chr1	839741	840250	839788	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	18010	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	1286847	1286913	1286880	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	4117	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	1744250	1744609	1744432	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	34354	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	295902	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	3421438	3421558	3421506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	104501	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	73049	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	8533889	8534027	8533958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	158003	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	9473687	9473864	9473791	Y	NA	NA	H6PD,SPSB1,SLC25A33	IMR90	Hi-C	24141950	SPSB1	122748	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	9535183	9535425	9535306	Y	NA	NA	SPSB1,H6PD,SLC25A33,TMEM201	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	62116	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	12513404	12513748	12513535	Y	AADACL4,VPS13D	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	161989	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	15119702	15119955	15119829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	196502	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	15649550	15649749	15649647	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9	NA	EFHD2	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	84642	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	RP11-169K16.4,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	16277350	16278224	16277618	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	22403	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP13A2	104719	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	95640	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr1	17495208	17495390	17495300	Y	NA	RP11-380J14.1,PADI1	PADI2,PADI1,PADI3,PADI6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	18888	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	18200796	18200931	18200864	Y	NA	NA	ACTL8,ARHGEF10L	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF10L	336466	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	19248887	19249092	19248943	Y	NA	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	21612	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	19803336	19803680	19803404	Y	TMCO4,UBR4	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	6386	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	20358851	20359226	20358857	Y	PLA2G2A	NA	VWA5B1,PLA2G2C,UBXN10	IMR90	Hi-C	24141950	OTUD3	151845	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	17270	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	21651763	21652284	21651923	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	17713	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF3	166991	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	22266159	22266438	22266333	Y	HSPG2	HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	4369	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	23076914	23077145	23077061	Y	NA	EPHB2	NA	NA	NA	NA	EPHB2	41582	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	23357547	23357765	23357628	Y	NA	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	13606	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	23387479	23387794	23387637	Y	ZNF436	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	43538	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	23903714	23904323	23904234	Y	ID3	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	19429	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	23912037	23912393	23912293	Y	PNRC2,RPL11	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	27752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	24854734	24855006	24854870	Y	NA	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	27347	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	26184900	26185246	26185071	Y	NA	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	796	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	27869425	27869556	27869494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	54756	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	27901397	27901604	27901422	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	27338	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	27928507	27928973	27928740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHDC1	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	29101544	29101853	29101799	Y	EPB41	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	40411	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	29598339	29598546	29598399	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	37311	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	30446180	30446480	30446328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRU	885152	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	31251697	31252042	31251870	Y	NA	NA	LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDC3	127566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	31430605	31430735	31430670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	50997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.82726901716897
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	106986	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	SNRNP40	29711	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	32227408	32227911	32227671	Y	NA	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	583	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	32263216	32263220	32263219	Y	NA	BAI2,SPOCD1	NA	NA	NA	NA	SPOCD1	16432	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	33427851	33428169	33427991	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	117	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	35294449	35294485	35294467	Y	NA	GJB3	NA	NA	NA	NA	GJB3	49659	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	37937293	37937526	37937471	Y	YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	486	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	38010731	38010979	38010768	Y	ZC3H12A,MTF1	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	6924	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	38495782	38495936	38495884	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,RP5-884C9.2	NA	NA	NA	NA	RP5-884C9.2	15050	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	38591881	38592061	38591968	Y	C1orf122,POU3F1	NA	LOC339442	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-884C9.2	80895	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	39598673	39599090	39598722	Y	MACF1	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1,RP1-118J21.5	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	40426190	40426638	40426252	Y	MFSD2A	MFSD2A	NA	NA	NA	NA	MFSD2A	7388	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	3671	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	42328578	42328878	42328730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	170718	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	43839359	43839523	43839441	Y	NA	RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2	NA	NA	NA	NA	ELOVL1	7663	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	44729368	44729720	44729427	Y	ATP6V0B	NA	NA	NA	NA	NA	DMAP1	52241	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	44951424	44951733	44951502	Y	TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82558	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	51809780	51810107	51809799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF11	109837	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	52885344	52885737	52885540	Y	ZCCHC11	ORC1,PRPF38A	NA	NA	NA	NA	PRPF38A	17108	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	55677745	55677788	55677767	Y	NA	USP24	NA	NA	NA	NA	USP24	998	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	57948146	57948309	57948229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	571843	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	59049880	59049917	59049902	Y	NA	DAB1,OMA1	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	OMA1	39406	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	59281510	59281579	59281545	Y	JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	33725	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	59394323	59394565	59394423	Y	NA	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-794H19.4	89494	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	59395500	59395772	59395634	Y	JUN	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-794H19.4	88287	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	59492942	59493154	59493036	Y	NA	RP4-794H19.4	FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	8883	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	59509588	59509786	59509693	Y	NA	RP4-794H19.4	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	25529	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	59986893	59986899	59986896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	226583	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	60072128	60072386	60072257	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	311818	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	60196566	60196799	60196671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP2J2	193663	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	61649786	61650305	61649984	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	320855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	65534177	65534450	65534358	Y	LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1	RP4-535B20.1	AK4,DNAJC6,LEPR,JAK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-535B20.1	2757	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	65888047	65888596	65888066	Y	LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	3777	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	66930584	66930841	66930604	Y	NA	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR78	457729	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	68027599	68027762	68027652	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	120982	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	68036173	68036524	68036291	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	112220	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	68118588	68118809	68118774	Y	GADD45A	GADD45A	GADD45A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	29935	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	68166463	68166766	68166597	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	17719	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.47971571343873
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	68314949	68315302	68315127	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	17799	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	LRRC7	NA	NA	NA	NA	LRRC7	14453	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	70238650	70238794	70238722	Y	LRRC7	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC7	206569	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	71377	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	75168986	75169131	75169081	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	27705	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	77385063	77385511	77385240	Y	ST6GALNAC5	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC5	53937	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	77522365	77522872	77522625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	69896	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	78002564	78002920	78002661	Y	NA	NA	ZZZ3	IMR90	Hi-C	24141950	ZZZ3	144184	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	78957462	78957762	78957688	Y	PTGFR	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44L	125845	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	79506230	79506516	79506373	Y	IFI44	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	392749	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL7	2193245	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	84966686	84966774	84966730	Y	NA	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	3474	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	85241214	85241288	85241250	Y	SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	86728	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	85795855	85796291	85796120	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55082	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	86077140	86077408	86077190	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	32696	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	33134	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	34017	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	87240012	87240427	87240202	Y	SH3GLB1	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71753	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	87636034	87636204	87636115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO4	155947	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	87868475	87868540	87868484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO4	76324	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	88292387	88292883	88292561	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	500236	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF326	85942	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF326	81915	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	91478571	91478975	91478771	Y	ZNF644,ZNF644	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	6854	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	92184014	92184251	92184134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	185641	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	164588	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	94161111	94161471	94161388	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR3	149235	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	94168203	94168325	94168229	Y	NA	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	142381	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	94474816	94474984	94474873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	101850	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-148B18.1	931	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	94788386	94788592	94788436	Y	ARHGAP29,F3	ARHGAP29	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	49762	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	94992236	94992413	94992325	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	12943	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	94996582	94996830	94996792	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	8526	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	95003688	95004160	95004042	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	1196	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	95007995	95008302	95008221	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	2639	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	95113814	95114327	95114013	Y	F3	NA	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	F3	108458	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	95179307	95179605	95179478	Y	F3	NA	F3,ABCD3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	F3	173951	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	96828119	96828533	96828302	Y	NA	NA	PTBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P11	81953	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	96939460	96939794	96939627	Y	NA	EEF1A1P11	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	28974	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	98373500	98373836	98373707	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	10769	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	98459458	98459857	98459685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	74853	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	109639	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	98497100	98497277	98497188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	112495	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	98499783	98500490	98500262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	115178	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	98677142	98677181	98677162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	292537	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	98788970	98789228	98789135	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	SNX7	336008	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	VCAM1	NA	NA	NA	NA	VCAM1	18969	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	108695322	108695861	108695595	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	45610	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	109104473	109104583	109104556	Y	PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	3762	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	109841804	109842152	109841978	Y	SORT1	PSRC1	NA	NA	NA	NA	PSRC1	17996	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	109913179	109913623	109913457	Y	SORT1	SORT1	NA	NA	NA	NA	SORT1	24950	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	110320163	110320291	110320225	Y	NA	GSTM3	CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	37779	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	52465	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr1	110363861	110364229	110364029	Y	GNAI3,AMPD2	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	81477	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	111209000	111209250	111209208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A4	277296	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	111677638	111678032	111677835	Y	NA	CEPT1,DRAM2	NA	NA	NA	NA	CEPT1	2217	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	114244987	114245321	114245197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54790	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	115722074	115722498	115722181	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN2	91953	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	116039640	116039989	116039911	Y	NA	NA	NGF,TSPAN2	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	142585	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	116920378	116921129	116920740	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	7088	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	117256857	117256976	117256917	Y	NA	IGSF3	CD101,TTF2	IMR90	Hi-C	24141950	IGSF3	48482	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	118153815	118153988	118153913	Y	FAM46C	FAM46C	NA	NA	NA	NA	FAM46C	7259	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	120180868	120181132	120181082	Y	NBPF7,ZNF697	GAPDHP33,ZNF697,PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	7264	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	120607153	120607333	120607254	Y	ZNF697,NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	2907	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	144941125	144941602	144941408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	131381	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	87115	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	144988079	144988414	144988189	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	85772	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SF3B4,MTMR11,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	MTMR11	25164	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	151386066	151386146	151386106	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	PSMB4	16056	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A2,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	153670755	153671012	153670885	Y	S100A9,S100A12	SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3	NA	NA	NA	NA	NPR1	21642	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	153818420	153818667	153818544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	73590	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	154979104	154979305	154979208	Y	ADAR,ADAR,MTX1,PBXIP1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	5977	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr1	155443130	155443303	155443253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L	87295	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L,MSTO1	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	155944562	155945214	155944815	Y	C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	NA	NA	NA	NA	ARHGEF2	29647	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	156966343	156966626	156966486	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	46536	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	ELL2P1,CD1D	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2P1	25856	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1,CD1D	NA	NA	NA	NA	CD1D	668	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	CD1D	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	159878004	159878104	159878054	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	10051	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,LINC01133	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,LINC01133	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	67039	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	160877833	160878093	160877963	Y	SLAMF7	ITLN1,RP11-312J18.5	CD48	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-312J18.5	15063	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	160881277	160881698	160881498	Y	NA	ITLN1,RP11-312J18.5	CD244,ITLN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-312J18.5	18507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.95734008880929
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	162508612	162508929	162508802	Y	UAP1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	20394	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	162603017	162603226	162603122	Y	DDR2	DDR2	NA	NA	NA	NA	DDR2	3854	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	163005587	163006022	163005933	Y	UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	30543	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	163006587	163006657	163006633	Y	RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	29908	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	164750243	164750515	164750387	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	227422	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	168050664	168051125	168050872	Y	SFT2D2	NA	NA	NA	NA	NA	GPR161	53696	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	172291507	172291926	172291559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	119304	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	172606833	172606931	172606882	Y	FASLG,C1orf9	NA	C1orf9,FASLG	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	195603	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	172631926	172632270	172632095	Y	C1orf9,C1orf9,FASLG	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	220696	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	138747	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	172903010	172903534	172903241	Y	TNFSF18,TNFSF4	NA	TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	114569	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr1	173958715	173958784	173958750	Y	NA	RC3H1	NA	NA	NA	NA	RC3H1	30651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	174365403	174365798	174365601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	238855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	176786385	176786536	176786461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	611601	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	179296885	179297079	179297006	Y	AXDND1,TOR3A,ABL2,SOAT1	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	35960	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	181046810	181047186	181046999	Y	NA	MR1,IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	8452	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	181110732	181111003	181110864	Y	STX6,MR1,IER5	NA	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	55094	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	183009080	183009399	183009240	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	18485	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	183129116	183129507	183129296	Y	LAMC2	LAMC2	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	23866	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	183133608	183133779	183133664	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	19594	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	183239968	183240242	183240112	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	86595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC2	95614	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	183256519	183256577	183256548	Y	NMNAT2	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC2	103146	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	183526698	183527308	183526965	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	NCF2	NA	NA	NA	NA	NCF2	30703	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	183594812	183595033	183594923	Y	NA	NCF2,ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	7859	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	184758240	184758595	184758304	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	36193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	184809721	184810151	184809898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	87674	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	185308384	185308771	185308525	Y	FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	23923	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	186580348	186580617	186580452	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	PLA2G4A	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS2	66942	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	198087299	198087585	198087454	Y	NEK7	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	36508	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	198090244	198090551	198090353	Y	NA	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	33542	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	198092315	198092633	198092473	Y	NEK7	NEK7	PTPRC,NEK7	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	31460	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	198136529	198137056	198136658	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	12436	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	198650930	198651643	198651116	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	526837	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	198894891	198894966	198894922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	770798	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	200068069	200068443	200068256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	308741	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	200857233	200857815	200857711	Y	KIF21B	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	361	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	201572031	201572237	201572112	Y	NA	NAV1	NAV1,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	NAV1	18174	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	92185	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	201709797	201710423	201710148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	85846	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	201717535	201717792	201717621	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	78477	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	202027341	202027750	202027511	Y	NA	NA	RNPEP,ELF3,NAV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ELF3	52268	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	202217450	202217807	202217629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2T	91301	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	202324768	202324787	202324778	Y	NA	UBE2T,PPP1R12B	NA	NA	NA	NA	PPP1R12B	8941	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	203525711	203525894	203525744	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	67795	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	KISS1	75033	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	204289566	204289863	204289752	Y	SOX13,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	54930	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	204317952	204318184	204318134	Y	ETNK2,PIK3C2B	PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	26609	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	204387566	204387645	204387629	Y	PPP1R15B	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	8647	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	204388302	204388627	204388415	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	9383	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	204902522	204902666	204902594	Y	LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,CNTN2,NFASC	NA	NA	NA	NA	NA	NFASC	106743	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	204976101	204976640	204976291	Y	LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,KLHDC8A,DSTYK,CNTN2,CDK18,NFASC	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP5	112503	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	205265235	205265548	205265359	Y	TMEM81,KLHDC8A	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	23335	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	205638734	205639222	205638979	Y	SLC45A3	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	8365	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	206807155	206807335	206807245	Y	NA	EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	DYRK3	274	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	207265739	207265906	207265769	Y	NA	PFKFB2,YOD1,C4BPB	NA	NA	NA	NA	C4BPB	5552	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	207413364	207413503	207413411	Y	IL19,CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	79350	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	207414217	207414394	207414309	Y	CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	78459	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	207998055	207998202	207998154	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	42293	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr1	209542596	209542897	209542763	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	57268	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	209571959	209572357	209572220	Y	LAMB3	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	27808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	209578512	209578819	209578654	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	21346	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr1	209579567	209579719	209579652	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	20446	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	209585617	209585757	209585708	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	14408	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	209597695	209597830	209597743	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	2335	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	209600780	209600928	209600808	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	615	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	209606620	209606963	209606837	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	6455	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	209829183	209829498	209829302	Y	IRF6,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3	LAMB3,G0S2,HSD11B1	NA	NA	NA	NA	LAMB3	5372	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	209830400	209831026	209830727	Y	TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3	LAMB3,G0S2,HSD11B1	NA	NA	NA	NA	LAMB3	6589	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	209915892	209916078	209915980	Y	NA	C1orf74	NA	NA	NA	NA	C1orf74	39826	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	209942657	209943400	209942924	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3	C1orf74	NA	NA	NA	NA	C1orf74	12504	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	212671541	212672116	212671670	Y	NA	NA	ATF3,NSL1,TATDN3,BATF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF3	64560	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	212923712	212923837	212923822	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	39287	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	213443269	213443475	213443372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	220680	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	214614073	214614284	214614198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109508	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	214712809	214712848	214712830	Y	NA	PTPN14	NA	NA	NA	NA	PTPN14	10944	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	215198285	215198630	215198297	Y	KCNK2,KCNK2	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP24	156208	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	218382752	218383112	218382930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	73517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	218633382	218633612	218633512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	115805	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	218636802	218637167	218637004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	119225	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	218662454	218662669	218662563	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,LOC643723	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	144877	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	218774491	218774602	218774534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	256914	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	218847947	218848245	218848113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	330370	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	218996564	218996649	218996607	Y	NA	NA	TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	348537	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	219264603	219264919	219264762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	80267	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	219971715	219971862	219971811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRS	246138	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	220510650	220511010	220510830	Y	NA	NA	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3GAP2	66854	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	221143804	221143903	221143854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	94105	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	221219252	221219404	221219360	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	169553	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	221273966	221274169	221274090	Y	HLX	NA	DUSP10,HLX	IMR90	Hi-C	24141950	HLX	224267	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr1	224685994	224686507	224686055	Y	NA	NA	WDR26,CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	63259	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	224811590	224812043	224811760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	188855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	225721902	225722011	225721957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LBR	107275	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	225954708	225954967	225954837	Y	NA	SRP9,EPHX1	ENAH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRP9	8564	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	226005413	226005573	226005512	Y	NA	SRP9,EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	9619	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	226366367	226366621	226366494	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	5810	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	227315962	227315970	227315966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	188205	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	227405146	227405174	227405158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	99001	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	227953974	227954299	227954123	Y	IBA57	SNAP47,JMJD4	NA	NA	NA	NA	JMJD4	32862	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	228272073	228272409	228272248	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	3712	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	109840	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	110504	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	230240540	230240902	230240735	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	49004	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	231531271	231531676	231531476	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	27114	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	233763307	233763375	233763341	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	15557	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	115572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	164880	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	16481	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	235114050	235115068	235114636	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	236026992	236027471	236027217	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	17469	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	236447659	236448000	236447830	Y	NA	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	4340	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	238811242	238811567	238811347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01139	163919	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	240405898	240406270	240405998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	74443	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	240437557	240437954	240437680	Y	FMN2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	106102	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	240476321	240476487	240476382	Y	GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	144866	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	241646029	241646431	241646168	Y	KMO	FH	NA	NA	NA	NA	FH	34630	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	243585242	243585384	243585313	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	167922	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr1	244212276	244213430	244213047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	199895	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	244267717	244267933	244267824	Y	NA	NA	SDCCAG8,LOC339529,AKT3,ZNF238	IMR90	Hi-C	24141950	AKT3	255336	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	245255337	245255432	245255385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	60855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	246591935	246592203	246592010	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	76411	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	246948292	246948613	246948340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	62943	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	247715651	247715843	247715723	Y	OR2G2,C1orf150	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF496	222503	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	247721715	247721996	247721768	Y	OR2G2,C1orf150	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF496	228567	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3124	224044	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	9.3517359798666
chr10	644331	644586	644526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	89097	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	1112826	1113160	1112997	Y	WDR37	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	19348	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	2951238	2951396	2951317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKP	155129	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	3028046	3028193	3028123	Y	NA	NA	LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	78332	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	3511181	3511689	3511507	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	298178	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	3852273	3852886	3852712	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	26800	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	3867491	3867713	3867639	Y	NA	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	42018	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	3868851	3869035	3868973	Y	KLF6	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	43378	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	4983862	4984222	4983900	Y	NA	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	51066	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	46912	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	5593718	5593999	5593816	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NET1	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-463N16.6	42082	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr10	6424082	6424357	6424201	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	LOC399715,RBM17,PFKFB3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	239201	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	258527	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	8909152	8909331	8909243	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	815585	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	135463	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	11924114	11924319	11924232	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	141749	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	11940492	11940889	11940732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	142280	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	12283843	12284276	12283949	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	NUDT5	47700	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	13829023	13829481	13829176	Y	PRPF18	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	202096	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr10	14441741	14441971	14441846	Y	NA	NA	FRMD4A,MIR1265	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	60170	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	14447046	14447458	14447244	Y	NA	NA	FRMD4A,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	54683	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr10	14458446	14458565	14458455	Y	NA	FRMD4A	FRMD4A,MIR1265,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	43576	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	14518978	14519126	14519049	Y	NA	FRMD4A	FRMD4A	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	16837	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	RPP38	21540	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	16481463	16481634	16481561	Y	NA	PTER	NA	NA	NA	NA	PTER	4521	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	16548527	16548808	16548668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTER	71585	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	17390739	17391085	17390858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N14.3	115907	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	17707752	17708081	17707913	Y	VIM,ST8SIA6,STAM	STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	23628	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	19927503	19927756	19927630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	175412	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	21218309	21218697	21218504	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	242419	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	22535914	22536341	22536050	Y	NA	NA	ARMC3,LOC100130992	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	66562	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	22628998	22629520	22629110	Y	EBLN1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	20858	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr10	22726811	22727194	22727116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	118671	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	22961361	22961802	22961720	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	39682	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	24917417	24917574	24917542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	93023	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	25348919	25349256	25349121	Y	NA	THNSL1	ARHGAP21,PRTFDC1,ENKUR,THNSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THNSL1	45332	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	26191189	26191209	26191199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	533923	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	27026601	27027004	27026841	Y	MASTL,APBB1IP,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42013	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	27032794	27033066	27033024	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	48206	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	28725980	28726021	28726001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAC	93401	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	29877671	29877896	29877784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	181340	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	31015875	31016223	31016049	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438,ERGIC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	MAP3K8	295009	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	31025766	31026097	31025992	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	292769	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	31073492	31073855	31073655	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	245011	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	31364412	31364707	31364567	Y	NA	ZNF438	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	45546	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	ITGB1	NA	NA	NA	NA	ITGB1	41416	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr10	35589038	35589427	35589190	Y	CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	55085	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	36783467	36783622	36783545	Y	NA	NAMPTL	FZD8	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPTL	27540	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	38149659	38150080	38149945	Y	ZNF248	RP11-162G10.5,ZNF248	NA	NA	NA	NA	ZNF248	4625	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	48279	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr10	44185196	44185271	44185205	Y	NA	ZNF32	NA	NA	NA	NA	ZNF32	42892	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	47057375	47057652	47057526	Y	NA	NA	GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL	IMR90	Hi-C	24141950	SYT15	87975	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr10	47080536	47081217	47080878	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	111136	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	47092142	47092537	47092340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	122742	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	144442	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	47129494	47129670	47129546	Y	SYT15,PPYR1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	160094	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	47149103	47149407	47149372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	179703	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-463P17.1	674126	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	52058471	52058580	52058526	Y	NA	DYNC1I2P1	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	35733	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	64371344	64371453	64371399	Y	EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	191063	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	65128612	65128923	65128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	56134	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	650987	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	68137896	68138170	68138033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	545594	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr10	68796734	68796983	68796808	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	112970	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	68802112	68802301	68802189	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	118348	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4,MYPN	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYPN	8635	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	70782889	70783013	70782952	Y	NA	KIAA1279	NA	