chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	1084	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1060905	1061095	1061000	Y	RNF223	C1orf159	MIR429,MIR200B,MIR200A,ACAP3,SCNN1D,B3GALT6,SDF4,UBE2J2,C1orf159	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C1orf159	11164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1063914	1064111	1063979	Y	AGRN,VWA1	C1orf159	B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C1orf159	14173	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	1093610	1093958	1093954	Y	ATAD3C,TMEM88B	C1orf159,TNFRSF18	NA	NA	NA	NA	C1orf159	43869	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1098630	1098901	1098641	Y	NA	C1orf159,TNFRSF18	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	41170	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	1173386	1173736	1173661	Y	PLEKHN1	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6,UBE2J2	NA	NA	NA	NA	B3GALT6	7757	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	2140151	2140337	2140252	Y	C1orf86	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	1822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	3136013	3136207	3136056	Y	ARHGEF16,PRDM16	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM16	152281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	3186377	3186508	3186443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	182482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	3269112	3269418	3269330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	99572	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	3325555	3326143	3325876	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	42847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	3521167	3521613	3521414	Y	NA	MEGF6,TPRG1L,TP73,WRAP73	NA	NA	NA	NA	MEGF6	4446	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	4.0121533282854
chr1	7947650	7947935	7947793	Y	TNFRSF9	UTS2	CAMTA1,VAMP3,PER3,UTS2,TNFRSF9	IMR90	Hi-C	24141950	UTS2	36078	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	8121436	8121582	8121497	Y	ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	RERE,ERRFI1,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	36638	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	52503	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	8154517	8154933	8154754	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	69719	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	72619	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	8226138	8226422	8226280	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	38235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	8257762	8258040	8257906	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	6617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	2116	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	7384	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	8520924	8521286	8521014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	145038	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	8724042	8724475	8724233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	151227	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr1	8849339	8849636	8849462	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	26066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	9223692	9223875	9223840	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	16388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	9223907	9224260	9224149	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-510D11.2	16003	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	9224991	9225286	9225137	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-510D11.2	14977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	9241165	9241560	9241362	Y	NA	RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	902	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	10359215	10359483	10359349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF1B	90352	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	10816030	10816223	10816138	Y	CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	38484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	10849807	10850141	10849963	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	4566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	10853986	10854555	10854168	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	152	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	11559549	11559947	11559917	Y	NA	PTCHD2	NA	NA	NA	NA	PTCHD2	22326	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	14992426	14992802	14992486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	69226	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	15335392	15335732	15335561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	141296	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	15499033	15499473	15499185	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	22005	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	15657730	15658111	15657770	Y	NA	NA	EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	76280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	15673118	15673422	15673270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	60969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	78362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	16291784	16292062	16291897	Y	CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	SPEN	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB17	8565	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	16339773	16339933	16339866	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	39146	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	16489021	16489207	16489116	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA2	8439	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	17027024	17027386	17027173	Y	NA	EIF1AXP1	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	16474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.93690160675847
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.76700229536924
chr1	17417123	17417163	17417153	Y	NA	SDHB,PADI2	NA	NA	NA	NA	PADI2	26785	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	17557386	17557571	17557478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PADI2	113438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	10.0995583780977
chr1	17867253	17867735	17867370	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	2923	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	19614370	19614635	19614441	Y	ALDH4A1,AKR7A3	MRTO4,AKR7A2,PQLC2	NA	NA	NA	NA	AKR7A2	22005	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4,RNF186	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	20790470	20790828	20790649	Y	NA	CAMK2N1,MUL1	NA	NA	NA	NA	CAMK2N1	19885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	21349725	21349786	21349755	Y	EIF4G3	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	21655798	21656254	21656078	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	13743	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	21663991	21664182	21664145	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	5815	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	21724067	21724372	21724186	Y	NA	NBPF3	ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48	IMR90	Hi-C	24141950	NBPF3	40249	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	61951	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	22076024	22076450	22076245	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	31649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	23076914	23077145	23077061	Y	NA	EPHB2	NA	NA	NA	NA	EPHB2	41582	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	23178080	23178304	23178193	Y	C1QA,C1QC,C1QB	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	142748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	23429944	23430077	23430039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	72224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	23839318	23839630	23839474	Y	HNRNPR,ZNF436	ASAP3,E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	E2F2	16082	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr1	24890021	24890356	24890213	Y	C1orf130	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN3	62634	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	25855984	25856012	25855998	Y	NA	LDLRAP1	MAN1C1,LDLRAP1,TMEM57,C1orf135,FAM54B,RHCE,SEPN1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	12059	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	26683687	26684084	26683890	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	5066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.90535241013771
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3,NR0B2	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr1	27468191	27468425	27468281	Y	NA	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	23047	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	27519342	27519481	27519412	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A1	27870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	27922522	27922947	27922946	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	5995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	27976905	27977430	27977241	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	AHDC1,IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	19299	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	27985480	27985709	27985578	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	11020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	28152962	28153213	28153036	Y	NA	PPP1R8	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	2076	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	28389248	28389585	28389551	Y	NA	EYA3	NA	NA	NA	NA	EYA3	23622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr1	28618110	28618271	28618191	Y	ATPIF1	SESN2,MED18	NA	NA	NA	NA	SESN2	34072	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	29104880	29105053	29104930	Y	NA	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	43747	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	TMEM200B	NA	NA	NA	NA	TMEM200B	2610	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	29513219	29513546	29513454	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	6720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	31238817	31239233	31238883	Y	LAPTM5	NA	PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3	IMR90	Hi-C	24141950	SDC3	140375	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	84858	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	31943761	31943827	31943813	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63349	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	31944306	31944695	31944578	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	RP11-73M7.1,TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-73M7.1	23584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	BAI2	47508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1522	22973	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	33202470	33202806	33202641	Y	ZBTB8OS,RBBP4,RBBP4,KIAA1522	KIAA1522	KIAA1522	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1522	2680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33203093	33203146	33203106	Y	NA	KIAA1522	KIAA1522	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1522	2340	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15786	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	19570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	33378487	33378646	33378567	Y	RNF19B	FNDC5,TMEM54,RNF19B	NA	NA	NA	NA	TMEM54	13448	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33622437	33622835	33622675	Y	PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	22825	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	33829513	33829825	33829684	Y	FNDC5,ZSCAN20	NA	NA	NA	NA	NA	PHC2	64828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT2	116288	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	36592352	36592554	36592389	Y	NA	TEKT2,ADPRHL2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	TRAPPC3	20544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	38495782	38495936	38495884	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1,RP5-884C9.2	NA	NA	NA	NA	POU3F1	14514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	38518708	38519047	38518874	Y	NA	FHL3,UTP11L,POU3F1,RP5-884C9.2	POU3F1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-884C9.2	7722	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	38739267	38739533	38739400	Y	NA	NA	POU3F1	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-884C9.2	228281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	39624919	39625154	39625144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	79931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	39633654	39634014	39633702	Y	BMP8A	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	88666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	39657786	39658129	39657912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	112798	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	40295095	40295414	40295254	Y	NA	BMP8B	NA	NA	NA	NA	BMP8B	42562	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	40853198	40853308	40853253	Y	NA	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	44676	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	141529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	41981831	41982007	41981926	Y	SLFNL1,SLFNL1	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	33487	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	42385609	42385954	42385889	Y	FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	113642	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	43402214	43402581	43402425	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	43426742	43427095	43427089	Y	CLDN19,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	4212	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	43427522	43427762	43427666	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	4992	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	5856	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	43473183	43473398	43473279	Y	C1orf210,C1orf210,SLC2A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	50653	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	43839359	43839523	43839441	Y	NA	RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2	NA	NA	NA	NA	ELOVL1	7663	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	45670767	45670868	45670821	Y	PTCH2,ZSWIM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM5	99013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	45746932	45746947	45746939	Y	NA	ZSWIM5,HPDL	ZSWIM5,UROD,HECTD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	22934	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	46008399	46008548	46008476	Y	PRDX1,AKR1A1	MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1,NASP	PRDX1,AKR1A1,NASP,CCDC17	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1A1	5667	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	46009549	46009894	46009666	Y	IPP,GPBP1L1,TOE1,TESK2	MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1,NASP	PRDX1,AKR1A1,NASP,CCDC17	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AKR1A1	4321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	46268583	46268737	46268651	Y	NA	MAST2	NA	NA	NA	NA	MAST2	17924	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	46637652	46637852	46637691	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	893	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	47718105	47718425	47718265	Y	NA	TAL1	TAL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAL1	22213	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	48570660	48571055	48570858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	340553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	48936089	48936471	48936227	Y	NA	RNU4-61P,SPATA6	NA	NA	NA	NA	SPATA6	244	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	49317577	49317713	49317702	Y	SPATA6,BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	381732	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	50619908	50620155	50620032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL4	132323	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	50902653	50903020	50902837	Y	NA	DMRTA2	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	15481	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	51102056	51102361	51102067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	214884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	51769565	51770027	51769738	Y	EPS15	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	38761	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	52238666	52238881	52238774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	103596	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	52507951	52508154	52508101	Y	NA	KTI12,BTF3L4,TXNDC12	NA	NA	NA	NA	KTI12	10463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9	NA	NA	NA	NA	ZFYVE9	22143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	53101245	53101408	53101322	Y	ZCCHC11,FAM159A	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC11	84086	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	54766230	54766370	54766314	Y	SSBP3,SSBP3	NA	MRPL37,CYB5RL	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	102521	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	55506956	55507037	55506997	Y	NA	PCSK9	NA	NA	NA	NA	PCSK9	3735	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	57472428	57472552	57472504	Y	C1orf168,C8A,C8B	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAA2	363433	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	57995135	57995251	57995193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	524901	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	59228706	59229186	59229035	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	18599	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	JUN	121264	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	59986893	59986899	59986896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	226583	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	60015651	60015887	60015758	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	255341	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	60087129	60087147	60087138	Y	CYP2J2	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	191311	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	61039424	61039611	61039555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	289320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	61522505	61523042	61522705	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	193574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	61583915	61584228	61583999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	254984	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	62119868	62120084	62119981	Y	NA	NA	TM2D1,INADL	IMR90	Hi-C	24141950	TM2D1	69011	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	62810220	62810245	62810233	Y	NA	KANK4	KANK4	IMR90	Hi-C	24141950	KANK4	27135	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	64496116	64496488	64496302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	188760	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	64558632	64559006	64558819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	251276	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	65381647	65381826	65381744	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	48361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	65398951	65399446	65399123	Y	LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	30741	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	65701792	65701883	65701838	Y	NA	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	10019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	65758796	65759173	65758995	Y	NA	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	46894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	66750727	66750832	66750780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	637738	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	66770897	66771283	66771085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	617287	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	66859299	66859884	66859497	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	528686	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	66878388	66878620	66878571	Y	PDE4B	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR78	509950	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	66881077	66881511	66881177	Y	PDE4B	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR78	507059	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	66904732	66904991	66904859	Y	MIER1,PDE4B	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR78	483579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	68000341	68000585	68000456	Y	SLC35D1	NA	GNG12,DIRAS3,LOC100289178,GADD45A,WLS	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERBP1	106243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	68364057	68364377	68364218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	66907	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	68488279	68488394	68488337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	191129	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	71444985	71444992	71444989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2	99988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	75182913	75182976	75182918	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	13860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	75683161	75683232	75683197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZ	486069	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	75694572	75694736	75694622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	493300	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	76197113	76197244	76197179	Y	NA	ACADM	NA	NA	NA	NA	ACADM	9077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	77713696	77713788	77713742	Y	NA	PIGK,AK5	PIGK,AK5,ZZZ3	IMR90	Hi-C	24141950	PIGK	30581	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	77891343	77891690	77891394	Y	AK5,AK5,ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	AK5	145607	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	77897197	77897334	77897266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AK5	151461	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	94366	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	80186272	80186571	80186386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	1072791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	81941853	81942198	81942026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	269600	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	82026431	82026771	82026601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	354178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	82137210	82137218	82137214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	464957	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	82146044	82146302	82146156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	473791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	82798183	82798427	82798305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	1125930	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	82913618	82913898	82913758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	1241365	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	84178650	84178667	84178652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	146039	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	84757421	84757614	84757534	Y	DNASE2B,DNASE2B,SAMD13,SAMD13	NA	UOX,DNASE2B	IMR90	Hi-C	24141950	RPF1	185328	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	85007374	85007584	85007581	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	30579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	85791287	85791404	85791348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	50514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	85992128	85992211	85992170	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	49722	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	86010493	86010816	86010648	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31117	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	86016463	86016866	86016755	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	25067	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	86071867	86071976	86071922	Y	NA	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61,ZNHIT6	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	27423	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	86805161	86805335	86805245	Y	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	NA	ODF2L	54688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	87190718	87190974	87190846	Y	NA	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	22459	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	88749888	88750086	88749988	Y	NA	NA	LOC339524	IMR90	Hi-C	24141950	PKN2	397819	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	89188530	89188764	89188647	Y	NA	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	40625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	89339924	89340210	89340169	Y	PKN2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	15417	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	89382528	89382593	89382561	Y	NA	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	26901	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	89942348	89942369	89942360	Y	NA	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	46026	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	90022562	90022945	90022840	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B,LRRC8B	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	34167	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	90032556	90032702	90032627	Y	LRRC8D,GBP2,LRRC8C,LRRC8B,LRRC8B	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	44161	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	90101821	90102213	90101853	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	5190	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	93408847	93409156	93409003	Y	NA	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	15901	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	93773027	93773315	93773230	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	36130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	79662	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	94204695	94204800	94204748	Y	NA	RP11-488P3.1	BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	34200	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	94309612	94309956	94309784	Y	NA	MIR760,BCAR3,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	MIR760	432	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	94450262	94450661	94450462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	77296	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	94937052	94937396	94937225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCD3	55119	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	95174059	95174304	95174182	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	109533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	95263833	95264301	95264195	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	19536	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	95267524	95267667	95267664	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	16170	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14,TMEM56	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	97308752	97309076	97308966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	123531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	97596064	97596178	97596116	Y	PTBP2	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	410843	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	98366677	98366793	98366726	Y	DPYD	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	357420	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX7	518774	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	100138206	100138591	100138311	Y	AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	28707	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	100494312	100494735	100494498	Y	CDC14A,HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	6918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	100502622	100502881	100502754	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	104525002	104525023	104525013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	458689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	107767992	107768000	107767996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	170725	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	108132692	108133060	108132878	Y	NTNG1,NTNG1,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	372706	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	108175822	108176099	108175961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	329667	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	109079557	109079899	109079743	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	20812	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	110778589	110778756	110778673	Y	NA	KCNC4	NA	NA	NA	NA	KCNC4	26624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	111178912	111179243	111179089	Y	RBM15,CD53	NA	KCNA2	K562	ChIA-PET	22265404	SLC16A4	247208	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	111729234	111729498	111729366	Y	NA	CEPT1,DRAM2,DENND2D	NA	NA	NA	NA	DENND2D	15659	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	111733520	111733879	111733740	Y	NA	DENND2D	NA	NA	NA	NA	DENND2D	11278	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	111735691	111736003	111735892	Y	CD53,LRIF1,RAP1A,C1orf162	DENND2D	NA	NA	NA	NA	DENND2D	9154	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	112196411	112196803	112196596	Y	C1orf183,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	DDX20	99064	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.49030206583232
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	116588429	116588746	116588471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	71310	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	116694646	116694883	116694753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	177527	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	117089417	117089635	117089469	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	22026	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	117422443	117422644	117422485	Y	NA	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28035	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	121285922	121286152	121286038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	381894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	581054	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	15122	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	57405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	145004446	145004804	145004625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	61774	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	145005016	145005394	145005195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	62344	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	145042783	145043227	145042898	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	30959	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	145090155	145090603	145090483	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	3617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	145519496	145519624	145519499	Y	NBPF10,TXNIP	LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B,ITGA10	NA	NA	NA	NA	ITGA10	3267	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	145627337	145627622	145627480	Y	NA	NUDT17,POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	18301	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	146612089	146612358	146612259	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	29771	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	146624494	146624779	146624637	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	17350	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	146999335	146999532	146999436	Y	NA	BCL9	BCL9	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9	11650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	147072641	147072971	147072883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	61459	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	147120817	147121145	147120987	Y	NA	ACP6	NA	NA	NA	NA	ACP6	19473	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	147283345	147283516	147283496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	142727	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	147344950	147345054	147345002	Y	NA	NA	GJA5	IMR90	Hi-C	24141950	ACP6	204332	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.07525172152693
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	149029458	149029500	149029498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN1P12	83155	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SF3B4,MTMR11,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	MTMR11	25164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	150668096	150668276	150668180	Y	NA	GOLPH3L,HORMAD1	NA	NA	NA	NA	GOLPH3L	466	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151284018	151284391	151284246	Y	FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB	ZNF687,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5	NA	NA	NA	NA	PI4KB	13800	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151418157	151418544	151418397	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	11397	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	151486181	151486300	151486231	Y	SELENBP1,RORC,CGN	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	5195	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	151579004	151579225	151579123	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	3316	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151809390	151809745	151809546	Y	RORC,C2CD4D	RP11-98D18.9,TDRKH,RORC	NA	NA	NA	NA	RORC	7042	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151909443	151909536	151909490	Y	S100A10	THEM4	THEM4,S100A10,CELF3,RORC	IMR90	Hi-C	24141950	THEM4	29159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151943125	151943453	151943289	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	21413	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	151945068	151945221	151945146	Y	TUFT1,S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	19645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	152116191	152116374	152116281	Y	LCE3A	FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	22227	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	152198460	152198859	152198660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	59859	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	15331	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	153671679	153672046	153671861	Y	NA	SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3	NA	NA	NA	NA	NPR1	22566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	153715466	153715694	153715559	Y	PGLYRP3,INTS3	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	16923	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	153818420	153818667	153818544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	73590	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	153841080	153841191	153841137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	52260	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	154151566	154151965	154151766	Y	NA	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	13159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	154391539	154392211	154392184	Y	GATAD2B,CRTC2,UBAP2L,ADAR,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	15870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	154957258	154957622	154957425	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B	NA	NA	NA	NA	FLAD1	3444	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	154978035	154978657	154978307	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	4908	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	154997722	154998120	154997917	Y	NA	FLAD1,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3	NA	NA	NA	NA	ADAM15	22922	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,TRIM46,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.62865218060078
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L,MSTO1	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	156073142	156073699	156073532	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	22778	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	156089405	156089622	156089466	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	39041	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	156461502	156461819	156461755	Y	MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6801	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	156541089	156541488	156541192	Y	NA	IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4	MEF2D,C1orf61	IMR90	Hi-C	24141950	IQGAP3	693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	156966343	156966626	156966486	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	46536	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	157964633	157965029	157964831	Y	OR10T2	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	3570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	158297399	158297524	158297486	Y	CD1C,CD1E,CD1B	NA	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	151854	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	158983439	158983572	158983497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-419N10.5	743388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	159793141	159793292	159793217	Y	SLAMF8	DUSP23,C1orf204	NA	NA	NA	NA	C1orf204	29845	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	159907968	159908165	159908117	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	IGSF9	5221	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	160510042	160510238	160510216	Y	DCAF8,SLAMF1,CD48,SLAMF6	NA	NA	NA	NA	NA	COPA	198852	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	160537909	160538272	160538136	Y	ATP1A4,CD48,SLAMF6,CD84	NA	NA	NA	NA	NA	COPA	226719	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	160632083	160632454	160632269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	230316	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	160790939	160791134	160791038	Y	SLAMF6,CD48,USF1,CD244,ARHGAP30,LY9	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	71636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	C1orf192	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	24002	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	C1orf192	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	33409	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLB	106847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	161892699	161893027	161892754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOS1AP	144537	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	162666168	162666338	162666209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UAP1	136845	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	164174347	164174632	164174490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	348189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	164289956	164290255	164290071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	232566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	164736884	164737252	164737025	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	214063	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	167192959	167193266	167193111	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	4893	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	167416859	167417570	167417161	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	103434	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	167586596	167587245	167587123	Y	POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1	NA	RCSD1	IMR90	Hi-C	24141950	CREG1	65592	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	168368318	168368620	168368438	Y	TBX19	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	120040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	168382983	168383105	168383068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	134705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	168440429	168440721	168440575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	192151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	168446219	168446589	168446402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	197941	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	168479157	168479362	168479223	Y	XCL2,XCL1	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	230879	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	168483874	168484202	168483927	Y	NA	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	235596	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	168526950	168527356	168527080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	278672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	168531443	168531650	168531547	Y	NA	NA	LOC100505918,NME7	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	283165	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	168994253	168994531	168994400	Y	XCL2,XCL1	NA	DPT,ATP1B1,NME7	IMR90	Hi-C	24141950	ATP1B1	78404	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	169071998	169072131	169072049	Y	C1orf114,ATP1B1	ATP1B1	NA	NA	NA	NA	ATP1B1	804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	169532682	169533387	169533357	Y	NA	F5	NA	NA	NA	NA	F5	20439	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	171473011	171473311	171473138	Y	NA	PRRC2C	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	20360	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	171832189	171832290	171832196	Y	DNM3	NA	NA	NA	NA	NA	METTL13	83401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	172369341	172369683	172369640	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	41547	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	172445364	172445579	172445472	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	34134	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	172978915	172979201	172979058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	465204	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	174132741	174133010	174132876	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	6193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	178235815	178236162	178236004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	174951	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	178379281	178379736	178379396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	130151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	178575191	178575363	178575289	Y	TOR3A,RALGPS2	NA	RALGPS2,ANGPTL1,FAM20B,C1orf220	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf220	65304	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	179595551	179595594	179595573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P54	171101	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	180200686	180200867	180200752	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	3265	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	181056649	181057124	181056887	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	1011	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr1	181122099	181122260	181122227	Y	NA	NA	STX6,KIAA1614,MR1,XPR1,ACBD6,IER5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	66461	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	181841665	181841910	181841788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLUL	517431	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	182998797	182999044	182998924	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	8202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	183567713	183567879	183567843	Y	NCF2,NCF2	ARPC5	DKFZP564C196,SMG7,NCF2,LAMC1,NMNAT2,ARPC5,RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	ARPC5	35013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	183594812	183595033	183594923	Y	NA	ARPC5	NA	NA	NA	NA	ARPC5	7859	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	184852237	184852590	184852311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	89092	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	184922808	184923031	184922923	Y	EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	18651	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	184929910	184930144	184930114	Y	TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	11538	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	186042920	186043354	186043253	Y	HMCN1,OCLM	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	299471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	186069411	186069628	186069551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	273197	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	186584580	186584711	186584687	Y	PTGS2,PLA2G4A,TPR	NA	PLA2G4A	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS2	62848	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	190286298	190286417	190286358	Y	FAM5C	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373J16.2	1185875	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	190678395	190678750	190678573	Y	FAM5C	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373J16.2	1577972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	466737	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	192597587	192597787	192597711	Y	RGS1,RGS13	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	85526	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	193226500	193227132	193226836	Y	RGS2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	137353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	193284093	193284405	193284249	Y	NA	NA	CDC73,B3GALT2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC73	194946	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	193547141	193547154	193547148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	457994	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	195765278	195765540	195765286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPM	1348284	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	197482296	197482309	197482303	Y	F13B,ZBTB41	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1B	260517	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	197513718	197513772	197513745	Y	CRB1,DENND1B	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1B	229054	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	197908297	197908430	197908355	Y	NA	C1orf53,LHX9	NA	NA	NA	NA	LHX9	29260	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	198090244	198090551	198090353	Y	NA	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	33542	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	198840125	198840497	198840438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	513772	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	198850238	198850638	198850585	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	503631	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	198894891	198894966	198894922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	459303	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	199038181	199038389	199038246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	315880	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	199349369	199349680	199349525	Y	NA	RP11-104D3.2	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	4589	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	200068069	200068443	200068256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR5A2	73339	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	200865264	200865418	200865332	Y	C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	200990087	200990628	200990489	Y	NA	KIF21B	NA	NA	NA	NA	KIF21B	200	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	92185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr1	201717986	201718364	201718179	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	77905	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	201743848	201744120	201743952	Y	CSRP1,CSRP1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	52149	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	26403	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	202016172	202016526	202016316	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ELF3,RP11-465N4.4	ELF3,NAV1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-465N4.4	38691	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	202054141	202054434	202054309	Y	NA	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	57435	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	202055098	202055409	202055277	Y	ELF3,GPR37L1	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	56460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr1	202077636	202077876	202077756	Y	ELF3,LGR6	ARL8A	NAV1,ARL8A,GPR37L1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARL8A	33993	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	202214153	202214446	202214299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGR6	53124	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	43291	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	203259429	203259985	203259729	Y	RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	LINC01136	12452	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	203297101	203297334	203297256	Y	LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	24482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	203489584	203489741	203489635	Y	BTG2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	103948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	203869829	203870180	203870005	Y	ETNK2	SNRPE,HSPE1P6	SNRPE,REN,LINC00303,SOX13,ETNK2,PLEKHA6,LOC127841,PPP1R15B,GOLT1A	IMR90	Hi-C	24141950	HSPE1P6	967	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	204073791	204074252	204073934	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	33548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	204330284	204330553	204330417	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	48366	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	205173095	205173476	205173227	Y	CNTN2,RBBP5,CDK18	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	5251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	205199524	205199884	205199765	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	TMCC2	4220	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	205418015	205418182	205418073	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	4900	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	205475126	205475451	205475289	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	3403	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	21017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	205638734	205639222	205638979	Y	SLC45A3	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	8365	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	206748926	206749451	206749084	Y	IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	RP11-534L20.4,EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	34453	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	206754982	206755508	206755274	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	28396	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	207080273	207080661	207080467	Y	FAIM3,FAIM3,IL19	RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	1309	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	207203424	207203586	207203506	Y	C1orf116	C1orf116,PFKFB2,YOD1	NA	NA	NA	NA	C1orf116	515	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	207509006	207509478	207509176	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	NA	NA	NA	NA	CD55	16153	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	207589572	207589691	207589631	Y	NA	CR2	PFKFB2,C4BPA,C4BPB	IMR90	Hi-C	24141950	CR2	35884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	207921430	207921703	207921565	Y	CR1L	CD46	CR1L	IMR90	Hi-C	24141950	CD46	1699	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	208335369	208335711	208335518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	79954	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	208358361	208358485	208358423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57180	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	208381145	208381344	208381321	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	34321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	208388887	208389573	208389450	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	26092	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	208418631	208418859	208418806	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2966	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	209578512	209578819	209578654	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	21346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	209766433	209766919	209766698	Y	CAMK1G	NA	NA	NA	NA	NA	LAMB3	56892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	209820544	209820823	209820626	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3,G0S2	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	2988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	209827285	209827712	209827546	Y	LOC642587,IRF6,HSD11B1,LAMB3,LAMB3	LAMB3,G0S2	NA	NA	NA	NA	LAMB3	3474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	210442761	210442899	210442830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHAT	56697	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	210812063	210812447	210812256	Y	HHAT,HHAT,KCNH1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU5A-8P	266452	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	211500826	211501119	211501083	Y	TRAF5,TRAF5	TRAF5	NA	NA	NA	NA	TRAF5	2869	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr1	211712804	211713120	211712963	Y	NA	SLC30A1	NEK2,RD3,SLC30A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	36964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	212650622	212650921	212650683	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NENF	NSL1,ATF3,FAM71A,BATF3,FLVCR1,VASH2,ANGEL2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	46393	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr1	213152730	213153023	213152876	Y	BATF3,TATDN3,VASH2	VASH2,ANGEL2	NA	NA	NA	NA	VASH2	30868	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	213160414	213160619	213160568	Y	VASH2	VASH2,ANGEL2	NA	NA	NA	NA	ANGEL2	26549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	214614073	214614284	214614198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	214712809	214712848	214712830	Y	NA	PTPN14	NA	NA	NA	NA	PTPN14	10944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	215198285	215198630	215198297	Y	KCNK2,KCNK2	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP24	156208	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	217306758	217307045	217306902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	495379	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	218338759	218338973	218338866	Y	NA	NA	ESRRG	IMR90	Hi-C	24141950	RRP15	117656	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	218523725	218524123	218523798	Y	NA	TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	6148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	218757146	218757164	218757156	Y	NA	NA	LOC728463,RRP15,TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	239569	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	218758903	218759111	218758977	Y	NA	NA	TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	241326	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	218774491	218774602	218774534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	256914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	218866278	218866341	218866301	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	348701	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	219092056	219092203	219092132	Y	NA	NA	LOC643723	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	252983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	219433064	219433395	219433229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	87878	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	221048646	221048850	221048821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	90545	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	221840936	221841145	221841053	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	72373	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	221997414	221997699	221997620	Y	DUSP10,DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	83896	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr1	223095586	223095912	223095632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISP1	109180	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	223276523	223276867	223276768	Y	NA	TLR5	NA	NA	NA	NA	TLR5	37757	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	224025511	224025803	224025713	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	5871	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.04370252490617
chr1	224528791	224528972	224528907	Y	NA	NVL,CNIH4	FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26	IMR90	Hi-C	24141950	NVL	12702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	225895377	225895885	225895482	Y	ENAH	NA	ENAH,TMEM63A,SRP9,EPHX1	IMR90	Hi-C	24141950	ENAH	56533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	226084943	226085104	226084975	Y	LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	LEFTY1	11978	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	226890098	226890374	226890232	Y	NA	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	34650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr1	228962635	228963190	228962905	Y	RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	93811	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	230089577	230089803	230089690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	101733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	230240540	230240902	230240735	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	49004	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	231036878	231036937	231036909	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	33543	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	231868761	231869568	231868969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSNAX	206362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	231939296	231939383	231939340	Y	EXOC8	NA	NA	NA	NA	NA	TSNAX	276897	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	11.7597597553193
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	234736336	234736615	234736485	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	6656	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr1	234812067	234812214	234812141	Y	NA	LINC01132	LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01132	45575	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	1054	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	235072383	235072603	235072483	Y	ARID4B,ARID4B	NA	LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506795,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01132	214594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	235094853	235095190	235094881	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	195061	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	192181	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	235186710	235186949	235186846	Y	ARID4B	NA	LOC100506795,LOC100506810,LINC00184,IRF2BP2	IMR90	Hi-C	24141950	TOMM20	103302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	236021417	236021780	236021768	Y	NA	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	23160	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	237509665	237509877	237509771	Y	RYR2	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	553055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	241790752	241791037	241791008	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	6195	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	243431437	243431793	243431509	Y	NA	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	14117	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	401492	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	80431	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	245563795	245563810	245563803	Y	KIF26B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	247508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	246469940	246470214	246470139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	198400	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	247295865	247296225	247296038	Y	ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	30191	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr1	247598454	247598709	247598523	Y	NLRP3,NLRP3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF496	105306	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	557102	557353	557317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	176330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	3507725	3507898	3507811	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	294722	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	3797195	3797502	3797389	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	27971	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	3845250	3845852	3845788	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	19777	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	3852273	3852886	3852712	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	26800	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	4034997	4035363	4035214	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	209524	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	4685784	4686138	4685885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	140683	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	121038	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	112948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr10	4812953	4813314	4813133	Y	NA	AKR1E2	KLF6,PITRM1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	13507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	TUBAL3	110581	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	78123	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.5	62566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	5590507	5590769	5590638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.5	59987	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.5	59486	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	6017924	6018316	6018090	Y	RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,IL15RA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	6051095	6051553	6051345	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17	IL15RA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	32945	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	6341993	6342400	6342249	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	157112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	465640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	7902237	7902611	7902424	Y	NA	TAF3	NA	NA	NA	NA	TAF3	43770	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	10558695	10559022	10558704	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1092731	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	10621382	10621742	10621475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1030011	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	10674223	10674364	10674239	Y	CELF2,CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	977389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	10868274	10868578	10868426	Y	CELF2	NA	SFTA1P,CELF2	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	783175	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	11924114	11924319	11924232	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	141749	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	12002775	12003103	12002939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	80066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	12307693	12308050	12307912	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT5	71550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	12747516	12747872	12747694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	391577	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	12823373	12823670	12823432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	315779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	13200624	13201003	13200885	Y	NA	MCM10	NA	NA	NA	NA	MCM10	551	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	14009769	14010162	14009916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	382842	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	14083240	14083439	14083425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	418702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	14605482	14605831	14605731	Y	HSPA14,DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	103341	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	14955590	14955884	14955736	Y	HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2	SUV39H2,DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	SUV39H2	36771	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	15157630	15158203	15157954	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111	NA	NA	NA	NA	C10orf111	20312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	15191044	15191371	15191092	Y	MEIG1,NMT2,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	17321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	15278281	15278573	15278465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	69589	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	15481671	15481810	15481693	Y	NA	NA	ITGA8,FAM188A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM171A1	70610	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	17010242	17010673	17010572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	152715	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	17116431	17116714	17116628	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	125339	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	17134567	17134821	17134694	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	107232	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	17215777	17215793	17215785	Y	NA	TRDMT1	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	26260	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	17390739	17391085	17390858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	148686	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	17430166	17430520	17430415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	188113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	17486063	17486497	17486283	Y	TRDMT1,VIM,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLA	170879	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	17652629	17652974	17652802	Y	NA	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	PTPLA	4402	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	18534018	18534028	18534023	Y	CACNB2,CACNB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	298552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	18860767	18861138	18861132	Y	NA	RP11-499P20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	28187	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	20203114	20203263	20203197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5B	1256780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	20517791	20518055	20517886	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	943061	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr10	21430870	21431276	21431139	Y	NEBL,C10orf113	NEBL	NA	NA	NA	NA	NEBL	29840	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	NEBL	120572	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	21582810	21582927	21582873	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,PIP4K2A,MLLT10	IMR90	Hi-C	24141950	NEBL	121694	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	21799318	21799715	21799601	Y	C10orf113	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	21379	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	22025175	22025497	22025336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	194575	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	22029877	22030194	22029992	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	189878	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	22907073	22907416	22907362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	94068	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	22972039	22972536	22972328	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	28948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	23801336	23801634	23801483	Y	OTUD1	NA	NA	NA	NA	NA	OTUD1	75138	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	24740338	24740618	24740546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	269979	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	25357102	25357468	25357353	Y	NA	NA	ARHGAP21	IMR90	Hi-C	24141950	THNSL1	53515	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	26223879	26224018	26223959	Y	GAD2,MYO3A	MYO3A	NA	NA	NA	NA	MYO3A	2683	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	26971794	26972079	26972065	Y	MASTL,ABI1	PDSS1	ABI1	IMR90	Hi-C	24141950	PDSS1	12509	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	27026601	27027004	27026841	Y	MASTL,APBB1IP,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	27419520	27419901	27419745	Y	NA	ANKRD26,MASTL,YME1L1	NA	NA	NA	NA	MASTL	21852	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	28002936	28003088	28002983	Y	ARMC4,MKX	NA	NA	NA	NA	NA	RAB18	211739	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	28230250	28230547	28230399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC4	55430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	28622392	28622559	28622538	Y	NA	MPP7	MPP7	IMR90	Hi-C	24141950	MPP7	977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	29228763	29229094	29228981	Y	NA	NA	BAMBI,LOC100507605,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	264492	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	29717478	29717845	29717536	Y	NA	PTCHD3P1	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	21147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	32034546	32034864	32034695	Y	NA	NA	ZNF438,ARHGAP12	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	180878	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr10	32335843	32336217	32336161	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	7142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	ITGB1	NA	NA	NA	NA	ITGB1	41416	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	33425212	33425871	33425404	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	132492	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	33560971	33561296	33561097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	61894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	33798158	33798349	33798267	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	174968	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	35070002	35070125	35070067	Y	CREM	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	32128	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	35431185	35431238	35431212	Y	NA	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	17466	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	35498991	35499412	35498996	Y	CCNY,CREM,CREM	CCNY	NA	NA	NA	NA	CCNY	34541	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	35589038	35589427	35589190	Y	CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	55085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	42798094	42798242	42798168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF37BP	248028	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	43761301	43761565	43761418	Y	RASGEF1A	RASGEF1A	NA	NA	NA	NA	RASGEF1A	934	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	43800197	43800376	43800318	Y	CSGALNACT2,HNRNPF,HNRNPF	RASGEF1A	ZNF487P	IMR90	Hi-C	24141950	RASGEF1A	39830	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	44046358	44046416	44046387	Y	NA	ZNF239	NA	NA	NA	NA	ZNF239	21650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	44185624	44185942	44185694	Y	NA	ZNF32	NA	NA	NA	NA	ZNF32	43320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	45434472	45434743	45434608	Y	OR13A1,ALOX5	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	18112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	45463684	45463996	45463754	Y	ALOX5,RASSF4	RASSF4,C10orf10,ZNF22	NA	NA	NA	NA	C10orf10	8262	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	47034323	47034345	47034334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-38L15.3	84851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	48482238	48482583	48482338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF488	129214	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	50742859	50743547	50743006	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	PGBD3	1539	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	51045236	51045418	51045327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC6	299652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	52081951	52082279	52082036	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59213	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	52614600	52614810	52614705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAH2B	117522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	54314755	54315032	54314894	Y	NA	NA	LOC100506939,DKK1	IMR90	Hi-C	24141950	DKK1	242699	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	54506041	54506302	54506141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	433985	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	54672481	54672671	54672577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	600425	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	54774491	54774616	54774570	Y	MBL2	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	702435	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	55377812	55377822	55377817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	1305756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	728672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	61665210	61665415	61665365	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	62096782	62097076	62096929	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	432368	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	62330469	62330833	62330827	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	205256	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	62726963	62727263	62727113	Y	NA	RHOBTB1	NA	NA	NA	NA	RHOBTB1	31935	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63736420	63736602	63736437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	77361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63752119	63752912	63752632	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	93060	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	63753079	63753613	63753266	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	94020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63778860	63779091	63779011	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	119801	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63803306	63803648	63803427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	144247	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63805040	63805237	63805084	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	145981	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63814731	63815034	63814907	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	155672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63839926	63839992	63839961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	180867	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	63859069	63859192	63859131	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	167274	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	64320064	64320236	64320175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	242280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	64470060	64470410	64470121	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	ZNF365	IMR90	Hi-C	24141950	ADO	92106	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	64495564	64495934	64495778	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	ZNF365,EGR2,JMJD1C	IMR90	Hi-C	24141950	ADO	66582	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	98071	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	65128612	65128923	65128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	94799	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	65196810	65197156	65196994	Y	NA	JMJD1C	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	26566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	65231848	65231938	65231929	Y	NA	JMJD1C,REEP3	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	8126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	65282188	65282459	65282345	Y	JMJD1C,JMJD1C	REEP3	NA	NA	NA	NA	REEP3	3065	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	65388414	65388608	65388512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	109291	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr10	65467084	65467405	65467282	Y	JMJD1C	NA	JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	187961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	66499441	66499455	66499448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	83874	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	68010262	68010544	68010403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	1426933	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	69523317	69523417	69523404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	72507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	71594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	69550767	69550960	69550901	Y	NA	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	44964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	69658139	69658146	69658142	Y	HNRNPH3,SIRT1,SIRT1	SIRT1	HERC4	IMR90	Hi-C	24141950	SIRT1	15712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	70832840	70833011	70832951	Y	DDX21,SRGN	SRGN,VPS26A	SRGN	K562	ChIA-PET	22265404	SRGN	12851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	70976966	70977432	70977124	Y	DDX21,SRGN,VPS26A	SUPV3L1,HKDC1	NA	NA	NA	NA	HKDC1	627	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	71239136	71239503	71239234	Y	NA	TSPAN15	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	29907	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	73026177	73026397	73026262	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	50192	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	73124315	73124355	73124335	Y	NA	SLC29A3,CDH23	NA	NA	NA	NA	CDH23	30336	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	73595852	73596345	73596141	Y	C10orf54,PSAP	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	12781	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	73649387	73649415	73649393	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	DNAJB12,PSAP,CHST3,CDH23,ASCC1,SPOCK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSAP	40261	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	73954988	73955333	73955161	Y	NA	RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	RP11-570G20.1	7289	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr10	74019515	74019657	74019544	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	12021	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.79855149199001
