chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.36493138595502
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	1098630	1098901	1098641	Y	NA	C1orf159,TNFRSF18	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	41170	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	1173386	1173736	1173661	Y	PLEKHN1	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6,UBE2J2,SCNN1D	NA	NA	NA	NA	B3GALT6	7757	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	1609619	1609864	1609850	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	21146	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	1714020	1714715	1714566	Y	SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	4124	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	2172142	2172385	2172270	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,PANK4,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	29983	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr1	5160051	5160190	5160114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AJAP1	447259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	9.63593987796211
chr1	8121436	8121582	8121497	Y	ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	RERE,ERRFI1,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	36638	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	8173446	8173525	8173493	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	88648	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	8215795	8215905	8215839	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	130997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	8319137	8319616	8319397	Y	NA	NA	PARK7,ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	56270	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	8457012	8457408	8457307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	81126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	8469706	8470061	8470001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	93820	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	8499087	8499228	8499177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	123201	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	195750	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	8686491	8686867	8686745	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	188835	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	8981771	8982005	8981888	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1,CA6	ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5	IMR90	Hi-C	24141950	CA6	21921	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	9111078	9111104	9111091	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	GPR157	76125	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.36493138595502
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	10558276	10558621	10558397	Y	NA	PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	DFFA	27693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	10849807	10850141	10849963	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	4566	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	10851136	10851604	10851471	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	3103	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	10853986	10854555	10854168	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	152	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	10864514	10864918	10864748	Y	NA	CASZ1	PEX14,CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	9807	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	10927237	10927380	10927309	Y	CASZ1	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	10997518	10997835	10997575	Y	CASZ1	NA	NA	NA	NA	NA	TARDBP	72579	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr1	11559549	11559947	11559917	Y	NA	PTCHD2	NA	NA	NA	NA	PTCHD2	22326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	11791882	11792060	11791938	Y	NA	MAD2L2,AGTRAP	AGTRAP	IMR90	Hi-C	24141950	AGTRAP	2081	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	11798918	11799121	11798987	Y	FBXO6,AGTRAP,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2,MTHFR,CLCN6	MAD2L2,AGTRAP	NA	NA	NA	NA	AGTRAP	4777	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	14638404	14638703	14638561	Y	NA	NA	KAZN	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM2	613711	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	14992426	14992802	14992486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	484226	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	15416988	15417263	15417153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	59765	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17,C1orf64	NA	NA	NA	NA	C1orf64	10629	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	16489021	16489207	16489116	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA2	8439	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	16616866	16617180	16617023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSG1	55209	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.12968851912662
chr1	17027024	17027386	17027173	Y	NA	EIF1AXP1	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	16474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	17229862	17230229	17230053	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	15718	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.04739707893253
chr1	17719874	17719991	17719911	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	44229	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	17.8953169162153
chr1	18884159	18884499	18884233	Y	NA	RP1-8B22.1	NA	NA	NA	NA	RP1-8B22.1	46547	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	18973426	18973594	18973515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-8B22.1	135814	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	19264079	19264209	19264144	Y	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	16971	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	19778785	19779174	19779108	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	30892	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	20693127	20693202	20693146	Y	KIF17,PINK1	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2N1	117511	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	61951	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	22366226	22366841	22366516	Y	USP48,ZBTB40	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	10279	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	22375194	22375332	22375261	Y	CDC42	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	1788	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	22740781	22741031	22740973	Y	NA	ZBTB40	CDC42,WNT4,C1QC,C1QA,ZBTB40,EPHB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB40	35313	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	23116669	23117052	23116861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	81337	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	23542417	23542518	23542468	Y	HTR1D	LUZP1	KDM1A,LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	LUZP1	40116	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.14131997288047
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.44722282614911
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	23918101	23918449	23918188	Y	SRSF10,CNR2,E2F2	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	33816	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	24265492	24265740	24265616	Y	SRSF10	RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.4	8133	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	25051079	25051208	25051162	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	18640	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	25425738	25426059	25426056	Y	NA	NA	RUNX3,IL22RA1,CLIC4,SRRM1,SYF2	IMR90	Hi-C	24141950	SYF2	130934	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	25942744	25943208	25942998	Y	EXTL1,MAN1C1	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAP1	74673	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	26495448	26495637	26495606	Y	NA	ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	ZNF593	1086	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	6.72986277191004
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.14131997288047
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	27353661	27353962	27353706	Y	TMEM222,MAP3K6,TRNP1	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46B	16334	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	27383957	27384315	27384137	Y	GPR3	FAM46B	C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM46B	46630	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	27561705	27561803	27561716	Y	NA	WDTC1	NA	NA	NA	NA	WDTC1	2698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,CD164L2,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	27890194	27890387	27890291	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	38555	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	28189568	28190269	28189912	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38	PPP1R8,RPA2	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	34279	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr1	28776524	28777127	28776532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCC1	53328	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	28970474	28970729	28970677	Y	NA	TAF12,RNU11,GMEB1	NA	NA	NA	NA	RNU11	2383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	29224369	29224479	29224424	Y	EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	12766	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	31430605	31430735	31430670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	50997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	31517703	31518005	31517854	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	18833	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	27517	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	31772172	31772177	31772175	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	4330	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	31904621	31905133	31905124	Y	NA	SERINC2	NA	NA	NA	NA	SERINC2	24209	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	COL16A1,BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL16A1	12683	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	32250836	32250955	32250895	Y	IQCC	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	22342	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	25153	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1522	22973	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	19570	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	33438571	33438703	33438616	Y	KIAA1522,ADC	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	10285	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	33593963	33594340	33594180	Y	TRIM62	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	49258	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	36351655	36352020	36351717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSPN	118087	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	121088	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	37169397	37169618	37169483	Y	OSCP1,GRIK3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS15	241359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	37195884	37196007	37195923	Y	OSCP1	NA	GRIK3	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS15	267846	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	38010731	38010979	38010768	Y	ZC3H12A,MTF1	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	6924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	38408316	38408623	38408470	Y	NA	INPP5B,SF3A3	NA	NA	NA	NA	INPP5B	2106	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	39327096	39327575	39327204	Y	NA	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	RP5-864K19.4	3424	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	39598673	39599090	39598722	Y	MACF1	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53685	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	16420	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	40426190	40426638	40426252	Y	MFSD2A	MFSD2A	NA	NA	NA	NA	MFSD2A	7388	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	40847285	40847634	40847387	Y	NA	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	38763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	40954031	40954187	40954167	Y	ZNF684,DEM1	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	RP11-656D10.3	18146	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	41365158	41365531	41365407	Y	NA	CITED4	CITED4,CTPS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	39140	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	42354251	42354647	42354385	Y	RIMKLA,HIVEP3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	144949	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	43426742	43427095	43427089	Y	CLDN19,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4022	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	43666420	43666443	43666435	Y	NA	WDR65	NA	NA	NA	NA	WDR65	30600	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	43884019	43884040	43884030	Y	ST3GAL3,MPL,SZT2	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	SZT2	30466	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	43901568	43901739	43901659	Y	NA	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	HYI	15921	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	44230271	44230532	44230402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	60776	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	44302297	44302456	44302338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	94536	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	44887961	44887973	44887968	Y	RNF220	RNF220	NA	NA	NA	NA	RNF220	19095	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	44941668	44941887	44941849	Y	C1orf228,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	72802	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	44951424	44951733	44951502	Y	TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82558	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	44962677	44962982	44962698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	93811	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	44999581	44999933	44999757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	130715	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	45167170	45167180	45167175	Y	NA	TMEM53,RNU5F-1,KIF2C	NA	NA	NA	NA	RNU5F-1	18394	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	45286834	45287205	45286951	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	3165	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	45990749	45991039	45990946	Y	NA	TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1	NA	NA	NA	NA	PRDX1	4030	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	47690580	47690745	47690639	Y	PDZK1IP1,TAL1	TAL1	NA	NA	NA	NA	TAL1	5147	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	48853667	48853917	48853792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	81928	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	50619908	50620155	50620032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL4	132323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	51302197	51302583	51302391	Y	FAF1	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	121352	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	52885344	52885737	52885540	Y	ZCCHC11	ORC1,PRPF38A	NA	NA	NA	NA	PRPF38A	17108	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	53092647	53093031	53092839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC11	75488	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42,LDLRAD1	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	54810685	54810861	54810859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	66291	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	54842500	54842749	54842625	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	34403	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	57821291	57821329	57821310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	537922	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	57887813	57887926	57887901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	604444	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	58969564	58969575	58969570	Y	NA	DAB1,OMA1	NA	NA	NA	NA	DAB1	40831	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	59049880	59049917	59049902	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	8714	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	59280364	59280505	59280397	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32579	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	59522982	59523218	59523118	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	237092	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	59761390	59761720	59761439	Y	NA	FGGY	NA	NA	NA	NA	FGGY	1080	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	62416847	62417238	62417043	Y	INADL,USP1,KANK4	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	210698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	63807580	63807600	63807590	Y	NA	LINC00466,FOXD3,RP4-792G4.2,ALG6	NA	NA	NA	NA	RP4-792G4.2	19468	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	64223023	64223051	64223037	Y	NA	ROR1	ROR1	IMR90	Hi-C	24141950	ROR1	14642	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	65238542	65238722	65238632	Y	NA	RAVER2	NA	NA	NA	NA	RAVER2	29764	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	65731337	65731853	65731407	Y	DNAJC6	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	19435	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	65758796	65759173	65758995	Y	NA	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	46894	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	66750727	66750832	66750780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D1	465310	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	68000341	68000585	68000456	Y	SLC35D1	NA	GNG12,DIRAS3,LOC100289178,GADD45A,WLS	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERBP1	106243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr1	68118588	68118809	68118774	Y	GADD45A	GADD45A	GADD45A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	29935	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.05902853268638
chr1	68321515	68321736	68321554	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	24365	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	68663588	68663867	68663728	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	32936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2-AS2	1204213	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	75694572	75694736	75694622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	493300	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	82172386	82172576	82172503	Y	NA	ST13P20	NA	NA	NA	NA	ST13P20	12802	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	85313015	85313206	85313127	Y	GNG5,MCOLN2,LPAR3,C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	NA	SSX2IP	158529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	87253936	87254322	87254171	Y	SH3GLB1	NA	SEP15	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GLB1	85677	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	87359712	87359873	87359793	Y	NA	SEP15,HS2ST1	NA	NA	NA	NA	SEP15	18234	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	88150561	88150732	88150650	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	358410	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	89188530	89188764	89188647	Y	NA	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	40625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	89534473	89534797	89534533	Y	GTF2B,GBP5,GBP4,GBP1,GBP2	GBP3	GBP1,GBP6	IMR90	Hi-C	24141950	GBP3	47896	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	90947023	90947038	90947031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	368169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	91183313	91183764	91183661	Y	BARHL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	131443	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	8.56527989152187
chr1	91185058	91185169	91185091	Y	BARHL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	130038	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	92497404	92497581	92497479	Y	BTBD8,EPHX4	EPHX4,BTBD8	NA	NA	NA	NA	EPHX4	3865	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	GFI1	NA	NA	NA	NA	GFI1	42826	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	94535371	94535770	94535449	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	162405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX7	518774	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	100169951	100170218	100170031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRS1	59969	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	100828525	100828922	100828611	Y	SASS6	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	19941	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	114997819	114998047	114997990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	53734	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	115055314	115055514	115055414	Y	NA	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	3533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	116291091	116291334	116291215	Y	CASQ2	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL1	108517	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	117111804	117112156	117112090	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	143	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	117130518	117130699	117130624	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	18857	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	118153815	118153988	118153913	Y	FAM46C	FAM46C	NA	NA	NA	NA	FAM46C	7259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	118678137	118678411	118678252	Y	NA	SPAG17	NA	NA	NA	NA	SPAG17	47435	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	119401140	119401399	119401296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	279620	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	120255895	120256325	120256050	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	55474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	120692453	120692808	120692620	Y	NBPF7,NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	82213	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	142538903	142539547	142539454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-417J8.3	77222	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	144871122	144871347	144871255	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	61378	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	43743	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	144988079	144988414	144988189	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	45407	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	50527	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	145009158	145009716	145009503	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	64470	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	145042783	145043227	145042898	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	30959	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	145435103	145435641	145435221	Y	CD160,TXNIP,ANKRD34A	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	828	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	145701524	145701615	145701570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF115	92488	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr1	151696469	151696693	151696535	Y	NA	MRPL9	NA	NA	NA	NA	MRPL9	37347	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr1	151913574	151913780	151913675	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33290	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	121996	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	152927734	152927742	152927738	Y	C1orf68,LCE1B	SPRR1A	LCE3E,IVL,SPRR1A,LCE3A,SPRR2F	IMR90	Hi-C	24141950	SPRR1A	26815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	153504746	153504953	153504860	Y	PGLYRP3,S100A7L2,SLC39A1	BX470102.3,S100A6,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	667	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	154302207	154302441	154302288	Y	CHRNB2,ATP8B2	ATP8B2	NA	NA	NA	NA	ATP8B2	6178	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	154405181	154405498	154405310	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,IL6R,ADAR,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29512	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	154579303	154579782	154579555	Y	UBAP2L,IL6R,SHC1,ADAR,ADAR	UBE2Q1,CHRNB2,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	18693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	154724205	154724584	154724329	Y	IL6R,ADAR	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	125730	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	154957258	154957622	154957425	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B	NA	NA	NA	NA	FLAD1	3444	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	155484519	155484611	155484545	Y	KRTCAP2,GBA,SCAMP3,CLK2,RUSC1,RUSC1,RUSC1-AS1,RUSC1	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	45210	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	156249668	156250061	156249953	Y	NA	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	SMG5	559	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	156405790	156406311	156406022	Y	NA	NA	RHBG,C1orf182,C1orf61,CCT3,TTC24,MEF2D,IQGAP3,BCAN,APOA1BP,GPATCH4,HAPLN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2D	62309	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	156464458	156464805	156464586	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	3815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	156631732	156631960	156631846	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	2516	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI16	820689	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI16	819919	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	160230168	160230604	160230300	Y	NA	RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	634	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	160444087	160444465	160444324	Y	VANGL2	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL2	75711	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	222772	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	C1orf192	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	24002	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	C1orf192	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	33409	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	HSPA6	NA	NA	NA	NA	HSPA6	8572	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	161892699	161893027	161892754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOS1AP	144537	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	162129294	162129634	162129458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOS1AP	91730	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	164389251	164389388	164389267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	65247	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	164736884	164737252	164737025	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	214063	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	167438624	167439122	167438966	Y	RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	81882	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	167480005	167480498	167480316	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	CREG1	NA	NA	NA	NA	CREG1	40506	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	169911234	169911623	169911565	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	49826	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	170794960	170795269	170795115	Y	FMO3	NA	KIFAP3,METTL11B	IMR90	Hi-C	24141950	GORAB	295690	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	172418117	172418641	172418353	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	6887	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	172715484	172715760	172715631	Y	NA	NA	C1orf105,TNFSF4,LOC100506023,PRDX6,RC3H1,SLC9A11,CENPL,DARS2,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	304254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	173379915	173380349	173380194	Y	TNFSF4,KLHL20	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	64056	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	173398914	173399297	173399234	Y	NA	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	45108	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	174503176	174503233	174503205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	376628	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	174937322	174937525	174937409	Y	KIAA0040,KIAA0040	CACYBP	NA	NA	NA	NA	CACYBP	28775	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	178378072	178378430	178378251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGPS2	313870	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	178414274	178414285	178414280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGPS2	278015	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	178901109	178901308	178901215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20B	91631	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	180612177	180612184	180612181	Y	NA	XPR1	NA	NA	NA	NA	XPR1	13037	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.29427139951479
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	181149230	181149365	181149283	Y	NA	NA	MR1,XPR1,KIAA1614,ACBD6,STX6,IER5	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	93592	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	182580570	182580950	182580946	Y	NA	RNASEL,RGS16	NA	NA	NA	NA	RGS16	9027	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	183129116	183129507	183129296	Y	LAMC2	LAMC2	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	23866	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	183310808	183311127	183310994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMG7	128224	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	183526698	183527308	183526965	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC5	75584	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	183836661	183836955	183836765	Y	RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	181856	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	184758240	184758595	184758304	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	36193	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	184820980	184820991	184820986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	98933	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	185344563	185345243	185344914	Y	FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP	NA	IVNS1ABP,LOC100288079	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	60102	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	185389591	185389741	185389658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	105130	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.75312567941774
chr1	185453251	185453699	185453469	Y	RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	168790	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	185771429	185771809	185771446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMCN1	69746	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	187268687	187268975	187268831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	472602	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	192458942	192459176	192459156	Y	RGS2,RGS13,RGS1	NA	RGS1,RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	224137	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	192608900	192609547	192609291	Y	RGS1,RGS2,RGS13	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	73766	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	192915458	192915787	192915575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP126	72343	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	194047687	194047732	194047710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALT2	893903	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	197513718	197513772	197513745	Y	CRB1,DENND1B	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P32	142118	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	198850238	198850638	198850585	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	726145	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	200341273	200341515	200341438	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	35669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM9	97304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	201244405	201244769	201244526	Y	PKP1	NA	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	105703	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	201280694	201280963	201280829	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	LAD1	85773	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	201366439	201366550	201366506	Y	PKP1,LAD1	LAD1	NA	NA	NA	NA	LAD1	186	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	202003479	202003610	202003599	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	25998	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	202016172	202016526	202016316	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ELF3,RP11-465N4.4	ELF3,NAV1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-465N4.4	38691	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	202054141	202054434	202054309	Y	NA	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	57435	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	202055098	202055409	202055277	Y	ELF3,GPR37L1	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	56460	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	202056138	202056515	202056288	Y	NA	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	55354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	202249421	202249522	202249480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2T	59586	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	202823240	202823502	202823372	Y	NA	KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF	PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-480I12.5	5246	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	203619380	203619832	203619595	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	25691	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	203965652	203965916	203965843	Y	NA	NA	ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13	IMR90	Hi-C	24141950	SOX13	74327	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.14131997288047
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	204053773	204053963	204053834	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	13530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	204653343	204653636	204653438	Y	PLEKHA6,TMEM81,NFASC,NFASC,LRRN2,LRRN2	NA	NA	NA	NA	NA	MDM4	169832	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	205449878	205450140	205449950	Y	RAB7L1,CNTN2	LEMD1,CDK18	KLHDC8A,NFASC,CNTN2,TMCC2,LOC284576,LEMD1,MIR135B,CDK18,MFSD4,SLC45A3	IMR90	Hi-C	24141950	CDK18	21583	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,MFSD4	NA	NA	NA	NA	MFSD4	23186	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	206751685	206751882	206751743	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	32022	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	206754982	206755508	206755274	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	28396	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	210662993	210663098	210663027	Y	HHAT	NA	NA	NA	NA	NA	HHAT	163397	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	211084997	211085192	211085095	Y	NA	NA	HHAT	IMR90	Hi-C	24141950	KCNH1	220265	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	212862785	212863120	212862899	Y	BATF3	NA	NA	NA	NA	NA	NSL1	100004	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	213545455	213545863	213545754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	322866	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	214157858	214157941	214157900	Y	PROX1	PROX1	PROX1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	PROX1	3334	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	214162828	214163073	214162948	Y	PROX1	PROX1	NA	NA	NA	NA	PROX1	8304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.75312567941774
chr1	214163432	214163790	214163677	Y	NA	PROX1	NA	NA	NA	NA	PROX1	8908	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	214490616	214490868	214490808	Y	SMYD2	SMYD2	NA	NA	NA	NA	SMYD2	38171	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr1	214619335	214619608	214619472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	104184	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	534812	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	217247144	217247287	217247272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	61810	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	219455848	219455941	219455895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	110662	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	219497403	219497406	219497405	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-95P13.1	116578	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	219497639	219497836	219497817	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-95P13.1	116148	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.50625135883549
chr1	219498496	219498646	219498574	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-95P13.1	115338	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	219632644	219633145	219633054	Y	NA	RP11-95P13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-95P13.1	18660	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	219728784	219728936	219728867	Y	NA	NA	RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-95P13.1	114800	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	219955751	219955972	219955860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRS	262028	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	C1orf115	NA	NA	NA	NA	C1orf115	7614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	222163243	222163609	222163382	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	249725	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	222502119	222502129	222502124	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-378J18.3	259038	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	222593417	222593447	222593433	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-378J18.3	167720	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	222594059	222594200	222594130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-378J18.3	166967	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	223892678	223892997	223892836	Y	NA	CAPN8,CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	5383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	224022197	224022347	224022288	Y	CAPN2,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	9327	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	12.5420169840142
chr1	224598124	224598418	224598271	Y	WDR26	WDR26	NA	NA	NA	NA	WDR26	24317	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	225778250	225778416	225778333	Y	ENAH	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	60428	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	226320775	226321123	226320910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	51308	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	226842752	226843521	226843149	Y	ITPKB	ITPKB-IT1	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	17247	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	226878935	226879345	226879207	Y	ITPKB	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	18167	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	226890098	226890374	226890232	Y	NA	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	29330	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	30097	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	226911425	226911742	226911463	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	13282	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	226927547	226927740	226927636	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	2523	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	227060204	227060463	227060334	Y	NA	PSEN2,ADCK3	NA	NA	NA	NA	PSEN2	4319	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	227315962	227315970	227315966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	188205	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	228398942	228399222	228399120	Y	TRIM17,GJC2	IBA57,C1orf145	NA	NA	NA	NA	C1orf145	143	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	228640073	228640088	228640081	Y	NA	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	3472	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr1	228686214	228686407	228686300	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	13452	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	15664	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	230289705	230290142	230289903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	98169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	230643766	230644066	230643893	Y	NA	NA	URB2	IMR90	Hi-C	24141950	COG2	132169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	230889321	230889962	230889601	Y	NA	CAPN9	NA	NA	NA	NA	CAPN9	8191	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	231860737	231860947	231860816	Y	TSNAX	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	100176	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	232760730	232761090	232760801	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2,DISC2,NTPCR	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	204843	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	9.63593987796211
chr1	233241853	233241955	233241904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	157502	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	233472763	233473058	233472911	Y	NA	RPS7P3,PCNXL2	NA	NA	NA	NA	PCNXL2	43304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	234534667	234535013	234534780	Y	NA	RP5-827C21.1,RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	27328	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	234639993	234640263	234640100	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	27144	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	234736336	234736615	234736485	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	6656	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr1	234887087	234887295	234887193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	143816	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	235094853	235095190	235094881	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	195061	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	235107452	235107692	235107572	Y	NA	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	182559	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	178848	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	235242792	235242999	235242934	Y	NA	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47252	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	235615040	235615273	235615157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	50508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	235805098	235806119	235805875	Y	LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	5935	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	236319808	236320415	236320177	Y	LYST,LGALS8,GPR137B	GPR137B	NA	NA	NA	NA	GPR137B	15976	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	237007861	237008154	237008008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	51251	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	241364891	241365186	241365103	Y	RGS7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	204797	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	243585242	243585384	243585313	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	167922	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr1	243644284	243644683	243644595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	226964	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	243781710	243782079	243781895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	230302	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	243853401	243853550	243853530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	158831	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	42384	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr1	244212276	244213430	244213047	Y	NA	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	40898	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	244505125	244505457	244505330	Y	AKT3,AKT3,ADSS	C1orf100	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf100	8480	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	244525463	244525578	244525509	Y	NA	C1orf100	NA	NA	NA	NA	C1orf100	11526	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	C1orf100	NA	NA	NA	NA	C1orf100	18965	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	244535063	244535306	244535184	Y	NA	C1orf100	NA	NA	NA	NA	C1orf100	21126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr1	245563795	245563810	245563803	Y	KIF26B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	247508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	246469940	246470214	246470139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	198400	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	246763574	246763751	246763579	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	35828	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3124	224044	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr10	3441336	3441600	3441518	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	228333	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	3528683	3528786	3528735	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	296687	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr10	3915881	3916422	3916098	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	90408	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	4712833	4713220	4712996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	113601	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	112948	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	4775719	4776039	4775944	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001	MCF7	ChIA-PET	22265404	AKR1E2	50782	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	4983862	4984222	4983900	Y	NA	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	51066	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	5113786	5114179	5114065	Y	AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3	AKR1C3	NA	NA	NA	NA	AKR1C3	38240	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	5316994	5317070	5317001	Y	NA	NA	tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C4	81569	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	UCN3	70760	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.28263994576094
chr10	5334474	5334640	5334544	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	UCN3	70332	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	5336164	5336286	5336241	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	UCN3	68686	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	5504427	5504665	5504478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	51913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	CALML3	33591	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.05902853268638
chr10	5576341	5576485	5576413	Y	NET1,CALML3	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	10636	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	22105	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	24305	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	CALML3,RP11-116G8.5	NA	NA	NA	NA	RP11-116G8.5	25254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr10	6182474	6182743	6182618	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	2138	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	10545513	10545788	10545615	Y	NA	NA	SFTA1P	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	1105965	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	10606146	10606522	10606191	Y	NA	NA	CELF2	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	1045231	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	11077382	11077525	11077432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	574228	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	11301422	11301770	11301497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	349983	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	11866902	11867068	11866972	Y	C10orf47	NA	LOC219731	IMR90	Hi-C	24141950	ECHDC3	84537	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	15191044	15191371	15191092	Y	MEIG1,NMT2,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	17321	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	15278281	15278573	15278465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	69589	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	15411341	15411434	15411388	Y	NA	FAM171A1	NA	NA	NA	NA	FAM171A1	280	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	16481463	16481634	16481561	Y	NA	PTER	NA	NA	NA	NA	PTER	4521	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	17429922	17430093	17430002	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	2987	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	17430166	17430520	17430415	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	3231	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	20203114	20203263	20203197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5B	1256780	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	21241912	21242237	21242078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	218879	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	21333319	21333508	21333415	Y	NEBL,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	127608	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	77370	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	21816987	21817223	21817104	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3871	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	21824374	21824606	21824490	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3280	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	22555688	22555894	22555791	Y	NA	COMMD3	NA	NA	NA	NA	COMMD3	47009	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	22890368	22890535	22890414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	110949	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	22961361	22961802	22961720	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	39682	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	22970665	22970972	22970902	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	30512	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	25155940	25156492	25156271	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	83041	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	27028326	27028583	27028339	Y	MASTL,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	43738	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	27032794	27033066	27033024	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	48206	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr10	28479939	28480308	28480124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP7	141107	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	28957755	28957993	28957831	Y	BAMBI	BAMBI	BAMBI	K562	ChIA-PET	22265404	BAMBI	6278	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	29184035	29184352	29184192	Y	BAMBI	NA	LYZL1,BAMBI	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	219764	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	29195098	29195451	29195275	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	230827	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	29196228	29196432	29196257	Y	BAMBI	NA	BAMBI,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	231957	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	29213480	29213697	29213581	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	249209	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr10	29970673	29971027	29970896	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	274342	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	30441068	30441357	30441150	Y	NA	KIAA1462	MTPAP,KIAA1462	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	38645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	30471622	30471929	30471877	Y	KIAA1462	NA	KIAA1462,SVIL	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	69199	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	31106973	31107176	31107079	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZNF438,KIF5B,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	211690	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr10	32335843	32336217	32336161	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	7142	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	32460264	32460451	32460341	Y	NA	NA	ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	70043	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	32607439	32608014	32607606	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	57712	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB1	269534	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	33798158	33798349	33798267	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	505438	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	34907489	34907514	34907502	Y	NA	RP11-8L18.3	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	43515	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	35768783	35768937	35768860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	234830	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	35932153	35932694	35932189	Y	FZD8	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	398200	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	29272	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	49542005	49542407	49542075	Y	NA	MAPK8	ARHGAP22,MAPK8	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	29307	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	49745028	49745223	49745126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	117087	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	49891983	49892370	49892073	Y	NA	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	29673	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	50480396	50480904	50480855	Y	C10orf128,C10orf71	NA	WDFY4,VSTM4,LOC100506733,FAM170B,C10orf71	IMR90	Hi-C	24141950	DRGX	120593	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	50519665	50520208	50519779	Y	C10orf128	NA	NA	NA	NA	NA	DRGX	81289	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	52270106	52270351	52270231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	112572	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	52752441	52752754	52752500	Y	NA	PRKG1	NA	NA	NA	NA	PRKG1	3496	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	53930569	53930919	53930744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	141137	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	54183491	54183679	54183585	Y	NA	NA	DKK1,LOC100506939	IMR90	Hi-C	24141950	DKK1	111435	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	61019605	61019954	61019626	Y	PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C	NA	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	85255	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	61992765	61993042	61992980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	328351	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	62330469	62330833	62330827	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	205256	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	64488428	64488586	64488476	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	EGR2	IMR90	Hi-C	24141950	ADO	73930	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	65097775	65098183	65098051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	86874	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	65282188	65282459	65282345	Y	JMJD1C,JMJD1C	REEP3	NA	NA	NA	NA	REEP3	3065	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	67154801	67155033	67154934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	571472	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	69523317	69523417	69523404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	72507	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	70832840	70833011	70832951	Y	DDX21,SRGN	VPS26A	SRGN	K562	ChIA-PET	22265404	VPS26A	48257	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	72202124	72202468	72202392	Y	EIF4EBP2,NODAL	EIF4EBP2,NODAL	NA	NA	NA	NA	NODAL	3239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr10	72218739	72219166	72218841	Y	NA	NODAL	KIAA1274,SGPL1,EIF4EBP2,ADAMTS14,NODAL,C10orf27	IMR90	Hi-C	24141950	NODAL	13032	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	72253805	72253950	72253868	Y	NA	NODAL	NA	NA	NA	NA	NODAL	48098	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	72593001	72593337	72593129	Y	SGPL1	RP11-399N22.3,SGPL1	NA	NA	NA	NA	SGPL1	19284	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	73595852	73596345	73596141	Y	C10orf54,PSAP	PSAP,RP11-472G21.2	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	12781	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP,RP11-472G21.2	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP,RP11-472G21.2	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	73627974	73628371	73628194	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP,RP11-472G21.2	C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-472G21.2	7743	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	74055686	74056073	74056016	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	24008	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	74385233	74385288	74385261	Y	NA	MICU1,HMGN2P34	NA	NA	NA	NA	MICU1	1334	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	74877758	74878048	74877901	Y	NA	P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	NUDT13	9541	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	74991679	74992005	74991988	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	14615	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	75022023	75022098	75022060	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-152N13.5	11474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.58854279902957
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	77164585	77164731	77164659	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4921	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	78059263	78059337	78059300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	700265	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	78216409	78216496	78216416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	857411	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	78920467	78920779	78920602	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	475574	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	79291052	79291779	79291330	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104574	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	79314756	79315094	79314952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	81259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	79382631	79383090	79382827	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	13263	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	79470426	79470747	79470598	Y	NA	NA	KCNMA1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNMA1	74073	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	79633336	79633510	79633397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	50868	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	81088418	81088982	81088641	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	16243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	81946319	81946704	81946639	Y	ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	16624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	81960969	81961796	81961521	Y	SH2D4B,ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	1532	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	82224459	82224735	82224582	Y	NA	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	12537	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	82296466	82296516	82296492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	84544	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr10	88631620	88631813	88631713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCG	84562	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	89820738	89820900	89820886	Y	NA	NA	RNLS,KLLN,PTEN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	117479	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	89864117	89864277	89864218	Y	NA	NA	PTEN,KLLN,RNLS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	160858	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	90145688	90145942	90145819	Y	LIPK	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-380G5.3	442429	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	94195534	94195885	94195710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDE	135948	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	95198614	95198817	95198708	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	41257	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	97545881	97546028	97545939	Y	ENTPD1,ENTPD1,BLNK	NA	NA	NA	NA	NA	TCTN3	93981	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	97640254	97640658	97640438	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-248J23.5	117342	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	98956083	98956405	98956104	Y	C10orf62	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP19	94008	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	100019738	100019959	100019849	Y	C10orf28	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	152982	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	102130336	102130669	102130535	Y	NA	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	703	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	102491662	102491849	102491769	Y	PAX2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM178A	178477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	103051353	103051800	103051498	Y	NA	NA	BTRC,FLJ41350,FBXW4,LBX1,POLL,DPCD,MIR3158-2,MGEA5,NPM3,FGF8,LOC100289509	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	60020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	103081687	103081713	103081699	Y	FAM178A	BTRC	BTRC,FBXW4,POLL,DPCD	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	30107	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	103539197	103539512	103539463	Y	NA	NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	NPM3	1658	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	104238092	104238376	104238328	Y	NA	CUEDC2,C10orf95,TMEM180,ACTR1A,SUFU	NA	NA	NA	NA	TMEM180	18943	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr10	104683249	104683568	104683410	Y	NA	CNNM2	NA	NA	NA	NA	CNNM2	7199	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	104909684	104910071	104909878	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	40985	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	33467	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	105436153	105436400	105436275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALHM2	225493	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	111136138	111136155	111136149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	545156	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.75312567941774