NA	NA	NA	KIAA1279	36402	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	71109104	71109433	71109270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HK1	81364	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	72592079	72592231	72592146	Y	SGPL1	RP11-399N22.3,SGPL1	NA	NA	NA	NA	SGPL1	18362	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	73528339	73528873	73528813	Y	CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	2382	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	78923836	78924098	78923933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	472255	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	79176142	79176460	79176291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	219893	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	79261142	79261358	79261250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	134995	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	80015725	80016226	80016048	Y	RPS24	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24	224207	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	80122259	80122477	80122368	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	330741	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	80912242	80912363	80912303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	85450	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	82215085	82215437	82215324	Y	TSPAN14,SH2D4B	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	3163	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	86108374	86108507	86108453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	209692	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr10	86152070	86152317	86152175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	165882	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	86588854	86589199	86589092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	270655	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	88004394	88004782	88004588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	119468	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	89875844	89876042	89875925	Y	NA	NA	PTEN,KLLN,RNLS,ATAD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	172585	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	92690903	92691268	92691118	Y	NA	ANKRD1	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD1	11870	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	92923893	92924265	92924064	Y	NA	NA	RPP30,NUDT9P1,PCGF5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	53643	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	94353992	94354203	94354151	Y	MARCH5	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	2949	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	95146698	95147164	95146872	Y	MYOF	NA	NA	NA	NA	NA	MYOF	92910	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr10	95327729	95327872	95327806	Y	O3FAR1	RBP4	NA	NA	NA	NA	RBP4	31629	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	95766976	95767368	95767096	Y	NA	PLCE1	NA	NA	NA	NA	PLCE1	15230	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	100993810	100993952	100993927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNNM1	92904	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	49662	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	102488726	102488983	102488821	Y	NA	NA	PAX2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM178A	181343	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	103591495	103591519	103591507	Y	BTRC,KCNIP2,KCNIP2	MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	14799	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	103699141	103699397	103699242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	114553	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	108342157	108342240	108342208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP5	898077	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	112185759	112186089	112185825	Y	SHOC2,DUSP5,BBIP1,BBIP1	NA	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	69507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	116394389	116394785	116394496	Y	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B1	184718	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	118034123	118034494	118034359	Y	GFRA1,GFRA1,GFRA1	GFRA1	NA	NA	NA	NA	GFRA1	3144	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	122267318	122267402	122267360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAPDC1A	52852	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	123707273	123707432	123707353	Y	PLEKHA1,BTBD16	ATE1-AS1,ATE1,NSMCE4A,TACC2	NA	NA	NA	NA	ATE1	20957	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	125935063	125935400	125935231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	83857	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	126768245	126768621	126768433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	79118	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	127751033	127751319	127751198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	167925	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	128592998	128593177	128593088	Y	NA	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	1020	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	129721316	129721687	129721518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	200962	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr11	1301851	1302228	1302044	Y	NA	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	26656	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	1320394	1320580	1320544	Y	DUSP8,TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	8304	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	1804182	1804577	1804353	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1	RP11-295K3.1,CTSD,AC139143.2	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8	IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7	Hi-C,5C,ChIA-PET	24141950,22955621,22265404	AC139143.2	18748	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	2176984	2177085	2177035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P30	177921	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	2635710	2635980	2635769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	83244	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	2655024	2655339	2655183	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	63885	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	3792611	3792742	3792677	Y	STIM1,RHOG,NUP98	PGAP2,NUP98	NA	NA	NA	NA	PGAP2	24212	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	3918054	3918451	3918253	Y	NA	STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	MIR4687	42762	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	6564206	6564247	6564227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP8	58603	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	6699628	6699937	6699850	Y	OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2	MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	2695	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	8756335	8756571	8756455	Y	ST5,ASCL3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL27A	54377	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	10396762	10397165	10396941	Y	ADM	NA	SBF2,SWAP70,LOC283104,ADM,LOC440028,AMPD3,RNF141,MRVI1-AS1,MRVI1,CTR9,MTRNR2L8	IMR90	Hi-C	24141950	AMPD3	68902	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	114475	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	14827	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	11473	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	12109558	12109847	12109697	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MICAL2	3696	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12132692	12132808	12132735	Y	MICAL2	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19149	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12148184	12148552	12148402	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	34641	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	12180569	12180722	12180645	Y	MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67026	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12181262	12181458	12181363	Y	MICALCL,MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67719	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	12184848	12185162	12185016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	71305	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	12204138	12204505	12204342	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	90595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12218036	12218499	12218053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	104493	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12222498	12222995	12222733	Y	MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	108955	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	12306799	12307179	12306992	Y	MICAL2,PARVA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	89553	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	12821812	12822118	12821851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	127843	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	19736892	19737150	19737126	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	366621	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	22631991	22632283	22632136	Y	NA	FANCF	NA	NA	NA	NA	FANCF	13104	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	23079827	23079841	23079834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	229982	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	27693843	27694020	27693988	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	47585	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	28132530	28132826	28132694	Y	NA	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	4675	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	28764751	28764902	28764829	Y	NA	RP11-115J23.1	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	42589	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	28778513	28778891	28778701	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	56351	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	28779294	28779601	28779473	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	57132	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr11	28853592	28853798	28853653	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	131430	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	133042	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	28856336	28856685	28856610	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	134174	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	135691	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	28864582	28864807	28864697	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	142420	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	29332369	29332533	29332436	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	610207	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	29974880	29975070	29974975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115J23.1	1252718	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	32109079	32109545	32109351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	277140	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	33096691	33097088	33096864	Y	NA	TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	37728	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	33394151	33394320	33394196	Y	C11orf41	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	117933	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	33427027	33427076	33427050	Y	NA	NA	C11orf41,C11orf91	IMR90	Hi-C	24141950	HIPK3	150809	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	33711808	33712191	33712002	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	43800	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	34621875	34622041	34621973	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	163403	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	35068839	35069139	35069034	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	89278	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	35099118	35099616	35099383	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	58801	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52906	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	35180596	35180888	35180668	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	22179	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	35575444	35575679	35575584	Y	PAMR1,FJX1	NA	PAMR1,TRIM44,LDLRAD3,FJX1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM44	106674	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	36412549	36413219	36412775	Y	COMMD9,PRR5L,PRR5L	NA	NA	NA	NA	NA	PRR5L	96711	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	40869203	40869352	40869278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	688632	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	43473758	43474114	43473936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC17	95276	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	44883806	44884166	44884088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	86674	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr11	46313081	46313234	46313158	Y	NA	CREB3L1,DGKZ	NA	NA	NA	NA	CREB3L1	15869	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	47252770	47253009	47252890	Y	NA	PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2,MADD	NA	NA	NA	NA	NR1H3	14842	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	57366352	57366685	57366510	Y	RTN4RL2,SLC43A1,SLC43A1,UBE2L6,SERPING1,SERPING1	UBE2L6,SERPING1,AP000662.4,CLP1	NA	NA	NA	NA	SERPING1	3492	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	59524471	59524655	59524596	Y	MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3	STX3	NA	NA	NA	NA	STX3	45542	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	60753567	60754105	60753691	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132A	63632	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	61146248	61146454	61146376	Y	SLC15A3,VPS37C,DAGLA,CYBASC3,TMEM138,CYBASC3,SDHAF2,CPSF7,CPSF7	DAK,DDB1,TMEM138,TMEM216,CPSF7,SDHAF2	NA	NA	NA	NA	TMEM216	10705	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	61780516	61780626	61780618	Y	NA	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47384	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	62226637	62226898	62226739	Y	FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	84573	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	62308532	62308826	62308693	Y	WDR74,NXF1	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	2645	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	RARRES3,HRASLS2	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	65059026	65059409	65059335	Y	EHD1,BATF2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20880	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr11	65259637	65259913	65259840	Y	SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3320	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CATSPER1	8651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	66093813	66094193	66094103	Y	NA	YIF1A,RIN1,BRMS1,B3GNT1	NA	NA	NA	NA	RIN1	8118	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	68270416	68270689	68270553	Y	MRGPRD	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	44230	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IFITM9P	113683	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	NA	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	166115	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	188820	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr11	70107513	70107580	70107548	Y	NA	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	7226	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	71892346	71892672	71892509	Y	NA	INPPL1	RNF121,NUMA1,LRTOMT,LAMTOR1,C11orf51,FOLR3,FOLR1	IMR90	Hi-C	24141950	INPPL1	40073	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	73034605	73034942	73034774	Y	NA	ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	17271	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	74382761	74383066	74382912	Y	NA	NA	POLD3,CHRDL2,RNF169	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-864N7.2	72093	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	76474777	76474856	76474817	Y	OMP	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90	Hi-C	24141950	TSKU	16439	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	KCTD14	3883	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	80438038	80438259	80438146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1960312	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	85419491	85419865	85419792	Y	SYTL2	CREBZF,CCDC89	NA	NA	NA	NA	CCDC89	24171	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	86229748	86229843	86229795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	151835	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	86389449	86389613	86389533	Y	NA	ME3	ME3,PRSS23	IMR90	Hi-C	24141950	ME3	7771	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	86430919	86431170	86431045	Y	PRSS23	ME3	PRSS23,ME3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ME3	49241	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	86664236	86664677	86664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD4	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr11	87139431	87139805	87139524	Y	NA	NA	GRM5	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	392545	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	88269213	88269357	88269284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	200258	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	91958948	91959142	91959077	Y	FAT3	NA	FAT3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	969988	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	95901866	95902123	95902033	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	172221	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	100747572	100748094	100747776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	191188	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	103571320	103571700	103571606	Y	PDGFD	NA	PDGFD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37O16.8	292935	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	106239516	106239921	106239716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD3	293024	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	110581726	110581943	110581819	Y	ARHGAP20	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP20	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	112375624	112375994	112375809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-356J5.12	236152	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	114152118	114152374	114152253	Y	ZBTB16,NNMT	NNMT	NNMT	IMR90	Hi-C	24141950	NNMT	25609	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	114162155	114162496	114162247	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	35646	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	114224881	114225192	114225037	Y	NA	RBM7,C11orf71	FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM7	43560	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	114288977	114289308	114289144	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	18800	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	115741521	115741886	115741709	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	CADM1	367846	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	116722234	116722744	116722542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF259	65468	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	118493849	118494041	118493911	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	18694	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	1969	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	KRT8P7	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	17585	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	121906863	121907080	121906924	Y	NA	NA	SORL1,MIR125B1,MIR100HG	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166D19.1	77951	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	122049218	122049681	122049522	Y	NA	MIRLET7A2	NA	NA	NA	NA	MIRLET7A2	33917	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	122080743	122080920	122080836	Y	NA	NA	SORL1,BLID,MIR125B1,MIR100HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIRLET7A2	65442	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr11	122608190	122608588	122608260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	83807	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	123394284	123394590	123394437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000783.1	95226	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-677M14.2	54655	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	126029421	126029682	126029619	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	HYLS1,CDON	IMR90	Hi-C	24141950	FAM118B	49627	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	128078462	128078679	128078487	Y	NA	NA	FLI1,ETS1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	376774	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	128373673	128373898	128373813	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	81555	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	128589113	128589189	128589151	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	34683	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	129716429	129716681	129716540	Y	TMEM45B	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	46804	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	130113792	130113937	130113867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB44	68644	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	130767627	130768066	130767878	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16338	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	132502586	132503019	132502881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	1321861	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	GLB1L2	508318	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	1211682	1211803	1211740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	114007	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	1428527	1428661	1428594	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	208396	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	1583254	1583583	1583419	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	53474	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	52725	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	1951658	1951835	1951754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	86481	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	2378088	2378425	2378378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	266387	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	2467250	2467467	2467306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	355549	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	2952217	2952396	2952310	Y	NA	ITFG2,RP4-816N1.6,FOXM1,TULP3	NA	NA	NA	NA	FOXM1	31810	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	4335261	4335485	4335373	Y	NA	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf5	92886	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	6335136	6335793	6335267	Y	SCNN1A	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	28255	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	6539566	6540029	6539921	Y	NA	TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	TAPBPL	18827	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	6622889	6622901	6622895	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	5501	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	9917181	9917686	9917498	Y	KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CD69	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	103049	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	11755379	11755464	11755421	Y	NA	ETV6	ETV6	IMR90	Hi-C	24141950	ETV6	45324	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	11986979	11987463	11987102	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186191	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	12009987	12010279	12010170	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	209199	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	LRP6	306048	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	13247337	13247745	13247512	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	52119	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	13292095	13292429	13292230	Y	NA	NA	EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	55221	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	14413561	14413925	14413703	Y	NA	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF7IP	102685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	224306	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	455045	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	SSPN	5113	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	26392228	26392317	26392290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	78336	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	26400740	26401146	26400920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	69507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	27332593	27333057	27332936	Y	STK38L	NA	STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK38L	61844	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	28119724	28120118	28120115	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	164064	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	28283625	28284072	28283761	Y	PTHLH,PTHLH	CCDC91	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	110	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	29844514	29844723	29844664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	90969	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	32607110	32607326	32607203	Y	NA	NA	FGD4,DNM1L,BICD1	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	222808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	33072560	33072656	33072597	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	24786	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	33740370	33740630	33740504	Y	NA	NA	SYT10,YARS2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ALG10	432586	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	33741113	33741380	33741221	Y	NA	NA	SYT10,YARS2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ALG10	431836	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	240019	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	42470575	42470704	42470641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	65977	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	42598855	42599145	42599001	Y	YAF2,YAF2,YAF2	YAF2,PPHLN1	NA	NA	NA	NA	YAF2	31006	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	44910336	44910664	44910572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM117	682566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	46825426	46825886	46825665	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	49964	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.39230455298913
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	5.87202026642786
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	47295020	47295376	47295198	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	176358	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	5.65453803433794
chr12	47476610	47477096	47476829	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	4876	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	47670448	47670925	47670783	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	198714	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	48415389	48415421	48415405	Y	OR10AD1	NA	COL2A1,TMEM106C,SENP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM106C	60037	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr12	49695692	49695788	49695732	Y	RHEBL1	TROAP,C1QL4	NA	NA	NA	NA	TROAP	19231	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	50378385	50378667	50378577	Y	NA	RACGAP1	NA	NA	NA	NA	RACGAP1	46252	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	NA	NA	NA	NA	NA	SMAGP	57866	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.60978678507905
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr12	52543416	52543547	52543482	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	40237	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr12	52609215	52609817	52609526	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	14487	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	52617951	52618303	52618240	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	6001	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	52624014	52624394	52624158	Y	KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT7	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr12	52624687	52625139	52624914	Y	KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	383	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.95734008880929
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8237	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT4	58707	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	61446	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	53338460	53338676	53338568	Y	KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1979	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	53359181	53359363	53359294	Y	PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	17443	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	53923951	53924170	53924046	Y	CALCOCO1,ATF7,ATF7,MAP3K12	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	TARBP2	31246	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	54012118	54012371	54012242	Y	PFDN5	ATF7	NA	NA	NA	NA	ATF7	5828	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	54145140	54145515	54145243	Y	NA	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	25611	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	54198975	54199124	54199050	Y	NA	SNORD81	HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD81	15886	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	54444172	54444407	54444311	Y	ATF7,ATP5G2,HOXC12,HOXC11	HOXC8,HOXC5,HOXC4	FLJ12825	IMR90	Hi-C	24141950	HOXC4	1254	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	54589708	54589846	54589777	Y	CALCOCO1,NCKAP1L,GPR84	SMUG1	SMUG1,HOXC4,HOXC9	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SMUG1	8930	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	NA	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	57026737	57026855	57026796	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	1745	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	4.34964464179842
chr12	57458942	57459239	57459094	Y	NA	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	20607	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	57523550	57524188	57523895	Y	MBD6,DDIT3,NAB2,STAT6,STAT6,LRP1	TMEM194A,NAB2,LRP1	NA	NA	NA	NA	STAT6	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	58819259	58819609	58819396	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	485935	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	62727827	62728150	62727887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	56896	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	56366	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	129508	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr12	63242425	63242574	63242486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	84243	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	64401221	64401399	64401310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	165148	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	64482177	64482504	64482346	Y	SRGAP1,TBK1,C12orf66	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	131572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	64575299	64575468	64575384	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	38608	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	65140575	65140710	65140636	Y	TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS	GNS	NA	NA	NA	NA	GNS	10517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	66048868	66049228	66049091	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	54219	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	66286698	66286979	66286899	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	70787	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	66697484	66697842	66697547	Y	HELB	HELB	NA	NA	NA	NA	HELB	3159	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	68221654	68222227	68222103	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	DYRK2	181536	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	68661732	68662103	68661918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDM1	62058	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	68705850	68706149	68706026	Y	IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18012	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	68932536	68932735	68932704	Y	NA	NA	MDM1	IMR90	Hi-C	24141950	RAP1B	69884	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	69446892	69447106	69446965	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM,MDM2	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	83542	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	70382625	70382986	70382644	Y	CCT2,CCT2,RAB3IP	NA	CNOT2,KCNMB4,PTPRB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT2	251788	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	72690281	72690495	72690341	Y	TPH2,TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE	211235	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	72728711	72729061	72728940	Y	TPH2,TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE	249665	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	74668744	74669132	74668938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	260419	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	76751627	76751939	76751780	Y	NA	BBS10	NA	NA	NA	NA	BBS10	11405	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr12	78551172	78551540	78551259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	328487	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	79526323	79526826	79526502	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	270550	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	79566745	79567141	79566931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	310972	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	135216	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	79803401	79803717	79803562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	91459	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	79817704	79817772	79817737	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	77404	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	79848111	79848561	79848284	Y	NA	RP1-78O14.1	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	46615	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	79918085	79918441	79918422	Y	NA	RP1-78O14.1	SYT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-78O14.1	22909	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	80974115	80974384	80974233	Y	MYF5	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRQ	176341	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	82155346	82155393	82155380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	595191	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	83134280	83134513	83134356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	55621	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRIQ1	83027	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	88064249	88064502	88064338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	361121	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	88700433	88700684	88700558	Y	NA	NA	KITLG	IMR90	Hi-C	24141950	TMTC3	166360	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	88828245	88828424	88828303	Y	NA	NA	KITLG	IMR90	Hi-C	24141950	KITLG	144204	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	89628967	89629343	89629087	Y	DUSP6,ATP2B1	NA	POC1B,LOC728084,DUSP6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	115705	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	90403694	90404042	90403890	Y	NA	NA	LOC338758	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	302617	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	91972476	91973067	91972734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCN	397576	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	92172749	92173207	92172879	Y	BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-796E2.4	364142	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	92505299	92505700	92505686	Y	NA	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	31649	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	18951	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	92987343	92988147	92987837	Y	EEA1,BTG1	NA	DCN,LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	332960	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	95594660	95595399	95595279	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	13859	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	95597894	95598075	95597980	Y	NA	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	11183	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	95609786	95609977	95609896	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	VEZT	264	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	96650909	96650966	96650937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	64749	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	96794959	96795305	96795211	Y	CDK17	CDK17,RN7SKP11	NA	NA	NA	NA	CDK17	2621	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	98793447	98793582	98793503	Y	NA	RNU4-41P	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	16234	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	98832634	98832896	98832762	Y	NA	RNU4-41P	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	22818	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	99021055	99021169	99021113	Y	NA	SLC25A3,IKBIP,APAF1	NA	NA	NA	NA	IKBIP	15722	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	NA	NA	NA	NA	NA	NUP37	397706	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	104613052	104613575	104613267	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	5495	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	104675995	104676292	104676137	Y	GLT8D2,TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	3495	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	104998326	104998912	104998568	Y	TXNRD1,EID3,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	151253	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	105032549	105032903	105032843	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	185476	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	105711063	105711549	105711425	Y	C12orf75	RP11-474B16.1	C12orf75,APPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-474B16.1	7246	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	105812004	105812354	105812179	Y	NA	NA	NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-474B16.1	93209	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	105839455	105839823	105839639	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-474B16.1	120660	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	106515905	106516067	106515985	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	15744	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	106529993	106530447	106530148	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	1364	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	106535331	106535540	106535446	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	3520	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	106664099	106664223	106664175	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	NUAK1,CKAP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCP11L2	29484	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	108054058	108054330	108054150	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	23179	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	109900309	109900503	109900403	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	12704	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	113709766	113709965	113709824	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,PLBD2	NA	NA	NA	NA	NA	IQCD	52867	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	115103963	115104215	115104201	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	15754	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	115791856	115792156	115792052	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	671887	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	116821073	116821333	116821156	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MED13L	107930	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	116865168	116865340	116865257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	152025	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	158897	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	117988619	117988948	117988784	Y	NOS1,NOS1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	362283	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	118012695	118013095	118012896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	386359	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	118123457	118123641	118123524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC5	325752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	118466445	118466738	118466629	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	RFC5	17052	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	118744725	118745093	118744968	Y	TAOK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P5	62848	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	119618645	119618705	119618687	Y	HSPB8	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	4198	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	18548	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	120700935	120701192	120701121	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	382	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	122462417	122462775	122462615	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	7089	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr12	123216800	123217069	123216944	Y	CLIP1,HCAR2,HCAR3,VPS37B	DENR	NA	NA	NA	NA	DENR	18252	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	124717911	124718282	124718055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	262123	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	124866398	124866679	124866460	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	183456	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	124875337	124875736	124875419	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	174399	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	125565000	125565015	125565008	Y	AACS	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	17075	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	125581977	125582373	125582099	Y	TMEM132B	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	34052	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr12	128823822	128824230	128823901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	482298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr12	131249995	131250369	131250318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	71442	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	20419964	20420131	20420036	Y	PSPC1,ZMYM5	ZMYM5	NA	NA	NA	NA	ZMYM5	15645	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	162595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	20993930	20994321	20994126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	103675	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	21748962	21749145	21749040	Y	NA	SAP18,SKA3,MRP63	NA	NA	NA	NA	MRP63	178	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	22545143	22545315	22545232	Y	NA	NA	FGF9	IMR90	Hi-C	24141950	RPS7P10	343989	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	23500406	23500844	23500578	Y	NA	NUS1P2	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	12616	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	23895900	23896291	23896206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACS	109550	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	24528296	24528692	24528455	Y	PCOTH	SPATA13	SPATA13,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	SPATA13	23252	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	29290769	29291025	29290846	Y	POMP	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	82	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	29293854	29294204	29294003	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	2747	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	36635	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	30969684	30969817	30969776	Y	USPL1	LINC01058,UBE2L5P	LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01058	24557	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	31444557	31445090	31444788	Y	C13orf26	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	136912	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	31746734	31747017	31746876	Y	NA	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	HSPH1	12209	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	32725009	32725223	32725116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	121572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	33781660	33782051	33781892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	140716	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	33896698	33896851	33896775	Y	NA	STARD13	NA	NA	NA	NA	STARD13	25916	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	34069113	34069239	34069161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	146346	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.47971571343873
