chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	1136667	1137146	1136877	Y	HES4,MIB2	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	28265	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	19954	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	5160051	5160190	5160114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AJAP1	447259	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	6342321	6342466	6342446	Y	NA	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	23286	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	8721734	8722143	8721896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	153559	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	9223692	9223875	9223840	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2,RP3-510D11.1	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	16388	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	9225492	9225752	9225745	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2,RP3-510D11.1	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-510D11.2	14511	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	9241165	9241560	9241362	Y	NA	RP3-510D11.2,RP3-510D11.1	SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	902	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	9535183	9535425	9535306	Y	NA	NA	SPSB1,H6PD,SLC25A33,TMEM201	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	62116	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	11559549	11559947	11559917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO44	152485	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	12238984	12239461	12239321	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D	TNFRSF1B,VPS13D	VPS13D	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1B	13924	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	15742467	15743324	15742634	Y	TMEM51,TMEM51,SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	8076	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.82230671908414
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	19762527	19762798	19762680	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	47268	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	17270	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	22236410	22236692	22236686	Y	NA	HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	25098	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	23748973	23749126	23749052	Y	NA	TCEA3	NA	NA	NA	NA	TCEA3	107	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	24680333	24680598	24680466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	59686	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	MIR3917	29188	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr1	27160002	27160387	27160288	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	8801	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	GPN2	22861	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	27625914	27626081	27626007	Y	TRNP1,MAP3K6,TMEM222	TMEM222,RP11-4K3__A.5	NA	NA	NA	NA	TMEM222	20570	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	27869425	27869556	27869494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	54756	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	32166698	32166999	32166824	Y	COL16A1	COL16A1	NA	NA	NA	NA	COL16A1	921	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	COL16A1,BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL16A1	12683	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	36428229	36428381	36428320	Y	STK40,EIF2C4,THRAP3,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	124095	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	36721428	36721771	36721600	Y	NA	THRAP3,SH3D21	NA	NA	NA	NA	THRAP3	33411	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	38285621	38285821	38285720	Y	ZC3H12A,MTF1	MANEAL,C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	YRDC	13764	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	38466019	38466413	38466271	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L	NA	NA	NA	NA	FHL3	2865	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	39736190	39736575	39736327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	137576	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	15628	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	141529	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	42081979	42082196	42082088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	376153	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	370805	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	43975817	43975939	43975873	Y	NA	PTPRF	SZT2,HYI,PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	12919	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	45283789	45284126	45283958	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	120	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	53566298	53566719	53566319	Y	NA	PODN	NA	NA	NA	NA	PODN	40444	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	58969564	58969575	58969570	Y	NA	DAB1,OMA1	NA	NA	NA	NA	DAB1	40831	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	60598724	60598934	60598848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	729997	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	60944384	60944420	60944402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	384511	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	62810220	62810245	62810233	Y	NA	NA	KANK4	IMR90	Hi-C	24141950	USP1	89723	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.17509505896966
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	71377	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	72155856	72156188	72156023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	590229	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	4.93903675839725
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	78171350	78171363	78171357	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	24246	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	78196845	78197195	78197020	Y	NA	ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	26342	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	78298815	78299027	78298921	Y	NA	NA	NEXN	IMR90	Hi-C	24141950	NEXN	53171	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.82230671908414
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL7	2193245	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr1	85791287	85791404	85791348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	50514	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	85796595	85797055	85796822	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55822	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	85810010	85810182	85810130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	69237	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.46951837919863
chr1	85968002	85968172	85968087	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	73761	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr1	85991291	85991622	85991523	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	50311	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	85992810	85993270	85993105	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	48663	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	86010493	86010816	86010648	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31117	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	34017	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	90204490	90205244	90205062	Y	LRRC8C,ZNF326,LRRC8D	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	79329	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF326	81915	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	93002551	93002867	93002761	Y	RPAP2,GLMN,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-59P	161624	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	94224546	94224929	94224684	Y	DNTTIP2	NA	MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR3	85777	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	95179307	95179605	95179478	Y	F3	NA	F3,ABCD3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	104232	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	372241	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	67841	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	101775588	101775858	101775753	Y	S1PR1	NA	NA	NA	NA	NA	S1PR1	75144	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	109159407	109159722	109159520	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	42426	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	109515208	109515609	109515409	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	CLCC1	11097	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	113013577	113014004	113013781	Y	CAPZA1	NA	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2NL	76774	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	113014906	113015158	113015047	Y	CAPZA1	NA	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2NL	78103	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	115873164	115873576	115873409	Y	NGF	NGF	NA	NA	NA	NA	NGF	5281	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	116192035	116192337	116192186	Y	NA	VANGL1	NA	NA	NA	NA	VANGL1	9461	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	581054	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	144871122	144871347	144871255	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	61378	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	145023690	145024549	145024240	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	49637	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	145054975	145055306	145055182	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	18880	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	145058996	145059322	145059204	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	14864	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	145065013	145065489	145065359	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	PDE4DIP	8697	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	145092450	145092883	145092733	Y	SEC22B,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	1337	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	145106553	145106772	145106662	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	12333	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	150668096	150668276	150668180	Y	NA	GOLPH3L	NA	NA	NA	NA	GOLPH3L	466	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	153095466	153095607	153095484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A6	411113	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	153824989	153825297	153825210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	68154	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	SLC39A1	1327	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MTX1	11531	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	156541089	156541488	156541192	Y	NA	IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4	MEF2D,C1orf61	IMR90	Hi-C	24141950	IQGAP3	693	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	161170260	161170636	161170567	Y	PCP4L1,ADAMTS4,NDUFS2	UFC1,USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,TOMM40L	NA	NA	NA	NA	ADAMTS4	3414	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	161324130	161324422	161324290	Y	NA	SDHC	NA	NA	NA	NA	SDHC	42083	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	162685333	162685375	162685354	Y	NOS1AP	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	86170	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	163005587	163006022	163005933	Y	UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	30543	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	167766380	167766616	167766548	Y	SFT2D2,CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	20870	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	168050664	168051125	168050872	Y	SFT2D2	NA	NA	NA	NA	NA	GPR161	53696	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	170633923	170634526	170634465	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	4054	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	170636506	170636902	170636792	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	6637	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	172853063	172853400	172853301	Y	NA	NA	LOC100506023,TNFSF18,TNFSF4	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	164703	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	138747	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr1	172900674	172900969	172900756	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	117134	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	172972573	172972790	172972603	Y	PRDX6	TNFSF18	NA	NA	NA	NA	TNFSF18	45313	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.17509505896966
chr1	173008475	173008781	173008627	Y	TNFSF18	TNFSF18	NA	NA	NA	NA	TNFSF18	9322	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	173167258	173167319	173167289	Y	NA	TNFSF4	NA	NA	NA	NA	TNFSF4	7133	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	175659647	175659870	175659824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	229241	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	176174471	176174980	176174673	Y	RFWD2	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	183237084	183237447	183237420	Y	NA	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	83711	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	184773428	184773803	184773695	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	51381	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	185408687	185409225	185409010	Y	NA	NA	IVNS1ABP,LOC100288079	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	124226	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	186936898	186937303	186937025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	140813	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	192914637	192914772	192914747	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	NA	NA	NA	NA	NA	TROVE2	111780	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	198087299	198087585	198087454	Y	NEK7	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	36508	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	198090244	198090551	198090353	Y	NA	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	33542	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	198650930	198651643	198651116	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	526837	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	198840125	198840497	198840438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	716032	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	198888798	198889070	198888879	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	764705	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	199187777	199188161	199187969	Y	NA	NA	LOC100131234	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	1063684	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	200321353	200321596	200321470	Y	DDX59,ZNF281	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	55588	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	201611388	201611697	201611489	Y	NA	NAV1	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	NAV1	20977	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr1	201711711	201712036	201711993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	84233	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	201739210	201739573	201739298	Y	CSRP1,CSRP1,CSRP1,NAV1,NAV1,SHISA4	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	56696	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	201768733	201769083	201768901	Y	NA	IPO9,IPO9-AS1	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	27186	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	203525711	203525894	203525744	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	67795	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	204961641	204962301	204961818	Y	MDM4,RBBP5,NUAK2	CNTN2	NA	NA	NA	NA	CNTN2	48024	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	204976101	204976640	204976291	Y	LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,KLHDC8A,DSTYK,CNTN2,CDK18,NFASC	CNTN2	NA	NA	NA	NA	CNTN2	33685	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	208381145	208381344	208381321	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	34321	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	209938931	209939742	209939534	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3,C1orf74	C1orf74	NA	NA	NA	NA	C1orf74	16162	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	209978699	209978810	209978755	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6	C1orf74,DIEXF	NA	NA	NA	NA	DIEXF	20542	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	211500826	211501119	211501083	Y	TRAF5,TRAF5	TRAF5	NA	NA	NA	NA	TRAF5	2869	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	212723252	212723516	212723384	Y	BATF3,ATF3	ATF3	ATF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF3	13160	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	219497639	219497836	219497817	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	152453	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	221135331	221135824	221135593	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	85632	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	221340978	221341184	221341062	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	291279	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1A	122071	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	224014874	224015267	224015181	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	16407	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	224023477	224023773	224023693	Y	CAPN2,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	7901	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr1	224598124	224598418	224598271	Y	WDR26	CNIH3,WDR26	NA	NA	NA	NA	CNIH3	21944	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	228272073	228272409	228272248	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	3712	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	234163168	234163347	234163228	Y	SLC35F3	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.1	327540	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	234630919	234631525	234631418	Y	TARBP1	TARBP1,RP5-855F14.1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	18070	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	234749342	234749645	234749570	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	LINC00184,LOC100506810,ARID4B	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	6071	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	235114050	235115068	235114636	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	175183	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	235120162	235120433	235120341	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	169818	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	235835688	235836968	235835896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	169907	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	236135691	236135959	236135881	Y	GPR137B	NA	LYST	IMR90	Hi-C	24141950	NID1	90503	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	237029172	237029469	237029246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	72562	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	240565334	240565372	240565353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM2	208077	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPN3	57207	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	243995795	243995860	243995825	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	16521	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	244417754	244418100	244418029	Y	AKT3,AKT3,ZNF238,ADSS	NA	LOC339529,AKT3,SDCCAG8,ZNF238	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	195336	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	245399077	245399186	245399185	Y	KIF26B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	82790	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	246038342	246038749	246038555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	629865	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	246432471	246432772	246432681	Y	SMYD3,CNST	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	235842	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	224300	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr10	644331	644586	644526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	89097	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	3928866	3929216	3928980	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	103393	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	3985648	3985956	3985684	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-433J20.1	105962	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	4386754	4387085	4386858	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	102650	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	4394953	4395258	4395067	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	110849	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	4910442	4910783	4910685	Y	NA	AKR1C1	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	22013	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	6281305	6281494	6281382	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	96424	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	6389510	6390540	6390147	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	204629	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	11217991	11218170	11218104	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	172732	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	11983561	11983569	11983563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	99600	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	13915234	13915426	13915347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	288307	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	14012361	14012685	14012430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	385434	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	14051386	14052060	14051814	Y	PRPF18	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	424459	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	14417107	14417451	14417285	Y	NA	NA	FRMD4A,FAM107B,PRPF18	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	84690	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr10	14438165	14438288	14438234	Y	NA	NA	FRMD4A,MIR1265	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	63853	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	21799318	21799715	21799601	Y	C10orf113	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	21379	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	22628998	22629520	22629110	Y	EBLN1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	20858	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	26775885	26776759	26776046	Y	APBB1IP,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50753	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	28432154	28432413	28432284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAC	387009	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	29766430	29766710	29766570	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	70099	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	SVIL	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	49497	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	30096449	30096548	30096521	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	72739	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	30331172	30331392	30331282	Y	MAP3K8,KIAA1462	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	71031	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	31364412	31364707	31364567	Y	NA	ZNF438	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	45546	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	NA	NA	NA	NA	RP11-462L8.1	5078	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	33415871	33415993	33415948	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	123151	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	35573688	35573878	35573784	Y	NA	CCNY	NA	NA	NA	NA	CCNY	39735	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.17509505896966
chr10	45927566	45927962	45927775	Y	FAM21C,ANUBL1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH8	160392	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	52751732	52752116	52752062	Y	PRKG1	PRKG1	NA	NA	NA	NA	PRKG1	2787	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	52753196	52753414	52753311	Y	PRKG1	PRKG1	NA	NA	NA	NA	PRKG1	4251	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	53406907	53407200	53407014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	50155	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	54438333	54438755	54438445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	366277	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	59225008	59225237	59225107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPMK	800457	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	59452175	59452288	59452232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPMK	573406	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13C	185197	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	63779948	63780456	63780395	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	120889	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	63839926	63839992	63839961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	180867	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	64305550	64305691	64305659	Y	EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	173599	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	64320064	64320236	64320175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	188113	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	64324371	64324598	64324504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	192420	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	64337534	64337777	64337652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	205583	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	71675422	71675425	71675424	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	115778	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B	NA	NA	NA	NA	UNC5B	3461	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	76916394	76916800	76916595	Y	MYST4,SAMD8	NA	NA	NA	NA	NA	VDAC2	51112	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	78059263	78059337	78059300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	700265	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	81159335	81159579	81159503	Y	ZCCHC24	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	43804	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	88171108	88171487	88171271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPAL	108085	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS,ACTA2	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr10	90844295	90844413	90844369	Y	NA	NA	FAS,LIPA,CH25H	IMR90	Hi-C	24141950	ACTA2	95148	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	93320562	93320757	93320661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	70054	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	93991232	93991452	93991342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	57392	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	95201631	95201931	95201645	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	38143	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	97311589	97311866	97311827	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	7305	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	98956083	98956405	98956104	Y	C10orf62	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP19	94008	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr10	104406463	104406725	104406695	Y	NFKB2,NFKB2,TRIM8	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	4210	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	849	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	105436153	105436400	105436275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	176901	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.17509505896966
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	113291830	113292231	113292158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRA2A	457040	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	120968752	120969030	120968753	Y	EIF3A,GRK5	SFXN4,PRDX3,GRK5	NA	NA	NA	NA	GRK5	3651	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	100289	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC23IP	179463	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	127816655	127816897	127816742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	233547	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	127822846	127823186	127823128	Y	MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	239738	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	128075178	128075883	128075417	Y	ADAM12	ADAM12	NA	NA	NA	NA	ADAM12	154	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	589256	589485	589371	Y	SIGIRR	RASSF7,MIR210HG,PHRF1,IRF7	NA	NA	NA	NA	PHRF1	14770	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	1870283	1870513	1870420	Y	CTSD,MOB2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP39	58500	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	1988846	1989279	1989052	Y	IGF2,TH,IGF2,IGF2,SYT8,TNNI2,TNNI2,TNNT3	MRPL23	NA	NA	NA	NA	MRPL23	22338	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	2465201	2465287	2465244	Y	INS	TSSC4	NA	NA	NA	NA	TSSC4	45483	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	2619837	2620105	2619972	Y	TRPM5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	99119	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	9588297	9588534	9588393	Y	NA	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	4694	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	9710363	9710796	9710568	Y	NA	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	26739	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	10003812	10004242	10004040	Y	ADM	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	309512	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	10633912	10633952	10633935	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,RNF141	NA	NA	NA	NA	NA	MRVI1-AS1	73093	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	10951981	10952433	10952195	Y	NA	NA	EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBED5	73638	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	DKK3	NA	NA	NA	NA	DKK3	30248	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-631K18.5	4368	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr11	12132692	12132808	12132735	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19149	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	12133218	12133350	12133292	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19675	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	12148184	12148552	12148402	Y	NA	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	34641	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	12177917	12178047	12177953	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	64374	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	12222498	12222995	12222733	Y	MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	108955	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.82230671908414
