chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 378 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 2111429 2112079 2111937 Y NA C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 30080 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 4004990 4005219 4005105 Y WRAP73,TP73 NA NA NA NA NA C1orf174 190133 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 5957166 5957512 5957348 Y KCNAB2,KCNAB2,CHD5 NA NA NA NA NA KCNAB2 92014 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 6336471 6336830 6336716 Y ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7 ICMT,GPR153 GPR153 K562 ChIA-PET 22265404 GPR153 17436 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 7531062 7531540 7531160 Y PARK7 NA NA NA NA NA VAMP3 297789 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr1 8001518 8001767 8001698 Y NA TNFRSF9,PARK7 NA NA NA NA TNFRSF9 2592 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 8121436 8121582 8121497 Y ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 36638 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 52503 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 8198088 8198334 8198235 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 113290 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 8457012 8457408 8457307 Y NA NA NA NA NA NA SLC45A1 81126 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 8488165 8488317 8488222 Y TNFRSF9,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 112279 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 8686491 8686867 8686745 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 188835 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 8986862 8987075 8987025 Y NA ENO1 SLC2A5,SLC2A7 IMR90 Hi-C 24141950 ENO1 49554 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 9298798 9298942 9298853 Y NA H6PD NA NA NA NA H6PD 5964 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 9856786 9856983 9856885 Y NA CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 25601 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 10821450 10821813 10821706 Y NA CASZ1 NA NA NA NA CASZ1 32894 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 11218028 11218196 11218080 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC10 60090 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 12050736 12051137 12050880 Y NPPA,NPPB,MFN2 MFN2,MIIP NA NA NA NA MFN2 12498 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 12609717 12610039 12609907 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 65698 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN NA NA NA NA SPEN 3332 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.51345206637968 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 16291784 16292062 16291897 Y CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 8565 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 9980 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 16502532 16502678 16502612 Y C1orf64 EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 21950 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MFAP2 73626 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA NA CROCC K562 ChIA-PET 22265404 MFAP2 64547 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr1 17887951 17888293 17888247 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 23621 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 19253034 19253391 19253292 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 25759 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 21149682 21149798 21149749 Y CAMK2N1,EIF4G3 HP1BP3 NA NA NA NA HP1BP3 37866 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 22076024 22076450 22076245 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 31649 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 22236410 22236692 22236686 Y NA RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA RP11-26H16.1 3819 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 22829217 22829453 22829426 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB40 52873 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr1 25559638 25560067 25559796 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 SYF2 NA NA NA NA SYF2 2645 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 26022319 26022793 26022555 Y SEPN1 NA NA NA NA NA SEPN1 101874 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 26617206 26617304 26617268 Y SH3BGRL3,RPS6KA1,PIGV,ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 13539 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 27165490 27165816 27165600 Y NA ZDHHC18,GPN2 NA NA NA NA ZDHHC18 14289 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr1 27883449 27884140 27883881 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 44802 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 28305616 28305920 28305789 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8 XKR8 NA NA NA NA XKR8 21643 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 31504221 31504603 31504488 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 32235 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 32701561 32701886 32701724 Y NA CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP NA NA NA NA MTMR9LP 3335 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 33082385 33082406 33082394 Y ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 32098 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 33131314 33131452 33131383 Y NA ZBTB8OS,RBBP4,SYNC NA NA NA NA RBBP4 16571 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 33564918 33565286 33565197 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA ADC 20213 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 36183411 36183689 36183588 Y C1orf216 C1orf216,CLSPN NA NA NA NA C1orf216 338 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 36397577 36397741 36397665 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 154735 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 36428229 36428381 36428320 Y STK40,EIF2C4,THRAP3,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 124095 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 36641160 36641451 36641218 Y NA TRAPPC3,MAP7D1,THRAP3 NA NA NA NA MAP7D1 21980 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 38308355 38308564 38308401 Y ZC3H12A,SNIP1,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 14728 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 40628781 40629153 40628997 Y NA RLF NA NA NA NA RLF 3736 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 41650800 41651168 41651109 Y KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 54658 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 41825927 41826139 41826062 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 333 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr1 42204580 42205516 42204895 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 294080 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 42328578 42328878 42328730 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 170718 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 42385461 42385560 42385511 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 114036 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 43901568 43901739 43901659 Y NA MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA HYI 15921 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 44240162 44240471 44240217 Y ATP6V0B NA NA NA NA NA ST3GAL3 70667 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 44299891 44300630 44300422 Y NA NA NA NA NA NA RP11-7O11.3 109593 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 44324219 44324394 44324336 Y NA NA NA NA NA NA RP11-7O11.3 85829 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 44378405 44378587 44378508 Y CCDC24,B4GALT2,ARTN RP11-7O11.3,IPO13 NA NA NA NA RP11-7O11.3 31636 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 46528388 46528566 46528496 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R3 111594 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 339924 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 51302197 51302583 51302391 Y FAF1 NA NA NA NA NA FAF1 121352 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 52033462 52033748 52033585 Y NA OSBPL9 OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL9 7103 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 53702100 53702340 53702220 Y NA CPT2,C1orf123 NA NA NA NA MAGOH 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 54695028 54695502 54695289 Y NA MRPL37,CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 31319 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 55650535 55650650 55650593 Y NA USP24 NA NA NA NA USP24 28136 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 56972242 56972492 56972299 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 136482 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 56991269 56991531 56991390 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 117443 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 57024882 57025247 57025166 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 83727 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 57042744 57043185 57043024 Y C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 65789 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 59050239 59050578 59050488 Y NA DAB1,OMA1 MYSM1,FGGY,OMA1 IMR90 Hi-C 24141950 OMA1 39765 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 59232576 59232611 59232594 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 15174 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 59492942 59493154 59493036 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 8883 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 59522982 59523218 59523118 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 38923 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 59910700 59911009 59910820 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 150390 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 59986893 59986899 59986896 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 226583 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 60144543 60144796 60144669 Y FGGY NA NA NA NA NA CYP2J2 245666 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 60157078 60157331 60157204 Y NA NA NA NA NA NA CYP2J2 233131 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 60174952 60174968 60174960 Y NA NA NA NA NA NA CYP2J2 215494 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 61517483 61517553 61517518 Y NA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 188552 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 62726098 62726337 62726314 Y NA NA NA NA NA NA KANK4 56748 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 65888047 65888596 65888066 Y LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 3777 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 69605544 69605634 69605589 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1 644640 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NA NA NA NA NA KRT8P21 818684 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 76730126 76730314 76730220 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC3 191722 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 77713696 77713788 77713742 Y NA PIGK,AK5 PIGK,AK5,ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGK 30581 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 78067790 78068312 78068066 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 78792 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 78132928 78133068 78133059 Y NA ZZZ3 NA NA NA NA ZZZ3 14036 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 78196845 78197195 78197020 Y NA ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 26342 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 3770 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 86035824 86036171 86035900 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 5762 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 33134 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 87082786 87082842 87082814 Y NA NA NA NA NA NA SH3GLB1 85417 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 87691904 87692436 87692089 Y NA NA LOC339524,LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 99715 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA BCAR3 182680 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 94128177 94128297 94128262 Y NA NA NA NA NA NA BCAR3 182409 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 151368 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1070A16.1 67841 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 101757305 101757513 101757430 Y NA NA SLC30A7,DPH5 IMR90 Hi-C 24141950 DPH5 267661 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 108673419 108673672 108673564 Y FAM102B NA NA NA NA NA SLC25A24 67799 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 110151943 110152270 110152107 Y NA AMPD2,GSTM4 NA NA NA NA AMPD2 4456 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.23417961455972 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 114326143 114326379 114326237 Y HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22 PHTF1,RSBN1 NA NA NA NA PHTF1 26032 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 114477404 114477721 114477665 Y RSBN1,HIPK1,HIPK1,HIPK1 DCLRE1B,AP4B1,HIPK1,OLFML3 NA NA NA NA HIPK1 7590 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 114575620 114575801 114575630 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 55557 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 114950620 114950667 114950644 Y NA NA NA NA NA NA TRIM33 101114 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 115722074 115722498 115722181 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 NGF 156359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 116588429 116588746 116588471 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 71310 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 116920378 116921129 116920740 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 7088 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 119450998 119451282 119451141 Y NA NA NA NA NA NA TBX15 78897 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 119503304 119503581 119503430 Y NA TBX15 NA NA NA NA TBX15 26598 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 121154332 121154613 121154395 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 104530 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 144009977 144010738 144010098 Y NA NA NA NA NA NA NBPF8 134070 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 145009158 145009716 145009503 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 64470 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 145113904 145114998 145114671 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 19684 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 150154529 150154860 150154771 Y SV2A,MCL1 PLEKHO1 HIST2H2AB,HIST2H2BE,HIST2H2AC MCF7 ChIA-PET 22265404 PLEKHO1 35156 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 150159099 150159241 150159135 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1,ANP32E HIST2H2AC,HIST2H2BE,HIST2H2AB K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PLEKHO1 39726 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 151386066 151386146 151386106 Y NA PSMB4,POGZ NA NA NA NA PSMB4 16056 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 151422102 151422465 151422287 Y NA POGZ NA NA NA NA POGZ 7476 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 151868154 151868386 151868273 Y NA THEM4 NA NA NA NA THEM4 11898 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 151877533 151877895 151877666 Y THEM4 THEM4 NA NA NA NA THEM4 2389 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 151913815 151914271 151914054 Y S100A10 THEM4 S100A10,CELF3,THEM4,RORC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33531 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 153767353 153767730 153767624 Y NA SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 22523 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 153841080 153841191 153841137 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 52260 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 154392646 154393050 154392862 Y CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 16977 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 154579303 154579782 154579555 Y UBAP2L,IL6R,SHC1,ADAR,ADAR UBE2Q1,CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 18693 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 155433776 155433971 155433878 Y MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1 NA NA NA NA NA ASH1L-AS1 95850 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 155830201 155830522 155830413 Y ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2 GON4L,SYT11,RIT1 ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907 IMR90 Hi-C 24141950 SYT11 2901 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 156067665 156067930 156067834 Y NA UBQLN4,LAMTOR2,MEX3A,LMNA LMNA,MEX3A K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LMNA 17301 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 156103413 156103690 156103594 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA NA NA NA NA NA LMNA 53049 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 156676478 156676824 156676750 Y C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2 RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 2870 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 156677217 156677612 156677436 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 3609 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 156895977 156896091 156896003 Y LRRC71 NA NA NA NA NA ARHGEF11 117071 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA NA NA NA NA NA KIRREL 186181 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 160203977 160204039 160204035 Y NA PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 25495 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA FCRLB 106847 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 164655011 164655383 164655197 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 132190 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 164717528 164717907 164717706 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 194707 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 164750243 164750515 164750387 Y PBX1 NA NA NA NA NA PBX1 227422 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 164753581 164753588 164753585 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 230760 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 165635693 165636148 165635824 Y NA MGST3,ALDH9A1 NA NA NA NA ALDH9A1 29952 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 169464285 169464545 169464529 Y BLZF1,SLC19A2 SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA AL021068.1 10905 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 172291507 172291926 172291559 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 119304 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 172327070 172327187 172327139 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 84043 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 172369341 172369683 172369640 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 41547 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 172507125 172507604 172507262 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 95895 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 172715484 172715760 172715631 Y NA NA C1orf105,TNFSF4,LOC100506023,PRDX6,RC3H1,SLC9A11,CENPL,DARS2,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 304254 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 172804293 172804464 172804387 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF4 369988 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 173909740 173909938 173909924 Y RC3H1,ZBTB37 NA NA NA NA NA GAS5 73720 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 173984193 173984403 173984298 Y GPR52,ZBTB37,RC3H1 RC3H1 NA NA NA NA RC3H1 5032 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 179296885 179297079 179297006 Y AXDND1,TOR3A,ABL2,SOAT1 SOAT1 NA NA NA NA SOAT1 35960 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 180100723 180101052 180100780 Y NA QSOX1 NA NA NA NA QSOX1 20917 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 181046810 181047186 181046999 Y NA MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 8452 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 182259351 182259676 182259514 Y NA NA GLUL K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 99665 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 183149947 183150219 183150157 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 3154 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 184852237 184852590 184852311 Y NA NA NA NA NA NA FAM129A 89092 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 185250433 185250655 185250484 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 33806 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 186580348 186580617 186580452 Y PTGS2,PLA2G4A NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 PTGS2 66942 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 186943840 186944382 186944105 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA PLA2G4A 147755 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 192500254 192500504 192500353 Y RGS1 NA UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 182809 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 192508796 192509150 192509060 Y NA NA UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 174163 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 192915458 192915787 192915575 Y NA NA NA NA NA NA TROVE2 110765 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 193080839 193080969 193080896 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 7595 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 196379497 196379989 196379846 Y CFHR3,KCNT2,CFH NA NA NA NA NA KCNT2 196366 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 198850238 198850638 198850585 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 726145 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 198893258 198893473 198893399 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 769165 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 200379777 200379959 200379899 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 2593 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 200401856 200401944 200401900 Y NA ZNF281 NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 24672 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 200783735 200784105 200783920 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 77049 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 201449602 201449822 201449716 Y LAD1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 PHLDA3 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA3 13237 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 201508517 201509575 201509484 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 31933 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NAV1 NA NA NA NA NAV1 28972 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 201639932 201640262 201640169 Y PTPN7 NAV1 NA NA NA NA NAV1 49521 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 202003479 202003610 202003599 Y NA NA NA NA NA NA RNPEP 53979 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 202737599 202737762 202737681 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA RP11-480I12.2 3053 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 202765097 202765528 202765162 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA KDM5B 11070 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 PRELP NA NA NA NA PRELP 39026 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 9.77453581369877 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE PRELP NA NA NA NA PRELP 48055 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 203506114 203506504 203506389 Y NA NA NA NA NA NA PRELP 63158 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 203524939 203525564 203525325 Y NA NA ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 68125 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.23417961455972 chr1 203525711 203525894 203525744 Y NA NA ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 67795 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 203541292 203541507 203541407 Y NA NA ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,ZC3H11A,LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 52182 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 203624863 203625211 203625050 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 31174 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr1 204388302 204388627 204388415 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 9383 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 205144631 205144860 205144785 Y NA DSTYK NA NA NA NA DSTYK 33867 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 205709805 205710150 205710085 Y NA NUCKS1,RAB7L1 NA NA NA NA NUCKS1 7254 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 206736469 206736632 206736474 Y NA RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA RP11-534L20.4 36221 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 207998055 207998202 207998154 Y NA C1orf132 NA NA NA NA C1orf132 42293 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 208267767 208267971 208267827 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 147694 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 210056461 210057439 210056772 Y NA NA DIEXF,SYT14 IMR90 Hi-C 24141950 SYT14 52099 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 211500826 211501119 211501083 Y TRAF5,TRAF5 TRAF5 NA NA NA NA TRAF5 2869 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 211998326 211998558 211998442 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 3556 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 212643548 212643711 212643612 Y NA NENF ATF3 K562 ChIA-PET 22265404 NENF 39319 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 212671541 212672116 212671670 Y NA NA ATF3,NSL1,TATDN3,BATF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF3 64560 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 213160414 213160619 213160568 Y VASH2 VASH2,ANGEL2 NA NA NA NA ANGEL2 26549 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 213500745 213500914 213500832 Y RPS6KC1 NA PROX1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KC1 278156 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 214712809 214712848 214712830 Y NA PTPN14 NA NA NA NA PTPN14 10944 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 217046388 217046574 217046481 Y ESRRG NA NA NA NA NA GPATCH2 755850 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 218648559 218648794 218648717 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 130982 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 220359525 220359939 220359742 Y NA NA NA NA NA NA RAB3GAP2 83857 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA RAB3GAP2 NA NA NA NA RAB3GAP2 16352 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr1 222000173 222000483 222000346 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 86655 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 222060426 222060817 222060685 Y NA NA DUSP10 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP10 146908 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 222142763 222142919 222142838 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 229245 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr1 222161205 222161607 222161394 Y DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 247687 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHIPL2 80241 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 222830626 222830783 222830705 Y TAF1A,MIA3 MIA3 NA NA NA NA MIA3 41198 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 4.46835922911944 chr1 224690718 224691054 224690869 Y WDR26 NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 67983 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 224883520 224883811 224883666 Y NA NA NA NA NA NA WDR26 260785 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 225613143 225613456 225613257 Y LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 1171 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 225780677 225780772 225780725 Y NA NA NA NA NA NA ENAH 58072 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 225843222 225843438 225843341 Y NA ENAH,RP11-145A3.1 NA NA NA NA ENAH 4378 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 226007337 226007385 226007361 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 11543 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 226867580 226868182 226867972 Y ITPKB NA NA NA NA NA ITPKB 56842 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 84574 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 228917012 228917506 228917078 Y RHOU RHOU RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 48188 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 230061007 230061186 230061097 Y ACTA1 NA NA NA NA NA GALNT2 130350 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 230220164 230220401 230220223 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 28628 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 230249347 230250007 230249645 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 57811 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 230279464 230279771 230279510 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 87928 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 231531776 231531955 231531804 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 26835 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 NTPCR 318224 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 233856724 233857076 233856900 Y NA NA NA NA NA NA PCNXL2 427265 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 234548581 234548830 234548706 Y NA RP5-827C21.4 NA NA NA NA RP5-827C21.4 41242 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 234736336 234736615 234736485 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 6656 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 234749342 234749645 234749570 Y IRF2BP2 IRF2BP2 LINC00184,LOC100506810,ARID4B IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 6071 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 234757412 234757805 234757606 Y NA IRF2BP2 LOC100506810 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IRF2BP2 14141 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 234812067 234812214 234812141 Y NA NA LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 68796 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 115572 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 164880 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 5739 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 235133014 235133422 235133155 Y NA RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 18463 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr1 235134086 235134438 235134232 Y NA RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 19535 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 235390754 235391125 235391097 Y NA NA NA NA NA NA RBM34 67982 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 235850857 235851038 235851012 Y LYST,ARID4B GNG4 NA NA NA NA GNG4 38803 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 236027883 236028291 236028094 Y NA LYST NA NA NA NA LYST 16649 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 236135691 236135959 236135881 Y GPR137B NA LYST IMR90 Hi-C 24141950 NID1 90503 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA MTR 677641 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 243585242 243585384 243585313 Y CEP170,AKT3,AKT3 NA NA NA NA NA SDCCAG8 167922 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 244212276 244213430 244213047 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 199895 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 245563795 245563810 245563803 Y KIF26B NA NA NA NA NA KIF26B 247508 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 245915127 245915205 245915167 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 598840 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246035151 246035554 246035345 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 633060 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246042512 246042669 246042578 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 625945 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246129057 246129404 246129358 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 539210 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246249452 246249819 246249636 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 418795 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246316735 246316955 246316845 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 351659 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246323685 246324051 246324002 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 344563 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246387027 246387389 246387208 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 281225 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 246538507 246538660 246538597 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 129954 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246588477 246588670 246588563 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 79944 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246591935 246592203 246592010 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 76411 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246760708 246760962 246760810 Y SMYD3,CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 32962 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 246763574 246763751 246763579 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 35828 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 247540028 247540387 247540122 Y NA ZNF496 AHCTF1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF496 46880 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 500969 501047 501008 Y ZMYND11 NA NA NA NA NA DIP2C 232636 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 644331 644586 644526 Y NA NA NA NA NA NA DIP2C 89097 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 652657 652929 652820 Y DIP2C NA NA NA NA NA DIP2C 80754 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 3028046 3028193 3028123 Y NA NA LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 78332 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 3932191 3932411 3932301 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 106718 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 3984866 3985563 3985082 Y KLF6 NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 159393 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 4283808 4284356 4284092 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 4289203 4289519 4289251 Y NA LINC00702 KLF6,LOC338588,LOC100216001 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 5099 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 5783071 5783414 5783247 Y NA NA GDI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 58270 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 8446683 8447080 8446823 Y GATA3 NA NA NA NA NA GATA3 353116 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 12490797 12491318 12490959 Y SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 101316 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 13388296 13388525 13388411 Y NA PHYH NA NA NA NA SEPHS1 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 13692317 13692641 13692563 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 65390 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 13747807 13748143 13748006 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 120880 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 13754952 13755339 13755135 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 128025 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 13812005 13812243 13812123 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 185078 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 17046094 17046522 17046399 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 188567 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 17116431 17116714 17116628 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 125339 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 21991974 21992366 21992143 Y NA NA NA NA NA NA MLLT10 170880 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 22726811 22727194 22727116 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 118671 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 22870490 22870524 22870509 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 130960 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 22890368 22890535 22890414 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 110949 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 22904639 22904845 22904818 Y PIP4K2A NA NA NA NA NA PIP4K2A 96639 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 22970665 22970972 22970902 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 30512 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 24772710 24773084 24772822 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 237513 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 24993053 24993414 24993236 Y GPR158,ARHGAP21 ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 17183 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 25190845 25191315 25190947 Y NA PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 48218 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 25201195 25201516 25201227 Y NA PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 38017 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 31093694 31093701 31093698 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 225165 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 31205866 31205987 31205927 Y NA NA NA NA NA NA ZNF438 112879 