chr1	839741	840250	839788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	52439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	855764	856157	855856	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	NOC2L	36532	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	858256	858648	858448	Y	SAMD11	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	NOC2L	34041	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	868565	868684	868625	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	NOC2L	24005	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	936652	937138	936860	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	C1orf170	K562	ChIA-PET	22265404	HES4	3100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.38965525099513
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.24683610025011
chr1	1008722	1008886	1008828	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	1035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.897620277261674
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	1060905	1061095	1061000	Y	RNF223	C1orf159	MIR429,MIR200B,MIR200A,ACAP3,SCNN1D,B3GALT6,SDF4,UBE2J2,C1orf159	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C1orf159	11164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	1098630	1098901	1098641	Y	NA	C1orf159,TNFRSF18	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	41170	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	1143531	1144198	1143599	Y	MIB2,LOC441869,TNFRSF18,TNFRSF4	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	3460	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	1173386	1173736	1173661	Y	PLEKHN1	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6,UBE2J2	NA	NA	NA	NA	B3GALT6	7757	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	1186391	1186507	1186467	Y	NA	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6,UBE2J2	NA	NA	NA	NA	UBE2J2	20758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.34486010885122
chr1	1609619	1609864	1609850	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	21146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr1	1714020	1714715	1714566	Y	SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	4124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.3111710405857
chr1	2059932	2059994	2059963	Y	HES5	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	82165	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	2068660	2068858	2068763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	73301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.08891123553465
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.83417572815571
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr1	3634737	3634863	3634787	Y	WRAP73,TP73	NA	NA	NA	NA	NA	WRAP73	67412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	7609389	7609632	7609504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	219697	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	7656791	7657175	7656983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	172154	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.83158133251167
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	8121436	8121582	8121497	Y	ERRFI1	ERRFI1	RERE,ERRFI1,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	37068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	52933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	73049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	34610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	8250099	8250155	8250127	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	14502	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	8254637	8254907	8254798	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	9750	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	8257762	8258040	8257906	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	6617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	7384	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	8445817	8446112	8445964	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	69931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	8488165	8488317	8488222	Y	TNFRSF9,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	112279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	195750	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	8858188	8858497	8858477	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	17205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.93210525249825
chr1	8971325	8971721	8971517	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ENO1	34017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	8983094	8983258	8983175	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	45786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr1	9195486	9195787	9195690	Y	SLC25A33,GPR157	GPR157,RP3-510D11.2	NA	NA	NA	NA	GPR157	8257	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	9223692	9223875	9223840	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	16388	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	9355493	9355709	9355601	Y	NA	SPSB1	NA	NA	NA	NA	SPSB1	4554	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.2226365189385
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr1	9960528	9960713	9960585	Y	NA	CTNNBIP1,LZIC,NMNAT1	NA	NA	NA	NA	CTNNBIP1	7681	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr1	10447707	10448369	10448247	Y	NA	PGD,APITD1,APITD1-CORT	NA	NA	NA	NA	PGD	8280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	10557233	10557456	10557348	Y	NA	PEX14,DFFA	CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	DFFA	26650	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	10559059	10559458	10559098	Y	NA	PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	DFFA	28476	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	10695291	10695734	10695495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	158973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	10816030	10816223	10816138	Y	CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	38484	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	10853986	10854555	10854168	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	152	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	10864514	10864918	10864748	Y	NA	CASZ1	PEX14,CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	9807	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr1	10926873	10927035	10926954	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72166	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	10927237	10927380	10927309	Y	CASZ1	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	10959985	10960148	10960064	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.67460791149422
chr1	11559549	11559947	11559917	Y	NA	PTCHD2	NA	NA	NA	NA	PTCHD2	22326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	12546528	12546819	12546674	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	128918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	14087510	14087640	14087574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	62817	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	15119702	15119955	15119829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	196502	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	15416988	15417263	15417153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	59765	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	15673118	15673422	15673270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	60969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	15742467	15743324	15742634	Y	TMEM51,TMEM51,SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	8076	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.05718809392317
chr1	16158409	16158760	16158690	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	5685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85755669608394
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	16277350	16278224	16277618	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	22403	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	16292565	16293101	16292653	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17,C1orf64	SPEN	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB17	7526	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.73648215355889
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.05158884813971
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MFAP2	73626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.47976007968361
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	MFAP2	64547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.3050593169716
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.96634260577234
chr1	17865185	17865523	17865202	Y	ARHGEF10L	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	17867253	17867735	17867370	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	2923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03851598054878
chr1	17880613	17880854	17880734	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	16283	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	17887951	17888293	17888247	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	23621	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	19190435	19190769	19190601	Y	NA	ALDH4A1	NA	NA	NA	NA	ALDH4A1	36506	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	19324821	19325090	19324988	Y	TAS1R2,IFFO2	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2,UBR4	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	43641	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	19701557	19701789	19701674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC2	64737	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	19703880	19704261	19704067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC2	67060	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	19762527	19762798	19762680	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	47268	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	19804974	19805167	19805055	Y	PLA2G2E	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	4899	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	21655798	21656254	21656078	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	13743	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	21663991	21664182	21664145	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	5815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	22740781	22741031	22740973	Y	NA	ZBTB40	CDC42,WNT4,C1QC,C1QA,ZBTB40,EPHB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB40	35313	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	23357547	23357765	23357628	Y	NA	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	13606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	23778586	23778784	23778678	Y	NA	TCEA3,ASAP3	NA	NA	NA	NA	TCEA3	29353	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.09687582827195
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr1	23912037	23912393	23912293	Y	PNRC2,RPL11	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	27752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	23916918	23917225	23917105	Y	HNRNPR	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	32633	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	23918101	23918449	23918188	Y	SRSF10,CNR2,E2F2	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	33816	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	24235925	24236209	24236107	Y	RPL11,PNRC2,CNR2	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.4	37664	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr1	24831610	24831804	24831717	Y	NA	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	4223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	25051079	25051208	25051162	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	18640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.939274805323
chr1	25942744	25943208	25942998	Y	EXTL1,MAN1C1	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAP1	74673	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	26101389	26101767	26101516	Y	PDIK1L,LDLRAP1,MAN1C1,FAM54B	SEPN1	NA	NA	NA	NA	SEPN1	22900	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.61441996763022
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.71115709833046
chr1	27021406	27021810	27021509	Y	NA	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.76667953389525
chr1	27160002	27160387	27160288	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18,SFN	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	8801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	10.4758677719431
chr1	27336678	27336931	27336804	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	396	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	27468191	27468425	27468281	Y	NA	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	23047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.91945364456094
chr1	27772061	27772370	27772216	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	42299	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	27831022	27831314	27831199	Y	NA	WASF2	SYTL1,GPR3,WASF2,AHDC1,FGR	IMR90	Hi-C	24141950	WASF2	16353	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.1607395704615
chr1	27893464	27893671	27893490	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	35271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	27901397	27901604	27901422	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	27338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	27922522	27922947	27922946	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	5995	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	27928507	27928973	27928740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHDC1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	28152962	28153213	28153036	Y	NA	PPP1R8,SCARNA1	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	2076	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	28318645	28318992	28318812	Y	FAM76A	XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	34672	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	28431716	28431884	28431798	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EYA3	18509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr1	28485616	28486049	28485996	Y	STX12,C1orf38,XKR8,EYA3,SESN2,MED18,PTAFR,PTAFR,DNAJC8	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC8	71487	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.739622767641473
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	29101544	29101853	29101799	Y	EPB41	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	40411	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr1	29104880	29105053	29104930	Y	NA	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	43747	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	29137630	29137906	29137764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41	73697	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr1	29598339	29598546	29598399	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	37311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.14679901805328
chr1	31251287	31251533	31251452	Y	NA	RP1-65J11.1	LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-65J11.1	43542	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	31430605	31430735	31430670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	50997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	84858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.23090604771702
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.38967795740746
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr1	31976608	31977048	31976952	Y	PUM1	NA	LOC284551	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	96196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	32170830	32171205	32171045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI2	57289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	25153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr1	33082385	33082406	33082394	Y	ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	32098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1522	22973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.8472258893343
chr1	33220963	33221073	33221021	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	19570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr1	33226574	33226719	33226667	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21088	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.95077736587264
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	33433896	33434020	33433958	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	5610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	33438571	33438703	33438616	Y	KIAA1522,ADC	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	10285	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.939274805323
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	36952484	36952865	36952715	Y	MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	OSCP1,MRPS15	NA	NA	NA	NA	MRPS15	24446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	37464724	37465074	37465012	Y	NA	GRIK3	NA	NA	NA	NA	GRIK3	32656	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	37784198	37784531	37784441	Y	GRIK3,EPHA10	NA	GRIK3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01137	153481	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	38312444	38312820	38312535	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	10472	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	38465723	38465839	38465779	Y	MTF1,FHL3	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	3439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	39357087	39357474	39357146	Y	MACF1,GJA9	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	MYCBP	11798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	39509536	39509726	39509631	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	19546	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr1	40283075	40283206	40283146	Y	PABPC4,RLF,MFSD2A	BMP8B	MYCL1	K562	ChIA-PET	22265404	BMP8B	30542	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	40866111	40866454	40866257	Y	RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	NA	NA	NA	NA	NA	SMAP2	57589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	41178788	41178979	41178866	Y	ZMPSTE24,SMAP2,SMAP2,ZNF642,DEM1,ZNF684,CITED4,NFYC,NFYC	RIMS3,NFYC	KCNQ4	IMR90	Hi-C	24141950	NFYC	23468	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	41365158	41365531	41365407	Y	NA	CITED4	CITED4,CTPS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	39140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.42542917070261
chr1	41367669	41367867	41367801	Y	NA	CITED4	CITED4,CTPS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	41651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.529379200482229
chr1	41828934	41829164	41829075	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	3340	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	41915297	41915638	41915514	Y	HIVEP3	EDN2	EDN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN2	32706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	41966127	41966464	41966357	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	17783	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr1	41967378	41967702	41967588	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	19034	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr1	41981831	41982007	41981926	Y	SLFNL1,SLFNL1	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	33487	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	41994633	41994922	41994778	Y	SCMH1,HIVEP3	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	46289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.572604035584846
chr1	42204198	42204327	42204253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	255854	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	42325828	42326208	42326056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	173388	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.44164058580608
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	42367142	42367456	42367439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	42385609	42385954	42385889	Y	FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	113642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.826305619677
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	43427522	43427762	43427666	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	43533809	43534205	43534063	Y	NA	NA	FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP	IMR90	Hi-C	24141950	WDR65	101615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	43975817	43975939	43975873	Y	NA	PTPRF	SZT2,HYI,PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	12919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7063301860472
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.614258563646172
chr1	44150815	44151139	44150977	Y	ST3GAL3,SLC6A9,IPO13	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	18356	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	44302297	44302456	44302338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-7O11.3	107767	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr1	44324219	44324394	44324336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-7O11.3	85829	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	44428103	44428423	44428269	Y	SLC6A9,RNF220,IPO13	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	5249	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr1	44729368	44729720	44729427	Y	ATP6V0B	NA	NA	NA	NA	NA	DMAP1	52241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	44764661	44765046	44764854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERI3	53886	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	45298718	45299070	45298894	Y	NA	PLK3,TCTEX1D4,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	PTCH2	7665	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	46268583	46268737	46268651	Y	NA	MAST2	NA	NA	NA	NA	MAST2	17924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	46573980	46574380	46574180	Y	TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	64365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	63570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr1	46637172	46637331	46637258	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	1414	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	46637652	46637852	46637691	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	893	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr1	46639254	46639547	46639393	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	47699046	47699332	47699189	Y	NA	TAL1	NA	NA	NA	NA	TAL1	3154	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	48429188	48429510	48429349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	482098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	51757763	51757925	51757844	Y	TTC39A,OSBPL9	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39A	50863	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	51809780	51810107	51809799	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	992	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	51986075	51986410	51986173	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	EPS15	3075	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chr1	52035422	52035744	52035601	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	5107	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.43901658269421
chr1	52044179	52044304	52044242	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL9	3328	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	52193707	52193852	52193763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	148625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.917862697677353
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	54715450	54715803	54715579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	51741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	54739679	54739787	54739710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	75970	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	54744858	54745090	54744974	Y	NA	NA	CYB5RL,MRPL37	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	81149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	54808081	54808294	54808188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	68858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	54842500	54842749	54842625	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	34403	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.32984315396009
chr1	56991269	56991531	56991390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-710M16.2	112634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	57042744	57043185	57043024	Y	C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	65789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	57297998	57298181	57298090	Y	NA	C1orf168	DAB1,C1orf168,C8A,C8B	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf168	14629	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	59085972	59086240	59086165	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	44806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01984386717439
chr1	59228706	59229186	59229035	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	18599	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	59232576	59232611	59232594	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	15174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	59280364	59280505	59280397	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32579	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.47898481255486
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03851598054878
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.529379200482229
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	JUN	121264	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.614258563646172
chr1	62307827	62308113	62307970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	101678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	62416847	62417238	62417043	Y	INADL,USP1,KANK4	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	210698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	62948948	62949316	62949132	Y	KANK4,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	48980	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	63886654	63886800	63886727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG6	55393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	64197270	64197475	64197385	Y	NA	ROR1	ROR1,UBE2U,PGM1	IMR90	Hi-C	24141950	ROR1	40218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	65381647	65381826	65381744	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	48361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	65383044	65383557	65383225	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	46630	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	65389011	65389411	65389276	Y	NA	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	40776	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	66930584	66930841	66930604	Y	NA	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR78	457729	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr1	68029743	68030232	68030044	Y	C1orf141	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	118512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	68340774	68341128	68340951	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	43624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	68572958	68573227	68573176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	123576	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	70745994	70746088	70746040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	61288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr1	77230839	77231032	77230870	Y	ST6GALNAC5	NA	NA	NA	NA	NA	TPI1P1	67365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	77547345	77547669	77547455	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	45099	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	78240205	78240392	78240373	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	USP33,ZZZ3,FAM73A	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-706L14.2	1656	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	84966686	84966774	84966730	Y	NA	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	3474	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	85143846	85143980	85143979	Y	SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,LPAR3,SSX2IP,SSX2IP	RP11-484D4.3,SSX2IP	NA	NA	NA	NA	SSX2IP	10506	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	85241214	85241288	85241250	Y	SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	86728	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	85313015	85313206	85313127	Y	GNG5,MCOLN2,LPAR3,C1orf52,BCL10	LPAR3	NA	NA	NA	NA	LPAR3	43690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.450380445672128
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.86186906396652
chr1	85695505	85695602	85695542	Y	NA	SYDE2,C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	C1orf52	27753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr1	85737728	85738105	85737917	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	2668	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	85744584	85744829	85744751	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	3811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	85763626	85763846	85763779	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	22853	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	85791287	85791404	85791348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	50514	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	85796595	85797055	85796822	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	85816683	85816718	85816701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	75910	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	85992128	85992211	85992170	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	49722	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	86010067	86010444	86010393	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr1	86010493	86010816	86010648	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	87689823	87690165	87689994	Y	HS2ST1,LMO4	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	101986	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	88081374	88081620	88081497	Y	NA	NA	LOC339524	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	289223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	88289775	88289792	88289784	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	497624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr1	89466934	89467175	89467138	Y	GTF2B,GBP2,GBP3	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	10291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	92021775	92022091	92021979	Y	NA	RP11-91I11.1	TGFBR3,CDC7,HSP90B3P,KIAA1107,RPAP2,GLMN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91I11.1	41637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	92268637	92268946	92268791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	100946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	144948	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.51750079310364
chr1	93386726	93386941	93386863	Y	NA	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	38116	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	94038553	94038921	94038737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	126865	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR760	184142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	NA	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	65079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	94769345	94769627	94769486	Y	NA	ARHGAP29	ARHGAP29,ABCA4	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	30721	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	95174059	95174304	95174182	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A3	109594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	96502437	96502585	96502484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	407901	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr1	96525307	96525707	96525578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	384779	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.60800210846338
chr1	96526012	96526996	96526157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	383490	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.43067527606946
chr1	96528556	96528891	96528724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	381595	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	96537517	96537524	96537521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	372962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	96541224	96541649	96541417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	368837	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr1	96699870	96700313	96700068	Y	NA	NA	PTBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P11	210173	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.76194797292908
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	98642709	98642844	98642773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	258104	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	100494312	100494735	100494498	Y	CDC14A,HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	6918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	104585164	104585551	104585358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	518851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	106836458	106836476	106836467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	760791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	107314405	107314715	107314560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	282552	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	107623686	107623858	107623772	Y	NA	PRMT6	NA	NA	NA	NA	PRMT6	26419	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	108122481	108123055	108122789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	382010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	108132692	108133060	108132878	Y	NTNG1,NTNG1,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	372005	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr1	108143362	108143805	108143489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	361260	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	108231996	108232161	108232053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	272904	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	108329022	108329589	108329361	Y	VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	175476	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	108695322	108695861	108695595	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	45610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.73062425161738
chr1	109099158	109099479	109099238	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	1232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	109104473	109104583	109104556	Y	PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	3762	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	109156863	109156955	109156909	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	45193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	109189516	109189718	109189617	Y	TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,HENMT1	HENMT1,PRPF38B	NA	NA	NA	NA	HENMT1	12430	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43327863933903
chr1	109693905	109693990	109693948	Y	AKNAD1	KIAA1324	NA	NA	NA	NA	KIAA1324	39604	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.43575997745224
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.88011991768729
chr1	109788948	109789150	109789063	Y	GSTM3	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	1491	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	14.0863305786774
chr1	109790443	109790471	109790466	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	NA	NA	NA	NA	CELSR2	170	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	109797001	109797635	109797309	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	NA	NA	NA	NA	CELSR2	6360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14206745708711
chr1	109928106	109928152	109928114	Y	NA	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	10421	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	110151943	110152270	110152107	Y	NA	AMPD2,GSTM4	NA	NA	NA	NA	AMPD2	4456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	110271520	110271826	110271755	Y	GSTM3	GSTM3	NA	NA	NA	NA	GSTM3	10558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.99152499600211
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	52465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	110335775	110336041	110335953	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,FAM40A,AHCYL1,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	53391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	110336950	110337403	110337105	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,FAM40A,AHCYL1,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	54566	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	110364881	110365302	110365225	Y	GNAI3,AMPD2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	82497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4	NA	NA	NA	NA	SLC16A4	3494	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	111729234	111729498	111729366	Y	NA	CEPT1,DRAM2,DENND2D	NA	NA	NA	NA	DENND2D	15659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	111735402	111735659	111735539	Y	CD53,LRIF1,RAP1A	DENND2D	NA	NA	NA	NA	DENND2D	9498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	111735691	111736003	111735892	Y	CD53,LRIF1,RAP1A,C1orf162	DENND2D	NA	NA	NA	NA	DENND2D	9154	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	112050044	112050594	112050328	Y	C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	32246	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	112276731	112276883	112276807	Y	C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183	DDX20,FAM212B	NA	NA	NA	NA	DDX20	18984	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	112438367	112438956	112438733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	141921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.591276148959233
chr1	113045318	113045599	113045574	Y	NA	WNT2B	NA	NA	NA	NA	WNT2B	38155	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT2B	65207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.83417572815571
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	114245723	114246101	114246018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	114258659	114258989	114258824	Y	NA	PHTF1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	41122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	114950620	114950667	114950644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	101114	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr1	115025085	115025405	115025244	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	26376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	115046601	115046805	115046703	Y	NA	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	4976	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.634500984061851
chr1	115627657	115627928	115627729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIKE1	306351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	116253956	116254148	116254046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL1	71382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.64288563694124
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	116920378	116921129	116920740	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	7088	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	117074509	117074935	117074769	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	117129425	117129671	117129544	Y	TTF2,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	17764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	117359174	117359463	117359379	Y	TTF2,CD2	NA	NA	NA	NA	NA	PTGFRN	91216	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	117422443	117422644	117422485	Y	NA	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36667283630819
chr1	117610144	117610413	117610279	Y	NA	RP11-27K13.3,TTF2	VTCN1,TRIM45	IMR90	Hi-C	24141950	TTF2	9219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	118153815	118153988	118153913	Y	FAM46C	FAM46C	NA	NA	NA	NA	FAM46C	7259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	118197868	118198044	118197956	Y	NA	NA	FAM46C	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46C	51312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr1	120255895	120256325	120256050	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	55474	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	75070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	120530218	120530524	120530431	Y	NOTCH2,FCGR1B,ZNF697	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	79716	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	581054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr1	144009977	144010738	144010098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	134070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	144941125	144941602	144941408	Y	NA	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	1070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	43743	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	50527	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	57405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr1	145437595	145437817	145437681	Y	CD160,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	1126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.24446988623777
chr1	145627337	145627622	145627480	Y	NA	NUDT17,POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	18301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.55550222925175
chr1	147104963	147105320	147105142	Y	NA	ACP6	NA	NA	NA	NA	ACP6	35298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	147189197	147189465	147189317	Y	NA	ACP6	ACP6,LOC100289211	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ACP6	48579	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.47898481255486
chr1	147344950	147345054	147345002	Y	NA	NA	GJA5	IMR90	Hi-C	24141950	ACP6	204332	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.3480007229338
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.756724573974569
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	RNVU1-17,RNU1-92P,RP11-403I13.5	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-403I13.5	5589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.49477703457475
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	372	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SF3B4	NA	NA	NA	NA	SF3B4	12664	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.40204820277439
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	150772798	150773105	150772952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT	74139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	151255796	151256115	151256047	Y	NA	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	RP11-126K1.2	3391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	151422102	151422465	151422287	Y	NA	POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	7476	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	151445792	151446161	151446000	Y	C1orf56,RIIAD1,OAZ3	POGZ,CGN	RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D	IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	POGZ	15851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.78614755424069
chr1	151486181	151486300	151486231	Y	SELENBP1,RORC,CGN	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	5195	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	151809390	151809745	151809546	Y	RORC,C2CD4D	RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,AL450992.2	NA	NA	NA	NA	AL450992.2	2608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	151943125	151943453	151943289	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	21413	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	151945504	151945625	151945562	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	19241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	151952807	151953143	151952837	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	11723	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.15357001763675
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	151962641	151962839	151962740	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2027	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.9345886571815
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	121996	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	153095466	153095607	153095484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRR1B	93788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	153337774	153338142	153337963	Y	S100A8,S100A9,S100A12	S100A9,S100A12,S100A8	NA	NA	NA	NA	S100A12	7983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	S100A6,S100A3,S100A4	NA	NA	NA	NA	S100A6	17972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.17224213101113
chr1	153505144	153505346	153505245	Y	NA	S100A6,S100A3,S100A4	NA	NA	NA	NA	S100A6	1374	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A3,S100A4,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A4	20406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	153841080	153841191	153841137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	52260	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.74876204780731
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	154302207	154302441	154302288	Y	CHRNB2,ATP8B2	ATP8B2	NA	NA	NA	NA	ATP8B2	6178	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	154395894	154396284	154395999	Y	UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	20225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	154397743	154397997	154397805	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	22074	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	154468503	154468634	154468566	Y	SHE	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2Q1	60870	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.60238015626758
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.54048320779058
chr1	154978035	154978657	154978307	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	4908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	155064813	155064992	155064903	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	30589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	155097183	155097419	155097260	Y	NA	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	517	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.03971044076112
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	GON4L	3010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	155944562	155945214	155944815	Y	C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	NA	NA	NA	NA	ARHGEF2	29647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.33808910926775
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	156251648	156251762	156251690	Y	RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	TMEM79	922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	156405790	156406311	156406022	Y	NA	NA	RHBG,C1orf182,C1orf61,CCT3,TTC24,MEF2D,IQGAP3,BCAN,APOA1BP,GPATCH4,HAPLN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2D	62309	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.45431490015572
chr1	156461502	156461819	156461755	Y	MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.83729363582596
chr1	156586355	156586564	156586460	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf61,HAPLN2,BCAN	IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4,RP11-284F21.7	NA	NA	NA	NA	GPATCH4	17067	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr1	156662788	156663099	156662881	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	BCAN,NES	IMR90	Hi-C	24141950	CRABP2	10509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	156663993	156664153	156664073	Y	TMEM79,CRABP2,CRABP2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	NA	NA	NA	NA	CRABP2	9455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr1	156679562	156679883	156679727	Y	NA	NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	5954	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	157111103	157111381	157111197	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	4837	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	NA	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV3	1013234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	1040433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	159907968	159908165	159908117	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	IGSF9	5221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	160202735	160202981	160202855	Y	SLAMF6,CD48,FCRL6,DCAF8	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	26553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	160377718	160378261	160377994	Y	IGSF9	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	9342	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL2	271452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.28298586678655
chr1	161360317	161360802	161360606	Y	NA	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,NDUFS2,ADAMTS4,SDHC,UFC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	78270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.72500229942159
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	HSPA6	NA	NA	NA	NA	HSPA6	8572	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA6	90176	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	162129294	162129634	162129458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOS1AP	91730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.44998189243084
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	162666168	162666338	162666209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UAP1	136845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	164685981	164686133	164686057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	163160	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	164686304	164686686	164686418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	163483	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	164719768	164719930	164719859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	196947	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	165635693	165636148	165635824	Y	NA	MGST3,ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	29952	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	166102836	166102913	166102873	Y	NA	FAM78B	NA	NA	NA	NA	FAM78B	31293	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	167518258	167518508	167518451	Y	CREG1	CREG1	NA	NA	NA	NA	CREG1	2496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	168787153	168787165	168787159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP1B1	285770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	168876326	168876730	168876527	Y	NA	NA	ATP1B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP1B1	196205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36353222222561
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	170225505	170225849	170225677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	173156	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	171156764	171157136	171156950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO4	124211	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	172418117	172418641	172418353	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	6887	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.897620277261674
chr1	172445364	172445579	172445472	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	34134	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	172466564	172466703	172466653	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	55334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	172468818	172469289	172468991	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	57588	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr1	172499206	172499418	172499304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	87976	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr1	172500351	172500710	172500527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	89121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	173164805	173165199	173165000	Y	TNFSF4	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	279206	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	173816933	173817269	173817101	Y	NA	DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	NA	NA	NA	NA	ZBTB37	17951	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	174375242	174375457	174375350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	248694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	174503176	174503233	174503205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	376628	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	174907888	174908105	174908034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	58195	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	174937322	174937525	174937409	Y	KIAA0040,KIAA0040	CACYBP	NA	NA	NA	NA	CACYBP	28775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	176174471	176174980	176174673	Y	RFWD2	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2,RP11-195C7.1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	176836644	176837016	176836830	Y	ASTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	661860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	177150553	177151051	177150740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568K15.1	854034	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	178414274	178414285	178414280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	95602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	179555221	179555646	179555325	Y	TDRD5,TDRD5,TDRD5	TDRD5	NA	NA	NA	NA	TDRD5	3102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	179606990	179607135	179607063	Y	NA	TDRD5	NA	NA	NA	NA	TDRD5	48242	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	179726041	179726329	179726185	Y	TDRD5,FAM163A	NA	NA	NA	NA	NA	TOR1AIP2	118609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	180200686	180200867	180200752	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	3265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	180554738	180554883	180554800	Y	MR1	XPR1	XPR1,ACBD6	IMR90	Hi-C	24141950	XPR1	44257	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr1	180613229	180613603	180613357	Y	NA	XPR1	NA	NA	NA	NA	XPR1	14089	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	180727103	180727211	180727157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPR1	127963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr1	181060502	181060611	181060567	Y	STX6,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	4864	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.93997949411704
chr1	181081690	181081905	181081806	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.492034973733454
chr1	181082184	181082367	181082268	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26546	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.71624179971325
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.450380445672128
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.52220964765748
chr1	182070634	182071001	182070793	Y	NA	NA	CACNA1E	IMR90	Hi-C	24141950	GLUL	288340	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	182363463	182363693	182363584	Y	RNASEL,NPL,GLUL,GLUL	GLUL	NA	NA	NA	NA	GLUL	4122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	183129116	183129507	183129296	Y	LAMC2	LAMC2	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	23866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.3822043356
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	184357629	184357933	184357738	Y	EDEM3	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	3437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr1	184506061	184506260	184506127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	151869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	184929910	184930144	184930114	Y	TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	11538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	185250433	185250655	185250484	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	33806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	185389788	185390210	185390053	Y	FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	105327	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	186201063	186201418	186201240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	141407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr1	196317530	196317735	196317633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPM	796089	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	196379497	196379989	196379846	Y	CFHR3,KCNT2,CFH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPM	733835	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	197513718	197513772	197513745	Y	CRB1,DENND1B	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P32	142118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.49765692592925
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	198845240	198845523	198845521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	721147	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	200750000	200750140	200750089	Y	NA	CAMSAP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	43314	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	201084133	201084558	201084403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM9	54144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9,IGFN1	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	201244405	201244769	201244526	Y	PKP1	PKP1	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	PKP1	5811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr1	201246115	201246382	201246194	Y	PKP1	PKP1	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	PKP1	4198	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	201277004	201277220	201277102	Y	NA	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	26424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.43292343235237
chr1	201277329	201277484	201277406	Y	PKP1	PKP1	NA	NA	NA	NA	PKP1	26749	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr1	201426190	201426373	201426369	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	9992	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr1	201463619	201463933	201463776	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	10436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.13529645750364
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.01267431434964
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	92185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.756724573974569
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr1	201709797	201710423	201710148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	85846	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83888458270955
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27776246783204
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	26403	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.52220964765748
chr1	202016172	202016526	202016316	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ELF3,RP11-465N4.4	ELF3,NAV1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-465N4.4	38691	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7682271345242
chr1	202027341	202027750	202027511	Y	NA	RP11-465N4.4	RNPEP,ELF3,NAV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-465N4.4	49860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	202045307	202045525	202045416	Y	PPP1R12B,ELF3	GPR37L1	NA	NA	NA	NA	GPR37L1	44461	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	202054141	202054434	202054309	Y	NA	GPR37L1	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPR37L1	35552	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.58253628909319
chr1	202055098	202055409	202055277	Y	ELF3,GPR37L1	GPR37L1	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPR37L1	34577	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.87295243143257
chr1	202056138	202056515	202056288	Y	NA	GPR37L1	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPR37L1	33471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	GPR37L1,ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR37L1	14795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	9.67317836859469
chr1	202077636	202077876	202077756	Y	ELF3,LGR6	GPR37L1,ARL8A	NAV1,ARL8A,GPR37L1	MCF7	ChIA-PET	22265404	GPR37L1	12110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.46031269918047
chr1	202214153	202214446	202214299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2T	94662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	202781525	202781905	202781812	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5	NA	NA	NA	NA	PCAT6	3443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0817408156514
chr1	202823240	202823502	202823372	Y	NA	KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF	PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-480I12.5	5246	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	43291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	203122696	203123081	203122889	Y	FMOD,ADORA1	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA1	64914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.61950466901301
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.529379200482229
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	204073791	204074252	204073934	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	33548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	204254999	204255106	204255048	Y	PIK3C2B,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	73779	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	204289566	204289863	204289752	Y	SOX13,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	54930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	204332438	204332553	204332500	Y	SOX13,PPP1R15B	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	12240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	204349568	204349875	204349782	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	4775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.05835984772317
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.15788238551933
chr1	204476628	204477018	204476840	Y	NA	PIK3C2B,MDM4	MDM4,PPP1R15B,PIK3C2B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MDM4	6493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	204700209	204700421	204700355	Y	NA	NA	LRRN2,NFASC	IMR90	Hi-C	24141950	NFASC	95358	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	205144631	205144860	205144785	Y	NA	DSTYK	NA	NA	NA	NA	DSTYK	33867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	205420910	205421289	205421224	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	1793	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	205475126	205475451	205475289	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	3403	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	21017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.70319163853465
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	206861410	206861458	206861434	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	5121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	206877016	206877221	206877081	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	20727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	206879935	206880172	206880039	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	23646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	207069223	207069337	207069332	Y	NA	IL20,IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	435	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	207413364	207413503	207413411	Y	IL19,CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	79350	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	207509006	207509478	207509176	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	NA	NA	NA	NA	CD55	16153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	207997315	207997832	207997786	Y	CR1,CD46	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	42663	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36353222222561
chr1	208381145	208381344	208381321	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	34321	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	208388887	208389573	208389450	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	26092	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	208412497	208412696	208412591	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	208415648	208415868	208415811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	209393390	209393475	209393433	Y	NA	ATP5G2P1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	46093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr1	209557331	209557442	209557421	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	42723	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	209600780	209600928	209600808	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	209601291	209601611	209601405	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	1126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	209978699	209978810	209978755	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6	C1orf74,IRF6,DIEXF	NA	NA	NA	NA	IRF6	1234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	21827	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	210468396	210468551	210468467	Y	HHAT	HHAT	SYT14,DIEXF,C1orf133,SERTAD4,HHAT	IMR90	Hi-C	24141950	HHAT	31045	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	211912030	211912428	211912229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK2	65070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	211925784	211926070	211925889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	76044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	212102475	212102639	212102508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	100361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr1	212484976	212485048	212485012	Y	NA	PPP2R5A,RP11-384C4.3	TMEM206	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-384C4.3	4116	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	212655370	212655477	212655424	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	51141	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	212658172	212658571	212658328	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	53943	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.43445039313904
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	213151011	213151388	213151292	Y	NA	VASH2,ANGEL2	NA	NA	NA	NA	VASH2	29149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	213500745	213500914	213500832	Y	RPS6KC1	NA	PROX1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KC1	278156	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	213545455	213545863	213545754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	322866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	214926316	214926334	214926325	Y	NA	NA	CENPF,KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	115743	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	215006647	215006892	215006866	Y	KCNK2,KCNK2	GAPDHP24	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	35185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	215655448	215655678	215655614	Y	NA	NA	CENPF,KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD3	83057	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr1	215691115	215691317	215691220	Y	NA	KCTD3	KCNK2,CENPF,SMYD2,PTPN14	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD3	47418	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	216550404	216550614	216550509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD3	811669	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.02546581937019
chr1	217308487	217308861	217308605	Y	ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	493563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	218550674	218551089	218550794	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	33097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	218553747	218554148	218553928	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	36170	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.54765276061533
chr1	218633382	218633612	218633512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	115805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr1	218649784	218650063	218649859	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	132207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	218662454	218662669	218662563	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,LOC643723	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	144877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	218666268	218666506	218666426	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,LOC643723	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	148691	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	218774491	218774602	218774534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	256914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	220393912	220394294	220394186	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	30618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	220443411	220443639	220443413	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	RAB3GAP2	157	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	221869897	221870257	221870077	Y	NA	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	43261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	221887766	221888016	221887890	Y	DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	25502	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	222164724	222164904	222164771	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	251206	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr1	222814663	222814910	222814786	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	25235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	223276523	223276867	223276768	Y	NA	TLR5	NA	NA	NA	NA	TLR5	37757	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	223904365	223904567	223904454	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	17070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	224026476	224026743	224026681	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	4931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.33052306977175
chr1	226163769	226163979	226163848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYCR2	53791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.74407176652575
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.82663032850202
chr1	226320775	226321123	226320910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	51308	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.96682547613515
chr1	227499470	227499818	227499796	Y	NA	CDC42BPA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	4357	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	227953974	227954299	227954123	Y	IBA57	SNAP47,JMJD4	NA	NA	NA	NA	JMJD4	32862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr1	228274281	228274680	228274319	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	228688608	228688902	228688729	Y	HIST3H2A	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	15846	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr1	229365571	229365974	229365758	Y	RHOU,SPHAR,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	38801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	229374566	229374670	229374620	Y	NA	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	30105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	230258907	230259286	230258969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	67371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	230887462	230887658	230887571	Y	NA	CAPN9	NA	NA	NA	NA	CAPN9	6332	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	230889321	230889962	230889601	Y	NA	CAPN9	NA	NA	NA	NA	CAPN9	8191	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.3365415086388
chr1	231347338	231347496	231347363	Y	C1orf124	C1orf131,GNPAT	NA	NA	NA	NA	C1orf131	27437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.80400105423169
chr1	232726496	232726761	232726608	Y	SIPA1L2	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	239172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.4081239557202
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr1	234471096	234471421	234471259	Y	NA	RP5-827C21.1,RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.1	19466	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	234681324	234681701	234681573	Y	NA	NA	LOC100506795,IRF2BP2	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	61570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	234709673	234709936	234709805	Y	NA	IRF2BP2	RBM34,TOMM20,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BP2	33335	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr1	234812067	234812214	234812141	Y	NA	LINC01132	LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01132	45575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr1	235012060	235012373	235012284	Y	IRF2BP2,ARID4B	NA	LINC00184,IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,RBM34	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01132	154271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	235094853	235095190	235094881	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	194062	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.35676122264214
chr1	235096560	235096855	235096619	Y	ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	192397	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	191182	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr1	235108971	235109355	235109264	Y	NA	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	179897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	177849	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	155830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr1	236109486	236110063	236109737	Y	LYST	NA	LYST,NID1,GNG4,B3GALNT2	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	64546	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43170833229774
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	240433849	240434175	240434014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	102394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	241320009	241320104	241320058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	159915	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	243431437	243431793	243431509	Y	NA	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	14117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr1	243893800	243893985	243893919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	476480	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	244094600	244094786	244094718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	518650	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	80431	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr1	245958364	245958743	245958685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	709871	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr1	246147829	246148201	246147973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	520413	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	246249452	246249819	246249636	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	418795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	246316735	246316955	246316845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	246588477	246588670	246588563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	79944	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	246772310	246772610	246772421	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	44564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19808379721027
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.34486010885122
chr10	384217	384634	384602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	205812	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr10	466300	466445	466373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	267238	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	564401	564761	564664	Y	ZMYND11,ZMYND11	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	168922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	587865	588161	588097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	145522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	652657	652929	652820	Y	DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	80754	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	1100843	1101035	1100898	Y	NA	IDI2,IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	7365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	1335739	1336079	1335908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	242261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	1336083	1336245	1336171	Y	ADARB2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	242605	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	1374654	1374709	1374682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	281176	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	2992232	2992361	2992295	Y	NA	NA	WDR37,LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	114164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	3137708	3138098	3138049	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	31183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.54088176103186
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.775396687348956
chr10	3598970	3599136	3599051	Y	KLF6	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	226337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	4562295	4562487	4562387	Y	NA	NA	KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	264334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	121038	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.41237900952402
chr10	4775344	4775645	4775580	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	MCF7	ChIA-PET	22265404	AKR1E2	51176	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.6313830763916
chr10	4891874	4892173	4892030	Y	NA	AKR1C1	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	40623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	5521591	5521814	5521622	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	17719	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	8200	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.45586663392475
chr10	5535635	5536039	5535950	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	3494	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.10786591099095
chr10	5577499	5577735	5577573	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	37966	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	48277	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	49348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.17224213101113
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	CALML5	50477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.23727969357072
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	NA	NA	NA	NA	NA	CALML5	51426	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	5593718	5593999	5593816	Y	NET1,CALML3	NA	NET1	IMR90	Hi-C	24141950	CALML5	54185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	5596279	5596669	5596478	Y	NA	NA	NET1,ASB13	IMR90	Hi-C	24141950	CALML5	56746	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	6055445	6055662	6055528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM17	73288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr10	6237775	6238114	6237949	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	52894	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	6242613	6242903	6242648	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	57732	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.811170607056443
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.70478258541824
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr10	6339022	6339139	6339081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	154141	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr10	7223481	7223753	7223543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	604237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	7452405	7452746	7452437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	375244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	8088862	8088888	8088874	Y	ITIH5,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	2616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.35636266940086
chr10	8089680	8090146	8089800	Y	ITIH5	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	1358	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr10	8090455	8090655	8090575	Y	NA	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	849	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.811170607056443
chr10	8098275	8098603	8098313	Y	NA	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	4708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.51033124027889
chr10	8098940	8099487	8099174	Y	TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	5373	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr10	8103293	8103465	8103334	Y	TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	9726	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.46239755062243
chr10	8103619	8104019	8103811	Y	KIN,TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	10052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.03134642772403
chr10	8139781	8140040	8139908	Y	NA	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	46214	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	8145104	8145382	8145246	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	51537	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.24564164003777
chr10	8374227	8374893	8374382	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	280660	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.995291145446165
chr10	8408171	8408387	8408297	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GATA3	314604	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr10	8794296	8794681	8794490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-428L9.2	215407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	8897116	8897206	8897161	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-428L9.2	112882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	8898873	8899238	8899165	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-428L9.2	110850	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98135059303794
chr10	8899367	8899664	8899620	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-428L9.2	110424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.756724573974569
chr10	8903701	8904023	8903876	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-428L9.2	106065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.72774436026288
chr10	8907472	8907746	8907562	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-428L9.2	102342	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.07185190839768
chr10	8909152	8909331	8909243	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-428L9.2	100757	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.44321089284738
chr10	8915965	8916215	8916048	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-428L9.2	93873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	8927492	8927792	8927642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-428L9.2	82296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr10	8931286	8931468	8931377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-428L9.2	78620	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr10	9013579	9013972	9013843	Y	NA	RP11-428L9.2	FLJ45983,GATA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-428L9.2	3491	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60277870950887
chr10	9017648	9017767	9017731	Y	NA	RP11-428L9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-428L9.2	7560	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.89516164556079
chr10	9042425	9042760	9042593	Y	NA	RP11-428L9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-428L9.2	32337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	9052186	9052462	9052283	Y	NA	RP11-428L9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-428L9.2	42098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr10	9058876	9059174	9059118	Y	NA	RP11-428L9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-428L9.2	48788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	9076423	9076646	9076599	Y	NA	NA	GATA3,FLJ45983,TAF3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-428L9.2	66335	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.694827625497564
chr10	9115735	9116358	9115988	Y	NA	NA	GATA3,FLJ45983	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-428L9.2	105647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.18374469156077
chr10	9139521	9139818	9139671	Y	NA	NA	TAF3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-428L9.2	129433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr10	9228708	9229315	9229271	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3,TAF3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-428L9.2	218620	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.56700478980139
chr10	10754108	10754441	10754195	Y	CELF2,CELF2	NA	LOC254312,CELF2	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	897312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	11980539	11980883	11980844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	102286	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	12002775	12003103	12002939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	80066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	12283843	12284276	12283949	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	NUDT5	47700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	12307693	12308050	12307912	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT5	71550	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	12431599	12431849	12431667	Y	NA	CAMK1D	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	42118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	12527553	12527985	12527598	Y	CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	138072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	13200624	13201003	13200885	Y	NA	MCM10	NA	NA	NA	NA	MCM10	551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	13390886	13391219	13391148	Y	NA	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	2589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr10	13692317	13692641	13692563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	65390	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	13747807	13748143	13748006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	120880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	14602319	14602604	14602483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	100178	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	121888	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	14628830	14629278	14629071	Y	HSPA14	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	126689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43327863933903
chr10	14647138	14647588	14647478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	144997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	14955590	14955884	14955736	Y	HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2	SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1	NA	NA	NA	NA	SUV39H2	36771	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	16557217	16557368	16557293	Y	NA	RNU2-18P	NA	NA	NA	NA	RNU2-18P	41215	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	17390739	17391085	17390858	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	35850	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	17429922	17430093	17430002	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	2987	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr10	17430166	17430520	17430415	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	3231	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.8528478415301
chr10	18897565	18897858	18897712	Y	NSUN6,ARL5B	NSUN6,ARL5B-AS1,ARL5B	NA	NA	NA	NA	NSUN6	40693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	19746484	19746585	19746537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	356583	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr10	19927503	19927756	19927630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	175412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	19943656	19943825	19943742	Y	NA	NA	ARL5B,NSUN6	IMR90	Hi-C	24141950	PLXDC2	159343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	20115618	20116154	20115807	Y	PLXDC2	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	12450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	20118701	20118910	20118781	Y	NA	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	15533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	20203114	20203263	20203197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	99946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	20219970	20220256	20220113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	116802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	20249117	20249390	20249254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	145949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	20384805	20385193	20384998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	281637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	20389150	20389455	20389350	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	285982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	20450242	20450397	20450276	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	347074	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	21241912	21242237	21242078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	218879	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	21333319	21333508	21333415	Y	NEBL,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	127608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43327863933903
chr10	21390009	21390197	21390106	Y	MLLT10,MLLT10,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	70919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	21436057	21436346	21436225	Y	C10orf113,NEBL	NEBL	NA	NA	NA	NA	NEBL	24770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr10	21716825	21717072	21716945	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	104022	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.2226365189385
chr10	21824374	21824606	21824490	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr10	22029877	22030194	22029992	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	189878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	22053811	22054026	22053942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	166046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	22265792	22265961	22265887	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	DNAJC1	24737	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	22555688	22555894	22555791	Y	NA	COMMD3	NA	NA	NA	NA	COMMD3	47009	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	22628998	22629520	22629110	Y	EBLN1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	20858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.42978488483983
chr10	22853668	22853687	22853679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	147797	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr10	22887940	22888243	22888209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	113241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	22894974	22895386	22895290	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	106098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	22920592	22920972	22920839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	80512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	22921960	22922313	22922139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	79171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr10	22922432	22922728	22922682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	78756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	22961361	22961802	22961720	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	39682	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	22972039	22972536	22972328	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	28948	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr10	23336632	23336974	23336803	Y	NA	MSRB2	NA	NA	NA	NA	MSRB2	45461	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	24746901	24747210	24747047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	263387	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.756724573974569
chr10	24772710	24773084	24772822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	237513	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	26955417	26955652	26955492	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	28936	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.18807976585569
chr10	27910064	27910147	27910106	Y	NA	NA	MPP7,MKX	IMR90	Hi-C	24141950	RAB18	118867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr10	27961311	27961466	27961388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB18	170114	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr10	27991244	27991520	27991382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB18	200047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	28002936	28003088	28002983	Y	ARMC4,MKX	NA	NA	NA	NA	NA	RAB18	211739	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0817408156514
chr10	28694229	28694387	28694304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP7	72814	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	28957755	28957993	28957831	Y	BAMBI	BAMBI	BAMBI	K562	ChIA-PET	22265404	BAMBI	6278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr10	29421778	29421876	29421872	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	274455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	29887787	29888175	29887987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	135535	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	29944854	29945090	29945003	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	78620	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	29948331	29948643	29948337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	75067	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	29966336	29966345	29966343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	57365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	SVIL	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	49497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr10	30092989	30093361	30093263	Y	SVIL	NA	SVIL,KIAA1462,MIR604	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	69279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	30736122	30736481	30736327	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	15256	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.77816145460258
chr10	32218329	32218518	32218508	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	2587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	32233498	32233707	32233615	Y	NA	ARHGAP12	ARHGAP12,KIF5B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	17756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	32438322	32438553	32438446	Y	NA	RPS4XP11	KIF5B,ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	48101	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	32460264	32460451	32460341	Y	NA	NA	ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	70043	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.34486010885122
chr10	32521454	32521704	32521579	Y	NA	NA	KIF5B,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	131233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	32579146	32579267	32579207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	86459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	ITGB1	NA	NA	NA	NA	ITGB1	41416	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	33560971	33561296	33561097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	61894	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0817408156514
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.79840180844823
chr10	33798158	33798349	33798267	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	174968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	34815006	34815362	34815018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	135667	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	34907489	34907514	34907502	Y	NA	RP11-8L18.3	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	43515	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	34924725	34924738	34924731	Y	NA	RP11-8L18.3	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	26291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	35028968	35029134	35029048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3	73119	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	35070002	35070125	35070067	Y	CREM	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	32128	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr10	35195075	35195256	35195166	Y	NA	SS18L2P1	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	SS18L2P1	32937	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.58253628909319
chr10	35717658	35717859	35717796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	183705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	35768783	35768937	35768860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4683	159243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	43635714	43636276	43636098	Y	HNRNPF,HNRNPF,CSGALNACT2	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	3780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	43761301	43761565	43761418	Y	RASGEF1A	NA	NA	NA	NA	NA	FXYD4	103525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	43872885	43873113	43872972	Y	NA	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	FXYD4	7795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr10	44185196	44185271	44185205	Y	NA	ZNF32	NA	NA	NA	NA	ZNF32	42892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	44185624	44185942	44185694	Y	NA	ZNF32	NA	NA	NA	NA	ZNF32	43320	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr10	44806540	44806774	44806646	Y	NA	NA	TMEM72-AS1,LOC100506835,ZNF32-AS3,RASSF4,ZNF32,C10orf136,LOC283033,CXCL12	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL12	73167	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	45132231	45132345	45132288	Y	NA	NA	TMEM72-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL12	252290	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr10	47008240	47008359	47008300	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-38L15.3	58768	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM25HP	82259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	49495763	49496101	49496063	Y	NA	MAPK8	FRMPD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAPK8	16597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr10	50742859	50743547	50743006	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	PGBD3	1539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	ASAH2,DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	52092316	52092324	52092320	Y	FAM21A,SGMS1	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	69578	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.670274903769335
chr10	52270106	52270351	52270231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	112572	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	54069854	54070012	54069944	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	2044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr10	54203068	54203427	54203228	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr10	54203502	54203868	54203680	Y	DKK1	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83888458270955
chr10	54208151	54208375	54208306	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	19918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr10	54211545	54211936	54211751	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	16357	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.89607267663272
chr10	54212412	54212659	54212464	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	15634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr10	54212715	54213183	54212814	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	15110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr10	54232102	54232449	54232243	Y	NA	RP11-346D6.6	DKK1,LOC100506939	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-346D6.6	3809	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	RP11-346D6.6	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-346D6.6	18264	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A9	558018	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	60949726	60949909	60949819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A9	543851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	61632760	61633170	61633000	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	31244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.679296126205757
chr10	61639238	61639777	61639520	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	24637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	62174641	62174784	62174750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	361305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr10	62185134	62185430	62185353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	350659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	62330469	62330833	62330827	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	205256	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	63596779	63597177	63597154	Y	NA	NA	RHOBTB1,C10orf107,ARID5B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID5B	61882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.13175935674981
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	63703432	63703559	63703511	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	44373	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr10	63752119	63752912	63752632	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	93060	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	63803306	63803648	63803427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	144247	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	63805040	63805237	63805084	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	145981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr10	64982889	64983009	64982950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	91839	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	65026237	65026642	65026597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	135187	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	65128612	65128923	65128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	56134	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	65196810	65197156	65196994	Y	NA	PRELID1P3,JMJD1C	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	11753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.897620277261674
chr10	69523317	69523417	69523404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	72507	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	69578155	69578433	69578238	Y	NA	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	17491	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr10	69579652	69579872	69579788	Y	DNAJC12	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	16052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.72553955023459
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	71145067	71145367	71145287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	63862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	71198445	71198595	71198514	Y	NA	TSPAN15	HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSPAN15	10634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.26314199961215
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	73816879	73817073	73816976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST3	94756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	73946489	73946835	73946688	Y	NA	RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	RP11-570G20.1	864	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.2861037744568
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	74091361	74091474	74091418	Y	SPOCK2,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	21514	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.47427595800102
chr10	74323187	74323566	74323386	Y	DDIT4,DNAJB12	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	60333	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	74765472	74765512	74765492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	P4HA1	89220	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	75240023	75240096	75240089	Y	NA	RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-137L10.6	13187	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	75337715	75337998	75337857	Y	CAMK2G,C10orf55,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	45713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43327863933903
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	135	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	76916394	76916800	76916595	Y	MYST4,SAMD8	NA	NA	NA	NA	NA	VDAC2	51112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	79545596	79545879	79545660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	138499	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	79633336	79633510	79633397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	50868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr10	80062995	80063366	80063293	Y	NA	NA	ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	271477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	80166856	80166996	80166943	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	375338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.9277949511857
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	80912242	80912363	80912303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	85450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	80981088	80981226	80981157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	123999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	80998898	81000011	80999247	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	105214	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr10	81005366	81005598	81005460	Y	PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	99627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	81010188	81010619	81010281	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	94606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	81027575	81027693	81027634	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	77532	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	82169935	82170184	82170082	Y	NA	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	FAM213A	4350	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	82207287	82207512	82207367	Y	NA	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	4410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	82215085	82215437	82215324	Y	TSPAN14,SH2D4B	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	3163	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	82251425	82251820	82251559	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	39503	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	34918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	82259709	82259999	82259959	Y	NA	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	33699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	83632793	83633001	83632946	Y	NA	NRG3	NA	NA	NA	NA	NRG3	69	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	83786101	83786374	83786143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG3	153031	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	83813687	83814033	83813708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG3	180617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	86108374	86108507	86108453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	209692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	36097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.19927825742261
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	89465152	89465360	89465258	Y	NA	PAPSS2	ATAD1	IMR90	Hi-C	24141950	PAPSS2	47782	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	55559	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	90600778	90601250	90600926	Y	LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22	STAMBPL1	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	36241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	90844295	90844413	90844369	Y	NA	NA	FAS,LIPA,CH25H	IMR90	Hi-C	24141950	FAS	95881	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	91173615	91173677	91173627	Y	NA	IFIT1,LIPA,IFIT5	NA	NA	NA	NA	IFIT5	1272	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	91682047	91682281	91682164	Y	NA	NA	HTR7	IMR90	Hi-C	24141950	SNRPD2P1	54193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr10	92923893	92924265	92924064	Y	NA	NA	RPP30,NUDT9P1,PCGF5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	53643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	93283444	93283748	93283596	Y	HECTD2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	107063	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	93432082	93432315	93432239	Y	NA	PPP1R3C	LOC100188947,HECTD2,TNKS2,RPP30,PPP1R3C	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3C	41271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	93697836	93698042	93697939	Y	NA	BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	16310	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.90403813642852
chr10	94593194	94593285	94593240	Y	NA	EXOC6	NA	NA	NA	NA	EXOC6	4259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	94608884	94609046	94608952	Y	NA	EXOC6	NA	NA	NA	NA	EXOC6	19949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	94831659	94831948	94831694	Y	CYP26A1,CYP26A1	CYP26A1	NA	NA	NA	NA	CYP26A1	427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr10	95081157	95081194	95081175	Y	O3FAR1	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6P1	113773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	95197787	95197992	95197919	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42082	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	95198614	95198817	95198708	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	41257	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.26747500733704
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.99962415317105
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr10	95222493	95222944	95222696	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	17130	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04125804139008
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19719340598065
chr10	95513454	95513618	95513536	Y	FRA10AC1,LGI1	LGI1	LGI1,O3FAR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LGI1	1948	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	RP11-310E22.4	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-310E22.4	45240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr10	97024100	97024800	97024493	Y	NA	RP11-310E22.4,PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	23981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	RP11-310E22.4,PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	97521944	97522167	97522133	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	TCTN3	70044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr10	98032542	98032692	98032630	Y	ZNF518A,BLNK	BLNK	NA	NA	NA	NA	BLNK	3198	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32932860955942
chr10	98956083	98956405	98956104	Y	C10orf62	SLIT1	NA	NA	NA	NA	SLIT1	12406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	99302007	99302242	99302124	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,HOGA1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	HOGA1	39838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85755669608394
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	100074404	100074582	100074525	Y	C10orf28,HPS1	LOXL4	LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1,HPSE2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LOXL4	48397	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	100120877	100121283	100120897	Y	PYROXD2,LOXL4	NA	PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1	IMR90	Hi-C	24141950	PYROXD2	51658	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.16819048585663
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	101170653	101170798	101170732	Y	SLC25A28	GOT1,RP11-441O15.3	NA	NA	NA	NA	GOT1	17583	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	101537826	101537964	101537919	Y	ABCC2	COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	47969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	49662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr10	101543856	101543953	101543936	Y	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	NA	COX15	53999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr10	101767938	101768201	101768028	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.0067937059958
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.58932999508899
chr10	102130336	102130669	102130535	Y	NA	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	703	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr10	102245055	102245685	102245323	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	41144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	102792815	102793017	102792917	Y	NA	C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3,KAZALD1	NA	NA	NA	NA	SFXN3	3824	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	103090701	103091057	103090801	Y	PDZD7,MGEA5,BTRC	BTRC	BTRC,FBXW4,DPCD,POLL,TLX1NB,TLX1,FLJ41350,LBX1,MIR3158-2,MGEA5,NPM3,FGF8	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	20763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	103453403	103453880	103453587	Y	LDB1,BTRC,MGEA5	FBXW4	NA	NA	NA	NA	FBXW4	351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	104102854	104103008	104102931	Y	ACTR1A	NFKB2	PSD,FBXL15,NFKB2	IMR90	Hi-C	24141950	NFKB2	48859	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.44609165126039