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	14306265	14306627	14306419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAS2	77425	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	17335831	17335998	17335921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	108131	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	146598	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	17929463	17929485	17929474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERGEF	103224	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	12477	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	18646989	18647318	18647154	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	7020	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	27481800	27481840	27481820	Y	NA	LGR4,LIN7C	NA	NA	NA	NA	LGR4	10482	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	27682701	27682852	27682777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58753	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	27693843	27694020	27693988	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	47585	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	27715832	27716154	27716086	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	25451	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	28776161	28776492	28776325	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	53999	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	28792909	28793103	28792913	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	70747	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	133042	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	135691	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr11	28864582	28864807	28864697	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	142420	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	28997579	28997988	28997773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115J23.1	275417	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	29330322	29330692	29330507	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	608160	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	37809838	37809966	37809929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	1195787	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	39183372	39183493	39183434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	2569321	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	43955473	43955506	43955502	Y	NA	C11orf96	NA	NA	NA	NA	C11orf96	10581	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	44221715	44221986	44221792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	106616	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CTD-2589M5.4,CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	28900	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	47939528	47939960	47939626	Y	OR4B1,OR4S1,NUP160	RP11-793I11.1	PTPRJ,NUP160	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-793I11.1	14369	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	48004294	48004631	48004323	Y	CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	4181	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	57045764	57045851	57045815	Y	NA	TNKS1BP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	44575	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	57549936	57550183	57550060	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	31221	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	61065380	61065516	61065448	Y	NA	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	33166	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	61146248	61146454	61146376	Y	SLC15A3,VPS37C,DAGLA,CYBASC3,TMEM138,CYBASC3,SDHAF2,CPSF7,CPSF7	DAK,DDB1,TMEM138,TMEM216,CPSF7,SDHAF2	NA	NA	NA	NA	TMEM216	10705	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	62248272	62248499	62248283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	62972	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	65121352	65121551	65121543	Y	NA	CDC42EP2,DPF2,FRMD8	NA	NA	NA	NA	DPF2	22127	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	65220740	65221001	65220852	Y	NA	NEAT1,AP000769.1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	AP000769.1	12	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.17509505896966
chr11	65379476	65379605	65379541	Y	FAU,CAPN1,RNASEH2C,EFEMP2,CCDC85B,C11orf68,FAM89B,MAP3K11	SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	MAP3K11	1248	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CST6,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CST6	5662	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	65875756	65875846	65875802	Y	NA	PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	39922	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	68921150	68921435	68921292	Y	NA	NA	ORAOV1,CCND1,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	106785	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	69069522	69069665	69069598	Y	TPCN2	NA	NA	NA	NA	NA	TPCN2	255157	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	69965939	69966135	69966116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FADD	81134	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	73989657	73990002	73989928	Y	NA	P4HA3	PPME1	IMR90	Hi-C	24141950	P4HA3	30700	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	74397873	74397982	74397928	Y	NA	CHRDL2	NA	NA	NA	NA	CHRDL2	42448	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	75538796	75538953	75538875	Y	NA	UVRAG	NA	NA	NA	NA	UVRAG	14584	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	75883349	75883640	75883491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	206375	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	78003105	78003596	78003355	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	105237	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	86452946	86453377	86453076	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	46724	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	27512	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	89222982	89223368	89223335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOX4	97411	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	95987343	95987574	95987537	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	86770	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	95990308	95990455	95990418	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	83889	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	95994127	95994433	95994401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	79911	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	103316988	103317242	103317115	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	38603	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	106138718	106139012	106138865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD3	192226	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	109958650	109959379	109958908	Y	NA	ZC3H12C	ZC3H12C	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H12C	2708	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	114152118	114152374	114152253	Y	ZBTB16,NNMT	NNMT	NNMT	IMR90	Hi-C	24141950	NNMT	25609	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	118481750	118482023	118481896	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	6595	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	118489001	118489167	118489084	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	13846	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	121915938	121916278	121916104	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1,BLID,SORL1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR125B1	52274	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	121947541	121947705	121947629	Y	NA	MIR125B1,RP11-166D19.1	NA	NA	NA	NA	MIR125B1	20847	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	121983293	121983692	121983594	Y	NA	MIR125B1,RP11-166D19.1,MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	RP11-166D19.1	1339	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	122059856	122060218	122060121	Y	NA	MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR100	38840	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	122072667	122072944	122072770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR100	51651	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	122989373	122989577	122989478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	57435	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	123471620	123471812	123471715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	138571	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	124611800	124612504	124612072	Y	NA	SIAE,NRGN,ESAM	NA	NA	NA	NA	NRGN	4058	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	125047891	125048113	125048002	Y	NA	PKNOX2	FEZ1	IMR90	Hi-C	24141950	PKNOX2	15308	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	125145861	125146105	125145988	Y	PKNOX2,FEZ1	NA	NA	NA	NA	NA	PKNOX2	113278	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	126188574	126188806	126188644	Y	NA	TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	16361	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	128352415	128352744	128352497	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	102709	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	128604470	128604603	128604537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLI1	50040	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	129013172	129013631	129013445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLI1	458742	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	131630069	131630486	131630160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	134516	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	131902527	131902770	131902649	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	137525	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	131924772	131924995	131924886	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	159770	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	131928107	131928500	131928434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	163105	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	131934936	131935322	131935091	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	169934	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr11	131995649	131996509	131995944	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	230647	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr11	133734615	133734790	133734669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-713P17.3	165377	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	1314182	1314497	1314340	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	ERC1	216507	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	1769144	1769497	1769318	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	26243	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	2374154	2374447	2374269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	262453	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	6.35019011793932
chr12	2405056	2405457	2405242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	293355	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	2749982	2750016	2749999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP4	152103	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	5198025	5198415	5198167	Y	NA	NA	NTF3,KCNA6,ANO2,VWF	IMR90	Hi-C	24141950	NTF3	340863	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	5542952	5543350	5543174	Y	NTF3,NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	3674	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr12	5566178	5566568	5566311	Y	NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	26900	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	8307747	8307921	8307806	Y	CLEC6A,CLEC4E,CLEC4D,C3AR1,NECAP1,CLEC4A	NA	NA	NA	NA	NA	NECAP1	74940	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	8605684	8606164	8606043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARNA11	141941	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	10337097	10337455	10337232	Y	NA	OLR1,GABARAPL1	NA	NA	NA	NA	OLR1	14360	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	11486966	11487331	11487130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	164794	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	11893113	11893308	11893155	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	92325	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	11918792	11919487	11919193	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	118004	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	11949422	11949819	11949574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	148634	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28488	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	16899142	16899376	16899259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1018J11.1	240684	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	19343816	19343915	19343891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	63168	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	39718	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	25207728	25208290	25207976	Y	C12orf77,KRAS,CASC1,LRMP	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662I13.1	89290	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	26427494	26428032	26427844	Y	NA	NA	SSPN,BHLHE41,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.3	149944	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	27332593	27333057	27332936	Y	STK38L	NA	STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK38L	61844	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	27346815	27347118	27346987	Y	NA	STK38L	STK38L,REP15,PPFIBP1,C12orf71	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK38L	47783	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	27513734	27513812	27513790	Y	NA	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	29947	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	44386878	44387178	44387042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM117	159108	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	45644542	45644793	45644668	Y	ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	36718	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	46825426	46825886	46825665	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	49964	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	6.35019011793932
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	74.4383397158443
chr12	47596373	47596459	47596419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	124639	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	47606052	47606349	47606300	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	134318	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	47787801	47788194	47788086	Y	NA	NA	AMIGO2,RPAP3	IMR90	Hi-C	24141950	RPAP3	309650	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	48297772	48297979	48297886	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	36852	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	48431282	48431505	48431439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKM	65417	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	49276307	49276420	49276362	Y	OR8S1,RND1	DDX23,CCDC65,FKBP11	RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CCDC65	19473	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	50555629	50555991	50555816	Y	ACCN2,DIP2B	CERS5	NA	NA	NA	NA	CERS5	3297	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	50913232	50913640	50913328	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	16464	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVRL1	56366	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	52249721	52249808	52249784	Y	SLC4A8,FIGNL2	ACVRL1	BIN2,SCN8A,SLC4A8,ANKRD33,ACVR1B,GALNT6,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVRL1	48884	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	52617951	52618303	52618240	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	6001	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	49739	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	33875	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	54804400	54804529	54804465	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	6715	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.82230671908414
chr12	57523550	57524188	57523895	Y	MBD6,DDIT3,NAB2,STAT6,STAT6,LRP1	TMEM194A,NAB2,LRP1	NA	NA	NA	NA	STAT6	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	57557421	57557508	57557464	Y	NA	LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	STAT6	33499	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	62315906	62316041	62315972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	336078	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	56366	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	63086673	63087045	63086801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	91207	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	64574864	64574988	64574911	Y	NA	C12orf66	NA	NA	NA	NA	C12orf66	39088	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	65926688	65927190	65926918	Y	NA	NA	MSRB3,HMGA2,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	67459	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	65959414	65959817	65959668	Y	NA	RP11-221N13.3	HMGA2,MSRB3,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	34832	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	66025227	66025796	66025503	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	30578	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	66028423	66029056	66028712	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	33774	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	66048868	66049228	66049091	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	54219	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	66089335	66089636	66089544	Y	IRAK3	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	94686	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr12	67752733	67753007	67752863	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	CAND1	91672	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr12	69418832	69418872	69418851	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	55482	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	70633612	70633702	70633681	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	1072	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	76890977	76890992	76890985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	60597	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	77166025	77166335	77166180	Y	NA	ZDHHC17	NA	NA	NA	NA	ZDHHC17	10657	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	77294765	77295012	77294889	Y	NA	CSRP2	CSRP2,ZDHHC17	IMR90	Hi-C	24141950	CSRP2	23925	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	78398192	78398473	78398333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	175507	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	89038835	89039086	89038961	Y	NA	NA	LOC728084	IMR90	Hi-C	24141950	KITLG	66207	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	90479667	90480000	90479790	Y	ATP2B1	NA	ATP2B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-654D12.2	205225	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	92987343	92988147	92987837	Y	EEA1,BTG1	NA	DCN,LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	332960	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	95477787	95477978	95477880	Y	NA	NR2C1	NR2C1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR2C1	12308	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	95594660	95595399	95595279	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	13859	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	96642925	96643253	96643074	Y	CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	56765	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	99235060	99235389	99235225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	198141	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	102329942	102330412	102330197	Y	DRAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DRAM1	60813	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	105324484	105324678	105324596	Y	CHST11,KIAA1033,SLC41A2	SLC41A2	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	25844	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	106328094	106328476	106328238	Y	CKAP4	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114F10.2	121556	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr12	106529993	106530447	106530148	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	1364	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr12	107424746	107425166	107425085	Y	NA	MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	45802	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	109116964	109117579	109117192	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5793	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	109167575	109167781	109167683	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	44203	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr12	109249389	109249909	109249762	Y	CORO1C,SSH1,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	23	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,ARPC3,GPN3	NA	NA	NA	NA	ARPC3	18728	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	112554455	112554606	112554536	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	TRAFD1,NAA25	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TRAFD1	6699	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	116590030	116590409	116590220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	122734	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	118466445	118466738	118466629	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	RFC5	17052	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	118632324	118632442	118632383	Y	NA	RPS2P5	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P5	49435	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	120689817	120690140	120689965	Y	CCDC64,RAB35,RNF10,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	11434	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	121715307	121715461	121715407	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	18650	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	123583230	123583584	123583407	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	48978	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	124486134	124486345	124486231	Y	NA	ZNF664,CCDC92,FAM101A	NA	NA	NA	NA	FAM101A	30346	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	124926088	124926324	124926239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123811	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr12	127725675	127725908	127725798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	77003	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	127769611	127770006	127769815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	120939	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	SNORA49,EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	171116	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr13	22243438	22243610	22243458	Y	FGF9	RPS7P10	NA	NA	NA	NA	FGF9	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr13	29106089	29106574	29106395	Y	NA	FLT1	FLT1,PAN3,POMP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FLT1	38824	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	31422053	31422459	31422280	Y	C13orf33	NA	USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX5AP	114408	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	31439697	31440107	31440029	Y	C13orf33	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	132052	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	33762622	33762899	33762709	Y	STARD13,STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	159868	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	35835884	35836142	35836013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	321460	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	37881013	37881265	37881086	Y	POSTN	NA	LINC00547	IMR90	Hi-C	24141950	POSTN	289716	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	38275506	38275878	38275580	Y	TRPC4	NA	NA	NA	NA	NA	POSTN	104525	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr13	42143744	42143800	42143772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	260403	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	44884974	44885381	44885134	Y	CCDC122,TSC22D1	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	60420	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	45333095	45333256	45333140	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	183812	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	47129209	47129516	47129266	Y	NA	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3906	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	47152736	47153076	47152881	Y	NA	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	27433	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	47369610	47369907	47369759	Y	NA	ESD	NA	NA	NA	NA	ESD	243	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	51800117	51800150	51800132	Y	DLEU7,FAM124A	FAM124A	NA	NA	NA	NA	FAM124A	5614	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	52218212	52218391	52218309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	61568	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	53775107	53775689	53775457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	550263	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	59980699	59980952	59980824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	755169	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	60033102	60033487	60033176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	702634	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	60338539	60338813	60338676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	397308	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	5814105	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	855761	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	74706134	74706569	74706487	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	77453598	77454010	77453765	Y	FBXL3,KCTD12	KCTD12	NA	NA	NA	NA	KCTD12	4530	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	78911933	78912082	78912037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF219	319232	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	79232403	79232753	79232546	Y	NA	RNF219	NA	NA	NA	NA	RNF219	1089	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	80078013	80078214	80078058	Y	NA	NDFIP2	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	24726	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	80510902	80511186	80511006	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	401900	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	93880621	93881133	93881009	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	3526	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr13	94297506	94297518	94297511	Y	GPC6	NA	NA	NA	NA	NA	GPC6	420411	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	95925874	95926219	95926059	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	25468	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	95938060	95938332	95938319	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	13355	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	97424682	97424992	97424817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	446696	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	98924976	98925080	98925019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP1	132160	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	GPR183	55832	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	101202947	101203040	101202996	Y	NA	RPS26P47	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	12419	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	101820185	101820500	101820343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	246343	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	106803810	106804031	106803901	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	414481	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	106808885	106809142	106808998	Y	NA	NA	EFNB2,LINC00460	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	409370	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	108919755	108919960	108919910	Y	TNFSF13B,LIG4,ABHD13	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	51028	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	110522374	110522680	110522537	Y	NA	NA	MYO16,IRS2,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	85459	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	110806854	110807322	110807103	Y	RAB20	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	148837	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	110902548	110902879	110902758	Y	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	53280	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	110956468	110956902	110956701	Y	COL4A2,COL4A1	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A2	309	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	110965035	110965206	110965124	Y	COL4A1,COL4A2	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	7539	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	110969695	110970088	110969892	Y	NA	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	12199	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	110982194	110982608	110982413	Y	NA	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	24698	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	110991031	110991380	110991291	Y	COL4A1,COL4A2	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	33535	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	111022548	111022884	111022711	Y	ING1	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	65052	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	111044675	111045176	111044974	Y	COL4A1,COL4A2	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	87179	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr13	111048888	111049110	111049017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	91392	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	111049993	111050394	111050073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	92497	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	111061947	111062361	111062286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	104451	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr13	111064452	111064750	111064655	Y	RAB20	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	106956	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	112711940	112712042	112711992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	528439	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	113982391	113982456	113982424	Y	NA	LAMP1,GRTP1	NA	NA	NA	NA	LAMP1	32835	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr13	114634569	114634891	114634593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	69523	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	23033088	23033184	23033134	Y	NA	TRAJ23,DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	22991	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	LRP10	19383	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	23584186	23584501	23584299	Y	C14orf119	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	ACIN1	21363	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	29227815	29227890	29227853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	270699	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	30663023	30663420	30663280	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	3919	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr14	30663968	30664325	30664158	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	4864	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	31905446	31905450	31905448	Y	NA	HEATR5A,RP11-176H8.1	NA	NA	NA	NA	HEATR5A	17658	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	32941850	32942320	32942112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	397851	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	35625298	35625573	35625393	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	35543	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	35755957	35756376	35756177	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	10118	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	48109739	48110114	48110083	Y	MDGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	441432	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr14	52006399	52006758	52006578	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	52581	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6-AS2	55266	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6-AS2	99010	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	52389104	52389259	52389151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	64934	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	52544712	52544946	52544828	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	11000	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	52547300	52547782	52547649	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	13588	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	53302326	53302477	53302407	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	45940	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	53361596	53362059	53361840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT2	55094	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	55035984	55036343	55036300	Y	SAMD4A	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	4169	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	55104908	55105113	55104939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	73093	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	55115744	55116109	55115959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	83929	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	59221069	59221139	59221083	Y	NA	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	38233	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	59330419	59330622	59330616	Y	NA	NA	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	71047	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	59861080	59861273	59861260	Y	DAAM1,RTN1	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	JKAMP	87888	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	220856	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	62032593	62032996	62032785	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	127235	