chr1 994198 994452 994303 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA RP11-465B22.3 1084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 1136075 1136463 1136398 Y HES4,ISG15 TNFRSF18,TNFRSF4,SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA TNFRSF18 3608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 1136667 1137146 1136877 Y HES4,MIB2 TNFRSF18,TNFRSF4,SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA TNFRSF18 2925 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 1611804 1612115 1611960 Y NA CDK11B,CDK11A NA NA NA NA CDK11B 23331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 2135885 2136186 2135927 Y NA C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 5973 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 2177615 2177829 2177732 Y NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 35456 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 2221868 2222548 2222316 Y TNFRSF14,SKI NA NA NA NA NA C1orf86 79709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 2232428 2232896 2232683 Y SKI,TNFRSF14 NA NA NA NA NA MORN1 88250 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.81501065459833 chr1 2509702 2510198 2509855 Y SKI,TNFRSF14 TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA FAM213B 5732 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 2574079 2574144 2574101 Y NA NA NA NA NA NA FAM213B 58149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 2804922 2805288 2805103 Y NA NA PRDM16 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00982 177713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr1 3232812 3232866 3232839 Y PRDM16 NA NA NA NA NA PRDM16 249080 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 3514172 3514403 3514294 Y TP73,MEGF6 MEGF6,TPRG1L NA NA NA NA MEGF6 11656 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 3594206 3594277 3594248 Y MEGF6,WRAP73,TP73,TP73 TP73,WRAP73 NA NA NA NA WRAP73 26881 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 6088225 6088518 6088328 Y TNFRSF25,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 37692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 6803995 6804151 6804092 Y NA DNAJC11,RP11-312B8.1,CAMTA1 CAMTA1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-312B8.1 38752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 7558449 7558725 7558667 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 270604 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 7709088 7709360 7709208 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 119969 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 8001518 8001767 8001698 Y NA TNFRSF9,PARK7 NA NA NA NA TNFRSF9 2592 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 8571636 8571856 8571737 Y SLC45A1,RERE NA NA NA NA NA RERE 303846 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 8720526 8720683 8720608 Y NA NA NA NA NA NA RERE 155019 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 8724042 8724475 8724233 Y NA NA NA NA NA NA RERE 151227 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 9291783 9292106 9291820 Y NA H6PD H6PD,GPR157,SLC2A5,SLC2A7,MIR34A,SPSB1,SLC25A33,TMEM201 IMR90 Hi-C 24141950 H6PD 728 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 9473687 9473864 9473791 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33 IMR90 Hi-C 24141950 SPSB1 122748 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 9486434 9486788 9486620 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 110753 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 9687482 9687636 9687558 Y NA TMEM201,PIK3CD NA NA NA NA PIK3CD 22154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 9689223 9689588 9689280 Y PIK3CD TMEM201,PIK3CD NA NA NA NA PIK3CD 20202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 9700704 9700713 9700707 Y PIK3CD PIK3CD,RP11-558F24.4 NA NA NA NA PIK3CD 9077 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 9840833 9841244 9840865 Y NA CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 41340 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 10127211 10127315 10127266 Y KIF1B UBE4B NA NA NA NA UBE4B 36321 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 10261395 10261566 10261473 Y KIF1B KIF1B NA NA NA NA KIF1B 7297 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 10269964 10270260 10269995 Y RBP7,PGD,KIF1B KIF1B NA NA NA NA KIF1B 1101 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 10821450 10821813 10821706 Y NA CASZ1 NA NA NA NA CASZ1 32894 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 10864514 10864918 10864748 Y NA CASZ1 PEX14,CASZ1 IMR90 Hi-C 24141950 CASZ1 9807 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 11050864 11051128 11051022 Y NA TARDBP C1orf127 IMR90 Hi-C 24141950 TARDBP 19286 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 11841016 11841080 11841048 Y NA AGTRAP,CLCN6,MTHFR NA NA NA NA CLCN6 23127 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 12126084 12126429 12126131 Y MIIP,TNFRSF8 MIIP,TNFRSF8 NA NA NA NA TNFRSF8 4650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 12210430 12211346 12210689 Y FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 13714 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 12243852 12244671 12244387 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D TNFRSF1B,VPS13D VPS13D IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1B 18792 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 12533412 12533678 12533545 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 142059 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 15575633 15576067 15575825 Y PLEKHM2,EFHD2,TMEM51,TMEM51,FHAD1 NA NA NA NA NA TMEM51 98605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 15664580 15664866 15664723 Y FBLIM1 NA EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B IMR90 Hi-C 24141950 EFHD2 69525 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 16030221 16030623 16030258 Y NA PLEKHM2 NA NA NA NA PLEKHM2 21394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 16292565 16293101 16292653 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 7526 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr1 17518130 17518260 17518142 Y NA NA NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI2 74182 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 19278388 19278892 19278719 Y UBR4,IFFO2 IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 2288 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 19796024 19796128 19796080 Y NA CAPZB NA NA NA NA CAPZB 13938 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 19803913 19804113 19803998 Y PLA2G2E,TMCO4,UBR4 CAPZB NA NA NA NA CAPZB 5953 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 19837772 19837831 19837816 Y NA CAPZB CAPZB,C1orf151-NBL1 IMR90 Hi-C 24141950 CAPZB 27706 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 19926811 19926972 19926927 Y TMCO4 RP5-1056L3.1,MINOS1,RPS14P3,NBL1 NA NA NA NA MINOS1 5334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 20111066 20111358 20111348 Y NA TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 13080 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 20358851 20359226 20358857 Y PLA2G2A NA VWA5B1,PLA2G2C,UBXN10 IMR90 Hi-C 24141950 RP3-340N1.2 119605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 20790470 20790828 20790649 Y NA MUL1 NA NA NA NA MUL1 41826 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 20930711 20931037 20930891 Y CDA CDA,PINK1 PINK1 IMR90 Hi-C 24141950 CDA 17270 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 21348947 21349299 21348998 Y CDA,ECE1,ECE1 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48947 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 21514333 21514464 21514390 Y KIF17,EIF4G3 EIF4G3 DDOST,KIF17,HP1BP3,SH2D5,EIF4G3 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4G3 12956 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 21611199 21611583 21611510 Y EIF4G3,ECE1,ALPL,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 58414 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 22236410 22236692 22236686 Y NA RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA RP11-26H16.1 3819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 22366226 22366841 22366516 Y USP48,ZBTB40 LINC00339,CDC42 CDC42 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42 10279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 23387479 23387794 23387637 Y ZNF436 KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 43538 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 24063897 24064210 24064053 Y PNRC2,RPL11 RPL11,TCEB3,PITHD1 RPL11 IMR90 Hi-C 24141950 TCEB3 3435 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 24237439 24237588 24237532 Y RPL11,PNRC2,FUCA1,CNR2 FUCA1,RP11-4M23.4,CNR2 NA NA NA NA RP11-4M23.4 36285 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 24833128 24833464 24833216 Y RUNX3,NIPAL3,SRRM1,RCAN3 RCAN3 NA NA NA NA RCAN3 5741 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 24970685 24970736 24970725 Y NA SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 14478 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 25242853 25242883 25242866 Y NA RUNX3 NA NA NA NA RUNX3 46729 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 25247095 25247311 25247210 Y NA RUNX3 CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 42301 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 25281668 25281921 25281754 Y NA RUNX3 NA NA NA NA RUNX3 7691 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 25355154 25355297 25355192 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 65542 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 25360165 25361177 25360621 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 70553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.25200852367867 chr1 25361269 25361784 25361393 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 71657 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 25425738 25426059 25426056 Y NA NA RUNX3,IL22RA1,CLIC4,SRRM1,SYF2 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 130934 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr1 25559638 25560067 25559796 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 SYF2 NA NA NA NA SYF2 2645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 25855984 25856012 25855998 Y NA LDLRAP1 MAN1C1,LDLRAP1,TMEM57,C1orf135,FAM54B,RHCE,SEPN1 IMR90 Hi-C 24141950 LDLRAP1 12059 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 26337765 26338024 26337895 Y PAQR7,ZNF683 PAFAH2 PAQR7,STMN1,EXTL1 IMR90 Hi-C 24141950 PAFAH2 15117 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 26452850 26453250 26452988 Y FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L PDIK1L,ZNF593 NA NA NA NA PDIK1L 17186 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 26613887 26614371 26614050 Y FAM54B,PDIK1L,RPS6KA1,HMGN2,ARID1A,CD52 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 10220 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 26616527 26617019 26616745 Y ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 12860 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 26634832 26635080 26634851 Y NA SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA CD52 7368 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A HMGN2,RPS6KA1 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPS6KA1 26383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 27154983 27155478 27155098 Y WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18 PIGV,ZDHHC18 NA NA NA NA ZDHHC18 3782 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr1 27289282 27289295 27289289 Y NA FAM46B NA NA NA NA FAM46B 48032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 FAM46B C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46B 46630 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 27926165 27926491 27926331 Y NA AHDC1,FGR NA NA NA NA AHDC1 2451 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 27926949 27927449 27927117 Y NA AHDC1,FGR NA NA NA NA AHDC1 1493 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 28152962 28153213 28153036 Y NA PPP1R8 NA NA NA NA PPP1R8 2076 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 28189568 28190269 28189912 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38 PPP1R8,RPA2 NA NA NA NA PPP1R8 34279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 28355043 28355235 28355139 Y NA NA NA NA NA NA EYA3 57972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 28437697 28438098 28437903 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3 EYA3 PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566 IMR90 Hi-C 24141950 EYA3 24490 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 28439074 28439949 28439426 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3 EYA3 PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566 IMR90 Hi-C 24141950 EYA3 25867 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 28454216 28454379 28454304 Y FGR,STX12,C1orf38,XKR8,EYA3,SESN2,MED18,PTAFR,PTAFR,DNAJC8 EYA3 NA NA NA NA EYA3 41009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 28495580 28496044 28495868 Y STX12,C1orf38,EYA3,SESN2,MED18,GMEB1,PTAFR,PTAFR,DNAJC8 PTAFR,AL353354.1 NA NA NA NA PTAFR 22403 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 28640564 28640739 28640692 Y C1orf38,XKR8,PTAFR,PTAFR,TAF12,GMEB1,SESN2,MED18 MED18 MED18 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED18 12774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 31231730 31232072 31231886 Y NA LAPTM5 NA NA NA NA LAPTM5 3063 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 31241795 31242280 31242065 Y LAPTM5 LAPTM5 PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3 IMR90 Hi-C 24141950 LAPTM5 13128 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 31770743 31770927 31770835 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 2901 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 31943761 31943827 31943813 Y NA RP11-439L8.3 SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-439L8.3 26014 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr1 31956203 31956482 31956384 Y PEF1 RP11-439L8.3 SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-439L8.3 13359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 32715599 32716062 32715681 Y PTP4A2,BSDC1,LCK,LCK IQCC,EIF3I,TMEM234,LCK,HDAC1 NA NA NA NA LCK 759 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 33428474 33429020 33428770 Y NA RNF19B NA NA NA NA RNF19B 188 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 34462454 34462825 34462727 Y CSMD2,HMGB4 NA NA NA NA NA ZSCAN20 526208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 36183411 36183689 36183588 Y C1orf216 C1orf216,CLSPN NA NA NA NA C1orf216 338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 36428229 36428381 36428320 Y STK40,EIF2C4,THRAP3,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 124095 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 36617554 36617914 36617691 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 1266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 36641160 36641451 36641218 Y NA TRAPPC3,MAP7D1,THRAP3 NA NA NA NA MAP7D1 21980 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 38312444 38312820 38312535 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 10472 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 38317043 38317898 38317556 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 5394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 38958971 38959191 38959076 Y AKIRIN1 NA NA NA NA NA RRAGC 364304 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 39357087 39357474 39357146 Y MACF1,GJA9 RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP NA NA NA NA MYCBP 11798 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA NA HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIT1 82063 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 40504860 40505165 40505013 Y ZNF684,ZNF642,DEM1,BMP8B,PPT1,CAP1 CAP1 NA NA NA NA CAP1 955 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 40628781 40629153 40628997 Y NA RLF NA NA NA NA RLF 3736 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 40847285 40847634 40847387 Y NA SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 38763 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 40848967 40849502 40849291 Y MFSD2A,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 40445 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 40851431 40851768 40851472 Y CAP1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 42909 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 41952015 41952273 41952132 Y EDN2 NA NA NA NA NA SCMH1 246189 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 42071739 42071927 42071841 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 365913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 370805 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 4.87935180130378 chr1 42149945 42149960 42149949 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 349636 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 42192975 42193489 42193266 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 306107 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 42268599 42269123 42268799 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 230473 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 42356899 42357259 42356906 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 142337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 42363874 42364167 42364002 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 135429 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 42385461 42385560 42385511 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 114036 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 42385609 42385954 42385889 Y FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 NA NA NA NA NA HIVEP3 113642 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 43428386 43429108 43428580 Y CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 5666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 43473183 43473398 43473279 Y C1orf210,C1orf210,SLC2A1 NA NA NA NA NA SLC2A1-AS1 50463 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 43976930 43977350 43977026 Y NA NA PTPRF IMR90 Hi-C 24141950 HYI 59270 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 44354357 44354471 44354414 Y SZT2,KDM4A,ST3GAL3,IPO13 ARTN NA NA NA NA ARTN 42521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 44430681 44431060 44430788 Y NA ARTN,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24 NA NA NA NA DPH2 2612 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 44887961 44887973 44887968 Y RNF220 RNF220 NA NA NA NA RNF220 19095 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 44897170 44897489 44897243 Y NA RNF220 NA NA NA NA RNF220 28304 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 44951424 44951733 44951502 Y TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220 NA NA NA NA NA RNF220 82558 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 44984751 44985020 44984777 Y C1orf228,RNF220 NA NA NA NA NA RNF220 115885 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 45283789 45284126 45283958 Y NA RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P NA NA NA NA RNU5E-6P 120 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 45746932 45746947 45746939 Y NA HPDL ZSWIM5,UROD,HECTD3 IMR90 Hi-C 24141950 HPDL 43598 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 46008399 46008548 46008476 Y PRDX1,AKR1A1 MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1,NASP PRDX1,AKR1A1,NASP,CCDC17 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1A1 5667 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 46009549 46009894 46009666 Y IPP,GPBP1L1,TOE1,TESK2 MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1,NASP PRDX1,AKR1A1,NASP,CCDC17 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AKR1A1 4321 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA TMEM69 48076 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 47055088 47055141 47055115 Y NA MKNK1 NA NA NA NA MKNK1 25374 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 47718105 47718425 47718265 Y NA TAL1 TAL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAL1 22213 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 47729037 47729382 47729210 Y NA TAL1,STIL TAL1 K562 ChIA-PET 22265404 TAL1 33145 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 50650068 50650310 50650189 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 162483 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 50763281 50763486 50763384 Y NA NA AGBL4 IMR90 Hi-C 24141950 AGBL4 275696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 51415396 51415400 51415398 Y NA FAF1,CDKN2C NA NA NA NA FAF1 8535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA RP11-191G24.1,EPS15 NA NA NA NA RP11-191G24.1 46389 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 52193707 52193852 52193763 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 148625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 52238666 52238881 52238774 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 103596 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 52999324 52999688 52999506 Y NA ZCCHC11 PRPF38A,ORC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC11 17471 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 53092647 53093031 53092839 Y NA GPX7 NA NA NA NA GPX7 26603 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 55677745 55677788 55677767 Y NA USP24 NA NA NA NA USP24 998 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 56992489 56992799 56992673 Y NA NA NA NA NA NA USP24 1313703 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 57024882 57025247 57025166 Y NA NA NA NA NA NA USP24 1346096 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA USP24 1364501 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 57821291 57821329 57821310 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P15 698823 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 57948146 57948309 57948229 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P15 571843 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 58713977 58714213 58714095 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P15 193825 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 59183945 59184311 59184005 Y NA MYSM1 FGGY,HOOK1,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 MYSM1 20181 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 59492942 59493154 59493036 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 8883 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 59522982 59523218 59523118 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 38923 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 59608045 59608421 59608204 Y NA NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 123986 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 60099613 60099733 60099673 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 339303 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 61516303 61516687 61516329 Y NA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 187372 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 61782237 61782437 61782337 Y NA NA NA NA NA NA TM2D1 406658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 62416847 62417238 62417043 Y INADL,USP1,KANK4 NA NA NA NA NA INADL 210698 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 63022251 63022602 63022448 Y NA NA NA NA NA NA USP1 122283 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 63151036 63151115 63151076 Y NA DOCK7 NA NA NA NA DOCK7 854 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 65364183 65364439 65364282 Y JAK1 NA NA NA NA NA JAK1 65748 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 66740731 66741065 66740898 Y NA NA NA NA NA NA TCTEX1D1 475077 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 66793414 66793646 66793530 Y PDE4B NA NA NA NA NA TCTEX1D1 422496 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 66904732 66904991 66904859 Y MIER1,PDE4B NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 TCTEX1D1 311151 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 69441381 69441536 69441435 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1 480477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA NA NA NA NA NA LRRC40 651675 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 70237887 70238124 70238005 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC40 431179 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 70418678 70418852 70418759 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC40 250451 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 70635460 70635702 70635581 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA LRRC40 33601 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 71399907 71400234 71400028 Y NA NA NA NA NA NA PTGER3 111257 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 72155856 72156188 72156023 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB2-AS2 610849 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 72334122 72334290 72334206 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB2-AS2 789115 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 73825398 73825415 73825407 Y NA NA NA NA NA NA LRRIQ3 836456 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 75571532 75571785 75571660 Y NA NA NA NA NA NA CRYZ 374440 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 75972237 75972619 75972428 Y NA NA NA NA NA NA ACADM 215417 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 76751449 76751689 76751612 Y NA NA NA NA NA NA TPI1P1 411785 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 77879256 77879430 77879369 Y NA NA NA NA NA NA AK5 133520 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr1 78214350 78214750 78214605 Y NA USP33,FAM73A NA NA NA NA USP33 8787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44 155719 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 80186272 80186571 80186386 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 1072791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 84757421 84757614 84757534 Y DNASE2B,DNASE2B,SAMD13,SAMD13 NA UOX,DNASE2B IMR90 Hi-C 24141950 RPF1 185328 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr1 85007374 85007584 85007581 Y NA GNG5,CTBS NA NA NA NA CTBS 30579 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 85241214 85241288 85241250 Y SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3 NA SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 86728 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 85328527 85328795 85328739 Y BCL10 LPAR3 NA NA NA NA LPAR3 28101 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 85457149 85457643 85457442 Y GNG5,MCOLN2,BCL10,LPAR3 NA NA NA NA NA LPAR3 100253 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 85737728 85738105 85737917 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 2668 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 86603097 86603550 86603341 Y NA COL24A1 NA NA NA NA COL24A1 17076 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 86926712 86927012 86926888 Y NA NA NA NA NA NA ODF2L 66689 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 87355999 87356364 87356182 Y NA SEP15,HS2ST1 NA NA NA NA SEP15 21743 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 87617475 87617831 87617556 Y NA NA NA NA NA NA LMO4 174320 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 87617997 87618150 87618101 Y NA NA NA NA NA NA LMO4 174001 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 87668655 87668791 87668683 Y HS2ST1,LMO4 NA LOC339524 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 123360 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 89339924 89340210 89340169 Y PKN2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 15417 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 89581205 89581610 89581506 Y NA GBP2 NA NA NA NA GBP2 32529 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 89776158 89776579 89776384 Y GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5 GBP5 NA NA NA NA GBP5 39614 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 90032556 90032702 90032627 Y LRRC8D,GBP2,LRRC8C,LRRC8B,LRRC8B LRRC8B NA NA NA NA LRRC8B 44161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 90101821 90102213 90101853 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 5190 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 90153439 90153806 90153511 Y NA NA NA NA NA NA LRRC8C 56808 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 90167146 90167167 90167157 Y NA NA NA NA NA NA LRRC8C 70515 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 90223174 90223447 90223368 Y NA NA LRRC8C,FLJ27354,LRRC8D IMR90 Hi-C 24141950 LRRC8D 61126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 90309838 90310280 90310072 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 25265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 90321378 90321621 90321467 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 36805 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 91185058 91185169 91185091 Y BARHL2 NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 130038 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 91361231 91361653 91361295 Y NA RP4-665J23.1 NA NA NA NA RP4-665J23.1 46024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA RP11-91I11.1 119515 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 92549605 92549624 92549615 Y NA BTBD8 NA NA NA NA BTBD8 5743 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 93324554 93324784 93324669 Y NA RPL5 NA NA NA NA RPL5 28972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 93773027 93773315 93773230 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 36130 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 94038553 94038921 94038737 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 126865 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 94450262 94450661 94450462 Y NA NA NA NA NA NA GCLM 77296 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 94557832 94558157 94557998 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 180467 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 94769345 94769627 94769486 Y NA ARHGAP29 ARHGAP29,ABCA4 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 30721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 94891778 94892070 94891849 Y NA ABCD3 NA NA NA NA ABCD3 9845 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 95186895 95187156 95187037 Y NA NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 96681 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 95256087 95256223 95256110 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 27614 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 95484238 95484316 95484279 Y NA NA NA NA NA NA ALG14 52185 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 95811904 95812058 95811981 Y NA NA NA NA NA NA RWDD3 114193 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 97199537 97199912 97199566 Y NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 14316 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 97308752 97309076 97308966 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 123531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 98275580 98275856 98275718 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 108749 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 98437572 98437739 98437700 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 52967 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 98518546 98518920 98518639 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 133941 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 98781999 98782036 98782018 Y NA NA LOC729987 IMR90 Hi-C 24141950 DPYD 397394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 98788970 98789228 98789135 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 DPYD 404365 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 98789496 98789901 98789701 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 DPYD 404891 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 99782000 99782078 99782026 Y NA NA NA NA NA NA FRRS1 448109 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 100878516 100878703 100878610 Y NA NA NA NA NA NA CDC14A 69932 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 100905821 100906168 100905941 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 97237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA VCAM1 NA NA NA NA VCAM1 18969 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 101554105 101554204 101554157 Y NA NA S1PR1,SLC30A7 IMR90 Hi-C 24141950 DPH5 64461 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 101577594 101578108 101577808 Y SLC30A7,SLC30A7,S1PR1 NA SLC30A7,EXTL2 IMR90 Hi-C 24141950 DPH5 87950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 101776223 101776281 101776251 Y S1PR1 NA NA NA NA NA S1PR1 75779 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 104641680 104641698 104641690 Y NA NA NA NA NA NA AMY2B 547243 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 105436709 105436763 105436736 Y NA NA NA NA NA NA AMY2B 1342272 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 105911296 105911317 105911307 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 1685950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 107853487 107853575 107853491 Y NTNG1,NTNG1 NA NA NA NA NA PRMT6 256220 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 108622242 108622251 108622249 Y FAM102B,VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 116476 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 108634261 108634637 108634400 Y NA NA VAV3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A24 106834 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 109188271 109188477 109188414 Y NA HENMT1,PRPF38B NA NA NA NA HENMT1 13671 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 109189516 109189718 109189617 Y TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,HENMT1 HENMT1,PRPF38B NA NA NA NA HENMT1 12430 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 109469350 109469540 109469522 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 34566 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 109933790 109934137 109934039 Y TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1 SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 4436 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 110142749 110143055 110142903 Y PSRC1,GNAT2 AMPD2 NA NA NA NA AMPD2 13671 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 110333273 110333688 110333592 Y GNAI3,AMPD2,AMPD2,CSF1 NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 50889 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 110336950 110337403 110337105 Y GSTM2,CSF1 NA CSF1,FAM40A,AHCYL1,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 54566 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 110895542 110895785 110895664 Y NA RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA RBM15 16414 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 111417921 111418422 111417947 Y NA CD53 NA NA NA NA CD53 4146 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 111441077 111441266 111441172 Y NA CD53 NA NA NA NA CD53 27302 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 111729234 111729498 111729366 Y NA CEPT1,DRAM2 NA NA NA NA DRAM2 48396 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 111762260 111762740 111762451 Y CD53,CEPT1,DENND2D,CHI3L2 NA C1orf88,CEPT1,PGCP1,RAP1A,DRAM2 IMR90 Hi-C 24141950 DRAM2 81422 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 111996023 111996307 111996190 Y NA ATP5F1,WDR77,C1orf162 NA NA NA NA WDR77 6025 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 112050044 112050594 112050328 Y C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3 C1orf162,RAP1A NA NA NA NA RAP1A 32246 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 112058803 112059167 112059005 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162,ADORA3 C1orf162,RAP1A NA NA NA NA RAP1A 23673 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr1 112942216 112942335 112942276 Y CTTNBP2NL CTTNBP2NL NA NA NA NA CTTNBP2NL 5413 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 113949729 113949849 113949733 Y NA RP11-512F24.1 NA NA NA NA RP11-512F24.1 40473 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 114258659 114258989 114258824 Y NA PHTF1 NA NA NA NA PHTF1 41122 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 114657343 114657372 114657355 Y NA NA NA NA NA NA OLFML3 137280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 115046601 115046805 115046703 Y NA TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 4976 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 TSPAN2,RP4-666F24.3 NA NA NA NA TSPAN2 24510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 116321345 116321551 116321511 Y NA NA CASQ2 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 138771 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 116918317 116918655 116918398 Y NA ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5027 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 117032033 117032296 117032175 Y ATP1A1,ATP1A1,CD58 NA ATP1A1,SLC22A15,MAB21L3,ATP1A1OS,CD58 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP1A1OS 72789 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 117112460 117112738 117112567 Y TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 799 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 117281390 117281752 117281592 Y TTF2,ATP1A1,CD2 CD2 CD101,TTF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2 13255 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 117421623 117422020 117421974 Y TTF2 PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 120380695 120381105 120381020 Y NA NA NA NA NA NA PHGDH 180274 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 120525502 120525838 120525670 Y NOTCH2,ZNF697,NBPF7 NA NA NA NA NA NOTCH2 84402 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.56568016249122 chr1 142536204 142536464 142536463 Y NA NA NA NA NA NA NBPF8 1608344 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 142538903 142539547 142539454 Y NA NA NA NA NA NA NBPF8 1605261 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 144993199 144993244 144993232 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 50527 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 145000077 145000849 145000623 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 57405 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 145030583 145030978 145030933 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 43208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 145032376 145032564 145032466 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 41622 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 145454760 145454851 145454762 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,TXNIP TXNIP,POLR3GL,LIX1L NA NA NA NA POLR3GL 13537 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 146774989 146775112 146775013 Y NA NA NA NA NA NA FMO5 62289 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 147120817 147121145 147120987 Y NA ACP6 NA NA NA NA ACP6 19473 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 147790636 147790862 147790749 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 14024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 149029458 149029500 149029498 Y NA NA NA NA NA NA PFN1P12 83155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 149138053 149138113 149138087 Y NA PFN1P12 NA NA NA NA PFN1P12 25398 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 149984633 149984917 149984775 Y SV2A NA NA NA NA NA VPS45 52452 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 150585815 150586394 150586132 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 13694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr1 151422102 151422465 151422287 Y NA POGZ NA NA NA NA POGZ 7476 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 151877533 151877895 151877666 Y THEM4 THEM4 NA NA NA NA THEM4 2389 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr1 151918898 151919222 151919024 Y S100A10 THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 38614 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 152010545 152011004 152010886 Y SNX27,S100A11 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 7379 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 152025147 152025277 152025212 Y NA S100A11 THEM4,S100A11,TCHH,TCHHL1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 S100A11 6764 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 152626575 152626861 152626670 Y NA NA LCE2B IMR90 Hi-C 24141950 HMGN3P1 256522 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 152878925 152879083 152878954 Y NA NA NA NA NA NA PGLYRP4 440233 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 153549643 153549828 153549736 Y PGLYRP3,S100A7L2 S100A6,S100A5,S100A4,S100A1 S100A14,S100A13,S100A16,CHTOP,S100A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S100A4 29031 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 153845025 153845089 153845058 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 48362 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 153853385 153853782 153853590 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 39669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 9.38336884866111 chr1 154694298 154694595 154694411 Y DCST1 NA NA NA NA NA ADAR 95823 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 154728745 154728994 154728977 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 130270 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 154731745 154732111 154731910 Y IL6R,ADAR NA NA NA NA NA ADAR 133270 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 154785688 154785964 154785697 Y NA NA NA NA NA NA PMVK 121503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 154914634 154915296 154915191 Y RUSC1-AS1,RUSC1,RUSC1,CLK2,ADAR,KCNN3,KCNN3,PMVK PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1 NA NA NA NA PMVK 7167 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 154957258 154957622 154957425 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B NA NA NA NA FLAD1 3444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 155830201 155830522 155830413 Y ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2 GON4L,SYT11,RIT1 ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907 IMR90 Hi-C 24141950 SYT11 2901 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 156066868 156067143 156067009 Y MEF2D,MSTO1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L UBQLN4,LAMTOR2,MEX3A,LMNA,SEMA4A LMNA,MEX3A K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LMNA 16504 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 157373072 157373269 157373181 Y NA NA NA NA NA NA FCRL4 192601 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA CD1D,RP11-404O13.5 NA NA NA NA CD1D 668 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA RP11-404O13.5 NA NA NA NA CD1D 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 158253654 158254229 158253918 Y NA CD1A,CD1C,CD1B NA NA NA NA CD1C 3347 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 158808262 158808538 158808444 Y IFI16 MNDA NA NA NA NA MNDA 9155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr1 160056214 160056779 160056425 Y C1orf204,PEA15,KCNJ10,KCNJ9,IGSF8,IGSF8,ATP1A2 IGSF8 NA NA NA NA IGSF8 9954 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 160544770 160545265 160545135 Y SLAMF7,CD48,CD244,CD84 CD84 NA NA NA NA CD84 2041 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 160546217 160546501 160546436 Y ATP1A4,SLAMF7,CD48,CD244,CD84 CD84 NA NA NA NA CD84 805 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 160677742 160679048 160678107 Y COPA,SLAMF7,CD244,ARHGAP30,CD48 CD48,SLAMF7 NA NA NA NA CD48 593 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 160713171 160713322 160713249 Y COPA,CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7 CD48,SLAMF7 NA NA NA NA SLAMF7 6134 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1,ARHGAP30 NA NA NA NA F11R 243 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 161348767 161349231 161349047 Y NDUFS2 NA NA NA NA NA SDHC 66720 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.43967590065189 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA FCRLB 106847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 161973588 161973892 161973770 Y FCGR2A,FCGR3A,OLFML2B OLFML2B NA NA NA NA OLFML2B 17752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 162599583 162599804 162599661 Y NA NA NA NA NA NA UAP1 70260 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 162659800 162660152 162659976 Y NA NA NA NA NA NA UAP1 130477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 162827762 162827953 162827847 Y NA NA NA NA NA NA UAP1 298439 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 162937771 162938014 162937902 Y C1orf110 NA RGS4,RGS5,C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 NUF2 296352 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 163098384 163098482 163098454 Y RGS5,RGS5 NA NA NA NA NA NUF2 135884 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 164686304 164686686 164686418 Y NA NA NA NA NA NA HMGB3P6 362300 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 165323712 165323885 165323804 Y NA NA NA NA NA NA MGST3 274213 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 165823413 165823808 165823568 Y NA UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 28421 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr1 167192959 167193266 167193111 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 4893 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 167419889 167420655 167420276 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 100349 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 167520671 167521013 167520898 Y CREG1 NA NA NA NA NA CREG1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 167586596 167587245 167587123 Y POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1 RCSD1 RCSD1 IMR90 Hi-C 24141950 RCSD1 10085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 167722412 167722527 167722511 Y NA MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 33983 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 167766380 167766616 167766548 Y SFT2D2,CREG1 NA NA NA NA NA MPZL1 77951 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 168311962 168312260 168312138 Y NA NA MIR557,LOC100505918 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 63684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 168787153 168787165 168787159 Y NA NA NA NA NA NA XCL1 243442 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 168994253 168994531 168994400 Y XCL2,XCL1 NA DPT,ATP1B1,NME7 IMR90 Hi-C 24141950 ATP1B1 78404 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 169532682 169533387 169533357 Y NA NA NA NA NA NA SELP 64044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 169661915 169662500 169662311 Y METTL11B,KIFAP3,SCYL3,METTL18,SELL C1orf112,SELL NA NA NA NA SELL 16339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 169860308 169860488 169860348 Y KIFAP3,SCYL3 SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 920 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 171170952 171171193 171171076 Y C1orf129,C1orf129,FMO2 NA NA NA NA NA FMO4 110154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 171473011 171473311 171473138 Y NA PRRC2C NA NA NA NA PRRC2C 20360 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 172507125 172507604 172507262 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 95895 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 172723165 172723536 172723368 Y TNFSF4 NA TNFSF4,LOC100506023,PRDX6,RC3H1,CENPL,DARS2 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 311935 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 172814602 172814764 172814686 Y TNFSF4 NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF4 359688 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 172862488 172862855 172862639 Y NA NA TNFSF4 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF4 311597 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 172920935 172921277 172921095 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF4 253175 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 173167258 173167319 173167289 Y NA TNFSF4 NA NA NA NA TNFSF4 7133 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 173984193 173984403 173984298 Y GPR52,ZBTB37,RC3H1 RC3H1,RP11-160H22.3 NA NA NA NA RC3H1 5032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 175003106 175003396 175003133 Y NA CACYBP,MRPS14 MRPS14 MCF7 ChIA-PET 22265404 MRPS14 12545 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 176244494 176244887 176244692 Y NA NA NA NA NA NA RP11-195C7.1 69710 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 178305054 178305336 178305195 Y RASAL2 NA NA NA NA NA RP11-568K15.1 299969 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 179098871 179099008 179098957 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 50359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 181097947 181098672 181098524 Y MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER5 42309 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 181100547 181100997 181100668 Y IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 44909 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 181454376 181454805 181454502 Y CACNA1E NA NA NA NA NA IER5 398738 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 182118170 182119053 182118696 Y RNASEL,GLUL,GLUL NA GLUL K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 240288 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 182228341 182228499 182228429 Y NA NA GLUL K562 ChIA-PET 22265404 GLUL 130842 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 183552584 183552988 183552777 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NCF2 5023 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 183855028 183855346 183855094 Y RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 163465 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 184828541 184828899 184828707 Y IVNS1ABP,FAM129A NA NA NA NA NA EDEM3 106494 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 184885517 184885894 184885706 Y NA NA NA NA NA NA FAM129A 55788 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 184929910 184930144 184930114 Y TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A FAM129A NA NA NA NA FAM129A 11538 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 185264835 185265233 185265202 Y NA IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 19228 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 185408004 185408345 185408164 Y RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 123543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 185528945 185529618 185529036 Y NA NA LOC100288079,IVNS1ABP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IVNS1ABP 244484 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 185536131 185536449 185536350 Y NA NA IVNS1ABP,SWT1,MIR548F1,HMCN1 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 251670 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 185771429 185771809 185771446 Y NA NA NA NA NA NA IVNS1ABP 486968 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 185796352 185796554 185796468 Y HMCN1 NA NA NA NA NA IVNS1ABP 511891 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 186590040 186590634 186590330 Y PTGS2,PLA2G4A,C1orf27 NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 PTGS2 56925 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 186851648 186851759 186851704 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 55563 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 186936898 186937303 186937025 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 140813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 187364832 187365131 187364982 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 568747 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 192458942 192459176 192459156 Y RGS2,RGS13,RGS1 NA RGS1,RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 83681 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 192507991 192508486 192508241 Y NA RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 34371 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 192524105 192524371 192524293 Y RGS1 RGS1 RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 18486 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 192578246 192578789 192578443 Y TROVE2,TROVE2,RGS1,RGS2 RGS1 UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 35389 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 192759096 192759311 192759202 Y TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 RGS2 RGS13 IMR90 Hi-C 24141950 RGS2 16858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 192848433 192848817 192848596 Y CDC73,RGS1 NA NA NA NA NA RGS2 72264 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 193073509 193073815 193073644 Y NA TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 193448401 193448721 193448536 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 359254 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 193604725 193604914 193604904 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 515578 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 196378121 196378217 196378169 Y CFHR3,KCNT2 NA NA NA NA NA CFH 240791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 197747792 197747875 197747834 Y NA DENND1B NA NA NA NA DENND1B 4966 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 197964894 197965254 197965077 Y NA NA NA NA NA NA C1orf53 95117 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 198437242 198437607 198437425 Y NA NA PTPRC,NEK7,DENND1B IMR90 Hi-C 24141950 PTPRC 168194 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 198526099 198526320 198526230 Y PTPRC NA NA NA NA NA PTPRC 79481 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 198633275 198633927 198633600 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 27474 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 198648714 198649413 198648876 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 42913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 198650930 198651643 198651116 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 45129 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr1 198850238 198850638 198850585 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 137528 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 198884632 198885024 198884962 Y NA NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 103142 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 198889384 198889935 198889528 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 98231 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 198893258 198893473 198893399 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 94693 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 198894891 198894966 198894922 Y NA NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 93200 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 83232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 199711776 199712042 199711895 Y NA NA NR5A2,C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-104D3.2 357507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 200068069 200068443 200068256 Y NA NA NA NA NA NA ZNF281 308741 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 200481491 200481643 200481567 Y NA NA NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 104307 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 200611653 200611882 200611754 Y DDX59 KIF14,DDX59 NA NA NA NA KIF14 23791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 200857233 200857815 200857711 Y KIF21B NA NA NA NA NA KIF21B 133013 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 201236006 201236165 201236054 Y LAD1,C1orf106,PKP1 NA NA NA NA NA TMEM9 97304 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 201508517 201509575 201509484 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 31933 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 201611388 201611697 201611489 Y NA NA NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 CSRP1 134804 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 201684946 201685300 201685285 Y ARL8A NA NA NA NA NA IPO9 110969 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 201717535 201717792 201717621 Y NA NA IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 78477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 202132024 202132258 202132104 Y PTPN7,PTPN7 ARL8A,PTPN7 NA NA NA NA PTPN7 3308 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 202872285 202872308 202872297 Y NA RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12 RABIF MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA1P59 6632 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 202937248 202937378 202937319 Y RABIF,KLHL12,BTG2 KLHL12,ADIPOR1,CYB5R1,TMEM183A NA NA NA NA CYB5R1 2840 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 202961586 202961702 202961644 Y NA ADIPOR1,CYB5R1,TMEM183A,PPFIA4 NA NA NA NA TMEM183A 12812 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 203258547 203259334 203258830 Y RABIF,KLHL12,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA LINC01136 13103 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 23709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 203525711 203525894 203525744 Y NA NA ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 67795 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 203598711 203598999 203598777 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 5022 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 203599092 203599518 203599142 Y BTG2,LAX1 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 5403 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 203624863 203625211 203625050 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 31174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 203643182 203643803 203643474 Y BTG2,LAX1 ATP2B4 LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 49493 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 204383374 204383435 204383377 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 4455 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 204430759 204431008 204430941 Y SOX13,PIK3C2B PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 30844 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 204449745 204450007 204449876 Y NA PIK3C2B,MDM4 NA NA NA NA PIK3C2B 11845 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 204684045 204684323 204684297 Y NA NA NFASC,LRRN2 IMR90 Hi-C 24141950 MDM4 200534 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 205179753 205180065 205179802 Y NA DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA DSTYK 1026 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 205638734 205639222 205638979 Y SLC45A3 ELK4,SLC45A3 NA NA NA NA SLC45A3 8365 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 206736469 206736632 206736474 Y NA EIF2D NA NA NA NA EIF2D 47272 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 206921953 206922243 206922101 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 IL10 NA NA NA NA IL10 21596 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 207999163 207999611 207999292 Y CR1,CD46 C1orf132 NA NA NA NA C1orf132 40884 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 208021631 208021781 208021738 Y CR1,CD46,PLXNA2,CD34 C1orf132 CD34 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf132 18714 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 208078027 208078145 208078067 Y CD34 C1orf132,CD34 NA NA NA NA CD34 4602 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 208081540 208081662 208081583 Y CD34 C1orf132,CD34 NA NA NA NA CD34 1085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 208135157 208135309 208135233 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD34 52410 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD34 54165 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr1 209570810 209570947 209570869 Y NA NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP5G2P1 131242 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 209577571 209577627 209577601 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA NA NA NA NA ATP5G2P1 138003 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 209930112 209930553 209930290 Y G0S2,TRAF3IP3,C1orf74 TRAF3IP3,C1orf74 NA NA NA NA TRAF3IP3 2735 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 209942657 209943400 209942924 Y LAMB3,G0S2,TRAF3IP3 TRAF3IP3,C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 12504 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 211022379 211022675 211022565 Y KCNH1 NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 322144 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 211210840 211210858 211210848 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 133961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 211423824 211424043 211423934 Y NA RCOR3 NA NA NA NA RCOR3 5676 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 211500826 211501119 211501083 Y TRAF5,TRAF5 TRAF5 NA NA NA NA TRAF5 2869 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 211780151 211780642 211780410 Y NA SLC30A1 SLC30A1 K562 ChIA-PET 22265404 SLC30A1 30067 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr1 211786767 211786829 211786805 Y NA SLC30A1 SLC30A1,NEK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC30A1 36683 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 211950086 211950249 211950170 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 51865 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 212182782 212182853 212182818 Y NA INTS7,DTL,RPL21P28 NA NA NA NA INTS7 24031 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 212655370 212655477 212655424 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 51141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 212769584 212769966 212769788 Y ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3 ATF3 NA NA NA NA ATF3 32908 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 213901619 213901794 213901707 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 550651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 214614555 214614760 214614639 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 214619335 214619608 214619472 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 104184 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 214926316 214926334 214926325 Y NA NA CENPF,KCNK2 IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP24 115743 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 215006647 215006892 215006866 Y KCNK2,KCNK2 GAPDHP24 KCNK2 IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP24 35185 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 216823711 216823952 216823948 Y ESRRG NA NA NA NA NA GPATCH2 978472 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 219259195 219259565 219259379 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 85621 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 220093194 220093327 220093261 Y NA NA NA NA NA NA EPRS 124673 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 220347108 220347461 220347410 Y NA NA NA NA NA NA MORF4L1P1 77451 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 221049992 221050390 221050089 Y HLX HLX NA NA NA NA HLX 293 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 221201107 221201163 221201135 Y HLX NA NA NA NA NA HLX 151408 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 221219642 221220032 221219744 Y HLX NA NA NA NA NA HLX 169943 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 221247820 221248047 221247891 Y HLX NA NA NA NA NA HLX 198121 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 221482496 221482661 221482579 Y NA NA NA NA NA NA DUSP10 430857 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 221862665 221862854 221862747 Y DUSP10,DUSP10 NA NA NA NA NA DUSP10 50664 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 221882292 221882723 221882499 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 30795 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr1 221949932 221950137 221950006 Y NA DUSP10 DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 36414 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 222461432 222461724 222461569 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-378J18.3 299443 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 222767372 222767396 222767384 Y NA RP11-378J18.3,TAF1A,MIA3 NA NA NA NA TAF1A 6097 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr1 224240602 224240763 224240683 Y TP53BP2 NA NVL IMR90 Hi-C 24141950 FBXO28 59026 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 224356788 224356993 224356891 Y WDR26,TP53BP2,FBXO28 DEGS1 NA NA NA NA DEGS1 4465 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 224691192 224691563 224691423 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 68457 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 224727681 224727955 224727807 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 104946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 225654906 225655584 225655524 Y TMEM63A,LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 40279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 226086980 226087330 226087189 Y NA TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 9752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 226189681 226190319 226189910 Y H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 57233 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 226190534 226190731 226190643 Y H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 56821 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr1 226222205 226222589 226222509 Y H3F3A,C1orf55 H3F3A H3F3A,C1orf55 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 24963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 226263544 226263865 226263697 Y C1orf55 H3F3A NA NA NA NA H3F3A 15992 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 226849753 226849884 226849818 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 10884 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 226864749 226865297 226865095 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 3981 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 226866232 226866788 226866582 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 5464 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 226875915 226876346 226876127 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 15147 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 228338299 228338457 228338378 Y GJC2 C1orf35,MRPL55,GUK1,IBA57 NA NA NA NA GUK1 12636 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 229074291 229074557 229074548 Y NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 205467 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 229699507 229699773 229699581 Y NA ABCB10 ABCB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 ABCB10 7065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 230407650 230408034 230407910 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 216114 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr1 231113054 231113423 231113208 Y EXOC8,C1orf124,TTC13 TTC13,ARV1 NA NA NA NA ARV1 327 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 231665787 231666093 231665981 Y EXOC8,C1orf124,TSNAX RP11-295G20.2,TSNAX NA NA NA NA TSNAX 3388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 232671774 232671885 232671830 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 412466 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 NTPCR 318224 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.94101491643767 chr1 232840612 232840778 232840695 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 243573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 234630919 234631525 234631418 Y TARBP1 TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 18070 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 234658291 234658851 234658374 Y NA TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 45442 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 164880 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 234980393 234980645 234980479 Y IRF2BP2 NA LOC100506810,IRF2BP2,LINC00184 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.3 133906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 234989990 234990213 234990057 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 124338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 235012060 235012373 235012284 Y IRF2BP2,ARID4B NA LINC00184,IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,RBM34 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 102178 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 235080718 235080947 235080875 Y ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.3 33604 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 235091073 235091332 235091158 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 23219 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 235094853 235095190 235094881 Y RBM34,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 19361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 235096560 235096855 235096619 Y ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 17696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 16481 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr1 235120162 235120433 235120341 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 5611 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 235151501 235151917 235151577 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.3 36950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 235151923 235152024 235152010 Y ARID4B RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.3 37372 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 235243001 235243596 235243521 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 46655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TOMM20 43394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 235927486 235927702 235927520 Y NA NA NA NA NA NA LYST 117238 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 236101998 236102489 236102172 Y LYST NA LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 57058 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 236118323 236118637 236118427 Y LYST NA LYST,B3GALNT2,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 73383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 241302172 241302404 241302286 Y NA NA NA NA NA NA FH 378657 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 241693216 241693255 241693236 Y KMO FH NA NA NA NA FH 12155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 241714901 241715765 241715555 Y KMO FH NA NA NA NA FH 33840 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 242068662 242068804 242068733 Y NA NA NA NA NA NA EXO1 59393 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 243428005 243428394 243428166 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 10685 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 243447752 243447803 243447788 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 30432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 243876652 243876733 243876693 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 135648 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr1 244212276 244213430 244213047 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 199895 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr1 244417754 244418100 244418029 Y AKT3,AKT3,ZNF238,ADSS NA LOC339529,AKT3,SDCCAG8,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 195336 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr1 245162358 245162654 245162559 Y NA EFCAB2 NA NA NA NA EFCAB2 31351 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 245971113 245971386 245971357 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 654826 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 246129057 246129404 246129358 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 539210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 246183399 246183819 246183679 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 484795 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 246249452 246249819 246249636 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 418795 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 246316735 246316955 246316845 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 351659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 246323685 246324051 246324002 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 344563 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 246432471 246432772 246432681 Y SMYD3,CNST NA NA NA NA NA SMYD3 235842 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 246730569 246731007 246730621 Y AHCTF1,CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 2823 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 246732690 246733040 246732711 Y SMYD3,CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 4944 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr1 246772310 246772610 246772421 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 44564 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 247206107 247206337 247206222 Y NA ZNF695,ZNF670 NA NA NA NA ZNF670 33776 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 247524183 247524555 247524546 Y NLRP3,NLRP3 ZNF496 ZNF496,AHCTF1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF496 31035 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 247537279 247537425 247537333 Y NA ZNF496,NLRP3 AHCTF1,ZNF496 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NLRP3 40033 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 247715651 247715843 247715723 Y OR2G2,C1orf150 NA NA NA NA NA NLRP3 138193 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr1 247720908 247721240 247721014 Y OR2G2,C1orf150 NA NA NA NA NA NLRP3 143450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 179287 179666 179475 Y NA ZMYND11 NA NA NA NA ZMYND11 882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 587865 588161 588097 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 387403 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 1241708 1242051 1241875 Y NA LINC00200 NA NA NA NA LINC00200 38000 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 1541138 1541906 1541672 Y WDR37,ADARB2 NA NA NA NA NA ADARB2 235764 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 2949589 2949730 2949646 Y NA NA NA NA NA NA PFKP 156795 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 3078434 3078646 3078540 Y NA PFKP NA NA NA NA PFKP 27879 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 3137708 3138098 3138049 Y NA PFKP NA NA NA NA PFKP 31183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr10 3598970 3599136 3599051 Y KLF6 NA NA NA NA NA KLF6 226337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 3762746 3763172 3762857 Y KLF6 NA NA NA NA NA KLF6 62301 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 3845250 3845852 3845788 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 19777 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 3846443 3847038 3846804 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 20970 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 3853393 3854169 3853583 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 27920 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 3867491 3867713 3867639 Y NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42018 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 3915881 3916422 3916098 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 90408 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 3934486 3935471 3934810 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 109013 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 3983198 3983475 3983337 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 157725 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 4003377 4003614 4003508 Y KLF6 NA LOC100216001,KLF6,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 177904 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 4060217 4060455 4060406 Y KLF6 NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 234744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 4172866 4173257 4173063 Y KLF6 NA KLF6 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF6 347393 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 4218877 4219029 4218964 Y NA NA KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 393404 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 4289203 4289519 4289251 Y NA NA KLF6,LOC338588,LOC100216001 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 463730 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 4556552 4557090 4556825 Y NA NA KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1E2 269731 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 4812953 4813314 4813133 Y NA AKR1E2 KLF6,PITRM1 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1E2 13507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 4991516 4991911 4991654 Y NA NA tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C3 83635 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 5105953 5106270 5106114 Y NA AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 30407 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 5334474 5334640 5334544 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 117874 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA NET1 51913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 5577499 5577735 5577573 Y NA NA NA NA NA NA NET1 124985 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 6013642 6013801 6013714 Y PFKFB3,PFKFB3,IL15RA IL15RA NA NA NA NA IL15RA 4349 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 6051095 6051553 6051345 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17 IL15RA NA NA NA NA IL15RA 32945 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 6182474 6182743 6182618 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 2138 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 6193132 6193393 6193272 Y GDI2,IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 8251 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 6333794 6333936 6333889 Y PFKFB3,PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 148913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 6340083 6340359 6340284 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 155202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 6424082 6424357 6424201 Y PFKFB3,PFKFB3 NA LOC399715,RBM17,PFKFB3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 195906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 176551 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 6503496 6503541 6503519 Y PRKCQ NA NA NA NA NA PRKCQ 116722 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 7226649 7227021 7226812 Y NA NA NA NA NA NA KIN 600969 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 7362038 7362350 7362337 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA KIN 465640 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 7667725 7668107 7668024 Y NA NA NA NA NA NA KIN 159883 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 8446683 8447080 8446823 Y GATA3 NA NA NA NA NA GATA3 353116 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 9013579 9013972 9013843 Y NA NA FLJ45983,GATA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GATA3 920012 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 10413071 10413088 10413080 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 421855 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 11061356 11061896 11061544 Y NA CELF2 NA NA NA NA CELF2 16097 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 11191600 11192013 11191743 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 146341 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 11205067 11205773 11205317 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 159808 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr10 11208955 11209315 11209006 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 163696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 11211427 11212417 11211529 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 166168 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr10 11217991 11218170 11218104 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 172732 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 11220579 11221039 11220795 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 175320 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr10 11222222 11222709 11222492 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 176963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 11252483 11252766 11252686 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 207224 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 11284467 11284694 11284626 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 239208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 11301422 11301770 11301497 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 256163 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 11746687 11746940 11746814 Y USP6NL ECHDC3 USP6NL,ECHDC3 IMR90 Hi-C 24141950 ECHDC3 35425 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 11980539 11980883 11980844 Y NA PROSER2-AS1 NA NA NA NA PROSER2-AS1 45840 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 12002775 12003103 12002939 Y NA NA NA NA NA NA PROSER2-AS1 68076 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 12261469 12261671 12261570 Y NA CDC123,NUDT5 NA NA NA NA NUDT5 25326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 12283843 12284276 12283949 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D CDC123,NUDT5 NA NA NA NA NUDT5 47700 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 13142941 13143287 13143115 Y NA OPTN NA NA NA NA OPTN 3492 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 13235342 13235711 13235527 Y NA MCM10 NA NA NA NA MCM10 33788 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 13829023 13829481 13829176 Y PRPF18 NA NA NA NA NA PRPF18 202096 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 14217181 14217543 14217379 Y FRMD4A NA NA NA NA NA PRPF18 590254 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 172933 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 15179834 15179919 15179877 Y NA RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 28773 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 16802586 16802595 16802591 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 54932 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 16906337 16906676 16906506 Y NA RSU1 NA NA NA NA RSU1 48810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 17017150 17017510 17017417 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 159623 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 17068694 17069080 17068926 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 172973 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 17456684 17457055 17456726 Y NA ST8SIA6 NA NA NA NA ST8SIA6 37274 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 17470783 17471060 17470983 Y TRDMT1,STAM,ST8SIA6 ST8SIA6 NA NA NA NA ST8SIA6 23269 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 17548531 17548697 17548633 Y ST8SIA6 NA CUBN IMR90 Hi-C 24141950 ST8SIA6 54202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 17652629 17652974 17652802 Y NA PTPLA,STAM NA NA NA NA PTPLA 4402 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 17697506 17697813 17697679 Y ST8SIA6,STAM PTPLA,STAM NA NA NA NA STAM 13382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 19267078 19267235 19267155 Y NA NA NA NA NA NA ARL5B 320744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 20203114 20203263 20203197 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 99946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 20292651 20293410 20292825 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 189483 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 20518444 20518755 20518482 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 415276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 21218309 21218697 21218504 Y C10orf113 NA NA NA NA NA MLLT10 602397 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 MLLT10 238585 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 21799318 21799715 21799601 Y C10orf113 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 21379 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr10 22029877 22030194 22029992 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA RN7SKP37 189878 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 22422730 22422874 22422802 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC1 132032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 22519481 22519667 22519580 Y BMI1,EBLN1 NA COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3 83236 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 22622234 22622399 22622330 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 10000 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 22625615 22626028 22625937 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 6371 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 22628998 22629520 22629110 Y EBLN1 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 2879 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 2418 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA SPAG6 92932 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.94101491643767 chr10 22870490 22870524 22870509 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 130960 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 22887940 22888243 22888209 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 113241 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 22932460 22932672 22932594 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 68812 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 22932994 22933290 22933224 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 68194 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 23737770 23738059 23737888 Y OTUD1 OTUD1 NA NA NA NA OTUD1 11572 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 23845968 23846451 23845996 Y NA NA NA NA NA NA OTUD1 119770 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 24117380 24117590 24117484 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1217 135705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 24772710 24773084 24772822 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 237513 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 25815030 25815346 25815189 Y NA NA NA NA NA NA THNSL1 511443 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 26737474 26738103 26737807 Y ABI1,APBB1IP APBB1IP NA NA NA NA APBB1IP 12342 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 26769950 26770105 26770002 Y APBB1IP,ABI1 APBB1IP NA NA NA NA APBB1IP 44818 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 27147453 27147834 27147772 Y YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1 ABI1 NA NA NA NA ABI1 182 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 27354652 27354729 27354695 Y NA ANKRD26 NA NA NA NA ANKRD26 32692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr10 28622853 28623578 28623396 Y NA MPP7 MPP7 IMR90 Hi-C 24141950 MPP7 1438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 28725980 28726021 28726001 Y NA NA NA NA NA NA WAC 93401 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 29556183 29556410 29556298 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 139921 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 29922205 29922549 29922392 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 225874 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 30117540 30117757 30117648 Y SVIL NA SVIL IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD3P1 421209 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 30786722 30786944 30786877 Y MAP3K8 NA MAP3K8 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 65856 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 30818244 30819051 30818562 Y MAP3K8,ZNF438 NA MAP3K8,KIAA1462,MTPAP,LOC729668,LYZL2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 97378 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 30862777 30863009 30862928 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA LOC729668 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 141911 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 31093694 31093701 31093698 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 225165 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 31192523 31192722 31192556 Y NA NA NA NA NA NA ZNF438 126144 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 31423488 31423889 31423800 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 104622 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 31770032 31770371 31770202 Y NA NA NA NA NA NA ZEB1-AS1 162656 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 31870933 31871207 31871087 Y NA NA ZNF438,ARHGAP12,ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 263557 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 32218329 32218518 32218508 Y NA ARHGAP12 NA NA NA NA ARHGAP12 2587 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 32598255 32598442 32598434 Y NA NA NA NA NA NA EPC1 67284 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 32607439 32608014 32607606 Y EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 57712 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 32639699 32640002 32639940 Y NA EPC1 EPC1,C10orf68 IMR90 Hi-C 24141950 EPC1 25724 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 33701574 33701923 33701712 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 408854 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 34165036 34165196 34165116 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 872316 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 35640077 35640405 35640144 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 106124 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 35717658 35717859 35717796 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 183705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 38264185 38264489 38264470 Y ZNF37A,ZNF248,ZNF25 ZNF25,ZNF33A NA NA NA NA ZNF25 624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 38325428 38325718 38325598 Y ZNF25,ZNF37A ZNF33A NA NA NA NA ZNF33A 27850 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 39138625 39138833 39138729 Y NA NA NA NA NA NA ZNF37A 757361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 42398389 42399045 42398432 Y NA NA NA NA NA NA ZNF37BP 647225 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 43616495 43616668 43616562 Y HNRNPF,HNRNPF,CSGALNACT2 CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 15266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr10 43635714 43636276 43636098 Y HNRNPF,HNRNPF,CSGALNACT2 CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 3780 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 43782816 43783033 43782934 Y CSGALNACT2 NA NA NA NA NA HNRNPF 119581 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 43800197 43800376 43800318 Y CSGALNACT2,HNRNPF,HNRNPF NA ZNF487P IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPF 102238 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 43905259 43905708 43905446 Y HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA HNRNPF 2645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 44100382 44100859 44100681 Y CSGALNACT2 CAP1P2,ZNF485,ZNF32 NA NA NA NA ZNF485 527 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 45132231 45132345 45132288 Y NA NA TMEM72-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF4 320510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 45914192 45914546 45914348 Y FAM21C,ALOX5,MARCH8 ALOX5 NA NA NA NA ALOX5 46531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 45914844 45915133 45915015 Y NA ALOX5 NA NA NA NA ALOX5 47183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 45925929 45926006 45925968 Y FAM21C,ANUBL1,ALOX5,MARCH8 NA NA NA NA NA ALOX5 58268 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 45927566 45927962 45927775 Y FAM21C,ANUBL1,ALOX5 NA NA NA NA NA ALOX5 59905 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 45965771 45965877 45965832 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5 98110 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 47093518 47093811 47093665 Y NA NA NA NA NA NA FAM21C 872870 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM21C 1435024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr10 48577583 48577860 48577722 Y NA NA SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 934838 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 49678205 49678472 49678354 Y NA NA NA NA NA NA MAPK8 165507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr10 50006443 50006792 50006603 Y NA NA NA NA NA NA WDFY4 115522 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 50008368 50008659 50008598 Y NA NA NA NA NA NA WDFY4 117447 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 50012425 50012991 50012650 Y NA NA NA NA NA NA WDFY4 121504 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 50138824 50138968 50138896 Y WDFY4 NA NA NA NA NA VSTM4 182586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 50398133 50398290 50398228 Y C10orf128 C10orf128 NA NA NA NA C10orf128 3503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 50462696 50462912 50462787 Y C10orf128 NA WDFY4,VSTM4 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf128 68066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 50508434 50508798 50508651 Y C10orf71 NA NA NA NA NA C10orf128 113804 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 50536610 50536839 50536655 Y NA NA NA NA NA NA C10orf128 141980 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 52085013 52085461 52085351 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 62275 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 52270106 52270351 52270231 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 112572 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 54428139 54428556 54428341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-556E13.1 84613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 54454130 54454506 54454318 Y NA NA NA NA NA NA RP11-556E13.1 58663 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 54471417 54471775 54471523 Y NA RP11-556E13.1 NA NA NA NA RP11-556E13.1 41394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 56854357 56854710 56854534 Y NA NA NA NA NA NA ZWINT 1264326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 60422217 60422354 60422286 Y NA NA NA NA NA NA TFAM 279435 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B NA NA NA NA NA ADO 898699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 63752119 63752912 63752632 Y ARID5B NA NA NA NA NA ADO 809604 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 63805040 63805237 63805084 Y ARID5B NA NA NA NA NA ADO 757279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 63805800 63806070 63805931 Y ARID5B NA NA NA NA NA ADO 756446 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 63806320 63806697 63806416 Y NA NA NA NA NA NA ADO 755819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 63859069 63859192 63859131 Y ARID5B NA NA NA NA NA ADO 703324 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 65016713 65017097 65017085 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 125663 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 68690818 68690961 68690956 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 904963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 68802540 68803252 68802892 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA DNAJC12 792672 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 69523317 69523417 69523404 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 72507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 69543460 69543596 69543528 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 52328 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 70088080 70088572 70088236 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 HNRNPH3,PBLD NA NA NA NA HNRNPH3 359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 70805220 70805884 70805439 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 39978 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 70817174 70817630 70817194 Y NA SRGN KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRGN 28232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr10 70821151 70821852 70821361 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 24010 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 70849672 70851282 70850023 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN,VPS26A SRGN,VPS26A NA NA NA NA SRGN 3810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 71662112 71662205 71662157 Y H2AFY2 NA NA NA NA NA H2AFY2 148347 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 71675422 71675425 71675424 Y H2AFY2 NA NA NA NA NA H2AFY2 135127 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr10 72165059 72165574 72165379 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA EIF4EBP2 2924 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 72424506 72424875 72424691 Y ADAMTS14 ADAMTS14 KIAA1274,PRF1,ADAMTS14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADAMTS14 5684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 72992169 72992442 72992307 Y C10orf105 NA NA NA NA NA SLC29A3 84573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73103146 73103452 73103170 Y NA SLC29A3 NA NA NA NA SLC29A3 26131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73398011 73398245 73398040 Y NA NA NA NA NA NA C10orf54 133010 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 73454502 73454799 73454537 Y NA NA NA NA NA NA C10orf54 76456 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73526896 73527242 73527133 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4013 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73531831 73532355 73532130 Y C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 576 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 73568339 73568950 73568859 Y NA C10orf54,PSAP NA NA NA NA C10orf54 37084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73612356 73612502 73612445 Y DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP NA NA NA NA PSAP 3230 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73649730 73650267 73649949 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP DNAJB12,PSAP,CHST3,CDH23,ASCC1,SPOCK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSAP 40604 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73652284 73652469 73652411 Y NA PSAP DNAJB12,PSAP,CHST3,CDH23,ASCC1,SPOCK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSAP 43158 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 73744363 73744592 73744410 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK2 102198 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 74014911 74015029 74015003 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 16649 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 74271285 74271561 74271407 Y DDIT4,DNAJB12,CBARA1 NA NA NA NA NA MICU1 112338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 74419820 74419980 74419900 Y NA MICU1,HMGN2P34,MCU MICU1,OIT3,MCU,PLA2G12B IMR90 Hi-C 24141950 HMGN2P34 25297 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 75240023 75240096 75240089 Y NA RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 13187 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 75349200 75349597 75349539 Y CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54 USP54 FAM149B1,PPP3CB,USP54,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L IMR90 Hi-C 24141950 USP54 34114 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 75665411 75665653 75665517 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 1282 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 75716399 75716797 75716501 Y FUT11,NDST2 PLAU,VCL CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VCL 39075 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 75931649 75931916 75931783 Y NA AP3M1,ADK NA NA NA NA ADK 22689 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 76053029 76053199 76053114 Y NA NA NA NA NA NA ADK 144069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 76633406 76633470 76633438 Y NA NA NA NA NA NA KAT6B 50066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 76737758 76737994 76737873 Y MYST4,SAMD8 NA NA NA NA NA SAMD8 119350 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 77189888 77190112 77189953 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 168886 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 77290134 77290404 77290261 Y SAMD8 NA C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 68594 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 77873300 77873608 77873454 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 514302 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 78792238 78792506 78792372 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 891872 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 80062995 80063366 80063293 Y NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 271477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 80338617 80339123 80338873 Y ZMIZ1 NA RPS24,ZMIZ1,LOC283050,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 ZMIZ1 487669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 80516479 80516892 80516667 Y ZMIZ1 NA LOC283050,RPS24,ZMIZ1,POLR3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMIZ1 309900 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 80860192 80860276 80860234 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 33400 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 80897644 80897901 80897807 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 70852 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr10 80944867 80945213 80944956 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 118075 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 5.81768868616989 chr10 81004480 81004949 81004783 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 100276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 81005366 81005598 81005460 Y PPIF NA NA NA NA NA PPIF 99627 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 81006414 81006827 81006670 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 98398 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81025991 81026714 81026492 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 