chr1	1063914	1064111	1063979	Y	AGRN,VWA1	C1orf159	B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C1orf159	14173	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	1744250	1744609	1744432	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	34354	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	2246556	2246763	2246722	Y	SKI	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	74383	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	6321567	6321961	6321896	Y	THAP3,THAP3,GPR153	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	2532	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.50668963362142
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	8686491	8686867	8686745	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	188835	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	10585199	10585569	10585453	Y	NA	NA	CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	DFFA	54616	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	12493910	12494304	12493999	Y	AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	181433	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	14029077	14029879	14029437	Y	PRDM2,PRDM2,PRDM2	PRDM2	NA	NA	NA	NA	PRDM2	4384	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	15946733	15946892	15946831	Y	EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,DDI2	CHCHD2P6,DDI2	NA	NA	NA	NA	DDI2	4738	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	16030221	16030623	16030258	Y	NA	PLEKHM2,RP11-169K16.4	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	21394	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17,HSPB7	NA	NA	NA	NA	HSPB7	4493	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.34225284482856
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr1	17896198	17896624	17896362	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	31868	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	19839147	19839427	19839318	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,AKR7A2,CAPZB	CAPZB	CAPZB,C1orf151-NBL1	IMR90	Hi-C	24141950	CAPZB	29081	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	21558552	21558736	21558644	Y	EIF4G3,ECE1,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	57175	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	21649091	21649481	21649332	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	20516	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	22468030	22468558	22468270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42	90910	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	24856559	24856784	24856672	Y	NA	RCAN3	C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN3	29172	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	25051605	25051987	25051744	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	17861	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	25823926	25824130	25824028	Y	NA	LDLRAP1	LDLRAP1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	43941	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3,NR0B2	NA	NA	NA	NA	GPN2	22861	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	27772061	27772370	27772216	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	42299	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	27775351	27775365	27775358	Y	GPR3	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39304	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	27869425	27869556	27869494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	54756	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	27893464	27893671	27893490	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	35271	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	28752190	28752435	28752364	Y	EYA3,PTAFR,PTAFR,SESN2,MED18,GMEB1	NA	NA	NA	NA	NA	PHACTR4	58076	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	28776524	28777127	28776532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCC1	53328	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	31251697	31252042	31251870	Y	NA	LAPTM5,RP1-65J11.1	LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAPTM5	23030	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21662	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	36397577	36397741	36397665	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	154735	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	38391752	38391859	38391812	Y	NA	INPP5B	NA	NA	NA	NA	INPP5B	18870	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	3671	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9,RP4-800M22.2	NA	NA	NA	NA	RP4-800M22.2	1491	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	57024882	57025247	57025166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	83727	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	113921	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	65363729	65364057	65363938	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	66130	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	65383044	65383557	65383225	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	46630	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	358223	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	68027599	68027762	68027652	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	120982	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.34225284482856
chr1	70040211	70040399	70040305	Y	LRRC7	LRRC7	NA	NA	NA	NA	LRRC7	8130	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	39652	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	72686486	72686621	72686551	Y	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	59796	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	72931284	72931506	72931356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	184867	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	75182913	75182976	75182918	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	13860	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	76231463	76231678	76231570	Y	NA	ACADM,RABGGTB	NA	NA	NA	NA	RABGGTB	18201	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGK	86739	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	77787155	77787455	77787305	Y	AK5,AK5	AK5	NA	NA	NA	NA	AK5	41419	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	77944616	77944628	77944624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AK5	198880	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	78008083	78008322	78008203	Y	NA	NA	ZZZ3	IMR90	Hi-C	24141950	ZZZ3	138782	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	78240205	78240392	78240373	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	USP33,ZZZ3,FAM73A	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-706L14.2	1656	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	81941853	81942198	81942026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	2382508	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	2055118	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	85007374	85007584	85007581	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	30579	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	85313015	85313206	85313127	Y	GNG5,MCOLN2,LPAR3,C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	NA	MCOLN2	147590	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	85810010	85810182	85810130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	69237	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	85950230	85950550	85950520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	91383	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	86049987	86050100	86050044	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	CYR61	5543	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	87171187	87171726	87171422	Y	SH3GLB1	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	2928	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	89466934	89467175	89467138	Y	GTF2B,GBP2,GBP3	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	10291	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	89775606	89775953	89775816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBP4	112991	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	90032556	90032702	90032627	Y	LRRC8D,GBP2,LRRC8C,LRRC8B,LRRC8B	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	44161	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	90101821	90102213	90101853	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	5190	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	94084336	94084510	94084423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	172648	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	164588	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr1	94992236	94992413	94992325	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	12943	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	94996582	94996830	94996792	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	8526	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	95003688	95004160	95004042	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	1196	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	95113814	95114327	95114013	Y	F3	NA	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	F3	108458	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	95174059	95174304	95174182	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	109533	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	95186012	95186295	95186154	Y	NA	NA	F3,ABCD3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	97542	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14,TMEM56	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	96541224	96541649	96541417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	368837	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	96822792	96822994	96822909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	87492	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	98437572	98437739	98437700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	52967	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	98693625	98693976	98693800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	309020	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	100878516	100878703	100878610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	69932	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	101469727	101469819	101469773	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	19615	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	109515208	109515609	109515409	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	CLCC1	11097	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	109797001	109797635	109797309	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	NA	NA	NA	NA	CELSR2	6360	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	109913179	109913623	109913457	Y	SORT1	SORT1	NA	NA	NA	NA	SORT1	24950	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	109933790	109934137	109934039	Y	TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	4436	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	109937534	109937767	109937651	Y	GSTM3,WDR47,CELSR2,PSRC1,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	806	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	111996023	111996307	111996190	Y	NA	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	WDR77	6025	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	112050044	112050594	112050328	Y	C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	32246	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	117074509	117074935	117074769	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	36726	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	117493512	117493635	117493571	Y	NA	PTGFRN	CD101	IMR90	Hi-C	24141950	PTGFRN	42833	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	144988079	144988414	144988189	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	85772	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	145004446	145004804	145004625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	69382	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	145005016	145005394	145005195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	68792	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	145519496	145519624	145519499	Y	NBPF10,TXNIP	LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B	NA	NA	NA	NA	PEX11B	5244	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	MTMR11	25164	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	151445792	151446161	151446000	Y	C1orf56,RIIAD1,OAZ3	POGZ	RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D	IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	POGZ	15851	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	1778	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	160881277	160881698	160881498	Y	NA	RP11-312J18.5	CD244,ITLN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-312J18.5	18507	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	162508612	162508929	162508802	Y	UAP1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	20394	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	162709795	162709973	162709884	Y	NOS1AP,DDR2	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	110632	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	162729988	162730048	162730018	Y	NOS1AP,UHMK1	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf110	106557	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	162830850	162831244	162831104	Y	NA	C1orf110	NA	NA	NA	NA	C1orf110	5361	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	162846595	162846764	162846655	Y	DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	C1orf110	C1orf110,RGS4,RGS5	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf110	9990	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	163005587	163006022	163005933	Y	UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	30543	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	164736884	164737252	164737025	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	214063	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	165635693	165636148	165635824	Y	NA	MGST3,ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	29952	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	169911234	169911623	169911565	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	49826	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	172369341	172369683	172369640	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	41547	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	172750590	172750943	172750749	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023,PRDX6,SLC9A11,KLHL20,DARS2,CENPL	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	339360	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	174132447	174132507	174132478	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	5899	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	174937322	174937525	174937409	Y	KIAA0040,KIAA0040	CACYBP	NA	NA	NA	NA	CACYBP	28775	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	175571336	175571362	175571351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	317749	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	178231351	178231525	178231428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	170487	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	178379281	178379736	178379396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	130151	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	183836661	183836955	183836765	Y	RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	181856	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	184773428	184773803	184773695	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	51381	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	185704575	185705000	185704612	Y	NA	HMCN1	NA	NA	NA	NA	HMCN1	2892	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	185771429	185771809	185771446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMCN1	69746	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	185830907	185831026	185830956	Y	HMCN1	NA	NA	NA	NA	NA	HMCN1	129224	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	186052629	186052877	186052681	Y	HMCN1,PDC	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	289948	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	186090860	186091020	186090873	Y	HMCN1	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	251805	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	186892657	186892915	186892791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	96572	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	191536543	191536778	191536610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	1146535	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	196379497	196379989	196379846	Y	CFHR3,KCNT2,CFH	NA	NA	NA	NA	NA	KCNT2	196366	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	200050544	200050911	200050727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	326273	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr1	200831452	200831819	200831500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	124766	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	201445401	201445412	201445405	Y	NAV1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	9036	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	201717535	201717792	201717621	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	78477	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	43291	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	FMOD	21549	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr1	203489584	203489741	203489635	Y	BTG2	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	46628	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	48055	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr1	203524939	203525564	203525325	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	68125	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	204389721	204389989	204389958	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	10802	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	205510005	205510378	205510192	Y	CNTN2,TMEM81,CDK18	CDK18,RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	23466	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	206897147	206897463	206897235	Y	RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	40858	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	207598053	207598267	207598174	Y	CR2	NA	PFKFB2,C4BPA,CR1,CR2	IMR90	Hi-C	24141950	CD55	105200	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	208415648	208415868	208415811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	209915892	209916078	209915980	Y	NA	C1orf74	NA	NA	NA	NA	C1orf74	39826	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	212723252	212723516	212723384	Y	BATF3,ATF3	ATF3	ATF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF3	13160	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	221881394	221881826	221881629	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	31692	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	222830626	222830783	222830705	Y	TAF1A,MIA3	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	41198	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	224014874	224015267	224015181	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	16407	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr1	225654906	225655584	225655524	Y	TMEM63A,LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	40279	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	225721902	225722011	225721957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LBR	107275	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	225778250	225778416	225778333	Y	ENAH	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	60428	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	225934674	225934968	225934833	Y	ENAH	RP11-145A3.1,SRP9	NA	NA	NA	NA	SRP9	28563	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	226014145	226014403	226014226	Y	EPHX1,EPHX1	EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	18351	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	231531776	231531955	231531804	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	26835	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	6.68450568965712
chr1	234630919	234631525	234631418	Y	TARBP1	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	18070	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	234736336	234736615	234736485	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	6656	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	234881537	234881788	234881657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	138266	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	3148	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	RP11-443B7.3	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	18463	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	235186710	235186949	235186846	Y	ARID4B	NA	LOC100506795,LOC100506810,LINC00184,IRF2BP2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-443B7.3	72159	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	235835688	235836968	235835896	Y	NA	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	23634	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	240514375	240514531	240514453	Y	FMN2,GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	182920	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	241771916	241772216	241772151	Y	KMO	NA	NA	NA	NA	NA	OPN3	66462	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	244459696	244459909	244459803	Y	NA	NA	SDCCAG8,AKT3,LOC339529,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	153527	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	246249452	246249819	246249636	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	418795	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	246323685	246324051	246324002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	344563	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	246456441	246456840	246456713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	211774	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	5113786	5114179	5114065	Y	AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3	AKR1C3	NA	NA	NA	NA	AKR1C3	38240	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	5553514	5553674	5553594	Y	NA	NA	FAM208B,NET1,CALML3,CALML5	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-463N16.6	82407	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	44811	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	258527	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	12749537	12749904	12749742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	360056	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	13807715	13808056	13807951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	180788	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	13915234	13915426	13915347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	288307	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	14015733	14016130	14015958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	388806	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr10	14099317	14099548	14099433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	402593	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	14131369	14132062	14131667	Y	NA	NA	PRPF18	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	370079	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	14447046	14447458	14447244	Y	NA	NA	FRMD4A,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	54683	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	15179834	15179919	15179877	Y	NA	RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	28773	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	17034715	17035049	17034848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	177188	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	17697506	17697813	17697679	Y	ST8SIA6,STAM	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	13382	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	17707752	17708081	17707913	Y	VIM,ST8SIA6,STAM	STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	23628	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	17755362	17755412	17755398	Y	SLC39A12	NA	NA	NA	NA	NA	STAM	71238	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	20384805	20385193	20384998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	281637	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	20446340	20446583	20446461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	343172	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	20450242	20450397	20450276	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	347074	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	20518444	20518755	20518482	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	415276	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	205224	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	22029877	22030194	22029992	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	208783	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	22961361	22961802	22961720	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	39682	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	23737770	23738059	23737888	Y	OTUD1	OTUD1	NA	NA	NA	NA	OTUD1	11572	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	209028	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	28957755	28957993	28957831	Y	BAMBI	BAMBI	BAMBI	K562	ChIA-PET	22265404	BAMBI	6278	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	29546571	29546627	29546599	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	149704	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1	286849	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	35424812	35424825	35424819	Y	CCNY	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11093	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	43422233	43422523	43422379	Y	NA	NA	RET	IMR90	Hi-C	24141950	BMS1	145984	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	45453721	45453921	45453864	Y	ALOX5	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	RASSF4	866	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	47057375	47057652	47057526	Y	NA	NA	GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL	IMR90	Hi-C	24141950	SYT15	87975	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	144442	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	47129494	47129670	47129546	Y	SYT15,PPYR1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	160094	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.76003445043213
chr10	49678205	49678472	49678354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK8	165507	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	49725975	49726150	49726063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	136160	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	49745028	49745223	49745126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	117087	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	49820546	49821434	49821281	Y	NA	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	40876	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	50776206	50776746	50776485	Y	PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	30622	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	52154516	52154956	52154688	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	131778	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	54203502	54203868	54203680	Y	DKK1	NA	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DKK1	131446	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	60674120	60674133	60674127	Y	BICC1	NA	NA	NA	NA	NA	BICC1	403220	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	61645173	61645419	61645305	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	18995	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	62185134	62185430	62185353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	350659	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	62674070	62674082	62674076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB1	85116	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	63814731	63815034	63814907	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	155672	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	65033384	65033629	65033527	Y	NRBF2,JMJD1C	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	142334	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	65097775	65098183	65098051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	125539	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	98071	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	65196810	65197156	65196994	Y	NA	JMJD1C	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	26566	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	65460115	65460254	65460185	Y	NA	NA	JMJD1C	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	180992	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	71145067	71145367	71145287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	63862	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	73531831	73532355	73532130	Y	C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	576	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	73595852	73596345	73596141	Y	C10orf54,PSAP	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	12781	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	75240023	75240096	75240089	Y	NA	RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-137L10.6	13187	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	78190160	78190348	78190225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	831162	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	78954967	78955278	78955208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	441075	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	79284063	79284455	79284320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	111898	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	79383458	79383833	79383807	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	12520	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	79651191	79651354	79651229	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	33024	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	80897644	80897901	80897807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	70852	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	81004480	81004949	81004783	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	100276	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	81159335	81159579	81159503	Y	ZCCHC24	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	43804	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	81960969	81961796	81961521	Y	SH2D4B,ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	1532	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr10	88571811	88572082	88571947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	57404	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	90689067	90689322	90689158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	51576	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	94195534	94195885	94195710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDE	135948	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	95223953	95224101	95224023	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15973	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.76003445043213
