chr1	839741	840250	839788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	52439	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	858256	858648	858448	Y	SAMD11	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	NOC2L	34041	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	936652	937138	936860	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	C1orf170	K562	ChIA-PET	22265404	HES4	3100	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	941791	942135	942082	Y	HES4	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	ISG15,AGRN	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ISG15	4668	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RP11-465B22.3	21720	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	1136667	1137146	1136877	Y	HES4,MIB2	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	28265	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	2135885	2136186	2135927	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	5973	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	3844625	3844991	3844786	Y	WRAP73,TP73,CEP104,DFFB	C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	29768	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	334349	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	7289758	7290075	7289881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	446374	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	7461964	7462325	7462107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	367004	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	8194345	8194402	8194374	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	109977	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	9298798	9298942	9298853	Y	NA	H6PD	NA	NA	NA	NA	H6PD	5964	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	9318130	9318195	9318182	Y	NA	H6PD,SPSB1	NA	NA	NA	NA	H6PD	25296	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	12614115	12614248	12614183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	61489	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	65352	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	16209325	16209770	16209445	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	36683	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	16478939	16479163	16479034	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	543	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP13A2	104719	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	95640	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	17865185	17865523	17865202	Y	ARHGEF10L	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	855	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	17867253	17867735	17867370	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	2923	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	17875004	17875168	17875086	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	10674	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	19274997	19275345	19275068	Y	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	5835	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	19276270	19276542	19276361	Y	AKR7A2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	4638	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	19278388	19278892	19278719	Y	UBR4,IFFO2	IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	2288	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	19280139	19280583	19280395	Y	UBR4,IFFO2	IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	597	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	20924301	20924404	20924353	Y	CDA	PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	PINK1	33544	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	21558552	21558736	21558644	Y	EIF4G3,ECE1,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	57175	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	21588829	21589430	21588896	Y	ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	80567	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	21618792	21618804	21618798	Y	EIF4G3,ECE1,ALPL,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	51193	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	21649091	21649481	21649332	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	20516	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	22235836	22236001	22235899	Y	HSPG2	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	RP11-26H16.1	3245	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	22266159	22266438	22266333	Y	HSPG2	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	4369	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.40893961237187
chr1	23903714	23904323	23904234	Y	ID3	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	19429	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	23916433	23916712	23916573	Y	ZNF436	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	32148	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	GRHL3,NIPAL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	48021	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	24736156	24736250	24736199	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	4034	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	25802039	25802147	25802084	Y	C1orf63	RHCE,TMEM57	NA	NA	NA	NA	TMEM57	46651	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	26184900	26185246	26185071	Y	NA	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	796	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	26337765	26338024	26337895	Y	PAQR7,ZNF683	PAFAH2,EXTL1	PAQR7,STMN1,EXTL1	IMR90	Hi-C	24141950	EXTL1	6351	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	26344142	26344420	26344335	Y	NA	PAFAH2	EXTL1	K562	ChIA-PET	22265404	EXTL1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	26735858	26736255	26735942	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	589	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	26739065	26739644	26739183	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	3796	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	27775351	27775365	27775358	Y	GPR3	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39304	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	27831022	27831314	27831199	Y	NA	WASF2	SYTL1,GPR3,WASF2,AHDC1,FGR	IMR90	Hi-C	24141950	WASF2	16353	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	27897947	27898332	27898153	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	30610	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF4	55037	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	31220962	31221590	31221236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-65J11.1	73485	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	27517	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	32108020	32108204	32108102	Y	NA	PEF1	NA	NA	NA	NA	PEF1	293	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	COL16A1,BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL16A1	12683	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	121088	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	36617554	36617914	36617691	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	1266	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	39598673	39599090	39598722	Y	MACF1	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53685	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	39644229	39644606	39644401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	99241	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	39651405	39651741	39651429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	106417	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	16420	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	15628	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1,RP1-118J21.5	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	40504860	40505165	40505013	Y	ZNF684,ZNF642,DEM1,BMP8B,PPT1,CAP1	CAP1	NA	NA	NA	NA	CAP1	955	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	41915297	41915638	41915514	Y	HIVEP3	EDN2	EDN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN2	32706	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	44232152	44232509	44232262	Y	SLC6A9,IPO13,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	62657	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	48515939	48516296	48516118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	395312	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	49043704	49044063	49043884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	107859	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	49812572	49812854	49812712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	876727	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	51383145	51383423	51383398	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	FAF1	40512	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	51475380	51475551	51475487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	50963	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	54286238	54286401	54286368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	68006	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	54586706	54586840	54586800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL37	60874	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	54804829	54805209	54805022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	71943	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	54810685	54810861	54810859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	66291	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACOT11	51605	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	56917995	56918217	56918107	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	1239209	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	57854194	57854446	57854303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	665706	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	57962222	57962547	57962385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	557605	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	JUN	121264	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	62119868	62120084	62119981	Y	NA	NA	TM2D1,INADL	IMR90	Hi-C	24141950	TM2D1	69011	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	67085027	67085363	67085216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	303207	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	68345947	68346247	68346097	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	48797	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	68354536	68354908	68354722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	57386	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	68364057	68364377	68364218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	66907	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	68657070	68657479	68657271	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	39324	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	68858132	68858533	68858311	Y	NA	NA	WLS,LOC100289178	IMR90	Hi-C	24141950	DEPDC1	102371	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	68945486	68945782	68945636	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	15122	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	73066346	73066731	73066539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	319929	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	3770	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	78350506	78350835	78350671	Y	FAM73A	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	1363	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	772913	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	NA	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf52	79768	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	90032556	90032702	90032627	Y	LRRC8D,GBP2,LRRC8C,LRRC8B,LRRC8B	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	44161	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	90137741	90138074	90137909	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	41110	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	90167146	90167167	90167157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	70515	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	90274070	90274340	90274210	Y	NA	LRRC8D	GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC8D	10233	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr1	92668364	92668570	92668467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAP2	93952	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	94038553	94038921	94038737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	126865	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	94701813	94701865	94701839	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	36759	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	94788386	94788592	94788436	Y	ARHGAP29,F3	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	8231	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	94792807	94793133	94793077	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	3690	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	94795618	94795987	94795955	Y	NA	RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	836	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	94996582	94996830	94996792	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	8526	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	1420834	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	4371	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	115713702	115714032	115713976	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN2	83581	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	120180868	120181132	120181082	Y	NBPF7,ZNF697	ZNF697	NA	NA	NA	NA	ZNF697	7264	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	144988079	144988414	144988189	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	45407	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	145023690	145024549	145024240	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22B	69671	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	145090155	145090603	145090483	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	3617	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SV2A,SF3B4,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	SF3B4	33719	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	150134154	150134397	150134243	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	14781	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P,CA14	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	150231710	150231944	150231778	Y	ECM1,CA14	ANP32E,RNU2-17P,CA14,C1orf54,APH1A,MRPS21	NA	NA	NA	NA	CA14	4156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	153361312	153361704	153361428	Y	S100A9,S100A12,S100A7L2,S100A8	S100A9	NA	NA	NA	NA	S100A9	32982	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	156066868	156067143	156067009	Y	MEF2D,MSTO1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L	UBQLN4,LAMTOR2,MEX3A,LMNA	LMNA,MEX3A	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	LMNA	16504	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	156118146	156118395	156118328	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	43485	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	156677217	156677612	156677436	Y	NA	RP11-284F21.7,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	3609	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	159142876	159143043	159143018	Y	OR10J5,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,CADM3,CADM3,DARC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-419N10.5	583917	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	159158093	159158524	159158429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-419N10.5	568436	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	159819832	159820037	159819980	Y	SLAMF9,SLAMF8,TAGLN2	CCDC19	NA	NA	NA	NA	CCDC19	47916	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	159878004	159878104	159878054	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	10051	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	160072097	160072234	160072133	Y	C1orf204,KCNJ10,KCNJ9,ATP1A2	IGSF8	NA	NA	NA	NA	IGSF8	5364	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	160877833	160878093	160877963	Y	SLAMF7	RP11-312J18.5	CD48	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-312J18.5	15063	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP12	216649	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	165635693	165636148	165635824	Y	NA	MGST3,ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	29952	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	167440766	167441089	167440893	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	79915	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	168594082	168594481	168594282	Y	NA	NA	DPT,F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	345804	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	170283796	170283969	170283911	Y	NA	NA	GORAB,PRRX1,KIFAP3,METTL11B	IMR90	Hi-C	24141950	GORAB	215301	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	33.3119881823652
chr1	170555759	170556062	170555849	Y	GORAB,PRRX1	NA	METTL11B	IMR90	Hi-C	24141950	GORAB	56489	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	170630769	170630992	170630884	Y	NA	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	900	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	170635008	170635144	170635076	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	5139	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	170637621	170637732	170637679	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	7752	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	170638824	170639138	170638981	Y	NA	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	8955	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	170794960	170795269	170795115	Y	FMO3	NA	KIFAP3,METTL11B	IMR90	Hi-C	24141950	PRRX1	165091	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	170864676	170864986	170864830	Y	PRRX1	NA	METTL11B,KIFAP3,LOC284688	IMR90	Hi-C	24141950	PRRX1	234807	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	171111810	171112100	171111910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO4	169247	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	171832189	171832290	171832196	Y	DNM3	DNM3	NA	NA	NA	NA	DNM3	23568	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	172106187	172106635	172106273	Y	NA	MIR214,MIR199A2,DNM3OS	NA	NA	NA	NA	MIR214	140	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	13.716701016268
chr1	172150201	172150456	172150219	Y	NA	MIR214,MIR199A2,DNM3OS	NA	NA	NA	NA	DNM3OS	38267	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	172150675	172151005	172150697	Y	NA	MIR214,MIR199A2,DNM3OS	NA	NA	NA	NA	DNM3OS	38741	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	172291507	172291926	172291559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	119304	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	172305839	172305991	172305915	Y	DNM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	105239	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	172327070	172327187	172327139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	84043	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	172369341	172369683	172369640	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	41547	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	172507125	172507604	172507262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	95895	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	174220636	174220943	174220783	Y	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	94088	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	174503176	174503233	174503205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	376628	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	176501841	176501939	176501877	Y	PAPPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	327212	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	180389473	180389640	180389557	Y	NA	NA	LHX4,LOC100527964	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	80449	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	180494187	180494417	180494302	Y	NA	ACBD6	XPR1,MR1,KIAA1614,STX6	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	24098	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	180508329	180508738	180508530	Y	NA	ACBD6	MR1,XPR1,KIAA1614	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	38240	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	181042855	181043067	181042961	Y	NA	MR1,IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12571	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	181060502	181060611	181060567	Y	STX6,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	4864	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.18423416449079
chr1	181110732	181111003	181110864	Y	STX6,MR1,IER5	NA	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	55094	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	182654224	182654561	182654393	Y	NA	NA	RGS8	IMR90	Hi-C	24141950	DHX9	151943	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	183526698	183527308	183526965	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC5	75584	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	186799738	186800031	186799804	Y	PTGS2,PLA2G4A	PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	3653	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	187235320	187235513	187235392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	439235	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr1	190151480	190151877	190151832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-547I7.2	293804	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	190286298	190286417	190286358	Y	FAM5C	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-547I7.2	159264	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	196687240	196687293	196687267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	68232	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	198845240	198845523	198845521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	721147	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	200862818	200862950	200862864	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	4642	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	201084133	201084558	201084403	Y	NA	ASCL5	NA	NA	NA	NA	ASCL5	9754	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	ASCL5,TMEM9,IGFN1	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	201160901	201161255	201161022	Y	IGFN1	TMEM9,IGFN1	NA	NA	NA	NA	IGFN1	2948	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr1	201424936	201425126	201425034	Y	NA	TNNI1,PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	11239	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr1	201426190	201426373	201426369	Y	NA	TNNI1,PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	9992	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	TNNI1,PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	92185	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr1	201709797	201710423	201710148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	85846	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	MYBPH	NA	NA	NA	NA	MYBPH	41695	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	203244129	203244381	203244323	Y	BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	LINC01136	28056	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	FMOD	21549	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	OPTC	NA	NA	NA	NA	OPTC	20711	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	OPTC	NA	NA	NA	NA	OPTC	29740	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	203526746	203526853	203526757	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	OPTC	65475	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	203561987	203562359	203562082	Y	BTG2,ZC3H11A	ATP2B4	ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	31330	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	205283024	205283394	205283339	Y	RBBP5,NUAK2	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	5489	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	205315491	205315533	205315512	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	SNRPGP10	2842	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	206754982	206755508	206755274	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	28396	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	208029774	208030104	208029939	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	10391	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH1	269924	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	211210840	211210858	211210848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH1	94599	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	212429433	212429795	212429457	Y	LPGAT1,PPP2R5A,ATF3,PPP2R5A	PPP2R5A	DTL	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R5A	27084	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	217046388	217046574	217046481	Y	ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	755850	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	217208758	217209105	217209063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	593319	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	218671989	218672275	218672071	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	RRP15	215360	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	RAB3GAP2	16352	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	221173730	221174353	221174046	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	MARC2	254163	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	222828361	222828786	222828451	Y	TLR5	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	38933	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	225778250	225778416	225778333	Y	ENAH	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	60428	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	225780677	225780772	225780725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	58072	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH,RP11-145A3.1	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr1	225845408	225845613	225845516	Y	ENAH	ENAH,RP11-145A3.1	NA	NA	NA	NA	ENAH	6564	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	225895377	225895885	225895482	Y	ENAH	RP11-145A3.1	ENAH,TMEM63A,SRP9,EPHX1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-145A3.1	9071	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	9.06282031431995
chr1	225934674	225934968	225934833	Y	ENAH	RP11-145A3.1,SRP9	NA	NA	NA	NA	SRP9	28563	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	PSEN2	164469	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.67411634364322
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	229825145	229825279	229825212	Y	NA	NA	TAF5L,URB2,GALNT2,PGBD5	IMR90	Hi-C	24141950	URB2	65164	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	231513422	231513769	231513758	Y	NA	EXOC8,EGLN1	NA	NA	NA	NA	EXOC8	41824	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr1	233250723	233251216	233250828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	166372	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	234471096	234471421	234471259	Y	NA	RP5-827C21.1,RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.1	19466	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	234630919	234631525	234631418	Y	TARBP1	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	18070	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	234692762	234692816	234692790	Y	NA	NA	LOC100506795,TARBP1,IRF2BP2,LOC100506810,TOMM20,RBM34,ARID4B	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	50455	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr1	234857710	234858181	234857899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	77675	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	78808	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	235094853	235095190	235094881	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	195061	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	192181	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	156829	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	235246558	235246857	235246620	Y	ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TOMM20	43394	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	235644219	235644255	235644237	Y	NA	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	21526	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	236150188	236150690	236150367	Y	GPR137B	NA	NA	NA	NA	NA	NID1	75772	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	236189775	236189998	236189887	Y	NA	NID1	NA	NA	NA	NA	NID1	36464	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	236453462	236453477	236453470	Y	NA	ERO1LB	ERO1LB,GPR137B,EDARADD	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ERO1LB	10143	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	243451071	243451374	243451087	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	33751	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	244482749	244483387	244483098	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	SDCCAG8,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	130049	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	244763140	244763529	244763408	Y	ADSS,EFCAB2	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf101	147461	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	246129057	246129404	246129358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	539210	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	246743297	246743408	246743371	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	15551	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	246948292	246948613	246948340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	62943	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	247325578	247326237	247325673	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	37125	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	3123873	3124204	3123982	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	17348	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr10	3511181	3511689	3511507	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	298178	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	3762746	3763172	3762857	Y	KLF6	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	62301	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	3808656	3808872	3808754	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	16601	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	3811743	3812009	3811888	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	13464	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	3845250	3845852	3845788	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	19777	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr10	3846443	3847038	3846804	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	20970	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	3937227	3937631	3937383	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	111754	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	4248027	4248358	4248250	Y	NA	LINC00702	LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	35746	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.18423416449079
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr10	4289203	4289519	4289251	Y	NA	LINC00702	KLF6,LOC338588,LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	5099	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	4358748	4358982	4358870	Y	NA	NA	KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	74644	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	4386754	4387085	4386858	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	102650	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	4394953	4395258	4395067	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	110849	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	4396174	4396330	4396296	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	112070	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	4540999	4541337	4541168	Y	NA	NA	KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	256895	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	4685784	4686138	4685885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	246658	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	218923	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	4775344	4775645	4775580	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	MCF7	ChIA-PET	22265404	AKR1C1	157151	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr10	4775719	4776039	4775944	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001	MCF7	ChIA-PET	22265404	AKR1C1	156757	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	6102683	6102909	6102850	Y	GDI2,IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA	RBM17	NA	NA	NA	NA	RBM17	26041	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	6440433	6440653	6440526	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	255552	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	258527	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	803694	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	11980539	11980883	11980844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	102286	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	12283843	12284276	12283949	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	NUDT5	47700	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	12987890	12988351	12988184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	151098	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	14031797	14031930	14031864	Y	FRMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	404870	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	14051386	14052060	14051814	Y	PRPF18	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	424459	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	15179834	15179919	15179877	Y	NA	RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	28773	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	17105178	17105416	17105257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	136637	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	17652629	17652974	17652802	Y	NA	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	PTPLA	4402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	21570991	21571411	21571151	Y	NA	NA	C10orf114,MLLT10,DNAJC1,C10orf140,PIP4K2A,NEBL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	88468	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	77370	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	21683965	21683997	21683982	Y	C10orf140	RP11-275N1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-275N1.1	24086	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	32040213	32040692	32040500	Y	NA	NA	ZNF438,ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	175050	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	32100174	32100489	32100483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	115253	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	ITGB1	NA	NA	NA	NA	ITGB1	41416	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	33265376	33265557	33265464	Y	NA	ITGB1	ITGB1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITGB1	27163	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.91905743321944
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	33297744	33297972	33297858	Y	NA	ITGB1	ITGB1,C10orf68,PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	5024	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	33406704	33407129	33406923	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	113984	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	33411139	33411539	33411218	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	118419	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	33422989	33423776	33423207	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	130269	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	33442264	33442381	33442320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB1	149544	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	33503049	33503394	33503286	Y	ITGB1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	119796	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	38325428	38325718	38325598	Y	ZNF25,ZNF37A	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	27850	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	44100382	44100859	44100681	Y	CSGALNACT2	ZNF239,CAP1P2,ZNF485,ZNF32	NA	NA	NA	NA	ZNF485	527	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	45441757	45442014	45441853	Y	ALOX5	C10orf10	NA	NA	NA	NA	C10orf10	30244	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	45491838	45491921	45491882	Y	C10orf10	C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	ZNF22	2002	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	50519665	50520208	50519779	Y	C10orf128	NA	NA	NA	NA	NA	PGBD3	224878	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	52081951	52082279	52082036	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21A	256303	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	54367095	54367120	54367106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	295039	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	55377812	55377822	55377817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-264A11.1	1249060	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	60026015	60026385	60026202	Y	UBE2D1,IPMK	IPMK,CISD1	NA	NA	NA	NA	IPMK	321	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	60949726	60949909	60949819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13C	171030	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	62096782	62097076	62096929	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	432368	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	63859069	63859192	63859131	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	703324	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	64300187	64300318	64300222	Y	EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	262198	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	64399010	64399243	64399150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	163273	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	65097775	65098183	65098051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	125539	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	SIRT1	33037	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	70782889	70783013	70782952	Y	NA	KIAA1279	NA	NA	NA	NA	KIAA1279	36402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1,CALM2P2	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	73568339	73568950	73568859	Y	NA	PSAP	NA	NA	NA	NA	PSAP	40176	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	73725868	73726411	73726297	Y	C10orf105,CHST3	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	3745	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	74877758	74878048	74877901	Y	NA	P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	NUDT13	9541	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	75987927	75988078	75987990	Y	KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	78967	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	77155063	77155414	77155221	Y	NA	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4250	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	77155629	77155954	77155896	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	3710	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	5434	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	77533288	77533636	77533475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF503	373624	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	78066711	78066848	78066773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF503	907047	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	78828890	78829127	78829009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	567226	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	79002896	79003188	79003042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	393165	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	79123955	79124246	79124101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	272107	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	79147874	79148082	79147903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	248271	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	79268227	79268357	79268284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	127996	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	79291052	79291779	79291330	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104574	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	79383458	79383833	79383807	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	12520	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	79470426	79470747	79470598	Y	NA	NA	KCNMA1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNMA1	74073	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	79636555	79636603	79636579	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	47775	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	80062995	80063366	80063293	Y	NA	NA	ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	271477	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	80735323	80735872	80735375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90920	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	81105192	81105332	81105235	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	82245417	82245911	82245608	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	33495	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	88631620	88631813	88631713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCG	84562	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	89822298	89822728	89822336	Y	KLLN,PTEN	NA	RNLS,KLLN,PTEN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	119039	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	90593606	90593715	90593661	Y	LIPK,LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,FAS,ANKRD22	NA	NA	NA	NA	NA	FAS	154699	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr10	95197787	95197992	95197919	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42082	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	97054774	97055369	97055126	Y	ENTPD1,PDLIM1	PDLIM1	PDLIM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PDLIM1	5993	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	97308667	97309047	97308880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH18A1	105416	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	99302007	99302242	99302124	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	PI4K2A	39889	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	100120877	100121283	100120897	Y	PYROXD2,LOXL4	NA	PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1	IMR90	Hi-C	24141950	HPS1	83401	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	101677861	101678026	101677917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	89650	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	101754114	101754425	101754203	Y	ENTPD7,ERLIN1,ERLIN1,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	13251	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	102792815	102793017	102792917	Y	NA	C10orf2,MRPL43,LZTS2,KAZALD1	NA	NA	NA	NA	KAZALD1	26581	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	103878662	103879287	103878814	Y	NA	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	452	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	104238092	104238376	104238328	Y	NA	