chr10	74068319	74068595	74068530	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ASCC1,ANAPC16	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	36641	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	74289425	74289733	74289722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	94166	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	74385233	74385288	74385261	Y	NA	MICU1,HMGN2P34	NA	NA	NA	NA	MICU1	1334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	74544491	74544662	74544597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCU	94602	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	75022023	75022098	75022060	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-152N13.5	11474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr10	75931649	75931916	75931783	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	ADK	22689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	5434	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	77300831	77301201	77300915	Y	NA	NA	KCNMA1,C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf11	57797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	77418041	77418318	77418185	Y	C10orf11	NA	C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf11	59043	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	79545596	79545879	79545660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	138499	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	79633336	79633510	79633397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	50868	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	79651191	79651354	79651229	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	33024	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	81956011	81956585	81956252	Y	ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	6743	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	82207287	82207512	82207367	Y	NA	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	4410	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	82288045	82288198	82288158	Y	TSPAN14,SH2D4B	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	76123	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	85937530	85937952	85937586	Y	NA	GHITM	NA	NA	NA	NA	GHITM	40334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	86108374	86108507	86108453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	209692	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	87752944	87753321	87753210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	370929	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	88713984	88714363	88714198	Y	SNCG	NA	NA	NA	NA	NA	FAM35A	137555	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr10	89851162	89851493	89851401	Y	NA	NA	PTEN,RNLS,CFL1P1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	147903	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	90601326	90601655	90601508	Y	IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22	ANKRD22,STAMBPL1	NA	NA	NA	NA	ANKRD22	7920	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	90608310	90608527	90608426	Y	LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22	ANKRD22,STAMBPL1	NA	NA	NA	NA	ANKRD22	1048	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	91096041	91096297	91096218	Y	IFIT2,IFIT3,IFIT3,IFIT5,IFIT1	IFIT2,IFIT3	NA	NA	NA	NA	IFIT3	10390	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	92731604	92731862	92731771	Y	NA	NA	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	RPP30	102131	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	93991232	93991452	93991342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	57392	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	94074059	94074408	94074234	Y	NA	CPEB3,MARCH5	NA	NA	NA	NA	MARCH5	25139	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	94195534	94195885	94195710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDE	135948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr10	94353992	94354203	94354151	Y	MARCH5	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	2949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	95873448	95873628	95873536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCE1	121702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	97020432	97020603	97020519	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	28178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	97527766	97528166	97527825	Y	ENTPD1,ENTPD1,ZNF518A	NA	NA	NA	NA	NA	TCTN3	75866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	99401742	99402052	99401841	Y	C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	10398	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	99764794	99764880	99764837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA7B	138905	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	101105244	101105424	101105335	Y	NA	CNNM1	NA	NA	NA	NA	CNNM1	18388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	101170653	101170798	101170732	Y	SLC25A28	GOT1,RP11-441O15.3	NA	NA	NA	NA	GOT1	17583	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	101300631	101300706	101300670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	77660	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	102130336	102130669	102130535	Y	NA	SCD,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	703	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	103124787	103125187	103124970	Y	NA	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12967	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	103514539	103514868	103514704	Y	NA	NPM3	NA	NA	NA	NA	NPM3	26302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	103699141	103699397	103699242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	114553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	103733720	103734121	103734043	Y	NA	NA	LOC100289509,MGEA5,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf76	79829	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	104370147	104370568	104370420	Y	NA	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	31685	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	849	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	104533606	104534005	104533917	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32,C10orf26	NA	NA	NA	NA	NA	SFXN2	61311	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	104780741	104781119	104780930	Y	LOC729020,PDCD11	NA	NA	NA	NA	NA	CNNM2	104691	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	NA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	50168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	105001544	105001968	105001663	Y	C10orf32,NT5C2	NA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	50488	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	105681714	105681858	105681786	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	OBFC1	5751	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	106020526	106021193	106020581	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,ITPRIP,CCDC147,GSTO1,GSTO1	WDR96,GSTO1,GSTO2	NA	NA	NA	NA	GSTO2	5438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	108757582	108757742	108757678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP5	1313502	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	108990726	108990863	108990795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP5	1546646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	109593803	109593820	109593812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	2087491	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	110120192	110120482	110120337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	1560829	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	112080196	112080214	112080204	Y	NA	SMNDC1	DUSP5,SMC3,RBM20	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	17487	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	112186754	112186909	112186851	Y	SHOC2,DUSP5,BBIP1,BBIP1	NA	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	68687	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	NA	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	106809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	114021080	114021581	114021336	Y	NA	GPAM	TECTB	IMR90	Hi-C	24141950	GPAM	47945	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	114148894	114149633	114149365	Y	VTI1A,ACSL5,ACSL5	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	17118	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	114693939	114693964	114693952	Y	NA	TCF7L2	TCF7L2,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	14045	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	114715800	114716132	114715855	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	7791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	114718173	114718547	114718195	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	10164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	114853789	114854299	114853993	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	145780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	114940720	114940897	114940795	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	232711	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	115022033	115022434	115022235	Y	NA	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	HABP2	286162	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	115719262	115719399	115719345	Y	NA	NA	ADRB1,NHLRC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NHLRC2	106842	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	115923622	115923898	115923760	Y	C10orf81	MIR2110,C10orf118	NA	NA	NA	NA	MIR2110	8040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr10	116161021	116161267	116161255	Y	NA	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	1248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	116259358	116259612	116259525	Y	C10orf118,ABLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	96843	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	116282298	116282595	116282502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	119783	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	116556570	116556696	116556633	Y	NA	FAM160B1	AFAP1L2,ABLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM160B1	22807	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	119069713	119069747	119069730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	63231	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	119256221	119256343	119256282	Y	KIAA1598,KCNK18,EMX2	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	123243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	120242508	120242736	120242622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM204A	142668	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	120482173	120482528	120482344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NANOS1	304700	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	65337	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	121153244	121153752	121153743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	146468	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr10	122963331	122963557	122963437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	72094	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	123268724	123269025	123268893	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	86947	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	123313040	123313152	123313149	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	FGFR2	NA	NA	NA	NA	FGFR2	42820	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	123526019	123526096	123526058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	159731	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr10	123914164	123914234	123914222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD16	114587	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	BTBD16	NA	NA	NA	NA	BTBD16	38657	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	22329	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr10	124222687	124222865	124222833	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	3646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	125151294	125151544	125151434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUB3	239501	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	120828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	126373894	126374059	126373997	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	56779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	126406559	126407126	126406852	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	23712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	126421726	126422139	126421939	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	8699	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	126490996	126491131	126491100	Y	NA	METTL10,FAM175B	NA	NA	NA	NA	FAM175B	2642	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	126768245	126768621	126768433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	79118	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	126840629	126841204	126840953	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	6535	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	127714877	127714997	127714888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	131769	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	128079863	128080136	128080091	Y	NA	NA	FANK1,ADAM12,C10orf90	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	496755	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	128258462	128258762	128258558	Y	NA	NA	FANK1,DHX32,ADAM12	IMR90	Hi-C	24141950	DOCK1	333216	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	128592998	128593177	128593088	Y	NA	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	1020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	131438209	131438380	131438294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	174761	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	133763722	133764008	133763747	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	29427	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	134212658	134212854	134212750	Y	NA	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	3986	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	12824	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	13298	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr10	134225356	134225596	134225555	Y	NA	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	16684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	RP11-432J24.5,INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.5	1137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	134373708	134374041	134373810	Y	PWWP2B,INPP5A	RP11-432J24.5,INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	24384	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	134385594	134385710	134385631	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	36270	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr10	134399818	134400353	134400054	Y	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	NA	INPP5A	50494	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	134552087	134552387	134552207	Y	KNDC1,GPR123,NKX6-2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC40	201940	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	44831	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	135119353	135119734	135119518	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	245	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	135191872	135192182	135191943	Y	NA	ECHS1,PAOX,MTG1	NA	NA	NA	NA	PAOX	1177	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	135322182	135322530	135322356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTG1	116584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr10	135329777	135330170	135329974	Y	NA	NA	LOC619207,SYCE1	IMR90	Hi-C	24141950	MTG1	124179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	NA	NA	NA	NA	NA	MUC5AC	76035	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	AC068580.7	3583	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	1851395	1851620	1851555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC068580.7	53777	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	1879618	1879880	1879749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC068580.7	82000	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	2223798	2223980	2223871	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2	54965	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	2226111	2226485	2226212	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2	57278	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	2238005	2238048	2238027	Y	NA	NA	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2	69172	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	2238430	2238670	2238577	Y	NA	NA	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2	69597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	2598295	2598461	2598377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1	134381	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	2705021	2705206	2705044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	199905	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	2913617	2913951	2913751	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	5000	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	3190882	3191107	3191009	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	4913	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	5647526	5647619	5647574	Y	OR51B2,OR51Q1,OR56B4,OR56A3,OR56A1,OR52N2,OR52E6,OR52N4,TRIM34,TRIM5,TRIM22	TRIM34	NA	NA	NA	NA	TRIM34	8532	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	6224718	6224948	6224898	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	28993	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	6723829	6724231	6724032	Y	NA	MRPL17,GVINP1	NA	NA	NA	NA	MRPL17	21197	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	7624372	7624649	7624458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	71804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	9060824	9061053	9060961	Y	ZNF143,RPL27A,TMEM9B,NRIP3,DENND5A	NRIP3	NA	NA	NA	NA	NRIP3	37228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	9623030	9623285	9623166	Y	ZNF143,WEE1,WEE1	WEE1	NA	NA	NA	NA	WEE1	29802	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	10350347	10350728	10350538	Y	NA	SBF2,ADM	NA	NA	NA	NA	ADM	26120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5	NA	NA	NA	NA	ZBED5	43600	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	12109558	12109847	12109697	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MICAL2	3696	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	13327996	13328024	13328011	Y	NA	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	31797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	13468446	13468721	13468666	Y	NA	BTBD10	NA	NA	NA	NA	BTBD10	14123	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	14354673	14355035	14354941	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	29017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr11	14910529	14910668	14910599	Y	NA	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	1130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	16817853	16818086	16817948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	176474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	17008586	17008989	17008853	Y	PLEKHA7	RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	14026	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr11	18444585	18444736	18444661	Y	SAAL1	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	LDHC	12731	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	24448444	24448604	24448524	Y	NA	NA	LOC100500938	IMR90	Hi-C	24141950	SVIP	1598599	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	26003639	26003950	26003795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBIN	1009678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	26752813	26752940	26752820	Y	NA	NA	BBOX1	IMR90	Hi-C	24141950	FIBIN	260688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	26863519	26863562	26863540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBIN	150066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	26969207	26969439	26969286	Y	NA	FIBIN	FIBIN,BBOX1	IMR90	Hi-C	24141950	FIBIN	44189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	27023421	27023808	27023612	Y	NA	FIBIN	NA	NA	NA	NA	FIBIN	9793	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	27140468	27140646	27140558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBIN	126840	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr11	27217576	27217737	27217656	Y	NA	NA	LGR4	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	165678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	27223366	27223795	27223565	Y	NA	NA	LGR4,LIN7C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	159620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	27255766	27256168	27256011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	127247	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	27263345	27263487	27263411	Y	NA	NA	LGR4	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	119928	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	27380505	27380624	27380565	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	2791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr11	27419147	27419279	27419213	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	35732	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr11	27451921	27452137	27452029	Y	NA	LGR4	NA	NA	NA	NA	LGR4	40185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	27481800	27481840	27481820	Y	NA	LGR4,LIN7C	NA	NA	NA	NA	LGR4	10482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	27649683	27650045	27649864	Y	NA	RP11-587D21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	48456	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	27657269	27657593	27657433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	56042	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	27683148	27683223	27683174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	81921	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	27715832	27716154	27716086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	114605	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	27779597	27779928	27779747	Y	NA	NA	METTL15,BDNF,MIR610,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	130652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	27940124	27940197	27940161	Y	NA	RP11-1033A18.1	BDNF,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	29544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	27955713	27956134	27955920	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45133	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	729998	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	31450770	31450827	31450799	Y	PAX6,PAX6,IMMP1L,ELP4,DNAJC24	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC24	61383	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr11	33096691	33097088	33096864	Y	NA	TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	37728	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	33181656	33182005	33181958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF3	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	33209856	33210115	33209986	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	27939	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	33778086	33778269	33778178	Y	FBXO3	CD59,FBXO3	NA	NA	NA	NA	FBXO3	15820	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	34368265	34368539	34368419	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NAT10,CAPRIN1	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	9016	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	34622320	34622551	34622432	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44	IMR90	Hi-C	24141950	EHF	18089	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	34661390	34661585	34661450	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	20750	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	34939	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	EHF	66237	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	34847243	34847532	34847469	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	PDHX	87844	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	35053022	35053283	35053109	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	105134	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	35053542	35053729	35053593	Y	CD44	NA	CD44,SLC1A2,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	104688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	35165614	35166208	35165794	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	7197	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	46567	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	35249361	35250020	35249669	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	90944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	35258280	35258546	35258460	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	99863	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	35825533	35825614	35825574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	137917	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	37978500	37978723	37978612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	1364449	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	43973549	43973561	43973555	Y	NA	C11orf96	NA	NA	NA	NA	C11orf96	28657	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	44123492	44123510	44123502	Y	NA	ACCS,EXT2	NA	NA	NA	NA	EXT2	8393	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	44581215	44581415	44581314	Y	CD82	CD82	EXT2,CD82,TSPAN18	IMR90	Hi-C	24141950	CD82	2562	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	44590064	44591217	44590888	Y	CD82	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	6087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	45000515	45000921	45000720	Y	SYT13,TSPAN18	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	29675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	45052722	45052734	45052728	Y	TSPAN18	NA	LOC221122,TP53I11,PRDM11	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	81882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr11	45864713	45865116	45864826	Y	NA	SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1	NA	NA	NA	NA	CRY2	1553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	46135373	46135563	46135504	Y	PHF21A,AMBRA1	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	5422	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CTD-2589M5.4,CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	28900	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	46465667	46466056	46465959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDK	65361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	47799022	47799247	47799135	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	12027	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr11	47965488	47965599	47965552	Y	NA	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRJ	34514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	48004294	48004631	48004323	Y	CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	4181	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	48077375	48077584	48077563	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	77262	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	48102794	48103200	48102989	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	102681	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	57542885	57543297	57542929	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	24170	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	57549936	57550183	57550060	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	31221	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	60877687	60877932	60877809	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	49157	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	23280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	61463458	61463769	61463630	Y	CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	17553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	BEST1,FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	BEST1,FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	61742606	61743000	61742909	Y	NA	BEST1,FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	9474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	61880097	61880151	61880125	Y	FADS2,FADS3,RAB3IL1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	9294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	AHNAK	14680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	9910	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	62718302	62718551	62718368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	96784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	RARRES3	35441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	63687620	63687907	63687858	Y	LGALS12,RCOR2	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	5304	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	PRDX5	19142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.35195195106386
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	MALAT1	24137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	MALAT1	23363	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.73545309874848
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	5.25730436120156
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	14950	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	65555605	65556077	65555902	Y	TSGA10IP,CATSPER1	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	3112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	65656792	65657262	65656985	Y	NA	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	CCDC85B	917	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	65852297	65852657	65852298	Y	TMEM151A,CNIH2	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	16463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	65903912	65904457	65904250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	68078	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	66047866	66048291	66048031	Y	NA	KLC2,RAB1B,YIF1A,TMEM151A,RP11-867G23.13	NA	NA	NA	NA	YIF1A	6350	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2,RNU1-84P	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr11	66494345	66494720	66494567	Y	NA	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	15202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr11	67037275	67037527	67037373	Y	TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	5394	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	67105994	67106296	67106145	Y	NA	SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	16147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr11	67143202	67143472	67143423	Y	CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	4147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	67388322	67388349	67388342	Y	NA	GSTP1,NDUFV1,NUDT8,ACY3	NA	NA	NA	NA	NUDT8	7052	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	67955066	67955423	67955397	Y	TCIRG1,SUV420H1	SUV420H1	NA	NA	NA	NA	SUV420H1	23872	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	68065646	68065898	68065824	Y	CHKA,LRP5	C11orf24,LRP5	SUV420H1,C11orf24,LRP5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP5	12179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr11	68140094	68140551	68140382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	62017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	68147876	68148306	68148095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	69799	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	MYEOV,IFITM9P	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	1122	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	69089155	69089700	69089444	Y	MRGPRD	MYEOV,IFITM9P	CCND1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM9P	19881	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	69197125	69197542	69197234	Y	ORAOV1,MYEOV	NA	MYEOV,CCND1	IMR90	Hi-C	24141950	AP000439.3	95166	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	34276	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr11	69639961	69640299	69640038	Y	NA	FGF3	FGF3	K562	ChIA-PET	22265404	FGF3	8169	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr11	69790032	69790392	69790217	Y	ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,FADD,ORAOV1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	39590	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	35162	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	34144	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	69809602	69809958	69809614	Y	NA	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	20024	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	69811990	69812239	69812133	Y	FGF4	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	17743	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	69857412	69857795	69857515	Y	NA	RP11-626H12.1	ANO1,FADD,ORAOV1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	27430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	69894907	69895080	69894991	Y	ANO1	ANO1	ANO1,FADD,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	27328	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	70483542	70483760	70483651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	240948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	70759663	70760245	70759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHANK2	201378	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	71598174	71598491	71598315	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NA	NA	NA	NA	RP11-849H4.2	39209	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	72474033	72474226	72474150	Y	STARD10,ARAP1	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	28418	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	72498496	72498726	72498679	Y	STARD10	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	3918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr11	72555518	72555570	72555544	Y	ATG16L2	ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ATG16L2	32165	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	73240043	73240049	73240046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	67185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	73722792	73723138	73723056	Y	LIPT2,C2CD3,UCP2	UCP2	UCP2	K562	ChIA-PET	22265404	UCP2	30440	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	73860209	73860535	73860372	Y	C2CD3	PPME1,C2CD3	NA	NA	NA	NA	PPME1	19609	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	74077556	74077917	74077717	Y	NA	PGM2L1	NA	NA	NA	NA	PGM2L1	29601	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	74171904	74172163	74171977	Y	SPCS2,RNF169,C2CD3	AP001372.2,LIPT2,POLD3	NA	NA	NA	NA	AP001372.2	30248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	74176233	74176573	74176529	Y	KCNE3	AP001372.2,LIPT2,POLD3	NA	NA	NA	NA	AP001372.2	25838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	74540659	74541010	74540832	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	82746	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	74857404	74857707	74857556	Y	SLCO2B1	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	SLCO2B1	47796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	74906257	74906584	74906454	Y	SPCS2,NEU3,ARRB1,SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO2B1	96649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	75248214	75248465	75248264	Y	UVRAG	GDPD5,SERPINH1	GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GDPD5	13266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	75497543	75497797	75497673	Y	NA	DGAT2,UVRAG	NA	NA	NA	NA	UVRAG	26415	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	75581181	75581426	75581320	Y	MAP6	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	56969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	75748582	75748924	75748753	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	WNT11	170856	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	WNT11	163545	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	4.15050344305387
chr11	75920696	75920900	75920748	Y	NA	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	916	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr11	75946013	75946323	75946187	Y	NA	WNT11	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT11	26233	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	75946917	75947052	75946991	Y	NA	WNT11	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT11	27137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr11	76510532	76510646	76510589	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	NA	NA	NA	NA	RP11-21L23.3	18426	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,RP11-21L23.3,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	76936185	76936353	76936269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	160206	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	76991897	76991950	76991949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1	191730	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	77156016	77156186	77156101	Y	PAK1	PAK1	NA	NA	NA	NA	PAK1	27494	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	78002337	78002637	78002489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	104469	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	78025089	78025245	78025191	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	102149	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	78073883	78074276	78074154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	53118	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	78134473	78134617	78134544	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	7079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	78144030	78144327	78144179	Y	NA	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	16636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	78376949	78377109	78377029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	93030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	78508087	78508456	78508162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	224168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	78517286	78517620	78517422	Y	GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	233367	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	78571472	78571494	78571483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	287553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	78947816	78948005	78947917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	663897	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	79130045	79130391	79130200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	846126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	82601745	82602138	82601973	Y	NA	C11orf82	NA	NA	NA	NA	C11orf82	6879	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	82961020	82961401	82961211	Y	NA	RP11-727A23.1,CCDC90B	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	34049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	83670710	83671103	83670907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	504454	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	84641385	84641714	84641549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	695915	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	85451857	85452132	85451995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBZF	59906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	85525659	85525879	85525765	Y	NA	SYTL2,AP000974.1	SYTL2,CCDC89,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL2	5475	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	85702937	85703343	85703240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PICALM	75581	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	86184196	86184398	86184363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	172943	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	86195168	86195425	86195393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	183915	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	86222200	86222363	86222315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	159315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.79855149199001
chr11	86328094	86328121	86328109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	53557	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	86433528	86433764	86433646	Y	NA	NA	PRSS23,ME3	IMR90	Hi-C	24141950	ME3	51850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	87871692	87871803	87871780	Y	NA	RAB38	NA	NA	NA	NA	RAB38	34832	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	27512	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	88276753	88276819	88276788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	207798	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	88538065	88538152	88538144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	469110	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	89219339	89219644	89219576	Y	NOX4	NA	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	734888	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	89893119	89893512	89893349	Y	NAALAD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	61020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	90171328	90171529	90171499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	157600	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	90492070	90492284	90492177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	478342	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	91980380	91980674	91980445	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	948456	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	93092294	93092353	93092324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	163164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	93258917	93259186	93259082	Y	MED17,SLC36A4,C11orf75	RP11-288E14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-288E14.2	7448	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr11	94317425	94317695	94317494	Y	PANX1,ANKRD49,FUT4	FUT4	NA	NA	NA	NA	FUT4	42408	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	94882788	94883137	94883023	Y	NA	RP11-712B9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-712B9.2	1085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr11	95177768	95177916	95177842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-712B9.2	296065	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	95525355	95525734	95525518	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	3782	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	95987343	95987574	95987537	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	86770	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	96024131	96024308	96024240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	50036	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr11	96072423	96072630	96072557	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	1714	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	96104891	96105001	96104961	Y	NA	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	CCDC82	16086	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	96579211	96579589	96579400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JRKL	458058	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	102450928	102451243	102451066	Y	BIRC3,BIRC2,TMEM123	NA	NA	NA	NA	NA	MMP7	51444	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	102678364	102678503	102678434	Y	NA	MMP1	NA	NA	NA	NA	MMP1	11473	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	103281581	103281752	103281672	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	3196	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	103401149	103401246	103401211	Y	NA	NA	DYNC2H1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37O16.8	122764	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	105061488	105061502	105061495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP5	169593	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	109961258	109961641	109961417	Y	ZC3H12C	NA	ZC3H12C	IMR90	Hi-C	24141950	RDX	203806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	110220556	110220727	110220626	Y	ZC3H12C,FDX1,RDX	NA	C11orf53,RDX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RDX	55109	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	110251327	110251472	110251332	Y	RDX	FDX1	NA	NA	NA	NA	FDX1	47135	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	111853928	111854208	111854100	Y	NA	DLAT	NA	NA	NA	NA	DLAT	39330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	112188870	112189262	112188962	Y	IL18	RP11-356J5.12	NA	NA	NA	NA	RP11-356J5.12	49398	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	113458188	113458759	113458447	Y	CLDN25	NA	TMPRSS5	IMR90	Hi-C	24141950	TMPRSS5	116336	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	113708252	113709087	113708915	Y	CLDN25	USP28	NA	NA	NA	NA	USP28	35205	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	113828537	113828676	113828607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	84245	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	115566939	115567266	115567117	Y	NA	NA	CADM1,LOC283143	IMR90	Hi-C	24141950	CADM1	193264	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	116722234	116722744	116722542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF259	65468	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	116790672	116791048	116790863	Y	NA	NA	APOA4,APOA1,APOC3	IMR90	Hi-C	24141950	AP000936.1	113719	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	117745558	117745882	117745720	Y	DSCAML1,SCN4B,SCN2B,FXYD6,FXYD6	FXYD2	NA	NA	NA	NA	FXYD2	48145	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	117756668	117756781	117756736	Y	FXYD6	TMPRSS13	FXYD6-FXYD2	IMR90	Hi-C	24141950	TMPRSS13	41393	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	117815353	117815538	117815443	Y	IL10RA	TMPRSS13,IL10RA	DSCAML1,TMPRSS13,TMPRSS4,LOC100526771,FXYD6-FXYD2	IMR90	Hi-C	24141950	TMPRSS13	17179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	118065939	118066307	118065952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL3	54758	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	118112268	118112532	118112411	Y	IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D	MPZL3,MPZL2	NA	NA	NA	NA	MPZL3	8533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	118153348	118153551	118153451	Y	NA	MPZL3,MPZL2	AMICA1	IMR90	Hi-C	24141950	MPZL2	20097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	118251385	118251554	118251508	Y	NA	UBE4A,ATP5L	NA	NA	NA	NA	ATP5L	18315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	5.53400459073849
chr11	118787524	118788054	118787588	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	5819	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.49030206583232
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	118975139	118975329	118975217	Y	NA	HYOU1,VPS11,HMBS,H2AFX,C2CD2L,DPAGT1,HINFP,ABCG4	NA	NA	NA	NA	DPAGT1	1712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	119383102	119383348	119383232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P7	89670	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	KRT8P7	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	17585	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	119540378	119540644	119540511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRL1	57150	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	119598046	119598312	119598172	Y	USP2	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	252	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	120083069	120083545	120083438	Y	GRIK4,ARHGEF12,OAF	TRIM29,OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	3594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205128	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	121526794	121527145	121526879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	122049218	122049681	122049522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	474702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	122311334	122311672	122311591	Y	NA	NA	SC5DL,MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	UBASH3B	212711	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	122312513	122312743	122312628	Y	NA	NA	SC5DL,MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	UBASH3B	211640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	122608190	122608588	122608260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	83807	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	122936469	122936659	122936561	Y	NA	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	4531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	123013120	123013348	123013342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLMP	50641	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	123407861	123408201	123408031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000783.1	108803	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	123605051	123605192	123605122	Y	NA	ZNF202	NA	NA	NA	NA	ZNF202	5191	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	123951200	123951810	123951503	Y	OR8B12,OR8A1,OR8G2,OR8D1,VWA5A	VWA5A	NA	NA	NA	NA	VWA5A	32259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	124048157	124048385	124048276	Y	OR8B12,TBRG1	NA	OR8B3	IMR90	Hi-C	24141950	VWA5A	64088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	124514246	124514548	124514258	Y	OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B4,OR8B8,OR8B12,OR8A1	TBRG1,SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	TBRG1	23514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	124587333	124587525	124587429	Y	NA	SPA17,SIAE,NRGN,ESAM	NA	NA	NA	NA	NRGN	20217	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	125363864	125364125	125364103	Y	PKNOX2,DDX25,FEZ1	FEZ1	NA	NA	NA	NA	FEZ1	88	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	125985923	125986168	125986013	Y	NA	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	54693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	126290424	126290762	126290592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	66889	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	127497249	127497440	127497362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	958013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	128071059	128071237	128071148	Y	NA	NA	FLI1,LOC100507392,ETS1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	384216	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	128078462	128078679	128078487	Y	NA	NA	FLI1,ETS1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	376774	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	128367325	128367539	128367441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	87914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	128419505	128419554	128419521	Y	NA	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	35899	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	219251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	129244480	129244782	129244484	Y	NA	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	129512959	129513316	129513039	Y	BARX2	NA	BARX2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM45B	170398	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	129717042	129717234	129717138	Y	ST14,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	33328	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr11	129920255	129920483	129920343	Y	APLP2	PRDM10,TCEB2P2,APLP2	APLP2,PRDM10,NFRKB,LINC00167,ST14	IMR90	Hi-C	24141950	APLP2	17249	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	129942098	129942391	129942179	Y	PRDM10	TCEB2P2,APLP2	NA	NA	NA	NA	APLP2	4366	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	130062798	130062918	130062846	Y	NA	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	35341	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	130505078	130505260	130505180	Y	NA	NA	ADAMTS8,ADAMTS15,SNX19	IMR90	Hi-C	24141950	SNX19	279144	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	130767172	130767510	130767285	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	131752861	131752973	131752917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	968457	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	132162679	132162975	132162706	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1378275	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	133825450	133825979	133825755	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	133903772	133904156	133904071	Y	NA	RP11-713P17.3,JAM3	NA	NA	NA	NA	RP11-713P17.3	3605	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr11	134509789	134510106	134509920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GAT1	229977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr11	134688539	134688830	134688760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GAT1	408727	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	574296	574697	574406	Y	B4GALNT3	B4GALNT3	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	6766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	685193	685500	685436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	52557	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1208361	1208617	1208550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	110686	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1261364	1261638	1261529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	163689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1387073	1387485	1387229	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	249572	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1407863	1408257	1407945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	228800	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	52725	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr12	1876861	1877254	1877034	Y	NA	RPS4XP14	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	11684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	2031257	2031345	2031320	Y	NA	CACNA2D4	NA	NA	NA	NA	CACNA2D4	5255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.49030206583232
chr12	2144277	2144357	2144308	Y	LRTM2	DCP1B	CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B	IMR90	Hi-C	24141950	DCP1B	32576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	3226381	3226449	3226415	Y	TSPAN9	TSPAN9	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	41860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	3226776	3227050	3226901	Y	TSPAN9	TSPAN9	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	42255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	4287687	4287885	4287726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCND2	93053	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	4396260	4396408	4396285	Y	NA	CCND2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	15322	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	6311406	6311775	6311432	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	4525	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	6339954	6340271	6340062	Y	VAMP1,TAPBPL,IFFO1	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	33073	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	29449	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	28074	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr12	6455086	6455266	6455191	Y	ZNF384,ZNF384,VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	5806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	6684613	6684668	6684641	Y	NA	GAPDH,NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	NOP2	8756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr12	7058563	7058923	7058712	Y	PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	NA	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	FOXJ2	70552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	NA	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	59553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr12	8725184	8725464	8725363	Y	NECAP1,CLEC4A,CLEC6A,M6PR,CLEC4D,CLEC4E	SCARNA11	KLRG1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARNA11	22641	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	9308932	9309318	9309073	Y	KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP4	81609	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	9947226	9947346	9947290	Y	OLR1,CLEC7A,CLEC2B,CD69	NA	CD69,CLEC7A	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDX12P	348401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	10281058	10281708	10281406	Y	CD69,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,GABARAPL1,OLR1,CLEC7A	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	81349	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	10458129	10458269	10458205	Y	KLRC3,KLRC4-KLRK1,KLRC1,KLRK1,KLRC4,KLRC2,KLRC1,KLRF1,KLRD1,KLRD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	56099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	10514396	10514426	10514411	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	28	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	10666685	10666858	10666772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	97364	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	10711881	10711950	10711935	Y	KLRD1,KLRD1,KLRK1,KLRC4,KLRC4-KLRK1,KLRC3,KLRC2,KLRC1,KLRC1	NA	CLEC1A,KLRC4-KLRK1	IMR90	Hi-C	24141950	MAGOHB	52272	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	8240	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	11238086	11238323	11238205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	83849	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	11867581	11867722	11867638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	66793	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	11949422	11949819	11949574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	148634	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	11951921	11952163	11952067	Y	ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	151133	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	11986979	11987463	11987102	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186191	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	11987992	11988316	11988087	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	187204	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	12033444	12033584	12033534	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	167194	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	88880	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	12185852	12185959	12185898	Y	ETV6,BCL2L14	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCL2L14	14819	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	12255233	12255559	12255327	Y	BCL2L14	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	6538	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.2136018362954
chr12	12298245	12298581	12298464	Y	LRP6	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	36148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	12504083	12504386	12504252	Y	BCL2L14,MANSC1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	MANSC1	2608	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr12	12545388	12545784	12545562	Y	DUSP16,CDKN1B,APOLD1,LOH12CR1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	37375	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	12592534	12593034	12592768	Y	BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	84521	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	12594845	12595716	12595015	Y	LOH12CR1,GPR19,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	86832	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	12735834	12736179	12735985	Y	NA	DUSP16,CREBL2	LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP16	22517	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	12766295	12766634	12766503	Y	DUSP16,CREBL2	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	3534	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	12838362	12838488	12838431	Y	KIAA1467,GSG1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	27504	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	12956264	12956405	12956396	Y	GPRC5A,DDX47	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	7845	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	RP11-392P7.6	3272	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	13251023	13251431	13251083	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	55805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr12	13325962	13326157	13326075	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	21493	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	13347729	13348002	13347866	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	79	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	13814153	13814481	13814422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf36	276052	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	13857134	13857357	13857246	Y	GRIN2B	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf36	319033	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	14711449	14711733	14711518	Y	PLBD1	RP11-695J4.2,PLBD1	NA	NA	NA	NA	RP11-695J4.2	6951	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	15121554	15121691	15121623	Y	NA	ERP27	NA	NA	NA	NA	ERP27	31538	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	15138089	15138465	15138277	Y	NA	ERP27	NA	NA	NA	NA	ERP27	48073	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	15853599	15853765	15853693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	179498	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	15916950	15917280	15917185	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	115983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr12	20543386	20543422	20543406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-146P	668017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	21059259	21059529	21059394	Y	SLCO1B3,LST-3TM12,SLCO1B1,SLCO1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	529020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	22654594	22654831	22654713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	121178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	23324864	23325062	23324963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	548855	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	23625293	23625709	23625512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	849284	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	426587	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	25058340	25058627	25058484	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	41766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr12	26013013	26013197	26013103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF8	96765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	26451676	26451798	26451755	Y	NA	NA	BHLHE41,SSPN,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.3	174126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	27006268	27006662	27006518	Y	NA	ITPR2	ITPR2,TM7SF3	IMR90	Hi-C	24141950	ITPR2	22137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	27513734	27513812	27513790	Y	NA	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	29947	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	27565982	27566076	27566029	Y	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	82195	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	27702695	27702969	27702865	Y	NA	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	28331	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	29473475	29473492	29473484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	58630	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	29793130	29793229	29793210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	261008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	31523025	31523181	31523129	Y	METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	45033	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr12	31754010	31754391	31754188	Y	DENND5B,METTL20	DENND5B-AS1,DENND5B,METTL20	DENND5B	IMR90	Hi-C	24141950	DENND5B	11979	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr12	32013496	32013579	32013537	Y	AMN1,H3F3C	NA	C12orf35	IMR90	Hi-C	24141950	H3F3C	70321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	32543557	32543792	32543676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	285788	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	32607110	32607326	32607203	Y	NA	NA	FGD4,DNM1L,BICD1	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	222808	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	32881013	32881116	32881065	Y	NA	RP11-278C7.1,YARS2	NA	NA	NA	NA	RP11-278C7.1	2692	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	39808802	39808894	39808882	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	26298	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	39816699	39816988	39816844	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	18204	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	RPL30P13,SLC2A13	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	7562	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	41137156	41137542	41137225	Y	CNTN1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	639265	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	42389498	42389678	42389588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	147003	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	42537125	42537342	42537234	Y	NA	GXYLT1	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	444	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	45236452	45236616	45236517	Y	DBX2,NELL2,NELL2,NELL2	NA	NA	NA	NA	NA	ANO6	371154	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	46398489	46398694	46398592	Y	NA	SCAF11	SCAF11	MCF7	ChIA-PET	22265404	SCAF11	14586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	46608402	46609191	46609043	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	52609	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	46894676	46894859	46894768	Y	SLC38A4	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	119214	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	47033293	47033660	47033445	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	257831	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	47058276	47058667	47058611	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	282814	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.76700229536924
chr12	47476610	47477096	47476829	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	4876	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	47583701	47583845	47583774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	111967	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	47612205	47612473	47612375	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	140471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	48053201	48053247	48053224	Y	ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	44597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	48215602	48215961	48215782	Y	OR10AD1,RPAP3	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	8954	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	48294417	48294695	48294497	Y	OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	40136	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	48297772	48297979	48297886	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	36852	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	48415389	48415421	48415405	Y	OR10AD1	NA	COL2A1,TMEM106C,SENP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM106C	60037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	49277442	49277626	49277534	Y	NA	DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11	RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CCDC65	18267	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	49678404	49678529	49678467	Y	NA	TROAP	NA	NA	NA	NA	TROAP	36490	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	DNAJC22	1270	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	49822830	49822961	49822896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2	64463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	50056796	50057319	50056974	Y	TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3	TMBIM6,FMNL3	NA	NA	NA	NA	TMBIM6	42189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	50092156	50092464	50092310	Y	FMNL3	TMBIM6,FMNL3	NA	NA	NA	NA	TMBIM6	7044	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	50507967	50508334	50508141	Y	NA	SMARCD1,GPD1	NA	NA	NA	NA	GPD1	12365	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	51762689	51763227	51762914	Y	SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6,BIN2	GALNT6	BIN2,CELA1	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT6	21424	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	52146424	52146626	52146525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN8A	164374	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	49739	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	53229830	53230092	53229928	Y	PFDN5	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	110563	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	67222	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	53368339	53368600	53368386	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT8	26601	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	53885903	53886227	53886219	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	5620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	54017367	54017528	54017445	Y	NA	ATF7	NA	NA	NA	NA	ATF7	671	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1	NA	NA	NA	NA	HOXC10	3660	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	12047	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	54413878	54414161	54414065	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10476	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264891	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,RDH5,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	56294124	56294208	56294164	Y	NA	DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	DGKA	24895	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	56877461	56877501	56877482	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	2697	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	7.19420596796003
chr12	57419370	57419645	57419508	Y	MYO1A	ZBTB39,MYO1A	ZBTB39,TAC3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBTB39	21140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	57462088	57462242	57462164	Y	R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6	MYO1A,TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	17604	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	57822292	57822475	57822384	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	313	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	59310774	59310957	59310933	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	1346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	59478007	59478346	59478177	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	165704	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	62525889	62526278	62526197	Y	MON2,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	125841	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	62727827	62728150	62727887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	75708	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	63086673	63087045	63086801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	92141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	63149457	63149757	63149616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	154925	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	63738861	63739061	63739005	Y	DPY19L2,AVPR1A	NA	NA	NA	NA	NA	RPL14P1	381766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	64386107	64386411	64386216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	150034	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	64718599	64718738	64718727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPOT	77392	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	64955008	64955199	64955103	Y	C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	RASSF3,GNS,MIR548Z	IMR90	Hi-C	24141950	RASSF3	47094	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	65005842	65006280	65005896	Y	GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	3549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	65888975	65889352	65889198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-221N13.3	105297	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	65926688	65927190	65926918	Y	NA	NA	MSRB3,HMGA2,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	67459	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	65959414	65959817	65959668	Y	NA	RP11-221N13.3	HMGA2,MSRB3,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	34832	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	66004084	66004433	66004259	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	9435	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	66242690	66243107	66242729	Y	HMGA2	HMGA2	NA	NA	NA	NA	HMGA2	26779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	66286698	66286979	66286899	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	70787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	66289506	66290040	66289751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	73595	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	66311039	66311339	66311117	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	95128	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	67361974	67362194	67362149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	98748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	67371255	67371618	67371453	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	89324	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	67396755	67396891	67396823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	64051	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	67821213	67821513	67821363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAND1	160152	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	67828762	67829103	67828960	Y	NA	NA	DYRK2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CAND1	167701	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	68304216	68304460	68304338	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	DYRK2	264098	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	68660485	68660819	68660713	Y	IL26,IL22	NA	NA	NA	NA	NA	MDM1	63342	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	68705850	68706149	68706026	Y	IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18012	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	69376854	69377042	69376929	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,CPM,YEATS4,FRS2,CPSF6	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	13504	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	69418832	69418872	69418851	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	55482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	69686526	69686874	69686654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYZ	53247	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	69722229	69722626	69722379	Y	LYZ	LYZ,YEATS4	CPSF6,YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	17495	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	69724869	69725108	69724964	Y	LYZ	LYZ,YEATS4	YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	15013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.62865218060078
chr12	69725132	69725785	69725647	Y	CPM,LYZ	LYZ,YEATS4	YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	14336	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	69839614	69839824	69839719	Y	CPSF6,FRS2,CCT2,CCT2,YEATS4	FRS2	FRS2	IMR90	Hi-C	24141950	FRS2	22305	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	69868200	69868446	69868430	Y	CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2	FRS2	NA	NA	NA	NA	FRS2	6071	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	70156698	70156941	70156820	Y	NA	RAB3IP	NA	NA	NA	NA	RAB3IP	26237	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	70360720	70360860	70360789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3IP	230259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	70382625	70382986	70382644	Y	CCT2,CCT2,RAB3IP	NA	CNOT2,KCNMB4,PTPRB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT2	251788	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	70626158	70626373	70626266	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	8401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	70644560	70644959	70644584	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	9420	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	73639499	73639785	73639508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	1289766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	17530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	75902459	75902855	75902619	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	561	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	75946648	75946656	75946652	Y	NA	KRR1	OSBPL8,NAP1L1,PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	43232	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	76116548	76116691	76116626	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	213132	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	76215246	76215339	76215312	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1,KRR1,GLIPR1,OSBPL8	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-114H23.1	160456	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-114H23.1	37578	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-114H23.1	37148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	76345818	76345948	76345927	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	29847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	76353921	76354019	76353970	Y	NA	RP11-114H23.1	KRR1,PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-114H23.1	21776	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	RP11-114H23.1	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	3668	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	76375899	76376264	76376114	Y	NA	RP11-114H23.1,PHLDA1	PHLDA1,KRR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-114H23.1	104	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	RP11-114H23.1,PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	76890977	76890992	76890985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	60597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	77056574	77056895	77056735	Y	NA	NA	ZDHHC17,CSRP2	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC17	98473	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	78884242	78884463	78884353	Y	NA	NA	SYT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-34H18.1	1167821	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	79363511	79363565	79363558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	719312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	79670829	79671264	79670913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	411613	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	79994209	79994302	79994256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	88575	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	81405150	81405419	81405285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244J10.1	910037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	83157091	83157416	83157138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	78432	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	83269676	83269939	83269806	Y	TMTC2	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	191017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	83461267	83461506	83461387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	81604	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	88064249	88064502	88064338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	361121	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	89856198	89856331	89856264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	61470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	90065963	90066366	90066126	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	34711	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	90150470	90150910	90150738	Y	NA	ATP2B1	LOC338758	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2B1	49393	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	92189163	92189178	92189169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	348171	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	92431355	92431571	92431463	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	105778	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	18951	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	92528487	92528918	92528861	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	8431	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	92772772	92773106	92773007	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	235099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	94135673	94136306	94136137	Y	NUDT4,SOCS2	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	66522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	94495978	94496358	94496187	Y	NA	NA	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBMS2P1	320387	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	94827148	94827488	94827330	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	10403	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	95727264	95727326	95727295	Y	NA	NA	NR2C1,FGD6,VEZT,USP44	IMR90	Hi-C	24141950	VEZT	117742	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	96659033	96659395	96659303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	72873	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	96839212	96840356	96839676	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	CDK17	46874	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	97108556	97108721	97108638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	190280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	97355714	97355975	97355919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	56713	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	97962496	97962841	97962674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	663495	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	98833710	98834204	98834052	Y	NA	RNU4-41P	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	23894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	99202700	99202798	99202749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	165781	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	101099927	101100118	101100023	Y	NA	NA	SLC17A8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-575G13.2	129405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	105031434	105031802	105031612	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	318720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	105620091	105620351	105620275	Y	APPL2	C12orf75,APPL2	NA	NA	NA	NA	C12orf75	6717	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	106694592	106694855	106694698	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	107153976	107154194	107154103	Y	RFX4,RIC8B	RIC8B	NA	NA	NA	NA	RIC8B	12179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG	NA	NA	NA	NA	UNG	37197	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	110633503	110633688	110633596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT81	73363	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	110682622	110683080	110682796	Y	ATP2A2	ATP2A2	ATP2A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2A2	33481	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	111016111	111016444	111016311	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	2681	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	111475040	111475231	111475136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CC	296296	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	112534496	112534670	112534605	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	10156	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	113502885	113503086	113502986	Y	DTX1	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL1	68958	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	CCDC42B,DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	115803300	115803402	115803336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX3	683331	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	116570796	116571229	116571121	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	141914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	117498032	117498586	117498265	Y	NA	TESC	NA	NA	NA	NA	TESC	36698	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	118123457	118123641	118123524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	281147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	118157825	118158191	118158007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	246597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	118605193	118605499	118605376	Y	NA	PEBP1,VSIG10	NA	NA	NA	NA	VSIG10	33362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	120926786	120926862	120926830	Y	SIRT4	TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	21133	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	121367131	121367281	121367257	Y	NA	SPPL3,RPL12P33,HNF1A,HNF1A-AS1	C12orf43,SPPL3,POP5	IMR90	Hi-C	24141950	RPL12P33	14583	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	121402785	121402795	121402791	Y	HNF1A	HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43	NA	NA	NA	NA	HNF1A	11551	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	121425440	121425755	121425495	Y	NA	HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43,OASL	NA	NA	NA	NA	HNF1A-AS1	8672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	121888305	121888670	121888535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF34	52461	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	121976471	121976819	121976719	Y	NA	KDM2B	NA	NA	NA	NA	KDM2B	40101	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	122086492	122086728	122086610	Y	KDM2B,SETD1B,ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	MORN3	21809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	122519763	122520228	122519936	Y	ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	5135	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	122771781	122771848	122771815	Y	NA	VPS33A	NA	NA	NA	NA	VPS33A	22713	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.93690160675847
chr12	123131126	123131793	123131490	Y	CLIP1,RSRC2,VPS37B,HCAR3,HCAR2	NA	NA	NA	NA	NA	HCAR1	81597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	123367402	123367963	123367875	Y	VPS37B	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	11028	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	123583230	123583584	123583407	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	48978	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	123917456	123917702	123917658	Y	SBNO1,RILPL2	RILPL2,SNRNP35	NA	NA	NA	NA	RILPL2	1562	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	451757	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr12	124963399	124963744	124963551	Y	UBC	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	401470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	361380	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	254030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	125124773	125124965	125124867	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	240249	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	125331273	125331577	125331425	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	33637	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	125577703	125578001	125577737	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	29778	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	129296403	129296565	129296505	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	9963	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	129341873	129342419	129342112	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	35345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	130824673	130824982	130824768	Y	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	496829	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.79855149199001