chr10	111650301	111650520	111650491	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	30791	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	111694003	111694304	111694154	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	12692	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	111834173	111834352	111834276	Y	ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1	NA	NA	NA	NA	NA	ADD3	80047	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	111981639	111982026	111981734	Y	ADD3,MXI1,MXI1	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	16276	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr10	112080196	112080214	112080204	Y	NA	SMNDC1	DUSP5,SMC3,RBM20	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	17487	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	112401121	112401469	112401220	Y	SMC3,RBM20	RBM20	NA	NA	NA	NA	RBM20	686	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	112402938	112403137	112402952	Y	NA	RBM20	NA	NA	NA	NA	RBM20	783	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.43559137239525
chr10	112514562	112514859	112514810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM20	112407	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	112562548	112562691	112562671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	66874	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	112668861	112669237	112669049	Y	PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	7795	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	114094924	114095156	114095118	Y	NA	ACSL5	TECTB	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL5	36620	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	115441699	115442134	115441810	Y	CASP7	CASP7	NA	NA	NA	NA	CASP7	4757	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	115719262	115719399	115719345	Y	NA	NA	ADRB1,NHLRC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADRB1	82407	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr10	116163429	116163722	116163475	Y	AFAP1L2	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	914	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	118500407	118500818	118500725	Y	NA	HSPA12A	NA	NA	NA	NA	HSPA12A	322	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	106893	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	119028396	119028853	119028412	Y	SLC18A2	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	104125	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A,LINC00867	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	120244875	120245269	120244982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00867	130255	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	94093	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	138826	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	121264797	121264861	121264829	Y	NA	RGS10	NA	NA	NA	NA	RGS10	35359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	121544240	121544543	121544312	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	MCMBP	105525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	122918665	122919069	122918920	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	RP11-159H3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	27428	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	76116	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64307	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	CPXM2	NA	NA	NA	NA	CPXM2	32447	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	125847012	125847291	125847256	Y	NA	CHST15	NA	NA	NA	NA	CHST15	3915	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	125853998	125854207	125854185	Y	CHST15	CHST15	NA	NA	NA	NA	CHST15	2792	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	126410085	126410502	126410408	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	20336	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	126840629	126841204	126840953	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	6535	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	128592998	128593177	128593088	Y	NA	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	1020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	129704108	129704655	129704249	Y	PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	FOXI2	170609	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr10	129721316	129721687	129721518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXI2	187817	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	129774599	129774927	129774767	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	147722	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	129786361	129786590	129786527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	136059	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	129789575	129789766	129789637	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	132883	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	129799058	129799270	129799164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	123379	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	130017279	130017540	130017352	Y	PTPRE	NA	EBF3,MGMT,LOC387723,GLRX3,CTAGE7P	IMR90	Hi-C	24141950	MKI67	94630	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.67083423922366
chr10	134212658	134212854	134212750	Y	NA	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	3986	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	12824	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	13298	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr10	134225356	134225596	134225555	Y	NA	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	16684	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr10	134235789	134236113	134236058	Y	NA	PWWP2B,C10orf91	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf91	19718	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.29427139951479
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	134385594	134385710	134385631	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	36270	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	UTF1,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	UTF1	32913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr10	135191872	135192182	135191943	Y	NA	PRAP1,ECHS1,PAOX,MTG1	NA	NA	NA	NA	PAOX	1177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr11	334344	334553	334421	Y	NA	ATHL1,IFITM2,IFITM3,B4GALNT4	NA	NA	NA	NA	IFITM3	8807	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	629192	629570	629436	Y	IRF7,IRF7,SCT,DRD4	IRF7	NA	NA	NA	NA	IRF7	15193	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	1043654	1043838	1043746	Y	MUC6	MUC6	AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	MUC6	8948	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	1331682	1331784	1331733	Y	NA	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	2798	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	1409546	1409852	1409608	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	417	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	1568333	1568421	1568379	Y	BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	22729	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	RP11-295K3.1,CTSD	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	10620	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	2223798	2223980	2223871	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2	54965	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	2484558	2484875	2484798	Y	TRPM5,KCNQ1	KCNQ1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1	20644	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	3090855	3091125	3090991	Y	NA	CARS	NA	NA	NA	NA	CARS	14012	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	3792611	3792742	3792677	Y	STIM1,RHOG,NUP98	PGAP2,NUP98	NA	NA	NA	NA	PGAP2	24212	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	5401217	5401226	5401222	Y	OR51T1,OR51G2,OR51G1,MMP26,OR51L1,OR52J3,OR52E2,OR52A1,OR51V1,OR51B2,OR52N2,OR52E6,OR56B1,OR52N4,OR52D1,OR52N5,OR52N1,OR51M1,OR51I1,OR51Q1	OR51B5	NA	NA	NA	NA	OR51B5	38408	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	8756335	8756571	8756455	Y	ST5,ASCL3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL27A	54377	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	8889520	8889803	8889779	Y	ST5	AKIP1	NA	NA	NA	NA	AKIP1	40883	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr11	10373282	10373523	10373408	Y	ADM,AMPD3	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49055	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	10373632	10373924	10373723	Y	NA	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	10373965	10374241	10374089	Y	LYVE1,EIF4G2	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49738	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	12458488	12458795	12458642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	61756	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	13299973	13300299	13300022	Y	FAR1,ARNTL	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	3774	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	12477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	19576557	19576571	19576564	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	206286	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	19649981	19650160	19650072	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	279710	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr11	19681860	19681955	19681908	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	311589	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	19717488	19717496	19717492	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	347217	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	23658000	23658323	23658162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	808155	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	25127401	25127422	25127412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO3	1081407	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	26610693	26610982	26610833	Y	ANO3,BBOX1	MUC15	NA	NA	NA	NA	MUC15	18913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	27380505	27380624	27380565	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	2791	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	27715832	27716154	27716086	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	25451	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	31317361	31317619	31317485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCDC1	71738	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	31450770	31450827	31450799	Y	PAX6,PAX6,IMMP1L,ELP4,DNAJC24	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC24	61383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	32109079	32109545	32109351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	277140	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr11	34393112	34393337	34393189	Y	ABTB2	RP1-145M24.1,ABTB2	ABTB2,ELF5,NAT10,CAT	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	15557	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	52068	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	35165614	35166208	35165794	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	7197	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	35297997	35298240	35298173	Y	CD44,SLC1A2,SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	139580	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	35325239	35326726	35325689	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	166822	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	35355923	35356216	35356038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	197506	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	35401982	35402383	35402345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	243565	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	36132577	36133046	36132774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	169046	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	36331203	36331536	36331365	Y	PRR5L	COMMD9,PRR5L	NA	NA	NA	NA	PRR5L	15365	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	36521882	36522155	36522112	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	7667	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	39183372	39183493	39183434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC4C	2295830	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	41471316	41471693	41471422	Y	NA	LRRC4C	NA	NA	NA	NA	LRRC4C	7630	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	43569506	43569887	43569721	Y	C11orf96	HSD17B12	NA	NA	NA	NA	HSD17B12	6099	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	44749241	44749630	44749607	Y	TSPAN18	NA	PRDM11,TSPAN18,CD82,TP53I11	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	221210	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr11	45864713	45865116	45864826	Y	NA	SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1	NA	NA	NA	NA	CRY2	1553	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	46004522	46004898	46004712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLTL1B	63350	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	NA	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	87257	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	47125777	47126225	47125967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	70451	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	47455882	47456058	47455970	Y	NA	SLC39A13,PSMC3	NA	NA	NA	NA	PSMC3	9889	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	47965488	47965599	47965552	Y	NA	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRJ	34514	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	48028604	48028990	48028813	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	28491	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	48053215	48053601	48053578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	53102	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr11	59331910	59331948	59331929	Y	OR5AN1,OR4D6,OR4D11	OSBP	NA	NA	NA	NA	OSBP	49669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	60721289	60721672	60721392	Y	NA	PRPF19,TMEM109,TMEM132A	NA	NA	NA	NA	TMEM132A	31354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	60754236	60754662	60754412	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132A	64301	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	60871198	60871450	60871295	Y	CD6,SDHAF2,CD5	NA	NA	NA	NA	NA	VPS37C	55639	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	60888310	60888547	60888414	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	38542	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	61394263	61394463	61394368	Y	NA	SYT7,RPLP0P2	NA	NA	NA	NA	RPLP0P2	13755	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHNAK	53596	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	AHNAK	14680	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	62587560	62587930	62587905	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9630	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	47272	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	63705603	63705837	63705685	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	1172	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	19.4248311825585
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	65328084	65328375	65328271	Y	NA	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	3683	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	65411467	65411885	65411633	Y	TIGD3,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,DKFZp761E198,SIPA1,SIPA1,RELA	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	SIPA1	7899	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	66717584	66717809	66717709	Y	CLCF1,ADRBK1	PC	NA	NA	NA	NA	PC	6038	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	68049630	68050030	68049692	Y	NA	C11orf24,LRP5	NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf24	12161	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	68110280	68110464	68110374	Y	NA	LRP5	PPP6R3	IMR90	Hi-C	24141950	LRP5	32203	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	68873890	68874116	68874013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPCN2	59525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	68883107	68883355	68883302	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1,FADD,ANO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TPCN2	68742	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	NA	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYEOV	175784	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	69517228	69517437	69517319	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	FGF19	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr11	69632815	69633180	69632998	Y	NA	FGF4,FGF3	NA	NA	NA	NA	FGF3	1023	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr11	69639961	69640299	69640038	Y	NA	FGF3	FGF3	K562	ChIA-PET	22265404	FGF3	8169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	9.17708559805915
chr11	69655407	69655781	69655522	Y	FGF19,FGF3	FGF3	ANO1	IMR90	Hi-C	24141950	FGF3	23615	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	72348117	72348448	72348274	Y	NA	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	35187	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	72498496	72498726	72498679	Y	STARD10	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	3918	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr11	72985787	72986008	72985881	Y	FCHSD2,RELT,RELT,P2RY6	ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	31326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	73126084	73126768	73126402	Y	RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	40775	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	74077556	74077917	74077717	Y	NA	PGM2L1	NA	NA	NA	NA	PGM2L1	29601	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	74171904	74172163	74171977	Y	SPCS2,RNF169,C2CD3	KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3	NA	NA	NA	NA	KCNE3	4611	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	74176233	74176573	74176529	Y	KCNE3	KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3	NA	NA	NA	NA	KCNE3	201	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr11	74257729	74258089	74257917	Y	KCNE3	NA	KCNE3,P4HA3,LIPT2,PPME1,C2CD3,CHRDL2,RNF169,POLD3,PGM2L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	POLD3	54833	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	75059269	75059623	75059491	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	1250	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	WNT11	163545	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	113	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	3522	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5,MYO7A	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	78002337	78002637	78002489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	104469	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	78060066	78060579	78060413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	66815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	78625090	78625245	78625168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	341171	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	79093983	79094278	79094131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	810064	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	79130045	79130391	79130200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	846126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr11	82781050	82781223	82781203	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	85	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	85047149	85047448	85047300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	290181	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	95745158	95745721	95745455	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	88679	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	95996412	95996766	95996624	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	77578	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	96006843	96007267	96007082	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	67077	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	99210590	99210859	99210725	Y	CNTN5,CNTN5	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	1345525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	100547720	100547959	100547794	Y	ARHGAP42	ARHGAP42	ARHGAP42	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP42	8425	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	100590591	100590889	100590693	Y	NA	ARHGAP42	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	34207	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	103316988	103317242	103317115	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	38603	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	105090888	105091203	105091058	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16	120730	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	105674568	105674985	105674652	Y	KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	RNU4-55P	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	18375	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	107727726	107727971	107727842	Y	NA	RP11-832N8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-832N8.1	49175	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr11	111560054	111560414	111560322	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R1B	74737	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	111824557	111824693	111824689	Y	NA	CRYAB	NA	NA	NA	NA	CRYAB	32111	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	113641541	113641621	113641581	Y	NA	ZW10	NA	NA	NA	NA	ZW10	912	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	113828537	113828676	113828607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	84245	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	115093237	115093486	115093408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	280189	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	115372753	115373113	115372889	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	562	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	116061103	116061309	116061204	Y	NA	NA	CADM1,FAM55B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00900	431758	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	117831249	117831487	117831331	Y	NA	TMPRSS13,IL10RA	FXYD6-FXYD2,IL10RA	IMR90	Hi-C	24141950	IL10RA	23576	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	118112268	118112532	118112411	Y	IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D	MPZL3,MPZL2	NA	NA	NA	NA	MPZL3	8533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	6.11805706537277
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	121337416	121337512	121337466	Y	NA	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	16504	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	121448904	121449244	121449069	Y	SORL1	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	127992	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	123001197	123001518	123001329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	69259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	123513712	123514126	123514044	Y	NA	SCN3B	NA	NA	NA	NA	SCN3B	9826	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	123519920	123520232	123520133	Y	OR8D4,SCN3B	SCN3B	NA	NA	NA	NA	SCN3B	3720	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	126290424	126290762	126290592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	66889	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	126328697	126328821	126328735	Y	NA	NA	ST3GAL4	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL4	105162	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	219251	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	129102482	129102753	129102618	Y	NA	ARHGAP32	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	44466	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	129185836	129186114	129185975	Y	NA	ARHGAP32	ARHGAP32,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP32	38617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	129717042	129717234	129717138	Y	ST14,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	33328	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	129723853	129724184	129723902	Y	NFRKB	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	39301	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	129730176	129730501	129730339	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	32984	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	130062798	130062918	130062846	Y	NA	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	35341	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	130450344	130450649	130450537	Y	NA	NA	ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB44	267763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	132885217	132885578	132885507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	1120215	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr11	133874244	133874525	133874385	Y	B3GAT1	NA	JAM3,NCAPD3,IGSF9B	IMR90	Hi-C	24141950	VPS26B	218014	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	647081	647236	647154	Y	ERC1,SLC6A12,SLC6A12,B4GALNT3	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	79551	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	57680	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	731666	731908	731742	Y	CCDC77,KDM5A,WNK1	RP11-218M22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	6149	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	783263	783371	783324	Y	NA	RP11-218M22.1	CCDC77,NINJ2,B4GALNT3,WNK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-218M22.1	45206	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	1432132	1432276	1432219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	204781	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	1691461	1691635	1691524	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	9696	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	1769649	1770205	1769686	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	25535	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr12	3361586	3361942	3361797	Y	NA	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	42490	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	3450642	3450947	3450795	Y	NA	PRMT8	PRMT8,EFCAB4B	IMR90	Hi-C	24141950	PRMT8	37568	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	3771576	3771874	3771725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB4B	100111	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	6187612	6187773	6187703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	119108	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	6339954	6340271	6340062	Y	VAMP1,TAPBPL,IFFO1	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	33073	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	29449	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	13546	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	6482550	6482923	6482687	Y	SCNN1A,SCNN1A	TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	TNFRSF1A	K562	ChIA-PET	22265404	LTBR	339	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	6525626	6525956	6525791	Y	NA	LTBR,SCNN1A,RP1-102E24.9,TAPBPL	TNFRSF1A,PLEKHG6,SCNN1A,TAPBPL,VAMP1,LOC678655,CD27,IFFO1,GAPDH	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-102E24.9	19708	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	6539566	6540029	6539921	Y	NA	RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	RP1-102E24.9	5635	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	7040569	7040832	7040702	Y	NA	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	8943	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	8.56527989152187
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.75312567941774
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	154430	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	11806275	11806670	11806607	Y	BCL2L14,ETV6	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	5487	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	12504083	12504386	12504252	Y	BCL2L14,MANSC1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	MANSC1	2608	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	12711400	12711706	12711553	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP16	1611	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	14410616	14411017	14410842	Y	PLBD1	RP11-134N1.2	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-134N1.2	43092	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B,C12orf39	NA	NA	NA	NA	C12orf39	10863	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8	NA	NA	NA	NA	RASSF8	20128	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	27430817	27431042	27430895	Y	NA	STK38L	NA	NA	NA	NA	STK38L	35916	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	27702695	27702969	27702865	Y	NA	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	28331	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	28119724	28120118	28120115	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	3520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr12	28126453	28126843	28126791	Y	PTHLH,PTHLH	PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	2815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	28128658	28128812	28128736	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	5020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	56117	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	28185706	28185999	28185851	Y	PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	PTHLH	62068	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	28275745	28275985	28275876	Y	NA	CCDC91	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	8197	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	29323817	29323981	29323882	Y	NA	FAR2	NA	NA	NA	NA	FAR2	23781	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	30975226	30975478	30975347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPRIN2	69341	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	8.25937703825323
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr12	39008158	39008221	39008190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	291011	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	40382618	40382994	40382971	Y	LRRK2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	114897	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	41680022	41680168	41680092	Y	PDZRN4	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN1	595778	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	42470575	42470704	42470641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	65977	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	44910336	44910664	44910572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	402967	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	45627812	45628672	45628351	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	19988	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	45654086	45654401	45654190	Y	NA	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	46262	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	47074564	47074850	47074707	Y	NA	NA	SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	299102	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	47310900	47311079	47310914	Y	NA	NA	SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	535438	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	48053201	48053247	48053224	Y	ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	44597	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	48100473	48100834	48100653	Y	VDR,ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3,SLC48A1	NA	NA	NA	NA	RP1-197B17.3	2605	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	49595765	49596022	49595888	Y	LMBR1L	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TUBA1A	14658	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr12	49646906	49646981	49646941	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,DHH,LMBR1L	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	65799	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	49972592	49972801	49972676	Y	NA	KCNH3,MCRS1,PRPF40B	MCRS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRPF40B	12591	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	50936330	50936621	50936410	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	39562	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	51833393	51833425	51833407	Y	NA	GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	48742	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	101125	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr12	52423514	52423824	52423679	Y	NA	GRASP,NR4A1,C12orf44,OR7E47P	NA	NA	NA	NA	NR4A1	8898	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44,OR7E47P	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	90259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	52888449	52888608	52888529	Y	C12orf44,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-416H24.4	116205	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	53253974	53254173	53254090	Y	RARG,KRT6A,KRT5	NA	KRT83,KRT82,KRT6A,KRT79,KRT78,KRT6B,KRT2,LOC283404,LOC283403,KRT81,KRT84,KRT85,KRT75,KRT6C,KRT71,KRT72,KRT73,KRT1,KRT77,KRT4	IMR90	Hi-C	24141950	KRT18	86482	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	53261473	53261693	53261598	Y	KRT2,KRT1,KRT77	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85	IMR90	Hi-C	24141950	KRT18	78962	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	67222	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	53301815	53302147	53302072	Y	KRT1,KRT76,KRT8	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	38508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	MFSD5	27213	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	53731844	53731991	53731931	Y	NA	PFDN5,C12orf10,AAAS,SP1	NA	NA	NA	NA	AAAS	15196	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	54072437	54072838	54072741	Y	CSAD,MAP3K12,ATF7,ATF7,ATP5G2,CALCOCO1	RP11-972K6.1,ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	3245	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	54444172	54444407	54444311	Y	ATF7,ATP5G2,HOXC12,HOXC11	HOXC8,HOXC5,HOXC4	FLJ12825	IMR90	Hi-C	24141950	HOXC4	1254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	RP11-834C11.4,SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	58595	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1	298940	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	11.3184055709396
chr12	58262646	58262949	58262748	Y	KIF5A,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1,AVIL	CTDSP2	CTDSP2	K562	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	24124	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	58283417	58283685	58283602	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,CTDSP2	CTDSP2,RP11-620J15.3,XRCC6BP1	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-620J15.3	44273	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	62772980	62773240	62773147	Y	MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	85357	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	63294376	63294638	63294612	Y	NA	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	32179	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	64482177	64482504	64482346	Y	SRGAP1,TBK1,C12orf66	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	131572	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	65005842	65006280	65005896	Y	GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	3549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	65065216	65065277	65065242	Y	LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	62923	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	65077868	65077886	65077879	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	73341	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	65176068	65176517	65176160	Y	TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS	GNS	NA	NA	NA	NA	GNS	24841	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	65528086	65528453	65528315	Y	NA	LEMD3	WIF1,TBC1D30,LEMD3,FLJ41278	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD3	32898	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	66012877	66013074	66012996	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	HMGA2	202837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	68314351	68314796	68314502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK2	274233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	69868200	69868446	69868430	Y	CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2	FRS2	NA	NA	NA	NA	FRS2	6071	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	70626158	70626373	70626266	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	8401	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	70650618	70650832	70650694	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	15478	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	71770650	71771010	71770955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGR5	60540	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	24179	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	75986624	75986957	75986791	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	83208	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	76153718	76154163	76153855	Y	NA	NA	PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	221632	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	76178520	76178723	76178659	Y	NA	NA	PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	197072	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	76250053	76250409	76250231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-114H23.1	125386	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	76271655	76271890	76271773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-114H23.1	103905	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-114H23.1	37148	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	RP11-114H23.1	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	3668	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	76373014	76373318	76373236	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	2477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	76919848	76920276	76920185	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	31313	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	76938616	76938968	76938946	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	12621	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	79323956	79323978	79323967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	68183	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	79325321	79325633	79325477	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	69548	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	79356068	79356388	79356099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	100295	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	79363511	79363565	79363558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	107738	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	79444921	79445122	79445022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	189148	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	79462781	79463098	79462967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	207008	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	79526323	79526826	79526502	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	270550	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	322917	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	79817704	79817772	79817737	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	265105	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr12	79817950	79818263	79818028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	264614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	80133375	80133617	80133496	Y	NA	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	50498	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	81077970	81078246	81078130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	251348	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	81596327	81596621	81596474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIN7A	266623	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	83461267	83461506	83461387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	81604	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	89550047	89551250	89550882	Y	NA	NA	POC1B,LOC728084	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	193798	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	89619217	89620117	89619718	Y	DUSP6,ATP2B1	NA	DUSP6,LOC728084,POC1B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP6	124931	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	89727563	89727887	89727725	Y	ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	17161	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	90479667	90480000	90479790	Y	ATP2B1	NA	ATP2B1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	378590	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	92402520	92402848	92402650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	131842	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr12	92415461	92415779	92415694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	118911	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	92419313	92419515	92419511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	115175	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	92424488	92424877	92424862	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	109813	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	92431355	92431571	92431463	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	103119	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	64494	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	92505299	92505700	92505686	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	28990	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	92517420	92517830	92517671	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16860	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	93489257	93489472	93489362	Y	NA	AC138123.2	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	13806	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr12	93757893	93758168	93758031	Y	NA	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	11491	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	93805604	93805748	93805676	Y	CRADD	NUDT4,UBE2N	NA	NA	NA	NA	UBE2N	28290	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	77597	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	95199817	95200100	95199987	Y	VEZT	NA	TMCC3,PLXNC1	IMR90	Hi-C	24141950	TMCC3	157479	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	USP44	104726	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	97203899	97204065	97203983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	94936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	97205009	97205147	97205078	Y	NA	NA	NEDD1	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD1	93854	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	98793447	98793582	98793503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMPO	113708	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	101099927	101100118	101100023	Y	NA	NA	SLC17A8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-575G13.2	129405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	101412491	101412895	101412554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP20	258992	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	102169550	102169734	102169688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	52982	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	102220478	102220758	102220699	Y	NA	GNPTAB,DRAM1	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	1958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	102325445	102326145	102325673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRAM1	56316	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	102892301	102892634	102892501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP37	380399	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	36793	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	104846909	104846975	104846916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	189853	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	105062941	105063154	105062961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	287368	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	107494078	107494256	107494167	Y	NA	CRY1	CRY1,BTBD11	IMR90	Hi-C	24141950	CRY1	8471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	111016111	111016444	111016311	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	2681	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	111868510	111869152	111868792	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26758	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	112920682	112921011	112920993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	66040	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	113579863	113580302	113580091	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,RASAL1,RASAL1	RASAL1,CCDC42B,DDX54	NA	NA	NA	NA	CCDC42B	5361	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	CCDC42B,DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.29427139951479
chr12	113670739	113671157	113670856	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	13840	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	113911337	113912000	113911521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDSL	53295	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	114200256	114200532	114200390	Y	NA	RP11-438N16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-438N16.1	8956	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	114449273	114449426	114449313	Y	NA	RBM19	RBM19,TBX5	IMR90	Hi-C	24141950	RBM19	47097	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	75409	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	118263351	118263381	118263366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	141407	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	118349165	118349453	118349309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	55335	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	118497859	118498236	118498048	Y	NA	RFC5	NA	NA	NA	NA	WSB2	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr12	120445148	120445418	120445237	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	107888	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	121725097	121725322	121725221	Y	OASL,P2RX7,ORAI1,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	8789	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	123606030	123606279	123606155	Y	SNRNP35,HIP1R	PITPNM2	MPHOSPH9,PITPNM2,OGFOD2,ABCB9,ARL6IP4,LOC100507091,VPS37B,C12orf65	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM2	26283	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	123616405	123617083	123616761	Y	ABCB9,MPHOSPH9,C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	PITPNM2,ARL6IP4,ABCB9,OGFOD2,LOC100507091,MPHOSPH9	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM2	15479	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	124717911	124718282	124718055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	262533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	367671	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	124866398	124866679	124866460	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	411020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	452167	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr12	124916261	124916578	124916546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	448636	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	124963399	124963744	124963551	Y	UBC	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	401470	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	125026162	125026505	125026332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	338709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	337221	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	125028947	125029179	125029054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	336035	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	125052829	125053041	125052928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	312173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	125331273	125331577	125331425	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	33637	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	125405622	125405939	125405923	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	5708	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	125423202	125423335	125423285	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	23288	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	125534116	125534467	125534247	Y	NA	AACS	AACS	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AACS	13458	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	127421224	127421361	127421312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.1	121585	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	AC079949.1	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	37812	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	127721490	127721936	127721873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	72818	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	130570123	130570399	130570261	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	FZD10-AS1	74402	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	130570935	130571227	130570972	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	FZD10-AS1	73574	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	130824673	130824982	130824768	Y	PIWIL1	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	PIWIL1	4241	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr12	130923831	130924224	130924207	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	PIWIL1	103399	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.75312567941774
chr12	131111744	131112133	131112105	Y	RIMBP2	NA	RIMBP2	IMR90	Hi-C	24141950	RIMBP2,RP11-662M24.2	86693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	131116739	131116826	131116804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	82000	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	131117194	131117823	131117569	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	81003	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr12	131119964	131120312	131120238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	78514	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	131249995	131250369	131250318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	51169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	131533063	131533346	131533198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	178639	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr12	132356836	132357024	132356894	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	20172	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	133005224	133005492	133005298	Y	NA	NA	P2RX2,GALNT9,POLE,LOC100507055,EP400NL,FBRSL1	IMR90	Hi-C	24141950	FBRSL1	58645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr12	133602699	133602978	133602704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF140	51446	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	21049956	21050288	21050172	Y	IFT88	CRYL1	NA	NA	NA	NA	CRYL1	47708	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	22009901	22010336	22010211	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	21173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	22249294	22249707	22249608	Y	FGF9	RPS7P10,FGF9	NA	NA	NA	NA	FGF9	5772	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	22583629	22583981	22583861	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	FGF9	340107	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	22793744	22794084	22793906	Y	NA	NA	FGF9	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P7	474629	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	23485782	23486124	23485811	Y	NA	NUS1P2	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	1666	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	24440474	24440724	24440677	Y	NA	C1QTNF9B-AS1,MIPEP	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	20304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	25691354	25691814	25691656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPTE2P1	150729	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	26118734	26119070	26118902	Y	FAM123A,ATP8A2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8A2	174525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	28534904	28535178	28535096	Y	LNX2,FLT3,PRHOXNB	PDX1	NA	NA	NA	NA	PDX1	42747	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	28540285	28540611	28540449	Y	LNX2,CDX2	PDX1	NA	NA	NA	NA	PDX1	48128	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	28660576	28660679	28660628	Y	FLT3	PAN3-AS1,PAN3	NA	NA	NA	NA	PAN3-AS1	49651	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	32052041	32052268	32052184	Y	NA	NA	RXFP2	IMR90	Hi-C	24141950	B3GALTL	279968	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	32620673	32620873	32620777	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY	FRY	NA	NA	NA	NA	FRY	17236	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	32664585	32664831	32664706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	61148	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	40090309	40090341	40090325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFP	85324	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	40761399	40761794	40761480	Y	FOXO1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	476940	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	41078224	41078580	41078410	Y	NA	NA	FOXO1,TTL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FOXO1	160154	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	42222511	42222753	42222632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	339170	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	42422497	42422720	42422629	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	189456	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	42534426	42534531	42534479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	77645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	43465852	43466112	43465970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	98295	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	43617981	43618110	43618046	Y	TNFSF11	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	22642	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	6.57691134527572
chr13	43635759	43636150	43635822	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	40420	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	44752615	44752904	44752760	Y	NA	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	300788	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	44765408	44765809	44765737	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,LINC00284	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC122	313581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	44848357	44848873	44848719	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	300410	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	45194278	45194532	45194405	Y	NA	TSC22D1	NUFIP1,TSC22D1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	44995	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	46709325	46709604	46709495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC63	74479	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	49433672	49433840	49433729	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	FNDC3A,MLNR	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3A	114208	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	34850	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	50671086	50671325	50671206	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	16779	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	50864303	50864629	50864474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	69270	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	51167597	51167659	51167628	Y	RNASEH2B	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	233698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr13	51204178	51204550	51204306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	270279	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	51288107	51288409	51288197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B	193405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	52572353	52572390	52572372	Y	NA	ATP7B,ALG11,UTP14C	NA	NA	NA	NA	ATP7B	11240	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	4172	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	340742	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	69285358	69285440	69285385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	1482890	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	71362393	71362632	71362470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	1076698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr13	72366390	72366725	72366609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	72605	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	72438548	72439003	72438895	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	327	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr13	74340193	74340396	74340347	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	365998	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	74467154	74467532	74467385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	238862	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	76390114	76390391	76390144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	197544	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	80357144	80357292	80357207	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP2	303857	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	80743577	80743798	80743732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	169288	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	80810111	80810307	80810235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	102779	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	91869538	91869920	91869747	Y	NA	NA	MIR17HG	K562	ChIA-PET	22265404	MIR17HG	128154	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	97550852	97551225	97550967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	320463	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	97636174	97636720	97636457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	234968	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	99128143	99128552	99128498	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99642	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	84816	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	100620497	100620786	100620718	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	1377	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	100642436	100643177	100642812	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	10410	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	100928465	100928851	100928516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	127119	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	102569627	102570054	102569972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	466661	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	104371816	104371919	104371873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	876622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr13	105791770	105791914	105791835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00460	1234997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	107001723	107002064	107002003	Y	NA	LINC00460	NA	NA	NA	NA	LINC00460	24847	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	107569449	107569874	107569676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	255664	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	108153519	108153767	108153691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIG4	714949	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	110781860	110782469	110782431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	173690	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	111188602	111188989	111188936	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB20	23091	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	113422543	113422856	113422607	Y	ATP11A	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	79900	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	113549464	113549664	113549543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	71474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F7	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F7	48411	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr13	113870568	113870732	113870682	Y	MCF2L,DCUN1D2,ADPRHL1,F10	CUL4A,PCID2	NA	NA	NA	NA	PCID2	9539	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.05902853268638
