194 111641556 111641398 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 202910 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 111671285 111671420 111671354 Y IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 173046 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 111745442 111745761 111745634 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 98705 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 111762700 111763025 111763010 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 81441 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 111814530 111814935 111814850 Y NA DOCK4,ZNF277 NA NA NA NA DOCK4 29531 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 112517846 112518028 112517949 Y IFRD1,C7orf60 NA NA NA NA NA C7orf60 59943 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 114571241 114571658 114571396 Y MDFIC NA NA NA NA NA TES 1276889 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 116035470 116035688 116035648 Y NA NA CAV1 IMR90 Hi-C 24141950 CAV2 110036 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 116332814 116332936 116332875 Y CAPZA2,TES MET NA NA NA NA MET 22370 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 116523983 116524309 116524052 Y NA NA NA NA NA NA ST7 66983 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 116793573 116793925 116793605 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 201185 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 117117954 117118324 117118139 Y NA NA NA NA NA NA CTTNBP2 393869 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 117448339 117448549 117448441 Y CTTNBP2 NA NA NA NA NA CTTNBP2 63644 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 117472298 117472618 117472458 Y CTTNBP2 CTTNBP2 NA NA NA NA CTTNBP2 39575 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 117863844 117864014 117863854 Y ANKRD7 NAA38 NA NA NA NA NAA38 41758 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 120589568 120589730 120589649 Y ING3 ING3 NA NA NA NA ING3 765 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 120703433 120703512 120703470 Y NA NA NA NA NA NA ING3 114630 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 120945288 120945594 120945402 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 88824 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 121116174 121116412 121116295 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 81756 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 121874177 121874561 121874390 Y NA NA NA NA NA NA AASS 91843 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 121948867 121948961 121948916 Y NA NA NA NA NA NA AASS 166533 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 121951914 121952318 121952125 Y NA NA NA NA NA NA AASS 169580 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 122072950 122073321 122073136 Y FEZF1,CADPS2 NA NA NA NA NA RPS26P31 246023 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 122253933 122254165 122254049 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P31 65179 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 122310921 122310935 122310929 Y TAS2R16 RPS26P31 NA NA NA NA RPS26P31 8409 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 123214320 123214699 123214510 Y NA IQUB,NDUFA5 NA NA NA NA NDUFA5 18011 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 123387168 123387479 123387315 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 47 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 125443892 125444229 125444219 Y NA NA NA NA NA NA RP11-420H19.3 504960 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 126606621 126606816 126606719 Y NA NA NA NA NA NA GRM8 284532 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 126658207 126658487 126658347 Y GRM8 NA NA NA NA NA GRM8 232861 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.55686168896433 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 128696279 128696583 128696469 Y NA TNPO3 NA NA NA NA TNPO3 3081 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 128762617 128763071 128762840 Y NRF1,ATP6V1F NA KCP,TNPO3 IMR90 Hi-C 24141950 TNPO3 69419 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 128995385 128995592 128995489 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 52619 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 129095634 129096008 129095821 Y NA RP11-305M3.2,RNU1-72P NA NA NA NA RNU1-72P 26337 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 129419118 129419176 129419138 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169563 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 9.61673047714768 chr7 129420694 129421120 129420768 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2H 169669 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 129421490 129421976 129421792 Y FAM40B NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2H 168813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.11973757636671 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 129650131 129650429 129650342 Y NRF1 ZC3HC1 NA NA NA NA ZC3HC1 38862 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 130005430 130005716 130005580 Y TMEM209 NA NA NA NA NA CEP41 74558 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr7 130552122 130552429 130552276 Y NA NA NA NA NA NA COPG2 200524 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 206421 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 NA FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 190035 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 130636331 130636776 130636707 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 156079 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 130644314 130644883 130644570 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 147972 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 147396 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 130697034 130697567 130697379 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 130741821 130742227 130742136 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 50628 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 130799789 130800044 130799917 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 6854 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 130916172 130916668 130916569 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1-AS 94313 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 131583321 131583576 131583386 Y NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 PODXL 342345 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 132484487 132484560 132484524 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 280288 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 133431716 133432104 133431827 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 377948 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 134430855 134431029 134430942 Y CALD1 NA CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 BPGM 101295 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 135430585 135430983 135430863 Y FAM180A NA NA NA NA NA C7orf73 85341 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 135771654 135771794 135771701 Y NA NA NA NA NA NA MTPN 111553 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 137311444 137311452 137311448 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 373361 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 137673807 137674359 137674139 Y NA CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 10454 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 137928273 137928746 137928445 Y AKR1D1,TRIM24 NA NA NA NA NA AC008155.2 52483 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 138630696 138630809 138630753 Y TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 33255 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 139367600 139367827 139367677 Y TBXAS1 NA NA NA NA NA HIPK2 107750 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 64906 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 139425752 139426584 139426362 Y TBXAS1,JHDM1D HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 48993 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 139431881 139432226 139432135 Y TBXAS1,JHDM1D,HIPK2 HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 43351 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 139560059 139560227 139560114 Y JHDM1D,HIPK2,TBXAS1 NA NA NA NA NA HIPK2 84482 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 139865327 139865485 139865448 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA PARP12 103806 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 139929659 139930294 139929953 Y TBXAS1,RAB19,JHDM1D NA JHDM1D,LOC100134229 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP12 168138 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr7 140613036 140613224 140613135 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 9340 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 140774728 140775101 140774915 Y NA RNU4-74P NA NA NA NA RNU4-74P 24679 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 140776370 140776415 140776407 Y LOC100131199 RNU4-74P NA NA NA NA RNU4-74P 26321 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 140807032 140807954 140807105 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-74P 56983 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 140947588 140947591 140947590 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-74P 197539 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147,RNU1-82P NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 141804639 141804894 141804740 Y CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA SSBP1 368518 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 142519257 142519562 142519385 Y TAS2R39,OR9A2 TRBJ2-1,TRBJ2-2P,TRBJ2-3,TRBJ2-4,TRBJ2-5,TRBJ2-6,EPHB6 EPHB6,TRPV5 IMR90 Hi-C 24141950 TRBJ2-6 26334 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 145934224 145934573 145934546 Y NA NA NA NA NA NA CNTNAP2 122771 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 146086153 146086538 146086171 Y NA NA NA NA NA NA CNTNAP2 274700 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 146230197 146230393 146230208 Y NA NA NA NA NA NA CNTNAP2 418744 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 150186882 150187279 150187035 Y LOC100128542,TMEM176B,GIMAP7,GIMAP6,GIMAP5,GIMAP4,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP8 NA NA NA NA NA RP4-584D14.6 107909 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 150283922 150284215 150284005 Y GIMAP8,NOS3,GIMAP6 NA NA NA NA NA RP4-584D14.6 204949 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 151284346 151284467 151284405 Y SMARCD3,SMARCD3,WDR86 NA NA NA NA NA RHEB 69140 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 151806252 151806472 151806362 Y NA NA NA NA NA NA GALNT11 85493 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28363 