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	62052395	62052634	62052478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	107597	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	62053265	62053527	62053394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	106704	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	62170336	62170562	62170449	Y	NA	HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1,HIF1A-AS2	NA	NA	NA	NA	HIF1A-AS1	9795	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	68571232	68571846	68571404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFYVE26	289925	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	68928051	68928068	68928059	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	41138	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	69328763	69329130	69328947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	67573	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	70387825	70388214	70387982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	68977	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	70555052	70555436	70555244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	236204	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	71828206	71828408	71828272	Y	PCNX,SIPA1L1	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	41675	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	71955425	71955735	71955597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	168894	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	71996595	71997083	71996703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	210064	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	72021992	72022911	72022768	Y	SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	235461	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	73110081	73110359	73110171	Y	NA	NA	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90	Hi-C	24141950	DPF3	248450	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	73131912	73132517	73132075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	226292	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	75040596	75041021	75040862	Y	LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	LTBP2	36285	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	76734272	76734379	76734290	Y	ESRRB	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	286938	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	79879176	79879207	79879192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	972893	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	79880226	79881040	79880569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	971060	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	80161976	80161991	80161984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	690109	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	80241894	80242194	80242045	Y	DIO2	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	609906	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	88884161	88884478	88884321	Y	NA	SPATA7	NA	NA	NA	NA	SPATA7	34893	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	89470593	89470919	89470743	Y	FOXN3	NA	EFCAB11,EML5,TTC8,FOXN3,TDP1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC8	182096	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	89887223	89887427	89887324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	196066	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	93051108	93051475	93051361	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	RIN3	72990	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	95984814	95985165	95984990	Y	NA	GLRX5,SCARNA13,SNHG10	NA	NA	NA	NA	GLRX5	12675	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	99706771	99707240	99707068	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	237976	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	100883887	100884104	100884057	Y	BEGAIN	WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	WARS	42745	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	102089844	102089938	102089891	Y	NA	NA	MEG8,LINC00523,MIR381,MIR376C,MIR654,MIR1185-1,MIR539,MIR376B,MIR495,MIR889,MIR1185-2,MIR300,MIR376A2,MIR376A1,MIR655,MIR487B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R5C	136197	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	102176439	102176788	102176690	Y	PPP2R5C	PPP2R5C	PPP2R5C,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R5C	49347	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	102277268	102277494	102277347	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	51133	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr14	102746257	102746658	102746398	Y	NA	MOK,ZNF839	NA	NA	NA	NA	MOK	22879	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	102836975	102837187	102837062	Y	NA	CINP,TECPR2	NA	NA	NA	NA	TECPR2	9675	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	103490121	103490395	103490347	Y	NA	CDC42BPB	NA	NA	NA	NA	CDC42BPB	31404	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr14	103848844	103849188	103848935	Y	TNFAIP2,EIF5,MARK3	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	541	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	105201949	105202125	105202062	Y	ADSSL1	INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	13426	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	25595443	25596209	25595953	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	85919	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	26106001	26106167	26106105	Y	UBE3A,ATP10A	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	2150	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	31620735	31621235	31621017	Y	MTMR10,KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	3677	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	33028073	33028475	33028235	Y	NA	GREM1,RP11-758N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	18865	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr15	33028976	33029226	33029070	Y	GREM1	GREM1,RP11-758N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	19768	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr15	33032997	33033143	33033070	Y	GREM1	GREM1,RP11-758N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	23789	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr15	33083952	33084023	33083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	74744	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	33120518	33121018	33120854	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	111310	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	33122479	33122828	33122652	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	113271	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	33123878	33123902	33123890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	114670	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	33124594	33124991	33124793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	115386	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	33133022	33133309	33133285	Y	GREM1	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-758N13.1	123814	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	33135808	33135977	33135886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	126600	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	33158575	33159178	33158960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	149367	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	35983013	35983197	35983137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	393372	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	38820654	38820765	38820702	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	35011	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39006951	39007336	39007132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	151175	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39174117	39174200	39174140	Y	C15orf53	NA	FSIP1,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	310310	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39175462	39175521	39175492	Y	NA	NA	FSIP1,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	308989	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39261255	39261645	39261450	Y	RASGRP1,C15orf53	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-265N7.1	222865	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39276567	39276774	39276671	Y	C15orf53	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	207736	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	122333	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	52098	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39432449	39432903	39432696	Y	C15orf54	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	51607	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39447330	39447720	39447666	Y	NA	RP11-265N7.1	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	36790	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr15	39458213	39458321	39458267	Y	THBS1	RP11-265N7.1	C15orf53,THBS1,FSIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-265N7.1	26189	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39484062	39484453	39484282	Y	NA	RP11-265N7.1	THBS1,FSIP1,C15orf53	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-265N7.1	57	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39563210	39563560	39563357	Y	THBS1	C15orf54	NA	NA	NA	NA	C15orf54	22325	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39650604	39651044	39650772	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	66352	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39673743	39674138	39673898	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	43258	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39702122	39702492	39702291	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	14904	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	39722195	39722553	39722498	Y	THBS1,C15orf54	RP11-624L4.1	C15orf53,FSIP1,THBS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-624L4.1	4799	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	5.29182509828277
chr15	39803650	39803776	39803696	Y	THBS1	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	67504	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	39866856	39867109	39867069	Y	FSIP1	THBS1	THBS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	THBS1	4171	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	40164744	40164978	40164948	Y	NA	GPR176	NA	NA	NA	NA	GPR176	46115	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	40192845	40193084	40192965	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	18009	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	45746745	45747578	45747238	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	8120	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	9844	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	48821826	48821860	48821843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN1	114186	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	48985825	48986062	48985871	Y	FBN1	FBN1	FBN1,CEP152,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	FBN1	49779	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	49087141	49087279	49087204	Y	NA	CEP152	NA	NA	NA	NA	CEP152	14064	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	49277375	49277481	49277428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECISBP2L	59279	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	49785048	49785439	49785238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF7	71755	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	50429549	50429984	50429688	Y	USP8,GABPB1	NA	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	GABPB1	215621	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	52369278	52369628	52369325	Y	MAPK6	NA	GNB5,BCL2L10,MYO5C	IMR90	Hi-C	24141950	LEO1	107275	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	52796168	52796272	52796220	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	22975	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	56201661	56201754	56201731	Y	NEDD4	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	82190	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	58732356	58732646	58732550	Y	NA	LIPC	NA	NA	NA	NA	LIPC	31588	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	59469975	59470287	59470131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74698	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	59646072	59646468	59646249	Y	NA	MYO1E	NA	NA	NA	NA	MYO1E	16631	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	60818402	60818756	60818740	Y	RORA	NARG2	NA	NA	NA	NA	NARG2	49043	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	60883059	60884017	60883872	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	NARG2	113700	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	60937521	60937640	60937631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARG2	168162	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	62683990	62684402	62684060	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3265	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	63368396	63368491	63368444	Y	NA	TPM1,LACTB	NA	NA	NA	NA	TPM1	35565	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	63484209	63484716	63484320	Y	LACTB,USP3,RAB8B	RPS27L,RAB8B	APH1B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB8B	4541	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	66006814	66006895	66006855	Y	NA	RAB11A	SLC24A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11A	9497	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	66971406	66971462	66971434	Y	NA	SMAD6	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	21104	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	67413336	67413759	67413492	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	59235	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	86574	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	68588456	68588855	68588647	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20315	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	68641532	68641916	68641757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEM1B	73391	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	68993008	68993104	68993034	Y	CORO2B,CORO2B	NA	NA	NA	NA	NA	SPESP1	115456	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	70679327	70679587	70679457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	290812	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	71008529	71008840	71008773	Y	NA	UACA	NA	NA	NA	NA	UACA	45092	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	71657535	71657734	71657662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP6	513037	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	109696	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	74223574	74223817	74223712	Y	LOXL1	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	7244	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	74258069	74258363	74258216	Y	C15orf59	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	26600	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	74721161	74721821	74721539	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A,UBL7	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	2987	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3	NA	NA	NA	NA	EDC3	32032	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	77351977	77352357	77352309	Y	NA	TSPAN3	PSTPIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN3	21969	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	77543876	77544254	77544063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAK1	166232	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	78953383	78953770	78953429	Y	MORF4L1	RPL18P11	CHRNA5,CHRNB4,LOC729911	IMR90	Hi-C	24141950	RPL18P11	1465	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	22929	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	80773280	80773702	80773515	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	78588	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr15	81082693	81083043	81082764	Y	KIAA1199	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	13009	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	81099060	81099288	81099113	Y	NA	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	29376	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	81197356	81197718	81197537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	82501	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	81316981	81317108	81317017	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	25686	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	83777211	83777631	83777545	Y	NA	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	3052	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr15	85225191	85225385	85225287	Y	PDE8A,ZNF592	WDR73,NMB,SEC11A	NA	NA	NA	NA	NMB	25397	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	89878895	89879173	89879043	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	2803	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	BLM	NA	NA	NA	NA	BLM	49562	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	91673515	91673609	91673520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS33B	109682	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	92461389	92461789	92461546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	66464	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	92509194	92509613	92509420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	114269	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	117845	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	96867848	96868085	96868000	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	505	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	96871345	96871608	96871517	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	2755	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	766	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	101733484	101734132	101733815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY1	56005	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr15	101739961	101740273	101740216	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	49864	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr15	101746461	101746795	101746690	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	43342	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	39163	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	1587113	1587406	1587251	Y	CLCN7	TELO2,TMEM204	NA	NA	NA	NA	TMEM204	10424	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	ZNF174	NA	NA	NA	NA	ZNF174	33998	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	3996199	3996445	3996330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	67472	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	4427155	4427449	4427262	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	7306	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr16	6132184	6132568	6132193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAGPA	1050042	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAGPA	1271291	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	8852303	8852368	8852337	Y	NA	PMM2,TMEM186	PMM2,TMEM186	IMR90	Hi-C	24141950	PMM2	28312	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	9221431	9221974	9221622	Y	USP7,C16orf72	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	37926	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr16	12505664	12505801	12505722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	390073	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	17462865	17463104	17462980	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	99634	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	20910424	20910792	20910538	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	718	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	25060889	25061147	25061001	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	35902	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr16	27247570	27247639	27247606	Y	IL4R,IL21R,JMJD5,JMJD5	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	30476	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	27254406	27254878	27254778	Y	IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	23237	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	27297334	27297620	27297361	Y	NA	NSMCE1,IL4R	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	19219	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	27326906	27327374	27327287	Y	KIAA0556,IL4R	NSMCE1,IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	3917	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	27334573	27334825	27334616	Y	NA	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	11584	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr16	28160349	28160575	28160437	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	60666	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	29283104	29283213	29283156	Y	SPNS1	NA	NA	NA	NA	NA	RRN3P2	198941	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	49910498	49910724	49910573	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	187128	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	50219057	50219422	50219113	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	34228	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	51282246	51282518	51282383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P48	395149	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	53802432	53802770	53802659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	66557	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	55544017	55544378	55544293	Y	MMP2,LPCAT2	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	3107	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	61357263	61357316	61357291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	711623	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	64944348	64944657	64944578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	213358	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	65020062	65020376	65020219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	137639	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	65047832	65047877	65047854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	110138	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	65093564	65093880	65093722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	64135	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	65154285	65154635	65154564	Y	NA	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3380	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	70461908	70462625	70462132	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	8515	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	70980057	70980287	70980181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	146993	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.82230671908414
chr16	71070712	71070940	71070844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	237648	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	71123508	71123782	71123642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALB2	266834	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.46951837919863
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	72912475	72912642	72912542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	178955	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	73558765	73558950	73558947	Y	NA	NA	HP,HPR	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	467168	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	75037611	75037819	75037667	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	5540	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	78564720	78564924	78564822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	433410	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	80694679	80694985	80694832	Y	CDYL2	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	141241	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	80965900	80966145	80965922	Y	NA	NA	CMC2	IMR90	Hi-C	24141950	CENPN	71958	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	81557764	81558419	81558110	Y	CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	80989	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28731	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	83480656	83480733	83480694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	358715	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	83556013	83556380	83556197	Y	NA	NA	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	HSBP1	283068	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	84676809	84677221	84677048	Y	KIAA1609	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2910	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	84682643	84682972	84682859	Y	NA	COTL1,KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	2512	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	84869763	84870234	84870125	Y	CRISPLD2	CRISPLD2	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	18173	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	4.93903675839725
chr16	85415557	85415973	85415759	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	305706	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	85558121	85558453	85558347	Y	KIAA0182,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	163226	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	120808	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	356884	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	363255	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr16	87607297	87607309	87607303	Y	NA	NA	MAP1LC3B,FBXO31,ZCCHC14,KLHDC4,JPH3,CA5A	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO31	183549	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	88337697	88337985	88337883	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179740	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	88450186	88450490	88450462	Y	NA	NA	CA5A,SLC7A5,BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	67235	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	88540534	88540913	88540729	Y	FAM38A,CTU2,APRT,ZNF469	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	22809	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	1094047	1094290	1094169	Y	SLC43A2,PITPNA	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	36025	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	1974774	1975359	1974921	Y	SCARF1,HIC1,HIC1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	19326	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr17	2026015	2026378	2026080	Y	SERPINF2,SERPINF2	NA	NA	NA	NA	NA	HIC1	70567	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	2084621	2084734	2084671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	119943	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	2126107	2126815	2126522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	77862	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	133114	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1,P2RX1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	6541812	6541912	6541862	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	TXNDC17	166	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	6655808	6656203	6655969	Y	RNASEK,GABARAP,XAF1	SLC13A5,XAF1	XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1	IMR90	Hi-C	24141950	XAF1	563	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.46951837919863
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	8600572	8600969	8600801	Y	MYH10	NA	MYH10,RPL26,RNF222	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	68493	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	8602115	8602249	8602166	Y	MYH10	NA	MYH10	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	70036	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	8649167	8649702	8649446	Y	ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	117088	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	9355317	9355480	9355419	Y	WDR16	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	122428	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	13288916	13289223	13288974	Y	NA	NA	HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST3A1	214021	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr17	13390789	13390935	13390899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	112309	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	13447669	13448094	13447771	Y	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	55150	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	13460367	13460669	13460622	Y	HS3ST3A1	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	42575	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	16924574	16924970	16924629	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	18889	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	20204150	20204477	20204216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS3P2	285894	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	20690369	20690534	20690439	Y	NA	SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	4411	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	25620233	25620423	25620280	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	1131	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	25858301	25858609	25858495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	76631	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	29423002	29423667	29423241	Y	NA	NF1	NA	NA	NA	NA	NF1	3057	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2A	49870	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	29599453	29600092	29599789	Y	NA	EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2A	46810	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	29887922	29888057	29887990	Y	NA	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	EVI2A	241020	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	30253386	30253637	30253512	Y	NA	UTP6,SUZ12	SUZ12	K562	ChIA-PET	22265404	SUZ12	8400	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	31072918	31073214	31073077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	128981	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	32581116	32581488	32581294	Y	NA	CCL2,CCL7,CCL11	NA	NA	NA	NA	CCL2	812	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	RASL10B	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	RASL10B	10853	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	38085522	38085789	38085697	Y	ERBB2,IKZF3,ORMDL3	ORMDL3,PSMD3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	3668	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	38229285	38229466	38229392	Y	GSDMB	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	13817	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	38619282	38619695	38619581	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,KRT23,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	21580	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	58146	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	38678609	38678667	38678638	Y	NA	NA	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP4	80907	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	38706778	38707153	38707073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	95607	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	38707495	38707811	38707586	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	94949	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	38708057	38709216	38708396	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	93544	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr17	39110175	39110404	39110304	Y	KRTAP3-2	NA	NA	NA	NA	NA	KRTAP1-5	71050	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	39218168	39218609	39218458	Y	NA	KRTAP1-5	NA	NA	NA	NA	KRTAP1-5	36714	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	40400517	40401003	40400833	Y	EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5B	25722	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	41410079	41410140	41410127	Y	NA	TMEM106A	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM106A	48225	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	41656262	41656390	41656311	Y	G6PC3	ETV4	DHX8,MIR2117,MPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	1274	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	4.23346007862622