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 31423488 31423889 31423800 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 104622 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 32335843 32336217 32336161 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 7142 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 32702583 32702830 32702714 Y NA EPC1,CCDC7 NA NA NA NA CCDC7 30238 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 34815006 34815362 34815018 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 135667 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 34922261 34922558 34922409 Y PARD3 RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 28471 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 35102675 35103059 35102787 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 422 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 35739762 35740277 35740119 Y CREM,CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY NA NA NA NA NA CCNY 205809 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 38325428 38325718 38325598 Y ZNF25,ZNF37A ZNF33A NA NA NA NA ZNF33A 27850 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr10 47057375 47057652 47057526 Y NA NA GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-38L15.3 107903 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 47129494 47129670 47129546 Y SYT15,PPYR1 NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 180022 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-38L15.3 706200 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 58240589 58240612 58240601 Y NA NA NA NA NA NA ZWINT 121553 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 60949726 60949909 60949819 Y NA NA NA NA NA NA FAM13C 171030 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 61632760 61633170 61633000 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 31244 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 62185134 62185430 62185353 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 350659 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 63225634 63225799 63225694 Y ARID5B NA ARID5B,TMEM26 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf107 194920 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 63805800 63806070 63805931 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 146741 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 69550767 69550960 69550901 Y NA DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 44964 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 69796463 69796828 69796573 Y HERC4 HERC4 NA NA NA NA HERC4 36277 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 70976966 70977432 70977124 Y DDX21,SRGN,VPS26A SUPV3L1,HKDC1 NA NA NA NA HKDC1 627 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 72424506 72424875 72424691 Y ADAMTS14 NA KIAA1274,PRF1,ADAMTS14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGPL1 148842 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 73816879 73817073 73816976 Y NA NA NA NA NA NA CHST3 94756 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 73986513 73986881 73986533 Y C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA ASCC1 11621 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 74020239 74021717 74020385 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9961 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 75022023 75022098 75022060 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA RP11-152N13.5 11474 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 75240023 75240096 75240089 Y NA RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 13187 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 76633406 76633470 76633438 Y NA NA NA NA NA NA KAT6B 50066 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 76737758 76737994 76737873 Y MYST4,SAMD8 NA NA NA NA NA SAMD8 119350 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 79123955 79124246 79124101 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 272107 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 79176142 79176460 79176291 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 219893 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 79254650 79254953 79254867 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 141400 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 79291052 79291779 79291330 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 104574 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 79538272 79538371 79538344 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 141919 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 79670022 79670276 79670149 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 14102 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1-AS1 90709 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 80737664 80737999 80737882 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1-AS1 87653 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.63054187365954 chr10 80806888 80807057 80806949 Y NA ZMIZ1-AS1,ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1-AS1 18595 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1-AS1,ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 81091409 81091966 81091732 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 13259 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 81138677 81139093 81139046 Y NA PPIF NA NA NA NA PPIF 33452 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 82176099 82176325 82176238 Y C10orf58 FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA FAM213A 10514 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 82237584 82237869 82237663 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 25662 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 82258642 82258780 82258737 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 46720 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 89802399 89802689 89802412 Y NA NA RNLS,CFL1P1,ATAD1,KLLN,PTEN,LIPF,LIPM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 99140 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 90552469 90552762 90552637 Y FAS,ANKRD22,LIPN NA NA NA NA NA STAMBPL1 84729 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 90711253 90711764 90711560 Y LIPF,CH25H,ACTA2 FAS,ACTA2 NA NA NA NA FAS 36650 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 93320562 93320757 93320661 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R3C 70054 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 93367671 93367850 93367762 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 22961 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 16896 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 93697836 93698042 93697939 Y NA FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA BTAF1 16310 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 95197787 95197992 95197919 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42082 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 97038434 97038774 97038645 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 10007 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 97205086 97205311 97205223 Y SORBS1,SORBS1 NA NA NA NA NA SORBS1 113860 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 97687985 97688127 97688056 Y NA NA NA NA NA NA CCNJ 113024 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 99449337 99449738 99449607 Y C10orf28,RRP12,PI4K2A AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA AVPI1 4257 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 104504643 104504897 104504711 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 32348 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 105208274 105208534 105208404 Y NA CALHM2 NA NA NA NA CALHM2 2126 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 105519063 105519154 105519109 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 94147 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 106087819 106088091 106087906 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 8071 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 106094943 106095283 106095247 Y NA ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 879 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 112533972 112534336 112534061 Y PDCD4 NA NA NA NA NA PDCD4 95229 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 114818562 114818849 114818630 Y HABP2 NA NA NA NA NA TCF7L2 110553 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 114823270 114823456 114823363 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 115261 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 121412148 121412380 121412196 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 3266 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 121417930 121418047 121417978 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 9048 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA SEC23IP 179463 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 123219385 123219723 123219573 Y NA NA NA NA NA NA FGFR2 136249 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 124254349 124254758 124254614 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 35308 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr10 127576052 127576450 127576389 Y NA DHX32,FANK1 NA NA NA NA DHX32 6555 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 127770762 127770961 127770902 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 187654 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr10 128075178 128075883 128075417 Y ADAM12 ADAM12,LINC00601 NA NA NA NA ADAM12 154 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 128595349 128595449 128595411 Y DOCK1 DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 3371 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 128947297 128947480 128947351 Y NA FAM196A NA NA NA NA FAM196A 44942 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr10 133776164 133776302 133776237 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 17133 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 134212658 134212854 134212750 Y NA NA NA NA NA NA LRRC27 69044 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr10 134373708 134374041 134373810 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 24384 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 368352 368730 368427 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR NA NA NA NA B4GALNT4 556 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 840856 841090 840896 Y NA SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,EFCAB4A,CD151,POLR2L,TSPAN4 NA NA NA NA TSPAN4 48 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 926738 926879 926801 Y BRSK2,CEND1,AP2A2 CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 3844 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 1409546 1409852 1409608 Y KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3 BRSK2 NA NA NA NA BRSK2 417 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 1982665 1983112 1982762 Y TH,IGF2,IGF2 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 16157 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 2714612 2714953 2714746 Y NA KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 4271 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 3035655 3035952 3035816 Y MRGPRG NAP1L4,CARS NA NA NA NA NAP1L4 24048 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 3859822 3860019 3859941 Y NUP98,STIM1,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1 NA NA NA NA RHOG 194 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 5504793 5505065 5505006 Y NA NA NA NA NA NA TRIM6 110274 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 8756335 8756571 8756455 Y ST5,ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 54377 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 9884475 9884852 9884652 Y NA NA NA NA NA NA SWAP70 200851 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 11378547 11378930 11378792 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2003C8.2 459678 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 12132692 12132808 12132735 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 19149 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 12146355 12146795 12146568 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 32812 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 12148184 12148552 12148402 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 34641 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 12199343 12199732 12199431 Y NA NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 85800 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 NA NA NA NA NA PSMA1 334359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 NA NA NA NA NA NUCB2 146598 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 27255766 27256168 27256011 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 127247 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 27277091 27277350 27277221 Y NA NA LGR4 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC34 106065 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 27683148 27683223 27683174 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58382 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 27956455 27956618 27956527 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45875 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 33181656 33182005 33181958 Y NA NA NA NA NA NA CSTF3 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 33394151 33394320 33394196 Y C11orf41 NA NA NA NA NA HIPK3 117933 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 35061713 35062540 35061871 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 95877 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 35341087 35341212 35341143 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 182670 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 36304870 36305003 36304937 Y LDLRAD3 COMMD9 NA NA NA NA COMMD9 3996 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 44306158 44306224 44306191 Y ALX4 ALX4 NA NA NA NA ALX4 23492 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 46090973 46091088 46091031 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 49897 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 56717332 56717681 56717506 Y NA NA LRRC55 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-100N3.2 215394 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 57200214 57200547 57200409 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 SLC43A3,RTN4RL2 SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5 IMR90 Hi-C 24141950 SLC43A3 7161 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.07199697001961 chr11 57224938 57225034 57225001 Y SLC43A1,SLC43A1,SERPING1,PRG3 SLC43A3,RTN4RL2 NA NA NA NA RTN4RL2 988 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 49157 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 61065380 61065516 61065448 Y NA DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 33166 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 61600948 61601213 61601130 Y CYBASC3 FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 6158 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK CTD-2531D15.4 NA NA NA NA CTD-2531D15.4 19430 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 62306762 62307027 62306934 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654 NA NA NA NA RP11-864I4.4 4444 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr11 63954598 63954956 63954814 Y FERMT3,CCDC88B,OTUB1 MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4,RP11-783K16.14,VEGFB NA NA NA NA STIP1 3854 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 64631898 64632818 64632128 Y CDC42EP2,FAU,EHD1 EHD1,ATG2A NA NA NA NA EHD1 20950 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 65248969 65249218 65249208 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 14015 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 65263684 65264604 65263856 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 451 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.63054187365954 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2C 50795 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 66801218 66801427 66801323 Y SYT12,SYT12 SYT12 NA NA NA NA SYT12 28969 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 67103841 67103862 67103852 Y NA ANKRD13D,SSH3,POLD4,AP003419.11 NA NA NA NA POLD4 18581 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 67253659 67253853 67253760 Y PTPRCAP,NUDT8,AIP CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2 NA NA NA NA AIP 5147 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 68121765 68121884 68121804 Y ALDH3B1,C11orf24 LRP5 NA NA NA NA LRP5 43688 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 68273880 68274272 68274031 Y NA PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 47694 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 73126084 73126768 73126402 Y RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 40775 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 73989657 73990002 73989928 Y NA P4HA3 PPME1 IMR90 Hi-C 24141950 P4HA3 30700 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 74534779 74535147 74534795 Y XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA RNF169 76866 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 GDPD5,SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 75270235 75270345 75270334 Y NA GDPD5,SERPINH1 NA NA NA NA SERPINH1 756 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 75748582 75748924 75748753 Y UVRAG NA NA NA NA NA RP11-535A19.2 224131 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 75755875 75756235 75755993 Y UVRAG NA NA NA NA NA RP11-535A19.2 231424 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 77445522 77445800 77445629 Y NA FTH1P16 NA NA NA NA FTH1P16 1451 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 78001305 78001608 78001428 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 103437 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 78002337 78002637 78002489 Y NA NA NA NA NA NA KCTD21 104469 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 86222200 86222363 86222315 Y NA NA NA NA NA NA ME3 159315 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 92767972 92767992 92767983 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 161138 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr11 95888064 95888524 95888506 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 185820 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 95995362 95995593 95995538 Y FAM76B,MAML2 NA NA NA NA NA MAML2 78751 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 96071900 96072294 96072196 Y MAML2,JRKL,CCDC82 MAML2,CCDC82,JRKL NA NA NA NA MAML2 2050 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 100747572 100748094 100747776 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 191188 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 106629947 106630142 106630045 Y NA NA NA NA NA NA GUCY1A2 257108 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 107885190 107885220 107885205 Y NA CUL5 NA NA NA NA CUL5 7731 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 108519095 108519272 108519184 Y NA DDX10 ATM,ACAT1,NPAT IMR90 Hi-C 24141950 DDX10 14480 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 109958650 109959379 109958908 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 2708 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr11 110581726 110581943 110581819 Y ARHGAP20 NA NA NA NA NA ARHGAP20 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 113828537 113828676 113828607 Y NA NA NA NA NA NA USP28 84245 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 116723326 116723638 116723620 Y SIK3 NA NA NA NA NA ZNF259 66560 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 118490168 118490609 118490335 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 15013 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA KRT8P7 TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 17585 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 120083069 120083545 120083438 Y GRIK4,ARHGEF12,OAF OAF,POU2F3 NA NA NA NA OAF 3594 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr11 120218040 120218378 120218085 Y NA TMEM136,ARHGEF12 NA NA NA NA ARHGEF12 12253 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 52393 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 125992920 125993185 125993052 Y NA NA CDON,DDX25 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 61690 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 126290424 126290762 126290592 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 66889 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 128294765 128294892 128294836 Y NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 160561 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 128367325 128367539 128367441 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 87914 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 131451036 131451143 131451102 Y NA NA NA NA NA NA SNX19 666632 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 133814977 133815479 133815368 Y NCAPD3,IGSF9B IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 9401 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 ACAD8 586697 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 1432132 1432276 1432219 Y NA NA NA NA NA NA FBXL14 269055 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 2374154 2374447 2374269 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 262453 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr12 2445525 2445973 2445758 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 333824 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 2451063 2451405 2451244 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 339362 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 2467815 2468125 2467879 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 356114 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 2724856 2725100 2724978 Y NA NA NA NA NA NA FKBP4 177019 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 6278115 6278307 6278240 Y TAPBPL CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 28574 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 6291358 6291755 6291562 Y VWF,CD9 CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 15126 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 6525626 6525956 6525791 Y NA LTBR,RP1-102E24.9,TAPBPL TNFRSF1A,PLEKHG6,SCNN1A,TAPBPL,VAMP1,LOC678655,CD27,IFFO1,GAPDH IMR90 Hi-C 24141950 RP1-102E24.9 19708 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2,C3AR1 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 10306018 10306454 10306037 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 56603 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 10517487 10517775 10517755 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 154430 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 12605511 12605890 12605533 Y NA NA NA NA NA NA LOH12CR1 97498 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 12991466 12991515 12991491 Y NA DDX47,RPL13AP20 NA NA NA NA DDX47 27216 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 15841016 15841330 15841173 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 191933 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 15853599 15853765 15853693 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 179498 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 18511225 18511610 18511392 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 769038 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 19284166 19284563 19284310 Y NA PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 3518 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 19343816 19343915 19343891 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 63168 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 23746822 23747228 23747075 Y SOX5 NA NA NA NA NA RP11-444D3.1 966296 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 25053045 25053436 25053335 Y KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 46957 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 25768042 25768407 25768182 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP262 162096 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 27332593 27333057 27332936 Y STK38L NA STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 61844 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 27726864 27727242 27727000 Y STK38L,PPFIBP1 NA NA NA NA NA PPFIBP1 52500 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 28501330 28501622 28501413 Y NA NA NA NA NA NA RP11-967K21.1 160031 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 29473475 29473492 29473484 Y NA NA NA NA NA NA ERGIC2 58630 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 30945631 30945953 30945771 Y NA CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 24 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 31671759 31672031 31671827 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 70000 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 22028 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 32426821 32426960 32426892 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 169052 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 39816699 39816988 39816844 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 18204 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 42958967 42958984 42958976 Y NA PRICKLE1 NA NA NA NA PRICKLE1 23173 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 46809510 46809878 46809694 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 34048 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.90981432547951 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.23417961455972 chr12 48202856 48203019 48202950 Y VDR,ASB8 HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 21896 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 49452736 49452852 49452791 Y NA PRKAG1,RHEBL1,LMBR1L NA NA NA NA RHEBL1 8956 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 49592771 49592915 49592838 Y NA TUBA1C,TUBA1A TUBA1B,PRPH,TUBA1A,TUBA1C,LMBR1L,DHH K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TUBA1A 11664 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 49595765 49596022 49595888 Y LMBR1L TUBA1C,TUBA1A TUBA1A,TUBA1B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TUBA1A 14658 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 49678404 49678529 49678467 Y NA TROAP NA NA NA NA TROAP 36490 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 50067341 50067888 50067543 Y TUBA1A,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 31620 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 50460197 50460562 50460363 Y NA RACGAP1,SMARCD1 NA NA NA NA SMARCD1 16193 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 50899744 50900179 50899947 Y DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 2976 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 50900445 50901076 50900765 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 3677 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 NA KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 C12orf44 79934 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 NA NA NA NA NA RP3-416H24.4 97726 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 54810296 54811355 54811225 Y GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5 NA ZNF385A IMR90 Hi-C 24141950 ITGA5 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.23417961455972 chr12 57079143 57079532 57079338 Y NA ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 627 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 57751585 57751906 57751872 Y R3HDM2 NA INHBC IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 70882 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 58337769 58337952 58337777 Y NA RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 4445 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 58923778 58923975 58923913 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 388328 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 62796049 62796447 62796072 Y NA NA NA NA NA NA MON2 62150 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 62998747 62999127 62998791 Y NA RP11-631N16.2 NA NA NA NA RP11-631N16.2 4215 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 63051832 63051994 63051914 Y MON2,PPM1H NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 57300 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 154925 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 65076423 65076649 65076481 Y NA NA NA NA NA NA RASSF3 74130 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 65926688 65927190 65926918 Y NA NA MSRB3,HMGA2,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 67459 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 66285844 66286273 66285967 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RP11-366L20.3 53986 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 71040722 71040853 71040780 Y CNOT2,CNOT2,CNOT2,PTPRB NA NA NA NA NA KCNMB4 282666 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 76209246 76209451 76209339 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 216261 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 76949947 76950382 76950258 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 1207 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 77425555 77425931 77425698 Y OSBPL8 E2F7 NA NA NA NA E2F7 31429 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr12 77747953 77748163 77748058 Y CSRP2 RP1-34H18.1 NA NA NA NA RP1-34H18.1 31532 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 77771188 77771377 77771281 Y CSRP2 NA NA NA NA NA RP1-34H18.1 54767 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 78544842 78545234 78545038 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 322157 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 79325321 79325633 79325477 Y SYT1 NA NA NA NA NA SYT1 69548 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 79817704 79817772 79817737 Y SYT1 NA NA NA NA NA PAWR 265105 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 80974115 80974384 80974233 Y MYF5 NA NA NA NA NA LIN7A 355320 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 92899278 92900031 92899712 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA BTG1 361605 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 100518805 100519127 100519119 Y NA UHRF1BP1L NA NA NA NA UHRF1BP1L 15499 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 101412491 101412895 101412554 Y NA NA NA NA NA NA UTP20 258992 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 105477471 105477556 105477526 Y ALDH1L2 ALDH1L2,KIAA1033 NA NA NA NA ALDH1L2 1116 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 109030971 109031245 109031128 Y NA TMEM119 NA NA NA NA TMEM119 40875 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 109083720 109083964 109083780 Y SSH1 CORO1C NA NA NA NA CORO1C 39408 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 109167575 109167781 109167683 Y NA CORO1C NA NA NA NA CORO1C 44203 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5 NA NA NA NA RP11-968O1.5 23553 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 109900993 109901418 109901152 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 11789 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 110867136 110867499 110867318 Y NA ANAPC7,ARPC3,GPN3 NA NA NA NA ARPC3 18728 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 113709766 113709965 113709824 Y OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,PLBD2 NA NA NA NA NA IQCD 52867 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 113741046 113741165 113741159 Y NA NA NA NA NA NA PLBD2 53206 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 115103963 115104215 115104201 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 15754 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 120672500 120673016 120672699 Y PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 28558 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 121841505 121841570 121841538 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 5661 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 122014724 122015549 122015007 Y NA KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 1371 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 124926088 124926324 124926239 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 123811 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 125026162 125026505 125026332 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 23630 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr12 125110878 125111184 125111029 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 60743 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 125204801 125205082 125204928 Y UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 154666 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 125239604 125239956 125239856 Y NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 125258 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 125258641 125259012 125258790 Y NCOR2,UBC NA NA NA NA NA SCARB1 106202 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 125259292 125259624 125259541 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 105590 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 125550830 125551017 125550923 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 2905 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 126796414 126796868 126796639 Y NA NA NA NA NA NA LINC00944 458089 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr12 129306542 129307039 129306920 Y SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4 NA NA NA NA SLC15A4 14 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 20711185 20711522 20711354 Y NA GJA3 NA NA NA NA GJA3 21666 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 21241518 21241702 21241584 Y NA IL17D NA NA NA NA IL17D 32564 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 21517643 21517924 21517794 Y LATS2 XPO4 CRYL1,SKA3,MRP63,LATS2,SAP18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XPO4 42456 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 21632492 21632727 21632640 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 959 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 27843033 27843378 27843206 Y NA RPL21,RASL11A NA NA NA NA RASL11A 569 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 28005406 28005795 28005597 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 8725 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 31314202 31314673 31314362 Y USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP ALOX5AP NA NA NA NA ALOX5AP 6557 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 31422053 31422459 31422280 Y C13orf33 NA USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX5AP 114408 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 31444557 31445090 31444788 Y C13orf26 NA NA NA NA NA ALOX5AP 136912 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 33051019 33051050 33051035 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2L1 50704 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr13 34781635 34781805 34781767 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 391449 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 36501740 36502135 36501882 Y NA NA NA NA NA NA CCDC169 367842 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 36853236 36853259 36853249 Y CCNA1,C13orf38 CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2 NA NA NA NA CCDC169 16718 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 37881013 37881265 37881086 Y POSTN NA LINC00547 IMR90 Hi-C 24141950 POSTN 289716 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 40690248 40690533 40690364 Y NA NA FOXO1 IMR90 Hi-C 24141950 COG6 462484 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 41234261 41234650 41234508 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 4084 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 43378134 43378246 43378162 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 186161 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 43392565 43392759 43392664 Y EPSTI1 NA CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 171648 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 6.70253884367915 chr13 43393954 43394179 43394038 Y NA NA CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 170228 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 12.2879878800784 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 43656094 43656342 43656191 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 60755 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 43964887 43965126 43964985 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 369548 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 44446151 44446617 44446342 Y NA LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 4803 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 45338378 45338728 45338554 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 189095 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 45745052 45745233 45745142 Y NA KCTD4 NA NA NA NA KCTD4 27942 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 45752820 45753055 45752934 Y NA KCTD4 NA NA NA NA KCTD4 20120 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 49688107 49688286 49688182 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 131761 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 50696626 50696754 50696746 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU2 1102 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 51464273 51464487 51464380 Y NA RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 17327 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 51486183 51486653 51486377 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 3335 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr13 60679231 60679569 60679243 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 56552 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 60716670 60717071 60716778 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 19050 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 74467154 74467532 74467385 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 238862 