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	97038434	97038774	97038645	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	10007	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	99167112	99167183	99167148	Y	NA	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	EXOSC1,ZDHHC16,PGAM1,RRP12	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RRP12	7985	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	99401742	99402052	99401841	Y	C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	10398	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	100020230	100020246	100020237	Y	NA	LOXL4	NA	NA	NA	NA	LOXL4	5761	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	101873975	101874319	101874110	Y	NA	NA	CPN1,ERLIN1,CHUK	IMR90	Hi-C	24141950	ERLIN1	71772	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	103124787	103125187	103124970	Y	NA	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12967	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	103591495	103591519	103591507	Y	BTRC,KCNIP2,KCNIP2	MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	14799	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	104364219	104364413	104364273	Y	NA	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	37840	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr10	104683249	104683568	104683410	Y	NA	CNNM2	NA	NA	NA	NA	CNNM2	7199	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	104909684	104910071	104909878	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	40985	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	111834173	111834352	111834276	Y	ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1	NA	NA	NA	NA	NA	ADD3	80047	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	114818562	114818849	114818630	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	110553	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	114859283	114859636	114859547	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	151274	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	115923622	115923898	115923760	Y	C10orf81	MIR2110,C10orf118	NA	NA	NA	NA	MIR2110	8040	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr10	120850460	120850786	120850708	Y	NA	EIF3A,FAM45A	EIF3A,PRDX3,SFXN4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM45A	10812	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	123900074	123900243	123900143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	153385	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	124231405	124231614	124231490	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	12364	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	124249700	124250033	124249857	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	30659	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	35308	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	124636899	124637143	124637021	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	14	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	OAT	349863	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	126768245	126768621	126768433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	79118	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	127821927	127822394	127822178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	238819	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	129775759	129776314	129776065	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRE	72434	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr10	135329777	135330170	135329974	Y	NA	NA	LOC619207,SYCE1	IMR90	Hi-C	24141950	MTG1	124179	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	840856	841090	840896	Y	NA	SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,CD151,POLR2L,TSPAN4	NA	NA	NA	NA	TSPAN4	48	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	8607763	8607778	8607771	Y	ASCL3,STK33	STK33	NA	NA	NA	NA	STK33	6058	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	8730669	8730993	8730843	Y	NA	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	28711	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	8756335	8756571	8756455	Y	ST5,ASCL3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL27A	54377	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	9185386	9185638	9185566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5A	99299	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	9250767	9251109	9250945	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	33828	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr11	10135641	10135992	10135817	Y	NA	NA	LOC283104,LOC440028	IMR90	Hi-C	24141950	SBF2	177762	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	10627707	10627864	10627812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVI1-AS1	66888	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	12177917	12178047	12177953	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	64374	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr11	12180569	12180722	12180645	Y	MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67026	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	12181262	12181458	12181363	Y	MICALCL,MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67719	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	12184848	12185162	12185016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	71305	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	12218036	12218499	12218053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	104493	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	12222498	12222995	12222733	Y	MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	108955	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	14436782	14437066	14436859	Y	NA	NA	RRAS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RRAS2	52730	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	17335831	17335998	17335921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	108131	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	18546072	18546398	18546234	Y	SPTY2D1,TSG101	TSG101	NA	NA	NA	NA	TSG101	381	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	27235010	27235184	27235094	Y	NA	NA	LIN7C,LGR4,CCDC34,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	148231	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	27683148	27683223	27683174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58382	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	28776161	28776492	28776325	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	53999	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	28779294	28779601	28779473	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	57132	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	28856336	28856685	28856610	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	134174	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	31946597	31946955	31946776	Y	NA	NA	ELP4,IMMP1L	IMR90	Hi-C	24141950	PAX6	109088	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	35061713	35062540	35061871	Y	CD44	NA	CD44,SLC1A2,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	95877	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	35261158	35261193	35261191	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	102741	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	43779324	43779404	43779364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	120957	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	45069975	45070079	45070038	Y	PRDM11	NA	SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	99135	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-430H10.1	172317	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CTD-2589M5.4,CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	28900	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	46732586	46732756	46732638	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ZNF408	12218	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	61065380	61065516	61065448	Y	NA	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	33166	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.50668963362142
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CST6,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CST6	5662	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.34225284482856
chr11	65875756	65875846	65875802	Y	NA	PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	39922	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	65903912	65904457	65904250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	68078	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	67037275	67037527	67037373	Y	TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	5394	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	67105994	67106296	67106145	Y	NA	SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	16147	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	68714020	68714198	68714127	Y	NA	MRPL21,IGHMBP2	NA	NA	NA	NA	IGHMBP2	44710	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	IL18BP	NA	NA	NA	NA	IL18BP	2740	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	72426186	72426236	72426211	Y	ATG16L2,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	76408	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	73034605	73034942	73034774	Y	NA	ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	17271	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	73036125	73036359	73036193	Y	NA	ARHGEF17,RELT	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	18791	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	73126084	73126768	73126402	Y	RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	40775	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	73722792	73723138	73723056	Y	LIPT2,C2CD3,UCP2	UCP2	UCP2	K562	ChIA-PET	22265404	UCP2	30440	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	74077556	74077917	74077717	Y	NA	PGM2L1	NA	NA	NA	NA	PGM2L1	29601	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	74667774	74667939	74667906	Y	RNF169	XRRA1,SPCS2,NEU3	NA	NA	NA	NA	SPCS2	9482	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	KCTD14	3883	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr11	78728809	78729043	78728943	Y	ODZ4	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	444890	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	9.19119532327854
chr11	81877588	81877688	81877592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	520883	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	282552	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	86262463	86262643	86262563	Y	FZD4	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	119035	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	86355497	86355659	86355578	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	26019	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	86430919	86431170	86431045	Y	PRSS23	ME3	PRSS23,ME3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ME3	49241	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr11	87149211	87149297	87149219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	402325	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	91958948	91959142	91959077	Y	FAT3	NA	FAT3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	969988	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr11	95893318	95893469	95893394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	180875	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	95906618	95906816	95906767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	167528	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	95938142	95938441	95938252	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	135903	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	95987343	95987574	95987537	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	86770	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	100747572	100748094	100747776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	191188	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	107885190	107885220	107885205	Y	NA	CUL5	NA	NA	NA	NA	CUL5	7731	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	107966906	107967320	107967120	Y	NA	ACAT1	ACAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACAT1	22923	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	107986432	107986807	107986620	Y	NA	ACAT1	NA	NA	NA	NA	ACAT1	3436	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	109965770	109966113	109965869	Y	RDX,FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	3683	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	112941331	112941794	112941502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM1	111334	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	113055291	113055738	113055452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	127421	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr11	113059055	113059658	113059425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	123501	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	118755477	118755626	118755517	Y	ATP5L,MLL,ARCN1,DDX6,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	23791	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	NA	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	142361	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	120363124	120363469	120363220	Y	NA	GRIK4	NA	NA	NA	NA	GRIK4	16999	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	121355865	121356201	121356100	Y	SORL1	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	34953	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205128	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	121947541	121947705	121947629	Y	NA	RP11-166D19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-166D19.1	37326	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	122177708	122178168	122177914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-820L6.1	113411	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	122989373	122989577	122989478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	57435	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	125980178	125980467	125980323	Y	NA	CDON	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	48948	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	125997963	125998111	125998066	Y	NA	NA	CDON	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	66733	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	126290424	126290762	126290592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	66889	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	128579282	128579748	128579400	Y	FLI1,FLI1	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	24852	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	128584156	128584534	128584279	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	29726	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	130743628	130743895	130743754	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	40509	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr11	133920876	133920983	133920947	Y	B3GAT1,SPATA19,JAM3	JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	15837	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	1407863	1408257	1407945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	228800	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	1640952	1641788	1641475	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	3895	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,ACRBP	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	12298245	12298581	12298464	Y	LRP6	NA	NA	NA	NA	NA	LRP6	119365	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr12	13213632	13213789	13213702	Y	DUSP16	KIAA1467	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	18414	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	13326583	13326856	13326645	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	20794	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	15105208	15105676	15105381	Y	WBP11,ARHGDIB	ARHGDIB	NA	NA	NA	NA	ARHGDIB	6986	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	15758880	15759078	15758989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERG	259271	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	24952536	24952732	24952634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	147661	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	16493	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	26538001	26538320	26538173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	260451	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	26624362	26624835	26624675	Y	FGFR1OP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	346812	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	29194633	29194954	29194755	Y	NA	NA	CCDC91	IMR90	Hi-C	24141950	ERGIC2	337168	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	29903685	29903894	29903854	Y	NA	TMTC1	NA	NA	NA	NA	TMTC1	31798	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	30945631	30945953	30945771	Y	NA	CAPRIN2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	24	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	32635235	32635487	32635321	Y	NA	NA	FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	194647	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	33072560	33072656	33072597	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	24786	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	39816699	39816988	39816844	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	18204	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A2	59513	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A2	123430	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC38A2	153325	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	7.10228729526069
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A2	178908	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	47053760	47053887	47053821	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A2	289110	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	6.26672408405355
chr12	49762011	49762098	49762055	Y	TUBA1A,PRPF40B	TROAP,SPATS2	NA	NA	NA	NA	SPATS2	3644	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	49801773	49801917	49801846	Y	NA	SPATS2	NA	NA	NA	NA	SPATS2	43406	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	50019010	50019299	50019155	Y	FMNL3	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	59009	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	50902358	50902765	50902415	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	5590	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52438176	52438423	52438378	Y	NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	22607	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52588132	52588259	52588205	Y	FIGNL2,GRASP,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	4348	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52595153	52595538	52595210	Y	NA	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT80	11369	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52596076	52596423	52596243	Y	NA	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT80	12292	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52624687	52625139	52624914	Y	KRT7	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT7	383	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT86	32959	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT86	33571	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	53359181	53359363	53359294	Y	PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	17443	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	NA	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	5.43116087284641
chr12	58168960	58169095	58169042	Y	TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	TSPAN31,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM	NA	NA	NA	NA	RP11-571M6.15	4149	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	58923778	58923975	58923913	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	388328	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	62658681	62658957	62658715	Y	C12orf61,USP15	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	6562	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	64575299	64575468	64575384	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	38608	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	65959414	65959817	65959668	Y	NA	RP11-221N13.3	HMGA2,MSRB3,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	34832	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	69933	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	NA	NA	NA	NA	NA	HELB	65035	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	67274459	67274765	67274734	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	186177	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	67392180	67392257	67392219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	68685	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	67828762	67829103	67828960	Y	NA	NA	DYRK2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CAND1	167701	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	69220588	69221011	69220784	Y	NA	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20632	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	70558769	70558849	70558809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT2	75925	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	71127373	71127661	71127517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRR	184962	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	75877380	75877665	75877492	Y	GLIPR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	4920	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	76183993	76184325	76184134	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1,KRR1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	241387	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr12	79918085	79918441	79918422	Y	NA	NA	SYT1	IMR90	Hi-C	24141950	PAWR	164436	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	80974115	80974384	80974233	Y	MYF5	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	355210	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	83082881	83083305	83083086	Y	NA	TMTC2	NA	NA	NA	NA	TMTC2	4222	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	83269676	83269939	83269806	Y	TMTC2	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	191017	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	87818479	87818840	87818660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	606783	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	93305938	93306210	93306048	Y	CLLU1OS	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	14897	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	101412491	101412895	101412554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP20	258992	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	102169550	102169734	102169688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	52982	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	102186333	102186570	102186556	Y	NA	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	36146	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	105032549	105032903	105032843	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	185476	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	105715924	105716167	105716100	Y	APPL2,C12orf75	RP11-474B16.1	C12orf75,APPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-474B16.1	2628	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	105812004	105812354	105812179	Y	NA	NA	NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-474B16.1	93209	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	106328094	106328476	106328238	Y	CKAP4	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NUAK1	203335	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	111028698	111029042	111028796	Y	ARPC3,PPTC7,HVCN1	PPTC7,TCTN1	PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPTC7	9573	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	111875686	111876044	111875771	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	33934	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	111939312	111939650	111939575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN2	95830	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	115791856	115792156	115792052	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	671887	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	117480044	117480441	117480323	Y	TESC	NA	NA	NA	NA	NA	TESC	54843	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	118626739	118626832	118626769	Y	KSR2	NA	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	VSIG10	54908	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	122363309	122363443	122363412	Y	NA	PSMD9,WDR66	NA	NA	NA	NA	WDR66	9541	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	122519763	122520228	122519936	Y	ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP	MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	5135	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	123367402	123367963	123367875	Y	VPS37B	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	11028	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	124717911	124718282	124718055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	262123	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	124951666	124951729	124951686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	98406	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	125169582	125169721	125169665	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	119447	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	21241518	21241702	21241584	Y	NA	IL17D	NA	NA	NA	NA	IL17D	32564	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	21571909	21572149	21572029	Y	NA	RNU4-9P	NA	NA	NA	NA	RNU4-9P	38657	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	RNU4-9P,LATS2	NA	NA	NA	NA	RNU4-9P	3146	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr13	23471356	23471597	23471410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	202643	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	23500406	23500844	23500578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	231693	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPATA13	170983	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	27728821	27729155	27728988	Y	USP12	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	14878	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr13	29290769	29291025	29290846	Y	POMP	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	82	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	30568304	30568485	30568443	Y	KATNAL1,KATNAL1	NA	UBL3	IMR90	Hi-C	24141950	UBL3	145483	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	31439697	31440107	31440029	Y	C13orf33	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	132052	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	32433681	32434084	32433895	Y	NA	EEF1DP3	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	14703	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	32470605	32470630	32470618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	51627	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr13	34527456	34527530	34527492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	137270	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	34727619	34727920	34727781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	337433	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	34781635	34781805	34781767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	391449	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	35817825	35818146	35817986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAB21L1	230686	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	35835884	35836142	35836013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAB21L1	212690	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	37881013	37881265	37881086	Y	POSTN	NA	LINC00547	IMR90	Hi-C	24141950	POSTN	289716	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	41651625	41651882	41651685	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	