CUEDC2,TMEM180,ACTR1A,SUFU	NA	NA	NA	NA	TMEM180	18943	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	108496360	108496741	108496551	Y	SORCS1	NA	NA	NA	NA	NA	SORCS1	425551	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	108585026	108585350	108585188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORCS1	336942	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	110360095	110360471	110360395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	1320840	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	110671685	110671807	110671696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	1009504	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	111136138	111136155	111136149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	545156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	112123790	112124003	112123953	Y	MXI1	NA	SMC3,DUSP5,RBM20	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	61081	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	114715800	114716132	114715855	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	7791	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	114818562	114818849	114818630	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	110553	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr10	114891441	114891844	114891554	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	183432	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	115027855	115028243	115028038	Y	TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	319846	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	115080077	115080348	115080162	Y	CASP7,TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	356594	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	115082665	115082909	115082839	Y	CASP7,TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	354033	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	115141716	115142302	115141804	Y	TCF7L2	NA	VTI1A,ZDHHC6,ACSL5,TCF7L2	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	294640	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	119306449	119306812	119306494	Y	NA	EMX2,EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2OS	3870	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	120968752	120969030	120968753	Y	EIF3A,GRK5	SFXN4,PRDX3	NA	NA	NA	NA	PRDX3	32407	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr10	124070319	124070720	124070447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	61492	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr10	124228546	124229001	124228737	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	9505	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	126717665	126717735	126717700	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	113953	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	127860130	127860500	127860453	Y	ADAM12	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	277022	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	128995351	128995518	128995467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK1	403373	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	131438209	131438380	131438294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	174761	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr10	134208745	134209013	134208865	Y	NA	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	73	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	1404202	1404317	1404259	Y	IFITM10,DUSP8	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4812	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4335	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	2465201	2465287	2465244	Y	INS	TSSC4	NA	NA	NA	NA	TSSC4	45483	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr11	2954251	2954383	2954325	Y	KCNQ1	SLC22A18	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	35300	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	3090855	3091125	3090991	Y	NA	CARS	NA	NA	NA	NA	CARS	14012	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	4129900	4130200	4130091	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,C11orf40,OR52I1	RRM1	NA	NA	NA	NA	RRM1	15963	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	5647526	5647619	5647574	Y	OR51B2,OR51Q1,OR56B4,OR56A3,OR56A1,OR52N2,OR52E6,OR52N4,TRIM34,TRIM5,TRIM22	NA	NA	NA	NA	NA	AC104389.32	265681	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	9824167	9824574	9824403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	140543	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	10913909	10914033	10913978	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	4836	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	3074	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	10948299	10948671	10948479	Y	NA	CTD-2003C8.2	EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2003C8.2	29430	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	10955665	10956051	10955935	Y	NA	CTD-2003C8.2	EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2003C8.2	36796	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	11323686	11323753	11323720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTND5P21	64380	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr11	11326137	11326382	11326218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTND5P21	66831	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	DKK3	NA	NA	NA	NA	DKK3	30248	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-631K18.5	7722	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-631K18.5	4368	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	12109558	12109847	12109697	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP13-631K18.5	3120	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	12133218	12133350	12133292	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19675	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	12136145	12136580	12136313	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	22602	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	12148184	12148552	12148402	Y	NA	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	34641	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr11	12218036	12218499	12218053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	104493	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	12458488	12458795	12458642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	61756	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	279551	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	18405328	18405801	18405464	Y	HPS5,TSG101,SPTY2D1	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	LDHA	8134	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	22379505	22379838	22379672	Y	ANO5	NA	NA	NA	NA	NA	ANO5	166783	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	22814174	22814335	22814255	Y	SVIP	RP11-17A1.3,SVIP	NA	NA	NA	NA	RP11-17A1.3	34591	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr11	24448444	24448604	24448524	Y	NA	NA	LOC100500938	IMR90	Hi-C	24141950	SVIP	1598599	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	27725050	27725226	27725138	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	16379	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	31450770	31450827	31450799	Y	PAX6,PAX6,IMMP1L,ELP4,DNAJC24	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC24	61383	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	31693471	31693827	31693649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	138112	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr11	33711808	33712191	33712002	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	43800	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	105728	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	35825533	35825614	35825574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	137917	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	35986660	35987036	35986965	Y	NA	LDLRAD3	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	23129	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	45864713	45865116	45864826	Y	NA	SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1	NA	NA	NA	NA	CRY2	1553	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr11	46270167	46270467	46270346	Y	CREB3L1	CREB3L1	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	26745	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	48028604	48028990	48028813	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	28491	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	59331910	59331948	59331929	Y	OR5AN1,OR4D6,OR4D11	OSBP	NA	NA	NA	NA	OSBP	49669	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	61484059	61484366	61484213	Y	CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,DAGLA,FTH1	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	38154	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	62226637	62226898	62226739	Y	FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	90019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	10314	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	9910	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	9310	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	62321348	62321821	62321541	Y	NA	EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr11	63687620	63687907	63687858	Y	LGALS12,RCOR2	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	5304	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	65184888	65185395	65184991	Y	FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	2850	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.40893961237187
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18189	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	7.34823268728644
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.91905743321944
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr11	65249962	65250245	65250146	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	12988	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	6.36846832898159
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	65695608	65695878	65695746	Y	EHBP1L1,MAP3K11,RELA,DKFZp761E198	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	DRAP1	10880	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	66738286	66738892	66738415	Y	POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1	PC,C11orf86	PC,SYT12,RHOD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf86	1856	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr11	67143202	67143472	67143423	Y	CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	4147	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr11	68270416	68270689	68270553	Y	MRGPRD	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	44230	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MYEOV	123352	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCND1	195423	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	73221521	73221768	73221630	Y	PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	85466	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	73731710	73731974	73731870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAF1	145966	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	74257729	74258089	74257917	Y	KCNE3	NA	KCNE3,P4HA3,LIPT2,PPME1,C2CD3,CHRDL2,RNF169,POLD3,PGM2L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	POLD3	54833	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	75265416	75265853	75265464	Y	SERPINH1	SERPINH1	RPS3,GDPD5,KLHL35	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINH1	5248	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	75270235	75270345	75270334	Y	NA	SERPINH1	NA	NA	NA	NA	SERPINH1	756	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	231663	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	75946013	75946323	75946187	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	143692	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	83190033	83190209	83190121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	194583	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	85929463	85929753	85929608	Y	NA	EED	PICALM,CCDC83,EED,SYTL2	IMR90	Hi-C	24141950	EED	23833	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	86262463	86262643	86262563	Y	FZD4	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	119035	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	86381936	86382132	86382071	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	258	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	86430919	86431170	86431045	Y	PRSS23	ME3	PRSS23,ME3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ME3	49241	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	48218	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr11	92818375	92818514	92818426	Y	SLC36A4,C11orf75	NA	SLC36A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	110616	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	94978287	94978585	94978436	Y	NA	NA	SESN3	IMR90	Hi-C	24141950	ENDOD1	157313	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	102956908	102957200	102957055	Y	NA	DCUN1D5,DYNC2H1	NA	NA	NA	NA	DCUN1D5	3744	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	103316988	103317242	103317115	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	38603	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	103742967	103742991	103742981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFD	290116	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	104747761	104748329	104748068	Y	CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFD	714654	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	107727726	107727971	107727842	Y	NA	RP11-832N8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-832N8.1	49175	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	107818531	107818875	107818638	Y	NA	RP11-832N8.1,SLC35F2,RAB39A	NA	NA	NA	NA	RAB39A	21302	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	110228106	110228348	110228289	Y	ZC3H12C,FDX1,RDX	RP11-347E10.1	RDX	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-347E10.1	4251	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	112016607	112016779	112016693	Y	DIXDC1	NA	NA	NA	NA	NA	SDHD	60980	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	112028082	112028533	112028265	Y	IL18	NA	NA	NA	NA	NA	PTS	66555	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	113375857	113376013	113375967	Y	CLDN25	DRD2	TTC12,DRD2	IMR90	Hi-C	24141950	DRD2	31444	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	114377967	114377980	114377974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REXO2	69859	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	115017965	115018296	115018131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REXO2	709857	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	116883407	116883544	116883525	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	21223	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	117050933	117051273	117050997	Y	SIDT2	PAFAH1B2,SIDT2,TAGLN,PCSK7	NA	NA	NA	NA	SIDT2	3484	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr11	118785112	118785368	118785332	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	5695	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	118787524	118788054	118787588	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6263	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	1969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	119703414	119703632	119703459	Y	NA	NA	TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	105620	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	120363124	120363469	120363220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF12	157337	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205128	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr11	121593077	121593718	121593342	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	272165	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	121983293	121983692	121983594	Y	NA	MIR125B1,RP11-166D19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-166D19.1	1339	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	122059856	122060218	122060121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-166D19.1	74825	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	122072667	122072944	122072770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-166D19.1	87636	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	122190699	122191055	122190877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-820L6.1	100524	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	123275970	123276355	123275979	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF202	334028	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	123415728	123416106	123415962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	194277	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	128168235	128168419	128168307	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	ETS1,FLI1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	287034	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BARX2	315867	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr11	129013172	129013631	129013445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BARX2	230204	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	130860257	130860277	130860267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	75853	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	132409803	132410133	132410132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	1414747	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr11	134688539	134688830	134688760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLB1L2	488771	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	112657	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	1314182	1314497	1314340	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	ERC1	216507	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	2307539	2307834	2307597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	195838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	2374154	2374447	2374269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	262453	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	159574	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	44613	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2,LAG3	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.65388070194808
chr12	7058563	7058923	7058712	Y	PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7584	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	7100414	7100432	7100423	Y	NA	RNU7-1,EMG1,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	6063	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	9491229	9491519	9491373	Y	NA	NA	C12orf33,LOC144571	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP4	100302	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	10707948	10707962	10707955	Y	NA	NA	CLEC1A,KLRC4-KLRK1	IMR90	Hi-C	24141950	MAGOHB	56260	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	11872628	11873141	11872822	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	71840	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	12016846	12017194	12017120	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	216058	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	12609505	12609975	12609758	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	101492	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	12646905	12646967	12646936	Y	LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	66350	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	12889732	12889911	12889754	Y	LOH12CR1,DUSP16,GPR19,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	23740	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	13359236	13359687	13359415	Y	EMP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	11586	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	13431254	13431391	13431326	Y	NA	NA	C12orf36	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	83604	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERA	491593	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERA	492147	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	16879908	16879915	16879912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1018J11.1	260145	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	23324864	23325062	23324963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	548855	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	23738517	23738975	23738828	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	962508	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr12	25539458	25539791	25539651	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137588	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	26658315	26658658	26658486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	325473	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	27513734	27513812	27513790	Y	NA	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	29947	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	27613510	27613909	27613776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	60455	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	29312653	29312987	29312866	Y	NA	NA	FAR2	IMR90	Hi-C	24141950	ERGIC2	219135	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	5.38870397067673
chr12	41680022	41680168	41680092	Y	PDZRN4	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	856513	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	43159561	43159769	43159665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25I15.1	88635	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	45628991	45629732	45629167	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	21167	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46398489	46398694	46398592	Y	NA	SCAF11	SCAF11	MCF7	ChIA-PET	22265404	SCAF11	14586	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46809510	46809878	46809694	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	34048	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	46825426	46825886	46825665	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	49964	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46832663	46832984	46832824	Y	NA	NA	SLC38A2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-96H19.1	57201	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	46887386	46887956	46887679	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	111924	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46947043	46947401	46947166	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	171581	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	46949913	46950236	46950181	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	174451	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46953166	46953383	46953275	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	177704	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46956105	46956322	46956188	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	180643	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	46956686	46956942	46956800	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	181224	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	47033293	47033660	47033445	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	257831	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	47053760	47053887	47053821	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	278298	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	47057089	47057400	47057270	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	281627	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	47185736	47186095	47186020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	285639	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	47295020	47295376	47295198	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	176358	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	48254260	48254459	48254349	Y	NA	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	29345	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	49822830	49822961	49822896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2	64463	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	50926707	50927114	50926974	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	29939	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	101125	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.42917525406701
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	6.12352723940537
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr12	52543416	52543547	52543482	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	40237	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr12	52575658	52575765	52575707	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	8019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	52588987	52589174	52589068	Y	ACVR1B,NR4A1	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	5203	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	53261473	53261693	53261598	Y	KRT2,KRT1,KRT77	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85	IMR90	Hi-C	24141950	KRT18	78962	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	53338460	53338676	53338568	Y	KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1979	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr12	53398446	53398634	53398511	Y	NA	EIF4B,TENC1,RP11-983P16.4	NA	NA	NA	NA	EIF4B	504	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	53885903	53886227	53886219	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	5620	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	54133160	54133497	54133297	Y	ATF7,ATP5G2	CALCOCO1	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	13631	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	54391907	54392298	54392098	Y	ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	113	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr12	54400493	54400742	54400596	Y	HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	90	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	54400746	54401119	54400931	Y	NA	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr12	54413878	54414161	54414065	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10476	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	54415475	54415883	54415632	Y	NA	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	8754	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	GPR84	NA	NA	NA	NA	GPR84	3622	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	GPR84	NA	NA	NA	NA	GPR84	2387	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	54754477	54754933	54754658	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	GPR84	NA	NA	NA	NA	GPR84	1338	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	56294124	56294208	56294164	Y	NA	WIBG	NA	NA	NA	NA	WIBG	30194	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	56690284	56690436	56690361	Y	NA	ANKRD52,COQ10A,RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2	NA	NA	NA	NA	RP11-977G19.11	1490	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	7.83811486643887
chr12	57473637	57473855	57473746	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1	NA	NA	NA	NA	TMEM194A	5991	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	57855378	57855667	57855523	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS	NA	NA	NA	NA	GLI1	3460	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	58283417	58283685	58283602	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,CTDSP2	CTDSP2,RP11-620J15.3,XRCC6BP1	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-620J15.3	44273	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	64336767	64336917	64336914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	100694	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	64718599	64718738	64718727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPOT	77392	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	NA	NA	NA	NA	NA	HELB	65035	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	68705071	68705359	68705215	Y	IL22	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18802	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr12	70633612	70633702	70633681	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	1072	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	70940880	70941156	70941028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	305740	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	75877380	75877665	75877492	Y	GLIPR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	4920	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	6495	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	13357	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	75902459	75902855	75902619	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	561	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	75983166	75983173	75983170	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	79750	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	76034915	76034997	76034960	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	131499	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	76052717	76052819	76052768	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	149301	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	76060831	76060974	76060901	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	157415	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr12	76104986	76105336	76105144	Y	NA	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRR1	201570	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	76114737	76114966	76114777	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	211321	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr12	76115407	76115603	76115505	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	211991	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	76119368	76119573	76119471	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	215952	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	76144802	76145155	76144918	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-114H23.1	230640	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	76215246	76215339	76215312	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1,KRR1,GLIPR1,OSBPL8	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-114H23.1	160456	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	76283192	76283327	76283260	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	92468	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	RP11-114H23.1	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	3668	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	76373014	76373318	76373236	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	2477	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	76375899	76376264	76376114	Y	NA	RP11-114H23.1,PHLDA1	PHLDA1,KRR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-114H23.1	104	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	5.38870397067673
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	RP11-114H23.1,PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	RP11-114H23.1,PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	77747953	77748163	77748058	Y	CSRP2	RP1-34H18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-34H18.1	31532	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	78238066	78238311	78238190	Y	NA	NAV3	NA	NA	NA	NA	NAV3	15381	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.67411634364322
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	87130786	87131140	87131095	Y	MGAT4C	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	1294483	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	88810675	88811028	88810796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KITLG	161600	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	91775053	91775433	91775292	Y	NA	NA	LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DCN	200153	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	92172749	92173207	92172879	Y	BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C12orf79	361483	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	92402520	92402848	92402650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	131842	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	8.3279970455913
chr12	92419313	92419515	92419511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	115175	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	92436632	92436991	92436801	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	97699	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	92500767	92501208	92501155	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	33482	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	92898384	92899001	92898666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	360711	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	92947125	92947543	92947361	Y	EEA1,BTG1	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	373564	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	92987343	92988147	92987837	Y	EEA1,BTG1	NA	DCN,LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	332960	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	93043351	93043536	93043441	Y	EEA1,CLLU1OS	NA	EPYC,C12orf12,KERA,LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	277571	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	93320988	93321201	93321103	Y	EEA1	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	93321551	93321826	93321626	Y	EEA1	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	444	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	94178297	94178734	94178344	Y	CRADD	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109146	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	94495978	94496358	94496187	Y	NA	PLXNC1	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLXNC1	44141	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	96664847	96665248	96665048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	78687	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	96794959	96795305	96795211	Y	CDK17	CDK17	NA	NA	NA	NA	CDK17	2621	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	106664099	106664223	106664175	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	NUAK1,CKAP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCP11L2	29484	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	113417200	113417385	113417312	Y	OAS1,OAS3,SLC24A6,SDSL,OAS2	OAS3	NA	NA	NA	NA	OAS3	43043	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	116561417	116561596	116561452	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	151547	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-148B3.1	81354	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B3.1	59845	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr12	116946088	116946451	116946189	Y	MED13L,MAP1LC3B2	RP11-148B3.1,LINC00173,RP11-809C9.2	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B3.1	7212	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	116946674	116946880	116946778	Y	NA	RP11-148B3.1,LINC00173,RP11-809C9.2	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B3.1	6783	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	116958826	116959052	116958939	Y	MED13L,MAP1LC3B2	RP11-148B3.1,LINC00173,RP11-809C9.2	LINC00173,MED13L,MIR4472-2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B3.1	5163	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	116975193	116975459	116975296	Y	MED13L,MAP1LC3B2	RP11-148B3.1,LINC00173,RP11-809C9.2	NA	NA	NA	NA	LINC00173	5966	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	116977765	116977838	116977800	Y	MED13L,MAP1LC3B2	RP11-148B3.1,LINC00173,RP11-809C9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-809C9.2	6073	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	117029905	117030297	117030145	Y	NA	RP11-809C9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-809C9.2	45994	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr12	118263351	118263381	118263366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC5	186012	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	118815733	118815925	118815736	Y	TAOK3	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	SUDS3	3548	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	120926786	120926862	120926830	Y	SIRT4	TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	21133	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr12	125052829	125053041	125052928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	312173	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	125169582	125169721	125169665	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	195493	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	125218943	125219209	125219142	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	146005	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	125331273	125331577	125331425	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	33637	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	AC079949.1	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	37812	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	128055090	128055285	128055188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	406418	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr12	133414550	133414990	133414881	Y	NA	RPS11P5,GOLGA3	GOLGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GOLGA3	11106	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	20979917	20980272	20980195	Y	GJB2,GJB6	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	117724	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	21045226	21045414	21045317	Y	IFT88	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	52582	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	21127500	21127725	21127613	Y	CRYL1,IL17D	CRYL1,IFT88	CRYL1,IFT88,IL17D,N6AMT2	IMR90	Hi-C	24141950	IFT88	10860	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	21893563	21893874	21893643	Y	NA	MIPEPP3	ZDHHC20	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEPP3	23285	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr13	22249294	22249707	22249608	Y	FGF9	RPS7P10	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	48140	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	22583629	22583981	22583861	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	382475	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	235445	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	28005406	28005795	28005597	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	8725	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	31447062	31447451	31447297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	257232	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr13	34527456	34527530	34527492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	137270	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	34653156	34653775	34653442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	262970	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	34730516	34730744	34730573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	340330	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	34736232	34736738	34736429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	346046	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	40615098	40615335	40615215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	387334	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	41438468	41438699	41438507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	55211	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	41560539	41560879	41560717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	66629	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	42509903	42509914	42509909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	334375	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	43796435	43796650	43796543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	201096	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr13	49255829	49255937	49255863	Y	NA	NA	CYSLTR2	IMR90	Hi-C	24141950	RCBTB2	150460	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	49427875	49428260	49428099	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	FNDC3A,MLNR,CDADC1	IMR90	Hi-C	24141950	RCBTB2	322506	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	256714	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	50857956	50857973	50857965	Y	NA	NA	DLEU2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	75926	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	51103280	51103738	51103647	Y	NA	RP11-175B12.2	DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-175B12.2	3695	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr13	51168515	51168827	51168588	Y	RNASEH2B	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-175B12.2	68930	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	51800117	51800150	51800132	Y	DLEU7,FAM124A	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	226150	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	52922324	52922434	52922379	Y	THSD1	NA	THSD1	IMR90	Hi-C	24141950	VPS36	100329	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	60580804	60581154	60581101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	154967	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	60723538	60723946	60723707	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	12175	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	61626383	61626760	61626680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	657792	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	67962999	67963167	67963083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	4284032	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr13	72349266	72349293	72349278	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	90037	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	72996613	72996915	72996766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	278916	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	75939473	75939484	75939479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	114766	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	80822359	80822707	80822533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	90379	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	84515909	84516210	84516058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK6	1855413	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	84624015	84624024	84624020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK6	1747599	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	90634693	90634897	90634785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1363177	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	91580553	91580648	91580601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	417426	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	93361116	93361155	93361136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	651019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr13	97188079	97188190	97188135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	484343	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	100033242	100033451	100033337	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	118220	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	100310859	100311153	100311058	Y	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	53940	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	102143126	102143433	102143292	Y	NA	ITGBL1	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	40160	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr13	102377146	102377246	102377196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	274180	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr13	102403781	102404089	102404035	Y	