78511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81027973 81028590 81028056 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76635 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81028676 81029041 81028720 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76184 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81030651 81030992 81030820 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 74233 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81033900 81034354 81034135 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 70871 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81059255 81059879 81059575 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 45346 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81077317 81078576 81077648 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 26649 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81083033 81083464 81083190 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 21761 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 81085771 81086240 81085963 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 18985 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81116031 81116092 81116064 Y NA PPIF ZCCHC24 IMR90 Hi-C 24141950 PPIF 10806 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 81698656 81698964 81698816 Y ANXA11 NA NA NA NA NA RP11-773D16.1 114306 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 81960969 81961796 81961521 Y SH2D4B,ANXA11 ANXA11 NA NA NA NA ANXA11 1532 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 82237584 82237869 82237663 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 25662 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 82253401 82253904 82253623 Y NA TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 39794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 82260440 82261008 82260524 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 32690 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 82288045 82288198 82288158 Y TSPAN14,SH2D4B RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 5500 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 82415742 82416112 82416077 Y NA NA NA NA NA NA RP11-137H2.4 122044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 85282693 85283044 85282869 Y NA NA NA NA NA NA GHITM 614152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 86152070 86152317 86152175 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP5 165882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 86993464 86993568 86993516 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP5 675265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 87180980 87181126 87181053 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP5 862781 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 87985912 87985977 87985945 Y NA NA NA NA NA NA WAPAL 293595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA NA WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 WAPAL 119278 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 88160347 88160841 88160714 Y OPN4,GRID1 NA WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 WAPAL 118731 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP8 81420 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 89519838 89520126 89519981 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 55559 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 89602886 89603081 89603056 Y NA CFL1P1,ATAD1,PTEN NA NA NA NA ATAD1 3786 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 89822298 89822728 89822336 Y KLLN,PTEN NA RNLS,KLLN,PTEN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 119039 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 89870251 89870340 89870276 Y PTEN NA PTEN,KLLN,RNLS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 166992 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 89876323 89876522 89876471 Y KLLN,PTEN NA PTEN,KLLN,RNLS,ATAD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 173064 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 89896518 89896551 89896536 Y NA NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 193259 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 89922654 89923094 89922746 Y NA NA PTEN,RNLS,KLLN,ATAD1,CFL1P1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 219395 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 90145688 90145942 90145819 Y LIPK NA NA NA NA NA RNLS 196345 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr10 90488275 90488596 90488466 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD22 120979 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 90593606 90593715 90593661 Y LIPK,LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,FAS,ANKRD22 ANKRD22,STAMBPL1 NA NA NA NA ANKRD22 15860 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 90597409 90597808 90597517 Y LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22 ANKRD22,STAMBPL1 NA NA NA NA ANKRD22 11767 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 90612844 90613292 90613035 Y IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22 ANKRD22,STAMBPL1 NA NA NA NA ANKRD22 3269 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 90618239 90618823 90618469 Y IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22 ANKRD22,STAMBPL1 ACTA2,ANKRD22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD22 8664 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 90643265 90643581 90643488 Y LIPK,FAS,STAMBPL1 ANKRD22,STAMBPL1 ACTA2 IMR90 Hi-C 24141950 STAMBPL1 5774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 90704546 90704848 90704768 Y NA FAS NA NA NA NA FAS 43566 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 90760903 90761071 90761028 Y FAS FAS NA NA NA NA FAS 12489 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 91055339 91055739 91055572 Y NA IFIT2,IFIT3 IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFIT2 3973 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 91806926 91807024 91806971 Y KIF20B NA NA NA NA NA SNRPD2P1 70452 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 92974122 92974225 92974155 Y NA PCGF5 NA NA NA NA PCGF5 3683 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 93697836 93698042 93697939 Y NA FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA BTAF1 16310 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 93991232 93991452 93991342 Y NA NHP2P1 NA NA NA NA NHP2P1 17143 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 94001133 94001473 94001377 Y CPEB3,CPEB3 NHP2P1,CPEB3,MARCH5 NA NA NA NA NHP2P1 27044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 94074059 94074408 94074234 Y NA CPEB3,MARCH5 NA NA NA NA MARCH5 25139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.43967590065189 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 94516915 94517155 94517045 Y HHEX,EXOC6 NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 70970 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 95081157 95081194 95081175 Y O3FAR1 NA NA NA NA NA XRCC6P1 113773 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 95128871 95128891 95128880 Y CYP26C1 NA NA NA NA NA CEP55 125498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 95851610 95851772 95851690 Y NA NA NA NA NA NA NOC3L 268944 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 97054774 97055369 97055126 Y ENTPD1,PDLIM1 PDLIM1 PDLIM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PDLIM1 5993 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 97157483 97157858 97157671 Y NA NA NA NA NA NA PDLIM1 108702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97236202 97236532 97236382 Y SORBS1,SORBS1 NA NA NA NA NA SORBS1 82639 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97239155 97239567 97239500 Y SORBS1,SORBS1 NA NA NA NA NA SORBS1 79604 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97302511 97302656 97302624 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 16515 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97313430 97313789 97313690 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 5382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97518502 97518757 97518660 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA TCTN3 66602 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97521944 97522167 97522133 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA TCTN3 70044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97591958 97592428 97592230 Y ENTPD1 NA NA NA NA NA TCTN3 140058 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97640254 97640658 97640438 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA CCNJ 160493 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97809134 97809259 97809196 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 7983 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 97809290 97809583 97809571 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 8139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 98308552 98308827 98308687 Y LCOR,C10orf12,ZNF518A,PIK3AP1,TM9SF3 NPM1P26,TM9SF3 NA NA NA NA NPM1P26 9115 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 98332019 98332237 98332217 Y NA NPM1P26,TM9SF3 NA NA NA NA TM9SF3 12972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 98407335 98407523 98407430 Y LCOR,C10orf12,PIK3AP1,TM9SF3 NA NA NA NA NA TM9SF3 62126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 98433072 98433822 98433312 Y LCOR,PIK3AP1,TM9SF3 PIK3AP1 NA NA NA NA PIK3AP1 44449 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 7.88202983287533 chr10 98455139 98455586 98455510 Y LCOR,TM9SF3,PIK3AP1 PIK3AP1 NA NA NA NA PIK3AP1 22685 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 98464941 98465141 98465037 Y LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1 PIK3AP1,RPL13AP5 NA NA NA NA PIK3AP1 13130 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 98468328 98468564 98468493 Y LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1 PIK3AP1,RPL13AP5 NA NA NA NA PIK3AP1 9707 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 98478120 98479023 98478503 Y LCOR,TM9SF3,PIK3AP1 RPL13AP5 NA NA NA NA PIK3AP1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 98638142 98638499 98638253 Y NA LCOR NA NA NA NA LCOR 48125 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 99113804 99114043 99113888 Y C10orf12,FRAT1,ZFYVE27,ZFYVE27,PI4K2A,FRAT2,RRP12 FRAT1,RP11-452K12.4,FRAT2,RRP12 FRAT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 FRAT2 21346 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 99167112 99167183 99167148 Y NA RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 EXOSC1,ZDHHC16,PGAM1,RRP12 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RRP12 7985 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 100153906 100154210 100154161 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 18731 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 101425049 101425416 101425233 Y NA SLC25A28,ENTPD7,CUTC NA NA NA NA ENTPD7 7786 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 101677861 101678026 101677917 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 89650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 101908352 101908679 101908530 Y DNMBP,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1 ERLIN1 NA NA NA NA ERLIN1 37412 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 101944283 101944461 101944347 Y DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1 ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6 NA NA NA NA ERLIN1 1630 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 102284617 102284981 102284927 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1848 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 103079137 103079339 103079238 Y PDZD7,BTRC BTRC FLJ41350,BTRC,FBXW4,DPCD,MIR3158-2,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 32481 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 103090701 103091057 103090801 Y PDZD7,MGEA5,BTRC BTRC BTRC,FBXW4,DPCD,POLL,TLX1NB,TLX1,FLJ41350,LBX1,MIR3158-2,MGEA5,NPM3,FGF8 IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 20763 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 103699141 103699397 103699242 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 114553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 104102854 104103008 104102931 Y ACTR1A NFKB2 PSD,FBXL15,NFKB2 IMR90 Hi-C 24141950 NFKB2 48859 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 104196250 104196338 104196269 Y NA NFKB2,FBXL15,CUEDC2,TMEM180 NA NA NA NA CUEDC2 5832 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 104359512 104359806 104359659 Y ACTR1A,C10orf26 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 42447 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 104372653 104372974 104372854 Y LDB1,NFKB2,NFKB2,TRIM8 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 29279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.00267803157156 chr10 104406463 104406725 104406695 Y NFKB2,NFKB2,TRIM8 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 4210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 104470539 104470788 104470556 Y FBXL15 ARL3,SFXN2 NA NA NA NA ARL3 1376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 104533606 104534005 104533917 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32,C10orf26 NA NA NA NA NA SFXN2 61311 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 104545681 104545915 104545784 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 66065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr10 104556220 104556459 104556323 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 55521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 104892620 104892981 104892840 Y C10orf32,NT5C2 NA NA NA NA NA NT5C2 58075 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 105001224 105001453 105001331 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50168 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 105230970 105231363 105231243 Y NT5C2,CALHM2 CALHM2 CALHM2,PDCD11,CALHM1,USMG5 IMR90 Hi-C 24141950 CALHM2 20310 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 105532054 105532211 105532109 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 81090 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 105610087 105610227 105610144 Y NA SH3PXD2A NA NA NA NA SH3PXD2A 3074 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 105654409 105654593 105654518 Y NA SH3PXD2A,OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 21370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 105667994 105668449 105668210 Y GSTO1,GSTO1,SLK OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 7514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 105853543 105853890 105853637 Y NA SFR1 SH3PXD2A IMR90 Hi-C 24141950 SFR1 25926 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 106052804 106053054 106052846 Y MEIR5,MEIR5,GSTO1 MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP NA NA NA NA GSTO2 26173 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 106464990 106465004 106464997 Y SORCS3 NA NA NA NA NA CCDC147-AS1 353657 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 108496360 108496741 108496551 Y SORCS1 NA NA NA NA NA CCDC147-AS1 2385027 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 110138864 110139232 110139127 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1542079 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 110699041 110699062 110699052 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 982249 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 111694003 111694304 111694154 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 12692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 111834173 111834352 111834276 Y ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1 NA NA NA NA NA ADD3 80047 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 111981639 111982026 111981734 Y ADD3,MXI1,MXI1 MXI1 SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 MXI1 16276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 112086434 112086715 112086567 Y DUSP5 SMNDC1 DUSP5,SMC3,RBM20,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 23725 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 112510754 112511032 112510934 Y ADRA2A NA NA NA NA NA PDCD4 118533 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 112624355 112624707 112624540 Y SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1 PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 4858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 113990529 113990656 113990593 Y NA GPAM NA NA NA NA GPAM 17394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 114148894 114149633 114149365 Y VTI1A,ACSL5,ACSL5 ACSL5 NA NA NA NA ACSL5 17118 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 114707857 114707918 114707888 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 91 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 114709018 114709405 114709296 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 1009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 115022033 115022434 115022235 Y NA NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 314024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 115070178 115070533 115070251 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 362169 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 115141716 115142302 115141804 Y TCF7L2 NA VTI1A,ZDHHC6,ACSL5,TCF7L2 IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 294640 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 116161021 116161267 116161255 Y NA NA NA NA NA NA C10orf118 229042 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 116561110 116561522 116561275 Y NA FAM160B1 AFAP1L2,ABLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM160B1 17981 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr10 116776820 116777128 116776974 Y NA NA ATRNL1 IMR90 Hi-C 24141950 TRUB1 80868 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 116902844 116903191 116903017 Y ATRNL1 NA NA NA NA NA TRUB1 206892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 116990897 116991177 116991005 Y NA NA NA NA NA NA TRUB1 294945 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 117425699 117425945 117425810 Y NA NA NA NA NA NA TRUB1 729747 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 118755256 118755410 118755333 Y NA NA NA NA NA NA SLC18A2 243194 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 120244875 120245269 120244982 Y NA NA NA NA NA NA FAM204A 145035 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 121027859 121028318 121028196 Y EIF3A,GRK5 NA NA NA NA NA PRDX3 91514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 121028416 121028802 121028728 Y EIF3A,GRK5 NA NA NA NA NA PRDX3 92071 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 121544240 121544543 121544312 Y NA NA MCMBP IMR90 Hi-C 24141950 MCMBP 105525 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 123418268 123418559 123418278 Y NA NA NA NA NA NA FGFR2 62296 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 125994221 125994735 125994322 Y CHST15,FAM175B NA NA NA NA NA OAT 110810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 125995390 125995927 125995626 Y NA NA NA NA NA NA OAT 109618 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126223134 126223253 126223169 Y CHST15,FAM53B RPS10P18 NA NA NA NA RPS10P18 45987 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126251501 126251899 126251725 Y METTL10 NA NA NA NA NA RPS10P18 74354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126329186 126329692 126329619 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 101146 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126329893 126330183 126330084 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 100655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126336359 126336702 126336537 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 94136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126338756 126339243 126338968 Y FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 91595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126347478 126347709 126347686 Y ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 83129 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126373894 126374059 126373997 Y ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 56779 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 126407586 126408269 126407949 Y ZRANB1,FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 22569 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126421726 126422139 126421939 Y FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 8699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126445536 126445891 126445571 Y ZRANB1 FAM53B,METTL10,FAM175B NA NA NA NA FAM53B 14698 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126490996 126491131 126491100 Y NA METTL10,FAM175B NA NA NA NA FAM175B 2642 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 126768245 126768621 126768433 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 79118 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 127574091 127574564 127574346 Y NA DHX32,FANK1 NA NA NA NA DHX32 8441 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 127824574 127824998 127824837 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 241466 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 127877615 127877988 127877913 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 294507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 128250187 128250329 128250271 Y DOCK1 NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK1 341649 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 129704108 129704655 129704249 Y PTPRE PTPRE NA NA NA NA PTPRE 783 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 130019475 130019749 130019593 Y PTPRE,PTPRE NA EBF3 IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 96826 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 130339551 130339892 130339738 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 416902 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 132099901 132100191 132100002 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 167238 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 133575509 133575820 133575665 Y NA NA TCERG1L IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 217615 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 133793049 133793425 133793362 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 10 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 134221496 134221692 134221620 Y PWWP2B PWWP2B,RP11-432J24.2 NA NA NA NA RP11-432J24.2 8895 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 RP11-432J24.2 NA NA NA NA RP11-432J24.2 29754 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr10 134364689 134365427 134365071 Y INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 15365 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr10 134369255 134369540 134369399 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 19931 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 134385594 134385710 134385631 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 36270 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 134388737 134389185 134389009 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 39413 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr10 135074691 135075148 135074934 Y TUBGCP2,ADAM8 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 13224 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 135092436 135092746 135092593 Y ADAM8,TUBGCP2 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 4064 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 135107749 135108037 135107982 Y ADAM8,TUBGCP2 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 11942 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 135119353 135119734 135119518 Y ADAM8,TUBGCP2 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 245 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 135322182 135322530 135322356 Y NA NA NA NA NA NA MTG1 116584 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr10 135342737 135342867 135342819 Y KNDC1,PRAP1,C10orf125,ECHS1,CYP2E1 NA NA NA NA NA MTG1 137139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 269337 269903 269511 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1 PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1 NA NA NA NA ATHL1 17232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 IFITM3 30340 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 741538 741804 741722 Y IRF7,IRF7 TMEM80,DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5 NA NA NA NA TALDO1 3525 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 944711 944765 944751 Y NA CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 21817 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 1241085 1241212 1241149 Y NA NA NA NA NA NA TOLLIP 87672 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 1675907 1676168 1675978 Y NA NA NA NA NA NA IFITM10 93653 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 1802371 1802846 1802577 Y TOLLIP,TNNI2,LSP1 IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8 IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 CTSD 19149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 1935889 1936214 1936052 Y IGF2,KRTAP5-3,TNNI2,TNNI2,TNNT3 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 30294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 1936655 1937042 1936845 Y TSSC4,TSPAN32,C11orf21,TNNI2,LSP1 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 29466 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 1982665 1983112 1982762 Y TH,IGF2,IGF2 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 16157 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 2082720 2083054 2082737 Y NA NA MOB2,IGF2-AS1,IGF2,INS-IGF2,LSP1,TH,MIR4686 IMR90,K562,GM12878,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 MRPL23 116212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 2844154 2844443 2844383 Y TSSC4,KCNQ1 NA NA NA NA NA CDKN1C 60668 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 3860220 3860837 3860518 Y NA PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4,MIR4687 NA NA NA NA RHOG 7 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr11 3880869 3881074 3880973 Y NA RHOG,STIM1,AC090587.4,MIR4687 NA NA NA NA MIR4687 5577 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 3902068 3902471 3902356 Y OR52B4,CHRNA10,NUP98,RHOG,STIM1 RHOG,STIM1,AC090587.4,MIR4687 NA NA NA NA MIR4687 26776 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 4413870 4414271 4414071 Y OR52K2,TRIM21 TRIM21 NA NA NA NA TRIM21 944 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 5504793 5505065 5505006 Y NA NA NA NA NA NA AC104389.32 122948 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 5836872 5837003 5836927 Y TRIM34,TRIM5,TRIM22,FAM160A2,OR52N5 NA NA NA NA NA TRIM5 120846 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 8857868 8857938 8857900 Y NA NA NA NA NA NA ST5 72560 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 9018976 9019300 9019138 Y NA TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3 NA NA NA NA NRIP3 4296 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 9588297 9588534 9588393 Y NA WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 4694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 9623030 9623285 9623166 Y ZNF143,WEE1,WEE1 WEE1 NA NA NA NA WEE1 29802 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 9703256 9703389 9703323 Y WEE1 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 19632 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 9710363 9710796 9710568 Y NA SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 26739 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 9760793 9761081 9760939 Y NA NA NA NA NA NA SWAP70 77169 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 9770028 9770265 9770206 Y WEE1,SWAP70 NA NA NA NA NA SWAP70 86404 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr11 9824167 9824574 9824403 Y NA NA NA NA NA NA SWAP70 140543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 10388178 10388602 10388329 Y ADM NA SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 AMPD3 60318 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 10436257 10436513 10436356 Y ZBED5,EIF4G2,SBF2,ADM,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3 NA MRVI1,SBF2,LOC283104,MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1,LYVE1,AMPD3,SWAP70 IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L8 92210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 10541440 10541628 10541530 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA MTRNR2L8 12717 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 10545162 10545253 10545208 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA RNF141 15524 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 10634601 10634999 10634904 Y MRVI1,MRVI1,MRVI1 NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 73782 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 12218036 12218499 12218053 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 104493 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 13244798 13244951 13244872 Y NA NA ARNTL,BTBD10 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 51248 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 13468446 13468721 13468666 Y NA BTBD10 NA NA NA NA BTBD10 14123 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 14563953 14564333 14564143 Y NA COPB1,PSMA1 NA NA NA NA PSMA1 24063 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 14785995 14786323 14786008 Y NA NA NA NA NA NA PDE3B 122726 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 16924689 16924921 16924805 Y NA NA NA NA NA NA RP11-466H18.1 69639 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 17164162 17164523 17164517 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C2A 63007 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 18404883 18405218 18405078 Y LDHA LDHA NA NA NA NA LDHA 8717 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 19938604 19938915 19938760 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 444316 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 19968611 19968779 19968666 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 414452 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 21478993 21479254 21479124 Y NA NA NA NA NA NA PRMT3 1071917 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 21637390 21637593 21637490 Y NA NA NA NA NA NA AC103801.2 1007267 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 22631991 22632283 22632136 Y NA AC103801.2,FANCF NA NA NA NA AC103801.2 12577 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 22814174 22814335 22814255 Y SVIP RP11-17A1.3,SVIP NA NA NA NA RP11-17A1.3 34591 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 23079827 23079841 23079834 Y NA NA NA NA NA NA SVIP 229982 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 26146208 26146539 26146374 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 1236876 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 27683148 27683223 27683174 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 27715832 27716154 27716086 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 25451 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 28764751 28764902 28764829 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 636896 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 31693471 31693827 31693649 Y NA NA NA NA NA NA RCN1 138112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 31838721 31838861 31838791 Y NA RCN1 NA NA NA NA RCN1 6782 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 32027608 32027790 32027700 Y WT1 NA PAX6,DKFZp686K1684,RCN1,IMMP1L IMR90 Hi-C 24141950 RCN1 195669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 33181656 33182005 33181958 Y NA NA NA NA NA NA CSTF3 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 33742880 33743486 33743237 Y NA CD59 NA NA NA NA CD59 12505 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 33778086 33778269 33778178 Y FBXO3 CD59,FBXO3 NA NA NA NA FBXO3 15820 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 33933945 33934087 33934016 Y LMO2,LMO2 LMO2 NA NA NA NA LMO2 22109 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 34322205 34322459 34322337 Y NA RP1-145M24.1 NA NA NA NA RP1-145M24.1 33091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 35057314 35058112 35057719 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 100305 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 35060106 35060254 35060180 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 98163 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 35094290 35094666 35094566 Y NA NA CD44,PDHX,APIP IMR90 Hi-C 24141950 CD44 63751 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr11 35105542 35105874 35105596 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 35132711 35132959 35132793 Y CD44 CD44 PDHX,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 25458 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 35186946 35187176 35187019 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 28529 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 35249361 35250020 35249669 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 90944 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 35257615 35257771 35257693 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 99198 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 36430795 36431099 36430893 Y TRAF6,PRR5L,PRR5L NA NA NA NA NA TRAF6 98723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 36530791 36531124 36530883 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 969 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 38210456 38210607 38210524 Y NA NA NA NA NA NA TRAF6 1680634 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 40212803 40212875 40212839 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 1345109 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 41472034 41472205 41472120 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 85779 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 44306158 44306224 44306191 Y ALX4 NA NA NA NA NA EXT2 191059 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 44563619 44563844 44563718 Y TSPAN18 CD82 EXT2,ACCS,ALX4,CD82,TSPAN18,PRDM11,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 CD82 20133 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 44590064 44591217 44590888 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 6087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 44592209 44592382 44592320 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 8232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 44596848 44597017 44596918 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 12871 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 44722938 44723067 44723002 Y NA TSPAN18 EXT2,TSPAN18,SYT13,CD82,PRDM11 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN18 22948 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 44811220 44811449 44811326 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN18 65205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 45069975 45070079 45070038 Y PRDM11 NA SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1 IMR90 Hi-C 24141950 TP53I11 99135 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 45864713 45865116 45864826 Y NA SLC35C1,CRY2 NA NA NA NA CRY2 1553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 46135373 46135563 46135504 Y PHF21A,AMBRA1 PHF21A NA NA NA NA PHF21A 5422 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 46143609 46143973 46143928 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 2624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 46534596 46534834 46534715 Y AMBRA1 NA NA NA NA NA AMBRA1 78841 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 47173206 47173550 47173416 Y NA ARFGAP2 NA NA NA NA ARFGAP2 23126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 47402161 47402584 47402458 Y MADD,MADD,MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SPI1,SLC39A13,RP11-750H9.5,PSMC3 NA NA NA NA SPI1 4034 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 48009293 48009653 48009420 Y CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 9180 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 48040860 48041151 48041006 Y CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 40747 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 57200214 57200547 57200409 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 PRG2,SLC43A3,RTN4RL2 SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5 IMR90 Hi-C 24141950 SLC43A3 7161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 57224938 57225034 57225001 Y SLC43A1,SLC43A1,SERPING1,PRG3 SLC43A3,RTN4RL2 NA NA NA NA RTN4RL2 988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 57371918 57372022 57371970 Y SLC43A1,SERPING1 UBE2L6,AP000662.4,CLP1,YPEL4 NA NA NA NA AP000662.4 31475 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr11 57713900 57713912 57713908 Y UBE2L6,OR9I1,OR5B17,OR1S1,OR10Q1,OR5B3,OR5B2,OR5B12,OR1S2,OR10W1,OR9Q2,OR9Q1,OR6Q1 NA NA NA NA NA CTNND1 195185 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 58991167 58991369 58991315 Y FAM111A,MPEG1,PATL1 MPEG1 NA NA NA NA MPEG1 12743 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 59034118 59034187 59034153 Y OR4D6,OR4D10,OR5A1,OR4D9,OR10V1 NA NA NA NA NA MPEG1 55694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 59278449 59278607 59278583 Y MPEG1,OR4D6,STX3,PATL1 NA NA NA NA NA OSBP 103010 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 59894907 59895094 59895001 Y OR10V1,STX3,MS4A13,MS4A2 NA NA NA NA NA RP11-736I10.2 52084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 59941614 59941716 59941665 Y MS4A7,MS4A4A,MS4A6A,MS4A6A MS4A6A NA NA NA NA MS4A6A 8423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 61064926 61064998 61064962 Y NA DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 33684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 61074897 61075402 61075197 Y CD6 DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 23280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,FADS2 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 62324383 62324580 62324456 Y WDR74,NXF1,EML3 AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 2676 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 62586827 62586893 62586843 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 10667 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 63321382 63321591 63321464 Y RARRES3,OTUB1 LGALS12,RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 19101 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 63639638 63639903 63639715 Y NA MARK2,RCOR2 NA NA NA NA MARK2 35238 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 63837811 63837961 63837886 Y NA NA NA NA NA NA OTUB1 86486 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 64238125 64238462 64238294 Y NA NA NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,MAP4K2,SF1,EHD1 IMR90,H1ESC,HELA,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 RPS6KA4 113505 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 64267191 64267548 64267420 Y RASGRP2 NA NRXN2,RASGRP2,PYGM,SLC22A12 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KA4 142571 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 64629180 64629438 64629292 Y TIGD3,CDC42EP2,RASGRP2,RASGRP2,SF1,SF1,SF1,MAP4K2,FAU,EHD1,ATG2A EHD1 NA NA NA NA EHD1 24330 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 64916686 64916783 64916734 Y NRXN2,C11orf85 TM7SF2,ZNHIT2,MRPL49,FAU,SYVN1,CAPN1 SYVN1,CAPN1,SPDYC MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SYVN1 16682 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 4.12868229341089 chr11 65411467 65411885 65411633 Y TIGD3,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,DKFZp761E198,SIPA1,SIPA1,RELA MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA SIPA1 7899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 65492459 65492791 65492625 Y NA KAT5,RNASEH2C RNASEH2C MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNASEH2C 6041 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 65559034 65559399 65559282 Y NA SNX32 NA NA NA NA SNX32 39713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 65849089 65849462 65849117 Y KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1 SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 13255 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 65852297 65852657 65852298 Y TMEM151A,CNIH2 SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 16463 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 65949541 65949768 65949655 Y NA NA NA NA NA NA KLC2 72997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 66697442 66697531 66697487 Y SPTBN2 PC NA NA NA NA PC 26316 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 66882341 66882514 66882428 Y NA KDM2A SYT12,KDM2A,SSH3,PC,RHOD,C11orf80 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KDM2A 2226 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 67032465 67032551 67032477 Y NA ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 584 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 67037275 67037527 67037373 Y TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 5394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 67039199 67039528 67039325 Y TBC1D10C,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 7318 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 67138301 67138677 67138619 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,TBC1D10C,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 378 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,TBC1D10C,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 68049630 68050030 68049692 Y NA C11orf24,LRP5 NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf24 12161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 68099033 68099353 68099110 Y NA LRP5 NA NA NA NA LRP5 20956 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr11 68141745 68141881 68141821 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 63668 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr11 68596165 68596440 68596230 Y MTL5,CPT1A CPT1A NA NA NA NA CPT1A 13438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 68611298 68611611 68611498 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1420 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 69857412 69857795 69857515 Y NA NA ANO1,FADD,ORAOV1 IMR90 Hi-C 24141950 FADD 189474 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 70159213 70159451 70159301 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 44407 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 71704625 71704847 71704670 Y NA IL18BP NA NA NA NA IL18BP 2740 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 71936800 71937067 71937009 Y INPPL1 INPPL1 NA NA NA NA INPPL1 4055 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 72003135 72003262 72003223 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 70390 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 72431268 72431435 72431330 Y FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 71209 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 72452508 72452870 72452656 Y STARD10,ATG16L2,ARAP1 ARAP1,STARD10 NA NA NA NA ARAP1 49774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 72498496 72498726 72498679 Y STARD10 ARAP1,STARD10,ATG16L2 NA NA NA NA ARAP1 3918 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr11 72555518 72555570 72555544 Y ATG16L2 ATG16L2 NA NA NA NA ATG16L2 32165 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 72662392 72662530 72662447 Y ARAP1,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT NA ATG16L2 IMR90 Hi-C 24141950 ATG16L2 139039 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 72854261 72854849 72854638 Y PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2 FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 2955 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr11 72909664 72909952 72909864 Y RELT,RELT,P2RY2,P2RY2 P2RY2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT IMR90 Hi-C 24141950 P2RY2 17391 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 73097153 73097443 73097265 Y FCHSD2,P2RY2,P2RY2,RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 11844 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 73706184 73706513 73706422 Y LIPT2,C2CD3,UCP2 UCP2 UCP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UCP2 13832 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 73722792 73723138 73723056 Y LIPT2,C2CD3,UCP2 UCP2 UCP2 K562 ChIA-PET 22265404 UCP2 30440 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 74871497 74871764 74871689 Y OR2AT4 NA NA NA NA NA NEU3 174318 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 74986725 74986901 74986808 Y DGAT2,ARRB1 NA NA NA NA NA ARRB1 73972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 75041361 75041638 75041486 Y ARRB1 ARRB1 NA NA NA NA ARRB1 19235 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 75060875 75061139 75061045 Y UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1 ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 2 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 75061558 75062072 75061823 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 685 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 75080203 75080380 75080292 Y ARRB1 ARRB1,RPS3,SNORD15B RPS3,ARRB1,GDPD5,XRRA1,NEU3,SPCS2,SLCO2B1,LOC100507050,KLHL35,SERPINH1,MAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARRB1 19330 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 NA NA NA NA NA PRKRIR 169769 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 75946013 75946323 75946187 Y NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 143692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 76353435 76353617 76353564 Y ACER3 LRRC32 NA NA NA NA LRRC32 26174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 76574228 76574537 76574458 Y OMP,ACER3 ACER3 NA NA NA NA ACER3 4317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2-KCTD14 37557 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 78000759 78000964 78000861 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 102891 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 78001305 78001608 78001428 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 103437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 78002337 78002637 78002489 Y NA NA NA NA NA NA KCTD21 104469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 78073883 78074276 78074154 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 53118 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 81696174 81696306 81696246 Y NA NA NA NA NA NA RP11-742N3.1 702265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 82418428 82418611 82418439 Y FAM181B RP11-742N3.1 NA NA NA NA RP11-742N3.1 19857 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 83190033 83190209 83190121 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 194583 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 83291402 83291636 83291613 Y DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 295952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 83668458 83668564 83668511 Y DLG2,DLG2,DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 673008 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 84327664 84327984 84327824 Y DLG2 NA NA NA NA NA TMEM126B 1009645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 85451857 85452132 85451995 Y NA NA NA NA NA NA CREBZF 59906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 85702937 85703343 85703240 Y NA NA NA NA NA NA PICALM 75581 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 85913618 85914066 85913698 Y PICALM,PICALM EED PICALM,CCDC83,EED IMR90 Hi-C 24141950 EED 39520 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 86222200 86222363 86222315 Y NA NA NA NA NA NA ME3 159315 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 86262463 86262643 86262563 Y FZD4 NA NA NA NA NA ME3 119035 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 86381936 86382132 86382071 Y NA ME3 NA NA NA NA ME3 258 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 87251916 87252279 87252098 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 505030 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 88041244 88041443 88041379 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 27512 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr11 88276753 88276819 88276788 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 207798 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 88447557 88447832 88447814 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 378602 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 88478875 88479129 88479002 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 409920 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 88909137 88909241 88909198 Y TYR NA NA NA NA NA CTSC 840182 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 91979590 91979911 91979751 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 949219 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 93227642 93227915 93227778 Y NA RP11-288E14.2 NA NA NA NA RP11-288E14.2 38719 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 93262165 93262293 93262229 Y SLC36A4,C11orf75 RP11-288E14.2 NA NA NA NA RP11-288E14.2 4341 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 95610217 95610530 95610374 Y NA MTMR2 NA NA NA NA MTMR2 45949 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 95987343 95987574 95987537 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 86770 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 96104891 96105001 96104961 Y NA MAML2,CCDC82,JRKL NA NA NA NA CCDC82 16086 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 96579211 96579589 96579400 Y NA NA NA NA NA NA JRKL 458058 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 97132944 97132967 97132956 Y NA NA NA NA NA NA JRKL 1011791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 97538549 97538882 97538714 Y NA NA NA NA NA NA CNTN5 1350801 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 100596808 100596968 100596888 Y NA NA NA NA NA NA BIRC3 1589247 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 102296028 102296376 102296245 Y NA TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 42739 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 102481047 102481230 102481118 Y NA NA NA NA NA NA MMP7 81563 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 102867069 102867245 102867157 Y NA NA MMP13,DCUN1D5,MMP3 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D5 93699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 103316988 103317242 103317115 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 38603 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 103458864 103459163 103459058 Y NA NA DYNC2H1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37O16.8 180479 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 103504226 103504419 103504320 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37O16.8 225841 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 103964860 103965229 103965142 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37O16.8 686475 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 104557129 104557467 104557298 Y NA NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 CASP4 280696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 104576314 104576795 104576668 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4 NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 CASP4 261368 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 104909877 104909932 104909922 Y CASP4,CASP5,CARD17,CARD16 NA NA NA NA NA CARD16,CASP1 60226 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 107859673 107859731 107859704 Y RAB39 CUL5 NA NA NA NA CUL5 17728 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 109358669 109358908 109358789 Y NA NA DDX10 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 603179 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 109545709 109546087 109545903 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H12C 416000 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 109939977 109940512 109940366 Y FDX1,ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C K562 ChIA-PET 22265404 ZC3H12C 21575 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr11 109957593 109958086 109957862 Y FDX1,ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3H12C 4001 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 109958650 109959379 109958908 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 2708 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 6.56835819406278 chr11 109965770 109966113 109965869 Y RDX,FDX1,ZC3H12C ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 3683 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 109990513 109990553 109990536 Y NA ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 28426 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 110241941 110242123 110242024 Y NA NA RDX IMR90 Hi-C 24141950 FDX1 56484 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 111050113 111050490 111050428 Y NA NA ARHGAP20,C11orf53 IMR90 Hi-C 24141950 SIK2 420625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 111191582 111191686 111191634 Y NA NA NA NA NA NA SIK2 279429 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 111534401 111534774 111534406 Y CRYAB NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK2 63286 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 111990651 111990899 111990830 Y NA C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18 NA NA NA NA SDHD 35024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 112031842 112032080 112031914 Y IL18,BCO2 IL18 NA NA NA NA IL18 760 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 112833069 112833192 112833175 Y NCAM1 NCAM1 NA NA NA NA NCAM1 3072 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 113059055 113059658 113059425 Y NA NA NA NA NA NA TTC12 123593 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 17089 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 113950793 113951339 113951236 Y TMPRSS5,ZBTB16,ZBTB16 ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 22478 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 113999597 113999969 113999698 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB16 71282 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 114030720 114031134 114030934 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA ZBTB16 102405 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 114049941 114050567 114050227 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA ZBTB16 121626 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 114162667 114162750 114162694 Y NA NA NA NA NA NA RBM7 106002 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 115557562 115557587 115557575 Y NA NA CADM1,LOC283143 IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 1084117 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 115801811 115802176 115802022 Y NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 839528 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 115927374 115927450 115927387 Y NA NA NA NA NA NA BUD13 714254 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 116458442 116458607 116458525 Y NA NA NA NA NA NA BUD13 183097 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 116722234 116722744 116722542 Y NA NA NA NA NA NA ZNF259 65468 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 116800933 116801381 116801052 Y SIK3,PCSK7 NA NA NA NA NA ZNF259 144167 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 116802235 116802679 116802498 Y SIK3,PCSK7 NA NA NA NA NA ZNF259 145469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 117050933 117051273 117050997 Y SIDT2 PAFAH1B2,SIDT2,PCSK7 NA NA NA NA SIDT2 3484 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 117685393 117685836 117685712 Y IL10RA NA NA NA NA NA FXYD6-FXYD2 59546 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 117819938 117820147 117820063 Y IL10RA IL10RA FXYD6-FXYD2,DSCAML1,TMPRSS13,IL10RA IMR90 Hi-C 24141950 IL10RA 34916 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 117882756 117883280 117883084 Y NA IL10RA NA NA NA NA IL10RA 27693 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 118112268 118112532 118112411 Y IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D AMICA1,MPZL3,MPZL2 NA NA NA NA MPZL3 8533 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr11 118187372 118187677 118187544 Y DDX6,UBE4A,MLL,MPZL3,CD3E,CD3G,CD3D CD3E,UBE4A NA NA NA NA CD3E 14112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 118481750 118482023 118481896 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46 NA NA NA NA IFT46 40065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 118489703 118490017 118489779 Y NA ARCN1,IFT46 NA NA NA NA IFT46 48018 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 118562658 118562793 118562724 Y FOXR1 NA BCL9L,DDX6,CXCR5,MIR4492,FOXR1,UPK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX6 97065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 118740767 118741727 118741016 Y MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6 NA DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BCL9L 52590 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 119595869 119596204 119596037 Y NA PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 1590 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 120895811 120895984 120895886 Y GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA TBCEL NA NA NA NA TBCEL 3030 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 121353016 121353670 121353326 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 32104 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 121355865 121356201 121356100 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 34953 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 121594118 121594399 121594120 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 273206 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 122052220 122052515 122052369 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 471868 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 122080743 122080920 122080836 Y NA NA SORL1,BLID,MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 UBASH3B 443463 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 122311334 122311672 122311591 Y NA NA SC5DL,MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 UBASH3B 212711 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 122568426 122568832 122568574 Y UBASH3B UBASH3B NA NA NA NA UBASH3B 44043 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 122608190 122608588 122608260 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 83807 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 122614600 122615453 122614815 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 90217 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 122949899 122950101 122950094 Y CLMP RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 17961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 123941712 123941923 123941829 Y OR8B12,OR8G2 VWA5A PANX3,OR8B2,VWA5A,OR8A1 IMR90 Hi-C 24141950 VWA5A 42146 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 124391253 124391530 124391392 Y OR10G7,OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1 NA NA NA NA NA TBRG1 99202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 125992920 125993185 125993052 Y NA NA CDON,DDX25 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1P1 57486 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 126188574 126188806 126188644 Y NA TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 16361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 126290424 126290762 126290592 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 66889 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr11 126337982 126338153 126338089 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 114447 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 128149754 128150077 128149906 Y NA NA KCNJ1,FLI1,ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 305376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 128596798 128597188 128596845 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 42368 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 130253238 130253357 130253298 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB44 70657 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 131799015 131799372 131799184 Y NTM NA NA NA NA NA SNX19 1014611 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 132409803 132410133 132410132 Y NA NA NA NA NA NA JAM3 1526687 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr11 134225265 134225400 134225316 Y NA NA NA NA NA NA ACAD8 103876 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 794631 794815 794739 Y CCDC77,KDM5A NINJ2 NINJ2,WNK1,B4GALNT3 IMR90 Hi-C 24141950 NINJ2 23686 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 1157508 1157869 1157627 Y ERC1 NA NA NA NA NA ERC1 59833 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA FBXL14 293074 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 1698978 1699322 1699295 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 1699844 1700200 1699934 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 1131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 1718029 1718183 1718131 Y ADIPOR2 FBXL14 FBXL14 MCF7 ChIA-PET 22265404 FBXL14 16698 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 2307539 2307834 2307597 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 195838 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 2467815 2468125 2467879 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1C-AS1 330241 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 2749982 2750016 2749999 Y NA CACNA1C-AS1 NA NA NA NA CACNA1C-AS1 48350 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr12 4448343 4448720 4448381 Y PARP11,CCND2,C12orf5 C12orf5,FGF23 NA NA NA NA C12orf5 19972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 4501724 4501927 4501789 Y NA FGF23 NA NA NA NA FGF23 14830 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.43967590065189 chr12 4543974 4544184 4544124 Y NA NA NA NA NA NA FGF23 57080 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 4758958 4759134 4759102 Y NA AKAP3,NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 2697 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 5918139 5918518 5918331 Y NA NA NA NA NA NA VWF 313418 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 6013764 6014121 6013944 Y VWF NA NA NA NA NA VWF 217815 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 6178640 6178845 6178761 Y TNFRSF1A NA NA NA NA NA VWF 53091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 6248004 6248757 6248208 Y NA VWF VWF,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 VWF 16068 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 6291358 6291755 6291562 Y VWF,CD9 CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 15126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 6332021 6332332 6332117 Y LPAR5 CD9 NA NA NA NA CD9 25140 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 6403662 6404056 6403860 Y PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6 TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 45224 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 6721904 6722326 6722186 Y GPR162,ENO2,C12orf53 NOP2,CHD4,ING4 NA NA NA NA CHD4 7262 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 6854848 6855156 6854990 Y TAPBPL,VAMP1,CHD4,ZNF384,PTPN6,CD4,CD4 COPS7A,PTMS,MLF2,CD4 NA NA NA NA PTMS 17526 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 6901890 6902092 6902006 Y TAPBPL,IFFO1,CHD4,ING4,ZNF384,ZNF384,PTPN6,CD4,CD4 PTMS,MLF2,CD4,GPR162,LEPREL2 NA NA NA NA CD4 7866 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 7058106 7058233 7058157 Y ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,PTPN6,EMG1,PHB2 NA NA NA NA PTPN6 4475 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2,C3AR1 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 9057442 9057557 9057500 Y CLEC6A,CLEC4D,CLEC4E,PHC1,M6PR M6PR,KLRG1 NA NA NA NA M6PR 42994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 9803369 9803672 9803507 Y KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D KLRB1,CLEC2D NA NA NA NA CLEC2D 11893 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 9910959 9911930 9911334 Y KLRB1,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69 CLECL1 NA NA NA NA CD69 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 9926148 9926473 9926272 Y CLEC2A,CD69 CLECL1,CD69 NA NA NA NA CD69 14651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 9966772 9967089 9966969 Y KLRB1,CD69,KLRD1,KLRD1,KLRF2,KLRF1,CLEC2B NA NA NA NA NA CLEC2B 53646 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 10538589 10538605 10538596 Y KLRC4-KLRK1,KLRK1,KLRC4 NA NA NA NA NA KLRD1 161932 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 10712275 10712375 10712307 Y KLRD1,KLRD1,KLRK1,KLRC4,KLRC4-KLRK1,KLRC1,KLRC1 NA CLEC1A,KLRC4-KLRK1 IMR90 Hi-C 24141950 MAGOHB 51847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 11755379 11755464 11755421 Y NA ETV6 ETV6 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 45324 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 11806275 11806670 11806607 Y BCL2L14,ETV6 ETV6 NA NA NA NA ETV6 5487 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 11864651 11864937 11864724 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 63863 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 11872628 11873141 11872822 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 71840 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 11893113 11893308 11893155 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 92325 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 11902953 11903896 11903427 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 102165 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 11918792 11919487 11919193 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118004 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 11926847 11927297 11927011 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 126059 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr12 11949422 11949819 11949574 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 148634 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 11963262 11963646 11963299 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 162474 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 12009987 12010279 12010170 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 209199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 12162075 12162513 12162342 Y ETV6,LOH12CR1,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 99584 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 12164191 12164556 12164498 Y NA NA ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 97541 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 12185852 12185959 12185898 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-267J23.4 76138 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 36148 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 12352896 12352921 12352909 Y NA NA NA NA NA NA LRP6 65025 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 12532834 12533375 12533099 Y DUSP16,CDKN1B,APOLD1,BCL2L14,LOH12CR1 MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 NA NA NA NA LOH12CR1 24821 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 12602381 12602995 12602706 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 94368 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 12883612 12883681 12883638 Y APOLD1 CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 17620 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 13251023 13251431 13251083 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 55805 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 13251588 13252400 13252038 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 56370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 14410616 14411017 14410842 Y PLBD1 NA ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 105593 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 18905579 18905804 18905692 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 374844 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 19496981 19496995 19496989 Y NA NA NA NA NA NA AEBP2 57984 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 24549320 24549550 24549435 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 550843 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 24895336 24895635 24895539 Y BCAT1 NA SOX5,LINC00477 IMR90 Hi-C 24141950 BCAT1 204758 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 25211723 25211990 25211841 Y C12orf77,LRMP LRMP NA NA NA NA LRMP 39787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 136520 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr12 26484826 26485166 26485077 Y NA NA NA NA NA NA RASSF8 374864 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 26622713 26623111 26622903 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 361020 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 26626326 26626794 26626426 Y FGFR1OP2 NA NA NA NA NA ITPR2 357337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 26921613 26921734 26921675 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 62397 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 27513734 27513812 27513790 Y NA ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 29947 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 27557115 27557162 27557139 Y C12orf71,KLHDC5 NA NA NA NA NA ARNTL2 73328 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 27565982 27566076 27566029 Y ARNTL2 NA NA NA NA NA ARNTL2 82195 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 27613510 27613909 27613776 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 60455 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 7.69436245590211 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 29312653 29312987 29312866 Y NA FAR2 FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 12617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 29317763 29317994 29317897 Y NA FAR2 NA NA NA NA FAR2 17727 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr12 29395961 29396397 29396130 Y NA NA NA NA NA NA RP11-996F15.2 72384 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 29487594 29487680 29487637 Y NA RP11-996F15.2,ERGIC2 NA NA NA NA RP11-996F15.2 18813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 32059556 32059920 32059668 Y AMN1,H3F3C,C12orf35 NA AMN1 IMR90 Hi-C 24141950 H3F3C 116381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 32263319 32263494 32263407 Y NA BICD1 NA NA NA NA BICD1 5550 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 32380941 32381343 32381040 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 123172 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 32426821 32426960 32426892 Y NA NA NA NA NA NA FGD4 123503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 32636528 32636789 32636676 Y NA NA FGD4 IMR90 Hi-C 24141950 FGD4 86065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 33740370 33740630 33740504 Y NA NA SYT10,YARS2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ALG10 432586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 40457263 40457286 40457275 Y NA SLC2A13 NA NA NA NA SLC2A13 40605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 40531165 40531312 40531256 Y NA SLC2A13 LRRK2 GM12878 5C 22955621 SLC2A13 33274 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 40610826 40611008 40610899 Y LRRK2 NA NA NA NA NA SLC2A13 112935 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 41680022 41680168 41680092 Y PDZRN4 NA NA NA NA NA GXYLT1 856513 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 46614251 46614418 46614333 Y NA SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 47382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 46956105 46956322 46956188 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 180643 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 47057089 47057400 47057270 Y NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 281627 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 47074564 47074850 47074707 Y NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 299102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA NA NA NA NA NA RPAP3 622595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 47613849 47614234 47614042 Y FAM113B NA NA NA NA NA RPAP3 483610 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 47701468 47701752 47701723 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 396092 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 47749691 47750629 47750307 Y NA NA FAM113B,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 347215 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 47755231 47755452 47755328 Y NA NA AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 342392 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 48202856 48203019 48202950 Y VDR,ASB8 RAPGEF3,HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 21896 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 48297772 48297979 48297886 Y ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR VDR NA NA NA NA VDR 36852 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 48431282 48431505 48431439 Y NA NA NA NA NA NA PFKM 65417 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 49371065 49371287 49371156 Y NA ARF3,PRKAG1 NA NA NA NA ARF3 21731 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 49584331 49584382 49584372 Y CACNB3,PRPF40B,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A NA NA NA NA TUBA1A 3224 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 49595765 49596022 49595888 Y LMBR1L TUBA1C,TUBA1A TUBA1A,TUBA1B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TUBA1A 14658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 50056796 50057319 50056974 Y TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 42189 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 50092156 50092464 50092310 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 7044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 50092738 50092974 50092805 Y AQP2,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 6534 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 50460197 50460562 50460363 Y NA RACGAP1,SMARCD1 NA NA NA NA SMARCD1 16193 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 50555629 50555991 50555816 Y ACCN2,DIP2B CERS5 NA NA NA NA CERS5 3297 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 50899744 50900179 50899947 Y DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 2976 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 50911573 50911988 50911666 Y SLC11A2,DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 14805 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 51534048 51534251 51534150 Y POU6F1 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 30675 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 51720540 51720949 51720738 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6 BIN2 NA NA NA NA BIN2 4088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 51765347 51765619 51765517 Y FIGNL2,GALNT6 BIN2,GALNT6 BIN2,CELA1 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT6 19032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 51787794 51788248 51788116 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6 GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 3143 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 52525424 52525587 52525584 Y NA NA NA NA NA NA C12orf44 64394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 52582905 52583052 52582979 Y ACVR1B,NR4A1 NA NA NA NA NA C12orf44 121875 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 52617951 52618303 52618240 Y NA NA NA NA NA NA C12orf44 156921 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 52815165 52815335 52815250 Y NA NA NA NA NA NA C12orf44 354135 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 53056178 53056504 53056341 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 284151 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 53336677 53336830 53336786 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 3825 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 53365695 53366044 53365885 Y NA KRT18,KRT8,EIF4B NA NA NA NA KRT8 23957 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 53610241 53610633 53610310 Y PFDN5 ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA ITGB7 11150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 53795240 53795255 53795248 Y ATP5G2,ATF7 SP1,PRR13,PCBP2 NA NA NA NA SP1 23280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 54228175 54228372 54228274 Y ATP5G2 NA HOXC13,HOXC12,SMUG1 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 108646 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 54254611 54254885 54254855 Y NA NA HOXC13,HOXC12,HOTAIR,LOC100240735,FLJ12825 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CALCOCO1 135082 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 54698103 54698502 54698288 Y NFE2,NFE2 CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1 NA NA NA NA COPZ1 5117 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 54700865 54701198 54701063 Y NCKAP1L,NFE2,NFE2,ZNF385A CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1 COPZ1,CBX5,HNRNPA1,NFE2,ITGA5,ZNF385A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 COPZ1 7879 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 GPR84,ZNF385A NA NA NA NA GPR84 2387 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 54810296 54811355 54811225 Y GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5 ZNF385A ZNF385A IMR90 Hi-C 24141950 ITGA5 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 55327074 55327342 55327157 Y OR6C65,OR6C3,NCKAP1L NA NA NA NA NA NCKAP1L 437579 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 56036628 56036862 56036687 Y NA NA NA NA NA NA BLOC1S1,RP11-644F5.10 70958 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 56193144 56193361 56193252 Y OR6C3,OR6C75 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA SARNP 16179 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 56323148 56323586 56323313 Y PAN2,PAN2,DGKA DGKA,WIBG,CDK2,RAB5B NA NA NA NA WIBG 816 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr12 57079143 57079532 57079338 Y NA ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 627 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 57094657 57094840 57094721 Y STAT2,STAT6,NAB2 PTGES3,NACA,PRIM1 NA NA NA NA PTGES3 14498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 57458942 57459239 57459094 Y NA TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 20607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 57494239 57494362 57494284 Y MBD6,STAT6 TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA NAB2 13562 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 57812894 57812946 57812929 Y NA R3HDM2 NA NA NA NA R3HDM2 9842 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,TSPAN31,AGAP2 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 58134915 58135263 58135010 Y ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,DDIT3,MBD6,MARCH9,AGAP2 OS9,TSPAN31,AGAP2,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,TSFM NA NA NA NA AGAP2 975 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 59364972 59365264 59365118 Y NA NA NA NA NA NA SLC16A7 622584 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 60093413 60093661 60093518 Y NA NA NA NA NA NA SLC16A7 105565 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 60910023 60910313 60910168 Y NA NA NA NA NA NA SLC16A7 922175 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 62278702 62278999 62278851 Y NA NA NA NA NA NA USP15 373120 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 62388270 62388603 62388449 Y FAM19A2 NA NA NA NA NA USP15 263516 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 62396688 62396737 62396702 Y FAM19A2 NA NA NA NA NA USP15 255382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 62658681 62658957 62658715 Y C12orf61,USP15 USP15,FAM19A2 NA NA NA NA USP15 6562 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 62712963 62713140 62713056 Y C12orf61,MON2,USP15 FAM19A2 NA NA NA NA FAM19A2 42032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 62727827 62728150 62727887 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A2 56896 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 62772980 62773240 62773147 Y MON2,USP15 NA NA NA NA NA MON2 85357 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 64414724 64414736 64414730 Y NA NA NA NA NA NA C12orf66 199340 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 64855437 64855720 64855602 Y C12orf66,TBK1 TBK1 NA NA NA NA TBK1 11777 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 64955008 64955199 64955103 Y C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 RASSF3,GNS,MIR548Z IMR90 Hi-C 24141950 RASSF3 47094 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 65012959 65013250 65013088 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 10666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 66051570 66051762 66051716 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 164149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 66507107 66507255 66507181 Y NA RP11-745O10.2,LLPH NA NA NA NA RP11-745O10.2 15276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 66584162 66585501 66584509 Y TMBIM4,IRAK3 TMBIM4,IRAK3 NA NA NA NA IRAK3 3503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB IRAK3 NA NA NA NA IRAK3 47633 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 67404997 67405349 67405173 Y NA NA NA NA NA NA CAND1 255712 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 68220868 68220929 68220899 Y IL22 NA DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 DYRK2 180750 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 68752517 68752875 68752786 Y NA MDM1 RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107,MDM2,MDM1,SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 28356 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 69006143 69006530 69006154 Y CPM,IFNG,RAP1B RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RAP1B 3524 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr12 69180946 69181662 69181342 Y NA SLC35E3,MDM2 SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM2 18294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 69403025 69403359 69403177 Y NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6 NA CPM IMR90 Hi-C 24141950 MDM2 203069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 69724869 69725108 69724964 Y LYZ LYZ,RP11-1143G9.4,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 15013 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 70393617 70393726 70393672 Y NA NA NA NA NA NA CNOT2 241048 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 70633612 70633702 70633681 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 1072 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 70644560 70644959 70644584 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 9420 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 72691947 72692219 72692098 Y TPH2,TRHDE NA NA NA NA NA TBC1D15 460460 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 72728711 72729061 72728940 Y TPH2,TRHDE NA NA NA NA NA TBC1D15 497224 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 73141333 73141529 73141426 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D15 909846 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 73639499 73639785 73639508 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 1289766 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 73660341 73660575 73660458 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 1268976 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 75872211 75872563 75872333 Y GLIPR1 KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 76497491 76497684 76497588 Y NA NAP1L1 OSBPL8,KRR1,NAP1L1,BBS10 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1 20678 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 76919848 76920276 76920185 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 31313 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 77060081 77060100 77060091 Y NA NA E2F7,ZDHHC17 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC17 95268 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 78061184 78061442 78061321 Y NA NA NA NA NA NA E2F7 603824 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 79279208 79279511 79279476 Y NA NA NA NA NA NA RP11-84G21.1 1047170 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 79804284 79804517 79804401 Y PAWR NA NA NA NA NA RP11-84G21.1 522164 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA NA SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-84G21.1 383044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 79994209 79994302 79994256 Y NA NA NA NA NA NA RP11-84G21.1 332379 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 80305277 80305475 80305376 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA RP11-84G21.1 21206 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 80327802 80327850 80327826 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 562 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 83134280 83134513 83134356 Y NA NA NA NA NA NA TMTC2 55621 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 85197588 85197851 85197679 Y NA NA NA NA NA NA LRRIQ1 230241 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 85389492 85389695 85389594 Y NA LRRIQ1 NA NA NA NA LRRIQ1 38397 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 87554185 87554198 87554192 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 871425 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 89856198 89856331 89856264 Y NA NA NA NA NA NA POC1B 61470 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 90065189 90065567 90065562 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 35510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 90091098 90091469 90091453 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 9608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 90115396 90115765 90115565 Y DUSP6,POC1B,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 14319 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 90150470 90150910 90150738 Y NA ATP2B1 LOC338758 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP2B1 49393 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 90156268 90156641 90156423 Y DUSP6,POC1B,ATP2B1 NA LOC338758,C12orf37 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP2B1 55191 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 90256648 90256905 90256732 Y POC1B,POC1B,ATP2B1 NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 155571 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr12 90403694 90404042 90403890 Y NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 302617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 92415461 92415779 92415694 Y NA NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 121570 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 92509431 92509711 92509674 Y NA RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 27638 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 92756580 92756813 92756713 Y BTG1,C12orf74 NA NA NA NA NA BTG1 218907 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 93757893 93758168 93758031 Y NA NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 11491 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 93949724 93949882 93949803 Y NA SOCS2,SOCS2-AS1 NA NA NA NA SOCS2 11708 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 94153192 94153314 94153253 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 84041 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 94170549 94170892 94170731 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 101398 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 94539021 94539385 94539203 Y NA PLXNC1 PLXNC1,CCDC41 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNC1 1114 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 94546167 94546575 94546217 Y CRADD,TMCC3,PLXNC1 PLXNC1 NA NA NA NA PLXNC1 5668 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 94598751 94598891 94598845 Y TMCC3,PLXNC1 NA NA NA NA NA PLXNC1 58252 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 94601562 94601834 94601710 Y TMCC3,PLXNC1 NA NA NA NA NA PLXNC1 61063 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 94657337 94657688 94657449 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA PLXNC1 116838 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 94919144 94919451 94919150 Y NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 67380 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 95037542 95037565 95037554 Y PLXNC1,TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 4773 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 95224895 95225184 95225071 Y VEZT,CCDC41 NA NA NA NA NA NDUFA12 170362 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 96502190 96502534 96502487 Y NA NA CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 LTA4H 66892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 96685157 96685428 96685293 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 98997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 97109716 97109867 97109783 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 189134 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 97807548 97807831 97807690 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 508547 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 98329389 98329500 98329445 Y NA NA NA NA NA NA RP11-718L23.1 380019 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 98499120 98499188 98499154 Y NA NA NA NA NA NA RP11-718L23.1 210331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 99235060 99235389 99235225 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 198141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 102191481 102191520 102191506 Y NA GNPTAB NA NA NA NA GNPTAB 31196 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 102329942 102330412 102330197 Y DRAM1 NA NA NA NA NA DRAM1 60813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 104872178 104872670 104872343 Y HCFC2,EID3,CHST11 CHST11 NA NA NA NA CHST11 25105 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 104963305 104963849 104963618 Y CHST11 NA NA NA NA NA CHST11 116232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 104997803 104998291 104998125 Y TXNRD1,TXNRD1,CHST11 NA NA NA NA NA CHST11 150730 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 104998326 104998912 104998568 Y TXNRD1,EID3,CHST11 NA NA NA NA NA CHST11 151253 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 105020354 105020448 105020373 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 173281 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr12 105030278 105030644 105030428 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 183205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 105031434 105031802 105031612 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 184361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 105032549 105032903 105032843 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 185476 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 105038686 105039023 105038871 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 191613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 105042709 105042954 105042777 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 195636 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 105043739 105043999 105043937 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 196666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 105066347 105066673 105066397 Y TXNRD1,TXNRD1,EID3,CHST11,SLC41A2,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 219274 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 105076733 105077008 105076882 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 229660 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 105114255 105114695 105114403 Y EID3,CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA C12orf45 263393 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 105620091 105620351 105620275 Y APPL2 C12orf75,APPL2 NA NA NA NA C12orf75 6717 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 106381323 106381559 106381463 Y NA NA NUAK1,C12orf75 IMR90 Hi-C 24141950 CKAP4 314498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 106529993 106530447 106530148 Y NA NA NA NA NA NA CKAP4 165610 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 106664099 106664223 106664175 Y NA CKAP4 NUAK1,CKAP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP4 31834 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 107153976 107154194 107154103 Y RFX4,RIC8B RIC8B NA NA NA NA RIC8B 12179 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 107723329 107723653 107723513 Y NA BTBD11 NA NA NA NA BTBD11 13139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 108056293 108056559 108056439 Y NA PWP1 NA NA NA NA PWP1 20950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 108238186 108238361 108238213 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 85137 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 108994702 108995211 108994982 Y NA SART3,ISCU,SELPLG NA NA NA NA SELPLG 30524 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 109036250 109036518 109036431 Y NA SELPLG NA NA NA NA SELPLG 10515 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 109058635 109058851 109058743 Y NA SELPLG NA NA NA NA SELPLG 32900 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 109084686 109085066 109084867 Y SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 38306 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 110517549 110517856 110517740 Y GIT2,RAD9B,C12orf76 C12orf76,IFT81 C12orf76 K562 ChIA-PET 22265404 C12orf76 8058 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 111015565 111016027 111015682 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 3098 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 111028698 111029042 111028796 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1 PPTC7,TCTN1 PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPTC7 9573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.25200852367867 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 111866764 111867021 111866784 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 25012 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 111867956 111868269 111868101 Y BRAP,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 111868510 111869152 111868792 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26758 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 111883923 111883990 111883957 Y NA SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 42171 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 111939312 111939650 111939575 Y NA NA NA NA NA NA ATXN2 95830 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 112363158 112363241 112363200 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAPK5 85376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 112566952 112567278 112567115 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA TRAFD1 5647 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 112569313 112569455 112569350 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA TRAFD1 8008 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 112633664 112633952 112633817 Y NA NA TRAFD1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAFD1 72359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 112741741 112742068 112741904 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 112087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 114917726 114918063 114917895 Y NA NA TBX5,RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 201906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 116666460 116666763 116666749 Y NA MED13L NA NA NA NA MED13L 46380 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 116882134 116882504 116882286 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 86723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 116958826 116959052 116958939 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173,RP11-809C9.2 LINC00173,MED13L,MIR4472-2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 10175 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr12 116990477 116990812 116990735 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173,RP11-809C9.2 NA NA NA NA RP11-809C9.2 6566 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 117025032 117025071 117025052 Y NA RP11-809C9.2 NA NA NA NA RP11-809C9.2 41121 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 117032027 117032578 117032232 Y MED13L,MAP1LC3B2 RP11-809C9.2 NA NA NA NA RP11-809C9.2 48116 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 117049040 117049175 117049108 Y MED13L,MAP1LC3B2 RP11-497G19.1 MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-497G19.1 48212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 117100450 117100717 117100699 Y NA RP11-497G19.1 MED13L,LINC00173,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-497G19.1 3063 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 12.5737142572059 chr12 117277511 117277610 117277564 Y NOS1,RNFT2,HRK NA NA NA NA NA FBXW8 69151 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 117483062 117483484 117483386 Y NA NA NA NA NA NA TESC 51800 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 117501024 117501320 117501281 Y NA TESC NA NA NA NA TESC 33964 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 118012695 118013095 118012896 Y NA NA NA NA NA NA FBXO21 386359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 119079795 119080190 119079993 Y NA NA LOC144742 IMR90 Hi-C 24141950 SNORA38 244179 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 50122 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 120433844 120433899 120433873 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 119407 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 120639993 120640274 120640078 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1 NA NA NA NA PXN-AS1 2899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 120953454 120953584 120953519 Y MSI1 SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 15699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 120976448 120976663 120976550 Y PXN,RNF10 RNF10,COQ5,POP5 NA NA NA NA COQ5 6211 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 121179921 121180187 121180096 Y NA UNC119B,ACADS NA NA NA NA ACADS 18383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 121245538 121245859 121245790 Y NA NA NA NA NA NA ACADS 84000 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 121533843 121533975 121533917 Y NA P2RX7 ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2 IMR90 Hi-C 24141950 P2RX7 34647 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 121566211 121566268 121566242 Y P2RX4,CAMKK2,P2RX7 P2RX7 P2RX4,P2RX7 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 P2RX7 2354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 121634517 121635169 121634888 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 P2RX4 P2RX4 IMR90 Hi-C 24141950 P2RX4 10491 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr12 122067749 122067897 122067832 Y ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA ORAI1 5294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr12 122086492 122086728 122086610 Y KDM2B,SETD1B,ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA MORN3 21809 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 122227826 122228273 122227974 Y CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 11036 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 122519763 122520228 122519936 Y ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 5135 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr12 123216800 123217069 123216944 Y CLIP1,HCAR2,HCAR3,VPS37B HCAR3,DENR NA NA NA NA HCAR3 17361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 123528001 123528432 123528293 Y C12orf65,C12orf65,C12orf65 NA NA NA NA NA ABCB9 63805 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 123762972 123763139 123763056 Y RILPL2 C12orf65,MPHOSPH9,RP11-282O18.3,CDK2AP1 NA NA NA NA CDK2AP1 8091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 124875337 124875736 124875419 Y NCOR2 NA NA NA NA NA CCDC92 419959 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 124916261 124916578 124916546 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 448636 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 337221 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 125030186 125030255 125030224 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 334959 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 313839 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 125052829 125053041 125052928 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 312173 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 125160747 125161145 125161022 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 204069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 125188436 125188747 125188585 Y NCOR2,UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 176467 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 125702978 125703342 125703032 Y TMEM132B NA TMEM132B IMR90 Hi-C 24141950 AACS 155053 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 130013972 130014167 130014070 Y NA NA NA NA NA NA SLC15A4 707444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 131135835 131135937 131135878 Y PIWIL1 NA NA NA NA NA STX2 185874 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 131706292 131706484 131706406 Y NA NA NA NA NA NA GPR133 269840 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 132349078 132349283 132349182 Y NA MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 27913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 132647278 132647407 132647355 Y SFSWAP,ULK1,FBRSL1 DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2 NA NA NA NA NOC4L 20285 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr12 133016189 133016370 133016267 Y FBRSL1 FBRSL1 GALNT9,EP400NL,POLE,P2RX2 IMR90 Hi-C 24141950 FBRSL1 47767 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 133065143 133065512 133065289 Y NA FBRSL1 NA NA NA NA FBRSL1 1006 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr12 133068109 133068464 133068122 Y NA FBRSL1 NA NA NA NA FBRSL1 3972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 19643994 19644193 19644094 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 561595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 20546038 20546426 20546233 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 15228 