chr12	132293483	132293821	132293495	Y	NA	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	17117	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr12	132315862	132315946	132315904	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4924	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	SNORA49,EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr12	133688468	133688629	133688567	Y	NA	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	16430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	20271500	20271544	20271543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	65712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	20546038	20546426	20546233	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	15228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	20624080	20624132	20624092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	93270	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	20692936	20693199	20693068	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39989	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	20694627	20695029	20694906	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	38159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	31088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr13	20979917	20980272	20980195	Y	GJB2,GJB6	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	117724	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	22111458	22111566	22111512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	79949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	22135396	22135683	22135678	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	65471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	22392520	22392762	22392640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF9	148998	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	22545143	22545315	22545232	Y	NA	NA	FGF9	IMR90	Hi-C	24141950	FGF9	301621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	22635626	22635842	22635673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF9	392104	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	146492	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	24365850	24365860	24365855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	95168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	24701250	24701640	24701393	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	239692	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	25082319	25082682	25082572	Y	PARP4	PARP4	NA	NA	NA	NA	PARP4	2266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	25859422	25859518	25859470	Y	NUPL1,MTMR6	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	MTMR6	629	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	26564398	26564731	26564565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	230060	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	27166168	27166184	27166175	Y	GPR12,WASF3	WASF3	NA	NA	NA	NA	WASF3	36328	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	27198783	27198789	27198786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF3	68943	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	27734553	27734882	27734861	Y	NA	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	9151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	27808177	27808245	27808213	Y	NA	RPL21,RASL11A	USP12,RPL21	IMR90	Hi-C	24141950	RPL21	15201	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	27843033	27843378	27843206	Y	NA	RPL21,RASL11A	NA	NA	NA	NA	RASL11A	569	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr13	28534904	28535178	28535096	Y	LNX2,FLT3,PRHOXNB	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	8098	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr13	28540285	28540611	28540449	Y	LNX2,CDX2	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	2665	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	28762730	28762825	28762778	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	23825	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	29106089	29106574	29106395	Y	NA	NA	FLT1,PAN3,POMP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF4A1P7	64396	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	29148829	29149214	29148994	Y	POMP	EIF4A1P7	FLT1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A1P7	21756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	36635	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	29631407	29631751	29631579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP69	247164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	31407198	31407336	31407268	Y	HSPH1	NA	USPL1	IMR90	Hi-C	24141950	USPL1	217368	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	31619955	31620221	31620066	Y	ALOX5AP	NA	TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HSPH1	114304	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	32501315	32501650	32501483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRCA2	385961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	32719251	32719642	32719447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRCA2	167969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	32956405	32956487	32956432	Y	NA	N4BP2L1	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	43828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	33526715	33527061	33526891	Y	NA	NA	KL,PDS5B,STARD13	IMR90	Hi-C	24141950	PDS5B	368151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	33788488	33788595	33788542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	134172	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	38740377	38740756	38740564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UFM1	181230	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	39673498	39673704	39673601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NHLRC3	63055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	40615098	40615335	40615215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	387334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	41177727	41178040	41178014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	60694	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	41468341	41468634	41468483	Y	NA	SUGT1P3	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	25276	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	41574237	41574406	41574394	Y	FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	59004	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	41581586	41581700	41581679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	51710	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	41589057	41589218	41589148	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	44192	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	41591294	41591779	41591504	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	41631	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	41651625	41651882	41651685	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	ELF1	18049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	42222511	42222753	42222632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	339170	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	42269057	42269475	42269218	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	342701	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	42276592	42276928	42276845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	335248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	241248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	42534426	42534531	42534479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	77645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	42855017	42855240	42855076	Y	AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	10728	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	43465852	43466112	43465970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	98295	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr13	43635759	43636150	43635822	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	40420	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	43662550	43662935	43662749	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	67211	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	43866757	43867095	43866777	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	271418	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	44201276	44201468	44201373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	157576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	44436870	44437053	44436962	Y	ENOX1	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	14367	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	44765408	44765809	44765737	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,LINC00284	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZP1	224848	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	44846792	44847050	44846982	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	302233	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	268192	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr13	45338378	45338728	45338554	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	189095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	45342536	45342642	45342588	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	193253	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	45496701	45496835	45496770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	64783	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr13	45548667	45548813	45548740	Y	NA	NUFIP1	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	12805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	46233080	46233407	46233244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	196020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	46244354	46244716	46244645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	207294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	46557145	46557532	46557508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	67362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	46709325	46709604	46709495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	84431	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr13	49601050	49601794	49601184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	53002	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	46274	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR3613	NA	NA	NA	NA	MIR3613	28839	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	50675373	50675756	50675618	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	21066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	50819119	50819505	50819321	Y	KPNA3	NA	DLEU1,DLEU2,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	114394	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	51204178	51204550	51204306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	270279	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	51395866	51396155	51396034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B	85659	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	51641920	51642198	51642053	Y	INTS6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM124A	152305	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	52126260	52126496	52126383	Y	INTS6,DHRS12,DHRS12,WDFY2	WDFY2	NA	NA	NA	NA	WDFY2	30148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	52406665	52407091	52406817	Y	NA	DHRS12,RP11-327P2.5	NA	NA	NA	NA	RP11-327P2.5	30232	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	52572353	52572390	52572372	Y	NA	ATP7B,ALG11,UTP14C	NA	NA	NA	NA	ATP7B	11240	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	58887491	58887889	58887651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	1848232	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	59685905	59686157	59686031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	1049964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	59854407	59854488	59854447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	881633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	59980699	59980952	59980824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	755169	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	63861440	63861454	63861447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	2892849	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	67168022	67168413	67168283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	6107418	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	5814105	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	67900276	67900454	67900293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	5375377	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	72437849	72438027	72438023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	837804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	72805044	72805055	72805050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	470776	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	73742042	73742346	73742194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF5	114928	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	73768530	73768732	73768575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF5	141416	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr13	73985614	73985783	73985667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF5	358500	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	477691	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	74707257	74707359	74707330	Y	NA	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	863	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	75346258	75346396	75346327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	639864	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	75776535	75776764	75776650	Y	NA	NA	KLF12	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D4	277486	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	75904010	75904233	75904150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	150017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr13	77078666	77078696	77078681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	475355	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	77166796	77167041	77166918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	387010	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	77599424	77599520	77599503	Y	NA	RPL7P44,CLN5,FBXL3	NA	NA	NA	NA	FBXL3	94	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	77897670	77898015	77897832	Y	NA	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	1170	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	78304455	78304850	78304591	Y	SLAIN1,SLAIN1	SLAIN1	NA	NA	NA	NA	SLAIN1	34432	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	80030193	80030565	80030379	Y	NA	NDFIP2	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	22722	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	80743577	80743798	80743732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	169288	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	80810111	80810307	80810235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	102779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr13	80916799	80917232	80917156	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3713	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	90634693	90634897	90634785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1363177	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	92927934	92928164	92928120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	929860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	94297506	94297518	94297511	Y	GPC6	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	278293	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	94766317	94766480	94766414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	480031	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	95128334	95128746	95128451	Y	DCT	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	117765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	95931058	95931197	95931128	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	20490	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	95951518	95951672	95951596	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	15	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	96164777	96165033	96164905	Y	NA	CLDN10-AS1	NA	NA	NA	NA	CLDN10-AS1	19131	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr13	96366031	96366158	96366093	Y	DNAJC3	DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	38638	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	96376622	96376681	96376676	Y	DNAJC3	DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	49229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	96424038	96424083	96424061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	96645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	97864377	97864530	97864454	Y	NA	MBNL2	MBNL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MBNL2	7158	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	97872304	97872639	97872450	Y	RAP2A,MBNL2	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	616	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	97890366	97890711	97890515	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	18678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	97913986	97914316	97914087	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	42298	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	98082020	98082299	98082214	Y	MBNL2,RAP2A	RAP2A	RAP2A	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2A	2177	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	98924976	98925080	98925019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP1	132160	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	99033515	99033578	99033537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	194616	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	99123285	99123381	99123333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	104813	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	99161455	99162128	99161863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	66066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	99403586	99403810	99403698	Y	SLC15A1	SLC15A1	NA	NA	NA	NA	SLC15A1	678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	99599525	99599781	99599653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	137098	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	99934075	99934613	99934350	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	68063	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	99950103	99950501	99950500	Y	GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	84091	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	99957500	99957664	99957598	Y	DOCK9,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	91488	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	99973342	99973591	99973472	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	107330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	100008605	100009044	100008755	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	142593	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	100024364	100024560	100024446	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	127111	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	100035133	100035296	100035208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	116375	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	100620497	100620786	100620718	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	1377	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	100644149	100644384	100644267	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	12123	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	100760491	100760725	100760608	Y	NA	PCCA,RPL15P18	NA	NA	NA	NA	PCCA	21222	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	100928465	100928851	100928516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	127119	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	101163000	101163083	101163042	Y	NA	RPS26P47	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	27445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	101820185	101820500	101820343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC4	494838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	102143126	102143433	102143292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC4	817779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	102377146	102377246	102377196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	870107	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	102691942	102692330	102692296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	555023	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	102926292	102926685	102926630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	320668	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	102928353	102928749	102928703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	318604	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	103244790	103245125	103245073	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	TPP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TPP2	2228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	105315212	105315547	105315380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00460	1711364	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	106751889	106752019	106751954	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	274892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	273639	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr13	106777477	106777605	106777541	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	249306	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr13	106810133	106810294	106810212	Y	NA	NA	EFNB2,LINC00460	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	216617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr13	107124360	107124455	107124408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	94057	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	107170805	107171068	107170962	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	47444	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	107624035	107624287	107624161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	310250	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	108647703	108647718	108647711	Y	NA	NA	FAM155A	IMR90	Hi-C	24141950	LIG4	220998	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	596578	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	110181276	110181465	110181371	Y	IRS2	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	224150	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	110322109	110322425	110322268	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	83190	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	110337257	110337548	110337429	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	68067	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	110352571	110352699	110352636	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	52916	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	110426988	110427362	110427201	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	9553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	110441173	110441468	110441257	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	4258	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	110790027	110791241	110790617	Y	RAB20,IRS2	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	164918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	111174336	111174835	111174468	Y	ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	37245	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	111176913	111177121	111177092	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	34959	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	111180820	111181023	111180903	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	31057	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	111212967	111213224	111213111	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB20	887	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	111312907	111313086	111312997	Y	NA	CARKD,ING1	NA	NA	NA	NA	CARKD	47026	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	111526935	111527249	111527195	Y	RAB20	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	LINC00346	6773	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr13	111564894	111565358	111565241	Y	RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	58	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	111719893	111720066	111720029	Y	NA	ARHGEF7	ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF7	44840	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	113650051	113650400	113650313	Y	MCF2L	MCF2L-AS1	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	28913	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr13	113660175	113660436	113660306	Y	NA	MCF2L-AS1	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	39037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	55896	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	11.3447094110139
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	53642	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	113828673	113828834	113828768	Y	ATP11A,DCUN1D2,CUL4A	CUL4A,PCID2	NA	NA	NA	NA	CUL4A	31718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	113928164	113928348	113928293	Y	CUL4A	LAMP1	NA	NA	NA	NA	LAMP1	21208	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	113982391	113982456	113982424	Y	NA	LAMP1,GRTP1	NA	NA	NA	NA	LAMP1	32835	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	7.74760642703388
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr13	114881275	114881557	114881414	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	14529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	21288613	21288985	21288797	Y	NA	RNASE1	NA	NA	NA	NA	RNASE1	19176	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	22080552	22080764	22080649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL2	77202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	23015324	23015612	23015395	Y	RBM23	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	40563	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	23322319	23322495	23322408	Y	NA	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	LRP10	16327	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	24014427	24014724	24014635	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,BCL2L2,BCL2L2,PABPN1,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,THTPA,JPH4	THTPA,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	8492	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	24163763	24164098	24163827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS2	66439	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	24743214	24743836	24743517	Y	DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2	NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	RABGGTA	4269	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	24755187	24755313	24755250	Y	DHRS4L1	TINF2,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	DHRS1	11726	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr14	25143666	25144075	25143734	Y	TINF2,CIDEB,LTB4R,RIPK3,KHNYN,SDR39U1,GZMH,GZMB	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	233555	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	25397817	25398161	25397990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP6	119342	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	30663023	30663420	30663280	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	3919	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	31055388	31055443	31055417	Y	NA	G2E3,SCFD1	NA	NA	NA	NA	G2E3	29059	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	31165114	31165442	31165278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD1	75796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COCH	58389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	31698850	31699225	31699035	Y	STRN3	HECTD1	AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	23840	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	32477016	32477383	32477087	Y	NA	RP11-187E13.2	NUBPL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-187E13.2	2908	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	32672212	32672871	32672506	Y	ARHGAP5	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	128213	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	32852666	32852915	32852789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	99091	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	32897111	32897507	32897201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	54499	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	32976944	32977104	32977024	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	24938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	34339517	34339744	34339631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	589818	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	35802308	35802726	35802409	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	53549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	37233433	37233885	37233827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	108660	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	37317346	37317701	37317507	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	192573	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	37785804	37785829	37785809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	120686	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	38052089	38052429	38052199	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	10623	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	41880555	41880659	41880564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1980851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	43420114	43420297	43420206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1944201	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	43777769	43777873	43777801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1586625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	44072704	44073040	44072872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1291458	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	44120052	44120074	44120065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1244424	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	44249775	44250158	44250052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1114340	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	45260875	45260890	45260883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	103608	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	47637485	47637798	47637642	Y	NA	RPL13AP2	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	30509	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	48101040	48101412	48101227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	432733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	50237132	50237443	50237218	Y	KLHDC2	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	4806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr14	50374574	50374717	50374657	Y	RPL36AL,MGAT2,C14orf182,C14orf183,ARF6	ARF6	NA	NA	NA	NA	ARF6	16764	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	50429310	50429592	50429451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	71500	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	81921	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr14	50562564	50562863	50562716	Y	RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	133413	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	51460024	51460383	51460203	Y	TRIM9	NA	NA	NA	NA	NA	PYGL	50570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	52104818	52105424	52105148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	151000	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	209862	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	52250544	52250794	52250677	Y	GNG2	NA	PYGL,TMX1,GNG2,LOC283553,C14orf166,TRIM9,FRMD6	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	203399	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	52315893	52316170	52316085	Y	PTGER2,PTGDR,GNG2	NA	GNG2	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	138023	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	52774627	52775077	52774946	Y	GNG2,PTGER2	PTGDR,PTGER2	NA	NA	NA	NA	PTGER2	3946	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	52790756	52791260	52791155	Y	NA	PTGER2	NA	NA	NA	NA	PTGER2	11733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	53421198	53421586	53421381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	164812	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	54443717	54444101	54443910	Y	NA	BMP4	NA	NA	NA	NA	BMP4	20238	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	54573774	54574066	54573953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	150295	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	54902274	54902529	54902415	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	40707	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	55109619	55109800	55109713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	77804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	55166048	55166175	55166112	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	134233	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	55538737	55539349	55538846	Y	FBXO34,FBXO34,ATG14,MAPK1IP1L	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	22388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	55569033	55569319	55569207	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	19509	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	56677019	56677095	56677057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	94487	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	56733293	56733420	56733313	Y	PELI2	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	150761	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	56738726	56738905	56738873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	156194	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	57047832	57047974	57047932	Y	PELI2,C14orf101	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	465300	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	57459148	57459304	57459264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	274422	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	57725682	57725794	57725735	Y	NA	EXOC5	NA	NA	NA	NA	EXOC5	7932	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	58637905	58638297	58638125	Y	NA	UBA52P3,ACTR10	NA	NA	NA	NA	ACTR10	26501	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	59221069	59221139	59221083	Y	NA	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	38233	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	59628600	59628806	59628703	Y	NA	DAAM1	DAAM1,KIAA0586,GPR135	IMR90	Hi-C	24141950	DAAM1	24558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	59742406	59742712	59742574	Y	DAAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	89042	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	59908838	59908842	59908840	Y	NA	GPR135,JKAMP	NA	NA	NA	NA	GPR135	21218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	60316176	60316431	60316304	Y	RTN1	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS7	318143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	61188145	61188381	61188263	Y	NA	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	685	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	61831813	61832066	61831889	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	44277	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	61934250	61934452	61934308	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	146714	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	150732	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	181993	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr14	61978357	61978646	61978426	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181585	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	63829601	63829975	63829789	Y	WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	178117	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	64117169	64117293	64117244	Y	SYNE2,WDR89,WDR89	WDR89	WDR89	MCF7	ChIA-PET	22265404	WDR89	10590	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	64214663	64214998	64214720	Y	SGPP1	SGPP1,RP11-804M7.2	NA	NA	NA	NA	RP11-804M7.2	11733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr14	64358003	64358294	64358235	Y	NA	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	40320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	65006188	65006351	65006244	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	HSPA2	5565	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	65637410	65637773	65637587	Y	NA	CTD-2509G16.2	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2509G16.2	49292	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	65691594	65691779	65691731	Y	NA	CTD-2509G16.2	FUT8,LOC645431,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2509G16.2	4529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	65705173	65705467	65705275	Y	NA	CTD-2509G16.2	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2509G16.2	18108	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	65722117	65722532	65722424	Y	NA	CTD-2509G16.2	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2509G16.2	35052	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	66104549	66104610	66104580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	229239	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	66510769	66510922	66510841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	461203	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	67478288	67478352	67478320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	227474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	67562927	67563276	67562937	Y	TMEM229B,PLEKHH1	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	142550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	67998625	67999040	67998762	Y	NA	PLEKHH1,TMEM229B	NA	NA	NA	NA	TMEM229B	169	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	68456427	68456429	68456428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	171931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	68555311	68555805	68555391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	270815	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	68634149	68634509	68634347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	252404	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	68658646	68658820	68658748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	228093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	68720004	68720020	68720012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	166893	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	68860375	68860378	68860377	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	26535	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	68873274	68873547	68873349	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	13366	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	69065409	69066172	69065453	Y	ZFP36L1	CTD-2325P2.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	26990	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	69252204	69252483	69252314	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	8707	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	69301401	69301774	69301727	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	40211	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	69396600	69396876	69396795	Y	ZFP36L1,DCAF5	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	47281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	69404659	69405002	69404945	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	39155	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	69867695	69867997	69867846	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	ERH	4351	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	70079600	70080000	70079702	Y	NA	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	3287	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	70161683	70161933	70161784	Y	KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	29684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	NA	NA	NA	NA	NA	TTC9	58030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	71711284	71711362	71711294	Y	NA	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	73804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	11927	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	72530304	72530701	72530359	Y	RGS6,RGS6	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L1	745138	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	73319855	73320202	73320119	Y	DPF3	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF4	70838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	73919503	73919783	73919743	Y	NA	RP1-240K6.3,NUMB,C14orf169	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	7346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	74220065	74220506	74220203	Y	C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	31557	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	26595	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	74229197	74229543	74229334	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43	RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	22520	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	75040596	75041021	75040862	Y	LTBP2	CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	40329	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	75492523	75492557	75492545	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	23678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	75607767	75608156	75607957	Y	FOS	NEK9,TMED10	NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK9	15720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	75697272	75697400	75697329	Y	NA	RP11-293M10.2,FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	26714	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	76395057	76395394	76395222	Y	ESRRB,TGFB3	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	28578	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	76513976	76514095	76514005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	66642	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	76564687	76564726	76564707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	117353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	77425025	77425260	77425132	Y	C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1044	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	77500544	77500911	77500765	Y	NA	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	7510	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	77554689	77554897	77554781	Y	NA	TMEM63C	KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63C	26014	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	77639599	77639692	77639653	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63C	58688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	78031949	78032369	78032266	Y	SNW1,SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	48747	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	80161976	80161991	80161984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1261870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	81442935	81443331	81443135	Y	TSHR	CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	19074	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	4.28885355782233
chr14	81977973	81978150	81978054	Y	NA	SEL1L	NA	NA	NA	NA	SEL1L	20055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	82233009	82233227	82233113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEL1L	234804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	85398952	85399308	85399126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALC	3058701	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	90055887	90056088	90056076	Y	NA	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	27405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	90378074	90378289	90378205	Y	FOXN3,FOXN3,TDP1	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	40832	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	90975200	90975474	90975336	Y	NA	NA	LOC400238,CALM1,C14orf102,TTC7B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CALM1	114354	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	91267745	91267886	91267834	Y	NA	TTC7B,CTD-3035D6.2	NA	NA	NA	NA	TTC7B	12937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	91454457	91454803	91454684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	69874	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	91511263	91511534	91511399	Y	NA	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	C14orf159	13143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	91863961	91864070	91864025	Y	C14orf159,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	18118	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr14	92446493	92446853	92446680	Y	SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP11	58387	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	92574762	92574984	92574843	Y	NA	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	3797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	92929701	92929788	92929745	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	48330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	92972797	92972893	92972844	Y	SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	5225	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	92997430	92998230	92997929	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	19312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	93044640	93044810	93044725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIN3	66522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	93051108	93051475	93051361	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	RIN3	72990	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	93192576	93192808	93192662	Y	MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	20239	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	93310569	93310815	93310655	Y	MOAP1,KIAA1409,C14orf142,C14orf109,C14orf109,BTBD7,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA5	51993	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	93539735	93540013	93539874	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	40652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	94808145	94809286	94808819	Y	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R4	197680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	95014834	95014854	95014844	Y	NA	SERPINA4,SERPINA5	SERPINA4	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINA4	10574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	95065322	95065753	95065523	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	10961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	95677984	95678067	95678026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	55637	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	95680303	95680655	95680479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	57956	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	95691488	95691499	95691495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	69141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	95724003	95724377	95724190	Y	DICER1,DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	59866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	95775450	95775616	95775533	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	8627	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	95946356	95946810	95946552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX5	51030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	97925761	97925890	97925827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK1	664120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	99132884	99133181	99132894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	602680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	296223	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	99713000	99713727	99713367	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	22134	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	99717197	99717337	99717253	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	18524	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	99734295	99735130	99734633	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	731	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr14	99739493	99739630	99739557	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	3632	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	100241205	100241603	100241404	Y	CYP46A1,EML1	EML1	EML1,CYP46A1	IMR90	Hi-C	24141950	EML1	39175	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	100495518	100495795	100495680	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	128705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	100503802	100504130	100503983	Y	NA	NA	EVL,DEGS2,EML1	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	120370	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	100633368	100633655	100633513	Y	YY1	DEGS2	NA	NA	NA	NA	DEGS2	8868	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	DEGS2,YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	34673	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr14	102173765	102174142	102173896	Y	NA	RP11-1029J19.5	PPP2R5C,DYNC1H1,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-1029J19.5	21303	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	102176439	102176788	102176690	Y	PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	PPP2R5C,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-1029J19.5	18657	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	102188292	102188876	102188640	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	LINC00239	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-1029J19.5	6569	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	102226478	102227031	102226824	Y	HSP90AA1	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	343	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	102281379	102281594	102281451	Y	PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	55244	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	102288392	102288845	102288491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	62257	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	102993844	102994139	102994010	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9,CTD-2555C10.3	RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2555C10.3	15452	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	102997284	102997579	102997375	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9,CTD-2555C10.3	MIR4309,RCOR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2555C10.3	12012	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	103726827	103727460	103727139	Y	MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5	NA	EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	70421	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	104582105	104582467	104582315	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	363	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.07525172152693
chr14	104616017	104616378	104616259	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	12957	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.93690160675847
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	105290315	105290696	105290451	Y	GPR132	AKT1	NA	NA	NA	NA	AKT1	30227	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	105434041	105434308	105434245	Y	NA	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8386	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	105500263	105500628	105500453	Y	NA	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	14778	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1262554	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr14	107254436	107254688	107254673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1263496	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	20570096	20570220	20570180	Y	NA	NA	REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-603B24.2	1973869	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	20599040	20599336	20599188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1944753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	25554216	25554517	25554319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	127611	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	25608093	25608225	25608159	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	73903	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	25625771	25626455	25625879	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	55673	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	25634776	25635000	25634877	Y	SNURF,SNRPN	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	47128	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	25646289	25646668	25646556	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	35460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	26094944	26095277	26095056	Y	UBE3A,UBE3A	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	13040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	26097872	26097956	26097914	Y	NA	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	10361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	29949236	29949642	29949365	Y	NA	RP11-680F8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	15552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	31372759	31373034	31372889	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR10	90949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	31627410	31627711	31627458	Y	NA	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	10352	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	31733081	31733438	31733352	Y	MTMR10,KLF13	NA	KLF13,OTUD7A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF13	116023	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	33123878	33123902	33123890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	218533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	33134248	33134560	33134512	Y	NA	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	228903	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	33148173	33148432	33148370	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	242828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	33172991	33173188	33173143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	267646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	34597819	34597943	34597881	Y	NA	SLC12A6,NOP10	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	30318	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	510266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	36349026	36349361	36349194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf41	520451	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	36547085	36547100	36547092	Y	C15orf41	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf41	322712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	38345293	38345611	38345599	Y	NA	NA	SPRED1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED1	196916	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	38820654	38820765	38820702	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	35011	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	38855450	38855620	38855537	Y	C15orf53,RASGRP1	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	156	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	39326121	39326439	39326280	Y	C15orf54	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	470345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	438868	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	39447330	39447720	39447666	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	423560	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	39449850	39450075	39449963	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	421205	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	39559141	39559459	39559346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	311821	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	39575623	39576160	39575979	Y	THBS1	NA	C15orf53,THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	295120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	39673743	39674138	39673898	Y	NA	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	197142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	39702122	39702492	39702291	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	168788	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	39706539	39706707	39706617	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	164573	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	40200668	40200777	40200723	Y	NA	EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK4	23570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	40361212	40361596	40361446	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	SRP14	31823	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	40388043	40388381	40388211	Y	NA	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	10712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr15	40395466	40395787	40395613	Y	NA	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	3306	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	40728458	40728872	40728667	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14,RP11-64K12.1	NA	NA	NA	NA	BAHD1	1048	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	40770055	40770415	40770235	Y	NA	BAHD1,CHST14,RP11-64K12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-64K12.1	1099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	NA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TYRO3	106045	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	42213328	42213713	42213448	Y	NA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	49063	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	42549506	42549513	42549508	Y	PLA2G4E	GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	13918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	43356735	43357067	43356746	Y	NA	UBR1,RPS3AP47	NA	NA	NA	NA	UBR1	39244	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	44431053	44431468	44431357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD5	53982	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	45892726	45892758	45892742	Y	NA	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	28588	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	48253775	48254090	48253870	Y	SEMA6D	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	MYEF2	214624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	48605520	48605711	48605648	Y	NA	DUT,RP11-154J22.1	NA	NA	NA	NA	DUT	15497	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	49189398	49189493	49189438	Y	SECISBP2L	EID1	NA	NA	NA	NA	EID1	21315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	50356629	50356698	50356664	Y	USP8,GABPB1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	115695	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	50416404	50416811	50416627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	55582	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	51358266	51358334	51358300	Y	GLDN	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	159397	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	51413367	51413627	51413497	Y	NA	NA	TNFAIP8L3,AP4E1,GLDN	IMR90	Hi-C	24141950	AP4E1	214498	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	51477619	51477870	51477745	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	GLDN	153956	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	51598187	51598615	51598465	Y	CYP19A1	GLDN	NA	NA	NA	NA	GLDN	33211	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	51868984	51870333	51869210	Y	NA	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	42697	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	52122599	52122915	52122757	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	2774	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	55559597	55559729	55559672	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	49429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	55581016	55581448	55581368	Y	RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	27710	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	94234	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	56331775	56332089	56331933	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	47831	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	56475850	56476168	56476009	Y	MNS1	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	57315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	56717939	56718122	56718071	Y	RFX7,ZNF280D,MNS1,TEX9	MNS1	NA	NA	NA	NA	MNS1	37213	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	57302684	57303020	57302852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	93863	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	57648977	57649377	57649143	Y	NA	CGNL1	CGNL1	IMR90	Hi-C	24141950	CGNL1	16788	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	57798359	57798473	57798399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCOM1	83633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	60547541	60548010	60547775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2	145072	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	60937521	60937640	60937631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	168144	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	62499952	62500233	62500097	Y	NA	C2CD4B	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	44470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	62683990	62684402	62684060	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3265	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	62684510	62685208	62684868	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3785	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	62906049	62906061	62906055	Y	NA	NA	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	225324	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	62949406	62949470	62949438	Y	LACTB	NA	NA	NA	NA	NA	TLN2	268681	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	63189821	63190186	63190004	Y	NA	NA	TPM1,TLN2,RAB8B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-244F12.1	53186	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	63780259	63780491	63780361	Y	LACTB,RAB8B,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,CA12,USP3,LOC100130855,FBXL22	IMR90	Hi-C	24141950	USP3	14302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	63785022	63785122	63785071	Y	LACTB,RAB8B,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,CA12,USP3,LOC100130855,FBXL22	IMR90	Hi-C	24141950	USP3	9671	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	64043759	64043975	64043867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	80166	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	64654607	64654901	64654754	Y	PIF1,KIAA0101	CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4	CSNK1G1	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G1	8165	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	64755596	64755800	64755698	Y	NA	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	4655	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr15	65589242	65589632	65589437	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PARP16	1324	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	65841762	65842141	65841952	Y	PARP16	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	21006	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr15	66701075	66701322	66701144	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	SNAPC5,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,ZWILCH,SNORD16	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	23920	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	67373443	67373710	67373534	Y	SMAD3	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	19342	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	67383217	67384219	67383746	Y	SMAD3	RP11-798K3.2,SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	29116	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	81760	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	33898	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	5919	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	67716264	67716618	67716446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf61	94788	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	67732554	67732598	67732576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf61	78808	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	68176779	68177152	68176934	Y	NA	NA	PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	167365	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	68325695	68325962	68325829	Y	NA	PIAS1	SKOR1,PIAS1	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	18555	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	68878617	68878894	68878756	Y	CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	9309	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	69490173	69490404	69490203	Y	NA	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	39250	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	70053152	70053574	70053296	Y	TLE3	NA	TLE3,LOC145837,C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	310029	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	70289516	70289879	70289625	Y	NA	NA	LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	98636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	70391261	70391735	70391557	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	2746	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	70392397	70392607	70392502	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	70392960	70393272	70393150	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	4445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	71615809	71616164	71615988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	432685	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	72003894	72004173	72003980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	400426	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	72226785	72227154	72226872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	177445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	72318611	72318818	72318715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	85781	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	72448533	72448632	72448574	Y	TMEM202,CELF6,CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A	NA	NA	NA	NA	MYO9A	39615	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	73032689	73032951	73032815	Y	PARP6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	43236	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	73035188	73035310	73035249	Y	NA	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	40877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	73978221	73978605	73978367	Y	NA	CD276	NA	NA	NA	NA	CD276	3914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	74909072	74909376	74909224	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	20231	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	74943465	74943852	74943659	Y	NA	EDC3	NA	NA	NA	NA	EDC3	42781	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	75460054	75460405	75460311	Y	NA	C15orf39	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	25579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	76218014	76218024	76218019	Y	NA	FBXO22	NA	NA	NA	NA	FBXO22	23814	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	76639629	76639850	76639740	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12564	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	77351977	77352357	77352309	Y	NA	TSPAN3	PSTPIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN3	21969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	77710600	77710857	77710802	Y	NA	PEAK1	NA	NA	NA	NA	HMG20A	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	77739736	77739821	77739778	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	28982	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	78364826	78365348	78365071	Y	DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	2718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	78667581	78667654	78667595	Y	NA	CRABP1	CRABP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CRABP1	36915	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	80258107	80258932	80258427	Y	MTHFS,MTHFS,ST20,ST20-MTHFS,ST20,ZFAND6,BCL2A1	C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	ST20	44063	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	80697752	80697924	80697805	Y	ARNT2	ARNT2	NA	NA	NA	NA	ARNT2	3060	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	80931217	80931542	80931410	Y	MESDC1	NA	FAM108C1,ARNT2,KIAA1199	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1199	138142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	81099060	81099288	81099113	Y	NA	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	29376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	81248296	81248446	81248370	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	31773	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	83815089	83815145	83815117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	59625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	83817881	83818018	83817954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	56752	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	83869308	83869629	83869461	Y	SH3GL3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	5141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	84040858	84041607	84041233	Y	NA	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	HDGFRP3	166088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	85131508	85131753	85131631	Y	PDE8A	ZSCAN2,EGLN1P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN2	10464	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	85725231	85725336	85725284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS7P4	146229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	85874454	85874742	85874552	Y	NA	ADAMTS7P4,AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS7P4	2889	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	85890027	85890200	85890120	Y	AKAP13	ADAMTS7P4,AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS7P4	18462	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	86247990	86248195	86248102	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	88066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	86267591	86267810	86267701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68451	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	86267980	86268030	86268003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68231	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	89014009	89014390	89014200	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	5325	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	89672226	89672631	89672291	Y	ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	5095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	90017364	90017928	90017702	Y	MESP1,C15orf42	RHCG	NA	NA	NA	NA	RHCG	19916	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90241907	90242276	90242092	Y	NA	KIF7,PEX11A,WDR93	NA	NA	NA	NA	WDR93	9879	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90456787	90457058	90456927	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	C15orf38	2599	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90547918	90548344	90548145	Y	NA	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	5294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90571687	90571922	90571811	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	29063	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	90577561	90577868	90577654	Y	AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	34937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90708840	90709227	90709106	Y	NA	SEMA4B	CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	7004	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1,TTLL13	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90938187	90938493	90938325	Y	NA	ZNF774,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	8737	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90957340	90957730	90957416	Y	FES,ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27890	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	91114363	91114916	91114453	Y	UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,IQGAP1	CRTC3	NA	NA	NA	NA	CRTC3	43206	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	92481402	92481730	92481524	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	86477	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	87773	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	93592081	93592145	93592113	Y	NA	RGMA	NA	NA	NA	NA	RGMA	38288	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	93864881	93865242	93865107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	234448	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	94850045	94850297	94850155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	77278	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	95387780	95387932	95387839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	615013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	95830783	95831278	95830942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	1035889	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	96630507	96630843	96630653	Y	NA	NA	LOC400456,LOC145820,NR2F2	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	236324	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	96898438	96898666	96898552	Y	NA	NR2F2,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	2972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	5042	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	98047383	98047776	98047510	Y	ARRDC4	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	413008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	99259262	99259477	99259337	Y	SYNM	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	69062	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	99298945	99299364	99299005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	108745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	99366453	99366700	99366460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	176253	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	99387029	99387216	99387183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	196829	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	99387614	99387887	99387660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	197414	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	218411	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	99559007	99559192	99559062	Y	NA	NA	PGPEP1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYNM	77228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr15	99561438	99561561	99561500	Y	NA	NA	PGPEP1L,IGF1R	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SYNM	74859	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	99661093	99661479	99661184	Y	NA	SYNM	NA	NA	NA	NA	SYNM	24673	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	99975346	99975780	99975666	Y	NA	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	39590	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	100651295	100651582	100651483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS17	228628	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	101102236	101102405	101102321	Y	NA	ASB7,LINS	NA	NA	NA	NA	ASB7	38334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	101481026	101481320	101481182	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	23606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr15	101723592	101723961	101723926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY1	66176	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr15	102213485	102213850	102213667	Y	NA	TM2D3,TARSL2	NA	NA	NA	NA	TM2D3	22891	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	369599	369830	369715	Y	NA	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	30843	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	39163	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr16	643606	643989	643708	Y	SSTR5,RAB40C,RAB40C	PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	6249	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	802051	802260	802100	Y	NA	FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,NARFL,MSLN,CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	MSLN	6502	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	891857	892147	892002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPUSD1	55460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	11551	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr16	1133120	1133226	1133175	Y	RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	12364	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	1150049	1150415	1150232	Y	NA	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	29293	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	1344323	1344595	1344461	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UNKL	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	8953	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,NOXO1,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,NOXO1,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	2065446	2065768	2065545	Y	NA	TBL3,NOXO1,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	RAB26	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC9A3R2	7589	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr16	2657653	2657823	2657765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVK13-1	63622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS22	20027	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	3796349	3796366	3796358	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	30751	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	4010667	4011135	4010934	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	81940	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	4063476	4063638	4063556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	100548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr16	4343991	4344084	4344046	Y	NA	TFAP4	CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1,TFAP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	22915	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr16	4678373	4678564	4678416	Y	CORO7,UBN1,UBN1,GLYR1,MGRN1	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	13879	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr16	5666199	5666502	5666317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	520390	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	8015278	8015380	8015329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	698160	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	8852303	8852368	8852337	Y	NA	PMM2,TMEM186	PMM2,TMEM186	IMR90	Hi-C	24141950	PMM2	28312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	9221431	9221974	9221622	Y	USP7,C16orf72	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	37926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	9237080	9237205	9237143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	53575	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	9325793	9326174	9325910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	142288	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	10563450	10564010	10563797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	108545	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	10672211	10672611	10672411	Y	ATF7IP2,EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	10847001	10847390	10847044	Y	CIITA,NUBP1	NUBP1	NA	NA	NA	NA	NUBP1	11358	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	11397402	11397565	11397484	Y	NA	SOCS1	CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4,SOCS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS1	49366	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	11633611	11633797	11633714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	94440	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	12623440	12623621	12623531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	272253	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	14599774	14599935	14599866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	124650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr16	17366939	17367350	17367135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	195388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	17542654	17543047	17542953	Y	XYLT1	XYLT1	NA	NA	NA	NA	XYLT1	19691	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	19106464	19106699	19106563	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	16555	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	19710173	19710469	19710241	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	15309	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	20030794	20030847	20030821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	135305	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1,CRYM	NA	NA	NA	NA	CRYM	634	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	21656930	21657029	21656972	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	NA	NA	NA	NA	NA	METTL9	50391	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	22201170	22202123	22201439	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13480	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	22421466	22421891	22421890	Y	NA	CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	CDR2	24595	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	22767811	22767852	22767832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRN3P3	320775	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	23377055	23377415	23377279	Y	SCNN1B	NA	NA	NA	NA	NA	COG7	85086	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	23473263	23473545	23473445	Y	SCNN1G,GGA2	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	10762	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	23831613	23831716	23831661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERN2	108792	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	25025498	25025977	25025718	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	27265638	27265791	27265719	Y	KIAA0556,IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	12324	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	27334573	27334825	27334616	Y	NA	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	11584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	27532420	27532769	27532492	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	26465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	27542863	27543251	27543051	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	15983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	28160349	28160575	28160437	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	60666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	28179891	28180117	28180009	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	41124	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	29126776	29127012	29126904	Y	SPNS1	RRN3P2	NA	NA	NA	NA	RRN3P2	42613	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	29168403	29168702	29168538	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	RRN3P2	84240	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	30458943	30459145	30459094	Y	SEPHS2	ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SEPHS2	3441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.49030206583232
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	31955307	31955602	31955455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	72228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	33948799	33949141	33948910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2065720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	33971109	33971442	33971126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2088030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	33974683	33974853	33974768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2091604	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	35029860	35030042	35030005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3146781	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	46671518	46671564	46671541	Y	NA	SHCBP1,VPS35,ORC6	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	17980	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	47072084	47072446	47072376	Y	DNAJA2	NA	ABCC11,DNAJA2,NETO2,ITFG1,PHKB,ABCC12	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJA2	66385	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	47176557	47176930	47176742	Y	NETO2	NETO2	NA	NA	NA	NA	NETO2	649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	47348245	47348526	47348436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHKB	144508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	49053950	49054007	49053977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	401891	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	49317625	49318405	49317904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	665566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	51179674	51179928	51179801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYLD	405713	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	52489873	52490156	52490047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOX3	89558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	52564240	52564587	52564414	Y	TOX3	TOX3	NA	NA	NA	NA	TOX3	15127	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	53075249	53075847	53075790	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	11098	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr16	53077641	53077824	53077723	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	9121	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr16	53517834	53518098	53518006	Y	NA	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	18225	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	53552731	53552904	53552850	Y	LOC643802,RBL2,AKTIP	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	16408	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	53915459	53915524	53915492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	179584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	56890645	56890781	56890713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD1	73179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	56985400	56985562	56985481	Y	NA	HERPUD1,NLRC5	CETP	IMR90	Hi-C	24141950	HERPUD1	21440	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	57488914	57489209	57489062	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	POLR2C	5090	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC135	70312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr16	57670999	57671200	57671100	Y	GPR56,PLLP,CX3CL1,CCL17,GPR56	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC135	55505	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	58061325	58061443	58061395	Y	NA	MMP15	NA	NA	NA	NA	MMP15	3855	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	60706684	60707081	60706883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	1940423	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	62889367	62889697	62889532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	3550730	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	63275323	63275660	63275492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	3164767	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr16	63294066	63294457	63294335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	3145970	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr16	63403336	63403421	63403379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	3037006	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	65047832	65047877	65047854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	1392550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	CA7,NAE1,PDP2,CDH16	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr16	66988106	66988414	66988274	Y	NA	CDH16,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	CES3	4726	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr16	67435763	67435871	67435819	Y	NA	ZDHHC1	NA	NA	NA	NA	ZDHHC1	12865	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	67689330	67689673	67689514	Y	NA	RLTPR,ACD,PARD6A	NA	NA	NA	NA	ACD	3040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	68234152	68234458	68234209	Y	NA	ESRP2,PLA2G15	NA	NA	NA	NA	ESRP2	35547	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.93690160675847
chr16	68281428	68281510	68281462	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	4221	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	68418958	68419037	68419019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	57526	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	NA	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	57964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	68818214	68818347	68818232	Y	CDH1	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	49086	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	68824913	68825217	68824976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH1	55785	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TMED6,TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr16	69761641	69762033	69761837	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	2787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr16	69865358	69865753	69865556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP2	71149	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	70725776	70726100	70725941	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	7807	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	70779915	70780216	70780046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52848	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr16	70909910	70910012	70909961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	76846	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	71734305	71734386	71734346	Y	PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	22218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	71828659	71828769	71828714	Y	NA	AP1G1,ATXN1L,IST1	NA	NA	NA	NA	AP1G1	12335	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	72751239	72751276	72751266	Y	NA	NA	HP,HPR	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	340321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	73096616	73096908	73096789	Y	NA	ZFHX3	ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	5019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr16	73185769	73185903	73185836	Y	NA	NA	ZFHX3,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	94172	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr16	78199099	78199491	78199298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	67789	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	81309341	81309748	81309489	Y	NA	BCMO1,GAN	GAN	IMR90	Hi-C	24141950	GAN	36809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	81979414	81979574	81979494	Y	CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B2	87035	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr16	84523883	84523965	84523925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C2	123750	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	84704578	84704887	84704734	Y	NA	KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	24447	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr16	85450092	85450367	85450166	Y	NA	NA	LOC727710,GINS2,KIAA0182,FAM92B,LOC400548,C16orf74	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	271312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr16	85456219	85456617	85456516	Y	FAM92B	NA	KIAA0182,LOC400548,LOC727710,C16orf74	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	265062	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	85471045	85471389	85471119	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250290	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	85548685	85548970	85548791	Y	NA	NA	KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	172709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	85569070	85569366	85569223	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	152313	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	85933693	85934060	85933697	Y	COX4I1,IRF8	IRF8	NA	NA	NA	NA	IRF8	3284	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	86017264	86017415	86017335	Y	IRF8	NA	COX4NB,COX4I1,MTHFSD,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	86855	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	FOXC2	10642	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	86619952	86620235	86620073	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	FOXC2	21095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	99272	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr16	86878430	86878569	86878503	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FOXC2,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	279573	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	86962886	86963146	86962899	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	364029	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	87774219	87774566	87774531	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23032	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	87810498	87810587	87810524	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	12900	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	87843209	87843416	87843290	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	45611	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	189449	189776	189505	Y	NA	RPH3AL	NA	NA	NA	NA	RPH3AL	44269	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	234794	234851	234823	Y	DOC2B	RPH3AL,C17orf97	RPH3AL,DOC2B	IMR90	Hi-C	24141950	RPH3AL	749	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	576455	576740	576580	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	17668	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	594616	594984	594846	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	27973	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	654300	654699	654470	Y	NA	VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	DBIL5P	400	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	1157102	1157245	1157179	Y	NA	ABR	ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	26787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	1267059	1267122	1267091	Y	NA	YWHAE	NA	NA	NA	NA	YWHAE	34550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr17	1864830	1864896	1864863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	61743	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr17	2163031	2163247	2163098	Y	SMYD4,MNT,METTL16,SMG6,SMG6	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	41430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	2299235	2299531	2299372	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2881	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	2307798	2307958	2307865	Y	PAFAH1B1	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5386	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	2439333	2439522	2439421	Y	NA	METTL16	PAFAH1B1,METTL16,LOC284009	IMR90	Hi-C	24141950	METTL16	26148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	2610688	2611037	2610862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	116184	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	2614073	2614260	2614119	Y	KIAA0664	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	119569	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	301456	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	2863545	2863659	2863602	Y	OR3A2,OR1G1	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	369041	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	3453416	3453706	3453615	Y	OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3	TRPV3	NA	NA	NA	NA	TRPV3	5583	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	4297689	4298014	4297723	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	4430442	4430571	4430507	Y	ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,C17orf107,ARRB2	SPNS2,MYBBP1A	NA	NA	NA	NA	MYBBP1A	26355	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	4614568	4615368	4615020	Y	MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16	NA	NA	NA	NA	ARRB2	2784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	GLTPD2,PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.76700229536924
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	6655808	6656203	6655969	Y	RNASEK,GABARAP,XAF1	NA	XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX12P2	98977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	6821400	6821836	6821600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	66220	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67587	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	C17orf49	9338	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	6997840	6997978	6997873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A13	60446	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	7119118	7119286	7119174	Y	WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	674	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	7233457	7233867	7233744	Y	WRAP53,POLR2A,DNAH2,DLG4,EIF5A	YBX2,EIF5A,GPS2,NEURL4,KCTD11,TNK1	NA	NA	NA	NA	NEURL4	2745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.49030206583232
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.04370252490617
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	5.67235470550695
chr17	7784207	7784538	7784352	Y	POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	CHD3	1586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	8268468	8268891	8268818	Y	SPDYE4,MFSD6L,CCDC42,CNTROB,ODF4	RPL26,NDEL1	NA	NA	NA	NA	RPL26	15640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	8649167	8649702	8649446	Y	ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	117088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	10702124	10702347	10702289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-963H4.2	54264	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	12523090	12523187	12523139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP44	167669	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	13241219	13241377	13241298	Y	NA	NA	HS3ST3B1	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST3A1	261867	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	14044844	14045160	14045003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX10	74031	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	15061931	15062018	15061975	Y	NA	NA	HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	PMP22	104625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	15860629	15861165	15860792	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	14398	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	15862469	15862773	15862614	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	16238	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	16035892	16036125	16036009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGL	82380	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	16487545	16487788	16487743	Y	NA	ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	17025	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	16924574	16924970	16924629	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	18889	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	17163211	17163219	17163215	Y	NA	FLCN,COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	COPS3	19388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	LRRC48	629	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	18865012	18865259	18865128	Y	NA	FAM83G	NA	NA	NA	NA	FAM83G	40858	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	19147768	19147949	19147793	Y	PRPSAP2,RNF112	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK7	131085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	19664052	19664492	19664204	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	13796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	19760986	19761170	19761020	Y	NA	ULK2	NA	NA	NA	NA	ULK2	8079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	21515861	21516199	21516031	Y	NA	C17orf51	CCDC144NL	K562	ChIA-PET	22265404	C17orf51	40139	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	25566194	25566546	25566273	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	52556	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	25672386	25672687	25672621	Y	NA	NA	KSR1,MIR4522,WSB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	53284	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.07525172152693
