chr1	936652	937138	936860	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	C1orf170	K562	ChIA-PET	22265404	HES4	3100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.36824589017894
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	1084	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RP11-465B22.3	21720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	1136667	1137146	1136877	Y	HES4,MIB2	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	28265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr1	1456676	1456699	1456688	Y	NA	ATAD3A	NA	NA	NA	NA	ATAD3A	11145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	1714020	1714715	1714566	Y	SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	4124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,TNFRSF14	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	89001	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	3309990	3310261	3310127	Y	PRDM16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	215798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	104994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	3514172	3514403	3514294	Y	TP73,MEGF6	MEGF6,RP11-46F15.2,TPRG1L	NA	NA	NA	NA	MEGF6	11656	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	4067941	4068288	4068115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf174	253084	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	6040561	6040806	6040680	Y	NA	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	KCNAB2	8720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	6350184	6350543	6350407	Y	ZBTB48,GPR153,ACOT7	GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	31149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	6709089	6709221	6709155	Y	NA	PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	THAP3	26163	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	7207208	7207593	7207350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	363824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	7461964	7462325	7462107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	367004	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.16231146494599
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.16231146494599
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	52503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	8156648	8157003	8156918	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	71850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	72619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	8194345	8194402	8194374	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	109547	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	8257762	8258040	8257906	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	117846	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	103496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	8445817	8446112	8445964	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	69931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	8450820	8451072	8450834	Y	RERE,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	74934	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	8720526	8720683	8720608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	155019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	8721734	8722143	8721896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	153559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	8858188	8858497	8858477	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	17205	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	9760502	9760837	9760631	Y	NA	RP11-558F24.4	NA	NA	NA	NA	RP11-558F24.4	14889	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	10057852	10058069	10058032	Y	NA	RBP7,UBE4B	NA	NA	NA	NA	RBP7	2588	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	10447707	10448369	10448247	Y	NA	PGD,APITD1,APITD1-CORT	NA	NA	NA	NA	PGD	8280	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	10849807	10850141	10849963	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	4566	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	10926873	10927035	10926954	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	11753086	11753651	11753386	Y	TNFRSF1B,MTHFR,CLCN6	FBXO44,FBXO6,MAD2L2,AGTRAP	NA	NA	NA	NA	MAD2L2	3379	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	11841016	11841080	11841048	Y	NA	AGTRAP,C1orf167,CLCN6,MTHFR	NA	NA	NA	NA	C1orf167	21172	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	12046023	12046196	12046108	Y	FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2	MFN2,MIIP	NA	NA	NA	NA	MFN2	7785	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	12114385	12114572	12114458	Y	MIIP,TNFRSF8	MIIP,TNFRSF8	TNFRSF1B	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF8	6862	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	12225396	12225718	12225601	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,MFN2,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	12493313	12493712	12493478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	182025	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	12493910	12494304	12493999	Y	AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	181433	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	12509354	12509466	12509435	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	166271	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	12616547	12616769	12616712	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	58968	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr1	12675687	12675874	12675779	Y	VPS13D	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	14087510	14087640	14087574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	62817	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	15738146	15738632	15738365	Y	SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	3755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	15742467	15743324	15742634	Y	TMEM51,TMEM51,SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	8076	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	15786440	15786713	15786642	Y	PLEKHM2,CTRC,CELA2A,CELA2B	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	52049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	15827976	15828116	15828046	Y	NA	CASP9,DNAJC16	NA	NA	NA	NA	CASP9	22913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	16489021	16489207	16489116	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA2	8439	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	16500084	16500309	16500220	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19502	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.08901637849427
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.78011474064484
chr1	17253207	17253541	17253218	Y	NA	RP11-108M9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-108M9.4	39063	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.47121310279541
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	19360402	19360809	19360663	Y	IFFO2	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	79222	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	19703880	19704261	19704067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC2	67060	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	17270	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	21349725	21349786	21349755	Y	EIF4G3	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48460	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr1	21588829	21589430	21588896	Y	ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	80567	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	21611199	21611583	21611510	Y	EIF4G3,ECE1,ALPL,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	58414	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	21650806	21651685	21651350	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	18312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	21670382	21670956	21670695	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	21967959	21968010	21967985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPL	134101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	21992948	21993402	21993156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP48	114697	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	22266159	22266438	22266333	Y	HSPG2	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	4369	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	24722613	24722643	24722628	Y	NA	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	17641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	24833128	24833464	24833216	Y	RUNX3,NIPAL3,SRRM1,RCAN3	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	5741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	25011612	25011937	25011775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRM1	55405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	26615016	26615421	26615346	Y	SH3BGRL3,ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	11349	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	26615527	26615997	26615758	Y	FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,ARID1A,UBXN11,UBXN11,CD52	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	11860	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.95637703971304
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.78011474064484
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	27353661	27353962	27353706	Y	TMEM222,MAP3K6,TRNP1	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46B	16334	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	27626897	27627231	27626926	Y	NA	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1	NA	NA	NA	NA	TMEM222	19420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	27924687	27925144	27924927	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	3798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	27985480	27985709	27985578	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	11020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	28143878	28144081	28143936	Y	NA	STX12,PPP1R8	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	11208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	28201800	28202156	28201857	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8	PPP1R8,RPA2	NA	NA	NA	NA	RPA2	37101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	28355043	28355235	28355139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA3	57972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	28437697	28438098	28437903	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566	IMR90	Hi-C	24141950	EYA3	24490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	28462161	28462385	28462304	Y	FAM76A,STX12,C1orf38,XKR8,EYA3,SESN2,MED18,PTAFR,PTAFR	EYA3	EYA3,LOC653566	IMR90	Hi-C	24141950	EYA3	48954	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	28618110	28618271	28618191	Y	ATPIF1	SESN2,MED18	NA	NA	NA	NA	SESN2	34072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	28776524	28777127	28776532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCC1	53328	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	TMEM200B	NA	NA	NA	NA	TMEM200B	2610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	31430605	31430735	31430670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	50997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	31517703	31518005	31517854	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	18833	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	106986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	31770743	31770927	31770835	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	2901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	BAI2	47508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.95637703971304
chr1	32423598	32423720	32423682	Y	PTP4A2	PTP4A2	SPOCD1,KHDRBS1,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,PTP4A2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	15141	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	32732571	32732683	32732626	Y	LCK	EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,HDAC1	NA	NA	NA	NA	HDAC1	23004	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.70681965419312
chr1	33082385	33082406	33082394	Y	ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	32098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	33284832	33285123	33284978	Y	NA	S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	YARS	3078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	33373602	33373851	33373812	Y	RNF19B	TMEM54	NA	NA	NA	NA	TMEM54	8563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	33457406	33457727	33457615	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	29120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	33463131	33463490	33463269	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	34845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.67714752802837
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	33593963	33594340	33594180	Y	TRIM62	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	49258	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	33622437	33622835	33622675	Y	PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	22825	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	34462454	34462825	34462727	Y	CSMD2,HMGB4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN20	526208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.64747540186361
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT2	116288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	36617554	36617914	36617691	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	1266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	36715455	36715834	36715645	Y	EIF2C1,EIF2C3	THRAP3	NA	NA	NA	NA	THRAP3	27438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	36721428	36721771	36721600	Y	NA	THRAP3,SH3D21	NA	NA	NA	NA	THRAP3	33411	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	36815580	36815775	36815719	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	33722	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	38010731	38010979	38010768	Y	ZC3H12A,MTF1	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	6924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	39327096	39327575	39327204	Y	NA	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	RP5-864K19.4	3424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	39357087	39357474	39357146	Y	MACF1,GJA9	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	MYCBP	11798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	39596184	39596482	39596236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	51196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	39644229	39644606	39644401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	99241	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	39736190	39736575	39736327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	137576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PABPC4	NA	NA	NA	NA	PABPC4	34503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	40295095	40295414	40295254	Y	NA	BMP8B	NA	NA	NA	NA	BMP8B	42562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1,RP1-118J21.5	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	40628781	40629153	40628997	Y	NA	RLF	NA	NA	NA	NA	RLF	3736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	40851431	40851768	40851472	Y	CAP1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	42909	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	41495531	41495820	41495676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	169513	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	141529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	41762082	41762223	41762153	Y	NA	NA	EDN2	IMR90	Hi-C	24141950	SCMH1	56256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	3671	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	41962532	41962651	41962593	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	14188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	41981831	41982007	41981926	Y	SLFNL1,SLFNL1	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	33487	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	42092770	42093067	42092919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	144426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	42356899	42357259	42356906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	142337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	42367142	42367456	42367439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	43400932	43401203	43401085	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	21327	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	43666420	43666443	43666435	Y	NA	WDR65	NA	NA	NA	NA	WDR65	30600	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	43760174	43760222	43760211	Y	TIE1	EBNA1BP2	C1orf210	K562	ChIA-PET	22265404	EBNA1BP2	25567	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	44150815	44151139	44150977	Y	ST3GAL3,SLC6A9,IPO13	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	18356	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	44176533	44177122	44176879	Y	SZT2,ATP6V0B	ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7038	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	44232152	44232509	44232262	Y	SLC6A9,IPO13,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	62657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	44333703	44334024	44333769	Y	SZT2,ATP6V0B	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	62968	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	44341126	44341302	44341213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	55690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	44354357	44354471	44354414	Y	SZT2,KDM4A,ST3GAL3,IPO13	ARTN	NA	NA	NA	NA	ARTN	42521	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	45192729	45193123	45192925	Y	NA	RNU5F-1,KIF2C,RPS8,SNORD55	KIF2C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU5F-1	7155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	45298718	45299070	45298894	Y	NA	PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	PTCH2	7665	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	45909846	45909857	45909852	Y	NA	TESK2	NA	NA	NA	NA	TESK2	45015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	63570	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	46951922	46952271	46952097	Y	NA	NA	FAAH,DMBX1,LOC729041,LOC100507423,MKNK1	IMR90	Hi-C	24141950	MKNK1	128244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	46999025	46999241	46999126	Y	ATPAF1-AS1	NA	NA	NA	NA	NA	MKNK1	81274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	47729037	47729382	47729210	Y	NA	TAL1,STIL	TAL1	K562	ChIA-PET	22265404	TAL1	33145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	48079368	48079696	48079596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMPK1	281899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	48178329	48178566	48178448	Y	NA	NA	CYP4A22,CMPK1,FOXD2,MGC12982	IMR90	Hi-C	24141950	CMPK1	380860	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	339924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	51454917	51455119	51455049	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	30500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	51475380	51475551	51475487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	50963	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	51823993	51824400	51824363	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	15205	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	52132018	52132585	52132263	Y	TXNDC12,EPS15,NRD1,NRD1,OSBPL9	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	91167	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	52193707	52193852	52193763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	148625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	52507951	52508154	52508101	Y	NA	KTI12,BTF3L4,TXNDC12	NA	NA	NA	NA	KTI12	10463	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9,RP4-800M22.2	NA	NA	NA	NA	RP4-800M22.2	1491	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	53702100	53702340	53702220	Y	NA	CPT2,C1orf123	NA	NA	NA	NA	MAGOH	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	54260217	54260562	54260390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	54261078	54261111	54261098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	54744858	54745090	54744974	Y	NA	NA	CYB5RL,MRPL37	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	81149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	54810685	54810861	54810859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	66291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	55894779	55895033	55894906	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	215993	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	58969564	58969575	58969570	Y	NA	DAB1,OMA1	NA	NA	NA	NA	DAB1	40831	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	59049880	59049917	59049902	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	8714	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	59050239	59050578	59050488	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	9073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	59083441	59083551	59083446	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	59083966	59084335	59084186	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42800	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	59221049	59221462	59221387	Y	NA	JUN,LINC01135	FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	26323	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	59232576	59232611	59232594	Y	NA	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	JUN	15174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	113921	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	59397559	59397706	59397597	Y	TACSTD2	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-794H19.4	86353	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	59522982	59523218	59523118	Y	NA	RP4-794H19.4	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	38923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	59608045	59608421	59608204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	123986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	124690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	59616706	59617089	59616861	Y	NA	NA	HSD52,FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	132647	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	59758328	59758666	59758447	Y	FGGY	FGGY	NA	NA	NA	NA	FGGY	1644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	61039424	61039611	61039555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	289320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	62416847	62417238	62417043	Y	INADL,USP1,KANK4	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	210698	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	63022251	63022602	63022448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	122283	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	64197270	64197475	64197385	Y	NA	ROR1	ROR1,UBE2U,PGM1	IMR90	Hi-C	24141950	ROR1	40218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	65387772	65388547	65388120	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	41640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	65398951	65399446	65399123	Y	LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	30741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	65510370	65510451	65510413	Y	NA	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	20969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	65527577	65527856	65527728	Y	NA	RP4-535B20.1	AK4	K562	ChIA-PET	22265404	RP4-535B20.1	3564	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	65775838	65775991	65775933	Y	PDE4B,DNAJC6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	63936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	65888047	65888596	65888066	Y	LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	3777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	65946781	65947169	65947001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	62511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	66724177	66724356	66724261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4B	467980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	66822714	66822988	66822804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	565582	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	67029191	67029437	67029359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	359133	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	358223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	4.32462292989197
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	67867795	67868154	67868057	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	25944	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	68036173	68036524	68036291	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	112220	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	68118588	68118809	68118774	Y	GADD45A	GADD45A	GADD45A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	29935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	68321515	68321736	68321554	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	24365	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	68572958	68573227	68573176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	123576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	68647153	68647165	68647159	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	49638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	68657070	68657479	68657271	Y	NA	WLS,RPS7P4	NA	NA	NA	NA	WLS	39324	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	75168986	75169131	75169081	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	27705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	75972237	75972619	75972428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	215417	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	76541670	76541922	76541777	Y	ST6GALNAC3	ST6GALNAC3	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	3266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	76730126	76730314	76730220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	191722	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	77713696	77713788	77713742	Y	NA	PIGK,AK5	PIGK,AK5,ZZZ3	IMR90	Hi-C	24141950	PIGK	30581	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	78019403	78019530	78019478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	127574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	3770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	78350506	78350835	78350671	Y	FAM73A	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	1363	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr1	79099852	79100232	79099854	Y	NA	IFI44L,IFI44	NA	NA	NA	NA	IFI44	13249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	82172386	82172576	82172503	Y	NA	ST13P20	NA	NA	NA	NA	ST13P20	12802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	84757421	84757614	84757534	Y	DNASE2B,DNASE2B,SAMD13,SAMD13	NA	UOX,DNASE2B	IMR90	Hi-C	24141950	RPF1	185328	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	84966686	84966774	84966730	Y	NA	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	3474	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr1	85007374	85007584	85007581	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	30579	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	85241214	85241288	85241250	Y	SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	86728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	85328527	85328795	85328739	Y	BCL10	LPAR3	NA	NA	NA	NA	LPAR3	28101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	85744584	85744829	85744751	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	3811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	85763626	85763846	85763779	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	22853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	85779776	85780132	85779838	Y	NA	BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	39003	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	85791287	85791404	85791348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	50514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	85795855	85796291	85796120	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55082	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	85843881	85844049	85844014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	103108	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	85992810	85993270	85993105	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	48663	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	86000890	86001115	86001087	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	40818	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	86010067	86010444	86010393	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31489	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	86016463	86016866	86016755	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	25067	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	86035824	86036171	86035900	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	5762	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	86049987	86050100	86050044	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	CYR61	5543	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	86071867	86071976	86071922	Y	NA	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61,ZNHIT6	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	27423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	86072885	86073441	86073156	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	28441	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	33134	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	34017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	87190718	87190974	87190846	Y	NA	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	22459	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	87240012	87240427	87240202	Y	SH3GLB1	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71753	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	87258759	87259068	87258988	Y	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	90500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.05934425232951
chr1	89594590	89594813	89594736	Y	GTF2B,GBP3,GBP5,GBP4,GBP1,GBP2	GBP2	NA	NA	NA	NA	GBP2	19326	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	89739985	89740544	89740197	Y	GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5	NA	NA	NA	NA	NA	GBP4	77370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	91322848	91323191	91323185	Y	NA	RP4-665J23.1	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	7641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	91865772	91865792	91865782	Y	NA	HFM1	NA	NA	NA	NA	HFM1	2634	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	92021775	92022091	92021979	Y	NA	NA	TGFBR3,CDC7,HSP90B3P,KIAA1107,RPAP2,GLMN	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	57367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	92164446	92164626	92164554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC7	200038	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	92184014	92184251	92184134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	185641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	92189033	92189061	92189048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	180831	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	92201825	92202076	92201951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	167816	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	92202579	92202753	92202666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	167139	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	92725087	92725311	92725273	Y	RPAP2,GLMN	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	RPAP2	37211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	93003662	93004045	93003868	Y	RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	GFI1	53229	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	93032261	93032386	93032324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFI1	81828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	93773027	93773315	93773230	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	36130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94038553	94038921	94038737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	126865	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94089710	94089715	94089713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	178022	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94093325	94093611	94093590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	181637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR760	184142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	94127789	94128026	94127840	Y	GCLM,TMED5,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR760	182362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	94133922	94134283	94134103	Y	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	NA	MIR760	176105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR760	164270	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	94158127	94158185	94158167	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	152203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	151050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	7.72254094623567
chr1	94161111	94161471	94161388	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90	Hi-C	24141950	MIR760	148917	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	142868	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr1	94168203	94168325	94168229	Y	NA	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	142063	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	94201362	94201612	94201551	Y	NA	NA	BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MIR760	108776	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94203705	94204234	94204026	Y	NA	NA	BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MIR760	106154	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94224546	94224929	94224684	Y	DNTTIP2	NA	MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L	IMR90	Hi-C	24141950	MIR760	85459	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	NA	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	65079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	94527681	94527931	94527843	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	154715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94621912	94621923	94621919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	89541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94684511	94684818	94684682	Y	NA	RP11-148B18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	26646	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94701813	94701865	94701839	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	9599	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94712051	94712193	94712123	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-148B18.1	587	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-148B18.1	931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	94784984	94785158	94785071	Y	NA	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	11665	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94787153	94787197	94787175	Y	ABCD3	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	9626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	94788386	94788592	94788436	Y	ARHGAP29,F3	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	8231	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	94991460	94991992	94991709	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	13364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	94992236	94992413	94992325	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	12943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	94996582	94996830	94996792	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	8526	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	95003688	95004160	95004042	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	1196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	95189546	95189834	95189690	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	94003	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	95484238	95484316	95484279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG14	52185	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	96938076	96938362	96938169	Y	NA	EEF1A1P11	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	27590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	97596064	97596178	97596116	Y	PTBP2	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	410843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	97656052	97656450	97656352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	352807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	97994700	97995088	97995052	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	14169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	98070725	98071007	98070866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	61468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	98100424	98100708	98100566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	91167	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	98373500	98373836	98373707	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	10769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	18761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	5.86913111913911
chr1	98497100	98497277	98497188	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	16142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	98499783	98500490	98500262	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	12929	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	98512823	98513144	98512962	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	98518546	98518920	98518639	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	5127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	98550811	98551163	98550987	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	37392	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	67841	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr1	98642709	98642844	98642773	Y	NA	RP5-1070A16.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	31459	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr1	98677142	98677181	98677162	Y	NA	RP5-1070A16.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	2839	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	98693625	98693976	98693800	Y	NA	RP5-1070A16.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	19322	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	98788970	98789228	98789135	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1070A16.1	114667	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	100424556	100424788	100424649	Y	NA	SLC35A3,RP5-884G6.2	SLC35A3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC35A3	8557	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	100494312	100494735	100494498	Y	CDC14A,HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	6918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	102141288	102141454	102141371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-556K13.1	110605	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	105911296	105911317	105911307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-364B6.2	1297664	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	107731970	107732212	107732091	Y	NTNG1,NTNG1	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	51341	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	108870455	108870699	108870577	Y	NA	NA	SLC25A24	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC25A24	128984	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	109104473	109104583	109104556	Y	PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	3762	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	109188271	109188477	109188414	Y	NA	HENMT1,PRPF38B	NA	NA	NA	NA	HENMT1	13671	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	109246671	109246905	109246843	Y	FAM102B,TMEM167B,PRPF38B	HENMT1,PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	PRPF38B	13726	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	109933790	109934137	109934039	Y	TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	4436	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	110320163	110320291	110320225	Y	NA	GSTM3	CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	37779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	110895542	110895785	110895664	Y	NA	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	16414	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	111677638	111678032	111677835	Y	NA	CEPT1,DRAM2	NA	NA	NA	NA	CEPT1	2217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	111735402	111735659	111735539	Y	CD53,LRIF1,RAP1A	CHI3L2	NA	NA	NA	NA	CHI3L2	5734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	112438367	112438956	112438733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	141921	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	113468568	113468671	113468620	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	NA	NA	NA	NA	SLC16A1-AS1	28366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	113675675	113676049	113675887	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	33567	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	113683682	113683919	113683753	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	25697	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	113949729	113949849	113949733	Y	NA	MAGI3,RP11-512F24.1	NA	NA	NA	NA	MAGI3	18358	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	114258659	114258989	114258824	Y	NA	PHTF1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	41122	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	114477404	114477721	114477665	Y	RSBN1,HIPK1,HIPK1,HIPK1	DCLRE1B,AP4B1,HIPK1	NA	NA	NA	NA	HIPK1	7590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	115296637	115296935	115296808	Y	NA	NRAS,CSDE1,SIKE1	NA	NA	NA	NA	CSDE1	2362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	115722074	115722498	115722181	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN2	91953	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	116087444	116087828	116087621	Y	NA	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	94746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	116918317	116918655	116918398	Y	NA	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5027	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	116920378	116921129	116920740	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	7088	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	117619913	117620299	117620136	Y	CD101	RP11-27K13.3,TTF2,TRIM45	NA	NA	NA	NA	TTF2	18988	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	75070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	120380695	120381105	120381020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	180274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	120530787	120531205	120531127	Y	NOTCH2,ZNF697	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	79035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	120608824	120609208	120608880	Y	NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	1032	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	120692453	120692808	120692620	Y	NBPF7,NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	82213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	144009977	144010738	144010098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	134070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	144871122	144871347	144871255	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	61378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	144912694	144913065	144913005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	102950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	117473	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	87115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	80942	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	73337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	145004446	145004804	145004625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	69382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	145005016	145005394	145005195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	68792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	61132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	145023690	145024549	145024240	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	49637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	145042783	145043227	145042898	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	30959	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	145054975	145055306	145055182	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	18880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	145058996	145059322	145059204	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	14864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	145064438	145064839	145064449	Y	PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	9347	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	145106553	145106772	145106662	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	12333	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	145519496	145519624	145519499	Y	NBPF10,TXNIP	LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B	NA	NA	NA	NA	PEX11B	5244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	147104963	147105320	147105142	Y	NA	ACP6	NA	NA	NA	NA	ACP6	35298	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	147775754	147775884	147775851	Y	NBPF14	RNU1-120P,RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	29002	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	147825273	147825748	147825617	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	20387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNU1-92P	NA	NA	NA	NA	RNU1-92P	1997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	372	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	149978692	149979077	149978971	Y	SV2A,CA14,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	150159099	150159241	150159135	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1,ANP32E	HIST2H2AC,HIST2H2BE,HIST2H2AB	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PLEKHO1	39726	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	150294873	150295138	150294978	Y	PLEKHO1,MCL1,CTSS,PRPF3	C1orf51,MRPS21,PRPF3,RPRD2	NA	NA	NA	NA	PRPF3	2948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	150800498	150800843	150800671	Y	NA	ARNT	NA	NA	NA	NA	ARNT	46401	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	CERS2	4090	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151284018	151284391	151284246	Y	FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB	ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5	NA	NA	NA	NA	PI4KB	13800	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	151422102	151422465	151422287	Y	NA	POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	7476	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151809390	151809745	151809546	Y	RORC,C2CD4D	RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,AL450992.2	NA	NA	NA	NA	AL450992.2	2608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	151941985	151942109	151942045	Y	S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	22757	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151945068	151945221	151945146	Y	TUFT1,S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	19645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	151945504	151945625	151945562	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	19241	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151949461	151949565	151949513	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	15301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	152001678	152001977	152001894	Y	S100A10,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	16406	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	1778	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	153718129	153718295	153718212	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	19586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	153841080	153841191	153841137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	52260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	154529043	154529152	154529118	Y	NA	UBE2Q1	NA	NA	NA	NA	UBE2Q1	352	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	154579303	154579782	154579555	Y	UBAP2L,IL6R,SHC1,ADAR,ADAR	UBE2Q1,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	18693	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	154728745	154728994	154728977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	130270	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	154899922	154900189	154899933	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1	NA	NA	NA	NA	PMVK	7278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,DCST2,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,DCST2,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,DCST2,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	154979104	154979305	154979208	Y	ADAR,ADAR,MTX1,PBXIP1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,DCST2,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	5977	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.26527867756246
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	155433776	155433971	155433878	Y	MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L	96627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	33586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	155620238	155620623	155620432	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	DAP3	35128	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	155916072	155916212	155916141	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	13881	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	155944562	155945214	155944815	Y	C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	NA	NA	NA	NA	ARHGEF2	29647	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	156089405	156089622	156089466	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	39041	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	156118146	156118395	156118328	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	43485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	156133837	156133883	156133860	Y	C1orf182,RHBG,HAPLN2,C1orf61,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,MEX3A,PAQR6,PAQR6	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	27997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	26479	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	156249668	156250061	156249953	Y	NA	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	SMG5	559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr1	156464458	156464805	156464586	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	3815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	156679562	156679883	156679727	Y	NA	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	5954	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	156895977	156896091	156896003	Y	LRRC71	LRRC71	NA	NA	NA	NA	LRRC71	7535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	157106691	157107326	157106962	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	157244599	157245063	157244641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	138333	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	157964633	157965029	157964831	Y	OR10T2	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	3570	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	157966753	157967127	157966789	Y	NA	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	5690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	159158093	159158524	159158429	Y	NA	AIM2	NA	NA	NA	NA	AIM2	43207	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,VSIG8,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	159878004	159878104	159878054	Y	NCSTN,TAGLN2	VSIG8,CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	10051	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	VSIG8,CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	159886226	159886307	159886250	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	7215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	SUMO1P3,NCSTN,COPA	NA	NA	NA	NA	COPA	21158	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	160592866	160593252	160593179	Y	SLAMF6,USF1,TSTD1,LY9,ARHGAP30,SLAMF1,CD48	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	269518	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	222772	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP12	135042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	161892699	161893027	161892754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFML2B	98617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	162508612	162508929	162508802	Y	UAP1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	20394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	162511455	162511984	162511719	Y	UAP1,UHMK1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	17339	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	162599583	162599804	162599661	Y	NA	DDR2	NA	NA	NA	NA	DDR2	420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	162603017	162603226	162603122	Y	DDR2	DDR2	NA	NA	NA	NA	DDR2	3854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	162604417	162604795	162604606	Y	NA	DDR2	NA	NA	NA	NA	DDR2	5254	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	164685981	164686133	164686057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	163160	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	167313306	167313474	167313390	Y	MAEL,POU2F1	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F1	125240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	168294165	168294357	168294261	Y	NA	TBX19	NA	NA	NA	NA	TBX19	45887	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	172608229	172608375	172608255	Y	NA	NA	C1orf9,FASLG	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	196999	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172788027	172788361	172788212	Y	NA	NA	CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	229742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172790579	172790978	172790769	Y	NA	NA	CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	227125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172851972	172852342	172852171	Y	NA	NA	LOC100506023,TNFSF18,TNFSF4	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	165761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172862488	172862855	172862639	Y	NA	NA	TNFSF4	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	155248	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172863432	172863838	172863572	Y	TNFSF4,C1orf9,C1orf9,FASLG	NA	TNFSF4	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	154265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr1	172870197	172870622	172870564	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	147481	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172872881	172872916	172872899	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	145187	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	138747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172887147	172887473	172887267	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,SNORD77,LOC100506046,SNORD79,SNORD78,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,SNORD81,SNORD75,GAS5,SNORD47	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	130630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172888696	172888994	172888711	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,SNORD77,LOC100506046,SNORD79,SNORD78,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,SNORD81,SNORD75,GAS5,SNORD47	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	129109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172900674	172900969	172900756	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	117134	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	172903010	172903534	172903241	Y	TNFSF18,TNFSF4	NA	TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	114569	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	172920935	172921277	172921095	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	96826	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	172972573	172972790	172972603	Y	PRDX6	TNFSF18	NA	NA	NA	NA	TNFSF18	45313	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	173008475	173008781	173008627	Y	TNFSF18	TNFSF18	NA	NA	NA	NA	TNFSF18	9322	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	174122877	174123205	174123041	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	3343	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	178207948	178208160	178207999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	147084	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	178252303	178252477	178252337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	191439	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	178414274	178414285	178414280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	95602	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	178903778	178903964	178903860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANGPTL1	65591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	42910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	180200686	180200867	180200752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	78717	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	180389473	180389640	180389557	Y	NA	NA	LHX4,LOC100527964	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	80449	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	181042855	181043067	181042961	Y	NA	MR1,IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12571	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	181065454	181065797	181065538	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	9816	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	182274457	182274562	182274517	Y	NA	NA	GLUL	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	84779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	183132366	183132749	183132653	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	20624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	183133608	183133779	183133664	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	19594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	183149947	183150219	183150157	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	3154	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	183241451	183241867	183241650	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	88078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	183577563	183577895	183577671	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	24997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	183579279	183579568	183579440	Y	NA	ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	23324	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	184005350	184005919	184005662	Y	RGL1,GLT25D2	TSEN15	RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	12892	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	184130086	184130836	184130514	Y	NA	NA	C1orf21	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	111275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	184357629	184357933	184357738	Y	EDEM3	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	3437	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	184758240	184758595	184758304	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	36193	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	184885517	184885894	184885706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	55788	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	184922808	184923031	184922923	Y	EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	18651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	184929910	184930144	184930114	Y	TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	11538	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	185032022	185032401	185032047	Y	SWT1,SWT1,IVNS1ABP,RNF2	RNF2	NA	NA	NA	NA	RNF2	19526	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	187235320	187235513	187235392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	439235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	187267139	187267250	187267195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	471054	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	192446152	192446393	192446247	Y	RGS2,RGS1	NA	UCHL5,RGS1,RGS13,RGS2,TROVE2,GLRX2	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	236920	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	192577525	192577907	192577716	Y	NA	NA	UCHL5	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	105406	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	192691567	192691932	192691775	Y	NA	MIR4426	RGS13	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	8254	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	196317530	196317735	196317633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNT2	258620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	198850238	198850638	198850585	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	503631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	199711776	199712042	199711895	Y	NA	NA	NR5A2,C1orf98	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-104D3.2	357507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	199828633	199828987	199828821	Y	NA	NA	C1orf98	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-104D3.2	474364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	200076437	200076447	200076441	Y	NR5A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	300737	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	200457893	200457983	200457938	Y	NA	NA	C1orf98,NR5A2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF281	80709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	200715755	200716027	200715890	Y	NA	CAMSAP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	9069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	201160901	201161255	201161022	Y	IGFN1	TMEM9,IGFN1	NA	NA	NA	NA	IGFN1	2948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	IGFN1	78053	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	201244405	201244769	201244526	Y	PKP1	NA	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFN1	86452	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	201426190	201426373	201426369	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	9992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	201463619	201463933	201463776	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	10436	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	92185	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	202997835	202998093	202998001	Y	NA	TMEM183A,PPFIA4	NA	NA	NA	NA	PPFIA4	4209	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr1	203506114	203506504	203506389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELP	63158	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	203526746	203526853	203526757	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	66836	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	203617500	203617713	203617599	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	23811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	203619380	203619832	203619595	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	25691	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	203643182	203643803	203643474	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	49493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	203661733	203662076	203661795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	68044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	204044571	204044810	204044641	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	4328	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	204053773	204053963	204053834	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	13530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	KISS1	75033	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	204330284	204330553	204330417	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	14240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	204358316	204358342	204358328	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	13523	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr1	204388302	204388627	204388415	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	9383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	204389721	204389989	204389958	Y	PPP1R15B	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	10802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	205144631	205144860	205144785	Y	NA	DSTYK	NA	NA	NA	NA	DSTYK	33867	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	205270500	205270865	205270692	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	18018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	205283024	205283394	205283339	Y	RBBP5,NUAK2	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	5489	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	206608344	206608425	206608385	Y	NA	IKBKE	NA	NA	NA	NA	IKBKE	33366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	206861410	206861458	206861434	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	5121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	206892674	206892943	206892811	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	36385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	207032663	207032940	207032848	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL19	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	35848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	207265739	207265906	207265769	Y	NA	PFKFB2,YOD1,C4BPB	NA	NA	NA	NA	C4BPB	5552	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	208029774	208030104	208029939	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	10391	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	209830400	209831026	209830727	Y	TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3	LAMB3,G0S2,HSD11B1	NA	NA	NA	NA	LAMB3	6589	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	210056461	210057439	210056772	Y	NA	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	DIEXF	57109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	210058060	210058292	210058164	Y	LAMB3	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	DIEXF	58708	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH1	269924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	211754949	211755173	211755061	Y	NA	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	4865	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	211837893	211837920	211837910	Y	NA	NEK2	NA	NA	NA	NA	NEK2	9040	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	212113260	212113497	212113379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	93387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.47121310279541
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3,FAM71A	NA	NA	NA	NA	FAM71A	25823	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	212780782	212781279	212780943	Y	NA	ATF3,FAM71A	NA	NA	NA	NA	FAM71A	14510	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	212808992	212809268	212809126	Y	VASH2,PPP2R5A	FAM71A,RP11-338C15.3	NA	NA	NA	NA	FAM71A	13203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	212809966	212810356	212810074	Y	RPS6KC1,ATF3,ATF3,ATF3	FAM71A,RP11-338C15.3	NA	NA	NA	NA	FAM71A	14177	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	212841280	212841455	212841352	Y	RPS6KC1,ATF3,ATF3,ATF3	FAM71A,RP11-338C15.3,BATF3	NA	NA	NA	NA	RP11-338C15.3	4504	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	213443269	213443475	213443372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	220680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	214712809	214712848	214712830	Y	NA	PTPN14	NA	NA	NA	NA	PTPN14	10944	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	215130656	215131050	215130800	Y	KCNK2,KCNK2	KCNK2	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNK2	46068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	216402261	216402628	216402445	Y	USH2A	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD3	663526	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	217105953	217106090	217106023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	696334	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	217306758	217307045	217306902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	495379	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	217308487	217308861	217308605	Y	ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	493563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	218338759	218338973	218338866	Y	NA	NA	ESRRG	IMR90	Hi-C	24141950	RRP15	117656	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	218382752	218383112	218382930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	73517	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	218553747	218554148	218553928	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	36170	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	218633382	218633612	218633512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	115805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	218648559	218648794	218648717	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	130982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	218669910	218670282	218669996	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	152333	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	218671989	218672275	218672071	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	154412	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	219498496	219498646	219498574	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	153310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	220347108	220347461	220347410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	77451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	C1orf115	NA	NA	NA	NA	C1orf115	7614	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	221209079	221209530	221209425	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	250978	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	221613404	221613745	221613476	Y	NA	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	299773	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	221877654	221878134	221877871	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	35384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	221899063	221899285	221899220	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	14233	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	222502119	222502129	222502124	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	HHIPL2	217316	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	222828361	222828786	222828451	Y	TLR5	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	38933	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	222829045	222829186	222829145	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	39617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	223903033	223903347	223903117	Y	TP53BP2,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	15738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	223907308	223907681	223907376	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	20013	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	223925260	223925580	223925340	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	37965	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	224025511	224025803	224025713	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	5871	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	7.00177045792034
chr1	224730441	224730985	224730669	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	107706	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH,RP11-145A3.1	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	225895377	225895885	225895482	Y	ENAH	RP11-145A3.1	ENAH,TMEM63A,SRP9,EPHX1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-145A3.1	9071	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	226007337	226007385	226007361	Y	NA	SRP9,EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	11543	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	226320775	226321123	226320910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	51308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	226815517	226815910	226815821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKB	109114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	227128899	227129131	227129032	Y	ADCK3	ADCK3	NA	NA	NA	NA	ADCK3	45662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	229131021	229131272	229131196	Y	RHOU	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	273503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	229601636	229601883	229601761	Y	NA	NUP133,RP4-613A2.1	NA	NA	NA	NA	NUP133	40220	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	229692979	229693368	229693287	Y	NUP133,TAF5L,ABCB10	ABCB10	NA	NA	NA	NA	ABCB10	537	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	229699507	229699773	229699581	Y	NA	ABCB10	ABCB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	ABCB10	7065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	230212552	230213069	230212856	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	21016	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	230240540	230240902	230240735	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	49004	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	230241590	230241986	230241849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	50054	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	230248068	230248475	230248108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	56532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	230249347	230250007	230249645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	57811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	230407650	230408034	230407910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	216114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	230978470	230978520	230978495	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	24815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	231531271	231531676	231531476	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	27114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	231531776	231531955	231531804	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	26835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	231720748	231721061	231720886	Y	TSNAX	DISC1	NA	NA	NA	NA	DISC1	39500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	232073278	232073500	232073389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	312717	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.75044261448009
chr1	233249275	233249581	233249334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	164924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	234548581	234548830	234548706	Y	NA	RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	41242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	234630919	234631525	234631418	Y	TARBP1	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	18070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	13899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	78808	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	128116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	192181	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	156829	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	235835688	235836968	235835896	Y	NA	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	23634	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	235842870	235843206	235843038	Y	NA	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	30816	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	235850857	235851038	235851012	Y	LYST,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	38803	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	235994307	235994722	235994588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYST	50218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	236447659	236448000	236447830	Y	NA	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	4340	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	236559628	236560010	236559876	Y	MTR,LGALS8,EDARADD,EDARADD	NA	NA	NA	NA	NA	EDARADD	50066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	236579529	236579860	236579770	Y	MTR,LGALS8,EDARADD	NA	NA	NA	NA	NA	ENO1P1	64605	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	237007861	237008154	237008008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	51251	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	237335807	237336186	237335810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	379197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	238811242	238811567	238811347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01139	163919	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	240306165	240306375	240306208	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	25080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	240397761	240398076	240397984	Y	GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	66306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	240433849	240434175	240434014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	102394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	240437557	240437954	240437680	Y	FMN2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	106102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	241646029	241646431	241646168	Y	KMO	FH	NA	NA	NA	NA	FH	34630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1LC3C	52027	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr1	243431437	243431793	243431509	Y	NA	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	14117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	243585242	243585384	243585313	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	167922	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	243637125	243637295	243637255	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	219805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	243688123	243688227	243688212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	270803	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	243995795	243995860	243995825	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	16521	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	203127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr1	244763140	244763529	244763408	Y	ADSS,EFCAB2	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf101	147461	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	244894306	244894456	244894354	Y	C1orf100,C1orf101	NA	PPPDE1,C1orf101	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPU-AS1	122343	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	246042512	246042669	246042578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	625945	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	246317158	246317459	246317368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	246387027	246387389	246387208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	281225	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	246538507	246538660	246538597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	129954	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	246591935	246592203	246592010	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	76411	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr1	246749077	246749442	246749258	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	21331	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	247507326	247507475	247507401	Y	NA	ZNF496	ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF496	14178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	247603500	247603921	247603563	Y	NLRP3,NLRP3	NLRP3	NA	NA	NA	NA	NLRP3	26042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	247608966	247609716	247609354	Y	NLRP3,NLRP3	NLRP3	NA	NA	NA	NA	NLRP3	31508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3124	224044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	516106	516519	516355	Y	ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	217164	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	644331	644586	644526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	89097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	3133662	3133717	3133688	Y	PITRM1,PFKP	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	27137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	3239590	3239795	3239693	Y	NA	PITRM1	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	26587	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	3800307	3800531	3800378	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	24942	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	3811743	3812009	3811888	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	13464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	3867491	3867713	3867639	Y	NA	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	42018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	3878027	3878387	3878159	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF6	52554	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	3893365	3894190	3893886	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	67892	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	4386754	4387085	4386858	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	102650	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr10	4712833	4713220	4712996	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	5126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr10	4812953	4813314	4813133	Y	NA	AKR1E2	KLF6,PITRM1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	13507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	4855217	4855416	4855349	Y	NA	AKR1E2	KLF6,NET1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	28396	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	6163143	6163430	6163287	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	RBM17,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	6242613	6242903	6242648	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	57732	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	6428287	6428757	6428405	Y	NA	NA	LOC399715,RBM17,PFKFB3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	191506	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	6764164	6764384	6764289	Y	NA	RP11-554I8.2	LOC100507127,SFMBT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554I8.2	12960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	6836289	6836715	6836468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-554I8.2	58945	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	344611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	568594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	11746687	11746940	11746814	Y	USP6NL	NA	USP6NL,ECHDC3	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	94934	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	11866902	11867068	11866972	Y	C10orf47	NA	LOC219731	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	215149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	11924114	11924319	11924232	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	158850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	12490797	12491318	12490959	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	101316	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	13754952	13755339	13755135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	128025	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	13831161	13831325	13831243	Y	PRPF18	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	204234	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	14026617	14027027	14026853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	399690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	14053069	14053428	14053261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	426142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	14175548	14175585	14175560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	326556	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	14518978	14519126	14519049	Y	NA	FRMD4A	FRMD4A	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	16837	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	14647138	14647588	14647478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	144997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	14689846	14690850	14690697	Y	RPP38,HSPA14,DCLRE1C,CDNF,C10orf111	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	124046	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	14955590	14955884	14955736	Y	HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2	SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1	NA	NA	NA	NA	SUV39H2	36771	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	RPP38	21540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	15179834	15179919	15179877	Y	NA	RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	28773	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	16548527	16548808	16548668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTER	71585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	17105178	17105416	17105257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	136637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	17215777	17215793	17215785	Y	NA	TRDMT1	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	26260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	17264441	17264580	17264545	Y	VIM	TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3	VIM,CUBN,RSU1,TRDMT1	IMR90	Hi-C	24141950	VIM	3678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	17280857	17281170	17281014	Y	TRDMT1,VIM	TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3	NA	NA	NA	NA	RP11-124N14.3	6025	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	17390739	17391085	17390858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6	103244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	17569630	17569764	17569656	Y	VIM	NA	PTPLA	IMR90	Hi-C	24141950	ST8SIA6	75301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	17652629	17652974	17652802	Y	NA	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	PTPLA	4402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	17697506	17697813	17697679	Y	ST8SIA6,STAM	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	13382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	17755362	17755412	17755398	Y	SLC39A12	NA	NA	NA	NA	NA	STAM	71238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	22025175	22025497	22025336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	194575	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	22029877	22030194	22029992	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	189878	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	22535914	22536341	22536050	Y	NA	NA	ARMC3,LOC100130992	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	66562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	22722910	22723095	22723003	Y	DNAJC1	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	114770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.47121310279541
chr10	22817226	22817294	22817260	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	184190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	22894974	22895386	22895290	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	106098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	22907073	22907416	22907362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	94068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	24772710	24773084	24772822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	237513	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	24996902	24997348	24997071	Y	NA	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	13249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	25100941	25101162	25100981	Y	GPR158,ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	90344	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	25155940	25156492	25156271	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	83041	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	25211297	25211494	25211421	Y	NA	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	28039	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr10	25733571	25733934	25733774	Y	GPR158	NA	NA	NA	NA	NA	THNSL1	429984	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	26223879	26224018	26223959	Y	GAD2,MYO3A	MYO3A	NA	NA	NA	NA	MYO3A	2683	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	26696445	26696722	26696578	Y	PDSS1,ABI1,APBB1IP	APBB1IP	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	28410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	26737474	26738103	26737807	Y	ABI1,APBB1IP	APBB1IP	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	12342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	26769950	26770105	26770002	Y	APBB1IP,ABI1	APBB1IP	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	44818	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	26775885	26776759	26776046	Y	APBB1IP,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50753	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	27027283	27027887	27027754	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42695	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	27069899	27070563	27070182	Y	MASTL,ACBD5,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	ABI1	77453	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr10	27991244	27991520	27991382	Y	NA	RP11-360I20.2,MKX	NA	NA	NA	NA	RP11-360I20.2	40195	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	28002936	28003088	28002983	Y	ARMC4,MKX	RP11-360I20.2,MKX	NA	NA	NA	NA	RP11-360I20.2	28627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.47121310279541
chr10	28467299	28467468	28467383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP7	153947	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	28700580	28701041	28700796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP7	79165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	28891962	28892254	28892152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAMBI	72017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	28957755	28957993	28957831	Y	BAMBI	BAMBI	BAMBI	K562	ChIA-PET	22265404	BAMBI	6278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	29761620	29761743	29761682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	65289	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	29879091	29879350	29879257	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	144360	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	29919320	29919950	29919696	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	103760	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	29922205	29922549	29922392	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	101161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	29944854	29945090	29945003	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	78620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	SVIL	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	49497	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	30736122	30736481	30736327	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	15256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	30742798	30743130	30743073	Y	NA	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	21932	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	31025766	31026097	31025992	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	292769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	31205866	31205987	31205927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF438	112879	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	31289701	31290078	31290005	Y	ZNF438,ZNF438	ZNF438	NA	NA	NA	NA	ZNF438	28788	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	ITGB1	NA	NA	NA	NA	ITGB1	41416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	33522627	33522949	33522766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	100241	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	33541909	33542109	33542065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	81081	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	34924725	34924738	34924731	Y	NA	RP11-8L18.3	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	26291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	35668149	35668482	35668241	Y	CREM,CREM	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	134196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	35932153	35932694	35932189	Y	FZD8	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	398200	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	36823544	36823839	36823735	Y	NA	NAMPTL	NA	NA	NA	NA	NAMPTL	12382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	38325428	38325718	38325598	Y	ZNF25,ZNF37A	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	27850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	44046358	44046416	44046387	Y	NA	ZNF239	NA	NA	NA	NA	ZNF239	21650	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	44100382	44100859	44100681	Y	CSGALNACT2	ZNF239,CAP1P2,ZNF485,ZNF32	NA	NA	NA	NA	ZNF485	527	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	45445885	45445945	45445917	Y	RASSF4	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	RASSF4	6910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	45461973	45462312	45462295	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	RASSF4	9118	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	45464299	45464380	45464314	Y	ZNF22,C10orf25	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	7878	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	45731417	45731707	45731606	Y	C10orf10	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf25	237081	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	47057375	47057652	47057526	Y	NA	NA	GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL	IMR90	Hi-C	24141950	SYT15	87975	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-463P17.1	674126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	49564940	49565014	49564977	Y	NA	NA	ARHGAP22	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	52242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	51039519	51039692	51039605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGDHL	71094	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	51574472	51574922	51574693	Y	FAM21A,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2,NCOA4	NA	NA	NA	NA	NCOA4	11364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	144467	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	52217733	52218081	52217894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	164842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	52218433	52218553	52218454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	164370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	53406907	53407200	53407014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	50155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	54078280	54078480	54078433	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	NA	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DKK1	174501	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr10	60026015	60026385	60026202	Y	UBE2D1,IPMK	IPMK,CISD1	NA	NA	NA	NA	IPMK	321	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	60727421	60727594	60727472	Y	PHYHIPL,PHYHIPL,FAM13C,FAM13C	NA	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	206756	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	60949726	60949909	60949819	Y	NA	PHYHIPL	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	15376	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	61665210	61665415	61665365	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	796	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	63839926	63839992	63839961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	180867	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	64004719	64005076	64004899	Y	ARID5B	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	21390	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	64024468	64024613	64024559	Y	ARID5B	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	1853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	64291559	64291877	64291687	Y	ZNF365	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	159608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	64320064	64320236	64320175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	188113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	64420095	64420329	64420212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	142187	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	64468413	64468758	64468500	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	ZNF365	IMR90	Hi-C	24141950	ADO	93758	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	65097775	65098183	65098051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	86874	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	65274637	65275000	65274913	Y	NA	REEP3	JMJD1C,REEP3	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	4123	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	65388414	65388608	65388512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	109291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	65460115	65460254	65460185	Y	NA	NA	JMJD1C	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	180992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	65467084	65467405	65467282	Y	JMJD1C	NA	JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	187961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	68753444	68753641	68753546	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	69680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	68755189	68755293	68755241	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	71425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	68773371	68773438	68773405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	89607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	68802540	68803252	68802892	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	118776	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	68832259	68832513	68832425	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	148495	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	69523317	69523417	69523404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRT1	119010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRT1	118097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	SIRT1	33037	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr10	69658139	69658146	69658142	Y	HNRNPH3,SIRT1,SIRT1	SIRT1	HERC4	IMR90	Hi-C	24141950	SIRT1	15712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4,MYPN	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4,MYPN	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYPN	8635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr10	69856894	69857171	69856968	Y	NA	HERC4,MYPN	MYPN,HERC4,PBLD,HNRNPH3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYPN	6741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	69900271	69900394	69900274	Y	MYPN	MYPN	NA	NA	NA	NA	MYPN	36359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	MYPN	NA	NA	NA	NA	MYPN	49395	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr10	69947860	69948185	69948022	Y	RUFY2,RUFY2,MYPN	NA	NA	NA	NA	NA	MYPN	83948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	69962839	69962995	69962921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPN	98927	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	70815943	70816217	70816018	Y	DDX21,SRGN	SRGN	KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRGN	29645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	70817174	70817630	70817194	Y	NA	SRGN	KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRGN	28232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	70821151	70821852	70821361	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	SRGN	KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	24010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	70849672	70851282	70850023	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN,VPS26A	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	3810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	70976966	70977432	70977124	Y	DDX21,SRGN,VPS26A	SUPV3L1,HKDC1,RP11-227H15.4	NA	NA	NA	NA	HKDC1	627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	71109104	71109433	71109270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HK1	81364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	71198445	71198595	71198514	Y	NA	TSPAN15	HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSPAN15	10634	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	71662112	71662205	71662157	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	102468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	71693212	71693346	71693279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFY2	117206	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	73026177	73026397	73026262	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC29A3	50618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	73531831	73532355	73532130	Y	C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr10	73568339	73568950	73568859	Y	NA	C10orf54,PSAP	NA	NA	NA	NA	C10orf54	37084	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr10	73725868	73726411	73726297	Y	C10orf105,CHST3	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	3745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.05934425232951