chr13	114462767	114463040	114462971	Y	FAM70B	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	102006	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	114743258	114743566	114743511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	178212	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr13	114926752	114926846	114926794	Y	NA	NA	LOC100506394,GAS6,RASA3,CDC16,CHAMP1,FLJ44054,ATP4B	IMR90	Hi-C	24141950	CDC16	71516	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	21135159	21135539	21135349	Y	RNASE4,ANG	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	RNASE4	14720	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	23058743	23059118	23058931	Y	REM2	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	2568	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MRPL52	2521	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	27311220	27311475	27311345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	246260	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	27376789	27377008	27376899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	311829	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	27997396	27997715	27997579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	932436	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	31698850	31699225	31699035	Y	STRN3	HECTD1	AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	23840	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	33402784	33403168	33402896	Y	NPAS3	NPAS3	NA	NA	NA	NA	NPAS3	645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	33406991	33407386	33407042	Y	NA	NPAS3	NA	NA	NA	NA	NPAS3	4852	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr14	34532843	34533079	34532927	Y	EGLN3	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	396483	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	35274619	35275001	35274810	Y	PPP2R3C,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	66548	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	36977511	36977654	36977606	Y	MBIP,SFTA3,NKX2-1,NKX2-1	NKX2-1	NA	NA	NA	NA	NKX2-1	10700	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	37119826	37119959	37119893	Y	NA	PAX9	NA	NA	NA	NA	PAX9	4814	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	38052956	38053419	38053189	Y	FOXA1	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	9633	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1199385	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.36493138595502
chr14	41585190	41585196	41585195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1685486	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	43816626	43817007	43816818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1547491	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr14	45458751	45458920	45458836	Y	NA	FAM179B	NA	NA	NA	NA	FAM179B	29340	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	50090977	50091033	50091007	Y	METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2	RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2	NA	NA	NA	NA	MGAT2	5488	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	50681069	50681448	50681362	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	14828	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	NA	NA	NA	NA	NA	ATL1	70885	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	51074312	51074388	51074350	Y	TRIM9,ATL1	MAP4K5	SAV1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K5	48468	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	51970793	51971031	51970913	Y	TRIM9	NA	NA	NA	NA	NA	TMX1	265913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	54075172	54075431	54075302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	348048	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	54573774	54574066	54573953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	150295	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	55281865	55282028	55281930	Y	NA	NA	GCH1,WDHD1	IMR90	Hi-C	24141950	GCH1	85542	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr14	58637905	58638297	58638125	Y	NA	UBA52P3,ACTR10	NA	NA	NA	NA	ACTR10	26501	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	59002332	59002438	59002384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACT1	96247	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	59800555	59800809	59800631	Y	GPR135	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	147191	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	61652622	61652735	61652681	Y	NA	PRKCH	SLC38A6,SIX4,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	345	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	61822624	61823005	61822699	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	35088	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	61888769	61889125	61888947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	101233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	61946614	61946719	61946667	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	159078	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	181993	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	61978878	61979019	61978952	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181212	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	62018127	62018466	62018303	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	141765	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr14	65673021	65673400	65673226	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	105608	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	65722117	65722532	65722424	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FUT8	152778	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	65748716	65749124	65748896	Y	FNTB	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	126186	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	67416708	67417057	67416792	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	288769	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	68666573	68666719	68666628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	220194	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr14	69076965	69077322	69077310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	183868	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr14	69246726	69246992	69246942	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	14198	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	69247587	69247770	69247677	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	13420	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	69516483	69516670	69516577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	72326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	71109519	71109752	71109636	Y	MED6,TTC9	MED6,TTC9	NA	NA	NA	NA	TTC9	3015	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	RP6-65G23.1	NA	NA	NA	NA	RP6-65G23.1	1119	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr14	71425019	71425182	71425094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCNX	52897	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	71865475	71866239	71865922	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	78944	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28482	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	74224542	74224784	74224663	Y	NA	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	27279	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	74229197	74229543	74229334	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43	RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	22520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	74741846	74742137	74741995	Y	FCF1	ABCD4	NA	NA	NA	NA	ABCD4	25622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	76395057	76395394	76395222	Y	ESRRB,TGFB3	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	28578	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	77265287	77265548	77265418	Y	NA	VASH1,ANGEL1	NA	NA	NA	NA	ANGEL1	25041	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	10455	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	77577466	77577695	77577651	Y	NA	TMEM63C,ZDHHC22	NA	NA	NA	NA	TMEM63C	3216	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	77640033	77640278	77640160	Y	NA	ZDHHC22	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC22	32956	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	79406333	79406507	79406344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1141907	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	79464675	79465065	79464871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1200249	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	79485942	79486245	79486016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1221516	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr14	79502772	79503033	79502836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1238346	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	36.2494881123336
chr14	79648106	79648286	79648169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1383680	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	79728948	79729331	79729131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1464522	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	79748672	79748684	79748678	Y	NRXN3	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1484246	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	79879176	79879207	79879192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1544654	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	79941274	79941440	79941360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1482421	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	80268385	80268746	80268504	Y	DIO2	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1155115	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	81220509	81220785	81220647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	203076	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	81484958	81485153	81484991	Y	TSHR	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	61097	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	STON2	NA	NA	NA	NA	STON2	33193	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	89680457	89680908	89680785	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC8	391960	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	89771520	89771819	89771727	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	311674	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	90167936	90168219	90168049	Y	TDP1,FOXN3,FOXN3	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	84443	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	90910680	90911014	90910847	Y	NA	CALM1	CALM1,TTC7B	MCF7	ChIA-PET	22265404	CALM1	49834	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	91734470	91734656	91734563	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	147532	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	92996224	92996503	92996297	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	18106	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	95068378	95068532	95068464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R4	457913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	95677984	95678067	95678026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	55637	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	95680303	95680655	95680479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	57956	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	117542	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	101029795	101030067	101029931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	188653	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	101151381	101151698	101151540	Y	RTL1,DLK1	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	310239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	102176439	102176788	102176690	Y	PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	PPP2R5C,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-1029J19.5	18657	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	102188292	102188876	102188640	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	LINC00239	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-1029J19.5	6569	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr14	102429527	102429743	102429691	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	662	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr14	103557952	103558007	103557980	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TNFAIP2	29772	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	104009097	104009329	104009267	Y	NA	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	15576	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr14	105148231	105148612	105148591	Y	INF2	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	5331	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	105198821	105199110	105199005	Y	C14orf180,ADSSL1	INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	10298	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	5167	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.90607710605206
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1262554	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr15	20547295	20547641	20547374	Y	NA	NA	LOC348120,REREP3,POTEB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-603B24.2	1996448	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	637959	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.81215421210413
chr15	23841916	23842255	23842027	Y	MKRN3	MKRN3	NA	NA	NA	NA	MKRN3	33462	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	25597069	25597306	25597188	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	84822	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	25604152	25604594	25604190	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	77534	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	29949236	29949642	29949365	Y	NA	RP11-680F8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	15552	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	30216999	30217403	30217070	Y	TJP1	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	41665	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	33188603	33188636	33188634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	283258	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	33437895	33438002	33437965	Y	NA	FMN1	FMN1	IMR90	Hi-C	24141950	FMN1	46895	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	35803904	35804280	35804092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	214263	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	37249666	37249815	37249741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	141006	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	39449850	39450075	39449963	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	421205	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	39650604	39651044	39650772	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	220236	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	39673743	39674138	39673898	Y	NA	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	197142	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	39699208	39699614	39699324	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	171666	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	39702122	39702492	39702291	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	168788	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	39803650	39803776	39803696	Y	THBS1	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	67504	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	40361212	40361596	40361446	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	SRP14	31823	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	40385571	40385715	40385643	Y	BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	13378	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,PPP1R14D,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	42091432	42091661	42091502	Y	NA	MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B	NA	NA	NA	NA	JMJD7,PLA2G4B	26622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr15	42535686	42535733	42535710	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	27698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr15	46256210	46256268	46256256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	334864	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	46416141	46416404	46416273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	494795	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	46441434	46441833	46441634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	520088	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	46528514	46528549	46528532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	607168	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr15	46545564	46545905	46545872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	624218	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr15	46758762	46759114	46758953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	837416	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.2119799593207
chr15	48975243	48975418	48975260	Y	NA	NA	FBN1,SHC4,CEP152	IMR90	Hi-C	24141950	CEP152	125925	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	49217829	49218211	49218108	Y	SHC4	EID1,SHC4	NA	NA	NA	NA	SHC4	35430	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	51382019	51382273	51382147	Y	NA	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	13200	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	51515990	51516083	51516067	Y	SPPL2A,TNFAIP8L3,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	120517	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	164608	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	51598187	51598615	51598465	Y	CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	202714	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	51619340	51619705	51619523	Y	TNFAIP8L3,CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	223867	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	51878196	51878692	51878342	Y	TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	34338	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	52122599	52122915	52122757	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	2774	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr15	52851602	52851989	52851853	Y	NA	MYO5A,ARPP19	NA	NA	NA	NA	ARPP19	8091	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	55928441	55928509	55928475	Y	NA	PYGO1	NA	NA	NA	NA	PYGO1	49296	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	57798359	57798473	57798399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCOM1	83633	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	59023904	59024166	59024035	Y	RNF111	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	16011	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	59469464	59469853	59469728	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74187	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	59566542	59566544	59566543	Y	MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	96348	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	59666396	59666611	59666505	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	NA	NA	NA	NA	MYO1E	3297	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	59688558	59688897	59688728	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	MYO1E,LDHAL6B,FAM81A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356M20.1	9456	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	60142100	60142185	60142180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP6	83557	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	60293275	60293547	60293411	Y	NA	FOXB1	NA	NA	NA	NA	FOXB1	874	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	60855817	60856094	60855923	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	86440	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	60865969	60866384	60866286	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	96592	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	60874514	60874871	60874792	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	105137	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	61520020	61520614	61520340	Y	RORA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	502	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	63189821	63190186	63190004	Y	NA	NA	TPM1,TLN2,RAB8B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-244F12.1	53186	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	PLEKHO2	3880	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.60017425278343
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr15	65403116	65403434	65403296	Y	ANKDD1A,PDCD7	PDCD7	UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12	IMR90	Hi-C	24141950	PDCD7	20740	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	65911878	65912241	65912183	Y	DENND4A	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	10174	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	66125063	66125305	66125185	Y	NA	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND4A	42432	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	66971406	66971462	66971434	Y	NA	SMAD6	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	21104	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	67732554	67732598	67732576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf61	78808	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	67982881	67982892	67982887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	149834	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	68078361	68078371	68078366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	245314	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	68900803	68901132	68901037	Y	CORO2B,CORO2B	NA	NA	NA	NA	NA	SPESP1	207428	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	65158	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr15	70392960	70393272	70393150	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	4445	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	70679327	70679587	70679457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	290812	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	70877631	70877741	70877691	Y	NA	NA	UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	176191	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	71406673	71406868	71406715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	223549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	71408872	71409066	71408998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	225748	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	71615809	71616164	71615988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	432685	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	71840441	71840454	71840446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	564145	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	72133892	72134113	72134003	Y	NA	NA	NR2E3	IMR90	Hi-C	24141950	SENP8	270486	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	72337253	72337262	72337258	Y	SENP8,SENP8,SENP8,MYO9A,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	67337	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	73061587	73061861	73061724	Y	PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	14326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	LOXL1	32927	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	74258069	74258363	74258216	Y	C15orf59	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	26600	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	74693719	74694069	74694004	Y	NA	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	30739	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	75404629	75405178	75404816	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39	NA	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	80806	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	75891777	75892150	75892003	Y	PTPN9	PTPN9,SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	PTPN9	22147	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	DNM1P35,RP11-24M17.5	NA	NA	NA	NA	RP11-24M17.5	14816	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr15	77489220	77489376	77489298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN3	114894	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	78667581	78667654	78667595	Y	NA	CRABP1	CRABP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CRABP1	36915	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	79316775	79317175	79316975	Y	RASGRF1	NA	NA	NA	NA	NA	CTSH	76859	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	80828578	80828783	80828681	Y	ZFAND6	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	133886	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	81316981	81317108	81317017	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	25686	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	286122	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr15	83539816	83540191	83540033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WHAMM	63436	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr15	86020857	86021180	86020870	Y	KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	99055	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	86294662	86294910	86294879	Y	NA	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	41351	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	89638395	89638800	89638498	Y	ISG20,HAPLN3,ABHD2	ABHD2	NA	NA	NA	NA	ABHD2	9705	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	89648424	89648609	89648517	Y	NA	ABHD2	NA	NA	NA	NA	ABHD2	19734	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2	NA	NA	NA	NA	ABHD2	35945	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr15	89672226	89672631	89672291	Y	ABHD2	ABHD2	NA	NA	NA	NA	ABHD2	43536	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	89673523	89673970	89673667	Y	ISG20,ABHD2	ABHD2	NA	NA	NA	NA	ABHD2	44833	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	89679824	89680306	89680208	Y	ABHD2	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD2	51134	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	89727640	89727726	89727722	Y	ABHD2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCI	57454	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	90590510	90590767	90590581	Y	ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	47886	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	90601701	90601819	90601779	Y	AP3S2,ZNF710,IQGAP1,CIB1	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	41917	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	90605708	90605863	90605756	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	37873	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	90649995	90650276	90650136	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	6259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.12968851912662
chr15	91190174	91190180	91190177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	68192	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	CTD-3094K11.1	NA	NA	NA	NA	CTD-3094K11.1	49218	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	92072848	92072979	92072916	Y	NA	NA	SV2B	IMR90	Hi-C	24141950	SLCO3A1	321946	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr15	92293461	92293635	92293548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	101290	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	92461389	92461789	92461546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	66464	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	92464513	92465010	92464828	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	69588	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr15	92481402	92481730	92481524	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	86477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	92486040	92486252	92486096	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91115	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	92614363	92614588	92614456	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	212483	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	ASB9P1,FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.51788281258934
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	93388455	93388698	93388628	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHD2	35828	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	93779330	93779873	93779589	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	148897	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	93791047	93791320	93791156	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	160614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	93820840	93821077	93820958	Y	RGMA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	190407	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	93864881	93865242	93865107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	234448	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	95370202	95370491	95370347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	597435	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	98545444	98546413	98546248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	84660	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	99295015	99295222	99295065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	104815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	99387029	99387216	99387183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	196829	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr15	99387614	99387887	99387660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	197414	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	99975346	99975780	99975666	Y	NA	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	39590	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	101677939	101678117	101678028	Y	CHSY1	NA	CHSY1,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	CHSY1	112020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	374352	374895	374583	Y	RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	PDIA2,AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	25778	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	643606	643989	643708	Y	SSTR5,RAB40C,RAB40C	PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	6249	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	651803	652154	651979	Y	NA	PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90	NA	NA	NA	NA	RAB40C	14446	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	68447	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	1339188	1339523	1339417	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UBE2I	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2I	14025	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	1585533	1585949	1585726	Y	NA	TELO2	NA	NA	NA	NA	TELO2	44188	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	1585996	1586318	1586108	Y	NA	TELO2	NA	NA	NA	NA	TELO2	44651	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	1698080	1698287	1698168	Y	CLCN7	IFT140,CRAMP1L,HN1L	NA	NA	NA	NA	HN1L	27970	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	1963457	1963729	1963593	Y	HS3ST6	HS3ST6,NDUFB10,RPS2,SNHG9	C16orf73,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST6	2712	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	HS3ST6,NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST6	13288	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	2212881	2213081	2213004	Y	NA	RAB26,SNORD60,TRAF7,CASKIN1,MLST8,PGP	NA	NA	NA	NA	TRAF7	9182	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	809	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	3013245	3013631	3013382	Y	KREMEN2	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9	NA	NA	NA	NA	KREMEN2	1300	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr16	3055976	3056164	3056082	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	4293	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	3060017	3060177	3060084	Y	NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	280	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.2119799593207
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	3207486	3207903	3207712	Y	SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	29708	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.2119799593207
chr16	3931357	3931444	3931401	Y	C16orf90	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	2630	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.2119799593207
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	SEC14L5,PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEC14L5	12588	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	5617634	5617654	5617644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	471825	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	5666199	5666502	5666317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	520390	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	6281507	6281857	6281681	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1135698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	6921909	6922299	6922100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1776100	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	7167298	7167326	7167312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1546214	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	7355051	7355694	7355418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1357846	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	8932650	8933046	8932848	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	27820	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	10133348	10133947	10133667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	284344	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	10549193	10549271	10549232	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	123284	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	10596760	10596940	10596850	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	75615	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	10677230	10677389	10677317	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	4675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr16	10759043	10759292	10759209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	76351	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	11319095	11319543	11319384	Y	LITAF,CLEC16A,SOCS1	RMI2,SOCS1	CLEC16A,SOCS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RMI2	21933	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	11489659	11490054	11489857	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	141623	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	11670817	11671132	11670939	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	57105	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	12049208	12049600	12049404	Y	NA	GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166B2.1	18900	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	12761788	12762198	12762001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	133676	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	12769820	12770024	12769919	Y	CPPED1	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	125850	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	14396583	14397514	14397260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	233405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	14423689	14423899	14423743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260511	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	14472258	14472411	14472327	Y	NA	NA	PARN,MIR365A,MIR193B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARN	252174	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	15738027	15738375	15738313	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	2903	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	16055043	16055430	16055122	Y	NDE1,NDE1,ABCC1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	13609	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	16092294	16092782	16092512	Y	NDE1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	50860	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	17451275	17451503	17451410	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	1126923	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	17963257	17963462	17963356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	836243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	18153312	18153685	18153560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	646020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	19489216	19489473	19489247	Y	NA	RNU4-46P,GDE1,CCP110	NA	NA	NA	NA	RNU4-46P	18459	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	20913163	20913441	20913303	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	3457	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	22421466	22421891	22421890	Y	NA	SMG1P1,CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	SMG1P1	24438	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	22432961	22433094	22433028	Y	NA	SMG1P1,CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	SMG1P1	13235	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	25072371	25072507	25072437	Y	SLC5A11	ARHGAP17,LCMT1	LCMT1,LOC100506655	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP17	47384	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	28629445	28629457	28629451	Y	SBK1,IL27	SULT1A2,SULT1A1	NA	NA	NA	NA	SULT1A1	3489	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	29712327	29712432	29712378	Y	HIRIP3,QPRT	QPRT,C16orf54	NA	NA	NA	NA	QPRT	39727	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	30579441	30579843	30579693	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	AC002310.7	1728	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	31125100	31125333	31125167	Y	STX4,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,PRSS36	NA	NA	NA	NA	KAT8	25	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,PRSS36	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	34441880	34442279	34442062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2558801	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr16	35029860	35030042	35030005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3146781	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	46791398	46792001	46791737	Y	C16orf87,ORC6	NA	MYLK3,C16orf87	IMR90	Hi-C	24141950	ORC6	69843	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	49316261	49316466	49316357	Y	CBLN1,C16orf78	CBLN1	NA	NA	NA	NA	CBLN1	2519	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	49900569	49900918	49900744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR3	196934	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	50219057	50219422	50219113	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	34228	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	50554457	50554868	50554623	Y	BRD7,NKD1	NKD1	NKD1	IMR90	Hi-C	24141950	NKD1	25373	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	50573093	50573439	50573278	Y	BRD7,NKD1	NKD1	NKD1	IMR90	Hi-C	24141950	NKD1	6802	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	50679822	50680132	50679910	Y	NA	NOD2	NA	NA	NA	NA	NOD2	45382	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYLD	412080	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr16	53517834	53518098	53518006	Y	NA	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	18225	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	54415438	54415695	54415567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	96763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	57269711	57269965	57269822	Y	NA	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	7045	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	57654867	57655271	57654917	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	12303	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.60017425278343
chr16	57701111	57701632	57701437	Y	FAM192A,ZNF319,C16orf57,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	25073	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	74322	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	58380820	58380997	58380928	Y	NDRG4,NDRG4,NDRG4	NA	NA	NA	NA	NA	GINS3	53836	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	58460815	58461210	58460990	Y	NDRG4,NDRG4,NDRG4	NDRG4	NA	NA	NA	NA	NDRG4	33540	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	62889367	62889697	62889532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	2268318	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	65047832	65047877	65047854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	110138	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	CA7,NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	66988106	66988414	66988274	Y	NA	FAM96B,CES2,CES4A	NA	NA	NA	NA	CES2	21759	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	67250789	67251131	67250954	Y	NA	NOL3,KIAA0895L,E2F4,LRRC29,TMEM208,SLC9A5,FHOD1	NA	NA	NA	NA	LRRC29	7820	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	67538327	67538734	67538468	Y	NA	ATP6V0D1,FAM65A	AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF,RLTPR,CTRL	IMR90	Hi-C	24141950	FAM65A	11587	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr16	68303268	68303682	68303412	Y	THAP11,EDC4,PSMB10,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6	6835	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	68306774	68307131	68306843	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6	10341	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.14131997288047
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	68433458	68433594	68433558	Y	NA	SMPD3	NA	NA	NA	NA	SMPD3	46997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	69106233	69106613	69106351	Y	NA	HAS3,CHTF8	NA	NA	NA	NA	HAS3	30854	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	69442470	69442627	69442557	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	1996	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	70356792	70356812	70356803	Y	NA	AARS,DDX19B,DDX19A	NA	NA	NA	NA	DDX19A	21920	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	70461908	70462625	70462132	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	8515	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	70779915	70780216	70780046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52848	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr16	72981236	72981554	72981364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	110043	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr16	74083907	74083919	74083914	Y	NA	NA	HPR	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD7	244754	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	74545615	74545910	74545763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLG1	93102	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	74599295	74599588	74599442	Y	NA	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	39424	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	75496858	75497008	75496924	Y	NA	CFDP1,TMEM170A,CHST6	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	387	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	9.33003702469347
chr16	77217218	77217275	77217245	Y	NA	MON1B,SYCE1L	NA	NA	NA	NA	MON1B	5457	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	77979179	77979195	77979185	Y	VAT1L,WWOX	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	152115	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	78325751	78325980	78325865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	194441	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	79635433	79635866	79635594	Y	MAF	MAF	NA	NA	NA	NA	MAF	2822	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	80571434	80571574	80571570	Y	NA	DYNLRB2	DYNLRB2	K562	ChIA-PET	22265404	DYNLRB2	1057	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	80838768	80839127	80839024	Y	CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2	CDYL2	NA	NA	NA	NA	CDYL2	2542	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	81491583	81491773	81491678	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	14808	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	81617620	81618040	81617835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	140845	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	81659418	81659741	81659491	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110961	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	81732062	81732263	81732080	Y	NA	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	38439	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	81763852	81764387	81764185	Y	NA	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	6315	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	81817758	81818047	81817850	Y	PLCG2	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	47056	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	84172759	84173286	84173220	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,DNAAF1,TAF1C,ADAD2	MBTPS1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HSDL1	3511	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	84208911	84209121	84208992	Y	OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C	HSDL1,DNAAF1,TAF1C,ADAD2	NA	NA	NA	NA	TAF1C	9548	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	84544701	84544717	84544711	Y	NA	NA	COTL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	COTL1	104966	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92B	58441	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	85496879	85497321	85497140	Y	FAM92B,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	224358	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	85548685	85548970	85548791	Y	NA	NA	KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	172709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	85557334	85557622	85557547	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	164057	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	85558121	85558453	85558347	Y	KIAA0182,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	163226	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr16	85603305	85603679	85603564	Y	KIAA0182	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	118000	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	85608106	85608214	85608158	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	113465	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	85678973	85679150	85679027	Y	NA	GINS2	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	42529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr16	85726494	85726553	85726524	Y	NA	GINS2	NA	NA	NA	NA	GINS2	4815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	85733301	85733460	85733373	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	11622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	86229284	86229646	86229464	Y	FOXF1	NA	FOXF1,LOC400550,LOC146513,LOC732275,MTHFSD,COX4I1,COX4NB,IRF8	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	357195	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	86698644	86698785	86698699	Y	FOXL1	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	111803	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	86962886	86963146	86962899	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	376045	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	87759379	87759621	87759456	Y	C16orf95,FBXO31,ZCCHC14,JPH3	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	37977	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	87810498	87810587	87810524	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	12900	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	87870717	87871153	87871035	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	29941	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	87889826	87890140	87890011	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	10954	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	87901718	87902209	87902044	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,KLHDC4,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	87957908	87958324	87958193	Y	NA	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	22526	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	87958916	87959287	87959164	Y	NA	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	21563	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	87981759	87982021	87981940	Y	ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	BANP	CA5A	K562	ChIA-PET	22265404	BANP	909	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	88082514	88082829	88082672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BANP	101664	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	17.4364626363124
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	32253	32376	32346	Y	DOC2B	DOC2B	NA	NA	NA	NA	DOC2B	2826	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	773525	773702	773655	Y	RNMTL1	NA	NA	NA	NA	NA	GLOD4	89944	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	818912	819288	819089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	61722	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	999488	999757	999623	Y	PITPNA,INPP5K,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	101131	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	1011015	1011228	1011147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	112658	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1094047	1094290	1094169	Y	SLC43A2,PITPNA	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	36025	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1216895	1217239	1217095	Y	TLCD2,TUSC5	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAE	84433	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1267059	1267122	1267091	Y	NA	YWHAE	NA	NA	NA	NA	YWHAE	34550	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1358484	1358816	1358590	Y	NA	CRK,MYO1C	NA	NA	NA	NA	CRK	5640	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1466992	1467380	1467296	Y	RILP	INPP5K,PITPNA-AS1,PITPNA	NA	NA	NA	NA	PITPNA	2882	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1864830	1864896	1864863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPH1	66508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	9740	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr17	1987683	1987948	1987816	Y	MNT,SLC43A2,WDR81,HIC1,HIC1	OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	44356	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	2126107	2126815	2126522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	77862	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	2167377	2167408	2167381	Y	NA	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	37269	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	2397010	2397265	2397138	Y	NA	METTL16	LOC284009	IMR90	Hi-C	24141950	METTL16	15920	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	133114	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	3453416	3453706	3453615	Y	OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3	NA	NA	NA	NA	NA	SHPK	83910	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	4386875	4387235	4387089	Y	NA	SPNS2	NA	NA	NA	NA	SPNS2	12898	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	4753672	4753828	4753714	Y	UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	18989	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	CHRNE,RNF167,SLC25A11,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	5412379	5412497	5412422	Y	USP6	DHX33,MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	24248	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	6818045	6818590	6818345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	62865	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	6821400	6821836	6821600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	66220	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	7015601	7015870	7015677	Y	TNFSF12,POLR2A,CD68,CD68,SLC13A5,XAF1,RNASEK,GABARAP,EIF5A,ASGR1,ASGR2,ASGR2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A11	70359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	7115018	7115437	7115195	Y	NA	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	3007	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.36493138595502
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.50625135883549
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.44722282614911
chr17	8031830	8031985	8031892	Y	CNTROB,ODF4	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	ALOXE3,HES7	IMR90	Hi-C	24141950	HES7	6420	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr17	9549792	9549873	9549833	Y	NA	USP43	NA	NA	NA	NA	USP43	3777	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	10658369	10658680	10658526	Y	SHISA6,TMEM220,PIRT	TMEM220,RP11-963H4.2	ZNF18,SHISA6,PIRT	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-963H4.2	10509	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	11266931	11267244	11267127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH9	232504	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	14206072	14206436	14206180	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	3672	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	16922074	16922240	16922157	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	21619	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	17566702	17566984	17566789	Y	NA	RAI1	RAI1,SMCR9,PEMT,NT5M,TOM1L2,COPS3,MED9,RASD1,SMCR5,SREBF1,C17orf39,ATPAF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAI1	15803	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	17595288	17595502	17595395	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	12501	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	18128078	18128354	18128155	Y	NA	ALKBH5,LLGL1,FLII	NA	NA	NA	NA	LLGL1	1177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3A	52233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr17	19769871	19770228	19769963	Y	NA	ULK2	NA	NA	NA	NA	ULK2	622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr17	19994905	19995311	19995047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	84248	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	20057823	20057990	20057893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	147166	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	20690369	20690534	20690439	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	4411	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	22069559	22069863	22069667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	593837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	25415234	25415538	25415430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203564	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	25415760	25416041	25415903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203061	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	54.4507078818176
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.58854279902957
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RPL23A,SNORD42A,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	28533256	28533617	28533437	Y	SLC6A4	SNORD63	NA	NA	NA	NA	SNORD63	38221	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	28716902	28717301	28716970	Y	SSH2,NSRP1,CPD,CPD,GOSR1	CPD	NA	NA	NA	NA	CPD	12979	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	19457	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	29759240	29759393	29759318	Y	NA	RAB11FIP4	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	42598	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	29816760	29817002	29816913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	100118	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	30847234	30847756	30847477	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	35597	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	30923806	30924081	30923942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	112169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	31155018	31155230	31155072	Y	MYO1D	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	46965	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	33786708	33787098	33786905	Y	NA	SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	12852	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	35078576	35079010	35078700	Y	NA	NA	LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRM1	122575	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	35292129	35292558	35292512	Y	ACACA,LHX1,AATF	RP11-445F12.1,AATF	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	35296825	35297078	35296886	Y	LHX1	RP11-445F12.1,AATF	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	4865	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	35492690	35492856	35492817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	188515	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	36134421	36134864	36134540	Y	DDX52	NA	DDX52,HNF1B,SYNRG	IMR90	Hi-C	24141950	DDX52	132928	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr17	36907984	36908100	36908042	Y	NA	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B	NA	NA	NA	NA	PSMB3	995	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	37831191	37831499	37831297	Y	GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2	STARD3,ERBB2,PGAP3	NA	NA	NA	NA	ERBB2	10668	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	38263317	38263642	38263602	Y	NA	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	8339	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	38467869	38468243	38468028	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	4425	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	39110175	39110404	39110304	Y	KRTAP3-2	KRT23	NA	NA	NA	NA	KRT23	18289	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	39802138	39802335	39802276	Y	NKIRAS2,NKIRAS2,DHX58,EIF1	EIF1	KRT19,KRT15	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF1	40802	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	15359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	43200086	43200194	43200154	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	7773	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	43389475	43389771	43389724	Y	FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14	MAP3K14	TEX34,LOC100133991	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	2643	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	43817871	43818233	43818138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	151515	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	18474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	44135698	44135955	44135827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	165950	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	44213270	44213366	44213318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	243522	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	44234299	44234706	44234578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	264551	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	44268679	44268848	44268762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	298931	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	CDC27	120552	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	45814083	45814467	45814294	Y	NA	TBX21	OSBPL7,MRPL10,SCRN2,LRRC46	IMR90	Hi-C	24141950	TBX21	5473	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	46101351	46101579	46101379	Y	NA	NFE2L1	NA	NA	NA	NA	NFE2L1	22112	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	NFE2L1	NA	NA	NA	NA	NFE2L1	20861	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	46583139	46583523	46583310	Y	SKAP1	NA	HOXB2,HOXB3,HOXB4,SKAP1,HOXB8,HOXB1,HOXB9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOXB4	71950	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7211	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	47049793	47049986	47049890	Y	IGF2BP1,SNF8	SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1	IGF2BP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IGF2BP1	22788	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	47815825	47816028	47815963	Y	MYST2,FAM117A,DLX4,DLX4	SLC35B1,KAT7,FAM117A	NA	NA	NA	NA	SLC35B1	31449	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	47966905	47967224	47967101	Y	DLX4,DLX3,TAC4	NA	LOC284080,ITGA3,SPOP,NXPH3,SLC35B1,DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,FLJ45513,TAC4,DLX4,PDK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLX4	77110	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	22709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	55504815	55504992	55504904	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	173603	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	55749375	55749748	55749439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	175669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	55978714	55978990	55978831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	51694	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	56012688	56013140	56012704	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,SRSF1,CUEDC1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	17544	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	56013342	56013699	56013370	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	16985	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	56468859	56469318	56469005	Y	RNF43	SUPT4H1,RNF43	NA	NA	NA	NA	RNF43	23638	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	56480586	56480907	56480747	Y	NA	RNF43	NA	NA	NA	NA	RNF43	12049	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	57837481	57837783	57837612	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	54494	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	57930626	57931026	57930760	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	13999	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	58169287	58169683	58169398	Y	RNFT1	HEATR6	HEATR6,LOC645638	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR6	14995	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	261797	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	59488217	59488528	59488332	Y	NA	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	C17orf82	1105	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	60557252	60557333	60557299	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	34795	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	153511	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	60877951	60878269	60878188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	175189	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	62310016	62310373	62310195	Y	C17orf72	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	28288	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	63624560	63624814	63624604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	68795	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	63654769	63655153	63655091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	99004	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	63747410	63747660	63747535	Y	CEP112,CEP112,AXIN2	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	191645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	63752923	63753189	63753062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	197158	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr17	63759124	63759374	63759249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	203359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	63996608	63996849	63996729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	189353	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr17	64961597	64961937	64961768	Y	CACNG4	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	2571	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	65470400	65470556	65470469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	98825	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	68033950	68033965	68033958	Y	NA	NA	KCNJ16,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	128849	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	68153518	68153744	68153613	Y	NA	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	9070	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	70183324	70183341	70183333	Y	SOX9	SOX9-AS1	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9-AS1	32636	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	70395717	70396043	70395724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	179740	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	201238	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	191903	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr17	70483632	70483939	70483786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	150672	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	70497980	70498445	70498203	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	136166	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	70499253	70499546	70499535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	135065	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	70511484	70511781	70511663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	122830	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	49131	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	46835	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	70628447	70628581	70628499	Y	NA	LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	6030	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	70680022	70680249	70680147	Y	NA	LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	45411	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr17	71639437	71639585	71639501	Y	SDK2	SDK2	NA	NA	NA	NA	SDK2	1209	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	72247418	72247796	72247504	Y	NA	RPL38,TTYH2	NA	NA	NA	NA	TTYH2	39765	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	72595328	72595714	72595383	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,SLC16A5,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	147077	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	72627955	72628575	72628190	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF	NA	GPRC5C,C17orf77,CD300LD,RAB37,CD300E	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A3R1	114216	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	73007918	73008254	73008160	Y	RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	1153	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	73531533	73531826	73531590	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	12372	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	73546030	73546166	73546084	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26869	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	WBP2,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	WBP2	18363	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	74116537	74116786	74116688	Y	NA	SRP68,GALR2,EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	880	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr17	74134600	74134832	74134764	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	548	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	74189615	74189996	74189806	Y	RNF157	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	30891	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	74255513	74255743	74255629	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	21059	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	74496062	74496568	74496378	Y	FAM100B,SPHK1,SPHK1,ST6GALNAC2,JMJD6,RHBDF2,RHBDF2	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	190	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	74593962	74594390	74594127	Y	FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,JMJD6	ST6GALNAC1	ST6GALNAC2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ST6GALNAC1	43530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	8052	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	75361925	75362048	75361987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	87274	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	75370768	75371003	75370901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	96117	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	75421302	75421687	75421325	Y	SEPT9,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	146651	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	19.4248311825585