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28735 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 29368 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 154743291 154743691 154743552 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49103 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 154882474 154882633 154882551 Y PAXIP1 NA NA NA NA NA PAXIP1 89680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 154958521 154958650 154958585 Y NA NA PAXIP1,HTR5A,LOC100128264,CNPY1 IMR90 Hi-C 24141950 INSIG1 128836 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 156309005 156309294 156309056 Y RNF32 NA RNF32,C7orf13,SHH,RBM33,LINC00244,LMBR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF32 121681 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 156735476 156735625 156735551 Y MNX1 NOM1 LMBR1 K562 ChIA-PET 22265404 NOM1 4792 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 156800292 156800601 156800569 Y MNX1,MNX1 MNX1 NA NA NA NA MNX1 744 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 156804828 156804838 156804833 Y NA MNX1 NA NA NA NA MNX1 3483 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 157071910 157072285 157071928 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 53790 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 157338058 157338440 157338352 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 211983 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr7 157366883 157367406 157367099 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 240808 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 157629246 157629505 157629365 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 503171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 157639011 157639249 157639125 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 512936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 157664220 157664476 157664307 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 538145 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 157673991 157674159 157674024 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 547916 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr7 157840945 157841296 157841083 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 537184 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 157868351 157868544 157868461 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 509936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 157956905 157957265 157957085 Y PTPRN2 NA NA NA NA NA PTPRN2 421215 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 153489 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 158238760 158239031 158238837 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 139449 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 158262390 158262764 158262595 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 115716 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 158301130 158301237 158301184 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 77243 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 158301829 158302021 158301840 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 76459 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 158378369 158378681 158378482 Y PTPRN2 NA NA NA NA NA PTPRN2 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 7.43110991415957 chr7 158452829 158453067 158452948 Y NA NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 42453 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr7 158656529 158657066 158657015 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA WDR60 9260 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 158765978 158766170 158766074 Y NA NA NCAPG2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 118709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr7 158808159 158808606 158808258 Y VIPR2 NA NA NA NA NA WDR60 160890 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 1220424 1220599 1220512 Y NA NA NA NA NA NA CLN8 481345 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 1452379 1452383 1452381 Y KBTBD11 NA NA NA NA NA CLN8 249561 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 2110600 2110940 2110833 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 340458 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 2141555 2141733 2141592 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 371413 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 2588091 2588111 2588101 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 817949 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 821027 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 4367909 4368064 4367988 Y CSMD1 NA NA NA NA NA PAICSP4 274790 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 6417141 6417596 6417436 Y ANGPT2 ANGPT2 NA NA NA NA ANGPT2 1334 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 6481206 6481441 6481325 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT2 62276 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 9912937 9913246 9913138 Y NA MSRA NA NA NA NA MSRA 3159 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 10117948 10118255 10118046 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 208170 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 10170975 10171338 10171157 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 261197 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 10187572 10187859 10187580 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 277794 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 10191869 10192038 10191953 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 282091 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 10192260 10192787 10192448 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 282482 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 10305932 10306275 10305955 Y NA NA NA NA NA NA PINX1 389119 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 10823160 10823372 10823178 Y PRSS55,C8orf74 NA NA NA NA NA PINX1 127766 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 11560575 11560973 11560829 Y GATA4 NA NA NA NA NA NEIL2 64175 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 12887888 12888235 12887965 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1456 86737 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 12893980 12894225 12894104 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1456 92829 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 13175354 13175726 13175606 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1456 374203 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 16613104 16613477 16613307 Y NA NA TUSC3,MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 398061 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 17465660 17466084 17465890 Y MTUS1 PDGFRL NA NA NA NA PDGFRL 33718 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 18244410 18244774 18244528 Y NA NA NA NA NA NA NAT1 218424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 18722659 18722821 18722740 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 217419 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 18854306 18854486 18854451 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 85754 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 18985501 18986149 18985818 Y NA PSD3 LOC100128993,PSD3 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 45261 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 18998257 18998415 18998308 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 58017 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 19341372 19341590 19341526 Y NA NA NA NA NA NA INTS10 331061 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 19808496 19808756 19808622 Y NA NA NA NA NA NA AC100802.3 126060 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 20029424 20029730 20029577 Y NA SLC18A1,ATP6V1B2 NA NA NA NA SLC18A1 8987 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 20294602 20294707 20294648 Y NA NA ATP6V1B2 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 241724 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 20296556 20296833 20296693 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1B2 243678 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 21167334 21167434 21167384 Y GFRA2 NA NA NA NA NA XPO7 607746 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 21226128 21226144 21226135 Y NA NA NA NA NA NA XPO7 549036 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 22408271 22408447 22408337 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA SORBS3 7772 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 22535910 22536200 22536167 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 11249 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 22626037 22626421 22626168 Y NA NA NA NA NA NA EGR3 77222 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 22758648 22758881 22758765 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB2 84049 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 23353842 23353942 23353892 Y TNFRSF10C,SLC25A37 ENTPD4,SLC25A37 NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A37 30376 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 24155243 24155623 24155554 Y ADAM28 ADAM28 NA NA NA NA ADAM28 5690 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 25306430 25306773 25306665 Y NA KCTD9 NA NA NA NA KCTD9 7219 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 25864670 25864945 25864828 Y EBF2 NA NA NA NA NA PPP2R2A 282062 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 27219743 27220043 27219778 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 52744 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 27630770 27631068 27630863 Y NA CCDC25 NA NA NA NA CCDC25 2600 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 27694349 27694720 27694534 Y NA NA NA NA NA NA CCDC25 66179 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 28569820 28569970 28569874 Y ZNF395,FZD3,EXTL3 NA NA NA NA NA EXTL3 113834 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 29144637 29144837 29144777 Y NA KIF13B KIF13B IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 25996 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 29198749 29199265 29198931 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 6920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 29631647 29631969 29631808 Y NA NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 306754 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 29758918 29759047 29759036 Y NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 179676 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 37748183 37748461 37748291 Y WHSC1L1,RAB11FIP1,LETM2,LETM2 BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 6524 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 37760968 37761285 37761070 Y RAB11FIP1 RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 5983 