chr10	74068319	74068595	74068530	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ASCC1,ANAPC16	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	36641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	74289425	74289733	74289722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	94166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	74327257	74327510	74327437	Y	DDIT4,DNAJB12	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	56389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	74877758	74878048	74877901	Y	NA	P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	NUDT13	9541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	75004761	75005017	75004932	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	1603	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	75022023	75022098	75022060	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-152N13.5	11474	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	75240023	75240096	75240089	Y	NA	RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-137L10.6	13187	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	75349200	75349597	75349539	Y	CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54	FAM149B1,PPP3CB,USP54,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	34114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	75654322	75654573	75654437	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	12362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	75658836	75659127	75658982	Y	NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	7808	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	135	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	75887856	75888019	75887938	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	AP3M1	20802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	75987927	75988078	75987990	Y	KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	78967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	77164585	77164731	77164659	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4921	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	77290134	77290404	77290261	Y	SAMD8	NA	C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf11	68594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	77300831	77301201	77300915	Y	NA	NA	KCNMA1,C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf11	57797	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	77803071	77803442	77803222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	444073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	77938797	77939052	77938925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	579799	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	78192206	78192310	78192258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	833208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	78790288	78790415	78790352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	605938	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	78954967	78955278	78955208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	441075	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	78974815	78975138	78974939	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	421215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	79051599	79051864	79051683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	344489	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	79123955	79124246	79124101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	272107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	79147874	79148082	79147903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	248271	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	79152642	79152983	79152827	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	243370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	79265772	79266169	79265902	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	130184	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	79274655	79274751	79274706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	121602	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	79291052	79291779	79291330	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	79291885	79292096	79291976	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104257	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr10	79346819	79347304	79347005	Y	KCNMA1	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	49049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	79383458	79383833	79383807	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	12520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	79389440	79389814	79389806	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	6539	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	141919	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1-AS1	91529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1-AS1	90709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1-AS1	87653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1-AS1,ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	80998898	81000011	80999247	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	105214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	81091409	81091966	81091732	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	13259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	81116031	81116092	81116064	Y	NA	PPIF	ZCCHC24	IMR90	Hi-C	24141950	PPIF	10806	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	81138677	81139093	81139046	Y	NA	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	33452	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	82169935	82170184	82170082	Y	NA	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	FAM213A	4350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	82211651	82212098	82211867	Y	SH2D4B	FAM213A	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	34918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	82260440	82261008	82260524	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	32690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	82288045	82288198	82288158	Y	TSPAN14,SH2D4B	RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	5500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	89500062	89500398	89500217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	75287	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	55559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	89735979	89736206	89736070	Y	PTEN	RP11-380G5.3	NA	NA	NA	NA	RP11-380G5.3	32720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	90689067	90689322	90689158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	51576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	90704546	90704848	90704768	Y	NA	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	43566	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	90968042	90968137	90968090	Y	LIPK	CH25H	NA	NA	NA	NA	CH25H	2971	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	91010610	91010883	91010698	Y	NA	CH25H,RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	30639	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	91020368	91020477	91020401	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	21045	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	91056885	91057091	91056998	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2,IFIT3	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT2	2621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	92676361	92676755	92676735	Y	NA	RPP30,ANKRD1	NA	NA	NA	NA	ANKRD1	2278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	92923893	92924265	92924064	Y	NA	NA	RPP30,NUDT9P1,PCGF5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	53643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr10	94459466	94459797	94459609	Y	HHEX	NA	NA	NA	NA	NA	KIF11	108423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	95136235	95136595	95136450	Y	MYOF	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-624L12.1	93920	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	95145053	95145431	95145242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOF	94643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	95197787	95197992	95197919	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42082	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr10	95222493	95222944	95222696	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	17130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.47121310279541
chr10	95766976	95767368	95767096	Y	NA	PLCE1	NA	NA	NA	NA	PLCE1	15230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	97311589	97311866	97311827	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	7305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	98464941	98465141	98465037	Y	LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1	PIK3AP1,RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	13130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	99334341	99334704	99334523	Y	NA	ANKRD2,HOGA1,PI4K2A	NA	NA	NA	NA	ANKRD2	4143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	99449337	99449738	99449607	Y	C10orf28,RRP12,PI4K2A	AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	AVPI1	4257	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	100020230	100020246	100020237	Y	NA	LOXL4	NA	NA	NA	NA	LOXL4	5761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	102251433	102251647	102251567	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	35182	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	102490692	102490976	102490862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM178A	179350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	102792815	102793017	102792917	Y	NA	C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3,KAZALD1	NA	NA	NA	NA	SFXN3	3824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	103600514	103600739	103600526	Y	NA	MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	23818	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	103662146	103662497	103662405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEA5	85450	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	103699141	103699397	103699242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	114553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	103807032	103807259	103807146	Y	NA	C10orf76,HPS6	NA	NA	NA	NA	C10orf76	6691	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	104364219	104364413	104364273	Y	NA	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	37840	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	104387544	104387817	104387672	Y	GBF1,CUEDC2,ACTR1A	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	14436	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	104388023	104388450	104388178	Y	NA	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	13803	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr10	104472705	104472855	104472743	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	104504643	104504897	104504711	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	32348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	104838794	104839158	104838851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	111898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	104892620	104892981	104892840	Y	C10orf32,NT5C2	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	58075	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	104903006	104903392	104903228	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	47664	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	104990991	104991184	104991120	Y	NA	NT5C2,INA	SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	39935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	105869782	105869970	105869884	Y	GSTO1,GSTO1,CCDC147,SLK,MEIR5,MEIR5	SFR1	NA	NA	NA	NA	SFR1	9846	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	106094943	106095283	106095247	Y	NA	ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	879	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	111981639	111982026	111981734	Y	ADD3,MXI1,MXI1	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	16276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	112113245	112113632	112113326	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	50536	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	112116359	112116685	112116467	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	53650	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr10	112117126	112117443	112117281	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	54417	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr10	112159079	112159451	112159258	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	96145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr10	112169656	112169922	112169805	Y	SMC3	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85674	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr10	112174147	112174523	112174256	Y	SMC3,DUSP5	NA	DUSP5,SMC3,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	81073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	112207134	112207519	112207380	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	48077	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	112259301	112259712	112259445	Y	MXI1,PDCD4,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	3705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	112263780	112264181	112263965	Y	SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	8184	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	112290201	112290297	112290249	Y	NA	DUSP5,SMC3	NA	NA	NA	NA	DUSP5	34605	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	112295745	112296221	112296000	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5,SMC3	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	29228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	NA	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	106809	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	113291830	113292231	113292158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP6	596839	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	114816164	114816362	114816263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	108155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	187173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	116392908	116393338	116393223	Y	ABLIM1	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	49424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	116394389	116394785	116394496	Y	ABLIM1	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	47977	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	118643126	118643297	118643273	Y	KIAA1598	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	35410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	118656077	118656284	118656258	Y	NA	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	48361	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	106893	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	118922718	118922822	118922754	Y	VAX1	KIAA1598	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	38621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	119294820	119294982	119294904	Y	EMX2	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	161842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	100289	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	110070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	121249100	121249168	121249139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	51052	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	121503034	121503182	121503110	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	BAG3	94152	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	76116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	123923874	123924133	123924069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	177185	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	124231405	124231614	124231490	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	12364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	35308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	124613518	124613778	124613722	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	23379	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	124636899	124637143	124637021	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	14	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	125204221	125204417	125204319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUB3	292428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr10	125792973	125793185	125793048	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	58021	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	126213697	126214091	126213879	Y	NA	RPS10P18	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	36550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	126386863	126386994	126386934	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	43844	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	126407586	126408269	126407949	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	22569	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	126712433	126712623	126712473	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	108721	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	126782105	126782284	126782195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	65455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	127432481	127432807	127432790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UROS	77010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	128947297	128947480	128947351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK1	355319	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	128995351	128995518	128995467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK1	403373	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr10	134208745	134209013	134208865	Y	NA	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	73	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	RP11-432J24.5,INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.5	1137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	135071993	135072118	135072056	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511	NA	NA	NA	NA	ADAM8	16254	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	135072735	135073128	135072895	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511	NA	NA	NA	NA	ADAM8	15244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	13224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr10	135092117	135092276	135092147	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	3745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	4064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	RP11-326C3.2	15402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	312288	312763	312359	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,ATHL1,IFITM2,IFITM1	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3	NA	NA	NA	NA	IFITM1	782	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	1147842	1148157	1148045	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	1423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	1331682	1331784	1331733	Y	NA	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	2798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	1543133	1543339	1543203	Y	NA	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	47811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	1870283	1870513	1870420	Y	CTSD,MOB2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP39	58500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	2705021	2705206	2705044	Y	NA	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	14018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	6217696	6217859	6217762	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	36082	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	7913705	7913868	7913824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLRP10	71105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	8632537	8632549	8632543	Y	ASCL3	STK33	NA	NA	NA	NA	STK33	18701	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	8988846	8989081	8988967	Y	ZNF143,DENND5A,TMEM9B,NRIP3	TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3,RP11-467K18.2	NA	NA	NA	NA	TMEM9B	4288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	9023312	9023663	9023569	Y	ZNF143,IPO7,DENND5A,TMEM9B,NRIP3	TMEM9B-AS1,TMEM9B,RP11-467K18.2	NA	NA	NA	NA	NRIP3	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	9060080	9060277	9060179	Y	NA	NRIP3,RP11-467K18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-467K18.2	36371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	9250767	9251109	9250945	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	33828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr11	9686542	9686911	9686729	Y	ZNF143,SWAP70	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	2918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	9786985	9787566	9787311	Y	NA	SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	9146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	10003812	10004242	10004040	Y	ADM	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	225973	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	10614045	10614168	10614107	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	MRVI1-AS1	53226	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	3074	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	12013824	12014110	12014066	Y	DKK3,DKK3,DKK3	DKK3	NA	NA	NA	NA	DKK3	15206	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	12133218	12133350	12133292	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	12181262	12181458	12181363	Y	MICALCL,MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67719	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr11	12199343	12199732	12199431	Y	NA	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	85800	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	12204138	12204505	12204342	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	90595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	12455335	12455581	12455453	Y	PARVA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	58603	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	190746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	SNORD14A,RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	17230717	17231092	17230803	Y	NA	PIK3C2A,NUCB2	NA	NA	NA	NA	NUCB2	3017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	12477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr11	18646989	18647318	18647154	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	7020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr11	19968611	19968779	19968666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	414452	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	23924626	23924923	23924775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	1074781	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	27023421	27023808	27023612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	359607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	27380505	27380624	27380565	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	2791	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	27683148	27683223	27683174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	27693843	27694020	27693988	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	47585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	27715832	27716154	27716086	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	25451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr11	27955713	27956134	27955920	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45133	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	28132530	28132826	28132694	Y	NA	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	4675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	28701449	28701661	28701530	Y	NA	RP11-115J23.1	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	20501	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	28778513	28778891	28778701	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	56351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	28779294	28779601	28779473	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	57132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	28792909	28793103	28792913	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	70747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	135691	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	29349456	29349731	29349594	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	627294	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	30144763	30144990	30144959	Y	MPPED2,C11orf46	NA	NA	NA	NA	NA	KCNA4	108193	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	31450770	31450827	31450799	Y	PAX6,PAX6,IMMP1L,ELP4,DNAJC24	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC24	61383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	32442373	32442742	32442611	Y	NA	WT1-AS,WT1	NA	NA	NA	NA	WT1-AS	12322	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	32913428	32913828	32913453	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	704	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	33074022	33074030	33074026	Y	NA	DEPDC7,TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	15059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	33146392	33146678	33146610	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	35239	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	33556123	33556337	33556230	Y	NA	NA	C11orf41	IMR90	Hi-C	24141950	CD59	199654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	33711808	33712191	33712002	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	43800	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	34183211	34183613	34183509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT10	58062	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	34331523	34331863	34331783	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	23687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	34368265	34368539	34368419	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NAT10,CAPRIN1	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	9016	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	34621875	34622041	34621973	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	EHF	18599	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	35827	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	EHF	66237	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	105728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52906	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	35165614	35166208	35165794	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	7197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	35358493	35359078	35358891	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	PAMR1	190770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	35643691	35643948	35643820	Y	NA	FJX1,TRIM44	NA	NA	NA	NA	FJX1	5956	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	35825533	35825614	35825574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	137917	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	35966511	35966551	35966528	Y	NA	LDLRAD3	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	2980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr11	36211739	36211961	36211850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	97038	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	36430795	36431099	36430893	Y	TRAF6,PRR5L,PRR5L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF6	98723	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	43779324	43779404	43779364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	120957	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	43955473	43955506	43955502	Y	NA	C11orf96	NA	NA	NA	NA	C11orf96	10581	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr11	46379063	46379180	46379102	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	21126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	47108178	47108230	47108204	Y	HARBI1	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	88446	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	47173206	47173550	47173416	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	23126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	47799022	47799247	47799135	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	12027	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	48028604	48028990	48028813	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	28491	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	48077375	48077584	48077563	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	77262	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	57224938	57225034	57225001	Y	SLC43A1,SLC43A1,SERPING1,PRG3	SLC43A3,RTN4RL2	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	988	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	AP000662.4,CLP1,YPEL4,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr11	59323878	59323962	59323920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBP	57655	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	59331910	59331948	59331929	Y	OR5AN1,OR4D6,OR4D11	OSBP	NA	NA	NA	NA	OSBP	49669	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	59539177	59539402	59539266	Y	NA	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	36943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	60877687	60877932	60877809	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	49157	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	61065380	61065516	61065448	Y	NA	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	4484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	61602064	61602538	61602257	Y	INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS1	7274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr11	61780516	61780626	61780618	Y	NA	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	61788241	61788385	61788315	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3,FADS2,RAB3IL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	55109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	62319122	62319673	62319430	Y	WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	AHNAK	IMR90	Hi-C	24141950	AHNAK	2034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr11	62321348	62321821	62321541	Y	NA	RP11-864I4.4,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	62587560	62587930	62587905	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	63377789	63377920	63377869	Y	PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	4435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	63496405	63496421	63496415	Y	NAA40	RTN3,C11orf95	NA	NA	NA	NA	C11orf95	37692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	63687620	63687907	63687858	Y	LGALS12,RCOR2	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	5304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	63777072	63777136	63777104	Y	NA	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	25747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr11	63954598	63954956	63954814	Y	FERMT3,CCDC88B,OTUB1	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4,RP11-783K16.14,VEGFB	NA	NA	NA	NA	STIP1	3854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	64455963	64456049	64456006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SF1	88209	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	64631898	64632818	64632128	Y	CDC42EP2,FAU,EHD1	EHD1,ATG2A	NA	NA	NA	NA	EHD1	20950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	64636604	64637051	64636910	Y	CDC42EP2,SF1,SF1,FAU,EHD1	EHD1,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	16717	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	64637838	64638320	64638071	Y	RASGRP2,SF1,SF1,EHD1,ATG2A	EHD1,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	15448	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.36824589017894
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr11	65261988	65262329	65262152	Y	FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	904	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	9.47298356071575
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr11	65656792	65657262	65656985	Y	NA	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	CCDC85B	917	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.88308195326132
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.91275407942607
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	6.38396718222149
chr11	65695608	65695878	65695746	Y	EHBP1L1,MAP3K11,RELA,DKFZp761E198	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	DRAP1	10880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	65739201	65739551	65739464	Y	NA	SART1,BANF1,EIF1AD	NA	NA	NA	NA	SART1	12041	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CATSPER1	8651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	65910089	65910568	65910423	Y	NA	NA	KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	74255	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	66494345	66494720	66494567	Y	NA	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	15202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	66801218	66801427	66801323	Y	SYT12,SYT12	RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	20862	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	67105994	67106296	67106145	Y	NA	SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	16147	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr11	67142500	67143040	67142970	Y	CDK2AP2,CLCF1,PPP1CA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	3445	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	67827034	67827402	67827396	Y	PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA	NDUFS8,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	TCIRG1	22551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	67955066	67955423	67955397	Y	TCIRG1,SUV420H1	SUV420H1	NA	NA	NA	NA	SUV420H1	23872	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	68387136	68387210	68387173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAL	62037	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	MYEOV,IFITM9P	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	1122	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	69069179	69069344	69069260	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	69069522	69069665	69069598	Y	TPCN2	MYEOV,IFITM9P	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	248	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	NA	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	166115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	69251942	69252241	69252024	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	182668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	70150439	70150493	70150466	Y	NA	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	35633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	70159213	70159451	70159301	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	44407	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr11	73221521	73221768	73221630	Y	PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	85466	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	73860209	73860535	73860372	Y	C2CD3	PPME1,C2CD3	NA	NA	NA	NA	PPME1	19609	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	74540659	74541010	74540832	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	82746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	74667774	74667939	74667906	Y	RNF169	XRRA1,SPCS2,NEU3	NA	NA	NA	NA	SPCS2	9482	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	75048473	75048863	75048534	Y	UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1	ARRB1	NA	NA	NA	NA	ARRB1	12010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	75482683	75483095	75482909	Y	UVRAG,DGAT2	DGAT2,UVRAG	NA	NA	NA	NA	DGAT2	14126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	231663	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	75781411	75781582	75781473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	257199	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	75794523	75794905	75794797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	270311	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	77156016	77156186	77156101	Y	PAK1	PAK1	NA	NA	NA	NA	PAK1	27494	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	78000759	78000964	78000861	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	102891	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	78002337	78002637	78002489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	104469	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	78036514	78036909	78036765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	90485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	82961020	82961401	82961211	Y	NA	RP11-727A23.1,CCDC90B	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	34049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	86222200	86222363	86222315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	159315	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	86399785	86399941	86399864	Y	NA	ME3	ME3,PRSS23	IMR90	Hi-C	24141950	ME3	18107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	86430919	86431170	86431045	Y	PRSS23	ME3	PRSS23,ME3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ME3	49241	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	86433528	86433764	86433646	Y	NA	NA	PRSS23,ME3	IMR90	Hi-C	24141950	ME3	51850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	86447030	86447398	86447213	Y	NA	NA	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	52703	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	48218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	27512	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	88069705	88069944	88069773	Y	CTSC	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	750	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr11	88087400	88087583	88087522	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	18445	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	91252482	91252645	91252564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	1238754	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	92603475	92603850	92603628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	325280	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	93248690	93248852	93248778	Y	SLC36A4,C11orf75	RP11-288E14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-288E14.2	17782	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	93868403	93868611	93868483	Y	FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	8309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	94317425	94317695	94317494	Y	PANX1,ANKRD49,FUT4	FUT4	NA	NA	NA	NA	FUT4	42408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	94978287	94978585	94978436	Y	NA	SESN3	SESN3	IMR90	Hi-C	24141950	SESN3	14582	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	94987550	94987767	94987639	Y	NA	SESN3	NA	NA	NA	NA	SESN3	23845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	95808686	95809082	95808927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	152207	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	96006843	96007267	96007082	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	67077	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	100747572	100748094	100747776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	191188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	101386837	101386845	101386841	Y	TRPC6	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1377	396901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr11	102175501	102175731	102175600	Y	BIRC2	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC3	10484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	102189237	102189699	102189428	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3022	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	103321873	103321933	103321886	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	43488	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	104838372	104838510	104838471	Y	CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4	CASP4	NA	NA	NA	NA	CASP4	209	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	105061488	105061502	105061495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	91330	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	105090888	105091203	105091058	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	120730	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr11	105513261	105513284	105513272	Y	GRIA4,GRIA4,KIAA1826	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	180076	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr11	105579191	105579256	105579211	Y	KBTBD3,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	114104	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	105590287	105590591	105590439	Y	GRIA4,GRIA4	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	102769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	105674568	105674985	105674652	Y	KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	RNU4-55P	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	18375	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	107727726	107727971	107727842	Y	NA	RP11-832N8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-832N8.1	49175	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	107986432	107986807	107986620	Y	NA	ACAT1	NA	NA	NA	NA	ACAT1	3436	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	108487361	108487672	108487557	Y	EXPH5	EXPH5,DDX10	NPAT,EXPH5,ATM	IMR90	Hi-C	24141950	EXPH5	24896	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	109957593	109958086	109957862	Y	FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	ZC3H12C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZC3H12C	4001	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	109958650	109959379	109958908	Y	NA	ZC3H12C	ZC3H12C	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H12C	2708	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr11	109965770	109966113	109965869	Y	RDX,FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	3683	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	109966397	109966711	109966537	Y	NA	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	4310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	109990513	109990553	109990536	Y	NA	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	28426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	110317898	110318249	110318012	Y	FDX1	FDX1	NA	NA	NA	NA	FDX1	19291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	111050113	111050490	111050428	Y	NA	NA	ARHGAP20,C11orf53	IMR90	Hi-C	24141950	MIR34B	331173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	111402540	111402739	111402658	Y	NA	MIR34B,LAYN	NA	NA	NA	NA	LAYN	6266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	111534401	111534774	111534406	Y	CRYAB	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK2	63286	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	111603895	111604265	111603971	Y	NA	PPP2R1B	NA	NA	NA	NA	PPP2R1B	30886	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	111824557	111824693	111824689	Y	NA	DIXDC1	NA	NA	NA	NA	DIXDC1	28689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	111849134	111849433	111849303	Y	SIK2,CRYAB,DIXDC1,DIXDC1	DLAT	NA	NA	NA	NA	DLAT	44105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	112028082	112028533	112028265	Y	IL18	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	4307	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	112031842	112032080	112031914	Y	IL18,BCO2	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	760	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	112397478	112397666	112397572	Y	IL18	NA	NCAM1,LOC100288346	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356J5.12	258006	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	113552333	113552865	113552581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZW10	89668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	114086670	114086890	114086745	Y	ZBTB16,ZBTB16	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	39619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	114288977	114289308	114289144	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	18800	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	115632209	115632334	115632272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	258534	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	116873672	116874047	116873840	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	30720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	117016262	117016599	117016456	Y	NA	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	3279	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	117853654	117853757	117853706	Y	NA	NA	IL10RA	K562	ChIA-PET	22265404	UBE4A	374543	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	118153348	118153551	118153451	Y	NA	NA	AMICA1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE4A	74749	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	118481750	118482023	118481896	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	6595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	118493849	118494041	118493911	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	18694	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr11	118787524	118788054	118787588	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6263	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	119124696	119124715	119124706	Y	NA	CBL	NA	NA	NA	NA	CBL	49944	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	120083069	120083545	120083438	Y	GRIK4,ARHGEF12,OAF	OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	3594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	120218040	120218378	120218085	Y	NA	TMEM136,ARHGEF12	NA	NA	NA	NA	ARHGEF12	12253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205128	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	122049218	122049681	122049522	Y	NA	MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR100	28202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	122568426	122568832	122568574	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	44043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	122584764	122585535	122585367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	60381	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	122586167	122586342	122586202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	61784	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	122614600	122615453	122614815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	90217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	122936469	122936659	122936561	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	4531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	122956299	122956503	122956402	Y	NA	SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	24361	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	122989373	122989577	122989478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	57435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	123013120	123013348	123013342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLMP	50641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	123172454	123172607	123172529	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	108465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	125670081	125670467	125670312	Y	CHEK1,PATE4,PATE1,PATE2	NA	NA	NA	NA	NA	HYLS1	81042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	6658	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	126209269	126209556	126209430	Y	NA	DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	13979	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	126515042	126515485	126515173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	291507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	126799997	126800007	126800001	Y	KIRREL3	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL3	71348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	127391525	127391650	127391576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL3	520170	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	128078462	128078679	128078487	Y	NA	NA	FLI1,ETS1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	376774	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	128323342	128323695	128323510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	131758	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	128335578	128335794	128335665	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	119659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	128339730	128340284	128340256	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	115169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	128352415	128352744	128352497	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	102709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	128363188	128363283	128363236	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	92170	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	128366966	128367159	128367092	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	88294	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr11	128377315	128377487	128377422	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	77966	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	128385518	128386026	128385881	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	69427	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	128584156	128584534	128584279	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	29726	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLI1	373163	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	133825450	133825979	133825755	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	570	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	133920876	133920983	133920947	Y	B3GAT1,SPATA19,JAM3	JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	15837	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	GLB1L2	508318	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	690377	690646	690594	Y	NA	RP11-218M22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	47411	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	1024438	1024795	1024721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	72424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	1157508	1157869	1157627	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	59833	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	1387073	1387485	1387229	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	249572	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	1583254	1583583	1583419	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	53474	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	1642572	1643085	1642916	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	5515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	6195	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	1654960	1654973	1654966	Y	NA	WNT5B,FBXL14	NA	NA	NA	NA	WNT5B	17903	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	1699844	1700200	1699934	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	1131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	1769649	1770205	1769686	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	25535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	2467815	2468125	2467879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	356114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	2902210	2902546	2902293	Y	NA	FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6	NA	NA	NA	NA	FKBP4	91	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	3313495	3313728	3313584	Y	NRIP2	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	5368	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	3450642	3450947	3450795	Y	NA	NA	PRMT8,EFCAB4B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-543P15.1	131546	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	5589537	5589706	5589616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTF3	50259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	5915509	5915755	5915702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	137643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	4.83945899297435
chr12	5918139	5918518	5918331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	134880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	6183650	6183782	6183713	Y	VWF	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	123099	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	6276820	6277298	6277162	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	29583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	6311406	6311775	6311432	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	4525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	61127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	59752	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	45224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	44613	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	6663248	6663743	6663420	Y	GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1	SCARNA10,GAPDH,NOP2	NA	NA	NA	NA	NOP2	12114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr12	7058563	7058923	7058712	Y	PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7584	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	NA	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	59553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2,C3AR1	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	9271887	9272280	9271908	Y	NA	NA	PZP	IMR90	Hi-C	24141950	PTMAP4	118647	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	CLEC2B	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	33813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	10272963	10273373	10273241	Y	NA	OLR1	NA	NA	NA	NA	OLR1	49364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	8240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	11043114	11043456	11043318	Y	TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13	NA	NA	NA	NA	NA	STYK1	218197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	11962012	11962232	11962094	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	161224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	11987514	11987811	11987531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186726	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	11989252	11989963	11989497	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	188464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	12038206	12038369	12038301	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	223728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	150199	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	12352896	12352921	12352909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP6	65025	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	12646905	12646967	12646936	Y	LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	66350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	6478	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	12883612	12883681	12883638	Y	APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	17620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	12911881	12912260	12911941	Y	NA	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	45889	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	12991466	12991515	12991491	Y	NA	DDX47,RPL13AP20	NA	NA	NA	NA	DDX47	27216	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.50088522896017
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	13050548	13050563	13050554	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	8832	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	13056884	13057235	13057060	Y	GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	MIR614	9528	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	MIR614	8304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	13292095	13292429	13292230	Y	NA	NA	EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	55221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	13332644	13332915	13332868	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	14735	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	13357534	13357828	13357577	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	9884	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	13359236	13359687	13359415	Y	EMP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	11586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28488	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	13403402	13403764	13403583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP1	55752	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	14987002	14987060	14987033	Y	NA	WBP11,C12orf60,MGP	NA	NA	NA	NA	C12orf60	32496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	15916950	15917280	15917185	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	115983	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	18511225	18511610	18511392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	769038	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	20780077	20780376	20780084	Y	LST-3TM12,PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-405A12.1	687622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	20950319	20950359	20950339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	638190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	20959036	20959191	20959158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	629358	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	6.48693439483796
chr12	21039353	21039668	21039511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	548881	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	21059259	21059529	21059394	Y	SLCO1B3,LST-3TM12,SLCO1B1,SLCO1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	529020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B,C12orf39	NA	NA	NA	NA	C12orf39	10863	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	22428776	22428931	22428867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA1	159044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	39718	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	24792708	24792841	24792775	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	79184	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	24952536	24952732	24952634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	147661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	24959393	24959656	24959538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	140737	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	24990714	24991079	24990897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	109314	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	24993015	24993329	24993020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	107064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	25062577	25063016	25062829	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	37377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.88308195326132
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	26142824	26143171	26142998	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	32126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	26427494	26428032	26427844	Y	NA	RP11-283G6.5	SSPN,BHLHE41,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.5	42621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	27513734	27513812	27513790	Y	NA	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	29947	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	27532512	27532752	27532665	Y	C12orf71	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	48725	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	27678444	27678624	27678473	Y	PPFIBP1	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	4080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	28127967	28128359	28128243	Y	PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	155823	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	28275745	28275985	28275876	Y	NA	CCDC91	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	8197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	28433746	28433796	28433771	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	36600	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	31602301	31602617	31602553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM60A	124309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	31671759	31672031	31671827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5B-AS1	68826	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	31754010	31754391	31754188	Y	DENND5B,METTL20	DENND5B-AS1,DENND5B,METTL20	DENND5B	IMR90	Hi-C	24141950	DENND5B	11979	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr12	31899631	31900083	31899901	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	METTL20,AMN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMN1	19523	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	32204633	32204870	32204740	Y	METTL20,AMN1,H3F3C	NA	METTL20,BICD1,AMN1	IMR90	Hi-C	24141950	BICD1	52899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	32559552	32559716	32559634	Y	BICD1	NA	BICD1,FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	270418	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	32842101	32842415	32842258	Y	NA	DNM1L,RP11-278C7.1	NA	NA	NA	NA	DNM1L	11967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	34500403	34500725	34500579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	99987	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	39094852	39095225	39095039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	204007	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	40250890	40251201	40251046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	209191	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	45627812	45628672	45628351	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	19988	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	46571353	46571525	46571439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	90275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	46848355	46848425	46848370	Y	NA	NA	SLC38A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-96H19.1	72893	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	46867492	46867759	46867536	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	92030	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.75044261448009
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr12	46949913	46950236	46950181	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	174451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	47066053	47066292	47066182	Y	SLC38A2	NA	SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	290591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	47786916	47787157	47787032	Y	NA	NA	AMIGO2,RPAP3	IMR90	Hi-C	24141950	RPAP3	310687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	49449678	49450138	49449974	Y	CCDC65,DHH	PRKAG1,RHEBL1	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	11670	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	49452736	49452852	49452791	Y	NA	PRKAG1,RHEBL1,LMBR1L	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	8956	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	59919	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	50019907	50020190	50020017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	59906	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	51782774	51782945	51782860	Y	SLC11A2,SLC11A2	SLC4A8,GALNT6	NA	NA	NA	NA	SLC4A8	156	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	51986166	51986575	51986504	Y	NA	SCN8A	NA	NA	NA	NA	SCN8A	4116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr12	52438699	52439014	52438738	Y	ACVR1B,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	22016	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	52525424	52525587	52525584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	58197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr12	52540237	52540565	52540533	Y	NA	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	43219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	9.2670491354828
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.98604916587779
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr12	52575658	52575765	52575707	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	8019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8237	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT18	75137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	67222	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	53892109	53892322	53892185	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	262	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7	62561	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	54017367	54017528	54017445	Y	NA	ATF7,RP11-972K6.1	NA	NA	NA	NA	ATF7	671	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC11,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	RP11-834C11.4,SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	58595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	NA	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264891	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	56690284	56690436	56690361	Y	NA	ANKRD52,COQ10A,RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,IL23A	NA	NA	NA	NA	RP11-977G19.11	1490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	56831514	56831759	56831654	Y	IKZF4	TIMELESS,SPRYD4,GLS2	NA	NA	NA	NA	TIMELESS	9428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	56877461	56877501	56877482	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	2697	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	6.89880324530387
chr12	57458942	57459239	57459094	Y	NA	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	20607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	57462088	57462242	57462164	Y	R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	17604	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	57672745	57672985	57672868	Y	NA	NDUFA4L2,STAC3	NA	NA	NA	NA	STAC3	29769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	58923778	58923975	58923913	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	388328	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	59435116	59435480	59435298	Y	NA	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150C16.1	122696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	62605397	62605543	62605465	Y	C12orf61	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	46576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	62727827	62728150	62727887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	56896	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	63025271	63025629	63025492	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	29805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	56366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	63094069	63094114	63094085	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	98603	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	63115696	63115706	63115701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	120230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	129508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	63294376	63294638	63294612	Y	NA	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	32179	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	64310301	64310738	64310490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	74228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	64349679	64350074	64349795	Y	TBK1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	113606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	64386107	64386411	64386216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	150034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	64575299	64575468	64575384	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	38608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	65012959	65013250	65013088	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	10666	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	66089335	66089636	66089544	Y	IRAK3	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	94686	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	66136008	66136292	66136116	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	79619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	66242690	66243107	66242729	Y	HMGA2	HMGA2	NA	NA	NA	NA	HMGA2	26779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	66286698	66286979	66286899	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53280	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	68221654	68222227	68222103	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	DYRK2	181536	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	68314351	68314796	68314502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK2	274233	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr12	69122207	69122406	69122269	Y	NA	RPL7P42,NUP107,SLC35E3	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	15480	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	69220588	69221011	69220784	Y	NA	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20632	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	69291565	69291701	69291633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	71649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	69305634	69305702	69305668	Y	RAP1B,LYZ,CPM,CPM	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	57648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	69312043	69312322	69312251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	51028	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	69446892	69447106	69446965	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM,MDM2	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	83542	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6,RP11-1143G9.2	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	70156698	70156941	70156820	Y	NA	RAB3IP	NA	NA	NA	NA	RAB3IP	26237	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	70633612	70633702	70633681	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	1072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	71055637	71055848	71055742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	195777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	71085208	71085379	71085280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	225348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	72767670	72768001	72767685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE	288624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	74668744	74669132	74668938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	260419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	75571924	75571966	75571945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPS2	210742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	75877380	75877665	75877492	Y	GLIPR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	4920	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	76115407	76115603	76115505	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	211991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	76206207	76206725	76206399	Y	GLIPR1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	218987	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	76347823	76348161	76347983	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	77551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	76373014	76373318	76373236	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	52394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	76405800	76405899	76405843	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	19813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	76429051	76429248	76429150	Y	NA	PHLDA1,NAP1L1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	3339	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	76552427	76552994	76552692	Y	PHLDA1,OSBPL8	NA	NAP1L1,PHLDA1,OSBPL8,BBS10	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L1	75614	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr12	77771188	77771377	77771281	Y	CSRP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-34H18.1	54767	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	79444921	79445122	79445022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	189148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	79526323	79526826	79526502	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	270550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	79566745	79567141	79566931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	310972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	135216	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	79804284	79804517	79804401	Y	PAWR	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	90659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	79817704	79817772	79817737	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	77404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	79848111	79848561	79848284	Y	NA	RP1-78O14.1	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	46615	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	80133375	80133617	80133496	Y	NA	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	50498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	80974115	80974384	80974233	Y	MYF5	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRQ	176341	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr12	81096686	81096945	81096788	Y	MYF5	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	232649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	83269676	83269939	83269806	Y	TMTC2	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	191017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	SLC6A15	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	39492	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	88703962	88704349	88704186	Y	NA	NA	KITLG	IMR90	Hi-C	24141950	TMTC3	169889	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	89845741	89845891	89845816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	71910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	89960420	89960675	89960548	Y	NA	POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4	LOC338758	MCF7	ChIA-PET	22265404	GALNT4,POC1B-GALNT4	42381	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	90065963	90066366	90066126	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	34711	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr12	90125293	90125953	90125608	Y	DUSP6,ATP2B1	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	24216	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	90150470	90150910	90150738	Y	NA	ATP2B1	LOC338758	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2B1	49393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	90251511	90251925	90251741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	150434	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	90353904	90354400	90354158	Y	ATP2B1	NA	ATP2B1,LOC338758,C12orf37	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	252827	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	91972476	91973067	91972734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCN	397576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	92189163	92189178	92189169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	345512	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	92424488	92424877	92424862	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	109813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	92474192	92474586	92474423	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	60104	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	92484962	92485088	92485023	Y	BTG1	C12orf79	NA	NA	NA	NA	C12orf79	49602	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	92500767	92501208	92501155	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	33482	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	92501411	92501848	92501769	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	32842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	92505299	92505700	92505686	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	28990	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr12	92528487	92528918	92528861	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	5772	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	93827795	93828172	93827984	Y	NA	UBE2N,MRPL42	NA	NA	NA	NA	UBE2N	5866	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	94539021	94539385	94539203	Y	NA	PLXNC1	PLXNC1,CCDC41	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNC1	1114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNC1	137747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr12	95012768	95013068	95012914	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	29270	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	95037595	95038737	95038539	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	3601	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	95492031	95492186	95492111	Y	NA	NR2C1	NA	NA	NA	NA	NR2C1	26552	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	95594660	95595399	95595279	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	13859	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	95597894	95598075	95597980	Y	NA	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	11183	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	95609786	95609977	95609896	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	VEZT	264	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	96027120	96027372	96027186	Y	LTA4H	NA	NTN4	IMR90	Hi-C	24141950	USP44	83854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	96031341	96031520	96031430	Y	NTN4	NA	NA	NA	NA	NA	USP44	88075	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	96502190	96502534	96502487	Y	NA	NA	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	LTA4H	66892	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	96592675	96593197	96592888	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	6515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	96630162	96630464	96630228	Y	CDK17	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	44002	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	96685157	96685428	96685293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	98997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	96819131	96819446	96819342	Y	NA	CDK17	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	96839212	96840356	96839676	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	19948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	96842223	96842407	96842329	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	22959	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	99235060	99235389	99235225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	198141	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	101099927	101100118	101100023	Y	NA	NA	SLC17A8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-575G13.2	129405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	102186333	102186570	102186556	Y	NA	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	36146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	104225376	104225573	104225475	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	7402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	104671230	104671489	104671317	Y	TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	1011	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	105032549	105032903	105032843	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	185476	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	105064571	105065844	105065441	Y	EID3,CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	217498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	105711063	105711549	105711425	Y	C12orf75	RP11-474B16.1	C12orf75,APPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-474B16.1	7246	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	106640032	106640193	106640140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	53514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	109023569	109024011	109023688	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	69211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	109088465	109088864	109088838	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	34508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	109120887	109121218	109121134	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	2154	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	110567516	110567657	110567554	Y	NA	IFT81	NA	NA	NA	NA	IFT81	7376	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	110707461	110707714	110707625	Y	NA	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	8847	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	111053049	111053390	111053220	Y	NA	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	TCTN1	3217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	111095518	111095878	111095698	Y	PPTC7,HVCN1,HVCN1	TCTN1	NA	NA	NA	NA	TCTN1	45686	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	111875686	111876044	111875771	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	33934	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	112363158	112363241	112363200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	85376	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	112464061	112464211	112464136	Y	NA	TMEM116,ERP29	NA	NA	NA	NA	ERP29	14941	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	112920682	112921011	112920993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	66040	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	113417200	113417385	113417312	Y	OAS1,OAS3,SLC24A6,SDSL,OAS2	OAS3,OAS2	NA	NA	NA	NA	OAS2	3000	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	113741046	113741165	113741159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLBD2	53206	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	114200256	114200532	114200390	Y	NA	RP11-438N16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-438N16.1	8956	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	116111611	116111662	116111637	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	601481	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	350534	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	117100450	117100717	117100699	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf49	73158	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	117277511	117277610	117277564	Y	NOS1,RNFT2,HRK	HRK	NA	NA	NA	NA	HRK	39636	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	118497379	118497776	118497426	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	WSB2	459	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	118744725	118745093	118744968	Y	TAOK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P5	62848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	118745418	118745709	118745623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAOK3	63041	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	118815733	118815925	118815736	Y	TAOK3	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	SUDS3	3548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA38	308626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	120453080	120453507	120453184	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	99799	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	120700086	120700381	120700233	Y	RAB35,PXN,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2	NA	NA	NA	NA	PXN	1193	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	121888305	121888670	121888535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF34	52461	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	122086492	122086728	122086610	Y	KDM2B,SETD1B,ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	MORN3	21809	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	122225058	122225273	122225168	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14036	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	122227826	122228273	122227974	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11036	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	4.73649178035788
chr12	123367402	123367963	123367875	Y	VPS37B	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	11028	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	123377732	123378127	123378026	Y	NA	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	124108091	124108301	124108196	Y	NA	TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2	NA	NA	NA	NA	EIF2B1	8012	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	124716985	124717336	124717220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	261197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	124717911	124718282	124718055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	262123	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	124721310	124721532	124721425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	265522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	124811433	124811602	124811518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	238533	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	226810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	124875337	124875736	124875419	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	174399	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	124926088	124926324	124926239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	124937911	124938596	124938282	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	111539	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	RP11-575F12.2,AC079949.1	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.2	18217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr12	132647278	132647407	132647355	Y	SFSWAP,ULK1,FBRSL1	DDX51,NOC4L	NA	NA	NA	NA	NOC4L	20285	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr12	133688468	133688629	133688567	Y	NA	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	16430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	20692936	20693199	20693068	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39989	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr13	20694627	20695029	20694906	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	38159	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	31088	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr13	21241518	21241702	21241584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT88	102933	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	21398890	21399124	21398998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	52793	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	21400254	21400509	21400379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	54157	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	21571909	21572149	21572029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LATS2	61537	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	21632492	21632727	21632640	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	959	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	21748962	21749145	21749040	Y	NA	SAP18,SKA3,MRP63	NA	NA	NA	NA	MRP63	178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	SPATA13	145059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	25856268	25856641	25856378	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	MTMR6	3506	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	25886402	25886789	25886419	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	12740	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	28005406	28005795	28005597	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	8725	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	30808946	30809107	30809021	Y	KATNAL1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	59177	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	31308709	31309017	31308774	Y	USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP	ALOX5AP	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	1064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	31314202	31314673	31314362	Y	USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP	ALOX5AP	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	6557	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	175921	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	31583300	31583599	31583486	Y	NA	NA	USPL1,C13orf33,TEX26-AS1,KATNAL1,TEX26,ALOX5AP	IMR90	Hi-C	24141950	HSPH1	150926	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	32956405	32956487	32956432	Y	NA	N4BP2L1	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	43828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	33051019	33051050	33051035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	50704	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	33698210	33698586	33698501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KL	110003	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	33728009	33728149	33728045	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	KL	139802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	33744347	33744745	33744546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KL	156140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	33822427	33822802	33822649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	99965	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	34781635	34781805	34781767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	391449	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	36630888	36631287	36631099	Y	DCLK1	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK1	72156	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	37662865	37663076	37662972	Y	FAM48A	NA	NA	NA	NA	NA	ALG5	90467	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	37881013	37881265	37881086	Y	POSTN	NA	LINC00547	IMR90	Hi-C	24141950	POSTN	289716	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	40057425	40057642	40057534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFP	118023	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	40139698	40140018	40139948	Y	NA	LHFP	NA	NA	NA	NA	LHFP	35647	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	40272314	40272449	40272352	Y	NA	COG6	NA	NA	NA	NA	COG6	44550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	41554566	41554842	41554704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	60656	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	41591294	41591779	41591504	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	41631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	92924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	43463998	43464341	43464228	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	100066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	43727960	43728297	43728107	Y	NA	NA	ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1	IMR90	Hi-C	24141950	EPSTI1	163553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	44811516	44811943	44811701	Y	NA	NA	TSC22D1,SERP2,NUFIP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERP2	133858	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	44838473	44838853	44838527	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	106948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	44842198	44842383	44842274	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	103418	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	44866763	44867044	44866942	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	NUFIP1,TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	78757	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	44875300	44875802	44875641	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	69999	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	64710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.64747540186361
chr13	45288309	45288506	45288432	Y	KCTD4	NA	NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	139026	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	45333095	45333256	45333140	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	183812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	45629728	45629998	45629866	Y	KCTD4	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	62652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	45752820	45753055	45752934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	60170	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	45774024	45774110	45774098	Y	KCTD4	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	81374	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	45783444	45783799	45783571	Y	TPT1,COG3	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	90794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	45813210	45813281	45813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1-AS1	100199	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	46650572	46650970	46650771	Y	NA	ZC3H13	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	25678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	47234173	47234447	47234310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCH1	108870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	48073971	48074167	48074083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P3	261428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	49888133	49888426	49888280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	68086	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	46274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	50555707	50555861	50555784	Y	NA	SPRYD7,TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	12163	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	50696626	50696754	50696746	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU2	1102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	50705225	50705612	50705497	Y	NA	DLEU2	DLEU7,DLEU1,DLEU2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLEU2	7369	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	51176389	51176436	51176413	Y	NA	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	242490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	51288107	51288409	51288197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B	193405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	52922324	52922434	52922379	Y	THSD1	NA	THSD1	IMR90	Hi-C	24141950	THSD1	56195	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	60570337	60570455	60570340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	165666	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	60580804	60581154	60581101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	154967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	60635732	60636010	60635830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	100111	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	61193005	61193146	61193084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	224414	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	61754011	61754066	61754041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH20	246154	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH20	2623531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	67168022	67168413	67168283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	634055	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	67674730	67675228	67675034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	127240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	73486233	73486587	73486410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIS3	131999	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	74377303	74377556	74377430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	328838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	74550144	74550303	74550225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	156091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	75800411	75800558	75800473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	253692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	75904010	75904233	75904150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	150017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	75933518	75933672	75933595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	120578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	75939887	75940324	75940051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	113926	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	76138851	76139260	76139031	Y	NA	COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	UCHL3	17232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	80658121	80658499	80658313	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	254587	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	80916799	80917232	80917156	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3713	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	90486324	90486483	90486404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1511591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	93880621	93881133	93881009	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	3526	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	93915220	93915506	93915338	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	38125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	93947360	93947697	93947394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC6	70265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	94472931	94472950	94472936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	453718	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	94762314	94762622	94762468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	483889	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	94976563	94976881	94976571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	269630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	95951518	95951672	95951596	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	15	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	97879082	97879401	97879140	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	7394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	97890366	97890711	97890515	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	18678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	99121203	99121258	99121231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	106936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	99130571	99130717	99130631	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	97477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	99161455	99162128	99161863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	66066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	99562711	99562955	99562841	Y	GPR183,STK24	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A1	159803	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	99655287	99655290	99655289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	81589	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	99922932	99923366	99923036	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	56920	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	99933141	99933542	99933359	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	67129	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	99934888	99935365	99935021	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	68876	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	100010340	100010660	100010510	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	141011	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	100026921	100028247	100027781	Y	UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	123424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	100620497	100620786	100620718	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5	NA	NA	NA	NA	ZIC5	1377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	100630794	100630989	100630800	Y	NA	ZIC5	NA	NA	NA	NA	ZIC5	8631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	106803810	106804031	106803901	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	222880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	107070030	107070366	107070265	Y	NA	LINC00460	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	43119	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	107160222	107160504	107160362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	58008	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	107173594	107173915	107173796	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	44597	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	107188808	107188962	107188940	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	29550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	108103235	108103615	108103559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	413468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	108310994	108311341	108311278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	205742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	108503880	108504176	108504028	Y	FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	12907	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	108520131	108520835	108520801	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF13B	666456	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	109806235	109806377	109806339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	599238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	4.11868850465902