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	76379911	76380778	76380428	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	7190	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	76669146	76669243	76669181	Y	DNAH17	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	107136	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	77022886	77023125	77023007	Y	C1QTNF1	LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	5990	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	77663951	77663958	77663954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX2	85973	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	77702456	77702572	77702532	Y	NA	CBX2	NA	NA	NA	NA	CBX2	47359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr17	77788517	77788922	77788877	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	15035	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	77817686	77818105	77817998	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	6458	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	77965696	77966573	77966281	Y	CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	41074	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr17	78008584	78008924	78008651	Y	TBC1D16,GAA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	CCDC40	149	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr17	78471918	78472124	78472096	Y	NA	NPTX1,RPL32P31,RPTOR	RPTOR,ENDOV,LOC100294362,CHMP6	IMR90	Hi-C	24141950	NPTX1	22275	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	78803936	78804105	78804080	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	159293	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	78844194	78844503	78844331	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	118895	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	79064673	79065032	79064884	Y	BAIAP2,TMEM105	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	57725	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr17	79789691	79790066	79789800	Y	NA	FAM195B,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	513	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	79886802	79887109	79886903	Y	NA	ANAPC11,ALYREF,PCYT2,SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1	NA	NA	NA	NA	MAFG-AS1	3097	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	79925685	79926075	79926048	Y	TSPAN10	SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1	ASPSCR1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ASPSCR1	6608	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	79949658	79950000	79949804	Y	SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1	NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	16975	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	NA	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CSNK1D	67224	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	80342594	80342740	80342634	Y	NA	HEXDC	NA	NA	NA	NA	HEXDC	31454	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr17	80594524	80594906	80594740	Y	UTS2R,WDR45L	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	59698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr17	80817363	80817528	80817446	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	109423	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	125269	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr18	1192820	1193070	1192907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP72	129016	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	3383416	3383792	3383691	Y	TGIF1,TGIF1	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	25814	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	3490071	3490183	3490142	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	80465	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	3508912	3509046	3509010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	99306	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	3610673	3610894	3610785	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	201067	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr18	4368151	4368526	4368370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	958545	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	4373306	4373648	4373563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	963700	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	5455725	5456092	5455990	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	172607	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	5515409	5515548	5515483	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	113151	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	5542461	5543034	5542604	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	85665	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	5629750	5630120	5629929	Y	NA	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	1051	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L3	266575	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	8500113	8500344	8500149	Y	NA	NA	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	107099	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	9094792	9095105	9094897	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	RALBP1,TWSG1,NDUFV2,CCDC165,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDUFV2	5523	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	9742137	9742641	9742378	Y	NA	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	35975	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	9838439	9838883	9838628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	73116	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr18	9849459	9849859	9849589	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	62140	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	9855760	9855978	9855869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	56021	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	10086468	10086802	10086635	Y	NAPG,APCDD1	NA	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	174469	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	10141033	10141178	10141087	Y	NA	NA	APCDD1,NAPG	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	229034	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr18	10766591	10766813	10766750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	242689	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr18	11431991	11432229	11432112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAL	254726	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	11995516	11995787	11995574	Y	NA	IMPA2	NA	NA	NA	NA	IMPA2	16492	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	12765132	12765369	12765274	Y	CEP76	NA	NA	NA	NA	NA	CEP76	64356	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	12837862	12838421	12838235	Y	PTPN2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	89221	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	12880036	12880906	12880743	Y	NA	PTPN2	NA	NA	NA	NA	PTPN2	46736	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr18	13382338	13382799	13382497	Y	RNMT,PTPN2,CEP192	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	341860	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	13500609	13500835	13500766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223824	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	13501125	13501479	13501273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223180	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	13542199	13542509	13542255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	182150	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr18	19415827	19415836	19415832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	132909	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	ANKRD29,LAMA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	12042	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	21463540	21463749	21463607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	106988	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr18	24267222	24267336	24267279	Y	KCTD1	KCTD1	NA	NA	NA	NA	KCTD1	31857	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	26852132	26852529	26852335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	1096722	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr18	28823621	28824065	28823663	Y	NA	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	143243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	29232383	29232901	29232639	Y	NA	B4GALT6	NA	NA	NA	NA	B4GALT6	30898	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	29441885	29441939	29441912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	89160	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	29897352	29897676	29897515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	227534	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	29952485	29952862	29952679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	282667	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	32106446	32106756	32106602	Y	NA	DTNA	NA	NA	NA	NA	DTNA	35192	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	32239709	32239834	32239782	Y	MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	168455	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	32291109	32291369	32291156	Y	MAPRE2,NOL4,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	219855	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr18	32413678	32413828	32413755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	141064	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	32925283	32925658	32925513	Y	MAPRE2,MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	1837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	43407687	43408063	43407797	Y	PSTPIP2,EPG5	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	137177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	43622844	43623013	43623010	Y	NA	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	27225	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr18	43732950	43733330	43733193	Y	RNF165,C18orf25	C18orf25	NA	NA	NA	NA	C18orf25	18189	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	44370223	44370563	44370393	Y	RNF165,PIAS2	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	124892	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	45379355	45379691	45379492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	75824	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	46072108	46072320	46072224	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	8691	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	46213796	46213995	46213850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	150379	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	46297484	46297823	46297654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	234067	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	46472885	46473143	46472966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	409468	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	46473942	46474323	46474293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	410525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	53072982	53073437	53073370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	256581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	53144810	53145149	53144924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	184869	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	53180110	53180413	53180343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	149605	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	55381917	55382196	55382152	Y	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	86137	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	55880754	55881007	55880894	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171155	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr18	56188664	56188776	56188720	Y	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	77087	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	59968434	59968761	59968590	Y	NA	TNFRSF11A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11A	21759	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	60173605	60173906	60173662	Y	KIAA1468,ZCCHC2	ZCCHC2	ZCCHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZCCHC2	14334	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr18	60273018	60273214	60273116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	84778	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	60456322	60456424	60456373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	75650	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	60609893	60610245	60610069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	229221	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	60822545	60823046	60822712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	162315	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	67069140	67069566	67069456	Y	DOK6	DOK6	NA	NA	NA	NA	DOK6	2849	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	74194351	74194716	74194640	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	10430	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	74745176	74745688	74745337	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	212613	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	74808374	74808713	74808562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	275811	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	74825736	74826105	74826060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	293173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	74841905	74842663	74842144	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	309342	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	616514	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	188995	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	283297	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	77394218	77394591	77394404	Y	NA	CTDP1	ATP9B,NFATC1	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	43210	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr18	77558494	77558673	77558529	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	120693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	485856	486161	485966	Y	PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1015	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34,GZMM	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	789308	789721	789469	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	909116	909504	909461	Y	STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22	MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	1736	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	934999	935434	935086	Y	MIDN,CIRBP	MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	11218	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	1016614	1016952	1016783	Y	C19orf6	WDR18,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	7346	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr19	1280981	1281104	1281044	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	MUM1	2786	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	1658049	1658081	1658059	Y	EFNA2,ONECUT3	TCF3	TCF3	MCF7	ChIA-PET	22265404	TCF3	7445	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	1725719	1725877	1725796	Y	C19orf26,MUM1,APC2	NA	TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF3	75115	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	2332363	2332647	2332580	Y	REXO1,CSNK1G2,MKNK2,GNG7,SPPL2B	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	5744	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	2489253	2489454	2489354	Y	BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	15133	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	2528875	2529093	2529033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	54755	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	2578988	2579272	2579256	Y	TMPRSS9	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	104868	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	2888802	2889178	2888846	Y	NA	ZNF555,ZNF556,ZNF57	NA	NA	NA	NA	ZNF57	9718	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	3314117	3314647	3314306	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	42914	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr19	3687832	3687894	3687862	Y	FZR1,APBA3	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	10583	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	4052414	4052757	4052628	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	12186	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	4084320	4084813	4084566	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	19377	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	4567148	4567365	4567215	Y	TICAM1,SEMA6B	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	70165	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	5046594	5046918	5046679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	79469	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr19	5578316	5578496	5578453	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	42550	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	5968660	5968756	5968716	Y	PSPN,SLC25A41,TMEM146,PRR22,NRTN,RFX2,ACSBG2	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	7397	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	6066698	6067208	6066827	Y	SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	90545	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	7559450	7559827	7559455	Y	NA	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	8051436	8051456	8051449	Y	NA	TIMM44,ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	17087	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	9402141	9402360	9402251	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	30088	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	9517572	9518021	9517955	Y	NA	ZNF266	NA	NA	NA	NA	ZNF266	26233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	9902440	9902843	9902543	Y	ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	33649	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	10949257	10949551	10949405	Y	CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	TMED1	4263	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	12261625	12261922	12261774	Y	NA	ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136,CTD-2666L21.1	NA	NA	NA	NA	ZNF625	3624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	13023589	13024232	13023881	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	HOOK2,DNASE2,GCDH,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	FARSA	18619	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	13095998	13096573	13096246	Y	ZNF490,ZNF791,TNPO2,TNPO2,MAST1	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	7849	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr19	13445795	13446271	13446068	Y	SYCE2	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	186566	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	13975574	13976059	13975671	Y	CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	38955	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	13995889	13996057	13995977	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	18957	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	14084978	14085262	14085120	Y	NA	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	DCAF15	23674	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	IL27RA,EEF1DP1,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr19	14636614	14636887	14636775	Y	OR7C2	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	DNAJB1	1695	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	14869692	14869911	14869839	Y	NA	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	EMR2	17442	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	15666666	15666804	15666739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WIZ	107904	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	16576710	16576784	16576751	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	4112	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	18264934	18265291	18265179	Y	NA	PIK3R2,IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	PIK3R2	2966	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	JUND	11955	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr19	18504645	18504988	18504829	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,UBA52,ELL,LRRC25	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	21104	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	18625662	18626077	18625893	Y	UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL	ELL,FKBP8,KXD1	NA	NA	NA	NA	ELL	4860	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	18722417	18722765	18722581	Y	GDF1,RAB3A,PDE4C,CRTC1,TMEM59L	UBA52,C19orf60,TMEM59L,CRLF1,KLHL26	NA	NA	NA	NA	CRLF1	5866	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	19589693	19590012	19589853	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	34533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	21505293	21505670	21505490	Y	ZNF429,ZNF708,ZNF493	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	4557	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	21511296	21511520	21511376	Y	NA	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	1069	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	22715195	22715609	22715437	Y	NA	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	1908	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr19	23855421	23855665	23855541	Y	NA	ZNF675	NA	NA	NA	NA	ZNF675	12357	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	28217479	28217822	28217621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1484626	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	28218670	28219232	28218933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1483216	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	28270762	28271411	28271062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1431037	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	30163705	30164366	30164027	Y	C19orf2,C19orf2,PLEKHF1,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	9742	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	33165229	33165376	33165346	Y	NA	RGS9BP,ANKRD27,NUDT19	NA	NA	NA	NA	ANKRD27	127	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	33382845	33383180	33383014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP89	77717	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	33875552	33875576	33875564	Y	NA	CEBPG	NA	NA	NA	NA	CEBPG	13316	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	34752762	34752909	34752837	Y	NA	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	9320	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	34992713	34992833	34992773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA2	75456	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	35494139	35494542	35494364	Y	NA	ZNF792,GRAMD1A,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	10451	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	35557782	35557965	35557875	Y	MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4	HPN,FXYD3	NA	NA	NA	NA	HPN	28372	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	35595565	35595951	35595710	Y	ZNF181,ZNF30	FXYD3,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	8781	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	IGFLR1	37792	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	36241217	36241384	36241301	Y	MAG,LRFN3	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55,ARHGAP33	NA	NA	NA	NA	LIN37	3955	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	37894729	37894877	37894831	Y	NA	ZNF527	NA	NA	NA	NA	ZNF527	34766	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	38470537	38470671	38470619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	74669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	38721338	38721526	38721432	Y	NA	SPINT2,PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	SPINT2	11149	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	PPP1R14A,YIF1B,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	YIF1B	14252	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	41304071	41304255	41304136	Y	SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	EGLN2	1170	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	41680959	41681276	41681150	Y	NA	CYP2S1	CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	15678	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	CYP2S1	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	14755	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.90607710605206
chr19	41803374	41803837	41803699	Y	B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	10257	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr19	42432096	42432209	42432128	Y	NA	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	29333	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	42440713	42441005	42440837	Y	ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	20537	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	42722677	42722859	42722787	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	ZNF526	254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	44124638	44124922	44124781	Y	CADM4	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	ZNF428	2612	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	45205949	45206135	45206066	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	42827	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.05902853268638
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3,CBLC,BCAM	NA	NA	NA	NA	CBLC	553	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	45663964	45664347	45664315	Y	NA	TRAPPC6A,BLOC1S3	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6A	15148	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.74149422566389
chr19	45953262	45953678	45953446	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	15575	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.44722282614911
chr19	45968349	45968608	45968538	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	FOSB	645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	46385401	46385465	46385433	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1911	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL1	46694	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	47662714	47662828	47662771	Y	NA	SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	ZC3H4	47705	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	47729030	47729228	47729064	Y	NA	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	4795	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	47744387	47744529	47744512	Y	SLC8A2	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	10364	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	8.56527989152187
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	47817254	47817597	47817448	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	32941	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	31401	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	48016569	48017036	48016994	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	72	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	48076356	48076760	48076653	Y	SLC8A2,ZNF541	NA	GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541	IMR90	Hi-C	24141950	NAPA	59859	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	48226445	48226596	48226537	Y	NA	GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	GLTSCR2	20183	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	48494541	48494691	48494555	Y	ELSPBP1,BSPH1	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4C	117383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,SYNGR4,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	26338	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	SLC17A7,ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	SLC17A7	19141	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	50317454	50317522	50317488	Y	PTH2	AP2A1,FUZ,MED25,PTOV1	NA	NA	NA	NA	FUZ	1111	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	50417620	50417965	50417778	Y	NA	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	11994	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	50718358	50718781	50718691	Y	NA	MYH14	NA	NA	NA	NA	MYH14	28915	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	50825197	50825861	50825498	Y	NA	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	NR1H2	5049	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	50990086	50990332	50990328	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	12076	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	51003635	51004295	51004006	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	8315	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	51104864	51105235	51104932	Y	NA	C19orf81	NA	NA	NA	NA	C19orf81	45467	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	51182448	51182932	51182864	Y	NA	C19orf81,SHANK1	NA	NA	NA	NA	C19orf81	31746	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	51197974	51198378	51198356	Y	NA	C19orf81,SHANK1	NA	NA	NA	NA	SHANK1	22329	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	33069	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	120291	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	52227755	52228377	52227966	Y	HAS1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	155204	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	52996616	52996734	52996658	Y	NA	ZNF578,ZNF808	NA	NA	NA	NA	ZNF808	32171	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	53660263	53660559	53660411	Y	NA	ZNF415,ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF347	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	55546101	55546409	55546255	Y	NA	RDH13,EPS8L1	NA	NA	NA	NA	RDH13	34250	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	55721470	55721547	55721521	Y	NA	SYT5,PTPRH,TMEM86B,PPP6R1	NA	NA	NA	NA	PTPRH	2596	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr19	55885541	55885905	55885786	Y	NA	SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	TMEM238	8061	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	55960580	55961094	55961009	Y	SYT5,BRSK1,SHISA7	UBE2S,ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ISOC2	10616	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr19	56169893	56170373	56169939	Y	NA	ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	U2AF2	6381	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	56810811	56811236	56810900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	66232	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	57965552	57965851	57965609	Y	NA	ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF749	20855	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	58080640	58080798	58080711	Y	NA	ZNF549,ZNF550,ZIK1,ZNF416,ZNF530,ZNF134	ZNF550,ZNF549	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZIK1	7026	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	58217187	58217439	58217313	Y	NA	ZNF551,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF551	25850	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	58415823	58415990	58415970	Y	NA	ZNF814,ZNF417,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	9988	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	58673997	58674222	58674118	Y	ZSCAN4	ZSCAN18,ZNF329,ZNF274	ZNF416,ZNF274	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF329	9520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	58784706	58785064	58784920	Y	NA	ZNF544,ZNF8,ERVK3-1	NA	NA	NA	NA	ZNF8	3254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.36493138595502
chr19	59049687	59049971	59049795	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1409	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	605283	605589	605326	Y	NA	NA	TPO,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	69850	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	628526	628919	628630	Y	NA	TMEM18	FAM150B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	46520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	857378	857399	857389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTG2	87155	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr2	1476597	1477084	1476655	Y	TPO,TPO	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	150107	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	1721166	1721471	1721224	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	25153	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	1999873	1999971	1999922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	253249	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYT1L	284052	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.58854279902957
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYT1L	517783	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	3699787	3700199	3700016	Y	NA	TMSB4XP2	NA	NA	NA	NA	TMSB4XP2	36440	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	7940244	7940644	7940444	Y	NA	NA	LINC00299	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	876331	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	8712183	8712281	8712245	Y	NA	NA	LINC00299,LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	104694	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	8743061	8743194	8743128	Y	ID2	NA	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	73781	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	CYS1,RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	10471190	10471549	10471320	Y	HPCAL1,HPCAL1	HPCAL1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	HPCAL1	30175	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	11838238	11838829	11838549	Y	E2F6,LPIN1	LPIN1	GREB1,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	LPIN1	22517	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	11890513	11890846	11890740	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	74792	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	14951995	14952243	14952237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	747211	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	15199994	15200355	15200088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	499099	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	15445260	15445596	15445428	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	253858	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	20356621	20356779	20356666	Y	NA	NA	SDC1,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	SDC1	66415	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	20372050	20372172	20372122	Y	SDC1,SDC1	NA	MATN3,SDC1,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	SDC1	51022	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	20379968	20380084	20380011	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	43110	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	20386283	20386578	20386422	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	36616	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	20409195	20409404	20409321	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	13790	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	20417309	20417694	20417511	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	5500	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	20421306	20421667	20421468	Y	NA	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	1527	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr2	20435780	20436055	20435965	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	12586	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	20629438	20629618	20629512	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOB	15217	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	20848318	20848468	20848370	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	381	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	24324329	24324521	24324426	Y	NA	SF3B14,TP53I3,PFN4	NA	NA	NA	NA	TP53I3	17598	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	24713346	24713697	24713476	Y	DNAJC27,ITSN2	NCOA1	CENPO,NCOA1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA1	563	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	17060	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	26943701	26943984	26943834	Y	GPR113	AC015977.5,CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	41173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	28731273	28731592	28731424	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	117958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	28767576	28768254	28768064	Y	WDR43,TRMT61B,SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	154261	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	28856660	28856889	28856764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	115617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	29009696	29009902	29009742	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	37190	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	29299232	29299374	29299303	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	19197	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	29349196	29349466	29349333	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	30625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	29435309	29435425	29435367	Y	SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	116738	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	29439591	29440302	29440265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	121020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	30644745	30644849	30644777	Y	NA	LCLAT1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	23243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	30807812	30808169	30807846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	139720	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	33863068	33863290	33863179	Y	NA	FAM98A	NA	NA	NA	NA	FAM98A	40619	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	37576725	37576898	37576775	Y	STRN,HEATR5B,PRKD3,QPCT	PRKD3,QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	7008	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr2	37603882	37604154	37604086	Y	QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	34165	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	37617673	37618124	37617783	Y	CDC42EP3,EIF2AK2	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	47956	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	38323202	38323810	38323564	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL7P12	132900	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	39340813	39341200	39341198	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	8286	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	39917142	39917449	39917282	Y	TMEM178,TMEM178	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	86958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	40484262	40484526	40484482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	351667	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	40506084	40506414	40506221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	329779	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	40698645	40699001	40698895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	137192	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	40958599	40958755	40958677	Y	NA	NA	LOC100128590,SLC8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	122406	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	41716160	41716289	41716225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	678201	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	317515	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	43205442	43205824	43205685	Y	MTA3,HAAO	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	245924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	43686078	43686091	43686085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135094	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	44542790	44543096	44543052	Y	SLC3A1	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	43905	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	45870946	45871356	45871039	Y	NA	SRBD1,PRKCE	PRKCE,EPAS1,RHOQ,SRBD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCE	5128	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	45974142	45974515	45974197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	97658	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	46100592	46100616	46100604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	224108	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	46993562	46993962	46993767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS5	69471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	47212237	47212567	47212294	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	45243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	47285421	47285805	47285614	Y	TTC7A	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	115935	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	47526778	47526800	47526792	Y	KCNK12	AC073283.4,EPCAM	TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61,EPCAM	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	43413	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	47569796	47569847	47569822	Y	NA	AC073283.4,EPCAM	EPCAM,MSH2	IMR90	Hi-C	24141950	AC073283.4	366	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	49534130	49534366	49534244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2A1L	691193	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	54165408	54165630	54165519	Y	NA	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	ACYP2	30345	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	54285444	54285567	54285472	Y	NA	NA	SPTBN1,EML6,PSME4	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	89467	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	54330282	54330384	54330333	Y	NA	NA	SPTBN1,RTN4,EML6,ACYP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSME4	134305	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	54800045	54800558	54800206	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	118623	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	56066410	56066608	56066510	Y	NA	NA	EFEMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EFEMP1	82666	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	56083172	56083316	56083296	Y	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	65958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	57707334	57707464	57707399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	425322	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	60760023	60760353	60760231	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	18349	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	60779041	60779656	60779263	Y	REL,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	339	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REL	58707	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	61464355	61464721	61464539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	61802	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.44722282614911
chr2	62534127	62534336	62534147	Y	NA	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	112879	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	63129477	63129780	63129501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	145412	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	63961711	63961835	63961773	Y	NA	NA	UGP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC096664.1	52272	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	64017775	64017931	64017855	Y	PELI1	WDPCP,UGP2	UGP2	IMR90	Hi-C	24141950	WDPCP	35046	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	64239166	64239247	64239208	Y	PELI1	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	4959	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	64490373	64490733	64490649	Y	NA	NA	LINC00309,PELI1	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	120785	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	64504356	64504878	64504479	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	134768	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	66306594	66306908	66306751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	351676	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	143315	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.75312567941774
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	69040869	69041120	69040946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	197190	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	69536922	69537085	69537004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	75297	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	69663778	69663884	69663817	Y	AAK1	NFU1	NA	NA	NA	NA	NFU1	1018	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	69857892	69858266	69858093	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	11291	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr2	70145725	70146134	70145771	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22905	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	70294861	70295138	70295000	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	17447	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	70346022	70346119	70346054	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	18339	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	71078987	71079152	71079069	Y	FIGLA,CD207	VAX2	ATP6V1B1,CLEC4F,ADD2,VAX2	IMR90	Hi-C	24141950	VAX2	46568	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	71129017	71129173	71129049	Y	NA	VAX2,ATP6V1B1	NA	NA	NA	NA	VAX2	3297	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	73402910	73403369	73403123	Y	SFXN5	RAB11FIP5,SMYD5	EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB11FIP5	21061	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	74446656	74447054	74446868	Y	NA	MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MTHFD2	22967	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	74804828	74804964	74804881	Y	MOBKL1B,DOK1	AUP1,DOK1	NA	NA	NA	NA	DOK1	30675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	74811573	74811810	74811692	Y	NA	DOK1	DOK1,LOXL3	IMR90	Hi-C	24141950	DOK1	37420	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	74968770	74968998	74968973	Y	TLX2,HK2	AC007387.2	HK2,SEMA4F	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007387.2	10948	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	75103488	75103536	75103515	Y	LBX2,HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	44380	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	78328146	78328439	78328293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	314638	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	78401270	78401306	78401289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	387762	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	78525487	78525634	78525561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	511979	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	85887180	85887589	85887391	Y	SH2D6,SFTPB	C2orf68	NA	NA	NA	NA	C2orf68	49991	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	86163596	86163679	86163638	Y	NA	ST3GAL5	POLR1A,ST3GAL5,ATOH8,LOC90784,LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	49459	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	IMMT	32286	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	88629818	88629863	88629841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXI3	120268	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	88899554	88899981	88899832	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	25113	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	88913679	88914090	88914022	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	11004	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	89871741	89871869	89871793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	808417	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2752348	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2872873	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	92309033	92309202	92309197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT4	3225976	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	96782666	96782871	96782861	Y	NA	ADRA2B,DUSP2	NA	NA	NA	NA	ADRA2B	2682	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	96911483	96911666	96911570	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7,TMEM127,CIAO1	NA	NA	NA	NA	TMEM127	18066	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	97428705	97428844	97428785	Y	NA	LMAN2L,CNNM4	NA	NA	NA	NA	CNNM4	4066	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	97554359	97554681	97554500	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	19865	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	97561594	97561991	97561828	Y	FAM178B	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	27100	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	98290312	98290690	98290542	Y	TMEM131	COX5B,ACTR1B	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	11742	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	89408	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	99250910	99251133	99251091	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	27868	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	99344413	99344676	99344545	Y	INPP4A,MGAT4A	MGAT4A	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	101946998	101947171	101947106	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	23835	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	103104673	103104833	103104753	Y	IL1R2,IL1R1,IL18R1,IL18RAP	SLC9A4	NA	NA	NA	NA	SLC9A4	16911	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	105477972	105479094	105478260	Y	NA	LINC01158	NA	NA	NA	NA	LINC01158	10331	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	105479098	105479298	105479181	Y	NA	LINC01158	NA	NA	NA	NA	LINC01158	11457	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	108841436	108841459	108841449	Y	NA	NA	SULT1C2P1	IMR90	Hi-C	24141950	SULT1C2	61636	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr2	109883526	109883741	109883650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	482313	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	110271705	110271931	110271836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	97852	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	110318153	110318301	110318244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	51482	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	111829364	111829577	111829485	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	45378	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	112375521	112375561	112375551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC1	264706	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	26628	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	DPP10	NA	NA	NA	NA	DPP10	20172	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	115897297	115897567	115897434	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	19353	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	118309015	118309417	118309218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	260809	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	120040037	120041002	120040438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	60653	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	121200367	121200763	121200697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBB	98648	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	121943239	121943562	121943401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFCP2L1	97221	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	122536391	122536587	122536559	Y	NA	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	43712	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	125517359	125517545	125517452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC023347.1	1546542	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC3	73929	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	129073927	129074235	129074112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	129393218	129393341	129393276	Y	NA	NA	UGGT1,HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	319067	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	133561799	133561885	133561850	Y	NA	NA	LYPD1,GPR39	IMR90	Hi-C	24141950	LYPD1	134647	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	135062328	135062641	135062375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	186774	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	136783030	136783335	136783274	Y	NA	AC093391.2,DARS	NA	NA	NA	NA	DARS	41360	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	137084668	137085432	137085239	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	210933	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	142874625	142874987	142874896	Y	LRP1B	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	2213148	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	144380348	144380398	144380373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	707737	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	145942500	145942836	145942668	Y	NA	NA	ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P5	149962	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	146450569	146451281	146450882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P5	357771	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	148089200	148089222	148089211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	476693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	148279824	148280174	148279855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	285741	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	148394087	148394646	148394415	Y	ACVR2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	171269	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	148397071	148397198	148397141	Y	ACVR2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	168717	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	150041045	150041195	150041136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6	143304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	151022837	151023057	151022971	Y	NA	NA	RND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RND3	370468	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	152930991	152931406	152931212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAM2	99100	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	154335936	154336181	154336134	Y	RPRM	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	2614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	154446220	154446391	154446306	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	1410	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	154729073	154729474	154729153	Y	NA	GALNT13	NA	NA	NA	NA	GALNT13	2647	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	155569761	155570004	155569789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT13	843335	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	157038752	157038990	157038871	Y	NR4A2	NA	NR4A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR4A2	157870	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	14.377434103626