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr8 37761676 37761790 37761689 Y NA RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 6691 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 38781974 38782296 38782041 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 25221 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 39801503 39801850 39801608 Y NA NA NA NA NA NA C8orf4 207139 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 41153046 41153278 41153162 Y NA NA NA NA NA NA SNORD65 128896 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 41775383 41775559 41775471 Y NA NA ANK1 IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 131949 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 41997279 41998522 41997937 Y NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 9942 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 42383718 42383741 42383730 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 11328 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 42588467 42588706 42588587 Y NA NA NA NA NA NA THAP1 107762 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 48434780 48435210 48435108 Y CEBPD NA NA NA NA NA CEBPD 214438 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 50466157 50466168 50466163 Y NA NA NA NA NA NA RPL29P19 1171007 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 50653553 50653944 50653741 Y NA NA NA NA NA NA RPL29P19 1358403 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 53059392 53059757 53059575 Y NA NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 249507 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 53141040 53141184 53141112 Y ST18 NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 331155 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 53242912 53243261 53243214 Y ST18 NA NA NA NA NA RB1CC1 413142 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr8 53243512 53243700 53243588 Y ST18 NA NA NA NA NA RB1CC1 412703 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr8 54256811 54256964 54256882 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 497154 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 54932125 54932445 54932251 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 644 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 55018716 55018874 55018809 Y ATP6V1H,ATP6V1H LYPLA1,MRPL15 LYPLA1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LYPLA1 6139 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 56919174 56919348 56919316 Y LYN NA NA NA NA NA RPS20 65721 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 59763369 59763610 59763548 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 38258 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 59971267 59971652 59971580 Y NA NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 57947 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 59980234 59980420 59980383 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 49179 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 59983682 59983838 59983818 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 45761 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 60010619 60010999 60010857 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 18600 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 60873102 60873331 60873244 Y NA NA NA NA NA NA CA8 318640 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr8 61705362 61705819 61705615 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 116025 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 62146139 62146518 62146329 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 478637 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 65284532 65284699 65284617 Y BHLHE22 NA NA NA NA NA YTHDF3 1205420 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 65758514 65758852 65758664 Y NA NA NA NA NA NA ARMC1 785590 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 66894095 66894367 66894181 Y PDE7A NA DNAJC5B IMR90 Hi-C 24141950 PDE7A 141538 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 67668655 67668834 67668702 Y ADHFE1,SGK3,SGK3 SGK3 NA NA NA NA SGK3 46002 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 68097028 68097398 68097213 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 103010 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 68147841 68148210 68148008 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 105702 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 69672075 69672426 69672227 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H10.3 1071920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 69904413 69904743 69904447 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H10.3 839603 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 70310732 70311124 70310931 Y NA NA C8orf34 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-159H10.3 433222 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 71569342 71569635 71569535 Y NA LACTB2,XKR9 NA NA NA NA LACTB2 9774 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 72757668 72757969 72757918 Y MSC NA NA NA NA NA TRPA1 227883 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 73227505 73227652 73227579 Y NA NA NA NA NA NA KCNB2 219974 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 73333960 73334345 73334224 Y NA NA NA NA NA NA KCNB2 113281 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 73481000 73481171 73481085 Y KCNB2 KCNB2 NA NA NA NA KCNB2 33374 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 73492870 73493054 73492949 Y NA KCNB2 NA NA NA NA KCNB2 45244 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 73559096 73559368 73559359 Y KCNB2 NA NA NA NA NA KCNB2 111470 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 73605435 73605486 73605461 Y KCNB2,TERF1 NA NA NA NA NA KCNB2 157809 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 73675277 73675455 73675366 Y KCNB2 NA NA NA NA NA KCNB2 227651 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 73690966 73691186 73691160 Y NA NA NA NA NA NA TERF1 227913 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 73733862 73734193 73733971 Y KCNB2 NA NA NA NA NA TERF1 184906 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 74453012 74453349 74453181 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 204594 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA HNF4G 186542 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 77389631 77389653 77389643 Y NA NA NA NA NA NA PEX2 521627 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 79663656 79664006 79663831 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 237282 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 248204 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr8 81289521 81289894 81289680 Y ZBTB10 NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB10 105960 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 81394996 81395282 81395074 Y NA ZBTB10 ZBTB10 K562 ChIA-PET 22265404 ZBTB10 572 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 81776862 81777324 81777099 Y PAG1,ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 244979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 81831009 81831253 81831114 Y ZBTB10,PAG1 NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 191050 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 82673208 82673424 82673316 Y NA CHMP4C,ZFAND1 NA NA NA NA ZFAND1 30070 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 83600691 83600995 83600934 Y NA NA NA NA NA NA SNX16 847590 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 84996950 84997281 84997116 Y NA NA NA NA NA NA LRRCC1 1020101 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 85296015 85296611 85296285 Y NA NA NA NA NA NA LRRCC1 720771 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 89124026 89124433 89124347 Y MMP16 NA NA NA NA NA CTB-118P15.2 139633 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 90105251 90105649 90105450 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 662306 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 92045909 92045927 92045918 Y TMEM55A TMEM55A,GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA TMEM55A 5365 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 94728357 94728657 94728477 Y NA FAM92A1,RBM12B,TMEM67 NA NA NA NA FAM92A1 19568 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 95132318 95132456 95132369 Y NA NA NA NA NA NA KB-1247B1.1 80824 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 95429933 95430227 95430143 Y NA NA NA NA NA NA RAD54B 55110 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 95943173 95943450 95943312 Y NA CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3 NA NA NA NA TP53INP1 16189 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 97174234 97174570 97174431 Y GDF6 NA NA NA NA NA UQCRB 71292 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 97410655 97411012 97410831 Y NA NA CPQ,TSPYL5,PTDSS1 IMR90 Hi-C 24141950 SDC2 92567 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 98001253 98001769 98001454 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 497674 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 98843865 98843962 98843914 Y NA MATN2 NA NA NA NA MATN2 35106 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 99478821 99479039 99478921 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL2 174200 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr8 101428409 101428827 101428524 Y RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 57076 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 101819182 101819619 101819498 Y RNF19A,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ NA SNX31,PABPC1,ANKRD46 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 86145 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 101920209 101920392 101920320 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 43224 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr8 102038562 102039020 102038731 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 74946 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 102191448 102191797 102191796 Y NA ZNF706 NA NA NA NA ZNF706 24624 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 102879018 102879156 102879087 Y NCALD,NCALD NA NA NA NA NA NCALD 255979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 104198945 104199161 104199050 Y NA BAALC,C8orf56 NA NA NA NA C8orf56 47242 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 104792192 104792465 104792329 Y RIMS2 NA NA NA NA NA RP11-5A11.1 222575 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 108287452 108287481 108287467 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 579211 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 109132004 109132262 109132106 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 313300 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 109222483 109222836 109222544 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 