chr13	34727619	34727920	34727781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	337433	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	34730516	34730744	34730573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	340330	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr13	34781635	34781805	34781767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	391449	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr13	35835884	35836142	35836013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	321460	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	36054193	36054594	36054324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	539769	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	38020689	38020970	38020810	Y	POSTN	NA	CSNK1A1L	IMR90	Hi-C	24141950	POSTN	150011	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	38067112	38067171	38067141	Y	POSTN	NA	CSNK1A1L	IMR90	Hi-C	24141950	POSTN	103810	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	40350825	40350889	40350868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	123061	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	40738384	40738430	40738407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	500304	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	41519573	41519973	41519773	Y	NA	SUGT1P3	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	25663	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	42849254	42849451	42849396	Y	TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	4965	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr13	44201276	44201468	44201373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	157576	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	44440154	44440346	44440262	Y	CCDC122,C13orf31,C13orf31	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	11074	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr13	45194278	45194532	45194405	Y	NA	TSC22D1	NUFIP1,TSC22D1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	44995	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	45211496	45211845	45211671	Y	NA	NA	NUFIP1,TSC22D1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	62213	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	45288309	45288506	45288432	Y	KCTD4	NA	NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	139026	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	45333095	45333256	45333140	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	183812	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	45496701	45496835	45496770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	64783	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	49888133	49888426	49888280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	68086	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	50555707	50555861	50555784	Y	NA	SPRYD7,TRIM13,MIR3613	NA	NA	NA	NA	TRIM13	12163	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	55208577	55208909	55208656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	1983733	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	60736273	60736548	60736444	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	152	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	72206339	72206570	72206525	Y	DACH1	H3F3BP1	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	40629	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	78410598	78410901	78410716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	511413	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	91863944	91864030	91864005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	134044	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	94706563	94706645	94706604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	539866	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	94766317	94766480	94766414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	480031	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	97424682	97424992	97424817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	446696	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	98599587	98599881	98599659	Y	NA	IPO5	NA	NA	NA	NA	IPO5	4031	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	99562711	99562955	99562841	Y	GPR183,STK24	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2P4	271218	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	99772014	99772367	99772137	Y	GPR18	NA	MIR548AN,UBAC2	IMR90	Hi-C	24141950	UBAC2-AS1	78597	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	99956041	99956410	99956299	Y	GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	90029	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	99963491	99964160	99963691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	97479	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	100631413	100631577	100631494	Y	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	NA	PCCA	107692	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	101820185	101820500	101820343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	246343	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	102105666	102105949	102105700	Y	ITGBL1	NALCN,ITGBL1	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	2700	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr13	102273007	102273389	102273072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	170041	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	102377146	102377246	102377196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	274180	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	103205925	103205941	103205933	Y	NA	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	41412	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	107160222	107160504	107160362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	58008	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	108103235	108103615	108103559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	413468	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	108310994	108311341	108311278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	205742	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	109806235	109806377	109806339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	630538	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	628940	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	110664530	110664847	110664695	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	227615	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	110965035	110965206	110965124	Y	COL4A1,COL4A2	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	7539	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	111049993	111050394	111050073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	92497	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr13	113982391	113982456	113982424	Y	NA	LAMP1	NA	NA	NA	NA	LAMP1	32835	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	114548051	114548420	114548108	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	16626	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC7A7	2462	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr14	27631441	27631502	27631472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	1325614	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	30663968	30664325	30664158	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	4864	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	32976944	32977104	32977024	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	24938	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	33126424	33126565	33126444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	174418	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	RPS19P3,SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	37587049	37587449	37587434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	52622	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2175434	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	45592379	45592731	45592576	Y	PRPF39	PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	FKBP3	9791	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	49979013	49979291	49979168	Y	C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	RPS29	84117	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	50511824	50512400	50511896	Y	RPL36AL,ARF6,SOS2,C14orf182	NA	C14orf182,ARF6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARF6	154014	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	51862095	51862490	51862300	Y	FRMD6,FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	242	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	3789	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	51909639	51909898	51909736	Y	NA	RP11-255G12.3,FRMD6	FRMD6-AS1,FRMD6,LOC283553,GNG2	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	43920	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	52076708	52076858	52076794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	122890	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	127064	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	52350999	52351848	52351141	Y	PTGER2,GNG2	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	60086	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	88894	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	54573774	54574066	54573953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	150295	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34	NA	NA	NA	NA	FBXO34	29918	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	55921336	55921695	55921412	Y	NA	ATG14	NA	NA	NA	NA	ATG14	44760	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr14	57343255	57343511	57343375	Y	OTX2,OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	390215	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	61612107	61612325	61612234	Y	SIX1	NA	SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	TRMT5	166031	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	61937176	61937384	61937282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	222847	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	61960014	61960497	61960231	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	199734	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	61983792	61983968	61983885	Y	SYT16	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	176263	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	62032593	62032996	62032785	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	127235	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	62040859	62041355	62041035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	118876	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	62082808	62083073	62082921	Y	SYT16	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	77158	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	62157799	62158071	62157921	Y	HIF1A	HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	2160	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	62219407	62219640	62219496	Y	HIF1A,SNAPC1	RP11-618G20.1,HIF1A-AS2,SNAPC1	NA	NA	NA	NA	HIF1A-AS2	3592	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	64975156	64975343	64975202	Y	NA	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	5225	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	65676815	65677190	65676899	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	109402	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	65705887	65706189	65706012	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	138474	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	65905118	65905243	65905181	Y	NA	FUT8	NA	NA	NA	NA	FUT8	29808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	66104549	66104610	66104580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	229239	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	68610058	68610732	68610311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	276181	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	68658646	68658820	68658748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	228093	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	68712620	68712855	68712738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	174058	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	68943032	68943562	68943135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	56119	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr14	69014972	69015327	69015083	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	128059	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	69159987	69160257	69160134	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	100933	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	69162018	69162337	69162187	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	98853	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr14	69171648	69171749	69171699	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	89441	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	70020113	70020453	70020282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	55860	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	73110081	73110359	73110171	Y	NA	NA	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90	Hi-C	24141950	DPF3	248450	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	43525	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	38286	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	75040596	75041021	75040862	Y	LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	LTBP2	36285	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	75701379	75701456	75701414	Y	FOS	FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	FOS	42021	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	76513976	76514095	76514005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT43	147497	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	77423763	77424258	77424192	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	77427398	77427552	77427469	Y	C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	3417	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	78194844	78195080	78194962	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	22430	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	80857236	80857459	80857352	Y	NA	DIO2	NA	NA	NA	NA	DIO2	5136	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	81088140	81088388	81088236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	236040	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr14	85881762	85881957	85881956	Y	FLRT2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	112375	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr14	88461350	88461753	88461554	Y	GALC,GALC,GPR65	GALC	NA	NA	NA	NA	GALC	3341	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	90280261	90280500	90280379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	138621	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	91683304	91683542	91683359	Y	NA	GPR68	NA	NA	NA	NA	GPR68	34727	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	93510584	93510744	93510686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	69921	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	93698124	93698181	93698153	Y	NA	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	C14orf142	26685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	95596986	95597082	95597060	Y	NA	DICER1	NA	NA	NA	NA	DICER1	25265	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	117542	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	100068632	100068970	100068687	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	269	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	3288	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	100497913	100498157	100498035	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	204478	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	NA	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WARS	208675	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	102226478	102227031	102226824	Y	HSP90AA1	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	343	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.39230455298913
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	105533738	105533893	105533826	Y	NA	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	48253	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	6059	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	5167	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1262554	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	21914435	21914569	21914482	Y	OR4N4	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	916826	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	645321	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	29949236	29949642	29949365	Y	NA	RP11-680F8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	15552	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	30213334	30213722	30213356	Y	NA	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	45346	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	30216999	30217403	30217070	Y	TJP1	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	41665	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	30315678	30315833	30315756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	56610	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	32962221	32962756	32962661	Y	NA	SCG5,GREM1	NA	NA	NA	NA	SCG5	30344	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	32974763	32975144	32974961	Y	NA	SCG5,GREM1	NA	NA	NA	NA	GREM1	33031	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	102835	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	33122479	33122828	33122652	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	114304	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	33162710	33163027	33162926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	154535	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	33266942	33267258	33267072	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	258767	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	33299476	33299841	33299744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	291301	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	RP11-323I15.2	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	2271	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	208049	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr15	35989992	35990298	35990145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-323I15.2	607310	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	38784019	38784367	38784201	Y	RASGRP1	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	39691	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	38830685	38830836	38830802	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	24940	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	39540453	39540799	39540512	Y	THBS1,C15orf54	C15orf54	NA	NA	NA	NA	C15orf54	86	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	39561378	39561942	39561743	Y	THBS1	C15orf54	NA	NA	NA	NA	C15orf54	20493	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.26223348134881
chr15	39563210	39563560	39563357	Y	THBS1	C15orf54	NA	NA	NA	NA	C15orf54	22325	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr15	39593792	39594300	39594108	Y	THBS1	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf54	52907	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	39668694	39669075	39668948	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	48321	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	39683457	39683798	39683639	Y	NA	RP11-624L4.1	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	33598	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	40179429	40179904	40179805	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	31189	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	40460566	40460976	40460804	Y	NA	BUB1B	NA	NA	NA	NA	BUB1B	9342	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	NA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TYRO3	106045	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	42236399	42236774	42236695	Y	NA	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	26002	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	42535686	42535733	42535710	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	27698	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	42547123	42547182	42547153	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	16249	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	44186295	44186523	44186409	Y	NA	PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	19853	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	44524937	44524986	44524960	Y	NA	FRMD5	CTDSPL2,WDR76,FRMD5,CASC4	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD5	39487	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5L1	55940	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	45892726	45892758	45892742	Y	NA	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	28588	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	45929603	45930187	45929917	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	8257	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	46441434	46441833	46441634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	520088	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	48884247	48884306	48884277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN1	51740	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	48963656	48963859	48963732	Y	FBN1	FBN1	SHC4,FBN1,CEP152	IMR90	Hi-C	24141950	FBN1	27610	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	50876708	50877085	50876843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	99927	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	51177416	51177715	51177636	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP4E1	21154	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	52581885	52582216	52582049	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	3779	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	55503902	55504218	55504040	Y	RAB27A,PIGB	RSL24D1	RSL24D1	K562	ChIA-PET	22265404	RSL24D1	16637	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	58732356	58732646	58732550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A2	55419	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	58761932	58762090	58762054	Y	NA	ALDH1A2	ADAM10	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1A2	25975	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	59587320	59587393	59587357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	75499	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	60757802	60757969	60757886	Y	NA	NARG2,RP11-219B17.1	NA	NA	NA	NA	NARG2	11390	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	60883059	60884017	60883872	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	113682	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	61264927	61265345	61265257	Y	NA	NA	NARG2	IMR90	Hi-C	24141950	RORA	254173	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	63142999	63143362	63143082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.1	100010	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	63386917	63387072	63386993	Y	RPS27L,TPM1	LACTB	NA	NA	NA	NA	LACTB	24927	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	63427902	63428515	63428147	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L	NA	NA	NA	NA	LACTB	15903	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	64540216	64540468	64540344	Y	HERC1,ZNF609	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	86812	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	64722485	64722825	64722650	Y	NA	KIAA0101,TRIP4,ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	28116	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	64748954	64749303	64749001	Y	PLEKHO2,SNX1	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	1638	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	65831867	65832220	65831871	Y	NA	DPP8,PTPLAD1	C15orf44	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD1	11111	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	65841762	65842141	65841952	Y	PARP16	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	21006	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr15	67413336	67413759	67413492	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	59235	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	67426476	67426864	67426547	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	72375	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	68579972	68580192	68580087	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	11831	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	68817140	68817423	68817327	Y	ITGA11	NA	ITGA11,FEM1B,ANP32A,MIR548H4	IMR90	Hi-C	24141950	CORO2B	51885	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	LINC00277	NA	NA	NA	NA	LINC00277	22336	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	71008529	71008840	71008773	Y	NA	UACA	NA	NA	NA	NA	UACA	45092	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	71149072	71149436	71149201	Y	LARP6	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	4574	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	71406673	71406868	71406715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	223549	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	71428826	71429023	71428945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	245702	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	72448533	72448632	72448574	Y	TMEM202,CELF6,CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A	NA	NA	NA	NA	MYO9A	39615	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	74216715	74216840	74216797	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	385	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	74223574	74223817	74223712	Y	LOXL1	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	7244	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	74226590	74227025	74226821	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	10260	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	LOXL1	32927	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	74332904	74333192	74333031	Y	NA	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	47890	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	74699762	74699966	74699869	Y	LOXL1,STOML1	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	24842	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	75288966	75289325	75289146	Y	CPLX3,ULK3,SCAMP5	SCAMP5,RPP25,PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	24571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	75400106	75401427	75400997	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39	NA	C15orf39,SCAMP5,PPCDC	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C15orf39	84557	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	77351977	77352357	77352309	Y	NA	TSPAN3	PSTPIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN3	21969	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	78114637	78114951	78114816	Y	LINGO1,ACSBG1	LINGO1	NA	NA	NA	NA	LINGO1	3395	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	22929	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	79635470	79635474	79635472	Y	NA	TMED3	NA	NA	NA	NA	TMED3	34066	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	80453068	80453275	80453180	Y	BCL2A1,ZFAND6	FAH	NA	NA	NA	NA	FAH	10236	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	80773280	80773702	80773515	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	78588	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	80786706	80787081	80786777	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	92014	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	80841630	80841706	80841692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	146938	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	81082693	81083043	81082764	Y	KIAA1199	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	13009	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	81099060	81099288	81099113	Y	NA	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	29376	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	81156027	81156230	81156065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	86343	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	83239509	83239741	83239625	Y	AP3B2,CPEB1	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB1	75871	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	83869308	83869629	83869461	Y	SH3GL3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	5141	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	3484	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	89795623	89795958	89795791	Y	NA	FANCI	NA	NA	NA	NA	FANCI	10443	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	90436374	90436604	90436501	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	800	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	90578762	90579351	90578884	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	36138	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1,TTLL13	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	90938187	90938493	90938325	Y	NA	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	8737	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	MAN2A2	NA	NA	NA	NA	MAN2A2	30130	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	91989048	91989141	91989075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	405784	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	92400491	92400865	92400640	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	5566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	93388455	93388698	93388628	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHD2	35828	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	191210	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr15	99450086	99450215	99450157	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	186205	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	101234924	101235169	101235060	Y	ALDH1A3	NA	ALDH1A3,LRRK1,ASB7	IMR90	Hi-C	24141950	LINS	93489	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr15	101462538	101462736	101462613	Y	NA	ALDH1A3,LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	5118	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr15	101499118	101499600	101499493	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	41698	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr16	374352	374895	374583	Y	RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	PDIA2,AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	25778	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	507891	508134	507965	Y	NHLRC4	RAB11FIP3	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP3	34272	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	1232339	1232689	1232437	Y	NA	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	31098	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	2041117	2041468	2041266	Y	MAPK8IP3,EME2,SPSB3	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2	NA	NA	NA	NA	SYNGR3	3456	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	FLYWCH2	45043	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	3996199	3996445	3996330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	67472	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr16	4262475	4262771	4262673	Y	SRL	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP4	58305	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	4422682	4422871	4422704	Y	NA	PAM16,VASN	NA	NA	NA	NA	VASN	2833	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr16	8852303	8852368	8852337	Y	NA	PMM2,TMEM186	PMM2,TMEM186	IMR90	Hi-C	24141950	PMM2	28312	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	8932650	8933046	8932848	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	27820	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	11407202	11407368	11407306	Y	NA	NA	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	59166	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	11422424	11422652	11422552	Y	NA	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74388	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	12861809	12861981	12861895	Y	NA	CPPED1	NA	NA	NA	NA	CPPED1	33893	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	16070854	16071189	16071093	Y	NDE1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	29420	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	16097959	16098303	16098187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	56525	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	16214258	16214439	16214353	Y	ABCC1	NA	ABCC6	IMR90	Hi-C	24141950	ABCC1	172824	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	17231064	17231355	17231210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	1189630	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	19489216	19489473	19489247	Y	NA	RNU4-46P,GDE1,CCP110	NA	NA	NA	NA	RNU4-46P	18459	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	19710173	19710469	19710241	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	15309	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	20910424	20910792	20910538	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	718	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	22202219	22202462	22202295	Y	NA	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13141	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	27541388	27541697	27541538	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	17537	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	28160349	28160575	28160437	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	60666	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.82726901716897
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	34264571	34264735	34264688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2381492	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	34979653	34980053	34979874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3096574	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	50219057	50219422	50219113	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	34228	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	50336956	50337409	50337067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD7	63436	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1E,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	57034523	57034824	57034736	Y	NLRC5	NLRC5	NA	NA	NA	NA	NLRC5	13126	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	65153548	65154160	65153979	Y	CDH11	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	65154285	65154635	65154564	Y	NA	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3380	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	67687517	67687714	67687560	Y	HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A	RLTPR,ACD,PARD6A	NA	NA	NA	NA	ACD	4999	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	NA	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	57964	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr16	70749058	70749400	70749223	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	31089	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	70918380	70918652	70918516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	85316	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	71828659	71828769	71828714	Y	NA	AP1G1,ATXN1L,IST1	NA	NA	NA	NA	AP1G1	12335	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	73023566	73023933	73023728	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	67664	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	73084736	73084892	73084798	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	6705	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	73102477	73102709	73102578	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	10880	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	80208286	80208441	80208438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	364190	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	80648932	80649251	80648956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	76301	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	NA	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MPHOSPH6	485308	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	82687467	82688028	82687715	Y	NA	NA	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MPHOSPH6	485636	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	487226	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	84636685	84637090	84636875	Y	ZDHHC7,KIAA0513,HSDL1,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	12593	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	84784930	84785133	84785062	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53346	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	84799622	84799923	84799772	Y	KLHL36	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	51667	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	85037797	85037883	85037799	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	5258	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.69719794552866
chr16	85548685	85548970	85548791	Y	NA	NA	KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	172709	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	85603902	85604423	85603949	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	117256	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	86417419	86417805	86417701	Y	NA	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	124328	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	22658	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	111288	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	188280	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	378017	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.82726901716897
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	398569	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	88337697	88337985	88337883	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179740	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	88365536	88366092	88365805	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	151633	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	88366840	88367234	88367013	Y	BANP,BANP,ZC3H18,CYBA	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	150491	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	88847421	88847701	88847601	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	1918	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	89181535	89182183	89181777	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3	ACSF3	NA	NA	NA	NA	ACSF3	28752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr16	89380978	89381130	89380989	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	98860	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	89382399	89382987	89382651	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	100281	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	89388621	89389157	89388908	Y	ZNF276,C16orf7	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	106503	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr16	89423849	89423969	89423923	Y	CBFA2T3,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	131000	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	594616	594984	594846	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	27973	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	595370	595681	595607	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	27276	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	698193	698349	698271	Y	NA	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	14612	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	932596	932954	932809	Y	NA	TIMM22	NXN	IMR90	Hi-C	24141950	TIMM22	34239	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	1863470	1863779	1863610	Y	SGSM2,SGSM2,RTN4RL1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	62860	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr17	1974774	1975359	1974921	Y	SCARF1,HIC1,HIC1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	19326	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	1979194	1979509	1979218	Y	NA	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	23746	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	133114	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	2952123	2952503	2952284	Y	ASPA,ASPA,PAFAH1B1	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	457619	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	5245508	5245890	5245691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABEP1	61950	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	CYB5D1,CHD3,LSMD1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	VAMP2	34748	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	8323983	8324286	8324133	Y	PIK3R5,PER1,VAMP2,C17orf59,NDEL1	KRBA2,RPL26,NDEL1	CCDC42,RPL26,RNF222	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDEL1	9534	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	13460367	13460669	13460622	Y	HS3ST3A1	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	42575	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.39230455298913
chr17	13472221	13472595	13472561	Y	NA	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	30649	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	71821	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	15225977	15226377	15226177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMP22	59334	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	15313128	15313509	15313354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMP22	146485	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	15787021	15787553	15787332	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	58678	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBB	92407	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	19398359	19398685	19398615	Y	NA	SLC47A1	SLC47A2,B9D1,EPN2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	1661	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH3A2	106941	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	27972817	27973010	27972914	Y	NA	CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	24892	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	29423002	29423667	29423241	Y	NA	NF1	NA	NA	NA	NA	NF1	3057	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	29599453	29600092	29599789	Y	NA	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	39038	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	29887922	29888057	29887990	Y	NA	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP4	171280	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	29923737	29923924	29923895	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	207095	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	30588630	30588823	30588726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf75	86219	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	30846365	30846870	30846526	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	34728	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	31062983	31063086	31063034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	139109	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	31598855	31599016	31598936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM98	345927	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	32425716	32426082	32425906	Y	CCL8,CCL7	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	154222	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	32633545	32633691	32633601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	53241	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	32634250	32634488	32634336	Y	CCL8,CCL7	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	53946	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	35278050	35278157	35278104	Y	MRM1	AATF	LHX1,AATF	MCF7	ChIA-PET	22265404	AATF	26018	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	38085522	38085789	38085697	Y	ERBB2,IKZF3,ORMDL3	ORMDL3,PSMD3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	3668	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	38440755	38440955	38440855	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	CDC6	930	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	38482426	38483282	38482568	Y	IKZF3,MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	18982	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	38488015	38488253	38488146	Y	MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	24571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	40400517	40401003	40400833	Y	EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5B	25722	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	40573451	40573881	40573544	Y	AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF	STAT3,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	40628029	40628344	40628111	Y	NA	ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A1	19167	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	15359	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	40816292	40816343	40816318	Y	NA	TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	6969	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	41242207	41242334	41242271	Y	NA	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	33166	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr17	42619909	42620020	42619938	Y	NA	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	12905	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	42624253	42624886	42624582	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD2	8039	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	43303050	43303852	43303644	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	6239	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	RPS26P8	NA	NA	NA	NA	RPS26P8	22736	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	18474	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	44232468	44232502	44232485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	262720	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	44261899	44262225	44262045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	292151	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.69719794552866
chr17	46101351	46101579	46101379	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	11813	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr17	46168455	46168716	46168586	Y	NA	NFE2L1,CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	CBX1	8167	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	46334759	46335012	46334885	Y	OSBPL7,SKAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	156040	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	46654606	46654947	46654902	Y	NA	HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB9	NA	NA	NA	NA	HOXB4	526	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	46767725	46768126	46768067	Y	NA	HOXB13	NA	NA	NA	NA	HOXB13	36414	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	47425065	47425127	47425096	Y	MYST2,ZNF652,ZNF652	ZNF652	NA	NA	NA	NA	ZNF652	12708	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	47738461	47738630	47738545	Y	NA	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SPOP	14966	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	48251038	48251269	48251124	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	25047	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	COL1A1	20876	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	NA	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MMD	181370	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	55517850	55518075	55517943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	186638	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	56362029	56362418	56362266	Y	SRSF1,MPO,BZRAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	66036	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	57500537	57500993	57500672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPEL2	93487	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	57502934	57503327	57503130	Y	YPEL2	NA	YPEL2	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	95884	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	57509065	57509242	57509141	Y	NA	NA	YPEL2,GDPD1,PRR11	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	102015	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	57698412	57698732	57698592	Y	YPEL2,RNFT1,VMP1	CLTC	NA	NA	NA	NA	CLTC	3193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	57841314	57841767	57841379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	58327	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	59327837	59328038	59327938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	147219	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	59780215	59780354	59780263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	113652	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	60729712	60730300	60729931	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	26950	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	60868640	60868941	60868827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165878	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	194524	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	61153436	61153733	61153585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	368006	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	62403904	62404562	62404234	Y	ERN1,PECAM1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	65243	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	62705157	62705447	62705234	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	48971	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	545803	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	64455929	64456369	64456061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	159175	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	64505568	64505880	64505716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	208814	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	64524337	64524637	64524487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	227583	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	65130860	65131108	65130984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	108997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	65220181	65220399	65220279	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	19706	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	65471645	65472025	65471701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	100070	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr17	68943933	68944102	68944047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	671017	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	69437254	69437446	69437407	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467,SLC39A11	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	177673	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	70939903	70940361	70940187	Y	SSTR2,C17orf80	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	146490	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	71336325	71336719	71336454	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42EP4	30011	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	73074678	73074996	73074848	Y	LLGL2,C17orf28,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	6826	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	73337527	73337917	73337722	Y	NA	AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	24117	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	73689850	73690283	73690148	Y	KIAA0195,CASKIN2,WBP2	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	25125	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	74134600	74134832	74134764	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1	EXOC7	NA	NA	NA	NA	EXOC7	18943	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	74494294	74494838	74494393	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	1034	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	75118026	75118235	75118074	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	37228	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75278845	75279720	75279369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	198047	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75338504	75338763	75338659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	257706	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75361925	75362048	75361987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	281127	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75402047	75402301	75402134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	321249	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75430734	75431332	75430992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	349936	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	4.56712687388834