chr10	104428446	104428647	104428547	Y	NA	TRIM8,ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	TRIM8	26193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	104470539	104470788	104470556	Y	FBXL15	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	ARL3	1376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	104472705	104472855	104472743	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	849	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	104545681	104545915	104545784	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf32	66065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	104556220	104556459	104556323	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf32	55521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	104892620	104892981	104892840	Y	C10orf32,NT5C2	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	58075	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	105000216	105000261	105000251	Y	NA	NT5C2	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	49160	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	NA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	50168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22579777286338
chr10	105001544	105001968	105001663	Y	C10orf32,NT5C2	NA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	50488	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr10	105302775	105302952	105302862	Y	NA	RP11-416N2.3	NA	NA	NA	NA	RP11-416N2.3	3880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-416N2.3	149468	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19719340598065
chr10	109306918	109307188	109307036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	2374123	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr10	109563158	109563160	109563159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	2118151	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	111650301	111650520	111650491	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	30791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.66626660486946
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	NA	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	106809	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	112562548	112562691	112562671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	66874	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	112668861	112669237	112669049	Y	PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	7795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	114707857	114707918	114707888	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	91	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	114853789	114854299	114853993	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	145780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	114929772	114930211	114930015	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	221763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	115022033	115022434	115022235	Y	NA	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	314024	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr10	115440649	115440877	115440799	Y	CASP7	CASP7	NA	NA	NA	NA	CASP7	3707	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	116259358	116259612	116259525	Y	C10orf118,ABLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	96843	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	116582671	116583074	116582920	Y	NA	FAM160B1	NA	NA	NA	NA	FAM160B1	3168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	117425699	117425945	117425810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATRNL1	574575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	117468082	117468283	117468150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRA1	562696	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.19091424438552
chr10	117502747	117502760	117502754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRA1	528219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	117936217	117936402	117936310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRA1	94577	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	118034123	118034494	118034359	Y	GFRA1,GFRA1,GFRA1	GFRA1	NA	NA	NA	NA	GFRA1	3144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.32070680742279
chr10	118643126	118643297	118643273	Y	KIAA1598	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	35410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	118656077	118656284	118656258	Y	NA	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	48361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	119021882	119022152	119021944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	110826	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr10	119445831	119446065	119445953	Y	NA	NA	CASC2	IMR90	Hi-C	24141950	PDZD8	312853	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.450380445672128
chr10	120997743	120998072	120997908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	61398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	121261864	121262026	121262018	Y	NA	RGS10	NA	NA	NA	NA	RGS10	38194	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	121277481	121277683	121277593	Y	EIF3A,RGS10	RGS10	NA	NA	NA	NA	RGS10	22537	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr10	121446860	121447228	121446967	Y	NA	BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	37978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	121503034	121503182	121503110	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	BAG3	94152	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	123197092	123197323	123197208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	158649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	76116	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.90757523718235
chr10	123900074	123900243	123900143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	153385	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	123914164	123914234	123914222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	167475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	124964667	124964815	124964746	Y	NA	NA	BUB3	MCF7	ChIA-PET	22265404	BUB3	52874	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	120828	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	125847012	125847291	125847256	Y	NA	CHST15	NA	NA	NA	NA	CHST15	3915	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	126315526	126315929	126315823	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B-AS1	74265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr10	126339460	126339914	126339618	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B-AS1	50280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	126346022	126346943	126346570	Y	FAM53B	FAM53B-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM53B-AS1	43251	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	126386863	126386994	126386934	Y	FAM53B	FAM53B-AS1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B-AS1	3200	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	126712433	126712623	126712473	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	108721	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr10	126749775	126749930	126749890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	97809	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr10	126837951	126838191	126838020	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	9548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	126840629	126841204	126840953	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	6535	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	127440633	127440786	127440709	Y	C10orf122,FANK1	NA	NA	NA	NA	NA	UROS	69031	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	127587236	127587432	127587340	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	4128	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	127591696	127592016	127591824	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	8588	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.15357001763675
chr10	127714877	127714997	127714888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	131769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	128595349	128595449	128595411	Y	DOCK1	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	3371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr10	128995351	128995518	128995467	Y	NA	FAM196A	NA	NA	NA	NA	FAM196A	2929	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	129704108	129704655	129704249	Y	PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	217994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr10	129706206	129706827	129706528	Y	PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	215822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	129707008	129707239	129707127	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	215410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	129851192	129851341	129851267	Y	PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	71308	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	133793049	133793425	133793362	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	10	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04324754151495
chr10	134142326	134142616	134142473	Y	NA	STK32C,LRRC27	LRRC27	K562	ChIA-PET	22265404	STK32C	735	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	134208745	134209013	134208865	Y	NA	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	73	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr10	134212658	134212854	134212750	Y	NA	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	3986	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.21232841860121
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8385	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.12618281737868
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.2	4120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.959517225738678
chr10	134266616	134267060	134266753	Y	LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	10785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.670274903769335
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	INPP5A	18146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	134352832	134353219	134353024	Y	NA	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	3508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	134360968	134361428	134361255	Y	INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	11644	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	134385594	134385710	134385631	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	36270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr10	134388737	134389185	134389009	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	39413	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	134536889	134537206	134537078	Y	LRRC27,LRRC27,INPP5A,C10orf92	NA	NA	NA	NA	NA	INPP5A	187565	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr10	134600599	134600670	134600635	Y	KNDC1,GPR123,NKX6-2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC40	153657	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	44831	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr10	135092117	135092276	135092147	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	27703	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	27233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.50915948647888
chr10	135143215	135143462	135143339	Y	C10orf92	ZNF511,TUBGCP2,ECHS1,PAOX	NA	NA	NA	NA	TUBGCP2	19374	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.2901554196113
chr11	364521	364678	364634	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3	ANO9,SIGIRR,B4GALNT4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	3118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	368352	368730	368427	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR	NA	NA	NA	NA	B4GALNT4	556	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr11	469770	469895	469845	Y	B4GALNT4,CEND1	ANO9,PTDSS2,RNH1	NA	NA	NA	NA	PTDSS2	23502	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr11	813578	813760	813591	Y	NA	PDDC1,AP006621.5,SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,CD151,POLR2L,TSPAN4	NA	NA	NA	NA	PNPLA2	3142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	926738	926879	926801	Y	BRSK2,CEND1,AP2A2	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	3844	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	1144773	1145129	1144879	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	4451	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr11	1147842	1148157	1148045	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	1423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	1228821	1229012	1228909	Y	NA	MUC5B	MUC5B,TOLLIP,MOB2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MUC5B	13284	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr11	1245627	1245992	1245771	Y	NA	MUC5B	NA	NA	NA	NA	MUC5B	3331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.1607395704615
chr11	1331682	1331784	1331733	Y	NA	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	2798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr11	1404202	1404317	1404259	Y	IFITM10,DUSP8	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4812	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.44164058580608
chr11	1726957	1727350	1727237	Y	IFITM10	IFITM10	NA	NA	NA	NA	IFITM10	42471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr11	1751706	1752102	1751905	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-3,KRTAP5-5,KRTAP5-6	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	NA	NA	NA	NA	IFITM10	17719	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	1772582	1772778	1772637	Y	IFITM10	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	NA	NA	NA	NA	IFITM10	2761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	1773349	1773482	1773395	Y	IFITM10	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	NA	NA	NA	NA	IFITM10	3528	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	AC068580.7	3583	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	1794819	1794975	1794880	Y	NA	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	AC068580.7	2643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr11	1804182	1804577	1804353	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7,SYT8	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8	IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7	Hi-C,5C,ChIA-PET	24141950,22955621,22265404	AC068580.7	6564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr11	1805001	1805048	1805024	Y	NA	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7,SYT8	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8	IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7	Hi-C,5C,ChIA-PET	24141950,22955621,22265404	AC068580.7	7383	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr11	2212480	2212615	2212548	Y	ASCL2,TH	IGF2	NA	NA	NA	NA	IGF2	43647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43170833229774
chr11	2223798	2223980	2223871	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2	54965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.91945364456094
chr11	2238430	2238670	2238577	Y	NA	NA	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	ASCL2	51512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	2643944	2644417	2644202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	74807	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	2714612	2714953	2714746	Y	NA	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	4271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	2847272	2847432	2847347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	57679	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	2933631	2934118	2933874	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	14567	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr11	2951529	2951649	2951619	Y	KCNQ1,PHLDA2	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	2844	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	3035655	3035952	3035816	Y	MRGPRG	NAP1L4,RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	24048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	3175519	3175620	3175572	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	10349	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	3792611	3792742	3792677	Y	STIM1,RHOG,NUP98	PGAP2,NUP98	NA	NA	NA	NA	PGAP2	24212	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	6699628	6699937	6699850	Y	OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2	MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	2695	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	8730669	8730993	8730843	Y	NA	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	28711	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	8973817	8973979	8973898	Y	NA	AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B	C11orf16	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9B-AS1	10243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	9067312	9067456	9067384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM9B	82754	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.5146869544161
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.0686906544728
chr11	9623030	9623285	9623166	Y	ZNF143,WEE1,WEE1	WEE1	NA	NA	NA	NA	WEE1	29802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr11	9732058	9732249	9732166	Y	NA	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	48434	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	313623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	10862862	10862982	10862965	Y	NA	SNORD97,EIF4G2,ZBED5	NA	NA	NA	NA	ZBED5	15361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	11326137	11326382	11326218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED5	447794	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	11641691	11641934	11641813	Y	GALNTL4	NA	NA	NA	NA	NA	USP47	219036	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	12561282	12561501	12561392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	132468	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	12821812	12822118	12821851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	127843	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.15830157860292
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF10	143692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF10	55073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr11	17008586	17008989	17008853	Y	PLEKHA7	RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	14026	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	17036768	17036996	17036882	Y	PLEKHA7	RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7	NA	NA	NA	NA	PLEKHA7	2778	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr11	17307346	17307410	17307378	Y	NA	NA	B7H6	IMR90	Hi-C	24141950	NUCB2	79646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	18546072	18546398	18546234	Y	SPTY2D1,TSG101	RP11-613F22.5,TSG101	NA	NA	NA	NA	TSG101	381	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	19440729	19441084	19440796	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	70458	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	19968611	19968779	19968666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	414452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	20016658	20016921	20016770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	366310	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.835723328784669
chr11	20053197	20053569	20053404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	329662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.670274903769335
chr11	26610693	26610982	26610833	Y	ANO3,BBOX1	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	772433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	27231187	27231325	27231258	Y	NA	NA	LIN7C,LGR4,CCDC34,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	152090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr11	27380505	27380624	27380565	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	2791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	29349456	29349731	29349594	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	1221601	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	29974880	29975070	29974975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPED2	631349	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	31630096	31630156	31630127	Y	PAX6	NA	NA	NA	NA	NA	ELP4	100799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	31693471	31693827	31693649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	138112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	32913428	32913828	32913453	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	704	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr11	33074022	33074030	33074026	Y	NA	DEPDC7,TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	15059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	33181656	33182005	33181958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF3	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	34183211	34183613	34183509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT10	58062	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	34187284	34187655	34187468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT10	62135	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr11	34272631	34272979	34272746	Y	LMO2,LMO2,ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	82571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52906	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr11	35296640	35296760	35296715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	138223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14206745708711
chr11	35297997	35298240	35298173	Y	CD44,SLC1A2,SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	139580	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.47272835737207
chr11	35317394	35317749	35317627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	158977	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	35347989	35348102	35348043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	189572	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.1607395704615
chr11	35358493	35359078	35358891	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	200076	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr11	35401982	35402383	35402345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FJX1	235352	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.18414324480205
chr11	35411545	35411735	35411634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FJX1	226000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.80400105423169
chr11	36052486	36052576	36052531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	88955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	36132577	36133046	36132774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	169046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	36173587	36173879	36173626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	135120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	42725880	42726064	42725972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	API5	605449	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	44883806	44884166	44884088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	86674	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	45000515	45000921	45000720	Y	SYT13,TSPAN18	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	29675	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.02780932697019
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr11	45864713	45865116	45864826	Y	NA	SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1	NA	NA	NA	NA	CRY2	1553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr11	46004522	46004898	46004712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLTL1B	63350	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.5270138535284
chr11	46270167	46270467	46270346	Y	CREB3L1	CREB3L1	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	26745	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	46534596	46534834	46534715	Y	AMBRA1	NA	NA	NA	NA	NA	AMBRA1	78841	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	46706691	46706778	46706735	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ARHGAP1	13387	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	46963806	46964041	46963934	Y	NA	LRP4,C11orf49	NA	NA	NA	NA	C11orf49	7566	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	47173206	47173550	47173416	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	23126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	47215723	47215949	47215852	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PACSIN3	9729	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.37503478277524
chr11	47414531	47414922	47414826	Y	MADD,MADD,MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SPI1,SLC39A13	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A13	11761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.940845112364291
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	48004294	48004631	48004323	Y	CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	4181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	48053215	48053601	48053578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	53102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	48077375	48077584	48077563	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	77262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr11	57366352	57366685	57366510	Y	RTN4RL2,SLC43A1,SLC43A1,UBE2L6,SERPING1,SERPING1	UBE2L6,CLP1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	32595	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr11	57801296	57801572	57801563	Y	OR9I1,OR1S1,OR5B12,OR6Q1	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND1	282581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	59539177	59539402	59539266	Y	NA	AP000640.10,MRPL16	NA	NA	NA	NA	AP000640.10	18729	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	59651741	59651793	59651768	Y	NA	TCN1	NA	NA	NA	NA	TCN1	19693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	60753567	60754105	60753691	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132A	63632	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	60789194	60789499	60789348	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132A	99259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr11	60906916	60907198	60907057	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	19891	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	60926054	60926399	60926274	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.20958635775991
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	61318161	61318561	61318361	Y	NA	LRRC10B,SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	28059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	61394263	61394463	61394368	Y	NA	SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	47643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83888458270955
chr11	61463458	61463769	61463630	Y	CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	17553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	61690120	61690238	61690179	Y	NA	FADS3,RAB3IL1,FTH1	RAB3IL1,FTH1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB3IL1	4379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr11	61880097	61880151	61880125	Y	FADS2,FADS3,RAB3IL1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	9294	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	RP11-864I4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	43360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	4444	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr11	62320057	62320478	62320186	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	AHNAK	IMR90	Hi-C	24141950	AHNAK	1229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	62586827	62586893	62586843	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	10667	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	62587560	62587930	62587905	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9630	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	62624183	62624258	62624224	Y	NA	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	2665	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	83132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	63321382	63321591	63321464	Y	RARRES3,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	60764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	44226	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	63705603	63705837	63705685	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	1172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	63795964	63796221	63796065	Y	NA	OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	44639	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	63846659	63847077	63846694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	84501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.17331940055255
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	9.71755431765502
chr11	65234874	65235172	65234954	Y	SNX32	NEAT1,AP000769.1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	AP000769.1	14146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.64600354461149
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	24.4679808243092
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.24222172995485
chr11	65257502	65257849	65257676	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5384	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.16507257818638
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	37.0036117908161
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.572604035584846
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr11	65328084	65328375	65328271	Y	NA	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	3683	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	65342581	65342818	65342732	Y	TIGD3,SIPA1,SIPA1,DKFZp761E198,KCNK7,MAP3K11,EHBP1L1	LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	EHBP1L1	1072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.64721864466613
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.68140161749002
chr11	65555605	65556077	65555902	Y	TSGA10IP,CATSPER1	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	3112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	65582060	65582341	65582183	Y	NA	OVOL1,MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	29567	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	65849089	65849462	65849117	Y	KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	13255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	65875756	65875846	65875802	Y	NA	PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	39922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	65894211	65894464	65894385	Y	NA	NA	RAB1B,KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	58377	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.58253628909319
chr11	65903912	65904457	65904250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	68078	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	65905081	65905308	65905252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	69247	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	65910089	65910568	65910423	Y	NA	NA	KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	74255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75044541237944
chr11	65949541	65949768	65949655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLC2	72997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr11	66047866	66048291	66048031	Y	NA	KLC2,RAB1B,CNIH2,YIF1A	NA	NA	NA	NA	CNIH2	4205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	66374477	66374855	66374526	Y	NA	CTSF,CCS,CCDC87,RNU4-39P,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4	RBM14-RBM4	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-39P	5706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	21940	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.68177746431897
chr11	66511038	66511198	66511076	Y	KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2	C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	1116	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	66801218	66801427	66801323	Y	SYT12,SYT12	SYT12,RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	20862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr11	66829661	66830298	66829741	Y	NA	RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	7372	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.02141417421568
chr11	66844888	66845141	66844944	Y	RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	22599	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	66845381	66845631	66845497	Y	TMEM134,SSH3,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23092	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.2627661527832
chr11	66849173	66849303	66849226	Y	NA	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	26884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.5226297077996
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	67955066	67955423	67955397	Y	TCIRG1,SUV420H1	SUV420H1	NA	NA	NA	NA	SUV420H1	23872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	68049630	68050030	68049692	Y	NA	C11orf24,LRP5	NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf24	12161	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr11	68110280	68110464	68110374	Y	NA	LRP5	PPP6R3	IMR90	Hi-C	24141950	LRP5	32203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.84005633650955
chr11	68147876	68148306	68148095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	69799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	68273880	68274272	68274031	Y	NA	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	47694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	68387136	68387210	68387173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAL	62037	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	68516686	68516842	68516764	Y	NA	MTL5	NA	NA	NA	NA	MTL5	190	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.37620653657525
chr11	68714020	68714198	68714127	Y	NA	MRPL21,IGHMBP2	NA	NA	NA	NA	IGHMBP2	44710	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	68873890	68874116	68874013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPCN2	59525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.66626660486946
chr11	68882412	68882724	68882575	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1,FADD,ANO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TPCN2	68047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.23976103168393
chr11	68883107	68883355	68883302	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1,FADD,ANO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TPCN2	68742	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.81550361478132
chr11	69042063	69042459	69042261	Y	NA	MYEOV	MYEOV,CCND1,ORAOV1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MYEOV	17146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr11	69069179	69069344	69069260	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	9574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	69069522	69069665	69069598	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	9917	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	AP000439.2	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	21935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr11	69251942	69252241	69252024	Y	NA	AP000439.2,AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	5270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.80400105423169
chr11	69257578	69257894	69257648	Y	NA	AP000439.2,AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	67	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	69295400	69295605	69295545	Y	NA	AP000439.2,AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	2692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.55915532116497
chr11	69296310	69296479	69296388	Y	NA	AP000439.2,AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	3602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	9.09338414034278
chr11	69332480	69332708	69332641	Y	NA	AP000439.3	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	39772	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.46031269918047
chr11	69339069	69339664	69339342	Y	NA	AP000439.3	MYEOV,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	46361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.93367555953954
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.91432439741201
chr11	69808413	69808546	69808480	Y	NA	NA	ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	113862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.512277394149133
chr11	70144122	70144421	70144277	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	29316	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	70155804	70155966	70155885	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	40998	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	70159213	70159451	70159301	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	44407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr11	70232495	70232810	70232653	Y	NA	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	CTTN	9700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	70413927	70414164	70414002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	171333	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	71658678	71659025	71658708	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NA	NA	NA	NA	RNF121	20931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	72426186	72426236	72426211	Y	ATG16L2,ARAP1	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	42551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	72474033	72474226	72474150	Y	STARD10,ARAP1	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	28418	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr11	72487947	72488068	72488008	Y	NA	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	14576	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	72498496	72498726	72498679	Y	STARD10	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	3918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr11	72662901	72663249	72663195	Y	ATG16L2,RELT,RELT	NA	ATG16L2	IMR90	Hi-C	24141950	ATG16L2	139548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	72906397	72906513	72906453	Y	NA	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT	IMR90,MCF7	Hi-C,3C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	P2RY2	20830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.739622767641473
chr11	73180484	73180765	73180625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELT	95175	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.80517280803169
chr11	73736954	73737107	73737038	Y	NA	UCP2	NA	NA	NA	NA	UCP2	44602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	75041361	75041638	75041486	Y	ARRB1	ARRB1	NA	NA	NA	NA	ARRB1	19235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	75051761	75052000	75051847	Y	UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1	ARRB1	NA	NA	NA	NA	ARRB1	8873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	75059269	75059623	75059491	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	1250	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	75581181	75581426	75581320	Y	MAP6	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	56730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	3522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.4236298149711
chr11	77445522	77445800	77445629	Y	NA	FTH1P16	NA	NA	NA	NA	FTH1P16	1451	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,THRSP,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	THRSP	21553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	77898869	77899120	77899016	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	1001	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr11	78003105	78003596	78003355	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	105237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	78131805	78132171	78132034	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	4411	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	78512207	78512629	78512463	Y	GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	228288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	78625090	78625245	78625168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	341171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	80411023	80411358	80411196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1987213	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.61271096301721
chr11	80438038	80438259	80438146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1960312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	80438742	80439167	80438978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1959404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr11	80458246	80458570	80458327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1940001	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	82610096	82610395	82610239	Y	PCF11,ANKRD42,RAB30	C11orf82	NA	NA	NA	NA	C11orf82	1079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	82961020	82961401	82961211	Y	NA	RP11-727A23.1,CCDC90B	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	34049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	84399485	84399833	84399681	Y	NA	CTD-2537O9.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2537O9.1	30036	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr11	84430887	84431242	84431065	Y	DLG2,DLG2	CTD-2537O9.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2537O9.1	1018	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	84842464	84842648	84842557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2537O9.1	412595	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	85047149	85047448	85047300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	290181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	85419491	85419865	85419792	Y	SYTL2	CREBZF,CCDC89	NA	NA	NA	NA	CCDC89	24171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr11	85463912	85464270	85464111	Y	CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2	NA	CCDC89	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL2	55914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.88080190006899
chr11	85484523	85484565	85484546	Y	NA	SYTL2	NA	NA	NA	NA	SYTL2	35619	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43170833229774
chr11	85491016	85491055	85491036	Y	SYTL2,SYTL2,SYTL2	SYTL2	NA	NA	NA	NA	SYTL2	29129	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr11	85494941	85495133	85495025	Y	SYTL2	SYTL2	NA	NA	NA	NA	SYTL2	25051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	85520282	85520495	85520394	Y	SYTL2,SYTL2,SYTL2	SYTL2,AP000974.1	NA	NA	NA	NA	SYTL2	98	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	85521123	85521272	85521226	Y	SYTL2,SYTL2	SYTL2,AP000974.1	NA	NA	NA	NA	SYTL2	939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr11	85525659	85525879	85525765	Y	NA	SYTL2,AP000974.1	SYTL2,CCDC89,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL2	5475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	85534830	85535249	85535043	Y	CREBZF,EED,SYTL2,SYTL2	SYTL2,AP000974.1	SYTL2,PICALM,CCDC89,CREBZF,TMEM126A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYTL2	14646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	85555514	85555895	85555623	Y	NA	SYTL2,AP000974.1	SYTL2,CCDC83,CCDC89,PICALM,EED	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000974.1	8091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr11	85768953	85769276	85769115	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	9648	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	86171239	86171469	86171359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	159986	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	86452946	86453377	86453076	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	46724	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr11	86514557	86514754	86514624	Y	NA	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	14456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	91477314	91477480	91477397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	1451650	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	94336010	94336194	94336103	Y	PANX1,ANKRD49,FUT4	NA	NA	NA	NA	NA	FUT4	60993	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr11	95994127	95994433	95994401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	79911	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	101881929	101882102	101882031	Y	NA	C11orf70	NA	NA	NA	NA	C11orf70	34072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	103342280	103342485	103342472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	63895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	108741188	108741366	108741295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	207436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	110228106	110228348	110228289	Y	ZC3H12C,FDX1,RDX	RP11-347E10.1	RDX	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-347E10.1	4251	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	110317898	110318249	110318012	Y	FDX1	FDX1	NA	NA	NA	NA	FDX1	19291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	111307551	111307700	111307641	Y	POU2AF1	NA	LAYN,C11orf53,C11orf92,LOC100132078,ALG9,FDX1,ARHGAP20	IMR90	Hi-C	24141950	SIK2	163415	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr11	111849134	111849433	111849303	Y	SIK2,CRYAB,DIXDC1,DIXDC1	DLAT	NA	NA	NA	NA	DLAT	44105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	113053106	113053348	113053234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	129811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	113708252	113709087	113708915	Y	CLDN25	USP28	NA	NA	NA	NA	USP28	35205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	201112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	115172228	115172553	115172441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	201122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr11	118112268	118112532	118112411	Y	IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D	MPZL3,MPZL2	NA	NA	NA	NA	MPZL3	8533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01984386717439
chr11	118146006	118146232	118146062	Y	FXYD6,MPZL2	MPZL3,MPZL2	MPZL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MPZL2	12755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	118493108	118493651	118493460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT46	51423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	118493849	118494041	118493911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT46	52164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr11	118740767	118741727	118741016	Y	MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6	MIR4492	DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4492	37690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0817408156514
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	12.1216422678644
chr11	118783640	118784096	118783954	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	118784118	118784508	118784405	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	118786339	118786473	118786384	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	6922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	5420	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.14366047054073
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7063301860472
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.34694496029319
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.1635052047737
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.82267316760608
chr11	119540378	119540644	119540511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRL1	57150	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	119542376	119542690	119542534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRL1	55104	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	119565806	119566154	119565980	Y	NA	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	31640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	120450377	120450712	120450535	Y	NA	NA	GRIK4	IMR90	Hi-C	24141950	GRIK4	69909	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	120677034	120677100	120677067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCEL	215681	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	122586167	122586342	122586202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	61784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr11	122727425	122727730	122727613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	176845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	123397233	123397392	123397331	Y	SCN3B,GRAMD1B	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	212991	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	141044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	124638889	124639135	124639012	Y	NA	NRGN,RP11-677M14.2,VSIG2,RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	8703	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr11	125327806	125328029	125327910	Y	PKNOX2,DDX25,FEZ1	NA	NA	NA	NA	NA	EI24	109083	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	125670081	125670467	125670312	Y	CHEK1,PATE4,PATE1,PATE2	NA	NA	NA	NA	NA	HYLS1	81042	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	125904022	125904031	125904027	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	27199	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr11	125985923	125986168	125986013	Y	NA	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	54693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr11	126290424	126290762	126290592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	66889	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr11	126517645	126518030	126517735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	294110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	128419505	128419554	128419521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	727665	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr11	129185836	129186114	129185975	Y	NA	ARHGAP32	ARHGAP32,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP32	38617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr11	129260546	129260711	129260629	Y	BARX2	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	16711	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	129601384	129601709	129601599	Y	NFRKB	NA	BARX2,ARHGAP32	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM45B	82005	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr11	129716429	129716681	129716540	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	32715	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	129723853	129724184	129723902	Y	NFRKB	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	39301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.95104222174079
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr11	130062798	130062918	130062846	Y	NA	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	35341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	132411283	132411428	132411357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	646281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	132774283	132774643	132774625	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	1009281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr11	134509789	134510106	134509920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLB1L2	310021	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	GLB1L2	508318	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.73648215355889
chr12	1925056	1925234	1925157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	59879	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	3239416	3239801	3239467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	54895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	3761240	3761323	3761284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB4B	110662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	159574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr12	4287687	4287885	4287726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf5	140486	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	4425726	4425978	4425852	Y	NA	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	2393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	5198025	5198415	5198167	Y	NA	NA	NTF3,KCNA6,ANO2,VWF	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA9	441764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83888458270955
chr12	6175047	6175276	6175191	Y	VAMP1,TNFRSF1A	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	121649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	6178640	6178845	6178761	Y	TNFRSF1A	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	125242	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr12	6183650	6183782	6183713	Y	VWF	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	123099	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.572604035584846
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	29449	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.529379200482229
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	28074	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	6622889	6622901	6622895	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	5501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.29486427416514
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.17381243805242
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	7058106	7058233	7058157	Y	ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7127	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	LPCAT3	19454	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.37412375170332
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	NA	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	59553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.811170607056443
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.25398294666253
chr12	9308932	9309318	9309073	Y	KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP4	81609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr12	9802084	9802505	9802358	Y	CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	3479	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	9804148	9804385	9804240	Y	CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	5543	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	11043114	11043456	11043318	Y	TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13	NA	NA	NA	NA	NA	STYK1	218197	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	11716028	11716373	11716142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	84415	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	11864651	11864937	11864724	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	63863	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	11867581	11867722	11867638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	66793	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	11987992	11988316	11988087	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	187204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	12009987	12010279	12010170	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	209199	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	12038206	12038369	12038301	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	223728	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	12599819	12600045	12599926	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	91806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	12708006	12708373	12708190	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	4944	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	12711400	12711706	12711553	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP16	1611	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr12	12956264	12956405	12956396	Y	GPRC5A,DDX47	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	7845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	RP11-392P7.6	3272	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	13251023	13251431	13251083	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	55805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chr12	13292095	13292429	13292230	Y	NA	NA	EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	55221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	13347729	13348002	13347866	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	79	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	13376628	13377027	13376828	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	14410616	14411017	14410842	Y	PLBD1	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL30P11	105420	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr12	14413561	14413925	14413703	Y	NA	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL30P11	102512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr12	14926467	14926701	14926675	Y	NA	HIST4H4,H2AFJ,WBP11,C12orf60	NA	NA	NA	NA	H2AFJ	1197	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr12	14987002	14987060	14987033	Y	NA	WBP11,C12orf60,ART4,MGP	NA	NA	NA	NA	ART4	7369	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr12	14994752	14995023	14994926	Y	H2AFJ,C12orf69,ART4	WBP11,C12orf60,ART4,MGP	NA	NA	NA	NA	ART4	323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	15315937	15316391	15316153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERG	183218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	15396058	15396194	15396126	Y	NA	NA	RERG,PTPRO	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RERG	103415	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr12	15782024	15782386	15782102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	250877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	15853599	15853765	15853693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	179498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	19343816	19343915	19343891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	63168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	23625293	23625709	23625512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	476257	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.63855262921636
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	39718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr12	24717054	24717156	24717119	Y	NA	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	3530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	24865404	24865546	24865458	Y	BCAT1	NA	SOX5,LINC00477	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-444D3.1	151880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	16493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.39516001252001
chr12	26013013	26013197	26013103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF8	96765	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.89045072443692
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.67706860976513
chr12	26451676	26451798	26451755	Y	NA	NA	BHLHE41,SSPN,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.3	174126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	26522536	26522924	26522687	Y	ITPR2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	244986	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	26805266	26805775	26805502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	178356	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	27332593	27333057	27332936	Y	STK38L	NA	STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK38L	61844	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr12	27346815	27347118	27346987	Y	NA	STK38L	STK38L,REP15,PPFIBP1,C12orf71	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK38L	47783	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	27513734	27513812	27513790	Y	NA	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	29947	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	28501330	28501622	28501413	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	30934	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	29859887	29860252	29860216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	75440	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	31899631	31900083	31899901	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	METTL20,AMN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-467L13.5	5568	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-467L13.5	3085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	33048688	33048837	33048763	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	33137070	33137259	33137186	Y	PKP2	NA	NA	NA	NA	NA	PKP2	89296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	33740370	33740630	33740504	Y	NA	NA	SYT10,YARS2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SYT10	149616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	33741113	33741380	33741221	Y	NA	NA	SYT10,YARS2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SYT10	150359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	40250890	40251201	40251046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	246690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	42537125	42537342	42537234	Y	NA	GXYLT1	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	444	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	45627812	45628672	45628351	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	19988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr12	45654086	45654401	45654190	Y	NA	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	46262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr12	46867492	46867759	46867536	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	92030	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr12	46886273	46886657	46886465	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	110811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr12	46887386	46887956	46887679	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	111924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr12	46902978	46903383	46903115	Y	NA	NA	SLC38A2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-96H19.1	127516	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	46947043	46947401	46947166	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	171581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	46949340	46949533	46949437	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	173878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	46949913	46950236	46950181	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	174451	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	47044408	47044812	47044711	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	268946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	47057089	47057400	47057270	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	281627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr12	47058808	47059020	47058972	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	283346	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.17941168383589
chr12	47294477	47294629	47294480	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	177105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	47310900	47311079	47310914	Y	NA	NA	SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	160655	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.27134547572371
chr12	47476610	47477096	47476829	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	4876	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr12	47583701	47583845	47583774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	111967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	47755231	47755452	47755328	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	283497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	48254260	48254459	48254349	Y	NA	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	29345	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM106C	39923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.77384908672
chr12	49276307	49276420	49276362	Y	OR8S1,RND1	DDX23,RND1,FKBP11	RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RND1	18626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.64049758357508
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	59919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	49646906	49646981	49646941	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,DHH,LMBR1L	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	65799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	DNAJC22	1270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	50913232	50913640	50913328	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	16464	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	50926707	50927114	50926974	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	29939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	50936330	50936621	50936410	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	39562	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	51327584	51327783	51327682	Y	NA	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	12329	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	NA	NA	NA	NA	NA	CSRNP2	61379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	101125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr12	52366669	52367046	52366914	Y	NR4A1,GRASP	ACVR1B,NR4A1	NA	NA	NA	NA	ACVR1B	23218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	52423514	52423824	52423679	Y	NA	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	8898	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19719340598065
chr12	52433623	52433924	52433798	Y	NA	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	19007	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	52540237	52540565	52540533	Y	NA	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	43219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	26.2573073386885
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	25.5041945769425
chr12	52543416	52543547	52543482	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	40237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.95548828699651
chr12	52575658	52575765	52575707	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	8019	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	52583620	52584080	52583828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03851598054878
chr12	52588132	52588259	52588205	Y	FIGNL2,GRASP,NR4A1	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	4348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	52588987	52589174	52589068	Y	ACVR1B,NR4A1	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	5203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr12	52594001	52594417	52594311	Y	NA	KRT80,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT80	10217	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.40520945669927
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.09038619125886
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT86	10877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT86,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.959517225738678
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT86,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	53253974	53254173	53254090	Y	RARG,KRT6A,KRT5	KRT4,KRT79	KRT83,KRT82,KRT6A,KRT79,KRT78,KRT6B,KRT2,LOC283404,LOC283403,KRT81,KRT84,KRT85,KRT75,KRT6C,KRT71,KRT72,KRT73,KRT1,KRT77,KRT4	IMR90	Hi-C	24141950	KRT79	27895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.916292390636061
chr12	53261473	53261693	53261598	Y	KRT2,KRT1,KRT77	KRT79	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85	IMR90	Hi-C	24141950	KRT79	35394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	KRT79	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT79	38963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr12	53266551	53266796	53266674	Y	NA	KRT79	KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT79	40472	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	KRT79	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT79	41702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	14.0726486824273
chr12	53270322	53270511	53270351	Y	RARG,KRT84,KRT6C,KRT6A,KRT5,KRT2,KRT1,KRT76,KRT3,KRT4,KRT78	KRT79	EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT79	44243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	KRT79	NA	NA	NA	NA	KRT79	47190	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.77499813410767
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT79	55836	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.55707253629304
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.57967910415102
chr12	53301815	53302147	53302072	Y	KRT1,KRT76,KRT8	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	38508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.87177861106253
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.66830811005679
chr12	53340686	53341032	53340856	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	31	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	53359181	53359363	53359294	Y	PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	17443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	22.1383876676993
chr12	53365695	53366044	53365885	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	23957	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr12	53368339	53368600	53368386	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT8	26601	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr12	53368990	53369278	53369065	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B,KRT18	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT8	27252	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr12	53370058	53370275	53370187	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B,KRT18,KRT85,KRT84,KRT75,KRT6B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF4B	27667	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr12	53445016	53445392	53445120	Y	IGFBP6,C12orf10,TENC1,TENC1,TENC1,SPRYD3	EIF4B,TENC1,RP11-983P16.4,SPRYD3,IGFBP6	NA	NA	NA	NA	RP11-983P16.4	830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	53610849	53611063	53610958	Y	NA	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	13701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.835723328784669
chr12	53627985	53628353	53628269	Y	NA	RARG,MFSD5,ESPL1	MFSD5	K562	ChIA-PET	22265404	RARG	3221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.80763350630261
chr12	54150655	54151094	54151055	Y	NA	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11,HOXC13,HOTAIR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	31126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC13,HOXC13-AS,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8	NA	NA	NA	NA	HOXC6	9219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	29198	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	56474601	56474862	56474633	Y	SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3	RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1	NA	NA	NA	NA	ERBB3	2960	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.883979188388
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	57326732	57326986	57326859	Y	SDR9C7	RDH16	NA	NA	NA	NA	RDH16	24172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr12	57458942	57459239	57459094	Y	NA	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	20607	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr12	57512672	57512926	57512798	Y	NAB2	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	TMEM194A,STAT6,LRP1,STAC3,SHMT2,NDUFA4L2	IMR90	Hi-C	24141950	LRP1	7350	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	57986482	57986782	57986634	Y	R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25	DCTN2,PIP4K2C,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1	NA	NA	NA	NA	PIP4K2C	3525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	60465724	60465931	60465829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A7	477876	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	62772980	62773240	62773147	Y	MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	85357	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	56366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr12	63096065	63096306	63096205	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	100599	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.42859042462749
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	129508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	64401221	64401399	64401310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	165148	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	64414724	64414736	64414730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	178651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	64482177	64482504	64482346	Y	SRGAP1,TBK1,C12orf66	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	131572	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	64855437	64855720	64855602	Y	C12orf66,TBK1	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	11777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	65076423	65076649	65076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	74130	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	65262498	65262651	65262575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D30	89909	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	67319023	67319379	67319201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	141563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	67361974	67362194	67362149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	98748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	67363946	67364340	67364143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	96602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	67371255	67371618	67371453	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	89324	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	67411263	67411633	67411591	Y	NA	RP11-123O10.4	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	49309	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	68705071	68705359	68705215	Y	IL22	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.715070045913242
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	70329390	70329536	70329438	Y	NA	NA	PTPRB,KCNMB4	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3IP	198929	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	70360720	70360860	70360789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3IP	230259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	70633612	70633702	70633681	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	1072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	72690281	72690495	72690341	Y	TPH2,TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	458794	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	74437082	74437415	74437248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	492136	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr12	75284095	75284191	75284160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	354544	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36353222222561
chr12	76061758	76061867	76061813	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	158342	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	76104986	76105336	76105144	Y	NA	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRR1	201570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04167723447366
chr12	76114737	76114966	76114777	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	211321	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr12	76178520	76178723	76178659	Y	NA	NA	PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	246989	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	76250053	76250409	76250231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	175303	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	76363545	76363908	76363622	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	OSBPL8,PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	61804	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	76552427	76552994	76552692	Y	PHLDA1,OSBPL8	NA	NAP1L1,PHLDA1,OSBPL8,BBS10	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L1	75614	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	76751627	76751939	76751780	Y	NA	BBS10	NA	NA	NA	NA	BBS10	11405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	78134909	78135174	78135084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-34H18.1	418488	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	79803401	79803717	79803562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	279160	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	79943391	79943637	79943513	Y	NA	NA	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	139240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.0531797950233
chr12	79994209	79994302	79994256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	88575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr12	80098707	80098999	80098853	Y	NA	PAWR	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	15830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	81077970	81078246	81078130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	251348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	86658149	86658358	86658243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	1767265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.45155219947213
chr12	87554185	87554198	87554192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	871425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	87657900	87657914	87657909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	767709	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	87724582	87724754	87724682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	700869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	89038835	89039086	89038961	Y	NA	NA	LOC728084	IMR90	Hi-C	24141950	KITLG	66207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.99086365346271
chr12	89978345	89978700	89978451	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT4	60306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	90065189	90065567	90065562	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	35510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	90162772	90163253	90163116	Y	DUSP6,POC1B,ATP2B1	NA	LOC338758,C12orf37	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP2B1	61695	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	90256648	90256905	90256732	Y	POC1B,POC1B,ATP2B1	RP11-654D12.2	LOC338758	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-654D12.2	17537	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	90353904	90354400	90354158	Y	ATP2B1	NA	ATP2B1,LOC338758,C12orf37	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-654D12.2	79462	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	91775053	91775433	91775292	Y	NA	NA	LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-796E2.4	761916	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	91900299	91900534	91900371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	636815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	92012209	92012543	92012276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	524806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr12	92172749	92173207	92172879	Y	BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-796E2.4	364142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	92474192	92474586	92474423	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	62763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	18951	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr12	92772772	92773106	92773007	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	235099	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	92941921	92942046	92942003	Y	EEA1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	379061	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.835723328784669
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	94201755	94201874	94201816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	132604	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	94349620	94349775	94349698	Y	NA	NA	SOCS2,LOC144481,CRADD,MRPL42	IMR90	Hi-C	24141950	CRADD	280469	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	94495978	94496358	94496187	Y	NA	NA	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC41	355406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr12	94827148	94827488	94827330	Y	NA	CCDC41	NA	NA	NA	NA	CCDC41	24276	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	95477787	95477978	95477880	Y	NA	NR2C1	NR2C1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR2C1	12308	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	95840387	95840581	95840484	Y	METAP2	METAP2	VEZT,FGD6	IMR90	Hi-C	24141950	METAP2	24715	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	96637849	96638243	96638007	Y	LTA4H,ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	51689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr12	96659033	96659395	96659303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	72873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	96752607	96752772	96752695	Y	CDK17	CDK17	NA	NA	NA	NA	CDK17	39566	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	97881336	97881621	97881374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	582335	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.61271096301721
chr12	97894107	97894881	97894494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	595106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75044541237944
chr12	97961446	97962002	97961660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	662445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.15357001763675
chr12	97962496	97962841	97962674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	663495	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19719340598065
chr12	98818500	98818672	98818666	Y	NA	RNU4-41P,SLC9A7P1	LOC100128191,TMPO	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU4-41P	8684	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	99541793	99542207	99542018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	504874	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	99768760	99769016	99768892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	731841	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	99786605	99786971	99786790	Y	ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	747655	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	100970454	100970954	100970686	Y	NA	GAS2L3	NA	NA	NA	NA	RP11-575G13.2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	102285250	102285626	102285359	Y	DRAM1	DRAM1	NA	NA	NA	NA	DRAM1	16121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	104252933	104253121	104253026	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	19958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	104872178	104872670	104872343	Y	HCFC2,EID3,CHST11	CHST11	NA	NA	NA	NA	CHST11	25105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	105035767	105036007	105035871	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	188694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	105062941	105063154	105062961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	215868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	106515905	106516067	106515985	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	15744	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	106610166	106610424	106610295	Y	RFX4	NA	NA	NA	NA	NA	NUAK1	78355	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	107473112	107473328	107473221	Y	NA	CRY1	NA	NA	NA	NA	CRY1	12279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	108238186	108238361	108238213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	85137	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.49035160916133
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr12	109036250	109036518	109036431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	109058635	109058851	109058743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO1C	64521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	109061186	109061401	109061295	Y	SELPLG,SELPLG,SSH1	NA	NA	NA	NA	NA	CORO1C	61971	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	109084686	109085066	109084867	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	38306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	109120887	109121218	109121134	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	2154	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	109249389	109249909	109249762	Y	CORO1C,SSH1,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	23	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	111015565	111016027	111015682	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	3098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	111867956	111868269	111868101	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	111875686	111876044	111875771	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	33934	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	112569313	112569455	112569350	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	TRAFD1	8008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	112920682	112921011	112920993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	66040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	113574868	113575216	113574905	Y	NA	RASAL1,DDX54	NA	NA	NA	NA	RASAL1	2824	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	113580533	113580764	113580647	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,RASAL1,RASAL1	RASAL1,DDX54	NA	NA	NA	NA	RASAL1	8489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr12	113652796	113652994	113652903	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	3861	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr12	113684297	113684702	113684391	Y	NA	TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	27398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	113798034	113798144	113798106	Y	SLC24A6,PLBD2,SDSL,SDS	PLBD2	SDS,SDSL	IMR90	Hi-C	24141950	PLBD2	3663	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	115172990	115173109	115173029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX3	53021	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	115889491	115890073	115889778	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	769522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	116308098	116308555	116308414	Y	NA	NA	RBM19,TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	404588	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	350534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr12	116561417	116561596	116561452	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	151547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	116590030	116590409	116590220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	122734	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.553931922210458
chr12	116666460	116666763	116666749	Y	NA	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	46380	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	116796896	116797249	116796984	Y	NA	NA	MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MED13L	83753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	116828176	116828516	116828354	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MED13L	115033	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr12	116864232	116864472	116864363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	104755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr12	116865168	116865340	116865257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	103887	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	96918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.09324337620103
chr12	116928717	116928987	116928846	Y	MED13L,MAP1LC3B2	LINC00173	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00173	40240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	117277511	117277610	117277564	Y	NOS1,RNFT2,HRK	HRK	NA	NA	NA	NA	HRK	39636	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	118263351	118263381	118263366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	141407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	18548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	119921747	119921758	119921753	Y	TMEM233	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	181800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	120153680	120153798	120153737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	50122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.52377995469877
chr12	120433844	120433899	120433873	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	119407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	120453080	120453507	120453184	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	99799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	120516744	120516801	120516776	Y	NA	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	36505	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04167723447366
chr12	120666780	120666906	120666823	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	29686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.33808910926775
chr12	120728531	120728703	120728617	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-1	337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	120926786	120926862	120926830	Y	SIRT4	TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	21133	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	121245538	121245859	121245790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADS	84000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	122086492	122086728	122086610	Y	KDM2B,SETD1B,ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	MORN3	21809	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	122771781	122771848	122771815	Y	NA	VPS33A	NA	NA	NA	NA	VPS33A	22713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.24526579320882
chr12	123367402	123367963	123367875	Y	VPS37B	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	11028	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	123528001	123528432	123528293	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB9	63805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr12	123636095	123636496	123636485	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	3533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	123919438	123919802	123919750	Y	C12orf65,RILPL2	RILPL2,SNRNP35	NA	NA	NA	NA	RILPL2	174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	124486134	124486345	124486231	Y	NA	ZNF664,CCDC92	NA	NA	NA	NA	CCDC92	30756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr12	124961644	124962003	124961833	Y	UBC	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	88132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	46301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	125049011	125049349	125049112	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.94763881836009
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	66973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr12	125331273	125331577	125331425	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	33637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	125369233	125369624	125369429	Y	NA	SCARB1,UBC	UBC	K562	ChIA-PET	22265404	SCARB1	4019	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr12	125423202	125423335	125423285	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	23288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.07302366219769
chr12	125534116	125534467	125534247	Y	NA	AACS	AACS	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AACS	13458	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32618799547683
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	125581977	125582373	125582099	Y	TMEM132B	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	34052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	129296403	129296565	129296505	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	9963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	130923831	130924224	130924207	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	397587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	131702988	131703123	131703024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	348564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.56632487398972
chr12	131703349	131703716	131703520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	348925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	131706292	131706484	131706406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	351868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr12	131707348	131707723	131707417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	352924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	131714239	131714475	131714357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	359815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.46277339745139
chr12	131730988	131731205	131731099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	376564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.88797145289375
chr12	131941405	131941587	131941511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	252039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr12	132265042	132265050	132265046	Y	NA	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	45888	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.17662055156069
chr12	132315862	132315946	132315904	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.799949409077185
chr12	132349078	132349283	132349182	Y	NA	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	27913	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr12	132356836	132357024	132356894	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	20172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.62979212950802
chr12	132368164	132368433	132368235	Y	NA	ULK1,PUS1	SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1	IMR90	Hi-C	24141950	ULK1	8763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.85587333151181
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	SNORA49,EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	132647278	132647407	132647355	Y	SFSWAP,ULK1,FBRSL1	DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2	NA	NA	NA	NA	NOC4L	20285	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr12	133052608	133053529	133052780	Y	FBRSL1	FBRSL1	FBRSL1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	FBRSL1	10608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	20137811	20138146	20137910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	67642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	20419964	20420131	20420036	Y	PSPC1,ZMYM5	ZMYM5	NA	NA	NA	NA	ZMYM5	15645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	20692936	20693199	20693068	Y	CRYL1	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	71838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	71493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.30871034231478
chr13	20694627	20695029	20694906	Y	PSPC1,ZMYM5	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	70008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	62937	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr13	20986336	20986694	20986525	Y	GJB2,GJB6	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	111302	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr13	21632492	21632727	21632640	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	959	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	21893563	21893874	21893643	Y	NA	MIPEPP3	ZDHHC20	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEPP3	23285	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	22111458	22111566	22111512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	79949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr13	23500406	23500844	23500578	Y	NA	NUS1P2	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	12616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	10.6815850898652
chr13	23539399	23539627	23539538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	51609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.52506769965817
chr13	23553152	23553552	23553369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	65362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.0686906544728
chr13	23733450	23734509	23733658	Y	NA	HMGA1P6,SGCG	NA	NA	NA	NA	SGCG	18582	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25504077587319
chr13	23735133	23735494	23735391	Y	NA	HMGA1P6,SGCG	NA	NA	NA	NA	SGCG	17597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	23815337	23815738	23815537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCG	62246	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr13	24062649	24062979	24062814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACS	56808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	146492	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	51.7260394641279
chr13	24290088	24290194	24290124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	147579	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.897620277261674
chr13	24317696	24317997	24317856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	143031	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr13	24365850	24365860	24365855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	95168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr13	24440474	24440724	24440677	Y	NA	C1QTNF9B-AS1,MIPEP	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	20304	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	24528296	24528692	24528455	Y	PCOTH	NA	SPATA13,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	66738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr13	24543608	24543809	24543709	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	82050	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	24701250	24701640	24701393	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	239692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0817408156514
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	24736701	24736916	24736809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPEP	275143	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	25082319	25082682	25082572	Y	PARP4	PARP4	NA	NA	NA	NA	PARP4	2266	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	25691354	25691814	25691656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR6	168333	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.71968854934858
chr13	26118734	26119070	26118902	Y	FAM123A,ATP8A2	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL1	245072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	26265597	26265968	26265783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL1	391935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	26562971	26563100	26563036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	231691	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr13	27706563	27707017	27706898	Y	NA	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	37016	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	36635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr13	30332929	30333348	30333111	Y	UBL3	NA	NA	NA	NA	NA	UBL3	89473	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr13	30486131	30486179	30486155	Y	NA	NA	HSPH1,UBL3,KATNAL1	IMR90	Hi-C	24141950	UBL3	63310	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	31444557	31445090	31444788	Y	C13orf26	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	254727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	32625512	32625609	32625561	Y	NA	FRY	NA	NA	NA	NA	FRY	22075	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	32664585	32664831	32664706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	61148	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	33728009	33728149	33728045	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	KL	139802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	33744347	33744745	33744546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KL	156140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	33758061	33758236	33758137	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	164531	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	33781660	33782051	33781892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	140716	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	33858244	33858802	33858357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	63965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	33870395	33870537	33870466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	52230	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.06070335532318
chr13	34216569	34217156	34216982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	173030	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.56543448276009
chr13	34217614	34217741	34217660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	172445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr13	39326204	39326315	39326228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FREM2	66938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr13	41187555	41187952	41187790	Y	ELF1,ELF1,FOXO1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	50782	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	41229483	41229797	41229615	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	8937	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	41574237	41574406	41574394	Y	FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	59004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	41589057	41589218	41589148	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	44192	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	41624170	41624528	41624466	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	ELF1,MTRF1,NAA16	IMR90	Hi-C	24141950	WBP4	8882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	41930999	41931186	41931065	Y	C13orf15,ELF1,ELF1,MTRF1,NAA16	NAA16	NA	NA	NA	NA	NAA16	47658	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	42269057	42269475	42269218	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	342701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	241248	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	92924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	43451053	43451467	43451346	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	143872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr13	43635759	43636150	43635822	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	40420	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	43656094	43656342	43656191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	60755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr13	45333095	45333256	45333140	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	183812	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	46082201	46082375	46082214	Y	NA	COG3	NA	NA	NA	NA	COG3	45141	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	46102041	46102392	46102214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	64981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98812159262141
chr13	46244354	46244716	46244645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	207294	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	46339630	46339901	46339775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	284993	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	46557145	46557532	46557508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	67362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	46696032	46696143	46696084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	71138	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	46709325	46709604	46709495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCP1	74402	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.25335534473102
chr13	46736375	46736487	46736423	Y	ZC3H13,C13orf18,LCP1	LCP1	NA	NA	NA	NA	LCP1	47519	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr13	46739572	46740633	46739908	Y	NA	LCP1	NA	NA	NA	NA	LCP1	43373	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	46750972	46751177	46751169	Y	ZC3H13,C13orf18,LCP1	LCP1	NA	NA	NA	NA	LCP1	32829	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.10474593675067
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	49601050	49601794	49601184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	53002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	49688107	49688286	49688182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	131761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	50696626	50696754	50696746	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU2	1102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	51034237	51034585	51034411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	100338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	51103280	51103738	51103647	Y	NA	NA	DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL34P26	169381	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	51252596	51252863	51252763	Y	NA	NA	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	228951	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr13	52572353	52572390	52572372	Y	NA	ATP7B,ALG11,UTP14C	NA	NA	NA	NA	ATP7B	11240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr13	53814883	53815070	53814977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	590039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	55208577	55208909	55208656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	1983733	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	63626096	63626398	63626247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	1021746	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	64508473	64508866	64508848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	139278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	64537945	64538229	64538154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	109915	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	4172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.10449624821815
chr13	69231271	69231529	69231442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	1428803	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.37974363732908
chr13	69259676	69259922	69259838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	1457208	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.46593465137627
chr13	70561834	70562171	70562003	Y	KLHL1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	1877159	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	71905168	71905271	71905222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	534059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	72102124	72102434	72102279	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	336896	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	72996613	72996915	72996766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	278916	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	73728646	73729047	73728833	Y	NA	RNU4-10P	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	34618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	74339681	74339964	74339912	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	366430	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.4099183112531
chr13	76269053	76269192	76269124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	76483	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	76290964	76291186	76291007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	98394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	77364596	77364759	77364678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	189292	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	77453598	77454010	77453765	Y	FBXL3,KCTD12	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	100041	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	77881758	77881859	77881809	Y	SLAIN1	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	17326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	77897670	77898015	77897832	Y	NA	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	1170	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	81048022	81048142	81048082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	134936	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	90167002	90167321	90167160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1830753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	91580553	91580648	91580601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	417426	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr13	93361116	93361155	93361136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC6	515940	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	93803477	93803844	93803711	Y	NA	NA	GPC6	IMR90	Hi-C	24141950	GPC6	73251	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	93880621	93881133	93881009	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	3526	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	94762314	94762622	94762468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	483889	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	94785518	94785984	94785813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	460527	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	94976563	94976881	94976571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	269630	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	97188079	97188190	97188135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	484343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	97302981	97303007	97302994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	568681	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	97913986	97914316	97914087	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	42298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	97991476	97991911	97991864	Y	MBNL2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2A	92565	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	99922932	99923366	99923036	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	56920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	100026921	100028247	100027781	Y	UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	123424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	100154383	100154610	100154487	Y	GPR183	TM9SF2	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	2712	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	100607991	100608280	100608183	Y	PCCA,ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	13883	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	103250853	103251030	103250900	Y	NA	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	3500	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	105791770	105791914	105791835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	1426598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	107173594	107173915	107173796	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	44597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	107569449	107569874	107569676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	255664	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0011717538
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	596578	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	109852673	109853050	109852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	552565	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	110322109	110322425	110322268	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	83190	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr13	110746992	110747342	110747118	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	310077	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	111526935	111527249	111527195	Y	RAB20	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	LINC00346	6773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	112867754	112868133	112868015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD44	163362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.916292390636061
chr13	113312485	113312628	113312557	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	30015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	113549464	113549664	113549543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	71474	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	113597069	113597276	113597160	Y	MCF2L	MCF2L-AS1	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	MCF2L-AS1	23862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr13	113624891	113625152	113625027	Y	MCF2L	MCF2L-AS1	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	3753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	113634758	113635206	113634958	Y	MCF2L	MCF2L-AS1	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	13620	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	53642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr13	113946276	113946648	113946334	Y	NA	LAMP1	LAMP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LAMP1	2908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.854395442159057
chr13	114065698	114065892	114065794	Y	MCF2L,ADPRHL1	GRTP1	NA	NA	NA	NA	GRTP1	49252	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr13	114080351	114080489	114080411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	62778	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	114127046	114127213	114127130	Y	GRTP1,DCUN1D2	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	16054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.36983409023307
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr13	114871084	114871554	114871378	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	24532	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.45560384462664
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.493605280774745
chr14	21577986	21578258	21578000	Y	NA	ARHGEF40,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	7105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr14	22080552	22080764	22080649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL2	77202	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr14	22736761	22737207	22736959	Y	NA	NA	OXA1L,SLC7A7	IMR90	Hi-C	24141950	TRAV29DV5	107627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.61634341508813