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 20771601 20771692 20771689 Y NA NA NA NA NA NA ZMYM2 240791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 21517643 21517924 21517794 Y LATS2 XPO4 CRYL1,SKA3,MRP63,LATS2,SAP18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XPO4 42456 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 21632492 21632727 21632640 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 959 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 21649033 21649391 21649144 Y NA LATS2 LATS2,SAP18 IMR90 Hi-C 24141950 LATS2 15347 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 21649697 21649802 21649731 Y NA LATS2 LATS2,SAP18 IMR90 Hi-C 24141950 LATS2 16011 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 22135396 22135683 22135678 Y EFHA1 NA NA NA NA NA RPS7P10 65471 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 23485782 23486124 23485811 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P7 217069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr13 24289001 24289462 24289192 Y PCOTH NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 171566 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 24841578 24841694 24841650 Y PARP4 NA NA NA NA NA PARP4 243254 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 24845538 24846279 24845979 Y PARP4 NA NA NA NA NA PARP4 238669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 25082319 25082682 25082572 Y PARP4 PARP4 NA NA NA NA PARP4 2266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 25115809 25116061 25115886 Y RNF17 PARP4 NA NA NA NA PARP4 30861 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 27572004 27572077 27572041 Y NA NA RASL11A,USP12,MTIF3,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 USP12 171956 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 28167075 28167372 28167253 Y NA LNX2,POLR1D NA NA NA NA LNX2 25169 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 28672949 28673159 28673054 Y FLT3 FLT3,PAN3-AS1,PAN3 NA NA NA NA FLT3 220 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 28902249 28902665 28902587 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P3 115599 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 28929986 28930443 28930168 Y POMP NA NA NA NA NA FLT1 136822 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr13 29045646 29045856 29045744 Y PAN3 FLT1 NA NA NA NA FLT1 21409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 29114848 29114983 29114927 Y NA FLT1 FLT1,POMP,PAN3 IMR90 Hi-C 24141950 FLT1 47583 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 29326195 29326394 29326274 Y MTUS2 SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 35088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 29700126 29700781 29700341 Y NA NA NA NA NA NA SLC46A3 409019 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 30879792 30879814 30879803 Y NA KATNAL1 NA NA NA NA KATNAL1 171 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 30968898 30969238 30968927 Y NA LINC00426,LINC01058 LINC00426,KATNAL1,USPL1,HMGB1,UBL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00426 19616 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 31407198 31407336 31407268 Y HSPH1 NA USPL1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX5AP 99553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 31472880 31473382 31473215 Y C13orf33 NA NA NA NA NA ALOX5AP 165235 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 31623581 31623925 31623587 Y NA NA TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 110600 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 32690357 32690648 32690536 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2 NA NA NA NA NA FRY 86920 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 32691995 32692202 32692106 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2 NA NA NA NA NA FRY 88558 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 33841256 33841381 33841376 Y NA NA NA NA NA NA KL 253049 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 33925449 33925669 33925575 Y NA NA NA NA NA NA KL 337242 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 272945 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr13 34304425 34304581 34304508 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 85605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 35753666 35753901 35753767 Y NA NA NA NA NA NA NBEA 239242 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 36992146 36992544 36992307 Y SPG20,SPG20 SPG20,CCNA1 NA NA NA NA CCNA1 11423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 40331110 40331478 40331245 Y NA NA NA NA NA NA COG6 103346 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 41581586 41581700 41581679 Y NA NA NA NA NA NA WBP4 51710 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr13 41586512 41586699 41586606 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 46711 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 41589057 41589218 41589148 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 44192 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 41591294 41591779 41591504 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 41631 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 42162855 42163294 42163201 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 279514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 42269057 42269475 42269218 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA DGKH 342701 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 42849254 42849451 42849396 Y TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 4965 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 43123702 43124102 43123919 Y AKAP11,TNFSF11,TNFSF11 NA CCDC122,ENOX1 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP11 279413 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 43171481 43171500 43171490 Y DGKH,AKAP11,TNFSF11,TNFSF11 NA NA NA NA NA AKAP11 327192 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 43465852 43466112 43465970 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 98295 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 43623808 43623875 43623842 Y EPSTI1 DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 28469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 43656094 43656342 43656191 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 60755 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 43947076 43947305 43947191 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 351737 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 43964887 43965126 43964985 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 369548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 44115188 44115336 44115262 Y ENOX1,ENOX1 NA NA NA NA NA LACC1 336084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 44833229 44833563 44833337 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZP1 292669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 44866763 44867044 44866942 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA NUFIP1,TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 282239 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 45783444 45783799 45783571 Y TPT1,COG3 NA NA NA NA NA GTF2F2 90794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 45846557 45846941 45846749 Y NA NA NA NA NA NA TPT1-AS1 66539 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 46736375 46736487 46736423 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 47519 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 46739572 46740633 46739908 Y NA LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 43373 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 46744966 46745134 46745049 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 38872 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 46750972 46751177 46751169 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 32829 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 46752144 46752602 46752461 Y C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 31404 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr13 47043152 47043449 47043301 Y NA COX17P1 LRCH1 IMR90 Hi-C 24141950 COX17P1 19548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 47152736 47153076 47152881 Y NA LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 27433 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 47242568 47242887 47242653 Y NA NA NA NA NA NA LRCH1 117265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 48464437 48464519 48464469 Y NA NA HTR2A IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L4P3 128842 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 48478393 48478707 48478627 Y RB1 NA NA NA NA NA NUDT15 130996 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 48718696 48718843 48718708 Y RCBTB2,RB1,ITM2B,MED4 POLR2KP2 NA NA NA NA POLR2KP2 12026 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 49105819 49106173 49105865 Y RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 NA NA NA NA RCBTB2 450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 49145630 49145973 49145846 Y FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 RB1,LPAR6,RCBTB2,ITM2B IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 40261 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 49153192 49153804 49153517 Y FNDC3A,ITM2B,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 ITM2B,RB1 IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 47823 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 49154464 49154790 49154627 Y FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 NA NA NA NA RCBTB2 49095 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 49433672 49433840 49433729 Y RCBTB2,FNDC3A NA FNDC3A,MLNR IMR90 Hi-C 24141950 PSME2P2 90408 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 49458465 49458772 49458590 Y RCBTB2,FNDC3A NA FNDC3A IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3A 89276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 49470564 49470768 49470657 Y RCBTB2,FNDC3A NA NA NA NA NA FNDC3A 77280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 50701411 50701707 50701686 Y ARL11 DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU2 3555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 50796509 50797212 50796853 Y NA NA DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 DLEU2 98653 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 50857956 50857973 50857965 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 75926 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 51176389 51176436 51176413 Y NA NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 242490 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 51209543 51210059 51209810 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 271755 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 51466138 51466579 51466443 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 15235 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 51467789 51467990 51467889 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 13824 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr13 51486183 51486653 51486377 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 3335 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr13 51491068 51491415 51491243 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 8220 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 52009334 52009441 52009388 Y NA RPS4XP16,INTS6 NA NA NA NA RPS4XP16 16859 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 52115699 52115709 52115704 Y UTP14C WDFY2 MIR4703,WDFY2,INTS6,DHRS12,LINC00282 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDFY2 40935 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 61626383 61626760 61626680 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 657792 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 64491531 64491783 64491579 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 156361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 64508473 64508866 64508848 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 139278 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 64537945 64538229 64538154 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 109915 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 64589476 64589676 64589576 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 58468 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 65267327 65267582 65267455 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 619183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 66687218 66687393 66687306 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 2039074 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 67457681 67458008 67457948 Y PCDH9 NA NA NA NA NA LINC00355 2809537 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 67962999 67963167 67963083 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 3314855 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 69149552 69149691 69149622 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 4126140 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 70671265 70671561 70671413 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 2604270 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 71340580 71340843 71340601 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 1934988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 71946830 71946958 71946919 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 1328873 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 72349266 72349293 72349278 Y DACH1 NA NA NA NA NA RPL21P110 926538 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 72385563 72385700 72385665 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 890131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 72424218 72424283 72424251 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 851548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 72507786 72507931 72507912 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 767900 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 73486233 73486587 73486410 Y NA NA NA NA NA NA DIS3 131999 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 73742042 73742346 73742194 Y NA NA NA NA NA NA KLF5 114928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 75574471 75574561 75574516 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 479689 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 76256605 76256814 76256659 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 64035 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 77078666 77078696 77078681 Y NA NA NA NA NA NA KCTD12 379844 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 77166796 77167041 77166918 Y NA NA NA NA NA NA KCTD12 291499 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 77881758 77881859 77881809 Y SLAIN1 MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 17326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 77898193 77898346 77898226 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 839 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr13 77899332 77899971 77899636 Y KCTD12,FBXL3,MYCBP2 MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 147 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 78227370 78227383 78227376 Y NA NA NA NA NA NA MYCBP2 328185 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 78911933 78912082 78912037 Y NA NA NA NA NA NA RNF219 319232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 79858157 79858217 79858187 Y NA NA NA NA NA NA RBM26-AS1 120227 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 80030193 80030565 80030379 Y NA NDFIP2 NA NA NA NA NDFIP2 22722 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 80078013 80078214 80078058 Y NA NDFIP2 NA NA NA NA NDFIP2 24726 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 84711549 84711699 84711638 Y NA NA NA NA NA NA NDFIP2 4658262 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 87758867 87758956 87758912 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 4239118 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 87776313 87776722 87776395 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 4221352 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 90053531 90053928 90053634 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1944146 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 91369763 91370108 91369936 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 627966 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 91487556 91487886 91487721 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 510188 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 91709082 91709307 91709247 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 288767 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 91807013 91807446 91807380 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 190628 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 93083293 93083662 93083475 Y NA NA NA NA NA NA GPC5 1034364 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 93915220 93915506 93915338 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 1331005 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 95620867 95621252 95621220 Y NA NA CLDN10 IMR90 Hi-C 24141950 GPR180 368710 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 95938060 95938332 95938319 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3-AS1 388847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 97274522 97274914 97274718 Y NA NA NA NA NA NA MBNL2 596774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 99121203 99121258 99121231 Y NA NA NA NA NA NA STK24 106936 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 99128143 99128552 99128498 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99642 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 99562711 99562955 99562841 Y GPR183,STK24 NA NA NA NA NA CALM2P4 271218 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 99698656 99698961 99698809 Y DOCK9 NA NA NA NA NA UBAC2-AS1 152003 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 99880215 99880463 99880360 Y GPR183 UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3,GPR18 NA NA NA NA H2AFZP3 14203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 99991522 99991909 99991574 Y NA GPR183 NA NA NA NA GPR183 33863 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 100008605 100009044 100008755 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA GPR183 50946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 100115582 100115885 100115820 Y NA TM9SF2 MIR548AN,UBAC2 IMR90 Hi-C 24141950 TM9SF2 35786 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 100306063 100306155 100306109 Y NA CLYBL NA NA NA NA CLYBL 49144 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 100318044 100318289 100318076 Y ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA NA CLYBL 61125 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 100614141 100614172 100614147 Y NA NA NA NA NA NA PCCA 125097 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 101310141 101310446 101310274 Y TMTC4 TMTC4,NALCN-AS1 NA NA NA NA TMTC4 14901 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 102742627 102742968 102742903 Y FGF14 NA NA NA NA NA TPP2 504385 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 102961357 102961731 102961699 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 285622 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 103150766 103150859 103150813 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 96494 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 103244790 103245125 103245073 Y ERCC5,TPP2 TPP2 TPP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TPP2 2228 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 105791770 105791914 105791835 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 1426598 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 105792553 105792815 105792695 Y DAOA NA NA NA NA NA ARGLU1 1425697 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 107070030 107070366 107070265 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 148146 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 107409899 107410182 107409996 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G1P5 96114 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 108428526 108428615 108428535 Y NA NA NA NA NA NA LIG4 440101 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 110042212 110042565 110042393 Y IRS2 NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 394350 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 110322109 110322425 110322268 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 114490 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 110426988 110427362 110427201 Y NA IRS2 NA NA NA NA IRS2 9553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 110902548 110902879 110902758 Y COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA NA RAB20 309201 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 110965035 110965206 110965124 Y COL4A1,COL4A2 NA NA NA NA NA RAB20 246874 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 111124207 111124408 111124318 Y RAB20,ING1,ING1,ANKRD10 NA NA NA NA NA RAB20 87672 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 111695990 111696309 111696026 Y NA NA ING1,ARHGEF7,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF7 68597 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 111863058 111863169 111863068 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 98152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 114459608 114459701 114459670 Y NA NA NA NA NA NA GAS6-AS1 56902 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr13 114927536 114927629 114927597 Y RASA3 RASA3 RASA3,CDC16,FLJ44054,ATP4B,CHAMP1 IMR90 Hi-C 24141950 RASA3 31450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 20895931 20896136 20896054 Y RNASE3,RNASE6,TEP1,TMEM55B,PNP TEP1,OSGEP,APEX1,TMEM55B,PNP NA NA NA NA TEP1 16343 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 22757693 22757837 22757724 Y NA NA NA NA NA NA TRDJ2 165844 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 22896809 22896968 22896893 Y NA TRDJ2 NA NA NA NA TRDJ2 26713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr14 22967453 22967812 22967580 Y NA TRDJ2,AE000661.37 SLC7A7,OXA1L IMR90 Hi-C 24141950 AE000661.37 17505 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 23029387 23029658 23029523 Y RBM23 DAD1,ABHD4 NA NA NA NA DAD1 26517 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 23030522 23031354 23030874 Y PSMB11,RBM23 DAD1,ABHD4 NA NA NA NA DAD1 24821 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 23056506 23056666 23056661 Y REM2 DAD1,ABHD4 NA NA NA NA DAD1 331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 23058743 23059118 23058931 Y REM2 DAD1,ABHD4 NA NA NA NA DAD1 2568 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 23320228 23321035 23320800 Y RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7 MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 16462 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1 NA NA NA NA LRP10 19383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 23466494 23466910 23466688 Y CDH24,C14orf93 MIR4707,HAUS4,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 10465 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 23554726 23554907 23554813 Y SLC7A7,RBM23,ACIN1 CDH24,C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA C14orf119 7067 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 24058094 24058646 24058322 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2,DHRS2 NA NA NA NA AP1G2 22815 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 24454112 24454320 24454216 Y DHRS4L2,DHRS4L2 DHRS4,DHRS4L2 NA NA NA NA DHRS4L2 16964 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 25140073 25140450 25140257 Y CMA1,CTSG,GZMB NA NA NA NA NA CTSG 96607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 25148998 25149284 25149081 Y CIDEB,KHNYN,GZMH,GZMB NA NA NA NA NA CTSG 105532 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 25164584 25164990 25164642 Y TINF2,CIDEB,LTB4R,CMA1,CTSG,GZMB NA NA NA NA NA CTSG 121118 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 25911186 25911198 25911192 Y NA NA NA NA NA NA HMGN2P6 176644 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 27376789 27377008 27376899 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 1580108 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 27997396 27997715 27997579 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 959401 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 28846944 28847285 28847115 Y FOXG1 NA NA NA NA NA RPL26P3 109831 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 29243100 29243320 29243118 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 285984 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 29706068 29706381 29706228 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 748952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 31165114 31165442 31165278 Y NA NA NA NA NA NA SCFD1 75796 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 33126424 33126565 33126444 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 174418 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 33366513 33366604 33366563 Y NA NA AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-320M16.1 414507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 33800321 33800549 33800409 Y NPAS3 NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 848315 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 34033986 34034251 34034169 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 895311 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 34407631 34407737 34407684 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 521825 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 35346506 35346753 35346630 Y PSMA6,EAPP,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A RP11-73E17.2,BAZ1A NA NA NA NA BAZ1A 3653 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 35625298 35625573 35625393 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 35543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 35865196 35865330 35865211 Y RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 6625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 36277376 36277519 36277444 Y NFKBIA,RALGAPA1 RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L NA NA NA NA RALGAPA1 866 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 38054173 38054544 38054319 Y NA NA NA NA NA NA MBIP 1266291 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 38534360 38534722 38534543 Y NA NA NA NA NA NA SEC23A 1042128 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 38961526 38961542 38961536 Y NA NA NA NA NA NA SEC23A 615308 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 38965761 38966052 38965907 Y NA NA NA NA NA NA SEC23A 610798 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 39122804 39122976 39122949 Y NA NA SSTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SEC23A 453874 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 39637578 39637824 39637713 Y NA PNN NA NA NA NA TRAPPC6B 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 39768270 39768447 39768359 Y PNN,MIA2 CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 35782 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 41880555 41880659 41880564 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1980851 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 42079862 42079990 42079926 Y LRFN5 NA NA NA NA NA FBXO33 2180158 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 44437752 44437871 44437812 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 926627 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 45592379 45592731 45592576 Y PRPF39 PRPF39,FKBP3,FANCM NA NA NA NA FKBP3 9791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 47637485 47637798 47637642 Y NA RPL13AP2 NA NA NA NA RPL13AP2 30509 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 50090977 50091033 50091007 Y METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2 RN7SL1,RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2 NA NA NA NA MGAT2 5488 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 50213261 50213687 50213459 Y NA KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 18639 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr14 50437883 50438206 50438091 Y RPS29,RPL36AL,DNAAF2,NEMF,SOS2,METTL21D,ATP5S,ARF6 NA NA NA NA NA ARF6 80073 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 50465888 50466432 50466066 Y NA NA NA NA NA NA ARF6 108078 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 50526790 50527127 50527082 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA ARF6,C14orf182 IMR90 Hi-C 24141950 ARF6 168980 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 50549012 50549388 50549195 Y RPS29,RPL36AL,DNAAF2,KLHDC1,KLHDC2,NEMF,ARF6,SOS2,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA SOS2 146888 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 50562564 50562863 50562716 Y RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D NA NA NA NA NA SOS2 133413 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 50648447 50648735 50648723 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 47541 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 51144322 51144826 51144405 Y NA SAV1 ATL1,SAV1,NIN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAV1 11273 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 51295991 51296327 51296165 Y NA NIN NA NA NA NA NIN 152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 51393835 51393896 51393861 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 15558 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 52008545 52008925 52008735 Y TRIM9 NA NA NA NA NA GNG2 281988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 52499515 52499529 52499523 Y NA C14orf166 NA NA NA NA C14orf166 45322 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 52726227 52726468 52726407 Y NA NA PTGDR,TXNDC16 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER2 52555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 52778296 52778738 52778457 Y GNG2,PTGER2 PTGER2 NA NA NA NA PTGER2 285 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 52779505 52779903 52779857 Y GNG2,PTGER2 PTGER2 NA NA NA NA PTGER2 482 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 53361596 53362059 53361840 Y NA NA NA NA NA NA GNPNAT1 105210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 53385393 53385542 53385402 Y DDHD1 NA NA NA NA NA GNPNAT1 129007 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 53399403 53399746 53399574 Y NA NA NA NA NA NA GNPNAT1 143017 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 54016830 54016998 54016934 Y NA NA CDKN3 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD1 398830 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 54137471 54137744 54137539 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD1 519471 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 54652051 54652096 54652074 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN3 209471 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 54758286 54758405 54758397 Y NA NA NA NA NA NA CDKN3 103162 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 55302493 55302656 55302575 Y NA NA NA NA NA NA GCH1 64914 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 55375075 55375158 55375100 Y LGALS3,FBXO34,GMFB,MAPK1IP1L,GCH1 GCH1 NA NA NA NA GCH1 7505 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 55538737 55539349 55538846 Y FBXO34,FBXO34,ATG14,MAPK1IP1L WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 22388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 57009593 57009936 57009765 Y NA NA NA NA NA NA PELI2 427061 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 57316970 57317076 57317023 Y OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 416650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 57725803 57726155 57725979 Y NA EXOC5 NA NA NA NA EXOC5 7571 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 59654580 59654708 59654599 Y NA DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 1216 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 60388442 60388458 60388449 Y NA NA NA NA NA NA DHRS7 246116 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 61122184 61122613 61122502 Y NA NA SLC38A6 IMR90 Hi-C 24141950 MNAT1 76847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 61855306 61855686 61855500 Y PRKCH NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 67770 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 61888769 61889125 61888947 Y NA NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 101233 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 62068950 62069250 62069099 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 90981 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 62454456 62454478 62454466 Y SYT16 NA SYT16 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 157369 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 63983921 63984319 63984190 Y NA PPP2R5E NA NA NA NA PPP2R5E 23773 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 64279695 64279796 64279746 Y NA SYNE2 SYNE2 IMR90 Hi-C 24141950 SYNE2 37887 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 64358003 64358294 64358235 Y NA SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 40320 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 65140427 65140812 65140646 Y SYNE2,ZBTB1,PLEKHG3,MAX,CHURC1 PLEKHG3 SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG3 28008 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 65175295 65175757 65175503 Y SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 6475 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr14 65189669 65189936 65189737 Y ZBTB25,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 20849 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 65525721 65526064 65525893 Y NA MAX NA NA NA NA MAX 41349 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 65601506 65601634 65601523 Y NA MAX FUT8,LOC645431 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 34093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 65691594 65691779 65691731 Y NA NA FUT8,LOC645431,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2509G16.5 91729 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 65959136 65959304 65959206 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 83826 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 66313303 66313471 66313387 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 437993 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 67478288 67478352 67478320 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 227474 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 67728313 67728625 67728469 Y NA MPP5 NA NA NA NA MPP5 22487 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 68699331 68699744 68699520 Y ZFYVE26 NA NA NA NA NA RAD51B 414835 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 68749669 68750047 68749943 Y RAD51L1 NA NA NA NA NA RAD51B 465173 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 68827959 68828328 68828144 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 432862 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 70081383 70081681 70081508 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 5070 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 70099072 70099485 70099117 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 22759 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 70116783 70116977 70116879 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 40470 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 71109519 71109752 71109636 Y MED6,TTC9 MED6,TTC9 NA NA NA NA TTC9 3015 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 71865475 71866239 71865922 Y PCNX,SIPA1L1 NA NA NA NA NA SIPA1L1 80309 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 74140666 74140779 74140723 Y FAM161B DNAL1,PNMA1 NA NA NA NA DNAL1 31088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 74208106 74208498 74208298 Y C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 14952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr14 74210197 74210586 74210513 Y ZNF410,C14orf43,C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 12864 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 74220862 74221204 74221002 Y NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 2246 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr14 74224982 74225468 74225101 Y NA PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 1532 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 74228460 74228789 74228681 Y NUMB,ZNF410,C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 5010 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 74981330 74981609 74981543 Y NPC2 ISCA2,NPC2 NA NA NA NA NPC2 22450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 75492523 75492557 75492545 Y NA EIF2B2,MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 23678 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 75592667 75593037 75593004 Y NA RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NA NA NA NA NEK9 620 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr14 75741549 75742051 75741730 Y NEK9,JDP2,FLVCR2,BATF,FOS RP11-293M10.2,FOS LOC731223 IMR90 Hi-C 24141950 FOS 1426 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 75750758 75751180 75750884 Y PROX2,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FOS RP11-293M10.2,FOS NA NA NA NA FOS 7281 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 75800922 75801146 75801057 Y FOS,JDP2,FLVCR2,BATF NA JDP2,BATF IMR90 Hi-C 24141950 FOS 57445 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 76234838 76235006 76234846 Y NA NA TGFB3,IFT43 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf1 109306 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 77384980 77385465 77385224 Y VASH1 RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 33887 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 77396429 77396646 77396562 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-7F17.1 36380 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 77422240 77422571 77422458 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.1 IRF2BPL,KIAA1737 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 10455 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 77466876 77467234 77466958 Y ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL RP11-7F17.1,IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 25800 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr14 77500544 77500911 77500765 Y NA IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 7510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 77503944 77504718 77504558 Y NA IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 10910 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 78031949 78032369 78032266 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 48747 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 78059840 78060228 78060134 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 20888 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 78771631 78771988 78771787 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 507205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 78836271 78836672 78836374 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 571845 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 80161976 80161991 80161984 Y NA NA NA NA NA NA CEP128 1261870 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 81503760 81504107 81503844 Y TSHR NA NA NA NA NA CEP128 79899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 NA NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.378012785518 chr14 81977973 81978150 81978054 Y NA SEL1L NA NA NA NA SEL1L 20055 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 85491912 85492155 85492034 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2341M24.1 906899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 87025819 87025837 87025829 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2341M24.1 626765 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 89378225 89378248 89378237 Y NA NA EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 89728 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 89680457 89680908 89680785 Y FOXN3 NA NA NA NA NA TTC8 391960 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 89770346 89770725 89770409 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 312768 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 201352 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 89887223 89887427 89887324 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 196066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 89895882 89896217 89896119 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 187276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 89924372 89924536 89924452 Y FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 158957 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 89953485 89953641 89953575 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 129852 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 90083286 90083622 90083526 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 90083771 90084428 90084236 Y TDP1,FOXN3 FOXN3 NA NA NA NA FOXN3 278 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 91069038 91069054 91069046 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 208192 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 91134460 91134696 91134603 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 146127 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 91529481 91529737 91529617 Y SMEK1,GPR68,CCDC88C,RPS6KA5 C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA RPS6KA5 4501 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 91734470 91734656 91734563 Y NA GPR68 GPR68 K562 ChIA-PET 22265404 GPR68 16201 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 91833483 91833974 91833648 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C CCDC88C NA NA NA NA CCDC88C 48214 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 91869322 91869469 91869402 Y TC2N,RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C CCDC88C NA NA NA NA CCDC88C 12719 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 91926776 91927002 91926960 Y NA CCDC88C,SMEK1 NA NA NA NA CCDC88C 44588 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 92994205 92994352 92994256 Y SLC24A4,SLC24A4,RIN3 RIN3 NA NA NA NA RIN3 16087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 93119846 93119961 93119893 Y ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 NA NA NA NA NA LGMN 93086 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 93120324 93121044 93120864 Y ITPK1,SLC24A4,RIN3 NA NA NA NA NA LGMN 92003 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr14 93121718 93122010 93121905 Y ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 NA NA NA NA NA LGMN 91037 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr14 93540322 93540650 93540529 Y NA ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 40015 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 93569992 93570233 93570210 Y KIAA1409,C14orf109,C14orf109 ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 10432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 93738394 93738720 93738557 Y NA NA NA NA NA NA BTBD7 58718 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 94000396 94000618 94000451 Y MOAP1,C14orf109,C14orf109,BTBD7,KIAA1409 NA NA NA NA NA BTBD7 202958 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 94437435 94437683 94437529 Y SERPINA1 ASB2 NA NA NA NA ASB2 3454 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 95734707 95735043 95734878 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 112360 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 95947097 95947214 95947185 Y NA NA NA NA NA NA GLRX5 50626 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 96592738 96593055 96592891 Y ATG2B NA C14orf49,ATG2B,AK7,BDKRB2,BDKRB1 IMR90 Hi-C 24141950 ATG2B 235152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 99132884 99133181 99132894 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 812035 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 100463833 100464185 100464009 Y NA EVL EVL,YY1,DEGS2 IMR90 Hi-C 24141950 EVL 28047 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 100478682 100479045 100478865 Y NA EVL EVL IMR90 Hi-C 24141950 EVL 42896 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 100534854 100535453 100535220 Y YY1,EVL NA NA NA NA NA EVL 99068 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 100539339 100539601 100539490 Y WARS,EVL NA NA NA NA NA EVL 103553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 100545432 100545867 100545549 Y YY1,EVL NA NA NA NA NA EVL 109646 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr14 100633368 100633655 100633513 Y YY1 NA NA NA NA NA YY1 68980 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 100687969 100688087 100687996 Y NA YY1,RP11-638I2.4 YY1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 YY1 14548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 100804523 100804880 100804765 Y NA SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25 NA NA NA NA RP11-638I2.10 26085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 100889838 100890227 100890041 Y BEGAIN WDR25 BEGAIN IMR90 Hi-C 24141950 WDR25 49083 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 101143693 101144188 101144055 Y NA DLK1 NA NA NA NA DLK1 45854 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 102001660 102001854 102001726 Y PPP2R5C,PPP2R5C,DYNC1H1 NA NA NA NA NA PPP2R5C 224281 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 102340393 102340589 102340458 Y PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C NA NA NA NA NA DYNC1H1 88276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 102342938 102343183 102343098 Y PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C NA NA NA NA NA DYNC1H1 85682 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 6.56835819406278 chr14 102554875 102555215 102555129 Y HSP90AA1 WDR20,HSP90AA1 NA NA NA NA WDR20 48625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr14 102989903 102989915 102989909 Y NA NA ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 67083 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 103585248 103585668 103585540 Y NA TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 2111 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 103929089 103929460 103929098 Y NA NA NA NA NA NA CKB 57988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 104993565 104993828 104993574 Y NA NA KIF26A IMR90 Hi-C 24141950 TMEM179 76156 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr14 105546439 105546836 105546640 Y NA GPR132 BTBD6,BRF1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR132 16657 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr14 105760670 105760918 105760811 Y C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1 BTBD6,PACS2,BRF1 NA NA NA NA PACS2 3982 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP1,C14orf80 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.62734327762511 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA IGHV3-62 155343 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.62734327762511 chr14 107253494 107254031 107253700 Y NA NA NA NA NA NA IGHV3-62 155906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 20570096 20570220 20570180 Y NA NA REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 2261175 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 22897960 22898211 22898128 Y CYFIP1,CYFIP1 CYFIP1 NIPA2 IMR90 Hi-C 24141950 CYFIP1 7955 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 25018281 25018456 25018384 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 48338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 25623423 25623523 25623473 Y SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 58605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 26104619 26105255 26104951 Y UBE3A,ATP10A ATP10A NA NA NA NA ATP10A 3062 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 26106001 26106167 26106105 Y UBE3A,ATP10A ATP10A NA NA NA NA ATP10A 2150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 ATP10A 219132 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA TJP1 236254 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 30128383 30128423 30128398 Y NA NA NA NA NA NA TJP1 130645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 31558458 31558972 31558644 Y MTMR10,KLF13 NA LOC283710,OTUD7A,KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-16E12.1 52235 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 31620735 31621235 31621017 Y MTMR10,KLF13 KLF13 NA NA NA NA KLF13 3677 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 31653483 31654056 31653579 Y MTMR10,KLF13 KLF13 NA NA NA NA KLF13 36425 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 31733081 31733438 31733352 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 116023 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 31739959 31740450 31740309 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 122901 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 33148173 33148432 33148370 Y GREM1 NA NA NA NA NA GREM1 139998 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 33502141 33502453 33502281 Y NA NA TMCO5B IMR90 Hi-C 24141950 GREM1 493966 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 34421770 34422050 34421910 Y NA PGBD4 NA NA NA NA PGBD4 29496 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 34625973 34627107 34626354 Y NA SLC12A6,NOP10,LPCAT4 NA NA NA NA SLC12A6 1154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 34627277 34627936 34627564 Y SLC12A6,SLC12A6,SLC12A6,SLC12A6 SLC12A6,NOP10,LPCAT4 NA NA NA NA SLC12A6 325 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 34807090 34807442 34807248 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA8A,GOLGA8B 71262 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 35354346 35354732 35354466 Y NA RP11-323I15.2 ATPBD4,ZNF770 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 27950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA RP11-323I15.2 ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 2271 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 37175924 37176266 37175984 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 67264 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 37656383 37656399 37656391 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 547723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 39006951 39007336 39007132 Y NA NA NA NA NA NA RASGRP1 151175 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 39028998 39029133 39029029 Y RASGRP1,C15orf53 NA FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 173222 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 39342673 39342985 39342799 Y RASGRP1,C15orf53 NA FSIP1,C15orf53,THBS1,C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 486897 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 39559141 39559459 39559346 Y NA NA NA NA NA NA THBS1 311821 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 39657352 39657591 39657529 Y THBS1,C15orf54 NA THBS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 213689 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 40341272 40341416 40341335 Y PLCB2,BMF,BMF,BMF SRP14 NA NA NA NA SRP14 11883 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 40397293 40397725 40397605 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1368 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 40601054 40601299 40601247 Y BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2 ANKRD63,PLCB2 PAK6 K562 ChIA-PET 22265404 PLCB2 2918 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 41139695 41139794 41139738 Y NA ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 5479 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr15 42228791 42229215 42228969 Y MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 33561 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 42833928 42834273 42834101 Y NA LRRC57,HAUS2,STARD9 NA NA NA NA LRRC57 4727 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 43356735 43357067 43356746 Y NA UBR1,RPS3AP47 NA NA NA NA UBR1 39244 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr15 43462121 43462322 43462222 Y NA TMEM62,CCNDBP1 NA NA NA NA CCNDBP1 12994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 43757406 43757566 43757505 Y NA TP53BP1,MAP1A NA NA NA NA TP53BP1 43360 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 43803895 43804004 43803947 Y TGM7,TP53BP1,MAP1A TP53BP1,MAP1A NA NA NA NA MAP1A 2739 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 45340934 45341315 45341066 Y SPG11,B2M,SPATA5L1 SORD NA NA NA NA SORD 27632 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 48605520 48605711 48605648 Y NA DUT,RP11-154J22.1 NA NA NA NA DUT 15497 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 49739111 49739383 49739247 Y NA NA NA NA NA NA DTWD1 171794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50108187 50108439 50108313 Y NA CTD-2647E9.1 GALK2,C15orf33,ATP8B4,DTWD1,GABPB1 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2647E9.1 23744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50169774 50170115 50169945 Y FGF7,DTWD1 NA NA NA NA NA CTD-2647E9.1 85331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50192335 50192466 50192401 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2647E9.1 107892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50201915 50201939 50201930 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2647E9.1 117472 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr15 50335306 50335619 50335473 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 136774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50347446 50348347 50347721 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 124046 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 50350203 50350407 50350311 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 121986 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50352002 50352368 50352185 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 120025 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50354134 50354493 50354375 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 117900 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50358473 50358749 50358576 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 113644 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr15 50399831 50400157 50400014 Y USP8,GABPB1,ATP8B4 NA NA NA NA NA SLC27A2 72236 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr15 50400309 50400464 50400394 Y ATP8B4 NA NA NA NA NA SLC27A2 71929 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 50400519 50400943 50400861 Y ATP8B4 NA NA NA NA NA SLC27A2 71450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr15 50408630 50408976 50408933 Y USP8,HDC,GABPB1,ATP8B4 NA NA NA NA NA SLC27A2 63417 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr15 50426655 50427246 50427087 Y USP8,GABPB1 SLC27A2,ATP8B4 ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC27A2 45147 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50475759 50476090 50475833 Y SLC27A2 SLC27A2,ATP8B4 NA NA NA NA ATP8B4 2745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 51177416 51177715 51177636 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 21154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 51619340 51619705 51619523 Y TNFAIP8L3,CYP19A1 NA NA NA NA NA DMXL2 293325 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 51921191 51921424 51921391 Y NA DMXL2 DMXL2,LYSMD2,TMOD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DMXL2 8161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 51921715 51922068 51922003 Y NA DMXL2 DMXL2,LYSMD2,TMOD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DMXL2 8685 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 52001202 52001578 52001400 Y TMOD3,MAPK6,DMXL2 TMOD2,LYSMD2 NA NA NA NA TMOD2 40180 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 52024012 52024470 52024199 Y TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2 TMOD2,LYSMD2 NA NA NA NA TMOD2 17288 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 52122599 52122915 52122757 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 2774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 52299898 52300006 52299952 Y NA LEO1 TMOD3,LEO1,MAPK6,BCL2L10,GNB5,MYO5C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LEO1 37895 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 52402379 52402574 52402478 Y BCL2L10 CTD-2184D3.1 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 16887 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 52438848 52438958 52438938 Y NA GNB5 NA NA NA NA GNB5 42608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 52734000 52734377 52734331 Y NA NA NA NA NA NA MYO5A 84870 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 54392300 54392397 54392327 Y UNC13C NA NA NA NA NA RSL24D1 1094868 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 55514866 55515077 55514981 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1,RAB27A RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 27601 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 55543162 55543346 55543241 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1,RAB27A NA NA NA NA NA RSL24D1 55897 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 55581016 55581448 55581368 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1 PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 27710 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 56615348 56615607 56615478 Y NA NA NA NA NA NA TEX9 81141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 56717939 56718122 56718071 Y RFX7,ZNF280D,MNS1,TEX9 MNS1 NA NA NA NA MNS1 37213 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 57529031 57529296 57529123 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 320210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 57814441 57814703 57814560 Y CGNL1 NA NA NA NA NA POLR2M 67528 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 58431985 58432548 58432046 Y NA NA NA NA NA NA LIPC 268220 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 58574640 58574908 58574743 Y LIPC NA LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 LIPC 125860 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 154856 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 59461586 59461962 59461756 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 66309 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 59467791 59468085 59467937 Y ADAM10,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 72514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 59587320 59587393 59587357 Y NA NA NA NA NA NA MYO1E 75706 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 59642348 59642705 59642508 Y BNIP2,RNF111 MYO1E NA NA NA NA MYO1E 20394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 59688558 59688897 59688728 Y NA MYO1E MYO1E,LDHAL6B,FAM81A IMR90 Hi-C 24141950 MYO1E 25459 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 59862569 59862935 59862765 Y NA RP11-112N19.2 NA NA NA NA RP11-112N19.2 19277 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 59978652 59978797 59978720 Y BNIP2 GTF2A2,BNIP2 NA NA NA NA RP11-361D15.2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 60337265 60337365 60337315 Y NA NA NA NA NA NA ANXA2 355717 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 63439577 63439949 63439764 Y NA LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 8271 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 63539312 63539664 63539446 Y LACTB,USP3,RAB8B APH1B APH1B IMR90 Hi-C 24141950 APH1B 26553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 64188807 64189333 64189164 Y USP3,HERC1 NA NA NA NA NA HERC1 64666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 RP11-330L19.1 NA NA NA NA RP11-330L19.1 37654 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 PLEKHO2 3880 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 65185651 65186463 65186157 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 NA NA NA NA NA PLEKHO2 53563 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 65911878 65912241 65912183 Y DENND4A SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 10174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 66111254 66111589 66111443 Y DPP8,DPP8,DENND4A DENND4A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44,RAB11A,MEGF11 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4A 28623 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 66301204 66301604 66301404 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 218573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 66662192 66662458 66662267 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 NA NA NA NA TIPIN 14626 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr15 67366599 67366961 67366679 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 12498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 67393197 67393867 67393527 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 39096 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 67413336 67413759 67413492 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 59235 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 67440032 67440420 67440131 Y NA NA NA NA NA NA SMAD3 85931 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 56252 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 67516633 67516865 67516859 Y NA IQCH,AAGAB NA NA NA NA IQCH 28273 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 68132952 68133362 68133003 Y PIAS1,CALML4 NA NA NA NA NA PIAS1 211155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 68564990 68565500 68565181 Y NA CLN6,FEM1B CLN6,ANP32A,CORO2B,FEM1B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 2641 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 68588456 68588855 68588647 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20315 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 68644845 68645256 68644912 Y PIAS1 NA NA NA NA NA FEM1B 76704 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 68821473 68821531 68821481 Y NA NA ITGA11,FEM1B IMR90 Hi-C 24141950 FEM1B 253332 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 69958901 69959304 69959004 Y TLE3 NA TLE3,C15orf50,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 215778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 70023380 70023641 70023505 Y TLE3 NA TLE3,C15orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPLP1 280257 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70047760 70048370 70048206 Y TLE3 NA C15orf50,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 304637 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70049728 70049802 70049765 Y TLE3 NA C15orf50,TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 306605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70052375 70052953 70052736 Y TLE3 NA TLE3,LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 309252 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70101259 70101454 70101340 Y TLE3 NA C15orf50,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 287061 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70391261 70391735 70391557 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 2746 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr15 70392397 70392607 70392502 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70551051 70551280 70551147 Y NA NA LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 162536 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 70551432 70551570 70551488 Y TLE3 NA LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 162917 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 70558801 70558908 70558873 Y TLE3 NA LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 170286 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70755114 70755202 70755130 Y TLE3 NA TLE3,C15orf50,KIF23,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 366599 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70766954 70767165 70766993 Y TLE3 NA C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 378439 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 70767457 70767783 70767604 Y TLE3 NA C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 378942 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 411628 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr15 70850665 70850865 70850772 Y NA NA KIF23 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 462150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 71176892 71177111 71177002 Y NA NA NA NA NA NA TLE3 788377 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 71335765 71335967 71335867 Y NA NA NA NA NA NA TLE3 947250 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 72041767 72041974 72041871 Y SENP8 NA NA NA NA NA SENP8 362625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 72213908 72214290 72214099 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 190309 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 73308423 73308823 73308623 Y NA NA NEO1,BBS4,ADPGK,LOC100287559 IMR90 Hi-C 24141950 ADPGK 232236 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 74221354 74221537 74221415 Y NA NA NA NA NA NA STOML1 63426 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA PML 127979 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 74681899 74682338 74682078 Y SEMA7A,SEMA7A,CLK3,ARID3B SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 42470 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 74834290 74834419 74834369 Y ULK3,CSK,CLK3,ARID3B ARID3B NA NA NA NA ARID3B 2772 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 75069783 75070047 75069931 Y ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 2351 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 75073348 75073866 75073498 Y ARID3B,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 75075558 75076065 75075775 Y ARID3B,CLK3,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 3160 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 75081771 75082003 75081872 Y ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 9373 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 75160479 75160721 75160578 Y NA ULK3,SCAMP2,MPI NA NA NA NA SCAMP2 2985 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 75162332 75162702 75162478 Y MAN2C1,SEMA7A,SEMA7A,ARID3B,CLK3,CSK,PPCDC,C15orf39,SCAMP2 ULK3,SCAMP2,MPI NA NA NA NA SCAMP2 1004 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr15 75339281 75339878 75339595 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 25385 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr15 75353716 75354155 75353786 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 39820 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 75361968 75362271 75362022 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 48072 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 75365607 75365911 75365770 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39 NA C15orf39 IMR90 Hi-C 24141950 PPCDC 51711 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 75402190 75402344 75402306 Y PPCDC NA SCAMP5,PPCDC,C15orf39 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 83640 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 4.50401704735733 chr15 75404629 75405178 75404816 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA SCAMP5,PPCDC,C15orf39 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 80806 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 75445545 75445830 75445694 Y SIN3A,SIN3A,CSK,C15orf39 C15orf39 PPCDC,C15orf39 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf39 40154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 75470847 75471095 75470955 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,C15orf39 C15orf39 C15orf39 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf39 14889 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.75334753946444 chr15 75495544 75495835 75495599 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,SCAMP2,C15orf39 C15orf39 NA NA NA NA C15orf39 9560 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 77785821 77785911 77785867 Y NA NA NA NA NA NA HMG20A 75067 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 77788110 77788356 77788224 Y NA NA NA NA NA NA HMG20A 77356 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 78362503 78362904 78362579 Y IREB2,DNAJA4,DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 5162 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 78368268 78368362 78368315 Y TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 79152508 79152900 79152703 Y IREB2 NA MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ADAMTS7 50735 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 79216586 79216987 79216944 Y RASGRF1 CTSH NA NA NA NA CTSH 22929 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 79269322 79269965 79269452 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 29406 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 79280826 79281229 79281127 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 40910 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 79767814 79767956 79767881 Y BCL2A1 NA NA NA NA NA TMED3 166410 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 80164886 80165472 80165199 Y ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS,MTHFS,MTHFS MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA MTHFS 22249 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 80192489 80192729 80192669 Y ZFAND6,ST20,BCL2A1,MTHFS,MTHFS,ST20-MTHFS MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA MTHFS 4768 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 81197356 81197718 81197537 Y NA NA NA NA NA NA MESDC2 82501 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1,C15orf26 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 82274392 82274506 82274449 Y FAM154B NA MEX3B IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 61976 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr15 82340231 82340454 82340397 Y NA MEX3B NA NA NA NA MEX3B 3749 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 83239509 83239741 83239625 Y AP3B2,CPEB1 RPS17L NA NA NA NA RPS17L 32194 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 83605139 83605146 83605143 Y NA HOMER2,FAM103A1 NA NA NA NA HOMER2 47515 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 83712711 83713060 83712967 Y NA C15orf40,BTBD1 C15orf40 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD1 21046 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr15 83857860 83858021 83857985 Y NA NA NA NA NA NA TM6SF1 83701 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 85141478 85141773 85141626 Y NA ZSCAN2 NA NA NA NA ZSCAN2 444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 85628969 85629268 85629119 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 107298 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 86131454 86131632 86131493 Y AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 204629 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 86192682 86192944 86192801 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 143317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.81501065459833 chr15 86285642 86285870 86285715 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 50391 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 88798414 88798598 88798494 Y NTRK3 NA NA NA NA NA MRPL46 210052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 88877677 88878020 88877849 Y NA NA NA NA NA NA MRPL46 130630 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 89542269 89542524 89542429 Y NA NA MFGE8,ISG20,HAPLN3,ABHD2,RLBP1 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD2 86166 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2 NA NA NA NA ABHD2 43536 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 89675943 89676620 89676217 Y ISG20,ABHD2 ABHD2 NA NA NA NA ABHD2 47253 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr15 89923171 89923194 89923182 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 47079 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 90357155 90357491 90357451 Y POLG,ZNF710,SEMA4B,AP3S2,ANPEP ANPEP NA NA NA NA ANPEP 522 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 90394929 90395092 90395007 Y ZNF710,CIB1,ANPEP ANPEP,AP3S2 NA NA NA NA ANPEP 38296 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 90563245 90563669 90563337 Y ANPEP,AP3S2,IQGAP1,CIB1,ZNF710 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 20621 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 90574620 90575072 90574763 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 31996 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 90577561 90577868 90577654 Y AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 34937 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 90578762 90579351 90578884 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 36138 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 90602725 90603219 90603002 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 IDH2 NA NA NA NA IDH2 40517 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 90606841 90607396 90607176 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,IQGAP1,CIB1 IDH2 NA NA NA NA IDH2 36340 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 90938187 90938493 90938325 Y NA ZNF774,IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 8737 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 91107423 91107655 91107549 Y UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,C15orf58,IQGAP1,CRTC3 CRTC3 NA NA NA NA CRTC3 36266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 91191799 91192162 91191976 Y UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1 NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 66210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2,BLM NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 91381352 91381687 91381526 Y CRTC3,UNC45A CTD-3094K11.1,FES CRTC3,BLM,FURIN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-3094K11.1 398 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 91412875 91413318 91412960 Y IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES CTD-3094K11.1,FES,MAN2A2 NA NA NA NA FES 11607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 91476522 91476977 91476740 Y NA MAN2A2,UNC45A,HDDC3,AC068831.3,RCCD1 NA NA NA NA AC068831.3 162 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 92464513 92465010 92464828 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 69588 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 92490454 92490951 92490737 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 95529 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 92644782 92645127 92644848 Y NA NA NA NA NA NA NPM1P5 181944 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 ASB9P1,FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA ASB9P1,FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 93424689 93424786 93424732 Y CHD2 CHD2 NA NA NA NA CHD2 163 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 93662634 93662642 93662638 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 238108 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 93793368 93793760 93793627 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 368842 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 94720488 94720627 94720578 Y NA NA MCTP2 IMR90 Hi-C 24141950 MCTP2 52140 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 94746622 94746847 94746732 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 25920 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 94749757 94750344 94749943 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 22423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 94815502 94815543 94815523 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 42735 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 94987207 94987229 94987220 Y MCTP2 NA NA NA NA NA MCTP2 214440 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 95050162 95050468 95050315 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 277395 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 95388455 95388700 95388578 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 615688 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 96703320 96703585 96703453 Y NA NA LOC400456,NR2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ARRDC4 1757199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 97731038 97731056 97731047 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 729728 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 98304362 98304376 98304369 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 156408 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 99259262 99259477 99259337 Y SYNM NA NA NA NA NA IGF1R 69062 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 99396507 99396665 99396608 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206307 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 99499686 99499980 99499831 Y NA NA NA NA NA NA TTC23 289448 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 99661093 99661479 99661184 Y NA NA NA NA NA NA TTC23 127949 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 99943673 99944058 99943986 Y NA NA NA NA NA NA MEF2A 71312 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 100014381 100014718 100014638 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEF2A 652 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 101234924 101235169 101235060 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1,ASB7 IMR90 Hi-C 24141950 LINS 93489 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 101481750 101481996 101481861 Y LRRK1 LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 24330 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 101667775 101667985 101667844 Y CHSY1 NA CHSY1,SELS,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 CHSY1 122152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr15 101748030 101748406 101748268 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 41731 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 101787304 101787467 101787386 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 2670 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 101795882 101795956 101795938 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 5745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 101945887 101945918 101945891 Y OR4F6,OR4F15,PCSK6 NA NA NA NA NA SNRPA1 112400 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr15 101979646 101980007 101979833 Y PCSK6 NA NA NA NA NA SNRPA1 146159 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 85163 85424 85312 Y HBA2,LUC7L,HBQ1,HBA1,AXIN1 SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA SNRNP25 15586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 405208 405433 405399 Y NA AXIN1,MRPL28,TMEM8A,NME4,DECR2 NA NA NA NA AXIN1 4535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ,NHLRC4 NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 651803 652154 651979 Y NA PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90 NA NA NA NA RAB40C 14446 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 1381826 1382192 1381930 Y UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3 UBE2I,GNPTG NA NA NA NA GNPTG 17732 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 1519780 1519909 1519802 Y SEPX1,MAPK8IP3,CLCN7 C16orf91,CLCN7,TELO2 NA NA NA NA CLCN7 3672 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 2737269 2737470 2737353 Y NA ERVK13-1,KCTD5 NA NA NA NA KCTD5 6793 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA ZG16B,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 3145997 3146167 3146082 Y NA IL32,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 31611 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 20841 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA ZNF174 NA NA NA NA ZNF174 33998 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 4262475 4262771 4262673 Y SRL NA NA NA NA NA TFAP4 58305 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 4427155 4427449 4427262 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 7306 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 4582537 4582680 4582608 Y NA NMRAL1 HMOX2,NMRAL1 IMR90 Hi-C 24141950 NMRAL1 38773 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 4713771 4714092 4713866 Y CORO7,NAGPA,GLYR1,MGRN1 MGRN1,NUDT16L1 NA NA NA NA NUDT16L1 27603 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.81501065459833 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 4900331 4900638 4900507 Y MGRN1,UBN1,UBN1 ROGDI,UBN1,GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 4988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 4912710 4912874 4912785 Y CORO7,MGRN1,GLYR1,UBN1,UBN1 UBN1,GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 17367 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 5474398 5474545 5474472 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 328589 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 5628530 5628815 5628673 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 482721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 6807749 6808080 6807872 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 1661940 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 7368708 7369078 7368893 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1344462 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 7473619 7473766 7473686 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1239774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 9237080 9237205 9237143 Y NA NA NA NA NA NA C16orf72 53575 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 10133348 10133947 10133667 Y NA NA NA NA NA NA ATF7IP2 284344 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 10563450 10564010 10563797 Y NA NA NA NA NA NA EMP2 108545 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 10847001 10847390 10847044 Y CIITA,NUBP1 NUBP1 NA NA NA NA NUBP1 11358 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 10982517 10982862 10982662 Y NUBP1,SOCS1,CLEC16A,CIITA CIITA NA NA NA NA CIITA 13462 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 11295999 11296122 11296015 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 RMI2 NA NA NA NA RMI2 45354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 11300663 11300859 11300814 Y NA RMI2,SOCS1 CLEC16A,RMI2,SNN,TXNDC11,SOCS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RMI2 40617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 11318108 11318467 11318211 Y NA RMI2,SOCS1 CLEC16A,SOCS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RMI2 23009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 11326911 11327269 11327154 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 RMI2,SOCS1 CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 RMI2 14207 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 11345704 11346020 11345999 Y NA RMI2,SOCS1 NA NA NA NA SOCS1 2016 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 11591931 11591962 11591945 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136275 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 11691003 11692063 11691252 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF LITAF MCF7 ChIA-PET 22265404 LITAF 36174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 11692306 11692793 11692487 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF NA NA NA NA LITAF 35444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 11782918 11783419 11783221 Y SOCS1,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN SNN NA NA NA NA SNN 22648 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 12049208 12049600 12049404 Y NA GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29 SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166B2.1 18900 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 12119567 12119880 12119724 Y NA NA NA NA NA NA SNX29 50973 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 12227047 12227260 12227153 Y NA NA NA NA NA NA SNX29 158453 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 12553349 12553483 12553416 Y CPPED1,RUNDC2A NA NA NA NA NA CPPED1 342391 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 12713340 12713716 12713664 Y NA NA SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 CPPED1 182158 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 13298770 13298922 13298846 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 402896 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 13711555 13711851 13711703 Y NA NA NA NA NA NA ERCC4 300163 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 14423320 14423633 14423477 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260142 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 15069619 15069687 15069631 Y PDXDC1 PDXDC1 NA NA NA NA PDXDC1 3171 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 15979661 15979785 15979715 Y NA FOPNL NA NA NA NA FOPNL 697 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 16092294 16092782 16092512 Y NDE1 NA NA NA NA NA ABCC1 50860 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr16 16198084 16198445 16198250 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 156650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 16214595 16215019 16214906 Y NDE1,ABCC1 NA ABCC6 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC1 173161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17231064 17231355 17231210 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 331383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17265522 17265904 17265644 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 296834 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17267039 17267537 17267379 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 295201 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17328915 17329184 17329121 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 233554 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17341896 17342078 17341982 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 220660 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 17366939 17367350 17367135 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 195388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17411483 17411608 17411498 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 151130 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17415798 17416101 17415962 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 146637 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17435762 17436100 17436052 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 126638 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17436977 17437203 17437056 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 125535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr16 17447725 17447942 17447834 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 114796 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17458127 17458575 17458373 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 104163 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17463561 17463824 17463658 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 98914 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 17469718 17469971 17469868 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 92767 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17471804 17472227 17471997 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 90511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 17472962 17473160 17473138 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 89578 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 17474516 17474881 17474733 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 87857 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 17476901 17477384 17477246 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 85354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr16 17491437 17491707 17491699 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 71031 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 17545858 17546183 17546022 Y NA XYLT1 NA NA NA NA XYLT1 16555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 19106464 19106699 19106563 Y NA COQ7,ITPRIPL2 NA NA NA NA ITPRIPL2 16555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 19769577 19769967 19769778 Y CCP110,GPRC5B,IQCK IQCK NA NA NA NA IQCK 43799 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 20910424 20910792 20910538 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 718 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 21566198 21566360 21566279 Y DNAH3 SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9 METTL9,IGSF6 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2547E10.2 36433 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 21611842 21611954 21611919 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 5303 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr16 21622558 21622759 21622643 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9,IGSF6 NA NA NA NA METTL9 16019 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 21637887 21638686 21638408 Y CRYM,METTL9,IGSF6 METTL9,IGSF6 NA NA NA NA IGSF6 23295 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 22206155 22206271 22206214 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,UQCRC2,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 9332 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 22630276 22630657 22630449 Y NA NA SLC7A5P2,OTOA,CRYM,CRYM-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RRN3P3 183240 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 23473263 23473545 23473445 Y SCNN1G,GGA2 COG7 NA NA NA NA COG7 10762 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 23855109 23855743 23855120 Y NA PRKCB NA NA NA NA PRKCB 9787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 23865316 23865641 23865479 Y GGA2,PRKCB PRKCB NA NA NA NA PRKCB 19994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 23867520 23867900 23867586 Y GGA2,PRKCB PRKCB NA NA NA NA PRKCB 22198 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 23874863 23875389 23875220 Y GGA2,PRKCB PRKCB NA NA NA NA PRKCB 29541 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 23968296 23968621 23968461 Y NA NA NA NA NA NA PRKCB 122974 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 24061843 24062218 24062031 Y NA NA NA NA NA NA PRKCB 216521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 24619135 24619479 24619307 Y SLC5A11 NA TNRC6A,RBBP6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP6 72121 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 25072371 25072507 25072437 Y SLC5A11 ARHGAP17,LCMT1 LCMT1,LOC100506655 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP17 47384 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 25121755 25122029 25121858 Y SLC5A11 LCMT1 NA NA NA NA LCMT1 705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 26115477 26115883 26115595 Y NA NA NA NA NA NA ZKSCAN2 848225 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 26407533 26407848 26407539 Y NA NA NA NA NA NA NSMCE1 870267 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 26605065 26605255 26605131 Y NA NA NA NA NA NA NSMCE1 672860 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 27184245 27184257 27184251 Y NA NA HS3ST4,LOC283888,IL21R IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 93858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 27248798 27249418 27249027 Y KIAA0556,IL4R,IL21R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 28697 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 27254406 27254878 27254778 Y IL4R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 23237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 27275592 27275718 27275658 Y NA NSMCE1,IL4R NA NA NA NA NSMCE1 2397 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 27329776 27330351 27329940 Y JMJD5,JMJD5,KIAA0556,IL21R,IL4R IL4R NA NA NA NA IL4R 6787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 27826167 27826272 27826220 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0556 266713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 28153289 28153624 28153397 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 67617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 28204572 28204722 28204690 Y CCDC101,APOBR,XPO6,SBK1 XPO6 NA NA NA NA XPO6 16519 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 29168403 29168702 29168538 Y SPNS1 NA RRN3P2 IMR90 Hi-C 24141950 LAT 174256 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 29709853 29709969 29709906 Y QPRT SPN,QPRT,C16orf54 NA NA NA NA QPRT 37253 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,SEPT1,ZNF771,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA DCTPP1 10853 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 5.067019178277 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA BCL7C 18052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 31124549 31124685 31124617 Y STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA KAT8 390 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 31139989 31140736 31140371 Y ARMC5,PRR14,FBRS,PHKG2,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,FUS NA NA NA NA KAT8 14914 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 31264985 31265278 31265093 Y STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM ITGAM NA NA NA NA ITGAM 4033 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 31361586 31361900 31361748 Y ARMC5,STX4,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS,PYCARD,ITGAM,ITGAX ITGAX NA NA NA NA ITGAX 2555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 31880759 31881790 31880862 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 KIAA0664L3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF267 1289 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 31887367 31887596 31887374 Y NA ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 4288 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 33952793 33953560 33953111 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2069714 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 34561668 34561868 34561796 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2678589 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 47324349 47324747 47324746 Y NA NA NA NA NA NA NETO2 148441 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 47348245 47348526 47348436 Y NA NA NA NA NA NA PHKB 144508 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 47526942 47527306 47527022 Y PHKB PHKB,ITFG1 NA NA NA NA ITFG1 30882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 48610830 48611144 48611073 Y SIAH1,N4BP1 N4BP1 NA NA NA NA N4BP1 40915 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 48646959 48647547 48647111 Y LONP2,N4BP1 N4BP1 NA NA NA NA N4BP1 4512 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 49882114 49882389 49882252 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 215463 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 40786 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 50287533 50287795 50287656 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 9485 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 50313130 50313496 50313255 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 35082 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.43967590065189 chr16 50315764 50316400 50316123 Y SNX20,NOD2,CYLD,CYLD,TMEM188,PAPD5,ADCY7 ADCY7 PAPD5,BRD7,ADCY7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADCY7 37716 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 50876551 50876846 50876632 Y NA NA NKD1,LOC388276,NOD2 IMR90 Hi-C 24141950 CYLD 102590 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 53125869 53126178 53125948 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 38924 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 53128013 53128430 53128279 Y RBL2 CHD9 NA NA NA NA CHD9 41068 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 53134908 53135206 53135001 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 47963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 55471492 55471915 55471743 Y NA MMP2 SLC6A2,CES1P1 IMR90 Hi-C 24141950 MMP2 49880 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 55544017 55544378 55544293 Y MMP2,LPCAT2 LPCAT2 NA NA NA NA LPCAT2 3107 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 56071659 56072051 56071855 Y GNAO1 NA GNAO1 IMR90 Hi-C 24141950 AMFR 385399 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 56194642 56194698 56194670 Y NA NA NA NA NA NA AMFR 262752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 57073128 57073339 57073201 Y FAM192A,NLRC5 NA NA NA NA NA CPNE2 51110 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 57578121 57578462 57578348 Y NA CCDC102A,GPR114 NA NA NA NA GPR114 3788 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 GPR97,CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 57927623 57928192 57928041 Y GPR97,ZNF319 KIFC3 NA NA NA NA KIFC3 32666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 58160772 58161211 58161024 Y C16orf80 C16orf80 NA NA NA NA C16orf80 143 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 58460815 58461210 58460990 Y NDRG4,NDRG4,NDRG4 NA NA NA NA NA SETD6 86173 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 60966592 60966717 60966655 Y NA NA NA NA NA NA GOT2 2200331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 63294066 63294457 63294335 Y NA NA NA NA NA NA LINC00920 3145970 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 65378012 65378388 65378200 Y NA NA NA NA NA NA LINC00920 1062039 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 66536058 66536398 66536347 Y CES3 TK2,CKLF,CKLF-CMTM1 NA NA NA NA TK2 48049 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 66555983 66556387 66556198 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1 NA NA NA NA TK2 28060 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 66557840 66558108 66558016 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1 NA NA NA NA TK2 26339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 66558803 66559094 66558929 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1 NA NA NA NA TK2 25353 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD FAM96B,CES2 NA NA NA NA FAM96B 5020 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 67011641 67011860 67011695 Y NA FAM96B,CES2,CBFB NA NA NA NA CES2 45294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 67278684 67278969 67278832 Y C16orf70,FAM65A,ATP6V0D1,LRRC29,LRRC29,FHOD1 TMEM208,FHOD1,PLEKHG4 NA NA NA NA FHOD1 592 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 67513836 67514185 67514007 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,PSMB10,ACD,FAM65A,ATP6V0D1 ATP6V0D1,FAM65A NA NA NA NA ATP6V0D1 696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 67565199 67565482 67565398 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,FHOD1,PSMB10,DPEP2,DDX28,ATP6V0D1,FAM65A FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 14878 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 67891676 67892114 67891889 Y RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1 NA NA NA NA CENPT 11962 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 68029500 68029744 68029642 Y PSMB10,DPEP2,DDX28 SLC12A4,DPEP2,DDX28 NA NA NA NA DPEP2 2745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 68504537 68504688 68504610 Y DPEP2 SMPD3 PRMT7,SMPD3 IMR90 Hi-C 24141950 SMPD3 23946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 68996002 68996219 68996099 Y NA NA HAS3,CHTF8 IMR90 Hi-C 24141950 CHTF8 156112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA CHTF8 91850 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 69442470 69442627 69442557 Y NA TERF2,CYB5B NFAT5,CYB5B IMR90 Hi-C 24141950 TERF2 1996 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 69477830 69478460 69477879 Y NA TERF2,CYB5B NA NA NA NA CYB5B 21402 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 69796957 69797361 69797156 Y EXOSC6,WWP2 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2748 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 69819174 69819469 69819322 Y NA NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 24965 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 70451023 70451476 70451223 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 19664 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 70464772 70465160 70465031 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 5980 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 71056781 71057070 71056926 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 223717 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 71828659 71828769 71828714 Y NA AP1G1,ATXN1L,IST1 NA NA NA NA AP1G1 12335 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 71931018 71931097 71931057 Y DHX38,ATXN1L,KIAA0174 ZNF821 NA NA NA NA ZNF821 3779 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 72237360 72237779 72237529 Y AP1G1,ATXN1L,KIAA0174,DHX38 NA HPR,PMFBP1,LOC100506172 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 111030 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 72965555 72965897 72965813 Y ZFHX3 NA NA NA NA NA ZFHX3 125700 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr16 73053285 73053647 73053466 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 37950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 73084736 73084892 73084798 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 6705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 73840295 73840469 73840382 Y NA NA HPR,PMFBP1,LOC100506172,ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD7 488204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 74083907 74083919 74083914 Y NA NA HPR IMR90 Hi-C 24141950 PSMD7 244754 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 74539925 74540002 74539964 Y NA NA NA NA NA NA GLG1 99010 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 74545615 74545910 74545763 Y NA NA NA NA NA NA GLG1 93102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 75034712 75035106 75034867 Y NA ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 2641 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 75037611 75037819 75037667 Y NA ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 5540 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 75109200 75109655 75109345 Y TMEM170A,ZNRF1 LDHD NA NA NA NA LDHD 39014 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 77979179 77979195 77979185 Y VAT1L,WWOX NA NA NA NA NA WWOX 152115 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 78802745 78802853 78802799 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 671435 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 81503648 81503971 81503709 