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	76338337	76338836	76338651	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15322	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	76480175	76480442	76480309	Y	TMEM235	NA	NA	NA	NA	NA	PGS1	107454	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	76930060	76930674	76930419	Y	NA	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10591	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	77817686	77818105	77817998	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	6458	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	48906	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	50438	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	102227	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	79979263	79979824	79979465	Y	NA	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L	NA	NA	NA	NA	LRRC45	85	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	80060759	80061000	80060880	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	6551	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	80066063	80066430	80066275	Y	GCGR,DCXR	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	11855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	80199457	80199968	80199484	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	15184	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	81038687	81040054	81039707	Y	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	3120	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr17	81067352	81067511	81067418	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31785	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	2031840	2031857	2031849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	537651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	2549022	2549121	2549072	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	20387	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	2658254	2658560	2658346	Y	METTL4,LPIN2,EMILIN2,SMCHD1	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	4517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	3963204	3963605	3963405	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	553598	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL4	517433	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.39230455298913
chr18	8412266	8412506	8412385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	194937	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	8704447	8704767	8704559	Y	NA	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	97004	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	9017601	9018155	9017805	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	82473	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	10417323	10417624	10417474	Y	NA	NA	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	NAPG	106278	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	10475783	10476043	10475911	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	47859	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr18	12048672	12049055	12049000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	69648	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	12808880	12809062	12808971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP76	108104	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	20046739	20046926	20046743	Y	GATA6	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	299335	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	152885	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr18	21562247	21562750	21562607	Y	NA	TTC39C	TTC39C	IMR90	Hi-C	24141950	TTC39C	7987	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	23657156	23657540	23657507	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	11641	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	25536974	25537193	25537082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	218217	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	25691984	25692409	25692174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	63001	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	26347956	26348190	26348041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	592546	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	26745136	26745536	26745463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	989726	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	32413678	32413828	32413755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	141064	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	32424641	32425032	32424811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129860	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	38400153	38400634	38400214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1132537	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	38457094	38457422	38457201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1075749	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	45420480	45420806	45420653	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	34709	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	46345038	46345364	46345209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	129717	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	46456597	46456819	46456703	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	18262	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	46520518	46520924	46520659	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	45437	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	53144810	53145149	53144924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	184869	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	54070241	54070409	54070308	Y	NA	NA	TCF4,LOC100505474	IMR90	Hi-C	24141950	WDR7	246165	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	55267032	55267261	55267214	Y	NEDD4L	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	15028	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	55448232	55448442	55448350	Y	NA	ATP8B1	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	19891	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	55671810	55671869	55671840	Y	NA	NEDD4L	NEDD4L,ATP8B1	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4L	37730	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	56159165	56159246	56159180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	106617	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	56161690	56161866	56161857	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	103997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	56188664	56188776	56188720	Y	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	77087	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	56337372	56337558	56337406	Y	MALT1	ALPK2,MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	754	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	57482239	57482409	57482315	Y	NA	NA	CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P54	55449	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	57566379	57566616	57566437	Y	NA	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	1199	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr18	60609893	60610245	60610069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	229221	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	60827006	60827299	60827155	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	KDSR	205444	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	65751741	65751802	65751772	Y	NA	NA	LOC643542,DSEL	IMR90	Hi-C	24141950	DSEL	569524	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	65837331	65837614	65837473	Y	NA	NA	LOC643542,DSEL	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	542832	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234470	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr18	74837664	74837983	74837939	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	305101	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr18	76807542	76807844	76807575	Y	NA	ATP9B	SALL3	IMR90	Hi-C	24141950	ATP9B	19441	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	532930	533293	533259	Y	C19orf6,C19orf22,ARID3A	MADCAM1,TPGS1,CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	CDC34	3216	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	675402	675838	675677	Y	FSTL3	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	1010	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	678997	679265	679214	Y	HCN2,PALM	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	4605	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	12.3964872291255
chr19	823657	823956	823874	Y	BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	MIR4745	20717	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	1140329	1140530	1140433	Y	NA	POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	31752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	1189532	1189666	1189566	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26	NA	NA	NA	NA	STK11	2126	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr19	3344211	3344472	3344340	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC	NFIC	NFIC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	NFIC	13089	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	5435162	5435432	5435167	Y	NA	NA	KDM4B,PTPRS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRS	96348	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	6060958	6061480	6061122	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	84805	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	6062045	6062746	6062500	Y	TNFSF9,DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	85892	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	6067299	6067617	6067410	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	91146	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	6801116	6801467	6801221	Y	SH2D3A,VAV1	SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	35517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	8518703	8518940	8518821	Y	NA	MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	HNRNPM	11052	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	9402141	9402360	9402251	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	30088	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	9757386	9757713	9757550	Y	NA	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	26063	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	10056236	10056512	10056406	Y	ZNF846,COL5A3,OLFM2	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A3	62635	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	10728527	10728590	10728559	Y	NA	SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	17394	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	13129050	13129163	13129107	Y	MAST1,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	24628	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	13164647	13164970	13164763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIX	60225	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT1	59023	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr19	13232805	13233031	13232944	Y	WDR83,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	5888	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	15505627	15505808	15505718	Y	NA	AKAP8,AKAP8L	NA	NA	NA	NA	AKAP8	17018	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	9846	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr19	15974006	15974442	15974280	Y	NA	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	36235	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	17961350	17961505	17961471	Y	FAM129C,FCHO1,FCHO1,IL12RB1,IFI30,ARRDC2,JAK3	RPL18A	PLVAP,FAM125A,TMEM221,BST2,NXNL1,UNC13A,GLT25D1,FAM129C,MAP1S,FCHO1,INSL3,B3GNT3,JAK3,SLC5A5,KCNN1,RPL18A,CCDC124,ARRDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL18A	7180	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	18960289	18960480	18960366	Y	NA	UPF1	NA	NA	NA	NA	UPF1	19542	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	20337633	20337845	20337749	Y	ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF486	61596	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	20747496	20747853	20747738	Y	NA	ZNF737	NA	NA	NA	NA	ZNF737	881	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr19	28278661	28279931	28279051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1422517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	28463343	28463461	28463402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1238987	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	31371885	31372199	31372043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	959334	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	34311417	34311691	34311576	Y	KCTD15	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26579	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	19912	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	36757480	36757645	36757542	Y	NA	ZNF565	ZNF146	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF565	22321	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	39621407	39621638	39621523	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	6997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	41120897	41121111	41120992	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	24108	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	14755	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	42036742	42037668	42037272	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,ARHGEF1	NA	CEACAM21,LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	92120	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	42444727	42445027	42444981	Y	NA	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16515	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	42711906	42712521	42712423	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	9771	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	43624762	43624964	43624855	Y	NA	NA	PSG5,PSG9	IMR90	Hi-C	24141950	PSG5	63724	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	46665382	46665717	46665592	Y	NA	IGFL2	NA	NA	NA	NA	IGFL2	21019	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL2	NA	NA	NA	NA	IGFL2	39593	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.95734008880929
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	47613894	47614902	47614503	Y	PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	35697	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	47867147	47867265	47867191	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	16609	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr19	48167427	48167718	48167620	Y	NA	EHD2	NA	NA	NA	NA	EHD2	46882	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	48832028	48832343	48832234	Y	CARD8,IZUMO1,EMP3	EMP3,CCDC114,TMEM143,SYNGR4	NA	NA	NA	NA	CCDC114	8877	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	49577003	49577438	49577313	Y	SULT2B1,MAMSTR,KCNA7	CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	9238	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	49590520	49590786	49590652	Y	NA	CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	3844	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	49832847	49832906	49832877	Y	PTH2	TEAD2	NA	NA	NA	NA	TEAD2	30808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	50116585	50116794	50116665	Y	NA	NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1	NA	NA	NA	NA	PRR12	23685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	50417620	50417965	50417778	Y	NA	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	11994	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2	NA	NA	NA	NA	NR1H2	2927	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	1272	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	94	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	17	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	555	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	52310413	52310785	52310550	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR1	5050	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	79524	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	AC008753.6	94882	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr19	55626810	55627228	55626935	Y	ZNF865,PPP1R12C	RDH13	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	1148	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	29193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	28507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	56064106	56064277	56064192	Y	ZNF579	ZNF579,ZNF524,FIZ1	NA	NA	NA	NA	ZNF579	25934	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr19	56118803	56119132	56118967	Y	COX6B2	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	7467	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	56807694	56808027	56807709	Y	NLRP13,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	69441	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	56810811	56811236	56810900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	66232	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	56833034	56833496	56833435	Y	ZSCAN5A	ZNF542,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZNF542	43972	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	57965552	57965851	57965609	Y	NA	ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF749	20855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	58237757	58238155	58237774	Y	NA	ZNF551,ZNF671,ZNF776,ZNF586	ZNF154	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF671	765	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	58415823	58415990	58415970	Y	NA	ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	9988	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr19	59049687	59049971	59049795	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1409	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	739928	740199	740059	Y	NA	NA	TMEM18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM18	64489	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	1659182	1659769	1659438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	86855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	9428594	9428712	9428653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	83700	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	15309828	15310293	15310034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	389161	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	15481171	15481552	15481362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	217902	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	19985229	19985530	19985434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC32	114217	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr2	19986322	19986559	19986384	Y	TTC32	NA	NA	NA	NA	NA	TTC32	113188	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	20435780	20436055	20435965	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	12586	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	20624612	20624982	20624777	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	19853	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	24941895	24942247	24942153	Y	NCOA1	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	71758	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	26291590	26291772	26291648	Y	FAM59B,RAB10	RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	36614	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	27939397	27939784	27939607	Y	TRIM54	NA	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL33	52800	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	28183212	28183402	28183309	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	71247	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	28303771	28304058	28303879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	191806	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	28519223	28519459	28519305	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	93856	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	28621403	28621758	28621597	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	5864	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB,SPDYA	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	29352302	29352469	29352324	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	33731	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	30887906	30888094	30887998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	219814	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	33805444	33805464	33805454	Y	RASGRP3	FAM98A	NA	NA	NA	NA	FAM98A	16985	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	36603527	36603925	36603600	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	22458	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	36654413	36654491	36654452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	73344	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	36687110	36687380	36687132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	106041	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	36688353	36688868	36688635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	107284	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	36700444	36700711	36700553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	119375	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	36790074	36790520	36790216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	80710	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	36934290	36934412	36934353	Y	NA	VIT	NA	NA	NA	NA	VIT	12457	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	37139828	37140219	37140054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	51396	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	37813379	37813644	37813592	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	149967	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	37858321	37858709	37858681	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	104902	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr2	37940534	37940802	37940700	Y	CDC42EP3	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	22809	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	37993289	37993401	37993340	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	29678	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	37995152	37995275	37995251	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	31541	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	38003207	38003253	38003231	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	39596	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	38008241	38008581	38008345	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	44630	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	38023099	38023324	38023154	Y	NA	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	59488	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	38369402	38369882	38369670	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	34358	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	39683895	39683929	39683912	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	21442	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	40767004	40767399	40767181	Y	NA	NA	SLC8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	68794	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	40961979	40962343	40962119	Y	NA	NA	LOC100128590,SLC8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	125786	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	42053679	42053991	42053965	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	104872	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	42149327	42149700	42149496	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	9163	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	42161610	42162017	42161892	Y	NA	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	2747	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr2	42194638	42194757	42194709	Y	NA	AC104654.2	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	35775	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	42368874	42369229	42369001	Y	EML4	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25261	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	43313736	43313941	43313748	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	137807	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	43686078	43686091	43686085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135094	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	44212195	44212421	44212308	Y	NA	LRPPRC	NA	NA	NA	NA	LRPPRC	8723	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	44718441	44718530	44718486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	131352	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	46525633	46526278	46526263	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	6827	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	46614603	46614745	46614671	Y	RHOQ	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	95797	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	47039745	47040099	47039914	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	101197	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	47296749	47297008	47296937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	104732	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	47418967	47419222	47419129	Y	NA	CALM2	TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	17227	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	51092337	51092826	51092639	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	2337815	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	54054125	54054397	54054212	Y	NA	ERLEC1,GPR75-ASB3,ASB3	NA	NA	NA	NA	GPR75-ASB3	30773	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	54111882	54111915	54111897	Y	NA	GPR75-ASB3,ASB3	NA	NA	NA	NA	ASB3	26585	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	54800045	54800558	54800206	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	118623	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	54816609	54817000	54816923	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	135187	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	55320625	55320761	55320684	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,EML6,RTN4	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	16996	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	55327095	55327368	55327210	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	10389	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	55327778	55327923	55327859	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	9834	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	55360803	55361407	55361172	Y	SMEK2,CCDC88A,RTN4	RTN4	RTN4,C2orf63,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	23046	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	56070301	56070618	56070423	Y	NA	NA	EFEMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EFEMP1	78656	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	56968776	56968885	56968798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007743.1	557871	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	57947710	57947899	57947805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	184887	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	60228228	60228402	60228315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	381338	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr2	62703316	62703520	62703358	Y	NA	TMEM17	TMEM17	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	33509	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	62805190	62805410	62805295	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	68161	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	63122149	63122353	63122251	Y	EHBP1,EHBP1,OTX1	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	152839	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	63840978	63841207	63841026	Y	NA	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	27235	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	65081925	65082185	65082093	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	105786	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	65440417	65440444	65440431	Y	NA	AC007318.5,ACTR2	LOC400958,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007318.5	10280	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	66721852	66722243	66721943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	63268	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	67067097	67067512	67067390	Y	NA	NA	LOC644838,MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS1	408513	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	67486839	67487275	67486977	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838,C1D	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	135176	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.26223348134881
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	NA	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR1	102453	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	70161598	70161791	70161659	Y	PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	25606	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	71681748	71682153	71682029	Y	NA	DYSF	NA	NA	NA	NA	DYSF	2896	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	72426245	72426403	72426323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	624767	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	72748040	72748317	72748179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	302853	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	72804113	72804334	72804239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	246836	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	74258403	74258434	74258418	Y	NA	AC073046.25,TET3	DGUOK,STAMBP,ACTG2,TET3,BOLA3,BOLA3-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	30563	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	74259703	74260366	74260024	Y	NA	AC073046.25,TET3	TET3,ACTG2,BOLA3	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	31863	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	74804828	74804964	74804881	Y	MOBKL1B,DOK1	AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	24011	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	75071156	75071353	75071277	Y	LBX2,HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	12048	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	75833018	75833198	75833114	Y	NA	MRPL19	FAM176A,TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL19	38711	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	77488333	77488701	77488549	Y	LRRTM4	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	524807	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	85034355	85034669	85034421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	96080	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	85362106	85362578	85362371	Y	NA	LSM3P3,TCF7L1	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	3573	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	85962374	85962602	85962521	Y	VAMP5	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	8914	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	86120990	86121249	86121122	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	6853	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	86224309	86224458	86224357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	106820	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	86225018	86225303	86225260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105975	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr2	86226191	86226620	86226368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	104658	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	88353539	88354148	88353800	Y	KRCC1	RNU2-63P,KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2752348	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2752502	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	96190968	96191044	96191006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	124499	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	97554359	97554681	97554500	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	19865	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC092675.3	147261	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	99118904	99119212	99119061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	59587	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	100323852	100324185	100324151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	219355	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	101872333	101872649	101872491	Y	RNF149	TBC1D8	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	5005	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	101884483	101884674	101884578	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	TBC1D8,RNF149	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	17155	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	102478902	102479140	102479043	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	167590	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	102654225	102654461	102654316	Y	NA	IL1R1	NA	NA	NA	NA	IL1R1	24543	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	106020017	106020290	106020154	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	32680	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	108883612	108883815	108883711	Y	NA	SULT1C2	NA	NA	NA	NA	SULT1C2	19280	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	109206329	109206788	109206425	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	57472	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	109209973	109210484	109210252	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61116	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	110318153	110318301	110318244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	51482	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP1	101146	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	111976914	111977297	111977138	Y	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	101959	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	113058633	113059002	113058901	Y	NA	ZC3H8,ZC3H6	NA	NA	NA	NA	ZC3H6	27462	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	113637417	113638142	113637790	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	44937	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	113969874	113970195	113970111	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	2775	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	114039556	114039944	114039632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	72457	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	118739522	118739775	118739730	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	29934	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	118740185	118740994	118740898	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	28715	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	119576873	119577223	119577048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QL2	337242	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	121040381	121040601	121040491	Y	NA	RALB	NA	NA	NA	NA	RALB	44741	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	121523492	121523901	121523763	Y	GLI2	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	32293	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr2	122132591	122132855	122132729	Y	CLASP1	NA	NA	NA	NA	NA	AC013399.3	67020	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	122298770	122299123	122298947	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	12313	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	122536391	122536587	122536559	Y	NA	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	43712	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	128119420	128119722	128119576	Y	NA	MAP3K2	IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	24319	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	129131715	129132088	129131976	Y	NA	NA	HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	57564	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	131485043	131485533	131485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF4	106956	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	ARHGEF4	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ARHGEF4	36669	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	136888890	136889365	136889195	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	NA	CXCR4	K562	ChIA-PET	22265404	DARS	147220	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	141778689	141779072	141778931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1108198	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	142358125	142358173	142358149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	529097	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	142647536	142647619	142647564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	239651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	150041045	150041195	150041136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6	143304	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	150278954	150279172	150279087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6	94455	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	150999673	151000010	150999769	Y	NA	NA	RND3,MMADHC,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	393515	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	151389498	151389697	151389616	Y	NA	RND3	RBM43,RND3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	3828	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	152159553	152159620	152159604	Y	TNFAIP6	RBM43,NMI	RBM43,NMI,TNFAIP6,RIF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NMI	14982	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	153261807	153262193	153261950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	72056	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	153599082	153599296	153599189	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	26571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	156219806	156220106	156219936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	1069696	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NA	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	GPD2	98271	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	160353770	160354019	160353895	Y	MARCH7,CD302	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	36003	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	161071101	161071394	161071301	Y	ITGB6	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	PLA2R1	153980	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	161078300	161078513	161078433	Y	ITGB6	NA	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	161179	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	161083916	161084239	161083958	Y	CD302,ITGB6	NA	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	166795	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	NA	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4785	163770	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	161979819	161979978	161979936	Y	TANK,TANK	TANK	PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TANK	11441	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	164205577	164205788	164205730	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	384734	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	164991272	164991524	164991400	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	400750	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	165777057	165777208	165777083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	78868	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	166796102	166796135	166796119	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12218	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	167070669	167070978	167070814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN9A	159525	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	170573146	170573520	170573335	Y	NA	PHOSPHO2,KLHL23	NA	NA	NA	NA	KLHL23	24148	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	173942556	173942831	173942720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	274717	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	175085975	175086128	175086062	Y	NA	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	25298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	175643140	175643660	175643376	Y	CIR1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	60635	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	175700542	175700958	175700833	Y	CHRNA1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	118037	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	175837054	175837318	175837218	Y	NA	CHN1	NA	NA	NA	NA	CHN1	30779	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	178030872	178031290	178031011	Y	NFE2L2,NFE2L2	HNRNPA3	HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPA3	44001	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	178036272	178036551	178036470	Y	NFE2L2	HNRNPA3	LOC100130691,NFE2L2,AGPS,HNRNPA3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPA3	38740	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	183626884	183626903	183626894	Y	NA	DNAJC10	NA	NA	NA	NA	DNAJC10	47885	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	183950583	183950613	183950599	Y	NA	NCKAP1,DUSP19,NUP35	NA	NA	NA	NA	DUSP19	9296	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	187420042	187420288	187420183	Y	ITGAV,ITGAV,ZC3H15	ITGAV	ZC3H15,ITGAV	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAV	32504	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	188326523	188326725	188326579	Y	NA	CALCRL	NA	NA	NA	NA	CALCRL	15336	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	188414787	188415077	188415012	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	13410	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	188464486	188464724	188464607	Y	NA	TFPI	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	35999	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	189973214	189973535	189973374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	69070	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	190014709	190015152	190014914	Y	NA	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	27453	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	190025289	190025449	190025364	Y	COL3A1	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	17156	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	190075572	190075716	190075672	Y	DIRC1	COL5A2	COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	32967	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	190118899	190119326	190119165	Y	NA	NA	COL5A2,COL3A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	76294	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	190133091	190133198	190133145	Y	NA	NA	COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	90486	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	190151091	190151337	190151257	Y	NA	NA	COL5A2,GULP1,COL3A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	108486	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	190276650	190276899	190276775	Y	NA	WDR75	COL5A2,GULP1,COL3A1,MIR1245B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	27260	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	190739432	190739578	190739518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS1	92325	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	191708638	191708846	191708778	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34707	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	191709136	191709198	191709167	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34355	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	191724518	191724884	191724701	Y	NA	GLS	GLS,STAT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	18669	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	192484958	192485198	192485089	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	IMR90	Hi-C	24141950	AC098617.1	224067	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	192500525	192500897	192500643	Y	NA	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	208368	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	205616	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	164033	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	196428777	196429172	196429092	Y	SLC39A10	SLC39A10	SLC39A10	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A10	9529	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	197195800	197196140	197196081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	156573	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	200611214	200611528	200611373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTCDNL1	102368	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	17207	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	202079360	202079680	202079556	Y	CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	16486	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	202104378	202104489	202104432	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	8212	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr2	203159775	203160145	203159798	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	31336	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	204448549	204448751	204448649	Y	NA	NA	CD28,RAPH1,CTLA4,ABI2,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	50416	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	206205217	206205608	206205348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	339106	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	104946	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	208200012	208200111	208200057	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	97638	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	208259563	208259980	208259919	Y	NA	NA	KLF7	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	132481	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	210233724	210233884	210233805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	52898	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	211032670	211033036	211032982	Y	NA	AC006994.2	NA	NA	NA	NA	AC006994.2	1206	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	214053041	214053239	214053088	Y	NA	IKZF2	NA	NA	NA	NA	IKZF2	37890	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	216522690	216522921	216522813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FN1	223795	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	216636605	216637052	216636855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	259767	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	216880783	216881070	216880972	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	15749	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	217357637	217357999	217357758	Y	NA	RPL37A,AC098820.3	RPL37A	IMR90	Hi-C	24141950	RPL37A	2913	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	217970488	217971016	217970653	Y	NA	NA	IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	412240	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	529950	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	218692379	218692710	218692548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	173008	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	218711012	218711358	218711190	Y	PNKD,TNS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	154360	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	218754028	218754172	218754100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	111546	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	218775990	218776338	218776183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	89380	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	218807007	218807384	218807322	Y	TNS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	58334	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	218857857	218858115	218857951	Y	NA	TNS1	TNS1,RUFY4	IMR90	Hi-C	24141950	TNS1	7603	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	219774108	219774202	219774159	Y	USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1	WNT10A,CDK5R2	NA	NA	NA	NA	WNT10A	31023	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,INHA,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	NA	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	SLC4A3	63704	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC4A3	603383	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr2	221484317	221484590	221484474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	952332	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	222383007	222383509	222383204	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	53413	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	223709158	223709348	223709234	Y	SGPP2	ACSL3	ACSL3,MOGAT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACSL3	14304	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	224773224	224773437	224773430	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	34667	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	224951199	224951592	224951399	Y	NA	SERPINE2	NA	NA	NA	NA	SERPINE2	49163	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	225086402	225086641	225086508	Y	NA	NA	SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINE2	184366	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	225759181	225759393	225759290	Y	CUL3	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	145769	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	225841174	225841410	225841405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	63752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	225857926	225857937	225857931	Y	NA	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	47225	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	225880660	225880871	225880768	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	24291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	226983188	226983709	226983518	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC068138.1	64378	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	227276579	227276895	227276743	Y	NA	NA	NYAP2,IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC068138.1	228492	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	228728073	228728272	228728126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	147345	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	230273013	230273684	230273347	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	139012	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1867	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	232046537	232047112	232046768	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	14148	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	232276597	232276762	232276665	Y	B3GNT7	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	46389	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	45708	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	234322287	234322459	234322373	Y	SAG	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	61134	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	234357256	234357513	234357369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	96103	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	234465976	234466363	234466311	Y	HJURP	USP40	NA	NA	NA	NA	USP40	7065	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	4.1321624097085