ELF1	18049	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr13	42269057	42269475	42269218	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	385716	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	112562	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	68254	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr13	44833229	44833563	44833337	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	112238	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	64710	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	45752820	45753055	45752934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	60170	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	47688288	47688343	47688330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTR2A	219119	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	48464437	48464519	48464469	Y	NA	NA	HTR2A	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L4P3	128842	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	48907859	48907955	48907897	Y	NA	LINC00441,RB1	NA	NA	NA	NA	RB1	31972	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	50630657	50630910	50630784	Y	NA	DLEU1	NA	NA	NA	NA	DLEU1	23397	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	60570337	60570455	60570340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	165666	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	60580804	60581154	60581101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	154967	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr13	60635732	60636010	60635830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	100111	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr13	60716670	60717071	60716778	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	19050	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	60736273	60736548	60736444	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	152	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	67722025	67722418	67722226	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	4524781	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	74550144	74550303	74550225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	156091	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	95854476	95854763	95854633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	96924	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	95919951	95920261	95920073	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	31426	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr13	96332135	96332467	96332276	Y	NA	DZIP1,DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	4742	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	97879082	97879401	97879140	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	7394	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	97890366	97890711	97890515	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	18678	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	69832	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	99963491	99964160	99963691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	97479	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	100278698	100278861	100278780	Y	NA	CLYBL	NA	NA	NA	NA	CLYBL	21779	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	103250853	103251030	103250900	Y	NA	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	3500	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	107026666	107026873	107026771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	191639	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	108407171	108407488	108407466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	109595	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	108503880	108504176	108504028	Y	FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	12907	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	110709567	110709794	110709737	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	246365	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	110965035	110965206	110965124	Y	COL4A1,COL4A2	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	7539	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	111044675	111045176	111044974	Y	COL4A1,COL4A2	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	87179	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	111048888	111049110	111049017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	91392	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr13	111064452	111064750	111064655	Y	RAB20	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	106956	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	111609846	111610157	111610005	Y	RAB20,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	44430	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	111819312	111819589	111819392	Y	ING1,ING1,ING1,ANKRD10,ARHGEF7,ARHGEF7	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF7	54406	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	111863058	111863169	111863068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF7	98152	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	113434951	113435188	113435090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	92308	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	23058743	23059118	23058931	Y	REM2	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	2568	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,MMP14,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MRPL52	2521	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	32261719	32262250	32261957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5	281070	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	42263954	42264273	42264114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2364250	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	45518258	45518310	45518284	Y	PRPF39	KLHL28,PRPF39	NA	NA	NA	NA	KLHL28	8733	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	52145900	52146294	52146052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	144619	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	52372298	52373220	52372436	Y	PTGER2,GNG2	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	80973	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	53392802	53392977	53392890	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	24176	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	55144129	55144414	55144262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	112314	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	55544097	55544118	55544108	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27748	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	59744882	59745126	59745004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	91518	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	59908838	59908842	59908840	Y	NA	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	40319	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	61645426	61645731	61645594	Y	NA	NA	SLC38A6,SIX1,MNAT1,TRMT5,SIX4	IMR90	Hi-C	24141950	TRMT5	199350	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	62032593	62032996	62032785	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	2262	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	62058743	62058958	62058799	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	23485	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	62129212	62129618	62129522	Y	HIF1A	HIF1A	NA	NA	NA	NA	HIF1A	30613	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	62157799	62158071	62157921	Y	HIF1A	HIF1A,RP11-618G20.1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	2160	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	62170336	62170562	62170449	Y	NA	HIF1A,RP11-618G20.1,HIF1A-AS2	NA	NA	NA	NA	HIF1A	10105	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	65637410	65637773	65637587	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	69997	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	66104549	66104610	66104580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	229239	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	68720004	68720020	68720012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	166893	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	69161300	69161452	69161356	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	99738	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	69417007	69417266	69417043	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	26891	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	69434857	69435075	69434960	Y	DCAF5	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	9082	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	70079600	70080000	70079702	Y	NA	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	3287	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	70081383	70081681	70081508	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	5070	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	70099072	70099485	70099117	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	22759	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L1	85206	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	73100225	73100572	73100516	Y	NA	NA	RGS6,DPF3	IMR90	Hi-C	24141950	DPF3	258237	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	38286	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	75086409	75086922	75086553	Y	PGF	LTBP2,CTD-2207P18.2	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2207P18.2	5059	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	75125565	75125963	75125764	Y	NA	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	44215	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS	NA	NA	NA	NA	FOS	18420	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	77384574	77384777	77384608	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33481	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	77386302	77386621	77386483	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35209	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr14	80062928	80063212	80063068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	788888	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	201352	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	90378938	90379536	90379158	Y	FOXN3,FOXN3,KCNK13	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	39585	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	93540905	93541183	93541053	Y	MOAP1,KIAA1409,C14orf109,C14orf109,BTBD7,ITPK1	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	39482	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	95610253	95610413	95610333	Y	CLMN,DICER1,DICER1	DICER1	NA	NA	NA	NA	DICER1	11934	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	100463833	100464185	100464009	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	YY1	238450	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGHM	932608	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	25604152	25604594	25604190	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	77534	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	25625771	25626455	25625879	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	55673	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	33169920	33170257	33170055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	161745	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	33188603	33188636	33188634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	180428	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	PGBD4	NA	NA	NA	NA	PGBD4	29496	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	35931462	35931854	35931625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	652974	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	39136416	39136749	39136509	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62C7.2	172685	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62C7.2	52558	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	39447330	39447720	39447666	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62C7.2	137896	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	39684245	39684484	39684421	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	32912	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	39696909	39697463	39697288	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,C15orf53	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-624L4.1	19933	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	40077574	40077698	40077636	Y	NA	FSIP1	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	FSIP1	4543	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	42221521	42221787	42221671	Y	MGA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	40989	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	50634288	50634665	50634477	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	10860	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	NA	NA	NA	NA	NA	GNB5	95609	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	55559597	55559729	55559672	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	49429	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	58884938	58885321	58885256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	154856	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	58898092	58898418	58898348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	141759	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	59649595	59649770	59649683	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	NA	NA	NA	NA	FAM81A	13122	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	61147545	61147585	61147565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	371933	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	64000367	64000635	64000532	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	108579	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	64060591	64060833	64060743	Y	USP3,HERC1,DAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	63308	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	64960104	64960464	64960341	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	33016	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr15	67348530	67348587	67348559	Y	NA	RP11-798K3.2,SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-798K3.2	1004	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	67393197	67393867	67393527	Y	SMAD3	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	39096	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr15	67394592	67394967	67394687	Y	NA	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	40491	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	67409139	67409556	67409296	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	55038	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	67423316	67423661	67423503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	69215	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	67426476	67426864	67426547	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	72375	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	67440032	67440420	67440131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	85931	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	86574	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	56252	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	54692	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.92447123922499
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	68777268	68777651	68777548	Y	NA	NA	CORO2B,ITGA11,MIR548H4,FEM1B	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA11	54767	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	71149072	71149436	71149201	Y	LARP6	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	4574	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	71155799	71156069	71155993	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	11301	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	71371688	71372044	71371801	Y	THSD4	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	188564	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr15	72213908	72214290	72214099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	190309	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	109696	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	74223574	74223817	74223712	Y	LOXL1	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	7244	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.50668963362142
chr15	74661495	74661657	74661620	Y	NA	CYP11A1	NA	NA	NA	NA	CYP11A1	3414	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	74899091	74899429	74899332	Y	PPCDC,CLK3,CLK3	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	10250	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	74909072	74909376	74909224	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	20231	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	75338663	75338960	75338803	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	24767	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	78340097	78340467	78340288	Y	TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	27599	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	80453068	80453275	80453180	Y	BCL2A1,ZFAND6	FAH	NA	NA	NA	NA	FAH	10236	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	80773280	80773702	80773515	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	78588	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	80786706	80787081	80786777	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	92014	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	80837325	80837722	80837524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	142633	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	80881213	80881527	80881378	Y	MESDC1	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	186521	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	81082693	81083043	81082764	Y	KIAA1199	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	13009	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.76003445043213
chr15	81099060	81099288	81099113	Y	NA	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	29376	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr15	81125183	81125474	81125331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	55499	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	81131497	81131895	81131781	Y	IL16	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	61813	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	81156027	81156230	81156065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	86343	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	81197356	81197718	81197537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	82501	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	81207632	81207924	81207778	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	72295	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr15	84118150	84118486	84118331	Y	NA	SH3GL3	NA	NA	NA	NA	SH3GL3	4170	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	85887676	85888027	85887852	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	33775	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	86020857	86021180	86020870	Y	KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	99055	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	86111518	86111581	86111550	Y	NA	RP11-815J21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-815J21.2	9828	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-815J21.2	89792	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	86247990	86248195	86248102	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	88066	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	86267980	86268030	86268003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68231	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	89183173	89183667	89183329	Y	ABHD2,ISG20	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	ISG20	5789	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	89183856	89184198	89184027	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	ISG20	6472	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	90945502	90945781	90945680	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	16052	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	BLM	NA	NA	NA	NA	BLM	49562	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	92464513	92465010	92464828	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	69588	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	92612839	92613223	92613006	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	213848	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	96871345	96871608	96871517	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	2755	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr15	99223373	99223476	99223421	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	33173	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	99298945	99299364	99299005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	108745	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	213345	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	191210	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr15	101741612	101741900	101741753	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	48237	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr15	101783359	101783726	101783540	Y	CHSY1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	6411	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	151121	151408	151265	Y	NA	POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	MPG	26115	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	4456	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	ZNF174	NA	NA	NA	NA	ZNF174	33998	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	4426208	4426420	4426289	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	6359	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAGPA	1271291	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	15611948	15612359	15612167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	85796	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	19710173	19710469	19710241	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	15309	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	20922860	20922979	20922921	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	13154	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	24865270	24865636	24865496	Y	SLC5A11	NA	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6A	126254	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	25060889	25061147	25061001	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	35902	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	28543579	28543953	28543732	Y	EIF3CL,EIF3C,SPNS1,IL27	CLN3,NUPR1,CCDC101	IL27	IMR90	Hi-C	24141950	NUPR1	4542	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	30458943	30459145	30459094	Y	SEPHS2	ZNF771,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SEPHS2	3441	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	49317625	49318405	49317904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	665566	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	49656058	49656138	49656098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR3	441714	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	50219057	50219422	50219113	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	34228	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	53128013	53128430	53128279	Y	RBL2	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	41068	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	65036446	65036851	65036669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	121164	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	65103847	65103999	65103923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	54016	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	65153548	65154160	65153979	Y	CDH11	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3855	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	68465013	68465120	68465067	Y	NA	SMPD3	NA	NA	NA	NA	SMPD3	15471	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	SMPD3	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	SMPD3	23140	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	68526458	68526774	68526616	Y	NA	SMPD3,ZFP90,RNU4-36P	SMPD3,CDH1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	35219	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr16	71828659	71828769	71828714	Y	NA	AP1G1,ATXN1L,IST1	NA	NA	NA	NA	AP1G1	12335	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	72235988	72236216	72236077	Y	AP1G1,ATXN1L,KIAA0174,DHX38	NA	HPR,PMFBP1,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	TXNL4B	109658	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	73084736	73084892	73084798	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	6705	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	74610751	74610842	74610827	Y	NA	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	28170	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	75283958	75284369	75284078	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	15582	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	77979179	77979195	77979185	Y	VAT1L,WWOX	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	152115	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	80694679	80694985	80694832	Y	CDYL2	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	141241	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	81585142	81585379	81585273	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	108367	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	81634791	81634955	81634874	Y	GAN	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	135747	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	82168947	82168959	82168953	Y	NA	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	32872	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	82663331	82663687	82663514	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4923	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	82667775	82667948	82667787	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	9367	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	83777004	83777385	83777194	Y	HSDL1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	62063	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	84862837	84863219	84863017	Y	CRISPLD2	CRISPLD2	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	11247	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	204800	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	85950196	85950424	85950316	Y	COX4I1,IRF8	IRF8	NA	NA	NA	NA	IRF8	19787	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	165516	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	378017	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	398569	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	87781357	87781475	87781397	Y	C16orf95	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16123	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	87843209	87843416	87843290	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	45611	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr16	87904170	87904524	87904347	Y	FBXO31	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	3076	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	88337697	88337985	88337883	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179740	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	88474264	88474567	88474378	Y	BANP,BANP,BANP,CYBA	ZFPM1	BANP,CA5A,ZNF469	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	43158	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	89449545	89449691	89449606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	105278	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	693293	693510	693390	Y	RNMTL1	GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	9712	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr17	2143435	2143643	2143533	Y	HIC1,HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	61034	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	4204226	4204625	4204419	Y	CAMKK1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	38952	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	4437372	4437692	4437444	Y	NA	SPNS2,MYBBP1A	NA	NA	NA	NA	MYBBP1A	19234	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,INCA1,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	7380968	7381115	7381038	Y	EIF5A	TMEM102,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	4467	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.92447123922499