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 75939887 75940324 75940051 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 113926 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 80510902 80511186 80511006 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 401900 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 80658121 80658499 80658313 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 254587 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 90858939 90859314 90859127 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1138760 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 91369763 91370108 91369936 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 627966 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 93880621 93881133 93881009 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 3526 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 95749553 95749872 95749713 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 201815 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 95938060 95938332 95938319 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 13355 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 96262046 96262201 96262124 Y DZIP1 DZIP1 NA NA NA NA DZIP1 32756 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 97877294 97877762 97877400 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 5606 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 97912286 97912462 97912389 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 40598 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 98599587 98599881 98599659 Y NA IPO5 NA NA NA NA IPO5 4031 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 98926557 98926890 98926623 Y NA NA NA NA NA NA FARP1 133741 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 99128143 99128552 99128498 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99642 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 99130571 99130717 99130631 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 97477 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 99135278 99135706 99135580 Y NA NA NA NA NA NA STK24 92488 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 99223213 99223429 99223417 Y STK24 STK24 NA NA NA NA STK24 4765 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 99628165 99628894 99628676 Y DOCK9 NA NA NA NA NA UBAC2-AS1 222070 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 99935844 99936009 99935907 Y GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 21650 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr13 100010340 100010660 100010510 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA GPR183 52681 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 100620497 100620786 100620718 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 1377 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 101046682 101046918 101046816 Y A2LD1 NA NA NA NA NA RPL15P18 245336 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 106808885 106809142 106808998 Y NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 217769 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 107182699 107183083 107182911 Y EFNB2 ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 35429 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 107186008 107186474 107186341 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 32038 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 110359460 110359633 110359542 Y IRS2 AL162497.1 MYO16,IRS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL162497.1 45982 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 110850022 110850027 110850025 Y NA NA NA NA NA NA COL4A2 106132 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 110956468 110956902 110956701 Y COL4A2,COL4A1 COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A2 309 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 110982194 110982608 110982413 Y NA COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A1 24698 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 111039905 111040155 111040082 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 82409 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 111526935 111527249 111527195 Y RAB20 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA LINC00346 6773 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 111544033 111544176 111544105 Y ING1,ING1 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 21240 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 111594578 111594832 111594693 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 29162 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 111881085 111881388 111881198 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 116179 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 113377120 113377559 113377252 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 34477 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 113437900 113438182 113438064 Y C13orf35 NA NA NA NA NA ATP11A 95257 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 113928610 113928824 113928747 Y CUL4A LAMP1 NA NA NA NA LAMP1 20732 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 114119812 114119949 114119881 Y NA DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 23318 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 114810103 114810577 114810313 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 85509 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr13 114864762 114865011 114864824 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 31075 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 114894223 114894969 114894576 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 1117 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr13 114995132 114995533 114995333 Y NA CDC16,UPF3A NA NA NA NA CDC16 2829 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA METTL17 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 23029996 23030028 23030008 Y NA TRAJ23,TRAC,DAD1,ABHD4 NA NA NA NA TRAC 15549 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1 NA NA NA NA LRP10 19383 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr14 30663968 30664325 30664158 Y PRKD1 PRKD1 PRKD1,FOXG1,C14orf23 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD1 4864 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 31400109 31400220 31400192 Y NA NA NA NA NA NA COCH 58389 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 33126424 33126565 33126444 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 174418 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 35120187 35120582 35120411 Y SNX6,SNX6 SNX6 SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C IMR90 Hi-C 24141950 SNX6 22798 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 35869907 35870271 35870165 Y FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 1684 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 39664073 39664414 39664121 Y SIP1,PNN TRAPPC6B,PNN NA NA NA NA PNN 21686 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 42297588 42297942 42297766 Y LRFN5 NA NA NA NA NA LRFN5 222815 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 48109739 48110114 48110083 Y MDGA2 NA NA NA NA NA RPL13AP2 441432 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 50328882 50329315 50329091 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10961 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr14 50648447 50648735 50648723 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 47541 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 53257268 53257587 53257438 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 882 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 55541499 55541595 55541574 Y NA WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 25150 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 64670198 64670275 64670237 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD1 182474 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 64912318 64912487 64912430 Y ESR2,ZBTB25,ZBTB1,AKAP5 AKAP5 NA NA NA NA AKAP5 17730 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 65637410 65637773 65637587 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 69997 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 65749378 65749653 65749574 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 125657 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr14 68607037 68607479 68607161 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 279434 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 69328763 69329130 69328947 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 67573 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 69851262 69851639 69851451 Y NA SLC39A9,ERH NA NA NA NA SLC39A9 11093 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 75086409 75086922 75086553 Y PGF CTD-2207P18.2 LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTD-2207P18.2 5059 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 75491919 75492089 75492033 Y NA EIF2B2,MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 24146 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 75697272 75697400 75697329 Y NA RP11-293M10.2,FOS TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.2 26714 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 76334268 76334588 76334390 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 31891 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr14 77384980 77385465 77385224 Y VASH1 RP11-488C13.1,RP11-7F17.7 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 33887 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 77508586 77508871 77508699 Y IRF2BPL IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 15552 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 NA NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr14 81867255 81867616 81867435 Y GTF2A1,GTF2A1,STON2 NA NA NA NA NA SEL1L 130589 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 81868469 81868528 81868519 Y GTF2A1,GTF2A1 NA NA NA NA NA SEL1L 129677 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 89630928 89631154 89631021 Y FOXN3 NA NA NA NA NA TTC8 342431 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 90280261 90280500 90280379 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB11 138621 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 90378938 90379536 90379158 Y FOXN3,FOXN3,KCNK13 EFCAB11,TDP1 NA NA NA NA EFCAB11 39585 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 91224328 91224362 91224343 Y C14orf159,CALM1 NA NA NA NA NA TTC7B 56461 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 93190849 93191078 93190938 Y MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 21969 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 93192576 93192808 93192662 Y MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 20239 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 93738394 93738720 93738557 Y NA NA NA NA NA NA BTBD7 58718 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr14 96125888 96126188 96126030 Y TCL1A NA NA NA NA NA SNHG10 126679 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 97647218 97647514 97647331 Y NA NA C14orf177 IMR90 Hi-C 24141950 VRK1 385577 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr14 99934490 99934508 99934499 Y EML1 SETD3,CCNK NA NA NA NA SETD3 10708 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 100905618 100905757 100905695 Y BEGAIN NA BEGAIN IMR90 Hi-C 24141950 WARS 64476 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 101143693 101144188 101144055 Y NA NA NA NA NA NA WARS 302551 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 101159258 101159870 101159708 Y NA NA NA NA NA NA WARS 318116 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 103557952 103558007 103557980 Y NA CDC42BPB,TNFAIP2 CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNFAIP2 29772 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 105368048 105368162 105368106 Y NA NA NA NA NA NA AHNAK2 74532 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 5167 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr15 25595443 25596209 25595953 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 85919 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 25608093 25608225 25608159 Y SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 73903 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 32962221 32962756 32962661 Y NA SCG5 NA NA NA NA SCG5 30344 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 32974763 32975144 32974961 Y NA SCG5 NA NA NA NA SCG5 42886 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 33134248 33134560 33134512 Y NA NA GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 SCG5 202371 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 33148173 33148432 33148370 Y GREM1 NA NA NA NA NA SCG5 216296 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 33162710 33163027 33162926 Y NA NA NA NA NA NA SCG5 230833 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 33165962 33166239 33166177 Y NA NA NA NA NA NA SCG5 234085 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 33172991 33173188 33173143 Y NA NA NA NA NA NA SCG5 241114 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 33299476 33299841 33299744 Y NA NA NA NA NA NA FMN1 185056 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 33408328 33408688 33408508 Y NA NA FMN1,SCG5 IMR90 Hi-C 24141950 FMN1 76209 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 33418806 33419006 33418854 Y NA NA FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 FMN1 65891 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 36720333 36720777 36720654 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf41 149035 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 37207397 37207450 37207424 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA MEIS2 184054 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 37249666 37249815 37249741 Y NA NA NA NA NA NA MEIS2 141689 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr15 37261192 37261563 37261502 Y NA NA NA NA NA NA MEIS2 129941 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 37398990 37399302 37399145 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 7486 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 38422177 38422570 38422209 Y NA NA SPRED1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 119957 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 39361992 39362177 39362006 Y NA NA FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 355219 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 284984 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr15 39866856 39867109 39867069 Y FSIP1 THBS1 THBS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 THBS1 4171 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 40164744 40164978 40164948 Y NA GPR176 NA NA NA NA GPR176 46115 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 42549506 42549513 42549508 Y PLA2G4E GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 13918 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 43810666 43810996 43810786 Y MAP1A TP53BP1,MAP1A NA NA NA NA MAP1A 9510 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 45016631 45017046 45016657 Y SPG11,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA TRIM69 2140 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48 NA NA NA NA C15orf48 27742 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 45914427 45914634 45914531 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 6712 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 48884454 48884907 48884660 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 51139 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 49163848 49164006 49163956 Y NA EID1 NA NA NA NA EID1 4077 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 49217829 49218211 49218108 Y SHC4 EID1 NA NA NA NA EID1 49746 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 50429549 50429984 50429688 Y USP8,GABPB1 NA ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4 IMR90 Hi-C 24141950 GABPB1 215621 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 51369445 51369616 51369500 Y TRPM7,SPPL2A TNFAIP8L3 NA NA NA NA TNFAIP8L3 25857 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 51385997 51386103 51386050 Y NA TNFAIP8L3 NA NA NA NA TNFAIP8L3 9370 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 52349753 52350120 52349937 Y NA CTD-2184D3.1 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 35372 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 52774147 52774333 52774216 Y MAPK6,MYO5A MYO5A NA NA NA NA MYO5A 44914 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA MYO5A,ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 55543162 55543346 55543241 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1,RAB27A NA NA NA NA NA RSL24D1 55897 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 55559597 55559729 55559672 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 49429 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 55874454 55874613 55874565 Y PRTG PYGO1 NA NA NA NA PYGO1 4532 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 56162319 56162688 56162565 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4 121256 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 58183047 58183076 58183062 Y NA NA GCOM1 IMR90 Hi-C 24141950 POLR2M 300816 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 59469975 59470287 59470131 Y NA NA NA NA NA NA CCNB2 74698 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 60874514 60874871 60874792 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 105137 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 63034731 63035286 63034964 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 208086 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 63142999 63143362 63143082 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 100010 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 63664402 63664810 63664706 Y LACTB,CA12 CA12 NA NA NA NA CA12 7550 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 64919514 64919887 64919625 Y NA NA NA NA NA NA OAZ2 73593 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 64940943 64941327 64941079 Y NA NA NA NA NA NA OAZ2 52153 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 67373443 67373710 67373534 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 19342 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 67401891 67402640 67402087 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 47790 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 88246 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 68579972 68580192 68580087 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 11831 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 68589122 68589626 68589166 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20981 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 68652766 68652805 68652797 Y NA NA FEM1B IMR90 Hi-C 24141950 ITGA11 69696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 68852393 68852527 68852460 Y CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 16781 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 69453904 69454158 69454121 Y GLCE GLCE NA NA NA NA GLCE 2981 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 71335765 71335967 71335867 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 152641 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 72832767 72832969 72832868 Y PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1 NA NA NA NA NA ARIH1 68100 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 73061587 73061861 73061724 Y PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK ADPGK NA NA NA NA ADPGK 14326 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 73926570 73926835 73926736 Y PML NPTN,CD276 C15orf60 IMR90 Hi-C 24141950 NPTN 2095 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 74222908 74223263 74222994 Y LOXL1,STOML1 LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 6578 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 74223574 74223817 74223712 Y LOXL1 LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 7244 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA STRA6 89360 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3 NA NA NA NA EDC3 32032 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 75397173 75397774 75397428 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA C15orf39 MCF7 ChIA-PET 22265404 PPCDC 83277 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr15 76639120 76639380 76639270 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12055 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 77710600 77710857 77710802 Y NA PEAK1 NA NA NA NA HMG20A 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 78754081 78754185 78754133 Y ACSBG1 IREB2 NA NA NA NA IREB2 26308 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 79049512 79049756 79049604 Y NA NA NA NA NA NA MORF4L1 51073 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 79280826 79281229 79281127 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 40910 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 80453068 80453275 80453180 Y BCL2A1,ZFAND6 FAH NA NA NA NA FAH 10236 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 80697752 80697924 80697805 Y ARNT2 ARNT2 NA NA NA NA ARNT2 3060 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 83500589 83500717 83500653 Y NA WHAMM NA NA NA NA WHAMM 24209 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr15 83605139 83605146 83605143 Y NA HOMER2,FAM103A1 NA NA NA NA HOMER2 47515 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 85290443 85290837 85290532 Y PDE8A,ZNF592 SEC11A,ZNF592 NA NA NA NA ZNF592 577 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 86192682 86192944 86192801 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 143317 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr15 86846270 86846590 86846430 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 510009 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 89675943 89676620 89676217 Y ISG20,ABHD2 ABHD2 NA NA NA NA ABHD2 47253 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 90371902 90372049 90371963 Y ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2 ANPEP NA NA NA NA ANPEP 15269 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr15 90379956 90380186 90379992 Y NA ANPEP NA NA NA NA ANPEP 23323 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr15 90574620 90575072 90574763 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 31996 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 91153046 91153352 91153276 Y NA NA NA NA NA NA CRTC3 81889 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 91331328 91331736 91331526 Y NA NA NA NA NA NA BLM 72770 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 92293461 92293635 92293548 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 101290 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 94739822 94739990 94739899 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 32777 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 95050162 95050468 95050315 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 277395 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 205286 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 99396507 99396665 99396608 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206307 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr15 100026499 100026994 100026794 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 11129 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 101233795 101233911 101233855 Y ASB7,ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1,SELS IMR90 Hi-C 24141950 LINS 92360 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 101667290 101667533 101667378 Y NA NA CHSY1,SELS,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 CHSY1 122604 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 101739961 101740273 101740216 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 49864 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 101741612 101741900 101741753 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 48237 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 101783359 101783726 101783540 Y CHSY1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 6411 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 1166792 1167154 1166886 Y NA NA CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2I 186394 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 4420946 4421237 4421026 Y NA PAM16,VASN NA NA NA NA VASN 1097 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 10131244 10131451 10131348 Y NA NA NA NA NA NA NUBP1 704192 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 11012685 11013009 11012730 Y TEKT5,FAM18A,CIITA,CLEC16A DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 21308 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 11086769 11086952 11086818 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 50424 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr16 11126143 11126448 11126303 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 89798 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 11666045 11666804 11666319 Y ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF NA NA NA NA NA LITAF 61433 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 12071486 12071797 12071761 Y NA RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 2892 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 13164381 13164582 13164482 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 268507 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 14395683 14396371 14395873 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 232505 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 14752031 14752218 14752119 Y NA PARN,BFAR NA NA NA NA BFAR 27359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 15583408 15583655 15583541 Y NDE1,C16orf45 NA KIAA0430 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf45 57256 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 15611948 15612359 15612167 Y NA NA NA NA NA NA C16orf45 85796 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 15730401 15730568 15730506 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 4455 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 16170462 16170862 16170553 Y NDE1 NA NA NA NA NA ABCC1 129028 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 22203475 22203890 22203761 Y POLR3E EEF2K UQCRC2,POLR3E,EEF2K,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 11713 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 23508487 23508934 23508786 Y GGA2 COG7,GGA2 NA NA NA NA GGA2 22382 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 24679861 24680253 24680057 Y NA NA TNRC6A,ARHGAP17,SLC5A11,RBBP6 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 58763 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 27254406 27254878 27254778 Y IL4R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 23237 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 27546889 27546978 27546937 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 12256 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 29954900 29955228 29955066 Y NA SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM219 4694 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.79272451819965 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 34377841 34378195 34377988 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2494762 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 47175603 47175949 47175815 Y NETO2 NA NA NA NA NA NETO2 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 48631315 48631363 48631339 Y NA N4BP1 NA NA NA NA N4BP1 20696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 50101332 50101352 50101341 Y NA HEATR3 NA NA NA NA HEATR3 3480 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 40786 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 2763 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr16 55544017 55544378 55544293 Y MMP2,LPCAT2 LPCAT2 NA NA NA NA LPCAT2 3107 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 67689330 67689673 67689514 Y NA RLTPR,ACD,PARD6A NA NA NA NA ACD 3040 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 67891676 67892114 67891889 Y RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1 NA NA NA NA CENPT 11962 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 68433458 68433594 68433558 Y NA NA NA NA NA NA PRMT7 90581 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 69225511 69225823 69225667 Y HAS3 SNTB2 NA NA NA NA SNTB2 6479 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 70470997 70471281 70471214 Y NA FUK NA NA NA NA ST3GAL2 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 70749058 70749400 70749223 Y NA MTSS1L MTSS1L,IL34 IMR90 Hi-C 24141950 MTSS1L 31089 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 70771415 70771759 70771684 Y EXOSC6 NA NA NA NA NA MTSS1L 53446 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 71070712 71070940 71070844 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 237648 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 71123508 71123782 71123642 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 290444 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 71753676 71753893 71753785 Y HPR,PHLPP2 PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 2711 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 71931018 71931097 71931057 Y DHX38,ATXN1L,KIAA0174 ZNF821 NA NA NA NA ZNF821 3779 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 72965555 72965897 72965813 Y ZFHX3 NA NA NA NA NA ZFHX3 125700 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 72981236 72981554 72981364 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 110043 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 75411958 75412267 75412159 Y NA NA NA NA NA NA CFDP1 53116 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 80694679 80694985 80694832 Y CDYL2 NA NA NA NA NA DYNLRB2 122048 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 81465654 81465943 81465745 Y PLCG2,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 10832 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 81634791 81634955 81634874 Y GAN NA NA NA NA NA CMIP 158016 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 81666319 81666849 81666608 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 189544 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA MPHOSPH6 326105 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 84862837 84863219 84863017 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 11247 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 85185210 85185759 85185517 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 125835 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.51345206637968 chr16 85415557 85415973 85415759 Y NA NA LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 305706 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 86959187 86959331 86959263 Y FOXC2 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 351213 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 86962886 86963146 86962899 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 354912 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 86963366 86964014 86963688 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 355392 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 87490621 87490719 87490682 Y NA NA NA NA NA NA FBXO31 66873 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 87843209 87843416 87843290 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 45611 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 87987504 87988357 87987703 Y ZCCHC14,BANP,BANP,BANP BANP NA NA NA NA BANP 6654 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 88275964 88276225 88276145 Y NA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 241500 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 88338212 88338634 88338285 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179091 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 88839181 88839507 88839410 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 10112 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 89449545 89449691 89449606 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 105278 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 89468980 89469266 89469225 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 85703 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr16 90024486 90024764 90024610 Y NA MC1R,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA DEF8 12153 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 473610 473838 473725 Y FAM101B NA NA NA NA NA RPS4XP17 84949 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 693293 693510 693390 Y RNMTL1 GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA GLOD4 9712 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 881410 881576 881449 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 400 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 932596 932954 932809 Y NA TIMM22 NXN IMR90 Hi-C 24141950 TIMM22 34239 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 1521068 1521369 1521308 Y CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2 NA NA NA NA SLC43A2 8811 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 2075592 2075724 2075696 Y HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 120144 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 2082960 2083277 2083133 Y NA NA NA NA NA NA SRR 121400 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 2291927 2292298 2292113 Y NA MNT NA NA NA NA MNT 10114 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 2409124 2409453 2409310 Y NA METTL16 NA NA NA NA METTL16 3732 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 3641791 3642428 3642283 Y ITGAE,ATP2A3 P2RX5-TAX1BP3,P2RX5,GSG2 NA NA NA NA GSG2 16580 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 4205148 4205753 4205440 Y P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39874 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 4412786 4412979 4412855 Y NA MYBBP1A NA NA NA NA MYBBP1A 43947 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,KIF1C NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 6790647 6790875 6790776 Y SLC16A11,DLG4,DLG4 NA NA NA NA NA AC027763.2 122793 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 6829288 6829561 6829425 Y SLC13A5,NLGN2,DLG4,ASGR2,ASGR2,ASGR1 NA ALOX12P2,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 AC027763.2 84107 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 18450 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 13194 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 12120 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr17 13445928 13446299 13446210 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 56945 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 13447669 13448094 13447771 Y HS3ST3A1 NA NA NA NA NA HS3ST3A1 55150 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 13460367 13460669 13460622 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 42575 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.23417961455972 chr17 13463603 13463645 13463626 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 39599 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 13835210 13835376 13835282 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10-AS1 135436 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 97149 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 15393997 15394379 15394217 Y PMP22,FAM18B2 NA NA NA NA NA CDRT1 126447 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 15925215 15925448 15925362 Y ZNF286A,NCOR1 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24184 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 17098696 17098916 17098799 Y MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN PLD6,FLCN NA NA NA NA PLD6 8713 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 17163211 17163219 17163215 Y NA FLCN,COPS3,NT5M NA NA NA NA COPS3 19388 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 17484274 17484547 17484424 Y NA PEMT NA NA NA NA PEMT 8475 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 20943914 20944165 20944106 Y NA USP22,AC087393.1 NA NA NA NA USP22 908 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 21908682 21908761 21908685 Y NA NA NA NA NA NA C17orf51 432960 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr17 27118575 27118718 27118697 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 49573 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 29596751 29597032 29596911 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 42098 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 30723443 30723679 30723561 Y NA C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 45600 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 30726822 30727202 30727012 Y NA PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 42077 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 35292129 35292558 35292512 Y ACACA,LHX1,AATF RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 169 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 35682301 35682446 35682421 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 82463 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 39861814 39861964 39861889 Y TTC25 EIF1,HAP1 NA NA NA NA EIF1 18677 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 40539110 40539537 40539349 Y NA STAT3,PTRF NA NA NA NA STAT3 524 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 40670495 40670831 40670653 Y WNK4,RAB5C,PTRF AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 905 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 41796772 41797488 41797204 Y TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3 NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 56868 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 42198947 42199210 42199140 Y NA C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.90981432547951 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 43095998 43096402 43096133 Y NA NMT1,DCAKD NA NA NA NA NMT1 30576 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 43201428 43201633 43201517 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 6334 