chr14	22757693	22757837	22757724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAV29DV5	128559	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.68294921811898
chr14	23029996	23030028	23030008	Y	NA	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	26147	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	23367708	23367835	23367778	Y	NA	LRP10,REM2,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5	NA	NA	NA	NA	REM2	17334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr14	23611395	23611621	23611510	Y	SLC7A8	C14orf119,ACIN1,SLC7A8	NA	NA	NA	NA	SLC7A8	39262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	24016944	24017157	24017064	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	6059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	24058094	24058646	24058322	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2,DHRS2	NA	NA	NA	NA	AP1G2	22815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr14	24071678	24071902	24071737	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2,DHRS2	C14orf167	IMR90	Hi-C	24141950	DHRS2	25422	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	24163763	24164098	24163827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS2	66439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.19119767352594
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	24604383	24604748	24604550	Y	NA	PCK2,DCAF11,PSME1,RNF31,PSME2,IRF9	NA	NA	NA	NA	PSME1	1016	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	24755187	24755313	24755250	Y	DHRS4L1	TINF2,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	DHRS1	11726	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr14	27631441	27631502	27631472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	566481	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	31055388	31055443	31055417	Y	NA	G2E3,SCFD1	NA	NA	NA	NA	G2E3	29059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COCH	58389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	31905446	31905450	31905448	Y	NA	HEATR5A,RP11-176H8.1	NA	NA	NA	NA	HEATR5A	17658	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr14	33366513	33366604	33366563	Y	NA	NPAS3	AKAP6	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS3	35535	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	33756619	33756719	33756669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	354480	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr14	33838745	33838916	33838831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	436606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	34033986	34034251	34034169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	631847	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	34162040	34162301	34162172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	759901	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.17657513873602
chr14	34529962	34530153	34530113	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	34801443	34801630	34801553	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127932	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	34802064	34802306	34802186	Y	C14orf147	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127256	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	34837330	34837452	34837391	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SPTSSA	92110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	34844314	34844466	34844419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	85096	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	34987475	34987508	34987491	Y	EAPP	EAPP,RPS19P3	NA	NA	NA	NA	EAPP	19408	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	RPS19P3,SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	35303172	35303324	35303248	Y	SRP54,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	38225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	35666202	35666508	35666414	Y	BAZ1A,FAM177A1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	76447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	35800965	35801124	35801022	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	55126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	35801463	35801750	35801570	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	54525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01984386717439
chr14	35802308	35802726	35802409	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	53549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr14	35805683	35806194	35806003	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	50081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.84567828870535
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr14	35875293	35875611	35875452	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	3338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	36277376	36277519	36277444	Y	NFKBIA,RALGAPA1	RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	37469718	37470010	37469970	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	170061	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	37785804	37785829	37785809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	120686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	37980657	37980979	37980818	Y	SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-356O9.2	53321	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	38052089	38052429	38052199	Y	NA	RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	10623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	38052956	38053419	38053189	Y	FOXA1	RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	9633	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.61233511618826
chr14	38054173	38054544	38054319	Y	NA	RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	8508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.63100722956265
chr14	38057887	38058022	38057995	Y	FOXA1	RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	5030	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.51239338530852
chr14	38067310	38067714	38067659	Y	NA	RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	FOXA1	65	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	39637578	39637824	39637713	Y	NA	PNN	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6B	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	39892906	39893200	39893154	Y	FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	6504	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	39900071	39900466	39900211	Y	PNN,CTAGE5,FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	367	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	39954969	39955272	39955039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	55265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	42297588	42297942	42297766	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2397884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	43777769	43777873	43777801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1586625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	44120052	44120074	44120065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1244424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	44247976	44248104	44248035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1116394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	44249775	44250158	44250052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1114340	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	47526400	47526720	47526539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	141587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	48030000	48030393	48030347	Y	MDGA2,MDGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	361693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	50090977	50091033	50091007	Y	METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2	RN7SL1,RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2	NA	NA	NA	NA	MGAT2	5488	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	50256678	50256775	50256761	Y	NA	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	24352	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.73767661377123
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.68972021770244
chr14	50429310	50429592	50429451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	71500	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	66080	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	39515	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	37101	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	10.5417957257323
chr14	50475850	50475934	50475889	Y	ARF6,C14orf182	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	30013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr14	50549012	50549388	50549195	Y	RPS29,RPL36AL,DNAAF2,KLHDC1,KLHDC2,NEMF,ARF6,SOS2,ATP5S,METTL21D	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	43065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	50988191	50988449	50988343	Y	NA	MAP4K5	NA	NA	NA	NA	MAP4K5	37395	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr14	51830897	51831022	51831007	Y	TRIM9	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	122796	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER2	156301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr14	54469950	54470091	54470024	Y	NA	BMP4	NA	NA	NA	NA	BMP4	46471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr14	55179095	55179183	55179143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	147280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	9.75311776194454
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	55589429	55589640	55589507	Y	NA	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	601	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98812159262141
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.614258563646172
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34,RP11-665C16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-665C16.6	29146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	56045964	56046135	56045995	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	1136	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	57265284	57265457	57265441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	468269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr14	58226988	58227367	58227355	Y	EXOC5,NAA30,SLC35F4,C14orf37,ACTR10	NA	NA	NA	NA	NA	NAA30	371726	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	58705309	58705629	58705462	Y	ARID4A	ACTR10,PSMA3	NA	NA	NA	NA	PSMA3	3920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	58766869	58767218	58767044	Y	ARID4A	RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	ARID4A	3766	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.959517225738678
chr14	59768078	59768328	59768116	Y	RTN1,DAAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	114714	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	59861080	59861273	59861260	Y	DAAM1,RTN1	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR135	68787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	60776777	60777011	60776895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184C24.2	63294	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	60778203	60778479	60778369	Y	PPM1A	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184C24.2	64720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	61188145	61188381	61188263	Y	NA	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	61795045	61795395	61795255	Y	PRKCH	TMEM30B,RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	7509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	61865216	61865457	61865337	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	77680	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.529379200482229
chr14	61904242	61904399	61904321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	116706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	61911036	61911322	61911077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	123500	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	150732	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	181993	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	61980898	61981080	61981008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	179151	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	61993253	61993443	61993274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	166788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr14	61993702	61994099	61993768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	166132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.50915948647888
chr14	62026213	62026731	62026533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	133500	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.15565486907871
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	64144701	64144896	64144792	Y	NA	WDR89,SGPP1	NA	NA	NA	NA	WDR89	38122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	64170371	64170528	64170450	Y	NA	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	22229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.694827625497564
chr14	64705009	64705329	64705170	Y	PLEKHG3,SYNE2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-544I20.2	97988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	65006188	65006351	65006244	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	HSPA2	5565	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.71310118563067
chr14	65193422	65193546	65193484	Y	ZBTB1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	24602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr14	65229015	65229197	65229106	Y	SPTB,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	60195	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	65347160	65347466	65347258	Y	RAB15	CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB	SPTB	IMR90	Hi-C	24141950	CHURC1	31613	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr14	65546452	65546770	65546602	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	20643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	65705173	65705467	65705275	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	137760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	65722117	65722532	65722424	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FUT8	152778	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.15357001763675
chr14	65801624	65801887	65801778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	73423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	65905118	65905243	65905181	Y	NA	FUT8	NA	NA	NA	NA	FUT8	29808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr14	67728313	67728625	67728469	Y	NA	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	22487	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	67998625	67999040	67998762	Y	NA	PLEKHH1,TMEM229B	NA	NA	NA	NA	TMEM229B	169	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	68033590	68034347	68033627	Y	NA	PLEKHH1,TMEM229B,PIGH	NA	NA	NA	NA	PIGH	30657	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11,RDH12	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.20396440556411
chr14	68281633	68281808	68281770	Y	PLEK2,ZFYVE26	ZFYVE26,RAD51B	NA	NA	NA	NA	ZFYVE26	326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr14	68555905	68556402	68556038	Y	PIGH	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	271409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr14	68864511	68864831	68864664	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	22082	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.26522685105412
chr14	68884830	68884917	68884875	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	1996	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	68925660	68925982	68925837	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	38747	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85755669608394
chr14	68933312	68933746	68933512	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	46399	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	68987766	68987894	68987825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	100853	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	69076965	69077322	69077310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	183868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	69241519	69241814	69241672	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	19376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	69246726	69246992	69246942	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	14198	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	69252204	69252483	69252314	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	8707	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr14	69274132	69274272	69274201	Y	NA	ZFP36L1	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	12942	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.90078153118655
chr14	69400981	69401191	69401073	Y	ZFP36L1,DCAF5	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	42966	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	69402735	69403079	69402843	Y	GALNTL1	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	41078	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr14	69824337	69824587	69824470	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	38145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0027420608413
chr14	69913588	69913836	69913761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERH	50244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	70099072	70099485	70099117	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	22759	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	70152055	70152259	70152141	Y	KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	39358	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	70464665	70464959	70464731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	273048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	70465984	70466470	70466191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	274367	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr14	71109519	71109752	71109636	Y	MED6,TTC9	MED6,TTC9	NA	NA	NA	NA	TTC9	3015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr14	71132254	71132379	71132336	Y	TTC9	TTC9	NA	NA	NA	NA	TTC9	25750	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr14	71158950	71159205	71159125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC9	52446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	NA	NA	NA	NA	NA	TTC9	58030	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	71996595	71997083	71996703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	210064	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	72438276	72438928	72438440	Y	NA	RGS6	NA	NA	NA	NA	RGS6	41120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	73391030	73391383	73391207	Y	NA	DPF3,RP1-146I3.1	NA	NA	NA	NA	DCAF4	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr14	73595262	73595380	73595321	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	5746	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28482	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.26314199961215
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.77855794127383
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	45854	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr14	74252099	74252503	74252342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGR2	64044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.34486010885122
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPC2	74615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr14	75607767	75608156	75607957	Y	FOS	NEK9,TMED10	NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK9	15720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	75649674	75650038	75649826	Y	FOS	TMED10	TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMED10	8340	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr14	75721756	75722023	75721798	Y	NA	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-293M10.2	2091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr14	75740024	75740353	75740051	Y	JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FOS	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	LOC731223	IMR90	Hi-C	24141950	FOS	3124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	75750758	75751180	75750884	Y	PROX2,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FOS	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	FOS	7281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.84134528098047
chr14	75765697	75765964	75765861	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	6590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	75777354	75777713	75777592	Y	NA	RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	18247	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr14	75990204	75990451	75990297	Y	FOS,BATF	BATF	NA	NA	NA	NA	BATF	3436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	76002139	76002648	76002337	Y	FOS,BATF	BATF,FLVCR2	NA	NA	NA	NA	BATF	15371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr14	76009076	76009592	76009288	Y	FOS,JDP2,BATF	BATF,FLVCR2	NA	NA	NA	NA	BATF	22308	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr14	76010953	76011159	76011009	Y	FOS,JDP2,BATF	BATF,FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	BATF	24185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	76032638	76033032	76032887	Y	FOS,BATF,FLVCR2	BATF,FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	9928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr14	76076330	76076878	76076479	Y	BATF,FLVCR2,FLVCR2	FLVCR2,RP11-507E23.1,TTLL5,C14orf1	NA	NA	NA	NA	RP11-507E23.1	15781	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	76564687	76564726	76564707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	117353	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	77381505	77381598	77381569	Y	NA	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	30412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr14	77442572	77442791	77442668	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-7F17.1	9546	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr14	77444143	77444725	77444469	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1,IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-7F17.1	11117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	77473789	77473986	77473849	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1,IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	19048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr14	77498012	77498283	77498148	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	4978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.63410243082056
chr14	77500544	77500911	77500765	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	7510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	77505083	77505447	77505354	Y	TMEM63C,TMED8,KIAA1737	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	12049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	77554689	77554897	77554781	Y	NA	RP11-7F17.3,TMEM63C	KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-7F17.3	14002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.54048320779058
chr14	77577466	77577695	77577651	Y	NA	RP11-7F17.3,TMEM63C,ZDHHC22	NA	NA	NA	NA	TMEM63C	3216	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.03134642772403
chr14	77780620	77780713	77780667	Y	NA	GSTZ1,POMT2	NA	NA	NA	NA	GSTZ1,POMT2	4514	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	78121399	78121579	78121501	Y	NA	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	40283	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	78447305	78447552	78447446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	182879	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr14	79880226	79881040	79880569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	971060	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	80268385	80268746	80268504	Y	DIO2	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	583354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	80857236	80857459	80857352	Y	NA	DIO2	NA	NA	NA	NA	DIO2	5136	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	81220509	81220785	81220647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	203076	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	81503760	81504107	81503844	Y	TSHR	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	79899	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	32.1220996402641
chr14	81713528	81713897	81713622	Y	NA	GTF2A1,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1P1	2621	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	STON2	NA	NA	NA	NA	STON2	33193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	81977973	81978150	81978054	Y	NA	SEL1L	NA	NA	NA	NA	SEL1L	20055	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	88884161	88884478	88884321	Y	NA	SPATA7	NA	NA	NA	NA	SPATA7	34893	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr14	90167936	90168219	90168049	Y	TDP1,FOXN3,FOXN3	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	EFCAB11	250902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	90910680	90911014	90910847	Y	NA	CALM1	CALM1,TTC7B	MCF7	ChIA-PET	22265404	CALM1	49834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	90975200	90975474	90975336	Y	NA	NA	LOC400238,CALM1,C14orf102,TTC7B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CALM1	114354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr14	91090658	91091172	91090732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	189651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	101280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	91454457	91454803	91454684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	70177	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	91723953	91724002	91723978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	158186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	91724533	91724847	91724784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	157341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	91729802	91729926	91729864	Y	GPR68,GPR68	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	152262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.66584741178588
chr14	91853544	91853834	91853633	Y	TC2N,RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	28354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr14	93193771	93194035	93193928	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	19012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	93477908	93477983	93477972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHGA	90483	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.52812606318925
chr14	93499320	93499712	93499545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	80953	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.86341666459548
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.679296126205757
chr14	93697718	93697880	93697787	Y	ITPK1,MOAP1	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	C14orf142	26279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	94441180	94441443	94441314	Y	SERPINA1,ASB2,ASB2	OTUB2	NA	NA	NA	NA	OTUB2	49232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	95064751	95064770	95064761	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA12,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	11944	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	95065322	95065753	95065523	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	10961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	95680303	95680655	95680479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	57956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	95724003	95724377	95724190	Y	DICER1,DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	59866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	95946356	95946810	95946552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX5	51030	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	95953401	95953498	95953450	Y	TCL1B	GLRX5,SCARNA13,SNHG10	C14orf49,SNHG10,GLRX5	IMR90	Hi-C	24141950	GLRX5	44342	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	96012218	96012367	96012292	Y	GLRX5	GLRX5,SCARNA13,SNHG10	NA	NA	NA	NA	SNHG10	13009	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	96125888	96126188	96126030	Y	TCL1A	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG10	126679	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	96539283	96539499	96539344	Y	NA	C14orf132	NA	NA	NA	NA	C14orf132	35622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr14	96550045	96550377	96550264	Y	NA	C14orf132	NA	NA	NA	NA	C14orf132	46384	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.95077736587264
chr14	96562177	96562641	96562498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf132	58516	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.61988051584196
chr14	96565122	96565402	96565262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf132	61461	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr14	98086982	98087081	98087062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK1	825341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.679296126205757
chr14	99739493	99739630	99739557	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	205586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr14	100068632	100068970	100068687	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.38182848877104
chr14	100196933	100197043	100196991	Y	NA	CYP46A1,EML1	NA	NA	NA	NA	EML1	4987	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr14	100448901	100449138	100448963	Y	NA	NA	EML1,EVL,YY1,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	175362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr14	100463833	100464185	100464009	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	160315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chr14	100478682	100479045	100478865	Y	NA	NA	EVL	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	145455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr14	100486645	100486967	100486738	Y	NA	NA	EVL,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	137533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.67460791149422
chr14	100495518	100495795	100495680	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	128705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr14	100497913	100498157	100498035	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	126343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.42821457779854
chr14	100503802	100504130	100503983	Y	NA	NA	EVL,DEGS2,EML1	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	120370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.634500984061851
chr14	100504494	100504745	100504607	Y	NA	NA	EVL,DEGS2,EML1	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	119755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr14	100525860	100526007	100525963	Y	NA	NA	EVL,DEGS2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DEGS2	98493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.76194797292908
chr14	100536033	100536254	100536161	Y	EVL	NA	NA	NA	NA	NA	DEGS2	88246	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	100539339	100539601	100539490	Y	WARS,EVL	NA	NA	NA	NA	NA	DEGS2	84899	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	100566376	100566553	100566536	Y	EVL	NA	NA	NA	NA	NA	DEGS2	57947	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	DEGS2,YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	34673	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.14679901805328
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.69442907225628
chr14	100768169	100768349	100768287	Y	NA	SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	2535	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr14	100905618	100905757	100905695	Y	BEGAIN	NA	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	WARS	64476	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	BEGAIN	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BEGAIN	1893	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	101370822	101370975	101370899	Y	BEGAIN,RTL1	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	319072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	101539526	101539734	101539702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO3	485954	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	102050999	102051149	102051091	Y	NA	DIO3	NA	NA	NA	NA	DIO3	25311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.1607395704615
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	102342938	102343183	102343098	Y	PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	85682	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	21.9607588328927
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	102429527	102429743	102429691	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	102977207	102977381	102977329	Y	AMN	ANKRD9	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	3071	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.47181525973011
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr14	103097343	103097523	103097412	Y	NA	RCOR1	NA	NA	NA	NA	RCOR1	40345	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	19538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr14	103557952	103558007	103557980	Y	NA	CDC42BPB	CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CDC42BPB	36153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPB	55407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	123915	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr14	103710310	103710630	103710449	Y	NA	NA	LOC100131366,EIF5,TNFAIP2,CDC42BPB,RCOR1,EXOC3L4	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	87251	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	104016804	104017118	104016961	Y	CKB	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P	NA	NA	NA	NA	KLC1	9115	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	104567152	104567615	104567473	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	14127	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr14	104582105	104582467	104582315	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	363	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	27.5906149484976
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.30636683471477
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	105368048	105368162	105368106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	74532	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr14	105500263	105500628	105500453	Y	NA	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	14778	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr14	105500629	105500990	105500916	Y	CRIP1,GPR132	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	15144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	105527767	105528238	105527899	Y	GPR132	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	42282	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	105529368	105529646	105529640	Y	GPR132	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	43883	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	105603404	105603554	105603490	Y	BTBD6,BRF1	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	29607	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	6059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.756724573974569
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	5167	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.94860422988221
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	925265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43327863933903
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr15	25634776	25635000	25634877	Y	SNURF,SNRPN	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	47128	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	645321	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr15	27333003	27333354	27333179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	1650875	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr15	30216999	30217403	30217070	Y	TJP1	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	41665	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr15	31598782	31598890	31598869	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	18168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	31600574	31600756	31600662	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	16302	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	31799647	31800074	31799955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	182589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	205665	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	33188603	33188636	33188634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	283258	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr15	37170652	37170846	37170749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	218694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	38827733	38827813	38827761	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	27963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	355219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	284984	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	39484062	39484453	39484282	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1,C15orf53	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-624L4.1	232943	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	39553586	39553959	39553839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-624L4.1	163437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	39561378	39561942	39561743	Y	THBS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-624L4.1	155454	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	39593792	39594300	39594108	Y	THBS1	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-624L4.1	123096	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	39650604	39651044	39650772	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	66352	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	39668694	39669075	39668948	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	48321	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	39705543	39706134	39706021	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	11262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	39866856	39867109	39867069	Y	FSIP1	THBS1	THBS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	THBS1	4171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	39960796	39961183	39960855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	89516	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chr15	40340748	40341007	40340885	Y	BMF,BMF,BMF	SRP14	NA	NA	NA	NA	SRP14	11359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.854395442159057
chr15	40395466	40395787	40395613	Y	NA	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	3306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.15396857087803
chr15	40728458	40728872	40728667	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14,RP11-64K12.1	NA	NA	NA	NA	BAHD1	1048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.50353753428309
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	5479	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	41158071	41158384	41158228	Y	RHOV	SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	RHOV	6103	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	41199675	41199878	41199759	Y	DLL4	RHOV,VPS18,DLL4,CHAC1	DLL4	IMR90	Hi-C	24141950	VPS18	15047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	42220921	42221174	42221042	Y	NA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	41602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	42221521	42221787	42221671	Y	MGA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	40989	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	43232186	43232306	43232267	Y	TTBK2	TTBK2	TTBK2	IMR90	Hi-C	24141950	TTBK2	21179	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr15	45892726	45892758	45892742	Y	NA	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	28588	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	46881345	46881677	46881639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA6D	592621	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	50335306	50335619	50335473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	136774	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	50620432	50620711	50620437	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	24814	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	50633863	50634132	50634006	Y	ATP8B4,HDC,USP8,GABPB1	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	11393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	50948351	50948714	50948533	Y	NA	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	28298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	51358266	51358334	51358300	Y	GLDN	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	37139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	51369900	51370046	51369953	Y	NA	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	25427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	51385997	51386103	51386050	Y	NA	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	9370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	51413367	51413627	51413497	Y	NA	TNFAIP8L3	TNFAIP8L3,AP4E1,GLDN	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP8L3	17894	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	51479240	51479465	51479382	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	83767	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	51535974	51536234	51536151	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	GLDN	95592	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLDN	71620	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr15	51598187	51598615	51598465	Y	CYP19A1	GLDN	NA	NA	NA	NA	GLDN	33211	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	51619340	51619705	51619523	Y	TNFAIP8L3,CYP19A1	GLDN	NA	NA	NA	NA	GLDN	12121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	51912435	51913121	51913004	Y	TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr15	52330351	52330361	52330356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	55131	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr15	52349753	52350120	52349937	Y	NA	CTD-2184D3.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	35372	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr15	52526918	52527038	52526972	Y	KIAA1370,GNB5	GNB5	NA	NA	NA	NA	GNB5	45352	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	52545063	52545254	52545150	Y	MAPK6	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	40741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.33443688441305
chr15	52581885	52582216	52582049	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	3779	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	52587042	52587046	52587044	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	1047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr15	52709691	52709954	52709774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5A	109293	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	52797123	52797448	52797286	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	21799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	54539203	54539230	54539217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	948035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	55503902	55504218	55504040	Y	RAB27A,PIGB	RSL24D1	RSL24D1	K562	ChIA-PET	22265404	RSL24D1	16637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	55928441	55928509	55928475	Y	NA	PYGO1	NA	NA	NA	NA	PYGO1	49296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	94234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr15	56452441	56452566	56452504	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	80917	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr15	57853638	57853874	57853726	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	GCOM1	28232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	58568513	58568584	58568545	Y	NA	NA	LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM10	471593	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	58733027	58733372	58733200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	306805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr15	58898092	58898418	58898348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	141759	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	59566542	59566544	59566543	Y	MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	96348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	59646072	59646468	59646249	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	16424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	59646649	59647004	59646975	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	15888	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	60699729	60699909	60699819	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	6647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	62042724	62043095	62042895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	307577	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr15	62130295	62130308	62130301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	220364	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	62684510	62685208	62684868	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	63041385	63041512	63041449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.1	201860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	63296233	63296451	63296342	Y	NA	TPM1	NA	NA	NA	NA	TPM1	36380	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	63368396	63368491	63368444	Y	NA	TPM1,LACTB	NA	NA	NA	NA	TPM1	35565	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	63372629	63373133	63372992	Y	NA	TPM1,LACTB	NA	NA	NA	NA	LACTB	38866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	63439577	63439949	63439764	Y	NA	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	8271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	63766170	63766327	63766326	Y	HERC1,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP3	28466	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	63792570	63793348	63792650	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	1445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr15	63803463	63803731	63803481	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	8670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	63894930	63894962	63894946	Y	FBXL22	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	3142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	63960737	63961079	63961007	Y	HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	68949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr15	64991554	64991938	64991797	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	1542	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	65135268	65135743	65135404	Y	TRIP4,ZNF609,OAZ2,SPG21,SPG21,PLEKHO2	PIF1,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	3180	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.3032055807899
chr15	65657580	65657851	65657711	Y	NA	IGDCC3	NA	NA	NA	NA	IGDCC3	10527	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.61988051584196
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	66125063	66125305	66125185	Y	NA	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND4A	42432	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	66866083	66866388	66866213	Y	NA	NA	ZWILCH,SNORD16,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,LCTL,SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	RPL4	51213	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.90078153118655
chr15	67175645	67176118	67175872	Y	NA	NA	IQCH,SMAD6,LOC100506686,SMAD3	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	177983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.670274903769335
chr15	67366599	67366961	67366679	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	12498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	67393197	67393867	67393527	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	39096	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr15	67440032	67440420	67440131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	85931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	86574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.15357001763675
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	56252	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	67716264	67716618	67716446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf61	94788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr15	70289516	70289879	70289625	Y	NA	NA	LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	98636	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	70391261	70391735	70391557	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	2746	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.36786522995049
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr15	70867778	70867861	70867857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UACA	186071	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	71008529	71008840	71008773	Y	NA	UACA	NA	NA	NA	NA	UACA	45092	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr15	71176892	71177111	71177002	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	THAP10	6013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	71363973	71364162	71364068	Y	NA	NA	LRRC49,THSD4	IMR90	Hi-C	24141950	THAP10	180849	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.2071050196467
chr15	71371688	71372044	71371801	Y	THSD4	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	188564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.8506499325573
chr15	71373131	71373408	71373250	Y	NA	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	190007	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.54088176103186
chr15	71406673	71406868	71406715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	223549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.7273458070216
chr15	71408872	71409066	71408998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	225748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.492034973733454
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr15	71677897	71678187	71678028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	494773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	71733741	71734068	71733788	Y	THSD4	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	550617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	71840441	71840454	71840446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	564145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	71984997	71985280	71985139	Y	SENP8	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	419319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	72082448	72082758	72082608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	321841	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	109696	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	73061587	73061861	73061724	Y	PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	14326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	73926570	73926835	73926736	Y	PML	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	2095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	73939698	73939908	73939794	Y	NA	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	15223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	74207446	74207874	74207634	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	8456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	74216715	74216840	74216797	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	385	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	LOXL1	32927	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr15	74287730	74287905	74287836	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	2716	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.2226365189385
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr15	74909072	74909376	74909224	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	20231	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr15	75081771	75082003	75081872	Y	ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK	CSK,CPLX3	NA	NA	NA	NA	CSK	9373	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.5638641757188
chr15	75107587	75107841	75107715	Y	CPLX3	CSK,CPLX3,ULK3	NA	NA	NA	NA	CPLX3	9047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr15	75470847	75471095	75470955	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,C15orf39	C15orf39	C15orf39	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf39	14889	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.87986126152924
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.995291145446165
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.91551799056582
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.03134642772403
chr15	75820261	75820616	75820439	Y	NA	PTPN9	NA	NA	NA	NA	PTPN9	49014	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	75867013	75867354	75867182	Y	C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	2276	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	DNM1P35,RP11-24M17.5	NA	NA	NA	NA	RP11-24M17.5	14816	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.30751588210245
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	77340153	77340443	77340173	Y	PSTPIP1	TSPAN3	NA	NA	NA	NA	TSPAN3	33883	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	78364826	78365348	78365071	Y	DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	2718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	RPL21P116	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL21P116	1171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr15	80269751	80270867	80269985	Y	ZFAND6,BCL2A1	NA	BCL2A1	K562	ChIA-PET	22265404	ST20-MTHFS	55655	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	80881213	80881527	80881378	Y	MESDC1	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	186521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	81291796	81292315	81292076	Y	NA	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	81315785	81316530	81316214	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	24490	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	286122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	82061645	82062005	82061987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	274477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	82302959	82303245	82303102	Y	NA	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	33237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.85872844988394
chr15	83539816	83540191	83540033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WHAMM	63436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	83815089	83815145	83815117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	59625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	83821433	83821717	83821575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	53053	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	83879617	83879962	83879641	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	4847	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	80180	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	83957181	83957322	83957252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	82411	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25998074568728
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	85711891	85712151	85712051	Y	NA	NA	PDE8A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE8A	190220	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.13735860253328
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	86020857	86021180	86020870	Y	KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	99055	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	86285642	86285870	86285715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	50391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	86321738	86321858	86321816	Y	NA	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	14403	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	86337060	86337529	86337372	Y	NA	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr15	87167883	87168150	87168017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	831622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr15	87733598	87733881	87733709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00052	384279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.30751588210245
chr15	88021101	88021401	88021180	Y	NA	NA	NTRK3,AGBL1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00052	96759	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14206745708711
chr15	88070699	88070948	88070819	Y	NA	LINC00052	NTRK3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00052	47212	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.03343127916599
chr15	88072064	88072456	88072332	Y	NA	LINC00052	NTRK3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00052	45704	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr15	88348186	88348352	88348346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00052	230026	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	89014009	89014390	89014200	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	5325	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	89027924	89028249	89027989	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	19240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chr15	89183856	89184198	89184027	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	ISG20	6472	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	89663203	89663358	89663281	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	14368	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	89878895	89879173	89879043	Y	NA	POLG,LINC00925	NA	NA	NA	NA	POLG	2803	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	90324413	90324614	90324489	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP	MESP1	NA	NA	NA	NA	MESP1	31872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr15	90371902	90372049	90371963	Y	ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	NA	NA	NA	NA	NA	AP3S2	63525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	90519497	90519678	90519588	Y	C15orf38,ZNF710	ZNF710	WDR93,ZNF710,IDH2,C15orf38-AP3S2,MESP1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF710	22946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	90578762	90579351	90578884	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	36138	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	90605290	90605500	90605324	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	38236	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	90641433	90641611	90641526	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	2125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr15	90649995	90650276	90650136	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	6259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	90708840	90709227	90709106	Y	NA	SEMA4B	CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	7004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr15	90945502	90945781	90945680	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	16052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr15	90957340	90957730	90957416	Y	FES,ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27890	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.3163944395402
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLM	72770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	7723	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	91989048	91989141	91989075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	405784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	92102399	92102560	92102448	Y	SV2B,SV2B	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	292365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	92481402	92481730	92481524	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	86477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	92486040	92486252	92486096	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91115	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	92491615	92492039	92491744	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	92509194	92509613	92509420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	114269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	93180228	93180540	93180295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	72437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.33808910926775
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	16.3839369136839
chr15	93365801	93366193	93365997	Y	NA	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	14687	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr15	93424689	93424786	93424732	Y	CHD2	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	163	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	117845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	95215107	95215293	95215200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	1651874	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	95387780	95387932	95387839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	1479235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	95388455	95388700	95388578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	1478467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	95790334	95790617	95790588	Y	NA	NA	NR2F2	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	1076550	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	95802916	95802946	95802933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	1064221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	96343167	96343435	96343301	Y	NA	NA	NR2F2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NR2F2	523732	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr15	96455471	96455904	96455768	Y	NA	NA	NR2F2,LOC400456	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NR2F2	411263	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.07826976756452
chr15	96807705	96807805	96807755	Y	NA	NA	LOC400456	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	59362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr15	96872860	96873000	96872921	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	4270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4408	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr15	96895727	96895870	96895799	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	33.9217025011625
chr15	99214674	99215061	99214732	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	24474	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	99223373	99223476	99223421	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	33173	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	99259262	99259477	99259337	Y	SYNM	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	69062	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr15	99289288	99289563	99289444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	99088	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr15	99295015	99295222	99295065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	104815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.20396440556411
chr15	99298945	99299364	99299005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	108745	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	99318481	99318879	99318554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	128281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chr15	99318917	99319236	99319025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	128717	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.91589383739478
chr15	99342514	99342944	99342658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	152314	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr15	99358585	99358846	99358731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	168385	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	99387029	99387216	99387183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	196829	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.873067555533447
chr15	99387614	99387887	99387660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	197414	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr15	99394435	99394579	99394453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	204235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	20.612148772482
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75044541237944
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	18.6806714307329
chr15	99399333	99399603	99399475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	209133	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.88056181718321
chr15	99401021	99401241	99401076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	210821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	213345	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.93172940566929
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	218411	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.01229846752069
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.06986240827281
chr15	99410702	99410893	99410822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	220502	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.98095203979666
chr15	99411740	99412504	99411960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	221540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.40675705732822
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	191210	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.860276050512899
chr15	99450086	99450215	99450157	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	186205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	99561438	99561561	99561500	Y	NA	NA	PGPEP1L,IGF1R	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SYNM	74859	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	99973623	99973819	99973721	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	41551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	99975346	99975780	99975666	Y	NA	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	39590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr15	100026499	100026994	100026794	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	11129	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr15	101805289	101805580	101805451	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	15152	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr15	101979646	101980007	101979833	Y	PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	83398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	16.2576823184589
chr16	374352	374895	374583	Y	RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	PDIA2,AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	25778	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr16	615969	616302	616108	Y	RGS11,NHLRC4	PIGQ,RAB40C	NA	NA	NA	NA	PIGQ	974	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr16	643606	643989	643708	Y	SSTR5,RAB40C,RAB40C	PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	6249	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.37976634374141
chr16	651803	652154	651979	Y	NA	PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90	NA	NA	NA	NA	RAB40C	14446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.62145082288326
chr16	756470	756692	756669	Y	NA	RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78,NARFL	NA	NA	NA	NA	FBXL16	2641	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	11551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	1344323	1344595	1344461	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UNKL	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	8953	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr16	1347371	1347380	1347376	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	6168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.617399177728752
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr16	1587113	1587406	1587251	Y	CLCN7	TELO2	NA	NA	NA	NA	TELO2	45768	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14206745708711
chr16	2041117	2041468	2041266	Y	MAPK8IP3,EME2,SPSB3	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2	NA	NA	NA	NA	SYNGR3	3456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	2065446	2065768	2065545	Y	NA	TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	RAB26	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC9A3R2	7589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	2104972	2105164	2105052	Y	NA	ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	NTHL1	9105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	2212881	2213081	2213004	Y	NA	RAB26,SNORD60,TRAF7,CASKIN1,MLST8,PGP	NA	NA	NA	NA	TRAF7	9182	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	2501459	2501492	2501476	Y	NA	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	C16orf59	6589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.09570407447195
chr16	2845811	2846048	2845884	Y	OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2,ZG16B	NA	NA	NA	NA	TCEB2	20513	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	2904626	2904661	2904644	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS22	1510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.38810765036617
chr16	2955389	2955781	2955669	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	NA	NA	NA	NA	FLYWCH1	4157	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.90560844346981
chr16	3058105	3058264	3058160	Y	ZNF434,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NAT15,NAT15,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1,SRRM2,PRSS33,MMP25	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B	NA	NA	NA	NA	CLDN9	2193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	3060017	3060177	3060084	Y	NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B	NA	NA	NA	NA	CLDN9	280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.81707392182261
chr16	3145997	3146167	3146082	Y	NA	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	14394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.47978278609595
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.68972228427248
chr16	3202363	3202472	3202417	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	24585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	3207486	3207903	3207712	Y	SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	29708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19719340598065
chr16	3512084	3512361	3512129	Y	OR1F1,TIGD7,OR2C1,CLUAP1	ZNF597,NAA60,LA16c-306E5.1,CLUAP1	NA	NA	NA	NA	NAA60	20473	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	3858926	3859164	3859045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	69563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	4061559	4061871	4061733	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	102315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	4063476	4063638	4063556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	100548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	4186619	4186736	4186682	Y	NA	ADCY9	CREBBP,ADCY9,SRL,TRAP1,CORO7-PAM16,PAM16	IMR90	Hi-C	24141950	ADCY9	22433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	9.99128371360481
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	12.388131223837
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr16	4420946	4421237	4421026	Y	NA	PAM16,VASN	NA	NA	NA	NA	VASN	1097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr16	4427155	4427449	4427262	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	7306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.64876831186512
chr16	4732185	4732598	4732284	Y	CORO7,ROGDI	NUDT16L1,C16orf71,ANKS3	NA	NA	NA	NA	NUDT16L1	9097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.02979882709507
chr16	4985283	4985359	4985321	Y	NA	PPL	NA	NA	NA	NA	PPL	23383	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	8041589	8041898	8041750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	671642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	8950746	8950997	8950816	Y	NA	CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	9869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	9141634	9142026	9141729	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	41479	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	9221431	9221974	9221622	Y	USP7,C16orf72	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	37926	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	10221722	10221780	10221751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	196511	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	10563450	10564010	10563797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	108545	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	10596760	10596940	10596850	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	75615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	10672211	10672611	10672411	Y	ATF7IP2,EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	10672618	10672930	10672712	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	63	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.4099183112531
chr16	10688488	10688836	10688661	Y	NA	EMP2	EMP2,TEKT5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP2	15933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.35556762948832
chr16	10710369	10710537	10710438	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	37814	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.835723328784669
chr16	10710964	10711341	10711185	Y	EMP2	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	38409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	10.2239696767226
chr16	10711733	10712021	10711873	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	39178	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.72668859762226
chr16	10746944	10747196	10747087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	74389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.11868648915889
chr16	10759043	10759292	10759209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	76351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	11024597	11024619	11024608	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	9698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	11032093	11032474	11032340	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	1843	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.20553471260541
chr16	11946483	11946539	11946512	Y	NA	RSL1D1	NA	NA	NA	NA	RSL1D1	3041	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	12049208	12049600	12049404	Y	NA	GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166B2.1	18900	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.08176352206373
chr16	12385190	12385413	12385324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX29	316596	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	13069429	13069750	13069475	Y	SHISA9	NA	NA	NA	NA	NA	SHISA9	75952	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	13158639	13159033	13158826	Y	SHISA9	NA	NA	NA	NA	NA	SHISA9	165162	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	13533694	13533856	13533709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC4	478158	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	14051699	14052037	14051838	Y	NA	ERCC4	NA	NA	NA	NA	ERCC4	39685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr16	14097024	14097356	14097296	Y	NA	NA	MKL2,ERCC4,MIR193B	IMR90	Hi-C	24141950	MKL2	65822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	14107471	14107706	14107529	Y	NA	NA	MKL2,ERCC4,MIR365A,MIR193B	IMR90	Hi-C	24141950	MKL2	55472	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	14326449	14326637	14326520	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	163271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr16	14397958	14398068	14398015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	234780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	14402100	14402342	14402181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	238922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	14428618	14428805	14428733	Y	NA	NA	MKL2,MIR365A,PARN,MIR193B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL2	265440	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	14472258	14472411	14472327	Y	NA	NA	PARN,MIR365A,MIR193B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARN	252174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	15576237	15576428	15576343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	50085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.0686906544728
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr16	15730401	15730568	15730506	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	4455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	16055043	16055430	16055122	Y	NDE1,NDE1,ABCC1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	13609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	16092294	16092782	16092512	Y	NDE1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	50860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	19103583	19103758	19103655	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	19496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	20913163	20913441	20913303	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	3457	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.694827625497564
chr16	21566198	21566360	21566279	Y	DNAH3	SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9	METTL9,IGSF6	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2547E10.2	36433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr16	21611842	21611954	21611919	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	5303	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.38965525099513
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.940845112364291
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	23518606	23518950	23518778	Y	GGA2	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	12366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	23693851	23693869	23693860	Y	NA	PALB2,DCTN5,PLK1	NA	NA	NA	NA	PLK1	6874	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	24855986	24856230	24856033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6A	116970	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	27242037	27242327	27242262	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	35788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr16	27254406	27254878	27254778	Y	IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	23237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	27275592	27275718	27275658	Y	NA	NSMCE1,IL4R	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	2397	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	27386500	27386691	27386620	Y	C16orf82,IL21R,IL4R	NA	NA	NA	NA	NA	IL4R	63511	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	28543579	28543953	28543732	Y	EIF3CL,EIF3C,SPNS1,IL27	CLN3,NUPR1,CCDC101	IL27	IMR90	Hi-C	24141950	NUPR1	4542	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	ZG16,KIF22,MAZ,PRRT2,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SNORA42	537	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	18.9765956006788
chr16	30726552	30726958	30726731	Y	ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS	SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93	RNF40,PHKG2,C16orf93	IMR90	Hi-C	24141950	SRCAP	19022	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22579777286338
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.79840180844823
chr16	31005740	31006063	31006002	Y	ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,ITGAM,FUS,STX4	ORAI3,SETD1A,HSD3B7,STX4	NA	NA	NA	NA	HSD3B7	11221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	31124549	31124685	31124617	Y	STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	390	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	31888166	31888535	31888469	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	5087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	33952235	33952334	33952272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2069156	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	46406585	46406940	46406771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	246598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	MYLK3,C16orf87	NA	NA	NA	NA	MYLK3	1464	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	47454284	47454574	47454519	Y	NA	PHKB,ITFG1	NA	NA	NA	NA	PHKB	38460	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	48655232	48655408	48655293	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	N4BP1	3173	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	49044263	49044492	49044405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	392204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr16	49053950	49054007	49053977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	401891	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	50229271	50229507	50229375	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	44442	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	51182471	51182868	51182589	Y	SALL1,SALL1	NA	NA	NA	NA	NA	CYLD	408510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr16	53075249	53075847	53075790	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	11098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr16	53114402	53114975	53114686	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	27457	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr16	53128013	53128430	53128279	Y	RBL2	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	41068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr16	53517834	53518098	53518006	Y	NA	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	18225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	54114585	54114959	54114772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	203716	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr16	54128589	54128847	54128718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	189828	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43170833229774
chr16	54209640	54210024	54209757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	108651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	54961070	54961275	54961203	Y	NA	IRX5	NA	NA	NA	NA	CRNDE	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.0067937059958
chr16	56406318	56406482	56406386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	50968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.63855262921636
chr16	56458239	56458402	56458321	Y	NA	AMFR,OGFOD1,NUDT21	NA	NA	NA	NA	AMFR	789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT2A,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr16	57125471	57125887	57125617	Y	NA	CPNE2	NA	NA	NA	NA	CPNE2	1022	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	57302834	57302977	57302910	Y	NA	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	PLLP	13622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	57377213	57377564	57377302	Y	CCL22	CCL22	COQ9,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,CCL17,CCDC102A	IMR90	Hi-C	24141950	CCL22	13120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	57428268	57428658	57428438	Y	GPR56	CCL22	NA	NA	NA	NA	CCL22	37584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	57518028	57518100	57518073	Y	DOK4	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	DOK4	1139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.96108753277997
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	14642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	74322	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr16	58061325	58061443	58061395	Y	NA	MMP15	NA	NA	NA	NA	MMP15	3855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chr16	58160772	58161211	58161024	Y	C16orf80	C16orf80	NA	NA	NA	NA	C16orf80	143	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	61776736	61777059	61776898	Y	CDH8	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	3010475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	63275323	63275660	63275492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	1882355	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	66440915	66440994	66440955	Y	CMTM3,CMTM3	NA	NA	NA	NA	NA	TK2	143453	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	67186810	67187094	67186952	Y	NA	C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD,HSF4,NOL3,KIAA0895L,E2F4,ELMO3	NA	NA	NA	NA	B3GNT9	3693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,AGRP,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr16	67687517	67687714	67687560	Y	HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A	RLTPR,ACD,PARD6A	NA	NA	NA	NA	ACD	4999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	67794099	67794447	67794264	Y	CTCF,GFOD2,DPEP2,RANBP10	GFOD2,RANBP10,TSNAXIP1	NA	NA	NA	NA	GFOD2	42775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	67895003	67895199	67895134	Y	TPPP3,CENPT	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	9727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.978189339113065
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	32.3355543998407
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	68765918	68766309	68765994	Y	NA	CDH1	CDH3,CDH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDH1	2819	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr16	68778758	68779020	68778839	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	9630	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr16	68804487	68804868	68804749	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	35359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	68818214	68818347	68818232	Y	CDH1	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	49086	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr16	69777344	69777472	69777408	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	9371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.880518470928578
chr16	69819174	69819469	69819322	Y	NA	NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	24965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	70356792	70356812	70356803	Y	NA	AARS,DDX19B,DDX19A	NA	NA	NA	NA	DDX19A	21920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	70424558	70424975	70424714	Y	NA	DDX19A,ST3GAL2	NA	NA	NA	NA	DDX19A	45826	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	70467076	70467247	70467197	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	3893	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr16	70716686	70717066	70716876	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	903	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	70740989	70741599	70741286	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	23020	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr16	70749058	70749400	70749223	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	31089	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	70769740	70769941	70769843	Y	NA	NA	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	51771	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	70779915	70780216	70780046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52848	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.64600354461149
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr16	71904264	71904408	71904360	Y	PHLPP2,ZNF821	ATXN1L,IST1,ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	22831	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr16	72882732	72883050	72882991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	208547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	72965555	72965897	72965813	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	73031148	73031384	73031285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	60213	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	73079348	73079373	73079361	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	12224	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	73084736	73084892	73084798	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	6705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr16	73102477	73102709	73102578	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	10880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	73102955	73103191	73103082	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	11358	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.53057366069457
chr16	73353192	73353326	73353259	Y	NA	NA	HPR,HP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	261595	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	74509119	74509400	74509260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-252A24.2	108981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	75034413	75034614	75034514	Y	FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2342	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.55550222925175
chr16	75034712	75035106	75034867	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2641	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	75045854	75046060	75045918	Y	TMEM170A,MLKL	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	13783	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr16	75101005	75101352	75101179	Y	NA	LDHD	NA	NA	NA	NA	LDHD	47317	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	75108938	75109127	75108974	Y	NA	LDHD	NA	NA	NA	NA	LDHD	39542	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	75369399	75369431	75369415	Y	BCAR1,CFDP1	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	69448	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	75420812	75420988	75420900	Y	NA	CFDP1	CTRB1,BCAR1,CTRB2	IMR90	Hi-C	24141950	CFDP1	44395	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	75594050	75594208	75594144	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	CHST5,TMEM231	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GABARAPL2	4041	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	75604496	75604511	75604504	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	6247	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	75618166	75618518	75618190	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	19917	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr16	77708958	77709175	77709081	Y	NA	NUDT7	CLEC3A,WWOX,VAT1L	IMR90	Hi-C	24141950	NUDT7	45236	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	78498317	78498699	78498508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	367007	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	78565966	78565983	78565974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	434656	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	78802745	78802853	78802799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	671435	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	80060890	80061347	80061153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	428279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	80401381	80401567	80401473	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	DYNLRB2	171064	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	80648932	80649251	80648956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	76301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	80694679	80694985	80694832	Y	CDYL2	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	122048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	80697320	80697330	80697325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	124689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	80710391	80710578	80710565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	125648	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	80838768	80839127	80839024	Y	CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2	CDYL2	NA	NA	NA	NA	CDYL2	2542	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	81026963	81027197	81027054	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	10906	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	81309341	81309748	81309489	Y	NA	GAN	GAN	IMR90	Hi-C	24141950	GAN	36809	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.694827625497564
chr16	81311371	81311608	81311483	Y	NA	GAN	NA	NA	NA	NA	GAN	34949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.79645565457798
chr16	81392292	81392329	81392311	Y	NA	GAN	NA	NA	NA	NA	GAN	45735	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	81763852	81764387	81764185	Y	NA	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	6315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	81831224	81831380	81831299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	60522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	81877175	81877498	81877479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	106473	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.55550222925175
chr16	83399347	83399604	83399475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	439844	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	83480656	83480733	83480694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	358715	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	83835897	83836084	83835978	Y	NA	HSBP1	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	HSBP1	3364	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.42542917070261
chr16	84130238	84130438	84130330	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,DNAAF1	NA	NA	NA	NA	MBTPS1	18073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.6932800248686
chr16	84177434	84177775	84177582	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	DNAAF1	569	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	84208911	84209121	84208992	Y	OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C	HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	TAF1C	9548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.615828870687463
chr16	84210153	84210392	84210356	Y	OSGIN1,COTL1,TAF1C	HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	TAF1C	8277	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr16	84682643	84682972	84682859	Y	NA	COTL1,KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	2512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr16	84704578	84704887	84704734	Y	NA	KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	24447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	84788106	84788226	84788167	Y	COTL1	NA	NA	NA	NA	NA	USP10	56522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	85028506	85028759	85028547	Y	COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	14382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.553931922210458
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	85049440	85049674	85049516	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	USP10,ZDHHC7,KIAA0513	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC7	6299	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	85062384	85062545	85062427	Y	ZDHHC7,KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	3009	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.18126542001759
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	204800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	85339922	85340091	85340012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	280547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr16	85344973	85345172	85345110	Y	NA	NA	KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	285598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr16	85355565	85356105	85355766	Y	NA	NA	FAM92B,LOC727710,GINS2,KIAA0182,KIAA0513,LINC00311	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	296190	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.76665682748291
chr16	85387544	85387685	85387655	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	328169	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.29764968126107
chr16	85398689	85398993	85398841	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	322686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	85405119	85405354	85405237	Y	NA	NA	KIAA0513,FAM92B,LINC00311,LOC727710,KIAA0182	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	316325	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	85418434	85418651	85418593	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	303028	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr16	85450092	85450367	85450166	Y	NA	NA	LOC727710,GINS2,KIAA0182,FAM92B,LOC400548,C16orf74	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	271312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	85456219	85456617	85456516	Y	FAM92B	NA	KIAA0182,LOC400548,LOC727710,C16orf74	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	265062	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr16	85470615	85470779	85470696	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250900	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr16	85471045	85471389	85471119	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250290	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.85872844988394
chr16	85473143	85473232	85473181	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	248447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	85496879	85497321	85497140	Y	FAM92B,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	224358	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.696397932538855
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.697968239580145
chr16	85498599	85498960	85498791	Y	KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	222719	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.14829000817162
chr16	85499556	85499891	85499629	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	221788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	85548685	85548970	85548791	Y	NA	NA	KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	172709	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr16	85557334	85557622	85557547	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	164057	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr16	85558121	85558453	85558347	Y	KIAA0182,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	163226	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.943985726446873
chr16	85591342	85591727	85591695	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	129952	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	85600571	85600865	85600718	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	120814	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	85603305	85603679	85603564	Y	KIAA0182	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	118000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr16	85608106	85608214	85608158	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	113465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60277870950887
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	85678973	85679150	85679027	Y	NA	GINS2	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	42529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr16	85734545	85734806	85734797	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	12866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	85758517	85758802	85758746	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2,KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	23933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	85780154	85780247	85780189	Y	NA	C16orf74,COX4I1	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	2488	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr16	85783425	85783755	85783547	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.32738245568917
chr16	85904396	85904814	85904496	Y	COX4I1,IRF8	IRF8	IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	25595	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	85925591	85925670	85925608	Y	NA	IRF8	COX4NB,COX4I1,IRF8,MTHFSD	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	4739	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	86878430	86878569	86878503	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FOXC2,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	291589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	378017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	363255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	87158204	87158531	87158278	Y	NA	NA	FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	190491	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	87378694	87379151	87378934	Y	FBXO31	C16orf95,MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	C16orf95	29672	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	87758673	87759076	87758907	Y	KLHDC4	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	38522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	87780321	87780693	87780507	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr16	87823592	87823837	87823720	Y	NA	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.55707253629304
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr16	87875229	87875683	87875262	Y	CA5A	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	25411	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	87888208	87888468	87888297	Y	KLHDC4,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	12626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.95991664603848
chr16	87986927	87987379	87987279	Y	ZCCHC14,SLC7A5,BANP,BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	6077	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	88275964	88276225	88276145	Y	NA	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	241500	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	88520905	88521327	88521137	Y	ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	3180	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	88826966	88827318	88827200	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	22301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.76665682748291
chr16	88829964	88830251	88830166	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	19368	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr16	88831388	88831665	88831630	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	17954	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.09692124109662
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.89436660564825
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.22973636048705
chr16	88839181	88839507	88839410	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	10112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	88839973	88840262	88840126	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	9357	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	88848890	88849172	88848995	Y	CYBA,RNF166,RNF166	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	88988977	88989104	88989054	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	52508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	CBFA2T3	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	49455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.36067503728344
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.26171935776811
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.49411982517542
chr16	89370103	89370259	89370211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	87985	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr16	89406185	89406252	89406205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	124067	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr16	89410388	89410772	89410415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	128270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	89423849	89423969	89423923	Y	CBFA2T3,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	131000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	89449545	89449691	89449606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	105278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.617399177728752
chr16	89568763	89569125	89568979	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPG7	13438	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.19248455142681
chr16	89992380	89992810	89992683	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	TUBB3	6580	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.43575997745224
chr16	90087429	90087721	90087595	Y	TUBB3,DBNDD1,PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	2893	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	597415	597783	597745	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	25174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83012408300121
chr17	999488	999757	999623	Y	PITPNA,INPP5K,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	101131	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.38182848877104
chr17	1358484	1358816	1358590	Y	NA	CRK,MYO1C	NA	NA	NA	NA	CRK	5640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.33298170147263
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.939274805323
chr17	1864830	1864896	1864863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	61743	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	1926126	1926449	1926286	Y	NA	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	190	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr17	1926930	1927151	1927006	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.8935913385195
chr17	2162010	2162402	2162193	Y	SMYD4,METTL16,SMG6,SMG6	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	42275	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	2163031	2163247	2163098	Y	SMYD4,MNT,METTL16,SMG6,SMG6	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	41430	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	2166387	2166805	2166676	Y	METTL16,SMG6,SMG6	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	37872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	2198811	2198924	2198868	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	SRR	5753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	2241529	2241816	2241651	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	TSR1	2728	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.71781210675454
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.20712565948899
chr17	2385753	2385870	2385809	Y	SMG6,SMG6,MNT,RAP1GAP2,METTL16	METTL16	SGSM2,MNT	IMR90	Hi-C	24141950	METTL16	27315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	2614073	2614260	2614119	Y	KIAA0664	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	119569	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	2652547	2653322	2653300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	158043	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	2863545	2863659	2863602	Y	OR3A2,OR1G1	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	369041	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	2952123	2952503	2952284	Y	ASPA,ASPA,PAFAH1B1	NA	NA	NA	NA	NA	ASPA	421165	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr17	3504662	3504760	3504711	Y	NA	TRPV3,SHPK,CTNS	TRPV3	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	32856	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	3698279	3698691	3698534	Y	ZZEF1,ATP2A3	ITGAE,C17orf85	NA	NA	NA	NA	ITGAE	3846	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	3699697	3700093	3699885	Y	ZZEF1,ATP2A3	ITGAE,C17orf85	NA	NA	NA	NA	ITGAE	2444	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.574174342626138
chr17	4065011	4065373	4065306	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	4752478	4752731	4752552	Y	ZNF232,RABEP1,CAMTA2,CAMTA2	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	17795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	RNF167,SLC25A11,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	6771162	6771276	6771219	Y	NA	ALOX12P2	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	15982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	6790647	6790875	6790776	Y	SLC16A11,DLG4,DLG4	ALOX12P2	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	35467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	59807	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	6821400	6821836	6821600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	66220	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	6829755	6829811	6829784	Y	NA	NA	ALOX12P2,ASGR1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX12P2	74575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	6950063	6950446	6950332	Y	ZBTB4,ZBTB4,POLR2A,MED31,ACAP1	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	SLC16A13	12669	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	7119118	7119286	7119174	Y	WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	674	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	7233457	7233867	7233744	Y	WRAP53,POLR2A,DNAH2,DLG4,EIF5A	YBX2,EIF5A,GPS2,NEURL4,KCTD11,TNK1	NA	NA	NA	NA	NEURL4	2745	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	7380968	7381115	7381038	Y	EIF5A	TMEM102,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	4467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	20328	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.01670531966185
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.09247104270083
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.00199036718339
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.40755503086931
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.5332971482636
chr17	7784207	7784538	7784352	Y	POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2	CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	CHD3	1586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	7854986	7855236	7855115	Y	NA	AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	TRAPPC1	21545	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	ALOX12B,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	27708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.96267847966356
chr17	8031830	8031985	8031892	Y	CNTROB,ODF4	ALOX12B,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	ALOXE3,HES7	IMR90	Hi-C	24141950	PER1	25839	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.03380712599494
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22579777286338
chr17	8407322	8407642	8407416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDEL1	92873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	9131847	9132010	9131919	Y	WDR16,NTN1	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	208988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	9133558	9133821	9133662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	210699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	233065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	9258278	9258564	9258422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	219344	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	10023147	10023510	10023462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	136569	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	13472221	13472595	13472561	Y	NA	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	30649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	TRPV2,FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.12866415549191
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.93210525249825
chr17	16487545	16487788	16487743	Y	NA	ZNF287,AC005822.1	NA	NA	NA	NA	ZNF287	17025	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr17	16922074	16922240	16922157	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	21619	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	17348587	17348892	17348689	Y	NA	MED9,RASD1	MED9,PEMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MED9	29408	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	17595288	17595502	17595395	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	12501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	17596410	17596829	17596636	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	13623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.47898481255486
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	12.2199613778227
chr17	17617254	17617499	17617388	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	34467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.61988051584196
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.48889522670939
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.50198993365413
chr17	17831776	17831833	17831804	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	41903	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	17847220	17847305	17847263	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	26431	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	17851403	17851564	17851499	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	22172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	LRRC48	629	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	18032331	18032623	18032472	Y	TOM1L2,MYO15A	DRG2	NA	NA	NA	NA	DRG2	43131	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH3A2	106941	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.25281119286253
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	21515861	21516199	21516031	Y	NA	NA	CCDC144NL	K562	ChIA-PET	22265404	MAP2K3	329877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	25415760	25416041	25415903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203061	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	13.2801505867451
chr17	25479961	25480088	25479965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	139014	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	25568498	25568933	25568830	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	50169	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.08884065719994
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.57719983260785
