chr1 858256 858648 858448 Y SAMD11 NOC2L,KLHL17,PLEKHN1 NA NA NA NA NOC2L 34041 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 945769 946034 945890 Y CCNL2,ATAD3B PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA ISG15 769 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 NA NA NA NA RNF223 2701 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 1098630 1098901 1098641 Y NA C1orf159,TNFRSF18 NA NA NA NA TNFRSF18 41170 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 1265677 1265980 1265829 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1 NA NA NA NA GLTPD1 7541 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20 NA NA NA NA AURKAIP1 12543 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 1456676 1456699 1456688 Y NA ATAD3A NA NA NA NA ATAD3A 11145 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 1611804 1612115 1611960 Y NA MMP23B,CDK11B,CDK11A NA NA NA NA CDK11B 23331 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 2068660 2068858 2068763 Y NA NA NA NA NA NA C1orf86 73301 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 2574079 2574144 2574101 Y NA NA NA NA NA NA FAM213B 58149 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 138833 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 3373716 3374006 3373818 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 4726 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 4697251 4697504 4697378 Y NA NA NPHP4 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf174 882394 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 6319998 6320272 6320169 Y NA ICMT,GPR153 NA NA NA NA GPR153 963 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 8469706 8470061 8470001 Y NA NA NA NA NA NA SLC45A1 93820 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 8488165 8488317 8488222 Y TNFRSF9,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 112279 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 8686491 8686867 8686745 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 188835 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 8721734 8722143 8721896 Y NA NA NA NA NA NA RERE 153559 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 8762126 8762475 8762428 Y NA NA NA NA NA NA RERE 113227 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr1 8875055 8875165 8875110 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 537 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 9223692 9223875 9223840 Y NA GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 16388 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 10447707 10448369 10448247 Y NA PGD,APITD1,APITD1-CORT NA NA NA NA PGD 8280 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 10849807 10850141 10849963 Y ANGPTL7,CASZ1 CASZ1 NA NA NA NA CASZ1 4566 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 10853772 10853865 10853819 Y NA CASZ1 NA NA NA NA CASZ1 842 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 10853986 10854555 10854168 Y ANGPTL7,CASZ1 CASZ1 NA NA NA NA CASZ1 152 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 10997518 10997835 10997575 Y CASZ1 NA NA NA NA NA TARDBP 72579 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.4758438752843 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 12238984 12239461 12239321 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D TNFRSF1B,VPS13D VPS13D IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1B 13924 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 12406013 12406127 12406056 Y NA NA NA NA NA NA VPS13D 117889 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 12544374 12544691 12544532 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 131046 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 12609717 12610039 12609907 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 65698 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 14054762 14055166 14054864 Y PRDM2,PRDM2,PRDM2 PRDM2 NA NA NA NA PRDM2 30069 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 16670445 16670837 16670642 Y SPEN,C1orf64,FBXO42 FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 6112 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr1 17027024 17027386 17027173 Y NA EIF1AXP1 NA NA NA NA EIF1AXP1 16474 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.05667386604781 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MFAP2 73626 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA NA CROCC K562 ChIA-PET 22265404 MFAP2 64547 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.07417155196102 chr1 17253207 17253541 17253218 Y NA NA NA NA NA NA MFAP2 51789 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 17518941 17519138 17519054 Y ATP13A2,PADI3 NA NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI2 74993 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 17746173 17746585 17746297 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 17635 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.69417772285914 chr1 19804974 19805167 19805055 Y PLA2G2E CAPZB NA NA NA NA CAPZB 4899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 20111066 20111358 20111348 Y NA TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 13080 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 21194399 21194490 21194445 Y NA NA NA NA NA NA HP1BP3 82583 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 21284001 21284025 21284019 Y NA NA NA NA NA NA RP11-487E1.2 114221 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 21406931 21406946 21406939 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 8685 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 21475659 21476054 21476002 Y EIF4G3,EIF4G3 EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 25323 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 22002610 22002786 22002701 Y NA RAP1GAP RAP1GAP K562 ChIA-PET 22265404 RAP1GAP 8809 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 23357547 23357765 23357628 Y NA KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 13606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 23445594 23445963 23445683 Y NA NA NA NA NA NA LUZP1 56338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.9650046281736 chr1 23882500 23882866 23882600 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 1419 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr1 24477754 24478041 24477856 Y NA IL22RA1 IL22RA1 IMR90 Hi-C 24141950 IL22RA1 10143 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 24519628 24519970 24519647 Y GRHL3 NA MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 IL22RA1 52017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 24968619 24968979 24968799 Y RUNX3,SRRM1 SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 12412 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 24970685 24970736 24970725 Y NA SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 14478 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 26907862 26908015 26907938 Y SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA NA HMGN2 110921 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr1 27175784 27176273 27175984 Y C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 11360 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 27184739 27184972 27184786 Y RPS6KA1,ZDHHC18,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 2661 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.29250539953586 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 FAM46B C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46B 46630 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,CD164L2,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 27854575 27854919 27854692 Y SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39906 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1,FGR NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 28216942 28217199 28217071 Y NA RPA2,SMPDL3B NA NA NA NA RPA2 22058 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.52833693302391 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 28776524 28777127 28776532 Y NA NA NA NA NA NA RCC1 53328 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 28970474 28970729 28970677 Y NA TAF12,RNU11,GMEB1 NA NA NA NA RNU11 2383 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 29565762 29566055 29565979 Y SRSF4,PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 4734 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 31241795 31242280 31242065 Y LAPTM5 NA PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3 IMR90 Hi-C 24141950 SDC3 137328 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 31401933 31402089 31402038 Y NA SDC3 NA NA NA NA SDC3 22325 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 31483120 31483355 31483250 Y NA NA NA NA NA NA PUM1 53483 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 32354934 32355150 32354987 Y LCK,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 NA NA NA NA NA PTP4A2 53307 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 33082385 33082406 33082394 Y ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 32098 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 33182280 33182513 33182368 Y KIAA1522 KIAA1522 SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1522 22973 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 33232248 33232565 33232367 Y NA KIAA1522,S100PBP,YARS NA NA NA NA KIAA1522 26762 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 33284832 33285123 33284978 Y NA S100PBP,YARS NA NA NA NA YARS 3078 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 33428474 33429020 33428770 Y NA RNF19B NA NA NA NA RNF19B 188 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 36428229 36428381 36428320 Y STK40,EIF2C4,THRAP3,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA TEKT2 119295 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 37279599 37279903 37279751 Y NA NA NA NA NA NA GRIK3 217827 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 37464724 37465074 37465012 Y NA GRIK3 NA NA NA NA GRIK3 32656 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 38308355 38308564 38308401 Y ZC3H12A,SNIP1,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 14728 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 39327096 39327575 39327204 Y NA RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP NA NA NA NA RP5-864K19.4 3424 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 39662647 39663006 39662738 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 117659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 40006104 40006751 40006634 Y MFSD2A,PABPC4 PABPC4 NA NA NA NA PABPC4 33711 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 NA NA NA NA NA EDN2 116538 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 41967378 41967702 41967588 Y NA EDN2 NA NA NA NA EDN2 19034 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 42126621 42126978 42126699 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 178277 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 42136267 42136586 42136329 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 187923 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr1 43250353 43250859 43250610 Y ZMYND12,WDR65,YBX1 LEPRE1,C1orf50,ERMAP,CCDC23 NA NA NA NA C1orf50 19413 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 43432863 43433109 43432938 Y CCDC30,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 10143 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 44689979 44690114 44690071 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 12852 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 44897170 44897489 44897243 Y NA RNF220 NA NA NA NA RNF220 28304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 44962677 44962982 44962698 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 93811 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 45376274 45376331 45376304 Y NA CCNB1IP1P1 NA NA NA NA CCNB1IP1P1 45898 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 45990749 45991039 45990946 Y NA TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1 NA NA NA NA PRDX1 4030 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 46575103 46575175 46575140 Y PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA TSPAN1 63570 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 47102400 47102701 47102616 Y NA MKNK1,ATPAF1 NA NA NA NA MKNK1 21885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 48178329 48178566 48178448 Y NA NA CYP4A22,CMPK1,FOXD2,MGC12982 IMR90 Hi-C 24141950 CMPK1 380860 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 51245588 51245972 51245952 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 177963 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 51302197 51302583 51302391 Y FAF1 NA NA NA NA NA FAF1 121352 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 51823993 51824400 51824363 Y NA TTC39A NA NA NA NA TTC39A 15205 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 52238666 52238881 52238774 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 103596 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 53020482 53020832 53020657 Y BTF3L4,PRPF38A,ZYG11B,FAM159A,ZCCHC11 ZCCHC11,GPX7 NA NA NA NA ZCCHC11 3323 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 53702100 53702340 53702220 Y NA CPT2,C1orf123 NA NA NA NA MAGOH 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 54844378 54844570 54844456 Y NA SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 32582 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 59085972 59086240 59086165 Y NA TACSTD2 TACSTD2,OMA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TACSTD2 44806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA JUN 121264 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 60157078 60157331 60157204 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 121127 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 60598724 60598934 60598848 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 320266 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 62307827 62308113 62307970 Y NA NA NA NA NA NA INADL 101678 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 62416847 62417238 62417043 Y INADL,USP1,KANK4 NA NA NA NA NA INADL 210698 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 64223023 64223051 64223037 Y NA ROR1 ROR1 IMR90 Hi-C 24141950 ROR1 14642 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 65363729 65364057 65363938 Y JAK1 NA NA NA NA NA JAK1 66130 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 65507944 65508037 65507991 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 23383 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 65701792 65701883 65701838 Y NA DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 10019 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 66736293 66736539 66736358 Y PDE4B,PDE4B NA NA NA NA NA WDR78 652031 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 68000341 68000585 68000456 Y SLC35D1 NA GNG12,DIRAS3,LOC100289178,GADD45A,WLS IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERBP1 106243 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 68215256 68215932 68215330 Y NA NA NA NA NA NA GADD45A 66512 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 68572958 68573227 68573176 Y NA NA NA NA NA NA WLS 123576 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 68640572 68640736 68640689 Y NA NA NA NA NA NA WLS 56067 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 14453 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.16584078983524 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NA NA NA NA NA ZRANB2-AS2 1204213 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 75683161 75683232 75683197 Y NA NA NA NA NA NA SLC44A5 391569 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 76197113 76197244 76197179 Y NA ACADM NA NA NA NA ACADM 9077 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 76730126 76730314 76730220 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC3 191722 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 76776213 76776609 76776411 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC3 237809 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 77403313 77403685 77403438 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC5 72187 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 78019403 78019530 78019478 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 127574 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 78240205 78240392 78240373 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A USP33,ZZZ3,FAM73A IMR90 Hi-C 24141950 RP4-706L14.2 1656 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 78423142 78423521 78423473 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 19273 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 79154444 79154658 79154581 Y NA IFI44 NA NA NA NA IFI44 40963 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 81843973 81844266 81844258 Y NA NA NA NA NA NA ST13P20 341112 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 83506477 83506486 83506482 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 818220 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 83528650 83529168 83528896 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 795538 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 85667688 85667915 85667906 Y NA SYDE2 NA NA NA NA SYDE2 2959 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 86000890 86001115 86001087 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 40818 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 87359712 87359873 87359793 Y NA SEP15,HS2ST1 NA NA NA NA SEP15 18234 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 87799623 87799998 87799801 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 7472 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 89149109 89149398 89149189 Y NA PKN2 NA NA NA NA PKN2 1204 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 90309838 90310280 90310072 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 25265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 92907492 92907607 92907552 Y NA NA NA NA NA NA GLMN 144948 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 93386726 93386941 93386863 Y NA FAM69A NA NA NA NA FAM69A 38116 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 94038553 94038921 94038737 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 126865 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 94089710 94089715 94089713 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 178022 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 94448988 94449099 94449044 Y NA NA NA NA NA NA GCLM 76022 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 94532879 94533090 94532990 Y NA NA NA NA NA NA ABCA4 51598 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 94784984 94785158 94785071 Y NA ARHGAP29 ARHGAP29,ABCA4,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 46360 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 94891778 94892070 94891849 Y NA ABCD3 NA NA NA NA ABCD3 9845 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 95551114 95551338 95551185 Y NA ALG14,TMEM56 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 14613 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 97199537 97199912 97199566 Y NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 14316 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 99782000 99782078 99782026 Y NA NA NA NA NA NA LPPR4 54491 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 99907375 99907562 99907467 Y NA NA NA NA NA NA LPPR4 179866 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr1 99907725 99907872 99907799 Y NA NA NA NA NA NA LPPR4 180216 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 100494312 100494735 100494498 Y CDC14A,HIAT1 HIAT1 NA NA NA NA HIAT1 6918 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 100828525 100828922 100828611 Y SASS6 CDC14A NA NA NA NA CDC14A 19941 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr1 100859089 100859486 100859291 Y NA NA NA NA NA NA CDC14A 50505 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 104105795 104105973 104105867 Y NA RNPC3 NA NA NA NA RNPC3 39482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 107684770 107685020 107684841 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 87503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 108695322 108695861 108695595 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 45610 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 110548379 110548612 110548408 Y NA AHCYL1 NA NA NA NA AHCYL1 23071 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 111514711 111514719 111514715 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 10010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 112013331 112014031 112013881 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162 OVGP1,ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 23333 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 112135698 112135869 112135721 Y C1orf183,DENND2D,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 52858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 113086746 113087141 113086830 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 72654 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 115046601 115046805 115046703 Y NA TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 4976 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 117110819 117111247 117111136 Y NA NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 414 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 117130518 117130699 117130624 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 18857 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 117256857 117256976 117256917 Y NA IGSF3 CD101,TTF2 IMR90 Hi-C 24141950 IGSF3 48482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 117421623 117422020 117421974 Y TTF2 PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 118153815 118153988 118153913 Y FAM46C FAM46C NA NA NA NA FAM46C 7259 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 119401140 119401399 119401296 Y NA NA NA NA NA NA RP11-418J17.1 279620 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 120147764 120147961 120147863 Y HSD3B1 GAPDHP33,ZNF697 NA NA NA NA GAPDHP33 9962 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 120180868 120181132 120181082 Y NBPF7,ZNF697 GAPDHP33,ZNF697,PHGDH NA NA NA NA ZNF697 7264 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 144987154 144987391 144987382 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 86795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 145004446 145004804 145004625 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 69382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 145042783 145043227 145042898 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 30959 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 145106553 145106772 145106662 Y NA PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 12333 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 145113904 145114998 145114671 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 19684 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 145701524 145701615 145701570 Y NA NA NA NA NA NA RNF115 92488 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 7.86001851269438 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 3037 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 149931955 149932255 149932237 Y NA SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B MTMR11,SF3B4 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR11 25164 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 150294873 150295138 150294978 Y PLEKHO1,MCL1,CTSS,PRPF3 C1orf51,MRPS21,PRPF3,RPRD2 NA NA NA NA PRPF3 2948 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 150592182 150592667 150592572 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 7421 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 150668096 150668276 150668180 Y NA GOLPH3L NA NA NA NA GOLPH3L 466 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 151418157 151418544 151418397 Y NA PSMB4,POGZ NA NA NA NA POGZ 11397 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 151422102 151422465 151422287 Y NA POGZ NA NA NA NA POGZ 7476 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 151868154 151868386 151868273 Y NA THEM4 NA NA NA NA THEM4 11898 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 152140379 152140745 152140485 Y NA NA NA NA NA NA TCHH 55823 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 17.1392070346252 chr1 153505144 153505346 153505245 Y NA BX470102.3,S100A6,S100A4 NA NA NA NA BX470102.3 1065 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 BX470102.3,S100A6,S100A4,S100A14 NA NA NA NA S100A4 20406 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr1 153762591 153763309 153762932 Y NPR1 SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 17761 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 153767353 153767730 153767624 Y NA SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 22523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 154151566 154151965 154151766 Y NA TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 13159 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 154587281 154587469 154587375 Y NA ADAR NA NA NA NA ADAR 11006 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 154977099 154977253 154977190 Y ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 3972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 155052148 155052357 155052334 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1 NA NA NA NA EFNA3 17924 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 155064813 155064992 155064903 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 30589 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA NA LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 IFI16 848069 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 159887185 159887340 159887284 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 6182 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 160203977 160204039 160204035 Y NA PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 25495 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 160696081 160696317 160696161 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 166453 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A NA NA NA NA NA DUSP12 216649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 164389251 164389388 164389267 Y NA NA NA NA NA NA HMGB3P6 65247 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 164580985 164581415 164581219 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 58164 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 164655011 164655383 164655197 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 132190 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 164685981 164686133 164686057 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 163160 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 164961189 164961330 164961260 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 438368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.72917309468555 chr1 165823413 165823808 165823568 Y NA UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 28421 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 166102836 166102913 166102873 Y NA FAM78B NA NA NA NA FAM78B 31293 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 167399403 167399506 167399433 Y CD247 NA NA NA NA NA CREG1 121498 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 167772811 167773182 167772825 Y CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 14304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 168355862 168356010 168355936 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 107584 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 168368318 168368620 168368438 Y TBX19 NA NA NA NA NA TBX19 120040 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 168409627 168409736 168409651 Y NA NA F5 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 161349 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 168440429 168440721 168440575 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 192151 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 168479157 168479362 168479223 Y XCL2,XCL1 NA C1orf114,BLZF1 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 230879 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 168531443 168531650 168531547 Y NA NA LOC100505918,NME7 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 283165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 168876326 168876730 168876527 Y NA NA ATP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1B1 196205 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 169911234 169911623 169911565 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 49826 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 170640579 170640941 170640702 Y NA PRRX1 NA NA NA NA PRRX1 10710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 171473011 171473311 171473138 Y NA PRRC2C NA NA NA NA PRRC2C 20360 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 173816933 173817269 173817101 Y NA DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5 NA NA NA NA ZBTB37 17951 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 173909740 173909938 173909924 Y RC3H1,ZBTB37 NA NA NA NA NA GAS5 73720 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 173984193 173984403 173984298 Y GPR52,ZBTB37,RC3H1 RC3H1 NA NA NA NA RC3H1 5032 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 174937322 174937525 174937409 Y KIAA0040,KIAA0040 CACYBP NA NA NA NA CACYBP 28775 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 175145439 175145838 175145619 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 14297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 175579228 175579572 175579481 Y NA NA NA NA NA NA RP11-318C24.1 309539 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 175902819 175902853 175902836 Y NA RP11-318C24.1 NA NA NA NA RP11-318C24.1 13708 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 178509347 178509739 178509543 Y NA C1orf220 NA NA NA NA C1orf220 148 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 178575191 178575363 178575289 Y TOR3A,RALGPS2 NA RALGPS2,ANGPTL1,FAM20B,C1orf220 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 65304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 179110934 179111289 179111201 Y AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2 NA NA NA NA NA TOR3A 62422 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 180249791 180250006 180249913 Y NA NA NA NA NA NA LHX4 52370 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 180251899 180252130 180252121 Y NA NA NA NA NA NA LHX4 54478 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 180371123 180371295 180371283 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 98794 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 180613229 180613603 180613357 Y NA XPR1 NA NA NA NA XPR1 14089 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 181459512 181459699 181459606 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1E 79274 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 182056560 182056703 182056632 Y NA NA TEDDM1,GLUL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 302638 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 182363463 182363693 182363584 Y RNASEL,NPL,GLUL,GLUL GLUL NA NA NA NA GLUL 4122 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 182585205 182585710 182585424 Y NA RNASEL,RGS16 NA NA NA NA RGS16 13662 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 183129116 183129507 183129296 Y LAMC2 LAMC2 LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 23866 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 183171353 183171815 183171539 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 17980 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 183836661 183836955 183836765 Y RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 181856 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 183861530 183861762 183861690 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA TSEN15 157049 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 184700299 184700688 184700567 Y NA EDEM3 NA NA NA NA EDEM3 21359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 184820980 184820991 184820986 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 98933 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 185253692 185254037 185253865 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 30424 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 185297372 185297765 185297602 Y FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 12911 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 186818504 186818763 186818666 Y PTGS2,PLA2G4A PLA2G4A NA NA NA NA PLA2G4A 22419 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 192691567 192691932 192691775 Y NA MIR4426 RGS13 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 8254 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 193080839 193080969 193080896 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 7595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 193226500 193227132 193226836 Y RGS2 NA NA NA NA NA B3GALT2 72716 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 197530309 197530378 197530355 Y NA NA NA NA NA NA DENND1B 212448 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 198127475 198127965 198127580 Y NA NEK7 NA NA NA NA NEK7 3382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 198136529 198137056 198136658 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 12436 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 198237796 198237952 198237874 Y NA NA NA NA NA NA NEK7 113703 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 198845240 198845523 198845521 Y NA NA NA NA NA NA NEK7 721147 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 198850238 198850638 198850585 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 726145 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 198887897 198888318 198888210 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 763804 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 779842 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 199053449 199054028 199053694 Y NA NA LOC100131234,PTPRC IMR90 Hi-C 24141950 NEK7 929356 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 201084133 201084558 201084403 Y NA NA NA NA NA NA TMEM9 54144 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 201139670 201140154 201139905 Y NA TMEM9,IGFN1 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 968 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 201236006 201236165 201236054 Y LAD1,C1orf106,PKP1 NA NA NA NA NA IGFN1 78053 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 201277004 201277220 201277102 Y NA NA NA NA NA NA LAD1 89516 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 201426190 201426373 201426369 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 9992 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 201500233 201500477 201500437 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 23649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 201864045 201864232 201864194 Y NA SHISA4 NA NA NA NA SHISA4 8237 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 202077636 202077876 202077756 Y ELF3,LGR6 ARL8A NAV1,ARL8A,GPR37L1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARL8A 33993 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 202872285 202872308 202872297 Y NA RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12 RABIF MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA1P59 6632 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 203063440 203063465 203063453 Y PPFIA4 NA NA NA NA NA PPFIA4 69814 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA MYBPH NA NA NA NA MYBPH 41695 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 23709 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 203297101 203297334 203297256 Y LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 24482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 203789427 203789442 203789436 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 26645 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 203965652 203965916 203965843 Y NA NA ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13 IMR90 Hi-C 24141950 SOX13 74327 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.16584078983524 chr1 204049581 204049822 204049645 Y LAX1,PIK3C2B,SOX13 SOX13 NA NA NA NA SOX13 9338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 204363456 204363666 204363499 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 15253 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA NA CDK18 61145 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 205512470 205512827 205512691 Y NA CDK18 NA NA NA NA CDK18 40747 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 205709805 205710150 205710085 Y NA NUCKS1,RAB7L1 NA NA NA NA NUCKS1 7254 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 207921430 207921703 207921565 Y CR1L CD46 CR1L IMR90 Hi-C 24141950 CD46 1699 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 209538127 209538433 209538258 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR205HG 61732 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA KCNH1 269924 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 211688648 211688771 211688711 Y NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61313 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 211950086 211950249 211950170 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 51865 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 211976591 211977124 211977068 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 24990 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr1 214162828 214163073 214162948 Y PROX1 PROX1 NA NA NA NA PROX1 8304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 214163432 214163790 214163677 Y NA PROX1 NA NA NA NA PROX1 8908 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 215481885 215482223 215482013 Y NA NA CENPF IMR90 Hi-C 24141950 KCTD3 256512 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 216774004 216774285 216774188 Y ESRRG,ESRRG NA NA NA NA NA ESRRG 534812 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 218523725 218524123 218523798 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 6148 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 218546684 218546887 218546789 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 29107 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 218636802 218637167 218637004 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 119225 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 219722653 219722988 219722821 Y NA NA RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-95P13.1 108669 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 219728784 219728936 219728867 Y NA NA RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-95P13.1 114800 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 219955751 219955972 219955860 Y NA NA NA NA NA NA EPRS 262028 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr1 220868801 220868862 220868831 Y C1orf115,MOSC2,MOSC1 C1orf115 NA NA NA NA C1orf115 7614 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 222814663 222814910 222814786 Y NA MIA3 NA NA NA NA MIA3 25235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 222828361 222828786 222828451 Y TLR5 MIA3 NA NA NA NA MIA3 38933 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 223095586 223095912 223095632 Y NA NA NA NA NA NA DISP1 109180 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 223203713 223203863 223203798 Y NA NA FAM177B IMR90 Hi-C 24141950 TLR5 110761 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.40167232332328 chr1 223204032 223204174 223204104 Y NA NA FAM177B IMR90 Hi-C 24141950 TLR5 110450 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 6.87751619860758 chr1 224914627 224914789 224914675 Y NA NA NA NA NA NA DNAH14 167175 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 226005413 226005573 226005512 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 9619 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A MIXL1 NA NA NA NA MIXL1 25811 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 226443007 226443187 226443097 Y NA MIXL1 NA NA NA NA MIXL1 33688 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 226841860 226842030 226841923 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 18738 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 226842752 226843521 226843149 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 17247 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 226864749 226865297 226865095 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 3981 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 226878935 226879345 226879207 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 18167 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 226890098 226890374 226890232 Y NA ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 29330 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 228640073 228640088 228640081 Y NA TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 3472 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 230203814 230204638 230204330 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 12278 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA NA NA NA NA NA COG2 113086 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 231347338 231347496 231347363 Y C1orf124 C1orf131,GNPAT NA NA NA NA C1orf131 27437 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 231868761 231869568 231868969 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 108200 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 232760730 232761090 232760801 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2,DISC2,NTPCR IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 204843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 53.9284603509864 chr1 233750790 233751092 233750957 Y KCNK1 KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 3040 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 234250535 234250574 234250556 Y NA NA NA NA NA NA SLC35F3 211856 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 115572 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47687 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 235242792 235242999 235242934 Y NA TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47252 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 235460869 235461278 235461096 Y RBM34,ARID4B,ARID4B GGPS1,ARID4B NA NA NA NA GGPS1 27387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 235805098 235806119 235805875 Y LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B GNG4 NA NA NA NA GNG4 5935 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 236430059 236430250 236430155 Y NA ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 13069 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 236559628 236560010 236559876 Y MTR,LGALS8,EDARADD,EDARADD NA NA NA NA NA EDARADD 50066 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 236698906 236699167 236699014 Y EDARADD,MTR NA NA NA NA NA HEATR1 66637 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 237007861 237008154 237008008 Y NA NA NA NA NA NA MTR 51251 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA MTR 677641 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.62000617089813 chr1 238730357 238730538 238730448 Y NA NA NA NA NA NA CHRM3 817327 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 239877993 239878320 239878052 Y NA NA NA NA NA NA CHRM3 330128 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 239893728 239894036 239893786 Y NA NA NA NA NA NA CHRM3 345863 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr1 240169714 240169802 240169754 Y NA NA NA NA NA NA ADH5P3 161653 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 240306165 240306375 240306208 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 25080 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 243585242 243585384 243585313 Y CEP170,AKT3,AKT3 NA NA NA NA NA SDCCAG8 167922 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 243995795 243995860 243995825 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 16521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 243997018 243997244 243997154 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 15137 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 244212276 244213430 244213047 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 199895 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 244505125 244505457 244505330 Y AKT3,AKT3,ADSS NA C1orf100,ADSS,AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 107979 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 244532902 244533005 244532971 Y NA NA NA NA NA NA ADSS 80431 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr1 246317158 246317459 246317368 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 351155 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 246749077 246749442 246749258 Y CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 21331 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 246763574 246763751 246763579 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 35828 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr1 247297966 247298129 247298007 Y NA ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 32292 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 49442 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA NA NA NA NA NA ZNF669 60892 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 1112826 1113160 1112997 Y WDR37 IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 19348 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 3441336 3441600 3441518 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 228333 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 4983862 4984222 4983900 Y NA NA tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 51066 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 5045021 5045414 5045392 Y AKR1C2 AKR1C2,AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C2 12809 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 5105953 5106270 5106114 Y NA AKR1C2,AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 30407 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr10 5113786 5114179 5114065 Y AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3 AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 38240 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 118302 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.83834001847297 chr10 5334474 5334640 5334544 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 117874 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr10 5336164 5336286 5336241 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 116228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA CALML5 NA NA NA NA CALML5 34868 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 5530637 5531333 5530982 Y NA CALML5,CALML3 NA NA NA NA CALML5 8200 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 13.6458654734277 chr10 5553514 5553674 5553594 Y NA CALML5,CALML3 FAM208B,NET1,CALML3,CALML5 IMR90 Hi-C 24141950 CALML3 11250 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr10 5590010 5590295 5590293 Y NET1,CALML3 CALML3 NA NA NA NA CALML3 25086 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 5707430 5707726 5707563 Y NA ASB13,FAM208B NA NA NA NA ASB13 872 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 5783071 5783414 5783247 Y NA NA GDI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 58270 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 6182474 6182743 6182618 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 2138 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr10 6183553 6183785 6183703 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 1096 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 6343712 6343937 6343834 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 158831 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 176551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 6449763 6450038 6449901 Y PRKCQ NA NA NA NA NA PRKCQ 170225 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 6959194 6959383 6959289 Y NA NA SFMBT2,LOC100507127 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCQ 338931 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 7277177 7277507 7277289 Y ITIH2 NA NA NA NA NA SFMBT2 173943 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 7356268 7356516 7356367 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA SFMBT2 94934 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 8903701 8904023 8903876 Y NA NA TAF3,GATA3,FLJ45983 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF3 1045234 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 10747328 10747568 10747448 Y NA NA NA NA NA NA USP6NL 904185 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 11165965 11166190 11166078 Y NA NA NA NA NA NA USP6NL 485563 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 12543456 12543849 12543654 Y SEC61A2 NA NA NA NA NA CAMK1D 153975 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 14175548 14175585 14175560 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 326556 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 14955590 14955884 14955736 Y HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2 SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1 NA NA NA NA SUV39H2 36771 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 17008974 17009242 17009052 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 151447 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 17067559 17067950 17067759 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 174103 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 18860767 18861138 18861132 Y NA RP11-499P20.2 NA NA NA NA RP11-499P20.2 28187 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 18897565 18897858 18897712 Y NSUN6,ARL5B NSUN6,ARL5B-AS1,ARL5B NA NA NA NA NSUN6 40693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 20134637 20134650 20134644 Y PLXDC2 PLXDC2 NA NA NA NA PLXDC2 31469 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 20841595 20841995 20841796 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 619121 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 21333319 21333508 21333415 Y NEBL,C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 127608 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 21716825 21717072 21716945 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA MLLT10 104022 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 22555688 22555894 22555791 Y NA COMMD3 NA NA NA NA COMMD3 47009 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr10 24740338 24740618 24740546 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 269979 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 24858253 24858468 24858359 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 152129 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 24996902 24997348 24997071 Y NA ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 13249 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 25201195 25201516 25201227 Y NA PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 38017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 25724945 25725304 25725156 Y NA NA NA NA NA NA THNSL1 421358 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 27028326 27028583 27028339 Y MASTL,PDSS1,ABI1 PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 43738 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 28002936 28003088 28002983 Y ARMC4,MKX NA NA NA NA NA RAB18 211739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 28957755 28957993 28957831 Y BAMBI BAMBI BAMBI K562 ChIA-PET 22265404 BAMBI 6278 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.29250539953586 chr10 29184035 29184352 29184192 Y BAMBI NA LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 219764 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.82084233255977 chr10 29195098 29195451 29195275 Y NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 230827 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 29196228 29196432 29196257 Y BAMBI NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 231957 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr10 29213480 29213697 29213581 Y NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 249209 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 12.4450293117661 chr10 29228333 29228416 29228371 Y NA NA BAMBI,LOC100507605,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 264062 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 29228763 29229094 29228981 Y NA NA BAMBI,LOC100507605,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 264492 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 29254247 29254334 29254291 Y NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 289976 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 29280500 29280692 29280596 Y NA NA LYZL1,BAMBI,LOC100507605 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 316229 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr10 29420684 29421072 29420878 Y NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD3P1 275259 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 29421778 29421876 29421872 Y NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD3P1 274455 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr10 29585652 29585835 29585744 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 110496 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 29761620 29761743 29761682 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 65289 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 29924706 29925406 29925356 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 98304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 32047879 32048374 32048138 Y ZEB1 NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 167368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr10 33773823 33773922 33773871 Y NA NA NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 150633 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 33798158 33798349 33798267 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 174968 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 34924725 34924738 34924731 Y NA RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 26291 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 35059349 35059608 35059479 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 42645 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2 NA NA NA NA CUL2 47242 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 35932153 35932694 35932189 Y FZD8 NA NA NA NA NA CCNY 398200 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 38325428 38325718 38325598 Y ZNF25,ZNF37A ZNF33A NA NA NA NA ZNF33A 27850 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 42400063 42400397 42400233 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 565291 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF NA NA NA NA HNRNPF 48279 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 49771020 49771173 49771105 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP22 91137 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 51039519 51039692 51039605 Y NA NA NA NA NA NA OGDHL 71094 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 52167205 52167434 52167402 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 144467 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 55377812 55377822 55377817 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 1305756 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 60935384 60935742 60935425 Y NA PHYHIPL NA NA NA NA PHYHIPL 1034 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 62307595 62307995 62307795 Y ANK3 NA NA NA NA NA CDK1 228094 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 63736420 63736602 63736437 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 77361 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 65016713 65017097 65017085 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 125663 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 65033384 65033629 65033527 Y NRBF2,JMJD1C NA NA NA NA NA NRBF2 142334 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 66069131 66069337 66069175 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 408126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr10 66085994 66086251 66086123 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 424989 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr10 69778500 69778679 69778642 Y NA NA NA NA NA NA HERC4 54426 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 70825489 70826129 70825820 Y HK1,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRGN 19733 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 71626507 71626840 71626632 Y COL13A1 NA NA NA NA NA H2AFY2 183712 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA UNC5B-AS1 50192 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 74019515 74019657 74019544 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 12021 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 74271285 74271561 74271407 Y DDIT4,DNAJB12,CBARA1 NA NA NA NA NA MICU1 112338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 75253773 75253975 75253905 Y NA RP11-137L10.6 NA NA NA NA PPP3CB 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 75361338 75361489 75361457 Y NA USP54 USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103 IMR90 Hi-C 24141950 USP54 22222 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr10 77155629 77155954 77155896 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 3710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 77164585 77164731 77164659 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4921 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 77165098 77165501 77165301 Y C10orf11 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 5434 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 77803071 77803442 77803222 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 444073 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 78192206 78192310 78192258 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 833208 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 78784039 78784371 78784322 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 611982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 78792238 78792506 78792372 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 603847 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 78974815 78975138 78974939 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 421215 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr10 79002896 79003188 79003042 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 393165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 79119995 79120222 79120109 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 276131 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 79123955 79124246 79124101 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 272107 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 79284063 79284455 79284320 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 111898 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 79313411 79313746 79313629 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 82607 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 79346819 79347304 79347005 Y KCNMA1 KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 49049 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 79389440 79389814 79389806 Y NA KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 6539 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 80981088 80981226 80981157 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 123999 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 81027973 81028590 81028056 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76635 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 81028676 81029041 81028720 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76184 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 81077317 81078576 81077648 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 26649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 82176099 82176325 82176238 Y C10orf58 FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA FAM213A 10514 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 82215085 82215437 82215324 Y TSPAN14,SH2D4B FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 3163 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 82224459 82224735 82224582 Y NA TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 12537 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr10 82260440 82261008 82260524 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 48518 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 86363925 86364033 86363979 Y NA RPS3AP5 NA NA NA NA RPS3AP5 45726 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA GRID1 WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 GRID1 35761 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 89519838 89520126 89519981 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 55559 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 89602886 89603081 89603056 Y NA CFL1P1,ATAD1,PTEN NA NA NA NA ATAD1 3786 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 93241945 93242217 93242081 Y NA NA NA NA NA NA HECTD2 73849 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 93991232 93991452 93991342 Y NA NA NA NA NA NA CPEB3 57392 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr10 94353992 94354203 94354151 Y MARCH5 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 2949 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 95081157 95081194 95081175 Y O3FAR1 RP11-624L12.1 NA NA NA NA RP11-624L12.1 38842 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA CEP55 NA NA NA NA CEP55 48759 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 95675431 95675709 95675545 Y NA SLC35G1 NA NA NA NA SLC35G1 23701 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 97218383 97218641 97218563 Y NA NA NA NA NA NA SORBS1 100530 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 97311589 97311866 97311827 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 7305 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 97687985 97688127 97688056 Y NA NA NA NA NA NA RP11-248J23.5 69873 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 98308552 98308827 98308687 Y LCOR,C10orf12,ZNF518A,PIK3AP1,TM9SF3 NPM1P26,TM9SF3 NA NA NA NA NPM1P26 9115 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 99174702 99174858 99174830 Y ZFYVE27,PI4K2A,RRP12 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 RRP12 K562 ChIA-PET 22265404 PGAM1 9059 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 102140082 102140467 102140275 Y NA SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 8710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 103708018 103708327 103708173 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 105623 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr10 104556220 104556459 104556323 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 55521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 105452274 105452407 105452303 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 223556 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 105611177 105611504 105611341 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 64459 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 106020526 106021193 106020581 Y SLK,MEIR5,MEIR5,ITPRIP,CCDC147,GSTO1,GSTO1 WDR96,GSTO1,MIR4482-1,GSTO2 NA NA NA NA MIR4482-1 4984 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 108152037 108152234 108152222 Y NA NA NA NA NA NA CCDC147-AS1 2040704 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 112215418 112215452 112215427 Y NA DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 40144 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 112401121 112401469 112401220 Y SMC3,RBM20 RBM20 NA NA NA NA RBM20 686 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr10 112402938 112403137 112402952 Y NA RBM20 NA NA NA NA RBM20 783 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr10 112582466 112582715 112582708 Y SMC3,ADRA2A PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 46850 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 112602862 112603073 112603000 Y SMC3,PDCD4 PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 26492 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 112674359 112675211 112674854 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 1821 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 113639834 113639959 113639897 Y NA NA NA NA NA NA GPAM 333176 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 113990529 113990656 113990593 Y NA GPAM NA NA NA NA GPAM 17394 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 114031765 114032053 114031942 Y NA NA NA NA NA NA GPAM 58630 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 114715800 114716132 114715855 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 7791 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 116927566 116927896 116927668 Y NA NA NA NA NA NA ATRNL1 76442 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 118714609 118714623 118714617 Y NA NA NA NA NA NA RP11-539I5.1 106893 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 118829822 118829902 118829862 Y C10orf82,KCNK18,KIAA1598 NA NA NA NA NA KIAA1598 54195 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 119019345 119019394 119019369 Y KCNK18,SLC18A2 SLC18A2 NA NA NA NA SLC18A2 20741 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 119028396 119028853 119028412 Y SLC18A2 SLC18A2 NA NA NA NA SLC18A2 29792 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr10 119107774 119108099 119107936 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 24879 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A,LINC00867 NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 120850460 120850786 120850708 Y NA EIF3A,FAM45A EIF3A,PRDX3,SFXN4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM45A 10812 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 122844342 122844508 122844416 Y NA RP11-159H3.1 NA NA NA NA RP11-159H3.1 46729 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 124222687 124222865 124222833 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 3646 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 125730230 125730378 125730329 Y NA NA NA NA NA NA CHST15 120828 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 125800015 125800214 125800088 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 50992 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 126029584 126030073 126029818 Y CHST15 NA HMX3 IMR90 Hi-C 24141950 OAT 75472 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 126397729 126397974 126397834 Y FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 32864 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 126411752 126412342 126412027 Y FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 18496 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 126749212 126749581 126749525 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98158 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 126749775 126749930 126749890 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 97809 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 126837951 126838191 126838020 Y NA CTBP2,MRPS21P6 NA NA NA NA CTBP2 9548 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 129675535 129675645 129675590 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 247004 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 129678841 129679128 129678968 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 243521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 129685028 129685334 129685080 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 237315 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr10 129704108 129704655 129704249 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 217994 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 113.861101510281 chr10 129706206 129706827 129706528 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 215822 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr10 129707008 129707239 129707127 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 215410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 129721316 129721687 129721518 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 200962 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr10 129742865 129742981 129742943 Y NPS NA NA NA NA NA MKI67 179668 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 129774599 129774927 129774767 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 147722 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 129775759 129776314 129776065 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 146335 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 129786361 129786590 129786527 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 136059 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr10 129787766 129788203 129788000 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 134446 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 129789575 129789766 129789637 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 132883 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 129799058 129799270 129799164 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 123379 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr10 129816655 129817081 129816870 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 105568 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr10 129893841 129894010 129893942 Y NA MKI67 NA NA NA NA MKI67 28639 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 131819686 131819939 131819817 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 112724 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 133776164 133776302 133776237 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 17133 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.14834310392203 chr10 134221496 134221692 134221620 Y PWWP2B PWWP2B NA NA NA NA PWWP2B 12824 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 NA NA NA NA NA PWWP2B 51669 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr10 135072735 135073128 135072895 Y TUBGCP2,ADAM8 ZNF511 NA NA NA NA ZNF511 46851 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 364521 364678 364634 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3 ANO9,SIGIRR,B4GALNT4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 3118 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 944711 944765 944751 Y NA CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 21817 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 1569740 1569888 1569766 Y TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 21262 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 1879618 1879880 1879749 Y NA NA NA NA NA NA MRPL23 86628 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 2223798 2223980 2223871 Y ASCL2 NA NA NA NA NA ASCL2 66202 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 2226111 2226485 2226212 Y ASCL2 NA NA NA NA NA ASCL2 63697 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 2238430 2238670 2238577 Y NA NA KCNQ1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCL2 51512 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 2988914 2989223 2989024 Y MRGPRG,SLC22A18 PHLDA2,NAP1L4 NA NA NA NA NAP1L4 22384 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 3077664 3078057 3077925 Y NA RNU1-91P,CARS NAP1L4 K562 ChIA-PET 22265404 CARS 821 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 3792611 3792742 3792677 Y STIM1,RHOG,NUP98 PGAP2,NUP98 NA NA NA NA PGAP2 24212 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 6273296 6273510 6273448 Y NA FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 19355 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 6281699 6281893 6281830 Y TRIM3,DCHS1,APBB1,APBB1 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 27758 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 7636630 7636941 7636786 Y PPFIBP2,OR5P3 NA NA NA NA NA CYB5R2 59512 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 7733058 7733320 7733201 Y NA CYB5R2 NA NA NA NA CYB5R2 36605 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 8607763 8607778 8607771 Y ASCL3,STK33 STK33 NA NA NA NA STK33 6058 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 8727919 8728019 8727969 Y ASCL3 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 25961 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 8756335 8756571 8756455 Y ST5,ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 54377 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 8799951 8800110 8800031 Y NA NA NA NA NA NA RPL27A 97993 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 8857868 8857938 8857900 Y NA NA NA NA NA NA AKIP1 72748 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 8889520 8889803 8889779 Y ST5 AKIP1 NA NA NA NA AKIP1 40883 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 9250767 9251109 9250945 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 33828 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr11 9824167 9824574 9824403 Y NA SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 46328 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 10373282 10373523 10373408 Y ADM,AMPD3 ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49055 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 10397619 10397698 10397657 Y AMPD3 NA SBF2,SWAP70,LOC283104,ADM,LOC440028,AMPD3,RNF141,MRVI1-AS1,MRVI1,CTR9,MTRNR2L8 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 73392 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 12146355 12146795 12146568 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 32812 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 12824175 12824668 12824395 Y TEAD1 NA NA NA NA NA TEAD1 130206 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 12973520 12973623 12973568 Y NA NA NA NA NA NA RASSF10 55073 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 13189363 13189539 13189451 Y NA NA TEAD1,LOC100506305,ARNTL,RASSF10,BTBD10 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 106660 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1,CALCB NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr11 16188431 16188789 16188610 Y NA NA NA NA NA NA C11orf58 443890 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 16574843 16575024 16574936 Y NA NA NA NA NA NA C11orf58 57655 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 17036768 17036996 17036882 Y PLEKHA7 RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7 NA NA NA NA PLEKHA7 2778 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 17164162 17164523 17164517 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C2A 63007 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr11 18649925 18650050 18650045 Y NA UEVLD,SPTY2D1 NA NA NA NA SPTY2D1 4288 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 19599589 19599793 19599635 Y NAV2,NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 229318 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 19717488 19717496 19717492 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 347217 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 19962898 19963229 19963064 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 420002 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 27140468 27140646 27140558 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 242769 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 28132530 28132826 28132694 Y NA METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 4675 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 28764751 28764902 28764829 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 636896 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 28864582 28864807 28864697 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 736727 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 30510063 30510254 30510126 Y FSHB,MPPED2,MPPED2 NA NA NA NA NA MPPED2 96165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 32442373 32442742 32442611 Y NA NA NA NA NA NA EIF3M 160602 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 33146392 33146678 33146610 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 35239 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 33889104 33889440 33889281 Y ABTB2,LMO2,LMO2 LMO2 NA NA NA NA LMO2 22396 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 34125347 34125667 34125520 Y NA NAT10 NA NA NA NA NAT10 198 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 34393112 34393337 34393189 Y ABTB2 RP1-145M24.1,ABTB2 ABTB2,ELF5,NAT10,CAT IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 15557 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 46567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 35341087 35341212 35341143 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 182670 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 35395403 35395808 35395629 Y SLC1A2 NA NA NA NA NA CD44 236986 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 41419040 41419236 41419231 Y NA NA NA NA NA NA LRRC4C 60087 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 41471316 41471693 41471422 Y NA LRRC4C NA NA NA NA LRRC4C 7630 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 42075853 42076183 42076170 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 517869 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 43360196 43360553 43360375 Y TTC17 API5,TTC17 NA NA NA NA TTC17 17929 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 43569506 43569887 43569721 Y C11orf96 HSD17B12 NA NA NA NA HSD17B12 6099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 44239965 44240168 44240067 Y NA NA NA NA NA NA ALX4 89548 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 46004522 46004898 46004712 Y NA NA NA NA NA NA GYLTL1B 63350 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 46058881 46059222 46059206 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 81763 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZ 87257 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 46706691 46706778 46706735 Y NA ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ARHGAP1 13387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr11 47787265 47787534 47787400 Y SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4 FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 270 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 47799022 47799247 47799135 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 12027 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 48040170 48040457 48040234 Y NA PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 40057 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 48102794 48103200 48102989 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 102681 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 57324540 57324747 57324726 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,SERPING1 SLC43A1,TIMM10,UBE2L6 NA NA NA NA UBE2L6 9010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 59524471 59524655 59524596 Y MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3 STX3 NA NA NA NA STX3 45542 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 60679748 60680120 60679877 Y CD5,CD6 PRPF19,TMEM109,TMEM132A NA NA NA NA TMEM109 402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr11 62267714 62268111 62267986 Y NA NA NA NA NA NA AHNAK 53596 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 62586827 62586893 62586843 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 10667 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 63298876 63299223 63298998 Y OTUB1,MARK2,RARRES3 NA NA NA NA NA PLA2G16 83132 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 63350815 63351029 63350927 Y RTN3,PLA2G16,PLA2G16 PLA2G16 NA NA NA NA PLA2G16 31326 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 63685258 63686079 63685609 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 2942 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 63686695 63687182 63686923 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 4379 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 63775286 63775368 63775342 Y KCNK4 COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA OTUB1 23961 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65076655 65076852 65076688 Y EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3437 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 22.7067201477838 chr11 65273934 65274467 65274182 Y NA MALAT1,SCYL1,LTBP3 LTBP3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10701 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65328084 65328375 65328271 Y NA SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 3683 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA OVOL1 NA NA NA NA OVOL1 14950 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65559034 65559399 65559282 Y NA OVOL1,SNX32 NA NA NA NA OVOL1 6541 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65849089 65849462 65849117 Y KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1 SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 13255 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 65949541 65949768 65949655 Y NA NA NA NA NA NA KLC2 72997 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 66118604 66119022 66118907 Y NA BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2 NA NA NA NA RP11-867G23.8 5183 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 66487767 66487982 66487867 Y NA RBM4B,C11orf80 NA NA NA NA C11orf80 21940 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 66511038 66511198 66511076 Y KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2 C11orf80 NA NA NA NA C11orf80 1116 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 67037275 67037527 67037373 Y TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 5394 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 67105994 67106296 67106145 Y NA SSH3,POLD4,AP003419.11 NA NA NA NA POLD4 16147 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 68049630 68050030 68049692 Y NA C11orf24,LRP5 NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf24 12161 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 68099033 68099353 68099110 Y NA LRP5 NA NA NA NA LRP5 20956 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 68110280 68110464 68110374 Y NA LRP5 PPP6R3 IMR90 Hi-C 24141950 LRP5 32203 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 68608164 68608616 68608368 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1262 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr11 69517228 69517437 69517319 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA FGF19 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr11 69632815 69633180 69632998 Y NA FGF4,FGF3 NA NA NA NA FGF3 1023 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr11 69639961 69640299 69640038 Y NA FGF3 FGF3 K562 ChIA-PET 22265404 FGF3 8169 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 33.7325794503134 chr11 69655407 69655781 69655522 Y FGF19,FGF3 FGF3 ANO1 IMR90 Hi-C 24141950 FGF3 23615 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.18333847574844 chr11 70155804 70155966 70155885 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 40998 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 70159213 70159451 70159301 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 44407 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 71493756 71493898 71493829 Y NA FAM86C1 NA NA NA NA FAM86C1 2658 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 71650610 71650763 71650692 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NUMA1,IL18BP IMR90 Hi-C 24141950 RNF121 12863 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 71990969 71991411 71991180 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 58224 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 72003135 72003262 72003223 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 70390 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 72462370 72462747 72462399 Y NA ARAP1,STARD10 NA NA NA NA ARAP1 39897 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 72808468 72808618 72808564 Y NA FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 42688 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 73722792 73723138 73723056 Y LIPT2,C2CD3,UCP2 UCP2 UCP2 K562 ChIA-PET 22265404 UCP2 30440 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 73731710 73731974 73731870 Y NA UCP2 NA NA NA NA UCP2 39358 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 74171904 74172163 74171977 Y SPCS2,RNF169,C2CD3 KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3 NA NA NA NA KCNE3 4611 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 74176233 74176573 74176529 Y KCNE3 KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3 NA NA NA NA KCNE3 201 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr11 74257729 74258089 74257917 Y KCNE3 NA KCNE3,P4HA3,LIPT2,PPME1,C2CD3,CHRDL2,RNF169,POLD3,PGM2L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POLD3 54833 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 75781411 75781582 75781473 Y NA NA NA NA NA NA WNT11 138198 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 76480789 76480971 76480905 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 3522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 7.86001851269438 chr11 76510532 76510646 76510589 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 NA NA NA NA RP11-21L23.3 18426 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 76674520 76674873 76674698 Y B3GNT6 NA NA NA NA NA CAPN5 101106 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 77156016 77156186 77156101 Y PAK1 PAK1 NA NA NA NA PAK1 27494 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 78144030 78144327 78144179 Y NA GAB2 NA NA NA NA GAB2 16636 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 78728809 78729043 78728943 Y ODZ4 NA NA NA NA NA MIR708 382110 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 79130045 79130391 79130200 Y NA MIR708 NA NA NA NA MIR708 18892 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 79148505 79148822 79148543 Y NA MIR708 NA NA NA NA MIR708 37352 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 85419491 85419865 85419792 Y SYTL2 CREBZF,CCDC89 NA NA NA NA CCDC89 24171 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 85702937 85703343 85703240 Y NA NA NA NA NA NA PICALM 75581 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 86195168 86195425 86195393 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 183915 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 86620154 86620414 86620285 Y NA FZD4,RP11-736K20.6 ME3 IMR90 Hi-C 24141950 FZD4 44019 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 87149211 87149297 87149219 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 402325 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 88069705 88069944 88069773 Y CTSC CTSC NA NA NA NA CTSC 750 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 91252482 91252645 91252564 Y NA NA NA NA NA NA RP11-121L10.3 1238754 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 92504926 92505284 92505105 Y NA NA NA NA NA NA SLC36A4 423846 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 92555481 92555703 92555592 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 373427 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 92764707 92764767 92764737 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 164363 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 93258917 93259186 93259082 Y MED17,SLC36A4,C11orf75 RP11-288E14.2 NA NA NA NA RP11-288E14.2 7448 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 93446176 93446355 93446266 Y NA SCARNA9,SNORD5,C11orf54 NA NA NA NA SCARNA9 6324 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 94882788 94883137 94883023 Y NA RP11-712B9.2 NA NA NA NA RP11-712B9.2 1085 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 95838694 95838939 95838802 Y FAM76B,CEP57,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 182215 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 95893318 95893469 95893394 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 180875 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 95963875 95964372 95964111 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 109972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 96104891 96105001 96104961 Y NA MAML2,CCDC82,JRKL NA NA NA NA CCDC82 16086 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr11 102177495 102177798 102177653 Y BIRC3 BIRC3,BIRC2 MMP7,BIRC2,BIRC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BIRC3 8417 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 102231981 102232209 102232014 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 16039 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 102283995 102284326 102284226 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 NA BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 54789 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 102296028 102296376 102296245 Y NA TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 42739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 102461117 102461349 102461270 Y NA NA NA NA NA NA TMEM123 122002 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 102798566 102798847 102798707 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D5 162097 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 103117200 103117534 103117367 Y NA NA NA NA NA NA DYNC2H1 139040 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 103281581 103281752 103281672 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 3196 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 103964272 103964478 103964415 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37O16.8 685887 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 106577276 106577400 106577281 Y NA NA NA NA NA NA GUCY1A2 309850 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 109965770 109966113 109965869 Y RDX,FDX1,ZC3H12C ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 3683 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 111307551 111307700 111307641 Y POU2AF1 NA LAYN,C11orf53,C11orf92,LOC100132078,ALG9,FDX1,ARHGAP20 IMR90 Hi-C 24141950 LAYN 101305 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr11 111569573 111569885 111569750 Y PPP2R1B NA NA NA NA NA PPP2R1B 65266 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 112016607 112016779 112016693 Y DIXDC1 BCO2 NA NA NA NA BCO2 27411 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 113637897 113638051 113637974 Y CLDN25 ZW10 NA NA NA NA ZW10 4482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA USP28 201112 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 114288977 114289308 114289144 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 18800 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 115093237 115093486 115093408 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 280189 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 115172228 115172553 115172441 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 201122 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 115360673 115361056 115361024 Y CADM1 CADM1 NA NA NA NA CADM1 12619 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 115371607 115371956 115371778 Y NA CADM1 NA NA NA NA CADM1 1719 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 117931677 117931995 117931810 Y IL10RA TMPRSS4 NA NA NA NA TMPRSS4 13758 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 118153348 118153551 118153451 Y NA MPZL3,MPZL2 AMICA1 IMR90 Hi-C 24141950 MPZL2 20097 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 118493108 118493651 118493460 Y NA PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 17953 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 118806138 118806167 118806153 Y NA MIR4492,BCL9L PHLDB1,TREH,DDX6,MIR4492,BCL9L,FOXR1,UPK2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9L 11821 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 120302835 120303154 120303088 Y OAF,ARHGEF12 NA NA NA NA NA GRIK4 77314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 120363124 120363469 120363220 Y NA GRIK4 NA NA NA NA GRIK4 16999 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 121289334 121289764 121289479 Y SORL1 SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 31148 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 121526794 121527145 121526879 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205882 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 121542614 121542884 121542776 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 221702 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 121983293 121983692 121983594 Y NA RP11-166D19.1 NA NA NA NA RP11-166D19.1 1339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 122100461 122100655 122100524 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166D19.1 115430 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 122100877 122101142 122101009 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166D19.1 115846 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 122936469 122936659 122936561 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 4531 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 122956299 122956503 122956402 Y NA SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 24361 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 123013120 123013348 123013342 Y NA NA NA NA NA NA HSPA8 81182 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 123941712 123941923 123941829 Y OR8B12,OR8G2 VWA5A PANX3,OR8B2,VWA5A,OR8A1 IMR90 Hi-C 24141950 VWA5A 42146 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 125304164 125304178 125304170 Y FEZ1 NA NA NA NA NA EI24 132934 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 126506687 126507034 126506855 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 283152 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 128588753 128589006 128588882 Y FLI1,FLI1,KCNJ5 NA NA NA NA NA ETS1 133300 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 128773699 128773839 128773753 Y KCNJ5,C11orf45 KCNJ5 NA NA NA NA KCNJ5 14448 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 128927593 128927968 128927781 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ5 168342 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 129149922 129150564 129150218 Y NA ARHGAP32 ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP32 2703 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 129185836 129186114 129185975 Y NA ARHGAP32 ARHGAP32,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP32 38617 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 129717042 129717234 129717138 Y ST14,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA TMEM45B 33328 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 129920255 129920483 129920343 Y APLP2 PRDM10,TCEB2P2,APLP2 APLP2,PRDM10,NFRKB,LINC00167,ST14 IMR90 Hi-C 24141950 APLP2 17249 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 130036262 130036668 130036368 Y PRDM10 ST14 NA NA NA NA ST14 8805 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 130062798 130062918 130062846 Y NA ST14 NA NA NA NA ST14 35341 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr11 130450344 130450649 130450537 Y NA NA ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB44 267763 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr11 130767627 130768066 130767878 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 16338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 131526472 131526629 131526570 Y NA NA NA NA NA NA NTM 288099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 GLB1L2 508318 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 647081 647236 647154 Y ERC1,SLC6A12,SLC6A12,B4GALNT3 NA NA NA NA NA B4GALNT3 79551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 685193 685500 685436 Y NA NA NA NA NA NA B4GALNT3 117663 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 1029926 1030313 1030120 Y WNK1 NA NA NA NA NA RAD52 66906 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA WNT5B 228800 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 1714275 1714637 1714592 Y NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 12944 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 3563518 3563854 3563701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543P15.1 244422 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 3771576 3771874 3771725 Y NA NA NA NA NA NA PARP11 208734 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 3948349 3948613 3948479 Y NA PARP11 NA NA NA NA PARP11 31995 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 4666420 4666590 4666540 Y NA C12orf4,RAD51AP1,DYRK4 NA NA NA NA DYRK4 2780 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 6311406 6311775 6311432 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 4525 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 6325035 6325634 6325452 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 18154 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 6339954 6340271 6340062 Y VAMP1,TAPBPL,IFFO1 CD9 NA NA NA NA CD9 33073 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr12 6482550 6482923 6482687 Y SCNN1A,SCNN1A TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A TNFRSF1A K562 ChIA-PET 22265404 LTBR 339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 6525626 6525956 6525791 Y NA LTBR,SCNN1A,RP1-102E24.9,TAPBPL TNFRSF1A,PLEKHG6,SCNN1A,TAPBPL,VAMP1,LOC678655,CD27,IFFO1,GAPDH IMR90 Hi-C 24141950 RP1-102E24.9 19708 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 6539566 6540029 6539921 Y NA RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1 NA NA NA NA RP1-102E24.9 5635 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 6721904 6722326 6722186 Y GPR162,ENO2,C12orf53 NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP,ING4 NA NA NA NA CHD4 7262 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 7040569 7040832 7040702 Y NA SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,PHB2 NA NA NA NA ATN1 8943 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 8069116 8069189 8069153 Y NA SLC2A3 NA NA NA NA SLC2A3 17682 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 9986583 9986922 9986755 Y NA NA NA NA NA NA CD69 75086 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 10515405 10515669 10515567 Y NA RP11-277P12.20 NA NA NA NA RP11-277P12.20 1037 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 11806275 11806670 11806607 Y BCL2L14,ETV6 ETV6 NA NA NA NA ETV6 5487 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 11902953 11903896 11903427 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 102165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 11926847 11927297 11927011 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 126059 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 11966137 11966507 11966203 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 165349 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 12009987 12010279 12010170 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA BCL2L14 190499 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 36148 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 12602381 12602995 12602706 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 94368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 12605511 12605890 12605533 Y NA NA NA NA NA NA LOH12CR1 97498 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 12661595 12661928 12661772 Y BCL2L14,DUSP16 NA LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 51389 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 12775556 12775830 12775680 Y LOH12CR1,CDKN1B,APOLD1,DUSP16 CREBL2 NA NA NA NA CREBL2 12795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA RP11-392P7.6,GPRC5D,HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 GPRC5D 21853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 14112244 14112326 14112257 Y GRIN2B NA NA NA NA NA ATF7IP 404284 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 15408630 15408974 15408946 Y NA NA NA NA NA NA PTPRO 64357 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 15697509 15697811 15697642 Y NA NA NA NA NA NA RP11-6K23.1 107048 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 15724023 15724144 15724072 Y NA NA NA NA NA NA RP11-6K23.1 133562 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 15899366 15899730 15899546 Y PTPRO NA NA NA NA NA EPS8 133533 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 15910995 15911177 15911085 Y NA NA PTPRO IMR90 Hi-C 24141950 EPS8 122086 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 19291558 19291779 19291581 Y AEBP2,PLEKHA5 PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 10910 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 19534179 19534194 19534187 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 20785 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 20076637 20076989 20076813 Y PDE3A NA NA NA NA NA RNU1-146P 201268 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 23625293 23625709 23625512 Y NA NA NA NA NA NA SOX5 476257 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 23746822 23747228 23747075 Y SOX5 NA NA NA NA NA SOX5 354738 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 24673435 24673806 24673663 Y SOX5 RP11-444D3.1 NA NA NA NA RP11-444D3.1 39718 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 24990714 24991079 24990897 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 109314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 24992180 24992695 24992446 Y BCAT1 NA NA NA NA NA BCAT1 107698 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 25445837 25446089 25445962 Y BCAT1 KRAS NA NA NA NA KRAS 43967 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA BHLHE41 NA NA NA NA BHLHE41 8249 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 27532512 27532752 27532665 Y C12orf71 ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 48725 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 27931494 27931809 27931627 Y MANSC4 NA NA NA NA NA MRPS35 69788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.93000925634719 chr12 28119724 28120118 28120115 Y MANSC4,PTHLH,PTHLH PTHLH NA NA NA NA PTHLH 3520 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.72917309468555 chr12 28126453 28126843 28126791 Y PTHLH,PTHLH PTHLH NA NA NA NA PTHLH 2815 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr12 28127967 28128359 28128243 Y PTHLH,PTHLH PTHLH NA NA NA NA PTHLH 4329 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 28128658 28128812 28128736 Y MANSC4,PTHLH,PTHLH PTHLH NA NA NA NA PTHLH 5020 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.94750694226039 chr12 28283625 28284072 28283761 Y PTHLH,PTHLH CCDC91 PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 110 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 32263319 32263494 32263407 Y NA BICD1 NA NA NA NA BICD1 5550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 33137070 33137259 33137186 Y PKP2 NA NA NA NA NA PKP2 89296 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 41137156 41137542 41137225 Y CNTN1 NA NA NA NA NA CNTN1 52912 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 41264985 41265046 41264997 Y CNTN1 NA NA NA NA NA CNTN1 180741 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 41286923 41287191 41287057 Y NA NA NA NA NA NA CNTN1 202679 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 41350746 41350817 41350787 Y NA NA NA NA NA NA CNTN1 266502 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 41393179 41393524 41393257 Y NA NA NA NA NA NA CNTN1 308935 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr12 42537125 42537342 42537234 Y NA GXYLT1 NA NA NA NA GXYLT1 444 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 42734111 42734478 42734288 Y NA ZCRB1 NA NA NA NA ZCRB1 16191 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 45236452 45236616 45236517 Y DBX2,NELL2,NELL2,NELL2 NA NA NA NA NA NELL2 77015 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 45241724 45241928 45241862 Y DBX2,NELL2,NELL2,NELL2 NA NA NA NA NA NELL2 71703 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 46381876 46382270 46382256 Y SLC38A2,SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 1633 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 46608402 46609191 46609043 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 52609 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 46609835 46610258 46610179 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 51542 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 47044408 47044812 47044711 Y NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 268946 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 47295020 47295376 47295198 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 519558 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 49277442 49277626 49277534 Y NA DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11 RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC65 18267 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 49678404 49678529 49678467 Y NA TROAP NA NA NA NA TROAP 36490 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 49972592 49972801 49972676 Y NA KCNH3,MCRS1,PRPF40B MCRS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRPF40B 12591 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 50067341 50067888 50067543 Y TUBA1A,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 31620 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 RP11-416A17.1,TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr12 52545730 52546132 52545994 Y KRT6A,C12orf44 KRT80 NA NA NA NA KRT80 37652 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 NA NA NA NA NA KRT80 90259 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 NA NA NA NA NA KRT80 90871 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 52915277 52915747 52915499 Y C12orf44 KRT6A,KRT5 NA NA NA NA KRT5 2806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 52973884 52973999 52973956 Y NA NA NA NA NA NA KRT5 61413 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.27500771362266 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 53301815 53302147 53302072 Y KRT1,KRT76,KRT8 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 38508 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 53336677 53336830 53336786 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 3825 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP7,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 54090300 54090537 54090319 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 21108 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 54228175 54228372 54228274 Y ATP5G2 NA HOXC13,HOXC12,SMUG1 IMR90 Hi-C 24141950 HOXC13 102163 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 54372759 54373189 54372957 Y HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10 HOXC13,HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8 NA NA NA NA HOXC10 3660 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 54446030 54446105 54446068 Y NA HOXC8,HOXC5,HOXC4 FLJ12825 IMR90 Hi-C 24141950 HOXC4 369 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 54820024 54820226 54820125 Y PPP1R1A ITGA5,GTSF1 ZNF385A,ITGA5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGA5 8780 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA BLOC1S1,RP11-644F5.10 299381 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 56150085 56150369 56150213 Y OR6C6,IKZF4 BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 15021 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 56218960 56219310 56218990 Y OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 2219 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 56323148 56323586 56323313 Y PAN2,PAN2,DGKA DGKA,WIBG,CDK2,PMEL,RAB5B NA NA NA NA WIBG 816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr12 56357532 56357679 56357667 Y NA DGKA,WIBG,CDK2,PMEL,RAB5B,SUOX,IKZF4 NA NA NA NA CDK2 874 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 56614575 56614693 56614609 Y NA SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,ANKRD52,COQ10A NA NA NA NA RNF41 858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 56877461 56877501 56877482 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 2697 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 57026737 57026855 57026796 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 1745 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 7.75085158890696 chr12 57079143 57079532 57079338 Y NA ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 627 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 57094657 57094840 57094721 Y STAT2,STAT6,NAB2 PTGES3,NACA,PRIM1 NA NA NA NA PTGES3 14498 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 57162340 57162564 57162470 Y PAN2,PAN2,APOF,SPRYD4,GLS2,RDH16,GPR182,HSD17B6 NACA,PRIM1 NA NA NA NA PRIM1 18183 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 57635972 57636429 57636328 Y SLC26A10,R3HDM2,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25,NDUFA4L2 NXPH4,SHMT2 NA NA NA NA SHMT2 14862 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 57751585 57751906 57751872 Y R3HDM2 NA INHBC IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 70882 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 58134915 58135263 58135010 Y ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,DDIT3,MBD6,MARCH9,AGAP2 OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,TSFM NA NA NA NA TSPAN31 5119 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 58923778 58923975 58923913 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 388328 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 59300729 59300915 59300862 Y LRIG3,LRIG3 LRIG3 NA NA NA NA LRIG3 11388 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 60014088 60014384 60014181 Y NA SLC16A7 NA NA NA NA SLC16A7 26240 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 62315906 62316041 62315972 Y NA NA NA NA NA NA USP15 336078 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 62517177 62517433 62517258 Y NA NA NA NA NA NA USP15 134686 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 62559325 62559470 62559411 Y NA NA NA NA NA NA USP15 92649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 62650628 62651393 62650813 Y C12orf61,USP15 USP15,FAM19A2 NA NA NA NA USP15 726 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 62772980 62773240 62773147 Y MON2,USP15 NA NA NA NA NA MON2 85357 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 63133542 63133622 63133582 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 138076 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 153991 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 64386107 64386411 64386216 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 150034 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA C12orf66 69010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 64574864 64574988 64574911 Y NA C12orf66,RPS11P6 NA NA NA NA C12orf66 39088 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 65005842 65006280 65005896 Y GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 3549 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 65015023 65015259 65015145 Y TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 12730 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 65037414 65037710 65037562 Y NA RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 35121 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 65076423 65076649 65076481 Y NA NA NA NA NA NA RASSF3 74130 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr12 65077868 65077886 65077879 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA GNS 73341 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 66285844 66286273 66285967 Y IRAK3 NA NA NA NA NA HMGA2 69933 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.85583770438617 chr12 69070582 69070990 69070845 Y MDM1,SLC35E3,NUP107,MDM2 RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RPL7P42 5385 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 69220588 69221011 69220784 Y NA MDM2 NA NA NA NA MDM2 20632 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6,RP11-1143G9.2 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 69686526 69686874 69686654 Y NA RP11-1143G9.2 NA NA NA NA RP11-1143G9.2 10349 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 73636899 73637241 73637070 Y NA NA NA NA NA NA TRHDE-AS1 970212 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 73639499 73639785 73639508 Y NA NA NA NA NA NA TRHDE-AS1 972812 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA KRR1 NA NA NA NA KRR1 24179 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 76026406 76026738 76026572 Y NA NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRR1 122990 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 76919848 76920276 76920185 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 31313 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 77747953 77748163 77748058 Y CSRP2 RP1-34H18.1 NA NA NA NA RP1-34H18.1 31532 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 79325321 79325633 79325477 Y SYT1 NA NA NA NA NA SYT1 69548 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 79356068 79356388 79356099 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 100295 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 79462781 79463098 79462967 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 207008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 79526323 79526826 79526502 Y SYT1 NA NA NA NA NA SYT1 270550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 79566745 79567141 79566931 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 310972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr12 79670829 79671264 79670913 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 411613 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 79817704 79817772 79817737 Y SYT1 NA NA NA NA NA PAWR 265105 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA NA SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 139240 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 80327802 80327850 80327826 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 562 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 81156248 81156255 81156252 Y NA NA NA NA NA NA ACSS3 173339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 81171843 81172335 81171905 Y NA NA NA NA NA NA ACSS3 157259 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 83157091 83157416 83157138 Y NA NA NA NA NA NA TMTC2 78432 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 85793012 85793355 85793084 Y NA NA NA NA NA NA ALX1 121127 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 86658149 86658358 86658243 Y NA NA NA NA NA NA NTS 392076 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 87859416 87859560 87859488 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 566063 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.05667386604781 chr12 89520522 89520961 89520666 Y DUSP6 NA POC1B,DUSP6 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP6 224087 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 89737833 89738159 89738081 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 6889 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 89740427 89740813 89740638 Y POC1B,ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 4235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 89856198 89856331 89856264 Y NA NA NA NA NA NA POC1B 61470 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 91775053 91775433 91775292 Y NA NA LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LUM 271445 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 92415461 92415779 92415694 Y NA NA NA NA NA NA C12orf79 118911 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 92428496 92429133 92428829 Y NA NA NA NA NA NA C12orf79 105557 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 92436632 92436991 92436801 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 97699 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 92469930 92470196 92470132 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 64494 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 92500767 92501208 92501155 Y NA C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 33482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 92517420 92517830 92517671 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16860 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16292 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 93321551 93321826 93321626 Y EEA1 EEA1 NA NA NA NA EEA1 444 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 93489257 93489472 93489362 Y NA AC138123.2 NA NA NA NA AC138123.2 13806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 93709037 93709216 93709174 Y NA NA NA NA NA NA NUDT4 60443 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 93770329 93770575 93770474 Y NUDT4 NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 670 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 93827795 93828172 93827984 Y NA UBE2N,MRPL42 NA NA NA NA UBE2N 5866 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 94601562 94601834 94601710 Y TMCC3,PLXNC1 NA NA NA NA NA PLXNC1 61063 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA PLXNC1 137747 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA CCDC41 77597 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA CCDC41 NA NA NA NA CCDC41 33416 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 95226806 95227127 95226860 Y CCDC41 NA NA NA NA NA NDUFA12 168419 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 95404686 95404921 95404803 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 9140 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 95939436 95939751 95939594 Y NA USP44 NA NA NA NA USP44 3515 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 96592675 96593197 96592888 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 6515 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 96664847 96665248 96665048 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 78687 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 96773991 96774080 96774036 Y NA CDK17 NA NA NA NA CDK17 18258 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 96828064 96828263 96828182 Y NEDD1,NEDD1,CDK17 CDK17 LTA4H,ELK3,CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 35726 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 97681446 97681573 97681508 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 382445 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 98424926 98425154 98425040 Y NA NA NA NA NA NA TMPO 482136 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 98793447 98793582 98793503 Y NA NA NA NA NA NA TMPO 113708 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 99524955 99525202 99525103 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 488036 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 103358686 103358916 103358881 Y NA ASCL1 NA NA NA NA ASCL1 9222 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 104613052 104613575 104613267 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 5495 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr12 104912129 104912512 104912321 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 65056 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 104972349 104972459 104972427 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 125276 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 105020354 105020448 105020373 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 173281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr12 105035767 105036007 105035871 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 188694 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 105038686 105039023 105038871 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 191613 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 105042709 105042954 105042777 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 195636 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 105061987 105062372 105062098 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 214914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 105064571 105065844 105065441 Y EID3,CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 217498 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 105066347 105066673 105066397 Y TXNRD1,TXNRD1,EID3,CHST11,SLC41A2,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 219274 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 105177272 105177383 105177327 Y NA NA NA NA NA NA SLC41A2 173139 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 106640032 106640193 106640140 Y NA NA NA NA NA NA TCP11L2 53514 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 106664099 106664223 106664175 Y NA TCP11L2,CKAP4 NUAK1,CKAP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCP11L2 29484 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 107396424 107396642 107396547 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 17480 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 107424746 107425166 107425085 Y NA MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 45802 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr12 108783050 108783376 108783111 Y NA NA WSCD2,CMKLR1 IMR90 Hi-C 24141950 FICD 123586 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 109037814 109037911 109037861 Y SSH1,SELPLG TMEM119 NA NA NA NA TMEM119 47718 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 109083720 109083964 109083780 Y SSH1 CORO1C NA NA NA NA CORO1C 39408 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr12 109116964 109117579 109117192 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5793 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 109785262 109785419 109785341 Y MYO1H NA DAO IMR90 Hi-C 24141950 UBE3B 127788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 110315331 110315497 110315413 Y MYO1H,GLTP TRPV4,GLTP,TCHP NA NA NA NA GLTP 796 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 111867956 111868269 111868101 Y BRAP,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26204 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 112633664 112633952 112633817 Y NA NA TRAFD1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAFD1 72359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 115103963 115104215 115104201 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 15754 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 115124772 115125182 115125089 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 4803 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 115803300 115803402 115803336 Y NA NA NA NA NA NA TBX3 683331 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 116111611 116111662 116111637 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 601481 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 116193913 116194329 116194111 Y NA NA TBX3,RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 518814 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 117375665 117375672 117375669 Y NA FBXW8 NA NA NA NA FBXW8 28904 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 118022640 118022660 118022650 Y NOS1 NA NA NA NA NA KSR2 382128 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 120141173 120141195 120141185 Y NA PRKAB1,RP11-768F21.1 NA NA NA NA RP11-768F21.1 37289 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA RP11-768F21.1 NA NA NA NA RP11-768F21.1 49796 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 120179533 120179605 120179597 Y NA NA NA NA NA NA RP11-768F21.1 75649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 120639993 120640274 120640078 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1 NA NA NA NA PXN-AS1 2899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 120912483 120912692 120912652 Y NA COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 6830 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 121367131 121367281 121367257 Y NA SPPL3,RPL12P33 C12orf43,SPPL3,POP5 IMR90 Hi-C 24141950 RPL12P33 14583 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 121841505 121841570 121841538 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 5661 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 122227826 122228273 122227974 Y CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 11036 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 122462417 122462775 122462615 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 7089 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 124511422 124511512 124511486 Y NA NA NA NA NA NA CCDC92 56044 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 124721310 124721532 124721425 Y NA NA NA NA NA NA CCDC92 265932 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr12 125117108 125117622 125117163 Y NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 66973 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 125229298 125229517 125229417 Y NA NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 135697 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 125230587 125231048 125230629 Y NCOR2,UBC NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 134166 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 125347630 125347766 125347649 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 17448 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC,RPL22P19 NA NA NA NA UBC 1042 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 125423202 125423335 125423285 Y NA UBC,RPL22P19,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 RPL22P19 4761 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,RPL22P19,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 RPL22P19 5636 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,RPL22P19,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 RPL22P19 6796 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 126408218 126408496 126408357 Y NA NA NA NA NA NA TMEM132B 738836 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 130570935 130571227 130570972 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA FZD10-AS1 73574 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr12 130624608 130625033 130624823 Y RIMBP2 FZD10-AS1,FZD10 NA NA NA NA FZD10-AS1 19768 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 130824673 130824982 130824768 Y PIWIL1 NA NA NA NA NA FZD10 179669 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.85583770438617 chr12 130923831 130924224 130924207 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 274602 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr12 130976350 130976555 130976530 Y NA NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 222271 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 131058824 131059096 131058850 Y NA NA RIMBP2 IMR90 Hi-C 24141950 RIMBP2,RP11-662M24.2 139730 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 131111744 131112133 131112105 Y RIMBP2 NA RIMBP2 IMR90 Hi-C 24141950 RIMBP2,RP11-662M24.2 86693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 131117194 131117823 131117569 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 81003 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 131272601 131272867 131272734 Y NA STX2 NA NA NA NA STX2 48944 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 131338058 131338482 131338208 Y NA STX2,RAN RAN K562 ChIA-PET 22265404 RAN 15942 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr12 133029955 133030417 133030330 Y NA FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 33720 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr12 133069115 133069562 133069360 Y ZNF26,FBRSL1 FBRSL1 NA NA NA NA FBRSL1 4978 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr12 133106394 133106977 133106699 Y CHFR,ANKLE2,FBRSL1 FBRSL1 NA NA NA NA FBRSL1 42257 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 20993930 20994321 20994126 Y NA NA NA NA NA NA CRYL1 103675 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 21102735 21102938 21102864 Y NA CRYL1,IFT88 NA NA NA NA CRYL1 4739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 22135396 22135683 22135678 Y EFHA1 NA NA NA NA NA RPS7P10 65471 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 22242983 22243087 22242992 Y NA RPS7P10,FGF9 NA NA NA NA FGF9 435 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr13 22243438 22243610 22243458 Y FGF9 RPS7P10 NA NA NA NA FGF9 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr13 22249294 22249707 22249608 Y FGF9 RPS7P10,FGF9 NA NA NA NA FGF9 5772 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 22249979 22250230 22250030 Y NA RPS7P10,FGF9 NA NA NA NA FGF9 6457 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 22583629 22583981 22583861 Y EFHA1 NA NA NA NA NA FGF9 340107 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.52833693302391 chr13 22793744 22794084 22793906 Y NA NA FGF9 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P7 474629 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr13 23735133 23735494 23735391 Y NA HMGA1P6 NA NA NA NA HMGA1P6 28820 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 23815337 23815738 23815537 Y NA NA NA NA NA NA HMGA1P6 109024 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 24289001 24289462 24289192 Y PCOTH NA NA NA NA NA TNFRSF19 146492 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 18.6675439676492 chr13 24290088 24290194 24290124 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF19 147579 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 24317696 24317997 24317856 Y NA NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 143031 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH NA SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 66738 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.18333847574844 chr13 24697003 24697328 24697264 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 235445 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 24839245 24839460 24839321 Y NA NA NA NA NA NA PARP4 245488 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 25691354 25691814 25691656 Y NA NA NA NA NA NA MTMR6 168333 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr13 26558733 26558979 26558920 Y NA NA NA NA NA NA RNF6 235812 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 26562971 26563100 26563036 Y NA NA NA NA NA NA RNF6 231691 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 27165274 27165454 27165331 Y NA WASF3 NA NA NA NA WASF3 35434 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 27808177 27808245 27808213 Y NA RPL21,RASL11A USP12,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 RPL21 15201 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 28005406 28005795 28005597 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 8725 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 28530575 28530960 28530888 Y CDX2 PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 12316 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr13 28534904 28535178 28535096 Y LNX2,FLT3,PRHOXNB PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 8098 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 28540285 28540611 28540449 Y LNX2,CDX2 PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 2665 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 29631407 29631751 29631579 Y NA NA NA NA NA NA SLC46A3 340300 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 29700126 29700781 29700341 Y NA NA NA NA NA NA SLC46A3 409019 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 NA LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 KATNAL1 90063 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 32620673 32620873 32620777 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY FRY NA NA NA NA FRY 17236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 32691995 32692202 32692106 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2 NA NA NA NA NA FRY 88558 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 33728009 33728149 33728045 Y STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 194618 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr13 33825211 33825616 33825598 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 97151 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 34729958 34730262 34730146 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 339772 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 36648943 36649115 36648997 Y DCLK1,CCNA1,C13orf38 NA NA NA NA NA DCLK1 54328 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr13 37424486 37424865 37424682 Y NA RFXAP NA NA NA NA RFXAP 33125 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 37493371 37493714 37493499 Y C13orf36,RFXAP,SMAD9 SMAD9,LAMTOR3P1 NA NA NA NA SMAD9 469 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 37723502 37723846 37723737 Y FAM48A,CSNK1A1L NA POSTN,LINC00547 IMR90 Hi-C 24141950 ALG5 151104 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr13 41624170 41624528 41624466 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 ELF1,MTRF1,NAA16 IMR90 Hi-C 24141950 WBP4 8882 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 43294593 43294957 43294764 Y NA NA ENOX1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC15 300382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 143494 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 5.78584696073336 chr13 43635759 43636150 43635822 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 40420 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr13 44765408 44765809 44765737 Y NA NA SERP2,TSC22D1,LINC00284 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP2 179992 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP2 64710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr13 45338378 45338728 45338554 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 189095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 45745052 45745233 45745142 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 52402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 45928010 45928281 45928087 Y NA TPT1-AS1,TPT1 NA NA NA NA TPT1 14505 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 46244354 46244716 46244645 Y NA NA NA NA NA NA SIAH3 179155 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr13 49155067 49155378 49155252 Y CYSLTR2 RCBTB2 NA NA NA NA RCBTB2 49698 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 14993 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr13 49569007 49569270 49569139 Y NA FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 20959 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 49615947 49616340 49616144 Y SETDB2,PHF11,PHF11,CAB39L,FNDC3A NA NA NA NA NA FNDC3A 67899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 49761885 49761908 49761899 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 58139 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 50217217 50217337 50217325 Y SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11 EBPL NA NA NA NA EBPL 46274 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 23387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 50602874 50603059 50603020 Y NA TRIM13,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 18138 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 50661413 50661685 50661628 Y NA MIR16-1,DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 7106 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 50796509 50797212 50796853 Y NA NA DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 DLEU2 98653 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 50804549 50804739 50804670 Y NA NA DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 DLEU2 106693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 51103280 51103738 51103647 Y NA RP11-175B12.2 DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-175B12.2 3695 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 51176389 51176436 51176413 Y NA NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-175B12.2 76804 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 51200392 51200766 51200454 Y NA NA NA NA NA NA RP11-175B12.2 100807 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 51204178 51204550 51204306 Y NA NA NA NA NA NA RP11-175B12.2 104593 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 51288107 51288409 51288197 Y NA NA NA NA NA NA RP11-175B12.2 188522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 55208577 55208909 55208656 Y NA NA NA NA NA NA PCDH8 1787802 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 60835773 60835952 60835863 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 99652 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 64623751 64624068 64623941 Y NA NA NA NA NA NA PCDH20 2623531 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 67686217 67686397 67686363 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 116071 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 71362393 71362632 71362470 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 884567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 72116042 72116082 72116062 Y DACH1 NA NA NA NA NA H3F3BP1 131117 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 72206339 72206570 72206525 Y DACH1 H3F3BP1 NA NA NA NA H3F3BP1 40629 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 72333025 72333078 72333052 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 85826 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 72385563 72385700 72385665 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 53630 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 72424218 72424283 72424251 Y NA DACH1 NA NA NA NA DACH1 15047 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 72438548 72439003 72438895 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 327 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 73985614 73985783 73985667 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P1 312491 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 74707257 74707359 74707330 Y NA KLF12 NA NA NA NA KLF12 863 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr13 76279211 76279429 76279239 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 86641 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 76289938 76289995 76289967 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 97368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 76336754 76337033 76336914 Y COMMD6,LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 144184 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 77453598 77454010 77453765 Y FBXL3,KCTD12 KCTD12 NA NA NA NA KCTD12 4530 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 77599424 77599520 77599503 Y NA RPL7P44,DHX9P1,CLN5,FBXL3 NA NA NA NA FBXL3 94 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 77898193 77898346 77898226 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 839 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 79232403 79232753 79232546 Y NA RNF219 NA NA NA NA RNF219 1089 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr13 80810111 80810307 80810235 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 102779 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 88259012 88259340 88259160 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1887389 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 88345046 88345403 88345227 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1973423 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr13 88383188 88383252 88383222 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 2011565 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 88384592 88384886 88384741 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 2012969 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr13 91369763 91370108 91369936 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 627966 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 93083293 93083662 93083475 Y NA NA NA NA NA NA GPC6 793433 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 93880621 93881133 93881009 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 3526 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 93947360 93947697 93947394 Y NA NA NA NA NA NA GPC6 70265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 94785518 94785984 94785813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 460527 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 95889051 95889313 95889178 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 62374 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 97636174 97636720 97636457 Y NA NA NA NA NA NA MBNL2 234968 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr13 97913986 97914316 97914087 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 42298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 99121203 99121258 99121231 Y NA NA NA NA NA NA STK24 106936 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 99128143 99128552 99128498 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99642 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 99223213 99223429 99223417 Y STK24 STK24 NA NA NA NA STK24 4765 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 100278698 100278861 100278780 Y NA CLYBL NA NA NA NA CLYBL 21779 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 100620497 100620786 100620718 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 1377 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 100631413 100631577 100631494 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC2 449 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 102731343 102731405 102731389 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 515948 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 106751889 106752019 106751954 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 466493 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 106753025 106753272 106753030 Y ARGLU1 NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 465240 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr13 106777477 106777605 106777541 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 440907 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 106810133 106810294 106810212 Y NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 408218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 107026666 107026873 107026771 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 191639 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 107182699 107183083 107182911 Y EFNB2 ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 35429 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 699317 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 514704 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 110746992 110747342 110747118 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 208817 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 111064452 111064750 111064655 Y RAB20 NA NA NA NA NA COL4A1 106956 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 111068169 111068419 111068294 Y RAB20,ANKRD10 NA NA NA NA NA COL4A1 110673 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr13 111695990 111696309 111696026 Y NA NA ING1,ARHGEF7,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF7 68597 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 113585588 113585716 113585676 Y CUL4A,CUL4A MCF2L-AS1 C13orf35,ATP11A,MCF2L GM12878,HELA,K562,H1ESC 5C 22955621 MCF2L-AS1 35422 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr13 113597069 113597276 113597160 Y MCF2L MCF2L-AS1 MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,ChIA-PET 22955621,24141950,22265404 MCF2L-AS1 23862 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 113650051 113650400 113650313 Y MCF2L MCF2L-AS1 NA NA NA NA MCF2L-AS1 28913 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr13 114995132 114995533 114995333 Y NA CDC16,UPF3A NA NA NA NA CDC16 2829 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 21268104 21268276 21268208 Y NA RNASE1 NA NA NA NA RNASE1 1161 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 21660147 21660368 21660311 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPC 75285 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 23158454 23158656 23158578 Y SLC7A7 CTD-2555K7.1 DAD1,OXA1L,SLC7A7,ABHD4,REM2,LRP10 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2555K7.1 3088 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MRPL52 2521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 23466494 23466910 23466688 Y CDH24,C14orf93 HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 10465 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 24163763 24164098 24163827 Y NA NA NA NA NA NA AP1G2 128484 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr14 24454112 24454320 24454216 Y DHRS4L2,DHRS4L2 DHRS4,DHRS4L2 NA NA NA NA DHRS4L2 16964 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 24973784 24974156 24973856 Y GZMB,CTSG,CMA1 NA NA NA NA NA SDR39U1 63673 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 25142710 25142963 25142951 Y CMA1,CTSG,GZMB GZMB NA NA NA NA GZMB 41237 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr14 25143666 25144075 25143734 Y TINF2,CIDEB,LTB4R,RIPK3,KHNYN,SDR39U1,GZMH,GZMB GZMB NA NA NA NA GZMB 42193 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 27997396 27997715 27997579 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 932436 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 28061472 28061526 28061498 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 895590 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 28957970 28957982 28957974 Y NA RPL26P3 NA NA NA NA RPL26P3 854 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 31055388 31055443 31055417 Y NA G2E3,SCFD1 NA NA NA NA G2E3 29059 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 31400109 31400220 31400192 Y NA NA NA NA NA NA COCH 58389 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 31478440 31478826 31478753 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 13486 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 33098616 33098902 33098649 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 146610 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 33126424 33126565 33126444 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 174418 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 33485809 33485898 33485821 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 83670 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 34801443 34801630 34801553 Y NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127932 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 35250371 35250766 35250653 Y SRP54,BAZ1A NA NA NA NA NA CFL2 68342 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 35855857 35856187 35856101 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA RP11-561B11.1 88 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 37233433 37233885 37233827 Y NA NA NA NA NA NA PAX9 108660 