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 26873 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 81512608 81512902 81512703 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 35833 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 81666319 81666849 81666608 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 103853 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 81785976 81786155 81786044 Y PLCG2,CMIP,CMIP PLCG2 ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720 IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 15274 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 81832236 81832757 81832339 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 61534 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 81855087 81855491 81855343 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 84385 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 81856913 81857368 81857087 Y CMIP,CMIP,PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 86211 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 81865379 81865629 81865509 Y CMIP,CMIP,PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 94677 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 81871176 81871311 81871248 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 100474 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 82142537 82142645 82142588 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH6 59186 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 83480656 83480733 83480694 Y NA NA NA NA NA NA HSBP1 358715 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 84633541 84633938 84633771 Y NA COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 15745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 84932043 84932340 84932235 Y ZDHHC7,KIAA0513,COTL1 NA NA NA NA NA CRISPLD2 80453 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 85339922 85340091 85340012 Y NA NA NA NA NA NA FAM92B 195808 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 85343472 85343805 85343554 Y KIAA0513 NA KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM92B 199358 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 85569816 85569916 85569832 Y NA NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 151763 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 85604470 85605423 85604746 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 116256 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 85650361 85650613 85650432 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 71066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 85969764 85970393 85969905 Y COX4I1,IRF8 IRF8 NA NA NA NA IRF8 39355 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 86587305 86587716 86587504 Y NA FOXF1,MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 464 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 87780321 87780693 87780507 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16905 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 87888208 87888468 87888297 Y KLHDC4,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 12626 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 87889826 87890140 87890011 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 10954 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 87901718 87902209 87902044 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,KLHDC4,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 88058800 88059189 88058918 Y BANP,BANP NA NA NA NA NA BANP 77950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 88771579 88772211 88771675 Y ACSF3,ZFPM1,ZC3H18,CYBA,GALNS,CBFA2T3,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166 MVD,SNAI3,RNF166,CTU2 NA NA NA NA CTU2 708 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 88857121 88857244 88857196 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 7502 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr16 89040833 89040974 89040903 Y CBFA2T3,CBFA2T3 CBFA2T3 NA NA NA NA CBFA2T3 638 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 89045543 89045751 89045645 Y CBFA2T3 CBFA2T3 NA NA NA NA CBFA2T3 3931 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 89181535 89182183 89181777 Y CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3 ACSF3 NA NA NA NA ACSF3 28752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 89382240 89382290 89382256 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778 NA NA NA NA NA ZNF778 100122 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 89392350 89392997 89392648 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 110232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 89449545 89449691 89449606 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 105278 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 89468980 89469266 89469225 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 85703 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr16 89601012 89601134 89601078 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L ANKRD11,SPG7,RPL13,CPNE7 NA NA NA NA RPL13 23931 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,TCF25 NA NA NA NA FANCA 23107 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr16 90024486 90024764 90024610 Y NA DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA DEF8 12153 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 473610 473838 473725 Y FAM101B NA NA NA NA NA RPS4XP17 84949 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 574639 574965 574941 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 15852 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 1100738 1101160 1100939 Y SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK ABR YWHAE,ABR,BHLHA9,TUSC5,CRK,PITPNA,LOC100306951,INPP5K,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 29155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 1254718 1255084 1255034 Y NA YWHAE NA NA NA NA YWHAE 46588 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 1358484 1358816 1358590 Y NA CRK,MYO1C NA NA NA NA CRK 5640 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 1521068 1521369 1521308 Y CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2,SCARF1,RILP NA NA NA NA SLC43A2 8811 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 1585953 1586309 1586247 Y NA SCARF1,RILP,TLCD2,WDR81,MIR22HG NA NA NA NA PRPF8 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 2078039 2078451 2078156 Y TSR1,HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 122591 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 2163031 2163247 2163098 Y SMYD4,MNT,METTL16,SMG6,SMG6 SRR,SMG6 NA NA NA NA SRR 41430 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 2167377 2167408 2167381 Y NA SRR,SMG6 NA NA NA NA SRR 37269 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 50253 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 2717801 2718168 2718053 Y MNT,METTL16,RAP1GAP2 RAP1GAP2 NA NA NA NA RAP1GAP2 39451 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 2719284 2719546 2719376 Y NA RAP1GAP2 NA NA NA NA RAP1GAP2 40934 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 2757819 2758227 2758154 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 79469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 3453416 3453706 3453615 Y OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3 NA NA NA NA NA SHPK 83910 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 3641791 3642428 3642283 Y ITGAE,ATP2A3 P2RX5-TAX1BP3,P2RX5,GSG2 NA NA NA NA GSG2 16580 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 8.06969720984856 chr17 3817602 3817987 3817757 Y UBE2G1,P2RX5,ZZEF1,P2RX1,ATP2A3 CAMKK1,ATP2A3 NA NA NA NA P2RX1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 3864052 3864295 3864184 Y CTNS,ZZEF1,P2RX1,ATP2A3 P2RX1,ATP2A3 NA NA NA NA ATP2A3 1441 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 4205148 4205753 4205440 Y P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39874 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 4278382 4278689 4278533 Y UBE2G1 UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 10459 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 4404427 4404640 4404582 Y SPNS3,SPNS2 SPNS2 NA NA NA NA SPNS2 4294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 4412786 4412979 4412855 Y NA SPNS2,MYBBP1A NA NA NA NA SPNS2 12653 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 4615866 4616105 4615999 Y MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16 PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11 NA NA NA NA ARRB2 4082 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 4655440 4655557 4655500 Y ZNF232,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15 PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,PSMB6 NA NA NA NA MED11 22717 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 4671718 4671981 4671846 Y SPAG7,MINK1,C17orf87,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15 MED11,PSMB6,PLD2 NA NA NA NA PSMB6 25458 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 4812526 4812616 4812571 Y SMTNL2,ZNF232,KIF1C C17orf107,GP1BA,RNF167,SLC25A11,PFN1 NA NA NA NA C17orf107 11813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,INCA1,KIF1C NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 5854578 5854683 5854630 Y NA NA NA NA NA NA NLRP1 333834 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 6614362 6614643 6614518 Y SLC16A13,SLC16A11,ASGR2,ASGR2,ASGR1,SLC13A5 XAF1 MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100 IMR90 Hi-C 24141950 XAF1 42123 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 6818045 6818590 6818345 Y NA NA NA NA NA NA ALOX12P2 62865 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 6822879 6823265 6823073 Y NA NA NA NA NA NA ALOX12P2 67699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 6851869 6852198 6852047 Y XAF1,GABARAP,RNASEK NA NA NA NA NA AC027763.2 61470 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 6925152 6925653 6925481 Y PLSCR3,C17orf49,BCL6B AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13 NA NA NA NA C17orf49 9338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 7119118 7119286 7119174 Y WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4 ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1 NA NA NA NA ACADVL 674 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A FGF11,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 20328 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 18450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 12120 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 8805259 8805593 8805532 Y NA PIK3R6 NA NA NA NA PIK3R6 36265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 8837408 8838325 8837962 Y NDEL1,PIK3R5,PIK3R5 PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 28704 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 8838354 8838934 8838685 Y NDEL1,PIK3R5,PIK3R5 PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 28095 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 8869986 8870720 8870441 Y PIK3R5,PIK3R5 PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 2957 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 9924626 9924875 9924814 Y NA NA NA NA NA NA RPS27AP1 235204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 9953965 9954309 9954075 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 205770 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 10055314 10055664 10055533 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 104415 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 10075017 10075299 10075198 Y MYH4,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 84780 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 10581804 10582199 10582113 Y MYH4 SCO1,TMEM220 NA NA NA NA SCO1 17493 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 13241219 13241377 13241298 Y NA NA HS3ST3B1 IMR90 Hi-C 24141950 ELAC2 321715 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 14044844 14045160 14045003 Y NA NA NA NA NA NA COX10 74031 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 14212324 14213048 14212775 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10 241511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 15124261 15124470 15124375 Y NA NA NA NA NA NA CDRT1 396356 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 16319642 16320463 16320033 Y NA UBB,TRPV2 NA NA NA NA TRPV2 2786 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 30203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 16948336 16948515 16948428 Y ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP MPRIP NA NA NA NA MPRIP 4477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 17615930 17616232 17616056 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 33143 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr17 17686462 17687119 17686716 Y NA NA NA NA NA NA SREBF1 51206 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 18804175 18804500 18804326 Y PRPSAP2 NA NA NA NA NA PRPSAP2 62777 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 20057823 20057990 20057893 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 147166 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 20825818 20826196 20825887 Y NA NA USP22,SPECC1 IMR90 Hi-C 24141950 USP22 118877 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 25609022 25609410 25609177 Y LGALS9,WSB1 WSB1 NA NA NA NA WSB1 9692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 25680204 25680481 25680340 Y LGALS9,WSB1 NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr17 25784873 25785075 25784939 Y WSB1,LGALS9 KSR1 KSR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 KSR1 3203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 25800672 25801019 25800756 Y WSB1,KSR1 KSR1 NA NA NA NA KSR1 19002 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 25858732 25858982 25858838 Y NA NA NA NA NA NA KSR1 77062 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr17 25891638 25891876 25891756 Y NA NA NA NA NA NA LGALS9 62948 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 26458610 26458889 26458687 Y NA NA NA NA NA NA NLK 91847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 27766880 27767142 27766912 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 51200 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 28033849 28034236 28034039 Y NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 85924 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 28049478 28050072 28049903 Y NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 101553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 28928053 28928382 28928251 Y NA SMURF2P1 NA NA NA NA SMURF2P1 2239 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 29136069 29136242 29136166 Y CRLF3 CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CRLF3 13552 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 29176780 29177123 29176952 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA ATAD5 19792 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 1490 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 31177798 31177958 31177878 Y CDK5R1 MYO1D NA NA NA NA MYO1D 24237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 32425716 32426082 32425906 Y CCL8,CCL7 NA NA NA NA NA CCL2 154222 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 32581116 32581488 32581294 Y NA CCL2 NA NA NA NA CCL2 812 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 32940308 32940705 32940417 Y TMEM132E NA NA NA NA NA CCL1 252058 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 33391990 33392005 33391998 Y NA RFFL NA NA NA NA RFFL 22333 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L SLFN12,SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 13552 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 33867743 33868178 33867841 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23 SLFN12L,AP2B1,PEX12 NA NA NA NA SLFN12L 4863 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 34258601 34258728 34258665 Y NA RDM1 NA NA NA NA RDM1 2824 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 34467011 34467104 34467058 Y LYZL6 NA CCL4,CCL16,CCL14-CCL15,CCL14 IMR90 Hi-C 24141950 CCL3 51496 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 35281857 35282039 35281949 Y LHX1 AATF NA NA NA NA AATF 22136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 35741498 35741507 35741502 Y NA ACACA,TADA2A NA NA NA NA ACACA 23402 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 36068867 36069181 36068997 Y ACACA,HNF1B NA NA NA NA NA DDX52 67374 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA CISD3,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 37010933 37011093 37011014 Y FBXO47,C17orf98 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA RPS20P35 1366 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 37366071 37366159 37366135 Y STAC2 CACNB1,RPL19 NA NA NA NA RPL19 11535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 37621502 37621553 37621528 Y NA MED1,CDK12 NA NA NA NA CDK12 5738 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 37661852 37662117 37661985 Y STAC2,FBXL20,MED1,CDK12 CDK12 NA NA NA NA CDK12 46088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 25371 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 37954623 37954701 37954662 Y ZPBP2,IKZF3,GSDMB NA NA NA NA NA MIEN1 69583 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 38084566 38084955 38084762 Y NA ORMDL3 NA NA NA NA ORMDL3 2712 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 38123672 38123938 38123865 Y NA ORMDL3,PSMD3 NA NA NA NA PSMD3 11112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 38480180 38480741 38480429 Y IKZF3,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA CDC6,RARA,GJD3 NA NA NA NA RARA 16736 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 38482426 38483282 38482568 Y IKZF3,MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA,GJD3 NA NA NA NA RARA 18982 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 38509274 38509600 38509311 Y NA RARA,GJD3 NA NA NA NA GJD3 8467 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 38689625 38689996 38689764 Y NA CCR7 NA NA NA NA CCR7 29728 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 38817101 38817471 38817286 Y NA SMARCE1 SMARCE1 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCE1 14341 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 39108843 39109211 39109026 Y KRTAP9-2,KRTAP2-1,KRTAP3-2 NA KRT23 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM99 135485 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 39823354 39823685 39823437 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 19452 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 39828583 39828768 39828687 Y RAB5C,NKIRAS2,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,EIF1 EIF1 SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3 IMR90 Hi-C 24141950 EIF1 14369 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 39835188 39835696 39835517 Y RAB5C,NKIRAS2,DHX58,EIF1 EIF1 SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,KRT19,EIF1,HAP1,JUP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF1 7441 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 40215698 40216046 40215772 Y ATP6V0A1 DNAJC7,DHX58 RAB5C IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC7 44304 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 40400517 40401003 40400833 Y EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A STAT5B,STAT5A NA NA NA NA STAT5B 25722 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 40438296 40438586 40438441 Y STAT5A STAT5B,STAT5A NA NA NA NA STAT5A 731 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 40517094 40517456 40517393 Y NA STAT3 NA NA NA NA STAT3 21130 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 40608913 40609089 40609017 Y NA PTRF,ATP6V0A1 NA NA NA NA ATP6V0A1 51 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 40670495 40670831 40670653 Y WNK4,RAB5C,PTRF NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA NAGLU 15359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 40942176 40942529 40942199 Y NA EZH1,VPS25,PSME3,BECN1 NA NA NA NA VPS25 18722 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 41242207 41242334 41242271 Y NA BRCA1,NBR2 NA NA NA NA BRCA1 33166 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 41324260 41324525 41324381 Y TMEM106A BRCA1,NBR2,NBR1,TMEM106A NA NA NA NA NBR1 3762 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 41686923 41687254 41687162 Y NA ETV4 DHX8,MEOX1,SOST IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 31935 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 41778909 41778996 41778931 Y NA NA MPP2,LOC100130581,MPP3,MEOX1,DUSP3,DHX8,ARL4D,MIR2117,ETV4,C17orf105,SOST,CD300LG IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 75360 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.00267803157156 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 NA NA NA NA NA GPATCH8 55222 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,ADAM11 NA NA NA NA DBF4B 14005 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 43301018 43301609 43301302 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 4207 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 43302645 43302970 43302880 Y NA FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 5834 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 43303050 43303852 43303644 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 6239 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 43505725 43505980 43505806 Y FMNL1,PLEKHM1,ARHGAP27 ARHGAP27 NA NA NA NA ARHGAP27 3807 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 RPS26P8 NA NA NA NA RPS26P8 22736 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 43863369 43863507 43863444 Y CRHR1 NA NA NA NA NA RPS26P8 179460 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA RPS26P8 448041 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 44198056 44198387 44198212 Y STH,KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA RPS26P8 514147 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 44271977 44272219 44272147 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA RPS7P11 525314 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPS7P11 453062 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 45302836 45303175 45303013 Y NA CDC27,MYL4,ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 26088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 45515544 45515843 45515768 Y NA NA NA NA NA NA NPEPPS 82465 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1,TBX21 NA NA NA NA TBX21 37143 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 45778272 45778788 45778511 Y SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21 TBX21 NA NA NA NA TBX21 29822 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 45798483 45798953 45798740 Y NA TBX21 NA NA NA NA TBX21 9657 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 45818522 45818785 45818780 Y OSBPL7,TBX21 TBX21 OSBPL7,MRPL10,SCRN2,LRRC46 IMR90 Hi-C 24141950 TBX21 9912 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 46079914 46080281 46080131 Y NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 33111 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 46318516 46318700 46318601 Y SKAP1,HOXB4 NA NA NA NA NA SNX11 139797 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 46334759 46335012 46334885 Y OSBPL7,SKAP1 NA NA NA NA NA SNX11 156040 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 46823953 46824311 46824136 Y HOXB2,HOXB4,IGF2BP1,PRAC NA NA NA NA NA CALCOCO2 82039 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 ABI3,GNGT2,PHOSPHO1 NA NA NA NA ABI3 15080 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 47278932 47279253 47279189 Y NA ABI3,GNGT2,PHOSPHO1 NA NA NA NA ABI3 6336 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 47647130 47647802 47647650 Y NA NA ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NGFR 76475 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 47765495 47765594 47765536 Y ABI3,GNGT2,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A,SPOP SPOP,SLC35B1 NA NA NA NA SPOP 11899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 47816909 47817569 47817208 Y ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A SLC35B1,KAT7,FAM117A NA NA NA NA SLC35B1 32533 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 47972520 47972640 47972580 Y NA NA LOC284080,ITGA3,NXPH3,SLC35B1,FAM117A,KAT7,TAC4,PDK2,NGFR,SPOP,FLJ45513,DLX4,DLX3 IMR90 Hi-C 24141950 DLX4 71694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 49210436 49210615 49210551 Y SPAG9 SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 SPAG9,NME1-NME2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPAG9 14210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 49505310 49505610 49505404 Y UTP18 NA NA NA NA NA UTP18 169421 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 49727164 49727246 49727242 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 391275 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 49774236 49774449 49774447 Y CA10,CA10,CA10 NA NA NA NA NA UTP18 438347 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 50838489 50838508 50838499 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1502600 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 51041886 51041892 51041889 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1705997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 51059537 51059872 51059705 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1723648 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 53457178 53457442 53457269 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 39911 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 53497797 53498268 53498065 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 53791541 53791562 53791552 Y NA PCTP NA NA NA NA PCTP 34778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 54263832 54264049 54263912 Y NA NA NA NA NA NA NOG 405011 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 54558441 54558834 54558449 Y ANKFN1 NA NA NA NA NA NOG 110226 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 54669912 54670125 54669969 Y NA NOG NA NA NA NA NOG 852 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 54864431 54864801 54864568 Y TRIM25,SCPEP1 DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 44659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 55432914 55433044 55432979 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 101702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 55472969 55473349 55473111 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 141757 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 55477911 55478459 55478198 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 146699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 55517850 55518075 55517943 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 186638 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 55523126 55523573 55523446 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 191914 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 55540558 55540950 55540705 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 209346 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 55604990 55605123 55605063 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 273778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 55655246 55655454 55655378 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 269963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 55734748 55734863 55734779 Y DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 190554 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 55763716 55764071 55763861 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 161346 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 55951789 55952442 55952113 Y SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 26372 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 56310140 56310517 56310331 Y SUPT4H1 EPX,MKS1,MPO MKS1 K562 ChIA-PET 22265404 MKS1 15174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 56359005 56359460 56359241 Y MPO MPO,BZRAP1,MIR142 NA NA NA NA MPO 2709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 56410599 56410851 56410735 Y RAD51C,SRSF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 532 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 56411173 56411562 56411307 Y SRSF1,MTMR4,BZRAP1 BZRAP1,MIR142,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 56412418 56413089 56412537 Y SRSF1,MPO,MTMR4,BZRAP1,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 1035 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 56413212 56413667 56413409 Y VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 1829 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 56419503 56419633 56419507 Y OR4D2 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 8120 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 56421439 56421596 56421520 Y NA BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 6858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736 NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57200500 57200626 57200599 Y GDPD1 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 18218 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57505453 57505591 57505508 Y YPEL2 NA YPEL2,GDPD1 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL2 98403 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57515173 57515465 57515270 Y YPEL2 NA YPEL2,GDPD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YPEL2 108123 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57515522 57515883 57515602 Y YPEL2 NA YPEL2,GDPD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YPEL2 108472 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57518143 57518390 57518285 Y YPEL2 NA YPEL2,GDPD1,SMG8,CLTC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YPEL2 111093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57837481 57837783 57837612 Y YPEL2,VMP1,RNFT1,CA4 NA NA NA NA NA PTRH2 54494 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57844650 57844791 57844732 Y YPEL2 NA NA NA NA NA PTRH2 61663 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57853705 57854627 57854148 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 62000 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 57975372 57975465 57975395 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA RPS6KB1 6925 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 59213347 59213460 59213422 Y TBX4,TBX2 NA NA NA NA NA AC005884.1 68115 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 59329573 59329874 59329791 Y NACA2 NA NA NA NA NA AC005884.1 184341 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 59434096 59434461 59434196 Y NA NA NA NA NA NA NACA2 232102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 60141349 60141594 60141514 Y NACA2,MED13 MED13 INTS2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED13 706 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 60729712 60730300 60729931 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 26950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 60970243 60970809 60970465 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 267481 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 61323201 61323584 61323320 Y NA NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 198155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 61357224 61357494 61357377 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 164245 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 61779769 61779866 61779823 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 3237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 62252131 62252624 62252334 Y LIMD2,ICAM2,DDX5,ERN1 ERN1,SNORD104 NA NA NA NA SNORD104 30688 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 62257655 62257782 62257719 Y DDX5,ERN1 SNORD104 NA NA NA NA SNORD104 36212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 62339620 62339793 62339707 Y CEP95 TEX2 NA NA NA NA TEX2 959 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 62981858 62982486 62982198 Y DDX5,CEP95,GNA13 AMZ2P1 AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AMZ2P1 12164 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr17 62985207 62985536 62985392 Y DDX5,CEP95,GNA13 AMZ2P1 NA NA NA NA AMZ2P1 15513 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 63044063 63044405 63044261 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 6552 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 11928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 508381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr17 64499082 64499411 64499095 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 202328 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 64505568 64505880 64505716 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 208814 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 64795831 64796224 64796168 Y NA NA NA NA NA NA HELZ 443881 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 64918437 64918756 64918597 Y NA NA HELZ,PRKCA,CACNG4,CACNG5 IMR90 Hi-C 24141950 HELZ 321349 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 65254064 65254307 65254144 Y HELZ HELZ,SNORA8 HELZ MCF7 ChIA-PET 22265404 SNORA8 11278 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 65470400 65470556 65470469 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 98825 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 65516763 65517072 65516877 Y PITPNC1 NA NOL11 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNC1 145188 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 65611157 65611527 65611357 Y NA NA NA NA NA NA NOL11 100422 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 65619223 65619512 65619368 Y NA NA NA NA NA NA NOL11 92437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 66016382 66016768 66016696 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 12867 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 66041204 66041633 66041268 Y NA KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 11569 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 66374219 66374806 66374507 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76848 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 67172740 67173121 67172931 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K6 235718 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 68154347 68154781 68154462 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K6 745508 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 69590205 69590225 69590215 Y NA LOC124685 NA NA NA NA LOC124685 24894 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA SLC39A11 669168 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 70432780 70433062 70433017 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 653789 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 70464411 70464702 70464656 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 622149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 70664433 70664574 70664507 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 422277 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 70706379 70706638 70706553 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 380213 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 70779461 70779663 70779556 Y CPSF4L NA NA NA NA NA SLC39A11 307188 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 71951541 71951772 71951658 Y NA NA NA NA NA NA RPL38 245949 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 72458870 72459093 72458877 Y TMEM104,SLC9A3R1,RAB37,RAB37,CD300LF,CD300LD,CD300LB,CD300E,CD300C,CD300A GPRC5C,CD300A NA NA NA NA CD300A 1462 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 72595328 72595714 72595383 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,SLC16A5,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD NA NA NA NA NA CD300C 55046 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 72673744 72674303 72674161 Y KCTD2,GRIN2C,RAB37,RAB37,RAB37 RAB37,CD300LF NA NA NA NA RAB37 9027 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 72684773 72685055 72684909 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF RAB37,CD300LF NA NA NA NA RAB37 20056 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 72734256 72734824 72734605 Y DNAI2,CD300A,CD300LB,SLC9A3R1,CD300LF,RAB37,RAB37 CD300LF,SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 7967 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA CD300LF,SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 73291742 73292218 73291951 Y SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA SLC25A19 8151 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 8177 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 73319762 73319905 73319788 Y SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 6352 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 73854851 73855120 73855038 Y GRB2,GRB2,C17orf109,RECQL5,RECQL5,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,ACOX1,UNC13D,WBP2 UNC13D,WBP2,TRIM65,MRPL38 UNC13D,UNK,WBP2 IMR90 Hi-C 24141950 WBP2 4263 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 74025620 74025914 74025713 Y H3F3B,TRIM47,EVPL CDK3,EVPL,SRP68 NA NA NA NA EVPL 4087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 74188017 74188310 74188175 Y RNF157,FAM100B RNF157 NA NA NA NA RNF157 46144 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 74188633 74188942 74188716 Y NA RNF157 NA NA NA NA RNF157 45512 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 74264426 74264836 74264522 Y NA RNF157 NA NA NA NA RNF157 29972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 74304435 74304789 74304685 Y NA NA NA NA NA NA SPHK1 65876 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 74415585 74415933 74415760 Y MFSD11,RNF157 SPHK1,PRPSAP1,UBE2O NA NA NA NA UBE2O 31355 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 74476907 74476989 74476929 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 18883 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 74511289 74512094 74511811 Y QRICH2,SPHK1,SPHK1,SRSF2,JMJD6,RHBDF2,RHBDF2 RHBDF2,CYGB NA NA NA NA RHBDF2 15417 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 75112462 75112730 75112694 Y SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 31664 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 75312591 75312808 75312697 Y NA SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 37940 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 75318595 75318736 75318679 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 43944 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 75338504 75338763 75338659 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 63853 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 109985 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 75385660 75386043 75385777 Y SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 111009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 75386259 75386377 75386341 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 111608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 75387909 75388384 75388205 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 113258 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 146651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 75553117 75553125 75553121 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 278466 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 75867513 75868184 75867868 Y SOCS3 NA NA NA NA NA TMC8 256667 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMC8 170055 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 9.94637097958078 chr17 76151038 76151473 76151368 Y SYNGR2,TMC8 TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID NA NA NA NA SYNGR2 11166 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76320464 76321292 76320695 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 NA NA NA NA SOCS3 32866 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 76330688 76331173 76330803 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 22985 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 76377337 76378350 76377903 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 4616 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr17 76384421 76384943 76384751 Y USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 11700 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76412850 76413399 76413170 Y CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 40129 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 76438570 76439399 76439026 Y USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 NA NA NA NA NA PGS1 65849 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76669146 76669243 76669181 Y DNAH17 NA NA NA NA NA CYTH1 107136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76669540 76669658 76669599 Y NA NA NA NA NA NA CYTH1 106721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76731686 76732147 76732043 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 44232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76744782 76745072 76745044 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 31307 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76755330 76755871 76755547 Y USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 20508 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 76770526 76771358 76771190 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 5021 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 76775899 76776536 76776049 Y USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 77036015 77036228 77036171 Y CYTH1,ENGASE CANT1,ENGASE NA NA NA NA CANT1 32066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 77342987 77343267 77343127 Y RBFOX3 NA NA NA NA NA ENGASE 273966 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 77916649 77916884 77916753 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 90763 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr17 78008584 78008924 78008651 Y TBC1D16,GAA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA CCDC40 149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 78149249 78149503 78149364 Y NA EIF4A3,SLC26A11,SGSH EIF4A3 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF4A3 30267 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr17 78524165 78524352 78524226 Y NA RPTOR NA NA NA NA RPTOR 7546 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 78734428 78734929 78734574 Y C17orf56 NA NA NA NA NA RPTOR 217809 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 78744627 78744900 78744734 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 218498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 78747049 78747482 78747085 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 215916 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 78754047 78754707 78754061 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 208691 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 78756741 78756888 78756815 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 206510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 78821401 78821639 78821452 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 141759 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 78844194 78844503 78844331 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 118895 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 78853513 78853762 78853623 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 109636 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 78992000 78992331 78992033 Y C17orf56 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 14617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr17 79261712 79261892 79261868 Y NA SLC38A10 NA NA NA NA SLC38A10 5455 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 79302293 79302557 79302318 Y NA SLC38A10 NA NA NA NA SLC38A10 34946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 79397073 79397461 79397298 Y MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 80628 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 79399158 79399431 79399295 Y NA NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 78658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 79399639 79399699 79399664 Y GCGR,BAHCC1 NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 78390 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 79439092 79439387 79439261 Y PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 38702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 79448388 79448678 79448571 Y NPB,AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 29411 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr17 79450324 79450444 79450386 Y NA RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 27645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 79698331 79698466 79698406 Y TMEM105 HGS,ARL16,MRPL12,SLC25A10 NA NA NA NA SLC25A10 29927 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 80158664 80158910 80158860 Y DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 FASN K562 ChIA-PET 22265404 CCDC57 9796 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 80164087 80164383 80164236 Y SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 NA NA NA NA CCDC57 4323 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,CD7,SECTM1 NA NA NA NA CD7 17723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,CD7,SECTM1 NA NA NA NA CD7 17003 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 80290802 80291044 80290895 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CD7,SECTM1,TEX19 NA NA NA NA SECTM1 852 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 80549446 80549833 80549578 Y RAB40B,FN3K NA NA NA NA NA FOXK2 73857 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 80817363 80817528 80817446 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF NA NA NA NA NA TBCD 109423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 13.1367163881256 chr17 80817904 80818262 80818042 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 109964 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr17 80821746 80822299 80821973 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF NA NA NA NA NA TBCD 113806 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 80889616 80889925 80889758 Y NA NA NA NA NA NA B3GNTL1 117761 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 81012071 81012294 81012223 Y NA B3GNTL1,METRNL NA NA NA NA B3GNTL1 4385 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr17 81067352 81067511 81067418 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31785 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr17 81147237 81149188 81147763 Y METRNL NA METRNL,B3GNTL1,TBCD MCF7 ChIA-PET 22265404 METRNL 111670 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 222573 222827 222703 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 43223 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 322671 322833 322785 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 56621 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 379694 380112 379776 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 113644 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 679559 679568 679564 Y NA TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 23219 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 813044 813594 813404 Y YES1 YES1 NA NA NA NA YES1 2497 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr18 2031840 2031857 2031849 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 537651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 2096653 2096904 2096779 Y NA NA ADCYAP1 IMR90 Hi-C 24141950 METTL4 472604 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr18 2636727 2637126 2636786 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA CBX3P2 16268 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr18 2658254 2658560 2658346 Y METTL4,LPIN2,EMILIN2,SMCHD1 CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 4517 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 2893280 2893456 2893355 Y NA EMILIN2 NA NA NA NA EMILIN2 48252 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 3015219 3015501 3015351 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 3906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 3213545 3213785 3213625 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 31694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 3704951 3705065 3705044 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 295345 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 3741003 3741403 3741194 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 331397 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 3798477 3798752 3798615 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 388871 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 4444990 4445233 4445112 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 1035384 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 5294371 5294839 5294435 Y ZFP161 NA NA NA NA NA RPL6P27 1166175 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr18 6187863 6188007 6187935 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P27 273007 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 8643425 8643722 8643508 Y ANKRD12,ANKRD12,RAB12 RAB12 NA NA NA NA RAB12 35982 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 9082770 9083125 9082859 Y ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2 ANKRD12,RALBP1,TWSG1,NDUFV2,CCDC165,PPP4R1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 17503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 9101793 9102110 9101852 Y RAB12,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 NA NA NA NA NDUFV2 1165 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 9604214 9604566 9604459 Y NA PPP4R1 NA NA NA NA PPP4R1 8672 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 9707499 9707519 9707509 Y NA RAB31 NA NA NA NA RAB31 1337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 9742137 9742641 9742378 Y NA RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 35975 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 9742767 9742849 9742828 Y VAPA,RAB31 RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 36605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 9758210 9758472 9758414 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 52048 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 9899069 9899359 9899167 Y NA VAPA NA NA NA NA VAPA 12640 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 10169065 10169310 10169224 Y NA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 257066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 10543130 10543398 10543236 Y NAPG NAPG NA NA NA NA NAPG 19228 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 11859926 11860218 11860181 Y CHMP1B CHMP1B,MPPE1 NA NA NA NA CHMP1B 10531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr18 11995516 11995787 11995574 Y NA IMPA2 NA NA NA NA IMPA2 16492 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 12048672 12049055 12049000 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 69648 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 12317654 12318000 12317871 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 11986 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 12330841 12331244 12331045 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 25173 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 12606965 12607268 12607096 Y PTPN2,SPIRE1 AP005482.1,SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA AP005482.1 48774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 12679329 12679437 12679359 Y NA AP005482.1,SPIRE1,PSMG2,CEP76 NA NA NA NA CEP76 21339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 12839100 12839985 12839163 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 87657 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 13137958 13138425 13138153 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 148597 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 13274084 13274183 13274139 Y RNMT,PTPN2,CEP192 NA NA NA NA NA CEP192 284723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 13279543 13279935 13279638 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 290182 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 13284469 13284622 13284521 Y C18orf1 NA NA NA NA NA CEP192 295108 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 13381993 13382212 13382131 Y RNMT,PTPN2,CEP192,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 342447 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 13382338 13382799 13382497 Y RNMT,PTPN2,CEP192 NA NA NA NA NA RNMT 341860 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr18 13470557 13470796 13470677 Y MC5R,C18orf1,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 253863 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 13564575 13564807 13564692 Y C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 159852 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 13577393 13578089 13577503 Y RNMT,C18orf19,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 146570 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 13824016 13824345 13824089 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 99354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 18515990 18516559 18516297 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 173253 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 19397108 19397142 19397125 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 114190 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 19453532 19453543 19453538 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 170614 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 19675139 19675157 19675148 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 MIB1 392221 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 20035500 20035848 20035676 Y NA NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 340376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 20272481 20272650 20272518 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 103574 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 20647533 20647626 20647580 Y NA NA RIOK3,CABLES1,TMEM241 IMR90 Hi-C 24141950 CABLES1 64902 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 20913960 20914007 20913982 Y NA NA NA NA NA NA TMEM241 101918 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 21091625 21091887 21091629 Y C18orf8 C18orf8 NA NA NA NA C18orf8 10152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 21228672 21228807 21228737 Y LAMA3,ANKRD29 NA NA NA NA NA NPC1 63810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 21440084 21440297 21440180 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 130440 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 21945811 21945986 21945899 Y NA OSBPL1A NA NA NA NA OSBPL1A 29858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 22813301 22813647 22813474 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 116507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 22828001 22828237 22828119 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 101917 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 23314380 23314536 23314458 Y NA NA NA NA NA NA SS18 354645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 23536740 23537129 23536935 Y NA NA NA NA NA NA SS18 132052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 23657156 23657540 23657507 Y NA SS18 NA NA NA NA SS18 11641 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 24290449 24290835 24290698 Y TAF4B NA NA NA NA NA KCTD1 55084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 24449654 24449975 24449785 Y AQP4,AQP4 NA NA NA NA NA KCTD1 214289 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 25502058 25502147 25502103 Y CDH2 NA NA NA NA NA KCTD1 1266693 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 29599439 29599921 29599769 Y RNF138,RNF138,TRAPPC8,RNF125 RNF125 NA NA NA NA RNF125 3104 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 29665285 29665308 29665296 Y TRAPPC8,RNF138 RNF138 NA NA NA NA RNF138 4510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 32183267 32183349 32183326 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 371543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 32300943 32301117 32301030 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 253775 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 32436094 32436130 32436112 Y DTNA NA NA NA NA NA MAPRE2 118762 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 33040584 33040905 33040747 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 35050 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 33042221 33042422 33042327 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 33533 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 33185452 33185527 33185471 Y ZNF397,GALNT1 GALNT1 NA NA NA NA GALNT1 26371 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 33844964 33845139 33845043 Y NA NA NA NA NA NA ELP2 137557 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 34406593 34406898 34406790 Y NA KIAA1328,TPGS2 NA NA NA NA KIAA1328 171 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 39898716 39899231 39898870 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 365545 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 39923968 39924095 39924054 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 390797 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 40040213 40040351 40040282 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 507042 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 42301858 42302085 42301972 Y NA NA NA NA NA NA SIGLEC15 1101392 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 42686338 42686675 42686545 Y NA NA SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 SIGLEC15 716802 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 43266827 43267110 43266932 Y NA NA NA NA NA NA SIGLEC15 136367 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 43407687 43408063 43407797 Y PSTPIP2,EPG5 SIGLEC15 NA NA NA NA SIGLEC15 4210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr18 43554012 43554440 43554292 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 8772 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 43582956 43583166 43583086 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 37716 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 43593456 43593723 43593664 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 48216 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 43622844 43623013 43623010 Y NA PSTPIP2 NA NA NA NA PSTPIP2 27225 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr18 43830546 43830877 43830624 Y EPG5,PSTPIP2 NA NA NA NA NA C18orf25 79027 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 45479794 45480168 45480059 Y SMAD2,SMAD2 SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 24279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 8.82036671774144 chr18 46184656 46184773 46184715 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 121239 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 46324397 46324797 46324645 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 150284 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 46459367 46459671 46459607 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 15410 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 46467138 46467469 46467322 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 7612 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr18 46479420 46479772 46479694 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 4339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr18 46508713 46508838 46508774 Y DYM,SMAD7 SMAD7 CTIF,SMAD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 33632 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 46579464 46579684 46579624 Y DYM NA NA NA NA NA SMAD7 104383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 46582084 46582553 46582428 Y SMAD7,DYM NA NA NA NA NA SMAD7 107003 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr18 47834587 47834811 47834691 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr18 48720847 48721238 48721193 Y NA MEX3C NA NA NA NA MEX3C 21436 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 49556425 49556602 49556514 Y NA NA NA NA NA NA MEX3C 813751 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 52613483 52613779 52613741 Y NA CCDC68 NA NA NA NA CCDC68 10960 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 52755312 52755656 52755484 Y NA NA NA NA NA NA CCDC68 130573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 54327448 54327828 54327638 Y NA WDR7,TXNL1 NA NA NA NA TXNL1 10617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 54672062 54672240 54672149 Y NA NA NA NA NA NA TXNL1 355231 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 55756032 55756268 55756150 Y NA NA NA NA NA NA ATP8B1 287699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 56317461 56317625 56317529 Y MALT1 MALT1 ALPK2,MALT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALT1 18993 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 56516862 56517001 56516932 Y NA U8,ZNF532 ZNF532 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF532 10831 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 56537923 56538093 56537956 Y ZNF532 ZNF532 NA NA NA NA ZNF532 10091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 56633214 56633485 56633410 Y ZNF532 NA NA NA NA NA ZNF532 105382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 60087978 60088258 60088046 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2,TNFRSF11A,BCL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF11A 97458 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 60173605 60173906 60173662 Y KIAA1468,ZCCHC2 ZCCHC2 ZCCHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZCCHC2 14334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr18 60221448 60221638 60221488 Y NA ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 33208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 60474704 60474908 60474800 Y ZCCHC2,PHLPP1 NA NA NA NA NA PHLPP1 94032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 60609893 60610245 60610069 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 229221 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 60767363 60767723 60767547 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 217638 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 60817160 60817550 60817308 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 167811 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 60854025 60854354 60854177 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 131007 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 60873001 60873358 60873117 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 112003 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 60875086 60875640 60875342 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 109721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 61852761 61853109 61852935 Y NA NA NA NA NA NA SERPINB8 217602 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 65945074 65945279 65945262 Y NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 435167 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 66131807 66132182 66131996 Y NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 248264 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 67862254 67862313 67862284 Y NA RTTN NA NA NA NA RTTN 8868 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 70228345 70228675 70228601 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 1584425 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 70535937 70536272 70536159 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 1276828 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 72683878 72684340 72684028 Y NA NA NA NA NA NA ZADH2 234963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 72702422 72702889 72702602 Y TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 216414 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 72916177 72916455 72916218 Y NA ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA ZADH2 2848 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 72919000 72919372 72919172 Y NA TSHZ1 NA NA NA NA ZADH2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 72919988 72920296 72920123 Y ZADH2,TSHZ1 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA TSHZ1 414 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 74088486 74089010 74088832 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 116136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74179507 74179930 74179654 Y ZNF516 ZNF516 NA NA NA NA ZNF516 25216 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 74199867 74199923 74199879 Y NA ZNF516 NA NA NA NA ZNF516 5223 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 72093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 74292470 74292738 74292612 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 87324 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74745176 74745688 74745337 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 212613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74754529 74754928 74754700 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 221966 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74755425 74755811 74755618 Y MBP,MBP NA NA NA NA NA ZNF236 222862 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74767033 74767545 74767189 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234470 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr18 74767591 74768136 74768025 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 235028 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr18 74774000 74774964 74774473 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 241437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74775208 74775557 74775363 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 242645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr18 74780243 74780707 74780579 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 247680 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74780891 74781094 74780990 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 248328 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74802146 74802233 74802190 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 269583 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74810011 74810388 74810104 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 277448 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 74813361 74814191 74813850 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 280798 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74816269 74816488 74816400 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 283706 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 74818309 74818676 74818510 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 285746 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 74823541 74824614 74824455 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 290978 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74826312 74827078 74826635 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 293749 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 74840150 74840705 74840388 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 307587 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 74840794 74841428 74841367 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 308231 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 76734377 76734736 76734420 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 92549 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 76831132 76831674 76831321 Y NFATC1,NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 3847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 76884362 76884757 76884560 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 57077 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 76955177 76955415 76955295 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 127892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 77267133 77267456 77267187 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 113277 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr18 77269136 77269505 77269398 Y ATP9B,NFATC1 NA NA NA NA NA NFATC1 115280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 77284524 77284884 77284797 Y ATP9B,NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 130668 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 77551694 77552094 77551810 Y PQLC1,CTDP1 NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 113893 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr18 77586114 77586172 77586164 Y NA NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA IMR90 Hi-C 24141950 PQLC1 123492 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 342831 343179 342882 Y MIER2 MIER2 NA NA NA NA MIER2 33 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 661410 661735 661571 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PRSS57,PALM NA NA NA NA RNF126 133 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 662216 662510 662281 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PRSS57,PALM NA NA NA NA RNF126 939 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 823657 823956 823874 Y BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1 PTBP1,MIR4745,AZU1,PRTN3,ELANE,CFD NA NA NA NA AZU1 560 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 888565 888780 888647 Y SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7 PRTN3,ELANE,CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA MED16 2438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 925071 925217 925123 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA ARID3A 1290 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1069175 1069494 1069467 Y C19orf22,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA HMHA1 5253 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 1101850 1102062 1101942 Y C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2 HMHA1,POLR2E NA NA NA NA GPX4 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1410481 1410741 1410600 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 4913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1755338 1755626 1755509 Y NA NA NA NA NA NA ATP8B3 54649 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr19 1856794 1856864 1856840 Y NA ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 4703 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 1895445 1895653 1895520 Y OAZ1,DOT1L,CSNK1G2 REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3,CSNK1G2 BTBD2,CSNK1G2,KLF16 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCAMP4 7560 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 1942393 1942508 1942451 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 1942586 1943099 1942836 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3398 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 2051815 2052053 2051955 Y NA BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 2572 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 2095281 2095723 2095416 Y NA MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MOB3A 609 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 2264561 2264657 2264590 Y TMPRSS9,SPPL2B SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1,C19orf35 NA NA NA NA OAZ1 2828 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 2330710 2331138 2330903 Y NA SPPL2B,LSM7 NA NA NA NA LSM7 4091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 2394369 2394570 2394516 Y NA TIMM13 NA NA NA NA TIMM13 31322 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 2629688 2630134 2629953 Y DOT1L,OAZ1,GADD45B NA NA NA NA NA GNG7 70573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 AES NA NA NA NA AES 25254 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 3154006 3154458 3154241 Y GNA15,FZR1,S1PR4 GNA15,S1PR4,NCLN NA NA NA NA S1PR4 15886 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 3344211 3344472 3344340 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC NFIC NFIC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 NFIC 13089 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 3570616 3571018 3570829 Y C19orf28,HMG20B,GIPC3 MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 3812391 3812689 3812466 Y CCDC94,FZR1,APBA3,MATK,ZBTB7A MATK MATK K562 ChIA-PET 22265404 MATK 12264 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 4067781 4068111 4067963 Y SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 2838 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 4089074 4089290 4089084 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 4089506 4089868 4089573 Y ZBTB7A ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24563 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 4108837 4109162 4109070 Y TMIGD2,CCDC94,C19orf29,APBA3,MRPL54,MATK,ZBTB7A ZBTB7A,MAP2K2,CREB3L3 NA NA NA NA MAP2K2 12964 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 4369210 4369467 4369256 Y ZBTB7A,CCDC94,TICAM1,SEMA6B MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA MPND 27686 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr19 5336072 5336705 5336347 Y PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 2109 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 5505612 5505767 5505690 Y PTPRS,NRTN NA PTPRS,ZNRF4,PLAC2 IMR90 Hi-C 24141950 SAFB 115279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 5517224 5517513 5517434 Y NA NA PTPRS,ZNRF4,PLAC2 IMR90 Hi-C 24141950 SAFB 103533 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 5898990 5899031 5899011 Y FUT5 FUT5,NDUFA11,VMAC NA NA NA NA FUT5 2767 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr19 6060958 6061480 6061122 Y RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 84805 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 6062045 6062746 6062500 Y TNFSF9,DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 85892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 11.823044749313 chr19 6066698 6067208 6066827 Y SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2 NA NA NA NA NA RANBP3 90545 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 6105811 6106211 6106011 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 91372 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 6108691 6108922 6108748 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88661 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 6394891 6395218 6395055 Y NA CLPP,ALKBH7,GTF2F1,KHSRP NA NA NA NA GTF2F1 2899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 6577471 6577956 6577654 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 TNFSF9,CD70 NA NA NA NA CD70 24158 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 6802447 6802718 6802569 Y DENND1C,TNFSF9,TNFSF14,EMR1,GPR108,VAV1 SH2D3A,VAV1 NA NA NA NA VAV1 31722 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 7427436 7427895 7427614 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 30104 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 8075966 8076193 8076120 Y NA ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 7423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 8226134 8226320 8226231 Y NA CERS4 FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 43300 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 8582725 8583114 8583112 Y NA PRAM1,ZNF414 NA NA NA NA ZNF414 5677 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 8605873 8606246 8606065 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F PRAM1,ZNF414,MYO1F NA NA NA NA ZNF414 28825 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 8607140 8607451 8607227 Y RAB11B,PRAM1,MYO1F PRAM1,ZNF414,MYO1F NA NA NA NA ZNF414 30092 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr19 9402141 9402360 9402251 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 30088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 9684452 9684634 9684543 Y NA ZNF426,ZNF121,ZNF561 NA NA NA NA ZNF121 8575 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 9777343 9777681 9777659 Y ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6095 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 9937602 9937876 9937738 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA UBL5 1034 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 9960910 9961072 9960969 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA PIN1 16977 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 10215397 10215725 10215533 Y TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,FBXL12,ICAM3,C19orf66,PPAN C19orf66,ANGPTL6,PPAN-P2RY11,PPAN,SNORD105B,P2RY11,EIF3G NA NA NA NA PPAN 432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 10215832 10216068 10215900 Y S1PR5,S1PR5,ANGPTL6 C19orf66,ANGPTL6,PPAN-P2RY11,PPAN,SNORD105B,P2RY11,EIF3G NA NA NA NA PPAN 867 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 10517647 10518072 10517920 Y NA TYK2,MIR1181 CDC37 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR1181 5433 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 10534715 10535011 10534785 Y C19orf66,ICAM1,ICAM3,S1PR5,S1PR5,DNM2,CDKN2D,CDKN2D,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 22501 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 10713789 10714290 10714179 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2 KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3 NA NA NA NA SLC44A2 2656 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 10766466 10766790 10766534 Y NA ILF3,QTRT1 NA NA NA NA ILF3 3529 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 10829647 10829946 10829894 Y ICAM3,TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2 QTRT1,DNM2 NA NA NA NA DNM2 2892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 10865897 10866291 10865968 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2 DNM2 NA NA NA NA DNM2 39142 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 10989126 10989500 10989238 Y NA TMED1,C19orf38,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 8937 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 11206953 11207150 11207057 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 8915 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 11679134 11679427 11679281 Y CCDC159,ACP5,ACP5 ECSIT,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 10945 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 12261625 12261922 12261774 Y NA ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136 NA NA NA NA ZNF625 3624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr19 12896870 12897372 12897198 Y ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB JUNB,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 2938 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 13094405 13094796 13094616 Y ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5 CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX NA NA NA NA NFIX 9626 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 13140737 13141121 13140967 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 36315 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 13153458 13153528 13153499 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 49036 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.62734327762511 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 13997855 13998026 13997925 Y CCDC130,IL27RA,DCAF15 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 16988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 14097142 14097697 14097482 Y CCDC130,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA DCAF15,RFX1,IL27RA NA NA NA NA RFX1 18154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 14229419 14229865 14229637 Y CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA PRKACA 2523 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 14404408 14404769 14404597 Y NA NA NA NA NA NA CD97 84544 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 14466734 14466953 14466791 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 CD97 LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97 IMR90 Hi-C 24141950 CD97 22360 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 14473667 14474081 14473883 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,PKN1,CD97 CD97 CD97,DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 15232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 14485924 14486626 14486057 Y NA CD97,DDX39A DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 2687 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr19 14576577 14576952 14576765 Y NA DDX39A,PKN1,PTGER1,GIPC1,TECR NA NA NA NA PTGER1 7222 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 14719213 14719509 14719361 Y PRKACA,DDX39A,PKN1,ZNF333 NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 38339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 14869692 14869911 14869839 Y NA EMR2,AC005255.3 NA NA NA NA EMR2 17442 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 14880267 14880429 14880348 Y NA EMR2,AC005255.3 NA NA NA NA EMR2 6924 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 15202796 15202947 15202871 Y OR7C2 ILVBL NA NA NA NA ILVBL 31649 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 15321082 15321623 15321224 Y RASAL3 NA NA NA NA NA ILVBL 86486 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 15666666 15666804 15666739 Y NA CYP4F22 NA NA NA NA CYP4F22 49362 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F12 166050 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr19 16229373 16229857 16229589 Y NA RAB8A,HSH2D NA NA NA NA RAB8A 8934 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr19 16256445 16256572 16256495 Y RAB8A,EPS15L1 RAB8A,HSH2D,FAM32A,AP1M1 NA NA NA NA HSH2D 13607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 16279649 16279838 16279744 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 HSH2D,FAM32A,AP1M1 NA NA NA NA FAM32A 14353 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 16394356 16394632 16394513 Y NWD1,KLF2 KLF2 EPS15L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF2 38996 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 16403791 16404489 16404426 Y NA KLF2 AP1M1,KLF2,EPS15L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF2 29139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 16445319 16445495 16445399 Y NA KLF2 NA NA NA NA KLF2 11691 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 16477143 16477842 16477298 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 43515 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 16510195 16510544 16510471 Y RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2 NA NA NA NA NA EPS15L1 70352 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 16556086 16556488 16556261 Y RAB8A,HSH2D,KLF2,MED26,EPS15L1 EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 24408 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 16998454 16998573 16998467 Y NA F2RL3 NA NA NA NA F2RL3 783 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr19 17202504 17202759 17202710 Y MED26,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 17913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 17236053 17237400 17237360 Y MED26,HAUS8,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 51462 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 17667126 17667426 17667289 Y MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1 PGLS NA NA NA NA PGLS 46688 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 18155923 18156099 18156029 Y NA ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 45982 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 18201963 18202321 18202146 Y FCHO1,FCHO1,JAK3,UBA52,LRRC25,IFI30,FKBP8,ELL,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1 MAST3,IL12RB1 MAST3 K562 ChIA-PET 22265404 MAST3 4282 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 18504645 18504988 18504829 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,UBA52,ELL,LRRC25 GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA LRRC25 1439 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 19432680 19432782 19432710 Y NA MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 3027 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 19483893 19484092 19484012 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 10543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 19708713 19709032 19708957 Y ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP PBX4,GMIP NA NA NA NA PBX4 18693 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 20110963 20111092 20111018 Y TSSK6 ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 37223 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,ZNF90 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 14571 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 20606211 20606644 20606560 Y ZNF90 ZNF826P NA NA NA NA ZNF826P 436 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 21511296 21511520 21511376 Y NA ZNF708,ZNF738 NA NA NA NA ZNF708 1069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 23309445 23309479 23309469 Y NA NA NA NA NA NA ZNF730 53433 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 23971294 23971621 23971458 Y NA ZNF681,RPSAP58 NA NA NA NA RPSAP58 27487 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 24216985 24217321 24217111 Y ZNF254 ZNF254 NA NA NA NA ZNF254 2709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 27732067 27732764 27732500 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1969684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 27732785 27733191 27732992 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1969257 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 27733888 27734761 27733974 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1967687 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 27739373 27739767 27739570 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1962681 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 28173659 28174043 28173717 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1528405 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 28508249 28508335 28508293 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1194113 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 28914991 28915131 28915061 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 787317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 29702850 29703471 29703365 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 402 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 32754044 32754196 32754068 Y NA NA NA NA NA NA ZNF507 80304 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 33758042 33758138 33758096 Y CEBPA CEBPA LOC80054,CEBPA,PEPD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPA 33332 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 33759449 33759718 33759650 Y CEBPA CEBPA CEBPA,LOC80054,PEPD,CEBPG,CHST8 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CEBPA 31752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 34301645 34301872 34301668 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 16807 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 35763871 35764402 35764192 Y FXYD1,FXYD1,HAMP USF2,CD22 NA NA NA NA USF2 5990 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 35808532 35808711 35808557 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 CD22 NA NA NA NA CD22 368 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 IGFLR1 37792 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 36400295 36400642 36400477 Y FFAR2,MLL4,IGFLR1,U2AF1L4,NFKBID,HCST,TYROBP NFKBID,HCST,TYROBP,LRFN3 NA NA NA NA TYROBP 3098 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 36402185 36402479 36402315 Y IGFLR1 NFKBID,HCST,TYROBP,LRFN3 NA NA NA NA TYROBP 4988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 37408041 37408149 37408081 Y ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 2810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 37424676 37424848 37424761 Y ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 19445 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 38470537 38470671 38470619 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L3 74669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 38480533 38480757 38480643 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L3 84665 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 38491114 38491333 38491222 Y PPP1R14A NA NA NA NA NA SIPA1L3 95246 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 38727709 38727942 38727826 Y NA SPINT2,PPP1R14A NA NA NA NA SPINT2 4733 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 38807798 38808031 38807971 Y MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA KCNK6 453 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 40413949 40414284 40414119 Y SUPT5H,SUPT5H CTC-471F3.4 NA NA NA NA CTC-471F3.4 33350 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 40473949 40474218 40474067 Y ZNF546,FCGBP CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546 NA NA NA NA PSMC4 694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 40942693 40943017 40942855 Y NA PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 5595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 41226531 41226793 41226653 Y PLD3,SPTBN4,LTBP4,EGLN2,EGLN2,CYP2B6,ITPKC,RAB4B NUMBL,ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA NA NA NA NA ADCK4 4419 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA 8162 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 41304071 41304255 41304136 Y SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1 SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA EGLN2 1170 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 41814398 41814719 41814610 Y HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2 HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1 NA NA NA NA CCDC97 304 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 41834727 41835191 41834967 Y CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 19625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA CEACAM21 CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 25521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 42036742 42037668 42037272 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,ARHGEF1 CEACAM21 CEACAM21,LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 16218 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 CEACAM21 LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 15573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 11.2600426183933 chr19 42052659 42053071 42052864 Y HNRNPUL1,CCDC97,B9D2,CEACAM21,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 CEACAM21 LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 815 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 42289644 42289819 42289732 Y NA CEACAM6 NA NA NA NA CEACAM6 36759 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 42308353 42308719 42308557 Y CCDC97,TGFB1,TMEM91,B9D2,TMEM91,CEACAM21,CEACAM4,ERF,DEDD2,ARHGEF1,CEACAM3 NA NA NA NA NA RPS19 53269 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,CD79A,ARHGEF1 NA NA NA NA CD79A 385 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 42430880 42431141 42430883 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 30401 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 42432096 42432209 42432128 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 29333 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 14986 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 15495 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 17070 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.62734327762511 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8 NA NA NA NA PRR19 19259 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 42902919 42903213 42903066 Y TMEM145 NA CNFN MCF7 ChIA-PET 22265404 MEGF8 75158 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 43934404 43934558 43934468 Y NA NA NA NA NA NA ZNF575 93091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 44178912 44179361 44178991 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6213 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 44257292 44257551 44257463 Y NA SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 44281524 44282142 44281780 Y IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 1267 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 44287065 44287299 44287223 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 3656 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 44288540 44288860 44288798 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 5131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 44440425 44440707 44440629 Y NA ZNF45,ZNF221,ZNF155 NA NA NA NA ZNF45 2995 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 44780646 44780756 44780701 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 26443 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 45270781 45271407 45271333 Y RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3,BCAM NA NA NA NA BCL3 21819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 45879605 45879880 45879744 Y NA ERCC2,CD3EAP NA NA NA NA ERCC2 7429 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 45945937 45946679 45946251 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1 ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22574 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 45953262 45953678 45953446 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 15575 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,FOSB,ERCC1,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.81501065459833 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 46133845 46134220 46134022 Y NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2 OPA3,EML2,GIPR NA NA NA NA EML2 12667 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 46833647 46834067 46833741 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 14184 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 46853988 46854113 46854077 Y PRKD2 PPP5C NA NA NA NA PPP5C 5737 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 47059268 47059423 47059384 Y NA CALM3 NA NA NA NA CALM3 42908 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 47221635 47221817 47221775 Y ZC3H4,PRKD2 PRKD2,FKRP,STRN4 NA NA NA NA PRKD2 3251 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 47234783 47235117 47235027 Y PTGIR,ZC3H4,PRKD2,STRN4 PRKD2,FKRP,STRN4 NA NA NA NA FKRP 12186 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 47448240 47448462 47448420 Y PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1 NA NA NA NA NA AP2S1 95991 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 47487878 47488175 47487946 Y ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM160 61713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr19 47613894 47614902 47614503 Y PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,C5AR1 NA NA NA NA C5AR1 14311 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr19 47805638 47805769 47805718 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1 CCDC9,C5AR1,DHX34 PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2 IMR90 Hi-C 24141950 C5AR1 14358 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 48494541 48494691 48494555 Y ELSPBP1,BSPH1 NA NA NA NA NA PLA2G4C 117383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 48903450 48903602 48903513 Y NA TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10640 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 49493898 49494273 49494153 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 49896315 49896677 49896489 Y BCL2L12 NA NA NA NA NA CTC-301O7.4 54450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 50323482 50323712 50323595 Y MED25 FUZ,MED25,PTOV1,PNKP NA NA NA NA MED25 3943 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,NAPSB,POLD1,SPIB NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 50948277 50948607 50948442 Y KLK4,LOC342918 SPIB NA NA NA NA SPIB 28082 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 51010284 51010518 51010437 Y KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 2092 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 51909569 51909701 51909635 Y NA ETFB,NKG7,SIGLEC10 NA NA NA NA SIGLEC10 9356 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 51972517 51972837 51972747 Y NA SIGLEC12 NA NA NA NA SIGLEC12 30206 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 52049983 52050318 52050095 Y ZNF615,SIGLEC7,CD33,SIGLEC8,SIGLEC6,ZNF175 SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175 ZNF175,CEACAM18 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SIGLEC6 16873 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 52053461 52053588 52053498 Y NA SIGLEC6,ZNF175 ZNF175,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF175 18963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 52124472 52124738 52124601 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 51921 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 52193633 52193945 52193814 Y ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA FPR2 59334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA FPR2 58020 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 52267467 52267945 52267800 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR1,FPR2,FPR2 FPR2,FPR1 NA NA NA NA FPR2 14188 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 52274579 52275152 52274785 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR2 FPR2,FPR1 NA NA NA NA FPR2 21300 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 52586676 52587051 52586863 Y NA ZNF432,ZNF841 NA NA NA NA ZNF432 9940 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 53660263 53660559 53660411 Y NA ZNF415,ZNF665 NA NA NA NA ZNF347 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr19 54098247 54098689 54098487 Y NA NA NA NA NA NA ZNF813 129258 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 54286017 54286259 54286128 Y ZNF765,ZNF761,ZNF813 AC008753.3,NLRP12 NA NA NA NA AC008753.3 9164 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 54373735 54373974 54373935 Y VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NLRP12,MYADM,AC008753.6 NA NA NA NA AC008753.6 3374 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 NA NA NA NA NA AC008753.6 94882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 54548907 54549052 54548979 Y NLRP12,NLRP12,VSTM1 VSTM1 NA NA NA NA VSTM1 16155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 54713468 54714085 54713942 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 10858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr19 54830246 54830549 54830451 Y MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRA6,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1 LILRB2,LILRA5,LAIR1 NA NA NA NA LILRA5 7837 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 54885175 54886148 54885583 Y VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRA6,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1 LAIR1,TTYH1 PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9 K562,HELA 5C 22955621 LAIR1 5010 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 54886806 54887123 54887067 Y VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1 LAIR1,TTYH1 PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9 K562,HELA 5C 22955621 LAIR1 6641 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr19 55387041 55387235 55387157 Y TMEM150B,PPP6R1,PPP1R12C,LENG8,LILRA2,LILRA1,LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR FCAR NA NA NA NA FCAR 3337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 55699968 55700281 55700219 Y NA NA NA NA NA NA PPP6R1 68082 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 55787779 55788010 55787914 Y KIR3DL1,KIR2DS4,KIR3DL2,NCR1,ZNF628,SUV420H2,EPN1,PPP6R1 PPP6R1,HSPBP1 NA NA NA NA HSPBP1 1739 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 55832834 55833432 55833321 Y FCAR,PPP1R12C,TMEM150B HSPBP1,TMEM150B,SUV420H2,COX6B2 NA NA NA NA TMEM150B 9984 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 TMEM150B,SUV420H2,COX6B2,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.43967590065189 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 56224436 56224703 56224570 Y TMEM150B EPN1 NA NA NA NA EPN1 39844 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 56789143 56789486 56789342 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 87982 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr19 56833034 56833496 56833435 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NA NA NA NA ZNF542 43972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr19 56835887 56836393 56836023 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NLRP5,ZNF787 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF542 41075 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 57020241 57020583 57020445 Y ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28 ZNF667-AS1,ZNF667,ZNF471 NA NA NA NA ZNF471 3029 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 57980425 57980680 57980553 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 6258 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 58237757 58238155 58237774 Y NA ZNF551,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF586 ZNF154 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF671 765 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 58788473 58788748 58788728 Y NA ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22 NA NA NA NA ZNF8 155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 58886804 58887095 58886950 Y ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B A1BG-AS1,A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584 NA NA NA NA ZNF837 3332 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr19 59049687 59049971 59049795 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA ZBTB45 1409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr19 59050036 59050316 59050176 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA ZBTB45 1758 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 1659182 1659769 1659438 Y NA NA NA NA NA NA TMEM18 983743 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 2105199 2105393 2105246 Y MYT1L NA NA NA NA NA TSSC1 1274260 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 3359907 3360169 3360140 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 19484 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 5938217 5938571 5938366 Y NA NA NA NA NA NA RSAD2 1065366 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 7000506 7000677 7000592 Y NA RSAD2,CMPK2 NA NA NA NA RSAD2 3260 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 7171830 7172101 7171947 Y RNF144A NA NA NA NA NA RNF144A 116307 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 7191649 7191931 7191786 Y RNF144A NA NA NA NA NA RNF144A 136126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 7382750 7382854 7382792 Y CMPK2,RSAD2 NA NA NA NA NA RNF144A 327227 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 8369680 8369964 8369925 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 351958 