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	18679	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr17	25833655	25833928	25833707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	51985	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	26311866	26312151	26312056	Y	NLK	NA	NOS2,NLK	IMR90	Hi-C	24141950	NLK	54612	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	27568035	27568215	27568131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	50921	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	27703475	27703981	27703860	Y	TIAF1,MYO18A,GIT1,TAOK1	TAOK1,MIR4523	MYO18A,TAOK1,CORO6,SSH2,CRYBA1,GIT1,TP53I13,ABHD15,MIR4523	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAOK1	11501	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	29136069	29136242	29136166	Y	CRLF3	CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5	NA	NA	NA	NA	CRLF3	13552	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	29599453	29600092	29599789	Y	NA	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	39038	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVI2A	229790	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	33349623	33350064	33349994	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL	LIG3	NA	NA	NA	NA	LIG3	44110	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr17	33373543	33373969	33373834	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	40369	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	34838937	34839070	34839023	Y	NA	ZNHIT3,PIGW	NA	NA	NA	NA	ZNHIT3	1403	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	38085522	38085789	38085697	Y	ERBB2,IKZF3,ORMDL3	ORMDL3,PSMD3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	3668	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21104	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr17	42365739	42366179	42366097	Y	UBTF,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39	SLC4A1,RUNDC3A,UBTF,SLC25A39,ATXN7L3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC25A39	34059	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	42620579	42620851	42620665	Y	GJC1,FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	12074	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	43201428	43201633	43201517	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	6334	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	CDC27	120552	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	45356357	45357027	45356891	Y	NA	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	27094	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	47928830	47928921	47928887	Y	FAM117A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	58125	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	48288364	48288588	48288396	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	11371	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT2	53639	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	48716691	48717083	48716761	Y	CHAD,SPAG9	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6553	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	NA	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOB1	53605	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	49513112	49513244	49513157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	177223	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	55456674	55456859	55456690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	125462	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	55501996	55502706	55502262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	170784	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	55979553	55979719	55979663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	50965	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	59018495	59018735	59018604	Y	NA	NA	TBX2,C17orf82	IMR90	Hi-C	24141950	BCAS3	265681	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	59780215	59780354	59780263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	113652	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	60141349	60141594	60141514	Y	NACA2,MED13	MED13	INTS2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED13	706	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	60868640	60868941	60868827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165878	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	61456495	61456666	61456581	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10,MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	65073	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	63030127	63030512	63030385	Y	NA	GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	20445	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	508381	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr17	63981969	63982296	63982133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	203906	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	64455929	64456369	64456061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	159175	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	64463185	64463416	64463350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	166431	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	64503657	64504241	64503882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	206903	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	64544411	64544774	64544437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	247657	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	64695504	64695853	64695677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	263173	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	70188799	70188845	70188822	Y	NA	NA	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9	73638	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	70892078	70892260	70892135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	194591	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	73684314	73684419	73684412	Y	NA	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	23045	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr17	75164022	75164186	75164074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	83224	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	75223747	75224089	75223824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	142949	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	75361925	75362048	75361987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	281127	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNGR2	207843	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	5.84894247844998
chr17	76147929	76148019	76147974	Y	NA	SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	14620	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	76325206	76325964	76325662	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	28194	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	76347582	76348110	76347694	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	6048	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	77034665	77035262	77034914	Y	CYTH1,USP36,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	17769	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	78500391	78500494	78500444	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	RPTOR,NPTX1,LOC100294362,ENDOV	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL32P31	13509	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	78524165	78524352	78524226	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	7546	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	79228717	79229006	79228862	Y	NA	AZI1,C17orf89,SLC38A10	NA	NA	NA	NA	C17orf89	17678	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	TYMS	10579	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	TYMS	12029	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr18	3747502	3747863	3747722	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	337896	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	3794813	3795294	3795021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	385207	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	3798477	3798752	3798615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	388871	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL4	517433	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.76003445043213
chr18	6193210	6193559	6193391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	219677	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	8704447	8704767	8704559	Y	NA	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	97004	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	8949015	8949649	8949122	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	150979	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr18	10528233	10528593	10528264	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	4331	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	10708268	10708433	10708298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	184366	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	13284469	13284622	13284521	Y	C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	295108	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	13890423	13890585	13890504	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	165761	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	14111961	14112330	14112146	Y	NA	ZNF519	NA	NA	NA	NA	ZNF519	18159	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	19746222	19746392	19746310	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	1012	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	ANKRD29	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	12042	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	152885	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	29441885	29441939	29441912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	89160	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	32106446	32106756	32106602	Y	NA	DTNA	NA	NA	NA	NA	DTNA	35192	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	32674767	32675124	32674837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	119875	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	33878609	33878753	33878681	Y	FHOD3	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	2932	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	34047658	34047774	34047716	Y	FHOD3	NA	NA	NA	NA	NA	FHOD3	171981	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	34048220	34048446	34048313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHOD3	172543	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	35024297	35024529	35024426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	617139	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	37418668	37419002	37418835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	505029	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	43351602	43351892	43351629	Y	SLC14A1	SLC14A1	NA	NA	NA	NA	SLC14A1	49510	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	286345	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	46353431	46353823	46353627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	290014	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	46365443	46365671	46365554	Y	SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	302026	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	397724	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	402091	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	NA	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	CTIF	418741	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	460738	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	46700838	46701084	46700955	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	284633	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	53180110	53180413	53180343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	149605	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	67711885	67712217	67712098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	158964	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr18	72919537	72919929	72919697	Y	ZADH2	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	74171783	74172228	74172071	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	32918	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr18	74556264	74556608	74556436	Y	NA	ZNF236	NA	NA	NA	NA	ZNF236	23701	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234039	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	137452	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	2064980	2065181	2065097	Y	MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	15737	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	2926811	2926963	2926923	Y	NA	ZNF57,ZNF77	NA	NA	NA	NA	ZNF77	16006	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	3458286	3458426	3458380	Y	NA	DOHH,FZR1	NA	NA	NA	NA	DOHH	40512	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	3555158	3555442	3555300	Y	C19orf28	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	15333	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	4067781	4068111	4067963	Y	SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2838	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	4567148	4567365	4567215	Y	TICAM1,SEMA6B	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	70165	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	5147751	5147768	5147760	Y	PTPRS	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	127977	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	5435162	5435432	5435167	Y	NA	NA	KDM4B,PTPRS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRS	96348	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	5536566	5536826	5536635	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,PLAC2	IMR90	Hi-C	24141950	SAFB	84220	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr19	6062045	6062746	6062500	Y	TNFSF9,DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	85892	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	6516969	6517178	6517079	Y	NA	TUBB4A	TNFSF9	K562	ChIA-PET	22265404	TUBB4A	16110	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	10829647	10829946	10829894	Y	ICAM3,TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	QTRT1,DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	2892	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	4.1778160560357
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	DAND5,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	17200078	17200517	17200217	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15487	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	21511296	21511520	21511376	Y	NA	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	1069	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	33382845	33383180	33383014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP89	77717	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	39189644	39189919	39189773	Y	RINL	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN4	53355	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	41289050	41289265	41289158	Y	SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	RAB4B	6929	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	41814398	41814719	41814610	Y	HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2	HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	304	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,LYPD5,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	44825986	44826083	44826035	Y	ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF285	77691	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr19	45931993	45932316	45932152	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	NA	NA	NA	NA	PPP1R13L	24386	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr19	46398825	46399093	46398978	Y	EML2,EML2	SYMPK,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	MYPOP	4769	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	47234783	47235117	47235027	Y	PTGIR,ZC3H4,PRKD2,STRN4	PRKD2,FKRP,STRN4	NA	NA	NA	NA	FKRP	12186	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr19	47448240	47448462	47448420	Y	PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS1	72615	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	47662714	47662828	47662771	Y	NA	SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	ZC3H4	47705	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	47689758	47690163	47690151	Y	GLTSCR1,BBC3	BBC3	NA	NA	NA	NA	BBC3	43860	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	49486890	49487028	49486959	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	7539	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	120291	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121505	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	53132219	53132465	53132335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	59284	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	MYADM	97766	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr19	56796830	56796936	56796883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	80532	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	56823857	56823998	56823922	Y	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	53470	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	56831287	56831644	56831534	Y	ZSCAN5A	ZNF542,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZNF542	45824	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr2	1676691	1676995	1676843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	69629	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	3508183	3508316	3508315	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	13191	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	NA	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	93617	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	15332010	15332377	15332192	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	367077	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	15339978	15339997	15339988	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	359457	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	15464031	15464396	15464252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	235058	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	18811449	18811776	18811476	Y	NA	NA	OSR1,NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	71503	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr2	19548078	19548301	19548191	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	8113	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	20848318	20848468	20848370	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	381	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	24047559	24047784	24047672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	100200	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	24234264	24234694	24234378	Y	MFSD2B	C2orf44,FKBP1B	NA	NA	NA	NA	C2orf44	35751	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	25545894	25546051	25546003	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	17408	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,KCNK3,CENPA	NA	NA	NA	NA	KCNK3	33315	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	27072631	27072808	27072721	Y	CCDC164,MAPRE3,DPYSL5	NA	NA	NA	NA	NA	CENPA	87474	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	30391485	30391578	30391503	Y	YPEL5	YPEL5	NA	NA	NA	NA	YPEL5	23678	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	30458307	30458498	30458425	Y	YPEL5,LBH	LBH,AC104698.1	NA	NA	NA	NA	LBH	5910	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	30807812	30808169	30807846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	139720	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	36687110	36687380	36687132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	106041	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	36790074	36790520	36790216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	80710	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	37852383	37852553	37852466	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	111058	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	37875700	37876061	37875917	Y	EIF2AK2,QPCT,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	87550	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	37892431	37892964	37892857	Y	QPCT,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	70647	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	37995727	37996117	37995888	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	32116	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr2	42155945	42156079	42156067	Y	NA	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	2784	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	42157961	42158315	42158139	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	548	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	42278314	42278459	42278342	Y	NA	PKDCC	NA	NA	NA	NA	PKDCC	5154	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	43152648	43152978	43152751	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	298770	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	43265724	43265951	43265843	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L2	185797	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	43269026	43269323	43269208	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	182425	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	43496273	43496611	43496398	Y	NA	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	44525	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	46125185	46125467	46125284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	248701	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	46525633	46526278	46526263	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	6827	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	47296749	47297008	47296937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	104732	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	54816609	54817000	54816923	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	135187	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	164425	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	55329161	55329446	55329300	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	8311	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	56099404	56099776	56099646	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	49498	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	61644750	61644896	61644823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	51008	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	63129477	63129780	63129501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	230491	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	64367846	64368162	64368149	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	1426	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	64368431	64369198	64368837	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	390	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	NA	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR1	102453	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	69424670	69425029	69424849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	186360	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	71704588	71704899	71704719	Y	NAGK,DYSF	DYSF	NA	NA	NA	NA	DYSF	25736	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	634159	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	72789461	72789923	72789792	Y	EXOC6B	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	261247	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	74298270	74298885	74298717	Y	MOBKL1B	FNBP1P1	NA	NA	NA	NA	FNBP1P1	46922	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	74968770	74968998	74968973	Y	TLX2,HK2	AC007387.2	HK2,SEMA4F	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007387.2	10948	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	86225018	86225303	86225260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105975	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	88923115	88923478	88923431	Y	NA	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	1616	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGKJ1	2656237	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGKJ1	2776762	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	95982487	95982780	95982632	Y	TRIM43B,KCNIP3	KCNIP3	NA	NA	NA	NA	KCNIP3	21435	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	96782666	96782871	96782861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD7	89692	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	99121825	99122251	99122089	Y	INPP4A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	62508	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	102150811	102151152	102151053	Y	RNF149,MAP4K4,MAP4K4	NA	MAP4K4,RFX8,TBC1D8	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K4	160160	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	105655685	105655967	105655739	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	3244	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	108841436	108841459	108841449	Y	NA	NA	SULT1C2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GCC2	221558	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	109206329	109206788	109206425	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	57472	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	109209973	109210484	109210252	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61116	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	113643095	113643585	113643305	Y	IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G	NA	CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1B	50615	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	114653014	114653311	114653090	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	7477	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.76003445043213
chr2	127824493	127824859	127824771	Y	MAP3K2,IWS1,BIN1	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	38072	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	127841716	127842041	127841975	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	20890	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	131582042	131582382	131582235	Y	NA	ARHGEF4	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF4	10107	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	133407314	133407482	133407398	Y	LYPD1,LYPD1	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	19670	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	134084028	134084575	134084301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP5	239459	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	139464660	139464674	139464668	Y	NXPH2	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH2	71244	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	145212298	145212826	145212615	Y	GTDC1,GTDC1,GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	67321	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	145214152	145214623	145214350	Y	GTDC1,GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	65524	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	151385444	151385651	151385488	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	7874	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	152971717	152971973	152971845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAM2	58533	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	157287649	157287933	157287736	Y	NR4A2,GPD2	GPD2	GPD2	K562	ChIA-PET	22265404	GPD2	1869	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	59674	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	161208357	161208687	161208675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	53706	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	163222658	163222682	163222670	Y	GCA	IFIH1,GCA	NA	NA	NA	NA	GCA	49308	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	267758	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	165643142	165643316	165643229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	54873	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	165727413	165727426	165727420	Y	NA	COBLL1	COBLL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	COBLL1	29224	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	168858571	168859104	168858832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	243547	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	170573146	170573520	170573335	Y	NA	PHOSPHO2,KLHL23	NA	NA	NA	NA	KLHL23	24148	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	171865748	171866100	171865790	Y	TLK1	NA	NA	NA	NA	NA	GORASP2	82774	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	173876038	173876102	173876070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	341446	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	173908830	173909139	173908955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	308409	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	187263813	187264095	187263899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	84788	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	187420042	187420288	187420183	Y	ITGAV,ITGAV,ZC3H15	ITGAV	ZC3H15,ITGAV	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAV	32504	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	187455745	187456210	187455889	Y	NA	ITGAV	NA	NA	NA	NA	ITGAV	2953	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	191030826	191031069	191031046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	175127	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	191814146	191814507	191814301	Y	STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	41786	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	191826753	191827142	191827070	Y	NA	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	29151	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	192084344	192084437	192084391	Y	NA	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	23474	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	192170125	192170408	192170266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	62214	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	197004793	197005261	197004933	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	33966	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	197110496	197110726	197110609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	71269	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	197195800	197196140	197196081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	156573	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.50668963362142