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.73545309874848
chr17	25823612	25823763	25823676	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	41942	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	26135195	26135302	26135249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGALS9	180371	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	26578773	26579067	26578920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65054	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	26894495	26894823	26894797	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,SGK494	NA	NA	NA	NA	PIGS	2067	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	28050852	28051063	28050953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	102927	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	28070496	28070746	28070685	Y	SSH2,EFCAB5	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	122571	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	28210608	28210734	28210655	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	44560	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	30170148	30170249	30170215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP6	56535	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	30335785	30336145	30335965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUZ12	73748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	30886393	30886627	30886490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	74756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	31150044	31150344	31150182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	51851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	32049616	32049940	32049779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM98	796688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	32579001	32579427	32579231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	707122	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	32579434	32580053	32579676	Y	CCL8,CCL7	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	706496	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	33407531	33407770	33407731	Y	NA	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	6568	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr17	34838937	34839070	34839023	Y	NA	ZNHIT3,PIGW	NA	NA	NA	NA	ZNHIT3	1403	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	35519679	35519723	35519693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215504	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	36068867	36069181	36068997	Y	ACACA,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	34025	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	36073088	36073441	36073335	Y	ACACA,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	29765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	36101828	36102076	36101951	Y	DDX52,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	1130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	36102823	36103051	36102995	Y	ACACA,DDX52,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	155	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr17	36103612	36103841	36103732	Y	HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	HNF1B	375	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	36947324	36947688	36947677	Y	NA	PCGF2,PSMB3,PIP4K2B,CWC25,MIR4727	NA	NA	NA	NA	PIP4K2B	6691	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	36996415	36996671	36996600	Y	SOCS7,FBXO47,C17orf98	PIP4K2B,CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	SNORA21	10576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	38084566	38084955	38084762	Y	NA	ORMDL3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	2712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	38085522	38085789	38085697	Y	ERBB2,IKZF3,ORMDL3	ORMDL3,PSMD3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	3668	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	38227405	38227627	38227516	Y	GSDMB	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	11937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr17	38229285	38229466	38229392	Y	GSDMB	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	13817	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	38464298	38464708	38464402	Y	MSL1,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	854	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	38502716	38503032	38502793	Y	NA	RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	39272	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	38630978	38631299	38631288	Y	NA	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	24550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	38703564	38704159	38703879	Y	SMARCE1,MED24,CASC3,TOP2A,CCR7	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	47715	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT15	23430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	39735892	39736012	39735959	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14	KRT16	NA	NA	NA	NA	KRT16	34139	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF1	34994	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	32315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	40155760	40155995	40155877	Y	STAT5A	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	5405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	40201052	40201290	40201078	Y	CNP	NKIRAS2,DNAJC7	HSPB9,KAT2A	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC7	29658	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	41017672	41017950	41017805	Y	NA	PSME3,BECN1,AOC2	NA	NA	NA	NA	AOC2	23055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	42061095	42061375	42061233	Y	NA	NAGS,TMEM101	NA	NA	NA	NA	NAGS	18539	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.87380321351694
chr17	42357085	42357361	42357237	Y	TMUB2,TMUB2,GPATCH8,GRN	SLC25A39	SLC4A1,RUNDC3A,UBTF,SLC25A39	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A39	42877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	43200086	43200194	43200154	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	7773	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	43201428	43201633	43201517	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	6334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	43370974	43371161	43371063	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	MAP3K14	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	21253	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	44234299	44234706	44234578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	264551	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	44342171	44342447	44342244	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAPT	372423	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr17	44993343	44993471	44993395	Y	NA	GOSR2	GOSR2	IMR90	Hi-C	24141950	GOSR2	5012	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1,TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	37143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	45778272	45778788	45778511	Y	SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21	TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	29822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	46043736	46043949	46043771	Y	PRR15L	AC003665.1,PNPO,PRR15L,CDK5RAP3	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP3	560	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	46091429	46091644	46091522	Y	NA	CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	SP2,PNPO,CDK5RAP3,PRR15L	IMR90	Hi-C	24141950	COPZ2	21748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	46205987	46206223	46206201	Y	TBX21,OSBPL7,MRPL10,SKAP1	CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	SNX11	27268	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB-AS3	17282	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	46644443	46644754	46644601	Y	HOXB9,HOXB8,HOXB6	HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB-AS3	19451	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB6	17123	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	46696942	46697254	46696999	Y	NA	HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	4585	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr17	46708678	46709096	46708978	Y	NA	HOXB6,HOXB8,HOXB9,RP11-357H14.17	HOXB8,HOXB9	IMR90	Hi-C	24141950	HOXB7	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALNT2	62380	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	47337469	47337918	47337568	Y	CALCOCO2,UBE2Z	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1079K10.3	98609	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	RP11-1079K10.3,ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	48066634	48067004	48066930	Y	NA	DLX4,DLX3	NA	NA	NA	NA	DLX3	3584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	48981540	48981884	48981711	Y	RSAD1	TOB1,RP11-700H6.1	TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-700H6.1	38190	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	22709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	51041886	51041892	51041889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P48	791339	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	51059537	51059872	51059705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P48	773359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	54669912	54670125	54669969	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	852	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	54833294	54833574	54833432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKE	75886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	54987224	54987877	54987630	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	1522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	54994598	54994773	54994687	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	5199	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	55101345	55101678	55101512	Y	NA	SCPEP1,RNF126P1	NA	NA	NA	NA	RNF126P1	19161	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	55501996	55502706	55502262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	170784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	55504815	55504992	55504904	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	173603	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	55523126	55523573	55523446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	191914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	55540558	55540950	55540705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	209346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	55763716	55764071	55763861	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	161346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	55978714	55978990	55978831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	51694	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	56015325	56015755	56015655	Y	CUEDC1	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	14929	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	56426877	56426962	56426920	Y	MTMR4,SUPT4H1	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	1492	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57515522	57515883	57515602	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YPEL2	108472	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57847286	57847866	57847541	Y	YPEL2,RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	64299	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	57881973	57882438	57882250	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	34189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr17	57925185	57925429	57925290	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	8558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	58228293	58228479	58228403	Y	CA4	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR6	74001	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	59232853	59233252	59232919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	242005	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	59488217	59488528	59488332	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	12960	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	59491856	59491969	59491928	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	16599	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	60250221	60250413	60250340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	109578	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	60973132	60973339	60973182	Y	TLK2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	381004	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	60976587	60977006	60976678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	384459	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	61431510	61431613	61431567	Y	STRADA,ACE	NA	MIR548W,MARCH10,DCAF7,TACO1,MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	90126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	61779769	61779866	61779823	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	3237	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	62154723	62155082	62154942	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	NA	NA	NA	NA	NA	ERN1	51097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	62169387	62169789	62169751	Y	MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	ICAM2,C17orf72	IMR90	Hi-C	24141950	ERN1	36390	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	62491373	62491767	62491605	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	219	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	62958497	62958860	62958615	Y	NA	LRRC37A3,AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	10834	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	63044063	63044405	63044261	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	6552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr17	63654769	63655153	63655091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	99004	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	63759124	63759374	63759249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	203359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	63981969	63982296	63982133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	203906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	64128284	64128318	64128301	Y	CEP112,CEP112	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	57884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	64518890	64518971	64518949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	222136	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	64708077	64708220	64708107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	250806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	64708425	64708706	64708566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	250320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	64714382	64714708	64714545	Y	PRKCA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	244318	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	64963064	64963179	64963122	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	4038	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	65823373	65823579	65823476	Y	SLC16A6,PITPNC1,BPTF	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	3733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	66301406	66301537	66301464	Y	BPTF,SLC16A6	ARSG	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	ARSG	48083	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	66306496	66306595	66306536	Y	BPTF,PRKAR1A,SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	ARSG	53173	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	66452097	66452412	66452224	Y	SLC16A6	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	443	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	66680223	66680499	66680398	Y	NA	NA	FAM20A	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAR1A	174302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	66694330	66694724	66694542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	188409	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	67055729	67056007	67055895	Y	ABCA6,ABCA9	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	265378	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	67089514	67089753	67089674	Y	ABCA6	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	231632	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	67753778	67754160	67754025	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	344939	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	68191235	68191546	68191422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K6	782396	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	68309642	68309948	68309717	Y	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K6	900803	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	69437254	69437446	69437407	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467,SLC39A11	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	177673	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	69493983	69494025	69494004	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	121094	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	70122851	70122907	70122879	Y	NA	SOX9	NA	NA	NA	NA	SOX9	7690	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	70374697	70374707	70374702	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9-AS1	158720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	70412502	70412837	70412669	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	196525	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	70416079	70416357	70416132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	200102	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	201238	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	70462396	70462597	70462589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	158773	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	70511880	70512176	70511979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	109194	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	70512872	70513243	70513164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	108127	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	70514986	70515384	70515137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	105986	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	70628447	70628581	70628499	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	6030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	70664433	70664574	70664507	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	29822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	70680022	70680249	70680147	Y	NA	LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	45411	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	71768	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	77797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	71152430	71152655	71152530	Y	C17orf80,SSTR2	COG1	NA	NA	NA	NA	COG1	34474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	71439964	71440055	71440021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	133650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	71639437	71639585	71639501	Y	SDK2	SDK2	NA	NA	NA	NA	SDK2	1209	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	72564769	72564992	72564860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB37	99725	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	73073656	73074040	73073685	Y	RAB37,RAB37,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	7782	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	21247	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	73546030	73546166	73546084	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26869	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	4.98060413166464
chr17	74134600	74134832	74134764	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	74258854	74259227	74259062	Y	ST6GALNAC1	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	24400	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	74269060	74269291	74269140	Y	RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNK,SPHK1,RNF157,FAM100B	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	34606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	12.866560673467
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	75199050	75199385	75199187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	118252	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	75229995	75230416	75230213	Y	SRSF2,SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	149197	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr17	75338504	75338763	75338659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	257706	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	75865692	75866230	75865998	Y	SOCS3	RNU1-80P	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	47950	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	75872051	75872295	75872261	Y	TMC6,SOCS3	RNU1-80P	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	41885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	75883563	75884329	75884163	Y	TNRC6C,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1	RNU1-80P	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	29851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P,TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	8.43935700087619
chr17	76147929	76148019	76147974	Y	NA	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	14620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	76731686	76732147	76732043	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	44232	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	76992140	76992468	76992317	Y	NA	LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1	NA	NA	NA	NA	CANT1	11481	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	77178893	77179196	77179046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	109872	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.35195195106386
chr17	77778301	77778701	77778443	Y	CBX2,CBX8,CBX4	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4819	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	77815304	77815490	77815418	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	4076	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr17	77815657	77816173	77815945	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	4429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	77816646	77816987	77816930	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	5418	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	77905324	77905507	77905415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX4	94096	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	77965696	77966573	77966281	Y	CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	41074	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	77970749	77971301	77971166	Y	CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	36346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	77979653	77979899	77979776	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	27748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.62865218060078
chr17	78744627	78744900	78744734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	218498	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	78962835	78962976	78962910	Y	NA	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	CHMP6	422	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15311	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	66316	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	79779684	79779899	79779792	Y	NA	FAM195B,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	9279	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80029941	80030069	80030002	Y	HEXDC	STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	DUS1L	8178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr17	80066063	80066430	80066275	Y	GCGR,DCXR	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	11855	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr17	80214734	80215057	80214944	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80796209	80796714	80796435	Y	METRNL,ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	88269	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	125269	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	126640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80842917	80843211	80843101	Y	C17orf62,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	134977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	80845276	80845458	80845382	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	137336	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	81038687	81040054	81039707	Y	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	3120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr17	81049749	81049909	81049815	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	14182	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.49030206583232
chr18	159482	159743	159659	Y	CETN1	USP14	NA	NA	NA	NA	USP14	3099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.2136018362954
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.79855149199001
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	1503663	1503683	1503673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP72	181577	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	2031840	2031857	2031849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	537651	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	2548368	2548472	2548420	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	21036	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	2549022	2549121	2549072	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	20387	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	2656589	2657177	2656999	Y	NA	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	2852	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	2978254	2978441	2978377	Y	NA	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	32872	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	2979905	2979994	2979950	Y	SMCHD1	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	31319	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	3015219	3015501	3015351	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2	LPIN2	LPIN2	K562	ChIA-PET	22265404	LPIN2	3906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr18	3333671	3334067	3333870	Y	NA	NA	DLGAP1,TGIF1,MYL12B,FLJ35776	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYL12B	73764	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	3446696	3446930	3446873	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	TGIF1	NA	NA	NA	NA	TGIF1	37090	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	3582686	3583234	3582964	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	173080	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	3625326	3625427	3625380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr18	3704951	3705065	3705044	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	295345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	4328751	4329143	4328947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	919145	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	5462292	5462507	5462408	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	950729	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	5538641	5539019	5538830	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	874217	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	6624543	6624930	6624551	Y	NA	NA	LOC100130480,ARHGAP28	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P27	163529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	6752571	6752962	6752632	Y	NA	NA	ARHGAP28	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P27	291557	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	7802923	7802988	7802937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	238143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	7950764	7950916	7950843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	385984	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	8140065	8140370	8140233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	467073	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	8730480	8730718	8730581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	123037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	9008810	9009212	9009095	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	91416	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	9771238	9771530	9771341	Y	VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	RAB31	65076	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	10475783	10476043	10475911	Y	NA	APCDD1,NAPG	NA	NA	NA	NA	APCDD1	23158	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	10726542	10726663	10726595	Y	NAPG	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	202640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr18	12076743	12076871	12076848	Y	NA	NA	GNAL	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	97719	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	12408700	12408821	12408736	Y	NA	AFG3L2,SLMO1	SPIRE1	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO1	2805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	12641281	12641332	12641311	Y	SPIRE1,SPIRE1,PSMG2	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	14710	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	13137958	13138425	13138153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	148597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	13579922	13580384	13580029	Y	RNMT,C18orf19,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	144275	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	13890423	13890585	13890504	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	165761	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	14111961	14112330	14112146	Y	NA	ZNF519	NA	NA	NA	NA	ZNF519	18159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	18513293	18513512	18513419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	176300	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	19457629	19457900	19457765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	174711	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	26808	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	20046739	20046926	20046743	Y	GATA6	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	299335	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr18	20072671	20072686	20072680	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	303538	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	20272481	20272650	20272518	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	103574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	20402088	20402300	20402139	Y	NA	RBBP8	RBBP8,CABLES1,RIOK3,GATA6,TMEM241	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	25864	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	20406610	20407011	20406855	Y	NA	RBBP8	RBBP8,CABLES1,RIOK3,GATA6,TMEM241	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	30386	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	20835223	20835287	20835255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	122695	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	21463540	21463749	21463607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	106988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	22428902	22429245	22429074	Y	NA	NA	ZNF521	IMR90	Hi-C	24141950	IMPACT	424322	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	22730586	22730811	22730699	Y	ZNF521	NA	NA	NA	NA	NA	IMPACT	726006	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	22864731	22865080	22865053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	804101	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	23118847	23119081	23118964	Y	NA	NA	ZNF521	IMR90	Hi-C	24141950	SS18	550100	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	23836366	23836416	23836389	Y	TAF4B	TAF4B	NA	NA	NA	NA	TAF4B	32466	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	29232383	29232901	29232639	Y	NA	B4GALT6	NA	NA	NA	NA	B4GALT6	30898	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	29441885	29441939	29441912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	89160	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	30031695	30031949	30031822	Y	FAM59A	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	361877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	31229161	31229406	31229348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	1325486	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	32106446	32106756	32106602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	448136	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	32436094	32436130	32436112	Y	DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	118762	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	32527945	32528002	32527974	Y	DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,ZNF397,MAPRE2	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	26890	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr18	32558962	32559433	32559316	Y	ZNF397,ZNF396,ZNF24,MAPRE2,MAPRE2	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	4070	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	32674767	32675124	32674837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	119875	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	4.70390390212772
chr18	32990022	32990156	32990089	Y	NA	ZNF396	GALNT1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF396	34721	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr18	33577061	33577192	33577127	Y	NA	C18orf21	NA	NA	NA	NA	C18orf21	27015	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	33711406	33711801	33711526	Y	NA	SLC39A6,ELP2	NA	NA	NA	NA	ELP2	3999	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	34048220	34048446	34048313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOCOS	282738	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	38509245	38509380	38509313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1023791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	40900367	40900665	40900516	Y	SYT4	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1367196	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	43210324	43210708	43210352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	334532	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	44394118	44394485	44394384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	100970	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	47216686	47217049	47216797	Y	NA	NA	MYO5B	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	121281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	48301659	48301815	48301762	Y	NA	MRO	NA	NA	NA	NA	MRO	47957	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	54057400	54057408	54057404	Y	NA	NA	TCF4,LOC100505474	IMR90	Hi-C	24141950	WDR7	259166	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	54171191	54171431	54171311	Y	NA	NA	TCF4	IMR90	Hi-C	24141950	WDR7	145143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	55104670	55104954	55104730	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	3753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	55255652	55255824	55255739	Y	FECH	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	3648	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr18	56633214	56633485	56633410	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	105382	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	61549883	61550442	61550030	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	NA	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	HMSD	64093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	68002975	68003345	68003133	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	48838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr18	68044126	68044452	68044254	Y	NA	NA	RTTN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	89989	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	68330552	68330663	68330607	Y	RTTN	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	376415	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	71950185	71950349	71950304	Y	NA	CYB5A	NA	NA	NA	NA	CYB5A	6902	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	72919537	72919929	72919697	Y	ZADH2	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	73233894	73234003	73233962	Y	C18orf62	NA	ZNF407	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ1	313184	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	73628376	73628483	73628456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	576663	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	74199867	74199923	74199879	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	5223	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr18	74735151	74735398	74735253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	202588	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	74745176	74745688	74745337	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	212613	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	74774000	74774964	74774473	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	241437	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	74780891	74781094	74780990	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	248328	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr18	74921028	74921148	74921053	Y	MBP	NA	MBP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF236	388465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	616514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	75529879	75530144	75530012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	997316	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	76403093	76403331	76403224	Y	ATP9B	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	423954	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	76884362	76884757	76884560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	57077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr18	77558494	77558673	77558529	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	120693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	659616	659868	659792	Y	NA	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	1409	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	719892	720284	720092	Y	C2CD4C,SHC2,HCN2,FGF22,PALM	FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	PALM	12939	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	ELANE,CFD,MED16,R3HDM4,KISS1R	NA	NA	NA	NA	CFD	9552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	908605	908810	908775	Y	NA	MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	2430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	909116	909504	909461	Y	STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22	MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	1736	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	1126082	1126504	1126271	Y	MIDN,SBNO2,SBNO2	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	GPX4	24146	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	1171027	1171165	1171096	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1117	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	1207906	1208235	1208159	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	STK11	20500	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr19	1400453	1400832	1400746	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	GAMT	884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	1747200	1747550	1747426	Y	PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3	ONECUT3	TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ONECUT3	2822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	1755338	1755626	1755509	Y	NA	ONECUT3	NA	NA	NA	NA	ONECUT3	4966	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	1763363	1763749	1763439	Y	NA	ONECUT3	NA	NA	NA	NA	ONECUT3	12991	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.35195195106386
chr19	1856794	1856864	1856840	Y	NA	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4703	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	2266489	2266732	2266611	Y	NA	SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1	NA	NA	NA	NA	OAZ1	753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr19	2332363	2332647	2332580	Y	REXO1,CSNK1G2,MKNK2,GNG7,SPPL2B	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	5744	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	2489253	2489454	2489354	Y	BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	15133	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	3222791	3223093	3222942	Y	NA	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	39230	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	3398670	3398894	3398830	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	41109	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	3607748	3607951	3607883	Y	NA	HMG20B,MFSD12	NA	NA	NA	NA	MFSD12	35460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	4051584	4052099	4051914	Y	CCDC94	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	12844	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	4568924	4569300	4569153	Y	TICAM1,KDM4B,SEMA6B	PLIN5,LRG1	NA	NA	NA	NA	LRG1	30438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	4936813	4936840	4936828	Y	NA	UHRF1,KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	30285	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	5147751	5147768	5147760	Y	PTPRS	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	127977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	5624052	5624252	5624226	Y	VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB	SAFB,SAFB2,RPL36	NA	NA	NA	NA	SAFB2	1995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	6066698	6067208	6066827	Y	SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	90545	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	6092440	6092966	6092758	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	104617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	6556475	6556744	6556665	Y	RFX2,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	27465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	24158	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	6587274	6587651	6587637	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	14463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	6588124	6588275	6588192	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	13839	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	6588388	6589226	6588715	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	12888	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	6593602	6593939	6593861	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	8175	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	6738802	6739114	6738954	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	TRIP10	2866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	7196747	7197124	7196928	Y	KIAA1543,INSR	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94921	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	7456079	7456435	7456169	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1564	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	7547905	7548376	7548024	Y	STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	C19orf45	7486	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	7559450	7559827	7559455	Y	NA	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	7665007	7665263	7665135	Y	INSR,PNPLA6,FLJ22184,KIAA1543	CAMSAP3,XAB2,STXBP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP3	6219	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	8075966	8076193	8076120	Y	NA	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	7423	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	8638437	8638868	8638608	Y	RAB11B,PRAM1,MYO1F	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF414	61389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	9747838	9748099	9747855	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	17763	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	9757386	9757713	9757550	Y	NA	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	26063	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	9758216	9758505	9758322	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	25271	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	9777343	9777681	9777659	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	10148101	10148280	10148177	Y	NA	COL5A3,C3P1,C19orf66	NA	NA	NA	NA	C3P1	1622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	10215397	10215725	10215533	Y	TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,FBXL12,ICAM3,C19orf66,PPAN	C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,EIF3G	NA	NA	NA	NA	PPAN	432	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	10865897	10866291	10865968	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	39142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	10988040	10988081	10988060	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	7851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	10992105	10992492	10992295	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	11916	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	11484314	11484469	11484411	Y	ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3	NA	NA	NA	NA	SWSAP1	953	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	11691804	11692141	11691953	Y	CCDC159,ACP5,ACP5	ELOF1,ZNF627	NA	NA	NA	NA	ZNF627	23615	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	12844296	12844608	12844453	Y	NA	FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1	NA	NA	NA	NA	C19orf43	707	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.07525172152693
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	12929124	12929310	12929217	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	MAST1	13455	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	12947043	12947383	12947213	Y	MAST1	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,HOOK2,DNASE2	NA	NA	NA	NA	MAST1	4278	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	13153458	13153528	13153499	Y	NA	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	49036	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	13743837	13744244	13743993	Y	NA	NA	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC130	96330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	IL27RA,EEF1DP1,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14189294	14189532	14189398	Y	CCDC130,ZSWIM4,NANOS3,DCAF15,RFX1,PKN1,DNAJB1,CD97	IL27RA,EEF1DP1,SAMD1,PRKACA	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	10140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14276845	14277176	14277145	Y	NA	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	31077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14474119	14474280	14474154	Y	ZNF333,RFX1,PKN1,CD97	CD97	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	15033	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14528800	14529217	14529142	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	DDX39A	608	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14570486	14570855	14570729	Y	OR7C2,ZNF333,IL27RA,DDX39A,PKN1	DDX39A,PKN1,PTGER1,GIPC1	NA	NA	NA	NA	PTGER1	13319	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14665322	14665552	14665478	Y	SLC1A6	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	15322	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	15666666	15666804	15666739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F3	82903	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F2	58811	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	16492713	16493267	16492962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF2	59085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	16560891	16561165	16561157	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	19731	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	16704980	16705245	16705094	Y	KLF2,MED26	SLC35E1,MED26	NA	NA	NA	NA	SLC35E1	23787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	17200078	17200517	17200217	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15487	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	17225282	17225997	17225467	Y	SIN3B,CPAMD8	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	40691	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	17961350	17961505	17961471	Y	FAM129C,FCHO1,FCHO1,IL12RB1,IFI30,ARRDC2,JAK3	RPL18A	PLVAP,FAM125A,TMEM221,BST2,NXNL1,UNC13A,GLT25D1,FAM129C,MAP1S,FCHO1,INSL3,B3GNT3,JAK3,SLC5A5,KCNN1,RPL18A,CCDC124,ARRDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL18A	7180	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A,PDE4C	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	18365499	18365609	18365555	Y	B3GNT3	PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188	NA	NA	NA	NA	PDE4C	1270	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	18401020	18401539	18401437	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,LRRC25,JUND	PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	10133	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	18498524	18498706	18498615	Y	ARRDC2,IFI30,JUND	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	18512599	18512849	18512719	Y	IFI30,UBA52,LRRC25	GDF15,SSBP4,ISYNA1	LRRC25	K562	ChIA-PET	22265404	SSBP4	14825	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	18852715	18852875	18852814	Y	GDF1,GDF15	NA	NA	NA	NA	NA	CRTC1	60228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	20128543	20128860	20128736	Y	NA	ZNF682	NA	NA	NA	NA	ZNF682	19455	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	21497472	21497811	21497647	Y	ZNF430,ZNF429,ZNF100,ZNF708,ZNF493	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	12416	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	21617862	21618096	21617867	Y	NA	ZNF493	NA	NA	NA	NA	ZNF493	39941	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	21976448	21976744	21976704	Y	NA	ZNF100	NA	NA	NA	NA	ZNF100	28018	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	27732067	27732764	27732500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1969684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	28231226	28231711	28231495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1470737	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	28252106	28252716	28252616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449732	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	28252920	28253113	28253061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449335	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	28270762	28271411	28271062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1431037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	28274249	28275061	28274473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1427387	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	29011348	29011742	29011545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	690706	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	29196051	29196136	29196055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	506312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	33064144	33064486	33064290	Y	NA	PDCD5	PDCD5	IMR90	Hi-C	24141950	PDCD5	5488	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	33541924	33542310	33542117	Y	NA	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	11484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	33750621	33750673	33750623	Y	CEBPA	CEBPA	CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA	IMR90	Hi-C	24141950	CEBPA	40797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	34311417	34311691	34311576	Y	KCTD15	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	34752762	34752909	34752837	Y	NA	KIAA0355,RPL29P33	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	9320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	34874880	34875495	34875019	Y	NA	GPI,PDCD2L,UBA2	NA	NA	NA	NA	PDCD2L	17794	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	ZNF792,GRAMD1A,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	35595565	35595951	35595710	Y	ZNF181,ZNF30	FXYD3,LGI4,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	8781	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	35763871	35764402	35764192	Y	FXYD1,FXYD1,HAMP	LSR,USF2	NA	NA	NA	NA	USF2	5990	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	35920564	35920848	35920820	Y	GRAMD1A,FFAR3,U2AF1L4,TYROBP,NFKBID,MLL4,FFAR2	NA	NA	NA	NA	NA	DMKN	81712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	IGFLR1	37792	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	36202440	36202452	36202444	Y	CD22,FFAR1,NFKBID,ZBTB32,U2AF1L4	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55	NA	NA	NA	NA	IGFLR1	28902	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	36373129	36373360	36373222	Y	NA	APLP1,NFKBID	NA	NA	NA	NA	APLP1	16328	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	36519340	36519516	36519376	Y	ZNF565	SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62	NA	NA	NA	NA	ALKBH6	16199	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	37424676	37424848	37424761	Y	ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF420	71911	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	37923813	37923829	37923821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF527	63850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	38491114	38491333	38491222	Y	PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	95246	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	38539760	38540070	38539905	Y	RASGRP4,ZNF571	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	143892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	38575229	38575296	38575264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPINT2	157379	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	38674383	38674545	38674477	Y	ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1	NA	NA	NA	NA	NA	SPINT2	58130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	39415058	39415337	39415248	Y	ZFP36,MAP4K1,HNRNPL,NFKBIB	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2,FBXO17	NA	NA	NA	NA	MRPS12	3851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	39645312	39645609	39645461	Y	LGALS7B	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	30902	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	39891902	39892845	39892340	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	2608	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	40048579	40048977	40048748	Y	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2	EID2B,EID2	DLL3,EID2,EID2B,LGALS16,LGALS17A,CLC,LEUTX,ZNF780A	IMR90	Hi-C	24141950	EID2	19709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	40441958	40442162	40442060	Y	FCGBP	CTC-471F3.4,PSMC4	NA	NA	NA	NA	CTC-471F3.4	5472	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	40543471	40543758	40543711	Y	SPTBN4,ZNF546,ZNF780B	ZNF780B	NA	NA	NA	NA	ZNF780B	16358	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	40696507	40696680	40696594	Y	SERTAD1	MAP3K10	NA	NA	NA	NA	MAP3K10	856	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10	NA	NA	NA	NA	MAP3K10	30176	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	40923099	40923282	40923196	Y	SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	PRX	5826	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	41037324	41037469	41037389	Y	ZNF780B,MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	43288	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	41695552	41695583	41695568	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	1371	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	41834727	41835191	41834967	Y	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	TMEM91	19625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	41849661	41849907	41849784	Y	HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	TMEM91	4909	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	41999420	41999792	41999606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5SL	54798	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr19	42381967	42382342	42382197	Y	CEACAM21,CEACAM4,CEACAM3,POU2F2,DEDD2,CD79A,ARHGEF1	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	2886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	42404902	42404963	42404932	Y	NA	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	19674	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr19	42430880	42431141	42430883	Y	NA	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	30401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	42444277	42444712	42444407	Y	POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16830	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	42444727	42445027	42444981	Y	NA	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16515	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	42571588	42571990	42571604	Y	NA	ZNF574	NA	NA	NA	NA	ZNF574	959	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	42756581	42756634	42756608	Y	ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	14986	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	15495	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	17070	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	ERF	18683	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	19259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	42924318	42924497	42924408	Y	NA	CXCL17	NA	NA	NA	NA	CXCL17	20703	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	42954515	42954747	42954627	Y	CEACAM1,LIPE	CXCL17	CXCL17	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL17	9315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	44185987	44186331	44186267	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	IRGC,SMG9,KCNN4,LYPD5,PLAUR	IMR90	Hi-C	24141950	PLAUR	13288	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr19	44283400	44283793	44283490	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	44284114	44284247	44284152	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	44616064	44616441	44616271	Y	KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284	ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234	NA	NA	NA	NA	ZNF225	1730	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	44821121	44821451	44821434	Y	ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF285,ZNF180,ZFP112,ZNF227	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	13922	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	44824668	44825027	44825022	Y	NA	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	17469	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3,CBLC	NA	NA	NA	NA	CBLC	553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE,APOC1,APOC1P1	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	45663964	45664347	45664315	Y	NA	TRAPPC6A,BLOC1S3	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6A	15148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr19	45953262	45953678	45953446	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	15575	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	46876247	46876539	46876393	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	27996	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	47458912	47459233	47458939	Y	ZC3H4,CCDC9	NA	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM160	90655	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	19511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	35697	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr19	47805638	47805769	47805718	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1	CCDC9,DHX34	PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2	IMR90	Hi-C	24141950	DHX34	44769	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	31401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	47886542	47886975	47886851	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	MEIS3	33805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.07525172152693
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	48657871	48658185	48658028	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	13675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,SYNGR4,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	48974873	48974967	48974920	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	4584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	49524183	49524468	49524237	Y	CGB5	GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	29478	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	49577003	49577438	49577313	Y	SULT2B1,MAMSTR,KCNA7	SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	9238	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	49698080	49698342	49698211	Y	NA	TRPM4	NA	NA	NA	NA	TRPM4	39082	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	49775600	49775657	49775630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKKL1	87383	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	ALDH16A1	29950	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	50205874	50206272	50205974	Y	NA	BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	PRMT1	28831	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	50825197	50825861	50825498	Y	NA	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	NR1H2	5049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.18205263967463
chr19	50993276	50993671	50993522	Y	MYH14,MYBPC2	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	18939	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr19	51003635	51004295	51004006	Y	MYH14,MYBPC2	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	8315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	47334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	51976564	51976794	51976679	Y	KLK14,C19orf75	CEACAM18	NA	NA	NA	NA	CEACAM18	1044	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	52243692	52243874	52243842	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	61489	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	52257401	52257666	52257533	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR1,FPR2,FPR2	FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR1	47697	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	53449736	53449992	53449814	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347,ZNF83	ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	5882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	53635063	53635358	53635174	Y	ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347	ZNF160,ZNF415,ZNF347	NA	NA	NA	NA	ZNF415	733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF347	67075	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	54523388	54523781	54523608	Y	TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA3	80255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	54713468	54714085	54713942	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	10858	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	54885175	54886148	54885583	Y	VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRA6,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1	NA	PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9	K562,HELA	5C	22955621	LENG8	71917	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	54981954	54982383	54982298	Y	NA	LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5	NA	NA	NA	NA	CDC42EP5	28	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr19	55909655	55909755	55909754	Y	PPP1R12C,TMEM150B	TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	7390	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	28507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.07525172152693
chr19	56789143	56789486	56789342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	88266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	56811653	56811926	56811777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	65826	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	57976528	57976751	57976646	Y	NA	ZNF749,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF772	10187	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58218479	58218613	58218485	Y	ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154	ZNF551,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF551	27142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58237757	58238155	58237774	Y	NA	ZNF551,ZNF776,ZNF586	ZNF154	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF776	18009	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58415823	58415990	58415970	Y	NA	ZNF417,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	9988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58501905	58502197	58501915	Y	ZNF8,ZNF132,ZNF773,ZNF549,ZNF550,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZSCAN18,ZNF329,ZNF256,ZSCAN1,ZNF606,ZNF135	ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	CTD-2368P22.1	9232	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58788473	58788748	58788728	Y	NA	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22	NA	NA	NA	NA	ZNF8	155	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58824678	58824957	58824818	Y	ZNF256	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG,ZNF497	NA	NA	NA	NA	ERVK3-1	9963	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	1115244	1115256	1115249	Y	SNTG2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	439805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	1721166	1721471	1721224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	93975	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	1810384	1810763	1810574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	183193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	7171830	7172101	7171947	Y	RNF144A	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	116307	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	8259720	8260124	8259943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	556851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	8597253	8597584	8597383	Y	KIDINS220	NA	LOC100506274,LINC00299,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	219391	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	9142736	9142998	9142867	Y	NA	MBOAT2	NA	NA	NA	NA	MBOAT2	794	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	10177778	10177985	10177865	Y	ADAM17	KLF11,CYS1	NA	NA	NA	NA	KLF11	2991	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	CYS1,RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr2	10261505	10261712	10261609	Y	NA	CYS1,RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	1050	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	64464	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	14951995	14952243	14952237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	181185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	15734291	15734400	15734305	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	DDX1	4989	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	16549594	16549787	16549691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	541531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	16827046	16827326	16827275	Y	FAM49A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	818983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	17005594	17005646	17005620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEN1	927479	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	19547126	19547267	19547173	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	9147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	19813910	19814220	19814076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSR1	257496	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	21149421	21149424	21149423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	128539	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	23524857	23525048	23524982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	81040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89641	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89174	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	25499637	25500641	25499751	Y	DNAJC27	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	62818	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	25517596	25517908	25517752	Y	DNAJC27,DNMT3A	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	45551	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	25701614	25701880	25701747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	138155	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	26258152	26258567	26258448	Y	RAB10	RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	3176	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	26328559	26328812	26328686	Y	FAM59B,RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	73583	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	37818	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	27939397	27939784	27939607	Y	TRIM54	AC074091.13	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC074091.13	2798	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	AC074091.13,MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	21721	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr2	28003613	28003725	28003670	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	11029	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	28496743	28497020	28496828	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	116295	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	28661421	28661637	28661498	Y	NA	FOSL2	FOSL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSL2	48106	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	28939068	28939564	28939261	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	32942	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	29879383	29879747	29879565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPEL5	488060	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	30440662	30440911	30440739	Y	NA	LBH	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	11486	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr2	30448125	30448425	30448217	Y	YPEL5,LBH	LBH	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	3972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	30807812	30808169	30807846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	139720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	37811087	37811457	37811150	Y	NA	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	152154	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	37864248	37864629	37864487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	98982	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	38264530	38264933	38264752	Y	CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	70111	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	38316576	38316959	38316768	Y	CDC42EP3,FAM82A1,CYP1B1	CYP1B1	CYP1B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYP1B1	18085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	38323202	38323810	38323564	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYP1B1	11234	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	38401547	38402107	38401851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	54603	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	38414893	38415136	38415061	Y	NA	RPL7P12	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	41574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	38599092	38599284	38599189	Y	FAM82A1	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	3143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	39079289	39079498	39079407	Y	SRSF7,ARHGEF33	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21577	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	39719153	39719730	39719398	Y	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	56700	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	42193606	42193918	42193678	Y	PKDCC	NA	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	79242	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	42194638	42194757	42194709	Y	NA	NA	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	78403	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	42412542	42412681	42412587	Y	NA	EML4	NA	NA	NA	NA	EML4	18052	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	43152648	43152978	43152751	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.1	78222	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	43197884	43198002	43197975	Y	NA	AC016735.1	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.1	33198	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	44518633	44519032	44518761	Y	NA	SLC3A1	NA	NA	NA	NA	SLC3A1	18034	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	44664975	44664991	44664983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	77886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	45160746	45160936	45160765	Y	SIX3	RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	3402	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	45164818	45165169	45165126	Y	NA	RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	480	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	45177079	45177275	45177123	Y	NA	RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1,AC012354.8	NA	NA	NA	NA	SIX3-AS1	10067	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	46212455	46212485	46212471	Y	PRKCE	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	306321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	46404703	46404889	46404799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	113917	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	46542401	46542637	46542520	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	23595	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	46614603	46614745	46614671	Y	RHOQ	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	95797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	46784048	46784469	46784214	Y	NA	RHOQ,ATP6V1E2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	16352	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	47229826	47230084	47229931	Y	TTC7A	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	62832	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	47282124	47282371	47282214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	115130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	48584014	48584658	48584325	Y	FBXO11,FOXN2	FOXN2,RNU4-49P	NA	NA	NA	NA	RNU4-49P	18049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	49931663	49931861	49931762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	1265926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	50570599	50570762	50570680	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	1904862	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	51010628	51010803	51010737	Y	NRXN1,NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	2344891	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	53162553	53162576	53162564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	830353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	115502	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	54806978	54807402	54807168	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	125556	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	102693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	54977564	54977711	54977648	Y	TSPYL6,C2orf73	EML6	NA	NA	NA	NA	EML6	28928	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr2	55327778	55327923	55327859	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	9834	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	55767070	55767336	55767332	Y	NA	CCDC104	NA	NA	NA	NA	CCDC104	22330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	57579954	57580103	57580029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	552683	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	57657043	57657316	57657246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	475470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	59385638	59385932	59385785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	919131	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	60133192	60133207	60133200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	476533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	60228228	60228402	60228315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	381338	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	61046625	61046961	61046874	Y	REL,AHSA2,PAPOLG	NA	NA	NA	NA	NA	REL	59695	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr2	62375163	62375426	62375211	Y	B3GNT2	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	45822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	62689007	62689250	62689129	Y	NA	TMEM17	EHBP1,COMMD1,OTX1,LOC100132215,TMEM17	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	47779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	63452850	63453196	63453026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	177658	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	63961711	63961835	63961773	Y	NA	NA	UGP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC096664.1	52272	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	64360908	64361228	64361132	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	8360	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	64364775	64365257	64365170	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	4331	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	64894012	64894430	64894356	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	81709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	65146455	65146831	65146643	Y	RAB1A,ACTR2,SLC1A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	66780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	143315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr2	69091781	69092116	69091950	Y	BMP10	NA	NA	NA	NA	NA	APLF	399088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	69536922	69537085	69537004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	75297	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	69851897	69852398	69852223	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	17159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	69888349	69888615	69888483	Y	NA	ANXA4,AAK1	NFU1,AAK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AAK1	10866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	70000495	70000634	70000556	Y	MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	54140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	70004336	70004726	70004528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	50048	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	70048617	70048893	70048741	Y	ANXA4	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	5881	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	70154281	70154743	70154417	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	31461	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	70202880	70203539	70203203	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	15483	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	70270545	70270983	70270722	Y	MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	41602	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	71129017	71129173	71129049	Y	NA	VAX2	NA	NA	NA	NA	VAX2	3297	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	74153090	74153262	74153147	Y	NA	DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	1137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	74793766	74794164	74794010	Y	WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1	DQX1,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	12949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	74939422	74939597	74939510	Y	NA	AC007387.2	HK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007387.2	40349	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	75090921	75091085	75091029	Y	NA	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	31813	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	75102185	75102665	75102322	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	43077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	79897461	79897533	79897497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	490728	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	83744068	83744130	83744079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	700813	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	84878729	84879090	84878910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH6	137150	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	84908864	84908877	84908871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH6	167285	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr2	85151844	85152193	85152004	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	21095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	85632531	85633066	85632892	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	10489	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	85726317	85726428	85726373	Y	CAPG,VAMP8	MAT2A	TMEM150A,USP39,SH2D6,MAT2A,LOC100630918,TGOLN2,RETSAT,GGCX,VAMP5,VAMP8,RNF181,CAPG,C2orf68	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAT2A	37860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	86224674	86224821	86224747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	106457	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	86245755	86246075	86245859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	85203	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	86262986	86263343	86263241	Y	GNLY,KDM3A,KDM3A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	67935	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	90485310	90485405	90485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	1496148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826664	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	95704112	95704396	95704258	Y	KCNIP3,MAL	MAL	NA	NA	NA	NA	MAL	14690	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	96190968	96191044	96191006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	124499	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr2	97175211	97175545	97175411	Y	NA	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	NEURL3	3365	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	97206009	97206227	97206118	Y	NA	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	5529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	97222458	97223029	97222771	Y	DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	21978	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	97547885	97548242	97548064	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	13391	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	97554359	97554681	97554500	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	19865	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	98389575	98389609	98389594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	111005	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWA3B	121353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	99213145	99213306	99213215	Y	INPP4A	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	COA5	9672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	99287467	99287477	99287472	Y	CNGA3	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	58112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	100885369	100885541	100885455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF2	51654	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	29250	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	28407	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	139	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	101397207	101397582	101397418	Y	C2orf29	NPAS2	NPAS2,RPL31,TBC1D8	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS2	37032	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr2	101669826	101670190	101670079	Y	TBC1D8	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	53649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	102353138	102353817	102353456	Y	IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	41826	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	102478902	102479140	102479043	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R2	127166	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	102649919	102650192	102650054	Y	IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2	IL1R2,IL1R1	NA	NA	NA	NA	IL1R1	28812	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	102920800	102921075	102920956	Y	IL1RL1,IL18R1	IL18R1	IL1R2,IL1RL1	IMR90	Hi-C	24141950	IL18R1	4914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	105129772	105130007	105129890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	522434	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	105913488	105913594	105913541	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	TGFBRAP1	30897	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	106026144	106026496	106026333	Y	GPR45,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	26474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	106480374	106480732	106480408	Y	NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	121020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	109506497	109506716	109506551	Y	LIMS1,CCDC138,EDAR	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	97112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	109648298	109648660	109648428	Y	LIMS1,RANBP2	EDAR	MALL,EDAR	IMR90	Hi-C	24141950	EDAR	44470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	110863536	110863928	110863763	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	8215	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	132	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	112459778	112460151	112459873	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	180116	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	16163	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	113388786	113388926	113388836	Y	NA	CHCHD5,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	12508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	26628	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	113457946	113458361	113458065	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	NT5DC4	FLJ42351,SLC20A1,IL37,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	NT5DC4	18702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	113556767	113557612	113557074	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L	IL37,CKAP2L,CHCHD5,IL1A,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	CKAP2L	36513	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	113569466	113569945	113569683	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	49212	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	113835949	113836406	113836219	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	130693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	113847761	113847860	113847813	Y	IL1A,IL1B,IL37,IL36G,CBWD2,IL36B,IL1F10,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	119239	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr2	114457868	114458149	114458009	Y	ACTR3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	54251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	114634434	114634643	114634539	Y	NA	ACTR3	ACTR3	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR3	10894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	114672841	114673224	114672915	Y	NA	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	27304	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	116469497	116469517	116469506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	1823960	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	116628047	116628319	116628183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	1941907	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	118309015	118309417	118309218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	260809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	118847045	118847263	118847087	Y	INSIG2	INSIG2	NA	NA	NA	NA	INSIG2	3017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	119932213	119932271	119932230	Y	PCDP1	STEAP3	C2orf76	IMR90	Hi-C	24141950	STEAP3	47113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	120025136	120025424	120025403	Y	DBI	STEAP3	NA	NA	NA	NA	STEAP3	45752	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	120039875	120040023	120039961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	60491	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	120891923	120892273	120892121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012363.4	79847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	120905923	120906046	120905986	Y	EPB41L5,EPB41L5	NA	NA	NA	NA	NA	AC012363.4	66074	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	AC012363.4,TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr2	121011894	