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 NA NA NA NA NA MAP3K14 268397 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPS7P11 453062 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 45317390 45317724 45317566 Y TBKBP1 ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 11539 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 45798483 45798953 45798740 Y NA NA NA NA NA NA KPNB1 73641 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 46583139 46583523 46583310 Y SKAP1 HOXB-AS1,HOXB2 HOXB2,HOXB3,HOXB4,SKAP1,HOXB8,HOXB1,HOXB9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HOXB-AS1 35390 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 46642274 46642589 46642562 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 12884 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr17 46647653 46647800 46647722 Y HOXB5,HOXB2,HOXB4,HOXB3 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 7673 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB8,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 7211 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 47017432 47017466 47017449 Y NA ATP5G1,UBE2Z,SNF8 NA NA NA NA SNF8 3013 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,IGF2BP1 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IGF2BP1 22788 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 NA NA NA NA NA RP11-1079K10.3 166018 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 47929255 47929264 47929260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613C6.4 58550 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 48281415 48281783 48281599 Y NA SGCA,COL1A1 SGCA,HILS1 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 4422 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B NA NA NA NA NA XYLT2 53639 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 54890834 54891042 54890937 Y NA DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 18418 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 56161643 56161969 56161895 Y VEZF1,MTMR4 DYNLL2 NA NA NA NA DYNLL2 2867 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 56701235 56701661 56701522 Y OR4D1,BZRAP1 RNU1-60P NA NA NA NA RNU1-60P 33005 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 57830594 57831044 57830806 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 47607 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 57853705 57854627 57854148 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 70718 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 57861698 57862055 57862024 Y RNFT1 NA NA NA NA NA PTRH2 78711 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 57882537 57882682 57882623 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 NA NA NA NA NA TUBD1 85622 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 42875 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 58240902 58241117 58241010 Y NA NA NA NA NA NA HEATR6 86610 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 58470515 58470600 58470558 Y RNFT1 USP32 NA NA NA NA USP32 27231 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 59473431 59474098 59473741 Y TBX2,C17orf82 TBX2 NA NA NA NA TBX2 1159 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 59939507 59939855 59939761 Y BRIP1 BRIP1 NA NA NA NA BRIP1 625 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 60897286 60897580 60897414 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 194524 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 60965502 60965873 60965703 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 262740 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 61042784 61043115 61042811 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340022 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 62339620 62339793 62339707 Y CEP95 TEX2 NA NA NA NA TEX2 959 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 62487438 62487665 62487534 Y ICAM2 POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 3489 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 62583721 62583959 62583840 Y NA NA NA NA NA NA SMURF2 72227 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 63169538 63169893 63169706 Y RGS9 NA NA NA NA NA GNA13 118581 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 64301184 64301397 64301241 Y NA PRKCA NA NA NA NA PRKCA 4430 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 64380133 64380302 64380218 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 83379 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 64505568 64505880 64505716 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 208814 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 64695504 64695853 64695677 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 398750 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 64796276 64796554 64796503 Y NA NA NA NA NA NA HELZ 443551 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 65339190 65339485 65339338 Y BPTF PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PSMD12 21258 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 66419326 66419636 66419592 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 32018 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 66434083 66434422 66434387 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 17232 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 66694330 66694724 66694542 Y NA NA NA NA NA NA PRKAR1A 188409 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 67603336 67603572 67603425 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 194497 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 67756789 67757245 67756902 Y KCNJ2 NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 347950 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 68288690 68288834 68288751 Y KCNJ2 NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 125876 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 70188799 70188845 70188822 Y NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 73638 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 70512872 70513243 70513164 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 108127 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 70975015 70975329 70975170 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 111522 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 72508636 72509320 72508920 Y TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LD,CD300LB,CD300C NA NA NA NA NA GPRC5C 89646 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 72564769 72564992 72564860 Y NA NA NA NA NA NA GPRC5C 145779 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 73074678 73074996 73074848 Y LLGL2,C17orf28,ARMC7 KCTD2,ATP5H,ARMC7 NA NA NA NA ARMC7 29051 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 73133469 73133809 73133510 Y NA ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2 NA NA NA NA NT5C 7579 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 73333353 73333637 73333600 Y H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3 SLC25A19 NA NA NA NA SLC25A19 49762 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 73351805 73351921 73351820 Y NA GRB2 NA NA NA NA GRB2 47869 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA RECQL5 35261 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 6.14399394003922 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 74785319 74785747 74785427 Y NA NA NA NA NA NA SRSF2 53863 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 74954315 74954497 74954426 Y AANAT,MGAT5B NA NA NA NA NA MGAT5B 91777 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 45019 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 146651 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 75422359 75422648 75422577 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 147708 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 4.18908677729947 chr17 76165603 76166001 76165654 Y SYNGR2 SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 2964 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 76268764 76268973 76268872 Y TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1 NA TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 60497 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 76875667 76876103 76875916 Y CYTH1,ENGASE,CANT1 USP36,TIMP2 NA NA NA NA USP36 40144 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 76929562 76929807 76929665 Y CANT1 TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10093 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 77330475 77330799 77330637 Y NA NA NA NA NA NA ENGASE 261454 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 77961931 77962339 77962251 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 45308 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr17 78352228 78352499 78352367 Y GAA,RNF213 ENDOV NA NA NA NA ENDOV 34466 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV NA NA NA NA ENDOV 41238 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr17 78431372 78431666 78431608 Y GAA,EIF4A3,SGSH,SLC26A11 ENDOV NA NA NA NA ENDOV 44407 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 78471918 78472124 78472096 Y NA RPL32P31,RPTOR RPTOR,ENDOV,LOC100294362,CHMP6 IMR90 Hi-C 24141950 RPL32P31 41879 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 78735331 78735538 78735429 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 218712 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 78754047 78754707 78754061 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 208691 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 78800697 78801105 78800867 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 162293 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 78843399 78843729 78843500 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 119669 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr17 79448388 79448678 79448571 Y NPB,AATK,AZI1,BAHCC1 ACTG1 NA NA NA NA ACTG1 40195 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 80889616 80889925 80889758 Y NA NA NA NA NA NA B3GNTL1 117761 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 81057799 81057924 81057864 Y METRNL METRNL NA NA NA NA METRNL 22232 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr17 81150899 81151424 81151082 Y METRNL NA METRNL MCF7 ChIA-PET 22265404 METRNL 115332 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr18 322671 322833 322785 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 56621 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 379694 380112 379776 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 113644 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr18 2515543 2515690 2515617 Y EMILIN2 NA NA NA NA NA METTL4 53818 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 2516331 2516615 2516492 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 52893 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr18 2875334 2875786 2875693 Y NA NA NA NA NA NA LPIN2 135527 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 3650005 3650381 3650193 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 240399 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L3 266575 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr18 6624543 6624930 6624551 Y NA NA LOC100130480,ARHGAP28 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP28 102787 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 8949015 8949649 8949122 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150979 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 9604214 9604566 9604459 Y NA PPP4R1 NA NA NA NA PPP4R1 8672 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 9758210 9758472 9758414 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 52048 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr18 9828298 9828524 9828428 Y RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 83475 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 9849459 9849859 9849589 Y PPP4R1,RAB31,VAPA NA NA NA NA NA VAPA 62140 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 9850282 9850437 9850360 Y PPP4R1,RAB31,VAPA NA NA NA NA NA VAPA 61562 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr18 10544333 10544521 10544427 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 20431 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 10852460 10852708 10852534 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 328558 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 10951449 10951581 10951501 Y FAM38B NA NA NA NA NA NAPG 427547 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr18 12048672 12049055 12049000 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 69648 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 9.21599091005884 chr18 13824016 13824345 13824089 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 99354 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr18 20072671 20072686 20072680 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 303538 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 101125 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr18 20855209 20855599 20855401 Y NA NA NA NA NA NA CABLES1 142681 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 21153994 21154335 21154180 Y NA NPC1 NA NA NA NA NPC1 10527 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 21562247 21562750 21562607 Y NA TTC39C TTC39C IMR90 Hi-C 24141950 TTC39C 7987 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 22929287 22929693 22929350 Y NA ZNF521 NA NA NA NA ZNF521 461 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 25695112 25695346 25695270 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 60064 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr18 25754926 25755429 25755157 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 988691 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr18 32291109 32291369 32291156 Y MAPRE2,NOL4,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA DTNA 219855 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 34052267 34052344 34052306 Y NA NA NA NA NA NA FHOD3 176590 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 34204611 34205032 34204799 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1328 202037 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 44451829 44452200 44451995 Y NA KATNAL2,PIAS2 NA NA NA NA KATNAL2 43255 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 45454827 45455289 45455128 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 226 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 46455103 46455621 46455353 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 19460 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 46524155 46524830 46524741 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 49074 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 46579464 46579684 46579624 Y DYM NA NA NA NA NA SMAD7 104383 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 52473282 52473502 52473359 Y NA NA CCDC68 IMR90 Hi-C 24141950 RAB27B 90191 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 55880754 55881007 55880894 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171155 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr18 60828947 60829338 60829223 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 156023 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr18 60860186 60860413 60860298 Y VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 124948 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 60874386 60874946 60874584 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 110415 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 61350519 61350880 61350698 Y SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11 NA SERPINB10,SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB7 67289 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 65027496 65027665 65027594 Y NA NA NA NA NA NA DSEL 154552 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 65781416 65781525 65781473 Y NA NA TMX3 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 598921 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 67439242 67439642 67439443 Y DOK6,RTTN,CD226 NA NA NA NA NA DOK6 372951 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 67815165 67815405 67815286 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 55776 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 73119333 73119364 73119349 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ1 198623 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 74089053 74089202 74089130 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 115944 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 74162277 74162639 74162448 Y ZNF516 ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 42507 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 74767033 74767545 74767189 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234470 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 662216 662510 662281 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA RNF126 939 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 823657 823956 823874 Y BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA MIR3187 12073 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 908605 908810 908775 Y NA MED16,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 2430 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 933164 933556 933549 Y NA MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 9383 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 2330710 2331138 2330903 Y NA SPPL2B,LSM7 NA NA NA NA LSM7 4091 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 3369394 3369884 3369615 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 11833 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 3555158 3555442 3555300 Y C19orf28 HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 15333 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 3655813 3656105 3655965 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 42372 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 3670243 3670423 3670333 Y NFIC PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 28054 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 3671007 3671294 3671202 Y NFIC,MAP2K2,EEF2,PIP5K1C,APBA3 PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 27183 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 4052414 4052757 4052628 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 12186 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 4812881 4813376 4813265 Y SEMA6B,TICAM1 FEM1A,TICAM1 NA NA NA NA TICAM1 16340 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 4970760 4971027 4970931 Y NA KDM4B NA NA NA NA KDM4B 3635 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 5339517 5339797 5339748 Y HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 703 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 6066698 6067208 6066827 Y SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2 NA NA NA NA NA RANBP3 90545 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 6076501 6076965 6076757 Y NA NA NA NA NA NA RANBP3 100348 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 6105811 6106211 6106011 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 91372 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 9684452 9684634 9684543 Y NA ZNF426,ZNF121,ZNF561 NA NA NA NA ZNF121 8575 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 9776683 9777096 9776903 Y OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6680 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 10928296 10928707 10928651 Y NA TMED1 NA NA NA NA TMED1 16287 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 11206953 11207150 11207057 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 8915 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 11248443 11248964 11248826 Y NA SPC24 NA NA NA NA SPC24 15520 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 11925678 11926080 11925867 Y NA ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439 NA NA NA NA ZNF440 2579 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 12245844 12245929 12245887 Y NA ZNF788,ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136 NA NA NA NA ZNF20 3293 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.79272451819965 chr19 13166882 13167358 13167036 Y NA LYL1 NA NA NA NA LYL1 44617 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.51345206637968 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 14276845 14277176 14277145 Y NA PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 31077 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 14528800 14529217 14529142 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A DDX39A,PKN1 NA NA NA NA DDX39A 608 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 16181046 16181841 16181607 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 5215 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 17225282 17225997 17225467 Y SIN3B,CPAMD8 HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 40691 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 17236053 17237400 17237360 Y MED26,HAUS8,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 51462 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 17307223 17307519 17307336 Y MYO9B USE1,OCEL1,NR2F6 NA NA NA NA USE1 16636 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 18760437 18760612 18760525 Y NA TMEM59L,KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA KLHL26 14662 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 18768622 18768973 18768794 Y KIAA1683 KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA KLHL26 22847 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 18811913 18812040 18811994 Y UPF1,SLC25A42,JUND,FKBP8,UBA52,CRTC1 CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 19426 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr19 20128543 20128860 20128736 Y NA ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 19455 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 20606211 20606644 20606560 Y ZNF90 ZNF826P NA NA NA NA ZNF826P 436 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 28232492 28232748 28232631 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1469700 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 28252106 28252716 28252616 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1449732 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 30157267 30157499 30157417 Y PLEKHF1,C19orf12,C19orf12 PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA PLEKHF1 3304 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 31841682 31842327 31842237 Y NA TSHZ3 NA NA NA NA TSHZ3 3229 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 32866000 32866258 32866129 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA DPY19L3 28191 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 34724001 34724111 34724046 Y NA KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 19331 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 35491833 35492367 35492256 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A ZNF792,GRAMD1A,SCN1B NA NA NA NA GRAMD1A 8145 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 36135988 36136183 36136108 Y ARHGAP33 HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1 NA NA NA NA COX6B1 942 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 IGFLR1 37792 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 37171128 37171323 37171227 Y NA ZNF461,AC074138.3,ZNF567 ZNF383,ZNF461,ZNF567,ZNF850 IMR90 Hi-C 24141950 AC074138.3 5028 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 38490005 38490506 38490269 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 94137 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 39150238 39150530 39150365 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 13949 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 39171828 39172087 39171896 Y FAM98C,RASGRP4,RINL,NFKBIB,HNRNPL,MAP4K1 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 35539 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 39175000 39175365 39175141 Y NFKBIB,HNRNPL,EIF3K ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 38711 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 39849240 39849632 39849436 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36 MED29,PAF1 IMR90 Hi-C 24141950 SAMD4B 18204 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 39891902 39892845 39892340 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 2608 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA 8162 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr19 44288540 44288860 44288798 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 5131 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 45959420 45959846 45959631 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP FOSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 9407 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 46905606 46905628 46905621 Y NA CCDC8 NA NA NA NA CCDC8 9213 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 47487878 47488175 47487946 Y ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM160 61713 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 49386525 49386775 49386581 Y CD37,PPP1R15A HSD17B14,PPP1R15A,NUCB1 NA NA NA NA PPP1R15A 12876 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2,CGB5 NA NA NA NA CGB5 23859 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 49524183 49524468 49524237 Y CGB5 GYS1,RUVBL2,CGB5 NA NA NA NA CGB5 20673 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 49590520 49590786 49590652 Y NA CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3 NA NA NA NA SNRNP70 3844 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 50090402 50090603 50090503 Y NA NOSIP,PRR12 NA NA NA NA NOSIP 916 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 50205874 50206272 50205974 Y NA BCL2L12,IRF3,PRMT1,CPT1C NA NA NA NA CPT1C 13719 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 HAS1 NA NA NA NA HAS1 32480 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 HAS1 NA NA NA NA HAS1 30743 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr19 52229316 52229816 52229631 Y HAS1 HAS1 NA NA NA NA HAS1 4069 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 52246105 52246442 52246257 Y ZNF350,SIGLEC10,HAS1,FPR2,FPR2,FPR1 HAS1 NA NA NA NA HAS1 20858 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 52674093 52674226 52674127 Y ZNF836 ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF836 1197 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 52734516 52734674 52734594 Y ZNF610 PPP2R1A,ZNF766 NA NA NA NA ZNF766 36150 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 53173643 53173679 53173660 Y ZNF83 ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 18070 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 54707641 54707712 54707644 Y NA LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 5031 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 1148 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 55988531 55988605 55988568 Y NAT14 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA ZNF628 2832 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 56031210 56031577 56031512 Y TMEM150B,SGK110 ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA SSC5D 33439 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 56807694 56808027 56807709 Y NLRP13,ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZNF542 69441 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 58784706 58785064 58784920 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 NA NA NA NA ZNF8 3254 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 8227210 8227486 8227386 Y NA NA NA NA NA NA LINC00299 294265 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 8627879 8628725 8628434 Y NA NA LOC339788,LOC100506274,LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00299 106128 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 9391833 9392063 9392058 Y NA ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 46939 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr2 9428594 9428712 9428653 Y NA NA NA NA NA NA ASAP2 83700 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 9641378 9641587 9641543 Y NA IAH1 NA NA NA NA IAH1 29591 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 10341486 10341905 10341708 Y KLF11 NA NA NA NA NA RRM2 81031 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 10501440 10501782 10501611 Y C2orf48 NA NA NA NA NA HPCAL1 60425 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA GEN1 108459 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 19985229 19985530 19985434 Y NA NA NA NA NA NA TTC32 114217 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 20262884 20263152 20263015 Y TTC32 LAPTM4A WDR35,MATN3,LAPTM4A IMR90 Hi-C 24141950 LAPTM4A 13095 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 20544740 20544866 20544805 Y NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5129 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 20690620 20690861 20690695 Y NA RHOB,AC023137.2 HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC023137.2 41817 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 20779015 20779511 20779185 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 69338 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 20795868 20796230 20795893 Y RHOB,HS1BP3 NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 52619 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 25473699 25473887 25473786 Y EFR3B NA NA NA NA NA DNMT3A 89572 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 28183212 28183402 28183309 Y FOSL2 NA NA NA NA NA RBKS 71247 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 28497824 28498240 28497982 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 115075 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 28583784 28584228 28583975 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2 SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2 IMR90 Hi-C 24141950 FOSL2 29087 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 29331222 29331429 29331307 Y NA CLIP4 CLIP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CLIP4 12651 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 30631915 30632243 30632028 Y LBH LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 35849 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 32166229 32166498 32166237 Y NA NA NA NA NA NA MEMO1 67801 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 37103475 37103824 37103655 Y NA NA NA NA NA NA STRN 87791 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 37383262 37383336 37383288 Y NA EIF2AK2,AC007390.4 NA NA NA NA EIF2AK2 1054 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 37841378 37841620 37841452 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 121991 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 38368766 38369153 38368894 Y CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 33722 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 38373682 38374230 38374188 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 38638 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 38401547 38402107 38401851 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 54603 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 317515 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 43437815 43438151 43437904 Y OXER1,ZFP36L2 ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 13597 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 45968952 45969144 45969027 Y PRKCE NA NA NA NA NA PRKCE 92468 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 46797577 46797967 46797772 Y NA RHOQ,ATP6V1E2,CRIPT,PIGF NA NA NA NA ATP6V1E2 29881 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 47194379 47194775 47194547 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 27385 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr2 47296749 47297008 47296937 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 104732 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 50631357 50631742 50631589 Y NRXN1 NA NA NA NA NA STON1 1876835 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 54751942 54752182 54752042 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 70520 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 56089907 56090266 56090122 Y NA NA NA NA NA NA EFEMP1 59008 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 56968776 56968885 56968798 Y NA NA NA NA NA NA AC007743.1 557871 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 61748471 61748954 61748828 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 14807 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 61757728 61758222 61758112 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 5539 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr2 63452850 63453196 63453026 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 177658 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 63601034 63601048 63601041 Y NA NA NA NA NA NA MDH1 212695 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 70144957 70145388 70145176 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22137 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 70212443 70213458 70213040 Y PCBP1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 25046 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 71129017 71129173 71129049 Y NA VAX2 NA NA NA NA VAX2 3297 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 72372444 72372716 72372574 Y CYP26B1 NA NA NA NA NA EXOC6B 678454 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 72732418 72732763 72732614 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 318407 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 73613683 73613856 73613817 Y DUSP11,ALMS1 ALMS1 NA NA NA NA ALMS1 2797 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 74060180 74060503 74060342 Y NA STAMBP NA NA NA NA STAMBP 6094 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 74237302 74237493 74237398 Y NA DGUOK-AS1,AC073046.25,TET3 DGUOK IMR90 Hi-C 24141950 TET3 9462 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 81709176 81709459 81709306 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1320915 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 81781528 81781694 81781559 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1393267 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 85632531 85633066 85632892 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG CAPG NA NA NA NA CAPG 10489 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 85997454 85997768 85997517 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 20987 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 86113603 86114063 86113862 Y CAPG,GNLY,ST3GAL5 ST3GAL5 LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 74 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 91815826 91816191 91816014 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826664 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 100576722 100576856 100576853 Y NA NA NA NA NA NA LONRF2 360339 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 102399741 102400097 102399970 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 88429 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 102738657 102738854 102738721 Y IL1R1 NA IL1RL2,IL1R2,IL1R1,IL1RL1,IL18RAP IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 59653 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 106364522 106364900 106364611 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 5168 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 108841436 108841459 108841449 Y NA NA SULT1C2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GCC2 221558 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 112811776 112811937 112811878 Y ZC3H6 TMEM87B NA NA NA NA TMEM87B 976 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 113556767 113557612 113557074 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B IL37,CKAP2L,CHCHD5,IL1A,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1A 16600 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 113581693 113582026 113582010 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 10454 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 113657771 113658101 113657937 Y NA NA CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 65291 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 113811675 113812041 113811939 Y IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN IL36RN NA NA NA NA IL36RN 2174 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.79272451819965 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 IL1RN 219658 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr2 114126317 114126521 114126419 Y IL1F10,IL1F10 NA PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4 IMR90 Hi-C 24141950 WASH2P 213143 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 114132430 114132930 114132660 Y IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2 NA PAX8,IL1RN,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 WASH2P 206734 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.51345206637968 chr2 118738362 118738806 118738651 Y NA CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 30903 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 121585967 121586372 121586071 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 94768 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.07199697001961 chr2 121650745 121651146 121650942 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 159546 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 122132591 122132855 122132729 Y CLASP1 NA NA NA NA NA RNU4ATAC 153602 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 124260647 124260891 124260797 Y NA NA NA NA NA NA TSN 1767968 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 127840546 127840814 127840619 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 22117 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 136417787 136417879 136417833 Y NA NA NA NA NA NA UBXN4 79310 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 145116388 145116823 145116635 Y NA GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 28253 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 148389005 148389228 148389160 Y ACVR2A NA NA NA NA NA ACVR2A 210858 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 151768299 151768310 151768305 Y NA NA RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RBM43 348083 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 152159553 152159620 152159604 Y TNFAIP6 RBM43,NMI RBM43,NMI,TNFAIP6,RIF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NMI 14982 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr2 160095412 160095531 160095474 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 45779 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 160097747 160098072 160097910 Y TANC1 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 43238 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 160208394 160208612 160208503 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 67084 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 161208357 161208687 161208675 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 53706 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 161607616 161608069 161607675 Y TANK,TANK NA RBMS1,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 259311 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 NA NA NA NA NA PSMD14 67138 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 267758 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 171997679 171997950 171997833 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 87874 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 172792873 172793084 172792979 Y NA HAT1 NA NA NA NA HAT1 15915 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 172962291 172962684 172962615 Y NA DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 2944 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 173557830 173558066 173557982 Y ZAK NA RAPGEF4,PDK1 IMR90 Hi-C 24141950 AC093818.1 138506 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 174518967 174519016 174518991 Y NA NA OLA1,CIR1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7 301419 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 175248509 175248787 175248661 Y SP3,SP3 CIR1,SCRN3 NA NA NA NA CIR1 9656 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 175540530 175540594 175540562 Y CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1 WIPF1,H3F3AP4 NA NA NA NA WIPF1 5050 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 175700542 175700958 175700833 Y CHRNA1 NA NA NA NA NA H3F3AP4 118037 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD11,HOXD10,HOXD-AS2,HOXD4 NA NA NA NA HOXD10 1222 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 6.70253884367915 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 180625658 180625928 180625899 Y ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 243912 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 183876955 183877317 183877185 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 24269 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 183897957 183897991 183897974 Y NA NCKAP1,DUSP19 NA NA NA NA NCKAP1 3595 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 187409105 187409391 187409239 Y ITGAV,ITGAV ITGAV ITGAV MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGAV 43401 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 189973214 189973535 189973374 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 69070 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 189988166 189988248 189988206 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 54357 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 NA NA NA NA NA STAT1 69179 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 193054279 193054640 193054459 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 946368 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 197075977 197076359 197076177 Y STK17B STK17B,AC020571.3 NA NA NA NA STK17B 36750 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 197466180 197466534 197466307 Y NA HECW2,CCDC150 CCDC150,HECW2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECW2 9764 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 201991403 201992374 201991715 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 12576 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143335 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 204362935 204363240 204363075 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 34893 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 204448549 204448751 204448649 Y NA NA CD28,RAPH1,CTLA4,ABI2,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 50416 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 206569997 206570271 206570078 Y NA NRP2 NA NA NA NA NRP2 25283 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr2 208195614 208195873 208195761 Y NA NA KLF7,CREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 93240 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 208198821 208199856 208199157 Y KLF7 NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 96447 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 216473974 216474094 216474034 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 174998 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 216522690 216522921 216522813 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 223714 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 216558345 216558652 216558547 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 259369 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 216948718 216948931 216948849 Y NA TMEM169,PECR,XRCC5 NA NA NA NA PECR 3040 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 218017889 218017912 218017895 Y NA NA DIRC3,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 459641 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 218663822 218664091 218663956 Y ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA ARPC2 415726 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 221093432 221093609 221093525 Y NA NA EPHA4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC4A3 603383 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 222356179 222356366 222356273 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 80556 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 222435699 222436339 222436058 Y EPHA4 EPHA4 NA NA NA NA EPHA4 583 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 PAX3 334304 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 223155643 223155970 223155818 Y PAX3,CCDC140 PAX3 NA NA NA NA PAX3 5745 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 223922386 223922775 223922580 Y KCNE4 KCNE4 NA NA NA NA KCNE4 7854 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 224564336 224564481 224564409 Y NA NA SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 99115 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 225133197 225133515 225133356 Y NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINE2 231161 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 225862598 225862777 225862689 Y NA DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 42385 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 228522025 228522410 228522050 Y CCL20,AGFG1 NA NA NA NA NA CCL20 154148 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 229044915 229045145 229045029 Y SPHKAP SPHKAP NA NA NA NA SPHKAP 554 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 230309727 230309993 230309861 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 175726 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 232176754 232176953 232176854 Y NA NA NA NA NA NA AC018738.2 57944 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 232227027 232227168 232227070 Y PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA AC018738.2 108217 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 232462110 232462133 232462126 Y NA NA NA NA NA NA LINC00471 85060 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr2 235732390 235732720 235732555 Y NA NA SH3BP4,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP4 125897 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 235863329 235863490 235863430 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 4712 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr2 235935583 235936015 235935761 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 76966 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 235959667 235960159 235959834 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 101050 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 508840 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 237640726 237641053 237640951 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 350902 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 237652147 237652530 237652442 Y NA NA CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 339425 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 237677514 237677881 237677605 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 314074 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 237685373 237686074 237685499 Y CXCR7 NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 305881 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 238036930 238037258 238037105 Y NA COPS8 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 44975 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 74081 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 238122137 238122516 238122344 Y COL6A3 NA MLPH,COL6A3 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 130182 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 238188791 238189175 238189021 Y COL6A3 NA MLPH,COL6A3,COPS8 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 131843 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 238374283 238374521 238374346 Y COL6A3 AC112721.1,AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 MLPH 17550 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 8715 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr2 238583352 238583931 238583637 Y UBE2F,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 49133 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 238596328 238596696 238596497 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 62109 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 240196255 240196671 240196554 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 124459 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr2 240238754 240239047 240238989 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 82083 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 241373489 241373922 241373594 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 401 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 242455386 242455795 242455485 Y NEU4,C2orf85 STK25,BOK NA NA NA NA STK25 8241 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr2 242714145 242714474 242714395 Y NEU4,D2HGDH,GAL3ST2 D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 42151 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 1083260 1083345 1083304 Y SCRT2 PSMF1 RSPO4 IMR90 Hi-C 24141950 PSMF1 8561 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 1097798 1098000 1097899 Y NA PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 5892 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 1338546 1338920 1338732 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 32886 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 1925678 1926256 1925964 Y SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA NA NA NA NA NA SIRPA 52524 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 3188788 3188839 3188809 Y NA UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 1274 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 3472887 3473113 3473000 Y NA ATRN NA NA NA NA ATRN 23200 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 4063526 4063882 4063813 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 35745 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 4065883 4066158 4066005 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 33469 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 4116351 4116485 4116423 Y PANK2,PANK2,SMOX SMOX ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 16724 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 4206645 4206924 4206784 Y NA NA NA NA NA NA SMOX 107018 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 5637936 5638327 5638312 Y NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 48264 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 9181393 9181497 9181455 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 133983 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 9384292 9384675 9384295 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 336882 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 10238596 10238857 10238656 Y NA SNAP25 NA NA NA NA SNAP25 41118 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 12152924 12153154 12153036 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 283553 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 13088080 13088439 13088260 Y NA NA NA NA NA NA SPTLC3 100453 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 14819565 14819718 14819593 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 503303 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNX5 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 18565876 18566072 18565973 Y CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1 LINC00493,DTD1 NA NA NA NA DTD1 465 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 19860938 19861220 19861002 Y NA RIN2 SLC24A3,RIN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIN2 3945 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 19881587 19881718 19881652 Y RIN2,RIN2 RIN2 NA NA NA NA RIN2 16422 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 19895665 19896589 19896325 Y NA RIN2 NA NA NA NA RIN2 30500 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 24603017 24603374 24603110 Y TMEM90B NA NA NA NA NA SYNDIG1 155182 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 24969855 24970103 24969979 Y NA CST7 NA NA NA NA CST7 41989 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 25291624 25291957 25291812 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 64919 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 170704 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 29518777 29518943 29518821 Y NA NA NA NA NA NA FRG1B 90914 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH NA NA NA NA ITCH 40630 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr20 34658286 34658599 34658390 Y EPB41L1 EPB41L1 LOC647979,C20orf152,EPB41L1,PHF20 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 18827 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 36041191 36041579 36041445 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 30357 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 40193452 40193754 40193691 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 51379 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 42379932 42380273 42380130 Y NA NA TOX2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 86178 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 42390017 42390272 42390131 Y C20orf111,GTSF1L NA TOX2,JPH2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 96263 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 42780306 42780638 42780459 Y NA JPH2 NA NA NA NA JPH2 33580 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 43540233 43540373 43540312 Y DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L YWHAB,PABPC1L,TOMM34 NA NA NA NA PABPC1L 3530 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 44604057 44604097 44604095 Y NA PCIF1,ZNF335,MMP9,SLC12A5 NA NA NA NA ZNF335 5224 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 108787 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 45944502 45944683 45944617 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 34622 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 32824 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 18929 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 46601191 46601469 46601377 Y SULF2,SULF2 NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 187831 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 11.7294429764385 chr20 46924305 46924474 46924390 Y NA NA SULF2,NCOA3,PREX1,ARFGEF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SULF2 510945 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 47413863 47414232 47414047 Y ZNFX1,PREX1 PREX1 NA NA NA NA PREX1 28188 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 48113589 48113975 48113763 Y NA NA NA NA NA NA B4GALT5 214440 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 48311078 48311758 48311363 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 16657 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 48317219 48317517 48317348 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 10898 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 48921857 48922230 48922089 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 116481 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 48950504 48950697 48950581 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 145128 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 49341306 49341865 49341532 Y NA PARD6B NCOA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PARD6B 4216 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 20815 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 49947847 49948420 49948354 Y NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 310181 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr20 49976918 49977375 49977162 Y NFATC2 NA NA NA NA NA KCNG1 339252 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA KCNG1 344943 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 50021136 50021625 50021333 Y NFATC2 NA NA NA NA NA ATP9A 361548 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 50030493 50030755 50030670 Y NFATC2 NA NA NA NA NA ATP9A 352418 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 50063853 50064072 50063963 Y NA NA NA NA NA NA ATP9A 319101 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 50178083 50178314 50178273 Y NA NA NA NA NA NA ATP9A 204859 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 50180369 50180507 50180463 Y NFATC2 NA NA NA NA NA ATP9A 202666 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 50244610 50244912 50244769 Y NA NA NA NA NA NA ATP9A 138261 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 50252715 50253081 50252915 Y NA NA NA NA NA NA ATP9A 130092 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 50527143 50527170 50527154 Y NA RP5-1112F19.2 ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1112F19.2 49692 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 52444580 52444892 52444748 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220134 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 52514730 52515023 52514955 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 290284 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 54729980 54730207 54730095 Y NA NA NA NA NA NA FAM210B 201764 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 56950925 56951211 56951109 Y NA VAPB NA NA NA NA VAPB 10967 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.07199697001961 chr20 57586300 57586427 57586364 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5998 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr20 60500389 60500694 60500636 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 138172 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 60874912 60875240 60875071 Y NA NA NA NA NA NA ADRM1 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 60972798 60973035 60972874 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 7306 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 62139467 62139677 62139572 Y NA PPDPF NA NA NA NA PPDPF 10400 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 62485386 62485810 62485510 Y PRIC285 ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5 SLC2A4RG,ZBTB46,LIME1,ZGPAT,TPD52L2,UCKL1,MIR1914,ARFRP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPD52L2 8786 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 16596629 16597038 16596898 Y NRIP1 NA NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 161308 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 17444153 17444342 17444293 Y NA LINC00478 NA NA NA NA LINC00478 3311 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 17656088 17656430 17656111 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 215246 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 17672058 17672352 17672205 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 231216 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 17678130 17678559 17678221 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 237288 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MIR155HG 19836 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 27335144 27335525 27335335 Y APP NA NA NA NA NA APP 205921 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr21 32662959 32662987 32662974 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 266571 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 34836293 34836479 34836379 Y OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 13839 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 35570503 35571291 35570720 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 126633 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 67464 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 35925582 35925949 35925790 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 59492 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 36185927 36186112 36186038 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 200486 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222946 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 229346 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr21 36281882 36282257 36282001 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 296441 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr21 36936186 36936505 36936342 Y NA NA RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 438460 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 38072912 38073314 38073050 Y SIM2 SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 3479 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA HLCS 78016 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 40127775 40128062 40127985 Y NA ETS2 NA NA NA NA ETS2 47169 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 41428469 41428477 41428473 Y NA NA NA NA NA NA SH3BGR 612688 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 43500906 43501194 43501017 Y ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ZNF295 NA NA NA NA NA C2CD2 128907 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 44499901 44500036 44499938 Y NA CBS,U2AF1 NA NA NA NA CBS 4848 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 72994 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 45359018 45359208 45359125 Y ICOSLG,C21orf2,TRAPPC10 NA NA NA NA NA TRAPPC10 70992 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 46295070 46295864 46295519 Y ITGB2 PTTG1IP NA NA NA NA PTTG1IP 3318 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 46549530 46549961 46549631 Y NA NA NA NA NA NA ADARB1 57762 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 46726845 46727332 46727050 Y NA POFUT2 NA NA NA NA POFUT2 21032 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr21 46738832 46739011 46738964 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33019 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 46739517 46739788 46739671 Y NA POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33704 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 46769779 46770045 46769871 Y NA NA ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 53007 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr21 46786853 46787266 46786994 Y COL18A1,POFUT2 COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 35786 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr21 46891281 46891413 46891347 Y NA NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 68229 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 47295042 47295436 47295304 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 104215 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr21 47394721 47394936 47394787 Y NA COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4715 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 47395087 47395227 47395108 Y COL6A2,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4424 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 47469357 47469652 47469491 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 46359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 47512247 47512670 47512489 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 3341 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr21 47554885 47555152 47555043 Y FTCD COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 38874 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr21 47935050 47935239 47935141 Y NA NA NA NA NA NA DIP2A 58238 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr21 48003626 48004009 48003657 Y S100B,PRMT2 PRMT2 NA NA NA NA PRMT2 49070 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 18404666 18404945 18404902 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 100380 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 19331396 19331535 19331466 Y NA NA NA NA NA NA CLTCL1 54157 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 19378121 19378382 19378253 Y NA MRPL40 NA NA NA NA MRPL40 39043 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 24080371 24080411 24080401 Y NA GUSBP11,ZNF70,MMP11,CHCHD10,SMARCB1 NA NA NA NA ZNF70 10868 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 24234499 24234593 24234547 Y NA SLC2A11,MIF NA NA NA NA MIF 308 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 24982 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 27415901 27416173 27415987 Y NA NA NA NA NA NA RP1-40G4P.1 134390 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 27501495 27502092 27501824 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 116596 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 27616278 27616656 27616487 Y NA RP5-1172A22.1 MIAT,PITPNB IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 2032 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 28082615 28082869 28082755 Y MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 112617 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 28475489 28475734 28475658 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 161367 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 28549378 28549438 28549411 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 235256 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 28956104 28956479 28956470 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 179540 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA NA HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GATSL3 78341 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr22 30630812 30631583 30630975 Y NA NA NA NA NA NA GATSL3 52033 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 30634003 30634340 30634268 Y TBC1D10A,LIF GATSL3 NA NA NA NA GATSL3 49276 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 GATSL3 29305 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr22 30666798 30667328 30667040 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM GATSL3 NA NA NA NA GATSL3 16288 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 31639861 31640267 31640177 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33636 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 33045580 33045773 33045677 Y NA NA NA NA NA NA TIMP3 149914 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 33202971 33203258 33203149 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 7284 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 33240240 33240586 33240349 Y NA TIMP3,Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 13834 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 36325608 36325959 36325784 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 96514 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 36385915 36386246 36386112 Y NA RBFOX2 NA NA NA NA RBFOX2 36227 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr22 36728624 36729163 36728912 Y IFT27 NA NA NA NA NA MYH9 52900 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 36762359 36762844 36762518 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 19219 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr22 37624378 37624586 37624525 Y SH3BP1,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,RAC2 NA NA NA NA RAC2 13902 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 39854172 39854554 39854368 Y CBX7,SYNGR1,MGAT3,MGAT3 NA NA NA NA NA ATF4 59146 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 40686331 40686363 40686350 Y MKL1,GRAP2,TNRC6B NA NA NA NA NA ADSL 54144 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37,MCHR1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 41839332 41839605 41839469 Y TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 1422 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr22 43004784 43005250 43005076 Y SERHL2 RRP7B,POLDIP3,RNU12,CYB5R3 NA NA NA NA POLDIP3 3718 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 43165805 43166293 43166166 Y NFAM1,ARFGAP3 NA ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3 IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 50501 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr22 43409761 43409918 43409853 Y PACSIN2,PACSIN2 PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 610 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 46035019 46035329 46035174 Y NA ATXN10 NA NA NA NA ATXN10 30349 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 46483894 46484294 46483949 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 20123 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 46745093 46745309 46745201 Y NA TRMU NA NA NA NA TRMU 20321 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 46903959 46904067 46904019 Y NA CELSR1 NA NA NA NA CELSR1 27000 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 46924162 46924396 46924177 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 6671 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 47250044 47250415 47250236 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 93526 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr22 47330872 47331057 47330965 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 174354 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr22 49009124 49009326 49009225 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 983701 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CTA-384D8.31,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA CTA-384D8.31 4415 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 143282 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 16178 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40 46235 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 10157932 10158133 10158106 Y NA BRK1,VHL,IRAK2 NA NA NA NA BRK1 2656 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 10236121 10236711 10236339 Y NA IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 31572 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 11609664 11609798 11609746 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 150422 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 11632872 11633201 11633091 Y SYN2,VGLL4 NA NA NA NA NA VGLL4 127019 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 11759856 11760132 11759896 Y NA VGLL4 NA NA NA NA VGLL4 88 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 12350153 12350305 12350183 Y NA PPARG NA NA NA NA PPARG 23286 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 12398616 12399008 12398699 Y RAF1,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 71749 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr3 15060728 15061023 15060876 Y NR2C2 MRPS25 NA NA NA NA MRPS25 43819 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 17114706 17114930 17114818 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 272547 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 17404652 17404912 17404782 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 562493 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 17441926 17442172 17442040 Y PLCL2 NA NA NA NA NA PLCL2 599767 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 17650424 17650697 17650561 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 808265 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 18399008 18399057 18399033 Y SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 85252 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 20012721 20012798 20012760 Y NA RAB5A NA NA NA NA RAB5A 26150 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 21623868 21623880 21623874 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D 788932 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 24340917 24341295 24341106 Y NA NA NA NA NA NA THRB 193478 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 24563741 24564038 24564033 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28968 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.07199697001961 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 339559 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 32534481 32534843 32534759 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 8057 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 32863625 32863886 32863704 Y NA AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 38487 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 34543919 34544003 34543961 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 706075 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 39191403 39191804 39191748 Y NA TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 2249 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr3 43221606 43221805 43221773 Y CCDC13,SNRK NA SNRK,ANO10,FAM198A,ABHD5 IMR90 Hi-C 24141950 SNRK 104199 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.51345206637968 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 44652575 44652865 44652702 Y ZNF445,ZNF502,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 28195 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 45155178 45155398 45155286 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 30516 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 45161726 45162069 45161866 Y TMEM158 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 23845 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 47203467 47203704 47203598 Y NA SETD2 NA NA NA NA SETD2 10 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA SMARCC1 116343 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 50354393 50354598 50354449 Y MST1R IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA HYAL2 3739 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 51377903 51378233 51378113 Y NA MANF,RBM15B NA NA NA NA MANF 42245 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 52590623 52590962 52590793 Y NA NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 23553 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 55194265 55194440 55194343 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 327533 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 56873709 56874050 56874038 Y NA NA NA NA NA NA FAM208A 158444 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr3 57995654 57995894 57995762 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3527 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 58038147 58038335 58038213 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 46020 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 58411955 58412199 58412053 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 5385 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 62572991 62573174 62573036 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 219986 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 64147375 64147623 64147507 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 139717 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 66021951 66022397 66022084 Y NA MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 112 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 67040750 67040873 67040812 Y NA KBTBD8 KBTBD8 MCF7 ChIA-PET 22265404 KBTBD8 5854 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 71509041 71509324 71509198 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 121816 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 71863099 71863325 71863212 Y NA NA NA NA NA NA EIF4E3 61175 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 73040663 73040928 73040772 Y NA PPP4R2 NA NA NA NA PPP4R2 3008 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 76160921 76161072 76160934 Y NA NA NA NA NA NA ROBO2 207075 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 77273270 77273652 77273462 Y ROBO2,ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 792101 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 89163442 89163800 89163560 Y NA EPHA3 NA NA NA NA EPHA3 8768 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 1144696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 98270793 98270966 98270897 Y CPOX,CLDND1,GPR15 CLDND1,CPOX NA NA NA NA CLDND1 30883 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 98272798 98273262 98273095 Y OR5H6,OR5H2,GPR15 CLDND1,CPOX NA NA NA NA CLDND1 32888 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 98685741 98686133 98685825 Y NA LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 11769 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 99582587 99582828 99582708 Y FILIP1L NA NA NA NA NA COL8A1 227268 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 99587238 99587483 99587373 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 231919 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 100482455 100482783 100482461 Y NA NA NA NA NA NA TFG 56250 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 105395533 105395739 105395657 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 190657 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 105722948 105723182 105723045 Y CBLB NA NA NA NA NA CBLB 136552 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 105838688 105838919 