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 8443687 8443971 8443812 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 277951 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 8573214 8573302 8573258 Y NA NA LOC339788,LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 148620 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 8661100 8661349 8661222 Y ID2 NA LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC011747.4 60573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 9955950 9956409 9956221 Y TAF1B,GRHL1 TAF1B RRM2,GRHL1,TAF1B,ODC1,ADAM17,CYS1,KLF11,HPCAL1,YWHAQ IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 25074 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 10153127 10153217 10153171 Y NA KLF11 NA NA NA NA KLF11 27759 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr2 10261505 10261712 10261609 Y NA CYS1,RRM2 NA NA NA NA RRM2 1050 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 10471190 10471549 10471320 Y HPCAL1,HPCAL1 HPCAL1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 HPCAL1 30175 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 10501440 10501782 10501611 Y C2orf48 NA NA NA NA NA HPCAL1 60425 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 12214361 12214708 12214578 Y NA NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 AC096559.1 227613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr2 12309855 12310149 12310048 Y LPIN1 NA TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 AC096559.1 323107 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 12317202 12317459 12317276 Y LPIN1 NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 AC096559.1 330454 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 12323357 12323603 12323480 Y NA NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 AC096559.1 336609 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 12596433 12596805 12596535 Y NA NA LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 258210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 12959326 12959589 12959403 Y NA NA LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 104311 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 15027568 15027702 15027655 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 671752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 15561739 15562014 15561765 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 137440 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 15565715 15566065 15565846 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 133389 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 15838211 15838536 15838342 Y NBAS NA NA NA NA NA DDX1 108909 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 16489272 16489649 16489463 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 355950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 16839236 16839985 16839538 Y FAM49A FAM49A NA NA NA NA FAM49A 5614 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 16845411 16845884 16845697 Y FAM49A NA NA NA NA NA FAM49A 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 19788015 19788399 19788228 Y NA NA NA NA NA NA TTC32 311348 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 20037141 20037249 20037195 Y NA NA OSR1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC32 62498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 20171563 20171753 20171690 Y TTC32 WDR35 NA NA NA NA WDR35 16139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 20249984 20250622 20250147 Y TTC32,PUM2 LAPTM4A NA NA NA NA LAPTM4A 195 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 20491517 20491908 20491876 Y NA NA SDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 58087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 20639369 20639757 20639507 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,GDF7 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 5078 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 20848318 20848468 20848370 Y NA HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 23681941 23682000 23681953 Y KLHL29 NA NA NA NA NA ATAD2B 465984 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA ITSN2 89641 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 24495048 24495317 24495183 Y NA NA NA NA NA NA ITSN2 86266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 24535588 24535972 24535848 Y NA ITSN2 NA NA NA NA ITSN2 45611 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA NCOA1 139264 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 25193628 25193634 25193631 Y NA DNAJC27-AS1,DNAJC27 NA NA NA NA DNAJC27 665 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 25352140 25352468 25352150 Y DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A NA NA NA NA NA EFR3B 89141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 25517596 25517908 25517752 Y DNAJC27,DNMT3A DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 45551 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 26184450 26184595 26184522 Y NA KIF3C NA NA NA NA KIF3C 19023 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 26258152 26258567 26258448 Y RAB10 RAB10 NA NA NA NA RAB10 3176 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 26328559 26328812 26328686 Y FAM59B,RAB10 NA NA NA NA NA RAB10 73583 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 26521727 26522029 26521734 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 7386 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK NA NA NA NA KHK 3129 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 27877424 27877712 27877568 Y NA GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 6626 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 28124092 28124474 28124302 Y FOSL2,RBKS BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 12127 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 28182324 28182658 28182394 Y FOSL2,GCKR,RBKS NA NA NA NA NA RBKS 70359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 28183212 28183402 28183309 Y FOSL2 NA NA NA NA NA RBKS 71247 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 28589661 28589896 28589794 Y FOSL2 FOSL2 BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSL2 23419 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 28621403 28621758 28621597 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 8088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 28811153 28811289 28811218 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB NA PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PLB1 133141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 28844259 28844848 28844625 Y FOSL2,TRMT61B,PPP1CB,PPP1CB NA NA NA NA NA PPP1CB 127658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 28939068 28939564 28939261 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 32942 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 30391485 30391578 30391503 Y YPEL5 YPEL5 NA NA NA NA YPEL5 23678 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 30448125 30448425 30448217 Y YPEL5,LBH LBH LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 3972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 30634519 30634754 30634635 Y YPEL5 LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 33338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 33688539 33688685 33688612 Y NA RASGRP3 NA NA NA NA RASGRP3 29148 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 33702756 33702976 33702846 Y RASGRP3,RASGRP3 RASGRP3 NA NA NA NA RASGRP3 43365 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr2 33863068 33863290 33863179 Y NA FAM98A NA NA NA NA FAM98A 40619 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 34402780 34402960 34402870 Y NA NA NA NA NA NA FAM98A 580331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 37199283 37199286 37199285 Y NA STRN NA NA NA NA STRN 7668 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 37383262 37383336 37383288 Y NA EIF2AK2 NA NA NA NA EIF2AK2 1054 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 37628786 37629269 37629037 Y NA NA CDC42EP3,FAM82A1 IMR90 Hi-C 24141950 QPCT 59069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 37687316 37687611 37687464 Y NA NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 QPCT 117599 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 37763462 37763512 37763507 Y FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 37789550 37789826 37789587 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 173785 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 37989393 37989693 37989581 Y QPCT,CDC42EP3 CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 25782 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 38049848 38050212 38050057 Y QPCT,CDC42EP3 NA CDC42EP3,LOC100505876,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 86237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 38323202 38323810 38323564 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYP1B1 11234 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 38368766 38369153 38368894 Y CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 33722 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 38464505 38464753 38464617 Y NA NA FAM82A1,CYP1B1-AS1,CYP1B1,ATL2 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1B1 129461 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 38949741 38950194 38950072 Y HNRPLL,SRSF7 SRSF7,GEMIN6 NA NA NA NA SRSF7 26442 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 39695061 39695250 39695144 Y NA MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 32608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 40358852 40359026 40359015 Y SLC8A1 NA NA NA NA NA THUMPD2 354445 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 40647677 40648234 40647999 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 187959 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 40853155 40853298 40853196 Y NA SLC8A1 NA NA NA NA SLC8A1 16962 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 41887358 41887712 41887535 Y PKDCC NA NA NA NA NA EML4 506778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 41963199 41963639 41963355 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 430851 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 42030306 42030675 42030574 Y NA NA NA NA NA NA EML4 363815 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 42161610 42162017 42161892 Y NA NA NA NA NA NA EML4 232473 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 42245014 42245155 42245121 Y PKDCC NA LOC388942,C2orf91 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 149335 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 42412542 42412681 42412587 Y NA EML4 NA NA NA NA EML4 18052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 19491 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 43151826 43152270 43152066 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 134093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 43195156 43195444 43195331 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 177423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 43197884 43198002 43197975 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 180151 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr2 43205442 43205824 43205685 Y MTA3,HAAO NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 187709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 43358229 43358771 43358564 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 92977 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 43359752 43360119 43360054 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 91629 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr2 43361205 43361386 43361340 Y OXER1,ZFP36L2,THADA,THADA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 90362 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 43367145 43367375 43367250 Y ZFP36L2,THADA,THADA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 84373 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 43421229 43421631 43421263 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 30117 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 43422005 43422472 43422185 Y THADA,THADA,ZFP36L2 ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 29276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 43672480 43672679 43672609 Y NA NA NA NA NA NA THADA 148506 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 44471855 44471912 44471885 Y NA AC013717.3 NA NA NA NA AC013717.3 23848 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 44935582 44935781 44935667 Y NA NA NA NA NA NA AC012354.8 285771 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 45405025 45405418 45405218 Y NA NA NA NA NA NA AC012354.8 183473 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 45974142 45974515 45974197 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 97658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 46100592 46100616 46100604 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 224108 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 46456791 46456944 46456828 Y NA NA PRKCE,EPAS1,PIGF IMR90 Hi-C 24141950 EPAS1 61862 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 47197841 47198107 47197954 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 30847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 47212237 47212567 47212294 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 45243 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 47284732 47284905 47284823 Y TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA NA CALM2 116835 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 47946277 47946754 47946432 Y NA AC079250.1,MSH6 KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 25608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 48347949 48348272 48348150 Y NA NA FOXN2,FBXO11,MSH6,PPP1R21,STON1-GTF2A1L IMR90 Hi-C 24141950 FOXN2 191504 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 48392535 48392754 48392657 Y FBXO11,FBXO11,FOXN2 NA NA NA NA NA FOXN2 147022 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 52304154 52304543 52304242 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1688386 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 54643124 54643489 54643323 Y NA SPTBN1 ACYP2,C2orf73,SPTBN1 IMR90 Hi-C 24141950 SPTBN1 37933 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 54682152 54682577 54682442 Y NA SPTBN1 NA NA NA NA SPTBN1 730 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 54714209 54714329 54714214 Y NA SPTBN1 NA NA NA NA SPTBN1 32787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 54751942 54752182 54752042 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 70520 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr2 54796924 54797237 54797074 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 115502 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 54801406 54802103 54801693 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 119984 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 55379709 55379882 55379800 Y SMEK2,RTN4 RTN4 NA NA NA NA RTN4 41952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 56070301 56070618 56070423 Y NA NA EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PNPT1 151256 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 56089907 56090266 56090122 Y NA NA NA NA NA NA PNPT1 170862 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 56112478 56112793 56112711 Y NA NA NA NA NA NA PNPT1 193433 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 56267618 56267636 56267627 Y NA NA NA NA NA NA PNPT1 348573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 57805621 57805995 57805808 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 326791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 59385638 59385932 59385785 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 919131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 60327078 60327537 60327382 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 282203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 60776650 60777166 60776879 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 1536 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 60778604 60778787 60778696 Y REL,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 60779041 60779656 60779263 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 60784320 60784652 60784428 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 5618 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 61095090 61095322 61095155 Y REL REL NA NA NA NA REL 11334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr2 62753696 62753810 62753753 Y NA TMEM17 TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 16667 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 62883210 62883234 62883222 Y OTX1 EHBP1 EHBP1,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 EHBP1 15752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 63514058 63514136 63514097 Y WDPCP NA NA NA NA NA MDH1 299607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 64439546 64439941 64439735 Y SERTAD2,AFTPH,PELI1 NA NA NA NA NA PELI1 69958 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 64836549 64836646 64836605 Y SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH NA NA NA NA NA AFTPH 87084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 64894012 64894430 64894356 Y NA NA SERTAD2,AFTPH K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 81709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 64957479 64957902 64957679 Y NA SERTAD2 SERTAD2,AFTPH,LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 18237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr2 65086460 65086681 65086529 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110321 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 65089781 65090129 65089916 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 113642 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 65151416 65151594 65151536 Y AFTPH,RAB1A,ACTR2,SLC1A4 NA NA NA NA NA SLC1A4 62017 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 65166338 65166539 65166535 Y NA SLC1A4 LOC400958,SLC1A4,CEP68,SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A4 47072 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 65173308 65173867 65173558 Y AFTPH,SERTAD2 SLC1A4 SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 39744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.81501065459833 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 66673073 66673647 66673570 Y NA MEIS1 NA NA NA NA MEIS1 14489 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 67908840 67908848 67908844 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 286389 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 68499892 68500037 68499965 Y NA PPP3R1,CNRIP1 NA NA NA NA PPP3R1 18523 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 68917276 68917507 68917390 Y PPP3R1,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25,PROKR1 ARHGAP25 PROKR1,APLF,ARHGAP25,BMP10,FBXO48 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 12543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 68964261 68964640 68964319 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP25 59528 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 68964895 68965352 68965007 Y PLEK,FBXO48,APLF NA NA NA NA NA ARHGAP25 60162 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 68989889 68990241 68990036 Y PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ARHGAP25 85156 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 68993342 68993784 68993560 Y PLEK,FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25 NA BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 88609 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 69012672 69013051 69012681 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP25 107939 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 69025646 69026018 69025855 Y PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ARHGAP25 120913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 69040869 69041120 69040946 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP25 136136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 69062805 69062948 69062879 Y PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ARHGAP25 158072 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 69578985 69578997 69578991 Y NA GFPT1 NA NA NA NA GFPT1 33385 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 69852685 69852770 69852748 Y NA ANXA4,AAK1 NA NA NA NA ANXA4 16787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 70172627 70172794 70172718 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 14603 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 70173540 70174234 70173890 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 13163 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 70342945 70343256 70343171 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4,AC016700.3 NA NA NA NA AC016700.3 14593 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4,AC016700.3 NA NA NA NA AC016700.3 34707 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 72980109 72980387 72980306 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 70783 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 74259703 74260366 74260024 Y NA AC073046.25 TET3,ACTG2,BOLA3 IMR90 Hi-C 24141950 AC073046.25 49444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 74766124 74766334 74766228 Y NA LBX2,PCGF1,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA DOK1 7819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 74801154 74801351 74801200 Y DOK1 HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA LOXL3 20337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 75063027 75063135 75063034 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 3919 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 75072652 75072899 75072736 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 13544 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 75498571 75498680 75498627 Y NA NA TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 POLE4 314952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 77377674 77377853 77377764 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA GCFC2 1441559 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 78033031 78033054 78033043 Y NA NA NA NA NA NA GCFC2 2096916 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 78386991 78387304 78387148 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 2000957 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 78464924 78465229 78465077 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1923032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 80264039 80264430 80264177 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 123831 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 84299529 84299779 84299675 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG1 385390 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 85632531 85633066 85632892 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG CAPG NA NA NA NA CAPG 10489 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 85817156 85817274 85817185 Y VAMP5 GGCX,VAMP8,VAMP5,RNF181,USP39,TMEM150A,C2orf68 NA NA NA NA RNF181 3574 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 86221169 86221618 86221314 Y NA NA POLR1A,ST3GAL5,LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 AC105053.4 106766 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 86226191 86226620 86226368 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 104658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 86452715 86452898 86452804 Y RNF103,RMND5A IMMT,MRPL35 NA NA NA NA MRPL35 28237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 88913679 88914090 88914022 Y EIF2AK3 EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 11004 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 91773979 91774217 91774117 Y NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 AC096579.7 2610326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA AC096579.7 2772544 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 92309033 92309202 92309197 Y NA NA NA NA NA NA AC096579.7 3145380 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 92323832 92324227 92324030 Y NA NA LOC654342,GDF7,EFEMP1,SLC30A6,MSH2,MFSD2B,USP34,TEX261,RGPD1,MTA3,AHSA2,SLC30A3,RBKS,SPRED2,ACTG2,HTRA2,TRMT61B,FLJ16341,MIR548AD,LOC100286979,LRRTM1,C2orf84,EXOC6B,KCNK12,CAD,LOXL3,DPYSL5,CD207,BCL11A,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,VAX2,PPP1CB,TAF1B,POLR1A,LOC644838,FSHR,MYCN,REG3G,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,RGPD2,PCGF1,C1D,MOB1A,PQLC3,ANTXR1,FKBP1B,CCT7,ATP6V1B1,C2orf89,OTX1,PPM1B,GKN1,DOK1,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,MIR4780,ZNF513,CLEC4F,FAM176A,BRE,LPIN1,PPP3R1,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,MRPL53,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,CENPO,SNRPG,C2orf42,KIF3C,EML6,POMC,LOC100505624,C2orf71,CCT4,SNRNP27,COX7A2L,TMEM178,IMMT,ALMS1,ATAD2B,ODC1,LOC100630918,LCLAT1,SLC1A4,PROKR1,CTNNA2,SRD5A2,CAPN14,C2orf65,PLGLB2,C2orf61,CCDC85A,CCDC164,LOC1720,LOC285074,VIT,TCF23,DNAJC27-AS1,UCN,DQX1,C2orf28,CENPA,ATP6V1C2,LOC375196,LOC728819,YWHAQ,KRTCAP3,EPAS1,C2orf74,MDH1,OSR1,HPCAL1,PAPOLG,GPN1,PREB,EMX1,REEP1,KCMF1,PRORSD1P,WDPCP,KDM3A,NAT8,GPR75-ASB3,PCYOX1,FANCL,ITSN2,ACYP2,DNMT3A,LOC151534,PNO1,YIPF4,E2F6,KCNF1,DNAH6,TET3,OXER1,AFTPH,UGP2,STRN,SMYD1,LOC339807,DYNC2LI1,YPEL5,HEATR5B,FUNDC2P2,EHD3,RAB10,FAM179A,PELI1,REL,CGREF1,C2orf44,PRKCE,KLHL29,DHX57,PRADC1,TCF7L1,C2orf68,CYP26B1,PREPL,OST4,WDR35,ATP6V1E2,REG1B,SIX2,MIR216A,CALM2,SLC4A1AP,IAH1,LOC100134259,ANKRD53,ASAP2,LOC100506474,CPSF3,LRPPRC,FBXO48,SUCLG1,GPR113,LOC100288911,WDR92,TACR1,CCDC121,C2orf43,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,GRHL1,DTNB,SLC4A5,VSNL1,MPV17,SDC1,SPAST,EIF2AK2,CYP1B1,KCNG3,PSME4,FLJ33534,MCFD2,TTC27,MIR4261,C2orf70,LOC100133985,SOS1,BOLA3-AS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,GNLY,PLB1,MSGN1,RRM2,EIF2AK3,TRIB2,FAM59B,SLC3A1,LINC00486,FNDC4,MIR3682,LTBP1,C2orf48,TMEM17,TPRKB,FBXO11,SNX17,TGFA,C2orf56,LINC00152,KHK,KCNK3,GREB1,FAM136A,NCOA1,FAM82A1,LOC645949,RTN4,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,SLC8A1,PPM1G,PEX13,MATN3,FABP1,C2orf81,LOC375190,PTRHD1,KRCC1,BIRC6,FAM161A,OTOF,HK2,ALK,SPR,GEMIN6,PNPT1,SMC6,TLX2,REG1A,LOC284950,ELMOD3,PKDCC,GALM,LOC100505716,RAD51AP2,TMSB10,PLEKHH2,ST3GAL5,NAT8B,THNSL2,CCDC88A,QPCT,RHOQ,SMYD5,CAPG,DGUOK,HAAO,MPHOSPH10,SULT6B1,RMND5A,DDX1,MIR4778,STAMBP,CEP68,NRXN1,EML4,ADCY3,LHCGR,LOC100189589,GMCL1,TGOLN2,MYCNOS,LOC339803,EMILIN1,EFR3B,ADAM17,FAM49A,FOXN2,CIB4,RTKN,CDKL4,FEZ2,TTC7A,TRIM54,PTCD3,C2orf18,NT5C1B-RDH14,SFXN5,POLE4,DUSP11,LOC400958,CYP1B1-AS1,CRIPT,APOB,GFPT1,CHAC2,ZNF512,ZFP36L2,FIGLA,MAP4K3,MYADML,ABCG8,CCDC142,C2orf73,ATL2,CD8A,NOL10,PDIA6,HADHB,GCFC2,ACTR2,MTIF2,LOC388948,ATOH8,LBX2,LOC100132215,SMEK2,ASXL2,EPT1,SRSF7,ITGB1BP1,RAB1A,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,MRPL33,SUPT7L,SPDYA,WDR54,ROCK2,NRBP1,PRKD3,TTC31,FLJ30838,RNF103-CHMP3,SOCS5,CRIM1,ABHD1,BOLA3,DNAJC27,MIR4429,MOGS,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VPS54,GALNT14,PLEK,MORN2,VAMP8,NTSR2,C2orf91,KIAA1841,NOTO,CHMP3,HADHA,MIR4435-1,LOC728730,AUP1,AGBL5,MSH6,LRRTM4,SF3B14,VAMP5,MCEE,SFTPB,AAK1,SEMA4F,PFN4,PCBP1-AS1,TTC32,GCKR,GGCX,THUMPD2,MRPL19,LAPTM4A,CCDC104,MAPRE3,LOC90784,GKN2,FAM84A,RASGRP3,PPP1R21,ANXA4,CD8B,DNAJC5G,SERTAD2,PIGF,SIX3,UBXN2A,MEIS1,FAM98A,GGT8P,NFU1,SNAR-H,VRK2,MIR4436A,C2orf50,THADA,MXD1,SLC5A6,CCDC75,LOC100129726,KCNS3,C2orf78,MIR4757,MRPL35,RHOB,CYS1,STON1-GTF2A1L,LOC388942,DCTN1,C2orf53,NAGK,MIR4262,UNQ6975,RPIA,SH2D6,USP39,PCBP1,KLF11,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,XPO1,NLRC4,PUS10,PAIP2B,RETSAT,CAMKMT,HNRPLL,IFT172,ZNF638,LGALSL,DPY30,BMP10,EIF2B4,REG3A,LOC100128590,ADD2,NBAS,OR7E91P,RNF181,PUM2,ABCG5,ALMS1P,CDC42EP3,FBXO41,C2orf51,TMEM214,DYSF,FOSL2,TMEM150A,FOXI3,EGR4,C2orf16 IMR90 Hi-C 24141950 AC096579.7 3160179 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 96922307 96922515 96922363 Y DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127 STARD7,TMEM127,CIAO1,SNRNP200 NA NA NA NA TMEM127 7217 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 97012594 97012961 97012778 Y ASTL SNRNP200,AC021188.4,ITPRIPL1,NCAPH NA NA NA NA NCAPH 13069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 98364129 98364314 98364298 Y TMEM131,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA ACTR1B 85559 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 98389575 98389609 98389594 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 111005 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 164641 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 99081402 99081780 99081544 Y TMEM131,UNC50,MGAT4A,INPP4A INPP4A UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 INPP4A 22085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 99122556 99122993 99122631 Y INPP4A,UNC50 NA NA NA NA NA INPP4A 63239 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 99273192 99273525 99273326 Y TSGA10,TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A NA NA NA NA NA UNC50 50150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 99374660 99374852 99374788 Y INPP4A,UNC50,MGAT4A MGAT4A NA NA NA NA MGAT4A 29071 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 99452356 99452772 99452668 Y TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A NA NA NA NA NA MGAT4A 106767 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 100036640 100036800 100036773 Y NA NA NA NA NA NA REV1 67697 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 101923239 101923757 101923472 Y RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149 RNF149 NA NA NA NA RNF149 76 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 101944459 101944757 101944675 Y NA RNF149 NA NA NA NA RNF149 21296 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 102081384 102081611 102081486 Y RNF149,MAP4K4,MAP4K4,RFX8 RFX8 NA NA NA NA RFX8 7554 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 102133779 102134093 102133972 Y MAP4K4,MAP4K4 RFX8 MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFX8 44614 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 102134407 102134716 102134504 Y NA RFX8 MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFX8 45242 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 102339341 102339788 102339615 Y IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 28029 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 102382879 102383094 102382925 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 71567 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 102628788 102628974 102628920 Y IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2,IL1R2 IL1R2 NA NA NA NA IL1R2 22482 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 104503960 104504175 104504043 Y NA NA NA NA NA NA MRPS9 1148266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 105466558 105467231 105466773 Y GPR45,POU3F3 NA NA NA NA NA MRPS9 185210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 105676474 105676490 105676482 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 24033 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 105913488 105913594 105913541 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA TGFBRAP1 30897 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 106026144 106026496 106026333 Y GPR45,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 26474 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 106370571 106370808 106370750 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 11217 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 106416912 106417146 106416970 Y C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 57558 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 106545066 106545218 106545146 Y NA NA LOC285000 IMR90 Hi-C 24141950 NCK2 185712 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 107698212 107698438 107698325 Y NA NA NA NA NA NA AC092106.1 830039 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 109206329 109206788 109206425 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 57472 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 109211421 109211903 109211563 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 62564 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 109648298 109648660 109648428 Y LIMS1,RANBP2 NA MALL,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 SH3RF3 95144 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 110319562 110319852 110319693 Y NA SEPT10 NA NA NA NA SEPT10 49931 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 111976914 111977297 111977138 Y BCL2L11 NA NA NA NA NA BCL2L11 101959 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 112253383 112253436 112253410 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L11 378428 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 112391711 112391985 112391831 Y NA NA ACOXL,BCL2L11 IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 248282 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 112699155 112699419 112699287 Y NA MERTK NA NA NA NA MERTK 45099 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 113384986 113385271 113385131 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 7242 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 113444240 113444400 113444290 Y NA SLC20A1 NA NA NA NA SLC20A1 42806 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 113551784 113552157 113551927 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP2L 31530 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 113552525 113552798 113552647 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP2L 32271 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 113569466 113569945 113569683 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1B NA NA NA NA IL1B 22535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 113869431 113870096 113869786 Y NA IL1RN,PSD4 NA NA NA NA IL1RN 6640 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 113969874 113970195 113970111 Y NA NA NA NA NA NA PSD4 56972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 114132430 114132930 114132660 Y IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2 NA PAX8,IL1RN,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 WASH2P 206734 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 114615220 114615283 114615253 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 ACTR3,SLC35F5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTR3 30254 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 118578074 118578451 118578195 Y CCDC93,DDX18 DDX18 NA NA NA NA DDX18 7848 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 118847045 118847263 118847087 Y INSIG2 INSIG2 NA NA NA NA INSIG2 3017 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 120887789 120888032 120887910 Y NA NA NA NA NA NA TMEM185B 90952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 121011894 121012098 121011996 Y TMEM185B,RALB TMEM185B,RALB NA NA NA NA RALB 16254 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 121495235 121495636 121495561 Y NA GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 4036 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 122226715 122226882 122226860 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC 59575 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 127103428 127103674 127103551 Y NA NA NA NA NA NA YWHAZP2 210065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 127416778 127417376 127416886 Y NA GYPC NA NA NA NA GYPC 5269 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 127862609 127862665 127862637 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 128453755 128454028 128453898 Y MAP3K2,IWS1,AMMECR1L,SFT2D3 SFT2D3 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 SFT2D3 2569 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 128470034 128470252 128470136 Y NA SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 13437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 129073927 129074235 129074112 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 129074706 129075071 129074888 Y NA HS6ST1 NA NA NA NA HS6ST1 555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 129248071 129248194 129248123 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 173920 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr2 129271609 129271755 129271698 Y NA NA HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 197458 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 129816667 129816796 129816732 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 742516 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 131110123 131110429 131110276 Y NA IMP4,CCDC115,PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 1151 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 131683053 131683224 131683139 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 165809 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 132995001 132995176 132995089 Y NA NA NA NA NA NA AC093838.4 746615 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 133035126 133035421 133035327 Y NA NA ANKRD30BL IMR90 Hi-C 24141950 AC093838.4 786740 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 136242341 136242686 136242514 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 44120 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 136337488 136337852 136337670 Y NA NA NA NA NA NA R3HDM1 50463 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 136504457 136504522 136504461 Y NA UBXN4 NA NA NA NA UBXN4 7268 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr2 136651588 136651672 136651630 Y NA MCM6 NA NA NA NA MCM6 19592 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 136780386 136780683 136780473 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 AC093391.2,DARS NA NA NA NA DARS 38716 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 136816831 136817220 136816922 Y NA NA NA NA NA NA CXCR4 56515 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 137936497 137936938 137936682 Y NA NA NA NA NA NA CXCR4 1062762 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 138059421 138059750 138059540 Y NA NA NA NA NA NA CXCR4 1185686 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 140478818 140479210 140479014 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 1221447 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 142150307 142150490 142150399 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 1482577 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 143591579 143592086 143591771 Y KYNU KYNU NA NA NA NA KYNU 40981 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 143841282 143841488 143841338 Y KYNU,ARHGAP15 ARHGAP15 NA NA NA NA ARHGAP15 5443 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 144013747 144014085 144013828 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP15 166816 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 144155569 144155721 144155633 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP15 308638 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 144214116 144214255 144214186 Y ARHGAP15 NA NA NA NA NA ARHGAP15 367185 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 145215157 145215664 145215657 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 64483 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 145459514 145460320 145459781 Y GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 179367 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 145461218 145461913 145461584 Y GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 181071 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 145580675 145580804 145580747 Y ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 300528 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 145942500 145942836 145942668 Y NA NA ZEB2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P5 149962 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 148089200 148089222 148089211 Y NA NA NA NA NA NA AC009480.4 476693 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 148296630 148296767 148296652 Y NA NA NA NA NA NA AC009480.4 269148 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 148366263 148366285 148366274 Y NA NA NA NA NA NA AC009480.4 199630 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 149372340 149372450 149372396 Y EPC2 EPC2 KIF5C IMR90 Hi-C 24141950 EPC2 27559 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 149527542 149527937 149527740 Y EPC2 NA NA NA NA NA EPC2 127533 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 149819679 149819759 149819686 Y KIF5C NA NA NA NA NA EPC2 419670 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 152144821 152144962 152144854 Y RIF1,RIF1,RIF1,NMI RBM43,NMI NA NA NA NA NMI 250 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr2 152493697 152493937 152493847 Y RBM43,NMI NA NA NA NA NA ARL5A 189069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 152789657 152790028 152790018 Y FMNL2 NA NA NA NA NA ARL5A 106651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 153362104 153362315 153362141 Y FMNL2 NA NA NA NA NA ARL6IP6 210092 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 153599082 153599296 153599189 Y NA ARL6IP6,PRPF40A NA NA NA NA PRPF40A 26571 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 154335936 154336181 154336134 Y RPRM NA NA NA NA NA PRPF40A 763425 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 154379200 154379581 154379374 Y NA NA NA NA NA NA PRPF40A 806689 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 157038752 157038990 157038871 Y NR4A2 NA NR4A2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NR4A2 157870 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 157314368 157314516 157314443 Y NR4A2,GPD2 GPD2 NA NA NA NA GPD2 24566 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 158039321 158039798 158039630 Y NA NA NR4A2,GALNT5,GPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYTIP 303675 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 158084243 158084386 158084315 Y NA NA GALNT5 IMR90 Hi-C 24141950 CYTIP 259087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 158323410 158323576 158323494 Y ACVR1C,CYTIP CYTIP NA NA NA NA CYTIP 19897 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 158325907 158326296 158326106 Y CYTIP CYTIP NA NA NA NA CYTIP 17177 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 158337382 158337447 158337407 Y ACVR1C CYTIP ACVR1C,UPP2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTIP 6026 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 158687871 158687996 158687910 Y ACVR1,ACVR1 ACVR1 NA NA NA NA ACVR1 42378 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 160208394 160208612 160208503 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 67084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 160219490 160219798 160219643 Y MARCH7,CD302 NA NA NA NA NA WDSUB1 78180 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 160353770 160354019 160353895 Y MARCH7,CD302 NA NA NA NA NA AC009506.1 115788 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 160646880 160647090 160646985 Y NA CD302 NA NA NA NA CD302 5663 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 161155946 161156394 161156280 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 105999 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 161173742 161174088 161173899 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 88305 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 161201536 161201707 161201641 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 60686 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 161238176 161238388 161238285 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 24005 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 161522878 161523352 161523066 Y TANK,TANK NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 174573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 161979819 161979978 161979936 Y TANK,TANK TANK PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANK 11441 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 AC009299.3 NA NA NA NA AC009299.3 3839 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 162727867 162728162 162727919 Y NA NA NA NA NA NA EIF3EP2 214607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 163035525 163035776 163035654 Y NA NA NA NA NA NA EIF3EP2 92756 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 163170742 163170802 163170773 Y NA IFIH1,GCA NA NA NA NA IFIH1 2411 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 163578974 163579343 163579088 Y KCNH7 NA NA NA NA NA GCA 405624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 165683192 165683287 165683237 Y NA COBLL1 NA NA NA NA COBLL1 14902 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 166671246 166671486 166671366 Y CSRNP3 GALNT3,AC009495.2 NA NA NA NA AC009495.2 21885 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 166779898 166780276 166780103 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 28077 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 168070984 168071000 168070992 Y NA NA NA NA NA NA STK39 1031651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 168858571 168859104 168858832 Y NA NA NA NA NA NA STK39 243547 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 168994093 168994243 168994234 Y NA NA NA NA NA NA STK39 108408 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 169894823 169895302 169894971 Y DHRS9,DHRS9 DHRS9 ABCB11 K562 ChIA-PET 22265404 DHRS9 23997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 169967622 169967787 169967727 Y NA DHRS9 NA NA NA NA DHRS9 48323 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 170441657 170442069 170441908 Y NA FASTKD1,PPIG NA NA NA NA PPIG 2807 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 170856738 170857087 170856755 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 174770 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 171093453 171093713 171093583 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 411485 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 171540516 171540678 171540597 Y NA NA MYO3B IMR90 Hi-C 24141950 GAD1 127045 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 171997679 171997950 171997833 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 87874 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 172957811 172957994 172957904 Y DYNC1I2,DLX1,DLX2 NA NA NA NA NA SLC25A12 95045 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 172962291 172962684 172962615 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A12 99525 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 173302497 173302807 173302540 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 12415 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 173942556 173942831 173942720 Y NA NA NA NA NA NA MLK7-AS1 201933 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 173966331 173966790 173966623 Y ZAK NA NA NA NA NA MLK7-AS1 177974 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 175434486 175434564 175434524 Y NA NA NA NA NA NA AC010894.4 69806 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 175465107 175465494 175465405 Y CIR1,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 80150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 175531113 175531313 175531213 Y WIPF1 WIPF1 NA NA NA NA WIPF1 14331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 175700542 175700958 175700833 Y CHRNA1 NA NA NA NA NA H3F3AP4 118037 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 178131060 178131559 178131324 Y NA MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 12322 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 178260156 178260330 178260230 Y NFE2L2 AGPS,AC074286.1,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 4731 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,AC074286.1,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 179923228 179923504 179923450 Y NA NA NA NA NA NA SESTD1 204013 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 180871045 180871158 180871103 Y NA CWC22 NA NA NA NA CWC22 1205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 180990064 180990392 180990254 Y NA NA ITGA4,UBE2E3,CERKL IMR90 Hi-C 24141950 CWC22 120224 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 182007427 182007580 182007504 Y ITGA4 AC104820.2 NA NA NA NA AC104820.2 42768 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 182170258 182170790 182170550 Y ITGA4 NA NA NA NA NA ITGA4 149139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 182171392 182171973 182171732 Y ITGA4 NA NA NA NA NA ITGA4 147956 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 182331950 182332387 182332122 Y ITGA4 ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 12021 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 182479995 182480235 182480115 Y PPP1R1C NA NA NA NA NA ITGA4 160066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 182494357 182494701 182494694 Y NEUROD1 NA NA NA NA NA ITGA4 174428 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 182956199 182956480 182956369 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R1C 139231 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 183876955 183877317 183877185 Y NA NA NA NA NA NA DUSP19 63970 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 184619513 184619865 184619689 Y NA NA NA NA NA NA CACYBPP2 148666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 187015061 187015446 187015349 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 333437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 188404228 188404596 188404560 Y TFPI TFPI NA NA NA NA TFPI 23891 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 188463858 188463880 188463868 Y TFPI TFPI GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 TFPI 35371 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 190399515 190399898 190399767 Y NA SLC40A1 SLC40A1,WDR75 IMR90 Hi-C 24141950 SLC40A1 46586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 12229 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 191406346 191406617 191406448 Y NA TMEM194B INPP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194B 8898 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 191416774 191417126 191416837 Y MFSD6,TMEM194B TMEM194B NA NA NA NA TMEM194B 19326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 191492626 191492865 191492683 Y INPP1,STAT1,NAB1 NAB1 MFSD6 IMR90 Hi-C 24141950 NAB1 16607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 191512036 191512188 191512066 Y INPP1,STAT1,GLS,NAB1 NAB1 NA NA NA NA NAB1 2564 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 191660541 191660565 191660553 Y NA NA STAT1,MFSD6,GLS,NAB1 IMR90 Hi-C 24141950 GLS 82988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 191826753 191827142 191827070 Y NA AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 29151 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 191861492 191861699 191861596 Y STAT1 AC067945.3,STAT1 NA NA NA NA AC067945.3 5199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 191992847 191993155 191993001 Y STAT4 STAT4 NA NA NA NA STAT4 21167 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 192030894 192031017 192030956 Y NA STAT4 STAT1,MYO1B,STAT4,OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STAT4 16572 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 192430419 192430599 192430542 Y NA NA TMEFF2,OBFC2A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDPR 279382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 192436242 192436430 192436383 Y OBFC2A NA TMEFF2,OBFC2A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDPR 273551 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 192500525 192500897 192500643 Y NA NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SDPR 209084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 192503383 192503649 192503532 Y OBFC2A NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SDPR 206332 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 192540623 192541368 192540746 Y OBFC2A NA NA NA NA NA SDPR 168613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 192717272 192717408 192717316 Y NA SDPR NA NA NA NA SDPR 7291 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 193356347 193356635 193356490 Y NA NA NA NA NA NA TMEFF2 297912 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 193718012 193718039 193718028 Y NA NA NA NA NA NA TMEFF2 659577 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 196439142 196439289 196439263 Y NA SLC39A10 NA NA NA NA SLC39A10 441 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 196515239 196515508 196515373 Y NA NA SLC39A10 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC39A10 76538 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 197023417 197023933 197023871 Y NA STK17B NA NA NA NA STK17B 15294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 197075977 197076359 197076177 Y STK17B STK17B,AC020571.3 NA NA NA NA STK17B 36750 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 197112196 197112499 197112370 Y STK17B AC020571.3 NA NA NA NA AC020571.3 10249 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 197623019 197623245 197623231 Y NA GTF3C3 NA NA NA NA GTF3C3 39204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 197962665 197962866 197962743 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 172145 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 198081229 198081750 198081370 Y MARS2,HSPD1,HSPD1 NA NA NA NA NA ANKRD44 92147 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 198158784 198159350 198159060 Y SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,COQ10B,ANKRD44 ANKRD44 NA NA NA NA ANKRD44 14547 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 201777095 201777270 201777183 Y FAM126B,CFLAR,CFLAR CLK1,PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA NIF3L1 25045 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 201991403 201992374 201991715 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 12576 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 201992378 201992654 201992500 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 13551 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 202102159 202102434 202102342 Y NA CASP8 NA NA NA NA CASP8 5993 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 202522160 202522705 202522330 Y NA TMEM237 NA NA NA NA TMEM237 15867 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 202723656 202723936 202723797 Y NA UBE2V1P11 NA NA NA NA UBE2V1P11 36385 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 202831820 202832017 202831920 Y ALS2 NA CDK15,NOP58,FZD7,ALS2,SUMO1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V1P11 144549 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143335 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 203176830 203176888 203176863 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 48391 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 203239784 203239912 203239798 Y NA BMPR2 NA NA NA NA BMPR2 125 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 203830574 203830808 203830669 Y NA WDR12,NBEAL1 NA NA NA NA WDR12 46713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 204570146 204570432 204570186 Y NA NA NA NA NA NA ABI2 379204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 204854228 204854702 204854425 Y NA NA NA NA NA NA ABI2 663286 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 207076453 207076789 207076513 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS1 54126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 207669258 207669658 207669463 Y NA FASTKD2,MDH1B NA NA NA NA MDH1B 40987 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 208016492 208017045 208016857 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 12946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 208368128 208368502 208368141 Y CREB1 CREB1 KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 23959 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1 NA NA NA NA CREB1 2961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr2 208472249 208472458 208472354 Y NA METTL21A NA NA NA NA METTL21A 16194 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 208839891 208840047 208839969 Y CREB1,PLEKHM3 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 48237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 208882565 208882782 208882664 Y CREB1,PIKFYVE,PLEKHM3 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 5502 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 210377827 210378108 210377968 Y NA NA NA NA NA NA RPE 487181 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 211413660 211414008 211413843 Y ACADL,CPS1,CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 73284 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 211445580 211445639 211445609 Y CPS1,CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 105204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 213339164 213339568 213339278 Y NA NA NA NA NA NA IKZF2 675583 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 213697090 213697822 213697143 Y NA NA IKZF2 IMR90 Hi-C 24141950 IKZF2 317329 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 214010561 214010823 214010756 Y IKZF2,IKZF2 IKZF2 NA NA NA NA IKZF2 4328 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 214022192 214022320 214022272 Y IKZF2,IKZF2 IKZF2 NA NA NA NA IKZF2 7041 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 215735917 215736192 215736055 Y NA NA NA NA NA NA BARD1 63489 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 216001903 216002158 216002054 Y BARD1,ABCA12 NA NA NA NA NA ATIC 172382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 216392572 216392838 216392755 Y NA NA LOC646324,FN1 IMR90 Hi-C 24141950 ATIC 218032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 216576202 216576464 216576327 Y NA NA NA NA NA NA MREG 320355 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 216865894 216866240 216866102 Y TMEM169,PECR,MREG MREG NA NA NA NA MREG 30579 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 217035180 217035407 217035275 Y NA NA PKI55 IMR90 Hi-C 24141950 XRCC5 64993 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 217357637 217357999 217357758 Y NA RPL37A,AC098820.3 RPL37A IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 2913 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 217557565 217558269 217557956 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP5 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr2 219155683 219156025 219155719 Y CXCR2,CXCR2,ARPC2,ARPC2,ZNF142,USP37,SLC11A1,PNKD AAMP,PNKD,TMBIM1 NA NA NA NA TMBIM1 374 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 219172762 219172931 219172847 Y NA AAMP,PNKD,TMBIM1,AC021016.7 NA NA NA NA TMBIM1 17453 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 219198042 219198221 219198149 Y CXCR2,ARPC2,ARPC2,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1 TMBIM1,AC021016.7 NA NA NA NA AC021016.7 18577 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 219704181 219704419 219704343 Y SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1 NA PRKAG3 IMR90 Hi-C 24141950 CYP27A1 59709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 221372972 221373224 221373091 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 STK11IP 912390 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 223643125 223643256 223643191 Y NA NA ACSL3,MOGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL3 80396 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 224564336 224564481 224564409 Y NA NA SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 136263 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 225711035 225711198 225711117 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 193964 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 225841174 225841410 225841405 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 63752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 225875465 225875930 225875836 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 29232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 225905656 225906528 225906251 Y CUL3,DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 494 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 225935577 225935699 225935638 Y NA DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 30415 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 226891308 226891496 226891402 Y NA NA IRS1,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD1 806801 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 227274732 227274736 227274734 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD1 423561 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 228648268 228648438 228648358 Y AGFG1,CCL20 NA DNER,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 313400 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 228895227 228895457 228895324 Y SPHKAP NA NA NA NA NA AGFG1 560359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 229940536 229940917 229940727 Y NA NA NA NA NA NA FBXO36 844101 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 230008208 230008295 230008257 Y NA NA NA NA NA NA FBXO36 776723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 230118973 230119267 230119206 Y NA NA NA NA NA NA FBXO36 665751 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 230175161 230175497 230175399 Y PID1 NA NA NA NA NA FBXO36 609521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 230299119 230299349 230299203 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA FBXO36 485669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 231841486 231841884 231841594 Y NA NA NA NA NA NA PSMD1 77694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 231901045 231901225 231901135 Y NA PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 18353 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232106599 232106881 232106746 Y B3GNT7 ARMC9,AC018738.2 NA NA NA NA AC018738.2 11929 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232186573 232186872 232186798 Y PTMA NA NA NA NA NA AC017104.6 64815 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232207003 232207399 232207160 Y NA AC017104.6 NA NA NA NA AC017104.6 44288 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 AC017104.6,B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18859 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232330093 232330255 232330170 Y NA SNORD82,NCL,LINC00471 NA NA NA NA SNORD82 6942 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA NMUR1 75682 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA NMUR1 85186 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 85673 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 232479434 232479727 232479552 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 86228 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232537656 232538064 232537748 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 31541 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 232551717 232552221 232552147 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17384 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 233181304 233181393 233181324 Y NA NA NA NA NA NA EIF4E2 231369 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 233283707 233283952 233283753 Y ALPPL2 NA NA NA NA NA EIF4E2 128810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 233927963 233928349 233928218 Y INPP5D INPP5D NA NA NA NA INPP5D 5286 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 233946973 233947142 233947080 Y INPP5D INPP5D NA NA NA NA INPP5D 24296 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 233949093 233949523 233949288 Y DGKD,ATG16L1,INPP5D INPP5D NA NA NA NA INPP5D 26416 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 234266690 234266835 234266770 Y INPP5D,ATG16L1,DGKD DGKD NA NA NA NA DGKD 5537 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 234614877 234615153 234615015 Y NA NA NA NA NA NA USP40 141449 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 235204346 235204543 235204459 Y ARL4C NA NA NA NA NA ARL4C 199154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 235360536 235360912 235360678 Y NA ARL4C TRPM8,ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 42785 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 235392262 235392984 235392812 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 10713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 237247429 237247691 237247614 Y IQCA1 NA NA NA NA NA COPS8 744264 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 237685373 237686074 237685499 Y CXCR7 NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 305881 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 238168767 238169127 238169034 Y NA NA NA NA NA NA AC105760.2 176307 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 238218155 238218362 238218259 Y NA NA NA NA NA NA AC105760.2 225695 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 238299841 238300132 238300017 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 NA NA NA NA NA LRRFIP1 234087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 238313764 238314133 238313949 Y NA NA NA NA NA NA LRRFIP1 220086 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 238411273 238411418 238411341 Y NA NA NA NA NA NA LRRFIP1 122801 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 238512238 238512938 238512467 Y LRRFIP1 LRRFIP1 LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP1 21281 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 238582267 238582825 238582560 Y LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 48048 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 238583352 238583931 238583637 Y UBE2F,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 49133 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr2 238609405 238609661 238609494 Y MLPH,LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 75186 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 238807318 238807662 238807419 Y PER2,ILKAP,ESPNL,UBE2F,RAMP1 RAMP1 NA NA NA NA RAMP1 41782 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr2 238832423 238832667 238832502 Y NA UBE2F NA NA NA NA UBE2F 40802 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr2 238876433 238876638 238876539 Y LRRFIP1,UBE2F UBE2F NA NA NA NA UBE2F 2964 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 239034841 239035063 239035020 Y LRRFIP1,KLHL30 NA NA NA NA NA SCLY 67311 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 239085902 239086198 239086162 Y NA ILKAP NA NA NA NA ILKAP 24172 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240080723 240081253 240081085 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 239877 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240144687 240145031 240144830 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 176099 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240179337 240179507 240179411 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 141623 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 123794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240201720 240202445 240202126 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 118685 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240207977 240208290 240208163 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 112840 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240321591 240321797 240321685 Y HDAC4 AC062017.1,HDAC4 NA NA NA NA HDAC4 243 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240866823 240867270 240867165 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA10 95549 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240876588 240876896 240876750 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA10 85923 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 240917886 240918180 240918030 Y NA NDUFA10 NA NA NA NA NDUFA10 44639 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr2 242679689 242679905 242679763 Y ATG4B,D2HGDH ING5,D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 7695 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 202220 202381 202310 Y NA NA NA NA NA NA C20orf96 67009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 453687 453779 453733 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 12490 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 478652 479003 478850 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA TBC1D20 37455 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 1396685 1396983 1396828 Y SDCBP2,SIRPA FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 24879 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 1801326 1801756 1801551 Y SDCBP2,NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA NA SIRPA IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 71398 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 1825403 1825828 1825539 Y SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA SIRPA STK35,LOC100289473,SIRPA,PDYN IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 47326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 1873360 1873375 1873370 Y NA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 206 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 1887501 1887776 1887639 Y NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 14347 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 2236537 2236677 2236642 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA TGM3 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 156280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 2273200 2273840 2273586 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA NA NA NA NA SNRPB 175659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 2295693 2295966 2295830 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA NA NA NA NA SNRPB 153533 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 2851057 2851398 2851292 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 8227 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 3188788 3188839 3188809 Y NA UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 1274 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 3411453 3411609 3411534 Y C20orf194,PANK2 C20orf194,ATRN ATRN,C20orf194 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf194 25181 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 3520013 3520365 3520159 Y NA NA NA NA NA NA ATRN 70326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 3690593 3690860 3690838 Y NA NA NA NA NA NA C20orf27 56174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 3993168 3993585 3993445 Y PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 NA NA NA NA RNF24 644 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 4018656 4019040 4018859 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 16104 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 4045309 4045541 4045432 Y C20orf27,CENPB,C20orf29 FTLP3 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 42757 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 4701383 4701758 4701518 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 36501 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 4794672 4795153 4795057 Y SLC23A2,CDS2,RASSF2,RASSF2 RASSF2 NA NA NA NA RASSF2 7138 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr20 4809679 4809816 4809774 Y NA RASSF2 NA NA NA NA RASSF2 7388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 5060940 5061369 5061194 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 43903 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 5588948 5589498 5589341 Y CDS2,TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr20 6015657 6015992 6015825 Y NA CRLS1 NA NA NA NA CRLS1 30921 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 6688727 6688944 6688822 Y BMP2 NA NA NA NA NA RP4-775C13.1 496381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 7905442 7905630 7905536 Y HAO1 NA NA NA NA NA TMX4 92846 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 7998924 7999176 7999047 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 448 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 8173456 8173854 8173482 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 62632 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 8350099 8350497 8350131 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 239275 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 9181393 9181497 9181455 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 133983 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 9291356 9291748 9291412 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 243946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 10482481 10482747 10482670 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 69611 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 10692033 10692226 10692094 Y MKKS NA NA NA NA NA JAG1 67019 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 14769224 14769434 14769329 Y NA NA NA NA NA NA ESF1 1005692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 19766218 19766359 19766289 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 29866 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 19894866 19895287 19895037 Y NA RIN2 NA NA NA NA RIN2 29701 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 20253391 20253707 20253561 Y NA NA NA NA NA NA CRNKL1 218701 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 20391161 20391545 20391351 Y NA NA NA NA NA NA RALGAPA2 299586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 20714961 20715479 20715201 Y RALGAPA2 RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 23830 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr20 22078229 22078315 22078273 Y NA NA NA NA NA NA FOXA2 485778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 22904759 22904912 22904836 Y NA NA NA NA NA NA THBD 123466 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 23067626 23068166 23067924 Y GZF1,THBD,CD93 THBD,CD93 NA NA NA NA CD93 2649 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 23136585 23137102 23136883 Y THBD,CD93,GZF1 NA NA NA NA NA CD93 71608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 23142150 23142576 23142525 Y CD93,NXT1,GZF1 NA NA NA NA NA CD93 77173 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 24013863 24014201 24014099 Y NA NA C20orf3 IMR90 Hi-C 24141950 CST3 396753 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 24510047 24510433 24510242 Y NA NA NA NA NA NA SYNDIG1 62212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 24969855 24970103 24969979 Y NA CST7 NA NA NA NA CST7 41989 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 25047846 25048544 25048538 Y NA ACSS1 ACSS1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 10230 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 25214082 25214352 25214216 Y ENTPD6,PYGB ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 12353 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 29650599 29650997 29650932 Y NA FRG1B NA NA NA NA FRG1B 40742 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 30109241 30109638 30109448 Y HM13 HM13 NA NA NA NA HM13 9010 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 30700574 30701059 30700820 Y HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 5265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 31069966 31070213 31070090 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 100663 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 31127706 31127839 31127777 Y ASXL1 C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 43037 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 31350973 31351317 31351235 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 2782 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 31872886 31873050 31872953 Y BPIL1,PLUNC,C20orf114 NA NA NA NA NA CDK5RAP1 114317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 32093960 32094027 32093984 Y NA CBFA2T2 NA NA NA NA CBFA2T2 18079 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 32400902 32401106 32400958 Y CHMP4B CHMP4B NA NA NA NA CHMP4B 3792 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr20 32783228 32783544 32783386 Y NA NA ITCH,ASIP,AHCY IMR90 Hi-C 24141950 EIF2S2 85090 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 32826582 32826856 32826719 Y TP53INP2 NA EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 70752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 34330989 34331372 34331294 Y SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39 ROMO1,NFS1,RBM39,PHF20 NA NA NA NA RBM39 2755 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA NA LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCAND1 107196 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24,SLA2 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 35239893 35239986 35239939 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24,SLA2 NA NA NA NA C20orf24 7756 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 35256577 35256898 35256664 Y RBL1,SLA2 C20orf24,SLA2 NA NA NA NA SLA2 15721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr20 35572677 35573004 35572914 Y RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5242 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 35616902 35617278 35617001 Y GHRH,RBL1,SLA2,SAMHD1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 38656 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 35723463 35723698 35723601 Y NA RBL1 NA NA NA NA RBL1 1275 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 35851515 35851770 35851561 Y SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1 RPN2 NA NA NA NA RPN2 46702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 35947612 35947897 35947800 Y NA MANBAL,SRC NA NA NA NA SRC 23191 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 35976271 35976569 35976418 Y NA SRC NA NA NA NA SRC 5183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 36693519 36693713 36693616 Y RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA RPRD1B 33571 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 37435049 37435642 37435193 Y RALGAPB,DHX35,ACTR5,PPP1R16B PPP1R16B NA NA NA NA PPP1R16B 2701 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 39620099 39620424 39620302 Y MAFB,TOP1 TOP1 TOP1,PLCG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 35034 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 39878072 39878223 39878164 Y NA NA NA NA NA NA ZHX3 66089 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 43292777 43293302 43293042 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 13903 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 43607893 43608251 43608061 Y NA TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 14778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 44739811 44740352 44740024 Y ZNF335,CD40 NCOA5,RPL13P2,CD40 SLC12A5,CD40,NCOA5,CDH22,ELMO2,SLC35C2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD40 4559 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 45059401 45059823 45059656 Y ZNF334,SLC12A5,CDH22 NA CD40,CDH22,ELMO2 IMR90 Hi-C 24141950 ELMO2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 45324546 45324927 45324721 Y TP53RK TP53RK SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 TP53RK 8128 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 46627599 46627830 46627732 Y NCOA3 NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 214239 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 46704624 46705027 46704821 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 291264 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 47390467 47391044 47390713 Y STAU1,PREX1 NA NA NA NA NA PREX1 51376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 47443501 47443751 47443699 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 1081 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 47784409 47784640 47784548 Y PREX1,ZNFX1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 18264 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 48619796 48620156 48619863 Y B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1 SNAI1 NA NA NA NA SNAI1 22260 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 48875786 48876183 48875986 Y NA RP11-290F20.3 PTPN1,LOC284751,FAM65C,PARD6B,CEBPB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 5840 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 50027410 50027791 50027676 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 149579 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 50114638 50114822 50114734 Y NFATC2 NA NA NA NA NA NFATC2 62548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 50141744 50142683 50142582 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 34687 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 NA NA NA NA NA NFATC2 239333 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 51027531 51027754 51027643 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 208684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 51110040 51110185 51110129 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 291193 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 51694232 51694450 51694303 Y TSHZ2 NA NA NA NA NA ZNF217 529996 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 51699247 51699566 51699407 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 524880 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr20 52212842 52213180 52212942 Y ZNF217 ZNF217 BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 11266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52238527 52238650 52238555 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 14081 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52271592 52271787 52271702 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 47146 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 52277634 52277772 52277670 Y NA NA SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 53188 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52294676 52294905 52294769 Y NA NA BMP7,SUMO1P1,BCAS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 70230 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr20 52346173 52346470 52346387 Y NA NA ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 121727 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52353948 52354213 52354172 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 129502 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52356771 52357178 52357063 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 132325 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52364781 52365137 52364834 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 140335 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52367753 52368082 52368002 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 143307 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52371075 52371265 52371223 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 146629 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr20 52392953 52393088 52393021 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 168507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52445043 52445455 52445100 Y NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220597 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52450407 52450594 52450483 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 225961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52516053 52516507 52516332 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 291607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52519942 52520105 52520009 Y ZNF217 NA SUMO1P1,ZNF217,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 295496 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52520115 52520714 52520380 Y ZNF217 NA SUMO1P1,ZNF217,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 295669 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52532315 52532889 52532591 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 289497 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52546811 52547086 52546962 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 275300 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52550838 52551665 52551067 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 270721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 256247 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52718989 52719002 52718996 Y NA NA PFDN4,SULF2,CYP24A1,DOK5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 103384 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 52743384 52744045 52743713 Y NA NA DOK5,PTPRT,SULF2,CYP24A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 78341 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 53767730 53768068 53767902 Y NA NA NA NA NA NA DOK5 677594 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 55041146 55041327 55041218 Y C20orf43 NA NA NA NA NA CASS4 55978 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 55968808 55969481 55968821 Y ZBP1,PMEPA1 RAE1,MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 4345 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 56831956 56832171 56832064 Y NA NA NA NA NA NA RAB22A 50581 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 57596187 57596442 57596344 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA ATP5E 8995 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 57739159 57739461 57739442 Y ZNF831 NA NA NA NA NA SLMO2 123195 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 58621223 58621546 58621377 Y PHACTR3,PPP1R3D,C20orf177,C20orf197 C20orf197,RP5-1043L13.1 NA NA NA NA C20orf197 7434 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 58680257 58680439 58680367 Y PPP1R3D,C20orf177,CDH26,C20orf197 RP5-1043L13.1 C20orf197 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP5-1043L13.1 19362 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 59619863 59620113 59619933 Y CDH4 NA NA NA NA NA RP5-1043L13.1 958968 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 60103711 60103923 60103817 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 534943 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 60328357 60328661 60328509 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 310205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 60758632 60758689 60758683 Y GATA5,CABLES2 PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 41810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 61200879 61201219 61201079 Y NA NA RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf166-AS1 54146 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 61282674 61283033 61282738 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 10877 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 61317452 61317806 61317666 Y DPH3P1,OGFR,SLCO4A1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 45655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 61418482 61419085 61418805 Y NA OGFR NA NA NA NA OGFR 15102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 61560348 61560848 61560731 Y NA DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA DIDO1 6456 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr20 62478016 62478296 62478069 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5 NA NA NA NA TPD52L2 16300 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 62485386 62485810 62485510 Y PRIC285 ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5 SLC2A4RG,ZBTB46,LIME1,ZGPAT,TPD52L2,UCKL1,MIR1914,ARFRP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPD52L2 8786 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.81501065459833 chr20 62545436 62545544 62545492 Y NA DNAJC5,RNU1-134P,UCKL1 NA NA NA NA RNU1-134P 7128 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr20 62685313 62685625 62685427 Y UCKL1,SOX18,TCEA2 ZNF512B,SOX18,TCEA2,RGS19 NA NA NA NA TCEA2 6124 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 11130122 11130404 11130162 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1163537 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 15450488 15450803 15450511 Y NA NA NA NA NA NA AP001347.6 52746 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 15825772 15825891 15825819 Y SAMSN1 NA NA NA NA NA HSPA13 71967 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 15854421 15854886 15854748 Y SAMSN1,HSPA13 NA NA NA NA NA SAMSN1 98837 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 15899627 15899749 15899688 Y NA NA NA NA NA NA SAMSN1 53974 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 15913641 15914593 15914326 Y SAMSN1 SAMSN1 NA NA NA NA SAMSN1 39130 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 16090789 16090838 16090814 Y NA NA NA NA NA NA SAMSN1 137066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 16222795 16222981 16222977 Y NA NA NRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRIP1 212340 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 16886196 16886753 16886663 Y NA NA NA NA NA NA USP25 213591 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 17054611 17055027 17054700 Y USP25 USP25 USP25 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 45317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 17104761 17105053 17104812 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 4417 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 2257 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 18706000 18706364 18706182 Y NA NA NA NA NA NA BTG3 276901 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 19152664 19153229 19152933 Y C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 36474 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 19171826 19171995 19171943 Y C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 17708 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 21905336 21905625 21905481 Y NA NA NA NA NA NA AP001171.1 276203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 23793949 23794126 23794048 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 985322 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr21 26724396 26724439 26724418 Y NA RPL13AP7 NA NA NA NA RPL13AP7 7696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 26836631 26836800 26836706 Y NA NA MIR155HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR155HG 95421 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 26882215 26882658 26882608 Y NA MIR155HG NA NA NA NA MIR155HG 49563 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 26932183 26932293 26932238 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MIR155HG 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 26956680 26957339 26957242 Y NA MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 20490 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 28804215 28804390 28804303 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS1 588487 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 30037436 30037730 30037586 Y NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 217963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 30276081 30276287 30276184 Y C21orf7 N6AMT1 NA NA NA NA N6AMT1 20388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.00267803157156 chr21 30591516 30591874 30591674 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 27124 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 30751100 30751464 30751308 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 186708 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 30798600 30798748 30798608 Y C21orf7,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 234208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 31029045 31029571 31029224 Y BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 464653 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 32727234 32727499 32727493 Y NA NA NA NA NA NA TIAM1 202791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 33104933 33105321 33105127 Y NA SCAF4 NA NA NA NA SCAF4 2545 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 33670455 33670601 33670551 Y NA MIS18A NA NA NA NA MIS18A 21075 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 33702310 33702533 33702421 Y NA NA NA NA NA NA MIS18A 52930 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 34379947 34380464 34380235 Y IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1 NA OLIG1 IMR90 Hi-C 24141950 OLIG1 59986 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 34571192 34571326 34571223 Y SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,OLIG2,OLIG1,IFNAR2 IFNAR2 GCFC1-AS1,GCFC1,IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,C21orf54,GART,CRYZL1 IMR90,H1ESC,GM12878,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 IFNAR2 28880 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 34576237 34576546 34576341 Y SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2 IFNAR2 IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432 IMR90 Hi-C 24141950 IFNAR2 23660 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 34577322 34577588 34577376 Y SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,OLIG1,IFNAR2 IFNAR2 IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432 IMR90 Hi-C 24141950 IFNAR2 22618 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 34587985 34588369 34588051 Y NA IFNAR2,IL10RB IFNAR2,TMEM50B,IFNGR2 IMR90 Hi-C 24141950 IFNAR2 11837 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 34718616 34718973 34718794 Y OLIG2,OLIG1 IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 23882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 34818143 34818502 34818323 Y OLIG2,OLIG1 IFNGR2,TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 31816 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 35319562 35320491 35320153 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 33278 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 KCNE1 NA NA NA NA KCNE1 34906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36219873 36220239 36220187 Y NA NA NA NA NA NA KCNE1 337300 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 36227422 36227493 36227482 Y NA NA NA NA NA NA KCNE1 344849 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA KCNE1 350643 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36263020 36263336 36263172 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA KCNE1 380447 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36326686 36327019 36326981 Y NA NA NA NA NA NA KCNE1 444113 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36351037 36351195 36351156 Y NA NA NA NA NA NA KCNE1 468464 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36355491 36355634 36355586 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA KCNE1 472918 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36356108 36356416 36356285 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA KCNE1 473535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36379576 36379916 36379746 Y RUNX1 NA NA NA NA NA KCNE1 497003 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36392735 36393025 36392943 Y RUNX1 NA NA NA NA NA KCNE1 510162 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36419290 36419780 36419662 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA KCNE1 536717 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36423642 36423856 36423739 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA KCNE1 541069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 36864275 36864649 36864330 Y RUNX1 NA NA NA NA NA RUNX1 510316 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 37222368 37222731 37222491 Y MORC3 NA RUNX1,LOC100506385,LINC00160,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 152234 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 37485408 37485566 37485491 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 19644 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 37486095 37486219 37486157 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 18991 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 37909542 37909917 37909766 Y NA NA NA NA NA NA AP000695.6 108884 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 38189032 38189251 38189142 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 147561 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr21 38730874 38731018 38730953 Y NA DYRK1A DSCR3,DYRK1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 5074 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 39430494 39430871 39430698 Y DSCR4 NA NA NA NA NA KCNJ15 96257 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 39630445 39631374 39631216 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ15 103317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 39683665 39683952 39683860 Y ETS2,KCNJ15 NA NA NA NA NA KCNJ15 156537 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 39832417 39832659 39832533 Y ETS2 NA NA NA NA NA ERG 199045 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 39845079 39845092 39845088 Y NA NA NA NA NA NA ERG 186612 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 39848171 39848499 39848471 Y ERG NA NA NA NA NA ERG 183205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr21 39866663 39867062 39866792 Y NA NA NA NA NA NA ERG 164642 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 39867622 39867911 39867841 Y ERG NA NA NA NA NA ERG 163793 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 40011652 40011749 40011697 Y NA ERG NA NA NA NA ERG 19955 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 40202751 40202888 40202797 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 27520 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 40331056 40331378 40331206 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 155825 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 40338093 40338255 40338153 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 162862 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 40351521 40351908 40351683 Y ETS2 NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 ETS2 176290 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 40357559 40358114 40357780 Y ETS2 NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 ETS2 182328 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 40376938 40377126 40376993 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 176651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 40388041 40388127 40388084 Y ETS2 NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 165650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr21 40389005 40389356 40389205 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 164421 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr21 40476284 40476629 40476514 Y ETS2 NA ETS2,LINC00114,ERG IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 77148 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 40742482 40742667 40742571 Y NA HMGN1,WRB BRWD1,BRWD1-IT2,WRB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WRB 7503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 41146916 41147071 41146994 Y LCA5L NA NA NA NA NA SH3BGR 331135 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 41729839 41730224 41730032 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 807504 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 41964918 41965179 41965085 Y DSCAM NA NA NA NA NA BACE2 572549 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 43331076 43331447 43331406 Y NA PRDM15,C2CD2 NA NA NA NA PRDM15 33485 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 43688335 43688602 43688509 Y C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1 NA NA NA NA NA ABCG1 70536 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 43885293 43886049 43885531 Y ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A SLC37A1 NA NA NA NA SLC37A1 28069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 44529146 44529448 44529286 Y U2AF1 CBS,U2AF1 NA NA NA NA U2AF1 3449 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.25200852367867 chr21 44819332 44820064 44819633 Y PKNOX1,SIK1 NA NA NA NA NA H2BFS 163006 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 44831891 44832268 44832005 Y SIK1 NA NA NA NA NA H2BFS 150802 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 44848808 44849083 44848957 Y CBS NA NA NA NA NA H2BFS 133987 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 44988675 44988868 44988840 Y NA H2BFS NA NA NA NA H2BFS 5605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr21 45117744 45118082 45118052 Y NA HSF2BP,RRP1B,PDXK PDXK IMR90 Hi-C 24141950 PDXK 18893 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 45566076 45566451 45566257 Y TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33,AP001055.6 NA NA NA NA AP001055.6 11508 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 45577373 45578052 45577512 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 NA NA NA NA AP001055.6 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 45593647 45593841 45593744 Y NA C21orf33,AP001055.6 PWP2,ICOSLG IMR90 Hi-C 24141950 AP001055.6 15688 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 45604332 45605113 45604833 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG AP001055.6 ICOSLG,PWP2,DNMT3L,PFKL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP001055.6 26373 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 45627966 45628150 45628090 Y NA ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 30699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 45661962 45662435 45662161 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 3113 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 45774954 45775325 45775130 Y NA C21orf2,TRPM2 NA NA NA NA TRPM2 6908 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 45890728 45891129 45890927 Y NA LRRC3 NA NA NA NA LRRC3 17359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 46295070 46295864 46295519 Y ITGB2 PTTG1IP,ITGB2-AS1 NA NA NA NA PTTG1IP 3318 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 46302536 46302756 46302646 Y NA PTTG1IP,ITGB2-AS1,ITGB2 PTTG1IP MCF7 ChIA-PET 22265404 PTTG1IP 10784 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 46552843 46553033 46552936 Y KRTAP10-11,KRTAP12-2,KRTAP12-1,ITGB2 NA NA NA NA NA ADARB1 61075 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 46953548 46953790 46953669 Y NA SLC19A1 NA NA NA NA SLC19A1 8535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 46970012 46970208 46970090 Y POFUT2,SLC19A1,SLC19A1 SLC19A1 SLC19A1,LOC100129027,PCBP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 7687 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 47312098 47312312 47312190 Y SLC19A1,SLC19A1 NA NA NA NA NA COL6A1 87339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr21 47637534 47637799 47637667 Y NA LSS,MCM3AP-AS1 NA NA NA NA LSS 8939 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr21 47788931 47789078 47789007 Y NA C21orf58,PCNT NA NA NA NA PCNT 46895 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr21 48042238 48042469 48042310 Y DIP2A,PRMT2 S100B,PRMT2 DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2 IMR90 Hi-C 24141950 PRMT2 10610 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 17305568 17305779 17305755 Y NA NA NA NA NA NA IL17RA 258065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 17306294 17306463 17306397 Y IL17RA,CECR1 NA NA NA NA NA IL17RA 257381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 