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	597640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	596578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	495801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	483404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr13	109958834	109959211	109959023	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	446404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	110664530	110664847	110664695	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	227615	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr13	110780432	110780795	110780703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	175364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	110785109	110785340	110785201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	170819	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	111064452	111064750	111064655	Y	RAB20	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	106956	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	111526935	111527249	111527195	Y	RAB20	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	LINC00346	6773	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	111564894	111565358	111565241	Y	RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	58	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr13	111607450	111607830	111607755	Y	RAB20,ING1,ING1,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	42034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	53642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr13	113982391	113982456	113982424	Y	NA	LAMP1,GRTP1	NA	NA	NA	NA	LAMP1	32835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	114557275	114557469	114557370	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	7577	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr13	114876029	114876284	114876205	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	19802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr13	114894223	114894969	114894576	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	1117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr13	115078776	115079079	115078928	Y	NA	UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	CHAMP1	788	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr14	21288613	21288985	21288797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANG	138277	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr14	21564675	21565076	21564876	Y	NA	ARHGEF40,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	5805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr14	23083172	23083436	23083304	Y	NA	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	ABHD4	18026	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	LRP10	19383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	23367708	23367835	23367778	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	RBM23	18558	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	23584186	23584501	23584299	Y	C14orf119	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	ACIN1	21363	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	25131991	25132384	25132236	Y	LTB4R,CTSG	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	221880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	25464405	25464804	25464526	Y	CMA1,CTSG,GZMB,STXBP6	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP6	52699	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	27311220	27311475	27311345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	246260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr14	27595143	27595156	27595150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	530183	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	28591045	28591340	28591192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3006G17.2	278553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	31055388	31055443	31055417	Y	NA	G2E3,SCFD1	NA	NA	NA	NA	G2E3	29059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	31165114	31165442	31165278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD1	75796	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COCH	58389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	31559968	31560471	31560185	Y	SCFD1,GPR33,STRN3	NA	NA	NA	NA	NA	STRN3	66361	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr14	32979007	32979394	32979291	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	27001	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	33366513	33366604	33366563	Y	NA	NPAS3	AKAP6	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS3	35535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	34033986	34034251	34034169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	631847	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr14	34162040	34162301	34162172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	759901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	RPS19P3,SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35120187	35120582	35120411	Y	SNX6,SNX6	SNX6	SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C	IMR90	Hi-C	24141950	SNX6	22798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	35325148	35325514	35325424	Y	PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	16035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	35346506	35346753	35346630	Y	PSMA6,EAPP,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	BAZ1A	3653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35353391	35353625	35353508	Y	NA	RP11-73E17.2,BAZ1A	BAZ1A,SRP54,SNX6,CFL2,IGBP1P1,FAM177A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BAZ1A	10538	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35575000	35575033	35575017	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	PPP2R3C	14690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35625298	35625573	35625393	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	35543	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35754543	35755119	35754804	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	8704	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35834310	35835208	35834855	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	21067	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35835253	35835895	35835561	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	20380	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	36277376	36277519	36277444	Y	NFKBIA,RALGAPA1	RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	866	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	39892906	39893200	39893154	Y	FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	6504	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	39900071	39900466	39900211	Y	PNN,CTAGE5,FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	39954969	39955272	39955039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	55265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	40868175	40868547	40868288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	968471	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN5	975530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	LRFN5	NA	NA	NA	NA	LRFN5	365	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	42158111	42158422	42158211	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN5	83338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	45160440	45160781	45160566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	203717	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	45260875	45260890	45260883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	103608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	45723245	45723364	45723320	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	2502	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	48030000	48030393	48030347	Y	MDGA2,MDGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	361693	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	48184413	48184780	48184597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	516106	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	50213261	50213687	50213459	Y	NA	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	18639	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	81921	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	50531720	50532221	50531875	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	164055	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	50681069	50681448	50681362	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	14828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	50988191	50988449	50988343	Y	NA	ATL1,MAP4K5	NA	NA	NA	NA	ATL1	8778	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	51862095	51862490	51862300	Y	FRMD6,FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	3789	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	52006399	52006758	52006578	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	52581	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	52076708	52076858	52076794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	122890	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	52104818	52105424	52105148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	151000	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr14	52145900	52146294	52146052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	144619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	127064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr14	52372298	52373220	52372436	Y	PTGER2,GNG2	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	80973	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	52547300	52547782	52547649	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	13588	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	88894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	53209302	53209454	53209392	Y	NA	ERO1L,PSMC6,STYX,GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	STYX	14404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	53399403	53399746	53399574	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	17407	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	53575786	53575939	53575850	Y	DDHD1	DDHD1	NA	NA	NA	NA	DDHD1	42061	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	55035984	55036343	55036300	Y	SAMD4A	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	4169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	55104908	55105113	55104939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	73093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	55120784	55121076	55120951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	88969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr14	55173516	55173842	55173679	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	141701	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	55544097	55544118	55544108	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27748	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	55841053	55841315	55841186	Y	MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,ATG14	ATG14	NA	NA	NA	NA	ATG14	35261	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	59002332	59002438	59002384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM9	110000	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	GPR135,JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	60330001	60330562	60330397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS7	304012	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	60618583	60618767	60618659	Y	PPM1A,C14orf135,DHRS7	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	15807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	61570265	61570959	61570637	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCH	81318	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	61571196	61571403	61571326	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCH	80874	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	61654939	61655124	61655060	Y	NA	PRKCH	SLC38A6,SIX4,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	2662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	61911036	61911322	61911077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	248909	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	190118	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	62454456	62454478	62454466	Y	SYT16	NA	SYT16	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	157369	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	64109095	64109326	64109156	Y	SYNE2,WDR89,WDR89	HSPE1P2,WDR89	NA	NA	NA	NA	WDR89	2516	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	64342094	64342269	64342170	Y	NA	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	24411	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB25,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	64975156	64975343	64975202	Y	NA	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	5225	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	65006188	65006351	65006244	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	PPP1R36	8269	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	65905118	65905243	65905181	Y	NA	FUT8	NA	NA	NA	NA	FUT8	29808	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	67562927	67563276	67562937	Y	TMEM229B,PLEKHH1	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	142550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	68555311	68555805	68555391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	270815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	68555905	68556402	68556038	Y	PIGH	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	271409	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	68571232	68571846	68571404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	286736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	68613334	68613955	68613742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	272958	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	68644384	68644906	68644390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	242007	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	68712620	68712855	68712738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	174058	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	68873274	68873547	68873349	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	13366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	68928051	68928068	68928059	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	41138	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69013502	69013901	69013730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	126589	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69162018	69162337	69162187	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	11736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69235165	69235315	69235240	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	25875	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69246726	69246992	69246942	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	14198	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69248827	69249033	69248912	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	12157	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69252204	69252483	69252314	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	8707	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69301401	69301774	69301727	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	40211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69377319	69377610	69377464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	66547	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69399139	69399257	69399202	Y	ZFP36L1	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	44900	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69402735	69403079	69402843	Y	GALNTL1	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	41078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	69913588	69913836	69913761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERH	50244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	70700911	70701061	70700986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX16	123387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	71955425	71955735	71955597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	168894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	73595262	73595380	73595321	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	5746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	73826978	73827275	73827127	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf43	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	99854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	74140666	74140779	74140723	Y	FAM161B	RP3-414A15.10,DNAL1,PNMA1	NA	NA	NA	NA	DNAL1	31088	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	74220862	74221204	74221002	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	2246	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	1532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	75086409	75086922	75086553	Y	PGF	NA	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FCF1	90925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	75118827	75119088	75118958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCF1	58759	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	75492523	75492557	75492545	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	23678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	75592667	75593037	75593004	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	NEK9	620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	75649674	75650038	75649826	Y	FOS	TMED10	TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMED10	8340	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	76564687	76564726	76564707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT43	198208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr14	77384574	77384777	77384608	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33481	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	77386302	77386621	77386483	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35209	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr14	77577466	77577695	77577651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	84432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	78031949	78032369	78032266	Y	SNW1,SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	48747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	78144886	78145071	78144891	Y	NA	ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	27292	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	78194844	78195080	78194962	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	22430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	81036045	81036252	81036151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	183945	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	81503760	81504107	81503844	Y	TSHR	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	79899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.67714752802837
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-299L17.1	69550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	84176891	84176909	84176900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-406A9.2	1069927	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	85881762	85881957	85881956	Y	FLRT2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2341M24.1	517097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	88461350	88461753	88461554	Y	GALC,GALC,GPR65	GALC,GPR65	NA	NA	NA	NA	GALC	3341	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	89739645	89739700	89739695	Y	NA	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	16238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	125810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	89953485	89953641	89953575	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	129852	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	90760704	90760984	90760838	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	39865	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	90875651	90876041	90875751	Y	NA	RPL21P11,CALM1	NA	NA	NA	NA	CALM1	14805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	91102939	91103218	91103079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	177605	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	101280	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	91406372	91406636	91406631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	113900	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	91528012	91528136	91528074	Y	SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	3032	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	91583338	91583593	91583462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	58358	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	91694873	91695058	91694948	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	169893	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	93569992	93570233	93570210	Y	KIAA1409,C14orf109,C14orf109	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	10432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	94441180	94441443	94441314	Y	SERPINA1,ASB2,ASB2	OTUB2	NA	NA	NA	NA	OTUB2	49232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	95239496	95239653	95239575	Y	SERPINA12	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	162782	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	95677984	95678067	95678026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	55637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	95691488	95691499	95691495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	69141	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	95724003	95724377	95724190	Y	DICER1,DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	59866	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	97646734	97646983	97646791	Y	NA	NA	C14orf177	IMR90	Hi-C	24141950	VRK1	385093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	208740	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	100566376	100566553	100566536	Y	EVL	NA	NA	NA	NA	NA	YY1	136082	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	100768169	100768349	100768287	Y	NA	SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	2535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	100804523	100804880	100804765	Y	NA	SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	RP11-638I2.10	26085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	100807709	100808060	100808026	Y	WDR25,WDR25,WARS,WARS	SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	RP11-638I2.10	22905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	100874667	100875097	100874987	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	WARS	33525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	100901180	100901603	100901493	Y	WARS,WARS	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	60038	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	107508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr14	102277268	102277494	102277347	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	51133	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	102292259	102292630	102292392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	66124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	102340393	102340589	102340458	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	88276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.98604916587779
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	102544859	102545271	102545048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR20	58569	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	102746257	102746658	102746398	Y	NA	MOK,ZNF839	NA	NA	NA	NA	MOK	22879	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	102780583	102780765	102780709	Y	NA	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF839	949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	103299136	103299384	103299260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3	57323	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	103672017	103672095	103672056	Y	NA	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	103878784	103878999	103878892	Y	NA	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	29055	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	104018443	104019067	104018893	Y	PPP1R13B	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1	NA	NA	NA	NA	KLC1	7166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	104483678	104483886	104483733	Y	ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD9	90879	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	105143455	105143754	105143546	Y	GPR132	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	1729	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	70050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr14	105440243	105440515	105440379	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2179	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	105630127	105630455	105630291	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	2706	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr14	105949862	105949973	105949911	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	1563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf80	1298739	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf80	1299302	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	27509398	27509798	27509429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC145436.1	73873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	31372759	31373034	31372889	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR10	90949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	31620735	31621235	31621017	Y	MTMR10,KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	3677	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	31733081	31733438	31733352	Y	MTMR10,KLF13	NA	KLF13,OTUD7A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF13	116023	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	32140399	32140767	32140585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA7	179924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	32962221	32962756	32962661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	56876	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	205665	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	33123878	33123902	33123890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	218533	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	33124594	33124991	33124793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	219249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	33125525	33125772	33125733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	220180	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	33133022	33133309	33133285	Y	GREM1	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	227677	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	33148173	33148432	33148370	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	242828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	33158575	33159178	33158960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	253230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	33162710	33163027	33162926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	257365	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	33164908	33165041	33164975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	259563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	33172991	33173188	33173143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	267646	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	33418806	33419006	33418854	Y	NA	NA	FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	FMN1	65891	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr15	33472781	33472968	33472835	Y	NA	FMN1	NA	NA	NA	NA	FMN1	11929	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	34531616	34532056	34531745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	96205	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	36547085	36547100	36547092	Y	C15orf41	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf41	322712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	37169508	37169702	37169583	Y	MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	60848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	37203314	37203431	37203373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	94654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	37207397	37207450	37207424	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	98737	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	38813403	38813501	38813452	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	42275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	39559889	39560120	39560079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-624L4.1	157276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	40162582	40162954	40162766	Y	NA	GPR176	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	48139	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	40164744	40164978	40164948	Y	NA	GPR176	NA	NA	NA	NA	GPR176	46115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	40179429	40179904	40179805	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	31189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	40180090	40180249	40180216	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	30844	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	40192845	40193084	40192965	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	18009	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr15	40200668	40200777	40200723	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	10316	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	40601054	40601299	40601247	Y	BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2	ANKRD63,PLCB2,C15orf52,DISP2	PAK6	K562	ChIA-PET	22265404	PLCB2	2918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	40728458	40728872	40728667	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	1048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	41741039	41741403	41741222	Y	NA	NDUFAF1,RTF1	NA	NA	NA	NA	RTF1	42433	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	41788010	41788393	41788374	Y	NA	RPAP1	NA	NA	NA	NA	RPAP1	46074	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr15	42220921	42221174	42221042	Y	NA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	41602	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	42226984	42227301	42227216	Y	LTK,MGA,JMJD7,VPS39,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	35475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr15	42260184	42260317	42260307	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	2459	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	42261117	42261163	42261140	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	1613	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	42549506	42549513	42549508	Y	PLA2G4E	GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	13918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	43356735	43357067	43356746	Y	NA	UBR1,RPS3AP47	NA	NA	NA	NA	UBR1	39244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	43757406	43757566	43757505	Y	NA	TP53BP1	NA	NA	NA	NA	TP53BP1	43360	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	44186295	44186523	44186409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR76	69134	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	44431053	44431468	44431357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD5	53982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr15	45005185	45005759	45005376	Y	CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3510	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	45076532	45076874	45076594	Y	B2M	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM69	57346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	45737363	45738279	45737765	Y	SQRDL,PLDN,SPATA5L1,C15orf48	GATM,SPATA5L1,C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	16636	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	45746745	45747578	45747238	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	26018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	27742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	45892726	45892758	45892742	Y	NA	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	28588	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	46416141	46416404	46416273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	494795	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	46441434	46441833	46441634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	520088	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	46528514	46528549	46528532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	607168	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr15	46545564	46545905	46545872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	624218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	48436189	48436527	48436248	Y	SLC24A5	MYEF2	NA	NA	NA	NA	MYEF2	32187	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	50010526	50010792	50010622	Y	NA	NA	C15orf33,GALK2,DTWD1,ATP8B4	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2647E9.1	73651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	50358473	50358749	50358576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	113644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	50429549	50429984	50429688	Y	USP8,GABPB1	SLC27A2	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	42409	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr15	51598187	51598615	51598465	Y	CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	314415	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	52330351	52330361	52330356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	55131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	52438848	52438958	52438938	Y	NA	CTD-2184D3.5,GNB5	NA	NA	NA	NA	GNB5	42608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	55463152	55463211	55463182	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	24054	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	55559739	55560363	55560096	Y	RAB27A,PIGB	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	48795	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	55581016	55581448	55581368	Y	RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	27710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	55928441	55928509	55928475	Y	NA	PYGO1	NA	NA	NA	NA	PYGO1	49296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	94234	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	56162319	56162688	56162565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	121256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	56201661	56201754	56201731	Y	NEDD4	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	82190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	56475345	56475479	56475412	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	58004	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	59566542	59566544	59566543	Y	MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	96348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	59649595	59649770	59649683	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	NA	NA	NA	NA	FAM81A	13122	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	59862569	59862935	59862765	Y	NA	RP11-112N19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	19277	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	61983322	61983363	61983348	Y	NA	NA	RORA	IMR90	Hi-C	24141950	VPS13C	367309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	62130295	62130308	62130301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	220364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	62684510	62685208	62684868	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3785	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr15	63368396	63368491	63368444	Y	NA	TPM1,LACTB	NA	NA	NA	NA	TPM1	35565	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	64540216	64540468	64540344	Y	HERC1,ZNF609	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	86812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	64960104	64960464	64960341	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	33016	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	65176143	65176677	65176391	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	AC069368.3,PLEKHO2,ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	ANKDD1A	25424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr15	65589242	65589632	65589437	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PARP16	1324	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	66060795	66060948	66060877	Y	NA	RAB11A,DENND4A	NA	NA	NA	NA	DENND4A	21683	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	67383217	67384219	67383746	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	29116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr15	67413336	67413759	67413492	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	59235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	67423316	67423661	67423503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	69215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	67436996	67437215	67437119	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	82895	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	86574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	56252	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	54692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	70679327	70679587	70679457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	290812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	71126164	71126470	71126369	Y	NA	LRRC49,LARP6	NA	NA	NA	NA	LRRC49	17108	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	71155799	71156069	71155993	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	11301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	71408872	71409066	71408998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	225748	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr15	71428826	71429023	71428945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	245702	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	71571390	71571701	71571551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	72337253	72337262	72337258	Y	SENP8,SENP8,SENP8,MYO9A,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	67337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	74216715	74216840	74216797	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	LOXL1	32927	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	74287730	74287905	74287836	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	2716	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	74689868	74690209	74689891	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	34599	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	74899091	74899429	74899332	Y	PPCDC,CLK3,CLK3	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	10250	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	75077206	75078007	75077402	Y	NA	CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	4808	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	75369871	75370272	75370177	Y	SIN3A,SIN3A,CLK3,CSK,C15orf39	NA	C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	PPCDC	55975	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	75867013	75867354	75867182	Y	C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	2276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	76218014	76218024	76218019	Y	NA	FBXO22	NA	NA	NA	NA	FBXO22	23814	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr15	76639629	76639850	76639740	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12564	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	77635534	77635848	77635691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAK1	74638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	77710600	77710857	77710802	Y	NA	PEAK1	NA	NA	NA	NA	HMG20A	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	79973105	79973417	79973260	Y	NA	NA	TMED3,KIAA1024	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFS	214304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	81219891	81220152	81220022	Y	STARD5	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	60067	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	286122	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr15	83603228	83603538	83603384	Y	NA	HOMER2,FAM103A1	NA	NA	NA	NA	HOMER2	49123	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	3484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	84048302	84048583	84048506	Y	BNC1	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GL3	65397	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	85225191	85225385	85225287	Y	PDE8A,ZNF592	WDR73,NMB,SEC11A	NA	NA	NA	NA	NMB	25397	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	85725231	85725336	85725284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	196466	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	85951204	85951442	85951357	Y	AKAP13,PDE8A,AKAP13	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	29402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	86131454	86131632	86131493	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	204629	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	89648424	89648609	89648517	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	19734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	89663203	89663358	89663281	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	14368	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	89673523	89673970	89673667	Y	ISG20,ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	3756	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	89795623	89795958	89795791	Y	NA	FANCI	NA	NA	NA	NA	FANCI	10443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	90363996	90364798	90364610	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	NA	NA	NA	NA	NA	AP3S2	70776	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	90379956	90380186	90379992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP3S2	55388	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	90402022	90402269	90402146	Y	NA	AP3S2	NA	NA	NA	NA	AP3S2	33305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr15	90669829	90670140	90669985	Y	NA	IDH2,SEMA4B	IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IDH2	26093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr15	90945502	90945781	90945680	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	16052	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	90950706	90950784	90950761	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	91476522	91476977	91476740	Y	NA	MAN2A2,UNC45A,HDDC3,AC068831.3,RCCD1	NA	NA	NA	NA	AC068831.3	162	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	92400967	92401402	92401150	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	6042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	92491615	92492039	92491744	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	5626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	117845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr15	93573195	93573591	93573395	Y	RGMA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	148669	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	95370202	95370491	95370347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	597435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr15	96884534	96884884	96884709	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	10044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	766	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	5042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	96959733	96960000	96959734	Y	NA	NA	LOC145820	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-522B15.3	64267	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	98400609	98400736	98400673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	60048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.75044261448009
chr15	99259262	99259477	99259337	Y	SYNM	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	69062	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99394435	99394579	99394453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	204235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	218411	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	99559007	99559192	99559062	Y	NA	NA	PGPEP1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYNM	77228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr15	100026499	100026994	100026794	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	11129	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	100243855	100244145	100244036	Y	NA	LYSMD4	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	27621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	101481026	101481320	101481182	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	23606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	101499118	101499600	101499493	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	41698	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr15	101807515	101807673	101807594	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	17378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	130955	131250	131103	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	5949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	612039	612238	612073	Y	RGS11,ARHGDIG,RHBDL1,GNG13,C16orf11	PIGQ,NHLRC4,RAB40C	NA	NA	NA	NA	PIGQ	2757	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	809662	809847	809755	Y	MSLN,MSLN,MSLN	METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78,NARFL,MSLN,CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	MSLN	900	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	1522812	1522824	1522818	Y	MAPK8IP3,CLCN7	C16orf91,CLCN7,TELO2	NA	NA	NA	NA	CLCN7	757	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	809	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	2518760	2519270	2519088	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	2561562	2561710	2561655	Y	PKD1,RAB26,CASKIN1,PDPK1	NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0C	161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	4420946	4421237	4421026	Y	NA	PAM16,VASN	NA	NA	NA	NA	VASN	1097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	4427155	4427449	4427262	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	7306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	4451383	4451509	4451446	Y	UBN1,UBN1,MGRN1,GLYR1,CORO7	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	CORO7	22197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	7354527	7355049	7354969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1358491	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	8015278	8015380	8015329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	698160	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	8041589	8041898	8041750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	671642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	8931520	8931573	8931545	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	29293	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	8932650	8933046	8932848	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	27820	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.75044261448009
chr16	8950746	8950997	8950816	Y	NA	CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	9869	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr16	9221431	9221974	9221622	Y	USP7,C16orf72	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	37926	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	9237080	9237205	9237143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	53575	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	9325793	9326174	9325910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	142288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	9767919	9768425	9768098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	584414	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	10563450	10564010	10563797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	108545	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	10922717	10923252	10923012	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	45803	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	10982517	10982862	10982662	Y	NUBP1,SOCS1,CLEC16A,CIITA	CIITA	NA	NA	NA	NA	CIITA	13462	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11024597	11024619	11024608	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	9698	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11032093	11032474	11032340	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	1843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	11058771	11058999	11058871	Y	CIITA,SOCS1,CLEC16A	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	22426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.36824589017894
chr16	11155783	11156117	11155981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	119438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	11284462	11284734	11284689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI2	56742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11296512	11296770	11296676	Y	SNN,LITAF,NUBP1	RMI2	NA	NA	NA	NA	RMI2	44706	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11300663	11300859	11300814	Y	NA	RMI2,SOCS1	CLEC16A,RMI2,SNN,TXNDC11,SOCS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RMI2	40617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11345704	11346020	11345999	Y	NA	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	SOCS1	2016	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11448700	11449053	11448750	Y	ZC3H7A,TXNDC11,CIITA,SOCS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS1	100664	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11677764	11678427	11678146	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	LITAF	NA	NA	NA	NA	LITAF	49810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr16	11738622	11738966	11738794	Y	NA	LITAF,SNN	CLEC16A,TXNDC11,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	10385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	11894292	11894377	11894335	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A,RSL1D1	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	5169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	14326449	14326637	14326520	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	163271	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	14423689	14423899	14423743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	16055043	16055430	16055122	Y	NDE1,NDE1,ABCC1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	13609	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	16092294	16092782	16092512	Y	NDE1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	50860	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	17300719	17300857	17300795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	976367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	19822629	19822921	19822772	Y	NA	NA	GPRC5B	IMR90	Hi-C	24141950	GPRC5B	72568	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	20908672	20908960	20908809	Y	CRYM,LYRM1,DCUN1D3	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	20910424	20910792	20910538	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	718	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	22020044	22020453	22020259	Y	OTOA,VWA3A	C16orf52	VWA3A	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf52	3085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	23473263	23473545	23473445	Y	SCNN1G,GGA2	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	10762	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	24863023	24863279	24863154	Y	NA	NA	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6A	124007	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	25005690	25005854	25005767	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	19133	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	25060889	25061147	25061001	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	35902	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	25104411	25104695	25104554	Y	NA	LCMT1	SLC5A11,ARHGAP17,LCMT1,LOC100506655	IMR90	Hi-C	24141950	LCMT1	16355	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	27180980	27181298	27181194	Y	KIAA0556,IL21R,JMJD5,JMJD5	NA	HS3ST4,LOC283888,IL21R,JMJD5,IL4R	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	96817	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	28108728	28108802	28108745	Y	APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	112439	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	28179891	28180117	28180009	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	41124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	28543579	28543953	28543732	Y	EIF3CL,EIF3C,SPNS1,IL27	CLN3,NUPR1,CCDC101	IL27	IMR90	Hi-C	24141950	NUPR1	4542	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1,ATP2A1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	28860977	28861369	28861174	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1,ATP2A1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	5056	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1,ATP2A1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SNORA42	537	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	8.8551802850169
chr16	30726552	30726958	30726731	Y	ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS	SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93	RNF40,PHKG2,C16orf93	IMR90	Hi-C	24141950	SRCAP	19022	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	8038	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr16	30994228	30994553	30994360	Y	VKORC1,HSD3B7	ORAI3,SETD1A,STX1B,STX4	NA	NA	NA	NA	HSD3B7	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	31005740	31006063	31006002	Y	ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,ITGAM,FUS,STX4	ORAI3,SETD1A,HSD3B7,STX1B,STX4	NA	NA	NA	NA	HSD3B7	11221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	31083220	31083516	31083291	Y	NA	STX4,ZNF668,ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8	NA	NA	NA	NA	ZNF646	227	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	31125100	31125333	31125167	Y	STX4,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	25	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	31223480	31223547	31223514	Y	ZNF629	FUS,PYCARD	NA	NA	NA	NA	PYCARD	10709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	31887367	31887596	31887374	Y	NA	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	4288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	31891820	31892363	31891972	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	8741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	34441880	34442279	34442062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2558801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	47125760	47125956	47125858	Y	NA	NETO2	NA	NA	NA	NA	NETO2	49952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	47175603	47175949	47175815	Y	NETO2	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	48610830	48611144	48611073	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	40915	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	50297167	50297573	50297410	Y	NA	ADCY7	PAPD5,BRD7,ADCY7	IMR90	Hi-C	24141950	ADCY7	19119	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	53128013	53128430	53128279	Y	RBL2	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	41068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	54961070	54961275	54961203	Y	NA	IRX5	NA	NA	NA	NA	CRNDE	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	57488914	57489209	57489062	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	POLR2C	5090	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	57927623	57928192	57928041	Y	GPR97,ZNF319	KIFC3	NA	NA	NA	NA	KIFC3	32666	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	58159860	58159971	58159905	Y	C16orf80	C16orf80	NA	NA	NA	NA	C16orf80	1383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	58445622	58445902	58445848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD6	101481	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	58493284	58493520	58493447	Y	NDRG4,NDRG4,NDRG4	NA	NA	NA	NA	NA	SETD6	53863	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	61608855	61609250	61609053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	459689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	63275323	63275660	63275492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	1206384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	66416297	66416567	66416426	Y	CDH5	NA	NA	NA	NA	NA	TK2	167880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	66416918	66416958	66416940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TK2	167489	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	66962213	66962449	66962329	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	FAM96B	3877	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	67345616	67346198	67345888	Y	RRAD,CBFB,FAM65A,FHOD1,PLEKHG4	PLEKHG4,KCTD19,LRRC36	NA	NA	NA	NA	KCTD19	12468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	67435763	67435871	67435819	Y	NA	TPPP3,ZDHHC1	NA	NA	NA	NA	TPPP3	10325	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	68129095	68129275	68129185	Y	NA	NFATC3	NA	NA	NA	NA	NFATC3	12441	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr16	68433458	68433594	68433558	Y	NA	SMPD3	NA	NA	NA	NA	SMPD3	46997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	69777344	69777472	69777408	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	9371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr16	70464772	70465160	70465031	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	5980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	70470997	70471281	70471214	Y	NA	FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	70779915	70780216	70780046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	72460868	72461258	72460965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	334538	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	72965555	72965897	72965813	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	72966138	72966319	72966212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	72981236	72981554	72981364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	110043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	73461043	73461303	73461173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	369446	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	74356396	74356719	74356558	Y	NA	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	27723	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	74545615	74545910	74545763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLG1	93102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL	NA	NA	NA	NA	MLKL	44754	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75034413	75034614	75034514	Y	FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75034712	75035106	75034867	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75037611	75037819	75037667	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	5540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	CTRB1,BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr16	75359436	75359702	75359569	Y	NA	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	59485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75369399	75369431	75369415	Y	BCAR1,CFDP1	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	69448	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75420812	75420988	75420900	Y	NA	CFDP1	CTRB1,BCAR1,CTRB2	IMR90	Hi-C	24141950	CFDP1	44395	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75496858	75497008	75496924	Y	NA	CFDP1,TMEM170A,CHST6	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75618166	75618518	75618190	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	19917	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	75628076	75628219	75628207	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	ADAT1	26979	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	77217218	77217275	77217245	Y	NA	MON1B,SYCE1L	NA	NA	NA	NA	MON1B	5457	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	78564720	78564924	78564822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	433410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	78776344	78776829	78776566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	645034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	79204565	79204790	79204678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	1073255	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	80208286	80208441	80208438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	364190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	80838768	80839127	80839024	Y	CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2	CDYL2	NA	NA	NA	NA	CDYL2	2542	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	81491583	81491773	81491678	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	14808	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	81503648	81503971	81503709	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	26873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	81645893	81646351	81645997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	124351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	81666319	81666849	81666608	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	103853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	81763852	81764387	81764185	Y	NA	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	6315	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr16	82663331	82663687	82663514	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	82667775	82667948	82667787	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	9367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	82685978	82686417	82686161	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	27570	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	82686651	82686853	82686732	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28731	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.75044261448009
chr16	82687467	82688028	82687715	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	29059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	30649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr16	82733427	82733620	82733554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	75019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	83069400	83069774	83069647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	410992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	83777004	83777385	83777194	Y	HSDL1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	62063	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	83790064	83790448	83790256	Y	NA	HSBP1	NA	NA	NA	NA	HSBP1	49000	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	84177434	84177775	84177582	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	DNAAF1	569	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	84208911	84209121	84208992	Y	OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C	HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	TAF1C	9548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	84523883	84523965	84523925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COTL1	125718	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	84624738	84624752	84624744	Y	HSDL1,COTL1	COTL1	NA	NA	NA	NA	COTL1	24931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr16	84633108	84633501	84633306	Y	ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	16182	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	84633541	84633938	84633771	Y	NA	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	15745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	84634431	84634711	84634540	Y	ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	14972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	84636685	84637090	84636875	Y	ZDHHC7,KIAA0513,HSDL1,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	12593	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	84676809	84677221	84677048	Y	KIAA1609	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	84785578	84785829	84785712	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	85028506	85028759	85028547	Y	COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	14382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	MTHFSD,FOXL1	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	90155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	86698644	86698785	86698699	Y	FOXL1	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	90670	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	86890972	86891338	86891155	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	282998	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	363255	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	87359959	87360279	87360119	Y	NA	C16orf95	NA	NA	NA	NA	C16orf95	10937	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr16	87498995	87499259	87499135	Y	BANP,BANP,MAP1LC3B,ZCCHC14	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO31	75247	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr16	87843209	87843416	87843290	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	45611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	88839181	88839507	88839410	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	10112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	89239100	89239467	89239213	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	CDH15	2925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr16	89406185	89406252	89406205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	124067	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	89449545	89449691	89449606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	105278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr16	89568763	89569125	89568979	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPG7	13438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	89879863	89880236	89880053	Y	NA	FANCA,SPIRE2	NA	NA	NA	NA	FANCA	829	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	597415	597783	597745	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	25174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	654300	654699	654470	Y	NA	VPS53,FAM57A,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GEMIN4	540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	693293	693510	693390	Y	RNMTL1	GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	9712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr17	1585953	1586309	1586247	Y	NA	RILP,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	PRPF8	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	3460153	3460261	3460230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHPK	77355	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	4118580	4118797	4118689	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	46477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	4437372	4437692	4437444	Y	NA	MYBBP1A	NA	NA	NA	NA	MYBBP1A	19234	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	4614568	4615368	4615020	Y	MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16	NA	NA	NA	NA	ARRB2	2784	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	GP1BA,RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	GP1BA	21550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	5243236	5243614	5243425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABEP1	59678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	6790647	6790875	6790776	Y	SLC16A11,DLG4,DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	122793	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	6822879	6823265	6823073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	90403	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	6829288	6829561	6829425	Y	SLC13A5,NLGN2,DLG4,ASGR2,ASGR2,ASGR1	NA	ALOX12P2,ASGR1	IMR90	Hi-C	24141950	AC027763.2	84107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	MIR497HG	4174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	7119118	7119286	7119174	Y	WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1	NA	NA	NA	NA	ACADVL	674	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	7233457	7233867	7233744	Y	WRAP53,POLR2A,DNAH2,DLG4,EIF5A	YBX2,EIF5A,GPS2,NEURL4,ACAP1,KCTD11,TNK1	NA	NA	NA	NA	NEURL4	2745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.08901637849427
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr17	8268468	8268891	8268818	Y	SPDYE4,MFSD6L,CCDC42,CNTROB,ODF4	KRBA2,RPL26,NDEL1	NA	NA	NA	NA	KRBA2	9138	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	8436852	8437236	8437053	Y	MYH10	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	94843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	8649167	8649702	8649446	Y	ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	117088	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	321602	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	15363919	15364293	15364237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	111040	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	15860629	15861165	15860792	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	14398	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	18679	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	17493657	17493822	17493814	Y	RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	17566702	17566984	17566789	Y	NA	RAI1	RAI1,SMCR9,PEMT,NT5M,TOM1L2,COPS3,MED9,RASD1,SMCR5,SREBF1,C17orf39,ATPAF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAI1	15803	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr17	17677876	17678068	17678030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	60257	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	LRRC48	629	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	18820621	18820763	18820720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPSAP2	79223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	19147768	19147949	19147793	Y	PRPSAP2,RNF112	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK7	131085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH3A2	106941	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	21070786	21070950	21070861	Y	NA	DHRS7B,AC087294.2,TMEM11	NA	NA	NA	NA	AC087294.2	44694	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	21188812	21189500	21189174	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	2828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	25620233	25620423	25620280	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	1131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.26527867756246
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	26368091	26368384	26368254	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	1328	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	26578258	26578420	26578387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65701	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	26894495	26894823	26894797	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5	NA	NA	NA	NA	PIGS	2067	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	27138672	27138846	27138777	Y	NA	ERAL1	NA	NA	NA	NA	ERAL1	41110	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	27264479	27264617	27264556	Y	UNC119,SDF2,FLOT2,TIAF1,TAOK1,NUFIP2,PHF12	FLOT2,DHRS13,PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	12172	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	27387642	27387771	27387728	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	PHF12	110853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	27972817	27973010	27972914	Y	NA	CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	24892	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	28108459	28108825	28108642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSH2	146469	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	28210608	28210734	28210655	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	44560	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	ADAP2,TEFM	NA	NA	NA	NA	ADAP2	18981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	42098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr17	29637373	29637640	29637434	Y	CRLF3,EVI2A	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	1490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	29780371	29780542	29780457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	63729	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	29892134	29892258	29892202	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	175492	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	29923737	29923924	29923895	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	207095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	30335785	30336145	30335965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUZ12	73748	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	30723443	30723679	30723561	Y	NA	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	45600	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	33407531	33407770	33407731	Y	NA	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	6568	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr17	33577736	33577912	33577824	Y	ZNF830,RFFL,SLFN5	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	9681	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	35292129	35292558	35292512	Y	ACACA,LHX1,AATF	AATF	NA	NA	NA	NA	AATF	11617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	35519679	35519723	35519693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215504	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	36859229	36859333	36859332	Y	NA	C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	462	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	37024501	37024874	37024707	Y	NA	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	37056956	37057300	37057070	Y	NA	SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	32844	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	37249276	37249451	37249365	Y	MLLT6,CWC25,FBXL20,CDK12	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC1	59196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	37542274	37542291	37542284	Y	NA	FBXL20	NA	NA	NA	NA	FBXL20	14485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	37621502	37621553	37621528	Y	NA	MED1,CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	5738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	37749329	37749495	37749400	Y	CACNB1,THRA,TCAP	STARD3	NA	NA	NA	NA	STARD3	41823	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	37832582	37832871	37832624	Y	NA	STARD3,ERBB2,PGAP3	NA	NA	NA	NA	ERBB2	9296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	38085522	38085789	38085697	Y	ERBB2,IKZF3,ORMDL3	ORMDL3,PSMD3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	3668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	38263317	38263642	38263602	Y	NA	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	8339	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	38466457	38466702	38466562	Y	IKZF3	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	3013	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	38467869	38468243	38468028	Y	NA	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	4425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	38496652	38496786	38496719	Y	MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	GJD3	21281	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	58146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT15	23430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	39735892	39736012	39735959	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14	NA	NA	NA	NA	NA	KRT19	53332	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	39823354	39823685	39823437	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	19452	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	40152830	40153154	40152992	Y	NA	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	CNP,TTC25	IMR90	Hi-C	24141950	NKIRAS2	8246	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	40573451	40573881	40573544	Y	AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF	STAT3,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	40628029	40628344	40628111	Y	NA	ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A1	19167	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	NAGLU,HSD17B1,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	15359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	40671173	40671319	40671240	Y	PTRF	NAGLU,HSD17B1,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	14871	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	40748943	40749226	40749085	Y	STAT5B,STAT3,STAT3	HSD17B1,COASY,MLX,PSMC3IP,TUBG1,FAM134C	NA	NA	NA	NA	TUBG1	10468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	41233585	41233852	41233719	Y	BRCA1	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	41648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	41242207	41242334	41242271	Y	NA	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	33166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	41441650	41441788	41441734	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	32539	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr17	41656262	41656390	41656311	Y	G6PC3	ETV4	DHX8,MIR2117,MPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	1274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	41657407	41657423	41657415	Y	MPP2	ETV4	DHX8,MIR2117,MPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	2419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	41796772	41797488	41797204	Y	TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3	NA	LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP3	56868	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	42101631	42102033	42102001	Y	C17orf105,CD300LG,LSM12	NAGS,TMEM101,LSM12,G6PC3	NA	NA	NA	NA	TMEM101	2317	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	42198947	42199210	42199140	Y	NA	C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.78011474064484
chr17	42620579	42620851	42620665	Y	GJC1,FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	12074	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	42624253	42624886	42624582	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD2	8039	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr17	43018379	43018606	43018493	Y	NA	CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1	NA	NA	NA	NA	KIF18B	4476	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	43034960	43035346	43035098	Y	ADAM11,HIGD1B,DCAKD,ACBD4,GFAP	KIF18B,C1QL1	KIF18B	IMR90	Hi-C	24141950	C1QL1	8093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	43230123	43230516	43230320	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	5551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	43253543	43253622	43253574	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	17476	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	43302645	43302970	43302880	Y	NA	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	5834	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	43303050	43303852	43303644	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	6239	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	43304336	43305039	43304628	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	7525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1	94696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr17	44848199	44848613	44848371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50666	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	45814083	45814467	45814294	Y	NA	TBX21	OSBPL7,MRPL10,SCRN2,LRRC46	IMR90	Hi-C	24141950	TBX21	5473	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP6,SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	46648538	46649382	46648794	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	46708678	46709096	46708978	Y	NA	HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,RP11-357H14.17	HOXB8,HOXB9	IMR90	Hi-C	24141950	HOXB7	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	46767725	46768126	46768067	Y	NA	RP11-357H14.17,HOXB13	NA	NA	NA	NA	HOXB13	36414	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	47049793	47049986	47049890	Y	IGF2BP1,SNF8	SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1	IGF2BP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IGF2BP1	22788	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF652	167326	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	47738461	47738630	47738545	Y	NA	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SPOP	14966	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	47941415	47941544	47941487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	70710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr17	48105546	48105721	48105634	Y	ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	25611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	48206052	48206167	48206088	Y	NA	PDK2,PPP1R9B,SGCA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	19824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	48338432	48338651	48338443	Y	EPN3	NA	LOC284080,ITGA3,PDK2,SAMD14,PPP1R9B,COL1A1,HILS1,SGCA,TMEM92	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	61439	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT2	53639	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	49196679	49197214	49196965	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	453	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	49324611	49324828	49324669	Y	MBTD1	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	10696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	54864431	54864801	54864568	Y	TRIM25,SCPEP1	DGKE,C17orf67	NA	NA	NA	NA	DGKE	44659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	54876339	54876519	54876454	Y	DGKE	DGKE,C17orf67	NA	NA	NA	NA	DGKE	32941	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	54987224	54987877	54987630	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	1522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	55504815	55504992	55504904	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	173603	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	55540558	55540950	55540705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	209346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	55763716	55764071	55763861	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	161346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	55952714	55953105	55953007	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	27297	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4,SEPT4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	57502587	57502904	57502671	Y	NA	NA	YPEL2	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	95537	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57509065	57509242	57509141	Y	NA	NA	YPEL2,GDPD1,PRR11	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	102015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57698412	57698732	57698592	Y	YPEL2,RNFT1,VMP1	CLTC	NA	NA	NA	NA	CLTC	3193	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	57925185	57925429	57925290	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	8558	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57930626	57931026	57930760	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	13999	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	58169287	58169683	58169398	Y	RNFT1	HEATR6	HEATR6,LOC645638	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR6	14995	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	453103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	59329573	59329874	59329791	Y	NACA2	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	336689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	59488217	59488528	59488332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	178035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	60745829	60746119	60745974	Y	TLK2	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	43067	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	60795868	60796183	60796045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	93106	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	60868640	60868941	60868827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165878	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	60877951	60878269	60878188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	175189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	194524	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	60980360	60980503	60980437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	277598	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	61042784	61043115	61042811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340022	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr17	61127299	61127625	61127462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	394114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	61153436	61153733	61153585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	368006	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	61538235	61538385	61538330	Y	NA	CYB561,ACE	CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYB561	16496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	61928781	61928798	61928790	Y	NA	PSMC5,FTSJ3,SMARCD2,TCAM1P	NA	NA	NA	NA	TCAM1P	4129	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	62154723	62155082	62154942	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	NA	NA	NA	NA	NA	ERN1	51097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	62409604	62410133	62409977	Y	ICAM2,ERN1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	70943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	62534383	62534677	62534525	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	32066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	62537971	62538164	62538007	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	35654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	62583721	62583959	62583840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	72227	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	62705157	62705447	62705234	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	48971	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	545803	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	64455929	64456369	64456061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	159175	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr17	64463185	64463416	64463350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	166431	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	64503657	64504241	64503882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	206903	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	64524337	64524637	64524487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	227583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	64544411	64544774	64544437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	247657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	64544919	64545280	64544935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	248165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	64714382	64714708	64714545	Y	PRKCA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	417628	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	65130860	65131108	65130984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	108997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	66618888	66618909	66618898	Y	NA	NA	ABCA10,ABCA8,ABCA9	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAR1A	112967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	68133591	68133755	68133649	Y	KCNJ2	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	29059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	70122851	70122907	70122879	Y	NA	SOX9	NA	NA	NA	NA	SOX9	7690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	70403681	70403886	70403813	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	217484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	77797	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	70924179	70924389	70924230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	162462	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	SSTR2,COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	71227425	71227646	71227536	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	C17orf80	1053	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	71336325	71336719	71336454	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42EP4	30011	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	72684773	72685055	72684909	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	57736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	72989354	72989561	72989458	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	7627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	73167917	73168048	73167983	Y	NA	NT5C,HN1,SUMO2,NUP85	HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HN1	5541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	73309965	73310187	73310156	Y	SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	3223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	73684314	73684419	73684412	Y	NA	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	23045	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	73850621	73850811	73850693	Y	GRB2,GRB2,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,EVPL,ACOX1,UNC13D,WBP2,TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65	NA	NA	NA	NA	WBP2	33	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	74188017	74188310	74188175	Y	RNF157,FAM100B	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	32577	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	74255513	74255743	74255629	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	21059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	74269060	74269291	74269140	Y	RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNK,SPHK1,RNF157,FAM100B	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	34606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.29495080372722
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	74481730	74482020	74481883	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	13852	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	74664017	74664029	74664023	Y	NA	MXRA7	NA	NA	NA	NA	MXRA7	41069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	74692944	74693312	74693210	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	11786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	75164022	75164186	75164074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	83224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	8052	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	10285	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.64747540186361
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	75321712	75322201	75321955	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	47061	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	75417194	75417582	75417357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	142543	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC6	171692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	76338337	76338836	76338651	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15322	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	76377337	76378350	76377903	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	4616	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	76731686	76732147	76732043	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	44232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	76767876	76768189	76768026	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	8190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	76801462	76801678	76801575	Y	DNAH17,USP36,CYTH1	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	CYTH1	25083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	76929562	76929807	76929665	Y	CANT1	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	76930060	76930674	76930419	Y	NA	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr17	77032690	77033106	77032818	Y	CYTH1,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	15794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	77034665	77035262	77034914	Y	CYTH1,USP36,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	17769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	77178498	77178880	77178689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	109477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr17	78471918	78472124	78472096	Y	NA	NPTX1,RPL32P31,RPTOR	RPTOR,ENDOV,LOC100294362,CHMP6	IMR90	Hi-C	24141950	NPTX1	22275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	78524165	78524352	78524226	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	7546	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	78626044	78626134	78626054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	109425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	78735331	78735538	78735429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	218712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	78800697	78801105	78800867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	162293	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr17	79011145	79011369	79011293	Y	BAIAP2	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	4197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	52465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	80214734	80215057	80214944	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	SECTM1	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr17	80494129	80494268	80494139	Y	NA	FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	18540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	81058904	81059222	81058949	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	23337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr17	81067352	81067511	81067418	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31785	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	221277	221425	221379	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	44625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	222573	222827	222703	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	43223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.29495080372722
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	679559	679568	679564	Y	NA	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	23219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	28430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	1888648	1888915	1888782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	680593	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr18	2223503	2223515	2223509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	345993	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr18	2515543	2515690	2515617	Y	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	53818	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	NDC80	36131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr18	2797990	2798254	2798233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	144253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	2810818	2810991	2810905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	157081	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	2883493	2883567	2883531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN2	127746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	2972158	2972493	2972361	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	38820	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	2980400	2980653	2980492	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,SMCHD1,EMILIN2	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	30660	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	3015219	3015501	3015351	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2	LPIN2	LPIN2	K562	ChIA-PET	22265404	LPIN2	3906	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr18	3305401	3305555	3305478	Y	MYL12B,TGIF1	MYL12B	DLGAP1,TGIF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYL12B	45494	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.95637703971304