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	42872286	42872458	42872432	Y	FMNL1,GRN	GJC1	NA	NA	NA	NA	GJC1	33726	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1	565835	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	46654606	46654947	46654902	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	526	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7211	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	46664992	46665342	46665097	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	9519	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	47081384	47081547	47081466	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8610	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	48136569	48136863	48136794	Y	NA	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	5237	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	48251038	48251269	48251124	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	SAMD14,PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	SGCA	11463	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	SGCA	15813	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	48282931	48283079	48283012	Y	COL1A1,TMEM92	SGCA,COL1A1	SGCA,HILS1	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	5938	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	SGCA,COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	48348027	48348139	48348077	Y	COL1A1,TMEM92	NA	NA	NA	NA	NA	COL1A1	71034	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT2	53639	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	88299	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	57502934	57503327	57503130	Y	YPEL2	NA	YPEL2	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	95884	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	57511883	57511981	57511933	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YPEL2	104833	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	261797	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	59327837	59328038	59327938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	147219	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	60649611	60649792	60649701	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	MRC2	52970	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	194524	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	61323201	61323584	61323320	Y	NA	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	198155	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	61787185	61787371	61787278	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	10653	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	62985207	62985536	62985392	Y	DDX5,CEP95,GNA13	AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	15513	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	63043139	63043174	63043152	Y	NA	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	7783	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr17	66421215	66421317	66421250	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	30337	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	73032786	73033119	73032977	Y	TSEN54,GGA3	ICT1,KCTD2,ATP5H,SLC16A5	NA	NA	NA	NA	KCTD2	6116	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	RECQL5	35261	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	74664017	74664029	74664023	Y	NA	MXRA7	NA	NA	NA	NA	MXRA7	41069	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	75199050	75199385	75199187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	75266	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	7160	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	75385660	75386043	75385777	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111009	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	75953939	75954304	75954190	Y	TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNGR2	208335	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNGR2	207843	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.82230671908414
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	77034665	77035262	77034914	Y	CYTH1,USP36,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	17769	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr17	77970749	77971301	77971166	Y	CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	36346	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	78853513	78853762	78853623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	109636	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	80546229	80546455	80546368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK2	70640	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	80889616	80889925	80889758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GNTL1	117761	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	81066773	81067186	81066924	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31206	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr17	81147237	81149188	81147763	Y	METRNL	NA	METRNL,B3GNTL1,TBCD	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	111670	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	TYMS	12029	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr18	3787478	3787640	3787637	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	377872	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	3794813	3795294	3795021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	385207	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	8704447	8704767	8704559	Y	NA	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	97004	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr18	10141033	10141178	10141087	Y	NA	NA	APCDD1,NAPG	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	229034	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	13219693	13219734	13219713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	230332	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	13500609	13500835	13500766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223824	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	13542199	13542509	13542255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	182150	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	19746222	19746392	19746310	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	1012	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	26808	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	20046739	20046926	20046743	Y	GATA6	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	299335	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	20074078	20074240	20074159	Y	NA	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	301984	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	152885	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	23657156	23657540	23657507	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	11641	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	25536974	25537193	25537082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	218217	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	25645893	25646031	25645963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	109379	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	25691984	25692409	25692174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	63001	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	25754926	25755429	25755157	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr18	26737941	26738491	26738211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	982531	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr18	39520548	39520801	39520707	Y	NA	PIK3C3	PIK3C3	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3C3	12370	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	43351602	43351892	43351629	Y	SLC14A1	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	193348	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	43381768	43381900	43381886	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPG5	163340	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	44372138	44372406	44372272	Y	RNF165,PIAS2	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS2	125717	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	45121488	45121559	45121552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	333956	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	45379355	45379691	45379492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	75824	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	45420480	45420806	45420653	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	34709	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	46254756	46255278	46254982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	191339	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	46449093	46449527	46449211	Y	SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	25554	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	46451209	46451517	46451363	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	23564	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	19820	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	47824396	47824519	47824438	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	MBD1,CXXC1	CCDC11	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC1	11722	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	52786792	52787169	52787029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC68	162053	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	53004994	53005474	53005290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	324544	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	55267032	55267261	55267214	Y	NEDD4L	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	15028	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	55382886	55383034	55382958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	85299	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	56159165	56159246	56159180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	106617	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	57386849	57386991	57386920	Y	NA	CCBE1,RPS26P54	CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	CCBE1	24237	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	57482239	57482409	57482315	Y	NA	NA	CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P54	55449	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	NA	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB2	186046	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	67158128	67158224	67158176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOK6	91837	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	74179507	74179930	74179654	Y	ZNF516	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	25216	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	75318958	75319303	75319131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	786395	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	77267643	77267970	77267877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	113787	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr18	77327843	77328066	77328013	Y	NA	NA	NFATC1,ATP9B	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	109735	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr19	1213863	1214369	1213961	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	C19orf26	21657	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	1840916	1841078	1840939	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16	NA	NA	NA	NA	REXO1	5374	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	2549602	2550221	2549903	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	75482	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	4456035	4456301	4456168	Y	NA	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	216	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.46951837919863
chr19	5968077	5968307	5968208	Y	NA	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	7846	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	9402141	9402360	9402251	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	30088	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	10056236	10056512	10056406	Y	ZNF846,COL5A3,OLFM2	OLFM2	NA	NA	NA	NA	OLFM2	11008	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	10120163	10120467	10120323	Y	NA	COL5A3	NA	NA	NA	NA	COL5A3	1016	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	10138488	10138727	10138608	Y	EIF3G,COL5A3	COL5A3	NA	NA	NA	NA	COL5A3	19341	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	10714716	10715205	10715003	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2	KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	3583	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	10863039	10863158	10863099	Y	NA	DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	36284	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	10928296	10928707	10928651	Y	NA	MIR199A1,TMED1	NA	NA	NA	NA	MIR199A1	2124	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	11044199	11044446	11044323	Y	NA	YIPF2,C19orf52,SMARCA4	NA	NA	NA	NA	C19orf52	6790	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	11878639	11879058	11878901	Y	NA	ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF441	2824	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	12844296	12844608	12844453	Y	NA	FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1	NA	NA	NA	NA	C19orf43	707	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr19	15321082	15321623	15321224	Y	RASAL3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	11290	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	16394356	16394632	16394513	Y	NWD1,KLF2	KLF2	EPS15L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF2	38996	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	16441306	16441578	16441415	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	7678	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	16998454	16998573	16998467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIN3B	60243	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	18614213	18614397	18614285	Y	IL12RB1,JUND,LRRC25,ELL	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	16540	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	18761338	18761719	18761657	Y	TMEM161A,COPE,COMP,CRLF1,KLHL26	TMEM59L,CRLF1,KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	15563	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	24216985	24217321	24217111	Y	ZNF254	ZNF254	NA	NA	NA	NA	ZNF254	2709	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	28225585	28226223	28225838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1476225	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	28229266	28230821	28229614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1471627	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	28508249	28508335	28508293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1194113	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	31586649	31586851	31586836	Y	NA	NA	ZNF507,TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ3	251602	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	31618618	31618806	31618712	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ3	219647	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	31627886	31628274	31628183	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ3	210179	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	31631644	31631911	31631778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	206542	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	36376938	36377077	36377046	Y	NA	APLP1,NFKBID,TYROBP,LRFN3	NA	NA	NA	NA	NFKBID	14128	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	36720266	36720641	36720459	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	14518	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	38495647	38495987	38495738	Y	SPRED3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	99779	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	39453898	39453904	39453901	Y	NA	MRPS12,SARS2,FBXO17	NA	NA	NA	NA	FBXO17	10646	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10,CNTD2	NA	NA	NA	NA	CNTD2	4528	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	42444277	42444712	42444407	Y	POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16830	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	42634554	42634824	42634791	Y	POU2F2	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F2	63913	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	14986	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	18683	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr19	45189303	45189576	45189367	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	44205	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	46133845	46134220	46134022	Y	NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2	GPR4,OPA3,EML2,GIPR	NA	NA	NA	NA	EML2	12667	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL2	NA	NA	NA	NA	IGFL2	39593	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	47448240	47448462	47448420	Y	PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS1	72615	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.46951837919863
chr19	47805638	47805769	47805718	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1	CCDC9,PRR24,DHX34	PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2	IMR90	Hi-C	24141950	PRR24	29496	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	50323482	50323712	50323595	Y	MED25	FUZ,MED25,PTOV1,PNKP	NA	NA	NA	NA	MED25	3943	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	51166998	51167396	51167198	Y	KLK4,KLK6,KLK14,SYT3,LOC342918	C19orf81	NA	NA	NA	NA	C19orf81	16296	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	32480	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.8806717387407
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	31697	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	31302	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	30743	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	29988	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	HAS1,FPR2	NA	NA	NA	NA	HAS1	4069	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	52310413	52310785	52310550	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR1	5050	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	54125750	54125846	54125808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF331	103515	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG7	54654	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	29193	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	1676691	1676995	1676843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	69629	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	3487019	3487372	3487201	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	34135	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	3698707	3698801	3698754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COLEC11	58281	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	10501440	10501782	10501611	Y	C2orf48	NA	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	60425	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	12928047	12928351	12928221	Y	NA	NA	LPIN1,MIR4262,TRIB2,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	73032	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	15464031	15464396	15464252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	235058	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	15629690	15629929	15629800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	69525	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEN1	108459	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr2	18066155	18066219	18066212	Y	MSGN1	KCNS3	NA	NA	NA	NA	KCNS3	9041	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	18807557	18807914	18807789	Y	NA	NA	OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	67611	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	18811449	18811776	18811476	Y	NA	NA	OSR1,NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	71503	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	23275216	23275518	23275368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	330570	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	23773853	23774056	23773955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	167765	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	28077414	28077634	28077524	Y	ZNF513,ZNF513,RBKS	BRE,RBKS	MRPL33	IMR90	Hi-C	24141950	BRE	33174	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	28498872	28499304	28499073	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	114011	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	28939068	28939564	28939261	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	32942	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	33435749	33436022	33435923	Y	FAM98A,LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	265710	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	33437244	33437520	33437371	Y	FAM98A,LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	267205	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	33805444	33805464	33805454	Y	RASGRP3	FAM98A	NA	NA	NA	NA	FAM98A	16985	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	36687110	36687380	36687132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	106041	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	36688353	36688868	36688635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	107284	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	36713753	36714120	36713762	Y	CRIM1,VIT,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	132684	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	37851057	37851610	37851419	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	112001	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	37868257	37868517	37868387	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	95094	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	39078847	39079086	39078967	Y	NA	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21989	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	39079289	39079498	39079407	Y	SRSF7,ARHGEF33	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21577	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	40647677	40648234	40647999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	187959	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	42155945	42156079	42156067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	117081	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	42161610	42162017	42161892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	111143	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	45881346	45881543	45881445	Y	NA	SRBD1,PRKCE	NA	NA	NA	NA	PRKCE	4862	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	46264148	46264418	46264310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	254388	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	46542401	46542637	46542520	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	23595	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	46554101	46554217	46554159	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	35295	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	46557036	46557117	46557077	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	38230	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	46561811	46562247	46561970	Y	SOCS5,SOCS5	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	43005	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	46586439	46586863	46586504	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	67633	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	46614603	46614745	46614671	Y	RHOQ	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	95797	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	46997897	46997963	46997932	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS5	73806	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr2	47109327	47109734	47109459	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	31562	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	47197841	47198107	47197954	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	30847	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	47298687	47298930	47298712	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102810	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	48696599	48696946	48696773	Y	NA	PPP1R21	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	30862	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	56099404	56099776	56099646	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	49498	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	56131792	56132138	56131916	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	17136	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	625852	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	61466894	61467158	61467026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	64341	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	61586795	61586939	61586907	Y	AHSA2,USP34	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	108965	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	65221577	65221744	65221661	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	7966	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	65849750	65849939	65849914	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	191979	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	66721852	66722243	66721943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	63268	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	66804720	66805040	66804911	Y	NA	AC007392.3	NA	NA	NA	NA	AC007392.3	5558	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	67730161	67730513	67730267	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	107710	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	68544914	68545935	68545552	Y	CNRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	CNRIP1	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	68989889	68990241	68990036	Y	PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	248069	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	69035170	69035391	69035267	Y	PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	202919	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	69040869	69041120	69040946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	197190	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	69163712	69163881	69163761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	74429	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	69241314	69241782	69241454	Y	ANTXR1	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	3004	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	69424670	69425029	69424849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	186360	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	72255008	72255182	72255094	Y	NA	NA	DYSF	IMR90	Hi-C	24141950	DYSF	576156	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	74298270	74298885	74298717	Y	MOBKL1B	FNBP1P1	NA	NA	NA	NA	FNBP1P1	46922	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	75779311	75779317	75779314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	92592	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	85034355	85034669	85034421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	96080	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	85404303	85404456	85404381	Y	NA	TCF7L1	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	45770	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	86452715	86452898	86452804	Y	RNF103,RMND5A	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	MRPL35	28237	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	88923115	88923478	88923431	Y	NA	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	1616	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	96813420	96813919	96813585	Y	NA	DUSP2	ASTL	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP2	4241	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	96816164	96816232	96816198	Y	NA	DUSP2	ASTL	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP2	6985	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	96923964	96924135	96924075	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	TMEM127,CIAO1,SNRNP200	NA	NA	NA	NA	TMEM127	5597	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	48395	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	98364129	98364314	98364298	Y	TMEM131,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	85559	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	100885369	100885541	100885455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	146577	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	102654225	102654461	102654316	Y	NA	IL1R1	NA	NA	NA	NA	IL1R1	24543	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	102744535	102744807	102744707	Y	IL1RL2,IL1R1,MAP4K4,MAP4K4	NA	IL1RL2,IL1R2,IL1R1,IL1RL1,IL18RAP	IMR90	Hi-C	24141950	IL1R1	65531	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	109859358	109859584	109859496	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	115554	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	110016494	110016637	110016500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	272690	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	111941595	111941939	111941767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	66640	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	111976914	111977297	111977138	Y	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	101959	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	113569466	113569945	113569683	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	22535	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	113637417	113638142	113637790	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	44937	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	114581845	114582045	114581946	Y	NA	NA	ACTR3	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR3	63492	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	118737562	118738119	118738029	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	31590	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	118738362	118738806	118738651	Y	NA	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	30903	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	121529153	121529256	121529206	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	37954	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	4.93903675839725
chr2	122132591	122132855	122132729	Y	CLASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	153602	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	LIMS2,SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	133025188	133025675	133025588	Y	NA	NA	GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2	IMR90	Hi-C	24141950	GPR39	146472	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	134548741	134549106	134548974	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	NCKAP5	224707	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	138765071	138765376	138765123	Y	NA	HNMT	NA	NA	NA	NA	HNMT	45481	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	142789500	142789791	142789646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	2298344	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	149925246	149925613	149925433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144449.1	516097	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	150505364	150505670	150505432	Y	NA	NA	RBM43,RND3	IMR90	Hi-C	24141950	MMADHC	63034	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	154335936	154336181	154336134	Y	RPRM	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	763425	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	158309744	158310453	158309937	Y	CYTIP	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1C	173064	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	160059380	160059738	160059444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	81572	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	160858239	160858486	160858430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	58635	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	161607616	161608069	161607675	Y	TANK,TANK	NA	RBMS1,ITGB6	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	259311	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	8.81970849713795