NALCN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	300815	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	102404664	102405031	102404843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	301698	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	102569627	102570054	102569972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	466661	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr13	107078443	107078580	107078574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	139932	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	109115794	109116062	109115942	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	ABHD13	247067	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	110709567	110709794	110709737	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	246365	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	111180820	111181023	111180903	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	NA	NA	NA	NA	NA	CARKD	84858	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr13	113393010	113393289	113393150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	50367	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	171523	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	113588902	113588931	113588917	Y	NA	NA	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	ATP11A	246259	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	53642	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr13	114810103	114810577	114810313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	85509	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr13	114834440	114834743	114834634	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	61343	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr13	114864762	114865011	114864824	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	31075	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr13	114893588	114893901	114893716	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	2185	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	LRP10	19383	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	24981735	24982034	24981828	Y	GZMB,CTSG,CMA1	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	71624	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	32420109	32420203	32420156	Y	NA	RP11-187E13.1	AKAP6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-187E13.1	8050	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr14	32425486	32425585	32425536	Y	NUBPL	RP11-187E13.1,RP11-187E13.2	AKAP6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-187E13.1	13427	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr14	32477016	32477383	32477087	Y	NA	RP11-187E13.2	NUBPL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-187E13.2	2908	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	32672212	32672871	32672506	Y	ARHGAP5	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	128213	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	32699129	32699310	32699220	Y	NA	NA	NUBPL,AKAP6	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP5-AS1	155130	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	32941850	32942320	32942112	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	9686	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	33485809	33485898	33485821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	533803	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	35675118	35675537	35675232	Y	NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	70302	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	35854902	35855043	35854959	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	1232	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	38052089	38052429	38052199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	386971	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	42297588	42297942	42297766	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2397884	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	66080	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	39515	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	37101	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	50510784	50511044	50510833	Y	NA	RP11-58E21.3	C14orf182	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-58E21.3	4837	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	50526790	50527127	50527082	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	RP11-58E21.3	ARF6,C14orf182	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-58E21.3	20843	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	50562564	50562863	50562716	Y	RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	56617	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	51393835	51393896	51393861	Y	NA	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	15558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	51999901	52000168	52000035	Y	NA	FRMD6	NA	NA	NA	NA	FRMD6	46083	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	52365324	52366071	52365347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	88122	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	53361596	53362059	53361840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT2	55094	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	53392802	53392977	53392890	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	24176	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	58182770	58183040	58182906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf105	224185	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	58637905	58638297	58638125	Y	NA	UBA52P3,ACTR10	NA	NA	NA	NA	ACTR10	26501	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	59002332	59002438	59002384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM9	110000	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	62018127	62018466	62018303	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	141765	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	64185455	64185764	64185678	Y	PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	6993	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	65524481	65524844	65524562	Y	PLEKHG3	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	42569	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	65637410	65637773	65637587	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	69997	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	65691594	65691779	65691731	Y	NA	NA	FUT8,LOC645431,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	124181	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	65705173	65705467	65705275	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	137760	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	65705887	65706189	65706012	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	138474	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	67416708	67417057	67416792	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	288769	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	67478288	67478352	67478320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	227474	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	67728313	67728625	67728469	Y	NA	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	22487	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	68320437	68320759	68320587	Y	ZFYVE26	ZFYVE26,RAD51B	NA	NA	NA	NA	RAD51B	35941	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68555311	68555805	68555391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	270815	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr14	68555905	68556402	68556038	Y	PIGH	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	271409	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68634149	68634509	68634347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	252404	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	68662623	68662933	68662778	Y	RDH12	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	223980	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68677466	68677903	68677626	Y	ZFYVE26	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	209010	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	68699331	68699744	68699520	Y	ZFYVE26	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	187169	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68712620	68712855	68712738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	174058	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68717033	68717146	68717097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	169767	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68734990	68735182	68735089	Y	ZFYVE26	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	151731	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68826345	68826913	68826628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	60000	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68827959	68828328	68828144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	58585	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68830652	68830772	68830712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	56141	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	68831089	68831428	68831316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	55485	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.42917525406701
chr14	68844207	68844566	68844276	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	42347	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr14	68846841	68847380	68847069	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	39533	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68850156	68850330	68850199	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	36583	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	68860375	68860378	68860377	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	26535	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68864511	68864831	68864664	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	22082	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr14	68868650	68868995	68868704	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	17918	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr14	68870731	68871233	68871108	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	15680	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68925660	68925982	68925837	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	38747	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	68933312	68933746	68933512	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	46399	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr14	68961774	68962026	68961864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	74861	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr14	69010932	69011443	69011159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	124019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr14	69065409	69066172	69065453	Y	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.3	84110	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	69076965	69077322	69077310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.3	72960	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	69149155	69149350	69149272	Y	ZFP36L1,DCAF5	CTD-2325P2.3	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	932	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	69155852	69156106	69155979	Y	NA	CTD-2325P2.3	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	5570	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr14	69157785	69158016	69157885	Y	NA	CTD-2325P2.3	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	7503	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	69159987	69160257	69160134	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	9705	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	69252204	69252483	69252314	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	8707	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	70251267	70251371	70251319	Y	SLC10A1	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59650	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	74224542	74224784	74224663	Y	NA	PNMA1,MIR4505	NA	NA	NA	NA	MIR4505	1092	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1,MIR4505	NA	NA	NA	NA	MIR4505	1532	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	75015716	75015962	75015839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPC2	56836	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	47569	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr14	75063394	75063798	75063525	Y	NPC2,LTBP2	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	17552	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	75084188	75084360	75084254	Y	PGF,EIF2B2	CTD-2207P18.2	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2207P18.2	2838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr14	75086409	75086922	75086553	Y	PGF	CTD-2207P18.2	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2207P18.2	5059	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	75592667	75593037	75593004	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	NEK9	620	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	76334268	76334588	76334390	Y	NA	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	31891	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	77277377	77277692	77277535	Y	C14orf166B	ANGEL1	VASH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANGEL1	12897	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	77423763	77424258	77424192	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	81036045	81036252	81036151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	387609	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr14	85881762	85881957	85881956	Y	FLRT2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	112375	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.18423416449079
chr14	85978533	85978728	85978633	Y	FLRT2	RP11-497E19.1,FLRT2	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	15604	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr14	85979706	85979846	85979775	Y	FLRT2	RP11-497E19.1,FLRT2	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	14486	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	86073952	86074255	86074109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	79464	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	89833380	89833593	89833517	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	249900	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	89894528	89894709	89894622	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	188784	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	91269936	91270352	91270297	Y	NA	TTC7B,CTD-3035D6.2	NA	NA	NA	NA	TTC7B	10471	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	101280	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	91752749	91752962	91752855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	129226	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	91827435	91827790	91827659	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	54398	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	100415478	100415881	100415722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML1	213448	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	100687969	100688087	100687996	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	YY1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	YY1	14548	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	101370822	101370975	101370899	Y	BEGAIN,RTL1	RP11-123M6.2,SNORD113-4,SNORD114-1	NA	NA	NA	NA	SNORD113-4	29853	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	102193066	102193341	102193142	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	RP11-1029J19.5	2104	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr14	102780583	102780765	102780709	Y	NA	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF839	949	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	102836975	102837187	102837062	Y	NA	CINP,TECPR2	NA	NA	NA	NA	TECPR2	9675	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	103993761	103994083	103993826	Y	NA	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	240	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	105132512	105132664	105132612	Y	TMEM179,INF2	INF2	NA	NA	NA	NA	INF2	21279	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	105143455	105143754	105143546	Y	GPR132	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	10189	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr14	105949862	105949973	105949911	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	1563	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	20596893	20597220	20597190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1946869	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	25554216	25554517	25554319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	127611	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	25623423	25623523	25623473	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	58605	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	25981968	25982324	25982145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	299840	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	27333003	27333354	27333179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA5	223493	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	31372759	31373034	31372889	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR10	90949	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	31598782	31598890	31598869	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	18168	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	33502141	33502453	33502281	Y	NA	NA	TMCO5B	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	596796	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-323I15.2	406072	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	40730551	40730903	40730713	Y	NA	IVD,BAHD1	NA	NA	NA	NA	BAHD1	631	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	41741039	41741403	41741222	Y	NA	NDUFAF1,RTF1,ITPKA	NA	NA	NA	NA	ITPKA	42188	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	42699224	42699321	42699233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP23	82110	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	43321563	43321622	43321602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR1	74689	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	44186295	44186523	44186409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR76	69134	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	46758762	46759114	46758953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA6D	715184	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr15	46881345	46881677	46881639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA6D	592621	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr15	47659982	47660177	47660079	Y	SEMA6D,SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA6D	185684	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr15	47894451	47894745	47894501	Y	SEMA6D,SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	126387	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr15	48884247	48884306	48884277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN1	51740	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	49217829	49218211	49218108	Y	SHC4	EID1,SHC4	NA	NA	NA	NA	SHC4	35430	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	51385997	51386103	51386050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	187128	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	52024012	52024470	52024199	Y	TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2	TMOD2,LYSMD2	NA	NA	NA	NA	TMOD2	17288	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	55928441	55928509	55928475	Y	NA	PYGO1	NA	NA	NA	NA	PYGO1	49296	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	63372629	63373133	63372992	Y	NA	TPM1,LACTB	NA	NA	NA	NA	LACTB	38866	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	63439577	63439949	63439764	Y	NA	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	8271	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	63602976	63602991	63602984	Y	NA	APH1B	NA	NA	NA	NA	APH1B	36759	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	64654607	64654901	64654754	Y	PIF1,KIAA0101	CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4	CSNK1G1	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G1	8165	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	64919514	64919887	64919625	Y	NA	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	36336	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	64940943	64941327	64941079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	52153	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	66866083	66866388	66866213	Y	NA	NA	ZWILCH,SNORD16,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,LCTL,SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	RPL4	51213	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	67175645	67176118	67175872	Y	NA	NA	IQCH,SMAD6,LOC100506686,SMAD3	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	177983	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	67440032	67440420	67440131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	85931	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	69490173	69490404	69490203	Y	NA	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	39250	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr15	70392960	70393272	70393150	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	4445	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	70934341	70934514	70934428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UACA	119418	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	71155799	71156069	71155993	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	11301	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	73077755	73078078	73077900	Y	ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	1568	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	74287730	74287905	74287836	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	2716	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	NA	NA	NA	NA	NA	PML	127979	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	74899091	74899429	74899332	Y	PPCDC,CLK3,CLK3	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	10250	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	75326958	75327212	75327152	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,ARID3B,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	13062	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	77351977	77352357	77352309	Y	NA	TSPAN3	PSTPIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN3	21969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	255769	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	78376570	78376702	78376629	Y	DNAJA4,DNAJA4	TBC1D2B,IDH3A,CIB2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	8504	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	22929	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	81125183	81125474	81125331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	154745	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	83376680	83377056	83376874	Y	NA	RP11-752G15.4,AP3B2,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	AP3B2	14	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	83412156	83412209	83412183	Y	NA	AP3B2,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.6	5107	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	83680959	83681167	83681099	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	2566	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	83733499	83733939	83733822	Y	WHAMM	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	167	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	85131508	85131753	85131631	Y	PDE8A	ZSCAN2	NA	NA	NA	NA	ZSCAN2	10464	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	85711891	85712151	85712051	Y	NA	NA	PDE8A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE8A	190220	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	88877677	88878020	88877849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTRK3	79678	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	89187882	89188205	89187952	Y	NA	AEN	NA	NA	NA	NA	AEN	25355	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	90605290	90605500	90605324	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	38236	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	93012777	93012983	93012904	Y	C15orf32	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	185706	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	93130741	93130751	93130746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	122226	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-386M24.4	69568	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	93347056	93347810	93347183	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-386M24.4	71631	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	69528	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	NA	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	CHD2	60372	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD2	48928	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	93424689	93424786	93424732	Y	CHD2	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	163	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	93425040	93425223	93425112	Y	C15orf32	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	514	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	87773	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	95215107	95215293	95215200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-255M2.2	458795	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr15	95370202	95370491	95370347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-255M2.2	303597	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	95387780	95387932	95387839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-255M2.2	286156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	95388455	95388700	95388578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-255M2.2	285388	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr15	95802916	95802946	95802933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2536I1.1	65412	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr15	95830783	95831278	95830942	Y	NA	CTD-2536I1.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2536I1.1	37080	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	95847774	95848063	95847919	Y	NA	CTD-2536I1.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2536I1.1	20295	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	96369112	96369214	96369163	Y	NA	NA	LOC400456,NR2F2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4G2.1	218945	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	96867848	96868085	96868000	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	505	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	96871345	96871608	96871517	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	2755	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr15	96884534	96884884	96884709	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	10044	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4408	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.40893961237187
chr15	96895727	96895870	96895799	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	261	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	766	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr15	96898438	96898666	96898552	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	2972	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4721	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	5042	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr15	99410702	99410893	99410822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC23	378535	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	101102236	101102405	101102321	Y	NA	ASB7,LINS	NA	NA	NA	NA	ASB7	38334	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr15	101739961	101740273	101740216	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	49864	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	39163	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	1076512	1076669	1076553	Y	RAB40C,RAB40C,RAB40C,RAB40C,RHBDL1,FBXL16,SOX8,BAIAP3,BAIAP3	LMF1,SOX8	NA	NA	NA	NA	SOX8	46704	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	1239202	1239436	1239320	Y	BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	37961	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS30P,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr16	2955389	2955781	2955669	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	NA	NA	NA	NA	FLYWCH1	4157	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	3013245	3013631	3013382	Y	KREMEN2	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1	NA	NA	NA	NA	KREMEN2	1300	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr16	3156056	3156304	3156227	Y	PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	4257	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	3202363	3202472	3202417	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	24585	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.42917525406701
chr16	4426208	4426420	4426289	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	6359	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	6415499	6415992	6415721	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1269690	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	10759043	10759292	10759209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	76351	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	11489659	11490054	11489857	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	141623	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	11618570	11618665	11618618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	109572	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	11677764	11678427	11678146	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	LITAF	NA	NA	NA	NA	LITAF	49810	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	11691003	11692063	11691252	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF	MCF7	ChIA-PET	22265404	LITAF	36174	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	11705983	11706695	11706338	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	21542	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	11715871	11716050	11715944	Y	NA	LITAF,SNN	CLEC16A,TXNDC11,PRM2,PRM1,LITAF,SNN,BCAR4,ZC3H7A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	12187	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	11726508	11726794	11726693	Y	NA	LITAF,SNN	CLEC16A,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	1443	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr16	11764274	11764504	11764414	Y	ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	NA	NA	NA	NA	SNN	4004	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	13069429	13069750	13069475	Y	SHISA9	NA	NA	NA	NA	NA	SHISA9	75952	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	14396583	14397514	14397260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	233405	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	16097959	16098303	16098187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	56525	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	16115976	16116215	16116101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	74542	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	17257893	17258025	17257960	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	1216459	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	20863043	20863195	20863109	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	45995	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	22201170	22202123	22201439	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13480	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	23473263	23473545	23473445	Y	SCNN1G,GGA2	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	10762	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	24061843	24062218	24062031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1	374866	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	24619135	24619479	24619307	Y	SLC5A11	NA	TNRC6A,RBBP6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP6	72121	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	27240450	27240772	27240769	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	37343	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	27247570	27247639	27247606	Y	IL4R,IL21R,JMJD5,JMJD5	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	30476	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	5.87858614982916
chr16	31888166	31888535	31888469	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	5087	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	33974683	33974853	33974768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2091604	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	46780849	46781142	46780994	Y	MYLK3	MYLK3	NA	NA	NA	NA	MYLK3	41177	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr16	46790458	46790825	46790642	Y	C16orf87	MYLK3	NA	NA	NA	NA	MYLK3	31494	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	50301586	50301804	50301716	Y	CYLD,CYLD,TMEM188,PAPD5,ADCY7	NA	NA	NA	NA	NA	BRD7	99041	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	52854151	52854308	52854232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	166935	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	53075249	53075847	53075790	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	11098	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	53915459	53915524	53915492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	179584	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	57654867	57655271	57654917	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	12303	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	14642	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr16	57665381	57665698	57665503	Y	GPR56,PLLP,CX3CL1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	22817	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	57670999	57671200	57671100	Y	GPR56,PLLP,CX3CL1,CCL17,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	28435	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	57680678	57681373	57680764	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	38114	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr16	58160772	58161211	58161024	Y	C16orf80	C16orf80	NA	NA	NA	NA	C16orf80	143	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	66300602	66300832	66300675	Y	NA	NA	CDH11,LOC283867	IMR90	Hi-C	24141950	TK2	283615	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr16	68418958	68419037	68419019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT7	76081	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHTF8	91850	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr16	70467076	70467247	70467197	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	3893	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	70725776	70726100	70725941	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	7807	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr16	70727989	70728270	70728171	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	10020	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr16	71731364	71731710	71731537	Y	NA	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	24894	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	73023566	73023933	73023728	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	67664	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	73053285	73053647	73053466	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	37950	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	73084736	73084892	73084798	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	6705	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr16	73096616	73096908	73096789	Y	NA	ZFHX3	ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	5019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	73156810	73157218	73157149	Y	NA	NA	ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	65213	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	73337860	73337902	73337872	Y	NA	NA	HPR,HP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	246263	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	73583865	73584319	73584076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	492268	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	75037611	75037819	75037667	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	5540	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	78325751	78325980	78325865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	194441	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	81465654	81465943	81465745	Y	PLCG2,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	10832	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	81831224	81831380	81831299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	60522	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	82142537	82142645	82142588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	59186	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	84305711	84305761	84305735	Y	NA	KCNG4	ATP2C2,KCNG4,WFDC1,KIAA1609	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG4	34355	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	84545075	84545257	84545139	Y	NA	NA	COTL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	COTL1	104426	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	84633108	84633501	84633306	Y	ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	16182	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92B	58441	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	9.55270249347238
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM92B	120061	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85268297	85268637	85268360	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM92B	124183	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85344973	85345172	85345110	Y	NA	NA	KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM92B	200859	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr16	85346294	85346686	85346622	Y	FAM92B	NA	KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM92B	202180	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.16399852279565
chr16	85355565	85356105	85355766	Y	NA	NA	FAM92B,LOC727710,GINS2,KIAA0182,KIAA0513,LINC00311	IMR90	Hi-C	24141950	FAM92B	211451	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85395325	85395548	85395434	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311	IMR90	Hi-C	24141950	FAM92B	251211	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85405119	85405354	85405237	Y	NA	NA	KIAA0513,FAM92B,LINC00311,LOC727710,KIAA0182	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM92B	261005	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85415557	85415973	85415759	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM92B	271443	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85424430	85424739	85424585	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM92B	280316	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85471045	85471389	85471119	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250290	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	85499556	85499891	85499629	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	221788	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr16	85591342	85591727	85591695	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	129952	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85606114	85606473	85606294	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	115206	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	85678973	85679150	85679027	Y	NA	GINS2	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	42529	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr16	87875229	87875683	87875262	Y	CA5A	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	25411	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	88448195	88448445	88448286	Y	NA	NA	CA5A,SLC7A5,BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	69280	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	88847421	88847701	88847601	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	1918	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	88988977	88989104	88989054	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	52508	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	89086731	89086969	89086798	Y	NA	CBFA2T3	ACSF3,CBFA2T3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CBFA2T3	45119	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	89796817	89796910	89796864	Y	NA	SPATA2L,ZNF276	NA	NA	NA	NA	ZNF276	12009	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	89879863	89880236	89880053	Y	NA	FANCA,SPIRE2	NA	NA	NA	NA	FANCA	829	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr16	89992380	89992810	89992683	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	TUBB3	6580	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	1107024	1107388	1107281	Y	NA	ABR	ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	22927	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr17	1926126	1926449	1926286	Y	NA	DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	DPH1	4955	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	9740	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	1994416	1994643	1994603	Y	HIC1,HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	OVCA2	51089	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	2299235	2299531	2299372	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2881	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	3504662	3504760	3504711	Y	NA	SHPK,CTNS	TRPV3	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	32856	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	3986731	3986836	3986770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZEF1	57478	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	5000892	5001205	5000989	Y	NA	AC012146.7,ZNF232	NA	NA	NA	NA	AC012146.7	11558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	20328	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.18423416449079