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.36824589017894
chr18	3625326	3625427	3625380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	3650005	3650381	3650193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	240399	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	5294371	5294839	5294435	Y	ZFP161	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	1166175	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	7802923	7802988	7802937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	238143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	8140065	8140370	8140233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	467073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	8643425	8643722	8643508	Y	ANKRD12,ANKRD12,RAB12	RAB12	NA	NA	NA	NA	RAB12	35982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	8704091	8704364	8704199	Y	CCDC165	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	96648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr18	9101793	9102110	9101852	Y	RAB12,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	NDUFV2	1165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	9128926	9129321	9129124	Y	NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	9129786	9129925	9129855	Y	PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	9375216	9375438	9375327	Y	NA	TWSG1	NA	NA	NA	NA	TWSG1	42451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	9812085	9812326	9812208	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	99673	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	9824351	9824715	9824532	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	87284	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	9838439	9838883	9838628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	73116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	9877272	9877635	9877453	Y	VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	34364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	10123098	10123445	10123261	Y	NAPG,RAB31,VAPA	NA	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	211099	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	10766591	10766813	10766750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	242689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr18	12048672	12049055	12049000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	69648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	12092408	12092760	12092594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	113384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	12153782	12153922	12153819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB6	151746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	12330841	12331244	12331045	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	25173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	12336380	12336603	12336512	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	30712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	12347442	12347507	12347473	Y	CEP76,AFG3L2	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	27806	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	12455577	12455852	12455727	Y	NA	SLMO1	NA	NA	NA	NA	SLMO1	49682	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	12471098	12471401	12471374	Y	PSMG2	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO1	65203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	12641281	12641332	12641311	Y	SPIRE1,SPIRE1,PSMG2	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	14710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	12763760	12763785	12763774	Y	CEP192,C18orf1	NA	PTPN2	IMR90	Hi-C	24141950	CEP76	62984	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr18	12765132	12765369	12765274	Y	CEP76	NA	NA	NA	NA	NA	CEP76	64356	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr18	12882540	12883190	12882840	Y	PTPN2	PTPN2	NA	NA	NA	NA	PTPN2	44452	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	12993260	12993605	12993433	Y	NA	SEH1L,CEP192	NA	NA	NA	NA	CEP192	3899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	13137958	13138425	13138153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	148597	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	18596588	18597119	18596879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	92693	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	19373794	19374099	19373861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	90876	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	19397108	19397142	19397125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	114190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	19675139	19675157	19675148	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	72247	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	26808	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	20138967	20139156	20139093	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	237068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	20811230	20811702	20811444	Y	NPC1,C18orf8,RBBP8,RBBP8	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	98702	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	ANKRD29	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	12042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	21368551	21368843	21368697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	127702	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	21780839	21781231	21781002	Y	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	NA	CABYR	63897	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	21975077	21975273	21975220	Y	OSBPL1A	OSBPL1A,IMPACT	NA	NA	NA	NA	OSBPL1A	571	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	25536974	25537193	25537082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	218217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	25695112	25695346	25695270	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	60064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	25754926	25755429	25755157	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	26737941	26738491	26738211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	982531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr18	26745136	26745536	26745463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	989726	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	29599439	29599921	29599769	Y	RNF138,RNF138,TRAPPC8,RNF125	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	68340	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	30501581	30501946	30501766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	831763	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	32239709	32239834	32239782	Y	MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	168455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	217835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	32291109	32291369	32291156	Y	MAPRE2,NOL4,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	219855	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	32386590	32386868	32386730	Y	MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	168024	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	32399644	32399985	32399810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	154907	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	32622568	32623026	32622758	Y	ZNF24,MAPRE2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	67676	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr18	33042221	33042422	33042327	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	33533	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	33057648	33057699	33057650	Y	MAPRE2,MAPRE2,ZNF24,ZNF396,INO80C	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	18256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	33577061	33577192	33577127	Y	NA	C18orf21	NA	NA	NA	NA	C18orf21	27015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	34765473	34765582	34765528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	358315	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	35142004	35142267	35142202	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	734846	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	37033966	37034182	37034037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	120327	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr18	37151664	37151869	37151793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	238025	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	39021552	39021652	39021602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	511519	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	39520548	39520801	39520707	Y	NA	PIK3C3	PIK3C3	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3C3	12370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	43307603	43307620	43307613	Y	NA	SLC14A1	NA	NA	NA	NA	SLC14A1	5511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	43381768	43381900	43381886	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC14A1	79676	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr18	43543003	43543287	43543010	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	1953	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	45541725	45542128	45542097	Y	SMAD2,SMAD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	86210	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	46259226	46259357	46259315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	195809	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	397724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	46479420	46479772	46479694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	416003	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	460061	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	460738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	46582084	46582553	46582428	Y	SMAD7,DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	403164	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	47794579	47794725	47794639	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	3687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr18	48721492	48722312	48721913	Y	SMAD4,MEX3C	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	20362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	48737977	48738244	48738154	Y	ME2	MEX3C	MEX3C	K562	ChIA-PET	22265404	MEX3C	4430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	51736292	51736523	51736417	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	12635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	52490491	52490717	52490508	Y	RAB27B	NA	RAB27B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAB27B	107400	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	52613483	52613779	52613741	Y	NA	CCDC68	NA	NA	NA	NA	CCDC68	10960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	53107364	53107398	53107375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	222620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	53361338	53361366	53361352	Y	NA	TCF4	TCF4	IMR90	Hi-C	24141950	TCF4	31320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	54171191	54171431	54171311	Y	NA	NA	TCF4	IMR90	Hi-C	24141950	WDR7	145143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	55101559	55101949	55101758	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	55382886	55383034	55382958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	85299	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	55513608	55513807	55513708	Y	NA	ATP8B1	ATP8B1,NEDD4L,ALPK2	IMR90	Hi-C	24141950	ATP8B1	45275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	55880754	55881007	55880894	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr18	55881305	55881780	55881408	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171706	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	55889534	55890049	55889817	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	179935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	55892299	55892691	55892549	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	182700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	55893671	55893850	55893725	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	184072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	55922134	55922493	55922309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	212535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	55929917	55930363	55930116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	220318	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	55957381	55957780	55957581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	247782	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	56012421	56012506	56012466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	253357	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	56337372	56337558	56337406	Y	MALT1	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	754	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	56359373	56359598	56359412	Y	NA	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	22755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	56633214	56633485	56633410	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	105382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	59766177	59766307	59766242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGN	86044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	59997447	59997624	59997536	Y	NA	TNFRSF11A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11A	6927	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	60886280	60886709	60886627	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	98652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	60905272	60905593	60905493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	79768	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	SERPINB4,SERPINB3	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB3	23322	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	61537611	61537785	61537630	Y	NA	SERPINB2,SERPINB10	SERPINB5	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB2	685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	61549883	61550442	61550030	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2,SERPINB10	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB10	11966	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	61565801	61566233	61565950	Y	NA	SERPINB2,SERPINB10,HMSD	NA	NA	NA	NA	SERPINB10	3393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr18	61576212	61576423	61576320	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2,SERPINB10,HMSD	SERPINB10	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB10	13804	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	61642248	61642613	61642430	Y	NA	HMSD,SERPINB8	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	7089	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr18	65434285	65434424	65434346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEL	252068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	2556	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.78011474064484
chr18	70536769	70537080	70536861	Y	CBLN2,NETO1,NETO1	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	3388	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr18	72452985	72453338	72453047	Y	C18orf63	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	189879	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	72704413	72704615	72704528	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	214688	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	72916177	72916455	72916218	Y	NA	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	2848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	72919988	72920296	72920123	Y	ZADH2,TSHZ1	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	TSHZ1	414	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74764902	74765159	74765004	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	78480	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	76617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	76094	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	74802146	74802233	74802190	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	41406	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74803559	74803662	74803615	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	39977	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74805603	74805845	74805816	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	37794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74808374	74808713	74808562	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	34926	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74810011	74810388	74810104	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	33251	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74814335	74814742	74814712	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	28897	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74821198	74821567	74821500	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	22072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	13430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	12830	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr18	74837664	74837983	74837939	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	5656	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74840150	74840705	74840388	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	2934	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	74840794	74841428	74841367	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	2211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr18	74841905	74842663	74842144	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	976	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	305438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	76807542	76807844	76807575	Y	NA	ATP9B	SALL3	IMR90	Hi-C	24141950	ATP9B	19441	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	6.79583603268739
chr18	76828001	76828378	76828185	Y	NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	716	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	77060474	77060624	77060564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	233189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr18	77723013	77723575	77723504	Y	HSBP1L1	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	HSBP1L1	452	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	532930	533293	533259	Y	C19orf6,C19orf22,ARID3A	MADCAM1,TPGS1,CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	CDC34	3216	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr19	823657	823956	823874	Y	BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1	PTBP1,MIR4745,MIR3187,ELANE,CFD	NA	NA	NA	NA	MIR3187	12073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	ELANE,CFD,MED16,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	9552	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	888565	888780	888647	Y	SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	ELANE,CFD,MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	MED16	2438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	996390	996745	996544	Y	HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	WDR18	15216	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1101850	1102062	1101942	Y	C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	HMHA1,POLR2E	NA	NA	NA	NA	GPX4	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1126082	1126504	1126271	Y	MIDN,SBNO2,SBNO2	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	GPX4	24146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1133172	1133384	1133209	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	GPX4	31236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	1133542	1133865	1133752	Y	C19orf22,ARID3A,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	GPX4	31606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr19	1189532	1189666	1189566	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26	NA	NA	NA	NA	STK11	2126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1213863	1214369	1213961	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	C19orf26	21657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	1280981	1281104	1281044	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	MUM1	2786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	1942586	1943099	1942836	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3398	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	2168320	2168637	2168529	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	5856	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	2529574	2529858	2529677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	55454	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	2627461	2627884	2627646	Y	DOT1L,OAZ1,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	DIRAS1	91532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	2775094	2775492	2775274	Y	GADD45B,GNA15	SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554	NA	NA	NA	NA	SGTA	5877	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	3428769	3429112	3428821	Y	TLE2,NFIC	NA	NA	NA	NA	NA	DOHH	69826	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	3555158	3555442	3555300	Y	C19orf28	C19orf71,HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	15333	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	3562421	3562565	3562489	Y	NA	C19orf71,HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	8210	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	3607748	3607951	3607883	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	2910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	3655813	3656105	3655965	Y	NA	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	42372	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	3969049	3969183	3969116	Y	NA	SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	DAPK3	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	4108837	4109162	4109070	Y	TMIGD2,CCDC94,C19orf29,APBA3,MRPL54,MATK,ZBTB7A	ZBTB7A,MAP2K2,CREB3L3	NA	NA	NA	NA	MAP2K2	12964	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	4374109	4374366	4374283	Y	TICAM1,SEMA6B	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	24178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	4575288	4575908	4575613	Y	CCDC94,TICAM1,SEMA6B	PLIN5	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN5	42052	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	4620862	4621172	4621017	Y	NA	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	16358	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	4870294	4870493	4870397	Y	SEMA6B,TICAM1	TICAM1,PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	PLIN3	4514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	5250100	5250567	5250354	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	25178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	5880679	5880918	5880789	Y	NA	FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS	NA	NA	NA	NA	FUT5	20880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	5989815	5989915	5989890	Y	SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	13662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	6060958	6061480	6061122	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	84805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	6062045	6062746	6062500	Y	TNFSF9,DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	85892	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	6066698	6067208	6066827	Y	SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	90545	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	6111447	6111675	6111584	Y	SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	85908	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	6228782	6229121	6229035	Y	NA	RFX2,MLLT1	NA	NA	NA	NA	RFX2	31199	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr19	6674780	6675150	6675080	Y	DENND1C,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14	NA	NA	NA	NA	NA	C3	53423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	6801116	6801467	6801221	Y	SH2D3A,VAV1	SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	35517	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	7414639	7414850	7414793	Y	NA	ARHGEF18	ZNF557,INSR	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	43149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	7483723	7483869	7483787	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	25724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	8051436	8051456	8051449	Y	NA	TIMM44,ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	17087	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	8638437	8638868	8638608	Y	RAB11B,PRAM1,MYO1F	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF414	61389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	8749433	8750038	8749788	Y	PRAM1,MYO1F	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF414	172385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	9120594	9120838	9120762	Y	MUC16	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF317	128218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	9758216	9758505	9758322	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	25271	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	9902440	9902843	9902543	Y	ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	33649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	9903168	9903577	9903239	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	32915	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	9937602	9937876	9937738	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	UBL5	1034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	10304383	10304612	10304534	Y	TYK2,KRI1,ILF3	S1PR2,DNMT1	PPAN-P2RY11,EIF3G	MCF7	ChIA-PET	22265404	S1PR2	35336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	10842367	10842486	10842420	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	QTRT1,DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	15612	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	11202963	11203178	11203054	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	11484314	11484469	11484411	Y	ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3	NA	NA	NA	NA	SWSAP1	953	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	11601973	11602308	11602059	Y	ZNF491,ZNF441	ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1	NA	NA	NA	NA	ZNF653	12430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	12724614	12724901	12724730	Y	ZNF136,ZNF44,ZNF563,ZNF564,JUNB,C19orf43,ZNF490,ZNF791,MAN2B1	ZNF791,ZNF490,CTD-2192J16.15	NA	NA	NA	NA	ZNF791	4882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	13164647	13164970	13164763	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	47005	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	44617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	13188264	13188490	13188383	Y	ZNF490,PRDX2,KLF1,STX10,LYL1	LYL1,TRMT1,NACC1	NA	NA	NA	NA	LYL1	23485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.64747540186361
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	13267779	13268208	13267877	Y	MAN2B1,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	8550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	13324184	13324516	13324349	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	64955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	13721187	13721366	13721219	Y	NA	NA	CACNA1A,MRI1,C19orf53,ZSWIM4,CCDC130	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC130	119208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr19	13944151	13944331	13944193	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	39877	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	13959901	13960035	13959978	Y	CCDC130,RFX1,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	54979	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	13995440	13995781	13995611	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	19233	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	13995889	13996057	13995977	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	18957	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	14229419	14229865	14229637	Y	CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	PRKACA	2523	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	14474119	14474280	14474154	Y	ZNF333,RFX1,PKN1,CD97	CD97	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	15033	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	14597679	14597949	14597721	Y	NA	GIPC1,TECR,DNAJB1	NA	NA	NA	NA	GIPC1	6995	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	14617819	14618098	14617969	Y	IL27RA,DDX39A,PKN1,DNAJB1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	7799	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	14636614	14636887	14636775	Y	OR7C2	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	DNAJB1	1695	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	15336591	15336774	15336684	Y	NA	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	26799	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	16441306	16441578	16441415	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	7678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	16445319	16445495	16445399	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	11691	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	16493561	16493905	16493595	Y	KLF2	NA	NA	NA	NA	NA	KLF2	59933	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	16779311	16779659	16779460	Y	NA	MED26,TMEM38A	NA	NA	NA	NA	TMEM38A	9373	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	17190539	17191239	17190954	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	5948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	17890338	17890582	17890537	Y	FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1	FCHO1,B3GNT3	NA	NA	NA	NA	B3GNT3	13055	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	18059806	18059879	18059816	Y	UNC13A,KCNN1	CCDC124	NA	NA	NA	NA	CCDC124	17981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	18134654	18135106	18134872	Y	MAP1S,LRRC25,JUND,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	71497	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	18793678	18793914	18793817	Y	PDE4C	KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	1191	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr19	19248225	19248392	19248286	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	903	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	19589693	19590012	19589853	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	34533	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	19708713	19709032	19708957	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	PBX4,LPAR2,GMIP	NA	NA	NA	NA	PBX4	18693	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	19711724	19712118	19712001	Y	RFXANK,GATAD2A,GMIP	PBX4,LPAR2,GMIP	NA	NA	NA	NA	PBX4	15607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	19973327	19973547	19973437	Y	NA	ZNF253,ZNF93	ZNF253	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF253	1148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF91	266883	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	28385204	28385282	28385243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1317166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH1	98322	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	33740333	33740640	33740371	Y	NA	NA	CHST8,CEBPA,LOC80054,PEPD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPA	50830	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr19	35595565	35595951	35595710	Y	ZNF181,ZNF30	FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	47682	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	36666444	36666524	36666464	Y	NA	CAPNS1,ZNF146	NA	NA	NA	NA	ZNF146	36980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	36720266	36720641	36720459	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	14518	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr19	38495647	38495987	38495738	Y	SPRED3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	99779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	38536828	38537171	38536963	Y	ZNF571,ZNF573	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	140960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	PPP1R14A,C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	38796841	38796867	38796854	Y	NA	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	4040	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	39152764	39152958	39152839	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	16475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	39919610	39919819	39919723	Y	NA	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50	NA	NA	NA	NA	RPS16	4769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	40923099	40923282	40923196	Y	SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	PRX	5826	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	41827649	41828097	41827915	Y	HNRNPUL1,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	13555	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	41834727	41835191	41834967	Y	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	TMEM91	19625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	41849661	41849907	41849784	Y	HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	TMEM91	4909	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	5368	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	42514619	42514744	42514681	Y	ATP1A3	ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	14970	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr19	42785500	42785936	42785827	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	14811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	42902919	42903213	42903066	Y	TMEM145	NA	CNFN	MCF7	ChIA-PET	22265404	MEGF8	75158	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	42913594	42913985	42913852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	85833	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	43267088	43267316	43267247	Y	CEACAM1,PSG5	PSG3	NA	NA	NA	NA	PSG3	24367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	43355116	43355369	43355287	Y	NA	PSG8,PSG1	NA	NA	NA	NA	PSG8	2474	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	43509119	43509344	43509219	Y	NA	PSG11	NA	NA	NA	NA	PSG11	19320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	43770053	43770115	43770084	Y	NA	PSG9	NA	NA	NA	NA	PSG9	1567	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	NA	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	PSG9	63866	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	43974415	43974832	43974599	Y	NA	LYPD3,PHLDB3	LYPD3	K562	ChIA-PET	22265404	LYPD3	6603	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	44152096	44152277	44152103	Y	ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF428,CADM4,PLAUR	CADM4	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CADM4	10105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	44165978	44166186	44166121	Y	NA	ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	PLAUR	6513	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	44283400	44283793	44283490	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr19	45129392	45129792	45129578	Y	PVRL2,GEMIN7,GEMIN7,PVR	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	15306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	45344497	45344782	45344640	Y	CEACAM16,NKPD1,CLASRP	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	2650	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	45844650	45844836	45844820	Y	FBXO46,PPP1R13L	KLC3,ERCC2	NA	NA	NA	NA	KLC3	9958	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	45953262	45953678	45953446	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	15575	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	46014236	46014617	46014413	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	6399	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	46361761	46362096	46361929	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	SYMPK	2452	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	46385401	46385465	46385433	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1911	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	46504246	46504437	46504355	Y	EML2,PNMAL2,PNMAL1,NOVA2	CCDC61	NA	NA	NA	NA	CCDC61	7907	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	47611153	47611400	47611382	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	49051864	49052159	49052158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPHK2	68389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	49386525	49386775	49386581	Y	CD37,PPP1R15A	HSD17B14,PLEKHA4,PPP1R15A,NUCB1,DHDH	NA	NA	NA	NA	PPP1R15A	12876	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	49836983	49837445	49837293	Y	SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37	CTC-301O7.4,TEAD2	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	4420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	50004159	50004640	50004502	Y	PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11	ALDH16A1,PIH1D1,FLT3LG,RPL13A,SNORD33,RPS11,SNORD35B,FCGRT,RCN3	NA	NA	NA	NA	FCGRT	3433	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	50116585	50116794	50116665	Y	NA	NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1	NA	NA	NA	NA	PRR12	23685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr19	50205874	50206272	50205974	Y	NA	BCL2L12,IRF3,PRMT1,CPT1C	NA	NA	NA	NA	CPT1C	13719	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	50231635	50231822	50231729	Y	NA	CPT1C,AP2A1	NA	NA	NA	NA	AP2A1	36403	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	50417620	50417965	50417778	Y	NA	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,MIR4750,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	11994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	51898753	51899047	51898851	Y	SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1	ETFB	NA	NA	NA	NA	ETFB	31081	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	1272	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	555	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF665	32764	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	ZNF331	NA	NA	NA	NA	ZNF331	26278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	54052581	54053344	54052712	Y	NA	ZNF331	NA	NA	NA	NA	ZNF331	30346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	54352555	54352808	54352773	Y	VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM	MYADM	CACNG8,CACNG6,VSTM1,NDUFA3,OSCAR,TFPT,PRPF31,TMC4,MBOAT7,LILRB5,LILRA6,LILRA4,LILRB1,PRKCG,CACNG7	HELA,K562,H1ESC,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	MYADM	14669	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr19	54713468	54714085	54713942	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	10858	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	54772917	54773137	54772927	Y	NLRP12,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,LAIR1,LILRB3,LILRB2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS9	70307	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	55699968	55700281	55700219	Y	NA	TNNT1	NA	NA	NA	NA	TNNT1	41246	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	1148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	55960580	55961094	55961009	Y	SYT5,BRSK1,SHISA7	UBE2S,ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ISOC2	10616	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	29193	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr19	56097081	56097467	56097273	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	6870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr19	56118803	56119132	56118967	Y	COX6B2	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	7467	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	56796830	56796936	56796883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	80532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	56810811	56811236	56810900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	66232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	56831287	56831644	56831534	Y	ZSCAN5A	ZNF542,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZNF542	45824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF551	15291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	58911739	58912056	58911822	Y	NA	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	868	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	MGC2752	3527	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	1725652	1725860	1725698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	1050213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	2105199	2105393	2105246	Y	MYT1L	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	1274260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	3198841	3199068	3198933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	180585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	4262227	4262596	4262412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7	641432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	8743061	8743194	8743128	Y	ID2	NA	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	73781	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	8872785	8872976	8872902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.7	52792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	9142736	9142998	9142867	Y	NA	MBOAT2	NA	NA	NA	NA	MBOAT2	794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	9391833	9392063	9392058	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	46939	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	9427289	9427526	9427454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82395	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.16231146494599
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	CYS1,RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	10425680	10425925	10425803	Y	HPCAL1	HPCAL1	HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	15090	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	10430004	10430228	10430116	Y	NA	HPCAL1	HPCAL1,C2orf48,CYS1,RRM2,MIR4261,ODC1,NOL10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	10787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	10501440	10501782	10501611	Y	C2orf48	NA	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	60425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	10522808	10523000	10522904	Y	HPCAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ODC1	63630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	10540655	10540950	10540779	Y	KLF11,KLF11,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	45680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr2	10633765	10634017	10633925	Y	NOL10	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1,HPCAL1,NOL10,CYS1,RRM2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-320M2.1	46945	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	68329	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	15199994	15200355	15200088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	499099	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	15309828	15310293	15310034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	389161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	15464031	15464396	15464252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	235058	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	15603966	15604351	15604182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	95103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	19547126	19547267	19547173	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	9147	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	19548078	19548301	19548191	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	8113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	19985229	19985530	19985434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	81091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	MATN3,LAPTM4A	NA	NA	NA	NA	LAPTM4A	195	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	20784084	20784557	20784460	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	64292	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	20793103	20793496	20793437	Y	APOB	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	55353	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	20795868	20796230	20795893	Y	RHOB,HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	52619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	20965440	20965780	20965672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	55102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	23412802	23412834	23412819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	193254	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	23609943	23610311	23610250	Y	KLHL29	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	3855	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	24047559	24047784	24047672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	100200	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	24213695	24213947	24213707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf44	56498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	24535588	24535972	24535848	Y	NA	RPL36AP13,ITSN2	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	19409	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	25021346	25021618	25021482	Y	NA	CENPO,PTRHD1	NA	NA	NA	NA	PTRHD1	7095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	17060	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	26328559	26328812	26328686	Y	FAM59B,RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	73583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	26567616	26567683	26567653	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	2	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	26919291	26919602	26919376	Y	NA	AC015977.5,KCNK3	NA	NA	NA	NA	KCNK3	5672	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,KCNK3,CENPA	NA	NA	NA	NA	KCNK3	33315	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	SLC30A3,TRIM54,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28018603	28018692	28018648	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	26019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	28215985	28216067	28216026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	104020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28496743	28497020	28496828	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	116295	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28498872	28499304	28499073	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	114011	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28519223	28519459	28519305	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	93856	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	28575124	28575240	28575182	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	38075	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28585996	28586077	28586031	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	27238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28811153	28811289	28811218	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	NA	PPP1CB,SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	161217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	28991945	28992473	28991994	Y	NA	PPP1CB,SPDYA	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	SPDYA	10910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	SNORD53	NA	NA	NA	NA	SNORD53	25397	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr2	29352302	29352469	29352324	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	33731	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	29435309	29435425	29435367	Y	SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	116738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	29439591	29440302	29440265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	121020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	30788740	30788786	30788763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	120648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	30887906	30888094	30887998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	219814	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	31145047	31145178	31145113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT14	230890	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	36700444	36700711	36700553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	119375	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	36713753	36714120	36713762	Y	CRIM1,VIT,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	132684	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	36790074	36790520	36790216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	80710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37592833	37593153	37593092	Y	NA	PRKD3,QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	23116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37763005	37763322	37763129	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	193288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	193745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	37788822	37789049	37788928	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	174562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	37847073	37847432	37847190	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	116179	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37856694	37857004	37856833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	106607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37858321	37858709	37858681	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	104902	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	37864248	37864629	37864487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	98982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	37881606	37881960	37881783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	81651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37940534	37940802	37940700	Y	CDC42EP3	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	22809	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	37995727	37996117	37995888	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	32116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	38243408	38243779	38243596	Y	CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	91265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	38538303	38538646	38538475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	63781	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	38770175	38770358	38770267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLP0P6	63255	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	39059251	39059604	39059469	Y	NA	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	41471	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	39079289	39079498	39079407	Y	SRSF7,ARHGEF33	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21577	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	39338546	39339120	39338978	Y	ARHGEF33	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	10366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	39722003	39722381	39722147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	59550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	40630548	40630840	40630736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	205353	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	40676285	40676532	40676459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	159661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	42359577	42359846	42359732	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	34644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	20896	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	149235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	43313736	43313941	43313748	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	137807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	43440136	43440508	43440361	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	11240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	43692800	43693176	43692988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	128009	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	43908548	43908922	43908739	Y	PLEKHH2	PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	PLEKHH2	46136	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	44577605	44577885	44577745	Y	NA	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	9116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	44718441	44718530	44718486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	131352	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	44849210	44849529	44849370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	262121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	45225232	45225342	45225296	Y	NA	AC012354.8,SIX2	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	3680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	45811183	45811373	45811272	Y	NA	SRBD1	NA	NA	NA	NA	SRBD1	25931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	46265425	46265774	46265513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	253032	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	46294979	46295300	46295093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	223506	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	46557036	46557117	46557077	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	38230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	46614603	46614745	46614671	Y	RHOQ	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	95797	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	46784048	46784469	46784214	Y	NA	RHOQ,ATP6V1E2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	16352	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	46797577	46797967	46797772	Y	NA	RHOQ,ATP6V1E2,CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	29881	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr2	47031260	47031826	47031474	Y	NA	LINC01119	LOC388948,SOCS5,CRIPT,LOC100134259,MCFD2,TTC7A	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01119	10010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	47109327	47109734	47109459	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	31562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	47136942	47137149	47137052	Y	RHOQ,TTC7A	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	TTC7A	4147	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	47171092	47171539	47171232	Y	TTC7A,MCFD2	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	4098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	47206692	47207332	47207009	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	39698	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	47212237	47212567	47212294	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	45243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr2	47496922	47497231	47497077	Y	NA	AC106869.2	TTC7A,CALM2,C2orf61,MCFD2,SOCS5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC106869.2	45989	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	AC106869.2	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC106869.2	48773	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	47526778	47526800	47526792	Y	KCNK12	AC073283.4,EPCAM	TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61,EPCAM	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	43413	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	47790557	47790758	47790693	Y	KCNK12	NA	NA	NA	NA	NA	AC079250.1	125627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	51092337	51092826	51092639	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	2337815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	53966054	53966447	53966241	Y	PSME4	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	CHAC2	26482	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	54165408	54165630	54165519	Y	NA	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	ACYP2	30345	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	54714209	54714329	54714214	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	32787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.08901637849427
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	102693	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	55212013	55212317	55212165	Y	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	125440	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	55320625	55320761	55320684	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,EML6,RTN4	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	16996	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	55327095	55327368	55327210	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	10389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	55327778	55327923	55327859	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	9834	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	58271974	58272513	58272036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	139188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	58336722	58337105	58336916	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	129402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	58347874	58348075	58347917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	118432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	61207503	61207627	61207564	Y	NA	PEX13,PUS10	NA	NA	NA	NA	PEX13	34733	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	61466894	61467158	61467026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	64341	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	61586795	61586939	61586907	Y	AHSA2,USP34	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	108965	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	61644750	61644896	61644823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	51008	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr2	62806044	62806443	62806244	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	69015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	63287182	63287416	63287280	Y	OTX1	OTX1	NA	NA	NA	NA	OTX1	11990	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	63452850	63453196	63453026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	177658	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	63601034	63601048	63601041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1	212695	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	64018167	64018385	64018267	Y	NA	WDPCP,UGP2	UGP2	IMR90	Hi-C	24141950	WDPCP	34592	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	64207040	64207416	64207228	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	36790	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	64239166	64239247	64239208	Y	PELI1	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	4959	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	64360908	64361228	64361132	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	7145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	64364775	64365257	64365170	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	3116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	64844748	64845048	64844870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	95283	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	64995321	64996019	64995711	Y	SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	19182	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	65065938	65066285	65066136	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	89799	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	65086460	65086681	65086529	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110321	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	65089781	65090129	65089916	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	113642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	65212867	65212968	65212911	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	65214378	65214996	65214823	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	767	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	65221577	65221744	65221661	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	7966	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	65609993	65610402	65610168	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	47369	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	65634027	65634394	65634212	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	23377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	67067097	67067512	67067390	Y	NA	AC009474.2	LOC644838,MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC009474.2	38842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	68780015	68780176	68780096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLF	87322	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	69241314	69241782	69241454	Y	ANTXR1	GKN1,ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	3004	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	12300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	69469857	69470021	69469934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	142361	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	69481133	69481450	69481229	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	130932	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	69533941	69534050	69534019	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78332	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	69578985	69578997	69578991	Y	NA	GFPT1	NA	NA	NA	NA	GFPT1	33385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	69717115	69717269	69717170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFU1	54355	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	69852685	69852770	69852748	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	16787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	69857892	69858266	69858093	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	11291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70004336	70004726	70004528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	50048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70048617	70048893	70048741	Y	ANXA4	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	5881	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	70160460	70161117	70160745	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	PCBP1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ASPRV1	26280	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70161598	70161791	70161659	Y	PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	25606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70285414	70285703	70285559	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	26882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70294861	70295138	70295000	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	17447	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70331843	70331986	70331900	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	4160	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70388970	70389092	70389031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	61287	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	70823463	70823663	70823562	Y	TGFA	TGFA	NA	NA	NA	NA	TGFA	44138	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	71725442	71725771	71725690	Y	DYSF	DYSF	NA	NA	NA	NA	DYSF	46590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	71819414	71819502	71819458	Y	PAIP2B,DYSF	NA	NA	NA	NA	NA	DYSF	140562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	73338552	73338952	73338867	Y	RAB11FIP5	SFXN5,RAB11FIP5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	37805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	74616605	74616668	74616637	Y	NA	DCTN1,C2orf81,WDR54	NA	NA	NA	NA	DCTN1	546	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	74647656	74647929	74647851	Y	SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81	DCTN1,C2orf81,WDR54,INO80B,WBP1,MOGS	NA	NA	NA	NA	WDR54	851	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	74722835	74723021	74722928	Y	NA	INO80B,WBP1,MOGS,MRPL53,TTC31,CCDC142,LBX2,PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1	NA	NA	NA	NA	LBX2	5422	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	74801154	74801351	74801200	Y	DOK1	HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	20337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	75043732	75043824	75043778	Y	NA	HK2	HK2,SEMA4F	IMR90	Hi-C	24141950	HK2	15284	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	75076703	75076941	75076867	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	17595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	75102185	75102665	75102322	Y	HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	40610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	75114636	75114786	75114714	Y	NA	AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	28489	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	75141745	75142080	75142074	Y	NA	AC104135.3,POLE4	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	1195	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	75172635	75172664	75172650	Y	NA	AC104135.3,POLE4	POLE4,TACR1,HK2	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POLE4	10955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	75770641	75770653	75770647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	101256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	75834246	75834589	75834429	Y	NA	MRPL19	FAM176A,TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL19	37320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	80261096	80261278	80261177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	126983	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr2	81820947	81821308	81821128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1432686	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.75044261448009
chr2	85166635	85167198	85166950	Y	KCMF1,C2orf89	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	29018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr2	85186958	85187334	85187145	Y	NA	KCMF1	TMSB10,KCMF1	IMR90	Hi-C	24141950	KCMF1	8882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	85726317	85726428	85726373	Y	CAPG,VAMP8	MAT2A	TMEM150A,USP39,SH2D6,MAT2A,LOC100630918,TGOLN2,RETSAT,GGCX,VAMP5,VAMP8,RNF181,CAPG,C2orf68	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAT2A	37860	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	85887180	85887589	85887391	Y	SH2D6,SFTPB	C2orf68	NA	NA	NA	NA	C2orf68	49991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	86030361	86030633	86030487	Y	SH2D6	NA	LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ATOH8	53894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	IMMT	32286	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	88959127	88959352	88959240	Y	NA	EIF2AK3,RPIA	EIF2AK3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPIA	29810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	90485310	90485405	90485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	1421986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2752348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2752502	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2758114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2872873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	95982962	95983225	95982998	Y	PROM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	83244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	96198442	96198677	96198560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	131973	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	96811828	96812146	96811999	Y	TMEM127,KIAA1310,ARID5A,ASTL,DUSP2	ADRA2B,DUSP2	ASTL	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP2	2649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	97012594	97012961	97012778	Y	ASTL	SNRNP200,AC021188.4,ITPRIPL1,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	13069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	NEURL3	19761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	97211723	97211896	97211824	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,CNNM3,ARID5A	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	11243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	98290312	98290690	98290542	Y	TMEM131	COX5B,ACTR1B	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	11742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	98364129	98364314	98364298	Y	TMEM131,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	85559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	89408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC092675.3	147261	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	99077455	99077668	99077504	Y	TMEM131,MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	18138	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	99792031	99792038	99792035	Y	NA	C2orf15,LIPT1,TSGA10,MITD1,MRPL30	NA	NA	NA	NA	MITD1	3483	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	100388150	100388296	100388223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	283653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	100484034	100484497	100484368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	379537	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	100496681	100496959	100496872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	392184	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	100576722	100576856	100576853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	455262	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	401505	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	123330	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	101884483	101884674	101884578	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	TBC1D8,RNF149	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	17155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	101922561	101923216	101923063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF149	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	102492851	102493221	102493042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	181539	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	102649919	102650192	102650054	Y	IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2	IL1R1	NA	NA	NA	NA	IL1R1	28812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	102654225	102654461	102654316	Y	NA	IL1R1	NA	NA	NA	NA	IL1R1	24543	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	102844003	102844653	102844435	Y	IL1R2,IL18RAP,IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	81309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	102867550	102867715	102867627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	58247	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	103390349	103390733	103390541	Y	NA	MFSD9,TMEM182	NA	NA	NA	NA	TMEM182	38982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	104643293	104643309	104643301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018880.2	405205	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	105655685	105655967	105655739	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	3244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	105664202	105664255	105664229	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	11761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	105868744	105869077	105868909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBRAP1	75414	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	106022630	106022770	106022732	Y	GPR45	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	30200	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	108100579	108100790	108100686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULT1C2	802305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	108841436	108841459	108841449	Y	NA	NA	SULT1C2P1	IMR90	Hi-C	24141950	SULT1C2	61636	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	109206329	109206788	109206425	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	57472	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	109229262	109229375	109229308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	80405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	109859358	109859584	109859496	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	458145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	110271705	110271931	110271836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	97852	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	110318153	110318301	110318244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	51482	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	110863536	110863928	110863763	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	8215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	111817819	111818113	111817910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	56842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	111941595	111941939	111941767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	66640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	112253383	112253436	112253410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	378428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	112420062	112420336	112420200	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	219931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	112459778	112460151	112459873	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	180116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	112462014	112462125	112462055	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	178142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	113292630	113292957	113292832	Y	IL1A	POLR1B,CHCHD5	NA	NA	NA	NA	POLR1B	4535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	7242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	113388786	113388926	113388836	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	11042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	113551784	113552157	113551927	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	11617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	113552525	113552798	113552647	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	12358	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	113556767	113557612	113557074	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	IL37,CKAP2L,CHCHD5,IL1A,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	IL1A	16600	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	113569466	113569945	113569683	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	22535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	113581693	113582026	113582010	Y	NA	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	10454	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	113635122	113635394	113635287	Y	NA	IL1B	IL1B,CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	42642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	113638257	113639193	113638961	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1B	CKAP2L,IL1A	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	45777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	113969874	113970195	113970111	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	2775	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	114014908	114015299	114015271	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	47809	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr2	114126317	114126521	114126419	Y	IL1F10,IL1F10	NA	PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	159218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	114649026	114649412	114649076	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	3489	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	114672841	114673224	114672915	Y	NA	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	27304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	118578074	118578451	118578195	Y	CCDC93,DDX18	DDX18	NA	NA	NA	NA	DDX18	7848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	118722673	118722961	118722817	Y	NA	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	46748	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	118737562	118738119	118738029	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	31590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	118741787	118742055	118741993	Y	CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	27654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	119989660	119989833	119989766	Y	NA	STEAP3	NA	NA	NA	NA	STEAP3	10276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	120891923	120892273	120892121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	86711	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr2	121575399	121575754	121575577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	84200	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	122132591	122132855	122132729	Y	CLASP1	NA	NA	NA	NA	NA	AC013399.3	67020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	122405703	122406017	122405860	Y	NA	CLASP1,NIFK-AS1	NA	NA	NA	NA	NIFK-AS1	477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	122456992	122457582	122457167	Y	CLASP1	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	35097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	122480192	122480543	122480332	Y	NA	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	12136	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	122660785	122660843	122660814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	168106	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	122862808	122863193	122863011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	370129	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	122994452	122994784	122994618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	501773	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	124260647	124260891	124260797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	1767968	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	127819018	127819251	127819149	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	43680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	127836525	127836721	127836623	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	26210	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	127863441	127863795	127863513	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	510	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	128143711	128144108	128144023	Y	SFT2D3,MAP3K2	NA	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	LIMS2,SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	128919923	128920212	128920008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT1	73149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	128927207	128927481	128927321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT1	80433	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	129073927	129074235	129074112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	129901785	129902172	129901852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	793618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	133011418	133011623	133011538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	160524	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	133035126	133035421	133035327	Y	NA	NA	ANKRD30BL	IMR90	Hi-C	24141950	GPR39	136726	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	261568	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	135054765	135054954	135054860	Y	MGAT5	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	179211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	135062328	135062641	135062375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	186774	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	16838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	136242341	136242686	136242514	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	44120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	136504457	136504522	136504461	Y	NA	UBXN4	NA	NA	NA	NA	UBXN4	7268	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	136720209	136720558	136720339	Y	NA	AC093391.2,DARS	NA	NA	NA	NA	AC093391.2	20188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	136816831	136817220	136816922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DARS	75161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	138825307	138825392	138825350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	431876	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	139112246	139112514	139112380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	144754	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	139198512	139198615	139198564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	58653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	139464660	139464674	139464668	Y	NXPH2	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH2	71244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	143615896	143616223	143616082	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	16844	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	143720663	143721004	143720729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	87596	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	144019688	144020135	144019849	Y	KYNU,ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	386621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	144048951	144048966	144048960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	415884	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	144333976	144334184	144334004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	700909	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	145078226	145078371	145078292	Y	ZEB2,GTDC1,GTDC1,GTDC1	GTDC1	NA	NA	NA	NA	GTDC1	9764	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	145214152	145214623	145214350	Y	GTDC1,GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	65524	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	145416857	145417708	145417448	Y	ZEB2	NA	ZEB2	K562	ChIA-PET	22265404	ZEB2	136710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	147189297	147189317	147189307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC1P2	153695	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	149017229	149017560	149017414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ORC4	240082	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	149645940	149646152	149646140	Y	KIF5C	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	15121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	150278954	150279172	150279087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6	94455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	150440132	150440521	150440417	Y	NA	MMADHC	NA	NA	NA	NA	MMADHC	1809	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	150999106	150999378	150999253	Y	RND3	NA	RND3,MMADHC,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	394147	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	150999673	151000010	150999769	Y	NA	NA	RND3,MMADHC,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	393515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	151323622	151323873	151323744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	69652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	151389498	151389697	151389616	Y	NA	RND3	RBM43,RND3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	3828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	152971717	152971973	152971845	Y	NA	CACNB4	NA	NA	NA	NA	CACNB4	18124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	153057173	153057360	153057266	Y	FMNL2	STAM2	FMNL2	IMR90	Hi-C	24141950	STAM2	26667	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	153302279	153302595	153302384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	112528	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	153347389	153347769	153347704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	157638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	153599082	153599296	153599189	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	26571	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	154729073	154729474	154729153	Y	NA	GALNT13	NA	NA	NA	NA	GALNT13	2647	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	157147606	157147983	157147795	Y	NA	NR4A2	NA	NA	NA	NA	NR4A2	48877	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.05934425232951
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	157287649	157287933	157287736	Y	NR4A2,GPD2	GPD2	GPD2	K562	ChIA-PET	22265404	GPD2	1869	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	158039321	158039798	158039630	Y	NA	NA	NR4A2,GALNT5,GPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYTIP	303675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	158687871	158687996	158687910	Y	ACVR1,ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	42378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	160097747	160098072	160097910	Y	TANC1	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	43238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.1	58278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	160470388	160470776	160470715	Y	NA	AC009506.1,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	427	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	161064664	161064880	161064794	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLA2R1	147543	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	161141907	161142179	161141926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	120214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	161348201	161348679	161348535	Y	RBMS1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	162770388	162770557	162770473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP4	158495	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	162817649	162818074	162817753	Y	IFIH1	NA	NA	NA	NA	NA	DPP4	110978	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	163578974	163579343	163579088	Y	KCNH7	NA	NA	NA	NA	NA	GCA	405624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	164205577	164205788	164205730	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	384734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	164501816	164502222	164502220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	88300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	164530260	164530475	164530368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	60047	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	168366215	168366278	168366264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	218534	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	169347640	169347834	169347737	Y	NA	CERS6	NA	NA	NA	NA	CERS6	37268	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	171671285	171671753	171671591	Y	NA	AC007405.4,AC007405.6,GAD1	NA	NA	NA	NA	GAD1	3562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	172649817	172649933	172649875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	107898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	173114788	173114930	173114869	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	149160	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	173117910	173118399	173118084	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	152282	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	173316258	173316587	173316571	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	26176	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	173942556	173942831	173942720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	274717	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	174518967	174519016	174518991	Y	NA	NA	OLA1,CIR1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7	301419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	174776201	174776462	174776332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	51968	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	175069870	175070170	175070019	Y	WIPF1,SP3,SP3	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	41256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	175519164	175519290	175519227	Y	NA	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	26354	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	175762241	175762347	175762322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHN1	105750	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	176969861	176970296	176970124	Y	HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10	HOXD13,HOXD11,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4	NA	NA	NA	NA	HOXD11	2917	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	8.64924585978395
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	178131060	178131559	178131324	Y	NA	MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	AC079305.10	3973	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	180123713	180123938	180123827	Y	NA	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	3579	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	180724883	180725244	180725071	Y	ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	144596	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	180860561	180860723	180860664	Y	NA	CWC22	NA	NA	NA	NA	CWC22	9117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	182418889	182419281	182419085	Y	NEUROD1,CERKL	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	98960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	182741385	182741846	182741532	Y	SSFA2	SSFA2	PPP1R1C	IMR90	Hi-C	24141950	SSFA2	12714	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	185522686	185523010	185522766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	61593	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	185595976	185596316	185596146	Y	ZNF804A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	134883	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	187015061	187015446	187015349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	333437	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	187194208	187194220	187194214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	154663	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	187409105	187409391	187409239	Y	ITGAV,ITGAV	ITGAV	ITGAV	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGAV	43401	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	187455745	187456210	187455889	Y	NA	ITGAV	NA	NA	NA	NA	ITGAV	2953	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	188214138	188214480	188214300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALCRL	96707	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	188326523	188326725	188326579	Y	NA	CALCRL	NA	NA	NA	NA	CALCRL	15336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr2	188340607	188340894	188340852	Y	NA	CALCRL	NA	NA	NA	NA	CALCRL	29420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	189994721	189995040	189994923	Y	NA	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	47565	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	190075572	190075716	190075672	Y	DIRC1	COL5A2	COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	32967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	190308827	190308942	190308831	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	4668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	190729809	190730106	190729887	Y	OSGEPL1,PMS1	C2orf88	NA	NA	NA	NA	C2orf88	12229	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	191217459	191217900	191217739	Y	NA	INPP1,HIBCH	NA	NA	NA	NA	HIBCH	10540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	191406346	191406617	191406448	Y	NA	TMEM194B	INPP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194B	8898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	191512036	191512188	191512066	Y	INPP1,STAT1,GLS,NAB1	NAB1	NA	NA	NA	NA	NAB1	2564	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	191814146	191814507	191814301	Y	STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	41786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	191861736	191862119	191861929	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	5443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	164033	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	192562556	192562918	192562693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	146347	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr2	192915570	192915970	192915770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	142465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	193718012	193718039	193718028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	659577	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	193817686	193817882	193817784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	759251	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	194428592	194428916	194428605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	1370157	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	196547563	196547821	196547646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	108862	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	197004793	197005261	197004933	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	33966	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	197466180	197466534	197466307	Y	NA	CCDC150	CCDC150,HECW2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC150	35744	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	197623019	197623245	197623231	Y	NA	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	39204	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	197787148	197787421	197787192	Y	NA	PGAP1	NA	NA	NA	NA	PGAP1	3099	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	198328385	198328433	198328409	Y	PLCL1	SF3B1,COQ10B,HSPE1,MOB4	NA	NA	NA	NA	COQ10B	12238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	200209653	200209909	200209897	Y	SATB2,SATB2,SATB2	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	110514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	200270966	200271332	200271300	Y	NA	SATB2-AS1	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	49091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	200675242	200675584	200675389	Y	NA	FTCDNL1	NA	NA	NA	NA	FTCDNL1	38312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	201238754	201239056	201238905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	70150	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	201411222	201411458	201411252	Y	PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2	SGOL2,KCTD18,AOX1	NA	NA	NA	NA	KCTD18	28715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	201454959	201455229	201455094	Y	NA	AOX1	NA	NA	NA	NA	AOX1	6368	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	201652202	201652395	201652320	Y	NA	BZW1	BZW1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1	20922	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	201978583	201978718	201978642	Y	CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	201991403	201992374	201991715	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	12576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	201995421	201995893	201995513	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	CFLAR	16594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	202100663	202100910	202100770	Y	NA	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	4497	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	202723656	202723936	202723797	Y	NA	UBE2V1P11	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P11	36385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.19198359111074