chr2	159853491	159853713	159853657	Y	NA	TANC1	NA	NA	NA	NA	TANC1	30345	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	159855059	159855514	159855150	Y	NA	TANC1	NA	NA	NA	NA	TANC1	31913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	161979819	161979978	161979936	Y	TANK,TANK	TANK	PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TANK	11441	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	166161416	166161745	166161474	Y	SCN2A,SCN2A	NA	NA	NA	NA	NA	CSRNP3	162412	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	166649551	166649790	166649651	Y	GALNT3	GALNT3	NA	NA	NA	NA	GALNT3	359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	166671246	166671486	166671366	Y	CSRNP3	GALNT3	NA	NA	NA	NA	GALNT3	22054	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	166778122	166778316	166778220	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	30037	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	166983519	166983786	166983732	Y	NA	SCN1A	NA	NA	NA	NA	SCN1A	996	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	169203110	169203445	169203278	Y	NA	NA	ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402	IMR90,Islet	Hi-C,4C	24141950,24413736	STK39	100459	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	169928135	169928282	169928217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPC25	160254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	170441657	170442069	170441908	Y	NA	FASTKD1,PPIG	NA	NA	NA	NA	PPIG	2807	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	170777121	170777463	170777246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	95153	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	171679560	171679730	171679653	Y	NA	GAD1	NA	NA	NA	NA	GAD1	11837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	173111540	173111762	173111691	Y	ITGA6	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	145912	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	173116941	173117298	173117012	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	151313	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	173378612	173378884	173378727	Y	NA	PDK1,AC093818.1	NA	NA	NA	NA	PDK1	39217	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	175459812	175460479	175460357	Y	CIR1,GPR155,WIPF1	AC018890.6	NA	NA	NA	NA	AC018890.6	49943	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	175519164	175519290	175519227	Y	NA	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	26354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr2	175540530	175540594	175540562	Y	CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1	WIPF1,H3F3AP4	NA	NA	NA	NA	WIPF1	5050	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	175651390	175651743	175651567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	68885	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	175762241	175762347	175762322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	179736	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	176846427	176846539	176846507	Y	NA	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	19028	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	177628731	177629135	177629049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01116	128072	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	178260156	178260330	178260230	Y	NFE2L2	AGPS,AC074286.1,NFE2L2	NA	NA	NA	NA	NFE2L2	4731	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	180127574	180128171	180127755	Y	NA	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	57	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	185595976	185596316	185596146	Y	ZNF804A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	134883	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	186616540	186616923	186616825	Y	NA	FSIP2	NA	NA	NA	NA	FSIP2	15185	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	186638782	186639016	186638929	Y	NA	FSIP2	NA	NA	NA	NA	FSIP2	37427	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	188464486	188464724	188464607	Y	NA	NA	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	CALCRL	153299	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	190324760	190324912	190324838	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	20601	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	190729809	190730106	190729887	Y	OSGEPL1,PMS1	C2orf88	NA	NA	NA	NA	C2orf88	12229	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	191416774	191417126	191416837	Y	MFSD6,TMEM194B	TMEM194B	NA	NA	NA	NA	TMEM194B	19326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	192084344	192084437	192084391	Y	NA	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	23474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	205616	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	192775335	192775569	192775423	Y	OBFC2A,SDPR	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	65354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	192870555	192870805	192870799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	160574	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	192882025	192882303	192882164	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	172044	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	192889960	192890123	192890039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	168312	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	192915570	192915970	192915770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	142465	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	194838514	194838698	194838568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	1600003	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	196278119	196278504	196278172	Y	NA	NA	SLC39A10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A10	160197	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr2	196531201	196531576	196531334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	92500	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	196547563	196547821	196547646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	108862	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	197779870	197780287	197779995	Y	NA	PGAP1	NA	NA	NA	NA	PGAP1	10233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	197936511	197936873	197936784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	145991	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	201454959	201455229	201455094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD18	72452	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	DAZAP2P1	165924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	205836059	205836159	205836109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	427543	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	206571507	206572136	206571741	Y	NRP2,INO80D	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	26793	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	206613471	206613845	206613585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	68757	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	210580281	210580584	210580403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPE	284705	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	211032670	211033036	211032982	Y	NA	AC006994.2	NA	NA	NA	NA	AC006994.2	1206	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	212769634	212769960	212769797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC013404.1	607720	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	213352343	213352729	213352575	Y	NA	ERBB4	NA	NA	NA	NA	ERBB4	48836	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	216563363	216563707	216563549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FN1	264468	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	216847055	216847597	216847305	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	49222	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	217214941	217215065	217215003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAL1	60072	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	217487227	217487455	217487235	Y	NA	PSMB3P2,IGFBP2	DIRC3,IGFBP2,XRCC5,RPL37A,IGFBP5,RUFY4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP2	8096	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	IGFBP5	NA	NA	NA	NA	AC007563.5	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	217639400	217639563	217639456	Y	NA	NA	DIRC3,TNS1,IGFBP5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP5	81152	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	217797120	217797464	217797294	Y	NA	NA	DIRC3,TNP1,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	238872	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	VIL1	9441	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	219648056	219648806	219648528	Y	TMBIM1,PNKD,SLC11A1,TTLL4,CYP27A1	CYP27A1	NA	NA	NA	NA	CYP27A1	3584	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	219994287	219994651	219994407	Y	NA	NHEJ1,FAM134A,CNPPD1	NA	NA	NA	NA	NHEJ1	28936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1,AC009502.4	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.4	5650	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	220557392	220557516	220557454	Y	NA	AC009502.1,AC009502.4	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.4	9289	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	220994864	220994875	220994870	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	AC009502.4	446761	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	221000091	221000153	221000122	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	AC009502.4	451988	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	221671008	221671386	221671029	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	765536	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	222312152	222312375	222312261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	124547	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	222383007	222383509	222383204	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	53413	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	222841384	222841657	222841521	Y	EPHA4	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	404462	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	224413942	224414282	224414142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCG2	50939	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	224452508	224452858	224452683	Y	SCG2	SCG2	NA	NA	NA	NA	SCG2	12363	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr2	232282956	232283086	232283021	Y	NA	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	24702	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.36493138595502
chr2	232470282	232470477	232470427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	93232	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	232505425	232505799	232505482	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	63806	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr2	233377568	233377661	233377601	Y	ECEL1,PRSS56	EIF4E2,TIGD1	MIR1471,ECEL1P2	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4E2	35101	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	234266690	234266835	234266770	Y	INPP5D,ATG16L1,DGKD	DGKD	NA	NA	NA	NA	DGKD	5537	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	234608579	234609196	234608912	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	10326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	235372630	235373257	235372862	Y	ARL4C	AC097713.3,ARL4C	NA	NA	NA	NA	AC097713.3	27658	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	235732390	235732720	235732555	Y	NA	NA	SH3BP4,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	125897	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr2	235959667	235960159	235959834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	101050	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	236453392	236453640	236453439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	52659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	236547901	236548387	236548201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	147168	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBX2	407971	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	238091026	238091296	238091147	Y	NA	NA	COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	98566	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	238384383	238384688	238384583	Y	LRRFIP1	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	7383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	238391204	238391436	238391383	Y	LRRFIP1,MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	635	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	238392046	238392381	238392184	Y	LRRFIP1,MLPH	NA	NA	NA	NA	NA	MLPH	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	238398938	238399241	238399144	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	6867	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	238581844	238582251	238582110	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	47625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	238596328	238596696	238596497	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	62109	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	239631175	239631419	239631288	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	123254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	239758150	239758505	239758333	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	3477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	239772979	239773251	239773061	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	18306	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	239870450	239870747	239870599	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	115777	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	240145548	240145836	240145702	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	175294	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	240168373	240168774	240168689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	152356	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	240190277	240190476	240190405	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	130654	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.28263994576094
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	240199614	240199929	240199643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	121201	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	240213505	240213689	240213606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	107441	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr2	240321591	240321797	240321685	Y	HDAC4	AC062017.1,HDAC4	NA	NA	NA	NA	HDAC4	243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	240362327	240362618	240362447	Y	HDAC4	AC062017.1,HDAC4	HDAC4,NDUFA10	IMR90	Hi-C	24141950	HDAC4	40979	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	240866823	240867270	240867165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA10	95549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr2	241395144	241395496	241395485	Y	NA	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	AC110619.2	1013	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	241585712	241586190	241585819	Y	DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN10	61579	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	242262018	242262304	242262161	Y	NA	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	7542	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	242455386	242455795	242455485	Y	NEU4,C2orf85	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	STK25	8241	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr2	242714145	242714474	242714395	Y	NEU4,D2HGDH,GAL3ST2	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	GAL3ST2	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr2	242911452	242911734	242911512	Y	NA	NA	LOC728323	IMR90	Hi-C	24141950	AC131097.3	89938	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	321375	321752	321587	Y	NA	ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3	NA	NA	NA	NA	NRSN2	3674	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	351057	351207	351131	Y	NA	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	8054	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	623135	623319	623297	Y	NA	TCF15,SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	8695	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	623492	623974	623709	Y	NA	TCF15,SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	8040	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	FAM110A	NA	NA	NA	NA	FAM110A	10670	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	1310858	1311228	1310987	Y	SDCBP2,SDCBP2,SIRPG	SDCBP2	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	2975	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	24402	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	1333009	1333271	1333126	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	25126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	25714	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	1415597	1415981	1415837	Y	NA	FKBP1A,NSFL1C	FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	NSFL1C	36506	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115061	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	1842464	1842590	1842566	Y	NA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	30564	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	2295693	2295966	2295830	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	TGM3	NA	NA	NA	NA	TGM3	21046	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	2648841	2649036	2648938	Y	NA	NOP56,SNORD110,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7,EBF4	EBF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-686C3.7	5843	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	2802059	2802221	2802148	Y	CPXM1	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	VPS16	17128	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	2964753	2965068	2964761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS26	59523	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	2978820	2979208	2979015	Y	NA	MRPS26	NA	NA	NA	NA	MRPS26	45383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	3159596	3159937	3159912	Y	PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	20754	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr20	4072203	4072410	4072307	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	SMOX	27217	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	4674724	4674919	4674762	Y	NA	PRNP	NA	NA	NA	NA	PRNP	9842	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	4970261	4970448	4970382	Y	NA	SLC23A2	RASSF2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	18491	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	5058710	5058848	5058784	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	46424	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr20	5588948	5589498	5589341	Y	CDS2,TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	174	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	6.57691134527572
chr20	5635212	5635550	5635485	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	45540	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	5717960	5718260	5718168	Y	C20orf196	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10779	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	5816621	5816994	5816701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHGB	73082	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	5825010	5825403	5825098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHGB	64673	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	6594261	6594618	6594466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT1	492070	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	8435134	8435511	8435284	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	324310	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	8437471	8437869	8437556	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	326647	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	10469146	10469624	10469385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	56276	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	10471502	10471750	10471599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	58632	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	10486121	10486184	10486148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	73251	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	10532947	10533172	10533034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	91842	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	10585324	10585599	10585462	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	39415	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	12250218	12250236	12250226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	380847	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	13142278	13142281	13142280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	58137	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	13705752	13706023	13705888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	57509	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	14036151	14036406	14036253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD2	62136	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	14800025	14800243	14800134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	483763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	18034343	18034358	18034351	Y	NA	PTMAP3,OVOL2	NA	NA	NA	NA	OVOL2	3474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	19717747	19718119	19717916	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	18233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	19881587	19881718	19881652	Y	RIN2,RIN2	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	16422	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	20324455	20324838	20324736	Y	NA	INSM1	NA	NA	NA	NA	INSM1	21927	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	22370980	22371107	22371043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00261	186173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	22452184	22452575	22452252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00261	104705	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	22471596	22471813	22471642	Y	FOXA2,FOXA2	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00261	85467	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	22555806	22556424	22556290	Y	NA	LINC00261,FOXA2	NA	NA	NA	NA	LINC00261	856	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	22558447	22558719	22558568	Y	FOXA2,FOXA2	LINC00261,FOXA2	NA	NA	NA	NA	LINC00261	1167	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	25267859	25268242	25268026	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	41154	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	25305837	25305970	25305904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	63649	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	25522357	25522633	25522495	Y	NA	NINL	NA	NA	NA	NA	NINL	41520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	30110463	30111086	30110768	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	10232	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	30699679	30699866	30699769	Y	BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	4370	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	31170393	31170766	31170763	Y	NA	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	110	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	31269107	31269491	31269215	Y	C20orf185,C20orf203	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD7	60312	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	32142835	32143155	32142948	Y	C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B	NA	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	66954	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	32966378	32966977	32966403	Y	GGT7	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	ITCH	17337	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	CDC42P1	1169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	33236140	33236313	33236227	Y	AHCY,TP53INP2,MYH7B	PIGU	NA	NA	NA	NA	PIGU	26597	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	33653192	33653349	33653271	Y	NA	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	25325	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	34127589	34128004	34127717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	FER1L4,SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	34479476	34479734	34479606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND1	65660	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCAND1	107196	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr20	34681523	34681969	34681863	Y	EPB41L1,DLGAP4,EPB41L1	NA	LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCAND1	136129	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	34685769	34686042	34685906	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1,DLGAP4	IMR90	Hi-C	24141950	SCAND1	140375	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	35305679	35305903	35305811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	66578	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	35362274	35362463	35362369	Y	NA	NDRG3,DSN1	NA	NA	NA	NA	NDRG3	10018	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	35874402	35874620	35874497	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	41421	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	36048250	36048624	36048494	Y	VSTM2L	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	23312	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	36056702	36057072	36056829	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	14864	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPB	130499	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	37326119	37326442	37326281	Y	NA	ACTR5	NA	NA	NA	NA	ACTR5	48643	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	37908580	37908938	37908759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	319638	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	38149772	38149784	38149778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	560830	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	39172537	39172674	39172606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	143206	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	39661985	39662084	39662008	Y	NA	RNU2-52P,TOP1	NA	NA	NA	NA	TOP1	6527	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	40188226	40188487	40188477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	56646	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	42828501	42828745	42828623	Y	NA	OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	8855	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	43239191	43239604	43239345	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39270	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	43569969	43570092	43570031	Y	RBPJL,TP53TG5,STK4	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	17035	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	44056635	44056652	44056644	Y	NA	PIGT,WFDC2	NA	NA	NA	NA	PIGT	13918	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	44935542	44935954	44935889	Y	ZNF334,SLC12A5,CDH22	CDH22	CDH22	IMR90	Hi-C	24141950	CDH22	405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	45324546	45324927	45324721	Y	TP53RK	TP53RK,SLC2A10	SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	TP53RK	8128	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr20	45526625	45526933	45526720	Y	NA	EYA2,RP11-323C15.2	NA	NA	NA	NA	RP11-323C15.2	1432	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	45944502	45944683	45944617	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	34622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	46370826	46370984	46370910	Y	NA	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	42376	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	47372882	47372931	47372907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	69489	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	47455528	47455923	47455726	Y	NA	PREX1	PREX1,ARFGEF2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PREX1	13108	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	47544338	47544681	47544534	Y	DDX27	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	7911	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48295598	48295872	48295769	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	32543	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48598723	48598794	48598730	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	RNF114,SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	1187	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48617449	48617575	48617507	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	19913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48760872	48761304	48761158	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	6870	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48868757	48869061	48868987	Y	NA	RP11-290F20.3	PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB,LOC284751,PARD6B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	12962	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	49032230	49032497	49032297	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	92394	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	49430215	49430240	49430227	Y	PARD6B,BCAS4,ADNP	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	20784	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	49454379	49454475	49454388	Y	NA	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	44948	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	49598879	49599145	49599015	Y	PTPN1	DPM1,MOCS3,KCNG1	NA	NA	NA	NA	MOCS3	25516	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	75345	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	50267344	50267677	50267577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	89974	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr20	50416342	50416699	50416509	Y	NA	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	33169	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	33530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	52481702	52482101	52481977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	257256	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	CYP24A1	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	47875	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	52784442	52785020	52784595	Y	PFDN4	CYP24A1,PFDN4	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	3492	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	54677058	54677284	54677222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210B	254687	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	55880789	55880965	55880877	Y	BMP7	BMP7,RAE1	NA	NA	NA	NA	BMP7	41104	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	55964119	55964506	55964297	Y	ZBP1,MTRNR2L3,RBM38	RAE1,MTRNR2L3	NA	NA	NA	NA	RBM38	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	55968808	55969481	55968821	Y	ZBP1,PMEPA1	RAE1,MTRNR2L3,RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	4345	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	56194057	56194266	56194203	Y	ZBP1	ZBP1	NA	NA	NA	NA	ZBP1	425	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	56550215	56550469	56550425	Y	NA	NA	ZBP1,CTCFL,PCK1,PMEPA1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf85	173491	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	56705842	56706001	56705847	Y	NA	C20orf85	ZBP1,PCK1,CTCFL,C20orf85	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf85	17959	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr20	56881907	56882420	56882011	Y	STX16,RAB22A	PPP4R1L,RAB22A	NA	NA	NA	NA	PPP4R1L	75	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	CTSZ,ATP5E	NA	NA	NA	NA	CTSZ	22091	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	57670365	57670649	57670522	Y	NA	NA	ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	54401	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	58044917	58045137	58045090	Y	NA	NA	EDN3	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	428953	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	54923	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	58459134	58459312	58459218	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177	SYCP2	NA	NA	NA	NA	SYCP2	47398	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	59048045	59048435	59048112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	387150	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	60561621	60561764	60561683	Y	GATA5,CABLES2	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	77102	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr20	60933408	60933760	60933692	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	6608	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.04739707893253
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	60944265	60944566	60944463	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3897	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	61001783	61002051	61001918	Y	NA	RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	21442	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	61342361	61342694	61342588	Y	NA	RP11-93B14.5	NA	NA	NA	NA	RP11-93B14.5	46285	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	61505589	61505880	61505712	Y	BHLHE23,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCFL5	14474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr20	61506279	61506510	61506352	Y	BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TCFL5	15164	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr20	61585167	61585546	61585389	Y	NA	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	17863	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIDO1	120685	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	62085174	62085706	62085468	Y	BHLHE23,NKAIN4,CHRNA4,SRMS,UCKL1,STMN3,RTEL1,EEF1A2,KCNQ2	RP11-358D14.2,EEF1A2	NA	NA	NA	NA	RP11-358D14.2	7770	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	62113410	62113704	62113637	Y	ZNF512B,EEF1A2	RP11-358D14.2,EEF1A2,PPDPF	NA	NA	NA	NA	EEF1A2	14801	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.9767370924923
chr20	62545436	62545544	62545492	Y	NA	DNAJC5,RNU1-134P,UCKL1	NA	NA	NA	NA	RNU1-134P	7128	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,SAMD10,PRPF6	NA	NA	NA	NA	SAMD10	3	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	10852099	10852403	10852350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAGE2	244577	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	11174514	11174910	11174556	Y	NA	NA	BAGE5,TPTE	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	77534	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	466067	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	518558	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr21	19171826	19171995	19171943	Y	C21orf91	C21orf91	NA	NA	NA	NA	C21orf91	17708	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	27544040	27544194	27544117	Y	APP	APP	NA	NA	NA	NA	APP	2594	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	27855729	27855767	27855735	Y	CYYR1	NA	NA	NA	NA	NA	CYYR1	87836	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	29660800	29661042	29660922	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	594651	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	29765694	29766009	29765812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	489684	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	9.63593987796211
chr21	31460569	31460950	31460760	Y	KRTAP19-2,KRTAP15-1,KRTAP13-3,KRTAP19-6,KRTAP19-4,KRTAP27-1,KRTAP25-1,KRTAP23-1,KRTAP19-7,KRTAP13-4,KRTAP13-1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	896177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	31781146	31781491	31781278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	1148067	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	32553780	32554124	32553993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	375434	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	32662959	32662987	32662974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	266571	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	32926891	32927175	32926925	Y	NA	AP000251.3	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	2383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	33247157	33247609	33247328	Y	NA	HUNK	NA	NA	NA	NA	HUNK	3529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr21	33822696	33822707	33822702	Y	C21orf63,C21orf62	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	59257	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	34383763	34384240	34383948	Y	IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1	NA	OLIG1	IMR90	Hi-C	24141950	OLIG1	56210	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr21	34766608	34766854	34766746	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	IFNGR2,TMEM50B,IFNAR1,IL10RB,IFNAR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFNGR2	6348	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	35308653	35309105	35308775	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	22369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000322.53	349707	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr21	36167928	36168243	36168166	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	AP000322.53	373664	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	36203156	36203348	36203246	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	AP000322.53	408892	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000322.53	420523	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	36220332	36220721	36220527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000322.53	426068	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000322.53	438952	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	36599466	36599950	36599803	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	775015	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr21	36604888	36605215	36605097	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RUNX1	769750	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	36638663	36638676	36638670	Y	NA	NA	RUNX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RUNX1	736289	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	37694250	37694633	37694410	Y	NA	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	3763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	37952364	37952489	37952422	Y	NA	NA	CLDN14,HLCS,DSCR6	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	116944	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr21	38349168	38349478	38349323	Y	TTC3,DYRK1A,HLCS	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	HLCS	11058	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	38500086	38500176	38500125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC3	56560	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	40690087	40690386	40690238	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	1099	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	42108090	42108273	42108169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3197	429211	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	42879173	42879227	42879200	Y	FAM3B,TMPRSS2,TMPRSS2	TMPRSS2	NA	NA	NA	NA	TMPRSS2	21816	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	43460613	43461088	43460825	Y	C2CD2,SLC37A1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	88614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr21	43758079	43758185	43758132	Y	NA	TFF3,TFF1	NA	NA	NA	NA	TFF3	24318	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	43832072	43832298	43832177	Y	NA	TFF1	NA	NA	NA	NA	TFF1	47369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	43881012	43881164	43881098	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32954	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	43881255	43881524	43881384	Y	NA	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32594	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	6.57691134527572
chr21	43944597	43944892	43944856	Y	NA	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	RSPH1	30133	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr21	44072717	44073208	44072832	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	971	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr21	44355985	44356328	44356154	Y	NA	PKNOX1	U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	PKNOX1	36292	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	44469974	44470172	44470008	Y	CBS	CBS	NA	NA	NA	NA	CBS	24881	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	44803157	44803673	44803421	Y	PKNOX1,SIK1	SIK1	HSF2BP,RRP1B,SIK1	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	41335	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr21	44817742	44818046	44817914	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	26962	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	44830426	44830842	44830489	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	14166	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	44831891	44832268	44832005	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	12740	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1,LINC00319	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.90607710605206
chr21	44908266	44908370	44908324	Y	NA	LINC00319	LINC00319,SIK1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00319	43785	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00319	53521	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00319	72303	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	45587301	45587635	45587415	Y	PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	C21orf33	C21orf33	K562	ChIA-PET	22265404	C21orf33	35814	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	45601467	45601803	45601706	Y	PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	C21orf33	ICOSLG,PWP2,DNMT3L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C21orf33	49980	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC3	70409	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	31919	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr21	46127419	46127576	46127516	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	1919	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	46294509	46294819	46294590	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	2757	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	46737459	46737695	46737585	Y	COL18A1	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	31646	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr21	46749567	46749782	46749739	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	43754	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	46894520	46894647	46894596	Y	COL18A1	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	67678	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	863	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr21	47543656	47544056	47543951	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	27645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr21	47554885	47555152	47555043	Y	FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	38874	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	17697692	17697885	17697853	Y	BCL2L13,IL17RA,CECR1	AC005300.5	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	25866	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	18402838	18403339	18403237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	101986	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.75312567941774
chr22	19749283	19749521	19749403	Y	NA	SEPT5,TBX1	NA	NA	NA	NA	TBX1	7057	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr22	19941739	19941814	19941777	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	14398	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	19983834	19983932	19983883	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	18399	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.05902853268638
chr22	22478098	22478432	22478244	Y	CCDC116,YPEL1,ZNF280B	NA	NA	NA	NA	NA	TOP3B	142885	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	23876230	23876637	23876426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	133317	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	24756229	24756614	24756466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	55233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	24799556	24799967	24799568	Y	NA	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	11880	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD56	86659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr22	27043800	27044733	27044318	Y	SEZ6L	MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	3408	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr22	27054967	27055259	27055032	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	CTA-211A9.5	11471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	28475489	28475734	28475658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	161367	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	29218930	29219398	29218977	Y	NA	XBP1,CTA-292E10.6	TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,HSCB,CHEK2,C22orf31	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	24259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	29280564	29280869	29280661	Y	NA	ZNRF3	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	2984	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	29319930	29320200	29320120	Y	NA	ZNRF3	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	42350	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	29469912	29470391	29470070	Y	XBP1,KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	2846	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr22	29471077	29471334	29471238	Y	KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	4011	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	29545879	29545979	29545929	Y	AP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	EMID1	53861	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	29548210	29548510	29548260	Y	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	NA	EMID1	51330	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	NA	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D10A	118936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D10A	72268	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	31030399	31030736	31030505	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	TCN2,PES1,SLC35E4,DUSP18	NA	NA	NA	NA	SLC35E4	760	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	31854917	31854933	31854925	Y	NA	SFI1,EIF4ENIF1	NA	NA	NA	NA	SFI1	27741	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	34073272	34073505	34073390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	1204609	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	35528321	35528338	35528332	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	96711	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	36775613	36775832	36775764	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	6231	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	17637	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	37428831	37429188	37428927	Y	CARD10,TMPRSS6,TST,MPST	MPST,TST,KCTD17	KCTD17,TMPRSS6	IMR90	Hi-C	24141950	TST	15150	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	37997690	37997947	37997695	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GGA1	4534	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	38105250	38105455	38105345	Y	NA	LGALS1,NOL12,TRIOBP	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	14239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.51788281258934
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	38653163	38653507	38653358	Y	NA	TMEM184B	MAFF	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM184B	13533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	38848472	38848673	38848585	Y	NA	KDELR3	NA	NA	NA	NA	KDELR3	13394	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	41128851	41129054	41128911	Y	NA	NA	XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP37	60396	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr22	42008568	42008780	42008674	Y	NA	PMM1,XRCC6	NA	NA	NA	NA	XRCC6	6343	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	42679264	42679621	42679518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	Z83851.1	83621	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	42696920	42697075	42696965	Y	NA	NA	TCF20,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	Z83851.1	66167	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	43288479	43288908	43288801	Y	NFAM1,PACSIN2,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	36367	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	44856761	44856923	44856842	Y	NA	LDOC1L	PARVB,PARVG,SAMM50,KIAA1644,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	35255	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	45012617	45012993	45012776	Y	NA	PRR5	NA	NA	NA	NA	PRR5	49600	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	45015871	45016262	45016114	Y	NA	PRR5	NA	NA	NA	NA	PRR5	46331	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	45016324	45016531	45016433	Y	PARVG,PARVG,PRR5	PRR5	NA	NA	NA	NA	PRR5	46062	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	45106642	45106985	45106689	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	10287	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.14131997288047
chr22	46285473	46285870	46285610	Y	NA	NA	FAM118A,SMC1B,ATXN10,FBLN1,WNT7B,PKDREJ,C22orf40	IMR90	Hi-C	24141950	RP6-109B7.3	161715	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763	NA	NA	NA	NA	C22orf26	19890	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763	NA	NA	NA	NA	C22orf26	22058	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	46770539	46770639	46770589	Y	NA	TRMU	NA	NA	NA	NA	TRMU	45767	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	46934347	46934575	46934459	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3280	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	46934777	46935027	46934877	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3710	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	46970983	46971382	46971054	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	1074	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	47430319	47430671	47430495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	273801	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	RP11-191L9.4	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-191L9.4	10218	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	283617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	9.94184273123074
chr22	49769098	49769971	49769308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	279219	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	50330725	50331030	50330945	Y	MAPK12,MAPK11	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	20619	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr22	50336699	50336868	50336781	Y	SELO	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	15293	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	50341970	50342055	50341995	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	10106	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	50346860	50347243	50347174	Y	BRD1,PANX2,HDAC10,PIM3	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	4918	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	50364171	50364294	50364188	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12010	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr22	50608010	50608409	50608105	Y	MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	850	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr22	50609711	50610057	50610042	Y	NA	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	2551	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr22	50891150	50891343	50891221	Y	MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2	NA	NA	NA	NA	SBF1	20111	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr22	50908246	50908896	50908576	Y	IL17REL,TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	2558	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	350243	350428	350336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHL1	113964	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	991989	992283	992135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN6	139977	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	LRRN1	NA	NA	NA	NA	LRRN1	15372	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	4870336	4870525	4870428	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	56452	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	6573697	6574039	6573711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1346366	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	8524896	8525313	8525187	Y	LMCD1	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	16080	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	8540908	8541201	8541046	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	192	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	9721492	9721576	9721535	Y	IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	MTMR14,BRPF1	NA	NA	NA	NA	MTMR14	32375	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	10202652	10202802	10202719	Y	TATDN2,VHL,IRAK2	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	1747	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	72185	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr3	13083903	13084071	13084052	Y	NA	IQSEC1	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	28546	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.90607710605206
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	14845285	14845503	14845389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf20	130679	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	15678965	15679290	15679049	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	37627	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	15835826	15836097	15835987	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	63181	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	536153	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	17505233	17505390	17505312	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	663074	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	701153	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	18399008	18399057	18399033	Y	SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	85252	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	KCNH8	NA	NA	NA	NA	KCNH8	423	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	19470380	19470682	19470561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH8	282434	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	23898490	23898770	23898565	Y	NA	NA	NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	53096	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	24563741	24564038	24564033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	577659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	27957485	27957491	27957488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	195279	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	28078428	28078736	28078583	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	202339	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	31116350	31116361	31116356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	455769	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	31149741	31150063	31149903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	422067	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	12268	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	34466240	34466377	34466243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	628396	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	34546800	34546816	34546806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	708956	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr3	38675761	38675887	38675842	Y	NA	SCN5A	NA	NA	NA	NA	SCN5A	13277	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr3	40341288	40341806	40341708	Y	EIF1B	EIF1B	NA	NA	NA	NA	EIF1B	7369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	42108875	42109165	42109003	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	55581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	42531634	42531985	42531932	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	NA	NA	NA	NA	VIPR1	2843	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	42922564	42922793	42922612	Y	C3orf39	ZNF662	NA	NA	NA	NA	ZNF662	22430	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr3	45315271	45315676	45315515	Y	SACM1L	AC010170.1,TMEM158	LARS2,CLEC3B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM158	49501	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	46048204	46048509	46048314	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	FYCO1	NA	NA	NA	NA	FYCO1	12888	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	46440905	46441384	46441314	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	CCR1,CCR2,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC2	178205	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	46989533	46989702	46989634	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	29471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	47203467	47203704	47203598	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	10	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	47845454	47845505	47845480	Y	DHX30	SMARCC1,DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	3055	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	3192	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	50302065	50302532	50302296	Y	SEMA3B	GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1	NA	NA	NA	NA	SEMA3B-AS1	271	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	50354393	50354598	50354449	Y	MST1R	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	HYAL2	3739	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	52926819	52927340	52927162	Y	PBRM1,SFMBT1,SFMBT1,PRKCD,DCP1A,TMEM110	TMEM110-MUSTN1,TMEM110	NA	NA	NA	NA	TMEM110-MUSTN1	2238	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	53876999	53877298	53877116	Y	CHDH	CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK	NA	NA	NA	NA	CHDH	1119	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	54389983	54390168	54390067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	235409	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	54477784	54478003	54477891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	180239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr3	54734224	54734587	54734407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	75982	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	54856337	54856720	54856396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	198095	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	55194450	55194988	55194909	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-875H7.5	342301	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	55516458	55517187	55517061	Y	NA	RP11-875H7.5	NA	NA	NA	NA	RP11-875H7.5	20102	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	RP11-875H7.5	NA	NA	NA	NA	RP11-875H7.5	19636	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	55518078	55518594	55518516	Y	WNT5A	RP11-875H7.5	NA	NA	NA	NA	RP11-875H7.5	18695	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	56443112	56443203	56443174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC2	57188	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr3	57096152	57096374	57096203	Y	ASB14	SPATA12,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	SPATA12	3683	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	57874517	57874643	57874579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	117484	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	58321418	58321818	58321477	Y	NA	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	4811	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	58412465	58412623	58412544	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	4961	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	59316034	59316229	59316222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	282224	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	59803830	59804011	59803964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	770020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	60018233	60018421	60018327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	984423	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	60360991	60361355	60361182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	873778	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	60392594	60392829	60392710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	842304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	60804439	60804744	60804592	Y	FHIT	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	430389	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	62926615	62926793	62926705	Y	CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	67561	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	63484465	63484750	63484608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC7	362829	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	64251870	64252260	64252194	Y	NA	NA	PRICKLE2,LOC100652759	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	244212	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	66467141	66467203	66467172	Y	LRIG1	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	82484	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	66549724	66550124	66549864	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	37	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	69228052	69228449	69228187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	95957	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	69255559	69255753	69255624	Y	TMF1	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	123464	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	69789363	69789667	69789441	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	2777	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	4090	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	71136796	71137147	71137136	Y	FOXP1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	493993	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	71151319	71151713	71151657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	479427	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	72213087	72213177	72213133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYBP	280892	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	72545339	72545749	72545633	Y	NA	NA	LOC201617	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	51270	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	72742209	72742242	72742224	Y	NA	NA	LOC201617,PROK2,RYBP	IMR90	Hi-C	24141950	SHQ1	166823	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	72862614	72863000	72862807	Y	SHQ1	SHQ1	NA	NA	NA	NA	SHQ1	46065	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	76778043	76778075	76778059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	296874	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	77090634	77090636	77090635	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	609465	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr3	79674571	79674688	79674630	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	140277	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD2P1	936015	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	98044011	98044208	