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr17	8597334	8597547	8597441	Y	NA	NA	MYH10	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	65255	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	8649167	8649702	8649446	Y	ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	117088	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	9368693	9368815	9368742	Y	GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	109093	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	15313128	15313509	15313354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMP22	146485	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	15862469	15862773	15862614	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	16238	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	TRPV2	NA	NA	NA	NA	TRPV2	38641	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	16924574	16924970	16924629	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	18889	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	17596410	17596829	17596636	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	13623	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	18128078	18128354	18128155	Y	NA	ALKBH5,LLGL1,FLII	NA	NA	NA	NA	LLGL1	1177	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr17	21795425	21795556	21795487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	319703	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	27138672	27138846	27138777	Y	NA	ERAL1	NA	NA	NA	NA	ERAL1	41110	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	27568035	27568215	27568131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	50921	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	28053660	28054255	28054185	Y	NUFIP2,TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	105735	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	28416461	28416826	28416644	Y	NA	NSRP1	NA	NA	NA	NA	NSRP1	23713	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	28533256	28533617	28533437	Y	SLC6A4	NA	NA	NA	NA	NA	BLMH	83457	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	29115484	29115559	29115508	Y	NA	CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5	NA	NA	NA	NA	CRLF3	34235	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	34838937	34839070	34839023	Y	NA	ZNHIT3,PIGW	NA	NA	NA	NA	ZNHIT3	1403	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	35177105	35177136	35177121	Y	NA	NA	AATF,LHX1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-445F12.1	114824	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	35492690	35492856	35492817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	188515	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	38466457	38466702	38466562	Y	IKZF3	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	3013	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	39003172	39003257	39003186	Y	KRTAP2-1,KRT10	TMEM99,KRT10,KRT20	NA	NA	NA	NA	KRT10	26325	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	39656265	39656585	39656468	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	3372	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	AC067852.1,NAGLU,HSD17B1,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	AC067852.1	905	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	40671173	40671319	40671240	Y	PTRF	AC067852.1,NAGLU,HSD17B1,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	AC067852.1	417	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	42101631	42102033	42102001	Y	C17orf105,CD300LG,LSM12	TMEM101,LSM12,G6PC3	NA	NA	NA	NA	TMEM101	2317	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.42917525406701
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	42919802	42920006	42919936	Y	NA	GJC1	NA	NA	NA	NA	GJC1	13618	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	43018379	43018606	43018493	Y	NA	CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1	NA	NA	NA	NA	KIF18B	4476	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	43370974	43371161	43371063	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	MAP3K14	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	21253	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	44261899	44262225	44262045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	292151	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	44896658	44896796	44896753	Y	WNT3,WNT9B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	99125	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2,RPRML	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	RPRML	89541	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	46091721	46092069	46091883	Y	NA	CDK5RAP3,NFE2L1	SP2,PNPO,CDK5RAP3,PRR15L	IMR90	Hi-C	24141950	NFE2L1	31622	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	46168455	46168716	46168586	Y	NA	NFE2L1,CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	CBX1	8167	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	46226881	46226967	46226912	Y	TBX21,OSBPL7,LRRC46,SKAP1	CBX1,SNX11	SNX11	IMR90	Hi-C	24141950	SNX11	48162	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	46583139	46583523	46583310	Y	SKAP1	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3	HOXB2,HOXB3,HOXB4,SKAP1,HOXB8,HOXB1,HOXB9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOXB-AS1	35390	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4	NA	NA	NA	NA	HOXB4	24905	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1079K10.3	166018	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,SGCA,HILS1,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,SGCA,HILS1,COL1A1	NA	NA	NA	NA	HILS1	422	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	48716691	48717083	48716761	Y	CHAD,SPAG9	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6553	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	49027288	49027482	49027366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	83949	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	49028088	49028439	49028211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	84749	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	53497202	53497618	53497598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	53841262	53841496	53841365	Y	PCTP,PCTP	TMEM100,PCTP	NA	NA	NA	NA	PCTP	14922	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	54367618	54367784	54367724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKFN1	181299	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	54669912	54670125	54669969	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	852	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr17	54674985	54675165	54675040	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	5925	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.42917525406701
chr17	54785072	54785457	54785265	Y	NA	NA	NOG	IMR90	Hi-C	24141950	NOG	116012	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	54857276	54857441	54857296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKE	52019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	54857525	54857918	54857805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKE	51542	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	56012688	56013140	56012704	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,SRSF1,CUEDC1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	17544	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	56600012	56600151	56600118	Y	DYNLL2,OR4D2,SEPT4,SEPT4	MTMR4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	6746	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	57839956	57840355	57840071	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	56969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	57902814	57903248	57902913	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	13379	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	59802247	59802551	59802410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	135684	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	60255991	60256253	60256151	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	115348	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	60649611	60649792	60649701	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	MRC2	52970	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	62258830	62259200	62259015	Y	SCN4A	SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	37387	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	545803	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	68361449	68361732	68361545	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	1253387	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	70194547	70194569	70194559	Y	NA	SOX9-AS1	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9-AS1	21408	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	70461830	70461987	70461862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	159383	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	70484276	70484648	70484400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	136722	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	70610080	70610203	70610142	Y	NA	RPL32P33	LOC100499467	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPL32P33	11167	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	71087635	71087942	71087798	Y	SLC39A11	SLC39A11	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	784	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	72565404	72566131	72565833	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	176660	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	73351805	73351921	73351820	Y	NA	AC011933.1,GRB2	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	38395	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	73426423	73426691	73426652	Y	MRPS7	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	8549	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	74337022	74337338	74337180	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	33327	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	74359249	74359572	74359412	Y	RHBDF2,SPHK1,SPHK1	SPHK1,PRPSAP1	PRPSAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPHK1	11093	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	74496600	74496786	74496748	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	728	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr17	75103651	75103906	75103737	Y	JMJD6,SRSF2	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	22853	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr17	75125483	75125742	75125630	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	44685	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	8052	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	10285	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	75402047	75402301	75402134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	127396	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	75430734	75431332	75430992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	156083	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	229848	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	75865692	75866230	75865998	Y	SOCS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6C	132019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	77146048	77146259	77146101	Y	RBFOX3	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	77027	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	77965696	77966573	77966281	Y	CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	41074	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	78008584	78008924	78008651	Y	TBC1D16,GAA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	CCDC40	149	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.18423416449079
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	36737	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38277	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	79482562	79482804	79482728	Y	NA	ACTG1,C17orf70	NA	NA	NA	NA	ACTG1	6069	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	TEX19	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TEX19	17805	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr18	2656589	2657177	2656999	Y	NA	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	2852	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	2978254	2978441	2978377	Y	NA	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	32872	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.18423416449079
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.18423416449079
chr18	3625326	3625427	3625380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215720	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr18	3650005	3650381	3650193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	240399	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr18	3661317	3661540	3661407	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	251711	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr18	5294371	5294839	5294435	Y	ZFP161	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	1118397	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL4	517433	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	13.4717599266918
chr18	6021141	6021623	6021376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	391613	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	6556939	6557309	6557113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	95925	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr18	6752571	6752962	6752632	Y	NA	ARHGAP28	ARHGAP28	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP28	24854	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr18	7116326	7116685	7116423	Y	NA	LAMA1	NA	NA	NA	NA	LAMA1	513	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	8689782	8689966	8689874	Y	NA	NA	NDUFV2,RAB12,CCDC165,ANKRD12,PPP4R1,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	82339	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr18	9554563	9554587	9554575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	58651	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	9772005	9772203	9772065	Y	VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	RAB31	65843	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	12471098	12471401	12471374	Y	PSMG2	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO1	65203	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	15197632	15197837	15197824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	1472970	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	160326	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	21780839	21781231	21781002	Y	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	NA	IMPACT	223349	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	24537528	24537649	24537589	Y	KCTD1	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	302163	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	33040584	33040905	33040747	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	35050	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	33577061	33577192	33577127	Y	NA	C18orf21	NA	NA	NA	NA	C18orf21	27015	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	34152288	34152711	34152516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	254358	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	37151664	37151869	37151793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	238025	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	37629293	37629563	37629339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	715654	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	45379355	45379691	45379492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	75824	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr18	46353431	46353823	46353627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	290014	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	397724	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	46740928	46741364	46741195	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	244353	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	47250062	47250416	47250239	Y	NA	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	87914	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr18	48721492	48722312	48721913	Y	SMAD4,MEX3C	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	20362	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	55381917	55382196	55382152	Y	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	86137	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	56161690	56161866	56161857	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SEC11C	642843	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	56666173	56666337	56666193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC11C	138372	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	67682034	67682164	67682099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	189017	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	67683360	67683665	67683513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	187516	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr18	72695045	72695604	72695384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	223699	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	75598045	75598259	75598152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	1065482	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	76807542	76807844	76807575	Y	NA	ATP9B	SALL3	IMR90	Hi-C	24141950	ATP9B	19441	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	188995	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr18	77936891	77937280	77937009	Y	CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	PARD6G	66149	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr19	908605	908810	908775	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	2430	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	928103	928378	928301	Y	SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf22,KISS1R,ARID3A	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	4322	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	1101850	1102062	1101942	Y	C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	POLR2E	NA	NA	NA	NA	GPX4	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	1410481	1410741	1410600	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	4913	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	3271003	3271310	3271072	Y	ZNF555,C19orf71,CELF5,CELF5	NA	NA	NA	NA	NA	NFIC	86251	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	3404656	3404792	3404728	Y	TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47095	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	3405079	3405252	3405203	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47518	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	3555158	3555442	3555300	Y	C19orf28	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	15333	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	3670243	3670423	3670333	Y	NFIC	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	28054	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	4089506	4089868	4089573	Y	ZBTB7A	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24563	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	4567148	4567365	4567215	Y	TICAM1,SEMA6B	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	70165	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	4568924	4569300	4569153	Y	TICAM1,KDM4B,SEMA6B	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	68230	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	5337153	5337266	5337237	Y	HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	1548	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	5339517	5339797	5339748	Y	HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	703	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	5624052	5624252	5624226	Y	VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB	SAFB,SAFB2,RPL36	NA	NA	NA	NA	SAFB2	1995	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	5989815	5989915	5989890	Y	SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	13662	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	7665007	7665263	7665135	Y	INSR,PNPLA6,FLJ22184,KIAA1543	CAMSAP3,XAB2,STXBP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP3	6219	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	46913	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	8607140	8607451	8607227	Y	RAB11B,PRAM1,MYO1F	ZNF414	NA	NA	NA	NA	ZNF414	30092	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	8635978	8636196	8636014	Y	MARCH2,PRAM1,MYO1F	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	37424	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr19	8989058	8989241	8989188	Y	ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1	ZNF558	NA	NA	NA	NA	ZNF558	48054	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	9120594	9120838	9120762	Y	MUC16	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF317	128218	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF317	119941	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	9919463	9919725	9919715	Y	ZNF846,FBXL12	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	16767	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM5	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181,PDE4A	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	10949257	10949551	10949405	Y	CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	TMED1	4263	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	11484314	11484469	11484411	Y	ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR	NA	NA	NA	NA	SWSAP1	953	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	11592904	11593323	11593025	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	PRKCSH,CCDC151,CTC-398G3.2,ECSIT	NA	NA	NA	NA	CTC-398G3.2	38928	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	12892597	12892707	12892653	Y	ZNF44,ZNF563,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,STX10,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	7603	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	13129050	13129163	13129107	Y	MAST1,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	24628	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	13133010	13133371	13133241	Y	FBXW9,NFIX	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	28588	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	13164647	13164970	13164763	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	47005	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	44617	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr19	13171487	13171654	13171570	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	40321	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	5.63364506025294
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	13959901	13960035	13959978	Y	CCDC130,RFX1,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	54979	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	14474119	14474280	14474154	Y	ZNF333,RFX1,PKN1,CD97	CD97	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	15033	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	14528800	14529217	14529142	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	DDX39A	608	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr19	15321082	15321623	15321224	Y	RASAL3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	11290	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.16399852279565
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr19	15944737	15944873	15944829	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	NA	NA	NA	NA	NA	TPM4	230958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	TPM4	227712	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	17190539	17191239	17190954	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	5948	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	17604234	17604409	17604322	Y	NA	TMEM221,SLC27A1,PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	16029	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	17890338	17890582	17890537	Y	FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1	FCHO1	NA	NA	NA	NA	FCHO1	33811	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	18590516	18590939	18590817	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	ISYNA1,ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	39998	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	19570650	19571032	19570761	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	53513	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	19589693	19590012	19589853	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	34533	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF730	53433	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	23500893	23501028	23500961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	69701	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	28270762	28271411	28271062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1431037	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	31415761	31415844	31415821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	1003210	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	33541924	33542310	33542117	Y	NA	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	11484	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1599	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	34992713	34992833	34992773	Y	NA	WTIP	NA	NA	NA	NA	WTIP	22839	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	36757480	36757645	36757542	Y	NA	ZNF565	ZNF146	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF565	22321	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	37795242	37795359	37795301	Y	ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1	HKR1	NA	NA	NA	NA	HKR1	6380	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	37822125	37822150	37822138	Y	NA	HKR1,ZNF527	NA	NA	NA	NA	HKR1	20386	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr19	38495647	38495987	38495738	Y	SPRED3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	99779	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	38575229	38575296	38575264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF1	143058	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	39152764	39152958	39152839	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	16475	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	40466097	40466407	40466254	Y	ZNF546,FCGBP	CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546	NA	NA	NA	NA	PSMC4	8505	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	41827649	41828097	41827915	Y	HNRNPUL1,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	13555	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	42404902	42404963	42404932	Y	NA	RPS19	NA	NA	NA	NA	RPS19	42914	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	DEDD2	29017	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	42756581	42756634	42756608	Y	ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	675	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	42785500	42785936	42785827	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	14811	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45240026	45240191	45240078	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	BCL3	K562	ChIA-PET	22265404	BCL3	8771	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.65388070194808
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	9.55270249347238
chr19	45954905	45955186	45955133	Y	GIPR,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB	IMR90	Hi-C	24141950	FOSB	14067	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45968349	45968608	45968538	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	FOSB	645	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45995542	45995743	45995643	Y	NANOS2,NKPD1,EXOC3L2	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	RTN2	2576	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	45999277	45999601	45999579	Y	NOVA2,DMPK,RTN2,RTN2	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	RTN2	958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	46361761	46362096	46361929	Y	NA	SYMPK,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	SYMPK	2452	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	46708652	46708841	46708747	Y	NA	IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL1	22168	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	47033456	47033629	47033471	Y	NA	GAPDHP38	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	26269	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3,DACT3	NA	NA	NA	NA	DACT3	19419	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	47458912	47459233	47458939	Y	ZC3H4,CCDC9	NA	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS1	61844	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	47662714	47662828	47662771	Y	NA	SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	ZC3H4	47705	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr19	47805638	47805769	47805718	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1	CCDC9,PRR24,DHX34	PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2	IMR90	Hi-C	24141950	PRR24	29496	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	47949356	47949644	47949521	Y	NA	MEIS3,KPTN	NA	NA	NA	NA	MEIS3	28576	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	49046614	49046906	49046677	Y	NA	SULT2B1	SULT2B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULT2B1	6426	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr19	49051864	49052159	49052158	Y	NA	SULT2B1	NA	NA	NA	NA	SULT2B1	1173	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	49590520	49590786	49590652	Y	NA	CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	3844	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	49836983	49837445	49837293	Y	SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37	DKKL1,TEAD2	NA	NA	NA	NA	DKKL1	25595	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	SLC17A7,ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	SLC17A7	19141	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	50825197	50825861	50825498	Y	NA	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	NR1H2	5049	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	50860908	50861268	50861186	Y	PNKP,VRK3,NR1H2	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	24193	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	51898753	51899047	51898851	Y	SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1	ETFB	NA	NA	NA	NA	ETFB	31081	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	120291	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121082	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	122043	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	54707641	54707712	54707644	Y	NA	LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	5031	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	54981954	54982383	54982298	Y	NA	LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5	NA	NA	NA	NA	CDC42EP5	28	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	56623811	56623981	56623918	Y	ZNF865,EPN1	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	6668	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF814,ZNF417,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	58415823	58415990	58415970	Y	NA	ZNF814,ZNF417,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	9988	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN1	13882	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	58911739	58912056	58911822	Y	NA	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	868	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	1530125	1530448	1530188	Y	TPO,TPO	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	854686	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	2263242	2263642	2263442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	1116011	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	9142736	9142998	9142867	Y	NA	MBOAT2	NA	NA	NA	NA	MBOAT2	794	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.18423416449079
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	10418251	10419155	10418675	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	21860	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	11970136	11970284	11970210	Y	NA	AC096559.1	NA	NA	NA	NA	AC096559.1	16464	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	AC096559.1	NA	NA	NA	NA	AC096559.1	16136	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	12703835	12703993	12703936	Y	NA	NA	TRIB2	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	151022	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	12835431	12835800	12835719	Y	NA	TRIB2	MIR4262,LPIN1,TRIB2,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	19215	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr2	15199994	15200355	15200088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	499099	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	16493094	16493437	16493362	Y	MYCN	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	485031	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	19325543	19325927	19325740	Y	NA	NA	MIR4757,FLJ12334,OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSR1	230487	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	19547126	19547267	19547173	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	9147	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	19562818	19563058	19562929	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	6404	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	19766934	19767238	19767086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSR1	210520	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	20784084	20784557	20784460	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	64292	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	23412802	23412834	23412819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	193254	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	23525558	23525779	23525689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	80309	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	23901267	23901426	23901347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	246558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	24859370	24859696	24859496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	154309	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	17060	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	26225947	26226220	26226028	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	RAB10,KIF3C,FAM59B,ASXL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	22329	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	26943701	26943984	26943834	Y	GPR113	AC015977.5,KCNK3,CENPA	NA	NA	NA	NA	KCNK3	30082	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,KCNK3,CENPA	NA	NA	NA	NA	KCNK3	33315	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	27432989	27433207	27433072	Y	NA	SLC5A6,CAD	NA	NA	NA	NA	SLC5A6	619	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	27574731	27574755	27574743	Y	NA	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3	NA	NA	NA	NA	AC074117.10	2358	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	27939397	27939784	27939607	Y	TRIM54	AC074091.13	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC074091.13	2798	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	27939854	27940151	27940111	Y	NA	AC074091.13	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC074091.13	3255	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	AC074091.13,MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	21721	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	29803354	29803753	29803678	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	484783	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	33645692	33646195	33645962	Y	RASGRP3	NA	TTC27,LTBP1,RASGRP3,FAM98A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM98A	176254	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37617673	37618124	37617783	Y	CDC42EP3,EIF2AK2	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	47956	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37760471	37760598	37760536	Y	SULT6B1,FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	190754	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37788822	37789049	37788928	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	174562	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	37797953	37798358	37798079	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	165253	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37798952	37799136	37799011	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	164475	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	37808694	37808848	37808817	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	154763	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	37811087	37811457	37811150	Y	NA	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	152154	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37813379	37813644	37813592	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	149967	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	37815586	37815764	37815605	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	147847	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	37841378	37841620	37841452	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	121991	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37842733	37843439	37843059	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	120172	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	37843563	37844180	37844009	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	119431	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37845314	37845753	37845669	Y	NA	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	117858	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37851057	37851610	37851419	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	112001	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr2	37851755	37851898	37851787	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	111713	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37852383	37852553	37852466	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	111058	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr2	37853380	37853621	37853410	Y	EIF2AK2,EIF2AK2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	109990	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.16399852279565
chr2	37854869	37855107	37855003	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	108504	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	37858321	37858709	37858681	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	104902	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr2	37860871	37861279	37860884	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	102332	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	37868257	37868517	37868387	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	95094	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	38429135	38429424	38429280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	94091	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	39079289	39079498	39079407	Y	SRSF7,ARHGEF33	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21577	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	39800503	39800829	39800666	Y	CDKL4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	138050	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	40628782	40629514	40629399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	624375	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	42046531	42047126	42046845	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	111737	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	42245014	42245155	42245121	Y	PKDCC	PKDCC	LOC388942,C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	28005	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	42535809	42536204	42535901	Y	NA	NA	COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	COX7A2L	114024	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	280047	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	43647114	43647287	43647224	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	173898	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	43685237	43685474	43685356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135711	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	43686078	43686091	43686085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135094	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	43818575	43818651	43818610	Y	NA	THADA,PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	THADA	2534	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	43908548	43908922	43908739	Y	PLEKHH2	PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	PLEKHH2	46136	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	44542790	44543096	44543052	Y	SLC3A1	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	43905	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	46265425	46265774	46265513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	253032	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	46797577	46797967	46797772	Y	NA	RHOQ,ATP6V1E2,CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	29881	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	46857387	46857788	46857588	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	PIGF	15129	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	47100841	47101015	47100907	Y	NA	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	40281	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	47796567	47796699	47796698	Y	NA	KCNK12	NA	NA	NA	NA	KCNK12	489	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	50631357	50631742	50631589	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	1876835	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	54111882	54111915	54111897	Y	NA	GPR75-ASB3,ASB3	NA	NA	NA	NA	ASB3	26585	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	54270419	54270555	54270547	Y	GPR75,ACYP2	NA	SPTBN1,EML6,PSME4,ACYP2	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	74442	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	55327778	55327923	55327859	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	9834	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	55552986	55553278	55553132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIF2	58503	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	55767070	55767336	55767332	Y	NA	CCDC104	NA	NA	NA	NA	CCDC104	22330	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	57846266	57846542	57846459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	286244	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	58726353	58726421	58726382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	259846	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	61586795	61586939	61586907	Y	AHSA2,USP34	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	108965	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.8988217915243
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	64352533	64352773	64352693	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	16815	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	64367846	64368162	64368149	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	1426	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	64540204	64540217	64540210	Y	NA	NA	LINC00309,PELI1,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	LGALSL	138886	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	64894012	64894430	64894356	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	81709	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.42917525406701
chr2	65849750	65849939	65849914	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	191979	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	66652427	66652950	66652646	Y	MEIS1	MEIS1,MEIS1-AS3	LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS1	5634	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr2	66653044	66653230	66653107	Y	NA	MEIS1,MEIS1-AS3	LOC644838,MEIS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEIS1	5354	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	66673073	66673647	66673570	Y	NA	MEIS1,MEIS1-AS3	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	14471	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	66721852	66722243	66721943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	63250	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	AC007392.3	NA	NA	NA	NA	AC007392.3	2737	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	66804515	66804719	66804617	Y	MEIS1	AC007392.3	NA	NA	NA	NA	AC007392.3	5353	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	66804720	66805040	66804911	Y	NA	AC007392.3	NA	NA	NA	NA	AC007392.3	5558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	66805277	66805644	66805568	Y	MEIS1	AC007392.3	NA	NA	NA	NA	AC007392.3	6115	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	67067097	67067512	67067390	Y	NA	NA	LOC644838,MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC007392.3	267935	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	67486839	67487275	67486977	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838,C1D	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	135176	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	5.38870397067673