chr2	198006606	198006666	198006636	Y	SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,ANKRD44	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	119169	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	201268506	201268867	201268734	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	99902	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	DAZAP2P1	165924	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	203159775	203160145	203159798	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	31336	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	204646981	204647288	204647136	Y	NA	NA	CD28,RAPH1,ABI2,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	248848	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	205836059	205836159	205836109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	427543	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	206569997	206570271	206570078	Y	NA	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	25283	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	206944485	206944991	206944704	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	2338	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	207076453	207076789	207076513	Y	NA	GPR1	NA	NA	NA	NA	GPR1	3982	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	208016492	208017045	208016857	Y	CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	12946	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	208259563	208259980	208259919	Y	NA	NA	KLF7	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	132481	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	208369274	208369395	208369347	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	23066	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	213402193	213402489	213402443	Y	NA	ERBB4	NA	NA	NA	NA	ERBB4	628	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	213842063	213842076	213842069	Y	IKZF2,IKZF2	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF2	173075	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	216222811	216223009	216222866	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48271	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	216489283	216489494	216489351	Y	FN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	190307	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	529950	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	5.01337926724284
chr2	218258363	218258761	218258688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	606957	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr2	218688412	218688604	218688508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	177114	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	218785631	218785811	218785787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	79907	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr2	218793134	218793717	218793417	Y	TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	72001	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1,PLCD4	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	223447202	223447309	223447256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	71747	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	224751909	224752110	224752042	Y	WDFY1	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	51165	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	225841174	225841410	225841405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	63752	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	225875465	225875930	225875836	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	29232	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	225895000	225895240	225895124	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	9922	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	227524213	227524410	227524360	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	138065	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	227586845	227587105	227586929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS1	75370	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	35.929218081907
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	230106282	230106638	230106611	Y	NA	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	27363	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	230784453	230784592	230784556	Y	NA	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	426	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	231636017	231636396	231636213	Y	NA	BANF1P3	NA	NA	NA	NA	BANF1P3	47899	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	B3GNT7	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18859	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	235353626	235353934	235353758	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	49763	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	235388083	235388436	235388365	Y	NA	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	15261	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	235902163	235902381	235902255	Y	NA	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	43546	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	235905010	235905389	235905297	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	46393	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	237016237	237016450	237016344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	397735	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	237454538	237454681	237454633	Y	NA	IQCA1	NA	NA	NA	NA	IQCA1	40353	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	68798	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	238066036	238066584	238066320	Y	MLPH,COL6A3	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	73576	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	238299841	238300132	238300017	Y	COPS8,LRRFIP1,COL6A3	COL6A3,AC112721.1,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	20886	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	238374283	238374521	238374346	Y	COL6A3	AC112721.1,AC112721.2,MLPH	LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	MLPH	17550	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	238508822	238509122	238509050	Y	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	25097	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	240302695	240302977	240302812	Y	HDAC4	HDAC4	NA	NA	NA	NA	HDAC4	18371	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	625872	626198	626085	Y	NA	SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	5816	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	1154843	1155127	1154985	Y	FAM110A,SIRPB2,SIRPB1	NA	NA	NA	NA	NA	PSMF1	62937	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	1801326	1801756	1801551	Y	SDCBP2,NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	71398	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	3286864	3286977	3286928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A11	69028	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	4941641	4941708	4941700	Y	NA	SLC23A2	RASSF2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	47231	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	5046140	5046913	5046758	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	57201	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	7978054	7978163	7978110	Y	NA	TMX4	NA	NA	NA	NA	TMX4	20313	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	9100209	9100421	9100248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	52799	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	9291356	9291748	9291412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	243946	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	9384292	9384675	9384295	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	336882	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	10501861	10501978	10501938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	88991	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	10585324	10585599	10585462	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	39415	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	10655214	10655688	10655561	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	30200	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	13380021	13380161	13380091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	237426	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	13427146	13427424	13427285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	190163	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	19881587	19881718	19881652	Y	RIN2,RIN2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	114042	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr20	20586775	20587103	20586803	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	104028	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	21417020	21417216	21417107	Y	NA	NA	XRN2	IMR90	Hi-C	24141950	XRN2	135078	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr20	30110463	30111086	30110768	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	10232	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	31171182	31171312	31171248	Y	DNMT3B,C20orf203	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	306	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr20	33699049	33699250	33699220	Y	TRPC4AP,EDEM2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	20375	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	33899361	33899545	33899443	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	28573	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	33907745	33907913	33907842	Y	MMP24,GDF5	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36957	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	CPNE1,RBM12	33318	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	39938508	39938643	39938544	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	5669	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	18822	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	DNTTIP1	8072	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	16091	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	48158294	48158522	48158408	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	24161	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	48174087	48174267	48174236	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	8416	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr20	48221158	48221415	48221229	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	38475	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	48295598	48295872	48295769	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	32543	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	48950504	48950697	48950581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	145128	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr20	49157621	49157908	49157761	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	32730	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	49487134	49487591	49487436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	57930	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	49553399	49553600	49553500	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	7441	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	49982226	49982434	49982404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344560	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr20	50180369	50180507	50180463	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	168565	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	33530	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	548194	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	305458	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	55985197	55985345	55985270	Y	RBM38,ZBP1	RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	20734	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIDO1	120685	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.50668963362142
chr21	17656088	17656430	17656111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	215246	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	17678130	17678559	17678221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	237288	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	466067	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	519825	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	28218728	28219247	28219071	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	3000	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	30294712	30295026	30294934	Y	NA	N6AMT1	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	39019	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr21	31066887	31067008	31066948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	502495	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	36219873	36220239	36220187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234432	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	237131	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	36339843	36340239	36340159	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	354402	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr21	36577614	36577815	36577724	Y	NA	NA	RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCAN1	592173	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	18991	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	38349168	38349478	38349323	Y	TTC3,DYRK1A,HLCS	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	HLCS	11058	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	43331076	43331447	43331406	Y	NA	PRDM15,C2CD2	NA	NA	NA	NA	PRDM15	33485	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr21	43460613	43461088	43460825	Y	C2CD2,SLC37A1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	88614	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr21	43477244	43477358	43477313	Y	NA	NA	ZNF295,UMODL1,C2CD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	C2CD2	105245	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	46749941	46750271	46750188	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	44128	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	47554885	47555152	47555043	Y	FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	38874	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr21	47993556	47993894	47993723	Y	DIP2A,S100B,PRMT2	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	59185	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	17528836	17529213	17528959	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	34631	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	18538907	18539143	18539025	Y	NA	MICAL3,PEX26	NA	NA	NA	NA	PEX26	19546	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	ZNF74,SCARF2	NA	NA	NA	NA	SCARF2	17370	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	24767148	24767407	24767278	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	44440	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr22	27109967	27110337	27110138	Y	NA	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	43237	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	27488405	27488660	27488521	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	130028	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	27527504	27527688	27527616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1172A22.1	91000	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	27530003	27530818	27530508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1172A22.1	87870	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	27616278	27616656	27616487	Y	NA	RP5-1172A22.1	MIAT,PITPNB	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	2032	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	29877762	29878123	29877961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP1B1	60594	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	30631749	30632163	30631958	Y	RNF215,MTFP1,GAL3ST1	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	8677	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	30634003	30634340	30634268	Y	TBC1D10A,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	6500	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	RP3-400N23.6,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	31692333	31692587	31692466	Y	SMTN,RNF185	RP3-400N23.6,PIK3IP1,PATZ1,AC005003.1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	5813	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	36759233	36759313	36759256	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	22750	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	36765300	36765605	36765487	Y	APOL3,NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	16458	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	9245	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	37942978	37943343	37943114	Y	NA	CARD10,RP5-1177I5.3,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1177I5.3	690	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	37986436	37986718	37986607	Y	CYTH4,SH3BP1,EIF3L,LGALS2,GGA1,GGA1	RP5-1177I5.3,CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	NA	NA	NA	NA	GGA1	15763	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	39091291	39091422	39091336	Y	NA	CBY1,RP3-508I15.9,TOMM22,JOSD1,GTPBP1	NA	NA	NA	NA	JOSD1	4139	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	40885973	40886127	40886071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	121378	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	47126357	47126654	47126612	Y	NA	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	CERK	5504	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	10402355	10402452	10402401	Y	FANCD2	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	41493	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	11261398	11261658	11261529	Y	HRH1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	50337	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	16379433	16379643	16379566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	74727	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	16402746	16402862	16402794	Y	DAZL,DAZL	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	98040	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	19470380	19470682	19470561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB5A	515889	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	23431263	23431479	23431424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	188752	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	23609558	23609766	23609671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E1	235628	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	26688087	26688474	26688152	Y	LRRC3B	NA	NA	NA	NA	NA	NEK10	720477	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.76003445043213
chr3	29412640	29413015	29412700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	92167	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	29496223	29496522	29496266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	175750	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	29568670	29568984	29568828	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	248197	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	29983920	29984245	29984164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	661749	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	30535531	30535813	30535695	Y	NA	NA	TGFBR2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	110181	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	31207703	31207815	31207739	Y	STT3B	NA	GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	STT3B	364315	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	32534481	32534843	32534759	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	8057	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	33639579	33639904	33639592	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	117944	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	37011455	37011827	37011685	Y	LRRFIP2,ITGA9,GOLGA4,MLH1,MLH1,EPM2AIP1	TRANK1,EPM2AIP1,MLH1,RPL29P11	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	20968	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	42108875	42109165	42109003	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	55581	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	42514954	42515471	42515310	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	5822	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	43812189	43812581	43812343	Y	NA	NA	ANO10,MIR138-1	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	81103	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	45594952	45595331	45595047	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	66	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCC1	116343	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	49347058	49347335	49347197	Y	NA	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	28810	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	50302065	50302532	50302296	Y	SEMA3B	GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3	NA	NA	NA	NA	SEMA3B	458	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	52081342	52081690	52081545	Y	GPR62,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	6876	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	53342432	53342824	53342628	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	36830	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	55201679	55201928	55201859	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA2D3	1047105	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	55377694	55377830	55377728	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	ERC2	1122561	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	56873709	56874050	56874038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	158444	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	57955527	57955938	57955800	Y	FLNB	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	36189	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	58162589	58162663	58162637	Y	KCTD6	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	58570	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	60501466	60501824	60501659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	733309	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	62008406	62008528	62008467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	281626	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	62573493	62573782	62573553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	220488	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	62590103	62590230	62590174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	237098	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	66503172	66503179	66503176	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	46508	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	69698353	69698679	69698548	Y	NA	NA	MITF	IMR90	Hi-C	24141950	MITF	87907	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	388644	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	70881667	70881911	70881828	Y	NA	NA	FOXP1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP1	749229	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	71080443	71080735	71080627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	550405	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	71158778	71158960	71158907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	472180	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	72151192	72151670	72151441	Y	RYBP,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2	NA	SHQ1,RYBP	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	342399	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	86972169	86972375	86972272	Y	VGLL3	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	65894	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	87038252	87038431	87038423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	98528384	98528734	98528634	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	89799	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	99356024	99356457	99356227	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	705	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223910	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	99582587	99582828	99582708	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	227268	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	99646991	99647087	99647049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	184270	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	100519297	100519336	100519310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	93092	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr3	101899188	101899342	101899284	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	354353	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	105486064	105486421	105486242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	99975	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	107148837	107149015	107148915	Y	NA	NA	LOC344595,BBX,LOC100302640	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BBX	90768	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	111655124	111655265	111655201	Y	NA	ABHD10	NA	NA	NA	NA	ABHD10	40592	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	112076380	112076550	112076391	Y	NA	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	27186	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	112095378	112095510	112095470	Y	CD200	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	46184	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	112109657	112110558	112110278	Y	CD200	NA	CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3	IMR90	Hi-C	24141950	CD200	60463	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	114078948	114079017	114078985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	305488	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	114165361	114165710	114165642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	391901	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	114246828	114247170	114246841	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	473368	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	114349924	114350199	114350024	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	513919	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	114813239	114813371	114813303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	50747	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	119052576	119052960	119052743	Y	NA	ARHGAP31	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31	41356	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	123351425	123351671	123351446	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	49036	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	123371138	123371512	123371325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	68749	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	123508502	123508917	123508819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK	92261	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	124708345	124708776	124708566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEG1	64026	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	7193	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	124781797	124782117	124781832	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	8995	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	300013	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	134087826	134088207	134088017	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	4114	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	138109159	138109469	138109274	Y	NA	MRAS,ESYT3	NA	NA	NA	NA	ESYT3	41959	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	139018358	139018692	139018412	Y	FOXL2,C3orf72	NA	BPESC1	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	87882	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	141707258	141707451	141707397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	53589	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	141746457	141746834	141746789	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	14206	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	145959602	145959992	145959865	Y	PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	6974	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	156538683	156538849	156538764	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	2421	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	159175843	159176214	159175971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	379436	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	159540179	159540477	159540438	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	15173	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	13133	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	439935	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	169051059	169051429	169051244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	327977	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	169376858	169377055	169376957	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	2351	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	169377431	169377952	169377740	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	1454	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	169494029	169494036	169494033	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	5410	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	170137645	170137870	170137713	Y	SLC7A14,CLDN11,CLDN11	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	2992	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	170138195	170138413	170138223	Y	NA	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	3542	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr3	170627321	170627621	170627516	Y	EIF5A2	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	2839	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	170972971	170973298	170973238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	202899	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	170975109	170975430	170975328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	200767	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	171074101	171074325	171074213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	101872	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	171859893	171860698	171860535	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	104475	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	171878014	171878468	171878150	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	122596	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	188097	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	172229975	172230511	172230380	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	8786	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	172238180	172238555	172238252	Y	NA	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	742	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	178236576	178236655	178236649	Y	KCNMB2	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT3	551412	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF639	60042	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	186490704	186490868	186490793	Y	ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2	EIF4A2,RFC4	NA	NA	NA	NA	EIF4A2	8126	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	187883507	187883633	187883573	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	13662	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	187948643	187949049	187948891	Y	LPP,LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	78798	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	188103161	188103345	188103235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	233316	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	188151524	188151812	188151760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	281679	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	188155903	188156126	188156022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	286058	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	188506419	188506821	188506595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	636574	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	189794828	189795104	189794939	Y	NA	LEPREL1-AS1,LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	41649	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.92447123922499