98044126	Y	NA	NA	GABRR3	IMR90	Hi-C	24141950	CLDND1	195702	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	99254161	99254407	99254283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	100912	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	99356024	99356457	99356227	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	705	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	99570772	99571127	99571120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	215453	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223910	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	99582587	99582828	99582708	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	227268	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	99749892	99750279	99749982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	81078	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	99782957	99783256	99783070	Y	NA	FILIP1L	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	48101	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	101547647	101547882	101547766	Y	ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	2812	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	101555569	101555949	101555674	Y	ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	10734	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	101901132	101901377	101901290	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFKBIZ	356297	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	107503481	107503523	107503501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	263698	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	112404368	112404581	112404378	Y	CCDC80	NA	NA	NA	NA	NA	ATG3	125475	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	112531892	112532184	112532038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	175581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	112537180	112537558	112537325	Y	ATG3,SLC35A5	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	170207	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	112543206	112543267	112543237	Y	C3orf17	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	164498	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPICE1	152852	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	113701770	113701838	113701802	Y	KIAA1407,DRD3,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	20842	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	114165361	114165710	114165642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	391901	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	114261968	114262342	114261973	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	488508	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	114813239	114813371	114813303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	50747	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	115790074	115790198	115790193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	925956	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	119088312	119088468	119088390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	97209	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	119866352	119866515	119866428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	54610	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	121713958	121714176	121714068	Y	HCLS1,EAF2,CD86	ILDR1	NA	NA	NA	NA	ILDR1	24875	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	121749287	121749529	121749356	Y	HCLS1,EAF2,CD86,CD86	ILDR1	NA	NA	NA	NA	ILDR1	10236	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	121791947	121792054	121791993	Y	HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	ILDR1	52896	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	122151096	122151154	122151125	Y	KPNA1	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18214	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	122476470	122476801	122476636	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	33870	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	123321303	123321432	123321369	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	18914	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	123372011	123372488	123372368	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	69622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	123476863	123477567	123477241	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK	123611	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr3	123756806	123757178	123756992	Y	NA	NA	KALRN,CCDC14	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC14	78242	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	123762181	123762190	123762188	Y	NA	NA	KALRN,ROPN1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC14	83617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr3	125200225	125200611	125200423	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	36430	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	125231315	125231583	125231558	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	5458	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	CCDC37	NA	NA	NA	NA	CCDC37	14898	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	127469268	127470071	127469577	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	69980	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	128135736	128135843	128135790	Y	GATA2,GATA2,GATA2,C3orf27,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	70212	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	128304030	128304455	128304163	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	NA	GATA2,SEC61A1,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8-AS1,DNAJB8,LOC90246,C3orf27	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPN1	93463	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	128538992	128539042	128539017	Y	DNAJB8,C3orf27	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	57131	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	129690304	129690667	129690526	Y	H1FOO	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	79885	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr3	130637982	130638444	130638066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	70543	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	132138974	132139193	132139084	Y	NA	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	4604	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	133393318	133393395	133393358	Y	NA	TOPBP1,TFP1	TMEM108	IMR90	Hi-C	24141950	TFP1	14476	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	134069780	134070244	134070081	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	3159	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	134100770	134101008	134100801	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	AMOTL2,MIR4788,ANAPC13,CEP63	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL2	8449	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	135828343	135828732	135828538	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	85351	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	136427457	136427837	136427826	Y	STAG1	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	41383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr3	138839594	138839666	138839621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS22	116946	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	139253953	139254145	139254018	Y	NA	RBP1	NA	NA	NA	NA	RBP1	2526	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	139898460	139898757	139898544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	246433	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	139922309	139922336	139922321	Y	CLSTN2	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	270282	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	141240287	141240651	141240396	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	36398	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	141659994	141660128	141660061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	67028	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	141845785	141846169	141845896	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	20217	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	141887290	141887616	141887590	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	20904	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	142585828	142586021	142585923	Y	NA	RP11-372E1.1,PCOLCE2	NA	NA	NA	NA	PCOLCE2	20024	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	143108310	143108441	143108388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST2	272137	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	143705621	143705974	143705695	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	16981	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	144134299	144134312	144134306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	445659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	145416082	145416315	145416265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P39	124211	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr3	149057749	149057981	149057865	Y	NA	TM4SF18,TM4SF1	NA	NA	NA	NA	TM4SF18	7548	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	149933925	149934322	149934006	Y	NA	NA	PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFN2	167350	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	151738872	151739003	151738949	Y	NA	NA	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	220614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	151739734	151740181	151739895	Y	NA	NA	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	219436	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	151993494	151994006	151993570	Y	NA	MBNL1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	33877	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	152574912	152575303	152575043	Y	P2RY1,RAP2B	P2RY1	NA	NA	NA	NA	P2RY1	24176	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	153002176	153002347	153002282	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	124147	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	155463707	155463869	155463800	Y	NA	PLCH1	NA	NA	NA	NA	PLCH1	2851	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	155465227	155465373	155465280	Y	NA	PLCH1	NA	NA	NA	NA	PLCH1	4371	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	156210737	156211059	156210900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	59914	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr3	156849691	156850000	156849844	Y	NA	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	26549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	158048767	158049059	158048913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRC1	227123	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	159493461	159493761	159493605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	447662	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	161133836	161133975	161133914	Y	NA	SPTSSB	NMD3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	45168	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	163917320	163917388	163917354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK3	995509	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	165215447	165215733	165215492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-85M11.2	292699	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	168136003	168136042	168136023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFEM1P	170693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	169172792	169172932	169172865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	206474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	169502698	169502873	169502785	Y	GPR160,MYNN,LRRC34	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	14079	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	170138195	170138413	170138223	Y	NA	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	3542	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	170957638	170957941	170957717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	218256	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.74149422566389
chr3	171522372	171522650	171522540	Y	TNIK,PLD1	PP13439,PLD1	NA	NA	NA	NA	PP13439	3064	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	199108	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	172234609	172234750	172234680	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	4547	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	174868634	174868952	174868706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	565506	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	174991972	174992412	174992335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	442046	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	177332842	177333173	177332964	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	419581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	181035769	181036114	181035791	Y	SOX2,DNAJC19,DNAJC19	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	330207	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	181418145	181418802	181418404	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	8912	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	14555	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.50625135883549
chr3	181900608	181900690	181900647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	472894	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	182973593	182973879	182973736	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4561	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	185821581	185821963	185821920	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	4144	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	185842493	185842801	185842568	Y	NA	ETV5	ETV5	K562	ChIA-PET	22265404	ETV5	16386	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	185948324	185948597	185948503	Y	DGKG	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	122217	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	186733684	186733815	186733810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	87410	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	186819692	186820086	186819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	76610	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	187457681	187458370	187457991	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	3145	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	188012691	188013249	188012784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142846	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	188155903	188156126	188156022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	286058	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	188324508	188324886	188324659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	454663	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	188953015	188953026	188953020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	394179	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	189022377	189022942	189022424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	324263	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	189192792	189192813	189192806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	154392	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	192608372	192608637	192608617	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	25313	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	193546369	193546601	193546485	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OPA1	237436	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	193548514	193548983	193548724	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OPA1	239581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	193590130	193590422	193590276	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HES1	261512	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	193597420	193597611	193597456	Y	NA	NA	HES1,OPA1,LOC647323	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HES1	254323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr3	193857372	193857551	193857481	Y	HES1	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	5438	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.12968851912662
chr3	194029385	194029774	194029648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	177451	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	194435877	194435987	194435931	Y	LSG1	LSG1,FAM43A	NA	NA	NA	NA	FAM43A	31255	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	90614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	194981425	194981579	194981527	Y	ACAP2	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	8317	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	195034615	195034891	195034753	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	44719	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	MUC20	NA	NA	NA	NA	MUC20	14513	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	195854063	195854320	195854202	Y	TFRC,TFRC	TFRC	LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFRC	47003	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	195921077	195921299	195921227	Y	UBXN7,RNF168,LRRC33,TM4SF19,PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	91529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	195946209	195946432	195946330	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	66396	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr3	195946520	195946837	195946671	Y	LRRC33,PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	65991	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	196047617	196047878	196047747	Y	NA	PCYT1A,TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D2	4447	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	196208308	196208582	196208445	Y	NA	RNF168	NA	NA	NA	NA	RNF168	20057	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	47637	47939	47761	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	3240	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	49782	50031	49981	Y	NA	ZNF595	NA	NA	NA	NA	ZNF595	1148	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	50610	50903	50681	Y	NA	ZNF595	NA	NA	NA	NA	ZNF595	276	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	867282	867339	867287	Y	NA	CPLX1	NA	NA	NA	NA	CPLX1	49296	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	991255	991645	991565	Y	ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175	DGKQ,IDUA,SLC26A1,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	SLC26A1	6027	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	1027686	1027967	1027729	Y	FGFRL1,FGFRL1,FGFRL1	DGKQ,IDUA,SLC26A1,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	25962	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	1035263	1035607	1035280	Y	FGFRL1,FGFRL1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	33539	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	1036795	1036974	1036954	Y	CRIPAK,SLC26A1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35071	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	1535396	1535629	1535516	Y	NA	NA	KIAA1530	IMR90	Hi-C	24141950	SLBP	176653	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	1710531	1710811	1710671	Y	NA	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	1471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	1769544	1769746	1769644	Y	FGFR3	TMEM129,TACC3,FGFR3	FGFR3	MCF7	ChIA-PET	22265404	FGFR3	23288	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	2174695	2175024	2174860	Y	NA	NA	NAT8L,C4orf48	IMR90	Hi-C	24141950	POLN	66824	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr4	3357519	3357800	3357660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	64764	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	3483238	3483365	3483266	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	48921	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	3485407	3485559	3485410	Y	DOK7	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	46727	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	3488499	3488826	3488767	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	43460	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	3492056	3492792	3492287	Y	DOK7	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	39494	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr4	3829290	3829379	3829335	Y	LYAR,LYAR,ADRA2C	NA	LOC100133461	IMR90	Hi-C	24141950	ADRA2C	63215	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	3836768	3837443	3837153	Y	NA	NA	LOC100133461	IMR90	Hi-C	24141950	ADRA2C	70693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	12.0831627041112
chr4	6171690	6172033	6171999	Y	PPP2R2C,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	JAKMIP1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	28285	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	6223621	6224023	6223692	Y	PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	JAKMIP1,WFS1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	23303	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	6278017	6278414	6278100	Y	PPP2R2C,CRMP1,JAKMIP1	WFS1	NA	NA	NA	NA	WFS1	8441	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	6513482	6513861	6513684	Y	JAKMIP1,PPP2R2C,PPP2R2C	PPP2R2C	NA	NA	NA	NA	PPP2R2C	49466	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	7807485	7807548	7807490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	132105	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	10830954	10831154	10831060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF518B	373920	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	11603431	11603452	11603441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	174042	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	15297006	15297030	15297019	Y	NA	NA	C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	172459	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	15485746	15486124	15486037	Y	CC2D2A	CC2D2A	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	16257	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	15488697	15488958	15488934	Y	NA	CC2D2A	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	19208	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	15536628	15536631	15536630	Y	NA	NA	FBXL5	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	67139	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	15553738	15553982	15553851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	84249	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	16629750	16630155	16629855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDB2	268277	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	21066453	21066508	21066495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	370548	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	21930853	21931229	21931116	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	KCNIP4	NA	NA	NA	NA	KCNIP4	17193	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	22270180	22270523	22270471	Y	NA	NA	LOC100505912	IMR90	Hi-C	24141950	GPR125	245154	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.81215421210413
chr4	22636795	22637032	22636911	Y	GBA3	RP11-10G12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10G12.1	42976	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	23890635	23890864	23890849	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	12848	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	23947088	23947695	23947571	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	43376	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	24346800	24347040	24346920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	237133	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	24913671	24913932	24913802	Y	CCDC149	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC149	65894	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	25828026	25828318	25828201	Y	NA	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	35064	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	27362567	27362929	27362697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	502346	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	28460749	28460765	28460756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1600528	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	28607417	28607640	28607532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1747196	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	28621646	28621809	28621725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1761425	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	28761802	28762128	28761877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1901581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	32142342	32142554	32142470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-734I18.1	145323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	36191564	36191723	36191675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	52408	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	37074925	37075290	37075112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf19	378273	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	38001084	38001300	38001133	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	41028	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr4	38283120	38283331	38283203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	323064	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	38607589	38607693	38607690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF3	56124	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	12.0831627041112
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	38673994	38674276	38674074	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	9490	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	38674773	38675062	38674906	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	10269	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	38871281	38871430	38871296	Y	NA	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3983	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	40056293	40056591	40056356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	40291292	40291570	40291382	Y	RHOH	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	234846	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	40313713	40314128	40314012	Y	PDS5A,N4BP2,RHOH,RBM47	NA	N4BP2,RHOH,RBM47,LOC344967,NSUN7,CHRNA9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	N4BP2	257267	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	40628320	40628499	40628391	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	2393	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	40791893	40792102	40791997	Y	NSUN7	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	41979	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	41999139	41999467	41999284	Y	NA	SLC30A9	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	8650	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	47121817	47122010	47121920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7B2	212565	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	48175521	48175903	48175579	Y	CNGA1	NA	NA	NA	NA	NA	TEC	93978	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	53879042	53879203	53879109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	152585	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	54951124	54951140	54951133	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2,FIP1L1,PDGFRA	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	22267	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	57740482	57740676	57740556	Y	PPAT,REST	REST	THEGL,SPINK2	IMR90	Hi-C	24141950	REST	31399	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr4	57905676	57905866	57905771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOA1	62687	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	58120421	58120667	58120607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	145870	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	62068799	62069364	62069049	Y	LPHN3	LPHN3	NA	NA	NA	NA	LPHN3	3823	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	65473910	65474488	65474148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	179283	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	66107153	66107671	66107555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA5	426542	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr4	66734101	66734181	66734134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA5	199888	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	66899965	66900079	66900021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA5	365752	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA5	426377	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr4	69598714	69599110	69598795	Y	UGT2B10,UGT2B7,UGT2A3	NA	NA	NA	NA	NA	TMPRSS11E	287547	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	74464812	74465326	74464976	Y	RASSF6,RASSF6	RASSF6	NA	NA	NA	NA	RASSF6	19022	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.90607710605206
chr4	74680452	74680792	74680616	Y	NA	NA	MTHFD2L,CXCL1	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL1	52318	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	74982637	74982975	74982882	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	4746	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	77545422	77545888	77545544	Y	SCARB2	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	322968	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr4	78842671	78842943	78842808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	60997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr4	78979777	78980204	78980085	Y	NA	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	3053	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	79083838	79083918	79083865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAS1	107114	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr4	79521197	79521480	79521236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	50524	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	79859042	79859275	79859190	Y	PAQR3	PAQR3	NA	NA	NA	NA	PAQR3	450	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	81392904	81393098	81393001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf22	138030	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	82331857	82332076	82331958	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	197639	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	83205945	83206187	83206036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPD	87469	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	84469544	84469879	84469660	Y	PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	14477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	88008599	88008816	88008710	Y	HSD17B11	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	139323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	88443267	88443740	88443428	Y	DSPP,SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	101533	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	89302401	89302730	89302543	Y	HERC6,HERC5	HERC6	NA	NA	NA	NA	HERC6	4510	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	89303859	89304128	89303998	Y	NA	HERC6	NA	NA	NA	NA	HERC6	5968	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	91049597	91049943	91049669	Y	FAM190A	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	292131	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.05902853268638
chr4	99344407	99344641	99344524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	163872	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	99580316	99580421	99580372	Y	NA	TSPAN5	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	2536	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	101659601	101659826	101659610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDIT4L	549662	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	102237823	102238346	102238192	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	28591	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	103483964	103484649	103484311	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	63478	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	104302340	104302484	104302413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	184774	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr4	106064596	106064807	106064750	Y	NA	TET2	TET2	K562	ChIA-PET	22265404	TET2	225	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	106305912	106306089	106306001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPA2	87149	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	106391866	106392288	106392204	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	950	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	106635528	106635690	106635582	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	7593	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	107780277	107780572	107780473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCK	539625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	108783895	108784172	108784033	Y	SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	40176	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	109047956	109048357	109048341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HADH	139086	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	112913088	112913237	112913174	Y	TIFA,AP1AR	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	151316	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	113956940	113957168	113957054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	219675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	114711770	114711906	114711870	Y	NA	CAMK2D,RP11-397D21.1	ANK2,CAMK2D	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2D	30687	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	117474098	117474276	117474187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM1L1	530460	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	121265421	121265690	121265531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD2L1	279192	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	121274788	121275179	121275049	Y	NA	NA	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	288559	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	124225969	124226069	124226019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	89881	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	127856646	127856765	127856706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	685661	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	129275726	129275798	129275762	Y	NA	NA	PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	63820	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	131206560	131206886	131206723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-314N14.1	1092282	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	133266182	133266225	133266204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH10	802245	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	139177153	139177364	139177274	Y	SLC7A11	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	15650	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	139326439	139326794	139326543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	164936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr4	139814320	139814623	139814472	Y	NA	NA	SLC7A11,LOC641365	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	120320	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	139831999	139832463	139832295	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	102480	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.14131997288047
chr4	139833159	139833355	139833260	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	101588	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	140656102	140656508	140656327	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	71180	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr4	141071159	141071540	141071326	Y	NA	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	1798	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	141712099	141712307	141712229	Y	TBC1D9,ZNF330	TBC1D9	TBC1D9,UCP1	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D9	36825	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	144277775	144277945	144277866	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	21860	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	146408898	146409228	146409003	Y	OTUD4	SMAD1	NA	NA	NA	NA	SMAD1	8552	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	146726845	146727018	146726937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	130769	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	146729401	146729770	146729628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	128017	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	146764373	146764705	146764540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	93082	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	149467274	149467593	149467420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	816060	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	151316952	151317347	151317150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	319526	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	151769111	151769151	151769130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	165728	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	151956610	151956785	151956696	Y	NA	LRBA	LRBA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRBA	21731	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	152406480	152406763	152406721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	78112	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	153877923	153878050	153877976	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	22419	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr4	154127038	154127322	154127172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	55544	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	154154502	154154721	154154529	Y	TRIM2,TRIM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	83008	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	154253952	154254140	154254046	Y	NA	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	9661	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	154429389	154429734	154429551	Y	NA	KIAA0922	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	43891	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	161240057	161240222	161240140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	1551767	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	164471489	164471679	164471583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	385416	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	164755416	164755437	164755427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	669343	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	169868186	169868202	169868194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	61224	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	169991170	169991417	169991322	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	61744	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	174106562	174106852	174106704	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	17759	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	178469887	178470022	178469954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-130F10.1	105754	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	180219335	180219346	180219341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-404J23.1	165113	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	STOX2	53095	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	184916743	184916943	184916831	Y	C4orf41,IRF2	RP11-739P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-739P1.2	9912	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	185186820	185187542	185187472	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	206192	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	185189434	185189785	185189717	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	203949	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	185209648	185210113	185209861	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CCDC111,LOC728175,CASP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	183621	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	185338413	185338600	185338537	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	55134	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	87445	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr4	186455582	186456046	186455940	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	816	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	186481104	186481365	186481225	Y	NA	PDLIM3	PDLIM3,SORBS2	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM3	26338	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	187027199	187027350	187027289	Y	SORBS2,FAM149A	TLR3	NA	NA	NA	NA	TLR3	38893	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	187591076	187591113	187591095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	54763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	188590659	188590926	188590793	Y	NA	RP11-565A3.2	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-565A3.2	869	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr4	190285262	190285611	190285472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	574332	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	151095	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	8.71823131815619
chr5	190691	190901	190821	Y	SDHA,LRRC14B	CCDC127,SDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC127	25429	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr5	392668	393182	392808	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	48076	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr5	523225	523441	523256	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	778	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	523686	523917	523764	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	1239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	601191	601577	601476	Y	PLEKHG4B,SLC9A3,CEP72	CEP72	SLC9A3,CEP72	IMR90	Hi-C	24141950	CEP72	8810	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.51788281258934
chr5	671573	671920	671762	Y	TPPP	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	19590	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.90607710605206
chr5	757060	757343	757251	Y	TPPP	NA	ZDHHC11,SLC9A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPPP	65550	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	758121	758535	758359	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,BRD9,CEP72,TRIP13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPPP	66611	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr5	777448	777883	777776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	85938	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr5	1007986	1008378	1008075	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	1042	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	1041596	1043550	1041859	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	34652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	1111223	1111556	1111501	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	1073	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	1130725	1130985	1130924	Y	NA	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	20575	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.20034850556685
chr5	1152155	1152545	1152489	Y	NA	SLC12A7	SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A7	42005	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	1155287	1155504	1155358	Y	NA	SLC12A7	SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A7	45137	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	1313264	1313453	1313378	Y	NA	TERT,CLPTM1L	NA	NA	NA	NA	TERT	20080	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	1315765	1316275	1315843	Y	TERT	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	22581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	1316464	1316882	1316563	Y	TERT,SLC6A3	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	23280	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr5	1746722	1746833	1746762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL36	52647	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	2594554	2594649	2594602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf38	155596	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	3595085	3595457	3595281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX2	844116	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	4412030	4412043	4412037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	1006734	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	6373242	6373393	6373318	Y	NA	MED10	NA	NA	NA	NA	MED10	3314	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	11.7772598508426
chr5	6774983	6775332	6775254	Y	SRD5A1	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	143527	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	9681641	9681655	9681648	Y	NA	NA	TAS2R1	IMR90	Hi-C	24141950	SNHG18	137329	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	10229611	10229778	10229690	Y	NA	FAM173B,CCT5	NA	NA	NA	NA	FAM173B	18231	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	10800983	10801250	10801024	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	41599	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	11648258	11648305	11648298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	253850	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	12670425	12670804	12670615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	768270	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	14250238	14250405	14250312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	108427	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	14251046	14251256	14251151	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	109235	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	14489488	14489835	14489662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	90049	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	14545472	14545570	14545529	Y	NA	FAM105A	FAM105A,TRIO	IMR90	Hi-C	24141950	FAM105A	34314	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	14582921	14583040	14582953	Y	FAM105A	FAM105A	NA	NA	NA	NA	FAM105A	3037	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	14666216	14666664	14666270	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	3443	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	15008718	15008950	15008809	Y	ANKH	NA	FAM105B,ANKH,LOC100130744	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	138831	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	16309962	16310362	16310162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH11	131091	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	16492574	16492683	16492630	Y	FAM134B	ZNF622	NA	NA	NA	NA	ZNF622	28673	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr5	16539355	16539674	16539525	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF622	75454	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	16698370	16698703	16698671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	83203	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr5	16723637	16724009	16723823	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	108470	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr5	16733521	16733894	16733888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	118354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	16736297	16736738	16736539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	121130	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr5	16740893	16741285	16741194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	125726	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	18697987	18698184	18698066	Y	NA	CTD-2023M8.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	46098	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	19735118	19735431	19735276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-774D14.1	874518	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	24549413	24549679	24549546	Y	CDH10	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	93408	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	30694167	30694547	30694365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	357125	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	31511930	31511946	31511938	Y	NA	DROSHA,C5orf22	NA	NA	NA	NA	DROSHA	18357	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	32772062	32772072	32772067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	242323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	32982024	32982196	32982110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-36C20.1	178089	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr5	34037436	34037722	34037670	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	31216	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	34048471	34048803	34048799	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	42251	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	34571432	34571721	34571601	Y	NA	NA	RAI14,TTC23L	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	82621	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	7.03576562517868
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	35430770	35431227	35431122	Y	NA	NA	SPEF2,CAPSL,UGT3A1	IMR90	Hi-C	24141950	SPEF2	184719	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	36119586	36119746	36119728	Y	SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	30317	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	36277104	36277309	36277165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	127013	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	36277859	36278299	36278119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	127768	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	37838047	37838605	37838394	Y	GDNF,GDNF,GDNF	GDNF	NA	NA	NA	NA	GDNF	259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	38551608	38551876	38551742	Y	NA	MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	3787	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	39014770	39014929	39014863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	57581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	39025065	39025383	39025224	Y	NA	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	47127	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	39069838	39069965	39069908	Y	NA	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	2545	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	39486280	39486288	39486284	Y	NA	DAB2	DAB2,C9	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	25878	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	41856929	41857024	41856977	Y	NA	OXCT1,C5orf51	NA	NA	NA	NA	OXCT1	11597	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	42465969	42466319	42466144	Y	GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR	GHR	NA	NA	NA	NA	GHR	44090	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	19060	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	43099724	43100011	43099805	Y	NA	ZNF131	ZNF131,LOC648987	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF131	36446	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	43498058	43498404	43498231	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	C5orf28	MCF7	ChIA-PET	22265404	C5orf34	14843	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	44805965	44806268	44806131	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	611	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	44821100	44821499	44821234	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	MRPS30	14073	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	52094372	52094720	52094546	Y	NA	ITGA1,PELO	NA	NA	NA	NA	PELO	12598	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	53298305	53298413	53298402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	184789	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	53969444	53970118	53969706	Y	SNX18,SNX18,CDC20B	NA	CDC20B,HSPB3,SNX18,GPX8	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	157855	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	54897039	54897427	54897238	Y	IL6ST,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	68161	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	58232883	58233370	58233101	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	478796	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr5	58243768	58244167	58243981	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	489681	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	58391200	58391585	58391393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	637113	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	58900988	58901299	58901144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	880241	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	59171284	59171310	59171298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	610230	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	60751661	60751965	60751750	Y	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	65963	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	78260	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	60119	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	66510755	66511249	66511045	Y	NA	NA	MAST4,PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAST4-AS1	212974	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	67066519	67066839	67066639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	442709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	67367322	67367390	67367356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	142158	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	CTC-498J12.1,SLC30A5	NA	NA	NA	NA	CTC-498J12.1	815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	71045616	71045849	71045733	Y	NA	NA	MCCC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MCCC2	164501	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	71424352	71424432	71424374	Y	NA	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	23291	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	71790679	71790815	71790747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	176206	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	71804159	71804292	71804254	Y	ZNF366	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	189686	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	98192	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	72764124	72764182	72764153	Y	NA	FOXD1,BTF3	FCHO2,TMEM174,FOXD1,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	21772	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	72792808	72793048	72792966	Y	NA	BTF3	NA	NA	NA	NA	BTF3	575	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	73611863	73612159	73611974	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321689	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	73981736	73982008	73981951	Y	HEXB	HEXB,ENC1	NA	NA	NA	NA	ENC1	46487	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	74883919	74884208	74884013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	77956	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	76590045	76590451	76590191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8B	85771	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	77807354	77807759	77807583	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	153015	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	77822722	77823939	77823093	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	168383	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	78439900	78440059	78439990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGDH	89802	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	78520885	78521246	78521066	Y	NA	DMGDH,JMY	NA	NA	NA	NA	DMGDH	8615	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	78843402	78843606	78843502	Y	CMYA5,HOMER1	RP11-342F17.1,HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35362	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.44722282614911
chr5	79376408	79376431	79376418	Y	THBS4	NA	NA	NA	NA	NA	MTX3	91326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	79421543	79422183	79421865	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	127715	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	79458255	79458620	79458438	Y	MSH3,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	91278	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	79480253	79480678	79480326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	69220	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	79768084	79768333	79768119	Y	NA	FAM151B,CTD-2015H6.3,RPL7P24	NA	NA	NA	NA	FAM151B	13455	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	80372631	80372748	80372736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	222631	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	80564528	80564843	80564784	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	30536	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102021	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	82005927	82005935	82005931	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	365382	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	398492	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	85654132	85654483	85654435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	257238	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	86604017	86604207	86604034	Y	RASA1,RASA1	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	42312	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	86629389	86629577	86629451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	67684	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	86653612	86653965	86653789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	52871	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	89451450	89451878	89451685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN3	251725	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	90458384	90458975	90458686	Y	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	NA	LUCAT1	149244	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F1	323059	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	92958001	92958327	92958133	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	40958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	93323557	93323685	93323621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	121719	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	95406696	95406840	95406768	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	110921	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	95562741	95563074	95562934	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	266966	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	68149	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr5	102304978	102305194	102305031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIP5K2	148659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	106724874	106725113	106725059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	279483	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	109125780	109125881	109125831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	102713	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	109257413	109257833	109257636	Y	MAN2A1	NA	TMEM232	IMR90	Hi-C	24141950	MAN2A1	234346	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr5	112242412	112242755	112242610	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	13481	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	115676265	115676288	115676277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	219970	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	115908516	115909016	115908646	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	120004624	120004640	120004633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	1218486	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	122885327	122885717	122885442	Y	CEP120,CSNK1G3	CSNK1G3	NA	NA	NA	NA	CSNK1G3	39534	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	123211449	123211701	123211673	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G3	365656	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	123739028	123739231	123739141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	343269	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	11.3184055709396
chr5	123774307	123774708	123774529	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	307792	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	123966351	123966687	123966497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	115813	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	123987356	123987539	123987440	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	94961	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	124029260	124029627	124029444	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	52873	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	124077955	124078154	124078062	Y	ZNF608	ZNF608	NA	NA	NA	NA	ZNF608	4346	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	124085012	124085124	124085092	Y	NA	ZNF608	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF608	2512	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	124473209	124473536	124473320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	330283	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.50625135883549
chr5	124593106	124593253	124593226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	450180	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.35329993220117