chr2	67751414	67751623	67751484	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	128963	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	67878004	67878254	67878218	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	AC010987.6	172440	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	67883850	67884178	67884174	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC010987.6	166516	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	67898821	67899162	67898930	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1	IMR90	Hi-C	24141950	AC010987.6	151532	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	69663778	69663884	69663817	Y	AAK1	NFU1	NA	NA	NA	NA	NFU1	1018	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	69857892	69858266	69858093	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	11291	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	70296121	70296604	70296392	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	15981	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	70346022	70346119	70346054	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	18339	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	70350372	70350687	70350608	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	22689	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	72012191	72012365	72012276	Y	NA	NA	DYSF	IMR90	Hi-C	24141950	DYSF	333339	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr2	72058319	72058599	72058494	Y	NA	NA	EXOC6B,DYSF,CYP26B1	IMR90	Hi-C	24141950	CYP26B1	314568	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	CYP26B1	451	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.42917525406701
chr2	72980109	72980387	72980306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	70783	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	74259703	74260366	74260024	Y	NA	AC073046.25,TET3	TET3,ACTG2,BOLA3	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	31863	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	74446656	74447054	74446868	Y	NA	MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MTHFD2	22967	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	2975710	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	81820947	81821308	81821128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	2863861	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	83058262	83058376	83058322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	1626793	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	85993562	85993638	85993601	Y	NA	RNU1-38P,ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	17095	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	85997454	85997768	85997517	Y	NA	RNU1-38P,ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	20987	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	86030361	86030633	86030487	Y	SH2D6	NA	LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ATOH8	53894	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	86113603	86114063	86113862	Y	CAPG,GNLY,ST3GAL5	ST3GAL5	LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	74	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	86224309	86224458	86224357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	106820	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	86225018	86225303	86225260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105975	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	SNORD94,IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	SNORD94	27224	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	86761300	86761347	86761323	Y	REEP1,REEP1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF103	87642	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	87019569	87019949	87019758	Y	CD8B,CD8A,CD8A	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP3,RNF103-CHMP3	73324	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	91759872	91760090	91759934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2770710	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	96782666	96782871	96782861	Y	NA	DUSP2	NA	NA	NA	NA	DUSP2	26308	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	96829653	96829922	96829703	Y	KIAA1310,ITPRIPL1,ITPRIPL1,ARID5A,DUSP2	DUSP2,STARD7	NA	NA	NA	NA	DUSP2	20474	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	97012594	97012961	97012778	Y	ASTL	SNRNP200,AC021188.4,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	13069	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	99551773	99552038	99551906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf15	203910	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	99792031	99792038	99792035	Y	NA	C2orf15,LIPT1,TSGA10,MITD1,MRPL30	NA	NA	NA	NA	MITD1	3483	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	29250	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	28407	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	102952325	102952611	102952473	Y	IL1RL1,IL18R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R1	273321	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	108841436	108841459	108841449	Y	NA	NA	SULT1C2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GCC2	221558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	109206329	109206788	109206425	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	57472	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	109209973	109210484	109210252	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61116	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	109229262	109229375	109229308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	80405	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	109506497	109506716	109506551	Y	LIMS1,CCDC138,EDAR	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	105284	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	109872122	109872341	109872247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	470909	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	112790755	112791066	112790965	Y	NA	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	19734	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	113292630	113292957	113292832	Y	IL1A	POLR1B,CHCHD5	NA	NA	NA	NA	POLR1B	4535	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	113448603	113448987	113448785	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	47169	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	48605	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr2	113847761	113847860	113847813	Y	IL1A,IL1B,IL37,IL36G,CBWD2,IL36B,IL1F10,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	119239	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	113969874	113970195	113970111	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	2775	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	114039556	114039944	114039632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	72457	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr2	114132430	114132930	114132660	Y	IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2	NA	PAX8,IL1RN,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	165331	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	114457868	114458149	114458009	Y	ACTR3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	54251	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	118982588	118982758	118982695	Y	NA	NA	EN1	IMR90	Hi-C	24141950	INSIG2	138560	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	121495235	121495636	121495561	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4036	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	122313325	122313599	122313462	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	26868	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	122405703	122406017	122405860	Y	NA	CLASP1,NIFK-AS1	NA	NA	NA	NA	NIFK-AS1	477	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	LIMS2,SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	128761594	128761964	128761779	Y	NA	SAP130	NA	NA	NA	NA	SAP130	21730	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	136217422	136217690	136217556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	69116	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	136242341	136242686	136242514	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	44120	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr2	136314098	136314477	136314288	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	R3HDM1	27073	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	143628214	143628759	143628425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	1459376	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	149566291	149566547	149566419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	64272	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	149925246	149925613	149925433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	294427	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	152356804	152357129	152357077	Y	NEB	NA	NA	NA	NA	NA	RIF1	92407	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	152789657	152790028	152790018	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	106651	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	153362104	153362315	153362141	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	172353	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	662369	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	158970320	158970633	158970479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	239946	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	162095171	162095411	162095272	Y	TBR1,SLC4A10	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD14	67138	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	166161416	166161745	166161474	Y	SCN2A,SCN2A	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	646608	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	166671246	166671486	166671366	Y	CSRNP3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	136867	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	167070669	167070978	167070814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN9A	159525	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	167269953	167270071	167269980	Y	NA	SCN9A	NA	NA	NA	NA	SCN9A	39450	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	168263159	168263570	168263327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	115478	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	168977927	168978148	168978038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	124503	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	168994093	168994243	168994234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	108408	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	169219824	169220222	169219967	Y	NA	NA	CERS6	Islet	4C	24413736	CERS6	90150	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	173064305	173064723	173064396	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	98677	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	175762241	175762347	175762322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	179736	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	179866335	179866441	179866388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	261076	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	180044911	180045098	180045020	Y	SESTD1	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	82419	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	180123713	180123938	180123827	Y	NA	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	3579	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	186638782	186639016	186638929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	709867	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	186785756	186786079	186786020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	562804	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	188340607	188340894	188340852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI	87593	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	191406346	191406617	191406448	Y	NA	TMEM194B	INPP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194B	8898	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	191416774	191417126	191416837	Y	MFSD6,TMEM194B	TMEM194B	NA	NA	NA	NA	TMEM194B	19326	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	191512036	191512188	191512066	Y	INPP1,STAT1,GLS,NAB1	NAB1	NA	NA	NA	NA	NAB1	2564	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	191991210	191991392	191991306	Y	STAT4	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	107524	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	192059001	192059141	192059071	Y	STAT4	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90	Hi-C	24141950	MYO1B	48770	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	196018640	196018983	196018812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC064834.1	292273	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	196278119	196278504	196278172	Y	NA	AC064834.1	SLC39A10	IMR90	Hi-C	24141950	AC064834.1	32752	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	196336170	196336186	196336178	Y	NA	AC064834.1	SLC39A10	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC064834.1	24914	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	196547563	196547821	196547646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	108862	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	197686451	197686687	197686569	Y	PGAP1,C2orf66	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	24002	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	200328214	200328741	200328463	Y	SATB2,SATB2,SATB2	NA	NA	NA	NA	NA	FTCDNL1	385155	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	200675242	200675584	200675389	Y	NA	FTCDNL1	NA	NA	NA	NA	FTCDNL1	38312	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	201268506	201268867	201268734	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	99902	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10	NA	NA	NA	NA	CASP10	32977	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	210580281	210580584	210580403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPE	284705	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	211413660	211414008	211413843	Y	ACADL,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	73284	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	212361261	212361269	212361265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC013404.1	199347	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	213352343	213352729	213352575	Y	NA	ERBB4	NA	NA	NA	NA	ERBB4	48836	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	213402193	213402489	213402443	Y	NA	ERBB4	NA	NA	NA	NA	ERBB4	628	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	214943255	214943270	214943263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BARD1	729158	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	216216233	216216482	216216439	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	41693	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	216489283	216489494	216489351	Y	FN1	NA	NA	NA	NA	NA	FN1	190388	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	217180784	217180970	217180877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH4	53780	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	217357637	217357999	217357758	Y	NA	RPL37A,AC098820.3	RPL37A	IMR90	Hi-C	24141950	RPL37A	2913	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	IGFBP5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	937	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	217557565	217558269	217557956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	217561099	217561345	217561263	Y	NA	IGFBP5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	2851	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr2	218142226	218142611	218142295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNP1	419439	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	218258363	218258761	218258688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	360555	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	218261138	218261287	218261221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	358029	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	218754028	218754172	218754100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	134712	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	36595	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	37503	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	219994287	219994651	219994407	Y	NA	NHEJ1,FAM134A,CNPPD1	NA	NA	NA	NA	NHEJ1	28936	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	222503214	222503315	222503298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	1015741	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	FARSB	691645	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	224564336	224564481	224564409	Y	NA	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	99115	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	228018054	228018265	228018160	Y	COL4A4	NA	NA	NA	NA	NA	MFF	169602	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	228717939	228718338	228718141	Y	NA	CCL20	WDR69	IMR90	Hi-C	24141950	CCL20	41381	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	228728073	228728272	228728126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL20	51515	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	230008208	230008295	230008257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNER	568979	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	230106282	230106638	230106611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNER	470636	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	231479752	231479888	231479843	Y	GPR55,SP110,SP140	NA	CAB39,SP140,FBXO36,SLC16A14,SP110,SP140L,SP100,ITM2C,SPATA3,LOC348761,LOC151475	IMR90	Hi-C	24141950	CAB39	95672	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	231881922	231882293	231882183	Y	ITM2C	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	37285	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	232106599	232106881	232106746	Y	B3GNT7	ARMC9,AC018738.2	NA	NA	NA	NA	AC018738.2	11929	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	232276597	232276762	232276665	Y	B3GNT7	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	46389	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	45708	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	232330093	232330255	232330170	Y	NA	SNORD82,NCL,LINC00471	NA	NA	NA	NA	SNORD82	6942	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	10.0425846726248
chr2	232470282	232470477	232470427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	93232	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	232505425	232505799	232505482	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	63806	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr2	232536483	232536778	232536606	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32827	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	232537231	232537488	232537452	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32117	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr2	232551717	232552221	232552147	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	17384	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	234357256	234357513	234357369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	96103	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	234882556	234882776	234882660	Y	TRPM8	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM8	58513	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr2	235166155	235166362	235166255	Y	NA	NA	SH3BP4,TRPM8,ARL4C,AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	SPP2	208832	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	235400661	235400783	235400733	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	2914	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	508840	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	238116338	238116655	238116516	Y	COL6A3	NA	MLPH,COL6A3	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	123878	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	238320410	238321055	238320789	Y	COL6A3	AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	AC112721.2	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC112721.2	41676	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	238384383	238384688	238384583	Y	LRRFIP1	AC112721.2	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC112721.2	42918	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	238968617	238969014	238968782	Y	NA	SCLY	NA	NA	NA	NA	SCLY	1087	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	239129575	239129683	239129630	Y	NA	ILKAP,HES6	NA	NA	NA	NA	HES6	17620	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	240854377	240854983	240854483	Y	NA	NA	LOC150935,MIR4786	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA10	107836	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr2	241395144	241395496	241395485	Y	NA	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	22056	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	241771658	241772038	241771862	Y	KIF1A	KIF1A	ANKMY1,RNPEPL1,CAPN10,KIF1A,C2orf54,SNED1,PASK,HDLBP,ANO7,PPP1R7	IMR90	Hi-C	24141950	KIF1A	13933	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	290991	291448	291293	Y	C20orf54	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	12759	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	1083260	1083345	1083304	Y	SCRT2	PSMF1	RSPO4	IMR90	Hi-C	24141950	PSMF1	8561	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	1119535	1119804	1119673	Y	NA	PSMF1	NA	NA	NA	NA	PSMF1	27629	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	1757222	1757297	1757260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115857	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	1790289	1790734	1790591	Y	NA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	82420	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr20	1792448	1792844	1792660	Y	NA	NA	STK35,SIRPA,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	80310	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	1800031	1800157	1800132	Y	SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	STK35,SIRPA,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	72997	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	1800783	1800896	1800815	Y	SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	72258	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	1808617	1808803	1808717	Y	PDYN,SIRPA,SIRPA,SIRPA,PDYN,PDYN	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	64351	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	1809297	1809437	1809336	Y	SDCBP2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	63717	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr20	1873360	1873375	1873370	Y	NA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	206	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	2964753	2965068	2964761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS26	59523	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	3411453	3411609	3411534	Y	C20orf194,PANK2	C20orf194,ATRN	ATRN,C20orf194	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf194	25181	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	4148418	4148828	4148571	Y	NA	SMOX	NA	NA	NA	NA	SMOX	48791	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	9610576	9610880	9610788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	801990	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	10307719	10307737	10307728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	105133	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	12578364	12578389	12578377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	708993	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	19194656	19195454	19194994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	540898	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	19323791	19324082	19323937	Y	SLC24A3	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	412270	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	19837391	19837690	19837414	Y	NA	RIN2	RIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RIN2	27475	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	25273617	25273934	25273643	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	46912	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	25842208	25842444	25842317	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF337	166731	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.67411634364322
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr20	30700574	30701059	30700820	Y	HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	5265	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	31045263	31045487	31045417	Y	KIF3B	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	101108	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr20	31373290	31373636	31373312	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B,MAPRE1	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	25099	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	31560072	31560429	31560192	Y	CDK5RAP1	NA	NA	NA	NA	NA	BPIFB4	105021	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	31872886	31873050	31872953	Y	BPIL1,PLUNC,C20orf114	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP1	114317	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr20	33646463	33646512	33646488	Y	TP53INP2,MYH7B	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	32162	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	CPNE1,RBM12	33318	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	34790985	34791133	34791034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	101125	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	35172533	35172668	35172598	Y	MYL9	MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2	NA	NA	NA	NA	MYL9	4646	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	36693519	36693713	36693616	Y	RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	33571	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	42698854	42699347	42699086	Y	C20orf111	NA	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	138253	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK4	96875	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	43876988	43877346	43877094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC4	97718	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	45944502	45944683	45944617	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	34622	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	16091	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	47378011	47378278	47378155	Y	STAU1,PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	64142	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	48809447	48810205	48810164	Y	B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	4071	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	48865015	48865181	48865091	Y	NA	NA	PTPN1,CEBPB,FAM65C,MIR645,LOC284751,PARD6B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	59639	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	49282822	49283060	49282941	Y	NA	FAM65C	PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,ADNP,MIR645	IMR90	Hi-C	24141950	FAM65C	23005	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr20	49286898	49287066	49286958	Y	NA	FAM65C	PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,EYA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM65C	18999	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	49306526	49306915	49306601	Y	NA	FAM65C,PARD6B	PARD6B,PTPN1,EYA2,MIR645	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM65C	461	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	49341306	49341865	49341532	Y	NA	FAM65C,PARD6B	NCOA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARD6B	4216	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	49345638	49345902	49345710	Y	MOCS3,PARD6B	FAM65C,PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	FAM65C,PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	49378032	49378227	49378094	Y	PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	31204	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	49406894	49407134	49407016	Y	NA	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	2297	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	49430215	49430240	49430227	Y	PARD6B,BCAS4,ADNP	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	20784	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	ADNP	NA	NA	NA	NA	ADNP	29532	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	21252	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	49943865	49944229	49943998	Y	NA	NA	KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	306199	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	50361169	50361338	50361278	Y	NA	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	12097	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52195343	52195714	52195527	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	28732	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr20	52213211	52213282	52213247	Y	NA	ZNF217	BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	11164	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52238141	52238435	52238216	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	13695	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52238527	52238650	52238555	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	14081	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr20	52294676	52294905	52294769	Y	NA	NA	BMP7,SUMO1P1,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	70230	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr20	52353948	52354213	52354172	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	129502	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr20	52367753	52368082	52368002	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	143307	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52374184	52374569	52374228	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	149738	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr20	52390351	52390640	52390407	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	165905	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52407558	52407732	52407573	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	183112	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52445043	52445455	52445100	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220597	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr20	52446362	52446831	52446771	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221916	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52480421	52480878	52480693	Y	ZNF217,PFDN4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	255975	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr20	52489475	52489586	52489523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	265029	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr20	52514730	52515023	52514955	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	290284	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr20	52516053	52516507	52516332	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	291607	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr20	52516990	52517464	52517242	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	292544	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52530834	52531236	52530898	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	291150	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	289497	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52533564	52534521	52533763	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	287865	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.42917525406701
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	278815	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	52565886	52566139	52565988	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	256247	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	NA	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	81749	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	56156805	56157077	56157010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P1	94722	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	56157531	56157671	56157617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P1	95448	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	56592321	56592469	56592395	Y	PMEPA1,PMEPA1	NA	ZBP1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP4R1L	290026	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	57032377	57032636	57032571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APCDD1L	55551	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	57228113	57228577	57228221	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	3623	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	57734969	57735118	57735019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	119005	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	57735475	57736078	57735576	Y	TUBB1,ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	119511	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr20	57738628	57739096	57738774	Y	ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	122664	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr20	57975904	57976026	57975986	Y	EDN3	NA	NA	NA	NA	NA	EDN3	102422	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	58402426	58402798	58402570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	103912	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	58621223	58621546	58621377	Y	PHACTR3,PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	RP5-1043L13.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	39349	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	58803424	58803657	58803451	Y	PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	142529	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	59619863	59620113	59619933	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	958968	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	60500389	60500694	60500636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	138172	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	60943690	60943839	60943760	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3322	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR,COL9A3	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	61903396	61903541	61903451	Y	NKAIN4	ARFGAP1	NA	NA	NA	NA	ARFGAP1	1259	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	62466212	62466776	62466445	Y	OPRL1,ABHD16B	ZBTB46,TPD52L2	PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,ABHD16B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBTB46	5615	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr20	62478016	62478296	62478069	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	16300	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	16129964	16130277	16130229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	376159	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	17399872	17399882	17399877	Y	NA	LINC00478	NA	NA	NA	NA	LINC00478	40960	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	17568022	17568137	17568068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	86952	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	17652343	17653123	17652644	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	1966	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr21	17672058	17672352	17672205	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	16969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	17678130	17678559	17678221	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	23041	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	17681993	17682347	17682285	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	26904	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	17745935	17746301	17746052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	90846	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	17882685	17882787	17882770	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	27356	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	17906222	17906467	17906345	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	3676	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	2257	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr21	17958916	17959192	17958984	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	48773	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	28105063	28105410	28105236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001597.1	341109	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	32560711	32560765	32560739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	368793	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	34746472	34746562	34746528	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	26640	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	34836293	34836479	34836379	Y	OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B	TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	13839	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	35574029	35574459	35574413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	130159	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr21	38349168	38349478	38349323	Y	TTC3,DYRK1A,HLCS	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	HLCS	11058	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	38629602	38630247	38630025	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	8015	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr21	41048329	41048488	41048408	Y	SH3BGR	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BGR	232548	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91551	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91066	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	45146832	45147391	45147298	Y	NA	PDXK,CSTB	NA	NA	NA	NA	PDXK	9857	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	C21orf90	NA	NA	NA	NA	C21orf90	8679	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr21	46738832	46739011	46738964	Y	COL18A1	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	33019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	46740711	46740979	46740801	Y	NA	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	34898	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	46742697	46743154	46742972	Y	NA	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	36884	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr21	47637534	47637799	47637667	Y	NA	LSS,MCM3AP-AS1	NA	NA	NA	NA	LSS	8939	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	18155331	18155602	18155421	Y	NA	ATP6V1E1,BCL2L13	NA	NA	NA	NA	BCL2L13	45710	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr22	19331396	19331535	19331466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	54157	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	19433007	19433028	19433018	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	196	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L,AC000078.5	NA	NA	NA	NA	AC000078.5	3125	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	19874514	19874924	19874610	Y	TRMT2A,C22orf29,GNB1L	C22orf29,GNB1L,AC000078.5	GNB1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC000078.5	1702	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	19983308	19983423	19983389	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	18908	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr22	22098382	22098623	22098439	Y	NA	YPEL1	NA	NA	NA	NA	YPEL1	10259	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	23863249	23863551	23863355	Y	NA	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	120336	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr22	23869031	23869208	23869053	Y	NA	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	126118	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.16399852279565
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	25082452	25082825	25082629	Y	ADORA2A,GGT1	NA	PIWIL3	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	95277	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM211B	361556	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	25352141	25352414	25352278	Y	NA	NA	KIAA1671,SGSM1,TMEM211	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	364966	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	25373601	25373706	25373654	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	386426	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	27536268	27536462	27536385	Y	NA	NA	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	254757	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	27546587	27546928	27546691	Y	NA	NA	MIAT,ZNF217,MN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	RP1-40G4P.1	265076	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	28261904	28262359	28262203	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	51005	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	28549378	28549438	28549411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	235256	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	29280564	29280869	29280661	Y	NA	ZNRF3	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	2984	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	30018031	30018407	30018261	Y	NF2	NIPSNAP1,NF2	NA	NA	NA	NA	NF2	20486	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr22	30621962	30622192	30622089	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	18648	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr22	30630812	30631583	30630975	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	9257	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr22	30643780	30644513	30644215	Y	GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	2940	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	5.38870397067673
chr22	30646485	30646883	30646861	Y	SEC14L2,RNF215,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	5645	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	30647782	30648063	30647863	Y	SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	6942	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	8356	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr22	30650339	30650644	30650477	Y	LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	9499	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr22	30652191	30652351	30652329	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11351	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	6.36846832898159