chr2	234615498	234615635	234615567	Y	NA	UGT1A9,UGT1A7,UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	17245	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr2	234670163	234670438	234670239	Y	NA	UGT1A1	NA	NA	NA	NA	UGT1A1	3269	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	234673088	234673246	234673167	Y	NA	UGT1A1	NA	NA	NA	NA	UGT1A1	6194	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.39230455298913
chr2	235905010	235905389	235905297	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	46393	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.95734008880929
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	68798	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	237583867	237584146	237584005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	169682	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	237640726	237641053	237640951	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	226541	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	237654357	237654656	237654652	Y	CXCR7	NA	CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	240172	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	237657869	237658188	237658029	Y	NA	NA	CXCR7	MCF7	ChIA-PET	22265404	IQCA1	243684	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	237677514	237677881	237677605	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	263329	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr2	237678524	237678883	237678772	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	264339	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	237685373	237686074	237685499	Y	CXCR7	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	271188	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	238131951	238132217	238132070	Y	COL6A3	NA	COL6A3,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	139491	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	238188791	238189175	238189021	Y	COL6A3	NA	MLPH,COL6A3,COPS8	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A3	131843	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	29670	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	238585463	238585872	238585569	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	51244	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	238596328	238596696	238596497	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	62109	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	FAM132B	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14795	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	239287999	239288325	239288245	Y	NA	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	45058	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	240213505	240213689	240213606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	107659	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	240854377	240854983	240854483	Y	NA	NA	LOC150935,MIR4786	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA10	107836	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr2	242485030	242485360	242485049	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	10776	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	290672	290826	290757	Y	SOX12,NRSN2	C20orf96,ZCCHC3,SOX12,NRSN2	NA	NA	NA	NA	SOX12	13381	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	453687	453779	453733	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	12490	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	1310858	1311228	1310987	Y	SDCBP2,SDCBP2,SIRPG	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	60578	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	1790289	1790734	1790591	Y	NA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	82420	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	1809297	1809437	1809336	Y	SDCBP2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	63717	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	1873360	1873375	1873370	Y	NA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	206	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	2295693	2295966	2295830	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPB	153533	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	3779808	3780100	3779895	Y	PANK2,PANK2,CDC25B	C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	14230	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	4206645	4206924	4206784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	107018	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	4487937	4488131	4488040	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	PRNP	176751	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	4941641	4941708	4941700	Y	NA	SLC23A2	RASSF2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	47231	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	5046140	5046913	5046758	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	57201	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	5058710	5058848	5058784	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	46424	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	6032121	6032454	6032230	Y	LRRN4	CRLS1,LRRN4	NA	NA	NA	NA	LRRN4	241	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	6094285	6094396	6094341	Y	NA	FERMT1	NA	NA	NA	NA	FERMT1	7795	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	6142519	6142722	6142563	Y	NA	FERMT1	HAO1	IMR90	Hi-C	24141950	FERMT1	40328	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	6684913	6685132	6685035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	61179	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	9384292	9384675	9384295	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	336882	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	9390788	9390859	9390825	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	343378	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	10447085	10447351	10447236	Y	NA	MKKS	NA	NA	NA	NA	MKKS	34215	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	13317482	13317575	13317520	Y	ESF1	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	117064	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	18650258	18650491	18650292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	83721	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	19881587	19881718	19881652	Y	RIN2,RIN2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	114042	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	20586775	20587103	20586803	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	104028	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	21417020	21417216	21417107	Y	NA	NA	XRN2	IMR90	Hi-C	24141950	XRN2	135078	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	22392618	22392869	22392732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	936504	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	584873	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr20	25305837	25305970	25305904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	63649	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	26293734	26293919	26293899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	563880	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr20	30305141	30305549	30305422	Y	PLAGL2,HCK	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	4243	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	30430838	30430847	30430843	Y	NA	FOXS1,TTLL9	NA	NA	NA	NA	FOXS1	573	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	30793339	30793589	30793452	Y	HCK,TM9SF4,PLAGL2	PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	PLAGL2	5	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	CDC42P1	1169	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	33699049	33699250	33699220	Y	TRPC4AP,EDEM2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	20375	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	33899361	33899545	33899443	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	28573	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	36007590	36007925	36007762	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	36502	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	36693519	36693713	36693616	Y	RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	33571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	37603521	37603525	37603523	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	14579	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	37606792	37607147	37606919	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	17850	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	39631777	39632207	39632178	Y	NA	TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOP1	23251	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	39632234	39632572	39632465	Y	MAFB,TOP1	TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOP1	22886	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	39939044	39939335	39939233	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	4977	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	40188226	40188487	40188477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	56646	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	42782324	42782724	42782613	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	31494	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	43238683	43239068	43238831	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39806	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr20	43321614	43322020	43321838	Y	WISP2,KCNK15	ADA,RP11-445H22.3	LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-445H22.3	717	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	WFDC3,DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	WFDC3	8067	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	45251611	45251999	45251807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53RK	64419	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	37086	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	20353	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	6.52446696269763
chr20	47439402	47439940	47439658	Y	ZNFX1,STAU1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	2480	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48168443	48168863	48168748	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	13820	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48200728	48200848	48200788	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	18045	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48201281	48201539	48201531	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	18598	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48406938	48407203	48407095	Y	B4GALT5,SNAI1,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	20047	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48496798	48497000	48496896	Y	NA	SPATA2	NA	NA	NA	NA	SPATA2	33080	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48838079	48838414	48838219	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	CEBPB	PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	32703	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48868757	48869061	48868987	Y	NA	NA	PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB,LOC284751,PARD6B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	63381	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48902426	48902799	48902722	Y	CEBPB	NA	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	97050	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48903106	48903611	48903352	Y	NA	NA	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90	Hi-C	24141950	CEBPB	97730	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	48956071	48956427	48956269	Y	NA	NA	LOC284751,PTPN1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	150695	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	49358421	49358698	49358635	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	12340	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	21252	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	49963208	49963745	49963374	Y	NFATC2	NA	KCNG1,ATP9A,NFATC2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	325542	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr20	50180369	50180507	50180463	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	168565	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr20	50664352	50664405	50664395	Y	NA	NA	ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	154442	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	51110040	51110185	51110129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	291193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	51110889	51111034	51110969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	292042	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	548194	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	342173	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	244941	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	CYP24A1	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	47875	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	53262462	53262813	53262618	Y	DOK5	NA	NA	NA	NA	NA	RPL12P4	426342	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	57125775	57125866	57125821	Y	NA	APCDD1L,APCDD1L-AS1	NA	NA	NA	NA	APCDD1L-AS1	37340	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	57420469	57420802	57420636	Y	NA	GNAS,GNAS-AS1,RP1-309F20.3	NA	NA	NA	NA	GNAS-AS1	3156	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	57984055	57984410	57984233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	368091	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	59325352	59325574	59325428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	499908	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	59761167	59761446	59761307	Y	NA	NA	CDH26,LOC284757,C20orf197,CDH4	IMR90	Hi-C	24141950	CDH4	64036	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	60939635	60939778	60939673	Y	SLCO4A1,NTSR1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	590	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr20	60944265	60944566	60944463	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3897	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	62243705	62243960	62243817	Y	TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,PRIC285,PRIC285,GMEB2	GMEB2,CTD-3184A7.4,STMN3,RTEL1	NA	NA	NA	NA	GMEB2	12434	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr20	62739506	62739724	62739570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCEA2	60317	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	15899627	15899749	15899688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMSN1	53974	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr21	16435480	16435873	16435862	Y	NRIP1	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	159	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	17457434	17457504	17457454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	197585	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	304311	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	305578	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	19836	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr21	27855729	27855767	27855735	Y	CYYR1	NA	NA	NA	NA	NA	AP001597.1	91775	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	28173911	28174139	28174005	Y	ADAMTS1	ADAMTS1	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS1	41589	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	28218728	28219247	28219071	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	3000	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr21	28319364	28319698	28319531	Y	CYYR1	ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	17134	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	28336800	28337144	28336952	Y	ADAMTS1,ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr21	28796596	28796902	28796773	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	459764	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr21	28942556	28942990	28942803	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	475743	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr21	28943005	28943182	28943085	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	475551	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	28945118	28945334	28945247	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	473399	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.26223348134881
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	33896612	33897009	33896807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf59	86167	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	34659541	34659728	34659635	Y	NA	IL10RB,IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IL10RB	22878	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	34836293	34836479	34836379	Y	OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B	TMEM50B	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	13839	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	35057919	35058071	35057938	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	43687	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	35099909	35100119	35099917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	85677	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	35750965	35751183	35751074	Y	KCNE1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234258	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	35917479	35917977	35917777	Y	KCNE1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	67464	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	158530	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	36281882	36282257	36282001	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	296441	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433849	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr21	36458819	36458923	36458887	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN1	473378	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr21	38282263	38282520	38282368	Y	CLDN14	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	54292	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.47971571343873
chr21	40364699	40365059	40364949	Y	ERG	NA	ETS2,WRB,LINC00114	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	PSMG1	188718	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	40386657	40387043	40386856	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	166734	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	42485232	42485526	42485376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	52202	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	43181534	43181711	43181623	Y	MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3555	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	43887564	43887652	43887608	Y	NA	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	26466	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	44573696	44574026	44573784	Y	NA	U2AF1	HSF2BP,LINC00319,LINC00313,SIK1,RRP1B,U2AF1,WDR4,NDUFV3,PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	47999	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	44913472	44913707	44913565	Y	PDXK	LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	16058	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	17052	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	44937921	44938237	44938215	Y	NA	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	40507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	44939768	44940090	44939875	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	42354	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	44942511	44942810	44942777	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	45097	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr21	45018693	45018962	45018883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	58412	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.17482232089921
chr21	45065485	45065706	45065596	Y	NA	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	11668	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	45426552	45426831	45426638	Y	NA	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	3369	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	46461202	46461645	46461341	Y	ITGB2,ADARB1	LINC00162,ADARB1	ADARB1,SSR4P1	K562	ChIA-PET	22265404	ADARB1	30123	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr21	46496242	46496452	46496442	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	4474	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	46786853	46787266	46786994	Y	COL18A1,POFUT2	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	35786	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr21	47266684	47266899	47266840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	132752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	47469357	47469652	47469491	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	46359	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr21	47480637	47481027	47480832	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	34984	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	17306294	17306463	17306397	Y	IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	257381	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr22	18527544	18527739	18527656	Y	SLC25A18,MICAL3	MICAL3,PEX26	NA	NA	NA	NA	MICAL3	22219	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr22	19476851	19477107	19476979	Y	NA	HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	CDC45	11869	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	19874514	19874924	19874610	Y	TRMT2A,C22orf29,GNB1L	C22orf29,GNB1L	GNB1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNB1L	34052	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	22334723	22335115	22334952	Y	NA	PPM1F	NA	NA	NA	NA	PPM1F	29514	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	23624437	23624690	23624563	Y	BCR	NA	NA	NA	NA	NA	BCR	104546	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	53550	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD56	86659	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	25472349	25472548	25472410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD56	177168	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	27028638	27029036	27028851	Y	NA	TPST2,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	CTA-211A9.5	37694	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	27109967	27110337	27110138	Y	NA	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	43237	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr22	27415901	27416173	27415987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-40G4P.1	134390	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	27503626	27504166	27503976	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	114522	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	27506238	27506397	27506317	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	112291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	27508990	27509624	27509325	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	109064	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	27536268	27536462	27536385	Y	NA	NA	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	82226	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	254091	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	28122669	28123242	28122949	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	72244	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	31005316	31005631	31005442	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	PES1,SLC35E4	NA	NA	NA	NA	PES1	4246	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	31639719	31639839	31639804	Y	LIMK2	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33494	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	32983251	32983414	32983333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	114588	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	33238776	33239102	33239072	Y	SYN3,SYN3	TIMP3,Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	15318	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	35772921	35773272	35773050	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	TOM1,MCM5,HMOX1,RASD2,MB,APOL6,APOL5,RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	HMOX1	1082	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	35842495	35842590	35842543	Y	NA	MCM5	NA	NA	NA	NA	MCM5	48439	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	36746983	36747265	36747123	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	34798	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr22	37937864	37938255	37937972	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1	CARD10,CDC42EP1	CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	16199	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	38351215	38351232	38351224	Y	NA	POLR2F,C22orf23	NA	NA	NA	NA	C22orf23	3539	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr22	38859370	38859653	38859488	Y	NA	KDELR3,DDX17	NA	NA	NA	NA	KDELR3	2414	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	39608827	39609203	39608881	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	29553	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	43144166	43144283	43144173	Y	NA	A4GALT	CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2,A4GALT	IMR90	Hi-C	24141950	A4GALT	28862	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	43400219	43400728	43400510	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	8423	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	44417424	44417686	44417555	Y	PARVB	PARVB	NA	NA	NA	NA	PARVB	24333	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	44705061	44705332	44705192	Y	PARVB,PARVG,PARVG	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	186846	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	45642150	45642482	45642292	Y	NA	KIAA0930	LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	7500	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	6.30698473060771
chr22	49769098	49769971	49769308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	449189	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	3202241	3202572	3202332	Y	NA	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	16822	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	4763636	4764014	4763825	Y	NA	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	27260	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	4781579	4781854	4781808	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	9420	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	4867902	4868594	4868233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	58383	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	9733	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	5058332	5058543	5058409	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BHLHE40	39531	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	46235	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	49173	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	8781836	8782151	8782020	Y	NA	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	27163	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	8783302	8783537	8783436	Y	NA	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	25777	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	8802643	8803023	8802833	Y	OXTR	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	6291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	8978841	8979048	8978945	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	24409	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	9926228	9926446	9926367	Y	LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC	RPUSD3,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1	IL17RE,IL17RC,JAGN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	JAGN1	3792	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	10234749	10235085	10234824	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	30200	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	11197111	11197379	11197271	Y	VGLL4,SLC6A11,SLC6A1,HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	20332	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	11279893	11280094	11280011	Y	NA	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	31901	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	11759856	11760132	11759896	Y	NA	VGLL4	NA	NA	NA	NA	VGLL4	88	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	12350153	12350305	12350183	Y	NA	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	23286	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	12584271	12584371	12584321	Y	NA	MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	12142	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	13580930	13581161	13581030	Y	FBLN2	NA	HDAC11,FBLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HDAC11-AS1	61377	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	15335582	15336799	15336677	Y	NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	44076	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	15341871	15342528	15342442	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	38347	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	15598070	15598395	15598206	Y	ANKRD28,CAPN7,SH3BP5,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	BTD	42453	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	15672231	15672450	15672312	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	30893	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	15677848	15678314	15678139	Y	ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	36510	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	16381472	16381685	16381579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	76766	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	16550067	16550455	16550405	Y	PLCL2,OXNAD1,RFTN1	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	3078	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	536153	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	20200050	20200329	20200065	Y	NA	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	25455	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	23206478	23206499	23206488	Y	NA	UBE2E2	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E2	36012	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	27448684	27449023	27448831	Y	NA	NEK10	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	NEK10	39733	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7,RNU1-96P	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.82726901716897
chr3	27719100	27719312	27719216	Y	NA	AC098614.2	NEK10,SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	46633	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	29412640	29413015	29412700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	92167	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	29531228	29531586	29531407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	210755	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	29725037	29725420	29725261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	404564	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	29735360	29735534	29735491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	414887	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	29736457	29736614	29736535	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	415984	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	29799751	29800074	29799882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	479278	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	31737462	31737733	31737598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	165332	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	42103073	42103570	42103397	Y	NA	TRAK1	ZNF621,ZNF620,TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	49779	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	45165344	45165812	45165623	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	20102	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	46136258	46136461	46136359	Y	CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	100942	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	46458266	46458446	46458353	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	CCRL2	NA	NA	NA	NA	CCRL2	11612	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	46546407	46546628	46546504	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC2	72961	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	52081342	52081690	52081545	Y	GPR62,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	6876	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	53568043	53568300	53568167	Y	SFMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1A	188389	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	55201679	55201928	55201859	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	320045	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	55223485	55223775	55223588	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	298198	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	55398457	55398867	55398717	Y	NA	NA	CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	123106	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	55401949	55401987	55401976	Y	NA	NA	CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	119986	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	55511418	55511654	55511489	Y	WNT5A	WNT5A	NA	NA	NA	NA	WNT5A	10319	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	55654086	55654842	55654426	Y	NA	NA	WNT5A	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	132113	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	57945627	57945950	57945779	Y	PDE12	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	46177	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	57955527	57955938	57955800	Y	FLNB	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	36189	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	57958534	57958833	57958768	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	33294	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	57963451	57963815	57963633	Y	NA	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	28312	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	58339773	58340193	58340113	Y	NA	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	23166	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	58457172	58457525	58457255	Y	RPP14,RPP14,KCTD6	PDHB,KCTD6	PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD6	18316	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	59803830	59804011	59803964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	770020	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	66543351	66543557	66543448	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	6130	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	67711705	67712002	67711881	Y	NA	SUCLG2,RP11-81N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-81N13.1	8584	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	76950761	76950890	76950828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	469592	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	79667523	79667843	79667648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	147122	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	85318532	85318917	85318639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	312400	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	87914039	87914361	87914172	Y	ZNF654,HTR1F	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf38	282532	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	98549481	98549862	98549828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	68671	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	99263702	99264060	99263882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	91259	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223910	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	99581173	99581391	99581282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	225854	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	99761045	99761306	99761215	Y	TMEM45A	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	70051	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	100492916	100493238	100493125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	66711	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	100784871	100785104	100785043	Y	ABI3BP	NA	ABI3BP	IMR90	Hi-C	24141950	ABI3BP	74512	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	103522825	103523125	103522973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	646021	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	105716646	105717231	105716913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	130250	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	105722948	105723182	105723045	Y	CBLB	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	136552	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	106782352	106782425	106782408	Y	NA	NA	CBLB	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00883	175114	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	106944388	106944677	106944531	Y	NA	LINC00883	NA	NA	NA	NA	LINC00883	12862	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	107085712	107085944	107085942	Y	NA	NA	LOC344595,LOC100302640	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00883	128173	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	107504411	107504731	107504449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	264628	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	110688601	110689002	110688903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRL3	97916	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	111583903	111584464	111583984	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	111393	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	111655124	111655265	111655201	Y	NA	ABHD10	NA	NA	NA	NA	ABHD10	40592	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	112182390	112182567	112182476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	95989	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	112354601	112355057	112354782	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	11320	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	112362530	112362627	112362586	Y	NA	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	3750	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	112372486	112372667	112372577	Y	NA	CCDC80	CCDC80,CD200R1L	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	6109	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	112390838	112391135	112390988	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	24461	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC80	29401	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	114287427	114287687	114287530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	513967	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	114373701	114374062	114373901	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	490056	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639145	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	117043153	117043455	117043304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	299608	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	117632292	117632433	117632362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	888747	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	119039607	119039839	119039731	Y	ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH	ARHGAP31	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31-AS1	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	119268818	119269399	119269045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	53439	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	119798224	119798287	119798255	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	12977	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.91468017761858