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 37317346 37317701 37317507 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA PAX9 192573 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 37445830 37445969 37445900 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 194102 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 37469718 37470010 37469970 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 170061 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 38057887 38058022 38057995 Y FOXA1 TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 5030 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 39664073 39664414 39664121 Y SIP1,PNN TRAPPC6B,PNN NA NA NA NA PNN 21686 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 39737909 39738305 39738022 Y NA CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 5421 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA ARF6 109565 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr14 50648447 50648735 50648723 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 47541 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 52329207 52329783 52329305 Y NA GNG2 NA NA NA NA GNG2 38294 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 52336144 52336756 52336579 Y PTGER2,GNG2 GNG2 NA NA NA NA GNG2 45231 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 52349798 52350236 52349885 Y PTGDR,GNG2 NA NA NA NA NA GNG2 58885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 53020677 53020806 53020735 Y PTGDR,TXNDC16,GPR137C TXNDC16,GPR137C NA NA NA NA GPR137C 2811 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 54640534 54640974 54640637 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 BMP4 217055 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 54649490 54649642 54649566 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN3 211925 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr14 55841053 55841315 55841186 Y MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,ATG14 ATG14 NA NA NA NA ATG14 35261 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 56738726 56738905 56738873 Y NA NA NA NA NA NA PELI2 156194 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 58226988 58227367 58227355 Y EXOC5,NAA30,SLC35F4,C14orf37,ACTR10 NA NA NA NA NA NAA30 371726 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 58911911 58912089 58912000 Y KIAA0586 KIAA0586,TIMM9 NA NA NA NA TIMM9 19579 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 59159760 59159979 59159850 Y NA NA DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 DACT1 61075 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 8.62418697920634 chr14 59221069 59221139 59221083 Y NA RP11-112J1.1 DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-112J1.1 38233 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr14 61108188 61108290 61108236 Y NA SIX1 NA NA NA NA SIX1 14687 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 61904242 61904399 61904321 Y NA NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 130859 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 61969529 61970113 61969734 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 65145 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 64912318 64912487 64912430 Y ESR2,ZBTB25,ZBTB1,AKAP5 AKAP5 NA NA NA NA AKAP5 17730 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2,RP11-973N13.4,PPP1R36 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 64976158 64976191 64976175 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,RP11-973N13.4,PPP1R36 NA NA NA NA ZBTB25 6227 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 65006188 65006351 65006244 Y NA ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,RP11-973N13.4,PPP1R36 NA NA NA NA RP11-973N13.4 1102 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 65169606 65170310 65170032 Y NA PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 786 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 128307 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr14 66912712 66912753 66912717 Y NA NA NA NA NA NA GPHN 59372 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 68666573 68666719 68666628 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 220194 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 68846841 68847380 68847069 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 39533 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 68882312 68882693 68882503 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 4220 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 69507227 69507425 69507309 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 63070 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 70168752 70169016 70168820 Y SLC8A3,KIAA0247,SRSF5,SRSF5 SRSF5 NA NA NA NA SRSF5 22601 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 70251545 70251918 70251732 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 59928 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 70700911 70701061 70700986 Y NA NA NA NA NA NA COX16 123387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 71164534 71164679 71164625 Y MED6 RP6-65G23.1 NA NA NA NA RP6-65G23.1 1119 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 73585185 73585324 73585255 Y NA PSEN1 NA NA NA NA PSEN1 15802 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 73595262 73595380 73595321 Y NA PSEN1 NA NA NA NA PSEN1 5746 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr14 74207610 74207866 74207660 Y C14orf43 PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA PNMA1 28482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 74208106 74208498 74208298 Y C14orf43 PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA PNMA1 28978 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 74224542 74224784 74224663 Y NA PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 27279 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 74224982 74225468 74225101 Y NA PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 26595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 74235090 74235238 74235164 Y C14orf43 RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 16825 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 75492523 75492557 75492545 Y NA EIF2B2,MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 23678 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 75607767 75608156 75607957 Y FOS RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NEK9 IMR90 Hi-C 24141950 NEK9 15720 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 75750758 75751180 75750884 Y PROX2,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FOS RP11-293M10.2,FOS NA NA NA NA FOS 7281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 76243945 76244101 76244023 Y TGFB3 NA NA NA NA NA C14orf1 118413 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 76444839 76444980 76444910 Y ESRRB,TGFB3 NA NA NA NA NA IFT43 78360 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 77265287 77265548 77265418 Y NA VASH1,ANGEL1 NA NA NA NA ANGEL1 25041 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 77591216 77591790 77591612 Y TMED8,NGB TMEM63C NA NA NA NA TMEM63C 10305 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 79406333 79406507 79406344 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1141907 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 79464675 79465065 79464871 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1200249 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 79485942 79486245 79486016 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1221516 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr14 79502772 79503033 79502836 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1238346 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 7.31418389375727 chr14 79626338 79626447 79626393 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 1225653 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 79728948 79729331 79729131 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 1122769 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 79880226 79881040 79880569 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 971060 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 80084258 80084404 80084331 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 767696 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 80156436 80156705 80156544 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 695395 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 80268385 80268746 80268504 Y DIO2 NA NA NA NA NA DIO2 583354 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 81248217 81248588 81248549 Y NA NA NA NA NA NA CEP128 175273 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 81588946 81589112 81589029 Y GTF2A1,GTF2A1 RP11-114N19.3 NA NA NA NA RP11-114N19.3 45646 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.4933415611975 chr14 81713528 81713897 81713622 Y NA GTF2A1,DYNLL1P1 NA NA NA NA DYNLL1P1 2621 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 84176891 84176909 84176900 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L 2178686 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 87025819 87025837 87025829 Y NA NA NA NA NA NA GALC 1432172 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 89680457 89680908 89680785 Y FOXN3 NA NA NA NA NA TTC8 391960 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 89770346 89770725 89770409 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 312768 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr14 89771520 89771819 89771727 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 311674 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 89887223 89887427 89887324 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 196066 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 89950912 89951066 89950980 Y FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 132427 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 89953485 89953641 89953575 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 129852 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 90761350 90761506 90761428 Y NA PSMC1 NA NA NA NA PSMC1 40511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 90875651 90876041 90875751 Y NA RPL21P11,CALM1 NA NA NA NA CALM1 14805 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 91814664 91814951 91814783 Y RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 67237 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 91926776 91927002 91926960 Y NA CCDC88C,SMEK1 NA NA NA NA CCDC88C 44588 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 92574762 92574984 92574843 Y NA ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 3797 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 94821145 94821362 94821256 Y SERPINA12,SERPINA1 NA NA NA NA NA PPP4R4 210680 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 95778689 95778956 95778833 Y DICER1,CLMN CLMN NA NA NA NA CLMN 5287 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 95946356 95946810 95946552 Y NA RP11-1070N10.3 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 33663 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 95953401 95953498 95953450 Y TCL1B RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10 C14orf49,SNHG10,GLRX5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1070N10.3 26975 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 96086261 96086587 96086424 Y NA RP11-1070N10.5 NA NA NA NA RP11-1070N10.5 1010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 96097186 96097458 96097322 Y NA RP11-1070N10.5 NA NA NA NA RP11-1070N10.5 11935 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 96125888 96126188 96126030 Y TCL1A RP11-1070N10.5 NA NA NA NA RP11-1070N10.5 40637 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 98086982 98087081 98087062 Y NA NA NA NA NA NA VRK1 825341 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 98613057 98613317 98613187 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 1331899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 99709481 99710408 99709988 Y BCL11B NA NA NA NA NA SETD3 234808 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,HHIPL1 NA NA NA NA CCDC85C 3288 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 100196933 100197043 100196991 Y NA EML1 NA NA NA NA EML1 4987 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 100463833 100464185 100464009 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90 Hi-C 24141950 DEGS2 160315 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA DEGS2,YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 34673 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 102001660 102001854 102001726 Y PPP2R5C,PPP2R5C,DYNC1H1 DIO3 NA NA NA NA DIO3 23834 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 102050999 102051149 102051091 Y NA DIO3 NA NA NA NA DIO3 25311 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 102188292 102188876 102188640 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C LINC00239 K562 ChIA-PET 22265404 PPP2R5C 37259 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 102340393 102340589 102340458 Y PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C NA NA NA NA NA DYNC1H1 88276 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.40167232332328 chr14 102415545 102415736 102415629 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13129 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 103266656 103267057 103266785 Y NA TRAF3 CDC42BPB,AMN IMR90 Hi-C 24141950 TRAF3 24843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 104583053 104583460 104583371 Y NA KIF26A NA NA NA NA KIF26A 19600 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr14 105198821 105199110 105199005 Y C14orf180,ADSSL1 INF2,ADSSL1,SIVA1 NA NA NA NA ADSSL1 10298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 105631701 105632085 105631796 Y NA JAG2,NUDT14 NA NA NA NA JAG2 1076 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 105653618 105653649 105653635 Y NA JAG2,NUDT14 NA NA NA NA NUDT14 7958 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 22450316 22450421 22450369 Y OR4N4 NA HERC2P3 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 380974 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 22908894 22909338 22909142 Y NA CYFIP1 NA NA NA NA CYFIP1 18889 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 22927527 22927784 22927666 Y CYFIP1 CYFIP1 NA NA NA NA CYFIP1 37522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 25577365 25577592 25577422 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 104536 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 26332554 26332834 26332747 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 650426 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 26854717 26854952 26854835 Y NA NA NA NA NA NA GABRG3 359477 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 28339947 28339987 28339948 Y NA OCA2 NA NA NA NA OCA2 2517 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 29266500 29266713 29266607 Y NA NA NA NA NA NA APBA2 138871 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 29277250 29277459 29277367 Y NDNL2,APBA2 NA NA NA NA NA APBA2 149621 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 29407243 29407640 29407337 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA NDNL2 152393 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA FAM189A1 161595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 31215782 31215951 31215851 Y FAN1,FAN1,MTMR10 FAN1 NA NA NA NA FAN1 21727 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 31620735 31621235 31621017 Y MTMR10,KLF13 KLF13 NA NA NA NA KLF13 3677 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 31690304 31690476 31690390 Y NA NA NA NA NA NA KLF13 73246 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 33437895 33438002 33437965 Y NA NA FMN1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP11A 532550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 34290038 34290177 34290053 Y NA CHRM5,AVEN NA NA NA NA CHRM5 31117 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA RP11-150L8.4 ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150L8.4 1090 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 36910960 36911073 36911017 Y MEIS2,C15orf41 C15orf41 NA NA NA NA C15orf41 41148 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 37877991 37878069 37878030 Y TMCO5A NA NA NA NA NA MEIS2 486487 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 38784019 38784367 38784201 Y RASGRP1 FAM98B NA NA NA NA FAM98B 39691 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 38814347 38814382 38814365 Y C15orf53,RASGRP1 RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 41394 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 39673743 39674138 39673898 Y NA NA THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 197142 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 39702122 39702492 39702291 Y NA NA THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 168788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 39703846 39704297 39704020 Y NA NA THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 166983 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 39722195 39722553 39722498 Y THBS1,C15orf54 NA C15orf53,FSIP1,THBS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 148727 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr15 41138213 41138409 41138269 Y RHOV,SPINT1,SPINT1 ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 3997 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 41219895 41220240 41219942 Y NA VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 357 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 41233721 41234461 41233781 Y C15orf57,VPS18 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 8699 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 41264604 41264924 41264664 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 21444 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 42228791 42229215 42228969 Y MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 33561 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 PLA2G4D PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 PLA2G4D 34770 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 42535686 42535733 42535710 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 27698 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 42786035 42786158 42786098 Y SNAP23 SNAP23 NA NA NA NA SNAP23 4604 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr15 46256210 46256268 46256256 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 334864 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr15 46416141 46416404 46416273 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 494795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr15 46441434 46441833 46441634 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 520088 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 46528514 46528549 46528532 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 607168 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 46545564 46545905 46545872 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 624218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr15 46758762 46759114 46758953 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 837416 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 47659982 47660177 47660079 Y SEMA6D,SEMA6D NA NA NA NA NA CTD-2270N23.1 360955 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 49598906 49599159 49599033 Y NA NA NA NA NA NA COPS2 153048 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 51171970 51172368 51172169 Y NA AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 26501 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 51358266 51358334 51358300 Y GLDN TNFAIP8L3 NA NA NA NA TNFAIP8L3 37139 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 51382019 51382273 51382147 Y NA TNFAIP8L3 NA NA NA NA TNFAIP8L3 13200 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 51628727 51629122 51629096 Y TNFAIP8L3,CYP19A1 NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 233254 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 51911355 51912275 51911714 Y TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2 DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 755 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 52122599 52122915 52122757 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 2774 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 52526918 52527038 52526972 Y KIAA1370,GNB5 GNB5 NA NA NA NA GNB5 45352 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 52580530 52580869 52580787 Y ARPP19,MYO5C MYO5C NA NA NA NA MYO5C 5126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 52587042 52587046 52587044 Y NA MYO5C NA NA NA NA MYO5C 1047 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 52774147 52774333 52774216 Y MAPK6,MYO5A MYO5A NA NA NA NA MYO5A 44914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA MYO5A,ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 53804819 53805218 53805019 Y NA NA NA NA NA NA WDR72 247857 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 54274504 54274660 54274581 Y NA NA NA NA NA NA WDR72 221429 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 55273105 55273417 55273157 Y NA NA NA NA NA NA RSL24D1 213848 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 55574844 55574949 55574897 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 34209 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 56475345 56475479 56475412 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 58004 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 56513902 56514185 56514176 Y NA RFX7,TEX9 NA NA NA NA RFX7 19298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 57302684 57303020 57302852 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 93863 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 57323913 57324233 57324065 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 115092 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 58521788 58521987 58521861 Y LIPC NA SLTM,ADAM10,LIPC,FAM63B IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A2 266078 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 59023904 59024166 59024035 Y RNF111 ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 16011 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 59138361 59138756 59138559 Y NA RNF111 NA NA NA NA RNF111 16618 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 59158498 59158653 59158597 Y ADAM10,RNF111,SLTM RNF111 NA NA NA NA RNF111 3124 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 59226674 59226915 59226795 Y NA SLTM FAM63B MCF7 ChIA-PET 22265404 SLTM 2822 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 59646072 59646468 59646249 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 16424 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 60836612 60836644 60836628 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 67235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 60855817 60856094 60855923 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 86440 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 60861865 60862603 60862448 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 92488 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 60883059 60884017 60883872 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 113682 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 61264927 61265345 61265257 Y NA NA NARG2 IMR90 Hi-C 24141950 RORA 254173 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 62207321 62207567 62207441 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 143105 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 62405210 62405473 62405223 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 54538 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 62684510 62685208 62684868 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3785 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 63803463 63803731 63803481 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 8670 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 63871063 63871418 63871089 Y NA USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 20370 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 63894930 63894962 63894946 Y FBXL22 USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 3142 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 64397616 64397971 64397713 Y SNX1 DAPK2,FAM96A,SNX1,SNX22 NA NA NA NA SNX1 13294 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr15 65403116 65403434 65403296 Y ANKDD1A,PDCD7 PDCD7 UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12 IMR90 Hi-C 24141950 PDCD7 20740 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 66125063 66125305 66125185 Y NA DENND4A SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND4A 42432 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 66177095 66177419 66177152 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 94464 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 66965990 66966192 66966090 Y MAP2K1 SMAD6 SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 26374 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 67348530 67348587 67348559 Y NA SMAD3 SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB IMR90 Hi-C 24141950 SMAD3 5514 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 67393197 67393867 67393527 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 39096 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 67716264 67716618 67716446 Y NA NA NA NA NA NA C15orf61 94788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 67926783 67927143 67926830 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 93736 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 68632739 68632989 68632864 Y NA NA NA NA NA NA FEM1B 64598 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 69063538 69063566 69063553 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA SPESP1 44994 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 69385602 69385765 69385704 Y NA NA NA NA NA NA GLCE 65158 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 69453904 69454158 69454121 Y GLCE GLCE NA NA NA NA GLCE 2981 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 69490173 69490404 69490203 Y NA GLCE NA NA NA NA GLCE 39250 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 69650842 69650990 69650924 Y NA NA NA NA NA NA KIF23 53595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr15 70562818 70563128 70562994 Y NA NA LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 174303 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 70679327 70679587 70679457 Y NA NA NA NA NA NA TLE3 290812 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 70877631 70877741 70877691 Y NA NA UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 176191 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 70924070 70924122 70924096 Y NA NA C15orf50,UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 129810 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 70934341 70934514 70934428 Y NA NA NA NA NA NA UACA 119418 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 71363973 71364162 71364068 Y NA NA LRRC49,THSD4 IMR90 Hi-C 24141950 THAP10 180849 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 71385768 71386181 71385996 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 202644 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 71406673 71406868 71406715 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 223549 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr15 71408872 71409066 71408998 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 225748 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 71409431 71409745 71409525 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 226307 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr15 71428826 71429023 71428945 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 245702 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 71615809 71616164 71615988 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 432685 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 71657535 71657734 71657662 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 474411 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 71677897 71678187 71678028 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 494773 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 71733741 71734068 71733788 Y THSD4 NA NA NA NA NA THAP10 550617 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 71840441 71840454 71840446 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 564145 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr15 71872548 71872837 71872596 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 531762 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 71984997 71985280 71985139 Y SENP8 NA NA NA NA NA SENP8 419319 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 72003894 72004173 72003980 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 400426 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 72124774 72125030 72124885 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 279569 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 72832767 72832969 72832868 Y PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1 NA NA NA NA NA ARIH1 68100 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 72897243 72897463 72897311 Y SENP8,SENP8,MYO9A,TMEM202 NA NA NA NA NA BBS4 79064 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 74666695 74666987 74666837 Y CLK3,ARID3B NA NA NA NA NA SEMA7A 57821 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 75820261 75820616 75820439 Y NA PTPN9 NA NA NA NA PTPN9 49014 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 75867013 75867354 75867182 Y C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1 PTPN9,SNUPN NA NA NA NA PTPN9 2276 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 76639120 76639380 76639270 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12055 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 77351977 77352357 77352309 Y NA TSPAN3 PSTPIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN3 21969 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 77739736 77739821 77739778 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 28982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 78110975 78112297 78111796 Y HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1 NA NA NA NA NA LINGO1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr15 79216586 79216987 79216944 Y RASGRF1 CTSH NA NA NA NA CTSH 22929 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 80194397 80194544 80194472 Y ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA MTHFS 6676 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 81125183 81125474 81125331 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1199 55499 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 81156027 81156230 81156065 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1199 86343 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 81277983 81278007 81277997 Y NA MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2212 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 82050341 82050360 82050353 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 286122 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr15 82202578 82202690 82202619 Y NA NA MEX3B IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 133792 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 83500589 83500717 83500653 Y NA WHAMM NA NA NA NA WHAMM 24209 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 83603228 83603538 83603384 Y NA HOMER2,FAM103A1 NA NA NA NA HOMER2 49123 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 83620312 83620736 83620674 Y NA HOMER2,FAM103A1 NA NA NA NA HOMER2 31925 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 83683877 83683893 83683890 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 5484 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 83712711 83713060 83712967 Y NA C15orf40,BTBD1 C15orf40 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD1 21046 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 83778085 83778410 83778297 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3926 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 83815089 83815145 83815117 Y NA TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 40930 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 83847712 83847957 83847821 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 26813 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 83862328 83862648 83862488 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 12122 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 84118150 84118486 84118331 Y NA SH3GL3 NA NA NA NA SH3GL3 4170 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 85662697 85662918 85662803 Y PDE8A NA NA NA NA NA PDE8A 141026 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 85711891 85712151 85712051 Y NA NA PDE8A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE8A 190220 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 85861581 85861931 85861753 Y PDE8A,AKAP13 NA AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 59871 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 87244660 87245052 87244738 Y NA NA NA NA NA NA LINC00052 873108 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 89187882 89188205 89187952 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA ISG20 10498 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 89328925 89329315 89329120 Y NA NA ACAN,HAPLN3 IMR90 Hi-C 24141950 HAPLN3 107542 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 89638395 89638800 89638498 Y ISG20,HAPLN3,ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA ABHD2 9705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 89648424 89648609 89648517 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA ABHD2 19734 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 89664635 89664981 89664666 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 12745 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 5095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 89672730 89673081 89673051 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 4645 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 89683953 89684135 89684061 Y ABHD2 HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 6227 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 90197559 90197639 90197586 Y KIF7 KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA KIF7 877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 90456787 90457058 90456927 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA C15orf38 2599 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr15 90563245 90563669 90563337 Y ANPEP,AP3S2,IQGAP1,CIB1,ZNF710 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 20621 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 90955763 90956502 90956124 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 26313 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 90956663 90957019 90956743 Y NA IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27213 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 91331328 91331736 91331526 Y NA CTD-3094K11.1 NA NA NA NA CTD-3094K11.1 49218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 92072848 92072979 92072916 Y NA NA SV2B IMR90 Hi-C 24141950 SLCO3A1 321946 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr15 93354824 93354998 93354897 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA RGMA 87773 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 93614981 93615057 93615003 Y NA RGMA NA NA NA NA RGMA 15376 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 94830973 94831315 94831184 Y MCTP2 NA MCTP2,NMUR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 MCTP2 58206 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 94868456 94868585 94868521 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 95689 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 95029258 95029308 95029272 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 256491 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr15 95038030 95038277 95038153 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 265263 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 96871345 96871608 96871517 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA NR2F2-AS1 2755 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 9552 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.52833693302391 chr15 99259262 99259477 99259337 Y SYNM NA NA NA NA NA IGF1R 69062 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 99298945 99299364 99299005 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 108745 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 99318917 99319236 99319025 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 128717 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr15 99342514 99342944 99342658 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 152314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 99366453 99366700 99366460 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 176253 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 99401021 99401241 99401076 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 210821 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 99403545 99404056 99403701 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 213345 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 99559007 99559192 99559062 Y NA NA PGPEP1L MCF7 ChIA-PET 22265404 TTC23 230236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 101564329 101564758 101564573 Y PCSK6 NA NA NA NA NA LRRK1 106909 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 101783359 101783726 101783540 Y CHSY1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 6411 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr15 101795882 101795956 101795938 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 5745 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 124533 124922 124605 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 84 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 151121 151408 151265 Y NA POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 26115 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 377235 377950 377755 Y SOLH,RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 22723 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr16 858833 859023 858927 Y RHBDL1,FBXL16,SOX8 CHTF18,RPUSD1 NA NA NA NA RPUSD1 22436 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 1046787 1046930 1046814 Y NA LMF1 NA NA NA NA LMF1 17469 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 1585533 1585949 1585726 Y NA TELO2,TMEM204 NA NA NA NA TMEM204 8844 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr16 1585996 1586318 1586108 Y NA TELO2,TMEM204 NA NA NA NA TMEM204 9307 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRSS22 11760 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr16 3908512 3908774 3908643 Y NA CREBBP NA NA NA NA CREBBP 19953 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 3931357 3931444 3931401 Y C16orf90 CREBBP NA NA NA NA CREBBP 2630 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr16 4460708 4460927 4460812 Y CORO7 VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA CORO7 12779 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 6882597 6882937 6882663 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 1736788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 7368708 7369078 7368893 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1344462 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 9055639 9056008 9055791 Y C16orf72,USP7 USP7 NA NA NA NA USP7 363 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 9141634 9142026 9141729 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 41479 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 9208363 9208890 9208559 Y NA C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 24858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 9774012 9774199 9774105 Y NA NA NA NA NA NA C16orf72 590507 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 10677230 10677389 10677317 Y NA EMP2 NA NA NA NA EMP2 4675 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 10710964 10711341 10711185 Y EMP2 EMP2 NA NA NA NA EMP2 38409 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 10713350 10713596 10713516 Y NUBP1 EMP2 NA NA NA NA EMP2 40795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 10885820 10885991 10885909 Y NA NA NA NA NA NA NUBP1 50177 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 11032093 11032474 11032340 Y NA DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 1843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 11391500 11391628 11391615 Y ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,CIITA,SOCS1 SOCS1 SOCS1,DEXI,CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SOCS1 43464 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 11590987 11591512 11591296 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136725 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr16 11591931 11591962 11591945 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136275 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 12071486 12071797 12071761 Y NA RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 2892 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 12700714 12700789 12700756 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 195085 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 15670640 15671032 15670885 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0430 63991 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 15738027 15738375 15738313 Y NA KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 2903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr16 15766344 15766530 15766415 Y C16orf45 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31220 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr16 15769690 15769796 15769712 Y NA KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 34566 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr16 16198084 16198445 16198250 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 156650 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 20915885 20916169 20915941 Y CRYM,DCUN1D3,LYRM1 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 6179 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1,CRYM NA NA NA NA CRYM 634 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 21656930 21657029 21656972 Y CRYM,METTL9,IGSF6 NA NA NA NA NA METTL9 50391 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 22020044 22020453 22020259 Y OTOA,VWA3A C16orf52 VWA3A IMR90 Hi-C 24141950 C16orf52 3085 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 25060889 25061147 25061001 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 35902 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 27242037 27242327 27242262 Y NA NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 35788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 27278659 27278775 27278715 Y JMJD5 NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 544 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 27737057 27737407 27737240 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0556 177603 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 28629445 28629457 28629451 Y SBK1,IL27 NA NA NA NA NA CCDC101 66209 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 28839972 28840187 28840086 Y CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA ATXN2L 7616 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA DCTPP1 10853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.07417155196102 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 31223480 31223547 31223514 Y ZNF629 FUS,PYCARD NA NA NA NA PYCARD 10709 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 50229271 50229507 50229375 Y NA PAPD5 NA NA NA NA PAPD5 44442 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 50424535 50424846 50424691 Y NKD1 BRD7 NA NA NA NA BRD7 23690 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.62000617089813 chr16 50424981 50425490 50425226 Y NKD1 BRD7 NA NA NA NA BRD7 24136 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.69417772285914 chr16 50554457 50554868 50554623 Y BRD7,NKD1 NKD1 NKD1 IMR90 Hi-C 24141950 NKD1 25373 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.9650046281736 chr16 50573093 50573439 50573278 Y BRD7,NKD1 NKD1 NKD1 IMR90 Hi-C 24141950 NKD1 6802 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.71167540877235 chr16 50679822 50680132 50679910 Y NA NOD2 NA NA NA NA NOD2 45382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.94750694226039 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA NA NA NA NA NA CYLD 412080 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 52526808 52526987 52526898 Y TOX3,TOX3 NA NA NA NA NA TOX3 52727 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 53915459 53915524 53915492 Y NA NA NA NA NA NA FTO 179584 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 56581201 56581558 56581471 Y MT3,GNAO1,BBS2 BBS2,MT3 MT1X,MT4,MT1B,NUP93,MT2A,MT1IP,MT1G,MT1H,OGFOD1,BBS2,MT3,AMFR,NUDT21,MT1A,MT1DP IMR90 Hi-C 24141950 BBS2 29006 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 57488914 57489209 57489062 Y NA COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4 NA NA NA NA POLR2C 5090 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 57654867 57655271 57654917 Y NA GPR56 NA NA NA NA GPR56 12303 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 57655846 57656393 57655974 Y FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56 GPR56 NA NA NA NA GPR56 13282 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr16 57657206 57657412 57657318 Y NA GPR56 NA NA NA NA GPR56 14642 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr16 61921949 61922053 61922001 Y NA NA NA NA NA NA GOT2 3155688 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 65103847 65103999 65103923 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 54016 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 65153548 65154160 65153979 Y CDH11 CDH11 NA NA NA NA CDH11 3855 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 65337559 65337576 65337568 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 179544 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 66557840 66558108 66558016 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 26339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 67892470 67892795 67892734 Y RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1 NA NA NA NA EDC4 12131 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 68268995 68269119 68269015 Y NA ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 886 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr16 68794775 68795028 68794920 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 25647 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA HAS3 76986 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 69106233 69106613 69106351 Y NA HAS3,CHTF8 NA NA NA NA HAS3 30854 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.94750694226039 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 69751128 69751528 69751345 Y PDF,TERF2,NQO1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 7326 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr16 70356792 70356812 70356803 Y NA AARS,DDX19B,DDX19A NA NA NA NA DDX19A 21920 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.29250539953586 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 72897745 72898023 72897884 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 193574 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 72958517 72958769 72958627 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 132828 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 72972740 72973001 72972925 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 118596 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr16 73206454 73206866 73206668 Y NA NA ZFHX3,HPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFHX3 114857 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 74356396 74356719 74356558 Y NA PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 27723 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 77868575 77868689 77868637 Y NA NA NA NA NA NA NUDT7 114164 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 78564720 78564924 78564822 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 433410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA MAF 724004 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 80694679 80694985 80694832 Y CDYL2 NA NA NA NA NA DYNLRB2 122048 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 104576 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 82172740 82172851 82172799 Y SDR42E1 MPHOSPH6 NA NA NA NA MPHOSPH6 28980 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 83715826 83716249 83715944 Y HSBP1 NA NA NA NA NA HSBP1 123199 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 84172759 84173286 84173220 Y NA MBTPS1,HSDL1,TAF1C MBTPS1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HSDL1 3511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr16 84704578 84704887 84704734 Y NA KLHL36,USP10 NA NA NA NA KLHL36 24447 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr16 85418434 85418651 85418593 Y NA NA LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 303028 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 85473143 85473232 85473181 Y NA NA KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 248447 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 85499556 85499891 85499629 Y NA NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 221788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 85591342 85591727 85591695 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 129952 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 85601000 85601159 85601100 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 120520 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 85648720 85648939 85648787 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 72740 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 85678973 85679150 85679027 Y NA GINS2 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 42529 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr16 85783855 85783992 85783913 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 1120 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 86962886 86963146 86962899 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 376045 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 87378694 87379151 87378934 Y FBXO31 MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA MAP1LC3B 36450 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 87773499 87773902 87773849 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23696 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 87839693 87840050 87839856 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 87870717 87871153 87871035 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 29941 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 88063556 88063600 88063578 Y BANP,BANP,BANP NA NA NA NA NA BANP 82706 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 88448195 88448445 88448286 Y NA NA CA5A,SLC7A5,BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 69280 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 88835950 88836275 88836191 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT RNF166,CTU2 K562 ChIA-PET 22265404 PIEZO1 13344 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 89370103 89370259 89370211 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 87985 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 89392350 89392997 89392648 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 110232 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr16 89683162 89683271 89683207 Y DPEP1,C16orf55 CPNE7,CHMP1A NA NA NA NA CHMP1A 38982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 89893816 89894170 89893993 Y SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 11229 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 89992380 89992810 89992683 Y NA AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA TUBB3 6580 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr16 90024486 90024764 90024610 Y NA AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA DEF8 12153 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 2241529 2241816 2241651 Y NA SRR,SMG6,SGSM2,TSR1 NA NA NA NA TSR1 2728 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 133114 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 4118580 4118797 4118689 Y NA ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 46477 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 4204226 4204625 4204419 Y CAMKK1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 38952 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 4233037 4233303 4233170 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 34620 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 4430442 4430571 4430507 Y ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,C17orf107,ARRB2 MYBBP1A NA NA NA NA MYBBP1A 26355 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 6542489 6542952 6542608 Y NA TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100 NA NA NA NA KIAA0753 242 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 6656419 6656747 6656461 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 NA NA NA NA NA ALOX12P2 98433 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 7271356 7271453 7271405 Y WRAP53,SHBG,AMAC1L3 NEURL4,ACAP1,KCTD11,TNK1,NLGN2 NA NA NA NA TNK1 10400 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 7380968 7381115 7381038 Y EIF5A TMEM102,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 4467 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 7381310 7382154 7381844 Y KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4 TMEM102,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 3428 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.29250539953586 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA PER1 27708 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr17 8532647 8532776 8532657 Y KRBA2 MYH10 NA NA NA NA MYH10 568 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 11874981 11875002 11874992 Y DNAH9 ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA ZNF18 23825 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 13249594 13249869 13249742 Y HS3ST3A1 NA HS3ST3B1,HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST3A1 253375 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 13460367 13460669 13460622 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 42575 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 13463603 13463645 13463626 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 39599 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 97149 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 14206072 14206436 14206180 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 3672 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 14212324 14213048 14212775 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 9924 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 15368147 15368483 15368202 Y NA NA NA NA NA NA SNORA74 106850 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 15925706 15925935 15925791 Y FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24675 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 16355497 16355695 16355534 Y TTC19,PIGL FAM211A NA NA NA NA FAM211A 37772 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 16374519 16374788 16374546 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 18679 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 16388389 16388725 16388555 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 4742 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 16487545 16487788 16487743 Y NA ZNF287,AC005822.1 NA NA NA NA ZNF287 17025 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 17098696 17098916 17098799 Y MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN PLD6,FLCN NA NA NA NA PLD6 8713 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 17319893 17320013 17319952 Y FLCN RPL13P12 NA NA NA NA RPL13P12 34567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 17628792 17629315 17629145 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 46005 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 17817256 17817562 17817444 Y SREBF1 NA NA NA NA NA TOM1L2 56174 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 17862888 17863023 17862956 Y NA TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 10713 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 18032331 18032623 18032472 Y TOM1L2,MYO15A DRG2 NA NA NA NA DRG2 43131 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 19268894 19269122 19269008 Y NA MAPK7,B9D1 NA NA NA NA MAPK7 9912 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 ALDH3A1 NA NA NA NA ALDH3A1 6134 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.07417155196102 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 20943914 20944165 20944106 Y NA USP22 NA NA NA NA USP22 908 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 21515861 21516199 21516031 Y NA C17orf51 CCDC144NL K562 ChIA-PET 22265404 C17orf51 40139 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 25415234 25415538 25415430 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 203564 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr17 25659360 25659787 25659571 Y LGALS9,WSB1 WSB1 NA NA NA NA WSB1 40258 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr17 25672386 25672687 25672621 Y NA NA KSR1,MIR4522,WSB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 53284 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.9650046281736 chr17 25707009 25707412 25707348 Y NA NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 KSR1 74258 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 26214261 26214593 26214427 Y NA NA NA NA NA NA NLK 152170 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 26578258 26578420 26578387 Y NA NA NA NA NA NA TMEM97 65701 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 26718724 26718918 26718801 Y FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1 POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 13297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 27118575 27118718 27118697 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 49573 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 27129097 27129445 27129306 Y NA NA NA NA NA NA ERAL1 50511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 27220048 27220212 27220121 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA FLOT2 2485 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 27405810 27406234 27406188 Y NA NA NA NA NA NA MYO18A 99196 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 27766880 27767142 27766912 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 51200 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 27791459 27791862 27791696 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 75779 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 27919265 27919579 27919303 Y NA TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 193 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 28009923 28010244 28010118 Y SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 61998 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 28049478 28050072 28049903 Y NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 101553 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 28050852 28051063 28050953 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 102927 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 28535067 28535437 28535252 Y NA SLC6A4,SNORD63 NA NA NA NA SLC6A4 25583 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 29176780 29177123 29176952 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA ATAD5 19792 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 79002 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr17 29759240 29759393 29759318 Y NA RAB11FIP4 NA NA NA NA RAB11FIP4 42598 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 30723443 30723679 30723561 Y NA C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 45600 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 30726822 30727202 30727012 Y NA PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 42077 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 30847234 30847756 30847477 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 35597 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 31072918 31073214 31073077 Y NA NA NA NA NA NA MYO1D 128981 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 31155018 31155230 31155072 Y MYO1D MYO1D NA NA NA NA MYO1D 46965 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 32365538 32365912 32365713 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 214392 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 32561287 32561685 32561349 Y CCL1,CCL8,CCL7,CCL2 CCL2,CCL7,CCL11 CCL13 IMR90 Hi-C 24141950 CCL2 18619 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 32740110 32740340 32740257 Y NA NA NLE1,TMEM132E,CCT6B,ZNF830 IMR90 Hi-C 24141950 CCL11 129423 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 33383216 33383365 33383329 Y SLFN5,RFFL RFFL NA NA NA NA RFFL 30973 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 33786708 33787098 33786905 Y NA SLFN12,SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 12852 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L SLFN12,SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 13552 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 33841707 33842053 33841976 Y SLFN5,SLFN12L,CCL5 NA UNC45B,SLFN13 IMR90 Hi-C 24141950 AP2B1 61012 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA TAF15 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 34223301 34223445 34223399 Y NA RDM1 NA NA NA NA RDM1 32332 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 34227790 34227961 34227895 Y SLFN12L,CCL5 RDM1 NA NA NA NA RDM1 27816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 35078576 35079010 35078700 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 122575 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 35184574 35184592 35184583 Y NA NA AATF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-445F12.1 107368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr17 35288156 35288415 35288296 Y LHX1 RP11-445F12.1,AATF AATF K562 ChIA-PET 22265404 RP11-445F12.1 3545 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 35292129 35292558 35292512 Y ACACA,LHX1,AATF RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 169 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 35296825 35297078 35296886 Y LHX1 RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 4865 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.72917309468555 chr17 37542274 37542291 37542284 Y NA FBXL20 NA NA NA NA FBXL20 14485 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 18231 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 37936494 37936791 37936643 Y IKZF3 GRB7 NA NA NA NA GRB7 44314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 38095307 38095463 38095385 Y NA ORMDL3,PSMD3 NA NA NA NA ORMDL3 13453 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 38470934 38471197 38471090 Y IKZF3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 7490 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 38703564 38704159 38703879 Y SMARCE1,MED24,CASC3,TOP2A,CCR7 TNS4 NA NA NA NA TNS4 47715 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 39572335 39572530 39572426 Y NA KRT31 NA NA NA NA KRT31 20491 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 39685394 39685532 39685463 Y KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9 KRT19 NA NA NA NA KRT19 2834 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 39956975 39957353 39957171 Y KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA LEPREL4 9503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 41242207 41242334 41242271 Y NA BRCA1,NBR2 NA NA NA NA BRCA1 33166 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 41409196 41409569 41409556 Y TMEM106A NA IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL4D 64758 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 42198947 42199210 42199140 Y NA C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.36667695149688 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 42589268 42589584 42589359 Y C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104 GPATCH8,FZD2 ATXN7L3,GPATCH8 K562 ChIA-PET 22265404 GPATCH8 10470 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 43919032 43919225 43919129 Y STH NA NA NA NA NA MAPT 50523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 144217 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 44198532 44198560 44198547 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 228784 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1,TBX21 NA NA NA NA TBX21 37143 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 46226881 46226967 46226912 Y TBX21,OSBPL7,LRRC46,SKAP1 CBX1,SNX11 SNX11 IMR90 Hi-C 24141950 SNX11 48162 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 46642274 46642589 46642562 Y NA HOXB4,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 12884 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 46654606 46654947 46654902 Y NA HOXB4,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 526 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 46662223 46662405 46662377 Y NA HOXB4,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 6750 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB4,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 7211 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 46680378 46680812 46680678 Y NA HOXB4,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB8 9666 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB4,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 35619 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 47337469 47337918 47337568 Y CALCOCO2,UBE2Z PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 31341 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 47966905 47967224 47967101 Y DLX4,DLX3,TAC4 NA LOC284080,ITGA3,SPOP,NXPH3,SLC35B1,DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,FLJ45513,TAC4,DLX4,PDK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLX4 77110 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 PPP1R9B NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 48386710 48386950 48386837 Y NA TMEM92,XYLT2 LRRC59,PPP1R9B,PDK2,SAMD14,SGCA,HILS1,COL1A1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 XYLT2 34503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 48504874 48504976 48504927 Y NA LRRC59,ACSF2,RSAD1 NA NA NA NA ACSF2 3355 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 48996944 48997365 48997235 Y UTP18,RSAD1,TOB1 RP11-700H6.1 LOC400604,TOB1,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-700H6.1 22709 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 49031638 49031879 49031784 Y NA RP11-700H6.1 NA NA NA NA RP11-700H6.1 11564 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 50795913 50796132 50795928 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 1037099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr17 50877242 50877515 50877351 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 955716 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 55210991 55211279 55211077 Y NA NA NA NA NA NA AKAP1 50538 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 55434822 55435211 55435067 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 103610 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 55456674 55456859 55456690 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 125462 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 55477911 55478459 55478198 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 146699 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 55501996 55502706 55502262 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 170784 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 55504815 55504992 55504904 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 173603 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 55523126 55523573 55523446 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 191914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 55706775 55707069 55706919 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 218348 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 56413212 56413667 56413409 Y VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 MIR142,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR142 5343 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 56419503 56419633 56419507 Y OR4D2 MIR142,SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 8821 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 56426877 56426962 56426920 Y MTMR4,SUPT4H1 MIR142,SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 1492 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 MIR142 NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.07417155196102 chr17 56468859 56469318 56469005 Y RNF43 SUPT4H1,RNF43 NA NA NA NA RNF43 23638 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr17 56480586 56480907 56480747 Y NA RNF43 NA NA NA NA RNF43 12049 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 56701235 56701661 56701522 Y OR4D1,BZRAP1 RNU1-60P NA NA NA NA RNU1-60P 33005 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 57200500 57200626 57200599 Y GDPD1 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 18218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 57231102 57231481 57231293 Y C17orf71 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 242 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 57853705 57854627 57854148 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 62000 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 57908316 57908645 57908515 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 7982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 59213347 59213460 59213422 Y TBX4,TBX2 NA NA NA NA NA TBX2 261797 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 59337920 59337981 59337951 Y NA NA NA NA NA NA TBX2 137276 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 59473194 59473360 59473229 Y NA TBX2,C17orf82 NA NA NA NA TBX2 1897 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 59473431 59474098 59473741 Y TBX2,C17orf82 TBX2,C17orf82 NA NA NA NA TBX2 1159 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr17 59474585 59474918 59474715 Y NA TBX2,C17orf82 NA NA NA NA TBX2 339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.93000925634719 chr17 59488217 59488528 59488332 Y NA TBX2,C17orf82 NA NA NA NA C17orf82 1105 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 59491856 59491969 59491928 Y NA TBX2,C17orf82 NA NA NA NA C17orf82 4744 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 59645902 59646266 59646152 Y NA NACA2 NA NA NA NA NACA2 20297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 59786803 59787088 59786946 Y NA NA NA NA NA NA NACA2 120240 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 60141349 60141594 60141514 Y NACA2,MED13 MED13 INTS2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED13 706 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 60555037 60555507 60555099 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 36621 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 60721967 60722242 60722046 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 19205 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 60729712 60730300 60729931 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 26950 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 60877951 60878269 60878188 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 175189 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 60970243 60970809 60970465 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 267481 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 61779039 61779508 61779383 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 2507 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 61787185 61787371 61787278 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 10653 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 61796482 61796787 61796636 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 19950 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 62484790 62485162 62485096 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 5992 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 62487438 62487665 62487534 Y ICAM2 POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 3489 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 62744260 62744559 62744528 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHM1P 86713 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 63645833 63645846 63645840 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 90068 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr17 63646847 63647018 63646933 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 91082 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 63654769 63655153 63655091 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 99004 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 63752923 63753189 63753062 