121012098	121011996	Y	TMEM185B,RALB	AC012363.4,TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	RALB	16254	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	121200367	121200763	121200697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALB	204727	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	121575399	121575754	121575577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	84200	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	121898319	121898402	121898361	Y	NA	NA	TFCP2L1,CLASP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFCP2L1	142381	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	122132591	122132855	122132729	Y	CLASP1	NA	NA	NA	NA	NA	AC013399.3	67020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	122298770	122299123	122298947	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	12313	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP27C1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	128119420	128119722	128119576	Y	NA	MAP3K2	IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	24319	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	128173465	128174362	128173731	Y	SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	29424	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1,MYO7B	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1,MYO7B	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	ARHGEF4	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ARHGEF4	36669	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	132182653	132182963	132182773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2A	65353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	133204437	133204733	133204517	Y	LYPD1	GPR39	NA	NA	NA	NA	GPR39	32290	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	133226429	133226806	133226618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	54282	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	133304410	133304432	133304421	Y	NA	NA	LYPD1	IMR90	Hi-C	24141950	LYPD1	122720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	133407314	133407482	133407398	Y	LYPD1,LYPD1	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	19670	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	133640372	133640755	133640626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	213220	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	134193619	134193983	134193802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP5	130051	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	134264492	134264718	134264584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP5	59316	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	134570885	134571181	134570989	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	NCKAP5	246851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	135931129	135931440	135931285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3GAP1	123294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	136217422	136217690	136217556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	69116	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	136389932	136390301	136390118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	R3HDM1	102907	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	136504457	136504522	136504461	Y	NA	UBXN4	NA	NA	NA	NA	UBXN4	7268	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	138717867	138718049	138717968	Y	HNMT	HNMT	HNMT	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HNMT	1541	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	139112246	139112514	139112380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	144754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	139198512	139198615	139198564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	58653	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	140977991	140978216	140978106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	1720620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	141613060	141613069	141613065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	2019998	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	141930622	141930813	141930718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	1702254	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	142150307	142150490	142150399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	1482577	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	143609004	143609300	143609152	Y	NA	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	23767	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	143628214	143628759	143628425	Y	NA	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	4308	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	144020720	144020920	144020801	Y	KYNU,ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	387653	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	144048951	144048966	144048960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	415884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	144488458	144488893	144488487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	599242	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	145338212	145338608	145338410	Y	NA	NA	ZEB2	K562	ChIA-PET	22265404	GTDC1	250077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	145583333	145583749	145583430	Y	ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	495198	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	149267026	149267240	149267133	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	132769	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	150314581	150314916	150314749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144449.1	126794	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	151022837	151023057	151022971	Y	NA	NA	RND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RND3	370468	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	151537937	151538357	151538169	Y	NA	NA	RBM43,RND3,MMADHC	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	144412	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	152356804	152357129	152357077	Y	NEB	NA	NA	NA	NA	NA	RIF1	92407	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	152742904	152743255	152743079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	59898	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	152971717	152971973	152971845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAM2	58533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	153319384	153319598	153319488	Y	CACNB4,CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	129633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	153347389	153347769	153347704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	157638	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	153356449	153356753	153356698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	166698	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	154379200	154379581	154379374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	68220	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	154729073	154729474	154729153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	281272	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	158277774	158278150	158278051	Y	ACVR1,ACVR1,CYTIP	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT5	165664	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	158719491	158719881	158719651	Y	ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	10493	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	160353770	160354019	160353895	Y	MARCH7,CD302	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	36003	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	160470388	160470776	160470715	Y	NA	BAZ2B	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	427	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	160817748	160817942	160817845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY75	58488	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	161014381	161014772	161014663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	97260	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	161079390	161079792	161079655	Y	ITGB6	ITGB6	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	46607	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	161086140	161086681	161086297	Y	NA	ITGB6	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	39718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	161607616	161608069	161607675	Y	TANK,TANK	NA	RBMS1,ITGB6	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	259311	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	162481875	162482596	162482291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	286038	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	164191180	164191525	164191340	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	GCA	1017830	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	164991272	164991524	164991400	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	484834	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	165643142	165643316	165643229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	54873	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	165683192	165683287	165683237	Y	NA	COBLL1	NA	NA	NA	NA	COBLL1	14902	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	165766653	165766876	165766835	Y	SLC38A11,COBLL1	SLC38A11	NA	NA	NA	NA	SLC38A11	43159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	165801450	165801783	165801617	Y	SLC38A11	SLC38A11	NA	NA	NA	NA	SLC38A11	8252	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	165924693	165924835	165924764	Y	SCN3A,SCN2A,SCN2A,CSRNP3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A11	114658	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	166240556	166240626	166240591	Y	SCN3A,SCN2A,SCN2A,CSRNP3	NA	NA	NA	NA	NA	CSRNP3	83531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	166671246	166671486	166671366	Y	CSRNP3	GALNT3	NA	NA	NA	NA	GALNT3	22054	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	166705742	166705996	166705870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT3	56550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	166778122	166778316	166778220	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	30037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	166821082	166821089	166821086	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12729	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	166890650	166891004	166890893	Y	TTC21B,SCN1A	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	82297	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	168858571	168859104	168858832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	243547	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	168977927	168978148	168978038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	124503	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	169961196	169961524	169961361	Y	NOSTRIN,DHRS9,DHRS9	DHRS9	NA	NA	NA	NA	DHRS9	41897	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr2	171774102	171774205	171774162	Y	NA	GORASP2	GORASP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GORASP2	8769	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	172628972	172629294	172629196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	87053	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	173061382	173062264	173061777	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	95754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	173114788	173114930	173114869	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	149160	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	173876038	173876102	173876070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLK7-AS1	268662	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	173942556	173942831	173942720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLK7-AS1	201933	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	174046612	174047013	174046770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLK7-AS1	97751	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	174518967	174519016	174518991	Y	NA	NA	OLA1,CIR1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7	301419	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	174776201	174776462	174776332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	51968	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	174888201	174889400	174889077	Y	SP3,SP3	NA	SP3,OLA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	59771	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	174900688	174901381	174900887	Y	SP3,SP3	NA	SP3,CDCA7,OLA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	72258	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	175651390	175651743	175651567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	68885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	175700542	175700958	175700833	Y	CHRNA1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	118037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	175762241	175762347	175762322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	179736	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	176846427	176846539	176846507	Y	NA	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	19028	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	177861889	177862194	177862097	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA3	213097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	179056084	179056225	179056143	Y	NA	OSBPL6	MIR548N	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL6	983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	179866335	179866441	179866388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	261076	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	180990064	180990392	180990254	Y	NA	NA	ITGA4,UBE2E3,CERKL	IMR90	Hi-C	24141950	CWC22	120224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	182089643	182089935	182089741	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E3	259668	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	182655515	182655597	182655556	Y	NA	NA	SSFA2,PPP1R1C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SSFA2	98963	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	182738960	182739358	182739283	Y	NA	SSFA2	PPP1R1C	IMR90	Hi-C	24141950	SSFA2	15202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	182956199	182956480	182956369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R1C	139231	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	184978816	184978913	184978865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	482180	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	187015061	187015446	187015349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	333437	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	188340607	188340894	188340852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI	87593	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	188464486	188464724	188464607	Y	NA	TFPI	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	35999	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	190067676	190068381	190068047	Y	NA	NA	GULP1,COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	235778	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	191659220	191659442	191659369	Y	GLS	NA	STAT1,MFSD6,GLS,NAB1	IMR90	Hi-C	24141950	GLS	84111	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	196018640	196018983	196018812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	419718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	196428777	196429172	196429092	Y	SLC39A10	SLC39A10	SLC39A10	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A10	9529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	196531201	196531576	196531334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	92500	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	196617949	196618273	196617953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	179248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	197069769	197070011	197069899	Y	STK17B	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	30542	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	197078069	197078253	197078160	Y	STK17B	STK17B,AC020571.3	NA	NA	NA	NA	STK17B	38842	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	197623019	197623245	197623231	Y	NA	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	39204	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	198350765	198350931	198350852	Y	NA	COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1	NA	NA	NA	NA	HSPE1	11787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	200839985	200840279	200840201	Y	NA	C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	TYW5	21526	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	201039971	201040241	201040105	Y	NA	NA	SPATS2L,KCTD18,SGOL2	IMR90	Hi-C	24141950	SPATS2L	128363	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	201238754	201239056	201238905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	70150	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	201262818	201262970	201262894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	94214	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	201270357	201270484	201270442	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	101753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	201454959	201455229	201455094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD18	72452	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	201777095	201777270	201777183	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR	CLK1,PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	NIF3L1	25045	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	17207	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	202302698	202302857	202302778	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR	TRAK2	NA	NA	NA	NA	TRAK2	11445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	202888272	202888578	202888425	Y	NA	NA	FZD7,ALS2,MPP4,SUMO1,CDK15	IMR90	Hi-C	24141950	DAZAP2P1	176031	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	DAZAP2P1	165924	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	203239784	203239912	203239798	Y	NA	BMPR2	NA	NA	NA	NA	BMPR2	125	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	204393119	204393487	204393303	Y	NA	RAPH1	NA	NA	NA	NA	RAPH1	4646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	205054126	205054419	205054273	Y	NA	NA	PARD3B	IMR90	Hi-C	24141950	PARD3B	354097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	205941822	205941857	205941840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	533306	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	104946	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	208622865	208623146	208623006	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	9141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	208791202	208791275	208791238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	97009	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	213352343	213352729	213352575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF2	662422	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	213401643	213402097	213401658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF2	613054	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	215971469	215971483	215971476	Y	NA	ABCA12	NA	NA	NA	NA	ABCA12	29668	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	216164232	216164517	216164455	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	10023	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	216636605	216637052	216636855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	259767	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	216847055	216847597	216847305	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	49222	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	216867934	216868318	216868147	Y	TMEM169	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	28501	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	217876929	217877326	217877128	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP2	381378	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	218549825	218550302	218550107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC2	529515	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	219177286	219177625	219177456	Y	NA	AAMP,PNKD,TMBIM1,AC021016.7,C2orf62	NA	NA	NA	NA	TMBIM1	21977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	VIL1	9441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16054	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16962	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	WNT10A,CDK5R2	NA	NA	NA	NA	WNT10A	30430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	219774108	219774202	219774159	Y	USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1	WNT10A,CDK5R2	NA	NA	NA	NA	WNT10A	31023	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX3	334304	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr2	223170887	223171031	223170916	Y	NA	PAX3	NA	NA	NA	NA	PAX3	9172	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	223447202	223447309	223447256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	71747	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	223595926	223596259	223596093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	76870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	223823432	223823602	223823532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE4	90930	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	223824867	223825201	223825044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE4	89331	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	224413942	224414282	224414142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCG2	50939	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	224467803	224467963	224467901	Y	SCG2	SCG2	NA	NA	NA	NA	SCG2	2582	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	104129	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	224751909	224752110	224752042	Y	WDFY1	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	51165	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	224808298	224808709	224808400	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	194	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	224810635	224810927	224810791	Y	AP1S3	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	2531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	225133197	225133515	225133356	Y	NA	NA	SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINE2	231161	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	226983188	226983709	226983518	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	678766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	227514541	227514866	227514704	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	147609	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	228331050	228331499	228331159	Y	NA	AGFG1	AGFG1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	3369	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO36	769215	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	230470740	230471103	230470968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO36	313915	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	231636017	231636396	231636213	Y	NA	BANF1P3	NA	NA	NA	NA	BANF1P3	47899	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	231658746	231658958	231658902	Y	SP140L,SP100,SP100	NA	NA	NA	NA	NA	ITM2C	68396	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	B3GNT7	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	28137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.49030206583232
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr2	232505425	232505799	232505482	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	63806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	232532385	232532510	232532473	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	232536483	232536778	232536606	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32827	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	232537231	232537488	232537452	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32117	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr2	232551717	232552221	232552147	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	17384	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	233096331	233096791	233096507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIS3L2	272376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	234330770	234331121	234330825	Y	INPP5D,ATG16L1	NA	USP40	IMR90	Hi-C	24141950	DGKD	69617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	234357256	234357513	234357369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	96103	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr2	234608579	234609196	234608912	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	10326	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	235400661	235400783	235400733	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	2914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	236404372	236404974	236404689	Y	AGAP1	AGAP1	NA	NA	NA	NA	AGAP1	3639	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	236698901	236699175	236699041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	298168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	236910231	236910384	236910319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	163706	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	236930696	236930917	236930807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	143173	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	237088797	237088932	237088867	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	GBX2	13785	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	237640726	237641053	237640951	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	350902	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	238018538	238018666	238018550	Y	NA	COPS8,AC105760.2	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	26078	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr2	238191599	238191938	238191660	Y	NA	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	199139	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	238223884	238224369	238224058	Y	COL6A3	NA	NA	NA	NA	NA	MLPH	167702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	238398938	238399241	238399144	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	6867	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	238581844	238582251	238582110	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	47625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	238832423	238832667	238832502	Y	NA	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	40802	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	KLHL30,FAM132B	NA	NA	NA	NA	KLHL30	5291	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	239290977	239291159	239291031	Y	NA	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	42224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	239631175	239631419	239631288	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	123254	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	239772979	239773251	239773061	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	18306	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	24450	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	240168373	240168774	240168689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	152356	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.35195195106386
chr2	240186875	240187303	240186998	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	133827	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.73545309874848
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	241366341	241366661	241366471	Y	GPR35,GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	6427	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	241431316	241431521	241431419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC1	58228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	241561048	241561275	241561167	Y	DUSP28,RNPEPL1,CAPN10,GPR35	CAPN10	NA	NA	NA	NA	CAPN10	36915	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	242262018	242262304	242262161	Y	NA	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	7542	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	242365047	242365293	242365170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP2	71389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr2	242679689	242679905	242679763	Y	ATG4B,D2HGDH	ING5,D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	7695	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	321375	321752	321587	Y	NA	ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,RP5-1103G7.4,TRIB3	NA	NA	NA	NA	RP5-1103G7.4	5116	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr20	483361	483443	483402	Y	NA	TBC1D20,CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	CSNK2A1	39022	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	FAM110A	NA	NA	NA	NA	FAM110A	10670	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	1119535	1119804	1119673	Y	NA	PSMF1,TMEM74B	NA	NA	NA	NA	PSMF1	27629	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	1338546	1338920	1338732	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	30663	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115061	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	2189828	2190037	2189979	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	PDYN,TGM3,TGM6	IMR90	Hi-C	24141950	STK35	109571	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	4072203	4072410	4072307	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	SMOX	27217	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	4423594	4423998	4423801	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP2	184867	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	4941641	4941708	4941700	Y	NA	SLC23A2	RASSF2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	47231	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	4942791	4943059	4943002	Y	RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	45880	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	4954142	4954446	4954407	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	34493	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	5059148	5059500	5059412	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	45772	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	5635212	5635550	5635485	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	45540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	6594261	6594618	6594466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	151693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	6684913	6685132	6685035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	61179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	7479812	7480195	7480004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	518281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	7978054	7978163	7978110	Y	NA	TMX4	NA	NA	NA	NA	TMX4	20313	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	8210701	8210953	8210827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	99877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	8380615	8380981	8380808	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	269791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	9001714	9001722	9001718	Y	NA	PLCB4	PLCB4,PLCB1	IMR90	Hi-C	24141950	PLCB4	45688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	9813866	9814210	9813923	Y	PAK7	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	598660	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	10299398	10299502	10299451	Y	MKKS	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	113368	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	10451023	10451290	10451134	Y	NA	MKKS	NA	NA	NA	NA	MKKS	38153	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	10455990	10456132	10456072	Y	NA	MKKS	NA	NA	NA	NA	MKKS	43120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	10477280	10477577	10477381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	64410	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	10651368	10651598	10651475	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	26354	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	10655214	10655688	10655561	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	30200	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	10692033	10692226	10692094	Y	MKKS	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	67019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	12274197	12274212	12274205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	404826	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	12374037	12374068	12374053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	504666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	13311967	13312338	13312291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	111549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	13380021	13380161	13380091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	179603	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	13434936	13435260	13435184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	182327	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	17538189	17538505	17538334	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	BFSP1	9360	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	17591305	17591483	17591343	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	42797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr20	18686203	18686430	18686281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	119666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	19804713	19804972	19804782	Y	NA	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RIN2	60193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	20499728	20499916	20499822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSM1	152963	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	20586775	20587103	20586803	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	104028	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	21967491	21967519	21967505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXA2	596574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	22392618	22392869	22392732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXA2	171224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	22471596	22471813	22471642	Y	FOXA2,FOXA2	NA	NA	NA	NA	NA	FOXA2	92280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	22501465	22501665	22501547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXA2	62428	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	22901688	22901945	22901781	Y	NA	NA	THBD	MCF7	ChIA-PET	22265404	THBD	126433	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	22905662	22905881	22905772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	122497	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	23042410	23042648	23042471	Y	NA	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	14032	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	23093286	23093480	23093394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	64908	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	23136585	23137102	23136883	Y	THBD,CD93,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	108207	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	25273617	25273934	25273643	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	46912	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	25346430	25346740	25346585	Y	ACSS1	ABHD12,GINS1	NA	NA	NA	NA	ABHD12	22879	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	25540985	25541222	25541104	Y	NA	NINL	NA	NA	NA	NA	NINL	22931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	25842208	25842444	25842317	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	112354	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr20	30158598	30158945	30158767	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	32141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr20	30200712	30201016	30200864	Y	TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	9626	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	30266315	30266710	30266574	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	43082	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	30305141	30305549	30305422	Y	PLAGL2,HCK	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	4243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	30624710	30624829	30624798	Y	PLAGL2,C20orf112,HCK	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	70480	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	30700574	30701059	30700820	Y	HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	5265	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	30793339	30793589	30793452	Y	HCK,TM9SF4,PLAGL2	TSPY26P,PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	PLAGL2	5	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.73545309874848
chr20	31373290	31373636	31373312	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B,MAPRE1	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	25099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	32623943	32624156	32623948	Y	NA	RALY,RP5-1125A11.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1125A11.1	43780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr20	32828802	32829240	32829000	Y	NA	NA	EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	68368	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	CDC42P1	1169	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	33024983	33025234	33025016	Y	TP53INP2	CDC42P1	NA	NA	NA	NA	CDC42P1	36481	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	33055325	33055363	33055345	Y	NA	DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	46851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	33646463	33646512	33646488	Y	TP53INP2,MYH7B	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	32162	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	33699049	33699250	33699220	Y	TRPC4AP,EDEM2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	20375	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	33723601	33723932	33723853	Y	EDEM2	TRPC4AP,PROCR	NA	NA	NA	NA	PROCR	33944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	33735973	33736225	33736096	Y	TRPC4AP,EDEM2	PROCR	NA	NA	NA	NA	PROCR	21651	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	33896147	33896435	33896303	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	25359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	34093619	34093844	34093641	Y	NA	ERGIC3	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	33926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	FER1L4,SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCAND1	107196	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	35964135	35964688	35964336	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	6400	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	35976271	35976569	35976418	Y	NA	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	5183	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	36040566	36040861	36040811	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31075	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	36831796	36832119	36831958	Y	NA	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	38816	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr20	36986320	36986515	36986447	Y	BPI	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG11	86706	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	37280609	37280856	37280791	Y	SLC32A1	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR5	94229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	37326119	37326442	37326281	Y	NA	ACTR5	NA	NA	NA	NA	ACTR5	48643	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	37500884	37501078	37500926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83D	51877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	37626282	37626666	37626585	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	37340	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	39939044	39939335	39939233	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	4977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	40193452	40193754	40193691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	51379	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	40657200	40657318	40657259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	412067	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	4176	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr20	43223501	43223813	43223570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADA	55061	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	43271158	43271637	43271427	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	7237	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	43767332	43767709	43767669	Y	NA	NA	STK4,MATN4,RBPJL	IMR90	Hi-C	24141950	SLPI	113496	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	43972131	43972359	43972259	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	2705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	44056635	44056652	44056644	Y	NA	PIGT,WFDC2	NA	NA	NA	NA	PIGT	13918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	44136889	44137182	44137082	Y	NA	WFDC2	NA	NA	NA	NA	WFDC2	40543	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	WFDC3,DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	WFDC3	8067	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	45251611	45251999	45251807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53RK	64419	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	45257949	45258319	45258134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53RK	58099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	45324546	45324927	45324721	Y	TP53RK	TP53RK,SLC2A10	SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	TP53RK	8128	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr20	46057073	46057256	46057165	Y	NA	NA	NCOA3,EYA2,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	71345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	46349798	46350132	46350127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	63228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	46420724	46421103	46420967	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	7364	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	46618615	46619022	46618889	Y	NA	NA	SULF2,CMTM7,BCAS1	MCF7	ChIA-PET	22265404,19890323	SULF2	205255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	47337131	47337315	47337224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	105105	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	47443501	47443751	47443699	Y	NA	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	1081	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	47463345	47463685	47463577	Y	ZNFX1	PREX1	PREX1	IMR90	Hi-C	24141950	PREX1	20925	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr20	48158294	48158522	48158408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	169893	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	48212349	48213057	48212923	Y	PTGIS	NA	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	B4GALT5	115358	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	48342320	48342493	48342407	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	ZNFX1-AS1,B4GALT5,SLC9A8	IMR90	Hi-C	24141950	SNRPFP1	1886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	48726581	48727101	48726820	Y	SPATA2,SPATA2	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	3395	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	48760872	48761304	48761158	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	6870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	48763985	48764114	48764046	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4060	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	48804007	48804349	48804187	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,PTPN1,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	1027	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	48922474	48922671	48922573	Y	NA	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	40451	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	49044286	49044567	49044388	Y	RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90	Hi-C	24141950	PTPN1	80324	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	49051331	49051557	49051444	Y	RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	73334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	49057048	49057261	49057196	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	67630	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	49063008	49063172	49063083	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	61719	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	49345638	49345902	49345710	Y	MOCS3,PARD6B	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	49553399	49553600	49553500	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	7441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	50149435	50150104	50149627	Y	NFATC2	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	27266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	50180369	50180507	50180463	Y	NFATC2	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	2999	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	75345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	50272756	50273155	50272761	Y	ATP9A	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	75917	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	50305128	50305301	50305215	Y	NA	RP5-827A12.2	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	43771	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	50366318	50366439	50366379	Y	NA	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	16734	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr20	50416342	50416699	50416509	Y	NA	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	360	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr20	50416861	50417288	50417180	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	SALL4	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	50913407	50913767	50913641	Y	NA	NA	TSHZ2,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	94560	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	50926761	50926990	50926876	Y	NA	NA	TSHZ2,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	107914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	51775056	51775397	51775227	Y	TSHZ2,TSHZ2	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	188110	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr20	52213211	52213282	52213247	Y	NA	ZNF217	BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	11164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	52238141	52238435	52238216	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	13695	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr20	52271592	52271787	52271702	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	47146	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr20	52356771	52357178	52357063	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	132325	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	52380425	52380741	52380578	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	155979	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	52407558	52407732	52407573	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	183112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	52531977	52532203	52532002	Y	NA	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	290183	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	52684102	52684485	52684350	Y	PFDN4	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	137901	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	53716299	53716500	53716400	Y	NA	RPL12P4	NA	NA	NA	NA	RPL12P4	27144	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	55838908	55839396	55838948	Y	NA	BMP7	NA	NA	NA	NA	BMP7	289	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	55964119	55964506	55964297	Y	ZBP1,MTRNR2L3,RBM38	RAE1,MTRNR2L3	NA	NA	NA	NA	RBM38	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	55973445	55973831	55973580	Y	RBM38,ZBP1,PMEPA1	RAE1,MTRNR2L3,RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	8982	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	56008066	56008273	56008156	Y	ZBP1	RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	43603	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	56027077	56027304	56027131	Y	NA	HMGB1P1	MIR5095	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HMGB1P1	34779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	56255217	56255759	56255498	Y	ZBP1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	28833	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr20	56323662	56324029	56323724	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	39070	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	56505657	56505795	56505725	Y	NA	NA	CTCFL,ZBP1,PMEPA1	IMR90	Hi-C	24141950	PMEPA1	221065	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	56592800	56593208	56592856	Y	NA	NA	ZBP1,PMEPA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1L	289287	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	57236406	57236742	57236622	Y	RAB22A,STX16	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	11916	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	CTSZ,ATP5E	NA	NA	NA	NA	CTSZ	22091	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	57596187	57596442	57596344	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	ATP5E	8995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	58402426	58402798	58402570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	110554	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	58552421	58552506	58552458	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3	PPP1R3D	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	39069	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	58621223	58621546	58621377	Y	PHACTR3,PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	107871	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	59581209	59581224	59581218	Y	CDH4	NA	C20orf197	IMR90	Hi-C	24141950	CDH4	244258	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	60529765	60530009	60529928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	108857	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr20	61001783	61002051	61001918	Y	NA	RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	21442	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	78738	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	61283206	61283870	61283565	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1,RP11-93B14.5	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	11409	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr20	61335955	61336196	61336080	Y	NA	RP11-93B14.5,NTSR1	C20orf20,LOC100652730,SLCO4A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NTSR1	1993	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	61342361	61342694	61342588	Y	NA	RP11-93B14.5,NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	4172	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	33351	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	61554875	61554902	61554887	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	12402	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	61724045	61724282	61724168	Y	NA	HAR1B	NA	NA	NA	NA	HAR1B	7389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	61810748	61810860	61810807	Y	STMN3,NKAIN4,KCNQ2,EEF1A2,COL20A1,CHRNA4	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	34726	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	62170184	62170345	62170251	Y	YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195	EEF1A2,PPDPF,PTK6	NA	NA	NA	NA	PTK6	3461	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.35195195106386
chr20	62478016	62478296	62478069	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	16300	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	4.28885355782233
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,SAMD10,PRPF6	NA	NA	NA	NA	SAMD10	3	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr21	15810858	15811228	15811061	Y	SAMSN1	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	57053	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	17054611	17055027	17054700	Y	USP25	USP25	USP25	IMR90	Hi-C	24141950	USP25	45317	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	17264124	17264427	17264344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	163780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	17276028	17276063	17276046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	175684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	18443678	18443955	18443817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXADR	438745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	19836	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	26956680	26957339	26957242	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	20490	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	27242944	27243154	27243052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	136960	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	27488837	27488970	27488850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	52476	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	27855729	27855767	27855735	Y	CYYR1	NA	NA	NA	NA	NA	APP	314283	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	30191610	30191885	30191792	Y	C21orf7	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	63808	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr21	30472474	30472512	30472479	Y	USP16,BACH1,BACH1	CCT8	NA	NA	NA	NA	CCT8	28356	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	30675702	30676052	30675894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	111310	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	32545915	32546496	32546250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	383794	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	33104933	33105321	33105127	Y	NA	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	2545	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	33105563	33105881	33105775	Y	SCAF4	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	3175	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	34451403	34451550	34451500	Y	SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1	OLIG1	NA	NA	NA	NA	OLIG1	10953	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	34718616	34718973	34718794	Y	OLIG2,OLIG1	IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	23882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	34755296	34756154	34755534	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	IFNGR2	MCF7	ChIA-PET	22265404	IFNGR2	17048	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	35057919	35058071	35057938	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	43687	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	35312592	35312729	35312724	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	26308	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	35508184	35508396	35508291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	64314	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	35915930	35915933	35915932	Y	KCNE1,RCAN1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	69508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	35917479	35917977	35917777	Y	KCNE1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	67464	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	158530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	36174477	36174817	36174756	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	189036	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	36217934	36218360	36217961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	232493	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	237131	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	36864275	36864649	36864330	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX1	510316	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	37529889	37530052	37529971	Y	DOPEY2	CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	DOPEY2	2809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	37670543	37670742	37670650	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	19745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	37695369	37695803	37695437	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	4882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	38069098	38069172	38069127	Y	NA	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	261	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	38346647	38347014	38346835	Y	NA	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	9835	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	38349168	38349478	38349323	Y	TTC3,DYRK1A,HLCS	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	HLCS	11058	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	38590434	38590491	38590485	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	AP001432.14	1229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.79855149199001
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	40159439	40159794	40159507	Y	NA	ETS2	ETS2,LINC00114	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ETS2	15437	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	40175166	40175325	40175215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	40182920	40183779	40183392	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	7689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	40277371	40277733	40277541	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	102140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	40476284	40476629	40476514	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	77148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	40983593	40983719	40983659	Y	LCA5L,SH3BGR,PCP4	C21orf88	NA	NA	NA	NA	C21orf88	845	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	41003318	41003469	41003395	Y	NA	C21orf88	NA	NA	NA	NA	C21orf88	20570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	41005118	41005297	41005205	Y	NA	C21orf88	SH3BGR	IMR90	Hi-C	24141950	C21orf88	22370	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr21	42217662	42218038	42217903	Y	DSCAM	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	319690	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	42543184	42543509	42543444	Y	BACE2	BACE2	NA	NA	NA	NA	BACE2	5456	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	43477244	43477358	43477313	Y	NA	NA	ZNF295,UMODL1,C2CD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	C2CD2	105245	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	43615416	43615758	43615654	Y	ZNF295,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	ABCG1	ABCG1	K562	ChIA-PET	22265404	ABCG1	2041	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	43881012	43881164	43881098	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32954	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	43881255	43881524	43881384	Y	NA	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr21	43885293	43886049	43885531	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	28069	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	43887564	43887652	43887608	Y	NA	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	26466	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	43944597	43944892	43944856	Y	NA	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	RSPH1	30133	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	43990087	43990457	43990275	Y	ABCG1,ABCG1	NA	NA	NA	NA	NA	RSPH1	75623	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	44074543	44074777	44074593	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	2797	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	44469974	44470172	44470008	Y	CBS	CBS	NA	NA	NA	NA	CBS	24881	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	44761192	44761567	44761446	Y	CRYAA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	83441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	39370	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	45235037	45235392	45235184	Y	NA	CSTB,RRP1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	27643	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	45358133	45358224	45358178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	71976	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	45563949	45564214	45564057	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	12462	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	45580983	45581335	45581160	Y	NA	C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	29496	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	AP001065.15,C21orf90	NA	NA	NA	NA	C21orf90	8679	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	46274069	46274460	46274264	Y	KRTAP12-4,UBE2G2,SUMO3	SUMO3,PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	17292	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	46295070	46295864	46295519	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	3318	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	46372506	46372851	46372669	Y	NA	FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	14581	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	46726845	46727332	46727050	Y	NA	POFUT2	NA	NA	NA	NA	POFUT2	21032	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr21	46749941	46750271	46750188	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	44128	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	46836537	46836812	46836569	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	13485	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	46894520	46894647	46894596	Y	COL18A1	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	67678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr21	47212658	47212880	47212769	Y	NA	NA	ADARB1,SLC19A1,PCBP3	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	151050	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	47240506	47240853	47240623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	158798	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	47968526	47968894	47968542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	84185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr21	48003626	48004009	48003657	Y	S100B,PRMT2	PRMT2	NA	NA	NA	NA	PRMT2	49070	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr22	17528836	17529213	17528959	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	34631	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	18264435	18264847	18264620	Y	CECR2,ATP6V1E1,BCL2L13,USP18,BID,BID	BID	NA	NA	NA	NA	BID	8899	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	19043288	19043502	19043327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGCR2	64465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	19400101	19400223	19400162	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39	NA	NA	NA	NA	MRPL40	17202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	19410653	19410889	19410838	Y	HIRA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39	NA	NA	NA	NA	MRPL40	6536	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	19930770	19931097	19930953	Y	ZDHHC8,COMT	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	3429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	21285744	21286048	21285865	Y	NA	CRKL,XXbac-B135H6.15,LZTR1	NA	NA	NA	NA	CRKL	16030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	22186398	22186549	22186531	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	33421	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr22	24470506	24470556	24470531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABIN1	64864	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	24603179	24603438	24603254	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	27952	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	24903018	24903252	24903052	Y	GGT1,ADORA2A	SNRPD3	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	46219	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	25203856	25204100	25203978	Y	GGT1,TMEM211,PIWIL3,SGSM1	SGSM1	NA	NA	NA	NA	SGSM1	3620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGSM1	148495	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	25466969	25467233	25467138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM1	266733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	27131212	27131584	27131334	Y	NA	NA	MN1,PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	64482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	27816576	27816924	27816809	Y	NA	NA	MIAT,MN1,PITPNB,TTC28,TTC28-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC28-AS1	496440	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	29365910	29365950	29365937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	88330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	29471077	29471334	29471238	Y	KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	4011	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	29765526	29765849	29765726	Y	ZNRF3,RASL10A,CABP7,NEFH	NA	NA	NA	NA	NA	AP1B1	51319	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	30608541	30609106	30608754	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	31734	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	8356	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.2136018362954
chr22	31030399	31030736	31030505	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	TCN2,PES1,SLC35E4,DUSP18	NA	NA	NA	NA	SLC35E4	760	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	31639418	31639541	31639442	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr22	32448968	32449243	32449043	Y	SLC5A4,RFPL3,SLC5A1	SC22CB-1E7.1,SLC5A1	NA	NA	NA	NA	SLC5A1	11949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	32615051	32615519	32615197	Y	DEPDC5	RP1-90G24.10	RFPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-90G24.10	15949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	33131563	33131860	33131765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	63827	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	36759233	36759313	36759256	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	22750	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr22	37261378	37262019	37261471	Y	RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB	NA	NA	NA	NA	NA	IFT27	91078	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	37428831	37429188	37428927	Y	CARD10,TMPRSS6,TST,MPST	MPST,TST,KCTD17	KCTD17,TMPRSS6	IMR90	Hi-C	24141950	TST	15150	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr22	37714418	37714696	37714539	Y	NA	CYTH4	NA	NA	NA	NA	CYTH4	38350	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	38330051	38330075	38330063	Y	NA	MICALL1,POLR2F,C22orf23	NA	NA	NA	NA	POLR2F	16539	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	38750839	38750902	38750852	Y	NA	CSNK1E	NA	NA	NA	NA	CSNK1E	41625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	38859370	38859653	38859488	Y	NA	KDELR3,DDX17	NA	NA	NA	NA	KDELR3	2414	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	39253318	39253463	39253391	Y	KCNJ4,LOC646851	NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	CBX6	12856	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	39631244	39631333	39631289	Y	PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	7423	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	40589903	40590338	40589971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	88833	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	40686331	40686363	40686350	Y	MKL1,GRAP2,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	ADSL	54144	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	43165805	43166293	43166166	Y	NFAM1,ARFGAP3	NA	ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3	IMR90	Hi-C	24141950	A4GALT	50501	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	43369248	43369530	43369410	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	39621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	44140171	44140361	44140266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB6	65856	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	45254258	45254434	45254345	Y	PHF21B	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21B	149446	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	45403389	45403735	45403573	Y	KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B	PHF21B	NA	NA	NA	NA	PHF21B	145	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	45575306	45575472	45575328	Y	FAM118A,NUP50	NUP50	NA	NA	NA	NA	NUP50	17584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	45642150	45642482	45642292	Y	NA	KIAA0930	LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	7500	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	46028588	46028889	46028879	Y	WNT7B	ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	36789	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.35195195106386
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3157	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	46441533	46441708	46441621	Y	NA	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	5877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr22	46835614	46835885	46835771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELSR1	95182	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	46935060	46935431	46935290	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3993	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	46970983	46971382	46971054	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	1074	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LL22NC03-75H12.2	354988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	47848340	47848433	47848387	Y	NA	LL22NC03-75H12.2	NA	NA	NA	NA	LL22NC03-75H12.2	32427	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	RP11-191L9.4	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-191L9.4	10218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr22	48184441	48184585	48184513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	159018	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	49009124	49009326	49009225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	983701	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	49031660	49032049	49031799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	1006237	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	453587	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr22	50324610	50324932	50324739	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	14504	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	50341970	50342055	50341995	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	10106	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr22	50680113	50680250	50680180	Y	SELO	SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11	NA	NA	NA	NA	TUBGCP6	1171	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr22	50815545	50815813	50815668	Y	MOV10L1,MOV10L1,SELO,MAPK8IP2,FAM116B	PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	35812	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	50976397	50976540	50976449	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	7388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	991989	992283	992135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC090043.1	643646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	3202241	3202572	3202332	Y	NA	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	16822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	3233755	3233950	3233817	Y	IL5RA,TRNT1,CRBN	CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	14361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	4783422	4783695	4783523	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	7579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	4790332	4790663	4790474	Y	BHLHE40	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	611	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	5043972	5044716	5044216	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	24326	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	5051476	5051665	5051567	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	31830	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	5181258	5181597	5181446	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	19353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	5191163	5191386	5191276	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	ARL8B	29258	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	5237403	5237551	5237430	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	EDEM1	10072	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	6398384	6398410	6398397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1171053	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	8500443	8500771	8500604	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	40622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	11138272	11138477	11138338	Y	NA	HRH1	HRH1,ATG7	IMR90	Hi-C	24141950	HRH1	38302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	11187629	11187920	11187792	Y	HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	10850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	11261398	11261658	11261529	Y	HRH1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	50337	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	11324850	11325078	11324951	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	12855	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	11591830	11592141	11591986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	168079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	11612359	11612503	11612424	Y	HRH1,ATG7	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	147717	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	11632872	11633201	11633091	Y	SYN2,VGLL4	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	127019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	72185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	11759856	11760132	11759896	Y	NA	VGLL4	NA	NA	NA	NA	VGLL4	88	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	12220728	12221239	12220905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	105628	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	12345089	12345969	12345668	Y	RAF1,PPARG,PPARG,PPARG	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	18222	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	12350153	12350305	12350183	Y	NA	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	23286	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr3	12386663	12386813	12386738	Y	PPARG,PPARG,PPARG	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	59796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	12398616	12399008	12398699	Y	RAF1,PPARG,PPARG	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	71749	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	12504126	12504446	12504275	Y	PPARG	TSEN2	SYN2,PPARG	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN2	19485	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr3	13042124	13042470	13042313	Y	RAF1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	70147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	13325256	13325344	13325300	Y	NA	NA	NUP210,LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	NUP210	134465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	TPRXL	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPRXL	39580	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr3	14257734	14258042	14257871	Y	NA	LSM3,XPC	NA	NA	NA	NA	XPC	39451	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr3	14407867	14408115	14407985	Y	NA	SLC6A6	SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC6A6	33961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	15285479	15285699	15285585	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	39820	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	15286616	15286745	15286681	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	40957	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	260537	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	16489627	16489868	16489748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	184921	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	17229616	17229788	17229702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	387457	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	536153	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	17505233	17505390	17505312	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	663074	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	700704	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	701153	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	18409984	18410150	18410103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	74159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	18430720	18430774	18430747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	53535	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB1	95162	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	KCNH8	NA	NA	NA	NA	KCNH8	423	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	19379484	19379512	19379499	Y	KCNH8	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH8	191538	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	19399413	19399531	19399472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH8	211467	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	19470380	19470682	19470561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH8	282434	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	19530788	19531160	19530898	Y	KCNH8	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH8	342842	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	19588918	19588928	19588923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	397589	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	19687209	19687217	19687213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	299300	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	20205868	20206079	20206039	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	19705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	21654380	21654503	21654471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	766807	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	22039046	22039346	22039196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	381964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	22152338	22152660	22152655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	268650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	23752138	23752437	23752199	Y	NA	NA	UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	92957	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	23898490	23898770	23898565	Y	NA	NA	NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	53096	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	25197239	25197467	25197372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	506931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	25767387	25767675	25767610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXSM	54733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7,RNU1-96P	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	27595774	27595869	27595845	Y	NA	RNU1-96P	SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-96P	42412	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	NA	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	87236	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr3	27957485	27957491	27957488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	195279	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	28050894	28051260	28051082	Y	EOMES,CMC1	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	229815	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	28534381	28534544	28534465	Y	ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	145744	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	30646968	30647109	30647039	Y	TGFBR2	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	32002546	32002801	32002555	Y	NA	ZNF860	NA	NA	NA	NA	ZNF860	18462	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	12268	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	33040516	33040939	33040781	Y	NA	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	32416	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	33086079	33086426	33086309	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	12724	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	33478074	33478410	33478365	Y	NA	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	2453	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	34546800	34546816	34546806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	708956	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	35105790	35105810	35105799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	1267946	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	35749341	35749720	35749410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRANK1	1234828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	35790038	35790162	35790114	Y	ARPP21	NA	NA	NA	NA	NA	TRANK1	1194386	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	35821013	35821323	35821076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRANK1	1163225	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	36937540	36937792	36937666	Y	NA	TRANK1	NA	NA	NA	NA	TRANK1	46756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	36942339	36942611	36942476	Y	TRANK1,GOLGA4	TRANK1	NA	NA	NA	NA	TRANK1	41937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	37332823	37333208	37333001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA4	50155	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr3	37904355	37904605	37904570	Y	NA	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	2904	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	38227489	38227608	38227524	Y	NA	MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	22909	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	41014854	41015242	41015015	Y	NA	NA	ULK4,CTNNB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-761N21.2	213818	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	CCK	84464	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	42725545	42725856	42725623	Y	LYZL4,KRBOX1,HHATL,CCDC13	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22C	84973	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	43042805	43043020	43042913	Y	FAM198A	FAM198A	NA	NA	NA	NA	FAM198A	24046	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	111255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	43614494	43614503	43614499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD5	115102	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	45138887	45139080	45139004	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	46834	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	45141662	45142027	45141978	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43887	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	45594952	45595331	45595047	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	66	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	45681547	45681721	45681608	Y	LIMD1	SACM1L	NA	NA	NA	NA	SACM1L	46827	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	45953510	45953801	45953609	Y	SACM1L,FYCO1	LZTFL1	NA	NA	NA	NA	LZTFL1	1733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	46341741	46342039	46341904	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR2	NA	SLC6A20,CCR9,CCR3,CCR5,LOC100132146,FYCO1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-24F11.2	104511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	46440782	46440864	46440851	Y	NA	RP11-24F11.2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	RP11-24F11.2	5686	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	132975	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr3	46670526	46670816	46670674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	62378	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	46967558	46967892	46967707	Y	KLHL18,NBEAL2	NA	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	51281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	46989736	46990203	46989983	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28970	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	47120016	47120037	47120026	Y	SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	83420	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	47134411	47134793	47134602	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	68664	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	47176804	47177094	47176949	Y	PRSS45,PRSS42	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	26363	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	47203467	47203704	47203598	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	10	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	48734201	48734270	48734236	Y	NA	CELSR3,NCKIPSD,IP6K2	NA	NA	NA	NA	NCKIPSD	12404	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	49382516	49382833	49382703	Y	ARIH2,DALRD3,UBA7,RHOA,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	6371	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	49938038	49938186	49938111	Y	TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54	TRAIP,CAMKV,MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MST1R	1113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	49968490	49968553	49968522	Y	NA	MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MON1A	2884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	50204265	50204566	50204413	Y	HYAL2	SEMA3F	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	13787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	50625949	50626261	50626110	Y	RBM5,RASSF1,RASSF1,CACNA2D2	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	20690	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	50638353	50638905	50638586	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	8046	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	50980831	50981015	50980923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4787	270320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	51506153	51506528	51506417	Y	VPRBP,RAD54L2,GPR62	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	25482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	51628881	51628909	51628894	Y	GPR62	NA	NA	NA	NA	NA	TEX264	65800	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	52009750	52010220	52010093	Y	NA	RRP9,PARP3,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29	NA	NA	NA	NA	ABHD14A-ACY1,ACY1	2684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	52287340	52287625	52287477	Y	PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M	RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	9499	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	53380883	53380907	53380896	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	1229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	53568043	53568300	53568167	Y	SFMBT1	CACNA1D	NA	NA	NA	NA	CACNA1D	41360	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	859259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	56013802	56014004	56013903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	575185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	56665346	56665542	56665444	Y	C3orf63	FAM208A	NA	NA	NA	NA	FAM208A	49723	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	56818012	56818198	56818042	Y	CCDC66,C3orf63,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	102747	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	56957686	56958168	56958064	Y	CCDC66,C3orf63,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA12	134301	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	57945627	57945950	57945779	Y	PDE12	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	46177	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	57957829	57958015	57957905	Y	NA	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	34112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	57958534	57958833	57958768	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	33294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	58321418	58321818	58321477	Y	NA	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	4811	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	58336517	58336871	58336595	Y	PXK	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	19910	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	58457172	58457525	58457255	Y	RPP14,RPP14,KCTD6	PDHB,KCTD6	PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD6	18316	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr3	58585428	58585740	58585446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD6	109587	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	59273031	59273129	59273094	Y	NA	NA	FHIT	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	239221	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	59579572	59579902	59579705	Y	NA	NA	FHIT	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	545762	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	59803830	59804011	59803964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	770020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	60013358	60013756	60013558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	979548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	60695765	60695821	60695814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	539312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	60804439	