222726 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 110288477 110288741 110288621 Y NA NA NA NA NA NA ENY2 55812 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 110602225 110602239 110602235 Y SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1 NA NA NA NA NA EBAG9 52285 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 110647152 110647483 110647459 Y NA NA NA NA NA NA SYBU 54537 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 112279514 112279729 112279622 Y NA NA NA NA NA NA SYBU 1577494 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 114445563 114445724 114445576 Y CSMD3 CSMD3 NA NA NA NA CSMD3 1604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 114447535 114447912 114447629 Y CSMD3 CSMD3 NA NA NA NA CSMD3 207 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 116695168 116695449 116695309 Y NA NA EIF3H IMR90 Hi-C 24141950 UTP23 1081293 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 119071597 119071694 119071650 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 50398 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 119264701 119264795 119264748 Y SAMD12 NA NA NA NA NA EXT1 142609 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 119536200 119536581 119536442 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 95653 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 119960672 119960883 119960778 Y NA TNFRSF11B NA NA NA NA TNFRSF11B 1556 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 121574734 121575043 121574888 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 119092 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 123317783 123317849 123317816 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX2 473784 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 123953901 123954018 123953907 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 98645 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 124524433 124524792 124524749 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 26654 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 124549741 124550229 124550044 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1217 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 124665857 124666229 124666132 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 112467 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 125210059 125210285 125210207 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 ARF1P3,FER1L6-AS2 TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FER1L6-AS2 28296 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 125282085 125282316 125282201 Y NA NA FAM91A1,TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FER1L6-AS2 100322 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 NA NA NA NA NA TMEM65 80121 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 125616678 125616991 125616828 Y ZNF572 NA NA NA NA NA TATDN1 66979 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 125984707 125984742 125984718 Y ZNF572 ZNF572,SQLE NA NA NA NA ZNF572 1167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 126526927 126527334 126527200 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 86364 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 126650987 126651167 126651050 Y NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 210424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 126710312 126710685 126710478 Y TRIB1 NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 269749 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 126961175 126961554 126961350 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 520612 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 128257606 128258262 128257899 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 487418 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 128264964 128265070 128265034 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 480610 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 128353206 128353555 128353361 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 392125 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 128519696 128520090 128519909 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 225590 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr8 128578179 128578386 128578271 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 167294 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr8 128879185 128879808 128879466 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 74406 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 129195465 129196052 129195562 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 174608 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 129209230 129209523 129209417 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 188373 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 129517304 129517688 129517627 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 496447 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 129569050 129569202 129569118 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 548193 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 129659601 129660006 129659683 Y NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-25P 638744 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 130150064 130150272 130150167 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 877103 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 130461810 130462206 130462131 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 565169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 130490796 130491097 130490948 Y FAM49B NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 536278 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 130527330 130527562 130527488 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 499813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 130557757 130558027 130557844 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 469348 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 130577240 130577439 130577294 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 449936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 130639363 130639590 130639478 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 387785 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 130716318 130716614 130716466 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 310761 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 131204007 131204378 131204106 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 176632 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 133221105 133221453 133221279 Y NA NA NA NA NA NA EFR3A 306770 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 133257165 133257466 133257335 Y NA NA NA NA NA NA EFR3A 342830 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 133318227 133318435 133318380 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 367403 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr8 133336709 133336808 133336784 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 349030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 133405004 133405160 133405099 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 280678 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 133463688 133463896 133463792 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 221942 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 133490570 133490736 133490650 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 195102 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 133490941 133491318 133491130 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 194520 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 133940290 133940656 133940355 Y NA NA NA NA NA NA PHF20L1 154672 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 133941953 133942327 133941974 Y NA NA NA NA NA NA PHF20L1 156335 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 133971075 133971466 133971078 Y TG NA NA NA NA NA PHF20L1 185457 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 134017615 134018358 134017854 Y NA NA NA NA NA NA PHF20L1 231997 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 134093873 134094293 134094081 Y ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1 NA NA NA NA NA NDRG1 217972 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 134131797 134131957 134131879 Y TG NA NA NA NA NA NDRG1 180308 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 134258134 134258466 134258300 Y PHF20L1,NDRG1 NA NA NA NA NA NDRG1 53799 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 134689963 134690092 134690028 Y NA NA ST3GAL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTC-458A3.1 353723 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 134930497 134930629 134930507 Y ST3GAL1 NA ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 CTC-458A3.1 594257 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 135842490 135842788 135842753 Y NA MIR30D ZFAT IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 27302 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 137225928 137226328 137226138 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 473190 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 137280479 137280540 137280510 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 527741 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 137554492 137554791 137554642 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 801754 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 139470723 139471056 139470890 Y NA FAM135B NA NA NA NA FAM135B 36009 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 139692214 139692696 139692462 Y NA NA NA NA NA NA FAM135B 185149 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 139799567 139799714 139799659 Y NA NA NA NA NA NA COL22A1 124535 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 141057159 141057398 141057253 Y KCNK9 NA NA NA NA NA KCNK9 343860 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr8 141108529 141108796 141108710 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 357882 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 141108929 141109987 141109387 Y KCNK9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 356691 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 141110302 141110773 141110688 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 355905 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.37124112597622 chr8 141606825 141607480 141607253 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 87428 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr8 141607900 141608150 141608005 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 88503 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr8 141707505 141707982 141707957 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 188108 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 141800912 141801386 141801027 