105838809 Y NA NA CBLB MCF7 ChIA-PET 22265404 CBLB 252292 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 107504411 107504731 107504449 Y NA NA NA NA NA NA BBX 264628 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 111018172 111018454 111018312 Y NA NA NA NA NA NA PVRL3 231254 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 114271834 114271933 114271884 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 498374 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 115595102 115595314 115595123 Y GAP43 NA NA NA NA NA GAP43 254931 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 115843003 115843038 115843021 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 502832 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 115939995 115940280 115940138 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 599824 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 116118770 116119229 116119052 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 624316 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 119357693 119358081 119357897 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 4696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 119644387 119644860 119644721 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 166404 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 123372011 123372488 123372368 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 69622 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 123508502 123508917 123508819 Y NA NA NA NA NA NA MYLK 92261 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 123662416 123662605 123662519 Y NA CCDC14 NA NA NA NA CCDC14 15959 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 124531464 124532111 124531823 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 84251 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA SLC41A3 108923 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 131056791 131057139 131056963 Y NA NUDT16 NA NA NA NA NUDT16 41376 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 133811108 133811508 133811147 Y SLCO2A1 SLCO2A1 SLCO2A1,C3orf36 IMR90 Hi-C 24141950 SLCO2A1 42080 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 134047160 134047394 134047241 Y ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 26009 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 134087826 134088207 134088017 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 4114 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 134182898 134183261 134183039 Y AMOTL2 CEP63,ANAPC13 NA NA NA NA CEP63 19324 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 136466232 136466235 136466234 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 2985 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 136571906 136572239 136572061 Y TMEM22 RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 6657 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 138109159 138109469 138109274 Y NA MRAS,ESYT3 NA NA NA NA ESYT3 41959 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr3 141056151 141056465 141056211 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 15096 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 148781933 148782210 148782183 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20131 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 15530 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 149676286 149676648 149676501 Y TM4SF4 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 7524 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 136110 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 156268270 156268550 156268410 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 2423 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 156403084 156403595 156403347 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 12917 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 156846039 156846735 156846192 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1 CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 29814 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 158447066 158447110 158447086 Y NA MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA MFSD1 877 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 169172792 169172932 169172865 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 206474 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA TERC 1241 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 171074101 171074325 171074213 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 101872 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 171146057 171146176 171146159 Y NA TNIK NA NA NA NA TNIK 30021 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 171594447 171594730 171594655 Y NA NA NA NA NA NA PLD1 67707 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 171855430 171855856 171855550 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 100012 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 171859893 171860698 171860535 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 104475 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 171948409 171948713 171948561 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 192991 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2 NA NA NA NA ECT2 43612 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 177170399 177170552 177170483 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 257138 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 183024720 183025033 183024891 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA B3GNT5 55688 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 185484664 185484670 185484667 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 56174 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 187459288 187459644 187459469 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA RP11-211G3.2 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 187901313 187901616 187901372 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 31468 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 187980692 187981197 187980748 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 110847 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 188324508 188324886 188324659 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 338542 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 188475500 188475699 188475599 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 187729 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 188618525 188618672 188618589 Y NA TPRG1-AS1 NA NA NA NA TPRG1-AS1 44756 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 189794828 189795104 189794939 Y NA LEPREL1-AS1,LEPREL1 NA NA NA NA LEPREL1-AS1 41649 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 194048965 194049014 194048990 Y NA LRRC15 NA NA NA NA LRRC15 39458 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 194299958 194300402 194300090 Y NA TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 2338 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 194341751 194341921 194341813 Y NA TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44,LSG1 NA NA NA NA AC046143.3 9731 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 195264699 195265107 195264994 Y ACAP2,TNK2,PPP1R2 PPP1R2 NA NA NA NA PPP1R2 3102 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 195627582 195627903 195627662 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 NA NA NA NA NA TFRC 179157 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 195633702 195634304 195633876 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 NA NA NA NA NA TFRC 172756 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 196381001 196381149 196381075 Y PCYT1A,TM4SF19,SENP5,MFI2,MFI2,LRRC33 LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 16355 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr3 197121526 197121880 197121703 Y DLG1 NA DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 97355 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 197214864 197215009 197214889 Y NA NA DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 BDH1 83185 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 742666 742733 742699 Y NA PCGF3,RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 30904 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr4 770204 770556 770391 Y ZNF141 RP11-440L14.1,CPLX1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 3081 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 1710531 1710811 1710671 Y NA SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 1471 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 2691649 2691991 2691819 Y NA NA NA NA NA NA TNIP2 64112 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 6732812 6732932 6732874 Y TBC1D14,TBC1D14 MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 23205 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 6887984 6888235 6888115 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 20734 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 105342 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 10116801 10117310 10116981 Y WDR1 WDR1 NA NA NA NA WDR1 228 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 15895700 15895839 15895750 Y FGFBP1 NA CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CD38 117802 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 16629750 16630155 16629855 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 268277 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 16898557 16898776 16898740 Y NA LDB2 NA NA NA NA LDB2 125 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 20521707 20522059 20521739 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 173846 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 21792715 21792997 21792947 Y NA NA NA NA NA NA KCNIP4 155425 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 23890635 23890864 23890849 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 12848 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr4 23947088 23947695 23947571 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 43376 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr4 26338276 26338542 26338322 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 175199 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 60645 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 38283120 38283331 38283203 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 323064 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr4 39038547 39038755 39038651 Y NA KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 5904 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 39285630 39285978 39285919 Y RFC1 NA NA NA NA NA RFC1 80017 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 42440171 42440281 42440226 Y NA NA NA NA NA NA ATP8A1 216841 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 57038192 57038203 57038198 Y ARL9 NA NA NA NA NA AASDH 213463 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 67430351 67431255 67431078 Y NA NA NA NA NA NA RP11-396M11.1 472507 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr4 74591640 74592145 74591915 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 12078 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 77133814 77134170 77133987 Y NAAA,CXCL10,CXCL11 SCARB2,FAM47E NA NA NA NA FAM47E 621 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 77626325 77626422 77626374 Y NA NA NA NA NA NA SEPT11 242434 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 77724798 77724936 77724862 Y NA NA NA NA NA NA SEPT11 143920 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 78656019 78656351 78656260 Y NA NA NA NA NA NA CNOT6L 82418 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 79568830 79569248 79568994 Y NA LINC01094 NA NA NA NA LINC01094 3773 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 84034119 84034423 84034342 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 21805 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 84398625 84398990 84398638 Y NA HELQ,MRPS18C,FAM175A NA NA NA NA MRPS18C 23540 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 84463489 84463647 84463621 Y AGPAT9 FAM175A,AGPAT9 NA NA NA NA AGPAT9 8422 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 87960081 87960248 87960138 Y NA NA NA NA NA NA TECRP1 90805 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 88939808 88939842 88939826 Y NA SPP1,PKD2 NA NA NA NA PKD2 12988 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 95542272 95542471 95542377 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1B 134648 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 100861794 100861850 100861822 Y NA LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ NA NA NA NA DNAJB14 4033 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 103360821 103361254 103361183 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 10406 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 103967476 103967511 103967493 Y NA SLC9B1,SLC9B2 NA NA NA NA SLC9B1 28580 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 108819119 108819373 108819246 Y NA CYP2U1 NA NA NA NA CYP2U1 31152 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.51345206637968 chr4 120205306 120205694 120205553 Y NA C4orf3 NA NA NA NA C4orf3 17906 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 123686146 123686329 123686228 Y FGF2 BBS12 NA NA NA NA BBS12 34289 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 124073506 124073670 124073588 Y NUDT6 NA NA NA NA NA SPATA5 231277 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 129389693 129389923 129389761 Y NA NA PHF17,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 177787 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 134077378 134077602 134077486 Y NA PCDH10 NA NA NA NA PCDH10 8908 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 139960222 139960706 139960403 Y CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25279 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 140035787 140036142 140035958 Y NA NA NA NA NA NA ELF2 60230 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 140235316 140235657 140235500 Y ELF2,RAB33B NAA15,NDUFC1 NA NA NA NA NDUFC1 13611 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 140656102 140656508 140656327 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 71180 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 148768906 148769305 148769088 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 117692 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 SH3D19 FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3D19 1248 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 152405859 152406228 152406131 Y NA NA NA NA NA NA FAM160A1 77491 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 153894415 153894544 153894479 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 38911 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr4 154253952 154254140 154254046 Y NA MND1 NA NA NA NA MND1 9661 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 154598070 154598582 154598380 Y TLR2 NA TLR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF175 80805 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 158941982 158942153 158942075 Y TMEM144 NA FAM198B,GRIA2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-597D13.9 147751 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 159082542 159083127 159082686 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA RP11-597D13.9 6777 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 169559850 169560019 169559874 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 102913 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 169716186 169716224 169716221 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 213202 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 169853850 169854103 169853858 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 75323 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 174435467 174435730 174435599 Y HAND2 HAND2 NA NA NA NA HAND2 13650 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 174443845 174444302 174443959 Y HAND2 HAND2 NA NA NA NA HAND2 5078 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr4 177191849 177192202 177191988 Y ASB5 ASB5,SPCS3,RP11-87F15.2 SPATA4 IMR90 Hi-C 24141950 ASB5 4520 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 183564955 183565246 183565103 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 271843 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 183826285 183826336 183826311 Y NA DCTD NA NA NA NA DCTD 10753 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 184387095 184387281 184387201 Y C4orf41,CDKN2AIP CDKN2AIP,ING2 NA NA NA NA CDKN2AIP 23351 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr4 184643961 184644129 184644061 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC11 65541 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 186455582 186456046 186455940 Y NA PDLIM3 NA NA NA NA PDLIM3 816 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 187621819 187622251 187622136 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 23625 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 190487491 190487755 190487631 Y FRG1 NA NA NA NA NA FRG1 372188 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 151095 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr5 190691 190901 190821 Y SDHA,LRRC14B CCDC127,SDHA NA NA NA NA CCDC127 25429 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 208612 208991 208802 Y PLEKHG4B CCDC127,SDHA NA NA NA NA CCDC127 7339 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 373392 373627 373429 Y EXOC3,C5orf55,PDCD6 NA NA NA NA NA C5orf55 67631 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 669501 669935 669710 Y TPPP NA NA NA NA NA CEP72 59114 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 672861 673336 673024 Y NA NA NA NA NA NA CEP72 62474 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.35126942183958 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TRIP13 105735 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 957591 958302 957640 Y NKD2 NA NA NA NA NA BRD9 66652 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 963791 964176 964051 Y NA NA SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 BRD9 72852 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 964244 964536 964396 Y NKD2 NA SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 BRD9 73305 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr5 964858 965249 965055 Y NA NA SLC12A7,TRIP13,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 BRD9 73919 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 1155287 1155504 1155358 Y NA SLC12A7 SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9 IMR90 Hi-C 24141950 SLC12A7 45137 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 1182870 1183091 1183042 Y SLC6A19,SLC6A18 NA LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 72720 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 5340490 5340721 5340596 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 78056 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.35126942183958 chr5 8843874 8844185 8844159 Y NA NA SEMA5A IMR90 Hi-C 24141950 SEMA5A 700002 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 10229611 10229778 10229690 Y NA FAM173B,CCT5 NA NA NA NA FAM173B 18231 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 10759548 10759882 10759715 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 164 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 14109130 14109647 14109337 Y NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 32164 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 14186205 14186627 14186374 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 44394 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 15451801 15451916 15451863 Y NA FBXL7 FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXL7 46389 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 18697987 18698184 18698066 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP21 650328 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 23303766 23303789 23303778 Y NA NA NA NA NA NA HSPD1P1 1423072 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 32274798 32274903 32274861 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 36212 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 32760271 32760413 32760371 Y SUB1 NA NA NA NA NA SUB1 230532 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 32768263 32768639 32768422 Y SUB1 NA NA NA NA NA SUB1 238524 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 33003912 33004012 33003962 Y NA NA NPR3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-36C20.1 156273 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 33789074 33789288 33789217 Y ADAMTS12 NA NA NA NA NA ADAMTS12 101009 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 34006520 34007060 34007033 Y C1QTNF3,AMACR AMACR NA NA NA NA AMACR 300 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 34710052 34710312 34710173 Y RAI14,RAI14 NA NA NA NA NA RAI14 55710 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 35853494 35854024 35853833 Y SPEF2,IL7R NA SPEF2 IMR90 Hi-C 24141950 SPEF2 237548 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 36119586 36119746 36119728 Y SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA LMBRD2 30317 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 37209037 37209204 37209072 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 38326 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 37718043 37718447 37718273 Y NA NA NA NA NA NA GDNF 119341 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 37838047 37838605 37838394 Y GDNF,GDNF,GDNF GDNF NA NA NA NA GDNF 259 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr5 37838959 37839206 37839080 Y GDNF,GDNF,GDNF GDNF NA NA NA NA GDNF 1171 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 38446340 38446486 38446390 Y EGFLAM CTD-2263F21.1 NA NA NA NA CTD-2263F21.1 19955 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 22884 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 39014770 39014929 39014863 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 57581 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 39399549 39400018 39399831 Y NA C9 NA NA NA NA C9 22952 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 39721328 39721512 39721418 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 260926 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 40411118 40411409 40411246 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 266191 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 40502915 40503143 40503055 Y NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 174457 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 40689630 40689893 40689724 Y NA PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 12030 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 41808683 41808882 41808783 Y NA NA NA NA NA NA OXCT1 59739 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8093 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 43034859 43034967 43034962 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC648987 MCF7 ChIA-PET 22265404 AC025171.1 4710 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr5 54197279 54197516 54197431 Y NA NA SNX18,HSPB3,ARL15,CDC20B,GPX8,GZMK,CCNO,ESM1 IMR90 Hi-C 24141950 GPX8 256430 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 56737388 56737596 56737493 Y NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 269613 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 56738135 56738571 56738168 Y ACTBL2 NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 270360 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 59630308 59630442 59630415 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1B 363575 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr5 59834380 59834549 59834441 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1B 159468 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 60625710 60626179 60625844 Y ELOVL7,ZSWIM6 NA ZSWIM6 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZSWIM6 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 60710257 60710608 60710433 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 24559 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 64328123 64328532 64328278 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA CWC27 265366 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 65898344 65898352 65898348 Y MAST4 MAST4 NA NA NA NA MAST4 8168 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr5 71643596 71644131 71643868 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 29123 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 71648982 71649164 71649085 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 34509 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 72607592 72607820 72607706 Y NA NA FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 134532 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 76086859 76087104 76086921 Y F2R,F2RL1 F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25654 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 76103019 76103387 76103332 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 9371 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 77148404 77148543 77148518 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 14061 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 77765293 77765351 77765322 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 110954 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 77822722 77823939 77823093 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 168383 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 77837141 77837359 77837248 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 182802 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 172566 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 78279443 78279488 78279465 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 422 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 79421543 79422183 79421865 Y ZFYVE16,FAM151B NA NA NA NA NA SERINC5 127715 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 79458255 79458620 79458438 Y MSH3,SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 91278 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 80898051 80898414 80898329 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 147202 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr5 81469981 81470152 81470091 Y NA NA NA NA NA NA RPS23 102244 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 81653126 81653457 81653257 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 80730 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 81661583 81662026 81661933 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 89187 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 81934356 81934439 81934367 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 361960 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 82769254 82769739 82769524 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3970 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 83545538 83546053 83545791 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 132192 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 83642905 83643068 83642987 Y NA CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 35177 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 83652187 83652571 83652379 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 25674 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 83674189 83674553 83674373 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 3692 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 83790350 83790680 83790547 Y NA NA NA NA NA NA EDIL3 111739 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 86417910 86418259 86418047 Y NA NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 143446 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 86604017 86604207 86604034 Y RASA1,RASA1 RASA1 NA NA NA NA RASA1 42312 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 5689 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 88182731 88182852 88182759 Y MEF2C,MEF2C MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 5586 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 88249242 88249425 88249337 Y NA NA NA NA NA NA MEF2C 51320 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 95178953 95179190 95179087 Y GLRX,ELL2 GLRX GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 22244 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 95199166 95199388 95199264 Y GLRX,ELL2 GLRX NA NA NA NA GLRX 42457 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 95205682 95206201 95205913 Y GLRX,ELL2 GLRX NA NA NA NA GLRX 48973 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 95845653 95846023 95845804 Y NA CAST NA NA NA NA CAST 12948 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 98197255 98197391 98197342 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 65484 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 106862612 106863005 106862809 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 141591 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 106906858 106907181 106907119 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97415 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 108749637 108749884 108749767 Y NA PJA2 NA NA NA NA PJA2 5942 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr5 110830968 110831101 110831035 Y WDR36,CAMK4,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 15187 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 112242412 112242755 112242610 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA REEP5 13481 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 112488509 112488542 112488526 Y NA NA NA NA NA NA DCP2 178110 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 114750887 114751289 114751050 Y NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 120359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 114970299 114970641 114970577 Y NA AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7 NA NA NA NA TMED7 3610 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr5 118703348 118703546 118703439 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 82592 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 122108155 122108524 122108401 Y SNX24,SNX2 SNX2 NA NA NA NA SNX2 167 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 122322384 122322589 122322416 Y NA PPIC NA NA NA NA PPIC 47847 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 123996464 123996708 123996619 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 85792 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 124077955 124078154 124078062 Y ZNF608 ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 4346 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 125704201 125704675 125704554 Y C5orf48 GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 10377 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 126217588 126217612 126217598 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 107273 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 129563384 129563648 129563470 Y NA NA NA NA NA NA CHSY3 325219 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 131015627 131015946 131015841 Y FNIP1,CDC42SE2 RAPGEF6 RAPGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF6 46698 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 131595834 131595951 131595900 Y KIF3A,PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 4470 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 10021 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA AFF4 26161 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 132404436 132404641 132404539 Y LEAP2 ZCCHC10,HSPA4 NA NA NA NA HSPA4 18782 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 133465566 133465711 133465642 Y PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 17164 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 133470244 133470404 133470305 Y NA TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 21842 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA AC005355.1 92728 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 91943 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 134602658 134602833 134602747 Y NA NA H2AFY,LOC340073,CATSPER3 IMR90 Hi-C 24141950 H2AFY 130771 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 134791969 134792408 134792068 Y H2AFY NA H2AFY K562 ChIA-PET 22265404 H2AFY 58365 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 135330774 135331163 135330964 Y NA TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 31421 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr5 135341804 135342193 135341990 Y FBXL21,TGFBI TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 20391 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 135352622 135352730 135352676 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 9854 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 138127302 138127500 138127374 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM2 81557 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM2 68892 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 138686401 138686737 138686569 Y NA PAIP2 NA NA NA NA PAIP2 11125 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1 NA NA NA NA VTRNA1-1 9421 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 140420005 140420137 140420073 Y NA NA PCDHA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PCDHB2 52090 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 140983787 140984197 140984031 Y PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 12425 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 141769483 141770003 141769555 Y NA NA SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 65463 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 142042808 142043187 142042997 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 104762 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 142362111 142362403 142362189 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 214162 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 143073364 143073384 143073375 Y KCTD16 NA ARHGAP26,KCTD16,HMHB1,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 260287 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 146242854 146243152 146243003 Y GPR151,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA PPP2R2B 219195 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 146783633 146784144 146783972 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 103475 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr5 146832241 146832308 146832261 Y JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55311 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 146887479 146887544 146887495 Y DPYSL3 DPYSL3 NA NA NA NA DPYSL3 75 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 148760371 148760619 148760464 Y NA GRPEL2,PCYOX1L,MIR143HG,MIR145 NA NA NA NA MIR143HG 23633 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 148777144 148777405 148777275 Y NA PCYOX1L,MIR143HG,MIR145 IL17B,MIR143HG,CSNK1A1,ARHGEF37 IMR90 Hi-C 24141950 MIR143HG 6847 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 148832906 148833066 148832986 Y NA MIR143HG,MIR145 NA NA NA NA MIR145 25057 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 148869266 148869383 148869317 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 59624 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 149111581 149111664 149111645 Y NA PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 3720 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 149522462 149523132 149522666 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 10303 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 150159490 150160262 150159991 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 22819 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr5 150476545 150477196 150477013 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5407 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 157097652 157097963 157097872 Y NA NA NA NA NA NA THG1L 58242 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 157257409 157257732 157257678 Y NA CLINT1 NA NA NA NA CLINT1 26451 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 158201990 158201999 158201995 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 322770 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 158394581 158395139 158394894 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 129630 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 158521683 158522288 158522053 Y EBF1 EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 2481 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 158876999 158877252 158877089 Y NA NA NA NA NA NA UBLCP1 188910 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 162428835 162428856 162428847 Y NA NA NA NA NA NA CCNG1 433719 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 167157088 167157552 167157214 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 559104 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 168221385 168221766 168221495 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 180068 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 168229147 168229460 168229328 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 187830 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 168279021 168279443 168279141 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 237704 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 168302839 168303219 168303163 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 261522 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 169763244 169763483 169763299 Y LCP2,KCNMB1 NA NA NA NA NA FAM196B 357500 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 170878093 170878163 170878150 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 65973 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 171094849 171095086 171094946 Y NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1 282729 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 171431879 171432256 171432181 Y UBTD2,STK10 FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 2 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 171660495 171660734 171660615 Y NA STK10,UBTD2 NA NA NA NA