60804744	60804592	Y	FHIT	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	430389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	63629436	63629448	63629442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC7	218131	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	63942094	63942115	63942105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	65543	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	63946118	63946531	63946303	Y	NA	NA	LOC100507062	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	61127	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	64850540	64850549	64850545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	842882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	65016570	65016819	65016695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	1005690	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	65690412	65690419	65690417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	332090	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	67512199	67512308	67512254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	190730	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	71136796	71137147	71137136	Y	FOXP1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	493993	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	71158778	71158960	71158907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	472180	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	71493467	71493739	71493621	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	137401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	71535859	71536392	71536211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	94748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	653678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	76160921	76161072	76160934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	320097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	79366624	79366716	79366670	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	448249	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	79667523	79667843	79667648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	147122	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	82013657	82013800	82013729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	204345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	88211290	88211624	88211397	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	14255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr3	97508761	97509065	97508913	Y	NA	ARL6	NA	NA	NA	NA	ARL6	27396	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	98291884	98292296	98292041	Y	OR5H6,OR5H2,CLDND1	CPOX	NA	NA	NA	NA	CPOX	18271	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	98665369	98665647	98665551	Y	NA	DCBLD2	DCBLD2,MIR548G,COL8A1	IMR90	Hi-C	24141950	DCBLD2	46836	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	99201113	99201346	99201253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	582580	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	251621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	99587238	99587483	99587373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	243874	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	99752092	99752383	99752194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	78974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	99766371	99766625	99766459	Y	NA	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	64732	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	100516379	100516430	100516403	Y	ABI3BP	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	90174	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	100519297	100519336	100519310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	93092	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	101592355	101592794	101592687	Y	NFKBIZ,NFKBIZ	NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	47520	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	101661289	101661744	101661436	Y	ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	116454	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	105081269	105081374	105081321	Y	ALCAM	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	505022	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	106146787	106146897	106146851	Y	NA	NA	CBLB	IMR90	Hi-C	24141950	MTND5P16	468839	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	107503481	107503523	107503501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	263698	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	107871244	107871518	107871381	Y	MYH15,HHLA2	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	63372	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	110587612	110587624	110587618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD2	803899	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr3	112145303	112145705	112145529	Y	TMPRSS7	NA	CD200	IMR90	Hi-C	24141950	SLC35A5	132851	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	112274528	112274888	112274746	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	3668	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	112354601	112355057	112354782	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	11320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	112390838	112391135	112390988	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	24461	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	112436805	112436974	112436889	Y	NA	NA	CD200R1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	70428	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	112486003	112486364	112486061	Y	ATG3	NA	CD200R1L,CD200R1,GTPBP8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	119626	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	112531892	112532184	112532038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC80	165515	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	112543206	112543267	112543237	Y	C3orf17	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	164498	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPICE1	152852	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	113209161	113209501	113209331	Y	NA	SPICE1	NA	NA	NA	NA	SPICE1	22533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	113270876	113271161	113270996	Y	NA	SPICE1	NA	NA	NA	NA	SPICE1	38842	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	113470106	113470294	113470144	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	ATP6V1A	6240	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	113701770	113701838	113701802	Y	KIAA1407,DRD3,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	20842	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	114354102	114354718	114354116	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	509400	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	114563365	114563725	114563545	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	300393	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	114577698	114578255	114577941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	285863	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	114784892	114785127	114785010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	78991	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639145	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	115503837	115504240	115504182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639719	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	681595	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	115558428	115558819	115558693	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	694310	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	115776361	115776759	115776562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	912243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	115790074	115790198	115790193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	925956	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	115843003	115843038	115843021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	900507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	115918215	115918449	115918332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	825096	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	115939995	115940280	115940138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	803265	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	116138506	116138899	116138890	Y	LSAMP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	604646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	116145742	116145918	116145863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	597627	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	116793804	116794496	116794150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	50259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	117175008	117175053	117175027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	431463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	117632292	117632433	117632362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	81662	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	119120015	119120150	119120022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	65527	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	119142297	119142580	119142348	Y	ARHGAP31,NR1I2,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	43097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	119157549	119157626	119157588	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	28051	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	119369915	119370223	119370069	Y	NR1I2	RP11-190C22.1,COX17	NA	NA	NA	NA	RP11-190C22.1	16918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	119798224	119798287	119798255	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	12977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	120065370	120065692	120065535	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	494	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	120355972	120356358	120356256	Y	NA	NDUFB4,HGD	NA	NA	NA	NA	NDUFB4	42816	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	121638049	121638246	121638101	Y	CSTA,ILDR1	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	86019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	121676624	121676834	121676729	Y	HCLS1,EAF2,CSTA,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	ILDR1	62217	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	121783086	121783706	121783373	Y	HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,DTX3L,CSTA,CD86,CD86	ILDR1	NA	NA	NA	NA	ILDR1	44035	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	122208819	122209075	122208974	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	22717	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	122464996	122465160	122465078	Y	PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	45511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	122988091	122988383	122988237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22A	69317	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	123351425	123351671	123351446	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	49036	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	123372011	123372488	123372368	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	69622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	124188163	124188429	124188181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	258784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	NA	NA	NA	NA	NA	MUC13	109332	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	124860643	124860954	124860853	Y	OSBPL11	NA	NA	NA	NA	NA	MUC13	189980	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	125235229	125235600	125235483	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	1441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	127729316	127729371	127729322	Y	DNAJB8	SEC61A1	SEC61A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SEC61A1	39113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr3	128329972	128330294	128330133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	67624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	128831103	128831496	128831287	Y	NA	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	8148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	128838520	128838686	128838629	Y	MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	958	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	129245456	129245718	129245564	Y	RHO	NA	NA	NA	NA	NA	PLXND1	77943	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	129519745	129520139	129519943	Y	H1FOO	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	90280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	130539887	130540309	130539974	Y	ATP2C1	ATP2C1	ATP2C1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2C1	27130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	131090710	131090810	131090760	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	RP11-933H2.4	7509	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	131742668	131742947	131742808	Y	CPNE4	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P16	218162	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	132288543	132288708	132288626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA5	82582	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	133537876	133537890	133537883	Y	NA	SRPRB	NA	NA	NA	NA	SRPRB	36999	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	133956955	133957302	133957129	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	10387	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	135488806	135488993	135488900	Y	NA	NA	KY,EPHB1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R3A	193522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	135861520	135861675	135861598	Y	MSL2,MSL2	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	52408	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	136420425	136420819	136420623	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	48401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	138080636	138080776	138080706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESYT3	70652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	138581757	138582253	138582041	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.07525172152693
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	NA	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIK3CB	82539	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	139082145	139082521	139082356	Y	PRR23A,PRR23B,PRR23C	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	24053	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	139344390	139344678	139344552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT3	50181	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	140800268	140800553	140800397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A36	141596	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	140919701	140920097	140919901	Y	NA	ACPL2	NA	NA	NA	NA	ACPL2	25471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	141240287	141240651	141240396	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	36398	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	141397804	141398070	141397938	Y	NA	NA	RASA2,ATP1B3,GRK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNF7	56976	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	141530287	141530473	141530380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	62493	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	141659994	141660128	141660061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	67028	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	141693372	141693614	141693574	Y	TFDP2,TFDP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	67426	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	142164400	142165110	142164972	Y	XRN1	RNU1-100P	NA	NA	NA	NA	XRN1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	143352573	143352896	143352700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	335744	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	143550197	143550392	143550264	Y	C3orf58	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	138248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	143696383	143696503	143696442	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	7743	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	145785304	145785639	145785521	Y	NA	RP11-274H2.3	NA	NA	NA	NA	RP11-274H2.3	332	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	146257874	146258309	146258204	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	2342	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	146955604	146955955	146955778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	694953	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	147072976	147073090	147073034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	809995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	148332840	148332859	148332850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYG1	374269	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	149225895	149226130	149226044	Y	RNF13	TM4SF4,RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	15448	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	149297469	149297617	149297606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	87022	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	149339543	149339560	149339552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	112941	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	149592323	149592638	149592448	Y	RNF13	NA	NA	NA	NA	NA	RNF13	63828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	108725	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	101365	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	100938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	149668313	149668642	149668480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	97933	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	151593609	151593922	151593765	Y	NA	SUCNR1	NA	NA	NA	NA	SUCNR1	4178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	151739734	151740181	151739895	Y	NA	NA	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	SUCNR1	150303	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	151915334	151915455	151915407	Y	NA	MBNL1	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	44162	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr3	151970606	151970904	151970617	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	10989	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	151976173	151976628	151976408	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	8716	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	152026905	152027295	152026911	Y	NA	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	41561	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	152965278	152966000	152965593	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	87249	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	155281187	155281565	155281523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCH1	179291	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	156210737	156211059	156210900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	59914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	156538683	156538849	156538764	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	2421	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	156837520	156837824	156837670	Y	NA	RP11-6F2.5,CCNL1	NA	NA	NA	NA	CCNL1	38725	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr3	156847368	156847750	156847738	Y	NA	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	28799	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRC1	114249	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	158435101	158435147	158435125	Y	NA	LXN,MFSD1,RARRES1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	12840	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	158466226	158466540	158466401	Y	MFSD1	MFSD1,RARRES1	NA	NA	NA	NA	RARRES1	17741	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	159514256	159514624	159514440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	426799	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	160014353	160014630	160014494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	72930	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	160627332	160627671	160627502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1L	155942	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	161032970	161033108	161033039	Y	NA	NA	SPTSSB	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	55560	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	161087231	161087661	161087620	Y	NA	SPTSSB	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	1007	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	163939562	163939697	163939594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	2850894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	167579478	167579761	167579515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINI1	128447	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	168595729	168595981	168595841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	783425	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	168606249	168606616	168606433	Y	NA	NA	EGFEM1P	IMR90	Hi-C	24141950	MECOM	772790	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	439935	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	169051059	169051429	169051244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	327977	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	169075984	169076327	169076322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	303079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	169172792	169172932	169172865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	206474	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr3	169344202	169344434	169344318	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	34972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	169376089	169376313	169376201	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	3093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	169376858	169377055	169376957	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	2351	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	169377431	169377952	169377740	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	1454	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	169378305	169378656	169378554	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	750	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	169379063	169379412	169379208	Y	MECOM	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	169502698	169502873	169502785	Y	GPR160,MYNN,LRRC34	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	14079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A2	140527	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	170957638	170957941	170957717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A2	215099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171002565	171002750	171002646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	173447	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	171175851	171176236	171176082	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171176900	171177208	171176991	Y	TNIK	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	703	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	171522372	171522650	171522540	Y	TNIK,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	4090	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171531632	171532210	171532036	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	PLD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLD1	4892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	171689808	171690183	171689996	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	65235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171693285	171693478	171693411	Y	FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	61940	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171863188	171863575	171863224	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	107770	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	172035782	172036031	172035880	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	106848	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	172325180	172325357	172325227	Y	NA	NA	TNFSF10	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF10	85883	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	172344996	172345137	172345044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEH1	81871	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	174260946	174261332	174261139	Y	NA	NA	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	106583	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	174493498	174493729	174493615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAALADL2	339135	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	175054266	175054532	175054399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	379926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	177018025	177018414	177018104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	104764	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	177038616	177038888	177038742	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	125355	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	177170399	177170552	177170483	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	257138	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	177313306	177313318	177313312	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	400045	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	178532692	178532946	178532777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	255121	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	178699167	178699475	178699434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	88592	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	178787910	178788066	178787991	Y	ZMAT3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	180473227	180473381	180473285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXR1	110548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	181035769	181036114	181035791	Y	SOX2,DNAJC19,DNAJC19	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	330207	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	181537254	181537571	181537413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	109540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	181900608	181900690	181900647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	472894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	182264358	182264360	182264359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11B	244928	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	182978108	182978472	182978157	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	9076	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	182980917	182981737	182981029	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	11885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	184158085	184158429	184158272	Y	NA	NA	CHRD,THPO	IMR90	Hi-C	24141950	POLR2H	80579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS8	199839	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	184775166	184775451	184775309	Y	VPS8	NA	NA	NA	NA	NA	EIF2S2P2	186778	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	185450719	185450896	185450815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	89948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	185533882	185534105	185533994	Y	NA	IGF2BP2	SENP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2BP2	6739	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	185731138	185731327	185731263	Y	DGKG	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-443P15.2	55406	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	186244233	186244290	186244262	Y	ST6GAL1	DNAJB11,TBCCD1	NA	NA	NA	NA	DNAJB11	38902	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	186745346	186745889	186745388	Y	TBCCD1,EIF4A2,RTP4,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99072	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	186892076	186892095	186892086	Y	NA	RPL39L	LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	RPL39L	4601	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	187457681	187458370	187457991	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	3145	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	187467867	187468249	187468141	Y	BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	6352	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	187607399	187607588	187607479	Y	BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	145884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	187660565	187660767	187660697	Y	RTP2	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	199050	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	187810458	187810736	187810660	Y	NA	NA	LPP,BCL6	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	58336	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	187901313	187901616	187901372	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	31468	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	114412	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	188002342	188002742	188002584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	132497	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	188012018	188012343	188012183	Y	LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142173	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	188103161	188103345	188103235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	233316	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	188107561	188108232	188108021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	237716	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	188149383	188149832	188149544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	279538	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	188151524	188151812	188151760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	281679	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	188223633	188224028	188223838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	353788	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	188312026	188312153	188312088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	442181	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	188324508	188324886	188324659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	454663	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	188400806	188401333	188400989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	530961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	188667737	188668123	188668016	Y	NA	NA	LPP,BCL6,LPP-AS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LPP-AS2	797892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	189022377	189022942	189022424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	813811	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	189628932	189629095	189629014	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	207658	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	193587539	193587846	193587782	Y	NA	RP11-528A4.2	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-528A4.2	27726	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	193807302	193807696	193807488	Y	ATP13A3,HES1	HES1	HES1,LOC100131551,LOC647323	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HES1	44238	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	193857372	193857551	193857481	Y	HES1	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	5438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	176183	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	194212902	194213208	194212990	Y	ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	3885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	194269976	194270037	194269999	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,FLJ34208,LRRC15,CPN2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	32703	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	194282077	194282468	194282283	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,XXYLT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM44-AS1	20272	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	194839135	194839291	194839213	Y	FAM43A,C3orf21	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	150605	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	196784656	196784743	196784700	Y	CEP19,PIGX,PAK2	MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	29969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	197247664	197248059	197247722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	50135	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	197301708	197302062	197301885	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	3514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr3	197461391	197461841	197461700	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	209	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	47637	47939	47761	Y	ZNF141	NA	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF141	281664	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	991255	991645	991565	Y	ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175	DGKQ,IDUA,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	10079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	1712467	1712893	1712787	Y	WHSC1	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	1970462	1970680	1970571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	71009	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	2415721	2415975	2415729	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	2415	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	2764467	2764789	2764630	Y	LOC402160	TNIP2,SH3BP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	8364	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr4	3483238	3483365	3483266	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	48921	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	3931557	3931999	3931672	Y	NA	FAM86EP	NA	NA	NA	NA	FAM86EP	23147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	6895356	6895637	6895499	Y	KIAA0232	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	13332	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	6919401	6919899	6919549	Y	MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	10432	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr4	7648496	7648718	7648592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPL1	213796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	8247542	8247920	8247851	Y	NA	HTRA3	NA	NA	NA	NA	HTRA3	21572	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	8411022	8411421	8411226	Y	NA	ACOX3	NA	NA	NA	NA	ACOX3	29029	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	9605717	9605843	9605777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-448G15.1	400263	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	13613048	13613249	13613164	Y	NA	AC006445.7	NA	NA	NA	NA	AC006445.7	18974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	17483580	17483992	17483821	Y	QDPR,CLRN2	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	27865	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	17853657	17853735	17853696	Y	NA	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	43132	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	23890124	23890507	23890316	Y	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	693666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	24407095	24407488	24407238	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	176685	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	NA	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	75834	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	25881877	25882168	25881954	Y	RBPJ,SLC34A2,SEL1L3	SEL1L3	C4orf52,SEL1L3	IMR90	Hi-C	24141950	SEL1L3	18495	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	26888311	26888739	26888468	Y	NA	STIM2,RP11-293A21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	28090	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	28602494	28602613	28602520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1742273	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	28621646	28621809	28621725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1761425	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	32028735	32028753	32028744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	4215378	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	36325568	36325959	36325621	Y	ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	81437	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	37477962	37478211	37478180	Y	C4orf19	C4orf19	NA	NA	NA	NA	C4orf19	24399	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	37668347	37668621	37668474	Y	NA	RELL1	NA	NA	NA	NA	RELL1	17377	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	37956443	37956472	37956456	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	3584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	38147438	38147709	38147590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	187382	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	38159115	38159505	38159287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	199059	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr4	38281500	38281609	38281534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	321444	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	38283120	38283331	38283203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	323064	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	38870386	38870769	38870503	Y	FAM114A1	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	39285630	39285978	39285919	Y	RFC1	NA	NA	NA	NA	NA	RFC1	80017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	40589734	40590029	40589952	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	40863	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	40609271	40609510	40609444	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	21382	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	40620437	40620847	40620835	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	10045	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	160138	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	41000829	41000972	41000906	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	215759	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	41859260	41859639	41859308	Y	PHOX2B	NA	PHOX2B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM33	75498	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	41999139	41999467	41999284	Y	NA	SLC30A9	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	8650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	46723004	46723195	46723100	Y	GABRA4	RAC1P2	NA	NA	NA	NA	RAC1P2	1430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	48125578	48125743	48125738	Y	TEC	NA	NA	NA	NA	NA	CNGA1	108889	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	54172916	54173263	54173102	Y	SCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	56979	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	54871626	54871896	54871863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	56961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	54890749	54890967	54890889	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	37890	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	57132335	57132393	57132366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP31	87908	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	57740482	57740676	57740556	Y	PPAT,REST	REST	THEGL,SPINK2	IMR90	Hi-C	24141950	REST	31399	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	57908977	57909199	57909089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	65352	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	57960936	57961321	57961171	Y	NA	IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	13230	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	61223497	61223597	61223547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN3	841379	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	62068799	62069364	62069049	Y	LPHN3	LPHN3	NA	NA	NA	NA	LPHN3	3823	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	62391434	62391750	62391592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	247818	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	65033615	65033630	65033623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	260997	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	71677284	71677574	71677429	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	26088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	71768830	71769244	71769107	Y	DCK,MOBKL1A	MOB1B	NA	NA	NA	NA	MOB1B	2787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	74393536	74393539	74393538	Y	ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF6	90809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	74549349	74549563	74549470	Y	MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	NA	CXCL5,IL8,CXCL6,CXCL3,CXCL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	54660	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	74583240	74583435	74583319	Y	ANKRD17,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	MTHFD2L,CXCL3	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	20788	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	74596111	74596370	74596188	Y	MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	7853	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	75228037	75228384	75228211	Y	NA	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	476	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	75257879	75258118	75257951	Y	CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	29019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	180987	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr4	75886267	75886485	75886344	Y	PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	29962	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	75955084	75955470	75955277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARM1	98779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	77522680	77522954	77522817	Y	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	168427	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	77665499	77665596	77665548	Y	STBD1,SEPT11	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	203260	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	78016666	78016743	78016704	Y	CCNG2	CCNI	SHROOM3,CCNG2	IMR90	Hi-C	24141950	CCNI	21508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	78263560	78263890	78263733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNG2	187256	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	78823537	78823752	78823560	Y	NA	MRPL1	NA	NA	NA	NA	MRPL1	41863	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	80958042	80958450	80958250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	86158	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	82133438	82133457	82133448	Y	PRKG2	PRKG2	NA	NA	NA	NA	PRKG2	761	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	82527950	82528304	82528033	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	393732	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	82531268	82531394	82531331	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	397050	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	84034119	84034423	84034342	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	21805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	84071761	84071998	84071930	Y	THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	15533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	84133552	84133853	84133829	Y	LIN54,HELQ,PLAC8	NA	COPS4,COQ2,PLAC8	IMR90	Hi-C	24141950	COQ2	70214	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	84887961	84887976	84887969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	432894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	85799806	85800014	85799906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	85524	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	533574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	88074850	88075090	88074969	Y	DSPP	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	84376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	89433703	89434055	89433857	Y	HERC5	PIGY	NA	NA	NA	NA	PIGY	6885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	130072	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	90224802	90225147	90225000	Y	FAM13A,GPRIN3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	194253	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	95270442	95270604	95270537	Y	PDLIM5,HPGDS	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	100433	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	95374521	95374795	95374668	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	3484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	100738800	100739047	100738840	Y	NA	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	2810	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	101803653	101803895	101803774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	463042	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	288765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	102153053	102153484	102153407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	113453	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	102254048	102254281	102254164	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	12656	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	102514961	102515130	102515025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP3CA	247526	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	103536028	103536474	103536149	Y	NHEDC1,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	115542	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	103541931	103542312	103542286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	121445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	103596395	103596588	103596491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	83563	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	103655976	103656198	103656076	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	23953	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	103701783	103702159	103702029	Y	NA	MANBA,RP11-10L12.4	NA	NA	NA	NA	MANBA	21632	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	103781884	103782294	103782163	Y	MANBA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	5759	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	106114825	106115208	106114882	Y	NA	TET2	NA	NA	NA	NA	TET2	49793	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	106362976	106363368	106363172	Y	NA	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	29870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	106390941	106391445	106391094	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	1793	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	106391866	106392288	106392204	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	950	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	106628155	106628490	106628322	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	220	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	106635528	106635690	106635582	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	7593	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	106841550	106841937	106841687	Y	TBCK,LOC100507096	NPNT,INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	26407	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	106846669	106847134	106846803	Y	NA	NPNT,INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	31526	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	109044329	109044618	109044592	Y	LEF1,LEF1	NA	NA	NA	NA	NA	HADH	135459	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	109276862	109276989	109276899	Y	CYP2U1,LEF1,LEF1	NA	LOC641518	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34-AS1	262627	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	110043690	110043849	110043769	Y	COL25A1	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24B	309079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	111027519	111027664	111027592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	90691	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	112797429	112797439	112797434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	267114	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	112814304	112814659	112814583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	249894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	113172339	113172711	113172527	Y	NEUROG2	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	AP1AR	21446	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	113201272	113201525	113201422	Y	TIFA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	3140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	113547591	113547910	113547748	Y	NA	LARP7,C4orf21	NA	NA	NA	NA	LARP7	8210	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	113979855	113980234	113980217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	242590	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	10.7913089519401
chr4	114366444	114366711	114366574	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	26965	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	114367129	114367387	114367298	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	27650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	114390310	114390498	114390393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	50831	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	114563561	114563906	114563734	Y	CAMK2D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	117177	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr4	119890642	119890944	119890758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24D	132804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	120024463	120024846	120024696	Y	NA	NA	SYNPO2,USP53,MYOZ2	IMR90	Hi-C	24141950	USP53	106896	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	120437308	120437708	120437606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	63362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	120444503	120444790	120444647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	70557	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr4	121266106	121266305	121266196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD2L1	279877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	122313649	122313906	122313729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA5	302362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr4	122703678	122703696	122703687	Y	NA	EXOSC9,CCNA2	NA	NA	NA	NA	EXOSC9	16776	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	123686146	123686329	123686228	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	34289	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	124272958	124273104	124273084	Y	NA	SPRY1	LOC285419,SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY1	42846	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.2136018362954
chr4	124709037	124709145	124709084	Y	SPRY1	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	393087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	124941316	124941540	124941431	Y	NA	NA	SPATA5,LOC285419	IMR90	Hi-C	24141950	TECRP2	441405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	128059787	128060054	128059921	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	482372	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	128403085	128403258	128403257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	139168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	128562832	128562937	128562880	Y	NA	INTU	NA	NA	NA	NA	INTU	20406	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	129275726	129275798	129275762	Y	NA	NA	PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	63820	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	130248969	130249354	130249162	Y	SCLT1,C4orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	236205	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	134191473	134191538	134191506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-553P9.3	1851396	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr4	140017684	140017800	140017744	Y	RAB33B,ELF2	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	78572	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140035787	140036142	140035958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	60230	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140737173	140737338	140737263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	152251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140793640	140793753	140793693	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	208718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140850270	140850709	140850607	Y	MAML3,CLGN	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	222629	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140886001	140886373	140886187	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	186965	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140924986	140925148	140925064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	148190	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	140970177	140970718	140970535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	102620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	141019887	141020108	141020058	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	53230	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	141020500	141020888	141020694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	52450	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	141217539	141217769	141217667	Y	NA	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	141287573	141287758	141287638	Y	NA	RP11-425I13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-425I13.1	1558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	141639566	141639883	141639758	Y	TBC1D9	TBC1D9	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	35391	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	142196982	142197372	142197125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF330	56941	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	143072986	143072994	143072990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	693591	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	143206374	143206633	143206590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	559952	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	143276364	143276478	143276442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	490107	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	143337797	143338156	143337961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	428429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	143608710	143609035	143608873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	157550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	143698676	143698917	143698797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	67668	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	144280232	144280410	144280287	Y	USP38,SMARCA5,GAB1	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	24317	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	146200337	146200591	146200486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN3P1	94104	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	146815736	146815927	146815832	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	41860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	147192653	147192904	147192792	Y	ZNF827,SLC10A7	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	97816	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	148374725	148374999	148374823	Y	TMEM184C	NA	TMEM184C	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM184C	161535	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	148981855	148982042	148981912	Y	PRMT10,NR3C2	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	330641	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	149364278	149364693	149364534	Y	NR3C2	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	713064	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	151681778	151681989	151681952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	252890	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	152033251	152033470	152033361	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	14526	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	152105959	152106222	152106091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	87234	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	152127737	152127987	152127916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	109012	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	152226044	152226315	152226216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-610P16.1	101672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	152367520	152367754	152367585	Y	NA	RP11-610P16.1,FAM160A1	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	39152	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	153180278	153180573	153180364	Y	NA	NA	PET112,FAM160A1,FBXW7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXW7	274680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	153412522	153412921	153412842	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	42332	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	154127038	154127322	154127172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	55544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	154138645	154138936	154138742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	67151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	154253952	154254140	154254046	Y	NA	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	9661	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	154562795	154563024	154562959	Y	TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR2	57628	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	154571958	154574588	154573746	Y	TLR2	TLR2	NA	NA	NA	NA	TLR2	46064	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	154580466	154580842	154580627	Y	TLR2	TLR2	NA	NA	NA	NA	TLR2	39810	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	155577667	155577895	155577781	Y	NA	LRAT	FGB	IMR90	Hi-C	24141950	LRAT	31570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	157868046	157868334	157868214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM144	1252422	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	158165713	158165951	158165760	Y	GRIA2,GRIA2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM144	954805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	158219771	158220072	158219781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM144	900684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	159728927	159729240	159728972	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	40637	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	159746098	159746434	159746194	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	57808	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	160195976	160196239	160196029	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	507686	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	160199508	160199928	160199727	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	511218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	378130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	169017252	169017480	169017407	Y	ANXA10	ANXA10	NA	NA	NA	NA	ANXA10	5586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	169375795	169375933	169375918	Y	NA	PALLD	NA	NA	NA	NA	PALLD	40284	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	169791118	169791499	169791286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	137927	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	169991170	169991417	169991322	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	61744	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	173920202	173920438	173920320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT7	167466	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	174112212	174112389	174112298	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	23409	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	174112816	174113032	174112924	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	24013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	174443232	174443552	174443433	Y	HAND2	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30	154112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	174470601	174470612	174470607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30	181481	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	174799900	174800331	174800064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP44	402497	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	174945090	174945120	174945105	Y	HAND2	NA	NA	NA	NA	NA	CEP44	257708	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	176340355	176340496	176340426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	644489	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	176349248	176349641	176349474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	635344	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	176814255	176814522	176814389	Y	GPM6A,GPM6A	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	170463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	177824075	177824477	177824359	Y	NA	NA	VEGFC	IMR90	Hi-C	24141950	NEIL3	404513	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	184328356	184328744	184328447	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	35000	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.90535241013771
chr4	184330014	184330225	184330125	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	33519	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	8.02430665657081
chr4	184376829	184376946	184376888	Y	CLDN24	CDKN2AIP,ING2	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	13085	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	184643961	184644129	184644061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC11	65541	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	STOX2	53095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	184751768	184752101	184751917	Y	NA	STOX2	ENPP6,STOX2,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	STOX2	20483	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	185231317	185231632	185231620	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,LOC728175	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2	162102	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	185269961	185270243	185270083	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	123491	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr4	185304654	185305034	185304819	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	88700	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	185306912	185307204	185307108	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	86530	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	185331771	185332231	185332067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	61503	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	186022699	186022728	186022714	Y	NA	SLC25A4	SLC25A4,LOC100506229	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A4	39667	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC110	104154	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	186730607	186731122	186730955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	257184	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr4	186760271	186760668	186760511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	227638	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	186823839	186824139	186824048	Y	CCDC110,SORBS2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	164167	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr4	190489859	190490580	190490206	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	138288	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	190498601	190498949	190498697	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	129919	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	79769	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	448605	448866	448667	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	EXOC3	7332	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	601191	601577	601476	Y	PLEKHG4B,SLC9A3,CEP72	CEP72	SLC9A3,CEP72	IMR90	Hi-C	24141950	CEP72	8810	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	5.25730436120156
chr5	1041596	1043550	1041859	Y	NA	NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	34652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr5	1110480	1111164	1110500	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	1130725	1130985	1130924	Y	NA	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	20575	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.90535241013771
chr5	1152155	1152545	1152489	Y	NA	SLC12A7	SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A7	42005	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	1315765	1316275	1315843	Y	TERT	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	22581	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	1316464	1316882	1316563	Y	TERT,SLC6A3	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	23280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	1475636	1475716	1475666	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT1	46376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	2740702	2741010	2740867	Y	NA	C5orf38,IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	9235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	3980262	3980454	3980301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX2	1229293	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	5423578	5423857	5423693	Y	KIAA0947	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	4801	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	6452962	6453210	6453103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED10	76255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	4.98060413166464
chr5	6927514	6927543	6927527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	163510	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	6961316	6961478	6961397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	197312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	10270287	10270466	10270406	Y	NA	FAM173B,CCT5,CMBL	NA	NA	NA	NA	CCT5	22254	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	10759548	10759882	10759715	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14037218	14037324	14037271	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14037561	14037744	14037653	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94909	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14039774	14040034	14039980	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	97122	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	14108761	14108933	14108800	Y	TRIO	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	32878	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14109130	14109647	14109337	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	32164	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14174472	14174896	14174531	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	32661	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14251046	14251256	14251151	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	109235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	14666216	14666664	14666270	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	3443	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	16492574	16492683	16492630	Y	FAM134B	ZNF622	NA	NA	NA	NA	ZNF622	28673	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	16733521	16733894	16733888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	118354	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	16736297	16736738	16736539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	121130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	16855522	16855861	16855692	Y	NA	CTB-55B8.1	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	44889	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	21551190	21551442	21551193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	211248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	23415572	23415664	23415586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1393926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	24155781	24155941	24155882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	653649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	24272966	24273308	24273185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	536282	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	24283282	24283641	24283411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	525949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	25438068	25438428	25438198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	249303	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	26847119	26847280	26847167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01021	623119	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	31511930	31511946	31511938	Y	NA	DROSHA,C5orf22	NA	NA	NA	NA	DROSHA	18357	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	CTD-2206G10.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2206G10.2	26639	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	32175167	32175567	32175368	Y	NA	GOLPH3,CTD-2186M15.1	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	2711	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	33808872	33808964	33808905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMACR	197256	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	34048471	34048803	34048799	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	42251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.07525172152693
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr5	34715239	34715402	34715248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	60897	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	34856339	34856427	34856383	Y	NA	TTC23L	NA	NA	NA	NA	TTC23L	19401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	34949030	34949157	34949062	Y	NA	BRIX1,RAD1,DNAJC21	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	21332	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	35822621	35822984	35822929	Y	IL7R	NA	NA	NA	NA	NA	SPEF2	206675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	36614653	36614946	36614866	Y	LMBRD2,RANBP3L,SLC1A3,SLC1A3	SLC1A3	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	10196	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPBL	154757	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	37776965	37777327	37776998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	399651	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	38650799	38651230	38651069	Y	NA	LIFR	EGFLAM,LIFR,OSMR	IMR90	Hi-C	24141950	LIFR	44343	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	38866844	38867106	38866976	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	22884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	39399549	39400018	39399831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2	60384	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	39486280	39486288	39486284	Y	NA	DAB2	DAB2,C9	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	25878	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	40378402	40378773	40378595	Y	PTGER4	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	298827	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	40515089	40515403	40515208	Y	PTGER4,CARD6	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	162197	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	40967939	40968194	40968008	Y	C6,C7	NA	NA	NA	NA	NA	CARD6	128653	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	4127	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	43038627	43038828	43038720	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	849	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	43105884	43106284	43106088	Y	NA	ZNF131	LOC153684,LOC100132356,ZNF131	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF131	42606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	44821100	44821499	44821234	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	MRPS30	14073	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	45492621	45492641	45492631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	685594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	49660016	49660402	49660209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMB	76680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	51211467	51211491	51211480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISL1	534546	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	52327592	52327905	52327807	Y	ITGA2	ITGA2	NA	NA	NA	NA	ITGA2	44436	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	52332019	52332357	52332083	Y	FST,ITGA2	ITGA2	NA	NA	NA	NA	ITGA2	48863	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	52333334	52333832	52333660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA2	50178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	52627320	52627670	52627488	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST,NDUFS4	IMR90	Hi-C	24141950	FST	146569	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	310514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	53358665	53359272	53358974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	245140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	53460447	53460703	53460575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	143709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	53585796	53586153	53585818	Y	NA	ARL15	NA	NA	NA	NA	ARL15	18259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	53597184	53597322	53597243	Y	SNX18,SNX18,ARL15	ARL15	NA	NA	NA	NA	ARL15	7090	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	54731133	54731267	54731160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	93262	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	54741987	54742107	54742028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	82422	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	54817845	54817996	54817921	Y	NA	RNF138P1,PPAP2A	SKIV2L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF138P1	6533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	55199167	55199571	55199365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL31RA	53960	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	55462645	55462763	55462717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	173650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	55575946	55576115	55576004	Y	NA	NA	MAP3K1,MIER3	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	222784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	55634989	55635155	55635072	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	163744	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	55711184	55711637	55711363	Y	MAP3K1	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	87262	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	56468272	56468727	56468348	Y	MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1	GPBP1	NA	NA	NA	NA	GPBP1	497	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	57758033	57758252	57758173	Y	NA	PLK2	NA	NA	NA	NA	PLK2	3946	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	58358500	58358548	58358538	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	604413	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	58374119	58374354	58374236	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	620032	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	58391200	58391585	58391393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	637113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	58421119	58421626	58421279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	667032	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	58428038	58428165	58428144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	673951	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	58445128	58445519	58445324	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	691041	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	58575824	58576193	58576112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	821737	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	58816932	58817290	58817225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	998657	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	58952543	58952885	58952791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	863062	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	59042319	59042506	59042428	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	773441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	60629089	60629454	60629159	Y	NA	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	2989	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	60751661	60751965	60751750	Y	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	65963	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	61661747	61661797	61661772	Y	NA	DIMT1,IPO11	NA	NA	NA	NA	DIMT1	35969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	64056126	64056496	64056311	Y	NA	SREK1IP1,CWC27	NA	NA	NA	NA	SREK1IP1	6016	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	64062074	64062237	64062149	Y	NA	SREK1IP1,CWC27	NA	NA	NA	NA	SREK1IP1	275	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	64309059	64309061	64309060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	246302	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	64572544	64572695	64572620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	284303	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	66041981	66042157	66042052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4	151805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	66178568	66178972	66178612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	118809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	67731585	67731712	67731618	Y	PIK3R1	NA	PIK3R1	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3R1	222037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	67898567	67898909	67898738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	389019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.35195195106386