chr3	194282522	194282723	194282605	Y	HES1,ATP13A3	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,XXYLT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM44-AS1	20017	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	194298758	194299295	194298977	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	3445	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2,APOD	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	196784656	196784743	196784700	Y	CEP19,PIGX,PAK2	MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	29969	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr3	197335598	197335855	197335727	Y	NA	BDH1,AC024560.3	NA	NA	NA	NA	AC024560.3	16922	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	1237849	1238004	1237927	Y	NA	SPON2,CTBP1,MAEA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	3737	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	1710531	1710811	1710671	Y	NA	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	1471	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	1970462	1970680	1970571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	71009	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	3484611	3485071	3484896	Y	NA	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	21578	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	79300	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	7972368	7972631	7972565	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	32715	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	8614691	8614733	8614712	Y	NA	CPZ	NA	NA	NA	NA	CPZ	22304	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB28	841794	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	13439753	13439937	13439845	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	44052	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	290207	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	15036867	15037072	15036952	Y	NA	CPEB2	NA	NA	NA	NA	CPEB2	34569	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	15297006	15297030	15297019	Y	NA	C1QTNF7	C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	C1QTNF7	42412	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	15915213	15915572	15915412	Y	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	NA	CD38	137315	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	16746759	16746814	16746782	Y	LDB2	NA	NA	NA	NA	NA	LDB2	151618	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	21619972	21620195	21620166	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP4	328227	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	21895049	21895394	21895392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP4	53028	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	23890124	23890507	23890316	Y	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	693666	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	24840398	24840758	24840578	Y	NA	NA	SOD3	IMR90	Hi-C	24141950	SOD3	50864	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	38525630	38525737	38525685	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF3	138080	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1	2696	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr4	38870386	38870769	38870503	Y	FAM114A1	TLR1,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3088	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	38950892	38951246	38951151	Y	KLF3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	83594	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	40803649	40803948	40803799	Y	APBB2,APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	53735	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	54055240	54055561	54055400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	174681	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	54871626	54871896	54871863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	56961	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	57937505	57937813	57937783	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	36115	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	57960936	57961321	57961171	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	12607	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	67438719	67438955	67438878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	480875	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	72130257	72130635	72130446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A4	79254	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	76621405	76621540	76621497	Y	RCHY1,THAP6,NUP54,G3BP2,G3BP2	G3BP2,USO1	NA	NA	NA	NA	G3BP2	26169	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	77545422	77545888	77545544	Y	SCARB2	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	191169	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	77546849	77546886	77546883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	192596	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	77974492	77974926	77974738	Y	CCNI	CCNI	NA	NA	NA	NA	CCNI	20232	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	80958042	80958450	80958250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	86158	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	464630	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	533574	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	87849171	87849370	87849272	Y	HSD17B11	AFF1	NA	NA	NA	NA	AFF1	4784	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	87880821	87880990	87880863	Y	NA	AFF1	NA	NA	NA	NA	AFF1	26667	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	95406092	95406259	95406175	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	35055	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	95469761	95469962	95469859	Y	HPGDS,PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	98724	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	95542272	95542471	95542377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	171235	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	99344407	99344641	99344524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	163872	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	100325584	100326020	100325850	Y	ADH5,ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5	317632	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	288765	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	102131266	102131303	102131283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	135634	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	103967476	103967511	103967493	Y	NA	SLC9B2	NA	NA	NA	NA	SLC9B2	37475	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	106383790	106383988	106383871	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	9250	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	108758517	108758852	108758585	Y	SGMS2,SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	14798	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	111086740	111086853	111086804	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	31502	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	113205194	113205406	113205300	Y	NA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	TIFA	135	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	113572868	113573168	113573031	Y	NA	LARP7,C4orf21	NA	NA	NA	NA	C4orf21	16717	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	325456	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	114369024	114369155	114369101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	311928	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	114390310	114390498	114390393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	290585	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	119890642	119890944	119890758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNPO2	82646	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr4	120493215	120493297	120493256	Y	C4orf3	NA	NA	NA	NA	NA	PDE5A	54849	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	122610538	122611647	122611314	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	4621	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32229	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	129275726	129275798	129275762	Y	NA	NA	PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	63820	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	129389693	129389923	129389761	Y	NA	NA	PHF17,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	177787	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	140868265	140868315	140868290	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	205023	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	144332697	144332829	144332792	Y	GAB1	NA	NA	NA	NA	NA	GAB1	76782	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	148729482	148729491	148729487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	78268	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	148752985	148753384	148753090	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	101771	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	151564216	151564527	151564372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	370352	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	SH3D19	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3D19	1248	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	154548347	154548481	154548383	Y	KIAA0922,TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR2	72171	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	157867687	157867968	157867878	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22578	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	159696369	159696741	159696680	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	8079	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	160195976	160196239	160196029	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	507686	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	200219	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	164471489	164471679	164471583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	207505	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	169849945	169850177	169850075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	79249	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	169853850	169854103	169853858	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	75323	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr4	169991170	169991417	169991322	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	61744	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	170030173	170030283	170030178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	100747	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	170132939	170133158	170133049	Y	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	57098	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	173077271	173077317	173077294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT7	1010587	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	174285204	174285286	174285258	Y	NA	HMGB2,SAP30	SAP30	K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	3834	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	177191849	177192202	177191988	Y	ASB5	SPCS3,RP11-87F15.2	SPATA4	IMR90	Hi-C	24141950	SPCS3	46913	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	177705907	177706270	177706189	Y	NA	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	5611	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	184208528	184208558	184208557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	155186	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	184256615	184256836	184256706	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	106908	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	186306025	186306048	186306047	Y	NA	LRP2BP,ANKRD37,UFSP2,C4orf47	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	9005	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	186730607	186731122	186730955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS2	144684	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	186760271	186760668	186760511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS2	115138	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr4	187834148	187834163	187834155	Y	NA	RP11-11N5.1	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-11N5.1	24025	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	395451	395827	395512	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	45431	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	964244	964536	964396	Y	NKD2	NKD2	SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688	IMR90	Hi-C	24141950	NKD2	42408	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	964858	965249	965055	Y	NA	NKD2	SLC12A7,TRIP13,LOC100506688	IMR90	Hi-C	24141950	NKD2	41695	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	1022145	1022187	1022166	Y	SLC6A18,NKD2	NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	15201	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	2758153	2758545	2758351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	958639	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	5.43116087284641
chr5	7882044	7882425	7882249	Y	NA	MTRR,C5orf49,FASTKD3	NA	NA	NA	NA	FASTKD3	14894	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	9544480	9544834	9544772	Y	SEMA5A	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	168	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P7	63616	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr5	14178655	14179133	14178814	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	36844	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	14208730	14209007	14208812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	66919	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	14251046	14251256	14251151	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	109235	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	16855522	16855861	16855692	Y	NA	CTB-55B8.1	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	44889	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	16927331	16927389	16927360	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	MYO10	6983	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr5	27309667	27310060	27309866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	2120902	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	32366924	32367006	32366965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR12	55809	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	37718043	37718447	37718273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	119341	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	37776965	37777327	37776998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	60461	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	37838959	37839206	37839080	Y	GDNF,GDNF,GDNF	GDNF	NA	NA	NA	NA	GDNF	1171	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	39519768	39520016	39519839	Y	DAB2	NA	DAB2	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	59366	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	41465247	41465490	41465440	Y	PLCXD3	PLCXD3	NA	NA	NA	NA	PLCXD3	43240	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	52168603	52169046	52168938	Y	PELO,ITGA1	NA	NA	NA	NA	NA	PELO	86829	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	53848607	53848967	53848787	Y	NA	SNX18	NA	NA	NA	NA	SNX18	37018	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	53886788	53887029	53886875	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	75199	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	54033914	54034212	54034128	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	222325	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	54731133	54731267	54731160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	93262	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	56784239	56784594	56784302	Y	GPBP1,ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	GPBP1	316464	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	58317891	58318186	58317997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	563804	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	669224	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	58497739	58497828	58497784	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	743652	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	60571773	60571988	60571884	Y	ZSWIM6	NA	NDUFAF2	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM6	54112	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr5	60625710	60626179	60625844	Y	ELOVL7,ZSWIM6	NA	ZSWIM6	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZSWIM6	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	60736184	60736544	60736365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	50486	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	63506762	63506909	63506842	Y	NA	RNF180	NA	NA	NA	NA	RNF180	47091	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	64062074	64062237	64062149	Y	NA	SREK1IP1,CWC27	NA	NA	NA	NA	SREK1IP1	275	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	2653	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	67437910	67437942	67437925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	71606	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr5	71424352	71424432	71424374	Y	NA	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	23291	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	72218346	72218584	72218427	Y	NA	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	31224	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	72950370	72950710	72950420	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	90859	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	73002983	73003378	73003181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	143472	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	73926262	73926632	73926507	Y	FAM169A	HEXB,ENC1	NA	NA	NA	NA	HEXB	7216	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	76103019	76103387	76103332	Y	F2RL1	F2RL1	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	9371	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	77814404	77814787	77814528	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	160065	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	77822722	77823939	77823093	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	168383	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	77835986	77836955	77836241	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	181647	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	77882234	77882399	77882291	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	181445	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	78203184	78203323	78203251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSB	76587	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	80372631	80372748	80372736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRF2	118140	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	81465137	81465359	81465307	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23	107037	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	82847701	82847887	82847796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	82417	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	83583813	83583994	83583988	Y	EDIL3	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	94251	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr5	83604677	83605057	83605023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	73188	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	83652187	83652571	83652379	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	25674	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	83668796	83668857	83668813	Y	NA	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	9388	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	83670446	83670810	83670539	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	7435	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr5	83674189	83674553	83674373	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	3692	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	83677578	83677928	83677708	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	317	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	86417910	86418259	86418047	Y	NA	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	143446	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	86653612	86653965	86653789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	52871	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	87692594	87693229	87692926	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM161B	129301	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C	26466	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	94395359	94395872	94395571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	222407	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr5	105752390	105752961	105752697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	1251635	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	110830968	110831101	110831035	Y	WDR36,CAMK4,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	15187	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	111018976	111019194	111019085	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD4	172688	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	111742657	111742758	111742708	Y	NA	EPB41L4A	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A	10255	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	112629156	112629538	112629463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	192989	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	118664608	118664762	118664738	Y	DMXL1,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	62221	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	119848516	119848911	119848640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	50543	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	344224	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	131430055	131430830	131430575	Y	RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	22572	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	131431180	131431494	131431281	Y	RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	23697	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	131774835	131775712	131775188	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.5,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.5	14429	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	133470244	133470404	133470305	Y	NA	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	21842	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	136361740	136362159	136361939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	170423	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	136477732	136478020	136477766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	286415	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	136482104	136482426	136482383	Y	SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	290787	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	136727566	136727823	136727577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	204245	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	136786191	136786446	136786319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	145622	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	136795919	136796307	136796181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	135761	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	136900041	136900222	136900186	Y	NA	SPOCK1	TRPC7	IMR90	Hi-C	24141950	SPOCK1	31846	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	137001251	137001596	137001494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL3	68183	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	66056	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	139572545	139572746	139572646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PURA	87183	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	139968065	139968565	139968419	Y	HBEGF,ANKHD1,CD14,CD14,SRA1,APBB3,SLC35A4	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3,TMCO6	NA	NA	NA	NA	APBB3	2772	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	145326011	145326414	145326305	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	11869	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	146834939	146835189	146835093	Y	DPYSL3,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	52430	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	146890135	146890280	146890247	Y	NA	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	2516	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	146947412	146947925	146947557	Y	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	59793	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	148349939	148350092	148350025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3TC2	90634	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	148591795	148592037	148591918	Y	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	57397	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	150455023	150455538	150455407	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	15600	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	151119916	151120243	151119990	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	SPARC	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	23696	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	151129219	151129502	151129338	Y	SLC36A1	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	14437	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	SGCD	423306	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	158366953	158367057	158367005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	157712	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	158491555	158491917	158491726	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	32852	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	158876999	158877252	158877089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBLCP1	188910	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	158938695	158938959	158938847	Y	EBF1	NA	ADRA1B,LOC285627,TTC1	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	250606	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	167224919	167225220	167225022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	491436	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	168229147	168229460	168229328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	187830	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	171498342	171498743	171498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	66465	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	171529769	171530204	171529991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	83186	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	171560333	171560981	171560496	Y	UBTD2,STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	52409	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	172167900	172168183	172168030	Y	UBTD2,DUSP1	DUSP1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	28015	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	172226784	172227709	172227394	Y	ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	30586	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	172304591	172304758	172304618	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	45313	