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	25833655	25833928	25833707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	51985	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr17	25858035	25858294	25858209	Y	WSB1,LGALS9	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	76365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	25858732	25858982	25858838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	77062	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	26578773	26579067	26578920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	26712546	26712820	26712749	Y	NA	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	19395	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr17	26825013	26825205	26825110	Y	NA	RPS7P1	NA	NA	NA	NA	RPS7P1	32199	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RPL23A,SNORD42B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	27367295	27367696	27367449	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	PHF12	90506	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	27405810	27406234	27406188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO18A	99196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	27582372	27582571	27582447	Y	NA	NUFIP2	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	36565	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	27814311	27814661	27814484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	76409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	27918652	27918967	27918817	Y	GIT1,EFCAB5,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	28041165	28041459	28041338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIT1	122093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	28928053	28928382	28928251	Y	NA	SMURF2P1	NA	NA	NA	NA	SMURF2P1	2239	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	29115484	29115559	29115508	Y	NA	CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5	NA	NA	NA	NA	CRLF3	34235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	29599453	29600092	29599789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	116550	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	29816760	29817002	29816913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	100118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.798379102035895
chr17	29886835	29887094	29886884	Y	EVI2A	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP4	170193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	29887922	29888057	29887990	Y	NA	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP4	171280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	29892134	29892258	29892202	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	175492	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	30005450	30005718	30005584	Y	NA	NA	RAB11FIP4,C17orf79,MIR193A,MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	UTP6	221066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	30850461	30850579	30850547	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	38824	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	920637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr17	33383216	33383365	33383329	Y	SLFN5,RFFL	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	30973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	34875469	34875747	34875679	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	13100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	35208602	35208822	35208707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	83138	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	35296825	35297078	35296886	Y	LHX1	RP11-445F12.1,AATF	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	4865	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	35492690	35492856	35492817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	188515	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	35514299	35514470	35514425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	210124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.07703196109756
chr17	36480536	36480738	36480637	Y	NA	MRPL45,SOCS7	NA	NA	NA	NA	SOCS7	25373	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS7	65535	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	36717036	36717303	36717215	Y	SOCS7,SRCIN1	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	42880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7697974415655
chr17	36907984	36908100	36908042	Y	NA	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B	NA	NA	NA	NA	PSMB3	995	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr17	37056956	37057300	37057070	Y	NA	SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	32844	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	37159505	37159646	37159582	Y	CWC25,FBXL20,CDK12,FBXO47	NA	PLXDC1,LOC100131347,MIR4727,CWC25,C17orf98,RPL23,LASP1,LOC100505576,FBXO47,FLJ43826,STAC2,RPL19,ARL5C,CACNB1,FBXL20,CDK12,PIP4K2B	IMR90	Hi-C	24141950	LASP1	135393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	37249276	37249451	37249365	Y	MLLT6,CWC25,FBXL20,CDK12	NA	NA	NA	NA	NA	CACNB1	102505	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	37831191	37831499	37831297	Y	GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2	STARD3,ERBB2,PGAP3	NA	NA	NA	NA	ERBB2	10668	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	37832582	37832871	37832624	Y	NA	STARD3,ERBB2,PGAP3	NA	NA	NA	NA	ERBB2	9296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	37862068	37862252	37862166	Y	GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2,ERBB2	ERBB2,PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	PGAP3	11018	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr17	38084566	38084955	38084762	Y	NA	ORMDL3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	2712	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	38374652	38374886	38374755	Y	KRT222,THRA,THRA,NR1D1,RARA,RAPGEFL1,WIPF2	RAPGEFL1,WIPF2	NA	NA	NA	NA	WIPF2	1096	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	38466457	38466702	38466562	Y	IKZF3	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	3013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	38467869	38468243	38468028	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	4425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	38468655	38468865	38468706	Y	IKZF3,CCR7	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	5211	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.43575997745224
chr17	38475638	38476939	38476599	Y	WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	12194	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr17	38480180	38480741	38480429	Y	IKZF3,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	16736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	38482426	38483282	38482568	Y	IKZF3,MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	18982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	38483867	38484266	38484015	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	20423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	38488015	38488253	38488146	Y	MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	24571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	38509274	38509600	38509311	Y	NA	RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	45830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	38607821	38607996	38607876	Y	NA	TOP2A,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	10119	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	38619282	38619695	38619581	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,KRT23,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	21580	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	38705273	38706158	38705806	Y	GJD3,IGFBP4	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	49424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	38707495	38707811	38707586	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	51646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr17	38763906	38764295	38764082	Y	CASC3,WIPF2,CCR7	SMARCE1	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	38465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	38776396	38776659	38776550	Y	WIPF2,RARA,RARA,CCR7	SMARCE1	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	26101	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr17	39003172	39003257	39003186	Y	KRTAP2-1,KRT10	TMEM99,KRT10,KRT20	NA	NA	NA	NA	KRT10	26325	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr17	39010500	39010808	39010654	Y	NA	TMEM99,KRT10,KRT20	NA	NA	NA	NA	KRT20	28671	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	39066622	39066986	39066860	Y	IGFBP4,KRTAP1-1,KRTAP1-5	KRT20,KRT23	NA	NA	NA	NA	KRT23	24900	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr17	39572335	39572530	39572426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT13	87427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	6606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	39667444	39667684	39667594	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	7487	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.19337494265644
chr17	39682585	39682843	39682821	Y	JUP,KRTAP4-11,KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	25	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr17	39685394	39685532	39685463	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	2834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	13.4635908113232
chr17	39692337	39692600	39692431	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT13,KRT15,KRT19	KRT15,KRT19,KRT13,KRT36	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19	9777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.69562353246861
chr17	39695431	39695775	39695718	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	KRT19	K562	ChIA-PET	22265404	KRT19	12871	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21104	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.81079476022749
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14206745708711
chr17	39705098	39705383	39705310	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	22538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.17941168383589
chr17	39735892	39736012	39735959	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14	KRT16,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT16	34139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	28634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.49843012648796
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.54765276061533
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.84005633650955
chr17	39956975	39957353	39957171	Y	KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	LEPREL4	9503	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	41198878	41199234	41199056	Y	NA	IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	VAT1	23738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	41723669	41723803	41723747	Y	TMEM106A,DUSP3	NA	NA	NA	NA	NA	ETV4	68681	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	41796772	41797488	41797204	Y	TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3	NA	LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP3	56868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	42198947	42199210	42199140	Y	NA	C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.23805289412944
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	42662887	42662974	42662928	Y	NA	FZD2	C17orf104,GPATCH8	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	29962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.61988051584196
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	43303050	43303852	43303644	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	6239	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr17	43370974	43371161	43371063	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	MAP3K14	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	21253	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	43398309	43398621	43398414	Y	NA	MAP3K14	LOC100133991,FMNL1,MAP3K14,TEX34,ARHGAP27	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	5895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.31941699589337
chr17	44135698	44135955	44135827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	165950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	44155479	44155559	44155517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	185731	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.32503894808916
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.959517225738678
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	45798483	45798953	45798740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	73641	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	45814083	45814467	45814294	Y	NA	NA	OSBPL7,MRPL10,SCRN2,LRRC46	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL7	82733	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	46034209	46034446	46034327	Y	NA	AC003665.1,PNPO,PRR15L,CDK5RAP3	NA	NA	NA	NA	PRR15L	965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.995291145446165
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	47092021	47092148	47092036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-42P	67139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr17	47099859	47100181	47099940	Y	PRAC,IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-42P	74977	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.6170233308998
chr17	47337469	47337918	47337568	Y	CALCOCO2,UBE2Z	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	31341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	47966905	47967224	47967101	Y	DLX4,DLX3,TAC4	NA	LOC284080,ITGA3,SPOP,NXPH3,SLC35B1,DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,FLJ45513,TAC4,DLX4,PDK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLX4	77110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36353222222561
chr17	47972520	47972640	47972580	Y	NA	NA	LOC284080,ITGA3,NXPH3,SLC35B1,FAM117A,KAT7,TAC4,PDK2,NGFR,SPOP,FLJ45513,DLX4,DLX3	IMR90	Hi-C	24141950	DLX4	71694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.02262927427032
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT2	53639	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	48504874	48504976	48504927	Y	NA	LRRC59,ACSF2,RSAD1	NA	NA	NA	NA	ACSF2	3355	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.959517225738678
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	22709	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03851598054878
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	11564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	49075036	49075414	49075227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	54962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	49182545	49182921	49182907	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	13305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	49210436	49210615	49210551	Y	SPAG9	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	SPAG9,NME1-NME2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPAG9	14210	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	50877242	50877515	50877351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P48	955716	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	52384555	52384722	52384639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P48	551324	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	53017345	53017570	53017451	Y	TOM1L1	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	26518	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr17	53497202	53497618	53497598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	55210991	55211279	55211077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP1	50538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr17	55292764	55293032	55292916	Y	NA	MSI2	MSI2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MSI2	38180	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.81669807499366
chr17	55501996	55502706	55502262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	170784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	55504815	55504992	55504904	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	173603	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	55517850	55518075	55517943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	186638	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	55568668	55569013	55568840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	237456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	55690023	55690365	55690280	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	235052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	55734748	55734863	55734779	Y	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	190554	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	55740175	55740776	55740501	Y	MSI2,MSI2,DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	184641	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	55763716	55764071	55763861	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	161346	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	55938337	55938724	55938439	Y	SUPT4H1,CUEDC1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	12920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.61988051584196
chr17	55952714	55953105	55953007	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	27297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr17	55976255	55976501	55976378	Y	OR4D2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	50838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr17	55977135	55977456	55977362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	51718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.72553955023459
chr17	55978714	55978990	55978831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	51694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	16.6042505648646
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.995291145446165
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	56413212	56413667	56413409	Y	VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	14787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	56468859	56469318	56469005	Y	RNF43	SUPT4H1,RNF43	NA	NA	NA	NA	RNF43	23638	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chr17	56480586	56480907	56480747	Y	NA	RNF43	NA	NA	NA	NA	RNF43	12049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	56701235	56701661	56701522	Y	OR4D1,BZRAP1	RNU1-60P	NA	NA	NA	NA	RNU1-60P	33005	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr17	56705180	56705300	56705276	Y	NA	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4	K562	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	29366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.83537018836805
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.05001854109841
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	57787983	57788139	57788057	Y	DHX40,CA4,VMP1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	4996	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.0686906544728
chr17	57833423	57834077	57833636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	50436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr17	57839956	57840355	57840071	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	56969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.48695027235066
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	57862470	57862813	57862554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	53814	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.7446090173387
chr17	57866887	57867071	57866969	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	49556	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	57884074	57884248	57884161	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	32379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	57902814	57903248	57902913	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	13379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.91043328918303
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	57908316	57908645	57908515	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	7982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.3003699027486
chr17	57925185	57925429	57925290	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	8558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.670274903769335
chr17	57930626	57931026	57930760	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	13999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.57902189475169
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr17	57952277	57952457	57952367	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	15847	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	57966021	57966396	57966241	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	1908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr17	57975372	57975465	57975395	Y	NA	TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	RPS6KB1	6925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	58172215	58172508	58172351	Y	RNFT1	HEATR6	HEATR6,LOC645638	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR6	17923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	58240902	58241117	58241010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR6	86610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	58467674	58467818	58467746	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,APPBP2,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	30013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	58470515	58470600	58470558	Y	RNFT1	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	27231	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	58471589	58471771	58471659	Y	RNFT1	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	26060	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	58475654	58476033	58475933	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	USP32,PPM1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP32	21798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.77499813410767
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	AC005884.1	68115	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	59232853	59233252	59232919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005884.1	87621	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	59327837	59328038	59327938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	147219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr17	59337920	59337981	59337951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	137276	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	59391895	59392060	59391978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	83197	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr17	59398606	59399069	59398760	Y	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	76188	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	59434096	59434461	59434196	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	40796	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.55433134251026
chr17	59449966	59450070	59450027	Y	NA	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	TBX2	25187	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.694827625497564
chr17	59473194	59473360	59473229	Y	NA	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	TBX2	1897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	59474585	59474918	59474715	Y	NA	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	TBX2	339	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.492034973733454
chr17	59488217	59488528	59488332	Y	NA	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	C17orf82	1105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr17	59491856	59491969	59491928	Y	NA	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	C17orf82	4744	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr17	59645902	59646266	59646152	Y	NA	NACA2	NA	NA	NA	NA	NACA2	20297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.50679413952505
chr17	59784149	59784411	59784258	Y	BRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	117586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	59802247	59802551	59802410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	135684	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98812159262141
chr17	59843979	59844190	59844083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRIP1	94692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.13529645750364
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	60141349	60141594	60141514	Y	NACA2,MED13	MED13	INTS2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED13	706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	60247601	60248070	60247921	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	106958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr17	60255991	60256253	60256151	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	115348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	60555037	60555507	60555099	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	36621	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	60557252	60557333	60557299	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	34795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.492034973733454
chr17	60729712	60730300	60729931	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	26950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04167723447366
chr17	60780424	60780717	60780568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	77662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr17	60795868	60796183	60796045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH10	87522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	MARCH10	NA	NA	NA	NA	MARCH10	27082	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	60877951	60878269	60878188	Y	NA	MARCH10	NA	NA	NA	NA	MARCH10	5436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.39333104932068
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	MARCH10	NA	NA	NA	NA	MARCH10	13581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.66310535094458
chr17	60938326	60938715	60938420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH10	54621	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	60954347	60954674	60954509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH10	70642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	60965502	60965873	60965703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH10	81797	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.91907779773199
chr17	60970243	60970809	60970465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH10	86538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr17	60973132	60973339	60973182	Y	TLK2	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH10	89427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH10	159416	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.7068674368602
chr17	61282907	61283291	61283099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	238448	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr17	61323201	61323584	61323320	Y	NA	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	198155	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	61431510	61431613	61431567	Y	STRADA,ACE	NA	MIR548W,MARCH10,DCAF7,TACO1,MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	90126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	61451328	61451417	61451341	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	70322	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	62134316	62134543	62134430	Y	MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf72	60605	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	62138721	62138967	62138947	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,DDX5,ERN1	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf72	65010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	62140311	62140756	62140628	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	NA	NA	NA	NA	NA	ERN1	65423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr17	62169387	62169789	62169751	Y	MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	ICAM2,C17orf72	IMR90	Hi-C	24141950	ERN1	36390	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	62537971	62538164	62538007	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	35654	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	62981100	62981441	62981419	Y	DDX5,CEP95,LRRC37A3,RGS9,GNA13	AMZ2P1	AMZ2P1,GNA13	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AMZ2P1	11406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	63030127	63030512	63030385	Y	NA	GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	20445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.91668974436584
chr17	63179961	63180187	63180056	Y	NA	RGS9	NA	NA	NA	NA	RGS9	48412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	508381	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	102432	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.636071291103141
chr17	64544411	64544774	64544437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	247657	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	64947420	64948018	64947947	Y	NA	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	11008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.93484937990958
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.25489604430449
chr17	64959449	64959766	64959607	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	64961597	64961937	64961768	Y	CACNG4	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	2571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.70907224688849
chr17	64962057	64962755	64962345	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	3031	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.79006050182347
chr17	64981602	64981762	64981682	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	22576	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	65001910	65002048	65001970	Y	CACNG4	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	42884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	65487114	65487504	65487449	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	115539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	65990543	65990874	65990748	Y	AMZ2,BPTF,C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	2778	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.855965749200348
chr17	65991969	65992126	65992052	Y	NA	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	4204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.48186557096788
chr17	66016382	66016768	66016696	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	12867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr17	66030294	66030564	66030453	Y	NA	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	66306496	66306595	66306536	Y	BPTF,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A6	21088	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	66322964	66323100	66323038	Y	SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	37556	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	66421215	66421317	66421250	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	30337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	67270709	67270940	67270826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	50445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr17	67603336	67603572	67603425	Y	NA	NA	KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	194497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	68295074	68295681	68295259	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	886235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr17	70398105	70398184	70398145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	223186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	70403681	70403886	70403813	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	217484	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	70461830	70461987	70461862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	159383	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr17	70462396	70462597	70462589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	158773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	70512872	70513243	70513164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	108127	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	91038	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	70975015	70975329	70975170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	111522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.46031269918047
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr17	71496173	71496542	71496358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK2	141686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	71639437	71639585	71639501	Y	SDK2	SDK2	NA	NA	NA	NA	SDK2	1209	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	72294185	72294322	72294273	Y	TMEM104,CD300LF,CD300LB,CD300E,CD300C,CD300A,TTYH2,TTYH2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL38	96464	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	72734256	72734824	72734605	Y	DNAI2,CD300A,CD300LB,SLC9A3R1,CD300LF,RAB37,RAB37	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	7967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.81824567562262
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.450380445672128
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.55510367601046
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	72989354	72989561	72989458	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	7627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	73074678	73074996	73074848	Y	LLGL2,C17orf28,ARMC7	KCTD2,ATP5H,ARMC7	NA	NA	NA	NA	ARMC7	29051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.7032349847893
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr17	73337527	73337917	73337722	Y	NA	AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	24117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	73351805	73351921	73351820	Y	NA	AC011933.1,GRB2	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	38395	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.2639379065832
chr17	73546030	73546166	73546084	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98812159262141
chr17	73685500	73685825	73685750	Y	GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	24231	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36353222222561
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.18582954300273
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	74233896	74234348	74234226	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr17	75094541	75094684	75094581	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	13743	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	75278845	75279720	75279369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	198047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.52220964765748
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	200466	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	303838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	409356	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	75567632	75567995	75567917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	346185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	75769300	75769393	75769353	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	144787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr17	75830749	75830836	75830793	Y	TMC8,TMC6	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	83344	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr17	75865692	75866230	75865998	Y	SOCS3	RNU1-80P	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	47950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	75953939	75954304	75954190	Y	TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C	RNU1-80P,TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	39759	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P,TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	13.6024395369163
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr17	76247000	76247249	76247129	Y	TMEM235	BIRC5	NA	NA	NA	NA	BIRC5	38733	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	76247657	76247919	76247750	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6	BIRC5	NA	NA	NA	NA	BIRC5	39390	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	76330688	76331173	76330803	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	22985	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	76377337	76378350	76377903	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	4616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	76379911	76380778	76380428	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	7190	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	76635563	76635793	76635778	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	DNAH17,CYTH1	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH1	140586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	76731686	76732147	76732043	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	44232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	76813236	76813533	76813481	Y	CYTH1,ENGASE,USP36	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	21990	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr17	76919844	76920193	76919970	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	375	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr17	76992140	76992468	76992317	Y	NA	LGALS3BP,CANT1	NA	NA	NA	NA	CANT1	11481	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr17	77702456	77702572	77702532	Y	NA	CBX2	NA	NA	NA	NA	CBX2	47359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	77730841	77731207	77731024	Y	CBX8,CBX2	CBX2,CBX8	NA	NA	NA	NA	CBX2	18724	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.835723328784669
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.77136774860679
chr17	77788517	77788922	77788877	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	15035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.59403884964283
chr17	77817686	77818105	77817998	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	6458	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr17	77916401	77916581	77916489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	91066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr17	77952311	77952542	77952488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	55105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	77965696	77966573	77966281	Y	CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	41074	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.55667398305175
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr17	78098181	78098723	78098426	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	20259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.21586638641354
chr17	78754047	78754707	78754061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	208691	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	78810006	78810317	78810174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	153081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	78844194	78844503	78844331	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	118895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	79011145	79011369	79011293	Y	BAIAP2	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	4197	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr17	79302293	79302557	79302318	Y	NA	SLC38A10,LINC00482	NA	NA	NA	NA	TMEM105	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr17	79302809	79302914	79302847	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	NA	NA	NA	NA	TMEM105	335	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14206745708711
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.80988166258553
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.20712565948899
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.89724443043272
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.80046395347786
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	57934	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr17	79362745	79363068	79363048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	60271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	62586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	66316	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.670274903769335
chr17	79450324	79450444	79450386	Y	NA	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	27645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	79482562	79482804	79482728	Y	NA	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1,C17orf70	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	3489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.76351827997037
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr17	80342594	80342740	80342634	Y	NA	TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	27471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.23887064045431
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.88731217692438
chr17	80494129	80494268	80494139	Y	NA	FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	18540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	80655375	80655626	80655561	Y	RAB40B,FN3K	RAB40B,FN3KRP,FN3K	NA	NA	NA	NA	RAB40B	771	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	80805995	80806457	80806155	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	9541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr17	80817363	80817528	80817446	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	20909	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.43693173125225
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	38126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	80845276	80845458	80845382	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	48822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr17	81014110	81014249	81014180	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,ZNF750,TBCD,METRNL	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	B3GNTL1	6424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	81031472	81031760	81031658	Y	METRNL	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1	K562	ChIA-PET	22265404	METRNL	3807	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr17	81038687	81040054	81039707	Y	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	3120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr17	81049749	81049909	81049815	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	14182	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr17	81057799	81057924	81057864	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	22232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01984386717439
chr17	81058904	81059222	81058949	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	23337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr17	81063257	81063563	81063336	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	27690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr17	81099382	81099733	81099616	Y	NA	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	63815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	221277	221425	221379	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	44625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr18	2810818	2810991	2810905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	157081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	3397218	3397593	3397406	Y	NA	TGIF1	TGIF1,DLGAP1,FLJ35776	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TGIF1	12013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr18	3490071	3490183	3490142	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	80465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	3726181	3726506	3726439	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	316575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	5294371	5294839	5294435	Y	ZFP161	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	1166175	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr18	8704447	8704767	8704559	Y	NA	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	97004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	9009931	9010219	9010076	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	90409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	9129786	9129925	9129855	Y	PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr18	9554563	9554587	9554575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	58651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr18	9740164	9740351	9740265	Y	NA	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	34002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	9742137	9742641	9742378	Y	NA	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	35975	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.529379200482229
chr18	10086468	10086802	10086635	Y	NAPG,APCDD1	NA	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	174469	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	10213578	10213746	10213662	Y	VAPA	NA	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	APCDD1	238879	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr18	10417323	10417624	10417474	Y	NA	APCDD1	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	APCDD1	35001	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr18	10528233	10528593	10528264	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	4331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	10545349	10545498	10545424	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	21447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	10708268	10708433	10708298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	184366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	10726542	10726663	10726595	Y	NAPG	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	202640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.37503478277524
chr18	10766591	10766813	10766750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	242689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	12092408	12092760	12092594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	113384	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	12408700	12408821	12408736	Y	NA	AFG3L2,SLMO1	SPIRE1	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO1	2805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	12606965	12607268	12607096	Y	PTPN2,SPIRE1	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	48774	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.61585157709979
chr18	13542199	13542509	13542255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	182150	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	9.18865765833209
chr18	13594708	13595078	13594794	Y	C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	129581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	13616190	13616419	13616254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	108240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr18	18596588	18597119	18596879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	92693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr18	20835223	20835287	20835255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	122695	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr18	21552370	21552656	21552582	Y	C18orf8,TTC39C,TTC39C	TTC39C	NA	NA	NA	NA	TTC39C	18081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	22888154	22888177	22888166	Y	ZNF521	ZNF521	NA	NA	NA	NA	ZNF521	41977	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	23657156	23657540	23657507	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	11641	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	24235836	24236242	24235958	Y	NA	KCTD1	TAF4B,KCTD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD1	471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	29228956	29229096	29229026	Y	RNF125	NA	NA	NA	NA	NA	DSG2	152950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	31140777	31140968	31140873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012123.1	793019	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	32106446	32106756	32106602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	448136	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	265489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	32300943	32301117	32301030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	253775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	32414940	32415436	32415021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	139456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	32424641	32425032	32424811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr18	32439346	32439714	32439476	Y	ZNF397,ZNF24,MAPRE2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	115178	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	32925283	32925658	32925513	Y	MAPRE2,MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	1837	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr18	33185452	33185527	33185471	Y	ZNF397,GALNT1	GALNT1	NA	NA	NA	NA	GALNT1	26371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	33311016	33311295	33311162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	151935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	33711406	33711801	33711526	Y	NA	SLC39A6,ELP2	NA	NA	NA	NA	ELP2	3999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.05681224709421
chr18	34908671	34908689	34908687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	501513	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	43381768	43381900	43381886	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC14A1	79676	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr18	43382830	43382969	43382904	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC14A1	80738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	43420676	43420820	43420745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC14A1	118584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr18	44120296	44120642	44120476	Y	LOXHD1,LOXHD1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF165	215524	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	44487034	44487390	44487355	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	8065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36353222222561
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr18	46074456	46074621	46074556	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	11039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	46254756	46255278	46254982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	191339	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	46353431	46353823	46353627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	121258	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr18	46451209	46451517	46451363	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	23564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	46456597	46456819	46456703	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	18262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	13311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.572604035584846
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	SMAD7	7077	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25998074568728
chr18	46508713	46508838	46508774	Y	DYM,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	33632	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	43105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.63478441320227
chr18	46520518	46520924	46520659	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	45437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	72794	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.13153030805959
chr18	47325286	47325511	47325399	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	12819	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	4568	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	51151759	51152047	51151782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	597111	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	51699489	51699550	51699520	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	49608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	51773425	51773767	51773527	Y	NA	MBD2,POLI	POLI	MCF7	ChIA-PET	22265404	POLI	20007	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr18	51787123	51787305	51787209	Y	MBD2	MBD2,POLI	POLI	MCF7	ChIA-PET	22265404	POLI	6469	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	52274779	52275056	52274934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB27B	108035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr18	53060777	53060994	53060923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC68	436038	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr18	54384245	54384484	54384365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	67414	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	55104670	55104954	55104730	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	3753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	55756032	55756268	55756150	Y	NA	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	46433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr18	55872819	55873190	55873005	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	163220	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr18	56359373	56359598	56359412	Y	NA	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	22755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	56514801	56515232	56515114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	178183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	58951957	58952157	58952057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P14	118281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.80873261519786
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr18	60281779	60281962	60281874	Y	ZCCHC2	NA	KDSR,PHLPP1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC2	93539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	60609893	60610245	60610069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	229221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	60828947	60829338	60829223	Y	VPS4B,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	156023	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr18	60857192	60857346	60857314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	128015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	60874386	60874946	60874584	Y	VPS4B,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	110415	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr18	60875086	60875640	60875342	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	109721	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	60877535	60878009	60877922	Y	SERPINB12,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	107352	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	60886280	60886709	60886627	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	98652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr18	60891499	60892086	60892002	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	93275	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	60903050	60903417	60903276	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	81944	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	60904218	60904684	60904493	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	80677	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	60905272	60905593	60905493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	79768	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	60966877	60967061	60966974	Y	NA	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	18300	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr18	60979120	60979234	60979125	Y	BCL2	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	6127	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	60984165	60984609	60984519	Y	BCL2	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	BCL2	752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	67683360	67683665	67683513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	187516	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	72424911	72425171	72425041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	161805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr18	74088486	74089010	74088832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	116136	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr18	74089053	74089202	74089130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	115944	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr18	74179507	74179930	74179654	Y	ZNF516	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	25216	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	74276166	74276377	74276252	Y	ZNF516	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	70689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.794068800723343
chr18	74285559	74285989	74285816	Y	ZNF516	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	80082	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr18	74292470	74292738	74292612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	86993	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr18	74409297	74409534	74409399	Y	NA	NA	ZNF516	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF236	123029	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr18	74755425	74755811	74755618	Y	MBP,MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	222862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	74840150	74840705	74840388	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	307587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	616514	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	76756179	76756568	76756439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	70717	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr18	77936891	77937280	77937009	Y	CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	PARD6G	66149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21586551935504
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	510583	510951	510744	Y	NA	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5284	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	660293	660821	660540	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.14209016349944
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.02467077945765
chr19	800594	800755	800691	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	MIR4745	2185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr19	823657	823956	823874	Y	BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1	PTBP1,MIR4745,MIR3187,CFD	NA	NA	NA	NA	MIR3187	12073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr19	888565	888780	888647	Y	SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	CFD,MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	MED16	2438	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	909116	909504	909461	Y	STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22	MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	1736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr19	934999	935434	935086	Y	MIDN,CIRBP	MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	11218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	953220	953565	953383	Y	EFNA2,MADCAM1,KISS1R,ARID3A	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	27609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.08490206957627
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr19	1140329	1140530	1140433	Y	NA	POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	31752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.1979893129517
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	1213863	1214369	1213961	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	C19orf26	21657	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.61988051584196
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	1410481	1410741	1410600	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	4913	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	1909763	1910077	1909925	Y	KLF16	KLF16,SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	ADAT3	6386	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.80517280803169
chr19	2064980	2065181	2065097	Y	MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	15737	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	2095281	2095723	2095416	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	2162744	2162943	2162860	Y	CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.732171852246339
chr19	2189110	2189498	2189160	Y	NA	DOT1L,AP3D1,SF3A2,PLEKHJ1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	26646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.978189339113065
chr19	2495780	2495940	2495859	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	21660	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr19	2528875	2529093	2529033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	54755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.67617821853551
chr19	2529574	2529858	2529677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	55454	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.553931922210458
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.959517225738678
chr19	2599036	2599584	2599134	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GNG7	101123	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	2950130	2950295	2950189	Y	NA	ZNF77	THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF77	7161	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.30751588210245
chr19	3131132	3131258	3131157	Y	NA	GNA11	NA	NA	NA	NA	GNA11	38724	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	3344211	3344472	3344340	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC	NFIC	NFIC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	NFIC	13089	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.12967657187789
chr19	3521162	3521389	3521298	Y	FZR1	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16891	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	3923611	3923782	3923733	Y	ITGB1BP3	DAPK3	NA	NA	NA	NA	DAPK3	45339	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	4061996	4062359	4062178	Y	NA	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	4089506	4089868	4089573	Y	ZBTB7A	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22579777286338
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.26314199961215
chr19	4379386	4379764	4379673	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	18780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.59403884964283
chr19	4381377	4381710	4381643	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	16834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	4567148	4567365	4567215	Y	TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1	NA	NA	NA	NA	LRG1	28662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	4970760	4971027	4970931	Y	NA	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	3635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr19	5046594	5046918	5046679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	79469	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	5091152	5091532	5091191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	124027	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	5287522	5287818	5287647	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	11777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	6060958	6061480	6061122	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	84805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	7254620	7254884	7254780	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	37161	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	7266028	7266415	7266222	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	25630	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	7746304	7746484	7746360	Y	ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59	STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	2575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21586551935504
chr19	10024468	10024837	10024779	Y	OLFM2	OLFM2	PIN1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	OLFM2	20391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	10715339	10715596	10715546	Y	ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2	KRI1,CDKN2D,AP1M2,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	4206	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	10829647	10829946	10829894	Y	ICAM3,TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	QTRT1,DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	2892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.920602691948613
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.4099183112531
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.52181109441619
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22579777286338
chr19	11592904	11593323	11593025	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	PRKCSH,CCDC151,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT	NA	NA	NA	NA	ZNF653	21415	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.46031269918047
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.741193074682762
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.32530173738728
chr19	12892597	12892707	12892653	Y	ZNF44,ZNF563,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,STX10,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	7603	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32618799547683
chr19	12896870	12897372	12897198	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	2938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.71391979901405
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.40613152196675
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.47898481255486
chr19	13995889	13996057	13995977	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	18957	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr19	13997855	13998026	13997925	Y	CCDC130,IL27RA,DCAF15	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	16988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr19	14084978	14085262	14085120	Y	NA	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	DCAF15	23674	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	IL27RA,EEF1DP1,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.05866598327592
chr19	14190971	14191218	14191036	Y	CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,PKN1,DNAJB1,CD97	EEF1DP1,SAMD1,PRKACA	NA	NA	NA	NA	SAMD1	8630	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	14597679	14597949	14597721	Y	NA	GIPC1,TECR,DNAJB1	NA	NA	NA	NA	GIPC1	6995	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr19	14661096	14661426	14661346	Y	NA	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	19448	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr19	14664309	14664503	14664361	Y	OR7C2	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	16371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr19	14665322	14665552	14665478	Y	SLC1A6	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	15322	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	14869692	14869911	14869839	Y	NA	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	EMR2	17442	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr19	15310768	15311119	15311001	Y	NA	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	976	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr19	15666666	15666804	15666739	Y	NA	CYP4F22	NA	NA	NA	NA	CYP4F22	49362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.873067555533447
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	95558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.7865006946573
chr19	16085655	16086068	16085771	Y	TPM4	CYP4F11	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	41978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.10041292902578
chr19	16477143	16477842	16477298	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	43515	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	16480475	16480862	16480751	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	46847	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	16482225	16482879	16482589	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	48597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr19	16573693	16573897	16573763	Y	HSH2D	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	6999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.18529229218973
chr19	16574808	16575111	16574962	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	5785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr19	16576710	16576784	16576751	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	4112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	17176287	17176664	17176476	Y	MYO9B	CPAMD8,HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	HAUS8	7771	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr19	17190539	17191239	17190954	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	5948	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr19	18264934	18265291	18265179	Y	NA	PIK3R2,IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	PIK3R2	2966	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	18430446	18430898	18430653	Y	ARRDC2,IL12RB1,IFI30,LRRC25	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	1186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.40675705732822
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr19	18512599	18512849	18512719	Y	IFI30,UBA52,LRRC25	GDF15,SSBP4,ISYNA1	LRRC25	K562	ChIA-PET	22265404	SSBP4	14825	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.28453346741551
chr19	18606803	18607671	18607185	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,KLHL26,ELL,LRRC25	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	23266	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	18630929	18631259	18631008	Y	UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL	FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	19483893	19484092	19484012	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	10543	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.61751516888814
chr19	19514283	19514636	19514393	Y	HOMER3,RFXANK,GMIP,GATAD2A	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	19648	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	19562909	19563265	19563209	Y	RFXANK,MEF2BNB,MAU2,GATAD2A,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	61280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	19977247	19977754	19977315	Y	PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253	ZNF506,ZNF253,ZNF93	NA	NA	NA	NA	ZNF253	2552	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	21689202	21689645	21689487	Y	ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429	ZNF429	NA	NA	NA	NA	ZNF429	11718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr19	22715195	22715609	22715437	Y	NA	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	1908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF730	53433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	28217479	28217822	28217621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1484626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	28218670	28219232	28218933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1483216	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr19	29896046	29896124	29896085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	193598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	30198391	30198719	30198555	Y	NA	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	5645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr19	31371885	31372199	31372043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	466254	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	TSHZ3	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	3229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr19	33664629	33664677	33664651	Y	NA	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1832	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1599	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.2424803861129
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.6313830763916
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.90912283781131
chr19	35494139	35494542	35494364	Y	NA	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	10451	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.91277799629457
chr19	35557782	35557965	35557875	Y	MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4	SCN1B,HPN,FXYD3	NA	NA	NA	NA	HPN	28372	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	35605566	35605978	35605759	Y	MAG,FFAR1,LGI4	FXYD3,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr19	35763871	35764402	35764192	Y	FXYD1,FXYD1,HAMP	LSR,USF2	NA	NA	NA	NA	USF2	5990	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr19	35808532	35808711	35808557	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	50651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr19	35838526	35838887	35838790	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	80645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	IGFLR1	37792	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.47181525973011
chr19	36241217	36241384	36241301	Y	MAG,LRFN3	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55,ARHGAP33	NA	NA	NA	NA	LIN37	3955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr19	36519340	36519516	36519376	Y	ZNF565	SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62	NA	NA	NA	NA	ALKBH6	16199	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	WDR87,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr19	38482400	38482784	38482644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	86532	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr19	38539064	38539251	38539168	Y	ZNF571	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	143196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	38575229	38575296	38575264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPINT2	157379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	38719187	38719304	38719247	Y	ZNF573,DPF1,PPP1R14A,DPF1	SPINT2	NA	NA	NA	NA	SPINT2	13371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	39152764	39152958	39152839	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	16475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	39171828	39172087	39171896	Y	FAM98C,RASGRP4,RINL,NFKBIB,HNRNPL,MAP4K1	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	35539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr19	39189644	39189919	39189773	Y	RINL	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN4	53355	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	39645312	39645609	39645461	Y	LGALS7B	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	30902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.8540195953301
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr19	40751869	40752087	40752041	Y	NA	CNTD2,AKT2	NA	NA	NA	NA	CNTD2	21272	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,C19orf47	NA	NA	NA	NA	C19orf47	28888	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.61388271681722
chr19	40951707	40952008	40951966	Y	NA	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	3095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	41014841	41015014	41014895	Y	MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4	BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SPTBN4	44693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	41120897	41121111	41120992	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	24108	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	41254580	41254859	41254762	Y	SHKBP1,ADCK4	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	SNRPA	38	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	41304071	41304255	41304136	Y	SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	EGLN2	1170	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	41802534	41802970	41802553	Y	B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	11124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	41814398	41814719	41814610	Y	HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2	HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	304	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr19	42027706	42027846	42027786	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83084	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	42036742	42037668	42037272	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,ARHGEF1	NA	CEACAM21,LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	92120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr19	42404902	42404963	42404932	Y	NA	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	19674	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.55707253629304
chr19	42430880	42431141	42430883	Y	NA	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	30401	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr19	42432096	42432209	42432128	Y	NA	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	29333	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	42440713	42441005	42440837	Y	ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	20537	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	42606774	42607144	42606983	Y	NA	ZNF574	NA	NA	NA	NA	ZNF574	36145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	42756581	42756634	42756608	Y	ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	675	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	14986	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.91896267363113
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	15495	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.91790604393198
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	17070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	18683	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	20038	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	19259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.67669276293618
chr19	42789863	42790090	42789919	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,DEDD2,CIC	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	14160	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	43943414	43943644	43943560	Y	PLAUR,KCNN4,C19orf61,PHLDB3	LYPD3	NA	NA	NA	NA	LYPD3	24168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	44187544	44187683	44187606	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	IRGC,SMG9,KCNN4,LYPD5,PLAUR	IMR90	Hi-C	24141950	PLAUR	14845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	44555398	44555498	44555444	Y	ZNF155,ZNF223	ZNF222,ZNF223,ZNF284,ZNF224	NA	NA	NA	NA	ZNF223	1878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr19	44616064	44616441	44616271	Y	KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284	ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234	NA	NA	NA	NA	ZNF225	1730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr19	44780646	44780756	44780701	Y	NA	ZNF233,ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	26443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	45195366	45195649	45195556	Y	RELB,CLASRP,BCL3	NA	NA	NA	NA	NA	PVR	50268	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr19	45242034	45242469	45242251	Y	RELB,CLASRP,BCL3	BCL3	BCL3	K562	ChIA-PET	22265404	BCL3	6493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3,BCAM	NA	NA	NA	NA	BCAM	30367	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.63855262921636
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.01904882726186
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	45373382	45373614	45373476	Y	NA	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	18212	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	45601584	45601804	45601678	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	8930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.811170607056443
chr19	45616872	45617353	45617125	Y	NA	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	24218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.78612484782835
chr19	45620495	45620703	45620563	Y	NA	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	27841	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14206745708711
chr19	45663964	45664347	45664315	Y	NA	TRAPPC6A,BLOC1S3	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6A	15148	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr19	45803954	45804164	45804074	Y	NA	KLC3	NA	NA	NA	NA	KLC3	30528	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.19431558119618
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.1900032133136
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.614258563646172
chr19	46014236	46014617	46014413	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	6399	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.20241680493516
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C,CCDC8	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3	NA	NA	NA	NA	CALM3	39864	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85755669608394
chr19	47234783	47235117	47235027	Y	PTGIR,ZC3H4,PRKD2,STRN4	PRKD2,FKRP,STRN4	NA	NA	NA	NA	FKRP	12186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	47295326	47295559	47295464	Y	NA	FKRP,STRN4,SLC1A5	FKRP,STRN4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A5	5475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	47299930	47299995	47299963	Y	NA	SLC1A5	FKRP,STRN4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A5	10079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr19	47324064	47324441	47324224	Y	NA	SLC1A5,AP2S1	NA	NA	NA	NA	AP2S1	27808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.63972438301636
chr19	47367294	47367354	47367334	Y	NA	AP2S1	SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	15045	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr19	47552678	47552827	47552750	Y	NA	TMEM160	NA	NA	NA	NA	TMEM160	2790	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.19993546682194
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr19	47662714	47662828	47662771	Y	NA	SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	ZC3H4	47705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr19	47689758	47690163	47690151	Y	GLTSCR1,BBC3	BBC3	NA	NA	NA	NA	BBC3	43860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	47742856	47743228	47743000	Y	NA	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	8833	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr19	47744387	47744529	47744512	Y	SLC8A2	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	10364	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.88056181718321
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.696397932538855
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.46673262491736
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr19	47854917	47855115	47854986	Y	ZC3H4,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	4379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	48016569	48017036	48016994	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	72	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	48076356	48076760	48076653	Y	SLC8A2,ZNF541	NA	GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541	IMR90	Hi-C	24141950	NAPA	59859	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85036650341688
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.89253557587888
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	48974873	48974967	48974920	Y	NA	GRWD1,CYTH2,LMTK3	NA	NA	NA	NA	CYTH2	4584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2,LMTK3	NA	NA	NA	NA	LMTK3	18067	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	49046614	49046906	49046677	Y	NA	LMTK3,SULT2B1	SULT2B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULT2B1	6426	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr19	49057128	49057239	49057162	Y	NA	LMTK3,SULT2B1	NA	NA	NA	NA	SULT2B1	3796	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	49151515	49151640	49151575	Y	NA	SPHK2,RPL18,DBP,CA11	NA	NA	NA	NA	CA11	3946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	50718001	50718188	50718073	Y	NA	MYH14	NA	NA	NA	NA	MYH14	28558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr19	50718358	50718781	50718691	Y	NA	MYH14	NA	NA	NA	NA	MYH14	28915	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.97779078587178
chr19	50993276	50993671	50993522	Y	MYH14,MYBPC2	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	18939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.495175587816035
chr19	51972517	51972837	51972747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFB	104845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	1272	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.17498419185243
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.20396440556411
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	94	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.93456595076917
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	17	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	555	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	52996616	52996734	52996658	Y	NA	ZNF808	NA	NA	NA	NA	ZNF808	32171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF665	32764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.996861452487456
chr19	54713468	54714085	54713942	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	10858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	55582606	55582776	55582718	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	EPS8L1	1218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr19	55600172	55600429	55600236	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	EPS8L1	18784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43170833229774
chr19	55885541	55885905	55885786	Y	NA	SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	TMEM238	8061	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr19	55962647	55962935	55962813	Y	SYT5,BRSK1,ZNF580,SHISA7	UBE2S,ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ISOC2	8775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	55985101	55985287	55985184	Y	ISOC2,SSC5D	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ZNF628	412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,NAT14,SBK2	NA	NA	NA	NA	SBK2	14879	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.65551660503625
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	56571705	56571858	56571782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF787	58791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	56603212	56603388	56603235	Y	ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	27261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr19	56811653	56811926	56811777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	65826	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	57630212	57630609	57630334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF264	70259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	58237757	58238155	58237774	Y	NA	ZNF551,ZNF671,ZNF776,ZNF586	ZNF154	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF671	765	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	58532436	58532530	58532517	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN1	10870	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	58824678	58824957	58824818	Y	ZNF256	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG-AS1,A1BG,ZNF497	NA	NA	NA	NA	ERVK3-1	9963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr19	58886804	58887095	58886950	Y	ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B	A1BG-AS1,A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584	NA	NA	NA	NA	ZNF837	3332	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.2757956741195
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	59078228	59078288	59078258	Y	CHMP2A,CHMP2A	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	CENPBD1P1	4582	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	MZF1	4477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr2	393939	394227	394175	Y	SH3YL1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3YL1	129541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	739928	740199	740059	Y	NA	NA	TMEM18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM18	64489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.6313624365493
chr2	1476597	1477084	1476655	Y	TPO,TPO	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	150107	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43327863933903
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	18973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	1608919	1609202	1609060	Y	PXDN	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	17989	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	1679499	1679591	1679561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	52308	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	3226385	3226781	3226690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	152872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	3487019	3487372	3487201	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	34135	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	8316367	8316666	8316568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	500309	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	8712183	8712281	8712245	Y	NA	NA	LINC00299,LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	104694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr2	8713737	8713978	8713829	Y	NA	NA	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	102997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	8816590	8817048	8816915	Y	NA	AC011747.7	NA	NA	NA	NA	ID2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.91591654380711
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	10425680	10425925	10425803	Y	HPCAL1	HPCAL1	HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	15090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr2	10441145	10441558	10441458	Y	KLF11	HPCAL1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	HPCAL1	130	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	10501440	10501782	10501611	Y	C2orf48	NA	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	60425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43170833229774
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	11443913	11444199	11444137	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	42257	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	11621258	11621798	11621627	Y	NA	E2F6	GREB1,NTSR2,FLJ33534,C2orf50,MIR4429,ROCK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	E2F6	16961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr2	11623044	11623914	11623865	Y	NA	E2F6,GREB1	GREB1,NTSR2,FLJ33534,C2orf50,MIR4429,ROCK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	E2F6	18747	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.79367024748206
chr2	11623935	11624324	11624249	Y	NA	E2F6,GREB1	GREB1,NTSR2,FLJ33534,C2orf50,MIR4429,ROCK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	E2F6	19638	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.17538274509372
chr2	11624930	11625118	11625003	Y	ROCK2,GREB1,GREB1,GREB1	E2F6,GREB1	NTSR2,GREB1,MIR4429,FLJ33534,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	E2F6	20633	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr2	11634636	11634845	11634741	Y	NA	E2F6,GREB1	GREB1,MIR4429	IMR90	Hi-C	24141950	E2F6	30339	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	11670828	11671487	11671198	Y	NA	GREB1	NA	NA	NA	NA	GREB1	755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	9.93493607241885
chr2	11672394	11672952	11672719	Y	NA	GREB1	NA	NA	NA	NA	GREB1	152	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.54324797504421
chr2	11673553	11673665	11673599	Y	NA	GREB1	NA	NA	NA	NA	GREB1	1311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43170833229774
chr2	11675998	11676466	11676097	Y	NA	GREB1	NA	NA	NA	NA	GREB1	3756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.06309140868934
chr2	11681139	11681830	11681410	Y	NA	GREB1	NA	NA	NA	NA	GREB1	8897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.799949409077185
chr2	11683947	11684460	11684379	Y	NA	GREB1	NA	NA	NA	NA	GREB1	11705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr2	12805628	12805875	12805752	Y	NA	TRIB2	LPIN1,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	49140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	12842829	12843040	12842916	Y	NA	TRIB2	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	11975	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr2	15152602	15153001	15152802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	381792	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	15446828	15446905	15446867	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	252549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	15464031	15464396	15464252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	235058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	15481171	15481552	15481362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	217902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	15700375	15700622	15700454	Y	DDX1,NBAS	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	NBAS	921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	15734291	15734400	15734305	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	DDX1	4989	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	16152892	16153059	16152979	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	MYCN	74206	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	19273463	19273583	19273517	Y	NA	NA	OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	533517	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr2	19325543	19325927	19325740	Y	NA	NA	MIR4757,FLJ12334,OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	585597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	19340591	19340734	19340664	Y	OSR1	NA	OSR1,MIR4757	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	600645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.03458032655366
chr2	19547126	19547267	19547173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	519354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	19548078	19548301	19548191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	518320	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	19562818	19563058	19562929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	503563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr2	19766934	19767238	19767086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	299383	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-644K8.1	89	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	20252703	20252899	20252848	Y	NA	MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-644K8.1	2808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.24446988623777
chr2	20341243	20341467	20341355	Y	NA	NA	PUM2,WDR35,MATN3,SDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDC1	81727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	20379968	20380084	20380011	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	43110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	20382454	20382566	20382495	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	40628	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	20407883	20408194	20408074	Y	RHOB,SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	15000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	20412962	20413136	20413039	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	10058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	20674316	20674523	20674398	Y	NA	RHOB,AC023137.2	RHOB,HS1BP3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC023137.2	25513	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr2	20709880	20710074	20709978	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90	Hi-C	24141950	AC023137.2	61077	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr2	20778645	20778883	20778839	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69966	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	20784084	20784557	20784460	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	64292	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	20793103	20793496	20793437	Y	APOB	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	55353	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	20849276	20849608	20849479	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	23119800	23119804	23119802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	486284	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	23923305	23923445	23923375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	224539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	24213695	24213947	24213707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf44	56498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	24234264	24234694	24234378	Y	MFSD2B	C2orf44,FKBP1B	NA	NA	NA	NA	C2orf44	35751	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	24238466	24238799	24238602	Y	NA	C2orf44,FKBP1B	NA	NA	NA	NA	C2orf44	31646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	62972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	24512394	24512744	24512638	Y	NA	RPL36AP13	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	42637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	24713346	24713697	24713476	Y	DNAJC27,ITSN2	NA	CENPO,NCOA1	IMR90	Hi-C	24141950	ITSN2	131763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	24941895	24942247	24942153	Y	NCOA1	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	71758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	25084468	25084617	25084543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY3	56091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	25473699	25473887	25473786	Y	EFR3B	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	89572	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	25789731	25789834	25789815	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	104669	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	17060	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	26231667	26232185	26231781	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	22791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	26241064	26241266	26241191	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	13710	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.9460685113188
chr2	27432989	27433207	27433072	Y	NA	SLC5A6,CAD	NA	NA	NA	NA	SLC5A6	619	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	SLC30A3,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr2	27557346	27557529	27557503	Y	DPYSL5,C2orf16	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	10799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	27629706	27629770	27629738	Y	NA	EIF2B4,SNX17,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	PPM1G	784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.03683054940662
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	28583784	28584228	28583975	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	29087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr2	28586671	28586953	28586834	Y	RBKS,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	26362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	28600937	28601380	28601351	Y	RBKS,BRE,BRE,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	RBKS,BRE,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,MRPL33,LOC100505716,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	11935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr2	28629645	28630316	28629830	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	14106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	28653761	28654131	28653949	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	38222	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	28659517	28659673	28659646	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	FOSL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC104695.3	43978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.74367441279597
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	NA	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	WDR43	215713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	29674441	29674554	29674498	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	558932	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	30850038	30850385	30850172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	181946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	33805444	33805464	33805454	Y	RASGRP3	FAM98A	NA	NA	NA	NA	FAM98A	16985	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	36189102	36189392	36189167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	391677	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr2	37139828	37140219	37140054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	51396	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	37497492	37497655	37497574	Y	HEATR5B	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	40636	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	38023099	38023324	38023154	Y	NA	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	59488	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	38323202	38323810	38323564	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYP1B1	11234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	38368766	38369153	38368894	Y	CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	33722	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	38372999	38373624	38373225	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	37955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	38375670	38375904	38375803	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	40626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.79800325520694
chr2	39683895	39683929	39683912	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	21442	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	39695061	39695250	39695144	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	32608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	39719153	39719730	39719398	Y	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	56700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	39727713	39727883	39727798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	65260	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	40767004	40767399	40767181	Y	NA	NA	SLC8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	68794	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	40964157	40964324	40964261	Y	NA	NA	LOC100128590	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	127964	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	42046531	42047126	42046845	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	226034	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	42053679	42053991	42053965	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	219169	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	42068299	42068635	42068587	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	204525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	42161610	42162017	42161892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	111143	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	42360195	42360705	42360352	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	33785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	42412542	42412681	42412587	Y	NA	EML4	NA	NA	NA	NA	EML4	18052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.35074071720506
chr2	43152648	43152978	43152751	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	298770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	149235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	43363400	43363787	43363633	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	87961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	43396497	43396745	43396689	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	LOC100129726,ZFP36L2,THADA	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	55003	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	43527782	43528145	43528003	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	76034	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	43666042	43666391	43666188	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	154794	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	43686078	43686091	43686085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135094	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	43818575	43818651	43818610	Y	NA	THADA,PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	THADA	2534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	43908548	43908922	43908739	Y	PLEKHH2	PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	PLEKHH2	46136	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	45881346	45881543	45881445	Y	NA	SRBD1,PRKCE	NA	NA	NA	NA	PRKCE	4862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	45974142	45974515	45974197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	97658	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	46100592	46100616	46100604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	224108	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	46212455	46212485	46212471	Y	PRKCE	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	306321	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	46662046	46662321	46662184	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1,LOC388946,ATP6V1E2,RHOQ,PIGF,CRIPT	IMR90	Hi-C	24141950	RHOQ	104624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	46857387	46857788	46857588	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	PIGF	15129	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr2	47194379	47194775	47194547	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	27385	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.20553471260541
chr2	47197841	47198107	47197954	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	30847	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr2	47199058	47199402	47199110	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	32064	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	47296749	47297008	47296937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	104732	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr2	47297632	47297822	47297725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	103918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	47418967	47419222	47419129	Y	NA	CALM2,AC106869.2	TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	17227	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.73648215355889
chr2	47420372	47420663	47420518	Y	NA	CALM2,AC106869.2	EPCAM,TTC7A,MCFD2,C2orf61,CALM2	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	18632	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	AC106869.2	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC106869.2	48773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr2	47790557	47790758	47790693	Y	KCNK12	KCNK12	NA	NA	NA	NA	KCNK12	5320	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	47979563	47979754	47979705	Y	NA	NA	KCNK12,MSH2,MSH6	IMR90	Hi-C	24141950	MSH6	58894	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	48373241	48373406	48373298	Y	FOXN2	NA	FOXN2,PPP1R21	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN2	166370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	51010628	51010803	51010737	Y	NRXN1,NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	2256106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	52304154	52304543	52304242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	1688386	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	54054125	54054397	54054212	Y	NA	ERLEC1,GPR75-ASB3,ASB3	NA	NA	NA	NA	GPR75-ASB3	30773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	54682152	54682577	54682442	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr2	56066410	56066608	56066510	Y	NA	NA	EFEMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EFEMP1	82666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr2	56968776	56968885	56968798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007743.1	557871	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	85099	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	60779041	60779656	60779263	Y	REL,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	169301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	61140048	61140151	61140100	Y	REL	REL,RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	3610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.83879216502102
chr2	62534127	62534336	62534147	Y	NA	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	112879	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.73807516701251
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	64352533	64352773	64352693	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	16815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	64732462	64732787	64732655	Y	NA	AFTPH	LGALSL	IMR90	Hi-C	24141950	AFTPH	16678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.90757523718235
chr2	64957479	64957902	64957679	Y	NA	SERTAD2	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	18237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	65656801	65657217	65657146	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	554	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr2	66616837	66617254	66616981	Y	NA	MEIS1,MEIS1-AS3	MEIS1,MIR4778	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MEIS1	41330	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.995291145446165
chr2	66652427	66652950	66652646	Y	MEIS1	MEIS1,MEIS1-AS3	LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS1	5634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr2	66653044	66653230	66653107	Y	NA	MEIS1,MEIS1-AS3	LOC644838,MEIS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEIS1	5354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.89005217119563
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	143297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19719340598065
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	69390293	69390547	69390355	Y	ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	151983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	69663778	69663884	69663817	Y	AAK1	NFU1	NA	NA	NA	NA	NFU1	1018	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	70048617	70048893	70048741	Y	ANXA4	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	5881	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	70145725	70146134	70145771	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	70161598	70161791	70161659	Y	PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	25606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	70202880	70203539	70203203	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	15483	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	70270545	70270983	70270722	Y	MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	41602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	70285414	70285703	70285559	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	26882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	70294861	70295138	70295000	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	17447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr2	70296121	70296604	70296392	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	15981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.20241680493516
chr2	70784432	70784674	70784554	Y	NA	TGFA	TGFA	K562	ChIA-PET	22265404	TGFA	5107	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	72541323	72541406	72541365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	509764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	72849954	72850312	72850133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	200858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	72936183	72936496	72936380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	114674	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr2	74060180	74060503	74060342	Y	NA	STAMBP	NA	NA	NA	NA	STAMBP	6094	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr2	74153090	74153262	74153147	Y	NA	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	1137	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	74259703	74260366	74260024	Y	NA	AC073046.25,TET3	TET3,ACTG2,BOLA3	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	31863	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	74264843	74264997	74264882	Y	NA	TET3	TET3,ACTG2,DGUOK,STAMBP,MOB1A,BOLA3-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	37003	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	74446656	74447054	74446868	Y	NA	MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MTHFD2	22967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	74616605	74616668	74616637	Y	NA	DCTN1,C2orf81,WDR54	NA	NA	NA	NA	DCTN1	546	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	74647656	74647929	74647851	Y	SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81	DCTN1,C2orf81,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS	NA	NA	NA	NA	WDR54	851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	74722835	74723021	74722928	Y	NA	INO80B,WBP1,MOGS,MRPL53,TTC31,CCDC142,LBX2,PCGF1,DQX1,HTRA2,AUP1	NA	NA	NA	NA	LBX2	5422	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0011717538
chr2	75076703	75076941	75076867	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	17595	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	75141745	75142080	75142074	Y	NA	AC104135.3,POLE4	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	1195	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	80371410	80371698	80371551	Y	NA	AC016716.1	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	16563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	80414498	80414731	80414615	Y	NA	AC016716.1	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	26237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	80850170	80850196	80850188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	461909	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	81781528	81781694	81781559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	1261561	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	85624104	85624259	85624204	Y	NA	ELMOD3,RETSAT	NA	NA	NA	NA	RETSAT	44361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	NA	NA	NA	NA	NA	RETSAT	84801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	85817156	85817274	85817185	Y	VAMP5	GGCX,VAMP8,RNF181,USP39,TMEM150A,C2orf68	NA	NA	NA	NA	RNF181	3574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	85969500	85969917	85969748	Y	VAMP5,TMEM150A,ATOH8	RNU1-38P	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	16040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr2	86307060	86307219	86307140	Y	GNLY,KDM3A,KDM3A	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	24059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	86692253	86692485	86692369	Y	NA	KDM3A	NA	NA	NA	NA	KDM3A	26483	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	86922220	86922584	86922381	Y	NA	RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3	NA	NA	NA	NA	RMND5A	22712	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	88353539	88354148	88353800	Y	KRCC1	RNU2-63P,KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	88899554	88899981	88899832	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	25113	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	88913679	88914090	88914022	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	11004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	88959127	88959352	88959240	Y	NA	EIF2AK3,RPIA	EIF2AK3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPIA	29810	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.42859042462749