chr5	124748569	124748778	124748675	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-436H11.1	605643	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	129327000	129327166	129327083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY3	88835	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	129563384	129563648	129563470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY3	325219	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr5	130592761	130592914	130592850	Y	NA	CDC42SE2	CDC42SE2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42SE2	13575	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	131561409	131561561	131561506	Y	PDLIM4,P4HA2,P4HA2	NA	NA	NA	NA	NA	P4HA2	67447	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	131763542	131763915	131763870	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	19214	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	131795302	131795488	131795309	Y	NA	AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.6	11247	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	131810095	131810374	131810235	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.6	3360	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr5	133463152	133463566	133463254	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	14750	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	133463735	133464046	133463858	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	15333	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MIR4461	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr5	134729023	134729250	134729122	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	4354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	134911665	134912029	134911924	Y	CXCL14	CTC-321K16.1,CXCL14	NA	NA	NA	NA	CXCL14	940	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	135309178	135309390	135309247	Y	LECT2	NA	LECT2,SMAD5,SMAD5-AS1,TGFBI,VTRNA2-1	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	53194	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	135955852	135956149	135955964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	235168	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	136359479	136359669	136359574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	168162	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	136361740	136362159	136361939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	170423	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	136374592	136374995	136374792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	183275	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	137833063	137833252	137833158	Y	FAM53C,EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	33884	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	138058227	138058591	138058405	Y	NA	NA	CTNNA1,SIL1,MATR3,LRRTM2	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNA1	113571	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.36493138595502
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	303483	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	139017934	139018665	139018227	Y	MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	6219	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139046727	139046903	139046804	Y	NA	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	21843	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139049454	139050310	139049802	Y	MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	24570	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139088295	139089196	139088669	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	63411	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139090416	139090834	139090571	Y	MATR3,MATR3,CXXC5	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	65532	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139113196	139113643	139113518	Y	C5orf53,PSD2	NA	DNAJC18,UBE2D2,CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	88312	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139132414	139132610	139132513	Y	NA	NA	UBE2D2,CXXC5,DNAJC18,NRG2,CYSTM1	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	107530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139135408	139135879	139135750	Y	NA	NA	UBE2D2,CXXC5,DNAJC18,NRG2,CYSTM1	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	110524	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139633683	139634086	139633757	Y	SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	46620	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139641396	139641769	139641570	Y	SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	38937	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2	NA	NA	NA	NA	ZMAT2	14336	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2	NA	NA	NA	NA	ZMAT2	22016	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	140457576	140457668	140457630	Y	NA	PCDHB2,PCDHB3,PCDHB4	NA	NA	NA	NA	PCDHB2	14559	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	141589976	141590075	141590026	Y	NA	NA	FGF1,GNPDA1,SPRY4,NDFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	103906	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	141818179	141818493	141818304	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	114159	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	141948217	141948584	141948420	Y	NA	NA	SPRY4	IMR90	Hi-C	24141950	FGF1	127033	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	142147545	142147931	142147625	Y	NA	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	18	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	142362111	142362403	142362189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	214162	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	142378250	142378447	142378318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	230301	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	143578105	143578377	143578180	Y	YIPF5	YIPF5,KCTD16	NA	NA	NA	NA	KCTD16	29709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	145166780	145167167	145167131	Y	GRXCR2	PRELID2	NA	NA	NA	NA	PRELID2	45765	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	146378574	146378711	146378699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	83636	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	146751772	146751865	146751838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	135754	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr5	146831561	146831956	146831686	Y	PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	55663	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	146832241	146832308	146832261	Y	JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	55311	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	146834939	146835189	146835093	Y	DPYSL3,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	52430	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	146890135	146890280	146890247	Y	NA	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	2516	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.60017425278343
chr5	146947412	146947925	146947557	Y	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	59793	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr5	146952297	146952481	146952389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	64678	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	148869266	148869383	148869317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	59624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	150004824	150005027	150004948	Y	SYNPO,MYOZ3	NA	NA	NA	NA	NA	RBM22	73642	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	150477506	150477962	150477585	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	6368	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	151108065	151108456	151108379	Y	NA	SPARC,RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	35483	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	151129219	151129502	151129338	Y	SLC36A1	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	14437	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr5	156814689	156815040	156814693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	123600	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	159637065	159637397	159637293	Y	FABP6	FABP6,RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	FABP6	24691	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	162483984	162483999	162483992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-541P9.3	378333	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	167558741	167558830	167558746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	157826	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	168055373	168055394	168055384	Y	NA	CTC-575D19.1	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	14056	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	168229147	168229460	168229328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	187830	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	168302839	168303219	168303163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-174D11.1	135013	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	169918518	169918694	169918619	Y	LCP2,KCNMB1	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	368180	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	170878093	170878163	170878150	Y	NA	FGF18	NA	NA	NA	NA	FGF18	33433	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	173169995	173170330	173170163	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	884	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	22163	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	173208911	173209406	173209234	Y	CPEB4	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	37697	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	173347710	173348091	173347729	Y	NA	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	34427	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	173391031	173391183	173391109	Y	HMP19	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	77748	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	175014406	175014419	175014414	Y	NA	RN7SKP148	NA	NA	NA	NA	RN7SKP148	38772	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	175026340	175026569	175026454	Y	NA	RN7SKP148	NA	NA	NA	NA	RN7SKP148	26622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	175180862	175181137	175181000	Y	NA	CPLX2	CPLX2,LOC643201	IMR90	Hi-C	24141950	CPLX2	40176	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	175347355	175347516	175347492	Y	NA	NA	CPLX2	IMR90	Hi-C	24141950	CPLX2	126042	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	175960481	175960718	175960661	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2	RNF44	NA	NA	NA	NA	RNF44	2308	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	RGS14	7330	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	176856256	176856655	176856453	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3	GRK6,PRR7,DBN1	NA	NA	NA	NA	PRR7	14791	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr5	178985972	178986151	178986083	Y	NA	RUFY1	NA	NA	NA	NA	RUFY1	10413	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	180541875	180541994	180541989	Y	OR2Y1	NA	BTNL8,MGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-338M12.5	74930	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	180615428	180615595	180615512	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	1329	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	1055850	1056126	1055989	Y	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	254549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	178369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.05902853268638
chr6	1335859	1336005	1335918	Y	NA	FOXQ1	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	25184	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	1388566	1388906	1388736	Y	NA	FOXF2	NA	NA	NA	NA	FOXF2	497	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	1391827	1392023	1391957	Y	FOXF2	FOXF2	NA	NA	NA	NA	FOXF2	3758	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	1609094	1609758	1609395	Y	FOXC1	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	413	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	1966788	1967127	1966958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	276799	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	2038182	2038509	2038345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	205417	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	2081468	2081822	2081645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	162104	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	2227886	2228034	2227944	Y	NA	GMDS,GMDS-AS1	NA	NA	NA	NA	GMDS	15892	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	2980500	2980669	2980575	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2	WRNIP1,MYLK4,MIR4645,MGC39372,SERPINB1,DKFZP686I15217,SERPINB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NQO2	5552	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	3248062	3248427	3248198	Y	SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B	PSMG4,TUBB2B	TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB2B	18098	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	3386855	3386871	3386861	Y	TUBB2A,TUBB2B,SLC22A23	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	68385	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	3389811	3390490	3390264	Y	SERPINB6,SLC22A23,C6orf145	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	64766	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	5966118	5966226	5966172	Y	NA	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	38974	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	5996432	5996750	5996575	Y	NA	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	8450	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	5997075	5997523	5997169	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	7677	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	6000594	6000986	6000896	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	4214	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	6460137	6460147	6460143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F13A1	140891	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	F13A1	367894	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr6	6750084	6750462	6750414	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	355368	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	6811454	6812228	6812086	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	293602	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	6825409	6825642	6825558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	280188	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	6970116	6970321	6970219	Y	NA	NA	LY86	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	135509	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	7130548	7130794	7130662	Y	RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	24718	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	7137966	7138068	7138020	Y	RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	32136	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	7324752	7324983	7324884	Y	RREB1,RREB1	RP11-69L16.5,SSR1	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	12818	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	7392474	7392879	7392481	Y	NA	SSR1,RIOK1,CAGE1	NA	NA	NA	NA	CAGE1	4498	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	7544425	7544740	7544519	Y	NA	DSP,SNRNP48	NA	NA	NA	NA	DSP	4617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	9839255	9839267	9839261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	578625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	10355646	10355875	10355765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	62017	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	10589491	10589864	10589781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCNT2	99035	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	11197003	11197299	11197017	Y	ERVFRD-1,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	183282	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	11229489	11229708	11229675	Y	TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	150873	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	11243333	11243432	11243383	Y	MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	137149	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	13184302	13184661	13184471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	142154	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	13396164	13396432	13396321	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	69349	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	14121845	14123283	14121874	Y	NA	CD83	NA	NA	NA	NA	CD83	5973	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	14889640	14889747	14889684	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	354780	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	15365610	15365867	15365688	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	118745	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	15542142	15542162	15542152	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	119127	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	18407685	18408142	18407784	Y	RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	40906	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	20418274	20418752	20418425	Y	NA	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	17876	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	21603523	21603934	21603831	Y	SOX4	SOX4	NA	NA	NA	NA	SOX4	11551	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	21740205	21740397	21740265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	148233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	21947021	21947287	21947156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	355049	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	22148644	22148866	22148767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	556672	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	22149387	22149566	22149505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	557415	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	22222867	22222924	22222901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	630895	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	22718056	22718333	22718272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-209A6.1	311676	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.50625135883549
chr6	24514097	24514400	24514249	Y	NA	ALDH5A1,GPLD1	NA	NA	NA	NA	GPLD1	20664	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	24584505	24584676	24584669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0319	59707	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	24799813	24800204	24799968	Y	DCDC2,GPLD1,GPLD1,ALDH5A1	GMNN	NA	NA	NA	NA	GMNN	26654	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	25406864	25407254	25406949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	129558	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.9767370924923
chr6	26397110	26397374	26397265	Y	NA	BTN3A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN2A3P,BTN3A3	NA	NA	NA	NA	BTN3A1	3091	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	27655152	27655475	27655306	Y	FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM	NA	LOC100507173,ZNF184	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HIST1H2BL	118234	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	28299231	28299616	28299424	Y	GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	16075	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	5674	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	30840574	30840974	30840689	Y	ABCF1,C6orf136	DDR1,GTF2H4,VARS2	DHX16,VARS2,DPCR1,DDR1,MUC22,CCHCR1,MDC1,PPP1R18,NRM,TUBB,IER3,FLOT1,SFTA2,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2	IMR90	Hi-C	24141950	DDR1	1224	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,LY6G6E,LY6G6D,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,LY6G6E,LY6G6D,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr6	31761868	31762215	31762042	Y	LY6G5C	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52	NA	NA	NA	NA	VARS	138	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	ATF6B	11988	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	32732829	32733005	32732964	Y	HLA-DRA,HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DQA2,HLA-DQB2	NA	NA	NA	NA	NA	TAP2	71552	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	33158336	33158731	33158575	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1	NA	NA	NA	NA	SLC39A7	7491	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	33581625	33581918	33581825	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4224	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	33684801	33685193	33684861	Y	NA	NA	MNF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LEMD2	69720	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	34624445	34624747	34624649	Y	TAF11	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	37889	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	35228332	35228733	35228603	Y	PPARD,ZNF76	ZNF76,DEF6	NA	NA	NA	NA	ZNF76	3646	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	35453228	35453566	35453395	Y	NA	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	TEAD3	9287	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	713	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	36634782	36635224	36635042	Y	MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAP3P2	4370	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr6	37366071	37366087	37366081	Y	NA	RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	46323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	37892657	37892863	37892737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	107382	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	38185251	38185625	38185371	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	399976	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	38514218	38514357	38514288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	91567	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	40964511	40964818	40964666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73866	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	41512989	41513289	41513139	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	FOXP4	825	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	41686086	41686432	41686391	Y	NA	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	15565	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	41696174	41696539	41696421	Y	TFEB	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	5458	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	42086253	42086632	42086383	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	21725	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	42738530	42739530	42738949	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226	TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	25972	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	43117769	43118043	43117966	Y	RSPH9,MAD2L1BP,C6orf154	SRF,CUL9	NA	NA	NA	NA	SRF	18994	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	87630	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	43979820	43980209	43980006	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	13503	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	C6orf223	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	45629	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	44044328	44044673	44044418	Y	C6orf223,NFKBIE	TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	47978	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	44096308	44096658	44096594	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	MRPL14	3114	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	44205807	44206020	44205896	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	6804	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	44891116	44891398	44891337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	452292	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	44893195	44893513	44893382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	450177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	45051436	45051642	45051539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	292048	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	45299468	45299716	45299591	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43974	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	45391820	45391891	45391857	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48130	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	45912284	45912306	45912296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC5	133826	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	47220408	47220656	47220576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	54985	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	49302208	49302375	49302292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	126529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	52505026	52505217	52505106	Y	NA	TMEM14A	EFHC1,TRAM2,PAQR8,LOC730101	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM14A	28690	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	52591404	52591712	52591556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM14A	57497	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	53381866	53382077	53382067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	97691	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr6	53449658	53449861	53449725	Y	GCLC	GCLC,RP1-27K12.2	NA	NA	NA	NA	GCLC	29907	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	53489073	53489386	53489175	Y	NA	GCLC,RP1-27K12.2	KLHL31	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-27K12.2	9104	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	55228034	55228050	55228042	Y	HMGCLL1,GFRAL	NA	NA	NA	NA	NA	BMP5	510312	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	56315031	56315399	56315215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	502027	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	56811664	56812033	56811848	Y	NA	DST,BEND6	BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DST	5393	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	57046105	57046302	57046204	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	10981	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	57267458	57267955	57267680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	89855	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.75312567941774
chr6	64308595	64308777	64308676	Y	NA	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	34948	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	NA	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	OGFRL1	298335	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	73354930	73355043	73354987	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25410	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	73524800	73525128	73524864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	195280	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	73728224	73728284	73728227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	242654	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	73786085	73786476	73786271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	184462	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.2119799593207
chr6	76494746	76495208	76494920	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	37837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	81044945	81045591	81045323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	230581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	82554529	82554698	82554614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	94038	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	82956000	82956181	82956090	Y	NA	IBTK	NA	NA	NA	NA	IBTK	529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	83546132	83546541	83546207	Y	NA	NA	UBE3D,IBTK	IMR90	Hi-C	24141950	DOPEY1	228844	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	84131430	84131508	84131469	Y	NA	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	7289	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	85087981	85088261	85088229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	152628	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	85258714	85258725	85258720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX18	213512	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	85334002	85334301	85334152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX18	137936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr6	87144768	87144816	87144792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P27	349916	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	88433013	88433258	88433054	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	AKIRIN2-AS1,AKIRIN2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AKIRIN2	23086	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	88499265	88499658	88499500	Y	AKIRIN2	NA	ORC3	IMR90	Hi-C	24141950	AKIRIN2	89338	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	90008898	90009057	90008978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	51510	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	90774597	90775020	90774993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	229607	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	90782420	90782788	90782672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	221839	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	90818937	90819075	90819003	Y	BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	185552	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	93036003	93036032	93036018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	1091233	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	99081727	99082103	99081968	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	POU3F2	198477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chr6	99272215	99272664	99272374	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	7916	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	99275631	99275937	99275716	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	4643	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	99279577	99279776	99279667	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	804	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	99279823	99280075	99279977	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	505	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	99280317	99280875	99280652	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	POU3F2	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	105088715	105088857	105088855	Y	LIN28B,HACE1	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	216937	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	105613649	105613734	105613671	Y	BVES	BVES,POPDC3	NA	NA	NA	NA	POPDC3	12136	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	106331932	106332259	106332081	Y	PRDM1	NA	ATG5,PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	199936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	91524	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	108141852	108141997	108141916	Y	SCML4	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	135396	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	109755732	109756057	109756030	Y	CD164	SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24	NA	NA	NA	NA	SMPD2	3909	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	110502951	110503352	110503102	Y	FIG4,CDC40	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	CDC40	3607	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	110864475	110864588	110864515	Y	CDK19	NA	RPF2,CDK19	IMR90	Hi-C	24141950	DDO	129710	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	111265873	111266130	111266017	Y	SLC16A10,AMD1,AMD1	GTF3C6,RPF2	CDK19,AMD1,SLC22A16	IMR90	Hi-C	24141950	GTF3C6	11633	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	111409580	111409942	111409703	Y	AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10	SLC16A10	NA	NA	NA	NA	SLC16A10	2799	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	111441165	111441538	111441348	Y	AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	SLC16A10	NA	NA	NA	NA	SLC16A10	34384	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	113966016	113966399	113966296	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-367G18.1	2877	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	116345065	116345141	116345103	Y	NA	FRK	NA	NA	NA	NA	FRK	34780	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	118008335	118008695	118008355	Y	NA	NUS1	NA	NA	NA	NA	NUS1	13670	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	118239349	118239524	118239437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-632C17__A.1	78614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	118648714	118648964	118648839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-632C17__A.1	330576	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	118699224	118699515	118699458	Y	SLC35F1,PLN	NA	CEP85L	IMR90	Hi-C	24141950	CEP85L	329723	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	120445667	120446036	120445852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	776741	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	125205098	125205436	125205268	Y	NA	NA	HEY2,RNF217,TPD52L1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF217	76255	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	125523153	125523251	125523202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	84958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	125579970	125580036	125580003	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	41246	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	137529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	130881420	130881601	130881528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L2	500861	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	132832416	132832580	132832524	Y	VNN1,STX7	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	79	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	133890779	133890909	133890844	Y	NA	NA	MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	EYA4	331043	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	134395597	134395721	134395640	Y	NA	SLC2A12	TBPL1,SLC2A12,HBS1L,EYA4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC2A12	23823	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr6	136795244	136795664	136795596	Y	MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	74293	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	136807435	136807796	136807768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	62161	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	137231671	137231914	137231792	Y	NA	SLC35D3	SLC35D3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC35D3	9488	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	137242009	137242335	137242164	Y	IL20RA,SLC35D3	SLC35D3	NA	NA	NA	NA	SLC35D3	607	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	137310723	137310892	137310775	Y	IL20RA,SLC35D3	NA	NA	NA	NA	NA	IL20RA	53406	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr6	138038588	138039125	138038794	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	147226	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	138045007	138045495	138045466	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	140856	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	138194322	138194912	138194642	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	7971	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr6	138914049	138914108	138914056	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97600	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	139304978	139305148	139305081	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	2250	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	141873662	141873944	141873832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	592423	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	142508557	142508921	142508635	Y	NA	VTA1	NA	NA	NA	NA	VTA1	42190	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	143171849	143172301	143172148	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	92037	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	143174967	143175237	143175142	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	89101	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	143248323	143248614	143248469	Y	NA	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	15724	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	144668159	144668272	144668217	Y	PLAGL1,STX11	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	63322	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	148564785	148565120	148564953	Y	NA	SASH1,RP11-631F7.1	SASH1,SAMD5	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	26320	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	149829691	149830032	149829852	Y	LATS1,KATNA1,TAB2,SUMO4,ZC3H12D,PPIL4	PPIL4	NA	NA	NA	NA	PPIL4	35142	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	150176203	150176399	150176290	Y	NA	LRP11	NA	NA	NA	NA	LRP11	7800	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	150286198	150286452	150286311	Y	ULBP1	RAET1G,ULBP2,ULBP1,RAET1K	NA	NA	NA	NA	ULBP1	3055	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	151042844	151043065	151042880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG1	123845	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	151090718	151090960	151090871	Y	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	93725	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	151246480	151246919	151246675	Y	ZBTB2	RP1-99E18.2	NA	NA	NA	NA	RP1-99E18.2	7185	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	151365804	151366060	151365928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	52605	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	151634197	151634634	151634284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP12	75063	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	151998579	151998786	151998683	Y	NA	NA	ESR1,C6orf97	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf211	227157	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	154664890	154665258	154665161	Y	IPCEF1	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	164535	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	155253920	155254165	155254066	Y	NA	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	201461	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	43210	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	155649228	155649931	155649893	Y	NA	TFB1M	ARID1B,MIR4466	IMR90	Hi-C	24141950	TFB1M	15601	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	158375265	158375579	158375328	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	25309	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	158398935	158399083	158399028	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	1805	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	158515424	158515781	158515670	Y	SYNJ2,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SERAC1	71531	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	158784092	158784407	158784250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	171061	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	32206	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr6	159495451	159495612	159495554	Y	SYTL3,TAGAP	NA	TAGAP	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	76232	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	160699946	160700334	160700305	Y	LPA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2R	311815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	163774373	163774768	163774571	Y	QKI	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	58264	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	163840967	163841346	163841003	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	7935	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	164572657	164572833	164572684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	739625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	167506323	167506574	167506340	Y	RNASET2,CCR6	CCR6	NA	NA	NA	NA	CCR6	16721	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr6	168789584	168789819	168789635	Y	NA	NA	CCR6	IMR90	Hi-C	24141950	SMOC2	50012	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr6	169368330	169368547	169368455	Y	NA	NA	TCTE3,WDR27,C6orf70,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	283592	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr6	169986941	169987258	169987132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR27	112901	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	387969	388196	388081	Y	PDGFA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	169737	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	555332	555565	555456	Y	GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	2368	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	94709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	968255	968622	968448	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	24421	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	1017371	1017727	1017512	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,CYP2W1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	COX19	4136	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	1139272	1139516	1139401	Y	SUN1,TMEM184A	C7orf50	NA	NA	NA	NA	C7orf50	36380	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr7	1140726	1141099	1140817	Y	SUN1,TMEM184A	C7orf50	NA	NA	NA	NA	C7orf50	34797	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr7	1546091	1546367	1546260	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2602	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	1546424	1546775	1546565	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2935	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	1968189	1968469	1968397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	188262	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	2063741	2064015	2063879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	206863	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	2298793	2298985	2298883	Y	LFNG,SNX8	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	18936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	2356665	2356933	2356799	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	34788	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	2548054	2548433	2548213	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1730	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	2548551	2548955	2548724	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1208	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	2550421	2551074	2550672	Y	LFNG,LFNG,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	258	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	2569854	2570215	2570046	Y	LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	19691	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	2667919	2668210	2667992	Y	NA	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	1375	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	2749963	2750288	2750147	Y	LFNG,LFNG,CARD11	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH3	80378	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	3283908	3284312	3284215	Y	SDK1	NA	SDK1	IMR90	Hi-C	24141950	SDK1	54768	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.89444565229821
chr7	3885202	3885340	3885271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	546122	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	4133088	4133284	4133186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	548104	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	5002733	5003319	5002998	Y	NA	RNF216P1	NA	NA	NA	NA	RNF216P1	8300	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	5231323	5231672	5231498	Y	WIPI2	WIPI2	NA	NA	NA	NA	WIPI2	3504	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	5471668	5472052	5471860	Y	NA	TNRC18	WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC18	8623	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	6422514	6422839	6422633	Y	CCZ1	RAC1	NA	NA	NA	NA	RAC1	10360	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	7249464	7249811	7249639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	54899	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	7996944	7997264	7997104	Y	NA	GLCCI1	LOC729852,GLCCI1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLCCI1	9161	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	8173918	8174349	8174085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	125514	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	8300349	8300667	8300508	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	32	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	387817	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	12297328	12297575	12297487	Y	ARL4A	TMEM106B	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	48461	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	12759659	12759934	12759702	Y	ARL4A,ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	35178	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	13057101	13057487	13057331	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	332620	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	15408798	15409004	15408901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGMO	190636	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR3	109980	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	20197239	20197492	20197368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	57535	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	SP8,RPL23P8,LINC01162	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	SP8	12925	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	21502446	21502711	21502550	Y	SP4	SP4	NA	NA	NA	NA	SP4	36794	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	22258487	22259062	22258816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	274785	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	102218	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr7	24963944	24964392	24964187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	54861	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	25582500	25582683	25582592	Y	NPVF	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf31	364525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	25992296	25992472	25992423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	197388	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	28520361	28520389	28520375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	183421	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	28548927	28549168	28548984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	211987	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	29325062	29325307	29325213	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	91995	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	29534563	29534631	29534599	Y	WIPF3	NA	NA	NA	NA	NA	AC007255.8	66655	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	30188805	30188913	30188846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8	123785	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	32551548	32551619	32551584	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	18510	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	33762230	33762341	33762268	Y	NA	NA	BMPER,BBS9	IMR90	Hi-C	24141950	BBS9	595374	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	36227905	36228111	36228000	Y	HERPUD2,EEPD1	EEPD1	NA	NA	NA	NA	EEPD1	37147	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	415606	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	39454182	39454306	39454268	Y	POU6F2	NA	NA	NA	NA	NA	YAE1D1	149669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	39629281	39629774	39629554	Y	RALA	YAE1D1,RALA	NA	NA	NA	NA	YAE1D1	25306	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	40938770	40939089	40938937	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	CDK13	951134	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr7	43117230	43117632	43117554	Y	NA	HECW1	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	HECW1	32566	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	43644873	43645023	43645002	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	24516	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	43783185	43783244	43783215	Y	NA	BLVRA	C7orf44,BLVRA	IMR90	Hi-C	24141950	BLVRA	13035	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	46385021	46385087	46385052	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	425548	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	8.87118274479051
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.29427139951479
chr7	47515604	47515892	47515680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104264	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	47518819	47519136	47519085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	101020	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	47533820	47533921	47533853	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	86235	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	47579966	47580265	47580181	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	39891	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	47588229	47588393	47588311	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	31763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr7	47709189	47709374	47709294	Y	UPP1,UPP1,HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	89033	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	50237139	50237380	50237343	Y	NA	NA	COBL	IMR90	Hi-C	24141950	FIGNL1	278708	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr7	50602565	50602886	50602809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	86477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	50769181	50769534	50769358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	53791556	53791934	53791745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-14P	359805	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	54215101	54215120	54215111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-745C15.2	609998	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	55063666	55063958	55063856	Y	EGFR	NA	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	SEC61G	237999	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	55506510	55507071	55506539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	75369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	55600079	55600443	55600389	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	38238	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	55608174	55608360	55608336	Y	NA	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	30321	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	55725404	55725623	55725518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	86723	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	56029737	56030120	56029923	Y	CCT6A,MRPS17,GBAS	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	MRPS17	12225	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	56243524	56243790	56243559	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	71255	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1467054	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	63767130	63767234	63767166	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1293	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	66015251	66015629	66015440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-124K5.4	58558	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	69409562	69409698	69409630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	347657	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	69643869	69644054	69643961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	581964	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	70146101	70146417	70146317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	1084196	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	70253382	70253537	70253463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	1191477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	72990459	72990574	72990513	Y	NA	BCL7B,TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	TBL2	547	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	73869724	73869891	73869863	Y	GTF2IRD1	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3604	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	74074203	74074528	74074318	Y	LAT2,GTF2I	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	4209	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	75266605	75266883	75266780	Y	CCL26,HIP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	99397	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	75599122	75599360	75599199	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	22617	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	SRRM3	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	SRRM3	33163	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.29427139951479
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	76002661	76002791	76002762	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	YWHAG	16313	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	77028776	77029116	77028943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	135476	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	80270298	80270436	80270331	Y	CD36	NA	NA	NA	NA	NA	GNAT3	130962	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	80270954	80271129	80271024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAT3	131618	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	86534596	86534997	86534797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	152018	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	89824940	89825230	89825139	Y	NA	STEAP1,STEAP2,C7orf63	NA	NA	NA	NA	STEAP2	30036	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	91195125	91195302	91195221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	303342	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	92260832	92261202	92261012	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43124	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	92263416	92263696	92263624	Y	SAMD9,CDK6	FAM133B	FAM133B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	45708	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	92277080	92277232	92277129	Y	ANKIB1,GATAD1,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	59372	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	92290698	92291011	92290856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	72990	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC132	371622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	94280099	94280356	94280228	Y	NA	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	SGCE	3165	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	94687971	94688075	94688023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9A	153457	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	94751086	94751478	94751282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9A	216572	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	95807779	95807791	95807785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	141668	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	96642145	96642338	96642223	Y	DLX6,DLX5	DLX6,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX6	9285	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	96646199	96646417	96646378	Y	DLX6,DLX5	DLX6,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX5	5992	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr7	99020392	99020577	99020441	Y	OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789	BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789	NA	NA	NA	NA	CPSF4	13968	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr7	99785086	99785350	99785241	Y	ZKSCAN1,MCM7,GATS	C7orf43,GPC2,STAG3	NA	NA	NA	NA	STAG3	11900	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	100434359	100434559	100434459	Y	SAP25,EPHB4	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,SRRT	EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	11238	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	100776070	100776161	100776131	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	7700	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	100952176	100952182	100952179	Y	NA	RABL5	NA	NA	NA	NA	RABL5	10922	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	101017578	101017665	101017619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	54474	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	101609189	101609564	101609377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	152230	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr7	101930729	101931104	101930861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	71215	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	102959356	102959407	102959404	Y	PMPCB,DNAJC2	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PSMC2	23294	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	RP11-325F22.2	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-325F22.2	5948	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	RP11-325F22.2	NA	NA	NA	NA	RP11-325F22.2	18121	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	105041443	105041755	105041449	Y	NA	SRPK2	SRPK2,PUS7	IMR90	Hi-C	24141950	SRPK2	3688	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	105766301	105766504	105766403	Y	NA	SYPL1	CDHR3,ATXN7L1,SYPL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	15279	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	107116622	107117169	107116900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	84760	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	107555392	107555607	107555420	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	25977	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	107939769	107940082	107939931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	155079	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	108011226	108011346	108011286	Y	NRCAM,NRCAM	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	83815	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	108023520	108023641	108023597	Y	NRCAM,NRCAM	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	71520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	108095684	108095814	108095727	Y	NRCAM,NRCAM	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	523	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	108118010	108118358	108118206	Y	NA	NRCAM,RPL7P32	NA	NA	NA	NA	NRCAM	22849	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	111814530	111814935	111814850	Y	NA	DOCK4,ZNF277	NA	NA	NA	NA	DOCK4	29531	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	111971895	111972278	111972086	Y	NA	RN7SKP187	NA	NA	NA	NA	RN7SKP187	45217	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	114056337	114056620	114056363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	331955	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	119283625	119284006	119283817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	261423	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	119342265	119342557	119342442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	202872	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	120391061	120391362	120391218	Y	KCND2	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	105094	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	120666718	120667076	120666787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	77915	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	120703433	120703512	120703470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	114630	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	120841632	120841687	120841660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT16	121734	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	120884704	120884786	120884745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT16	78635	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	120945288	120945594	120945402	Y	NA	WNT16	NA	NA	NA	NA	WNT16	17827	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	121120093	121120403	121120217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	85675	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	126299329	126299605	126299476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRM8	591743	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	126658207	126658487	126658347	Y	GRM8	NA	NA	NA	NA	NA	GRM8	232861	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	126894131	126894431	126894281	Y	NA	GRM8	NA	NA	NA	NA	GRM8	2783	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.04739707893253
chr7	129418602	129418801	129418733	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169047	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.44722282614911
chr7	129450096	129450204	129450150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	140585	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	216343	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	131307786	131308102	131307944	Y	NA	NA	PODXL	MCF7	ChIA-PET	22265404	PODXL	66810	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	133093379	133093621	133093500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	95212	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	135395183	135395352	135395286	Y	NA	C7orf73,FAM180A	NA	NA	NA	NA	FAM180A	36242	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	135459124	135459310	135459189	Y	NA	FAM180A	C7orf73,SLC13A4,FAM180A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	27530	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.50625135883549
chr7	137928273	137928746	137928445	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	AC008155.2	52483	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr7	138081171	138081424	138081337	Y	TRIM24	AC008155.1	NA	NA	NA	NA	AC008155.1	5844	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr7	138143570	138143814	138143720	Y	NA	TRIM24	NA	NA	NA	NA	TRIM24	491	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	138858843	138859133	138858995	Y	SVOPL	TTC26	NA	NA	NA	NA	TTC26	42353	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	139420496	139420947	139420749	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	54630	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	139929659	139930294	139929953	Y	TBXAS1,RAB19,JHDM1D	NA	JHDM1D,LOC100134229	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP12	168138	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr7	139930411	139930852	139930521	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	168890	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr7	139931722	139931923	139931859	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAB19	169920	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	139932775	139933344	139933009	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D,SLC37A3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB19	168499	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	140271542	140271796	140271668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRN1	94173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	141380130	141380660	141380538	Y	NA	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	19293	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	141512676	141512822	141512821	Y	TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	76555	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	142505354	142505882	142505518	Y	GSTK1,CASP2	TRBJ2-1	NA	NA	NA	NA	TRBJ2-1	13305	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.60017425278343