chr2	165683192	165683287	165683237	Y	NA	COBLL1	NA	NA	NA	NA	COBLL1	14902	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	168858571	168859104	168858832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	243547	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	171362276	171362354	171362315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF2S2P4	243867	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	175459812	175460479	175460357	Y	CIR1,GPR155,WIPF1	AC018890.6	NA	NA	NA	NA	AC018890.6	49943	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	175540530	175540594	175540562	Y	CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1	WIPF1,H3F3AP4	NA	NA	NA	NA	WIPF1	5050	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	175708773	175709382	175709264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	126268	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	175837054	175837318	175837218	Y	NA	CHN1	NA	NA	NA	NA	CHN1	30779	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPS	153801	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	NA	NA	NA	NA	NA	AGPS	150203	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	187390995	187391341	187391159	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	42112	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	187455745	187456210	187455889	Y	NA	ITGAV	NA	NA	NA	NA	ITGAV	2953	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	187922387	187922712	187922454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007319.1	56440	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	188347584	188347786	188347681	Y	NA	CALCRL	NA	NA	NA	NA	CALCRL	36397	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	189957665	189957918	189957859	Y	COL3A1,COL5A2	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	84687	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	190075572	190075716	190075672	Y	DIRC1	COL5A2	COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	32967	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	190151091	190151337	190151257	Y	NA	NA	COL5A2,GULP1,COL3A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	108486	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	190477917	190478080	190477982	Y	NA	SLC40A1,ASNSD1	SLC40A1,WDR75,ASNSD1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC40A1	31433	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	191876125	191876480	191876302	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	STAT1	7206	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	192489815	192490209	192490062	Y	STAT4,OBFC2A	NA	OBFC2A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDPR	219772	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	197023417	197023933	197023871	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	15294	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	198112714	198113044	198112879	Y	NA	ATP5G2P3	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	12791	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	198144443	198144693	198144592	Y	NA	ATP5G2P3,ANKRD44	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	18608	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	201995421	201995893	201995513	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	CFLAR	16594	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	202723656	202723936	202723797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2	79744	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr2	204548440	204549024	204548878	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	150307	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	204553496	204553837	204553643	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	155363	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	204668913	204669218	204669026	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,ABI2	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	270780	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	205595294	205595620	205595457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	186778	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	208016492	208017045	208016857	Y	CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	12946	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	213323461	213323863	213323827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF2	691288	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	216223263	216223304	216223303	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48723	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	216290729	216290756	216290730	Y	FN1	FN1,AC012462.1	NA	NA	NA	NA	FN1	8139	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	216392572	216392838	216392755	Y	NA	NA	LOC646324,FN1	IMR90	Hi-C	24141950	AC012462.1	93596	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	217173399	217173560	217173479	Y	NA	AC069155.1	NA	NA	NA	NA	AC069155.1	7351	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	217181584	217181763	217181674	Y	NA	AC069155.1	NA	NA	NA	NA	AC069155.1	15536	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	217214941	217215065	217215003	Y	NA	AC069155.1,MARCH4	NA	NA	NA	NA	MARCH4	19685	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	217400220	217400574	217400443	Y	NA	RPL37A,AC098820.3	DIRC3,XRCC5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	AC098820.3	38736	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	217561099	217561345	217561263	Y	NA	AC007563.5,IGFBP5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	2851	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	529950	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.17509505896966
chr2	218258363	218258761	218258688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	606957	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr2	218711012	218711358	218711190	Y	PNKD,TNS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	154360	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	218714903	218715515	218715204	Y	PNKD,ARPC2,ARPC2	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	150203	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	218785631	218785811	218785787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	79907	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.46951837919863
chr2	218798822	218799459	218799101	Y	TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	66259	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	218800054	218800255	218800170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	65463	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	224773224	224773437	224773430	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	34667	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	224852422	224852838	224852675	Y	NA	WDFY1,MRPL44,SERPINE2	NA	NA	NA	NA	MRPL44	32301	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	225203875	225203992	225203960	Y	NA	NA	SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	CUL3	244118	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	225307433	225307612	225307516	Y	FAM124B	NA	FAM124B,CUL3,SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	CUL3	140498	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	229721016	229721028	229721022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	412973	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	230008208	230008295	230008257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	125706	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	232032893	232033210	232033082	Y	NA	HTR2B,ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	28050	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	232054877	232055306	232054968	Y	HTR2B,ARMC9	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	5954	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	232176754	232176953	232176854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC9	115494	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	232186573	232186872	232186798	Y	PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC9	125313	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	206788	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	235353626	235353934	235353758	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	49763	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	236562836	236563015	236562857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	162103	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	238092955	238093156	238093082	Y	NA	NA	COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	100495	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr2	238116338	238116655	238116516	Y	COL6A3	NA	MLPH,COL6A3	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	123878	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	238122137	238122516	238122344	Y	COL6A3	NA	MLPH,COL6A3	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	129677	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr2	238131951	238132217	238132070	Y	COL6A3	NA	COL6A3,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	139491	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr2	238168767	238169127	238169034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A3	151891	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	238223884	238224369	238224058	Y	COL6A3	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A3	96649	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	238292882	238293292	238292932	Y	COPS8,LRRFIP1,COL6A3	COL6A3,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	27726	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr2	238299841	238300132	238300017	Y	COPS8,LRRFIP1,COL6A3	COL6A3,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	20886	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	238320410	238321055	238320789	Y	COL6A3	AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	238321382	238321708	238321611	Y	COL6A3	COL6A3,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	364	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	238508822	238509122	238509050	Y	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	25097	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	238578518	238578831	238578655	Y	COL6A3	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	44299	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	238795312	238795637	238795485	Y	LRRFIP1,UBE2F,RAMP1	RAMP1	NA	NA	NA	NA	RAMP1	29776	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	238810877	238811153	238811015	Y	NA	RAMP1	NA	NA	NA	NA	RAMP1	45341	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr2	239636221	239636523	239636333	Y	TWIST2	NA	LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	118150	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	24450	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	240250439	240250711	240250592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	70419	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr2	242484648	242485001	242484705	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	11135	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr20	268547	268840	268655	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12	NA	NA	NA	NA	C20orf96	550	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	290991	291448	291293	Y	C20orf54	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	12759	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	478652	479003	478850	Y	NA	TBC1D20,CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	37455	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	1803835	1803933	1803903	Y	SDCBP2,SIRPB2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	69221	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	1842464	1842590	1842566	Y	NA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	30564	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	3159596	3159937	3159912	Y	PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	20754	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	3377596	3377907	3377772	Y	C20orf194	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	8365	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	8408277	8408546	8408511	Y	TMX4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	297453	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	9291356	9291748	9291412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	243946	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	13380021	13380161	13380091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	237426	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	19293639	19293701	19293669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	102349	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	19797665	19798070	19797910	Y	RIN2,RIN2	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	61313	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	19967147	19967464	19967305	Y	NA	NAA20	NA	NA	NA	NA	NAA20	28296	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.46951837919863
chr20	32782933	32783102	32782955	Y	ASIP	NA	ITCH,ASIP,AHCY	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2S2	84795	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	39312030	39312408	39312229	Y	MAFB	MAFB	NA	NA	NA	NA	MAFB	3472	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	39938508	39938643	39938544	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	5669	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	43239191	43239604	43239345	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39270	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	DNTTIP1	8072	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	113049	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	47893075	47893400	47893157	Y	B4GALT5,ZNFX1	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	ZNFX1	112	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	48174087	48174267	48174236	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	8416	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	48221158	48221415	48221229	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	38475	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	48313235	48313496	48313350	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	14919	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	48650281	48650896	48650575	Y	NA	NA	TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNAI1	52745	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	48995783	48996016	48995938	Y	NA	NA	LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	128875	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr20	49057048	49057261	49057196	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	67630	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	49650336	49650514	49650422	Y	NA	KCNG1	KCNG1,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCNG1	12670	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	49982226	49982434	49982404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344560	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr20	51110889	51111034	51110969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	292042	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	52533564	52534521	52533763	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	287865	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	53262462	53262813	53262618	Y	DOK5	NA	NA	NA	NA	NA	DOK5	172326	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	59828827	59829192	59829064	Y	CDH4	CDH4	NA	NA	NA	NA	CDH4	3345	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	105937	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	15962241	15962603	15962321	Y	NRIP1,SAMSN1	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	208436	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	17958916	17959192	17958984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	518074	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	176393	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	22572618	22572960	22572789	Y	NCAM2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	203985	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MIR155HG,MRPL39,JAM2	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	28955057	28955188	28955121	Y	NA	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	618225	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	29660800	29661042	29660922	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	594651	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	30276081	30276287	30276184	Y	C21orf7	N6AMT1	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	20388	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	30535648	30535784	30535688	Y	NA	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	15176	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr21	30669074	30669451	30669267	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	104682	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	35402450	35402634	35402553	Y	GART,GART	MRPS6,SLC5A3	MRPS6,LOC100506334	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	40890	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	35750965	35751183	35751074	Y	KCNE1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234258	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	35925582	35925949	35925790	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	59492	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	36203156	36203348	36203246	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	217715	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	36216696	36217156	36217046	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	231255	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	36227422	36227493	36227482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	241981	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	36901066	36901165	36901116	Y	NA	NA	RUNX1,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	473800	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	37695369	37695803	37695437	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	4882	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	37909542	37909917	37909766	Y	NA	CLDN14	NA	NA	NA	NA	CLDN14	36950	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	38074425	38074708	38074699	Y	NA	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	4992	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	38189032	38189251	38189142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIM2	119599	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	38235070	38235202	38235136	Y	TTC3,HLCS	NA	NA	NA	NA	NA	HLCS	125334	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	38628157	38628175	38628166	Y	NA	DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	10087	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	39616792	39617335	39616969	Y	KCNJ15	NA	KCNJ6,KCNJ15,DSCR10	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	557896	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	39845079	39845092	39845088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	330139	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	43460613	43461088	43460825	Y	C2CD2,SLC37A1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	88614	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr21	43477244	43477358	43477313	Y	NA	NA	ZNF295,UMODL1,C2CD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	C2CD2	105245	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	44355985	44356328	44356154	Y	NA	PKNOX1	U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	PKNOX1	36292	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	44913472	44913707	44913565	Y	PDXK	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	68464	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	72994	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	46461202	46461645	46461341	Y	ITGB2,ADARB1	ADARB1	ADARB1,SSR4P1	K562	ChIA-PET	22265404	ADARB1	30123	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr21	46496242	46496452	46496442	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	4474	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	46719490	46719844	46719718	Y	NA	POFUT2	NA	NA	NA	NA	POFUT2	13677	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	46739517	46739788	46739671	Y	NA	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	33704	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	47469357	47469652	47469491	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	46359	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	47480637	47481027	47480832	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	34984	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	47499343	47499535	47499461	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	16476	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr21	47524636	47524785	47524711	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	8625	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	18402838	18403339	18403237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	101986	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	18452405	18452779	18452681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	52546	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	19874514	19874924	19874610	Y	TRMT2A,C22orf29,GNB1L	C22orf29,GNB1L,AC000078.5	GNB1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC000078.5	1702	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	19941739	19941814	19941777	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	14398	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	21103174	21103455	21103372	Y	PI4KA,PI4KA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP29	107816	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	22219429	22219677	22219523	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	293	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	27109967	27110337	27110138	Y	NA	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	43237	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	27501495	27502092	27501824	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	116596	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	27503626	27504166	27503976	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	114522	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	27527504	27527688	27527616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1172A22.1	91000	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	27530003	27530818	27530508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1172A22.1	87870	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	28372624	28372939	28372782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58502	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	30178140	30178286	30178234	Y	NA	ZMAT5,UQCR10	NA	NA	NA	NA	UQCR10	16782	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	30938421	30938985	30938910	Y	LIF,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18	SIRPAP1	NA	NA	NA	NA	SIRPAP1	1898	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	31226011	31226350	31226247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUG1	138313	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	31631095	31631484	31631184	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	24870	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	31639861	31640267	31640177	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33636	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	32448968	32449243	32449043	Y	SLC5A4,RFPL3,SLC5A1	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	15491	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	34167018	34167152	34167086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	971331	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	37625376	37625551	37625537	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4	RAC2	NA	NA	NA	NA	RAC2	12937	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	NA	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,RP5-1177I5.3,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	38601471	38601546	38601509	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	1774	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	39277533	39277801	39277644	Y	NA	NPTXR,CBX6	CBX6,APOBEC3A,APOBEC3H,APOBEC3G,CBX7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CBX6	11214	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	39637977	39638270	39638005	Y	MGAT3,MGAT3,SUN2,SUN2,NPTXR,CBX7,SYNGR1,PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	486	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	39801832	39802048	39801979	Y	NA	TAB1	NA	NA	NA	NA	TAB1	8086	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr22	43100819	43101017	43100994	Y	NA	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	14287	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	43740111	43740598	43740319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL12	158972	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	46392166	46392677	46392532	Y	C22orf26	NA	C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU	IMR90	Hi-C	24141950	C22orf26	55347	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	50608010	50608409	50608105	Y	MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	850	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	4783422	4783695	4783523	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	143282	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr3	8524896	8525313	8525187	Y	LMCD1	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	16080	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	8544131	8544195	8544133	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	2738	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	9926228	9926446	9926367	Y	LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC	RPUSD3,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1	IL17RE,IL17RC,JAGN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	JAGN1	3792	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	9995528	9995903	9995716	Y	NA	IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1,PRRT3	NA	NA	NA	NA	PRRT3	3450	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	29146	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	11197111	11197379	11197271	Y	VGLL4,SLC6A11,SLC6A1,HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	20332	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	11609664	11609798	11609746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	150422	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	13526767	13526807	13526787	Y	NA	HDAC11,FBLN2	NA	NA	NA	NA	HDAC11	7543	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	15286616	15286745	15286681	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	40957	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	15598070	15598395	15598206	Y	ANKRD28,CAPN7,SH3BP5,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	BTD	42453	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	15675662	15676068	15675826	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	34324	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	16108554	16108934	16108707	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	195545	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	16440818	16441233	16441127	Y	DPH3,RFTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	112300	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	16474276	16474529	16474346	Y	RFTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	79004	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB1	95162	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	20012721	20012798	20012760	Y	NA	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	26150	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	27595774	27595869	27595845	Y	NA	RNU1-96P	SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-96P	42412	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	27.5174905110704
chr3	28534381	28534544	28534465	Y	ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	145744	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	29531228	29531586	29531407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	210755	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	29660032	29660218	29660060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	339559	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	29660758	29661082	29660950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	340285	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	29735360	29735534	29735491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	414887	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	29800986	29801236	29801157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	480513	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	29983920	29984245	29984164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	661749	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	32501642	32502196	32501852	Y	CNOT10,CCR4,CMTM7	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	40704	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	33837400	33837658	33837523	Y	CLASP2,PDCD6IP	PDCD6IP	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	186	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	36805780	36806178	36806113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRANK1	178370	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	40341288	40341806	40341708	Y	EIF1B	EIF1B	NA	NA	NA	NA	EIF1B	7369	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	42514598	42514851	42514767	Y	NA	VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VIPR1	13940	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	42514954	42515471	42515310	Y	NA	VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VIPR1	13320	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr3	42531634	42531985	42531932	Y	NA	VIPR1	NA	NA	NA	NA	VIPR1	2843	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr3	45175300	45175656	45175542	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	10258	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	45609249	45609611	45609389	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	14363	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	46354449	46354761	46354695	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	CCR3,CCR9,CCR2,CCR5,LTF	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC2	264828	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	46989736	46990203	46989983	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28970	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	47120016	47120037	47120026	Y	SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	83420	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	47420724	47420876	47420775	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	223	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	47898226	47898293	47898260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX30	55827	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	50208155	50208394	50208279	Y	MAPKAPK3,RBM5,GNAI2	SEMA3F	GNAT1,SLC38A3,GNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3F	17677	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	50377372	50377700	50377536	Y	NA	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	961	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	50480518	50480758	50480638	Y	TMEM115	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM115	85477	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	51728520	51728585	51728552	Y	NA	TEX264	NA	NA	NA	NA	TEX264	33811	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	52271619	52271840	52271686	Y	PBRM1,WDR82,GLYCTK,TWF2,PPM1M,PPM1M	ALAS1,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	TWF2	343	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	54734224	54734587	54734407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5A	787386	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	55194265	55194440	55194343	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	327533	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	55201679	55201928	55201859	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	320045	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	55232673	55232906	55232681	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	289067	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	55319384	55319763	55319619	Y	WNT5A	NA	CACNA2D3,ERC2,WNT5A	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	202210	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	55511418	55511654	55511489	Y	WNT5A	WNT5A	NA	NA	NA	NA	WNT5A	10319	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	56665346	56665542	56665444	Y	C3orf63	FAM208A	NA	NA	NA	NA	FAM208A	49723	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	56873709	56874050	56874038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	158444	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	58341032	58341142	58341087	Y	DNASE1L3	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	24425	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	65909802	65910182	65909992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112327	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	66533474	66533812	66533569	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	15875	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	68196316	68196649	68196332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-81N13.1	493195	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	69555585	69555706	69555646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	230880	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	4090	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	71553174	71553740	71553492	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	77400	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	72132186	72132563	72132457	Y	RYBP,FOXP1,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4E3	330262	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	72386025	72386536	72386317	Y	NA	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	107533	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	72862614	72863000	72862807	Y	SHQ1	SHQ1	NA	NA	NA	NA	SHQ1	46065	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	93945004	93945149	93945097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFRL1	164771	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	99201113	99201346	99201253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	153973	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	100516379	100516430	100516403	Y	ABI3BP	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	90174	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	101899188	