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	96198442	96198677	96198560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	131973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	96782666	96782871	96782861	Y	NA	ADRA2B,DUSP2,AC012307.2	NA	NA	NA	NA	ADRA2B	2682	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	97222458	97223029	97222771	Y	DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	21978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr2	97540190	97540589	97540281	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	5696	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	97554359	97554681	97554500	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	19865	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.62105226964197
chr2	97557375	97557484	97557475	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	22881	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr2	97561594	97561991	97561828	Y	FAM178B	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	27100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr2	97565299	97565614	97565457	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	30805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	88784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	98910663	98910871	98910767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	148446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	99081402	99081780	99081544	Y	TMEM131,UNC50,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	INPP4A	22085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	99104168	99104367	99104271	Y	TMEM131,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	44851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	99121825	99122251	99122089	Y	INPP4A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	62508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	99268200	99268767	99268592	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	45158	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	99452356	99452772	99452668	Y	TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	106767	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF2	306582	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	29250	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	28407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.29760633500643
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.28977957278235
chr2	101270237	101270473	101270387	Y	RPL31	NA	NPAS2	IMR90	Hi-C	24141950	PDCL3	93085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	101866406	101866620	101866513	Y	NA	TBC1D8	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr2	101944459	101944757	101944675	Y	NA	RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	21296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	101972073	101972519	101972434	Y	NA	RNF149,CREG2	NA	NA	NA	NA	CREG2	29538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	103104673	103104833	103104753	Y	IL1R2,IL1R1,IL18R1,IL18RAP	SLC9A4	NA	NA	NA	NA	SLC9A4	16911	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	105489803	105490153	105490078	Y	GPR45,POU3F3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	162288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	105655685	105655967	105655739	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	3244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	106009982	106010344	106010250	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	42626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	106417583	106417937	106417755	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	58229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	106480374	106480732	106480408	Y	NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	121020	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	106551669	106551989	106551685	Y	NCK2	NA	C2orf40	IMR90	Hi-C	24141950	NCK2	192315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	110271705	110271931	110271836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	97852	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	112459778	112460151	112459873	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	180116	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	113341105	113341247	113341152	Y	POLR1B	POLR1B,CHCHD5,AC079922.2	NA	NA	NA	NA	CHCHD5	1288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	113444240	113444400	113444290	Y	NA	SLC20A1,NT5DC4	NA	NA	NA	NA	NT5DC4	32663	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	113448603	113448987	113448785	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	28076	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	26628	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	113657771	113658101	113657937	Y	NA	NA	CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	CKAP2L	137517	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	114163815	114164191	114163891	Y	NA	IGKV1OR2-108	IL1RN	IMR90	Hi-C	24141950	IGKV1OR2-108	1842	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	118722673	118722961	118722817	Y	NA	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	46748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	118739522	118739775	118739730	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	29934	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	118740185	118740994	118740898	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	28715	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	120891923	120892273	120892121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	86711	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	120905923	120906046	120905986	Y	EPB41L5,EPB41L5	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	72938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	120971736	120972136	120971936	Y	NA	TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	6848	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr2	121155649	121155973	121155708	Y	INHBB	NA	LOC84931,INHBB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INHBB	53930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	121200367	121200763	121200697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBB	98648	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.80203426051915
chr2	121299175	121299329	121299252	Y	NA	NA	RALB,GLI2,INHBB,LOC84931	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INHBB	197456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	122297511	122297730	122297621	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	11054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	127824493	127824859	127824771	Y	MAP3K2,IWS1,BIN1	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	38072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	127837369	127837492	127837432	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	25439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	127915404	127915435	127915422	Y	NA	NA	CYP27C1,BIN1,MAP3K2	IMR90	Hi-C	24141950	BIN1	52473	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr2	128119420	128119722	128119576	Y	NA	MAP3K2	IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	24319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	128165400	128165641	128165534	Y	NA	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	21359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr2	128173465	128174362	128173731	Y	SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	29424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.35676122264214
chr2	128761594	128761964	128761779	Y	NA	SAP130	NA	NA	NA	NA	SAP130	21730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	129073927	129074235	129074112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	130201021	130201117	130201085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	494673	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	131485043	131485533	131485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF4	106956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.52898064724094
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	ARHGEF4	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ARHGEF4	36669	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	132182653	132182963	132182773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2A	65353	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.553931922210458
chr2	132426552	132426927	132426662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093838.4	178166	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr2	133111183	133111270	133111216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	60877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr2	133609225	133609410	133609318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	182073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	133737397	133737586	133737506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	310245	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	134193030	134193115	134193062	Y	NCKAP5	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP5	130919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	134262685	134263066	134262922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP5	60968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.54765276061533
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr2	135437323	135437554	135437491	Y	TMEM163	TMEM163	NA	NA	NA	NA	TMEM163	37016	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	26936	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	136504457	136504522	136504461	Y	NA	UBXN4	NA	NA	NA	NA	UBXN4	7268	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr2	138845772	138845790	138845781	Y	NA	NA	HNMT	IMR90	Hi-C	24141950	HNMT	126182	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	139112246	139112514	139112380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	144754	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	139289140	139289372	139289256	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	31769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	143451325	143451501	143451413	Y	NA	NA	KYNU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KYNU	181566	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	143615203	143615596	143615531	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	17471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	143615896	143616223	143616082	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	16844	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr2	143625721	143626570	143625926	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	6497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	1360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr2	143688672	143689047	143688712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	55605	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	143699726	143700104	143699915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	66659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	143720663	143721004	143720729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	87596	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	143756654	143756995	143756685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	123587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	145461218	145461913	145461584	Y	GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	373083	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	147189297	147189317	147189307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC1P2	153695	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	149267026	149267240	149267133	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	132769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	149527542	149527937	149527740	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	102882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	149925246	149925613	149925433	Y	NA	LYPD6B	NA	NA	NA	NA	LYPD6B	32625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr2	149981587	149981830	149981709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6B	88966	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr2	150184579	150184898	150184643	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	80	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.8472258893343
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr2	150278954	150279172	150279087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6	94455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.10357418295066
chr2	151022837	151023057	151022971	Y	NA	NA	RND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RND3	370468	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	152757130	152757527	152757465	Y	CACNB4,CACNB4,CACNB4	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	74124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	153568262	153568351	153568307	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	4056	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	155556801	155556983	155556830	Y	NA	KCNJ3	NA	NA	NA	NA	KCNJ3	3990	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr2	157038752	157038990	157038871	Y	NR4A2	NA	NR4A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR4A2	157870	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.48577851855066
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	157287649	157287933	157287736	Y	NR4A2,GPD2	GPD2	GPD2	K562	ChIA-PET	22265404	GPD2	1869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr2	157293916	157294289	157294044	Y	NA	GPD2	NA	NA	NA	NA	GPD2	4114	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	158084243	158084386	158084315	Y	NA	GALNT5	GALNT5	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT5	27724	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	158117931	158118105	158118018	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	5821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr2	159581549	159581597	159581577	Y	NA	NA	CCDC148,LOC554201,PKP4,UPP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TANC1	241549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr2	160208394	160208612	160208503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	67084	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	161078300	161078513	161078433	Y	ITGB6	ITGB6	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	47886	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	161079390	161079792	161079655	Y	ITGB6	ITGB6	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	46607	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	161080666	161080905	161080769	Y	NA	ITGB6	ITGB6,RBMS1,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	45494	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr2	161083916	161084239	161083958	Y	CD302,ITGB6	ITGB6	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	42160	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.62145082288326
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	ITGB6	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB6	27776	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	ITGB6	NA	NA	NA	NA	ITGB6	29547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	161201536	161201707	161201641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	60686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	161277229	161277590	161277411	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	14836	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	161609287	161609535	161609411	Y	TANK,TANK	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	260982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	161979819	161979978	161979936	Y	TANK,TANK	TANK	PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TANK	11441	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	161991888	161992259	161991958	Y	NA	TANK	NA	NA	NA	NA	TANK	469	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr2	162095171	162095411	162095272	Y	TBR1,SLC4A10	AC009299.3	NA	NA	NA	NA	AC009299.3	3839	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr2	162727867	162728162	162727919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP4	200890	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	162817649	162818074	162817753	Y	IFIH1	NA	NA	NA	NA	NA	DPP4	110978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	163477809	163478160	163477991	Y	KCNH7	NA	NA	NA	NA	NA	GCA	304459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.81313826782749
chr2	164205577	164205788	164205730	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	384734	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	164991272	164991524	164991400	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	400750	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	165371083	165371396	165371192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	104962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.89045072443692
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	165683192	165683287	165683237	Y	NA	AC019181.2,COBLL1	NA	NA	NA	NA	AC019181.2	11972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	166778122	166778316	166778220	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	30037	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	166796102	166796135	166796119	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	170573146	170573520	170573335	Y	NA	PHOSPHO2,KLHL23	NA	NA	NA	NA	KLHL23	24148	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	171003090	171003284	171003187	Y	NA	NA	UBR3	IMR90	Hi-C	24141950	UBR3	321122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	171742019	171742156	171742111	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	40818	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	171865748	171866100	171865790	Y	TLK1	NA	NA	NA	NA	NA	GORASP2	82774	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	172957811	172957994	172957904	Y	DYNC1I2,DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	7634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	173796243	173796588	173796342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093818.1	376919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	173908830	173909139	173908955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	308409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	173909393	173909689	173909541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	307859	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	173942556	173942831	173942720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	274717	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	174129335	174129853	174129516	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	87695	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	174776201	174776462	174776332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	51968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	175463861	175463949	175463936	Y	CIR1,WIPF1	NA	NA	NA	NA	NA	AC018890.6	53992	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	175519164	175519290	175519227	Y	NA	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	26354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	175531113	175531313	175531213	Y	WIPF1	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	14331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	175540530	175540594	175540562	Y	CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1	WIPF1,H3F3AP4	NA	NA	NA	NA	WIPF1	5050	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	180006156	180006503	180006499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	121014	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	182639482	182639685	182639584	Y	NA	NA	SSFA2	IMR90	Hi-C	24141950	SSFA2	114875	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	182942372	182942392	182942382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R1C	125404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	183876955	183877317	183877185	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	24269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	186638782	186639016	186638929	Y	NA	FSIP2	NA	NA	NA	NA	FSIP2	37427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	186645587	186645801	186645694	Y	NA	FSIP2	NA	NA	NA	NA	FSIP2	44232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	187015061	187015446	187015349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	333437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	187390995	187391341	187391159	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	42112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	190014709	190015152	190014914	Y	NA	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	27453	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	190056615	190056806	190056658	Y	NA	COL5A2	GULP1,COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	14010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	190075572	190075716	190075672	Y	DIRC1	COL5A2	COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	32967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr2	190090759	190091067	190090911	Y	NA	COL5A2	COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	48154	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	190243884	190244287	190244000	Y	NA	NA	COL5A2,GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	59872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	190272344	190272674	190272405	Y	NA	WDR75	COL5A2,GULP1,COL3A1,MIR1245B,WDR75,DIRC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WDR75	31485	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	190399515	190399898	190399767	Y	NA	NA	SLC40A1,WDR75	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	95356	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	190739432	190739578	190739518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS1	92325	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	191104181	191104357	191104269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	101839	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	191876857	191877189	191877023	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	STAT1	6497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	192123995	192124097	192124046	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	16084	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	192170125	192170408	192170266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	62214	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	192529976	192530334	192530120	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	422065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	193817686	193817882	193817784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	1709775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr2	196427777	196428076	196427925	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A10	10625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	196428777	196429172	196429092	Y	SLC39A10	SLC39A10	SLC39A10	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A10	9529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	197097649	197097961	197097892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	58422	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.43575997745224
chr2	197110496	197110726	197110609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	71269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	197112196	197112499	197112370	Y	STK17B	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	72969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr2	198350765	198350931	198350852	Y	NA	COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1	NA	NA	NA	NA	HSPE1	11787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	200675242	200675584	200675389	Y	NA	FTCDNL1	NA	NA	NA	NA	FTCDNL1	38312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	200839985	200840279	200840201	Y	NA	C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	TYW5	21526	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	201652202	201652395	201652320	Y	NA	BZW1	BZW1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1	20922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	201978583	201978718	201978642	Y	CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	109	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	202092113	202092210	202092162	Y	CLK1,CLK1,CASP10	CASP10	NA	NA	NA	NA	CASP10	46509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	202522160	202522705	202522330	Y	NA	TMEM237	NA	NA	NA	NA	TMEM237	15867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	202831820	202832017	202831920	Y	ALS2	NA	CDK15,NOP58,FZD7,ALS2,SUMO1	IMR90	Hi-C	24141950	FZD7	65293	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.52535026174006
chr2	203239784	203239912	203239798	Y	NA	BMPR2	NA	NA	NA	NA	BMPR2	125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	203726604	203726681	203726643	Y	FAM117B,CYP20A1,ABI2,ICA1L,ICA1L,ALS2CR8,ALS2CR8	KRT8P15,ICA1L	NA	NA	NA	NA	ICA1L	8027	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	204288063	204288423	204288243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABI2	97121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	204548440	204549024	204548878	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	150307	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	507561	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	208016492	208017045	208016857	Y	CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	12946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr2	210233724	210233884	210233805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	52898	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	212273112	212273708	212273419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	932736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr2	213770329	213770669	213770422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF2	244482	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	215964526	215964926	215964726	Y	NA	ABCA12	NA	NA	NA	NA	ABCA12	36225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	216001903	216002158	216002054	Y	BARD1,ABCA12	ABCA12	NA	NA	NA	NA	ABCA12	752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr2	216158816	216158951	216158871	Y	NA	ATIC	ATIC,ABCA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATIC	15589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	216216233	216216482	216216439	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	41693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	216216979	216217372	216217176	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	42439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	216223263	216223304	216223303	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48723	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	216483720	216484034	216483877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FN1	184825	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	216847055	216847597	216847305	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	49222	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.87897087029962
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.495175587816035
chr2	216867934	216868318	216868147	Y	TMEM169	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	28501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr2	216869710	216869915	216869809	Y	MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	26904	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	216870818	216871425	216871006	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	25394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	216876845	216877231	216877087	Y	MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	19588	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	217106974	217107312	217107143	Y	TMEM169	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC5	136787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	217312390	217312696	217312543	Y	NA	SMARCAL1,RPL37A,AC098820.3	NA	NA	NA	NA	SMARCAL1	37253	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	IGFBP5	NA	NA	NA	NA	AC007563.5	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr2	217557565	217558269	217557956	Y	NA	AC007563.5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	217561099	217561345	217561263	Y	NA	AC007563.5,IGFBP5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	2851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	217876929	217877326	217877128	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	318681	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	218113105	218113304	218113205	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DIRC3	506012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.24446988623777
chr2	218225746	218225904	218225806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	393412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	218230998	218231217	218231116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	388099	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr2	218261138	218261287	218261221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	358029	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.61988051584196
chr2	218475010	218475509	218475247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	143807	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14206745708711
chr2	218518007	218518420	218518200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	100896	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.34486010885122
chr2	218519075	218519229	218519103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	100087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr2	218521142	218521493	218521318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	97823	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr2	218537102	218537529	218537433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	81787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.4774372119259
chr2	218549825	218550302	218550107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	69014	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	12.7326579650554
chr2	218571910	218572214	218572013	Y	NA	DIRC3	NA	NA	NA	NA	DIRC3	47102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.81550361478132
chr2	218714903	218715515	218715204	Y	PNKD,ARPC2,ARPC2	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	95587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.18098199087718
chr2	220460061	220460205	220460133	Y	NA	INHA,OBSL1,STK11IP,SLC4A3	NA	NA	NA	NA	STK11IP	377	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1,AC009502.4	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.4	5650	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	221000091	221000153	221000122	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	AC009502.4	451988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC009502.4	545329	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.77097126193553
chr2	221484317	221484590	221484474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009502.4	936214	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.47898481255486
chr2	221802042	221802413	221802264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	634509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	222312152	222312375	222312261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	124547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr2	222376122	222376296	222376209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	60626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr2	223170887	223171031	223170916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPP2	116205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	223784632	223784923	223784806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	60980	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	223823432	223823602	223823532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE4	90930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr2	224428219	224428432	224428353	Y	NA	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	272312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	224477772	224478078	224477872	Y	NA	NA	AP1S3,KCNE4,SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	222666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr2	225522077	225522236	225522157	Y	NA	NA	FAM124B	IMR90	Hi-C	24141950	CUL3	73967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	225734569	225734902	225734735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	170260	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	225841174	225841410	225841405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	63752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	225864044	225864445	225864307	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	40717	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	226895670	226896158	226895921	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	766317	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr2	226896202	226896600	226896518	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	765875	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	226979861	226980232	226980018	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	682243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr2	226983188	226983709	226983518	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	678766	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.32789700008983
chr2	226985613	226985988	226985800	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	676487	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	226988054	226988110	226988074	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	674365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr2	227002262	227002653	227002458	Y	NA	NA	LOC646736,IRS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	659822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.35076342361739
chr2	227015814	227016273	227016071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS1	646202	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.39803990387452
chr2	227020272	227020467	227020413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS1	642008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.64288563694124
chr2	227389268	227389492	227389368	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	272983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr2	227415451	227415852	227415652	Y	NA	NA	LOC646736,IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	246623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	227586845	227587105	227586929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS1	75370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.76194797292908
chr2	227665142	227665696	227665306	Y	IRS1	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	2667	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.811170607056443
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.42620237126133
chr2	227822351	227822632	227822559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	124054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	228331050	228331499	228331159	Y	NA	AGFG1	AGFG1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	3369	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr2	228950123	228950186	228950154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	615255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	229922941	229923063	229923002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	210938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.98878086859078
chr2	230273013	230273684	230273347	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	139012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr2	231649547	231649844	231649697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BANF1P3	61429	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	232042131	232042529	232042280	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	18731	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD82	93034	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	232256793	232257091	232256822	Y	PTMA,NMUR1,B3GNT7	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD82	66060	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	45708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.17458770518117
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.0885345216472
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.42542917070261
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.0067937059958
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.85797675622603
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.4648071108894
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.26314199961215
chr2	232536483	232536778	232536606	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32827	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.69644127879348
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.12339534371272
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	233951283	233951765	233951418	Y	GIGYF2,DGKD,ATG16L1,INPP5D	NA	NA	NA	NA	NA	NGEF	75301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	234357256	234357513	234357369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	96103	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	234615498	234615635	234615567	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	17245	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	235400661	235400783	235400733	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	2914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	235542442	235542778	235542606	Y	NA	NA	SH3BP4,AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	138745	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	235862299	235862667	235862586	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	3682	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.13529645750364
chr2	235952893	235953060	235952916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	94276	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	236453392	236453640	236453439	Y	NA	AGAP1-IT1	NA	NA	NA	NA	AGAP1-IT1	40997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr2	236842338	236842740	236842449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	231350	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	237481215	237481391	237481283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011286.1	158634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011286.1	156910	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr2	237640726	237641053	237640951	Y	NA	AC011286.1	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011286.1	701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr2	237654357	237654656	237654652	Y	CXCR7	AC011286.1	CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011286.1	14332	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.35165381484702
chr2	237657869	237658188	237658029	Y	NA	AC011286.1	CXCR7	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC011286.1	17844	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	237678524	237678883	237678772	Y	NA	AC011286.1	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011286.1	38499	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	237685373	237686074	237685499	Y	CXCR7	AC011286.1	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011286.1	45348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	237721989	237722187	237722088	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011286.1	81964	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.43575997745224
chr2	237724521	237724572	237724547	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011286.1	84496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr2	237733388	237733732	237733561	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011286.1	93363	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	237764752	237765407	237765371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011286.1	124727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr2	237784498	237784842	237784604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011286.1	144473	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75789632777457
chr2	237897246	237897595	237897363	Y	NA	NA	AGAP1,IQCA1,CXCR7	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	94360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	237933842	237934085	237933935	Y	NA	NA	CXCR7,IQCA1,ASB18	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPS8	57870	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr2	238016795	238017153	238016975	Y	NA	COPS8,AC105760.2	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	24335	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	238173251	238173336	238173294	Y	COL6A3	NA	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	180791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	238384383	238384688	238384583	Y	LRRFIP1	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	7383	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22579777286338
chr2	238391204	238391436	238391383	Y	LRRFIP1,MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.24484660012523
chr2	238392046	238392381	238392184	Y	LRRFIP1,MLPH	NA	NA	NA	NA	NA	MLPH	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.4333434924945
chr2	238396973	238397455	238397139	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	4902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.77384908672
chr2	238398938	238399241	238399144	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	6867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr2	238411273	238411418	238411341	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	19202	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	29670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.677725819164468
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	238596328	238596696	238596497	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	62109	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	238779455	238779579	238779499	Y	RAMP1	RAMP1	NA	NA	NA	NA	RAMP1	13919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	238807318	238807662	238807419	Y	PER2,ILKAP,ESPNL,UBE2F,RAMP1	RAMP1	NA	NA	NA	NA	RAMP1	41782	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	238968617	238969014	238968782	Y	NA	SCLY	NA	NA	NA	NA	SCLY	1087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	239017680	239017839	239017760	Y	ESPNL	KLHL30,FAM132B	NA	NA	NA	NA	KLHL30	27524	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	239085902	239086198	239086162	Y	NA	KLHL30,FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	20279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	239290977	239291159	239291031	Y	NA	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	42224	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	239426928	239427234	239427055	Y	TWIST2	NA	NA	NA	NA	NA	ASB1	93545	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	239593183	239593431	239593307	Y	NA	NA	LOC151171	IMR90	Hi-C	24141950	ASB1	259800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	240238754	240239047	240238989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	82083	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr2	240321591	240321797	240321685	Y	HDAC4	AC062017.1,HDAC4	NA	NA	NA	NA	HDAC4	243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr2	241395144	241395496	241395485	Y	NA	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	AC110619.2	1013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr2	241431316	241431521	241431419	Y	NA	AC110619.2	NA	NA	NA	NA	AC110619.2	37185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	241771658	241772038	241771862	Y	KIF1A	KIF1A	ANKMY1,RNPEPL1,CAPN10,KIF1A,C2orf54,SNED1,PASK,HDLBP,ANO7,PPP1R7	IMR90	Hi-C	24141950	KIF1A	13933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr2	242171569	242171970	242171814	Y	AGXT	ANO7	NA	NA	NA	NA	ANO7	45645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr2	242500447	242500594	242500505	Y	NEU4,BOK	BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	4311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr2	242710043	242710405	242710079	Y	NA	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	38049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr2	242801923	242802843	242802016	Y	NA	AC131097.3	NA	NA	NA	NA	AC131097.3	18671	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr2	242833644	242833731	242833683	Y	NA	AC131097.3	NA	NA	NA	NA	AC131097.3	12130	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr20	351057	351207	351131	Y	NA	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	8054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.09481368324232
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98135059303794
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	FAM110A	NA	NA	NA	NA	FAM110A	10670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr20	1083260	1083345	1083304	Y	SCRT2	PSMF1	RSPO4	IMR90	Hi-C	24141950	PSMF1	8561	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	1119535	1119804	1119673	Y	NA	PSMF1	NA	NA	NA	NA	PSMF1	27629	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	24402	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	1338546	1338920	1338732	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	30663	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	3779808	3780100	3779895	Y	PANK2,PANK2,CDC25B	C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	14230	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr20	3788108	3788452	3788409	Y	NA	C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	22530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	4090299	4090467	4090408	Y	SMOX	SMOX	LOC728228,PANK2,MIR103B2,ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	9160	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr20	4674724	4674919	4674762	Y	NA	PRNP	NA	NA	NA	NA	PRNP	9842	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	7058177	7058257	7058218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-775C13.1	865831	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr20	7978054	7978163	7978110	Y	NA	TMX4	NA	NA	NA	NA	TMX4	20313	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	8350099	8350497	8350131	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	239275	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	8380615	8380981	8380808	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	269791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	8408277	8408546	8408511	Y	TMX4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	297453	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	8437471	8437869	8437556	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	326647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	353789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr20	9378451	9378962	9378838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	331041	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	10471502	10471750	10471599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	58632	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr20	10585324	10585599	10585462	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	39415	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	13427146	13427424	13427285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	190163	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	13705752	13706023	13705888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	57509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	13757612	13757978	13757886	Y	NA	ESF1	NA	NA	NA	NA	ESF1	5554	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	14769224	14769434	14769329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	452962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	15888913	15889317	15889175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	662761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr20	17538189	17538505	17538334	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	BFSP1	9360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	18700394	18700719	18700556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	133857	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.995291145446165
chr20	19005334	19005751	19005629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	185539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.96944947924702
chr20	19194656	19195454	19194994	Y	NA	SLC24A3	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	3366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	19243504	19243879	19243692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	52214	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	19323791	19324082	19323937	Y	SLC24A3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	132501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	19408281	19408453	19408368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	216991	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39998605774476
chr20	19638978	19639033	19639006	Y	C20orf26	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	97319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	19660392	19660672	19660518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	75680	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	19716018	19716528	19716293	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	19824	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr20	19717747	19718119	19717916	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	18233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr20	22788362	22788588	22788490	Y	NA	NA	NXT1,THBD	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	239790	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	23087078	23087428	23087253	Y	CD93,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	58700	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	23347147	23347295	23347221	Y	THBD,CD93,GZF1	NXT1,RP3-322G13.7,RP3-322G13.5,GZF1	NA	NA	NA	NA	GZF1	6360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	24137887	24138185	24138103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CST5	279500	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	24452235	24452353	24452295	Y	TMEM90B	SYNDIG1	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	4400	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	24947572	24947946	24947787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS1	89670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.95077736587264
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr20	25273617	25273934	25273643	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	46912	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	25305837	25305970	25305904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	63649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	25838960	25839094	25839045	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	109106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	25846181	25846562	25846485	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	116327	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.618969484770045
chr20	30104625	30104737	30104681	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	4394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	30305141	30305549	30305422	Y	PLAGL2,HCK	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	4243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	30793339	30793589	30793452	Y	HCK,TM9SF4,PLAGL2	TSPY26P,PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	PLAGL2	5	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	31045263	31045487	31045417	Y	KIF3B	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	101108	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	31126528	31126767	31126720	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	44109	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr20	32966378	32966977	32966403	Y	GGT7	ITCH	NA	NA	NA	NA	ITCH	17337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	33491673	33492056	33491689	Y	TP53INP2,ACSS2	ACSS2,GGT7,GSS	NA	NA	NA	NA	GGT7	33010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	33769921	33770187	33770054	Y	NA	PROCR,MT1P3	NA	NA	NA	NA	PROCR	12045	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.10474593675067
chr20	34790985	34791133	34791034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	101125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	35102828	35103254	35103050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-977B1.7	96540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	35213949	35214340	35214145	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	TGIF2	14058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	35239893	35239986	35239939	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	7756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.37974363732908
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	35633884	35634240	35634054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	55638	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	35976271	35976569	35976418	Y	NA	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	5183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	36621379	36621533	36621455	Y	NNAT,VSTM2L	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	38337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr20	37751909	37752078	37752003	Y	NA	NA	LOC339568	IMR90	Hi-C	24141950	DHX35	162967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.529379200482229
chr20	38988320	38988484	38988394	Y	MAFB	NA	MAFB	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAFB	327396	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	39190771	39191062	39190839	Y	TOP1,MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	124818	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	40247725	40248017	40247738	Y	NA	CHD6	NA	NA	NA	NA	CHD6	2592	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr20	40466540	40466641	40466591	Y	NA	NA	PTPRT	IMR90	Hi-C	24141950	CHD6	221407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	RPL27AP,MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL27AP	6898	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.55763042694835
chr20	42545648	42546044	42545953	Y	NA	TOX2	NA	NA	NA	NA	TOX2	4144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	42828501	42828745	42828623	Y	NA	OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	8855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	42847207	42847559	42847248	Y	NA	OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	9607	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	42948601	42948866	42948737	Y	NA	FITM2	GDAP1L1,FITM2,C20orf111,LOC100505783,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FITM2	10792	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	43181922	43182397	43182243	Y	SERINC3	SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	PKIG	23496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	43321614	43322020	43321838	Y	WISP2,KCNK15	ADA,WISP2	LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WISP2	19465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.670274903769335
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.35205236808831
chr20	43569969	43570092	43570031	Y	RBPJL,TP53TG5,STK4	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	17035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	43709360	43709760	43709560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK4	116245	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr20	43972131	43972359	43972259	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	2705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr20	44622132	44622355	44622242	Y	CD40,ZNF335	ZNF335,MMP9,SLC12A5	ZNF335,MMP9,SLC12A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	MMP9	13192	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr20	44658598	44659307	44659051	Y	NA	MMP9,SLC12A5	NA	NA	NA	NA	SLC12A5	10242	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	45599929	45600258	45600137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA2	78666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr20	45825158	45825275	45825178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1050K3.3	126654	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.10357418295066
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.759865188057151
chr20	45943818	45944172	45944095	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	35133	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.492034973733454
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	16091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.8163222281647
chr20	45988883	45989283	45988988	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5316	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.80402376064402
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	33.1562533144379
chr20	46067688	46067974	46067774	Y	NCOA3	NA	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	60627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr20	46067997	46068157	46068096	Y	NCOA3	NA	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	60444	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.46865400580523
chr20	46082300	46082410	46082355	Y	NA	NCOA3	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	46191	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	46116511	46116614	46116567	Y	NCOA3	NCOA3	NCOA3,ZMYND8,EYA2	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	11987	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	46122337	46122452	46122395	Y	NA	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NCOA3	6149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	46239342	46239637	46239413	Y	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA3	110741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.24993336807806
chr20	46316176	46316372	46316269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	96988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr20	46320177	46320280	46320230	Y	SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	93080	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr20	46351193	46351379	46351286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	61981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr20	46355529	46356013	46355849	Y	SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	57347	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	46356086	46356757	46356412	Y	SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	56603	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	46369453	46369926	46369648	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	43434	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	46390354	46390743	46390546	Y	NA	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	22617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	46394797	46395044	46394952	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	18316	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr20	46417679	46418052	46417809	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	4319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.38653734332488
chr20	46419082	46419263	46419121	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	5722	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32618799547683
chr20	46420724	46421103	46420967	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	7364	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr20	46429440	46429610	46429525	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	16080	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	46430567	46430747	46430684	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	17207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.26314199961215
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.99175404469233
chr20	46618615	46619022	46618889	Y	NA	NA	SULF2,CMTM7,BCAS1	MCF7	ChIA-PET	22265404,19890323	SULF2	205255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	13.4957343455299
chr20	46620419	46620799	46620546	Y	NA	NA	SULF2,CMTM7,BCAS1	MCF7	ChIA-PET	22265404,19890323	SULF2	207059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.84685004250535
chr20	46620819	46621265	46621146	Y	NA	NA	SULF2,CMTM7,BCAS1	MCF7	ChIA-PET	22265404,19890323	SULF2	207459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.6397479564872
chr20	46632163	46632260	46632228	Y	SULF2	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	218803	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	46641368	46641640	46641447	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	228008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98812159262141
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr20	46704624	46705027	46704821	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00494	281666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.06152110164805
chr20	46705616	46705776	46705742	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00494	280917	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr20	46800515	46800803	46800725	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00494	185890	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	46808866	46809145	46808965	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00494	177548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.13489790426236
chr20	47316327	47316412	47316396	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	126008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	47339273	47339687	47339536	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	102733	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	47376585	47377468	47377050	Y	STAU1,PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	64952	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	47379085	47379213	47379130	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	63207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	47390467	47391044	47390713	Y	STAU1,PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	51376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	47391442	47391734	47391549	Y	STAU1,PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	50686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr20	47397993	47398168	47398081	Y	NA	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	44252	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	47400245	47400718	47400585	Y	ZNFX1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	41702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	47407398	47407765	47407606	Y	NA	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	34655	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	47434951	47435381	47435210	Y	ZNFX1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	7039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	47439402	47439940	47439658	Y	ZNFX1,STAU1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	2480	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr20	47443501	47443751	47443699	Y	NA	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	1081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.614258563646172
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr20	48221158	48221415	48221229	Y	PTGIS	NA	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	B4GALT5	107000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	48532841	48533167	48533004	Y	SPATA2,SPATA2	SPATA2,RNF114	NA	NA	NA	NA	SPATA2	2761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr20	48533898	48534043	48533948	Y	B4GALT5,SLC9A8,CEBPB,SPATA2,SNAI1,RNF114	SPATA2,RNF114	NA	NA	NA	NA	SPATA2	3818	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr20	48664895	48665291	48665189	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	NA	SNAI1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2V1	65205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	48707582	48707967	48707775	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	22529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	48726581	48727101	48726820	Y	SPATA2,SPATA2	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	3395	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.574174342626138
chr20	48770876	48771106	48770991	Y	NA	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189	2541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	48809447	48810205	48810164	Y	B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	4071	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	48900220	48901229	48900600	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	94844	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	48901354	48901524	48901384	Y	NA	NA	PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	95978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.37974363732908
chr20	49032230	49032497	49032297	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	92394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	49057048	49057261	49057196	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	67630	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr20	49133154	49133451	49133362	Y	CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	8263	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	49134968	49135201	49135019	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	10077	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	49157621	49157908	49157761	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	32730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	49170357	49170595	49170426	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	45466	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	49286898	49287066	49286958	Y	NA	NA	PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,EYA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARD6B	59015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr20	49306526	49306915	49306601	Y	NA	PARD6B	PARD6B,PTPN1,EYA2,MIR645	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARD6B	39166	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	49341306	49341865	49341532	Y	NA	PARD6B	NCOA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARD6B	4216	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.41355076332402
chr20	49343968	49344383	49344182	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	1698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.30636683471477
chr20	49345638	49345902	49345710	Y	MOCS3,PARD6B	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.05001854109841
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.89164518464926
chr20	49350102	49350473	49350150	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	4021	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.16230987750279
chr20	49358421	49358698	49358635	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	12340	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.68177746431897
chr20	49378032	49378227	49378094	Y	PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	31204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.3524951346427
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	27.1037806673064
chr20	49406894	49407134	49407016	Y	NA	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	2297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	12.7565827760344
chr20	49430215	49430240	49430227	Y	PARD6B,BCAS4,ADNP	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	20784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.50105826273991
chr20	49454379	49454475	49454388	Y	NA	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	44948	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	49487134	49487591	49487436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	57930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	49553399	49553600	49553500	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	7441	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.572604035584846
chr20	49582344	49582455	49582393	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	8981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	49598879	49599145	49599015	Y	PTPN1	DPM1,MOCS3,KCNG1	NA	NA	NA	NA	MOCS3	25516	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	49650336	49650514	49650422	Y	NA	KCNG1	KCNG1,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCNG1	12670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr20	49947847	49948420	49948354	Y	NA	NA	KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3	IMR90	Hi-C	24141950	NFATC2	228950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	50033542	50033860	50033623	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	143510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	50063853	50064072	50063963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	113298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	50072988	50073809	50073517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	103561	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.04809509364051
chr20	50141744	50142683	50142582	Y	NA	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	34687	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	50178083	50178314	50178273	Y	NA	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	75345	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	50361169	50361338	50361278	Y	NA	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	12097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.835723328784669
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.45080050581422
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.32384535493534
chr20	50416342	50416699	50416509	Y	NA	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	50601567	50601698	50601647	Y	NA	NA	ATP9A,SALL4,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SALL4	184508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr20	50664352	50664405	50664395	Y	NA	NA	ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	154442	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	50665033	50665229	50665099	Y	NA	NA	ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	153618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	51962199	51962423	51962230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	262023	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	52195343	52195714	52195527	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	28732	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.08488142973398
chr20	52196593	52196861	52196746	Y	TSHZ2,ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39122555803642
chr20	52212842	52213180	52212942	Y	ZNF217	ZNF217	BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	11266	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	52238527	52238650	52238555	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	14081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75044541237944
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	10.5073313903381
chr20	52256215	52256545	52256380	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	31769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr20	52268867	52269118	52269044	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	44421	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	52271592	52271787	52271702	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	47146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	24.8725214791728
chr20	52277634	52277772	52277670	Y	NA	NA	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	53188	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	52294676	52294905	52294769	Y	NA	NA	BMP7,SUMO1P1,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	70230	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	52333135	52333286	52333219	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,ZNF217	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	108689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22579777286338
chr20	52364781	52365137	52364834	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	140335	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr20	52374184	52374569	52374228	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	149738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.53577435323674
chr20	52390351	52390640	52390407	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	165905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.34448426202226
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr20	52407558	52407732	52407573	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	183112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.18529229218973
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220134	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	52445043	52445455	52445100	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85755669608394
chr20	52456095	52456522	52456189	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	231649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr20	52480421	52480878	52480693	Y	ZNF217,PFDN4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	255975	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	34.3359962993366
chr20	52481702	52482101	52481977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	257256	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	18.4346670446318
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	33.8804151611223
chr20	52483715	52484176	52483911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	259269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	52489475	52489586	52489523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	265029	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	52514730	52515023	52514955	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	273489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	52531977	52532203	52532002	Y	NA	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	256309	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	255623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.01112671372068
chr20	52684102	52684485	52684350	Y	PFDN4	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	104027	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.12351340144215
chr20	52685158	52685357	52685239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	103155	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85755669608394
chr20	52701459	52701889	52701687	Y	NA	NA	CYP24A1,SULF2,DOK5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	86623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr20	52718989	52719002	52718996	Y	NA	NA	PFDN4,SULF2,CYP24A1,DOK5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	69510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chr20	52726626	52726868	52726743	Y	CYP24A1	NA	CYP24A1,DOK5	IMR90	Hi-C	24141950	CYP24A1	61644	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	52730221	52730319	52730270	Y	NA	NA	CYP24A1,DOK5,BMP7,SULF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	58193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	52732445	52732648	52732547	Y	NA	NA	CYP24A1,DOK5,BMP7,SULF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	55864	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr20	52738263	52738706	52738357	Y	NA	CYP24A1	DOK5,SULF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	49806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	CYP24A1	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	47875	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.98097474620899
chr20	52743384	52744045	52743713	Y	NA	CYP24A1	DOK5,PTPRT,SULF2,CYP24A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	44467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr20	52749215	52749597	52749386	Y	NA	CYP24A1	DOK5	IMR90	Hi-C	24141950	CYP24A1	38915	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr20	52784442	52785020	52784595	Y	PFDN4	CYP24A1,PFDN4	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	3492	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	52811815	52812290	52812012	Y	NA	CYP24A1,PFDN4	SULF2,DOK5,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PFDN4	10096	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr20	52812299	52812959	52812479	Y	NA	CYP24A1,PFDN4	SULF2,DOK5,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PFDN4	9427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04167723447366
chr20	52831217	52831490	52831439	Y	NA	CYP24A1,PFDN4	NA	NA	NA	NA	PFDN4	8831	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	53716299	53716500	53716400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	893913	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	54729980	54730207	54730095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210B	201764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	55379556	55380011	55379738	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMAP6	104986	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr20	55825592	55825967	55825782	Y	NA	BMP7	NA	NA	NA	NA	BMP7	13718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.14286336405816
chr20	55880789	55880965	55880877	Y	BMP7	BMP7,RAE1	NA	NA	NA	NA	BMP7	41104	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.574174342626138
chr20	55964119	55964506	55964297	Y	ZBP1,MTRNR2L3,RBM38	RAE1,MTRNR2L3	NA	NA	NA	NA	RBM38	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr20	55965649	55965902	55965759	Y	NA	RAE1,MTRNR2L3,RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	1186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	55985197	55985345	55985270	Y	RBM38,ZBP1	RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	20734	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	56010646	56011025	56010972	Y	NA	RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	46183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	56032255	56032633	56032497	Y	NA	HMGB1P1	MIR5095,CTCFL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HMGB1P1	29450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr20	56232830	56233085	56232989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	51507	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	56247287	56247513	56247399	Y	PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	37079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	56255217	56255759	56255498	Y	ZBP1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	28833	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr20	56291330	56291601	56291401	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	6738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr20	56323662	56324029	56323724	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	39070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.37974363732908
chr20	56550215	56550469	56550425	Y	NA	NA	ZBP1,CTCFL,PCK1,PMEPA1	IMR90	Hi-C	24141950	PMEPA1	265623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	56566291	56566641	56566399	Y	NA	NA	ZBP1,PMEPA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PMEPA1	281699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr20	56983736	56983744	56983737	Y	NA	VAPB	NA	NA	NA	NA	VAPB	21558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	57186271	57186506	57186395	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	37822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.64443323757019
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.73648215355889
chr20	57228113	57228577	57228221	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	3623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	CTSZ,ATP5E	NA	NA	NA	NA	CTSZ	22091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	57670365	57670649	57670522	Y	NA	NA	ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	54401	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	57741298	57741742	57741512	Y	ZNF831	NA	ZNF831,SLMO2-ATP5E,GNAS-AS1,GNAS	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	125334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	54923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	58459134	58459312	58459218	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177	SYCP2	NA	NA	NA	NA	SYCP2	47398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	58632319	58632618	58632585	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	118967	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	58803424	58803657	58803451	Y	PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	290072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.05119029489842
chr20	60803093	60803442	60803179	Y	NA	HRH3,OSBPL2	NA	NA	NA	NA	OSBPL2	8138	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr20	60874912	60875240	60875071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRM1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.42859042462749
chr20	61001783	61002051	61001918	Y	NA	RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	21442	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr20	61057611	61057886	61057678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES2	77270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	61283206	61283870	61283565	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	11409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr20	61335955	61336196	61336080	Y	NA	NA	C20orf20,LOC100652730,SLCO4A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLCO4A1	64158	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.96474062469319
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr20	61822824	61823015	61822948	Y	NA	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	22571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	62113410	62113704	62113637	Y	ZNF512B,EEF1A2	RP11-358D14.2,KCNQ2,EEF1A2,PPDPF	NA	NA	NA	NA	KCNQ2	11417	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr20	62150785	62151100	62150943	Y	CHRNA4,KCNQ2,STMN3,EEF1A2	KCNQ2,EEF1A2,PPDPF,PTK6	NA	NA	NA	NA	PPDPF	708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr20	62170184	62170345	62170251	Y	YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195	EEF1A2,PPDPF,PTK6	NA	NA	NA	NA	PTK6	3461	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.48697297876299
chr20	62176586	62176848	62176717	Y	NA	EEF1A2,PPDPF,PTK6	NA	NA	NA	NA	PTK6	9863	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	ZGPAT	22592	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr20	62461535	62461811	62461587	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2	PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,ABHD16B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBTB46	938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr20	62466212	62466776	62466445	Y	OPRL1,ABHD16B	ZBTB46,TPD52L2	PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,ABHD16B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBTB46	5615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	10.9312198614672
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	11063933	11064260	11064086	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	32720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	11082328	11082591	11082458	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	14389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	11090314	11090328	11090319	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	6652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	11099662	11099866	11099764	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	2682	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	11122554	11122900	11122727	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	25574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	11128400	11128724	11128645	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	31420	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	11174514	11174910	11174556	Y	NA	NA	BAGE5,TPTE	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	77534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	16238708	16238887	16238795	Y	NRIP1	NA	NRIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRIP1	196434	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	16251857	16252256	16251994	Y	SAMSN1,NRIP1	NA	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	NRIP1	183065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr21	16431175	16431558	16431528	Y	NA	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	3763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	16435480	16435873	16435862	Y	NRIP1	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	159	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	519825	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	22572618	22572960	22572789	Y	NCAM2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	203985	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr21	26960524	26960778	26960645	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	17051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	27285950	27286116	27286033	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	179966	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	28218728	28219247	28219071	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	3000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr21	29186148	29186441	29186404	Y	NA	NA	LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	849316	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	29476694	29476903	29476871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	778790	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	30006167	30006692	30006407	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	249001	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	30274097	30274402	30274148	Y	NA	N6AMT1	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	18404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.79641230832335
chr21	30390843	30391016	30390919	Y	NA	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	NA	NA	NA	NA	RWDD2B	1144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	30528025	30528174	30528089	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	22786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	30567218	30567411	30567380	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	2826	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	30567933	30569654	30568878	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	3541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr21	30591516	30591874	30591674	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	27124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	30675702	30676052	30675894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	111310	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr21	30751100	30751464	30751308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	186708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.854395442159057
chr21	30754427	30754628	30754578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	190035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.06114525481909
chr21	30758449	30758782	30758692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	194057	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.18623706386955
chr21	30802537	30802636	30802587	Y	NA	NA	C21orf7	IMR90	Hi-C	24141950	BACH1	238145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	32556885	32557051	32556941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	372507	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	33042550	33042842	33042696	Y	NA	SOD1,SNORA81	NA	NA	NA	NA	SNORA81	7931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	33104933	33105321	33105127	Y	NA	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	2545	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	33105563	33105881	33105775	Y	SCAF4	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	3175	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr21	33893754	33894020	33893930	Y	C21orf63	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf59	89156	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	34383763	34384240	34383948	Y	IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1	OLIG2	OLIG1	IMR90	Hi-C	24141950	OLIG2	11913	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr21	34408839	34409098	34408898	Y	IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1	OLIG2	NA	NA	NA	NA	OLIG2	12686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr21	35574029	35574459	35574413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	130159	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	36220749	36221095	36220890	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	235308	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	237131	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	247775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	438201	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr21	36604888	36605215	36605097	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCAN1	619447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	37485408	37485566	37485491	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	19644	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	18991	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr21	37529889	37530052	37529971	Y	DOPEY2	CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	DOPEY2	2809	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr21	38346647	38347014	38346835	Y	NA	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	9835	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	38500086	38500176	38500125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC3	56560	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.23137724586306
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.54767546702766
chr21	39135127	39135274	39135173	Y	KCNJ6	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	399035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	39189154	39189496	39189325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	453062	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	39678263	39678712	39678528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	496519	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	39715625	39715930	39715831	Y	ERG	NA	KCNJ15,KCNJ6,DSCR8	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	459301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr21	39866663	39867062	39866792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	308169	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	39867622	39867911	39867841	Y	ERG	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	307320	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	40159439	40159794	40159507	Y	NA	ETS2	ETS2,LINC00114	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ETS2	15437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr21	40278958	40279421	40279192	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	103727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	40338093	40338255	40338153	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,PSMG1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	162862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.09485702949696
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr21	40689481	40689668	40689601	Y	BRWD1	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	1817	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	40691878	40692008	40691991	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	40716228	40716377	40716303	Y	NA	BRWD1,HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	HMGN1	3196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	40860443	40860729	40860586	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	SH3BGR	44662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	41441424	41441816	41441699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCP4	204181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	41524041	41524191	41524116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCAM-AS1	228819	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	41692592	41693050	41692776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCAM-AS1	59960	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75946663481586
chr21	41696342	41696651	41696581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCAM-AS1	56359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr21	41707713	41708038	41707827	Y	NA	DSCAM-AS1	NA	NA	NA	NA	DSCAM-AS1	44972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.58897685467237
chr21	41712304	41712672	41712472	Y	NA	DSCAM-AS1	NA	NA	NA	NA	DSCAM-AS1	40338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.65593579811983
chr21	41729839	41730224	41730032	Y	NA	DSCAM-AS1	NA	NA	NA	NA	DSCAM-AS1	22786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	41759918	41760275	41760196	Y	NA	DSCAM-AS1	NA	NA	NA	NA	DSCAM-AS1	6908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.995291145446165
chr21	42212691	42212879	42212820	Y	DSCAM	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	324849	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr21	42213096	42213280	42213166	Y	DSCAM	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	324448	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr21	42485232	42485526	42485376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	52202	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	42879173	42879227	42879200	Y	FAM3B,TMPRSS2,TMPRSS2	TMPRSS2,SNORA32	NA	NA	NA	NA	TMPRSS2	21816	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.33808910926775
chr21	42880678	42881074	42881005	Y	TMPRSS2,TMPRSS2	TMPRSS2,SNORA32	NA	NA	NA	NA	TMPRSS2	19969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	43477244	43477358	43477313	Y	NA	NA	ZNF295,UMODL1,C2CD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	C2CD2	105245	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.65005518976599
chr21	43730278	43730819	43730757	Y	NA	TFF3,TFF2	NA	NA	NA	NA	TFF3	2942	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	43758079	43758185	43758132	Y	NA	TFF3,TFF2,TFF1	NA	NA	NA	NA	TFF2	11052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	43784554	43784935	43784758	Y	NA	TFF2	NA	NA	NA	NA	TFF1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.87337162451616
chr21	44355985	44356328	44356154	Y	NA	PKNOX1	U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	PKNOX1	36292	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	44752617	44753007	44752874	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	92001	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.01986657358673
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	84095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr21	44764269	44764611	44764455	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	80397	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H2BFS	64669	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	45927	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.46593465137627
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	37534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.20476031253516
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr21	45235037	45235392	45235184	Y	NA	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	27643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr21	45337582	45337952	45337767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT3	54515	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	45358133	45358224	45358178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	71976	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10,H2AFZP1	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr21	45528208	45528453	45528331	Y	NA	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	PWP2	3037	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	45616099	45616530	45616288	Y	PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	ICOSLG	AIRE,PFKL,C21orf33,PWP2,ICOSLG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ICOSLG	42319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	45627966	45628150	45628090	Y	NA	ICOSLG	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	30699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	45790273	45790500	45790387	Y	TRAPPC10,ICOSLG,TRPM2	C21orf2	NA	NA	NA	NA	C21orf2	32988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	31919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	46129789	46130121	46129955	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	294	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	46185657	46185775	46185721	Y	NA	UBE2G2	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	34159	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr21	46295070	46295864	46295519	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	3318	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	46349799	46350126	46349963	Y	KRTAP10-12	FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	7799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	46749567	46749782	46749739	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	43754	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.73652756638356
chr21	46749941	46750271	46750188	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	44128	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr21	46831544	46831752	46831652	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	8492	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	46836537	46836812	46836569	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	13485	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr21	46850245	46850628	46850488	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	27193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr21	46891281	46891413	46891347	Y	NA	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	68229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	46894520	46894647	46894596	Y	COL18A1	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	67678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	47167832	47168236	47167895	Y	NA	NA	PCBP3,LOC100129027	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	106224	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.696397932538855
chr21	47191109	47191365	47191237	Y	NA	NA	LOC100129027,SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	129501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr21	47637534	47637799	47637667	Y	NA	LSS,MCM3AP-AS1	NA	NA	NA	NA	LSS	8939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr21	47651317	47651563	47651562	Y	NA	LSS,MCM3AP-AS1	NA	NA	NA	NA	MCM3AP-AS1	4186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr22	17722377	17722633	17722505	Y	CECR2,BCL2L13,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	50551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	18921428	18921794	18921531	Y	MICAL3,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	272	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	19074552	19074704	19074618	Y	NA	DGCR2	NA	NA	NA	NA	DGCR2	33263	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.07654099016773
chr22	19337870	19338225	19337898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	60631	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L,AC000078.5	NA	NA	NA	NA	AC000078.5	3125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	19874514	19874924	19874610	Y	TRMT2A,C22orf29,GNB1L	C22orf29,GNB1L,AC000078.5	GNB1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC000078.5	1702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	19883943	19884390	19884320	Y	NA	C22orf29,GNB1L,AC000078.5,COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	AC000078.5	11131	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr22	19946850	19947150	19946987	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	19509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.59087759571795
chr22	20009239	20009629	20009574	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	6908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	XXbac-B444P24.10	1760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	21221716	21221966	21221814	Y	NA	SNAP29,PI4KA,CRKL	NA	NA	NA	NA	PI4KA	10011	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	21273214	21273312	21273263	Y	NA	CRKL,XXbac-B135H6.15	NA	NA	NA	NA	CRKL	3500	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.61857093152876
chr22	22187099	22187411	22187395	Y	PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	32559	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	22231244	22231441	22231355	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	PPM1F	K562	ChIA-PET	22265404	MAPK1	11274	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	22334723	22335115	22334952	Y	NA	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	TOP3B	98	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	MMP11,CHCHD10,SMARCB1,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	SMARCB1	26138	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.57656119648077
chr22	24603797	24604355	24604162	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	28570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	13631	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	24870306	24870552	24870389	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	58459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	53550	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr22	25463993	25464364	25464309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD56	168812	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	322457	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	29194018	29194404	29194339	Y	NA	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	XBP1	181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.17381243805242
chr22	29206791	29206989	29206921	Y	EMID1,CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	XBP1	K562	ChIA-PET	22265404	CTA-292E10.6	12120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr22	29209751	29210048	29209892	Y	CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	15080	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.55198576834021
chr22	29215471	29215733	29215666	Y	XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,CHEK2,HSCB,C22orf31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	20800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr22	29218930	29219398	29218977	Y	NA	XBP1,CTA-292E10.6	TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,HSCB,CHEK2,C22orf31	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	24259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.811170607056443
chr22	29605025	29605391	29605212	Y	EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	5185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr22	29730982	29731069	29731026	Y	NA	GAS2L1,RASL10A	NA	NA	NA	NA	RASL10A	17314	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	29877762	29878123	29877961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP1B1	60594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	30014203	30014547	30014300	Y	NA	NIPSNAP1,NF2	NA	NA	NA	NA	NF2	16658	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	30390990	30391309	30391217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR3	113846	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	30440424	30440670	30440589	Y	MTMR3,OSM,CCDC157	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR3	163280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	30608541	30609106	30608754	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	NA	NA	NA	NA	NA	GATSL3	74510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr22	30621962	30622192	30622089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATSL3	61424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	30721148	30721367	30721290	Y	MTMR3,OSM,SLC35E4,TBC1D10A	GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1	NA	NA	NA	NA	TBC1D10A	113	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr22	30808332	30808723	30808528	Y	NA	SEC14L2,RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	RNF215	7037	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	31278490	31278624	31278556	Y	SEC14L4	NA	NA	NA	NA	NA	MORC2	83660	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	31854917	31854933	31854925	Y	NA	SFI1,EIF4ENIF1	NA	NA	NA	NA	SFI1	27741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	32957010	32957396	32957188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	88347	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.618969484770045
chr22	32970558	32970778	32970668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	101895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	33091404	33091880	33091552	Y	TIMP3,SYN3	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	103807	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	33199078	33199894	33199157	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	3391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr22	33202022	33202333	33202121	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	6335	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	33202971	33203258	33203149	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	7284	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr22	33226594	33226824	33226709	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	30907	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	33248825	33249077	33248981	Y	SYN3	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	53138	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	33252376	33252746	33252411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	56689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	33265683	33265702	33265692	Y	TIMP3	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	69996	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr22	33446975	33447060	33447003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	251288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	34055725	34056096	34055879	Y	NA	SNORA76	NA	NA	NA	NA	SNORA76	42810	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr22	34073272	34073505	34073390	Y	NA	SNORA76	NA	NA	NA	NA	SNORA76	25401	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr22	34167018	34167152	34167086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	68112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	34249918	34249944	34249938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	151012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr22	34317541	34317731	34317667	Y	LARGE	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	218635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr22	35983528	35983815	35983759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM5	189472	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.679296126205757
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	36310688	36310985	36310744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	111488	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	36448788	36448904	36448856	Y	NA	RBFOX2	RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	26315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	36728624	36729163	36728912	Y	IFT27	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	52900	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr22	36748222	36748386	36748297	Y	NA	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	33677	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	36753062	36753318	36753212	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	28745	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	36763287	36763361	36763324	Y	NA	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	18702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.86589800270869
chr22	36855477	36855678	36855599	Y	NA	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	6486	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	9245	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.715070045913242
chr22	37428831	37429188	37428927	Y	CARD10,TMPRSS6,TST,MPST	MPST,TST,KCTD17	KCTD17,TMPRSS6	IMR90	Hi-C	24141950	TST	15150	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.10041292902578
chr22	37484097	37484413	37484195	Y	IL2RB	KCTD17,TMPRSS6	NA	NA	NA	NA	TMPRSS6	19190	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr22	37585028	37585323	37585113	Y	NA	C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	8102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	37702859	37703284	37702965	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	109434	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	37714418	37714696	37714539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELFN2	106809	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	37731445	37731637	37731610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELFN2	89868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	37997690	37997947	37997695	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GGA1	4534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	38434638	38434982	38434731	Y	NA	PICK1	BAIAP2L2,LOC400927,KCNJ4,DMC1	IMR90	Hi-C	24141950	PICK1	15336	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr22	38705287	38705445	38705426	Y	NA	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	38247	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	38711439	38711868	38711815	Y	SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	44399	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.5638641757188
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	39635664	39635940	39635710	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	2816	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	39637977	39638270	39638005	Y	MGAT3,MGAT3,SUN2,SUN2,NPTXR,CBX7,SYNGR1,PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	486	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	39698105	39698354	39698234	Y	NA	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	16040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr22	39760819	39761142	39760964	Y	CBX7,SYNGR1	RPL3,SYNGR1,TAB1	NA	NA	NA	NA	SYNGR1	16889	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	40680802	40681181	40680841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSL	59326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.79367024748206
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.32867140016008
chr22	41080878	41081122	41080979	Y	NA	GAPDHP37	NA	NA	NA	NA	GAPDHP37	12423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	41105876	41106003	41105936	Y	EP300	GAPDHP37	MKL1,MCHR1,SLC25A17,ST13,XPNPEP3,DNAJB7	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP37	37421	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	41128851	41129054	41128911	Y	NA	NA	XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP37	60396	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr22	41416837	41417114	41416960	Y	NA	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	40942	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.42976217842749
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.17941168383589
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.35793297644215
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr22	42327988	42328313	42328152	Y	NA	CENPM,SEPT3	TNFRSF13C	MCF7	ChIA-PET	22265404	CENPM	12855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	42736832	42736915	42736874	Y	SEPT3	Z83851.1	LOC100132273,NDUFA6,TCF20,CYP2D6,LOC388906	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	Z83851.1	26327	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr22	43075486	43075676	43075580	Y	NFAM1,ARFGAP3	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	CYB5R3	31912	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	43076677	43076928	43076817	Y	NFAM1,ARFGAP3	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	CYB5R3	33103	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	43100819	43101017	43100994	Y	NA	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	14287	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	43116155	43116318	43116237	Y	CYB5R3,A4GALT	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	43130388	43130736	43130634	Y	NA	A4GALT	CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2	IMR90	Hi-C	24141950	A4GALT	15084	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.39527720319092
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	43315293	43315433	43315381	Y	NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	63181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	43409761	43409918	43409853	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	45106642	45106985	45106689	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	10287	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr22	45403389	45403735	45403573	Y	KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B	PHF21B	NA	NA	NA	NA	PHF21B	145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	45501114	45501367	45501144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	56295	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83888458270955
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WI2-85898F10.1,WNT7B	NA	NA	NA	NA	WI2-85898F10.1	43738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	46330758	46331082	46331012	Y	NA	WI2-85898F10.1,WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	39927	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83888458270955
chr22	46370456	46370600	46370533	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3157	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.10041292902578
chr22	46771050	46771392	46771204	Y	NA	TRMU	NA	NA	NA	NA	TRMU	46278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.26588406045345
chr22	46928379	46928595	46928487	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	2472	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr22	46934347	46934575	46934459	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr22	46934777	46935027	46934877	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3710	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr22	46935060	46935431	46935290	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3993	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	46970983	46971382	46971054	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	1074	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.90912283781131
chr22	46992036	46992348	46992220	Y	NA	GRAMD4	CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	22127	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	47045339	47045722	47045527	Y	PPARA,TTC38	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD4	75430	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	47173530	47173804	47173706	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	17012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	47250044	47250415	47250236	Y	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	93526	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.00548412168259