chr3	120361404	120361730	120361550	Y	NA	NDUFB4	NA	NA	NA	NA	NDUFB4	48248	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	121714355	121714445	121714384	Y	HCLS1,CSTA,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	162325	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	123372011	123372488	123372368	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	69622	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	123376969	123377163	123377136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	74580	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	123395755	123396140	123395948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	93366	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	123407272	123407514	123407399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	104883	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	123469666	123469916	123469803	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	167277	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	123508502	123508917	123508819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	169647	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	123511285	123511578	123511394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	166986	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	123553686	123553794	123553787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	124770	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	124773884	124774020	124773942	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	1082	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	125200225	125200611	125200423	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	36430	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A3	108923	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	125986265	125986571	125986320	Y	NA	RP11-71E19.1	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-71E19.1	2626	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	126259496	126259659	126259567	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	TXNRD3NB	65739	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	2213	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	15639	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNA1	240445	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	128327283	128327483	128327387	Y	GATA2,GATA2,GATA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	70435	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	129543558	129543741	129543650	Y	MBD4,H1FOO,TMCC1,TMCC1	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	66678	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	134034499	134034569	134034531	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5	ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-200A1.1	4081	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	134050159	134050571	134050486	Y	AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	19741	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	135235230	135235627	135235440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	446888	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	135615560	135615771	135615666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	66744	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	FOXL2,C3orf72	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXL2	29292	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	139028849	139029030	139028940	Y	NA	NA	BPESC1,FOXL2,C3orf72,MRPS22,COPB2	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	77544	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	141130337	141130617	141130393	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	73272	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	141458120	141458481	141458300	Y	RASA2	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	3074	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	141611491	141611772	141611584	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	18525	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	142580771	142580984	142580878	Y	NA	RP11-372E1.1,PCOLCE2	NA	NA	NA	NA	PCOLCE2	25061	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	145931100	145931141	145931121	Y	PLSCR5,PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	35825	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	145959602	145959992	145959865	Y	PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	6974	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	149151278	149151442	149151363	Y	NA	NA	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	57626	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	149361418	149361700	149361559	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	90801	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	149668313	149668642	149668480	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	15530	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	149823678	149824072	149823966	Y	NA	NA	RNF13,PFN2,LOC646903,TSC22D2	IMR90	Hi-C	24141950	PFN2	57103	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	156506058	156506346	156506123	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	20175	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	157248554	157248748	157248629	Y	VEPH1	VEPH1	C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1	IMR90	Hi-C	24141950	VEPH1	660	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	159175843	159176214	159175971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	528323	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr3	159465414	159465509	159465463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	239028	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	159480182	159480541	159480238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	223996	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	159493461	159493761	159493605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	210776	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	159847336	159847699	159847492	Y	KPNA4	NA	C3orf80,IFT80	IMR90	Hi-C	24141950	IL12A	142799	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	169075984	169076327	169076322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	303079	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	170137645	170137870	170137713	Y	SLC7A14,CLDN11,CLDN11	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	2992	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	170138195	170138413	170138223	Y	NA	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	3542	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	170420897	170421107	170421029	Y	CLDN11	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	36047	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	170431417	170431656	170431537	Y	NA	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	25498	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	170435342	170435619	170435400	Y	NA	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,RPL22L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	21535	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr3	170527835	170528013	170527928	Y	NA	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	58259	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	170627321	170627621	170627516	Y	EIF5A2	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	2839	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	188097	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	172325180	172325357	172325227	Y	NA	NA	TNFSF10	IMR90	Hi-C	24141950	NCEH1	101651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	174984866	174985269	174985168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	339998	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	177234134	177234201	177234168	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00578	76425	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	177623365	177623625	177623388	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	90712	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	177623981	177624160	177624047	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	91328	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	178787910	178788066	178787991	Y	ZMAT3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	181456298	181456477	181456331	Y	SOX2	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	750736	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	184504548	184504615	184504585	Y	NA	VPS8	VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD	IMR90	Hi-C	24141950	VPS8	23316	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	185374091	185374577	185374335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP2	75807	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	114412	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	187988232	187988684	187988401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	118387	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	188012691	188013249	188012784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142846	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	188014586	188014976	188014809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	144741	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	188312026	188312153	188312088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	442181	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	189559377	189559697	189559485	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	277056	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	189632708	189632930	189632825	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	203823	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	176183	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	194227767	194228126	194227819	Y	ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	10674	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	194277383	194277706	194277514	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,GP5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM44-AS1	25034	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	194282077	194282468	194282283	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,XXYLT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM44-AS1	20272	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	194298758	194299295	194298977	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	3445	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr3	194299958	194300402	194300090	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	2338	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	194319358	194319899	194319518	Y	LRRC15	TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44	NA	NA	NA	NA	TMEM44-AS1	16618	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	196855650	196855726	196855688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFI2	100963	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	197035558	197035706	197035585	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	11387	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	197036480	197036785	197036693	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	12309	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	197121526	197121880	197121703	Y	DLG1	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	97355	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	197190389	197190580	197190458	Y	NA	NA	DLG1,BDH1,LOC100507086,MFI2,MFI2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	BDH1	107614	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	48171	48447	48418	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	2732	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	1035263	1035607	1035280	Y	FGFRL1,FGFRL1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	33539	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	7251	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	4854782	4854915	4854832	Y	NA	MSX1	MSX1	K562	ChIA-PET	22265404	MSX1	4478	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	7209017	7209262	7209117	Y	NA	SORCS2	NA	NA	NA	NA	SORCS2	16752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	7807485	7807548	7807490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	132105	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	7846072	7846237	7846145	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	93416	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	7905982	7906260	7906100	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	33393	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	7972368	7972631	7972565	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	32715	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	7974971	7975417	7975298	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	35318	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	7978189	7978377	7978271	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	38536	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr4	11696419	11696433	11696426	Y	NA	NA	CLNK,HS3ST1	IMR90	Hi-C	24141950	RNPS1P1	324820	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	13484540	13485001	13484899	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	551	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	20197125	20197285	20197196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT2	55598	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	25868469	25868747	25868610	Y	NA	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	5087	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	36078000	36078189	36078065	Y	DTHD1,ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	165942	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	37668347	37668621	37668474	Y	NA	RELL1	NA	NA	NA	NA	RELL1	17377	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	37956443	37956472	37956456	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	3584	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	38084338	38084956	38084492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	124282	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	38102941	38103486	38103298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	142885	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	38159115	38159505	38159287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	199059	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	38162520	38162833	38162765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	202464	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	38870386	38870769	38870503	Y	FAM114A1	TLR1,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3088	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	39045588	39045914	39045752	Y	NA	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	929	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	40628627	40628976	40628881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	572181	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	40803649	40803948	40803799	Y	APBB2,APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	412783	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	40998550	40998604	40998585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	218127	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	41162074	41162440	41162321	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	54291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	41363966	41364137	41364015	Y	LIMCH1,LIMCH1	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	4342	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	41509451	41509766	41509557	Y	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	149827	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	54871626	54871896	54871863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	56961	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	66516104	66516284	66516196	Y	NA	RP11-807H7.1,EPHA5	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	17395	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	67430351	67431255	67431078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	472507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	67431681	67431779	67431730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	473837	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	67438719	67438955	67438878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	480875	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr4	72315211	72315582	72315397	Y	SLC4A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A4	264208	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	76621405	76621540	76621497	Y	RCHY1,THAP6,NUP54,G3BP2,G3BP2	G3BP2,USO1	NA	NA	NA	NA	G3BP2	26169	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	76963504	76963670	76963541	Y	NAAA,CXCL9,CXCL10,CXCL11	NA	NA	NA	NA	NA	SDAD1	53389	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	77380282	77380659	77380469	Y	NA	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	26029	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	77522680	77522954	77522817	Y	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	168427	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	77543952	77543974	77543961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	189699	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	77611633	77612016	77611712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	256840	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	78014068	78014466	78014356	Y	CCNG2	CCNI	SHROOM3,CCNG2	IMR90	Hi-C	24141950	CCNI	18910	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	78508035	78508650	78508360	Y	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	230119	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	78708574	78708903	78708795	Y	CNOT6L	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	29866	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	83205945	83206187	83206036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPD	87469	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	86683082	86683251	86683166	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	288815	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	86704673	86705059	86704806	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	310406	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	87960081	87960248	87960138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	90805	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	88038562	88038726	88038648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	120740	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	88128695	88128755	88128733	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30711	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	88765103	88765413	88765203	Y	HSD17B11	NA	NA	NA	NA	NA	SPP1	129406	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	88943044	88943294	88943160	Y	NA	SPP1,RNU1-36P,PKD2	NA	NA	NA	NA	PKD2	16224	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	89099576	89099877	89099636	Y	HERC6,HERC5	NA	PKD2	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG2	50597	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	89202679	89202817	89202765	Y	NA	PPM1K	NA	NA	NA	NA	PPM1K	1104	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	130072	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	96071597	96071692	96071645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	700560	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	99319477	99319794	99319573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	138942	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	99575135	99575326	99575229	Y	NA	TSPAN5	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	2454	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	101269712	101269900	101269796	Y	LAMTOR3	NA	NA	NA	NA	NA	DDIT4L	159773	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	103678847	103679008	103678977	Y	NA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	1143	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	106064596	106064807	106064750	Y	NA	TET2	TET2	K562	ChIA-PET	22265404	TET2	225	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	110623287	110623426	110623357	Y	LRIT3	CASP6,PLA2G12A	NA	NA	NA	NA	CASP6	548	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	112732930	112733119	112733025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	331434	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	117474098	117474276	117474187	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	43041	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr4	119115424	119115493	119115457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG8	82371	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	120444503	120444790	120444647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	70557	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	120526109	120526399	120526288	Y	NA	PDE5A	NA	NA	NA	NA	PDE5A	21747	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	123685251	123685615	123685333	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	33394	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	123686146	123686329	123686228	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	34289	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	123704519	123704897	123704616	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	40966	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	124373851	124374047	124373905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5	531622	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32229	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	129244714	129244881	129244798	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	129438976	129439122	129439055	Y	NA	NA	PHF17,LARP1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	227070	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	132481968	132482201	132482085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-9G1.3	1586070	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	134077378	134077602	134077486	Y	NA	RP11-9G1.3,PCDH10	NA	NA	NA	NA	PCDH10	8908	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	135287127	135287346	135287189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	166224	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.69719794552866
chr4	138975341	138975477	138975408	Y	NA	SLC7A11-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC7A11-AS1	1141	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr4	139173167	139173319	139173175	Y	NA	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	11664	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	140292626	140292906	140292778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	70921	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	SCOC	103815	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	146015172	146015244	146015208	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	1840	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	146655718	146656086	146655845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118303	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	147379746	147379894	147379845	Y	LSM6	NA	NA	NA	NA	NA	SLC10A7	61229	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	150808373	150808555	150808464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	188871	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	151204830	151205055	151204941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	207404	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	153461614	153461859	153461737	Y	NA	FBXW7	NA	NA	NA	NA	FBXW7	6361	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	153894415	153894544	153894479	Y	NA	FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	38911	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	155239135	155239272	155239204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRG1	230315	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	157868046	157868334	157868214	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22212	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	378130	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	164465601	164465786	164465694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	379528	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	169283971	169284191	169284081	Y	NA	DDX60	NA	NA	NA	NA	DDX60	46013	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	177459522	177459662	177459586	Y	VEGFC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-87F15.2	219913	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	180585671	180585931	180585800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-404J23.1	201212	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	180979740	180980372	180979835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-404J23.1	595281	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	185189434	185189785	185189717	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	203949	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	185573558	185573933	185573744	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	4895	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	187679181	187679543	187679362	Y	NA	FAT1	LOC339975,FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	33305	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr4	187766570	187766763	187766651	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAT1	120694	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr4	190485123	190485226	190485156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	143642	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	496367	496484	496443	Y	SLC9A3	CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2228K2.5	25154	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	1516282	1516761	1516468	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	5331	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	1930136	1931342	1930853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	130622	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	2750184	2750594	2750355	Y	C5orf38,IRX2	IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	5.2195735701581
chr5	7742239	7742282	7742261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRR	107017	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	9544480	9544834	9544772	Y	SEMA5A	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	168	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	9547741	9548115	9547963	Y	NA	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	3429	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	10692588	10692818	10692805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	66566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	11324017	11324157	11324081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	564633	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	13325974	13326290	13326142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH5	616362	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	14035955	14036534	14036234	Y	TRIO	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	93303	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	14178655	14179133	14178814	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	36844	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	14204877	14205144	14204973	Y	FAM105B	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	63066	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	14673178	14673249	14673214	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	10405	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO10	218844	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	16723637	16724009	16723823	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	MYO10	210363	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	17255490	17256325	17255691	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	87400	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	19735118	19735431	19735276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH18	838551	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	1339298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr5	27309667	27310060	27309866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01021	160339	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	33892874	33893172	33893071	Y	NA	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	2577	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	34571432	34571721	34571601	Y	NA	NA	RAI14,TTC23L	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	82621	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	35281144	35281439	35281292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPEF2	334507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	35924372	35924674	35924571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL7R	73575	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	36681914	36682309	36681923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	77457	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	36690488	36690876	36690655	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	86031	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP6	53296	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	37272795	37272956	37272876	Y	C5orf42	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	25265	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	37311676	37311784	37311730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP155	57499	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	37771819	37772240	37771999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	394505	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	39543496	39543808	39543708	Y	FYB	NA	DAB2,FYB,C9,PRKAA1,TTC33,RPL37,CARD6	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	83094	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	260926	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	31500	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	31239	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	44805965	44806268	44806131	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	611	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	50677492	50677845	50677668	Y	NA	ISL1	NA	NA	NA	NA	ISL1	571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	52327592	52327905	52327807	Y	ITGA2	ITGA2	NA	NA	NA	NA	ITGA2	44436	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	54039991	54040439	54040234	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18,GPX8,CDC20B	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	228402	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	54896440	54896979	54896639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	67562	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	55555067	55555385	55555210	Y	NA	NA	ANKRD55,IL6ST,MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	243514	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	55575946	55576115	55576004	Y	NA	NA	MAP3K1,MIER3	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	222784	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	57120821	57121296	57121146	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	632791	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	58746343	58746348	58746346	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	992256	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	60108847	60109238	60109043	Y	NA	ELOVL7	NA	NA	NA	NA	ELOVL7	28978	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	64224703	64224806	64224755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	161946	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	64505244	64505511	64505327	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	270236	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	64809602	64809952	64809754	Y	NA	ADAMTS6,CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	33855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	65220429	65221204	65220462	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	126	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	65529315	65529329	65529322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	95516	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	65814686	65814967	65814740	Y	MAST4	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4	75209	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	67242397	67242498	67242448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	267050	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	67561361	67561424	67561384	Y	PIK3R1,PIK3R1,PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	51813	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	71424352	71424432	71424374	Y	NA	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	23291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	71748206	71748633	71748536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	133733	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	71763835	71764098	71763993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	149362	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	71800012	71800268	71800102	Y	ZNF366	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	185539	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	71800879	71801269	71800999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	186406	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	71896178	71896784	71896469	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNPO1	213355	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	72792808	72793048	72792966	Y	NA	BTF3	NA	NA	NA	NA	BTF3	575	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	72934554	72934908	72934667	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	75043	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	72950370	72950710	72950420	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	90859	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	74355814	74356040	74355964	Y	ANKRD31,FAM169A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM169A	195038	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	74862624	74863010	74862882	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	56661	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	74863696	74863807	74863784	Y	ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	57733	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	74883919	74884208	74884013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	77956	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	76958449	76958840	76958645	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	44013	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	77821454	77822246	77822105	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	167115	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	77837654	77837953	77837804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	183315	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	77890894	77891278	77891114	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	172566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	81069582	81069591	81069587	Y	NA	SSBP2	SSBP2,ATG10,ZCCHC9	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP2	23966	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	82768927	82769141	82769084	Y	VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	246291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	83018086	83018575	83018426	Y	NA	HAPLN1	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	2654	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	83214867	83215139	83214962	Y	HAPLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	117494	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	83545538	83546053	83545791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	132192	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr5	83588624	83588917	83588807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	89328	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	83652187	83652571	83652379	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	25674	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	83670446	83670810	83670539	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	7435	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	83674189	83674553	83674373	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	3692	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr5	83677578	83677928	83677708	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	317	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr5	86275506	86275814	86275708	Y	CCNH,CCNH	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2161E19.1	96808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	87985363	87985679	87985523	Y	MEF2C	NA	LINC00461	K562	ChIA-PET	22265404	MEF2C	212243	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C	26466	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	90679835	90680013	90679955	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	2659	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F1	323059	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	92760867	92761238	92761060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F1	155805	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	92914746	92915169	92914912	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	1874	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	95063779	95063897	95063838	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2154I11.2	2102	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	95227563	95227763	95227704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1	67942	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	95403711	95404019	95403912	Y	ELL2	RP11-254I22.1	ELL2,CAST,MIR583,C5orf27	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-254I22.1	19892	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	95414896	95415105	95415065	Y	GLRX,ELL2	RP11-254I22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-254I22.1	31077	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	95416336	95416571	95416427	Y	GLRX,ELL2	RP11-254I22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-254I22.1	32517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	95555701	95555931	95555845	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	171882	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	95594948	95595289	95595074	Y	ELL2	NA	ELL2,RFESD,GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	211129	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	95633075	95633361	95633245	Y	GLRX	NA	ELL2,RHOBTB3,MIR583,GLRX,C5orf27,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	225610	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	106802102	106802350	106802226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	202246	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	106805205	106805528	106805416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	199068	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	106900103	106900354	106900202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	104242	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	106908701	106908838	106908775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	95758	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	110838164	110838531	110838380	Y	WDR36,CAMK4,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	7757	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	118453384	118453586	118453485	Y	NA	CTB-161M19.4,RP11-950K24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-950K24.2	8553	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	119848516	119848911	119848640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	50543	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	104813	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	121519182	121519443	121519230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	107202	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	122542890	122543069	122542980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIC	172454	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	122765811	122765999	122765906	Y	NA	CEP120	CEP120	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CEP120	8525	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	123987356	123987539	123987440	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	94961	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	123996464	123996708	123996619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	85792	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	123997171	123997561	123997207	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	84939	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	124077955	124078154	124078062	Y	ZNF608	ZNF608	NA	NA	NA	NA	ZNF608	4346	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	125686848	125687181	125687011	Y	GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3,ALDH7A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	6643	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	125779791	125780174	125779834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	85967	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	125782209	125782552	125782386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	88385	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	18816	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIPNL	117541	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	134824618	134825007	134824746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFY	91014	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	136450174	136450503	136450334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	258857	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	136482104	136482426	136482383	Y	SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	290787	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	136900041	136900222	136900186	Y	NA	SPOCK1	TRPC7	IMR90	Hi-C	24141950	SPOCK1	31846	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	137172827	137173063	137172946	Y	KLHL3,MYOT	RP11-381K20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-381K20.2	49962	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	137333439	137333810	137333723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13B	51840	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	139017934	139018665	139018227	Y	MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	6219	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	139076374	139076603	139076510	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	51490	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	139077054	139077268	139077188	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	52170	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	66056	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	139104562	139104943	139104720	Y	NA	NA	DNAJC18,UBE2D2,CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	79678	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	139691635	139691999	139691907	Y	HBEGF	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	10929	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	139968839	139969020	139968884	Y	NA	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3,TMCO6	NA	NA	NA	NA	APBB3	2317	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	141825669	141826086	141825870	Y	SPRY4	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	121649	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	141992944	141993173	141993092	Y	FGF1,FGF1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	154776	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	142357164	142357537	142357332	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	209215	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	143300463	143300651	143300509	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	247627	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	143567299	143567675	143567503	Y	NA	YIPF5,KCTD16	NA	NA	NA	NA	KCTD16	18903	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	143569314	143569909	143569557	Y	KCTD16	YIPF5,KCTD16	NA	NA	NA	NA	KCTD16	20918	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	143578105	143578377	143578180	Y	YIPF5	YIPF5,KCTD16	NA	NA	NA	NA	KCTD16	29709	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	143858927	143858997	143858987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD16	310531	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	144740586	144740760	144740654	Y	NA	NA	KCTD16,SH3RF2	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	472172	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	145094622	145094634	145094628	Y	GRXCR2	NA	KCTD16	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	118298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	145319403	145319467	145319435	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	5261	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	145326011	145326414	145326305	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	11869	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	145447855	145448292	145447919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	111931	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	31391	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	148290314	148290586	148290452	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	86158	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	148514080	148514173	148514127	Y	NA	ABLIM3	ABLIM3,AFAP1L1,ADRB2,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	4873	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	148515213	148515594	148515276	Y	ABLIM3	ABLIM3	ABLIM3,AFAP1L1,ADRB2,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	3452	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	148533618	148533717	148533668	Y	NA	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	ABLIM3	14572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	148832906	148833066	148832986	Y	NA	MIR143HG	NA	NA	NA	NA	MIR143HG	48654	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	149267173	149267449	149267330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	70851	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	14812	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	150536063	150536329	150536162	Y	ANXA6	ANXA6	NA	NA	NA	NA	ANXA6	620	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	151078700	151079028	151078874	Y	ATOX1,SPARC	SPARC	SPARC,ATOX1	IMR90	Hi-C	24141950	SPARC	13974	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	153807428	153807565	153807497	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	15845	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	154274946	154275114	154275030	Y	NA	CNOT8,GEMIN5,MRPL22	NA	NA	NA	NA	CNOT8	39833	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	155107244	155107656	155107286	Y	NA	NA	PPP1R2P3,TIMD4,SGCD	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL22	788614	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	157030326	157030804	157030600	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM19	29543	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	158154303	158154569	158154437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	370200	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	158366953	158367057	158367005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	157712	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	158489129	158489509	158489418	Y	NA	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	35260	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PWWP2A	47677	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PWWP2A	48187	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	159815159	159815328	159815245	Y	NA	CCNJL,C1QTNF2,C5orf54,SLU7,PTTG1	NA	NA	NA	NA	C5orf54	9776	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	167011273	167011672	167011457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.1	73814	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	167034408	167034621	167034436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.1	50865	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	167066911	167067143	167066981	Y	NA	CTB-78F1.1	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.1	18343	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	167157088	167157552	167157214	Y	NA	CTB-78F1.2	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	10720	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr5	167197574	167197786	167197665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	51206	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	167224919	167225220	167225022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	78551	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.95734008880929
chr5	167230041	167230378	167230210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	83673	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr5	167241894	167242222	167242118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	95526	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	167243466	167243587	167243564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	97098	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	167243967	167244280	167244072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	97599	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	167320595	167320600	167320598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	174227	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	167343894	167343960	167343927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	197526	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	167372516	167372785	167372694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	226148	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.95734008880929