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr7	150075425	150075527	150075503	Y	NA	REPIN1,ZNF775,RP4-584D14.6	NA	NA	NA	NA	RP4-584D14.6	3446	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	151622915	151623433	151623313	Y	RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	LOC100505483,PRKAG2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRKAG2	50705	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	151806252	151806472	151806362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	85493	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	66552	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	25886	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28735	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	81060	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	155714561	155715080	155714837	Y	NA	AC021218.2	LMBR1	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	38246	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	155737542	155737967	155737857	Y	NA	AC021218.2	LMBR1,LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	15359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	155752755	155752934	155752845	Y	SHH	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	392	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	1232	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr7	156290432	156290782	156290467	Y	RNF32	NA	SHH,LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	RNF32	140193	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	156800292	156800601	156800569	Y	MNX1,MNX1	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	744	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr7	157085416	157085724	157085621	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	40351	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	157366883	157367406	157367099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	240808	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	157943729	157944143	157943925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	551377	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	157956905	157957265	157957085	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	538255	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	158301130	158301237	158301184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	194283	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr7	158768295	158768665	158768480	Y	NA	NA	NCAPG2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR60	121026	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	3001693	3001780	3001737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	1081649	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	4367909	4368064	4367988	Y	CSMD1	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	274790	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	6275449	6275723	6275483	Y	NA	MCPH1	NA	NA	NA	NA	MCPH1	13336	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	6536860	6537447	6537204	Y	NA	CTD-2541M15.1,AGPAT5	LOC100287015,MCPH1,ANGPT2	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2541M15.1	26283	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	9912937	9913246	9913138	Y	NA	MSRA	NA	NA	NA	NA	MSRA	3159	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	10659261	10659473	10659367	Y	NA	PINX1	NA	NA	NA	NA	PINX1	35921	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	24343	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	11322358	11322501	11322433	Y	NEIL2,XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	7723	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	13988363	13988798	13988479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf48	566011	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	16280941	16281214	16281102	Y	MSR1	NA	NA	NA	NA	NA	FGF20	576476	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	17165650	17166030	17165840	Y	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT7	63263	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	17665479	17665814	17665519	Y	NA	RP11-156K13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	8625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	19518773	19518959	19518866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	94581	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	19534251	19534633	19534630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	78907	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	19562281	19562595	19562501	Y	ATP6V1B2	NA	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	CSGALNACT1	50945	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	19566953	19567512	19567287	Y	NA	CSGALNACT1	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	CSGALNACT1	46028	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	20296556	20296833	20296693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	243678	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	20345349	20345374	20345363	Y	NA	NA	LOC286114,GFRA2	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	292471	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	24861094	24861317	24861155	Y	NA	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	48470	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	27547704	27547787	27547746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARA3	58319	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	27630770	27631068	27630863	Y	NA	ESCO2,CCDC25	NA	NA	NA	NA	CCDC25	2600	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr8	28320295	28320574	28320435	Y	NA	FBXO16,FZD3	NA	NA	NA	NA	FBXO16	25261	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	28569820	28569970	28569874	Y	ZNF395,FZD3,EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	12839	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	29412862	29413263	29412985	Y	DUSP4,DUSP4	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	206677	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	343509	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr8	29623150	29623293	29623215	Y	NA	NA	C8orf75,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	315430	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	29631647	29631969	29631808	Y	NA	NA	C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	306754	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr8	34682233	34682421	34682327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5D	408554	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr8	36441429	36441454	36441442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-962G15.1	193228	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	37404927	37405081	37405004	Y	NA	RP11-150O12.1	KCNU1,ZNF703	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	4620	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	37749222	37749683	37749580	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	5302	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr8	37751458	37752024	37751766	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	2961	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	37760968	37761285	37761070	Y	RAB11FIP1	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	5983	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.98836854624615
chr8	37761676	37761790	37761689	Y	NA	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	6691	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	38313401	38313535	38313485	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	10817	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	38406722	38407104	38406913	Y	NA	RNF5P1	FGFR1,C8orf86,RNF5P1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF5P1	49614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	38491506	38491745	38491628	Y	FGFR1	RNF5P1	FGFR1,C8orf86,LETM2,WHSC1L1,PPAPDC1B,RNF5P1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF5P1	34788	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	38624356	38624716	38624649	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1	TACC1	NA	NA	NA	NA	TACC1	40652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	38762883	38763134	38762941	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	6130	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	40273499	40273632	40273622	Y	NA	NA	ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	264510	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	42356471	42356680	42356560	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	38389	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	42377318	42377512	42377415	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	17557	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	47903412	47903538	47903475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	163203	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr8	48350721	48350922	48350822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	152249	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	48434780	48435210	48435108	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	67961	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	48438620	48439345	48439203	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	63826	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	53379796	53380092	53379874	Y	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	276311	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	56362318	56362387	56362358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGS1	321314	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	56684291	56684685	56684461	Y	NA	TGS1,TMEM68	NA	NA	NA	NA	TMEM68	325	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	57594764	57594896	57594825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17A4.1	95820	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	60070914	60070936	60070925	Y	NA	RP11-25K19.1,TOX	NA	NA	NA	NA	TOX	41147	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	77567	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	61705362	61705819	61705615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	116025	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	62427686	62427987	62427837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	197168	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	64908546	64908816	64908686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	829434	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	66934530	66934705	66934628	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM55	102426	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr8	66935018	66935363	66935175	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM55	101768	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr8	67454365	67454567	67454497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	69915	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr8	68105132	68105308	68105276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	111114	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	68633375	68633571	68633446	Y	NA	CPA6	NA	NA	NA	NA	CPA6	23049	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	68660562	68660687	68660613	Y	NA	CPA6	NA	NA	NA	NA	CPA6	3942	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	69717744	69718003	69717874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf34	476787	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	70662491	70662649	70662617	Y	SLCO5A1,SLCO5A1,SLCO5A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO5A1	82650	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	71084923	71085298	71085131	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	70509	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1,RP11-382J12.1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	72147139	72147519	72147466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XKR9	567539	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	72187885	72188197	72188041	Y	EYA1	NA	NA	NA	NA	NA	XKR9	608285	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	73330216	73330391	73330304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	117235	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	73333960	73334345	73334224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	113281	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	75135577	75135926	75135753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP1	95439	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	76035291	76035498	76035400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	140541	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	186542	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr8	76148779	76148868	76148824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	169281	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	77128503	77128819	77128661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	462635	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	80275634	80276026	80275830	Y	STMN2	NA	NA	NA	NA	NA	HEY1	402072	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	81587419	81587669	81587654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	191565	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	81671131	81671440	81671286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	275277	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	81695028	81695405	81695288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	299174	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	81774871	81775022	81774952	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	247281	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	82673208	82673424	82673316	Y	NA	CHMP4C,ZFAND1	NA	NA	NA	NA	ZFAND1	30070	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	86090980	86091058	86091024	Y	E2F5,E2F5	E2F5,C8orf59,CA13	NA	NA	NA	NA	E2F5	3520	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	87358801	87359051	87358932	Y	NA	WWP1	NA	NA	NA	NA	WWP1	5834	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	87444767	87445117	87444942	Y	WWP1	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	49942	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	87475103	87475472	87475288	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	19587	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	90479154	90479488	90479317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	288467	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	90794286	90794738	90794600	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	26311	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	90838382	90838725	90838688	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK2	70407	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	90942619	90942853	90942786	Y	RIPK2,NBN,OSGIN2	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	30532	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	91479231	91479432	91479327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	322428	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	94947484	94947898	94947643	Y	GEM	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	79449	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	95003706	95004122	95004001	Y	NA	NA	LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	135671	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	95429933	95430227	95430143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	55110	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	95974189	95974483	95974287	Y	TP53INP1	NA	C8orf69	IMR90	Hi-C	24141950	CCNE2	67283	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	96086597	96087380	96086897	Y	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	56652	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	96244132	96244425	96244279	Y	NA	C8orf37	NA	NA	NA	NA	C8orf37	35004	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	97295015	97295255	97295133	Y	NA	UQCRB,MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	23072	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	98843865	98843962	98843914	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31320	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	98877971	98878157	98878074	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	MATN2	911	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	101927731	101928052	101928034	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	35564	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	102110720	102110996	102110973	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	FLJ42969	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF706	105425	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.14131997288047
chr8	102516990	102517159	102517011	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	14330	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	103780362	103780633	103780498	Y	NA	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1507C5.2	93895	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	51244	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	106582164	106582354	106582260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	253244	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	106764019	106764032	106764026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	306720	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	107972770	107973116	107972943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	264529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	108322581	108322730	108322655	Y	ANGPT1	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	614340	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	115707569	115707650	115707588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	1112249	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	117711370	117711748	117711590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	64994	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	119303956	119304407	119304075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	181864	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr8	119339236	119339376	119339324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	217144	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	121649803	121649981	121649892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	173532	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	121702901	121703232	121703165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	120281	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	121737162	121737328	121737239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	86185	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	121798029	121798317	121798256	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	25196	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	122755244	122755615	122755430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	103614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	123795111	123795992	123795667	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	3478	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	123882951	123883328	123883140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	91318	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	123883965	123883977	123883971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	92332	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	124547812	124548082	124548041	Y	NA	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	3364	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	125275002	125275221	125275161	Y	RNF139	NA	FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM65	107712	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr8	125468258	125468440	125468349	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	NA	NA	NA	NA	TRMT12	7210	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	126193275	126193543	126193371	Y	NA	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	91193	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	127445250	127445715	127445335	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	122405	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	127837362	127837443	127837401	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	268724	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	127928770	127929133	127928805	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	300200	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	128048074	128048382	128048201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	180951	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	128578179	128578386	128578271	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	167294	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	121653	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	128989961	128990273	128990255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	185182	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	198130	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	129036981	129037022	129036995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	232202	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	248933	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	129569050	129569202	129569118	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	PVT1	764271	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr8	129593885	129594223	129593976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	789106	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	129981605	129981909	129981758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	1045466	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	131024148	131024528	131024501	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	2847	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	131148484	131148822	131148654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	121109	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	131232940	131233341	131233190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	205565	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	133689212	133689471	133689356	Y	PHF20L1	LRRC6	NA	NA	NA	NA	LRRC6	3374	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr8	133942965	133943606	133943238	Y	TG	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	157347	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	78009	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	134387761	134388081	134387916	Y	NA	ST13P6	TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST13P6	30168	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr8	141108929	141109987	141109387	Y	KCNK9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	356691	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	141189770	141190115	141189943	Y	TRAPPC9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	276563	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chr8	142403963	142404243	142404183	Y	PTP4A3	GPR20,PTP4A3	FLJ43860,PSCA,JRK,PTP4A3	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	3870	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	142424633	142425265	142424919	Y	NA	GPR20,PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	24540	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	142426003	142426250	142426062	Y	PTP4A3	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25910	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	142550661	142551112	142550824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P38	83486	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	144598131	144598463	144598197	Y	PARP10	ZC3H3,GSDMD	NA	NA	NA	NA	ZC3H3	23160	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr8	145002494	145002937	145002709	Y	SPATC1,PLEC	PLEC	NA	NA	NA	NA	PLEC	45965	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr8	145071465	145071788	145071627	Y	NA	PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH	NA	NA	NA	NA	GRINA	9239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr8	146058579	146058595	146058588	Y	ARHGAP39	ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5	NA	NA	NA	NA	ZNF7	7730	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	211500	211823	211657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	256468	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	755797	756516	755921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT3	218448	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	2241944	2242239	2242031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228602	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	3507863	3508210	3507917	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15794	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	3508264	3508975	3508586	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15029	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	4334414	4334840	4334611	Y	NA	GLIS3	GLIS3	IMR90	Hi-C	24141950	GLIS3	11552	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr9	4829866	4830028	4829909	Y	NA	RCL1,MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	18263	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	6788210	6788382	6788241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	69347	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	8576629	8576984	8576673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	134327	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	11018357	11018684	11018521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	407634	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	454302	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.96510563873845
chr9	13034069	13034552	13034397	Y	NA	NA	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-3L8.3	221725	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	13278024	13278458	13278161	Y	NA	MPDZ	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	435	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	14147587	14147657	14147622	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	249325	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	14251419	14251628	14251514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	145354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	14301558	14301649	14301604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	95333	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.75312567941774
chr9	14400700	14401012	14400908	Y	ZDHHC21,NFIB	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	3718	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	14437606	14437932	14437918	Y	NA	NFIB	FLJ41200,NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	NFIB	40624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	14992180	14992514	14992235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHAP4	71848	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	16794774	16794903	16794900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTLN	338077	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr9	18857353	18857783	18857553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	167107	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	20552301	20552464	20552406	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	ACER2	1145376	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	20784777	20784885	20784831	Y	IFNW1	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	1225269	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	33158582	33158891	33158872	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	6463	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	42928	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	37198449	37198887	37198604	Y	ZBTB5,ZCCHC7	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	79913	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	37295997	37296383	37296038	Y	PAX5,ZCCHC7,FRMPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	124280	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	37371196	37371387	37371281	Y	PAX5,ZCCHC7,FBXO10,ZBTB5	GRHPR	NA	NA	NA	NA	GRHPR	49276	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	37908726	37909073	37908864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	109292	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	37954084	37954355	37954258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	112329	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	38017265	38017614	38017440	Y	SHB	RP11-613M10.9,SHB	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49070	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1,IGFBPL1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBPL1	15126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr9	38689769	38689953	38689855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD18A	114565	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	66825190	66825317	66825256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1628058	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	68377347	68377469	68377407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	75906	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	6.57691134527572
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	80021	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	71795556	71796114	71795819	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	147381	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.67083423922366
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.37656283970887
chr9	73178748	73179070	73178790	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	151208	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	73198481	73198826	73198654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	170941	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	73402441	73402694	73402566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	374901	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	73569162	73569421	73569277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM3	490399	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	73715626	73715840	73715770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM3	343980	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	73749210	73749614	73749539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM3	310206	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	74167536	74167704	74167695	Y	NA	RPL35AP21	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	34813	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	3.36493138595502
chr9	75511457	75511847	75511682	Y	NA	RP11-151D14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-151D14.1	24432	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	75580383	75580516	75580515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-151D14.1	93358	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	79257487	79257560	79257491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	72756	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	85081862	85082035	85081990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD95	580029	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	88142542	88142852	88142743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	212092	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	88264467	88264715	88264594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	90229	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	91125141	91125399	91125267	Y	NA	NA	SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2	IMR90	Hi-C	24141950	SPIN1	123807	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	5.04739707893253
chr9	92218643	92218902	92218819	Y	GADD45G	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	715	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	92218967	92219282	92219262	Y	NA	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	1039	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	92276961	92277319	92277054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	59033	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	92762358	92762553	92762476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-389K14.3	431234	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	93577739	93577890	93577821	Y	SYK,SYK	SYK	NA	NA	NA	NA	SYK	15670	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	93862627	93863018	93862659	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	259177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	93975322	93975401	93975365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	146794	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	94181531	94181930	94181720	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	2214	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	95363262	95363623	95363482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPPK	66924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	95716430	95716630	95716571	Y	SUSD3,FAM120AOS,FGD3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF484	78126	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	95845794	95846166	95845981	Y	NINJ1,C9orf89	SUSD3,C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	C9orf89	10334	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	95912569	95912767	95912671	Y	IPPK,C9orf89,NINJ1	NINJ1	WNK2,NINJ1,C9orf89,FAM120A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NINJ1	17999	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	96057122	96057472	96057169	Y	ZNF484,ZNF484,WNK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120A	154532	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	96057493	96057765	96057581	Y	ZNF484,ZNF484,C9orf129,WNK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120A	154239	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	96329605	96329732	96329668	Y	NA	PHF2	PHF2	IMR90	Hi-C	24141950	PHF2	6957	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	97629577	97629759	97629671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	142594	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	97679079	97679413	97679326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	192096	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	97839686	97839862	97839737	Y	PTCH1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	238129	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	97852376	97852657	97852531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	225334	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	97853945	97854061	97854005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	223930	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	97966859	97967268	97967183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	110723	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	100432763	100433089	100432926	Y	TSTD2,XPA	NCBP1,TSTD2,XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	24550	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	100841115	100841498	100841123	Y	C9orf156	NANS,TRIM14	NA	NA	NA	NA	NANS	24094	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	101868249	101868435	101868378	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	3929	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	105248809	105248820	105248818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF20	954676	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	107734203	107734221	107734212	Y	SLC44A1,OR13C3,OR13C8	NA	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	NIPSNAP3B	209765	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NIPSNAP3B	230974	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	107979204	107979331	107979268	Y	TAL2,SLC44A1,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	SLC44A1,ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A1	25572	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	108623002	108623305	108623152	Y	FSD1L,FSD1L,TAL2	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	168177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	110266981	110267369	110267173	Y	NA	KLF4,RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	16218	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	110514044	110514454	110514287	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	219373	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	110802909	110803314	110803056	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	508238	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	111003656	111003963	111003923	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	383150	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	111025609	111025952	111025781	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	361161	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	111034300	111034792	111034481	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-220D10.1	352321	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr9	111063260	111063480	111063351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-220D10.1	323633	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	112802389	112802506	112802448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf152	165963	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	113113544	113113865	113113705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	96624	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	114364049	114364191	114364143	Y	KIAA0368,GNG10	PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10	NA	NA	NA	NA	PTGR1	3914	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	114783014	114783329	114783192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	125968	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	115071018	115071139	115071076	Y	NA	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	22808	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	115982258	115982474	115982402	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	FKBP15,SLC31A1	NA	NA	NA	NA	SLC31A1	450	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	116131358	116131644	116131397	Y	NA	WDR31,BSPRY,HDHD3,ALAD,C9orf43,POLE3	NA	NA	NA	NA	HDHD3	5635	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLE3	110835	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	117040965	117041219	117041139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMBP	202213	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	117135053	117135760	117135486	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	129970	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	117137275	117137511	117137393	Y	DFNB31,DFNB31	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	128219	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	117647197	117647589	117647272	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	275711	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	117976093	117976379	117976336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	604607	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	118024698	118025071	118024956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	653212	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.07065998644023
chr9	118706424	118707025	118706637	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	740556	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	119311432	119311888	119311785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	135693	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	119404408	119404429	119404420	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	43152	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	120162627	120162904	120162792	Y	NA	ASTN2	NA	NA	NA	NA	ASTN2	12444	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	123640419	123640826	123640772	Y	NA	PSMD5,PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	2813	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr9	124034360	124034626	124034492	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	51068	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr9	126029655	126030141	126030108	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	800	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	126154038	126154354	126154284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	125183	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	126160444	126160608	126160526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	131589	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	127165878	127166187	127166033	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	9536	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	127266277	127266534	127266531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMB7	90554	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	127424345	127424738	127424542	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	5599	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	127976903	127977044	127976974	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	16082	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	4.12968851912662
chr9	128394575	128395007	128394820	Y	PPP6C	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	72506	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	129485609	129485808	129485757	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	79477	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	129889359	129889542	129889416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARNL3	95002	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	130373507	130373780	130373645	Y	GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	STXBP1	963	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	130733227	130733464	130733411	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	7328	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	130743802	130743907	130743855	Y	FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	3010	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	130753520	130753846	130753692	Y	SLC25A25,DPM2,FAM102A	FAM102A	FAM102A	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM102A	12728	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	130844598	130844860	130844677	Y	NA	SLC25A25,NAIF1,PTGES2	NA	NA	NA	NA	NAIF1	16113	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr9	132176730	132177172	132176936	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	66558	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	132220495	132220692	132220545	Y	FAM73B,USP20,USP20,C9orf78,ASB6	LINC00963	PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	23038	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132249735	132250094	132249903	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	6005	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	132312044	132312247	132312152	Y	NA	RP11-492E3.2	DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	23441	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	15632	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	5180	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	4264	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132349858	132350089	132350073	Y	NA	RP11-492E3.2	LOC100506190,IER5L,C9orf50	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-492E3.2	14170	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132359283	132359664	132359324	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-492E3.2	23595	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-492E3.2	24086	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.764757133171596
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132598761	132599163	132598839	Y	NA	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	C9orf78	2619	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	132712659	132713039	132713009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	90434	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.60017425278343
chr9	134258707	134258891	134258799	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	8589	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	134278219	134278688	134278276	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	10739	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	134316967	134317380	134317020	Y	NA	PRRC2B	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	49487	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	134515858	134516155	134515990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	97306	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	134600757	134600889	134600837	Y	RAPGEF1,NTNG2	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	12572	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	134602820	134603314	134602971	Y	PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	10147	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	134821616	134821991	134821804	Y	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	MED27	131304	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	135016724	135016887	135016786	Y	NA	NA	MED27,RAPGEF1,NTNG2,SETX	IMR90	Hi-C	24141950	MED27	63429	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	135287067	135287190	135287129	Y	NA	TTF1,C9orf171	NA	NA	NA	NA	C9orf171	3637	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	135999727	136000118	136000091	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	37183	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.83541711961183
chr9	136017295	136017625	136017456	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	19676	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	136226163	136226469	136226316	Y	NA	SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96	NA	NA	NA	NA	SURF1	4611	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	136292897	136293168	136293034	Y	SLC2A6,RALGDS	REXO4,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	REXO4	11733	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	136753303	136753756	136753577	Y	C9orf7,VAV2	NA	SARDH	IMR90	Hi-C	24141950	VAV2	101970	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr9	137215635	137215833	137215709	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	8691	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	137739401	137739789	137739783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	225479	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	138021937	138022314	138022177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	56669	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	138886133	138886389	138886266	Y	NA	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	34907	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	138992686	138992828	138992756	Y	SOHLH1	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	7555	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	139420614	139420765	139420738	Y	PTGDS,LCNL1,C9orf172	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	17549	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	139590539	139590822	139590769	Y	FUT7,C9orf142,ABCA2	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	AGPAT2	10664	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,LCN12	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	139919787	139920355	139920165	Y	NA	C9orf142,CLIC3,ABCA2,NPDC1,ENTPD2,UAP1L1	NA	NA	NA	NA	ABCA2	1012	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	12.0831627041112
chr9	140047623	140048201	140047695	Y	NA	DPP7,MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1	NA	NA	NA	NA	MIR3621	13521	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chr9	140132594	140132714	140132654	Y	LCN15,NPDC1,PNPLA7,ENTPD8	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	951	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.22361141307455
chr9	140169154	140169348	140169240	Y	NA	TUBB4B,NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	25355	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	5111	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chr9	140205114	140205300	140205216	Y	PNPLA7,NOXA1,NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	10411	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	140205908	140206072	140205991	Y	NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	11205	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	140306093	140306345	140306289	Y	NRARP	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	9369	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chr9	140341522	140341675	140341601	Y	EHMT1,ANAPC2,NELF	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	ENTPD8	7254	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	3629342	3629771	3629444	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	3661828	3662267	3662009	Y	PRKX	PRKX	NA	NA	NA	NA	PRKX	32179	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	8955651	8955925	8955865	Y	TBL1X	NA	TBL1X	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1X	473410	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	9433838	9434425	9434365	Y	TBL1X	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	4503	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	9701264	9701389	9701313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM2	51107	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	9896256	9896650	9896356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	84952	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	CLCN4	NA	NA	NA	NA	CLCN4	38639	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	10586151	10586408	10586285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	263365	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	11158305	11158560	11158458	Y	ARHGAP6	RP11-120D5.1,HCCS	NA	NA	NA	NA	HCCS	30884	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.44722282614911
chrX	11352228	11352284	11352258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCCS	224807	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	2.29427139951479
chrX	11359316	11359697	11359568	Y	MSL3,MSL3,HCCS	NA	NA	NA	NA	NA	HCCS	231895	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	11360130	11360328	11360210	Y	MSL3	NA	NA	NA	NA	NA	HCCS	232709	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	11368234	11368298	11368266	Y	ARHGAP6	NA	NA	NA	NA	NA	HCCS	240813	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	11430955	11431077	11431016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	250744	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	11441273	11441771	11441607	Y	ARHGAP6	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	240050	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chrX	11444012	11444192	11444085	Y	ARHGAP6	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	237629	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	11444311	11444864	11444622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	236957	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	11455735	11455931	11455831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	225890	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	11460430	11460509	11460495	Y	AMELX	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	221312	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	11.4713569975739
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	12972600	12972806	12972677	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	18421	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chrX	12989837	12990050	12989934	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	1177	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	12991564	12992257	12991938	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	337	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	12996986	12997135	12997061	Y	TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5759	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	13097151	13097463	13097240	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	105924	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	13208277	13208528	13208394	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	GS1-600G8.5	111043	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	13687345	13687715	13687534	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	RAB9A	17529	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	15493209	15493485	15493347	Y	NA	PIR	NA	NA	NA	NA	PIR	16202	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	17856457	17856771	17856610	Y	NA	RAI2	NA	NA	NA	NA	RAI2	20686	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	20154251	20154286	20154269	Y	NA	MAP7D2,EIF1AX	NA	NA	NA	NA	EIF1AX	3676	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	21947998	21948242	21948120	Y	NA	SMS	MBTPS2,SMS	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	8449	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	22013670	22013825	22013692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	56979	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	23368174	23368523	23368350	Y	NA	PTCHD1	NA	NA	NA	NA	PTCHD1	18041	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	23390523	23390925	23390723	Y	PTCHD1	PTCHD1	NA	NA	NA	NA	PTCHD1	40390	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	23806806	23807042	23806932	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	7516	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	23829236	23829783	23829513	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	29946	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	23971140	23971524	23971479	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	47083	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	24027801	24028121	24027962	Y	NA	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	42712	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	24044003	24044417	24044292	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	26416	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	38338792	38338989	38338897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN7	79634	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	39612631	39612800	39612742	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	32590	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chrX	39953769	39954197	39953849	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	80385	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	39963931	39964200	39963990	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70382	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	39964938	39965503	39965246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69079	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	40902136	40902158	40902147	Y	NA	USP9X	MED14	IMR90	Hi-C	24141950	USP9X	40730	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	41242516	41242827	41242698	Y	DDX3X	NA	DDX3X,USP9X	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDX3X	51865	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	41480372	41480697	41480463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	289721	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	42574181	42574201	42574191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P4	617755	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	44173548	44173763	44173665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	226484	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	45493055	45493058	45493057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR222	111472	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	45647781	45648040	45647909	Y	NA	MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	43251	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	45943096	45943186	45943141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	234176	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	46316161	46316444	46316394	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18012	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	47582458	47582548	47582504	Y	ARAF,CFP,CFP	NA	NA	NA	NA	NA	UXT	65898	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	58292059	58292236	58292148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P17	282939	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	63554308	63554471	63554461	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	58862	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	64821176	64821755	64821551	Y	MSN	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	14919	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	GJB1	NA	NA	NA	NA	GJB1	30910	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	88083	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	73510244	73510542	73510484	Y	RLIM	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	867	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	79965324	79965547	79965436	Y	BRWD3	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	97640	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	84475648	84475726	84475688	Y	NA	ZNF711	NA	NA	NA	NA	ZNF711	21271	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	95690630	95690825	95690798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	246837	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	95940743	95941133	95941025	Y	DIAPH2	DIAPH2	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	3081	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	99903962	99904188	99904076	Y	SRPX2	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	6747	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chrX	99913933	99914424	99914133	Y	SYTL4,SYTL4	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	16718	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	GPRASP2	50168	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chrX	102063503	102063615	102063509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHB9	89887	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	102820880	102821034	102820957	Y	NA	TCEAL4,TCEAL3	NA	NA	NA	NA	TCEAL4	8125	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	102880714	102880758	102880737	Y	PLP1,PLP1	TCEAL3,TCEAL1	NA	NA	NA	NA	TCEAL1	874	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	106448636	106449011	106448824	Y	NA	NUP62CL	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	966	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.611805706537277
chrX	109003262	109003404	109003333	Y	ACSL4	ACSL4	NA	NA	NA	NA	ACSL4	28630	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	113028207	113028379	113028299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSU72P1	594748	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	114819160	114819326	114819285	Y	NA	PLS3	NA	NA	NA	NA	PLS3	25659	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	115372300	115372667	115372491	Y	NA	NA	SLC6A14	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A14	193123	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	118824830	118825236	118824917	Y	UBE2A,UBE2A,SEPT6	SEPT6	NA	NA	NA	NA	SEPT6	97	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	119076607	119076872	119076702	Y	NKRF	NKAP	NA	NA	NA	NA	NKAP	872	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	119883101	119883187	119883145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	121096	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	119886658	119886814	119886790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	124653	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.52951426634319
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	120720651	120720690	120720671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	958646	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	123606177	123606254	123606218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	514115	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	125406399	125406559	125406479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	198309	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	1.68246569297751
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638
chrX	131159301	131159695	131159439	Y	RAP2C,MBNL3,MST4,MST4	MST4	NA	NA	NA	NA	MST4	4008	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	131615038	131615178	131615106	Y	MST4,MST4,MBNL3	MBNL3	NA	NA	NA	NA	MBNL3	6818	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC160	62912	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	133847905	133848292	133848163	Y	NA	PLAC1	LOC100506757,FAM122B,PLAC1,MIR450A1,MGC16121,MIR542,MIR450A2,MIR450B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLAC1	48060	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.917708559805915
chrX	134138094	134138444	134138243	Y	NA	FAM127C,FAM127A,FAM127B	NA	NA	NA	NA	FAM127C	16115	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	135917972	135918329	135918167	Y	NA	RBMX	NA	NA	NA	NA	RBMX	42594	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	136647486	136647742	136647575	Y	NA	ZIC3	NA	NA	NA	NA	ZIC3	1185	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	138277070	138277325	138277232	Y	NA	FGF13	NA	NA	NA	NA	FGF13	25614	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	NA	MTM1	201173	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	150047001	150047063	150047035	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	18226	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.458854279902957
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNMA3	95010	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrX	153239828	153239923	153239886	Y	ABCD1,ARHGAP4,RENBP,MECP2,EMD,DNASE1L1,TMEM187	ARHGAP4,NAA10,RENBP,HCFC1,TMEM187,IRAK1	NA	NA	NA	NA	TMEM187	4050	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrY	13687009	13687218	13687129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTY15	1085047	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.152951426634319
chrY	28555183	28555400	28555298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1AY	5819572	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	6.57691134527572
chrY	28555690	28555797	28555743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1AY	5820079	CAGE	HSQ-89	hg19	FANTOM5	0.305902853268638