101899342	101899284	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	354353	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	101914180	101914598	101914381	Y	NFKBIZ,NFKBIZ,ZPLD1	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	369345	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	103100242	103100251	103100247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	223438	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	103188921	103189148	103189133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	312117	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	105549302	105549342	105549320	Y	CBLB	CBLB	NA	NA	NA	NA	CBLB	37054	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	105722948	105723182	105723045	Y	CBLB	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	136552	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	105732865	105733115	105732992	Y	NA	NA	CBLB	IMR90	Hi-C	24141950	CBLB	146469	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	107802397	107802714	107802497	Y	MYH15,HHLA2	CD47	NA	NA	NA	NA	CD47	5158	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	111583903	111584464	111583984	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	111393	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr3	112076880	112077055	112076913	Y	BTLA	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	27686	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	112097877	112098105	112098057	Y	ATG3	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	48683	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	112165241	112165518	112165388	Y	CD200	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	113038	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	112315835	112316301	112316186	Y	NA	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	ATG3	36942	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BOC	151074	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639145	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	117632292	117632433	117632362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT4	1325517	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	119157549	119157626	119157588	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	28051	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	121798487	121798500	121798494	Y	PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	CSTA	243591	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	124604448	124604779	124604703	Y	NA	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	13486	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	124770854	124771405	124771326	Y	HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	1397	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	7193	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr3	124786089	124786383	124786283	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	13287	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDC	65895	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	300013	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	27353	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	134145641	134145965	134145857	Y	NA	NA	ANAPC13,AMOTL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMOTL2	53320	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	139922309	139922336	139922321	Y	CLSTN2	NA	NA	NA	NA	NA	RBP1	665638	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	141131755	141132151	141131882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	71738	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	141173878	141174028	141173977	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	29861	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	141174545	141175038	141174891	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28851	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	141175186	141175511	141175311	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28378	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	141458120	141458481	141458300	Y	RASA2	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	3074	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	142886908	142887049	142886974	Y	NA	NA	SLC9A9,CHST2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHST2	50735	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	144785670	144785716	144785693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P39	754810	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	145785304	145785639	145785521	Y	NA	RP11-274H2.3	NA	NA	NA	NA	RP11-274H2.3	332	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	145959602	145959992	145959865	Y	PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	6974	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	147331675	147331840	147331755	Y	ZIC4,ZIC4,ZIC1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	551245	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	148781933	148782210	148782183	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20131	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	148942843	148943311	148943144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPS3	97472	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	150714222	150714233	150714228	Y	CLRN1	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	87251	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	150943935	150944361	150944164	Y	P2RY14	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	142451	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	152100220	152100544	152100298	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	114876	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	136110	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	154688654	154689001	154688833	Y	MME,MME,MME,MME	NA	LOC100507537,MME	IMR90	Hi-C	24141950	MME	50912	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	156202207	156202259	156202239	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	68714	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP	53749	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	156959494	156959508	156959501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550I24.2	68482	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	158435101	158435147	158435125	Y	NA	LXN,MFSD1,RARRES1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	12840	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	159538960	159539273	159539207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	165264	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	162020	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	170137645	170137870	170137713	Y	SLC7A14,CLDN11,CLDN11	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	2992	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	170138195	170138413	170138223	Y	NA	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	3542	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	171708179	171708567	171708376	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	46851	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	171789788	171790157	171789907	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	34370	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	171853185	171854055	171853751	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	97767	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	172086059	172086253	172086084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	330641	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	180122489	180122783	180122636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC14	195135	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	182727471	182727797	182727625	Y	NA	DCUN1D1	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	25730	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	185036051	185036269	185036182	Y	NA	EHHADH,MAP3K13	NA	NA	NA	NA	MAP3K13	37322	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	185050290	185050463	185050301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K13	51561	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	186746012	186746360	186746185	Y	RTP1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99738	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	187891343	187891657	187891500	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	21498	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	187980692	187981197	187980748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	110847	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	188234530	188234788	188234659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	364685	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	188374364	188374933	188374638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	504519	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	188406951	188407256	188407141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	537106	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	189793562	189793947	189793945	Y	LEPREL1	LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	44279	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	190284228	190284576	190284349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	54388	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	193807302	193807696	193807488	Y	ATP13A3,HES1	HES1	HES1,LOC100131551,LOC647323	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HES1	44238	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr3	194296552	194296878	194296640	Y	HES1,ATP13A3	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	5862	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	90614	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	1874737	1875082	1874826	Y	WHSC1	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	3586	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	1970462	1970680	1970571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	71009	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	5545973	5546345	5546227	Y	CRMP1	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	162930	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	6887984	6888235	6888115	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	20734	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	7208150	7208325	7208274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPEL1	140226	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	7834057	7834311	7834184	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	105342	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	10174055	10174638	10174268	Y	NA	NA	WDR1,CLNK	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	57482	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	13484540	13485001	13484899	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	551	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	15596739	15596980	15596942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	84305	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr4	21785959	21786161	21786155	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	729516	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	24840398	24840758	24840578	Y	NA	NA	SOD3	IMR90	Hi-C	24141950	SOD3	50864	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	25815962	25816321	25816294	Y	SEL1L3	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	47061	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	28602494	28602613	28602520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O22.1	167423	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr4	28621646	28621809	28621725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O22.1	186575	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr4	38102941	38103486	38103298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D1	212233	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr4	38143865	38144232	38143981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D1	253157	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	38159115	38159505	38159287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D1	268407	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	38668617	38669179	38668850	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	4113	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	38871281	38871430	38871296	Y	NA	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3983	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	40533771	40533999	40533881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	215915	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	40943410	40943552	40943502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	193496	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	40994779	40995404	40995184	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	221327	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	41413971	41414162	41414067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	54347	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	RASL11B	NA	NA	NA	NA	RASL11B	383	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	54866446	54866641	54866544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	62216	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	54871626	54871896	54871863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	56961	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	54886131	54886730	54886449	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	42127	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	54890749	54890967	54890889	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	37890	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr4	55097338	55097659	55097499	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	4074	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	57908977	57909199	57909089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	64729	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr4	61590476	61590574	61590525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	1048994	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	71695000	71695080	71695041	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	8582	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	72097898	72098083	72097986	Y	SLC4A4	SLC4A4	NA	NA	NA	NA	SLC4A4	46895	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	72130257	72130635	72130446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A4	79254	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	75187079	75187238	75187159	Y	EPGN	EPGN,EREG	NA	NA	NA	NA	EPGN	14889	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	77133814	77134170	77133987	Y	NAAA,CXCL10,CXCL11	SCARB2	NA	NA	NA	NA	SCARB2	768	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr4	77380282	77380659	77380469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB2	247236	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	80932597	80932846	80932722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	111762	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	87932880	87932928	87932888	Y	AFF1,AFF1	NA	NA	NA	NA	NA	AFF1	78726	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	88128695	88128755	88128733	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30711	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr4	95437375	95437547	95437461	Y	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	66338	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	99580316	99580421	99580372	Y	NA	TSPAN5	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	2536	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	99827146	99827610	99827384	Y	NA	AC019131.1,EIF4E	NA	NA	NA	NA	AC019131.1	21528	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	103701783	103702159	103702029	Y	NA	MANBA,RP11-10L12.4	NA	NA	NA	NA	MANBA	21632	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	106382528	106382833	106382619	Y	TET2,TET2	PPA2	NA	NA	NA	NA	PPA2	10405	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	110043690	110043849	110043769	Y	COL25A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL25A1	177964	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	114366444	114366711	114366574	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	26965	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	115198943	115199113	115199023	Y	NA	NA	ARSJ,ANK2	IMR90	Hi-C	24141950	ARSJ	300060	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	119910469	119910954	119910765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNPO2	102473	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	120437308	120437708	120437606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	63362	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	123751494	123751575	123751556	Y	FGF2	FGF2	NA	NA	NA	NA	FGF2	5631	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	123771840	123772248	123772020	Y	NA	FGF2	NA	NA	NA	NA	FGF2	25977	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	123792983	123793156	123793069	Y	NA	FGF2,NUDT6,SPATA5	NA	NA	NA	NA	FGF2	47120	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	131082218	131082340	131082279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	1069454	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	135287127	135287346	135287189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	166224	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	141015177	141015539	141015358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	57799	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	142347756	142348088	142347922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	207664	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	143059861	143060134	143059998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	504109	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	143471391	143471615	143471483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	294970	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	147710837	147711224	147710894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-44P	211637	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	148677279	148677473	148677309	Y	NA	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	26065	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	149467274	149467593	149467420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	816060	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	151204830	151205055	151204941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	207404	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	153265183	153265560	153265526	Y	FBXW7	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW7	189693	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	157692679	157692824	157692748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	197722	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	157811355	157811573	157811537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	78973	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	164465601	164465786	164465694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	379528	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	169849945	169850177	169850075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	79249	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	169853850	169854103	169853858	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	75323	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	170193381	170193745	170193612	Y	SH3RF1	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	3125	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30,SCRG1	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SCRG1	11808	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	174440246	174440721	174440674	Y	NA	HAND2-AS1,HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2-AS1	5700	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	174443845	174444302	174443959	Y	HAND2	HAND2-AS1,HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2-AS1	2119	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr4	178229393	178229664	178229462	Y	NA	NEIL3	NA	NA	NA	NA	NEIL3	403	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	183397757	183397986	183397872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	333355	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	183418367	183418505	183418425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	353965	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	183564955	183565246	183565103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	271843	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	184330014	184330225	184330125	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	33519	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	186432179	186432538	186432506	Y	NA	RP11-279O9.4,CCDC110,PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	22228	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr4	190508115	190508175	190508144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	120693	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr5	7882044	7882425	7882249	Y	NA	MTRR,FASTKD3	NA	NA	NA	NA	FASTKD3	14894	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	10551479	10551871	10551616	Y	NA	ANKRD33B	MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33B	10571	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	12314219	12314247	12314235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1554835	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	14037218	14037324	14037271	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94566	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	14142332	14142650	14142445	Y	NA	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	521	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr5	14204877	14205144	14204973	Y	FAM105B	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	63066	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO10	218844	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	16733521	16733894	16733888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO10	200478	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	17185868	17186222	17185997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	122161	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	17196578	17196835	17196707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	132871	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P10	102873	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.52788339885518
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	33312073	33312323	33312255	Y	NA	NA	NPR3,LOC340113	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2203K17.1	126402	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	33676049	33676427	33676252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	213870	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	33892874	33893172	33893071	Y	NA	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	2577	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	34658306	34658537	34658364	Y	RAI14,RAI14	RAI14	TTC23L	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	3964	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	37718043	37718447	37718273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	340729	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	37776965	37777327	37776998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	399651	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	37838047	37838605	37838394	Y	GDNF,GDNF,GDNF	NA	NA	NA	NA	NA	EGFLAM	417906	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	38872248	38872554	38872396	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	28288	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	39186669	39186768	39186720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	114159	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	39403483	39403837	39403660	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	19133	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	52155124	52155267	52155195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELO	73350	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	52714720	52715039	52714904	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	59200	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	53998804	53998843	53998825	Y	NA	NA	HSPB3,SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	187215	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	54039991	54040439	54040234	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18,GPX8,CDC20B	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	228402	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	54120977	54121197	54121092	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	ESM1	195302	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	54128628	54129104	54128925	Y	SNX18,SNX18,CDC20B	NA	SNX18,ARL15,HSPB3	IMR90	Hi-C	24141950	ESM1	187395	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	54132867	54133361	54133072	Y	SNX18,SNX18,CDC20B	NA	SNX18,ARL15,HSPB3	IMR90	Hi-C	24141950	ESM1	183138	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr5	54433990	54434008	54434000	Y	CDC20B	GPX8	NA	NA	NA	NA	GPX8	19938	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	58400134	58400374	58400226	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	646047	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	60526663	60526879	60526778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	99221	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	61917589	61917885	61917879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKS1B	111280	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	5.64461343816829
chr5	64358648	64358799	64358710	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27	IMR90	Hi-C	24141950	CWC27	295891	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	64423186	64423354	64423272	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	352393	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	64727937	64728302	64728145	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	47445	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	64755187	64755203	64755196	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	20544	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	67232108	67232276	67232192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	277272	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	71804159	71804292	71804254	Y	ZNF366	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	189686	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	72607592	72607820	72607706	Y	NA	NA	FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	134532	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	73612322	73612454	73612340	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321394	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	79458255	79458620	79458438	Y	MSH3,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	91278	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	80927026	80927304	80927299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	118312	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	82339174	82339396	82339285	Y	NA	XRCC4,TMEM167A	NA	NA	NA	NA	XRCC4	31921	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	82771448	82771603	82771549	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	6164	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	83305524	83305826	83305754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	290092	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	83545538	83546053	83545791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	132192	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	83652187	83652571	83652379	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	25674	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	83785098	83785110	83785104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDIL3	106487	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	90236488	90236655	90236581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-90P	327889	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	95179469	95179934	95179619	Y	NA	GLRX	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	22760	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	95555701	95555931	95555845	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	171882	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM174A	480164	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr5	111054290	111054596	111054444	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD4	208002	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	112585948	112586168	112586156	Y	MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	236359	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	118453384	118453586	118453485	Y	NA	RP11-950K24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-950K24.2	8553	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr5	119848516	119848911	119848640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	50543	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	120004624	120004640	120004633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	206651	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	121402997	121403353	121403172	Y	LOX,LOX	LOX	NA	NA	NA	NA	LOX	8627	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	121427924	121428247	121427929	Y	NA	LOX	SRFBP1,ZNF474,LOC100505841	IMR90	Hi-C	24141950	LOX	15944	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	126478879	126479210	126479043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf63	71695	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	131430055	131430830	131430575	Y	RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	22572	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	131594769	131595694	131595371	Y	PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	3405	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	133331351	133332089	133331904	Y	NA	C5orf15,VDAC1	C5orf15	IMR90	Hi-C	24141950	VDAC1	6735	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIPNL	117541	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	133864116	133864195	133864168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	118284	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	134727973	134728292	134728105	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	5312	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	135360039	135360154	135360090	Y	NA	TGFBI	LECT2,TGFBI	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	2430	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	135372729	135373019	135372874	Y	NA	TGFBI	NA	NA	NA	NA	TGFBI	10145	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	135373156	135373467	135373188	Y	NA	TGFBI	NA	NA	NA	NA	TGFBI	10572	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	135405259	135405482	135405390	Y	NA	TGFBI	NA	NA	NA	NA	TGFBI	42675	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	136361740	136362159	136361939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	170423	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	136795919	136796307	136796181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	135761	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	182646	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	138290386	138290689	138290535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	316752	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	142362111	142362403	142362189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	214162	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	143684115	143684365	143684240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD16	135719	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	146378574	146378711	146378699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	508908	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	147248632	147248939	147248760	Y	NA	C5orf46	NA	NA	NA	NA	C5orf46	35162	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	5.64461343816829