chr22	31343097	31343477	31343430	Y	NA	TUG1	NA	NA	NA	NA	TUG1	21186	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	31639418	31639541	31639442	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33193	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	31639719	31639839	31639804	Y	LIMK2	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33494	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	31639861	31640267	31640177	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33636	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	34055725	34056096	34055879	Y	NA	SNORA76	NA	NA	NA	NA	SNORA76	42810	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	35771173	35771320	35771248	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	TOM1,MCM5,HMOX1,RASD2,MB,APOL6,APOL5,RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	HMOX1	3034	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	35842495	35842590	35842543	Y	NA	MCM5	NA	NA	NA	NA	MCM5	48439	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	35983528	35983815	35983759	Y	NA	RASD2,MB	NA	NA	NA	NA	MB	48183	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	MB	117673	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	36765300	36765605	36765487	Y	APOL3,NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	16458	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	37714418	37714696	37714539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	239758	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr22	37942978	37943343	37943114	Y	NA	CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	11111	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	38294842	38295023	38294932	Y	CARD10,CDC42EP1,SH3BP1,MICALL1	MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	4641	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	38330051	38330075	38330063	Y	NA	MICALL1,POLR2F,C22orf23	NA	NA	NA	NA	POLR2F	16539	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	39570081	39570473	39570178	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBX7	23402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	39608827	39609203	39608881	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	29553	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	39637977	39638270	39638005	Y	MGAT3,MGAT3,SUN2,SUN2,NPTXR,CBX7,SYNGR1,PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	486	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr22	39650923	39651173	39651026	Y	ATF4,SUN2,SUN2,APOBEC3A	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	12167	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	39686679	39687117	39686848	Y	NA	PDGFB,RPL3	CBX7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL3	27277	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	39693596	39693744	39693670	Y	MGAT3	RPL3	NA	NA	NA	NA	RPL3	20650	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	39695935	39696099	39695991	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	18295	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	39698105	39698354	39698234	Y	NA	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	16040	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.16399852279565
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	39705997	39706111	39706064	Y	NA	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	8283	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	40575185	40575584	40575306	Y	TNRC6B,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	74115	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	40982487	40982801	40982645	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	47905	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,MCHR1	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,MCHR1	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr22	41294862	41295130	41294948	Y	NA	ST13,XPNPEP3	NA	NA	NA	NA	XPNPEP3	43781	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	42073632	42073949	42073667	Y	TOB2	C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	8994	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	6311	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr22	46483894	46484294	46483949	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	20123	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	48185959	48186142	48186052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	160536	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	50232497	50232886	50232656	Y	TUBGCP6,BRD1,ZBED4,CRELD2	BRD1,ZBED4	ZBED4	K562	ChIA-PET	22265404	ZBED4	12604	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	50272789	50273094	50272966	Y	NA	ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	27299	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr22	50838232	50838664	50838480	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	58499	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	4870336	4870525	4870428	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	56452	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	4892426	4892911	4892721	Y	BHLHE40	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	34066	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	5030402	5030899	5030722	Y	NA	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	10756	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr3	5054958	5055470	5055112	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	35312	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr3	5058332	5058543	5058409	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	38686	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	5061219	5061509	5061357	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	41573	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	5470535	5470892	5470804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	243204	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	9050336	9050687	9050476	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	46879	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	9721492	9721576	9721535	Y	IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	MTMR14,BRPF1	NA	NA	NA	NA	MTMR14	32375	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	9995528	9995903	9995716	Y	NA	IL17RC,CRELD1,PRRT3,EMC3-AS1	NA	NA	NA	NA	PRRT3	3450	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	10402355	10402452	10402401	Y	FANCD2	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	41493	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	11632872	11633201	11633091	Y	SYN2,VGLL4	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	127019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr3	11645125	11645451	11645297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	114769	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	13111176	13111312	13111239	Y	NUP210,IQSEC1	IQSEC1	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	1305	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	13209777	13210019	13209898	Y	NA	NA	NUP210	IMR90	Hi-C	24141950	IQSEC1	97160	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	13325256	13325344	13325300	Y	NA	NA	NUP210,LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	NUP210	134465	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	ANKRD28	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	2597	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	16379697	16380223	16379925	Y	DPH3	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	74991	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr3	19648890	19649201	19649045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB5A	337370	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	27448460	27448581	27448568	Y	NA	NEK10	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	NEK10	39509	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.65388070194808
chr3	28713649	28713858	28713754	Y	ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00693	99367	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	29321469	29321877	29321696	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	996	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr3	30201103	30201223	30201162	Y	NA	NA	TGFBR2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	444771	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	7.83811486643887
chr3	30203021	30203159	30203075	Y	NA	NA	TGFBR2,GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	442835	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr3	30535531	30535813	30535695	Y	NA	NA	TGFBR2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	110181	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	30537430	30537491	30537435	Y	NA	NA	TGFBR2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	108503	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	30646968	30647109	30647039	Y	TGFBR2	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	974	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr3	31149741	31150063	31149903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADL1	215484	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	31737462	31737733	31737598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	165332	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	30788	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	33081513	33081785	33081661	Y	NA	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	8158	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	33086079	33086426	33086309	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	12724	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	33089398	33089551	33089467	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE,GLB1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	16043	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	33554713	33555077	33554895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	73850	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	33599519	33599564	33599543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	118656	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	36937540	36937792	36937666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	95003	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	38210566	38210752	38210690	Y	VILL,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	5986	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr3	42108875	42109165	42109003	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	55581	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	111255	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr3	46254679	46255280	46254912	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	SLC6A20,CCR1,CCR5,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	219363	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCC1	116343	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	49358291	49358883	49358713	Y	ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	17262	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	49503154	49503264	49503210	Y	NA	NICN1,DAG1	NA	NA	NA	NA	DAG1	882	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,RP11-493K19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	3192	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	1071536	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	57096152	57096374	57096203	Y	ASB14	ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	14983	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	57555554	57555589	57555572	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	PDE12	15551	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	57937235	57937402	57937348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	54725	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	57945627	57945950	57945779	Y	PDE12	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	46177	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	58400417	58400633	58400461	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	16951	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	1010436	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	61728117	61728514	61728321	Y	NA	RPL10AP6	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	1337	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	64251870	64252260	64252194	Y	NA	NA	PRICKLE2,LOC100652759	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	244212	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	67512199	67512308	67512254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	190730	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	69549148	69549545	69549320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	237041	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	388644	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	71153323	71153512	71153422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYBP	1340557	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYBP	1027780	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	71490469	71490633	71490551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYBP	1003436	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	71863099	71863325	71863212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYBP	630744	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	75472638	75472968	75472803	Y	NA	FAM86DP	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	9293	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	76544086	76544385	76544235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	62917	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	76583087	76583286	76583187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	101918	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	76778043	76778075	76778059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	296874	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	76950761	76950890	76950828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	469592	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	77239163	77239286	77239225	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	757994	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	79455772	79456088	79455911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	358877	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr3	79557050	79557111	79557081	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	257854	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	79667523	79667843	79667648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	147122	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	79674571	79674688	79674630	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	140277	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	80049303	80049456	80049382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	234338	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	80100853	80101105	80100983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	285888	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	31.1075183761793
chr3	80239226	80239506	80239338	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	424261	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	85071263	85071596	85071400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	65131	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr3	85120525	85120655	85120534	Y	CADM2	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	114393	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	85158641	85158936	85158716	Y	CADM2	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	152509	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	85318532	85318917	85318639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	312400	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	98291884	98292296	98292041	Y	OR5H6,OR5H2,CLDND1	CPOX	NA	NA	NA	NA	CPOX	18271	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	98528384	98528734	98528634	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	89799	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	98572463	98572830	98572744	Y	NA	DCBLD2	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	45703	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	99579150	99579217	99579184	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	398627	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	99587238	99587483	99587373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	390361	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	99596957	99597300	99597045	Y	TBC1D23	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	380544	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	99766371	99766625	99766459	Y	NA	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	211219	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	101637736	101637924	101637829	Y	FAM55C	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	92901	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	106984184	106984525	106984343	Y	NA	LINC00883	NA	NA	NA	NA	LINC00883	26645	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	111265245	111265633	111265405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	430224	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	1240292	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	117175008	117175053	117175027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	431463	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	117715221	117715404	117715326	Y	NA	LSAMP,RP11-384F7.2	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	782	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	120355972	120356358	120356256	Y	NA	NDUFB4	NA	NA	NA	NA	NDUFB4	42816	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	121786804	121787238	121787039	Y	HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	234774	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	123757264	123757578	123757422	Y	NA	NA	KALRN,CCDC14	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC14	78700	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	124770854	124771405	124771326	Y	HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	1397	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	126569545	126569928	126569643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	148482	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	127449073	127449115	127449094	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	59295	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-475N22.4	10465	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	129486149	129486279	129486214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	124140	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	130073130	130073578	130073320	Y	ATP2C1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R4	390095	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	136420425	136420819	136420623	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	48401	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK1	52601	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	138109159	138109469	138109274	Y	NA	MRAS	NA	NA	NA	NA	MRAS	44620	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	140960734	140961103	140960784	Y	ACPL2	ACPL2	NA	NA	NA	NA	ACPL2	15166	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	141050524	141051086	141050761	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	9469	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	141746457	141746834	141746789	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	14206	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	141833838	141834123	141833981	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	32263	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	143352573	143352896	143352700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	335744	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	145164438	145164687	145164563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P39	375839	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	149225388	149225682	149225672	Y	RNF13	RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	14941	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	149339543	149339560	149339552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	112941	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	152409592	152409745	152409669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	424248	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	156356152	156356341	156356222	Y	NA	TIPARP,TIPARP-AS1	LOC339894	IMR90	Hi-C	24141950	TIPARP	32683	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	156846039	156846735	156846192	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	29814	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	156847368	156847750	156847738	Y	NA	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	28799	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr3	156852547	156853124	156852850	Y	NA	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	23425	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	159572503	159572920	159572729	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	16853	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	160014353	160014630	160014494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	100432	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	167181640	167181820	167181812	Y	SERPINI2	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD10	268907	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	168606249	168606616	168606433	Y	NA	NA	EGFEM1P	IMR90	Hi-C	24141950	GOLIM4	794486	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	169051059	169051429	169051244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERC	429419	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	169872442	169872609	169872497	Y	NA	PHC3	NA	NA	NA	NA	PHC3	24928	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	169941070	169941418	169941334	Y	MYNN,MYNN,LRRIQ4,PHC3	PHC3,PRKCI	NA	NA	NA	NA	PRKCI	2917	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171529898	171530084	171530030	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	3158	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171592038	171592451	171592208	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	65298	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr3	171684878	171685278	171685188	Y	PLD1,FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	70140	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171693285	171693478	171693411	Y	FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	61940	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171708179	171708567	171708376	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	46851	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171789788	171790157	171789907	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	34370	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171859893	171860698	171860535	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	104475	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171927297	171927567	171927433	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	171879	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	188097	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	178786594	178786786	178786690	Y	NA	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1281	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	182550667	182550775	182550721	Y	ATP11B	ATP11B	NA	NA	NA	NA	ATP11B	41379	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	183098974	183099227	183099069	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	MCF2L2	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	45339	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	187980692	187981197	187980748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	110847	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	114412	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	187988232	187988684	187988401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	118387	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	188017658	188018009	188017791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	147813	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	188035801	188035961	188035890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	165956	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	188475500	188475699	188475599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	605655	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	188506419	188506821	188506595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	636574	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	188658561	188658620	188658591	Y	NA	NA	LPP,LPP-AS2,BCL6,LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	LPP-AS2	788716	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	193993457	193993565	193993509	Y	NA	NA	LOC647323,LOC100131551	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC15	94907	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	194022185	194022450	194022442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC15	66022	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	47562	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	90614	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	162657	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	196000563	196000815	196000680	Y	NA	PCYT1A,TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	12013	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	196694427	196694825	196694642	Y	NA	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	496	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	51618	52013	51955	Y	NA	ZNF595	NA	NA	NA	NA	ZNF595	439	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	1339085	1339471	1339276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57446	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	1865990	1866293	1866178	Y	NA	LETM1,WHSC1	LETM1,WHSC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WHSC1	4858	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	7251	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr4	2814764	2815186	2815021	Y	NA	SH3BP2,ADD1	NA	NA	NA	NA	SH3BP2	22014	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	3228357	3228568	3228469	Y	SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	64187	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr4	6171393	6171654	6171618	Y	CRMP1	NA	NA	NA	NA	NA	WFS1	97922	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	6592942	6593078	6593012	Y	NA	PPP2R2C,MAN2B2,MRFAP1	NA	NA	NA	NA	MAN2B2	18040	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	7972368	7972631	7972565	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	32715	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPZ	562368	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	9693091	9693174	9693121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR1	423399	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	20521707	20522059	20521739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	173846	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	21862980	21863295	21863138	Y	KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	652382	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	22363170	22363219	22363195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	152458	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	25536997	25537326	25537166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC34A2	117597	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr4	25554656	25554918	25554808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC34A2	100005	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.8988217915243
chr4	25658653	25659023	25658860	Y	SLC34A2,SLC34A2	SLC34A2,RP11-302F12.1	NA	NA	NA	NA	SLC34A2	3730	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	25868469	25868747	25868610	Y	NA	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	5087	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	27362567	27362929	27362697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	502346	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	36183139	36183486	36183313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	1502512	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	37956443	37956472	37956456	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	3584	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	38735219	38735515	38735398	Y	NA	NA	KLF3,TBC1D1,FLJ13197	IMR90	Hi-C	24141950	KLF3	71402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	48195485	48195896	48195611	Y	SLAIN2	NA	NA	NA	NA	NA	TEC	73985	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	RASL11B	NA	NA	NA	NA	RASL11B	383	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	54771921	54772318	54772120	Y	NA	NA	FIP1L1,LNX1,SCFD2,RPL21P44,CHIC2,GSX2,PDGFRA	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	156539	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr4	54798924	54799227	54799060	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,LNX1,RPL21P44,FIP1L1,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	129630	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	54825725	54826062	54825894	Y	GSX2	NA	RPL21P44,SCFD2,LNX1,FIP1L1,CHIC2,GSX2,PDGFRA	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	102795	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr4	54828835	54828858	54828847	Y	NA	NA	CHIC2,SCFD2,FIP1L1,RPL21P44,PDGFRA	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	99999	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr4	54886131	54886730	54886449	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	42127	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	41.8849263175327
chr4	54890749	54890967	54890889	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	37890	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2,GSX2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2,GSX2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	GSX2	5555	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	54968962	54969096	54969029	Y	NA	CHIC2,GSX2	NA	NA	NA	NA	GSX2	5272	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	55080110	55080272	55080192	Y	CHIC2	PDGFRA	SCFD2,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2,PDGFRA	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFRA	12992	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	55093024	55093294	55093182	Y	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.40893961237187
chr4	55093767	55093987	55093860	Y	NA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	503	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	55097338	55097659	55097499	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	4074	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	61914465	61914653	61914582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	724915	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	68394565	68394648	68394607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-584P21.4	84580	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	75147835	75148186	75148011	Y	MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD2L	169944	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	79537274	79537650	79537411	Y	BMP2K	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2K	157846	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	85868944	85869302	85869263	Y	NA	WDFY3-AS2,WDFY3	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	16236	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	99984592	99984944	99984751	Y	NA	ADH5	NA	NA	NA	NA	ADH5	23008	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	102093748	102093766	102093752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP3CA	173669	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	106324406	106324791	106324687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPA2	68447	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	107920048	107920412	107920337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCK	679396	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	108758517	108758852	108758585	Y	SGMS2,SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	14798	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	113672704	113673017	113672851	Y	NA	RP11-119H12.1,RPL7AP30	NA	NA	NA	NA	RP11-119H12.1	14876	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	113852159	113852312	113852236	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	114894	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr4	120444503	120444790	120444647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	70557	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	120476359	120476426	120476393	Y	PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	102413	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	121561847	121561947	121561897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM5	280078	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	121670758	121670998	121670880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM5	171027	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	123719302	123719557	123719375	Y	FGF2	NA	FGF2,NUDT6,BBS12	IMR90	Hi-C	24141950	BBS12	67445	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	36151	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	129847015	129847068	129847042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	165404	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	140650307	140650710	140650510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	65385	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	140690476	140690707	140690592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	105554	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	140897225	140897350	140897279	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	175988	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	140967961	140968185	140967999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	105153	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr4	140970177	140970718	140970535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	102620	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	140992977	140993283	140993131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	80055	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr4	141013693	141013823	141013696	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	59515	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	141015177	141015539	141015358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	57799	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	141015706	141016341	141016156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56997	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr4	141017143	141017617	141017414	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	55721	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	141019887	141020108	141020058	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	53230	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr4	141118561	141118903	141118732	Y	NA	MAML3	MGST2,MAML3,LOC100129858,SCOC	IMR90	Hi-C	24141950	MAML3	45223	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr4	142026323	142026393	142026368	Y	RNF150	NA	NA	NA	NA	NA	RNF150	105638	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	143276364	143276478	143276442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	490107	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	145498597	145498714	145498656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHIP	66459	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	152033251	152033470	152033361	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	14526	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM160A1	82203	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	152937640	152937817	152937694	Y	FBXW7	NA	PET112	IMR90	Hi-C	24141950	PET112	257465	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	153313306	153313343	153313324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW7	141910	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	157692679	157692824	157692748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	197722	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	157718385	157718680	157718607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	171866	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr4	157860997	157861294	157861204	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	29252	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr4	157866755	157867028	157866930	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	23518	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	157867687	157867968	157867878	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22578	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	157889828	157890031	157889884	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	515	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr4	157894352	157894618	157894485	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	3806	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	158125886	158126027	158125941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRB	130677	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	158186667	158186917	158186738	Y	PDGFC,GLRB,GLRB	NA	NA	NA	NA	NA	GLRB	191458	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	19.5952871660972
chr4	159082542	159083127	159082686	Y	NA	RP11-597D13.9,FAM198B	NA	NA	NA	NA	RP11-597D13.9	6777	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	159083815	159084086	159083970	Y	NA	RP11-597D13.9,FAM198B	NA	NA	NA	NA	RP11-597D13.9	5818	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	159169271	159169555	159169414	Y	TMEM144	NA	NA	NA	NA	NA	FAM198B	76801	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	159643443	159643599	159643521	Y	FNIP2,PPID	PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	PPID	895	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	164492203	164492428	164492316	Y	NAF1,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	406130	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA3P	651653	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	165728924	165729125	165729024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA3P	133317	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	166331391	166331603	166331463	Y	C4orf39,CPE	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	51045	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	168154040	168154351	168154284	Y	SPOCK3,SPOCK3	SPOCK3	NA	NA	NA	NA	SPOCK3	93	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	168818156	168818524	168818473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60	419434	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	169375795	169375933	169375918	Y	NA	PALLD	NA	NA	NA	NA	PALLD	40284	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	184042355	184042696	184042526	Y	NA	WWC2	NA	NA	NA	NA	WWC2	23909	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	184208528	184208558	184208557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	155186	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	185331149	185331516	185331503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	62218	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	185804358	185804540	185804405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL1	58386	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr4	190285262	190285611	190285472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	343257	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP72	62474	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP13	105735	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr5	9456049	9456295	9456139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2143L24.1	445643	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P7	63616	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	10626840	10627122	10626983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	132262	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	14036813	14036909	14036843	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94161	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	14174472	14174896	14174531	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	32661	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	14199302	14199513	14199379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	57491	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	14250238	14250405	14250312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	108427	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr5	14926139	14926359	14926282	Y	NA	NA	FAM105B,ANKH,FAM105A,LOC100130744	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	56252	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	17181604	17182061	17181749	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P10	170672	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	19315150	19315342	19315248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP21	1267491	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	22669055	22669169	22669153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH12	182562	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	24595497	24595875	24595702	Y	CDH10	CDH10	NA	NA	NA	NA	CDH10	47212	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	34048471	34048803	34048799	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	42251	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	35673129	35673344	35673237	Y	SPEF2,IL7R	NA	NA	NA	NA	NA	SPEF2	57183	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	40263385	40263650	40263545	Y	NA	NA	PTGER4,TTC33	IMR90	Hi-C	24141950	TTC33	490427	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	40281597	40281809	40281703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC33	472268	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	42999523	42999876	42999700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF131	63402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	43010298	43010802	43010620	Y	GHR,ZNF131,C5orf39	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF131	52476	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	42661	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	43038627	43038828	43038720	Y	ZNF131,C5orf39	ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	24450	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	44821100	44821499	44821234	Y	NA	MRPS30	NA	NA	NA	NA	MRPS30	14073	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	310514	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	53886377	53886761	53886569	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	74788	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	54777886	54777973	54777929	Y	SKIV2L2	RNF138P1	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	46556	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	54791399	54791640	54791617	Y	NA	RNF138P1,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	32889	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	54893100	54893403	54893257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	64222	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr5	54896440	54896979	54896639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	67562	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr5	54897039	54897427	54897238	Y	IL6ST,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	68161	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr5	55597444	55597813	55597629	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	201086	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	57758033	57758252	57758173	Y	NA	PLK2	NA	NA	NA	NA	PLK2	3946	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	58186995	58187365	58187085	Y	PDE4D	NA	PDE4D	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3C	310947	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	58314415	58314788	58314579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	438367	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	58332286	58332474	58332297	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	456238	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	58395760	58396044	58395902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	519712	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	58421119	58421626	58421279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	545071	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	58422372	58422713	58422580	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	546324	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	547263	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	59173236	59173442	59173374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	608098	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	67875476	67875860	67875665	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	511613	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	72599094	72599410	72599166	Y	NA	NA	FCHO2,BTF3,FOXD1,TMEM171	IMR90	Hi-C	24141950	BTF3	192823	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	78270986	78271091	78271032	Y	NA	ARSB	NA	NA	NA	NA	ARSB	8819	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	78990549	78990790	78990669	Y	THBS4,CMYA5	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD4	84606	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	79768084	79768333	79768119	Y	NA	FAM151B,CTD-2015H6.3,RPL7P24	NA	NA	NA	NA	FAM151B	13455	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	81045433	81045821	81045530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr5	81148608	81149026	81148707	Y	SSBP2	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	3188	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	81149415	81149815	81149554	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	3995	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	81630753	81631047	81630851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23	58357	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	86524222	86524964	86524759	Y	RASA1,RASA1	RASA1	MIR4280,RASA1	IMR90	Hi-C	24141950	RASA1	36741	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	87835885	87836098	87835917	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM161B	272592	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	95063779	95063897	95063838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSK	175001	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	95406696	95406840	95406768	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	452131	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	95507678	95508048	95507916	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	350923	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB	72968	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr5	102787833	102788088	102787961	Y	NA	NA	C5orf30	IMR90	Hi-C	24141950	NUDT12	108406	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	103048573	103048840	103048666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT12	152079	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	106806041	106806198	106806107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	198398	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	106862612	106863005	106862809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	141591	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	106878561	106878904	106878854	Y	EFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	125692	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	106900103	106900354	106900202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	104242	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	106907307	106907511	106907485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97085	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	106931094	106931453	106931417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	73143	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr5	106967635	106967784	106967710	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	36812	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	109207541	109207704	109207623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	184474	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	112265559	112265904	112265733	Y	NA	REEP5,DCP2	REEP5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	REEP5	9323	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	118257403	118257748	118257576	Y	NA	PTMAP2	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	49743	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	121402997	121403353	121403172	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	SRFBP1	107341	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	131437879	131438240	131437995	Y	RAPGEF6,IRF1	NA	PDLIM4,IL3	IMR90	Hi-C	24141950	P4HA2	190768	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	131989640	131989693	131989667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF3A	81637	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AFF4	26161	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	133313011	133313350	133313119	Y	UBE2B,PPP2CA	C5orf15,VDAC1	NA	NA	NA	NA	C5orf15	10533	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	133890594	133890960	133890666	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	91519	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	6.6134094185578