STK10 47105 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr5 172308731 172309533 172309021 Y DUSP1,C5orf41 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 49453 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 172329840 172330200 172330006 Y DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1 NA NA NA NA NA RPL26L1 53532 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 172370220 172370579 172370385 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 13153 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 173764742 173765021 173764892 Y NA RP11-267A15.1 HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 3444 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 173765324 173765497 173765445 Y MSX2 RP11-267A15.1 HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 4026 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 173811612 173811806 173811713 Y NA NA NA NA NA NA RP11-267A15.1 50314 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr5 173815215 173815442 173815329 Y NA NA NA NA NA NA RP11-267A15.1 53917 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 173829000 173829006 173829003 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 67702 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 173956576 173956772 173956664 Y HMP19 NA MSX2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-267A15.1 195278 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 176359562 176359884 176359876 Y RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6 NA NA NA NA NA UIMC1 87750 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 176790168 176790403 176790363 Y DOK3,RGS14 LMAN2,RGS14,GRK6 NA NA NA NA RGS14 7330 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 176855088 176855271 176855220 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,PRR7-AS1,DBN1 NA NA NA NA PRR7 16175 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 178034122 178034420 178034258 Y ZNF354B,AGXT2L2,CLK4 CLK4 NA NA NA NA CLK4 21196 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 179434619 179435010 179434852 Y NA NA NA NA NA NA RNF130 62108 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr5 180541875 180541994 180541989 Y OR2Y1 NA BTNL8,MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-338M12.5 74930 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 3248062 3248427 3248198 Y SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B PSMG4,TUBB2B TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 TUBB2B 18098 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 5997075 5997523 5997169 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 7677 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 6811454 6812228 6812086 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 293602 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 7166669 7166920 7166778 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 60839 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA SSR1 83959 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 7591248 7591486 7591394 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 2816 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 11212824 11213214 11213068 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 167367 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 11318376 11319012 11318732 Y TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 61569 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 16771345 16771373 16771363 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATXN1 11623 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 17932767 17932988 17932837 Y RNF144B,KDM1B NA NA NA NA NA KIF13A 52866 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 21129910 21130117 21129994 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 461855 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr6 25441655 25442041 25441684 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 164349 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr6 26025834 26026125 26026038 Y BTN2A1,BTN2A1,TRIM38 HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 354 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 26029019 26029363 26029242 Y NA HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H3B 925 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2AH 32868 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 27686942 27687278 27687069 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 86431 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 27798416 27798741 27798578 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H4K 1111 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 28180543 28180884 28180590 Y NA ZKSCAN4 NA NA NA NA ZKSCAN4 44127 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 28565127 28565440 28565259 Y NA SCAND3 SCAND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SCAND3 16549 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 28834475 28834586 28834545 Y NA NA NA NA NA NA TRIM27 55180 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 30434534 30434831 30434712 Y DDR1,DDR1,DDR1,DDR1 RANP1,HLA-E PPP1R10,HLA-E,GNL1,PRR3,MRPS18B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RANP1 16886 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 30604064 30604457 30604261 Y NA MRPS18B,PPP1R10,ATAT1,C6orf136,DHX16,PPP1R18 NA NA NA NA C6orf136 8359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 30755729 30756010 30755821 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,IER3,MDC1,DDR1,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 45398 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr6 32114130 32114430 32114186 Y GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,PBX2 NA NA NA NA PPT2 4788 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr6 33386765 33387072 33386901 Y HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 918 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 6949 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 34625381 34625487 34625387 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37149 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 35457906 35458213 35458053 Y TEAD3 FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA TEAD3 4640 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 35875551 35875739 35875654 Y SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1 SRPK1 NA NA NA NA SRPK1 11380 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 36321421 36321620 36321472 Y CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7 NA NA NA NA NA KCTD20 86924 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 7.26108374731908 chr6 36737758 36737957 36737899 Y ETV7,ETV7,PXT1,PIM1 NA NA NA NA NA CPNE5 67821 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 37210643 37210874 37210721 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 12674 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 37892657 37892863 37892737 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 107382 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 39850347 39850811 39850571 Y NA MOCS1 NA NA NA NA MOCS1 49479 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 42413186 42413554 42413522 Y NA TRERF1 GUCA1B,MRPS10 IMR90 Hi-C 24141950 TRERF1 4235 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 42678244 42678442 42678368 Y PRPH2 TBCC NA NA NA NA TBCC 34116 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 43084087 43084410 43084171 Y PTK7 PTK7 NA NA NA NA PTK7 42081 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 43505816 43505905 43505861 Y ABCC10,TJAP1 POLR1C,LRRC73,YIPF3,XPO5,POLH NA NA NA NA YIPF3 23088 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 43757757 43757886 43757846 Y NFKBIE,TJAP1 VEGFA NA NA NA NA VEGFA 21836 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA C6orf223 87630 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 43978439 43978901 43978686 Y NFKBIE C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 12122 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr6 43979820 43980209 43980006 Y NFKBIE,MAD2L1BP C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 13503 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA C6orf223,RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.1 27904 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 44021972 44022127 44022048 Y SLC35B2 RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.1 18262 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 44024667 44024914 44024806 Y SLC35B2 RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.1 15475 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 44031882 44032664 44032378 Y NFKBIE,MAD2L1BP RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.1 7725 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 44396303 44396427 44396307 Y NA CDC5L NA NA NA NA CDC5L 43041 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 44627574 44627760 44627625 Y NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 274312 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 45299904 45300369 45300004 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 6010 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 45354242 45354498 45354371 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 10552 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 45623562 45623937 45623654 Y NA NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 279872 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 52416321 52416567 52416441 Y NA TRAM2 EFHC1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAM2 23146 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 52439625 52439825 52439764 Y TRAM2 NA NA NA NA NA TRAM2 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 53167531 53167800 53167691 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 44147 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA COL21A1 NA NA NA NA COL21A1 39521 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 56811664 56812033 56811848 Y NA BEND6 BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BEND6 5740 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 57052407 57052730 57052411 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 17283 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 69487592 69487966 69487779 Y BAI3 NA NA NA NA NA BAI3 144333 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 70505414 70505608 70505498 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 411 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 71337325 71337571 71337450 Y NA SMAP1 NA NA NA NA SMAP1 37908 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 58249 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 74295823 74296227 74295840 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 64303 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 74432369 74432753 74432573 Y MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109 CD109 NA NA NA NA CD109 28861 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 75278400 75278829 75278677 Y NA NA COL12A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL12A1 634938 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 75914223 75914620 75914578 Y COL12A1 COL12A1,COX7A2 NA NA NA NA COL12A1 456 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr6 88433013 88433258 88433054 Y AKIRIN2 AKIRIN2 AKIRIN2-AS1,AKIRIN2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AKIRIN2 23086 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 90774597 90775020 90774993 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 229607 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 90994076 90994276 90994132 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 10351 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 107014040 107014053 107014047 Y BEND3,RTN4IP1 NA NA NA NA NA RTN4IP1 61320 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 109381114 109381226 109381160 Y NA SESN1,CEP57L1 NA NA NA NA SESN1 32796 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 110604803 110604988 110604982 Y NA NA NA NA NA NA CDC40 105459 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 111382725 111382978 111382849 Y AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10 NA NA NA NA NA RPF2 81507 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr6 111808995 111809308 111809091 Y REV3L,FYN,TRAF3IP2 TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA REV3L 6077 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 112078631 112078983 112078811 Y REV3L,FYN,FYN,FYN NA NA NA NA NA FYN 113672 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 112145008 112145393 112145362 Y REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 47262 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 112358882 112359559 112359206 Y TRAF3IP2 TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 47173 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 112449250 112449618 112449554 Y NA TUBE1 NA NA NA NA TUBE1 42518 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA RP11-367G18.1 NA NA NA NA RP11-367G18.1 36530 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 115163170 115163515 115163320 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 832698 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 116469368 116469398 116469382 Y NA NT5DC1 NA NA NA NA NT5DC1 49356 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 118759105 118759218 118759162 Y NA NA NA NA NA NA CEP85L 270020 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 119668375 119668773 119668762 Y NA MAN1A1 NA NA NA NA MAN1A1 153 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 126271537 126271736 126271680 Y NA HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 4191 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 128331151 128331455 128331303 Y NA NA NA NA NA NA SOGA3 493005 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 128921613 128921847 128921739 Y NA NA PTPRK MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTPRK 81743 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 133839183 133839299 133839241 Y EYA4 NA NA NA NA NA EYA4 279447 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 134669516 134669878 134669820 Y NA SGK1 SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 32266 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 134743944 134744382 134744175 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 106694 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 136336050 136336507 136336258 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 165216 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 136528020 136528260 136528195 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 80729 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr6 138194322 138194912 138194642 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 7971 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 139697079 139697371 139697327 Y NA CITED2 NA NA NA NA CITED2 3322 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 145131744 145132215 145131879 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 611642 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA YAP1P1 81824 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 148830845 148831563 148831298 Y UST NA NA NA NA NA UST 234901 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 150076607 150076998 150076645 Y KATNA1,LATS1 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 7806 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 150200694 150201094 150200866 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 16495 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 152281783 152282174 152281880 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA C6orf211 510361 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 157267788 157267851 157267817 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 170725 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 157274060 157274135 157274104 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 176997 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 157297453 157297730 157297519 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 200390 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 158185393 158186221 158185862 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 56075 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 158424430 158424803 158424679 Y SYNJ2 SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 23542 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 158463343 158463878 158463391 Y SNX9,SYNJ2 NA NA NA NA NA SYNJ2 62455 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr6 158478416 158478907 158478642 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 77528 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 32985 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 160532967 160533203 160533063 Y NA NA SLC22A1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2R 144836 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 161693137 161693518 161693484 Y NA AGPAT4 MAP3K4 IMR90 Hi-C 24141950 AGPAT4 44 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 161855973 161856365 161856002 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 162880 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr6 161865712 161865782 161865740 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 172619 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 162477618 162478021 162477976 Y NA NA NA NA NA NA PACRG 668143 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 163784160 163784198 163784179 Y NA QKI PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 48834 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA LINC00473 22766 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr6 169497404 169497715 169497550 Y THBS2 NA PHF10,THBS2,WDR27,C6orf70 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 63304 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 169546204 169546599 169546528 Y NA RP11-417E7.1 NA NA NA NA RP11-417E7.1 14420 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 169568038 169568505 169568172 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 7019 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr6 169588480 169588865 169588804 Y NA RP11-417E7.1 WDR27,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 27461 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr6 169827902 169828288 169828095 Y NA NA NA NA NA NA THBS2 175763 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 89354 89662 89513 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 101307 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 90161 90450 90245 Y FAM20C NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 100519 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C FAM20C NA NA NA NA FAM20C 562 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 213646 214008 213845 Y NA FAM20C NA NA NA NA FAM20C 22677 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 1456103 1456158 1456132 Y NA MICALL2,AC102953.4 NA NA NA NA MICALL2 40980 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 1495047 1495214 1495102 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1 NA NA NA NA MICALL2 1924 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 1553000 1553189 1553120 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 9511 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 1560213 1560697 1560426 Y C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 7653 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr7 1573524 1573718 1573598 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5174 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 1574153 1574602 1574313 Y NA INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5803 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 1883097 1883273 1883258 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 103170 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 2058424 2058871 2058630 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 212007 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 2143904 2144149 2144041 Y LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 126729 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 2150639 2150902 2150796 Y SNX8,LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 119976 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 2351826 2352447 2352374 Y SNX8 EIF3B,SNX8 NA NA NA NA EIF3B 39274 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 2356665 2356933 2356799 Y NA EIF3B,SNX8 NA NA NA NA EIF3B 34788 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 2364831 2365125 2365016 Y SNX8,LFNG EIF3B,SNX8 KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1,MAD1L1,SNX8,FTSJ2,NUDT1,EIF3B,MAFK,TMEM184A IMR90 Hi-C 24141950 EIF3B 26596 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 2681143 2681305 2681209 Y SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3 TTYH3,AMZ1 NA NA NA NA TTYH3 11558 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 2773642 2774144 2773933 Y SNX8,LFNG NA NA NA NA NA AMZ1 56486 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 2778515 2778860 2778688 Y NA NA NA NA NA NA AMZ1 61359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 2797465 2798227 2798113 Y SNX8,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 75028 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 4133088 4133284 4133186 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 548104 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr7 4913549 4913687 4913618 Y NA AC092610.12 NA NA NA NA AC092610.12 10114 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 5471668 5472052 5471860 Y NA TNRC18 WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC18 8623 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 5718052 5718263 5718155 Y USP42 NA NA NA NA NA FSCN1 87613 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 5787686 5787972 5787829 Y NA RNF216 NA NA NA NA RNF216 31398 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316,AC073343.13 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316,AC073343.13 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 AC073343.13,ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 11869426 11869707 11869551 Y NA THSD7A NA NA NA NA THSD7A 117 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 17412000 17412058 17412028 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 75019 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 227019 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 17664691 17664931 17664811 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 313193 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 17721637 17721811 17721724 Y NA NA HDAC9,AGR2,AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 256313 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 19017733 19017917 19017790 Y TWIST1 NA NA NA NA NA TWIST1 137378 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 19146147 19146774 19146493 Y FERD3L,TWIST1 TWIST1 NA NA NA NA TWIST1 8521 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr7 19746950 19747169 19747121 Y NA TWISTNB NA NA NA NA TWISTNB 240 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 20346814 20347223 20346902 Y NA ITGB8 TMEM196,MACC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB8 21102 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 24151573 24151679 24151626 Y NPY NA NA NA NA NA MPP6 459208 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 24818395 24818855 24818677 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 11151 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 25002827 25003181 25002973 Y C7orf31,OSBPL3 OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 16072 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX3 342321 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX3 336668 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr7 27143635 27143783 27143725 Y NA HOTAIRM1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5 NA NA NA NA HOXA-AS2 1613 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 27152655 27152825 27152741 Y NA HOTAIRM1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5 NA NA NA NA HOXA-AS2 7259 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 27717680 27717897 27717733 Y NA HIBADH HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 17066 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 27876967 27877264 27877116 Y CREB5 NA NA NA NA NA AC004549.6 98953 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 28172246 28172388 28172317 Y NA JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 45974 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 28398288 28398440 28398364 Y NA NA NA NA NA NA CREB5 61348 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 29163209 29163338 29163275 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 3319 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 29294942 29295238 29295004 Y CHN2 NA NA NA NA NA CPVL 61875 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 33762230 33762341 33762268 Y NA NA BMPER,BBS9 IMR90 Hi-C 24141950 BMPER 180182 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 36231676 36232185 36231885 Y HERPUD2,EEPD1 EEPD1 NA NA NA NA EEPD1 40918 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 36555269 36555573 36555424 Y ELMO1,AOAH,EEPD1 NA NA NA NA NA KIAA0895 127535 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 36843340 36843728 36843600 Y ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 415606 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 40591236 40591497 40591392 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 603600 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 40611677 40611985 40611889 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 624041 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 40706026 40706047 40706035 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 718390 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 41926602 41926763 41926636 Y NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 185896 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 43683947 43684262 43684105 Y POLM,DBNL,STK17A NA NA NA NA NA STK17A 63590 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 43801940 43802267 43802061 Y NA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 5661 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 47367058 47367181 47367120 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 252975 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 47482953 47483112 47483033 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 137044 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 50905745 50905993 50905866 Y GRB10 GRB10 COBL,GRB10 IMR90 Hi-C 24141950 GRB10 46586 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 55198488 55198937 55198616 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 113774 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 55725404 55725623 55725518 Y NA NA NA NA NA NA VOPP1 86723 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 56173322 56173423 56173410 Y NA SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 1053 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 63767130 63767234 63767166 Y NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 1293 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 65360437 65360759 65360712 Y NA VKORC1L1 NA NA NA NA VKORC1L1 24183 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 68721718 68722081 68721900 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 339824 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 69308115 69308415 69308239 Y AUTS2,AUTS2 NA NA NA NA NA AUTS2 246210 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 69643869 69644054 69643961 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 581964 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 70206735 70207047 70206891 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1144830 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 72990459 72990574 72990513 Y NA BCL7B,TBL2 NA NA NA NA TBL2 547 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 73002313 73002519 73002399 Y BCL7B BCL7B,TBL2 TBL2 K562 ChIA-PET 22265404 TBL2 11192 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 73785571 73785673 73785623 Y CLIP2 NA NA NA NA NA GTF2IRD1 80447 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 75567331 75567651 75567437 Y POR POR NA NA NA NA POR 40813 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 75599122 75599360 75599199 Y NA TMEM120A NA NA NA NA TMEM120A 22617 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 157068 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 80836919 80837151 80837079 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 287244 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 81233474 81233832 81233648 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163922 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 81234008 81234151 81234026 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163603 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr7 94021237 94021945 94021560 Y NA NA NA NA NA NA COL1A2 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 94284072 94284624 94284343 Y NA SGCE,RPS3AP25 NA NA NA NA SGCE 551 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 95030354 95030375 95030365 Y NA PON2 NA NA NA NA PON2 32135 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 98871923 98872129 98871984 Y NA ARPC1A NA NA NA NA ARPC1A 49392 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 98990795 98991133 98991082 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 13131 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 99963158 99963846 99963542 Y ZCWPW1,MEPCE,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 25627 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 100144113 100144628 100144364 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9279 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 100760673 100761017 100760905 Y GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF AP1S1,VGF MCF7 ChIA-PET 22265404 SERPINE1 7353 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 100765253 100766084 100765924 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 2286 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 101372678 101373024 101372861 Y NA NA CUX1,EMID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 83935 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr7 101525517 101525682 101525579 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 68558 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 101678350 101678537 101678444 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 221391 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 70882 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 NA NA NA NA NA LINC01004 53622 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 104771248 104771300 104771252 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 119757 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 104844953 104845066 104844998 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 192689 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 89729 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 110651753 110651984 110651824 Y LRRN3 NA NA NA NA NA LRRN3 77078 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 115849891 115849987 115849939 Y NA TES NA NA NA NA TES 1344 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 115887290 115887609 115887434 Y NA TES,CAV2 NA NA NA NA CAV2 37825 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 116181805 116181927 116181813 Y CAV1,CAV1 AC002066.1,CAV1 NA NA NA NA CAV1 18966 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 117470735 117470951 117470843 Y CTTNBP2 NA NA NA NA NA NAA38 351135 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 119300626 119300913 119300840 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 244516 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 120724784 120725242 120725000 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 135981 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 120945288 120945594 120945402 Y NA WNT16 NA NA NA NA WNT16 17827 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 121008996 121009049 121009023 Y NA WNT16,FAM3C NA NA NA NA FAM3C 25369 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 121783025 121783385 121783205 Y PTPRZ1,AASS AASS NA NA NA NA AASS 691 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 127663304 127663714 127663503 Y IMPDH1,GCC1,LRRC4 LRRC4 NA NA NA NA LRRC4 6446 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 127807416 127807928 127807646 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC4 137256 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 5.86472148821926 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 129598516 129598781 129598654 Y NRF1,UBE2H,UBE2H UBE2H UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2H 7727 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 7370 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 37404 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 131010342 131010498 131010376 Y MKLN1,MKLN1 MKLN1-AS NA NA NA NA MKLN1-AS 483 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 131580267 131580830 131580536 Y NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009518.4 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 131581821 131581890 131581855 Y NA AC009518.4 PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009518.4 1421 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 131589581 131589949 131589748 Y NA AC009518.4 PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009518.4 9181 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 133092941 133093104 133093022 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 94774 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 134144888 134145050 134144951 Y AKR1B1 AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 2852 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 134378159 134378392 134378229 Y AKR1B1,CALD1 BPGM,CALD1 NA NA NA NA BPGM 48599 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 134422783 134423192 134423006 Y NA CALD1 CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 CALD1 3811 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 134521262 134521714 134521389 Y NA NA NA NA NA NA CALD1 94259 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 135120473 135120740 135120725 Y NA NA NA NA NA NA CNOT4 72135 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 137352437 137352725 137352566 Y NA NA NA NA NA NA DGKI 177113 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 137418965 137419308 137419135 Y NA NA NA NA NA NA DGKI 110530 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 137646084 137646360 137646126 Y TRIM24,CREB3L2 CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 38453 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 139333682 139334086 139333875 Y TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA NA ERHP1 116696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 139358057 139358402 139358214 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 117175 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 139365521 139365926 139365718 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 109651 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 139616229 139616509 139616457 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 140652 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 139865327 139865485 139865448 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA PARP12 103806 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 148637842 148638122 148637883 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58429 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr7 148685182 148685277 148685231 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 38456 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 151193551 151193826 151193799 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21380 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 151397116 151397356 151397195 Y SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2 174854 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr7 155049368 155049519 155049432 Y NA INSIG1 NA NA NA NA INSIG1 37967 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 AC009403.2 318659 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 156800292 156800601 156800569 Y MNX1,MNX1 NA NA NA NA NA NOM1 59875 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 156932490 156932855 156932681 Y NA UBE3C NA NA NA NA UBE3C 2883 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 157070019 157070314 157070105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 55761 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 1693210 1693378 1693280 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 8566 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 1693574 1694042 1693752 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 7902 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 1694228 1694696 1694461 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 ARHGEF10,CLN8,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 7248 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 1765271 1765682 1765322 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 4460 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 6481206 6481441 6481325 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT2 62276 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr8 6517765 6517796 6517790 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA CTD-2541M15.1 45934 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 5.86472148821926 chr8 6518047 6518428 6518274 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA CTD-2541M15.1 45302 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 27.6479727301765 chr8 6536860 6537447 6537204 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2541M15.1 26283 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 32.6748768629359 chr8 8153597 8154098 8153801 Y NA NA MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 87910 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 8932382 8932915 8932599 Y CLDN23,PPP1R3B NA