9.19570147168789 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5,CECR1 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 17697692 17697885 17697853 Y BCL2L13,IL17RA,CECR1 AC005300.5,CECR1 NA NA NA NA CECR1 2994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 18162976 18163469 18163294 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L13 53355 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 18372617 18372984 18372801 Y NA NA NA NA NA NA LINC00528 114529 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.81501065459833 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L,AC000078.5 GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 AC000078.5 1702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 21273214 21273312 21273263 Y NA CRKL,XXbac-B135H6.15 NA NA NA NA CRKL 3500 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr22 22231244 22231441 22231355 Y HIC2,MAPK1 MAPK1 PPM1F K562 ChIA-PET 22265404 MAPK1 11274 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 23907888 23908026 23907993 Y IGLL1 IGLL1 NA NA NA NA IGLL1 12469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr22 24603179 24603438 24603254 Y GGT1,ADORA2A NA NA NA NA NA SPECC1L 61348 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 24603797 24604355 24604162 Y GGT1,ADORA2A NA NA NA NA NA SPECC1L 60431 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 24767148 24767407 24767278 Y GGT1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 102282 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 26967025 26967265 26967145 Y TFIP11 TPST2 NA NA NA NA TPST2 23416 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 28261904 28262359 28262203 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA TTC28-AS1 51005 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 28372624 28372939 28372782 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 58502 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA TTC28 235661 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 29206791 29206989 29206921 Y EMID1,CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 XBP1 K562 ChIA-PET 22265404 CTA-292E10.6 12120 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr22 29207861 29207973 29207910 Y EMID1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 XBP1,CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTA-292E10.6 13190 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 29548210 29548510 29548260 Y KREMEN1 NA NA NA NA NA EMID1 51330 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 29877762 29878123 29877961 Y NA NA NA NA NA NA AP1B1 60594 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 30014203 30014547 30014300 Y NA NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 16658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 30651841 30652045 30651989 Y RNF215 LIF,OSM,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 OSM 8784 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 30668970 30669757 30669162 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM LIF,OSM,GATSL3 NA NA NA NA OSM 8141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 31229455 31229575 31229536 Y NA NA NA NA NA NA MORC2-AS1 86720 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 31626331 31627201 31626769 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 20106 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 32322992 32323244 32323115 Y RFPL2,EIF4ENIF1,EIF4ENIF1,YWHAH YWHAH NA NA NA NA YWHAH 15203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 32447993 32448178 32448103 Y NA SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 14516 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 33131563 33131860 33131765 Y NA NA NA NA NA NA TIMP3 63827 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 35443354 35443580 35443467 Y TOM1,TOM1,HMOX1 NA ISX IMR90 Hi-C 24141950 CTA-714B7.5 181469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 36821515 36821891 36821703 Y IFT27 MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 MYH9 39452 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 37258335 37258758 37258531 Y RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB NCF4,CSF2RB NA NA NA NA NCF4 3305 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr22 37259042 37259418 37259076 Y NA NCF4,CSF2RB NA NA NA NA NCF4 4012 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 37624378 37624586 37624525 Y SH3BP1,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 Z82188.1,RAC2 NA NA NA NA Z82188.1 4343 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 Z82188.1,CYTH4 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 37663226 37663580 37663275 Y MFNG,MFNG,NCF4,RAC2 Z82188.1,RAC2,CYTH4 CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH4 12488 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 37703673 37703847 37703799 Y SH3BP1,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 CYTH4 NA NA NA NA CYTH4 27605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 37986436 37986718 37986607 Y CYTH4,SH3BP1,EIF3L,LGALS2,GGA1,GGA1 GGA1,SH3BP1 NA NA NA NA GGA1 15763 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 38143248 38143734 38143618 Y LGALS1,TRIOBP,POLR2F NA NA NA NA NA TRIOBP 52237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 38572177 38572681 38572373 Y DDX17,EIF3L,PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA MAFF 23208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA NA NA NA NA NA CBX7 63781 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 39704707 39705214 39704970 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 9180 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 39890901 39891082 39890968 Y ATF4 ATF4,RPS19BP1 SMCR7L IMR90 Hi-C 24141950 ATF4 22618 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 40357456 40357744 40357564 Y TNRC6B,GRAP2 NA NA NA NA NA GRAP2 62370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 40575185 40575584 40575306 Y TNRC6B,TNRC6B NA NA NA NA NA RPL7P52 74115 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 40589903 40590338 40589971 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 88833 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 40781478 40781596 40781515 Y NA ADSL,SGSM3 NA NA NA NA SGSM3 16883 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 41128851 41129054 41128911 Y NA NA XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17 IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP37 60396 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr22 42164516 42164747 42164690 Y NA CCDC134 NA NA NA NA CCDC134 29936 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 42327988 42328313 42328152 Y NA CENPM TNFRSF13C MCF7 ChIA-PET 22265404 CENPM 12855 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 42331053 42331125 42331089 Y SHISA8 CENPM NA NA NA NA CENPM 10043 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 42485778 42486189 42485966 Y CCDC134,CENPM,NFAM1,C22orf32 NAGA,NDUFA6,OLA1P1 NA NA NA NA NDUFA6 819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 42579681 42579799 42579740 Y CCDC134,CENPM,TCF20 NA NA NA NA NA OLA1P1 76724 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 42696005 42696062 42696030 Y SEPT3,NFAM1 NA TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 OLA1P1 193048 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 42763845 42763943 42763880 Y NA NA NA NA NA NA RRP7A 149865 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 42792596 42792990 42792712 Y ARFGAP3,TCF20,NFAM1 NA NA NA NA NA RRP7A 120818 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 43178512 43178746 43178699 Y NA NA NA NA NA NA A4GALT 63208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 43327460 43327806 43327638 Y NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA ARFGAP3 75348 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 43409761 43409918 43409853 Y PACSIN2,PACSIN2 PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 610 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 43659776 43660445 43660004 Y NA NA NA NA NA NA SCUBE1 76949 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 44856761 44856923 44856842 Y NA LDOC1L PARVB,PARVG,SAMM50,KIAA1644,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 35255 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr22 44906403 44906765 44906584 Y PHF21B LDOC1L PNPLA3,PARVB,SAMM50,KIAA1644,LINC00207,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 14225 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 45015871 45016262 45016114 Y NA PRR5 NA NA NA NA PRR5 46331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 45350005 45350214 45350111 Y NA NA NA NA NA NA CTA-217C2.1 207448 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr22 46285473 46285870 46285610 Y NA NA FAM118A,SMC1B,ATXN10,FBLN1,WNT7B,PKDREJ,C22orf40 IMR90 Hi-C 24141950 RP6-109B7.3 161715 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr22 46470082 46470656 46470309 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 6311 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 46989093 46989561 46989508 Y TBC1D22A,CERK,GRAMD4 GRAMD4 GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 19184 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr22 47250044 47250415 47250236 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 93526 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 47338470 47338938 47338889 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 181952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 47364562 47364667 47364649 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 208044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 49123378 49123388 49123383 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 925802 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50105800 50106184 50105992 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 56610 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50242140 50242406 50242374 Y MLC1,HDAC10 BRD1,ZBED4 ZBED4,BRD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZBED4 3084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr22 50248429 50248807 50248623 Y TUBGCP6,TRABD,SELO,PIM3,MOV10L1,HDAC10,BRD1,ZBED4 BRD1,ZBED4 NA NA NA NA ZBED4 2939 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50272789 50273094 50272966 Y NA ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 27299 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50273824 50274276 50274235 Y TUBGCP6,HDAC10,ZBED4 ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 28334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 50329443 50330313 50330025 Y TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 19337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr22 50608010 50608409 50608105 Y MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA PANX2 850 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50629840 50630128 50630062 Y BRD1,ZBED4,PIM3,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TRABD,TUBGCP6,SELO,HDAC10 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA SELO 7280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr22 50742925 50743370 50743124 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 686 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr22 50891150 50891343 50891221 Y MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2 NA NA NA NA SBF1 20111 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50912071 50912698 50912340 Y NA SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 50979060 50979802 50979496 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 10051 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr22 51110202 51110387 51110248 Y MAPK11,FAM116B,MAPK8IP2,SHANK3 ARSA,SHANK3 SHANK3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SHANK3 456 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 3532969 3532987 3532979 Y NA NA NA NA NA NA CRBN 313575 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 4392615 4392774 4392664 Y ITPR1 SETMAR NA NA NA NA SETMAR 49627 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 4428359 4428568 4428464 Y NA NA NA NA NA NA SUMF1 78397 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 4793961 4794169 4794077 Y EDEM1,BHLHE40 EGOT NA NA NA NA EGOT 2687 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 4876052 4876387 4876225 Y EDEM1,BHLHE40 NA NA NA NA NA AC018816.3 50590 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 4908577 4908896 4908639 Y BHLHE40 AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 18081 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 16178 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.19034540854478 chr3 5028057 5028369 5028268 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8411 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr3 5029624 5029825 5029730 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 9978 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 5054958 5055470 5055112 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 BHLHE40-AS1 35312 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 5061219 5061509 5061357 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 41573 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 5077846 5078259 5077971 Y BHLHE40 NA ITPR1,EGOT IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE40-AS1 58200 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 5237403 5237551 5237430 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 AC026202.3,EDEM1 NA NA NA NA EDEM1 10072 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 5470535 5470892 5470804 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 243204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 5539274 5539498 5539388 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 311943 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 6741976 6742157 6742067 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 1514645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 7546591 7546999 7546787 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 1456458 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 11316376 11316801 11316733 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 4381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 11688028 11688035 11688032 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 72185 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 12036535 12036797 12036666 Y NA SYN2 NA NA NA NA SYN2 7079 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 12234951 12235397 12235194 Y RAF1,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA SYN2 191075 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 12345089 12345969 12345668 Y RAF1,PPARG,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA TSEN2 177962 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 12723455 12723677 12723573 Y RAF1 RAF1 TMEM40,RAF1,MKRN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAF1 19730 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 13049028 13049396 13049212 Y NA NA NA NA NA NA IQSEC1 63221 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 13209777 13210019 13209898 Y NA NA NUP210 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 97160 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 13455554 13455885 13455702 Y NUP210 NUP210 NA NA NA NA NUP210 3924 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43,AC093495.4 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 14246419 14246703 14246618 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 28136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 14444961 14445761 14445267 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 2885 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 15286616 15286745 15286681 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 40957 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 15337083 15337387 15337223 Y NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 43488 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 15675662 15676068 15675826 Y NA BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 34324 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 15783171 15783247 15783208 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD28 116031 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 15847096 15847637 15847448 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 51641 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 16342509 16342839 16342720 Y OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 37803 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 16551037 16551376 16551345 Y NA RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 2157 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 16552919 16553213 16553144 Y NA RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 320 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 16562564 16562943 16562811 Y RFTN1 RFTN1 RFTN1,OXNAD1,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 RFTN1 9031 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 17441926 17442172 17442040 Y PLCL2 NA NA NA NA NA PLCL2 599767 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 18252681 18253057 18252788 Y TBC1D5,SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 231252 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 18366679 18366900 18366790 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 117409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 18415394 18415659 18415606 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 68650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 18485117 18485365 18485120 Y NA TBC1D5,AC144521.1,SATB1 NA NA NA NA SATB1 37 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA NA NA NA NA NA SATB1 95162 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 19972760 19973227 19972950 Y RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA EFHB 13290 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 20082717 20083237 20083200 Y RAB5A,KAT2B KAT2B NA NA NA NA KAT2B 3202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 20145803 20146135 20145937 Y KAT2B NA NA NA NA NA KAT2B 66288 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 22152338 22152660 22152655 Y NA NA NA NA NA NA HMGB1P5 268650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 23049713 23049732 23049723 Y NA NA NA NA NA NA HMGB1P5 628403 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 23389835 23390198 23389844 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E1 455196 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 23752138 23752437 23752199 Y NA NA UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 92957 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 23782023 23782329 23782145 Y NR1D2,UBE2E1 NA UBE2E2,UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 63065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 24563741 24564038 24564033 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28968 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 25515408 25515797 25515715 Y NA NA NA NA NA NA TOP2B 188601 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 150696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr3 27707886 27708022 27707939 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 183975 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 28684984 28685217 28685101 Y NA NA NA NA NA NA ZCWPW2 296347 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 29568670 29568984 29568828 Y RBMS3 NA NA NA NA NA TGFBR2 1077010 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 29660758 29661082 29660950 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR2 984912 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 30535531 30535813 30535695 Y NA NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 110181 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 30723230 30723490 30723363 Y TGFBR2 NA NA NA NA NA TGFBR2 77236 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 31584966 31585359 31585050 Y NA STT3B NA NA NA NA STT3B 12836 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 32339022 32339260 32339142 Y NA NA NA NA NA NA CMTM8 60851 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 32463504 32463726 32463567 Y CMTM6 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 32341 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 32501642 32502196 32501852 Y CNOT10,CCR4,CMTM7 CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 40704 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA TRIM71 301 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr3 33002804 33002999 33002866 Y NA CCR4 NA NA NA NA CCR4 11738 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 33081513 33081785 33081661 Y NA NA NA NA NA NA TMPPE 54508 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 33478074 33478410 33478365 Y NA UBP1 NA NA NA NA UBP1 2453 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 33758685 33758853 33758767 Y UBP1,UBP1,CLASP2 CLASP2 NA NA NA NA CLASP2 837 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 34023342 34023687 34023515 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 185498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 35115308 35115491 35115323 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 1277464 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 36953847 36954333 36954176 Y TRANK1,MLH1,LRRFIP2,GOLGA4,EPM2AIP1 TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 30215 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 37164159 37164535 37164493 Y NA NA MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 58645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 37805955 37806276 37805982 Y ITGA9 NA NA NA NA NA AC093415.2 94995 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr3 37939195 37939560 37939378 Y NA AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 37744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 37949474 37949626 37949550 Y SLC22A14 AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 48023 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 38144034 38144304 38144167 Y VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88 ACAA1,MYD88 NA NA NA NA ACAA1 32429 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 38227489 38227608 38227524 Y NA MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 22909 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 38568637 38569221 38568871 Y SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG EXOG NA NA NA NA EXOG 33019 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 39712999 39713450 39713220 Y NA NA NA NA NA NA RPSA 266819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 40964745 40964983 40964875 Y CTNNB1 NA NA NA NA NA RP11-761N21.2 163709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 41014854 41015242 41015015 Y NA NA ULK4,CTNNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-761N21.2 213818 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 41020127 41020439 41020283 Y NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 213889 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 42067110 42067525 42067205 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 13816 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 42078040 42078206 42078049 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 24746 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 42113196 42113588 42113376 Y CCK NA NA NA NA NA TRAK1 59902 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 42601905 42602046 42601976 Y NA SS18L2,NKTR,SEC22C NA NA NA NA SS18L2 19286 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 43221606 43221805 43221773 Y CCDC13,SNRK NA SNRK,ANO10,FAM198A,ABHD5 IMR90 Hi-C 24141950 SNRK 104199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 43431181 43431702 43431413 Y SNRK,ABHD5 NA NA NA NA NA SNRK 105177 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA SNRK 111255 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 45175300 45175656 45175542 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 10258 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 45208648 45208845 45208728 Y LIMD1 CDCP1 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCP1 22734 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 45609249 45609611 45609389 Y LIMD1 LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 14363 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 46036343 46036779 46036493 Y CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1 FYCO1 NA NA NA NA FYCO1 1027 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 46135224 46135371 46135312 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 99908 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 46139244 46140413 46139465 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 103928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 46228445 46228784 46228752 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 CCR1 NA NA NA NA CCR1 19103 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 46254679 46255280 46254912 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 CCR1 SLC6A20,CCR1,CCR5,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 CCR1 6792 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 46365618 46366089 46365745 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 CCR2,CCR5 CCR1 IMR90 Hi-C 24141950 CCR2 27136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 46410114 46410344 46410205 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 CCR2,CCR5,RP11-24F11.2,CCRL2 NA NA NA NA CCR5 481 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 46546407 46546628 46546504 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA NA NA NA NA LRRC2 72961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 47134411 47134793 47134602 Y SETD2 NA NA NA NA NA SETD2 68664 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 49382516 49382833 49382703 Y ARIH2,DALRD3,UBA7,RHOA,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 6371 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.00267803157156 chr3 50040739 50040850 50040788 Y SEMA3B NA NA NA NA NA RBM6 65299 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 50302065 50302532 50302296 Y SEMA3B GNAI2,IFRD2,NAT6,HYAL3 NA NA NA NA IFRD2 25817 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 50510468 50510743 50510606 Y RASSF1,RASSF1 NA NA NA NA NA HEMK1 93840 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 50610940 50611501 50611164 Y RASSF1,CYB561D2,NPRL2,C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA C3orf18 4482 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 50627976 50628161 50628029 Y RASSF1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 18790 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 50628296 50628501 50628442 Y RASSF1,RASSF1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 18450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 50638353 50638905 50638586 Y MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 8046 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 50639346 50639782 50639525 Y C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 7169 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 51720527 51720790 51720691 Y VPRBP TEX264 NA NA NA NA TEX264 25818 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 52088878 52089257 52089156 Y ACY1,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 312 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 52121101 52121264 52121190 Y NA DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 32535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr3 52219997 52220195 52220128 Y ALAS1,ALAS1 POC1A,ALAS1 RPL29,DUSP7,POC1A,ALAS1,WDR82,PPM1M,DNAH1,BAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ALAS1 9907 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 52531917 52532418 52532268 Y TWF2,PPM1M,PPM1M,WDR82,GLYCTK,PBRM1,PBRM1,STAB1 NISCH,STAB1,NT5DC2 NA NA NA NA STAB1 4563 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 52652258 52652629 52652403 Y GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1 NA NA NA NA NA GNL3 60543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 52704686 52705129 52704984 Y WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1 GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1 NA NA NA NA GNL3 8043 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 53107324 53107487 53107433 Y TMEM110,SFMBT1,SFMBT1,DCP1A SFMBT1 NA NA NA NA SFMBT1 28558 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 53174758 53175140 53175000 Y PBRM1,TKT,DCP1A,PRKCD RFT1,PRKCD RFT1,PRKCD,TKT IMR90 Hi-C 24141950 RFT1 12280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 53288705 53289353 53289077 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 637 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 53362706 53362961 53362819 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 16693 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 53897423 53897785 53897604 Y NA CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK NA NA NA NA ACTR8 16444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 54686814 54686829 54686822 Y NA RPS15P5 NA NA NA NA RPS15P5 28572 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 55178043 55178603 55178498 Y NA NA WNT5A,CACNA2D3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS15P5 519801 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 55201679 55201928 55201859 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 RPS15P5 543437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 55707711 55707857 55707784 Y NA NA NA NA NA NA CCDC66 881332 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 56159334 56159686 56159623 Y NA NA NA NA NA NA CCDC66 429503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 56818012 56818198 56818042 Y CCDC66,C3orf63,ARHGEF3 NA NA NA NA NA FAM208A 102747 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 56864313 56864691 56864516 Y NA NA NA NA NA NA FAM208A 149048 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 57091445 57091606 57091516 Y ARHGEF3 ARHGEF3 NA NA NA NA ARHGEF3 19751 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA DNAH12,PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 57937235 57937402 57937348 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 54725 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 57968397 57968639 57968468 Y PDE12,PXK FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 23488 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 58163548 58163776 58163593 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57457 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 58321418 58321818 58321477 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 4811 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 58335663 58335765 58335715 Y PXK RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 19056 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr3 58339773 58340193 58340113 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 23166 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr3 58411955 58412199 58412053 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 5385 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 58412465 58412623 58412544 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 4961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 59367122 59367264 59367184 Y NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 C3orf67 333312 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 59413085 59413290 59413187 Y NA NA FAM3D,FHIT IMR90 Hi-C 24141950 C3orf67 379275 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 60392594 60392829 60392710 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 842304 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 65181490 65181728 65181609 Y NA NA ADAMTS9-AS2,ADAMTS9 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A26 935557 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 66021951 66022397 66022084 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A26 94888 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 66295672 66296073 66295873 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A26 178387 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 67040750 67040873 67040812 Y NA KBTBD8 KBTBD8 MCF7 ChIA-PET 22265404 KBTBD8 5854 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 67050514 67050733 67050633 Y KBTBD8 KBTBD8 NA NA NA NA KBTBD8 3787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 70175230 70175612 70175604 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 1043135 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 71151319 71151713 71151657 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 479427 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 71222111 71222440 71222307 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 408700 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 71441439 71441788 71441676 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 189352 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 71465988 71466289 71466193 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 164851 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 71494304 71494367 71494336 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 136773 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 71553174 71553740 71553492 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 77400 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 71628462 71628802 71628743 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 2338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 72151192 72151670 72151441 Y RYBP,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2 NA SHQ1,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 LINC00877 138046 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 72359769 72360170 72359863 Y RYBP NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00877 70053 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 72445751 72445968 72445860 Y NA RYBP NA NA NA NA RYBP 48101 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 72862614 72863000 72862807 Y SHQ1 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 46065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 72871393 72871600 72871481 Y RYBP,PPP4R2 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 37465 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 72936024 72936237 72936180 Y RYBP,EBLN2 SHQ1,GXYLT2 NA NA NA NA GXYLT2 800 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 78848211 78848429 78848320 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 2367042 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 79366624 79366716 79366670 Y ROBO1 NA NA NA NA NA GBE1 2442596 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 82013657 82013800 82013729 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 204345 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 86677530 86677814 86677672 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 596607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B NA NA NA NA NA CHMP2B 275121 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 87914039 87914361 87914172 Y ZNF654,HTR1F NA NA NA NA NA RP11-451B8.1 73260 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 88026085 88026449 88026267 Y NA NA NA NA NA NA C3orf38 170444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 88255753 88255858 88255769 Y HTR1F NA NA NA NA NA CGGBP1 58718 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 89352653 89353050 89352849 Y EPHA3 NA NA NA NA NA ABCF2P1 988347 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 89698328 89698586 89698457 Y NA NA NA NA NA NA ABCF2P1 1334022 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 95797016 95797346 95797181 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 97700858 97701029 97700931 Y OR5K3,OR5AC2,MINA,MINA MINA MINA MCF7 ChIA-PET 22265404 MINA 11557 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 98060136 98060151 98060144 Y OR5AC2,OR5H6,OR5H2,OR5K4 NA GABRR3 IMR90 Hi-C 24141950 CLDND1 179759 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 98282496 98282734 98282630 Y CLDND1,GPR15 CLDND1,CPOX NA NA NA NA CPOX 27833 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 98291884 98292296 98292041 Y OR5H6,OR5H2,CLDND1 CPOX NA NA NA NA CPOX 18271 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 98411733 98411959 98411833 Y ST3GAL6 ST3GAL6 ST3GAL6 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL6 37121 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 98691142 98691300 98691170 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 6602 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 99724570 99724720 99724642 Y TBC1D23 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 106637 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 100077983 100078198 100078091 Y FILIP1L NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA NIT2 26438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 100519297 100519336 100519310 Y NA NA NA NA NA NA TFG 93092 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 101556101 101556413 101556156 Y SENP7,ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NFKBIZ NA NA NA NA NFKBIZ 11266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 103100242 103100251 103100247 Y NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 1555407 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 105078282 105078611 105078543 Y NA ALCAM ALCAM IMR90 Hi-C 24141950 ALCAM 5142 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 107106402 107106700 107106604 Y NA NA NA NA NA NA BBX 133083 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 107720264 107720547 107720441 Y NA NA CD47,IFT57,HHLA2,MYH15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 87325 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 107803224 107803878 107803522 Y NA CD47 NA NA NA NA CD47 3994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 107807468 107807936 107807811 Y MYH15,CD47 NA NA NA NA NA CD47 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 107843189 107843582 107843382 Y MYH15,CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 35317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 107844539 107845078 107844606 Y DZIP3,IFT57,CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 36667 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr3 109075200 109075484 109075317 Y NA NA NA NA NA NA TRAT1 535655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 111289781 111290083 111289847 Y CD96 NA NA NA NA NA PLCXD2 101440 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 112095378 112095510 112095470 Y CD200 CD200 NA NA NA NA CD200 46184 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 112097877 112098105 112098057 Y ATG3 CD200 NA NA NA NA CD200 48683 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 112117788 112118189 112117996 Y ATG3 NA CD200,BTLA IMR90 Hi-C 24141950 CD200 68594 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 112143988 112144379 112144150 Y NA NA NA NA NA NA CD200 94794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 112531892 112532184 112532038 Y NA NA NA NA NA NA CD200R1 159785 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 112677670 112678011 112677841 Y NA CD200R1,GTPBP8 NA NA NA NA CD200R1 13958 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 112960908 112961353 112961141 Y NA NA NA NA NA NA C3orf17 224200 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 113254837 113255012 113254902 Y NA SPICE1,SIDT1 NA NA NA NA SIDT1 5694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 113941944 113942320 113942165 Y ZNF80,TIGIT NA NA NA NA NA KIAA1407 168484 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 114078948 114079017 114078985 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 305488 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 114373701 114374062 114373901 Y ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 600241 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 114374818 114375057 114374945 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 601358 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 114724447 114724794 114724621 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 950987 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 114798123 114798367 114798245 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 1024663 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 115548074 115548457 115548266 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 1195088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 115941110 115941531 115941311 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 802014 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 116060787 116061142 116061019 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 682403 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 117050913 117051371 117051328 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 307368 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 117352880 117353039 117353016 Y NA NA NA NA NA NA LSAMP 361056 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 117708320 117708646 117708547 Y NA LSAMP NA NA NA NA LSAMP 5449 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 119038073 119038376 119038095 Y NA ARHGAP31 NA NA NA NA ARHGAP31 26853 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 119315385 119315520 119315495 Y TMEM39A,POGLUT1,CD80,ADPRH,COX17 CD80,ADPRH,RP11-190C22.1 NA NA NA NA ADPRH 19270 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 119809073 119809433 119809278 Y NA GSK3B,RP11-18H7.1 NA NA NA NA GSK3B 1831 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 120065370 120065692 120065535 Y NA LRRC58 NA NA NA NA LRRC58 494 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 120181920 120182038 120181979 Y NA NA GSK3B IMR90 Hi-C 24141950 LRRC58 115734 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr3 120361404 120361730 120361550 Y NA NDUFB4 NA NA NA NA NDUFB4 48248 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 121664489 121664635 121664539 Y NA NA NA NA NA NA CD86 107578 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 121800469 121800680 121800559 Y EAF2,CD86 CD86 NA NA NA NA CD86 28256 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 122074989 122075000 122074995 Y NA CSTA,CCDC58,FAM162A NA NA NA NA CCDC58 25078 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 122201925 122202222 122202174 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 29570 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 122400701 122401439 122401076 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14 EIF4BP8,PARP14 NA NA NA NA PARP14 3236 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 122486684 122487080 122486948 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 23591 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 123391718 123392030 123392015 Y ADCY5,MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 89329 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 123476863 123477567 123477241 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 174474 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 125235229 125235600 125235483 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 1441 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA RP11-124N2.1 91582 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr3 125987620 125987662 125987641 Y NA NA KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37 IMR90 Hi-C 24141950 SLC41A3 169216 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 126259496 126259659 126259567 Y ZXDC CHST13 NA NA NA NA CHST13 18370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA CHCHD6 209278 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 127465577 127465875 127465733 Y NA NA NA NA NA NA MGLL 74176 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 127489555 127490079 127489815 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 49972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4,GATA2 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GATA2 6492 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 128735204 128735460 128735306 Y NA NA GP9 IMR90 Hi-C 24141950 RAB43 104184 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 128949165 128949421 128949200 Y MBD4,KIAA1257,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43,ISY1,CNBP CNBP KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 48400 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 128957834 128958071 128957930 Y NA NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 57069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 128967680 128967946 128967799 Y NA NA NA NA NA NA H1FX-AS1 64289 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 129295610 129296083 129295875 Y RAB43,C3orf37,C3orf37,H1FX,MBD4 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 27578 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 129313710 129313984 129313815 Y H1FOO PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 9677 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 129337923 129338085 129337977 Y NA PLXND1 RPL32P3,C3orf25,IFT122,MBD4,H1FOO,PLXND1,TMCC1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXND1 14262 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 129346331 129346490 129346427 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 22670 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 129519745 129520139 129519943 Y H1FOO NA NA NA NA NA TMCC1 90280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 129630197 129630419 129630269 Y MBD4,TMCC1,TMCC1 TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 19778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 129636051 129636397 129636223 Y MBD4,TMCC1,TMCC1 TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 25632 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 130637982 130638444 130638066 Y NA NA NA NA NA NA ATP2C1 70543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 132137953 132138107 132138033 Y DNAJC13 DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 3583 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 132138974 132139193 132139084 Y NA DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 4604 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 132524079 132524175 132524127 Y NA NA NA NA NA NA NPHP3 84776 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 132685595 132685662 132685629 Y NA NA NA NA NA NA NPHP3 246292 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 133537876 133537890 133537883 Y NA SRPRB NA NA NA NA SRPRB 36999 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 133596347 133596652 133596615 Y NA NA NA NA NA NA SRPRB 95470 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 133646484 133646682 133646583 Y NA NA NA NA NA NA SRPRB 145607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 136466232 136466235 136466234 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 2985 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 136492102 136492187 136492145 Y NA STAG1 NCK1,IL20RB IMR90 Hi-C 24141950 STAG1 22882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 136521386 136521500 136521443 Y NA NA NCK1 IMR90 Hi-C 24141950 STAG1 52166 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 138410318 138410460 138410372 Y NA NA NA NA NA NA FAIM 84870 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 138581550 138581663 138581597 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29770 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 139344390 139344678 139344552 Y NA NA NA NA NA NA RP11-319G6.1 237733 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 139909278 139909663 139909338 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A36 749009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA SLC25A36 736336 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 140444115 140444514 140444321 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A36 214158 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 141065863 141066028 141065983 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 24808 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 141126018 141126305 141126087 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 77584 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 141230074 141230471 141230125 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 26185 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 141240287 141240651 141240396 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 36398 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 141316631 141317016 141316779 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 112742 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 141887290 141887616 141887590 Y NA TFDP2 NA NA NA NA TFDP2 20904 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 142225702 142226031 142225867 Y NA NA NA NA NA NA XRN1 60798 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 145546772 145546788 145546780 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 713863 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 148510378 148510745 148510562 Y CPA3 NA NA NA NA NA CPA3 70298 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 148781596 148781850 148781723 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20491 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 148942843 148943311 148943144 Y NA NA NA NA NA NA RP11-206M11.7 57258 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 149666531 149666918 149666689 Y NA NA NA NA NA NA RNF13 138036 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 149823678 149824072 149823966 Y NA NA RNF13,PFN2,LOC646903,TSC22D2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF13 295183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 150001972 150002287 150002130 Y NA NA TSC22D2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 121835 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 150943935 150944361 150944164 Y P2RY14 GPR171,P2RY14 NA NA NA NA GPR171 24947 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 151065337 151065743 151065553 Y CLRN1,P2RY14,GPR87,P2RY13,P2RY12 P2RY13 NA NA NA NA P2RY13 20001 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 151066126 151066377 151066226 Y MED12L,GPR87,P2RY12 P2RY13 NA NA NA NA P2RY13 20790 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 151593609 151593922 151593765 Y NA SUCNR1 NA NA NA NA SUCNR1 4178 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 151918966 151919116 151919042 Y NA MBNL1 NA NA NA NA MBNL1 40501 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 151922139 151922351 151922251 Y AADACL2 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 37266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 151923088 151923367 151923343 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 36250 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.378012785518 chr3 151970606 151970904 151970617 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1 10989 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr3 151971438 151971777 151971516 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1 11821 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 151976173 151976628 151976408 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 8716 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 152091128 152091426 152091240 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 105784 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 152313972 152314194 152314081 Y NA NA NA NA NA NA P2RY1 236542 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr3 155905021 155905068 155905045 Y NA NA NA NA NA NA GMPS 318696 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 156305125 156305202 156305164 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1 SSR3 LOC339894,LOC100498859,TIPARP,TIPARP-AS1,LEKR1 IMR90 Hi-C 24141950 SSR3 34152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 156324679 156324757 156324718 Y NA NA TIPARP-AS1,TIPARP,CCNL1,SSR3,LOC339894,LOC100498859 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SSR3 53706 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 158048767 158049059 158048913 Y NA NA NA NA NA NA RSRC1 227123 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 158440805 158440990 158440882 Y MFSD1 MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 6997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 159597816 159598076 159597925 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 343347 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 160714920 160715128 160715024 Y NA NA NA NA NA NA NMD3 105356 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 163476418 163476433 163476426 Y NA NA NA NA NA NA B3GALNT1 2655246 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 165217698 165218028 165217864 Y NA NA NA NA NA NA WDR49 2151743 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 165459636 165459647 165459642 Y NA NA NA NA NA NA WDR49 1910124 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 166686803 166687129 166686941 Y NA NA NA NA NA NA WDR49 682642 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 167990404 167990484 167990444 Y NA EGFEM1P NA NA NA NA EGFEM1P 25094 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 169379063 169379412 169379208 Y MECOM NA NA NA NA NA MECOM 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA TERC 1241 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr3 169762658 169762980 169762844 Y SKIL,SKIL,GPR160 GPR160 NA NA NA NA GPR160 8941 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 170073991 170074311 170074218 Y SKIL,SKIL SKIL NA NA NA NA SKIL 525 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 170613123 170613340 170613232 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA EIF5A2 11142 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 170795068 170795319 170795194 Y NA NA NA NA NA NA EIF5A2 170586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 171678764 171678932 171678818 Y NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 76486 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr3 171693285 171693478 171693411 Y FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 61940 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 171789788 171790157 171789907 Y PLD1,FNDC3B FNDC3B NA NA NA NA FNDC3B 34370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 171792323 171792831 171792493 Y PLD1,FNDC3B FNDC3B NA NA NA NA FNDC3B 36905 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 171825348 171825521 171825406 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 69930 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 171935922 171936083 171936003 Y FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 180504 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 174048960 174049199 174049115 Y NA RP11-393N4.2 NA NA NA NA RP11-393N4.2 43835 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 174949841 174950235 174950187 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-91P 375032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 175885302 175885685 175885495 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 450844 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 176133548 176133972 176133699 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 699090 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 176862590 176862993 176862904 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 50268 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00578 79625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 177293593 177293900 177293627 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 135884 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 177434552 177434810 177434802 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 276843 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 177719503 177719830 177719752 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00578 561794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 178423779 178424120 178423952 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 363947 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 178755149 178755598 178755383 Y NA ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 32469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 179684304 179684515 179684308 Y NA NA NA NA NA NA USP13 315761 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 180059459 180059617 180059527 Y PEX5L NA NA NA NA NA TTC14 258301 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 180473227 180473381 180473285 Y NA NA NA NA NA NA FXR1 110548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 181414061 181414442 181414162 Y SOX2 NA NA NA NA NA DNAJC19 708499 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 181442269 181442851 181442522 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC19 736707 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 181537254 181537571 181537413 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC19 831692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 181876844 181877235 181877011 Y NA NA NA NA NA NA ATP11B 632053 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 182928659 182929484 182928893 Y ATP11B,DCUN1D1,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 39548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 182930309 182930644 182930583 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 38388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 183224815 183225118 183224901 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 KLHL6 NA NA NA NA KLHL6 46359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 183231092 183231442 183231267 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 KLHL6 NA NA NA NA KLHL6 40035 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 183271974 183272463 183272322 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 KLHL6 NA NA NA NA KLHL6 497 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 184190977 184191077 184191023 Y HTR3D,FAM131A NA POLR2H,CHRD,THPO IMR90 Hi-C 24141950 EPHB3 86495 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 185339016 185339200 185339107 Y NA SENP2 NA NA NA NA SENP2 40732 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 185482318 185482647 185482554 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 58197 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 185900125 185900504 185900315 Y NA NA NA NA NA NA ETV5 74018 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 186490704 186490868 186490793 Y ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2 EIF4A2,RFC4 NA NA NA NA EIF4A2 8126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 186715660 186715959 186715816 Y RTP1,ST6GAL1,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 69386 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 187636889 187637150 187637085 Y BCL6,BCL6 NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 175374 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 187810458 187810736 187810660 Y NA NA LPP,BCL6 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 58336 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 188151524 188151812 188151760 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 281679 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 188234530 188234788 188234659 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 364685 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 188826947 188827206 188827077 Y NA NA BCL6,LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP-AS2 957102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 NA LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 IL1RAP 166459 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 190284228 190284576 190284349 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAP 54388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 190335085 190335347 190335197 Y IL1RAP NA NA NA NA NA IL1RAP 105245 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr3 190336230 190336434 190336308 Y IL1RAP NA NA NA NA NA IL1RAP 106390 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 191018915 191018927 191018921 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAP 789075 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 239725 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 193548514 193548983 193548724 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OPA1 239581 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 194875742 194876159 194875826 Y FAM43A,C3orf21 XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 9142 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 32063 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 195627582 195627903 195627662 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 AC124944.5,TNK2-AS1 NA NA NA NA TNK2-AS1 5044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 196047617 196047878 196047747 Y NA PCYT1A,TCTEX1D2 NA NA NA NA TCTEX1D2 4447 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr3 196339004 196339201 196339061 Y LRRC33 FBXO45,WDR53,PIGX PCYT1A,TCTEX1D2,FBXO45,WDR53,CEP19,PIGX,LRRC33,PAK2,MFI2,MFI2-AS1,SENP5 IMR90 Hi-C 24141950 PIGX 25445 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr3 196437709 196437842 196437776 Y NA CEP19,PAK2 NA NA NA NA CEP19 545 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr3 197264445 197264691 197264611 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 33503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr3 197461391 197461841 197461700 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 209 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 43553 43799 43797 Y ZNF141 NA ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF141 285804 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 48171 48447 48418 Y ZNF141 NA ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF141 281156 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 50610 50903 50681 Y NA NA NA NA NA NA ZNF141 278700 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 683740 684022 683889 Y GAK,MYL5,MFSD7,PCGF3 MYL5,ATP5I,MFSD7,PCGF3 NA NA NA NA MFSD7 2510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 1170900 1171323 1171147 Y GAK,DGKQ,KIAA1530 NA NA NA NA NA RNF212 65550 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 1843900 1844033 1843967 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA LETM1 11941 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 1874737 1875082 1874826 Y WHSC1 LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 3586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 1970462 1970680 1970571 Y NA NA NA NA NA NA C4orf48 71009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr4 2765898 2766146 2766030 Y NA TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 9795 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 2802009 2802382 2802309 Y ZFYVE28,LOC402160,HTT,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2 TNIP2,SH3BP2,ADD1 NA NA NA NA SH3BP2 9259 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 2802562 2803388 2803116 Y ZFYVE28,LOC402160,HTT,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2 TNIP2,SH3BP2,ADD1 NA NA NA NA SH3BP2 9812 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 3047149 3047582 3047407 Y RGS12,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2 HTT NA NA NA NA HTT 26826 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 3390647 3391111 3390815 Y RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 97892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 4272259 4272533 4272507 Y ZBTB49 TMEM128,LYAR,ZBTB49 NA NA NA NA LYAR 17363 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 5034935 5035238 5035206 Y NA CYTL1,STK32B STK32B,EVC2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTL1 15736 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr4 6223621 6224023 6223692 Y PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1 WFS1 NA NA NA NA WFS1 45553 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 6887984 6888235 6888115 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 20734 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 6918330 6918775 6918508 Y KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 9361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 6919401 6919899 6919549 Y MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 10432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 6920106 6920340 6920183 Y MAN2B2,S100P,KIAA0232,TADA2B,GRPEL1,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 11137 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 6928884 6929127 6929009 Y KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 19915 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 6934348 6934486 6934417 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 25379 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 6959680 6959690 6959685 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D14 50711 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 7012933 7013112 7013014 Y NA TADA2B NA NA NA NA TADA2B 28514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 7654451 7654682 7654596 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1-AS1 99135 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 8106884 8107059 8106970 Y NA NA NA NA NA NA ABLIM2 51500 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 8421251 8421740 8421359 Y SH3TC1,ACOX3 ACOX3 NA NA NA NA ACOX3 18710 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 10182011 10182277 10182105 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 65438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 10182678 10183260 10182921 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 66105 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 12125393 12125532 12125432 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST1 696004 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 12138975 12139085 12139030 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST1 709586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 13193944 13194185 13194064 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 289804 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 13923595 13923747 13923678 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 RAB28 439606 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 13983712 13984051 13983910 Y NA NA LOC441009,CPEB2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB28 499723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr4 14614653 14614784 14614719 Y NA NA NA NA NA NA CPEB2 387514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 15488697 15488958 15488934 Y NA NA NA NA NA NA FAM200B 192327 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 15536628 15536631 15536630 Y NA NA FBXL5 IMR90 Hi-C 24141950 FAM200B 144654 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 15757957 15758240 15758119 Y FBXL5,TAPT1,CD38 CD38 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CD38 19658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr4 15781600 15782008 15781690 Y FBXL5,BST1,CD38 CD38 NA NA NA NA CD38 3702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 15820988 15821366 15820993 Y NA CD38 NA NA NA NA CD38 43090 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 16226860 16227020 16226938 Y FGFBP2,TAPT1 TAPT1,RPS21P4 NA NA NA NA TAPT1 13 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 17483580 17483992 17483821 Y QDPR,CLRN2 QDPR NA NA NA NA QDPR 27865 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 17853657 17853735 17853696 Y NA DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 43132 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 18392393 18392740 18392571 Y NA NA NA NA NA NA LCORL 370894 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 18578786 18579116 18578810 Y NA NA FAM184B IMR90 Hi-C 24141950 LCORL 557287 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 21173357 21173594 21173476 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 477452 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 21930853 21931229 21931116 Y KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA RP11-10G12.1 662590 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 22743232 22743512 22743354 Y NA CDC42P6 NA NA NA NA CDC42P6 15659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 24227575 24227894 24227795 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 356279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 24840398 24840758 24840578 Y NA NA SOD3 IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 256225 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 25818516 25818837 25818677 Y SEL1L3 SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 44545 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 26073475 26073565 26073520 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 89512 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 26085593 26085874 26085733 Y NA NA RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 77203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 26094993 26095582 26095349 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 67495 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 26198985 26199293 26199235 Y RBPJ,RBPJ RBPJ RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 35908 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 26219568 26220289 26219918 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 56491 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 26275280 26275493 26275371 Y RBPJ,RBPJ NA NA NA NA NA RBPJ 112203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 26994323 26994529 26994430 Y STIM2 NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 134102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 33937784 33937916 33937850 Y NA NA NA NA NA NA RP11-734I18.1 1940765 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 34734758 34735069 34734951 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1509062 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 35904315 35904632 35904474 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 339499 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 60645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 36243506 36243686 36243606 Y NA ARAP2 NA NA NA NA ARAP2 445 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 36324523 36324972 36324771 Y ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 80392 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 36325568 36325959 36325621 Y ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 81437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 36328363 36328501 36328441 Y ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 84232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 37756081 37756203 37756129 Y RELL1,TBC1D1,PGM2 NA RELL1 IMR90 Hi-C 24141950 PGM2 70052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 37759790 37760114 37760015 Y RELL1,TBC1D1 NA RELL1 IMR90 Hi-C 24141950 PGM2 66141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 37887233 37887434 37887366 Y TBC1D1 TBC1D1 NA NA NA NA TBC1D1 3274 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 38176506 38176684 38176575 Y NA NA TBC1D1,KLF3,FLJ13197,FAM114A1,TLR6,TLR1 IMR90 Hi-C 24141950 PTTG2 216450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 38496068 38496343 38496206 Y NA NA NA NA NA NA KLF3 167474 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 38530760 38531092 38530874 Y TLR6,TLR1,KLF3 NA FLJ13197,KLF3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF3 132725 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 38663074 38663393 38663234 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA KLF3 424 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 38668617 38669179 38668850 Y KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 4113 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 38671040 38671097 38671090 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 6536 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 38857753 38857899 38857797 Y KLF3,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 1315 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 39038547 39038755 39038651 Y NA TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 5904 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 39316114 39316675 39316347 Y NA RFC1 NA NA NA NA RFC1 49320 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 39354929 39355678 39355646 Y NA RFC1 WDR19 IMR90 Hi-C 24141950 RFC1 10317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 39548258 39548506 39548382 Y KLHL5 UGDH-AS1,UGDH NA NA NA NA UGDH 20327 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 40056293 40056591 40056356 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr4 40057110 40057493 40057154 Y RHOH,N4BP2 N4BP2 NA NA NA NA N4BP2 664 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr4 40205209 40205567 40205376 Y NA RHOH NA NA NA NA RHOH 14536 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 40208219 40208356 40208278 Y RBM47 RHOH NA NA NA NA RHOH 17546 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr4 40220241 40220518 40220360 Y NA RHOH NA NA NA NA RHOH 29568 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 40303636 40304018 40303887 Y PDS5A,N4BP2,RHOH NA N4BP2,LOC344967,RHOH,RBM47 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RHOH 112963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 40998550 40998604 40998585 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 248636 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 41365518 41365934 41365651 Y NA NA NA NA NA NA TMEM33 569203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 41509451 41509766 41509557 Y LIMCH1 NA NA NA NA NA TMEM33 425371 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 42615195 42615457 42615407 Y NA ATP8A1 NA NA NA NA ATP8A1 41665 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 47308450 47308659 47308604 Y NA NA NA NA NA NA COMMD8 155077 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 48126278 48126641 48126461 Y ZAR1,TEC,SLAIN2 NA NA NA NA NA TEC 143240 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 48130124 48130516 48130320 Y TXK NA NA NA NA NA TEC 139365 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 52873079 52873103 52873091 Y NA SGCB NA NA NA NA SGCB 29545 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 53890542 53890886 53890882 Y NA NA NA NA NA NA RASL11B 164085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 54352112 54352115 54352114 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 110302 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 54928262 54928437 54928381 Y NA CHIC2,GSX2 NA NA NA NA CHIC2 420 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 54929171 54929915 54929573 Y CHIC2 CHIC2,GSX2 NA NA NA NA CHIC2 314 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 54951124 54951140 54951133 Y NA CHIC2,GSX2 SCFD2,CHIC2,FIP1L1,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 GSX2 12550 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2,GSX2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 GSX2 5555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr4 55039924 55040302 55040112 Y NA NA CHIC2,LNX1,SCFD2,RPL21P44,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 52962 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 55080110 55080272 55080192 Y CHIC2 PDGFRA SCFD2,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 12992 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 55093024 55093294 55093182 Y PDGFRA NA NA NA NA NA PDGFRA 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr4 55100480 55100923 55100634 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 7216 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 57940962 57941225 57941094 Y NA IGFBP7-AS1,IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7-AS1 32703 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 62391434 62391750 62391592 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 247818 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 65271026 65271195 65271112 Y NA RP11-204H9.2 NA NA NA NA RP11-204H9.2 23432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 70697485 70697758 70697651 Y SULT1B1 SULT1B1,SULT1E1 NA NA NA NA SULT1E1 26112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 70698476 70698796 70698636 Y UGT2A2 SULT1B1,SULT1E1 NA NA NA NA SULT1E1 25074 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 71179158 71179548 71179340 Y NA NA NA NA NA NA IGJ 365986 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 71638038 71638166 71638102 Y NA NA NA NA NA NA GRSF1 65496 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 71768830 71769244 71769107 Y DCK,MOBKL1A MOB1B NA NA NA NA MOB1B 2787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 72125321 72125676 72125518 Y NA NA NA NA NA NA DCK 269066 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 74740201 74740473 74740311 Y IL8,PPBP,PF4,EREG,CXCL3,CXCL2,PF4V1 CXCL1 NA NA NA NA CXCL1 7091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 74881912 74882135 74882023 Y IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2 PPBP,CXCL3 NA NA NA NA CXCL3 20389 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 74884607 74884942 74884772 Y IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2 PPBP,CXCL3 NA NA NA NA CXCL3 17582 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 74975298 74975961 74975834 Y CXCL1,AREG CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 1930 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 75072226 75072712 75072476 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA MTHFD2L 94335 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 75397621 75397842 75397732 Y NA NA EREG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EREG 168761 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 75585032 75585282 75585171 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EREG 356172 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 75806298 75806441 75806350 Y NA NA NA NA NA NA EREG 577438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 76623783 76624179 76623867 Y RCHY1,G3BP2,G3BP2 G3BP2,USO1 NA NA NA NA G3BP2 23530 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 77923148 77923272 77923214 Y CCNI NA NA NA NA NA SEPT11 54292 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 77928518 77929121 77928831 Y CCNI,CCNG2 NA NA NA NA NA SEPT11 59662 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 77974492 77974926 77974738 Y CCNI CCNI NA NA NA NA CCNI 20232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 78656019 78656351 78656260 Y NA NA NA NA NA NA CNOT6L 82418 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 78775607 78776169 78775749 Y NA CNOT6L,MRPL1 MRPL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL1 5505 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 78979777 78980204 78980085 Y NA NA NA NA NA NA MRPL1 198103 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 79566071 79566139 79566107 Y NA LINC01094 NA NA NA NA LINC01094 1014 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 79579251 79579554 79579361 Y BMP2K LINC01094 NA NA NA NA LINC01094 14194 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 79671266 79671448 79671350 Y BMP2K BMP2K LOC100505702,FRAS1,ANXA3,BMP2K IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP2K 24048 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 79783704 79784023 79783864 Y NA NA NA NA NA NA PAQR3 74569 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 80979830 80980309 80980136 Y ANTXR2 NA NA NA NA NA ANTXR2 64299 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 8.06969720984856 chr4 82427003 82427499 82427111 Y RASGEF1B NA NA NA NA NA RASGEF1B 535898 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 83205148 83205451 83205300 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPD 88205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 83205945 83206187 83206036 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPD 87469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 83419173 83419188 83419181 Y NA NA NA NA NA NA TMEM150C 62322 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 84033440 84033690 84033502 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 22538 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 84034119 84034423 84034342 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 21805 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 84074574 84075011 84074839 Y THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 18346 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 84466595 84466890 84466743 Y NA FAM175A,AGPAT9 NA NA NA NA AGPAT9 11528 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 84469544 84469879 84469660 Y PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9 FAM175A,AGPAT9 NA NA NA NA AGPAT9 14477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 84934181 84934545 84934426 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 479114 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 85797280 85797425 85797336 Y WDFY3 NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 88113 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 87626625 87626818 87626720 Y PTPN13 NA NA NA NA NA PTPN13 113157 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 87839773 87840193 87839957 Y HSD17B11 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 13961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 88408034 88408084 88408060 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 66300 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 88441557 88441872 88441810 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 99823 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 88817372 88817671 88817543 Y NA NA NA NA NA NA SPP1 77148 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 88939808 88939842 88939826 Y NA SPP1,PKD2 NA NA NA NA PKD2 12988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 88943044 88943294 88943160 Y NA SPP1,PKD2 NA NA NA NA PKD2 16224 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 89099576 89099877 89099636 Y HERC6,HERC5 NA PKD2 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG2 50597 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 89534713 89535020 89534799 Y PPM1K,HERC3 NA NA NA NA NA NAP1L5 82366 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 89726737 89726837 89726787 Y NA NA NA NA NA NA NAP1L5 109351 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 90226723 90227111 90227016 Y GPRIN3 NA NA NA NA NA FAM13A 196174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 90850750 90851156 90851023 Y NA NA NA NA NA NA MMRN1 52067 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA MMRN1 250914 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 93695522 93695754 93695563 Y GRID2 NA NA NA NA NA SMARCAD1 1431008 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 99319477 99319794 99319573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 138942 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 101440272 101440596 101440446 Y NA NA NA NA NA NA EMCN 358687 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 102121858 102122120 102121969 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 144817 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 102131266 102131303 102131283 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 135634 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 103324481 103324677 103324563 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 NA NA NA NA SLC39A8 25738 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 103360070 103360216 103360146 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 9655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 103655976 103656198 103656076 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA MANBA NA NA NA NA MANBA 23953 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 103679962 103680312 103680150 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA NA NA NA NA NA MANBA 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 104506534 104506711 104506623 Y NA NA NA NA NA NA CENPE 388968 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 106041903 106042080 106041990 Y TET2,TET2 TET2 NA NA NA NA TET2 22952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 106064596 106064807 106064750 Y NA TET2 TET2 K562 ChIA-PET 22265404 TET2 225 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 106226051 106226420 106226239 Y TET2,TET2 NA NA NA NA NA TET2 161019 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 106841550 106841937 106841687 Y TBCK,LOC100507096 INTS12 NA NA NA NA INTS12 26407 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 107780277 107780572 107780473 Y NA NA NA NA NA NA TBCK 539625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 109513186 109513523 109513472 Y NA RPL34-AS1,RPL34 NA NA NA NA RPL34-AS1 26093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 110043690 110043849 110043769 Y COL25A1 NA NA NA NA NA COL25A1 177964 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 110125324 110125640 110125483 Y NA NA NA NA NA NA COL25A1 96173 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 110320309 110320596 110320490 Y LRIT3 SEC24B,SEC24B-AS1 OSTC,AGXT2L1,COL25A1,CFI IMR90 Hi-C 24141950 SEC24B 32332 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 110449545 110449722 110449703 Y SEC24B CCDC109B CCDC109B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC109B 29639 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr4 113067380 113067784 113067656 Y LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32 C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 2827 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr4 113181018 113181306 113181029 Y AP1AR,TIFA AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 23359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 113205194 113205406 113205300 Y NA ALPK1,TIFA NA NA NA NA TIFA 135 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 113572868 113573168 113573031 Y NA LARP7,C4orf21 NA NA NA NA C4orf21 16717 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 118953861 118954102 118953937 Y NDST3 NDST3 NA NA NA NA NDST3 1088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 119629667 119629850 119629760 Y NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 25144 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 119890642 119890944 119890758 Y NA NA NA NA NA NA SEC24D 132804 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 120093482 120093688 120093586 Y NA USP53,RP11-455G16.1 NA NA NA NA USP53 38054 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 120205306 120205694 120205553 Y NA C4orf3 NA NA NA NA C4orf3 17906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 122703678 122703696 122703687 Y NA EXOSC9,CCNA2 NA NA NA NA EXOSC9 16776 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 122869375 122869534 122869455 Y TRPC3 NA NA NA NA NA BBS7 79723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 123074024 123074337 123074286 Y KIAA1109,IL21,IL2 KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 2536 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 123096398 123096477 123096437 Y IL2 KIAA1109 NA NA NA NA KIAA1109 24910 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 123771840 123772248 123772020 Y NA NA NA NA NA NA NUDT6 69875 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 123776087 123776259 123776177 Y NA NA NA NA NA NA NUDT6 65864 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 124521229 124521410 124521292 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 205279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 127610256 127610572 127610414 Y NA NA NA NA NA NA INTU 931854 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 128894970 128895372 128895225 Y NA C4orf29,MFSD8 NA NA NA NA MFSD8 9820 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 129308281 129308471 129308363 Y NA NA PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 100297 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 129609627 129610025 129609830 Y NA NA PHF17 K562 ChIA-PET 22265404 PGRMC2 401643 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 129834414 129834678 129834574 Y PHF17,SCLT1,C4orf33,C4orf33 NA NA NA NA NA C4orf33 177794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 129837993 129838340 129838111 Y PHF17,SCLT1,C4orf33 NA NA NA NA NA C4orf33 174132 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 133292934 133293335 133293044 Y NA NA NA NA NA NA PCDH10 775135 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 133872156 133872185 133872177 Y NA NA NA NA NA NA PCDH10 196285 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 139327385 139327721 139327507 Y SLC7A11 NA NA NA NA NA SLC7A11 165882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 140096766 140097018 140096889 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2 ELF2 ELF2,NAA15 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELF2 394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 140578910 140579141 140579109 Y NA MGST2 SCOC,LOC100129858,MGST2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MGST2 5781 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 140886001 140886373 140886187 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 186965 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 140891718 140892054 140891918 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 181284 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 140897225 140897350 140897279 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 175988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 140970177 140970718 140970535 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 102620 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 141015177 141015539 141015358 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 57799 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 141016837 141017139 141016990 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 56199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 141017143 141017617 141017414 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 55721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 141071687 141072625 141072041 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 141164479 141164682 141164571 Y MAML3 SCOC MAML3,MGST2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCOC 11758 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 146101946 146102251 146102199 Y NA OTUD4 ABCE1 K562 ChIA-PET 22265404 OTUD4 2633 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 146656396 146656737 146656614 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118981 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 147194396 147194957 147194565 Y ZNF827,LSM6 NA NA NA NA NA LSM6 99559 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 147196519 147196807 147196609 Y NA NA NA NA NA NA LSM6 101682 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 148374725 148374999 148374823 Y TMEM184C NA TMEM184C IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 161535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 148677279 148677473 148677309 Y NA ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 26065 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 148735623 148735823 148735723 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 84409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 148746659 148746986 148746792 Y PRMT10,ARHGAP10 NA NA NA NA NA ARHGAP10 95445 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 151557010 151557332 151557171 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 377547 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 153313306 153313343 153313324 Y NA NA NA NA NA NA MIR4453 142073 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 153858553 153859077 153858605 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 ARFIP1,FHDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FHDC1 3049 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 153884926 153884958 153884941 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 29422 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 153986368 153986713 153986555 Y NA NA FHDC1,ARFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 FHDC1 130864 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 154001109 154001458 154001304 Y KIAA0922,FHDC1 NA FHDC1,ARFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 FHDC1 145605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 154235645 154236052 154235798 Y TRIM2,TRIM2,RNF175 MND1 NA NA NA NA MND1 27749 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 154408922 154409996 154409474 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 23424 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr4 155577667 155577895 155577781 Y NA NA FGB IMR90 Hi-C 24141950 PLRG1 108080 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 156388113 156388229 156388171 Y NA NA GUCY1A3 IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 91991 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 159641149 159641258 159641192 Y NA ETFDH,C4orf46,PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 1290 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 159643443 159643599 159643521 Y FNIP2,PPID PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 895 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 162590696 162590746 162590721 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 1495327 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 164414222 164414415 164414319 Y TKTL2,C4orf43 NA NA NA NA NA NAF1 328149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 378130 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 164486081 164486094 164486088 Y MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 400008 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 167966899 167967430 167967268 Y NA NA NA NA NA NA DDX60 1270528 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 170543360 170543629 170543529 Y NEK1,CLCN3 NEK1,CLCN3 C4orf27 IMR90 Hi-C 24141950 CLCN3 11576 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 170934636 170934767 170934702 Y NA MFAP3L NA NA NA NA MFAP3L 17415 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 174470601 174470612 174470607 Y NA NA NA NA NA NA RANP6 82910 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 175138375 175138746 175138561 Y CEP44,CEP44 NA NA NA NA NA CEP44 64082 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 178172534 178172656 178172598 Y NEIL3 NA NEIL3,VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 NEIL3 56334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 178849873 178850023 178850005 Y NA NA NA NA NA NA AGA 488216 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 182070656 182070725 182070691 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 1766364 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 184423820 184424211 184423984 Y STOX2 NA NA NA NA NA ING2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 185189191 185189340 185189323 Y IRF2,CASP3 NA IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 204394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 185269961 185270243 185270083 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 123491 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 185283565 185283989 185283873 Y ACSL1 NA LOC728175,IRF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 109745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 185324238 185324411 185324337 Y ACSL1,IRF2,CASP3 NA NA NA NA NA IRF2 69323 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr4 185455694 185456195 185455840 Y IRF2 NA IRF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2 61960 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 185613623 185613900 185613762 Y CCDC111 CASP3 NA NA NA NA CASP3 44960 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 186306025 186306048 186306047 Y NA LRP2BP,UFSP2,C4orf47 NA NA NA NA LRP2BP 9005 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 190485123 190485226 190485156 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 93004 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 190488095 190488477 190488229 Y FRG1 NA NA NA NA NA HSP90AA4P 95976 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr4 190504163 190504534 190504471 Y FRG1 NA NA NA NA NA HSP90AA4P 112044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 148457 148511 148484 Y NA NA NA NA NA NA CCDC127 67819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 190691 190901 190821 Y SDHA,LRRC14B CCDC127,SDHA NA NA NA NA CCDC127 25429 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 360822 360962 360952 Y EXOC3 NA NA NA NA NA AHRR 58531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 373392 373627 373429 Y EXOC3,C5orf55,PDCD6 NA NA NA NA NA C5orf55 67631 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr5 378611 379250 378849 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 62008 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 389983 390379 390026 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 50879 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 392668 393182 392808 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 48076 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr5 448928 449328 449227 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA EXOC3 7655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 496367 496484 496443 Y SLC9A3 CTD-2228K2.5 NA NA NA NA CTD-2228K2.5 25154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 523225 523441 523256 Y SLC9A3 NA NA NA NA NA CTD-2228K2.5 52012 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr5 963791 964176 964051 Y NA NA SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 BRD9 72852 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA NA NA NA NA NA SLC12A7 66600 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 1104689 1105159 1104882 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 4991 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 1105639 1106251 1106127 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 3899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 1107341 1108073 1107860 Y SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 2077 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr5 1490323 1490754 1490675 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 31338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr5 1501941 1502569 1502322 Y LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 19523 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 1512306 1512503 1512434 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 9589 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 1521795 1522349 1522119 Y NA NA NA NA NA NA LPCAT1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 1522529 1522699 1522639 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 5.44235393222344 chr5 7250846 7251033 7250922 Y NA NA NA NA NA NA MTRR 598266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 10692588 10692818 10692805 Y NA NA NA NA NA NA DAP 66566 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 10857093 10857358 10857239 Y NA NA ROPN1L,DAP,CTNND2,MARCH6,ANKRD33B IMR90 Hi-C 24141950 DAP 97709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 11283783 11284165 11283974 Y NA NA NA NA NA NA DAP 524399 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 12314219 12314247 12314235 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1554835 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 13465782 13466001 13465924 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 675810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 14545472 14545570 14545529 Y NA FAM105A FAM105A,TRIO IMR90 Hi-C 24141950 FAM105A 34314 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 14672104 14672643 14672283 Y FAM105A,FAM105B EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 9331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 14817188 14817452 14817373 Y NA RBBP4P1 NA NA NA NA RBBP4P1 20679 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 16627050 16627278 16627163 Y ZNF622 NA FAM134B,MYO10 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF622 163149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 17118695 17119132 17119047 Y BASP1 NA NA NA NA NA BASP1 54988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 17154255 17154624 17154440 Y NA NA NA NA NA NA BASP1 90548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 17224986 17225514 17225115 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 118211 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 17359663 17360122 17359876 Y BASP1 RN7SKP133,FTH1P10 NA NA NA NA FTH1P10 6930 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 21398666 21398852 21398730 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 58724 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 21551190 21551442 21551193 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 211248 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 24272966 24273308 24273185 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 536282 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 24740161 24740327 24740244 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 69263 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 26336181 26336366 26336274 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 1147416 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 32274798 32274903 32274861 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 36212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 32366924 32367006 32366965 Y NA NA NA NA NA NA MTMR12 55809 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 32391012 32391652 32391274 Y SUB1 NA NA NA NA NA ZFR 51215 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 32582779 32582965 32582856 Y SUB1 NA ZFR,SUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUB1 53040 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 33808872 33808964 33808905 Y NA NA NA NA NA NA AMACR 197256 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 34877157 34877486 34877355 Y NA BRIX1,RAD1 NA NA NA NA BRIX1 35995 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 36119586 36119746 36119728 Y SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA LMBRD2 30317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr5 36243430 36243676 36243553 Y SLC1A3 NA NA NA NA NA SKP2 93339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 36665318 36665543 36665428 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2353F22.1 57754 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 36689194 36689678 36689532 Y NIPBL CTD-2353F22.1 NA NA NA NA CTD-2353F22.1 33619 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 36692375 36692470 36692423 Y SLC1A3 CTD-2353F22.1 NA NA NA NA CTD-2353F22.1 30827 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 36854982 36855055 36855019 Y NA NIPBL NA NA NA NA NIPBL 19806 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 205404 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 