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	RP11-191L9.4	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-191L9.4	10218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	48185959	48186142	48186052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	160536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	49031660	49032049	49031799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	1006237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	453587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr22	50262824	50262951	50262946	Y	TUBGCP6,MLC1	BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	17334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	50324610	50324932	50324739	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	14504	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr22	50341970	50342055	50341995	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	10106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.97348048455923
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.873067555533447
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.84565764886305
chr22	50667232	50667412	50667320	Y	NA	TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11	NA	NA	NA	NA	TUBGCP6	14009	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.48695027235066
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	50891150	50891343	50891221	Y	MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2	NA	NA	NA	NA	SBF1	20111	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,CTA-384D8.31,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	4415	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	3219649	3219829	3219819	Y	NA	CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	4468384	4468713	4468579	Y	NA	SUMF1	NA	NA	NA	NA	SUMF1	38252	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	4782990	4783362	4783182	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	235439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	4885679	4886087	4885777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	132714	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	5038569	5038695	5038648	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	18923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr3	8544131	8544195	8544133	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	2738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	8754319	8754664	8754531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	212926	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	8781836	8782151	8782020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	221306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	8783302	8783537	8783436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	219920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	8924124	8924195	8924160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	79262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr3	9452001	9452408	9452073	Y	MTMR14,SETD5	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5-AS1	13738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	9926228	9926446	9926367	Y	LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC	RPUSD3,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1	IL17RE,IL17RC,JAGN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	JAGN1	3792	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	9995528	9995903	9995716	Y	NA	IL17RC,CRELD1,PRRT3,EMC3-AS1	NA	NA	NA	NA	PRRT3	3450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	NA	VHL	53003	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr3	10593561	10593984	10593868	Y	NA	NA	ATP2B2	IMR90	Hi-C	24141950	SEC13	232699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	11138272	11138477	11138338	Y	NA	NA	HRH1,ATG7	IMR90	Hi-C	24141950	ATG7	173518	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	11632872	11633201	11633091	Y	SYN2,VGLL4	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	127019	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	11645125	11645451	11645297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	114769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	11759856	11760132	11759896	Y	NA	VGLL4	NA	NA	NA	NA	VGLL4	88	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.0079654597958
chr3	12512871	12513125	12512991	Y	PPARG,PPARG	TSEN2	PPARG,TSEN2,SYN2,TIMP4	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN2	10806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.08251608278015
chr3	13153880	13154026	13153953	Y	NA	IQSEC1	LOC285375,NUP210,HDAC11	IMR90	Hi-C	24141950	IQSEC1	41263	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr3	13325256	13325344	13325300	Y	NA	NA	NUP210,LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	NUP210	134465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	13455554	13455885	13455702	Y	NUP210	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	3924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.67784181032385
chr3	13526767	13526807	13526787	Y	NA	HDAC11,HDAC11-AS1	NA	NA	NA	NA	HDAC11-AS1	7214	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	13549267	13549563	13549350	Y	NA	HDAC11,HDAC11-AS1	NA	NA	NA	NA	HDAC11-AS1	29714	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr3	13555033	13555410	13555088	Y	NA	HDAC11,HDAC11-AS1	NA	NA	NA	NA	HDAC11-AS1	35480	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr3	13555627	13555924	13555826	Y	NA	HDAC11,HDAC11-AS1	NA	NA	NA	NA	HDAC11-AS1	36074	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.65122694356599
chr3	13575229	13575656	13575462	Y	NA	NA	HDAC11,FBLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HDAC11-AS1	55676	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	NA	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHCHD4	227194	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43,AC093495.4	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.715070045913242
chr3	14451404	14452012	14451691	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	9328	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	15334615	15334919	15334862	Y	NR2C2,SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	45956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	15337083	15337387	15337223	Y	NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	43488	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	15337572	15337812	15337795	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	43063	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	15340806	15341141	15340974	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	39734	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	15341871	15342528	15342442	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	38347	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	15351984	15352244	15352145	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	28631	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.41237900952402
chr3	15352253	15352542	15352441	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	28333	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	15675662	15676068	15675826	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	34324	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr3	15677848	15678314	15678139	Y	ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	36510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	15678965	15679290	15679049	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	37627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	ANKRD28	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	2597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	16440818	16441233	16441127	Y	DPH3,RFTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	112300	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	16550067	16550455	16550405	Y	PLCL2,OXNAD1,RFTN1	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	3078	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	16647619	16647698	16647658	Y	DAZL,DAZL	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	94086	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	17193194	17193470	17193300	Y	PLCL2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	351035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	17505233	17505390	17505312	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	663074	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	701153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	17674085	17674191	17674137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	810118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr3	19379484	19379512	19379499	Y	KCNH8	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	607005	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	20082717	20083237	20083200	Y	RAB5A,KAT2B	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	3202	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr3	20096123	20096547	20096288	Y	RAB5A	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	16608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	20201632	20201832	20201780	Y	KAT2B	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	23952	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	23061430	23061727	23061579	Y	NA	NA	UBE2E1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E2	180784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	23431263	23431479	23431424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	188752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	23946487	23946815	23946592	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	RPL15	9221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	27396607	27396872	27396740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	127039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.00745298196517
chr3	27957485	27957491	27957488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	195279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	28029513	28029820	28029667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	251255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	31267763	31268179	31268080	Y	STT3B	NA	GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	STT3B	303951	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	31268600	31269021	31268879	Y	NA	NA	GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	STT3B	303109	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	32463504	32463726	32463567	Y	CMTM6	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	32341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	32534481	32534843	32534759	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	8057	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	32857811	32858132	32857909	Y	NA	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	32673	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	33081513	33081785	33081661	Y	NA	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	8158	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	33382066	33382350	33382208	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL2	65549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	33619018	33619340	33619189	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	138155	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	39192828	39193549	39193225	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	504	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.13124687891918
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	42002407	42002746	42002471	Y	ULK4	ULK4	NA	NA	NA	NA	ULK4	485	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	42108875	42109165	42109003	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	55581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	42113196	42113588	42113376	Y	CCK	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	59902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	167631	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	42514598	42514851	42514767	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	5466	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	42518371	42518582	42518469	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	9239	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr3	42922564	42922793	42922612	Y	C3orf39	NA	NA	NA	NA	NA	KRBOX1	73589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.939274805323
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	43614494	43614503	43614499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD5	115102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	45594952	45595331	45595047	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	66	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	46152557	46153082	46152773	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1	NA	CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	117241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr3	46973216	46973514	46973421	Y	KLHL18,NBEAL2	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	45659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	46988775	46989017	46988932	Y	SETD2,KLHL18,KIF9,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	30156	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	46989533	46989702	46989634	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	29471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	46995135	46995433	46995392	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	23740	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	47004561	47004925	47004746	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	14248	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.43575997745224
chr3	47026763	47026874	47026817	Y	KLHL18,NBEAL2	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	CCDC12	5263	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	47134411	47134793	47134602	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	68664	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr3	47898226	47898293	47898260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX30	55827	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	49286239	49286578	49286497	Y	ARIH2,DALRD3,NDUFAF3,RHOA,USP4	NA	NA	NA	NA	NA	KLHDC8B	79195	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,TCTA,RHOA,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	49938038	49938186	49938111	Y	TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54	TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MST1R	1113	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	50040739	50040850	50040788	Y	SEMA3B	NA	NA	NA	NA	NA	RBM6	65299	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	3192	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.64443323757019
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	50302065	50302532	50302296	Y	SEMA3B	GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3	NA	NA	NA	NA	SEMA3B	458	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr3	50638353	50638905	50638586	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	8046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr3	50639096	50639152	50639124	Y	NA	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	7799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr3	50639346	50639782	50639525	Y	C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	7169	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr3	50642550	50642869	50642710	Y	NA	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	4082	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	50643029	50643593	50643387	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	3358	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	50667799	50667847	50667824	Y	MAPKAPK3	MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	CISH	20537	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	52009750	52010220	52010093	Y	NA	RRP9,PARP3,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29	NA	NA	NA	NA	ABHD14A-ACY1,ACY1	2684	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	52278175	52278351	52278252	Y	PBRM1,PBRM1,WDR82,GLYCTK,TWF2,PPM1M,PPM1M	ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	52590623	52590962	52590793	Y	NA	NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	23553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	52926819	52927340	52927162	Y	PBRM1,SFMBT1,SFMBT1,PRKCD,DCP1A,TMEM110	TMEM110-MUSTN1,TMEM110	NA	NA	NA	NA	TMEM110-MUSTN1	2238	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	53107324	53107487	53107433	Y	TMEM110,SFMBT1,SFMBT1,DCP1A	SFMBT1	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	28558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.995291145446165
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	53286308	53286764	53286678	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	1304	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	53568043	53568300	53568167	Y	SFMBT1	CACNA1D	NA	NA	NA	NA	CACNA1D	41360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	53723669	53724036	53723853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHDH	154381	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	53876999	53877298	53877116	Y	CHDH	CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK	NA	NA	NA	NA	CHDH	1119	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	54734224	54734587	54734407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	75982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	859259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	56106137	56106188	56106158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC2	394203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	57637831	57638080	57637955	Y	SLMAP,FAM116A,PDE12	RP11-755B10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-755B10.3	38852	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	57971589	57971767	57971672	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	20360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.18374469156077
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.05718809392317
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	60804439	60804744	60804592	Y	FHIT	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	430389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	62924105	62924506	62924306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	571100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	63942094	63942115	63942105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	65543	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	64136720	64136844	64136782	Y	THOC7,PSMD6	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	129062	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.18843290627231
chr3	64317353	64317618	64317474	Y	NA	NA	PRICKLE2,PSMD6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRICKLE2,RP11-14D22.2	111534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	64330217	64330685	64330502	Y	NA	NA	PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879	IMR90	Hi-C	24141950	PRICKLE2,RP11-14D22.2	98467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr3	64475093	64475304	64475254	Y	NA	PRICKLE2,RP11-14D22.2	LOC100652759,LOC100287879,PRICKLE2,LOC100507062,PSMD6,ADAMTS9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRICKLE2,RP11-14D22.2	45941	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	65690412	65690419	65690417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	332090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	65831008	65831290	65831149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	191219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.66155775031563
chr3	65950044	65950258	65950163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	72251	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	66503172	66503179	66503176	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	46508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	66546176	66546348	66546214	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	3339	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	67040750	67040873	67040812	Y	NA	NA	KBTBD8	MCF7	ChIA-PET	22265404	LRIG1	491063	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr3	67420914	67421310	67421112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	281728	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	67512199	67512308	67512254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	190730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	69218338	69218527	69218433	Y	FRMD4B	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	86243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	69228052	69228449	69228187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	95957	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	4090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	70898973	70899254	70899114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	731886	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	71031841	71032211	71032107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	598929	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr3	71109660	71109993	71109875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	521147	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	71267437	71267786	71267612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	363354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	71436688	71437201	71436910	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	193939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	71553174	71553740	71553492	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	77400	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	71634476	71634568	71634542	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	3336	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	72322807	72323018	72322913	Y	NA	NA	RYBP,SHQ1,LOC201617	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	171051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	72388262	72388804	72388511	Y	RYBP	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	105265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	72536556	72536893	72536709	Y	RYBP	RYBP	PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	42487	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	PDZRN3	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	25523	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr3	73998423	73998717	73998570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	326332	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	76950761	76950890	76950828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	469592	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	77239163	77239286	77239225	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	757994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	83266585	83266839	83266721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	1457273	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr3	83268139	83268257	83268189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	1458827	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	275121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	87382490	87382853	87382616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	108069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA6	194756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.22420682597979
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	99555247	99555560	99555404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	275797	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	99664130	99664284	99664246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	167073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	99749892	99750279	99749982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	81078	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	101598551	101599071	101598955	Y	NFKBIZ,NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	53716	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	101899188	101899342	101899284	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	354353	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	101914180	101914598	101914381	Y	NFKBIZ,NFKBIZ,ZPLD1	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	369345	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.81913606685224
chr3	107348544	107348833	107348648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	108761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	107705661	107706042	107705959	Y	CD47	NA	MYH15,IFT57,CD47,LOC285205	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	101830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr3	107707360	107707957	107707585	Y	CD47	NA	MYH15,CD47,LOC285205,IFT57,HHLA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	99915	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	107720264	107720547	107720441	Y	NA	NA	CD47,IFT57,HHLA2,MYH15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	87325	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43327863933903
chr3	107725103	107725159	107725131	Y	NA	NA	MYH15,CD47,IFT57,HHLA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	82713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	107807468	107807936	107807811	Y	MYH15,CD47	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	113254837	113255012	113254902	Y	NA	SPICE1,SIDT1	NA	NA	NA	NA	SIDT1	5694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.572604035584846
chr3	113293012	113293390	113293190	Y	SPICE1,SIDT1	SIDT1	NA	NA	NA	NA	SIDT1	43869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	113416036	113416177	113416128	Y	SIDT1	KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	KIAA2018	2543	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	116444477	116444635	116444556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	298910	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	117632292	117632433	117632362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	82006	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr3	119019675	119019984	119019904	Y	ARHGAP31,ADPRH	ARHGAP31-AS1	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31-AS1	19623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	119798224	119798287	119798255	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	12977	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	119864415	119864682	119864534	Y	COX17,GSK3B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	52673	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr3	119866352	119866515	119866428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	54610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.49765692592925
chr3	120065370	120065692	120065535	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	494	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	121374377	121374548	121374517	Y	EAF2,HCLS1,GOLGB1	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGB1	92054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	121380323	121380507	121380462	Y	CD86,HCLS1,GOLGB1	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGB1	86095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	121820083	121820229	121820142	Y	HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CSTA,CD86,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	ILDR1	81032	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	121982687	121983119	121983048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTA	58972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	122151664	122151964	122151814	Y	NA	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18782	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	122400701	122401439	122401076	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14	EIF4BP8,PARP14	NA	NA	NA	NA	PARP14	3236	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr3	123321303	123321432	123321369	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	18914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.44255368344804
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr3	123355394	123355731	123355464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	53005	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.66272950411563
chr3	123356199	123356268	123356234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	53810	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	123358215	123358608	123358268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	55826	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	123372011	123372488	123372368	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	69622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	123396914	123397344	123397115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	94525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr3	123511748	123512001	123511875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK	89177	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	123782092	123782280	123782136	Y	NA	NA	KALRN,ROPN1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC14	103528	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	124188163	124188429	124188181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	258784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	124510454	124510815	124510629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	63241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr3	124564415	124564677	124564502	Y	HEG1,ITGB5	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	53588	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	124604448	124604779	124604703	Y	NA	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	13486	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	NA	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	HEG1	191610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	126108107	126108472	126108304	Y	NA	NA	KLF15,CCDC37,ALDH1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ZXDC	84290	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	126266700	126266876	126266788	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	TXNRD3NB	58522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	126690804	126691208	126691031	Y	ZXDC,CHST13	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	269741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	126700801	126701293	126700904	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	279738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr3	126939932	126940049	126939992	Y	NA	NA	NUP210P1,CHCHD6	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	375017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	368760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	127472997	127473428	127473061	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	66623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	127489555	127490079	127489815	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	49972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	127494660	127494939	127494869	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	45112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.62890173827839
chr3	127729316	127729371	127729322	Y	DNAJB8	SEC61A1	SEC61A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SEC61A1	39113	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	128054461	128054660	128054529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUVBL1	183704	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32098730293466
chr3	128152586	128152939	128152776	Y	NA	NA	EEFSEC,DNAJB8-AS1,DNAJB8,LOC90246,GATA2,C3orf27	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPN1	244979	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr3	128153952	128154067	128154030	Y	GATA2	NA	EEFSEC,C3orf27,GATA2,LOC90246,DNAJB8-AS1,DNAJB8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPN1	243851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	NA	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPN1	180995	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21675591058466
chr3	128327283	128327483	128327387	Y	GATA2,GATA2,GATA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	70435	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	128335495	128335812	128335650	Y	GATA2,GATA2,GATA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	62106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.82267316760608
chr3	128337505	128337705	128337543	Y	KIAA1257,GP9	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	60213	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	128564550	128565114	128564776	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	31325	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.87740056325833
chr3	128967680	128967946	128967799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H1FX-AS1	64289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	129204579	129204997	129204770	Y	NA	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	47611	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.73648215355889
chr3	129436791	129437287	129437073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXND1	113130	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	129655699	129655849	129655774	Y	NA	TMCC1	TMCC1,TRH,IFT122,MBD4,LOC100507032	IMR90	Hi-C	24141950	TMCC1	45280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	131090710	131090810	131090760	Y	NA	NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16	7705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	132979220	132979385	132979303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BFSP2-AS1	193235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	133147395	133147694	133147637	Y	NA	BFSP2-AS1	NA	NA	NA	NA	BFSP2-AS1	24926	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.31470814133953
chr3	133180256	133180441	133180371	Y	NA	BFSP2-AS1	NA	NA	NA	NA	BFSP2-AS1	7636	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	133631190	133631374	133631292	Y	SRPRB	RAB6B	NA	NA	NA	NA	RAB6B	18510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	134069780	134070244	134070081	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	3159	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.50878363964993
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr3	134100770	134101008	134100801	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	AMOTL2,MIR4788,ANAPC13,CEP63	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL2	8449	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr3	135861520	135861675	135861598	Y	MSL2,MSL2	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	52408	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	138510806	138511198	138511002	Y	NA	PIK3CB	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	40582	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	138581550	138581663	138581597	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	NA	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIK3CB	82539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr3	139344390	139344678	139344552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT3	50181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	139898460	139898757	139898544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	246433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	141032180	141032338	141032258	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	8717	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	141050524	141051086	141050761	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	9469	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	141133650	141133961	141133787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	69928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	141173878	141174028	141173977	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	29861	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr3	141174545	141175038	141174891	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	10.2369513261365
chr3	141175186	141175511	141175311	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28378	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	141240287	141240651	141240396	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	36398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	141316631	141317016	141316779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	112742	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	143693787	143694146	143693885	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	5147	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	143705621	143705974	143705695	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	16981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr3	146955604	146955955	146955778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC4	166692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	148963630	148964002	148963862	Y	NA	RP11-206M11.7,CPHL1P	GYG1,HPS3,CP,TM4SF18,HLTF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-206M11.7	36567	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	149057749	149057981	149057865	Y	NA	TM4SF1	NA	NA	NA	NA	TM4SF1	35671	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27776246783204
chr3	149113631	149114007	149113702	Y	NA	TM4SF1	WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	19979	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	149119420	149119639	149119543	Y	NA	TM4SF1	WWTR1,ANKUB1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	25768	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	149297469	149297617	149297606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	87022	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	149666531	149666918	149666689	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	17254	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	149676286	149676648	149676501	Y	TM4SF4	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	7524	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	150066449	150066620	150066527	Y	NA	NA	PFN2,RNF13,LOC646903,TSC22D2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	57502	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.46593465137627
chr3	150445626	150445906	150445750	Y	SIAH2	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	FAM194A	25868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	150453151	150453509	150453478	Y	CLRN1	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	24215	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	150455785	150455994	150455895	Y	TSC22D2,SERP1,SIAH2	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	21730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	150456267	150456381	150456351	Y	NA	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	21343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	151738872	151739003	151738949	Y	NA	NA	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	220614	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	151739734	151740181	151739895	Y	NA	NA	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	219436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36353222222561
chr3	152374942	152375112	152375027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	389598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.21546696611375
chr3	153886362	153886734	153886548	Y	NA	ARHGEF26,ARHGEF26-AS1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF26-AS1	49241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	154987917	154988101	154988024	Y	NA	PABPC1P10	NA	NA	NA	NA	PABPC1P10	37495	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	155281187	155281565	155281523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCH1	179291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	155705974	155706059	155706016	Y	NA	SETP14	NA	NA	NA	NA	SETP14	2881	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	156403084	156403595	156403347	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	12917	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	156480605	156480801	156480703	Y	NA	PA2G4P4	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	45720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	156527707	156527883	156527795	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	1186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	113601	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	158070419	158070585	158070503	Y	MFSD1	NA	NA	NA	NA	NA	MLF1	216367	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	158440805	158440990	158440882	Y	MFSD1	MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	6997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr3	158466226	158466540	158466401	Y	MFSD1	MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	18239	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	159532172	159532274	159532246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	409149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	159765726	159765787	159765757	Y	NA	NA	IQCJ-SCHIP1	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf80	175636	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	160014353	160014630	160014494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	72930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr3	161085552	161085707	161085669	Y	NA	SPTSSB	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	2961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	161086549	161087201	161086872	Y	NA	SPTSSB	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	1467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	161087231	161087661	161087620	Y	NA	SPTSSB	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	1007	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.636071291103141
chr3	161125031	161125340	161125185	Y	NA	SPTSSB	NMD3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	36363	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75044541237944
chr3	161126891	161127108	161126997	Y	NA	SPTSSB	NMD3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	38223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr3	161133836	161133975	161133914	Y	NA	SPTSSB	NMD3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	45168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr3	161138601	161138921	161138632	Y	NMD3,C3orf57	SPTSSB	NMD3,PPM1L,B3GALNT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	49933	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.52429449909944
chr3	161139893	161140384	161140069	Y	NA	NA	NMD3,PPM1L,B3GALNT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	51225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr3	161521648	161521661	161521655	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	432980	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	163200280	163200389	163200295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	2111612	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	167369160	167369394	167369277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD10	81333	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	168595729	168595981	168595841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFEM1P	630419	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.65005518976599
chr3	168606249	168606616	168606433	Y	NA	NA	EGFEM1P	IMR90	Hi-C	24141950	EGFEM1P	640939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr3	168930237	168930275	168930257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	449131	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	169051059	169051429	169051244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	327977	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	169376089	169376313	169376201	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	3093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr3	169376858	169377055	169376957	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	2351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	169379063	169379412	169379208	Y	MECOM	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.492034973733454
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.54765276061533
chr3	169872442	169872609	169872497	Y	NA	PHC3	NA	NA	NA	NA	PHC3	24928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	171897555	171897878	171897648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	142137	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	172280796	172281206	172280981	Y	TNFSF10,TNFSF10	RP11-408H1.3	NCEH1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-408H1.3	30191	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	174868634	174868952	174868706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	456315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.799949409077185
chr3	174987266	174987320	174987290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	337947	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	174988288	174988312	174988303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	336955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	175054266	175054532	175054399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	270735	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr3	175056588	175056892	175056754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	268375	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32618799547683
chr3	175057076	175057252	175057186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	268015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr3	175204149	175204623	175204405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	120644	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	176133548	176133972	176133699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	699090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.09324337620103
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.87269170870449
chr3	177542015	177542147	177542058	Y	NA	RP11-91K9.1	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	9362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr3	179471930	179472312	179472121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	103387	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	179659956	179660305	179660211	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	PEX5L	92536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr3	180122489	180122783	180122636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC14	195135	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	183684356	183684550	183684447	Y	NA	ABCC5	NA	NA	NA	NA	ABCC5	49253	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr3	183726020	183726143	183726081	Y	NA	ABCC5,EEF1A1P8	PARL	IMR90	Hi-C	24141950	ABCC5	7660	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	184503800	184503841	184503824	Y	NA	VPS8	VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD	IMR90	Hi-C	24141950	VPS8	24090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf70	140855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr3	187458720	187459019	187458856	Y	LPP,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	2496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	187467867	187468249	187468141	Y	BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	6352	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr3	187883507	187883633	187883573	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	13662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	187891343	187891657	187891500	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	21498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	188012691	188013249	188012784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142846	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	188065570	188065751	188065619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	195725	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	188109949	188110178	188110065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	240104	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	188149383	188149832	188149544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	279538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	188816884	188817275	188817066	Y	NA	NA	BCL6	IMR90	Hi-C	24141950	TP63	529930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	9.02163892627545
chr3	189022377	189022942	189022424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	324263	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr3	189029389	189029728	189029564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	317477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	189034066	189034494	189034299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	312711	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.20396440556411
chr3	189559377	189559697	189559485	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	212172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	190041292	190041577	190041442	Y	NA	CLDN1	NA	NA	NA	NA	CLDN1	3028	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	191049369	191049653	191049414	Y	NA	CCDC50	NA	NA	NA	NA	CCDC50	4503	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	191873125	191873377	191873252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	610176	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	192128509	192128782	192128632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	354771	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	192289148	192289495	192289213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	194058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr3	192315409	192315812	192315620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	167741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr3	192332888	192333028	192332958	Y	FGF12	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	150525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	192608372	192608637	192608617	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	25313	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.63295338343289
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	239725	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	193588211	193588236	193588227	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HES1	263698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	193597420	193597611	193597456	Y	NA	NA	HES1,OPA1,LOC647323	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HES1	254323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.46619537410435
chr3	193857372	193857551	193857481	Y	HES1	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	5438	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.1952472521104
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.615828870687463
chr3	194022185	194022450	194022442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC15	66022	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	47562	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	194850291	194850713	194850430	Y	PPP1R2,LSG1	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	139183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr3	194909017	194909237	194909137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	80659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr3	195073897	195074088	195073990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	84001	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	195632869	195633225	195632990	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2	NA	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	195633702	195634304	195633876	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	TNK2-AS1	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	195871770	195871934	195871856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	64710	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr3	196068097	196068272	196068177	Y	UBXN7,RNF168,LRRC33,PCYT1A,TM4SF19	TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D2	24927	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr3	196105226	196105537	196105382	Y	PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	UBXN7	51808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr3	197153931	197154131	197153988	Y	MFI2,MFI2	NA	BDH1,DLG1,LOC100507086	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	129760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	991255	991645	991565	Y	ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175	DGKQ,IDUA,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	10079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr4	1027686	1027967	1027729	Y	FGFRL1,FGFRL1,FGFRL1	DGKQ,IDUA,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	25962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	1237849	1238004	1237927	Y	NA	CTBP1,MAEA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	3737	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	1339085	1339471	1339276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	1535396	1535629	1535516	Y	NA	RP11-1398P2.1	KIAA1530	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1398P2.1	44351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	1796551	1796852	1796752	Y	NA	FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	3517	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	1865990	1866293	1866178	Y	NA	LETM1,WHSC1	LETM1,WHSC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WHSC1	4858	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.72500229942159
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr4	2764467	2764789	2764630	Y	LOC402160	TNIP2,SH3BP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	8364	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	3194617	3194824	3194669	Y	SH3BP2,HTT	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	97931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	3203733	3204143	3203890	Y	SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	88612	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	3228357	3228568	3228469	Y	SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	64187	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr4	3389642	3390154	3389980	Y	HTT,RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	DOK7	72879	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	DOK7	NA	NA	NA	NA	DOK7	24044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.28731887451143
chr4	3442737	3443092	3442838	Y	RGS12	DOK7	NA	NA	NA	NA	DOK7	19941	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	3463022	3463837	3463465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOK7	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.873067555533447
chr4	3468694	3469098	3468894	Y	NA	DOK7	NA	NA	NA	NA	DOK7	5661	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	3483238	3483365	3483266	Y	NA	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	20205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	3485407	3485559	3485410	Y	DOK7	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	22374	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr4	3488499	3488826	3488767	Y	NA	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	25466	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	3784192	3784335	3784264	Y	OTOP1,RGS12	ADRA2C	NA	NA	NA	NA	ADRA2C	18117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	3829713	3829948	3829819	Y	ADRA2C	NA	LOC100133461	IMR90	Hi-C	24141950	ADRA2C	63638	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	5587454	5587568	5587511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	612750	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	6044726	6045073	6044900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	155245	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	6247478	6247620	6247538	Y	PPP2R2C,PPP2R2C,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	JAKMIP1,WFS1	NA	NA	NA	NA	WFS1	21956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	6311062	6311148	6311105	Y	NA	WFS1	NA	NA	NA	NA	WFS1	41486	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.77815938803255
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.28453346741551
chr4	6909761	6910075	6909918	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	792	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	6918330	6918775	6918508	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	9361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr4	6919401	6919899	6919549	Y	MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	10432	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	6920106	6920340	6920183	Y	MAN2B2,S100P,KIAA0232,TADA2B,GRPEL1,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	11137	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	6928884	6929127	6929009	Y	KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	19915	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	6974782	6974959	6974886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	65813	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	6989470	6989868	6989678	Y	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	NA	TADA2B	51758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	7209017	7209262	7209117	Y	NA	SORCS2	NA	NA	NA	NA	SORCS2	16752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	7807485	7807548	7807490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	132105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	7978189	7978377	7978271	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	38536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACOX3	714305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr4	9980867	9981172	9981022	Y	NA	RP11-448G15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-448G15.1	24934	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	10627577	10627791	10627684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR1	511004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	13282552	13282692	13282688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	50346	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	13908947	13909321	13909089	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,LOC152742	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	202271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	14857906	14858386	14858211	Y	CPEB2	NA	CPEB2,LOC441009	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CPEB2	143912	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr4	15151544	15151754	15151565	Y	NA	NA	CPEB2	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB2	149246	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	15775826	15776085	15775905	Y	FGFBP2	RP11-115L11.1	CC2D2A,CD38	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115L11.1	44576	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	17829390	17829398	17829394	Y	CLRN2,NCAPG	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	18865	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	18578786	18579116	18578810	Y	NA	NA	FAM184B	IMR90	Hi-C	24141950	LCORL	557287	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	19620943	19621209	19621076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-608O21.1	165884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	21602576	21603408	21603328	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	906671	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	21792715	21792997	21792947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	722680	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	24471602	24472014	24471897	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	112159	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr4	24599702	24600087	24599863	Y	NA	DHX15	SOD3,CCDC149	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	15529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	24840398	24840758	24840578	Y	NA	NA	SOD3	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC149	139068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	24913671	24913932	24913802	Y	CCDC149	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC149	65894	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	24975738	24976056	24975826	Y	DHX15,CCDC149,CCDC149	CCDC149	NA	NA	NA	NA	CCDC149	3770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	25402341	25402497	25402460	Y	NA	ANAPC4	NA	NA	NA	NA	ANAPC4	25506	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	25554656	25554918	25554808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-302F12.1	123554	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	26123354	26123506	26123386	Y	NA	RBPJ	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	39571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr4	26343884	26344230	26344058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPJ	180807	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	28226739	28226872	28226806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1366518	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.76194797292908
chr4	30719661	30720023	30719741	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	14	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr4	38080175	38080435	38080304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	120119	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	38083648	38084173	38083860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	123592	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	38159115	38159505	38159287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	199059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr4	38320550	38320897	38320770	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	342920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	39038547	39038755	39038651	Y	NA	KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	5904	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	39503771	39503950	39503862	Y	NA	RPL9,LIAS,UGDH-AS1,UGDH	NA	NA	NA	NA	UGDH-AS1	23689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	39541890	39542238	39542037	Y	NA	UGDH-AS1,UGDH	NA	NA	NA	NA	UGDH	13959	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr4	39548258	39548506	39548382	Y	KLHL5	UGDH-AS1,UGDH	NA	NA	NA	NA	UGDH	20327	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	39614591	39614990	39614756	Y	NA	RP11-539G18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-539G18.2	23770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	39933245	39933555	39933419	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	44021	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	40050527	40050740	40050634	Y	NA	N4BP2	NA	NA	NA	NA	N4BP2	5706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	40056293	40056591	40056356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	40205209	40205567	40205376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	148763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	40240312	40240963	40240621	Y	RHOH,RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	183866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	40533771	40533999	40533881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	96893	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	40578690	40579499	40579160	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	51393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr4	40609271	40609510	40609444	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	21382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	40623743	40623952	40623867	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	6940	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	40628320	40628499	40628391	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	2393	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	40765283	40765623	40765452	Y	RBM47	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	15369	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	40791893	40792102	40791997	Y	NSUN7	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	41979	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	160138	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	40943410	40943552	40943502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	193496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr4	40997224	40997582	40997567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	219149	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	41100025	41100220	41100123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	116511	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	41130759	41131325	41130803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	85406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	41148833	41148910	41148907	Y	LIMCH1,LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	67821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	41162074	41162440	41162321	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	54291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	41936193	41936441	41936268	Y	TMEM33	TMEM33	NA	NA	NA	NA	TMEM33	1056	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	47464691	47464980	47464836	Y	NA	COMMD8	NA	NA	NA	NA	COMMD8	955	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	48195485	48195896	48195611	Y	SLAIN2	NA	NA	NA	NA	NA	TEC	73985	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	48753826	48753871	48753849	Y	NA	FRYL	NA	NA	NA	NA	FRYL	26468	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	53829746	53830111	53829929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	103289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	55578146	55578442	55578293	Y	KIT	NA	NA	NA	NA	NA	KIT	56061	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	57132335	57132393	57132366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP31	87908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	57740482	57740676	57740556	Y	PPAT,REST	REST	THEGL,SPINK2	IMR90	Hi-C	24141950	REST	31399	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	66107153	66107671	66107555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	812526	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.99035117563207
chr4	69590341	69590581	69590489	Y	UGT2B17,UGT2A3,UGT2B15	NA	NA	NA	NA	NA	UGT2B15	55995	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	69602663	69602782	69602708	Y	UGT2B15,UGT2B11,UGT2B7,UGT2A3,UGT2B10	NA	NA	NA	NA	NA	UGT2B15	68317	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	74055104	74055142	74055123	Y	ANKRD17,ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD17	67373	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	75397621	75397842	75397732	Y	NA	NA	EREG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTHFD2L	419730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	75411825	75412170	75412032	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MTHFD2L	433934	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr4	75505281	75505609	75505356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARM1	350696	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.66626660486946
chr4	75508347	75508621	75508479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARM1	347684	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr4	75545554	75545864	75545679	Y	NA	NA	EREG,EPGN,MTHFD2L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARM1	310441	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.835723328784669
chr4	75550011	75550323	75550221	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARM1	305982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr4	75585032	75585282	75585171	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARM1	271023	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	76487136	76487403	76487267	Y	NA	THAP6,RCHY1,C4orf26	NA	NA	NA	NA	C4orf26	7878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr4	76750745	76750859	76750802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USO1	102968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	77500789	77501039	77500904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	146536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr4	77611633	77612016	77611712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOWAHB	204986	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	77724798	77724936	77724862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOWAHB	92066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	78067816	78068100	78067958	Y	CCNI,CCNG2	CCNG2	CCNI	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCNG2	8204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr4	79083838	79083918	79083865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAS1	107114	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	79473983	79474151	79474067	Y	ANXA3	ANXA3	NA	NA	NA	NA	ANXA3	3310	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	79537274	79537650	79537411	Y	BMP2K	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	66601	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	81199073	81199101	81199087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	154465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	81392904	81393098	81393001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	348296	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	84359899	84360122	84360011	Y	NA	HELQ,MRPS18C	NA	NA	NA	NA	HELQ	14887	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr4	86410493	86410688	86410582	Y	NA	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	16226	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	86684588	86684743	86684670	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	290321	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	533574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	87177601	87177837	87177745	Y	MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	335631	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	88443267	88443740	88443428	Y	DSPP,SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	101533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	88474539	88474761	88474650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMP1	94698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr4	88480312	88480555	88480436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMP1	88904	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr4	88480669	88480961	88480822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMP1	88498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr4	89212160	89212449	89212362	Y	MEPE,NAP1L5,PPM1K	PPM1K	NA	NA	NA	NA	PPM1K	8239	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	89433703	89434055	89433857	Y	HERC5	HERC3,PIGY	NA	NA	NA	NA	HERC3	6144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	91049597	91049943	91049669	Y	FAM190A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115D19.1	579090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr4	99580316	99580421	99580372	Y	NA	TSPAN5	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	2536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	99845137	99845196	99845164	Y	NA	EIF4E	NA	NA	NA	NA	EIF4E	4592	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	101440272	101440596	101440446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZ	570727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	101498016	101498230	101498123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZ	628471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	101502580	101502805	101502658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZ	633035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr4	102113415	102113532	102113437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	153405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	102200557	102200885	102200839	Y	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	66052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr4	103520132	103520300	103520232	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	99646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	103608721	103609347	103609253	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	70804	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	103781884	103782294	103782163	Y	MANBA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	5759	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	106064596	106064807	106064750	Y	NA	TET2	TET2	K562	ChIA-PET	22265404	TET2	225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr4	106324406	106324791	106324687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPA2	68447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	106391866	106392288	106392204	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	106841550	106841937	106841687	Y	TBCK,LOC100507096	NPNT,INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	26407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	107955286	107955747	107955665	Y	DKK2	NA	NA	NA	NA	NA	PAPSS1	683861	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	110604562	110604565	110604563	Y	NA	CASP6,PLA2G12A	NA	NA	NA	NA	CASP6	18174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.42976217842749
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.27942605962038
chr4	112881409	112881611	112881510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	182942	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	113208440	113208624	113208493	Y	NA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	TIFA	3381	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr4	119905071	119905247	119905165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24D	147233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	120432594	120432728	120432661	Y	PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	58648	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	120437308	120437708	120437606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	63362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	125359100	125359252	125359188	Y	NA	TECRP2	ANKRD50	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECRP2	23693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.05001854109841
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	36151	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	129254148	129254471	129254310	Y	NA	PGRMC2	PHF17,LARP1B	IMR90	Hi-C	24141950	PGRMC2	46164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	133266182	133266225	133266204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-9G1.3	802046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	134191473	134191538	134191506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH10	123003	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr4	139067903	139068306	139067999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	93197	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	139158628	139158837	139158817	Y	SLC7A11	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	2666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	139831999	139832463	139832295	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	102480	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr4	139833159	139833355	139833260	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	101588	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr4	140292626	140292906	140292778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	70921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	140737173	140737338	140737263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	152251	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	141015177	141015539	141015358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	57799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	141015706	141016341	141016156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr4	141071159	141071540	141071326	Y	NA	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	1798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr4	141217539	141217769	141217667	Y	NA	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41099	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	141581582	141581699	141581656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	93575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr4	141639566	141639883	141639758	Y	TBC1D9	TBC1D9	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	35391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	141640362	141640569	141640401	Y	NA	TBC1D9	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	34705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	141640892	141641150	141641076	Y	TBC1D9	TBC1D9	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	34124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr4	142984215	142984339	142984277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF330	844174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	143012897	143013276	143013057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF330	872856	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	143072986	143072994	143072990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF330	932945	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	143185718	143186074	143185891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP38	917996	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	143206374	143206633	143206590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP38	897437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr4	143276364	143276478	143276442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP38	827592	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	143337797	143338156	143337961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP38	765914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.495175587816035
chr4	143393475	143393485	143393480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP38	710585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	143471391	143471615	143471483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP38	632455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	143536371	143536723	143536559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP38	567347	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.6313830763916
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	148654111	148654384	148654270	Y	PRMT10	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	2897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	149467274	149467593	149467420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C2	103424	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	151956610	151956785	151956696	Y	NA	LRBA	LRBA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRBA	21731	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.939274805323
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	152592685	152592821	152592753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PET112	87354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	153265183	153265560	153265526	Y	FBXW7	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	189856	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	153630965	153631147	153631056	Y	NA	TMEM154	TMEM154	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM154	31648	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.73648215355889
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr4	153894415	153894544	153894479	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	38911	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr4	154429389	154429734	154429551	Y	NA	KIAA0922	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	43891	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	158125886	158126027	158125941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	235340	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	159643443	159643599	159643521	Y	FNIP2,PPID	PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	PPID	895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr4	160195976	160196239	160196029	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	507686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	160892821	160893077	160892949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	1204531	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	161769764	161769816	161769790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-234O6.2	528289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	162808424	162808493	162808459	Y	FSTL5	NA	NA	NA	NA	NA	FSTL5	274694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	164414222	164414415	164414319	Y	TKTL2,C4orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	150238	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr4	164465601	164465786	164465694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	201617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	612373	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	166397894	166398226	166397967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	117548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	169509077	169509260	169509148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	52140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr4	169559850	169560019	169559874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102913	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	169595912	169596309	169596196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	138975	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr4	169737785	169738127	169737934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	191299	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	169839395	169839702	169839549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	89724	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	169853850	169854103	169853858	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	75323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr4	169991170	169991417	169991322	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	61744	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.26747500733704
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.39372960256197
chr4	170030173	170030283	170030178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	100747	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	170132939	170133158	170133049	Y	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	57098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	170570348	170570457	170570384	Y	NA	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	38564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	174210504	174211007	174210885	Y	GALNT7	HMGB2	NA	NA	NA	NA	HMGB2	43269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	176452577	176452812	176452695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	532173	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr4	180979072	180979692	180979379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	1943057	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr4	180979740	180980372	180979835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	1943725	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr4	183418367	183418505	183418425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	353965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr4	183727349	183727751	183727542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	109338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr4	184643961	184644129	184644061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC11	65541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	STOX2	53095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	NA	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC127	162156	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.09826043287765
chr5	190691	190901	190821	Y	SDHA,LRRC14B	CCDC127,SDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC127	25429	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	373392	373627	373429	Y	EXOC3,C5orf55,PDCD6	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67631	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.694827625497564
chr5	671573	671920	671762	Y	TPPP	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	19590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.742763381724053
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC11	64078	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21024563372928
chr5	1086141	1086649	1086569	Y	NA	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	23501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	1097598	1097832	1097647	Y	NA	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	12318	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	1130725	1130985	1130924	Y	NA	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	20575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.95548828699651
chr5	1315765	1316275	1315843	Y	TERT	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	22581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	1470037	1470319	1470275	Y	SLC12A7,LPCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	51773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	1475636	1475716	1475666	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT1	46376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	1498250	1498484	1498297	Y	LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	23608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	1503544	1504024	1503726	Y	LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	18068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	1506387	1506607	1506390	Y	NA	LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT1	15485	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr5	1512306	1512503	1512434	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT1	9589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr5	1514952	1515327	1515072	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	6765	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32618799547683
chr5	1516282	1516761	1516468	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	5331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.20398711197645
chr5	1521795	1522349	1522119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.694827625497564
chr5	1555263	1555850	1555560	Y	NA	LPCAT1,SDHAP3	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	33171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.38653734332488
chr5	1565484	1565589	1565562	Y	NA	LPCAT1,SDHAP3	NA	NA	NA	NA	SDHAP3	27146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	2758153	2758545	2758351	Y	NA	C5orf38,IRX2	NA	NA	NA	NA	IRX2	7184	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr5	2780518	2780773	2780623	Y	NA	C5orf38,IRX2	NA	NA	NA	NA	IRX2	29549	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.83417572815571
chr5	3188206	3188572	3188389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX2	437237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	5026027	5026363	5026168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	392414	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	12.6073960134327
chr5	6766717	6766947	6766763	Y	SRD5A1,PAPD7	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	135261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr5	9681641	9681655	9681648	Y	NA	NA	TAS2R1	IMR90	Hi-C	24141950	SNHG18	137329	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	10229611	10229778	10229690	Y	NA	FAM173B,CCT5	NA	NA	NA	NA	FAM173B	18231	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	10302153	10302258	10302208	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	CMBL	3880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr5	10309087	10309259	10309181	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	CMBL	2949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	10371627	10371888	10371758	Y	NA	MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	19812	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	10996392	10996605	10996573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	237008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	11035965	11036506	11036174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	276581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	11324017	11324157	11324081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	564633	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr5	11591848	11592143	11592119	Y	CTNND2	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	310012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	12099131	12099529	12099330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	196976	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	12246135	12246533	12246334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	343980	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	14250238	14250405	14250312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	108427	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	14251046	14251256	14251151	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	109235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr5	14489488	14489835	14489662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	90049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	14666216	14666664	14666270	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	3443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	14672104	14672643	14672283	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	9331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	14673178	14673249	14673214	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	10405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	16492574	16492683	16492630	Y	FAM134B	ZNF622	NA	NA	NA	NA	ZNF622	28673	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	17317191	17317354	17317270	Y	NA	RN7SKP133,FTH1P10	BASP1,LOC285696,LOC401177	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP133	26371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	19315150	19315342	19315248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	570868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	19735118	19735431	19735276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH18	838551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr5	20109541	20109702	20109685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH18	464280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.57536673626844
chr5	21933936	21933993	21933965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPD1P1	53242	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPD1P1	1423072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	27309667	27310060	27309866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	2120902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	29758752	29759069	29758903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	1292603	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	CTD-2206G10.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2206G10.2	26639	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr5	32175167	32175567	32175368	Y	NA	GOLPH3,CTD-2186M15.1	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	2711	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr5	32283224	32283342	32283283	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	27773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	32349231	32349269	32349250	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	38116	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	32592950	32593432	32593186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	63211	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	32768263	32768639	32768422	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	238524	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr5	34006520	34007060	34007033	Y	C1QTNF3,AMACR	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	300	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	34048471	34048803	34048799	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	42251	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	34564903	34565130	34565039	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14,TTC23L,RAD1,BRIX1	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	89212	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	34835599	34835693	34835610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRIX1	77788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	34856339	34856427	34856383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRIX1	57054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	35159419	35159781	35159689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLR	69013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr5	35212336	35212576	35212457	Y	PRLR	PRLR	NA	NA	NA	NA	PRLR	16218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	35220570	35220626	35220598	Y	AGXT2,PRLR	PRLR	NA	NA	NA	NA	PRLR	8168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	35281144	35281439	35281292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLR	52350	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	36109062	36109362	36109328	Y	NA	UGT3A2,LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	UGT3A2	39602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	36690488	36690876	36690655	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	86031	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	36744638	36744936	36744711	Y	NA	NA	LOC646719,NIPBL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NIPBL	129925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr5	37740558	37740859	37740716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	363244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83888458270955
chr5	38846956	38846992	38846979	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	2996	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	38854077	38854436	38854323	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	10117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	38866844	38867106	38866976	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	22884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr5	39211947	39212087	39212048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	139437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	39292432	39292553	39292530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9	130417	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	39606080	39606287	39606184	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	145678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04167723447366
chr5	39713773	39713912	39713841	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	253371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.78062008630347
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.5706578817146
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	260926	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	40447095	40447379	40447222	Y	PTGER4,CARD6	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	230221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	40689630	40689893	40689724	Y	NA	PTGER4	NA	NA	NA	NA	PTGER4	12030	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	42505068	42505257	42505244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHR	83189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.87547711580041
chr5	43010298	43010802	43010620	Y	GHR,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	5729	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	4127	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	43099724	43100011	43099805	Y	NA	ZNF131,CTD-2201E18.3	ZNF131,LOC648987	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2201E18.3	34203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	43498058	43498404	43498231	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	C5orf28	MCF7	ChIA-PET	22265404	C5orf34	14843	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	44821100	44821499	44821234	Y	NA	MRPS30	NA	NA	NA	NA	MRPS30	14073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	49660016	49660402	49660209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMB	76680	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	53298305	53298413	53298402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	184789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	53358665	53359272	53358974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	245140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	53460447	53460703	53460575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	143709	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	53585796	53586153	53585818	Y	NA	ARL15	NA	NA	NA	NA	ARL15	18259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	53848607	53848967	53848787	Y	NA	SNX18	NA	NA	NA	NA	SNX18	37018	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	54897039	54897427	54897238	Y	IL6ST,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	68161	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	55597915	55598317	55598114	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	200582	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	55643078	55643375	55643183	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	155524	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr5	55646435	55647044	55646625	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	151855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	55655118	55655221	55655151	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	143678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.934964504010451
chr5	55711184	55711637	55711363	Y	MAP3K1	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	87262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.45560384462664
chr5	55717668	55718171	55718097	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	80728	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.43538413062329
chr5	55724940	55725264	55725061	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	73635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr5	55756528	55756674	55756600	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	42225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr5	55786817	55787069	55786944	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	11830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr5	55830072	55830234	55830153	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	31173	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	55966831	55967044	55966902	Y	NA	NA	MAP3K1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAP3K1	142357	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	56013185	56013294	56013238	Y	NA	NA	MAP3K1	HELA	5C	22955621	MAP3K1	96107	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.939274805323
chr5	56060040	56060308	56060136	Y	NA	MAP3K1	MAP3K1	MCF7,IMR90,HELA	ChIA-PET,Hi-C,5C	22265404,24141950,22955621	MAP3K1	49093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr5	56468272	56468727	56468348	Y	MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1	GPBP1	NA	NA	NA	NA	GPBP1	497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	56731620	56731973	56731778	Y	NA	NA	PLK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPBP1	263845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	56790461	56790772	56790742	Y	NA	NA	ACTBL2,PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	GPBP1	322686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	57158264	57158637	57158547	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	595450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.80400105423169
chr5	57376590	57376893	57376708	Y	NA	NA	PLK2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLK2	377194	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr5	57479551	57479905	57479697	Y	NA	NA	PLK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLK2	274182	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.05001854109841
chr5	58165920	58166304	58166218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	411833	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	59505321	59505489	59505391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	276051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr5	60626678	60627139	60626902	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	578	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	60629089	60629454	60629159	Y	NA	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	2989	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	61100852	61101227	61101135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	415154	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr5	64224703	64224806	64224755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	161946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr5	65228217	65228394	65228309	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	7914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	65918246	65918267	65918259	Y	MAST4	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	28070	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	66117932	66118220	66117961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	179561	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	66120383	66120788	66120519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	176993	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	66178568	66178972	66178612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	118809	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	66502779	66503107	66502965	Y	NA	NA	MAST4,CD180,PIK3R1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAST4-AS1	204998	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.34164771692241
chr5	66507901	66508010	66507958	Y	NA	NA	MAST4,PIK3R1,CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	210120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr5	66510755	66511249	66511045	Y	NA	NA	MAST4,PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAST4-AS1	212974	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.50719269276634
chr5	66511530	66511924	66511850	Y	NA	NA	MAST4,PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAST4-AS1	213749	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.14054256287048
chr5	66511956	66512390	66512172	Y	NA	NA	MAST4,PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAST4-AS1	214175	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.42297053900173
chr5	66518350	66518491	66518422	Y	CD180	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	220569	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	66528867	66529360	66529108	Y	NA	NA	PIK3R1,MAST4,CD180	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAST4-AS1	231086	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.13529645750364
chr5	66531527	66531959	66531721	Y	NA	NA	PIK3R1,MAST4,CD180	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAST4-AS1	233746	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.39370689614963
chr5	66577788	66577996	66577882	Y	NA	NA	PIK3R1	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	280007	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	66590569	66590717	66590590	Y	NA	NA	PIK3R1	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	292788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr5	66597093	66597537	66597250	Y	NA	NA	PIK3R1	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	299312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	66641373	66641711	66641542	Y	NA	NA	PIK3R1	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	343592	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr5	66786490	66786676	66786582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	488709	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	67103829	67104163	67104152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	405385	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	67242397	67242498	67242448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	267050	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	67448850	67449023	67448936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	60525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	67474487	67474653	67474570	Y	NA	PIK3R1	PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIK3R1	34895	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr5	67752610	67752698	67752666	Y	PIK3R1	NA	PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIK3R1	243062	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr5	67875476	67875860	67875665	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	365928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	68627457	68627610	68627506	Y	NA	CCDC125,RAD17,TAF9	NA	NA	NA	NA	CCDC125	821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr5	68823946	68824105	68824026	Y	NA	OCLN	NA	NA	NA	NA	OCLN	37827	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr5	71045616	71045849	71045733	Y	NA	NA	MCCC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MCCC2	164501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.57691640346743
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	71998945	71999238	71999064	Y	NA	NA	ZNF366,TNPO1	IMR90	Hi-C	24141950	TNPO1	110901	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	73612322	73612454	73612340	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	74163639	74163858	74163748	Y	NA	FAM169A	GFM2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM169A	2863	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	74616844	74617109	74616992	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	HMGCR,CTD-2235C13.2	NA	NA	NA	NA	HMGCR	13045	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	74883919	74884208	74884013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	77956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr5	77289736	77289928	77289813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCA	127132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	77412957	77413018	77412987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP3B1	175561	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	77582031	77582256	77582186	Y	AP3B1	AP3B1	NA	NA	NA	NA	AP3B1	6323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	77779546	77779957	77779719	Y	AP3B1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	125207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr5	77802337	77802767	77802745	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	147998	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	77807354	77807759	77807583	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	153015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	77810178	77810481	77810268	Y	AP3B1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	155839	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	77819717	77819752	77819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	165378	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	77825252	77825732	77825631	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	170913	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	77843085	77843301	77843193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	188746	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	77940704	77941073	77940964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	122771	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr5	78744780	78744887	78744834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOMER1	63153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	78843402	78843606	78843502	Y	CMYA5,HOMER1	HOMER1,RP11-342F17.2	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-342F17.2	20277	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr5	78843882	78844075	78843988	Y	NA	HOMER1,RP11-342F17.2	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-342F17.2	20757	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	78993167	78993488	78993350	Y	THBS4,CMYA5	CMYA5	NA	NA	NA	NA	CMYA5	9467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	79418428	79418727	79418619	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	131171	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	79421543	79422183	79421865	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	127715	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	79440817	79441220	79441029	Y	ZFYVE16,FAM151B,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	108678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	79458255	79458620	79458438	Y	MSH3,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	91278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	79480253	79480678	79480326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	69220	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.75517697334561
chr5	79553045	79553765	79553579	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	3147	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr5	79902559	79902570	79902565	Y	NA	ANKRD34B,MTRNR2L2,MSH3,DHFR	NA	NA	NA	NA	ANKRD34B	38252	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	80490965	80491330	80491148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	104049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.87426201574578
chr5	81148608	81149026	81148707	Y	SSBP2	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	3188	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	81319192	81319550	81319375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG10	53348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	81934356	81934439	81934367	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	361960	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	82356692	82356869	82356781	Y	NA	XRCC4,TMEM167A	NA	NA	NA	NA	XRCC4	14448	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	82576471	82576688	82576580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	204789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	82608517	82608916	82608727	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	236835	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	82682858	82683173	82683064	Y	VCAN	NA	VCAN	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM167A	311176	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	82768927	82769141	82769084	Y	VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	328232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	82769870	82770125	82769934	Y	TMEM167A,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	327248	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	326678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	83018086	83018575	83018426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	78798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr5	86316064	86316214	86316124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2161E19.1	137366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	86662563	86662890	86662661	Y	RASA1,RASA1	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	CTC-467M3.1	NA	NA	NA	NA	CTC-467M3.1	12867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr5	87985071	87985193	87985112	Y	NA	CTC-467M3.1	LINC00461	K562	ChIA-PET	22265404	CTC-467M3.1	15035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	87985363	87985679	87985523	Y	MEF2C	CTC-467M3.1	LINC00461	K562	ChIA-PET	22265404	CTC-467M3.1	15327	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	88063737	88063896	88063817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-467M3.1	93701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr5	89313497	89313753	89313625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN3	389850	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	89940937	89941287	89941029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD3	117536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	90458384	90458975	90458686	Y	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-90P	105569	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	90686186	90686389	90686288	Y	NA	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	9010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P27	423389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	92932960	92933102	92933051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P27	84271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	95007981	95008178	95008080	Y	NA	RFESD,RHOBTB3	NA	NA	NA	NA	RFESD	27523	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	95053997	95054284	95054091	Y	ELL2,RHOBTB3	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB3	6771	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	95063779	95063897	95063838	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2154I11.2	2102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	95360201	95360335	95360279	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	64426	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	95406696	95406840	95406768	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	110921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	65484	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	99386410	99387139	99386777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	481827	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr5	103048573	103048840	103048666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT12	152079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	103465253	103465580	103465434	Y	NA	RNU1-140P	NA	NA	NA	NA	RNU1-140P	32678	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	106823409	106823505	106823457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	181091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	106900103	106900354	106900202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	104242	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	106931094	106931453	106931417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	73143	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	107896272	107896622	107896503	Y	NA	NA	PJA2	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL17	180473	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	108391550	108391948	108391605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	310027	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	108460806	108460908	108460857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PJA2	282787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	108747394	108747617	108747516	Y	MAN2A1	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	3699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	110592143	110592348	110592174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC010468.1	65403	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	111181854	111182145	111181999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	312078	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	111523730	111523898	111523814	Y	NA	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	29507	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	111535274	111535427	111535350	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	41051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	111734624	111734920	111734701	Y	APC	EPB41L4A	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A	18093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	117345669	117346019	117345844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00992	596464	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr5	118453384	118453586	118453485	Y	NA	CTB-161M19.4,RP11-950K24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-950K24.2	8553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	118592872	118593203	118593036	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	9184	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	118626064	118626362	118626186	Y	DMXL1,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	23677	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	118670685	118671156	118670901	Y	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	68298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr5	120004624	120004640	120004633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	990732	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	122885327	122885717	122885442	Y	CEP120,CSNK1G3	CSNK1G3	NA	NA	NA	NA	CSNK1G3	39534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	123987356	123987539	123987440	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	155387	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	124748569	124748778	124748675	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-436H11.1	605643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	125704201	125704675	125704554	Y	C5orf48	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	10377	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	127421091	127421133	127421112	Y	NA	SLC12A2	NA	NA	NA	NA	SLC12A2	3633	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	127717489	127717780	127717635	Y	FBN2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A2	300031	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	128432436	128432693	128432508	Y	SLC27A6,SLC27A6,ISOC1	ISOC1	NA	NA	NA	NA	ISOC1	3992	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	128462285	128462535	128462410	Y	NA	ISOC1	NA	NA	NA	NA	ISOC1	33841	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.83417572815571