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 197158 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 64947420 64948018 64947947 Y NA CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 11008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 65318264 65318584 65318454 Y NA PSMD12 NA NA NA NA PSMD12 42159 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 65339190 65339485 65339338 Y BPTF PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PSMD12 21258 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 65823373 65823579 65823476 Y SLC16A6,PITPNC1,BPTF BPTF NA NA NA NA BPTF 3733 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 66030294 66030564 66030453 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 66374808 66375131 66375016 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 66419326 66419636 66419592 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 32018 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 66421215 66421317 66421250 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 30337 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 67577769 67578023 67578007 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 168930 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 67603336 67603572 67603425 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 194497 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 70245372 70245384 70245378 Y NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 130211 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 70395717 70396043 70395724 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 225327 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 70442621 70442708 70442666 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 178662 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 70585200 70585480 70585419 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 35890 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 70939903 70940361 70940187 Y SSTR2,C17orf80 NA NA NA NA NA SLC39A11 146490 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 70975015 70975329 70975170 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 111522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 71305759 71306422 71306099 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 71470506 71470810 71470640 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 164192 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 71476918 71477129 71477067 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 161099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 71499846 71500069 71499928 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 138159 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 71603632 71603970 71603800 Y NA SDK2 NA NA NA NA SDK2 34258 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 73032786 73033119 73032977 Y TSEN54,GGA3 ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA KCTD2 6116 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 73133469 73133809 73133510 Y NA ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2 NA NA NA NA NT5C 7579 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 8177 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 73319762 73319905 73319788 Y SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 6352 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 73333353 73333637 73333600 Y H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3 SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 19943 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 73545364 73545732 73545559 Y NA CASKIN2,TSEN54,LLGL2 NA NA NA NA LLGL2 26203 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 73719261 73719909 73719549 Y MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4 ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 3853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 74128444 74128992 74128680 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1 EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 12787 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr17 74264426 74264836 74264522 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 29972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA PRPSAP1 NA NA NA NA PRPSAP1 36626 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 74713062 74713219 74713141 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA JMJD6 7647 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.62000617089813 chr17 74752987 74753327 74752991 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA SRSF2 21531 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 75086431 75086552 75086490 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 5633 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 75359988 75360125 75360083 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 85337 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 109985 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 75953939 75954304 75954190 Y TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43945 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 22.4883863002089 chr17 75955923 75956319 75956134 Y TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 41930 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 76195016 76195360 76195224 Y TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 BIRC5 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 12907 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 76409170 76409735 76409347 Y CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 36449 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 76412850 76413399 76413170 Y CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 40129 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 76643240 76643420 76643373 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA DNAH17,CYTH1 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 132959 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 76662391 76662551 76662479 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 113828 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 76669540 76669658 76669599 Y NA NA NA NA NA NA CYTH1 106721 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 76718520 76718722 76718578 Y TMEM235 NA NA NA NA NA CYTH1 57657 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 76764263 76764724 76764556 Y SOCS3,PGS1,USP36,CANT1,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 11655 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 76767876 76768189 76768026 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 8190 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 76770526 76771358 76771190 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 5021 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 76775899 76776536 76776049 Y USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 77788517 77788922 77788877 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 15035 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 77965696 77966573 77966281 Y CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 41074 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr17 77970749 77971301 77971166 Y CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 36346 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 78121490 78121818 78121740 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 2508 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 78134790 78135293 78135090 Y NA EIF4A3 EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A3 15808 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.29250539953586 chr17 78734428 78734929 78734574 Y C17orf56 NA NA NA NA NA RPTOR 217809 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 79011145 79011369 79011293 Y BAIAP2 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 4197 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 50438 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA SLC38A10 93061 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 79365060 79367456 79365203 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 97713 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 79368790 79369424 79369000 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 101443 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 102227 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 103407 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr17 79399639 79399699 79399664 Y GCGR,BAHCC1 NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 78390 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 79925685 79926075 79926048 Y TSPAN10 SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1 ASPSCR1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ASPSCR1 6608 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 79949658 79950000 79949804 Y SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1 NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR NA NA NA NA ASPSCR1 16975 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.9650046281736 chr17 79950743 79950987 79950865 Y SLC25A10,GCGR,DCXR,PCYT2 NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR NA NA NA NA ASPSCR1 18060 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 79958827 79959194 79958989 Y NA NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG NA NA NA NA LRRC45 19984 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr17 79979263 79979824 79979465 Y NA ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L NA NA NA NA LRRC45 85 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.07417155196102 chr17 80068913 80069274 80069094 Y NARF,HEXDC,CCDC57 DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 14705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 80164087 80164383 80164236 Y SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 NA NA NA NA CCDC57 4323 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 80214734 80215057 80214944 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 80239829 80239997 80239937 Y NA CSNK1D CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 10222 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 80245965 80246238 80246057 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 16358 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 80296831 80297318 80297085 Y NA TEX19 SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TEX19 17805 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 80453708 80453979 80453866 Y LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2 C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 21610 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr17 80745153 80745621 80745526 Y ZNF750 TBCD NA NA NA NA TBCD 37213 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 80796209 80796714 80796435 Y METRNL,ZNF750 NA NA NA NA NA ZNF750 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 80821463 80821609 80821520 Y NA ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 25009 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr17 80833209 80833609 80833394 Y ZNF750 ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 36755 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr17 80845276 80845458 80845382 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 48822 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 336673 336972 336812 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 70623 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.14834310392203 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr18 679559 679568 679564 Y NA TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 23219 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 2223503 2223515 2223509 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 345993 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 2548368 2548472 2548420 Y NA METTL4,NDC80 NA NA NA NA METTL4 21036 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 2549022 2549121 2549072 Y NA METTL4,NDC80 NA NA NA NA METTL4 20387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 2641738 2642012 2641797 Y METTL4,EMILIN2,SMCHD1 CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA CBX3P2 11382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 3250721 3251122 3250738 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5242 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 3610673 3610894 3610785 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 201067 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr18 3665613 3666165 3665884 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 256007 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr18 3704951 3705065 3705044 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 295345 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 3842681 3843070 3842877 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 433075 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 4003748 4003994 4003928 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 594142 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 4011173 4011412 4011293 Y DLGAP1,DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 601567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 4306944 4307316 4307247 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 897338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 4328751 4329143 4328947 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 919145 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 4356734 4357177 4357014 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 947128 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 4453408 4453552 4453479 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 1043802 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 4453597 4454207 4453941 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 1043991 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 5294371 5294839 5294435 Y ZFP161 NA NA NA NA NA L3MBTL4 1118397 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 L3MBTL4 517433 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr18 7512213 7512497 7512355 Y NA NA PTPRM IMR90 Hi-C 24141950 PTPRM 52283 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 9548277 9548390 9548335 Y ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1 NA NA NA NA NA PPP4R1 64848 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 9877272 9877635 9877453 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 34364 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 10086468 10086802 10086635 Y NAPG,APCDD1 NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 174469 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.40167232332328 chr18 10123098 10123445 10123261 Y NAPG,RAB31,VAPA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 211099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 10133595 10133911 10133753 Y NA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 221596 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr18 10141033 10141178 10141087 Y NA NA APCDD1,NAPG IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 229034 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 10297142 10297534 10297283 Y NA NA APCDD1,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 APCDD1 155091 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr18 10458574 10458933 10458647 Y NA APCDD1 NA NA NA NA APCDD1 5949 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr18 10475783 10476043 10475911 Y NA APCDD1,NAPG NA NA NA NA APCDD1 23158 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 10476562 10476712 10476630 Y NAPG,APCDD1 APCDD1,NAPG NA NA NA NA APCDD1 23937 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 10543130 10543398 10543236 Y NAPG NAPG NA NA NA NA NAPG 19228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 10544333 10544521 10544427 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 20431 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr18 10726542 10726663 10726595 Y NAPG NA NA NA NA NA NAPG 202640 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 10766591 10766813 10766750 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 242689 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 12059774 12060081 12059918 Y NA NA GNAL,IMPA2 IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 80750 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 12471098 12471401 12471374 Y PSMG2 NA NA NA NA NA SLMO1 65203 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 13500609 13500835 13500766 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 223824 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 13564575 13564807 13564692 Y C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 159852 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 19453532 19453543 19453538 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 170614 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 20811230 20811702 20811444 Y NPC1,C18orf8,RBBP8,RBBP8 NA NA NA NA NA CABLES1 98702 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 21228672 21228807 21228737 Y LAMA3,ANKRD29 ANKRD29,LAMA3 NA NA NA NA ANKRD29 12042 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 21336252 21336608 21336275 Y NA NA NA NA NA NA LAMA3 68845 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 21463540 21463749 21463607 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 106988 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 21808250 21808465 21808434 Y OSBPL1A NA NA NA NA NA CABYR 91308 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 22043448 22044004 22043747 Y NA IMPACT NA NA NA NA IMPACT 38868 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 23609881 23610142 23609962 Y NA NA NA NA NA NA SS18 59039 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 24645556 24645568 24645562 Y NA NA NA NA NA NA CHST9 117713 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 25754926 25755429 25755157 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 26231611 26231936 26231774 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 476201 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 28823621 28824065 28823663 Y NA NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 143243 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr18 29441885 29441939 29441912 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC8 89160 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 30501581 30501946 30501766 Y NA NA NA NA NA NA KLHL14 150556 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 32289089 32289403 32289194 Y NA NA NA NA NA NA DTNA 217835 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 32386590 32386868 32386730 Y MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA MAPRE2 168024 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 32414940 32415436 32415021 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 139456 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 33577061 33577192 33577127 Y NA C18orf21 NA NA NA NA C18orf21 27015 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 33711406 33711801 33711526 Y NA SLC39A6,ELP2 NA NA NA NA ELP2 3999 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 33878609 33878753 33878681 Y FHOD3 FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 2932 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 35063649 35063942 35063793 Y NA NA NA NA NA NA CELF4 80058 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 35114898 35115196 35115047 Y NA CELF4 NA NA NA NA CELF4 28804 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 35142004 35142267 35142202 Y CELF4 CELF4 NA NA NA NA CELF4 1733 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 37539904 37540304 37540052 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 626265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr18 37629293 37629563 37629339 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 715654 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.14834310392203 chr18 39317275 39317429 39317352 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 215742 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 43307603 43307620 43307613 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 237620 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 43543003 43543287 43543010 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 1953 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 43622844 43623013 43623010 Y NA PSTPIP2 NA NA NA NA PSTPIP2 27225 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 44675442 44676177 44675810 Y NA HDHD2,IER3IP1 NA NA NA NA HDHD2 551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 45790060 45790073 45790067 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB7C 145050 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 45915673 45915749 45915744 Y NA ZBTB7C NA NA NA NA ZBTB7C 19374 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr18 46354445 46354549 46354497 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 120532 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 46428346 46428737 46428479 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 46344 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 46455103 46455621 46455353 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 19460 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 46456597 46456819 46456703 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 18262 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 47325286 47325511 47325399 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 12819 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 48274760 48275068 48274915 Y NA NA NA NA NA NA ME2 128351 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 48720847 48721238 48721193 Y NA MEX3C NA NA NA NA MEX3C 21436 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 51736292 51736523 51736417 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 12635 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 51860775 51860976 51860876 Y NA NA NA NA NA NA POLI 67001 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.60250848498492 chr18 53072982 53073437 53073370 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 256581 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr18 53107364 53107398 53107375 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 222620 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 53144810 53145149 53144924 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 184869 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 53167517 53167871 53167822 Y TCF4 NA NA NA NA NA TCF4 162147 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 53180110 53180413 53180343 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 149605 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr18 53200351 53200719 53200535 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 129299 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 53204965 53205096 53205075 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 124922 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr18 54487568 54487957 54487622 Y NA NA NA NA NA NA TXNL1 170737 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 55102016 55102207 55102112 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 1099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 55250571 55250884 55250819 Y FECH FECH,NARS NA NA NA NA FECH 1120 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 55255652 55255824 55255739 Y FECH FECH,NARS NA NA NA NA FECH 3648 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 56337372 56337558 56337406 Y MALT1 MALT1 NA NA NA NA MALT1 754 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 56339458 56339877 56339543 Y MALT1 MALT1 NA NA NA NA MALT1 2840 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 56394566 56394962 56394680 Y MALT1 NA NA NA NA NA MALT1 57948 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 57566379 57566616 57566437 Y NA PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 1199 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 58114055 58114449 58114252 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP49 299247 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 59137424 59137774 59137646 Y CDH20 NA NA NA NA NA RPL30P14 66986 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr18 60456322 60456424 60456373 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 75650 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 60598497 60598585 60598560 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 217825 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 60805787 60806310 60806122 Y VPS4B,SERPINB12,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 179051 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 60864948 60865713 60864996 Y PHLPP1,VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 119648 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 60973604 60973976 60973940 Y NA BCL2 NA NA NA NA BCL2 11385 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 66405862 66406252 66406056 Y NA CCDC102B,TMX3 NA NA NA NA TMX3 25327 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 72919988 72920296 72920123 Y ZADH2,TSHZ1 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA TSHZ1 414 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 74205649 74206020 74205889 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 172 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 74745176 74745688 74745337 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 212613 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 74754529 74754928 74754700 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 221966 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 75149077 75149342 75149210 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 616514 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 76574789 76574960 76574953 Y SALL3 NA NA NA NA NA SALL3 163315 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr18 77245359 77245518 77245445 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 91503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr18 77558494 77558673 77558529 Y NA NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 120693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr18 78004258 78004625 78004566 Y PARD6G PARD6G NA NA NA NA PARD6G 829 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 289700 289869 289784 Y C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 307 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,BSG NA NA NA NA BSG 4137 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 934999 935434 935086 Y MIDN,CIRBP MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 11218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 1632932 1633212 1633140 Y STK11 MBD3,UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 17392 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 2032329 2032652 2032524 Y LINGO3,C19orf35 BTBD2,MKNK2 NA NA NA NA BTBD2 228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 2503555 2504136 2503623 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 29435 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 2507206 2507458 2507335 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B GADD45B NA NA NA NA GADD45B 33086 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 3222791 3223093 3222942 Y NA NCLN NA NA NA NA NCLN 39230 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 3428769 3429112 3428821 Y TLE2,NFIC NA NA NA NA NA DOHH 69826 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 3520804 3521051 3520913 Y NA DOHH,FZR1,HMG20B NA NA NA NA FZR1 16533 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 4064154 4064453 4064218 Y SEMA6B,MATK ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 490 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 4375126 4375688 4375404 Y NA STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 22856 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 4375735 4376107 4375790 Y ZBTB7A,EBI3 STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 22437 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 4381377 4381710 4381643 Y NA STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 16834 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 5940860 5941142 5941001 Y NA FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS,RANBP3 NA NA NA NA CAPS 31142 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 6516969 6517178 6517079 Y NA TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 11832 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 6518032 6518368 6518308 Y RFX2,CD70,TNFSF9 TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 10642 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 6577471 6577956 6577654 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 48461 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 7756040 7757119 7756175 Y ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2 TRAPPC5 NA NA NA NA TRAPPC5 12311 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 9777343 9777681 9777659 Y ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 9896233 9896620 9896495 Y ZNF266,COL5A3,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 39872 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 OLFM2 NA NA NA NA OLFM2 11008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr19 10562469 10562629 10562543 Y NA KEAP1 NA NA NA NA KEAP1 49788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 10678483 10678588 10678537 Y TYK2,KRI1 ATG4D,KRI1,CDKN2D,AP1M2,SLC44A2 NA NA NA NA CDKN2D 748 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 10766466 10766790 10766534 Y NA ILF3,QTRT1 NA NA NA NA ILF3 3529 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr19 10992105 10992492 10992295 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 11916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 10999263 10999360 10999313 Y SMARCA4 CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 19074 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 11925678 11926080 11925867 Y NA ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439 NA NA NA NA ZNF440 2579 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr19 12890492 12890682 12890617 Y ZNF44,ZNF564,MAN2B1,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 9628 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 12901644 12901726 12901699 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 1334 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 14089228 14089566 14089336 Y CCDC130,PKN1,CD97,RFX1 DCAF15,RFX1 NA NA NA NA RFX1 26285 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 14229419 14229865 14229637 Y CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA PRKACA 2523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 14473667 14474081 14473883 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,PKN1,CD97 CD97 CD97,DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 15232 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 14869692 14869911 14869839 Y NA EMR2,AC005255.3 NA NA NA NA EMR2 17442 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr19 15321082 15321623 15321224 Y RASAL3 NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 11290 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 15336591 15336774 15336684 Y NA NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 26799 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F11 95558 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A,HSH2D NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 16704980 16705245 16705094 Y KLF2,MED26 SLC35E1,MED26 NA NA NA NA SLC35E1 23787 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 16772555 16772747 16772653 Y NA MED26,TMEM38A NA NA NA NA TMEM38A 2617 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 17570047 17570102 17570055 Y CPAMD8,NXNL1 CTD-2521M24.4,SLC27A1 NA NA NA NA SLC27A1 7476 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 18588665 18588964 18588926 Y NA ISYNA1,ELL NA NA NA NA ISYNA1 41554 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 19488658 19488936 19488750 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 5699 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 21511296 21511520 21511376 Y NA ZNF708,ZNF738 NA NA NA NA ZNF708 1069 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 21689202 21689645 21689487 Y ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429 ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 11718 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 22715195 22715609 22715437 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P34 165441 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 23425915 23426300 23426108 Y NA ZNF724P NA NA NA NA ZNF724P 4892 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 24216985 24217321 24217111 Y ZNF254 ZNF254 NA NA NA NA ZNF254 2709 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 28200767 28201213 28200857 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1501235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 28218670 28219232 28218933 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1483216 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 28252106 28252716 28252616 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1449732 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 29702850 29703471 29703365 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 30157267 30157499 30157417 Y PLEKHF1,C19orf12,C19orf12 PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA PLEKHF1 3304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 30195599 30196138 30195979 Y NA PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 8226 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 30718140 30718340 30718240 Y NA NA NA NA NA NA URI1 305589 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr19 32551696 32552017 32551879 Y NA NA NA NA NA NA ZNF507 282483 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 33750621 33750673 33750623 Y CEBPA CEBPA CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA IMR90 Hi-C 24141950 CEBPA 40797 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 34752762 34752909 34752837 Y NA KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 9320 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 35491833 35492367 35492256 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A ZNF792,GRAMD1A NA NA NA NA GRAMD1A 8145 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 36020756 36020837 36020796 Y NA DMKN,TMEM147,AD000090.2 NA NA NA NA TMEM147 13660 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 36135988 36136183 36136108 Y ARHGAP33 HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1 NA NA NA NA COX6B1 942 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 36720266 36720641 36720459 Y ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565 ZNF146,ZNF565 NA NA NA NA ZNF565 14518 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 37322216 37322466 37322299 Y ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345 ZNF345 NA NA NA NA ZNF345 16797 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 38470537 38470671 38470619 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L3 74669 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 39152764 39152958 39152839 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 16475 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 41109606 41110134 41110046 Y SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1 SHKBP1 NA NA NA NA SHKBP1 28849 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA 8162 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 42501283 42501478 42501381 Y TMEM145 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 39741 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 44152096 44152277 44152103 Y ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ ZNF428,CADM4,PLAUR CADM4 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CADM4 10105 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 44261449 44261664 44261525 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9 NA NA NA NA SMG9 4307 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 44287065 44287299 44287223 Y NA SMG9,ZNF283 NA NA NA NA SMG9 29923 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr19 44616064 44616441 44616271 Y KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284 ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234 NA NA NA NA ZNF225 1730 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr19 45663964 45664347 45664315 Y NA TRAPPC6A,BLOC1S3 NA NA NA NA TRAPPC6A 15148 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 45844650 45844836 45844820 Y FBXO46,PPP1R13L ERCC2 NA NA NA NA ERCC2 27340 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 45905744 45905944 45905844 Y EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1 ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA CD3EAP 1523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 46386037 46386278 46386146 Y OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3 SYMPK,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1098 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 46665382 46665717 46665592 Y NA NA NA NA NA NA CCDC61 169043 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 46708652 46708841 46708747 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 139410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3 NA NA NA NA CALM3 39864 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 47220951 47221042 47220998 Y ZC3H4,PRKD2 PRKD2,FKRP,STRN4 NA NA NA NA PRKD2 2567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr19 47324064 47324441 47324224 Y NA SLC1A5,AP2S1 NA NA NA NA AP2S1 27808 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr19 47610820 47611121 47611012 Y NA SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 3410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 47662714 47662828 47662771 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA ZC3H4 47705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 47961170 47962467 47962382 Y SLC8A2 KPTN NA NA NA NA KPTN 23058 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 48151789 48152128 48151872 Y NA NA NA NA NA NA GLTSCR2 94651 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr19 49482120 49482542 49482303 Y FUT1,C19orf73 DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 12025 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 50276330 50276635 50276461 Y VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25 AP2A1,FUZ,MED25 NA NA NA NA AP2A1 8105 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 50425284 50425454 50425359 Y RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5 TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 4505 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA NA NA NA NA NA ZNF845 107141 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr19 57351144 57351414 57351350 Y ZNF543,AURKC,AURKC,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZFP28,ZNF470,LOC147670,ZNF835,PEG3,ZIM2,PEG3 NA NA NA NA NA ZNF264 349454 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 57976528 57976751 57976646 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 10187 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 58321012 58321020 58321017 Y VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 3261 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF417 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr19 58480028 58480253 58480224 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA CTD-2368P22.1 31176 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 58742086 58742094 58742090 Y NA ZNF274,ZNF544,ZNF8 NA NA NA NA ZNF544 4126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 58788473 58788748 58788728 Y NA ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22 NA NA NA NA ZNF8 155 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr19 59029635 59029989 59029796 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M SLC27A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC27A5 7855 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr19 59050036 59050316 59050176 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA ZBTB45 1758 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 2311871 2312010 2311889 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 565247 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 3226385 3226781 3226690 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 152872 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 3699787 3700199 3700016 Y NA TMSB4XP2 NA NA NA NA TMSB4XP2 36440 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 5532908 5533092 5533010 Y NA NA NA NA NA NA CMPK2 1471674 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 8597253 8597584 8597383 Y KIDINS220 NA LOC100506274,LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 219391 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 8743061 8743194 8743128 Y ID2 NA LOC100506274,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 73781 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 8872785 8872976 8872902 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.7 52792 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 9142736 9142998 9142867 Y NA MBOAT2 NA NA NA NA MBOAT2 794 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 9411571 9411694 9411610 Y ADAM17 NA NA NA NA NA ASAP2 66677 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr2 10261505 10261712 10261609 Y NA RRM2 NA NA NA NA RRM2 1050 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 10341486 10341905 10341708 Y KLF11 NA NA NA NA NA RRM2 81031 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 10425680 10425925 10425803 Y HPCAL1 HPCAL1 HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 15090 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 11514785 11514933 11514926 Y NA ROCK2 ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 28329 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 13069256 13069287 13069272 Y NA NA TRIB2,LPIN1,MIR4262 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 214241 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 13768746 13768755 13768750 Y NA NA NA NA NA NA TRIB2 913731 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 15629690 15629929 15629800 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 69525 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 16152892 16153059 16152979 Y NBAS NA NA NA NA NA MYCNOS 72521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 16576517 16576693 16576605 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 268906 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 16837187 16837623 16837438 Y FAM49A FAM49A NA NA NA NA FAM49A 7976 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 17005594 17005646 17005620 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 159995 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 20431248 20431615 20431535 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 8054 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr2 20825545 20825949 20825765 Y RHOB HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 22900 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 20965440 20965780 20965672 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 55102 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 23275216 23275518 23275368 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 330570 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 23609943 23610311 23610250 Y KLHL29 KLHL29 NA NA NA NA KLHL29 3855 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 23681941 23682000 23681953 Y KLHL29 NA NA NA NA NA KLHL29 75853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 23783139 23783161 23783150 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 177051 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 23923305 23923445 23923375 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2B 224539 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA RPL36AP13 63439 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 24491972 24492409 24492370 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP13 62972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA CENPO 161636 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 26328559 26328812 26328686 Y FAM59B,RAB10 NA NA NA NA NA RAB10 73583 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 27005355 27005756 27005547 Y NA CENPA NA NA NA NA CENPA 20198 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 27574731 27574755 27574743 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3 NA NA NA NA AC074117.10 2358 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 27629706 27629770 27629738 Y NA EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3 NA NA NA NA PPM1G 784 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 27631105 27631216 27631160 Y C2orf16 EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3 NA NA NA NA PPM1G 551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 28319174 28319559 28319300 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 207209 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 28976141 28976573 28976382 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B PPP1CB SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 3635 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 29026080 29026331 29026243 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB NA NA NA NA NA PPP1CB 53574 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 29174818 29175149 29175047 Y NA NA NA NA NA NA WDR43 59309 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 29352302 29352469 29352324 Y NA NA NA NA NA NA WDR43 236793 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 29439591 29440302 29440265 Y NA NA NA NA NA NA WDR43 324082 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 29485561 29485725 29485698 Y NA NA NA NA NA NA WDR43 370052 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 30889265 30889652 30889547 Y NA NA YPEL5,LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 221173 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 37432341 37432705 37432523 Y NA AC007390.4,CEBPZ NA NA NA NA AC007390.4 12461 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 37489254 37489354 37489306 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 32398 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 37491311 37491687 37491498 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 34455 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 37576725 37576898 37576775 Y STRN,HEATR5B,PRKD3,QPCT PRKD3,QPCT NA NA NA NA QPCT 7008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 37592833 37593153 37593092 Y NA PRKD3,QPCT NA NA NA NA QPCT 23116 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 37603882 37604154 37604086 Y QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 34165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 37605671 37605839 37605750 Y CCDC75,QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 35954 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr2 37763462 37763512 37763507 Y FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA AC006369.2 61767 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 37842733 37843439 37843059 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 AC006369.2 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC006369.2 17454 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 37864248 37864629 37864487 Y NA AC006369.2 NA NA NA NA AC006369.2 38969 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA AC006369.2 58743 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 37892431 37892964 37892857 Y QPCT,CDC42EP3 NA NA NA NA NA AC006369.2 67152 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 38348355 38348465 38348410 Y NA NA CYP1B1,FAM82A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL7P12 108245 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 38571888 38572175 38572032 Y FAM82A1,ATL2 ATL2 NA NA NA NA ATL2 30252 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 39079289 39079498 39079407 Y SRSF7,ARHGEF33 DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21577 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 39719153 39719730 39719398 Y MAP4K3 NA NA NA NA NA MAP4K3 56700 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 40703678 40703929 40703762 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 132264 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 40958599 40958755 40958677 Y NA NA LOC100128590,SLC8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 122406 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 42030306 42030675 42030574 Y NA NA NA NA NA NA PKDCC 242485 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 42481657 42481775 42481735 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 87167 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 42535809 42536204 42535901 Y NA NA COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 COX7A2L 114024 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 42869718 42869759 42869739 Y NA NA NA NA NA NA AC025750.7 111136 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 43762812 43762910 43762862 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 58275 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 44718441 44718530 44718486 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 131352 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 45161073 45161475 45161220 Y SIX3 NA NA NA NA NA AC012354.8 60077 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 47212237 47212567 47212294 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 45243 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 47526778 47526800 47526792 Y KCNK12 AC073283.4,EPCAM TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61,EPCAM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073283.4 43413 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 48373241 48373406 48373298 Y FOXN2 NA FOXN2,PPP1R21 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN2 166370 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 52785437 52785822 52785630 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1207107 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 54196339 54196842 54196524 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 NA NA NA NA PSME4 362 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 54751942 54752182 54752042 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 70520 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr2 54845847 54845943 54845895 Y NA NA NA NA NA NA EML6 102693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 54861793 54862155 54861956 Y NA NA NA NA NA NA EML6 86481 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 55212013 55212317 55212165 Y CCDC88A NA NA NA NA NA RTN4 125440 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 55558772 55559057 55558882 Y NA NA NA NA NA NA MTIF2 64289 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 58336722 58337105 58336916 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 129402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 60694839 60695290 60695042 Y PAPOLG,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 83412 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 60711222 60711498 60711369 Y REL NA NA NA NA NA BCL11A 67204 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 60747849 60747913 60747881 Y PEX13,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 30789 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 60757464 60757761 60757646 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 20941 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 60760023 60760353 60760231 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 18349 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 60776650 60777166 60776879 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 1536 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 60779041 60779656 60779263 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 60784320 60784652 60784428 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 5618 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 61428317 61428371 61428344 Y USP34,AHSA2 AHSA2 NA NA NA NA AHSA2 25764 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 61757728 61758222 61758112 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 5539 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr2 62342790 62343015 62342903 Y NA NA NA NA NA NA B3GNT2 78233 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 62534127 62534336 62534147 Y NA NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 112879 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 63023345 63023597 63023471 Y NA NA NA NA NA NA EHBP1 124359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 63601034 63601048 63601041 Y NA NA NA NA NA NA MDH1 212695 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 63842322 63842740 63842368 Y UGP2 MDH1 NA NA NA NA MDH1 28579 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 64245195 64245602 64245370 Y NA VPS54 NA NA NA NA VPS54 989 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 64352533 64352773 64352693 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 15600 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 64364775 64365257 64365170 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 3116 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 64367846 64368162 64368149 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 211 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 64490373 64490733 64490649 Y NA NA LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 120785 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 64756167 64756526 64756224 Y NA AFTPH NA NA NA NA AFTPH 6702 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 64995321 64996019 64995711 Y SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 19182 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 65609993 65610402 65610168 Y NA SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 47369 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.93000925634719 chr2 67883850 67884178 67884174 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 261399 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 68263709 68263719 68263714 Y NA NA NA NA NA NA C1D 72361 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 68499892 68500037 68499965 Y NA PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 18523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 68971664 68971962 68971728 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 266348 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR1 102453 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr2 69533941 69534050 69534019 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 78332 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 69536922 69537085 69537004 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 75297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 69578985 69578997 69578991 Y NA GFPT1 NA NA NA NA GFPT1 33385 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 69717115 69717269 69717170 Y NA NA NA NA NA NA NFU1 54355 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 69989990 69990667 69990520 Y NA NA GMCL1 IMR90 Hi-C 24141950 GMCL1 64107 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 70000495 70000634 70000556 Y MXD1 NA NA NA NA NA GMCL1 54140 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 70141198 70141461 70141241 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 18378 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 70296121 70296604 70296392 Y GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA PCBP1 15981 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 70847317 70847463 70847388 Y FIGLA,ADD2,ADD2 NA NA NA NA NA TGFA 67992 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr2 71228347 71228418 71228366 Y ANKRD53 ANKRD53,TEX261 TEX261 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TEX261 8272 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 72426245 72426403 72426323 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 624767 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 72748040 72748317 72748179 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 302853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 73142422 73142663 73142543 Y NA SPR NA NA NA NA SPR 29933 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 73338552 73338952 73338867 Y RAB11FIP5 SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37805 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 74084079 74084249 74084166 Y SLC4A5,ALMS1 STAMBP NA NA NA NA STAMBP 29993 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr2 74446656 74447054 74446868 Y NA MOB1A,MTHFD2 NA NA NA NA MTHFD2 22967 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 74766124 74766334 74766228 Y NA PCGF1,HTRA2,AUP1 NA NA NA NA AUP1 11058 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 75894065 75894458 75894192 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 22156 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 75903279 75903482 75903481 Y C2orf3,C2orf3 MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 31370 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 77488333 77488701 77488549 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA AC105399.2 524807 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 84908864 84908877 84908871 Y NA NA NA NA NA NA DNAH6 167285 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 85154234 85154422 85154323 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 23485 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA CAPG NA NA NA NA CAPG 29587 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr2 85969500 85969917 85969748 Y VAMP5,TMEM150A,ATOH8 RNU1-38P,ATOH8 ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ATOH8 6550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 86307060 86307219 86307140 Y GNLY,KDM3A,KDM3A POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 24059 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 86388217 86388607 86388413 Y NA SNORD94,IMMT,MRPL35 NA NA NA NA SNORD94 27224 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 87014966 87015089 87014978 Y CD8B,CD8A,KDM3A,KDM3A,RNF103,CD8A NA NA NA NA NA CHMP3,RNF103-CHMP3 68721 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 87019569 87019949 87019758 Y CD8B,CD8A,CD8A NA NA NA NA NA CHMP3,RNF103-CHMP3 73324 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 87020151 87020270 87020209 Y CD8B,CD8A,CD8A NA NA NA NA NA CHMP3,RNF103-CHMP3 73906 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 91759872 91760090 91759934 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2696548 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2752348 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 91821438 91821799 91821741 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2758114 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2872873 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 95972113 95972447 95972295 Y KCNIP3 PROM2 NA NA NA NA PROM2 33912 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 97175211 97175545 97175411 Y NA NEURL3,ARID5A NA NA NA NA NEURL3 3365 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 97204407 97205263 97204568 Y NA NEURL3,ARID5A NA NA NA NA ARID5A 3927 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr2 97522669 97523105 97522935 Y NA CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA ANKRD39 837 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr2 97565299 97565614 97565457 Y NA ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 30805 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 97579294 97579390 97579355 Y NA SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 44800 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ZAP70 115188 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 98485830 98486136 98485916 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 124252 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 100026434 100026453 100026444 Y NA NA NA NA NA NA TXNDC9 71269 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 100061589 100061940 100061765 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 42557 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 100104968 100105518 100105262 Y REV1 REV1 NA NA NA NA REV1 471 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 101587758 101587775 101587767 Y NA RPL31 NA NA NA NA RPL31 28402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 101680419 101680493 101680454 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 64242 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 101922226 101922443 101922331 Y NA RNF149 NA NA NA NA RNF149 720 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 102604405 102604499 102604418 Y NA IL1R2 NA NA NA NA IL1R2 1807 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr2 103104673 103104833 103104753 Y IL1R2,IL1R1,IL18R1,IL18RAP SLC9A4 NA NA NA NA SLC9A4 16911 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 106022630 106022770 106022732 Y GPR45 FHL2 NA NA NA NA FHL2 30200 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 106417583 106417937 106417755 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 58229 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 106809174 106809856 106809272 Y UXS1 UXS1 NA NA NA NA UXS1 379 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 112376562 112376898 112376751 Y BCL2L11 NA ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 263369 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 112456456 112456792 112456629 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 183475 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 112459778 112460151 112459873 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 180116 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr2 112811776 112811937 112811878 Y ZC3H6 TMEM87B NA NA NA NA TMEM87B 976 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 113448603 113448987 113448785 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 47169 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 113450039 113450435 113450231 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 48605 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 113573367 113573750 113573559 Y IL1A NA NA NA NA NA CKAP2L 53113 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 113581693 113582026 113582010 Y NA NA NA NA NA NA CKAP2L 61439 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 113583112 113583470 113583291 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B NA NA NA NA NA CKAP2L 62858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 WASH2P 256849 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 114457868 114458149 114458009 Y ACTR3 NA NA NA NA NA SLC35F5 54251 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 114634434 114634643 114634539 Y NA ACTR3 ACTR3 IMR90 Hi-C 24141950 ACTR3 10894 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr2 114644100 114644364 114644199 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 1173 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 114652011 114652405 114652035 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 6474 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.29250539953586 chr2 114653014 114653311 114653090 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 7477 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr2 118309015 118309417 118309218 Y NA NA NA NA NA NA DDX18 260809 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 118738362 118738806 118738651 Y NA CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 30903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 119067655 119067950 119067737 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 125693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 120402567 120402612 120402590 Y PTPN4 TMEM177 NA NA NA NA TMEM177 32131 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 121200367 121200763 121200697 Y NA NA NA NA NA NA INHBB 98648 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 121614859 121615272 121615044 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 123660 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 122275440 122275469 122275455 Y NA RNU4ATAC NA NA NA NA RNU4ATAC 10988 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 122536391 122536587 122536559 Y NA TSN NA NA NA NA TSN 43712 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 122656153 122656341 122656293 Y NA NA NA NA NA NA TSN 163474 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 128469057 128469300 128469179 Y NA SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 12460 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 128617356 128617514 128617464 Y NA POLR2D NA NA NA NA POLR2D 3625 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 129131715 129132088 129131976 Y NA NA HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 57564 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 130201021 130201117 130201085 Y NA NA NA NA NA NA AC079776.4 494673 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 134193030 134193115 134193062 Y NCKAP5 NA NA NA NA NA NCKAP5 130919 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 134878887 134879265 134878997 Y NA MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 3333 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 135054765 135054954 135054860 Y MGAT5 NA NA NA NA NA MGAT5 179211 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 135426529 135426662 135426570 Y CCNT2,TMEM163 TMEM163 NA NA NA NA TMEM163 47908 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 136651588 136651672 136651630 Y NA MCM6 NA NA NA NA MCM6 19592 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 136783030 136783335 136783274 Y NA AC093391.2,DARS NA NA NA NA DARS 41360 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 137134367 137134774 137134473 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 260632 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 137755829 137756118 137755974 Y NA NA NA NA NA NA THSD7B 234714 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 139112246 139112514 139112380 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 144754 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 141775509 141775873 141775812 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 1111397 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 141813454 141813825 141813640 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 1073445 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 142222584 142223129 142223081 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 664141 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 142404808 142405288 142404942 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 481982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 142886868 142887183 142887052 Y LRP1B LRP1B NA NA NA NA LRP1B 87 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 145350126 145350524 145350325 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 261991 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 145457710 145457931 145457780 Y GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA GTDC1 369575 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 147189297 147189317 147189307 Y NA NA NA NA NA NA PABPC1P2 153695 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 148126586 148126890 148126739 Y NA NA NA NA NA NA AC009480.4 439025 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 148366263 148366285 148366274 Y NA NA NA NA NA NA AC009480.4 199630 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 148389868 148390030 148389960 Y ACVR2A NA NA NA NA NA AC009480.4 175885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 148399289 148399503 148399381 Y ACVR2A NA NA NA NA NA AC009480.4 166412 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 148446935 148447551 148447322 Y ACVR2A NA NA NA NA NA AC009480.4 118364 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 148671388 148671433 148671412 Y ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4 NA NA NA NA NA ACVR2A 71302 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 149017229 149017560 149017414 Y NA NA NA NA NA NA ORC4 240082 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr2 149645940 149646152 149646140 Y KIF5C KIF5C NA NA NA NA KIF5C 15121 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr2 150314581 150314916 150314749 Y NA NA NA NA NA NA AC144449.1 126794 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 153275296 153275683 153275311 Y FMNL2 NA NA NA NA NA FMNL2 85545 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 153347389 153347769 153347704 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 157638 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 154333342 154333495 154333419 Y RPRM RPRM NA NA NA NA RPRM 20 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 154335936 154336181 154336134 Y RPRM RPRM NA NA NA NA RPRM 2614 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr2 154442869 154442990 154442930 Y NA AC012501.2 NA NA NA NA AC012501.2 4811 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 154446220 154446391 154446306 Y NA AC012501.2 NA NA NA NA AC012501.2 1410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 156837562 156837650 156837606 Y NA NA NA NA NA NA NR4A2 359210 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 157287649 157287933 157287736 Y NR4A2,GPD2 GPD2 GPD2 K562 ChIA-PET 22265404 GPD2 1869 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 157659765 157659881 157659802 Y NA NA NA NA NA NA GPD2 369963 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr2 158325907 158326296 158326106 Y CYTIP NA NA NA NA NA ERMN 143682 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 158687871 158687996 158687910 Y ACVR1,ACVR1 ACVR1 NA NA NA NA ACVR1 42378 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 159994086 159994676 159994284 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 146634 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr2 160013990 160014170 160014100 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 127140 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 160219490 160219798 160219643 Y MARCH7,CD302 NA NA NA NA NA WDSUB1 78180 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 160411225 160411529 160411489 Y NA NA NA NA NA NA AC009506.1 58278 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 160470388 160470776 160470715 Y NA AC009506.1,BAZ2B NA NA NA NA BAZ2B 427 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 160646880 160647090 160646985 Y NA CD302 NA NA NA NA CD302 5663 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 161951172 161951432 161951220 Y NA TANK TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 TANK 39987 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 161979819 161979978 161979936 Y TANK,TANK TANK PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANK 11441 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 AC009299.3 NA NA NA NA AC009299.3 3839 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA GRB14 NA NA NA NA GRB14 45927 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 165777057 165777208 165777083 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 78868 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 166671246 166671486 166671366 Y CSRNP3 GALNT3 NA NA NA NA GALNT3 22054 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 166842018 166842187 166842119 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 33665 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 166946411 166946569 166946490 Y NA SCN1A NA NA NA NA SCN1A 35954 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 166982475 166982914 166982672 Y SCN1A,SCN1A NA NA NA NA NA SCN1A 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 166983519 166983786 166983732 Y NA SCN1A NA NA NA NA SCN1A 996 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 168977927 168978148 168978038 Y NA NA NA NA NA NA STK39 124503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 169347640 169347834 169347737 Y NA CERS6 NA NA NA NA CERS6 37268 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 169402356 169402715 169402396 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 91984 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 170856738 170857087 170856755 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 174770 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 171623254 171623407 171623331 Y NA AC007405.4,AC007405.6,GAD1 NA NA NA NA AC007405.4 1869 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 171977769 171978174 171977980 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 107650 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 172101085 172101413 172101325 Y NA TLK1 METTL8,TLK1 IMR90 Hi-C 24141950 TLK1 15261 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 172628972 172629294 172629196 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 87053 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 172792873 172793084 172792979 Y NA HAT1 NA NA NA NA HAT1 15915 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 172962291 172962684 172962615 Y NA DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 2944 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 174776201 174776462 174776332 Y NA NA NA NA NA NA SP3 51968 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 175085975 175086128 175086062 Y NA OLA1 NA NA NA NA OLA1 25298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 175248509 175248787 175248661 Y SP3,SP3 CIR1,SCRN3 NA NA NA NA CIR1 9656 