chr5	71310073	71310274	71310173	Y	MAP1B	NA	PTCD2,MRPS27	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1B	90787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	71648982	71649164	71649085	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	34509	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	71790341	71790453	71790397	Y	MAP1B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	175868	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	71814906	71815162	71815011	Y	NA	NA	PTCD2,ZNF366,TNPO1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	200433	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	72218346	72218584	72218427	Y	NA	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	31224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	98192	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	72599094	72599410	72599166	Y	NA	NA	FCHO2,BTF3,FOXD1,TMEM171	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	142942	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	72764124	72764182	72764153	Y	NA	FOXD1,BTF3	FCHO2,TMEM174,FOXD1,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	21772	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	73926262	73926632	73926507	Y	FAM169A	HEXB,ENC1	NA	NA	NA	NA	HEXB	7216	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	74862624	74863010	74862882	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	56661	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	74883919	74884208	74884013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	77956	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	74974099	74974276	74974194	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	37037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	75764656	75765363	75765023	Y	IQGAP2,S100Z	NA	NA	NA	NA	NA	IQGAP2	67582	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	76086514	76086772	76086643	Y	F2R	F2RL1	NCRUPAR,F2R,IQGAP2	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	25986	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	76422152	76422524	76422338	Y	NA	ZBED3-AS1,ZBED3	NA	NA	NA	NA	ZBED3	41004	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	77374282	77374304	77374295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCA	211678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	77825252	77825732	77825631	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	170913	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	77882234	77882399	77882291	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	181445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	77888034	77888302	77888035	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	175542	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	77974245	77974379	77974312	Y	NA	NA	SCAMP1,LHFPL2,ARSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LHFPL2	89465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	78270986	78271091	78271032	Y	NA	ARSB	NA	NA	NA	NA	ARSB	8819	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	79418428	79418727	79418619	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	131171	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	79421543	79422183	79421865	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	127715	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	79553045	79553765	79553579	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	3147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	79768084	79768333	79768119	Y	NA	CTD-2015H6.3,RPL7P24	NA	NA	NA	NA	CTD-2015H6.3	13549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	80055694	80056072	80055883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFR	106892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	81054697	81054861	81054755	Y	NA	SSBP2	SSBP2,ATG10	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP2	9081	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102021	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	81701396	81701769	81701673	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	129000	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	81702078	81702394	81702360	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	129682	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	82005927	82005935	82005931	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	365382	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	82453115	82453241	82453191	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	81433	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	82521420	82521438	82521429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	149738	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	82664842	82665072	82664989	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	293160	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	83018086	83018575	83018426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	78798	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	88125046	88125161	88125149	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	449272	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	495308	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	88367349	88367581	88367488	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	691575	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	88589438	88590015	88589833	Y	NA	NA	MEF2C	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP22	913664	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	89219373	89219748	89219561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN3	483855	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	89259292	89259660	89259475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN3	443943	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	89313497	89313753	89313625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN3	389850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	90680524	90680637	90680608	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3348	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	91949366	91949620	91949441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P27	1067753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	92221738	92222106	92221922	Y	NA	NA	FLJ42709,NR2F1	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P27	795267	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P27	423389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	93853995	93854051	93854006	Y	ANKRD32	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	98001	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	94052096	94052474	94052285	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	99787	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	95240158	95240487	95240414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1	55218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	95414896	95415105	95415065	Y	GLRX,ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	ELL2	119121	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	96051794	96052190	96051986	Y	LNPEP	NA	NA	NA	NA	NA	ERAP1	89613	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	65484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	102121468	102121525	102121497	Y	PPIP5K2	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	33783	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	103465253	103465580	103465434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT12	568759	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	103559627	103559775	103559695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT12	663133	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	106805205	106805528	106805416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	199068	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	106810286	106811182	106810589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	193414	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	106822252	106822471	106822392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	182125	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	106878561	106878904	106878854	Y	EFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	125692	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	106906858	106907181	106907119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97415	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	107179705	107179785	107179745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	175109	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	107555103	107555441	107555272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL17	160358	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	108329034	108329385	108329210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	247511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	108391550	108391948	108391605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	310027	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	108735031	108735161	108735096	Y	NA	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	8534	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	108955472	108955843	108955794	Y	NA	NA	TMEM232	IMR90	Hi-C	24141950	MAN2A1	67224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	109237094	109237311	109237203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	214027	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	110057836	110058086	110057958	Y	NA	SLC25A46,TMEM232	NA	NA	NA	NA	SLC25A46	13751	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	112242412	112242755	112242610	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	13481	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	112314594	112314663	112314629	Y	NA	DCP2	NA	NA	NA	NA	DCP2	4195	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	114623111	114623418	114623265	Y	NA	PGGT1B,CCDC112	NA	NA	NA	NA	CCDC112	7110	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	114755701	114755980	114755870	Y	PGGT1B,TICAM2,FEM1C	NA	FEM1C,TMED7-TICAM2	IMR90	Hi-C	24141950	FEM1C	122611	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	115205022	115205387	115205036	Y	FEM1C	AP3S1,ATG12	NA	NA	NA	NA	ATG12	29467	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	116228958	116228967	116228963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	179029	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	118592872	118593203	118593036	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	9184	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	118627745	118627943	118627845	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	25358	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	118659966	118660476	118660173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	57579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	118703348	118703546	118703439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	82592	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	118742371	118742700	118742646	Y	TNFAIP8,TNFAIP8	HSD17B4	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	43438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	118836565	118836574	118836570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	50427	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	119016321	119016356	119016339	Y	NA	CTC-507E12.1	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	2429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	404650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr5	124006979	124007355	124007057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	135571	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	125773418	125773804	125773609	Y	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	79594	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	126738712	126738949	126738790	Y	MEGF10	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC1	112352	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	127295109	127295375	127295239	Y	NA	NA	SLC12A2,FLJ33630,PRRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC12A2	122083	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	127421091	127421133	127421112	Y	NA	SLC12A2	NA	NA	NA	NA	SLC12A2	3633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	128103121	128103414	128103268	Y	NA	NA	FBN2	IMR90	Hi-C	24141950	FBN2	110243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	128462285	128462535	128462410	Y	NA	ISOC1	NA	NA	NA	NA	ISOC1	33841	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	130560152	130560579	130560426	Y	NA	CDC42SE2	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	18607	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	130693580	130694145	130693755	Y	FNIP1,CDC42SE2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	114394	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	131633963	131634368	131634191	Y	IRF1,SLC22A4	P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	4955	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	131774835	131775712	131775188	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	C5orf56	30507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	131795302	131795488	131795309	Y	NA	AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.6	11247	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	132137425	132137486	132137431	Y	SEPT8,SEPT8	SEPT8,SOWAHA,SHROOM1	NA	NA	NA	NA	SEPT8	3447	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	132404436	132404641	132404539	Y	LEAP2	ZCCHC10,HSPA4	NA	NA	NA	NA	HSPA4	18782	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	132982592	132982988	132982790	Y	NA	FSTL4	FSTL4	IMR90	Hi-C	24141950	FSTL4	36337	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	133290184	133290209	133290197	Y	NA	C5orf15,VDAC1	NA	NA	NA	NA	C5orf15	12269	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	133313011	133313350	133313119	Y	UBE2B,PPP2CA	C5orf15,VDAC1	NA	NA	NA	NA	C5orf15	10533	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	133435759	133436442	133436277	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	TCF7,SKP1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7	11960	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	133543428	133543671	133543548	Y	NA	SKP1,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	16162	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	135341804	135342193	135341990	Y	FBXL21,TGFBI	TGFBI	TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	20391	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	136940488	136940640	136940554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL3	129139	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	137333439	137333810	137333723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13B	51840	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	138241399	138241693	138241546	Y	NA	NA	SIL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	154401	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	161141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	138436608	138436808	138436708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	170633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	139017934	139018665	139018227	Y	MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	6219	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	139070074	139070356	139070181	Y	NA	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	45190	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	139077054	139077268	139077188	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	52170	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	139078128	139078514	139078502	Y	C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	53244	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	139088295	139089196	139088669	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	63411	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	139090416	139090834	139090571	Y	MATR3,MATR3,CXXC5	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	65532	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	66056	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	139167686	139167904	139167758	Y	NA	NA	CXXC5,UBE2D2,DNAJC18,NRG2,PSD2,CYSTM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC5	142802	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	139598972	139599011	139598993	Y	ANKHD1	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	81695	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr5	140376000	140376321	140376119	Y	PCDHGA8,PCDHGC4,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA6,PCDHB16,PCDHB15,PCDHB12,PCDHA1,PCDHA2,PCDHA3,PCDHA4,PCDHA5,PCDHA6,PCDHA7,PCDHA10,PCDHA13	PCDHAC2	NA	NA	NA	NA	PCDHAC2	32180	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	140381838	140382244	140382041	Y	DND1,PCDHAC1,PCDHAC2,PCDHAC2	PCDHAC2	NA	NA	NA	NA	PCDHAC2	38018	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	140464698	140465034	140464866	Y	SLC25A2,PCDHGC4,PCDHGC3,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA7,PCDHGA2,PCDHB7,PCDHB6,PCDHB15,PCDHB12,PCDHB10,PCDHAC1,PCDHB1,PCDHB4	PCDHB2,PCDHB4	PCDHB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	7193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	22059	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	141191253	141191653	141191448	Y	PCDHGA3,PCDHGB1,PCDHGB2,PCDHGA6,PCDHGA8,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1	NA	PCDH1,LOC729080,PCDH12	IMR90	Hi-C	24141950	PCDH1	65158	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	141201064	141201327	141201197	Y	PCDH1	NA	PCDH1,LOC729080,FCHSD1,ARAP3,KIAA0141,PCDH12,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	PCDH1	55484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	141311332	141311399	141311366	Y	NA	KIAA0141,RNF14	NA	NA	NA	NA	KIAA0141	9959	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	141851932	141852283	141852109	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	147912	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	141977799	141977936	141977865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	170013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	141992944	141993173	141993092	Y	FGF1,FGF1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	154776	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	142216734	142217104	142216831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	68785	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	142315332	142315934	142315386	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	167383	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	142339728	142340345	142340014	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	191779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	142357164	142357537	142357332	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	209215	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	142541504	142541934	142541585	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	168236	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	142631598	142631871	142631713	Y	ARHGAP26,NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	78299	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	142819954	142820205	142820015	Y	NA	NR3C1	NA	NA	NA	NA	NR3C1	6877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	143567299	143567675	143567503	Y	NA	YIPF5	NA	NA	NA	NA	YIPF5	19021	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	144549099	144549238	144549211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID2	663694	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	144740586	144740760	144740654	Y	NA	NA	KCTD16,SH3RF2	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	472172	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	145356389	145356594	145356491	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	42247	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	145572478	145572767	145572623	Y	GPR151,GRXCR2	LARS,RBM27	LARS,RBM27	IMR90	Hi-C	24141950	RBM27	8346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	146242854	146243152	146243003	Y	GPR151,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	219195	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	146378574	146378711	146378699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	83636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPINK1	254479	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr5	147603808	147604119	147603866	Y	SPINK6,SPINK13	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373N22.3	157227	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	147605275	147606051	147605859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373N22.3	155295	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr5	147722722	147723108	147722793	Y	SPINK14,SPINK7	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	RP11-373N22.3	38238	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	148533618	148533717	148533668	Y	NA	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	ABLIM3	14572	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	148869266	148869383	148869317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	59624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	149063374	149063774	149063380	Y	NA	PPARGC1B	CSF1R,PDE6A,PPARGC1B,ARHGEF37,HMGXB3,TIGD6,SLC26A2	IMR90	Hi-C	24141950	PPARGC1B	44087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr5	149456060	149456090	149456075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIGD6	77330	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	149838456	149838698	149838517	Y	SYNPO,ZNF300,SLC6A7	RPS14,NDST1	NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS14	11137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	150462985	150463261	150463131	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	7877	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	150505089	150505277	150505181	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69,ANXA6	TNIP1,ANXA6	TNIP1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA6	30166	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	150873344	150873758	150873456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A1	58737	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	151119916	151120243	151119990	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	SPARC	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	23696	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	151129219	151129502	151129338	Y	SLC36A1	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	14437	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	151894600	151894915	151894691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	744507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	152822087	152822411	152822258	Y	NA	NA	GRIA1	IMR90	Hi-C	24141950	MFAP3	594055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	153472059	153472154	153472107	Y	NA	NA	SAP30L,GALNT10,FLJ38109	IMR90	Hi-C	24141950	FAM114A2	55563	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr5	156540141	156540423	156540353	Y	NIPAL4,ADAM19,HAVCR2	HAVCR2,MED7	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	27457	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	156657159	156657494	156657327	Y	MED7,MED7	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	33595	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	156700202	156700407	156700238	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	9113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	156724834	156725095	156724964	Y	NA	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	33745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	156814689	156815040	156814693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL4	69987	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	156968105	156968405	156968157	Y	NA	ADAM19	NA	NA	NA	NA	ADAM19	32378	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	157038675	157038947	157038784	Y	NIPAL4,ADAM19	ADAM19	NA	NA	NA	NA	ADAM19	37892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	157838787	157838874	157838861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLINT1	554604	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	158366953	158367057	158367005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	267872	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	158605991	158606398	158606265	Y	NA	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	28531	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	22663	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr5	158764609	158764870	158764738	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B	NA	NA	NA	NA	NA	UBLCP1	76520	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	159480874	159481257	159481243	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	46754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	159837617	159837836	159837727	Y	NA	C5orf54,SLU7,PTTG1	NA	NA	NA	NA	SLU7	8882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	167909535	167909826	167909541	Y	NA	RARS,FBLL1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	RARS	1624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	168232470	168232861	168232812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	191153	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	169381509	169381572	169381541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP1	396919	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	GABRP	127423	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr5	170378492	170378604	170378547	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	91618	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	171039588	171039891	171039740	Y	NA	NA	FBXW11	IMR90	Hi-C	24141950	FGF18	194928	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	171298269	171298393	171298371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	133484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	171388246	171388386	171388315	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	43491	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	171556306	171556459	171556365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	56931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	172208951	172208972	172208964	Y	UBTD2	DUSP1	ERGIC1,DUSP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	12753	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	172329840	172330200	172330006	Y	DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	53532	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	172463160	172463425	172463226	Y	NA	NA	C5orf41	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V0E1	54400	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	119633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	173237626	173237876	173237751	Y	NA	NA	BOD1	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	75407	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	173311853	173312083	173311958	Y	NA	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	1200	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	173846140	173846257	173846227	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	303279	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	173846628	173846975	173846845	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	302561	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	174148035	174148467	174148121	Y	MSX2	MSX2	NA	NA	NA	NA	MSX2	1069	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	175974830	175975038	175974917	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,C5orf25,RNF44,CDHR2	RNF44,CDHR2	NA	NA	NA	NA	CDHR2	7318	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	176337374	176337559	176337468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5A	101896	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	176359562	176359884	176359876	Y	RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	87750	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,GRK6	NA	NA	NA	NA	LMAN2	13315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7,RP11-1277A3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1277A3.1	5744	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7,RP11-1277A3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1277A3.1	6334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	177647239	177647603	177647383	Y	CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	17731	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr5	177757894	177758005	177757937	Y	CLK4	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	128386	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B,RNU1-39P	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	178323440	178323622	178323554	Y	NA	ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2	NA	NA	NA	NA	ZFP2	2545	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	178326649	178327118	178326669	Y	NA	ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2	NA	NA	NA	NA	ZFP2	5754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	178985972	178986151	178986083	Y	NA	RUFY1	NA	NA	NA	NA	RUFY1	10413	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	179188972	179189165	179189138	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	MAML1	31121	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	179398044	179398477	179398178	Y	RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9B	65185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	179777875	179778220	179778048	Y	OR2Y1	GFPT2	NA	NA	NA	NA	GFPT2	167	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	179967202	179967410	179967248	Y	NA	CNOT6	NA	NA	NA	NA	CNOT6	47790	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	180371458	180371675	180371567	Y	OR2Y1,BTNL8,OR2V2,BTNL3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP62	85172	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	180600516	180600767	180600667	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	16157	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr6	286457	287090	286788	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	2540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	320653	321052	320689	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	31023	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	399829	400349	400039	Y	DUSP22,IRF4,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	110199	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	440153	440531	440212	Y	NA	NA	IRF4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP22	150523	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	1250840	1251149	1250977	Y	NA	NA	EXOC2,LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	59526	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr6	1335859	1336005	1335918	Y	NA	FOXQ1	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	25184	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	1554418	1554641	1554530	Y	NA	NA	MYLK4,LOC100508120,EXOC2,GMDS	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC1	54040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	1654317	1654529	1654407	Y	NA	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	45636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	1702305	1702315	1702310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	93624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	1869270	1869328	1869296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	260589	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	2038182	2038509	2038345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	205417	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr6	2081468	2081822	2081645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	162104	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	2299603	2299973	2299788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	55621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	2763251	2763536	2763387	Y	NA	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	2849123	2849376	2849246	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	8883	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	2952080	2952258	2952142	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9,NQO2	SERPINB6,NQO2	NA	NA	NA	NA	SERPINB6	17832	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	3403581	3403822	3403689	Y	BPHL,SLC22A23	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	51434	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	3749707	3750120	3749911	Y	C6orf145	PXDC1	NA	NA	NA	NA	PXDC1	140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	4613428	4613746	4613742	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	90647	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	4717932	4718044	4717990	Y	PPP1R3G	CDYL	NA	NA	NA	NA	CDYL	13539	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	4931719	4931926	4931911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPP40	70371	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	4990656	4990905	4990781	Y	NA	RPP40	NA	NA	NA	NA	RPP40	11392	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	5246431	5246752	5246693	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	LYRM4	12420	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	5296297	5296648	5296345	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	37020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	5996432	5996750	5996575	Y	NA	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	8450	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	5997075	5997523	5997169	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	7677	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	6008887	6009261	6009138	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	3687	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	6319679	6319940	6319886	Y	F13A1	NA	NA	NA	NA	NA	NRN1	314479	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	6657678	6658009	6657847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	447821	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	6678540	6678781	6678655	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	427049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr6	6807115	6807400	6807321	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	298430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	6851413	6851674	6851488	Y	NA	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	254156	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	6970116	6970321	6970219	Y	NA	NA	LY86	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	135509	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	7052517	7053280	7052961	Y	LY86	NA	RREB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RREB1	52550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr6	7074033	7074425	7074227	Y	LY86,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	31405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	7137966	7138068	7138020	Y	RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	32136	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	7143191	7143555	7143322	Y	NA	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	37361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	7392474	7392879	7392481	Y	NA	SSR1,RIOK1	NA	NA	NA	NA	RIOK1	4745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	7692548	7692711	7692643	Y	NA	BMP6	PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	BMP6	32319	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	7996922	7997003	7996963	Y	BMP6,TXNDC5,TXNDC5	TXNDC5	NA	NA	NA	NA	TXNDC5	27643	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	9037386	9037741	9037564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	603592	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	9645896	9646138	9645974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	771754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	10355646	10355875	10355765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	62017	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	10552532	10552740	10552636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCNT2	62076	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	10719904	10720278	10720060	Y	NA	PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	TMEM14C	870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	10771427	10771996	10771700	Y	ELOVL2,MAK	TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	25400	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	10897145	10897485	10897326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAK	60381	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	11263609	11264019	11263885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	116562	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	11318376	11319012	11318732	Y	TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	61569	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	11460199	11460430	11460300	Y	TMEM170B,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	75508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	11523168	11523305	11523200	Y	TMEM170B,HIVEP1	TMEM170B	NEDD9,SYCP2L,C6orf228,ELOVL2,LOC100506409,GCM2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	12633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	11651155	11651370	11651270	Y	NA	NA	HIVEP1,EDN1,ADTRP	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	115217	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	11729368	11729745	11729666	Y	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	193430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	12332214	12332482	12332362	Y	NA	EDN1	EDN1,TMEM170B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EDN1	43618	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	12343376	12343753	12343652	Y	NA	NA	TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	54780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	217412	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr6	12795944	12795984	12795964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	283602	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	13636617	13636971	13636795	Y	TBC1D7,GFOD1,CD83	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	23058	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	14638705	14639298	14639002	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	522833	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	14748705	14748822	14748765	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	495705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	14758684	14758801	14758713	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	485726	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	14826835	14827098	14826967	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	417429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16218769	16218941	16218854	Y	NA	NA	GMPR,JARID2,DTNBP1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYLIP	91413	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16244335	16244343	16244339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLIP	116979	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16420932	16421664	16421198	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	MYLIP	293576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16422379	16422759	16422608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLIP	295023	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16436821	16437137	16436938	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	MYLIP	309465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16474193	16474630	16474472	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	284739	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16669504	16669854	16669679	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	89515	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	85886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16712557	16713382	16713252	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	45987	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16714644	16714961	16714802	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	44408	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16724246	16724395	16724344	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	34974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	16729304	16729629	16729584	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	29740	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	16771345	16771373	16771363	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATXN1	11623	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	17925685	17925969	17925835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	59885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	17932767	17932988	17932837	Y	RNF144B,KDM1B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	52866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	18308493	18308879	18308567	Y	NA	DEK	RNF144B	IMR90	Hi-C	24141950	DEK	45439	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	18700371	18700729	18700516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	333592	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	20418274	20418752	20418425	Y	NA	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	17876	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	20811412	20811642	20811580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	278724	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	21129910	21130117	21129994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	461855	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr6	24228927	24229160	24229097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCDC2	127120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	24348668	24348920	24348794	Y	DCDC2,KAAG1,DCDC2	DCDC2	NA	NA	NA	NA	DCDC2	7360	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	24927472	24927654	24927651	Y	ALDH5A1,TDP2,C6orf62	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	46993	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	25303199	25303368	25303284	Y	NA	LRRC16A	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	25893	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	25406864	25407254	25406949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	129558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	25525007	25525226	25525060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	247701	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	4.56555378735925
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	26322637	26323123	26322876	Y	NA	HIST1H4H,BTN3A2	HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H4H	38875	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	26522673	26522990	26522813	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	2597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	27136362	27136689	27136526	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AH	23501	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	27205361	27205470	27205416	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	28338	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	27740489	27740807	27740621	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	32902	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	27780866	27781094	27780996	Y	ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BM	44	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	28099505	28099599	28099552	Y	OR2B2,OR2B6,ZNF187,ZSCAN16	ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	9167	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12,ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	5674	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	28565127	28565440	28565259	Y	NA	SCAND3	SCAND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SCAND3	16549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	28601930	28602271	28602104	Y	NA	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	19941	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND3	128816	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr6	28834475	28834586	28834545	Y	NA	HCG14	NA	NA	NA	NA	HCG14	27721	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	28956602	28956848	28956725	Y	NA	HCG15,ZNF311	NA	NA	NA	NA	HCG15	4622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	29568471	29568641	29568556	Y	MOG,GABBR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP57	78246	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,TRIM31	NA	NA	NA	NA	TRIM31	10038	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.76700229536924
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,TRIM31	NA	NA	NA	NA	TRIM31	8845	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	30716024	30716359	30716084	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	5693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr6	30731311	30731508	30731442	Y	VARS2,VARS2	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	20980	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	30731781	30732171	30732168	Y	NA	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	21450	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	27125	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	30755729	30756010	30755821	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,IER3,MDC1,DDR1,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	45398	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr6	30761567	30761766	30761739	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PRR3,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,PBMUCL1,HLA-C,FLOT1,IER3	NA	FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,MDC1,DDR1,IER3,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4,MUC22,PSORS1C3,TCF19,POU5F1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	51236	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	30926851	30926868	30926858	Y	ATAT1,ATAT1,PBMUCL1,DDR1,DDR1,DDR1,DDR1	SFTA2	NA	NA	NA	NA	SFTA2	28899	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	31240851	31241006	31240942	Y	NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B	HLA-C,RPL3P2	NA	NA	NA	NA	HLA-C	2944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.90535241013771
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	ATF6B	11988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	32430540	32430779	32430657	Y	PSMB8,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DMB,HLA-DMA,STK19,HLA-DRA,HLA-DRB5	NA	NA	NA	NA	NA	PBX2	274577	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	32576157	32576293	32576243	Y	AGPAT1,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,PSMB8,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1	NA	NA	NA	NA	NA	HLA-DQA2	130826	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	32783377	32783532	32783485	Y	HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,TAPBP,RGL2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,HLA-DOB	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	21025	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA	NA	NA	NA	NA	HLA-DOA	19118	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	33129390	33129479	33129402	Y	NA	SLC39A7,RXRB,RING1	NA	NA	NA	NA	SLC39A7	36743	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	33158336	33158731	33158575	Y	NA	SLC39A7,RXRB,RING1	NA	NA	NA	NA	SLC39A7	7491	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	34202925	34203288	34202990	Y	NA	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	NA	NA	NA	NA	HMGA1	275	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	35268720	35268850	35268792	Y	TAF11,ZNF76,DEF6,PPARD	ZNF76,DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	DEF6	5125	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	35270455	35270931	35270541	Y	TAF11,ANKS1A,ZNF76,DEF6,PPARD	ZNF76,DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	DEF6	6860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	713	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	36596849	36597094	36596895	Y	NA	SRSF3,RNU1-88P,CDKN1A	NA	NA	NA	NA	RNU1-88P	8355	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	36634782	36635224	36635042	Y	MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN1A	7081	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	37227057	37227393	37227190	Y	FTSJD2,TMEM217,TBC1D22B,TMEM217	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TMEM217	3126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	37464858	37465170	37465019	Y	NA	CCDC167	NA	NA	NA	NA	CCDC167	528	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	37879889	37880256	37879963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	94614	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	39654865	39655018	39654985	Y	DAAM2,DAAM2,KIF6	KIF6	NA	NA	NA	NA	KIF6	36163	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	40964511	40964818	40964666	Y	NA	UNC5CL	NA	NA	NA	NA	UNC5CL	40110	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	40965087	40965613	40965406	Y	NA	UNC5CL	NA	NA	NA	NA	UNC5CL	39315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	41623844	41623904	41623860	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	21224	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	42283170	42283354	42283262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	99567	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	42372266	42372455	42372353	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	45334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	42515662	42516014	42516002	Y	GUCA1A,MEA1,KIAA0240	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	13786	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	42735698	42735757	42735728	Y	NA	TBCC	TBCC,KIAA0240,GUCA1A,PRPH2,UBR2,ATP6V0CP3,RPL7L1,C6orf226,CNPY3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	23140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	43505816	43505905	43505861	Y	ABCC10,TJAP1	POLR1C,LRRC73,YIPF3,XPO5,POLH	NA	NA	NA	NA	YIPF3	23088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	43767552	43768173	43767868	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	31631	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	43769637	43769823	43769746	Y	NFKBIE,TJAP1	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	33716	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	87630	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	43894411	43894725	43894584	Y	NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	71592	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	43945734	43945924	43945799	Y	NFKBIE	C6orf223	LOC100132354,POLH,MAD2L1BP,RSPH9,GTPBP2,VEGFA,C6orf223,MRPS18A	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	20393	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	43975133	43975197	43975165	Y	CDC5L,C6orf223	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	8816	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	43979820	43980209	43980006	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	13503	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	C6orf223,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	30636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	C6orf223,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	27904	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	44040704	44041103	44040711	Y	C6orf223,NFKBIE	RP5-1120P11.1	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A,HSP90AB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	44443307	44443732	44443616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	90045	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	44887030	44887214	44887174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	456476	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45083481	45083547	45083514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	260143	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45299468	45299716	45299591	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45299904	45300369	45300004	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	41388	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45319946	45320392	45320176	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	23298	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45338943	45339150	45338952	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	4540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45503698	45503963	45503769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	160008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45575518	45575910	45575680	Y	NA	NA	RUNX2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SUPT3H	231828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	45981226	45981258	45981242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-8B1.4	114185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	46436428	46436771	46436600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP39A1	181752	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	46628141	46628475	46628252	Y	NA	CYP39A1,SLC25A27	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	9463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	47214948	47215452	47215060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	60189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	47220408	47220656	47220576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	54985	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	47275760	47275938	47275849	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	119	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	47287720	47287828	47287773	Y	NA	TNFRSF21	TNFRSF21,GPR110	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TNFRSF21	12079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	47550559	47550935	47550672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	107034	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	47618805	47618920	47618863	Y	OPN5	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	175280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr6	48967422	48967791	48967607	Y	MUT	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	461113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	49302208	49302375	49302292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	126529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	49521190	49521511	49521254	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	5077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	49533704	49534052	49533813	Y	C6orf141	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	17591	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P5	396291	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	52242466	52242866	52242548	Y	NA	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	PAQR8	18247	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	52339756	52339820	52339788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	56650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	52345672	52345732	52345729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	62566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	52389241	52389494	52389368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	50219	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	52972904	52973327	52973040	Y	NA	ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	48304	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	53195071	53195341	53195324	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	16606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	53454332	53454653	53454605	Y	NA	GCLC,RP1-27K12.2	KLHL31	IMR90	Hi-C	24141950	GCLC	25115	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	53660581	53660848	53660781	Y	LRRC1	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	3286	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	54845767	54846152	54846043	Y	GFRAL	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83B	136198	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	56315031	56315399	56315215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	502027	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	57052407	57052730	57052411	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	17283	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	57354557	57355032	57354719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	176954	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr6	64386722	64387357	64386973	Y	PHF3	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	42997	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	64814643	64814659	64814650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	470918	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	70479579	70479974	70479889	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	25029	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	70808594	70808991	70808795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	303591	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	71835104	71835283	71835120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	161223	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	73987583	73987923	73987651	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	KHDC1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398K22.12	16645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	74307690	74308056	74307857	Y	KHDC1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC17A5	53822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	74518792	74518970	74518881	Y	MB21D1,CD109,CD109	NA	NA	NA	NA	NA	CD109	115284	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	74861347	74861685	74861516	Y	NA	NA	COL12A1	IMR90	Hi-C	24141950	CD109	457839	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	75278400	75278829	75278677	Y	NA	NA	COL12A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL12A1	634938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	76092789	76092908	76092839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM30A	100105	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	76367901	76367953	76367944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP6	58676	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	76467215	76467333	76467230	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	10306	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	80777050	80777287	80777243	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	37077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	81048044	81048318	81048128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	233680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	82444623	82444816	82444722	Y	NA	FAM46A	NA	NA	NA	NA	FAM46A	15675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	83745270	83745402	83745336	Y	NA	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	29983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	83756669	83757034	83756938	Y	PGM3,DOPEY1	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	18351	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	83931407	83931579	83931543	Y	UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	IMR90	Hi-C	24141950	PGM3	29752	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	84139998	84140114	84140099	Y	ME1	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	1201	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	84601276	84601399	84601338	Y	NA	CYB5R4	NA	NA	NA	NA	CYB5R4	33914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	84931248	84931348	84931298	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	4005	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	85087981	85088261	85088229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	152628	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	85258714	85258725	85258720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	323361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	85484432	85484730	85484624	Y	TBX18	NA	TBX18	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1009	549079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	85834833	85835082	85834958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-30P6.6	262822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	RP11-30P6.6,NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-30P6.6	16592	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	88183289	88183642	88183572	Y	NA	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	4948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	89577904	89578284	89578094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	93064	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	89591363	89591365	89591364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	79983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1,SRSF12	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	90970974	90971061	90971018	Y	NA	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	33566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	91004830	91005121	91005041	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	203	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	91134952	91135221	91135020	Y	NA	NA	BACH2	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	130325	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	91792357	91792687	91792522	Y	MAP3K7,MAP3K7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	497593	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	96292932	96293309	96293121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT9	168551	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	99081727	99082103	99081968	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	311746	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	100051584	100051769	100051603	Y	NA	CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	36735	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	100584000	100584312	100584155	Y	NA	NA	SIM1,ASCC3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	391840	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	106094309	106094752	106094489	Y	PRDM1	NA	ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	245350	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	106433951	106434222	106434177	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	97973	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	106643011	106643217	106643065	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	110816	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	108324190	108324471	108324239	Y	NA	SEC63,RPL3P7	NA	NA	NA	NA	RPL3P7	301	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	108574394	108574619	108574507	Y	NA	SNX3,LACE1	NA	NA	NA	NA	SNX3	5845	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr6	109602805	109602853	109602823	Y	NA	NA	CCDC162P	IMR90	Hi-C	24141950	CD164	98909	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	110606267	110606424	110606326	Y	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	NA	CDC40	106923	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	110858540	110858785	110858603	Y	NA	NA	AMD1,RPF2,GTF3C6,CDK19,SLC16A10	IMR90	Hi-C	24141950	CDK19	276376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	110938341	110938479	110938410	Y	SLC16A10,AMD1,AMD1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	196682	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	111614404	111614762	111614615	Y	NA	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	35853	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	111739300	111739614	111739444	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	REV3L	63304	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	111784023	111784230	111784203	Y	NA	REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	18688	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	112068361	112068832	112068769	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	123823	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	112110533	112110931	112110911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	81724	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	112306517	112306577	112306547	Y	TRAF3IP2	NA	FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	100155	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	115929904	115930082	115929997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRK	449839	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	116469368	116469398	116469382	Y	NA	NT5DC1	NA	NA	NA	NA	NT5DC1	49356	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	116786414	116786618	116786522	Y	DSE,FAM26F,ZUFSP	NA	NA	NA	NA	NA	RWDD1	103912	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	117165832	117166170	117166001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNA5	165482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	118009013	118009297	118009155	Y	NA	NUS1	NA	NA	NA	NA	NUS1	14348	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	125599408	125599745	125599577	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	21537	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	126197747	126198095	126197755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HINT3	77832	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	127907573	127907629	127907601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	152792	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	131594186	131594488	131594335	Y	AKAP7,MED23,AKAP7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	139380	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	131595636	131595766	131595737	Y	MED23,AKAP7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	140830	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	132811280	132811490	132811390	Y	VNN2,VNN2,VNN2,VNN1,STX7	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	20847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	132812514	132812803	132812689	Y	TAAR5,C6orf192,TAAR6	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	19534	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	134614780	134615032	134614956	Y	SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	22218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	135044677	135044952	135044807	Y	NA	NA	SGK1,ALDH8A1,LOC154092	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH8A1	224308	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr6	136278220	136278515	136278405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	107386	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	136716338	136716450	136716395	Y	MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	107349	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	137558937	137559207	137559098	Y	NA	IFNGR1	IFNGR1,OLIG3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IFNGR1	20351	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	138027517	138027801	138027604	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	158550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	138096329	138096662	138096455	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	89689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	138290142	138290398	138290268	Y	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	103791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr6	138914049	138914108	138914056	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97600	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97149	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	139860975	139861228	139861133	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC100132735	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	167218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	139918701	139919066	139919016	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	224944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	140400470	140400745	140400517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	706713	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	141300848	141301178	141301014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	1165189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	142091291	142091499	142091406	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	374868	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr6	143130260	143130659	143130530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	133679	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	143141084	143141442	143141235	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	122896	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	143234166	143234456	143234293	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	29882	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	143516746	143517148	143516792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	137113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	143770817	143770943	143770879	Y	ADAT2	ADAT2,PEX3	NA	NA	NA	NA	PEX3	873	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	144302032	144302409	144302359	Y	PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	SF3B5	112345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	144384858	144385125	144384924	Y	NA	SF3B5	NA	NA	NA	NA	SF3B5	29629	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	144585551	144585700	144585606	Y	NA	UTRN	UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	UTRN	19137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	144931961	144932452	144932213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	327124	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	144975415	144975576	144975532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	370578	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	145136843	145137199	145137021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	532006	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	147217441	147217852	147217780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	305709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	147831138	147831275	147831225	Y	SAMD5	SAMD5	NA	NA	NA	NA	SAMD5	3075	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	147985018	147985058	147985038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD5	156955	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	148823673	148823949	148823781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	232233	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	149434183	149434490	149434327	Y	NA	NA	ZC3H12D,TAB2	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	103287	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	149657882	149658028	149657899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	120105	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	150176203	150176399	150176290	Y	NA	LRP11	NA	NA	NA	NA	LRP11	7800	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	150917591	150917716	150917654	Y	NA	PLEKHG1	PLEKHG1	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG1	1283	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	151365804	151366060	151365928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	52605	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	152281783	152282174	152281880	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf211	510361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	155181312	155181660	155181451	Y	TIAM2,TIAM2	NA	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	128853	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	159229924	159230242	159230166	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	8202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr6	159513696	159514062	159513864	Y	DYNLT1,TAGAP	NA	TAGAP	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	94477	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	160409606	160409719	160409663	Y	IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	21475	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	161545851	161546111	161545978	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	135092	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	161571430	161571737	161571637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	121356	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	161791976	161792215	161792098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	98883	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	161855973	161856365	161856002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	162880	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	164758879	164759308	164759212	Y	NA	NA	PARK2,DKFZp451B082,PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	925847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	165696140	165696152	165696147	Y	NA	C6orf118	NA	NA	NA	NA	C6orf118	24944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	166078176	166078539	166078376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	319552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	166673039	166673451	166673325	Y	SFT2D1	PRR18	LOC100289495	IMR90	Hi-C	24141950	PRR18	46485	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	166754936	166755437	166755076	Y	SFT2D1	PRR18,SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	857	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	167001220	167001407	167001338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	247141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	167028527	167028763	167028637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	274448	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	202321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	167411045	167411413	167411177	Y	NA	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	375	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	167834861	167835135	167834902	Y	NA	NA	SMOC2	IMR90	Hi-C	24141950	UNC93A	152204	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	167837583	167837890	167837668	Y	FGFR1OP,UNC93A,MLLT4	NA	SMOC2	IMR90	Hi-C	24141950	UNC93A	154926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.59710298398002
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr6	169080976	169080998	169080987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACT2	362542	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	DACT2	590494	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	169325623	169325636	169325631	Y	NA	NA	LINC00574,WDR27,LOC154449,PHF10	IMR90	Hi-C	24141950	DACT2	607189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	169356921	169357287	169357202	Y	NA	NA	WDR27,PHF10,C6orf70,TCTE3,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	DACT2	638487	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	170203615	170204008	170203729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCTE3	53960	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	170449336	170449548	170449442	Y	NA	NA	DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	148013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr6	170838453	170838652	170838543	Y	NA	PSMB1,TBP	NA	NA	NA	NA	PSMB1	21777	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	543299	543586	543435	Y	GET4,CYP2W1,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	14347	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	875702	875833	875757	Y	SUN1,SUN1	SUN1,GET4	NA	NA	NA	NA	SUN1	22174	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	949613	949923	949864	Y	NA	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	35424	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	1017371	1017727	1017512	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,CYP2W1	ADAP1,COX19,CYP2W1	NA	NA	NA	NA	CYP2W1	3108	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	1329910	1330257	1330187	Y	NA	NA	UNCX	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND2A	131515	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	1416814	1417157	1416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	79981	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	1945683	1945719	1945693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	165756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2150639	2150902	2150796	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	119976	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2548551	2548955	2548724	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1208	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2550421	2551074	2550672	Y	LFNG,LFNG,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	258	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2551232	2551336	2551252	Y	LFNG,LFNG,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	1069	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2561604	2562123	2561810	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	11441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2575019	2575461	2575251	Y	NA	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	BRAT1	17900	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2667919	2668210	2667992	Y	NA	TTYH3,AMZ1	NA	NA	NA	NA	TTYH3	1375	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	2681143	2681305	2681209	Y	SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3	TTYH3,AMZ1	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2778515	2778860	2778688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMZ1	61359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2838950	2839257	2839071	Y	SNX8,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	33998	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2842322	2842519	2842421	Y	NA	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	30736	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	3065152	3065430	3065291	Y	NA	CARD11	NA	NA	NA	NA	CARD11	16149	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	4287329	4287662	4287450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	393726	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	4779326	4779630	4779587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	4913549	4913687	4913618	Y	NA	AC092610.12,RADIL	NA	NA	NA	NA	RADIL	7663	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	5471668	5472052	5471860	Y	NA	TNRC18	WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC18	8623	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	5488496	5488516	5488506	Y	NA	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	25451	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	5571351	5571818	5571666	Y	WIPI2,ACTB	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	19922	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	5571967	5572766	5572739	Y	RBAK,RBAK	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	20538	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	5635420	5636238	5635862	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	4981	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr7	7298478	7298713	7298536	Y	MIOS	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	103913	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	7759003	7759285	7759121	Y	NA	RPA3,RPL23AP51	NA	NA	NA	NA	RPA3	2765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	8218168	8218233	8218201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	81630	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	250156	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	10043571	10043672	10043621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8P8	445266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	12582030	12582229	12582042	Y	NA	SCIN	SCIN	IMR90	Hi-C	24141950	SCIN	25974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	13021746	13022072	13021909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	297265	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	13057101	13057487	13057331	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	332620	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	13085757	13085829	13085793	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	361276	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	13368007	13368354	13368181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	643526	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	13372875	13373192	13373034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	648394	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	13512547	13512927	13512737	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	516123	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	13553275	13553295	13553283	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	475755	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr7	13592138	13592417	13592278	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	436633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	13758700	13759051	13758876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	269999	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	13797003	13797366	13797185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	231684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	15957269	15957287	15957277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGMO	357629	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	16886935	16887473	16887050	Y	NA	AGR2,AGR3	NA	NA	NA	NA	AGR2	15878	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR3	109980	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	17162731	17163011	17162882	Y	AHR	NA	NA	NA	NA	NA	AHR	173235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	17273276	17274796	17274578	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	61450	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	17314276	17314419	17314335	Y	AHR	AHR,AC003075.4	NA	NA	NA	NA	AHR	21827	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	17446496	17446663	17446580	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	109515	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	17664691	17664931	17664811	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC017060.1	68158	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	17729678	17729968	17729803	Y	AHR	NA	HDAC9	IMR90	Hi-C	24141950	AC017060.1	133145	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	18540943	18541343	18541016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX13	562819	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	18695404	18695888	18695683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	459407	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	19746950	19747169	19747121	Y	NA	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	240	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20054783	20055072	20055055	Y	NA	RPL21P75	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	14437	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20217388	20217681	20217578	Y	TWISTNB,MACC1	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	37346	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	20228342	20228547	20228441	Y	TWISTNB,ITGB8	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	26480	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	20239036	20239390	20239182	Y	TWISTNB	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	15637	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20239950	20240328	20240220	Y	TWISTNB	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	14699	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	20240719	20241217	20240796	Y	TWISTNB	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	13810	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20263871	20263993	20263901	Y	NA	MACC1,AC005083.1	ITGB8	IMR90	Hi-C	24141950	AC005083.1	8671	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20386006	20386499	20386153	Y	ITGB8	ITGB8	NA	NA	NA	NA	ITGB8	17681	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20414219	20414454	20414223	Y	NA	ITGB8	NA	NA	NA	NA	ITGB8	45894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20477231	20477463	20477293	Y	ITGB8	NA	TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB8	108906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20488630	20489286	20488971	Y	ITGB8	NA	TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB8	120305	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20513866	20514196	20514029	Y	ITGB8	NA	TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB8	145541	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20636374	20636677	20636443	Y	ITGB8	NA	TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	RPL23P8	228268	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	RPL23P8	27126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	20993749	20993911	20993806	Y	SP8	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23P8	128804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	21928607	21928632	21928620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	55070	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	22339389	22339576	22339483	Y	RAPGEF5	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	210042	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	22386592	22386681	22386637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	162937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	73122	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	23168039	23168122	23168081	Y	NA	KLHL7-AS1,KLHL7	NA	NA	NA	NA	KLHL7	24686	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	132005	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	24006556	24006902	24006729	Y	NPY	NA	NA	NA	NA	NA	AC006026.13	288151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	24229401	24229422	24229412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP6	381465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	24818395	24818855	24818677	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	11151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	24825805	24826210	24826109	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	18561	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	24860577	24860798	24860662	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53333	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	24947142	24947425	24947387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	71828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	24960670	24960974	24960767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	58279	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	25010250	25010501	25010375	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	8752	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	26568856	26569109	26568983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	132643	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	27152655	27152825	27152741	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	7259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	27176174	27176251	27176224	Y	HOXA3,HOXA3,HOXA4,HOXA5	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA10-AS,RP1-170O19.20,HOXA11	NA	NA	NA	NA	HOXA5	5036	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	27386345	27386573	27386562	Y	NA	AC004009.3	NA	NA	NA	NA	AC004009.3	12889	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	27717680	27717897	27717733	Y	NA	HIBADH	HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1	IMR90	Hi-C	24141950	HIBADH	17066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	27876967	27877264	27877116	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	98953	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	28505826	28505846	28505837	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	168886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	28765604	28765886	28765745	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	CHN2	394004	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	28825008	28825257	28825133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHN2	334633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	29310713	29310833	29310750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	77646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	30204020	30204306	30204163	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	117617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	30206134	30206379	30206282	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	115544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	32337399	32337512	32337422	Y	PDE1C	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	195383	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	32531348	32531711	32531530	Y	PDE1C,PDE1C,PDE1C	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	LSM5	1184	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	34394594	34394965	34394781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPSR1	300886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPSR1	380010	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr7	36157611	36157822	36157717	Y	NA	EEPD1	EEPD1,KIAA0895	IMR90	Hi-C	24141950	EEPD1	32936	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	36305265	36305717	36305464	Y	AOAH,SEPT7,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	EEPD1	114507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NPM1P18	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	12836	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	37221797	37222057	37221923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	365233	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	37255343	37255621	37255439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	398779	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	37726522	37726811	37726756	Y	GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1,ELMO1	EPDR1	NA	NA	NA	NA	EPDR1	5076	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	37731277	37731583	37731449	Y	GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1	EPDR1	NA	NA	NA	NA	EPDR1	9831	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	37866533	37866785	37866612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPDR1	145087	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	38349304	38349469	38349333	Y	TARP	AC006033.22	LOC100506776	IMR90	Hi-C	24141950	AC006033.22	320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	38664238	38664553	38664451	Y	POU6F2	NA	NA	NA	NA	NA	VPS41	305441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	38750267	38750277	38750273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS41	219717	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	39641991	39642218	39642176	Y	RALA	YAE1D1,RALA	LINC00265	IMR90	Hi-C	24141950	RALA	18864	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	39661364	39661771	39661496	Y	NA	RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	282	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr7	40336838	40336939	40336891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	349202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	40580986	40581112	40581049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	593350	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	40584238	40584551	40584395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	596602	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	40585377	40585721	40585560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	597741	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	40706026	40706047	40706035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	718390	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	40755655	40755948	40755803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	768019	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	40756959	40757193	40757114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	769323	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	41048804	41049055	41048930	Y	NA	NA	LOC285954,INHBA,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	CDK13	1061168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chr7	43138797	43138930	43138838	Y	NA	NA	HECW1	IMR90	Hi-C	24141950	PSMA2	168975	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	43625293	43625372	43625313	Y	URGCP,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	4936	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	43625905	43626316	43625996	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	5548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	43626451	43626626	43626528	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	6094	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	43644873	43645023	43645002	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	24516	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	43714128	43714419	43714274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	81860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	44616133	44616490	44616314	Y	NA	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	TMED4	3396	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	44936968	44937252	44937141	Y	OGDH,MYO1G,PURB	PURB	TBRG4,OGDH	IMR90	Hi-C	24141950	PURB	14008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	45595486	45595825	45595527	Y	NA	ADCY1	NA	NA	NA	NA	ADCY1	15914	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	45947887	45948101	45948023	Y	NA	IGFBP1,IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	11372	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	46803788	46804144	46803966	Y	NA	NA	IGFBP1,IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	816012	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	46839094	46839193	46839144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	780963	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	46894770	46895049	46894960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	725107	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47185619	47185934	47185820	Y	NA	NA	IGFBP3,IGFBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	434222	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47366502	47366627	47366552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	253529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47475545	47475747	47475668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	144409	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr7	47482953	47483112	47483033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	137044	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47505797	47506192	47505996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	113964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	23.7962197401755
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr7	47518819	47519136	47519085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	101020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47542893	47543371	47543076	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	76785	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47548092	47548390	47548234	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	71766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47554592	47554957	47554775	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	65199	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	47575953	47576318	47576309	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	43838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47645534	47645685	47645627	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	25378	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	50305644	50305818	50305741	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	210270	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	50484533	50484862	50484717	Y	NA	FIGNL1	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	31226	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	50603281	50603405	50603343	Y	NA	DDC	NA	NA	NA	NA	DDC	27749	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	DDC	NA	NA	NA	NA	DDC	35697	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	50807671	50808051	50807982	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	51108	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	50886712	50886722	50886717	Y	GRB10	GRB10	COBL	IMR90	Hi-C	24141950	GRB10	27553	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	50889237	50889584	50889351	Y	NA	GRB10	COBL,GRB10	IMR90	Hi-C	24141950	GRB10	30078	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	50905745	50905993	50905866	Y	GRB10	GRB10	COBL,GRB10	IMR90	Hi-C	24141950	GRB10	46586	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	50948563	50948792	50948678	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89404	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	55134555	55134962	55134733	Y	NA	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	49841	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	55142882	55143327	55143024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	58168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.18205263967463
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	NA	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	LANCL2	108185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr7	55541787	55541962	55541880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	96719	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	55543241	55543436	55543358	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95245	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	56034549	56034772	56034661	Y	NA	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	MRPS17	17037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	61968807	61969730	61969008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	1989473	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	61971522	61971701	61971612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	1987502	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	65762762	65763060	65762890	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	NA	NA	NA	NA	TPST1	94576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	65790150	65790379	65790243	Y	RABGEF1,KCTD7,TPST1	NA	LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	TPST1	121964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	66184244	66184571	66184390	Y	NA	RABGEF1	LOC493754,RABGEF1,LOC729156	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	39093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	66223934	66224293	66224105	Y	KCTD7,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	78783	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	70953472	70953588	70953527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYW1B	1343189	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.32040275444309