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA PTK2 208929 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 141804565 141804680 141804623 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 205635 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 141945462 141945818 141945641 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 64497 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 142084181 142084412 142084295 Y PTK2 DENND3 PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 40965 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 142106680 142106937 142106833 Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 18440 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 142182442 142182863 142182588 Y NA NA NA NA NA NA DENND3 57065 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 142216641 142216829 142216751 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 91264 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 142255319 142255549 142255470 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA SLC45A4 60855 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 142411426 142411896 142411690 Y DENND3,SLC45A4,PTP4A3 PTP4A3 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 11333 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.55686168896433 chr8 142424106 142424307 142424175 Y NA PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 24013 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr8 142424633 142425265 142424919 Y NA PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 24540 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 142741264 142741485 142741355 Y NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P38 274089 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr8 142919518 142919535 142919527 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P38 452343 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 142975914 142976309 142976112 Y NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 TSNARE1 506292 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 143449565 143449834 143449726 Y TSNARE1 TSNARE1 NA NA NA NA TSNARE1 32767 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 143757526 143757895 143757616 Y NA JRK NA NA NA NA JRK 3491 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 144252290 144252651 144252555 Y LYNX1,LYNX1,RHPN1,LY6H,LY6H,LY6H NA NA NA NA NA ZFP41 74629 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr8 144799188 144799437 144799334 Y MAPK15 ZNF707,MAPK15,FAM83H NA NA NA NA MAPK15 2759 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.11973757636671 chr8 145558616 145559185 145558966 Y ZNF517,ZNF34,LRRC24,KIFC2,CYHR1,SCRT1 BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 10043 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr9 972038 972418 972053 Y NA DMRT3 NA NA NA NA DMRT3 2546 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 2241944 2242239 2242031 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 228602 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr9 2281532 2281772 2281628 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 268190 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 2465114 2465154 2465134 Y NA NA VLDLR,FLJ35024 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 154680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 2655543 2655805 2655674 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 35709 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 3865342 3865632 3865553 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 340619 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 3879857 3880094 3879976 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 355134 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 4042913 4043209 4043135 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 303183 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 4334414 4334840 4334611 Y NA GLIS3 GLIS3 IMR90 Hi-C 24141950 GLIS3 11552 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 4715214 4715412 4715290 Y AK3 CDC37L1,AK3 NA NA NA NA AK3 24631 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 5494240 5494600 5494348 Y KIAA1432,C9orf46,CD274 NA NA NA NA NA KIAA1432 132425 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 8495779 8496144 8495966 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 592732 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 8675420 8675557 8675548 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 413319 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 8925554 8925879 8925717 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 162997 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 1746982 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 23.6047020802716 chr9 12784417 12784967 12784682 Y C9orf150 RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 27377 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA ZDHHC21 368559 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 14353468 14353873 14353760 Y NFIB NA NA NA NA NA ZDHHC21 337596 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 14477951 14478302 14478282 Y NFIB NA NA NA NA NA ZDHHC21 213167 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 15146901 15147026 15146964 Y FREM1,PSIP1 NA NA NA NA NA TTC39B 158332 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA CNTLN 616528 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 17799521 17799655 17799588 Y NA NA NA NA NA NA CNTLN 666541 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 20793724 20794222 20793867 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 173182 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL9 236740 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103429 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 22040932 22041035 22040938 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 30778 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 23703145 23703507 23703326 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL2 120828 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 26260192 26260607 26260418 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 583336 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 27365157 27365383 27365271 Y MOBKL2B NA NA NA NA NA MOB3B 162396 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 28932604 28932646 28932625 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 1360740 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 29211344 29211542 29211410 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 1639480 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 1642036 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 2254184 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 29826427 29826586 29826507 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 2254563 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 32429787 32430147 32430005 Y NA ACO1 NA NA NA NA ACO1 47169 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11219 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 33229414 33229715 33229547 Y NA BAG1,CHMP5 NFX1 MCF7 ChIA-PET 22265404 BAG1 33046 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 34158490 34158839 34158617 Y NA DCAF12,UBAP1 DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBAP1 18164 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 35232989 35233276 35233133 Y DNAJB5 NA NA NA NA NA UNC13B 72990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA NA NA NA NA NA TESK1 82515 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 36765862 36766252 36766147 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 195003 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA PAX5 107013 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 37030516 37030798 37030764 Y NA PAX5 NA NA NA NA PAX5 1305 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 37035251 37035762 37035526 Y ZCCHC7,PAX5 PAX5 NA NA NA NA PAX5 3148 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 37035783 37036025 37035954 Y ZCCHC7,PAX5 PAX5 NA NA NA NA PAX5 3680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 PAX5 NA NA NA NA PAX5 4538 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 37771609 37771892 37771762 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 26607 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 37859471 37859543 37859507 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 60037 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 37945283 37945292 37945288 Y SHB NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 121392 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 38008217 38008489 38008387 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 58195 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA NA NA NA NA NA PIP5K1B 2900429 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA NA NA NA NA NA PIP5K1B 2863019 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr9 71784003 71784073 71784064 Y TJP2 NA NA NA NA NA FXN 135828 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 71793410 71793781 71793424 Y NA NA NA NA NA NA FXN 145235 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 71955767 71955808 71955788 Y FAM189A2,FAM189A2 NA NA NA NA NA FXN 307592 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 72612607 72612791 72612699 Y NA NA MAMDC2 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf135 178898 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 72695513 72695798 72695599 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 176139 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 72725457 72725742 72725656 Y NA NA NA NA NA NA SMC5 146195 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 72801648 72801771 72801710 Y MAMDC2 NA NA NA NA NA SMC5 70166 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 72805213 72805492 72805447 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 66445 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 72837972 72838313 72838181 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 33624 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 9.17960636455006 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr9 73068741 73068752 73068748 Y NA KLF9 TRPM3,SMC5,KLF9 IMR90 Hi-C 24141950 KLF9 41201 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 73145053 73145085 73145070 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 117513 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 73181724 73181999 73181924 Y SMC5 NA NA NA NA NA KLF9 154184 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 73701762 73702162 73701962 Y TRPM3 NA NA NA NA NA RPL35AP21 500355 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 74318584 74318670 74318629 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 110936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 74657404 74657841 74657552 Y TMEM2,ZFAND5 NA NA NA NA NA GDA 69670 