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 175464337 175464570 175464451 Y CIR1,WIPF1 NA NA NA NA NA AC018890.6 54468 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 175519164 175519290 175519227 Y NA WIPF1 NA NA NA NA WIPF1 26354 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 175525795 175526184 175525990 Y NA WIPF1 NA NA NA NA WIPF1 19460 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 175529164 175529469 175529254 Y NA WIPF1 NA NA NA NA WIPF1 16175 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 175540530 175540594 175540562 Y CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1 WIPF1,H3F3AP4 NA NA NA NA WIPF1 5050 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 175753579 175753941 175753870 Y NA NA NA NA NA NA H3F3AP4 171074 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 177047108 177047317 177047213 Y NA AC009336.24,HOXD-AS1,AC016739.2 NA NA NA NA HOXD-AS1 4369 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 17167 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr2 180127574 180128171 180127755 Y NA SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 57 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 180579667 180579746 180579673 Y ZNF385B,ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 290094 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 180585338 180585678 180585637 Y ZNF385B,ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 284162 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 182741385 182741846 182741532 Y SSFA2 SSFA2 PPP1R1C IMR90 Hi-C 24141950 SSFA2 12714 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 183950583 183950613 183950599 Y NA NCKAP1,DUSP19,NUP35 NA NA NA NA DUSP19 9296 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 184619513 184619865 184619689 Y NA NA NA NA NA NA CACYBPP2 148666 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 186638782 186639016 186638929 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 709867 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 187263813 187264095 187263899 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 84788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 190014709 190015152 190014914 Y NA COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 27453 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 190212269 190212619 190212416 Y NA NA COL5A2,COL3A1,GULP1,MIR1245B IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 91540 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 190741113 190741271 190741187 Y NA C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 1064 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 191443312 191443866 191443668 Y NA TMEM194B TMEM194B MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM194B 45864 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 191930608 191930782 191930695 Y NAB1,STAT1,STAT4 STAT1 NA NA NA NA STAT1 46922 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 192123995 192124097 192124046 Y NA MYO1B NA NA NA NA MYO1B 16084 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 192170125 192170408 192170266 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 62214 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA AC098617.1 164033 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 192707967 192708344 192708338 Y NA AC098617.1,SDPR NA NA NA NA AC098617.1 921 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 192709927 192710444 192710339 Y SDPR AC098617.1 NA NA NA NA SDPR 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 192717272 192717408 192717316 Y NA AC098617.1,SDPR NA NA NA NA SDPR 7291 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 192775335 192775569 192775423 Y OBFC2A,SDPR NA NA NA NA NA SDPR 65354 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 192839658 192840009 192839864 Y TMEFF2 NA NA NA NA NA SDPR 129677 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 192870555 192870805 192870799 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 160574 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 192882025 192882303 192882164 Y TMEFF2 NA NA NA NA NA SDPR 172044 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 192915570 192915970 192915770 Y NA NA NA NA NA NA TMEFF2 142465 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr2 196617949 196618273 196617953 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 179248 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 197004793 197005261 197004933 Y NA STK17B NA NA NA NA STK17B 33966 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 197099483 197099689 197099603 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 60256 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 197818777 197818924 197818851 Y NA PGAP1 PGAP1,ANKRD44 IMR90 Hi-C 24141950 PGAP1 28257 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 198525365 198525756 198525561 Y NA MARS2 NA NA NA NA MARS2 42331 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 200850363 200850607 200850485 Y NA C2orf47,TYW5 SPATS2L,KCTD18 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TYW5 31904 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 200946029 200946235 200946132 Y NA NA SPATS2L,KCTD18,C2orf47,TYW5,SGOL2 IMR90 Hi-C 24141950 TYW5 127570 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 201270357 201270484 201270442 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SPATS2L 101753 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 201403171 201403461 201403317 Y NA SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 20664 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 201454959 201455229 201455094 Y NA NA NA NA NA NA KCTD18 72452 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 201922447 201922672 201922559 Y NA NDUFB3,FAM126B,AC007272.3 ORC2 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB3 11484 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 203026340 203026455 203026401 Y ALS2 PSMA2P3,DAZAP2P1 CDK15,ALS2,MPP4,FZD7,SUMO1,NOP58 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA2P3 15565 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 203292079 203292309 203292231 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 52420 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 203726604 203726681 203726643 Y FAM117B,CYP20A1,ABI2,ICA1L,ICA1L,ALS2CR8,ALS2CR8 KRT8P15,ICA1L NA NA NA NA ICA1L 8027 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 204798836 204799123 204798969 Y CD28,CTLA4,ICOS ICOS NA NA NA NA ICOS 348 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 204804910 204805470 204805072 Y CD28,CTLA4,ICOS ICOS NA NA NA NA ICOS 5439 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 204815782 204815888 204815822 Y CD28,CTLA4,ICOS ICOS NA NA NA NA ICOS 16311 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 204816181 204816619 204816422 Y CD28,ICOS ICOS NA NA NA NA ICOS 16710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 14.3008670161523 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 206439575 206439768 206439663 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 104946 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 206613471 206613845 206613585 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 68757 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 207076453 207076789 207076513 Y NA GPR1 NA NA NA NA GPR1 3982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr2 208472249 208472458 208472354 Y NA METTL21A NA NA NA NA METTL21A 16194 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 213402193 213402489 213402443 Y NA ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 628 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 215735917 215736192 215736055 Y NA NA NA NA NA NA BARD1 63489 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 216698635 216698894 216698754 Y NA NA NA NA NA NA MREG 197925 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 218279336 218279520 218279367 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP2 783785 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A NA NA NA NA NA IHH 149178 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 220385870 220386219 220385945 Y ACCN4 GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 20166 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 220553753 220554082 220553876 Y NA AC009502.1,AC009502.4 DES,SLC4A3 K562 5C 22955621 AC009502.4 5650 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 220557392 220557516 220557454 Y NA AC009502.1,AC009502.4 DES,SLC4A3 K562 5C 22955621 AC009502.4 9289 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr2 220695146 220695491 220695319 Y SLC4A3 NA NA NA NA NA AC009502.4 147043 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr2 220994864 220994875 220994870 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009502.4 446761 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 221000091 221000153 221000122 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009502.4 451988 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 221372972 221373224 221373091 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009502.4 824869 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 222312152 222312375 222312261 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 124547 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 222392667 222392822 222392760 Y EPHA4 EPHA4 NA NA NA NA EPHA4 44100 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 222435699 222436339 222436058 Y EPHA4 EPHA4 NA NA NA NA EPHA4 583 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 223439256 223439394 223439332 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 79662 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 223462160 223462364 223462326 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 56692 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 224428219 224428432 224428353 Y NA NA SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 272312 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 225621293 225621621 225621457 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 173183 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 226894785 226894963 226894843 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 767512 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 227781487 227781745 227781553 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 83190 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 229407284 229407450 229407381 Y NA NA NA NA NA NA PID1 726551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 229922941 229923063 229923002 Y NA NA NA NA NA NA PID1 210938 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 231534770 231534898 231534834 Y C2orf72 CAB39 CAB39 IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 40662 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 232026724 232026986 232026907 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 34274 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA NMUR1 75682 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA NMUR1 85186 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 85673 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 232551717 232552221 232552147 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17384 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 232840477 232840577 232840527 Y DIS3L2 DIS3L2 NA NA NA NA DIS3L2 16522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 233563344 233563704 233563468 Y NA GIGYF2 NA NA NA NA GIGYF2 3335 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 233703407 233703613 233703510 Y NEU2 C2orf82 NA NA NA NA C2orf82 16367 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 234330770 234331121 234330825 Y INPP5D,ATG16L1 NA USP40 IMR90 Hi-C 24141950 DGKD 69617 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 234357256 234357513 234357369 Y NA NA NA NA NA NA DGKD 96103 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 234608579 234609196 234608912 Y NA UGT1A6,UGT1A4 NA NA NA NA UGT1A6 10326 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr2 234615498 234615635 234615567 Y NA UGT1A6,UGT1A4 NA NA NA NA UGT1A4 9789 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 234630754 234630813 234630784 Y NA UGT1A6,UGT1A4 NA NA NA NA UGT1A4 5330 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 234670163 234670438 234670239 Y NA UGT1A4 NA NA NA NA UGT1A4 44739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 235353626 235353934 235353758 Y ARL4C AC097713.3,ARL4C NA NA NA NA AC097713.3 8654 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 235354817 235355457 235355266 Y ARL4C AC097713.3,ARL4C SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 AC097713.3 9845 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 235360536 235360912 235360678 Y NA AC097713.3,ARL4C TRPM8,ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 AC097713.3 15564 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 235732390 235732720 235732555 Y NA NA SH3BP4,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP4 125897 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 235862299 235862667 235862586 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 3682 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 235905010 235905389 235905297 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 46393 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 235959667 235960159 235959834 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 101050 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 236404372 236404974 236404689 Y AGAP1 AGAP1 NA NA NA NA AGAP1 3639 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 236514356 236514561 236514454 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 113623 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 236552972 236553189 236553098 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 152239 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 236886303 236886528 236886416 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 187562 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 236908752 236909098 236908877 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 164992 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 236910231 236910384 236910319 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 163706 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 237073092 237073409 237073337 Y NA AC079135.1,GBX2 NA NA NA NA AC079135.1 681 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 237088797 237088932 237088867 Y NA AC079135.1,GBX2 NA NA NA NA GBX2 13785 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 238018538 238018666 238018550 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 26078 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 73576 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 238391204 238391436 238391383 Y LRRFIP1,MLPH MLPH NA NA NA NA MLPH 635 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 239290977 239291159 239291031 Y NA ASB1 NA NA NA NA ASB1 42224 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 239772979 239773251 239773061 Y NA NA NA NA NA NA ASB1 439596 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 240080723 240081253 240081085 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 239877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 240144176 240144295 240144274 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 176835 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr2 240144687 240145031 240144830 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 176099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 240145548 240145836 240145702 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 175294 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 240147854 240148066 240148024 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 173064 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 240168373 240168774 240168689 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 152356 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr2 240173626 240173903 240173698 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 147227 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 240179337 240179507 240179411 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 141623 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 240186875 240187303 240186998 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 133827 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr2 240190277 240190476 240190405 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 130654 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.40167232332328 chr2 240195931 240196233 240196082 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 124897 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 240196255 240196671 240196554 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 124459 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 45.3042733717801 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 123794 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 6.00418080830821 chr2 240199614 240199929 240199643 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 121201 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.38417463741008 chr2 240200846 240201180 240201020 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 119950 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr2 240201720 240202445 240202126 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 118685 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 9.06085467435602 chr2 240207243 240207370 240207354 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 113760 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 240207977 240208290 240208163 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 112840 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr2 240210840 240211190 240211015 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 109940 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 240213505 240213689 240213606 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 107441 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 240248408 240248826 240248656 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 72304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 53464 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 241190569 241190767 241190645 Y NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV2 116345 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr2 241585712 241586190 241585819 Y DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2 NA NA NA NA NA CAPN10 61579 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr2 241719064 241719393 241719333 Y KIF1A KIF1A NA NA NA NA KIF1A 38332 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 247683 247718 247701 Y NA C20orf96,ZCCHC3 NA NA NA NA C20orf96 21672 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 483361 483443 483402 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 39022 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 519765 520062 519888 Y NA CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 2403 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 623135 623319 623297 Y NA TCF15,SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 8695 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 1124805 1124974 1124890 Y SCRT2,C20orf202,C20orf46 PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 32899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 1168274 1168908 1168417 Y NA NA NA NA NA NA PSMF1 76368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA NA FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 112837 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 1873360 1873375 1873370 Y NA NA NA NA NA NA STK35 206882 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 3159596 3159937 3159912 Y PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 20754 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 3170247 3170648 3170474 Y NA FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA DDRGK1 12683 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 5070783 5071219 5071039 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 34053 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr20 5741425 5741673 5741600 Y NA C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 12386 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 5816621 5816994 5816701 Y NA NA NA NA NA NA CHGB 73082 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 8380615 8380981 8380808 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 269791 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 8435134 8435511 8435284 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 324310 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 10477280 10477577 10477381 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 64410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 12250218 12250236 12250226 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 380847 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 13427146 13427424 13427285 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 190163 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 13434936 13435260 13435184 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 182327 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 13473886 13474103 13473974 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 143484 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr20 13734374 13734725 13734663 Y NA ESF1 NA NA NA NA ESF1 28807 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 15282242 15282264 15282251 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 965980 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 17787378 17787545 17787462 Y NA NA BANF2,C20orf72,SNX5,RRBP1,DSTN IMR90 Hi-C 24141950 RRBP1 126438 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 19638978 19639033 19639006 Y C20orf26 NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 97319 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 19716018 19716528 19716293 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 19824 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 19737104 19737460 19737269 Y NA RP1-122P22.2 SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 752 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr20 19917960 19918777 19918135 Y NA NA NA NA NA NA NAA20 76983 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 20391161 20391545 20391351 Y NA INSM1 NA NA NA NA INSM1 44396 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 20712652 20712995 20712853 Y NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 21521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 21576434 21576748 21576508 Y NA NA NA NA NA NA XRN2 294492 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 22452184 22452575 22452252 Y NA NA NA NA NA NA LINC00261 104705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 22555806 22556424 22556290 Y NA LINC00261,FOXA2 NA NA NA NA LINC00261 856 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 22558447 22558719 22558568 Y FOXA2,FOXA2 LINC00261,FOXA2 NA NA NA NA LINC00261 1167 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr20 25229395 25229593 25229494 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 2690 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 25302337 25302549 25302435 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 67070 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 25346430 25346740 25346585 Y ACSS1 ABHD12,GINS1 NA NA NA NA ABHD12 22879 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 25540985 25541222 25541104 Y NA NINL NA NA NA NA NINL 22931 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 30158598 30158945 30158767 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 32141 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr20 30175524 30175854 30175562 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 15232 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 30182515 30183026 30182914 Y NA ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 8060 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.72917309468555 chr20 30183712 30184220 30184085 Y ID1 ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 6866 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr20 30194967 30195344 30195216 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 3881 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 30292336 30292785 30292516 Y NA BCL2L1,TPX2 COX4I2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L1 17007 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 30793339 30793589 30793452 Y HCK,TM9SF4,PLAGL2 PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA PLAGL2 5 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 33055325 33055363 33055345 Y NA DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 46851 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 33900177 33900484 33900409 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 29389 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 33907745 33907913 33907842 Y MMP24,GDF5 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36957 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 33908268 33908438 33908376 Y NA EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 37480 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 35612420 35612442 35612434 Y RBL1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 34174 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 35874402 35874620 35874497 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 41421 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 40247725 40248017 40247738 Y NA CHD6 NA NA NA NA CHD6 2592 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 42847207 42847559 42847248 Y NA OSER1-AS1 NA NA NA NA OSER1-AS1 9607 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 43540233 43540373 43540312 Y DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L YWHAB,PABPC1L,TOMM34 NA NA NA NA PABPC1L 3530 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 43709360 43709760 43709560 Y NA NA NA NA NA NA STK4 116245 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 108787 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 45943818 45944172 45944095 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 35133 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 46419082 46419263 46419121 Y NA NA SULF2,PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 290481 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 47337131 47337315 47337224 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF2 199112 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 47544338 47544681 47544534 Y DDX27 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 7911 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 47547466 47547777 47547635 Y ZNFX1,ARFGEF2 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 11039 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 48316345 48316673 48316621 Y NA B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 11742 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 48388811 48389348 48388940 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 37902 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 48810888 48811172 48811109 Y B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB NA NA NA NA CEBPB 5512 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 49553399 49553600 49553500 Y NA RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 7441 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 200870 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 52195343 52195714 52195527 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 28732 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 52392953 52393088 52393021 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 168507 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 222373 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 55764763 55765005 55764884 Y NA NA NA NA NA NA BMP7 74680 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 55838908 55839396 55838948 Y NA BMP7 NA NA NA NA BMP7 289 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 56705842 56706001 56705847 Y NA NA ZBP1,PCK1,CTCFL,C20orf85 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R1L 176494 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.9650046281736 chr20 57585788 57586041 57585915 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5486 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 57752920 57753075 57753012 Y TUBB1,ZNF831 NA ZNF831,GNAS,SLMO2-ATP5E IMR90 Hi-C 24141950 EDN3 120407 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 58436515 58436843 58436553 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 69867 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 54923 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr20 58583578 58583859 58583737 Y C20orf197,PPP1R3D NA NA NA NA NA PPP1R3D 70226 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 60256764 60257074 60256889 Y CDH4 NA NA NA NA NA TAF4 381792 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 60803093 60803442 60803179 Y NA OSBPL2 NA NA NA NA OSBPL2 8138 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 60972798 60973035 60972874 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 7306 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr20 61555881 61556606 61556058 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 10698 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.85583770438617 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr21 11118249 11118623 11118434 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1151664 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 15449757 15449894 15449826 Y NA NA NA NA NA NA AP001347.6 52015 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 16288603 16288806 16288642 Y NA NA NRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRIP1 146515 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 16354668 16355055 16354876 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 80266 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 16431175 16431558 16431528 Y NA NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 3763 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr21 16662871 16663259 16663022 Y NA NA SAMSN1,NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 227550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 16815878 16816236 16816057 Y NA NA SAMSN1,LOC388813 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 284108 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 17276028 17276063 17276046 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 164779 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr21 17790629 17790733 17790681 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 135540 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 251820 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 305578 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 18984370 18984546 18984496 Y NA BTG3 NA NA NA NA BTG3 1105 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr21 26952450 26952820 26952600 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25009 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 26956680 26957339 26957242 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 20490 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 27275894 27276232 27276045 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 169910 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr21 27855729 27855767 27855735 Y CYYR1 NA NA NA NA NA AP001597.1 91775 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 28018634 28018812 28018723 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS1 196916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 29765694 29766009 29765812 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT1 489684 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 6.55001542724532 chr21 30751100 30751464 30751308 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 186708 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 30798600 30798748 30798608 Y C21orf7,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 234208 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 33042550 33042842 33042696 Y NA SOD1 NA NA NA NA SOD1 12615 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 33247157 33247609 33247328 Y NA HUNK NA NA NA NA HUNK 3529 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr21 35319562 35320491 35320153 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 33278 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 35508184 35508396 35508291 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 64314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 35959381 35959645 35959576 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 515511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 700101 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr21 36167928 36168243 36168166 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 724058 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 764517 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 770917 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr21 36219873 36220239 36220187 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 776003 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36220749 36221095 36220890 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 776879 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36223731 36223900 36223856 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 779861 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 789346 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 810334 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36257911 36258724 36258067 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 814041 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36326686 36327019 36326981 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 882816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr21 36336896 36337096 36337005 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 893026 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr21 36339843 36340239 36340159 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 895973 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.18333847574844 chr21 36342558 36342757 36342568 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 898688 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36349860 36350141 36349984 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 905990 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36355491 36355634 36355586 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 911621 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36356108 36356416 36356285 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 912238 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36379576 36379916 36379746 Y RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 935706 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36418469 36418852 36418527 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RUNX1 956113 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36419290 36419780 36419662 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RUNX1 955185 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 36599466 36599950 36599803 Y NA NA RUNX1 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 775015 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr21 38062761 38063015 38062888 Y NA SIM2 CLDN14,HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 6418 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 38072912 38073314 38073050 Y SIM2 SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 3479 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr21 38151764 38151954 38151859 Y NA NA NA NA NA NA SIM2 82331 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 38294804 38294853 38294850 Y NA AP000704.5 NA NA NA NA AP000704.5 41959 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.18333847574844 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 39291581 39291864 39291721 Y NA NA NA NA NA NA DYRK1A 555489 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 40690087 40690386 40690238 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 1099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 41729839 41730224 41730032 Y NA NA NA NA NA NA DSCAM 486841 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 42212691 42212879 42212820 Y DSCAM DSCAM NA NA NA NA DSCAM 4186 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 42213096 42213280 42213166 Y DSCAM DSCAM NA NA NA NA DSCAM 3785 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr21 42543184 42543509 42543444 Y BACE2 MIR3197,BACE2,PLAC4 NA NA NA NA BACE2 5456 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr21 42598872 42599018 42598944 Y NA PLAC4 NA NA NA NA PLAC4 42157 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 42610946 42611279 42611113 Y BACE2 NA NA NA NA NA PLAC4 54231 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 43758079 43758185 43758132 Y NA TFF3 NA NA NA NA TFF3 24318 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 43881255 43881524 43881384 Y NA SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA SLC37A1 32594 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr21 43944597 43944892 43944856 Y NA SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA RSPH1 30133 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr21 44832284 44832425 44832365 Y SIK1 SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 12583 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 44930607 44930875 44930782 Y PDXK,SIK1 NA NA NA NA NA LINC00319 66126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 44936784 44937143 44936907 Y PDXK NA NA NA NA NA LINC00319 72303 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr21 45563949 45564214 45564057 Y TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 12462 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 45574660 45575436 45575042 Y NA PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 23173 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 45890728 45891129 45890927 Y NA LRRC3 NA NA NA NA LRRC3 17359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 TSPEAR NA NA NA NA TSPEAR 31919 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 46495480 46495526 46495490 Y KRTAP10-12,ADARB1 ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 3712 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 46501791 46502122 46501857 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 10023 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 46823895 46824295 46824014 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1,AL133493.2 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL133493.2 863 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 47010868 47011351 47011033 Y NA SLC19A1,AL133493.2 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL133493.2 217 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr21 47651317 47651563 47651562 Y NA LSS,MCM3AP-AS1 NA NA NA NA MCM3AP-AS1 4186 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 18349077 18349481 18349311 Y SLC25A18,TUBA8,MICAL3 NA NA NA NA NA BID 93541 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 18916909 18917370 18917163 Y MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH DGCR6,PRODH,DGCR5 NA NA NA NA PRODH 4696 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr22 19331396 19331535 19331466 Y NA NA NA NA NA NA CLTCL1 54157 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 19378121 19378382 19378253 Y NA MRPL40 NA NA NA NA MRPL40 39043 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 19941739 19941814 19941777 Y NA COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 14398 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr22 20142939 20143182 20143142 Y NA RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA ZDHHC8 27960 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 20287043 20287283 20287165 Y NA XXbac-B444P24.10,DGCR6L NA NA NA NA XXbac-B444P24.10 1760 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 21273214 21273312 21273263 Y NA CRKL NA NA NA NA CRKL 3500 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 22010846 22011267 22010978 Y YPEL1 YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 6287 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr22 22478098 22478432 22478244 Y CCDC116,YPEL1,ZNF280B NA NA NA NA NA TOP3B 142885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 24234499 24234593 24234547 Y NA SLC2A11,MIF NA NA NA NA MIF 308 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr22 24796747 24798216 24797446 Y GGT1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 131881 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 26462921 26463001 26462961 Y NA NA MYO18B,SEZ6L IMR90 Hi-C 24141950 ASPHD2 360238 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 MIAT,CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 MIAT 689 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr22 27043800 27044733 27044318 Y SEZ6L MIAT,CTA-211A9.5 NA NA NA NA MIAT 3408 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr22 27054967 27055259 27055032 Y SEZ6L,ASPHD2 MIAT,CTA-211A9.5 NA NA NA NA CTA-211A9.5 11471 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr22 28065247 28065726 28065530 Y PITPNB,MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC28-AS1 247638 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 28122669 28123242 28122949 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA TTC28-AS1 190122 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr22 28797071 28797274 28797258 Y PITPNB,XBP1,CCDC117 NA NA NA NA NA HSCB 338745 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 28956104 28956479 28956470 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 179540 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 29319930 29320200 29320120 Y NA ZNRF3 NA NA NA NA ZNRF3 42350 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr22 29365910 29365950 29365937 Y NA NA NA NA NA NA ZNRF3 88330 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 29467563 29467858 29467701 Y NA KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 497 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr22 29469912 29470391 29470070 Y XBP1,KREMEN1 KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 2846 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr22 29471077 29471334 29471238 Y KREMEN1 KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 4011 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr22 35528321 35528338 35528332 Y NA NA LARGE IMR90 Hi-C 24141950 CTA-714B7.5 96711 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 36172767 36172943 36172931 Y MB,MB,RBFOX2,RBFOX2 NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 RBFOX2 249530 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 36448788 36448904 36448856 Y NA RBFOX2 RBFOX2 IMR90 Hi-C 24141950 RBFOX2 26315 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 24084 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 36855477 36855678 36855599 Y NA TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 20399 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 37997690 37997947 37997695 Y GGA1,GGA1 CDC42EP1,GGA1,SH3BP1 CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GGA1 4534 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 38458818 38459072 38458999 Y SOX10,PLA2G6,PLA2G6,PICK1,SLC16A8 PICK1 NA NA NA NA PICK1 8500 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 38568765 38569142 38568994 Y PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA MAFF 26747 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 38750839 38750902 38750852 Y NA CSNK1E NA NA NA NA CSNK1E 41625 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 39513543 39514109 39513822 Y NA APOBEC3H,CBX7 NA NA NA NA APOBEC3H 22314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 39635664 39635940 39635710 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 2816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 39637977 39638270 39638005 Y MGAT3,MGAT3,SUN2,SUN2,NPTXR,CBX7,SYNGR1,PDGFB PDGFB NA NA NA NA PDGFB 486 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 39693596 39693744 39693670 Y MGAT3 RPL3 NA NA NA NA RPL3 20650 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 39704707 39705214 39704970 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 9180 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 39705997 39706111 39706064 Y NA RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 8283 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 40273568 40273773 40273673 Y NA UQCRFS1P1 NA NA NA NA UQCRFS1P1 4275 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 40451411 40451463 40451437 Y NA TNRC6B,RPL7P52 NA NA NA NA TNRC6B 12590 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 40575185 40575584 40575306 Y TNRC6B,TNRC6B NA NA NA NA NA RPL7P52 74115 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 40589903 40590338 40589971 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 88833 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 41105876 41106003 41105936 Y EP300 GAPDHP37 MKL1,MCHR1,SLC25A17,ST13,XPNPEP3,DNAJB7 IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP37 37421 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 41128851 41129054 41128911 Y NA NA XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17 IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP37 60396 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr22 41839332 41839605 41839469 Y TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 1422 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 42345357 42345934 42345409 Y NA SHISA8,TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 TNFRSF13C K562 ChIA-PET 22265404 CENPM 4189 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 43551882 43552085 43551987 Y ARFGAP3,PACSIN2 BIK,MCAT,TSPO,TTLL12 NA NA NA NA TSPO 6362 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 44218722 44218869 44218865 Y NA EFCAB6,SULT4A1 NA NA NA NA EFCAB6 12505 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 45106642 45106985 45106689 Y NA PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 NA NA NA NA ARHGAP8 10287 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr22 45254258 45254434 45254345 Y PHF21B NA NA NA NA NA ARHGAP8 157903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3849 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 46462776 46462894 46462836 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 46495432 46495673 46495573 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,PPARA NA NA NA NA MIR4763 11773 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 46771050 46771392 46771204 Y NA TRMU NA NA NA NA TRMU 46278 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 47525665 47525872 47525801 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 369147 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr22 48146543 48146838 48146641 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 121120 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 48475770 48476014 48475872 Y NA NA TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 450347 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 49546517 49546852 49546699 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 502338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr22 50554222 50554639 50554443 Y NA NA NA NA NA NA PANX2 52521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 50608010 50608409 50608105 Y MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA PANX2 850 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 50625511 50626004 50625814 Y BRD1,ZBED4,PIM3,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TUBGCP6,SELO,HDAC10 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA TRABD 3167 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr22 50784754 50785397 50785059 Y PPP6R2 PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PPP6R2 5021 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr22 51051274 51051666 51051314 Y NA CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA NA NA NA NA ARSA 12941 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 253885 254142 254014 Y NA CHL1 NA NA NA NA CHL1 17606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 3177157 3177268 3177188 Y CRBN TRNT1,CRBN NA NA NA NA TRNT1 10557 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 3202241 3202572 3202332 Y NA TRNT1,CRBN NA NA NA NA CRBN 16822 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 3532969 3532987 3532979 Y NA NA NA NA NA NA CRBN 313575 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 3639816 3640081 3639965 Y NA NA NA NA NA NA CRBN 420422 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA NA NA NA NA NA SETMAR 488335 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 4392615 4392774 4392664 Y ITPR1 SETMAR NA NA NA NA SETMAR 49627 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 4782990 4783362 4783182 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B EGOT NA NA NA NA EGOT 7912 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 4871506 4871670 4871602 Y ITPR1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA EGOT 80232 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 4876052 4876387 4876225 Y EDEM1,BHLHE40 NA NA NA NA NA EGOT 84778 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 5470535 5470892 5470804 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 243204 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 6513553 6513934 6513726 Y NA NA NA NA NA NA GRM7 295754 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 6573697 6574039 6573711 Y NA NA NA NA NA NA GRM7 235649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 8398896 8399319 8399110 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 604138 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 8533422 8533759 8533554 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 469698 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 8978841 8979048 8978945 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 24409 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 9452001 9452408 9452073 Y MTMR14,SETD5 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5-AS1 13738 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 9721492 9721576 9721535 Y IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC MTMR14,BRPF1 NA NA NA NA MTMR14 32375 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 9995528 9995903 9995716 Y NA IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1,PRRT3,EMC3-AS1 NA NA NA NA PRRT3 3450 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 11316376 11316801 11316733 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 4381 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 11581408 11581480 11581447 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 178740 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 11645125 11645451 11645297 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 114769 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 11812040 11812191 11812115 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 51820 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 12131259 12131529 12131269 Y NA NA NA NA NA NA SYN2 87383 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 12917586 12917878 12917745 Y NA RPL32 IQSEC1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL32 36499 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 15060728 15061023 15060876 Y NR2C2 MRPS25 NA NA NA NA MRPS25 43819 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 15443040 15443420 15443273 Y ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 23442 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 15704167 15704382 15704274 Y ANKRD28,CAPN7 NA NA NA NA NA HACL1 62829 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 15847096 15847637 15847448 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 51641 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 17248138 17248312 17248225 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 405979 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA KCNH8 NA NA NA NA KCNH8 423 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr3 19379484 19379512 19379499 Y KCNH8 NA NA NA NA NA KCNH8 191538 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 19399413 19399531 19399472 Y NA NA NA NA NA NA KCNH8 211467 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 19470380 19470682 19470561 Y NA NA NA NA NA NA KCNH8 282434 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 20200050 20200329 20200065 Y NA SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 25455 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 23431263 23431479 23431424 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 188752 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 26688087 26688474 26688152 Y LRRC3B NA NA NA NA NA SLC4A7 835437 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 87236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr3 28050894 28051260 28051082 Y EOMES,CMC1 NA NA NA NA NA CMC1 229815 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 28078428 28078736 28078583 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA CMC1 202339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 31149741 31150063 31149903 Y NA NA NA NA NA NA STT3B 422067 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 32557705 32558097 32557882 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 14805 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 33063733 33064078 33063817 Y NA SEC13P1 NA NA NA NA SEC13P1 9277 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 33436260 33436332 33436276 Y CLASP2,FBXL2,FBXL2 UBP1 NA NA NA NA UBP1 44531 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 37304089 37304216 37304152 Y GOLGA4 GOLGA4,AC097359.1 NA NA NA NA AC097359.1 20403 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 37344922 37345358 37345096 Y NA NA NA NA NA NA AC097359.1 61236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 37904355 37904605 37904570 Y NA AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 2904 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 38497232 38497482 38497354 Y NA ACVR2B,EXOG NA NA NA NA ACVR2B 3890 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 40491258 40491489 40491375 Y NA ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619 NA NA NA NA ENTPD3-AS1 1331 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 42067110 42067525 42067205 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 13816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 42518371 42518582 42518469 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 9239 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 43427917 43428246 43428244 Y NA NA NA NA NA NA RP11-353H3.1 97126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA RP11-353H3.1 87790 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 44036592 44036799 44036686 Y NA NA NA NA NA NA ANO10 305506 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.03917618013461 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 44654573 44654874 44654724 Y ZNF445,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 30193 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 45138887 45139080 45139004 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 46834 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 45681547 45681721 45681608 Y LIMD1 SACM1L NA NA NA NA SACM1L 46827 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 46036343 46036779 46036493 Y CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1 FYCO1 NA NA NA NA FYCO1 1027 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 46152557 46153082 46152773 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1 NA CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 117241 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 47466111 47466297 47466204 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 45610 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA SMARCC1 116343 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 48469321 48469953 48469633 Y NA CCDC51,ATRIP,TREX1 NA NA NA NA PLXNB1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 50354393 50354598 50354449 Y MST1R IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA HYAL2 3739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 51506153 51506528 51506417 Y VPRBP,RAD54L2,GPR62 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 25482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 52073968 52074235 52074157 Y GPR62 RPL29,DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 14331 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 53024364 53024471 53024418 Y NA NA NA NA NA NA SFMBT1 54295 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 53136597 53136930 53136874 Y PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD RFT1 NA NA NA NA RFT1 25548 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr3 53362706 53362961 53362819 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 16693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 54477784 54478003 54477891 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 180239 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr3 54675181 54675533 54675345 Y NA RPS15P5 NA NA NA NA RPS15P5 16939 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 54734224 54734587 54734407 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 75982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 54851764 54851786 54851775 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 193522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 54856337 54856720 54856396 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 198095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 55224453 55224624 55224517 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 297349 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 55511418 55511654 55511489 Y WNT5A WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 10319 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr3 55516458 55517187 55517061 Y NA WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 4786 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 4320 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 55518078 55518594 55518516 Y WNT5A WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 3379 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.62000617089813 chr3 55650041 55650551 55650186 Y NA NA WNT5A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-875H7.5 112752 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 55659848 55660431 55660092 Y NA NA WNT5A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-875H7.5 122559 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 56769464 56769764 56769614 Y CCDC66 NA NA NA NA NA FAM208A 54199 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 57164609 57165207 57164899 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA RP11-157F20.1 963 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr3 57194526 57194869 57194698 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA IL17RD 7465 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 57197470 57197866 57197668 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA IL17RD 4468 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 57818713 57819025 57818868 Y NA NA NA NA NA NA SLMAP 79536 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 58321418 58321818 58321477 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 4811 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 58336517 58336871 58336595 Y PXK RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 19910 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 59318495 59318699 59318681 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 284685 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 59321300 59321572 59321528 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 287490 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 59803830 59804011 59803964 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 770020 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 60695765 60695821 60695814 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 539312 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 61728117 61728514 61728321 Y NA RPL10AP6 NA NA NA NA RPL10AP6 1337 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 61828479 61828865 61828501 Y PTPRG NA NA NA NA NA RPL10AP6 101699 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 62214246 62214436 62214339 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 88212 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 62422700 62423042 62422978 Y C3orf14,FEZF2,CADPS NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 69695 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 63341056 63341329 63341193 Y NA NA NA NA NA NA CADPS 482002 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 64200446 64200649 64200513 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 192788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 65690412 65690419 65690417 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 332090 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 66295672 66296073 66295873 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A26 178387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 66507485 66507541 66507513 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 42146 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 66546176 66546348 66546214 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 3339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 66547159 66547390 66547275 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 2297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 66549724 66550124 66549864 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 37 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 69345659 69345717 69345688 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 213564 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 71031841 71032211 71032107 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 598929 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 71080443 71080735 71080627 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 550405 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 71099698 71099964 71099817 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 531176 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 71149356 71149810 71149695 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 481330 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 71150221 71150629 71150383 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 480511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 71350482 71350829 71350491 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 280311 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 71465988 71466289 71466193 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 164851 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr3 71478043 71478236 71478134 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 152904 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 79013956 79013976 79013966 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 800989 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 86842931 86843272 86843115 Y VGLL3 NA VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 VGLL3 194997 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 86972169 86972375 86972272 Y VGLL3 NA NA NA NA NA VGLL3 65894 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 38969 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 87038252 87038431 87038423 Y NA NA NA NA NA NA VGLL3 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 87038753 87038992 87038799 Y VGLL3 VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 484 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 88151728 88152092 88151734 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA C3orf38 44801 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 95126685 95126804 95126745 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD2P1 273233 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 95710737 95710941 95710839 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD2P1 310700 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr3 97509307 97509490 97509360 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27942 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 99356024 99356457 99356227 Y NA COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 99377938 99378211 99378054 Y COL8A1 COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 22619 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 223910 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 99587238 99587483 99587373 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 231919 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 99620045 99620512 99620235 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 210845 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 99749892 99750279 99749982 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 81078 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 99751196 99751332 99751292 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 80025 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 99768992 99769102 99769071 Y C3orf26 NA NA NA NA NA FILIP1L 62255 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 100054250 100054545 100054496 Y NA NIT2 NA NA NA NA NIT2 2705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr3 100088429 100088702 100088566 Y NA NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA LNP1 29335 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 100482455 100482783 100482461 Y NA NA NA NA NA NA TFG 56250 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 101046086 101046265 101046174 Y ZBTB11,SENP7,CEP97 NA NA NA NA NA SENP7 183820 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 101146332 101146443 101146386 Y NA NA NA NA NA NA SENP7 83642 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 104241726 104241855 104241791 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 841898 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 105088270 105088514 105088471 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4517 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 107348544 107348833 107348648 Y NA NA NA NA NA NA BBX 108761 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 107504411 107504731 107504449 Y NA NA NA NA NA NA BBX 264628 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 107803224 107803878 107803522 Y NA CD47 NA NA NA NA CD47 3994 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 110549558 110549723 110549642 Y NA NA NA NA NA NA PVRL3 237195 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 111329542 111329937 111329641 Y NA NA NA NA NA NA PLCXD2 61586 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 111589313 111589732 111589431 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 106125 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 111723588 111723714 111723651 Y SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3 ABHD10,TAGLN3 NA NA NA NA TAGLN3 8077 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 111943889 111944218 111944054 Y NA NA NA NA NA NA CD200 104976 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 112436805 112436974 112436889 Y NA NA CD200R1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 70428 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 112465605 112465931 112465711 Y CCDC80,CD200R1 NA CD200R1,CCDC80,CD200R1L,GTPBP8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 99228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 112531892 112532184 112532038 Y NA NA NA NA NA NA CCDC80 165515 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 112543206 112543267 112543237 Y C3orf17 NA NA NA NA NA GTPBP8 164498 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 112813368 112813729 112813549 Y NA NA BOC,KIAA2018,WDR52 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf17 76660 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 113416036 113416177 113416128 Y SIDT1 KIAA2018,NAA50,ATP6V1A,RP11-271C24.2 NA NA NA NA KIAA2018 2543 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 113470106 113470294 113470144 Y QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A NAA50,ATP6V1A,RP11-271C24.2 NA NA NA NA RP11-271C24.2 5851 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 114103176 114103363 114103329 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 329716 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 114144881 114145214 114145066 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 371421 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 114374818 114375057 114374945 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 489061 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 115502758 115503253 115502970 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 638640 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 115503837 115504240 115504182 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639719 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 115545713 115545826 115545800 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 681595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 115548074 115548457 115548266 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 683956 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 115556507 115556695 115556650 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 692389 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 115558428 115558819 115558693 Y GAP43 NA NA NA NA NA ZBTB20 694310 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 115696572 115696769 115696673 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 832454 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr3 115724212 115724599 115724432 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 860094 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 115771171 115771507 115771363 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 907053 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 115790074 115790198 115790193 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 925956 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr3 115831620 115831831 115831726 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 911714 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 115863058 115863426 115863241 Y LSAMP NA NA NA NA NA PTMAP8 880119 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 115918215 115918449 115918332 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 825096 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr3 115939995 115940280 115940138 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 803265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 115941110 115941531 115941311 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 802014 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 115992297 115992662 115992480 Y LSAMP NA NA NA NA NA PTMAP8 750883 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr3 116061509 116061660 116061570 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 681885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 116064864 116065195 116065030 Y LSAMP NA NA NA NA NA PTMAP8 678350 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 117482430 117482643 117482537 Y NA NA NA NA NA NA LSAMP 231452 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 119436291 119436418 119436355 Y C3orf15,NR1I2 COX17 NA NA NA NA COX17 41990 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 119758013 119758347 119758179 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 52917 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 119866352 119866515 119866428 Y NA NA NA NA NA NA RP11-18H7.1 54610 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 120463141 120463503 120463258 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 3301 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 120857899 120858271 120857953 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5L 232980 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 121450275 121450346 121450335 Y NA GOLGB1 NA NA NA NA GOLGB1 16256 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 122379671 122379962 122379841 Y NA EIF4BP8,PARP14 NA NA NA NA EIF4BP8 2211 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 122988091 122988383 122988237 Y NA NA NA NA NA NA SEC22A 69317 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 123241172 123241525 123241376 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 60507 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 123824591 123825032 123824690 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 146027 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr3 126108107 126108472 126108304 Y NA KLF15 KLF15,CCDC37,ALDH1L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF15 33822 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 281870 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 127244302 127244595 127244437 Y NA NA UROC1,CHST13,NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 70471 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 128327283 128327483 128327387 Y GATA2,GATA2,GATA2 NA NA NA NA NA RPN1 70435 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 128338287 128338590 128338558 Y RAB7A NA NA NA NA NA RPN1 59328 