chr5	167439777	167440090	167439882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	276566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	169215174	169215454	169215255	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK2	152923	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr5	169398141	169398453	169398335	Y	NA	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	7291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	1198	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	171094849	171095086	171094946	Y	NA	NA	FBXW11,FGF18	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1	282729	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	171298269	171298393	171298371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	133484	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	171498342	171498743	171498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	66465	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	171529769	171530204	171529991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	83186	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	171709316	171709633	171709569	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	241	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	171838601	171839062	171838738	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	40465	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	172064248	172064489	172064361	Y	NA	NEURL1B,CTB-79E8.3	NA	NA	NA	NA	NEURL1B	1780	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr5	172308731	172309533	172309021	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	49453	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	172329840	172330200	172330006	Y	DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	53532	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	172761341	172761739	172761505	Y	STC2	STC2	NA	NA	NA	NA	STC2	6835	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr5	173031200	173031306	173031275	Y	NA	BOD1	NA	NA	NA	NA	BOD1	10357	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	173191567	173191754	173191643	Y	CPEB4	NA	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	121529	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	173208911	173209406	173209234	Y	CPEB4	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	103877	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	173293319	173293521	173293407	Y	CPEB4	CPEB4	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	19762	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	173765324	173765497	173765445	Y	MSX2	NA	HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	384039	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	173846140	173846257	173846227	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	303279	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	176424414	176424699	176424557	Y	NA	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	22935	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	176699119	176699281	176699198	Y	NSD1	RAB24,PRELID1,MXD3	NA	NA	NA	NA	RAB24	29464	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	178692524	178692976	178692825	Y	ADAMTS2	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS2	77455	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	179517331	179517686	179517646	Y	HNRNPH1,MAML1,RNF130	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	20213	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	MAPK9	907	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	180541875	180541994	180541989	Y	OR2Y1	NA	BTNL8,MGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-338M12.5	74930	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	501922	502087	502051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC2	189030	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	1702305	1702315	1702310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	93624	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	2790944	2791090	2791014	Y	NA	WRNIP1,SERPINB1	SERPINB1	IMR90	Hi-C	24141950	WRNIP1	27296	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	2877769	2878087	2877933	Y	SERPINB9,NQO2,SERPINB1	SERPINB1,SERPINB9	NA	NA	NA	NA	SERPINB9	23427	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	2902288	2902696	2902436	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB9	MGC39372,MIR4645,SERPINB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	774	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	9108	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	30302	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr6	3389811	3390490	3390264	Y	SERPINB6,SLC22A23,C6orf145	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	64766	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	3797931	3798162	3798051	Y	NA	PXDC1,FAM50B	SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL	IMR90	Hi-C	24141950	PXDC1	47671	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	3826272	3826513	3826435	Y	C6orf145	FAM50B	SLC22A23,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	21107	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	3913172	3913519	3913429	Y	NA	NA	SLC22A23,FAM50B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	65552	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	4317088	4317563	4317434	Y	CDYL	NA	RPP40,CDYL,LYRM4	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	183257	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	5966118	5966226	5966172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	706841	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	9037386	9037741	9037564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	603592	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	9503675	9503928	9503802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	913964	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	9516527	9516706	9516607	Y	NA	NA	LOC100130275,TFAP2A,LINC00518	IMR90	Hi-C	24141950	TFAP2A	901186	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr6	10383571	10383981	10383824	Y	TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	33911	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	167522	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	11318376	11319012	11318732	Y	TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	61569	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	11609469	11609947	11609818	Y	NA	NA	HIVEP1,EDN1,ADTRP	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD9	228888	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	11769423	11769725	11769659	Y	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	237270	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	12592849	12593177	12593094	Y	EDN1	NA	TMEM170B,EDN1,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	80507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	12965020	12965354	12965088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	246934	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	14598711	14599042	14598876	Y	CD83	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	482839	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	14884214	14884345	14884265	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	360182	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	15206545	15206759	15206651	Y	JARID2	JARID2,JARID2-AS1	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	37768	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	15313668	15313748	15313709	Y	DTNBP1,JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	66803	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	15542142	15542162	15542152	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	119127	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	15580663	15580900	15580755	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	80389	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	16319874	16320274	16319989	Y	MYLIP	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	83063	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	16439523	16439703	16439580	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	202712	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	16712557	16713382	16713252	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	45987	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	18020711	18021071	18020890	Y	NA	KIF13A	KIF13A,NHLRC1,TPMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KIF13A	34857	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	18342517	18342875	18342695	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	23904	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	18370927	18371512	18371225	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	4148	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	19691933	19692175	19692049	Y	ID4	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	110808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	20978432	20978689	20978561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	445744	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	21129910	21130117	21129994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	461855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr6	21589338	21589711	21589681	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2261	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr6	21947021	21947287	21947156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	355049	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	21987708	21987959	21987863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	395736	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	22149387	22149566	22149505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	557415	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	24584505	24584676	24584669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0319	59707	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	24743523	24743742	24743610	Y	TDP2,C6orf62	C6orf62,GMNN	GMNN,CMAHP,C6orf62	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf62	24459	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	24743891	24744276	24743998	Y	TDP2,C6orf62	C6orf62,GMNN	GMNN,CMAHP,C6orf62	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf62	24827	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	24981053	24981388	24981201	Y	NA	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	CMAHP	183405	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAHP	70052	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	25458860	25459089	25458879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	181554	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr6	26025834	26026125	26026038	Y	BTN2A1,BTN2A1,TRIM38	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	354	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	27065086	27065154	27065121	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	33387	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	27146789	27146995	27146901	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30028	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr6	28715387	28715696	28715451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND3	133398	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	29568471	29568641	29568556	Y	MOG,GABBR1	UBD	NA	NA	NA	NA	UBD	42769	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	29949488	29949840	29949664	Y	NA	HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	42451	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	PPP1R11	36152	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	30651242	30651620	30651357	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2052	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	30811913	30812084	30812025	Y	NA	DDR1	FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1	IMR90	Hi-C	24141950	DDR1	30114	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	32051111	32051460	32051307	Y	NA	TNXB,ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	TNXB	29651	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	32819276	32819643	32819486	Y	HLA-DRA,HLA-DRB5,TAPBP,RGL2,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP1	112	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	33129390	33129479	33129402	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1	NA	NA	NA	NA	SLC39A7	36743	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	33216178	33216307	33216243	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2	NA	NA	NA	NA	HCG25	867	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	33581625	33581918	33581825	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4224	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	36399958	36400295	36400126	Y	NA	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	8249	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	36547678	36548077	36547769	Y	PI16,MTCH1	STK38,SRSF3	STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRSF3	12068	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	36737758	36737957	36737899	Y	ETV7,ETV7,PXT1,PIM1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	95453	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	36786044	36786391	36786334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf89	51255	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	37094186	37094408	37094276	Y	PPIL1	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	41571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	37210643	37210874	37210721	Y	TMEM217,TMEM217	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	12674	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	37521439	37521998	37521635	Y	FTSJD2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC167	55741	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	37524660	37525395	37524727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC167	58962	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	39850347	39850811	39850571	Y	NA	MOCS1	NA	NA	NA	NA	MOCS1	49479	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	40215028	40215342	40215185	Y	NA	NA	KIF6	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-278E11.3	290456	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	40544323	40544531	40544427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	494153	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	40904550	40904902	40904649	Y	UNC5CL	NA	APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL	IMR90	Hi-C	24141950	NFYA	133782	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	40965087	40965613	40965406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73071	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr6	41341728	41341773	41341752	Y	FRS3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP4	170391	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	42086253	42086632	42086383	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	21725	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	43636886	43637091	43636988	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	16437	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	43978439	43978901	43978686	Y	NFKBIE	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1120P11.3	60749	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	44002049	44002379	44002368	Y	NFKBIE,GTPBP2	RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	37271	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	29897	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	44026121	44027353	44026480	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	12297	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	RP5-1120P11.3,TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	44230828	44231731	44231363	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,AARS2	NA	NA	NA	NA	NFKBIE	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	8290	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	45313959	45314320	45314140	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	20065	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	45319946	45320392	45320176	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	23298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	45503403	45503548	45503462	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	159713	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	45557969	45558292	45558091	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,SUPT3H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	214279	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	45618234	45618676	45618425	Y	RUNX2	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	274544	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.82726901716897
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr6	45665421	45665594	45665503	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	321731	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	45678135	45678537	45678416	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,SUPT3H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	334445	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	46640633	46640732	46640698	Y	NA	CYP39A1,SLC25A27	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	21955	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	48794608	48794845	48794713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	634059	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P5	396291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	52431726	52432083	52432005	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	7630	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	52952230	52952503	52952367	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	27630	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	53167531	53167800	53167691	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	44147	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	53205102	53205427	53205266	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	6520	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	55706850	55707208	55707026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	1110218	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	55905205	55905398	55905302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	912028	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	520858	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	56578288	56578394	56578341	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	DST	239032	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	57004936	57005232	57005084	Y	NA	BAG2	NA	NA	NA	NA	BAG2	29892	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	57327654	57327860	57327770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	150051	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	64810831	64811146	64811044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-59D5__B.2	296102	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	65390704	65390953	65390803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-59D5__B.2	875975	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	72103736	72104124	72104114	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	7200	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	72179171	72179414	72179328	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30C2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	50699	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr6	73378236	73378609	73378395	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	48716	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	73524800	73525128	73524864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	195280	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	73987583	73987923	73987651	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	KHDC1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398K22.12	16645	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	75911376	75911573	75911562	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	2194	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	75914223	75914620	75914578	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	456	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	79753259	79753564	79753411	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	32389	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	80838245	80838506	80838365	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	23881	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	81662295	81662532	81662438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	797959	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	84101816	84101824	84101820	Y	NA	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	36973	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	84601276	84601399	84601338	Y	NA	CYB5R4	NA	NA	NA	NA	CYB5R4	33914	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	86174491	86174911	86174693	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	16682	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	87433521	87433927	87433716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1P1	396479	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	88416343	88416722	88416531	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	6416	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	88433013	88433258	88433054	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	AKIRIN2-AS1,AKIRIN2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AKIRIN2	23086	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	91112012	91112325	91112109	Y	BACH2,BACH2	NA	BACH2,CALN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	MAP3K7	182439	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	92644130	92644239	92644185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	1349366	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	102688376	102688518	102688447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK2	843712	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	105061628	105062008	105061974	Y	LIN28B,HACE1	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	243786	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	108574394	108574619	108574507	Y	NA	SNX3,LACE1	NA	NA	NA	NA	SNX3	5845	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	111733320	111733976	111733973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	68738	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	112192236	112192610	112192499	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	45	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	112449250	112449618	112449554	Y	NA	TUBE1	NA	NA	NA	NA	TUBE1	42518	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	112523729	112524008	112523937	Y	LAMA4	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA4	50133	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	112525181	112525504	112525289	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	48637	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	113505450	113505765	113505678	Y	NA	NA	FLJ34503,MARCKS,HDAC2	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	670776	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	113966016	113966399	113966296	Y	MARCKS	NA	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MARCKS	210142	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	113975639	113976185	113975774	Y	MARCKS	NA	MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	200356	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	114005806	114006016	114005966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	170525	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1,RNU4-35P	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr6	122016612	122016787	122016747	Y	NA	NA	GJA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-35P	243345	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	122172452	122172679	122172567	Y	NA	NA	GJA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-35P	399185	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	125424080	125424400	125424202	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	13795	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	126267356	126267782	126267584	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	8145	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	126271537	126271736	126271680	Y	NA	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	4191	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	129250577	129251100	129251039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	410707	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr6	134679459	134679725	134679553	Y	SGK1,SGK1	SGK1	SGK1,ALDH8A1,LOC154092	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	42209	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	138194322	138194912	138194642	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	7971	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178098	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	140383051	140383491	140383322	Y	NA	NA	CITED2,LOC100132735	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	689294	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	140400470	140400745	140400517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	706713	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	140893217	140893627	140893519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1199460	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	140920515	140920620	140920568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1226758	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	140984884	140985153	140985121	Y	NA	NA	LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	1291127	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.60978678507905
chr6	141765105	141765268	141765171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	701099	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	144066654	144067070	144066822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	95411	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	144585551	144585700	144585606	Y	NA	NA	UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	STX11	115888	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	146401880	146402209	146402045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHPRH	118321	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	147124877	147125201	147125102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	262048	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	147234581	147234754	147234661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288807	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	148588961	148589218	148589102	Y	UST	SASH1	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	2222	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	149657882	149658028	149657899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	120105	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	150176203	150176399	150176290	Y	NA	LRP11	NA	NA	NA	NA	LRP11	7800	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	151709507	151709685	151709611	Y	C6orf97,ZBTB2	ZBTB2	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	998	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	152012429	152012574	152012475	Y	ZBTB2,C6orf97,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf211	241007	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	152606341	152606739	152606594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	350197	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	155509471	155509833	155509659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFB1M	123794	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	157168828	157169241	157169084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	71765	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	158478416	158478907	158478642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	77528	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	158784092	158784407	158784250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2H5	196708	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	158895983	158896180	158896053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	167591	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	32527	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	32985	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	161549553	161550030	161549828	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	138794	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	161646912	161646998	161646955	Y	NA	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	46095	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	161838884	161839117	161839007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	145791	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	161855398	161855535	161855440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	162305	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	161855973	161856365	161856002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	162880	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	166067950	166069085	166068916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	329006	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	166970262	166970784	166970543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	216183	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	167411045	167411413	167411177	Y	NA	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	375	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	251753	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	169470702	169471012	169470790	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	90007	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	169495883	169496177	169495989	Y	NA	NA	PHF10,THBS2,WDR27,C6orf70	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	64842	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	169556642	169556776	169556709	Y	NA	RP11-417E7.1	C6orf70	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	4243	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	169572627	169572772	169572742	Y	NA	RP11-417E7.1	THBS2,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	11608	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	169573934	169574190	169574061	Y	NA	RP11-417E7.1	THBS2,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	12915	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr6	170020305	170020690	170020593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR27	79469	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	89354	89662	89513	Y	NA	NA	FAM20C,HEATR2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20C	101307	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	409137	409513	409244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	148420	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	2077835	2078163	2078150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	192715	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	2569438	2569603	2569498	Y	LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	19275	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	2672306	2673216	2673099	Y	LFNG,TTYH3	TTYH3,AMZ1	NA	NA	NA	NA	TTYH3	2721	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	2744937	2745164	2745051	Y	NA	AMZ1	NA	NA	NA	NA	AMZ1	27781	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	2773642	2774144	2773933	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	AMZ1	56486	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	2960647	2961036	2960906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	78689	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	2990961	2991263	2991178	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	CARD11	90316	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	3350976	3351346	3351174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD11	269397	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	3668930	3669293	3669112	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	CARD11	587351	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	5419074	5419498	5419154	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	43547	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	5733172	5733453	5733321	Y	CCZ1,USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	85917	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	5761606	5761918	5761762	Y	USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	57452	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	6676235	6676334	6676285	Y	NA	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	1282	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	7162473	7162881	7162670	Y	NA	C1GALT1	COL28A1,RPA3,LOC729852,ICA1	IMR90	Hi-C	24141950	C1GALT1	31684	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	7608686	7608956	7608841	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	4183	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	7996944	7997264	7997104	Y	NA	GLCCI1	LOC729852,GLCCI1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLCCI1	9161	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	12759659	12759934	12759702	Y	ARL4A,ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	35178	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	14876245	14876455	14876355	Y	DGKB	NA	NA	NA	NA	NA	DGKB	135947	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	17664691	17664931	17664811	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	313193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	18551067	18551390	18551179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX13	572943	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	22614875	22615270	22614981	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	65257	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	73122	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	24229401	24229422	24229412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP6	381465	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	24739704	24740021	24739930	Y	DFNA5,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	67223	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	24826484	24826966	24826807	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	19240	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	26355868	26356236	26355954	Y	NA	AC010677.5,SNX10	NA	NA	NA	NA	SNX10	26327	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	27143635	27143783	27143725	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA6	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	1613	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	27717680	27717897	27717733	Y	NA	HIBADH	HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1	IMR90	Hi-C	24141950	HIBADH	17066	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	27980070	27980278	27980209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	202056	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	140769	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	28094781	28094986	28094893	Y	HIBADH	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	122955	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	28190212	28190323	28190268	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	27618	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	28893180	28893544	28893363	Y	CREB5	NA	CREB5	IMR90	Hi-C	24141950	CHN2	266346	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	29310713	29310833	29310750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	77646	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	29528576	29528813	29528695	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	AC007255.8	72473	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	30005426	30005693	30005606	Y	NA	AC007285.6,SCRN1	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	20523	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	20915	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	31923409	31923701	31923603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	413240	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	32026855	32027150	32027002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	309791	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr7	32202741	32202908	32202813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	134033	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	34316740	34316919	34316850	Y	BMPER	NA	NA	NA	NA	NA	BMPER	374217	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	36785983	36786266	36786088	Y	AOAH	NA	AOAH	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P18	70298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	37221797	37222057	37221923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	365233	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	40867151	40867518	40867335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBA	873188	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	40961938	40962183	40962107	Y	NA	NA	C7orf10,INHBA,LOC285954	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	778523	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	43612098	43612408	43612297	Y	DBNL	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	7949	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	43835897	43835899	43835898	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	39618	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	64510	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	44616133	44616490	44616314	Y	NA	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	TMED4	3396	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	44679392	44679514	44679453	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	35221	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	45963987	45964294	45964096	Y	NA	IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	4514	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	46072625	46072971	46072717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	113152	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	46186122	46186484	46186177	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	226649	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	227039	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	46972513	46972753	46972628	Y	NA	NA	IGFBP3,IGFBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	647403	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	47367058	47367181	47367120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	252975	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	47496897	47497228	47497063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	122928	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr7	47534455	47534849	47534744	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	85307	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	47554592	47554957	47554775	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	65199	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	47588229	47588393	47588311	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	31763	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	47631233	47631542	47631345	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	11077	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr7	47641950	47642196	47642073	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	21794	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	47691174	47691510	47691360	Y	C7orf69,TNS3,C7orf65	NA	TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	71018	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	47797544	47797859	47797606	Y	NA	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	35030	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	47823605	47823820	47823740	Y	TNS3	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	9069	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr7	48122110	48122308	48122209	Y	NA	UPP1	UPP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	UPP1	3917	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	55253994	55254266	55254079	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	169280	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	55313083	55313480	55313282	Y	NA	NA	EGFR,SEC61G,LANCL2	IMR90	Hi-C	24141950	LANCL2	117661	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	NA	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	LANCL2	108185	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	55506510	55507071	55506539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	75369	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	55603072	55603362	55603151	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	35319	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	55614421	55614857	55614666	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	23824	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	57577552	57577783	57577653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-725G10.3	1348714	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	66096553	66096745	66096681	Y	NA	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	KCTD7	4685	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	68797127	68797219	68797173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-859M6.1	693342	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	72990459	72990574	72990513	Y	NA	BCL7B,TBL2	NA	NA	NA	NA	TBL2	547	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	73309402	73309628	73309515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	54537	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	73311055	73311352	73311116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	56190	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	73987997	73988205	73988054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	81789	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr7	75993529	75993613	75993570	Y	POR	YWHAG,ZP3	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7181	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr7	77038853	77039042	77038951	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	125550	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	77039475	77039927	77039691	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	124665	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	79803492	79803786	79803598	Y	NA	GNAI1	NA	NA	NA	NA	GNAI1	42221	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	80128570	80128822	80128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	367299	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	80352083	80352704	80352185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	196971	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	80441834	80442054	80441993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	107621	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	81233474	81233832	81233648	Y	NA	NA	HGF,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	HGF	163922	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	84267436	84267624	84267532	Y	NA	NA	SEMA3A	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3A	147396	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	92233387	92233691	92233548	Y	NA	FAM133B	FAM133B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	15679	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	92274593	92274946	92274914	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	56885	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	92439060	92439368	92439205	Y	PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9	CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	24540	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	92533719	92534002	92533863	Y	SAMD9	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	CDK6	69811	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	BET1	180994	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	93926616	93927074	93926886	Y	SGCE,COL1A2	NA	COL1A2,GNG11	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A2	94799	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	93930998	93931300	93931121	Y	NA	NA	COL1A2,GNG11	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A2	90573	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	94003622	94003870	94003684	Y	NA	COL1A2	NA	NA	NA	NA	COL1A2	18003	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	94021237	94021945	94021560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL1A2	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr7	94140158	94140537	94140353	Y	CASD1	CASD1	NA	NA	NA	NA	CASD1	3627	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	95546532	95546890	95546577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I1	146666	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	98739351	98739615	98739543	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	108	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	98978423	98978863	98978747	Y	SMURF1,ZNF655,ZNF655,ZNF498,ZNF394,ZKSCAN5	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	8551	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	100144720	100144853	100144769	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9886	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	100752309	100752636	100752570	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	15734	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	100772573	100772742	100772614	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4203	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	100772917	100773243	100773005	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4547	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	101789481	101789757	101789558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	212562	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	102452256	102452586	102452421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	64838	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	102514621	102514825	102514690	Y	NA	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM185A	127203	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM185A	128808	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	105705488	105705603	105705542	Y	NA	SYPL1	ATXN7L1,SYPL1,CDHR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	45419	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	105857491	105857771	105857742	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	67001	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	105922869	105923204	105923197	Y	NA	NAMPT	NA	NA	NA	NA	NAMPT	1568	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	106009960	106010160	106010041	Y	PIK3CG,NAMPT	NA	CCDC71L,SYPL1,NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	85188	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	106089773	106090176	106089868	Y	NAMPT,PIK3CG	NA	NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	165001	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	106209189	106209713	106209400	Y	NAMPT	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC004917.1	89629	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	106280912	106281173	106281054	Y	NAMPT,PIK3CG	AC004917.1,CCDC71L	NA	NA	NA	NA	AC004917.1	18169	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	107136125	107136576	107136361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	65353	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	107190959	107191312	107191306	Y	NA	DUS4L,COG5,BCAP29	NA	NA	NA	NA	DUS4L	10617	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	107205466	107205592	107205534	Y	COG5	DUS4L,COG5,BCAP29	NA	NA	NA	NA	COG5	2507	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	107562078	107562130	107562088	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	32663	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	107939769	107940082	107939931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	155079	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	110470494	110470759	110470627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	729814	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	114570083	114570518	114570369	Y	MDFIC	MDFIC	NA	NA	NA	NA	MDFIC	9874	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	115912136	115912451	115912327	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	12983	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31798	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	116035470	116035688	116035648	Y	NA	NA	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	AC002066.1	101831	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	116083167	116083483	116083344	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	TES,CAV2,CAV1,MET	IMR90,MCF7,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	AC002066.1	54036	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	116152142	116152412	116152205	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	CAV1	10427	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	116168216	116168790	116168273	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	5377	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	116181805	116181927	116181813	Y	CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	18966	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	116202174	116202561	116202326	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	39335	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	116217100	116217359	116217210	Y	CAV1,CAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CAV1	54261	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	116504290	116504456	116504319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	55166	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	728487	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	4.1321624097085
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr7	128472556	128472915	128472760	Y	NA	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4125	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr7	129421490	129421976	129421792	Y	FAM40B	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	168813	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	129469996	129470292	129470140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	120497	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	130005893	130006126	130006010	Y	MEST	NA	NA	NA	NA	NA	CEP41	74148	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	130013597	130013906	130013823	Y	CPA2,CPA1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP41	66368	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	130665753	130666114	130665990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	69684	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	130795999	130796263	130796171	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	3064	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	131314351	131314532	131314442	Y	NA	NA	PODXL,MKLN1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PODXL	73375	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	131581821	131581890	131581855	Y	NA	NA	PLXNA4	IMR90	Hi-C	24141950	PODXL	340845	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	225554	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr7	134378159	134378392	134378229	Y	AKR1B1,CALD1	BPGM,CALD1	NA	NA	NA	NA	BPGM	48599	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	134540961	134541304	134541061	Y	CALD1	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	113958	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	134571220	134571518	134571300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL3	97741	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	134677531	134677740	134677636	Y	AGBL3	AGBL3	NA	NA	NA	NA	AGBL3	8272	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	134862087	134862457	134862329	Y	NA	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	8540	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	134939025	134939170	134939094	Y	TMEM140,CNOT4,WDR91	WDR91	NA	NA	NA	NA	WDR91	44709	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	135430585	135430983	135430863	Y	FAM180A	FAM180A	NA	NA	NA	NA	FAM180A	611	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	FAM180A	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	11846	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	135771654	135771794	135771701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	111553	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	136582219	136582518	136582369	Y	NA	CHRM2	NA	NA	NA	NA	CHRM2	30803	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	137264728	137264844	137264813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTN	238117	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	137355325	137355590	137355458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTN	328714	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	139367160	139367381	139367316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108196	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	141285767	141286195	141285861	Y	TAS2R38,AGK	AGK	NA	NA	NA	NA	AGK	36778	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	141380130	141380660	141380538	Y	NA	KIAA1147,RNU1-82P	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	19293	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	FAM131B,AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	146573041	146573429	146573238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	1702064	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	147109889	147110169	147110008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	1165324	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	149191913	149192296	149192075	Y	SSPO,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	612	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	149193399	149193541	149193458	Y	ZNF467,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	491	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	149413428	149413754	149413591	Y	NA	KRBA1	NA	NA	NA	NA	KRBA1	3556	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	150137170	150137441	150137307	Y	TMEM176B,GIMAP5,GIMAP8	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF775	73291	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	151157060	151157432	151157203	Y	NA	NA	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	57774	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	151384772	151384923	151384848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	169566	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	152330696	152330805	152330751	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	40445	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	154730644	154730988	154730877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	61806	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	154742897	154743129	154742996	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49665	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	NA	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	INSIG1	86416	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	155005136	155005410	155005191	Y	INSIG1	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	82076	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	155137693	155138087	155137815	Y	NA	NA	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INSIG1	50207	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	155247602	155247748	155247675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	160116	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	157334866	157335140	157335002	Y	DNAJB6,DNAJB6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	208791	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr7	157338058	157338440	157338352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	211983	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	158167398	158167566	158167494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	327954	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr7	158225517	158225999	158225657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	269521	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	1845111	1845463	1845298	Y	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	74969	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	2206891	2206904	2206898	Y	NA	NA	CSMD1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF10	436749	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	8247461	8247709	8247494	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	5453	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	10872577	10873059	10872733	Y	XKR6,MTMR9	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	177183	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	11001237	11001609	11001584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XKR6	55266	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.95734008880929