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 77927689 77927701 77927695 Y NA NA NA NA NA NA OSTF1 226230 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 79350296 79350357 79350327 Y PRUNE2 NA NA NA NA NA AL161626.1 165565 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 79383801 79384093 79383990 Y PRUNE2 NA NA NA NA NA PRUNE2 134910 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr9 80062290 80062578 80062526 Y NA NA NA NA NA NA GNA14 198645 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 80091262 80091345 80091331 Y NA NA NA NA NA NA GNA14 169878 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 80422497 80422534 80422513 Y NA NA NA NA NA NA GNA14 161274 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 80560530 80561013 80560815 Y GNAQ NA NA NA NA NA GNAQ 83361 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 81586798 81586848 81586823 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 417371 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 81780001 81780184 81780092 Y TLE4 NA NA NA NA NA CHCHD2P9 224035 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 81836088 81836324 81836206 Y TLE4 NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 167895 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 83412048 83412181 83412140 Y NA NA NA NA NA NA TLE1 890039 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 85072190 85072207 85072199 Y FAM75D1 NA NA NA NA NA SNORD95 570357 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 85587803 85587810 85587807 Y NA NA NA NA NA NA RASEF 88282 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 85888522 85888919 85888721 Y NA NA NA NA NA NA RP11-439K3.1 56276 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 86123071 86123201 86123136 Y UBQLN1,KIF27,HNRNPK,HNRNPK FRMD3 NA NA NA NA FRMD3 28260 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 87569128 87569215 87569172 Y NTRK2,NTRK2,NTRK2 NA NA NA NA NA AGTPBP1 785729 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 88346951 88347024 88346988 Y NA AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 7920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 90115567 90115708 90115625 Y DAPK1 DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA DAPK1 5424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 90131164 90131697 90131347 Y DAPK1 DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 6520 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 90169791 90170300 90170098 Y DAPK1 RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 31574 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 90216174 90216503 90216403 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 77957 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 11.8023510401358 chr9 91998036 91998395 91998345 Y NA NA NA NA NA NA SECISBP2 66615 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 92036953 92037404 92037167 Y SECISBP2 NA NA NA NA NA SEMA4D 73641 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 92040069 92040496 92040389 Y C9orf47,S1PR3 NA NA NA NA NA SEMA4D 70549 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 92218643 92218902 92218819 Y GADD45G GADD45G NA NA NA NA GADD45G 715 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 92218967 92219282 92219262 Y NA GADD45G NA NA NA NA GADD45G 1039 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr9 92762010 92762340 92762146 Y NA NA NA NA NA NA GADD45G 544082 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 92887274 92887574 92887411 Y NA NA UNQ6494,SYK,DIRAS2 IMR90 Hi-C 24141950 DIRAS2 515812 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 93029524 93029856 93029690 Y NA NA NA NA NA NA DIRAS2 373530 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 93633003 93633051 93633027 Y SYK,SYK,SYK NA NA NA NA NA SYK 70934 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 93880356 93880696 93880620 Y NA NA LOC100129316,AUH,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 241499 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 93910029 93910270 93910112 Y SYK,SYK,NFIL3 NA LOC100129316,AUH,NFIL3 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 211925 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 93975322 93975401 93975365 Y NA NA NA NA NA NA AUH 146794 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.55686168896433 chr9 94182259 94182597 94182338 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 1547 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 94191307 94191702 94191505 Y NA NFIL3 SYK,LOC100129316,AUH,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 NFIL3 7163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 94660957 94661066 94661012 Y NA ROR2 NA NA NA NA ROR2 49378 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 94662459 94662552 94662493 Y ROR2 ROR2 NA NA NA NA ROR2 47892 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 94668024 94668724 94668369 Y ROR2 ROR2 NA NA NA NA ROR2 41720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 95969732 95970127 95969930 Y NA NA NA NA NA NA NINJ1 75162 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 96377714 96377795 96377762 Y PHF2 PHF2 NA NA NA NA PHF2 41025 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 96434811 96435085 96434948 Y PHF2 NA NA NA NA NA PHF2 98122 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 97428025 97428222 97428124 Y NA FBP1 FANCC,C9orf3,MIR3074 IMR90 Hi-C 24141950 FBP1 27494 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 97622499 97622697 97622598 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 135516 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 98389369 98389482 98389428 Y NA NA LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 PTCH1 112030 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 98486890 98487110 98487000 Y PTCH1,PTCH1 NA C9orf102,SLC35D2,LINC00476,HSD17B3,LINC00092,LOC158435,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00476 149149 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 98583076 98583344 98583210 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 52915 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 98768233 98768612 98768423 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 131974 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 100705742 100706039 100705791 Y NA C9orf156,ANP32B NA NA NA NA C9orf156 22890 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 100994380 100994637 100994474 Y TBC1D2 TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 21278 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 102006739 102006945 102006777 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24393 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 102580616 102580992 102580865 Y NA NR4A3 NA NA NA NA NR4A3 1145 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 103317087 103317229 103317158 Y C9orf30-TMEFF1,TMEFF1,LPPR1 NA NA NA NA NA TMEFF1 114527 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 107597613 107597745 107597668 Y NA NA NA NA NA NA NIPSNAP3B 73175 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 107723549 107723790 107723714 Y NIPSNAP3A,ABCA1 ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 35031 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 41992 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 107816840 107817157 107817097 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 128322 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 108284643 108284789 108284719 Y NA FKTN NA NA NA NA FKTN 33622 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 108623002 108623305 108623152 Y FSD1L,FSD1L,TAL2 NA MIR548Q,ZNF462 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM38B 168177 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 109655422 109655715 109655552 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 32044 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 109932773 109933133 109932953 Y NA NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110285 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 109975791 109976065 109975989 Y KLF4 NA NA NA NA NA RAD23B 67353 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 110266981 110267369 110267173 Y NA KLF4,RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 16218 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 110401220 110401740 110401394 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 106549 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 110437099 110437420 110437250 Y KLF4 NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 142428 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.49699290078098 chr9 110811401 110811623 110811540 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 516730 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 111049624 111049640 111049632 Y NA NA NA NA NA NA RP11-220D10.1 337473 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 111249150 111249381 111249291 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 137732 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 112569081 112569243 112569086 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 28312 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 112730714 112730897 112730789 Y NA NA NA NA NA NA AKAP2 189945 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 113119206 113119305 113119256 Y NA NA NA NA NA NA TXN 102286 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 113202507 113202544 113202523 Y NA NA NA NA NA NA TXN 185587 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 113515835 113516213 113516024 Y NA NA NA NA NA NA TXN 498915 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 113753501 113753784 113753656 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0368 491241 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 113831010 113831369 113831228 Y NA NA OR2K2,MUSK,LPAR1,KIAA0368,SVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0368 413656 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 115523438 115523763 115523601 Y ZFP37 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA SNX30 12320 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 115527127 115527401 115527315 Y NA RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA SNX30 16009 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 116281787 116282895 116282664 Y NA NA NA NA NA NA POLE3 110835 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 116286167 116286399 116286304 Y NA NA NA NA NA NA POLE3 115215 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 116385277 116385518 116385372 Y RGS3 RP11-18B16.2 NA NA NA NA RP11-18B16.2 25718 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 117159955 117160026 117159991 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 105704 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 117660866 117661644 117661253 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA C9orf91 289380 