chr5	137810438	137810840	137810496	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	11259	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	138325344	138325620	138325482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	281821	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	139076374	139076603	139076510	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	51490	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	139077393	139077627	139077507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	52509	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	139078128	139078514	139078502	Y	C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	53244	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	139090416	139090834	139090571	Y	MATR3,MATR3,CXXC5	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	65532	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	66056	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr5	139091629	139092020	139091912	Y	NA	NA	CXXC5,UBE2D2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CXXC5	66745	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2	NA	NA	NA	NA	ZMAT2	14336	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2	NA	NA	NA	NA	ZMAT2	22016	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	142024486	142024769	142024581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY4	320466	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	142105384	142105400	142105392	Y	FGF1	NA	ARHGAP26,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	401364	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	142693038	142693275	142693171	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	16895	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	146378574	146378711	146378699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCERG1	553700	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	149852669	149852742	149852704	Y	NA	RPS14,NDST1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	10639	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	149853688	149853975	149853788	Y	NA	RPS14,NDST1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	9406	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	149945724	149945760	149945742	Y	SYNPO,ZNF300	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	32882	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	150401918	150402484	150402308	Y	GPX3,TNIP1	NA	NA	NA	NA	NA	TNIP1	68654	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	152017704	152018012	152017858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR2	206775	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	152022104	152022437	152022374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR2	211175	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	152238072	152238143	152238108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR2	427143	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	152494885	152495216	152495051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA1	371959	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	152730391	152730628	152730512	Y	GRIA1	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA1	136547	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.67411634364322
chr5	152822087	152822411	152822258	Y	NA	GRIA1	GRIA1	IMR90	Hi-C	24141950	GRIA1	44764	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	153110203	153110493	153110348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA1	243028	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	153855980	153856061	153856023	Y	HAND1	SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	HAND1	156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	153900553	153900872	153900681	Y	NA	HAND1	NA	NA	NA	NA	HAND1	44729	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	153963327	153963532	153963423	Y	MRPL22,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	HAND1	107503	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	154274946	154275114	154275030	Y	NA	CNOT8,GEMIN5,MRPL22	NA	NA	NA	NA	CNOT8	39833	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	156911705	156911968	156911830	Y	NIPAL4,ADAM19	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM19	88815	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	157257409	157257732	157257678	Y	NA	CLINT1	NA	NA	NA	NA	CLINT1	26451	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	22663	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PWWP2A	47677	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PWWP2A	48187	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	160156032	160156411	160156222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	309203	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	165757388	165757495	165757442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P20	303072	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	167001995	167002057	167002026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.1	83429	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	167011273	167011672	167011457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.1	73814	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	167066911	167067143	167066981	Y	NA	CTB-78F1.1	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.1	18343	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	167088894	167089267	167088997	Y	NA	CTB-78F1.1	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.1	3408	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	31.8423416449079
chr5	167171330	167171561	167171437	Y	NA	CTB-78F1.2	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	24962	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	167224919	167225220	167225022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	78551	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	167259769	167260121	167259976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	113401	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	167298999	167299254	167299082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	152631	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	167320595	167320600	167320598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	174227	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr5	167372516	167372785	167372694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	226148	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr5	167439777	167440090	167439882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	276566	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	167558741	167558830	167558746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	157826	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	169398141	169398453	169398335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT3	672008	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	GABRP	127423	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	170172646	170172739	170172712	Y	NA	GABRP	NA	NA	NA	NA	GABRP	15615	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	170179191	170179549	170179383	Y	GABRP	GABRP	NA	NA	NA	NA	GABRP	8805	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	170378492	170378604	170378547	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	91618	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	171498342	171498743	171498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	66465	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	171577546	171577959	171577717	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	35431	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	172370220	172370579	172370385	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	13153	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	172881373	172881649	172881564	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	160014	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	119633	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	173237626	173237876	173237751	Y	NA	NA	BOD1	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	75407	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	174472825	174472846	174472836	Y	NA	NA	FLJ16171,DRD1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN1	429219	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	175036645	175036962	175036784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFXN1	134580	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	176421508	176421945	176421807	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6,HK3	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	25689	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	178323440	178323622	178323554	Y	NA	ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2	NA	NA	NA	NA	ZFP2	2545	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	179517331	179517686	179517646	Y	HNRNPH1,MAML1,RNF130	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	20213	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	1298118	1298254	1298186	Y	NA	NA	EXOC2,LOC285768,FOXF2	IMR90	Hi-C	24141950	EXOC2	607001	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	9108	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr6	4317088	4317563	4317434	Y	CDYL	RP3-527G5.1	RPP40,CDYL,LYRM4	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-527G5.1	27708	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	4352111	4352211	4352192	Y	CDYL	RP3-527G5.1	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-527G5.1	6840	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	4613428	4613746	4613742	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	90647	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	4717932	4718044	4717990	Y	PPP1R3G	CDYL	NA	NA	NA	NA	CDYL	13539	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	4778036	4778769	4778420	Y	CDYL	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL	73643	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	12273843	12273861	12273852	Y	NA	EDN1	HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	14735	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	12285143	12285495	12285317	Y	NA	EDN1	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	3101	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	4.16399852279565
chr6	12315136	12315383	12315260	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	26540	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	12328741	12329205	12329092	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	40145	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	12332214	12332482	12332362	Y	NA	EDN1	EDN1,TMEM170B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EDN1	43618	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	12383787	12384051	12383890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	95191	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr6	12484193	12484504	12484246	Y	EDN1	RPL15P3	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	27838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr6	12485726	12485919	12485760	Y	NA	RPL15P3	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	26423	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr6	12577591	12578036	12577836	Y	NA	NA	EDN1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	65249	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.44941089576215
chr6	12602137	12602410	12602274	Y	EDN1	NA	TMEM170B,EDN1,HIVEP1,ADTRP	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	89795	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	12602673	12603131	12602821	Y	NA	NA	TMEM170B,EDN1,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	90331	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr6	12965020	12965354	12965088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	246934	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	13455271	13455432	13455317	Y	NA	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	30462	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	13662469	13662838	13662724	Y	NA	NOL7,RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	46958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	13671877	13672171	13672102	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1,CD83	RANBP9	NOL7,SIRT5	K562	ChIA-PET	22265404	RANBP9	37625	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	14748705	14748822	14748765	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	495705	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	15061765	15062156	15061960	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	182371	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	16495109	16495178	16495163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	833820	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	17932767	17932988	17932837	Y	RNF144B,KDM1B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	52866	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	19298680	19298958	19298819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	504025	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	22148644	22148866	22148767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	556672	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	22149387	22149566	22149505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	557415	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	24698648	24698887	24698768	Y	NA	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	C6orf62	20177	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chr6	26025834	26026125	26026038	Y	BTN2A1,BTN2A1,TRIM38	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	354	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	26029019	26029363	26029242	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H3B	925	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	26522673	26522990	26522813	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	2597	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	26536966	26537248	26536997	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	333	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	27203038	27203420	27203229	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	26015	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	27205361	27205470	27205416	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	28338	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF391	39368	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	27637652	27637706	27637685	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	136003	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	28603148	28603326	28603259	Y	NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	21159	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	28822567	28822754	28822660	Y	OR2J3,OR14J1,OR2B3	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	17784	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	30182160	30182533	30182417	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2956	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	30910531	30910726	30910623	Y	NA	GTF2H4,VARS2,DPCR1	NA	NA	NA	NA	DPCR1	3782	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	32577297	32577935	32577770	Y	GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1	NA	NA	NA	NA	NA	TAP2	226622	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	33581625	33581918	33581825	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4224	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	33712309	33712484	33712432	Y	IP6K3	IP6K3,LEMD2	NA	NA	NA	NA	IP6K3	278	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	35035271	35035638	35035433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	180229	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	PXT1	591	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	37210217	37210497	37210343	Y	TMEM217,TMEM217	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	13051	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	41506487	41506686	41506561	Y	NFYA,TREML4,TREM1,TFEB	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	FOXP4	5478	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	41649853	41650127	41649990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFEB	51870	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	42280829	42281179	42280973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	97226	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	42409399	42409623	42409499	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	8166	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	43295599	43295850	43295834	Y	TJAP1	ZNF318	NA	NA	NA	NA	ZNF318	39366	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	82898	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	80166	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	44783475	44783845	44783660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	430213	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	45413515	45413853	45413708	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	69825	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P5	451885	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	52439625	52439825	52439764	Y	TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	53205102	53205427	53205266	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	6520	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	66424040	66424212	66424126	Y	EYS	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	2080315	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	73987583	73987923	73987651	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	KHDC1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398K22.12	16645	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	74785141	74785313	74785227	Y	NA	NA	COL12A1,CD109	IMR90	Hi-C	24141950	SLC17A5	423263	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr6	74861347	74861685	74861516	Y	NA	NA	COL12A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC17A5	499469	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	75791624	75791955	75791790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL12A1	121812	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	75853490	75853812	75853630	Y	COL12A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL12A1	59955	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr6	75906514	75906841	75906796	Y	NA	COL12A1	NA	NA	NA	NA	COL12A1	6926	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr6	75911376	75911573	75911562	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	2194	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr6	82854780	82854947	82854862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IBTK	100524	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	83931407	83931579	83931543	Y	UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	IMR90	Hi-C	24141950	PGM3	29752	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1,SRSF12	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	90527291	90527624	90527395	Y	NA	CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	MDN1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	90788132	90788473	90788314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	216154	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	90983807	90984597	90984358	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	20030	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	90994449	90994671	90994572	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	9956	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	91320632	91321099	91320814	Y	MAP3K7,MAP3K7	MAP3K7	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	25868	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr6	91424968	91425340	91425086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	130204	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	91655857	91655883	91655870	Y	MAP3K7,MAP3K7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	361093	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr6	91792357	91792687	91792522	Y	MAP3K7,MAP3K7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	497593	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr6	91881447	91881774	91881612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	586683	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	92009340	92009566	92009453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	714576	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	94018186	94018578	94018382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	108687	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	94443419	94443467	94443447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	316154	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	99275631	99275937	99275716	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	117912	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	105707945	105708326	105708046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREP	140633	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4IP1	61320	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	109602805	109602853	109602823	Y	NA	NA	CCDC162P	IMR90	Hi-C	24141950	CD164	98909	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	111784023	111784230	111784203	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	18484	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	118896988	118897011	118897000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP85L	132227	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	132406911	132407089	132407028	Y	NA	NA	CTGF,LOC100507254,ENPP1	IMR90,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	CTGF	136398	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	133843297	133843543	133843427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	283561	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	134863333	134863348	134863341	Y	NA	NA	LOC154092,SGK1,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	226083	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	138353138	138353418	138353320	Y	PERP	NA	PERP	MCF7	ChIA-PET	22265404	HEBP2	369250	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	140383051	140383491	140383322	Y	NA	NA	CITED2,LOC100132735	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	689294	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	140858869	140859245	140859045	Y	NA	NA	LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	1165112	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	140920515	140920620	140920568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1226758	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	140929042	140929323	140929183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1235285	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	147124877	147125201	147125102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	262048	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	149080716	149081059	149080880	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	14252	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	149376073	149376391	149376158	Y	NA	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	24364	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	149400726	149401123	149400736	Y	NA	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	49017	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	149491877	149492459	149492093	Y	NA	RP1-111D6.3,TAB2	TAB2,UST,ZC3H12D,PPIL4	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-111D6.3	44603	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	149554491	149554815	149554668	Y	ZC3H12D	RP1-111D6.3,TAB2	UST,TAB2	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	16714	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	149571086	149571460	149571281	Y	NA	RP1-111D6.3,TAB2	TAB2,PPIL4	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	33309	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr6	151373285	151373500	151373395	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	45165	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	155179611	155179904	155179758	Y	NA	TIAM2	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	TIAM2	27780	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	155443662	155443674	155443667	Y	TIAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TFB1M	189953	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	43210	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr6	157162870	157163071	157163026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	65807	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr6	158439513	158439767	158439649	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	38625	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	159476148	159476442	159476248	Y	TAGAP	NA	TAGAP	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	56929	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	159862041	159862452	159862257	Y	NA	NA	FNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC1	273612	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr6	159882331	159882470	159882428	Y	NA	NA	FNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	WTAP	262147	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr6	160395204	160395414	160395271	Y	SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	7073	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	160409606	160409719	160409663	Y	IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	21475	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	161549553	161550030	161549828	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	138794	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	161796504	161796762	161796717	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	103411	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	161829346	161829532	161829475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	136253	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	161838884	161839117	161839007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	145791	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	161843779	161844082	161843863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	150686	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	161855973	161856365	161856002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	162880	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	161864912	161865081	161864974	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	171819	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	161865712	161865782	161865740	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	172619	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	163784160	163784198	163784179	Y	NA	CAHM,QKI	PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	CAHM	48794	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	CAHM,QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	790893	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	169986941	169987258	169987132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR27	112901	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	170203615	170204008	170203729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCTE3	53960	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	170654095	170654292	170654195	Y	FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	56304	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr6	170692180	170692479	170692329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	94389	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	1013884	1014155	1013955	Y	NA	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	COX19	649	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	1066965	1067028	1066969	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	15184	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	1416814	1417157	1416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	79981	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	1546424	1546775	1546565	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2935	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	2960647	2961036	2960906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	78689	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	5571351	5571818	5571666	Y	WIPI2,ACTB	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	19922	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr7	5733172	5733453	5733321	Y	CCZ1,USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	85917	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr7	7759003	7759285	7759121	Y	NA	RPA3,RPL23AP51	NA	NA	NA	NA	RPA3	2765	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	8465802	8466184	8465978	Y	NA	NXPH1	NA	NA	NA	NA	NXPH1	5401	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	7.34823268728644
chr7	8482629	8482725	8482675	Y	NXPH1	NXPH1	NA	NA	NA	NA	NXPH1	11044	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	8530046	8530057	8530051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH1	58461	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr7	8547057	8547266	8547162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH1	75472	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH1	78888	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	8663784	8663976	8663856	Y	NXPH1	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH1	192199	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	8667021	8667341	8667088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH1	195436	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	11089099	11089199	11089149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF14	77600	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	13553275	13553295	13553283	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	475755	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	15957269	15957287	15957277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEOX2	232832	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	17446496	17446663	17446580	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	110250	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	17664691	17664931	17664811	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	313193	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	19024350	19024628	19024489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	722082	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	21502446	21502711	21502550	Y	SP4	SP4	NA	NA	NA	NA	SP4	36794	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P6	419301	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	392403	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	25886406	25886699	25886443	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA3,HOXA4,SKAP2	IMR90	Hi-C	24141950	NFE2L3	303161	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	26317891	26318244	26318068	Y	NA	AC010677.5,SNX10	HNRNPA2B1,CBX3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AC010677.5	4076	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	26477083	26477150	26477118	Y	CBX3	NA	NA	NA	NA	NA	SNX10	147542	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	27231816	27231998	27231907	Y	HOXA10,HOXA11,HOXA13	HOXA6,HOXA7	NA	NA	NA	NA	HOXA7	36261	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	28192724	28193110	28193000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAX1BP1	415774	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	33316298	33316594	33316442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	149442	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	36323214	36323703	36323368	Y	AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	ANLN	103712	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	44679392	44679514	44679453	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	35221	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	45595486	45595825	45595527	Y	NA	ADCY1	NA	NA	NA	NA	ADCY1	15914	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	46184955	46185274	46185142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	225482	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	46186122	46186484	46186177	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	226649	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	227039	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	47575600	47575737	47575669	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	44419	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	47575953	47576318	47576309	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	43838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	47604317	47604552	47604435	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	15604	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	5.63364506025294
chr7	47797544	47797859	47797606	Y	NA	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	35030	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr7	47823605	47823820	47823740	Y	TNS3	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	9069	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	6293	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	56173322	56173423	56173410	Y	NA	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1053	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	56243524	56243790	56243559	Y	LOC389493	RP4-725G10.3	NA	NA	NA	NA	RP4-725G10.3	14686	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	57471842	57471971	57471867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP12	202538	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	61968807	61969730	61969008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-340I6.8	1389471	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	63767130	63767234	63767166	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1293	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	66897123	66897210	66897167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	131229	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	WBSCR22	32741	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	73641053	73641366	73641100	Y	LIMK1,LAT2	RFC2	NA	NA	NA	NA	RFC2	25408	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	74050043	74050194	74050049	Y	GTF2IRD2B	GTF2I	GTF2IRD1,GTF2I	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTF2I	19800	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr7	74074203	74074528	74074318	Y	LAT2,GTF2I	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	4209	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr7	75833146	75833486	75833315	Y	NA	SRRM3	NA	NA	NA	NA	SRRM3	3930	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	83866816	83867276	83866988	Y	NA	NA	SEMA3A,SEMA3D	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3A	252764	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	128617	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	91456025	91456190	91456079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERF	51844	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	94022848	94022915	94022881	Y	NA	COL1A2	NA	NA	NA	NA	COL1A2	975	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr7	100761754	100762006	100761835	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	6364	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr7	101609189	101609564	101609377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	152230	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72659	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	104607797	104607862	104607830	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	43629	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	104854124	104854334	104854271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	183421	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	104992589	104992852	104992773	Y	NA	SRPK2	NA	NA	NA	NA	SRPK2	44903	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	105041443	105041755	105041449	Y	NA	SRPK2	SRPK2,PUS7	IMR90	Hi-C	24141950	SRPK2	3688	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	105447842	105448108	105447962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	66942	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	105705488	105705603	105705542	Y	NA	SYPL1	ATXN7L1,SYPL1,CDHR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	45419	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	105714190	105714395	105714300	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	36627	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr7	107562078	107562130	107562088	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	32663	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	107644827	107645024	107644950	Y	LAMB1	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	3127	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	108139925	108140311	108140116	Y	PNPLA8,DNAJB9	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	44764	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	116651956	116652355	116652105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	59568	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	127455662	127455822	127455742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SND1	165428	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	174034	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	ATP6V1F	32371	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	130583676	130584341	130584164	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	11728	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	130696655	130697004	130696978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95851	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	131304608	131304982	131304803	Y	NA	NA	PODXL	MCF7	ChIA-PET	22265404	PODXL	63632	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	131314351	131314532	131314442	Y	NA	NA	PODXL,MKLN1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PODXL	73375	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr7	132106504	132106703	132106622	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	658145	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	133148039	133148314	133148177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	212210	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	287892	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	135430585	135430983	135430863	Y	FAM180A	SLC13A4,FAM180A	NA	NA	NA	NA	FAM180A	611	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	SLC13A4,FAM180A	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	11846	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	135446640	135446883	135446777	Y	FAM180A	SLC13A4,FAM180A	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	15046	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	137573369	137573542	137573460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	111271	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	139553792	139554214	139553890	Y	NA	NA	PARP12	IMR90	Hi-C	24141950	HIPK2	78215	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	139615919	139616013	139615969	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	140342	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	140024684	140024714	140024699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC37A3	77519	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	141501394	141501805	141501703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	65273	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr7	148680544	148680840	148680694	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	42893	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr7	150063162	150063570	150063276	Y	GIMAP2	ZNF775	NA	NA	NA	NA	REPIN1	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	150944441	150944847	150944697	Y	ASB10,SMARCD3	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	16866	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	151386683	151387049	151386915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	171477	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	151452177	151452367	151452235	Y	SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2	119843	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	151452676	151452877	151452750	Y	SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2	119333	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	151453235	151453789	151453377	Y	SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2	118421	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr7	156792805	156792864	156792835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOM1	52388	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	157069496	157069783	157069568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	56292	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	158603982	158604371	158604316	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	16573	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr7	158656529	158657066	158657015	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	WDR60	9260	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	1750336	1750494	1750412	Y	NA	CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	19648	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	1837817	1838203	1838066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	67675	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	2530387	2530737	2530464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-57L11.1	52121	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	2591169	2591450	2591225	Y	NA	GS1-57L11.1	NA	NA	NA	NA	GS1-57L11.1	8311	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr8	8242841	8243169	8242949	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	833	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	8701542	8701893	8701762	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	47262	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	9912937	9913246	9913138	Y	NA	MSRA	NA	NA	NA	NA	MSRA	3159	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	10009702	10010057	10009864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	99924	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	10192260	10192787	10192448	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	282482	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	10193189	10193473	10193425	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	283411	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr8	10676875	10677241	10677058	Y	NA	PINX1	NA	NA	NA	NA	PINX1	18153	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	12834183	12834569	12834376	Y	KIAA1456	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF1	222601	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	16018468	16018649	16018533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	745744	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	16265487	16265655	16265571	Y	NA	NA	MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	745883	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	16318498	16318830	16318750	Y	NA	NA	MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	692708	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	16476986	16477261	16477122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	534277	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	16504194	16504460	16504327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	507078	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	16609902	16609923	16609912	Y	VPS37A	NA	TUSC3,MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	401615	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	16898778	16899115	16898947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	112423	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	20064190	20064507	20064297	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	11312	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	22103553	22103662	22103605	Y	NA	MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	POLR3D	2936	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	22408271	22408447	22408337	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	SORBS3	7772	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	23203813	23204244	23204131	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	76597	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPYSL2	62455	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	28859805	28860025	28859905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	51427	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	28886327	28886717	28886347	Y	HMBOX1,HMBOX1,DUSP4	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	24735	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	29938783	29938843	29938811	Y	NA	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	TMEM66	60	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr8	31040746	31040774	31040760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	151429	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.18423416449079