chr2	203159775	203160145	203159798	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	31336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr2	203239784	203239912	203239798	Y	NA	BMPR2	NA	NA	NA	NA	BMPR2	125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	204288063	204288423	204288243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABI2	97121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	204315265	204315638	204315451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	82495	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	204373438	204373815	204373626	Y	NA	RAPH1	NA	NA	NA	NA	RAPH1	24318	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	204393119	204393487	204393303	Y	NA	RAPH1	NA	NA	NA	NA	RAPH1	4646	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	206563648	206564168	206563856	Y	INO80D	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	18934	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	206577207	206577609	206577411	Y	INO80D	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	32493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	207348794	207348941	207348896	Y	NA	ADAM23	NA	NA	NA	NA	ADAM23	42531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	207981292	207981447	207981370	Y	NA	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	48544	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	208195614	208195873	208195761	Y	NA	NA	KLF7,CREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	93240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	208200012	208200111	208200057	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	97638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	208366657	208366920	208366770	Y	METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	25541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	208378687	208378932	208378791	Y	CREB1	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	13529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr2	208791202	208791275	208791238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	97009	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	210233724	210233884	210233805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	52898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	213339164	213339568	213339278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERBB4	61997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	213400949	213401339	213401014	Y	ERBB4	ERBB4	NA	NA	NA	NA	ERBB4	226	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	216216979	216217372	216217176	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	42439	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	216222058	216222324	216222191	Y	FN1	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	47518	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	217181584	217181763	217181674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH4	52987	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	217214941	217215065	217215003	Y	NA	MARCH4	NA	NA	NA	NA	MARCH4	19685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	217224230	217224623	217224427	Y	NA	MARCH4	NA	NA	NA	NA	MARCH4	10127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	529950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1,PLCD4	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	219598381	219598949	219598614	Y	TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,CYP27A1	TTLL4,CYP27A1	NA	NA	NA	NA	TTLL4	24813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	NA	WNT6	50971	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.1	6236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	221802042	221802413	221802264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	634509	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	222997950	222998004	222997977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPP2	289232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	223447202	223447309	223447256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	71747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	223654105	223654355	223654256	Y	SGPP2	NA	ACSL3,MOGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL3	69297	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	223757137	223757389	223757313	Y	NA	ACSL3	NA	NA	NA	NA	ACSL3	33485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	224413942	224414282	224414142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCG2	50939	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	224428219	224428432	224428353	Y	NA	SCG2	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	36789	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	104129	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr2	224808298	224808709	224808400	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	194	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	224852422	224852838	224852675	Y	NA	WDFY1,MRPL44,SERPINE2	NA	NA	NA	NA	MRPL44	32301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	224951199	224951592	224951399	Y	NA	SERPINE2	NA	NA	NA	NA	SERPINE2	49163	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	225307433	225307612	225307516	Y	FAM124B	NA	FAM124B,CUL3,SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	CUL3	140498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	225641346	225641365	225641350	Y	CUL3,DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	193236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	225667173	225667319	225667307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	219063	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	225711035	225711198	225711117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	193964	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	225720701	225721025	225720950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	184137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	225841174	225841410	225841405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	63752	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	225864044	225864445	225864307	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	40717	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	225878647	225879031	225878803	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	26131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	227448462	227448628	227448535	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736,NYAP2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	213847	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	227526564	227526855	227526789	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	135620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	227624688	227624840	227624750	Y	NA	IRS1	NA	NA	NA	NA	IRS1	37635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	228253438	228253721	228253534	Y	CCL20,AGFG1	NA	TM4SF20,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	MFF	65571	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	228270733	228271155	228270942	Y	NA	NA	C2orf83,AGFG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	63713	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	228578021	228578290	228578242	Y	NA	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	2438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	228713173	228713709	228713566	Y	NA	CCL20	NA	NA	NA	NA	CCL20	36615	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	228728073	228728272	228728126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL20	51515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	228742760	228743014	228742884	Y	WDR69	NA	NA	NA	NA	NA	CCL20	66202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	230118973	230119267	230119206	Y	NA	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	14734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	230177949	230179205	230178556	Y	PID1	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	43948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	230280795	230281434	230280933	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	146794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	230784453	230784592	230784556	Y	NA	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1867	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	231322204	231322520	231322312	Y	SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,CAB39,SP100,SP100	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	43547	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	231348028	231348161	231348095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP100	69371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	231658746	231658958	231658902	Y	SP140L,SP100,SP100	NA	NA	NA	NA	NA	ITM2C	68396	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	232046537	232047112	232046768	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	14148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	232176481	232176522	232176502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018738.2	57671	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	232254414	232254430	232254422	Y	NA	B3GNT7	B3GNT7	K562	ChIA-PET	22265404	B3GNT7	3824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	75682	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85186	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85673	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	232580827	232581056	232580891	Y	NA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	11222	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	233180259	233180746	233180485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPP	60498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	233763823	233764207	233764133	Y	EFHD1,NGEF	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	43843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr2	234411221	234411336	234411279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP40	62092	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	130399	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	235872484	235872869	235872649	Y	NA	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	13867	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	235905010	235905389	235905297	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	46393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr2	235959667	235960159	235959834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	101050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	236453392	236453640	236453439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	52659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	236489079	236489125	236489102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	88346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	236562836	236563015	236562857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	162103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	236698901	236699175	236699041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	298168	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.95637703971304
chr2	237088797	237088932	237088867	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	GBX2	13785	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBX2	407971	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	238016795	238017153	238016975	Y	NA	COPS8,AC105760.2	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	24335	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	238036930	238037258	238037105	Y	NA	COPS8,AC105760.2	COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	44470	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	238092955	238093156	238093082	Y	NA	NA	COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	100495	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	238188791	238189175	238189021	Y	COL6A3	NA	MLPH,COL6A3,COPS8	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A3	131843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	238190645	238190921	238190759	Y	NA	NA	MLPH,COL6A3,COPS8,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A3	130097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	238374283	238374521	238374346	Y	COL6A3	MLPH	LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	MLPH	17550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr2	238694351	238694559	238694455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	160132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.19198359111074
chr2	239367827	239368002	239367915	Y	NA	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	34444	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	NA	NA	NA	NA	NA	ASB1	445740	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	240173626	240173903	240173698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	147227	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	240195931	240196233	240196082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124897	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	240210840	240211190	240211015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	109940	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	240267449	240267666	240267577	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	53464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	241366341	241366661	241366471	Y	GPR35,GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	6427	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr2	242425566	242425726	242425646	Y	NA	STK25	NA	NA	NA	NA	STK25	21419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	242484648	242485001	242484705	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	11135	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	353974	354548	354311	Y	SRXN1,FAM110A	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	4713	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	1154843	1155127	1154985	Y	FAM110A,SIRPB2,SIRPB1	NA	NA	NA	NA	NA	PSMF1	62937	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	1168274	1168908	1168417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPH	76052	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	1310858	1311228	1310987	Y	SDCBP2,SDCBP2,SIRPG	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	60578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	37961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	1396685	1396983	1396828	Y	SDCBP2,SIRPA	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	24879	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	2648841	2649036	2648938	Y	NA	NOP56,SNORD110,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7	EBF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-686C3.7	5843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	3159596	3159937	3159912	Y	PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	20754	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	3779808	3780100	3779895	Y	PANK2,PANK2,CDC25B	C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	14230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	4198420	4198722	4198592	Y	SMOX,ADRA1D	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	98793	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	4203123	4203484	4203336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	103496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	4906931	4907179	4907055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA31	59301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	8210701	8210953	8210827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	99877	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	8412863	8413194	8412910	Y	TMX4,PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	302039	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	8435134	8435511	8435284	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	324310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	8534755	8534925	8534840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	423931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	9476940	9477296	9477117	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	429530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	17538189	17538505	17538334	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	BFSP1	9360	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	17830949	17831353	17831268	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	110236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	19783112	19783320	19783290	Y	NA	RP1-122P22.2	RIN2,SLC24A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	46760	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	19804713	19804972	19804782	Y	NA	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	68361	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	19889354	19889507	19889429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	106253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	19897230	19897457	19897372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	98303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	19967147	19967464	19967305	Y	NA	NAA20	NA	NA	NA	NA	NAA20	28296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	20652620	20652826	20652771	Y	NA	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	38305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	21082914	21083089	21083038	Y	NA	PLK1S1	PLK1S1,NKX2-2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLK1S1	21535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	21417020	21417216	21417107	Y	NA	NA	XRN2	IMR90	Hi-C	24141950	XRN2	135078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	21486506	21486611	21486559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRN2	204564	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	30109241	30109638	30109448	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	9010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30111445	30111879	30111615	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	11214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	30190743	30190994	30190797	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	92	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr20	30194967	30195344	30195216	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	3881	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30200712	30201016	30200864	Y	TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	9626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	30305141	30305549	30305422	Y	PLAGL2,HCK	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	4243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30538610	30538727	30538660	Y	DUSP15,DUSP15,DUSP15,TTLL9	PDRG1	NA	NA	NA	NA	PDRG1	715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30613136	30613382	30613302	Y	NA	HCK	NA	NA	NA	NA	HCK	24609	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30646515	30646916	30646613	Y	BCL2L1,PLAGL2,C20orf112,HCK	HCK,TM9SF4	NA	NA	NA	NA	HCK	8524	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	30658621	30658804	30658731	Y	PLAGL2,C20orf112,HCK	HCK,TM9SF4	NA	NA	NA	NA	HCK	20630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr20	32828802	32829240	32829000	Y	NA	NA	EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	68368	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	33899361	33899545	33899443	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	28573	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	33900177	33900484	33900409	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	29389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	33907005	33907177	33907091	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	33943108	33943431	33943270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF6	72320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	34018897	34019177	34019037	Y	MYH7B	GDF5,CEP250	NA	NA	NA	NA	GDF5	21391	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	34470947	34471302	34471125	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	2279	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr20	35102828	35103254	35103050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	64633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	35212579	35212832	35212706	Y	NA	MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	TGIF2	12688	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	35723463	35723698	35723601	Y	NA	RBL1	NA	NA	NA	NA	RBL1	1275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	35874402	35874620	35874497	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	41421	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	35923453	35923684	35923588	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	7412	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	36056702	36057072	36056829	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	14864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	36763112	36763416	36763201	Y	NA	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	29564	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	36780859	36781241	36781066	Y	RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	11739	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	36796708	36797026	36796907	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	TGM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TGM2	3728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPB	130499	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	37351314	37351914	37351610	Y	SLC32A1	ACTR5	NA	NA	NA	NA	ACTR5	23171	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	39661985	39662084	39662008	Y	NA	RNU2-52P,TOP1	NA	NA	NA	NA	TOP1	6527	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	39958158	39958419	39958360	Y	NA	ZHX3,LPIN3,EMILIN3	PLCG1,ZHX3,LPIN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LPIN3	9141	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	40188226	40188487	40188477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	56646	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	40247725	40248017	40247738	Y	NA	CHD6	NA	NA	NA	NA	CHD6	2592	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	4176	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	43223501	43223813	43223570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADA	55061	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	43239191	43239604	43239345	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39270	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	43321614	43322020	43321838	Y	WISP2,KCNK15	ADA,RP11-445H22.3,WISP2	LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-445H22.3	717	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFDC5	51465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr20	43709360	43709760	43709560	Y	NA	WFDC5	NA	NA	NA	NA	WFDC5	32053	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	43744637	43744818	43744729	Y	WFDC5	WFDC5	NA	NA	NA	NA	WFDC5	2824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	43767332	43767709	43767669	Y	NA	WFDC5,PI3	STK4,MATN4,RBPJL	IMR90	Hi-C	24141950	WFDC5	25519	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	43970100	43970351	43970215	Y	NA	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	4713	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	44056635	44056652	44056644	Y	NA	PIGT,WFDC2	NA	NA	NA	NA	PIGT	13918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	44393897	44394275	44394207	Y	NA	DNTTIP1,UBE2C	NA	NA	NA	NA	DNTTIP1	24301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	44604057	44604097	44604095	Y	NA	PCIF1,ZNF335,MMP9,SLC12A5	NA	NA	NA	NA	ZNF335	5224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	47544338	47544681	47544534	Y	DDX27	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	7911	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	47773105	47773432	47773269	Y	NA	STAU1	NA	NA	NA	NA	STAU1	29472	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	47961628	47961789	47961714	Y	NA	NA	B4GALT5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD12	66408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48615959	48616196	48616096	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	18423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48707582	48707967	48707775	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	22529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48753681	48754062	48753956	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	14112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48760872	48761304	48761158	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	6870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48809447	48810205	48810164	Y	B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	4071	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48903106	48903611	48903352	Y	NA	RP11-290F20.3	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-290F20.3	21083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr20	48938558	48938763	48938674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	56535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	69772	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	49553399	49553600	49553500	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	7441	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	49596851	49597164	49596956	Y	PTPN1	DPM1,MOCS3,KCNG1	NA	NA	NA	NA	MOCS3	23488	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	50100584	50100753	50100686	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	248319	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	100689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr20	50366318	50366439	50366379	Y	NA	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	16734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	50664352	50664405	50664395	Y	NA	NA	ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	154442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	50692863	50693237	50693120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	125610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	52195343	52195714	52195527	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	28732	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	52196593	52196861	52196746	Y	TSHZ2,ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	52346173	52346470	52346387	Y	NA	NA	ZNF217	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	121727	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	52390351	52390640	52390407	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	165905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220134	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	52445043	52445455	52445100	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220597	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	52516053	52516507	52516332	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	272005	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr20	52530834	52531236	52530898	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	257276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	52531977	52532203	52532002	Y	NA	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	256309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	255623	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	244941	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	52831217	52831490	52831439	Y	NA	CYP24A1,PFDN4	NA	NA	NA	NA	PFDN4	8831	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	53116440	53116542	53116504	Y	DOK5	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	294054	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P1	211172	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	57585788	57586041	57585915	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	5486	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	57596187	57596442	57596344	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	ATP5E	8995	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	58225793	58225841	58225817	Y	ZNF831,PHACTR3,PHACTR3,CDH26,PHACTR3	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	280869	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	54923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr20	58459134	58459312	58459218	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177	SYCP2	NA	NA	NA	NA	SYCP2	47398	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	60972798	60973035	60972874	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	7306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	61200879	61201219	61201079	Y	NA	NA	RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20	IMR90	Hi-C	24141950	SLCO4A1	70578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	61317452	61317806	61317666	Y	DPH3P1,OGFR,SLCO4A1	SLCO4A1,NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	20383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIDO1	120685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	62479673	62479738	62479706	Y	NA	RP4-583P15.11,TPD52L2,DNAJC5	SLC2A4RG,ZBTB46,LIME1,ZGPAT,TPD52L2,UCKL1,MIR1914	IMR90	Hi-C	24141950	TPD52L2	14858	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr21	10701810	10702195	10702003	Y	NA	NA	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	394785	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	11174514	11174910	11174556	Y	NA	NA	BAGE5,TPTE	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	77534	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	11184749	11185145	11184947	Y	BAGE2,BAGE	NA	NA	NA	NA	NA	BAGE2	87769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	17264124	17264427	17264344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	163780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	17276028	17276063	17276046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	164779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	17568022	17568137	17568068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	86952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	251820	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr21	17924273	17924626	17924451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	269184	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	17947903	17948171	17948037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	292814	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	304311	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	305578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr21	18212520	18212612	18212566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	557431	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	18984370	18984546	18984496	Y	NA	BTG3	NA	NA	NA	NA	BTG3	1105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	176393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	23538013	23538045	23538029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	1169380	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	19836	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	26952450	26952820	26952600	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	20229	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	26956680	26957339	26957242	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	20490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MIR155HG,MRPL39,JAM2	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr21	26980548	26980842	26980671	Y	NA	MIR155HG,MRPL39,JAM2	NA	NA	NA	NA	MRPL39	2719	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	27242944	27243154	27243052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	136960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	27335144	27335525	27335335	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	205921	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	28207147	28207505	28207325	Y	NA	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	8223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	28336800	28337144	28336952	Y	ADAMTS1,ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	28797067	28797570	28797293	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	460235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	28942556	28942990	28942803	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	605724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr21	28945118	28945334	28945247	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	608286	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	30009367	30009732	30009551	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	245961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr21	30555048	30555502	30555259	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	4088	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	30580486	30581464	30581071	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	16094	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	30669074	30669451	30669267	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	104682	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	30675702	30676052	30675894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	111310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	30754427	30754628	30754578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	190035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	30967382	30967686	30967533	Y	GRIK1	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK1	342665	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	31029045	31029571	31029224	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK1	280780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	32531402	32531778	32531665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	397780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	32727234	32727499	32727493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	202059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	32868770	32868927	32868849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	60631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	34576237	34576546	34576341	Y	SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2	IFNAR2	IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432	IMR90	Hi-C	24141950	IFNAR2	23660	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	35570503	35571291	35570720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	126633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	35750965	35751183	35751074	Y	KCNE1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234258	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	35917479	35917977	35917777	Y	KCNE1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	67464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	158530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr21	36167928	36168243	36168166	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	182487	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36174477	36174817	36174756	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	189036	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36181032	36181199	36181134	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	195591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36185927	36186112	36186038	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	200486	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36203156	36203348	36203246	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	217715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36207924	36208159	36208081	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222483	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	36217934	36218360	36217961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	232493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	36219873	36220239	36220187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	36220749	36221095	36220890	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	235308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	237131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36227422	36227493	36227482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	241981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	247775	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr21	36263020	36263336	36263172	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	277579	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36281882	36282257	36282001	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	296441	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr21	36326686	36327019	36326981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	341245	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36336896	36337096	36337005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	351455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36349860	36350141	36349984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	364419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36355491	36355634	36355586	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	370050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	36356108	36356416	36356285	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	370667	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr21	36367475	36367815	36367753	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	382034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	36379576	36379916	36379746	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	394135	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433849	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	438201	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	38074425	38074708	38074699	Y	NA	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	4992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	38235070	38235202	38235136	Y	TTC3,HLCS	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	101610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	38282263	38282520	38282368	Y	CLDN14	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	54292	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	39430494	39430871	39430698	Y	DSCR4	NA	NA	NA	NA	NA	DSCR4	60583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	40176258	40176616	40176368	Y	NA	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	1027	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	40209875	40210169	40209958	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	34644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	40211972	40212276	40212079	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	36741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	40212954	40213097	40213043	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	37723	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	40527943	40528201	40528072	Y	NA	PSMG1	NA	NA	NA	NA	PSMG1	25576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	40814197	40814412	40814270	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	LCA5L	1319	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	43174806	43174946	43174886	Y	NA	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	10320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	43183711	43183960	43183836	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	1306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	43214290	43214658	43214474	Y	NA	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	29024	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	43331076	43331447	43331406	Y	NA	PRDM15,C2CD2	NA	NA	NA	NA	PRDM15	33485	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	43460613	43461088	43460825	Y	C2CD2,SLC37A1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	88614	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr21	44166782	44167013	44166806	Y	UBASH3A,PKNOX1	NA	NA	NA	NA	NA	WDR4	130665	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44355985	44356328	44356154	Y	NA	PKNOX1	U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	PKNOX1	36292	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr21	44573696	44574026	44573784	Y	NA	U2AF1	HSF2BP,LINC00319,LINC00313,SIK1,RRP1B,U2AF1,WDR4,NDUFV3,PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	47999	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44582937	44583304	44583126	Y	NA	NA	HSF2BP,LINC00313,U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	57240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44727448	44727599	44727495	Y	PKNOX1,SIK1	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	117409	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44759656	44759904	44759692	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	85104	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44792965	44793192	44793096	Y	NA	NA	LINC00313,CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	51816	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	44830426	44830842	44830489	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	14166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	44831891	44832268	44832005	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	12740	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44859375	44859527	44859442	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	14367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	44860778	44861412	44860950	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	15770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	44913472	44913707	44913565	Y	PDXK	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	68464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	69458	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	72994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr21	45029471	45029828	45029593	Y	PDXK	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	47546	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	45543595	45544017	45543789	Y	KRTAP10-6,TRPM2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	7470	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	46302248	46302499	46302417	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PTTG1IP	10496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	46495480	46495526	46495490	Y	KRTAP10-12,ADARB1	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	3712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	46501791	46502122	46501857	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	10023	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	46894520	46894647	46894596	Y	COL18A1	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	67678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	47295042	47295436	47295304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	104215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	47564330	47564867	47564460	Y	S100B,FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	48319	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr21	47993556	47993894	47993723	Y	DIP2A,S100B,PRMT2	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	59185	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	17528836	17529213	17528959	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	34631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	18056540	18056875	18056678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E1	52709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	18264435	18264847	18264620	Y	CECR2,ATP6V1E1,BCL2L13,USP18,BID,BID	BID	NA	NA	NA	NA	BID	8899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	18280978	18281337	18281098	Y	BID,BID	BID	NA	NA	NA	NA	BID	25442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L,AC000078.5	NA	NA	NA	NA	AC000078.5	3125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	19874514	19874924	19874610	Y	TRMT2A,C22orf29,GNB1L	C22orf29,GNB1L,AC000078.5	GNB1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC000078.5	1702	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	20199029	20199266	20199148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8	84050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	XXbac-B444P24.10	1760	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	ZNF74,SCARF2	NA	NA	NA	NA	SCARF2	17370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr22	20885626	20885829	20885752	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	37426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	21273214	21273312	21273263	Y	NA	CRKL,XXbac-B135H6.15	NA	NA	NA	NA	CRKL	3500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr22	22067448	22067680	22067564	Y	YPEL1	YPEL1	NA	NA	NA	NA	YPEL1	20443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	23624437	23624690	23624563	Y	BCR	NA	NA	NA	NA	NA	BCR	104546	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	24080371	24080411	24080401	Y	NA	GUSBP11,ZNF70,MMP11,CHCHD10,SMARCB1	NA	NA	NA	NA	ZNF70	10868	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	24234499	24234593	24234547	Y	NA	SLC2A11,MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	13631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	24948988	24949121	24949055	Y	ADORA2A	SNRPD3,FAM211B	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM211B	361556	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	394665	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	25390259	25390306	25390285	Y	NA	NA	KIAA1671	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM211B	403084	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	25587613	25587664	25587639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5L	211680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC28-AS1	247638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	28475489	28475734	28475658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	161367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	28797071	28797274	28797258	Y	PITPNB,XBP1,CCDC117	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	338745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	29188218	29188399	29188309	Y	NA	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	XBP1	6186	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	29591621	29591757	29591669	Y	EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	8083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	29705410	29705600	29705517	Y	GAS2L1	EWSR1,RHBDD3,GAS2L1	NA	NA	NA	NA	GAS2L1	4838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30018031	30018407	30018261	Y	NF2	NIPSNAP1,NF2	NA	NA	NA	NA	NF2	20486	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30608541	30609106	30608754	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	31734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30631749	30632163	30631958	Y	RNF215,MTFP1,GAL3ST1	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	8677	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30643780	30644513	30644215	Y	GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	2940	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30646485	30646883	30646861	Y	SEC14L2,RNF215,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	5645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	30647782	30648063	30647863	Y	SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	6942	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	8356	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr22	30650339	30650644	30650477	Y	LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	9499	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30652191	30652351	30652329	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr22	32027602	32027834	32027718	Y	NA	PISD	NA	NA	NA	NA	PISD	28584	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	32042427	32042918	32042716	Y	RNF185,LIMK2	PISD	NA	NA	NA	NA	PISD	13500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	35555825	35556131	35555978	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	68918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	35767811	35768194	35767985	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	NA	NA	NA	NA	HMOX1	6160	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	36753062	36753318	36753212	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	28745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	36759233	36759313	36759256	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	22750	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	36767098	36767482	36767405	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	14581	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	17637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	37663226	37663580	37663275	Y	MFNG,MFNG,NCF4,RAC2	Z82188.1,RAC2	CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	24738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr22	38711439	38711868	38711815	Y	SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	44399	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	39570081	39570473	39570178	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBX7	23402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	40451411	40451463	40451437	Y	NA	TNRC6B,RPL7P52	NA	NA	NA	NA	TNRC6B	12590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	40888295	40888668	40888528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	123700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	41346258	41346618	41346399	Y	EP300	RBX1	NA	NA	NA	NA	RBX1	907	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	42008568	42008780	42008674	Y	NA	PMM1,XRCC6	NA	NA	NA	NA	XRCC6	6343	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr22	42257974	42258323	42258180	Y	CENPM	SREBF2	NA	NA	NA	NA	SREBF2	30865	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	42485778	42486189	42485966	Y	CCDC134,CENPM,NFAM1,C22orf32	NAGA,FAM109B,NDUFA6,OLA1P1	NA	NA	NA	NA	NDUFA6	819	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	42527695	42528060	42527840	Y	CYP2D6	NDUFA6,OLA1P1	NA	NA	NA	NA	OLA1P1	24738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	43076677	43076928	43076817	Y	NFAM1,ARFGAP3	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	CYB5R3	33103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	43116155	43116318	43116237	Y	CYB5R3,A4GALT	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	851	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	44731310	44731638	44731630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	160540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	44947082	44947372	44947286	Y	PARVG,PARVG	NA	PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	54904	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46008367	46008678	46008581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	57000	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	46028588	46028889	46028879	Y	WNT7B	ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	36789	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46035019	46035329	46035174	Y	NA	ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	30349	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	45249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3157	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr22	46423205	46423605	46423251	Y	NA	C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	C22orf26	24419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	6311	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46924162	46924396	46924177	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	6671	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	46989093	46989561	46989508	Y	TBC1D22A,CERK,GRAMD4	GRAMD4	GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	19184	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	47150443	47150659	47150583	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	5859	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	RP11-191L9.4	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-191L9.4	10218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	48184441	48184585	48184513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	159018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	50327730	50328489	50328002	Y	TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr22	50449954	50450129	50450055	Y	IL17REL	NA	NA	NA	NA	NA	PIM3	97793	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	50769449	50769513	50769481	Y	MOV10L1	PLXNB2,PPP6R2	PLXNB2,FAM116B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PPP6R2	10220	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CTA-384D8.31,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	4415	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	3202241	3202572	3202332	Y	NA	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	16822	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	4468384	4468713	4468579	Y	NA	SUMF1	NA	NA	NA	NA	SUMF1	38252	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	4561829	4562207	4561897	Y	BHLHE40,ITPR1	ITPR1-AS1,ITPR1	NA	NA	NA	NA	ITPR1	28797	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	4782381	4782909	4782524	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	8365	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	4870806	4870892	4870849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGOT	79532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	4908577	4908896	4908639	Y	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	109905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	16924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	5181258	5181597	5181446	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	19353	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	5191163	5191386	5191276	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	ARL8B	29258	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	8529087	8529361	8529226	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	12032	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	8544131	8544195	8544133	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	2738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	8802643	8803023	8802833	Y	OXTR	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	6291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	8807929	8808317	8808062	Y	OXTR	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	8906303	8906783	8906429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	96674	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr3	8978841	8979048	8978945	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	24409	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	9050336	9050687	9050476	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	46879	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	29146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	10240691	10241307	10240999	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	36142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr3	10247090	10247317	10247193	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	40390	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	10402355	10402452	10402401	Y	FANCD2	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	41493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	11187629	11187920	11187792	Y	HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	10850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	11197111	11197379	11197271	Y	VGLL4,SLC6A11,SLC6A1,HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	20332	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	11261398	11261658	11261529	Y	HRH1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	50337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	11279893	11280094	11280011	Y	NA	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	31901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	11316376	11316801	11316733	Y	NA	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	4381	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	11320526	11320900	11320739	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	8531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	11591830	11592141	11591986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	168079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	11609664	11609798	11609746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	150422	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	12345089	12345969	12345668	Y	RAF1,PPARG,PPARG,PPARG	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	18222	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	12350153	12350305	12350183	Y	NA	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	23286	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr3	12369841	12370512	12370195	Y	PPARG,PPARG,PPARG	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	42974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	12386663	12386813	12386738	Y	PPARG,PPARG,PPARG	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	59796	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	12555203	12555562	12555379	Y	NA	TSEN2,MKRN2	NA	NA	NA	NA	TSEN2	31272	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	12584271	12584371	12584321	Y	NA	MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	12142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	12621651	12621927	12621686	Y	RPL32	MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	25138	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr3	13457131	13457321	13457226	Y	NUP210	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	2488	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43,AC093495.4	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr3	14413329	14413583	14413465	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC6A6	28493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	14466133	14466429	14466346	Y	C3orf19,XPC,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	24057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	15060728	15061023	15060876	Y	NR2C2	MRPS25	NA	NA	NA	NA	MRPS25	43819	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	15453852	15454017	15453935	Y	NA	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	12845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	15723851	15723947	15723900	Y	NA	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	HACL1	82513	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	15780032	15780074	15780052	Y	SH3BP5,EAF1	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	119204	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	15835826	15836097	15835987	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	63181	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	ANKRD28	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	2597	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	16097736	16098110	16098018	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	198458	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	16352603	16353027	16352777	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	47897	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	16379697	16380223	16379925	Y	DPH3	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	74991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	16489627	16489868	16489748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	63665	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	17248138	17248312	17248225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	405979	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	536153	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	17404652	17404912	17404782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	562493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	17505233	17505390	17505312	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	663074	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	700704	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	701153	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	17622451	17622654	17622556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	780292	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	18140643	18140862	18140682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	343447	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	18485117	18485365	18485120	Y	NA	TBC1D5,AC144521.1,SATB1	NA	NA	NA	NA	SATB1	37	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	610204	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	19276013	19276112	19276058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	697848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	20012721	20012798	20012760	Y	NA	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	26150	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	20200050	20200329	20200065	Y	NA	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	25455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	21722785	21723001	21722895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D	689811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	23201434	23201636	23201539	Y	UBE2E2	UBE2E2	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E2	40875	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	23389835	23390198	23389844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	147324	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	23709947	23710120	23710034	Y	UBE2E1	NA	UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	135274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	23787915	23788432	23788117	Y	UBE2E1	NA	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	56962	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	23946487	23946815	23946592	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	RPL15	9221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	23991964	23992189	23991965	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	5882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	27448684	27449023	27448831	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	74888	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	27574847	27574895	27574871	Y	NA	NA	AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	50936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	27595449	27595580	27595515	Y	NA	NA	SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	71538	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.57418031541189
chr3	27719100	27719312	27719216	Y	NA	AC098614.2,EOMES	NEK10,SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	42894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	28049666	28050044	28049928	Y	EOMES,CMC1	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	231031	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	29568670	29568984	29568828	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	248197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	29660032	29660218	29660060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	339559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	30646968	30647109	30647039	Y	TGFBR2	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32434248	32434406	32434345	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	3085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	12268	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32453477	32453643	32453560	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	22314	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	30788	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32463504	32463726	32463567	Y	CMTM6	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	32341	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32490271	32490322	32490297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMTM6	52578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32501642	32502196	32501852	Y	CNOT10,CCR4,CMTM7	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	40704	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32534481	32534843	32534759	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	8057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	32557705	32558097	32557882	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	14805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	33086079	33086426	33086309	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	12724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	36937540	36937792	36937666	Y	NA	TRANK1	NA	NA	NA	NA	TRANK1	46756	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	37332823	37333208	37333001	Y	NA	AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	49137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	38207945	38208258	38208101	Y	VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	3365	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	38227489	38227608	38227524	Y	NA	MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	22909	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	38497232	38497482	38497354	Y	NA	ACVR2B,EXOG	NA	NA	NA	NA	ACVR2B	3890	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	39191403	39191804	39191748	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	2249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	42078040	42078206	42078049	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	24746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	42103073	42103570	42103397	Y	NA	TRAK1	ZNF621,ZNF620,TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	49779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	167631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	43427917	43428246	43428244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	101913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	44039694	44039852	44039755	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	113852	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	112870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	9.16408192286633
chr3	44073188	44073424	44073310	Y	NA	NA	FAM198A,ANO10,MIR138-1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	80280	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	45106273	45106458	45106405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	79456	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	45138887	45139080	45139004	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	46834	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	45140818	45140977	45140897	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	44937	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	45142532	45142787	45142664	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	45146738	45147081	45147019	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38833	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38307	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.64747540186361
chr3	45161726	45162069	45161866	Y	TMEM158	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	23845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	45164613	45164770	45164669	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	21144	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	45165344	45165812	45165623	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	20102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	19777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	45175300	45175656	45175542	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	10258	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	45185924	45186005	45185965	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	10	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	45208648	45208845	45208728	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	8981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	46546407	46546628	46546504	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC2	72961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	4.2216557172755
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	47004561	47004925	47004746	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	14248	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	47120016	47120037	47120026	Y	SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	83420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	48651627	48651919	48651775	Y	TREX1,DALRD3,ARIH2	COL7A1,UQCRC1,SLC26A6,CELSR3	NA	NA	NA	NA	UQCRC1	5218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	48734201	48734270	48734236	Y	NA	CELSR3,NCKIPSD,IP6K2	NA	NA	NA	NA	NCKIPSD	12404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	49171125	49171202	49171164	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2,CCDC71,KLHDC8B	NA	NA	NA	NA	LAMB2	2574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,GPX1,TCTA,RHOA,AMT,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	50040739	50040850	50040788	Y	SEMA3B	NA	NA	NA	NA	NA	RBM6	65299	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	4232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	50204844	50205012	50204945	Y	NA	SEMA3F	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	14366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	50208155	50208394	50208279	Y	MAPKAPK3,RBM5,GNAI2	SEMA3F	GNAT1,SLC38A3,GNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3F	17677	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	50664800	50665228	50664999	Y	GNAI2,MAPKAPK3	MAPKAPK3,CISH,MIR4787,DOCK3	NA	NA	NA	NA	CISH	17538	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	51506153	51506528	51506417	Y	VPRBP,RAD54L2,GPR62	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	25482	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	52081342	52081690	52081545	Y	GPR62,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	6876	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	53286308	53286764	53286678	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	1304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	53360286	53360418	53360351	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	19236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	53380883	53380907	53380896	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	1229	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	55178043	55178603	55178498	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS15P5	519801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	56864313	56864691	56864516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	149048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	57555554	57555589	57555572	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	PDE12	15551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	57639210	57639572	57639391	Y	SLMAP,FAM116A	RP11-755B10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-755B10.3	37360	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	57874517	57874643	57874579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	117484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	58164078	58164222	58164150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57011	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	58168035	58168365	58168200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	52868	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	58192298	58192649	58192549	Y	NA	ABHD6	NA	NA	NA	NA	ABHD6	28584	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	58411955	58412199	58412053	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	5385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	59545502	59545850	59545701	Y	NA	NA	FAM3D,FHIT,C3orf67	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	511692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	59803830	59804011	59803964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	770020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	60013358	60013756	60013558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	979548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	60064522	60064780	60064643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1030712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	60360991	60361355	60361182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	873778	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	60392594	60392829	60392710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	842304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	60695765	60695821	60695814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	539312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	61579072	61579152	61579112	Y	PTPRG	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	33829	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	61728117	61728514	61728321	Y	NA	RPL10AP6	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	1337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	62572991	62573174	62573036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	219986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	62590103	62590230	62590174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	237098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	62926615	62926793	62926705	Y	CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	573610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	63946118	63946531	63946303	Y	NA	NA	LOC100507062	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	61127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	66295672	66296073	66295873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A26	178387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	66543351	66543557	66543448	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	6130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	66547159	66547390	66547275	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	2297	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	66549724	66550124	66549864	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	37	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	67050514	67050733	67050633	Y	KBTBD8	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	500827	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	67420914	67421310	67421112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	281728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	67741334	67741732	67741533	Y	NA	SUCLG2,RP11-81N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-81N13.1	38213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	71137411	71137566	71137489	Y	FOXP1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	493574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	71151319	71151713	71151657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	479427	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	71153323	71153512	71153422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	477628	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	71588104	71588187	71588146	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	42953	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	71628462	71628802	71628743	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	2338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	72536556	72536893	72536709	Y	RYBP	RYBP	PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	42487	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	76950761	76950890	76950828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	469592	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	77239163	77239286	77239225	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	757994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	78867121	78867519	78867219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	947446	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	79013956	79013976	79013966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	800989	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	83266585	83266839	83266721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	1457273	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	85120525	85120655	85120534	Y	CADM2	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	114393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	86842931	86843272	86843115	Y	VGLL3	NA	VGLL3	IMR90	Hi-C	24141950	VGLL3	194997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr3	86972169	86972375	86972272	Y	VGLL3	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	65894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	87022678	87022843	87022761	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	15426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	87033428	87033764	87033572	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	4505	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	87038252	87038431	87038423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	87038753	87038992	87038799	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	87101402	87101690	87101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	63133	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	88211290	88211624	88211397	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	14255	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA6	194756	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	98549481	98549862	98549828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	68671	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	98848000	98848317	98848116	Y	DCBLD2	NA	COL8A1,MIR548G	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2021J15.1	228732	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99238230	99238268	99238249	Y	NA	NA	MIR548G,COL8A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL8A1	117051	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99254161	99254407	99254283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	100912	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99262027	99262447	99262268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	92872	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	99367111	99367532	99367193	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	11792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	99381280	99381540	99381410	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	25961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99555247	99555560	99555404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	199928	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99575221	99575605	99575379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	219902	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99579150	99579217	99579184	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223831	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99581173	99581391	99581282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	225854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	99582587	99582828	99582708	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	227268	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99584293	99584813	99584482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	228974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99620045	99620512	99620235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	210845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	99761045	99761306	99761215	Y	TMEM45A	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	70051	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	99782957	99783256	99783070	Y	NA	FILIP1L	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	48101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	100028092	100028475	100028284	Y	TBC1D23	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	23070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	100088429	100088702	100088566	Y	NA	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	LNP1	29335	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	100492916	100493238	100493125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	66711	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	100630207	100630226	100630217	Y	NA	RP11-301G23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-301G23.1	1188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	100755056	100755464	100755248	Y	NA	ABI3BP	ABI3BP	IMR90	Hi-C	24141950	ABI3BP	44697	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	101556101	101556413	101556156	Y	SENP7,ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	11266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	101592355	101592794	101592687	Y	NFKBIZ,NFKBIZ	NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	47520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	101598094	101598345	101598104	Y	ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	53259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	101707550	101707746	101707649	Y	ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	162715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	104014158	104014524	104014365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALCAM	1069229	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	104155776	104156155	104156140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALCAM	927598	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	105081269	105081374	105081321	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	2379	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	105722948	105723182	105723045	Y	CBLB	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	136552	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	106782352	106782425	106782408	Y	NA	NA	CBLB	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00882	175063	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	106839867	106840135	106840037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00882	117353	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	106944388	106944677	106944531	Y	NA	LINC00882,LINC00883	NA	NA	NA	NA	LINC00882	12811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	107348544	107348833	107348648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	108761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	107503481	107503523	107503501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	263698	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	107504411	107504731	107504449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	264628	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	107706134	107706639	107706380	Y	NA	NA	MYH15,IFT57,CD47,LOC285205	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	101233	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	107807468	107807936	107807811	Y	MYH15,CD47	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	107841863	107841996	107841935	Y	NA	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	33991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	107850030	107850463	107850156	Y	MYH15,CD47	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	42158	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	107850651	107850908	107850836	Y	NA	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	42779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	110800210	110800608	110800220	Y	NA	PVRL3,PVRL3-AS1	NA	NA	NA	NA	PVRL3-AS1	11810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	111454124	111454225	111454190	Y	C3orf52,PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	4780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	111456632	111456831	111456661	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	7288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	111583903	111584464	111583984	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	111393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.67714752802837
chr3	111655124	111655265	111655201	Y	NA	ABHD10	NA	NA	NA	NA	ABHD10	40592	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	112258715	112258936	112258847	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	19620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	112274528	112274888	112274746	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	3668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	112315835	112316301	112316186	Y	NA	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	ATG3	36942	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	112354601	112355057	112354782	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	11320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	112370377	112370712	112370567	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	4000	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	112372486	112372667	112372577	Y	NA	CCDC80	CCDC80,CD200R1L	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	6109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	112390838	112391135	112390988	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	24461	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC80	29401	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	112465605	112465931	112465711	Y	CCDC80,CD200R1	NA	CD200R1,CCDC80,CD200R1L,GTPBP8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-180K7.1	53394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	112494891	112495176	112495106	Y	ATG3	RP11-180K7.1	GTPBP8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-180K7.1	24149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BOC	151074	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F17.1	71167	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	113701770	113701838	113701802	Y	KIAA1407,DRD3,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	20842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	113704407	113704728	113704558	Y	SIDT1,KIAA2018,KIAA1407,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	17952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	114078948	114079017	114078985	Y	NA	ZBTB20-AS1	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	10290	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	114144881	114145214	114145066	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	76223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	114165361	114165710	114165642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	96703	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	114246828	114247170	114246841	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	178170	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	114257066	114257260	114257069	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	188408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	114289543	114289832	114289667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	220885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	114373701	114374062	114373901	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	305043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	114563365	114563725	114563545	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	300393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	114724447	114724794	114724621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	139324	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	115231466	115231705	115231586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	367348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	681595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr3	115548074	115548457	115548266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	683956	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	115556507	115556695	115556650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	692389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	115558428	115558819	115558693	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	694310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	115790074	115790198	115790193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	925956	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	115939995	115940280	115940138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	803265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	117175008	117175053	117175027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	431463	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	119142297	119142580	119142348	Y	ARHGAP31,NR1I2,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	43097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	119356620	119357543	119356968	Y	GSK3B,ARHGAP31,ADPRH,COX17	RP11-190C22.1,COX17	NA	NA	NA	NA	RP11-190C22.1	3623	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	119436291	119436418	119436355	Y	C3orf15,NR1I2	COX17	NA	NA	NA	NA	COX17	41990	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	119809073	119809433	119809278	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	1831	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	119864415	119864682	119864534	Y	COX17,GSK3B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	52673	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	120065370	120065692	120065535	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	494	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	120397142	120397339	120397236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E1	62145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	120463141	120463503	120463258	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	3301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	120492875	120493095	120492951	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	121450275	121450346	121450335	Y	NA	GOLGB1	NA	NA	NA	NA	GOLGB1	16256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	122151096	122151154	122151125	Y	KPNA1	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	122151664	122151964	122151814	Y	NA	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18782	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	122400701	122401439	122401076	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14	EIF4BP8,PARP14	NA	NA	NA	NA	PARP14	3236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	122467278	122467457	122467368	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	43214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	122488258	122488637	122488447	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	22034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	122787344	122787648	122787385	Y	SEMA5B,PDIA5	PDIA5	NA	NA	NA	NA	PDIA5	3435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	123321303	123321432	123321369	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	18914	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	123371138	123371512	123371325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	68749	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	123376969	123377163	123377136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	74580	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	123391718	123392030	123392015	Y	ADCY5,MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	89329	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	123407272	123407514	123407399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	104883	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	123476863	123477567	123477241	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	174474	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	123508502	123508917	123508819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	169647	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	123553686	123553794	123553787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	124770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	123602021	123602338	123602298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	76226	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	124714923	124714954	124714939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEG1	57848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	124773884	124774020	124773942	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	1082	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	NA	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	HEG1	191610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	125200225	125200611	125200423	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	36430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	126359707	126359720	126359714	Y	NA	TXNRD3NB,TXNRD3	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	12278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	74839	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	2213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	15639	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	127265985	127266382	127266013	Y	NA	MCM2,TPRA1	CHCHD6	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	48684	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	127487223	127487760	127487461	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	52291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	127496785	127497122	127497034	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	42929	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	127522578	127522702	127522699	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	17349	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	127655460	127655715	127655545	Y	KBTBD12	KBTBD12	NA	NA	NA	NA	KBTBD12	23385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr3	127729316	127729371	127729322	Y	DNAJB8	SEC61A1	SEC61A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SEC61A1	39113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	128214371	128214730	128214426	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4	DNAJB8,DNAJB8-AS1,GATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-475N22.4	8316	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-475N22.4	10465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	128267469	128267837	128267725	Y	NA	NA	GATA2	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-475N22.4	61414	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	128538992	128539042	128539017	Y	DNAJB8,C3orf27	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	57131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	128831103	128831496	128831287	Y	NA	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	8148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	128958880	128959235	128959095	Y	H1FOO	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	58115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	129572979	129573244	129573238	Y	NA	TMCC1	NA	NA	NA	NA	TMCC1	37175	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	130539887	130540309	130539974	Y	ATP2C1	ATP2C1	ATP2C1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2C1	27130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	132137953	132138107	132138033	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	3583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	132164768	132165015	132164817	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	30398	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	133132587	133132784	133132642	Y	SRPRB,TMEM108	NA	NA	NA	NA	NA	CDV3	157790	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	134034499	134034569	134034531	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5	ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-200A1.1	4081	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	134050159	134050571	134050486	Y	AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	19741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	134051149	134051359	134051254	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	20731	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	134067109	134067364	134067237	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	6039	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	134069780	134070244	134070081	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	3159	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	134206320	134206511	134206427	Y	CEP63,CEP63,CEP63	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	ANAPC13	2762	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	135861520	135861675	135861598	Y	MSL2,MSL2	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	52408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	135890782	135891068	135890882	Y	NA	MSL2	NA	NA	NA	NA	MSL2	23015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	136427457	136427837	136427826	Y	STAG1	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	41383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	136466232	136466235	136466234	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	2985	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	136563637	136563997	136563817	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	14899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	136571906	136572239	136572061	Y	TMEM22	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	6657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	137768870	137769254	137769106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DZIP1L	63406	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	137990064	137990319	137990141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC8	85955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	141130337	141130617	141130393	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	73272	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	141131172	141131505	141131226	Y	SLC25A36,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	72384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	141131755	141132151	141131882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	71738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	141204930	141205324	141205031	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	1041	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	141397804	141398070	141397938	Y	NA	NA	RASA2,ATP1B3,GRK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNF7	56976	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	141611491	141611772	141611584	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	18525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	141693372	141693614	141693574	Y	TFDP2,TFDP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	67426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	141887290	141887616	141887590	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	20904	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	142844875	142844897	142844886	Y	PAQR9,CHST2	CHST2	NA	NA	NA	NA	CHST2	8702	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	143363444	143363621	143363553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	201752	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	143705621	143705974	143705695	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	16981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	145931100	145931141	145931121	Y	PLSCR5,PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	35825	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	146257874	146258309	146258204	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	2342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	147137005	147137222	147137047	Y	ZIC4,ZIC4,ZIC4,ZIC1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	745863	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	148581754	148581862	148581820	Y	CPA3	CPA3	NA	NA	NA	NA	CPA3	711	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	10.0907868364146