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr3 128564550 128565114 128564776 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 31325 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA KIAA1257 NA NA NA NA KIAA1257 26306 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr3 129167159 129167354 129167260 Y NA MBD4,IFT122 NA NA NA NA IFT122 10191 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 130637982 130638444 130638066 Y NA NA NA NA NA NA ATP2C1 70543 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 132138974 132139193 132139084 Y NA DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 4604 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 133646484 133646682 133646583 Y NA RAB6B NA NA NA NA RAB6B 33804 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 134069780 134070244 134070081 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 3159 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 135897983 135898047 135898015 Y NA MSL2 NA NA NA NA MSL2 16036 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 136466232 136466235 136466234 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 2985 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 136631651 136631818 136631718 Y NA IL20RB NA NA NA NA IL20RB 31254 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 137768870 137769254 137769106 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 63406 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 139253953 139254145 139254018 Y NA RBP1 NA NA NA NA RBP1 2526 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr3 139344390 139344678 139344552 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT3 50181 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 139715933 139715982 139715958 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 63906 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 270282 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 140005716 140005856 140005800 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 353689 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 140186013 140186197 140186105 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A36 472475 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 141217752 141218175 141217834 Y ATP1B3,RASA2 RASA2 NA NA NA NA RASA2 13863 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 141693372 141693614 141693574 Y TFDP2,TFDP2 NA NA NA NA NA RP11-343B5.1 67426 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 142225702 142226031 142225867 Y NA NA NA NA NA NA XRN1 60798 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 144785670 144785716 144785693 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 754810 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 145416082 145416315 145416265 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 124211 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 149666531 149666918 149666689 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 17254 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 15530 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 149967725 149967887 149967784 Y NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2,EIF2A,SERP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 156235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 150453151 150453509 150453478 Y CLRN1 RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 24215 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 150990274 150990572 150990423 Y NA GPR87 NA NA NA NA GPR87 42168 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 151065337 151065743 151065553 Y CLRN1,P2RY14,GPR87,P2RY13,P2RY12 GPR87 NA NA NA NA GPR87 32597 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 152091128 152091426 152091240 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 105784 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 156403084 156403595 156403347 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 12917 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 156444390 156444661 156444493 Y NA NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 54223 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 156453441 156453522 156453482 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 63274 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 156527707 156527883 156527795 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 1186 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 156529352 156529637 156529452 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 2831 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 156852547 156853124 156852850 Y NA CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 23425 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 159175843 159176214 159175971 Y NA NA NA NA NA NA MFSD1 727856 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 159983948 159984179 159984064 Y NA C3orf80 NA NA NA NA C3orf80 42525 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 160627332 160627671 160627502 Y NA NA NA NA NA NA PPM1L 155942 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 160735129 160735256 160735193 Y NA NA NA NA NA NA NMD3 85228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 167659472 167659590 167659531 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 152173 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 167699117 167699438 167699278 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 112325 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 167769401 167769602 167769443 Y NA GOLIM4 NA NA NA NA GOLIM4 42161 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 169502698 169502873 169502785 Y GPR160,MYNN,LRRC34 TERC,MYNN NA NA NA NA MYNN 14079 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 169872442 169872609 169872497 Y NA PHC3 NA NA NA NA PHC3 24928 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 170137645 170137870 170137713 Y SLC7A14,CLDN11,CLDN11 CLDN11 NA NA NA NA CLDN11 2992 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.27500771362266 chr3 170138195 170138413 170138223 Y NA CLDN11 NA NA NA NA CLDN11 3542 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 170883066 170883220 170883212 Y TNIK NA NA NA NA NA EIF5A2 258584 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 170957638 170957941 170957717 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 218256 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.4758438752843 chr3 171002565 171002750 171002646 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 173447 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 171074101 171074325 171074213 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 101872 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 171175851 171176236 171176082 Y TNIK NA NA NA NA NA TNIK 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.85583770438617 chr3 171176900 171177208 171176991 Y TNIK TNIK NA NA NA NA TNIK 703 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr3 171522372 171522650 171522540 Y TNIK,PLD1 PLD1 NA NA NA NA PLD1 4090 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 171611345 171611619 171611482 Y NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 PLD1 84605 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 171816708 171816982 171816800 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 61290 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 171878014 171878468 171878150 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 122596 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 171948409 171948713 171948561 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 192991 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 172264557 172265002 172264759 Y NA TNFSF10 TNFSF10,NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 25260 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 176774167 176774584 176774367 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 138677 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 176776147 176776153 176776150 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 137108 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 177168818 177169119 177168967 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 255557 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 177383116 177383499 177383118 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 469855 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr3 177434552 177434810 177434802 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 521291 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 178236932 178237225 178237103 Y KCNMB2,KCNMB2 NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 550842 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 178423779 178424120 178423952 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 363947 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 178432864 178433172 178432931 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 354895 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 178435674 178435882 178435779 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 352185 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 178532692 178532946 178532777 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 255121 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 179687230 179687579 179687379 Y PEX5L NA NA NA NA NA USP13 318687 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 181437056 181437346 181437302 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 9342 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 181438058 181438556 181438099 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 10344 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 181440813 181441146 181440897 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 13099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 181442269 181442851 181442522 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 14555 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 16690 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 9.38835544571829 chr3 182642205 182642465 182642335 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D1 59276 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 182980917 182981737 182981029 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 11885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 183010054 183010455 183010255 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 41022 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 183244954 183245294 183245134 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA MCF2L2 100388 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 184504548 184504615 184504585 Y NA VPS8 VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD IMR90 Hi-C 24141950 VPS8 23316 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr3 186901070 186901277 186901226 Y NA RPL39L LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39L 4374 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 187459288 187459644 187459469 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 1871 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 187980692 187981197 187980748 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 110847 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 188953015 188953026 188953020 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 289587 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 189022377 189022942 189022424 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 358949 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr3 190956161 190956506 190956333 Y NA NA NA NA NA NA CCDC50 88360 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 191873125 191873377 191873252 Y NA NA NA NA NA NA FGF12 610176 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 192605604 192605670 192605648 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 28280 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 193546369 193546601 193546485 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OPA1 237436 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 194341751 194341921 194341813 Y NA TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44,LSG1 NA NA NA NA AC046143.3 9731 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 194360985 194361172 194361065 Y NA AC046143.3,TMEM44,LSG1,FAM43A NA NA NA NA TMEM44 8567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 194423323 194423392 194423358 Y NA LSG1,FAM43A,AC106706.1 NA NA NA NA AC106706.1 885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 194824432 194824598 194824501 Y PPP1R2 NA NA NA NA NA XXYLT1 165298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 194826238 194826399 194826316 Y FAM43A NA NA NA NA NA XXYLT1 163497 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 194875742 194876159 194875826 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 113737 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 90614 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 195034615 195034891 195034753 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 44719 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 195171713 195171904 195171805 Y ACAP2,PPP1R2 ACAP2 ACAP2,LSG1,PPP1R2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ACAP2 9906 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 195430866 195431240 195430948 Y NA NA NA NA NA NA MUC4 105908 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 195946520 195946837 195946671 Y LRRC33,PCYT1A NA NA NA NA NA PCYT1A 65991 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 196290932 196291284 196291114 Y NA FBXO45,WDR53 NA NA NA NA FBXO45 2198 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr3 196758283 196758681 196758467 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 3596 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr3 197035558 197035706 197035585 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 11387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 43553 43799 43797 Y ZNF141 ZNF595 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF595 7380 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 48171 48447 48418 Y ZNF141 ZNF595 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF595 2732 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 49782 50031 49981 Y NA ZNF595 NA NA NA NA ZNF595 1148 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 50610 50903 50681 Y NA ZNF595 NA NA NA NA ZNF595 276 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr4 867282 867339 867287 Y NA CPLX1 NA NA NA NA CPLX1 49296 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 1339592 1340250 1339850 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57953 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 1970462 1970680 1970571 Y NA SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 3683 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 2174695 2175024 2174860 Y NA NA NAT8L,C4orf48 IMR90 Hi-C 24141950 POLN 66824 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 2185494 2185628 2185619 Y NA NA NA NA NA NA POLN 56220 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 2403922 2404158 2403968 Y ZFYVE28 ZFYVE28 NA NA NA NA ZFYVE28 14232 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 2762487 2762593 2762537 Y SH3BP2 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 6384 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 3203733 3204143 3203890 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT NA NA NA NA NA RGS12 88612 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 3438789 3438989 3438900 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 93297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 3484611 3485071 3484896 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 47215 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 3488499 3488826 3488767 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 43460 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 3829290 3829379 3829335 Y LYAR,LYAR,ADRA2C NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 ADRA2C 63215 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 3829713 3829948 3829819 Y ADRA2C NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 ADRA2C 63638 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 3836768 3837443 3837153 Y NA NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 ADRA2C 70693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 8.9516877505686 chr4 3872963 3873310 3873200 Y NA NA LOC100133461,FAM86EP,FLJ35424,ADRA2C IMR90 Hi-C 24141950 FAM86EP 81836 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA PPP2R2C,MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 S100P,MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr4 6940825 6940952 6940860 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 31856 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 6974782 6974959 6974886 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D14 65813 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 7648496 7648718 7648592 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 290935 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 7905982 7906260 7906100 Y AFAP1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 33393 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 8047837 8047991 8047936 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 108184 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 8112180 8112452 8112336 Y NA ABLIM2 NA NA NA NA ABLIM2 46107 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 8411022 8411421 8411226 Y NA ACOX3 NA NA NA NA ACOX3 29029 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 10627577 10627791 10627684 Y NA NA NA NA NA NA ZNF518B 170543 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 10956396 10956801 10956583 Y NA NA NA NA NA NA MIR572 411650 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 11029361 11029726 11029544 Y NA NA NA NA NA NA MIR572 338725 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 690843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 13439753 13439937 13439845 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 44052 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 13981901 13982273 13982087 Y NA NA LOC441009,CPEB2,BOD1L IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-2 437227 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 14857906 14858386 14858211 Y CPEB2 NA CPEB2,LOC441009 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CPEB2 143912 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 15151544 15151754 15151565 Y NA NA CPEB2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 149246 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 15907638 15908044 15907859 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 FGFBP1 BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 30319 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 17642152 17642177 17642165 Y CLRN2 MED28 NA NA NA NA MED28 27898 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 17829390 17829398 17829394 Y CLRN2,NCAPG DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 18865 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 17938692 17938903 17938798 Y NA NA NA NA NA NA LCORL 82596 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 17979858 17980211 17980206 Y CLRN2,LCORL LCORL NA NA NA NA LCORL 41288 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 22270180 22270523 22270471 Y NA NA LOC100505912 IMR90 Hi-C 24141950 GPR125 245154 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 23879721 23879980 23879976 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 23732 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 24107474 24107652 24107563 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1A 203762 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 24322640 24323331 24322979 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 260842 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 24474307 24474984 24474891 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 109189 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 25813122 25813401 25813272 Y NA SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 49981 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 25881877 25882168 25881954 Y RBPJ,SLC34A2,SEL1L3 SEL1L3 C4orf52,SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L3 18495 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 26077794 26078229 26078077 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 84848 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 26449466 26449471 26449469 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D19 126588 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 26888311 26888739 26888468 Y NA STIM2,RP11-293A21.1 NA NA NA NA RP11-293A21.1 28090 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 60645 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 37568600 37568635 37568618 Y NA NA NA NA NA NA C4orf19 115037 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 38159115 38159505 38159287 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 199059 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 38281500 38281609 38281534 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 321444 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 38281692 38282075 38281884 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 321636 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 38320550 38320897 38320770 Y NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 342920 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 38607589 38607693 38607690 Y NA NA NA NA NA NA KLF3 56124 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 11.3533600738919 chr4 38671040 38671097 38671090 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 6536 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 38857753 38857899 38857797 Y KLF3,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 1315 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 38870386 38870769 38870503 Y FAM114A1 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 3088 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 39045195 39045532 39045360 Y NA KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 536 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 39316114 39316675 39316347 Y NA RFC1 NA NA NA NA RFC1 49320 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 39933245 39933555 39933419 Y NA PDS5A NA NA NA NA PDS5A 44021 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 40056293 40056591 40056356 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 40791893 40792102 40791997 Y NSUN7 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 41979 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 40997224 40997582 40997567 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 219149 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 42073690 42073968 42073740 Y NA NA NA NA NA NA BEND4 78927 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 44727575 44727855 44727678 Y KCTD8,GNPDA2 GUF1,GNPDA2 NA NA NA NA GNPDA2 963 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 48700290 48700744 48700528 Y NA NA NA NA NA NA FRYL 79595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 54951124 54951140 54951133 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2,FIP1L1,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 22267 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr4 55093024 55093294 55093182 Y PDGFRA NA NA NA NA NA PDGFRA 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 55581532 55581678 55581605 Y KIT NA NA NA NA NA KIT 59447 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 56419632 56419978 56419838 Y NA CLOCK NA NA NA NA CLOCK 8327 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 57278248 57278433 57278373 Y NA AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA PPAT 21348 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 57740482 57740676 57740556 Y PPAT,REST REST THEGL,SPINK2 IMR90 Hi-C 24141950 REST 31399 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr4 66899965 66900079 66900021 Y NA NA NA NA NA NA EPHA5 365752 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 66960590 66960760 66960693 Y NA NA NA NA NA NA EPHA5 426377 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr4 67430351 67431255 67431078 Y NA NA NA NA NA NA EPHA5 896138 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.9650046281736 chr4 68266370 68266649 68266476 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 298248 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 68281708 68281730 68281719 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 283167 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 71677284 71677574 71677429 Y NA GRSF1 NA NA NA NA GRSF1 26088 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 74055104 74055142 74055123 Y ANKRD17,ALB,AFM NA NA NA NA NA ANKRD17 67373 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 74581765 74581937 74581894 Y ANKRD17,IL8 IL8 MTHFD2L,CXCL3 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 22286 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 75183618 75183847 75183685 Y CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG NA NA NA NA NA MTHFD2L 205727 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 75859868 75860329 75860092 Y BTC,PARM1 PARM1 NA NA NA NA PARM1 3563 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr4 75945312 75945392 75945352 Y PARM1 NA NA NA NA NA PARM1 89007 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 77133814 77134170 77133987 Y NAAA,CXCL10,CXCL11 SCARB2,FAM47E NA NA NA NA FAM47E 621 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 77366246 77366349 77366298 Y NA SHROOM3 NA NA NA NA SHROOM3 11993 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 77367704 77367795 77367750 Y NA SHROOM3 NA NA NA NA SHROOM3 13451 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 77468225 77468282 77468244 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 113972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 77505994 77506531 77506183 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 151741 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr4 77543952 77543974 77543961 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 189699 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 77545422 77545888 77545544 Y SCARB2 NA NA NA NA NA SHROOM3 191169 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 77869398 77869850 77869619 Y SEPT11 SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 542 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 77931984 77932418 77932077 Y NA NA NA NA NA NA CCNI 62740 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 78096366 78096378 78096373 Y NA CCNG2 NA NA NA NA CCNG2 20062 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 78705418 78705617 78705518 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 33152 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 78708574 78708903 78708795 Y CNOT6L CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 29866 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 78711096 78711128 78711114 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 27641 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr4 78979777 78980204 78980085 Y NA FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 3053 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 79083838 79083918 79083865 Y NA NA NA NA NA NA FRAS1 107114 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 80958042 80958450 80958250 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 86158 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 82388876 82389215 82389175 Y NA NA NA NA NA NA PRKG2 254658 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 83383009 83383387 83383198 Y NA ENOPH1 NA NA NA NA ENOPH1 33294 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 84934181 84934545 84934426 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 479114 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 85047369 85047537 85047456 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 454595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 81224 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr4 86927841 86928538 86928361 Y MAPK10,MAPK10,MAPK10 NA NA NA NA NA ARHGAP24 533574 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 87838829 87839174 87839055 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 14980 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 87839773 87840193 87839957 Y HSD17B11 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 13961 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 88074850 88075090 88074969 Y DSPP NA NA NA NA NA KLHL8 84376 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 88787227 88787597 88787501 Y NA NA NA NA NA NA SPP1 107222 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 89099576 89099877 89099636 Y HERC6,HERC5 NA PKD2 IMR90 Hi-C 24141950 PPM1K 104044 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 89747458 89747948 89747469 Y NA NA NA NA NA NA NAP1L5 130072 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA SNCA 292131 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 95527874 95528162 95527964 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1B 148957 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 99124941 99125231 99125094 Y RAP1GDS1 NA RAP1GDS1 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1GDS1 55304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 99469455 99469759 99469656 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN5 108021 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 99580316 99580421 99580372 Y NA TSPAN5 NA NA NA NA TSPAN5 2536 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 103701783 103702159 103702029 Y NA MANBA,RP11-10L12.4 NA NA NA NA MANBA 21632 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 103781884 103782294 103782163 Y MANBA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA UBE2D3 5759 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 104302340 104302484 104302413 Y NA NA NA NA NA NA CENPE 184774 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr4 106064596 106064807 106064750 Y NA TET2 TET2 K562 ChIA-PET 22265404 TET2 225 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr4 106071010 106071297 106071196 Y TET2,TET2 TET2 NA NA NA NA TET2 5978 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 106112779 106113198 106113105 Y TET2,TET2 TET2 NA NA NA NA TET2 47747 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 106362976 106363368 106363172 Y NA PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 29870 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 107780277 107780572 107780473 Y NA NA NA NA NA NA DKK2 422391 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 107920048 107920412 107920337 Y NA NA NA NA NA NA DKK2 282551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 107948370 107948896 107948718 Y DKK2 NA NA NA NA NA DKK2 254067 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 107949471 107949545 107949510 Y DKK2 NA NA NA NA NA DKK2 253418 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 107955286 107955747 107955665 Y DKK2 NA NA NA NA NA DKK2 247216 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.4758438752843 chr4 108430904 108430932 108430918 Y SGMS2 NA NA NA NA NA PAPSS1 208676 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 109044329 109044618 109044592 Y LEF1,LEF1 LEF1-AS1,LEF1 NA NA NA NA LEF1-AS1 42063 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 109047956 109048357 109048341 Y NA LEF1-AS1,LEF1 NA NA NA NA LEF1-AS1 38324 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 109078014 109078240 109078233 Y NA LEF1-AS1,LEF1 NA NA NA NA LEF1-AS1 8441 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 109081038 109081258 109081096 Y NA LEF1-AS1,LEF1 NA NA NA NA LEF1-AS1 5423 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 109281025 109281423 109281353 Y CYP2U1,LEF1,LEF1 NA LOC641518,LEF1 IMR90 Hi-C 24141950 LEF1 192913 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 109318263 109318610 109318312 Y NA NA NA NA NA NA RPL34-AS1 221006 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 110623287 110623426 110623357 Y LRIT3 CASP6,PLA2G12A NA NA NA NA CASP6 548 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 113201272 113201525 113201422 Y TIFA ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 3140 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 113205194 113205406 113205300 Y NA ALPK1,TIFA NA NA NA NA TIFA 135 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 113852159 113852312 113852236 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 114894 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 116213565 116213665 116213636 Y NA NA NA NA NA NA NDST4 180533 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 119115424 119115493 119115457 Y NA NA NA NA NA NA SNHG8 82371 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 120205306 120205694 120205553 Y NA C4orf3 NA NA NA NA C4orf3 17906 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 120432594 120432728 120432661 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 58648 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr4 120439031 120439404 120439161 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 65085 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 120444503 120444790 120444647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 70557 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 120476359 120476426 120476393 Y PDE5A NA NA NA NA NA PDE5A 71720 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr4 120493215 120493297 120493256 Y C4orf3 NA NA NA NA NA PDE5A 54849 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 120511055 120511277 120511169 Y NA PDE5A NA NA NA NA PDE5A 36869 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 120646977 120647104 120647042 Y NA NA NA NA NA NA PDE5A 98831 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 121812608 121812671 121812657 Y NA PRDM5 NA NA NA NA PRDM5 29354 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 122077221 122077584 122077249 Y TNIP3 NA NA NA NA NA NDNF 85045 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 122609803 122610189 122610094 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 6079 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 122802111 122802121 122802116 Y NA BBS7 NA NA NA NA BBS7 12459 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 122868336 122868638 122868444 Y TRPC3 TRPC3 NA NA NA NA TRPC3 2271 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.16584078983524 chr4 122869375 122869534 122869455 Y TRPC3 TRPC3 NA NA NA NA TRPC3 1375 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr4 123074024 123074337 123074286 Y KIAA1109,IL21,IL2 KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 2536 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 124225969 124226069 124226019 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 89881 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 128752654 128753022 128752839 Y HSPA4L PLK4 NA NA NA NA PLK4 46994 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 130012970 130013118 130013063 Y PHF17,SCLT1,C4orf33 C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA SCLT1 206 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 139158628 139158837 139158817 Y SLC7A11 SLC7A11 NA NA NA NA SLC7A11 2666 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr4 140035787 140036142 140035958 Y NA NA NA NA NA NA ELF2 60230 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 140074901 140075184 140075104 Y NA ELF2 CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 21188 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 140334690 140334958 140334824 Y ELF2 RAB33B NA NA NA NA RAB33B 37428 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 140690476 140690707 140690592 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 105554 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 140967961 140968185 140967999 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 105153 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 141014112 141014221 141014167 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 59117 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 141021103 141021485 141021348 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 51853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 141071159 141071540 141071326 Y NA MAML3 NA NA NA NA MAML3 1798 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 141164479 141164682 141164571 Y MAML3 SCOC MAML3,MGST2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCOC 11758 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 146101946 146102251 146102199 Y NA OTUD4 ABCE1 K562 ChIA-PET 22265404 OTUD4 2633 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 146729401 146729770 146729628 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 128017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 146815736 146815927 146815832 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 41860 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 148374725 148374999 148374823 Y TMEM184C EDNRA TMEM184C IMR90 Hi-C 24141950 EDNRA 25070 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 148426409 148426782 148426596 Y NA EDNRA NA NA NA NA EDNRA 26340 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 148951514 148951899 148951701 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 300300 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 149364278 149364693 149364534 Y NR3C2 NR3C2 NA NA NA NA NR3C2 428 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 151241204 151241585 151241396 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 693294 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 152033251 152033470 152033361 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 14526 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 152047125 152047385 152047255 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 28400 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 152090134 152090652 152090546 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 71409 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 152105959 152106222 152106091 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 87234 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 152117073 152117218 152117121 Y FAM160A1,SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 98348 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 152127737 152127987 152127916 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 109012 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 152582106 152582499 152582283 Y NA NA NA NA NA NA PET112 97676 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 152931325 152931616 152931495 Y NA NA PET112 IMR90 Hi-C 24141950 PET112 251150 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 154004659 154004831 154004688 Y NA NA FHDC1,ARFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM2 66663 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 158125886 158126027 158125941 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 130677 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 159493065 159493294 159493179 Y NA NA NA NA NA NA ETFDH 97983 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 159592059 159592445 159592194 Y NA ETFDH,C4orf46 NA NA NA NA C4orf46 652 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 159696369 159696741 159696680 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 8079 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 164471489 164471679 164471583 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 385416 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 164543460 164543823 164543698 Y MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 457387 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 164741001 164741233 164741117 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 654928 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 164876357 164876532 164876526 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 790284 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 165210734 165210789 165210744 Y NA NA NA NA NA NA RP11-366M4.2 629426 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr4 167356237 167356241 167356239 Y NA NA NA NA NA NA TLL1 563827 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 169853850 169854103 169853858 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 75323 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 170023521 170023783 170023621 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 94095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 170543360 170543629 170543529 Y NEK1,CLCN3 NEK1,CLCN3 C4orf27 IMR90 Hi-C 24141950 CLCN3 11576 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 174440246 174440721 174440674 Y NA HAND2 NA NA NA NA HAND2 8659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 175281816 175282139 175281824 Y CEP44,CEP44,FBXO8 NA NA NA NA NA FBXO8 78401 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 178362238 178362457 178362307 Y NA AGA NA NA NA NA AGA 581 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 180979740 180980372 180979835 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 2084030 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 181045421 181045488 181045454 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 2018914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 183727349 183727751 183727542 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 109338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 184643961 184644129 184644061 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC11 65541 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 184718887 184719489 184719407 Y NA NA ENPP6,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 STOX2 53095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 184910732 184910983 184910894 Y C4orf41,IRF2 RP11-739P1.2 NA NA NA NA RP11-739P1.2 3901 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr4 185189434 185189785 185189717 Y IRF2,CASP3 NA IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 203949 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 185303433 185303616 185303580 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 90118 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 185306912 185307204 185307108 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 86530 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr4 186227102 186227608 186227442 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD37 87567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 186455582 186456046 186455940 Y NA PDLIM3 NA NA NA NA PDLIM3 816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 186831211 186831564 186831371 Y SORBS2 NA NA NA NA NA TLR3 156742 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 187027199 187027350 187027289 Y SORBS2,FAM149A TLR3,FAM149A NA NA NA NA FAM149A 3626 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr4 187591076 187591113 187591095 Y NA NA NA NA NA NA FAT1 54763 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 190485123 190485226 190485156 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 93004 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr4 190523750 190523781 190523766 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 105087 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 601191 601577 601476 Y PLEKHG4B,SLC9A3,CEP72 CEP72 SLC9A3,CEP72 IMR90 Hi-C 24141950 CEP72 8810 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 672237 672545 672500 Y EXOC3,CEP72 TPPP NA NA NA NA TPPP 18965 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr5 759096 759567 759320 Y TPPP NA SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13 IMR90 Hi-C 24141950 TPPP 67586 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 777448 777883 777776 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC11 71218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA ZDHHC11 64078 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr5 957095 957485 957381 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA RP11-43F13.3 37938 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 957591 958302 957640 Y NKD2 RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA RP11-43F13.3 37121 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.4758438752843 chr5 964244 964536 964396 Y NKD2 RP11-43F13.3,NKD2 SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-43F13.3 30887 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 1007986 1008378 1008075 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA NKD2 1042 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.27500771362266 chr5 1022145 1022187 1022166 Y SLC6A18,NKD2 RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA NKD2 15201 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 8.29668620784407 chr5 1067872 1068133 1067963 Y NA SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 42017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr5 1080709 1080898 1080802 Y NA SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 29252 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 1108916 1109348 1109069 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 802 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 1130725 1130985 1130924 Y NA SLC12A7 BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 20575 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr5 1315765 1316275 1315843 Y TERT TERT,CLPTM1L TERT IMR90 Hi-C 24141950 TERT 22581 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 1316464 1316882 1316563 Y TERT,SLC6A3 TERT,CLPTM1L TERT IMR90 Hi-C 24141950 TERT 23280 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 2580576 2580893 2580736 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS6 781062 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 4565513 4565575 4565544 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 853202 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 50027 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 7.09585004618243 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 10371627 10371888 10371758 Y NA MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 19812 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA NA NA NA NA NA RPL30P7 63616 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 10601684 10601853 10601839 Y ANKRD33B ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 39242 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 10685117 10685512 10685343 Y NA NA NA NA NA NA DAP 73872 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 10733059 10733302 10733226 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 26082 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 14251046 14251256 14251151 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 109235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 14668408 14668752 14668531 Y FAM105A,FAM105B EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 5635 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 14739809 14739939 14739877 Y NA NA NA NA NA NA RBBP4P1 56570 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 14809867 14810211 14810035 Y FAM105A,FAM105B RBBP4P1 NA NA NA NA RBBP4P1 13358 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 16309962 16310362 16310162 Y NA NA NA NA NA NA ZNF622 153539 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 16698370 16698703 16698671 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 83203 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr5 16727981 16728387 16728161 Y FAM134B NA NA NA NA NA FAM134B 112814 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 16733521 16733894 16733888 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 118354 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr5 16736297 16736738 16736539 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 121130 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr5 16740893 16741285 16741194 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 125726 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 16821332 16821498 16821415 Y NA NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 79252 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 16855522 16855861 16855692 Y NA CTB-55B8.1 NA NA NA NA CTB-55B8.1 44889 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 23415572 23415664 23415586 Y NA NA NA NA NA NA CDH12 563841 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 25424909 25424931 25424920 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 236144 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 26336181 26336366 26336274 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 1147416 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 26847119 26847280 26847167 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 1658354 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 29758752 29759069 29758903 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 1292603 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 32164142 32164348 32164245 Y ZFR GOLPH3 NA NA NA NA GOLPH3 8108 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 32366924 32367006 32366965 Y NA NA NA NA NA NA MTMR12 55809 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 32592950 32593432 32593186 Y NA NA NA NA NA NA SUB1 63211 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 33003912 33004012 33003962 Y NA NA NPR3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-36C20.1 156273 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr5 33676049 33676427 33676252 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 213870 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 34048471 34048803 34048799 Y NA AMACR NA NA NA NA AMACR 42251 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 34710052 34710312 34710173 Y RAI14,RAI14 NA NA NA NA NA RAI14 55710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 35859478 35859884 35859711 Y NA IL7R NA NA NA NA IL7R 8681 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 36111562 36111962 36111762 Y NA LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA LMBRD2 38101 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 86031 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 36744638 36744936 36744711 Y NA NA LOC646719,NIPBL MCF7 ChIA-PET 22265404 NIPBL 129925 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 36898243 36898633 36898363 Y NIPBL NIPBL NA NA NA NA NIPBL 23382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 40224075 40224396 40224233 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 453204 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 40754670 40754884 40754791 Y PTGER4 TTC33,PRKAA1 NA NA NA NA TTC33 593 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 41826733 41826755 41826744 Y NA OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 41866 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 42505068 42505257 42505244 Y NA NA NA NA NA NA GHR 83189 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 44821100 44821499 44821234 Y NA RP11-53O19.1,MRPS30 NA NA NA NA MRPS30 14073 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 44875784 44875973 44875831 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 68757 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 50149268 50149286 50149277 Y NA NA NA NA NA NA PARP8 189535 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 50677492 50677845 50677668 Y NA ISL1 NA NA NA NA ISL1 571 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 52094372 52094720 52094546 Y NA ITGA1,PELO NA NA NA NA PELO 12598 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 53293727 53293898 53293842 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 310514 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 53971615 53971811 53971712 Y SNX18,SNX18,CDC20B NA CDC20B,HSPB3,SNX18,GPX8 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 160026 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 54722913 54723133 54723024 Y SKIV2L2 NA NA NA NA NA RNF138P1 101396 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 54741987 54742107 54742028 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 82422 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 54777886 54777973 54777929 Y SKIV2L2 RNF138P1 NA NA NA NA RNF138P1 46556 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 55904081 55904422 55904204 Y NA NA MAP3K1,IL6ST IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 105182 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 56021671 56022071 56022000 Y MAP3K1 NA MAP3K1 GM12878 5C 22955621 MAP3K1 87330 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 57758033 57758252 57758173 Y NA PLK2 NA NA NA NA PLK2 3946 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 59045613 59045932 59045792 Y PDE4D NA NA NA NA NA PART1 735608 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 59183388 59183889 59183871 Y NA NA NA NA NA NA PART1 597651 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 60626678 60627139 60626902 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 578 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 64062726 64062917 64062822 Y NA SREK1IP1 NA NA NA NA CWC27 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 64224703 64224806 64224755 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 161946 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 64755187 64755203 64755196 Y NA NA NA NA NA NA CENPK 101795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 47046 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4-AS1 151855 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA CTC-498J12.1,SLC30A5 NA NA NA NA CTC-498J12.1 815 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr5 68712626 68712834 68712773 Y NA RAD17,TAF9,MARVELD2 NA NA NA NA MARVELD2 3687 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 70772003 70772134 70772073 Y NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 22561 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 71045616 71045849 71045733 Y NA NA MCCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MCCC2 164501 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 71462643 71462861 71462688 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 61582 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 72511984 72512100 72512037 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM171 97865 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 72512311 72512636 72512493 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM171 98192 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 75034241 75034569 75034405 Y NA POC5 NA NA NA NA POC5 22928 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 75832909 75833104 75832996 Y NA NA NA NA NA NA F2RL2 84155 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 77231954 77232009 77231997 Y NA NA OTP IMR90 Hi-C 24141950 TBCA 69350 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 77792703 77793028 77792954 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 138364 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 77819717 77819752 77819740 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 165378 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 78585055 78585206 78585119 Y NA CTC-451P13.1 NA NA NA NA CTC-451P13.1 6314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 79480253 79480678 79480326 Y NA NA NA NA NA NA SERINC5 69220 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 79487807 79488093 79488033 Y SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 61805 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr5 80579237 80579431 80579394 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 15948 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 81653126 81653457 81653257 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 80730 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.18333847574844 chr5 81655341 81655441 81655346 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 82945 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 81934356 81934439 81934367 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 361960 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 82005927 82005935 82005931 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA XRCC4 365382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 82224684 82224708 82224696 Y NA NA NA NA NA NA XRCC4 146609 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 82636435 82636494 82636447 Y XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 128790 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 82768408 82768816 82768560 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 3124 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 84086289 84086461 84086342 Y NA NA NA NA NA NA VCAN 1321005 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 86610420 86610785 86610768 Y NA RASA1 NA NA NA NA RASA1 48715 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 87692594 87693229 87692926 Y MEF2C NA NA NA NA NA TMEM161B 129301 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 87967371 87967797 87967486 Y MEF2C LINC00461 NA NA NA NA LINC00461 17061 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 87985363 87985679 87985523 Y MEF2C LINC00461 LINC00461 K562 ChIA-PET 22265404 LINC00461 505 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 88030090 88030417 88030349 Y MEF2C,MEF2C LINC00461 NA NA NA NA LINC00461 45232 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C MEF2C NA NA NA NA MEF2C 26466 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 90604425 90604632 90604611 Y NA LUCAT1 GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LUCAT1 3587 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 90662566 90662573 90662570 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 14603 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 90679835 90680013 90679955 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 2659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1P27 423389 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 93013083 93013343 93013254 Y NA NPM1P27 NA NA NA NA NPM1P27 4030 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 93316390 93316647 93316523 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 128757 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 95873123 95873359 95873236 Y LNPEP,CAST,CAST CAST ELL2,PCSK1,CAST IMR90 Hi-C 24141950 CAST 14152 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 96152147 96152486 96152312 Y LNPEP,ERAP1 ERAP1 ERAP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ERAP1 10344 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr5 101404486 101404751 101404619 Y NA NA NA NA NA NA PAM 682934 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 102847325 102847595 102847369 Y NA NUDT12 NA NA NA NA NUDT12 48899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 106901710 106902084 106901897 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 102512 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 109257413 109257833 109257636 Y MAN2A1 NA TMEM232 IMR90 Hi-C 24141950 MAN2A1 234346 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 111054290 111054596 111054444 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 208002 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 112585066 112585229 112585152 Y NA NA NA NA NA NA MCC 237298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 112825129 112825430 112825300 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA MCC 2602 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 114848957 114849251 114849109 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 29340 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 114881094 114881387 114881239 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 2503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 114970299 114970641 114970577 Y NA TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7 NA NA NA NA TMED7 3610 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 115719103 115719184 115719144 Y NA NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 177074 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 115721196 115721558 115721420 Y NA NA SEMA6A IMR90 Hi-C 24141950 CTB-118N6.1 174700 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 115855956 115855969 115855965 Y NA CTB-118N6.1 NA NA NA NA CTB-118N6.1 40289 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 115908516 115909016 115908646 Y SEMA6A CTB-118N6.1,CTB-118N6.2 NA NA NA NA SEMA6A 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr5 115911792 115912152 115911976 Y SEMA6A CTB-118N6.1,CTB-118N6.2,SEMA6A NA NA NA NA SEMA6A 3162 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr5 116384111 116384324 116384221 Y SEMA6A NA NA NA NA NA RPS17P2 334182 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.07417155196102 chr5 118678067 118678220 118678144 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8 75680 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 119016321 119016356 119016339 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 230183 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 122690309 122690381 122690346 Y NA NA NA NA NA NA CEP120 66905 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 122765811 122765999 122765906 Y NA CEP120 CEP120 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CEP120 8525 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 122885327 122885717 122885442 Y CEP120,CSNK1G3 CSNK1G3 NA NA NA NA CSNK1G3 39534 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 123738017 123738276 123738143 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 344224 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 123739028 123739231 123739141 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 343269 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 123966351 123966687 123966497 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 115813 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 123996464 123996708 123996619 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 85792 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 124042490 124042759 124042619 Y NA ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 39741 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 124593106 124593253 124593226 Y NA NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 450180 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 6.22251465588305 chr5 126015927 126016326 126016055 Y LMNB1,LMNB1 NA LMNB1,MEGF10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-395C3.1 53916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 127421091 127421133 127421112 Y NA SLC12A2 NA NA NA NA SLC12A2 3633 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 128462285 128462535 128462410 Y NA ISOC1 NA NA NA NA ISOC1 33841 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 129020678 129020929 129020798 Y ADAMTS19 NA NA NA NA NA CHSY3 217236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 129060395 129060594 129060495 Y NA NA NA NA NA NA CHSY3 177571 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 129563384 129563648 129563470 Y NA NA NA NA NA NA CHSY3 325219 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.58501079907172 chr5 131074214 131074509 131074363 Y NA NA NA NA NA NA FNIP1 56201 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 131810095 131810374 131810235 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 NA NA NA NA IRF1 14116 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 132792857 132792990 132792924 Y NA NA NA NA NA NA FSTL4 153265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 133463152 133463566 133463254 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 14750 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 133763329 133763680 133763576 Y NA CDKN2AIPNL CDKN2AIPNL MCF7 ChIA-PET 22265404 CDKN2AIPNL 17740 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 55877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 133802349 133802592 133802584 Y PPP2CA,SEC24A,UBE2B NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 56760 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 133864116 133864195 133864168 Y NA NA NA NA NA NA SEC24A 118284 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 134911665 134912029 134911924 Y CXCL14 NEUROG1,CTC-321K16.1,CXCL14 NA NA NA NA CXCL14 940 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr5 135022581 135022649 135022615 Y NA NA SLC25A48,CXCL14 IMR90 Hi-C 24141950 CXCL14 109612 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 135097584 135097864 135097724 Y NA NA TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A48 70474 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 135171365 135171441 135171403 Y SLC25A48 SLC25A48 NA NA NA NA SLC25A48 3027 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 135373156 135373467 135373188 Y NA TGFBI NA NA NA NA TGFBI 10572 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 135885544 135885599 135885577 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 305718 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr5 135943812 135943901 135943857 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 247416 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 135955852 135956149 135955964 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 235168 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 136359479 136359669 136359574 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 168162 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 136420806 136421212 136420952 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 229489 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 136900041 136900222 136900186 Y NA SPOCK1 TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 31846 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 137075973 137076263 137076118 Y NA KLHL3,HNRNPA0 NA NA NA NA KLHL3 6194 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 137237773 137238021 137237897 Y WNT8A NA NA NA NA NA FAM13B 147629 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 137870529 137870619 137870574 Y FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 6370 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 138058227 138058591 138058405 Y NA AC034243.1 CTNNA1,SIL1,MATR3,LRRTM2 IMR90 Hi-C 24141950 AC034243.1 28407 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 138290386 138290689 138290535 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 203388 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 138686401 138686737 138686569 Y NA PAIP2 NA NA NA NA PAIP2 11125 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 139641396 139641769 139641570 Y SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 38937 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 14336 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 22016 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3,PCDHGC4 NA NA NA NA PCDHGC4 12898 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3,PCDHGC4 NA NA NA NA PCDHGC4 30772 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 140910138 140910894 140910494 Y NA PCDHGC4 NA NA NA NA PCDHGC4 47397 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 141407173 141407212 141407192 Y NA GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GNPDA1 16567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 141475352 141475622 141475404 Y NA NDFIP1 FGF1,NDFIP1,ARAP3,FCHSD1,RNF14,GNPDA1,PCDH12 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP1 10448 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 AC005592.2,SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr5 141818179 141818493 141818304 Y NA NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 114159 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr5 142105384 142105400 142105392 Y FGF1 ARHGAP26 ARHGAP26,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP26 42549 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 145455339 145455700 145455520 Y NA NA NA NA NA NA LARS 104523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 146751772 146751865 146751838 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 135754 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 146831561 146831956 146831686 Y PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55663 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 146834939 146835189 146835093 Y DPYSL3,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 52430 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 146887479 146887544 146887495 Y DPYSL3 DPYSL3 NA NA NA NA DPYSL3 75 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 146890135 146890280 146890247 Y NA DPYSL3 NA NA NA NA DPYSL3 2516 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 20.5233816720353 chr5 146933864 146934089 146933936 Y DPYSL3 DPYSL3 NA NA NA NA DPYSL3 46245 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 146940926 146941225 146941075 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 53307 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 146947412 146947925 146947557 Y DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 59793 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr5 146952297 146952481 146952389 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 64678 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr5 147083144 147083174 147083159 Y SPINK14,JAKMIP2 NA NA NA NA NA JAKMIP2 77164 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr5 147184471 147185173 147184731 Y NA JAKMIP2 NA NA NA NA JAKMIP2 24133 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 147201124 147201544 147201446 Y JAKMIP2 JAKMIP2 NA NA NA NA JAKMIP2 40786 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 147343599 147343802 147343701 Y FBXO38 NA NA NA NA NA SPINK5 59444 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 147463828 147464105 147463998 Y NA NA NA NA NA NA SPINK5 60582 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 147565828 147566233 147565944 Y FBXO38 NA NA NA NA NA SPINK5 162582 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 147605275 147606051 147605859 Y NA NA NA NA NA NA RP11-373N22.3 155295 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 148336270 148336420 148336344 Y NA NA ADRB2,ABLIM3,SH3TC2 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 132114 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 148349939 148350092 148350025 Y NA NA NA NA NA NA ADRB2 145783 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 148836415 148836621 148836572 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 92386 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 149379132 149379170 149379142 Y NA SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 150086779 150087134 150086956 Y RBM22,DCTN4,DCTN4 RBM22,DCTN4 MYOZ3,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 RBM22 8110 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 150403259 150403641 150403341 Y NA GPX3 NA NA NA NA GPX3 5135 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 150462985 150463261 150463131 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 7877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 151108065 151108456 151108379 Y NA RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 35483 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 151470527 151470867 151470697 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 320434 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 153807428 153807565 153807497 Y NA SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1 NA NA NA NA SAP30L-AS1 15845 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 153809274 153809597 153809436 Y NA SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1 NA NA NA NA SAP30L-AS1 13813 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr5 155211653 155211669 155211662 Y NA NA NA NA NA NA MRPL22 893023 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 155906894 155907163 155907007 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R2P3 368386 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 156814689 156815040 156814693 Y NA NA NA NA NA NA CYFIP2 123600 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 156897739 156898102 156897921 Y NA NA NA NA NA NA ADAM19 102681 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 158605991 158606398 158606265 Y NA RNF145,CTB-11I22.2 NA NA NA NA RNF145 28663 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145,CTB-11I22.2 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 158878372 158878607 158878465 Y RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA UBLCP1 190283 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 162507124 162507145 162507136 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 355187 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 162811410 162811429 162811421 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 50903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 167011273 167011672 167011457 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 134696 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 167078229 167078612 167078310 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 67756 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 167243466 167243587 167243564 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 97098 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 167320595 167320600 167320598 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 174227 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 167327544 167327856 167327700 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 