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	38313401	38313535	38313485	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	10817	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr8	40256946	40256967	40256958	Y	NA	NA	ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	247957	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	41153046	41153278	41153162	Y	NA	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	11738	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	41160567	41160649	41160637	Y	NA	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	4367	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	41628099	41628173	41628135	Y	ANK1	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT6	195393	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	41649689	41649828	41649744	Y	NKX6-3	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT6	216983	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	41851790	41851810	41851800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	55698	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	41886687	41887061	41886965	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	20447	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr8	42072486	42072556	42072531	Y	NA	PLAT	AP3M2,IKBKB	IMR90	Hi-C	24141950	PLAT	9244	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	42383718	42383741	42383730	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	11328	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	49427546	49427722	49427633	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	132396	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	53607875	53608327	53608179	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	48076	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr8	56756553	56757241	56756740	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM68	72587	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	59497301	59497891	59497607	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	33818	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr8	59722655	59722843	59722749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMAF	152252	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	60154501	60154880	60154691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMAF	584098	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	RAB2A	423074	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	RAB2A	423360	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	62427686	62427987	62427837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	197168	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	62566892	62567143	62567071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	58012	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	62634023	62634407	62634126	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	8676	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	62646245	62646286	62646251	Y	NA	ASPH,MIR4470,RP11-705O24.1	NA	NA	NA	NA	MIR4470	20898	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	AC084082.3,TRIM55	NA	NA	NA	NA	TRIM55	492	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	67042054	67042413	67042255	Y	NA	AC084082.3,TRIM55	NA	NA	NA	NA	TRIM55	4923	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	67045701	67045983	67045786	Y	NA	AC084082.3,TRIM55	NA	NA	NA	NA	TRIM55	8570	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	67054200	67054772	67054375	Y	NA	AC084082.3,TRIM55	CRH	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM55	17069	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	67055533	67055834	67055559	Y	NA	AC084082.3,TRIM55	CRH	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM55	18402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr8	67425057	67425564	67425100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf46	54819	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf46	63753	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	67434763	67435122	67434951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf46	64525	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	71522610	71523035	71522826	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	3988	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	73521032	73521314	73521060	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	397785	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	77529546	77529917	77529736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX2	381363	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	81993720	81993926	81993821	Y	PAG1	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P11	438541	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	86442499	86442766	86442633	Y	CA13	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf59	311849	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	91020764	91021152	91020912	Y	NA	DECR1,NBN	NA	NA	NA	NA	NBN	7308	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	95089628	95089913	95089904	Y	NA	NA	GEM,CDH17,RAD54B	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1247B1.1	123367	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	95222452	95222635	95222544	Y	NA	KB-1247B1.1,GEM	NA	NA	NA	NA	KB-1247B1.1	9172	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	95246535	95247070	95246768	Y	GEM	KB-1247B1.1,GEM	CDH17	IMR90	Hi-C	24141950	GEM	25508	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	96814161	96814420	96814290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDF6	356600	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	98795675	98796209	98795739	Y	NA	LAPTM4B	NA	NA	NA	NA	LAPTM4B	10390	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	99411965	99412163	99412094	Y	NIPAL2,KCNS2	KCNS2	NIPAL2,STK3,POP1,KCNS2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNS2	25087	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr8	99478821	99479039	99478921	Y	NA	KCNS2	NA	NA	NA	NA	KCNS2	41571	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	99485745	99486120	99486088	Y	NA	KCNS2	NA	NA	NA	NA	KCNS2	48495	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	99643221	99643590	99643555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNS2	205971	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	101222720	101222891	101222806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG1	54586	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81963	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chr8	101455424	101455703	101455525	Y	PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF19A	108978	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	101502356	101502514	101502451	Y	SPAG1,SPAG1	NA	RNF19A,GRHL2,SPAG1,ANKRD46	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD46	67498	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr8	101512336	101512720	101512423	Y	SPAG1,SPAG1	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD46	57292	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	102120764	102121998	102120921	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF706	94423	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	102167683	102167913	102167765	Y	NA	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	48508	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	103422542	103423104	103422992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR5	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	103597495	103597662	103597589	Y	UBR5	NA	UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1980E6.3	58527	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr8	103669922	103670289	103670129	Y	ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3792	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	103741796	103742226	103742065	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	75666	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	84763	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	72755	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	103803215	103803631	103803453	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	70897	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr8	103806867	103807011	103806958	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	67517	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr8	105349291	105349404	105349348	Y	LRP12,TM7SF4	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	249848	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	116988617	116988643	116988632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	788099	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	117529764	117530094	117529930	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	246648	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	118894000	118894167	118894051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	227925	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	119469054	119469434	119469101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P35	303006	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	128684618	128684766	128684674	Y	NA	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	60914	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	128835085	128835527	128835341	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	30306	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	128948050	128948240	128948055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	72617	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	128973364	128973763	128973565	Y	MYC	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	47094	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	128993662	128993919	128993808	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26938	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	129036981	129037022	129036995	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	16124	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	129121216	129121486	129121350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100359	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	129129719	129130040	129129840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	108862	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr8	130279904	130280064	130280038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	410421	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	130284402	130285105	130284786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	405380	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	130461810	130462206	130462131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	228279	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr8	130548053	130548359	130548185	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	142126	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	130573431	130573829	130573545	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	116656	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	130604361	130604767	130604632	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	85718	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	130702467	130702491	130702479	Y	NA	CCDC26	PVT1,MYC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC26	11982	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	CCDC26	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	29856	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	131114299	131114376	131114317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	86924	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	131289962	131290145	131290029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	163761	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	131495645	131495684	131495664	Y	NA	ASAP1	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	41739	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	131540584	131540868	131540737	Y	NA	NA	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	86678	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	134315401	134315895	134315622	Y	ST3GAL1	NA	TG,NDRG1,ST3GAL1	IMR90	Hi-C	24141950	PHF20L1	529783	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	134572976	134573374	134573175	Y	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	787358	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr8	136587606	136587905	136587756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	119906	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	140716297	140716707	140716660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	749971	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr8	140830815	140831120	140830968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	635558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	141179581	141179847	141179769	Y	EIF2C2,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	286831	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr8	141604721	141605198	141605144	Y	EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	85324	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	141725005	141725293	141725149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	205608	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	141945462	141945818	141945641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	64497	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	142046833	142047172	142047003	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	36518	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr8	142047873	142048201	142048171	Y	PTK2	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	37558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr8	142084181	142084412	142084295	Y	PTK2	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	40965	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	142247795	142248221	142248078	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	68183	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	144106773	144106936	144106849	Y	NA	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	9374	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	144112654	144112974	144112830	Y	CYP11B2	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	15255	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,FAM83H	NA	NA	NA	NA	FAM83H	14534	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	NRBP2	26228	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	144959402	144959607	144959478	Y	C8orf73,MAPK15,EPPK1	PUF60,NRBP2	PLEC,NRBP2,PUF60	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRBP2	37202	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	GRINA	NA	NA	NA	NA	GRINA	35424	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr8	145863462	145863727	145863548	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,LRRC14,RECQL4,LRRC24,ZNF250	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP39	45467	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	3508264	3508975	3508586	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15029	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	3719575	3720240	3719887	Y	NA	NA	GLIS3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-509J21.1	194852	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	3742705	3743097	3742775	Y	NA	NA	GLIS3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-509J21.1	217982	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr9	3848588	3848740	3848655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	323865	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	3971837	3971870	3971849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	374522	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr9	4042913	4043209	4043135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	303183	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr9	4083576	4083986	4083877	Y	GLIS3,GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	262406	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	4162852	4162875	4162864	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	183517	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	4241498	4241696	4241599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	104696	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	4283058	4283285	4283172	Y	GLIS3,GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	63107	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	4293316	4293716	4293485	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	52676	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	4366732	4366922	4366806	Y	GLIS3	GLIS3	GLIS3,RFX3	IMR90	Hi-C	24141950	GLIS3	20340	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	8675420	8675557	8675548	Y	NA	RP11-134K1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	35754	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	9758146	9758159	9758153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	669270	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	10027810	10028140	10027960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	582583	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	10509018	10509139	10509079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	101584	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	10509839	10510073	10509956	Y	PTPRD	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	100650	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	10554298	10554680	10554497	Y	PTPRD	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	56043	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	10563880	10564197	10564091	Y	PTPRD	PTPRD,RP11-87N24.2	NA	NA	NA	NA	PTPRD	46526	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	7211	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr9	16869534	16869976	16869661	Y	BNC2	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	693	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	17580370	17580488	17580383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTLN	447390	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	18857353	18857783	18857553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	167107	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	21708302	21708720	21708435	Y	IFNA6,IFNA1,MTAP	NA	MIR31HG,IFNE	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	91822	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	28492930	28493080	28493005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	921066	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	29825337	29825639	29825488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1004584	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	32556634	32556872	32556767	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	TOPORS	6083	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5,CCL21	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	35490989	35491345	35491127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	112022	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	84777	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	82515	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	42.3748084966852
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	35907858	35908401	35908282	Y	OR2S2,OR13J1,HRCT1	NDUFA5P4,HRCT1	NA	NA	NA	NA	HRCT1	3669	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	35914292	35914707	35914657	Y	NA	NDUFA5P4,HRCT1	NA	NA	NA	NA	HRCT1	10103	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	66835234	66835620	66835427	Y	NA	NA	LOC642236	IMR90	Hi-C	24141950	FAM122A	4557344	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	73021440	73021667	73021582	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5873	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	5.63364506025294
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	73100288	73100509	73100429	Y	KLF9	NA	SMC5,KLF9,TRPM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF9	72748	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	73168765	73169157	73169115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	141225	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	73198481	73198826	73198654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	170941	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	77207530	77207789	77207659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-197P3.1	340303	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	85587803	85587810	85587807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	732699	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	90425634	90425952	90425875	Y	CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	161716	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr9	94872861	94873095	94872978	Y	NA	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	2571	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	95845794	95846166	95845981	Y	NINJ1,C9orf89	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	C9orf89	10334	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	97770536	97771110	97770577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	283553	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	100685565	100685605	100685585	Y	NA	C9orf156	NA	NA	NA	NA	C9orf156	2713	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	103029299	103029483	103029391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEX10	83738	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	107668768	107669725	107669153	Y	SLC44A1,OR13C3	ABCA1	NA	NA	NA	NA	ABCA1	18793	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABCA1	66894	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr9	107833426	107833839	107833430	Y	NA	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	144908	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	111313727	111314112	111313882	Y	NA	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-220D10.1	73001	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	114678571	114678728	114678577	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	21525	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	116031847	116032083	116031965	Y	NA	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	3540	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00474	331361	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	118395472	118395834	118395653	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00474	289652	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00474	250273	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118435271	118435690	118435488	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00474	249796	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	118436011	118436199	118436119	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00474	249287	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118473939	118474297	118474118	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00474	211189	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118496415	118496674	118496563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00474	188812	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118701397	118701694	118701515	Y	NA	LINC00474	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00474	15911	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	118706424	118707025	118706637	Y	NA	LINC00474	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00474	20938	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118758811	118759033	118758921	Y	NA	NA	PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00474	73325	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118838142	118838541	118838342	Y	NA	NA	LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	75542	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118849643	118849804	118849724	Y	NA	NA	PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	64279	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr9	118914445	118914679	118914506	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	362	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr9	118917854	118918405	118917899	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	3771	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chr9	118919313	118920155	118919798	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	5230	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	118953256	118953446	118953306	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	39173	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	118993225	118993558	118993231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	79142	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	119018286	119018486	119018325	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	104203	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	119025545	119025710	119025628	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	111462	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	119055041	119055304	119055148	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	140958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	119066427	119066819	119066625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	152344	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	119084686	119084813	119084781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	170603	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	119311432	119311888	119311785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	135693	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	122135998	122136186	122136092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1204262	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	123640419	123640826	123640772	Y	NA	PSMD5,PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	2813	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	123683801	123684328	123684093	Y	NA	PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	46195	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	126154038	126154354	126154284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	125183	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	126624648	126624917	126624783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	65514	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	130307843	130308200	130307973	Y	SLC2A8,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	31068	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	132115283	132115797	132115318	Y	NA	C9orf106,RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	22704	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chr9	132176730	132177172	132176936	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	66558	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	132241150	132241608	132241414	Y	NA	LINC00963	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	2122	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.20446980618593
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	132249735	132250094	132249903	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	6005	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr9	132310411	132310629	132310520	Y	NA	NA	PTGES,DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	66681	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	132312044	132312247	132312152	Y	NA	NA	DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	68314	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.93929307491458
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71936	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	132331590	132331738	132331651	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	70706	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.42917525406701
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	132835796	132835981	132835917	Y	TOR1B,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	22091	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	132949592	132949704	132949653	Y	C9orf78	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	16735	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	133001906	133002144	133002026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCS1	69049	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr9	134770006	134770262	134770128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	156545	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	137215635	137215833	137215709	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	8691	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	138915703	138915918	138915811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC1	64477	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	139237317	139237472	139237398	Y	GPSM1	GPSM1,DNLZ	NA	NA	NA	NA	GPSM1	17385	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	139444945	139445101	139445057	Y	TMEM141,SDCCAG3	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	6281	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	139458570	139458737	139458661	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	19906	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	139466507	139466851	139466737	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-611D20.2	27843	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	3.67411634364322
chr9	139493398	139493576	139493438	Y	NA	NA	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-611D20.2	54734	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chr9	139514178	139514562	139514471	Y	CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7	NA	MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGPAT2	65313	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	139737773	139737949	139737875	Y	NA	PHPT1,EDF1,TRAF2	NA	NA	NA	NA	PHPT1	3227	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,MIR3621	NA	NA	NA	NA	MIR3621	38118	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	MIR3621	37331	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	15.921170822454
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chr9	140199547	140199668	140199608	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	4844	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chr9	140303397	140303743	140303573	Y	NA	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	11971	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	330032	330194	330129	Y	NA	PPP2R3B	NA	NA	NA	NA	PPP2R3B	15496	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	1367285	1367756	1367429	Y	P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	141861	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	2301315	2301326	2301321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED1	115682	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	3732525	3732707	3732561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	102876	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	4628683	4629054	4628903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-555H23.1	594115	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chrX	9701264	9701389	9701313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	271929	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	357333	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	12912381	12912679	12912531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	78548	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	12965371	12965491	12965432	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	25736	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chrX	12969061	12969258	12969197	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	21969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.7145876270335
chrX	12972600	12972806	12972677	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	18421	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	12989837	12990050	12989934	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	1177	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.95952871660972
chrX	12996273	12996492	12996427	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5046	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	12996986	12997135	12997061	Y	TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5759	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chrX	13017682	13017863	13017801	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X,FAM9C	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	26455	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chrX	13018378	13018636	13018544	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X,FAM9C	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	27151	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	13041801	13041932	13041889	Y	TMSB4X,FAM9C	FAM9C	NA	NA	NA	NA	FAM9C	18869	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	2.69435198533836
chrX	13108157	13108758	13108452	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	FAM9C	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM9C	47356	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	13108770	13109761	13109358	Y	TLR8,TMSB4X	FAM9C	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM9C	47969	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	13128879	13129151	13129129	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM9C	68078	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	13138325	13138351	13138340	Y	NA	NA	FAM9C,LOC100133123,TMSB4X	IMR90	Hi-C	24141950	FAM9C	77524	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.22470544788107
chrX	13711501	13711681	13711616	Y	ATXN3L,RAB9A	TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1	NA	NA	NA	NA	RAB9A	6257	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	13958141	13958523	13958388	Y	NA	GPM6B	NA	NA	NA	NA	GPM6B	3384	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	14040371	14040544	14040433	Y	NA	GEMIN8	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	5468	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chrX	22074447	22074583	22074515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	117756	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	22078705	22079027	22078867	Y	PHEX	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	122014	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	28961310	28961674	28961353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAPL1	357794	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	28999435	28999810	28999466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAPL1	395919	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	29610847	29611180	29610948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAPL1	1007331	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	39087394	39087538	39087449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	428709	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	39473708	39474029	39473869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	171361	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	39676098	39676409	39676231	Y	NA	GAPDHP1	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	30708	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chrX	41192009	41192079	41192030	Y	NA	DDX3X	NA	NA	NA	NA	DDX3X	1358	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	43831630	43831930	43831676	Y	NDP	NDP	NA	NA	NA	NA	NDP	880	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	NDP	57840	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	231336	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	45305345	45305614	45305509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-245M24.1	57019	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	45648299	45648762	45648585	Y	NA	MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	43769	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	45665386	45665505	45665456	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	43415	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	45668056	45668432	45668257	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	40488	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	46316161	46316444	46316394	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18012	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	46435390	46435934	46435628	Y	RP2,ZNF674,CHST7	ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	CHST7	4171	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.979764358304859
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	62728532	62728688	62728610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-357C3.3	50263	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	64255385	64255512	64255449	Y	ZC4H2	ZC4H2	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	2792	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	64520324	64520642	64520384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	232013	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	67352579	67352916	67352601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	298839	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chrX	69386644	69386665	69386655	Y	NA	IGBP1	NA	NA	NA	NA	IGBP1	35345	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	145420	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	145914	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644
chrX	102820880	102821034	102820957	Y	NA	TCEAL4	NA	NA	NA	NA	TCEAL4	8125	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	120799323	120799330	120799327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	1037318	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	1.46964653745729
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	133160063	133160287	133160179	Y	GPC3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF6	344996	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	PHF6	199118	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.48988217915243
chrX	152951257	152951653	152951455	Y	NA	DUSP9,RPL18AP16,BCAP31,ABCD1	NA	NA	NA	NA	SLC6A8	0	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.244941089576215
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	G-402	hg19	FANTOM5	0.734823268728644