chr5	147253882	147254078	147253986	Y	NA	C5orf46	NA	NA	NA	NA	C5orf46	30023	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	147266523	147266583	147266553	Y	NA	C5orf46	NA	NA	NA	NA	C5orf46	17518	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	147283651	147283737	147283694	Y	NA	C5orf46	NA	NA	NA	NA	C5orf46	364	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	147777538	147777934	147777556	Y	NA	FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	16040	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	346281	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	148591795	148592037	148591918	Y	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	57397	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	148788188	148788451	148788258	Y	NA	MIR143HG,MIR145	NA	NA	NA	NA	MIR143HG	3936	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	14812	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr5	149533722	149534084	149534015	Y	SYNPO,SYNPO,PDGFRB	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	287	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	150455023	150455538	150455407	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	15600	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	150505089	150505277	150505181	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69,ANXA6	TNIP1,ANXA6	TNIP1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA6	30166	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	151078700	151079028	151078874	Y	ATOX1,SPARC	SPARC	SPARC,ATOX1	IMR90	Hi-C	24141950	SPARC	13974	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	151108065	151108456	151108379	Y	NA	SPARC,RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	35483	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	151119916	151120243	151119990	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	SPARC	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	23696	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	153862086	153862603	153862319	Y	NA	SAP30L	HAND1,FAM114A2,MFAP3,LARP1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	SAP30L	38569	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	153939934	153940118	153940082	Y	NA	NA	FAM114A2,MFAP3,SAP30L	IMR90	Hi-C	24141950	SAP30L	116417	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	SGCD	423306	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	157521038	157521096	157521067	Y	NA	NA	EBF1	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	236855	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	158605991	158606398	158606265	Y	NA	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	28663	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	167088894	167089267	167088997	Y	NA	CTB-78F1.1	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.1	3408	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	167224919	167225220	167225022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	78551	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	8.81970849713795
chr5	167372516	167372785	167372694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	226148	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	169055988	169056168	169056078	Y	SLIT3	DOCK2	DOCK2,FAM196B	IMR90	Hi-C	24141950	DOCK2	6083	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	169078080	169078216	169078155	Y	DOCK2	DOCK2	NA	NA	NA	NA	DOCK2	15829	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	169180786	169180969	169180879	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK2	118535	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	169301637	169301901	169301769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	103843	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	169398752	169398877	169398815	Y	NA	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	6867	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	169578231	169578535	169578387	Y	NA	NA	KCNIP1,KCNMB1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM196B	172487	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	171529769	171530204	171529991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	83186	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	171834226	171834319	171834273	Y	NA	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	45208	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	172202171	172203025	172202666	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	5973	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	172313877	172314602	172314167	Y	DUSP1,C5orf41	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	54599	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	172380663	172381064	172380838	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	2668	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr5	172880266	172880558	172880434	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	125760	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	172881373	172881649	172881564	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	126867	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	172901872	172902293	172901982	Y	ATP6V0E1	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	139370	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	172921295	172921366	172921331	Y	NA	NA	STC2,LOC285593,BNIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	120297	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	173811612	173811806	173811713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267A15.1	50314	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	173956576	173956772	173956664	Y	HMP19	NA	MSX2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MSX2	192764	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	176543923	176544044	176544003	Y	TSPAN17,PRR7,DBN1	FGFR4,NSD1	NA	NA	NA	NA	NSD1	13982	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	16897	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	178257722	178258121	178258094	Y	NA	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	26833	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr5	178698075	178698460	178698284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS2	71971	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	2330490	2330806	2330587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	86508	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	3904869	3905227	3905048	Y	NA	NA	SLC22A23,FAM50B,BPHL,RIPK1,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	57249	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	5206171	5206360	5206265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	52812	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	5994378	5994644	5994564	Y	NRN1	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	735101	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	11197003	11197299	11197017	Y	ERVFRD-1,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	183282	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	11316345	11316699	11316437	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	63882	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	13059086	13059210	13059117	Y	PHACTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	153078	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr6	13709903	13710182	13710119	Y	TBC1D7,CD83,RANBP9	RANBP9	SIRT5,NOL7	K562	ChIA-PET	22265404	RANBP9	107	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	14706582	14707144	14706813	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	537383	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	14735052	14735658	14735282	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	508869	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	14826835	14827098	14826967	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	417429	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	14975402	14975457	14975430	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	269070	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	15474239	15474654	15474451	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	186635	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	16436821	16437137	16436938	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	200010	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	17418097	17418389	17418210	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	26650	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	18342517	18342875	18342695	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	23904	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	18413524	18414034	18413760	Y	KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	46745	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	22072015	22072158	22072069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	480043	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	22149387	22149566	22149505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	557415	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAHP	70052	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	4.93903675839725
chr6	25098063	25098345	25098205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAHP	66448	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	25303199	25303368	25303284	Y	NA	LRRC16A	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	25893	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H2AH	32868	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN12P1,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZNF192P1	26290	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	30722480	30722729	30722541	Y	TRIM39,TRIM39,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	12149	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	30755729	30756010	30755821	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,IER3,MDC1,DDR1,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	45398	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	31530961	31531387	31531305	Y	HLA-B,STK19,CLIC1,TNF,LST1	SNORD84,DDX39B,ATP6V1G2-DDX39B,NFKBIL1,ATP6V1G2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G2	16757	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	31761868	31762215	31762042	Y	LY6G5C	SAPCD1,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48	NA	NA	NA	NA	VARS	138	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	32050642	32051035	32051003	Y	LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB	TNXB,ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	TNXB	30076	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	35561770	35562146	35562007	Y	NA	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	40120	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	37745135	37745338	37745265	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	39937	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	37751286	37751497	37751341	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	33778	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	38514218	38514357	38514288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	91567	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	39850347	39850811	39850571	Y	NA	MOCS1	NA	NA	NA	NA	MOCS1	49479	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	41219899	41219963	41219959	Y	NA	TREM1	NA	NA	NA	NA	TREM1	32494	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	41244772	41245078	41245061	Y	NA	TREM1	NA	NA	NA	NA	TREM1	7379	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	41686086	41686432	41686391	Y	NA	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	15565	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	42358029	42358310	42358233	Y	CCND3,TAF8,UBR2,TBCC,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	59479	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	42375139	42375533	42375327	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	42256	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	42982951	42983183	42983012	Y	NA	PEX6,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2	NA	NA	NA	NA	KLHDC3	3000	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	44029482	44029781	44029724	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,VEGFA,XPO5,MRPS18A,C6orf223,MRPL14	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	62870	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	44031882	44032664	44032378	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	59987	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	44039522	44039890	44039644	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	52761	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	44458019	44458222	44458132	Y	NA	NA	SUPT3H,RUNX2,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	104757	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	44634916	44635472	44635214	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	281654	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	45618234	45618676	45618425	Y	RUNX2	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	274544	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	47831581	47831627	47831604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	388056	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	52377018	52377269	52377212	Y	GSTA5,TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62444	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr6	52404444	52404567	52404560	Y	NA	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	35146	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	53454332	53454653	53454605	Y	NA	GCLC	KLHL31	IMR90	Hi-C	24141950	GCLC	25115	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	57052407	57052730	57052411	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	17283	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	57123026	57123284	57123221	Y	BAG2,RAB23,RAB23	RAB23	RAB23,ZNF451,BAG2,PRIM2,KIAA1586,BEND6	IMR90	Hi-C	24141950	RAB23	37948	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	73861458	73861626	73861542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	109312	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	75917428	75917795	75917727	Y	NA	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	3661	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	79753259	79753564	79753411	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	32389	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	81044945	81045591	81045323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	230581	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	82956000	82956181	82956090	Y	NA	IBTK	NA	NA	NA	NA	IBTK	529	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	83931407	83931579	83931543	Y	UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	IMR90	Hi-C	24141950	PGM3	29752	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	85484432	85484730	85484624	Y	TBX18	NA	TBX18	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1009	549079	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	87832223	87832245	87832242	Y	NA	CGA,RCN1P1,ZNF292	ZNF292	IMR90	Hi-C	24141950	RCN1P1	1817	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	91792357	91792687	91792522	Y	MAP3K7,MAP3K7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	497593	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	101204667	101204976	101204826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	122272	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	101593141	101593339	101593267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK2	251325	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	101862927	101863147	101863037	Y	NA	GRIK2	NA	NA	NA	NA	GRIK2	18263	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	101973409	101973432	101973421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK2	128745	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	105100220	105100270	105100246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	205524	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	111924339	111924647	111924531	Y	TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	834	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	112068361	112068832	112068769	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	123823	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	112337513	112337988	112337740	Y	TRAF3IP2,FYN	NA	FYN,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	68744	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	113505450	113505765	113505678	Y	NA	NA	FLJ34503,MARCKS,HDAC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-367G18.1	463511	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	114318333	114318559	114318390	Y	NA	RP3-399L15.3,HDAC2	NA	NA	NA	NA	HDAC2	11913	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	115163170	115163515	115163320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC2	832698	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	116745242	116745485	116745336	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	35048	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	117914764	117915043	117914904	Y	NA	GOPC	NA	NA	NA	NA	GOPC	6648	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	125424080	125424400	125424202	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	13795	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	126271537	126271736	126271680	Y	NA	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	4191	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	130022144	130022554	130022402	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	6816	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	131592339	131592544	131592531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	137533	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	131594186	131594488	131594335	Y	AKAP7,MED23,AKAP7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	139380	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	132468651	132469082	132468847	Y	CTGF,TAAR2	LINC01013	NA	NA	NA	NA	LINC01013	17596	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	132714700	132714987	132714844	Y	NA	MOXD1	NA	NA	NA	NA	MOXD1	5697	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	133020075	133020153	133020114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS12	113427	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	134669516	134669878	134669820	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	32266	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	134741718	134742020	134741875	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104468	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	134742048	134742399	134742278	Y	SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104798	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	136227219	136227382	136227241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	56385	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	136278220	136278515	136278405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	107386	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	137538142	137538256	137538167	Y	NA	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	330	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	138167673	138168756	138168052	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	17595	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	138903718	138904112	138903907	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,CCDC28A	IMR90	Hi-C	24141950	HEBP2	181050	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	138914049	138914108	138914056	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178549	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	139923737	139923853	139923795	Y	NA	NA	CITED2,LOC100132735	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	229980	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	140299062	140299512	140299364	Y	NA	NA	CITED2,HECA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	605305	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	143154152	143154557	143154355	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	109781	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	143200640	143200895	143200768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	63443	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	144283195	144283286	144283251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	100449	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	144982592	144982877	144982735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	462490	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	148588961	148589218	148589102	Y	UST	SASH1	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	2222	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	148823673	148823949	148823781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	232233	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr6	150176203	150176399	150176290	Y	NA	LRP11	NA	NA	NA	NA	LRP11	7800	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	150286198	150286452	150286311	Y	ULBP1	RAET1G,ULBP2,ULBP1	NA	NA	NA	NA	ULBP1	3055	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr6	151392463	151392726	151392659	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	25939	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	152634983	152635621	152635105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	321315	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr6	153358098	153358156	153358117	Y	SYNE1,RGS17	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	36278	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	43210	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	157110744	157110907	157110826	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	13681	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	158784092	158784407	158784250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	171061	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	158982051	158982465	158982168	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	26583	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	160083070	160083297	160083182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTAP	61320	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	163840967	163841346	163841003	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	7935	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	165988383	165988522	165988473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	409569	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	166078176	166078539	166078376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	319552	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	22766	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	166901571	166901917	166901742	Y	SFT2D1,RNASET2	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	147492	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	167527463	167527857	167527693	Y	CCR6,CCR6	CCR6	NA	NA	NA	NA	CCR6	4168	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	169470702	169471012	169470790	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	181127	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	169475360	169475647	169475438	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	176492	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	169542234	169542607	169542421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS2	109532	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr6	169556642	169556776	169556709	Y	NA	NA	C6orf70	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	95363	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	169568038	169568505	169568172	Y	NA	NA	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	83634	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	169569548	169569688	169569622	Y	NA	NA	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	82451	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr6	169572627	169572772	169572742	Y	NA	NA	THBS2,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	79367	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr6	169588480	169588865	169588804	Y	NA	NA	WDR27,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	63274	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	115581	115835	115665	Y	NA	NA	FAM20C	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20C	75134	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	AC147651.4	NA	NA	NA	NA	AC147651.4	11820	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	1968189	1968469	1968397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	302409	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	2681143	2681305	2681209	Y	SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3	TTYH3,AMZ1	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11558	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	2797465	2798227	2798113	Y	SNX8,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	75028	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	3528330	3528371	3528351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD11	446751	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	4765280	4765661	4765569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83892	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	5787686	5787972	5787829	Y	NA	RNF216	NA	NA	NA	NA	RNF216	31398	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	AC073343.13,ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	7197591	7197789	7197703	Y	C1GALT1	C1GALT1	COL28A1	IMR90	Hi-C	24141950	C1GALT1	3026	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	544048	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	12759659	12759934	12759702	Y	ARL4A,ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	35178	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN13	238431	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	18901208	18901607	18901411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	253688	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	24739704	24740021	24739930	Y	DFNA5,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	67223	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	28194446	28194874	28194789	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	23488	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	34026970	34027411	34027080	Y	BMPER	NA	NA	NA	NA	NA	BMPER	84447	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	39641991	39642218	39642176	Y	RALA	YAE1D1,AC004837.3,RALA	LINC00265	IMR90	Hi-C	24141950	AC004837.3	5098	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr7	40706026	40706047	40706035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	718390	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	41738328	41738691	41738507	Y	INHBA	INHBA	NA	NA	NA	NA	INHBA	2015	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	41952797	41953130	41952994	Y	NA	NA	LOC285954,C7orf10,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	212091	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	43683947	43684262	43684105	Y	POLM,DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	63590	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	44140138	44140294	44140236	Y	NA	POLM,AEBP1,POLD2	NA	NA	NA	NA	AEBP1	1666	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	45550212	45550523	45550366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT7P2	256094	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	45963987	45964294	45964096	Y	NA	IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	4514	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	46186122	46186484	46186177	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	226649	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	227039	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	46385021	46385087	46385052	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	425548	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	46431809	46432084	46431947	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	472336	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	47092629	47092731	47092679	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	527425	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	47366502	47366627	47366552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	253529	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	47554592	47554957	47554775	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	65199	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	47644474	47644665	47644612	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	24318	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	48220744	48220923	48220871	Y	NA	ABCA13	NA	NA	NA	NA	ABCA13	11689	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	50426559	50426564	50426562	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	89524	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	55142882	55143327	55143024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	58168	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	55600779	55601841	55601199	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	36840	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	55603072	55603362	55603151	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	35319	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	55608174	55608360	55608336	Y	NA	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	30321	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	70363018	70363036	70363028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYW1B	1933741	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	73686776	73686884	73686792	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	RFC2,LAT2,CLIP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIP2	14921	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	75291375	75291448	75291402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	74832	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG	NA	NA	NA	NA	YWHAG	22825	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	77316787	77316835	77316811	Y	NA	RSBN1L-AS1,RSBN1L	NA	NA	NA	NA	RSBN1L-AS1	6747	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	77908468	77908642	77908513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	482346	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr7	80441834	80442054	80441993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	107621	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	84613691	84613734	84613712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	493651	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	89852350	89852687	89852439	Y	NA	C7orf63	NA	NA	NA	NA	C7orf63	19801	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	93511378	93511666	93511551	Y	BET1,TFPI2	TFPI2,GNG11	NA	NA	NA	NA	TFPI2	6637	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	93577576	93577749	93577619	Y	NA	GNG11	GNG11,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	GNG11	28565	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	93811483	93811628	93811573	Y	TFPI2,GNG11	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	161338	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	93926616	93927074	93926886	Y	SGCE,COL1A2	NA	COL1A2,GNG11	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A2	94799	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	94021237	94021945	94021560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL1A2	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr7	94284072	94284624	94284343	Y	NA	SGCE,PEG10	NA	NA	NA	NA	PEG10	435	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr7	98739351	98739615	98739543	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	108	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	100761754	100762006	100761835	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	6364	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr7	100772573	100772742	100772614	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4203	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr7	100772917	100773243	100773005	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4547	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	101566593	101566799	101566736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	109634	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	102081983	102082063	102082048	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	ORAI2	10430	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	102512857	102513072	102512991	Y	NA	LRRC17	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC17	38366	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	102514621	102514825	102514690	Y	NA	LRRC17	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC17	36613	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	LRRC17	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC17	34819	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	105123568	105123582	105123575	Y	NA	PUS7,RINT1	NA	NA	NA	NA	PUS7	37132	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RINT1	52601	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	119912248	119912651	119912361	Y	KCND2	KCND2	NA	NA	NA	NA	KCND2	526	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	120030311	120030667	120030374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND2	118589	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	121439115	121439246	121439188	Y	PTPRZ1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRZ1	71897	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	128473793	128474194	128473994	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	5362	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	45656	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	130665753	130666114	130665990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	69684	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	132656149	132656423	132656408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	108425	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	133148039	133148314	133148177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	149872	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	134399420	134399826	134399626	Y	NA	CALD1	CALD1,BPGM	IMR90	Hi-C	24141950	CALD1	27177	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	134422783	134423192	134423006	Y	NA	CALD1	CALD1,BPGM	IMR90	Hi-C	24141950	CALD1	3811	