PPP1R3B,ERI1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PPP1R3B 74169 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 9219931 9220273 9220102 Y PPP1R3B NA NA NA NA NA TNKS 191151 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 10009702 10010057 10009864 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 99924 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 11754568 11755261 11754938 Y CTSB CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 29611 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 16222246 16222424 16222309 Y MSR1 NA MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 789114 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 16304872 16305090 16304981 Y NA NA TUSC3 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 706448 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 16476986 16477261 16477122 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 534277 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 16609902 16609923 16609912 Y VPS37A NA TUSC3,MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 401615 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr8 18722659 18722821 18722740 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 217419 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 18836263 18836433 18836318 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 103807 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 19028579 19029034 19028823 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 88339 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 19075736 19075934 19075838 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 93194 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr8 19533548 19533780 19533688 Y CSGALNACT1 NA NA NA NA NA CSGALNACT1 79760 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 19982799 19983157 19983022 Y ATP6V1B2 NA NA NA NA NA ATP6V1B2 69721 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NA NA NA NA NA FAM160B2 76752 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 22222955 22223268 22223121 Y EPB49,SLC39A14,SLC39A14 SLC39A14 NA NA NA NA SLC39A14 193 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 22300361 22300587 22300487 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4029 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 22808149 22808394 22808223 Y NA RHOBTB2 PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 34536 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 22872750 22872814 22872762 Y NA RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 29820 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 23184959 23185020 23184990 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 59326 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NEFL NA NA NA NA NEFL 12906 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 26498541 26498935 26498595 Y NA NA NA NA NA NA RP11-384C12.1 128372 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 27464961 27465271 27465267 Y NA CLU,SCARA3 NA NA NA NA CLU 5277 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 28569820 28569970 28569874 Y ZNF395,FZD3,EXTL3 NA NA NA NA NA EXTL3 113834 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 28635981 28636227 28636104 Y EXTL3 NA NA NA NA NA INTS9 109532 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 28859805 28860025 28859905 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2647L4.4 51427 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 28930417 28930501 28930459 Y NA CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 18965 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 29028606 29028803 29028712 Y NA NA NA NA NA NA KIF13B 89838 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 29705863 29706038 29705974 Y MBOAT4 NA NA NA NA NA TMEM66 232685 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 30580467 30580796 30580574 Y GSR GSR,UBXN8 NA NA NA NA GSR 2647 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 30666266 30666462 30666364 Y NA PPP2CB NA NA NA NA PPP2CB 3368 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 30907025 30907279 30907152 Y LOC100507341,TEX15,PURG PURG,WRN NA NA NA NA WRN 17708 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 33579772 33580017 33579844 Y NA NA NA NA NA NA RP1-273G13.1 135724 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr8 37376212 37376482 37376355 Y NA RP11-150O12.6,RP11-150O12.1 KCNU1,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150O12.6 3673 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 37939512 37939733 37939625 Y NA ASH2L ASH2L,PROSC,GPR124,BRF2,RAB11FIP1,GOT1L1,EIF4EBP1,STAR,DDHD2,WHSC1L1,LETM2,FGFR1,TACC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASH2L 21027 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 38160807 38161004 38160956 Y NA PPAPDC1B NA NA NA NA PPAPDC1B 36046 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 38627692 38628125 38628027 Y LETM2,LETM2,C8orf86,PLEKHA2,TACC1 TACC1 NA NA NA NA TACC1 43988 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr8 38762883 38763134 38762941 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 6130 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 38791407 38791790 38791499 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 34654 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.95490716273975 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 38862169 38862388 38862283 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 9781 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 39865066 39865447 39865202 Y NA NA NA NA NA NA CTA-392C11.1 333474 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 40016557 40016909 40016733 Y NA NA NA NA NA NA CTA-392C11.1 182012 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 40273499 40273632 40273622 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-392C11.1 74578 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 42270426 42270603 42270558 Y NA VDAC3 NA NA NA NA VDAC3 23284 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 42749479 42749732 42749583 Y NA MIR4469,HOOK3,RNF170 NA NA NA NA MIR4469 61 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 48265920 48266584 48265994 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191427 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 48294076 48294490 48294332 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 219583 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 48343978 48344357 48344119 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 269485 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 48814148 48814416 48814291 Y NA NA NA NA NA NA PRKDC 56327 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 49321087 49321473 49321210 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25937 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 132396 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 49448389 49448771 49448580 Y NA NA SNAI2,MCM4,UBE2V2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 153239 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 49467466 49467648 49467542 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 172316 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 49470061 49470124 49470086 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 174911 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 49701443 49701572 49701502 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB1 55573 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 49815340 49815765 49815552 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 16534 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 49835974 49836286 49836197 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 3675 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr8 50968903 50969278 50969091 Y NA NA NA NA NA NA SNAI2 1136604 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 51847143 51847430 51847428 Y NA NA NA NA NA NA RP11-119N19.1 498732 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 52809491 52809887 52809877 Y PCMTD1 NA NA NA NA NA PCMTD1,RP11-110G21.1 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 53188453 53188874 53188470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 378568 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr8 54414943 54415096 54415020 Y NA RP11-400K9.4 NA NA NA NA RP11-400K9.4 19395 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 54798731 54798762 54798749 Y NA ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA RGS20 36363 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 56756553 56757241 56756740 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 33131 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 56798106 56798776 56798363 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 7734 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 56876027 56876489 56876217 Y LYN NA NA NA NA NA LYN 85655 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 59497301 59497891 59497607 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 33818 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 59499727 59499886 59499762 Y UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 36244 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 61511489 61511770 61511631 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 77567 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 61705362 61705819 61705615 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 116025 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 61824212 61824789 61824465 Y CHD7 NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 234875 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 63051600 63051694 63051612 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 426445 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 63945359 63945546 63945425 Y YTHDF3 GGH NA NA NA NA GGH 4184 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 65669426 65669620 65669518 Y NA CYP7B1 NA NA NA NA CYP7B1 39698 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 69837388 69837920 69837570 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 538939 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 70982774 70982831 70982803 Y PRDM14 RP11-152C15.1 NA NA NA NA RP11-152C15.1 31583 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 71106642 71106934 71106707 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 92228 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 71158637 71159069 71158929 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 144223 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA RP11-382J12.1 3798 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 72187885 72188197 72188041 Y EYA1 NA NA NA NA NA EYA1 84270 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 72741414 72742172 72741688 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA RP11-383H13.1 3012 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 72753377 72753463 72753388 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 1240 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 72880263 72880309 72880290 Y NA NA NA NA NA NA MSC 125560 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 73139685 73140008 73139881 Y NA NA NA NA NA NA MSC 384982 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 77731385 77731402 77731393 Y ZFHX4 NA NA NA NA NA ZFHX4-AS1 137872 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 3.90981432547951 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59,CA13 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 87358801 87359051 87358932 Y NA WWP1 NA NA NA NA WWP1 5834 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 90740659 90741027 90740842 Y NA RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,NBN,RIPK2,OSGIN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26928 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 90776453 90776674 90776498 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 8478 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 93086953 93087351 93087249 Y NA NA NA NA NA NA OTUD6B 1006529 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 94928107 94928427 94928252 Y NA NA NA NA NA NA PDP1 60072 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 94947484 94947898 94947643 Y GEM NA NA NA NA NA PDP1 79449 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 95254172 95254606 95254439 Y GEM KB-1247B1.1,GEM CDH17 IMR90 Hi-C 24141950 GEM 17972 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 97919369 97919918 97919418 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 415790 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 97934277 97934647 97934426 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 430698 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 99526737 99526942 99526761 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL2 222116 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 99637150 99637421 99637401 Y NA NA NA NA NA NA STK3 315634 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 99658802 99659210 99659171 Y NA NA NA NA NA NA STK3 293845 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 101773934 101774280 101774106 Y NA PABPC1 SNX31,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 40897 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 101887203 101887360 101887288 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 76256 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 102092753 102093116 102092848 Y GRHL2 NA NA NA NA NA ZNF706 123305 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 102167683 102167913 102167765 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48508 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 103401606 103401938 103401841 Y NA UBR5 NA NA NA NA UBR5 21131 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 103411260 103411483 103411351 Y UBR5 UBR5 NA NA NA NA UBR5 11586 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 103549220 103549421 103549330 Y NA NA UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 116709 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 103766474 103766656 103766574 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 100344 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 72755 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 103922083 103922307 103922186 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 17991 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 104117409 104117806 104117725 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32 BAALC,C8orf56 FZD6,BAALC,SLC25A32,LOC100499183,ATP6V1C1,C8orf56,DCAF13,RIMS2,CTHRC1 IMR90 Hi-C 24141950 BAALC 33132 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 104196928 104197190 104197047 Y AZIN1,DCAF13 BAALC,C8orf56 NA NA NA NA C8orf56 45225 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 104198945 104199161 104199050 Y NA BAALC,C8orf56 NA NA NA NA C8orf56 47242 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr8 104331705 104332089 104331783 Y RIMS2 FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1 NA NA NA NA RP11-318M2.2 22705 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 104457896 104458033 104457972 Y NA DCAF13,SLC25A32 NA NA NA NA SLC25A32 32479 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 105523001 105523289 105523222 Y NA NA NA NA NA NA LRP12 75963 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 107054607 107054687 107054647 Y OXR1 RP11-152P17.2 OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 16065 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 107059911 107060047 107059923 Y NA RP11-152P17.2 OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 10705 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 107614798 107614912 107614855 Y OXR1,OXR1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 93329 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 107633742 107634133 107633852 Y OXR1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 74108 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 108336572 108336625 108336598 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 171658 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 113119329 113119491 113119407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 1267407 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 116068457 116069128 116068655 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 750771 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 119013126 119013396 119013387 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 108696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 119023512 119024035 119023740 Y EXT1 NA NA NA NA NA EXT1 98057 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 119117518 119117887 119117807 Y NA EXT1 NA NA NA NA EXT1 4205 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 123801301 123801636 123801353 Y ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 9668 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 124169504 124169661 124169520 Y NA NA NA NA NA NA C8orf76 81977 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 124179869 124179997 124179932 Y NA NA NA NA NA NA C8orf76 71641 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 124363606 124363931 124363783 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2 62659 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 124524433 124524792 124524749 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 26654 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 124549741 124550229 124550044 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1217 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 124552481 124552488 124552485 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1035 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 124684984 124685340 124685256 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 93356 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 RP11-383J24.1 NA NA NA NA RP11-383J24.1 20536 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 126037665 126038021 126037843 Y NA SQLE NA NA NA NA SQLE 28926 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 126187320 126187484 126187432 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA NA NA NA NA KIAA0196 85238 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 126193275 126193543 126193371 Y NA NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 91193 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 126268557 126268681 126268622 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0196 166475 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 126335524 126335526 126335525 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 105037 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 126400704 126400965 126400873 Y NA TRIB1 TRIB1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIB1 39598 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 128772812 128773062 128772941 Y NA MYC,PVT1 NA NA NA NA MYC 27132 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 128822251 128823013 128822500 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17472 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 128871975 128872421 128872033 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 67196 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 128923296 128923609 128923453 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 118517 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 128973364 128973763 128973565 Y MYC NA NA NA NA NA PVT1 168585 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 129061512 129061955 129061598 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 256733 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr8 129162104 129162535 129162406 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 357325 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PVT1 384046 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 130907129 130907396 130907263 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 119979 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 131024148 131024528 131024501 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 2847 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 131276645 131276741 131276715 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 177165 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 131291188 131291588 131291505 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 162318 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 132828459 132829599 132829218 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 84736 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 5.02690413275937 chr8 132868655 132869774 132869195 Y EFR3A EFR3A ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 44561 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 133958787 133959149 133958918 Y TG NA NA NA NA NA PHF20L1 173169 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr8 134143122 134143607 134143263 Y ST3GAL1,NDRG1,PHF20L1 NA NA NA NA NA WISP1 57675 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 134206657 134207025 134206839 Y NA WISP1 NA NA NA NA WISP1 5375 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 134532639 134533046 134532970 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 49137 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 134562758 134562922 134562840 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 19261 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 141454964 141454973 141454969 Y NA TRAPPC9 NA NA NA NA TRAPPC9 11705 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 141604721 141605198 141605144 Y EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 85324 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 141804565 141804680 141804623 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 205635 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 142355986 142356286 142356136 Y NA SLC45A4,PTP4A3 NA NA NA NA SLC45A4 39582 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 144107532 144108153 144107940 Y MAFA LY6E,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 10133 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 144300737 144301128 144300944 Y GPIHBP1 ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 26152 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 144301806 144302247 144302025 Y MAFA ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 25033 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr8 145002494 145002937 145002709 Y SPATC1,PLEC PLEC NA NA NA NA PLEC 45965 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 145863462 145863727 145863548 Y NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,LRRC14,RECQL4,LRRC24,ZNF250 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP39 45467 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 3848588 3848740 3848655 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 323865 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 3971837 3971870 3971849 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 374522 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr9 4293316 4293716 4293485 Y GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 52676 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 1746982 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 7.26108374731908 chr9 13237438 13237544 13237492 Y NA MPDZ NA NA NA NA MPDZ 40045 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 13278024 13278458 13278161 Y NA MPDZ NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 435 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 16710736 16710820 16710819 Y NA RP11-62F24.2 NA NA NA NA RP11-62F24.2 13992 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA PTPLAD2 497105 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 21817235 21817446 21817291 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 16693 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 21832056 21832478 21832164 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 31514 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 22216803 22217265 22216812 Y NA NA CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 206649 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr9 23639161 23639473 23639317 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL2 184862 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 23850835 23851256 23851099 Y NA ELAVL2 NA NA NA NA ELAVL2 26500 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 32443270 32443461 32443367 Y TOPORS,DDX58 NA NA NA NA NA ACO1 60652 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 35924357 35924707 35924422 Y NA HRCT1,YBX1P10 NA NA NA NA HRCT1 20168 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 37771609 37771892 37771762 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 26607 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 37859471 37859543 37859507 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 60037 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 37938183 37938323 37938277 Y SHB NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 128361 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 66843628 66843847 66843730 Y NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-764K9.4 1609528 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 73021810 73022419 73022127 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5121 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 73215942 73217043 73216172 Y KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 188402 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.67563471091979 chr9 74511654 74511799 74511765 Y NA C9orf85 NA NA NA NA C9orf85 12627 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 75549526 75549619 75549601 Y NA NA NA NA NA NA ANXA1 215054 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 75731054 75731296 75731180 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 33377 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr9 80325325 80325445 80325383 Y NA NA NA NA NA NA GNAQ 318929 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 81807982 81808307 81808129 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 195912 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 84270722 84271111 84271084 Y NA TLE1 NA NA NA NA TLE1 31109 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 88358353 88358730 88358394 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 3409 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 88588670 88588806 88588674 Y NA NAA35 NA NA NA NA NAA35 34609 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 89627893 89628105 89627999 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 3326 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 2.79272451819965 chr9 93862627 93863018 93862659 Y SYK,SYK,NFIL3 NA AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 259177 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 94123007 94123342 94123181 Y NA AUH NA NA NA NA AUH 812 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 94178668 94178865 94178761 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 5279 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 94181531 94181930 94181720 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 2214 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA NA NA NA NA NA ZNF169 90183 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 97622499 97622697 97622598 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 135516 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 143091 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 97633078 97633398 97633277 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 146095 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 97684288 97685133 97684708 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 197305 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 97881296 97881429 97881363 Y FBP1 NA NA NA NA NA FANCC 196562 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 98054647 98055067 98054952 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 22924 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 104137974 104138033 104138006 Y NA MRPL50,ZNF189 NA NA NA NA MRPL50 20863 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 107635337 107635884 107635542 Y ABCA1 NA NA NA NA NA ABCA1 52634 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 41992 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 107833426 107833839 107833430 Y NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 144908 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 109933165 109933377 109933258 Y KLF4 NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110041 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 113560028 113560416 113560156 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 238565 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 115031676 115032066 115031959 Y KIAA1958 NA NA NA NA NA PTBP3 61881 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 115657106 115657497 115657253 Y SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2 NA NA NA NA NA ZNF883 115010 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 116250853 116251013 116250930 Y NA RGS3 NA NA NA NA RGS3 45842 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 117040965 117041219 117041139 Y NA NA NA NA NA NA COL27A1 125125 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 117351016 117351370 117351316 Y TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1 ATP6V1G1,C9orf91 NA NA NA NA ATP6V1G1 2990 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 118024698 118025071 118024956 Y NA NA NA NA NA NA TNC 146162 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 118412488 118412760 118412588 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 533952 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr9 118435271 118435690 118435488 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 556735 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 119466124 119466469 119466162 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 18543 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 120523356 120523735 120523438 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 1075775 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 123251976 123252022 123252001 Y CDK5RAP2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 88426 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 124664946 124665174 124665060 Y DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 188711 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA CRB2 180622 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 127044216 127044998 127044297 Y DENND1A NEK6 NA NA NA NA NEK6 26331 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 127110676 127110867 127110772 Y NA NA NA NA NA NA PSMB7 64856 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 127165878 127166187 127166033 Y NA PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 9536 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 127466904 127467345 127467172 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 48158 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 128274126 128274455 128274251 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 193058 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 128396600 128396979 128396804 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 70534 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 130179463 130179679 130179569 Y NA ZNF79,SNORA65,RPL12,LRSAM1 NA NA NA NA ZNF79 4982 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 130597952 130598640 130598378 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS,FPGS FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 16395 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 131908135 131908616 131908494 Y METTL11A PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA IER5L 29924 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 131909035 131909223 131909126 Y PHYHD1 PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA IER5L 29317 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 29758 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 132459422 132459648 132459595 Y NA PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 33502 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 132539303 132540203 132539702 Y C9orf106,FNBP1,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 23229 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr9 133736245 133736518 133736410 Y ABL1 NA NA NA NA NA FIBCD1 76155 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 134600757 134600889 134600837 Y RAPGEF1,NTNG2 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 12572 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 134608936 134609538 134609242 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3923 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 136001171 136001330 136001249 Y SLC2A6,RALGDS,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 35971 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 136284309 136284583 136284382 Y C9orf96 SURF4,C9orf96,REXO4 NA NA NA NA REXO4 3145 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 136576519 136576779 136576603 Y SURF4 SARDH NA NA NA NA SARDH 26298 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr9 136739075 136739598 136739373 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 116128 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 137394714 137394986 137394879 Y NA NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 136634 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 138233554 138233668 138233594 Y NA NA OLFM1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R26 135257 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 139445894 139446087 139445949 Y SEC16A,NOTCH1 NOTCH1 MIR4674,NOTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 NOTCH1 7580 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5,PTGDS NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 6.42326639185919 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 3263317 3263504 3263415 Y NA MXRA5 NA NA NA NA MXRA5 635 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA MXRA5 470160 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 10127294 10127534 10127336 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 4270 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 10143530 10143844 10143687 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 20506 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 10161663 10162021 10162010 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 38639 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 13128879 13129151 13129129 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 137652 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 19742705 19742979 19742907 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 160740 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 29496854 29497166 29496936 Y NA NA NA NA NA NA NR0B1 828549 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 29610847 29611180 29610948 Y NA NA NA NA NA NA NR0B1 714535 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 38079037 38079366 38079180 Y SRPX SRPX NA NA NA NA SRPX 341 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 39794971 39795100 39795036 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 149581 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 40012729 40012965 40012840 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 21617 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 40013089 40013254 40013186 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 21328 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 40132742 40132979 40132844 Y ATP6AP2 NA BCOR K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 98160 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 44774748 44775132 44774822 Y NA KDM6A NA NA NA NA KDM6A 43991 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 45631125 45631239 45631172 Y NA MIR222 NA NA NA NA MIR222 26595 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 58292059 58292236 58292148 Y NA NA NA NA NA NA ZXDB 675790 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 64891840 64892073 64891978 Y NA NA NA NA NA NA MSN 85583 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 40441 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 68215899 68216039 68215946 Y NA NA NA NA NA NA PJA1 167597 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 69655002 69655313 69655257 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 7398 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 74033137 74033450 74033294 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 200685 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA LPAR4 92243 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 99903962 99904188 99904076 Y SRPX2 TSPAN6,SRPX2 NA NA NA NA SRPX2 6747 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chrX 120337126 120337342 120337247 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 575121 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chrX 129066097 129066492 129066260 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 28000 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.837817355459894 chrX 129245756 129246153 129246006 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 3065 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.39636225909982 chrX 129307329 129307713 129307433 Y NA AIFM1 NA NA NA NA AIFM1 9468 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 134096434 134096824 134096629 Y NA MOSPD1 FAM127C IMR90 Hi-C 24141950 MOSPD1 49137 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 149535049 149535581 149535391 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 7360 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 149996146 149996459 149996317 Y NA NA NA NA NA NA CD99L2 68830 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 1.11708980727986 chrX 151149745 151149882 151149808 Y NA GABRE NA NA NA NA GABRE 8593 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929 chrX 153311757 153312308 153312067 Y NA IRAK1,MECP2 NA NA NA NA IRAK1 28326 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.279272451819965 chrY 14775457 14775545 14775476 Y NA TTTY15 NA NA NA NA TTTY15 3192 CAGE GI-1 hg19 FANTOM5 0.558544903639929