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 117732454 117732820 117732578 Y ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA LOC100505478,TNFSF15,DFNB31,TNFSF8,AKNA,C9orf91 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf91 360968 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 117785314 117785612 117785505 Y NA NA NA NA NA NA C9orf91 413828 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 117845711 117845781 117845750 Y TNFSF15 NA NA NA NA NA C9orf91 474225 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 118350454 118350525 118350489 Y DEC1 NA ASTN2,PAPPA,TNC,DEC1,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf91 978968 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 118436011 118436199 118436119 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 1011382 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 119025545 119025710 119025628 Y PAPPA NA NA NA NA NA TRIM32 421871 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 119084686 119084813 119084781 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 362768 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 119311432 119311888 119311785 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 135693 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 119466124 119466469 119466162 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 18543 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 120175638 120175763 120175745 Y ASTN2 ASTN2 NA NA NA NA ASTN2 290 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 120251678 120252073 120251686 Y NA NA NA NA NA NA ASTN2 76330 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 120522424 120523171 120522785 Y NA NA NA NA NA NA ASTN2 347076 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 122984020 122984078 122984028 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 356370 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 123251976 123252022 123252001 Y CDK5RAP2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 88426 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 123262222 123262341 123262282 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 78107 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 123640419 123640826 123640772 Y NA PSMD5,PHF19,TRAF1 NA NA NA NA PHF19 2813 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr9 123877856 123878087 123877972 Y NA CNTRL NA NA NA NA CNTRL 42715 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 124035384 124035709 124035520 Y NA NA NA NA NA NA RAB14 52092 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 124498744 124498978 124498839 Y GSN NA NA NA NA NA TTLL11 354907 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 124819502 124819624 124819563 Y DAB2IP,OR1J4,OR1J2,OR1N2,OR1N1,MRRF,LHX6,LHX6,LHX6 TTLL11 NA NA NA NA TTLL11 34261 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 125138740 125138980 125138872 Y OR1L3 PTGS1 NA NA NA NA PTGS1 7916 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 126644407 126644614 126644564 Y LHX2 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 45817 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 126683805 126684169 126683927 Y NA DENND1A NA NA NA NA DENND1A 6262 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 127029560 127030143 127029899 Y DENND1A NA NA NA NA NA PSMB7 145580 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 127329970 127330135 127330093 Y NA NA NA NA NA NA MIR181A2HG 88611 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 127458498 127458770 127458741 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 39752 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 127861290 127861583 127861437 Y NA SCAI NA NA NA NA SCAI 42202 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 127947242 127947259 127947251 Y NA SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 2959 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 128408655 128409172 128408692 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 58341 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 129285503 129285639 129285571 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 279646 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 129483874 129484165 129483990 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 81120 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 130341922 130342377 130342071 Y NA FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2654 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 130461605 130461892 130461787 Y GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16 C9orf117,PTRH1,TOR2A NA NA NA NA C9orf117 5376 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 130526190 130526474 130526312 Y FPGS,FPGS,ENG,CDK9,SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C PTRH1,TOR2A,CDK9,FPGS NA NA NA NA CDK9 19484 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 130718218 130718307 130718248 Y NA ST6GALNAC4,DPM2,FAM102A NA NA NA NA DPM2 19455 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 130730158 130730541 130730220 Y NA DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 10251 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 130731999 130732057 130732026 Y SLC25A25,DPM2,FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 8735 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 130733227 130733464 130733411 Y SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 7328 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 130733540 130734011 130733863 Y SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 6781 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 130736209 130736450 130736330 Y NA DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 4342 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 130753520 130753846 130753692 Y SLC25A25,DPM2,FAM102A FAM102A FAM102A K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM102A 12728 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 131788763 131789149 131789046 Y SH3GLB2 SH3GLB2,FAM73B NA NA NA NA SH3GLB2 181 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-65J3.1 53278 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 132171147 132171349 132171255 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 72381 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.9341170133786 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.80836523857384 chr9 132221518 132221749 132221614 Y USP20,USP20,C9orf78 LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 21981 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 132319720 132320056 132319894 Y DOLPP1 NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 75990 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 132330057 132330508 132330201 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71936 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 132379342 132379626 132379484 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 22818 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 132464908 132465166 132465090 Y C9orf50,PRRX2 NA NA NA NA NA ASB6 62464 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 132646480 132646964 132646831 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 50338 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 133619181 133619471 133619230 Y NA ABL1 NA NA NA NA ABL1 31848 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 133776271 133776620 133776446 Y NA FIBCD1 NA NA NA NA FIBCD1 36053 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.80836523857384 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr9 134258707 134258891 134258799 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 8589 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 134278219 134278688 134278276 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 10739 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 134316967 134317380 134317020 Y NA PRRC2B NA NA NA NA PRRC2B 49487 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 134515858 134516155 134515990 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 97306 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 134553923 134554245 134554041 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 59216 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 134582403 134582762 134582583 Y NA RAPGEF1 PRRC2B,UCK1,POMT1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF1 30699 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 134608249 134608835 134608704 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 4626 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 134950793 134951083 134950938 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 2212 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 135197315 135197652 135197484 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 30720 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 136001357 136002105 136001796 Y SLC2A6,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 35196 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 136008698 136009031 136008833 Y ADAMTSL2,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 28270 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 19.2334609542954 chr9 136009735 136010292 136009932 Y GTF3C4,DDX31,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27009 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 136017295 136017625 136017456 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 19676 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chr9 136753303 136753756 136753577 Y C9orf7,VAV2 NA SARDH IMR90 Hi-C 24141950 VAV2 101970 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 37.1555495707979 chr9 136820460 136820750 136820516 Y SARDH VAV2 NA NA NA NA VAV2 34976 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 136996268 136996567 136996488 Y NA WDR5 WDR5 K562 ChIA-PET 22265404 WDR5 1920 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 MIR4479,FBXW5,LCN12 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 139919787 139920355 139920165 Y NA C9orf142,CLIC3,ABCA2,NPDC1,ENTPD2,UAP1L1 NA NA NA NA ABCA2 1012 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 31.4729361070288 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA RNF208 3555 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 140132594 140132714 140132654 Y LCN15,NPDC1,PNPLA7,ENTPD8 TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 951 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 4.80836523857384 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 3.05986878818335 chr9 140163781 140164247 140164025 Y NA RNF208,TUBB4B,NRARP NA NA NA NA TUBB4B 30116 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 10.9281028149405 chr9 140169154 140169348 140169240 Y NA TUBB4B,NRARP NA NA NA NA NRARP 25355 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 140189199 140189592 140189229 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 5111 