chr5	128924961	128925290	128925126	Y	ADAMTS19	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS19-AS1	130579	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	129020678	129020929	129020798	Y	ADAMTS19	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY3	217236	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	130711215	130711396	130711236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	132029	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	130715394	130715800	130715520	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	136208	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.835723328784669
chr5	131763102	131763516	131763179	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	18774	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	131800033	131800450	131800090	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	24040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60954970909234
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.08736276784719
chr5	132581339	132581487	132581431	Y	ANKRD43	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	195685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.19208599818553
chr5	132792857	132792990	132792924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	407203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	133331351	133332089	133331904	Y	NA	C5orf15,VDAC1	C5orf15	IMR90	Hi-C	24141950	VDAC1	6735	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	133460352	133460406	133460379	Y	UBE2B,PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	11950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	133470244	133470404	133470305	Y	NA	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	21842	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	133543428	133543671	133543548	Y	NA	SKP1,MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	MIR3661	15777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	133681629	133682059	133681927	Y	NA	CDKL3,UBE2B	NA	NA	NA	NA	CDKL3	22679	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.40483360987031
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	37651	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr5	133847692	133847829	133847767	Y	NA	AC005355.2	PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	7449	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr5	133890594	133890960	133890666	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	50351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.54428309784253
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.803090023159767
chr5	134469772	134469821	134469797	Y	C5orf20	NA	PCBD2,LOC340073,PITX1,CATSPER3,H2AFY	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	101269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	134471631	134472059	134471710	Y	C5orf20,PITX1	NA	PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	103128	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	134527149	134527274	134527245	Y	NA	NA	CATSPER3,PCBD2,H2AFY,PITX1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	158646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	134727973	134728292	134728105	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	5312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr5	134977604	134977997	134977801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXCL14	64635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr5	135347789	135348106	135347904	Y	NA	TGFBI	VTRNA2-1,TGFBI	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	14478	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	136104885	136104913	136104899	Y	NA	NA	SPOCK1	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD5	638351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr5	136374592	136374995	136374792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	557073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	136477732	136478020	136477766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	454048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	136478407	136478752	136478599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	453316	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98812159262141
chr5	136786191	136786446	136786319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	145622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	137784370	137784924	137784495	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	REEP2	11664	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.21394207189714
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.88157923376778
chr5	137810438	137810840	137810496	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	11259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr5	137826508	137826985	137826545	Y	NA	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	27329	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.878948163887287
chr5	137833063	137833252	137833158	Y	FAM53C,EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	33884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	137991577	137991739	137991658	Y	NA	CTNNA1	SIL1,MATR3,CTNNA1,HSPA9,LRRTM2	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNA1	46921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	138078029	138078389	138078209	Y	NA	AC034243.1	CTNNA1,SIL1,HSPA9,MATR3	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	8609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	138241399	138241693	138241546	Y	NA	NA	SIL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	154401	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	161141	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	138258617	138258897	138258757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	171619	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	138262166	138262549	138262196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	175168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	138686401	138686737	138686569	Y	NA	PAIP2	NA	NA	NA	NA	PAIP2	11125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	138727034	138727338	138727139	Y	LOC389333	SPATA24	NA	NA	NA	NA	SPATA24	10439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.35074071720506
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	139017086	139017541	139017145	Y	CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	7343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	139017934	139018665	139018227	Y	MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	6219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.9500983171195
chr5	139022530	139022885	139022670	Y	NA	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	1999	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.90078153118655
chr5	139023017	139023340	139023136	Y	NA	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	1544	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.89045072443692
chr5	139040519	139041115	139040855	Y	PAIP2	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	15635	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.995291145446165
chr5	139049454	139050310	139049802	Y	MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	24570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	139076374	139076603	139076510	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	51490	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.73648215355889
chr5	139077054	139077268	139077188	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	52170	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	139088295	139089196	139088669	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	63411	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr5	139090416	139090834	139090571	Y	MATR3,MATR3,CXXC5	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	65532	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	66056	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.15396857087803
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	139984023	139984383	139984203	Y	NA	SRA1,SLC35A4,APBB3,TMCO6,IK,NDUFA2,MIR3655	HARS,SLC35A4,APBB3,ANKHD1-EIF4EBP3,SRA1	IMR90	Hi-C	24141950	APBB3	12686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.03448704180661
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0817408156514
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	140457576	140457668	140457630	Y	NA	PCDHB2,PCDHB3,PCDHB4	NA	NA	NA	NA	PCDHB2	14559	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.47898481255486
chr5	140714021	140714065	140714043	Y	PCDHB12,PCDHB15,PCDHGC4	TAF7,PCDHGA1,PCDHGA2,PCDHGB1,PCDHGB2,PCDHGA5,PCDHGA6,PCDHGA7	NA	NA	NA	NA	PCDHGA2	2474	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	22059	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr5	140894023	140894210	140894163	Y	NA	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	40443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	56558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	140985133	140985553	140985464	Y	TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	11069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	141394614	141394984	141394650	Y	PCDH12	GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	4008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr5	141917041	141917377	141917209	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	213021	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	142600445	142600900	142600783	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	109270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	142785420	142785784	142785543	Y	NR3C1	NR3C1	ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	27293	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr5	142974978	142975222	142975128	Y	NR3C1,NR3C1	NA	ARHGAP26,NR3C1,KCTD16,YIPF5,HMHB1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	161901	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	147364399	147364757	147364579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO38	396741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	31391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr5	148349939	148350092	148350025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRB2	145783	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	148505231	148505419	148505389	Y	NA	ABLIM3	ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	13627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01984386717439
chr5	148508817	148508996	148508890	Y	NA	ABLIM3	ADRB2,AFAP1L1,SH3TC2,ABLIM3,PCYOX1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABLIM3	10050	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr5	148514080	148514173	148514127	Y	NA	ABLIM3	ABLIM3,AFAP1L1,ADRB2,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	4873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	148700478	148700631	148700542	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL2	22362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	149110531	149110757	149110649	Y	PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.46865400580523
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	149838456	149838698	149838517	Y	SYNPO,ZNF300,SLC6A7	CD74,RPS14,NDST1,CTC-367J11.1	NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS14	11137	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	149921548	149921861	149921663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNPO	56781	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	149985154	149985492	149985203	Y	NA	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	6512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	150006488	150006837	150006695	Y	SYNPO,MYOZ3	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	27846	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr5	150108879	150109189	150109172	Y	SYNPO	RBM22,DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	27482	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	150403932	150404163	150404140	Y	NA	GPX3	NA	NA	NA	NA	GPX3	5808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	150533385	150533816	150533573	Y	NA	ANXA6	NA	NA	NA	NA	ANXA6	1627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	150974691	150975014	150974782	Y	SLC36A3	NA	FAT2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A1	160084	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	151088912	151089056	151088970	Y	SLC36A3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	54883	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	151108065	151108456	151108379	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	35483	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	153809274	153809597	153809436	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	13813	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	153862086	153862603	153862319	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L	HAND1,FAM114A2,MFAP3,LARP1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	SAP30L	38569	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	153963327	153963532	153963423	Y	MRPL22,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	LARP1	126930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr5	154224391	154224774	154224575	Y	NA	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	10339	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	158366953	158367057	158367005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF145	268004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr5	158471730	158472045	158472013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF145	163016	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	158491555	158491917	158491726	Y	EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF145	143144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	158938695	158938959	158938847	Y	EBF1	NA	ADRA1B,LOC285627,TTC1	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	250606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	159471418	159471693	159471487	Y	SLU7	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	37298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr5	167212148	167212412	167212280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	504244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	167716783	167717259	167717053	Y	NA	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	127	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	169578231	169578535	169578387	Y	NA	FOXI1	KCNIP1,KCNMB1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXI1	47330	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	GABRP	127423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr5	170172646	170172739	170172712	Y	NA	GABRP	NA	NA	NA	NA	GABRP	15615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22579777286338
chr5	170174489	170174734	170174652	Y	GABRP	GABRP	NA	NA	NA	NA	GABRP	13620	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	170177072	170177289	170177179	Y	GABRP	GABRP	NA	NA	NA	NA	GABRP	11065	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	170179191	170179549	170179383	Y	GABRP	GABRP	NA	NA	NA	NA	GABRP	8805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr5	170552523	170552751	170552637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	259369	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	171298269	171298393	171298371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	133484	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	171560333	171560981	171560496	Y	UBTD2,STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	52409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	172064248	172064489	172064361	Y	NA	NEURL1B,CTB-79E8.3	NA	NA	NA	NA	NEURL1B	1780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.916292390636061
chr5	172182355	172182703	172182434	Y	NA	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	13495	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr5	172329840	172330200	172330006	Y	DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	53532	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	172729503	172729731	172729610	Y	NA	STC2	NA	NA	NA	NA	STC2	24775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr5	172730964	172731211	172731128	Y	NA	STC2	NA	NA	NA	NA	STC2	23295	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr5	172761341	172761739	172761505	Y	STC2	STC2	NA	NA	NA	NA	STC2	6835	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	172880266	172880558	172880434	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	125760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.1607395704615
chr5	172881373	172881649	172881564	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	126867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr5	172899322	172899544	172899428	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	142119	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	173031200	173031306	173031275	Y	NA	BOD1	NA	NA	NA	NA	BOD1	10357	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	173191567	173191754	173191643	Y	CPEB4	NA	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	121529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	173251298	173251668	173251379	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	61615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	173252274	173252478	173252451	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	60805	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.13529645750364
chr5	173391031	173391183	173391109	Y	HMP19	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	77748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	173846628	173846975	173846845	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	302561	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	173909800	173909986	173909867	Y	NA	NA	MIR4634,MSX2	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	239550	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr5	174148035	174148467	174148121	Y	MSX2	MSX2	NA	NA	NA	NA	MSX2	1069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	176250127	176250448	176250189	Y	GPRIN1,SNCB,EIF4E1B,NSD1,UNC5A	UNC5A	NA	NA	NA	NA	UNC5A	14649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	176699119	176699281	176699198	Y	NSD1	RAB24,PRELID1,MXD3	NA	NA	NA	NA	RAB24	29464	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,GRK6	NA	NA	NA	NA	LMAN2	13315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	16897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	177505252	177505654	177505536	Y	NA	RP11-889L3.1,N4BP3	N4BP3,GMCL1P1,NHP2,HNRNPAB,AGXT2L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-889L3.1	24647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43327863933903
chr5	177508624	177508880	177508650	Y	NA	RP11-889L3.1,N4BP3,RMND5B	N4BP3,GMCL1P1,NHP2,AGXT2L2,HNRNPAB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-889L3.1	28019	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr5	177513304	177513421	177513395	Y	NA	RP11-889L3.1,N4BP3,RMND5B	NHP2,RMND5B,HNRNPAB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	N4BP3	25023	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.8472258893343
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.15516303109037
chr5	177542150	177542670	177542238	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	3706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	177543541	177543921	177543784	Y	AGXT2L2,N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	5097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr5	178034122	178034420	178034258	Y	ZNF354B,AGXT2L2,CLK4	COL23A1,CLK4	NA	NA	NA	NA	COL23A1	18566	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	COL23A1,CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B,RNU1-39P	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	179434619	179435010	179434852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF130	62108	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr5	179496400	179496705	179496553	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	413	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	179512347	179512479	179512439	Y	MAML1,LTC4S	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	15229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr5	179777875	179778220	179778048	Y	OR2Y1	GFPT2	NA	NA	NA	NA	GFPT2	167	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr5	180300925	180301152	180301099	Y	MGAT1,MGAT1,BTNL8	LINC00847,ZFP62	MGAT1,LOC729678,LOC100859930,BTNL9,BTNL8	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP62	14639	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36353222222561
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	1311552	1311897	1311757	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	1641578	1641903	1641733	Y	NA	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	32897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	2038182	2038509	2038345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	205417	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	2081468	2081822	2081645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	162104	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	2330490	2330806	2330587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	86508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	2902288	2902696	2902436	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	NA	MGC39372,MIR4645,SERPINB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB1	62048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	24309	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.495175587816035
chr6	3749707	3750120	3749911	Y	C6orf145	PXDC1	NA	NA	NA	NA	PXDC1	140	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr6	4362615	4362967	4362771	Y	CDYL	NA	CDYL	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	228784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	4511516	4511645	4511592	Y	NA	NA	CDYL	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	192748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	4931719	4931926	4931911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPP40	70371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14677837821098
chr6	6702168	6702420	6702249	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	403410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr6	6712780	6713068	6712936	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	392762	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr6	6750084	6750462	6750414	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	355368	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.17224213101113
chr6	6803868	6804205	6804018	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	301625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	6825409	6825642	6825558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	280188	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr6	6886373	6886682	6886449	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	219148	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	7112981	7113125	7113000	Y	RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	7151	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	7130548	7130794	7130662	Y	RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	24718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75044541237944
chr6	7392474	7392879	7392481	Y	NA	SSR1,RIOK1,CAGE1	NA	NA	NA	NA	CAGE1	4498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	7505623	7505742	7505694	Y	RREB1,DSP	DSP	DSP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DSP	34066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	7532623	7532708	7532667	Y	NA	DSP	CAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	DSP	7100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr6	7544425	7544740	7544519	Y	NA	DSP,SNRNP48	NA	NA	NA	NA	DSP	4617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr6	7673327	7673604	7673437	Y	NA	NA	MUTED-TXNDC5,BMP6	IMR90	Hi-C	24141950	BMP6	51426	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	8083649	8083837	8083720	Y	NA	EEF1E1	NA	NA	NA	NA	EEF1E1	16974	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	9503675	9503928	9503802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	913964	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	9516527	9516706	9516607	Y	NA	NA	LOC100130275,TFAP2A,LINC00518	IMR90	Hi-C	24141950	TFAP2A	901186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.2587145076287
chr6	10383571	10383981	10383824	Y	TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	33911	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	10719904	10720278	10720060	Y	NA	PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	TMEM14C	870	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	10825104	10825395	10825250	Y	ELOVL2	MAK	NA	NA	NA	NA	MAK	11369	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr6	11197003	11197299	11197017	Y	ERVFRD-1,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	154456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	167522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr6	11229489	11229708	11229675	Y	TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	150873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr6	11316345	11316699	11316437	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	63882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.42699947774391
chr6	11357622	11357891	11357774	Y	NA	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	22690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr6	11390283	11390548	11390416	Y	NEDD9	NEDD9	NEDD9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NEDD9	9702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.47898481255486
chr6	11439294	11439659	11439465	Y	TMEM170B,ERVFRD-1,NEDD9	NA	NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1,ELOVL2,SYCP2L	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD9	58713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	11606636	11606709	11606673	Y	NA	NA	TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	70698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	11750046	11750450	11750402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	214108	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	12287477	12287842	12287503	Y	NA	EDN1	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	754	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0027420608413
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	12291396	12291672	12291434	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	2800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01307286759093
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.41148861829439
chr6	12328741	12329205	12329092	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	40145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	12332214	12332482	12332362	Y	NA	EDN1	EDN1,TMEM170B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EDN1	43618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.96108753277997
chr6	12383787	12384051	12383890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	95191	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.450380445672128
chr6	12472967	12473281	12473124	Y	NA	RPL15P3	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	39061	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	12485726	12485919	12485760	Y	NA	RPL15P3	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	26423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr6	12573441	12573699	12573559	Y	NA	NA	EDN1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	61099	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	12602673	12603131	12602821	Y	NA	NA	TMEM170B,EDN1,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	90331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.2282584711343
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	217412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.811170607056443
chr6	13096654	13096703	13096662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	115585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	13307248	13307611	13307538	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	LOC100130357	K562	ChIA-PET	22265404	TBC1D7	19204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	13454706	13455038	13454979	Y	RANBP9,TBC1D7,GFOD1,GFOD1	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	30856	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	13602068	13602103	13602086	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	11456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.64288563694124
chr6	14721605	14721949	14721821	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	522578	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	14744083	14744613	14744392	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	499914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr6	14762682	14762941	14762784	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	481586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	14763577	14763747	14763646	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	480780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr6	14766593	14766865	14766789	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	477662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	14910842	14911169	14911097	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	333358	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	14945973	14946248	14946214	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	298279	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	14982265	14982427	14982346	Y	JARID2	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	262100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	15022090	15022421	15022413	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	222106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.10357418295066
chr6	15037123	15037399	15037250	Y	NA	NA	JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	207128	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32618799547683
chr6	15066743	15067555	15067031	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	176972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr6	15485085	15485275	15485180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	176014	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	15530882	15531100	15530987	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	130189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	15589107	15589675	15589446	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	71614	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	15908447	15908579	15908514	Y	NA	NA	MYLIP	K562	ChIA-PET	22265404	MYLIP	218777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	16322882	16323237	16323091	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	86071	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	16439523	16439703	16439580	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	202712	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	16488193	16488587	16488526	Y	MYLIP	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	251382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	16588159	16588355	16588257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	171014	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	17280388	17280785	17280395	Y	CAP2,RBM24,RBM24,RBM24	RBM24	NA	NA	NA	NA	RBM24	811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	17430018	17430227	17430123	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	38571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	17473157	17473283	17473220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	56600	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	17864491	17864751	17864619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	121103	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	18020711	18021071	18020890	Y	NA	KIF13A	KIF13A,NHLRC1,TPMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KIF13A	34857	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	18342517	18342875	18342695	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	23904	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.38248569817038
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	20444927	20445761	20445060	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	44529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.12194309440086
chr6	21589338	21589711	21589681	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr6	21738487	21738974	21738702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	146515	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr6	21740205	21740397	21740265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	148233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	24302656	24303033	24302868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCDC2	53247	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	24313904	24313964	24313914	Y	DCDC2,KAAG1,DCDC2	DCDC2	NA	NA	NA	NA	DCDC2	42316	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr6	24323980	24324360	24324286	Y	DCDC2,KAAG1,DCDC2	DCDC2	NA	NA	NA	NA	DCDC2	31920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr6	24341517	24341649	24341583	Y	DCDC2,KAAG1,DCDC2	DCDC2	NA	NA	NA	NA	DCDC2	14631	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAHP	70052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	25193718	25194203	25194002	Y	NA	CMAHP	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	CMAHP	28925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr6	25525007	25525226	25525060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AA	199564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr6	26025834	26026125	26026038	Y	BTN2A1,BTN2A1,TRIM38	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83888458270955
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.85673894975907
chr6	26169489	26169538	26169514	Y	BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BE	12420	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr6	26219063	26219301	26219164	Y	NA	HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AE	3898	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr6	26232920	26233434	26233137	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	26266741	26266990	26266911	Y	NA	HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H3G	2622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr6	26283996	26284379	26284279	Y	NA	HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H4H	234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19808379721027
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	27071259	27071558	27071409	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	26983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.34486010885122
chr6	27203038	27203420	27203229	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	26015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.775396687348956
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	27780866	27781094	27780996	Y	ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BM	44	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.923743306031195
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN12P1,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12P1	15544	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.33052100320171
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	COX11P1	NA	NA	NA	NA	COX11P1	44475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr6	28601930	28602271	28602104	Y	NA	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	19941	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr6	28715387	28715696	28715451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND3	133398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr6	28834475	28834586	28834545	Y	NA	HCG14	NA	NA	NA	NA	HCG14	27721	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.17941168383589
chr6	28860175	28860528	28860363	Y	NA	HCG14,TRIM27	NA	NA	NA	NA	HCG14	1779	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	29568471	29568641	29568556	Y	MOG,GABBR1	NA	NA	NA	NA	NA	HLA-F	119911	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	26974	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.732171852246339
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	28146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr6	30175844	30176213	30176153	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2991	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	30182160	30182533	30182417	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr6	30651242	30651620	30651357	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	30716024	30716359	30716084	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	5693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr6	31275830	31276119	31275994	Y	NA	HLA-C,RPL3P2,HLA-B	MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26	IMR90	Hi-C	24141950	RPL3P2	29736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	31789098	31789184	31789146	Y	TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	4328	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.41345627906546
chr6	31942054	31942322	31942254	Y	NA	SKIV2L,STK19	NA	NA	NA	NA	STK19	5186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	32050642	32051035	32051003	Y	LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB	ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	ATF6B	42995	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	32427743	32428120	32427936	Y	PRRT1	HLA-DRA	NA	NA	NA	NA	HLA-DRA	22124	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr6	33129390	33129479	33129402	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1	NA	NA	NA	NA	SLC39A7	36743	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.854395442159057
chr6	33699058	33699289	33699109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	55624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	33950913	33951144	33951041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01016	88222	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.3984384571158
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.01513501262056
chr6	34512763	34512881	34512822	Y	SPDEF	SPDEF,RP3-391O22.3	NA	NA	NA	NA	SPDEF	9229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.09169577557208
chr6	34514432	34514838	34514655	Y	NA	SPDEF,RP3-391O22.3	NA	NA	NA	NA	SPDEF	7272	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.67018041951076
chr6	34521580	34522143	34521703	Y	NA	RP3-391O22.3	NA	NA	NA	NA	SPDEF	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.4099183112531
chr6	34522619	34522917	34522660	Y	SPDEF	SPDEF,RP3-391O22.3	NA	NA	NA	NA	SPDEF	509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.85872844988394
chr6	35026753	35026994	35026778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCUBE3	153196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	35133552	35133743	35133648	Y	NA	SCUBE3	UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3	IMR90	Hi-C	24141950	SCUBE3	46447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr6	35152934	35153484	35153156	Y	NA	SCUBE3	UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11	IMR90	Hi-C	24141950	SCUBE3	26706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	35228332	35228733	35228603	Y	PPARD,ZNF76	SCUBE3,ZNF76,DEF6	NA	NA	NA	NA	ZNF76	3646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	35622155	35622366	35622317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	71994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	35632268	35633036	35633003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	61324	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	36086314	36086741	36086595	Y	SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3	MAPK13	NA	NA	NA	NA	MAPK13	6845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.492034973733454
chr6	37094186	37094408	37094276	Y	PPIL1	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	41571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	38185251	38185625	38185371	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	399976	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	38229881	38230014	38229948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	375910	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr6	39171657	39171958	39171719	Y	NA	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	23268	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.79683150140694
chr6	39279620	39279758	39279742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK5	84394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr6	40215028	40215342	40215185	Y	NA	NA	KIF6	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-278E11.3	290456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	40544323	40544531	40544427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	494153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	40678267	40678503	40678338	Y	NA	NA	APOBEC2	IMR90	Hi-C	24141950	NFYA	360181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	40964511	40964818	40964666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73866	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	40965087	40965613	40965406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73071	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42086253	42086632	42086383	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	21725	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01984386717439
chr6	42090479	42090803	42090657	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	17554	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.36353222222561
chr6	42255073	42255501	42255249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	71470	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42259187	42259201	42259195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	75584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42284486	42284710	42284609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	100883	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42361651	42361664	42361659	Y	TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	56125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42361929	42362135	42362048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	55654	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42409399	42409623	42409499	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	8166	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.14642317122432
chr6	42738530	42739530	42738949	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226	ATP6V0CP3,TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	25972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42739653	42739820	42739731	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,C6orf226	ATP6V0CP3,TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	27095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	42898508	42898648	42898552	Y	NA	C6orf226,CNPY3,RPL24P4,GNMT,PEX6	NA	NA	NA	NA	CNPY3	3570	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	43117769	43118043	43117966	Y	RSPH9,MAD2L1BP,C6orf154	SRF,CUL9	NA	NA	NA	NA	SRF	18994	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	43635973	43636240	43636108	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	17288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr6	43774176	43774478	43774332	Y	NA	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	38255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	80166	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	44026121	44027353	44026480	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	65298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	44040704	44041103	44040711	Y	C6orf223,NFKBIE	NA	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A,HSP90AB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	51548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	44052522	44052743	44052633	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	MAD2L1BP,GTPBP2,RSPH9,POLH,VEGFA,MRPS18A,XPO5,LOC100132354,TMEM63B,CAPN11,MRPL14,HSP90AB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	39908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	44096308	44096658	44096594	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	MRPL14	3114	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr6	44396303	44396427	44396307	Y	NA	CDC5L	NA	NA	NA	NA	CDC5L	43041	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	44519247	44519352	44519300	Y	NA	NA	CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	165985	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	44949602	44949944	44949774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	393746	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	45083481	45083547	45083514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	260143	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	45391820	45391891	45391857	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48130	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	45409618	45409900	45409810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	65928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	45413515	45413853	45413708	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	69825	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	47704906	47704915	47704911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR115	53306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	49508325	49508636	49508524	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	7477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	49508939	49509088	49508998	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	7025	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr6	49509760	49510135	49509972	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	5978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr6	49510900	49511136	49511061	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	4977	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.81550361478132
chr6	49521190	49521511	49521254	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	5077	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.71666099279683
chr6	49524322	49524464	49524384	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	8209	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr6	49858814	49859043	49858929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf141	342701	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	RP3-437C15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-437C15.1	1925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	52261634	52261809	52261784	Y	EFHC1	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	EFHC1	21297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	52339756	52339820	52339788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	56650	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr6	53195071	53195341	53195324	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	16606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	53199994	53200715	53200310	Y	FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	11232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr6	53329907	53330283	53330016	Y	NA	NA	GCM1	IMR90	Hi-C	24141950	ELOVL5	117960	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr6	53617793	53617916	53617855	Y	NA	LRRC1	LRRC1,GCLC	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC1	39379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	53660581	53660848	53660781	Y	LRRC1	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	3286	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	53838542	53838554	53838548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	181247	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	54563992	54564126	54564047	Y	NA	NA	HCRTR2,FAM83B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM83B	145443	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr6	54583648	54583812	54583730	Y	NA	NA	FAM83B,HCRTR2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM83B	125757	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	54714400	54714688	54714559	Y	NA	FAM83B	NA	NA	NA	NA	FAM83B	4831	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	55228034	55228050	55228042	Y	HMGCLL1,GFRAL	NA	NA	NA	NA	NA	HMGCLL1	213962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	55501240	55501664	55501490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGCLL1	59228	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.939274805323
chr6	57292576	57292862	57292719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	114973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	57325457	57325813	57325552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	147854	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	63124224	63124506	63124365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1C	794845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	64386722	64387357	64386973	Y	PHF3	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	42997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	66497701	66498057	66497748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	2153976	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	70489653	70490034	70489967	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	14969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	71133094	71133376	71133235	Y	NA	FAM135A	NA	NA	NA	NA	FAM135A	12450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	71548622	71548700	71548661	Y	FAM135A	NA	NA	NA	NA	NA	SMAP1	173143	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	72051718	72051897	72051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	55212	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.98929334642142
chr6	73524800	73525128	73524864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	195280	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr6	73981759	73981798	73981779	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	10821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	73987583	73987923	73987651	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	KHDC1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398K22.12	16645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	74186150	74186447	74186193	Y	MTO1	MB21D1,MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	16849	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	74307690	74308056	74307857	Y	KHDC1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC17A5	53822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	74861347	74861685	74861516	Y	NA	NA	COL12A1	IMR90	Hi-C	24141950	CD109	457839	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	75911376	75911573	75911562	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	2194	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr6	76498619	76498787	76498703	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	41710	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr6	80663174	80663336	80663221	Y	NA	ELOVL4,TTK	NA	NA	NA	NA	ELOVL4	7877	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	81044945	81045591	81045323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	230581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	81048044	81048318	81048128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	233680	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	82522164	82522345	82522246	Y	FAM46A	NA	BCKDHB,FAM46A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM46A	61673	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	83279659	83280006	83279832	Y	NA	NA	TPBG,IBTK,UBE3D	MCF7	ChIA-PET	22265404	TPBG	208736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr6	83931407	83931579	83931543	Y	UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	IMR90	Hi-C	24141950	PGM3	29752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	84139998	84140114	84140099	Y	ME1	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	1201	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr6	84877511	84877669	84877594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	57684	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	84931248	84931348	84931298	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	4005	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	87431954	87432148	87432061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTR1E	212876	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.79683150140694
chr6	87433521	87433927	87433716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTR1E	211097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.60238015626758
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr6	88183289	88183642	88183572	Y	NA	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	4948	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	88398633	88398672	88398653	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	11255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	88441576	88441861	88441705	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	AKIRIN2,AKIRIN2-AS1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AKIRIN2	31649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	90031448	90031662	90031542	Y	PNRC1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	28905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	90596283	90596734	90596349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	58670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	90856849	90857084	90856969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	147543	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	92185644	92186055	92185825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	890880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.916292390636061
chr6	93036003	93036032	93036018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	1091233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	93697293	93697548	93697421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	429717	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	97681036	97681361	97681334	Y	NA	MMS22L	NA	NA	NA	NA	MMS22L	47732	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	99275631	99275937	99275716	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	117912	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	99280317	99280875	99280652	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	112974	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	99886915	99887218	99887074	Y	NA	COQ3,RP11-98I9.4,PNISR	NA	NA	NA	NA	PNISR	15708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	100007525	100007878	100007702	Y	LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	6971	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	100008682	100008928	100008805	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	5921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	100012296	100012415	100012356	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	2434	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	100584000	100584312	100584155	Y	NA	NA	SIM1,ASCC3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	391840	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	100676865	100677032	100676949	Y	NA	NA	SIM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	299120	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	101311437	101311450	101311446	Y	NA	ASCC3	NA	NA	NA	NA	ASCC3	15798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	102471700	102472091	102472046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	1144452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	105214871	105215235	105215053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	90559	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	106057484	106057635	106057546	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	208525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	AIM1	56310	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	107230465	107230834	107230696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf203	116573	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr6	108324190	108324471	108324239	Y	NA	SEC63,RPL3P7	NA	NA	NA	NA	RPL3P7	301	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr6	108574394	108574619	108574507	Y	NA	SNX3,LACE1	NA	NA	NA	NA	SNX3	5845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.959517225738678
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.715070045913242
chr6	108951509	108952142	108951722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	72471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	108954654	108955002	108954825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	75616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	109217323	109217611	109217483	Y	FOXO3,CD164	ARMC2,RP11-249L21.4	NA	NA	NA	NA	RP11-249L21.4	9465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	109218749	109218814	109218782	Y	NA	RP11-249L21.4	NA	NA	NA	NA	RP11-249L21.4	8262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	109268721	109269067	109268913	Y	NA	RP11-249L21.4	SESN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-249L21.4	41645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr6	109269728	109269873	109269801	Y	NA	RP11-249L21.4	SESN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-249L21.4	42652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr6	109288163	109288636	109288487	Y	FOXO3,SMPD2,MICAL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-249L21.4	61087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr6	109672770	109673128	109672949	Y	NA	CD164	NA	NA	NA	NA	CD164	28634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	109680867	109680881	109680874	Y	SMPD2	CD164	NA	NA	NA	NA	CD164	20881	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	110360700	110361043	110360911	Y	GPR6	NA	FIG4,AKD1,PPIL6,MICAL1,SMPD2,DDO,METTL24	IMR90	Hi-C	24141950	WASF1	138164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr6	110812850	110813232	110813170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC40	313506	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	111409580	111409942	111409703	Y	AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10	SLC16A10	NA	NA	NA	NA	SLC16A10	2799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	111776910	111777281	111777179	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	25433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr6	111784023	111784230	111784203	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	18484	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	111905296	111905479	111905396	Y	NA	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	20002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	112306517	112306577	112306547	Y	TRAF3IP2	NA	FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	100155	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr6	115163170	115163515	115163320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC2	832698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	115795867	115795888	115795877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRK	584033	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	116395142	116395462	116395394	Y	NA	FRK,NT5DC1	FRK,TPI1P3,NT5DC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FRK	15221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	117003694	117003845	117003770	Y	TSPYL4,TSPYL1,DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	KPNA5	3344	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr6	118964875	118965125	118965000	Y	MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	CEP85L	64113	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	119131601	119131904	119131835	Y	C6orf204,MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	81480	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	120445667	120446036	120445852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	776741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	121399720	121399938	121399829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	354900	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	123013285	123013516	123013365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	94799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr6	123017987	123018416	123018219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	89899	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr6	123412243	123412622	123412277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	303928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr6	125523153	125523251	125523202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	84958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	125599408	125599745	125599577	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	21537	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	126071522	126071828	126071676	Y	NA	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	HEY2	4712	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	128637396	128637725	128637581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	202145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr6	128919743	128920041	128919928	Y	PTPRK,PTPRK	NA	PTPRK	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTPRK	79873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23,RNU4-18P	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	132406911	132407089	132407028	Y	NA	NA	CTGF,LOC100507254,ENPP1	IMR90,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	CTGF	136398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	135489674	135489968	135489829	Y	NA	MYB	AHI1,BCLAF1,MYB	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYB	10485	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.96542054050485
chr6	136691586	136691742	136691665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	82597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	136702762	136702864	136702842	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	93773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	136807435	136807796	136807768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	62161	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	136965409	136965459	136965418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	95452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	137545116	137545441	137545236	Y	MAP3K5,IFNGR1	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	6530	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	137999518	137999862	137999682	Y	NA	NA	IL20RA	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	186489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	138131793	138132158	138131947	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	54193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	138132277	138133056	138132650	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	53295	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	138356192	138356530	138356352	Y	NA	NA	PERP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PERP	70118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	138426575	138426770	138426671	Y	PERP	NA	NA	NA	NA	NA	PERP	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	138552516	138552583	138552548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	71458	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr6	138876782	138877039	138876959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	154114	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	138890859	138891324	138891176	Y	PBOV1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	168191	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	139697079	139697371	139697327	Y	NA	CITED2	NA	NA	NA	NA	CITED2	3322	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	139852407	139852567	139852460	Y	HECA	NA	LOC100132735,CITED2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	158650	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr6	140299062	140299512	140299364	Y	NA	NA	CITED2,HECA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	605305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	140858869	140859245	140859045	Y	NA	NA	LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	1165112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.02546581937019
chr6	140860203	140860346	140860259	Y	NA	NA	LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	1166446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	141300848	141301178	141301014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	1165189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	141873662	141873944	141873832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	592423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	142091291	142091499	142091406	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	374868	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	142644630	142644955	142644766	Y	NA	GPR126	NA	NA	NA	NA	GPR126	23639	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	143471502	143471640	143471571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	91869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	143770817	143770943	143770879	Y	ADAT2	ADAT2,PEX3	NA	NA	NA	NA	PEX3	873	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr6	143864167	143864345	143864273	Y	NA	FUCA2,PHACTR2	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	8185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	144015519	144015660	144015590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	146821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	144537313	144537754	144537668	Y	NA	TPT1P4	STX11,SF3B5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TPT1P4	17211	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	145131744	145132215	145131879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	611642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	145588326	145588537	145588434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2A	466623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	145977217	145977350	145977284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2A	77810	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	146867560	146867942	146867733	Y	RAB32	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	4731	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	147124877	147125201	147125102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	262048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	148628020	148628101	148628061	Y	NA	SASH1	SASH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SASH1	36580	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	149381475	149381972	149381595	Y	ZC3H12D,TAB2,PPIL4	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	29766	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr6	149382626	149382831	149382713	Y	NA	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	30917	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.19091424438552
chr6	149400726	149401123	149400736	Y	NA	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	49017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr6	149829691	149830032	149829852	Y	LATS1,KATNA1,TAB2,SUMO4,ZC3H12D,PPIL4	PPIL4	NA	NA	NA	NA	PPIL4	35142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	149929442	149929538	149929496	Y	NA	RPS18P9,KATNA1	NA	NA	NA	NA	RPS18P9	16222	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr6	151770191	151770744	151770510	Y	NA	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	RMND1	515	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.715070045913242
chr6	151806818	151807048	151806974	Y	ZBTB2	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	C6orf211	35396	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	151815811	151815987	151815867	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1,C6orf97	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	C6orf211	44389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	12.4202747580436
chr6	151820828	151820963	151820895	Y	ZBTB2	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	C6orf211	49406	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	151937495	151937566	151937531	Y	ESR1,ESR1	ESR1	NA	NA	NA	NA	ESR1	38260	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.53369156836481
chr6	151973040	151973410	151973224	Y	NA	ESR1	NA	NA	NA	NA	ESR1	2416	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.41825961787786
chr6	151973589	151973736	151973663	Y	NA	ESR1	NA	NA	NA	NA	ESR1	2090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr6	151979271	151979626	151979398	Y	NA	ESR1	C6orf97	MCF7	ChIA-PET	22265404	ESR1	3445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	11.0837745290894
chr6	151986546	151986831	151986690	Y	NA	ESR1	ESR1,C6orf97,RMND1,C6orf211,SYNE1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ESR1	10720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.14366047054073
chr6	151987748	151987949	151987849	Y	ESR1,C6orf97,ESR1	ESR1	ESR1,RMND1,C6orf211,SYNE1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ESR1	11922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	14.2789119897505
chr6	151990047	151990437	151990162	Y	NA	ESR1	ESR1,RMND1,C6orf211,SYNE1,C6orf97	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ESR1	14221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.53268811960436
chr6	151998579	151998786	151998683	Y	NA	ESR1	ESR1,C6orf97	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ESR1	22753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.951175919113921
chr6	152012429	152012574	152012475	Y	ZBTB2,C6orf97,ESR1	ESR1	NA	NA	NA	NA	ESR1	36603	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr6	152024103	152024469	152024196	Y	NA	ESR1	NA	NA	NA	NA	ESR1	48277	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.06114525481909
chr6	152027567	152027789	152027650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESR1	51741	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr6	152064394	152064417	152064406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESR1	88568	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	152085145	152085342	152085266	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	ESR1	109319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.56220351755901
chr6	152213732	152213746	152213738	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	ESR1	237906	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	152281783	152282174	152281880	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	ESR1	305957	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr6	153411582	153411939	153411751	Y	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	89762	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	154664890	154665258	154665161	Y	IPCEF1	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	164535	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.1675332764573
chr6	155509471	155509833	155509659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	66025	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	155545212	155545590	155545426	Y	SCAF8	RP11-477D19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	30268	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	155593046	155593119	155593050	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	17188	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	156758659	156759033	156758861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	338030	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.81550361478132
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr6	157144043	157144235	157144146	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	46980	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.83888458270955
chr6	157695432	157695688	157695582	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	46945	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr6	158424430	158424803	158424679	Y	SYNJ2	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	23542	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	158472000	158472226	158472116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	71112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.44164058580608
chr6	158640222	158640658	158640460	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2H5	52838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	158702253	158702563	158702348	Y	TMEM181	NA	TMEM181,TULP4,SYTL3,GTF2H5,DYNLT1	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2H5	114869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	158895983	158896180	158896053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	59288	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22579777286338
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	160135538	160135989	160135680	Y	IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	8628	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr6	160409606	160409719	160409663	Y	IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	21475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	163972161	163972427	163972234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	139129	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	164520797	164520864	164520831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	687765	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	165696140	165696152	165696147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	701939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	166055438	166055636	166055513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	342455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	166067204	166067448	166067238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	330643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	166067950	166069085	166068916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	329006	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A	NA	NA	NA	NA	PDE10A	24211	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr6	166754936	166755437	166755076	Y	SFT2D1	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	857	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	166970262	166970784	166970543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	216183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr6	167001220	167001407	167001338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	247141	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr6	168198261	168198623	168198456	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	26979	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.05315915518099
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	168789584	168789819	168789635	Y	NA	NA	CCR6	IMR90	Hi-C	24141950	SMOC2	50012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	251753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr6	169495883	169496177	169495989	Y	NA	NA	PHF10,THBS2,WDR27,C6orf70	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	64842	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	170352210	170352516	170352388	Y	TCTE3,FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	TCTE3	202555	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	170449336	170449548	170449442	Y	NA	NA	DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	148013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr6	170468202	170468424	170468316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	129137	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr6	170501868	170502090	170502073	Y	DLL1	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	95471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr6	170589556	170589600	170589578	Y	WDR27,TCTE3,TBP	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	DLL1	7961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM20C	182125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	475920	475996	475984	Y	NA	NA	HEATR2,PRKAR1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	81937	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.13018904970852
chr7	875702	875833	875757	Y	SUN1,SUN1	SUN1,GET4	NA	NA	NA	NA	SUN1	22174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	919141	919296	919237	Y	NA	GET4	NA	NA	NA	NA	GET4	4952	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	1013884	1014155	1013955	Y	NA	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	COX19	649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	1035018	1035209	1035116	Y	NA	ADAP1,COX19,GPR146	NA	NA	NA	NA	COX19	21783	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	1037816	1038118	1037953	Y	NA	ADAP1,COX19,GPR146	NA	NA	NA	NA	COX19	24581	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	1066965	1067028	1066969	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	15184	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr7	1139272	1139516	1139401	Y	SUN1,TMEM184A	C7orf50	NA	NA	NA	NA	C7orf50	36380	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr7	1140726	1141099	1140817	Y	SUN1,TMEM184A	C7orf50	NA	NA	NA	NA	C7orf50	34797	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	1198505	1198792	1198744	Y	NA	C7orf50,AC091729.9,ZFAND2A	NA	NA	NA	NA	ZFAND2A	110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr7	1329910	1330257	1330187	Y	NA	NA	UNCX	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND2A	131515	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr7	1416814	1417157	1416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	79981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	1456103	1456158	1456132	Y	NA	MICALL2	NA	NA	NA	NA	MICALL2	40980	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.73807516701251
chr7	1500451	1500958	1500750	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	3313	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	1571848	1572026	1571934	Y	ZFAND2A,TMEM184A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.31470814133953
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	1574153	1574602	1574313	Y	NA	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5803	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	1598591	1598955	1598779	Y	NA	MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	TMEM184A	134	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.65122694356599
chr7	1616013	1616182	1616098	Y	ELFN1	MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	TFAMP1	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG3	7372	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	1961711	1962148	1962025	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	308730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	1968189	1968469	1968397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	302409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0011717538
chr7	2306623	2306831	2306646	Y	MAD1L1	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	26766	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	2353156	2353455	2353307	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	38266	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	2561604	2562123	2561810	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	11441	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	2674160	2674375	2674212	Y	SNX8,TTYH3	TTYH3,AMZ1	NA	NA	NA	NA	TTYH3	4575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	2728821	2729163	2728994	Y	NA	AMZ1	NA	NA	NA	NA	AMZ1	11665	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.52900335365328
chr7	2778515	2778860	2778688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMZ1	61359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	2800822	2801226	2800961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	72029	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	3283908	3284312	3284215	Y	SDK1	NA	SDK1	IMR90	Hi-C	24141950	SDK1	54768	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr7	3528330	3528371	3528351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	189250	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	3603136	3603457	3603297	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	264056	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	3699539	3699733	3699636	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	360459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	4287329	4287662	4287450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	393726	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.00079590697105
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr7	4773446	4773760	4773608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	92058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	5388439	5388783	5388611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC18	74262	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	5469639	5470034	5469987	Y	NA	TNRC18	TNRC18,FBXL18,ACTB	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TNRC18	6594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr7	5490349	5490801	5490564	Y	NA	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	27304	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	5571351	5571818	5571666	Y	WIPI2,ACTB	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	19922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	5609221	5609424	5609333	Y	FBXL18	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	7806	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.91945364456094
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	5787686	5787972	5787829	Y	NA	RNF216	NA	NA	NA	NA	RNF216	31398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	6425136	6425343	6425226	Y	CCZ1,USP42	RAC1	NA	NA	NA	NA	RAC1	12982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	6473446	6473633	6473567	Y	DAGLB	DAGLB,KDELR2	NA	NA	NA	NA	DAGLB	48188	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	6670090	6670335	6670172	Y	NA	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	4618	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr7	6676235	6676334	6676285	Y	NA	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	1282	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.493605280774745
chr7	7216835	7216977	7216903	Y	NA	C1GALT1	C1GALT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	C1GALT1	22270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.44281440617612
chr7	7996944	7997264	7997104	Y	NA	GLCCI1	LOC729852,GLCCI1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLCCI1	9161	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	8165403	8166093	8165752	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	133770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	8300349	8300667	8300508	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	32	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	16886935	16887473	16887050	Y	NA	AGR2,AGR3	NA	NA	NA	NA	AGR2	15878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	16961680	16961908	16961842	Y	NA	AGR3	AGR2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AGR3	42069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	19746950	19747169	19747121	Y	NA	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	20163699	20164108	20163996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	90919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	20191913	20192270	20192088	Y	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	62757	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	20197239	20197492	20197368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	57535	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	RPL23P8	27126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	21254928	21255253	21254997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	210399	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	21260621	21260992	21260836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	204660	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	22122614	22122929	22122771	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	138912	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	22122992	22123068	22123014	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	139290	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr7	23060438	23060786	23060654	Y	IL6	NA	LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHL7-AS1	82536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	24229401	24229422	24229412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP6	381465	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr7	25897167	25897316	25897282	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292544	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.68294921811898
chr7	26460550	26460642	26460600	Y	NA	AC004540.4,AC004540.5	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	24337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	26697823	26697978	26697927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	261610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	28733136	28733327	28733267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	396196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	30188805	30188913	30188846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8	123785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr7	30265497	30265992	30265714	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	55931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS,AC005154.6	NA	NA	NA	NA	AC005154.6	3667	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	31028177	31028553	31028368	Y	ADCYAP1R1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM188B	219144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	31704634	31704826	31704694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	828069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	34135793	34136189	34135904	Y	BMPER	NA	NA	NA	NA	NA	BMPER	193270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	36766830	36767015	36766909	Y	ELMO1,AOAH	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	339096	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	36938916	36939307	36939244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	511182	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	37221797	37222057	37221923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	794063	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	38282478	38282707	38282629	Y	NA	TRGJP	NA	NA	NA	NA	TRGJP	28541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	38379769	38380269	38379922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRGJP	68521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	39660879	39661112	39661042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALA	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	39774001	39774145	39774098	Y	CDK13,RALA	LINC00265	NA	NA	NA	NA	LINC00265	2770	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	40756959	40757193	40757114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	769323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr7	41087461	41087737	41087599	Y	NA	NA	LOC285954,INHBA,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	652969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	41094451	41094797	41094675	Y	NA	NA	LOC285954,INHBA,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	645909	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	41099054	41099343	41099161	Y	NA	NA	LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	641363	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	42533163	42533415	42533331	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	GLI3	257694	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.73648215355889
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	43644873	43645023	43645002	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	24516	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	43801940	43802267	43802061	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	5661	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr7	44936968	44937252	44937141	Y	OGDH,MYO1G,PURB	PURB	TBRG4,OGDH	IMR90	Hi-C	24141950	PURB	14008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	45495394	45495553	45495539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY1	116186	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.23296732568813
chr7	45497218	45497499	45497401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY1	114240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.65005518976599
chr7	45550212	45550523	45550366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY1	61216	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.59649954791374
chr7	45616146	45616461	45616432	Y	NA	ADCY1	NA	NA	NA	NA	ADCY1	4407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.56348832888985
chr7	45618868	45619147	45619007	Y	NA	ADCY1	NA	NA	NA	NA	ADCY1	7129	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	47631233	47631542	47631345	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	11077	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr7	47644474	47644665	47644612	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	24318	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.7865006946573
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	190582	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	51417920	51418197	51418059	Y	NA	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	35405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	53130490	53130791	53130640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-14P	300960	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	55600079	55600443	55600389	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	38238	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	55600779	55601841	55601199	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	36840	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr7	56029737	56030120	56029923	Y	CCT6A,MRPS17,GBAS	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	MRPS17	12225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	56243524	56243790	56243559	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	71255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1467054	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.34243521775825
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	66096553	66096745	66096681	Y	NA	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	KCTD7	4685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	66159622	66159870	66159746	Y	NA	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	14471	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	66184244	66184571	66184390	Y	NA	RABGEF1	LOC493754,RABGEF1,LOC729156	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	39093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	66223934	66224293	66224105	Y	KCTD7,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	78783	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	66897123	66897210	66897167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	131229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	68797127	68797219	68797173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	264686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	68877694	68877897	68877796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	184008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr7	69069799	69069881	69069840	Y	NA	AUTS2	NA	NA	NA	NA	AUTS2	7894	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	69091011	69091330	69091153	Y	NA	AUTS2	NA	NA	NA	NA	AUTS2	29106	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	69213443	69213490	69213467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	151538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	69308115	69308415	69308239	Y	AUTS2,AUTS2	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	246210	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	71336027	71336353	71336220	Y	CALN1	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-111G14.1	68891	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	71473269	71473662	71473638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-111G14.1	68025	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	73156040	73156347	73156148	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	4843	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr7	73156679	73157033	73156789	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5482	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.62576112419581
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.47024701925885
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07496981606793
chr7	73239407	73239632	73239469	Y	NA	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	15233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.651602790394947
chr7	73625323	73625613	73625399	Y	LIMK1,LAT2	EIF4H,RFC2	NA	NA	NA	NA	EIF4H	38748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	73869724	73869891	73869863	Y	GTF2IRD1	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3604	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	73915723	73915843	73915806	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	49603	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	73989785	73989913	73989858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	80081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	73994648	73994954	73994780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	75040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr7	74001829	74001994	74001904	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	68000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr7	74020286	74020548	74020393	Y	NA	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	49446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr7	74020929	74021149	74021053	Y	NA	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	48845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.12339534371272
chr7	74050043	74050194	74050049	Y	GTF2IRD2B	GTF2I	GTF2IRD1,GTF2I	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTF2I	19800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	75522158	75522529	75522343	Y	RHBDD2	POR	NA	NA	NA	NA	POR	3989	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	75567331	75567651	75567437	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	40813	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	75580822	75581199	75581009	Y	POR	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	40778	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC005077.12	59736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.27265506003692
chr7	75920543	75920716	75920673	Y	NA	HSPB1	HSPB1	IMR90	Hi-C	24141950	HSPB1	9145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	75922960	75923105	75923022	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	6756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.69173242423965
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.444101284077
chr7	75934206	75934543	75934471	Y	NA	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	4345	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	75940045	75940212	75940167	Y	NA	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	10184	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32618799547683
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	16.5472039364286
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.32503894808916
chr7	76002661	76002791	76002762	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	YWHAG	16313	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.15357001763675
chr7	77201219	77201434	77201295	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	36627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	77561991	77562080	77562036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	135869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	80171671	80172049	80171853	Y	NA	NA	GNAT3,CD36	IMR90	Hi-C	24141950	CD36	174780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr7	80272863	80273241	80273058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD36	275972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr7	80337478	80337851	80337650	Y	NA	NA	SEMA3C	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	211824	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	80399893	80400101	80400015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	149574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	80488123	80488172	80488148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	61503	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr7	80512986	80513276	80513113	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	36399	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	80550378	80550824	80550614	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	703	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	16.2335487898143
chr7	80571600	80571811	80571745	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	21925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.51194489357481
chr7	80788656	80789003	80788846	Y	NA	NA	SEMA3C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SEMA3C	238981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr7	81108173	81108384	81108283	Y	NA	NA	SEMA3C,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	558498	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	86601476	86601934	86601661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	85081	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	86946167	86946460	86946286	Y	NA	TP53TG1,CROT	NA	NA	NA	NA	TP53TG1	26371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	86948267	86948659	86948457	Y	CROT	TP53TG1,CROT	NA	NA	NA	NA	TP53TG1	24172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr7	87389107	87389401	87389254	Y	NA	ABCB1	NA	NA	NA	NA	ABCB1	48496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	88657273	88657647	88657446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRI	802965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	89975005	89975165	89975035	Y	NA	GTPBP10,CLDN12	NA	NA	NA	NA	GTPBP10	12468	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	90305838	90306207	90306023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK14	212100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	92217809	92218139	92217980	Y	NA	FAM133B	NA	NA	NA	NA	FAM133B	101	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	93204906	93205045	93204997	Y	NA	CALCR	NA	NA	NA	NA	CALCR	2864	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr7	94021237	94021945	94021560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASD1	114586	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	94140158	94140537	94140353	Y	CASD1	CASD1	NA	NA	NA	NA	CASD1	3627	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	94781809	94782176	94781990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	56270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	95867967	95868008	95867988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	81451	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	98650927	98651298	98651264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF1	88425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.89841618423272
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	ARPC1A	NA	NA	NA	NA	ARPC1A	49392	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr7	98978423	98978863	98978747	Y	SMURF1,ZNF655,ZNF655,ZNF498,ZNF394,ZKSCAN5	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	8551	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	98990795	98991133	98991082	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	13131	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	99291105	99291222	99291169	Y	PTCD1,CYP3A43,CYP3A4,AZGP1,CYP3A5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200A	136946	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	99678619	99678725	99678657	Y	NA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	ZNF3	448	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	99994747	99995042	99994880	Y	ACTL6B,PILRB	MEPCE,ZCWPW1,RP11-758P17.3,PPP1R35	NA	NA	NA	NA	MEPCE	29371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	100809834	100810470	100810178	Y	NA	SERPINE1,AP1S1,VGF,ZNHIT1,PLOD3	NA	NA	NA	NA	VGF	2960	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	101045498	101045795	101045583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	82394	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	101372678	101373024	101372861	Y	NA	NA	CUX1,EMID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	83935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01984386717439
chr7	101377148	101377442	101377338	Y	NA	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	79517	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.835723328784669
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	101525517	101525682	101525579	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	68558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03851598054878
chr7	101566593	101566799	101566736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	109634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	101569375	101569771	101569405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	112416	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	101585210	101585567	101585389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	128251	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	101609189	101609564	101609377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	152230	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	101707897	101708291	101708217	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	250938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.2991548026939
chr7	101930729	101931104	101930861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	71215	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	101967480	101967865	101967673	Y	NA	PRKRIP1	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	34454	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM185A	128808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	103181471	103181723	103181644	Y	NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-276O3.4	194423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	53622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	104603312	104603563	104603438	Y	MLL5	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	47928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	104607797	104607862	104607830	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	43629	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	104612836	104613032	104612935	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	38459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	104614051	104614727	104614598	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	36764	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	104618643	104618978	104618693	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	32513	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	104626890	104627731	104627241	Y	MLL5	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	23760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	104771634	104771765	104771700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	120143	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	104857177	104857523	104857432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	180232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	104992589	104992852	104992773	Y	NA	SRPK2	NA	NA	NA	NA	SRPK2	44903	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	105123568	105123582	105123575	Y	NA	PUS7,RINT1	NA	NA	NA	NA	PUS7	37132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	EFCAB10	NA	NA	NA	NA	EFCAB10	16028	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	105705488	105705603	105705542	Y	NA	SYPL1	ATXN7L1,SYPL1,CDHR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	45419	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr7	105711914	105712310	105712244	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	38712	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	105714803	105715079	105714993	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	35943	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	106686077	106686421	106686249	Y	GPR22	PRKAR2B	NA	NA	NA	NA	PRKAR2B	2983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	106706392	106706759	106706607	Y	GPR22	PRKAR2B	NA	NA	NA	NA	PRKAR2B	23298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr7	107116622	107117169	107116900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	84760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	107840467	107840775	107840621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMB1	198767	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85755669608394
chr7	107842206	107842455	107842327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMB1	200506	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	107923246	107923634	107923440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	171527	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr7	107939769	107940082	107939931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	155079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.78935994616951
chr7	107999064	107999449	107999339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	95712	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.56632487398972
chr7	108046989	108047316	108047161	Y	NA	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	47845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	108060932	108061217	108061051	Y	PNPLA8,DNAJB9	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	33944	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	108095684	108095814	108095727	Y	NRCAM,NRCAM	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	523	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr7	108118010	108118358	108118206	Y	NA	NRCAM,RPL7P32	NA	NA	NA	NA	NRCAM	22849	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	112062066	112062509	112062349	Y	DOCK4,ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1	IFRD1	NA	NA	NA	NA	IFRD1	1043	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	112404343	112404501	112404446	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	24146	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	115873924	115874179	115873941	Y	TES	TES	NA	NA	NA	NA	TES	25377	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	115912136	115912451	115912327	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	12983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	116035470	116035688	116035648	Y	NA	NA	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	AC002066.1	101831	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	116058055	116058274	116058222	Y	NA	NA	CAV2,TES,MET,CAV1	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	AC002066.1	79245	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr7	116083167	116083483	116083344	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	TES,CAV2,CAV1,MET	IMR90,MCF7,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	AC002066.1	54036	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr7	116168216	116168790	116168273	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	5377	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	119283625	119284006	119283817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	261423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	121170486	121170616	121170551	Y	NA	NA	FAM3C,WNT16	IMR90	Hi-C	24141950	FAM3C	136068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	121951485	121951902	121951877	Y	NA	FEZF1-AS1	NA	NA	NA	NA	FEZF1-AS1	9773	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	122148231	122148536	122148406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P31	170808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	123284312	123284364	123284338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5	88003	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	128047079	128047125	128047082	Y	LRRC4,IMPDH1	PRRT4,IMPDH1,HILPDA,RP11-155G14.6	NA	NA	NA	NA	IMPDH1	1181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.19286539845436
chr7	129419118	129419176	129419138	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.15593623164909
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.916292390636061
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04167723447366
chr7	129469996	129470292	129470140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	120497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	129508183	129508482	129508331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	82307	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	129540244	129540548	129540396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	50241	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	129598516	129598781	129598654	Y	NRF1,UBE2H,UBE2H	UBE2H	UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UBE2H	7727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	206421	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	158985	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	130636331	130636776	130636707	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	156079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	130696655	130697004	130696978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95851	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	130720133	130720826	130720768	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	72029	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	130756735	130757090	130757043	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	MKLN1	35765	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr7	131166569	131166943	131166757	Y	PODXL	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	74033	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	131836395	131836658	131836601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	494789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	131872857	131873222	131873095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	458225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	411440	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	132484487	132484560	132484524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	153040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	132656149	132656423	132656408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	108425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	133092941	133093104	133093022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	157112	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	287892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	135120473	135120740	135120725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT4	72135	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	135459124	135459310	135459189	Y	NA	NA	C7orf73,SLC13A4,FAM180A	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	113880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr7	136582219	136582518	136582369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	922118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	137311444	137311452	137311448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	373361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	137544616	137544738	137544677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	140075	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	137573369	137573542	137573460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	111271	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	138643234	138643648	138643551	Y	TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549	KIAA1549	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	20416	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr7	139354231	139354464	139354322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	121113	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	139368106	139368669	139368373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	106908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	139431881	139432226	139432135	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	43351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	139930411	139930852	139930521	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	168890	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	140398687	140398980	140398834	Y	NA	ADCK2,NDUFB2	NA	NA	NA	NA	NDUFB2	10110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	140613036	140613224	140613135	Y	NA	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	9340	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	141334636	141334647	141334642	Y	TAS2R3	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	65306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	141371952	141372250	141372100	Y	CLEC5A	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	27703	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	145974420	145974737	145974579	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	1442932	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	148269293	148269443	148269383	Y	NA	AC005229.5	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	6050	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.08331112269269