38968924 38969094 38969009 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 103416 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 39256594 39256894 39256792 Y RICTOR,FYB FYB NA NA NA NA FYB 15736 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 39292432 39292553 39292530 Y NA FYB NA NA NA NA FYB 19802 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 39519768 39520016 39519839 Y DAB2 NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 59366 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 39606080 39606287 39606184 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 145678 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 40263385 40263650 40263545 Y NA NA PTGER4,TTC33 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 413950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 40385282 40385417 40385333 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 292183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 40388555 40388624 40388591 Y NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 288976 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 40406938 40407269 40407103 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 270331 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 40688188 40688473 40688414 Y PRKAA1,PTGER4 PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 10588 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 40754670 40754884 40754791 Y PTGER4 TTC33,PRKAA1 NA NA NA NA TTC33 593 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 42949793 42950117 42950048 Y ZNF131,C5orf39 NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 SEPP1 64299 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr5 43020658 43020829 43020797 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 4127 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 44821100 44821499 44821234 Y NA RP11-53O19.1,MRPS30 NA NA NA NA MRPS30 14073 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 49719324 49719499 49719409 Y PARP8 EMB NA NA NA NA EMB 17583 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 52627320 52627670 52627488 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST,NDUFS4 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS2 223427 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 53598110 53598544 53598224 Y NA ARL15 NA NA NA NA ARL15 5868 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 53848607 53848967 53848787 Y NA SNX18 NA NA NA NA SNX18 37018 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 53907517 53907722 53907626 Y SNX18,SNX18 NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 95928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 54128628 54129104 54128925 Y SNX18,SNX18,CDC20B NA SNX18,ARL15,HSPB3 IMR90 Hi-C 24141950 GZMA 267372 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 54741987 54742107 54742028 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 82422 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 55555067 55555385 55555210 Y NA NA ANKRD55,IL6ST,MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 243514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 55969082 55969325 55969253 Y MAP3K1 NA MAP3K1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAP3K1 140076 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 56060040 56060308 56060136 Y NA MAP3K1 MAP3K1 MCF7,IMR90,HELA ChIA-PET,Hi-C,5C 22265404,24141950,22955621 MAP3K1 49093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 56731620 56731973 56731778 Y NA NA PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPBP1 263845 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 56737388 56737596 56737493 Y NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 269613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 57122032 57122386 57122209 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 631701 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58156479 58156810 58156634 Y GAPT,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 176778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58165920 58166304 58166218 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 167284 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58395760 58396044 58395902 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 62172 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58400134 58400374 58400226 Y PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 66546 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58408149 58408473 58408383 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 74561 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 89723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58816932 58817290 58817225 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 483344 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58866470 58866828 58866806 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 532882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58874550 58874813 58874554 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 540962 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 58951498 58952014 58951831 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 617910 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr5 59045613 59045932 59045792 Y PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 712025 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 59070253 59070532 59070393 Y PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 736665 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 59183388 59183889 59183871 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 632058 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 59505321 59505489 59505391 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 310458 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 59555623 59555791 59555707 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 260156 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 60629089 60629454 60629159 Y NA ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 2989 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 60710257 60710608 60710433 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 24559 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 64062726 64062917 64062822 Y NA SREK1IP1 NA NA NA NA CWC27 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 64224703 64224806 64224755 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 161946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 65220429 65221204 65220462 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 65228217 65228394 65228309 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 7914 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 66483260 66483440 66483335 Y CD180 CD180 NA NA NA NA CD180 7187 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 66491573 66491775 66491706 Y CD180 CD180 NA NA NA NA CD180 946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 66502779 66503107 66502965 Y NA CD180 MAST4,CD180,PIK3R1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD180 12152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 66553391 66553646 66553530 Y NA NA PIK3R1 IMR90 Hi-C 24141950 CD180 62764 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 67103829 67104163 67104152 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 405385 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 67437910 67437942 67437925 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 71606 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 71852331 71852540 71852377 Y NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF366 50777 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 71852712 71853181 71852905 Y TNPO1 NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF366 51158 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 72235988 72236210 72236099 Y FCHO2 FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 13598 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 72599094 72599410 72599166 Y NA NA FCHO2,BTF3,FOXD1,TMEM171 IMR90 Hi-C 24141950 BTF3 192823 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 73527907 73527999 73527953 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 405849 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 74212679 74213001 74212847 Y NA CTD-2503O16.1 NA NA NA NA CTD-2503O16.1 12486 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 74862624 74863010 74862882 Y ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 56661 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 74997783 74997822 74997793 Y COL4A3BP,COL4A3BP POC5 NA NA NA NA POC5 13491 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 75697663 75698026 75697714 Y S100Z,IQGAP2 RP11-156N15.1,IQGAP2 NA NA NA NA IQGAP2 589 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 75747956 75748255 75748106 Y NA NA NA NA NA NA IQGAP2 50882 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 75789158 75789213 75789186 Y NA NA NA NA NA NA IQGAP2 92084 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 76147668 76147777 76147734 Y IQGAP2,S100Z S100Z NA NA NA NA S100Z 3842 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr5 77178463 77178819 77178704 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 15859 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 77581141 77581448 77581332 Y AP3B1 AP3B1 NA NA NA NA AP3B1 7131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 77792703 77793028 77792954 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 138364 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 77807354 77807759 77807583 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 153015 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 77833920 77834065 77833967 Y AP3B1 NA NA NA NA NA SCAMP1 179581 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 77974245 77974379 77974312 Y NA NA SCAMP1,LHFPL2,ARSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARSB 305531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 78102378 78102749 78102647 Y NA NA NA NA NA NA ARSB 177161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 78203184 78203323 78203251 Y NA NA NA NA NA NA ARSB 76587 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 79863969 79864090 79864030 Y ANKRD34B NA NA NA NA NA RPL7P24 69818 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 80927026 80927304 80927299 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 118312 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 81045433 81045821 81045530 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 81081275 81081428 81081352 Y NA SSBP2 ZCCHC9,SSBP2,ATG10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP2 35659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP2 102021 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 81469981 81470152 81470091 Y NA NA NA NA NA NA RPS23 102244 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 81653126 81653457 81653257 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 80730 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 82224684 82224708 82224696 Y NA NA NA NA NA NA XRCC4 146609 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 82608517 82608916 82608727 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 156368 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 88031441 88031631 88031536 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 145514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 88101722 88102045 88101857 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 75100 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 88120689 88121105 88120942 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 56040 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 88125046 88125161 88125149 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 51984 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 88171456 88171902 88171752 Y MEF2C,MEF2C MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 5243 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 88550638 88550704 88550671 Y NA NA NA NA NA NA MEF2C 352716 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 90466120 90466308 90466241 Y ARRDC3 NA NA NA NA NA ARRDC3 210868 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 90514939 90515247 90515096 Y ARRDC3 NA ARRDC3,LOC100129716,GPR98 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARRDC3 161929 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 90686186 90686389 90686288 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 9010 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 92940140 92940350 92940245 Y NR2F1 NA NA NA NA NA NPM1P27 77023 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 93013083 93013343 93013254 Y NA NPM1P27 NA NA NA NA NPM1P27 4030 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 93638641 93638753 93638697 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 193237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 94412847 94413065 94412956 Y MCTP1 NA NA NA NA NA MCTP1 205214 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 94977624 94977816 94977698 Y NA RFESD NA NA NA NA RFESD 2642 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 95170246 95170624 95170377 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 13537 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 95178953 95179190 95179087 Y GLRX,ELL2 GLRX GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 22244 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 95414896 95415105 95415065 Y GLRX,ELL2 NA NA NA NA NA ELL2 119121 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 95633075 95633361 95633245 Y GLRX NA ELL2,RHOBTB3,MIR583,GLRX,C5orf27,CAST IMR90 Hi-C 24141950 CAST 225610 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 96902008 96902041 96902023 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2278B20.1 231264 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 100115654 100116503 100116220 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 120467 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 100225154 100225321 100225225 Y NA ST8SIA4 NA NA NA NA ST8SIA4 11649 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 102121468 102121525 102121497 Y PPIP5K2 PAM NA NA NA NA PAM 33783 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 106078046 106078054 106078050 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 1637745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 107795519 107795743 107795631 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 79720 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 109079577 109079706 109079642 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 56510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 111286612 111286649 111286638 Y NA NA NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 207574 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 112611486 112611688 112611586 Y NA NA NA NA NA NA YTHDC2 235692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 114970299 114970641 114970577 Y NA TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7 NA NA NA NA TMED7 3610 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 115205022 115205387 115205036 Y FEM1C AP3S1,ATG12 NA NA NA NA ATG12 29467 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 118399353 118399657 118399513 Y NA DMXL1,CTB-161M19.4 DMXL1 K562 ChIA-PET 22265404 CTB-161M19.4 4928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 118453384 118453586 118453485 Y NA CTB-161M19.4 NA NA NA NA CTB-161M19.4 48799 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 119079822 119079988 119079905 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 293684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 124047399 124047512 124047455 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1G3 1201606 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 124473209 124473536 124473320 Y NA NA NA NA NA NA ALDH7A1 1455574 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 125704201 125704675 125704554 Y C5orf48 NA NA NA NA NA ALDH7A1 224435 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 125782209 125782552 125782386 Y NA NA NA NA NA NA ALDH7A1 146558 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 126708435 126708706 126708571 Y NA NA NA NA NA NA PRRC1 142595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 130711215 130711396 130711236 Y NA NA NA NA NA NA CDC42SE2 132029 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 130718102 130718482 130718270 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 138916 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 130730635 130730890 130730763 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 151449 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 130872269 130872423 130872341 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA RAPGEF6 96506 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 131450160 131450175 131450167 Y NA NA IL3,ACSL6,CSF2,LOC553103,SLC22A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A4 177961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 131764930 131765294 131765112 Y NA C5orf56,AC116366.5 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 AC116366.5 4524 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 131802496 131802987 131802660 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.5,IRF1 NA NA NA NA IRF1 21503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 131981394 131981469 131981432 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 89861 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA AFF4 26161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 132368718 132369095 132368932 Y AFF4,ZCCHC10 ZCCHC10,HSPA4 ZCCHC10,HSPA4,AFF4 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZCCHC10 8422 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 133330374 133330645 133330542 Y NA C5orf15,VDAC1 C5orf15 IMR90 Hi-C 24141950 VDAC1 8179 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 55877 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA NA PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 93721 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 91943 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 134712896 134713181 134712989 Y SLC25A48,H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 20423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr5 134729023 134729250 134729122 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 4354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 134791969 134792408 134792068 Y H2AFY TIFAB H2AFY K562 ChIA-PET 22265404 TIFAB 5880 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 135171365 135171441 135171403 Y SLC25A48 NA NA NA NA NA SMAD5 295093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 136450174 136450503 136450334 Y NA NA NA NA NA NA KLHL3 619276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 137075973 137076263 137076118 Y NA KLHL3,HNRNPA0 NA NA NA NA KLHL3 6194 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 137795066 137795334 137795165 Y FAM13B,FAM53C,ETF1,EGR1 EGR1 NA NA NA NA EGR1 3845 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 138325344 138325620 138325482 Y NA NA NA NA NA NA MATR3 281821 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 138838499 138838633 138838566 Y TMEM173 TMEM173 NA NA NA NA TMEM173 21887 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 138927819 138928160 138927896 Y NA UBE2D2 SPATA24,DNAJC18,ECSCR,TMEM173,UBE2D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2D2 23803 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 139043719 139044204 139043873 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 18835 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 139049454 139050310 139049802 Y MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 24570 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr5 139076374 139076603 139076510 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 51490 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 139990904 139991173 139991064 Y HBEGF,ANKHD1,SRA1,APBB3,SLC35A4,CD14,CD14 SLC35A4,APBB3,CD14,TMCO6,IK,NDUFA2,MIR3655 NA NA NA NA APBB3 19567 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 NA NA NA NA NA DIAPH1 102731 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 140983787 140984197 140984031 Y PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 12425 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 141659754 141659954 141659854 Y NA NA SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP1 173684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 144549099 144549238 144549211 Y NA NA NA NA NA NA PRELID2 663694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 147201124 147201544 147201446 Y JAKMIP2 NA NA NA NA NA FBXO38 559954 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 147283651 147283737 147283694 Y NA NA NA NA NA NA FBXO38 477761 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 147572374 147572821 147572603 Y FBXO38 NA NA NA NA NA FBXO38 188677 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 148185507 148185821 148185751 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 18335 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 148508817 148508996 148508890 Y NA NA ADRB2,AFAP1L1,SH3TC2,ABLIM3,PCYOX1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTC-529P8.1 67937 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 148738164 148738422 148738235 Y PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L NA NA NA NA PCYOX1L 2594 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 148836415 148836621 148836572 Y NA MIR143 NA NA NA NA MIR143 29934 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 149063374 149063774 149063380 Y NA PPARGC1B CSF1R,PDE6A,PPARGC1B,ARHGEF37,HMGXB3,TIGD6,SLC26A2 IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1B 44087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 149267478 149267903 149267779 Y NA NA NA NA NA NA SLC26A2 70397 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 150142965 150143377 150143063 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 DCTN4,C5orf62 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 DCTN4 6294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr5 150144156 150144495 150144295 Y NA DCTN4 C5orf62,DCTN4,RBM22 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 DCTN4 7485 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 150159490 150160262 150159991 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 22819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.43967590065189 chr5 150267218 150267533 150267276 Y IRGM NA NA NA NA NA DCTN4 130547 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 150593680 150594043 150593885 Y DCTN4,DCTN4,TNIP1,SLC36A1,CCDC69 GM2A,CCDC69 NA NA NA NA GM2A 3969 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr5 150625199 150625215 150625207 Y NA GM2A,CCDC69 ANXA6,CCDC69 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC69 23493 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 153955712 153955778 153955745 Y NA NA NA NA NA NA SAP30L 132195 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 154274946 154275114 154275030 Y NA CNOT8,GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA CNOT8 39833 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 156471573 156471840 156471835 Y NA NA NA NA NA NA HAVCR2 96040 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 156503614 156503701 156503659 Y NA NA NA NA NA NA HAVCR2 64179 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 156524131 156524285 156524208 Y NIPAL4,ADAM19,HAVCR2 HAVCR2,ITK NA NA NA NA HAVCR2 43595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 156540141 156540423 156540353 Y NIPAL4,ADAM19,HAVCR2 HAVCR2,ITK,MED7 NA NA NA NA HAVCR2 27457 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 156814689 156815040 156814693 Y NA NA NA NA NA NA CYFIP2 123600 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 156883361 156883688 156883515 Y NA NA NA NA NA NA ADAM19 117095 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 157284724 157285025 157284835 Y NIPAL4,ADAM19 CLINT1 LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 541 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 158366953 158367057 158367005 Y NA NA NA NA NA NA RNF145 268004 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 158507046 158507207 158507202 Y NA NA NA NA NA NA RNF145 127854 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 158605991 158606398 158606265 Y NA RNF145 NA NA NA NA RNF145 28663 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 159434366 159434726 159434546 Y FABP6 TTC1 NA NA NA NA TTC1 246 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 159894087 159894191 159894139 Y NA SLU7,PTTG1,MIR146A NA NA NA NA MIR146A 812 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 159932805 159932943 159932874 Y NA MIR146A NA NA NA NA MIR146A 39530 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 162507124 162507145 162507136 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 355187 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 167011273 167011672 167011457 Y NA NA NA NA NA NA RARS 899778 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 167439777 167440090 167439882 Y NA NA NA NA NA NA RARS 471360 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 167741798 167742197 167741960 Y WWC1 NA NA NA NA NA RARS 169253 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 168279021 168279443 168279141 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 237704 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 169301637 169301901 169301769 Y NA NA NA NA NA NA DOCK2 239386 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 169703877 169704236 169704148 Y KCNMB1,LCP2 LCP2 NA NA NA NA LCP2 18995 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 169740418 169740772 169740553 Y LCP2,KCNMB1 LCP2 LCP2,KCNIP1 IMR90 Hi-C 24141950 LCP2 17187 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 171431879 171432256 171432181 Y UBTD2,STK10 FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 2 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 171432610 171432692 171432660 Y NA FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 733 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 171498342 171498743 171498483 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 66465 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 171560333 171560981 171560496 Y UBTD2,STK10 NA NA NA NA NA STK10 52409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 171600987 171601129 171601000 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 12261 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 171602273 171602685 171602548 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 10705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr5 171605314 171605550 171605494 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 7840 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 171606484 171606964 171606720 Y UBTD2,STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 6426 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr5 172200337 172200842 172200639 Y UBTD2,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 4139 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 173169045 173169768 173169685 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1 127382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 173205115 173205307 173205218 Y CPEB4 NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 107976 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 173909800 173909986 173909867 Y NA NA MIR4634,MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 596517 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 173987682 173987853 173987786 Y NA NA MIR4634,MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 674399 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 175116445 175116962 175116612 Y HRH2 HRH2 NA NA NA NA HRH2 33412 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 175118111 175118311 175118228 Y HRH2 HRH2 NA NA NA NA HRH2 35078 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 175960481 175960718 175960661 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2 RNF44 NA NA NA NA RNF44 2308 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 175962179 175962700 175962413 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2 RNF44 FAF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF44 326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 176187940 176187958 176187949 Y NA NA CDHR2,UNC5A,HK3 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN17 115552 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 176782864 176783054 176782988 Y NA MXD3,LMAN2,RGS14,GRK6 NA NA NA NA RGS14 26 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 177904382 177904800 177904603 Y NA NA NA NA NA NA COL23A1 110756 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 178052813 178053238 178053128 Y AGXT2L2,CLK4 COL23A1,CLK4 COL23A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLK4 2378 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 179476258 179476557 179476475 Y MAML1,LTC4S RNF130 NA NA NA NA RNF130 20561 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 179513863 179514025 179513944 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 16745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 179718006 179718384 179718320 Y NA MAPK9 NA NA NA NA MAPK9 907 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 293338 293822 293579 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 3708 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 298712 298948 298810 Y DUSP22,IRF4 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 9082 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 542839 543066 543064 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 148051 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 710742 711015 710979 Y HUS1B EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 19625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr6 2038182 2038509 2038345 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 205417 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 2081468 2081822 2081645 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 162104 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 2128026 2128199 2128099 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 115727 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 2377151 2377429 2377354 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 133169 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 2726588 2726793 2726728 Y SERPINB9,SERPINB1,RIPK1,NQO2 WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 36855 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 2818912 2819151 2819031 Y SERPINB1 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 21089 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 2866705 2867019 2866860 Y SERPINB9,RIPK1,SERPINB1 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 26465 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 2981739 2982093 2981882 Y SERPINB1,RIPK1,SERPINB9 SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2 SERPINB6 MCF7 ChIA-PET 22265404 NQO2 4128 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 30302 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 5157743 5158129 5157936 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 101043 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 5206171 5206360 5206265 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 52812 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 401666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 5865845 5866110 5865982 Y NA NA FARS2,F13A1,LY86-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 F13A1 453136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 6592115 6592710 6592545 Y LY86 LY86 NA NA NA NA LY86 5774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 6660040 6660205 6660116 Y NA NA NA NA NA NA LY86 73699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr6 6662049 6662264 6662157 Y NA NA NA NA NA NA LY86 75708 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 6707572 6707761 6707694 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 121231 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 6712780 6713068 6712936 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 126439 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 6713207 6713532 6713382 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 126866 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 6717376 6717439 6717378 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 131035 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr6 6718281 6718608 6718369 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,DSP,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 131940 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 6826283 6826384 6826333 Y NA NA NA NA NA NA LY86 239942 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 6858872 6859247 6858991 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 246583 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 6871234 6871442 6871386 Y LY86 NA NA NA NA NA RREB1 234388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr6 6885637 6886125 6885854 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 219705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 6886373 6886682 6886449 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 219148 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 6940785 6941121 6940953 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 164709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 6972865 6973138 6973002 Y NA NA LY86 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 132692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 7112981 7113125 7113000 Y RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 7151 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 7130548 7130794 7130662 Y RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 24718 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 7137966 7138068 7138020 Y RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 32136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 7202193 7202713 7202370 Y RIOK1,SSR1,RREB1,RREB1 NA NA NA NA NA RREB1 96363 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr6 9454371 9454420 9454396 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B3 1020577 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A NA NA NA NA NA GCNT2 82702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 10771427 10771996 10771700 Y ELOVL2,MAK TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA SYCP2L 25400 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11210069 11210603 11210460 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 169978 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11236748 11236970 11236788 Y TMEM170B,MAK,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 143611 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 11243333 11243432 11243383 Y MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 137149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11260945 11261346 11261257 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 119235 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11277838 11278167 11278081 Y TMEM170B,MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 102414 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11318376 11319012 11318732 Y TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 61569 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11321238 11321480 11321378 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 59101 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11414898 11415336 11414989 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NEDD9,C6orf228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 34317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11428073 11428442 11428380 Y NA NEDD9 NEDD9,C6orf228,SYCP2L,ELOVL2,ERVFRD-1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 47492 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11439294 11439659 11439465 Y TMEM170B,ERVFRD-1,NEDD9 NA NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1,ELOVL2,SYCP2L IMR90 Hi-C 24141950 NEDD9 58713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 11519890 11520089 11519970 Y TMEM170B,HIVEP1,NEDD9 TMEM170B NEDD9,SYCP2L,C6orf228,ELOVL2,LOC100506409,GCM2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 15849 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11607697 11608051 11607761 Y NA NA TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 71759 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 11828547 11828846 11828697 Y TMEM170B NA ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 178149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 12315136 12315383 12315260 Y NA EDN1 NA NA NA NA EDN1 26540 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 12370081 12370433 12370308 Y HIVEP1 NA NA NA NA NA EDN1 81485 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 12587436 12587655 12587553 Y NA NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 75094 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 13059086 13059210 13059117 Y PHACTR1 NA NA NA NA NA RNU1-11P 153078 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 13096654 13096703 13096662 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 115585 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 13107797 13107872 13107835 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 104416 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 13454706 13455038 13454979 Y RANBP9,TBC1D7,GFOD1,GFOD1 GFOD1 NA NA NA NA GFOD1 30856 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 13651430 13651585 13651505 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 37871 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 13671877 13672171 13672102 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1,CD83 RANBP9 NOL7,SIRT5 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 37625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 13845342 13845484 13845413 Y RNF182,RNF182,RNF182 NA NA NA NA NA RANBP9 135546 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 14295530 14295570 14295550 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 179658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 14517575 14517722 14517649 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 401703 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 14657070 14657479 14657115 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 541198 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr6 14661271 14661715 14661503 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 545399 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 14735052 14735658 14735282 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 508869 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 14792379 14792566 14792457 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 451961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 14885997 14886091 14886040 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 358436 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 14945973 14946248 14946214 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 298279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 14975849 14976030 14975884 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 268497 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 15066743 15067555 15067031 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 176972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 15299924 15300312 15299931 Y NA NA NA NA NA NA JARID2-AS1 53059 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 15365610 15365867 15365688 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA JARID2-AS1 118745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 15516223 15516554 15516389 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 144735 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 15542142 15542162 15542152 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 119127 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 15589107 15589675 15589446 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 71614 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 15616123 15616332 15616207 Y JARID2 DTNBP1 NA NA NA NA DTNBP1 44957 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 16481404 16481763 16481500 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 244593 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 16712557 16713382 16713252 Y ATXN1 ATXN1 NA NA NA NA ATXN1 46340 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 17614611 17614952 17614695 Y KIF13A,NUP153,FAM8A1 FAM8A1 NA NA NA NA FAM8A1 16025 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 18016545 18016825 18016604 Y NA KIF13A TPMT,NHLRC1 IMR90 Hi-C 24141950 KIF13A 30691 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 18350965 18351333 18351089 Y KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 15446 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 18400891 18401631 18401172 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 34112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 21028713 21029000 21028890 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 496025 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 21383430 21383704 21383606 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 208268 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr6 21667588 21667834 21667745 Y SOX4 NA NA NA NA NA SOX4 75616 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 21808482 21808727 21808539 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 216510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 21987708 21987959 21987863 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 395736 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 24584505 24584676 24584669 Y NA NA NA NA NA NA TDP2 80585 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 24834309 24834321 24834317 Y NA NA NA NA NA NA GMNN 61150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 24935264 24935625 24935445 Y TDP2 NA FAM65B,CMAHP IMR90 Hi-C 24141950 GMNN 162105 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 25006784 25007291 25007025 Y TDP2,C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 157502 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr6 25007534 25007864 25007632 Y TDP2,C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 156929 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 25027478 25027700 25027588 Y NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 137093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 25034556 25034972 25034914 Y C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 129821 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA CMAHP 70052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr6 25137169 25137503 25137225 Y C6orf62 CMAHP NA NA NA NA CMAHP 27290 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 4.31634967038411 chr6 26025834 26026125 26026038 Y BTN2A1,BTN2A1,TRIM38 HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 354 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 26034352 26034599 26034546 Y NA HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H2AB 2556 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr6 26232920 26233434 26233137 Y NA HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI NA NA NA NA HIST1H1D 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 26397110 26397374 26397265 Y NA BTN3A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN2A3P,BTN3A3 NA NA NA NA BTN3A1 3091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23,COX11P1 NA NA NA NA COX11P1 44475 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr6 28749781 28750084 28750010 Y NA NA NA NA NA NA TRIM27 139682 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 28834475 28834586 28834545 Y NA NA NA NA NA NA TRIM27 55180 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 36152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 30182160 30182533 30182417 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 2956 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 30755729 30756010 30755821 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,IER3,MDC1,DDR1,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 45398 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 30796195 30796565 30796398 Y HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1 IER3,FLOT1,DDR1,VARS2,GTF2H4,C6orf136,DHX16,C6orf15,PSORS1C1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDR1 45633 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 30845366 30845734 30845666 Y PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1,GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA DDR1 3168 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,C6orf25,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,C6orf25,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.56568016249122 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr6 32571766 32572024 32571886 Y NA HLA-DRB1 NA NA NA NA HLA-DRB1 16141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 32572305 32572687 32572408 Y GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1 HLA-DRB1 NA NA NA NA HLA-DRB1 16680 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 32577297 32577935 32577770 Y GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1 HLA-DRB1 NA NA NA NA HLA-DRB1 21672 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr6 32608259 32608402 32608344 Y GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1 HLA-DQB1 NA NA NA NA HLA-DQB1 25758 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 32952668 32952702 32952685 Y NA HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA NA NA NA NA BRD2-IT1 16659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 32996316 32996705 32996419 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,HLA-DOA HLA-DOA,HLA-DPB1,HLA-DPA1 HLA-DPB2,VPS52,HLA-DPB1 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DOA 20927 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 32997077 32997532 32997301 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA HLA-DOA,HLA-DPB1,HLA-DPA1 HLA-DPB2,VPS52,HLA-DPB1 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DOA 21688 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr6 33546480 33546561 33546538 Y LEMD2,B3GALT4,RGL2,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 461 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 33602402 33602476 33602439 Y NA ITPR3 IP6K3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR3 16260 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 33872168 33872571 33872419 Y PHF1,ZBTB9,LEMD2 LINC01016 NA NA NA NA LINC01016 9477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr6 33872922 33873175 33873050 Y PHF1 LINC01016 NA NA NA NA LINC01016 10231 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr6 34150537 34150894 34150814 Y HMGA1 CYCSP55 C6orf106,NUDT3,RPS10-NUDT3,PACSIN1,MNF1,ANKS1A,SPDEF,HMGA1,IP6K3,MLN,LEMD2,GRM4,UHRF1BP1,TAF11,SNRPC,C6orf1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYCSP55 34322 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 35152934 35153484 35153156 Y NA NA UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF76 71202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 35268720 35268850 35268792 Y TAF11,ZNF76,DEF6,PPARD ZNF76,DEF6,PPARD NA NA NA NA DEF6 5125 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 35311267 35311540 35311417 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD DEF6,PPARD NA NA NA NA PPARD 2932 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 36391024 36391283 36391227 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 17261 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr6 36547678 36548077 36547769 Y PI16,MTCH1 STK38,SRSF3 STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF3 12068 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 36660058 36660307 36660143 Y FGD2,PXT1,STK38,SRSF3 LAP3P2,CDKN1A NA NA NA NA CDKN1A 17753 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 36755507 36755765 36755636 Y NA NA NA NA NA NA C6orf89 81881 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 36997320 36997527 36997354 Y STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,C6orf89,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FGD2 MTCH1,FGD2 NA NA NA NA FGD2 25898 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 37016531 37017062 37016596 Y NA FGD2 NA NA NA NA FGD2 45109 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 37017809 37018367 37018074 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 FGD2 NA NA NA NA FGD2 46387 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 37051169 37051555 37051360 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FGD2 NA CPNE5,PIM1,C6orf89,PPIL1,FGD2,TBC1D22B,MTCH1,TMEM217 IMR90 Hi-C 24141950 FGD2 79747 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr6 37150975 37151397 37151210 Y TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1 PIM1 NA NA NA NA PIM1 14996 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 37154148 37154217 37154171 Y TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1 PIM1 NA NA NA NA PIM1 18169 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 37159773 37160042 37159866 Y TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1 PIM1 NA NA NA NA PIM1 23794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 37190361 37190574 37190538 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 32974 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 37212541 37212901 37212835 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 10647 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 37227057 37227393 37227190 Y FTSJD2,TMEM217,TBC1D22B,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TMEM217 3126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 37469900 37470015 37469935 Y NA CCDC167 NA NA NA NA CCDC167 4202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 38229881 38230014 38229948 Y NA NA NA NA NA NA BTBD9 375910 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 38450593 38450822 38450666 Y BTBD9 NA NA NA NA NA BTBD9 155102 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 39122561 39122673 39122617 Y NA SAYSD1 GLP1R,DNAH8 IMR90 Hi-C 24141950 SAYSD1 41596 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 40904550 40904902 40904649 Y UNC5CL NA APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL IMR90 Hi-C 24141950 NFYA 133782 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 41239404 41240112 41239982 Y NFYA,TREML1,TFEB,TREML2,TREML4,TREM1 TREM1 NA NA NA NA TREM1 12345 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 41286601 41286824 41286755 Y NFYA,TFEB,TREML4,TREM1 TREM1,NCR2 C6orf130 K562 ChIA-PET 22265404 NCR2 14569 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 41907242 41907431 41907365 Y TAF8,TFEB,CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20316 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 42255073 42255501 42255249 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 71470 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 42413186 42413554 42413522 Y NA TRERF1 GUCA1B,MRPS10 IMR90 Hi-C 24141950 TRERF1 4235 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 42537614 42537689 42537648 Y TRERF1,CNPY3,UBR2 UBR2 NA NA NA NA UBR2 7814 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 42688111 42688359 42688261 Y PRPH2 TBCC NA NA NA NA TBCC 24199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 42735698 42735757 42735728 Y NA TBCC TBCC,KIAA0240,GUCA1A,PRPH2,UBR2,ATP6V0CP3,RPL7L1,C6orf226,CNPY3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 23140 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 43636886 43637091 43636988 Y NA GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A NA NA NA NA MRPS18A 16437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 43767552 43768173 43767868 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 31631 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 43804281 43804391 43804327 Y TCTE1,CAPN11,ABCC10,C6orf154,MAD2L1BP,RSPH9 NA VEGFA,RSPH9,MRPS18A,LOC100132354,MAD2L1BP,POLH,GTPBP2,TMEM63B,C6orf223,CAPN11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VEGFA 68360 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 43945734 43945924 43945799 Y NFKBIE NA LOC100132354,POLH,MAD2L1BP,RSPH9,GTPBP2,VEGFA,C6orf223,MRPS18A IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 146727 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 43974450 43974566 43974521 Y NA NA NA NA NA NA TMEM63B 118085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 44458019 44458222 44458132 Y NA NA SUPT3H,RUNX2,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 104757 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 44532734 44533132 44533068 Y NA NA CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 179472 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 44887030 44887214 44887174 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 456476 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 44893195 44893513 44893382 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 450177 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 41388 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 45322429 45322774 45322605 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 20916 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 45330194 45330521 45330358 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 13169 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 45428920 45429031 45428964 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 85230 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 45665421 45665594 45665503 Y NA NA RUNX2,CDC5L,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 321731 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 45912284 45912306 45912296 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 568594 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 46021255 46021630 46021408 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 677565 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 46259169 46259392 46259281 Y ENPP4,SLC25A27 NA NA NA NA NA SUPT3H 915479 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 46304950 46305239 46305235 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 961260 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 46685904 46686172 46686038 Y PLA2G7,PLA2G7 NA NA NA NA NA CD2AP 757353 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 46765034 46765418 46765226 Y NA NA NA NA NA NA CD2AP 678107 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 46784396 46784595 46784543 Y NA NA NA NA NA NA CD2AP 658930 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 49138743 49138828 49138786 Y NA NA NA NA NA NA MUT 290076 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 49302208 49302375 49302292 Y NA NA NA NA NA NA MUT 126529 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 51275260 51275721 51275608 Y NA NA NA NA NA NA RPS17P5 451885 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 51642474 51642504 51642490 Y NA NA NA NA NA NA MCM3 505175 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 52241741 52241853 52241800 Y NA PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA PAQR8 17522 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 53174339 53174666 53174484 Y FBXO9,ELOVL5 ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 37281 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 53195071 53195341 53195324 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 16606 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 53925678 53925800 53925739 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 268383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 54904951 54905261 54905001 Y NA NA MLIP IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 1247656 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 55228034 55228050 55228042 Y HMGCLL1,GFRAL NA NA NA NA NA LRRC1 1570739 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 55905205 55905398 55905302 Y NA NA NA NA NA NA BEND6 912375 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 56315031 56315399 56315215 Y NA NA NA NA NA NA BEND6 502374 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 57046105 57046302 57046204 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 10981 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 57251417 57251660 57251585 Y KIAA1586 NA NA NA NA NA PRIM2 73814 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 57288314 57288720 57288442 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 110711 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 57389697 57390070 57389732 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 212094 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 58773660 58773770 58773718 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 519091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.94101491643767 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr6 63124224 63124506 63124365 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS2 130092 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 64062508 64062954 64062798 Y NA NA PTP4A1,EYS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FKBP1C 143157 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 64629183 64629230 64629207 Y NA NA NA NA NA NA RP11-59D5__B.2 114454 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 65227331 65227644 65227620 Y NA NA NA NA NA NA RP11-59D5__B.2 712602 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 69896068 69896326 69896076 Y NA NA NA NA NA NA LMBRD1 608677 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 71548622 71548700 71548661 Y FAM135A NA NA NA NA NA SMAP1 173143 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 72034617 72034728 72034673 Y NA OGFRL1 NA NA NA NA OGFRL1 38111 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 72056766 72057142 72057043 Y OGFRL1 NA OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 60260 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 74295823 74296227 74295840 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 64303 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 74432369 74432753 74432573 Y MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109 CD109 NA NA NA NA CD109 28861 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 75977936 75978331 75978062 Y NA COX7A2,TMEM30A NA NA NA NA TMEM30A 14353 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 79597447 79597572 79597510 Y NA IRAK1BP1 NA NA NA NA IRAK1BP1 22258 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 80246020 80246303 80246162 Y NA NA NA NA NA NA DBIP1 101136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 81044945 81045591 81045323 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 230581 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 81434803 81435240 81434962 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 620439 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 82422345 82422435 82422390 Y NA FAM46A NA NA NA NA FAM46A 38056 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 82631547 82631830 82631690 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 171056 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 83449136 83449335 83449235 Y NA NA UBE3D IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 326050 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 83793136 83793338 83793237 Y PRSS35,DOPEY1 DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 17751 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 83935269 83935637 83935453 Y NA RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA PGM3 33614 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 84877511 84877669 84877594 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 57684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 85087981 85088261 85088229 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 152628 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 85258714 85258725 85258720 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 323361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 88183289 88183642 88183572 Y NA SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 4948 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 88401154 88401337 88401278 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 8590 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 89084006 89084236 89084119 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 587112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 89744158 89744669 89744587 Y UBE2J1,RRAGD,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PNRC1 43801 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 90094957 90095218 90095193 Y NA UBE2J1,RRAGD NA NA NA NA RRAGD 24771 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 90778063 90778292 90778178 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 240450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 90878882 90879095 90878991 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 341269 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 93036003 93036032 93036018 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 1741239 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 2221342 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 96546026 96546326 96546099 Y NA NA NA NA NA NA UFL1 421145 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 99382979 99383150 99383065 Y NA FBXL4 NA NA NA NA FBXL4 10699 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 100012296 100012415 100012356 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 2434 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 100676865 100677032 100676949 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-121G13.3 299120 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 104975114 104975455 104975382 Y NA NA NA NA NA NA HACE1 330339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 105743987 105744339 105744163 Y NA NA NA NA NA NA PREP 104620 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 105906571 105906609 105906590 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 57612 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 106139083 106139418 106139221 Y PRDM1 NA ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 290124 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 106331932 106332259 106332081 Y PRDM1 NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 199936 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 91524 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 106442778 106443178 106442990 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 89017 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr6 106537985 106538349 106538117 Y PRDM1,PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 5790 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 106582399 106582514 106582457 Y AIM1 NA NA NA NA NA PRDM1 50204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 107195885 107196112 107195999 Y NA NA NA NA NA NA QRSL1 120432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 108574394 108574619 108574507 Y NA SNX3,LACE1 NA NA NA NA SNX3 5845 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 109158885 109159026 109158956 Y NA ARMC2 NR2E1,FOXO3,LINC00222,ARMC2,SESN1,LACE1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARMC2 8593 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 109162509 109162938 109162684 Y NA ARMC2 FOXO3,ARMC2,SESN1 IMR90 Hi-C 24141950 ARMC2 4681 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 109288163 109288636 109288487 Y FOXO3,SMPD2,MICAL1 ARMC2-AS1 NA NA NA NA ARMC2-AS1 44857 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 109558807 109559007 109558956 Y SMPD2,MICAL1,CD164 NA CD164,CCDC162P K562 ChIA-PET 22265404 CD164 142755 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 109602805 109602853 109602823 Y NA NA CCDC162P IMR90 Hi-C 24141950 CD164 98909 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 109625470 109626069 109625736 Y NA NA NA NA NA NA CD164 75693 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 110093256 110093531 110093346 Y CDC40,SMPD2,MICAL1,AKD1,FIG4 NA NA NA NA NA FIG4 82757 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 110150540 110150563 110150552 Y NA NA NA NA NA NA FIG4 140041 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 110502951 110503352 110503102 Y FIG4,CDC40 WASF1,CDC40 NA NA NA NA CDC40 3607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 111049772 111049981 111049963 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 85180 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 111180623 111180918 111180752 Y CDK19,SLC16A10,AMD1,AMD1 CDK19,AMD1 CDK19,AMD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMD1 13055 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 111265873 111266130 111266017 Y SLC16A10,AMD1,AMD1 GTF3C6,RPF2 CDK19,AMD1,SLC22A16 IMR90 Hi-C 24141950 GTF3C6 11633 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 111441165 111441538 111441348 Y AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L SLC16A10 NA NA NA NA SLC16A10 34384 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 111551650 111551849 111551726 Y NA KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 26702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 111949677 111949980 111949829 Y REV3L TRAF3IP2 TRAF3IP2,REV3L,TRAF3IP2-AS1,FYN MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRAF3IP2 24196 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 112097804 112098263 112098017 Y NA NA NA NA NA NA FYN 94392 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 112337513 112337988 112337740 Y TRAF3IP2,FYN NA FYN,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 68744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 112364338 112364486 112364397 Y TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 42246 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 112619249 112619579 112619380 Y LAMA4 NA LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 212517 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 112629632 112629958 112629797 Y NA NA LAMA4,FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 222900 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 113974523 113974815 113974721 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 201726 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 114131008 114131408 114131371 Y NA MARCKS NA NA NA NA MARCKS 45133 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 114603610 114603654 114603632 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 273138 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 116713690 116714094 116713959 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA FAM26F 66439 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 116767554 116767785 116767590 Y ZUFSP,DSE,FAM26F FAM26F NA NA NA NA FAM26F 12748 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 117003694 117003845 117003770 Y TSPYL4,TSPYL1,DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA KPNA5 3344 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 117720321 117720599 117720460 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD1 52381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 119090277 119090473 119090377 Y C6orf204,MCM9 NA CEP85L IMR90 Hi-C 24141950 CEP85L 61039 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 121399720 121399938 121399829 Y NA NA NA NA NA NA RP1-276J11.2 300680 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 121869277 121869599 121869440 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-276J11.2 168659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 125952344 125952361 125952353 Y NA NA NA NA NA NA NCOA7 147946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 126265741 126265870 126265827 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 10057 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 127618608 127618885 127618797 Y NA RNF146,ECHDC1 NA NA NA NA RNF146 32853 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 127805440 127805627 127805534 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 50659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 127892310 127892704 127892511 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 137529 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 128080284 128080680 128080614 Y THEMIS NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 325503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 128331151 128331455 128331303 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 576370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 128617083 128617221 128617152 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 862302 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 128816273 128816626 128816620 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 1061492 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 129822485 129822770 129822701 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP18 206600 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 129989152 129989478 129989315 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 39892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 130022144 130022554 130022402 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 6816 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 130151547 130151808 130151689 Y C6orf191 NA NA NA NA NA ARHGAP18 122177 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 133134288 133134908 133134317 Y NA RPS12 NA NA NA NA SNORD101 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 134745374 134745525 134745506 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 108124 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 134845573 134845660 134845628 Y NA NA NA NA NA NA RP11-557H15.4 133314 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 134863333 134863348 134863341 Y NA NA LOC154092,SGK1,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-557H15.4 115626 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 134971404 134971740 134971658 Y NA RP11-557H15.4 SGK1,HMGA1P7,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-557H15.4 7234 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 134987118 134987554 134987416 Y SGK1,SGK1 RP11-557H15.4 SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-557H15.4 8144 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 135033530 135033783 135033658 Y NA NA SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-557H15.4 54556 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 135044677 135044952 135044807 Y NA NA SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-557H15.4 65703 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 135352829 135352991 135352910 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 69203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr6 135647254 135647460 135647355 Y MYB,AHI1 NA NA NA NA NA MYB 146801 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 136133495 136133602 136133548 Y NA PDE7B PDE7B,LINC00271 IMR90 Hi-C 24141950 PDE7B 37232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 136434966 136435173 136435049 Y BCLAF1 NA NA NA NA NA BCLAF1 173816 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 136691586 136691742 136691665 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 82597 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 136702762 136702864 136702842 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 93773 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 136729350 136729610 136729525 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 120361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 136813959 136814231 136814138 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA MAP7 55726 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 136965409 136965459 136965418 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 95452 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 137109342 137109643 137109396 Y IFNGR1,BCLAF1,MAP3K5 MAP3K5,PEX7 NA NA NA NA MAP3K5 2013 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 137438439 137438749 137438739 Y NA NA NA NA NA NA IFNGR1 99837 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 137469913 137470185 137470040 Y IFNGR1 NA NA NA NA NA IFNGR1 68401 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 137543604 137543841 137543754 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 5018 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 137545116 137545441 137545236 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 6530 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 137612569 137612863 137612741 Y NA NA IL22RA2 IMR90 Hi-C 24141950 IFNGR1 73983 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 138213585 138213859 138213696 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 27234 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 138232915 138233113 138232947 Y NA TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 46564 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 138291437 138291772 138291605 Y PBOV1 NA NA NA NA NA TNFAIP3 105086 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 138523816 138523995 138523837 Y NA NA NA NA NA NA HEBP2 198673 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 138914049 138914108 138914056 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 NHSL1 97600 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 139300314 139300341 139300327 Y NHSL1 REPS1 NA NA NA NA REPS1 7057 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 139351818 139352158 139351992 Y CCDC28A,C6orf115,HECA REPS1 NA NA NA NA REPS1 44420 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 139434485 139434651 139434546 Y REPS1,HECA HECA ECT2L,TXLNB,REPS1 IMR90 Hi-C 24141950 HECA 19598 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 139611795 139612307 139611990 Y REPS1,C6orf115,HECA TXLNB NA NA NA NA TXLNB 519 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 139812084 139812114 139812099 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 118327 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 139854911 139854985 139854931 Y HECA,CITED2,CITED2,CITED2 NA LOC100132735,CITED2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 161154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 140893217 140893627 140893519 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 1199460 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 140984884 140985153 140985121 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1291127 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr6 141765105 141765268 141765171 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 701099 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 141884052 141884255 141884131 Y NA NA CITED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 VTA1 582112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 142091291 142091499 142091406 Y VTA1 NA NA NA NA NA VTA1 374868 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 143117753 143118019 143117854 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 146319 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 143134397 143134731 143134564 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 129607 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 143234736 143235083 143235000 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 29255 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 143329201 143329459 143329330 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 50174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 143770817 143770943 143770879 Y ADAT2 ADAT2,PEX3 NA NA NA NA PEX3 873 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 144279957 144280354 144280096 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 103381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 144283965 144283971 144283968 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 99764 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 144284201 144284585 144284512 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 99150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 144376148 144376476 144376440 Y NA PLAGL1,SF3B5 NA NA NA NA PLAGL1 7259 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr6 144384858 144385125 144384924 Y NA PLAGL1,SF3B5 NA NA NA NA PLAGL1 1123 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 144474457 144475387 144474631 Y PLAGL1,STX11 STX11,TPT1P4 NA NA NA NA STX11 4794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 144537313 144537754 144537668 Y NA TPT1P4 STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPT1P4 17211 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 147197725 147198235 147197942 Y STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 325326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 147202417 147202548 147202496 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5 321013 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 147217441 147217852 147217780 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5 305709 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA YAP1P1 81824 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr6 148834877 148835159 148834957 Y UST NA NA NA NA NA UST 231305 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 149435248 149435596 149435422 Y NA NA ZC3H12D,TAB2 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-111D6.3 101466 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 149571086 149571460 149571281 Y NA RP1-111D6.3,TAB2 TAB2,PPIL4 IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 33309 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 149657882 149658028 149657899 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 120105 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 149803455 149803649 149803509 Y LATS1,KATNA1,TAB2,PPIL4,ZC3H12D ZC3H12D NA NA NA NA ZC3H12D 548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 150958103 150958422 150958105 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA MTHFD1L 226263 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 151037354 151037386 151037370 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA MTHFD1L 147299 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 151634197 151634634 151634284 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB2 76049 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 151647622 151647708 151647665 Y NA NA ZBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB2 62975 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 152497154 152497169 152497162 Y NA NA NA NA NA NA MYCT1 519861 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 154470248 154470609 154470429 Y NA NA NA NA NA NA IPCEF1 205317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 154623242 154623554 154623472 Y NA NA NA NA NA NA IPCEF1 52372 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 154676071 154676546 154676403 Y NA IPCEF1 NA NA NA NA IPCEF1 145 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.94101491643767 chr6 155179611 155179904 155179758 Y NA NA TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 SCAF8 127152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 155545212 155545590 155545426 Y SCAF8 RP11-477D19.2 NA NA NA NA RP11-477D19.2 30268 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 157695432 157695688 157695582 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 46945 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 157978590 157978748 157978669 Y SYNJ2,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ZDHHC14 178425 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 158525965 158526121 158526043 Y NA NA NA NA NA NA SERAC1 61191 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 158784092 158784407 158784250 Y NA NA NA NA NA NA GTF2H5 196708 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 159088035 159088513 159088361 Y TAGAP,SYTL3 DYNLT1,SYTL3 NA NA NA NA SYTL3 18989 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 159171374 159171393 159171384 Y NA NA NA NA NA NA EZR 67051 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 159477039 159477499 159477296 Y TAGAP TAGAP TAGAP IMR90 Hi-C 24141950 TAGAP 12855 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 159483193 159483967 159483477 Y DYNLT1,SYTL3,TAGAP TAGAP NA NA NA NA TAGAP 19009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 159525207 159525384 159525309 Y EZR,EZR,TAGAP NA TAGAP,RSPH3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAGAP 61023 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 159542385 159542836 159542696 Y NA NA NA NA NA NA TAGAP 78201 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 160837218 160837569 160837394 Y NA NA NA NA NA NA IGF2R 449087 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 161607618 161607817 161607715 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 85276 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr6 161647412 161647643 161647524 Y MAP3K4,AGPAT4 AGPAT4 NA NA NA NA AGPAT4 45450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.25200852367867 chr6 163881453 163881850 163881463 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA QKI 48421 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr6 166672303 166672771 166672615 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 81308 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 167411692 167411848 167411735 Y RNASET2,GPR31 RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 1022 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 167468441 167468774 167468681 Y NA NA NA NA NA NA CCR6 54521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 167566823 167567425 167567137 Y RNASET2,GPR31 CCR6 NA NA NA NA CCR6 43528 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 168100191 168100503 168100332 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 125099 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 168356861 168357132 168356996 Y NA KIF25-AS1 NA NA NA NA KIF25-AS1 38625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 790893 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 170020305 170020690 170020593 Y NA NA NA NA NA NA WDR27 79469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr6 170403251 170403438 170403365 Y TCTE3,FAM120B NA NA NA NA NA FAM120B 194353 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr7 90161 90450 90245 Y FAM20C NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 57147 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 119028 119765 119436 Y NA AC093627.10 FAM20C IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 27832 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 875702 875833 875757 Y SUN1,SUN1 SUN1,GET4 NA NA NA NA SUN1 22174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 949613 949923 949864 Y NA GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 35424 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 968255 968622 968448 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 24421 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr7 1066965 1067028 1066969 Y NA GPR146 NA NA NA NA GPR146 15184 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 1101900 1102191 1102037 Y ADAP1,COX19,ZFAND2A,MAFK GPR146 NA NA NA NA GPR146 19688 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 1274384 1274791 1274446 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND2A 75989 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 1546091 1546367 1546260 Y NA MICALL2,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2602 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 1553000 1553189 1553120 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 9511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 1883097 1883273 1883258 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 103170 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 1959743 1960348 1960159 Y SNX8,MAFK NA NA NA NA NA AC074389.9 179816 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 1965570 1966023 1965918 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 185643 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 1978042 1978502 1978293 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 198115 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 1983409 1983820 1983695 Y SNX8 NA NA NA NA NA AC074389.9 203482 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 2058424 2058871 2058630 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 212007 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 2101889 2102279 2102085 Y ELFN1 NA NA NA NA NA MAD1L1 168599 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 2124507 2124641 2124577 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 146237 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 2139021 2139385 2139174 Y IQCE NA NA NA NA NA MAD1L1 131493 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 2276986 2277172 2277058 Y LFNG,SNX8 MAD1L1,FTSJ2,NUDT1 NA NA NA NA FTSJ2 2668 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 2366728 2366801 2366785 Y SNX8,LFNG EIF3B,SNX8 FTSJ2,NUDT1,SNX8,EIF3B,KIAA1908,MAD1L1,MAFK,TFAMP1,PSMG3,TMEM184A,ELFN1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3B 24920 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 2738537 2739051 2738765 Y LFNG,CARD11 AMZ1 GNA12 IMR90 Hi-C 24141950 AMZ1 21381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 2773642 2774144 2773933 Y SNX8,LFNG NA NA NA NA NA AMZ1 56486 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 2812534 2812892 2812775 Y SNX8,LFNG,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 60363 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 3018099 3018595 3018309 Y NA NA NA NA NA NA CARD11 62984 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 3603136 3603457 3603297 Y SDK1 NA NA NA NA NA CARD11 521557 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 5571967 5572766 5572739 Y RBAK,RBAK FBXL18,ACTB NA NA NA NA FBXL18 20538 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr7 8215934 8216623 8216095 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA AC007009.1 83240 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 11827353 11827497 11827425 Y THSD7A NA NA NA NA NA TMEM106B 421370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 13512547 13512927 13512737 Y NA NA DGKB IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P21 596078 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 17081003 17081300 17081099 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AGR2 209946 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 18442328 18442677 18442600 Y NA NA NA NA NA NA SNX13 464204 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 20346814 20347223 20346902 Y NA AC099342.1 TMEM196,MACC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC099342.1 12483 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 22258487 22259062 22258816 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 274785 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 22386592 22386681 22386637 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 162937 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 22861021 22861212 22861181 Y NA TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 551 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2 NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 24803089 24803421 24803235 Y DFNA5,DFNA5 NA DFNA5,OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL3 215832 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 26477083 26477150 26477118 Y CBX3 AC004540.5 NA NA NA NA AC004540.5 40870 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 26589150 26589521 26589235 Y SNX10 KIAA0087 LOC441204,KIAA0087 IMR90 Hi-C 24141950 AC004947.2 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr7 27176174 27176251 27176224 Y HOXA3,HOXA3,HOXA4,HOXA5 HOTAIRM1,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,HOXA10 NA NA NA NA HOXA3 13949 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 27206716 27206932 27206874 Y HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10 HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,HOXA10 NA NA NA NA HOXA10-AS 478 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 27253282 27253417 27253378 Y NA HOXA10-AS,HOXA9,HOXA10 NA NA NA NA HOXA10 35402 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 27923177 27923290 27923234 Y NA NA NA NA NA NA TAX1BP1 146227 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 28549355 28549638 28549419 Y NA NA NA NA NA NA CREB5 212415 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 29042480 29042583 29042532 Y NA NA NA NA NA NA CHN2 117307 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 29325062 29325307 29325213 Y CHN2 NA NA NA NA NA CHN2 165172 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 29486224 29486601 29486413 Y CHN2 NA NA NA NA NA CHN2 326334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 29995785 29995993 29995963 Y NA AC007285.6,SCRN1 NA NA NA NA AC007285.6 30223 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 30203047 30203422 30203138 Y NA NA NA NA NA NA ZNRF2 118501 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 30222465 30222780 30222592 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 99143 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 30265497 30265992 30265714 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 55931 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 30505141 30505406 30505161 Y NA NOD1 NA NA NA NA NOD1 10994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 31985831 31986192 31986012 Y PDE1C,PDE1C,PDE1C NA NA NA NA NA LSM5 546703 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 32264519 32264896 32264708 Y PDE1C NA NA NA NA NA LSM5 267999 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 32337399 32337512 32337422 Y PDE1C NA NA NA NA NA LSM5 195383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 32551548 32551619 32551584 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 18510 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 32944853 32945232 32945065 Y KBTBD2 KBTBD2,RP9P,FKBP9 NA NA NA NA KBTBD2 13110 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 35825022 35825249 35825115 Y SEPT7 AC007551.3,SEPT7 NA NA NA NA AC007551.3 12977 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 36230425 36230774 36230535 Y HERPUD2,EEPD1 EEPD1 NA NA NA NA EEPD1 39667 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 36301055 36301385 36301112 Y AOAH,SEPT7,EEPD1 NA NA NA NA NA EEPD1 110297 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 36771570 36771751 36771708 Y AOAH AOAH NA NA NA NA AOAH 9416 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 36998037 36998382 36998290 Y NA NA NA NA NA NA NPM1P18 141473 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 37105106 37105894 37105654 Y AOAH,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA NPM1P18 248542 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 37321463 37321896 37321681 Y GPR141,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 164956 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 37394321 37394728 37394476 Y GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 92124 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 37429930 37430114 37430020 Y GPR141 NA NA NA NA NA ELMO1 56738 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 37729641 37730111 37730020 Y GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1 GPR141,EPDR1 NA NA NA NA EPDR1 8195 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 38272460 38272983 38272698 Y TARP TRGJP1 NA NA NA NA TRGJP1 40936 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 38285257 38285450 38285342 Y TARP TRGJP1 NA NA NA NA TRGJP1 28469 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 38349304 38349469 38349333 Y TARP TRGJP1,AC006033.22,TRGV9,TRGV3 LOC100506776 IMR90 Hi-C 24141950 AC006033.22 320 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 38371416 38371642 38371578 Y STARD3NL,TARP AC006033.22,TRGV9,TRGV3 NA NA NA NA TRGV9 14954 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 38980085 38980104 38980095 Y NA VPS41 NA NA NA NA VPS41 10091 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 39629281 39629774 39629554 Y RALA YAE1D1,RALA NA NA NA NA YAE1D1 25306 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 39661364 39661771 39661496 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 282 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 41849167 41849509 41849273 Y INHBA NA LOC285954,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 108461 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 41964397 41964735 41964538 Y INHBA NA C7orf10,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 223691 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 42118085 42118260 42118176 Y NA NA NA NA NA NA INHBA 377379 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr7 43612098 43612408 43612297 Y DBNL STK17A NA NA NA NA STK17A 7949 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 43625905 43626316 43625996 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 5548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 43783185 43783244 43783215 Y NA BLVRA C7orf44,BLVRA IMR90 Hi-C 24141950 BLVRA 13035 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 44954682 44954978 44954822 Y DDX56,OGDH,ZMIZ2,MYO1G,CCM2,PURB PURB OGDH,H2AFV,NACAD,PURB,TMED4,DDX56,MYO1G,SNHG15 IMR90 Hi-C 24141950 PURB 31722 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr7 45633722 45633912 45633893 Y ADCY1 NA NA NA NA NA SEPT7P2 172705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 46708141 46708157 46708149 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 901524 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 47258454 47258947 47258703 Y NA NA IGFBP1,IGFBP3,TNS3,C7orf69,PKD1L1 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 361209 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 47366502 47366627 47366552 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 253529 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr7 47536985 47537239 47537063 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 82917 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 48031393 48031616 48031481 Y HUS1 HUS1,C7orf57 HUS1 K562 ChIA-PET 22265404 HUS1 14215 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 50321209 50321522 50321293 Y NA IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 20198 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 50350065 50350197 50350095 Y IKZF1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 8345 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 50424101 50424707 50424349 Y IKZF1 NA NA NA NA NA IKZF1 82381 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 50427753 50428088 50427922 Y NA NA NA NA NA NA IKZF1 86033 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 50431442 50431665 50431622 Y IKZF1 NA NA NA NA NA FIGNL1 84423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 50461623 50461903 50461710 Y FIGNL1,IKZF1 NA NA NA NA NA FIGNL1 54185 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 50695565 50695835 50695829 Y NA NA NA NA NA NA GRB10 163324 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 53130490 53130791 53130640 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-14P 300960 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 53557235 53557239 53557237 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-14P 125484 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 55253994 55254266 55254079 Y SEC61G NA NA NA NA NA LANCL2 176875 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 55506510 55507071 55506539 Y NA NA NA NA NA NA LANCL2 75369 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 56243524 56243790 56243559 Y LOC389493 NA NA NA NA NA CHCHD2 71255 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-73B2.6 1414954 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr7 61970082 61970606 61970553 Y NA NA NA NA NA NA RP11-73B2.6 1414078 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.94101491643767 chr7 65613460 65613645 65613556 Y ASL,ASL CRCP NA NA NA NA CRCP 35869 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 66056218 66056609 66056384 Y NA KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 35259 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 69308115 69308415 69308239 Y AUTS2,AUTS2 NA NA NA NA NA AUTS2 246210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 70206735 70207047 70206891 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1144830 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 71336027 71336353 71336220 Y CALN1 NA NA NA NA NA CALN1 573783 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 72939749 72940060 72940006 Y BAZ1B BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 5141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr7 73512377 73512557 73512465 Y NA LIMK1 NA NA NA NA LIMK1 17114 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 73625323 73625613 73625399 Y LIMK1,LAT2 EIF4H,LAT2,RFC2 NA NA NA NA LAT2 13341 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr7 73641053 73641366 73641100 Y LIMK1,LAT2 LAT2,RFC2 NA NA NA NA RFC2 25408 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 73702546 73702842 73702658 Y NA RFC2,CLIP2 NA NA NA NA CLIP2 741 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.378012785518 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 75701168 75701283 75701226 Y NA STYXL1,MDH2 NA NA NA NA MDH2 25799 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 75793189 75793404 75793365 Y NA NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 117820 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 75922960 75923105 75923022 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 6756 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 75993529 75993613 75993570 Y POR YWHAG,ZP3 YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7181 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 75993825 75994303 75994024 Y NA YWHAG,ZP3 YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 77028776 77029116 77028943 Y NA NA NA NA NA NA PTPN12 135476 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 77201219 77201434 77201295 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 36627 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr7 78207984 78208362 78208197 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 781862 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 78373810 78373889 78373850 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 947688 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 78412122 78412354 78412238 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 986000 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 80550378 80550824 80550614 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 703 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 80840847 80841237 80841156 Y SEMA3C NA NA NA NA NA SEMA3C 291172 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 82224524 82224592 82224558 Y NA NA CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 1674849 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 82596075 82596467 82596271 Y NA NA NA NA NA NA AC074183.4 1971094 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 85711087 85711321 85711204 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 975694 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 86275254 86275414 86275320 Y KIAA1324L,KIAA1324L,GRM3 NA NA NA NA NA KIAA1324L 411601 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 86283403 86283799 86283516 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 403216 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 89975005 89975165 89975035 Y NA GTPBP10,CLDN12 NA NA NA NA GTPBP10 12468 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 90600966 90601241 90601095 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 290542 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 92340516 92340848 92340839 Y CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 122808 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 92373404 92373742 92373580 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 90055 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 92392967 92393205 92393086 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9,CDK6,CDK6 NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 AC002454.1 70592 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 92412911 92413100 92413006 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 50697 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 93426376 93426400 93426388 Y NA NA NA NA NA NA GNG11 122611 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 93806058 93806399 93806215 Y NA NA GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 174364 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 95179507 95179842 95179679 Y DYNC1I1 NA NA NA NA NA PON2 116997 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 95320009 95320109 95320059 Y PON1 NA ASB4 IMR90 Hi-C 24141950 PON2 257499 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 98557558 98557720 98557639 Y KPNA7 NA NA NA NA NA MIR3609 80285 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 98907896 98908116 98908033 Y ZKSCAN5,LOC100289187 ARPC1A ARPC1A IMR90 Hi-C 24141950 ARPC1A 13405 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 98978423 98978863 98978747 Y SMURF1,ZNF655,ZNF655,ZNF498,ZNF394,ZKSCAN5 ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 8551 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 99678619 99678725 99678657 Y NA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA ZNF3 448 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1,PILRA PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PILRA 194 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 101062164 101062286 101062177 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 99060 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 101384323 101384583 101384424 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 72376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr7 101499743 101500539 101499888 Y SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1 CUX1 NA NA NA NA CUX1 42784 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 101569375 101569771 101569405 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 112416 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 101609189 101609564 101609377 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 152230 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 101613260 101613283 101613272 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 156301 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 102919685 102919710 102919698 Y NAPEPLD DPY19L2P2,PMPCB NA NA NA NA DPY19L2P2 828 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 