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	172329840	172330200	172330006	Y	DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	53532	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	172370220	172370579	172370385	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	13153	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	172901872	172902293	172901982	Y	ATP6V0E1	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	139370	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr5	172921295	172921366	172921331	Y	NA	NA	STC2,LOC285593,BNIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	120297	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	173252274	173252478	173252451	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	60805	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr5	179038504	179038699	179038602	Y	NA	HNRNPH1	NA	NA	NA	NA	HNRNPH1	21086	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr5	179859627	179859895	179859761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6	59517	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	1702305	1702315	1702310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	93624	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	2726588	2726793	2726728	Y	SERPINB9,SERPINB1,RIPK1,NQO2	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	36855	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	5266800	5267044	5266922	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	7523	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	401666	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	8083649	8083837	8083720	Y	NA	EEF1E1	NA	NA	NA	NA	EEF1E1	16974	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	9037386	9037741	9037564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	603592	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	11139608	11139936	11139820	Y	TMEM170B,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	240645	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	11197003	11197299	11197017	Y	ERVFRD-1,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	183282	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	13354550	13354809	13354680	Y	NA	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	27735	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	13662469	13662838	13662724	Y	NA	NOL7,RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	46958	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	15436683	15436898	15436793	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	192156	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	16420932	16421664	16421198	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	184121	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	16714644	16714961	16714802	Y	NA	ATXN1	NA	NA	NA	NA	ATXN1	44761	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	ATXN1	NA	NA	NA	NA	ATXN1	18105	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	17473157	17473283	17473220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	56600	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	17712711	17712926	17712817	Y	NA	NUP153	FAM8A1,NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	8055	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	17948397	17948663	17948653	Y	NA	KIF13A	NA	NA	NA	NA	KIF13A	37191	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	18342517	18342875	18342695	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	23904	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	19805542	19805809	19805569	Y	NA	RP4-625H18.2,ID4	ID4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP4-625H18.2	2559	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	20811412	20811642	20811580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	278724	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr6	22072015	22072158	22072069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	480043	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	24313904	24313964	24313914	Y	DCDC2,KAAG1,DCDC2	DCDC2	NA	NA	NA	NA	DCDC2	42316	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	24879563	24879866	24879842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP29	94781	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAHP	70052	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	25303199	25303368	25303284	Y	NA	LRRC16A	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	25893	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	26474010	26474599	26474187	Y	NA	BTN3A3,BTN2A1,HCG11	NA	NA	NA	NA	BTN2A1	17860	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H2AH	43410	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZSCAN12P1,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12P1	15544	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	28280351	28280639	28280495	Y	NA	PGBD1,ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	PGBD1	33037	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	28805076	28805418	28805247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM27	84348	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.50668963362142
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8,AGPAT1,RNF5,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA	NA	NA	NA	NA	HLA-DMA	21166	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	35159725	35159966	35159851	Y	TAF11,DEF6	NA	UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11,TAF11	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF76	64720	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	36321421	36321620	36321472	Y	CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD20	86924	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	36786044	36786391	36786334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf89	51255	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	37424991	37425195	37425093	Y	NA	CCDC167	CCDC167	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC167	40503	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	38122967	38123257	38123161	Y	ZFAND3,BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	337692	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	38400132	38400305	38400246	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	205619	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	41674655	41674829	41674723	Y	TREM1,TFEB	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	27168	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	41929474	41929675	41929644	Y	NA	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	42548	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	42283764	42284050	42283900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	100161	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	82898	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	80166	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	44031882	44032664	44032378	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	59987	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	45092657	45092762	45092710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX2	201132	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	45299904	45300369	45300004	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	6010	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	45301191	45301441	45301316	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	7297	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	45338943	45339150	45338952	Y	RUNX2	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	4540	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	45404651	45404813	45404715	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	60961	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	45618234	45618676	45618425	Y	RUNX2	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	274544	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	52339756	52339820	52339788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	56650	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	52376478	52376751	52376615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62962	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	52416960	52417092	52417044	Y	GSTA5,PAQR8	TRAM2	NA	NA	NA	NA	TRAM2	22621	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	52461371	52461586	52461469	Y	NA	TRAM2	EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRAM2	21658	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	53195071	53195341	53195324	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	16606	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	53660581	53660848	53660781	Y	LRRC1	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	3286	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	53734127	53734150	53734138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	76832	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	COL21A1	NA	NA	NA	NA	COL21A1	39521	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	56573677	56574046	56573938	Y	NA	NA	DST,BEND6,ZNF451	IMR90	Hi-C	24141950	DST	243380	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	56594458	56594846	56594652	Y	NA	NA	DST,BEND6,KIAA1586,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	DST	222580	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	56779787	56780031	56779873	Y	NA	DST,BEND6	BAG2,ZNF451,BEND6,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	DST	37395	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	56811664	56812033	56811848	Y	NA	DST,BEND6	BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DST	5393	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	71133094	71133376	71133235	Y	NA	FAM135A	NA	NA	NA	NA	FAM135A	12450	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	71906987	71907342	71907159	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30A	IMR90	Hi-C	24141950	OGFRL1	89164	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	72103028	72103231	72103130	Y	NA	LINC00472	NA	NA	NA	NA	LINC00472	25241	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	73354930	73355043	73354987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	615895	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	73524800	73525128	73524864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	445810	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	75325664	75325910	75325787	Y	NA	NA	CD109,COL12A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL12A1	587857	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	76494746	76495208	76494920	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	37837	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	79779425	79779709	79779568	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	6244	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	81044945	81045591	81045323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	230581	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	83307766	83307938	83307852	Y	NA	NA	UBE3D,IBTK	IMR90	Hi-C	24141950	TPBG	236843	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	83931407	83931579	83931543	Y	UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	IMR90	Hi-C	24141950	PGM3	29752	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	84877511	84877669	84877594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	57684	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	89440448	89440768	89440686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	230580	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1,SRSF12	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	90695509	90695956	90695679	Y	BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	157896	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	90995736	90996093	90996004	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	8534	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	325188	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	99382979	99383150	99383065	Y	NA	FBXL4	NA	NA	NA	NA	FBXL4	10699	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	102251136	102251209	102251173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	923888	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	105388915	105389637	105389155	Y	HACE1	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	83121	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	106217867	106218170	106217999	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	314025	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	106258484	106259193	106259052	Y	NA	NA	ATG5,PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	273002	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	107773333	107773402	107773368	Y	SOBP	PDSS2,SOBP	NA	NA	NA	NA	PDSS2	5366	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	110018501	110018834	110018668	Y	NA	FIG4	NA	NA	NA	NA	FIG4	8002	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	111748625	111749047	111748803	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	53667	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	112110273	112110463	112110418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	82192	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	112163238	112163349	112163330	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	29306	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	112525181	112525504	112525289	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	48637	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	113975639	113976185	113975774	Y	MARCKS	NA	MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	200356	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	114005806	114006016	114005966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	170525	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	114662587	114662962	114662866	Y	NA	HS3ST5	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	378	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	114866496	114866590	114866545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	204287	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	116731085	116731228	116731157	Y	NA	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	49305	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	117785630	117785714	117785673	Y	NA	DCBLD1	DCBLD1,GOPC,ROS1	IMR90	Hi-C	24141950	DCBLD1	12650	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	121399720	121399938	121399829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	354900	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	229556	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	128577381	128577403	128577392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	262467	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	129250577	129251100	129251039	Y	NA	LAMA2	NA	NA	NA	NA	LAMA2	48235	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	129768788	129769141	129769019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	260229	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	130453386	130453776	130453491	Y	L3MBTL3,SAMD3,SAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	120542	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	130499525	130499533	130499529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	166681	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	130922387	130922557	130922422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM200A	237508	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	133837061	133837238	133837150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	277325	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	134636367	134636606	134636545	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	644	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	134741718	134742020	134741875	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104468	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	134743944	134744382	134744175	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	106694	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	135707385	135707414	135707388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00271	109075	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	136813959	136814231	136814138	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	55726	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	138023530	138023872	138023701	Y	OLIG3	NA	TNFAIP3,IFNGR1,PERP	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	162479	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	139812084	139812114	139812099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	118327	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	140029935	140030328	140030123	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	336178	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	140069895	140070090	140070024	Y	NA	NA	CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	376138	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr6	140400470	140400745	140400517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	706713	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	141873662	141873944	141873832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	592423	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	143124343	143124671	143124507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	139667	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	143154152	143154557	143154355	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	109781	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	143163714	143164598	143164218	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	99740	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	143234166	143234456	143234293	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	29882	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	143248323	143248614	143248469	Y	NA	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	15724	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	144284201	144284585	144284512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	99150	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	144481002	144481382	144481026	Y	PLAGL1,STX11	NA	NA	NA	NA	NA	SF3B5	66248	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	148443958	148444368	148444103	Y	NA	NA	SAMD5	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	147072	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	148588961	148589218	148589102	Y	UST	SASH1	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	2222	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr6	148704148	148704305	148704200	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	112708	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	149080716	149081059	149080880	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	14252	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	149829691	149830032	149829852	Y	LATS1,KATNA1,TAB2,SUMO4,ZC3H12D,PPIL4	PPIL4	NA	NA	NA	NA	PPIL4	35142	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	152085145	152085342	152085266	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	ESR1	109319	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	152495125	152495413	152495269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	461523	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	152889271	152889451	152889361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	67485	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	153358098	153358156	153358117	Y	SYNE1,RGS17	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	36278	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	157411919	157412211	157412008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	314856	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	159229924	159230242	159230166	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	8202	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	32527	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	35481	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	159498189	159498579	159498308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPH3	78970	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	161855973	161856365	161856002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	162880	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr6	162572071	162572234	162572145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARK2	574569	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	163840967	163841346	163841003	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	7935	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	169572627	169572772	169572742	Y	NA	RP11-417E7.1	THBS2,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	11608	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	89354	89662	89513	Y	NA	NA	FAM20C,HEATR2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20C	101307	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	968255	968622	968448	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	24421	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	2101889	2102279	2102085	Y	ELFN1	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	168599	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	2154470	2154643	2154557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	116235	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	2351826	2352447	2352374	Y	SNX8	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	39274	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	2356665	2356933	2356799	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	34788	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	3307587	3307977	3307629	Y	NA	SDK1	SDK1	IMR90	Hi-C	24141950	SDK1	31103	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	4765280	4765661	4765569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83892	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	AC073343.13,ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	7268746	7268912	7268835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	74181	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	7984706	7984926	7984839	Y	GLCCI1	GLCCI1	RPA3,LOC729852	IMR90	Hi-C	24141950	GLCCI1	21499	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	13368007	13368354	13368181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	643526	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	13700759	13700990	13700876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	328060	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	17564000	17564574	17564249	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	227019	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	18443957	18444129	18444043	Y	HDAC9,HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	319385	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	18483962	18483986	18483974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	359390	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	18563504	18563902	18563528	Y	HDAC9,HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	438932	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	18678711	18679112	18678888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	476183	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	20516668	20517013	20516807	Y	ITGB8	NA	TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB8	148343	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	21502446	21502711	21502550	Y	SP4	SP4	NA	NA	NA	NA	SP4	36794	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	22631710	22632105	22631870	Y	IL6	STEAP1B	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	38439	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	22740240	22740629	22740473	Y	IL6	IL6,AC073072.5	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	22874	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	24739704	24740021	24739930	Y	DFNA5,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	67223	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	24860577	24860798	24860662	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53333	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	24882463	24882674	24882596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	75219	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	28000804	28001209	28000940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	216732	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	28192724	28193110	28193000	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	24831	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	29903782	29904130	29903956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WIPF3	59680	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	32090584	32090879	32090675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	246062	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	32133021	32133498	32133272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	203443	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	37071492	37071821	37071657	Y	AOAH,ELMO1,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	643758	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	39695521	39695649	39695585	Y	NA	RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	34439	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	40580986	40581112	40581049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	593350	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	43821678	43821920	43821805	Y	DBNL,BLVRA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	25399	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	44085815	44086626	44086335	Y	STK17A,DBNL,POLM	POLR2J4,DBNL,POLM	NA	NA	NA	NA	DBNL	3576	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	47390589	47390737	47390670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	229419	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	47496897	47497228	47497063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	122928	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.50668963362142
chr7	47517591	47517776	47517700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	102380	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr7	47521562	47522093	47521877	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	98063	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr7	47553531	47553930	47553845	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	66226	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	47823605	47823820	47823740	Y	TNS3	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	9069	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	55543241	55543436	55543358	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95245	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	65790150	65790379	65790243	Y	RABGEF1,KCTD7,TPST1	NA	LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	TPST1	121964	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	69215481	69215818	69215531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	153576	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	70206735	70207047	70206891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	388108	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	70953472	70953588	70953527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	358317	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	80399893	80400101	80400015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	149574	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	81582871	81583219	81583134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	487895	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	86637666	86638039	86637853	Y	NA	KIAA1324L	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	48976	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	92233387	92233691	92233548	Y	NA	FAM133B	FAM133B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	15679	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	92264263	92264527	92264407	Y	SAMD9	FAM133B	FAM133B	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	46555	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	92271044	92271426	92271360	Y	SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	53336	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	92290698	92291011	92290856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	72990	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	92384322	92384817	92384698	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	78980	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	92392967	92393205	92393086	Y	PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9,CDK6,CDK6	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	AC002454.1	70592	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	94021237	94021945	94021560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL1A2	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	94799053	94799326	94799190	Y	PPP1R9A,PPP1R9A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	73514	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	100342957	100343164	100343095	Y	NA	POP7	NA	NA	NA	NA	POP7	41281	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	101596326	101596693	101596419	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	139367	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	53622	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	104608110	104608364	104608281	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	43127	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	105705488	105705603	105705542	Y	NA	SYPL1	ATXN7L1,SYPL1,CDHR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	45419	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	119692917	119693243	119693083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	803213	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	127665265	127665386	127665326	Y	NA	LRRC4	NA	NA	NA	NA	LRRC4	4774	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.50668963362142