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chr9 140205114 140205300 140205216 Y PNPLA7,NOXA1,NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 10411 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.62274467558573 chr9 140205908 140206072 140205991 Y NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 11205 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chr9 140274735 140275080 140274933 Y CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7 EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 40634 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,NOXA1,ENTPD8 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chr9 140523205 140523460 140523276 Y ANAPC2,NDOR1,EHMT1 ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA EHMT1 11761 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA MIR4767 3330638 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 6137776 6138094 6138031 Y NLGN4X,NLGN4X NA NA NA NA NA MIR4767 925807 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 8955651 8955925 8955865 Y TBL1X NA TBL1X IMR90 Hi-C 24141950 KAL1 257424 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 9536624 9537203 9536862 Y TBL1X,TBL1X NA NA NA NA NA TBL1X 107289 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 9896256 9896650 9896356 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 84952 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 10161663 10162021 10162010 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 38639 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 11158305 11158560 11158458 Y ARHGAP6 HCCS NA NA NA NA HCCS 30884 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 11441273 11441771 11441607 Y ARHGAP6 NA NA NA NA NA ARHGAP6 240050 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 12272654 12272870 12272762 Y NA NA NA NA NA NA FRMPD4 118069 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 12968289 12968795 12968434 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 22432 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 12969061 12969258 12969197 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 21969 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 14917883 14918076 14917977 Y PIGA,MOSPD2,MOSPD2 FANCB,MOSPD2 NA NA NA NA MOSPD2 28320 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 15531518 15531626 15531572 Y NA PIR NA NA NA NA PIR 21831 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 16805192 16805460 16805250 Y TXLNG TXLNG NA NA NA NA TXLNG 2642 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 17395556 17395647 17395622 Y NHS NHS NA NA NA NA NHS 4013 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA PHKA2 307292 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chrX 19407416 19407434 19407425 Y NA PDHA1 NA NA NA NA PDHA1 47405 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 23390523 23390925 23390723 Y PTCHD1 NA NA NA NA NA PRDX4 289454 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 30630746 30631092 30631067 Y GK,CXorf21 FTLP2,GK NA NA NA NA FTLP2 15323 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 33221652 33221797 33221725 Y NA NA NA NA NA NA DMD 133761 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 37604688 37604864 37604776 Y CYBB NA NA NA NA NA XK 61676 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 37605291 37605973 37605549 Y CYBB NA NA NA NA NA XK 62279 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 39680161 39680842 39680511 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 34771 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 39719669 39720024 39719856 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 74279 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 39871700 39871985 39871950 Y BCOR,BCOR NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 162597 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 39949495 39949781 39949700 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 84801 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 39964938 39965503 39965246 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 69079 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 40011614 40011816 40011787 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 22766 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 40034377 40034649 40034428 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 0 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 40902136 40902158 40902147 Y NA USP9X MED14 IMR90 Hi-C 24141950 USP9X 40730 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOA 375123 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 45631125 45631239 45631172 Y NA MIR222 NA NA NA NA MIR222 26595 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 46435390 46435934 46435628 Y RP2,ZNF674,CHST7 ZNF674,CHST7 NA NA NA NA CHST7 4171 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 46483970 46484106 46484017 Y RP2,ZNF674,CHST7 NA NA NA NA NA CHST7 52751 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 46487332 46487848 46487692 Y RP2,ZNF674,CHST7 NA NA NA NA NA CHST7 56113 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 46496839 46496883 46496861 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 65620 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 46509009 46509283 46509068 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 77790 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 46569898 46570252 46570035 Y SLC9A7 SLC9A7 NA NA NA NA SLC9A7 46238 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 46697676 46697837 46697692 Y ZNF674,CHST7,CDK16,RP2 RP2 CXorf31 IMR90 Hi-C 24141950 RP2 3301 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 46773328 46773680 46773526 Y NA NA NA NA NA NA RP2 78953 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 48571549 48571765 48571661 Y NA SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 53467183 53467489 53467297 Y FAM156A,TSPYL2,IQSEC2 SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 7863 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 10.9281028149405 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.74849645039049 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 57420009 57420263 57420031 Y NA NA NA NA NA NA FAAH2 108870 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 64821176 64821755 64821551 Y MSN MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 14919 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 65265877 65266020 65265940 Y NA NA VSIG4 K562 ChIA-PET 22265404 MSN 459620 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA DLG3 NA NA NA NA DLG3 8763 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 69655002 69655313 69655257 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 7398 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO GJB1 NA NA NA NA GJB1 30910 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 71327344 71327556 71327407 Y NA RGAG4 NA NA NA NA RGAG4 22202 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 71785357 71785413 71785385 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 5540 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 74143243 74143469 74143354 Y KIAA2022 NA NA NA NA NA ABCB7 231098 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 74259170 74259182 74259176 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 115385 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 74958533 74958836 74958643 Y ZDHHC15,MAGEE2 TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 5913 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 75280912 75281307 75281110 Y CXorf26 NA NA NA NA NA TTC3P1 316163 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 81507283 81507526 81507344 Y NA NA NA NA NA NA ATG4AP1 744181 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 96737764 96737861 96737813 Y NA NA NA NA NA NA CALM1P1 1985161 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 NA NA NA NA NA BHLHB9 58680 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 103597874 103598258 103598063 Y NA NA NA NA NA NA FAM199X 188573 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 103953879 103954145 103953966 Y IL1RAPL2 NA NA NA NA NA IL1RAPL2 144883 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147542 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 1.31137233779287 chrX 106693156 106693529 106693316 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 176208 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 106985108 106985412 106985307 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 TSC22D3 NA NA NA NA TSC22D3 33160 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 110863259 110863845 110863518 Y NA EIF4BP7,ALG13 NA NA NA NA EIF4BP7 542 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 115004721 115004876 115004807 Y NA NA NA NA NA NA PLS3 211220 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 115239457 115239782 115239623 Y NA NA NA NA NA NA PLS3 445956 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 117843836 117843978 117843907 Y LONRF3 IL13RA1 NA NA NA NA IL13RA1 15557 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 118824830 118825236 118824917 Y UBE2A,UBE2A,SEPT6 NA NA NA NA NA RPL39 98370 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 6.11973757636671 chrX 128225148 128225423 128225251 Y NA NA NA NA NA NA OCRL 446403 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA OCRL NA NA NA NA OCRL 15372 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 129219681 129220251 129219907 Y SASH3,ELF4,ELF4,BCORL1 ELF4 NA NA NA NA ELF4 22440 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 129226171 129226435 129226352 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 16256 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 2.18562056298811 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.874248225195244 chrX 132678168 132678604 132678343 Y NA NA NA NA NA NA GPC4 130650 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 140000500 140000988 140000725 Y NA NA NA NA NA NA MAGEC1 988692 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 144930014 144930037 144930026 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPCP10 1009716 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 153166203 153166850 153166548 Y ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP L1CAM,ARHGAP4,NAA10,RENBP NA NA NA NA L1CAM 5827 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 153965423 153965624 153965606 Y NA DKC1 CTAG2 IMR90 Hi-C 24141950 DKC1 23407 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrX 154256125 154256514 154256179 Y IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2 FUNDC2,F8,BRCC3 NA NA NA NA F8 2910 CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrY 13470203 13470486 13470410 Y NA NA NA NA NA NA NA NA CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622 chrY 59019347 59019376 59019362 Y NA NA NA NA NA NA NA NA CAGE ECC4 hg19 FANTOM5 0.437124112597622