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	148781933	148782210	148782183	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	148942843	148943311	148943144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPS3	97472	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	149057749	149057981	149057865	Y	NA	TM4SF1	NA	NA	NA	NA	TM4SF1	35671	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	149099928	149100323	149100052	Y	TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	6276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr3	149151278	149151442	149151363	Y	NA	NA	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	57626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	149330317	149330600	149330464	Y	WWTR1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	119870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	149339543	149339560	149339552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	112941	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	149668313	149668642	149668480	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	15530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	149669691	149669713	149669697	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	14459	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	150417166	150417289	150417212	Y	NA	RP11-103G8.2,FAM194A	NA	NA	NA	NA	RP11-103G8.2	2062	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	150453151	150453509	150453478	Y	CLRN1	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	24215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	151016558	151016712	151016648	Y	MED12L,P2RY12,GPR87	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	16028	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	151582597	151582803	151582700	Y	NA	NA	MED12L	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	376814	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	152026905	152027295	152026911	Y	NA	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	41561	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	136110	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	152848416	152848799	152848521	Y	RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	29230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	152856443	152856813	152856615	Y	RAP2B	RAP2B	RAP2B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAP2B	21216	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	154788699	154789128	154788815	Y	NA	MME	MME	IMR90	Hi-C	24141950	MME	48786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	156402848	156403019	156402937	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	12681	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	156444390	156444661	156444493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	54223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	156506058	156506346	156506123	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	20175	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	156538683	156538849	156538764	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	2421	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	156846039	156846735	156846192	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	29814	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	156959494	156959508	156959501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550I24.2	68482	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	113601	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	158226530	158226854	158226539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLF1	60098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	158827452	158827795	158827624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARRES1	378967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	159175843	159176214	159175971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	528323	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	159480182	159480541	159480238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	223996	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	159493461	159493761	159493605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	210776	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	159514256	159514624	159514440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	189913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	159514645	159514911	159514780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	189626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	159540179	159540477	159540438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	164060	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	162020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	159647586	159647883	159647684	Y	NA	NA	IQCJ-SCHIP1,IL12A,IFT80,SMC4	IMR90	Hi-C	24141950	IL12A	56654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	159983948	159984179	159984064	Y	NA	C3orf80	NA	NA	NA	NA	C3orf80	42525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	168616433	168616445	168616439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFEM1P	651123	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	168930237	168930275	168930257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	449131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	439935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	169075984	169076327	169076322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	303079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	169344202	169344434	169344318	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	34972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	169376089	169376313	169376201	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	3093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	169376858	169377055	169376957	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	2351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	169377431	169377952	169377740	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	1454	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	169379063	169379412	169379208	Y	MECOM	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	169502698	169502873	169502785	Y	GPR160,MYNN,LRRC34	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	14079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	170137645	170137870	170137713	Y	SLC7A14,CLDN11,CLDN11	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	2992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	170138195	170138413	170138223	Y	NA	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	3542	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	170442364	170442688	170442585	Y	CLDN11	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	14466	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr3	170446657	170446914	170446737	Y	NA	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	10240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	170463049	170463502	170463289	Y	CLDN11	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	5895	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	170469010	170469069	170469037	Y	CLDN11,CLDN11,EIF5A2	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11856	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	170529231	170529401	170529316	Y	NA	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI,RPL22L1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	56871	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	170579509	170579531	170579522	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	6741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	170627321	170627621	170627516	Y	EIF5A2	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	2839	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	170957638	170957941	170957717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	218256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171522372	171522650	171522540	Y	TNIK,PLD1	PP13439,PLD1	NA	NA	NA	NA	PP13439	3064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171529898	171530084	171530030	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	3158	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	171543191	171543627	171543455	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	16451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171592038	171592451	171592208	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	65298	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr3	171594447	171594730	171594655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	67707	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	171684878	171685278	171685188	Y	PLD1,FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	70140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171792323	171792831	171792493	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	36905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171826024	171826613	171826515	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	70606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	171853185	171854055	171853751	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	97767	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	171856568	171857271	171856877	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	101150	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	171878014	171878468	171878150	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	122596	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171897555	171897878	171897648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	142137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	172035782	172036031	172035880	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	106848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	172038895	172038985	172038971	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	103894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	172086059	172086253	172086084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	56626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	172377276	172377377	172377327	Y	NA	NCEH1	NA	NA	NA	NA	NCEH1	49631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	172418207	172418359	172418236	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	8649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	172423916	172424228	172424139	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	2780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	173176022	173176131	173176077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN1	63948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	173462363	173462632	173462507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN1	350289	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	173767282	173767499	173767320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	325535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	174159946	174160135	174160080	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	5583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	176439687	176439857	176439773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	473404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	176774167	176774584	176774367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	138677	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	178236576	178236655	178236649	Y	KCNMB2	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT3	551412	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	179372057	179372188	179372123	Y	NA	USP13	NA	NA	NA	NA	USP13	3514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	179687230	179687579	179687379	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	318687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	181414061	181414442	181414162	Y	SOX2	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	708499	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	181418145	181418802	181418404	Y	SOX2	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	712583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	LAMP3	123952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr3	183088664	183088916	183088772	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	55650	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf70	140855	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	185374091	185374577	185374335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf65	53739	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	185482318	185482647	185482554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf65	54002	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	185484664	185484670	185484667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	56174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	187457681	187458370	187457991	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	3145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	187458720	187459019	187458856	Y	LPP,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	2496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	187467867	187468249	187468141	Y	BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	6352	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	187495200	187495392	187495316	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	BCL6,LPP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCL6	33685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	187607399	187607588	187607479	Y	BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	145884	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	187891343	187891657	187891500	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	21498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	187901313	187901616	187901372	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	31468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	187948643	187949049	187948891	Y	LPP,LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	78798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	187988232	187988684	187988401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	118387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	188012691	188013249	188012784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142846	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	188065570	188065751	188065619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	195725	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	188109949	188110178	188110065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	240104	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	188149383	188149832	188149544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	279538	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	188151524	188151812	188151760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	281679	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	188312026	188312153	188312088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	351275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	188374364	188374933	188374638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	288495	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	188400806	188401333	188400989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	262095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	188953015	188953026	188953020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	289587	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	189240469	189240487	189240479	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	577041	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	189428483	189428800	189428617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	407953	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	189654011	189654252	189654134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	182501	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	189793562	189793947	189793945	Y	LEPREL1	LEPREL1-AS1,LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	42806	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	189794828	189795104	189794939	Y	NA	LEPREL1-AS1,LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	41649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	190041292	190041577	190041442	Y	NA	CLDN1	NA	NA	NA	NA	CLDN1	3028	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr3	190252374	190252607	190252502	Y	CLDN1,IL1RAP	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	22534	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	190335085	190335347	190335197	Y	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	105245	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	191884950	191884967	191884959	Y	FGF12	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	598586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	192561492	192561800	192561547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	72150	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	192608372	192608637	192608617	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	25313	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	192610862	192611520	192611033	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	22430	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	194212902	194213208	194212990	Y	ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	3885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	194227767	194228126	194227819	Y	ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	10674	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	194298758	194299295	194298977	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	3445	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	194299958	194300402	194300090	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	2338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	194341751	194341921	194341813	Y	NA	TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44,LSG1	NA	NA	NA	NA	AC046143.3	9731	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	194754255	194754281	194754268	Y	NA	NA	XXYLT1,LOC100507391,LSG1,FAM43A,PPP1R2	IMR90	Hi-C	24141950	XXYLT1	235615	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	90614	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	194909017	194909237	194909137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	80659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	195034615	195034891	195034753	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	44719	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	195073897	195074088	195073990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	84001	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr3	195153778	195154174	195153996	Y	NA	ACAP2	NA	NA	NA	NA	ACAP2	7633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	162657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	195632869	195633225	195632990	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2	TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	195633702	195634304	195633876	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	TNK2-AS1,TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	196047617	196047878	196047747	Y	NA	PCYT1A,TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D2	4447	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	196208308	196208582	196208445	Y	NA	RNF168	NA	NA	NA	NA	RNF168	20057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	196757369	196757726	196757658	Y	LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	2682	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	196758283	196758681	196758467	Y	NA	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	3596	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	196784656	196784743	196784700	Y	CEP19,PIGX,PAK2	MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	29969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	196995168	196995509	196995411	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	28662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	197007663	197007913	197007866	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	16258	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	197033346	197033465	197033406	Y	DLG1	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	9175	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	197036480	197036785	197036693	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	12309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	197044593	197044660	197044627	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	20422	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	197121526	197121880	197121703	Y	DLG1	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	97355	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	197214864	197215009	197214889	Y	NA	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	BDH1	83185	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr3	197216995	197217339	197217145	Y	DLG1	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	80855	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr3	197838995	197839386	197839068	Y	NA	ANKRD18DP	LMLN,ANKRD18DP	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD18DP	33404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	330052	330352	330160	Y	NA	ZNF141	NA	NA	NA	NA	ZNF141	449	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	1237849	1238004	1237927	Y	NA	SPON2,CTBP1,MAEA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	3737	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	1710531	1710811	1710671	Y	NA	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	1471	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	7251	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	1968542	1968629	1968571	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	5734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	4692859	4693117	4692937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX18	150786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	5640113	5640289	5640201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	68986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	5671799	5672167	5671822	Y	CRMP1	EVC2,EVC	NA	NA	NA	NA	EVC2	37108	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	5786154	5786273	5786214	Y	CRMP1	NA	NA	NA	NA	NA	EVC	75230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	6592942	6593078	6593012	Y	NA	MAN2B2,MRFAP1	NA	NA	NA	NA	MAN2B2	18040	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	7807485	7807548	7807490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	132105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	7834057	7834311	7834184	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	105342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	7846072	7846237	7846145	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	93416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	7868592	7868926	7868734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	70727	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	7905982	7906260	7906100	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	33393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	8614691	8614733	8614712	Y	NA	CPZ	NA	NA	NA	NA	CPZ	22304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	10116801	10117310	10116981	Y	WDR1	WDR1	NA	NA	NA	NA	WDR1	228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	13282552	13282692	13282688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	50346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	13908947	13909321	13909089	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,LOC152742	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	202271	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	188667	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	15536628	15536631	15536630	Y	NA	NA	FBXL5	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	67139	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	15596739	15596980	15596942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	84305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	15915213	15915572	15915412	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	22791	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	15922988	15923279	15923080	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	15084	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	16544160	16544423	16544292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS21P4	287982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	16629750	16630155	16629855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS21P4	373572	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	17581888	17582305	17582055	Y	LAP3,MED28	LAP3,MED28	NA	NA	NA	NA	LAP3	5073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	17829390	17829398	17829394	Y	CLRN2,NCAPG	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	18865	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	17853657	17853735	17853696	Y	NA	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	43132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	20340711	20340985	20340805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT2	87828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	20757566	20757961	20757877	Y	KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	61661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	21602576	21603408	21603328	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	906671	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	21714034	21714408	21714405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	801269	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	24474307	24474984	24474891	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	109189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	24840398	24840758	24840578	Y	NA	NA	SOD3	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC149	139068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	25972032	25972237	25972135	Y	NA	NA	RBPJ,C4orf52,TBC1D19,STIM2,SEL1L3	IMR90	Hi-C	24141950	SEL1L3	108650	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	26085593	26085874	26085733	Y	NA	NA	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	77203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	26087064	26087357	26087217	Y	NA	NA	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	75720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	26090058	26090547	26090383	Y	RBPJ,RBPJ	NA	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	72530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	26338276	26338542	26338322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPJ	175199	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	26343884	26344230	26344058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPJ	180807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	32028735	32028753	32028744	Y	NA	RP11-734I18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-734I18.1	31716	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr4	35107542	35107966	35107823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1136165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	36314989	36315291	36315111	Y	ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	70858	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	37477962	37478211	37478180	Y	C4orf19	C4orf19	NA	NA	NA	NA	C4orf19	24399	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	38664467	38664838	38664653	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	39548258	39548506	39548382	Y	KLHL5	UGDH-AS1,UGDH	NA	NA	NA	NA	UGDH	20327	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	39619957	39620342	39620150	Y	NA	RP11-539G18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-539G18.2	18418	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	39913580	39913628	39913604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	63948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	39933245	39933555	39933419	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	44021	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	39935708	39936100	39935904	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	41476	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	40578690	40579499	40579160	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	170415	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	40674929	40675349	40675137	Y	RBM47	NA	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NSUN7	74565	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	160138	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	40943410	40943552	40943502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	193496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	40994779	40995404	40995184	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	221327	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	41162074	41162440	41162321	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	54291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	41197133	41197282	41197239	Y	NA	APBB2	NA	NA	NA	NA	APBB2	19449	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	41454099	41454301	41454195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	94475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	41574178	41574364	41574271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	214554	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	48263385	48263565	48263503	Y	NA	TEC	TXK	IMR90	Hi-C	24141950	TEC	6316	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	54866446	54866641	54866544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	62216	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	54886131	54886730	54886449	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	42127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	54928262	54928437	54928381	Y	NA	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	55093024	55093294	55093182	Y	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	56323586	56323848	56323646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM165	63462	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	57313900	57314193	57314047	Y	NA	PPAT,PAICS,SRP72	NA	NA	NA	NA	PAICS	13993	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	57831930	57832208	57832081	Y	NA	POLR2B,NOA1	NA	NA	NA	NA	POLR2B	9680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	62212497	62212753	62212605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	426815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	66107153	66107671	66107555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	426008	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	5.76616390652263
chr4	66376802	66376924	66376863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	156755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	66533536	66533932	66533732	Y	EPHA5	EPHA5	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr4	67430351	67431255	67431078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	472507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	68394565	68394648	68394607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-584P21.4	84580	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	68538149	68538306	68538215	Y	NA	UBA6,UBA6-AS1	NA	NA	NA	NA	UBA6	26591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	72978297	72978597	72978489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPFFR2	82776	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	73633759	73633947	73633815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS3	201243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	73673744	73673875	73673808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS3	241228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	74055104	74055142	74055123	Y	ANKRD17,ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD17	67373	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	74464812	74465326	74464976	Y	RASSF6,RASSF6	NA	NA	NA	NA	NA	IL8	138897	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	74569694	74570920	74570464	Y	ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	33303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	74591640	74592145	74591915	Y	MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	12078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	74783021	74783195	74783091	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2,CXCL1	CXCL1,CXCL1P	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL1P	24846	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	74974477	74974715	74974630	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	3176	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	74974850	74975280	74974976	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	2611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr4	74977575	74978125	74977847	Y	NA	CXCL2	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr4	74982637	74982975	74982882	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	4746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	75096380	75097063	75096677	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	NA	EPGN	75127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	75097904	75098121	75097961	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	NA	EPGN	74069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	75183618	75183847	75183685	Y	CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG	EPGN,EREG	NA	NA	NA	NA	EPGN	11428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	180987	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.70681965419312
chr4	75556698	75556816	75556809	Y	EREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	161080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	75585032	75585282	75585171	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BTC	132614	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	77380282	77380659	77380469	Y	NA	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	26029	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	77868010	77868840	77868612	Y	NA	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	16	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	77974492	77974926	77974738	Y	CCNI	CCNI	NA	NA	NA	NA	CCNI	20232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	78708574	78708903	78708795	Y	CNOT6L	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	29866	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	78775607	78776169	78775749	Y	NA	CNOT6L,MRPL1	MRPL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL1	5505	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	79083838	79083918	79083865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAS1	107114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	79253143	79253310	79253148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	217363	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	79783704	79784023	79783864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAQR3	74569	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	80958042	80958450	80958250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	86158	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	81093417	81093540	81093479	Y	NA	ANTXR2,PRDM8	NA	NA	NA	NA	PRDM8	9493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	81199073	81199101	81199087	Y	NA	FGF5	NA	NA	NA	NA	FGF5	13320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	81228486	81228584	81228534	Y	NA	FGF5,C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	26290	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	81229160	81229644	81229481	Y	NA	FGF5,C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	25230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	82553061	82553360	82553250	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B	410037	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	82555972	82556257	82556101	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B	407140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	83383009	83383387	83383198	Y	NA	ENOPH1	NA	NA	NA	NA	ENOPH1	33294	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	83680712	83680815	83680808	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37195	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	84029980	84030193	84029996	Y	NA	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	26035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	84033440	84033690	84033502	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	22538	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	84034119	84034423	84034342	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	21805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	84237643	84238153	84237819	Y	THAP9,LIN54,PLAC8,HELQ,AGPAT9,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE	COQ2,HPSE	NA	NA	NA	NA	HPSE	16153	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	84474210	84474441	84474327	Y	PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	19143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	84773321	84773491	84773400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	318254	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	84776291	84776536	84776414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	321224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	464630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr4	85798168	85798515	85798434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	87023	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	86684588	86684743	86684670	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	290321	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	87048261	87048368	87048363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	465100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	87766035	87766280	87766137	Y	SLC10A6	NA	NA	NA	NA	NA	AFF1	87874	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	88038562	88038726	88038648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	120740	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	88817372	88817671	88817543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPP1	77148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	89377235	89377564	89377513	Y	HERC6,HERC5	HERC5	NA	NA	NA	NA	HERC5	967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	89455158	89455345	89455247	Y	NA	HERC3,PIGY	NA	NA	NA	NA	PIGY	14218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	130072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	95374521	95374795	95374668	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	3484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	95469761	95469962	95469859	Y	HPGDS,PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	98724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	99827146	99827610	99827384	Y	NA	AC019131.1,EIF4E	NA	NA	NA	NA	AC019131.1	21528	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	99848541	99848872	99848707	Y	NA	AC019131.1,EIF4E	NA	NA	NA	NA	AC019131.1	266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	100325584	100326020	100325850	Y	ADH5,ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5	317632	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	100861794	100861850	100861822	Y	NA	LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ	NA	NA	NA	NA	DNAJB14	4033	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	101008872	101009147	101009050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDIT4L	100792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	101816852	101816959	101816896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	449978	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	288765	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	102093748	102093766	102093752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	173171	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	102113415	102113532	102113437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	153405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	102121858	102122120	102121969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	144817	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	102894116	102894225	102894174	Y	BANK1,BANK1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A8	456190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	103673229	103673433	103673315	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	6718	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	103679962	103680312	103680150	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	103793013	103793145	103793075	Y	MANBA,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	CISD2	4878	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	103937289	103937350	103937320	Y	NA	SLC9B1	NA	NA	NA	NA	SLC9B1	1546	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	106324406	106324791	106324687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPA2	68447	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	106362976	106363368	106363172	Y	NA	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	29870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	108758517	108758852	108758585	Y	SGMS2,SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	14798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	108760061	108760236	108760128	Y	NA	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	16342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	108783895	108784172	108784033	Y	SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	40176	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	111041485	111041815	111041651	Y	NA	RP11-115A14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	23715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	111085558	111085919	111085739	Y	NA	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	20028	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	111535166	111535692	111535412	Y	NA	PITX2	NA	NA	NA	NA	PITX2	25587	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	113067380	113067784	113067656	Y	LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32	C4orf32	NA	NA	NA	NA	C4orf32	2827	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	113972367	113972735	113972428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	235102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	114367129	114367387	114367298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	313696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	291278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	114554794	114555018	114554909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	126065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM1L1	484131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr4	119910469	119910954	119910765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOZ2	143985	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	119946666	119946843	119946767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOZ2	108096	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	120432594	120432728	120432661	Y	PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	58648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	120439031	120439404	120439161	Y	PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	65085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	120962747	120963053	120963021	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NA	NA	NA	NA	RP11-679C8.2	23060	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	121812608	121812671	121812657	Y	NA	PRDM5	NA	NA	NA	NA	PRDM5	29354	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	122609803	122610189	122610094	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	6079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	122610538	122611647	122611314	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	4621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr4	123685251	123685615	123685333	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	33394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	123686146	123686329	123686228	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	34289	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	123704519	123704897	123704616	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	40966	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	123776087	123776259	123776177	Y	NA	FGF2	NA	NA	NA	NA	FGF2	30224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	124941316	124941540	124941431	Y	NA	NA	SPATA5,LOC285419	IMR90	Hi-C	24141950	TECRP2	441405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	129389693	129389923	129389761	Y	NA	NA	PHF17,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	177787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	129609627	129610025	129609830	Y	NA	NA	PHF17	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-420A23.1	397721	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	129847015	129847068	129847042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	165404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	133980064	133980227	133980146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-9G1.3	88044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr4	140017684	140017800	140017744	Y	RAB33B,ELF2	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	78572	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	140035787	140036142	140035958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	60230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	141021103	141021485	141021348	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	51853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	141209212	141209581	141209237	Y	NA	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	32772	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	141287573	141287758	141287638	Y	NA	RP11-425I13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-425I13.1	1558	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	141640892	141641150	141641076	Y	TBC1D9	TBC1D9	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	34124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	142196982	142197372	142197125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF330	56941	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	142559455	142559780	142559588	Y	ZNF330,IL15	IL15	NA	NA	NA	NA	IL15	3703	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	142561940	142562315	142562048	Y	ZNF330,IL15	IL15	NA	NA	NA	NA	IL15	6188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	143059861	143060134	143059998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	504109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	143325385	143325488	143325414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	441097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	146729401	146729770	146729628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	128017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	147250249	147250611	147250430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	155412	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	148752985	148753384	148753090	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	101771	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	148768906	148769305	148769088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	117692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	148951514	148951899	148951701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	300300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	151017552	151017612	151017555	Y	NA	DCLK2	NA	NA	NA	NA	DCLK2	20126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	151314417	151314500	151314459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	316991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	152033251	152033470	152033361	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	14526	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	152048107	152048440	152048274	Y	LRBA,LRBA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	29382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	SH3D19	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3D19	1248	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	152406480	152406763	152406721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	78112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	153190429	153190517	153190474	Y	NA	NA	FAM160A1,PET112,FBXW7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXW7	264736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	154253952	154254140	154254046	Y	NA	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	9661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	154548347	154548481	154548383	Y	KIAA0922,TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR2	72171	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	154580466	154580842	154580627	Y	TLR2	TLR2	NA	NA	NA	NA	TLR2	39810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	154584497	154584872	154584724	Y	NA	TLR2	NA	NA	NA	NA	TLR2	35780	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	157867687	157867968	157867878	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22578	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr4	157868046	157868334	157868214	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22212	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	157869778	157870097	157870082	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	20449	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	159101630	159101785	159101708	Y	NA	FAM198B,TMEM144	NA	NA	NA	NA	FAM198B	9160	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	159103850	159104073	159103996	Y	NA	FAM198B,TMEM144	NA	NA	NA	NA	FAM198B	11380	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	159169271	159169555	159169414	Y	TMEM144	TMEM144	NA	NA	NA	NA	TMEM144	48515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	159641149	159641258	159641192	Y	NA	ETFDH,C4orf46,PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	PPID	1290	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	159643443	159643599	159643521	Y	FNIP2,PPID	PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	PPID	895	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	160160934	160161439	160160999	Y	FNIP2,RAPGEF2	NA	FNIP2,RAPGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	FNIP2	472644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	160195976	160196239	160196029	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	507686	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	163021917	163022313	163022263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTL5	60874	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	200219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	164465601	164465786	164465694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	201617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	164740451	164740688	164740570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	476467	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	164741001	164741233	164741117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	477017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	164755416	164755437	164755427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	491432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	164817939	164818272	164818106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	553955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	164871108	164871241	164871176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	607124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	612373	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366M4.2	629426	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr4	166247009	166247140	166247075	Y	NA	MSMO1,CPE	NA	NA	NA	NA	MSMO1	234	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	166315734	166315907	166315821	Y	NA	CPE	NA	NA	NA	NA	CPE	35388	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	167711328	167711639	167711580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	1430982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	169361585	169362025	169361769	Y	DDX60,DDX60L	NA	NA	NA	NA	NA	PALLD	54192	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	169372558	169373482	169372741	Y	NA	PALLD	NA	NA	NA	NA	PALLD	42735	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	169408175	169408648	169408311	Y	DDX60,DDX60L	PALLD,DDX60L	DDX60,DDX60L,PALLD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PALLD	7569	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	169444605	169444881	169444719	Y	NA	PALLD,DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	12056	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	169479701	169480223	169479961	Y	NA	DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	22764	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr4	169509077	169509260	169509148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	52140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	169559092	169559502	169559116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	169559850	169560019	169559874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	169716186	169716224	169716221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	213202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	169757761	169758092	169757987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	171334	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	170023521	170023783	170023621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	94095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	170132939	170133158	170133049	Y	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	57098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	170543360	170543629	170543529	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	11576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	172774003	172774328	172774166	Y	GALNTL6	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT7	1313576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	174443845	174444302	174443959	Y	HAND2	HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2	5078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	176340355	176340496	176340426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRA3	591890	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	177191849	177192202	177191988	Y	ASB5	SPCS3,RP11-87F15.2	SPATA4	IMR90	Hi-C	24141950	SPCS3	46913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	177705907	177706270	177706189	Y	NA	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	5611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	177710943	177711419	177711262	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	462	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	177715411	177715680	177715585	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	3530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	177760403	177760587	177760468	Y	NA	VEGFC	VEGFC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VEGFC	48522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	177824075	177824477	177824359	Y	NA	NA	VEGFC	IMR90	Hi-C	24141950	VEGFC	112194	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	180219335	180219346	180219341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-130F10.1	1855202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	181844755	181844937	181844843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	1219465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	183110695	183110955	183110887	Y	NA	AC108142.1	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	46293	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	183353287	183353302	183353295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	288885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	183439666	183439879	183439717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	375264	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	183515054	183515204	183515166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	321885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	183730445	183730610	183730498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	106479	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	183897058	183897307	183897172	Y	NA	NA	WWC2,FAM92A3	IMR90	Hi-C	24141950	DCTD	59969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	184150030	184150375	184150203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC2	131584	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	184256615	184256836	184256706	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	106908	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	184270201	184270461	184270317	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	93283	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185115354	185115759	185115584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-739P1.2	208523	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185186820	185187542	185187472	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	206192	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185189191	185189340	185189323	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	204394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185296048	185296446	185296396	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	97288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185298493	185298859	185298858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	94875	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	185303433	185303616	185303580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	90118	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185304654	185305034	185304819	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	88700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185331771	185332231	185332067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	61503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185573558	185573933	185573744	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	4895	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185589829	185589977	185589872	Y	ACSL1,IRF2	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	21166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	185613623	185613900	185613762	Y	CCDC111	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	44960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr4	186432179	186432538	186432506	Y	NA	RP11-279O9.4,CCDC110,PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	22228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	40301	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr4	186760271	186760668	186760511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	227638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	187371571	187371697	187371634	Y	NA	F11-AS1	NA	NA	NA	NA	F11-AS1	48454	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	187597728	187597911	187597833	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	47965	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr4	187810272	187810501	187810328	Y	NA	NA	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	164396	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr4	189048639	189048958	189048819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219G10.1	220220	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	79769	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr4	190936592	190936699	190936668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	76649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	354736	354943	354840	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	AHRR	52445	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	366173	366499	366337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHRR	63882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	373392	373627	373429	Y	EXOC3,C5orf55,PDCD6	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72	NA	NA	NA	NA	CEP72	45797	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP72	62474	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP13	105735	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	1007986	1008378	1008075	Y	NA	NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	1042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	1503544	1504024	1503726	Y	LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	18068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	2580576	2580893	2580736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	781062	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	5026027	5026363	5026168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS16	112080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	5351586	5351742	5351664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	67035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	5423578	5423857	5423693	Y	KIAA0947	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	4801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	11.3263933878123
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	10551479	10551871	10551616	Y	NA	ANKRD33B	MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33B	10571	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	10562652	10562841	10562738	Y	ANKRD33B	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	210	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	10565896	10566253	10566086	Y	NA	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	3454	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	10585111	10585259	10585181	Y	NA	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	22669	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	10607952	10608169	10608061	Y	MARCH6,ANKRD33B	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	45510	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	10631579	10631933	10631756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	69137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	10632197	10632744	10632366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	69755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	10636353	10636579	10636473	Y	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	73911	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	10685117	10685512	10685343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	73872	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	10759548	10759882	10759715	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	164	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	12314219	12314247	12314235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1554835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	12658501	12658830	12658774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH5	1283822	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	14035955	14036534	14036234	Y	TRIO	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	93303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	14036813	14036909	14036843	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	14037561	14037744	14037653	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94909	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	14142332	14142650	14142445	Y	NA	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	521	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr5	14174472	14174896	14174531	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	32661	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	14178655	14179133	14178814	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	36844	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr5	14199302	14199513	14199379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	57491	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	14208272	14208510	14208423	Y	FAM105B	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	66461	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	14250238	14250405	14250312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	108427	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	14251046	14251256	14251151	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	109235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.08901637849427
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	14545472	14545570	14545529	Y	NA	FAM105A	FAM105A,TRIO	IMR90	Hi-C	24141950	FAM105A	34314	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	15216648	15217026	15216659	Y	NA	NA	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	346761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	15451801	15451916	15451863	Y	NA	NA	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	581914	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	16736297	16736738	16736539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	121130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	16821332	16821498	16821415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	79252	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	16855522	16855861	16855692	Y	NA	CTB-55B8.1	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	44889	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	16898106	16898497	16898302	Y	MYO10	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	2253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	17118695	17119132	17119047	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	54988	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	17177639	17177702	17177672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	113932	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	17224986	17225514	17225115	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	118211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	93865	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	17255490	17256325	17255691	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	87400	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	17359663	17360122	17359876	Y	BASP1	RN7SKP133,FTH1P10	NA	NA	NA	NA	FTH1P10	6930	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	19315150	19315342	19315248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	570868	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	21392233	21392585	21392409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	52291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	21539943	21540207	21540075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	200001	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	26847119	26847280	26847167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	1658354	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr5	29758752	29759069	29758903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	1292603	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	30677257	30677653	30677571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	374019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	30694167	30694547	30694365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	357125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	32083300	32083310	32083305	Y	PDZD2	NA	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	89146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	32175167	32175567	32175368	Y	NA	GOLPH3,CTD-2186M15.1	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	2711	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	32592950	32593432	32593186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	63211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	33781524	33781664	33781594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	108633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	33834348	33834761	33834680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	55536	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	33892874	33893172	33893071	Y	NA	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	2577	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	34048471	34048803	34048799	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	42251	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	34710052	34710312	34710173	Y	RAI14,RAI14	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	55710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	34856339	34856427	34856383	Y	NA	TTC23L	NA	NA	NA	NA	TTC23L	19401	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	35405015	35405048	35405025	Y	NA	NA	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	PRLR	176221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.64747540186361
chr5	35857994	35858411	35858032	Y	IL7R	IL7R	NA	NA	NA	NA	IL7R	7197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	35884312	35884698	35884400	Y	NA	IL7R	NA	NA	NA	NA	IL7R	33515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	35924372	35924674	35924571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL7R	73575	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	36358126	36358437	36358252	Y	NA	NA	RANBP3L	IMR90	Hi-C	24141950	SKP2	208035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	36689194	36689678	36689532	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	84737	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP6	53296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	37209037	37209204	37209072	Y	C5orf42	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	38326	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	37272795	37272956	37272876	Y	C5orf42	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	25265	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	37771819	37772240	37771999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	65548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	37838959	37839206	37839080	Y	GDNF,GDNF,GDNF	GDNF	NA	NA	NA	NA	GDNF	1171	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	38446340	38446486	38446390	Y	EGFLAM	CTD-2263F21.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2263F21.1	19955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	38854077	38854436	38854323	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	10117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	38866844	38867106	38866976	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	22884	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	38872248	38872554	38872396	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	28288	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	39014770	39014929	39014863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	57581	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	39069838	39069965	39069908	Y	NA	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	2545	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	39256594	39256894	39256792	Y	RICTOR,FYB	FYB	NA	NA	NA	NA	FYB	15736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	39395044	39395463	39395161	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	27507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	39399549	39400018	39399831	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	22952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	39760848	39761179	39761033	Y	NA	NA	PTGER4,PRKAA1,TTC33	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	300446	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	40224075	40224396	40224233	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	453204	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	40688188	40688473	40688414	Y	PRKAA1,PTGER4	PTGER4	NA	NA	NA	NA	PTGER4	10588	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	40689630	40689893	40689724	Y	NA	PTGER4	NA	NA	NA	NA	PTGER4	12030	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	40796420	40796758	40796693	Y	NA	TTC33,RPL37,CARD6	NA	NA	NA	NA	PRKAA1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	40967939	40968194	40968008	Y	C6,C7	NA	NA	NA	NA	NA	CARD6	128653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	41113994	41114275	41114076	Y	NA	NA	C7,C6	IMR90	Hi-C	24141950	CARD6	274708	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	4127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	43034859	43034967	43034962	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC648987	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC025171.1	4710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	43099724	43100011	43099805	Y	NA	ZNF131,CTD-2201E18.3	ZNF131,LOC648987	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2201E18.3	34203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	43303282	43303485	43303367	Y	NA	HMGCS1	NA	NA	NA	NA	HMGCS1	8129	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	44805965	44806268	44806131	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	50036304	50036403	50036354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARP8	76571	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	52545484	52545615	52545603	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS2	141591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	52714720	52715039	52714904	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	59200	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	310514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	54039991	54040439	54040234	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18,GPX8,CDC20B	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	228402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	54472215	54472598	54472476	Y	NA	GPX8,CDC20B	NA	NA	NA	NA	CDC20B	5210	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	54964345	54964561	54964453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A9	102461	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	55199167	55199571	55199365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL31RA	53960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	55471391	55471677	55471521	Y	IL6ST	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	182396	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	55555067	55555385	55555210	Y	NA	NA	ANKRD55,IL6ST,MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	243514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	57099848	57100234	57100012	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	GPBP1	632073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	57111915	57112364	57112128	Y	ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	641723	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	57117655	57118000	57117917	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	636087	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	57120821	57121296	57121146	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	632791	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	57133445	57133721	57133581	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	620366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	57137483	57137861	57137645	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	616226	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	58359884	58360252	58360059	Y	RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	483836	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	58421119	58421626	58421279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	545071	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	547263	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	58445128	58445519	58445324	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	569080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	58866470	58866828	58866806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	949119	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	60315642	60315784	60315678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	76686	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr5	60600910	60601202	60601013	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	24898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	60710257	60710608	60710433	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	24559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	60736184	60736544	60736365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	50486	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	64062074	64062237	64062149	Y	NA	SREK1IP1,CWC27	NA	NA	NA	NA	SREK1IP1	275	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr5	64498189	64498386	64498364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	277361	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	64572544	64572695	64572620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	203052	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	64710773	64711167	64710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	64580	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	64727937	64728302	64728145	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	47445	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	64755187	64755203	64755196	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	20544	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	64759325	64759328	64759327	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	16419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	2653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	20801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	65070343	65070573	65070458	Y	SREK1,ERBB2IP,SGTB	NA	NA	NA	NA	NA	SGTB	53481	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	66306628	66307107	66306725	Y	NA	MAST4-AS1	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	8847	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	71648982	71649164	71649085	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	34509	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	72118223	72118546	72118402	Y	TNPO1	TNPO1	NA	NA	NA	NA	TNPO1	8084	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	72511984	72512100	72512037	Y	FOXD1	RP11-60A8.1	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-60A8.1	4210	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	RP11-60A8.1	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-60A8.1	4537	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	72607592	72607820	72607706	Y	NA	NA	FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-60A8.1	99818	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	72670335	72670728	72670600	Y	NA	NA	FOXD1,BTF3,FCHO2,TMEM171,TMEM174	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	71624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	72934554	72934908	72934667	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	75043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	73611863	73612159	73611974	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	73612322	73612454	73612340	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	74805918	74806308	74805968	Y	NA	POLK	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	76958449	76958840	76958645	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	44013	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	77374282	77374304	77374295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCA	211678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	77412957	77413018	77412987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP3B1	175561	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	77581141	77581448	77581332	Y	AP3B1	AP3B1	NA	NA	NA	NA	AP3B1	7131	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	77800435	77801147	77800993	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	146096	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	77819717	77819752	77819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	165378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	77829299	77829474	77829415	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	174960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	77830052	77831195	77830385	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	175713	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	77837654	77837953	77837804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2073O6.1	171952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	77882234	77882399	77882291	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2073O6.1	127506	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	77890894	77891278	77891114	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2073O6.1	118627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	77974245	77974379	77974312	Y	NA	CTD-2073O6.1	SCAMP1,LHFPL2,ARSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2073O6.1	35526	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	78585055	78585206	78585119	Y	NA	CTC-451P13.1	NA	NA	NA	NA	CTC-451P13.1	6314	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	79553045	79553765	79553579	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	3147	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	79869152	79869296	79869229	Y	SPZ1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P24	75001	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	80263371	80263585	80263478	Y	NA	RASGRF2	NA	NA	NA	NA	RASGRF2	8880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	81045433	81045821	81045530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102021	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	81319192	81319550	81319375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG10	53348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	82576471	82576688	82576580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	188596	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3970	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	82769870	82770125	82769934	Y	TMEM167A,VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	85654132	85654483	85654435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	257238	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	85789046	85789185	85789116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	122536	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	85833622	85833763	85833693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	77958	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	86610420	86610785	86610768	Y	NA	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	48715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	86619148	86619498	86619336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	57443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	86619927	86620237	86620117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58222	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	86620547	86620785	86620574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	86629389	86629577	86629451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	67684	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	86673186	86673474	86673330	Y	CCNH,CCNH	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	33362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	90662566	90662573	90662570	Y	NA	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	14603	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F1	323059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	92932600	92932748	92932677	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	15557	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	93013083	93013343	93013254	Y	NA	NPM1P27	NA	NA	NA	NA	NPM1P27	4030	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	93304446	93304744	93304683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	140660	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	94052096	94052474	94052285	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	99787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	94395359	94395872	94395571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	222407	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	94843632	94843977	94843805	Y	NA	TTC37,ARSK	NA	NA	NA	NA	TTC37	44734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	95157129	95157323	95157255	Y	NA	GLRX,AC008592.5	NA	NA	NA	NA	GLRX	420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX,AC008592.5	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	95178953	95179190	95179087	Y	GLRX,ELL2	GLRX,AC008592.5	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC008592.5	16300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	95179469	95179934	95179619	Y	NA	GLRX,AC008592.5	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC008592.5	15556	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	95205682	95206201	95205913	Y	GLRX,ELL2	GLRX,AC008592.5	NA	NA	NA	NA	AC008592.5	10192	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	95240158	95240487	95240414	Y	NA	AC008592.5	NA	NA	NA	NA	AC008592.5	44668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	95294794	95295285	95294896	Y	ELL2	CTD-2337A12.1,ELL2	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1	420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	95298372	95298734	95298686	Y	ELL2	CTD-2337A12.1,ELL2	NA	NA	NA	NA	ELL2	2597	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	95403711	95404019	95403912	Y	ELL2	NA	ELL2,CAST,MIR583,C5orf27	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ELL2	107936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	95414896	95415105	95415065	Y	GLRX,ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	ELL2	119121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	95555701	95555931	95555845	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	259926	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	95562741	95563074	95562934	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	266966	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	95633075	95633361	95633245	Y	GLRX	NA	ELL2,RHOBTB3,MIR583,GLRX,C5orf27,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	225610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	95845653	95846023	95845804	Y	NA	CAST	NA	NA	NA	NA	CAST	12948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	95904696	95905047	95904872	Y	NA	CAST	PCSK1,CAST,ELL2,C5orf27,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	45725	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	96019190	96019368	96019302	Y	CAST,CAST	NA	NA	NA	NA	NA	ERAP1	122435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	96022483	96022592	96022538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAP1	119211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	96028306	96028536	96028386	Y	CAST,CAST	NA	NA	NA	NA	NA	ERAP1	113267	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	96152147	96152486	96152312	Y	LNPEP,ERAP1	ERAP1	ERAP1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ERAP1	10344	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	97643613	97643769	97643691	Y	NA	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	28679	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	97750593	97751065	97750933	Y	RGMB	NA	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	78145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	68149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	65484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	99386410	99387139	99386777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	481827	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr5	100720192	100720438	100720315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA4	483222	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr5	103465253	103465580	103465434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT12	568759	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	103559627	103559775	103559695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT12	663133	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	106724874	106725113	106725059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	279483	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	106802102	106802350	106802226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	202246	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	106806041	106806198	106806107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	198398	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	106878561	106878904	106878854	Y	EFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	125692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	106967635	106967784	106967710	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	36812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	108170397	108170414	108170406	Y	FER	NA	NA	NA	NA	NA	FER	88874	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	108329034	108329385	108329210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	247511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	108735031	108735161	108735096	Y	NA	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	8534	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	108747394	108747617	108747516	Y	MAN2A1	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	3699	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	109079577	109079706	109079642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	56510	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	109207541	109207704	109207623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	184474	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	110830968	110831101	110831035	Y	WDR36,CAMK4,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	15187	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	110838164	110838531	110838380	Y	WDR36,CAMK4,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	7757	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	114913600	114913827	114913746	Y	NA	FEM1C,AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2	NA	NA	NA	NA	AC010226.4	21927	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	114959651	114959879	114959766	Y	COMMD10	AC010226.4,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7-TICAM2,TICAM2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	115276815	115277206	115277011	Y	LOC644100	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	101260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	118453384	118453586	118453485	Y	NA	CTB-161M19.4,RP11-950K24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-950K24.2	8553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	118592872	118593203	118593036	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	9184	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	118627745	118627943	118627845	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	25358	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	118725501	118725774	118725509	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	60364	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	119837700	119837812	119837711	Y	PRR16	PRR16	NA	NA	NA	NA	PRR16	39727	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	119848516	119848911	119848640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	50543	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	119940626	119940961	119940736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	142653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	120004624	120004640	120004633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	206651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	104813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	122087226	122087448	122087366	Y	NA	SNX2	PRDM6	IMR90	Hi-C	24141950	SNX2	21243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	122181959	122182300	122182177	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	4825	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	123987356	123987539	123987440	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	94961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	124077955	124078154	124078062	Y	ZNF608	ZNF608	NA	NA	NA	NA	ZNF608	4346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	125701796	125702121	125701959	Y	GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	7972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	125773418	125773804	125773609	Y	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	79594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	125779791	125780174	125779834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	85967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	126367022	126367218	126367207	Y	NA	MARCH3,C5orf63	NA	NA	NA	NA	MARCH3	2522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	129563384	129563648	129563470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY3	325219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	130714603	130715158	130715088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	135417	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	131560740	131561286	131561173	Y	IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2	PDLIM4	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	30078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	131633963	131634368	131634191	Y	IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	4955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	131641002	131641297	131641050	Y	NA	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	11994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	131764930	131765294	131765112	Y	NA	C5orf56,AC116366.6	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	20602	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	131774835	131775712	131775188	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	C5orf56	30507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	131795302	131795488	131795309	Y	NA	AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.6	11247	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	131833002	131833333	131833168	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8512	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	131833441	131833717	131833513	Y	IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8951	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	131833993	131834254	131834119	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	9503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	133330374	133330645	133330542	Y	NA	C5orf15,VDAC1	C5orf15	IMR90	Hi-C	24141950	VDAC1	8179	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	133435759	133436442	133436277	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	TCF7,SKP1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7	11960	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	133455254	133455613	133455348	Y	NA	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	6852	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	MIR3661	18431	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	133543428	133543671	133543548	Y	NA	SKP1,MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	MIR3661	15777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	133681629	133682059	133681927	Y	NA	CDKL3,UBE2B	NA	NA	NA	NA	CDKL3	22679	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.1	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	31064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	NA	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	68908	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.1	92728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	133890161	133890536	133890268	Y	TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	91943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	134712896	134713181	134712989	Y	SLC25A48,H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	20423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	134727973	134728292	134728105	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	5312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	135329682	135329872	135329792	Y	TGFBI	TGFBI	TGFBI,VTRNA2-1,LECT2,SMAD5	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	32712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	135955852	135956149	135955964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	235168	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	137370531	137370718	137370637	Y	PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5	FAM13B	PKD2L2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM13B	14932	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr5	137810438	137810840	137810496	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	11259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	138078029	138078389	138078209	Y	NA	AC034243.1	CTNNA1,SIL1,HSPA9,MATR3	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	8609	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	161141	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	190951	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	138436608	138436808	138436708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	170633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	138727034	138727338	138727139	Y	LOC389333	SPATA24	NA	NA	NA	NA	SPATA24	10439	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2D2	61556	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	139015811	139016118	139015905	Y	MATR3,MATR3,MZB1,CXXC5	NA	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2D2	111795	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	UBE2D2	186924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	139167686	139167904	139167758	Y	NA	NA	CXXC5,UBE2D2,DNAJC18,NRG2,PSD2,CYSTM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	263670	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	139570156	139570435	139570301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGIP	66635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	139633683	139634086	139633757	Y	SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	46620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	12898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	140888509	140888855	140888756	Y	PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	25768	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	141054975	141055298	141055138	Y	PCDHB12,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4	HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3	NA	NA	NA	NA	ARAP3	4490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	141826368	141826739	141826520	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	122348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	141977799	141977936	141977865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	170013	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	142315332	142315934	142315386	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	167383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	142362111	142362403	142362189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	214162	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	142444859	142445221	142444946	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	264949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	142461616	142461728	142461672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	248442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr5	142625760	142626024	142625785	Y	ARHGAP26,NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	84146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	143300463	143300651	143300509	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	247627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	144549099	144549238	144549211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID2	663694	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	145455339	145455700	145455520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	104523	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	145499175	145499563	145499369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	60660	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	148293572	148293925	148293745	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	89416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	148551862	148552080	148551971	Y	NA	ABLIM3	AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	32816	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	148591795	148592037	148591918	Y	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	57397	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	149789263	149789759	149789627	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,CD74,CD74	CD74,RPS14	NA	NA	NA	NA	CD74	733	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	149945724	149945760	149945742	Y	SYNPO,ZNF300	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	32882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	149979570	149980059	149979818	Y	NA	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	928	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	149985154	149985492	149985203	Y	NA	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	6512	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	150108879	150109189	150109172	Y	SYNPO	RBM22,DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	27482	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	150401918	150402484	150402308	Y	GPX3,TNIP1	NA	NA	NA	NA	NA	TNIP1	68654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	150433768	150433905	150433861	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	37233	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	150454717	150454894	150454780	Y	NA	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	16244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	150455023	150455538	150455407	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	15600	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	150464543	150466084	150465220	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	5054	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	150468607	150468833	150468706	Y	RBM22,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	2305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	150505089	150505277	150505181	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69,ANXA6	TNIP1,ANXA6	TNIP1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA6	30166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	151097773	151098033	151097910	Y	SPARC	SPARC,RP11-54C4.1	SPARC,SLC36A1,ATOX1,G3BP1	IMR90	Hi-C	24141950	SPARC	33047	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	151108065	151108456	151108379	Y	NA	SPARC,RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	35483	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	151119916	151120243	151119990	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	SPARC	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	23696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	153807428	153807565	153807497	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	15845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	153809274	153809597	153809436	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	13813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	156623203	156623385	156623294	Y	CYFIP2,CYFIP2,ITK	MED7	NA	NA	NA	NA	MED7	39173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	156943029	156943356	156943193	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM19	57427	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	157097652	157097963	157097872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THG1L	58242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	158605991	158606398	158606265	Y	NA	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	28663	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	159402452	159402764	159402629	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	31356	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	163343940	163344177	163344063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAT2B	415820	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	167088894	167089267	167088997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	57101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	167241894	167242222	167242118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	95526	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	167372516	167372785	167372694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	226148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	167716783	167717259	167717053	Y	NA	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	167741798	167742197	167741960	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	25142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	167744761	167745078	167744891	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	28105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	168051900	168052268	168052099	Y	NA	PANK3,CTC-575D19.1	SLIT3	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-575D19.1	10583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	168588352	168588495	168588423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT3	137638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	169215174	169215454	169215255	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	190290	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	169398141	169398453	169398335	Y	NA	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	7291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	169733349	169733836	169733608	Y	NA	NA	LCP2,KCNIP1,C5orf58	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf58	75898	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	171094849	171095086	171094946	Y	NA	NA	FBXW11,FGF18	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1	282729	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	171298269	171298393	171298371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	133484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	171432610	171432692	171432660	Y	NA	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	733	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	171540284	171540310	171540295	Y	STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	73080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	171702162	171702431	171702281	Y	DUSP1,UBTD2,STK10	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	6644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr5	171879589	171880295	171879961	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	62	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	171882832	171882998	171882915	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	3305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr5	172167900	172168183	172168030	Y	UBTD2,DUSP1	DUSP1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	28015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172182355	172182703	172182434	Y	NA	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	13495	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172205264	172205447	172205353	Y	UBTD2,C5orf41,DUSP1	DUSP1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP1	9066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172225425	172225974	172225664	Y	ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	29227	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172262088	172262814	172262509	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	2810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172304591	172304758	172304618	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	45313	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172310587	172310757	172310673	Y	DUSP1	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	51309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172313877	172314602	172314167	Y	DUSP1,C5orf41	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	54599	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172329840	172330200	172330006	Y	DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	53532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	172370220	172370579	172370385	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	13153	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172380663	172381064	172380838	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	2668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	172881373	172881649	172881564	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	126867	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	172883833	172884047	172883943	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	129327	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr5	173191567	173191754	173191643	Y	CPEB4	NA	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	121529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	174906234	174906555	174906308	Y	NA	SFXN1	NA	NA	NA	NA	SFXN1	4169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	176359562	176359884	176359876	Y	RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	87750	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	176699119	176699281	176699198	Y	NSD1	RAB24,PRELID1,MXD3	NA	NA	NA	NA	RAB24	29464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	178985972	178986151	178986083	Y	NA	RUFY1	NA	NA	NA	NA	RUFY1	10413	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	179188972	179189165	179189138	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	MAML1	31121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	179206190	179206408	179206299	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	SQSTM1	24980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	179402324	179402667	179402531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9B	69465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr5	179517331	179517686	179517646	Y	HNRNPH1,MAML1,RNF130	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	20213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	180615428	180615595	180615512	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	1329	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	3401	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM7,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1,CTC-338M12.9	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	251975	252188	252075	Y	DUSP22	DUSP22	IRF4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP22	37442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	501922	502087	502051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC2	189030	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	710742	711015	710979	Y	HUS1B	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	19625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	1702305	1702315	1702310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	93624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	2767771	2767941	2767856	Y	NA	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	4123	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	2886440	2886951	2886782	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9,NQO2	SERPINB1,SERPINB9	MGC39372,MIR4645	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB9	14563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	3308463	3308483	3308477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	78499	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	3685850	3685982	3685964	Y	NA	NA	SLC22A23,PSMG4	IMR90	Hi-C	24141950	PXDC1	64278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	3797931	3798162	3798051	Y	NA	PXDC1	SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL	IMR90	Hi-C	24141950	PXDC1	47671	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	3826272	3826513	3826435	Y	C6orf145	NA	SLC22A23,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	PXDC1	76012	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	4317088	4317563	4317434	Y	CDYL	NA	RPP40,CDYL,LYRM4	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	183257	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	4355650	4355845	4355682	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	221819	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	4358823	4359231	4358978	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	224992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	5157743	5158129	5157936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	101043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	5204719	5205035	5204877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	54137	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	5246431	5246752	5246693	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	LYRM4	12420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	5287917	5288162	5288028	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	28640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	5296297	5296648	5296345	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	37020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	5966118	5966226	5966172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	706841	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	6742676	6742724	6742701	Y	NA	NA	RREB1,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	363106	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	6803868	6804205	6804018	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	301625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	9156165	9156451	9156310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	722371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	9503675	9503928	9503802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	913964	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	9516527	9516706	9516607	Y	NA	NA	LOC100130275,TFAP2A,LINC00518	IMR90	Hi-C	24141950	TFAP2A	901186	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	3.08901637849427