chr8	11314255	11315026	11314813	Y	XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	15198	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr8	11337266	11337614	11337440	Y	FAM167A	FAM167A	C8orf12,BLK	IMR90	Hi-C	24141950	FAM167A	7042	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	11368445	11368737	11368558	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	38221	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	16569846	16570195	16569986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	441343	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	17463292	17463534	17463469	Y	MTMR7,MTUS1	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	PDGFRL	31350	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	19436473	19436611	19436572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	176929	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	19522969	19523285	19523139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	90255	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	21425650	21425756	21425703	Y	GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	349424	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	21541404	21541810	21541602	Y	DOK2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	233370	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,HR,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3	NA	NA	NA	NA	BIN3	36382	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	23138717	23138953	23138815	Y	LOXL2	CHMP7,R3HCC1	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	13084	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	23203813	23204244	23204131	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	76597	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	23210314	23210863	23210698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	69978	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	24624446	24624496	24624472	Y	NEFM,NEFM,NEFL	NA	NA	NA	NA	NA	NEFL	188128	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	24858208	24858485	24858356	Y	NA	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	45584	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	25242857	25243137	25242939	Y	NA	NA	KCTD9	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD9	70855	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	25348135	25348483	25348309	Y	CDCA2	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	33622	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	27387404	27387600	27387502	Y	PTK2B,PTK2B,EPHX2	EPHX2	NA	NA	NA	NA	EPHX2	41108	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	28565617	28566294	28565942	Y	EXTL3	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3	109631	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	28874740	28875053	28874870	Y	KIF13B	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	36399	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	30363851	30364149	30364000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	122934	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	32084575	32084724	32084674	Y	NRG1,NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1	589673	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	32553058	32553329	32553194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	775611	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	35119361	35119644	35119503	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	261637	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr8	37000181	37000618	37000483	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	409083	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	37002327	37002551	37002443	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	407150	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	38523213	38523472	38523342	Y	C8orf86	NA	C8orf86,FGFR1,WHSC1L1,RNF5P1,PPAPDC1B	IMR90	Hi-C	24141950	TACC1	60232	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	38627692	38628125	38628027	Y	LETM2,LETM2,C8orf86,PLEKHA2,TACC1	TACC1	NA	NA	NA	NA	TACC1	43988	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr8	38794203	38794537	38794324	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37450	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	40032102	40032537	40032342	Y	IDO1	C8orf4	NA	NA	NA	NA	C8orf4	23113	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	42567868	42568024	42567945	Y	IKBKB,IKBKB	CHRNB3	NA	NA	NA	NA	CHRNB3	17349	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	48265617	48265884	48265750	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191124	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	48910578	48910837	48910684	Y	NA	PRKDC,MCM4,UBE2V2	NA	NA	NA	NA	UBE2V2	8123	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	49321878	49322114	49322046	Y	NA	RPL29P19	SNAI2,MCM4,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	26728	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	56684291	56684685	56684461	Y	NA	TGS1,TMEM68	NA	NA	NA	NA	TMEM68	325	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	56916302	56916441	56916350	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	68019	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	57470544	57470680	57470612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD7	348299	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	59470194	59470547	59470220	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	6711	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	59763369	59763610	59763548	Y	NA	RNU4-50P	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	38258	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	59768911	59769118	59769011	Y	NA	RNU4-50P	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	43800	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr8	60028775	60028875	60028825	Y	NA	RP11-25K19.1,TOX	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	724	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB2A	84073	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	RAB2A	423074	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr8	62631895	62632623	62632238	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	6740	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	62634023	62634407	62634126	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	8868	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	62679636	62680132	62679874	Y	NA	NA	ASPH,MIR4470	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASPH	54481	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	65135384	65135588	65135486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	1056272	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	67419818	67420060	67419977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	79398	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	67425057	67425564	67425100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	84637	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89869	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	67434763	67435122	67434951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89360	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr8	67447907	67448273	67448065	Y	MYBL1,C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	76209	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	68090392	68090564	68090531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	96374	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	68105132	68105308	68105276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	111114	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-865I6.2	90572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	69833238	69833706	69833452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-865I6.2	70240	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	69837388	69837920	69837570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-865I6.2	74390	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-865I6.2	279380	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	70310732	70311124	70310931	Y	NA	NA	C8orf34	IMR90	Hi-C	24141950	SULF1	65735	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	70404093	70404306	70404271	Y	NA	SULF1	NA	NA	NA	NA	SULF1	27234	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	71522610	71523035	71522826	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	3988	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	72745133	72745517	72745318	Y	MSC	RP11-383H13.1,MSC	NA	NA	NA	NA	RP11-383H13.1	6731	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	72753377	72753463	72753388	Y	NA	RP11-383H13.1,MSC	NA	NA	NA	NA	MSC	1240	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	72880263	72880309	72880290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPA1	105543	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	72917567	72918022	72917791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPA1	67830	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	73008234	73008433	73008334	Y	NA	TRPA1	TRPA1,LOC100132891	IMR90	Hi-C	24141950	TRPA1	22382	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	77469082	77469378	77469240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	122076	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	77585675	77585844	77585753	Y	ZFHX4	ZFHX4,ZFHX4-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	5610	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	77589671	77589739	77589705	Y	NA	ZFHX4,ZFHX4-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	1715	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	82019096	82019493	82019305	Y	PAG1	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5	171105	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	83304243	83304478	83304361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX16	551142	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	94850124	94850307	94850200	Y	PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17728	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	94892570	94892797	94892694	Y	NA	PDP1	TMEM67,PDP1,MIR378D2	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	24535	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	97295015	97295255	97295133	Y	NA	UQCRB,MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	23072	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	97319675	97319761	97319753	Y	NA	MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	47732	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	100461450	100461455	100461453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13B	437956	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	101385316	101385524	101385421	Y	NA	RNF19A	MIR4471	IMR90	Hi-C	24141950	RNF19A	38870	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	102161878	102162231	102162054	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	54190	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	102191448	102191797	102191796	Y	NA	ZNF706	NA	NA	NA	NA	ZNF706	24624	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	102388506	102388737	102388522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	172085	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	84763	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	103757592	103757997	103757773	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	91462	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	103766474	103766656	103766574	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	100344	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	72755	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	103922083	103922307	103922186	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	17991	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	104043647	104043928	104043793	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	12356	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	105677496	105678173	105677683	Y	TM7SF4,LRP12	NA	LRP12	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP12	78244	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	106582164	106582354	106582260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	253244	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	107870700	107870850	107870776	Y	NA	NA	ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	TAGLN2P1	162459	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	108235435	108235863	108235712	Y	NA	NA	ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	TAGLN2P1	527194	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	110647152	110647483	110647459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	54537	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	113719309	113719645	113719477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	667253	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	114266349	114266595	114266472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	120303	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	115947625	115947931	115947832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-536K17.1	1466064	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.17482232089921
chr8	115953309	115953537	115953446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-536K17.1	1460458	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	116067507	116067816	116067663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-536K17.1	1346179	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	117364382	117364703	117364447	Y	NA	RP11-536K17.1	LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-536K17.1	49292	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	117366472	117366785	117366629	Y	NA	RP11-536K17.1	LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-536K17.1	47210	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	117378539	117378781	117378660	Y	NA	RP11-536K17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-536K17.1	35214	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	117529764	117530094	117529930	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-536K17.1	115769	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	119023512	119024035	119023740	Y	EXT1	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	98057	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	119339236	119339376	119339324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	217144	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	119485123	119485454	119485409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	146780	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.52237562462945
chr8	119761036	119761418	119761238	Y	TNFRSF11B	RPS26P35	COLEC10	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	11022	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	119808728	119809168	119808881	Y	TNFRSF11B	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	36288	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	119879416	119879736	119879577	Y	NA	NA	TNFRSF11B,COLEC10	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF11B	82703	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	119917519	119917835	119917587	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	44604	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	119925422	119925588	119925448	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	36851	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	119960672	119960883	119960778	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	1556	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	120066342	120066835	120066563	Y	NA	NA	SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF11B	103903	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	120217398	120217670	120217528	Y	MAL2	MAL2	NA	NA	NA	NA	MAL2	42125	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	120995010	120995163	120995088	Y	DEPTOR	NA	NA	NA	NA	NA	DEPTOR	111053	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	124816728	124816894	124816751	Y	NA	FAM91A1	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	38032	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	125764120	125764533	125764318	Y	ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	MTSS1	MTSS1,ZNF572,NDUFB9,TATDN1,LOC157381,SQLE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTSS1	25390	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	126710957	126711330	126711190	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,TRIB1,KIAA0196	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	270394	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	127386877	127387004	127386941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	181634	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	127387635	127388005	127387836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	180633	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	128865187	128865467	128865327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	60408	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	129336748	129337038	129336807	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	315891	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	129569050	129569202	129569118	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	548193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	130276048	130276167	130276108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	751208	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	130285758	130286324	130285998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	741051	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	130975001	130975392	130975263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	51983	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	130996669	130996803	130996748	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	131089372	131089764	131089568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	61997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	131289962	131290145	131290029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	163761	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.30489339253953
chr8	131495645	131495684	131495664	Y	NA	ASAP1	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	41739	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	132828459	132829599	132829218	Y	EFR3A	NA	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	84736	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	133274886	133274900	133274893	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	360551	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	134914879	134915101	134914942	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	332696	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr8	141804565	141804680	141804623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	205635	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	141972530	141972881	141972765	Y	NA	PTK2	NA	NA	NA	NA	PTK2	37434	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	142163740	142163864	142163753	Y	NA	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	38363	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	143897219	143897551	143897306	Y	LY6E,GLI4	NA	LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669	MCF7	ChIA-PET	22265404	JRK	135833	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	145129247	145129547	145129402	Y	GSDMD,GRINA,SPATC1,OPLAH	PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN	DGAT1,HSF1,GRINA,PARP10,PLEC,SPATC1,MAF1,SHARPIN,GPAA1,CYC1,EXOSC4,KIAA1875	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXOSC4	1982	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	145549095	145549459	145549304	Y	NA	BOP1,HSF1,DGAT1,SCRT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	522	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	442373	442547	442460	Y	NA	KANK1	NA	NA	NA	NA	KANK1	25744	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	3719575	3720240	3719887	Y	NA	NA	GLIS3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-509J21.1	194852	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	4042913	4043209	4043135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	303183	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	4137159	4137519	4137339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	208873	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	4296901	4297617	4297146	Y	GLIS3	GLIS3	NA	NA	NA	NA	GLIS3	48775	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	5269155	5269233	5269193	Y	NA	NA	C9orf46	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	179270	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	5509549	5510003	5509837	Y	C9orf46,CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	1004	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	5580709	5581016	5580868	Y	NA	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	46009	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	6384866	6385180	6385056	Y	NA	UHRF2	NA	NA	NA	NA	UHRF2	25971	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr9	7320258	7320407	7320333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	155913	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	13278024	13278458	13278161	Y	NA	MPDZ	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	435	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr9	16344409	16344763	16344480	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	380049	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	16506213	16506544	16506471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	218268	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	16729817	16729878	16729869	Y	BNC2	RP11-62F24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	5005	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	16869534	16869976	16869661	Y	BNC2	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	693	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	16917257	16917516	16917383	Y	NA	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	48416	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	18695	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr9	18547624	18547850	18547739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	75732	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313922	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	21696721	21697113	21696912	Y	IFNA8	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313041	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	26243860	26243998	26243927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	567004	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	27117778	27117984	27117879	Y	NA	TEK	NA	NA	NA	NA	TEK	10639	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	27155069	27155179	27155099	Y	TEK	TEK	NA	NA	NA	NA	TEK	47930	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	32004800	32005157	32005020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	377461	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	35490989	35491345	35491127	Y	NA	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	2865	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	35492185	35492605	35492350	Y	RUSC2	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	4061	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	35516545	35516820	35516591	Y	NA	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	28421	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	29917	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	32354	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	7.39439589105731
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,SPAG8,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	GBA2	21997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	35914292	35914707	35914657	Y	NA	NDUFA5P4,HRCT1	NA	NA	NA	NA	HRCT1	10103	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	35924357	35924707	35924422	Y	NA	HRCT1,YBX1P10	NA	NA	NA	NA	HRCT1	20168	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	36037997	36038326	36038187	Y	NA	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	3567	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	36039800	36039974	36039887	Y	OR2S2,RECK	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	5370	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	36040345	36040403	36040371	Y	NA	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	5915	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	36166552	36166755	36166690	Y	CREB3,TLN1	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	22098	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	32675	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	36764220	36764685	36764538	Y	NA	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	193361	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	36765862	36766252	36766147	Y	RNF38,RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	195003	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	37938183	37938323	37938277	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	128361	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	38016375	38016730	38016641	Y	NA	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49954	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	55707	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	71793410	71793781	71793424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	59201	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	72801648	72801771	72801710	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	70166	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.73985785671937
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr9	73168765	73169157	73169115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	141225	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr9	73178748	73179070	73178790	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	151208	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	73202028	73202554	73202277	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	174488	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	73203378	73203385	73203382	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	175838	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr9	73569162	73569421	73569277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM3	490399	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	74292775	74292963	74292884	Y	TMEM2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	90258	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	75172533	75172850	75172692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	194370	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	80325325	80325445	80325383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	318929	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	80637884	80638322	80638164	Y	NA	GNAQ	NA	NA	NA	NA	GNAQ	6052	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	81471083	81471392	81471194	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	PSAT1	561024	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	81480672	81480887	81480778	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	PSAT1	570613	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	81586798	81586848	81586823	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	TLE4	597840	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	81600122	81600487	81600176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	584201	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	81641483	81641834	81641545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	542854	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	81977149	81977423	81977213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	207265	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	86088348	86088544	86088498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD3	62917	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	86238855	86239256	86239056	Y	UBQLN1,GKAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	81253	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	86911270	86911583	86911478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI1	317644	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	87326939	87327108	87327024	Y	NTRK2,NTRK2,NTRK2	NA	NA	NA	NA	NA	RMI1	733313	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	88598937	88598983	88598960	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	44876	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	88902044	88902242	88902143	Y	NA	ISCA1	NA	NA	NA	NA	ISCA1	6368	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	90115567	90115708	90115625	Y	DAPK1	DAPK1	NA	NA	NA	NA	DAPK1	5424	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	90182587	90182864	90182726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAPK1	72444	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	DAPK1	218029	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr9	91150927	91151269	91151097	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	2911	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	91654177	91654400	91654289	Y	NA	S1PR3	NA	NA	NA	NA	S1PR3	49815	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	3.47971571343873
chr9	94587450	94587551	94587492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	122893	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	94872861	94873095	94872978	Y	NA	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	2571	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	95732704	95733017	95732861	Y	NINJ1,C9orf89,FGD3	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD3	85972	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	96377714	96377795	96377762	Y	PHF2	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	41025	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr9	97629577	97629759	97629671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	142594	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	97631649	97631973	97631839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	144666	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	97633078	97633398	97633277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	146095	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	98583076	98583344	98583210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	52915	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	99171138	99171308	99171256	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	3572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr9	99182775	99182932	99182834	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	4164	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	100841115	100841498	100841123	Y	C9orf156	NANS,TRIM14	NA	NA	NA	NA	NANS	24094	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	101883874	101884261	101884068	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	19554	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	102646895	102646933	102646914	Y	NA	STX17	NA	NA	NA	NA	STX17	19982	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEFF1	28424	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	103192373	103192745	103192675	Y	C9orf30	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEFF1	9815	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	108042949	108043294	108043141	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	38046	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	110500244	110500586	110500377	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-438P9.1	205573	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	110517575	110517896	110517754	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	222904	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	26333	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	114721832	114722310	114722097	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	64786	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	114783014	114783329	114783192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	125968	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	114809786	114810087	114810015	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	125601	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	114812315	114812544	114812429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123144	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr9	114823556	114823978	114823803	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	111710	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	114828005	114828556	114828288	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	107132	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	114831912	114832228	114831995	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	103460	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	114835497	114835862	114835756	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	99826	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	114836654	114837091	114837061	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	98597	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	115110736	115110930	115110781	Y	NA	PTBP3,HSDL2	NA	NA	NA	NA	PTBP3	16789	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	116036635	116036980	116036798	Y	SLC31A2,FKBP15,RGS3	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	CDC26	766	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	116304651	116305008	116304842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	99640	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	116341254	116341479	116341362	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	136243	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	475416	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	118358577	118359027	118358666	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	480041	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	118378080	118378500	118378342	Y	NA	NA	PAPPA,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	499544	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	118413110	118413431	118413289	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	534574	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	118430899	118431573	118430988	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	552363	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	556397	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr9	118758811	118759033	118758921	Y	NA	NA	PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	688548	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	118858385	118858739	118858560	Y	NA	NA	LINC00474,PAPPA,LOC100128505,ASTN2	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	588842	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	119329308	119329509	119329406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	118072	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	119704265	119704279	119704273	Y	ASTN2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	256684	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	123208545	123208837	123208691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	131611	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	124040831	124041134	124040970	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	57539	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	125811144	125811514	125811213	Y	NA	NA	MIR600HG	IMR90	Hi-C	24141950	RABGAP1	110032	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	126624648	126624917	126624783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	65514	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	OLFML2A	NA	NA	NA	NA	OLFML2A	17328	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	13790	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	130718218	130718307	130718248	Y	NA	ST6GALNAC4,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	DPM2	19455	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	130730158	130730541	130730220	Y	NA	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	10251	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	1.0874111604496
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chr9	132464908	132465166	132465090	Y	C9orf50,PRRX2	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	48160	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	132712659	132713039	132713009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	90434	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	132785309	132785843	132785545	Y	USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	17630	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	134316967	134317380	134317020	Y	NA	PRRC2B	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	49487	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	134498956	134499243	134499097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UCK1	94301	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	134553923	134554245	134554041	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	59216	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	134600757	134600889	134600837	Y	RAPGEF1,NTNG2	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	12572	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	136292897	136293168	136293034	Y	SLC2A6,RALGDS	REXO4,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	REXO4	11733	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	SARDH	NA	NA	NA	NA	SARDH	26298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	136738611	136738757	136738701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116969	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	136800116	136800268	136800192	Y	C9orf7	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	55458	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	136999790	136999893	136999856	Y	NA	WDR5	NA	NA	NA	NA	WDR5	1303	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	137285570	137286195	137285918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	78626	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	137367331	137367474	137367390	Y	COL5A1	NA	COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	RXRA	160387	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	137483960	137484781	137484422	Y	NA	COL5A1	RXRA,COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A1	46839	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chr9	137718262	137718824	137718799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	186642	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr9	138852334	138852387	138852361	Y	CARD9	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	1108	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	138915703	138915918	138915811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC1	64477	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	9.56921821195652
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	140274735	140275080	140274933	Y	CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	40634	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	177609	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chrX	10712546	10712862	10712704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	136911	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	11460430	11460509	11460495	Y	AMELX	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	313769	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMPD4	73997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chrX	12390298	12390694	12390463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMPD4	235713	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	12965371	12965491	12965432	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	25736	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	12996273	12996492	12996427	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5046	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	13138325	13138351	13138340	Y	NA	NA	FAM9C,LOC100133123,TMSB4X	IMR90	Hi-C	24141950	TMSB4X	147098	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	15354246	15354416	15354344	Y	ZRSR2,CA5B,MOSPD2,PIGA	PIGA	NA	NA	NA	NA	PIGA	2570	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	19859063	19859320	19859184	Y	SH3KBP1	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	44399	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	20281516	20281702	20281609	Y	SH3KBP1,SH3KBP1,RPS6KA3	RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	1821	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	22013670	22013825	22013692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	56979	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	25664451	25664736	25664645	Y	MAGEB18	NA	NA	NA	NA	NA	POLA1	954415	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	39614973	39615267	39615108	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	30123	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	39619041	39619197	39619186	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	26193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	40012729	40012965	40012840	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21617	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	40692126	40692324	40692241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	72913	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	41480372	41480697	41480463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	289721	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	41594711	41594837	41594774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	185879	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	231336	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	45210801	45210962	45210882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	392732	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	228617	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	45480900	45481410	45481103	Y	NA	NA	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	122284	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	45569317	45570037	45569421	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	33657	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	45631125	45631239	45631172	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	26595	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	36895	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	47360973	47361468	47361218	Y	CFP,CFP,ARAF	ZNF41	ZNF41,ARAF,SYN1,TIMP1,MIR4769	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF41	20628	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	47423323	47423681	47423373	Y	CDK16,CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	4807	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4A2P4	103295	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	53467837	53468052	53468003	Y	KDM5C	SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	8517	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	57421884	57422193	57422039	Y	FAAH2	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-323P24.3	275789	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	73272054	73272428	73272273	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	109895	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	73338057	73338325	73338191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53400	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	73755621	73755953	73755678	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	76499	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	73756739	73756964	73756863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75488	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	79827525	79827860	79827693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	235327	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	87351546	87351899	87351791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL4	580794	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	100498384	100498730	100498494	Y	ARMCX3,ARMCX3,TMEM35,DRP2	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM8A	103454	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHB9	58680	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	193880	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	113028207	113028379	113028299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSU72P1	594748	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	117654579	117654738	117654653	Y	LONRF3	DOCK11	NA	NA	NA	NA	DOCK11	26718	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	117896439	117896822	117896632	Y	NA	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	36904	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.652446696269763
chrX	125556519	125556645	125556582	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	48223	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	2.17482232089921
chrX	127434305	127434453	127434370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	1221024	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	129218658	129218852	129218759	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	23839	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1	NA	NA	NA	NA	AIFM1	9468	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.869928928359684
chrX	129966535	129966828	129966682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	68380	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	130880517	130880959	130880705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	274334	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	133646648	133646903	133646776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPRT1	54465	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	153166203	153166850	153166548	Y	ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP	L1CAM,ARHGAP4,NAA10	NA	NA	NA	NA	L1CAM	5827	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	153600469	153600779	153600667	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	227	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrX	153829365	153829583	153829391	Y	NA	AF277315.19	NA	NA	NA	NA	AF277315.19	2528	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrY	7637940	7638259	7638201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKY	497927	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921
chrY	14775457	14775545	14775476	Y	NA	TTTY15	NA	NA	NA	NA	TTTY15	3192	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3Y	193325	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.434964464179842
chrY	21046816	21047207	21047093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTY14	190095	CAGE	Mero-41	hg19	FANTOM5	0.217482232089921