181176 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 167439777 167440090 167439882 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 276566 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 168287563 168287715 168287633 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 246246 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 170378492 170378604 170378547 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 91618 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA TLX3 71942 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 170878093 170878163 170878150 Y NA FGF18 NA NA NA NA FGF18 33433 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 171498342 171498743 171498483 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 66465 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 171839597 171840252 171839919 Y DUSP1,STK10,UBTD2 SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 39275 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 171879589 171880295 171879961 Y SH3PXD2B SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 62 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 172049637 172049969 172049831 Y NA NEURL1B,CTB-79E8.3 NEURL1B,SH3PXD2B IMR90 Hi-C 24141950 NEURL1B 16300 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 172064248 172064489 172064361 Y NA NEURL1B,CTB-79E8.3 NA NA NA NA NEURL1B 1780 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 172182355 172182703 172182434 Y NA DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 13495 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 173390340 173390538 173390358 Y NA NA NA NA NA NA CPEB4 77057 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 173391031 173391183 173391109 Y HMP19 NA NA NA NA NA CPEB4 77748 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 173391394 173391777 173391587 Y CPEB4 NA NA NA NA NA CPEB4 78111 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 173586705 173586920 173586830 Y NA NA NA NA NA NA RP11-267A15.1 174378 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 173829000 173829006 173829003 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 67702 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 173846140 173846257 173846227 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 84842 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.9650046281736 chr5 173846628 173846975 173846845 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 85330 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr5 173941794 173942027 173942024 Y NA NA MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 180496 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr5 173956576 173956772 173956664 Y HMP19 NA MSX2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSX2 192764 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 174148035 174148467 174148121 Y MSX2 MSX2 NA NA NA NA MSX2 1069 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 19.4317124341611 chr5 176422952 176423155 176423071 Y HK3,UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6 UIMC1,ZNF346 NA NA NA NA UIMC1 24479 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 177373047 177373130 177373089 Y PROP1 RP11-1252I4.2 NA NA NA NA RP11-1252I4.2 8424 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 177607687 177607881 177607743 Y NA NHP2,HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 21627 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 178052813 178053238 178053128 Y AGXT2L2,CLK4 COL23A1,CLK4 COL23A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLK4 2378 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr5 179635074 179635183 179635129 Y C5orf45,MAPK9,RASGEF1C NA NA NA NA NA MAPK9 81916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 179718006 179718384 179718320 Y NA MAPK9 NA NA NA NA MAPK9 907 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 180285670 180285966 180285744 Y NA MGAT1,LINC00847,ZFP62 NA NA NA NA ZFP62 320 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A NA NA NA NA CTC-338M12.5 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 1055850 1056126 1055989 Y FOXQ1 NA NA NA NA NA FOXQ1 254549 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr6 1311143 1311466 1311342 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 468 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr6 1311552 1311897 1311757 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 1335859 1336005 1335918 Y NA FOXQ1 LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 25184 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 1391827 1392023 1391957 Y FOXF2 FOXF2 NA NA NA NA FOXF2 3758 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 1609094 1609758 1609395 Y FOXC1 FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 413 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 1966604 1966616 1966610 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 277310 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 1966788 1967127 1966958 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 276799 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 2038182 2038509 2038345 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 205417 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 2081468 2081822 2081645 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 162104 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 2800199 2800731 2800412 Y SERPINB9,SERPINB1 WRNIP1,SERPINB1 NA NA NA NA WRNIP1 36551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 3160462 3160701 3160583 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 4702 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.18333847574844 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 3166310 3166878 3166542 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 10550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr6 3230738 3231042 3230747 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 774 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr6 3254273 3254642 3254472 Y SLC22A23 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 24309 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 29975 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 3749707 3750120 3749911 Y C6orf145 PXDC1 NA NA NA NA PXDC1 140 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 5266800 5267044 5266922 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 7523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 5996432 5996750 5996575 Y NA NRN1 NA NA NA NA NRN1 8450 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 5997075 5997523 5997169 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 7677 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 6008887 6009261 6009138 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 3687 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 6151506 6151793 6151650 Y F13A1 NA NA NA NA NA NRN1 146306 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 F13A1 367894 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 7143191 7143555 7143322 Y NA RREB1 NA NA NA NA RREB1 37361 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 7157997 7158379 7158000 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 52167 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 7174134 7174405 7174138 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 68304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 7505623 7505742 7505694 Y RREB1,DSP DSP DSP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DSP 34066 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 7544425 7544740 7544519 Y NA DSP,SNRNP48 NA NA NA NA DSP 4617 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 9710906 9711148 9711028 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 706744 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 9839255 9839267 9839261 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 578625 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 11414898 11415336 11414989 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NEDD9,C6orf228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 34317 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 12183004 12183212 12183108 Y HIVEP1,EDN1 NA NA NA NA NA EDN1 105384 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 13261181 13261379 13261243 Y NA RNU1-11P NA NA NA NA RNU1-11P 48893 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 13449737 13449960 13449842 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1 GFOD1 NA NA NA NA GFOD1 35934 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 13662469 13662838 13662724 Y NA NOL7,RANBP9 NA NA NA NA RANBP9 46958 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 13709903 13710182 13710119 Y TBC1D7,CD83,RANBP9 RANBP9 SIRT5,NOL7 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 107 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 13766479 13766874 13766549 Y NA NA NA NA NA NA RANBP9 56683 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 14758684 14758801 14758713 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 485726 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 14766593 14766865 14766789 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 477662 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 14777704 14777964 14777898 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 466563 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.03917618013461 chr6 15526544 15526623 15526553 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 134666 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr6 15554239 15554360 15554316 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 106929 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 16588159 16588355 16588257 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 171014 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 16668776 16668955 16668866 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 90414 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 16712557 16713382 16713252 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45987 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 17712711 17712926 17712817 Y NA NUP153 FAM8A1,NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 8055 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 18342517 18342875 18342695 Y NA RNF144B RNF144B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF144B 23904 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 18343795 18344357 18344138 Y RNF144B RNF144B RNF144B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF144B 22422 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 19819390 19819399 19819395 Y NA ID4 ID4 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID4 16218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 20211469 20211688 20211565 Y NA MBOAT1 NA NA NA NA MBOAT1 799 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 20418274 20418752 20418425 Y NA E2F3 NA NA NA NA E2F3 17876 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 21589338 21589711 21589681 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2261 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 21603523 21603934 21603831 Y SOX4 SOX4 NA NA NA NA SOX4 11551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 21667588 21667834 21667745 Y SOX4 NA NA NA NA NA SOX4 75616 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.18333847574844 chr6 21738487 21738974 21738702 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 146515 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 21765300 21765398 21765349 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 173328 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 21808482 21808727 21808539 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 216510 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 21859421 21859505 21859462 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 267449 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 21887910 21888037 21887975 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 295938 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 21925228 21925506 21925404 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 333256 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 21987708 21987959 21987863 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 395736 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 21997954 21998076 21998022 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 405982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 22024666 22024942 22024815 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 432694 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 22026062 22026222 22026161 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 434090 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 22073995 22074367 22074183 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 482023 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 22148644 22148866 22148767 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 556672 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 22149387 22149566 22149505 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 557415 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 22222867 22222924 22222901 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 630895 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 23416144 23416318 23416203 Y NA NA LINC00340,SOX4 IMR90 Hi-C 24141950 NRSN1 708032 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 23623042 23623053 23623048 Y NA NA NA NA NA NA NRSN1 501297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 23630929 23631073 23631036 Y NA NA NA NA NA NA NRSN1 493277 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 23656570 23656900 23656609 Y NA NA NA NA NA NA NRSN1 467450 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.62000617089813 chr6 23682082 23682309 23682196 Y NA NA NA NA NA NA NRSN1 442041 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 24228927 24229160 24229097 Y NA NA NA NA NA NA NRSN1 104577 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 24348668 24348920 24348794 Y DCDC2,KAAG1,DCDC2 DCDC2 NA NA NA NA DCDC2 7360 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 24584505 24584676 24584669 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0319 59707 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 24698648 24698887 24698768 Y NA TDP2,ACOT13,C6orf62 NA NA NA NA C6orf62 20177 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 24799813 24800204 24799968 Y DCDC2,GPLD1,GPLD1,ALDH5A1 GMNN NA NA NA NA GMNN 26654 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 25303199 25303368 25303284 Y NA LRRC16A NA NA NA NA LRRC16A 25893 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 25406864 25407254 25406949 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 129558 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 4.69417772285914 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr6 26266741 26266990 26266911 Y NA HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H3G 2622 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 26521444 26521777 26521577 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 1368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 27655152 27655475 27655306 Y FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM NA LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HIST1H2BL 118234 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 27740489 27740807 27740621 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J NA NA NA NA HIST1H2BL 32902 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 28102608 28102781 28102677 Y ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 12270 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 28280351 28280639 28280495 Y NA PGBD1,ZKSCAN3 NA NA NA NA PGBD1 33037 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 28299231 28299616 28299424 Y GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1 ZKSCAN3 NA NA NA NA ZKSCAN3 16075 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 28302002 28302386 28302196 Y NA ZKSCAN3 NA NA NA NA ZKSCAN3 13305 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 28805076 28805418 28805247 Y NA XXbac-BPG308K3.5 NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 293 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 30247447 30247451 30247450 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 22086 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 30497672 30498068 30497880 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PBMUCL1,PPP1R10,ATAT1,ATAT1 RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 24595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,LY6G6E,LY6G6D,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,MSH5 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,LY6G6E,LY6G6D,LY6G6C,DDAH2,CLIC1 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 32952668 32952702 32952685 Y NA HLA-DMB,BRD2,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2-IT1 16659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA HLA-DMB,BRD2,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2-IT1 20028 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 35035271 35035638 35035433 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 180229 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 35171617 35171779 35171698 Y NA NA TCP11,ANKS1A,ZNF76,SCUBE3,UHRF1BP1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF76 52907 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 35632268 35633036 35633003 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 61324 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA PXT1 591 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 36634782 36635224 36635042 Y MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAP3P2 4370 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr6 37269905 37270172 37270040 Y C6orf89,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA TMEM217 45974 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 37484293 37484960 37484497 Y NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 18595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 38033139 38033395 38033278 Y ZFAND3 NA NA NA NA NA ZFAND3 247864 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 38447266 38447403 38447335 Y DNAH8,BTBD9,BTBD9 NA NA NA NA NA BTBD9 158521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 40964017 40964029 40964023 Y NA NA UNC5CL,APOBEC2,C6orf130 IMR90 Hi-C 24141950 NFYA 74655 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 41612844 41613289 41612975 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 10224 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 41929474 41929675 41929644 Y NA MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 42548 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 42259187 42259201 42259195 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 75584 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 42375139 42375533 42375327 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 42256 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 42743007 42743021 42743017 Y CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,C6orf226 TBCC KIAA0240,UBR2,RPL7L1,C6orf226,PTCRA,TBCC,PRPH2,KLHDC3,MEA1,PPP2R5D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 30449 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 43505816 43505905 43505861 Y ABCC10,TJAP1 POLR1C,LRRC73,YIPF3,XPO5,POLH NA NA NA NA YIPF3 23088 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA C6orf223 87630 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 44002049 44002379 44002368 Y NFKBIE,GTPBP2 C6orf223,RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 35732 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA RP5-1120P11.3,TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 44924205 44924374 44924290 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 419316 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 45299904 45300369 45300004 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 43321 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 45319946 45320392 45320176 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 23298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 45390987 45391259 45391097 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 45391331 45391628 45391429 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47641 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr6 45392235 45392572 45392528 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48545 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 45404651 45404813 45404715 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 60961 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr6 45409618 45409900 45409810 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 65928 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 45413515 45413853 45413708 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 69825 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 45503403 45503548 45503462 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 159713 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 45912284 45912306 45912296 Y NA NA NA NA NA NA CLIC5 133826 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr6 45937892 45938281 45938228 Y NA NA NA NA NA NA CLIC5 107851 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 10.5891916073799 chr6 45981226 45981258 45981242 Y NA NA NA NA NA NA CLIC5 64874 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 46021255 46021630 46021408 Y NA CLIC5 NA NA NA NA CLIC5 24502 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 50818020 50818494 50818241 Y NA RPS17P5 NA NA NA NA RPS17P5 4881 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 51275260 51275721 51275608 Y NA RP3-437C15.1 NA NA NA NA RP3-437C15.1 1925 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 52383934 52384018 52383972 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 55695 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 53225010 53225140 53225110 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 13063 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 53348299 53348382 53348306 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 131386 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr6 53678166 53678361 53678262 Y NA LRRC1 NA NA NA NA LRRC1 20871 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA NA NA NA NA NA DST 520858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 56811664 56812033 56811848 Y NA DST,BEND6 BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DST 5393 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 68340064 68340094 68340079 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 1003165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 69390302 69390390 69390344 Y NA BAI3 NA NA NA NA BAI3 47043 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 69598127 69598365 69598163 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 254868 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 69809524 69809816 69809670 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 466265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 72294841 72295504 72295148 Y NA KRT19P1 RIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 KRT19P1 2417 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 73330314 73330844 73330342 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 794 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 73335940 73336259 73335964 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 6420 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 73354930 73355043 73354987 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 25410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 73378236 73378609 73378395 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 48716 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 73786085 73786476 73786271 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 184462 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.18333847574844 chr6 73833038 73833304 73833144 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 137634 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 73861458 73861626 73861542 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 109312 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 73981759 73981798 73981779 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 NA NA NA NA RP11-398K22.12 10821 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 74861347 74861685 74861516 Y NA NA COL12A1 IMR90 Hi-C 24141950 CD109 457839 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 76467215 76467333 76467230 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 10306 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 76498619 76498787 76498703 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 41710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 80013382 80013562 80013472 Y NA NA NA NA NA NA HMGN3 70976 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 80638393 80638474 80638434 Y ELOVL4 ELOVL4 NA NA NA NA ELOVL4 16823 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 81443202 81443816 81443539 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 628838 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 83194805 83194910 83194858 Y NA NA NA NA NA NA TPBG 123882 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 83737150 83737334 83737242 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 38051 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 83745270 83745402 83745336 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 29983 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 83935269 83935637 83935453 Y NA RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA PGM3 33614 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 84139998 84140114 84140099 Y ME1 ME1 NA NA NA NA ME1 1201 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 84917634 84917758 84917696 Y NA KIAA1009 NA NA NA NA KIAA1009 17595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 85087981 85088261 85088229 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 152628 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 85258714 85258725 85258720 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 323361 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 85334002 85334301 85334152 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 398649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 85484432 85484730 85484624 Y TBX18 NA TBX18 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1009 549079 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr6 87144768 87144816 87144792 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P27 349916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 87897430 87897787 87897609 Y NA ZNF292 NA NA NA NA ZNF292 36879 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 88401154 88401337 88401278 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 8590 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 88433013 88433258 88433054 Y AKIRIN2 AKIRIN2 AKIRIN2-AS1,AKIRIN2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AKIRIN2 23086 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 89440448 89440768 89440686 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 230580 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 90061423 90061611 90061503 Y RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 856 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 90550185 90550523 90550354 Y NA MDN1,CASP8AP2 NA NA NA NA CASP8AP2 12572 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 90774597 90775020 90774993 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 229607 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 90778063 90778292 90778178 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 226335 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 90793727 90794010 90793801 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 210617 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 90856849 90857084 90856969 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 147543 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 90994449 90994671 90994572 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 9956 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 91008460 91008611 91008538 Y NA BACH2 NA NA NA NA BACH2 3833 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 99272215 99272664 99272374 Y POU3F2 POU3F2 NA NA NA NA POU3F2 7916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 99275631 99275937 99275716 Y POU3F2 POU3F2 NA NA NA NA POU3F2 4643 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 99276652 99276809 99276736 Y POU3F2 POU3F2 NA NA NA NA POU3F2 3771 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 99279577 99279776 99279667 Y POU3F2 POU3F2 NA NA NA NA POU3F2 804 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr6 99279823 99280075 99279977 Y POU3F2 POU3F2 NA NA NA NA POU3F2 505 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 99280317 99280875 99280652 Y POU3F2 NA NA NA NA NA POU3F2 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr6 99293549 99293815 99293794 Y POU3F2 POU3F2 NA NA NA NA POU3F2 12969 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 99901572 99901766 99901669 Y NA RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 30365 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 100051584 100051769 100051603 Y NA CCNC,PRDM13 NA NA NA NA PRDM13 837 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 100676865 100677032 100676949 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-121G13.3 299120 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 101965513 101965732 101965659 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 638265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 105073456 105073750 105073604 Y LIN28B NA NA NA NA NA HACE1 232044 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 91524 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr6 106442778 106443178 106442990 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 89017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 106537985 106538349 106538117 Y PRDM1,PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 5790 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 106540002 106540199 106540101 Y PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 7807 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 106542282 106542482 106542317 Y ATG5,PRDM1,PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 10087 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 106589360 106589531 106589446 Y NA NA ATG5,PRDM1,LIN28B IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 57165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 107014040 107014053 107014047 Y BEND3,RTN4IP1 NA NA NA NA NA AIM1 56310 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 107774853 107775271 107775085 Y BEND3 PDSS2,SOBP NA NA NA NA PDSS2 3497 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 108239964 108240066 108240015 Y NA SEC63 NA NA NA NA SEC63 37327 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 108440032 108440340 108440122 Y NA OSTM1 LACE1,NR2E1,ARMC2,SESN1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 44718 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr6 111614404 111614762 111614615 Y NA KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 35853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 111924339 111924647 111924531 Y TRAF3IP2 TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 834 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 112110533 112110931 112110911 Y NA NA NA NA NA NA FYN 81724 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 112163238 112163349 112163330 Y NA FYN NA NA NA NA FYN 29306 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 118246881 118246985 118246933 Y SLC35F1 SLC35F1 NA NA NA NA SLC35F1 20192 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 119217591 119217640 119217616 Y NA ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 4207 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr6 119606195 119606320 119606258 Y NA NA NA NA NA NA MAN1A1 62606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 121530032 121530291 121530288 Y NA NA NA NA NA NA GJA1 224547 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1 NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 122172452 122172679 122172567 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 GJA1 417614 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 122253904 122254092 122253993 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 HSF2 464599 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 122769670 122769957 122769896 Y HSF2,PKIB SERINC1,PKIB NA NA NA NA SERINC1 21010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 123160043 123160346 123160190 Y CLVS2,FABP7 NA NA NA NA NA SMPDL3A 51728 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 16995 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr6 125424080 125424400 125424202 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 13795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 125426714 125426967 125426959 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 11228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr6 125523153 125523251 125523202 Y NA NA NA NA NA NA TPD52L1 84958 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 125579970 125580036 125580003 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 41246 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr6 125622252 125622475 125622321 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 970 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 127618608 127618885 127618797 Y NA RNF146,ECHDC1 NA NA NA NA RNF146 32853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 127741693 127741944 127741787 Y RNF146 RP3-403A15.1,KIAA0408 NA NA NA NA RP3-403A15.1 12837 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 127907573 127907629 127907601 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0408 129037 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0408 202338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 128617083 128617221 128617152 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 222649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 128637396 128637725 128637581 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 202145 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 128754727 128754989 128754858 Y PTPRK,PTPRK NA NA NA NA NA PTPRK 84881 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 129661219 129661453 129661336 Y LAMA2 NA NA NA NA NA ARHGAP18 367917 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 129816833 129816992 129816913 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 212378 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 130022144 130022554 130022402 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 6816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 130513480 130513753 130513616 Y NA NA NA NA NA NA TMEM200A 171126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr6 131929733 131930009 131929873 Y NA MED23 NA NA NA NA MED23 17360 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 133020075 133020153 133020114 Y NA NA NA NA NA NA RPS12 113427 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 133843297 133843543 133843427 Y NA NA NA NA NA NA TBPL1 427765 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 133890779 133890909 133890844 Y NA NA MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 380399 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 135059362 135059611 135059471 Y NA NA SGK1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 362583 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 135352829 135352991 135352910 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 69203 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 135491546 135491834 135491743 Y NA MYB AHI1,BCLAF1,MYB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYB 8619 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 136316549 136316741 136316613 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 145715 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 136807435 136807796 136807768 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 62161 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 137231671 137231914 137231792 Y NA SLC35D3 SLC35D3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35D3 9488 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 138132277 138133056 138132650 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53295 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 138356192 138356530 138356352 Y NA NA PERP MCF7 ChIA-PET 22265404 PERP 70118 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 138426575 138426770 138426671 Y PERP NA NA NA NA NA PERP 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.40167232332328 chr6 138786189 138786282 138786236 Y NA NA NA NA NA NA HEBP2 63521 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 138862383 138862798 138862711 Y PBOV1 NA NA NA NA NA HEBP2 139715 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr6 141765105 141765268 141765171 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 701099 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 141873662 141873944 141873832 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 592423 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 142091291 142091499 142091406 Y VTA1 NA NA NA NA NA VTA1 374868 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 143503002 143503176 143503018 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 123369 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 143994840 143994998 143994919 Y NA NA NA NA NA NA PHACTR2 138858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 144066654 144067070 144066822 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 95411 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 144996503 144996745 144996624 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 391666 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 149352415 149352625 149352483 Y ZC3H12D,TAB2,SUMO4 NA NA NA NA NA TAB2 185152 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 149382626 149382831 149382713 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 154946 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 151302311 151302568 151302430 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 116097 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 151325792 151326084 151325926 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 92581 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 151373285 151373500 151373395 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 45165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 151381285 151381592 151381452 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 37073 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 151815811 151815987 151815867 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1,C6orf97 RMND1,C6orf211 NA NA NA NA C6orf211 44389 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 152583976 152584217 152584151 Y NA NA NA NA NA NA FBXO5 718497 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 154402078 154402202 154402141 Y NA NA NA NA NA NA IPCEF1 273724 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 154664890 154665258 154665161 Y IPCEF1 IPCEF1 NA NA NA NA IPCEF1 10668 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 154665591 154665920 154665816 Y IPCEF1 IPCEF1 NA NA NA NA IPCEF1 10006 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 155590165 155590417 155590245 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 14307 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 156748534 156748826 156748680 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 348237 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 157168828 157169241 157169084 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 71765 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 157267788 157267851 157267817 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 170725 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 157410432 157410741 157410647 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 313369 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 157411919 157412211 157412008 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 314856 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr6 157639062 157639495 157639253 Y C6orf35 NA NA NA NA NA TMEM242 103138 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 158440159 158440546 158440248 Y SYNJ2 SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 39271 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 158784092 158784407 158784250 Y NA NA NA NA NA NA TMEM181 171061 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 158895983 158896180 158896053 Y NA NA NA NA NA NA TMEM181 59288 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 25935 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 158982051 158982465 158982168 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 26583 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 159074587 159075256 159074889 Y TAGAP,DYNLT1,SYTL3 DYNLT1 NA NA NA NA DYNLT1 10816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 159195572 159195684 159195582 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 42760 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 159211450 159211647 159211549 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 26797 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 160135538 160135989 160135680 Y IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 8628 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 160425266 160425362 160425272 Y NA IGF2R NA NA NA NA IGF2R 37135 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 160839575 160839730 160839653 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A3 72275 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 161646912 161646998 161646955 Y NA AGPAT4 NA NA NA NA AGPAT4 46095 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 161790443 161790679 161790575 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 97350 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 161829346 161829532 161829475 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 136253 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 162527778 162527928 162527812 Y NA NA NA NA NA NA PACRG 618236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 163833338 163833600 163833428 Y QKI QKI NA NA NA NA QKI 306 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 165596464 165596827 165596646 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 801264 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 165988383 165988522 165988473 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 409569 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA PDE10A NA NA NA NA PDE10A 24211 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 166958964 166959195 166959080 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 204885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 166959684 166959988 166959836 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 205605 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 166964478 166964522 166964502 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 210399 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr6 166998471 166998754 166998610 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 244392 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 167001220 167001407 167001338 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 247141 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 167038809 167038976 167038893 Y RPS6KA2 NA NA NA NA NA RPS6KA2 278963 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 167115544 167115618 167115576 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 202321 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 170461603 170461884 170461744 Y NA NA LINC00574,LOC154449 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 135677 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 170461964 170462067 170462016 Y NA NA LINC00574,LOC154449 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 135494 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 170463024 170463652 170463502 Y PHF10,TCTE3,C6orf70,FAM120B NA LOC154449 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 133909 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr6 170468202 170468424 170468316 Y NA NA NA NA NA NA DLL1 129137 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr6 170491997 170492052 170492021 Y NA NA NA NA NA NA DLL1 105509 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr6 170492436 170492647 170492551 Y NA NA NA NA NA NA DLL1 104914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr6 170692180 170692479 170692329 Y NA NA NA NA NA NA FAM120B 94389 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 113076 113191 113126 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 77778 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 AC093627.12 180914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr7 579426 579712 579625 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 21493 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 850307 850449 850380 Y SUN1,SUN1 SUN1 NA NA NA NA SUN1 3079 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 1140726 1141099 1140817 Y SUN1,TMEM184A C7orf50 NA NA NA NA C7orf50 34797 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 1416814 1417157 1416984 Y NA NA NA NA NA NA INTS1 126332 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 1546091 1546367 1546260 Y NA INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2602 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 1571848 1572026 1571934 Y ZFAND2A,TMEM184A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3498 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 1968189 1968469 1968397 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 188262 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 2063741 2064015 2063879 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 206863 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 2145561 2145831 2145692 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 125047 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 2306623 2306831 2306646 Y MAD1L1 MAD1L1,FTSJ2,NUDT1 NA NA NA NA NUDT1 26766 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 2366728 2366801 2366785 Y SNX8,LFNG EIF3B,SNX8 FTSJ2,NUDT1,SNX8,EIF3B,KIAA1908,MAD1L1,MAFK,TFAMP1,PSMG3,TMEM184A,ELFN1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3B 24920 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 2548551 2548955 2548724 Y LFNG,LFNG LFNG,BRAT1,IQCE LFNG K562 ChIA-PET 22265404 LFNG 1208 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 2569854 2570215 2570046 Y LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 19691 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 2570337 2570495 2570402 Y LFNG,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 20174 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 2575019 2575461 2575251 Y NA LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA BRAT1 17900 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 2795099 2795530 2795383 Y LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 77725 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 3283908 3284312 3284215 Y SDK1 NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 SDK1 54768 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 3453682 3454067 3453904 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 114602 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 3699539 3699733 3699636 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 360459 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 3885202 3885340 3885271 Y NA NA NA NA NA NA SDK1 546122 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 4723112 4724257 4723950 Y NA FOXK1 NA NA NA NA FOXK1 41724 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 4778448 4778853 4778548 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 97060 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 5379232 5379531 5379399 Y NA NA NA NA NA NA SLC29A4 67232 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 5452779 5453024 5452968 Y NA TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 10021 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 5458136 5458686 5458477 Y FBXL18,TNRC18 TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 4359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 5578052 5578271 5578166 Y NA FBXL18,ACTB RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 ACTB 23144 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 5609221 5609424 5609333 Y FBXL18 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 7806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 5650367 5650762 5650403 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 19928 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 5739659 5740040 5739772 Y USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 79330 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 6422514 6422839 6422633 Y CCZ1 RAC1 NA NA NA NA RAC1 10360 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 6425136 6425343 6425226 Y CCZ1,USP42 RAC1 NA NA NA NA RAC1 12982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr7 7216835 7216977 7216903 Y NA C1GALT1 C1GALT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 C1GALT1 22270 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 7604061 7604281 7604173 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 222 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 7759003 7759285 7759121 Y NA RPA3,RPL23AP51 NA NA NA NA RPA3 2765 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 7896018 7896243 7896099 Y NA NA NA NA NA NA GLCCI1 110182 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 8175214 8175426 8175339 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA AC007009.1 124437 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 11860647 11861050 11860853 Y THSD7A NA NA NA NA NA TMEM106B 387817 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr7 17029591 17029925 17029620 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AGR2 158534 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr7 18575593 18575869 18575740 Y HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 451021 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr7 18678257 18678434 18678328 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 476861 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 19157963 19158297 19158271 Y NA TWIST1 NA NA NA NA TWIST1 2668 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 19186475 19186536 19186492 Y TWIST1,FERD3L TWIST1 NA NA NA NA TWIST1 31180 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 19409277 19409527 19409387 Y NA NA HDAC9 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST1 253982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 19640371 19640397 19640383 Y TMEM196 NA NA NA NA NA TWISTNB 106313 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 20386006 20386499 20386153 Y ITGB8 ITGB8 NA NA NA NA ITGB8 17681 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8,RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr7 21222695 21222703 21222699 Y NA NA NA NA NA NA SP4 242949 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 21502446 21502711 21502550 Y SP4 SP4 NA NA NA NA SP4 36794 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 22339389 22339576 22339483 Y RAPGEF5 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 210042 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 22589401 22589537 22589455 Y NA EEF1A1P6 KLHL7,KLHL7-AS1,TOMM7,FAM126A,LOC100506178,IL6,SNORD93,IGF2BP3 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P6 39783 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA GPNMB 72788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 23375804 23376081 23376055 Y IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 102218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 23501559 23501943 23501874 Y NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 6143 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 AC079780.3 3989 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 24739704 24740021 24739930 Y DFNA5,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 67223 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 24875802 24875986 24875894 Y NA NA NA NA NA NA DFNA5 68558 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 24882463 24882674 24882596 Y NA NA NA NA NA NA DFNA5 75219 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 25872655 25872829 25872766 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 317031 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 26477083 26477150 26477118 Y CBX3 AC004540.5 NA NA NA NA AC004540.5 40870 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 26489472 26489611 26489541 Y NA NA NA NA NA NA AC004540.5 53259 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 27156534 27156699 27156617 Y HOXA3 HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA6,HOXA7,HOXA10-AS NA NA NA NA HOXA-AS2 11138 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 27206716 27206932 27206874 Y HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10 HOXA6,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11 NA NA NA NA HOXA10-AS 478 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 28450839 28451193 28451101 Y CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 113899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 29321344 29321971 29321667 Y CHN2 NA NA NA NA NA CPVL 88277 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 29325062 29325307 29325213 Y CHN2 NA NA NA NA NA CPVL 91995 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 29534563 29534631 29534599 Y WIPF3 NA NA NA NA NA AC007255.8 66655 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 30387689 30388072 30387783 Y NOD1,ZNRF2 AC006978.6 NA NA NA NA AC006978.6 20915 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 32944853 32945232 32945065 Y KBTBD2 KBTBD2,RP9P,FKBP9 NA NA NA NA KBTBD2 13110 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 33316298 33316594 33316442 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 149442 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA NPSR1 380010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 37105106 37105894 37105654 Y AOAH,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA NPM1P18 248542 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 37221797 37222057 37221923 Y NA NA NA NA NA NA ELMO1 264795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 37370501 37370793 37370647 Y GPR141,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 116059 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 37992305 37992525 37992415 Y NA NA NA NA NA NA STARD3NL 223299 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 39438073 39438438 39438256 Y NA NA NA NA NA NA YAE1D1 165537 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 39661947 39662014 39661981 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 865 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 39695521 39695649 39695585 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 34439 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 40584238 40584551 40584395 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 596602 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 40747688 40748041 40747865 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 760052 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 40756959 40757193 40757114 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 769323 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 42120488 42120725 42120693 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 154744 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 42258020 42258279 42258155 Y GLI3 GLI3 NA NA NA NA GLI3 17190 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 43117230 43117632 43117554 Y NA HECW1 HECW1,MRPL32,PSMA2 IMR90 Hi-C 24141950 HECW1 32566 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 43714128 43714419 43714274 Y NA NA NA NA NA NA BLVRA 81860 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 44426024 44426371 44426281 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2B 53848 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 44616133 44616490 44616314 Y NA DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA TMED4 3396 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 46972513 46972753 46972628 Y NA NA IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 647403 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 47510195 47510559 47510444 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 109597 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr7 47515604 47515892 47515680 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 104264 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 47588229 47588393 47588311 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 31763 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 50428255 50428613 50428317 Y IKZF1 NA NA NA NA NA FIGNL1 87475 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 50666851 50666964 50666921 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 150763 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 50682806 50683075 50682899 Y DDC NA NA NA NA NA FIGNL1 166718 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 50769181 50769534 50769358 Y NA NA NA NA NA NA GRB10 89625 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 50859334 50859716 50859525 Y NA GRB10 NA NA NA NA GRB10 175 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 50948563 50948792 50948678 Y GRB10 NA NA NA NA NA GRB10 89404 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 53118098 53118324 53118211 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-14P 313427 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 55637986 55638270 55638071 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 411 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA CHCHD2 1534165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 64217374 64217388 64217381 Y NA ZNF138 NA NA NA NA ZNF138 35378 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 65360437 65360759 65360712 Y NA VKORC1L1 NA NA NA NA VKORC1L1 24183 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 65762762 65763060 65762890 Y RABGEF1,KCTD7 NA NA NA NA NA TPST1 94576 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 68132850 68133026 68132938 Y NA RP5-859M6.1 NA NA NA NA RP5-859M6.1 29065 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 68877694 68877897 68877796 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 184008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 70206735 70207047 70206891 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1144830 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 70358448 70358664 70358566 Y NA NA NA NA NA NA GS1-111G14.1 1046580 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 71695325 71695502 71695415 Y NA NA NA NA NA NA GS1-111G14.1 290081 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 73153813 73154099 73154081 Y FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 2616 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 73156040 73156347 73156148 Y NA STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 4843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 73987997 73988205 73988054 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 81789 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 74020286 74020548 74020393 Y NA GTF2I NA NA NA NA GTF2I 49446 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 74074203 74074528 74074318 Y LAT2,GTF2I GTF2I NA NA NA NA GTF2I 4209 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR SRRM3 SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 SRRM3 33163 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 76002661 76002791 76002762 Y POR YWHAG,ZP3,SRCRB4D NA NA NA NA YWHAG 16313 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3,SRCRB4D NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 77028776 77029116 77028943 Y NA NA NA NA NA NA PTPN12 135476 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 79803492 79803786 79803598 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 42221 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr7 79844591 79844960 79844776 Y NA NA NA NA NA NA GNAI1 83320 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 83081582 83081807 83081725 Y NA NA NA NA NA NA PCLO 291336 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr7 83092459 83092603 83092529 Y NA NA NA NA NA NA PCLO 302213 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr7 86534596 86534997 86534797 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 152018 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 91195125 91195302 91195221 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 303342 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 91466585 91467314 91466893 Y NA MTERF NA NA NA NA MTERF 40720 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.29250539953586 chr7 92156983 92157235 92157087 Y CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64 PEX1,RBM48 NA NA NA NA RBM48 896 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 92217809 92218139 92217980 Y NA FAM133B NA NA NA NA FAM133B 101 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 92274593 92274946 92274914 Y CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 56885 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 92412911 92413100 92413006 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 50697 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 93231275 93231507 93231391 Y CCDC132 NA NA NA NA NA TFPI2 286796 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 93426376 93426400 93426388 Y NA NA NA NA NA NA TFPI2 91903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 94280099 94280356 94280228 Y NA SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA SGCE 3165 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 94557636 94557931 94557784 Y PPP1R9A PPP1R9A NA NA NA NA PPP1R9A 23122 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 94781809 94782176 94781990 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R9A 247295 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 94799053 94799326 94799190 Y PPP1R9A,PPP1R9A NA NA NA NA NA PON2 263184 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 95765148 95765192 95765170 Y DYNC1I1,FLJ42280 NA NA NA NA NA SLC25A13 184267 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 96642145 96642338 96642223 Y DLX6,DLX5 DLX6,DLX6-AS1,DLX5 NA NA NA NA DLX6-AS1 768 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 96642423 96642668 96642630 Y NA DLX6,DLX6-AS1,DLX5 NA NA NA NA DLX6-AS1 1046 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 96646199 96646417 96646378 Y DLX6,DLX5 DLX6,DLX6-AS1,DLX5 NA NA NA NA DLX6-AS1 4822 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr7 96647181 96647459 96647313 Y NA DLX6,DLX6-AS1,DLX5 NA NA NA NA DLX5 4950 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 96657052 96657215 96657134 Y DLX6,DLX5 DLX6,DLX6-AS1,DLX5 NA NA NA NA DLX5 4643 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 96748066 96748124 96748095 Y NA ACN9 NA NA NA NA ACN9 4164 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 99020392 99020577 99020441 Y OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789 BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789 NA NA NA NA CPSF4 13968 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr7 99178135 99178365 99178354 Y ZNF789 ZNF655,FAM200A NA NA NA NA FAM200A 23976 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 99684818 99685168 99684993 Y TSC22D4,PILRB,PILRA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,RP11-506M12.1 NA NA NA NA COPS6 241 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 99961767 99962035 99961969 Y NA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 24236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 25045 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 99994747 99995042 99994880 Y ACTL6B,PILRB MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35 NA NA NA NA MEPCE 29371 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 100144113 100144628 100144364 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9279 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 100514077 100514183 100514130 Y NA SRRT,UFSP1 MUC12,MUC17 IMR90 Hi-C 24141950 UFSP1 28738 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 101096950 101097344 101097147 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 133846 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 101499743 101500539 101499888 Y SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1 CUX1 NA NA NA NA CUX1 42784 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 101586234 101586281 101586260 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 129275 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 101775527 101775981 101775908 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 226338 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr7 102081983 102082063 102082048 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA ORAI2 10430 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 102958965 102959200 102958983 Y NA PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PMPCB 23096 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 104206127 104206133 104206130 Y NA NA NA NA NA NA ORC5 359632 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 104612836 104613032 104612935 Y NA RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 33326 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 104857177 104857523 104857432 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 180232 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 104884738 104885065 104884890 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 152690 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 104960256 104960357 104960307 Y MLL5,SRPK2 NA NA NA NA NA SRPK2 77398 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 105602769 105602970 105602871 Y NA NA NA NA NA NA CDHR3 87527 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 105714803 105715079 105714993 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 35943 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 106089773 106090176 106089868 Y NAMPT,PIK3CG NA NAMPT IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 165001 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 89729 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 107554407 107554624 107554481 Y DLD DLD NA NA NA NA DLD 24992 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 107555392 107555607 107555420 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 25977 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 107562078 107562130 107562088 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 32663 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 107842206 107842455 107842327 Y NA NA NA NA NA NA LAMB1 200506 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 107875663 107876003 107875815 Y NRCAM NA NA NA NA NA NRCAM 219158 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 107925271 107925573 107925565 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 169588 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 107939769 107940082 107939931 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 155079 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 108046989 108047316 108047161 Y NA NRCAM NA NA NA NA NRCAM 47845 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 111628049 111628221 111628153 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 216245 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 111745442 111745761 111745634 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 98705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 111762700 111763025 111763010 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 81441 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 111819433 111819596 111819575 Y NA DOCK4,ZNF277 NA NA NA NA DOCK4 24870 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 112224523 112224575 112224552 Y NA NA NA NA NA NA IFRD1 163500 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 112383831 112384204 112384019 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 44443 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 113688055 113688258 113688160 Y NA FOXP2 NA NA NA NA FOXP2 36124 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 114056337 114056620 114056363 Y NA NA NA NA NA NA FOXP2 331955 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 115887290 115887609 115887434 Y NA TES,CAV2 NA NA NA NA CAV2 37825 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 116651956 116652355 116652105 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 59568 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 118520575 118520914 118520745 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 698489 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 120368280 120368610 120368445 Y KCND2 NA NA NA NA NA TSPAN12 127846 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr7 120377184 120377407 120377295 Y KCND2 NA NA NA NA NA TSPAN12 119049 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 120378721 120379121 120378975 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN12 117335 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.60250848498492 chr7 120420685 120421066 120420916 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN12 75390 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 120422644 120422993 120422820 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN12 73463 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 120942380 120942663 120942460 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 91755 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 121025846 121026096 121025939 Y ING3 FAM3C NA NA NA NA FAM3C 8322 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 121120093 121120403 121120217 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 85675 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr7 121783025 121783385 121783205 Y PTPRZ1,AASS AASS NA NA NA NA AASS 691 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 121874177 121874561 121874390 Y NA NA NA NA NA NA FEZF1-AS1 67151 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 10.6983585311674 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 129418602 129418801 129418733 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169047 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr7 129450096 129450204 129450150 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 140585 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 129469996 129470292 129470140 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 120497 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 129990951 129991103 129991027 Y NA NA NA NA NA NA CPA4 59977 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 130644314 130644883 130644570 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 147972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 130692586 130692952 130692786 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 99903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 133223721 133224093 133223724 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 225554 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 134798847 134799175 134799011 Y NA NA NA NA NA NA C7orf49 54372 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 134862087 134862457 134862329 Y NA C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 8540 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 135459124 135459310 135459189 Y NA NA C7orf73,SLC13A4,FAM180A IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 113880 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr7 136582219 136582518 136582369 Y NA NA NA NA NA NA MTPN 922118 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 136635462 136635508 136635485 Y NA NA NA NA NA NA MTPN 975361 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 139320398 139320629 139320471 Y LUC7L2 NA NA NA NA NA ERHP1 103412 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 139320693 139321014 139320839 Y PARP12,LUC7L2 NA NA NA NA NA ERHP1 103707 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 139333682 139334086 139333875 Y TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA NA ERHP1 116696 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 139367600 139367827 139367677 Y TBXAS1 NA NA NA NA NA TBXAS1 107023 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA TBXAS1 64179 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 139865327 139865485 139865448 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA PARP12 103806 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 139919307 139919330 139919319 Y NA NA JHDM1D,SLC37A3,LOC100134229 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP12 157786 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr7 139929659 139930294 139929953 Y TBXAS1,RAB19,JHDM1D NA JHDM1D,LOC100134229 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP12 168138 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.94750694226039 