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,GCNT2	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr6	10719904	10720278	10720060	Y	NA	PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	TMEM14C	870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	10771427	10771996	10771700	Y	ELOVL2,MAK	TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	25400	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	10897145	10897485	10897326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAK	60381	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	10968528	10968697	10968612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	73850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	11144047	11144288	11144135	Y	TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	101500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	11197003	11197299	11197017	Y	ERVFRD-1,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	154456	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	167522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	11321238	11321480	11321378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	59101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	11428073	11428442	11428380	Y	NA	NEDD9	NEDD9,C6orf228,SYCP2L,ELOVL2,ERVFRD-1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	47492	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	11741947	11742326	11741953	Y	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	206009	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	11772710	11773287	11772940	Y	NEDD9,TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	233708	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	11921182	11921467	11921322	Y	NA	NA	ADTRP,HIVEP1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIVEP1	85528	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	12113688	12114092	12113700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	106693	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	12183004	12183212	12183108	Y	HIVEP1,EDN1	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	105384	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	12315136	12315383	12315260	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	26540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr6	12328741	12329205	12329092	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	40145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	12484193	12484504	12484246	Y	EDN1	RPL15P3	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	27838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	12546211	12546443	12546327	Y	NA	RPL15P3	EDN1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	33869	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	12577591	12578036	12577836	Y	NA	NA	EDN1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	65249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	12592849	12593177	12593094	Y	EDN1	NA	TMEM170B,EDN1,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	80507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	12948801	12948938	12948870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	263350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	13096654	13096703	13096662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	115585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	13302076	13302266	13302171	Y	NA	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	24549	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	13307248	13307611	13307538	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	LOC100130357	K562	ChIA-PET	22265404	TBC1D7	19204	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	13354550	13354809	13354680	Y	NA	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	27735	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	13602068	13602103	13602086	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	11456	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	13671877	13672171	13672102	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1,CD83	RANBP9	NOL7,SIRT5	K562	ChIA-PET	22265404	RANBP9	37625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	13709903	13710182	13710119	Y	TBC1D7,CD83,RANBP9	RANBP9	SIRT5,NOL7	K562	ChIA-PET	22265404	RANBP9	107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	14121845	14123283	14121874	Y	NA	CD83	NA	NA	NA	NA	CD83	5973	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	14138760	14138894	14138788	Y	CD83	CD83	NA	NA	NA	NA	CD83	22888	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr6	14271187	14271701	14271310	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	155315	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	14272446	14272765	14272606	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	156574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	14640701	14640843	14640773	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	524829	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	14661271	14661715	14661503	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	545399	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	14666096	14666691	14666258	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	550224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	14711169	14711813	14711625	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	532714	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	14713126	14713654	14713380	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	530873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	14728833	14729150	14728996	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	515377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	14732820	14733791	14733202	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	14735052	14735658	14735282	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	508869	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	14744083	14744613	14744392	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	499914	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	15436683	15436898	15436793	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	189818	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	15516223	15516554	15516389	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	144735	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	15530882	15531100	15530987	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	130189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	15589107	15589675	15589446	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	71614	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	15621958	15622209	15622147	Y	JARID2	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	39080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	15622564	15622845	15622741	Y	JARID2	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	38444	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16320322	16320626	16320375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	83511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16399265	16399639	16399452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	162454	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16422379	16422759	16422608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	185568	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	16474193	16474630	16474472	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	237382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16477089	16477316	16477218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	240278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16607418	16607798	16607611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	151571	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	85886	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16684094	16684384	16684208	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	74985	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16712557	16713382	16713252	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	45987	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr6	16713666	16713734	16713668	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	45635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	16724246	16724395	16724344	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	34974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16729304	16729629	16729584	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	29740	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	16747394	16747788	16747685	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	11581	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	16771345	16771373	16771363	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATXN1	11623	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	17418097	17418389	17418210	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	26650	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	17473157	17473283	17473220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	56600	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	17614611	17614952	17614695	Y	KIF13A,NUP153,FAM8A1	FAM8A1	NA	NA	NA	NA	FAM8A1	16025	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	17712711	17712926	17712817	Y	NA	NUP153	FAM8A1,NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	8055	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	17864491	17864751	17864619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	121103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	17925685	17925969	17925835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	59885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18148522	18148811	18148697	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	NHLRC1,TPMT,KDM1B	NHLRC1	IMR90	Hi-C	24141950	TPMT	4494	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18150871	18151234	18151053	Y	NUP153,KDM1B	NHLRC1,TPMT,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	2071	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	18263099	18263635	18263391	Y	RNF144B,DEK	DEK	NA	NA	NA	NA	DEK	45	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18308493	18308879	18308567	Y	NA	DEK	RNF144B	IMR90	Hi-C	24141950	DEK	45439	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr6	18330565	18331115	18330847	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	35664	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18341418	18341503	18341461	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF144B	25276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18342517	18342875	18342695	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	23904	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr6	18350965	18351333	18351089	Y	KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	15446	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18370927	18371512	18371225	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	4148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18400891	18401631	18401172	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	34112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18405939	18406237	18405987	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	39160	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	18406770	18407159	18406964	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	39991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18419977	18420304	18420012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	53198	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18432400	18432879	18432647	Y	KDM1B,RNF144B	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	65621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	18445456	18445774	18445699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	78677	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18501640	18502226	18502085	Y	NA	NA	RNF144B,DEK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF144B	134861	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	18503772	18504216	18504116	Y	NA	NA	RNF144B,DEK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF144B	136993	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18585399	18585722	18585618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	218620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18626849	18627153	18627001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	260070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	18741782	18741870	18741788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	375003	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	19805542	19805809	19805569	Y	NA	RP4-625H18.2,ID4	ID4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP4-625H18.2	2559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	20174199	20174610	20174442	Y	MBOAT1	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	36060	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	20206748	20206864	20206806	Y	MBOAT1	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	3806	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr6	20418274	20418752	20418425	Y	NA	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	17876	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr6	20498349	20498567	20498410	Y	MBOAT1	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	34121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	20604004	20604027	20604016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	71316	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	20811412	20811642	20811580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	278724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	20868773	20869042	20868908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	336085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	20994795	20995087	20994932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	462107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr6	21258987	21259049	21259040	Y	NA	NA	CDKAL1	IMR90	Hi-C	24141950	SOX4	332923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	21383430	21383704	21383606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	208268	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	21723251	21723611	21723431	Y	SOX4	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	131279	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	21925228	21925506	21925404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	333256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	21947021	21947287	21947156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	355049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	24498598	24498722	24498660	Y	NA	ALDH5A1	NA	NA	NA	NA	ALDH5A1	5518	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	5.14836063082378
chr6	26016753	26016987	26016816	Y	HIST1H1A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	713	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	26025834	26026125	26026038	Y	BTN2A1,BTN2A1,TRIM38	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	354	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	26169489	26169538	26169514	Y	BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BE	12420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	26233560	26233958	26233761	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	344	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	26266741	26266990	26266911	Y	NA	HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H3G	2622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	26283996	26284379	26284279	Y	NA	HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H4H	234	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	26304989	26305345	26305268	Y	NA	HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H4H	21227	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	26322637	26323123	26322876	Y	NA	HIST1H4H,BTN3A2	HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H4H	38875	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	26522673	26522990	26522813	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	2597	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	26536966	26537248	26536997	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	333	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr6	27065086	27065154	27065121	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	33387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	27071259	27071558	27071409	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	26983	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	27136362	27136689	27136526	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AH	23501	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	27205361	27205470	27205416	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	28338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	27637652	27637706	27637685	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	136003	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	27686942	27687278	27687069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	86431	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	27780866	27781094	27780996	Y	ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BM	44	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	28102608	28102781	28102677	Y	ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	12270	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	8.23737700931805
chr6	28601930	28602271	28602104	Y	NA	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	19941	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	28603148	28603326	28603259	Y	NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	21159	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	28715387	28715696	28715451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	89087	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	28834475	28834586	28834545	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5,HCG14	NA	NA	NA	NA	HCG14	27721	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	PPP1R11	37324	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	30175844	30176213	30176153	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	30495647	30495976	30495809	Y	PPP1R11,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3,FLOT1,HLA-E	RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	26687	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	30519269	30519607	30519590	Y	NA	PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	3056	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	30651242	30651620	30651357	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2052	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	30703511	30703691	30703651	Y	NA	PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	NA	NA	NA	NA	FLOT1	4819	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	4854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	30748515	30748873	30748611	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3,HCG20	CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,NRM,MRPS18B,PPP1R10,DDR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	15913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	30785907	30786494	30786279	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	53305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	C6orf48	10117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	TNXB	541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	32405012	32405514	32405402	Y	TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DRB1,HLA-DQB2,HLA-DQB1,HLA-DQA2,STK19,GPSM3,HLA-DRB5,HLA-DRA	HLA-DRA	HLA-DRA,HLA-DQB2,HLA-DQA2	IMR90	Hi-C	24141950	HLA-DRA	105	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	32572305	32572687	32572408	Y	GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1	HLA-DQA1	NA	NA	NA	NA	HLA-DQA1	21269	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	32577297	32577935	32577770	Y	GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1	HLA-DQA1	NA	NA	NA	NA	HLA-DQA1	16021	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	HLA-DOB,TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA	NA	NA	NA	NA	HLA-DOA	19118	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	33159164	33159383	33159309	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1	NA	NA	NA	NA	SLC39A7	6839	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	33602402	33602476	33602439	Y	NA	ITPR3	IP6K3	IMR90	Hi-C	24141950	ITPR3	16260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	34048216	34048600	34048360	Y	NA	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	136616	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	34615040	34615205	34615123	Y	NA	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	47431	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	34992488	34992843	34992549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	137446	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	35035271	35035638	35035433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCUBE3	144552	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	35149645	35149913	35149805	Y	NA	SCUBE3	UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11	IMR90	Hi-C	24141950	SCUBE3	30277	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	35185451	35185811	35185631	Y	NA	SCUBE3,ZNF76	NA	NA	NA	NA	SCUBE3	5261	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	35279423	35279720	35279457	Y	FKBP5,TAF11,ZNF76,RPL10A,DEF6	DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	DEF6	15828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	35331114	35331538	35331252	Y	PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	22779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	35561770	35562146	35562007	Y	NA	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	40120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	35875551	35875739	35875654	Y	SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1	SRPK1	NA	NA	NA	NA	SRPK1	11380	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	PXT1	591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	36628616	36629003	36628769	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90	Hi-C	24141950	LAP3P2	10591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	37190361	37190574	37190538	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	32974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	37210217	37210497	37210343	Y	TMEM217,TMEM217	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	13051	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	37366071	37366087	37366081	Y	NA	RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	46323	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	38844345	38844470	38844408	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	GLO1	175428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	39279620	39279758	39279742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK5	84394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	41512989	41513289	41513139	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	FOXP4	825	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	42255073	42255501	42255249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	71470	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	42283170	42283354	42283262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	99567	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	42306418	42306926	42306742	Y	UBR2,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	110863	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	42369897	42370202	42370080	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	47587	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	42375139	42375533	42375327	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	42256	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	42390239	42390257	42390249	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	27532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	42722931	42723177	42723029	Y	NA	ATP6V0CP3,TBCC	UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	10373	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	43295599	43295850	43295834	Y	TJAP1	CRIP3,ZNF318	NA	NA	NA	NA	CRIP3	21064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	43767552	43768173	43767868	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	31631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	43769637	43769823	43769746	Y	NFKBIE,TJAP1	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	33716	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	87630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	43894411	43894725	43894584	Y	NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	71592	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	44002049	44002379	44002368	Y	NFKBIE,GTPBP2	C6orf223,RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	35732	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	C6orf223,RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	29897	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	44010067	44010199	44010133	Y	C6orf223	C6orf223,RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	29451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	C6orf223,RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	27165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr6	44029482	44029781	44029724	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,VEGFA,XPO5,MRPS18A,C6orf223,MRPL14	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	9869	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	44031882	44032664	44032378	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	6986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr6	44052522	44052743	44052633	Y	NA	RP5-1120P11.3,TMEM63B,MRPL14	MAD2L1BP,GTPBP2,RSPH9,POLH,VEGFA,MRPS18A,XPO5,LOC100132354,TMEM63B,CAPN11,MRPL14,HSP90AB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	12872	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	44230828	44231731	44231363	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2	NA	NA	NA	NA	NFKBIE	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr6	44396303	44396427	44396307	Y	NA	CDC5L	NA	NA	NA	NA	CDC5L	43041	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	44458019	44458222	44458132	Y	NA	NA	SUPT3H,RUNX2,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	104757	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	44949602	44949944	44949774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX2	343950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	8290	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	45306825	45307168	45307007	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	12931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	45313959	45314320	45314140	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	20065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	45330194	45330521	45330358	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	13169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	45335233	45335541	45335303	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	8149	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	45678135	45678537	45678416	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,SUPT3H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	334445	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	47550559	47550935	47550672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	107034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	47618805	47618920	47618863	Y	OPN5	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	175280	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	48794608	48794845	48794713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	634059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	52377018	52377269	52377212	Y	GSTA5,TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62444	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	52382425	52382779	52382512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	56934	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	52389241	52389494	52389368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	50219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	52416321	52416567	52416441	Y	NA	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	23146	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	52439625	52439825	52439764	Y	TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	52952230	52952503	52952367	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	27630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	53195071	53195341	53195324	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	16606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	53205102	53205427	53205266	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	6520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr6	53326196	53326715	53326377	Y	NA	NA	ELOVL5,GCM1,FBXO9,GCLC	IMR90	Hi-C	24141950	ELOVL5	114249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	53348299	53348382	53348306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	131386	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	53660581	53660848	53660781	Y	LRRC1	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	3286	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr6	53734127	53734150	53734138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	76832	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	54604535	54604549	54604543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83B	105020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	520858	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	56459514	56459884	56459699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	357542	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	56543882	56543906	56543894	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	DST	273520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	57046105	57046302	57046204	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	10981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	57267458	57267955	57267680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	89855	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	57454700	57454967	57454896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	277097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	69073987	69074006	69073998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI3	269253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	69550268	69550631	69550285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI3	207009	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	70479579	70479974	70479889	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	25029	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	71548622	71548700	71548661	Y	FAM135A	NA	NA	NA	NA	NA	SMAP1	173143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	72034617	72034728	72034673	Y	NA	OGFRL1	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	38111	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	72051718	72051897	72051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	55212	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	72103028	72103231	72103130	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	8093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	72103736	72104124	72104114	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	7200	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	72114373	72114910	72114587	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	3049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	72178822	72179167	72178995	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30C2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	50350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	72598807	72598978	72598957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT19P1	306383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	72640618	72640942	72640781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT19P1	348194	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	73330314	73330844	73330342	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	73355182	73355469	73355282	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	73378236	73378609	73378395	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	48716	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	73861458	73861626	73861542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	109312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	74186150	74186447	74186193	Y	MTO1	MB21D1,MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	16849	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	74295823	74296227	74295840	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	64303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	74432369	74432753	74432573	Y	MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109	CD109	NA	NA	NA	NA	CD109	28861	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	75911376	75911573	75911562	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	2194	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	75914223	75914620	75914578	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	456	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	79597447	79597572	79597510	Y	NA	IRAK1BP1	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	22258	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	79718228	79718616	79718429	Y	PHIP	NA	NA	NA	NA	NA	PHIP	67337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	79779425	79779709	79779568	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	6244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	79835760	79835776	79835768	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	49807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	80246020	80246303	80246162	Y	NA	LCA5	NA	NA	NA	NA	LCA5	845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	80487784	80488033	80487927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL2	148784	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	80777050	80777287	80777243	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	37077	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	80873508	80873660	80873570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	59144	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	81048044	81048318	81048128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	233680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	82956000	82956181	82956090	Y	NA	IBTK	NA	NA	NA	NA	IBTK	529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	83893224	83893469	83893362	Y	RWDD2A,PGM3,PGM3	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	RWDD2A	7629	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	84101816	84101824	84101820	Y	NA	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	36973	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	84877511	84877669	84877594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	57684	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	85087981	85088261	85088229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	152628	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	86074188	86074341	86074265	Y	NA	NA	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	83468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	86174491	86174911	86174693	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	16682	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr6	86178039	86178499	86178211	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	20230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	88097721	88097946	88097834	Y	NA	C6orf164,C6orf165	C6orf165,RNGTT,GJB7	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf164	6894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	88183289	88183642	88183572	Y	NA	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	4948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	89315918	89316052	89315985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	331210	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	89470471	89470676	89470540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	200672	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	89473318	89473558	89473438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	197790	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	89577904	89578284	89578094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	93064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1,SRSF12	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	90031448	90031662	90031542	Y	PNRC1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	28905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	90061423	90061611	90061503	Y	RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	856	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	90550185	90550523	90550354	Y	NA	MDN1,CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	12572	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	90994076	90994276	90994132	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	10351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	90994449	90994671	90994572	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	9956	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	91004075	91004656	91004496	Y	MDN1,BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	91078844	91079184	91078980	Y	NA	NA	BACH2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BACH2	74217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	91121051	91121489	91121257	Y	BACH2,BACH2	NA	BACH2,MIR4464	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	116424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	95887569	95887862	95887716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	135557	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	99293549	99293815	99293794	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	100034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	99975087	99975427	99975257	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	USP45	7483	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	100007525	100007878	100007702	Y	LOC100130890	USP45,CCNC,PRDM13	NA	NA	NA	NA	CCNC	6971	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	100008682	100008928	100008805	Y	NA	USP45,CCNC,PRDM13	NA	NA	NA	NA	CCNC	5921	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	100012296	100012415	100012356	Y	NA	USP45,CCNC,PRDM13	NA	NA	NA	NA	CCNC	2434	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	100051584	100051769	100051603	Y	NA	CCNC,PRDM13	NA	NA	NA	NA	PRDM13	837	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	100676865	100677032	100676949	Y	NA	NA	SIM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	299120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	101204667	101204976	101204826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	122272	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	101211686	101211775	101211752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	115473	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	106048262	106048533	106048347	Y	NA	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	199303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	91524	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	106442778	106443178	106442990	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	106643011	106643217	106643065	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	110816	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	107773333	107773402	107773368	Y	SOBP	PDSS2,SOBP	NA	NA	NA	NA	PDSS2	5366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	107774853	107775271	107775085	Y	BEND3	PDSS2,SOBP	NA	NA	NA	NA	PDSS2	3497	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	108728233	108728375	108728296	Y	ARMC2	NA	NA	NA	NA	NA	LACE1	114135	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	109011028	109011405	109011217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	131990	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	109059217	109059645	109059338	Y	FOXO3	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARMC2	107974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	110093256	110093531	110093346	Y	CDC40,SMPD2,MICAL1,AKD1,FIG4	NA	NA	NA	NA	NA	FIG4	82757	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	111744480	111744594	111744536	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	58120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	111758931	111759246	111759206	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	43468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	111776910	111777281	111777179	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	25433	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	111784023	111784230	111784203	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	18484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	111905296	111905479	111905396	Y	NA	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	20002	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	112062889	112063206	112062987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	129449	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	112170510	112170904	112170903	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	21751	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	112618415	112618437	112618426	Y	NA	LAMA4	LAMA4	IMR90	Hi-C	24141950	LAMA4	44274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	112619942	112620186	112620045	Y	NA	LAMA4	LAMA4	IMR90	Hi-C	24141950	LAMA4	45801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	113951649	113952852	113952545	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-367G18.1	16424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	113966975	113967088	113966980	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-367G18.1	2188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	114318333	114318559	114318390	Y	NA	RP3-399L15.3,HDAC2	NA	NA	NA	NA	HDAC2	11913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	114391441	114391608	114391525	Y	HS3ST5	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC2	60969	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	116395142	116395462	116395394	Y	NA	NT5DC1	FRK,TPI1P3,NT5DC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC1	24550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	116550472	116550927	116550585	Y	KPNA5,TSPYL4,TSPYL1	TSPYL4,DSE,RP3-486I3.4,TSPYL1	NA	NA	NA	NA	TSPYL4	22334	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	116706605	116706866	116706798	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26F	73667	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	116708579	116708861	116708730	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26F	71672	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	117585963	117586004	117585985	Y	NA	VGLL2	NA	NA	NA	NA	VGLL2	1242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	117937053	117937396	117937164	Y	NA	GOPC	ROS1	IMR90	Hi-C	24141950	GOPC	15362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	118229466	118229974	118229859	Y	NA	SLC35F1	NA	NA	NA	NA	SLC35F1	2777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	118964875	118965125	118965000	Y	MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	CEP85L	64113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	125315315	125315695	125315334	Y	NA	RNF217,RP11-510H23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-510H23.1	33130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	125424080	125424400	125424202	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	13795	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	126167488	126167529	126167508	Y	NCOA7	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA7	67181	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	127653585	127653894	127653740	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	8860	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	137529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	128577381	128577403	128577392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	262467	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	128637396	128637725	128637581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	202145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	128747260	128747445	128747404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	92425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	128978518	128978541	128978530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	138648	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	129822062	129822220	129822139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	207150	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	130001069	130001170	130001133	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	28200	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	131961253	131961437	131961342	Y	NA	MED23	NA	NA	NA	NA	MED23	13884	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	133020075	133020153	133020114	Y	NA	VNN1,VNN3	NA	NA	NA	NA	VNN1	13035	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	133057339	133057671	133057545	Y	STX7,VNN1,VNN2,VNN2	VNN1,VNN3,VNN2	NA	NA	NA	NA	VNN3	3435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	133383318	133383532	133383367	Y	EYA4	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	176204	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	133890779	133890909	133890844	Y	NA	NA	MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	EYA4	331043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	134622486	134622615	134622584	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	14635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	134741718	134742020	134741875	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	135344059	135344242	135344151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	77952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	135491546	135491834	135491743	Y	NA	MYB	AHI1,BCLAF1,MYB	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYB	8619	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	136293369	136293422	136293396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	122535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	136455870	136456219	136456181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	152770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	136983395	136983458	136983427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	113438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	137109342	137109643	137109396	Y	IFNGR1,BCLAF1,MAP3K5	MAP3K5,PEX7	NA	NA	NA	NA	MAP3K5	2013	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	137231671	137231914	137231792	Y	NA	NA	SLC35D3	IMR90	Hi-C	24141950	PEX7	89954	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	137545116	137545441	137545236	Y	MAP3K5,IFNGR1	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	6530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138005755	138006075	138006062	Y	NA	NA	IL20RA	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	180276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138027517	138027801	138027604	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	158550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138049891	138050457	138050087	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	135894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138132277	138133056	138132650	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	53295	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138194322	138194912	138194642	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	7971	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	138254871	138255039	138254951	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	68520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138290142	138290398	138290268	Y	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	103791	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138426575	138426770	138426671	Y	PERP	NA	NA	NA	NA	NA	PERP	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138523816	138523995	138523837	Y	NA	KIAA1244	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	42758	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138552516	138552583	138552548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	71458	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	139300314	139300341	139300327	Y	NHSL1	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	7057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	139304978	139305148	139305081	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	2250	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	139860975	139861228	139861133	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC100132735	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	167218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	139861409	139861802	139861629	Y	HECA,CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC100132735	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	167652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	140083778	140084203	140083954	Y	NA	NA	TXLNB,CITED2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	390021	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	140085604	140086085	140085978	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	391847	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	140299062	140299512	140299364	Y	NA	NA	CITED2,HECA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	605305	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	141805925	141806152	141806020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	660215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	142335769	142335959	142335859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	130408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	142698366	142698689	142698587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR126	77375	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	143150171	143150307	143150239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	114031	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	143163714	143164598	143164218	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	99740	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	143174967	143175237	143175142	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	89101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	143192899	143193375	143193200	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	70963	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	143200640	143200895	143200768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	63443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	143204143	143204540	143204474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	59798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr6	143223836	143224147	143224035	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	40191	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	143234166	143234456	143234293	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	29882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr6	143248323	143248614	143248469	Y	NA	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	15724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	143476820	143477010	143476926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	97187	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	143770817	143770943	143770879	Y	ADAT2	ADAT2,PEX3	NA	NA	NA	NA	PEX3	873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	144053697	144053884	144053799	Y	STX11,PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	108597	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	144975415	144975576	144975532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	455313	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	145337204	145337426	145337274	Y	NA	NA	UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	EPM2A	717734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	146866760	146867250	146866919	Y	RAB32	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	3931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	147217441	147217852	147217780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	305709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	147235645	147236230	147236149	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	287331	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	148443958	148444368	148444103	Y	NA	NA	SAMD5	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	147072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	148685178	148685519	148685372	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	93738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	148822303	148822649	148822378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	230863	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	148879188	148879351	148879251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UST	187113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	149368124	149368336	149368236	Y	NA	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	16415	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	150259749	150260211	150260119	Y	NA	RAET1G,ULBP2	NA	NA	NA	NA	ULBP2	925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	151246480	151246919	151246675	Y	ZBTB2	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	61795	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	151302311	151302568	151302430	Y	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	116097	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	151325792	151326084	151325926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	92581	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	151366985	151367228	151367157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	51437	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	151701197	151701769	151701451	Y	C6orf97,ZBTB2	ZBTB2	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	8914	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	151990047	151990437	151990162	Y	NA	NA	ESR1,RMND1,C6orf211,SYNE1,C6orf97	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf211	218625	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	152583976	152584217	152584151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	372719	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	152606341	152606739	152606594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	350197	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	153132437	153132820	153132584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO5	169894	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	153358098	153358156	153358117	Y	SYNE1,RGS17	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	36278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	155179611	155179904	155179758	Y	NA	NA	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	127152	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	155193821	155194059	155193913	Y	NA	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	141362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	155544931	155545059	155544995	Y	SCAF8	RP11-477D19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	30799	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	155739222	155739872	155739692	Y	CLDN20	NA	NA	NA	NA	NA	TFB1M	105595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	157097774	157098131	157097933	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	711	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	157174408	157174845	157174627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	77345	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	157421397	157421571	157421514	Y	ARID1B	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	321062	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr6	157726321	157726550	157726459	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	16083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	158034114	158034488	158034146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	207808	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	158136804	158137189	158136890	Y	NA	NA	TMEM242,SNX9,ZDHHC14	IMR90	Hi-C	24141950	SNX9	105107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	158189433	158189765	158189601	Y	SNX9	NA	SNX9,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	52531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	158191942	158192437	158192205	Y	SNX9	SNX9	SNX9,SYNJ2	IMR90	Hi-C	24141950	SNX9	49859	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr6	158478416	158478907	158478642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	77528	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	158515424	158515781	158515670	Y	SYNJ2,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SERAC1	71531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	158982051	158982465	158982168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	75680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	SYTL3	72390	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	159171374	159171393	159171384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	67051	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	159211450	159211647	159211549	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	26797	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	159229924	159230242	159230166	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	8202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr6	159315379	159315577	159315478	Y	NA	C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	26408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	159359890	159360005	159359951	Y	EZR	NA	EZR	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	59214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	159383408	159383511	159383422	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	35708	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	159416474	159416597	159416565	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	2622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	160137124	160138386	160137829	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	6231	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	160144181	160144267	160144224	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	NA	NA	NA	NA	WTAP	350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	160404785	160405521	160405109	Y	SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	16654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	160699946	160700334	160700305	Y	LPA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2R	311815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	161591208	161591315	161591299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	101778	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	161607618	161607817	161607715	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	85276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	161647412	161647643	161647524	Y	MAP3K4,AGPAT4	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	45450	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	161678868	161678882	161678875	Y	NA	AGPAT4	MAP3K4	IMR90	Hi-C	24141950	AGPAT4	14211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	163675303	163675599	163675476	Y	QKI	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	157433	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	163840967	163841346	163841003	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	7935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	163976539	163976874	163976679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	143507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A	NA	NA	NA	NA	PDE10A	24211	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASET2	253061	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	167372859	167373027	167372950	Y	GPR31,RNASET2	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	RNASET2	4180	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	167395299	167395692	167395496	Y	NA	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	RP1-167A14.2	14861	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	168356861	168357132	168356996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	131259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr6	168493730	168493970	168493824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	268128	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	169063183	169063460	169063262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS2	588679	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	342873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	169343312	169344112	169343559	Y	NA	NA	LOC154449,WDR27,PHF10,C6orf70,TCTE3	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	308027	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	169568038	169568505	169568172	Y	NA	NA	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	83634	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	169569548	169569688	169569622	Y	NA	NA	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	82451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	169572627	169572772	169572742	Y	NA	NA	THBS2,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	79367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	170692180	170692479	170692329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	94389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr6	170838453	170838652	170838543	Y	NA	PSMB1,TBP	NA	NA	NA	NA	PSMB1	21777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	94709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	1066965	1067028	1066969	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	15184	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	1125303	1125884	1125584	Y	GPER,GPER	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	43091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	1456103	1456158	1456132	Y	NA	MICALL2	NA	NA	NA	NA	MICALL2	40980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	1571848	1572026	1571934	Y	ZFAND2A,TMEM184A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	1945683	1945719	1945693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	165756	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	2797465	2798227	2798113	Y	SNX8,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	75028	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	3453682	3454067	3453904	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	571724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	3877207	3877255	3877231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	804133	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	5452779	5453024	5452968	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	10021	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	5724329	5724708	5724518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	93890	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	6096315	6096609	6096412	Y	EIF2AK1	PMS2,AIMP2,EIF2AK1,AC004895.4,USP42	NA	NA	NA	NA	EIF2AK1	252	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	6425136	6425343	6425226	Y	CCZ1,USP42	RAC1	NA	NA	NA	NA	RAC1	12982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	6473446	6473633	6473567	Y	DAGLB	DAGLB,KDELR2	NA	NA	NA	NA	DAGLB	48188	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	AC073343.13,ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	7896018	7896243	7896099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	110182	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	13085757	13085829	13085793	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	361276	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	13889552	13889950	13889896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	139100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	17409796	17409963	17409863	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	72815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	17446496	17446663	17446580	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	109515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	18483962	18483986	18483974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	359390	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	18548166	18548343	18548284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	423594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	18563504	18563902	18563528	Y	HDAC9,HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	438932	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	19146147	19146774	19146493	Y	FERD3L,TWIST1	TWIST1	NA	NA	NA	NA	TWIST1	8521	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	19157963	19158297	19158271	Y	NA	TWIST1	NA	NA	NA	NA	TWIST1	2668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	20242848	20242947	20242898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	125378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	21502446	21502711	21502550	Y	SP4	SP4	NA	NA	NA	NA	SP4	36794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	22616988	22617783	22617407	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	52761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	STEAP1B	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	47340	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	102218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	23410116	23410259	23410188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	97827	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	24739704	24740021	24739930	Y	DFNA5,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	67223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	24795767	24795828	24795792	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	11416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	25897167	25897316	25897282	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292544	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	26193570	26193972	26193862	Y	SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	3710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	26747648	26747831	26747740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKAP2	285027	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	27386345	27386573	27386562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35P4	79048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	27717680	27717897	27717733	Y	NA	HIBADH	HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1	IMR90	Hi-C	24141950	HIBADH	17066	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	141190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr7	28094781	28094986	28094893	Y	HIBADH	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	123376	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	29628381	29628403	29628392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	395314	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	30005426	30005693	30005606	Y	NA	AC007285.6,SCRN1	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	20523	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	30204020	30204306	30204163	Y	ZNRF2	AC007036.5	NA	NA	NA	NA	AC007036.5	8873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	30222465	30222780	30222592	Y	ZNRF2	AC007036.5	NA	NA	NA	NA	AC007036.5	27318	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	32202741	32202908	32202813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	134033	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	32944853	32945232	32945065	Y	KBTBD2	KBTBD2,RP9P,FKBP9	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	13110	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	33079333	33079582	33079400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP9	67431	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	33316298	33316594	33316442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	149442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	34173056	34173436	34173156	Y	BMPER	NA	NA	NA	NA	NA	BMPER	230533	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	36227905	36228111	36228000	Y	HERPUD2,EEPD1	EEPD1	NA	NA	NA	NA	EEPD1	37147	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NPM1P18	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	12836	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	40706026	40706047	40706035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	718390	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	41926602	41926763	41926636	Y	NA	NA	LOC285954,C7orf10,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	185896	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	43625293	43625372	43625313	Y	URGCP,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	4936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	43912365	43912715	43912516	Y	NA	MRPS24	NA	NA	NA	NA	MRPS24	4873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	44426024	44426371	44426281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004453.8	79070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	44679392	44679514	44679453	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	35221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	44884505	44884603	44884554	Y	NA	H2AFV,PURB	NA	NA	NA	NA	H2AFV	1079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	45947887	45948101	45948023	Y	NA	IGFBP1,IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	11372	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	46186122	46186484	46186177	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	226649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	227039	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	46972513	46972753	46972628	Y	NA	NA	IGFBP3,IGFBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	647403	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47293209	47293414	47293276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	326742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47367058	47367181	47367120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	252975	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47390589	47390737	47390670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	229419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	47517591	47517776	47517700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	102380	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47533820	47533921	47533853	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	86235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47536985	47537239	47537063	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	82917	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47641950	47642196	47642073	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	21794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47644474	47644665	47644612	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	24318	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47691174	47691510	47691360	Y	C7orf69,TNS3,C7orf65	NA	TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	71018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	47709189	47709374	47709294	Y	UPP1,UPP1,HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	89033	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	47823605	47823820	47823740	Y	TNS3	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	9069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	6293	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	48127053	48127182	48127123	Y	HUS1,UPP1,UPP1	UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	50419918	50420354	50420176	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	95734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	50602565	50602886	50602809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	86477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	55198488	55198937	55198616	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	113774	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	CALM1P2	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	CALM1P2	2993	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	55506510	55507071	55506539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	75369	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	55637986	55638270	55638071	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	411	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1467054	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr7	57706434	57706786	57706770	Y	ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1534165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	65360437	65360759	65360712	Y	NA	VKORC1L1	NA	NA	NA	NA	VKORC1L1	24183	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	65613460	65613645	65613556	Y	ASL,ASL	CRCP	NA	NA	NA	NA	CRCP	35869	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	65790150	65790379	65790243	Y	RABGEF1,KCTD7,TPST1	NA	LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	TPST1	121964	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	73133049	73133354	73133303	Y	NA	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	STX1A	1047	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73180066	73180446	73180256	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3,CLDN4	NA	NA	NA	NA	CLDN3	2154	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73314080	73314324	73314199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	59215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73704690	73704803	73704747	Y	CLIP2	RFC2,CLIP2	NA	NA	NA	NA	CLIP2	2885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73705467	73705815	73705641	Y	NA	RFC2,CLIP2	NA	NA	NA	NA	CLIP2	3662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73748357	73748609	73748491	Y	LAT2	CLIP2	NA	NA	NA	NA	CLIP2	46552	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73785571	73785673	73785623	Y	CLIP2	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	80447	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr7	73869161	73869472	73869346	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3041	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	73869724	73869891	73869863	Y	GTF2IRD1	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3604	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	75546128	75546229	75546156	Y	NA	POR	STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	POR	19610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	75563701	75564093	75563872	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	37183	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	75573320	75573489	75573400	Y	POR	POR,TMEM120A	NA	NA	NA	NA	POR	46802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	75675722	75675985	75675853	Y	NA	STYXL1,MDH2	NA	NA	NA	NA	MDH2	353	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	75934206	75934543	75934471	Y	NA	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	4345	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	76002661	76002791	76002762	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	YWHAG	16313	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	76052692	76053023	76052931	Y	NA	ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	SRCRB4D	15680	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	77037268	77037509	77037460	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	127083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	77199277	77199536	77199359	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	34685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	77908468	77908642	77908513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	482346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	78478233	78478612	78478564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI2-AS3	601586	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	78922771	78923130	78923056	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI2-AS3	157068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	78947044	78947146	78947095	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI2-AS3	133052	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	79776985	79777288	79777110	Y	NA	GNAI1	NA	NA	NA	NA	GNAI1	15714	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	80337478	80337851	80337650	Y	NA	NA	SEMA3C	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	211824	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	80352083	80352704	80352185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	196971	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	80399893	80400101	80400015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	149574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	80441834	80442054	80441993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	107621	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	81061967	81062325	81062146	Y	NA	NA	SEMA3C,CD36	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	512292	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	81582871	81583219	81583134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	487895	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	86534596	86534997	86534797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	152018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	87453552	87453801	87453676	Y	NA	DBF4,SLC25A40	NA	NA	NA	NA	DBF4	49730	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	87984321	87984701	87984565	Y	STEAP4	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP4	50115	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	88029071	88029091	88029081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP4	94865	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	90033847	90034185	90034017	Y	STEAP2	CLDN12	NA	NA	NA	NA	CLDN12	22812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	90250368	90250899	90250569	Y	NA	AC002456.2	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	AC002456.2	25701	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	92217809	92218139	92217980	Y	NA	FAM133B	NA	NA	NA	NA	FAM133B	101	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	92227351	92227620	92227450	Y	CDK6,CDK6	FAM133B	FAM133B	K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	9643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	92260832	92261202	92261012	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	92271044	92271426	92271360	Y	SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	53336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	92274593	92274946	92274914	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	56885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	92279692	92280069	92279965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	61984	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	92383173	92383232	92383216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK6	80676	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	92437286	92437617	92437517	Y	SAMD9	CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	26291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	95747900	95748043	95747945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	201416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	97763424	97763629	97763532	Y	BRI3,LMTK2	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	29227	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	98739351	98739615	98739543	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	108	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	ARPC1A	NA	NA	NA	NA	ARPC1A	49392	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	98970307	98970479	98970399	Y	PTCD1,CPSF4	ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	99020392	99020577	99020441	Y	OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789	BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789	NA	NA	NA	NA	CPSF4	13968	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	99785086	99785350	99785241	Y	ZKSCAN1,MCM7,GATS	C7orf43,GAL3ST4,GPC2	NA	NA	NA	NA	GPC2	12091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	99965993	99966135	99966041	Y	C7orf59,C7orf43,ZCWPW1,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	28462	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	100433472	100433773	100433685	Y	NA	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	10351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	101372678	101373024	101372861	Y	NA	NA	CUX1,EMID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	83935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	101525517	101525682	101525579	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	68558	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	101569375	101569771	101569405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	112416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	77099	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM185A	128808	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	102790674	102790901	102790766	Y	NAPEPLD	RPL19P12,NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NAPEPLD	2667	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	104684659	104684988	104684665	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	33168	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	104844953	104845066	104844998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	192689	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	104992589	104992852	104992773	Y	NA	SRPK2	NA	NA	NA	NA	SRPK2	44903	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	105123568	105123582	105123575	Y	NA	PUS7,RINT1	NA	NA	NA	NA	PUS7	37132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	105766301	105766504	105766403	Y	NA	SYPL1	CDHR3,ATXN7L1,SYPL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	15279	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	105856842	105857229	105857099	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	67543	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	105922869	105923204	105923197	Y	NA	NAMPT	NA	NA	NA	NA	NAMPT	1568	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr7	106360961	106361340	106361088	Y	NA	NA	CCDC71L,NAMPT	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-884M6.1	52117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	106943118	106943475	106943297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	135712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	107205466	107205592	107205534	Y	COG5	DUS4L,COG5,BCAP29	NA	NA	NA	NA	COG5	2507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	108118010	108118358	108118206	Y	NA	NRCAM,RPL7P32	NA	NA	NA	NA	NRCAM	22849	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	110778024	110778148	110778086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	422425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	110849154	110849473	110849333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	351100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	110856868	110857086	110856977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	343487	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	111971895	111972278	111972086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFRD1	88745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	112599414	112599621	112599541	Y	C7orf60	C7orf60,AC018464.3	NA	NA	NA	NA	C7orf60	21443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	114301114	114301124	114301119	Y	FOXP2	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	259085	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	115873924	115874179	115873941	Y	TES	TES	NA	NA	NA	NA	TES	25377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	TES,CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	37825	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	115912136	115912451	115912327	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	12983	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	115957025	115957120	115957073	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31591	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr7	116035470	116035688	116035648	Y	NA	NA	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	AC002066.1	101831	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	116083167	116083483	116083344	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	TES,CAV2,CAV1,MET	IMR90,MCF7,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	AC002066.1	54036	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr7	116168216	116168790	116168273	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	5377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr7	116202174	116202561	116202326	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	39335	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr7	116271021	116271344	116271193	Y	NA	MET	TES,CAV1,MET,CAPZA2	IMR90,H1ESC,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	MET	39100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	116273487	116274025	116273860	Y	CAPZA2,TES	MET	TES,MET	IMR90,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	MET	36419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	116314942	116315351	116315128	Y	ST7,TES,CAV2,CAV2,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	4498	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	116332814	116332936	116332875	Y	CAPZA2,TES	MET	NA	NA	NA	NA	MET	22370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	116356493	116356879	116356812	Y	NA	MET	NA	NA	NA	NA	MET	46049	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	116504290	116504456	116504319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	55166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	116651956	116652355	116652105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	59568	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	116793573	116793925	116793605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	201185	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	116804623	116804954	116804811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	212235	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	120703433	120703512	120703470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	114630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	120724784	120725242	120725000	Y	C7orf58	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	135981	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	120841632	120841687	120841660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT16	121734	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	WNT16	NA	NA	NA	NA	WNT16	24936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	120942380	120942663	120942460	Y	NA	WNT16	NA	NA	NA	NA	WNT16	20758	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	120967407	120967422	120967415	Y	NA	WNT16	NA	NA	NA	NA	WNT16	3986	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	121008996	121009049	121009023	Y	NA	WNT16,FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	25369	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	121025846	121026096	121025939	Y	ING3	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	8322	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	121170860	121171233	121171047	Y	PTPRZ1	NA	FAM3C,WNT16	IMR90	Hi-C	24141950	FAM3C	136442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	123558914	123558958	123558950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASL	171793	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	125279639	125279913	125279647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-420H19.3	340707	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	126214480	126214602	126214539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	855376	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	728487	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	6.17803275698854
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	128500948	128501348	128501123	Y	NA	FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	ATP6V1F	68	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	128549999	128550078	128550039	Y	NA	ATP6V1F,IRF5	NA	NA	NA	NA	IRF5	25588	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	128915299	128915657	128915368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHCYL2	52435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	129057225	129057410	129057318	Y	NA	RP11-305M3.2	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	9014	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	129410177	129410359	129410300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRF1	160622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	129418602	129418801	129418733	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169047	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	130583676	130584341	130584164	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	11728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.33857376401418
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr7	130636331	130636776	130636707	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	40262	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	45656	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	130644314	130644883	130644570	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48245	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	130645057	130645459	130645325	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48988	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	130692586	130692952	130692786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	96517	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	130696655	130697004	130696978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95851	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	130735932	130736596	130736429	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	56259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	130795999	130796263	130796171	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	3064	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	130799789	130800044	130799917	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	6854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	130920397	130920794	130920689	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	4555	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	132340200	132340344	132340290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	424504	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	132488555	132488726	132488642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	276122	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	132607236	132607300	132607268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	157548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	133092941	133093104	133093022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	94774	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	133706471	133706698	133706584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGUK	103354	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr7	134521262	134521714	134521389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	94259	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	134571220	134571518	134571300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL3	97741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	135395183	135395352	135395286	Y	NA	C7orf73	NA	NA	NA	NA	C7orf73	49939	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	NA	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	98196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	137663180	137663556	137663478	Y	CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	21257	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	137671053	137671416	137671301	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	13397	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	138858843	138859133	138858995	Y	SVOPL	TTC26	NA	NA	NA	NA	TTC26	42353	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	139227178	139227349	139227257	Y	NA	ERHP1	NA	NA	NA	NA	ERHP1	10192	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	12.3560655139771