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	73702546	73702842	73702658	Y	NA	RFC2,CLIP2	NA	NA	NA	NA	CLIP2	741	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	73705467	73705815	73705641	Y	NA	RFC2,CLIP2	NA	NA	NA	NA	CLIP2	3662	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	73915723	73915843	73915806	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	49603	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	73994648	73994954	73994780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	75040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	75253450	75253956	75253637	Y	POR	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P3	97972	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	75675722	75675985	75675853	Y	NA	STYXL1,MDH2	NA	NA	NA	NA	MDH2	353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	SRRM3	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	SRRM3	33163	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	76874732	76875015	76874923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC146	124981	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	77038853	77039042	77038951	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	125550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	77042821	77043194	77043007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	121398	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	80128570	80128822	80128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	367299	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	80441834	80442054	80441993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	107621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	81502965	81503222	81503098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGF	105211	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	82224524	82224592	82224558	Y	NA	NA	CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	PCLO	565654	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	83081582	83081807	83081725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCLO	291336	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	83688045	83688341	83688303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	431699	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	84613691	84613734	84613712	Y	NA	AC074183.4	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	46130	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	87946934	87947082	87946963	Y	STEAP4	NA	NA	NA	NA	NA	SRI	92626	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	89852350	89852687	89852439	Y	NA	C7orf63	NA	NA	NA	NA	C7orf63	19801	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	90236421	90236455	90236438	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN12	225386	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	91456025	91456190	91456079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERF	51844	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	91466585	91467314	91466893	Y	NA	MTERF	NA	NA	NA	NA	MTERF	40720	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	92261903	92262272	92262087	Y	CDK6,CDK6	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	44195	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	92264263	92264527	92264407	Y	SAMD9	FAM133B	FAM133B	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	46555	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	92384322	92384817	92384698	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	CDK6	79091	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	92392967	92393205	92393086	Y	PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9,CDK6,CDK6	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	CDK6	70703	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	93426376	93426400	93426388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BET1	205294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	94557636	94557931	94557784	Y	PPP1R9A	PPP1R9A	NA	NA	NA	NA	PPP1R9A	23122	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	94781809	94782176	94781990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	56270	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	94799053	94799326	94799190	Y	PPP1R9A,PPP1R9A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	73514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	95030354	95030375	95030365	Y	NA	PON1,PON3,PON2	NA	NA	NA	NA	PON3	6674	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	95320009	95320109	95320059	Y	PON1	NA	ASB4	IMR90	Hi-C	24141950	PDK4	96206	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	96642145	96642338	96642223	Y	DLX6,DLX5	DLX6,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX6	9285	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	96905282	96905489	96905385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACN9	161380	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	98048213	98048460	98048408	Y	BRI3	RPS3AP26,BAIAP2L1	BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAIAP2L1	19833	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.90535241013771
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	ARPC1A	NA	NA	NA	NA	ARPC1A	49392	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	99020392	99020577	99020441	Y	OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789	BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789	NA	NA	NA	NA	CPSF4	13968	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	100433472	100433773	100433685	Y	NA	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	10351	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	101430141	101430201	101430171	Y	NA	CUX1	CUX1	IMR90	Hi-C	24141950	CUX1	26758	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	101596326	101596693	101596419	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	139367	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	77099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM185A	128808	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	102642009	102642230	102642051	Y	NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL13	71056	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	RP11-325F22.5,RP11-325F22.2	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-325F22.2	5948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	104844953	104845066	104844998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	192689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	104854124	104854334	104854271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	183421	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	104857177	104857523	104857432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	180232	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	105407460	105407845	105407653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	50093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	105489836	105490303	105490021	Y	NA	CTA-351J1.1,ATXN7L1,CDHR3	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	24747	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	105766301	105766504	105766403	Y	NA	SYPL1	CDHR3,ATXN7L1,SYPL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	15279	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	106008187	106008469	106008327	Y	PIK3CG,FLJ36031,NAMPT	NA	CCDC71L,SYPL1,NAMPT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	83415	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	106012031	106012296	106012165	Y	PIK3CG,FLJ36031,NAMPT	NA	CCDC71L,NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	87259	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	106209189	106209713	106209400	Y	NAMPT	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC71L	89729	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	106943118	106943475	106943297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	135712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	107079032	107079264	107079148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	122665	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	92284	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	107136125	107136576	107136361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	65353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	107554407	107554624	107554481	Y	DLD	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	24992	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	107562078	107562130	107562088	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	32663	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	107784751	107785008	107784880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMB1	143051	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	109682039	109682053	109682046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP5	1473845	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	110326552	110326706	110326634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	873867	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	111156714	111156954	111156834	Y	NA	IMMP2L	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	43619	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	111421395	111421784	111421410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	220822	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	111455220	111455605	111455549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	254647	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	112258006	112258292	112258069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM168	170355	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	113688055	113688258	113688160	Y	NA	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	36124	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	113772890	113773070	113772980	Y	NA	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	48508	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	114408811	114408841	114408826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	151368	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	114571864	114572137	114571962	Y	MDFIC	MDFIC	NA	NA	NA	NA	MDFIC	11655	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	114637628	114638014	114637704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	77419	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	115326798	115327008	115326857	Y	NA	NA	FOXP2	IMR90	Hi-C	24141950	TES	521539	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	115628505	115628783	115628705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TES	219764	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	115673185	115673535	115673360	Y	TFEC	NA	NA	NA	NA	NA	TES	175012	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	115721454	115721656	115721555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TES	126891	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	115849891	115849987	115849939	Y	NA	TES	NA	NA	NA	NA	TES	1344	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	115873924	115874179	115873941	Y	TES	TES	NA	NA	NA	NA	TES	25377	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	TES,CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	37825	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr7	115912136	115912451	115912327	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	12983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	115955390	115955624	115955546	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	29956	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116035470	116035688	116035648	Y	NA	NA	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	CAV2	110036	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116083167	116083483	116083344	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	TES,CAV2,CAV1,MET	IMR90,MCF7,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	CAV1	79356	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116152142	116152412	116152205	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1	CAV1	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	CAV1	10427	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116181805	116181927	116181813	Y	CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	18966	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	116202174	116202561	116202326	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	39335	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr7	116232713	116233127	116232950	Y	NA	NA	MET,TES,CAV2,CAV1,CAPZA2	IMR90,H1ESC,GM12878,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	CAV1	69874	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116261779	116262057	116261957	Y	CAPZA2,TES	MET	MET,TES,CAPZA2,ST7,ST7-AS2	IMR90,GM12878,H1ESC,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	MET	48387	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116271021	116271344	116271193	Y	NA	MET	TES,CAV1,MET,CAPZA2	IMR90,H1ESC,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	MET	39100	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116292970	116293085	116293033	Y	NA	MET	MET	IMR90	Hi-C	24141950	MET	17359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116314942	116315351	116315128	Y	ST7,TES,CAV2,CAV2,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	4498	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	116319612	116319902	116319758	Y	NA	MET	NA	NA	NA	NA	MET	9168	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116356493	116356879	116356812	Y	NA	MET	NA	NA	NA	NA	MET	46049	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	116452966	116453226	116453141	Y	CAPZA2	CAPZA2	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	3842	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116483555	116483740	116483606	Y	CAPZA2	CAPZA2	MET,TES	IMR90	Hi-C	24141950	CAPZA2	34431	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116504290	116504456	116504319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	55166	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr7	116651956	116652355	116652105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	59568	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116699859	116700243	116700052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	107471	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	116793573	116793925	116793605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	201185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr7	116804623	116804954	116804811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	212235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	116891724	116892257	116891966	Y	NA	NA	TES,ST7,WNT2	H1ESC,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	ST7-AS1	299336	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	117117954	117118324	117118139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	525566	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	117290130	117290152	117290141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	531934	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	117421041	117421137	117421089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	400949	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	119283625	119284006	119283817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND2	627716	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	119342265	119342557	119342442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND2	569165	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	119692917	119693243	119693083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND2	218479	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	119912248	119912651	119912361	Y	KCND2	KCND2	NA	NA	NA	NA	KCND2	526	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	120030311	120030667	120030374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND2	118589	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120035648	120036038	120035761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND2	123926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120046229	120046628	120046268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND2	134507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120287689	120287705	120287697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	208751	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120378721	120379121	120378975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	117335	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120532080	120532359	120532220	Y	NA	TSPAN12	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	35624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120589568	120589730	120589649	Y	ING3	ING3	NA	NA	NA	NA	ING3	765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120631722	120632107	120631938	Y	NA	ING3	NA	NA	NA	NA	ING3	42919	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120644740	120645140	120644839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	55937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	120659124	120659336	120659215	Y	ING3	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	70321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120703433	120703512	120703470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	114630	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120723269	120723399	120723324	Y	C7orf58	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	134466	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	120884704	120884786	120884745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	149632	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	95933	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	120942380	120942663	120942460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	91755	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	121008996	121009049	121009023	Y	NA	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	25369	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	121025846	121026096	121025939	Y	ING3	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	8322	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	121048712	121048836	121048774	Y	NA	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	14294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	121069872	121070160	121070016	Y	NA	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	35454	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	121126211	121126499	121126344	Y	NA	NA	FAM3C	IMR90	Hi-C	24141950	FAM3C	91793	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	121150464	121150828	121150695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	116046	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	121874177	121874561	121874390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZF1-AS1	67151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr7	121951485	121951902	121951877	Y	NA	FEZF1-AS1,FEZF1	NA	NA	NA	NA	FEZF1	2740	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	121951914	121952318	121952125	Y	NA	FEZF1-AS1,FEZF1	NA	NA	NA	NA	FEZF1	3169	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	122072950	122073321	122073136	Y	FEZF1,CADPS2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZF1	124205	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	122610759	122610994	122610853	Y	TAS2R16	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS2	85946	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr7	128603332	128603696	128603619	Y	ATP6V1F,IRF5,IRF5,IRF5,TSPAN33	IRF5	NA	NA	NA	NA	IRF5	27666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	128915299	128915657	128915368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHCYL2	52435	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	129084265	129084564	129084426	Y	AHCYL2,FAM40B	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	36054	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr7	130552122	130552429	130552276	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	43640	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	130873403	130873921	130873619	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	51428	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	130910382	130910723	130910553	Y	MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	14626	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	130916172	130916668	130916569	Y	NA	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	8681	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	132607236	132607300	132607268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	157548	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr7	134287776	134287871	134287820	Y	NA	BPGM	AKR1B1,AKR1B10,AKR1B15,BPGM	IMR90	Hi-C	24141950	BPGM	41689	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	136635462	136635508	136635485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	975361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	137311444	137311452	137311448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	373361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	137673807	137674359	137674139	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	10454	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	139498127	139498170	139498155	Y	TBXAS1	TBXAS1,HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	22550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	139929659	139930294	139929953	Y	TBXAS1,RAB19,JHDM1D	NA	JHDM1D,LOC100134229	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP12	168138	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr7	140497709	140498045	140497887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB2	109132	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	140776370	140776415	140776407	Y	LOC100131199	RNU4-74P	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	26321	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	141374630	141374958	141374810	Y	NA	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	24995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	141512676	141512822	141512821	Y	TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	76555	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	143856214	143856503	143856359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OR2A20P	91547	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	148334506	148334940	148334775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL1	58066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	149745351	149745623	149745500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E2	177294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	150075425	150075527	150075503	Y	NA	REPIN1,ZNF775	NA	NA	NA	NA	ZNF775	11546	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	150944441	150944847	150944697	Y	ASB10,SMARCD3	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	16866	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	151192969	151193321	151193145	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	151442202	151442898	151442523	Y	NA	NA	CRYGN,RHEB	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAG2-AS1	129229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	151591335	151591652	151591492	Y	NA	PRKAG2-AS1,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	PRKAG2	19125	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	151629318	151629666	151629588	Y	RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	PRKAG2,LOC100505483	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRKAG2	57108	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	151986893	151987163	151987026	Y	MLL3	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	266134	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	152111667	152111916	152111792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	259334	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	152123020	152123275	152123182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	247975	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210696	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr7	154746550	154746681	154746616	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	46113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	157072331	157072686	157072549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53389	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	157334866	157335140	157335002	Y	DNAJB6,DNAJB6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	208791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	157366883	157367406	157367099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	240808	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	157924006	157924393	157924072	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	571127	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	157943729	157944143	157943925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	551377	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	270529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	158225517	158225999	158225657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	269521	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	158262390	158262764	158262595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	232756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr7	158301130	158301237	158301184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	194283	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr7	158595763	158596162	158596010	Y	ESYT2	ESYT2	NA	NA	NA	NA	ESYT2	24782	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	603336	603665	603448	Y	ERICH1	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	82441	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	637812	637858	637835	Y	NA	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	48248	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	3252665	3252838	3252782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	1332621	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	4848301	4848393	4848346	Y	CSMD1	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	205447	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	6323096	6323426	6323195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	60983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr8	6605896	6606328	6606048	Y	NA	CTD-2541M15.1,AGPAT5	NA	NA	NA	NA	AGPAT5	42018	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	6721983	6722491	6722202	Y	NA	XKR5,DEFB1	NA	NA	NA	NA	DEFB1	11053	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr8	8247461	8247709	8247494	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	5453	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	8746516	8746997	8746809	Y	CLDN23	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	2158	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	8775264	8775462	8775326	Y	NA	MFHAS1	MFHAS1,FLJ10661,SGK223	IMR90	Hi-C	24141950	MFHAS1	26109	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr8	10305932	10306275	10305955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	389119	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	10589802	10590079	10589941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	105315	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	11001237	11001609	11001584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XKR6	55266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	24343	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	11744810	11745247	11745024	Y	NA	CTSB	CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTSB	19853	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	11755941	11756161	11756072	Y	CTSB	CTSB	CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	30984	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	12608373	12608831	12608472	Y	NA	LONRF1	NA	NA	NA	NA	LONRF1	2751	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	13393176	13393534	13393351	Y	DLC1	DLC1	DLC1	IMR90	Hi-C	24141950	DLC1	22009	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	15546823	15547116	15546970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	274099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	17355613	17356072	17355737	Y	NA	SLC7A2	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	3016	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	17665479	17665814	17665519	Y	NA	RP11-156K13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	8625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	17708923	17709156	17709065	Y	MTMR7,MTUS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	52069	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	18854306	18854486	18854451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	85754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	18993184	18993532	18993372	Y	NA	NA	LOC100128993,PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	52944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	92527	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	22222955	22223268	22223121	Y	EPB49,SLC39A14,SLC39A14	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	22439546	22439823	22439672	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	5754	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	22858322	22858618	22858470	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15392	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	23016406	23016568	23016458	Y	ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	2975	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	23020215	23020436	23020325	Y	NA	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	672	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	23353842	23353942	23353892	Y	TNFRSF10C,SLC25A37	ENTPD4,SLC25A37	NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A37	30376	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	26162518	26162881	26162571	Y	NA	PPP2R2A	NA	NA	NA	NA	PPP2R2A	15511	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	26232086	26232281	26232177	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	BNIP3L	6133	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	26429509	26429959	26429867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	59718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	27252539	27252934	27252816	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	85540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	27474556	27474730	27474657	Y	NA	CLU	SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CLU	4008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	27694349	27694720	27694534	Y	NA	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	737	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	INTS9	108163	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	28884105	28884486	28884217	Y	HMBOX1,HMBOX1	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	26966	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	29083031	29083529	29083345	Y	KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	35112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	29175941	29176203	29176072	Y	NA	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	29982	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	30506010	30506203	30506101	Y	NA	GTF2E2	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	7565	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	30892930	30893420	30892948	Y	NA	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	3613	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	32508172	32508500	32508337	Y	NRG1,NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	820440	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	33287156	33287526	33287341	Y	NA	FUT10	NA	NA	NA	NA	FUT10	41414	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	33291442	33291793	33291639	Y	MAK16,FUT10,C8orf41,C8orf41	FUT10,MAK16	NA	NA	NA	NA	FUT10	37147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.62865218060078
chr8	37376212	37376482	37376355	Y	NA	NA	KCNU1,ERLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150O12.3	78894	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	37679848	37680132	37679943	Y	RAB11FIP1	GPR124,BRF2	NA	NA	NA	NA	BRF2	25290	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	37760968	37761285	37761070	Y	RAB11FIP1	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	5983	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	37929132	37929304	37929218	Y	NA	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	31456	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	38216773	38217155	38217067	Y	WHSC1L1,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	WHSC1L1	20635	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	38624356	38624716	38624649	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1	TACC1	NA	NA	NA	NA	TACC1	40652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	38926192	38926523	38926358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM9	73804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	39163297	39163513	39163405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM9	310909	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	39957250	39957527	39957387	Y	NA	NA	C8orf4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	51462	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	41628099	41628173	41628135	Y	ANK1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	194212	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	41649689	41649828	41649744	Y	NKX6-3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	215802	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	42398083	42398473	42398470	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	3014	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	48293270	48293403	48293337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	209768	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	48350721	48350922	48350822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	152249	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	77792	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	48910578	48910837	48910684	Y	NA	PRKDC,MCM4,UBE2V2	NA	NA	NA	NA	UBE2V2	8123	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	53288358	53288826	53288682	Y	ST18	NA	NA	NA	NA	NA	FAM150A	187241	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	56684291	56684685	56684461	Y	NA	TGS1,TMEM68	NA	NA	NA	NA	TMEM68	325	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	56831577	56831790	56831640	Y	NA	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	41205	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	57389900	57390701	57390447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17A4.1	108243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	59849492	59849915	59849740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	124381	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	77567	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr8	61660299	61660611	61660357	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	70962	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	62600598	62600698	62600684	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	24457	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr8	68075038	68075412	68075329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	81020	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	68105132	68105308	68105276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	111114	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	72009245	72009445	72009345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XKR9	429645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	72753377	72753463	72753388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	1165636	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	73008234	73008433	73008334	Y	NA	NA	TRPA1,LOC100132891	IMR90	Hi-C	24141950	TERF1	910666	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	186542	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	77590079	77590470	77590424	Y	ZFHX4	NA	NA	NA	NA	NA	PEX2	320810	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	79670742	79671103	79670995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEY1	1006995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	80680806	80681178	80681064	Y	HEY1	HEY1	NA	NA	NA	NA	HEY1	2708	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18244	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	80701258	80701483	80701350	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	23160	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	87358801	87359051	87358932	Y	NA	WWP1	NA	NA	NA	NA	WWP1	5834	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	90105251	90105649	90105450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	662306	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	90741352	90741628	90741481	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	DECR1,RIPK2,NBN	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-37B2.1	26327	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	90787257	90787620	90787439	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	19282	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	90797084	90797193	90797178	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	29109	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	90846733	90847086	90847012	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSGIN2	65001	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	90901747	90901955	90901807	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	10132	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	91683219	91683417	91683315	Y	NA	NA	TMEM64,NECAB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMEM64	118443	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	94314304	94314475	94314463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	394314	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	95896385	95896691	95896542	Y	NA	CCNE2	NA	NA	NA	NA	CCNE2	10215	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	96129740	96130058	96129951	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	PLEKHF2,C8orf38,C8orf69,C8orf37,MIR3150B,MIR3150A	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLEKHF2	13974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	97272793	97273157	97272974	Y	NA	UQCRB,MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	97779129	97779296	97779215	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	507186	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	98843865	98843962	98843914	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31320	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14235	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14749	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	102171817	102172037	102171960	Y	YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44384	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	102191448	102191797	102191796	Y	NA	ZNF706	NA	NA	NA	NA	ZNF706	24624	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	102373140	102373427	102373201	Y	NA	NACAP1	GRHL2,NACAP1,NCALD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NACAP1	1118	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr8	102513804	102514123	102513992	Y	NA	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	11144	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	102665065	102665479	102665281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRHL2	162405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	103401606	103401938	103401841	Y	NA	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	21131	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	103597495	103597662	103597589	Y	UBR5	NA	UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	68468	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	103858397	103858789	103858587	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	15739	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	103922083	103922307	103922186	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	17991	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	103939794	103939949	103939858	Y	NA	AZIN1	AZIN1,ATP6V1C1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	35702	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	105655226	105655568	105655399	Y	TM7SF4,LRP12	NA	LRP12	IMR90	Hi-C	24141950	LRP12	55974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	106070905	106071230	106071068	Y	NA	NA	ZFPM2	IMR90	Hi-C	24141950	LRP12	471653	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	106769068	106769071	106769070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXR1	511402	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	107665296	107665542	107665419	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	42699	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	108969667	108970068	108969868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	475494	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	109222483	109222836	109222544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	222726	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	109230205	109230491	109230349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	215071	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	110595372	110595737	110595555	Y	NA	EBAG9	NA	NA	NA	NA	EBAG9	45432	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	112163030	112163347	112163189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544L4.1	597393	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	112672404	112672565	112672485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544L4.1	1106767	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	115233906	115233914	115233910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	847008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	116988617	116988643	116988632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	168718	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	117889939	117890223	117890034	Y	RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	4834	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	118859857	118860327	118860104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	261765	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	118958698	118959000	118958912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	163092	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr8	119339236	119339376	119339324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	217144	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	119419771	119420080	119419851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	212154	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	119443463	119443781	119443622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	188453	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	119536200	119536581	119536442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	95653	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	119536968	119537364	119537323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	94870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	119781554	119781682	119781618	Y	NA	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	9114	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	119788546	119788868	119788707	Y	NA	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	16106	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	119917519	119917835	119917587	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	44604	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	120232000	120232286	120232044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	56727	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	120995010	120995163	120995088	Y	DEPTOR	NA	NA	NA	NA	NA	DEPTOR	111053	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	121628287	121628559	121628462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	172645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	121702901	121703232	121703165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	120281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr8	121737162	121737328	121737239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	86185	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	121821026	121821194	121821110	Y	SNTB1	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	2319	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	121939165	121939179	121939172	Y	NA	NA	SNTB1,MTBP,MRPL13	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	115652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	122347057	122347434	122347232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	523544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	122361097	122361402	122361250	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	537584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	123398501	123398841	123398672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	392792	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	123443932	123444239	123444086	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX2	347394	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	123795111	123795992	123795667	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	3478	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	124013159	124013422	124013291	Y	NA	DERL1	NA	NA	NA	NA	DERL1	39241	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	124166912	124167054	124166991	Y	FBXO32	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf76	84584	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	124179869	124179997	124179932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf76	71641	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	124549741	124550229	124550044	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1217	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	125267263	125267302	125267281	Y	FAM91A1,RNF139	RP11-383J24.1	TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-383J24.1	14622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	125275002	125275221	125275161	Y	RNF139	RP11-383J24.1	FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-383J24.1	6703	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr8	125447179	125447220	125447200	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	FER1L6,FER1L6-AS1,ANXA13,FAM91A1,KLHL38,TMEM65,FBXO32	IMR90	Hi-C	24141950	TRMT12	13828	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	125466570	125466668	125466619	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	NA	NA	NA	NA	TRMT12	5522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	125878645	125879203	125878949	Y	RNF139,MTSS1,ZNF572,NSMCE2,KIAA0196	NA	MTSS1,NDUFB9,TATDN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1082L8.4	52721	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr8	126232175	126232753	126232302	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr8	126354343	126354802	126354718	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	85761	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	126520641	126520793	126520709	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	80078	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	127829528	127829825	127829677	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	260890	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	127837362	127837443	127837401	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	268724	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	127908732	127908971	127908856	Y	NA	NA	MYC,LOC727677,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	320362	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	127927068	127927434	127927240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	301899	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	127928770	127929133	127928805	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	300200	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	128048074	128048382	128048201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	180951	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128068284	128068629	128068554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	160704	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	129791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	128171088	128171312	128171255	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	58021	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128179610	128179821	128179807	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	49512	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	128180134	128180587	128180334	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48746	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128182729	128182789	128182759	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	128185119	128185731	128185383	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	43602	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128222835	128223182	128223058	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	6151	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128231853	128232218	128232163	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	2520	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128257606	128258262	128257899	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	28273	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	128258299	128258698	128258657	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	28966	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	77601	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr8	128311072	128311242	128311156	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	81739	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	128678694	128678799	128678726	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	66881	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	129036981	129037022	129036995	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	16124	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	129061512	129061955	129061598	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	40655	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	129129719	129130040	129129840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	108862	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	129185963	129186138	129186049	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	165106	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	129397787	129398025	129397906	Y	NA	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	376930	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	129569050	129569202	129569118	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	548193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr8	130317973	130318201	130318181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	709174	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	130573431	130573829	130573545	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	453546	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	130897837	130898360	130898140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	129015	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	131024148	131024528	131024501	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	2847	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	131080516	131080850	131080671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	53141	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	131204007	131204378	131204106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	176632	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	131271304	131271556	131271460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	182350	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	131271729	131272058	131271952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	181848	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	131364558	131364729	131364627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	89177	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	133257165	133257466	133257335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	342830	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	133971075	133971466	133971078	Y	TG	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	185457	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	78009	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	135352426	135352442	135352435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	370850	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	135637758	135638024	135637881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	85268	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	136623331	136623657	136623494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	129081	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	141102173	141102317	141102281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	364361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	141178627	141178635	141178631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	288043	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	141190446	141190798	141190723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	275880	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	141266447	141267055	141266903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	199623	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	141849368	141849592	141849371	Y	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	160723	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	141972530	141972881	141972765	Y	NA	PTK2	NA	NA	NA	NA	PTK2	37434	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	142033227	142033651	142033460	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	22912	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	142036879	142037195	142037043	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	26564	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr8	142413850	142414371	142414167	Y	DENND3,SLC45A4	PTP4A3	PTP4A3,FLJ43860	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	13757	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	142426003	142426250	142426062	Y	PTP4A3	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25910	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	BAI1	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	BAI1	5207	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	143809767	143809928	143809818	Y	C8orf55	JRK	NA	NA	NA	NA	JRK	48381	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.2136018362954
chr8	143813380	143813410	143813405	Y	GPIHBP1	NA	NA	NA	NA	NA	JRK	51994	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chr8	144629463	144629732	144629564	Y	SPATC1,GRINA	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,TIGD5,EEF1D	NA	NA	NA	NA	GSDMD	3645	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	144684263	144684410	144684337	Y	NA	NAPRT1,TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623	NA	NA	NA	NA	EEF1D	4552	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.18205263967463
chr8	145088816	145089042	145088955	Y	PLEC,GRINA,SPATC1	PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1	NA	NA	NA	NA	PARP10	3876	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	145549095	145549459	145549304	Y	NA	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	145887419	145887725	145887588	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,RECQL4,LRRC24,LRRC14,MFSD3,PPP1R16A,GPT,RPL8,ZNF34,ZNF517,ZNF250,TMED10P1,ZNF252,COMMD5	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP39	21469	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	145995593	145996127	145996081	Y	COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34	ZNF251,ZNF34,RPL8	NA	NA	NA	NA	ZNF34	14603	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr8	146058579	146058595	146058588	Y	ARHGAP39	ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5	NA	NA	NA	NA	ZNF7	7730	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	277612	278164	277810	Y	DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	64758	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	642151	642448	642253	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	173860	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	758228	758480	758338	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	289937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	2655543	2655805	2655674	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	35709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	3848588	3848740	3848655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	323865	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	4086123	4086410	4086330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	259982	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	4099830	4100173	4099979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	246219	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	4241498	4241696	4241599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	104696	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	4283058	4283285	4283172	Y	GLIS3,GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	63107	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	4829866	4830028	4829909	Y	NA	RCL1	NA	NA	NA	NA	RCL1	38997	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	5851473	5851729	5851648	Y	C9orf46,CD274,KIAA1432	ERMP1	ERMP1	IMR90	Hi-C	24141950	ERMP1	20356	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	6788210	6788382	6788241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	69347	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	7149898	7149929	7149914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	326391	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	10322828	10323093	10322961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1233952	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	10446077	10446442	10446410	Y	PTPRD	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1357201	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	13084176	13084414	13084323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDZ	193175	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	14353468	14353873	14353760	Y	NFIB	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	43109	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	15477137	15477463	15477300	Y	NA	PSIP1,FTH1P12	NA	NA	NA	NA	PSIP1	31554	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	16159777	16160100	16159939	Y	NA	NA	C9orf93,BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	634096	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	16505238	16505575	16505407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNC2	363266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	16662784	16663109	16662968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNC2	205732	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	19184256	19184894	19184463	Y	PLIN2	PLIN2	HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	36968	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313922	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313456	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	22389357	22389650	22389489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	55190	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	22414049	22414273	22414161	Y	NA	DMRTA1	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	30567	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	23622735	23622745	23622740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	1177895	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	27352450	27352737	27352522	Y	IFT74,IFT74,PLAA,C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	175042	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	27434079	27434197	27434145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	93582	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	27600339	27600663	27600535	Y	C9orf72,C9orf72	C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	28475	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	28259858	28260256	28260250	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	687994	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	32524178	32524624	32524592	Y	DDX58	TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	34630838	34631031	34630927	Y	ENHO,CNTFR,CNTFR,KIAA1045,DNAJB5	CNTFR,DCTN3,SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	SIGMAR1	4775	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr9	35971862	35972364	35972237	Y	NA	YBX1P10	C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK	IMR90	Hi-C	24141950	YBX1P10	1547	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	36764220	36764685	36764538	Y	NA	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	193361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	107013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr9	37032033	37032396	37032120	Y	ZCCHC7,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	4538	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	37197241	37197478	37197431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	78705	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	37295997	37296383	37296038	Y	PAX5,ZCCHC7,FRMPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	124280	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	37945283	37945292	37945288	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	121392	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	37963992	37964293	37964120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	102391	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1,IGFBPL1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBPL1	15126	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	33077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	71413577	71413589	71413582	Y	NA	FAM122A	NA	NA	NA	NA	FAM122A	20613	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	71449303	71449452	71449360	Y	PRKACG	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	56339	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.52185126245308
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	73085472	73085592	73085532	Y	NA	NA	TRPM3,SMC5,KLF9	IMR90	Hi-C	24141950	KLF9	57932	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	73178748	73179070	73178790	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	151208	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	73184848	73185244	73185056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	157308	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	74511654	74511799	74511765	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	12627	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	74999256	74999273	74999266	Y	NA	ZFAND5	ZFAND5,TMC1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	21093	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	75797609	75797655	75797632	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	32936	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	75852010	75852329	75852219	Y	ANXA1	NA	RORB	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	87337	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	80422497	80422534	80422513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	221840	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	80560530	80561013	80560815	Y	GNAQ	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	83361	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	82213229	82213622	82213243	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	28541	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	84025176	84025464	84025320	Y	NA	NA	TLE1	IMR90	Hi-C	24141950	TLE1	276756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	84270722	84271111	84271084	Y	NA	TLE1,RP11-154D17.1	NA	NA	NA	NA	TLE1	31109	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	88588670	88588806	88588674	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	34609	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	88598937	88598983	88598960	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	44876	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	89759959	89760319	89760025	Y	GAS1	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	135392	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	90166692	90166955	90166778	Y	NA	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	28475	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	90279667	90279982	90279701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	141450	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chr9	92218643	92218902	92218819	Y	GADD45G	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	715	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	92762358	92762553	92762476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	544430	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr9	93957941	93958089	93958015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	164106	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	93975322	93975401	93975365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	146794	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	94181531	94181930	94181720	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	2214	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr9	94282129	94282472	94282345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIL3	97985	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	94968812	94969005	94968908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	85033	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	96701891	96702241	96702065	Y	NA	BARX1,RP11-231K24.2	NA	NA	NA	NA	BARX1	13413	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	96723182	96723238	96723197	Y	NA	BARX1,RP11-231K24.2	BARX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-231K24.2	7303	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	96747674	96747956	96747917	Y	NA	BARX1,RP11-231K24.2,PTPDC1	PHF2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-231K24.2	31795	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	96845736	96845997	96845867	Y	NA	CYCSP24	NA	NA	NA	NA	CYCSP24	47424	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	97633078	97633398	97633277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	146095	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	97711275	97711380	97711332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	224292	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	97950881	97951234	97951005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	126757	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	98173547	98173783	98173614	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	13295	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	100454693	100454853	100454773	Y	TSTD2,XPA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2786	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	101554135	101554384	101554323	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	2863	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	102006739	102006945	102006777	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	24393	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	102193543	102193636	102193577	Y	NR4A3	NA	NA	NA	NA	NA	SEC61B	211197	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	102569580	102569664	102569622	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	ALG2,SEC61B,NR4A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-554F20.1	10507	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	104185147	104185490	104185310	Y	NA	MRPL50,ZNF189	NA	NA	NA	NA	ZNF189	25992	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	104223219	104223646	104223385	Y	ZNF189,C9orf125	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF189	64064	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	105957487	105957816	105957647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	896725	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	109714113	109714149	109714131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF462	90735	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	112181102	112181354	112181228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN3	77236	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	112262069	112262452	112262225	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	3479	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	113507067	113507395	113507232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	490147	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	113753501	113753784	113753656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	491241	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	114831912	114832228	114831995	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	103460	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	114960117	114960327	114960222	Y	NA	SUSD1	NA	NA	NA	NA	SUSD1	24429	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	115067475	115067560	115067518	Y	SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	26387	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	115605913	115605928	115605920	Y	ZFP37	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	94795	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	115657106	115657497	115657253	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF883	115010	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	116036635	116036980	116036798	Y	SLC31A2,FKBP15,RGS3	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	CDC26	766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	116648716	116649282	116648886	Y	NA	ZNF618	NA	NA	NA	NA	ZNF618	12154	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	117040965	117041219	117041139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	125125	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	117125723	117126093	117125808	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	139637	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	117135053	117135760	117135486	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	129970	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	117171817	117171955	117171874	Y	TNFSF15,TNFSF15,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	93775	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	117481130	117481475	117481264	Y	TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	84931	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	117647197	117647589	117647272	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	80791	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	117670443	117671027	117670891	Y	TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	104037	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	119228607	119228748	119228704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	218833	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	122806056	122806349	122806093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	534099	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	123283577	123283819	123283724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	56629	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	123878647	123878673	123878659	Y	NA	CNTRL	NA	NA	NA	NA	CNTRL	43506	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	124260871	124261375	124261091	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	65961	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chr9	124383753	124383935	124383823	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	56417	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	124463473	124463936	124463619	Y	TTLL11,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	136137	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr9	124704763	124705076	124704868	Y	TTLL11,MRRF,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	148809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	125869246	125869355	125869301	Y	OR1L3,OR1K1,GPR21	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	159500	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	126237774	126237937	126237796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	208919	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	126302696	126302988	126302896	Y	LHX2	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	273841	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	126597388	126597650	126597587	Y	DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	92781	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	126624648	126624917	126624783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	65514	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	127029560	127030143	127029899	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	11675	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	127475055	127475439	127475319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR6A1	56150	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	129929259	129929425	129929350	Y	LRSAM1,RALGPS1	NA	NA	NA	NA	NA	GARNL3	55119	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	130564311	130564645	130564479	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9	SH2D3C,CDK9,FPGS	NA	NA	NA	NA	FPGS	9435	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	130590782	130591142	130590862	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	CDK9,FPGS,AK1	NA	NA	NA	NA	FPGS	35906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	130627836	130628198	130628079	Y	NA	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4	NA	NA	NA	NA	AK1	9824	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	130718218	130718307	130718248	Y	NA	ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	DPM2	19455	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	130730158	130730541	130730220	Y	NA	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	10251	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	130731999	130732057	130732026	Y	SLC25A25,DPM2,FAM102A	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	8735	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	132040752	132040968	132040856	Y	NA	NA	C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7,HELA,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	IER5L	102212	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	132141110	132141440	132141368	Y	NA	NA	LOC100506190,C9orf50,METTL11A,C9orf106,SH3GLB2,PPP2R4,CRAT,IER5L,PTGES	IMR90,K562,GM12878,HELA,H1ESC,MCF7	Hi-C,5C,ChIA-PET	24141950,22955621,22265404	LINC00963	102290	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	LINC00963	97579	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.73545309874848
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71936	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	132359283	132359664	132359324	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42780	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42522	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	3.73545309874848
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr9	132751387	132751642	132751502	Y	USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	51831	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	132769657	132769989	132769916	Y	NA	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	33484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	2.49030206583232
chr9	133565926	133566149	133566038	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	959	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	133619181	133619471	133619230	Y	NA	ABL1	NA	NA	NA	NA	ABL1	31848	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	133711348	133711666	133711497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	101007	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	134113096	134113636	134113575	Y	PRRC2B,NUP214,FAM78A	PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	PPAPDC3	49445	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chr9	134278219	134278688	134278276	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	10739	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	134581500	134581783	134581703	Y	RAPGEF1	RAPGEF1	PRRC2B,UCK1,POMT1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF1	31678	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	135495171	135495179	135495175	Y	NTNG2	GTF3C4,DDX31	NA	NA	NA	NA	GTF3C4	48243	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	135994562	135994927	135994701	Y	ADAMTSL2,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	42374	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	136387799	136387823	136387811	Y	NA	SLC2A6	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	45540	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	137030495	137030803	137030732	Y	NA	WDR5	NA	NA	NA	NA	WDR5	32008	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	137193665	137194015	137193832	Y	NA	RXRA	RXRA	MCF7	ChIA-PET	22265404	RXRA	12929	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	138778583	138778765	138778659	Y	KCNT1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	18309	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	138796932	138797111	138797062	Y	CAMSAP1	RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	138797876	138798018	138797978	Y	CAMSAP1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	218	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	138884665	138885093	138884961	Y	NA	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	33439	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	139120043	139120348	139120196	Y	NOTCH1	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	15339	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	139294189	139294305	139294248	Y	TRAF2,FAM69B,INPP5E	DNLZ,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E	NA	NA	NA	NA	SDCCAG3	8756	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	139420614	139420765	139420738	Y	PTGDS,LCNL1,C9orf172	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	17549	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr9	139444945	139445101	139445057	Y	TMEM141,SDCCAG3	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	6281	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	139458570	139458737	139458661	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	19906	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,C8G	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	139858882	139858961	139858922	Y	NA	FBXW5,C8G,C9orf142,CLIC3	NA	NA	NA	NA	C8G	21184	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	8.02430665657081
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.38350114768462
chr9	140132594	140132714	140132654	Y	LCN15,NPDC1,PNPLA7,ENTPD8	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	951	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chr9	140205908	140206072	140205991	Y	NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	11205	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	140221048	140221451	140221248	Y	UAP1L1,NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	26345	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	140301516	140301688	140301630	Y	CACNA1B,NRARP	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	14026	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	140306093	140306345	140306289	Y	NRARP	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	9369	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chrX	1480354	1481325	1480771	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	28292	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	1513605	1514177	1513885	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	3988	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	1514556	1514901	1514870	Y	ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	4939	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	2301315	2301326	2301321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED1	115682	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	2816950	2817136	2817043	Y	ARSH,ARSE	ARSD	NA	NA	NA	NA	ARSD	28256	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	3870962	3871082	3871022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	241313	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	4628683	4629054	4628903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-555H23.1	594115	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	9701264	9701389	9701313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR143	50948	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	GPR143,SHROOM2,RP11-98L4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	1159	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	180061	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	12996273	12996492	12996427	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5046	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	13002969	13003378	13003273	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	11742	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	13077920	13078128	13078034	Y	TLR7	NA	LOC100133123,TMSB4X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMSB4X	86693	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	13106166	13106719	13106370	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	NA	FAM9C	IMR90	Hi-C	24141950	TMSB4X	114939	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	128697	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	13128879	13129151	13129129	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	137652	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	13138325	13138351	13138340	Y	NA	NA	FAM9C,LOC100133123,TMSB4X	IMR90	Hi-C	24141950	TMSB4X	147098	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	13687345	13687715	13687534	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	RAB9A	17529	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	16203717	16204054	16203956	Y	NA	RPL6P30	CTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P30	11358	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	16769633	16769754	16769694	Y	NA	CTPS2,SYAP1,TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	32796	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	18904504	18904672	18904535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	96044	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chrX	20154251	20154286	20154269	Y	NA	EIF1AX	NA	NA	NA	NA	EIF1AX	3676	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	20628422	20628647	20628433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	344899	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	22909771	22909782	22909777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	770597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	23368174	23368523	23368350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	311856	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	23817688	23817829	23817775	Y	NA	ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1,RPL9P7	NA	NA	NA	NA	SAT1	18398	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	32265071	32265187	32265129	Y	DMD,DMD	NA	NA	NA	NA	NA	TAB3	1273870	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	38134878	38135257	38135079	Y	CYBB,RPGR	RPGR	NA	NA	NA	NA	RPGR	49560	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	39055539	39055797	39055668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	396854	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	39490684	39490840	39490763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	154550	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	39865489	39865898	39865566	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	168684	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	162597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.79855149199001
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.66020137722155
chrX	39949495	39949781	39949700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84801	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.24515103291616
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chrX	39968932	39969265	39969200	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65317	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	40011614	40011816	40011787	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	22766	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	40012729	40012965	40012840	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chrX	40028554	40028949	40028781	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	5633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	41192009	41192079	41192030	Y	NA	DDX3X	NA	NA	NA	NA	DDX3X	1358	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	41413588	41413590	41413589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	222937	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	41594711	41594837	41594774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	185879	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	43562549	43562948	43562749	Y	MAOA	MAOA	NA	NA	NA	NA	MAOA	49082	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	43579100	43579475	43579156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	65633	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	43884922	43885126	43885055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	145229	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	44774748	44775132	44774822	Y	NA	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	43991	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	45241202	45241396	45241250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	362298	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	45338516	45338773	45338583	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	264921	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	45666628	45666834	45666726	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42086	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	45667637	45667718	45667664	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41202	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	46487332	46487848	46487692	Y	RP2,ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	NA	CHST7	56113	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.553400459073849
chrX	47582458	47582548	47582504	Y	ARAF,CFP,CFP	NA	NA	NA	NA	NA	UXT	65898	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	47701110	47701161	47701136	Y	NA	ZNF81	NA	NA	NA	NA	ZNF81	6809	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	48571837	48572283	48571996	Y	TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19892	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	1.1068009181477
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	53745141	53745273	53745207	Y	NA	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	33468	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	55355292	55355323	55355308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L10	148348	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	56830107	56830267	56830196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	68097	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	57490949	57491197	57490977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	125072	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	57927530	57927661	57927604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	311261	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	63554308	63554471	63554461	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	58862	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	64255385	64255512	64255449	Y	ZC4H2	ZC4H2	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	2792	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	64520324	64520642	64520384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	232013	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chrX	68215899	68216039	68215946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PJA1	167597	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	GJB1	NA	NA	NA	NA	GJB1	30910	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	72786594	72786762	72786676	Y	NAP1L2,CDX4,CHIC1	CHIC1	NA	NA	NA	NA	CHIC1	5558	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	73755621	73755953	73755678	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	76499	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	74143858	74143903	74143869	Y	KIAA2022	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	230664	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	74266683	74266817	74266750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	107750	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	77306835	77307068	77306952	Y	NA	PGK1	NA	NA	NA	NA	PGK1	11617	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chrX	78664657	78664917	78664787	Y	GPR174,ITM2A	NA	NA	NA	NA	NA	TAF9B	1271454	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	85196824	85197022	85197001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	103544	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	85278748	85279124	85278988	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	21442	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chrX	95228939	95229189	95229110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	708473	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMCX6	77437	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	102880714	102880758	102880737	Y	PLP1,PLP1	TCEAL3,TCEAL1	NA	NA	NA	NA	TCEAL1	874	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	103120032	103120203	103120118	Y	TCEAL1,ZCCHC18,RAB9B	RAB9B	NA	NA	NA	NA	RAB9B	34874	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.830100688610773
chrX	107070299	107070693	107070500	Y	MID2	MID2	NA	NA	NA	NA	MID2	3314	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	107313303	107313469	107313386	Y	NA	VSIG1,PSMD10,ATG4A	NA	NA	NA	NA	PSMD10	19379	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	109563862	109564162	109564033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	117299	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chrX	115238483	115238690	115238635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	155061	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	117896439	117896822	117896632	Y	NA	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	36904	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.968450803379235
chrX	128942088	128942398	128942239	Y	ELF4,ELF4,XPNPEP2	ZDHHC9	NA	NA	NA	NA	ZDHHC9	33487	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.415050344305387
chrX	129216343	129216741	129216485	Y	SASH3,ELF4,ELF4,BCORL1	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	25950	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	129966535	129966828	129966682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	68380	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	130627096	130627500	130627335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	527793	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	132678168	132678604	132678343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-417G15.1	124395	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC160	62912	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.691750573842311
chrX	133320992	133321049	133321007	Y	NA	CCDC160	NA	NA	NA	NA	CCDC160	48028	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	134485580	134485626	134485601	Y	ZNF449,CT45A6	ZNF75D,ZNF449	NA	NA	NA	NA	ZNF449	8859	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.276700229536924
chrX	135275239	135275595	135275317	Y	CT45A6,MMGT1,FHL1,FHL1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7D3	61046	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	141932956	141933305	141933131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	2907521	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	148595188	148595518	148595383	Y	IDS,CXorf40A	IDS,CXorf40A,LINC00893	NA	NA	NA	NA	IDS	17952	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	149369210	149369612	149369376	Y	MAMLD1	NA	MIR2114,LOC100272228	IMR90	Hi-C	24141950	MAMLD1	158077	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	149996146	149996459	149996317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD99L2	68830	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	150047001	150047063	150047035	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	18226	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	MKN45	hg19	FANTOM5	0.138350114768462