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	134469498	134469802	134469635	Y	CALD1	CALD1	NA	NA	NA	NA	CALD1	42495	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	134550071	134550586	134550435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	123068	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	FAM180A	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	11846	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	135809318	135809401	135809360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	149217	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	136495640	136495742	136495691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRM2	55674	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	137352437	137352725	137352566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKI	177113	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	137355325	137355590	137355458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKI	174248	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	137366991	137367195	137367079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKI	162643	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	137505466	137505823	137505684	Y	NA	DGKI	NA	NA	NA	NA	DGKI	24015	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	137685065	137685809	137685664	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	252	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	140613036	140613224	140613135	Y	NA	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	9340	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	140880261	140880624	140880319	Y	LOC100131199	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	130212	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr7	149112304	149112563	149112312	Y	ZNF862	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF746	80345	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	150948540	150948854	150948603	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	20965	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	154250985	154251004	154250995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	541790	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr7	158603982	158604371	158604316	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	16573	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	1736486	1736690	1736554	Y	NA	CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	CTD-2336O2.1	25818	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	3252665	3252838	3252782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439C15.4	1331862	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	6405382	6405492	6405403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	143269	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	6903640	6903941	6903841	Y	DEFA5	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT5	339762	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr8	11337266	11337614	11337440	Y	FAM167A	FAM167A	C8orf12,BLK	IMR90	Hi-C	24141950	FAM167A	7042	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	11558749	11558994	11558836	Y	GATA4	GATA4	NA	NA	NA	NA	GATA4	26281	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	12901230	12901467	12901407	Y	NA	NA	DLC1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1456	100079	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	12975034	12975328	12975181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1456	173883	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr8	13219594	13219925	13219803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	151242	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	16609902	16609923	16609912	Y	VPS37A	NA	TUSC3,MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	MSR1	186903	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	19522969	19523285	19523139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	90255	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	22048643	22048944	22048828	Y	DOK2	BMP1	NA	NA	NA	NA	BMP1	28394	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	23138717	23138953	23138815	Y	LOXL2	CHMP7,R3HCC1	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	13084	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	23195606	23195838	23195725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	69973	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	23210314	23210863	23210698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	69978	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	26466894	26467238	26467101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	97103	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	27192227	27192436	27192262	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	25228	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr8	28635981	28636227	28636104	Y	EXTL3	NA	NA	NA	NA	NA	INTS9	109532	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	29230784	29230978	29230896	Y	KIF13B,DUSP4	DUSP4	C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	24599	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr8	30262933	30263230	30262977	Y	NA	RBPMS,RBPMS-AS1	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	22016	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	30506010	30506203	30506101	Y	NA	GTF2E2	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	7565	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	32052985	32053085	32053036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1	558083	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	34682233	34682421	34682327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	966492	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	1667067	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr8	38077409	38077725	38077419	Y	NA	BAG4,LSM1,DDHD2,PPAPDC1B	DDHD2	IMR90	Hi-C	24141950	DDHD2	3011	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	38762883	38763134	38762941	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	6130	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	38794203	38794537	38794324	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37450	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	38816649	38817007	38816807	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	TM2D2	35336	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	40207660	40208018	40207838	Y	NA	NA	ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	198671	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	40273499	40273632	40273622	Y	NA	NA	ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	264510	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	41146046	41146081	41146065	Y	SFRP1	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	18935	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2,PLAT	NA	NA	NA	NA	PLAT	9107	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	42370484	42370865	42370805	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	24204	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25217	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	49815340	49815765	49815552	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	16534	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	58358336	58358551	58358444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPAD1	453933	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	77567	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	68105132	68105308	68105276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	111114	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	69094354	69094545	69094486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	840442	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	704433	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr8	69883083	69883390	69883339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	493469	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	69902361	69902629	69902513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	474230	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr8	69961345	69961578	69961445	Y	SULF1	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	415281	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	334080	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	72839217	72839615	72839291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSC	84514	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	72880263	72880309	72880290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPA1	105543	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	74432524	74433240	74432853	Y	C8orf84,RDH10	NA	NA	NA	NA	NA	STAU2	224703	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	85709918	85710114	85710016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRCC1	307268	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	89124026	89124433	89124347	Y	MMP16	NA	NA	NA	NA	NA	MMP16	213821	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	92112003	92112264	92112167	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	31579	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	94928107	94928427	94928252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	60072	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	94947484	94947898	94947643	Y	GEM	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	79449	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	97136855	97137003	97136873	Y	NA	GDF6	NA	NA	NA	NA	GDF6	34017	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	99478821	99479039	99478921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	174200	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	101927731	101928052	101928034	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	35564	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	103411260	103411483	103411351	Y	UBR5	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	11586	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	104043647	104043928	104043793	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	12356	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	106290444	106290757	106290601	Y	NA	ZFPM2	ZFPM2	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM2	38163	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	111464049	111464068	111464059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	762029	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	113064401	113064537	113064469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	1322361	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	117664503	117664654	117664532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112088	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	118801002	118801354	118801210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	270050	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr8	118969079	118969407	118969255	Y	MED30	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	152685	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	119761036	119761418	119761238	Y	TNFRSF11B	NA	COLEC10	IMR90	Hi-C	24141950	SAMD12	128802	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	119921281	119921551	119921414	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	40888	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	119960672	119960883	119960778	Y	NA	TNFRSF11B,COLEC10	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	1556	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	123050237	123050548	123050394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-94A24.1	388242	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	123122948	123123294	123123119	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-94A24.1	315496	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	124547812	124548082	124548041	Y	NA	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	3364	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	124665857	124666229	124666132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	112467	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	126296437	126296656	126296547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	143907	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	126354343	126354802	126354718	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	85761	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	126649729	126649959	126649891	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	209166	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	126706494	126706783	126706659	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,TRIB1,KIAA0196	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	265931	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	129062971	129063389	129063062	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	42114	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	131289962	131290145	131290029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	163761	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	134940088	134940285	134940173	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	357905	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	136476552	136476867	136476709	Y	NA	KHDRBS3	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	8852	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	141361313	141361457	141361385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	105221	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	141849368	141849592	141849371	Y	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	160723	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	142289630	142289814	142289772	Y	NA	SLC45A4	SLC45A4,PTK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	26590	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	708345	708423	708359	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	240054	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	2623377	2623723	2623671	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	3543	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	2657497	2657645	2657571	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	37663	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	3719575	3720240	3719887	Y	NA	NA	GLIS3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-509J21.1	194852	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	4083576	4083986	4083877	Y	GLIS3,GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	262406	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	4086123	4086410	4086330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	259982	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	4162852	4162875	4162864	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	183517	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	4293316	4293716	4293485	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	52676	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	5558340	5558581	5558428	Y	CD274,KIAA2026,KIAA1432	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	49795	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	5895206	5895407	5895334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	64089	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	15300887	15301166	15301002	Y	TTC39B	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	4192	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	16203449	16203717	16203596	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	521095	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	16515842	16516452	16516406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	208360	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	16794774	16794903	16794900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	69962	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	19161675	19162031	19161810	Y	PLIN2,ACER2	PLIN2	DENND4C,PLIN2,HAUS6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLIN2	14387	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	20552301	20552464	20552406	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	68078	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	21479977	21480007	21479992	Y	NA	MIR31	NA	NA	NA	NA	MIR31	30177	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	21677834	21678156	21678014	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	120166	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	28649799	28650020	28649948	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1077935	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1642036	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.82230671908414
chr9	32535541	32535857	32535751	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11219	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	33172218	33172440	33172320	Y	NA	B4GALT1	B4GALT1,SPINK4	IMR90	Hi-C	24141950	B4GALT1	6864	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	33375284	33375639	33375462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQP3	69970	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	35491656	35492052	35492019	Y	OR13J1,TPM2,CREB3,CCDC107,RUSC2	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	3532	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	35516545	35516820	35516591	Y	NA	RUSC2,FAM166B	NA	NA	NA	NA	RUSC2	28421	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	RUSC2,FAM166B	NA	NA	NA	NA	RUSC2	29917	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	RUSC2,FAM166B	NA	NA	NA	NA	RUSC2	32354	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.52788339885518
chr9	36166552	36166755	36166690	Y	CREB3,TLN1	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	22098	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	41948	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	37902777	37903120	37902949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	103343	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1,IGFBPL1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBPL1	15126	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	4.93903675839725
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	72837972	72838313	72838181	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	33624	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	72871058	72871439	72871223	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	498	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	73036465	73036957	73036835	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8925	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	73100288	73100509	73100429	Y	KLF9	NA	SMC5,KLF9,TRPM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF9	72748	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	73168765	73169157	73169115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	141225	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	73202028	73202554	73202277	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	174488	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	73437817	73438081	73438034	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	410277	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	73569162	73569421	73569277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	541622	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	73749210	73749614	73749539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	452903	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	75978047	75978446	75978247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	213374	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	81486579	81486867	81486725	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	PSAT1	576520	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	81627556	81627780	81627606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	556908	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	81804624	81804840	81804732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	379848	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	84889033	84889227	84889130	Y	FAM75D1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-154D17.1	586405	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	91762072	91762095	91762084	Y	NA	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	29587	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	3.17509505896966
chr9	92050487	92050811	92050719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECISBP2	119066	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	93754369	93754628	93754484	Y	NA	NA	AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	367567	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	93892173	93892363	93892269	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	229832	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYCSP24	130483	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	97688379	97688667	97688436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	201396	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	101136906	101136938	101136922	Y	ANKS6	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	120991	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	101868249	101868435	101868378	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	3929	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	101883874	101884261	101884068	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	19554	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	102015806	102016715	102016602	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	33460	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	102585833	102586368	102586147	Y	ERP44,NR4A3	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NR4A3	3696	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	107635337	107635884	107635542	Y	ABCA1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA1	52634	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	107668768	107669725	107669153	Y	SLC44A1,OR13C3	ABCA1	NA	NA	NA	NA	ABCA1	18793	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF4	261390	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	204314	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	112813346	112813601	112813470	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	203319	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	114707434	114708001	114707643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	50388	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr9	114721832	114722310	114722097	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	64786	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	114792518	114792641	114792625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	135472	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	114809786	114810087	114810015	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	125601	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	114811444	114811737	114811486	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123951	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	114812315	114812544	114812429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123144	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	114812842	114813221	114813099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	122467	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	114835497	114835862	114835756	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	99826	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	118024698	118025071	118024956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	146162	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	118358577	118359027	118358666	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	480041	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	118412488	118412760	118412588	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	501323	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	118430899	118431573	118430988	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	482510	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.41115335954207
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478870	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	118435271	118435690	118435488	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478393	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	118436011	118436199	118436119	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	477884	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	118917854	118918405	118917899	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	3771	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr9	118993225	118993558	118993231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	79142	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	119084686	119084813	119084781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	170603	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	119466124	119466469	119466162	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	18543	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	123283577	123283819	123283724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	56629	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	124318942	124319249	124319097	Y	NA	DAB2IP	DAB2IP,TTLL11,MIR4478	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2IP	8087	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	128530354	128530667	128530385	Y	NA	PBX3	NA	NA	NA	NA	PBX3	22730	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	130373507	130373780	130373645	Y	GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	STXBP1	963	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	131900982	131901116	131901071	Y	ENDOG,PHYHD1,CRAT,IER5L	PPP2R4,CRAT,IER5L	NA	NA	NA	NA	CRAT	29514	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	132107499	132107735	132107644	Y	TOR1B,C9orf106	RP11-65J3.1	IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,ASB6,METTL11A,PPP2R4	H1ESC,HELA,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	RP11-65J3.1	14920	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	132141110	132141440	132141368	Y	NA	RP11-65J3.1	LOC100506190,C9orf50,METTL11A,C9orf106,SH3GLB2,PPP2R4,CRAT,IER5L,PTGES	IMR90,K562,GM12878,HELA,H1ESC,MCF7	Hi-C,5C,ChIA-PET	24141950,22955621,22265404	RP11-65J3.1	48531	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	132373475	132373922	132373518	Y	NA	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	28522	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	132385793	132386123	132385875	Y	C9orf106,TOR1B,PRRX2	ASB6,PRRX2	NA	NA	NA	NA	ASB6	16321	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	133711348	133711666	133711497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABL1	124015	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	133721311	133721454	133721341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABL1	133978	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	ABL1	148912	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.05836501965655
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	134619507	134619884	134619596	Y	FAM78A,RAPGEF1	RAPGEF1	RAPGEF1	K562	ChIA-PET	22265404	RAPGEF1	6046	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	136019465	136020353	136020023	Y	NA	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	16948	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	SARDH	NA	NA	NA	NA	SARDH	26298	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.82230671908414
chr9	136579870	136580130	136580087	Y	NA	SARDH	NA	NA	NA	NA	SARDH	22947	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	137394714	137394986	137394879	Y	NA	NA	COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A1	136634	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	137494646	137494892	137494734	Y	NA	COL5A1	RXRA,COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A1	36728	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	137535299	137535511	137535433	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	3679	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	137667512	137667789	137667676	Y	OLFM1,OLFM1	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	135892	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	139540778	139541198	139541031	Y	NOTCH1,NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7	AGPAT2	SEC16A,C9orf163	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AGPAT2	38677	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.11673003931311
chr9	140101916	140102100	140102008	Y	C9orf172,FUT7	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	NDOR1	3769	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chr9	140163781	140164247	140164025	Y	NA	TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	30116	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chrX	1513605	1514177	1513885	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	3988	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	2628097	2628730	2628199	Y	NA	CD99	NA	NA	NA	NA	CD99	20877	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	10135057	10135251	10135239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	153455	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMPD4	73997	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	12272654	12272870	12272762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMPD4	118069	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	20154251	20154286	20154269	Y	NA	MAP7D2,EIF1AX	NA	NA	NA	NA	EIF1AX	3676	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	24044003	24044417	24044292	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	26416	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	25664451	25664736	25664645	Y	MAGEB18	NA	NA	NA	NA	NA	POLA1	954415	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	30717069	30717144	30717107	Y	CXorf21,GK	GK	NA	NA	NA	NA	GK	47593	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	33221652	33221797	33221725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMD	133761	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	1.76394169942759
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chrX	40749971	40750359	40750172	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	RP11-77G22.2	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	14878	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	45617544	45618196	45618069	Y	NA	MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	13014	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	149964	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	49011448	49011844	49011738	Y	GATA1,HDAC6,MAGIX	GPKOW,PLP2,PRICKLE3	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	14429	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	2.82230671908414
chrX	53292881	53293274	53292937	Y	NA	KDM5C	NA	NA	NA	NA	KDM5C	40277	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	69655002	69655313	69655257	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	7398	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	77589072	77589352	77589220	Y	ATP7A,CYSLTR1	NA	NA	NA	NA	NA	TAF9B	195869	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	79965324	79965547	79965436	Y	BRWD3	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	97640	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chrX	96641794	96641810	96641802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	704132	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	99903962	99904188	99904076	Y	SRPX2	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	6747	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	99913933	99914424	99914133	Y	SYTL4,SYTL4	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	16718	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	ARMCX1	NA	NA	NA	NA	ARMCX1	9960	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	GPRASP1	NA	NA	NA	NA	GPRASP1	10490	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chrX	108746613	108746831	108746724	Y	NXT2,NXT2	NXT2	NA	NA	NA	NA	NXT2	30179	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.705576679771036
chrX	108950609	108950797	108950701	Y	NXT2,NXT2	ACSL4	NA	NA	NA	NA	ACSL4	23835	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	109083708	109084134	109083977	Y	NXT2,NXT2,ACSL4	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL4	109076	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	115238483	115238690	115238635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLS3	444982	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	119619980	119620335	119620161	Y	NA	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18760	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	125556519	125556645	125556582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	2464457	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	2514215	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	130013053	130013179	130013116	Y	NA	ENOX2	NA	NA	NA	NA	ENOX2	22029	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	152742295	152742894	152742640	Y	NA	TREX2,BGN,HAUS7	HAUS7,ATP2B3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TREX2	8250	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	152980497	152980777	152980637	Y	NA	SLC6A8,BCAP31,ABCD1,PLXNB3	NA	NA	NA	NA	BCAP31	7375	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	LI90	hg19	FANTOM5	0.352788339885518