chr7	139333682	139334086	139333875	Y	TBXAS1,HIPK2	NA	NA	NA	NA	NA	ERHP1	116696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	139354231	139354464	139354322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	121113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	139365521	139365926	139365718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	109651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr7	139367600	139367827	139367677	Y	TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	107750	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	139368106	139368669	139368373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	106908	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	139410403	139410671	139410537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	64906	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	139431881	139432226	139432135	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	43351	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	139553792	139554214	139553890	Y	NA	NA	PARP12	IMR90	Hi-C	24141950	HIPK2	78215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	139555360	139555974	139555461	Y	JHDM1D,TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	79783	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	141285767	141286195	141285861	Y	TAS2R38,AGK	AGK	NA	NA	NA	NA	AGK	36778	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	141374630	141374958	141374810	Y	NA	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	24995	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	141492164	141492415	141492290	Y	TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	56043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	148306193	148306206	148306200	Y	NA	AC005229.5	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	30700	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	148424586	148424815	148424779	Y	NA	CUL1	NA	NA	NA	NA	CUL1	31580	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	151182414	151182755	151182660	Y	AGAP3,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	32451	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	151192969	151193321	151193145	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	151282868	151283053	151282986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	67662	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	151442202	151442898	151442523	Y	NA	NA	CRYGN,RHEB	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAG2-AS1	129229	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	151453235	151453789	151453377	Y	SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	118338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	151480048	151480422	151480235	Y	PRKAG2,GALNTL5	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	91705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	305822	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	NA	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	INSIG1	86416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr7	155049368	155049519	155049432	Y	NA	INSIG1	NA	NA	NA	NA	INSIG1	37967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	155105447	155105513	155105480	Y	NA	INSIG1	NA	NA	NA	NA	INSIG1	17961	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	155744220	155744341	155744281	Y	NA	NA	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC009403.2	308321	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	NA	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC009403.2	318659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	157034052	157034373	157034213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	50990	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	157054104	157054271	157054188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	71042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	157067817	157068138	157067978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	57937	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr7	157334866	157335140	157335002	Y	DNAJB6,DNAJB6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	208791	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	157476988	157477433	157477353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	350913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	158500449	158500649	158500582	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	4929	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr7	158595763	158596162	158596010	Y	ESYT2	ESYT2	NA	NA	NA	NA	ESYT2	24782	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	2591169	2591450	2591225	Y	NA	GS1-57L11.1,RP11-134O21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-134O21.1	7178	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	6275449	6275723	6275483	Y	NA	MCPH1,RP11-115C21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-115C21.2	12786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	6415254	6415472	6415345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	148258	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	6490542	6490767	6490601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	72963	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	8742026	8742246	8742225	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	6909	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	8878847	8879137	8878870	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	21190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	8932382	8932915	8932599	Y	CLDN23,PPP1R3B	NA	PPP1R3B,ERI1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PPP1R3B	74169	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	8935191	8935379	8935249	Y	NA	NA	ERI1,PPP1R3B,TNKS	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3B	71705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	8939736	8940088	8939838	Y	CLDN23,ERI1,PPP1R3B	NA	ERI1,PPP1R3B,TNKS	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3B	66996	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	10079596	10079605	10079601	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	169818	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	10187572	10187859	10187580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	277794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	10591008	10591121	10591065	Y	RP1L1,SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	SOX7	104236	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	10676875	10677241	10677058	Y	NA	SOX7,PINX1	NA	NA	NA	NA	SOX7	18116	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	11282611	11282836	11282801	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	47388	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	7.10473767053682
chr8	11314255	11315026	11314813	Y	XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	15198	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr8	11315246	11315781	11315560	Y	XKR6,MTMR9	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	14443	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	11337266	11337614	11337440	Y	FAM167A	FAM167A	C8orf12,BLK	IMR90	Hi-C	24141950	FAM167A	7042	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr8	11368445	11368737	11368558	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	38221	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	11373324	11373814	11373559	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	43100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	11690057	11690160	11690110	Y	NA	SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB	NA	NA	NA	NA	RP11-297N6.4	31980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	11744810	11745247	11745024	Y	NA	CTSB	CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTSB	19853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	12988209	12988727	12988474	Y	DLC1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1456	187058	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	13101435	13101826	13101810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	269341	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	13210778	13210972	13210875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	160195	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	13230060	13230464	13230283	Y	DLC1	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	140703	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	17355613	17356072	17355737	Y	NA	SLC7A2	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	3016	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	17466233	17466439	17466333	Y	NA	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	PDGFRL	34291	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	17665479	17665814	17665519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCM1	112535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	17893767	17894158	17893964	Y	NAT1,ASAH1,ASAH1	CTD-2547L16.1,ASAH1	NA	NA	NA	NA	CTD-2547L16.1	46219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	18722659	18722821	18722740	Y	PSD3	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	217419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	19066932	19067320	19067099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	101808	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	19330951	19331201	19331187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	161823	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	19534251	19534633	19534630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	78907	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	19798785	19799134	19798803	Y	NA	LPL	NA	NA	NA	NA	LPL	41557	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	20064190	20064507	20064297	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	11312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	20125746	20125979	20125927	Y	NA	NA	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	72868	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	21624397	21624558	21624547	Y	NPM2,GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	150622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	22439546	22439823	22439672	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	5754	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	22516346	22516607	22516450	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	8054	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	22840134	22840430	22840185	Y	BIN3,TNFRSF10B	RHOBTB2,RP11-875O11.1	BIN3,TNFRSF10B,RHOBTB2,PEBP4,C8orf58,KIAA1967,LOC286059	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB2	2500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2,RP11-875O11.1	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	22858322	22858618	22858470	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2,RP11-875O11.1	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15392	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	23020215	23020436	23020325	Y	NA	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	672	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	23202733	23203217	23203148	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	77100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	23211536	23211676	23211614	Y	TNFRSF10D,LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	69165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	23353842	23353942	23353892	Y	TNFRSF10C,SLC25A37	ENTPD4,SLC25A37	NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A37	30376	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	23397982	23398147	23398067	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	13664	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	23618921	23619563	23619216	Y	ENTPD4,ENTPD4	NA	STC1,ENTPD4	IMR90	Hi-C	24141950	NKX3-1	80481	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	23710742	23711028	23710888	Y	STC1	STC1	NA	NA	NA	NA	STC1	422	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	24857844	24858008	24857898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	182230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	25242857	25243137	25242939	Y	NA	NA	KCTD9	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD9	70855	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R2A	137853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	26162518	26162881	26162571	Y	NA	PPP2R2A	NA	NA	NA	NA	PPP2R2A	15511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	26232086	26232281	26232177	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	BNIP3L	6133	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	63575	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr8	26466209	26466513	26466418	Y	PPP2R2A,BNIP3L	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	96418	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	26466894	26467238	26467101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	97103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	27192227	27192436	27192262	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	25228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	27200806	27201031	27200919	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	33807	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	27464961	27465271	27465267	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	CLU	5277	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	29028606	29028803	29028712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13B	89838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	29513867	29514215	29514082	Y	KIF13B	NA	DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF13B	395226	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	29914930	29915195	29915084	Y	NA	TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	TMEM66	23528	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	30462940	30463157	30463081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	50611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	30506010	30506203	30506101	Y	NA	GTF2E2	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	7565	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.36824589017894
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	PURG,WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	30907025	30907279	30907152	Y	LOC100507341,TEX15,PURG	PURG,WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	17708	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	32490865	32491103	32490993	Y	NRG1,NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	609130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	32508172	32508500	32508337	Y	NRG1,NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	626437	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	32553058	32553329	32553194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	671323	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	32572764	32572916	32572840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1-IT1	691029	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	33579772	33580017	33579844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	135724	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	10.399688474264
chr8	33668021	33668356	33668148	Y	NA	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	47385	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	33718252	33718557	33718395	Y	NA	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	2511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	33743518	33743769	33743644	Y	MAK16	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	27777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.98604916587779
chr8	37000181	37000618	37000483	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	409083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	11.0174917499629
chr8	37002327	37002551	37002443	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	407150	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	8.443311434551
chr8	37005639	37005772	37005739	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	403929	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	37372940	37373020	37372980	Y	NA	RP11-150O12.1	KCNU1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150O12.1	36681	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	37376212	37376482	37376355	Y	NA	RP11-150O12.1	KCNU1,ERLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150O12.1	33219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	37574092	37574593	37574403	Y	NA	ZNF703,ERLIN2,PROSC	NA	NA	NA	NA	ERLIN2	17524	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr8	37739186	37739703	37739509	Y	RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	GPR124,BRF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP1	15282	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	37992032	37992208	37992120	Y	NA	ASH2L,BAG4,LSM1	NA	NA	NA	NA	ASH2L	31272	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	38077409	38077725	38077419	Y	NA	BAG4,LSM1,DDHD2,PPAPDC1B	DDHD2	IMR90	Hi-C	24141950	DDHD2	3011	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	38216773	38217155	38217067	Y	WHSC1L1,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	WHSC1L1	20635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	38313401	38313535	38313485	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	10817	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	38384926	38385302	38385064	Y	HTRA4,TACC1,PLEKHA2,C8orf86	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR1	60574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	38523213	38523472	38523342	Y	C8orf86	NA	C8orf86,FGFR1,WHSC1L1,RNF5P1,PPAPDC1B	IMR90	Hi-C	24141950	TACC1	60232	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	38757431	38758061	38757845	Y	C8orf86,TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	678	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	38762883	38763134	38762941	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	6130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	38770998	38771507	38771224	Y	NA	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	14245	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	38791407	38791790	38791499	Y	NA	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	34654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	38794203	38794537	38794324	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37450	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr8	38816649	38817007	38816807	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	TM2D2	35336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	39976615	39976841	39976744	Y	IDO1	C8orf4	C8orf4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	32148	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	40032102	40032537	40032342	Y	IDO1	C8orf4	NA	NA	NA	NA	C8orf4	23113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	41146046	41146081	41146065	Y	SFRP1	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	18935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	41160567	41160649	41160637	Y	NA	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	4367	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	41628099	41628173	41628135	Y	ANK1	NA	NA	NA	NA	NA	NKX6-3	121244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	41733569	41733873	41733722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	173635	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	41775383	41775559	41775471	Y	NA	NA	ANK1	IMR90	Hi-C	24141950	KAT6A	131949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	41851790	41851810	41851800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	55698	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	41886687	41887061	41886965	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	20447	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2,PLAT	NA	NA	NA	NA	PLAT	9107	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	42398083	42398473	42398470	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	3014	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	61	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	48242793	48242802	48242797	Y	NA	NA	PRKDC	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA5P12	168300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	48341345	48341518	48341449	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	266852	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	224269	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	48434780	48435210	48435108	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	214438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	48438620	48439345	48439203	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	210303	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	48531592	48531742	48531667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	117906	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	48746170	48746340	48746217	Y	MCM4	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	96522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	48853752	48854057	48853918	Y	NA	PRKDC,MCM4	NA	NA	NA	NA	PRKDC	16686	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	48910578	48910837	48910684	Y	NA	PRKDC,MCM4,UBE2V2	NA	NA	NA	NA	UBE2V2	8123	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	49282720	49283033	49282877	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	12117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25217	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr8	49427546	49427722	49427633	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	132396	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	53607875	53608327	53608179	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	48076	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	55065365	55066496	55065716	Y	ATP6V1H,ATP6V1H	MRPL15	NA	NA	NA	NA	MRPL15	19595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	57122742	57122884	57122813	Y	NA	PLAG1,CHCHD7	NA	NA	NA	NA	CHCHD7	497	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	57389900	57390701	57390447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17A4.1	108243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	58908204	58908269	58908237	Y	NA	FAM110B	NA	NA	NA	NA	FAM110B	3136	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	59476129	59476409	59476167	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	12646	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	59499727	59499886	59499762	Y	UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	36244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	59763369	59763610	59763548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMAF	192966	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	59768911	59769118	59769011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMAF	198508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.57418031541189
chr8	61821464	61821801	61821596	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	232127	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	62631895	62632623	62632238	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	6548	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	62634023	62634407	62634126	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	8676	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	63934936	63935021	63934979	Y	NA	GGH	NA	NA	NA	NA	GGH	14709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	64133013	64133210	64133061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	53901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	66652181	66652518	66652302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	97212	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRH	52321	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	67424340	67424761	67424541	Y	C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	RRS1	85077	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	67425057	67425564	67425100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRS1	85794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89869	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	67447907	67448273	67448065	Y	MYBL1,C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	76209	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	67565254	67565409	67565332	Y	NA	MYBL1,VCPIP1,C8orf44	NA	NA	NA	NA	VCPIP1	12043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	68090392	68090564	68090531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	96374	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	71084923	71085298	71085131	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	70509	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	71106642	71106934	71106707	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	92228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	71459765	71459799	71459782	Y	NA	NA	NCOA2	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM1	58823	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2,XKR9	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	73690966	73691186	73691160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	227913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	75908161	75908345	75908173	Y	NA	CRISPLD1	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	13411	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	77128503	77128819	77128661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01111	188070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	77389631	77389653	77389643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01111	72742	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr8	77464469	77464479	77464474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	126975	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	77469082	77469378	77469240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	122076	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	77515612	77515766	77515691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	75688	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	77729936	77730258	77730097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4-AS1	136423	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	77731385	77731402	77731393	Y	ZFHX4	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4-AS1	137872	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	79597617	79597771	79597694	Y	PKIA,FAM164A	NA	NA	NA	NA	NA	IL7	117987	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	79678624	79678939	79678782	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	36819	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	79762134	79762468	79762223	Y	IL7	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	46376	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	80680806	80681178	80681064	Y	HEY1	HEY1	NA	NA	NA	NA	HEY1	2708	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18244	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.54450818924713
chr8	81015641	81015664	81015650	Y	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	75117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	81035979	81036376	81036336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	95455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	81041762	81041917	81041834	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	99550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	81050951	81051119	81051010	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	90348	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	81400222	81400395	81400296	Y	ZBTB10	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	4368	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	81774871	81775022	81774952	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	247281	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	90740659	90741027	90740842	Y	NA	RP11-37B2.1,RIPK2	DECR1,NBN,RIPK2,OSGIN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-37B2.1	26928	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	90776453	90776674	90776498	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	8478	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	90901747	90901955	90901807	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	10132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	90912887	90913271	90913166	Y	NA	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	800	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	90942619	90942853	90942786	Y	RIPK2,NBN,OSGIN2	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	30532	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	91926136	91926682	91926246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662G23.1	56668	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	93470444	93470468	93470456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	1238321	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	94850124	94850307	94850200	Y	PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17728	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	94850724	94850939	94850832	Y	GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17096	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	94892570	94892797	94892694	Y	NA	PDP1	TMEM67,PDP1,MIR378D2	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	24535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	94928107	94928427	94928252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	60072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	94947484	94947898	94947643	Y	GEM	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	79449	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	95246535	95247070	95246768	Y	GEM	KB-1247B1.1,GEM	CDH17	IMR90	Hi-C	24141950	GEM	25508	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	95254172	95254606	95254439	Y	GEM	KB-1247B1.1,GEM	CDH17	IMR90	Hi-C	24141950	GEM	17972	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	95433210	95433488	95433370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	51849	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	95786265	95786660	95786406	Y	RAD54B,KIAA1429	INTS8	NA	NA	NA	NA	INTS8	36879	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	95896385	95896691	95896542	Y	NA	CCNE2	NA	NA	NA	NA	CCNE2	10215	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	98843281	98843693	98843349	Y	POP1	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31589	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	99643221	99643590	99643555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	309465	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	99952283	99952358	99952318	Y	OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	697	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	99952429	99952792	99952702	Y	NA	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	263	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr8	101913945	101914105	101914022	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	49511	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	43224	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	102423654	102423774	102423714	Y	NA	NA	GRHL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NACAP1	51632	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	102842210	102842224	102842217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2B	407122	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	103422542	103423104	103422992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR5	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	103669922	103670289	103670129	Y	ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	84763	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	103795045	103795342	103795198	Y	NA	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1507C5.2	79186	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	72755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr8	103803215	103803631	103803453	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	70897	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr8	103806867	103807011	103806958	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	67517	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	103825525	103825897	103825586	Y	NA	KB-1507C5.2	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	48631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	103858397	103858789	103858587	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	15739	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	103918538	103918841	103918687	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	ATP6V1C1,AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	14446	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr8	105011226	105011541	105011384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-5A11.1	441609	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	105034041	105034154	105034124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-5A11.1	464424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	105655226	105655568	105655399	Y	TM7SF4,LRP12	NA	LRP12	IMR90	Hi-C	24141950	LRP12	55974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	106511726	106511821	106511774	Y	ZFPM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	182806	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	106764019	106764032	106764026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	306720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	106769068	106769071	106769070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	301681	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	107054607	107054687	107054647	Y	OXR1	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	16065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	107059911	107060047	107059923	Y	NA	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	10705	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	107735956	107736285	107736121	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	27715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	107740443	107740789	107740616	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	32202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	109222483	109222836	109222544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	222726	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	109230205	109230491	109230349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	215071	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	110288477	110288741	110288621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	55812	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	111947421	111947490	111947466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	1245401	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	115322659	115322858	115322759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSMD3	875331	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	116068457	116069128	116068655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	750771	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	116620399	116620545	116620472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	199354	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	118130413	118130798	118130606	Y	RAD21,SLC30A8,SLC30A8,SLC30A8	NA	NA	NA	NA	NA	RAD21	245308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	118801002	118801354	118801210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	270050	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	118859857	118860327	118860104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	261765	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119023512	119024035	119023740	Y	EXT1	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	98057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119049251	119049636	119049444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	72456	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119117518	119117887	119117807	Y	NA	EXT1	NA	NA	NA	NA	EXT1	4205	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119189481	119189499	119189490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	67389	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119264701	119264795	119264748	Y	SAMD12	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	142609	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr8	119339236	119339376	119339324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	217144	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119452841	119453220	119453102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	179014	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119536200	119536581	119536442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	95653	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119536968	119537364	119537323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	94870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	119781554	119781682	119781618	Y	NA	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	9114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	119939542	119939811	119939755	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	22628	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	121456351	121456697	121456524	Y	SNTB1,MTBP,MRPL13	MTBP,MRPL13	NA	NA	NA	NA	MRPL13	709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	121702901	121703232	121703165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	120281	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	122157265	122157468	122157378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	333752	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	123117461	123117740	123117615	Y	HAS2	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	465831	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	123882951	123883328	123883140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	91318	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	123983848	123983920	123983884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	68743	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124337288	124337362	124337325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX1	51507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124407044	124407322	124407183	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	19268	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124462485	124463022	124462596	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	WDYHV1	35520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124529265	124529734	124529486	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	21712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124684984	124685340	124685256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	93356	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124695521	124695846	124695602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	82850	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	124889263	124889525	124889394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	110567	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	125382714	125382961	125382953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	125539571	125539718	125539637	Y	RNF139	NDUFB9,TATDN1	RNF139	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NDUFB9	9626	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	126112372	126112753	126112532	Y	TRIB1,NSMCE2	NSMCE2,KIAA0196	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	10290	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	126283499	126283849	126283769	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	156714	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	126353679	126353867	126353799	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	86696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	126365187	126365461	126365226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	75102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	126451967	126452238	126452064	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	126452500	126452812	126452633	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11937	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	126649729	126649959	126649891	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	209166	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	128219153	128219489	128219426	Y	NA	NA	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYC	526191	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128258299	128258698	128258657	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	486982	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	438397	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128344177	128344591	128344565	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	401089	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128352367	128352670	128352528	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	393010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128744100	128744550	128744397	Y	NA	MYC	NA	NA	NA	NA	MYC	1130	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128768623	128768723	128768690	Y	NA	MYC,PVT1	NA	NA	NA	NA	MYC	22943	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	128811691	128811973	128811933	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	6912	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128821272	128821652	128821500	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	16493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128822019	128822203	128822035	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	128911546	128911899	128911640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	106767	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128923296	128923609	128923453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	97248	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128930937	128931257	128931067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	89600	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	128961875	128962320	128962073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	58537	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	128988975	128989172	128989023	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	31685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	129036981	129037022	129036995	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	16124	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	129062971	129063389	129063062	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	42114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	129129719	129130040	129129840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	108862	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	129180047	129180432	129180183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	159190	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	129185963	129186138	129186049	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	165106	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	129195465	129196052	129195562	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	174608	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	129204780	129204979	129204839	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	183923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	129336748	129337038	129336807	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	315891	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	129436806	129436985	129436896	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	415949	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	306817	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	130876466	130876830	130876577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	150545	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	130897837	130898360	130898140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	129015	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	131024148	131024528	131024501	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	2847	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	131232940	131233341	131233190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	205565	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	131245360	131245556	131245456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	208350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	131264949	131265429	131265208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	188477	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	131271304	131271556	131271460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	182350	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	131276645	131276741	131276715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	177165	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	131296989	131297286	131297259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	156620	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	131354482	131354860	131354810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	99046	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	131456841	131457348	131457080	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	2935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	132828459	132829599	132829218	Y	EFR3A	NA	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	84736	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr8	132913668	132913705	132913672	Y	HHLA1	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	132928633	132929053	132928845	Y	NA	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	14298	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chr8	133490570	133490736	133490650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	195102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	133689212	133689471	133689356	Y	PHF20L1	LRRC6	NA	NA	NA	NA	LRRC6	3374	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	134915462	134915636	134915545	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	333279	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	135570853	135571245	135571049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	152047	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	136424351	136424597	136424474	Y	NA	KHDRBS3	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	43103	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	140830815	140831120	140830968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	635558	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr8	141479707	141479835	141479741	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	EIF2C2,CHRAC1,TRAPPC9,PTK2	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TRAPPC9	13029	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	141555144	141555348	141555233	Y	EIF2C2,CHRAC1	CHRAC1	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	35747	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	141608422	141608817	141608788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	89025	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	141800912	141801386	141801027	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	208929	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	141945462	141945818	141945641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	64497	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	142096370	142097040	142096464	Y	EIF2C2,SLC45A4,DENND3	DENND3	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	28337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	142129714	142130013	142129874	Y	EIF2C2,SLC45A4,DENND3	DENND3	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	4337	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	142182442	142182863	142182588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	57065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	142424633	142425265	142424919	Y	NA	GPR20,PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	24540	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	142426003	142426250	142426062	Y	PTP4A3	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25910	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	143353648	143353818	143353814	Y	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	128783	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	143696778	143697162	143696893	Y	NA	ARC	NA	NA	NA	NA	ARC	1945	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	143757526	143757895	143757616	Y	NA	PSCA,JRK,LY6K	NA	NA	NA	NA	JRK	3491	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr8	144629463	144629732	144629564	Y	SPATC1,GRINA	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,TIGD5,EEF1D	NA	NA	NA	NA	GSDMD	3645	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	MAPK15,FAM83H	NA	NA	NA	NA	FAM83H	6228	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr8	145070098	145070262	145070188	Y	NA	PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH	NA	NA	NA	NA	GRINA	7872	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	145558616	145559185	145558966	Y	ZNF517,ZNF34,LRRC24,KIFC2,CYHR1,SCRT1	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	10043	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	614528	614756	614656	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	146237	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	694779	695236	694990	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	226488	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	2655543	2655805	2655674	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	35709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	3470131	3470258	3470195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	53746	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	3971837	3971870	3971849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	374522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	4137159	4137519	4137339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	208873	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	4241498	4241696	4241599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	104696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	4293316	4293716	4293485	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	52676	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	4296901	4297617	4297146	Y	GLIS3	GLIS3	NA	NA	NA	NA	GLIS3	48775	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	5460253	5460626	5460389	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	11750	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	5509549	5510003	5509837	Y	C9orf46,CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	1004	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	5558340	5558581	5558428	Y	CD274,KIAA2026,KIAA1432	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	49795	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	5580709	5581016	5580868	Y	NA	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	46009	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	6384866	6385180	6385056	Y	NA	UHRF2	NA	NA	NA	NA	UHRF2	25971	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	7320258	7320407	7320333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	155913	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	8576629	8576984	8576673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	134327	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	10027810	10028140	10027960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	582583	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	12779203	12779569	12779249	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	32775	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	12784417	12784967	12784682	Y	C9orf150	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	27377	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	13034069	13034552	13034397	Y	NA	NA	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-3L8.3	221725	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	13278024	13278458	13278161	Y	NA	MPDZ	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	435	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	14233168	14233395	14233282	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	163587	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	14320331	14320603	14320385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	76379	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr9	14347993	14348154	14348106	Y	NFIB	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	48828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	14992180	14992514	14992235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHAP4	71848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.44154097663066
chr9	16709928	16710291	16710201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNC2	158550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	17580370	17580488	17580383	Y	NA	SH3GL2	NA	NA	NA	NA	SH3GL2	3290	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	18695	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	20793724	20794222	20793867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	173182	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD2	66759	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	21696721	21697113	21696912	Y	IFNA8	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103429	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	21809706	21810111	21809856	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	9164	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	21984231	21984381	21984318	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	8919	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	21996110	21996456	21996153	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	2810	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	21996542	21996712	21996656	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	3242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chr9	22040932	22041035	22040938	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	30778	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	22080061	22080293	22080228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	69907	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	22103396	22103678	22103511	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2B	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	93242	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	22148170	22148538	22148388	Y	NA	NA	MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2B,CDKN2A	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	138016	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	22216803	22217265	22216812	Y	NA	NA	CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	206649	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	22414049	22414273	22414161	Y	NA	DMRTA1	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	30567	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	23703145	23703507	23703326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	120828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	23850835	23851256	23851099	Y	NA	ELAVL2	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	26500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	26260192	26260607	26260418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	583336	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	26265141	26265461	26265258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	588285	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	26921358	26921728	26921543	Y	NA	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	IFT74	23309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	MOB3B,C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	7562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	28813062	28813251	28813159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1241198	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1615829	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	29826427	29826586	29826507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003637	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	31966420	31966696	31966558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	415922	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	32004800	32005157	32005020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	377461	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	32183281	32183478	32183392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	199140	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	32437038	32437275	32437091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	54420	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	32524178	32524624	32524592	Y	DDX58	TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	33028063	33028460	33028077	Y	NA	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	4854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	33033161	33033386	33033274	Y	TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	9952	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	33953868	33954185	33954034	Y	UBE2R2,UBAP1	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	92762	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	34179799	34180083	34180009	Y	UBE2R2,UBAP1	UBAP1,AL353662.2,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	2796	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	35153448	35153469	35153459	Y	NA	FAM214B,UNC13B	UNC13B,ATP8B5P	IMR90	Hi-C	24141950	UNC13B	6530	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	35232989	35233276	35233133	Y	DNAJB5	NA	NA	NA	NA	NA	UNC13B	72990	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	35492185	35492605	35492350	Y	RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	110762	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	84777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	82515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	66455332	66455763	66455668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1997612	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.75044261448009
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	80021	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	141741	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	72344996	72345326	72345161	Y	NA	PTAR1	NA	NA	NA	NA	PTAR1	27549	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.05934425232951
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	73036465	73036957	73036835	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	73184848	73185244	73185056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	157308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	74511654	74511799	74511765	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	12627	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	74515794	74516103	74515949	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	8323	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	74849498	74849569	74849533	Y	GDA,GDA,TMC1	NA	NA	NA	NA	NA	GDA	121987	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	75791521	75791823	75791639	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	26848	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	75797609	75797655	75797632	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	32936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	78507446	78507579	78507560	Y	PCSK5	NA	NA	NA	NA	NA	RFK	499854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	79191243	79191544	79191412	Y	NA	AL161626.1	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	6512	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	80325325	80325445	80325383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	318929	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	81486579	81486867	81486725	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	PSAT1	576520	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	82185317	82185693	82185378	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	629	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	82213229	82213622	82213243	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	28541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	82483722	82484194	82484004	Y	TLE4	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	299034	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	83116655	83116891	83116780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	931967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	85478657	85478918	85478814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASEF	197174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	86238855	86239256	86239056	Y	UBQLN1,GKAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	81253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	86271805	86271878	86271876	Y	NA	RP11-522I20.3,UBQLN1	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	48631	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	86911270	86911583	86911478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI1	317644	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	88294983	88295025	88294997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	59919	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	88329158	88329382	88329166	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	25562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	88346951	88347024	88346988	Y	NA	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	7920	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	88870940	88871069	88871028	Y	C9orf153	ISCA1	NA	NA	NA	NA	ISCA1	24607	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	88983987	88984393	88984184	Y	NA	ZCCHC6	DAPK1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC6	16618	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	89020840	89021025	89020931	Y	ZCCHC6	NA	GAS1,DAPK1,ZCCHC6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZCCHC6	53471	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	90279667	90279982	90279701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	141450	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	91140669	91140820	91140815	Y	NA	NXNL2	SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2,CDK20,NXNL2,S1PR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NXNL2	7196	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	91147328	91147523	91147436	Y	NXNL2	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	493	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	91150927	91151269	91151097	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	2911	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	93823339	93823577	93823437	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-305L7.3	99792	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	93833669	93833838	93833696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-305L7.3	89531	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	93847721	93848063	93847983	Y	NA	NA	LOC100129316,ROR2,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305L7.3	75306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	93893646	93894080	93893930	Y	NA	RP11-305L7.3	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305L7.3	29289	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	RP11-305L7.3	NA	NA	NA	NA	RP11-305L7.3	31874	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	RP11-305L7.3	NA	NA	NA	NA	RP11-305L7.3	32622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr9	93975322	93975401	93975365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-305L7.3	51953	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	94181531	94181930	94181720	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	2214	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	94182259	94182597	94182338	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	1547	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	95452860	95453088	95452974	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	22313	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	95860928	95861146	95861059	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	C9orf89	4428	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	95894467	95895029	95894875	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89	NA	NA	NA	NA	NINJ1	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	96701891	96702241	96702065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPDC1	88835	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr9	97288097	97288106	97288102	Y	FBP1,FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FBP1	112425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	97629577	97629759	97629671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	142594	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	97633078	97633398	97633277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	146095	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	97699905	97700054	97699963	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	212922	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	97969652	97969878	97969805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	108113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	98054647	98055067	98054952	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	22924	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	98768233	98768612	98768423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	131974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	99132173	99132333	99132255	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	11659	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	99182775	99182932	99182834	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	4164	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	99317265	99317554	99317408	Y	HABP4,CDC14B	NA	HABP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC14B	62558	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	99334926	99335181	99335054	Y	NA	CDC14B	HABP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC14B	44931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	99535821	99536158	99535990	Y	NA	ZNF510	NA	NA	NA	NA	ZNF510	2253	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	99774924	99775195	99775041	Y	C9orf21,TDRD7	HIATL2	NA	NA	NA	NA	HIATL2	1062	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	100432763	100433089	100432926	Y	TSTD2,XPA	NCBP1,TSTD2,XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	24550	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	FOXE1	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	FOXE1	47272	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr9	100631883	100631909	100631896	Y	NA	FOXE1	NA	NA	NA	NA	FOXE1	18347	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	100667728	100667773	100667740	Y	NA	C9orf156	NA	NA	NA	NA	C9orf156	15079	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	100705742	100706039	100705791	Y	NA	C9orf156,ANP32B	NA	NA	NA	NA	C9orf156	22890	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	100994380	100994637	100994474	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	21278	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	101630117	101630425	101630271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT12	62136	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	101973951	101974336	101974174	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	ALG2	7902	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	102015806	102016715	102016602	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	33460	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	102585833	102586368	102586147	Y	ERP44,NR4A3	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NR4A3	3696	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	102621794	102622137	102621866	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3,STX17	NA	NA	NA	NA	NR4A3	39657	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEFF1	28424	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	103192373	103192745	103192675	Y	C9orf30	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEFF1	9815	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	107510718	107511248	107511059	Y	ABCA1,NIPSNAP3A	NIPSNAP3A,NIPSNAP3B	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3A	2749	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	107769025	107769996	107769532	Y	FSD1L,FSD1L,ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	80507	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	109627297	109627657	109627483	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3919	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	109655422	109655715	109655552	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	32044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	109932773	109933133	109932953	Y	NA	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110285	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	110109718	110109795	110109757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	66300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	59864	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF4	261390	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr9	111206149	111206336	111206243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-220D10.1	180777	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	111386829	111386933	111386883	Y	NA	RP11-220D10.1	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	180	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr9	111872786	111872983	111872905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	98977	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	112162175	112162241	112162208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4B	80931	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	112569081	112569243	112569086	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	28312	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	204314	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	112831833	112832445	112832154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	184475	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	112858157	112858314	112858244	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	158606	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	112861625	112861803	112861710	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	155117	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	112878723	112879133	112878887	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	137787	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	112885616	112885820	112885688	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	131100	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	112903621	112903940	112903708	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	112980	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	113490447	113490547	113490496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	308434	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	113642497	113642777	113642637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	156204	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	113783956	113784262	113784109	Y	NA	LPAR1	NA	NA	NA	NA	LPAR1	14719	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	114505631	114505796	114505739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG10	84016	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	114678571	114678728	114678577	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	21525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	114700203	114700566	114700273	Y	DNAJC25,GNG10,SUSD1,ROD1,HSDL2	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	43157	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	114705587	114705765	114705623	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	48541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr9	114707434	114708001	114707643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	50388	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.05934425232951
chr9	114721832	114722310	114722097	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	64786	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	114723325	114723781	114723480	Y	NA	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	66279	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	114729315	114729452	114729372	Y	NA	NA	UGCG,MIR3134,SUSD1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UGCG	72269	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	114774761	114774976	114774762	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	117715	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr9	114783014	114783329	114783192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	125968	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	114790542	114790702	114790622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	133496	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	114805021	114805139	114805071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	130549	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	114808602	114808743	114808666	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	126945	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	114823556	114823978	114823803	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	111710	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	114825806	114826033	114825918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	109655	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	114828005	114828556	114828288	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	107132	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.85340982709656
chr9	114835497	114835862	114835756	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	99826	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	114836654	114837091	114837061	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	98597	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr9	115031676	115032066	115031959	Y	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP3	61881	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	115067475	115067560	115067518	Y	SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	26387	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	115470219	115470249	115470232	Y	ROD1,HSDL2,C9orf80	RP11-276E15.4,SNX30	NA	NA	NA	NA	RP11-276E15.4	40487	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	115901783	115902068	115901877	Y	ZNF883,ALAD	SLC31A2	NA	NA	NA	NA	SLC31A2	9154	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	116250853	116251013	116250930	Y	NA	RGS3	NA	NA	NA	NA	RGS3	45842	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	76776	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	117040965	117041219	117041139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	125125	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	117131457	117132230	117131898	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	133500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	117137275	117137511	117137393	Y	DFNB31,DFNB31	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	128219	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	117159955	117160026	117159991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	105704	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	117247262	117247587	117247370	Y	TNFSF8,TNFSF15,ATP6V1G1,DFNB31	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	18143	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.823737700931805
chr9	117845711	117845781	117845750	Y	TNFSF15	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	32755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	117860552	117860777	117860665	Y	NA	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	17759	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	117878279	117878434	117878355	Y	NA	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	102	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	475416	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	118358577	118359027	118358666	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	480041	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	118378080	118378500	118378342	Y	NA	NA	PAPPA,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	499544	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	118412488	118412760	118412588	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	501323	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr9	118430899	118431573	118430988	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	482510	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	118435271	118435690	118435488	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	118436011	118436199	118436119	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	477884	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	118453042	118453852	118453530	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	460231	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	118919313	118920155	118919798	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	5230	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	118993225	118993558	118993231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	79142	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	119055041	119055304	119055148	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	140958	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	120175638	120175763	120175745	Y	ASTN2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	728057	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	1075775	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	123640419	123640826	123640772	Y	NA	PSMD5,PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	PHF19	2813	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	123662780	123662807	123662790	Y	NA	PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	PHF19	25174	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	123682864	123683506	123683209	Y	FBXW2,TRAF1,TRAF1	PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	TRAF1	5945	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	124134922	124135274	124134953	Y	NA	STOM	GSN	MCF7	ChIA-PET	22265404	STOM	4391	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	124161523	124161647	124161545	Y	NA	STOM	GSN,RAB14,GGTA1P,CNTRL,STOM	IMR90	Hi-C	24141950	STOM	30992	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	125654025	125654372	125654281	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	11248	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	125869246	125869355	125869301	Y	OR1L3,OR1K1,GPR21	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	159500	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	125956223	125956395	125956307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	72460	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	126003896	126004111	126004004	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	24744	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127018843	127019044	127018944	Y	NA	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	958	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127029560	127030143	127029899	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	11675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127155102	127155374	127155331	Y	DENND1A	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	20349	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	127161847	127162149	127162003	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	13574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127165878	127166187	127166033	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	9536	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127356039	127356231	127356145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	62515	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127468042	127468336	127468195	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	49296	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	127475055	127475439	127475319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR6A1	56150	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	127523126	127523289	127523221	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	8300	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127861290	127861583	127861437	Y	NA	SCAI	NA	NA	NA	NA	SCAI	42202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	127980597	127980978	127980790	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	19776	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.64747540186361
chr9	128275898	128276280	128276126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	191233	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	129951111	129951299	129951234	Y	NA	GARNL3	NA	NA	NA	NA	GARNL3	33245	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	130281582	130281994	130281773	Y	TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	57274	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	130283548	130283912	130283802	Y	SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C,PTRH1,FPGS,FPGS,FAM129B,ENG	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	55356	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	130307843	130308200	130307973	Y	SLC2A8,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	31068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	130335827	130336224	130335842	Y	TOR2A,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	3044	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	130341922	130342377	130342071	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2654	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	130675929	130676130	130676030	Y	NA	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC4	1187	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	130681632	130682091	130681875	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC4	4315	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	130844598	130844860	130844677	Y	NA	SLC25A25,NAIF1,PTGES2	NA	NA	NA	NA	NAIF1	16113	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	131988173	131988389	131988342	Y	NA	IER5L	LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,ASB6,SH3GLB2,CRAT,C9orf106,C9orf50	IMR90,K562,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	IER5L	49633	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132241150	132241608	132241414	Y	NA	LINC00963	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	2122	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-483H20.4	70247	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-483H20.4	69331	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	132359283	132359664	132359324	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6	RP11-483H20.4,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-483H20.4	41091	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	RP11-483H20.4,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-483H20.4	40833	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	RP11-483H20.4,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-483H20.4	30379	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	RP11-483H20.4,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-483H20.4	28069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132535885	132536300	132536143	Y	FNBP1,USP20,USP20,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PRRX2,TOR1A,TOR1B,PPP2R4,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTGES	22559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	132568357	132568650	132568524	Y	TOR1B	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	TOR1B	4925	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132707337	132707718	132707526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	95755	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132718798	132719167	132719105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	84306	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132757819	132758165	132758070	Y	TOR1B,FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	45308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132778768	132779165	132778966	Y	ASB6,USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	24308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	132785309	132785843	132785545	Y	USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	17630	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132802902	132803300	132803100	Y	ASB6,USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	173	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	132847110	132847326	132847217	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	33405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.13263933878123
chr9	133721311	133721454	133721341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABL1	133978	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	133721974	133722320	133722184	Y	NA	NA	QRFP,FIBCD1	IMR90	Hi-C	24141950	ABL1	134641	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	133733743	133734142	133733821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABL1	146410	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	ABL1	148912	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	134821616	134821991	134821804	Y	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	MED27	131304	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	134882586	134882673	134882600	Y	SETX,NTNG2,MED27	NA	NA	NA	NA	NA	MED27	70622	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	135248049	135248343	135248270	Y	SETX	SETX,TTF1	NA	NA	NA	NA	SETX	19677	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	136235762	136236074	136236007	Y	NA	SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	SURF4	4896	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	136236880	136237291	136237149	Y	NA	SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	SURF4	3679	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	234260	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	137231518	137231916	137231717	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	24574	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	138287033	138287362	138287321	Y	NA	NA	OLFM1,LOC100506599	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP1R26	81563	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	138778583	138778765	138778659	Y	KCNT1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	18309	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	139033609	139034132	139033822	Y	NA	NACC2,C9orf69	QSOX2,UBAC1,NACC2,C9orf69,LHX3,CAMSAP1	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf69	24878	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	139294189	139294305	139294248	Y	TRAF2,FAM69B,INPP5E	DNLZ,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E	NA	NA	NA	NA	SDCCAG3	8756	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chr9	139458570	139458737	139458661	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	19906	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	139737773	139737949	139737875	Y	NA	PHPT1,EDF1,TRAF2,MIR4479	NA	NA	NA	NA	PHPT1	3227	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	MIR4479,FBXW5,C8G,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chr9	139860664	139860836	139860756	Y	NA	FBXW5,C8G,PTGDS,C9orf142,CLIC3	NA	NA	NA	NA	PTGDS	9120	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	2.05934425232951
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	140526461	140526811	140526551	Y	NA	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	15017	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	177609	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chrX	3870962	3871082	3871022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	241313	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	9433838	9434425	9434365	Y	TBL1X	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	4503	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	9477403	9477544	9477474	Y	FAM9B,TBL1X,LOC100288814	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	48068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	9509355	9509595	9509475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	80020	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	9700566	9700851	9700709	Y	LOC100288814	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	271231	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	194651	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chrX	10135057	10135251	10135239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	153455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	10540681	10540690	10540686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	309083	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	10547215	10547494	10547354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	302279	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	11131962	11132102	11132014	Y	HCCS	RP11-120D5.1,HCCS	NA	NA	NA	NA	HCCS	4541	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	13809735	13809880	13809737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OFD1	58903	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	14040371	14040544	14040433	Y	NA	GEMIN8	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	5468	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	15769418	15769925	15769650	Y	PIGA,CA5B,ZRSR2	ZRSR2	NA	NA	NA	NA	ZRSR2	36670	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	16900871	16900973	16900947	Y	TXLNG	RBBP7	RBBP7,TXLNG	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RBBP7	14334	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	17395556	17395647	17395622	Y	NHS	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	4013	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	17415371	17415448	17415410	Y	NA	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	23828	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	21945015	21945333	21945248	Y	NA	SMS	SMS,MBTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	11358	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	21950501	21951081	21950869	Y	NA	SMS	SMS	K562	ChIA-PET	22265404	SMS	5610	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	22007452	22007864	22007637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	50761	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	23799321	23799855	23799568	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	31	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	23800091	23800377	23800148	Y	NA	ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	801	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	23806806	23807042	23806932	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1,RPL9P7	NA	NA	NA	NA	SAT1	7516	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	23821683	23821773	23821728	Y	NA	ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1,RPL9P7	NA	NA	NA	NA	SAT1	22393	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	24187705	24188069	24187889	Y	NA	ZFX	NA	NA	NA	NA	ZFX	22415	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	29496854	29497166	29496936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR0B1	828549	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	30302023	30302242	30302150	Y	GK,CXorf21	NR0B1	NA	NA	NA	NA	NR0B1	23473	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	30615830	30616021	30615866	Y	GK,CXorf21	FTLP2	NA	NA	NA	NA	FTLP2	30394	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	30679380	30679764	30679404	Y	NA	FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	GK	9904	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chrX	39767458	39767957	39767519	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	122068	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC2	311830	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.720770488315329
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	32007	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	44774748	44775132	44774822	Y	NA	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	43991	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	228617	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	45631125	45631239	45631172	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	26595	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	45667637	45667718	45667664	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41202	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	45668056	45668432	45668257	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	40488	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	36895	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	47701110	47701161	47701136	Y	NA	ZNF81	NA	NA	NA	NA	ZNF81	6809	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	48794332	48794681	48794452	Y	PORCN,TBC1D25,WAS,PQBP1,TFE3,PPP1R3F,FOXP3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1	NA	NA	NA	NA	OTUD5	18967	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	49139256	49139619	49139438	Y	FOXP3,PPP1R3F	CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	14950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	53741584	53742291	53741941	Y	KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29911	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	57927530	57927661	57927604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	311261	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	67724193	67724408	67724299	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	8028	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	67905949	67906235	67906128	Y	NA	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40441	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.617803275698854
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	73236075	73236382	73236224	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	73916	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	73755621	73755953	73755678	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	76499	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	73791399	73791714	73791557	Y	RLIM	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	40738	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	79827525	79827860	79827693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	235327	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	79965324	79965547	79965436	Y	BRWD3	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	97640	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	84475648	84475726	84475688	Y	NA	ZNF711	NA	NA	NA	NA	ZNF711	21271	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.02967212616476
chrX	87351546	87351899	87351791	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	1320	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chrX	95940743	95941133	95941025	Y	DIAPH2	DIAPH2	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	3081	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	96454742	96455056	96454899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	517080	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	99900251	99900361	99900308	Y	SRPX2	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	3036	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.308901637849427
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMCX6	77437	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	GPRASP1	NA	NA	NA	NA	GPRASP1	10490	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	106247149	106247504	106247327	Y	CLDN2	MORC4	MORC4	IMR90	Hi-C	24141950	MORC4	5675	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	109429267	109429621	109429491	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	185408	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	117487110	117487426	117487273	Y	DOCK11,WDR44	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	9074	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	117661937	117662181	117662084	Y	LONRF3,IL13RA1,DOCK11	DOCK11	NA	NA	NA	NA	DOCK11	34076	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	119619289	119619732	119619620	Y	ZBTB33,ZBTB33	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18069	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	124338810	124338926	124338869	Y	NA	RP1-161N10.1	NA	NA	NA	NA	RP1-161N10.1	2623	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	1.23560655139771
chrX	127434305	127434453	127434370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	1221024	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.514836063082378
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1,RAB33A	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1,RAB33A	NA	NA	NA	NA	RAB33A	3706	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	135927542	135927922	135927796	Y	NA	RBMX	ARHGEF6	IMR90	Hi-C	24141950	RBMX	33001	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	139587896	139588308	139588126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	562461	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	139793034	139793280	139793108	Y	CDR1	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	476030	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	139809387	139809785	139809560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	459525	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	139858514	139858763	139858620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	410547	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	149996146	149996459	149996317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD99L2	68830	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	150047001	150047063	150047035	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	18226	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	152065195	152065303	152065205	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	67684	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	PNMA5	NA	NA	NA	NA	PNMA5	32915	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	152648727	152649001	152648990	Y	SLC6A8,ZNF275	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF275	51114	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	153152883	153153053	153153003	Y	RENBP	CYCSP45,L1CAM,ARHGAP4,NAA10	NA	NA	NA	NA	L1CAM	19624	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chrX	153771070	153771275	153771201	Y	IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG	FAM3A,IKBKG,G6PD	NA	NA	NA	NA	G6PD	2512	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrX	153829365	153829583	153829391	Y	NA	AF277315.19	NA	NA	NA	NA	AF277315.19	2528	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.411868850465902
chrX	154256125	154256514	154256179	Y	IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2	FUNDC2,BRCC3	NA	NA	NA	NA	FUNDC2	3870	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.205934425232951
chrY	9987303	9987404	9987354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	6761572	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	1541535	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.92670491354828
chrY	28555183	28555400	28555298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	11806207	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476
chrY	28555690	28555797	28555743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	11806714	CAGE	JMSU1	hg19	FANTOM5	0.102967212616476