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.82700617533096
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chr7	149280287	149280529	149280408	Y	NA	ZNF767	NA	NA	NA	NA	ZNF767	39314	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr7	151039447	151039627	151039551	Y	SLC4A2,AGAP3,SMARCD3,SMARCD3,NUB1	NUB1	NA	NA	NA	NA	NUB1	2662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.617399177728752
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	151386683	151387049	151386915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	171477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	151727248	151727389	151727313	Y	NA	GALNT11	NA	NA	NA	NA	GALNT11	6489	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210696	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.90912283781131
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.89162247823692
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	154743291	154743691	154743552	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49103	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	81060	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	155580383	155580450	155580415	Y	NA	SHH	NA	NA	NA	NA	SHH	22517	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr7	155714561	155715080	155714837	Y	NA	NA	LMBR1	IMR90	Hi-C	24141950	SHH	111594	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	NA	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	SHH	151591	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr7	156309005	156309294	156309056	Y	RNF32	NA	RNF32,C7orf13,SHH,RBM33,LINC00244,LMBR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF32	121681	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr7	156409241	156409518	156409427	Y	NA	RNF32,C7orf13	NA	NA	NA	NA	RNF32	21457	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	156412276	156412413	156412345	Y	NA	RNF32,C7orf13	NA	NA	NA	NA	RNF32	18562	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	156544134	156544345	156544262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf13	112786	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	156792805	156792864	156792835	Y	NA	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	8481	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	156800292	156800601	156800569	Y	MNX1,MNX1	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	744	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	157070019	157070314	157070105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	55761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.05564049329421
chr7	157078729	157079029	157078826	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	47046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.8623836083672
chr7	157082402	157082699	157082633	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chr7	157085416	157085724	157085621	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	40351	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr7	157094771	157094925	157094848	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAJB6	31150	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	157131379	157131690	157131421	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	5304	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr7	157225296	157225625	157225465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	99221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr7	158387429	158387829	158387629	Y	WDR60	NA	PTPRN2	K562	ChIA-PET	22265404	NCAPG2	107691	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr7	158493510	158493807	158493659	Y	NCAPG2	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	1713	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr7	158595763	158596162	158596010	Y	ESYT2	ESYT2	NA	NA	NA	NA	ESYT2	24782	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr7	158603982	158604371	158604316	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	16573	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr7	158768295	158768665	158768480	Y	NA	NA	NCAPG2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR60	121026	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr7	158808159	158808606	158808258	Y	VIPR2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR60	160890	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01396325882055
chr8	1693574	1694042	1693752	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	2263330	2263439	2263406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	343286	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr8	2418829	2418999	2418939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	498785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	6635287	6635646	6635406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT5	71409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	8147008	8147233	8147135	Y	NA	NA	SGK223,MFHAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	94775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.803090023159767
chr8	8203793	8204189	8204138	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	37819	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	8242841	8243169	8242949	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	833	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	8247461	8247709	8247494	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	5453	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	8939736	8940088	8939838	Y	CLDN23,ERI1,PPP1R3B	NA	ERI1,PPP1R3B,TNKS	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3B	66996	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	9040807	9041224	9041065	Y	NA	PPP1R3B,RP11-10A14.4	NA	NA	NA	NA	RP11-10A14.4	33555	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	9912937	9913246	9913138	Y	NA	MSRA	NA	NA	NA	NA	MSRA	3159	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	10267879	10268236	10267884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	358101	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	10873844	10874251	10874241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	178450	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	11310026	11310392	11310209	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	19832	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	17355613	17356072	17355737	Y	NA	SLC7A2	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	3016	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.41708786407785
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr8	22227261	22227593	22227504	Y	SLC39A14,SLC39A14	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	4499	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	22410101	22410594	22410364	Y	EPB49,LGI3,PHYHIP,RHOBTB2,RHOBTB2,EGR3,EGR3,SORBS3	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	SORBS3	9602	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	22513437	22513754	22513670	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	10907	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	22522684	22522941	22522886	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	1720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	22535910	22536200	22536167	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	11249	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.59087759571795
chr8	22590552	22590890	22590661	Y	NA	EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	41737	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	22596434	22597212	22596743	Y	NA	EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	47619	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.492034973733454
chr8	22605845	22606262	22606042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGR3	57030	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	22626037	22626421	22626168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGR3	77222	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	22832854	22833100	22833063	Y	CHMP7	RHOBTB2	BIN3,PEBP4,LOC254896,TNFRSF10B,RHOBTB2,C8orf58,KIAA1967	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	9830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr8	22872750	22872814	22872762	Y	NA	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	29820	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	23353842	23353942	23353892	Y	TNFRSF10C,SLC25A37	ENTPD4,SLC25A37	NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A37	30376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	25904215	25904335	25904275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2A	242672	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R2A	137853	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	63575	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr8	27232540	27232742	27232661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	65541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	27474556	27474730	27474657	Y	NA	CLU,SCARA3	SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CLU	4008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	28004860	28005043	28004968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELP3	59670	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.60238015626758
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	80225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	29144637	29144837	29144777	Y	NA	KIF13B	KIF13B	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	25996	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	29326854	29327197	29326996	Y	NA	NA	C8orf75,DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	120669	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	29522725	29523096	29522814	Y	KIF13B	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	316540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	343509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.07302366219769
chr8	29623150	29623293	29623215	Y	NA	NA	C8orf75,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	315430	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03851598054878
chr8	29631647	29631969	29631808	Y	NA	NA	C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	306754	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.68177746431897
chr8	30280646	30281238	30280961	Y	MBOAT4	RBPMS,RBPMS-AS1	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	39729	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	30358644	30358942	30358767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	117727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	30462940	30463157	30463081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	50611	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	30892930	30893420	30892948	Y	NA	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	3613	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	32052985	32053085	32053036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	1163668	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	33287156	33287526	33287341	Y	NA	FUT10	NA	NA	NA	NA	FUT10	41414	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.00588267492388
chr8	37000181	37000618	37000483	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.3	454758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.50599823255401
chr8	37002327	37002551	37002443	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.3	452825	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0817408156514
chr8	37005639	37005772	37005739	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.3	449604	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	37100624	37100997	37100794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150O12.3	354379	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr8	37133368	37133442	37133405	Y	NA	NA	ERLIN2,ZNF703	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150O12.3	321934	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	37159589	37159912	37159750	Y	NA	NA	ZNF703,KCNU1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-150O12.3	295464	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	37376212	37376482	37376355	Y	NA	NA	KCNU1,ERLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150O12.3	78894	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	37404927	37405081	37405004	Y	NA	NA	KCNU1,ZNF703	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.3	50295	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	37449026	37449149	37449088	Y	RAB11FIP1,ZNF703	RP11-150O12.3	ZNF703	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-150O12.3	6227	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr8	37643587	37643772	37643645	Y	NA	PROSC,GPR124	NA	NA	NA	NA	GPR124	3878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	37738160	37738666	37738484	Y	RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	GPR124,BRF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP1	16319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	37751458	37752024	37751766	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	2961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	37760968	37761285	37761070	Y	RAB11FIP1	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	5983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.493605280774745
chr8	37761676	37761790	37761689	Y	NA	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	6691	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.62576112419581
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	38242599	38242872	38242674	Y	TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	874	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	38406722	38407104	38406913	Y	NA	RNF5P1	FGFR1,C8orf86,RNF5P1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF5P1	49614	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	38523213	38523472	38523342	Y	C8orf86	NA	C8orf86,FGFR1,WHSC1L1,RNF5P1,PPAPDC1B	IMR90	Hi-C	24141950	TACC1	60232	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	41775383	41775559	41775471	Y	NA	NA	ANK1	IMR90	Hi-C	24141950	KAT6A	131949	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	42338924	42339272	42339098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	55797	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	42356471	42356680	42356560	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	38389	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	HOOK3	343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.495175587816035
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43327863933903
chr8	48293270	48293403	48293337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	218777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	48295911	48296182	48296008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	221418	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	224269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	48746170	48746340	48746217	Y	MCM4	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	96522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.52181109441619
chr8	49427546	49427722	49427633	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	132396	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	50653553	50653944	50653741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	821254	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	50710537	50710832	50710685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	878238	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr8	53379796	53380092	53379874	Y	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	276311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.32618799547683
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	54931181	54931405	54931291	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	1684	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	56903187	56904166	56903812	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	80294	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	59786438	59786547	59786493	Y	UBXN2B	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	61327	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr8	61657043	61657068	61657053	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	67706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	61708880	61709194	61708899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	119543	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	61824212	61824789	61824465	Y	CHD7	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	234875	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	62679636	62680132	62679874	Y	NA	NA	ASPH,MIR4470	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4470	54289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	62937802	62937913	62937858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4470	312455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	65281748	65282274	65281884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	1202636	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr8	66934530	66934705	66934628	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	88197	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.06154380806038
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	AC084082.3	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	13095	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	67045701	67045983	67045786	Y	NA	AC084082.3	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	22799	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	67424340	67424761	67424541	Y	C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	83920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	67425057	67425564	67425100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	84637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.58616874116411
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.37503478277524
chr8	67434763	67435122	67434951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89360	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	9.83527570410948
chr8	67436986	67437117	67437055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	87365	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	67454365	67454567	67454497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	69915	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98093139995436
chr8	67626224	67626609	67626278	Y	SGK3,VCPIP1,SGK3	VCPIP1,C8orf44,SGK3	NA	NA	NA	NA	SGK3	3571	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.47898481255486
chr8	67694398	67694637	67694506	Y	VCPIP1,SGK3,SGK3	PTTG3P	NA	NA	NA	NA	PTTG3P	16158	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	68075038	68075412	68075329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	81020	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	68660562	68660687	68660613	Y	NA	CPA6	NA	NA	NA	NA	CPA6	3942	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-865I6.2	90572	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	69765670	69765946	69765808	Y	NA	RP11-865I6.2	SULF1,C8orf34,LOC100505718	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-865I6.2	2672	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	70982774	70982831	70982803	Y	PRDM14	RNU1-101P,RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	RNU1-101P	5436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	71158637	71159069	71158929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	144223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	71188678	71189062	71188836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	124978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	73690966	73691186	73691160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	227913	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	75605656	75605872	75605764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	91177	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	236574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr8	77128503	77128819	77128661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX2	782461	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	NA	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS28	243974	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	80991495	80991889	80991678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	50971	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.25281119286253
chr8	81015641	81015664	81015650	Y	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	75117	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr8	81489520	81489653	81489606	Y	NA	NA	ZBTB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBTB10	93666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	81695028	81695405	81695288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	299174	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	81782792	81783006	81782996	Y	ZBTB10,ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	239297	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	83490846	83490929	83490888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX16	737745	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr8	85472216	85472229	85472220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRCC1	545153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	86853135	86853591	86853380	Y	NA	CTA-392E5.1	CA2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTA-392E5.1	3201	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	87358801	87359051	87358932	Y	NA	WWP1	NA	NA	NA	NA	WWP1	5834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	88655608	88655638	88655622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMP16	682616	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	89124026	89124433	89124347	Y	MMP16	NA	NA	NA	NA	NA	MMP16	213821	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	90797084	90797193	90797178	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	29109	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	90838382	90838725	90838688	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK2	70407	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	90901747	90901955	90901807	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	10132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	90912887	90913271	90913166	Y	NA	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	91020764	91021152	91020912	Y	NA	DECR1,NBN	NA	NA	NA	NA	NBN	7308	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	91683219	91683417	91683315	Y	NA	NA	TMEM64,NECAB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LINC01030	66926	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	91688598	91688714	91688665	Y	NA	NA	TMEM64	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LINC01030	72305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	91705068	91705420	91705305	Y	NA	NA	TMEM64	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01030	88775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.02546581937019
chr8	91766467	91766873	91766643	Y	NA	NECAB1,TMEM64	TMEM64,NECAB1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NECAB1	34905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.26314199961215
chr8	91783069	91783387	91783235	Y	NA	NECAB1,TMEM64	NECAB1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NECAB1	18391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr8	91805525	91805869	91805629	Y	NA	NECAB1,TMEM64	NA	NA	NA	NA	TMEM64	3665	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr8	91868991	91869019	91869004	Y	NA	RP11-662G23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-662G23.1	449	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.37974363732908
chr8	91899917	91900334	91900037	Y	NA	RP11-662G23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-662G23.1	30449	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.957946918697387
chr8	91901009	91901192	91901063	Y	NA	RP11-662G23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-662G23.1	31541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.54048320779058
chr8	91925150	91925428	91925277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662G23.1	55682	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr8	91926136	91926682	91926246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662G23.1	56668	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.7246037461803
chr8	92128196	92128480	92128215	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	47772	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	94003281	94003430	94003355	Y	NA	NA	C8orf83	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM92A1	705359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr8	94698311	94698521	94698416	Y	NA	FAM92A1	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	10268	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	94928107	94928427	94928252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	60072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	94950843	94950973	94950908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	82808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	95003706	95004122	95004001	Y	NA	NA	LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	135671	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr8	95254172	95254606	95254439	Y	GEM	KB-1247B1.1,GEM	CDH17	IMR90	Hi-C	24141950	GEM	17972	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	95429933	95430227	95430143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	55110	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.309484742385022
chr8	96197025	96197314	96197170	Y	NA	NA	PLEKHF2,C8orf69	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHF2	52993	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	97136855	97137003	97136873	Y	NA	GDF6	NA	NA	NA	NA	GDF6	34017	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	97779129	97779296	97779215	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	275550	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	98843281	98843693	98843349	Y	POP1	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	98843865	98843962	98843914	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31320	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.1607395704615
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	99637150	99637421	99637401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	315634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr8	100461450	100461455	100461453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13B	437956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	100901053	100901332	100901194	Y	NA	COX6C	NA	NA	NA	NA	COX6C	2958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04167723447366
chr8	101444913	101445066	101444990	Y	RGS22	NA	RNF19A,SPAG1,MIR4471	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF19A	98467	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	101457496	101457930	101457593	Y	NA	NA	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF19A	111050	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.369811383820736
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	43224	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.6142812700585
chr8	101927731	101928052	101928034	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	35564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.694827625497564
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.42542917070261
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr8	102103047	102103317	102103255	Y	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	113104	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	102135026	102135273	102135149	Y	NA	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	81148	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	102149452	102149813	102149564	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	66608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	102167683	102167913	102167765	Y	NA	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	48508	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	102344838	102345360	102345078	Y	NA	NACAP1	GRHL2,NCALD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NACAP1	26662	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	102373140	102373427	102373201	Y	NA	NACAP1	GRHL2,NACAP1,NCALD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NACAP1	1118	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.9460685113188
chr8	102388506	102388737	102388522	Y	NA	NACAP1	NA	NA	NA	NA	NACAP1	16484	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	102449376	102449720	102449428	Y	GRHL2	NA	NACAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRHL2	52940	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.4774372119259
chr8	102450789	102450808	102450799	Y	GRHL2	NA	NACAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRHL2	51852	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.2139193654848
chr8	102478937	102479163	102479080	Y	NA	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	23497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03851598054878
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.39961021091581
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	12.2576369056343
chr8	102513804	102514123	102513992	Y	NA	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	11144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	102516990	102517159	102517011	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	14330	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.16230987750279
chr8	102543448	102543645	102543547	Y	NA	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	40788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	103120269	103120923	103120717	Y	UBR5,NCALD	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2B	128423	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	103422542	103423104	103422992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR5	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr8	103613012	103613469	103613324	Y	KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1,RRM2B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	52661	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.25752004741636
chr8	103639654	103639717	103639685	Y	NA	KLF10	UBR5,ODF1,AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF10	26413	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	103741796	103742226	103742065	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	75666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	103743323	103743460	103743418	Y	NA	NA	KLF10	IMR90	Hi-C	24141950	KLF10	77193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	72755	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	51244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.63293067702056
chr8	103939794	103939949	103939858	Y	NA	AZIN1	AZIN1,ATP6V1C1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	35702	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	104149565	104149597	104149584	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32	BAALC	NA	NA	NA	NA	BAALC	1341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	107665296	107665542	107665419	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	42699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	107972770	107973116	107972943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	264529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	110922372	110922703	110922477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	220352	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	111381887	111381916	111381903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	679867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr8	112739475	112739733	112739604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	1647165	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	114266349	114266595	114266472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	120303	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	116439816	116440252	116439936	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	379647	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	116450341	116450508	116450425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	369391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	116463689	116463880	116463766	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	356019	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.529379200482229
chr8	116879779	116880131	116880045	Y	TRPS1	NA	TRPS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRPS1	59880	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	117000021	117000603	117000221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	180122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.755154266933278
chr8	117364382	117364703	117364447	Y	NA	NA	LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	412039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	117378539	117378781	117378660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	397961	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	117484091	117484236	117484201	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	292506	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr8	117664503	117664654	117664532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112088	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	119049251	119049636	119049444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	72456	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	119071597	119071694	119071650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	50398	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	119323544	119323883	119323714	Y	SAMD12	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	201452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	119862438	119862804	119862573	Y	NA	NA	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	89998	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	119917519	119917835	119917587	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	44604	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	120066342	120066835	120066563	Y	NA	NA	SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF11B	103903	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	120232000	120232286	120232044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	56727	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	120288665	120289048	120288857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	113392	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	120779948	120780281	120780115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF2	62822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	120995010	120995163	120995088	Y	DEPTOR	NA	NA	NA	NA	NA	DEPTOR	111053	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.96944947924702
chr8	121085383	121085735	121085617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPTOR	201426	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	121089268	121089526	121089403	Y	DEPTOR	NA	DEPTOR,DSCC1,COL14A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEPTOR	205311	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	121092888	121093091	121092967	Y	DEPTOR	NA	DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13	IMR90	Hi-C	24141950	DEPTOR	208931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	121456351	121456697	121456524	Y	SNTB1,MTBP,MRPL13	MTBP,MRPL13	NA	NA	NA	NA	MRPL13	709	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	122157265	122157468	122157378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	701623	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	122163182	122163617	122163305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	707540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr8	123795111	123795992	123795667	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	3478	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr8	123801301	123801636	123801353	Y	ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	9668	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	123811167	123811696	123811506	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	19534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	123882951	123883328	123883140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	91318	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	123883965	123883977	123883971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	92332	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	124169504	124169661	124169520	Y	NA	FAM83A	NA	NA	NA	NA	FAM83A	19539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	124407044	124407322	124407183	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	19268	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	124816728	124816894	124816751	Y	NA	FAM91A1	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	38032	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	124934433	124934622	124934528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	155737	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	124965382	124965556	124965469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	186686	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	125212215	125212575	125212395	Y	NA	NA	TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARF1P3	50051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr8	125275002	125275221	125275161	Y	RNF139	RP11-383J24.1	FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-383J24.1	6703	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	RP11-383J24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-383J24.1	20536	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	125466570	125466668	125466619	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	NA	NA	NA	NA	TRMT12	5522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr8	125468258	125468440	125468349	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	NA	NA	NA	NA	TRMT12	7210	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	125539571	125539718	125539637	Y	RNF139	NDUFB9,TATDN1	RNF139	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NDUFB9	9626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	125656235	125656588	125656492	Y	ZNF572,RNF139,MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	82142	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	125984707	125984742	125984718	Y	ZNF572	ZNF572,SQLE	NA	NA	NA	NA	ZNF572	1167	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	126232175	126232753	126232302	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130093	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	126232781	126233016	126232896	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130699	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	126245115	126245425	126245196	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	143033	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	126268557	126268681	126268622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	166475	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr8	126335524	126335526	126335525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	105037	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	126372255	126372562	126372409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	68001	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.04167723447366
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	126451967	126452238	126452064	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	126959086	126959931	126959629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	518523	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	127640965	127641019	127640992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	72327	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	127732344	127732562	127732346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	163706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	127938432	127938773	127938643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	369794	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128048074	128048382	128048201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	479436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr8	128112845	128113195	128113019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	544207	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128171088	128171312	128171255	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	574368	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128182261	128182424	128182343	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	563256	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128313110	128313516	128313211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	432164	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128418204	128418600	128418512	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	327080	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128608525	128608821	128608655	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	136859	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	128680448	128680536	128680487	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	65144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128821272	128821652	128821500	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	16493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128822019	128822203	128822035	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128835085	128835527	128835341	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	30306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75426594227369
chr8	128878082	128878481	128878225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	73303	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.00276476725363
chr8	128883085	128883449	128883196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	78306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.50915948647888
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.371381690862027
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	128930937	128931257	128931067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	89600	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	128973364	128973763	128973565	Y	MYC	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	47094	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	128989961	128990273	128990255	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	30584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	129062971	129063389	129063062	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	42114	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	129076309	129076777	129076518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	55452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	129114844	129115073	129114937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	93987	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	129115789	129116244	129116059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94932	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	129152052	129152429	129152207	Y	NA	NA	MYC,PVT1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNU4-25P	131195	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.56452551825821
chr8	129180743	129180870	129180780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	159886	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	129195465	129196052	129195562	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	174608	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	129339245	129339624	129339435	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	318388	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	129706266	129706412	129706340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	685409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	129872221	129872562	129872390	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	851364	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	130897837	130898360	130898140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	129015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	130975001	130975392	130975263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	51983	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	130996080	130996422	130996182	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30953	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	131011351	131011453	131011402	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	15922	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	131024148	131024528	131024501	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	2847	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27057227516499
chr8	131089372	131089764	131089568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	61997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	131204007	131204378	131204106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	176632	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	131264949	131265429	131265208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	188477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	131269679	131269819	131269766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	184087	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	131354482	131354860	131354810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	99046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	134368494	134368766	134368633	Y	NDRG1	CTC-458A3.1	WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-458A3.1	32254	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	134387761	134388081	134387916	Y	NA	NA	TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-458A3.1	51521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr8	134580779	134581429	134580915	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	754	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	135493726	135493930	135493821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	229362	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	135697258	135697603	135697427	Y	NA	ZFAT	NA	NA	NA	NA	ZFAT	25689	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	140115684	140115926	140115805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	1350752	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	141102173	141102317	141102281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	364361	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	141108529	141108796	141108710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	357882	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	141108929	141109987	141109387	Y	KCNK9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	356691	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr8	141110302	141110773	141110688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	355905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.20396440556411
chr8	141475903	141476104	141476028	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	9225	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	141604721	141605198	141605144	Y	EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	85324	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	141945462	141945818	141945641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	64497	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	141972530	141972881	141972765	Y	NA	PTK2	NA	NA	NA	NA	PTK2	37434	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr8	142082969	142083325	142083150	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	42052	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.98812159262141
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr8	142275441	142276204	142275736	Y	NA	SLC45A4	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	40200	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	142424633	142425265	142424919	Y	NA	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	24540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	143696778	143697162	143696893	Y	NA	ARC	NA	NA	NA	NA	ARC	1945	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	143757526	143757895	143757616	Y	NA	PSCA,JRK	NA	NA	NA	NA	JRK	3491	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr8	143758809	143759081	143758941	Y	NA	PSCA,JRK	NA	NA	NA	NA	JRK	2305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr8	143809767	143809928	143809818	Y	C8orf55	JRK,SLURP1,RP11-706C16.7	NA	NA	NA	NA	SLURP1	11901	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.82346907457713
chr8	143869768	143870087	143870041	Y	PSCA,SLURP1,LYNX1,LY6D	SLURP1,RP11-706C16.7,LY6D	NA	NA	NA	NA	LY6D	3760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr8	143897219	143897551	143897306	Y	LY6E,GLI4	LY6D	LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669	MCF7	ChIA-PET	22265404	LY6D	31211	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.78495309402835
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.30714003527349
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H	14534	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.0817408156514
chr8	144843026	144843252	144843141	Y	NA	FAM83H,FAM83H-AS1	SCRIB,PUF60	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83H-AS1	28716	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.44635150692996
chr8	144950990	144951185	144951055	Y	C8orf73,NAPRT1,FAM83H,EXOSC4,CYC1,SCRIB,PUF60,PUF60,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2,PLEC,LOC100128338,FAM83H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	358	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.90195328498656
chr8	145030645	145030911	145030698	Y	NA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	17991	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr8	145040615	145041072	145040959	Y	GSDMD,EEF1D,PARP10	PLEC,GRINA,PARP10	NA	NA	NA	NA	PLEC	7830	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr8	145071465	145071788	145071627	Y	NA	PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH	NA	NA	NA	NA	GRINA	9239	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	145549095	145549459	145549304	Y	NA	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr8	145909522	145909717	145909620	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	328	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	2018040	2018611	2018274	Y	SMARCA2	SMARCA2	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	4698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	4530559	4530733	4530650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	129565	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	4862153	4862558	4862241	Y	NA	MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	13862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr9	4933308	4933545	4933427	Y	NA	JAK2	RCL1,JAK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JAK2	49488	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr9	5269155	5269233	5269193	Y	NA	RLN2	C9orf46	IMR90	Hi-C	24141950	RLN2	33736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	5843832	5844207	5843936	Y	NA	ERMP1	ERMP1	IMR90	Hi-C	24141950	ERMP1	12715	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.8528478415301
chr9	5844710	5844756	5844733	Y	RANBP6	ERMP1	ERMP1	IMR90	Hi-C	24141950	ERMP1	13593	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.80400105423169
chr9	5879621	5879741	5879699	Y	NA	ERMP1	ERMP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ERMP1	48504	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	8.97233023766003
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1746982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr9	12779203	12779569	12779249	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	32775	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.4099183112531
chr9	12784417	12784967	12784682	Y	C9orf150	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	27377	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr9	12818643	12818927	12818803	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	6299	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	13034069	13034552	13034397	Y	NA	NA	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-3L8.3	221725	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.86709246292103
chr9	13064041	13064558	13064334	Y	NA	NA	MPDZ,NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	213031	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7853289408573
chr9	13082855	13083077	13082983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDZ	194512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.45560384462664
chr9	13083475	13083616	13083536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDZ	193973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.77345053347871
chr9	13084176	13084414	13084323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDZ	193175	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.32621070188917
chr9	13088815	13089048	13088932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDZ	188541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr9	13278024	13278458	13278161	Y	NA	MPDZ	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	435	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	14233168	14233395	14233282	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	163587	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.93770656485175
chr9	14353468	14353873	14353760	Y	NFIB	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	43109	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	14575436	14575689	14575562	Y	ZDHHC21	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	115780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr9	20927571	20927855	20927623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLAD2	101780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	21708302	21708720	21708435	Y	IFNA6,IFNA1,MTAP	NA	MIR31HG,IFNE	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	91822	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr9	22083926	22084220	22084073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	73772	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	22084782	22085031	22084907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	74628	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85755669608394
chr9	22085335	22085732	22085534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	75181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr9	22103396	22103678	22103511	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2B	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	93242	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.23413907948814
chr9	22216803	22217265	22216812	Y	NA	NA	CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	206649	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	27460604	27461032	27460875	Y	C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	66747	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	27591202	27591627	27591327	Y	C9orf72,C9orf72	C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	19338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	28649799	28650020	28649948	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1077935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	32701589	32701944	32701680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB6	130429	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr9	33028063	33028460	33028077	Y	NA	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	4854	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	33151008	33151398	33151341	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	13956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	33162668	33163130	33162954	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	2224	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr9	33229414	33229715	33229547	Y	NA	BAG1,CHMP5	NFX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	BAG1	33046	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr9	33229811	33230012	33229910	Y	NA	BAG1,CHMP5	NFX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	BAG1	32749	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.37974363732908
chr9	33231410	33231538	33231469	Y	NA	BAG1,CHMP5	NA	NA	NA	NA	BAG1	31223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	33233885	33234477	33234128	Y	NA	BAG1,CHMP5	NA	NA	NA	NA	BAG1	28284	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr9	33445339	33445789	33445589	Y	AQP3	NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	34375136	34375287	34375212	Y	NA	KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	285	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	34575663	34576052	34575846	Y	ARID3C,KIAA1045,DNAJB5,DNAJB5,C9orf25,ENHO,CNTFR,CNTFR	CNTFR,DCTN3	NA	NA	NA	NA	CNTFR	12069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr9	35232989	35233276	35233133	Y	DNAJB5	NA	NA	NA	NA	NA	UNC13B	72990	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	84777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.10357418295066
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.7063301860472
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	GBA2	21997	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	35798752	35798996	35798852	Y	NA	TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	TMEM8B	13452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	36715190	36715486	36715338	Y	NA	NA	MELK,RNF38	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	144331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	107013	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	4538	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	37914600	37914735	37914730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	115166	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	37945283	37945292	37945288	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	121392	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	37963992	37964293	37964120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	102391	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	38008217	38008489	38008387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	58195	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	38016375	38016730	38016641	Y	NA	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49954	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	38074399	38074817	38074731	Y	NA	RP11-613M10.9,SHB	DCAF10,MCART1,SHB	IMR90	Hi-C	24141950	SHB	7189	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1,IGFBPL1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBPL1	15126	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr9	66471270	66471410	66471340	Y	NA	NA	LOC642236	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-764K9.4	1981965	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43170833229774
chr9	71795556	71796114	71795819	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	61347	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	71991675	71991950	71991811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	257466	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	73007611	73008045	73007709	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	19495	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.30583251753032
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.54088176103186
chr9	74292775	74292963	74292884	Y	TMEM2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	90258	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	74293239	74293379	74293310	Y	TMEM2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	90722	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	74398068	74398402	74398258	Y	TMEM2	TMEM2	TMEM2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMEM2	31204	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr9	76299237	76299618	76299309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	534564	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	77588894	77589149	77589022	Y	NA	RP11-197P3.1,C9orf40	NA	NA	NA	NA	C9orf40	23092	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	79383801	79384093	79383990	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	PRUNE2	134910	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	80325325	80325445	80325383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA14	64102	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	80422497	80422534	80422513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA14	161274	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	81486579	81486867	81486725	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD2P9	517352	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	81641483	81641834	81641545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	362385	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	81977149	81977423	81977213	Y	NA	CHCHD2P9	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	26796	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	83933520	83933761	83933604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE1	368459	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.93456595076917
chr9	84025176	84025464	84025320	Y	NA	NA	TLE1	IMR90	Hi-C	24141950	TLE1	276756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	84270722	84271111	84271084	Y	NA	TLE1,RP11-154D17.1	NA	NA	NA	NA	TLE1	31109	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr9	86238855	86239256	86239056	Y	UBQLN1,GKAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	81253	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	87370377	87370471	87370425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTRK2	88911	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	88184194	88184649	88184621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	170295	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	88298792	88299000	88298900	Y	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	55944	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	89381829	89382120	89381981	Y	ZCCHC6	NA	ZCCHC6,GAS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDC20P1	242447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	89422548	89422732	89422697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	201835	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	90060695	90060799	90060768	Y	C9orf79	NA	DAPK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	77418	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	90337110	90337856	90337443	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	198893	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	91146731	91147178	91146985	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	838	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.54765276061533
chr9	91147328	91147523	91147436	Y	NXNL2	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.62667422183776
chr9	91148176	91148373	91148274	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	160	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr9	91150927	91151269	91151097	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	2911	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.44726253800188
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.12653595779531
chr9	92004867	92005103	92005008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECISBP2	73446	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	92042592	92043030	92042739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4D	68015	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	92047808	92047987	92047898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4D	63058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	92218967	92219282	92219262	Y	NA	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	1039	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr9	92276961	92277319	92277054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	59033	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr9	92296049	92296284	92296165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	78121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	93602327	93602707	93602517	Y	SYK,SYK	SYK	NA	NA	NA	NA	SYK	40258	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	93683361	93683758	93683679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYK	121292	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.1900032133136
chr9	93710406	93710774	93710540	Y	NA	NA	ROR2,AUH,LOC100129316,NFIL3	IMR90	Hi-C	24141950	SYK	148337	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr9	93892173	93892363	93892269	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	229832	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	94123007	94123342	94123181	Y	NA	AUH	NA	NA	NA	NA	AUH	812	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	94668024	94668724	94668369	Y	ROR2	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	41720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	94834730	94835154	94834963	Y	OGN	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	40512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	95168954	95169114	95169066	Y	OGN	NA	NA	NA	NA	NA	NOL8	83036	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	95894467	95895029	95894875	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89	NA	NA	NA	NA	NINJ1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	95898491	95898622	95898578	Y	NA	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	3921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	96329605	96329732	96329668	Y	NA	PHF2	PHF2	IMR90	Hi-C	24141950	PHF2	6957	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr9	96434811	96435085	96434948	Y	PHF2	NA	NA	NA	NA	NA	PHF2	98122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.67941211736514
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.29603602796514
chr9	97393129	97393529	97393332	Y	NA	FBP1	NA	NA	NA	NA	FBP1	7002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.63255483019161
chr9	97395176	97395462	97395319	Y	NA	FBP1	NA	NA	NA	NA	FBP1	5069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	97630074	97630491	97630387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	143091	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	97631649	97631973	97631839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	144666	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	97679079	97679413	97679326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	192096	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.978189339113065
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.85247199470114
chr9	97685167	97685467	97685319	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	198184	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr9	97688379	97688667	97688436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	201396	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01984386717439
chr9	97758166	97758608	97758351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	271183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65476404431983
chr9	97770536	97771110	97770577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	283553	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	97839686	97839862	97839737	Y	PTCH1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	238129	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	97852724	97853044	97852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	224947	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	85934	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.10041292902578
chr9	98629500	98629569	98629535	Y	NA	LINC00476	NA	NA	NA	NA	LINC00476	6690	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	99132173	99132333	99132255	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	11659	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr9	100432763	100433089	100432926	Y	TSTD2,XPA	NCBP1,TSTD2,XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	24550	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.88735552317902
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	100908591	100908763	100908677	Y	NA	TRIM14,CORO2A	TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM14	29097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	100981172	100981639	100981390	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	28250	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	102621794	102622137	102621866	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3,STX17	NA	NA	NA	NA	NR4A3	39657	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	102646895	102646933	102646914	Y	NA	STX17	NA	NA	NA	NA	STX17	19982	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	NA	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TEX10	60609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.39370689614963
chr9	105248809	105248820	105248818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF20	954676	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr9	105957487	105957816	105957647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	896725	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	107510718	107511248	107511059	Y	ABCA1,NIPSNAP3A	NIPSNAP3A,NIPSNAP3B	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3A	2749	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr9	107769025	107769996	107769532	Y	FSD1L,FSD1L,ABCA1	RP11-217B7.3	ABCA1,SLC44A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-217B7.3	16963	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	107979204	107979331	107979268	Y	TAL2,SLC44A1,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	SLC44A1,ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A1	25572	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	108474101	108474491	108474408	Y	TMEM38B	TMEM38B	NA	NA	NA	NA	TMEM38B	19276	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	108673876	108674293	108674054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM38B	219051	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.939274805323
chr9	108675156	108675451	108675279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM38B	220331	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.01829626654543
chr9	110109718	110109795	110109757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	66300	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	110227888	110228126	110228018	Y	KLF4	KLF4	NA	NA	NA	NA	KLF4	22637	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	110266981	110267369	110267173	Y	NA	KLF4,RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	16218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr9	110390815	110391213	110391017	Y	NA	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	96144	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr9	110500244	110500586	110500377	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-438P9.1	205573	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr9	110502996	110503145	110503135	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-438P9.1	208325	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr9	110517575	110517896	110517754	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	222904	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr9	111241256	111241607	111241441	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-220D10.1	145506	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	112238648	112239006	112238827	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	19584	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	112262069	112262452	112262225	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	3479	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr9	113014576	113014999	113014920	Y	AKAP2,TXN	C9orf152,TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	1921	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr9	114705587	114705765	114705623	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	48541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	114774761	114774976	114774762	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	117715	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr9	114784464	114784581	114784539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	127418	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	114811444	114811737	114811486	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123951	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	114828005	114828556	114828288	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	107132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr9	114831912	114832228	114831995	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	103460	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chr9	114836654	114837091	114837061	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	98597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr9	115071018	115071139	115071076	Y	NA	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	22808	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	115110736	115110930	115110781	Y	NA	PTBP3,HSDL2	NA	NA	NA	NA	PTBP3	16789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr9	115470219	115470249	115470232	Y	ROD1,HSDL2,C9orf80	SNX30	NA	NA	NA	NA	SNX30	40869	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	115527127	115527401	115527315	Y	NA	SNX30	NA	NA	NA	NA	SNX30	16009	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01984386717439
chr9	115614204	115614389	115614297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	103086	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	115981344	115981857	115981657	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP15,SLC31A1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	116011576	116011925	116011593	Y	NA	FKBP15,SLC31A1,PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	23698	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	116031847	116032083	116031965	Y	NA	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	3540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr9	116036635	116036980	116036798	Y	SLC31A2,FKBP15,RGS3	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	CDC26	766	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	76776	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	116286167	116286399	116286304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	81156	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	116341254	116341479	116341362	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	136243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr9	116648716	116649282	116648886	Y	NA	ZNF618	NA	NA	NA	NA	ZNF618	12154	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr9	117314293	117314590	117314355	Y	TNFSF8,TNFSF15,DFNB31,ATP6V1G1	DFNB31,ATP6V1G1	DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP6V1G1	33436	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr9	117351016	117351370	117351316	Y	TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	ATP6V1G1,C9orf91	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	2990	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	118706424	118707025	118706637	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	740556	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chr9	119311432	119311888	119311785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	135693	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	120162627	120162904	120162792	Y	NA	ASTN2	NA	NA	NA	NA	ASTN2	12444	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr9	120507373	120507587	120507563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN2	332025	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	121918529	121918824	121918789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1421624	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	122127885	122128245	122128065	Y	DBC1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1212203	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	123983385	123983622	123983510	Y	TRAF1,TRAF1,GSN	GSN,RAB14	GSN,GGTA1P	IMR90	Hi-C	24141950	RAB14	93	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.82700617533096
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.62014123857005
chr9	124383753	124383935	124383823	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	56417	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	125578475	125578645	125578596	Y	NA	PDCL	NA	NA	NA	NA	PDCL	10265	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	126029655	126030141	126030108	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	800	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	126116431	126116619	126116525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	87576	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	126138103	126138404	126138241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	109248	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	126154038	126154354	126154284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	125183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	126200869	126200875	126200873	Y	RABGAP1,GPR21,DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	172014	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	126901442	126901607	126901525	Y	NA	NA	DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	116278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	127509473	127509808	127509481	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	21781	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	127976903	127977044	127976974	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	16082	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	128211957	128212104	128212028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPVD1	189884	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.64443323757019
chr9	128274126	128274455	128274251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	193058	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.71310118563067
chr9	128275898	128276280	128276126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	191233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chr9	128276459	128276912	128276764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	190601	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.07302366219769
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.4099183112531
chr9	128299092	128299304	128299184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168209	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.889278970636917
chr9	128408655	128409172	128408692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	58341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	128530354	128530667	128530385	Y	NA	PBX3	NA	NA	NA	NA	PBX3	22730	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	129090797	129090964	129090895	Y	ZBTB43	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1B	283758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	129405263	129405520	129405376	Y	NA	LMX1B	NA	NA	NA	NA	LMX1B	30541	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.552361615169167
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.48015656635486
chr9	129485609	129485808	129485757	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	79477	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr9	129889359	129889542	129889416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARNL3	95002	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	129929259	129929425	129929350	Y	LRSAM1,RALGPS1	NA	NA	NA	NA	NA	GARNL3	55119	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	130307843	130308200	130307973	Y	SLC2A8,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	31068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.976619032071775
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	130342769	130343108	130342811	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	3501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	PTRH1	23260	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	130681632	130682091	130681875	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC4	4315	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chr9	130718218	130718307	130718248	Y	NA	ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	DPM2	19455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	130730158	130730541	130730220	Y	NA	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	10251	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	130731999	130732057	130732026	Y	SLC25A25,DPM2,FAM102A	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	8735	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chr9	130733227	130733464	130733411	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	7328	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chr9	130733540	130734011	130733863	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	6781	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	130743802	130743907	130743855	Y	FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	3010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	130770213	130770372	130770289	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A	FAM102A	FAM102A,SLC25A25,NAIF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM102A	29421	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.60837795529233
chr9	130834459	130834744	130834726	Y	NA	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	5974	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	130844598	130844860	130844677	Y	NA	SLC25A25,NAIF1,PTGES2	NA	NA	NA	NA	NAIF1	16113	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr9	131788763	131789149	131789046	Y	SH3GLB2	SH3GLB2,FAM73B	NA	NA	NA	NA	SH3GLB2	181	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.45560384462664
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.64180923445831
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.388483497195124
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.20241680493516
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.70124548466441
chr9	132040752	132040968	132040856	Y	NA	RP11-344B5.2,C9orf106	C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7,HELA,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-344B5.2	1769	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	132124421	132124717	132124470	Y	NA	C9orf106,RP11-65J3.1	LOC100506190,PHYHD1,SH3GLB2,DOLPP1,CRAT,PPP2R4,IER5L,C9orf50	MCF7,HELA,K562,GM12878,H1ESC,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	31842	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.76902304149526
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	7.71145910074316
chr9	132171147	132171349	132171255	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	72381	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	16.6622893387367
chr9	132176730	132177172	132176936	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	66558	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr9	132220495	132220692	132220545	Y	FAM73B,USP20,USP20,C9orf78,ASB6	LINC00963	PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	23038	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	132221518	132221749	132221614	Y	USP20,USP20,C9orf78	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	21981	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr9	132236208	132236504	132236334	Y	NA	LINC00963	LOC100506190,PPP2R4,IER5L,METTL11A,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	7226	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chr9	132241150	132241608	132241414	Y	NA	LINC00963	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	2122	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.20241680493516
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.18620538983169
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.70122277825208
chr9	132249735	132250094	132249903	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	6005	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.33574646872626
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	5180	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	4264	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.19562309893936
chr9	132331590	132331738	132331651	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	3950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.71743419335554
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.75044541237944
chr9	132373475	132373922	132373518	Y	NA	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	28522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	132476868	132477255	132477106	Y	NA	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	36071	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	132505331	132505539	132505390	Y	PTGES	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	7787	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr9	132568357	132568650	132568524	Y	TOR1B	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	TOR1B	4925	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.14206745708711
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	132718798	132719167	132719105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	84306	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	132754435	132754683	132754561	Y	USP20,USP20,FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	48790	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	132758529	132758977	132758901	Y	FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	44496	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	132814142	132814504	132814316	Y	TOR1B	FNBP1,GPR107	NCS1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR107	437	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	133342925	133343088	133343007	Y	PRDM12	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	24609	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.31901844265208
chr9	133619181	133619471	133619230	Y	NA	ABL1	NA	NA	NA	NA	ABL1	31848	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	133733743	133734142	133733821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	78531	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	76155	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	14.1365351310291
chr9	134258707	134258891	134258799	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	8589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chr9	134278219	134278688	134278276	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	10739	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	134421730	134421959	134421845	Y	NA	POMT1,UCK1	UCK1,RAPGEF1,POMT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	UCK1	17075	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chr9	134510539	134511032	134510903	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	102429	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	134532379	134532786	134532611	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	80675	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr9	134908976	134909021	134908999	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	44274	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	135068223	135068386	135068305	Y	NTNG2	NA	NA	NA	NA	NA	MED27	114928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	135999727	136000118	136000091	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	37183	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.247587793908018
chr9	136017634	136018138	136017813	Y	GTF3C4,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	19163	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	136727885	136728287	136727895	Y	SLC2A6,RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	127439	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	136738611	136738757	136738701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.50407478509609
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	14.757704591342
chr9	136746393	136746610	136746453	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	109116	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.59521060344283
chr9	136779643	136779949	136779796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	75777	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	136821729	136822115	136821856	Y	NA	VAV2	NA	NA	NA	NA	VAV2	33611	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	136996268	136996567	136996488	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	WDR5	K562	ChIA-PET	22265404	WDR5	1920	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chr9	136999790	136999893	136999856	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	NA	NA	NA	NA	WDR5	1303	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	137030495	137030803	137030732	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU6ATAC	2809	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr9	137040428	137040559	137040494	Y	SARDH,SARDH,RXRA	WDR5,RNU6ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU6ATAC	12742	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chr9	137219951	137220008	137219980	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	13007	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	137220336	137220598	137220352	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	13392	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.09324337620103
chr9	137221069	137221192	137221119	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14125	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.46593465137627
chr9	137221806	137221969	137221887	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	137231518	137231916	137231717	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	24574	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chr9	137233458	137233505	137233466	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	26514	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	137247900	137248164	137247916	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	40956	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.820191829492863
chr9	137250651	137250992	137250728	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	43707	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.21429521231375
chr9	137252796	137253042	137252967	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	45852	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.713499738871951
chr9	137257724	137257990	137257923	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	50780	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.34603186265122
chr9	137259692	137260046	137259796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	52748	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.69852613023546
chr9	137267558	137268069	137267755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	60614	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chr9	137285570	137286195	137285918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	78626	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	137302036	137302210	137302202	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	95092	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.35676122264214
chr9	137305745	137306050	137305907	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	98801	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.22343242590955
chr9	137667512	137667789	137667676	Y	OLFM1,OLFM1	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	135892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	137670812	137671011	137670912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	139192	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	138285505	138285888	138285678	Y	NA	NA	OLFM1,LOC100506599,PPP1R26	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP1R26	83037	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.18255229791847
chr9	138287033	138287362	138287321	Y	NA	NA	OLFM1,LOC100506599	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP1R26	81563	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	138780125	138780291	138780208	Y	CAMSAP1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	16783	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	138808024	138808108	138808066	Y	GLT6D1	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	10366	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	138818727	138819161	138818918	Y	CAMSAP1,CARD9	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	21069	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chr9	139294189	139294305	139294248	Y	TRAF2,FAM69B,INPP5E	DNLZ,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E	NA	NA	NA	NA	SDCCAG3	8756	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	139444945	139445101	139445057	Y	TMEM141,SDCCAG3	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	6281	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chr9	139445894	139446087	139445949	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	7230	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	139462526	139462651	139462613	Y	C9orf69	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	23862	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	139613892	139613944	139613895	Y	NA	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	SNHG7	6692	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chr9	139858882	139858961	139858922	Y	NA	FBXW5,C9orf142,CLIC3	NA	NA	NA	NA	FBXW5	21734	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chr9	139919787	139920355	139920165	Y	NA	C9orf142,CLIC3,ABCA2,NPDC1,ENTPD2,UAP1L1	NA	NA	NA	NA	ABCA2	1012	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.61988051584196
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	34.634272944508
chr9	140047623	140048201	140047695	Y	NA	DPP7,MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1	NA	NA	NA	NA	MIR3621	13521	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	10.2766349273452
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.79957356224823
chr9	140163781	140164247	140164025	Y	NA	RNF208,C9orf169,TUBB4B,NRARP	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	30116	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	5111	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chr9	140205114	140205300	140205216	Y	PNPLA7,NOXA1,NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	10411	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chr9	140205908	140206072	140205991	Y	NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	11205	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.6313830763916
chr9	140274735	140275080	140274933	Y	CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	40634	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chr9	140341522	140341675	140341601	Y	EHMT1,ANAPC2,NELF	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	ENTPD8	7254	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chrX	1480354	1481325	1480771	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	28292	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	2625453	2625758	2625570	Y	ZBED1,ZBED1,DHRSX,CD99,ARSD	CD99,XG	NA	NA	NA	NA	CD99	18233	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	3591324	3591658	3591618	Y	NA	PRKX	NA	NA	NA	NA	PRKX	37991	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.93421281035254
chrX	7896783	7897141	7896963	Y	VCX	PNPLA4	NA	NA	NA	NA	PNPLA4	3003	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	9477403	9477544	9477474	Y	FAM9B,TBL1X,LOC100288814	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	48068	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	SHROOM2,RP11-98L4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	1159	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	9896256	9896650	9896356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	84952	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chrX	9929375	9929481	9929417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	52121	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	12912381	12912679	12912531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	78548	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	12965371	12965491	12965432	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	25736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chrX	12969061	12969258	12969197	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	21969	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	12996518	12996966	12996772	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5291	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.264689600241115
chrX	13002969	13003378	13003273	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	11742	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.03017467392402
chrX	13026247	13026553	13026429	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	TMSB4X,FAM9C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMSB4X	35020	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	128697	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	13128879	13129151	13129129	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	137652	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.448810138630837
chrX	13208277	13208528	13208394	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	217050	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.939274805323
chrX	13208985	13209208	13209149	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	217758	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.01829626654543
chrX	13416625	13416882	13416754	Y	NA	NA	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCEANC	252343	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chrX	13687345	13687715	13687534	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	RAB9A	17529	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	15787454	15787695	15787561	Y	NA	ZRSR2	NA	NA	NA	NA	ZRSR2	18900	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	16680488	16680840	16680664	Y	NA	CTPS2	NA	NA	NA	NA	CTPS2	48219	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.792498493682052
chrX	18904504	18904672	18904535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	96044	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.80400105423169
chrX	20154251	20154286	20154269	Y	NA	EIF1AX	NA	NA	NA	NA	EIF1AX	3676	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	22007452	22007864	22007637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	50761	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	22152966	22153318	22153142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	196275	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	24187705	24188069	24187889	Y	NA	ZFX,ZFX-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFX-AS1	21934	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	24497982	24498378	24498262	Y	NA	PDK3	NA	NA	NA	NA	PDK3	16644	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	26656235	26656312	26656257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA1P1	107834	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	28999435	28999810	28999466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-12D5.5	1119425	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	37764139	37764531	37764292	Y	NA	NA	DYNLT3	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYNLT3	59249	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.5420555814019
chrX	38922224	38922690	38922464	Y	MID1IP1	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	263539	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chrX	39256964	39257428	39257231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	387962	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	39614973	39615267	39615108	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	30123	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	162597	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.78858554609927
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.56751933420206
chrX	39950207	39950578	39950448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84004	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chrX	39963931	39964200	39963990	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.571033728543555
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.80400105423169
chrX	39964938	39965503	39965246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69079	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	5.01632947283289
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.34486010885122
chrX	39968932	39969265	39969200	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65317	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	40691770	40692090	40691930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	73147	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chrX	40693990	40694519	40694253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	70718	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.510707087107842
chrX	41413588	41413590	41413589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	222937	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.307914435343731
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.614258563646172
chrX	44834978	44835378	44835063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	104221	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chrX	45210801	45210962	45210882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR222	393568	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	229453	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chrX	45493055	45493058	45493057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR222	111472	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chrX	45667637	45667718	45667664	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41202	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	46120012	46120235	46120091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	64845	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	46569898	46570252	46570035	Y	SLC9A7	SLC9A7	NA	NA	NA	NA	SLC9A7	46238	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	46651969	46652131	46652053	Y	ZNF674,CHST7,RP2	SLC9A7,RP2	CHST7,ZNF674,LOC401588,SLC9A7,RP2,PHF16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A7	35479	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	47221089	47221361	47221213	Y	NA	NA	USP11,ZNF157,UBA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF41	118984	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	47382833	47383145	47382966	Y	SYN1,SPACA5,CFP,CFP	ZNF41,ARAF	UBA1,ZNF41,USP11,CDK16	IMR90	Hi-C	24141950	ARAF	35371	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.84567828870535
chrX	47880817	47881226	47880903	Y	SYN1	ZNF182,ZNF630	NA	NA	NA	NA	ZNF182	19440	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	48571837	48572283	48571996	Y	TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19892	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	48938465	48938570	48938518	Y	NA	TFE3,CCDC120,PRAF2,WDR45,GPKOW	NA	NA	NA	NA	PRAF2	8735	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	49011448	49011844	49011738	Y	GATA1,HDAC6,MAGIX	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	14429	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.76665682748291
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	6.45393905332677
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chrX	53741584	53742291	53741941	Y	KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29911	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.54767546702766
chrX	54668047	54668238	54668126	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	113403	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.1797157528186
chrX	56839801	56840427	56840156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	77791	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	67728770	67728923	67728861	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	12605	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.66633924977421
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chrX	71265824	71266148	71265948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGAG4	83610	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.71666099279683
chrX	73338057	73338325	73338191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTX	173084	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	73338544	73338621	73338582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTX	172788	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	FTX	170270	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	NA	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	FTX	160589	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	73510244	73510542	73510484	Y	RLIM	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	867	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	73791399	73791714	73791557	Y	RLIM	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	40738	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chrX	77306835	77307068	77306952	Y	NA	PGK1	NA	NA	NA	NA	PGK1	11617	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chrX	85196824	85197022	85197001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	103544	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	86664443	86664822	86664622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL4	105930	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.44726253800188
chrX	93615949	93615975	93615962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1137935	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	95228939	95229189	95229110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	708473	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	100001357	100001522	100001440	Y	NA	SYTL4	SRPX2,SYTL4	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL4	16247	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	GPRASP1	NA	NA	NA	NA	GPRASP1	10490	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.78689924789859
chrX	102063503	102063615	102063509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHB9	89887	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.07339950902664
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	3.44166329221842
chrX	106944916	106945406	106945227	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	73166	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	106954265	106954667	106954451	Y	TSC22D3,TSC22D3,ATG4A	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	63905	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	106970108	106970471	106970179	Y	NA	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	48101	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.43013802525645
chrX	109083708	109084134	109083977	Y	NXT2,NXT2,ACSL4	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM164	159725	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	109315579	109315956	109315731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	71720	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	109382352	109382583	109382468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	138493	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	109429267	109429621	109429491	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	185408	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	109645744	109645944	109645869	Y	NA	AMMECR1	TMEM164	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMMECR1	35517	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.368241076779445
chrX	115004721	115004876	115004807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1GP5	69590	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.467482252005224
chrX	115239457	115239782	115239623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	156035	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	115364202	115364338	115364320	Y	NA	NA	SLC6A14	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A14	201452	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chrX	115371529	115371930	115371863	Y	NA	NA	SLC6A14	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A14	193860	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01396325882055
chrX	115372300	115372667	115372491	Y	NA	NA	SLC6A14	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A14	193123	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.773826380307665
chrX	115415637	115415812	115415646	Y	NA	NA	SLC6A14	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A14	149978	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	119619980	119620335	119620161	Y	NA	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18760	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.39841575070347
chrX	123144517	123144692	123144607	Y	XIAP,XIAP,STAG2,STAG2	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	52455	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	125406399	125406559	125406479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF12L2	108319	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	125556519	125556645	125556582	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	48223	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.22851919386238
chrX	127434305	127434453	127434370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OCRL	1237373	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.30751588210245
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.185690845431013
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1,RAB33A	NA	NA	NA	NA	RAB33A	3706	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	130577809	130578170	130577990	Y	NA	IGSF1	NA	NA	NA	NA	IGSF1	46132	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chrX	130627096	130627500	130627335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	95419	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.09207162240103
chrX	130698816	130699203	130699008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	167139	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.817051215410282
chrX	130706744	130706880	130706830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	175067	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.589705841917942
chrX	130722065	130722519	130722153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	190388	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.85755669608394
chrX	130722581	130722843	130722721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	190904	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chrX	130722857	130723460	130723167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	191180	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.17941168383589
chrX	130751126	130751587	130751253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	219449	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	4.16036372363255
chrX	130760946	130761148	130761072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	229269	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chrX	130880517	130880959	130880705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	274334	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.01150256054963
chrX	130952432	130952771	130952603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	202522	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	131159301	131159695	131159439	Y	RAP2C,MBNL3,MST4,MST4	MST4	NA	NA	NA	NA	MST4	4008	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	131625337	131625543	131625484	Y	MBNL3	MBNL3	NA	NA	NA	NA	MBNL3	3341	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chrX	132089755	132090160	132089782	Y	NA	HS6ST2	NA	NA	NA	NA	HS6ST2	3263	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.123793896954009
chrX	133121319	133121626	133121494	Y	GPC3	GPC3	NA	NA	NA	NA	GPC3	3397	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	133509019	133509280	133509152	Y	PHF6	PHF6	NA	NA	NA	NA	PHF6	3736	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	134048475	134048529	134048502	Y	MOSPD1	MOSPD1	NA	NA	NA	NA	MOSPD1	1178	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.827382022159913
chrX	135940631	135940874	135940833	Y	HTATSF1	RBMX,RP11-308D16.4	NA	NA	NA	NA	RBMX	20049	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	136647486	136647742	136647575	Y	NA	ZIC3	NA	NA	NA	NA	ZIC3	1185	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	139589403	139589691	139589600	Y	NA	SOX3	NA	NA	NA	NA	SOX3	4178	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	2.58841896401707
chrX	141121057	141121306	141121182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	851747	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	149084401	149084780	149084588	Y	NA	LINC00894,CXorf40B	NA	NA	NA	NA	LINC00894	20066	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.246017486866727
chrX	149201039	149201275	149201132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXorf40B	96010	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chrX	149534295	149534593	149534360	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	6606	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.60120840246758
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.27619216079075
chrX	152064300	152064566	152064432	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	66789	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.670274903769335
chrX	152065195	152065303	152065205	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	67684	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.386913190153833
chrX	152997863	152998070	152997986	Y	TMEM187,RENBP,MECP2,IRAK1,ARHGAP4,ABCD1	SLC6A8,BCAP31,ABCD1,PLXNB3	NA	NA	NA	NA	ABCD1	9540	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chrX	153084450	153084610	153084498	Y	NA	SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	9410	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.20279265176411
chrX	153233137	153233308	153233234	Y	ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TAZ,MECP2,DNASE1L1,TMEM187	ARHGAP4,NAA10,HCFC1,TMEM187	NA	NA	NA	NA	HCFC1	1950	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	1.65277454419495
chrX	153600469	153600779	153600667	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	227	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.40558530352822
chrX	153771070	153771275	153771201	Y	IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG	FAM3A,IKBKG,G6PD	NA	NA	NA	NA	G6PD	2512	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.326586548718119
chrX	154029933	154030114	154030065	Y	EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1	DKC1	NA	NA	NA	NA	DKC1	40902	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.184120538389722
chrX	155157070	155157446	155157240	Y	NA	VAMP7	NA	NA	NA	NA	VAMP7	48114	CAGE	MCF7	hg19	FANTOM5	0.0618969484770045