RP11-325F22.2 NA NA NA NA RP11-325F22.2 18121 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr7 104601504 104601791 104601630 Y SRPK2,MLL5 RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 21994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 104684659 104684988 104684665 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 33168 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 104854124 104854334 104854271 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 183421 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 104857177 104857523 104857432 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 180232 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 105711914 105712310 105712244 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 38712 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 105922869 105923204 105923197 Y NA NAMPT NA NA NA NA NAMPT 1568 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 106039283 106039583 106039459 Y NA NA NA NA NA NA NAMPT 114511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 106452481 106452693 106452586 Y NA CTB-111H14.1 PIK3CG IMR90 Hi-C 24141950 CTB-111H14.1 43828 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 106767105 106767389 106767258 Y PIK3CG,HBP1 HBP1 NA NA NA NA HBP1 40017 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 106943118 106943475 106943297 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 135712 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 107142222 107142266 107142244 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 59663 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 107875663 107876003 107875815 Y NRCAM NA NA NA NA NA RPL7P32 272674 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 108139925 108140311 108140116 Y PNPLA8,DNAJB9 RPL7P32 NA NA NA NA RPL7P32 8366 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 110723657 110723799 110723727 Y LRRN3 NA NA NA NA NA IMMP2L 476774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 110732834 110733321 110733005 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 467252 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 111172015 111172332 111172167 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 28241 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 111627210 111627406 111627307 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 217060 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 114637628 114638014 114637704 Y NA NA NA NA NA NA MDFIC 77419 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 115489996 115490263 115490130 Y NA NA FOXP2 IMR90 Hi-C 24141950 TFEC 307687 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 116356493 116356879 116356812 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA2 92245 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 116483555 116483740 116483606 Y CAPZA2 CAPZA2 MET,TES IMR90 Hi-C 24141950 CAPZA2 34431 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 116504290 116504456 116504319 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA2 55166 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 116699859 116700243 116700052 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 107471 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 116930307 116930575 116930441 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 337919 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 117027196 117027213 117027205 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 434808 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 117371474 117371913 117371723 Y CTTNBP2 NA NA NA NA NA CTTNBP2 140280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 117472298 117472618 117472458 Y CTTNBP2 CTTNBP2 NA NA NA NA CTTNBP2 39575 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 117509516 117509657 117509617 Y CTTNBP2 CTTNBP2 NA NA NA NA CTTNBP2 2536 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 117938685 117938909 117938797 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 116599 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 117951613 117952046 117951751 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 129527 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 117953120 117953279 117953191 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 131034 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 119269873 119270211 119270042 Y NA NA NA NA NA NA ING3 1318592 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 120967407 120967422 120967415 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 66996 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 126214480 126214602 126214539 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 855376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 126341155 126341491 126341268 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 728487 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 127807416 127807928 127807646 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC4 137256 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 127841401 127841535 127841457 Y FAM71F2 NA SND1,MIR129-1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM28 140427 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 127876972 127877440 127877187 Y IMPDH1,LRRC4 NA PAX4,FSCN3,SND1,LEP,RBM28 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM28 104522 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.689006392759 chr7 128549999 128550078 128550039 Y NA ATP6V1F,IRF5 NA NA NA NA IRF5 25588 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 129005588 129005946 129005786 Y AHCYL2,NRF1,FAM40B,AHCYL2 RP11-305M3.2 NA NA NA NA RP11-305M3.2 42265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 129057225 129057410 129057318 Y NA RP11-305M3.2 NA NA NA NA RP11-305M3.2 9014 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 129095634 129096008 129095821 Y NA RP11-305M3.2 NA NA NA NA RP11-305M3.2 47423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 129176186 129176414 129176275 Y NRF1 NA NA NA NA NA NRF1 73141 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 130739026 130739346 130739289 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 53509 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 130756735 130757090 130757043 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA MKLN1 35765 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 130875085 130875581 130875276 Y NA AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 49768 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 131806652 131806768 131806697 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA4 524679 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 132106504 132106703 132106622 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PLXNA4 224744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 132340200 132340344 132340290 Y NA PLXNA4 NA NA NA NA PLXNA4 8753 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 133706471 133706698 133706584 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B4 293105 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 135015340 135015403 135015372 Y STRA8 NA NA NA NA NA WDR91 121024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 137227927 137228294 137228111 Y PTN NA NA NA NA NA CREB3L2 456519 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 137573369 137573542 137573460 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 111271 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 137928273 137928746 137928445 Y AKR1D1,TRIM24 NA NA NA NA NA AC008155.1 158522 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 138001269 138001637 138001460 Y TRIM24 NA NA NA NA NA AC008155.1 85631 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 138250447 138250496 138250473 Y AKR1D1,TRIM24 NA NA NA NA NA TRIM24 107368 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 138643234 138643648 138643551 Y TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 20416 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 138779904 138780459 138780182 Y NA ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 12006 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr7 138791748 138791993 138791908 Y UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 472 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 138802981 138803298 138803094 Y UBN2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 KIAA1549,ZC3HAV1L,ZC3HAV1,TTC26,LUC7L2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3HAV1 10516 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 139320398 139320629 139320471 Y LUC7L2 NA NA NA NA NA ERHP1 103412 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 139367600 139367827 139367677 Y TBXAS1 NA NA NA NA NA TBXAS1 107023 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 139368106 139368669 139368373 Y NA NA NA NA NA NA TBXAS1 106181 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 139431881 139432226 139432135 Y TBXAS1,JHDM1D,HIPK2 TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA TBXAS1 42624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 139521100 139521456 139521321 Y LUC7L2 TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 45523 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 139555360 139555974 139555461 Y JHDM1D,TBXAS1 NA NA NA NA NA HIPK2 79783 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 139588015 139588387 139588262 Y JHDM1D,TBXAS1 NA NA NA NA NA HIPK2 112438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 140613036 140613224 140613135 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 9340 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 140774728 140775101 140774915 Y NA NA NA NA NA NA MRPS33 61700 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 140807032 140807954 140807105 Y NA NA NA NA NA NA MRPS33 94004 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 141648757 141649893 141649555 Y CLEC5A,TAS2R38 CLEC5A NA NA NA NA CLEC5A 3950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 141679454 141679850 141679687 Y OR9A4,CLEC5A,TAS2R38 CLEC5A NA NA NA NA CLEC5A 34647 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 141804639 141804894 141804740 Y CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA CLEC5A 159832 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 142519257 142519562 142519385 Y TAS2R39,OR9A2 TRBJ2-1,TRBJ2-2P,TRBJ2-3,TRBJ2-4,TRBJ2-5,TRBJ2-6,TRBJ2-7,EPHB6 EPHB6,TRPV5 IMR90 Hi-C 24141950 TRBJ2-7 26117 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 142956760 142956899 142956833 Y NA GSTK1,CASP2 EPHA1,LOC285965,CASP2 IMR90 Hi-C 24141950 GSTK1 17574 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 143048257 143048354 143048306 Y TRPV5,OR9A2,OR6V1,TAS2R40,TAS2R41,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX NA NA NA NA AC093673.5 27234 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 144539515 144539760 144539575 Y TPK1 TPK1 TPK1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPK1 8027 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 146189423 146189726 146189575 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA CNTNAP2 377970 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 146573041 146573429 146573238 Y NA NA NA NA NA NA CNTNAP2 761588 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 149232526 149232604 149232565 Y SSPO ZNF746 NA NA NA NA ZNF746 39618 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 150063162 150063570 150063276 Y GIMAP2 LRRC61,ACTR3C,ZNF775 NA NA NA NA REPIN1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr7 150363010 150363297 150363193 Y LOC100128542 GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1 NA NA NA NA GIMAP2 17488 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 150365537 150365923 150365694 Y ACTR3C,GIMAP8,GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,LOC100128542,GIMAP5,GIMAP2,GIMAP1 GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1 NA NA NA NA GIMAP2 14862 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 151622915 151623433 151623313 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA LOC100505483,PRKAG2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAG2 50705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 152111667 152111916 152111792 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 259334 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 152123020 152123275 152123182 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 247975 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 153866590 153866687 153866639 Y NA NA NA NA NA NA PAXIP1 926107 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 155383034 155383540 155383287 Y RBM33 NA LMBR1,CNPY1,RBM33,LOC100132707 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM33 51605 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 157069496 157069783 157069568 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 56292 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr7 157131379 157131690 157131421 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 5304 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 157629246 157629505 157629365 Y NA AC011899.9 NA NA NA NA AC011899.9 15716 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 157644571 157644735 157644629 Y NA AC011899.9 NA NA NA NA AC011899.9 486 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 157691639 157691978 157691861 Y NA AC011899.9 NA NA NA NA AC011899.9 46418 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 158609735 158609944 158609833 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 11000 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr7 158988480 158988780 158988594 Y ESYT2 NA VIPR2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 341211 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 582547 582966 582856 Y ERICH1 NA NA NA NA NA ERICH1 103140 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 1386881 1387011 1386929 Y NA NA NA NA NA NA CLN8 314933 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 1837817 1838203 1838066 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2336O2.1 127149 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA GS1-57L11.1,RP11-134O21.1 NA NA NA NA RP11-134O21.1 7178 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr8 2704498 2704682 2704590 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134O21.1 120507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 3552666 3552917 3552915 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134O21.1 968675 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 6536860 6537447 6537204 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2541M15.1 26283 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr8 6725876 6726138 6725988 Y NA XKR5 NA NA NA NA XKR5 34710 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 8147008 8147233 8147135 Y NA NA SGK223,MFHAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 94775 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 8203793 8204189 8204138 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 37819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 8610591 8610846 8610739 Y NA NA ERI1,SGK223,MFHAS1 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN23 53143 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 8637281 8637697 8637535 Y PPP1R3B,MFHAS1,CLDN23 NA NA NA NA NA CLDN23 79833 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 8935191 8935379 8935249 Y NA NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3B 71705 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 10192260 10192787 10192448 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 282482 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 10358887 10359102 10358991 Y MSRA NA PRSS55 IMR90 Hi-C 24141950 PINX1 336292 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 11032163 11032532 11032339 Y NA NA NA NA NA NA MTMR9 107393 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 12615395 12615750 12615522 Y NA LONRF1 NA NA NA NA LONRF1 3813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 12834183 12834569 12834376 Y KIAA1456 NA NA NA NA NA LONRF1 222601 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 13515427 13515756 13515570 Y NA NA KIAA1456,DLC1 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf48 93075 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 16456679 16456744 16456714 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 554794 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 16898778 16899115 16898947 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 112423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 18424432 18424631 18424532 Y NA NA NA NA NA NA NAT1 398446 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 18874321 18874582 18874494 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 65658 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 18996849 18997050 18996949 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 56609 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 19120111 19120389 19120229 Y NA NA PSD3,LOC100128993,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 179871 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 19798785 19799134 19798803 Y NA NA NA NA NA NA INTS10 126134 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 20059971 20060332 20060110 Y ATP6V1B2 ATP6V1B2 NA NA NA NA ATP6V1B2 7093 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 21624397 21624558 21624547 Y NPM2,GFRA2 NA NA NA NA NA DOK2 144813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 DOK2,XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA DOK2,XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 21817623 21817860 21817686 Y NA DOK2,XPO7 NA NA NA NA XPO7 42443 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NPM2 NA NA NA NA NPM2 11718 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 22300361 22300587 22300487 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4029 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 22441359 22441704 22441532 Y NA SORBS3,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13410 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 22522684 22522941 22522886 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 1720 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 22573211 22573477 22573404 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,TNFRSF10B,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 24396 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 22710401 22710511 22710455 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB2 132419 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 22838413 22838742 22838578 Y NA RHOBTB2,RP11-875O11.1 BIN3,TNFRSF10B,RHOBTB2,PEBP4,C8orf58,KIAA1967,LOC286059 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB2 4188 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 23038375 23038737 23038576 Y ENTPD4,ENTPD4,TNFRSF10D TNFRSF10D,TNFRSF10A NA NA NA NA TNFRSF10D 18832 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 23620926 23621248 23621019 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A37 236608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 24176460 24176602 24176560 Y ADAM28 ADAM28 NA NA NA NA ADAM28 26907 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 24194480 24194906 24194724 Y NA ADAM28,ADAMDEC1 NA NA NA NA ADAMDEC1 44892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 24206605 24207043 24206844 Y ADAM28,ADAMDEC1 ADAMDEC1 NA NA NA NA ADAMDEC1 32755 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 24242968 24243278 24243228 Y ADAM28,ADAMDEC1 ADAMDEC1 NA NA NA NA ADAMDEC1 3170 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 24858208 24858485 24858356 Y NA NA NA NA NA NA RP11-624C23.1 90622 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 25059177 25059384 25059268 Y DOCK5 DOCK5 NA NA NA NA DOCK5 18939 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 25186094 25186253 25186181 Y NA NA NA NA NA NA KCTD9 127739 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 26124778 26124900 26124838 Y PPP2R2A PPP2R2A PPP2R2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 22107 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 26324913 26325141 26325047 Y NA DPYSL2 NA NA NA NA DPYSL2 44650 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 26453595 26453975 26453687 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 83804 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.56568016249122 chr8 27114452 27114997 27114718 Y NA NA NA NA NA NA TRIM35 51839 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 27200806 27201031 27200919 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 33807 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 27219743 27220043 27219778 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 52744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 27236352 27236561 27236406 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 69353 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 27265822 27266045 27265950 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 98823 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29028606 29028803 29028712 Y NA NA NA NA NA NA KIF13B 89838 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29213594 29213602 29213597 Y NA DUSP4 DUSP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP4 7409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29230223 29230556 29230411 Y KIF13B,DUSP4 DUSP4 C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 24038 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 29230784 29230978 29230896 Y KIF13B,DUSP4 DUSP4 C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 24599 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29316675 29316889 29316765 Y KIF13B,DUSP4 NA C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 110490 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29412011 29412162 29412114 Y NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 205826 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29513867 29514215 29514082 Y KIF13B NA DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 307682 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29631359 29631483 29631421 Y DUSP4 NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 307240 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29938783 29938843 29938811 Y NA TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA TMEM66 60 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29948448 29949236 29948548 Y TMEM66,LEPROTL1 TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA LEPROTL1 1678 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 29957112 29957836 29957408 Y TMEM66,LEPROTL1 TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA LEPROTL1 6198 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 30280646 30281238 30280961 Y MBOAT4 RBPMS,RBPMS-AS1 NA NA NA NA RBPMS-AS1 39729 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr8 30358644 30358942 30358767 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS-AS1 117727 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 32508172 32508500 32508337 Y NRG1,NRG1 NA NA NA NA NA FUT10 820440 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 33051592 33051837 33051715 Y NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 277103 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 33287156 33287526 33287341 Y NA FUT10 NA NA NA NA FUT10 41414 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 33743518 33743769 33743644 Y MAK16 NA NA NA NA NA RNF122 320875 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 34447539 34447655 34447597 Y NA NA NA NA NA NA RP1-84O15.1 268379 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA NA NA NA NA NA RP1-84O15.1 1203648 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 36108720 36108918 36108819 Y NA NA NA NA NA NA ERLIN2 1483199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 37738160 37738666 37738484 Y RAB11FIP1 BRF2,RAB11FIP1 GPR124,BRF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP1 16319 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 37739186 37739703 37739509 Y RAB11FIP1 BRF2,RAB11FIP1 GPR124,BRF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP1 15282 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr8 37757888 37758317 37758017 Y WHSC1L1,RAB11FIP1 RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 2903 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 38242599 38242872 38242674 Y TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 874 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 38330883 38331237 38331060 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 6531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 38624356 38624716 38624649 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1 TACC1 NA NA NA NA TACC1 40652 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 38627692 38628125 38628027 Y LETM2,LETM2,C8orf86,PLEKHA2,TACC1 TACC1 NA NA NA NA TACC1 43988 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 38647998 38648343 38648132 Y LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1 NA NA NA NA NA TACC1 64294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 38757431 38758061 38757845 Y C8orf86,TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 678 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 38770998 38771507 38771224 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 14245 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 39767656 39767843 39767773 Y IDO1 IDO1 NA NA NA NA IDO1 9862 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 39850643 39850769 39850706 Y NA NA NA NA NA NA IDO1 92849 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 39865066 39865447 39865202 Y NA NA NA NA NA NA IDO1 107272 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 41886687 41887061 41886965 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 20447 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 42270426 42270603 42270558 Y NA VDAC3 NA NA NA NA VDAC3 23284 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 42588467 42588706 42588587 Y NA NA NA NA NA NA THAP1 107762 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 47903412 47903538 47903475 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP2 163203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 48282787 48283030 48282901 Y KIAA0146,CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 208294 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 48311654 48311845 48311740 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 191326 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 48434780 48435210 48435108 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 67961 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 48513197 48513620 48513373 Y KIAA0146,CEBPD RP11-697N18.2 NA NA NA NA RP11-697N18.2 10026 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 48531592 48531742 48531667 Y NA RP11-697N18.2 NA NA NA NA RP11-697N18.2 28421 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 48814148 48814416 48814291 Y NA NA NA NA NA NA PRKDC 56327 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 49430601 49430974 49430806 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 135451 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 50082521 50082569 50082532 Y NA NA NA NA NA NA RPL29P19 787371 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr8 54605815 54605949 54605850 Y NA RP11-463C14.1 NA NA NA NA RP11-463C14.1 17308 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 54658367 54658716 54658684 Y NA RP11-463C14.1 NA NA NA NA RP11-463C14.1 35110 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 56756553 56757241 56756740 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 33131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 56916302 56916441 56916350 Y LYN NA NA NA NA NA RPS20 68628 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 59529081 59529390 59529262 Y SDCBP NSMAF NA NA NA NA NSMAF 41013 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 59713339 59713715 59713527 Y TOX NA NA NA NA NA NSMAF 142936 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 59821707 59822062 59821885 Y NA NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 207537 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 60010619 60010999 60010857 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 18600 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 60154501 60154880 60154691 Y NA NA NA NA NA NA TOX 124734 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 60746258 60746448 60746353 Y NA NA NA NA NA NA CA8 445523 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 61705362 61705819 61705615 Y NA NA NA NA NA NA AC022182.1 114793 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 62631895 62632623 62632238 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 6548 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 63294919 63295081 63295000 Y NA NA NA NA NA NA GGH 654649 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 66652181 66652518 66652302 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 97212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 66749896 66750187 66749927 Y PDE7A PDE7A NA NA NA NA PDE7A 2370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 66863902 66864441 66863992 Y RRS1,PDE7A NA PDE7A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 111345 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr8 66894469 66894744 66894561 Y NA NA DNAJC5B IMR90 Hi-C 24141950 PDE7A 141912 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 68147841 68148210 68148008 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 105702 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 69744780 69745024 69744928 Y NA NA NA NA NA NA PREX2 882427 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 69983747 69983982 69983910 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 1030432 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 70042378 70042779 70042585 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 971635 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 71084923 71085298 71085131 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 70509 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 71106642 71106934 71106707 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 92228 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 71303418 71303670 71303544 Y NA NCOA2,RP11-333A23.1 NA NA NA NA NCOA2 10370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 72770493 72770720 72770591 Y MSC RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 15790 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 72839217 72839615 72839291 Y NA NA NA NA NA NA MSC 84514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 72922675 72922996 72922837 Y NA NA NA NA NA NA MSC 167972 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 74453012 74453349 74453181 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 204594 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 77590079 77590470 77590424 Y ZFHX4 NA NA NA NA NA PEX2 320810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 80991495 80991889 80991678 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 50971 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 81261345 81261481 81261420 Y ZBTB10 NA NA NA NA NA TPD52 119878 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 81489520 81489653 81489606 Y NA NA ZBTB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZBTB10 93666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 81695028 81695405 81695288 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 299174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 81782792 81783006 81782996 Y ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 239297 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 82019096 82019493 82019305 Y PAG1 PAG1 NA NA NA NA PAG1 2810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 86371692 86371842 86371770 Y CA13,CA2 CA2 NA NA NA NA CA2 2239 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 87444767 87445117 87444942 Y WWP1 CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 49942 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 87650704 87651077 87650891 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A3P4 136884 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 90479154 90479488 90479317 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 288467 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 90740659 90741027 90740842 Y NA RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,NBN,RIPK2,OSGIN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 90741352 90741628 90741481 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,RIPK2,NBN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26327 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 90776453 90776674 90776498 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 8478 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 90794286 90794738 90794600 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 26311 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 90899646 90899998 90899819 Y RIPK2,OSGIN2 OSGIN2 OSGIN2,RIPK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OSGIN2 12089 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 91266668 91266938 91266670 Y NA NA NA NA NA NA NBN 253212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 94139551 94139943 94139747 Y NA NA NA NA NA NA FAM92A1 568846 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 94947484 94947898 94947643 Y GEM NA NA NA NA NA PDP1 79449 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 95429933 95430227 95430143 Y NA NA NA NA NA NA RAD54B 55110 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 95943173 95943450 95943312 Y NA CCNE2,TP53INP1 NA NA NA NA TP53INP1 16189 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 96133166 96133378 96133300 Y PLEKHF2 PLEKHF2 C8orf38,C8orf69,C8orf37,PLEKHF2,MIR3150B,MIR3150A IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHF2 10654 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 96146998 96147210 96147103 Y TP53INP1,PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 2966 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 97272793 97273157 97272974 Y NA UQCRB,MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 850 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 97361476 97361586 97361537 Y NA NA NA NA NA NA PTDSS1 89533 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 97718661 97719173 97718897 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 215082 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 97870778 97871083 97870857 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 367199 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 97991385 97991967 97991693 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 487806 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 98454033 98454434 98454234 Y NA NA PTDSS1,SDC2,CPQ,TSPYL5 IMR90 Hi-C 24141950 MTDH 199973 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 98877971 98878157 98878074 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA MATN2 911 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 99865650 99865661 99865656 Y NA NA NA NA NA NA STK3 87394 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 100618724 100618876 100618800 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 285414 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 100803946 100804239 100804046 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 100051 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 101450289 101450675 101450373 Y RNF19A NA SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19A 103843 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 101506755 101507113 101506895 Y YWHAZ,YWHAZ,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA GRHL2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD46 62899 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 102120764 102121998 102120921 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF706 94423 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr8 102665065 102665479 102665281 Y NA NA NA NA NA NA NACAP1 293043 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 103022910 103023168 103023036 Y UBR5,NCALD NA NA NA NA NA RRM2B 226178 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 103613012 103613469 103613324 Y KLF10,KLF10 NA UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1,RRM2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 52661 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 103922083 103922307 103922186 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 17991 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 103933096 103933543 103933196 Y NA AZIN1 AZIN1,ATP6V1C1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 29004 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 104088692 104088862 104088809 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32 NA NA NA NA NA ATP6V1C1 57401 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 104196928 104197190 104197047 Y AZIN1,DCAF13 BAALC,C8orf56 NA NA NA NA C8orf56 45225 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 104305857 104306236 104306047 Y NA FZD6,RP11-318M2.2 NA NA NA NA FZD6 2425 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 104457896 104458033 104457972 Y NA DCAF13,SLC25A32 NA NA NA NA SLC25A32 32479 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 105598029 105598284 105598149 Y TM7SF4,LRP12 LRP12 NA NA NA NA LRP12 968 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 107598628 107599080 107598706 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 109161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 107603836 107604153 107603995 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 104088 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 107633742 107634133 107633852 Y OXR1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 74108 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 107740443 107740789 107740616 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 32202 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 108317294 108317670 108317585 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 190613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr8 108452941 108453080 108453009 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 55203 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 108508143 108508403 108508294 Y ANGPT1 NA NA NA NA NA ANGPT1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 109230205 109230491 109230349 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 215071 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 110537386 110537661 110537551 Y NA EBAG9 NA NA NA NA EBAG9 12279 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 111109081 111109287 111109184 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2544L4.1 456350 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 112279514 112279729 112279622 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2544L4.1 713877 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 114909341 114909408 114909375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 522443 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 115086564 115086665 115086613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 699666 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 116454411 116454736 116454628 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 365163 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 159152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 116695168 116695449 116695309 Y NA NA EIF3H IMR90 Hi-C 24141950 TRPS1 124450 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 116756032 116756330 116756181 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 63569 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 118040478 118040807 118040576 Y SLC30A8,SLC30A8,SLC30A8 NA NA NA NA NA RAD21 155373 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 118128259 118128494 118128265 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 243154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 118524766 118524786 118524776 Y NA MED30 NA NA NA NA MED30 6166 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 119047899 119048328 119048216 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 73764 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 119117518 119117887 119117807 Y NA EXT1 NA NA NA NA EXT1 4205 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 119333193 119333561 119333493 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 211101 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 119536968 119537364 119537323 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P35 235076 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 119862438 119862804 119862573 Y NA NA TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P35 89998 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 120288665 120289048 120288857 Y NA NA NA NA NA NA ENPP2 394645 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 121092888 121093091 121092967 Y DEPTOR NA DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13 IMR90 Hi-C 24141950 DEPTOR 208931 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 123050237 123050548 123050394 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 741085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 123882951 123883328 123883140 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 91318 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 124889263 124889525 124889394 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 110567 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 125210059 125210285 125210207 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 172648 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 125275002 125275221 125275161 Y RNF139 NA FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 107712 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 125304968 125305098 125305033 Y NA NA NA NA NA NA TMEM65 77835 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 125382714 125382961 125382953 Y NA NA NA NA NA NA TMEM65 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 125656235 125656588 125656492 Y ZNF572,RNF139,MTSS1 NA NA NA NA NA MTSS1 82142 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 125764120 125764533 125764318 Y ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1 MTSS1 MTSS1,ZNF572,NDUFB9,TATDN1,LOC157381,SQLE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTSS1 25390 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 125794770 125795104 125794917 Y NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1 RP11-1082L8.4 MTSS1,ZNF572 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1082L8.4 30820 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 126112372 126112753 126112532 Y TRIB1,NSMCE2 NSMCE2,KIAA0196 NA NA NA NA KIAA0196 10290 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 126283499 126283849 126283769 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 156714 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 128068284 128068629 128068554 Y NA NA NA NA NA NA MYC 677051 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA MYC 675051 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA MYC 632485 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128167127 128167527 128167484 Y NA NA NA NA NA NA MYC 578153 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128193341 128193750 128193748 Y NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 551930 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128196669 128197128 128196955 Y NA NA NA NA NA NA MYC 548552 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128258299 128258698 128258657 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 486982 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128811691 128811973 128811933 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 6912 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 128948050 128948240 128948055 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 72617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 129061512 129061955 129061598 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 40655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 129195465 129196052 129195562 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 174608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 129196843 129197355 129196931 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 175986 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 129251528 129251800 129251626 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 230671 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 129279863 129280046 129279972 Y NA NA MYC,MIR1208 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU4-25P 259006 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 129569050 129569202 129569118 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 548193 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 129706266 129706412 129706340 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 685409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 129888455 129888974 129888966 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-26E5.1 537221 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 130248733 130249143 130248913 Y NA NA NA NA NA NA RP11-26E5.1 177052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 130548053 130548359 130548185 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RP11-26E5.1 121858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 130559153 130559435 130559226 Y NA NA NA NA NA NA RP11-26E5.1 132958 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 130605679 130605945 130605781 Y FAM49B NA NA NA NA NA RP11-26E5.1 179484 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 130651209 130651494 130651319 Y FAM49B NA NA NA NA NA RP11-26E5.1 225014 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 130947350 130947645 130947497 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 79730 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 130975001 130975392 130975263 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 51983 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 130983929 130984348 130984047 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 43027 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 131007390 131007737 131007622 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 19638 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 131264949 131265429 131265208 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 237574 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 131503797 131504200 131504000 Y NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 476422 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 131612100 131612112 131612106 Y NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 584725 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 131813824 131814167 131813944 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 786449 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 132658196 132658445 132658435 Y HHLA1 NA NA NA NA NA EFR3A 255890 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 132830894 132831106 132830962 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 83229 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 132839746 132840116 132840009 Y NA NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 74219 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 133774185 133774477 133774346 Y TMEM71,PHF20L1 TMEM71,PHF20L1 NA NA NA NA TMEM71 3227 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 133846055 133846325 133846220 Y NA NA NA NA NA NA PHF20L1 60437 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 134090070 134090677 134090415 Y ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1 SLA NA NA NA NA SLA 22621 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 134131797 134131957 134131879 Y TG SLA NA NA NA NA SLA 18499 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 134157262 134157543 134157339 Y ST3GAL1,NDRG1,TMEM71,PHF20L1 SLA NA NA NA NA SLA 43964 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 134233745 134234256 134234169 Y NA NA NA NA NA NA NDRG1 78009 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 134580779 134581429 134580915 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 754 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 134905620 134906007 134905914 Y ST3GAL1 RP11-157E21.1 ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-157E21.1 8881 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 134940088 134940285 134940173 Y ST3GAL1 RP11-157E21.1 ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-157E21.1 43349 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 135035920 135036152 135036031 Y ST3GAL1 NA ST3GAL1,ZFAT,ZFAT-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-157E21.1 139181 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 135763975 135764179 135764077 Y NA ZFAT ZFAT MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFAT 40683 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr8 135984758 135985124 135984941 Y NA NA NA NA NA NA MIR30D 169570 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 140115684 140115926 140115805 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 1350752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 141110302 141110773 141110688 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 355905 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 141725005 141725293 141725149 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 205608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 141849368 141849592 141849371 Y TRAPPC9 NA NA NA NA NA PTK2 160723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 142031986 142032097 142032042 Y NA PTK2 PTK2,DENND3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 21671 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 142099604 142099791 142099736 Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3,RP11-809O17.1 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 25586 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 142105625 142105840 142105724 Y EIF2C2,SLC45A4,PTP4A3,DENND3 DENND3,RP11-809O17.1 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 19537 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 142129714 142130013 142129874 Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3,RP11-809O17.1 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 4337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 142411426 142411896 142411690 Y DENND3,SLC45A4,PTP4A3 PTP4A3 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 11333 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 142413850 142414371 142414167 Y DENND3,SLC45A4 PTP4A3 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 13757 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr8 142425618 142425919 142425790 Y NA PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 25525 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 142426003 142426250 142426062 Y PTP4A3 PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 25910 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 142591617 142591932 142591762 Y NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P38 124442 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 143813380 143813410 143813405 Y GPIHBP1 NA NA NA NA NA JRK 51994 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 144107532 144108153 144107940 Y MAFA LY6E NA NA NA NA LY6E 10133 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 144272609 144273113 144272936 Y NA NA NA NA NA NA ZFP41 54167 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 144785317 144785390 144785376 Y NA ZNF707,FAM83H NA NA NA NA ZNF707 20695 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 145002494 145002937 145002709 Y SPATC1,PLEC PLEC NA NA NA NA PLEC 45965 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr8 145083268 145083683 145083273 Y NA PLEC,GRINA,PARP10,EXOSC4,CTD-3065J16.9 NA NA NA NA PARP10 1257 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr8 145909522 145909717 145909620 Y NA NA ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF251 70085 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 269214 269364 269293 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA DOCK8 56360 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 277612 278164 277810 Y DOCK8 NA NA NA NA NA DOCK8 64758 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 447782 447949 447838 Y DOCK8,DOCK8 NA NA NA NA NA DOCK8 234928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 631583 631920 631840 Y KANK1 NA NA NA NA NA DOCK8 418729 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 642151 642448 642253 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA DOCK8 429297 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.43967590065189 chr9 708345 708423 708359 Y KANK1 NA NA NA NA NA DOCK8 495491 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 749759 749963 749884 Y NA NA NA NA NA NA DOCK8 536905 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chr9 758228 758480 758338 Y KANK1 NA NA NA NA NA DOCK8 545374 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 1871699 1872019 1872015 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 141323 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 4366732 4366922 4366806 Y GLIS3 NA GLIS3,RFX3 IMR90 Hi-C 24141950 PPAPDC2 293376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 5446001 5446185 5446074 Y NA CD274 INSL6,CD274,PDCD1LG2 IMR90 Hi-C 24141950 CD274 2318 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 5493502 5493936 5493824 Y KIAA1432,C9orf46,CD274 CD274 NA NA NA NA CD274 44999 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 5499914 5500215 5500099 Y NA NA NA NA NA NA CD274 51411 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 5563943 5564345 5564035 Y C9orf46,CD274,KIAA1432 NA NA NA NA NA KIAA1432 62680 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 5851473 5851729 5851648 Y C9orf46,CD274,KIAA1432 ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 20356 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 6004392 6004777 6004642 Y NA KIAA2026,RANBP6 NA NA NA NA KIAA2026 1124 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 8576629 8576984 8576673 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 511892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 8973007 8973018 8973013 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 115858 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 9842303 9842691 9842629 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 753427 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 10446077 10446442 10446410 Y PTPRD NA NA NA NA NA RPS26P3 1357201 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 10563880 10564197 10564091 Y PTPRD NA NA NA NA NA RPS26P3 1475004 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 11018357 11018684 11018521 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 1929481 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 12699213 12699340 12699226 Y TYRP1 NA NA NA NA NA ZDHHC21 1992129 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 13349077 13349432 13349255 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC21 1342037 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 13860061 13860338 13860200 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC21 831131 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 14147587 14147657 14147622 Y NFIB NA NA NA NA NA ZDHHC21 543812 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 14353468 14353873 14353760 Y NFIB NA NA NA NA NA ZDHHC21 337596 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 14395378 14395755 14395567 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC21 295714 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 14477951 14478302 14478282 Y NFIB NA NA NA NA NA ZDHHC21 213167 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 16508530 16508711 16508621 Y BNC2 NA NA NA NA NA CNTLN 624269 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 306073 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 19124098 19124309 19124196 Y ACER2,PLIN2 HAUS6,PLIN2 NA NA NA NA PLIN2 22979 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 19642332 19642566 19642449 Y SLC24A2 NA NA NA NA NA ACER2 235407 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 19789655 19789934 19789795 Y SLC24A2 NA NA NA NA NA ACER2 382730 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 21388342 21388353 21388348 Y NA NA NA NA NA NA KLHL9 54963 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 26954235 26954527 26954290 Y IFT74,IFT74 IFT74,PLAA NA NA NA NA PLAA 8774 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 27333351 27333416 27333383 Y IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA C9orf72 238448 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P2 1003845 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 32453982 32454272 32454141 Y NA NA NA NA NA NA DDX58 70050 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 32556634 32556872 32556767 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA TOPORS 6083 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 33017262 33017602 33017524 Y NA APTX,DNAJA1 DNAJA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 APTX 5564 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 33268680 33268843 33268732 Y NA BAG1,CHMP5,NFX1 NA NA NA NA CHMP5 5740 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 34158490 34158839 34158617 Y NA DCAF12,UBAP1 DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBAP1 18164 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 35603577 35603740 35603659 Y RECK TESK1 NA NA NA NA TESK1 210 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr9 35971862 35972364 35972237 Y NA YBX1P10 C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK IMR90 Hi-C 24141950 YBX1P10 1547 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 36232965 36233105 36233040 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 41948 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 36765862 36766252 36766147 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 195003 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 36840898 36841246 36841074 Y NA NA NA NA NA NA MELK 270039 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 36909866 36910144 36910005 Y ZCCHC7,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 208392 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 37035783 37036025 37035954 Y ZCCHC7,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 82511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 37908726 37909073 37908864 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 109292 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB NA NA NA NA NA SHB 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1B1 46909 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA NA NA NA NA NA PIP5K1B 2863019 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 71413577 71413589 71413582 Y NA FAM122A NA NA NA NA FAM122A 20613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 72653472 72653608 72653542 Y NA NA MAMDC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMC5 218329 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 72805213 72805492 72805447 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 66445 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 73168765 73169157 73169115 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 141225 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 73178748 73179070 73178790 Y SMC5 NA NA NA NA NA KLF9 151208 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 73184848 73185244 73185056 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 157308 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 73219456 73219798 73219627 Y TRPM3,KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 191916 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 73436676 73436913 73436883 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 409136 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 73437817 73438081 73438034 Y TRPM3 NA NA NA NA NA KLF9 410277 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 75612445 75612548 75612497 Y NA NA ALDH1A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A1 80810 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr9 75852010 75852329 75852219 Y ANXA1 NA RORB IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 87337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 77669304 77669618 77669461 Y NA C9orf41,OSTF1 NA NA NA NA C9orf41 27965 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 77765912 77766310 77766149 Y OSTF1 NA NA NA NA NA OSTF1 64453 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 79185914 79186293 79186104 Y NA AL161626.1 PRUNE2 IMR90 Hi-C 24141950 AL161626.1 1183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 79191243 79191544 79191412 Y NA AL161626.1 NA NA NA NA AL161626.1 6512 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chr9 79383801 79384093 79383990 Y PRUNE2 NA NA NA NA NA AL161626.1 199070 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 80559906 80560072 80560021 Y NA NA NA NA NA NA GNAQ 84302 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 80560530 80561013 80560815 Y GNAQ NA NA NA NA NA GNAQ 83361 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 80637884 80638322 80638164 Y NA GNAQ NA NA NA NA GNAQ 6052 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 81154672 81154952 81154897 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 244613 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 81310487 81310719 81310691 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 400428 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 81600122 81600487 81600176 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 403732 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 81977149 81977423 81977213 Y NA CHCHD2P9 NA NA NA NA CHCHD2P9 26796 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 83330853 83330878 83330866 Y NA NA NA NA NA NA TLE1 971342 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 84583939 84584128 84583953 Y FAM75D1 NA NA NA NA NA TLE1 281719 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 86123071 86123201 86123136 Y UBQLN1,KIF27,HNRNPK,HNRNPK NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 197308 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 87320052 87320082 87320067 Y NA NA NA NA NA NA RMI1 726426 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 87470234 87470516 87470442 Y NTRK2,NTRK2,NTRK2 NA NA NA NA NA RMI1 876608 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 88357534 88357780 88357692 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 2590 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 88935508 88935794 88935577 Y NA ISCA1,ZCCHC6 NA NA NA NA ZCCHC6 31575 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 90117444 90117744 90117580 Y DAPK1 DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA DAPK1 7301 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 90131164 90131697 90131347 Y DAPK1 DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 6520 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 90133886 90134005 90133888 Y NA DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 4212 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.00267803157156 chr9 90216174 90216503 90216403 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 77957 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 90329827 90330158 90329945 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 191610 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 91022048 91022386 91022218 Y NA SPIN1 NA NA NA NA SPIN1 20714 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 91551590 91551944 91551773 Y S1PR3,C9orf47 NA S1PR3,LOC286238,MIR4289 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S1PR3 52418 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 92004867 92005103 92005008 Y NA NA NA NA NA NA SECISBP2 73446 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 92015404 92015642 92015537 Y SECISBP2 NA NA NA NA NA SECISBP2 83983 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chr9 92116297 92116830 92116600 Y NA SEMA4D SEMA4D,SECISBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 5252 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 92142091 92142330 92142203 Y NA SEMA4D SECISBP2,SEMA4D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 31046 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 92218643 92218902 92218819 Y GADD45G GADD45G NA NA NA NA GADD45G 715 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 92515795 92516064 92515808 Y NA NA NA NA NA NA RP11-316P17.2 201229 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 93577739 93577890 93577821 Y SYK,SYK SYK NA NA NA NA SYK 15670 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 93913194 93913593 93913428 Y SYK,SYK,NFIL3 RP11-305L7.3 LOC100129316,AUH,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305L7.3 9776 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA RP11-305L7.3 NA NA NA NA RP11-305L7.3 32622 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 94182259 94182597 94182338 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 1547 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 94872861 94873095 94872978 Y NA SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 2571 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 95168954 95169114 95169066 Y OGN NA NA NA NA NA NOL8 83036 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 95452860 95453088 95452974 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 22313 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 95727493 95728071 95727743 Y IPPK,SUSD3,NINJ1,FAM120A,C9orf89,FGD3 FGD3 NA NA NA NA FGD3 19760 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 95826654 95827012 95826884 Y FGD3,FAM120AOS,SUSD3 SUSD3,C9orf89 NA NA NA NA SUSD3 7665 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 95860928 95861146 95861059 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 SUSD3,C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA C9orf89 4428 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 95880555 95880921 95880640 Y NA C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 13649 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 96901972 96902054 96902023 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 37062 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 96919415 96919512 96919464 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 19604 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr9 97273853 97274253 97274073 Y NA NA NA NA NA NA FBP1 126278 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 97505796 97506082 97505939 Y NA NA NA NA NA NA FBP1 105265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 97520794 97521111 97520953 Y C9orf3 NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 FBP1 120263 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 97623374 97623749 97623496 Y C9orf3,C9orf3 NA NA NA NA NA FBP1 222843 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 97906311 97906710 97906505 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 171281 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 99774924 99775195 99775041 Y C9orf21,TDRD7 HIATL2 NA NA NA NA HIATL2 1062 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 100455337 100455352 100455343 Y NA XPA NA NA NA NA XPA 2287 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 100681065 100681283 100681122 Y TSTD2,XPA,TRIM14,TRIM14,C9orf156 C9orf156,HEMGN NA NA NA NA C9orf156 1569 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 100685565 100685605 100685585 Y NA C9orf156,HEMGN NA NA NA NA C9orf156 2713 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 100696898 100697242 100697085 Y NA C9orf156,HEMGN,ANP32B NA NA NA NA HEMGN 7896 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 100747732 100748046 100747912 Y NA HEMGN,ANP32B NA NA NA NA ANP32B 4089 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 100788386 100788828 100788550 Y NA ANP32B,NANS NA NA NA NA NANS 28193 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 101697632 101697708 101697670 Y NA NA COL15A1,GALNT12,TGFBR1 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT12 129651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 102007294 102007527 102007424 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24948 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 102391563 102391903 102391698 Y ERP44,NR4A3 NA SEC61B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-554F20.1 188268 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 102524873 102525065 102524930 Y ERP44,NR4A3 NA SEC61B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-554F20.1 55106 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 104805727 104805738 104805734 Y NA NA NA NA NA NA RNF20 511594 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 105966405 105966781 105966517 Y NA NA NA NA NA NA SMC2 887760 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 106717687 106717746 106717717 Y NA NA NA NA NA NA SMC2 136795 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 107635337 107635884 107635542 Y ABCA1 NA NA NA NA NA ABCA1 52634 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 107734203 107734221 107734212 Y SLC44A1,OR13C3,OR13C8 ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 45685 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 107828676 107828970 107828830 Y NIPSNAP3A,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 140158 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 107950174 107950339 107950255 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC44A1 54564 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 107954000 107954398 107954183 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC44A1 50505 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 109627297 109627657 109627483 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 415761 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 109881477 109881496 109881488 Y NA NA MIR548Q IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 161922 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 109932773 109933133 109932953 Y NA NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110285 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 110109718 110109795 110109757 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 66300 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 110130757 110130886 110130824 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 87339 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 110701939 110701966 110701953 Y NA NA NA NA NA NA KLF4 451176 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 111003656 111003963 111003923 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 383150 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 111025609 111025952 111025781 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 361161 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 112419836 112420089 112419963 Y C9orf4,PALM2 NA PALM2-AKAP2 IMR90 Hi-C 24141950 TXN 596831 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 112569081 112569243 112569086 Y PALM2 NA NA NA NA NA TXN 447677 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 113044793 113045024 113044909 Y NA TXN NA NA NA NA TXN 27873 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 113113544 113113865 113113705 Y NA NA NA NA NA NA TXN 96624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 114596249 114596662 114596321 Y NA NA UGCG,MIR3134,HSDL2,SUSD1,C9orf84 IMR90 Hi-C 24141950 UGCG 60384 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 114705587 114705765 114705623 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 48541 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 114825806 114826033 114825918 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 109655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 114831912 114832228 114831995 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 103460 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 114938880 114939057 114938953 Y SUSD1 SUSD1 NA NA NA NA SUSD1 3192 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 115892263 115892507 115892365 Y SNX30,RGS3,SLC31A2 SLC31A2 NA NA NA NA SLC31A2 18715 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 115981344 115981857 115981657 Y SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15 NA NA NA NA NA FKBP15,SLC31A1 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 116728685 116728905 116728795 Y AMBP NA NA NA NA NA ZNF618 92123 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 116754970 116754989 116754980 Y ORM2,ORM1,AMBP NA NA NA NA NA ZNF618 118408 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 117147567 117148178 117147802 Y DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1,ORM2,AKNA AKNA NA NA NA NA AKNA 6507 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 117720208 117721654 117720651 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 TNFSF8 LOC100505478,DFNB31,C9orf91,TNFSF15,TNFSF8,TNC IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF8 29511 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 123640419 123640826 123640772 Y NA PSMD5,PHF19,TRAF1 NA NA NA NA PHF19 2813 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 124031340 124031517 124031432 Y GSN RAB14 NA NA NA NA RAB14 48048 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 124034360 124034626 124034492 Y GSN NA NA NA NA NA RAB14 51068 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 124040831 124041134 124040970 Y GSN NA NA NA NA NA RAB14 57539 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 124366644 124366826 124366729 Y NA NA NA NA NA NA GGTA1P 106338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 124383753 124383935 124383823 Y DAB2IP NA NA NA NA NA GGTA1P 123447 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 124463473 124463936 124463619 Y TTLL11,DAB2IP NA NA NA NA NA GGTA1P 203167 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 125529101 125529466 125529284 Y MRRF,OR1J1,OR1J2,OR1J4,OR1N1,OR1N2,OR1L8,OR1Q1,OR1B1,OR1L1,GPR21,OR1L4,OR1L6 NA NA NA NA NA PDCL 59444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 125578475 125578645 125578596 Y NA PDCL NA NA NA NA PDCL 10265 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 126002195 126002288 126002252 Y OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP STRBP NA NA NA NA STRBP 26567 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 126003896 126004111 126004004 Y NA STRBP NA NA NA NA STRBP 24744 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 126102323 126102736 126102675 Y NA NA RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STRBP 73468 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 126116431 126116619 126116525 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 87576 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 126119304 126119701 126119598 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 90449 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 126237774 126237937 126237796 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 208919 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 126468286 126468378 126468332 Y STRBP,STRBP NA NA NA NA NA DENND1A 222053 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 126690123 126690365 126690192 Y DENND1A DENND1A NA NA NA NA DENND1A 66 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 126978996 126979273 126979176 Y DENND1A,NEK6,NEK6 NEK6 DENND1A,NEK6,PSMB7 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 38612 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 127040505 127040685 127040582 Y NEK6,NEK6 NEK6 NA NA NA NA NEK6 22620 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 127424345 127424738 127424542 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 5599 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 127468042 127468336 127468195 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 49296 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 128985043 128985372 128985125 Y NA NA MAPKAP1,FAM125B,PBX3 IMR90 Hi-C 24141950 PBX3 477419 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 129185557 129185839 129185698 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 379446 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 129466839 129467134 129467067 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 98151 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 129495309 129495335 129495322 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 69950 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 129624910 129625209 129625060 Y RALGPS1 ZBTB34,RALGPS1 NA NA NA NA ZBTB34 3966 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 129951111 129951299 129951234 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A8 206122 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 130532355 130532628 130532471 Y NA PTRH1,TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS NA NA NA NA SH2D3C 6392 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 130564311 130564645 130564479 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9 SH2D3C,CDK9,FPGS NA NA NA NA FPGS 9435 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 130597952 130598640 130598378 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS,FPGS FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 16395 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 130834459 130834744 130834726 Y NA SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 5974 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 131930457 131930532 131930510 Y PRRX2 IER5L NA NA NA NA IER5L 8008 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 131936354 131936600 131936398 Y METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4 IER5L NA NA NA NA IER5L 1940 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-65J3.1 53278 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.00267803157156 chr9 132359774 132359922 132359814 Y PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A ASB6 NA NA NA NA ASB6 42522 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 132598761 132599163 132598839 Y NA TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78 NA NA NA NA C9orf78 2619 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 132646480 132646964 132646831 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 50338 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.50133901578578 chr9 132772679 132773108 132773032 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 30365 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 132785309 132785843 132785545 Y USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 17630 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 132807262 132807460 132807345 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 3789 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr9 134113096 134113636 134113575 Y PRRC2B,NUP214,FAM78A FAM78A NA NA NA NA FAM78A 36298 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 134128008 134128436 134128111 Y RAPGEF1,QRFP,FAM78A FAM78A NA NA NA NA FAM78A 21498 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.378012785518 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A FAM78A NA NA NA NA FAM78A 17773 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 134144427 134144727 134144559 Y NUP214,FAM78A FAM78A NA NA NA NA FAM78A 5207 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 134158436 134158891 134158763 Y NA FAM78A NUP214,FAM78A,PPAPDC3,PRRC2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM78A 8502 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.31367163881256 chr9 134545557 134545955 134545779 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 67506 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 134552911 134553181 134553024 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 60280 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 134577502 134577617 134577602 Y NA RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 35844 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 134583624 134583883 134583876 Y NA RAPGEF1 PRRC2B,UCK1,POMT1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF1 29578 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 134613837 134614689 134614350 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 134619507 134619884 134619596 Y FAM78A,RAPGEF1 RAPGEF1 RAPGEF1 K562 ChIA-PET 22265404 RAPGEF1 6046 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 134773213 134773507 134773412 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 159752 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 135068223 135068386 135068305 Y NTNG2 NTNG2 NA NA NA NA NTNG2 32889 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 135248049 135248343 135248270 Y SETX SETX,TTF1 NA NA NA NA SETX 19677 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 135257633 135257732 135257683 Y SETX SETX,TTF1 NA NA NA NA TTF1 22477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 135279793 135280144 135280078 Y TTF1 TTF1 NA NA NA NA TTF1 65 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 135878294 135878662 135878488 Y NA EEF1A1P5,GTF3C5 NA NA NA NA EEF1A1P5 14154 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 135988765 135989084 135988965 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 48217 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 135994562 135994927 135994701 Y ADAMTSL2,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 42374 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 135995063 135995322 135995085 Y RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 41979 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 135999727 136000118 136000091 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 37183 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 136012982 136013095 136013034 Y RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 24206 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 136022907 136023306 136022967 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 13995 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 137219951 137220008 137219980 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 13007 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 137250651 137250992 137250728 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 43707 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 137348030 137348540 137348200 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 141086 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 137718262 137718824 137718799 Y NA NA NA NA NA NA FCN1 88985 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA MRPS2 41123 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 138915703 138915918 138915811 Y NA NA NA NA NA NA UBAC1 64477 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 139123667 139124081 139124003 Y SEC16A,NOTCH1,CARD9 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 11606 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 4.31634967038411 chr9 139136338 139136616 139136467 Y QSOX2 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 651 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 139294189 139294305 139294248 Y TRAF2,FAM69B,INPP5E DNLZ,CARD9,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E NA NA NA NA SDCCAG3 8756 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 139428258 139428617 139428423 Y NACC2,CARD9,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 9697 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 139428801 139428944 139428850 Y SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 9370 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 139433298 139433437 139433354 Y ABCA2,CARD9,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 4877 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 139434156 139434495 139434364 Y FUT7,NACC2,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 3819 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 139445894 139446087 139445949 Y SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-611D20.2 7230 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 139493398 139493576 139493438 Y NA NA MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-611D20.2 54734 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 139513037 139513494 139513208 Y CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7,ABCA2 RP11-251M1.1 MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-251M1.1 39379 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 139514178 139514562 139514471 Y CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7 RP11-251M1.1 MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-251M1.1 38311 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 139539341 139539721 139539606 Y CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,EGFL7,EGFL7 RP11-251M1.1,AGPAT2 SEC16A,C9orf163 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RP11-251M1.1 13152 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 139540454 139540544 139540487 Y FAM69B,EGFL7,EGFL7 RP11-251M1.1,AGPAT2 SEC16A,C9orf163 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RP11-251M1.1 12329 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 139540778 139541198 139541031 Y NOTCH1,NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7 RP11-251M1.1,AGPAT2 SEC16A,C9orf163 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RP11-251M1.1 11675 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chr9 139541579 139541677 139541660 Y NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7 RP11-251M1.1,AGPAT2 SEC16A,C9orf163 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-251M1.1 11196 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.62734327762511 chr9 139550372 139550684 139550526 Y FAM69B,EGFL7,EGFL7 RP11-251M1.1,AGPAT2 NA NA NA NA RP11-251M1.1 2189 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chr9 139551445 139551904 139551545 Y INPP5E,FAM69B,EGFL7,EGFL7 RP11-251M1.1,AGPAT2 NA NA NA NA RP11-251M1.1 969 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 139590539 139590822 139590769 Y FUT7,C9orf142,ABCA2 RP11-251M1.1,AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA AGPAT2 10664 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 139595249 139595639 139595357 Y SEC16A,FUT7,C9orf142,ANAPC2,ABCA2 RP11-251M1.1,AGPAT2,FAM69B,SNHG7 SNORA43,SNHG7 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM69B 9383 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 139595835 139596071 139595988 Y SEC16A,LCNL1,FUT7,C9orf142,ANAPC2,ABCA2 RP11-251M1.1,AGPAT2,FAM69B,SNHG7 SNORA43,SNHG7 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM69B 8951 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 9.38336884866111 chr9 140047623 140048201 140047695 Y NA DPP7,MIR3621,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1 NA NA NA NA MIR3621 13521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA RNF208 3555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chr9 140189199 140189592 140189229 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 5111 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 140294443 140294697 140294564 Y UAP1L1,C9orf167,NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 21017 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chr9 140523205 140523460 140523276 Y ANAPC2,NDOR1,EHMT1 ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA EHMT1 11761 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 3.19034540854478 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chrX 4628683 4629054 4628903 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 999034 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 9320763 9320959 9320875 Y TBL1X,TBL1X NA TBL1X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1X 108376 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 9536624 9537203 9536862 Y TBL1X,TBL1X NA NA NA NA NA TBL1X 107289 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA TBL1X 271929 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 9979967 9980360 9980271 Y NA WWC3 NA NA NA NA WWC3 1242 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 10079384 10079999 10079621 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 43025 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chrX 10127294 10127534 10127336 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 4270 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 10128815 10129321 10128989 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 5791 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 10133570 10133893 10133819 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 10546 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 10135694 10135962 10135820 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 12670 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 10138679 10138762 10138721 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 15655 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 12974854 12975280 12975169 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 15947 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 12991564 12992257 12991938 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 337 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 12996273 12996492 12996427 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 5046 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 13108770 13109761 13109358 Y TLR8,TMSB4X NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 117543 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 13208985 13209208 13209149 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 GPX1P1 186251 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 13414990 13415289 13415163 Y NA GPX1P1 FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPX1P1 19531 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 13958141 13958523 13958388 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 87489 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 15769418 15769925 15769650 Y PIGA,CA5B,ZRSR2 ZRSR2 NA NA NA NA ZRSR2 36670 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 16203717 16204054 16203956 Y NA RPL6P30 CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P30 11358 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 19701008 19701387 19701257 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 202332 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 19734259 19734420 19734314 Y CXorf23,SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 169299 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 19774987 19775285 19775138 Y NA NA NA NA NA NA SH3KBP1 128434 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 19859063 19859320 19859184 Y SH3KBP1 SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 44399 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 22007452 22007864 22007637 Y NA PHEX NA NA NA NA PHEX 40695 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 23448720 23448865 23448793 Y NA NA NA NA NA NA PRDX4 231514 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 23971140 23971524 23971479 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 47083 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chrX 24187705 24188069 24187889 Y NA ZFX NA NA NA NA ZFX 22415 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 30675885 30676221 30676093 Y CXorf21,GK GK NA NA NA NA GK 6409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 36121615 36121639 36121627 Y NA NA NA NA NA NA RPS15AP40 269659 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 38338792 38338989 38338897 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN7 79634 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 39118729 39118972 39118855 Y NA NA NA NA NA NA MID1IP1 460044 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chrX 39680161 39680842 39680511 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 34771 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 39714493 39714779 39714604 Y BCOR NA NA NA NA NA GAPDHP1 69103 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 39719139 39719410 39719301 Y BCOR NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 73749 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 39806135 39806423 39806318 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 160745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 39865489 39865898 39865566 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 168684 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 39964528 39964690 39964611 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 69892 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 39964938 39965503 39965246 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 69079 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 40012729 40012965 40012840 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 21617 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.938336884866111 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 40034377 40034649 40034428 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 0 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chrX 40132742 40132979 40132844 Y ATP6AP2 NA BCOR K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 98160 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 40902136 40902158 40902147 Y NA USP9X MED14 IMR90 Hi-C 24141950 USP9X 40730 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.750669507892889 chrX 41097774 41098084 41098012 Y USP9X,GPR82,DDX3X NA NA NA NA NA DDX3X 92567 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 41125005 41125150 41125071 Y NA NA DDX3X,USP9X IMR90 Hi-C 24141950 DDX3X 65501 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 43728223 43728397 43728303 Y NA NA NA NA NA NA EFHC2 472521 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 44173548 44173763 44173665 Y NA EFHC2 NA NA NA NA EFHC2 27155 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 44174118 44174402 44174260 Y MAOB,EFHC2 EFHC2 NA NA NA NA EFHC2 26516 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 44927976 44928345 44928046 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 197219 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 45618389 45618809 45618683 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13859 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chrX 45631125 45631239 45631172 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 26595 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 46773328 46773680 46773526 Y NA NA NA NA NA NA RP2 78953 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 48648070 48648274 48648122 Y SSX3,SLC38A5,MAGIX,GATA1,HDAC6 GATA1,HDAC6 NA NA NA NA GATA1 5108 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 53741584 53742291 53741941 Y KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8 HUWE1 HUWE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HUWE1 29911 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chrX 54668047 54668238 54668126 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 113403 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 64815346 64815780 64815481 Y MSN MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 9089 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 64818518 64818695 64818582 Y NA MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 12261 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 65207808 65208088 65207980 Y MSN MIR223,VSIG4 NA NA NA NA MIR223 28624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 40441 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 67914058 67914579 67914414 Y STARD8 STARD8 NA NA NA NA STARD8 48550 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO RP5-1091N2.9 NA NA NA NA RP5-1091N2.9 13891 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 70842464 70842816 70842607 Y TAF1,OGT,CXCR3 CXCR3 NA NA NA NA CXCR3 6097 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 71089658 71089933 71089796 Y NA NHSL2 NA NA NA NA NHSL2 39005 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 71328161 71328456 71328268 Y FLJ44635 RGAG4 NA NA NA NA RGAG4 21302 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 71341349 71341530 71341428 Y FLJ44635 RGAG4 NA NA NA NA RGAG4 8228 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 71402877 71403170 71402921 Y NA PIN4 NA NA NA NA PIN4 3674 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 73510244 73510542 73510484 Y RLIM FTX NA NA NA NA FTX 867 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 73833460 73833840 73833652 Y NA RLIM NA NA NA NA RLIM 1008 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA P2RY10 289866 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 78514564 78514938 78514760 Y P2RY10,GPR174 NA NA NA NA NA ITM2A 106226 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 102810293 102810676 102810485 Y NA TCEAL4,TCEAL3 NA NA NA NA TCEAL4 18483 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 103570216 103570358 103570287 Y NA NA NA NA NA NA FAM199X 160915 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 106917022 106917635 106917444 Y NA PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 47285 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 2.06434114670544 chrX 106928255 106928525 106928381 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 58518 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 106942927 106943203 106943078 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 NA NA NA NA NA PRPS1 73190 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.87667376973222 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 111949700 111949719 111949710 Y NA NA NA NA NA NA ALG13 1042657 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 115238483 115238690 115238635 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 155061 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 117654579 117654738 117654653 Y LONRF3 DOCK11 NA NA NA NA DOCK11 26718 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 118149361 118149839 118149621 Y LONRF3 NA NA NA NA NA HNRNPA1P28 202906 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 118175275 118175676 118175499 Y LONRF3 NA LONRF3,KIAA1210 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P28 177069 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 118816365 118816526 118816445 Y NKRF,RPL39,RNF113A,SEPT6 SEPT6 NA NA NA NA SEPT6 8807 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 118819274 118819809 118819515 Y UBE2A,UBE2A,SEPT6 SEPT6 NA NA NA NA SEPT6 5524 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 1.12600426183933 chrX 119385485 119385791 119385733 Y NA NKAPP1,ZBTB33 NA NA NA NA ZBTB33 2878 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 124320424 124320430 124320427 Y NA NA NA NA NA NA SH2D1A 842230 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 128238716 128238747 128238732 Y NA NA NA NA NA NA OCRL 433079 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 128892181 128892423 128892313 Y ELF4,ELF4,SASH3 SASH3 SASH3 IMR90 Hi-C 24141950 SASH3 19532 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 128917393 128917858 128917649 Y ELF4,ELF4,BCORL1,SASH3 SASH3 NA NA NA NA SASH3 5438 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 129066097 129066492 129066260 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 28000 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 129226171 129226435 129226352 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 16256 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chrX 129307329 129307713 129307433 Y NA AIFM1,RAB33A NA NA NA NA RAB33A 3706 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.563002130919667 chrX 129950617 129950764 129950691 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 84444 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 130952432 130952771 130952603 Y NA NA NA NA NA NA MST4 202522 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 131222922 131223204 131223042 Y MST4,MST4,RAP2C RP1-305B16.3 NA NA NA NA RP1-305B16.3 40176 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 133320992 133321049 133321007 Y NA NA NA NA NA NA PHF6 184234 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 135252733 135252893 135252813 Y FHL1,FHL1 FHL1 NA NA NA NA FHL1 25174 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 139814619 139814812 139814632 Y NA NA NA NA NA NA ATP11C 789184 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 148595188 148595518 148595383 Y IDS,CXorf40A IDS,CXorf40A,LINC00893 NA NA NA NA IDS 17952 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 150018859 150019330 150019048 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 45959 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 150562078 150562258 150562159 Y NA VMA21 VMA21 MCF7 ChIA-PET 22265404 VMA21 729 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 152812807 152812922 152812865 Y SLC6A8 NA NA NA NA NA FAM58A 50578 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 153152883 153153053 153153003 Y RENBP L1CAM,ARHGAP4,NAA10 NA NA NA NA L1CAM 19624 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 153166203 153166850 153166548 Y ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP L1CAM,ARHGAP4,NAA10,RENBP NA NA NA NA L1CAM 5827 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 153946199 153946375 153946299 Y TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3 GAB3,DKC1 NA NA NA NA GAB3 31483 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrX 153962169 153963128 153962765 Y EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3 GAB3,DKC1 CTAG2 IMR90 Hi-C 24141950 GAB3 14730 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 154030534 154030629 154030574 Y EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1 DKC1,MPP1 NA NA NA NA MPP1 16653 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrX 154256125 154256514 154256179 Y IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2 FUNDC2,BRCC3 NA NA NA NA FUNDC2 3870 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.375334753946444 chrY 7143028 7143486 7143308 Y AMELY PRKY NA NA NA NA PRKY 3015 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrY 13687009 13687218 13687129 Y NA NA NA NA NA NA TTTY15 1085047 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrY 14775457 14775545 14775476 Y NA TTTY15 NA NA NA NA TTTY15 3192 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA DDX3Y 193325 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrY 28555183 28555400 28555298 Y NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5819572 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 5.067019178277 chrY 28555690 28555797 28555743 Y NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5820079 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222 chrY 59019812 59020026 59019919 Y NA NA NA NA NA NA EIF1AY 36284201 CAGE Kasumi-3 hg19 FANTOM5 0.187667376973222