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 5.56751311315852 chr7 139931722 139931923 139931859 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 RAB19 169920 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr7 140013981 140014173 140014077 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA RAB19 87670 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 140398687 140398980 140398834 Y NA ADCK2,DENND2A,NDUFB2 NA NA NA NA NDUFB2 10110 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 140885436 140885795 140885618 Y NA NA NA NA NA NA MRPS33 172408 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 141334636 141334647 141334642 Y TAS2R3 NA NA NA NA NA KIAA1147 65306 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 142936809 142937123 142937021 Y NA GSTK1,CASP2 NA NA NA NA GSTK1 2063 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 148269293 148269443 148269383 Y NA AC005229.5 NA NA NA NA AC005229.5 6050 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.52833693302391 chr7 148321858 148322147 148322004 Y NA AC005229.5 NA NA NA NA AC005229.5 46365 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 148334506 148334940 148334775 Y NA NA NA NA NA NA CUL1 58066 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.29250539953586 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 149575159 149575279 149575218 Y NA ZNF862,ATP6V0E2,ATP6V0E2-AS1 NA NA NA NA ATP6V0E2-AS1 420 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 57774 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr7 155752755 155752934 155752845 Y SHH NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 SHH 149788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 SHH 151591 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 156290432 156290782 156290467 Y RNF32 NA SHH,LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 RNF32 140193 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 156407407 156407702 156407556 Y NOM1,MNX1,RNF32 RNF32,C7orf13 RBM33,LMBR1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF32 23273 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 156444597 156444947 156444772 Y NA RNF32,C7orf13 NA NA NA NA C7orf13 13249 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr7 156800292 156800601 156800569 Y MNX1,MNX1 MNX1 NA NA NA NA MNX1 744 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr7 157034052 157034373 157034213 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 50990 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 157082177 157082296 157082243 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 43779 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr7 158054533 158054880 158054707 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 440640 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 479972 480137 480087 Y NA NA NA NA NA NA FBXO25 125544 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 1765271 1765682 1765322 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 4460 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 1971088 1971527 1971116 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 200946 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 821027 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 4848301 4848393 4848346 Y CSMD1 NA NA NA NA NA PAICSP4 205447 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 6323096 6323426 6323195 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115C21.2 60433 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 6536860 6537447 6537204 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2541M15.1 26283 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 6577742 6577949 6577849 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 13864 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 8746516 8746997 8746809 Y CLDN23 MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 2158 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 9912937 9913246 9913138 Y NA MSRA NA NA NA NA MSRA 3159 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 10634302 10634482 10634369 Y SOX7 NA NA NA NA NA SOX7 60875 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 11032163 11032532 11032339 Y NA NA NA NA NA NA MTMR9 107393 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 13988363 13988798 13988479 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 617196 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 5.02167849422141 chr8 16489924 16490119 16489983 Y MSR1 NA NA NA NA NA FGF20 367571 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 16504194 16504460 16504327 Y NA NA NA NA NA NA FGF20 353230 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 16629867 16630175 16630011 Y ZDHHC2 NA TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2 IMR90 Hi-C 24141950 FGF20 227515 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 17665479 17665814 17665519 Y NA RP11-156K13.1 NA NA NA NA RP11-156K13.1 8625 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 17893767 17894158 17893964 Y NAT1,ASAH1,ASAH1 CTD-2547L16.1,ASAH1 NA NA NA NA CTD-2547L16.1 46219 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NPM2 NA NA NA NA NPM2 11718 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 22300361 22300587 22300487 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4029 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 22410101 22410594 22410364 Y EPB49,LGI3,PHYHIP,RHOBTB2,RHOBTB2,EGR3,EGR3,SORBS3 SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA SORBS3 9602 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 22441359 22441704 22441532 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 7567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13889 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 22710401 22710511 22710455 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB2 132419 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 23038375 23038737 23038576 Y ENTPD4,ENTPD4,TNFRSF10D TNFRSF10D,TNFRSF10A NA NA NA NA TNFRSF10D 18832 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 24242811 24242949 24242863 Y ADAM28,ADAMDEC1 NA NA NA NA NA ADAM28 93258 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 24858208 24858485 24858356 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 45584 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 24861094 24861317 24861155 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 48470 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 25348135 25348483 25348309 Y CDCA2 KCTD9,CDCA2 NA NA NA NA CDCA2 33622 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 26008929 26009154 26009015 Y NA NA PPP2R2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 137853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 26468935 26469319 26469207 Y DPYSL2 NA NA NA NA NA DPYSL2 99144 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 27547704 27547787 27547746 Y NA NA NA NA NA NA SCARA3 58319 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 28355222 28355409 28355286 Y NA FBXO16,FZD3 NA NA NA NA FZD3 5493 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 28923074 28923318 28923180 Y NA CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 11622 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 29202154 29202365 29202273 Y DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 3820 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 30015593 30015700 30015665 Y NA RPS15AP24,DCTN6 NA NA NA NA DCTN6 3780 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 30462940 30463157 30463081 Y NA NA NA NA NA NA GTF2E2 50611 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 30580467 30580796 30580574 Y GSR GSR,UBXN8 NA NA NA NA GSR 2647 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 30666266 30666462 30666364 Y NA PPP2CB NA NA NA NA PPP2CB 3368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.85583770438617 chr8 30892930 30893420 30892948 Y NA PURG,WRN NA NA NA NA WRN 3613 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 32508172 32508500 32508337 Y NRG1,NRG1 NA NA NA NA NA FUT10 820440 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 33064719 33064932 33064826 Y MAK16,FUT10,C8orf41,C8orf41 NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 264008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 33743518 33743769 33743644 Y MAK16 RP1-273G13.1 NA NA NA NA RP1-273G13.1 27777 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 35119361 35119644 35119503 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 261637 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.16584078983524 chr8 35731817 35732109 35732035 Y NA NA NA NA NA NA LSM12P1 350536 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 407150 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 37376212 37376482 37376355 Y NA RP11-150O12.1 KCNU1,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150O12.1 33219 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 37404927 37405081 37405004 Y NA RP11-150O12.1 KCNU1,ZNF703 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 4620 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 37755287 37755548 37755453 Y NA BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 302 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 37760968 37761285 37761070 Y RAB11FIP1 RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 5983 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 37889292 37889604 37889448 Y NA EIF4EBP1 NA NA NA NA EIF4EBP1 3433 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 37939512 37939733 37939625 Y NA ASH2L ASH2L,PROSC,GPR124,BRF2,RAB11FIP1,GOT1L1,EIF4EBP1,STAR,DDHD2,WHSC1L1,LETM2,FGFR1,TACC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASH2L 21027 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 38223626 38223954 38223916 Y DDHD2,DDHD2 WHSC1L1,LETM2 DDHD2,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 WHSC1L1 13836 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 38312135 38312514 38312441 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 11838 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 38401976 38402324 38402150 Y NA NA FGFR1,LETM2,C8orf86,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF5P1 54394 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 38404543 38404848 38404696 Y FGFR1 NA FGFR1,C8orf86,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF5P1 51870 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 38770998 38771507 38771224 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 14245 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 38790614 38790631 38790622 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 33861 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 39912317 39912749 39912459 Y C8orf4 NA C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-359E19.2 57421 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 39976615 39976841 39976744 Y IDO1 RP11-359E19.2,C8orf4 C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-359E19.2 6445 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 40273499 40273632 40273622 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 264510 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 40590362 40590383 40590373 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT4 162969 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 42149533 42149606 42149596 Y NA RP11-231D20.2,IKBKB,POLB NA NA NA NA IKBKB 22713 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 48242793 48242802 48242797 Y NA NA PRKDC IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA5P12 168300 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 48486280 48486631 48486481 Y NA RP11-697N18.2 NA NA NA NA RP11-697N18.2 16540 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 49430601 49430974 49430806 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 135451 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 49494192 49494425 49494282 Y NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 199042 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 49835974 49836286 49836197 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 3675 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 52747281 52747589 52747434 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 62146 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 52809491 52809887 52809877 Y PCMTD1 NA NA NA NA NA PCMTD1,RP11-110G21.1 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 53243512 53243700 53243588 Y ST18 NA NA NA NA NA FAM150A 232367 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 54256811 54256964 54256882 Y NA NA NA NA NA NA OPRK1 94554 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 54658367 54658716 54658684 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 95402 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 54659884 54660111 54659998 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 94007 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 54932125 54932445 54932251 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 644 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 55382610 55382722 55382677 Y SOX17 NA NA NA NA NA RP11-53M11.3 82199 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 56777129 56777253 56777157 Y LYN LYN LYN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LYN 13119 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 56885324 56886256 56885536 Y LYN NA NA NA NA NA LYN 94952 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 57215871 57215911 57215891 Y NA SDR16C5 NA NA NA NA SDR16C5 15424 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 57360424 57360919 57360645 Y SDR16C5,PENK,PENK RP11-17A4.2,PENK NA NA NA NA PENK 3131 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 15.5017031778139 chr8 59040948 59041341 59041285 Y SDCBP NA NA NA NA NA FAM110B 135880 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 59470194 59470547 59470220 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 6711 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 59476129 59476409 59476167 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 12646 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 59491466 59491801 59491581 Y UBXN2B,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 27983 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 60028775 60028875 60028825 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 724 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 61660299 61660611 61660357 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 70962 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 62427686 62427987 62427837 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 197168 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 62566892 62567143 62567071 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 58012 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 62634023 62634407 62634126 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 8868 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 63162204 63162589 63162538 Y NA NKAIN3 NA NA NA NA NKAIN3 3054 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 64799410 64799591 64799501 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 720298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 65176402 65176460 65176431 Y NA NA NA NA NA NA CYP7B1 532858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 66742209 66742357 66742281 Y NA PDE7A NA NA NA NA PDE7A 10200 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 67454365 67454567 67454497 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 69915 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr8 68098646 68098899 68098873 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 104628 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 68499569 68499804 68499684 Y NA NA NA NA NA NA CPA6 156816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 68889187 68889526 68889357 Y NA PREX2 NA NA NA NA PREX2 26834 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 69983747 69983982 69983910 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H10.3 760364 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 71124105 71124438 71124275 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 109691 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 72628483 72628731 72628610 Y NA NA NA NA NA NA MSC 125972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 72917567 72918022 72917791 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 67830 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 73139685 73140008 73139881 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 153833 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 73227505 73227652 73227579 Y NA NA NA NA NA NA KCNB2 219974 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 73330216 73330391 73330304 Y NA NA NA NA NA NA KCNB2 117235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 73333960 73334345 73334224 Y NA NA NA NA NA NA KCNB2 113281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr8 73481000 73481171 73481085 Y KCNB2 KCNB2 NA NA NA NA KCNB2 33374 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 73497405 73497640 73497408 Y NA KCNB2 NA NA NA NA KCNB2 49779 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 73690966 73691186 73691160 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1145L24.1 100789 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 73733862 73734193 73733971 Y KCNB2 NA NA NA NA NA RP11-1145L24.1 57782 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 73742215 73742578 73742518 Y NA RP11-1145L24.1 NA NA NA NA RP11-1145L24.1 49397 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 73785443 73785827 73785649 Y KCNB2 RP11-1145L24.1 NA NA NA NA RP11-1145L24.1 6148 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr8 73798520 73798610 73798565 Y NA RP11-1145L24.1 NA NA NA NA RP11-1145L24.1 6545 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 74453012 74453349 74453181 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 204594 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 74544159 74544287 74544223 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 113656 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 74625237 74625516 74625377 Y NA STAU2 NA NA NA NA STAU2 32427 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 74637544 74637721 74637705 Y NA STAU2 NA NA NA NA STAU2 20222 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 74805063 74805433 74805333 Y NA UBE2W UBE2W IMR90 Hi-C 24141950 UBE2W 15918 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 75135577 75135926 75135753 Y NA NA NA NA NA NA GDAP1 95439 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 75748881 75749089 75748985 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 145661 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 76035291 76035498 76035400 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 140541 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA HNF4G 186542 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr8 76148779 76148868 76148824 Y NA NA NA NA NA NA HNF4G 169281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 77128503 77128819 77128661 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 462635 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 77389631 77389653 77389643 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 201801 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40896 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 80275634 80276026 80275830 Y STMN2 NA NA NA NA NA STMN2 245023 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 80680806 80681178 80681064 Y HEY1 HEY1 NA NA NA NA HEY1 2708 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 80859511 80859794 80859653 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 80730 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 81034251 81034528 81034390 Y ZBTB10,TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 93727 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 81041762 81041917 81041834 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 99550 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 81587419 81587669 81587654 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 191565 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 81615108 81615487 81615408 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 219254 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 81639602 81640013 81639931 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 243748 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr8 81695028 81695405 81695288 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 299174 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 81699574 81699876 81699725 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 303720 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 81742521 81742946 81742703 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 279357 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 81782792 81783006 81782996 Y ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 239297 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59,CA13 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 86378354 86378674 86378384 Y LRRCC1,CA2 CA2 NA NA NA NA CA2 4273 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 87444767 87445117 87444942 Y WWP1 CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 49942 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 87475103 87475472 87475288 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 19587 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 87650704 87651077 87650891 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A3P4 136884 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 88655608 88655638 88655622 Y NA NA NA NA NA NA MMP16 682616 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 90105251 90105649 90105450 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 662306 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 90912887 90913271 90913166 Y NA OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 800 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 93495936 93496276 93496106 Y NA NA NA NA NA NA FAM92A1 1212513 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 94504789 94504812 94504801 Y NA NA NA NA NA NA FAM92A1 203977 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 94947484 94947898 94947643 Y GEM NA NA NA NA NA PDP1 79449 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 95974189 95974483 95974287 Y TP53INP1 TP53INP1,RP11-347C18.3 C8orf69 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-347C18.3 13924 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 97494117 97494415 97494266 Y NA SDC2 NA NA NA NA SDC2 9164 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 98304769 98305167 98304968 Y NA NA PTDSS1,CPQ,TSPYL5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTDH 349240 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 98877971 98878157 98878074 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA MATN2 911 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 99485745 99486120 99486088 Y NA NA NA NA NA NA POP1 358220 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 100808377 100808591 100808586 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 95699 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 101880714 101880933 101880768 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 82683 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 101881903 101882335 101882088 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706,FLJ42969 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 81281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 101920209 101920392 101920320 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 43224 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 102075998 102076526 102076187 Y GRHL2 NA NA NA NA NA YWHAZ 112382 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 102161878 102162231 102162054 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 54190 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 102388506 102388737 102388522 Y NA NACAP1 NA NA NA NA NACAP1 16484 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 102505547 102505759 102505677 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 2887 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr8 102505982 102506363 102506168 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 3322 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr8 102513804 102514123 102513992 Y NA GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 11144 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 102516990 102517159 102517011 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 14330 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr8 103411260 103411483 103411351 Y UBR5 UBR5 NA NA NA NA UBR5 11586 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 103922083 103922307 103922186 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 17991 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 103933096 103933543 103933196 Y NA AZIN1 AZIN1,ATP6V1C1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 29004 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 104093090 104093280 104093223 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32,DCAF13 NA NA NA NA NA BAALC 57658 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 104331705 104332089 104331783 Y RIMS2 FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1 NA NA NA NA RP11-318M2.2 22705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 105034041 105034154 105034124 Y NA NA NA NA NA NA RP11-5A11.1 464424 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 105487204 105487256 105487230 Y NA NA NA NA NA NA LRP12 111996 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 107073787 107074172 107073868 Y NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-395G23.3 206200 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 107231497 107231750 107231624 Y NA RP11-395G23.3,OXR1 NA NA NA NA RP11-395G23.3 48622 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 107603836 107604153 107603995 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 104088 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 107770186 107770567 107770447 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 61945 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 108314571 108314619 108314595 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 606330 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 108508143 108508403 108508294 Y ANGPT1 NA NA NA NA NA RSPO2 585510 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 108969667 108970068 108969868 Y NA NA NA NA NA NA RSPO2 123845 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 109222483 109222836 109222544 Y NA NA NA NA NA NA RSPO2 128570 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 109230205 109230491 109230349 Y NA NA NA NA NA NA RSPO2 136292 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA RSPO2 136816 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 111109081 111109287 111109184 Y NA NA NA NA NA NA KCNV1 123005 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 114877856 114878270 114878128 Y NA NA NA NA NA NA CSMD3 430528 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 115707569 115707650 115707588 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 1112249 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.09166923787422 chr8 116450341 116450508 116450425 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 369391 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 116454411 116454736 116454628 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 365163 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr8 116641527 116641923 116641875 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 177976 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 159152 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr8 116858162 116858607 116858322 Y TRPS1 TRPS1 NA NA NA NA TRPS1 38263 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 117378539 117378781 117378660 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 397961 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 117889939 117890223 117890034 Y RAD21 MIR3610,RAD21 NA NA NA NA RAD21 4834 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 117990895 117991108 117991002 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 105790 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 119023512 119024035 119023740 Y EXT1 NA NA NA NA NA EXT1 98057 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr8 119323544 119323883 119323714 Y SAMD12 NA NA NA NA NA EXT1 201452 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 120066342 120066835 120066563 Y NA NA SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF11B 103903 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 120232000 120232286 120232044 Y NA NA NA NA NA NA MAL2 56727 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 121456351 121456697 121456524 Y SNTB1,MTBP,MRPL13 MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MRPL13 709 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 121574734 121575043 121574888 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 119092 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 121628287 121628559 121628462 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 172645 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 121702901 121703232 121703165 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 120281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr8 121737162 121737328 121737239 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 86185 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 121809679 121809816 121809747 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 13697 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 121815954 121816374 121816244 Y SNTB1 SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 7139 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.83834001847297 chr8 121821026 121821194 121821110 Y SNTB1 SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 2319 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 121822442 121823157 121823030 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 356 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr8 122361097 122361402 122361250 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 HAS2 290228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 123443932 123444239 123444086 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398G24.2 306509 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 123811167 123811696 123811506 Y C8orf76,ZHX2 NA NA NA NA NA DERL1 240967 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 123883965 123883977 123883971 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 168686 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 144180 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 124169504 124169661 124169520 Y NA NA NA NA NA NA C8orf76 81977 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 124407455 124407786 124407574 Y FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2 ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 18804 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 124524433 124524792 124524749 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 26654 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 124552481 124552488 124552485 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1035 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 125275002 125275221 125275161 Y RNF139 NA FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 107712 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 125466570 125466668 125466619 Y NA TRMT12,RNF139-AS1,RNF139 NA NA NA NA TRMT12 5522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 126037665 126038021 126037843 Y NA SQLE NA NA NA NA SQLE 28926 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr8 127928770 127929133 127928805 Y FAM84B NA NA NA NA NA FAM84B 360132 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 128048074 128048382 128048201 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 479436 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA FAM84B 501690 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 544207 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 128258299 128258698 128258657 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 486982 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 128260594 128261000 128260832 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 484680 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 128578179 128578386 128578271 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 167294 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 128811691 128811973 128811933 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 6912 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 128993662 128993919 128993808 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26938 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129002909 129003328 129003001 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 17529 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129047466 129047656 129047576 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26609 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 129061512 129061955 129061598 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 40655 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129062971 129063389 129063062 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 42114 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 129129719 129130040 129129840 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 108862 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 129569050 129569202 129569118 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 548193 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.74667078059875 chr8 129593885 129594223 129593976 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 573028 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129614909 129615287 129615035 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 594052 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.764168466511954 chr8 129626202 129626412 129626297 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 605345 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr8 129655139 129655338 129655239 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 634282 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129659601 129660006 129659683 Y NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-25P 638744 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr8 129684580 129684880 129684731 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 663723 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129691731 129691904 129691818 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 670874 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 129706266 129706412 129706340 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 685409 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr8 130975001 130975392 130975263 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 51983 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 131012344 131012436 131012358 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 14939 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 131024148 131024528 131024501 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 2847 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 131201084 131201473 131201279 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 173709 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 131291188 131291588 131291505 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 162318 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 131549189 131549211 131549200 Y NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 95283 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 132913668 132913705 132913672 Y HHLA1 EFR3A NA NA NA NA EFR3A 630 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 133221105 133221453 133221279 Y NA NA NA NA NA NA EFR3A 306770 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 133538042 133538101 133538072 Y NA NA NA NA NA NA PHF20L1 247517 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 133958787 133959149 133958918 Y TG NA NA NA NA NA PHF20L1 173169 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 134131797 134131957 134131879 Y TG NA NA NA NA NA WISP1 69325 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr8 134135187 134135428 134135308 Y TG,SLA NA NA NA NA NA WISP1 65854 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr8 134141328 134141671 134141507 Y TG NA NA NA NA NA WISP1 59611 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 137512042 137512062 137512052 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 759304 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 137554492 137554791 137554642 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 801754 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 140830815 140831120 140830968 Y NA NA NA NA NA NA KCNK9 117516 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr8 141604721 141605198 141605144 Y EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 85324 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 141849368 141849592 141849371 Y TRAPPC9 NA NA NA NA NA PTK2 160723 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 141945462 141945818 141945641 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 64497 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 142286712 142287093 142287044 Y NA SLC45A4 SLC45A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 29311 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 142289630 142289814 142289772 Y NA SLC45A4 SLC45A4,PTK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 26590 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 143403466 143403590 143403541 Y TSNARE1 NA NA NA NA NA TSNARE1 79011 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 143809767 143809928 143809818 Y C8orf55 JRK NA NA NA NA JRK 48381 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 144820199 144820570 144820386 Y RHPN1,C8orf73,FAM83H MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1 NA NA NA NA FAM83H-AS1 5889 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 144948428 144948782 144948624 Y EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 NRBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EPPK1 1850 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 145002494 145002937 145002709 Y SPATC1,PLEC PLEC NA NA NA NA PLEC 45965 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 145088816 145089042 145088955 Y PLEC,GRINA,SPATC1 PLEC,GRINA,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1 NA NA NA NA GRINA 26590 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 145257344 145257608 145257476 Y NA NA NA NA NA NA SHARPIN 96317 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 145549095 145549459 145549304 Y NA BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 145911932 145912089 145912059 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 2738 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 631583 631920 631840 Y KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 163292 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr9 1871699 1872019 1872015 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 141323 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 1917403 1917482 1917443 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 95860 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 2241944 2242239 2242031 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 228602 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 2279055 2279418 2279226 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 265713 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 2494677 2494706 2494692 Y VLDLR NA KIAA0020 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 125128 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 2632517 2632641 2632572 Y KCNV2 VLDLR NA NA NA NA VLDLR 12683 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 2655543 2655805 2655674 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 35709 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 3450123 3450354 3450276 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 73650 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 3470131 3470258 3470195 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 53746 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 4835219 4835506 4835309 Y CDC37L1,RCL1 RCL1,MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 12785 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 5460253 5460626 5460389 Y JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274 CD274 PDCD1LG2 IMR90 Hi-C 24141950 CD274 11750 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 5558340 5558581 5558428 Y CD274,KIAA2026,KIAA1432 NA NA NA NA NA KIAA1432 68444 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 6488249 6488567 6488283 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 77098 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr9 8576629 8576984 8576673 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 134327 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 8673225 8673587 8673438 Y NA RP11-134K1.2 NA NA NA NA RP11-134K1.2 37724 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 8675420 8675557 8675548 Y NA RP11-134K1.2 NA NA NA NA RP11-134K1.2 35754 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 8676177 8676347 8676262 Y NA RP11-134K1.2 NA NA NA NA RP11-134K1.2 34964 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 8973007 8973018 8973013 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 115858 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 9469595 9469625 9469608 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 380719 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 13278024 13278458 13278161 Y NA MPDZ,RP11-272P10.3 NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 435 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 14271164 14271559 14271500 Y NA NA NA NA NA NA NFIB 125423 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 14533478 14534091 14533689 Y NFIB NA NA NA NA NA NFIB 136496 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 14575436 14575689 14575562 Y ZDHHC21 NA NA NA NA NA ZDHHC21 115780 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 15300887 15301166 15301002 Y TTC39B TTC39B NA NA NA NA TTC39B 4192 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 15306066 15306408 15306119 Y NA TTC39B NA NA NA NA TTC39B 708 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 15477137 15477463 15477300 Y NA PSIP1,FTH1P12 NA NA NA NA PSIP1 31554 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 17742097 17742364 17742226 Y SH3GL2 NA NA NA NA NA SH3GL2 165017 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 306073 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 20552301 20552464 20552406 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 68078 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL9 236740 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 21388342 21388353 21388348 Y NA NA NA NA NA NA KLHL9 54963 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 21496569 21496909 21496764 Y NA MIR31 NA NA NA NA MIR31 13275 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103429 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 22310596 22310829 22310637 Y NA NA MTAP,DMRTA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMRTA1 134011 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 23850835 23851256 23851099 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA1 1405995 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chr9 27564116 27564302 27564198 Y C9orf72,C9orf72 MOB3B,C9orf72 NA NA NA NA C9orf72 7562 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 29211344 29211542 29211410 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1475561 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 32524178 32524624 32524592 Y DDX58 TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 33033161 33033386 33033274 Y TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1 APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 9952 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 33160944 33161390 33161236 Y DNAJA1,SMU1,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 3964 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 33931170 33931493 33931332 Y UBAP1,UBE2R2 NA NA NA NA NA UBAP2 115454 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 34016159 34016420 34016379 Y NA UBAP2 NA NA NA NA UBAP2 30527 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 34158490 34158839 34158617 Y NA DCAF12,UBAP1 DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBAP1 18164 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr9 36039800 36039974 36039887 Y OR2S2,RECK RECK NA NA NA NA RECK 5370 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 36232965 36233105 36233040 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 41948 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 36765862 36766252 36766147 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 195003 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 37197498 37198123 37197885 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78962 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 37963992 37964293 37964120 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 102391 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1,IGFBPL1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBPL1 15126 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 68299584 68299663 68299624 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 153712 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 68423908 68424365 68424207 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 29010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 68436364 68436652 68436508 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 16723 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 71784003 71784073 71784064 Y TJP2 TJP2 NA NA NA NA TJP2 49794 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 71793410 71793781 71793424 Y NA NA NA NA NA NA TJP2 59201 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 72360056 72360394 72360281 Y NA PTAR1 NA NA NA NA PTAR1 12481 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 72837972 72838313 72838181 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 33624 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 73025378 73025559 73025525 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 1981 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 5.89501388452079 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.20083616166164 chr9 73196795 73197009 73196903 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 169255 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 73402441 73402694 73402566 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 374901 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 73451012 73451025 73451019 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 423472 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 73507524 73507538 73507531 Y TRPM3 NA NA NA NA NA KLF9 479984 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 73749210 73749614 73749539 Y NA NA NA NA NA NA TRPM3 310206 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 73870587 73870996 73870794 Y NA NA TRPM3 IMR90 Hi-C 24141950 TRPM3 188824 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 74167536 74167704 74167695 Y NA RPL35AP21 NA NA NA NA RPL35AP21 34813 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.52833693302391 chr9 74293239 74293379 74293310 Y TMEM2 NA NA NA NA NA RPL35AP21 90722 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 74986433 74986819 74986683 Y NA ZFAND5 ZFAND5,TMC1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFAND5 8270 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 75155526 75155660 75155598 Y ZFAND5 NA NA NA NA NA ZFAND5 177363 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 75511457 75511847 75511682 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 181511 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 75518800 75519107 75519099 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 174251 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.52833693302391 chr9 75549526 75549619 75549601 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 143739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.655001542724532 chr9 75562890 75563230 75563163 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 130128 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr9 75580383 75580516 75580515 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 112842 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 75602878 75603123 75602991 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 90235 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 77844840 77845130 77844986 Y NA NA NA NA NA NA OSTF1 143381 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 85072190 85072207 85072199 Y FAM75D1 NA NA NA NA NA SNORD95 570357 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 86051693 86051979 86051837 Y NA NA NA NA NA NA FRMD3 99482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 86239584 86239974 86239757 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 80535 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 88142542 88142852 88142743 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 212092 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 88935508 88935794 88935577 Y NA ISCA1,ZCCHC6 NA NA NA NA ZCCHC6 31575 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 88983987 88984393 88984184 Y NA ZCCHC6 DAPK1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC6 16618 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 90166692 90166955 90166778 Y NA RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 28475 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 91762072 91762095 91762084 Y NA NA NA NA NA NA S1PR3 157710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr9 92037669 92038073 92037727 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 72972 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 92050487 92050811 92050719 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 60234 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 92218967 92219282 92219262 Y NA GADD45G NA NA NA NA GADD45G 1039 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 93602327 93602707 93602517 Y SYK,SYK SYK NA NA NA NA SYK 40258 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 93975322 93975401 93975365 Y NA NA NA NA NA NA AUH 146794 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 94993084 94993195 94993158 Y NA NA NA NA NA NA IARS 60843 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 95288173 95288480 95288343 Y NA RP11-19J3.5 NA NA NA NA RP11-19J3.5 10986 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 95452860 95453088 95452974 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 22313 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 95880555 95880921 95880640 Y NA C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 13649 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 96901972 96902054 96902023 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 37062 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.41917000923649 chr9 97590305 97590486 97590422 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 103322 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 142594 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 97679079 97679413 97679326 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 192096 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 97699905 97700054 97699963 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 212922 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 97758166 97758608 97758351 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 271183 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 97839686 97839862 97839737 Y PTCH1 NA NA NA NA NA FANCC 238129 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 97852376 97852657 97852531 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 225334 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 97852724 97853044 97852860 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 224947 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 97853945 97854061 97854005 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 223930 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 97881296 97881429 97881363 Y FBP1 NA NA NA NA NA FANCC 196562 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 98075518 98075673 98075591 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 2318 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 98237628 98237804 98237716 Y NA PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 39535 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 98262009 98262267 98262138 Y PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 15072 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.873335390299376 chr9 98583076 98583344 98583210 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 52915 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 100454693 100454853 100454773 Y TSTD2,XPA XPA NA NA NA NA XPA 2786 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 100455337 100455352 100455343 Y NA XPA NA NA NA NA XPA 2287 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 100994380 100994637 100994474 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 21278 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 101572840 101572995 101572898 Y GALNT12 ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA GALNT12 4859 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 101573359 101573810 101573605 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA GALNT12 5378 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 101868249 101868435 101868378 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 3929 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 102569580 102569664 102569622 Y NA RP11-554F20.1 ALG2,SEC61B,NR4A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-554F20.1 10507 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 107983498 107983520 107983511 Y NA SLC44A1 SLC44A1,ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 21383 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 108052780 108053053 108052862 Y ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L SLC44A1 NA NA NA NA SLC44A1 47877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 108621964 108622364 108622354 Y NA NA MIR548Q,ZNF462 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM38B 167139 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 109627297 109627657 109627483 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3919 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 110228422 110228558 110228470 Y NA KLF4 NA NA NA NA KLF4 22205 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr9 110802909 110803314 110803056 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 508238 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 111003656 111003963 111003923 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 383150 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 111025609 111025952 111025781 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 361161 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 111759404 111759745 111759575 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 14064 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 114364049 114364191 114364143 Y KIAA0368,GNG10 PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10 NA NA NA NA PTGR1 3914 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 114389379 114389396 114389388 Y NA PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10,GNG10 DNAJC25-GNG10 MCF7 ChIA-PET 22265404 DNAJC25 2236 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 114678571 114678728 114678577 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 21525 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 115605913 115605928 115605920 Y ZFP37 NA NA NA NA NA SNX30 94795 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 115625683 115626114 115625766 Y SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2 NA NA NA NA NA SNX30 114565 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 116281787 116282895 116282664 Y NA NA NA NA NA NA POLE3 110835 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 117080236 117080340 117080297 Y TNFSF15,ATP6V1G1,ORM1 NA NA NA NA NA DFNB31 185390 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 117317532 117317672 117317593 Y TNFSF8,TNFSF15,ATP6V1G1 ATP6V1G1 DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP6V1G1 30354 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 117647197 117647589 117647272 Y ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA C9orf91 275711 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 118353952 118354125 118354022 Y TNC NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf91 982466 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 119311432 119311888 119311785 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 135693 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 119404408 119404429 119404420 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 43152 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 123446824 123446976 123446902 Y TRAF1,TRAF1 MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 27772 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 123455501 123455738 123455670 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 19010 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 123640419 123640826 123640772 Y NA PSMD5,PHF19 NA NA NA NA PHF19 2813 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 125811144 125811514 125811213 Y NA NA MIR600HG IMR90 Hi-C 24141950 RABGAP1 110032 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 125956223 125956395 125956307 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 72460 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 126002195 126002288 126002252 Y OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP STRBP NA NA NA NA STRBP 26567 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 126632279 126632299 126632291 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 58132 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 126644407 126644614 126644564 Y LHX2 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 45817 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 127329970 127330135 127330093 Y NA NA NA NA NA NA MIR181A2HG 88611 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 127433186 127433516 127433351 Y NR6A1 MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 14440 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 127458498 127458770 127458741 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 39752 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 127475055 127475439 127475319 Y NA NA NA NA NA NA NR6A1 56150 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 127509473 127509808 127509481 Y NA NR6A1 NA NA NA NA NR6A1 21781 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1 NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 127523126 127523289 127523221 Y NA NR6A1 NA NA NA NA NR6A1 8300 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 127621077 127621225 127621167 Y NA RPL35,ARPC5L,RNU4-82P NA NA NA NA RPL35 1035 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 127861290 127861583 127861437 Y NA SCAI NA NA NA NA SCAI 42202 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 129185557 129185839 129185698 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 379446 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 129232894 129233686 129233447 Y ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 331599 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 129263295 129263658 129263477 Y FAM125B,RALGPS1,RALGPS1,LMX1B NA NA NA NA NA ZBTB43 301627 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 129285503 129285639 129285571 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 279646 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 129290502 129290605 129290554 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 274680 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 129951111 129951299 129951234 Y NA GARNL3 NA NA NA NA GARNL3 33245 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 130373507 130373780 130373645 Y GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1 FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA STXBP1 963 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 130834970 130835273 130835056 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25 SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 6485 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 131007254 131007504 131007363 Y URM1,CERCAM,FPGS,FPGS,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA SWI5 28154 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 132168772 132168919 132168823 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 74811 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 132319720 132320056 132319894 Y DOLPP1 NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 75990 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chr9 132349858 132350089 132350073 Y NA NA LOC100506190,IER5L,C9orf50 MCF7 ChIA-PET 22265404 ASB6 52355 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 132359774 132359922 132359814 Y PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A ASB6 NA NA NA NA ASB6 42522 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 132459422 132459648 132459595 Y NA PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 33502 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chr9 132707337 132707718 132707526 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1 95755 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 132785309 132785843 132785545 Y USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 17630 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 132802902 132803300 132803100 Y ASB6,USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 173 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.31000308544906 chr9 133565926 133566149 133566038 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 959 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.9650046281736 chr9 134278219 134278688 134278276 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 10739 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 134537317 134537597 134537547 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 75864 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 134582403 134582762 134582583 Y NA RAPGEF1 PRRC2B,UCK1,POMT1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF1 30699 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 135197315 135197652 135197484 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 30720 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 136226163 136226469 136226316 Y NA SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96 NA NA NA NA SURF1 4611 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 137030495 137030803 137030732 Y NA WDR5 NA NA NA NA WDR5 32008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 137717068 137717259 137717190 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 510124 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 137718262 137718824 137718799 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 511318 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 137739401 137739789 137739783 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 532457 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 138992686 138992828 138992756 Y SOHLH1 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 7555 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 139136338 139136616 139136467 Y QSOX2 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 651 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 139237317 139237472 139237398 Y GPSM1 GPSM1,DNLZ NA NA NA NA GPSM1 17385 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 139444945 139445101 139445057 Y TMEM141,SDCCAG3 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-611D20.2 6281 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 139608163 139608561 139608378 Y EGFL7,EGFL7,NPDC1,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3141 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 139608810 139609132 139608936 Y SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3788 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 3.60250848498492 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 2.29250539953586 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,NOXA1,ENTPD8 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chr9 140341522 140341675 140341601 Y EHMT1,ANAPC2,NELF EXD3,NOXA1,ENTPD8 NA NA NA NA ENTPD8 7254 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 3732525 3732707 3732561 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 102876 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.54583461893711 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 9477403 9477544 9477474 Y FAM9B,TBL1X,LOC100288814 TBL1X NA NA NA NA TBL1X 48068 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM2 51107 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 9929375 9929481 9929417 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 52121 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 10009531 10009534 10009533 Y NA WWC3 NA NA NA NA WWC3 27929 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 10586151 10586408 10586285 Y NA NA NA NA NA NA MID1 263365 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 16769633 16769754 16769694 Y NA CTPS2,SYAP1,TXLNG NA NA NA NA TXLNG 32796 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 20283183 20283718 20283506 Y SH3KBP1,RPS6KA3 NA NA NA NA NA RPS6KA3 0 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 20998267 20998386 20998380 Y NA NA NA NA NA NA CNKSR2 392150 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 22013670 22013825 22013692 Y NA NA NA NA NA NA SMS 56979 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 23800091 23800377 23800148 Y NA ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 801 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 23922308 23922544 23922448 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 1513 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 38338792 38338989 38338897 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN7 79634 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 40028554 40028949 40028781 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 5633 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 41547328 41547693 41547479 Y NA NA NA NA NA NA CASK 233023 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 43503580 43504080 43503735 Y NA NA NA NA NA NA RP3-326I13.1 469337 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA FUNDC1 511159 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 45617544 45618196 45618069 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13014 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 45645081 45645275 45645187 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 40551 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 46316672 46316948 46316811 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18523 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 47382833 47383145 47382966 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 35371 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 48777238 48777933 48777700 Y TBC1D25,WAS,PQBP1,PPP1R3F,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1 PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5 NA NA NA NA PIM2 2937 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 49139256 49139619 49139438 Y FOXP3,PPP1R3F CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 14950 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 53292881 53293274 53292937 Y NA KDM5C NA NA NA NA KDM5C 40277 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 56756944 56757158 56757051 Y NA RP11-622K12.1,UQCRBP1 NA NA NA NA RP11-622K12.1 3252 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 56791132 56791384 56791234 Y NA RP11-622K12.1,UQCRBP1 NA NA NA NA UQCRBP1 29122 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 56839801 56840427 56840156 Y NA NA NA NA NA NA UQCRBP1 77791 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 57929641 57930031 57929858 Y NA ZXDA NA NA NA NA ZXDA 5036 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chrX 73236075 73236382 73236224 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 73916 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 73250242 73250558 73250399 Y NA NA NA NA NA NA JPX 88083 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 73352212 73352497 73352336 Y NA USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 39228 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chrX 73791399 73791714 73791557 Y RLIM RLIM NA NA NA NA RLIM 40738 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 76056271 76056538 76056478 Y NA NA NA NA NA NA MAGEE1 410225 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 77226253 77226302 77226278 Y NA NA NA NA NA NA ATP7A 62059 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 79827525 79827860 79827693 Y NA NA NA NA NA NA HMGN5 627581 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 84475648 84475726 84475688 Y NA ZNF711 NA NA NA NA ZNF711 21271 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 85196824 85197022 85197001 Y NA NA NA NA NA NA CHM 103544 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 85278748 85279124 85278988 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 21442 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 87351546 87351899 87351791 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 1320 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 99572593 99572603 99572598 Y PCDH19 NA NA NA NA NA PCDH19 90668 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2 NA NA NA NA CSTF2 38037 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 NA NA NA NA NA GPRASP2 50168 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 105846689 105846768 105846729 Y CLDN2 CXorf57 NA NA NA NA CXorf57 6392 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.982502314086798 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 115372300 115372667 115372491 Y NA NA SLC6A14 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A14 193123 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 125406399 125406559 125406479 Y NA NA NA NA NA NA MTND4P24 198309 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 125556519 125556645 125556582 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 48223 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.63750385681133 chrX 127434305 127434453 127434370 Y NA NA NA NA NA NA OCRL 1237373 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 128911334 128911515 128911430 Y ELF4,ELF4,BCORL1,SASH3 NA NA NA NA NA ZDHHC9 64370 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 129066097 129066492 129066260 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 28000 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.327500771362266 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 129848088 129848429 129848259 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 186779 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 130627096 130627500 130627335 Y NA NA NA NA NA NA MST4 527793 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 131159301 131159695 131159439 Y RAP2C,MBNL3,MST4,MST4 MST4 NA NA NA NA MST4 4008 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 132400242 132400521 132400363 Y NA NA NA NA NA NA GPC4 146997 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 133509019 133509280 133509152 Y PHF6 PHF6 NA NA NA NA PHF6 3736 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 138215503 138215737 138215513 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 87202 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 147499581 147499753 147499673 Y NA NA NA NA NA NA AFF2 80386 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 149084401 149084780 149084588 Y NA LINC00894,CXorf40B NA NA NA NA LINC00894 20066 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 149863384 149863571 149863479 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3949 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 149996146 149996459 149996317 Y NA NA NA NA NA NA CD99L2 68830 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 1.85583770438617 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA NSDHL 129860 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844 chrX 154365480 154365529 154365504 Y NA MTCP1 NA NA NA NA MTCP1 8683 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrY 13470203 13470486 13470410 Y NA DUX4L17 NA NA NA NA DUX4L17 1606 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.436667695149688 chrY 13484567 13484797 13484656 Y NA DUX4L17 NA NA NA NA DUX4L17 15970 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.109166923787422 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 1541535 CAGE LK-2 hg19 FANTOM5 0.218333847574844