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	129095634	129096008	129095821	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RNU1-72P	26337	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	129598516	129598781	129598654	Y	NRF1,UBE2H,UBE2H	UBE2H	UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UBE2H	7727	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	45656	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	130669444	130669692	130669631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	73375	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	130795999	130796263	130796171	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	3064	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	132488555	132488726	132488642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	157108	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	134514825	134515095	134514960	Y	STRA8	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	87822	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	134540961	134541304	134541061	Y	CALD1	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	113958	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	134550071	134550586	134550435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL3	118673	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	134555607	134555837	134555722	Y	CALD1,STRA8	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL3	113422	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	137659854	137660135	137660099	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	24678	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	137685065	137685809	137685664	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	252	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	142191082	142191483	142191195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRBJ2-2P	300898	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	149266694	149267035	149266833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF767	52808	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	151068443	151068736	151068590	Y	SMARCD3,CRYGN,WDR86	NUB1	NA	NA	NA	NA	NUB1	31658	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	151157060	151157432	151157203	Y	NA	NA	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	57774	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	151806252	151806472	151806362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	85493	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	151955	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr7	154958521	154958650	154958585	Y	NA	NA	PAXIP1,HTR5A,LOC100128264,CNPY1	IMR90	Hi-C	24141950	INSIG1	128836	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	155580383	155580450	155580415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009403.2	144484	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	157054104	157054271	157054188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	71042	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	6405382	6405492	6405403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	143269	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	8878847	8879137	8878870	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	21190	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	24343	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	11036366	11036550	11036458	Y	MTMR9,XKR6	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	20325	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	11337266	11337614	11337440	Y	FAM167A	NA	C8orf12,BLK	IMR90	Hi-C	24141950	GATA4	194854	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	11560575	11560973	11560829	Y	GATA4	GATA4	NA	NA	NA	NA	GATA4	28107	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	12608373	12608831	12608472	Y	NA	LONRF1	NA	NA	NA	NA	LONRF1	2751	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	17893767	17894158	17893964	Y	NAT1,ASAH1,ASAH1	CTD-2547L16.1,ASAH1	NA	NA	NA	NA	CTD-2547L16.1	46219	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	18585215	18585382	18585299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	354858	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr8	18722659	18722821	18722740	Y	PSD3	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	217419	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	18768857	18769292	18769046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	170948	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	18836263	18836433	18836318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	103807	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	18874321	18874582	18874494	Y	PSD3	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	65658	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	5.43116087284641
chr8	18951503	18951869	18951728	Y	NA	PSD3	LOC100128993,CSGALNACT1,INTS10,PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	11263	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	20125746	20125979	20125927	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	33495	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	22240884	22241560	22241218	Y	C8orf58	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	18122	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	22516346	22516607	22516450	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	8054	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	22522684	22522941	22522886	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	1720	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	12228	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	23020215	23020436	23020325	Y	NA	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	672	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	23202733	23203217	23203148	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	77100	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	23405243	23405645	23405476	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	20925	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	24013716	24014104	24013764	Y	STC1	NA	STC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-148P	81045	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	25092167	25092564	25092364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	51929	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	25096912	25097126	25097024	Y	DOCK5	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	56674	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	25186094	25186253	25186181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD9	127739	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	26466894	26467238	26467101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	97103	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	28193434	28193777	28193606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF395	64441	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr8	28884105	28884486	28884217	Y	HMBOX1,HMBOX1	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	26966	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	28930417	28930501	28930459	Y	NA	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	18965	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	30015593	30015700	30015665	Y	NA	RPS15AP24,DCTN6	NA	NA	NA	NA	DCTN6	3780	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	30280646	30281238	30280961	Y	MBOAT4	RBPMS	NA	NA	NA	NA	RBPMS	40702	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.76003445043213
chr8	37002327	37002551	37002443	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.6	369988	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2,PLAT	NA	NA	NA	NA	PLAT	9107	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	54798731	54798762	54798749	Y	NA	ATP6V1H,RGS20	NA	NA	NA	NA	RGS20	36363	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	45981	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-101P	945488	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	72835218	72835410	72835314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSC	80515	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	74432524	74433240	74432853	Y	C8orf84,RDH10	NA	NA	NA	NA	NA	STAU2	224703	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	81933989	81934508	81934361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	87795	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	NA	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	PAG1	145047	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	90845997	90846144	90846052	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSGIN2	65943	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	90899646	90899998	90899819	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	12089	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	91237897	91238158	91237933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBN	224441	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	92112003	92112264	92112167	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	31579	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	94928107	94928427	94928252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	60072	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	94971751	94971853	94971800	Y	GEM	NA	RBM12B,FAM92A1,PDP1,TMEM67,MIR378D2,RAD54B,C8orf39,LINC00535	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDP1	103716	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	95786265	95786660	95786406	Y	RAD54B,KIAA1429	INTS8	NA	NA	NA	NA	INTS8	36879	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	97873455	97873860	97873757	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	369876	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	98045362	98045723	98045714	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	242453	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	98843281	98843693	98843349	Y	POP1	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31589	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	102110720	102110996	102110973	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	FLJ42969	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF706	105425	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	103757592	103757997	103757773	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	91462	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	2.08890802801785
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	51244	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	CTHRC1,DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	106511726	106511821	106511774	Y	ZFPM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	182806	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	107059911	107060047	107059923	Y	NA	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	10705	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	109455148	109455290	109455182	Y	NA	EIF3E	NA	NA	NA	NA	EIF3E	9586	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	110647152	110647483	110647459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	54537	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	114266349	114266595	114266472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	120303	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	116450341	116450508	116450425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	369391	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	117456775	117457003	117456919	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	319739	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	117883999	117884137	117884073	Y	UTP23,RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	MIR3610	902	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	118801002	118801354	118801210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	270050	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	118969079	118969407	118969255	Y	MED30	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	152685	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	119013126	119013396	119013387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	108696	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	119023512	119024035	119023740	Y	EXT1	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	98057	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr8	119049251	119049636	119049444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	72456	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr8	119071597	119071694	119071650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	50398	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	119313185	119313253	119313219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	191093	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr8	119395540	119395777	119395661	Y	EXT1	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	236457	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	119485123	119485454	119485409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	146780	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	119781554	119781682	119781618	Y	NA	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	9114	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	119917519	119917835	119917587	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	44604	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	121822442	121823157	121823030	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	356	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	123983848	123983920	123983884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	68743	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	124337288	124337362	124337325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX1	51507	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	80121	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	126187320	126187484	126187432	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	85238	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	126354343	126354802	126354718	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	85761	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	126649729	126649959	126649891	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	209166	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	127387635	127388005	127387836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	180115	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	128821272	128821652	128821500	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	16493	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	129061512	129061955	129061598	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	40655	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	306817	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	131058084	131058195	131058140	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30709	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	131134027	131134054	131134041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	106652	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	131148484	131148822	131148654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	121109	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr8	131289962	131290145	131290029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	163761	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	131456841	131457348	131457080	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	2935	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	132928633	132929053	132928845	Y	NA	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	14298	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	133765736	133766089	133765913	Y	SLA,TMEM71,PHF20L1	TMEM71,PHF20L1	NA	NA	NA	NA	TMEM71	4869	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr8	136587606	136587905	136587756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	119906	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	141212639	141212826	141212733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	253852	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	142031986	142032097	142032042	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	21671	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	142289630	142289814	142289772	Y	NA	SLC45A4	SLC45A4,PTK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	26590	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	144032047	144032423	144032233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY6E	64976	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	749759	749963	749884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	281468	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	3971837	3971870	3971849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	374522	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	4296901	4297617	4297146	Y	GLIS3	GLIS3	NA	NA	NA	NA	GLIS3	48775	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	5451547	5451984	5451704	Y	JAK2,KIAA1432,CD274	CD274	NA	NA	NA	NA	CD274	3044	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	5556456	5556542	5556499	Y	CD274,KIAA1432	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	47911	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	5895206	5895407	5895334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	64089	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	10027810	10028140	10027960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	1316499	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	16515842	16516452	16516406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	208360	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	16521914	16522385	16522163	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	202427	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	16709928	16710291	16710201	Y	NA	RP11-62F24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	14521	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	16854631	16854704	16854668	Y	NA	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	14137	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	138853	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	21699320	21699393	21699347	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	141652	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1642036	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	33023891	33023961	33023926	Y	NA	APTX,DNAJA1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	682	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	33931170	33931493	33931332	Y	UBAP1,UBE2R2	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	115454	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	34193349	34193568	34193460	Y	NA	UBAP1,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	16346	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	36040345	36040403	36040371	Y	NA	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	5915	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	107013	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	38016375	38016730	38016641	Y	NA	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49954	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr9	71825244	71825637	71825441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	91035	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	72837972	72838313	72838181	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	33624	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	72871058	72871439	72871223	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	498	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	79303501	79303668	79303622	Y	GCNT1	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	118770	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	88294983	88295025	88294997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	59919	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	88474562	88474738	88474650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA35	79323	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	94123007	94123342	94123181	Y	NA	AUH	NA	NA	NA	NA	AUH	812	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	95288173	95288480	95288343	Y	NA	ASPN,ECM2	NA	NA	NA	NA	ECM2	8457	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	97273853	97274253	97274073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBP1	126278	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	97624826	97625112	97624969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	137843	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	97672080	97672130	97672087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	185097	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	100841115	100841498	100841123	Y	C9orf156	NANS,TRIM14	NA	NA	NA	NA	NANS	24094	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	101868249	101868435	101868378	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	3929	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	101871896	101872113	101872024	Y	TGFBR1	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	7576	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	102621794	102622137	102621866	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3,STX17	NA	NA	NA	NA	NR4A3	39657	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	107510718	107511248	107511059	Y	ABCA1,NIPSNAP3A	NIPSNAP3A,NIPSNAP3B	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3A	2749	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	59864	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF4	261390	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	204314	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	112827825	112828236	112827913	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	188684	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	112864001	112864218	112864083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	152702	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	112937115	112937268	112937191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	79652	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	114811444	114811737	114811486	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123951	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr9	116437693	116438045	116437945	Y	BSPRY,ZNF618	NA	RGS3,POLE3,C9orf43	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF618	198517	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	117657108	117657611	117657338	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	220925	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	117774488	117774830	117774662	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	103706	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	475416	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478870	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	118917854	118918405	118917899	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	3771	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	118924041	118924437	118924245	Y	NA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	9958	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	118993225	118993558	118993231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	79142	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chr9	120576644	120576954	120576806	Y	TLR4	NA	NA	NA	NA	NA	TLR4	112034	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	123346430	123346633	123346540	Y	TRAF1	CDK5RAP2	CDK5RAP2	K562	ChIA-PET	22265404	CDK5RAP2	5982	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	124161523	124161647	124161545	Y	NA	STOM	GSN,RAB14,GGTA1P,CNTRL,STOM	IMR90	Hi-C	24141950	STOM	30992	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	126237774	126237937	126237796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRB2	121325	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	127029560	127030143	127029899	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	11675	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	13790	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	130733540	130734011	130733863	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	6781	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	130834459	130834744	130834726	Y	NA	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	5974	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	131136560	131136899	131136687	Y	NA	SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4962	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	131900982	131901116	131901071	Y	ENDOG,PHYHD1,CRAT,IER5L	PPP2R4,CRAT,IER5L	NA	NA	NA	NA	CRAT	29514	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	132992988	132992995	132992992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCS1	60131	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	ABL1	148912	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	234260	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chr9	136580491	136580641	136580566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	238232	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	139445894	139446087	139445949	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	7230	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	3.34225284482856
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.67112642241428
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	1514556	1514901	1514870	Y	ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	4939	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	2626782	2627186	2626915	Y	ZBED1,ZBED1,DHRSX,CD99	CD99	NA	NA	NA	NA	CD99	19562	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	2845714	2845991	2845779	Y	NA	ARSD,ARSE	NA	NA	NA	NA	ARSD	322	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	9477403	9477544	9477474	Y	FAM9B,TBL1X,LOC100288814	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	48068	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	12996986	12997135	12997061	Y	TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5759	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	13128879	13129151	13129129	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	137652	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	13138325	13138351	13138340	Y	NA	NA	FAM9C,LOC100133123,TMSB4X	IMR90	Hi-C	24141950	TMSB4X	147098	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	23368174	23368523	23368350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	311856	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	23971140	23971524	23971479	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	47083	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	39767458	39767957	39767519	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	122068	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	41480372	41480697	41480463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	289721	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	NDP	57840	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	45366261	45366615	45366438	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	237079	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	45647781	45648040	45647909	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	43251	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	45666059	45666529	45666404	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42391	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	46524990	46525241	46525097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A7	91249	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chrX	64816232	64816499	64816342	Y	NA	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	9975	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	64891840	64892073	64891978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	85583	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	69655002	69655313	69655257	Y	DLG3	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	146638	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	73228588	73229157	73228689	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	66429	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	73791399	73791714	73791557	Y	RLIM	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	40738	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	74370869	74370931	74370900	Y	NA	ABCB7	NA	NA	NA	NA	ABCB7	3636	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	79827525	79827860	79827693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	235327	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	79828855	79829064	79828956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	234123	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	99903962	99904188	99904076	Y	SRPX2	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	6747	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	102651183	102651525	102651372	Y	NA	WBP5,NGFRAP1	NA	NA	NA	NA	NGFRAP1	21915	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	103120032	103120203	103120118	Y	TCEAL1,ZCCHC18,RAB9B	RAB9B	NA	NA	NA	NA	RAB9B	34874	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM41	235155	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.83556321120714
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	109017803	109018393	109018148	Y	NA	ACSL4	NA	NA	NA	NA	ACSL4	43171	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	193880	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	1.25334481681071
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	139855409	139855570	139855490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	413740	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357
chrX	149084401	149084780	149084588	Y	NA	LINC00894,CXorf40B	NA	NA	NA	NA	LINC00894	20066	CAGE	KGN	hg19	FANTOM5	0.41778160560357